JP2010501175A - ヒト固形腫瘍における遺伝子欠失及び突然変異alkキナーゼ - Google Patents
ヒト固形腫瘍における遺伝子欠失及び突然変異alkキナーゼ Download PDFInfo
- Publication number
- JP2010501175A JP2010501175A JP2009525538A JP2009525538A JP2010501175A JP 2010501175 A JP2010501175 A JP 2010501175A JP 2009525538 A JP2009525538 A JP 2009525538A JP 2009525538 A JP2009525538 A JP 2009525538A JP 2010501175 A JP2010501175 A JP 2010501175A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- alk
- seq
- fusion
- eml4
- polypeptide
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 102100033793 ALK tyrosine kinase receptor Human genes 0.000 title claims abstract description 395
- 101710168331 ALK tyrosine kinase receptor Proteins 0.000 title claims abstract description 381
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 title claims abstract description 197
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 title abstract description 72
- 230000035772 mutation Effects 0.000 title abstract description 26
- 238000012224 gene deletion Methods 0.000 title abstract description 13
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 432
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 325
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 287
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 229
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 200
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims abstract description 163
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims abstract description 140
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims abstract description 140
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims abstract description 140
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 121
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 114
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 claims abstract description 81
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims abstract description 80
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims abstract description 69
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 claims abstract description 62
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 claims abstract description 62
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims abstract description 57
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract description 57
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims abstract description 47
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 39
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims abstract description 29
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 claims abstract description 16
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 claims abstract description 13
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 claims abstract description 13
- 108010020004 Microtubule-Associated Proteins Proteins 0.000 claims abstract description 6
- 102000009664 Microtubule-Associated Proteins Human genes 0.000 claims abstract description 6
- 230000004927 fusion Effects 0.000 claims description 354
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 112
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 112
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 claims description 78
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 77
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 68
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 65
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 56
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 45
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims description 41
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 38
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 35
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 35
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 claims description 28
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 26
- 101000779641 Homo sapiens ALK tyrosine kinase receptor Proteins 0.000 claims description 24
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 18
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 16
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 16
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 claims description 14
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 claims description 11
- 238000002820 assay format Methods 0.000 claims description 9
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 9
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 claims description 9
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 9
- 201000009030 Carcinoma Diseases 0.000 claims description 8
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 claims description 8
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 8
- 238000002509 fluorescent in situ hybridization Methods 0.000 claims description 6
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 claims description 4
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 3
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 claims 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 abstract description 99
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 abstract description 99
- 230000005945 translocation Effects 0.000 abstract description 29
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 abstract description 23
- 230000012010 growth Effects 0.000 abstract description 19
- 238000012216 screening Methods 0.000 abstract description 17
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 abstract description 14
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 97
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 76
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 69
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 56
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 52
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 45
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 40
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 39
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 39
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 37
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 32
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 27
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 27
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 26
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 26
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 25
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 25
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 25
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 24
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 20
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 20
- 238000012228 RNA interference-mediated gene silencing Methods 0.000 description 19
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 19
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 18
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 18
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 17
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 17
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 17
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 17
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 17
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 17
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 17
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 16
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 16
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 16
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 16
- 239000000047 product Substances 0.000 description 16
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 15
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 15
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 15
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 14
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 14
- 241000894007 species Species 0.000 description 14
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 13
- 108091008598 receptor tyrosine kinases Proteins 0.000 description 13
- 101150023956 ALK gene Proteins 0.000 description 12
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 12
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 12
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 12
- DCWXELXMIBXGTH-UHFFFAOYSA-N phosphotyrosine Chemical compound OC(=O)C(N)CC1=CC=C(OP(O)(O)=O)C=C1 DCWXELXMIBXGTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 108010001441 Phosphopeptides Proteins 0.000 description 11
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 11
