JP2019535262A - キメラ抗原受容体 - Google Patents

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Abstract

本発明は、異なる抗原に結合する第1および第2のキメラ抗原受容体(CAR)を含む細胞であって、第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド(CAML)相互作用因子(TACI)に結合する、細胞を提供する。本発明は、異なる抗原に結合する第1および第2の抗原結合ドメインを含むtanCARを含む細胞であって、第1の抗原結合ドメインは、抗原の膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド(CAML)相互作用因子(TACI)に結合する、細胞も提供する。本発明は、対応する核酸配列および/または構築物、前記核酸配列および/または構築物、分子を含むキットおよびベクター、ならびにそのような細胞を作製する方法をさらに提供する。細胞は、多発性骨髄腫などの疾患を処置するための細胞免疫療法の手法で使用することができる。

Description

本発明は、抗原の膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド(CAML)相互作用因子(TACI)に結合するキメラ抗原受容体(CAR)を含む細胞に関する。そのような細胞は、多発性骨髄腫などのがん性疾患の処置に有用である。
キメラ抗原受容体(CAR)
キメラ抗原受容体は、その通常の形式では、モノクローナル抗体(mAb)の特異性をT細胞のエフェクター機能につなげたタンパク質である。その通常の形態は、抗原を認識するアミノ末端、スペーサー、膜貫通ドメインが全て、T細胞の生存および活性化シグナルを伝達する複合エンドドメインに接続している、I型膜貫通ドメインタンパク質の形態である(図1参照)。
これらの分子の最も多い形態は、モノクローナル抗体に由来する単鎖可変断片(scFv)を使用して標的抗原を認識する。scFvは、スペーサーおよび膜貫通ドメインを介してシグナル伝達エンドドメインと融合している。そのような分子は、scFvによるその標的の認識に応答してT細胞の活性化をもたらす。T細胞は、そのようなCARを発現すると、標的抗原を発現する標的細胞を認識して死滅させる。
腫瘍関連抗原に対する数種類のCARが開発されており、そのようなCAR発現T細胞を使用する養子移入手法が、種々のがんを処置するために現在臨床試験中である。例えば、血液悪性腫瘍の処置のために、CD19を標的とするCAR T細胞の使用を含む、いくつかの臨床試験が進行中である(Parkら、2016年、Blood 127巻(26号):3312〜3320頁)
サイトカイン放出症候群(CRS)
しかしながら、CAR T細胞の注入に関連する重要な欠点は毒性の誘発であり、その最も一般的なものがサイトカイン放出症候群(CRS)である。「第1世代」の構築物(共刺激シグナル伝達エレメントなし)を利用する初期のCAR T細胞の試みでは、T細胞増殖/サイトカイン産生が不十分であり、抗腫瘍応答を欠如することが認められた。第2世代のCARの設計(例えばCD28または41BB)では共刺激シグナル伝達が加わって、血液悪性腫瘍を有する患者における改善されたT細胞活性化/拡大増殖、サイトカイン産生、および最も顕著に劇的な抗腫瘍応答をもたらした。しかしながら、CAR T細胞を投与した後の同様に印象的で潜在的に生命を脅かすCRSで、CAR T細胞の「両刃の剣」が示されている。
CRSの顕著な特徴は、炎症性サイトカインの上昇をもたらす免疫活性化である。臨床および実験室での測定では、軽度/中程度のCRS(全身症状および/または等級2の器官毒性)から重度のCRS(sCRS;等級≧3の器官毒性、積極的な臨床的介入、および/または潜在的に生命を脅かす)に及ぶ。臨床的特徴には、高熱、倦怠感、疲労、筋肉痛、悪心、食欲不振、頻脈/低血圧、毛細血管漏出、心機能不全、腎機能障害、肝不全、および播種性血管内凝固が含まれる。CAR T細胞注入に続いて、インターフェロン−ガンマ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、IL−10、およびIL−6を含むサイトカインの劇的な上昇が観察された。
CRSの存在は、養子移入された細胞の拡大増殖および進行性免疫活性化と一般的に関連する。CRSを引き起こすサイトカインは、注入されたT細胞ならびに単球およびマクロファージを含む周囲の間質細胞から生ずる。CRSに関与する主要なサイトカインは、骨髄性細胞(単球およびマクロファージ)により主に分泌されるIL−6である。IL−6は、CRSの徴候および症状と共に、抗IL6受容体抗体(例えばtoci)または抗IL6抗体(例えばシルツキシマブ)を使用することにより中和することができる。
高腫瘍量の患者はより高度のsCRSを経験するので、CRSの重症度の程度は、注入時の疾患負荷によって決まることが示されている。再発/難治性B細胞急性リンパ芽球性白血病の患者をCD19特異的CAR T細胞で処置した報告では、sCRSの発生率は19から43%の範囲であり、その変動は、その症候群の臨床的同定、キメラ受容体の設計、および注入される細胞の表現型の差による可能性が高い。患者はこの毒性を生じずに抗腫瘍応答を示すことがあるので、臨床転帰はsCRSの進展に基づいて予測できない。しかしながら、血液悪性腫瘍の状況で、応答する患者の大部分は、CAR T細胞注入後に少なくとも軽度のCRS(発熱)を示す。
CRSの診断後の課題は、操作された細胞の抗腫瘍効力を低下させずに、制御されない炎症の生理学的症状を軽減する適切な療法を選択することであった。全身性コルチコステロイドは、初期の抗腫瘍応答を損なわずにsCRSの症状を急速に好転させることを示した。しかしながら、高用量のコルチコステロイドの長期の使用(例えば、14日より長く)は、養子移入されたCAR T細胞集団の除去も生じさせて、その長期の抗白血病効果を潜在的に限定する。効果的な代替法として、食品医薬品局の承認したmAbであるトシリズマブによるIL−6受容体(IL−6R)の遮断により、CRSがほぼ即座に好転することを示した。しかしながら、IL−6Rは、CAR T細胞の増殖、持続性、および最も重要なことに抗腫瘍効果に対して負の効果を有することがある。
したがって、CAR−T細胞療法と関連するCRSを回避および制御する代替機構の必要性がある。
多発性骨髄腫
多発性骨髄腫(骨髄腫)は、形質細胞の骨髄悪性腫瘍である。異常な形質細胞の集まりが骨髄に蓄積して、そこでそれらの細胞は正常な血液細胞の産生に干渉する。骨髄腫は、米国における2番目に多い血液悪性腫瘍(非ホジキンリンパ腫に次ぐ)であり、血液悪性腫瘍の13%および全てのがんの1%を占める。該疾患は、病理学的骨折、感染に対する感受性、腎不全、次いで死ぬことになる骨髄不全を引き起こすため、苦痛ならびに医療費に関して耐えがたい負担となる。
多くのリンパ腫と異なって、骨髄腫は、現在のところ治癒不能である。リンパ腫で使用される標準的化学療法剤は、大部分が骨髄腫に対して無効である。典型的には、これらの免疫療法剤は、単一の抗原を標的とする。例えば、リツキシマブはCD20を標的とし、マイロターグはCD33を標的とし、アレムツズマブはCD52を標的とする。しかしながら、CD20の発現は形質細胞で失われているので、リツキシマブは骨髄腫に対して使用することができない。ボルテゾミブ(Bortezamib)およびレナリドミド(Lenolidomide)などの新しい薬剤は部分的に効果的であるが、長く続く寛解をもたらすことはできない。
BCMA
BCMAは、成熟リンパ球、例えば、記憶B細胞、形質芽球、骨髄形質細胞および骨髄腫細胞中で発現される膜貫通タンパク質である。抗BCMA CARを発現するように形質導入されたT細胞は、骨髄腫患者の形質細胞腫からの骨髄腫細胞を特異的に死滅させることができることが示された(Carpenterら、2013年、Clin Cancer Res 19巻(8号)2048〜60頁)。
しかしながら、BCMAを標的とする場合の考慮すべき事項は、例えば、リンパ腫細胞上のCD19と比較して、骨髄腫細胞上でのBCMAの密度が特に低いことである(図2)。さらに、初期の臨床的データから、抗BCMA CARを発現するT細胞による処置は、経時的に骨髄腫細胞におけるBCMA発現の減少およびBCMA陰性骨髄腫の進行と関連することが示唆された(Aliら、(2016年、Blood 128巻(13号)1688〜1700頁)。それに加えて、BCMA−CARを受けた全ての患者は、試験でCRS(サイトカイン放出症候群)について陽性であった。
したがって、これらの問題に対処する骨髄腫の処置のための改善された治療手法に対する必要性がある。
Parkら、2016年、Blood 127巻(26号):3312〜3320頁 Carpenterら、2013年、Clin Cancer Res 19巻(8号)2048〜60頁 Aliら、(2016年、Blood 128巻(13号)1688〜1700頁
本発明は、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)を、別の抗原と一緒に標的とするCARに基づくシステムに関する。CARシステムは、
a)2種もしくはそれより多くの異なるCARを共発現し、それらのうち1種がTACIに結合する細胞;
b)2種もしくはそれより多くの抗原結合ドメインを有し、それらのうち1種がTACIに結合するtanCARシステム;
c)各々異なるCARを発現する2つもしくはそれより多くの細胞集団を含み、それらのうち1つがTACIに結合する組成物;または
d)2つもしくはそれより多くの細胞集団を別々の投与ステップで投与することを含む、疾患を処置する方法であって、各細胞集団は異なるCARを発現し、それらのうち1つがTACIに結合する、方法
であり得る。
したがって、本発明の第1の態様の第1の実施形態は、異なる抗原に結合する第1および第2のキメラ抗原受容体(CAR)を含む細胞であって、第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、細胞を提供する。
第2のCARは、多発性骨髄腫と関連する別の抗原に結合することができる。例えば、第2のCARはBCMAまたはBAFFに結合することができる。
第1のCARは、免疫グロブリン様抗原結合ドメインを含むことができる。例えば、第1のCARは、TACI結合scFvを含むことができる。第1のCARは、増殖を誘導するリガンド(APRIL)からのTACI結合ドメインを欠くこともある。
本発明の第1の態様の第2の実施形態は、異なる抗原に結合する第1および第2の抗原結合ドメインを含むtanCARを含む細胞であって、第1の抗原結合ドメインは、抗原の膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、細胞を提供する。
第2の抗原結合ドメインは、多発性骨髄腫と関連する別の抗原に結合することができる。例えば、第2の抗原結合ドメインは、BCMAまたはBAFFに結合することができる。
第1の抗体結合ドメインは、免疫グロブリン様抗原結合ドメインであってもよい。例えば、第1の抗体結合ドメインは、TACI結合scFvを含むことができる。第1の抗体結合ドメインは、増殖を誘導するリガンド(APRIL)からのTACI結合ドメインを欠くこともある。
第2の態様では、本発明は、本発明の第1の態様の第2の実施形態で定義されたtanCARをコードする核酸配列を提供する。
核酸配列は、以下の構造:
AgB1−リンカー−AgB2−スペーサー−TM−endo
(式中、
AgB1は、tanCARの第1の抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
リンカーは、tanCARのリンカーをコードする核酸配列であり;
AgB2は、tanCARの第2の抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサーは、tanCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TMは、tanCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
endoは、tanCARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有することができ、細胞において発現された場合、第1および第2の抗原結合ドメインを細胞表面にタンデムで発現するポリペプチドをコードする。
