JP2019530470A - γδFoxp3+調節性T細胞のエクスビボ生成及びその治療的使用 - Google Patents

γδFoxp3+調節性T細胞のエクスビボ生成及びその治療的使用 Download PDF

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Abstract

本発明は、γδFoxp3+調節性T細胞をエクスビボで生成及び増殖させるための方法、ならびにその治療的使用に関する。本発明者らは、エクスビボでのヒト誘導性腫瘍抗原特異的CD4+TCRγδ非制限T細胞におけるFoxp3+発現の誘導及び腫瘍抗原特異的FOXP3発現CD4+TCRγδ非制限T細胞に対する自己CD8媒介性T細胞応答の誘導を実施した。本発明者らは、いずれの刺激の培養条件であっても、排他的に調節活性を発揮するようにコミットされた、エクスビボで生成及び増殖された抗原特異的Foxp3発現CD3+TCRγδ+非制限T細胞に対する方法を開発した。特に、本発明は、以下の表現型:CD3+TCRγδ+Foxp3+を有するエクスビボのγδFoxp3+調節性T細胞を生成するための方法に関する。

Description

本発明は、γδFoxp3調節性T細胞を生成及び増殖させるためのエクスビボ方法及びその治療的使用に関する。
発明の背景
γδT細胞は循環T細胞の約1〜5%を占め、自然免疫と適応免疫の間の境界面で作用する。これらの細胞は、先天的免疫細胞と適応的免疫細胞の性質を組み合わせて持ち、治療、特に癌免疫療法における利用のために魅力的なものとなっている。実際に、γδT細胞は炎症性サイトカインを産生し、感染細胞又は悪性細胞を直接溶解し、再曝露時に攻撃病原体への記憶応答を確立することができる。古典的なαβT細胞とは異なり、Vγ9Vδ2T細胞(循環γδT細胞プールの主要なサブセット)は未処理抗原(例えばホスホモノエステルなど)を認識する。この認識はTCRにより媒介され、MHC分子により制限されない。
Foxp3を発現する調節性γδT細胞を、適切な抗原刺激及びサイトカインの下で誘導することができることが当技術分野において示されている(Casetti et al. JI 2009, 183:3574-3577)。これらのFoxp3調節性γδT細胞は抑制活性が可能である。
今日の時点で、これらのFoxp3調節性γδT細胞をそれらの治療的利用のためにエクスビボで増殖させる方法は、当技術分野において示唆されていない。
本発明は、このように、Foxp3γδ調節性T細胞をエクスビボで生成及び増殖させる方法、ならびに前記Foxp3γδ調節性T細胞の治療的使用を提供する。
要約
本発明は、以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞をエクスビボで生成するための方法に関し、以下を含む
−γδT細胞活性化剤及び以下の薬剤:i)cAMP(環状アデノシン一リン酸)活性化剤、ii)TGFβ(形質転換成長因子ベータ)経路活性化剤、iii)mTOR 阻害剤、場合によりiv)IL−2、IL−7、IL−15、及びTSLPの群において選択される少なくとも1つのサイトカイン、ならびに場合によりv)少なくとも1つのTET酵素活性化剤(好ましくはビタミンC及びNaHS硫化水素放出薬剤より選択される)及び/又は少なくとも1つのDNMT阻害剤(例えば、RG108、DAC、又は5ACなど)の存在において、少なくとも5日間CD3TCRγδT細胞を培養すること。
一実施形態において、γδT細胞活性化剤はポリクローナルγδT細胞活性化剤、好ましくは抗TCRγδ抗体又は非ペプチドリン酸化抗原である。
別の実施形態において、γδT細胞活性化剤は抗原特異的γδT細胞活性化剤、好ましくは寛容原性樹状細胞(DC)であり、少なくとも1つのビスホスホネート、好ましくは少なくとも1つのアミノビホスホネートを用いてパルスされる。
本発明の一実施形態において、cAMP活性化剤は、プロスタグランジンE2(PGE2)、EP2もしくはEP4アゴニスト、膜アデニンシクラーゼ活性化剤、又は代謝型グルタミン酸受容体アゴニストを含む群より選択される。
一実施形態において、TGFβ経路活性化剤は、TGFβ、骨形成タンパク質(BMP)、成長及び分化因子(GDF)、抗ミュラー管ホルモン(AMH)、アクチビン、ならびにノダールを含む群より選択される。
一実施形態において、mTOR阻害剤は、ラパマイシン、ラパマイシン類似体、ウォルトマンニン;テオフィリン;カフェイン;エピガロカテキンガレート(EGCG)、クルクミン、レスベラトロール;ゲニステイン、3,3−ジインドリルメタン(DIM)、LY294002(2−(4−モルホリニル)−8−フェニル−4H−1−ベンゾピラン−4−オン)、PP242、PP30、Torin1、Ku−0063794、WAY−600、WYE−687、WYE−354、GNE477、NVP−BEZ235、PI−103、XL765、及びWJD008を含む群より選択される。
一実施形態において、本発明の方法は増殖工程をさらに含み、それにおいて、上に記載する生成方法により得られたγδFoxp3調節性T細胞を、γδT細胞活性化剤及び以下の薬剤:i)cAMP(環状アデノシン一リン酸)活性化剤、ii)TGFβ(形質転換成長因子ベータ)経路活性化剤、iii)mTOR阻害剤、場合によりiv)IL−2、IL−7、IL−15、及びTSLPの群において選択される少なくとも1つのサイトカイン、ならびに場合によりv)少なくとも1つのTET酵素活性化剤(好ましくはビタミンC及びNaHS硫化水素放出剤より選択される)及び/又は少なくとも1つのDNMT阻害剤(例えばRG108、DAC、又は5ACなど)の存在において、少なくとも5日間培養する。
本発明の別の目的は、本明細書中の上で記載する方法により入手可能なエクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞集団である。
本発明のさらなる目的は、本発明に従った方法により入手可能な、エクスビボで生成及び増殖されたγδFoxp3調節性T細胞集団に関する。
本発明はまた、炎症状態において機能的に安定なままである、エクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞集団に関する。
本発明はさらに、不活化γδFoxp3調節性T細胞もしくはγδFoxp3調節性T細胞のブレブ、又はγδFoxp3調節性T細胞のブレブを負荷した免疫原性樹状細胞を含む免疫原性産物に関する。
本発明はまた、不活化γδFoxp3調節性T細胞及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤もしくはγδFoxp3調節性T細胞のブレブ、又はγδFoxp3調節性T細胞のブレブを負荷した免疫原性樹状細胞を含む医薬組成物を提供する。
本発明の別の目的は、不活化γδFoxp3調節性T細胞及び少なくとも1つのアジュバントもしくはγδFoxp3調節性T細胞のブレブ、又はγδFoxp3調節性T細胞のブレブを負荷した免疫原性樹状細胞を含むワクチン組成物である。
本発明のさらなる目的は、癌の処置における使用のための本発明に従った免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物に関する。
本発明はまた、γδFoxp3調節性T細胞及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む医薬組成物に関する。
本発明はさらに、細胞療法における使用のための、本明細書において上に記載する医薬組成物に関する。
本発明のさらなる目的は、炎症性疾患もしくは自己免疫疾患を処置する際での使用のための、又は移植拒絶反応もしくは移植片対宿主病(GVHD)を防止するための、本明細書において上に記載する医薬組成物である。
定義
本明細書において使用するように、「調節性T細胞」又は「Treg」は、細胞−細胞接触又はMLR抑制(混合リンパ球反応)のいずれかにより抑制活性(即ち、従来型T細胞の増殖を阻害すること)が可能な細胞を指す。これらの細胞は、異なる亜集団(MHCII制限CD4Foxp3調節性T細胞、γδFoxp3調節性T細胞、及びインバリアントFoxp3調節性T細胞を含むが、これらに限定しない)を含む。
本明細書において使用するように、「インバリアントFoxp3調節性T細胞」は、以下の表現型:CD3Vα24Foxp3を有する細胞を指す。これらの細胞は、CD1制限下で非ペプチド脂質抗原を認識する。
本明細書において使用するように、「γδFoxp3調節性T細胞」は、以下の表現型:γδTCR+Foxp3を有する細胞を指す。これらの細胞は、MHC(主要組織適合遺伝子複合体)制限を伴わずに非ペプチドリン酸化抗原を認識する。
本明細書において使用するように、「MHCII制限CD4Foxp3調節性T細胞」は、以下の表現型:CD4CD25Foxp3を有する細胞を指す。これらの細胞は、それらのαβTCR(T細胞受容体)により同定され、制限MHCクラスII(主要組織適合遺伝子複合体クラスII)分子により提示されるペプチド(外来又は自己ペプチドを含む)を認識する。
本明細書において使用するように、用語「処置」は、治療的処置ならびに予防的及び防止的手段を指し、それにおいて、その目的は、標的とされる病理学的障害又は状態を防止又は減速(減少、軽減)することである。処置を必要とする人は、既にその障害を伴っている人ならびにその障害に罹りやすい人、又はその障害を防止すべき人を含む。被験体又は哺乳動物は、本発明に従った治療量のγδFoxp3調節性T細胞又は治療量の不活化γδFoxp3調節性T細胞を受けた後、患者が以下の1つ以上における観察可能及び/又は測定可能な低下又は非存在を示す場合、疾患について成功裏に処置されている:病原性細胞の数における低下;病原性である全細胞のパーセントにおける低下;及び/又は特定の疾患又は状態に関連する1つ以上の症状のある程度の緩和;罹患率及び死亡率の低下、ならびに生活の質の問題における改善。疾患における成功裏の処置及び改善を評価するための上のパラメータは、医師が精通している日常的な手順により容易に測定可能である。
本明細書において使用するように、「治療的な効果的な量」は、標的に対して有意な負の又は有害な副作用を起こすことなく治療応答を誘導することを目的とするγδFoxp3調節性T細胞又は不活化γδFoxp3調節性T細胞の数を指す。治療的に効果的な量を、予防的又は防止的な作用のために、処置される疾患の発症に先立ち投与してもよい。あるいは又は加えて、治療的に効果的な量は、治療作用のために、処置される疾患の開始後に投与してもよい。
本明細書において使用するように、「治療応答」は、被験体におけるγδFoxp3調節性T細胞治療又はγδFoxp3調節性T細胞ワクチン接種により誘導される治療上の利益を指す。治療応答は、(1)処置される疾患の発症を遅延又は防止する;(2)処置される疾患の1つ以上の症状の進行、増悪、又は悪化を減速又は停止させる;(3)処置される疾患の症状の寛解をもたらす;(4)処置される疾患の重症度又は発生率を低下させる;あるいは(5)処置される疾患を治癒するという事実を含みうる。
本明細書において使用するように、数値の前の「約」は、その数値の値の10%より多いか又は少ないことを意味する。
本明細書において使用するように、「被験体又は患者」は哺乳動物、好ましくはヒトを指す。本発明において、用語、被験体及び患者を同じ意味で使用することがある。非ヒト哺乳動物の例は、ペット(例えばイヌ、ネコ、家畜のブタ、ウサギ、フェレット、ハムスター、マウス、ラットなど);霊長類(例えばチンパンジー、サルなど);経済的に重要な動物(例えばウシ、ブタ、ウサギ、ウマ、ヒツジ、ヤギなど)を含む。一実施形態において、被験体は、医療を受けるのを待っている、もしくは受けている、又は医学的手技の対象であった/である/になりうる、又は疾患の発症についてモニターされている。一実施形態において、被験体は成体である(例えば、18を上回る被験体)。別の実施形態において、被験体は子である(例えば、18歳未満の被験体)。一実施形態において、被験体は雄である。別の実施形態において、被験体は雌である。
本明細書において使用するように、「同種異系細胞」は、1つの被験体(ドナー)から単離され、別の被験体(レシピエント又は宿主)に注入された細胞を指す。
本明細書において使用するように、「自己細胞」は、単離され、同じ被験体(レシピエント又は宿主)に注入される細胞を指す。
詳細な説明
本発明は、エクスビボでγδFoxp3調節性T細胞を生成するための方法に関する。
一実施形態において、エクスビボでγδFoxp3調節性T細胞を生成するための方法は以下を含む:
−γδT細胞活性化剤及び以下の薬剤:i)cAMP(環状アデノシン一リン酸)活性化剤、ii)TGFβ(形質転換成長因子ベータ)経路活性化剤、iii)mTOR阻害剤、場合によりiv)IL−2、IL−7、IL−15、及びTSLP(胸腺ストローマリンホポエチン)の群において選択される少なくとも1つのサイトカイン、ならびに、場合によりv)少なくとも1つのTET酵素活性化剤及び/又は少なくとも1つのDNMT阻害剤の存在においてCD3TCRγδT細胞、好ましくはCD3TCRγδCD45RAT細胞を、少なくとも5日間培養すること、
−それにより、好ましくはγδナイーブ(CD45RA)T細胞から、エクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞の集団を得ること。
一実施形態において、CD3TCRγδT細胞、好ましくはCD3TCRγδCD45RAT細胞は、血液サンプルから当技術分野において周知の任意の技術により得る。一実施形態において、CD3TCRγδT細胞、好ましくはCD3TCRγδCD45RAT細胞は、フローサイトメトリーによりPBMC(末梢血単核球)から単離する。一実施形態において、CD3TCRγδT細胞、好ましくはCD3TCRγδCD45RAT細胞を凍結PBMCから単離してもよい。
一実施形態において、単離CD3TCRγδT細胞、好ましくはCD3TCRγδCD45RAT細胞の取得は、任意の最初の精製工程により改善されうる。CD3TCRγδT細胞、好ましくはCD3TCRγδCD45RAT細胞を、可溶性抗CD28及び抗CD40抗体の存在において抗原パルス寛容原性DC(例えば、オボアルブミンパルス寛容原性DC)を用いて刺激する。一実施形態において、刺激の時間は1時間〜24時間の間、好ましくは10時間〜20時間の間、より好ましくは約16時間の間の範囲である。刺激後、細胞を、例えばPBSを用いて洗浄し、選別のために抗CD154及び抗CD4抗体を用いて染色する。精製CD3TCRγδCD154T細胞を濃縮し、以下の活性化工程のために使用してもよい。
一実施形態において、CD3TCRγδT細胞をγδT細胞活性化剤の存在において活性化する。前記γδT細胞活性化剤は、ポリクローナルγδT細胞活性化剤又は抗原特異的γδT細胞活性化剤でありうる。
本発明において、ポリクローナルγδT細胞活性化剤はTCRγδ活性化剤である。TCRγδ活性化剤の例は、抗TCRγδ抗体、例えば精製マウス抗ヒトTCRγδクローンB1(参照555715、BD Biosciences)、抗ヒトTCRγδ抗体(参照331209、Biolegend)、モノクローナルTCRγδ抗体(参照NBP2−22489又はNBP2−22510、Novus Biologicals)、抗マウスγδTCR抗体(参照12−5711−81、eBioscience)、TCRγδ抗体(参照MAB7297、R&D Systems)、抗T細胞受容体γδ抗体(参照ABIN2372990、抗体オンライン)、抗TCRガンマ+TCRデルタ抗体(参照ab25663、Abcam)、抗γδTCR抗体クローンIMMU510(Beckman Coulter);非ペプチドリン酸化抗原(リン酸化非ペプチド抗原とも呼ばれる)、イソプレニルピロリン酸(IPP)、(E)−4−ヒドロキシ−3−メチル−ブタ−2−エニル二リン酸(HMB−PP)及びそれらの類似体(例えばブロモヒドリン二リン酸(BrHPP)及び2−メチル−3−ブテニル−1−ピロリン酸(2M3B1PP)など)を含むが、これらに限定しない;F1−ATPアーゼ;アポリポタンパク質A−1;結核菌;UL16結合タンパク質4(ULBP4);CD1c;スルファチドを負荷したCD1d四量体;内皮プロテインC受容体(EPCR)、リポエキサペプチド;フィコエリトリン、ヒスチジルtRNAシンターゼ及びブチロフィリン3A1などを含むが、これらに限定しない。
別の実施形態において、ポリクローナルγδT細胞活性化剤は、MHCクラスI関連A(MICA)である。
別の実施形態において、ポリクローナルγδT細胞活性化剤は、癌細胞からの免疫原性アポトーシス小体又は癌細胞からの、もしくは組織溶解物から由来するブレブである。
癌細胞は、腫瘍生検から又は循環癌細胞の増殖から由来しうる。
癌細胞からの免疫原性アポトーシス小体は、例えばアントラサイクリン(ドキソルビシン、ダウノルビシン、イダルビシン、及びミトキサントロンを含む);オキサリプラチン、アポトーシス小体を放出するUVC又はγ線処理癌細胞を用いて得てもよい、あるいはアントラサイクリン(ドキソルビシン、ダウノルビシン、イダルビシン、及びミトキサントロンを含む);オキサリプラチン;UVC又はγ線処置癌から直接単離することができる。
ブレブは重要な免疫原性粒子を構成する。それらはアポトーシス細胞の表面で形成された不均一な小胞である。一実施形態において、ブレブのサイズは0.05〜5μm、好ましくは0.1〜1μmの範囲である。種々の免疫原性細胞死(ICD)誘導物質が、アポトーシス細胞又は自食作用細胞からのブレブの放出を誘導することができ、例えば、5000radでの照射、ならびにいくつかの抗新生物剤(ドキソルビシン、オキサリプラチン、及びシスプラチンを含む)などである。免疫原性癌細胞ブレブは、特に、アポトーシス性癌細胞から、又は化学的もしくは物理的誘導物質による処理後の癌細胞オートファジーから得てもよい。
一実施形態において、ポリクローナルγδT細胞活性化剤は、抗TCRγδ抗体又は非ペプチドリン酸化抗原、例えばイソプレニルピロリン酸(IPP)などである。
一実施形態において、ポリクローナルγδT細胞活性化剤、好ましくは、抗TCRγδ抗体は、培養培地中に可溶性である。別の実施形態において、ポリクローナルγδT細胞活性化剤を培養プレートにコーティングする。
一実施形態において、ポリクローナルγδT細胞活性化剤、好ましくは、抗TCRγδ抗体は、フィーダー細胞、好ましくは自己フィーダー細胞の存在において使用する。
フィーダー細胞は、ΔCD3細胞(T細胞枯渇アクセサリー細胞)、照射PBMC、照射DC、人工APC(抗原提示細胞)、Sf9細胞、昆虫細胞、異なる被験体からのPBMCのプール又はB細胞のプール、KCD40L細胞、EBV形質転換B細胞株、及びEBV形質転換リンパ芽球細胞(LCL)を含むが、これらに限定しない。
好ましくは、本発明において使用するフィーダー細胞は、抗CD3コーティングビーズとのインキュベーションによるPBMCからのネガティブ選択により単離され、次に3000radで照射されるΔCD3細胞である。
一実施形態において、T細胞/支持細胞の比率は約1:100から約1:10000、好ましくは1:1000から1:5000の範囲である。本発明の範囲内では、表現「1:100から1:10000」は、1:100、1:200、1:300、1:400、1:500、1:600、1:700、1:800、1:900、1:1000、1:1250、1:1500、1:1750、1:2000、1:2250、1:2500、1:2750、1:3000、1:3250、1:3500、1:3750、1:4000、1:4250、1:4500、1:4750、1:5000、1:5250、1:5500、1:5750、1:6000、1:6250、1:6500、1:6750、1:7000、1:7250、1:7500、1:7750、1:8000、1:8250、1:8500、1:8750、1:9000、1:9250、1:9500、1:9750、及び1:10000を含むが、これらに限定しない。
本発明において、抗原特異的γδT細胞活性化剤は寛容原性樹状細胞(DC)である。
本明細書において使用するように、「寛容原性DC」は、寛容を誘導することが可能なDCを指す。一実施形態において、寛容原性DCは、前炎症誘発性サイトカイン(例えばIL−12、IL−23、又はTNFαなど)よりも抑制性のサイトカイン(例えばIL−10及びTGFβなど)を分泌することが可能である。一実施形態において、DCは、それらがIL−10:IL−12>1の比率においてIL−10及びIL−12を分泌する場合、寛容原性として定義する。