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 11
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 11
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 11
- 102000027426 receptor tyrosine kinases Human genes 0.000 description 11
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 10
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 10
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 10
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 10
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 10
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 10
- 102000052116 epidermal growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 description 10
- 108700015053 epidermal growth factor receptor activity proteins Proteins 0.000 description 10
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 10
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 10
- YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N n-[3-[[6-[3-(trifluoromethyl)anilino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide Chemical compound FC(F)(F)C1=CC=CC(NC=2N=CN=C(NC=3C=C(NC(=O)C4CC4)C=CC=3)C=2)=C1 YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 10
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 10
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 9
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 9
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 9
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 9
- 230000006870 function Effects 0.000 description 9
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 9
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 9
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 8
- 101001057929 Homo sapiens Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 Proteins 0.000 description 8
- -1 IgM Proteins 0.000 description 8
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 8
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 8
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 8
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 8
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 8
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 8
- 238000011161 development Methods 0.000 description 8
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 8
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 8
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 8
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 8
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 8
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 8
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 7
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 7
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 7
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 7
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 7
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 7
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 7
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 7
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 7
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 7
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 7
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 7
- KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N imatinib Chemical compound C1CN(C)CCN1CC1=CC=C(C(=O)NC=2C=C(NC=3N=C(C=CN=3)C=3C=NC=CC=3)C(C)=CC=2)C=C1 KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 7
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 7
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 7
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 7
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 7
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102100027100 Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 Human genes 0.000 description 6
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 6
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 208000032004 Large-Cell Anaplastic Lymphoma Diseases 0.000 description 6
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 6
- 239000007993 MOPS buffer Substances 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 6
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 6
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 6
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 6
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 6
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 6
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 6
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 6
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 6
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 6
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 6
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 6
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 208000032791 BCR-ABL1 positive chronic myelogenous leukemia Diseases 0.000 description 5
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 5
- 208000010833 Chronic myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 5
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 5
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 5
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 5
- 239000005517 L01XE01 - Imatinib Substances 0.000 description 5
- 208000033761 Myelogenous Chronic BCR-ABL Positive Leukemia Diseases 0.000 description 5
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 5
- 102000001253 Protein Kinase Human genes 0.000 description 5
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 5
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 5
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 5
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 5
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 5
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 5
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 5
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 5
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 5
- 102000052509 human EML4-ALK fusion Human genes 0.000 description 5
- 108700000027 human EML4-ALK fusion Proteins 0.000 description 5
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 5
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 5
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 5
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 5
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 5
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 5
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 5
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 5
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 5
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 5
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 5
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 5
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 206010073478 Anaplastic large-cell lymphoma Diseases 0.000 description 4
- 241000283073 Equus caballus Species 0.000 description 4
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 4
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 4
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 4
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 4
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 4
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 4
- 208000002151 Pleural effusion Diseases 0.000 description 4
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 4
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 4
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 4
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 4
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 4
- 102100033080 Tropomyosin alpha-3 chain Human genes 0.000 description 4
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 4
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 4
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 4
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 4
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 4
- 239000007900 aqueous suspension Substances 0.000 description 4
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 4
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 4
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 4
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 4
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 4
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 4
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 4
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 4
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 4
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 4
