JP2011510664A5 - - Google Patents

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別の実施形態では、本発明は、前段落の方法によって同定されたモジュレーターを提供する。
したがって、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
対象とするヘテロ二量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする導入核酸から該対象とするヘテロ二量体タンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とするヘテロ二量体タンパク質を産生することを特徴とし、該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まないか、または該タンパク質が、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せである、細胞。
（項目２）
対象とするヘテロ二量体タンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、該対象とするヘテロ二量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されており、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とするヘテロ二量体タンパク質を産生することを特徴とし、該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まないか、または該タンパク質が、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せである、細胞。
（項目３）
対象とするヘテロ二量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする導入核酸から該対象とするヘテロ二量体タンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、選択圧の不在下で培養される、細胞。
（項目４）
対象とするヘテロ二量体タンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、該対象とするヘテロ二量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されており、生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、選択圧の不在下で培養される、細胞。
（項目５）
上記対象とするヘテロ二量体タンパク質の第２サブユニットをコードする核酸が内因性である、項目１から４のいずれか一項に記載の細胞。
（項目６）
上記対象とするヘテロ二量体タンパク質の第２サブユニットをコードする核酸が導入されている、項目２または４に記載の細胞。
（項目７）
上記対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まない、項目１から６のいずれか一項に記載の細胞。
（項目８）
上記対象とするヘテロ二量体タンパク質が、イオンチャネル、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ）、チロシン受容体キナーゼ、サイトカイン受容体、核ステロイドホルモン受容体および免疫学的受容体からなる群より選択される、項目１から７のいずれか一項に記載の細胞。
（項目９）
上記対象とするヘテロ二量体タンパク質が、甘味受容体およびうま味受容体からなる群より選択される、項目８に記載の細胞。
（項目１０）
上記対象とするヘテロ二量体タンパク質が公知のリガンドを有さない、項目１から８のいずれか一項に記載の細胞。
（項目１１）
上記対象とするヘテロ二量体タンパク質が同じ型の細胞中で発現されない、項目１から１０のいずれか一項に記載の細胞。
（項目１２）
哺乳動物細胞である、項目１から１１のいずれか一項に記載の細胞。
（項目１３）
１を超えるシグナル対ノイズ比、時間をわたって安定であること、発現の消失を伴わない選択圧なしでの増殖、生理的なＥＣ５０値、および生理的なＩＣ５０値からなる群より選択される追加の望ましい特性を有することをさらに特徴とする、項目１から１２のいずれか一項に記載の細胞。
（項目１４）
上記対象とするヘテロ二量体タンパク質が少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも１ヶ月、少なくとも２ヶ月、少なくとも３ヶ月、少なくとも４ヶ月、少なくとも５ヶ月、少なくとも６ヶ月、少なくとも７ヶ月、少なくとも８ヶ月、および少なくとも９ヶ月から選択される期間１つの形で一貫して再現性よく産生される、項目１、２および５から１３のいずれか一項に記載の細胞。
（項目１５）
上記機能アッセイが細胞ベースアッセイ、蛍光細胞ベースアッセイ、高スループットスクリーニングアッセイ、受容体細胞ベースアッセイ、Ｇタンパク質媒介細胞ベースアッセイ、およびカルシウムフラックス細胞ベースアッセイからなる群より選択される、項目１、２および５から１３のいずれか一項に記載の細胞。
（項目１６）
上記細胞が細胞ベースの高スループットスクリーニングでの利用に適している、項目１、２および５から１３のいずれか一項に記載の細胞。
（項目１７）
上記選択圧が抗生物質である、項目３から１３のいずれか一項に記載の細胞。
（項目１８）
少なくとも１５日間、３０日間、４５日間、６０日間、７５日間、１００日間、１２０日間、または１５０日間、選択圧の不在下で上記ヘテロ二量体タンパク質を発現する、項目３から１３および１７のいずれか一項に記載の細胞。
（項目１９）
対象とするヘテロ多量体タンパク質を発現する細胞であって、該ヘテロ多量体タンパク質が少なくとも３つのサブユニットを含み、該対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットが導入核酸によってコードされており、該細胞は、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とするヘテロ二量体タンパク質を産生することを特徴とし、該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まないか、または該タンパク質が、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せである、細胞。
（項目２０）
対象とするヘテロ多量体タンパク質を発現する細胞であって、該ヘテロ多量体タンパク質が少なくとも３つのサブユニットを含み、該細胞は、該対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されており、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とするヘテロ二量体タンパク質を産生することを特徴とし、該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まないか、または該タンパク質が、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せである、細胞。