一実施形態において、寛容原性DCはそれらの表面上に主要組織適合性(MHC)クラスIa及び/又はMHCクラスIbを発現する。MHCクラスIaの提示は、HLA−A、HLA−B及び/又はHLA−C分子を通じた「古典的」提示を指すのに対し、MHCクラスIbの提示は、HLA−E、HLA−F、HLA−G、及び/又はHLA−H分子を通じた「非古典的」抗原提示を指す。
一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に50%のMHCクラスIa分子及び50%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に45%のMHCクラスIa分子及び55%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に40%のMHCクラスIa分子及び60%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に35%のMHCクラスIa分子及び65%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に30%のMHCクラスIa分子及び70%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に25%のMHCクラスIa分子及び75%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に20%のMHCクラスIa分子及び80%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に15%のMHCクラスIa分子及び85%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に10%のMHCクラスIa分子及び90%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に5%のMHCクラスIa分子及び95%のMHCクラスIb分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上にMHCクラスIb分子だけを発現する。
一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に50%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに50%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に45%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに55%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に40%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに60%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に35%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに65%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に30%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに70%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に25%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに75%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に20%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに80%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に15%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに85%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に10%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに90%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上に5%のHLA−A、HLA−B、及び/又はHLA−C分子ならびに95%のHLA−E分子を発現する。一実施形態において、寛容原性DCは、それらの表面上にHLA−E分子だけを発現する。
寛容原性DCを得るための方法は当技術分野において周知である。例示的な方法は、CD14単球からの免疫寛容原性DCの生成である。例えば、CD14単球を、未成熟DCの生成のために、GM−CSF及びIL−4の存在において、又はGM−CSF及びIFNαの存在において培養する。
寛容原性DCの表面上のMHCクラスIa分子発現を阻害する又はHLA−E分子の発現を誘導するための方法は周知である。
TAPトランスポーター(抗原プロセシングに関連するトランスポーター)の阻害は、MHCクラスIa分子の発現の減少に導き、それにより寛容原性DCの表面上でのHLA−E分子発現が促進される。
小胞体におけるTAPトランスポーターを阻害するための例示的な方法は、CRISPR−CAS−9技術、サイレンシングRNA、CMV(サイトメガロウイルス)からのUL−10ウイルスタンパク質を用いたトランスフェクトDC、又はウイルスタンパク質の使用を含むが、これらに限定しない。
TAPトランスポーターを阻害することができるウイルスタンパク質の例は、HSV−11CP47タンパク質、水痘ウイルスUL49.5タンパク質、サイトメガロウイルスUS6タンパク質、又はガンマヘルペスウイルスEBV BNLF2aタンパク質を含むが、これらに限定しない。
別の方法は、寛容原性DCの表面上のHLA−E発現を変化させることなくMHCクラスIa分子の発現を阻害するための化学製品の使用である。化学製品の例は、5’−メチル−5’−チオアデノシン又はレプトマイシンBを含むが、これらに限定しない。
寛容原性DCを、少なくとも1つのビスホスホネート、好ましくはアミノビスホスホネート(aminobiphosphonate)の存在において約24時間パルスする。ビスホスホネート(biphosphonate)の例は、ゾレドロン酸(又はゾレドロネート)、パミドロン酸、アレンドロン酸、リセドロン酸、イバンドロン酸、インカドロン酸、エチドロン酸、チルドロン酸、それらの組み合わせ、それらの塩、及びそれらの水和物を含むが、これらに限定しない。好ましくは、ビスホスホネート(biphosphonate)はゾレドロン酸又はゾレドロネートである。
一実施形態において、ビスホスホネート、特にゾレドロン酸を10nMから50μMの濃度で使用する。本発明の範囲内において、表現「10nMから50μM」は、50nM、100nM、250nM、500nM、750nM、1μM、10μM、20μM、30μM、40μM、50μMを含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、培養物中に加えられたcAMP活性化剤によって、cAMP経路の活性化が可能になる。cAMP活性化剤の例は、PGE2(プロスタグランジンE2)、EP2又はEP4アゴニスト、膜アデニンシクラーゼ活性化剤(例えばフォルスコリンなど)、又は代謝型グルタミン酸受容体アゴニストを含むが、これらに限定しない。PGE2の例は、参照P5640又はP0409のPGE2(Sigma-Aldrich)、参照2296のPGE2(R&D Systems)、参照2268のPGE2(BioVision)、参照72192のPGE2(Stemcell)、参照ab144539のPGE2(Abcam)、及び参照14010のPGE2(Cayman Chemical)を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、cAMP活性化剤、好ましくはPGE2を0.01μMから10μMの範囲の濃度で使用する。本発明の範囲内において、表現「0.01μMから10μM」は、0.02μM、0.03μM、0.04μM、0.05μM、0.06μM、0.07μM、0.08μM、0.09μM、0.1μM、0.2μM、0.3μM、0.4μM、0.5μM、0.6μM、0.7μM、0.8μM、0.9μM、1μM、1.5μM、2μM、2.5μM、3μM、3.5μM、4μM、4.5μM、5μM、6μM、7μM、8μM、9μMを含むが、これらに限定しない。特定の実施形態において、PGE2は0.03μMから1.5μMの範囲の濃度である。
一実施形態において、培養物中に加えたTGFβ経路活性化剤によって、TGFβ経路の活性化が可能になる。TGFβ経路活性化剤の例は、TGFβファミリー(TGFβ1、TGFβ2、TGFβ3)、骨形成タンパク質(BMP)、成長及び分化因子(GDF)、抗ミュラー管ホルモン(AMH)、アクチビン、及びノダールを含むが、これらに限定しない。TGFβの例は、参照T7039のTGFβ1(Sigma-Aldrich)、参照T2815のTGFβ2(Sigma-Aldrich)、参照T5425のTGFβ3(Sigma-Aldrich)、参照P01137のヒトTGFβ1(R&D systems)、参照580702のヒトTGFβ1(Biolegend)、参照HZ−1011のTGFβ1(HumanZyme)、参照14−8348−62のTGFβ1(Affymetrix eBioscience)を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、経路活性化因子を1ng/mlから20ng/mlの範囲の濃度で使用する。本発明の範囲内において、表現「1ng/mlから20ng/ml」は、2ng/ml、2.5ng/ml、3ng/ml、3.5ng/ml、4ng/ml、4.5ng/ml、5ng/ml、5.5ng/ml、6ng/ml、6.5ng/ml、7ng/ml、7.5ng/ml、8ng/ml、8.5ng/ml、9ng/ml、9.5ng/ml、10ng/ml、11ng/ml、12ng/ml、13ng/ml、14ng/ml、15ng/ml、16ng/ml、17ng/ml、18ng/ml、19ng/mlを含むが、これらに限定しない。特定の実施形態において、TGFβは2.5ng/mlから7.5ng/mlの範囲の濃度である。
一実施形態において、培養物中に加えられたmTOR阻害剤によって、mTOR経路の阻害が可能になる。mTOR阻害剤の例は、ラパマイシン(シロリムスとも呼ばれる)及びその類似体(ラパログとも呼ばれる);ウォルトマンニン;テオフィリン;カフェイン;エピガロカテキンガレート(EGCG);クルクミン;レスベラトロール;ゲニステイン;3,3−ジインドリルメタン(DIM);LY294002(2−(4−モルホリニル)−8−フェニル−4H−1−ベンゾピラン−4−オン);PP242;PP30;Torin1;Ku−0063794;WAY−600;WYE−687;WYE−354;ならびにmTOR及びPI3K二重特異性阻害剤(例えばGNE477、NVP−BEZ235、PI−103、XL765、及びWJD008など)を含むが、これらに限定しない。ラパマイシンの例は、参照R0395のラパマイシン(Sigma-Aldrich)、参照S1039のラパマイシン(Selleckchem)、参照1292のラパマイシン(Tocris)、参照R− 5000のラパマイシン(LC Laboratories)、参照Tlrl−rapのラパマイシン(InvivoGen)、参照ab120224のラパマイシン(Abcam)、参照R0395のラパマイシン(Sigma−Aldrich)を含むが、これらに限定しない。
臨床的に使用されるラパマイシンと同じ化学クラスの化合物の例は、エベロリムス(コード名RAD001)、テムシロリムス(コード名CCI−779、NSC 683864)、ゾタロリムス(コード名ABT−578)を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、mTOR阻害剤、好ましくは、ラパマイシンを0.1nMから50nMの範囲の濃度で使用する。本発明の範囲内において、表現「0.1nMから50nM」は、0.2nM、0.3nM、0.4nM、0.5nM、0.6nM、0.7nM、0.8nM、0.9nM、1nM、2nM、3nM、4nM、5nM、6nM、7nM、8nM、9nM、10nM、11nM、12nM、13nM、14nM、15nM、16nM、17nM、18nM、19nM、20nM、21nM、22nM、23nM、24nM、25nM、26nM、27nM、28nM、29nM、30nM、31nM、32nM、33nM、34nM、35nM、36nM、37nM、38nM、39nM、40nM、41nM、42nM、43nM、44nM、45nM、46nM、47nM、48nM、49nMを含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、IL−2、IL−7、IL−15、及びTSLPより選択される少なくとも1つのサイトカインを培養物中に加えることができる。
一実施形態において、IL−2を10IU/mlから1000IU/mlの範囲の濃度で使用する。本発明の範囲内において、表現「10IU/mlから1000IU/ml」は、15IU/ml、20IU/ml、25IU/ml、30IU/ml、35IU/ml、40IU/ml、45IU/ml、50IU/ml、55IU/ml、60IU/ml、65IU/ml、70IU/ml、75IU/ml、80IU/ml、85IU/ml、90IU/ml、95IU/ml、100IU/ml、150IU/ml、200IU/ml、250IU/ml、300IU/ml、350IU/ml、400IU/ml、450IU/ml、500IU/ml、550IU/ml、600IU/ml、650IU/ml、700IU/ml、750IU/ml、800IU/ml、850IU/ml、900IU/ml、950IU/mlを含むが、これらに限定しない。特定の実施形態において、IL−2を50IU/mlから250IU/mlの範囲の濃度で使用する。
一実施形態において、IL−7を1ng/mlから100ng/mlの範囲の濃度で使用する。本発明の範囲内において、表現「1ng/mlから100ng/ml」は、1ng/ml、5ng/ml、10ng/ml、15ng/ml、20ng/ml、25ng/ml、30ng/ml、35ng/ml、40ng/ml、45ng/ml、50ng/ml、55ng/ml、60ng/ml、65ng/ml、70ng/ml、75ng/ml、80ng/ml、85ng/ml、90ng/ml、95ng/ml、100ng/mlを含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、IL−15を1ng/mlから50ng/mlの範囲の濃度で使用する。本発明の範囲内において、表現「1ng/mlから50ng/ml」は、2ng/ml、3ng/ml、4ng/ml、5ng/ml、6ng/ml、7ng/ml、8ng/ml、9ng/ml、10ng/ml、15ng/ml、20ng/ml、25ng/ml、30ng/ml、35ng/ml、40ng/ml、45ng/mlを含むが、これらに限定しない。特定の実施形態において、IL−15を10ng/mlから30ng/mlの範囲の濃度で使用する。
一実施形態において、TSLPを1ng/mlから100ng/mlの範囲の濃度で使用する。本発明の範囲内において、表現「1ng/mlから100ng/ml」は、1ng/ml、5ng/ml、10ng/ml、15ng/ml、20ng/ml、25ng/ml、30ng/ml、35ng/ml、40ng/ml、45ng/ml、50ng/ml、55ng/ml、60ng/ml、65ng/ml、70ng/ml、75ng/ml、80ng/ml、85ng/ml、90ng/ml、95ng/ml、100ng/mlを含むが、これらに限定しない。
TET活性化剤の例は、ビタミンC及びNaHS硫化水素放出剤(H2S供与体としても公知である)を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、ビタミンCを1から100μg/mlの範囲の濃度で使用する。
一実施形態において、NaHS硫化水素放出剤を0.25から8mMの範囲の濃度で使用する。
DNMT阻害剤の例は、2−(1,3−ジオキソ−1,2−ジヒドロ−2H−イソインドール−2−イル)−3−(1H−インドール−3−イル)プロパン酸(RG108)、5−アザ−2’−デオキシシチジン(デシタビン又はDAC)、及び5−アザシチジン(5AC)を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、RG108を20から500μMの範囲の濃度で使用する。
一実施形態において、DACを0.1から2μMの範囲の濃度で使用する。
一実施形態において、5ACを0.1から10μMの範囲の濃度で使用する。
一実施形態において、中和抗体を培養物に加え、調節性T細胞の他の集団の生成を防止することができる。
中和抗体の例は、抗IFNγ抗体、抗IL−4抗体、及び/又は抗IL12抗体を含むが、これらに限定しない。
抗IFNγ抗体の例は、Affymetrix eBioscience(参照14−7318)、R&D systems(参照MAB285)、Novus Biologicals(参照AF−485−NA)を含むが、これらに限定しない。
抗IL−4抗体の例は、R&D Systems(参照MAB304、MAB204、又はMAB204)、Affymetrix eBioscience(参照14−7048)、GeneTex(参照GTX10755)を含むが、これらに限定しない。
抗IL−12抗体の例は、Affymetrix eBioscience(参照16−7129又は16−8126)、Biolegend(参照508803)、R&D Systems(参照MAB219、AF−219、又はAB−219)を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、本発明の培養物中に使用される培養培地は、(i)1つ以上のpH緩衝系;(ii)無機塩;(iii)微量元素;(iv)遊離アミノ酸;(v)ビタミン;(vi)ホルモン;(vii)炭素/エネルギー源を含む。
無機塩の例は、臭化カルシウム、塩化カルシウム、リン酸カルシウム、硝酸カルシウム、亜硝酸カルシウム、硫酸カルシウム、臭化マグネシウム、塩化マグネシウム、硫酸マグネシウム、重炭酸カリウム、臭化カリウム、塩化カリウム、二水素化リン酸カリウム、二硫酸カリウム、リン酸水素二カリウム、硝酸カリウム、亜硝酸カリウム、亜硫酸カリウム、硫酸カリウム、炭酸水素ナトリウム、臭化ナトリウム、塩化ナトリウム、二硫酸ナトリウム、炭酸水素ナトリウム、リン酸二水素ナトリウム、リン酸水素二ナトリウム、硫酸ナトリウム及びそれらの混合物を含むが、これらに限定しない。
微量元素の例は、コバルト(Co)、銅(Cu)、鉄(Fe)、マグネシウム(Mg)、マンガン(Mn)、モリブデン(Mo)、ニッケル(Ni)、セレン(Se)、亜鉛(Zn)及びそれらの塩を含むが、これらに限定しない。
遊離アミノ酸の例は、L−アラニン、L−アルギニン、L−アスパラギン、L−アスパラギン酸、L−システイン、L−シスチン、L−グルタミン、L−グルタミン酸、グリシン、L− ヒスチジン、L−イソロイシン、L−ロイシン、L−リジン、L−メチオニン、L−フェニルアラニン、L−プロリン、L−セリン、タウリン、L−スレオニン、L−トリプトファン、L−チロシン、L−バリン及びそれらの混合物を含むが、これらに限定しない。
ビタミンの例は、ビオチン(ビタミンH);D−パントテン酸カルシウム;塩化コリン;葉酸(ビタミンB9);ミオイノシトール;ニコチンアミド;ピリドキサール(ビタミンB6);リボフラビン(ビタミンB2);チアミン(ビタミンB1);コバラミン(ビタミンB12);アスコルビン酸;α−トコフェロール(ビタミンE)及びそれらの混合物を含むが、これらに限定しない。