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 4
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 4
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 4
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 4
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 4
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 4
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 4
- 229940080856 gleevec Drugs 0.000 description 4
- 210000003917 human chromosome Anatomy 0.000 description 4
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 4
- 239000012742 immunoprecipitation (IP) buffer Substances 0.000 description 4
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 4
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 4
- 238000005040 ion trap Methods 0.000 description 4
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 4
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 4
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 4
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 4
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 4
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 4
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 4
- 108700009251 p80(NPM-ALK) Proteins 0.000 description 4
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 description 4
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Chemical compound [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 4
- 108060006633 protein kinase Proteins 0.000 description 4
- 239000002096 quantum dot Substances 0.000 description 4
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 4
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 4
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 4
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 4
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 4
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 4
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 4
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 4
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 4
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 4
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 4
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 4
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 4
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 4
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 4
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 3
- 102100031780 Endonuclease Human genes 0.000 description 3
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 3
- 108010076876 Keratins Proteins 0.000 description 3
- 102000011782 Keratins Human genes 0.000 description 3
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 3
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 3
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 3
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 description 3
- 206010061309 Neoplasm progression Diseases 0.000 description 3
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 3
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 3
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 3
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 3
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 3
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 3
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 3
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 3
- 101150010028 TFG gene Proteins 0.000 description 3
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 3
- 101710091952 Tropomyosin alpha-3 chain Proteins 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Chemical compound CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 3
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 3
- 230000002788 anti-peptide Effects 0.000 description 3
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 3
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 3
- 108010056708 bcr-abl Fusion Proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000004441 bcr-abl Fusion Proteins Human genes 0.000 description 3
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 3
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 3
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 3
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 3
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 3
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 description 3
- 238000001360 collision-induced dissociation Methods 0.000 description 3
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 3
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 3
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 3
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 3
- 239000003651 drinking water Substances 0.000 description 3
- 235000020188 drinking water Nutrition 0.000 description 3
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 3
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 3
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 3
- 102000051965 human ALK Human genes 0.000 description 3
- 102000043618 human EML4 Human genes 0.000 description 3
- 229960002411 imatinib Drugs 0.000 description 3
- 238000003365 immunocytochemistry Methods 0.000 description 3
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 3
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 3
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 3
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 3
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 3
- 229940043355 kinase inhibitor Drugs 0.000 description 3
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 3
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 3
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 3
- 108091005601 modified peptides Proteins 0.000 description 3
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 3
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 3
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 3
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 3
- 239000003757 phosphotransferase inhibitor Substances 0.000 description 3
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 3
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 3
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 3
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 3
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 3
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 3
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 3
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 3
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 3
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 3
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 3
- 230000005751 tumor progression Effects 0.000 description 3
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 3
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 3
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- VBICKXHEKHSIBG-UHFFFAOYSA-N 1-monostearoylglycerol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)CO VBICKXHEKHSIBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 2-diethylaminoethanol Chemical compound CCN(CC)CCO BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IZHVBANLECCAGF-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-3-(octadecanoyloxy)propyl octadecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)COC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC IZHVBANLECCAGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WEVYNIUIFUYDGI-UHFFFAOYSA-N 3-[6-[4-(trifluoromethoxy)anilino]-4-pyrimidinyl]benzamide Chemical compound NC(=O)C1=CC=CC(C=2N=CN=C(NC=3C=CC(OC(F)(F)F)=CC=3)C=2)=C1 WEVYNIUIFUYDGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940126069 ALK kinase inhibitor Drugs 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 2
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 2
- XKJMBINCVNINCA-UHFFFAOYSA-N Alfalone Chemical compound CON(C)C(=O)NC1=CC=C(Cl)C(Cl)=C1 XKJMBINCVNINCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 2
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 2
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 2
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L Calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 108091033380 Coding strand Proteins 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- 108060006698 EGF receptor Proteins 0.000 description 2
- 101150029707 ERBB2 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 108010055196 EphA2 Receptor Proteins 0.000 description 2
- 102100030340 Ephrin type-A receptor 2 Human genes 0.000 description 2