（項目２１）
対象とするヘテロ多量体タンパク質を発現する細胞であって、該ヘテロ多量体タンパク質が少なくとも３つのサブユニットを含み、該対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットが導入核酸によってコードされており、該細胞が生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とする、細胞。
（項目２２）
対象とするヘテロ多量体タンパク質を発現する細胞であって、該ヘテロ多量体タンパク質が少なくとも３つのサブユニットを含み、該細胞が該対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されており、該細胞が生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とする細胞。
（項目２３）
上記対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする上記核酸が内因性である、項目１９から２２のいずれか一項に記載の細胞。
（項目２４）
上記対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする上記核酸が導入されている、項目２０または２２に記載の細胞。
（項目２５）
上記対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まない、項目１９から２４のいずれか一項に記載の細胞。
（項目２６）
上記対象とするヘテロ多量体タンパク質が、イオンチャネル、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ）、チロシン受容体キナーゼ、サイトカイン受容体、核ステロイドホルモン受容体および免疫学的受容体からなる群より選択される、項目１９から２５のいずれか一項に記載の細胞。
（項目２７）
上記対象とするヘテロ多量体タンパク質が、ＧＡＢＡ、ＥＮａＣおよびＮａＶからなる群より選択される、項目２６に記載の細胞。
（項目２８）
上記対象とするヘテロ多量体タンパク質が公知のリガンドを有さない、項目１９から２６のいずれか一項に記載の細胞。
（項目２９）
上記対象とするヘテロ二量体タンパク質が同じ型の細胞中で発現されない、項目１９から２８のいずれか一項に記載の細胞。
（項目３０）
哺乳動物細胞である、項目１９から２９のいずれか一項に記載の細胞。
（項目３１）
１を超えるシグナル対ノイズ比、時間をわたって安定であること、発現の消失を伴わない選択圧なしでの増殖、生理的なＥＣ５０値、および生理的なＩＣ５０値からなる群より選択される追加の望ましい特性を有することをさらに特徴とする、項目１９から３０のいずれか一項に記載の細胞。
（項目３２）
上記対象とするヘテロ多量体タンパク質が少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも１ヶ月、少なくとも２ヶ月、少なくとも３ヶ月、少なくとも４ヶ月、少なくとも５ヶ月、少なくとも６ヶ月、少なくとも７ヶ月、少なくとも８ヶ月、および少なくとも９ヶ月から選択される期間１つの形で一貫して再現性よく産生される、項目１９、２０および２３から３１のいずれか一項に記載の細胞。
（項目３３）
上記機能アッセイが細胞ベースアッセイ、蛍光細胞ベースアッセイ、高スループットスクリーニングアッセイ、受容体細胞ベースアッセイ、Ｇタンパク質媒介細胞ベースアッセイ、およびカルシウムフラックス細胞ベースアッセイからなる群より選択される、項目１９、２０および２３から３１のいずれか一項に記載の細胞。
（項目３４）
細胞ベースの高スループットスクリーニングでの利用に適している、項目１９、２０および２３から３１のいずれか一項に記載の細胞。
（項目３５）
選択圧の不在下で培養される、項目２１から３１のいずれか一項に記載の細胞。
（項目３６）
上記選択圧が抗生物質である、項目３５に記載の細胞。
（項目３７）
少なくとも１５日間、３０日間、４５日間、６０日間、７５日間、１００日間、１２０日間、または１５０日間、選択圧の不在下で上記ヘテロ多量体タンパク質を発現する、項目３５または３６に記載の細胞。
（項目３８）
対象とするタンパク質の少なくとも１つをコードする導入核酸から２つ以上の該対象とするタンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まないか、または該タンパク質が、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せである、細胞。
（項目３９）
２つ以上の対象とするタンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、該対象とするタンパク質の少なくとも１つをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されており、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まないか、または該タンパク質が、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せである、細胞。
（項目４０）
対象とするタンパク質の少なくとも１つをコードする導入核酸から２つ以上の該対象とするタンパク質を発現する細胞であって、生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とする細胞。
（項目４１）
２つ以上の対象とするタンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、該対象とするタンパク質の少なくとも１つをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されており、生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とする細胞。
（項目４２）
対象とする少なくとも１つのタンパク質が二量体タンパク質である、項目３８から４１のいずれか一項に記載の細胞。
（項目４３）
上記対象とする二量体タンパク質がホモ二量体タンパク質である、項目４２に記載の細胞。
（項目４４）
上記対象とする二量体タンパク質がヘテロ二量体タンパク質である、項目４２に記載の細胞。
（項目４５）
対象とする少なくとも１つのタンパク質が多量体タンパク質である、項目３８から４１のいずれか一項に記載の細胞。
（項目４６）
上記対象とする多量体タンパク質がホモ多量体タンパク質である、項目４５に記載の細胞。
（項目４７）
上記対象とする多量体タンパク質がヘテロ多量体タンパク質である、項目４５に記載の細胞。