炭素/エネルギー源の例は、D−グルコース;ピルビン酸;乳酸;ATP;クレアチン;クレアチンホスファート及びそれらの混合物を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、培養培地は市販の細胞培養培地であり、特にGIBCO(登録商標)からのIMDM(Iscove’s Modified Dulbecco’s Medium)又はGIBCO(登録商標)からのRPMI1640培地を含む群において選択される。
他の実施形態において、培養培地は、無血清培養培地、例えばGIBCO(登録商標)からのAIM−V培地、LONZAからのX−VIVO 10、15、及び20培地などである。
別の実施形態において、培養培地に、特にウシ胎児血清、プールされたヒトAB血清、サイトカイン、及び成長因子を含む群において選択される追加の化合物;特にペニシリン、ストレプトマイシン、及びそれらの混合物を含む群において選択される抗生物質をさらに添加することができる。
一実施形態において、培養培地はIMDMである。
一部の特定の実施形態において、培養培地はIMDM細胞培養培地;1%(w/w)から5%(w/w)のウシ胎児血清;10IU/mlから200IU/mlのペニシリン;10IU/mlから200IU/mlのストレプトマイシン;非必須アミノ酸、特にアラニン、アスパラギン、アスパラギン酸、システイン、グルタミン酸、グルタミン、グリシン、プロリン、セリン、及びチロシンを含む群において選択されるアミノ酸の0.1mMから10mMの混合物;0.5mMから10mMのグルタミン、10mMから25mMのHEPES(pH7.6〜7.8)を含む。
一実施形態において、培地はnTreg極性化培地である。本発明者らは、「nTreg極性化培地」を、本明細書の上に記載する少なくとも1つのcAMP活性化剤、本明細書の上に記載する少なくとも1つのTGFβ経路活性化剤、及び本明細書の上に記載する少なくとも1つのmTor阻害剤を含むRPMI培地などの培地として定義する。好ましい実施形態において、「nTreg極性化培地」は、TGFβ、ラパマイシン、及びPGE2を含むRPMI培地を指す。
他の実施形態において、培地は炎症性培地である。本発明者らは、「炎症性培地」を、炎症性サイトカイン、例えばIL−1β(10ng/ml)、IL−6(30ng/ml)、IL−21(50ng/ml)、IL−23(30ng/ml)、IL−2(100UI/ml)などを含む培地(例えばIMDMなど)として定義する。
一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞を生成するための培養は、少なくとも5日、少なくとも6日、少なくとも7日、少なくとも8日の間実施する。本発明の範囲内において、表現「少なくとも5日」は、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、培養培地の一部を生成培地の時間経過の間に1回、2回、3回、4回、又は5回捨て、同容量の新鮮培養培地と交換する。本発明の範囲内において、用語「一部」は、培養培地の容量の少なくとも20%(v/v)、少なくとも25%(v/v)、少なくとも30%(v/v)、少なくとも35%(v/v)、少なくとも40%(v/v)、少なくとも45%(v/v)、少なくとも50%(v/v)、少なくとも55%(v/v)、少なくとも60%(v/v) 少なくとも65%(v/v)、少なくとも70%(v/v)、少なくとも75%(v/v)を意味することを意図する。特定の実施形態において、工程a)の培養培地の容量の40%(v/v)から60%(v/v)を捨てる。特定の実施形態において、捨てる容量を、同容量の新鮮培養培地と交換する。本発明の範囲内において、表現「新鮮培養培地」は、任意のCD3T細胞と接触していない培養培地を指す。
一実施形態において、エクスビボでγδFoxp3調節性T細胞を生成するための方法は以下を含む:
−CD3TCRγδT細胞、好ましくはCD3TCRγδCD45RAT細胞を、自己ΔCD3フィーダー細胞及びコーティングされた抗TCRγδ抗体の存在において、ならびに以下の薬剤:i)PGE2、ii)TGFβ、iii)ラパマイシン、場合によりiv)IL−2及びIL−15の群において選択される少なくとも1つのサイトカイン、ならびに場合によりv)ビタミンCの存在において、少なくとも5日間培養すること、
−それにより、好ましくはγδナイーブ(CD45RA)T細胞から、エクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞の集団を得る。
一実施形態において、エクスビボでγδFoxp3調節性T細胞を生成するための方法は以下を含む:
−約24時間ゾレドロネートを用いてパルスされた寛容原性DCの存在において及びΔCD3フィーダー細胞の存在において及び以下の薬剤:i)PGE2、ii)TGFβ、iii)ラパマイシン、場合によりiv)IL−2及びIL−15の群において選択される少なくとも1つのサイトカイン、及び場合によりv)ビタミンCの存在においてCD3TCRγδT細胞、好ましくはCD3TCRγδCD45RAT細胞を、少なくとも5日間培養すること、
−それにより、好ましくはγδナイーブ(CD45RA)T細胞から、エクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞の集団を得ること。
本発明はまた、γδFoxp3調節性T細胞の生成及び増殖のエクスビボでの方法に関し、以下を含む:
−本明細書において上に記載するようにγδFoxp3調節性T細胞を生成すること、
−それらを、γδT細胞活性化剤(好ましくは自己△CD3フィーダー細胞及びコーティングされた抗TCRγδ抗体又は約24時間ゾレドロネートを用いてパルスされた寛容原性DCのいずれか、及び△CD3フィーダー細胞の存在において)及び以下の薬剤:i)cAMP(環状アデノシン一リン酸)活性化剤(好ましくはPGE2)、ii)TGFβ(形質転換成長因子ベータ)経路活性化剤(好ましくはTGFβ)、iii)mTOR阻害剤(好ましくはラパマイシン)、場合によりiv)IL−2、IL−7、IL−15、及びTSLP(好ましくはIL−2及び/又はIL−15)の群において選択される少なくとも1つのサイトカイン、ならびに場合によりv)少なくとも1つのTET酵素活性化剤(好ましくはビタミンC及びNaHS硫化水素放出剤より選択される)及び/又は少なくとも1つのDNMT阻害剤(例えばRG108、DAC、又は5ACなど)の存在において接触させることにより生成されたγδFoxp3調節性T細胞を、少なくとも5日間増殖させること。
−それにより、γδFoxp3調節性T細胞の増殖集団を得ること。
一実施形態において、エクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞集団を、以下の表現型:CD3TCRγδCD45ROFoxp3に基づくフローサイトメトリーにより単離する。
一実施形態において、このようにして得られた単離γδFoxp3調節性T細胞集団を、ポリクローナルγδT細胞活性化剤の存在においてこれらの細胞を培養することによりエクスビボで増殖させる。ポリクローナルγδT細胞活性化剤の例は本明細書において上に列挙する。あるいは、増殖の間に使用されうるポリクローナルT細胞活性化剤の他の例は、マイトジェン(例えばPMA/イオノマイシンなど)、スーパー抗原、抗CD3抗体・・・を含むが、これらに限定しない。好ましくは、抗CD3モノクローナル抗体をコーティングする。一実施形態において、ポリクローナルγδT細胞活性化剤を、本明細書において上に記載するようにフィーダー細胞の存在において使用することができる。
別の実施形態において、このようにして得られた単離γδFoxp3調節性T細胞集団を次に、本明細書において上に記載するように抗原特異的γδT細胞活性化剤の存在においてこれらの細胞を培養することによりエクスビボで増殖させる。一実施形態において、抗原特異的γδT細胞活性化剤を、本明細書において上に記載するようにフィーダー細胞の存在において使用することができる。
一実施形態において、本発明のエクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞を増殖させるための培養は、少なくとも5日、少なくとも6日、少なくとも7日、少なくとも8日の間実施する。本発明の範囲内において、表現「少なくとも5日」は、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日、20日、21日、22日、23日、24日、25日、26日、27日、28日、29日、30日又はそれ以上を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、培養培地の一部を生成培地の時間経過の間に1回、2回、3回、4回、又は5回捨て、同容量の新鮮培養培地と交換する。本発明の範囲内において、用語「一部」は、培養培地の容量の少なくとも20%(v/v)、少なくとも25%(v/v)、少なくとも30%(v/v)、少なくとも35%(v/v)、少なくとも40%(v/v)、少なくとも45%(v/v)、少なくとも50%(v/v)、少なくとも55%(v/v)、少なくとも60%(v/v) 少なくとも65%(v/v)、少なくとも70%(v/v)、少なくとも75%(v/v)を意味することを意図する。特定の実施形態において、工程a)の培養培地の容量の40%(v/v)から60%(v/v)を捨てる。特定の実施形態において、捨てる容量を、同容量の新鮮培養培地と交換する。本発明の範囲内において、表現「新鮮培養培地」は、任意のCD3T細胞と接触していない培養培地を指す。
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、IMDM−5中のPGE2(1μM)、TGFβ(5ng/ml)、ラパマイシン(10nM)、及びIL−2(100UI/ml)の存在における自己ΔCD3フィーダー細胞(125 10細胞/ml)及びコーティングされた抗TCRγδ抗体(2μg/ml)の存在において、PBMCからフローサイトメトリーにより得られたCD3TCRγδCD45RAT細胞(5. 10細胞/ml)を培養することによりエクスビボで生成する。1日目に、IL−2(100UI/ml)及びIL−15(10ng/ml)を培養物に加える。3日毎に、培地容量の半分を捨て、PGE2(50nM)、TGFβ(5ng/ml)、ラパマイシン(1nM)、IL−2(100μl/ml)、及びIL−15(10ng/ml)を含む新鮮培地により交換する。細胞が増殖し始めたら、2〜3日毎に細胞を分割し、PGE2(1μM)、TGFβ(5ng/ml)、ラパマイシン(10nM)、及びIL−2(100UI/ml)を含む培地中で9日毎にΔCD3フィーダー細胞及びコーティングされた抗TCRγδ抗体の存在において培養することができる。
別の実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、約24時間ゾレドロネートを用いてパルスされた寛容原性DCの存在において、ならびにIMDM−5中のΔCD3フィーダー細胞(125 10細胞/ml)、PGE2(1μM)、TGFβ(5ng/ml)、ラパマイシン(10nM)、及びIL−2(100UI/ml)の存在において、フローサイトメトリーによりPBMCから得られた(5. 10細胞/ml)CD3TCRγδCD45RAT細胞(5. 10細胞/ml)を培養することによりエクスビボで生成する。1日目に、IL−2(100UI/ml)、IL−15(10ng/ml)、及びTGFβ(5ng/ml)を培養物に加える。3日毎に、培地容量の半分を捨て、PGE2(50nM)、TGFβ(5ng/ml)、ラパマイシン(1nM)、IL−2(100UI/ml)、及びIL−15(10ng/ml)を含む新鮮培地により交換する。細胞が増殖し始めたら、それらを2又は3日毎に分割し、ΔCD3フィーダー細胞及びPGE2(1μM)、TGFβ(5ng/ml)、ラパマイシン(10nM)、及びIL−2(100UI/ml)の存在において、寛容原性DCを用いて9日毎に再刺激することができる。
この実施形態において、寛容原性DCは、GMCSF(100ng/ml)及びIL−4(10ng/ml)を添加したAIMVの存在においてPBMCから単離されたCD14単球を培養することにより得た。3日目及び6日目に、培地を捨て、GM−CSF及びIL−4を含む新鮮培地により交換する。6日目に、寛容原性DCをゾレドロネート(100nM)の存在において24時間にわたりパルスする。
本発明はまた、本明細書において上に記載するエクスビボでの生成方法により入手可能なγδFoxp3調節性T細胞に関する。
本発明はまた、本明細書において上に記載するエクスビボでの生成及び増殖方法により入手可能なγδFoxp3調節性T細胞に関する。
一実施形態において、本発明の生成及び増殖方法により得られたγδFoxp3調節性T細胞の集団は、少なくとも10、10、10、10、1010個の細胞を含む。
一実施形態において、本発明の生成及び増殖方法により得られたγδFoxp3調節性T細胞の集団は以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有する。
一実施形態において、本発明の方法により取得可能な又は得られたγδFoxp3調節性T細胞は、Vδ2アイソタイプを発現する。一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞は、Vδ2アイソタイプを発現しない。
別の実施形態において、本発明の方法により取得可能な又は得られたγδFoxp3調節性T細胞はVγ9アイソタイプを発現する。一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞は、Vγ9アイソタイプを発現しない。
一実施形態において、本発明の方法により取得可能な又は得られたγδFoxp3調節性T細胞は、Vγ9Vδ2アイソタイプを発現する。一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞は、Vγ9Vδ2アイソタイプを発現しない。
一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞はVδ3アイソタイプを発現する。一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞はVδ4アイソタイプを発現する。一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞はVδ5アイソタイプを発現する。一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞はVδ6アイソタイプを発現する。
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδ
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−1R1
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−6R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD45ROCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−1R1
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−6R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CD45ROCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−1R1CTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−6RCTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−23RCTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−33RCTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−1R1CD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−6RCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−23RCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−33RCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−1R1CD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−6RCD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−23RCD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−33RCD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−1R1IL−6R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−1R1IL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−1R1IL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−6RIL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−6RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδIL−23RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−1R1CTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−6RCTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−23RCTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−33RCTLA4
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−1R1CD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−6RCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−23RCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−33RCD127
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−1R1CD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−6RCD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−23RCD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−33RCD45RO
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−1R1IL−6R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−1R1IL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−1R1IL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−6RIL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−6RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25IL−23RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−1R1
