JP2020531028A - ニューロピリン−1(nrp1)のヒト心室前駆細胞を単離するための細胞表面マーカーとしての使用 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2017年8月23日に出願された米国仮出願第62/549,345号の優先日の利益を主張する。この仮出願の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
Isl1の心臓前駆細胞のマーカーとしての同定は大幅に進歩したが、Isl1が細胞内タンパク質であるため、これは、大量の生存細胞の単離で使用するために好適なマーカーではない。むしろ、細胞表面マーカー(複数可)がなお必要とされている。さらに、マーカーとしてのIsl1は、心臓系統内の複数の細胞型に分化し得る集団を同定し、したがって、心臓系統内の特定の細胞型に、特に心室細胞に分化する前駆細胞に偏向している心臓前駆細胞を同定するマーカーに対するさらなるニーズがある。したがって、当該技術分野においては、優勢に、心筋細胞を生じさせ、かつ心筋原性前駆細胞の迅速な単離および大規模増殖を可能にする、心臓前駆細胞の追加のマーカー、特に心臓前駆細胞の細胞表面マーカーに対する大きなニーズがある。さらに、当該技術分野においては、インビボで心室筋細胞に分化し、それにより、心室前駆体または心室筋細胞のインビボでの移植を可能にして心機能を向上させる、心室前駆体を単離するための方法および組成物に対する大きなニーズがある。
ヒト心臓前駆細胞を含有する細胞の培養物を、NRP1と反応性の1つ以上の薬剤と接触させることと、
NRP1反応性陽性細胞を、非反応性細胞から分離して、それにより、ヒト心室前駆細胞を単離することと、を含む。
ヒト多能性幹細胞を、心臓前駆細胞を生成する条件下で培養して、培養細胞集団を得ることと、
培養細胞集団を、NRP1と反応性の1つ以上の薬剤と接触させることと、
NRP1反応性陽性細胞を、非反応性細胞から分離して、それにより、ヒト心室前駆細胞を単離することと、を含む。
単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞を単離することと、
単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞を、細胞が少なくとも1×109個の細胞にまで増殖するような条件下で培養し、それにより、ヒト心室前駆細胞のクローン集団を得ることと、を含む。
NRP1+ヒト心室前駆細胞を非ヒト動物の臓器に移植することと、
ヒト心室組織が生成されるように、前駆細胞をインビボで成長させることと、を含む、ヒト心室組織を生成するための方法に関する。
NRP1+心室前駆細胞を提供することと、
この細胞を試験化合物と接触させることと、
この細胞に対する試験化合物の毒性を測定することと、を含み、
この細胞に対する試験化合物の毒性は、試験化合物の心臓毒性を示す。この細胞に対する試験化合物の毒性は、例えば、細胞生存度または細胞の他の生理学的パラメータを評価することによって、測定することができる。
心臓中胚葉マーカーが生成されるように、ヒト多能性幹細胞(hPSC)を、CHIR98014を含む培地中で培養することと、
HVPが生成されるように、心臓中胚葉マーカーを発現する細胞を、Wnt−C59を含む培地中で培養することと、を含む、ヒト心室前駆体(HVP)を生成する方法に関する。
一態様では、本発明は、ヒト心室前駆細胞を単離するための方法に関する。実施例に記載されるように、NRP1はここでは、ヒト心室前駆細胞の細胞表面マーカーとして特定されているため、このマーカーは前駆細胞の単離を容易にするために使用することができる。NRP1の代わりに、表1、5、および10に示されるマーカーを含む、ヒト心室前駆細胞に対する追加のマーカーが本明細書で提供されている。細胞表面タンパク質であるこれらの表のタンパク質のいずれも、本明細書に記載されるHVPの単離において使用することができる。
心臓前駆細胞を含有するヒト細胞の培養物を、NRP1と反応性の1つ以上の薬剤と接触させることと、
NRP1反応性陽性細胞を、非反応性細胞から分離して、それにより、ヒト心室前駆細胞を単離することと、を含む。
ヒト多能性幹細胞を、心臓前駆細胞を生成する条件下で培養して、細胞の培養物を得ることと、
細胞の培養物を、NRP1と反応性の1つ以上の薬剤と接触させることと、
NRP1反応性陽性細胞を、非反応性細胞から分離して、それにより、ヒト心室前駆細胞を単離することと、を含む。
別の態様では、本発明は、ヒト心室前駆細胞のクローン集団、ならびにこのような前駆体の単離されたクローン集団を得るための方法を提供する。本発明は、十億個以上の細胞のクローン集団を達成できるように、心室前駆細胞の増殖および繁殖を可能にする。NRP1+心室前駆細胞をこのような多数にクローン的に増殖させる能力は、このような使用には十億個以上ほどの細胞が必要であるため、心機能を強化するためのインビトロでのこれらの細胞の成功利用のために必要な機能である。
単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞を単離することと、