リンカーは、Gly−Serの可撓性リンカーであってもよくまたはそれを含むこともできる。
相同組換えを避けるために、同一または類似のアミノ酸配列をコードする配列の領域で代替のコドンが使用されることもある。
第3の態様では、本発明は、本発明の第1の態様の第2の実施形態で定義された第1のCARおよび第2のCARをコードする核酸構築物を提供する。
核酸構築物は、以下の構造:
AgB1−スペーサー1−TM1−endo1−coexpr−AgB2−スペーサー2−TM2−endo2
(式中、
AgB1は、第1のCARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー1は、第1のCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM1は、第1のCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
endo1は、第1のCARのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
coexprは、第1および第2のCARの共発現を可能にする核酸配列であり
AgB2は、第2のCARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー2は、第2のCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM2は、第2のCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
endo2は、第2のCARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有することができ、細胞において発現された場合、第1および第2のCARが細胞の表面で共発現されるような開裂部位で開裂されるポリペプチドをコードする。
「coexpr」は、自己開裂ペプチドを含む配列をコードすることができる。
相同組換えを避けるために、同一または類似のアミノ酸配列をコードする配列の領域で代替のコドンが使用される。
第4の態様では、本発明の第2の態様による核酸配列、または本発明の第3の態様による核酸構築物を含むベクターが提供される。
ベクターは、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターまたはトランスポゾンであることもある。
本発明の第5の態様の第1の実施形態では、
(i)本発明の第1の態様の第1の実施形態で定義された第1のCARをコードする第1の核酸配列であって、以下の構造:
AgB1−スペーサー1−TM1−endo1
(式中、
AgB1は、第1のCARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー1は、第1のCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM1は、第1のCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
endo1は、第1のCARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有する第1の核酸配列;および
(ii)請求項1または2で定義された第2のCARをコードする第2の核酸配列であって、以下の構造:
AgB2−スペーサー2−TM2−endo2
(式中、
AgB2は、第2のCARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー2は、第2のCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM2は、第2のCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
endo2は、第2のCARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有する第2の核酸配列を含むキットが提供される。
本発明の第5の態様の第2の実施形態では、キットは、請求項15で定義された第1の核酸配列を含む第1のベクター;および請求項15で定義された第2の核酸配列を含む第2のベクターを含む。
ベクターは、例えば、ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクターまたはトランスポゾンを組み込んでいることもできる。
第6の態様では、本発明の第1の態様による細胞を作製する方法が提供され、方法は、本発明の第2の態様による核酸配列;本発明の第3の態様による核酸構築物;本発明の第4の態様によるベクターまたは本発明の第5の態様による配列もしくはベクターのキットを、細胞に導入するステップを含む。
細胞は、被験体から単離された試料に由来してもよい。
本発明の第7の態様の第1の実施形態では、本発明の複数の第1の態様による細胞を含む医薬組成物が提供される。
本発明の第7の態様の第2の実施形態では、
(i)第1のCARを発現する第1の細胞集団;および
(ii)第2のCARを発現する第2の細胞集団
を含む医薬組成物であって、
第1および第2のCARは、異なる抗原に結合し、第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、医薬組成物を提供する。
第8の態様の第1の実施形態では、本発明は、本発明の第7の態様による医薬組成物を被験体に投与するステップを含む、疾患を処置および/または予防する方法を提供する。
第8の態様の第2の実施形態では、本発明は、以下のステップ:
(i)第1のCARを発現する第1の細胞集団を投与するステップ、
(ii)第2のCARを発現する第2の細胞集団を投与するステップ
を含む、疾患を処置および/または予防する方法であって、第1および第2のCARは、異なる抗原に結合し、第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、方法を提供する。
方法は、以下のステップ:
(i)細胞を含有する試料を被験体から単離するステップ;
(ii)本発明の第2の態様による核酸配列;本発明の第3の態様による核酸構築物;本発明の第4の態様によるベクターまたは本発明の第5の態様による配列もしくはベクターのキットを、細胞に形質導入またはトランスフェクトするステップ;および
(iii)(ii)からの細胞を被験体に投与するステップ
を含むことができる。
第9の態様では、本発明の第8の態様による方法で使用するためのキットであって、キットは、
(i)第1のCARを発現する第1の細胞集団、
(ii)第2のCARを発現する第2の細胞集団
を含み、第1および第2のCARは、異なる抗原に結合し、第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、キットが提供される。
第10の態様では、疾患を処置および/または予防することに使用するための、本発明の第7の態様による医薬組成物が提供される。
第11の態様では、疾患を処置および/または予防するための医薬の製造における、本発明の第1の態様による細胞の使用が提供される。
本発明の第8、第10および第11の態様に関して、疾患は、成熟B細胞悪性腫瘍などのがんであってもよい。疾患は、例えば、多発性骨髄腫であってもよい。
第12の態様では、異なる抗原に結合する第1および第2の抗原結合ドメインを含むtanCARが提供され、第1の抗原結合ドメインは、抗原の膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド(CAML)相互作用因子(TACI)に結合する。
第13の態様では、抗TACI剤を被験体に投与するステップを含む、被験体におけるサイトカイン放出症候群を回避および/または緩和する方法が提供される。
抗TACI剤は、抗TACI抗体であるかまたはそれを含むこともできる。該薬品は、例えば、抗体−薬物コンジュゲート(ADC)、二重特異性抗体または二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)であってもよい。
抗TACI剤は、抗TACIキメラ抗原受容体(CAR)を発現する細胞であってもよくまたはそれを含むこともできる。
抗TACI CARは、2つの別の成分:抗原結合ドメインおよび膜貫通ドメインを含む抗原結合成分;ならびにエンドドメインを含む細胞内シグナル伝達成分を含むことができる。抗原結合成分および細胞内シグナル伝達成分は、細胞表面で会合して、機能性CAR複合体を形成する。
抗原結合成分および細胞内シグナル伝達成分は、WO2015/150771およびWO2016/030691にそれぞれ記載された、ある特定の分子の存在または不在下においてのみ会合することができる。分子、例えばテトラサイクリンは、抗原結合成分および細胞内シグナル伝達成分の解離を引き起こし、CAR機能を低下または停止させることができる。
抗TACI CARは、WO2015/052538に記載されたAPRILからのBCMA結合ドメインを含む抗原結合ドメインを有することができる。抗原結合ドメインは、上で配列番号2で示された配列またはTACI結合能力を保持するそれらの断片もしくはバリアントを含むこともできる。
抗TACI剤は、本発明の第1の態様による細胞であってもよくまたはそれを含むこともできる。
抗TACI剤は、被験体における骨髄性細胞によるサイトカイン分泌を阻害することができる。抗TACI剤は、被験体における骨髄性細胞を、例えばアポトーシスにより死滅させることができる。
被験体におけるサイトカイン放出症候群を回避および/または緩和する方法で使用するための、上で定義された抗TACI剤も提供される。
被験体におけるサイトカイン放出症候群を回避および/または緩和することに使用するための医薬の製造における、上で定義された抗TACI剤の使用も提供される。
単一の抗原を唯一の標的とすることは、がんに固有の高い突然変異速度に基づく抗原の改変による腫瘍の逃避を生じさせ得る。CAR手法を用いてBCMAのみを標的とすることは、BCMA陰性の骨髄腫の再発を生ずることが示された(Aliら、2016年)。TACIと別の骨髄腫に関連する抗原を共に標的とすれば、そのような逃避は回避されるはずである。
2種の抗原を共に標的とすることも、多発性骨髄腫細胞の表面における低いBCMA発現の問題に対する対処であり:別の抗原に加えてTACIを標的とすれば、CARシステムにより認識され得る、標的細胞における有効な抗原濃度が全体として増大する。
BCMAは、胚中心B細胞により発現され、一方、TACIは、主に脾臓の遷移型2および辺縁帯のB細胞、ならびに活性化されたB細胞により発現される(図5を参照されたい)。CAR T細胞手法を用いてBCMAのみを標的とすることは、骨髄腫前駆体細胞を残存させる(spare)ようである。それに加えて、BCMAのみを標的とすることは、間質細胞によるAPRILおよびBAFF分泌を増大させる結果となり、それにより骨髄腫前駆体細胞の生存および成長を促進し得る。これらの2つの理由で、BCMAのみを標的とすることは、永続性が劣る結果を生ずるようであり、CAR−T細胞が持続する間だけ持続する。
それに反して、TACIを標的とすると、形質芽球および後期のプレb細胞のクレアランスが向上して、応答の永続性の向上を導く結果となるはずである。
TACIは、CRSの原因となり得るIL−6などのサイトカインを分泌する単球およびマクロファージで発現される。
したがって、抗TACI剤を用いる前処置、共処置または後処置は、CAR T細胞免疫療法におけるCRSを回避および/または緩和するために使用することができる。この手法は、抗IL6抗体または抗IL6受容体抗体を用いる患者の処置よりも良好であり、それは、この手法が、より長く持続して、IL6だけでなく、単球およびマクロファージにより産生される他のCRSに関連するサイトカインも減少させるからである。
図1は、キメラ抗原受容体の標準設計を示す。キメラ抗原受容体の典型的な形式を示す。これらは、I型膜貫通タンパク質である。エクトドメインが抗原を認識する。これは、スペーサードメインに結びついた、抗体由来の単鎖可変断片(scFv)で構成されている。これは、順送りで分子を膜に固定するように作用する膜貫通ドメインに接続している。最終的に、これは、細胞内シグナルを細胞に伝達するように作用するエンドドメインに接続している。これは1つまたは複数のシグナル伝達ドメインで構成されている。