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−6R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−6R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−6RIL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−6RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−23RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−6RIL−23RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−23RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−6RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−6RIL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−6RIL−23RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−1R1
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−6R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−6R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−6RIL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は次の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−6RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD125ROCD127IL−23RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD125ROCD127IL−6RIL−23RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD125ROCD127IL−1R1IL−23RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−6RIL−33R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD45ROCD127IL−1R1IL−6RIL−23R
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、以下の表現型を有する:CD4Foxp3TCRγδCD25CTLA4CD125RCD127IL−1R1IL−6RIL−23RIL−33R
一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞は、遺伝子Foxp3の調節性T細胞特異的な脱メチル化領域(TSDR)を提示しない。別の実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞は、遺伝子Foxp3の調節性T細胞特異的な脱メチル化領域(TSDR)を提示する。一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、少なくとも30%、40%、50%を超える、遺伝子FOXP3のTSDRの脱メチル化のパーセンテージを提示する。プロモーター脱メチル化パーセンテージを測定するためのプロトコールを、実施例の材料及び方法のパートに示す。
別の実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、少なくとも10%、20%、30%、40%、又は50%を超える、Foxp3プロモーター領域におけるアセチル化ヒストンの濃縮パーセンテージを提示する。アセチル化ヒストンの濃縮をパーセンテージで測定するためのプロトコールを、実施例の材料及び方法のパートに示す。
本発明のγδFoxp3調節性T細胞の集団の表現型の特徴の例を図1に示す。
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞の前記集団は、ナイーブ調節性T細胞において測定されたFoxp3 MFIと少なくとも等価の蛍光強度の中央値(MFI)でFoxp3を発現する。本明細書において使用するように、「ナイーブ調節性T細胞」は、表現型Foxp3CD45RACD4CD25CD127を有するT細胞を指す。
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、少なくとも2000の蛍光強度の中央値(MFI)でFoxp3を発現する。
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、ナイーブ調節性T細胞において測定されるFoxp3 MFIの少なくとも2又は3倍の蛍光強度の中央値(MFI)でFoxp3を発現する。
一実施形態において、γδ調節性T細胞は、少なくとも2000、3000、4000、5000、10000、20000、30000、40000、50000、60000、70000の蛍光強度の中央値(MFI)でFoxp3を発現する。
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞集団は、少なくとも65%のFoxp3を発現するCD3CD4細胞を含む。表現「少なくとも65%」は、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、752%、76%、77%、78%、79%、80%、81% 、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、82%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、及び100%を含むが、これらに限定しない。
本明細書において使用するように、用語「発現」は、あるいは、分子の転写(即ち、mRNAの発現)又は分子の翻訳(即ち、タンパク質の発現)を指しうる。一実施形態において、発現を検出することは、細胞内検出に対応しうる。別の実施形態において、発現を検出することは、表面検出、即ち、細胞表面で発現される分子の検出に対応しうる。別の実施形態において、発現を検出することは、細胞外検出、即ち、分泌の検出に対応しうる。別の実施形態において、発現を検出することは、細胞内検出、表面検出、及び/又は細胞外検出に対応しうる。発現レベルを決定するための方法は当業者に周知であり、細胞のトランスクリプトーム(発現が分子の転写に関連する実施形態において)又はプロテオーム(発現が細胞傷害性分子の翻訳に関連する実施形態において)の決定を含むが、これらに限定しない。
本発明の一実施形態において、分子の発現をmRNAレベルで評価する。分子の転写レベルを評価するための方法は先行技術において周知である。そのような方法の例は、RT−PCR、RT−qPCR、ノーザンブロット、ハイブリダイゼーション技術(例えばマイクロアレイの使用など)、及びそれらの組み合わせ(RT−PCRにより得られたアンプリコンのハイブリダイゼーション、シークエンシング、例えば次世代DNAシークエンシング(NGS)又はRNA−seq(「全トランスクリプトームショットガンシークエンシング」としても公知)などを含むが、これらに限定しない)を含むが、これらに限定しない。本発明の別の実施形態において、分子の発現をタンパク質レベルで評価する。サンプル中のタンパク質レベルを決定するための方法は当技術分野において周知である。そのような方法の例は、免疫組織化学、マルチプレックス方法(Luminex)、ウエスタンブロット、酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)、サンドイッチELISA、蛍光結合免疫吸着検定法(FLISA)、酵素免疫検定法(EIA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)、フローサイトメトリー(FACS)などを含む。
別の実施形態において、少なくとも1つの分子の発現レベルを決定することは、分子へのリガンドの結合を検出及び/又は定量化することに対応する。一実施形態において、前記リガンドは前記分子に特異的な抗体であり、本発明の方法は前記抗体と前記分子の間に形成された複合体を検出及び/又は定量化することを含む。リガンドが、例えば、検出可能な分子、例えば抗体定常フラグメント(Fc)又は蛍光化合物(例、シアニン色素、Alexa色素、Quantum色素など)などと共有結合されている場合、複合体を検出することができる。リガンドが当業者に周知の異なる手段でタグ付けされている場合も複合体を検出することができる。例えば、本発明と使用されるタグは、ヘマグルチニンタグ、ポリアルギニンタグ、ポリヒスチジンタグ、Mycタグ、Strepタグ、Sタグ、HATタグ、3×フラグタグ、カルモジュリン結合ペプチドタグ、SBPタグ、キチン結合ドメインタグ、GSTタグ、マルトース結合タンパク質タグ、蛍光タンパク質タグ、T7タグ、V5タグ、及びXpressタグを含むか又はそれらからなる群より選択されるタグでありうる。リガンドの使用によって、従って、一方では使用されるリガンドに依存して分子の同定及び検出が、他方では形成された複合体の定量化が可能になる。
一実施形態において、分子の発現レベルを決定することは、フローサイトメトリー、免疫蛍光法、又は画像分析、例えばハイコンテント分析により行う。好ましくは、分子の発現レベルの決定はフローサイトメトリーにより行う。一実施形態において、フローサイトメトリー分析を行う前に、細胞を固定して透過処理し、それにより細胞内タンパク質の検出を可能にする。
一実施形態において、細胞集団中の分子の発現レベルを決定することは、その分子を発現する細胞集団での細胞のパーセンテージ(即ち、その分子についての細胞「+」)を決定することを含む。好ましくは、その分子を発現する細胞の前記パーセンテージをFACSにより測定する。
用語「発現している(又は+)」及び「発現していない(又は−)」は当技術分野において周知であり、目的の細胞マーカーの発現レベルを指し、それにおいて、「+」に対応する細胞マーカーの発現レベルは高又は中程度であり、「+/−」としても言及する。「−」に対応する細胞マーカーは、細胞マーカーのヌル発現レベルである、又は前記細胞マーカーを発現する細胞集団の10%未満も指す。
目的の細胞マーカーの発現レベルは、このマーカーについて特異的な蛍光標識抗体を用いて染色された細胞集団からの細胞の蛍光強度中央値(MFI)を、無関係な特異性を伴うが、同じアイソタイプ、同じ蛍光プローブを伴い、同じ種に由来する(アイソタイプ対照として言及する)蛍光標識抗体を用いて染色された同じ細胞集団からの細胞の蛍光強度(FI)と比較することにより決定する。このマーカーについて特異的な蛍光標識抗体を用いて染色され、アイソタイプ対照を用いて染色された細胞と等価のMFI又はより低いMFIを示す集団からの細胞は、このマーカーを発現しておらず、従って(−)又は陰性と指定する。このマーカーについて特異的であり、アイソタイプ対照を用いて染色された細胞を超えるMFI値を示す集団からの細胞は、このマーカーを発現しており、従って(+)又は陽性と指定する。
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、ナイーブCD4CD25CD45RACD127調節性T細胞の抑制活性と同様の抑制活性が可能である。細胞集団の抑制活性の決定は当技術分野において周知であり、従来のアッセイ、例えば標準的なポリクローナル細胞−細胞接触Treg抑制アッセイ又は実施例に記載するような自己MLR抑制アッセイなどにより実施することができる。
本発明の別の目的は、炎症状態に置かれた場合に機能的に安定なままであるγδFoxp3調節性T細胞の集団である。
一実施形態において、本発明のエクスビボでの生成及び増殖方法により取得可能な又は得られたγδFoxp3調節性T細胞の集団は、炎症状態に置かれた場合に機能的に安定なままであるという特性を有する。
本明細書において使用するように、「機能的に安定」は、IL−17の無分泌又は低分泌、即ち、200ng/ml、100ng/ml、50ng/mlより劣り、依然として抑制能力、即ち、実施例において示すように従来型T細胞の増殖を阻害することが可能であることを指す。
本明細書において使用するように、「炎症状態」は、炎症性サイトカイン、例えばIL−1β(10ng/ml)、IL−6(30ng/ml)、IL−21(50ng/ml)、IL−23(30ng/ml)、IL−2(100UI/ml)などを含む、芳香族酸、好ましくはトリプトファン、例えばIMDMなどに富む培地を指す。調節性T細胞の集団が炎症状態において機能的に安定なままであるか否かを決定するための方法は、好ましくはコーティングされた抗CD3(4μg/ml)、好ましくは可溶型の抗CD28(4μg/ml)の存在において、本明細書において上に記載するように調節性T細胞を炎症状態培地中で培養することを含む。36〜72時間の培養後、培養上清中のIL−17の存在を測定する。培養上清中でのIL−17の認識は、当技術分野において公知の従来の方法、例えばサンドイッチELISA抗IL−17などにより行うことができる。簡単には、プレートを捕捉抗IL−17抗体でコーティングした後、培養上清を、希釈系列を伴う各々のウェルに加える。インキュベーション後、検出抗IL−17抗体を各々のウェルに加える。ELISAは、当技術分野において公知の任意の比色的手段、例えば、ビオチンを用いて標識された検出抗体、ポリストレプトアビジンHRP増幅システム、及びo−フェニレンジアミン二塩酸塩基質溶液を使用するなどにより開発する。200ng/ml、100ng/ml、50ng/mlより劣るIL−17レベルは、IL−17の無分泌又は低分泌に対応する。
理論に拘束されることを望まないが、本発明者らは、悪性腫瘍細胞の間質が、調節性T細胞が高度に豊富であり、特にNK細胞に対して免疫抑制活性(局所癌の免疫逃避を説明する可能性が高い)を発揮するTIL(腫瘍浸潤リンパ球)を含むと述べている。不活化γδFoxp3調節性T細胞は、TIL中に存在するγδFoxp3調節性T細胞に対して免疫応答を誘導する抗原性標的を表し、それにより、それらの免疫抑制活性を防止し、腫瘍細胞に対するエフェクター細胞(例えばNK細胞など)の細胞傷害活性を可能にする。本発明者らは、このように、不活化γδFoxp3調節性T細胞を含むワクチン組成物を有効成分として使用することを示唆する。
本発明の1つの目的は、本明細書において上に記載するように、不活化γδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれからなる免疫原性産物である。
一実施形態において、免疫原性産物は、本明細書において上に記載するように、以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有する不活化γδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれからなる。
本明細書において使用するように、用語「から本質的になる」は、免疫原性産物、医薬組成物、ワクチン、又は医薬に関して、本発明の少なくとも1つのγδFoxp3調節性T細胞集団又は抗体が、前記免疫原性産物、医薬組成物、ワクチン、もしくは医薬内に生物学的活性を伴う唯一の治療薬剤又は薬剤であることを意味する。
一実施形態において、免疫原性産物は、本明細書において上に記載するように生成され、場合によりエクスビボで増殖される、以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有する不活化γδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれからなる。
本発明の1つの目的は、本明細書において上に記載するようにγδFoxp3調節性T細胞からのブレブを含む免疫原性産物である。
本発明の1つの目的は、本明細書において上に記載するようにγδFoxp3調節性T細胞からのブレブを負荷した免疫原性樹状細胞(免疫原性DC)を含む免疫原性産物である。
本明細書において使用するように、「免疫原性DC」は、免疫原性応答を誘導することが可能なDCを指す。一実施態様において、免疫原性DCは以下の表現型:CD80highCD83highCD86highHLAクラスIhigh及びHLAクラスIIhighを有し、IL−12/IL−10>1の比率でIL−10及びIL−12を分泌する。
免疫原性DCを得るための方法は当技術分野において周知である。例示的な方法はCD14単球からの免疫原性DCの生成である。例えば、CD14単球は、MoDCを得るためにGM−CSF(約20ng/mL)及びIFNα(約10ng/mL)の存在において培養する。MoDCの成熟は、IL−1β(約10ng/ml)、IL−6(約10ng/ml)TNFα(約200U/ml)、及びPGE2(約10ng/ml)からなるサイトカインカクテルにより誘導されうる。
本発明の別の目的は、本明細書において上に記載するように免疫原性産物及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む、それから本質的になる、又はそれからなる医薬組成物である。
本発明の別の目的は、以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有する不活化γδFoxp3調節性T細胞及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む、それから本質的になる、又はそれからなる医薬組成物である。
本発明の別の目的は、本明細書において上に記載する方法によりエクスビボで生成及び増殖させた、以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有する不活化γδFoxp3調節性T細胞及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む、それから本質的になる、又はそれからなる医薬組成物である。
本発明の別の目的は、本明細書において上に記載するように以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブ及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む、それから本質的になる、又はそれからなる医薬組成物である。
本発明の別の目的は、本明細書において上に記載するように以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブを負荷した免疫原性DC及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む、それから本質的になる、又はそれからなる医薬組成物である。
本明細書において使用するように、用語「賦形剤」は、任意の及び全ての溶媒、分散媒質、充填剤、固体担体、水溶液、コーティング、抗菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延剤などを指す。ヒトへの投与のためには、調製物は、規制当局(例えばFDA Office又はEMAなど)により要求されるように、無菌性、発熱性、一般的な安全性、及び純度基準を満たすべきである。
「医薬的に許容可能な」により、医薬組成物の成分が互いに親和性があり、それが投与される被験体に有害ではないことを意味する。医薬的に許容可能な賦形剤の例は、水、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、デキストロース、グリセロール、エタノールなど、又はそれらの組み合わせを含むが、これらに限定しない。
本発明の別の目的は、本明細書において上に記載する免疫原性産物を含む、それから本質的になる、又はそれからなるワクチン組成物である。
本発明の別の目的は、以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有する不活化γδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれからなるワクチン組成物である。