単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞を、細胞が少なくとも1×109個の細胞にまで増殖するような条件下で培養し、それにより、ヒト心室前駆細胞のクローン集団を得ることと、を含む。
前述の方法による分離、および任意に前述の方法によるクローン集団の取得の前に、ヒト心室前駆細胞(HVP)の非クローン集団は、HVPを生成するための適切な培養条件下でヒト多能性幹細胞(hPSC)を培養することによって得ることができる。例示的な培養条件のセット、および好適な開始細胞は、実施例1および実施例10に詳細に記載されており、本明細書でヒト心室前駆細胞生成(HVPG)プロトコルとしても称される。好適なhPSC開始細胞としては、誘導多能性幹細胞(iPSC)、およびES細胞株などのヒト胚性幹細胞が挙げられる。プロトコルについては、Wnt/β−カテニンシグナル伝達が、最初にhPSC中で活性化され、その後インキュベーション期間が続き、その後Wnt/β−カテニンシグナル伝達の阻害が続く。Wnt/β−カテニンシグナル伝達活性化は、Gsk3阻害剤、好ましくは、CHIR98014(例えば、Selleckchemから市販されている、CAS556813−39−9)とのインキュベーションにより達成される。Wnt/β−カテニンシグナル伝達阻害は、Porcn阻害剤、好ましくは、Wnt−C59(SelleckchemまたはTocrisなどから市販されている、CAS1243243−89−1)とのインキュベーションにより達成される。Gsk3阻害剤は、心臓中胚葉分化を促進するために使用されるが、一方Porcn阻害剤は、中胚葉細胞からの心室前駆細胞の分化を増強させるために使用される。
ヒト心室前駆細胞(HVP)がヌードマウスの腎被膜下に移植された実施例6および7に記載されるインビボでの移植研究は、腎被膜の表面上の成熟した機能的なヒトの心室筋の大きな壁に自発的に集合するHVPの能力を実証している。血管新生は、ネズミの脈管構造を心室の室筋壁に呼び込むことによってパラクリン経路を介して生じるが、マトリックスは、前駆体自体から細胞自律的経路を介して生成される。HVPが正常なネズミ心臓に移植された実施例8に記載さるインビボでの心筋内移植研究では、HVPが心外膜表面に自発的に移動し、そこで拡大増殖し、その後分化して、成熟して心外膜の表面のヒト心室筋の壁になることを実証している。総合すれば、これらの研究は、精製されたHVPを介したインビボでの完全な細胞自律的経路を介してヒトの心室形成が生じ、それによって臓器対臓器のインビボティッシュエンジニアリングにおけるそれらの使用を可能にすることを示している。
本発明の心室前駆細胞は、細胞を心臓中に直接移植することによって心機能を増強するためにインビボで使用され得る。NRP1+前駆体は、3つ全ての型の心系統細胞(心筋細胞、内皮細胞および平滑筋細胞)へと分化する能力を有することが、本明細書で示されている(実施例3を参照されたい)。さらに、心室系統に偏向させる条件下で培養される場合、NRP1+前駆体は、天然の心室環境中にインビボで移植される場合に、優勢に心室の筋肉表現型をとることが本明細書で示されており、このことは、これらの前駆細胞が心室環境を「認識」し、インビボで適切に応答および分化することを実証している。心室環境への損傷は、心疾患および障害において損なわれた心機能の大きな原因であるので、本発明の心室前駆細胞を使用して心室筋細胞を回復させる能力は、当該分野において顕著な進歩を示す。
本発明の心室前駆細胞は、心成熟化および分化の種々の態様の研究、特に、心成熟化および分化のプロセスに関与する細胞シグナル伝達経路および生物学的メディエータを同定する際に、インビトロで使用され得る。
NRP1+ヒト心室前駆細胞を提供することと、
この細胞を試験化合物と接触させることと、
この細胞に対する試験化合物の毒性を測定することと、を含み、
この細胞に対する試験化合物の毒性は、試験化合物の心臓毒性を示す。
NRP1+ヒト心室前駆細胞を提供することと、
細胞を、試験化合物の存在下または非存在下で培養することと、
細胞の分化を、試験化合物の存在下または非存在下で測定することと、
試験化合物の非存在下での分化と比較して、ヒト心室前駆細胞分化を調節する試験化合物を選択し、それにより、ヒト心室前駆細胞分化を調節する化合物を同定することと、を含む。
NRP1+ヒト心室前駆細胞を提供することと、
細胞を、ヒト心室心筋細胞を生成する条件下で、試験化合物の存在下または非存在下で培養することと、
ヒト心室心筋細胞の機能を、試験化合物の存在下または非存在下で測定することと、
試験化合物の非存在下での機能と比較して、ヒト心室心筋細胞機能を調節する試験化合物を選択し、それにより、ヒト心室心筋細胞機能を調節する化合物を同定することと、を含む。