（項目４８）
上記タンパク質の１つが内因性核酸によってコードされている、項目３８から４７のいずれか一項に記載の細胞。
（項目４９）
上記タンパク質の１つが導入核酸によってコードされている、項目３９または４１に記載の細胞。
（項目５０）
上記対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まない、項目３８から４９のいずれか一項に記載の細胞。
（項目５１）
上記対象とするタンパク質の１つが、イオンチャネル、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ）、チロシン受容体キナーゼ、サイトカイン受容体、核ステロイドホルモン受容体および免疫学的受容体からなる群より選択される、項目３８から４９のいずれか一項に記載の細胞。
（項目５２）
上記対象とするタンパク質の１つが公知のリガンドを有さない、項目３８から５１のいずれか一項に記載の細胞。
（項目５３）
上記対象とするタンパク質の１つが同じ型の細胞中で発現されない、項目３８から５２のいずれか一項に記載の細胞。
（項目５４）
哺乳動物細胞である、項目３８から５３のいずれか一項に記載の細胞。
（項目５５）
１を超えるシグナル対ノイズ比、時間をわたって安定であること、発現の消失を伴わない選択圧なしでの増殖、生理的なＥＣ５０値、および生理的なＩＣ５０値からなる群より選択される追加の望ましい特性を有することをさらに特徴とする、項目３８から５４のいずれか一項に記載の細胞。
（項目５６）
上記対象とする２つ以上のタンパク質が少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも１ヶ月、少なくとも２ヶ月、少なくとも３ヶ月、少なくとも４ヶ月、少なくとも５ヶ月、少なくとも６ヶ月、少なくとも７ヶ月、少なくとも８ヶ月、および少なくとも９ヶ月から選択される期間１つの形で一貫して再現性よく産生される、項目３８、３９および４２から５５のいずれか一項に記載の細胞。
（項目５７）
上記機能アッセイが細胞ベースアッセイ、蛍光細胞ベースアッセイ、高スループットスクリーニングアッセイ、受容体細胞ベースアッセイ、Ｇタンパク質媒介細胞ベースアッセイ、およびカルシウムフラックス細胞ベースアッセイからなる群より選択される、項目３８、３９および４２から５５のいずれか一項に記載の細胞。
（項目５８）
細胞ベースの高スループットスクリーニングでの利用に適している、項目３８、３９および４２から５５のいずれか一項に記載の細胞。
（項目５９）
選択圧の不在下で培養される、項目４０から５５のいずれか一項に記載の細胞。
（項目６０）
上記選択圧が抗生物質である、項目５９に記載の細胞。
（項目６１）
少なくとも１５日間、３０日間、４５日間、６０日間、７５日間、１００日間、１２０日間、または１５０日間、選択圧の不在下で上記２つ以上のタンパク質を発現する、項目５９または６０に記載の細胞。
（項目６２）
対象とする少なくとも１つのＲＮＡを発現する細胞であって、該対象とするＲＮＡが導入核酸によってコードされており、該細胞が機能アッセイでの使用に適した形で該対象とする少なくとも１つのＲＮＡを産生することを特徴とし、該対象とするＲＮＡがタグを含まず、または該ＲＮＡが、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せである、細胞。
（項目６３）
対象とする少なくとも１つのＲＮＡを発現する細胞であって、該細胞は、該対象とする少なくとも１つのＲＮＡをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されており、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とする少なくとも１つのＲＮＡを産生することを特徴とし、該対象とするＲＮＡがタグを含まず、または該ＲＮＡが、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せである、細胞。
（項目６４）
対象とする少なくとも２つのＲＮＡを発現する、項目６２または６３に記載の細胞。
（項目６５）
対象とする少なくとも３つのＲＮＡを発現する、項目６２または６３に記載の細胞。
（項目６６）
導入核酸によってコードされるＲＮＡをさらに発現する、項目６４から６５のいずれか一項に記載の細胞。
（項目６７）
上記対象とするＲＮＡが、イオンチャネルをコードするＲＮＡ、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ）をコードするＲＮＡ、チロシン受容体キナーゼをコードするＲＮＡ、サイトカイン受容体をコードするＲＮＡ、核ステロイドホルモン受容体をコードするＲＮＡおよび免疫学的受容体をコードするＲＮＡからなる群より選択される、項目６２から６６のいずれか一項に記載の細胞。
（項目６８）
上記対象とするＲＮＡが同じ型の細胞中で発現されない、項目６２から６７のいずれか一項に記載の細胞。
（項目６９）
哺乳動物細胞である、項目６２から６８のいずれか一項に記載の細胞。
（項目７０）
１を超えるシグナル対ノイズ比、時間をわたって安定であること、発現の消失を伴わない選択圧なしでの増殖、生理的なＥＣ５０値、および生理的なＩＣ５０値からなる群より選択される追加の望ましい特性を有することをさらに特徴とする、項目６２から６９のいずれか一項に記載の細胞。
（項目７１）
上記対象とするＲＮＡが少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも１ヶ月、少なくとも２ヶ月、少なくとも３ヶ月、少なくとも４ヶ月、少なくとも５ヶ月、少なくとも６ヶ月、少なくとも７ヶ月、少なくとも８ヶ月、および少なくとも９ヶ月から選択される期間１つの形で一貫して再現性よく産生される、項目６２から７０のいずれか一項に記載の細胞。
（項目７２）
上記機能アッセイが細胞ベースアッセイ、蛍光細胞ベースアッセイ、高スループットスクリーニングアッセイ、受容体細胞ベースアッセイ、Ｇタンパク質媒介細胞ベースアッセイ、およびカルシウムフラックス細胞ベースアッセイからなる群より選択される、項目６２から７１のいずれか一項に記載の細胞。
（項目７３）
細胞ベースの高スループットスクリーニングでの利用に適している、項目６１から７２のいずれか一項に記載の細胞。
（項目７４）
項目１から７３のいずれか一項に記載の細胞から作製された細胞系。
（項目７５）
対象とするタンパク質を発現する細胞を作製するための方法であって、該細胞が時間をわたって一貫する少なくとも１つの望ましい特性を有し、
ａ）該対象とするタンパク質をコードするｍＲＮＡを発現する複数の細胞を提供するステップと、
ｂ）細胞を個々の培養容器中に個々に分散させ、それによって複数の別々の細胞培養物を提供するステップと、
ｃ）自動化細胞培養方法を使用して一組の望ましい培養条件下で該細胞を培養するステップであって、該条件が該別々の細胞培養物のそれぞれについて実質的に同一であり、該培養中、別々の細胞培養物当たりの細胞数を培養物毎に正規化し、該別々の培養物を同じスケジュールで継代することを特徴とする、ステップと、