本発明の別の目的は、本明細書において上に記載する方法によりエクスビボで生成及び増殖された、以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有する不活化γδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれからなるワクチン組成物である。
本発明の別の目的は、本明細書において上に記載するように以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブを含む、それから本質的になる、又はそれからなるワクチン組成物である。
本発明の別の目的は、本明細書において上に記載するように以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブを負荷した免疫原性DCを含む、それから本質的になる、又はそれからなるワクチン組成物である。
本明細書において使用するように、「不活化」T細胞は、生存可能であるがエフェクター機能が低下しているか又は全くない、即ち、病原性の潜在力を喪失したT細胞を指す。不活化T細胞の細胞表面マーカーの例は、7−アミノアクチノマイシンD(7−AAD)、カルレティキュリン及び熱ショックタンパク質90(HSP−90)を含むが、これらに限定しない。従って、不活化T細胞は7−AAD及び/又はカルレティキュリン及び/又はHSP−90を発現する。本発明の不活化γδFoxp3調節性T細胞はそれらの抑制活性を喪失しているが、依然として免疫原性である。T細胞エフェクター機能アッセイの例は、T細胞増殖アッセイであるが、これに限定しない。T細胞増殖は、固定T細胞対非固定T細胞で評価してもよい。簡単には、T細胞増殖アッセイは、フローサイトメトリーにより、固定T細胞対非固定T細胞中の生存増殖細胞のパーセンテージを決定することを目的とする。T細胞をCFSE、抗CD3抗体、及び7−AADで染色した後、生増殖細胞を、ゲートCD37−AAD−細胞中のCFSE低画分として定義する。
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、当技術分野において周知の任意の方法により不活化する。細胞を不活化するための方法の例は、好ましくは約2500〜3000ラドでの照射及び/又は化学的不活化、例えばシスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、マイトマイシンC、又はアントラサイクリンへの曝露などを含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、本発明のワクチン組成物は、少なくとも1つのアジュバントをさらに含む。ワクチン組成物中に使用することができるアジュバントの例は、ISA51;乳剤、例えばCFA、MF59、モンタニド、AS03、及びAF03など;無機塩、例えばミョウバン、リン酸カルシウム、鉄塩、ジルコニウム塩、及びAS04など;TLRリガンド、例えばTLR2リガンド(例えば外表面タンパク質A又はOspAなど)、TLR3リガンド(例えばポリI:Cなど)、TLR4リガンド(例えばMPL及びGLAなど)、TLR5リガンド、TLR7/8リガンド(例えばイミキモドなど)、TLR9リガンド(例えばCpG ODNなど);多糖類、例えばキチン、キトサン、α−グルカン、β−グルカン、フルクタン、マンナン、デキストラン、レンチナン、イヌリンベースのアジュバント(例えばガンマイヌリンなど)など;TLR9及びSTINGリガンド、例えばK3 CpG及びcGAMPなどを含むが、これらに限定しない。本明細書において使用するように、「アジュバント」は、抗原への免疫応答を増強する、及び/又はそれを所望の免疫応答に向かって調節する薬剤を指す。
一実施形態において、不活化γδFoxp3調節性T細胞は、本明細書において上に記載するように少なくとも1つの非ペプチドリン酸化抗原に特異的である。
別の実施形態において、不活化γδFoxp3調節性T細胞は、癌細胞のアポトーシス小体上に存在した少なくとも1つの非ペプチドリン酸化抗原に特異的である。
別の実施形態において、不活化γδFoxp3調節性T細胞は、癌細胞のブレブ上に存在した少なくとも1つの非ペプチドリン酸化抗原に特異的である。
一実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物中に存在する不活化γδFoxp3調節性T細胞は、ヒトγδFoxp3調節性T細胞である。
一実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物中に存在する不活化γδFoxp3調節性T細胞は、自己γδFoxp3調節性T細胞である。
一実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物中に存在する不活化γδFoxp3調節性T細胞は、同種γδFoxp3調節性T細胞である。
別の実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物は、患者のために個別化してもよい。本明細書において使用するように、「個別化された」免疫原性産物又はワクチン組成物は、少なくとも1つの患者特異的なエピトープを用いてエクスビボで生成及び増殖させたγδFoxp3調節性T細胞の使用を指す。この実施形態において、免疫原性産物として又はワクチン組成物中で使用されるγδFoxp3調節性T細胞は、患者から得られた癌細胞のアポトーシス小体の存在において又は癌細胞のブレブの存在においてエクスビボで生成及び増殖され、それにより、少なくとも1つの患者特異的なエピトープを提供する。
一実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物は、活性成分として不活化γδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれからなる。
一実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物は、活性成分として少なくとも10、10、10、10、10、10、1010個の不活化γδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれからなる。
一実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物は、活性成分として約10、5×10、10、5×10、10、5×10、10、5×10、10、5×10、10、5×10、1010個の不活化γδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれらからなる。
一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞、不活化γδFoxp3調節性T細胞、免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物は凍結されている。
一実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物は、皮下注射、筋肉内注射、腹腔内注射、又は静脈内注射により、又は直接腫瘍中に投与してもよい。
一実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物は、被験体に1年に少なくとも1回、2回、3回、4回、5回投与してもよい。投与計画の例は、0日目、0日の4週間後、0日の8週間後、0日の12週間後、及び0日の24週間後の免疫原性産物又はワクチン組成物の投与を含むが、これらに限定しない。
本発明の別の目的は、治療的に効果的な量の不活化γδFoxp3調節性T細胞、又は本発明の免疫原性産物、医薬組成物、もしくはワクチン組成物を被験体に投与することを含む、それを必要とする被験体において癌を処置するための方法である。
本発明の別の目的は、癌に罹患している被験体のTIL中に存在するγδFoxp3調節性T細胞に対して免疫応答を誘発するための方法であって、治療的に効果的な量の不活化γδFoxp3調節性T細胞又は 本明細書において上に記載する本発明の免疫原性産物、医薬組成物、もしくはワクチン組成物を被験体に投与することを含む。
本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物を用いて処置することができる癌の例は、副腎皮質癌、肛門癌、膀胱癌、上衣腫、髄芽細胞腫、テント上原始神経外胚葉、松果体腫瘍、視床下部神経膠腫、乳癌、カルチノイド腫瘍、癌腫、子宮頸癌、結腸癌、子宮内膜癌、食道癌、肝外胆管癌、ユーイング家族性腫瘍(pnet)、頭蓋外胚細胞腫瘍、眼癌、眼球内黒色腫、胆嚢癌、胃癌、生殖細胞腫瘍、性腺外腫瘍、妊娠性絨毛性腫瘍、頭頸部癌、下咽頭癌、膵島細胞癌、喉頭癌、白血病、急性リンパ芽球性白血病、口腔癌、肝臓癌、肺癌、小細胞リンパ腫、AIDS関連、リンパ腫、中枢神経系(原発性)リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫、ホジキン病、非ホジキン病、悪性中皮腫、黒色腫、メルケル細胞癌、転移性扁平上皮癌、多発性骨髄腫、形質細胞新生物、菌状息肉腫、骨髄異形成症候群、骨髄増殖性疾患、鼻咽頭癌、神経芽細胞腫、口腔咽頭癌、骨肉腫、卵巣上皮癌、卵巣胚細胞腫瘍、卵巣低悪性度腫瘍、膵臓癌、外分泌性、膵臓癌、副鼻腔癌及び鼻腔癌、副甲状腺癌、褐色細胞腫癌、下垂体癌、形質細胞新生物、横紋筋肉腫、直腸癌、腎細胞癌、唾液腺癌、セザリー症候群、カポジ肉腫、小腸癌、軟部組織肉腫、胸腺腫、悪性甲状腺癌、尿道癌、子宮癌 、肉腫、小児の異常癌、膣癌、外陰癌又はウィルムス腫瘍、化学療法の処置に関連する良性状態(例えばループス、関節リウマチ、及び皮膚疾患など)を含むが、これらに限定しない。
一実施形態において、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物を用いて処置することができる癌は、乳癌、前立腺癌、卵巣癌、及び神経膠芽腫を含むが、これらに限定しない。
本発明の別の目的は、本発明の免疫原性産物を調製するための方法であって、以下を含む:
−処置される被験体からの生物学的サンプル、好ましくは血液サンプル、及び場合により処置される被験体からの腫瘍サンプルを提供すること、
−生物学的サンプルから単離されたCD3TCRγδT細胞、好ましくはCD3TCRγδCD45RAT細胞からのγδFoxp3調節性T細胞を本明細書において上に記載するようにエクスビボで生成及び増殖させること、
−以前の工程において得られたγδFoxp3調節性T細胞を不活化すること、
−それにより本発明の免疫原性産物を得ること。
好ましい実施形態において、生成及び増殖工程は、寛容原性樹状細胞(DC)の存在において行い、被験体の腫瘍サンプルから得られたアポトーシス性腫瘍体又はブレブを用いてパルスする。
本発明の別の目的は、それを必要とする被験体において癌を処置するための方法であって、本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物を被験体に投与することを含む。
本発明の別の目的は、それを必要とする被験体において癌を処置するための方法であって、以下を含む:
−本明細書において上に記載する免疫原性産物を調製すること、
−場合により、免疫原性産物を含む医薬組成物又はワクチン組成物を調製すること、
−場合により、被験体を血漿交換療法に供すること、
−本発明の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物を被験体に投与すること。
理論に拘束されることを望まないが、本発明者らは、本発明のγδFoxp3調節性T細胞は、免疫抑制機能を発揮するようにコミットしており、自己反応性病原性免疫エフェクター細胞(CD4細胞、CD8細胞、B細胞又は自然NK細胞を含む)を阻害することが可能でありうるが、それらは次に、自己細胞に対して細胞傷害特性を発揮できないことを示唆する。
本発明の1つの目的は、本明細書において上に記載するγδFoxp3調節性T細胞又はγδFoxp3調節性T細胞集団及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む、それらから本質的になる、又はそれらからなる医薬組成物である。
本発明の別の目的は、以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む、それらから本質的になる、又はそれらからなる医薬組成物である。
本発明の別の目的は、本明細書において上に記載する方法によりエクスビボで生成及び増殖させた以下の表現型CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む、それらから本質的になる、又はそれらからなる医薬組成物である。
本発明の1つの目的は、養子療法における使用のための、本明細書において上に記載するγδFoxp3調節性T細胞もしくはγδFoxp3調節性T細胞集団又は医薬組成物である。
本発明の別の目的は、炎症性疾患又は自己免疫疾患を処置する際での使用のための、本明細書において上に記載するγδFoxp3調節性T細胞もしくはγδFoxp3調節性T細胞集団又は医薬組成物である。
炎症性疾患又は自己免疫疾患の例は、急性播種性脳脊髄炎、急性壊死性出血性白質脳炎、アディソン病、無ガンマグロブリン血症、円形脱毛症、アミロイドーシス、強直性脊椎炎、抗GBM/抗TBM腎炎、抗リン脂質症候群、自己免疫性血管性浮腫、自己免疫性再生不良性貧血、自己免疫性自律神経障害、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫性高脂血症、自己免疫性免疫不全、自己免疫性内耳疾患、自己免疫性心筋炎、自己免疫性卵巣炎、自己免疫性膵炎、自己免疫性網膜症、自己免疫性血小板減少性紫斑病、自己免疫性甲状腺疾患、自己免疫性蕁麻疹、軸索及び神経性神経障害、バロ病、ベーチェット病、水疱性類天疱瘡、心筋症、キャッスルマン病、セリアック病、シャーガス病、慢性疲労症候群、慢性炎症性脱髄性多発神経炎、慢性再発性多巣性骨髄炎、チャーグ・ストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡/良性粘膜類天疱瘡、クローン病、コーガン症候群、寒冷凝集素症、先天性心ブロック、コクサッキー心筋炎、CREST病、本態性混合型クリオグロブリン血症、脱髄性ニューロパチー、疱疹性皮膚炎、皮膚筋炎、デヴィック病、円盤状狼瘡、ドスラー症候群、子宮内膜症、好酸球性食道炎、好酸球性筋膜炎、結節性紅斑、実験的アレルギー性脳脊髄炎、エヴァンス症候群、線維筋痛、線維性肺胞炎、巨大細胞性動脈炎、巨大細胞性心筋炎、糸球体腎炎、グッドパスチャー症候群、多発性血管炎を伴う肉芽腫症(ウェゲナー症候群)、バセドウ病、ギラン・バレー症候群、橋本脳炎、橋本甲状腺炎、溶血性貧血、ヘノッホ・シェーンライン紫斑病、妊娠ヘルペス、低ガンマグロブリン血症、特発性肺線維症、特発性血小板減少性紫斑病、IgA腎症、IgG4関連硬化性疾患、免疫調節リポタンパク質、封入体筋炎、間質性膀胱炎、若年性関節炎、若年性糖尿病(1型糖尿病)、若年性筋炎、川崎症候群、ランバート・イートン症候群、白血球破砕性血管炎、扁平苔癬、硬化性苔癬、木質結膜炎、線形IgA病、狼瘡、ライム慢性病、メニエール病、顕微鏡的多発血管炎、混合性結合組織病、モーレン潰瘍、ムッハ・ハーベルマン病、多発性硬化症、重症筋無力症、筋炎、ナルコレプシー、視神経脊髄炎、好中球減少症、眼瘢痕性類天疱瘡、視神経炎、回帰性リウマチ、連鎖球菌に関連する小児自己免疫性神経精神障害、傍腫瘍性小脳変性症、発作性夜間血色素尿症、パリーロンバーグ症候群、パーソネイジ・ターナー症候群、扁平部炎 (末梢ブドウ膜炎)、天疱瘡、末梢神経障害、静脈周囲脳脊髄炎、悪性貧血、POEMS 症候群、結節性多発動脈炎、I、II、及びIII型多腺性自己免疫症候群、リウマチ性多発筋痛症、多発性筋炎、心筋梗塞後症候群、心外膜剥離術症候群、プロゲステロン皮膚炎、原発性胆汁性肝硬変、原発性硬化性胆管炎、乾癬、乾癬性関節炎、壊疽性膿皮症、赤芽球癆、レイノー現象、反応性関節炎、反射***感神経性ジストロフィー、ライター症候群、再発性多発性軟骨炎、下肢静止不能症候群、後腹膜線維症、リウマチ熱、関節リウマチ、サルコイドーシス、シュミット症候群、強膜炎、強皮症、シェーグレン症候群、***及び精巣自己免疫、スティッフパーソン症候群、亜急性細菌性心内膜炎、スザック症候群、交感性眼炎、全身性エリテマトーデス、高安動脈炎、側頭動脈炎/巨細胞性動脈炎、血小板減少性紫斑病、トロサ・ハント症候群、横断性脊髄炎、1型糖尿病、潰瘍性大腸炎、未分化結合組織病、ブドウ膜炎、血管炎、小水疱性皮膚病、及び白斑症を含むが、これらに限定しない。
炎症性疾患又は自己免疫疾患の例は、関節リウマチ、1型糖尿病、及び多発性硬化症を含むが、これらに限定しない。
本発明の別の目的は、移植拒絶、又は移植片対宿主病(GVHD)を防止する際での使用のための、本明細書において上に記載するγδFoxp3調節性T細胞もしくはγδFoxp3調節性T細胞集団又は医薬組成物である。
一実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、本明細書において上に記載する少なくとも1つの非ペプチドリン酸化抗原に特異的である。
別の実施形態において、γδFoxp3調節性T細胞は、組織溶解物中に存在していた少なくとも1つの非ペプチドリン酸化抗原に特異的である。
一実施形態において、本発明の医薬組成物は、有効成分として少なくとも10、10、10、10、10、10、1010個のγδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれからなる。
一実施形態において、本発明の医薬組成物は、有効成分として約10、5×10、10、5×10、10、5×10、10、5×10、10、5×10、10、5×10、1010個のγδFoxp3調節性T細胞を含む、それから本質的になる、又はそれからなる。
一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞、γδ調節性T細胞集団、又は医薬は凍結されている。
一実施形態において、本発明の医薬組成物中に存在するγδFoxp3調節性T細胞はヒトγδ調節性T細胞である。
一実施形態において、本発明の医薬組成物中に存在するγδFoxp3調節性T細胞は自己γδFoxp3調節性T細胞である。
一実施形態において、本発明の医薬組成物中に存在するγδFoxp3調節性T細胞は同種γδFoxp3調節性T細胞である。
一実施形態において、本発明の医薬組成物は、皮下注射、筋肉内注射、腹腔内注射、又は静脈内注射により被験体に投与してもよい。
一実施形態において、本発明の医薬組成物は、週に少なくとも1回、2回、3回、4回、5回、被験体に投与してもよい。
別の実施形態において、本発明の医薬組成物は、月に少なくとも1回、2回、3回、4回、5回、被験体に投与してもよい。
別の実施形態において、本発明の医薬組成物は、3ヶ月間に少なくとも1回、2回、3回、4回、5回、被験体に投与してもよい。
本発明の別の目的は、それを必要とする被験体において炎症性疾患又は自己免疫疾患を処置するための方法であって、本明細書において上に記載する、治療的に効果的な量のγδFoxp3調節性T細胞もしくはγδFoxp3調節性T細胞集団又はその医薬組成物を被験体に投与することを含む。
T細胞ワクチン接種は、クローン型特異的決定基について特異的なT細胞を活性化することにより免疫原性T細胞を特異的に抑制する調節ネットワークを誘導する(抗イディオタイプ応答)ことが当技術分野において示されている。また、活性化マーカー(エルゴトープに対応する)に向けられた抗エルゴタイプ応答もまた、標的とされる調節性T細胞集団の抑制を部分的に説明しうる。
本発明の別の目的は、本発明のγδFoxp3調節性T細胞のTCR(T細胞受容体)を認識する抗体である。
一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞のTCRを認識する抗体は、TCRのCDR1、CDR2、及びCDR3(相補性決定領域1、2、及び3)の少なくとも1つを認識する。
別の実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞のTCRを認識する抗体は、TCRのCDR3を認識する。
本発明の別の目的は、前記抗体及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む、それらから本質的になる、又はそれらからなる医薬組成物である。