心疾患のヒトiPSおよびES細胞ベースのモデルの開発は、心血管薬物の開発および発見における新たな展望を開いている。しかしながら、現在まで、これらの系は、培養細胞系における2D構造に基づいているという制限を有してきた。加えて、細胞の胎児特性および未熟特性が、成体心臓に対するそれらの有用性および忠実度を制限している。ヒト心疾患、特に心不全は、治療標的として既知の部位である、環境性、ホルモン性および他の重要な臓器、例えば腎臓によって影響される、複雑な多因子性の多臓器疾患である。異所的に、またはインタクトな正常マウス心臓の表面上のいずれかに成熟した機能的なヒト心室臓器を構築する能力は、通常は成熟ヒト心室筋腔に対してアッセイされ得るだけの研究を可能にするための、新たなインビボモデル系、例えば、心室不整脈、収縮力の発生、線維症、および再生のための潜在力を開拓する。したがって、インビトロ組織培養系を離れて、インビボで心不全の背景において直接的にヒト心疾患を研究するための選択肢が、本明細書では明らかに可能である。
NRP1+ヒト心室前駆細胞を非ヒト動物の臓器に移植することと、
ヒト心室組織が生成されるように、前駆体をインビボで成長させることと、
試験化合物を非ヒト動物に投与することと、
非ヒト動物におけるヒト心室組織に対する試験化合物の影響を評価することと、を含む。
試験化合物を非ヒト動物に投与することであって、この非ヒト動物が、非ヒト動物の臓器中に移植されたNRP1+ヒト心室前駆体を含む、投与することと、
非ヒト動物におけるNRP1+ヒト心室前駆体に対する試験化合物の影響を評価することと、を含む。
古典的Wntシグナル伝達の一時的調節は、多数のhPSC株から、高い収量かつ純度で機能的心筋細胞を生成するのに十分であることが示されている(Lian,X.et al.(2012年)Proc.Natl.Acad.Sci.USA109:E1848−1857頁;Lian,X.et al.(2013)Nat.Protoc.8:162−175)。このプロトコルについては、Wnt/β−カテニンシグナル伝達が、最初にhPSC中で活性化され、その後インキュベーション期間が続き、その後Wnt/β−カテニンシグナル伝達の阻害が続く。元々公開されたプロトコルでは、Wnt/β−カテニンシグナル伝達の活性化は、Gsk3阻害剤CHIR99021(GSK−3α、IC50=10nM;GSK−3、βIC50=6.7nM)とのインキュベーションによって達成され、Wnt/β−カテニンシグナル伝達の阻害は、Porcn阻害剤IWP2(IC50=27nM)とのインキュベーションによって達成されていた。本発明者らは、心分化のためにGsk3阻害剤およびWnt産生阻害剤を使用したので、このプロトコルをGiWiプロトコルと称した。元のプロトコルの効率を改善し、元のプロトコルにおいて使用した小分子の潜在的副作用を低減させるために、より高い阻害効力を有する小分子の別のセットを使用する第2世代プロトコルを開発した。この第2世代GiWiプロトコルでは、Wnt/β−カテニンシグナル伝達の活性化を、Gsk3阻害剤CHIR98014(CAS 556813−39−9;例えば、Selleckchemから市販されている)(GSK−3α、IC50=0.65nM;GSK−3、βIC50=0.58nM)とのインキュベーションによって達成し、Wnt/β−カテニンシグナル伝達の阻害を、Porcn阻害剤Wnt−C59(CAS 1243243−89−1;例えば、SelleckchemまたはTocrisから市販されている)(IC50=74pM)とのインキュベーションによって達成した。Gsk3阻害剤CHIR98014を使用して、心中胚葉分化を促進し、Porcn阻害剤Wnt−C59を使用して、中胚葉細胞からの心室前駆体分化を増強した。
心分化プロセスの間に生じる転写変化をゲノム規模レベルでプロファイリングするために、RNA配列決定(RNA−seq)を、分化後の異なる時点において実施して、心発生転写景観を構築した。本発明者らは、0日目〜7日目の試料、ならびに19日目および35日目の試料に対して、RNA−seq実験を実施した(1つの時点につき2つの独立した生物学的複製)。2バッチのRNA−seq(100bpおよび50bpのリード長さ)を、illumine Hiseq 2000プラットホームを使用して実施した。合計で、20の試料を検査した。BowtieおよびTophatを使用して、本発明者らのリードを参照ヒトゲノム(hg19)へとマッピングし、本発明者らは、RPKM法(リード/転写物1キロベース/100万リード)を使用して、各遺伝子発現(Refseqに従う遺伝子のアノテーション)を計算した。心筋細胞へのhPSCの分化には、5つの主要な細胞型が関与する:多能性幹細胞(0日目)、中胚葉前駆体(1日目〜2日目)、心中胚葉細胞(3日目〜4日目)、心臓原基前駆体(5日目、6日目および7日目)、および心筋細胞(10日目の後)。
Isl1+Jag1+細胞のクローン性分化潜在力を特性化するために、心筋原性前駆細胞を、実施例1に記載される培養プロトコルによって生成し、1つの単一のIsl1+Jag1+細胞を、Matrigelコーティングされた48ウェルプレートの1つのウェル中に播種した。細胞を、Jag1の抗体を用いて精製し、次いで、1つの単一の細胞を、1つのウェル中に播種した。次いで、単一の細胞を、心臓前駆体培養(CPC)培地(2.5mMのGlutaMAX、100μg/mlのビタミンC、20%のノックアウト血清代替物を補充したアドバンストDMEM/F12)中で3週間培養した。