ｄ）該対象とするタンパク質の少なくとも１つの望ましい特徴について該別々の細胞培養物を少なくとも２回アッセイするステップと、
ｅ）両方のアッセイで該望ましい特徴を有する別々の細胞培養物を同定するステップであって、該細胞がその細胞（ａ ｃｅｌｌ ｔｈａｔ）であるステップ、と
を含む、方法。
（項目７６）
ステップａ）における複数の細胞を、ステップｂ）の分散させることの前に、ある程度の期間培養する、項目７５に記載の方法。
（項目７７）
上記個々の培養容器がマルチウエルプレートの個々のウエルおよびバイアルからなる群より選択される、項目７５に記載の方法。
（項目７８）
複数の上記別々の細胞培養物の増殖速度を決定するステップ、および任意の群中で最も速い増殖速度と最も遅い増殖速度との差がステップｂ）とｃ）の間で１、２、３、４、または５日を超えないように、その増殖速度によって該別々の細胞培養物を群に分けるステップをさらに含む、項目７５に記載の方法。
（項目７９）
１つまたは複数の上記別々の培養物の保存ストックを調製するステップをさらに含む、項目７５または項目７８に記載の方法。
（項目８０）
上記別々の細胞培養物の１つまたは複数の複製セットのステップ、および供給源である上記別々の細胞培養物由来の該１つまたは複数の複製セットを別々に培養するステップをさらに含む、項目７５に記載の方法。
（項目８１）
ステップｄ）でのアッセイが上記タンパク質の機能アッセイである、項目７５に記載の方法。
（項目８２）
ステップｅ）で一定のままである上記少なくとも１つの特徴がタンパク質機能である、項目７５に記載の方法。
（項目８３）
ステップｃ）での上記培養がロボット細胞培養装置におけるものである、項目７５に記載の方法。
（項目８４）
上記ロボット細胞培養装置がマルチチャネルロボットピペッターを含む、項目８３に記載の方法。
（項目８５）
上記マルチチャネルロボットピペッターが少なくとも９６チャネルを含む、項目８４に記載の方法。
（項目８６）
上記ロボット細胞培養装置がチェリーピッキングアームをさらに含む、項目８４に記載の方法。
（項目８７）
上記自動化方法が培地除去、培地交換、細胞洗浄、試薬添加、細胞の除去、細胞分散、および細胞継代の１つまたは複数を含む、項目７５に記載の方法。
（項目８８）
複数の上記別々の細胞培養物が少なくとも５０個の培養物である、項目７５に記載の方法。
（項目８９）
複数の上記別々の細胞培養物が少なくとも１００個の培養物である、項目７５に記載の方法。
（項目９０）
複数の上記別々の細胞培養物が少なくとも５００個の培養物である、項目７５に記載の方法。
（項目９１）
複数の上記別々の細胞培養物が少なくとも１０００個の培養物である、項目７５に記載の方法。
（項目９２）
ＡＴＰの測定、細胞集密度の測定、光散乱、光学濃度測定からなる群より選択される方法によって上記増殖速度を決定する、項目７８に記載の方法。
（項目９３）
上記群中で最も速い増殖速度と最も遅い増殖速度との差が１、２、３、４、または５時間を超えない、項目７８に記載の方法。
（項目９４）
ステップｃ）での培養が少なくとも２日間である、項目７５に記載の方法。
（項目９５）
複数の上記別々の細胞培養物の増殖速度を上記細胞を分散させることおよび細胞集密度を測定することによって決定する、項目７８に記載の方法。
（項目９６）
上記それぞれ別々の細胞培養物中の細胞を細胞集密度の測定前に分散させる、項目９５に記載の方法。
（項目９７）
上記分散ステップがトリプシンを上記ウエルに加えて塊を除去することを含む、項目９５または９６に記載の方法。
（項目９８）
複数の上記別々の細胞培養物の細胞集密度を、自動化マイクロプレートリーダーを使用して測定する、項目９５に記載の方法。
（項目９９）
少なくとも２回の集密度測定を、増殖速度を計算する前に実施する、項目９５に記載の方法。
（項目１００）
上記細胞集密度を自動化プレートリーダーによって測定し、かつ増殖速度を計算するソフトウェアプログラムと共に該集密度値を使用する、項目９８に記載の方法。
（項目１０１）
ステップｄ）での別々の細胞培養物が、脆弱性、形態、固体表面との接着性、固体表面との接着性の欠如およびタンパク質機能の１つまたは複数から選択される望ましい特質を特徴とする、項目７５に記載の方法。
（項目１０２）
上記細胞が真核細胞である、項目７５に記載の方法。
（項目１０３）
上記真核細胞が哺乳動物細胞である、項目７５に記載の方法。
（項目１０４）
上記哺乳動物細胞系がＮＳ０細胞、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞、ＨＥＫ−２９３細胞、ＨＵＶＥＣ、３Ｔ３細胞およびＨｅＬａ細胞からなる群より選択される、項目７５に記載の方法。
（項目１０５）
上記対象とするタンパク質がヒトタンパク質である、項目７５に記載の方法。
（項目１０６）
上記対象とするタンパク質がヘテロ多量体である、項目７５に記載の方法。
（項目１０７）
上記対象とするタンパク質がＧタンパク質共役受容体である、項目７５に記載の方法。
（項目１０８）
上記タンパク質が公知のリガンドを有さない、項目７５に記載の方法。
（項目１０９）
上記同定ステップの後に、
ａ）望ましい培養条件下においてステップｅ）で同定した細胞培養物の保存アリコートを拡大増殖させるステップと、
ｂ）該ａ）の拡大増殖させた細胞培養物が望ましい特徴を有するかどうかを決定するステップと
をさらに含む、項目７５に記載の方法。
（項目１１０）
クローン細胞系の適合パネルであって、該クローン細胞系が同じ細胞型であり、該パネル中のそれぞれの細胞系が対象とするタンパク質を発現し、該パネル中のクローン細胞系が同じ生理学的特徴を共有するように適合されていることにより並行処理が可能となる、クローン細胞系の適合パネル。
（項目１１１）
上記生理学的特徴が増殖速度である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１１２）
上記生理学的特徴が組織培養物表面との接着性である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１１３）
上記生理学的特徴がＺ’係数である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１１４）
上記生理学的特徴が上記対象とするタンパク質をコードするＲＮＡの発現レベルである、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１１５）
上記生理学的特徴が上記対象とするタンパク質の発現レベルである、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１１６）
上記パネル中のクローン細胞系の増殖速度が互いに１、２、３、４、または５時間の範囲内にある、項目１１１に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１１７）