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 2
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Chemical group OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DHCLVCXQIBBOPH-UHFFFAOYSA-N Glycerol 2-phosphate Chemical compound OCC(CO)OP(O)(O)=O DHCLVCXQIBBOPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 2
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 2
- 108010093488 His-His-His-His-His-His Proteins 0.000 description 2
- 101000800847 Homo sapiens Protein TFG Proteins 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 2
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 2
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 2
- 108010034219 Insulin Receptor Substrate Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102100025087 Insulin receptor substrate 1 Human genes 0.000 description 2
- 102100025092 Insulin receptor substrate 2 Human genes 0.000 description 2
- 102100039688 Insulin-like growth factor 1 receptor Human genes 0.000 description 2
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical group OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical group OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- 102100027869 Moesin Human genes 0.000 description 2
- 102100038938 Myosin-9 Human genes 0.000 description 2
- 101710204108 Myosin-9 Proteins 0.000 description 2
- 206010029260 Neuroblastoma Diseases 0.000 description 2
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 2
- 102000016979 Other receptors Human genes 0.000 description 2
- 238000002944 PCR assay Methods 0.000 description 2
- 229930040373 Paraformaldehyde Natural products 0.000 description 2
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 2
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 2
- 102000057297 Pepsin A Human genes 0.000 description 2
- 108090000284 Pepsin A Proteins 0.000 description 2
- 241000276498 Pollachius virens Species 0.000 description 2
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 2
- 241001505332 Polyomavirus sp. Species 0.000 description 2
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 2
- 238000011530 RNeasy Mini Kit Methods 0.000 description 2
- 238000010240 RT-PCR analysis Methods 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010041067 Small cell lung cancer Diseases 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 2
- 101710120037 Toxin CcdB Proteins 0.000 description 2
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 description 2
- 108091008605 VEGF receptors Proteins 0.000 description 2
- 102100033177 Vascular endothelial growth factor receptor 2 Human genes 0.000 description 2
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 2
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 2
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 2
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 2
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 2
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000001106 artificial yeast chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 description 2
- 238000010322 bone marrow transplantation Methods 0.000 description 2
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 2
- 239000002771 cell marker Substances 0.000 description 2
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 2
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 2
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 2
- 239000007979 citrate buffer Substances 0.000 description 2
- 102000014907 clathrin heavy chain Human genes 0.000 description 2
- 108060001643 clathrin heavy chain Proteins 0.000 description 2
- 230000009918 complex formation Effects 0.000 description 2
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 2
- 238000005094 computer simulation Methods 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- 238000004163 cytometry Methods 0.000 description 2
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 229960002086 dextran Drugs 0.000 description 2
- 229960000633 dextran sulfate Drugs 0.000 description 2
- 239000007884 disintegrant Substances 0.000 description 2
- 230000007783 downstream signaling Effects 0.000 description 2
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 2
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 2
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 2
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 2
- 235000013355 food flavoring agent Nutrition 0.000 description 2
- 239000007903 gelatin capsule Substances 0.000 description 2
- 238000012226 gene silencing method Methods 0.000 description 2
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 2
- 230000009036 growth inhibition Effects 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 102000049263 human TFG Human genes 0.000 description 2
- 102000055906 human TFG-ALK fusion Human genes 0.000 description 2
- 108700013310 human TFG-ALK fusion Proteins 0.000 description 2
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 2
- 230000008105 immune reaction Effects 0.000 description 2
- 210000004201 immune sera Anatomy 0.000 description 2
- 229940042743 immune sera Drugs 0.000 description 2
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 2
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 239000003701 inert diluent Substances 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 239000002198 insoluble material Substances 0.000 description 2
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 description 2
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 2
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 2
- 108010071525 moesin Proteins 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- 239000001788 mono and diglycerides of fatty acids Substances 0.000 description 2
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 2
- 238000011527 multiparameter analysis Methods 0.000 description 2
- 230000017066 negative regulation of growth Effects 0.000 description 2
- 238000007857 nested PCR Methods 0.000 description 2
- 102000027450 oncoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108091008819 oncoproteins Proteins 0.000 description 2
- 229920002866 paraformaldehyde Polymers 0.000 description 2
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 2
- 229940111202 pepsin Drugs 0.000 description 2
- YPJUNDFVDDCYIH-UHFFFAOYSA-N perfluorobutyric acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)F YPJUNDFVDDCYIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 2
- 239000008196 pharmacological composition Substances 0.000 description 2
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 2
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 2
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 2
- 230000009822 protein phosphorylation Effects 0.000 description 2
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 2
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 2
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 2
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 description 2
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 2
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 2
- 208000000587 small cell lung carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 2
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 2
- FQENQNTWSFEDLI-UHFFFAOYSA-J sodium diphosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O FQENQNTWSFEDLI-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- CMZUMMUJMWNLFH-UHFFFAOYSA-N sodium metavanadate Chemical compound [Na+].[O-][V](=O)=O CMZUMMUJMWNLFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940048086 sodium pyrophosphate Drugs 0.000 description 2
- DAEPDZWVDSPTHF-UHFFFAOYSA-M sodium pyruvate Chemical compound [Na+].CC(=O)C([O-])=O DAEPDZWVDSPTHF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 2
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 2
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 2
- 239000000375 suspending agent Substances 0.000 description 2
- 235000019818 tetrasodium diphosphate Nutrition 0.000 description 2
- 239000001577 tetrasodium phosphonato phosphate Substances 0.000 description 2
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 2
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- HRXKRNGNAMMEHJ-UHFFFAOYSA-K trisodium citrate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O HRXKRNGNAMMEHJ-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 229940038773 trisodium citrate Drugs 0.000 description 2
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 108091005990 tyrosine-phosphorylated proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 2
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 2