ES03ヒト胚性幹細胞(hESC)株(WiCell Research Instituteから取得した)は、心特異的cTnTプロモーターによって駆動される緑色蛍光タンパク質(GFP)を発現する。ES03細胞を使用して、実施例1に記載される培養プロトコルを使用して、Isl1+Jag1+心筋原性前駆細胞を生成した。これらのIsl1+Jag1+心筋原性前駆細胞を、重症複合免疫不全(SCID)ベージュマウスの心臓中に移植して、インビボでのそれらの発生潜在力を立証した。
実施例2に記載されるように、Frizzled4(FZD4)は、RNA−seq分析によって心臓前駆細胞において発現することが同定された。したがって、心臓前駆細胞の細胞表面マーカーとしてFZD4を確認するために、FZD4発現を、ウエスタンブロット分析を介して心分化の間に判定した。図5に示される結果は、FZD4が、多能性幹細胞および最初の3日間の分化した細胞においては発現されなかったことを実証した。しかしながら、FZD4は、4日目に発現され始め、発現の5日目にその発現を最大化する。
心室の心筋腔の構築は、ヒト臓器形成の間の最も重要かつ早期の工程のうちの1つであり、遊走、増殖、血管新生、アセンブリおよびマトリックス整列を含む、一連の協調された工程を必要とする。HVPがインビボで心室形成を駆動する能力を試験するために、本発明者らは、免疫不全マウスの腎臓被膜下に、精製されたHVPまたは未精製のHVP(92.0±1.9% ISL1+)を移植した。移植の2カ月後に、未精製のHVPを移植した動物は、腫瘍を形成し、100%の腫瘍形成効率(100%、4/4)を生じたが、精製されたHVPを移植した動物は、いずれの腫瘍も形成しなかった(0%、0/10)。
ヒト心生物学および疾患の研究のためのhPSCの有用性についての重要な制限の1つは、成熟度の欠如および胎児アイソフォームの発現の持続である。HVP由来の臓器が機能的な成熟した心室筋肉になることができるかどうかを決定するために、長期移植研究を実施し、その後、T管の形成(Brette,F.and Orchard,C.(2003)Circ.Res.92:1182−1192頁;Marks,A.R.(2013)J.Clin.Invest.123:46−52)、操作された心室組織の他の研究と同等な力を生む能力、自動能の喪失、および成体−桿状心室心筋細胞の獲得を含む、成体心室心筋の十分に受容された特色のパネルの詳細な分析を行った。
心外膜は、緻密層拡大増殖の間に心室腔の成長を駆動し、ならびに心筋傷害後に増殖でき、既知の脈管細胞運命スイッチ、例えばVEGFに応答して脈管形成を駆動できる成体心外膜前駆体のホームとして機能する、心臓前駆体のための既知のニッチである(Giordano,F.J.et al.(2001)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 98:5780−5785;Masters,M.and Riley,P.R.(2014)Stem Cell Res.13:683−692;Zangi,L.et al.(2013)Nat.Biotechnol.31:898−907)。HVPが正常心臓の心外膜表面へと自発的に遊走し得るかどうかを決定するために、精製された緑色蛍光タンパク質(GFP)標識HVPを、免疫不全マウスの心臓中に心筋内注射した。移植の1週間後または1カ月後、動物を屠殺し、生着した心臓を組織学のために取り出した。移植の1週間後、GFP+細胞の大部分は、心筋中で保持された。しかしながら、ほぼ全てのGFP+細胞が、移植の1ヶ月後に心外膜に遊走した。加えて、GFP+細胞は、移植の1週間後にISL1+かつKi67+であった。
この実施例では、実施例1〜8において使用した実験材料および方法に関するさらなる詳細が提供される。
hESC(ES03、H9)およびヒトiPSC(19−9−11)を、以前に公開された方法(Lian,X.et al.(2013)Nat.Proc.8:162〜175;Lian,X.et al.(2013)Stem Cells 31:447〜457)に従って、mTeSR1培地(STEMCELL Technologies)中でMatrigel(BD Biosciences)コーティングしたプレート上で維持した。
mTeSR1中でMatrigelコーティングされた表面上で維持したhPSCを、37℃で10分間Accutaseを用いて単一の細胞へと解離させ、次いで、5μMのROCK阻害剤Y−27632を補充したmTeSR1中100,000〜200,000細胞/cm2で、Matrigelコーティングされた細胞培養ディッシュ上に24時間播種した(−2日目)。−1日目に、細胞をmTeSR1中で培養した。0日目に、細胞を、インスリン非含有B27を補充したRPMI(RPMI/B27−ins)中1μMのCHIR−98014(Selleckchem)で24時間(0日目〜1日目)処理し、次いで、これを、1日目に培地交換の間に除去した。3日目に、培地の半分を、2μMのWnt−C59(Selleckchem)を含むRPMI/B27−ins培地に交換し、次いで、これを、5日目に培地交換の間に除去した。6日目に、細胞を、単一の細胞へと解離させ、抗JAG1抗体または抗FZD4抗体を用いて精製した。