本発明の別の目的は、それを必要とする被験体において癌を処置するための前記抗体の使用である。
一実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞に対する抗体は、本明細書において上に記載する免疫原性組成物を用いた哺乳動物(ヒトを含む)の免疫化後に産生される抗体からなる。
別の実施形態において、抗体はまた、それらをコードする関連DNA材料を、例えば前記哺乳動物から(前記ヒトからを含む)得られるB細胞から出発してクローニングすることにより得てもよい。
別の実施形態において、抗体はまた、本発明のγδFoxp3調節性T細胞に対する関連する組換え抗体を産生するために、前記哺乳動物から(前記ヒトからを含む)収集した抗体のアミノ酸配列をシークエンシングし、次に抗体をコードするDNA分子又はそのCDRを含むその一部を合成することにより得てもよい。
本発明の免疫原性組成物を用いた免疫化により本発明のγδFoxp3調節性T細胞に対する抗体を調製することは、当技術分野からの一般的な技術的知識を使用し、当業者により簡単に実施されうる。
あるいは、本発明のγδFoxp3調節性T細胞に対する抗体は、それらを産生するヒトBリンパ球の不死化後に得てもよい;それらのcDNAはまた、クローン化し、組換えDNA技術を通じてそれら又はそれらの誘導体を産生するためにさらに使用することができる。
本明細書における用語「抗体」は、有用な抗原結合特異性を有する分子を指すために使用する。当業者は、この用語が、抗体のフラグメント又は誘導体であるが、その上、同じ又は密接に類似した機能性を示しうるポリペプチドもカバーしうることを容易に理解するであろう。そのような抗体フラグメント又は誘導体は、本明細書において使用するように、用語「抗体」により包含されることを意図している。受動免疫療法の目的のための「抗体」又は「抗体分子」により、本明細書において全免疫グロブリン分子だけでなく、そのフラグメント、例えばFab、F(ab’)2、Fv、及びγδFoxp3調節性T細胞を結合し、不活化する能力を保持するそれらの他のフラグメントも意図する。同様に、用語「抗体」は、抗体の遺伝子操作された誘導体、例えば一本鎖Fv分子(scFv)及びドメイン抗体(dAb)などを含む。
一部の実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞に対する抗体はポリクローナル抗体からなる。
一部の実施形態において、本発明のγδFoxp3調節性T細胞に対する抗体はモノクローナル抗体からなる。
用語「モノクローナル抗体」は、本明細書において、任意の単離Ab、例えば従来のモノクローナル抗体ハイブリドーマなどを包含するが、任意の細胞により産生された単離された単一特異性抗体、例えば哺乳動物細胞株において発現された同一のヒト免疫グロブリンのサンプルなども包含する。
抗体の可変重鎖(V H)及び可変軽鎖(V L)ドメインは抗原認識において含まれ、初期のプロテアーゼ消化実験により最初に認識された事実である。さらなる確認が、げっ歯類抗体の「ヒト化」により見出された。げっ歯類由来の可変ドメインを、結果として得られた抗体がげっ歯類親抗体の抗原特異性を保持するようにヒト由来の定常ドメインに融合させてもよい(Morrison et al. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 6851-6855)。抗原特異性は可変ドメインにより付与され、定常ドメインに非依存的であることは、抗体フラグメント(全てが1つ以上の可変ドメインを含む)の細菌発現を含む実験から公知である。これらの分子は、Fab様分子(Better et al (1988) Science 240, 1041);Fv分子(Skerra et al (1988) Science 240, 1038);V.sub.H及びV.sub.Lパートナードメインが柔軟なオリゴペプチドを介して連結されている一本鎖Fv(ScFv)分子(Bird et al (1988) Science 242, 423; Huston et al (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 5879)及び単離Vドメインを含む単一ドメイン抗体(dab)(Ward et al (1989) Nature 341, 544)を含む。それらの特異的結合部位を保持する抗体フラグメントの合成において含まれる技術の一般的な総説が、Winter & Milstein(1991, Nature 349, 293-299)に見出される。
用語「ScFv分子」は、V H及びV Lパートナードメインが柔軟なオリゴペプチドを介して連結された分子を包含する。操作された抗体(例えばScFv抗体など)は、J. Huston et al, (1988) "Protein engineering of antibody binding sites: recovery of specific activity in an anti-digoxin single chain Fv analogue produced in E. coli", Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85, pp. 5879-5883において、及びA. Pluckthun, (1991) "Antibody engineering; Advances from use of E. coli expression systems", Bio/technology 9 (6): 545-51(本明細書において参照により組み入れられる)において記載されている技術及び手法を使用して作製することができる。
本明細書において記載するように反応性である適切なモノクローナル抗体は、公知の技術、例えば、"Monoclonal Antibodies; A manual of techniques", H Zola (CRC Press, 1988)において、及び "Monoclonal Hybridoma Antibodies: Techniques and Application", S G R Hurrell (CRC Press, 1982)において開示されている技術により調製してもよい。
さらなる実施形態は、抗原と接触したマウス抗体の領域である相補性決定領域(CDR)がヒト抗体フレームワークに移されたヒト化抗体を包含する。そのような抗体はほぼ完全にヒト型であり、患者に投与した場合に有害な抗体反応を起こすことはほとんどない。いくつかのキメラ抗体又はヒト化抗体が治療用薬物として登録されており、現在では種々の適応症において広く使用されている(Borrebaeck & Carlsson, 2001, Curr. Opin. Pharmacol. 1: 404-408)。
抗体はヒト化抗体である場合が好ましい。適切に調製された非ヒト抗体は、公知の方法で、例えばマウス抗体のCDR領域をヒト抗体のフレームワーク中に挿入することにより「ヒト化」することができる。ヒト化抗体は、Verhoeyen et al (1988) Science, 239, 1534-1536において、及びKettleborough et al, (1991) Protein Engineering, 14 (7), 773-783において記載されている技術及び手法を使用して作製することができる。
別の実施形態において、抗体はまた、完全なヒト抗体を包含し、それは組換え技術を使用して産生しうる。典型的には、数十億の異なる抗体を含む大きなライブラリーを使用する。例えばマウス抗体のキメラ化又はヒト化を用いた過去の技術とは対照的に、この技術は、特異的抗体を生成するために動物の免疫化に頼らない。代わりに、組換えライブラリーは膨大な数の予め作製された抗体変異体を含み、それにおいて、ライブラリーは任意の抗原について特異的な少なくとも1つの抗体を有する可能性が高い。
投与の頻度は、経時的に患者の血清中での抗体価の低下を追跡することにより臨床的に決定してもよいが、任意の事象において、年に1〜52回、最も好ましくは年に1〜12回の頻度でありうる。抗体の量は、疾患の重症度、又は血清中での抗体の半減期に従って変動しうるが、好ましくは、1〜10mg/kg患者の範囲内、好ましくは1〜5mg/kg患者の範囲内、最も好ましくは1〜2mg/kg患者である。
ヒト末梢血(PBMC)及び***腫瘍から単離されたTILにおけるそれらの可変的なTCR認識により定義される、Foxp3とFOXP3CD3T細胞集団間での異なる頻度及び表現型の特徴。 CD4TCRγδ非制限T細胞を発現するエクスビボでのヒト誘導性腫瘍抗原特異的FOXP3におけるFoxp3発現の分析。アポトーシス腫瘍抗原(Ag)パルス免疫寛容原性DC(tDC)を使用し、IL−2(100IU/ml)及びTGFβ(5ng/ml)、PGE2(1μM)、及びRapa(10nM)で構成されるnTreg極性化培地の存在においてナイーブCD4T細胞から特異的pTregを生成及び増殖させた。無負荷のtDCを対照として使用した。CD4T細胞培養におけるFoxp3の(A)頻度及び(B)発現レベル(MFIにより評価)。 BC生検から単離されたFoxp3発現CD3CD4γδT細胞非制限T細胞と現在記載されているγδT細胞のサブタイプの間での表現型の違い。Foxp3発現CD3CD4γδT細胞の表現型同定は、CD3(クローンSK7)、CD4(クローンSK3)、CD8(クローンSK1)、汎γδT(クローンIMMU510)、及びFoxp3(クローン259D)に対する抗体を使用したフローサイトメトリーにより実施した。 BC生検から単離されたFoxp3を発現するCD3CD4γδT細胞の間でのTCRVδの使用。TCRVγδ鎖の同定を、CD3(クローンSK7)、CD4(クローンSK3)、CD8(クローンSK1)、汎γδT(クローンIMMU510)、TCRVδ1(REA173)、TCRVδ2(REA771)、及びFoxp3(クローン259D)に対する抗体を使用したフローサイトメトリーにより実施した。 BC生検から単離されたFoxp3発現CD3CD4γδT細胞非制限T細胞の抑制能力。CFSE標識Tconv(TconvCFSE)を、異なる比率の選別したCD3CD4γδT細胞と共培養した。CD4γδT細胞によるTconvCFSE増殖の阻害パーセントを示した。健常ドナーからの循環新鮮Tregを対照として使用した。 特異的病原性CD4T細胞、即ち、腫瘍抗原特異的FOXP3発現CD4TCRγδ非制限T細胞を溶解するよう機能的にコミットされた自己CD8T細胞株の生成。その誘導性病原性CD4T細胞クローンを溶解するCD8T細胞クローンの能力を、以前に記載されたように古典的な7−AAD/CFSE細胞媒介性細胞傷害性アッセイを用いて評価する。簡単には、刺激後4日目に、病原性CD4標的細胞又は自己リンパ芽球細胞系をCFSEで標識し、96ウェルU底プレート中に1ウェル当たり3×10個で三通りに配置した。CD8エフェクターT細胞(5:1のE:T比率)を加え、インキュベーションを37℃で6時間にわたり行った。実験の終了時に、死細胞を7−AADで標識して溶解細胞を検出した。標的細胞に対する細胞溶解活性を、FACSCalibur機器を使用し、二重陽性染色CFSE及び7−AADを示す領域に基づいて分析した。CD8T細胞クローンの細胞溶解活性(%)を、陰性対照における自然溶解(%)を差し引いた後、CFSE及び7−AADの両方について陽性の細胞/全CFSE陽性細胞として算出した。細胞溶解活性のパーセンテージを次に、以下の式を使用して算出した:細胞溶解活性(%)[死んだ標的細胞(%)−自然死(%)]×100/[100−自然死(%)]。 内腔A及び内腔B***サブタイプから抽出されたTIL中に存在するリンパ球におけるFoxp3発現の分析。内腔A及び内腔Bを伴う患者からの腫瘍組織を、メスを用いて細かく刻み、コラゲナーゼIV型中での一晩のインキュベーションにより酵素的に消化した。単離されたTIL中に存在するリンパ球におけるFOXP3マーカーの発現をフローサイトメトリー分析により決定した。 3つの異なる乳癌のサブグループから抽出されたTIL中に存在するリンパ球におけるFoxp3発現の分析:管腔Aを伴う患者(n=3)、管腔Bを伴う患者(n=3)及びトリプルネガティブ乳癌(TNBC)を伴う患者(n=2)からの腫瘍組織を、メスを用いて細かく刻み、コラゲナーゼIV型中での一晩のインキュベーションにより酵素的に消化した。単離されたTIL中に存在するリンパ球におけるFOXP3マーカーの発現をフローサイトメトリー分析により決定した。CD3CD4TCRγδ非制限T細胞におけるFOXP3発現のパーセンテージの表示。 内腔A及びB***サブタイプからのTIL中に存在するリンパ球のマルチパラメトリックフローサイトメトリー分析。TIL中に存在するリンパ球を、CD3、CD4、CD25、CD56、CD161に対するAbを使用して細胞表面で染色した。固定及び透過処理後、Foxp3及びCTLA4を細胞内で染色した。 刺激されたナイーブCD3TCRγδT細胞からの、エクスビボで生成されたAg特異的CD3TCRγδT細胞の表現型及び機能的抑制能力。ナイーブCD3TCRγδT細胞を、nTreg極性化培地ならびにIL−2(100IU/ml)及びIL−15(10ng/ml)の存在においてゾレドロン酸処理自己tDCを用いて刺激した。(A)Foxp3発現プロファイルを呈するオーバーレイヒストグラム及び(B)21又は42日間にわたり増殖したAg特異的CD3TCRγδT細胞の抑制能力。
実施例
本発明を以下の実施例によりさらに例証する。
材料及び方法
ヒト血液サンプル。健常な個人からの血液サンプルは、Etablissement Francais du Sang(EFS、パリ)から由来した。血球を標準的な手順を使用して収集する。
ヒト腫瘍サンプル。腫瘍組織サンプルは、管腔A及び管腔Bの乳癌を伴う患者に由来した(Institut Jean Godinot、ランス)。
細胞の精製及び培養
末梢血単核細胞(PBMC)を、Ficoll-Hypaque(Pharmacia)での密度勾配遠心分離により単離する。PBMCは、新鮮な細胞として使用するか、又は液体窒素中で凍結保存する。T細胞サブセット及びT細胞枯渇アクセサリー細胞(ΔCD3細胞)を新鮮又は凍結PBMCから単離する。T細胞枯渇アクセサリー細胞(ΔCD3細胞)を、抗CD3コーティングDynabeads(Dynal Biotech)とのインキュベーションによるPBMCからのネガティブ選択により単離し、3000ラドで照射する(ΔCD3フィーダーとして言及する)。
CD4T細胞を、CD4T細胞単離キット(Miltenyi Biotec、純度96〜99%のCD4T細胞集団を生じる)を用いてネガティブ選択する。その後に、選択されたCD4T細胞を、FACSAria III Cell Sorter(Becton Dickinson)を使用してCD4CD127−/loCD25high(pTregs)及びCD4CD127CD25neg/dim[従来型ヘルパーCD4 T細胞(Tconv)]亜集団に分類する前に、抗CD4(13B8.2)−FITC(Beckman Coulter)、抗CD25(4E3)−APC(Miltenyi Biotec)、及び抗CD127(R34.34)−PE(Beckman Coulter)を用いて標識する。
CD14単球を、MACSシステムを使用したポジティブセレクションによりPBMCから単離する。
CD3CD4CD127CD45RACD25TCRαβMHCII制限(ナイーブ従来型CD4T細胞)を、磁気濃縮(MACSシステム:CD4マイクロビーズ)及びFAC選別後にPBMCから単離する。選別工程前に、濃縮されたCD3CD4T細胞を、抗CD4(13B8.2)−FITC(Beckman Coulter)、抗CD25(4E3)−APC(Miltenyi Biotec)、及び抗CD127(R34.34)−PE(Beckman Coulter)、抗TCRαβ−BV421(IP26)(Biolegend)を用いて染色する。
CD3CD45RAinvTCR Vα24CD1制限T細胞を、磁気濃縮(MACSシステム:抗iNKTマイクロビーズ及びFACS選別)後にPBMCから単離する。選別工程前に、濃縮されたCD3invTCR Vα24T細胞を、抗CD3(UCHT−1)V450抗不バリアントTCR Vα24−JαQ(6B11)−PE(inv TCR)Vα24−JαQ(Becton Dickinson)、及び抗CD45RA(T6D11)−FITC(Miltenyi Biotec)を用いて染色する 。
CD3CD45RACD27TCRγδ非制限T細胞を、磁気濃縮(MACSシステム:TCRγδT細胞単離キット)及びFACS選別後にPBMCから単離する。選別工程前に、濃縮されたCD3TCRγδT細胞を、抗CD3(UCHT−1)V450、抗TCR汎γδPE(IMMU510)(Beckman Coulter)、抗CD27−APC efluor 780(O323)(ebioscience)、及び抗CD45RA(T6D11)−FITC(Miltenyi Biotec)を用いて染色する。
T細胞サブセットを、5%SVF、100IU/mlペニシリン/ストレプトマイシン、1mMピルビン酸ナトリウム、1mM非必須アミノ酸、グルタマックス、及び10mM HEPES(IMDM−5培地)を添加したIMDM中で2%低酸素において培養する。
乳癌細胞株及び培養。ヒト乳癌細胞株MCF−7をAmerican Type Culture Collection(USA)から入手した。細胞を、10%ウシ胎児血清(FBS)を添加したダルベッコ改変イーグル培地(DMEM;Invitrogen、USA)中で維持する。MCF−7細胞を、5μg/mlのドキソルビシンで24時間又はγ線照射(20Gy)により処理する。アポトーシスの程度はフローサイトメトリー分析(FACS)によりモニターする。細胞を、DCを供給する前に徹底的に洗浄する。
TIL単離。腫瘍組織をメスで細かく刻み、2mMグルタミン(Gibco)、50mg/mLゲンタマイシン、及び0.25%ヒト血清アルブミンを添加したDMEM高グルコース培地中のコラゲナーゼタイプIV(2mg/mL、Roche Diagnostic GmbH)中で、37℃のロータリーシェーカー上での一晩のインキュベーションにより酵素消化した。
ポリクローナルの機能的にコミットされたFOXP3発現調節性T細胞のエクスビボでの生成。
ポリクローナルの機能的にコミットされたFOXP3発現CD3TCRαβMHCII制限T細胞のエクスビボでの生成:0日目に、T細胞を48ウェルプレート中に2.5×10個/ウェルで播種し、ΔCD3フィーダー(1M)の存在においてプレート結合抗CD3 mAb(4μg/ml)で刺激する。細胞を、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa 10nMを伴うIMDM−5培地(5%SVF、100IU/mlペニシリン/ストレプトマイシン、1mMピルビン酸ナトリウム、1mM非必須アミノ酸、グルタマックス、及び10mM HEPESを添加したIMDM)中で培養する。2日目に、IL−2(100IU/ml)を培養物に加える。3日毎に、上清容量の半分を捨て、IL−2(100UI/ml)を伴う新鮮なIMDM−5と交換する。11日目に、これらのCD4T細胞株を、プレート結合抗CD3 Ab(4μg/ml)を用いた再刺激によりさらに増殖させた。この再刺激は、ΔCD3フィーダー、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa 10nM、及びIL−2(100UI/ml)の存在において実施した。次に、3日毎に、上清容量の半分を捨て、IL−2を伴う新鮮なIMDM−5(100UI/ml)と交換する。20日目に、増殖したCD4T細胞の表現型をフローサイトメトリーにより評価した。CD45ROになった、刺激されたナイーブ従来型T細胞の75%がFoxp3を発現する。