図2は、骨髄腫におけるBCMAの発現データを示す。39名の多発性骨髄腫患者の骨髄試料からの骨髄腫細胞を、CD138+磁性ビーズ選択により単離した。これらの細胞を、PEとコンジュゲートした抗BCMAモノクローナル抗体J6MO(GSK)で染色した。抗原のコピー数を、PE Quantibriteビーズ(Becton Dickenson)をメーカーの使用説明書に従って使用して定量した。抗原コピー数の箱ひげ図は、範囲に沿って示して四分位間および中央値をプロットする。本発明者らは、範囲は1細胞当たり348.7〜4268.4のBCMAコピーであり、平均は1181、中央値は1084.9であることを見出した。
図3は、APRILおよびBAFFのリガンドの特異性および機能の割り当てを示す。B細胞活性化因子(BAFF、TNFSF13B)は、BAFF−受容体(BAFF−R、TNFRSF13C)、B細胞膜抗原(BCMA、TNFRSF17)ならびに膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI、TNFRSF13B)と相互作用するが、それに対して、増殖を誘導するリガンド(APRIL、TNFSF13)は、BCMAおよびTACIとだけ相互作用する。BAFF−Rの活性化は、末梢B細胞の生存に影響し、一方、BCMAは形質細胞の生存に影響し得る。
図4は、生理学的B細胞の発達中の表面マーカーを示す。発達中に、B細胞は、種々の表面マーカーを発現し、それらのうちいくつかは示されたように治療用モノクローナル抗体により標的とされる。骨髄中における初期の発達の後、成熟B細胞は、血流を通って二次リンパ器官に移動して、胚中心反応およびクラススイッチ組換えを受けることができる。それらは記憶B細胞および抗体分泌細胞を形成し、それらは短寿命の形質芽球または長寿命の形質細胞である。薄れてゆくバーは、表面マーカーの発現についての報告は均一でないことを示す。略記号:BAFF−Rは、TNFファミリー受容体(TNFRSF13C)のB細胞活性化因子;BCMAは、B細胞成熟抗原(TNFRSF17);TACIは、膜貫通活性化因子とCAMLの相互作用因子(TNFRSF13B)。
図5は、3通りの可能なTACI CAR設計を例示する模式図である。第1のCAR(A)で、ヒトCD8ストークドメインは、スペーサードメインとして使用される。第2のCAR(B)で、IgG1のヒンジは、スペーサードメインとして使用される。第3のCAR(C)で、Fc受容体への結合を弱める、Hombachら(2010年、Gene Ther.17巻:1206〜1213頁)により記載されたpva/a突然変異で改変された、ヒトIgG1のヒンジ、CH2およびCH3ドメインはスペーサーとして使用される。全てのCARにおいて、これらのスペーサーは、CD28膜貫通ドメインに、次にCD28、OX40およびCD3−ゼータエンドドメインの融合体を含有する3部からなるエンドドメインに接続している。
図6は、TACI特異的バインダーの産生を示す。a)TACI陽性の抗体を分泌するハイブリドーマを同定するためのELISAスクリーニング。親ハイブリドーマ系統の合計で10枚のプレートをスクリーニングしてTACI結合について試験した。b)フローサイトメトリーによるTACI結合の確認分析。ハイブリドーマ系統を、TACI陽性およびBCMA陽性SupT1細胞についてスクリーニングした。SupT1 TACI細胞に対する反応性が最高の4つのハイブリドーマを、サブクローニングおよび特徴付けのために選んだ。 図6は、TACI特異的バインダーの産生を示す。a)TACI陽性の抗体を分泌するハイブリドーマを同定するためのELISAスクリーニング。親ハイブリドーマ系統の合計で10枚のプレートをスクリーニングしてTACI結合について試験した。b)フローサイトメトリーによるTACI結合の確認分析。ハイブリドーマ系統を、TACI陽性およびBCMA陽性SupT1細胞についてスクリーニングした。SupT1 TACI細胞に対する反応性が最高の4つのハイブリドーマを、サブクローニングおよび特徴付けのために選んだ。
図7は、TACI CARを示す。a)TACIキメラ抗原受容体カセットの模式的表示。TACI CAR2H6をエンドドメインOX40 CD28 CD3ゼータを組み込んでいる第3世代CAR形式中にクローニングした。b)TACI抗原結合ドメイン(2H6)を有するCARおよびトランケート型APRILを含む結合ドメインを有する等価のCARと比較した、TACIおよびBCMA発現細胞の24時間死滅アッセイ。4:1のエフェクター:標的比で共培養を実施した。c)TACIを発現するSupT1細胞とBCMAを発現するSupT1細胞とを4:1で共培養した後のIFNγ放出を比較するアッセイ。
図8は、TACI結合ドメインについてのBiacore親和性決定を示す。 図8は、TACI結合ドメインについてのBiacore親和性決定を示す。
図9は、実施例4に記載されたCARを例示する模式図である。
図10は、標的細胞とのAPRIL CAR−T細胞の関わりが、高レベルのIFNgおよびGM−CSFの産生を生ずることを示す。APRIL CART細胞およびMM1s標的細胞の共培養からの培地中のサイトカイン濃度。MM1s細胞をAPRIL CART細胞または形質導入されていない(NT)対照T細胞のいずれかと1:1の比で播種した。48時間のインキュベーション後、培地を捕集して、サイトカインのパネルをLuminex Multiplexアッセイにより(A)APRIL CAR−T細胞;(B)形質導入されていないT細胞を測定した。
図11は、IFNgおよびGM−CSFの組合せが単球におけるIL−6の産生を誘導することを示す。INFgは、GMC−SFとの組合せで、ヒトの初代単球および単球様THP1細胞においてIL−6産生を誘導する。(A)3名の健康なドナー(n=3)から単離されたヒトの初代単球またはTHP1細胞(n=1)を、単独あるいはIFNg(50ng/ml)もしくはGMC−SF(10ng/ml)または両方の存在下のいずれかで48時間培養した。インキュベーション後、培養培地中におけるIL−6レベルを、ELISAにより測定した。(B)48時間のインキュベーション後に、INFgおよびGMC−SFの組合せに応答して明瞭な形態学的変化を示すヒト初代単球の代表的像である。
図12は、APRIL細胞が単球に対して細胞傷害性活動を示すことを示す。APRIL CARTのTHP1細胞に対する細胞傷害性効果。(A)細胞傷害性アッセイ結果のまとめ。APRIL CART、TRBC1 CARTおよび形質導入されていない(NT)対照細胞を、2名のマッチしたドナー(n=2)から得た。THP1細胞を、CART細胞またはそれらのそれぞれのNT対照のいずれかと1:1の比で72時間共培養した。THP1の溶解をフローサイトメトリーにより分析した。(B)THP1およびCART細胞による細胞傷害性アッセイの代表的なFACSプロット。
図13は、自家サプレッサー細胞の存在下におけるCARに媒介された腫瘍細胞溶解を示す。(a)M2単球(M2)、骨髄由来のサプレッサー細胞(MDSC)および樹状細胞(DC)の、刺激されていない単球と比較したTACI発現。(b)非形質導入T細胞(青色)、またはAPRIL−CAR(橙色)もしくは抗BCMAモノクローナル抗体に基づくscFv抗原結合ドメインを有する抗BCMA CAR(グレイ)のいずれかを形質導入されたT細胞を、1:4のE:T比でMM.1s細胞と、自家単球に由来するサプレッサー細胞の存在下で共培養した。M2単球、MDSCおよびDCが、MM1s細胞と1:10の相対比で含まれた。
キメラ抗原受容体(CAR)
図1に図式的に示したCARは、細胞外抗原認識ドメイン(バインダー)を細胞内シグナル伝達ドメイン(エンドドメイン)に接続するキメラI型膜貫通タンパク質である。バインダーは、典型的には、モノクローナル抗体(mAb)に由来する単鎖可変断片(scFv)であるが、それは抗体様抗原結合部位を含む他の形式に基づくこともできる。スペーサードメインは、バインダーを膜から単離して、それを適当に配向させるために通常必要である。使用される一般的なスペーサードメインは、IgG1のFcである。よりコンパクトなスペーサーは、抗原に依存して、例えばCD8αのストークおよびIgG1のヒンジ単独でも十分であることができる。膜貫通ドメインは、タンパク質を細胞膜に固定して、スペーサーをエンドドメインに接続する。
初期のCAR設計は、FcεR1のγ鎖またはCD3ζのいずれかの細胞内部分に由来するエンドドメインを有した。その結果として、これらの第1世代の受容体は、免疫学的シグナル1を伝達して、それはT細胞に同起源の標的細胞の死滅を開始させるためには十分であったが、増殖および生存のためにT細胞を十分に活性化するには至らなかった。この限界を克服するために、複合エンドドメインが構築された:T細胞の共刺激分子の細胞内部分とCD3ζのそれとの融合により、抗原認識後に活性化シグナルおよび共刺激シグナルを同時に伝達することができる第2世代の受容体が生ずる。最も一般的に使用される共刺激ドメインは、CD28のものである。これが、最も強い共刺激シグナル、すなわち免疫学的シグナル2を供給して、それがT細胞の増殖を開始させる。生存シグナルを伝達する、密接に関係するOX40および41BBなどのTNF受容体ファミリーのエンドドメインを含む、いくつかの受容体も記載されている。活性化、増殖および生存シグナルを伝達することができるエンドドメインを有する、より強い第3世代CARさえ、現在は記載されている。
CARをコードする核酸は、例えば、レトロウイルスベクターを使用してT細胞に移すことができる。レンチウイルスベクターを使用することができる。このようにして、多くのがんに特異的なT細胞を、養子細胞移入のために生成させることができる。CARが標的抗原に結合した場合、活性化シグナルの、CARを発現するT細胞への伝達がもたらされる。したがって、CARは、標的とされる抗原を発現する腫瘍細胞に対して、T細胞の特異性および細胞傷害性を指示する。
ORゲート
第1の実施形態では、本発明の第1の態様は、第1のCARおよび第2のCARを共発現する細胞に関し、一方のCARが抗原TACIに結合して他方のCARが異なる抗原に結合すると、その結果、細胞は、TACIおよび/または他方の抗原のいずれかをマーカーとして発現する標的細胞を認識することができる。
例えば、第2のCARは、BCMAまたはBAFFなどの多発性骨髄腫細胞に特徴的な抗原に結合することができる。
したがって、細胞はORゲートを含む。抗原のパターンを認識するキメラ抗原受容体システムのための論理ゲートは、WO2015/075468に記載されている。
第1および第2のCARは開裂部位によって隔てられた両方のCARを含むポリペプチドとして産生され得る。開裂部位における開裂は、2つのCARが細胞表面で別の実体として発現されることを可能にする。
タンデムCAR(TanCAR)
タンデムCARまたはTanCARとして公知の二重特異性CARは、2種またはそれより多くのがんに特異的なマーカーを同時に標的とするように開発された。TanCARでは、エクトドメインは、リンカーによってタンデムに連結された2つの抗原結合の特異性を含む。したがって、2つの結合特異性(scFv)は両方共単一の膜貫通部分に連結されて、一方のscFvは膜に近接して並置され、他方は遠位の位置にある。TanCARが標的抗原のいずれかまたは両方に結合した場合、活性化シグナルがTanCARを発現する細胞に伝達される。
Gradaらは(2013年、Mol Ther Nucleic Acids 2巻:e105頁)、Gly−Serリンカー、ついでHER2に特異的なscFvが続くCD19に特異的なscFvを含むTanCARを記載している。HER2−scFvは膜に近い位置にあり、CD19−scFvは遠位の位置にあった。TanCARは、腫瘍に限定された2つの抗原の各々に対して別個のT細胞応答を誘導することが示された。HER2(632aa/125Å)およびCD19(280aa、65Å)のそれぞれの長さが、その空間的配置に適しているので、この配置が選択された。HER2のscFvがHER2の最も遠位の4本のループを結合していることも公知であった。
本発明の第1の態様の第2の実施形態は、第1の抗原結合ドメインは抗原TACIに結合し、第2の抗原結合ドメインは異なる抗原に結合する、2つの抗原結合特異性をタンデムに含むTanCARを含む細胞に関する。