上記培養条件が上記パネル中の全てのクローン細胞系で同じである、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１１８）
上記クローン細胞系が真核細胞系である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１１９）
上記真核細胞系が哺乳動物細胞系である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２０）
上記細胞系の細胞が初代細胞および不死化細胞からなる群より選択される、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２１）
上記細胞系の細胞が原核細胞または真核細胞である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２２）
上記細胞系の細胞が真核細胞であり、真菌細胞、昆虫細胞、哺乳動物細胞、酵母細胞、藻類、甲殻類細胞、節足動物細胞、鳥類細胞、爬虫類細胞、両生類細胞および植物細胞からなる群より選択される、項目１２１に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２３）
上記細胞系の細胞が哺乳動物細胞であり、ヒト、非ヒト霊長類、ウシ、ブタ、ネコ、ラット、有袋動物、ネズミ、イヌ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ、モルモット、ハムスターからなる群より選択される、項目１２２に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２４）
上記細胞系の細胞が上記対象とするタンパク質を発現するように操作されている、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２５）
上記細胞系の細胞が、上記対象とするタンパク質をコードする、または多量体タンパク質の場合では該タンパク質のサブユニットをコードする導入核酸から該タンパク質を発現する、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２６）
上記細胞が内因性核酸から上記対象とするタンパク質を発現し、該細胞が内因性タンパク質の転写を活性化する、または多量体タンパク質の場合では該タンパク質のサブユニットの転写を活性化するように操作されている、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２７）
上記パネルが少なくとも４個のクローン細胞系を含む、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２８）
上記パネルが少なくとも６個のクローン細胞系を含む、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１２９）
上記パネルが少なくとも２５個のクローン細胞系を含む、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３０）
上記パネル中の２つ以上のクローン細胞系が対象とする同じタンパク質を発現する、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３１）
上記パネル中の２つ以上のクローン細胞系が対象とする異なるタンパク質を発現する、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３２）
上記パネル中の細胞系が異なる形態の対象とするタンパク質を発現し、該形態がアイソフォーム、アミノ酸配列変異体、スプライス変異体、切断型、融合タンパク質、キメラ、またはそれらの組合せからなる群より選択される、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３３）
上記パネル中の細胞系が対象とするタンパク質の群中の異なるタンパク質を発現し、該対象とするタンパク質の群が同じシグナル伝達経路中のタンパク質、類似したタンパク質の発現ライブラリー、モノクローナル抗体重鎖ライブラリー、モノクローナル抗体軽鎖ライブラリーおよびＳＮＰからなる群より選択される、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３４）
上記対象とするタンパク質が単鎖タンパク質である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３５）
上記単鎖タンパク質がＧタンパク質共役受容体である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３６）
上記Ｇタンパク質共役受容体が味覚受容体である、項目１３５に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３７）
上記味覚受容体が苦味受容体、甘味受容体、塩味受容体およびうま味受容体からなる群より選択される、項目１３６に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３８）
上記タンパク質が多量体タンパク質である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１３９）
上記タンパク質がヘテロ二量体またはヘテロ多量体である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４０）
上記タンパク質が、イオンチャネル、イオンチャネル、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ）、チロシン受容体キナーゼ、サイトカイン受容体、核ステロイドホルモン受容体および免疫学的受容体からなる群より選択される、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４１）
上記タンパク質が上皮ナトリウムチャネル（ＥＮａＣ）である、項目１４０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４２）
上記ＥＮａＣがαサブユニット、βサブユニットおよびγサブユニットを含む、項目１４０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４３）
上記パネル中の細胞系が異なるＥＮａＣアイソフォームを発現する、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４４）
上記パネル中の細胞系がＥＮａＣの異なるタンパク質分解アイソフォームを含む、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４５）
上記ＥＮａＣがヒトＥＮａＣである、項目１４１から１４３のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４６）
上記タンパク質が電位依存性ナトリウムチャネル（ＮａＶ）である、項目１４０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４７）