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012130 whole-cell lysate Substances 0.000 description 2
- 238000002424 x-ray crystallography Methods 0.000 description 2
- 238000001086 yeast two-hybrid system Methods 0.000 description 2
- 229910000166 zirconium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N (2R)-6-amino-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R,3S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-amino-1-hydroxyethylidene)amino]-3-carboxy-1-hydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1,5-dihydroxy-5-iminopentylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=N[C@@H](CS)C(=N[C@@H](C)C(=N[C@@H](CO)C(=NCC(=N[C@@H](CCC(=N)O)C(=NC(CS)C(=N[C@H]([C@H](C)O)C(=N[C@H](CS)C(=N[C@H](CO)C(=NCC(=N[C@H](CS)C(=NCC(=N[C@H](CCCCN)C(=O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)N=C([C@H](CS)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](C)N=C(CN=C([C@H](CO)N=C([C@H](CS)N=C(CN=C(C(CS)N=C(C(CC(=O)O)N=C(CN)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N 0.000 description 1
- IXPNQXFRVYWDDI-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-2,4-dioxo-1,3-diazinane-5-carboximidamide Chemical compound CN1CC(C(N)=N)C(=O)NC1=O IXPNQXFRVYWDDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 1
- BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 3-azaniumyl-2-hydroxypropanoate Chemical compound NCC(O)C(O)=O BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 4',6-Diamino-2-phenylindol Chemical compound C1=CC(C(=N)N)=CC=C1C1=CC2=CC=C(C(N)=N)C=C2N1 FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940090248 4-hydroxybenzoic acid Drugs 0.000 description 1
- 208000024893 Acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000014697 Acute lymphocytic leukaemia Diseases 0.000 description 1
- 108010025188 Alcohol oxidase Proteins 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 229940122531 Anaplastic lymphoma kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 108010032595 Antibody Binding Sites Proteins 0.000 description 1
- 108020004491 Antisense DNA Proteins 0.000 description 1
- 101100031730 Arabidopsis thaliana PUMP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 240000003291 Armoracia rusticana Species 0.000 description 1
- 235000011330 Armoracia rusticana Nutrition 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 108091032955 Bacterial small RNA Proteins 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100398597 Botryotinia fuckeliana lcc1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000005367 Carboxypeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108010006303 Carboxypeptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000003952 Caspase 3 Human genes 0.000 description 1
- 108090000397 Caspase 3 Proteins 0.000 description 1
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 1
- 102000005600 Cathepsins Human genes 0.000 description 1
- 108010084457 Cathepsins Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 101000714457 Chaetoceros protobacilladnavirus 2 Capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 108090000317 Chymotrypsin Proteins 0.000 description 1
- 208000005443 Circulating Neoplastic Cells Diseases 0.000 description 1
- 108091062157 Cis-regulatory element Proteins 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 1
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 229920002261 Corn starch Polymers 0.000 description 1
- 229920000858 Cyclodextrin Polymers 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 108020003215 DNA Probes Proteins 0.000 description 1
- 108050009160 DNA polymerase 1 Proteins 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 241000255581 Drosophila <fruit fly, genus> Species 0.000 description 1
- 102000001301 EGF receptor Human genes 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical class OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 108060002716 Exonuclease Proteins 0.000 description 1
- 108091008794 FGF receptors Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 101100068374 Gibberella zeae (strain ATCC MYA-4620 / CBS 123657 / FGSC 9075 / NRRL 31084 / PH-1) GIP1 gene Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 108010009202 Growth Factor Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000009465 Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 102100021888 Helix-loop-helix protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 description 1
- 108090001101 Hepsin Proteins 0.000 description 1
- 102000004989 Hepsin Human genes 0.000 description 1
- 101000897691 Homo sapiens Helix-loop-helix protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001077604 Homo sapiens Insulin receptor substrate 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001077600 Homo sapiens Insulin receptor substrate 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001034652 Homo sapiens Insulin-like growth factor 1 receptor Proteins 0.000 description 1
- 101100130645 Homo sapiens MMP7 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000692455 Homo sapiens Platelet-derived growth factor receptor beta Proteins 0.000 description 1
- 101000823316 Homo sapiens Tyrosine-protein kinase ABL1 Proteins 0.000 description 1
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010031794 IGF Type 1 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 1
- 208000026350 Inborn Genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 108010002386 Interleukin-3 Proteins 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 1
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 1
- 102100030417 Matrilysin Human genes 0.000 description 1
- 108091027974 Mature messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 108010006035 Metalloproteases Proteins 0.000 description 1
- 102000005741 Metalloproteases Human genes 0.000 description 1
- 108090000157 Metallothionein Proteins 0.000 description 1
- 102000003792 Metallothionein Human genes 0.000 description 1
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- 101000969137 Mus musculus Metallothionein-1 Proteins 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N O-Xylene Chemical compound CC1=CC=CC=C1C CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 description 1
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010055723 PDGF receptor tyrosine kinase Proteins 0.000 description 1
- 235000019483 Peanut oil Nutrition 0.000 description 1
- 108010067902 Peptide Library Proteins 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 229940049937 Pgp inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- 102000001393 Platelet-Derived Growth Factor alpha Receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010068588 Platelet-Derived Growth Factor alpha Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100026547 Platelet-derived growth factor receptor beta Human genes 0.000 description 1
- 206010035610 Pleural Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- RVGRUAULSDPKGF-UHFFFAOYSA-N Poloxamer Chemical compound C1CO1.CC1CO1 RVGRUAULSDPKGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000776 Poly(Adenosine diphosphate-ribose) polymerase Polymers 0.000 description 1
- 229920002732 Polyanhydride Polymers 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 229920000954 Polyglycolide Polymers 0.000 description 1
- 229920001710 Polyorthoester Polymers 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 208000006664 Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 description 1
- 108010045292 Proto-Oncogene Proteins c-abl Proteins 0.000 description 1
- 102000005663 Proto-Oncogene Proteins c-abl Human genes 0.000 description 1
- 108020004518 RNA Probes Proteins 0.000 description 1
- 239000003391 RNA probe Substances 0.000 description 1
- 230000007022 RNA scission Effects 0.000 description 1
- 102000000574 RNA-Induced Silencing Complex Human genes 0.000 description 1
- 108010016790 RNA-Induced Silencing Complex Proteins 0.000 description 1
- 102100038150 RNA-binding protein 6 Human genes 0.000 description 1
- 101710133275 RNA-binding protein 6 Proteins 0.000 description 1
- 239000012979 RPMI medium Substances 0.000 description 1
- 102000004278 Receptor Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 1
- 108090000873 Receptor Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 1
- 108091005682 Receptor kinases Proteins 0.000 description 1
- 108700005075 Regulator Genes Proteins 0.000 description 1
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000006265 Renal cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 108010029477 STAT5 Transcription Factor Proteins 0.000 description 1