本発明のTanCARにおいて、TACIに結合する抗原結合ドメインは、膜に近接して並置され得て、他方の抗原結合ドメインは、遠位の位置にあることができ、または逆も可能である。
第2の抗原結合ドメインは、BCMAまたはBAFF−Rなどの骨髄腫細胞で発現された別の抗原に結合することができる。
抗原結合ドメイン
抗原結合ドメインは、抗原を認識するCARまたはTanCARの部分である。抗体、抗体模倣体、およびT細胞受容体の抗原結合部位に基づくものを含む多数の抗原結合ドメインが当技術分野において公知である。例えば、抗原結合ドメインは、モノクローナル抗体に由来する単鎖可変断片(scFv);標的抗原の天然のリガンド;標的に対する十分な親和性を有するペプチド;単一ドメイン抗体;Darpin(設計されたアンキリン反復タンパク質)などの人工の単一のバインダー;またはT細胞受容体に由来する単鎖を含むことができる。
抗原結合ドメインは、scFvなどの免疫グロブリン様抗原結合ドメインを含むこともできる。
TACI
膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド(CAML)相互作用因子)TACI(UniProtKB:O14836)は、免疫応答における制御因子であり、BCMAのように、CD27+記憶B細胞、特に辺縁帯B細胞、骨髄形質細胞および骨髄腫細胞などの成熟リンパ球で優先的に発現される。
加えて、TACIは、マクロファージで発現されてマクロファージの生存を媒介する。TACIは、腫瘍壊死因子(TNF)受容体スーパーファミリーのリンパ球に特異的なメンバーであり、腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーのメンバー13B(TNFRSF13B)としても公知であり、細胞の表面から脱落して、その可溶形態で循環することができる。BCMAと対照的に、TACIは、胚中心B細胞から不在であることが注目される。TACIは、TNFSF13/APRILおよびTNFSF13B/BAFFの受容体として機能して、両方のリガンドに高い親和性で結合することが公知である。TACIは、B細胞の拡大増殖を阻害して、形質細胞の分化および生存を促進する。
TACIは、腫瘍壊死因子受容体(TNFR)スーパーファミリーのメンバーであり、B細胞機能の非常に重要な制御因子として役立つ。TACIは、2つのリガンド、APRILおよびBAFFに、高い親和性で結合し、その細胞外領域に2つのシステインに富むドメイン(CRD)を含有する。しかしながら、TACIの別の形態が存在して、そこでは、N末端のCRDが代替的スプライシングにより除去されている。このより短い形態は、リガンドに誘発された細胞シグナルを伝達することができること、および第2のCRDだけ(TACI_d2)が両方のリガンドに十分な親和性を含有することが示された(Hymowitzら、2005年、Am Soc. Biochem. And Mol. Biol. Inc 280巻(8号)7218〜7227頁)。
TACI_d2の結晶構造は、APRILTACI_d2およびAPRIL BCMA複合体の共結晶構造とともに解明されている(Hymowitzら、2005年、同上)。
TACIのCRDは、他のTNFRのCRDと一緒に、共通配列の特色、保存された6個の残基配列(Phe/Tyr/Trp)−Asp−Xaa−Leu−(Val/Thr)−(Arg/Gly)(配列番号50)からなるいわゆるDXLモチーフを有する。このモチーフは、APRILまたはBAFFのいずれかに結合することが必要である。受容体モチーフは疎水性ポケットで結合して、BAFF表面に保存された2つのアルギニン残基と相互作用する。
TACIに結合するCARまたはtanCARの抗原結合ドメインは、TACIに結合することができる任意のドメインであってもよい。例えば、抗原結合ドメインは、以下の表のリストに挙げた市販の抗TACI抗体の1つに由来するTACIバインダーを含むことができる:
抗原結合ドメインは、実施例2に記載したTACIバインダー、すなわちクローン2H6、2G2、1G6または4B11から1つを含むことができる。
これらのTACIバインダーは、以下の配列を有する:
本発明は、抗TACI剤、例えば、抗体、scFv、CAR、またはクローン2H6、2G2、1G6もしくは4B11のうちの1つに基づくTCI結合ドメインを含むtanCARを提供する。抗TACI剤は、配列番号37〜42;44〜49;55〜57;59〜61;63〜65;67〜69として示される配列を有する1種または複数のCDRを含むことができる。該薬品は、以下の6種のCDRの群の1つを含むことができる:
配列番号37〜42;配列番号44〜49;配列番号55〜57および59〜61;または配列番号63〜65および67〜69。
抗TACI剤は、配列番号36または43で示されるVHおよび/またはVL配列を含むことができる(VHは、セリン−グリシンリンカーの前にあり、VLは、セリン−グリシンリンカーの後にある)。抗TACI剤は、配列番号54もしくは62で示されるVH配列および/または配列番号58もしくは66で示されるVL配列を含むことができる。抗TACI剤は、配列番号36もしくは43で示されるscFvまたは配列番号54を配列番号58と、もしくは配列番号62を配列番号66と連結することにより形成されるscFvを含むことができる。
全ての上記の配列で、抗TACI剤は、所与の配列と80%、85%、90%、95%または98%の同一性を有する配列を含むことができるが、ただし、バリアント配列はTACIに結合する能力を保持することが条件である。
本発明のCARまたはTanCAR中のTACIに特異的な抗原結合ドメインは、増殖を誘導するリガンド(APRIL)の全てまたは一部を欠いてもよい。APRILは、BCMAおよびTACIに対する天然のリガンドである(図4を参照されたい)。
本発明のCARのBCMA結合ドメインは、増殖を誘導するリガンド(APRIL)の任意の部分を欠いてもよい。APRILはTNFSF13としても公知である。
APRILの野生型配列は、UNIPROT/O75888で入手可能であり、下で示される(配列番号1)。BCMAおよびTACI結合を保持しているが、プロテオグリカン結合を喪失しているトランケート型のAPRILは、配列番号2として示される。配列番号2は、配列番号1として示される野生型APRIL分子のアミノ末端側の116アミノ酸を欠いている。
本発明のCARまたはTanCAR中のTACIに特異的な抗原結合ドメインは、増殖を誘導するリガンド(APRIL)の任意の部分を欠いてもよい。例えば、それは、配列番号1または配列番号2の任意の10、20、30または40アミノ酸長の区間の連続したアミノ酸を欠いてもよい。それは、配列番号2として示された完全な配列を欠いてもよい。
CARまたはTanCAR中のTACIに特異的な抗原結合ドメインは、APRILのBCMA結合ドメインを欠いてもよい。
BAFF−R
BF3としても公知のBAFF−R(UniProtKB:Q96RJ3)の主な役割は、末梢B細胞の生存および成熟を媒介することである。コードされるタンパク質は、BAFFの受容体であり、フェニルアラニンに富む単一のエクトドメインを含有するIII型膜貫通タンパク質である。この受容体は、BAFFに媒介される成熟B細胞生存のために必要な主たる受容体であると考えられる。
BAFF−R欠損マウスで実施された研究は、BAFF−Rは、BAFFに媒介されるBリンパ球生存シグナルを伝達する主たる受容体であると指摘している。
BAFF−Rに結合する第1および/もしくは第2のCARまたはTanCARの抗原結合ドメインは、以下の表のリストに挙げた市販の抗BAFF−R抗体の1つに由来する配列を含むことができる:
BAFF
BLyS、THANK、TALl−1またはzTNF4)ともいわれるTNFファミリー(BAFF)のB細胞活性化因子は、B細胞の応答で炎症誘発性機能を果たすと考えられる骨髄性細胞により発現されるサイトカインである。Waltersら(2009年、Journal of Immunology 182巻:793〜801頁)は、BAFFも、特定の条件下においてT細胞応答で抗炎症性役割を担うことを示している。これらの役割の調節は、サイトカイン応答の調整による。BAFFは、主として単球などの骨髄性細胞によって産生される。
BAFFは、成熟過程中のBリンパ球のT1からT2段階への転移を容易にすることにより、Bリンパ球のホメオスタシスを維持することに決定的に重要であることが示された。Bリンパ球の生存および成熟におけるBAFFの必要不可欠な役割は、可溶性BCMA分子をin vivoで使用して、成熟B細胞の低下したレベルならびにT依存性抗原およびTに独立な抗原に対するひどく損傷した抗体応答を有する、BAFFを発現しない遺伝子操作されたマウスで示された。対照的に、高レベルのBAFFを発現するトランスジェニックマウスは、増大した数の循環する成熟B細胞を有することが示された。
BAFFは、APRILとの構造類似性、および重なり合うがそれでも別個の受容体結合特異性を示す。BAFFのBCMAおよび/またはTACIに対する同等の結合は、転写因子NF−κBを活性化して、生存を支持するBcl−2ファミリーのメンバー(例えばBcl−2、Bcl−xL、Bcl−w、Mcl−1、A1)の発現およびプロアポトーシス因子(例えばBid、Bad、Bik、Bim、その他)の下方制御を強化し、したがってアポトーシスを阻害して生存を促進する。この組み合わされた作用がB細胞の分化、増殖、生存および抗体産生を促進する(Rickert RCら、Immunol Rev(2011年)244巻(1号):115〜133頁に総説されているように)。
本発明のTACIに特異的なCARまたはtanCARは、BAFFの全てまたは一部を含む抗原結合ドメインを含むことができる。抗原結合ドメインは、例えば、BAFFのTACI結合ドメインを含むことができる。
BAFFおよびTACIの3D結晶構造が得られて、TACIにより識別されたBAFF中の非常に重要なドメインは、Ile233からGlu238およびAsp205からLeu211のドメインであることを示した(Wangら、J Genet Syndr Gene Ther 2012年、3巻:3頁)。
BAFFのアミノ酸配列を下に示す。
BAFF−R、BCMAおよび/またはTACIに結合するCARまたはtanCARの抗原結合ドメインは、配列番号3の全てまたは一部を含むことができる。例えば、それは、BAFF−R、BCMAおよび/またはTACIの結合を保持する、配列番号3のトランケート型を含むことができる。それは、BAFFのBAFF−R、BCMAおよび/またはTACI結合部位を含むことができる。TACIに結合する抗原結合ドメインは、配列番号3の残基205〜211および233〜238を含むことができる。TACIに結合する抗原結合ドメインは、配列番号3の残基205〜238を含むことができる。
BCMA
BCMA;TR17_HUMAN、TNFRSF17(UniProt Q02223)としても公知のB細胞成熟の標的は、成熟リンパ球、例えば、記憶B細胞、形質芽球および骨髄形質細胞で発現された膜貫通タンパク質である。BCMAは、骨髄腫細胞でも発現される。BCMAは、グリコシル化されていないIII型膜貫通タンパク質であり、それは、B細胞の成熟、成長および生存に関与する。
BCMAに結合するCARまたはTanCARの抗原結合ドメインは、BCMAに結合することができる任意のドメインであってもよい。例えば、抗原結合ドメインは、以下の表のリストに挙げた市販の抗BAFF−R抗体の1つに由来する配列であってもよい:
3種の抗BCMA抗体のVHおよびVL配列を、CDRの配列に下線を引いて、下に示す。
BCMAに結合するCARまたはTanCARの抗原結合ドメインは、上に記載した抗BCMA Ab1、2または3からのCDRを含むことができる。
BCMAに結合するCARまたはTanCARの抗原結合ドメインは、上に記載した抗BCMA Ab1、2もしくは3からのVHおよび/もしくはVL配列、またはBCMAに結合する能力を保持する、少なくとも70、80、90もしくは90%の配列同一性を有するそれらのバリアントを含むことができる。
膜貫通ドメイン
本発明のCARおよび/またはTanCARは、膜の両側に及ぶ膜貫通ドメインを含む。それは、疎水性のアルファヘリックスを含むことができる。膜貫通ドメインは、CD28に由来してもよく、そのことは優れた受容体安定性を与える。
膜貫通ドメインは、配列番号10として示される配列を含むことができる。