上記ＮａＶが１つのαサブユニットおよび２つのβサブユニットを含む、項目１４６に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４８）
上記ＮａＶがヒトＮａＶである、項目１４０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１４９）
上記タンパク質がγ−アミノ酪酸Ａ受容体（ＧＡＢＡ Ａ 受容体）、γ−アミノ酪酸Ｂ受容体（ＧＡＢＡ Ｂ 受容体）およびγ−アミノ酪酸Ｃ受容体（ＧＡＢＡ Ｃ 受容体）からなる群より選択される、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１５０）
上記タンパク質がＧＡＢＡ Ａ 受容体である、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１５１）
上記ＧＡＢＡ Ａ 受容体が２つのαサブユニット、２つのβサブユニットおよび１つのγまたはδサブユニットを含む、項目１５０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１５２）
上記パネル中のクローン細胞系が同時に、または互いに４週間を超えない内に作製された、項目１１０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
（項目１５３）
対象とする単量体タンパク質をコードする導入核酸から該対象とする単量体タンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、該細胞は選択圧の不在下で培養され、かつ該タンパク質の発現が３ヶ月にわたって３０％を超えて変化しない、細胞。
（項目１５４）
上記タンパク質の発現が６ヶ月にわたって３０％を超えて変化しない、項目１５３に記載の細胞。
（項目１５５）
上記対象とするタンパク質が公知のリガンドを有さない、項目１５３または１５４に記載の細胞。
（項目１５６）
対象とするタンパク質のモジュレーターを同定するための方法であって、該細胞は：
ａ）項目１から７４のいずれか一項に記載の細胞を試験化合物と接触させるステップと、
ｂ）該試験化合物と接触させなかった細胞における該タンパク質の活性と比較した、該試験化合物と接触させた細胞における該対象とするタンパク質の活性の変化を検出するステップと
を含み、不在下と比較して存在下で活性の差を生じる化合物が該対象とするタンパク質のモジュレーターである、方法。
（項目１５７）
項目１５６に記載の方法によって同定されたモジュレーター。
（項目１５８）
項目１５６に記載の方法によって同定されたモジュレーター。
（項目１５９）
上記対象とするＲＮＡがｓｉＲＮＡまたはアンチセンスＲＮＡである、項目６３に記載の細胞。
（項目１６０）
対象とする少なくとも１つのタンパク質を発現する細胞であって、該対象とするタンパク質が公知のリガンドを有さないか、または該対象とするタンパク質の機能的発現を検出する公知のアッセイが存在せず、かつ該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まない細胞。
（項目１６１）
上記対象とするタンパク質が少なくとも２、３、４、５、または６つのサブユニットを含む、項目１５９に記載の細胞。
（項目１６２）
上記対象とするタンパク質が
Figure 2011510664
 からなる群より選択される表３に示すヒト遺伝子記号によって特定されるオーファン受容体である、項目１５９に記載の細胞。
（項目１６３）
上記対象とするタンパク質の少なくとも１つのサブユニットが遺伝子活性化によって発現される、項目１５９に記載の細胞。
（項目１６４）
上記対象とするタンパク質の少なくとも１つのサブユニットが導入核酸から発現される、項目１５９に記載の細胞。
（項目１６５）
上記対象とするタンパク質が公知のリガンドを有さない、項目１５９に記載の細胞。
（項目１６６）
上記対象とするタンパク質が公知の機能を有さない、項目１５９に記載の細胞。
（項目１６７）
上記対象とするタンパク質が公知のリガンドを有さず、公知の機能も有さない、項目１５９に記載の細胞。
（項目１６８）
上記タンパク質の発現が３ヶ月にわたって５％を超えて変化しない、項目１５３に記載の細胞。
（項目１６９）
細胞系を生成するための方法であって、同一培養条件下で複数の並行培養物中の複数の細胞系を培養するステップ、および時間をわたって一貫した状態のままである少なくとも１つの特徴を有する細胞系を同定するステップを含む、方法。
（項目１７０）
上記複数の並行培養物が少なくとも５０個の細胞培養物を含む、項目１６８に記載の方法。
（項目１７１）
上記複数の並行培養物が少なくとも１００個の細胞培養物を含む、項目１６８に記載の方法。
（項目１７２）
上記複数の並行培養物が少なくとも２００個の細胞培養物を含む、項目１６８に記載の方法。

Claims (39)

  1. クローン細胞系の適合パネルであって、該クローン細胞系が同じ細胞型であり、該パネル中のそれぞれの細胞系が対象とするＲＮＡまたは対象とするタンパク質を発現し、該パネル中のクローン細胞系が同じ生理学的特徴を共有するように適合されていることにより並行処理が可能となる、クローン細胞系の適合パネル。
  2. 前記生理学的特徴が：
    ａ）増殖プロファイル；
    ｂ）組織培養物表面との接着性；
    ｃ）機能アッセイにおけるＺ’係数；
    ｄ）前記対象とするタンパク質をコードするＲＮＡの発現レベル；
    ｅ）前記対象とするＲＮＡの発現レベル；
    ｆ）該対象とするタンパク質の発現レベル；または
    生理学的特徴ａ）〜ｆ）の組み合わせ；
    である、請求項１に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  3. 前記パネル中のクローン細胞系の増殖速度が互いに１、２、３、４、または５時間の範囲内にある、請求項２に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  4. 前記培養条件が前記パネル中の全てのクローン細胞系で同じである、請求項１〜３のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  5. 前記クローン細胞系が、
    ａ）真核細胞系、または
    ｂ）原核細胞系
    である、請求項１〜４のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  6. 前記真核細胞系が哺乳動物細胞系である、請求項５に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  7. 前記クローン細胞系が
    ａ）初代細胞の細胞系；または
    ｂ）不死化細胞の細胞系