- 102000001712 STAT5 Transcription Factor Human genes 0.000 description 1
- 241000293869 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Species 0.000 description 1
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 description 1
- 102000012479 Serine Proteases Human genes 0.000 description 1
- 108010022999 Serine Proteases Proteins 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- UIIMBOGNXHQVGW-DEQYMQKBSA-M Sodium bicarbonate-14C Chemical compound [Na+].O[14C]([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-DEQYMQKBSA-M 0.000 description 1
- 241000256248 Spodoptera Species 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 1
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 1
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 1
- 206010042971 T-cell lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 208000027585 T-cell non-Hodgkin lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- 108090001109 Thermolysin Proteins 0.000 description 1
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 1
- RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N Titanium Chemical compound [Ti] RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001615 Tragacanth Polymers 0.000 description 1
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 102100022596 Tyrosine-protein kinase ABL1 Human genes 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- 101710108545 Viral protein 1 Proteins 0.000 description 1
- IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N WHWLQLKPGQPMY Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C1=CNC=N1 IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N 0.000 description 1
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 102000035181 adaptor proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005764 adaptor proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 238000005377 adsorption chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000000783 alginic acid Substances 0.000 description 1
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 1
- 229960001126 alginic acid Drugs 0.000 description 1
- 150000004781 alginic acids Chemical class 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical group 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000012870 ammonium sulfate precipitation Methods 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 description 1
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 1
- 230000001028 anti-proliverative effect Effects 0.000 description 1
- 238000011091 antibody purification Methods 0.000 description 1
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 1
- 229940124691 antibody therapeutics Drugs 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 239000003816 antisense DNA Substances 0.000 description 1
- 239000012062 aqueous buffer Substances 0.000 description 1
- 125000000637 arginyl group Chemical group N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)* 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- 210000004436 artificial bacterial chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000004507 artificial chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000000305 astragalus gummifer gum Substances 0.000 description 1
- 108010058966 bacteriophage T7 induced DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N benzenesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940092714 benzenesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N beta-L-uridine Natural products O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000227 bioadhesive Substances 0.000 description 1
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 1
- 229920000249 biocompatible polymer Polymers 0.000 description 1
- 229920002988 biodegradable polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000004621 biodegradable polymer Substances 0.000 description 1
- 239000003124 biologic agent Substances 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 230000008499 blood brain barrier function Effects 0.000 description 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000001218 blood-brain barrier Anatomy 0.000 description 1
- 210000002798 bone marrow cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 244000309464 bull Species 0.000 description 1
- DQXBYHZEEUGOBF-UHFFFAOYSA-N but-3-enoic acid;ethene Chemical compound C=C.OC(=O)CC=C DQXBYHZEEUGOBF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 210000000234 capsid Anatomy 0.000 description 1
- 239000007963 capsule composition Substances 0.000 description 1
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 1
- 239000012876 carrier material Substances 0.000 description 1
- 238000005266 casting Methods 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000007444 cell Immobilization Methods 0.000 description 1
- 230000020411 cell activation Effects 0.000 description 1
- 238000000423 cell based assay Methods 0.000 description 1
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 1
- 239000012578 cell culture reagent Substances 0.000 description 1
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 1
- 238000000006 cell growth inhibition assay Methods 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000033077 cellular process Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 229960002376 chymotrypsin Drugs 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 239000005515 coenzyme Substances 0.000 description 1
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 1
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 1
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 238000013270 controlled release Methods 0.000 description 1
- 239000008120 corn starch Substances 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 229940097362 cyclodextrins Drugs 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 102000004419 dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 206010013023 diphtheria Diseases 0.000 description 1
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 1
- RUZYUOTYCVRMRZ-UHFFFAOYSA-N doxazosin Chemical compound C1OC2=CC=CC=C2OC1C(=O)N(CC1)CCN1C1=NC(N)=C(C=C(C(OC)=C2)OC)C2=N1 RUZYUOTYCVRMRZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000890 drug combination Substances 0.000 description 1
- 238000012377 drug delivery Methods 0.000 description 1
- 238000007877 drug screening Methods 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 101150068690 eml4 gene Proteins 0.000 description 1
- JJJFUHOGVZWXNQ-UHFFFAOYSA-N enbucrilate Chemical compound CCCCOC(=O)C(=C)C#N JJJFUHOGVZWXNQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229950010048 enbucrilate Drugs 0.000 description 1
- 239000008393 encapsulating agent Substances 0.000 description 1
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 229940116977 epidermal growth factor Drugs 0.000 description 1
- 238000001317 epifluorescence microscopy Methods 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 238000012869 ethanol precipitation Methods 0.000 description 1
- BEFDCLMNVWHSGT-UHFFFAOYSA-N ethenylcyclopentane Chemical compound C=CC1CCCC1 BEFDCLMNVWHSGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004403 ethyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 235000010228 ethyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 229940043351 ethyl-p-hydroxybenzoate Drugs 0.000 description 1
- 239000005038 ethylene vinyl acetate Substances 0.000 description 1
- NUVBSKCKDOMJSU-UHFFFAOYSA-N ethylparaben Chemical compound CCOC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 NUVBSKCKDOMJSU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000010429 evolutionary process Effects 0.000 description 1
- 102000013165 exonuclease Human genes 0.000 description 1
- 210000000416 exudates and transudate Anatomy 0.000 description 1
- 102000052178 fibroblast growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000009969 flowable effect Effects 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 1
- 235000003599 food sweetener Nutrition 0.000 description 1
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 239000005350 fused silica glass Substances 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 230000007274 generation of a signal involved in cell-cell signaling Effects 0.000 description 1
- 208000016361 genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 229940074045 glyceryl distearate Drugs 0.000 description 1
- 229940075507 glyceryl monostearate Drugs 0.000 description 1
- 229940046257 glyceryl phosphate Drugs 0.000 description 1
- 239000002748 glycoprotein P inhibitor Substances 0.000 description 1
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 238000002446 heavy isotope labeling Methods 0.000 description 1