配列番号10
FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV
細胞内のT細胞シグナル伝達ドメイン(エンドドメイン)
本発明のCARは、CARの活性化エンドドメイン、シグナル伝達部分を含むかまたはそれと会合することができる。抗原認識後、受容体がクラスター化してシグナルが細胞に伝達される。最も一般的に使用されるエンドドメイン成分は、3つのITAMを含有するCD3−ゼータの成分である。抗原が結合した後に、これが活性化シグナルをT細胞に伝達する。CD3−ゼータは、十分に適格な活性化シグナルを提供することができず、追加の共刺激シグナル伝達が必要なこともある。例えば、キメラCD28およびOX40は、CD3ゼータと共に増殖性/生存のシグナルを伝達するために使用することができ、または3者全てを一緒に使用することもできる。
本発明のCARまたはTanCARのエンドドメインは、CD28のエンドドメインならびにOX40およびCD3−ゼータのエンドドメインを含むことができる。
エンドドメインは、
(i)ITAM含有エンドドメイン、例えば、CD3ゼータからのエンドドメイン;および/または
(ii)共刺激ドメイン、例えば、CD28からのエンドドメイン;および/または
(iii)生存シグナルを伝達するドメイン、例えば、TNF受容体ファミリーのOX−40もしくは4−1BBなどのエンドドメイン
を含むことができる。
ITAMモチーフを含有するエンドドメインは、本発明では、活性化エンドドメインとして作用することができる。数種のタンパク質が、エンドドメインを1つまたは複数のITAMモチーフと共に含有することが公知である。そのようなタンパク質の例は、2〜3の名を挙げれば、CD3のイプシロン鎖、CD3のガンマ鎖およびCD3のデルタ鎖が挙げられる。ITAMモチーフは、YxxL/I(配列番号51)という署名(signature)を与える、ロイシンまたはイソロイシンから任意の2個の他のアミノ酸により隔てられたチロシンとして容易に認識され得る。典型的には、ただし常にではなく、これらのモチーフのうちの2つは、分子の末尾で、6個と8個の間のアミノ酸により隔てられている(YxxL/Ix(6〜8)YxxL/I)。したがって、当業者は、1つまたは複数のITAMを含有して活性化シグナルを伝達する、存在するタンパク質を容易に見出すことができる。さらに、モチーフが単純で、複合体の二次構造が必要とされなければ、当業者は、活性化シグナルを伝達する人工ITAMを含有するポリペプチドを設計することができる(合成シグナル伝達分子に関するWO2000/063372を参照されたい)。
いくつかのエンドドメインおよび共刺激ドメインの配列を下に示す。
CARは、少なくとも80、85、90、95、98または99%の配列同一性を有する配列番号11〜14として示される配列の任意のバリアントを含むことができるが、ただし、バリアント配列が、抗原認識時に、T細胞シグナル伝達を誘導する、すなわち、関係する活性化/増殖または生存シグナルをT細胞に提供する能力を保持することが条件である。
例えば、WO015/150771;WO2016/124930およびWO2016/030691などに記載されているものなど、抗原認識部分がシグナル伝達部分と別の分子にある多くのシステムが、記載されている。本発明のCARまたはTanCARは、シグナル伝達エンドドメインを欠いてもよい。
本発明は、TACIに結合する抗原結合ドメイン、および膜貫通ドメインを含み;シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達成分と相互作用することができる抗原結合成分も提供する。本発明は、そのような抗原結合成分および細胞内シグナル伝達成分を含むCARシグナル伝達システムも提供する。
シグナルペプチド
本発明の細胞は、シグナルペプチドを含むことができて、その結果、CARまたはTanCARが細胞の内側で発現された場合、発生したばかりのタンパク質は、それが発現された小胞体に、その後細胞表面に向かう。
シグナルペプチドのコアは、単一のアルファ−ヘリックスを形成する傾向がある疎水性アミノ酸の長い区間を含有することができる。シグナルペプチドは、短い正に荷電した区間のアミノ酸で開始することができて、移動中にポリペプチドの適当な形態を強制することに役立つ。シグナルペプチドの末端には、典型的には、シグナルペプチダーゼに認識されて開裂されるアミノ酸の区間がある。シグナルペプチダーゼは、移動中または移動の完了後のいずれかに開裂されて、遊離のシグナルペプチドおよび成熟タンパク質を発生することができる。次いで、遊離のシグナルペプチドは、特異的プロテアーゼにより消化される。
シグナルペプチドは、分子のアミノ末端にあることができる。
本発明のCARは、一般式:
シグナルペプチド−抗原結合ドメイン−スペーサードメイン−膜貫通ドメイン−細胞内のT細胞シグナル伝達ドメイン(エンドドメイン)
を有することができる。
シグナルペプチドは、配列番号15、または5、4、3、2もしくは1個のアミノ酸の突然変異(挿入、置換または付加)を有するそれらのバリアントを含むことができるが、ただし、シグナルペプチドは、それでもCARの細胞表面発現を生じさせるように機能する。
配列番号15:METDTLLLWVLLLWVPGSTG
配列番号15のシグナルペプチドは、コンパクトであり、高度に効率的である。それは、末端グリシンの後で約95%の開裂を生じさせて、シグナルペプチダーゼによる効率的な除去を生じさせると予測される。
スペーサー
本発明のCARおよび/またはTanCARは、抗原結合ドメインを、膜貫通ドメインと接続して、抗原結合ドメインをエンドドメインから空間的に分離するスペーサー配列を含むことができる。可撓性スペーサーは、抗原結合ドメインがいろいろな方向に向いて抗原を結合することが可能になるようにする。例として、スペーサー配列は、膜貫通ドメインをTACI結合ドメインと接続して、TACI結合ドメインをエンドドメインから空間的に分離することができる。あるいは、スペーサー配列は、BCMA結合ドメインを膜貫通ドメインと接続して、BCMA結合ドメインをエンドドメインから空間的に分離することができる。あるいは、本発明のスペーサー配列は、BAFF−R結合ドメインを膜貫通ドメインと接続して、BAFF−R結合ドメインをエンドドメインから空間的に分離することができる。
スペーサー配列は、例えば、IgG1 Fc領域、IgG1ヒンジもしくはCD8ストーク、またはそれらの組合せを含むことができる。あるいは、スペーサーは、類似の長さおよび/またはIgG1 Fc領域、IgG1ヒンジもしくはCD8ストークのようなドメインの間隔を空ける性質を有する代替配列を含むこともできる。
ヒトIgG1のスペーサーは、Fc結合モチーフを除去するように変更することができる。これらのスペーサーのアミノ酸配列の例を、下に示す:
改変された残基に下線を引いた;は欠失を表す。
リンカー
本発明の第1の態様の第2の実施形態のTanCARは、2つの抗原結合ドメインをタンデムに連結しているリンカー配列を含む。例として、リンカーにより連結されて一緒になった2つの抗原結合ドメインは、抗原TACIおよび抗原BCMAを結合することができる。あるいは、リンカーにより連結されて一緒になった2つの抗原結合ドメインは、抗原TACIおよび抗原BAFF−Rを結合することができる。高度に可撓性のリンカーの例を下に示す:
配列番号21(Gly−Serリンカー)
SGGGS
核酸配列
本発明の第2の態様は、TanCARをコードする核酸配列に関する。
核酸は、標的細胞により発現された場合、コードされたTanCARを標的細胞の細胞表面に発現させる。
核酸配列はRNAまたはcDNAなどのDNAであってもよい。
核酸構築物
本発明は、2種またはそれより多くの核酸配列を含む核酸構築物を提供する。例えば、核酸構築物は、
− TACIに結合する第1のCARおよびTACI以外の抗原に結合する第2のCAR;
− TACIに結合する第1のCAR、TACI以外の抗原に結合する第2のCAR、および自殺遺伝子;または
− TanCARおよび自殺遺伝子
をコードすることができる。
核酸は、標的細胞により発現された場合、コードされたポリペプチドを標的細胞の内または表面に独立に発現させる。
核酸構築物における核酸配列は、2種のポリペプチドが、一度翻訳されると、細胞内または細胞で別々に発現されることを可能にする「共発現」配列により分離され得る。
上の構造で、「coexpr」は、2種のポリペプチドの共発現を可能にする核酸配列である。それは、核酸構築物が、開裂部位により連結された2種またはそれより多くのポリペプチドを生じて含むような開裂部位をコードする配列であってもよい。開裂部位は、ポリペプチドが産生されたときに、それが、いかなる外部の開裂活性も必要とせずに、直ちに開裂されて個々のポリペプチドになるような自己開裂であることができる。
開裂部位は、2種またはそれより多くのポリペプチドが分離されることを可能にするどのような配列であってもよい。
用語「開裂」は、本明細書では便宜上使用されるが、開裂部位は、古典的開裂以外の機構により、ポリペプチドを個々の実体に分離させることができる。例えば、***ウイルス(FMDV)2Aの自己開裂ペプチドについて(下を参照されたい)、種々のモデルが、「開裂」活性:宿主細胞プロテイナーゼによるタンパク質分解、自己タンパク質分解または翻訳(translational)効果を説明するために提案されている(Donnellyら(2001年)J. Gen. Virol.82巻:1027〜1041頁)。そのような「開裂」の厳密な機構は、開裂部位が、タンパク質をコードする核酸配列間に位置する場合に、タンパク質を別の実体として発現させる限り、本発明の目的にとって重要ではない。
開裂部位は、フーリン開裂部位であることもできる。
フーリンは、サブチリシン様プロタンパク質変換酵素ファミリーに属する酵素である。このファミリーのメンバーは、潜在的前駆体タンパク質を加工してそれらの生物学的に活性な生成物にするプロタンパク質変換酵素である。フーリンは、前駆体タンパク質を、それらの対化された塩基性アミノ酸プロセシング部位で効率的に開裂することができるカルシウム依存性のセリンエンドプロテアーゼである。フーリンの基質の例は、プロ副甲状腺ホルモン、トランスフォーミング増殖因子ベータ1前駆体、プロアルブミン、プロ−ベータ−セクレターゼ、膜1型マトリックスメタロプロテアーゼ、プロ神経増殖因子のベータサブユニットおよびフォン・ウィルブラント因子を含む。フーリンは、タンパク質を、塩基性アミノ酸の標的配列(標準的には、Arg−X−(Arg/Lys)−Arg’(配列番号52))の直ぐ下流で開裂して、ゴルジ体において富化されている。
開裂部位は、タバコエッチウイルス(TEV)開裂部位であってもよい。
TEVプロテアーゼは、高度に配列に特異的なシステインプロテアーゼであり、それはキモトリプシン様プロテアーゼである。それは、その標的開裂部位に非常に特異的であり、それ故、in vitroおよびin vivoの両方で融合タンパク質の制御された開裂のためにしばしば使用される。コンセンサスTEV開裂部位は、ENLYFQ\Sである(ここで、「\」は開裂されるペプチド結合を表す)(配列番号53)。ヒト細胞などの哺乳動物の細胞は、TEVプロテアーゼを発現しない。したがって、本核酸構築物がTEV開裂部位を含み、哺乳動物の細胞で発現される実施形態では、外因性TEVプロテアーゼも哺乳動物の細胞中で発現されなければならない。
開裂部位は、自己開裂ペプチドをコードすることもできる。
「自己開裂ペプチド」は、タンパク質および自己開裂ペプチドを含むポリペプチドが産生される場合に、いかなる外部の開裂活性も必要とせずに、それが直ちに「開裂される」かまたは別個のおよび離散的な第1および第2のポリペプチドに分離されるように機能するペプチドを指す。
自己開裂ペプチドは、アフトウイルスまたはカルジオウイルスからの2A自己開裂ペプチドであることができる。アフトウイルスおよびカルジオウイルスの主要な2A/2B開裂は、それ自体のC末端で2A「開裂」により媒介される。***ウイルス(FMDV)およびウマ鼻炎Aウイルスなどのアフトウイルスでは、2A領域は、約18アミノ酸の短い区画であり、それは、タンパク質2BのN末端残基(保存されたプロリン残基)と一緒に、それ自体のC末端における「開裂」を媒介することができる自律性のエレメントを代表する(Donellyら(2001年)、同上)。