RNAを単離し(RNeasy Mini kit、Qiagen)、定量化し(Qubit RNA Assay Kit、Life Technologies)、品質制御した(BioAnalyzer 2100、Agilent)。各試料由来のRNA(800ng)を、Illumina TruSeq mRNA Sample Prep Kit v2(Illumina)のためのインプットとして使用し、配列決定ライブラリを、製造者のプロトコルに従って創出した。簡潔に言うと、ポリ−A含有mRNA分子を、ポリ−Tオリゴが結合した磁性ビーズを使用して精製した。精製後、mRNAを断片化し、ランダムプライマーおよび逆転写酵素を使用して第1鎖相補的DNAへとコピーした。次いで、第2鎖cDNA合成を、DNAポリメラーゼIおよびRNase Hを使用して実施した。cDNAをアダプターにライゲーションさせ、PCRで富化して、最終cDNAライブラリを創出した。このライブラリをプールし、製造者の指示に従ってHiSeq 2000(Illumina)機器で配列決定した。
RNA−seqのリードをトリミングし、Tophat 2を使用してhg19参照にマッピングした。平均して、およそ2,300万リードが1試料当たり生成され、これらのリードのうち76%が、独自にマッピングされた。各遺伝子についての発現レベルを、python script rpkmforgenesを使用して定量化し、RefSeqを使用してアノテーションした。少なくとも10リードを有する少なくとも1つの試料がない遺伝子を、分析から除去した。Principle Component nalysisおよびヒートマップを、それぞれ、RおよびGene−Eを使用して構築した。
200万の精製されたHVPのアリコートを、エッペンドルフチューブ中に収集した。細胞を遠心分離し、上清を廃棄した。細胞の各チューブを、以前に記載されたプロトコル(Shultz,L.D.et al.(2005)J.Immunol.174:6477−6489)に従って、それぞれ免疫不全マウス、NOD.Cg−Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJまたはSCID−ベージュ(Charles River France)の腎臓被膜下に移植したか、またはそれらの心臓中に心筋内注射した。生着した腎臓または心臓を、組織学的分析および生理学的分析のために、種々の時間間隔で採取した。
細胞を、Accutaseを10分間用いて単一の細胞へと解離させ、次いで、1%のパラホルムアルデヒドで室温で20分間固定し、PBS+0.1%のTriton X−100および0.5%のBSA中の一次抗体および二次抗体で染色した。データを、FACSCaliberフローサイトメーター(Beckton Dickinson)で収集し、FlowJoを使用して分析した。
細胞を、4%パラホルムアルデヒドを用いて室温で15分間固定し、次いで、PBS+0.4%のTriton X−100および5%の脱脂粉乳(Bio−Rad)中の一次抗体および二次抗体で染色した。核を、DAPI(Invitrogen)と共にGold Anti−fade Reagentを用いて染色した。落射蛍光顕微鏡および共焦点顕微鏡(ZEISS、LSM 700)を、画像分析に使用した。
細胞を、Halt Protease and Phosphatase Inhibitor Cocktail(Pierce)の存在下で、M−PER Mammalian Protein Extraction Reagent(Pierce)中で溶解させた。タンパク質を、変性条件下で10%のTris−グリシンSDS/PAGE(Invitrogen)によって分離し、ニトロセルロース膜に移した。TBST中5%の粉乳でブロッキングした後、膜を、一次抗体と共に4℃で一晩インキュベートした。次いで、この膜を洗浄し、抗マウス/ウサギペルオキシダーゼコンジュゲート化二次抗体と共に室温で1時間インキュベートし、SuperSignal化学発光(Pierce)によって発色させた。
拍動する心室筋細胞クラスターを、顕微解剖し、記録前にガラスカバースリップ上に再プレートした。活動電位活性を、120mMのK D−グルコネート、25mMのKCl、4mMのMgATP、2mMのNaGTP、4mMのNa2−ホスホ−クレアチン、10mMのEGTA、1mMのCaCl2および10mMのHEPES(25℃でHClによってpH7.4に調整した)からなる細胞内溶液を満たしたホウケイ酸ガラスピペット(4〜5Mオームの抵抗)を使用して判定した。カバースリップディッシュ上に播種した培養した心筋細胞を、140mMのNaCl、5.4mMのKCl、1mMのMgCl2、10mMのグルコース、1.8mMのCaCl2および10mMのHEPES(25℃でNaOHによってpH7.4に調整した)を含む細胞外溶液(タイロード溶液)中に浸した。自発的活動電位を、1kHzでローパスフィルタをかけたMulticlamp 700B増幅器(Molecular Devices、CA、USA)ソフトウェアを使用して実施したパッチクランプ技術(全細胞、電流固定構成)を使用して37℃で記録し、デジタル化し、Digidata 1322AおよびClampex 9.6ソフトウェア(Molecular Devices、CA、USA)を使用して保存した。