    である、請求項１〜６のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  8. 前記細胞系の細胞が前記対象とするＲＮＡまたは前記対象とするタンパク質を発現するように操作されている、請求項１〜７のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  9. ａ）前記細胞系の細胞が、前記対象とするタンパク質をコードする導入核酸から前記対象とするＲＮＡもしくは該タンパク質を発現する、または
    ｂ）該対象とするタンパク質が多量体タンパク質であり、該細胞系の細胞が、該多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする少なくとも１つの導入核酸から該少なくとも１つのサブユニットを発現する、
    請求項１〜８のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  10. ａ）前記細胞が内因性核酸から前記対象とするＲＮＡもしくは前記対象とするタンパク質を発現し、該細胞が内因性タンパク質の転写を活性化するように操作されている；または
    ｂ）該対象とするタンパク質が多量体タンパク質であり、該細胞系の細胞が、内因性核酸から該多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットを発現し、かつ該細胞が該少なくとも１つのサブユニットの転写を活性化するように操作されている、
    請求項１〜８のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  11. 前記パネルが、
    ａ）少なくとも４個のクローン細胞系
    ｂ）少なくとも６個のクローン細胞系、または
    ｃ）少なくとも２５個のクローン細胞系
    を含む、請求項１〜１０のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  12. 前記パネル中の２つ以上のクローン細胞系が対象とする同じＲＮＡまたはタンパク質を発現する、請求項１〜１１のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  13. 前記パネル中の２つ以上のクローン細胞系が対象とする異なるＲＮＡまたはタンパク質を発現する、請求項１〜１２のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  14. 前記パネル中の細胞系が異なる形態の対象とするタンパク質を発現し、該形態がアイソフォーム、アミノ酸配列変異体、スプライス変異体、切断型、融合タンパク質、キメラ、またはそれらの組合せからなる群より選択される、請求項１〜１３のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  15. 前記パネル中の細胞系が対象とするタンパク質の群中の異なるタンパク質を発現し、該対象とするタンパク質の群が同じシグナル伝達経路中のタンパク質、類似したタンパク質の発現ライブラリー、モノクローナル抗体重鎖ライブラリー、モノクローナル抗体軽鎖ライブラリーおよびタンパク質の変異した形態からなる群より選択される、請求項１〜１４のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  16. 前記対象とするタンパク質が単鎖タンパク質である、請求項１〜１５のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  17. 前記単鎖タンパク質がＧタンパク質共役受容体である、請求項１６に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  18. 前記Ｇタンパク質共役受容体が味覚受容体である、請求項１７に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  19. 前記味覚受容体が苦味受容体、甘味受容体、およびうま味受容体からなる群より選択される、請求項１８に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  20. 前記タンパク質が多量体タンパク質である、請求項１〜１５のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  21. 前記タンパク質がヘテロ二量体またはヘテロ多量体である、請求項２０に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  22. 前記タンパク質が、イオンチャネル、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ）、チロシン受容体キナーゼ、サイトカイン受容体、核ステロイドホルモン受容体および免疫学的受容体からなる群より選択される、請求項１に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  23. 前記タンパク質が、
    ａ）上皮ナトリウムチャネル（ＥＮａＣ）、または
    ｂ）電位依存性ナトリウムチャネル（ＮａＶ）
    である、請求項２２に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  24. 前記タンパク質がγ−アミノ酪酸Ａ受容体（ＧＡＢＡＡ受容体）、γ−アミノ酪酸Ｂ受容体（ＧＡＢＡＢ受容体）およびγ−アミノ酪酸Ｃ受容体（ＧＡＢＡＣ受容体）からなる群より選択される、請求項２２に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  25. 前記パネル中のクローン細胞系が同時に、または互いに４週間を超えない内に作製された、請求項１〜２４のいずれか一項に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  26. 前記対象とするタンパク質が、塩味受容体である、請求項１に記載のクローン細胞系の適合パネル。
  27. 対象とするヘテロ二量体タンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とするヘテロ二量体タンパク質を産生することを特徴とし、該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まないか、または該タンパク質が、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せであり、ここで、
    ａ）該対象とするヘテロ二量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットが、導入核酸から発現される；または
    ｂ）該細胞は、該対象とするヘテロ二量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されている、
    細胞。