「2A様」配列は、アフトウイルスまたはカルジオウイルス以外のピコルナウイルス、「ピコルナウイルス様」昆虫ウイルス、C型ロタウイルスおよびTrypanosoma spp内の反復配列および細菌の配列で見出されている(Donnellyら(2001年)、同上)。開裂部位は、
などのこれらの2A様配列の1つを含むことができる。
開裂部位は、配列番号27(RAEGRGSLLTCGDVEENPGP)として示される2A様配列を含むこともできる。
自殺遺伝子
T細胞は、合体し(engraft)および自律性であるので、患者におけるCAR T細胞を選択的に欠失させる手段が望ましい。自殺遺伝子は、許容されない毒性にさらされて、注入されたT細胞の選択的破壊を生ずる遺伝的にコードされ得る機構である。自殺遺伝子についての最も初期の臨床的経験は、ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼ(HSV−TK)についてであり、これは、T細胞をガンシクロビルに感受性にする。HSV−TKは高度に効果的な自殺遺伝子である。しかしながら、予め形成された免疫応答は、ハプロタイプ一致の幹細胞移植などの考慮され得る免疫抑制の臨床的設定にその使用を限定し得る。誘導性カスパーゼ9(iCasp9)は、カスパーゼ9の活性化ドメインを、改変されたFKBP12で置き換えることにより構築された自殺遺伝子である。iCasp9は、そうでなければ不活性な二量化の低分子化学誘導物質(CID)により活性化される。iCasp9は、最近ハプロタイプ一致のHSCTの設定で試験されてGvHDを中断することができる。iCasp9の最大の限界は、臨床的等級の特許権のあるCIDの利用可能性に対する依存性である。iCasp9およびHSV−TKは両方共細胞内タンパク質であり、したがって唯一の導入遺伝子として使用される場合には、それらは、マーカー遺伝子と共発現されて、形質導入される細胞の選択を可能にする。
iCasp9という自殺遺伝子は、配列番号34として示される配列または少なくとも80、90、95もしくは98%の配列同一性を有するそれらのバリアントを含むことができる。
WO2013/153391は、抗体QBEnd10で検出することができるRQR8として公知のマーカー/自殺遺伝子、および治療用抗体リツキシマブで溶解される発現する細胞を記載している。
自殺遺伝子は、配列番号35として示される配列または少なくとも80、90、95もしくは98%の配列同一性を有するそれらのバリアントを含むことができる。
自殺遺伝子は、例えば、2つの配列間で自己開裂ペプチドを使用することにより、CARまたはTanCARを有する単一のポリペプチドとして発現させることができる。
ベクター
本発明は、本発明による核酸配列または核酸構築物を含むベクターも提供する。そのようなベクターは、核酸配列または構築物を宿主細胞に導入するために使用することができて、その結果それが発現して1種もしくは複数のCAR、tanCARおよび/または自殺遺伝子を産生する。
ベクターは、例えば、プラスミドまたは合成mRNAまたは、レトロウイルスベクターもしくはレンチウイルスベクターなどのウイルスベクターであってもよい。
ベクターは、エフェクター細胞にトランスフェクトまたは形質導入することができる。
細胞
本発明は、1種または複数のCAR/TanCARを任意選択で自殺遺伝子と一緒に発現する細胞を提供する。
細胞は、本発明による核酸配列または構築物を含むことができる。
宿主細胞は、T細胞またはナチュラルキラー(NK)細胞などの免疫細胞であってもよい。宿主細胞は細胞を溶解する免疫細胞であってもよい。
T細胞以外の細胞、例えばNKT細胞について、CARのシグナル伝達ドメインは、T細胞のシグナル伝達ドメインと異なってもよく、その特定の細胞型のために誂えることもできる。
細胞は、細胞にCARをコードするまたはTanCARをコードする核酸を形質導入またはトランスフェクトすることにより作製することができる。
細胞は、ex vivoのT細胞であってもよい。T細胞は、末梢血液の単核細胞(PBMC)試料由来であってもよい。T細胞は、CARまたはTanCARをコードする核酸を形質導入する前に、例えば、抗CD3モノクローナル抗体で処置することにより、活性化および/または拡大増殖させることも可能である。
医薬組成物
本発明は、複数の本発明の第1の態様による細胞を含む医薬組成物にも関する。
本発明は、以下:
(i)第1のCARを発現する第1の細胞集団;および
(ii)第2のCARを発現する第2の細胞集団
の混合物を含む医薬組成物であって、第1および第2のCARは、異なる抗原に結合し、第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、医薬組成物も提供する。
第2のCARは、BCMAに結合することができる。
本発明の医薬組成物は、薬学的に許容される担体、希釈剤または賦形剤、ならびに必要に応じて1種または複数のさらなる薬学的に活性なポリペプチドおよび/または化合物を含むこともできる。そのような製剤は、例えば、静脈内点滴のために適当な形態であることができる。
処置する方法
本発明の細胞は、後期段階のB細胞悪性腫瘍などのがん細胞を死滅させることができることもある。
細胞は、ex vivoで、患者自身の末梢血液(第1の集合)から、または供与者の末梢血液(第2の集合)、もしくは無縁の供与者からの末梢血液(第3の集合)からの造血性幹細胞移植の設定のいずれかで創ることができる。あるいは、細胞は、誘導性の親細胞または胚の親細胞の分化からex vivoで誘導することもできる。これらの場合には、細胞は、CARまたはTanCARをコードするDNAまたはRNAを、ウイルスベクターを用いる形質導入、DNAまたはRNAを用いるトランスフェクションを含む多くの手段の1つによって導入することにより生成される。
本発明は、以下のステップ:
(i)第1のCARを発現する第1の細胞集団を投与するステップ
(ii)第2のCARを発現する第2の細胞集団を投与するステップ
を含む、疾患を処置および/または予防する方法であって、第1および第2のCARは、異なる抗原に結合し、第1のまたは第2のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、方法も提供する。
TACI−CAR細胞集団は、TACI以外の抗原に対する結合特異性を有する細胞集団の投与の前、後または同時に患者に投与することができる。
上記のような方法で使用するためのキットであって、キットは、
(i)第1のCARを発現する第1の細胞集団
(ii)第2のCARを発現する第2の細胞集団
を含み、第1および第2のCARは、異なる抗原に結合し、第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、キットも提供される。
第1および第2の細胞集団は、その後の、別のまたは同時の投与のために、キットで別々に(例えば別の容器で)提供することができる。第1の細胞集団は、第2の細胞集団の前に、後でまたは同時に、患者に投与することができる。
本発明の方法は、がん性疾患、特に増大したTACI/BCMA発現と相関する形質細胞障害またはB細胞障害を処置するためであることができる。
形質細胞障害は、形質細胞腫、形質細胞白血病、多発性骨髄腫、マクログロブリン血症、アミロイドーシス、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症、孤立性骨形質細胞腫、延髄外形質細胞腫、骨硬化性骨髄腫(POEMS症候群)および重鎖病ならびに臨床的に不明の意義不明/くすぶり型多発性骨髄腫のモノクローナル高ガンマグロブリン血症を含む。
疾患は多発性骨髄腫であることもある。
上昇したTACI/BCMAの発現レベルと相関するB細胞障害の例は、CLL(慢性リンパ球性白血病)および非ホジキンリンパ腫(NHL)である。
疾患を処置する方法は、本発明の医薬組成物の治療的使用に関する。このことに関して、医薬組成物は、既存の疾患または状態を有する被験体に、疾患と関連する少なくとも1つの症状を軽減、緩和もしくは改善するために、および/または疾患の進行を遅延、緩和もしくは阻止するために投与することができる。本発明の方法は、形質細胞などのTACIを発現するかまたはTACI/BCMAを発現する細胞の、細胞に媒介される死滅を引き起こし、または促進することができる。
サイトカイン放出症候群の阻害
本発明の第13の態様は、被験体におけるサイトカイン放出症候群を回避および/または緩和する方法に関する。
本発明者らは、TACIが、IL−6などの炎症誘発性サイトカインを分泌する単球およびマクロファージなどの骨髄性細胞で発現されることを見出した。これらのサイトカインはサイトカイン放出症候群と関連する。したがって、患者におけるCRSを、単球およびマクロファージを、TACIにより標的とすることにより予防、緩和または処置することは可能である。
IL−6などのサイトカインの分泌は、がん、特に固形腫瘍と関連する敵対的微小環境の一因になるとも考えられる。TACIは、微小環境を改良して、それを効果的な抗がん免疫学的応答にさらに寄与させるために、骨髄性細胞によるサイトカイン分泌を予防または緩和するための標的とすることもあり得る。
抗TACI剤は、被験体における骨髄性細胞によるサイトカイン分泌を阻害することができる。抗TACI剤は、被験体における骨髄性細胞を、例えばアポトーシスまたは他の機構の細胞死により死滅させることができる。抗TACI剤は腫瘍微小環境を改良することができる。
TACIは、抗TACI抗体を使用して標的とすることができる。該薬品は、例えば、抗TACI抗体−薬物コンジュゲート(ADC、二重特異性抗体または二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)であることもできる。
あるいはTACIは、抗TACIキメラ抗原受容体(CAR)を使用して標的とすることもできる。WO2015/052538に記載されたように、CARは、APRILというTACIの天然のリガンドに基づく結合ドメインを含むことができ;またはそれは抗TACI scFvを含むことができる。
抗TACI CARは、2つの別の成分:抗原結合ドメインおよび膜貫通ドメインを含む抗原結合成分;ならびにエンドドメインを含む細胞内シグナル伝達成分を含む。抗原結合成分および細胞内シグナル伝達成分は、細胞表面で会合して機能性CAR複合体を形成する。
抗原結合成分および細胞内シグナル伝達成分は、WO2015/150771およびWO2016/030691にそれぞれ記載されたある特定の分子の存在または不在下でのみ会合することができる。分子、例えばテトラサイクリンは、抗原結合成分と細胞内シグナル伝達成分の解離を生じさせて、CAR機能を低下または停止させることができる。
抗TACI剤は、本発明の第1の態様による細胞であってもよくまたはそれを含むこともできる。
細胞がORゲート(本発明の第1の態様の第1の実施形態)またはTanCAR(本発明の第1の態様の第2の実施形態)を含む場合、第2の抗原結合ドメインは、任意の他の抗原、例えば任意の他の腫瘍関連抗原に結合することができる。
第2の抗原結合ドメインは、以下の腫瘍関連抗原の1つに結合することができる:
CRSは、がんの処置の間緩和または回避され得る。第2の抗原結合ドメインは、そのがんと関連する抗原を標的とすることができる。がんは、多発性骨髄腫、血液悪性腫瘍または固形腫瘍であってもよい。がんは、上の表のリストに挙げたもの1つであってもよい。
抗TACI剤は、CRSを処置するために使用することができる。CRSを処置する方法は、本発明の薬品(例えば細胞)の治療的使用に関する。本明細書では、該薬品は、既存のCRSまたはCRSに関連する状態を有する被験体に、CRSと関連する少なくとも1つの症状を軽減、緩和もしくは改善するために、および/またはCRSの進行を、遅延、緩和もしくは阻止するために投与することができる。
被験体は、以前CAR発現細胞で処置されていてもよい。
CRSを予防する方法は、本発明の薬品(例えば細胞)の予防的使用に関する。この使用のために、該薬品を、どのようなCRSの症状も示していない被験体に、CRSの原因を予防するかもしくは減ずるために、またはCRSと関連する少なくとも1つの症状の発症を緩和するかもしくは予防するために投与することもできる。被験体は、CARに基づく処置などの免疫療法を受け入れようとしていてもよい。
予防的使用のために、抗TACI剤は、CARに基づく療法の前に、例えば前処置のレジメンで投与されてもよい。あるいは、抗TACI剤は、CARに基づく療法と共投与されてもよい。