データは、平均±平均値の標準誤差(SEM)として示される。統計的有意性を、2つの群間のスチューデントt検定(両側)によって決定した。p<0.05を統計的に有意とみなした。
この実施例では、規定されたゼノフリー培養培地、Essential 8を利用する、ヒト心室前駆体の分化のための代替的分化プロトコルが提供される。Essential 8培地は、ヒト多能性幹細胞(hPSC)の成長および増殖のために開発したものであり、Chen,G.et al.(2011)Nat.Methods 8:424−429(この中では「E8」培地と呼ばれる)中にさらに記載されている。
この実施例では、ヒト心室前駆細胞(HVP)に発現する血管新生ファミリーの遺伝子を同定した。HVPを、実施例1または10に記載される通りに生成し、RNA配列決定(RNA−seq)を、実施例1に記載される通りに、分化後の異なる時点で実施した。HVP分化の間の遺伝子発現プロファイルのクラスター分析は、段階依存的なシグネチャー遺伝子を同定した。これらの遺伝子を、それらの発現プロファイルの類似性に基づいて、階層的にクラスター化した。最初に、4つの異なるカテゴリーでの発現を示す遺伝子を同定した:(i)細胞表面発現、(ii)Islet1との共発現、(iii)分化の5日目での高発現、および(iv)高いd5/d0比。この分析は、JAG1、FZD4、FGFR3、LIFR(CD118)およびTNFSF9のHVPに対する細胞表面タンパク質を確認した。次に、細胞表面マーカーを同定したHVPの同じ集団から、遺伝子個体発生探索を実施して、このHVPの集団で発現された血管新生ファミリー遺伝子を同定し、それにより、細胞生着に重要な遺伝子を同定する遺伝子フィンガープリントプロファイルを同定した。
この実施例では、ヒト心室前駆細胞(HVP)に発現する細胞外マトリックスファミリーの遺伝子を同定した。HVPを、実施例1または10に記載される通りに生成し、RNA配列決定(RNA−seq)を、実施例1に記載される通りに、分化後の異なる時点で実施した。HVP分化の間の遺伝子発現プロファイルのクラスター分析は、段階依存的なシグネチャー遺伝子を同定した。これらの遺伝子を、それらの発現プロファイルの類似性に基づいて、階層的にクラスター化した。最初に、4つの異なるカテゴリーでの発現を示す遺伝子を同定した:(i)細胞表面発現、(ii)Islet1との共発現、(iii)分化の5日目での高発現、および(iv)高いd5/d0比。この分析は、JAG1、FZD4、FGFR3、LIFR(CD118)およびTNFSF9のHVPに対する細胞表面タンパク質を確認した。次に、細胞表面マーカーを同定したHVPの同じ集団から、遺伝子個体発生探索を実施して、このHVPの集団で発現された細胞外マトリックスファミリー遺伝子を同定し、それにより、細胞生着に重要な遺伝子を同定する遺伝子フィンガープリントプロファイルを同定した。
この実施例では、6日目のHVP集団内のIslet1陰性細胞について、遺伝子発現プロファイルを決定し、必要なマーカーを発現しない6日目の集団内の細胞のサブ集団をさらに特性化し、生着可能なHVPとみなした。6日目のHVP集団を、実施例1または10に記載される通りに生成し、RNA配列決定(RNA−seq)を、実施例2に記載される通りに、分化後に実施した。Islet1陰性(Isl1−)である細胞を、それらの遺伝子発現プロファイルに関してさらに分析した。2000以上の平均RNAコピー数を有するIsl1−細胞で圧減された遺伝子を、以下の表9に示している。
この実施例では、単一細胞配列決定を、分化の4、5、6、8、9または15日目に実施し、それにより分化の異なる段階において個々の細胞中で発現された遺伝子を同定した。バルク中の細胞集団の配列決定は、その集団内の細胞のサブタイプをマスクすることができる。単一細胞配列決定は、集団内の細胞型を分類するために偏りのないアプローチを提供する。
この実施例では、ヒト胚性幹細胞株でのNRP1の発現をさらに検討した。H9幹細胞株(当該技術分野においては、WA09としても知られる;Thomson,J.A.et al.(1998)Science 282:1145−1147;WiCell Research Institute)を、これらの実験に使用した。H9細胞を、心臓分化条件下で培養し(例えば、本明細書で実施例1および10に記載されるように)、6日目のヒト心室前駆細胞(HVP)を生成した。
当業者は、慣用的実験にすぎないものを使用して、本明細書に記載される発明の具体的実施形態の多くの等価物を認識し、またはそれらを確認することができる。このような等価物は、以下の特許請求の範囲によって包含されることを意図する。
Claims (53)
- ヒト心室前駆細胞を単離するための方法であって、前記方法が、
心臓前駆細胞を含有するヒト細胞の培養物を、ニューロピリン−1(NRP1)と反応性の1つ以上の薬剤と接触させることと、
NRP1反応性陽性細胞を、非反応性細胞から分離して、それにより、ヒト心室前駆細胞を単離することと、を含む、方法。 - 前記ヒト細胞の培養物が、ヒト心室前駆細胞と反応性の少なくとも1つの第2の薬剤とさらに接触され、NRP1反応性/第2の薬剤反応性陽性細胞が、非反応性細胞から分離され、それにより、ヒト心室前駆細胞を単離する、請求項1に記載の方法。