- 239000001307 helium Substances 0.000 description 1
- 229910052734 helium Inorganic materials 0.000 description 1
- SWQJXJOGLNCZEY-UHFFFAOYSA-N helium atom Chemical compound [He] SWQJXJOGLNCZEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000005787 hematologic cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000024200 hematopoietic and lymphoid system neoplasm Diseases 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000688 human artificial chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000000017 hydrogel Substances 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004191 hydrophobic interaction chromatography Methods 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 238000012872 hydroxylapatite chromatography Methods 0.000 description 1
- 229960003685 imatinib mesylate Drugs 0.000 description 1
- YLMAHDNUQAMNNX-UHFFFAOYSA-N imatinib methanesulfonate Chemical compound CS(O)(=O)=O.C1CN(C)CCN1CC1=CC=C(C(=O)NC=2C=C(NC=3N=C(C=CN=3)C=3C=NC=CC=3)C(C)=CC=2)C=C1 YLMAHDNUQAMNNX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000008073 immune recognition Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 230000000984 immunochemical effect Effects 0.000 description 1
- 238000011532 immunohistochemical staining Methods 0.000 description 1
- 238000013198 immunometric assay Methods 0.000 description 1
- 239000003547 immunosorbent Substances 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 239000007943 implant Substances 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 206010022000 influenza Diseases 0.000 description 1
- 230000004941 influx Effects 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 238000007852 inverse PCR Methods 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000000021 kinase assay Methods 0.000 description 1
- 101150066555 lacZ gene Proteins 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 1
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 1
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 1
- 231100000636 lethal dose Toxicity 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 229940057995 liquid paraffin Drugs 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 201000003866 lung sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 230000012976 mRNA stabilization Effects 0.000 description 1
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 1
- 231100000682 maximum tolerated dose Toxicity 0.000 description 1
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 230000031864 metaphase Effects 0.000 description 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 1
- 102000021160 microtubule binding proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091011150 microtubule binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 1
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 102000035118 modified proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005573 modified proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 210000000865 mononuclear phagocyte system Anatomy 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 125000004123 n-propyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 239000002088 nanocapsule Substances 0.000 description 1
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 1
- 230000017095 negative regulation of cell growth Effects 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 210000000653 nervous system Anatomy 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 108091008104 nucleic acid aptamers Proteins 0.000 description 1
- 238000007826 nucleic acid assay Methods 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Natural products CCCCCCCC(C)CCCCCCCCC(O)=O OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 1
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 239000004006 olive oil Substances 0.000 description 1
- 235000008390 olive oil Nutrition 0.000 description 1
- 230000014207 opsonization Effects 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 1
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 239000000312 peanut oil Substances 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 1
- 210000003200 peritoneal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000002733 pharmacodynamic assay Methods 0.000 description 1
- 210000004214 philadelphia chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 238000007747 plating Methods 0.000 description 1
- 201000003437 pleural cancer Diseases 0.000 description 1
- 229920001200 poly(ethylene-vinyl acetate) Polymers 0.000 description 1
- 229920000747 poly(lactic acid) Polymers 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 239000004633 polyglycolic acid Substances 0.000 description 1
- 239000004626 polylactic acid Substances 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 1
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 1
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- 244000144977 poultry Species 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 230000001915 proofreading effect Effects 0.000 description 1
- 230000004853 protein function Effects 0.000 description 1
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000012743 protein tagging Effects 0.000 description 1
- 208000009305 pseudorabies Diseases 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 238000012205 qualitative assay Methods 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 238000012207 quantitative assay Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 108091006091 regulatory enzymes Proteins 0.000 description 1
- 230000008844 regulatory mechanism Effects 0.000 description 1
- 201000010174 renal carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 230000004043 responsiveness Effects 0.000 description 1
- 230000003307 reticuloendothelial effect Effects 0.000 description 1
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 1
- 210000003935 rough endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 1
- 239000006152 selective media Substances 0.000 description 1
- 239000004054 semiconductor nanocrystal Substances 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000010008 shearing Methods 0.000 description 1
- 230000006807 siRNA silencing Effects 0.000 description 1
- 102000034285 signal transducing proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091006024 signal transducing proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000007781 signaling event Effects 0.000 description 1
- 238000002553 single reaction monitoring Methods 0.000 description 1
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 1
- 235000010413 sodium alginate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000661 sodium alginate Substances 0.000 description 1
- 229940005550 sodium alginate Drugs 0.000 description 1
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WXMKPNITSTVMEF-UHFFFAOYSA-M sodium benzoate Chemical compound [Na+].[O-]C(=O)C1=CC=CC=C1 WXMKPNITSTVMEF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000004299 sodium benzoate Substances 0.000 description 1
- 235000010234 sodium benzoate Nutrition 0.000 description 1
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L sodium carbonate Substances [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940054269 sodium pyruvate Drugs 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 230000003381 solubilizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 239000004334 sorbic acid Substances 0.000 description 1
- 235000010199 sorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940075582 sorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 206010041823 squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 1
- 239000008117 stearic acid Substances 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 210000002536 stromal cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 238000007627 surgical diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 238000013268 sustained release Methods 0.000 description 1
- 239000012730 sustained-release form Substances 0.000 description 1
- 239000003765 sweetening agent Substances 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000007910 systemic administration Methods 0.000 description 1
- 239000000454 talc Substances 0.000 description 1
- 235000012222 talc Nutrition 0.000 description 1
- 229910052623 talc Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002626 targeted therapy Methods 0.000 description 1
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 231100001274 therapeutic index Toxicity 0.000 description 1