ここで、本発明を、実施例により、さらに記載することにするが、実施例は本発明の実施で当業者を助けることに役立つことを意図するもので、本発明の範囲を限定することは決して意図されない。
(実施例1)骨髄腫細胞の表面におけるBCMAの発現
初代の骨髄腫細胞を、随伴疾患を有することが知られている多発性骨髄腫患者からの新鮮骨髄試料で、CD138免疫磁性選択を行うことにより単離した。これらの細胞を、PEとコンジュゲートされたBCMA特異的J6MO mAb(GSK)を用いて染色した。同時に、結合部位の数が知られている標準のビーズを、PE Quantibrite bead kit(Becton Dickenson)をメーカーの使用説明書に従って使用して生成させた。ビーズから導いた標準曲線と、骨髄腫細胞からの平均蛍光性強度を関連付けることにより、骨髄腫細胞上のBCMAコピー数を導き出した。骨髄腫細胞表面上のBCMAのコピー数の範囲は、低いことが見出され、1細胞当たり348.7〜4268.4BCMAコピーで、平均は1181および中央値は1084.9であった(図2)。これは、例えばCARの古典的な標的であるCD19およびGD2よりも相当低い。
(実施例2)TACI CARの設計および生成
免疫化およびハイブリドーマの生成
ヒトTACIをコードする遺伝子をベクターpVAC2中にクローニングした。5匹のBalBCマウスを、金ナノ粒子に吸着されたTACIをコードするプラスミドDNAを用いて免疫した。Gene−Gun(商標)(Biorad)システムを使用してコートされた金ナノ粒子を筋肉内に送達した。マウスを21日のコースの間に3回追加免疫した。マウスからの試験採血を、抗TACI抗体の力価についてELISAおよびフローサイトメトリーによりスクリーニングした。
血清がTACI陽性の5匹のマウスを最終の追加免疫のために選択した後、B細胞の単離およびハイブリドーマ産生のために脾臓を採取した。10×96ウェルのプレートで、選択されたマウスのリンパ球とのハイブリドーマ融合を実施した。ハイブリドーマの上清を、組換えヒトTACIの精製タンパク質(Peprotech、310−17)に対するELISAスクリーニングにより、反応性の抗TACI抗体についてスクリーニングして、代表的データを図6aに示す。ELISA陽性のハイブリドーマ上清を、操作されてTACIを過発現するSupT1細胞について、フローサイトメトリーにより試験した。対照としてBCMAを発現するSupT1細胞を使用した、図6b。候補のハイブリドーマを拡大増殖した。
ハイブリドーマの拡大増殖およびクローニング
最も強いおよび最も特異的な抗TACI応答を発現する4種の親クローンハイブリドーマを、フローサイトメトリー(2H6、2G2、1G6、4B11)により同定して拡大増殖させ、ストックをクローニングしてモノクローナル抗体を分泌するハイブリドーマを生成させた。ハイブリドーマのクローンを限界希釈により得た。
モノクローナルハイブリドーマ細胞系統からの抗体の配列決定
TRIzol(登録商標)試薬をメーカーの使用説明書に従って使用して、モノクローナルハイブリドーマ細胞から全RNAを単離した。全RNAをアガロースゲル電気泳動により分析して、NanoDrop2000Cを使用して濃度を評価した。全RNAを、アイソタイプに特異的な抗センスプライマーまたはユニバーサルプライマーのいずれかを、PrimeScriptTM 1st Strand cDNA Synthesis Kitをメーカーの使用説明書に従って使用して、cDNAに逆転写した。VHおよびVLの抗体断片を5’RACE PCR方法を使用して増幅した。DNA断片を、平滑末端でTオーバーハングを含有するベクター(TOPO−Thermofisher)中にクローニングした。重鎖および軽鎖の各々について5つのコロニーをスクリーニングして、コンセンサス配列を得た。クローンの配列が、VHおよびVL領域のCDR配列と一緒に、上の17〜19頁に示されている。
タグ付き可溶性のFcおよびCAR形式におけるTACI結合抗体のクローニング
可変重鎖および軽鎖を、標準的分子生物学技法を使用してscFv形式にクローニングした。TACI scFvを、細胞に結合するそれらの能力についてフローサイトメトリーにより、およびそれらの結合の反応速度についてBIAcoreにより試験した、図8。
scFv抗体を、キメラ抗原受容体形式におけるように操作した。CAR形式における発現を示すために、各CARのscFvを、SFGレトロウイルスベクターにおいてヒトヒンジ、TYRP膜貫通ドメインならびにCD28 OX40およびCD3ゼータエンドドメインを有する単一のオープンリーディングフレームでクローニングした、図7a。T細胞にこのベクターを形質導入して、カセットを発現するT細胞表面で、ウサギIgG1のFcドメインと融合した組換えTACIを用いる染色により、CARを検出した。
(実施例3)TACI−CAR T細胞による標的細胞の死滅
293T細胞に、CAR、gag/polおよびエンベロープタンパク質RD114をコードするプラスミドを、一過性でトランスフェクトすることにより、レトロウイルスを産生した。3日後に上清を捕集して、レトロネクチンをコートしたプレートで、PHA/IL2で活性化されたPBMCに等力価のレトロウイルスを形質導入するために使用した。形質導入の6日後にCARの発現をフローサイトメトリーにより確認して、PBMCを、TACI+BFP SupT1細胞またはBCMA+BFP SupT1細胞のいずれかと1:1の比で共培養した。標的細胞の死滅を1日および3日後にアッセイした。1日および3日後に、上清を取り出して、インターフェロン−γのレベルもELISAによりアッセイした。結果を図7bおよびcに示す。
(実施例4)骨髄性細胞によるIL−6産生に対するTACI−CARの効果
骨髄性細胞、末梢血から単離された細胞系統および初代細胞の両方を、in vitroで標的細胞に曝露したCAR−T細胞からの馴化培地で処置して、活性化されたCAR−T細胞により産生されるサイトカインに応答した骨髄性細胞によるIL−6の分泌を研究する。
骨髄性細胞によるTACIの発現も、標的細胞に曝露したCAR−T細胞からの馴化培地を用いる処置の前におよび後で研究する。
CAR−T細胞、標的細胞および骨髄性細胞で共培養を確立して、TACIに媒介されるCAR−T細胞による骨髄性細胞の死滅のIL−6産生に対する効果を研究する。CAR−T細胞の2種の異なった型:APRIL CARを発現するT細胞(図9Aを参照されたい)およびCD19/22 CARを発現するT細胞(図9Bを参照されたい)を試験する。APRIL CARは、トランケート型のAPRILを抗原結合ドメインとして含む。これの配列は上で配列番号2として与えられている。トランケート型APRILは、BCMAおよびTACI結合を保持するが、プロテオグリカン結合の能力は最早ない。CD19/CD22 CAR T細胞は、2種のCAR、1つはCD19に対するものおよび1つはCD22に対するものを発現する。CD19/22 CARを発現するT細胞は、骨髄性細胞を死滅させないので陰性対照として働く。
標的細胞で活性化されたときに、CAR−T細胞により分泌されたサイトカインの存在下で、骨髄性細胞によるIL−6を阻害するトラメチニブ、MEK阻害剤の潜在能力も研究する。
(実施例5)APRILに基づくCARは、IL−6を産生する単球を死滅させることができる
CRSは、高レベルのIL−6などのサイトカインにより惹起されるCART療法の主な有害な効果の1つである。患者でCRSが開始される可能な機構を研究するために、本発明者らは、1:1の比で播種されたAPRIL CART細胞のMM1s標的細胞との48時間の共培養からの上清中における炎症誘発性サイトカインの濃度を分析した。Luminex Multiplexアッセイにより実施されたこの分析により、GM−CSFおよびIFNgは、試験されたサイトカインパネルの中で最も豊富な2種のサイトカインであることが明らかになった(図10A)。これらのサイトカインは、形質導入されていないT細胞とMM1s細胞の共培養からの上清には存在しなかった(図10B)。単球におけるIL−6産生に対するGM−CSFおよびIFNgの効果を研究するために、3名の健康なドナーから単離されたヒト初代単球またはTHP1単球様細胞を、単独あるいはIFNg(50ng/ml)もしくはGM−CSF(10ng/ml)または両方の組合せの存在下のいずれかで48時間培養した。インキュベーションに続いて、培養培地中のIL−6レベルを、ELISAにより測定した。結果を図11に示す。初代単球およびTHP1細胞の両方共、未処置の対照または単一のサイトカイン処置と比較した場合、IFNgとGM−CSFの組合せに応答してIL−6の産生を増大したことが見出された。ヒト初代単球は、48時間のインキュベーション後に、IFNgとGM−CSFの組合せに応答して、明瞭な形態学的変化を示すことも見出された(図11B)。
単球に対するAPRIL CAR−T細胞の細胞傷害活性を研究するために、APRIL CARTをTHP1細胞と72時間共培養した。CARがT細胞抗原TRBC1に特異的である対照のCARを発現するT細胞も試験した。形質導入されていない細胞でもTRBC1 CAR−T細胞でもなく、APRIL CAR−T細胞が、これらの単球細胞に対して、FACSにより決定される高度に細胞傷害性効果を示した(図12)。
(実施例6)APRIL CARは、単球由来のサプレッサー細胞の存在下で標的細胞の優れた死滅を生ずる
悪性の形質細胞の生存は、骨髄の微小環境との相互作用により支持される(Kawanoら(2015年)Immunol. Rev.263巻:160〜172頁)。これらの相互作用は、腫瘍に関連するマクロファージ、骨髄由来のサプレッサー細胞(MDSC)および樹状細胞(DC)を含む。これらの細胞のタイプは、骨髄腫細胞集団の支持および腫瘍に向けられる免疫応答の抑制の両方に作用する。骨髄マクロファージによる高レベルの骨髄浸潤を有する患者は、予後不良を有し(Suyaniら(2013年)Ann Hematology 92巻:669〜677頁)、MDSCの数は、多発性骨髄腫患者の末梢血および骨髄で大きく増加している(Gorgunら(2013年)Blood 121巻:2975〜2987頁)。
免疫抑制骨髄の微小環境が内因性T細胞活性を低下させることが示されたことと同様に、養子移入されたCAR−T細胞は骨髄腫患者の骨髄の微小環境中の免疫抑制細胞により影響される。MDSC、マクロファージおよびDCは、単球から誘導されるので、本発明者らは、自家末梢血液の単核細胞(PBMC)から培養されたこれらの単球誘導体の存在下で、CARに媒介される腫瘍細胞溶解を評価するin vitroシステムを開発した。
単球を、PBMCから全単球単離マイクロビーズ(Miltenyl)を使用して単離して、サイトカイン中で1週間培養して、M2単球、MDSCおよびDCを誘導した。これらの細胞は、骨髄腫患者の骨髄で見出される腫瘍浸潤マクロファージに類似の抑制的表現型を有する(Gutierrez−Gonzalezら(2016年)Blood 128巻:2241〜2252頁)。したがって同じドナーに由来するCAR T細胞を、ヒト骨髄腫細胞系統(HMCL)MM.1sとこれらの抑制細胞型の不在または存在下で共培養した。
APRIL CARおよび抗BCMAモノクローナル抗体に由来するscFvに基づく抗原結合ドメインを含む抗BCMA CAR(BCMAscFv CAR)という2つのタイプのCARを試験した。このシステムでは、M2単球、MDSCおよびDCの存在下におけるBCMAscFv CARによる有意に減弱した腫瘍死滅が見られた(図13)。対照的に、APRIL CARに媒介される死滅は単球由来のサプレッサー細胞の存在下で維持された。
FACS分析により、本発明者らは、M2単球、MDSCおよびDCが、TACIを発現することを確立した(図13a)。APRIL CAR T細胞の二重の標的を有する能力は、TACIを発現する免疫抑制細胞を直接標的とすることを可能にする。したがって、これらの単球誘導体は、BCMAのみを標的とするCAR T細胞による腫瘍死滅を抑制し、一方、APRIL CARに媒介される死滅は維持される。
上の明細書で言及した全ての出版物は、参照により本明細書に組み込まれる。本発明の記載された方法およびシステムの種々の改変および変形は、本発明の範囲および精神から逸脱することなく、当業者には明らかであろう。本発明は、特定の好ましい実施形態に関して記載されたが、特許請求された本発明は、そのような特定の実施形態に不当に限定されるべきでないことが理解されるべきである。実際、分子生物学または関連する分野における当業者には明白な、本発明を実施するための記載の様式の種々の改変は、以下の請求項の範囲内であることが意図されている。