- 前記少なくとも1つの第2の薬剤が、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9と反応性である、請求項2に記載の方法。
- 前記ヒト細胞の培養物が、前記少なくとも1つの第2の薬剤と接触する前に、前記NRP1と反応性の薬剤と接触される、請求項2に記載の方法。
- 前記ヒト細胞の培養物が、前記NRP1と反応性の薬剤と接触する前に、前記少なくとも1つの第2の薬剤と接触される、請求項2に記載の方法。
- 前記ヒト細胞の培養物が、前記NRP1と反応性の薬剤と、前記少なくとも1つの第2の薬剤とに、同時に接触される、請求項2に記載の方法。
- 前記ヒト心室前駆細胞を、ヒト多能性幹細胞の表面上に発現する少なくとも1つのマーカーと反応性の1つ以上の薬剤と接触させることと、マーカーに非反応性の陰性細胞を反応性細胞から分離して、それにより、ヒト心室前駆細胞をさらに単離することと、をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- ヒト多能性幹細胞の表面上に発現する前記少なくとも1つのマーカーが、TRA−1−60、TRA−1−81、TRA−2−54、SSEA1、SSEA3、SSEA4、CD9、CD24、E−カドヘリン、およびポドカリキシン、ならびにこれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項7に記載の方法。
- ヒト多能性幹細胞の表面上に発現する前記少なくとも1つのマーカーが、TRA−1−60である、請求項7に記載の方法。
- 前記TRA−1−60と反応性の薬剤が、抗TRA−1−60抗体である、請求項9に記載の方法。
- 前記NRP1と反応性の薬剤が、抗NRP1抗体である、請求項1〜10のいずれか一項に記載の方法。
- 前記NRP1と反応性の薬剤が、可溶性NRP1リガンド融合タンパク質である、請求項1〜10のいずれか一項に記載の方法。
- 前記NRP1リガンドが、VEGF−AまたはSema3Aである、請求項12に記載の方法。
- 前記NRP1反応性陽性細胞が、蛍光活性化細胞選別法(FACS)または磁気活性化細胞選別法(MACS)によって、前記非反応性細胞から分離される、請求項1〜13のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ヒト心室前駆細胞が、これらがMLC2v陽性であるように、さらに培養され、かつ分化される、請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法。
- 心臓前駆細胞を含有する前記ヒト細胞の培養物が、ヒト誘導多能性幹細胞のヒト胚性幹細胞に由来する、請求項1〜15のいずれか一項に記載の方法。
- ヒト心室前駆細胞を単離するための方法であって、前記方法が、
ヒト多能性幹細胞を、心臓前駆細胞を生成する条件下で培養して、細胞の培養物を得ることと、
前記細胞の培養物を、ニューロピリン−1(NRP1)と反応性の1つ以上の薬剤と接触させることと、
NRP1反応性陽性細胞を、非反応性細胞から分離して、それにより、ヒト心室前駆細胞を単離することと、を含む、方法。 - 前記ヒト細胞の培養物が、ヒト心室前駆細胞と反応性の少なくとも1つの第2の薬剤とさらに接触され、NRP1反応性/第2の薬剤反応性陽性細胞が、非反応性細胞から分離され、それにより、ヒト心室前駆細胞を単離する、請求項17に記載の方法。
- 前記少なくとも1つの第2の薬剤が、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9と反応性である、請求項18に記載の方法。
- 前記ヒト細胞の培養物が、前記少なくとも1つの第2の薬剤と接触する前に、前記NRP1と反応性の薬剤と接触される、請求項18に記載の方法。
- 前記ヒト細胞の培養物が、前記NRP1と反応性の薬剤と接触する前に、前記少なくとも1つの第2の薬剤と接触される、請求項18に記載の方法。
- 前記ヒト細胞の培養物が、前記NRP1と反応性の薬剤と、前記少なくとも1つの第2の薬剤とに、同時に接触される、請求項18に記載の方法。
- 前記ヒト心室前駆細胞を、ヒト多能性幹細胞の表面上に発現する少なくとも1つのマーカーと反応性の1つ以上の薬剤と接触させることと、マーカーに非反応性の陰性細胞を反応性細胞から分離して、それにより、ヒト心室前駆細胞をさらに単離することと、をさらに含む、請求項17に記載の方法。
- ヒト多能性幹細胞の表面上に発現する前記少なくとも1つのマーカーが、TRA−1−60、TRA−1−81、TRA−2−54、SSEA1、SSEA3、SSEA4、CD9、CD24、E−カドヘリン、およびポドカリキシン、ならびにこれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項23に記載の方法。
- ヒト多能性幹細胞の表面上に発現する前記少なくとも1つのマーカーが、TRA−1−60である、請求項23に記載の方法。