ポリクローナルの機能的にコミットされたFOXP3発現インバリアントT細胞のエクスビボでの生成:0日目に、T細胞を96ウェルプレート中に1×10個/ウェルで播種し、ΔCD3フィーダー(2.5×10個)の存在においてプレート結合抗inv TCR Vα24−JαQ(6B11)mAb(2μg/ml)で刺激する。細胞を、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa 10nM、IL−2(100UI/ml)、及びIL−15(10ng/ml)を伴うIMDM−5培地中で培養する。3日毎に、IL−2(100IU/ml)及びIL−15(10ng/ml)を培養物に加える。12日目に、T細胞を、ΔCD3フィーダー、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa 10nM、IL−2(100UI/ml)、及びIL−15(10ng/ml)の存在において、プレート結合抗inv TCR Vα24−JαQ(6B11)mAb(2μg/ml)を用いた再刺激によりさらに増殖させた。次に、3日毎に、上清容量の半分を捨て、IL−2(100UI/ml)及びIL−15(10ng/ml)を伴う新鮮なIMDM−5と交換する。21日目に、細胞をフローサイトメトリーにより分析した。CD45ROになった、刺激されたCD3 invTCR Vα24RAT細胞の70%がFoxp3を発現する。
ポリクローナルの機能的にコミットされたFOXP3発現TCRγδT 細胞のエクスビボでの生成:0日目に、T細胞を96ウェルプレート中に1×10個/ウェルで播種し、ΔCD3フィーダー(2.5×10個)の存在においてプレート結合抗TCRγδ mAb(2μg/ml)で刺激する。細胞を、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa 10nM、IL−2(100UI/ml)、及びIL−15(10ng/ml)を伴うIMDM−5培地(5%SVF、100IU/mlペニシリン/ストレプトマイシン、1mMピルビン酸ナトリウム、1mM非必須アミノ酸、グルタマックス、及び10mM HEPESを添加したIMDM)中で培養する。3日毎に、上清容量の半分を捨て、IL−2(100UI/ml)及びIL−15(10ng/ml)を伴う新鮮なIMDM−5と交換する。11日目に、T細胞を、プレート結合抗汎TCRγδ Ab(2μg/ml)を用いた再刺激によりさらに増殖させた。この再刺激は、ΔCD3フィーダー、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa 10nM、ならびにIL−2(100UI/ml)及びIL−15(10ng/ml)の存在において実施した。次に、3日毎に、上清容量の半分を捨て、IL−2(100UI/ml)及びIL−15(10ng/ml)を伴う新鮮なIMDM−5と交換する。21日目に、細胞をフローサイトメトリーにより分析した。CD45ROになった、刺激されたCD3CD45RACD27TCRγδT細胞の65%がFoxp3を発現する。
抗原特異的に機能的にコミットされたFOXP3発現T細胞のエクスビボでの生成。
抗原(オボアルブミン)特異的に機能的にコミットされたFoxp3発現CD3TCRαβMHCII制限T細胞のエクスビボでの生成:
a)CD14単球からのオボアルブミン負荷寛容原性DC(寛容原性単球由来DC(Tol−Mo−DC)と呼ぶ)のインビトロでの生成:単球を、未成熟DCの生成のために100ng/mlの組換えヒト顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)及び10ng/mlのヒト組換えIL−4を添加した1ウェル当たり0.5mlのAIMVを含む48ウェル平底プレート中で培養する。3日目に、サイトカインを含む500μlの培地を加えた。6日目に、Tol−Mo−DCを、1)ウェルから取り出し、IMDM−5(5%SVF、100IU/mlペニシリン/ストレプトマイシン、1mMピルビン酸ナトリウム、1mM非必須アミノ酸、glutamax、及び10mM HEPESを添加したIMDM)で2回洗浄し、2)IMDM−5中の3×10個/mlの濃度で48ウェルプレートのウェルに加え、3)特異的Ag(OVA)を用いてIMDM−5中でパルスした。
b)特定の機能的にコミットされたFOXP3発現CD3TCRαβMHCII制限T細胞のエクスビボでの生成及び増殖:0日目に、オボアルブミンパルスtDCを、1)IMDM−5で2回洗浄し、2)IMDM−5中の3×10個/mlの濃度で、2×10個の照射自己フィーダー、PGE2 1μM、及びRapa 10nMの存在において48ウェルプレートのウェルに加える。精製されたナイーブ従来型CD4T細胞(FACSにより以前に凍結されたPBMCから単離)をパルスtDCに加える。1日目に、IL−2(100IU/ml)及びTGFβ(5ng/ml)を共培養物に加える。3日毎に、上清容量の半分を捨て、IL−2を伴う新鮮なIMDM−5(100UI/ml(T細胞クローニング培地))と交換する。12日目に、これらのT細胞を、ΔCD3−フィーダー、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa 10nM、IL−2(100UI/ml)の存在においてovaパルスtDCを用いた再刺激によりさらに増殖させる。一度、T細胞が増殖し始めたら、それらをT細胞クローニング培地及び照射フィーダーを用いて2〜3日毎に分割することができる。21日目に、細胞をフローサイトメトリーにより分析する。CD45ROになった刺激されたナイーブ従来型CD4T細胞の85%がFoxp3を発現する。Ova特異的記憶CD3TCRαβMHCII制限T細胞が、刺激のいかなる培養条件においても、nTreg極性化培地中での21日間の増殖後に、排他的に調節活性を発揮するようにコミットされていることを確認するために、Ova特異的pTregを、nTreg極性化培地(IL−2、TGFβ、PGE2、及びラパマイシンの組み合わせを含む)又はTH−17極性化培地(IL−2、IL−1、IL−6、IL−21、IL−23サイトカインを含むIMDM培地)のいずれかにおいてさらに3週間にわたり培養する。21日増殖させたFoxp3発現CD3CD4TCRαβMHCII制限T細胞を、48ウェルプレート中で、ΔCD3フィーダー(1M)の存在においてプレート結合抗CD3mAb(4μg/ml)で3日毎に刺激し、上清容量の半分を捨て、新鮮なT細胞クローニング培地又はTH−17極性化培地と21日間にわたり交換する。
機能的にコミットされたFOXP3発現CD3TCRγδ非制限T細胞のエクスビボでの生成:
CD14単球からの腫瘍負荷寛容原性DC(寛容原性単球由来DC(tDC)と呼ぶ)のインビトロでの生成:単球を、100ng/ml組換えヒト顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)及び10ng/mlヒト組換えIL−4を添加した1ウェル当たり0.5mlのAIMVを含む48ウェル平底プレート中で培養する。3日目に、サイトカインを含む500μlの培地を加える。5日目に、tDCの一部を、GM−CSF(100ng/mL)、IL−4(10ng/mL)を伴うAIMV中で、DC/腫瘍細胞比1:2で24時間にわたりアポトーシスMCF−7細胞と共培養する。tDCの別の一部を90%FBS−10%DMSO中の2×10個/バイアルで凍結する。
腫瘍リン酸化抗原特異的に機能的にコミットされたFoxp3発現CD3TCRγδ+非制限T細胞のエクスビボでの生成及び増殖。
0日目に、腫瘍抗原パルスtDCを、1)IMDM−5で2回洗浄し、2)2×10個の照射自己フィーダー、PGE2 1μM、及びRapa 10nMの存在においてIMDM−5中の3×10個/mlの濃度で48ウェルプレートのウェルに加える。精製CD3CD45RATCRγδ非制限T細胞(FACSにより以前に凍結したPBMCから単離)をパルスtDCに加える。1日目に、IL−2(100IU/ml)及びTGFβ(5ng/ml)を共培養物に加える。3日毎に、上清容量の半分を捨て、IL−2を伴う新鮮なIMDM−5(100UI/ml)(T細胞クローニング培地)と交換する。12日目に、これらのT細胞を、ΔCD3フィーダー、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa 10nM、及びIL−2(100UI/ml)の存在において腫瘍AgパルスtDCを用いた再刺激によりさらに増殖させる。一度、T細胞が増殖し始めたら、それらをT細胞クローニング培地及び照射フィーダーで2〜3日毎に分割することができる。21日目に、細胞をフローサイトメトリーにより分析する。CD45ROになった刺激されたナイーブCD3CD45RATCRγδT細胞の75%がFoxp3を発現する。
腫瘍抗原特異的に機能的にコミットされたFOXP3発現CD3invTCR Vα24CD1d制限T細胞のエクスビボでの生成。
a)CD14単球からの腫瘍負荷寛容原性DC(寛容原性単球由来DC(tDC)と呼ぶ)のインビトロでの生成:単球を、CD1dを発現する未成熟DCの生成のために100ng/ml組換えヒト顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)ならびに10ng/mlヒト組換えIL−4及びAM580(100nM)を添加した1ウェル当たり0.5mlのAIMVを含む48ウェル平底プレート中で培養する。3日目に、サイトカインを含む500μlの培地を加える。5日目に、tDCの一部を、GM−CSF(100 ng/mL)、IL−4(10ng/mL)を伴うAIMV中で、DC/腫瘍細胞比率1:2で24時間にわたりアポトーシスMCF−7細胞と共培養する。tDCの他の一部を、2×106個/バイアルで90%FBS−10%DMSO中に凍結する。
b)腫瘍抗原特異的に機能的にコミットされたFoxp3発現CD3invTCR Vα24CD1d制限T細胞のエクスビボでの生成及び増殖:0日目に、腫瘍抗原パルスtDCを、1)IMDM−5で2回洗浄し、2)2×10個の照射自己フィーダー、PGE2 1μM、及びRapa 10nMの存在においてIMDM−5中の3×10個/mlの濃度で48ウェルプレートのウェルに加える。精製CD3CD45RAinvTCR Vα24CD1制限T細胞(FACSにより以前に凍結したPBMCから単離)をパルスtDCに加える。1日目に、IL−2(100IU/ml)、IL−15(10ng/ml)、及びTGFβ(5ng/ml)を共培養物に加える。3日毎に、上清容量の半分を捨て、IL−2(100UI/ml)及びIL−15(10ng/ml)を伴う新鮮なIMDM−5(T細胞クローニング培地)と交換する。12日目に、これらのT細胞を、ΔCD3フィーダー、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa 10nM、IL−2(100UI/ml)、及びIL−15(10ng/ml)の存在における腫瘍AgパルスtDCを用いた再刺激によりさらに増殖させる。T細胞が増殖し始めたら、それらをT細胞クローニング培地及び照射フィーダーを用いて2〜3日毎に分割することができる。21日目に、細胞をフローサイトメトリーにより分析する。CD45ROになった刺激CD3CD45RAinvTCR Vα24細胞の75%がFoxp3を発現する。
リン酸化抗原特異的な機能的にコミットされたFOXP3発現CD3TCRγδ非制限T細胞のエクスビボでの生成。
a)CD14単球からの寛容原性DCのインビトロでの生成(寛容原性単球由来DC(Tol−Mo−DC)と呼ぶ):単球を、未成熟DCの生成のための100ng/ml組換えヒト顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)及び10ng/mlヒト組換えIL−4を添加した1ウェル当たり0.5mlのAIMVを含む48ウェル平底プレート中で培養する。3日目に、サイトカインを含む500μlの培地を加えた。6日目に、生成したTol−Mo−DCをウェルから取り出し、IMDM−5(5%SVF、100IU/mlペニシリン/ストレプトマイシン、1mMピルビン酸ナトリウム、1mM非必須アミノ酸、グルタマックス、及び10mM HEPESを添加したIMDM)で2回洗浄し、凍結するか、又はリン酸化抗原特異的な機能的にコミットされたFOXP3発現CD3TCRγδ非制限T細胞の生成及び増殖のために使用する。
b)リン酸化抗原特異的な機能的にコミットされたFOXP3発現CD3TCRγδ非制限T細胞のエクスビボでの生成及び増殖:0日目に、tDMを、2×10個照射自己フィーダー、PGE2 1μM、ならびにRapa 10nM及びゾレドロン酸(100nM)の存在において、IMDM中の3×105個/mlの濃度で48ウェルプレートのウェルに加える。精製されたCD3CD45RATCRγδ非制限T細胞(FACSにより以前に凍結したPBMCから単離)をパルスtDCに加える。1日目に、IL−2(100IU/ml)、IL−15(10ng/ml)、及びTGFβ(5ng/ml)を共培養物に加える。3日毎に、上清容量の半分を捨て、IL−2(100UI/ml)及びIL−15(10ng/ml)を伴う新鮮なIMDM−5(T細胞クローニング培地)と交換する。12日目に、これらのT細胞を、ΔCD3フィーダー、PGE2 1μM、TGFβ 5ng/ml、Rapa10nM、IL−2(100UI/ml)、IL−15(10ng/ml)、及びゾレドロン酸(100nM)の存在においてtDCでの再刺激によりさらに増殖させる。一度、T細胞が増殖し始めたら、それらをT細胞クローニング培地及び照射フィーダーを用いて2〜3日毎に分割することができる。21日目に、細胞をフローサイトメトリーにより分析する。CD45ROになった刺激されたCD3CD45RATCRγδT細胞の75%がFoxp3を発現する。
MLRアッセイ用の刺激細胞のインビトロでの生成:単球を、未成熟DC(iDC)の生成のために、20ng/ml組換えヒト顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)及び20ng/mlヒト組換えIL−4を添加した1ウェル当たり0.5mlのRPMI−5を含む48ウェル平底プレート中で培養する。3日目に、サイトカインを含む500μlの培地を加える。5日目に、iMDCの一部を、GM−CSF(20ng/mL)、IL−4(20ng/mL)、及び5%FBSを添加したRPMI1640中で24時間にわたりDC/腫瘍細胞比率1:2でアポトーシスMCF−7細胞と共培養する。iDCの別の一部を2×10個/バイアル(90%FBS−10%DMSO中)で凍結する。指示された場合、パルスDCを腫瘍壊死因子α(TNF−α;最終20ng/mL)及びPGE 2(1μM)を用いて2日間にわたり成熟させる(mDC)。一部の実験において、TNF及びPGE2(同じ濃度で)、又はリポ多糖(LPS;10〜1000ng/mL;Sigma)をMLRに直接加える。抗原負荷DC刺激装置を30Gyで照射する。
MLRアッセイ用のTAP阻害刺激細胞のインビトロでの生成:上に記載するように得られた成熟DCを、BHV−1からのUL49.5遺伝子を含むpGem4Zベクターから合成された20μgのRNAを用いてエレクトロポレーションする(参考文献:Lampen MH, Verweij MC, Querido B, van der Burg SH, Wiertz EJ, van Hall T)。TAP阻害細胞に対するCD8T細胞応答は、ヒト集団において容易に検出される(J Immunol. 2010 Dec 1;185(11):6508-17.)。
アポトーシスT細胞−DC共培養:未成熟DCを単独で又はアポトーシス細胞(3のアポトーシス細胞:1のiDC)と16時間にわたり培養した。DCを次に、抗CD3コーティングマイクロビーズ(Miltenyi Biotec)を使用したアポトーシスT細胞の免疫磁気枯渇により精製し、20μgの合成RNAを用いてエレクトロポレーションし、又はすることなく、20ng/ml GM−CSF、20ng/mlヒト組換えIL−4、及び成熟化カクテル(TNF−α20ng/ml及びPGE2 1μM)を添加したRPMI−5中で24時間にわたりインキュベートした。
フローサイトメトリー分析
mAb標識。以下のコンジュゲートmAbを使用する。a)CD3T細胞について:抗CD4(SK3)−PerCP−eFluor 710、抗TCRαβ(IP26)−APC(ebioscience)、抗CD25(B1.49.9)−PeCy55、抗CD127(R34.34)−APC−AF700(Beckman Coulter)、抗CD3(UCHT1)−BB515抗インバリアントTCR Vα24−JaQ(6B11)−PE、抗Foxp3(259D/C7)−PE−CF594及び抗CD152(BNI3)−BV421、抗CD161(DX12)BV605及び抗CD56(NCAM 16.2)BU395(Becton Dickinson)、抗TCRαβ−BV421(IP26)(Biolegend)、抗TCR汎γδPE(IMMU510)(Beckman Coulter)及び抗CD27−APC efluor 780(O323)(ebioscience)。細胞を、BSA/NaN(0.5%BSA、0.01%NaN)を含むPBS(FACS緩衝液)中で希釈したAbの混合物を使用して表面マーカーについて染色する(暗所で、4℃で30分間)。Foxp3及びCTLA−4の細胞内染色を、ebioscienceから得られたFOXP3染色キットを製造者の指示に従って用いて実施する。適当なアイソタイプ対照Abを各々の染色の組み合わせについて使用する。サンプルは、BD FACSDIVA 8.0.1ソフトウェア(Becton Dickinson)を使用してBD LSR FORTESSAフローサイトメーターで取得する。結果をパーセンテージ(%)又は平均蛍光強度(MFI)で表す。
b) 誘導性の特異的Tregについて:誘導性TregでのIL−1R1の存在を、モノクローナル抗Foxp3(259D/C7)−PE−CF594Ab及びポリクローナル抗IL1R1−PE(R&D Systems、FAB269P)を用いて評価した。
CFSE染色。Tconvを、PBS中の1μMカルボキシ−フルオレセインスクシンイミジルエステル(CFSE)(CellTrace細胞増殖キット;Molecular Probes/Invitrogen)を用いて、37℃で1×10細胞/mLの濃度で8分間にわたり染色する。標識化を、10%FBSを含むRPMI1640培養培地を用いて2回細胞を洗浄することにより停止する。細胞を次に、所望の濃度で再懸濁し、その後に増殖アッセイのために使用する。
7−AAD(7−アミノ−アクチノマイシンD)染色。刺激されたCFSE標識又は非標識nTreg及びTconvのアポトーシスを、7−AADアッセイを使用して決定した。簡単には、培養細胞を20μg/mLの核色素7−AAD(Sigma-Aldrich)を用いて4℃で30分間にわたり染色する。FSC/7−AADドットプロットによって、アポトーシス(FSChigh/7−AAD)細胞及びアポトーシス小体(FSClow/7−AAD)ならびに細片((FSClow/7−AAD)から生存(FSChigh/7−AAD)を区別する。生細胞をCD37−AADFSC細胞として同定する。
BC生検から単離されたFoxp3発現CD3CD4γδT細胞非制限T細胞の表現型の特徴:TCRγδT細胞サブセットの同定をフローサイトメトリーにより実施した。パネルには、CD3(クローンSK7)、CD4(クローンSK3)、CD8(クローンSK1)、汎γδT(クローンIMMU510)、TCR Vδ1(REA173)、TCR Vδ2(REA771)、及びFoxp3(クローン259D)に対する抗体が含まれた。
機能アッセイ
T細胞増殖。T細胞増殖を、5%FBS、100IU/mlペニシリン/ストレプトマイシン、1mMピルビン酸ナトリウム、1mM非必須アミノ酸、グルタマックス、及び10mM HEPES(RPMI−5培地)を添加したRPMI中で酸素正常状態において評価する。共培養の完了時、刺激されたCFSE標識Tconvを収集し、抗CD3mAb及び7−AADで共染色し、ゲートCD37−AAD−細胞中の生増殖細胞のパーセンテージ(CFSE低画分として定義)をフローサイトメトリーにより決定する。
T細胞アポトーシス誘導:腫瘍抗原特異的な機能的にコミットされたFOXP3発現CD3TCRγδ非制限T細胞を、上に記載するようにエクスビボで生成する。次に、腫瘍抗原特異的な刺激T細胞を254nm(UV−C)で照射し(240mJ/cm2)、未成熟DCとの共培養の前に6時間にわたり培養した。アポトーシスを7−AAD染色により確認した。平均して、細胞の75%が7−AADである。
標準的なポリクローナル細胞−細胞接触Treg抑制アッセイ:レスポンダー細胞として使用されるCFSE標識Tconv(4×10個/ウェル)を、規定量のFoxp3T細胞(血液Treg又はエクスビボで生成されたT細胞)の存在又は非存在においてΔCD3−フィーダー(4×10個/ウェル)と4〜5日間にわたり培養する。培養は、200μLの完全RPMI培地中の0.2μg/mLの抗CD3 mAbでコーティングされた丸底プレート中で実施する。結果を、増殖CFSE低 T細胞のパーセンテージとして、又は以下のように算出される抑制のパーセンテージとして表す:(100×[(Tconv CFSE低細胞のパーセンテージ−nTregsとの共培養中のTconv CFSEのパーセンテージ)/Tconv CSFE低細胞のパーセンテージ]。