  28. 対象とするヘテロ二量体タンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、選択圧の不在下で培養され、ここで、
    ａ）該対象とするヘテロ二量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットが導入核酸から発現される；または
    ｂ）該細胞は、該対象とするヘテロ二量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されている、
    細胞。
  29. 対象とするヘテロ多量体タンパク質を発現する細胞であって、該ヘテロ多量体タンパク質が少なくとも３つのサブユニットを含み、該細胞は、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とするヘテロ二量体タンパク質を産生することを特徴とし、該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まないか、または該タンパク質が、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せであり、ここで、
    ａ）該対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットが導入核酸から発現される；または
    ｂ）該細胞は、該対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されている、
    細胞。
  30. 対象とするヘテロ多量体タンパク質を発現する細胞であって、該ヘテロ多量体タンパク質が少なくとも３つのサブユニットを含み、該細胞が生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、ここで、
    ａ）該対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットが導入核酸によってコードされている；または
    ｂ）該細胞は、該対象とするヘテロ多量体タンパク質の少なくとも１つのサブユニットをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されている、
    細胞。
  31. ２つ以上の対象とするタンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、機能アッセイでの使用に適した形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まないか、または該タンパク質が、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せであり、ここで、
    ａ）対象とするタンパク質の少なくとも１つが導入核酸によってコードされている；または
    ｂ）該細胞は、対象とするタンパク質の少なくとも１つをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されている、
    細胞。
  32. ２つ以上の対象とするタンパク質を発現する細胞であって、生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、ここで、
    ａ）対象とするタンパク質の少なくとも１つが導入核酸によってコードされている；または
    ｂ）該細胞は、対象とするタンパク質の少なくとも１つをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されている、
    細胞。
  33. 対象とする少なくとも１つのＲＮＡを発現する細胞であって、該細胞が機能アッセイでの使用に適した形で該対象とする少なくとも１つのＲＮＡを産生することを特徴とし、該対象とするＲＮＡがタグを含まず、または該ＲＮＡが、該細胞が該機能アッセイ中で少なくとも０．４のＺ’係数を有するようにその形で一貫して再現性よく産生されるか、または該細胞が選択圧の不在下で培養されるか、またはそれらの任意の組合せであり、ここで、
    ａ）該対象とする少なくとも１つのＲＮＡが導入核酸によってコードされている；または
    ｂ）該細胞は、該対象とする少なくとも１つのＲＮＡをコードする内因性核酸の転写を活性化するように操作されている、
    細胞。
  34. 対象とする単量体タンパク質をコードする導入核酸から該対象とする単量体タンパク質を発現する細胞であって、該細胞は、生物学的に活性な形もしくは生物学的に活性になることができる形で該対象とするタンパク質を産生することを特徴とし、該細胞は選択圧の不在下で培養され、かつ該タンパク質の発現が３ヶ月にわたって３０％を超えて変化しない、細胞。
  35. 対象とするタンパク質のモジュレーターを同定するための方法であって、該細胞は：
    ａ）請求項１から２６のいずれか一項に記載の細胞または適合パネルを試験化合物と接触させるステップと、
    ｂ）該試験化合物と接触させなかった細胞における該タンパク質の活性と比較した、該試験化合物と接触させた細胞における該対象とするタンパク質の活性の変化を検出するステップと
    を含み、不在下と比較して存在下で活性の差を生じる化合物が該対象とするタンパク質のモジュレーターである、方法。
  36. 請求項３５に記載の方法によって同定されたモジュレーター。
  37. 対象とする少なくとも１つのタンパク質を発現する細胞であって、該対象とするタンパク質が公知のリガンドを有さないか、または該対象とするタンパク質の機能的発現を検出する公知のアッセイが存在せず、かつ該対象とするタンパク質がタンパク質タグを含まない細胞。
  38. 細胞系を生成するための方法であって、同一培養条件下で複数の並行培養物中の複数の細胞系を培養するステップ、および時間をわたって一貫した状態のままである少なくとも１つの特徴を有する細胞系を同定するステップを含む、方法。
  39. 対象とするタンパク質を発現する細胞を作製するための方法であって、該細胞が時間をわたって一貫する少なくとも１つの望ましい特性を有し、
    ａ）該対象とするタンパク質をコードするｍＲＮＡを発現する複数の細胞を提供するステップと、
    ｂ）細胞を個々の培養容器中に個々に分散させ、それによって複数の別々の細胞培養物を提供するステップと、
    ｃ）自動化細胞培養方法を使用して一組の望ましい培養条件下で該細胞を培養するステップであって、該条件が該別々の細胞培養物のそれぞれについて実質的に同一であり、該培養中、別々の細胞培養物当たりの細胞数を培養物毎に正規化し、該別々の培養物を同じスケジュールで継代することを特徴とする、ステップと、
    ｄ）該対象とするタンパク質の少なくとも１つの望ましい特徴について該別々の細胞培養物を少なくとも２回アッセイするステップと、
    ｅ）両方のアッセイで該望ましい特徴を有する別々の細胞培養物を同定するステップ、と
    を含む、方法。
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