Claims (41)

  1. 異なる抗原に結合する第1および第2のキメラ抗原受容体(CAR)を含む細胞であって、前記第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、細胞。
  2. 前記第2のCARがBCMAに結合する、請求項1に記載の細胞。
  3. 異なる抗原に結合する第1および第2の抗原結合ドメインを含む、tanCARを含む細胞であって、前記第1の抗原結合ドメインは、前記抗原の膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、細胞。
  4. 前記第2の抗原結合ドメインがBCMAに結合する、請求項3に記載の細胞。
  5. 請求項3または4で定義されたtanCARをコードする核酸配列。
  6. 以下の構造:
    AgB1−リンカー−AgB2−スペーサー−TM−endo
    (式中、
    AgB1は、前記tanCARの前記第1の抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
    リンカーは、前記tanCARのリンカーをコードする核酸配列であり;
    AgB2は、前記tanCARの前記第2の抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
    スペーサーは、前記tanCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
    TMは、前記tanCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
    endoは、前記tanCARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
    を有し、細胞において発現された場合、前記第1および第2の抗原結合ドメインを細胞表面にタンデムで発現するポリペプチドをコードする、請求項5に記載の核酸配列。
  7. リンカーが、Gly−Ser可撓性リンカーを含む配列をコードする、請求項6に記載の核酸配列。
  8. 相同組換えを避けるために、同一または類似のアミノ酸配列をコードする配列の領域で代替のコドンが使用される、請求項5から7のいずれかに記載の核酸配列。
  9. 請求項1または2で定義された第1のCAR;および請求項1または2で定義された第2のCARをコードする核酸構築物。
  10. 以下の構造:
    AgB1−スペーサー1−TM1−endo1−coexpr−AgB2−スペーサー2−TM2−endo2
    (式中、
    AgB1は、前記第1のCARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
    スペーサー1は、前記第1のCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
    TM1は、前記第1のCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
    endo1は、前記第1のCARのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
    coexprは、前記第1および第2のCARの共発現を可能にする核酸配列であり、
    AgB2は、前記第2のCARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
    スペーサー2は、前記第2のCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
    TM2は、前記第2のCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
    endo2は、前記第2のCARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
    を有し、細胞において発現された場合、前記第1および第2のCARが前記細胞の表面で共発現されるような開裂部位で開裂されるポリペプチドをコードする、請求項9に記載の核酸構築物。
  11. coexprが、自己開裂ペプチドを含む配列をコードする、請求項10に記載の核酸構築物。
  12. 相同組換えを避けるために、同一または類似のアミノ酸配列をコードする配列の領域で代替のコドンが使用される、請求項9から11のいずれかに記載の核酸構築物。
  13. 請求項5から8のいずれか一項に記載の核酸配列、または請求項9から12のいずれかに記載の核酸構築物を含むベクター。
  14. 請求項13に記載のレトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターまたはトランスポゾン。
  15. (i)請求項1または2で定義された第1のCARをコードする第1の核酸配列であって、以下の構造:
    AgB1−スペーサー1−TM1−endo1
    (式中、
    AgB1は、前記第1のCARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
    スペーサー1は、前記第1のCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
    TM1は、前記第1のCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
    endo1は、前記第1のCARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
    を有する第1の核酸配列;および
    (ii)請求項1または2で定義された第2のCARをコードする第2の核酸配列であって、以下の構造:
    AgB2−スペーサー2−TM2−endo2
    (式中、
    AgB2は、前記第2のCARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
    スペーサー2は、前記第2のCARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
    TM2は、前記第2のCARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
    endo2は、前記第2のCARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
    を有する第2の核酸配列
    を含むキット。
  16. 請求項15で定義された前記第1の核酸配列を含む第1のベクター;および請求項15で定義された前記第2の核酸配列を含む第2のベクターを含むキット。
  17. 前記ベクターがウイルスベクターまたはトランスポゾンを組み込んでいる、請求項16に記載のキット。
  18. 請求項5から8のいずれかに記載の核酸配列;請求項10から12のいずれかに記載の核酸構築物;請求項13もしくは14に記載のベクター、または請求項15から17のいずれかに記載の配列もしくはベクターのキットを細胞に導入するステップを含む、請求項1から4のいずれか一項に記載の細胞を作製する方法。
  19. 前記細胞が、被験体から単離された試料に由来する、請求項18に記載の方法。
  20. 複数の、請求項1から4のいずれか一項に記載の細胞を含む医薬組成物。
  21. (i)第1のCARを発現する第1の細胞集団;および
    (ii)第2のCARを発現する第2の細胞集団
    を含む医薬組成物であって、前記第1および第2のCARは、異なる抗原に結合し、前記第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、医薬組成物。
  22. 請求項20または21に記載の医薬組成物を被験体に投与するステップを含む、疾患を処置および/または予防する方法。
  23. 以下のステップ:
    (i)第1のCARを発現する第1の細胞集団を投与するステップ、
    (ii)第2のCARを発現する第2の細胞集団を投与するステップ
    を含む、疾患を処置および/または予防する方法であって、前記第1および第2のCARは、異なる抗原に結合し、前記第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、方法。
  24. 以下のステップ:
    (i)細胞を含有する試料を被験体から単離するステップ;
    (ii)請求項5から8のいずれかに記載の核酸配列;請求項10から12のいずれかに記載の核酸構築物;請求項13もしくは14に記載のベクター、または請求項15から17のいずれかに記載の配列もしくはベクターのキットを細胞に形質導入またはトランスフェクトするステップ;および
    (iii)(ii)からの前記細胞を前記被験体に投与するステップ
    を含む、請求項22または23に記載の方法。
  25. 請求項23に記載の方法で使用するためのキットであって、前記キットは、
    (i)第1のCARを発現する第1の細胞集団
    (ii)第2のCARを発現する第2の細胞集団
    を含み、前記第1および第2のCARは、異なる抗原に結合し、前記第1のCARは、膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド相互作用因子(TACI)に結合する、キット。
  26. 前記疾患ががんである、請求項22から24のいずれかに記載の方法。
  27. 疾患が成熟B細胞悪性腫瘍である、請求項26に記載の方法。
  28. 前記疾患が多発性骨髄腫である、請求項26または27に記載の方法。
  29. 疾患を処置および/または予防することに使用するための請求項20または21に記載の医薬組成物。
  30. 疾患を処置および/または予防するための医薬の製造における、請求項1から4のいずれかに記載の細胞の使用。
  31. 異なる抗原に結合する第1および第2の抗原結合ドメインを含むtanCARであって、前記第1の抗原結合ドメインは、前記抗原の膜貫通活性化因子およびカルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド(CAML)相互作用因子(TACI)に結合する、tanCAR。
  32. 被験体におけるサイトカイン放出症候群を回避および/または緩和する方法であって、抗TACI剤を前記被験体に投与するステップを含む方法。
  33. 前記抗TACI剤が抗TACI抗体である、請求項32に記載の方法。
  34. 前記抗TACI剤が、抗TACIキメラ抗原受容体(CAR)を発現する細胞である、請求項32に記載の方法。
  35. 前記抗TACI CARが、2つの別の成分:抗原結合ドメインおよび膜貫通ドメインを含む抗原結合成分;ならびにエンドドメインを含む細胞内シグナル伝達成分を含み、
    前記抗原結合成分および細胞内シグナル伝達成分が、細胞表面で会合して機能性CAR複合体を形成する、請求項34に記載の方法。
  36. 前記抗TACI CARが、APRILからのBCMA結合ドメインを含む抗原結合ドメインを有する、請求項34に記載の方法。
  37. 前記抗TACI剤が、請求項1から4のいずれかに記載の細胞である、請求項34に記載の方法。
  38. 前記被験体が、CARに基づく免疫療法を現在受けているかまたは受け入れようとしている、請求項32から37のいずれかに記載の方法。
  39. 前記抗TACI剤が、前記被験体における骨髄性細胞によるサイトカイン分泌を阻害する、請求項32から38のいずれかに記載の方法。
  40. 前記抗TACI剤が前記被験体における骨髄性細胞を死滅させる、請求項32から38のいずれかに記載の方法。
  41. 被験体において、
    a)サイトカイン放出症候群を回避および/もしくは緩和する;
    b)骨髄性細胞によるサイトカイン分泌を阻害する;ならびに/または
    c)骨髄性細胞を死滅させる
    方法で使用するための抗TACI剤。
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