- 前記TRA−1−60と反応性の薬剤が、抗TRA−1−60抗体である、請求項25に記載の方法。
- 前記NRP1と反応性の薬剤が、抗NRP1抗体である、請求項17〜26のいずれか一項に記載の方法。
- 前記NRP1と反応性の薬剤が、可溶性NRP1リガンド融合タンパク質である、請求項17〜26のいずれか一項に記載の方法。
- 前記NRP1リガンドが、VEGF−AまたはSema3Aである、請求項28に記載の方法。
- 前記NRP1反応性陽性細胞が、蛍光活性化細胞選別法(FACS)または磁気活性化細胞選別法(MACS)によって、前記非反応性細胞から分離される、請求項17〜29のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ヒト心室前駆細胞が、これらがMLC2v陽性であるように、さらに培養され、かつ分化される、請求項17〜30のいずれか一項に記載の方法。
- 心臓前駆細胞を含有する前記ヒト細胞の培養物が、ヒト誘導多能性幹細胞のヒト胚性幹細胞に由来する、請求項17〜31のいずれか一項に記載の方法。
- ヒト心室前駆細胞のクローン集団を得るための方法であって、前記方法が、
ヒト心室前駆細胞の培養物をNRP1と反応性の1つ以上の薬剤と接触させることによって、単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞を単離することと、
単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞が、前記細胞が少なくとも1×109個の細胞にまで拡大増殖するような条件下で培養し、それにより、ヒト心室前駆細胞のクローン集団を得ることと、を含む、方法。 - 前記単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞が、初期培養時に、Islet1陽性、Nkx2.5陰性、およびflk1陰性である、請求項33に記載の方法。
- 前記単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞が、蛍光活性化細胞選別法または磁気活性化細胞選別法によって単離される、請求項33に記載の方法。
- 前記NRP1と反応性の薬剤が、抗NRP1抗体である、請求項33に記載の方法。
- 前記単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞が、前記細胞を心室分化に偏向させるような条件下で培養される、請求項33に記載の方法。
- 前記単一のNRP1+ヒト心室前駆細胞が、少なくとも10×109個の細胞にまで拡大増殖する、請求項33に記載の方法。
- 請求項33に記載の方法によって得られた、少なくとも1×109個のNRP1+ヒト心室前駆細胞のクローン集団。
- 請求項38に記載の方法によって得られた、少なくとも10×109個のNRP1+ヒト心室前駆細胞のクローン集団。
- 対象の心機能を向上させる方法であって、前記方法が、請求項39に記載のクローン集団を含む薬学的組成物を、前記対象に投与することを含む、方法。
- 前記クローン集団が、前記対象の心臓に直接投与される、請求項41に記載の方法。
- 前記対象が、心筋梗塞に罹患している、請求項41または42に記載の方法。
- 前記対象が、先天性心臓障害を有する、請求項41または42に記載の方法。
- 前記クローン集団が、前記対象の心臓の心室領域に直接投与される、請求項42に記載の方法。
- 前記薬学的組成物が、二次元または三次元マトリックス上に製剤化された前記クローン集団を含む、請求項41〜45のいずれか一項に記載の方法。
- ヒト心室組織を生成する方法であって、
NRP1+ヒト心室前駆細胞を非ヒト動物の臓器に移植することと、
ヒト心室組織が生成されるように、前駆細胞をインビボで増殖させることと、を含む、方法。 - 前記非ヒト動物が、免疫不全マウスである、請求項47に記載の方法。
- 前記臓器が、腎臓または心臓である、請求項47に記載の方法。
- 前記細胞が、以下の、(i)心臓中胚葉形成のピーク後、(ii)Islet−1発現のピーク時、(iii)NKX2.5発現のピーク前、(iv)下流遺伝子MEF−2およびTBX−1のピーク発現の前、ならびに(v)分化した収縮タンパク質遺伝子の発現前のうちの細胞マーカーパターンのうちの1つ、2つ、3つ、4つ、または5つが存在する時点で移植される、請求項47に記載の方法。
- 前記細胞が、ヒト心室前駆細胞を生成する条件下でのヒト多能性幹細胞のインビトロ培養の5日目〜7日目(両端の値を含む)に移植される、請求項47に記載の方法。
- 前記細胞が、ヒト心室前駆細胞を生成する条件下でのヒト多能性幹細胞のインビトロ培養の6日目に移植される、請求項51に記載の方法。
- 試験化合物の心臓毒性をスクリーニングする方法であって、
NRP1+ヒト心室前駆細胞を提供することと、
前記細胞を、前記試験化合物と接触させることと、
前記細胞に対する前記試験化合物の毒性を測定することと、を含み、
前記細胞に対する前記試験化合物の毒性が、前記試験化合物の心臓毒性を示す、方法。
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