自己MLR抑制アッセイ:CFSE標識Tconv CD4CD25T細胞(5×10個)を、RPMI−5培地中の1×10個のパルスiDCを用いて、又はIL−2(20IU/ml)IL−1b(10ng/ml)、IL−6(30ng/ml)、IL−21(50ng/ml)、及びIL−23(30ng/ml)を添加したIMDM−5培地中の5×10個のパルス−mDCを用いて、規定量のFoxp3 T細胞(血液Treg又はエクスビボで生成されたT細胞)の存在又は非存在において5〜6日間にわたり刺激する。指示がある場合、培養を、IL−2(20IU/ml)、IL−1β(10ng/ml)、IL−6(30ng /ml)、IL−21(50ng/ml)、及びIL−23(30ng/ml)を添加したIMDM−5培地中で実施する。結果を、増殖CFSE低 T細胞のパーセンテージとして、又は以下のように算出された抑制のパーセンテージとして表す:(100×[(Tconv CFSE低細胞のパーセンテージ−nTregsとの共培養におけるTconv CFSEのパーセンテージ)/Tconv CSFE低細胞のパーセンテージ)。
古典的7−AAD/CFSE細胞媒介性の細胞傷害性アッセイ:標的細胞を上に記載するようにCFSEで標識し、96ウェルU底プレートに3通りに3×10個/ウェルで配置した。CD8エフェクターT細胞(5:1のE:T比率)を加え、インキュベーションを37℃で6時間にわたり行った。実験の終了時に、死細胞を7−AADで標識して溶解細胞を検出した。標的細胞に対する細胞溶解活性を、FACSCalibur機器を使用し、二重陽性染色CFSE及び7−AADを示す領域に基づいて分析した。CD8T細胞クローンの細胞溶解活性(%)を、陰性対照における自然溶解(%)を差し引いた後、CFSE及び7−AADの両方について陽性の細胞/全CFSE陽性細胞として算出した。細胞溶解活性のパーセンテージを次に、以下の式を使用して算出した:細胞溶解活性(%)[死んだ標的細胞(%)−自然死(%)]×100/[100−自然死(%)]。
DNAメチル化の測定:古典的には、安定したTreg遺伝子シグネチャーは、Treg特異的脱メチル化領域(TSDR)の保存された非コード配列2(CNS2)内の高度に脱メチル化されたCpGアイランドからなった。遺伝子FOXP3のTSDR領域のDNAメチル化分析を、Christopher Fuhrman(Fuhrman et al, Divergent Phenotypes of Human Regulatory T Cells Expressing the Receptors TIGIT and CD226, 2015, Journal of immunology)により以前に記載されているように、ゲノムDNAの亜硫酸水素塩処理後の定量的PCRにより評価した。簡単には、ヌクレオチドを、AllPrep DNA/RNA Mini Kit(Qiagen)又はDNeasy組織キット(Qiagen)を適宜用いて単離した。ゲノムDNAの亜硫酸水素塩処理は、EZ DNA Methylation Kit(Zymo Research)を用いて500ngのDNAで実施した。DNA標準は、非メチル化亜硫酸水素塩変換ヒトEpiTect対照DNA(Qiagen)又は汎用メチル化亜硫酸水素塩変換ヒト対照DNA(Zymo Research)から由来する。多量の標準を得るために、TSDRを、以下の反応を使用してPCR増幅した:25μlのZymoTaq PreMix緩衝液(Zymo Research)ならびに各々0.5μMのプライマーFOXP3_TSDRfwd(5’−ATATTTTTAGATAGGGATATGGAGATGATTTGTTTGG−3’−配列番号1)及びFOXP3_TSDRrev(5’−AATAAACATCACCTACCACATCCACCAACAC−3’−配列番号2)を含む50μMの反応容量。95℃で10分間にわたるインキュベーション後、増幅を以下の通りに実施した:95℃で30秒間、55℃で30秒間、及び72℃で1分間の50サイクル。増幅されたPCR産物を、QIAquick Gel Extraction Kit(Qiagen)を用いて精製した。精製された対照TSDR DNAの濃度を、GE NanoVue分光光度計(GE Healthcare Life Sciences)を用いて決定した。TSDRリアルタイムPCRを、メチル化又は脱メチル化標的配列を標的とするプローブを用いて実施した。反応は、Roche LightCycler 480システム(Roche Diagnostics)を用いて96ウェル白色トレイ中で実施した。各々の反応液は、10μlのLightCycler 480 Probes Master Mix(Roche)、10ngの亜硫酸水素塩変換DNAサンプル又は標準、1μMの各々のプライマー、及び150nMの各々のプローブを含み、最終反応値は20μlであった。増幅のために使用したプローブは、TSDR−フォワード5’−GGTTTGTATTTGGGTTTTGTTGTTATAGT−3’(配列番号3)及びTSDR−リバース5’−CTATAAAATAAAATATCTACCCTCTTCTCTTCCT−3’(配列番号4)であった。標的配列検出用のプローブは、FAM標識メチル化プローブ、FAM−CGGTCGGATGCGTC−MGB−NFQ(配列番号5)、又はVIC標識非メチル化プローブ、VIC−TGGTGGTTGGATGTGTTG−MGB−NFQ(配列番号6)であった。全てのサンプルを三通りに試験した。リアルタイム増幅用のプロトコールは以下の通りである:95℃で10分間の初期変性後、サンプルを95℃で15秒間及び61℃で1分間の50サイクルに供した。14の異なる比率の完全メチル化及び脱メチル化鋳型をリアルタイム標準として使用した。6次多項式を使用して、各々のサンプルについて、TSDRで脱メチル化された細胞のパーセンテージを推定した。
ヒストンアセチル化の測定:FOXP3遺伝子の4つの異なる部位のヒストンアセチル化分析を、以前にLing Lu(Ling Lu et al, PNAS 2014)により記載されているように、ChIPアッセイにより評価した。簡単には、各々の処理nTreg細胞サンプルの50,000個の細胞を収集し、1%ホルムアルデヒドで架橋し、次に120μLの溶解緩衝液[50mM Tris・HCl、pH8.0、10mM EDTA、1%(wt/vol)SDS、プロテアーゼ阻害剤混合物(1:100希釈;Sigma)、1mM PMSF、20mM酪酸Na]を用いて溶解した。溶解物中のクロマチンを500〜800bpのフラグメントに超音波処理し、次に800μLのRIPA ChIP緩衝液[10mM Tris・HCl、pH 7.5、140mM NaCl、1mM EDTA、0.5mM EGTA、1%(vol/1)Triton X−100、0.1%(wt/vol)SDS、0.1%(wt/vol)Na−デオキシコール酸、プロテアーゼ阻害剤混合物(1:100希釈;Sigma)、1mM PMSF、及び20mM酪酸Na]を用いて希釈した。DynabeadsプロテインG(10μL;Invitrogen)を1μgのH3K4me3(Abcam)もしくはH3K9ac(Cell Signaling)又は正常ウサギIgG陰性対照ChIPグレード抗体と別々に2時間にわたりインキュベートした。次に、100μLの剪断されたクロマチンを、全インプットDNA抽出のために、前処理された抗体−ビーズ複合体及び別の100μLの断片化されたクロマチンと別々に免疫沈降させた。免疫沈降したDNAを、以下のプライマーを用いたリアルタイムPCRにより定量化した:プロモーター、5’−ACC GTA CAG CGT GGT TTT TC−3’(配列番号7)及び5’−CTA CCT CCC TGC CAT CTC CT−3’( 配列番号8);CNS1、5’−CCC AAG CCC TAT GTG TGATT−3’(配列番号9)及び5’−GTG TGT CAG GCC TTG TGC TA−3’(配列番号10);CNS2、5’−GTC CTC TCC ACAACC CAA GA−3’(配列番号11)及び5’−GAC ACC ACG GAG GAA GAG AA−3’(配列番号12);CNS3、5’−AGG TGC CGA CCT TTA CTG TG−3’(配列番号13)及び5’−ACA ATA CGG CCT CCT CCT CT−3’(配列番号14)。
結果
a)エクスビボのヒト誘導性腫瘍抗原特異的CD4TCRγδ非制限T細胞におけるFoxp3発現の誘導。
最適条件を、前に記載したように、腫瘍抗原特異的Foxp3発現CD4TCRγδ非制限T細胞を誘導するために設定する。図2は、IL−2ならびにTGFβ、PGE2、及びラパマイシンで構成されるnTreg極性化培地の存在におけるアポトーシス性腫瘍抗原パルスされた免疫寛容原性DC(「腫瘍Ag負荷tDC」)が、抗原特異的な刺激ナイーブ従来型CD4T細胞(「ナイーブTreg」)において高レベルのFoxp3発現を誘導することができ(図2A中の頻度及び図2B中のMFI)、非パルスtDC(「無負荷tDC」)は、同じ極性化培地の存在において、ナイーブ従来型CD4T細胞においてFoxp3発現を誘導することができないことを示す。
b)ヒト乳癌におけるFoxp3を発現する病原性CD4γδT細胞の特異的な動員。
CD4及びFoxp3の発現を示す新規γδT細胞のサブセットが、乳癌(BC)生検から単離されたTILにおいて同定されている。実際に、Foxp3を発現するγδT細胞は正常個体からのPBMCにおいては稀であるが(<1%)、それらは、図3に示すように、BC生検から精製されたTILにおいて強く濃縮されている(約10倍)。
一般的にヒトγδT細胞は、それらのTCRδ鎖の用途に従って2つの主要な構造サブセット:Vδ1及びVδ2T細胞(Vδ1は優勢な組織内在細胞であるのに対し、Vδ2は末梢血における主要なサブセットである)に分けられるため、本発明者らは、この新たなCD4Foxp3γδTサブセットにおけるTCR Vδ鎖をフローサイトメトリーにより検討してきた。図4は、Foxp3を発現する病原性CD4γδT細胞の大半(>85%)が、Vδ1negVδ2negであることを示す。
本発明者らは次に、BC生検から単離されたFoxp3発現CD3CD4γδT細胞非制限T細胞の機能抑制能力を評価した。図5は、新鮮なTregと同様に、Foxp3を発現するこれらのCD4γδT細胞が、標準的なポリクローナル細胞−細胞接触Treg抑制アッセイを使用した場合に抑制活性を呈することを示す。
c)腫瘍抗原特異的FOXP3発現CD4TCRγδ非制限T細胞に対する自己CD8媒介性T細胞応答の誘導。
培養系を確立し、それにおいて、自己CD3ナイーブT細胞と共培養したアポトーシス性病原性CD4T細胞を負荷した炎症性DC(inf DC)によって、樹状細胞を負荷するために使用した病原性CD4T細胞に対するCD8T細胞株の生成を誘導することができる。図6は、それぞれ−inf DC(「mDC」)又は−TAP阻害DCを負荷したアポトーシス性病原性CD4T細胞を用いて誘導された2つのCD8クローンによって、それらの特異的標的、それらの誘導性病原性CD4T細胞クローンを溶解できることを示す。しかし、両方のCD8クローンを自己EBV細胞株に対して試験する場合、それらはこの標的を溶解することはできない(図6)。
d)内腔B乳癌から分離された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)におけるFoxp3発現T細胞の存在。
内腔A及びBサブタイプは両方ともエストロゲン受容体陽性(ER+)及び低悪性度であり、内腔A腫瘍は非常にゆっくり成長し、内腔B腫瘍はより急速に成長する。内腔A腫瘍は最良の予後を有する。内腔B腫瘍は不良な臨床転帰と関連付けられる。本発明者らは、両方の内腔サブタイプの乳癌から単離されたTIL中のリンパ球の表現型をフローサイトメトリーにより検証し、CD3CD4TCRαβMHCII制限及びCD3CD4TCRγδ非制限T細胞におけるFoxp3発現の存在を見出した。Foxp3は内腔A***腫瘍から抽出されたTILにおいて検出されなかった(図7)。さらに、正の相関が、CD3CD4TCRγδ非制限T細胞における高いパーセンテージのFoxp3発現と乳癌における不良な臨床転帰の間で観察される(図8)。
Foxp3発現CD3CD4TCRαβMHCII制限T細胞及びFoxp3発現CD3TCRαβ非制限T細胞はそれぞれ、試験サンプル中のCD3TCRαβT細胞の約20%及びCD3TCRγδの23%に相当する。Foxp3発現CD3TCRγδT細胞は、Foxp3CD3TCRαβT細胞と同じ表現型プロファイルを提示する。これらのFoxp3TCRγδT細胞集団は、Foxp3CD3TCRαβT細胞のレベルと同様のレベルのFoxp3、CD25、及びCTLA4を発現する(図9)。
d)排他的に調節活性を発揮するようにコミットされた、Foxp3を発現する特異的CD3TCRγδのエクスビボでの生成及び増殖。
抗原特異的Tregの抑制能力が、ポリクローナルTregのそれよりもはるかに大きいことが試験によって示唆されたため、本発明者らは、いずれの刺激の培養条件であっても、排他的に調節活性を発揮するようにコミットされた、エクスビボで生成及び増殖された抗原特異的Foxp3発現CD3TCRγδ非制限T細胞に対する方法を設定した。
図10は、IL−15、IL−2、TGFβ、PGE2、及びラパマイシンの組み合わせを含むnTreg極性化培地の存在において、ゾレドロン酸処理自己tDCで刺激されたナイーブCD3TCRγδT細胞(CD3CD45RACD27+TCRγδT細胞)が、21日間の増殖後にFoxp3を発現し、標準的なポリクローナル細胞−細胞接触Treg抑制アッセイにより評価されるように、有意な機能的抑制活性を示すことを示す。興味深いことに、21日間増殖させたFOXP3発現CD3TCRγδT細胞は、nTreg極性化培地中でのさらに21日間の培養後、それらのFoxp3レベル及びそれらの抑制活性を維持している。

Claims (18)

  1. 以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞をエクスビボで生成するための方法であって、以下を含む方法
    γδT細胞活性化剤及び以下の薬剤:i)cAMP(環状アデノシン一リン酸)活性化剤、ii)TGFβ(形質転換成長因子ベータ)経路活性化剤、iii)mTOR 阻害剤、場合によりiv)IL−2、IL−7、IL−15、及びTSLPの群において選択される少なくとも1つのサイトカイン、ならびに場合によりv)少なくとも1つのTET酵素活性化剤及び/又は少なくとも1つのDNMT阻害剤の存在においてCD3TCRγδT細胞を、少なくとも5日間培養すること。
  2. γδT細胞活性化剤がポリクローナルγδT細胞活性化剤、好ましくは抗TCRγδ抗体又は非ペプチドリン酸化抗原である、請求項1記載の方法。
  3. γδT細胞活性化剤が抗原特異的γδT細胞活性化剤、好ましくは寛容原性樹状細胞(DC)であり、少なくとも1つのビスホスホネート、好ましくは少なくとも1つのアミノビスホスホネート(aminobiphosphonate)を用いてパルスされる、請求項1記載の方法。
  4. cAMP活性化剤が、プロスタグランジンE2(PGE2)、EP2もしくはEP4アゴニスト、膜アデニンシクラーゼ活性化剤、又は代謝型グルタミン酸受容体アゴニストを含む群より選択される、請求項1〜3のいずれか一項記載の方法。
  5. TGFβ経路活性化剤が、TGFβ、骨形成タンパク質(BMP)、成長及び分化因子(GDF)、抗ミュラー管ホルモン(AMH)、アクチビン、ならびにノダールを含む群より選択される、請求項1〜4のいずれか一項記載の方法。
  6. mTOR阻害剤が、ラパマイシン、ラパマイシン類似体、ウォルトマンニン;テオフィリン;カフェイン;エピガロカテキンガレート(EGCG)、クルクミン、レスベラトロール;ゲニステイン、3,3−ジインドリルメタン(DIM)、LY294002(2−(4−モルホリニル)−8−フェニル−4H−1−ベンゾピラン−4−オン)、PP242、PP30、Torin1、Ku−0063794、WAY−600、WYE−687、WYE−354、GNE477、NVP−BEZ235、PI−103、XL765、及びWJD008を含む群より選択される、請求項1〜5のいずれか一項記載の方法。
  7. 請求項1〜6の生成方法により得られたγδFoxp3調節性T細胞を、γδT細胞活性化剤及び以下の薬剤:i)cAMP(環状アデノシン一リン酸)活性化剤、ii)TGFβ(形質転換成長因子ベータ)経路活性化剤、iii)mTOR 阻害剤、場合によりiv)IL−2、IL−7、IL−15、及びTSLPの群において選択される少なくとも1つのサイトカイン、ならびに場合によりv)少なくとも1つのTET酵素活性化剤及び/又は少なくとも1つのDNMT阻害剤の存在において、少なくとも5日間培養する工程をさらに含む、請求項1〜6のいずれか一項記載の方法。
  8. 請求項1〜6のいずれか一項記載の方法により入手可能なエクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞集団。
  9. γδFoxp3調節性T細胞が、以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有する、請求項7記載の方法により入手可能なエクスビボで生成及び増殖されたγδFoxp3調節性T細胞集団。
  10. γδFoxp3調節性T細胞が、以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有する、炎症条件において機能的に安定なままである、エクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞集団。
  11. 調節性T細胞集団が以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3IL−1R1を有する、請求項10記載のエクスビボで生成されたγδFoxp3調節性T細胞集団。
  12. 以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有する不活化γδFoxp3調節性T細胞、又は以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブ、又は以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブを負荷した免疫原性樹状細胞を含む免疫原性産物。
  13. 以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有する不活化γδFoxp3調節性T細胞、又は以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブ、又は以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブを負荷した免疫原性樹状細胞、及び少なくとも医薬的に許容可能な賦形剤を含む医薬的組成物。
  14. 以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有する不活化γδFoxp3調節性T細胞、又は以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブ、又は以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞のブレブを負荷した免疫原性樹状細胞、及び少なくとも1つのアジュバントを含むワクチン組成物。
  15. 癌を処置する際での使用のための、請求項10〜12のいずれか一項記載の免疫原性産物、医薬組成物、又はワクチン組成物。
  16. 以下の表現型:CD3TCRγδFoxp3を有するγδFoxp3調節性T細胞、及び少なくとも1つの医薬的に許容可能な賦形剤を含む医薬組成物。
  17. 細胞治療における使用のための、請求項15記載の医薬組成物。
  18. 炎症性疾患もしくは自己免疫疾患を処置する際での使用のための、又は移植拒絶反応もしくは移植片対宿主病(GVHD)を防止するための、請求項15記載の医薬組成物。
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