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- 230000002476 tumorcidal effect Effects 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- 230000004222 uncontrolled growth Effects 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N uracil arabinoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
- QDLHCMPXEPAAMD-QAIWCSMKSA-N wortmannin Chemical compound C1([C@]2(C)C3=C(C4=O)OC=C3C(=O)O[C@@H]2COC)=C4[C@@H]2CCC(=O)[C@@]2(C)C[C@H]1OC(C)=O QDLHCMPXEPAAMD-QAIWCSMKSA-N 0.000 description 1
- 238000002689 xenotransplantation Methods 0.000 description 1
- 239000008096 xylene Substances 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/82—Translation products from oncogenes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K19/00—Hybrid peptides, i.e. peptides covalently bound to nucleic acids, or non-covalently bound protein-protein complexes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
- C12N9/1205—Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1), e.g. protein kinases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57423—Specifically defined cancers of lung
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/178—Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA
Abstract
【選択図】図1A
Description
本出願は、現在審査中の、2006年4月14に出願された米国特許出願番号(USSN)第60/792,364号の優先権を主張し、その開示の全てを参照して本明細書に組み入れる。
本発明に従い、ヒト染色体2で生ずる、未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)の部分が二次タンパク質と結合している融合タンパク質をもたらす新規の遺伝子の欠失変異が、ヒト固形腫瘍である非小細胞肺癌(NSCLC)中で同定された。ALK融合に関わる二次タンパク質は微小管結合タンパク質様4(EML−4)及びTRK−融合遺伝子(TFG)を包含している。突然変異/融合ALKキナーゼは現在、非小細胞肺癌患者の試料中で観察されている。
本発明により、未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)の部分が二次タンパク質の部分と結合している突然変異融合タンパク質をもたらす従来知られていない遺伝子の欠失及び転座が、ヒト固形腫瘍である非小細胞肺癌(NSCLC)中で同定された。発見されたALK融合に関わる二次タンパク質は微小管結合タンパク質様4(EML−4)及びTRK−融合遺伝子(TFG)を包含している。
本明細書では、以下の用語は表記の意味を有している。
「抗体」(複数を含む)は、Fab又はその抗原認識断片を包含し、キメラ、ポリクローナル及びモノクローナル抗体を包含する、IgG、IgM、IgA、及びIgEを含んでいる全てのタイプの免疫グロブリンを示す。本明細書では、用語「ヒト化抗体」は、元の結合能力を保持しながら、ヒト抗体により酷似するように、非抗原結合領域のアミノ酸を置き換えた抗体を示す。
染色体2上で生じて、EML−4のN末端をキナーゼドメイン及びALKのC末端と結合する2つの融合タンパク質変異体の発現をもたらす、本明細書に開示されている新規なヒト遺伝子欠失が、非小細胞肺癌(NSCLC)細胞株(H2228を含む)及び患者の固形腫瘍の抽出物における、広範囲のホスホペプチドプロファイルの実験中に、意外にも同定された。固形腫瘍である、NSCLCは肺癌の亜類型である。これら欠失融合に含まれるタンパク質は図1A−1Bの上の図に示されている。
本発明は、一つには、EML4−ALK融合ポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチド、そのようなポリヌクレオチドにハイブリダイズするヌクレオチドプローブ、及び組み換えの融合ポリペプチドを産生するためにそのようなポリヌクレオチドを用いるための方法、ベクター、及び宿主細胞を提供する。
(a)配列番号1又は配列番号18のアミノ酸配列を含有している微小管結合タンパク質様4/未分化リンパ腫キナーゼ(Echnoderm Micrutubule-Associated Protein-LIke 4/Anaplastic Lymphoma Kinase; EML4−ALK)融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列;
(b)EML4−ALK融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、そのヌクレオチド配列は配列番号2又は配列番号19のヌクレオチド配列を含有している;
(c)EML−4のN−末端アミノ酸配列(配列番号3の残基1−233又は配列番号19の残基1−495)及びALKのキナーゼドメイン(配列番号5の残基1116−1383)を含有しているEML4−ALK融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列;
(d)EML−4のN−末端ヌクレオチド配列(配列番号4の1−700ヌクレオチド又は配列番号4の1−1486ヌクレオチド)及びALKのキナーゼドメインヌクレオチド配列(配列番号6の3348−4149ヌクレオチド)を含有しているヌクレオチド配列;
(e)EML4−ALK融合ポリヌクレオチドの融合接合部(配列番号2の700−701ヌクレオチド又は配列番号19の1486−1487ヌクレオチド)を包含するする少なくとも6つの隣接ヌクレオチドを含有しているヌクレオチド配列;
(f)EML4−ALK融合ポリペプチドの融合接合部(配列番号1の残基233−234又は配列番号18の残基495−496)を包含する少なくとも6つの隣接アミノ酸を含有しているポリペプチドをコードするヌクレオチド配列;及び
(g)(a)〜(f)のヌクレオチド配列の何れかと相同性を有するヌクレオチド配列:
よりなる群から選ばれる配列に対して少なくとも95%の相同性を有するヌクレオチド配列を含有している単離されたポリヌクレオチドを提供する。
別の態様では、本発明は、EML−4のN−末端アミノ酸配列(配列番号3の残基1−233、又は配列番号3の残基1−495)及びALKのキナーゼドメイン(配列番号5の残基1116−1183)を含有しているEML4−ALK融合ポリペプチドをコードする単離されたヌクレオチド配列を提供する。
一態様では、ALKのキナーゼドメインを含有しているポリペプチドは配列番号5の残基1057−1620を含んでいる(図1Cの下の図を参照されたい)。
その他の態様では、上記EML−4のN−末端アミノ酸配列及びALKのキナーゼドメインは配列番号4のヌクレオチド1−700を含有しているヌクレオチド配列又は配列番号4の1−1486のヌクレオチド及び配列番号6の3171−4860のヌクレオチドによってそれぞれコードされる。
その他の好ましい態様では、本発明の単離されたポリヌクレオチドは、EML4−ALK融合ポリペプチドの融合接合部(配列番号1の残基233−234又は配列番号18の残基495−496)を包含する少なくとも6つの隣接アミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列/断片を含んでいる(図1A−B、最下図(配列番号7及び24)を参照されたい)。
本発明のこの態様のある好ましい実施態様では、マーカーアミノ酸配列は、pQEベクター(Qiagen,Inc.)に備わっている標識のような、ヘキサ−ヒスチジンペプチドであり、とりわけこれらの多くは市販されている。Gentz et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:821-824 (1989) に記載されているように、例えばヘキサ−ヒスチジンは融合タンパク質の簡便な精製を提供する。「HA」標識は、インフルエンザ血球凝集素タンパク質由来の抗原決定基に対応する、精製に有用な別のペプチドであり、Wilson et al., Cell 37:767 (1984) によって記載されている。以下で検討するように、他のそのような融合タンパク質は、自体がN−又はC−末端のFcと融合しているEML4−ALK融合ポリペプチドを包含する。
本発明は、本発明の単離されたポリヌクレオチドを含有する組み換えベクター、組み換えベクターで遺伝子操作された宿主細胞、及び組み換え技術による組み換えEML4−ALKポリペプチド又はその断片の産生も提供する。
本発明は、ある部分では、単離された突然変異ALKキナーゼポリペプチド及びその断片を提供する。一態様では、本発明は、
(a)配列番号1又は配列番号18のアミノ酸配列を含有しているEML4−ALK融合ポリペプチドをコードするアミノ酸配列;
(b)EML−4のN−末端アミノ酸配列(配列番号3の残基1−123、又は配列番号3の残基1−495)及びALKのキナーゼドメイン(配列番号5の残基1116−1383)を含有しているEML4−ALK融合ポリペプチドをコードするアミノ酸配列;及び
(c)EML4−ALK融合ポリペプチドの融合接合部(配列番号1の残基233−234、又は配列番号18の残基495−496)を包含する少なくとも6つの隣接アミノ酸を含有しているポリペプチドをコードするアミノ酸配列:
よりなる群から選ばれる配列と少なくとも95%の相同性を有するアミノ酸配列を含有する単離されたポリペプチドを提供する。
開示される方法の実施に有用な突然変異ALKポリペプチドに特異的な試薬は、とりわけ、融合ポリペプチドに特異的な抗体及び対応するAQUAペプチド(重同位体標識化ペプチド)を包含し、そして哺乳類の固形肉腫又は癌腫瘍のような、癌由来の生体試料におけるEML4−ALK融合ポリペプチドの発現を検出及び定量化するのに適している。本発明の切断されたALKキナーゼポリヌクレオチド又はポリペプチドの存在又は非存在を検出するのに適している、抗体、AQUAペプチド又は核酸プローブのような、切断片に特異的な試薬も有用である。融合ポリペプチドに特異的な試薬は、生体試料中に発現されたEML4−ALK融合ポリペプチドに特異的に結合して、その存在/レベルを検出及び/又は定量化できる、生物学的又は化学的試薬の何れかである。この用語は、これに限定されないが、以下で検討する好ましい抗体及びAQUAペプチド試薬を包含し、均等な試薬は本発明の範囲内である。
本発明方法の実施で用いるのに適している試薬は、EML4−ALK融合ポリペプチドに特異的な抗体及びTFG−ALK融合ポリペプチドに特異的な抗体を包含する。本発明の融合体に特異的な抗体は、本発明のEML4−ALK融合ポリペプチド(例えば、配列番号1)に特異的に結合するが野生型のEML−4又は野生型のALKの何れとも実質的に結合しない、又は本明細書に記載されるTFG−ALK融合ポリペプチド(例えば、配列番号20)に特異的に結合するが野生型のTFG又は野生型のALKの何れとも実質的に結合しない、単離された抗体(複数を含む)である。他の適切な試薬は、野生型ALKタンパク質配列の細胞外ドメイン(このドメインは本明細書に開示される切断された活性ALKキナーゼ中に存在していない)中のエピトープに特異的に結合するので、試料中の野生型ALKの存在(又は非存在)を検出できる、エピトープに特異的な抗体を包含する。
開示される方法の実施に有用なEML4−ALK又はTFG−ALK融合ポリペプチドに特異的な試薬は、生体試料中の発現されたALK融合ポリペプチド又は切断されたALKキナーゼポリペプチドの絶対的定量化に適している重同位体標識化ペプチドを含有していてもよい。複合混合物中のタンパク質(AQUA)の絶対的定量化用のAQUAペプチド産生及び使用は記述されている。国際公開WO第03/016861号公報、"Absolute Quantification of Proteins and Modified Forms Thereof by Multistage Mass Spectrometry", Gygi et al. 及び Gerber et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100:6940-5 (2003) も参照されたい;これらの教示はその全てを参照して本明細書に組み入れる)。
本発明により提供される融合に特異的な試薬は、上記B欄に詳細に述べたように、EML4−ALK融合ポリペプチド又は切断されたALKキナーゼポリヌクレオチドの検出に適している核酸プローブ及びプライマーも包含している。そのようなプローブはとりわけ、融合を産生する野生型のEML4及び/又は野生型ALK遺伝子における切断点の両側に対応する切断点プローブを望ましく包含する。蛍光in situハイブリダイゼーション法(FISH)又はポリメラーゼ連鎖反応(PCR)増幅のようなアッセイ中でのそのようなプローブの特異的な使用は、以下のF欄に記載されている。同様な切断点プローブを、TFG−ALK融合ポリヌクレオチド(図1C(配列番号21)を参照されたい)の存在を検出するために作成することができる。
本発明の方法は当該技術分野で公知の多種の異なったアッセイで実施することができる。
本発明の方法の実施に有用な免疫アッセイは、同種免疫アッセイ又は異種免疫アッセイであってもよい。同種アッセイにおいては、免疫学的反応は一般に、突然変異ALK−キナーゼポリペプチドに特異的な試薬(例えば、EML4−ALK融合ポリペプチドに特異的な抗体)、標識化した検体、及び目的となる生体試料を包含している。抗体が標識化検体と結合すると、標識からのシグナル発生は、直接的に又は間接的に修飾される。免疫学的反応及びその程度の検出の両方は、同種溶液中で実施される。利用することのできる免疫化学的標識は、フリーラジカル、放射性同位元素、蛍光染料、酵素、バクテリオファージ、補酵素、などを包含する。半導体ナノ結晶標識、又は「量子ドット」も有利に使用でき、それらの作成及び使用は十分に記載されている。一般に、K. Barovsky, Nanotech. Law & Bus. 1(2): Article 14 (2004) 及びそこで引用されている特許を参照されたい。
同様に、腫瘍由来細胞を含有する生体試料中で発現する突然変異ALKキナーゼポリペプチドを検出/定量化するためのAQUAペプチドは、上のE欄で詳細に記載されるように作成されて、標準的なAQUAアッセイで使用することができる。従って、本発明方法のいくつかの好ましい態様では、ALK融合ポリペプチドに特異的な試薬は、上のE欄に記載されるように、EML4−ALK融合ポリペプチド又はTFG−ALK融合ポリペプチドの融合接合部よりなるペプチド配列に対応している重同位元素標識化ホスホペプチド(AQUAペプチド)を含有している。
本発明の方法の実施において有用な生体試料は、EML4−ALK又はTFG−ALK融合ポリペプチドの発現によって特徴付けられる癌が存在又は進展している哺乳類の何れかから得ることができる。ある態様では、哺乳類はヒトであって、そのヒトは癌、例えば、NSCLCの治療のためにALK阻害療法の候補者であってよい。ヒト候補者はWHI−131及び/又はWHI−154のようなALKキナーゼ阻害剤で最近治療されている患者か又はそれで治療することが考えられている患者であってよい。別の態様では、哺乳類は、ウマ又はウシのような、大動物であり、一方他の態様では、哺乳類は、イヌ又はネコのような小動物であり、それらの全ては、肺癌を含む癌を発現することが知られている。
EML4−ALK及び/又はTFG-ALK融合ポリヌクレオチド及び/又は融合ポリペプチドが存在している癌を選択的に同定する能力は、診断目的でそのような癌を的確に同定するための重要な新規な方法を、更にまたそのような癌がALKを阻害する治療薬組成物に応答しそうであるか、又は癌を治療するために単剤として投与したときに、異なるキナーゼを標的にしている阻害剤に部分的に又は全く応答しそうもないかを判定するのに有用な情報を得ることも可能にする。
(a)哺乳類の癌から生体試料を得ること;及び
(b)融合ポリヌクレオチド、又はALKの部分と二次タンパク質の部分を含有しており、それをコードする融合ポリペプチドを検出する少なくとも1つの試薬を用いて、ALK突然変異ポリヌクレオチド及び/又はそれをコードする突然変異ALKポリペプチドが当該生体試料中に存在するか否かを判定すること:
を含んでいる。
本明細書に記載の新規なEML4−ALK融合ポリペプチドの発見も、この突然変異ALKタンパク質の活性、特にそのALKキナーゼ活性を阻害する新規な化合物の開発を可能にする。従って、本発明は、ある側面で、化合物が、EML4−ALK融合ポリヌクレオチド及び/又は融合ポリペプチドによって特徴付けられる癌の進行を阻害するか否かを判定する方法を提供し、その方法は当該化合物が当該癌において当該EML4−ALK融合ポリペプチドの発現及び/又は活性を阻害するか否かを判定する段階を含んでいる。ある好ましい態様では、EML4−ALK融合ポリペプチドの発現及び/又は活性の阻害は、本発明の融合ポリヌクレオチド及び/又は融合ポリペプチドを検出する少なくとも1つの試薬を用いて判定する。本発明の好ましい試薬は上記されている。ALKキナーゼ活性を阻害するのに適している化合物は以下のG欄により詳細に記述されている。
本発明によって、そこでEML4−ALK融合タンパク質が発現されるような哺乳類の固形癌腫瘍(NSCLC)の進行を、インビボでそのような癌にあるALKキナーゼの活性を阻害することによって、阻止できるということが示された。同様に、本明細書に記載のように、インビボでそのような癌にあるALKキナーゼの活性を阻害することによって、TFG−ALK融合タンパク質が発現される哺乳類の固形癌腫瘍の活性も、同様に阻害できる。癌(例えば、腫瘍)を、WHI−131又はWHI−154様の小分子キナーゼ阻害剤のようなALKキナーゼを阻害する治療薬と接触させることによって、突然変異ALKポリペプチドの発現によって特徴付けられる癌におけるALK活性を阻害することができる。以下の実施例2に更に記述されるように、ALK融合タンパク質を発現する腫瘍の生育阻害は、例えば、典型的なALKを阻害する治療薬である、siRNAを用いて融合キナーゼを阻害することによって達成することができる。従って、本発明は、ある側面で、癌にある突然変異ALKキナーゼの発現及び/又は活性を阻害することによって、EML4−ALK融合ポリペプチドを発現する癌又はTFG−ALK融合ポリペプチドを発現する固形腫瘍の進行を阻害する方法を提供する。
いくつかの好ましい態様では、本発明方法を実施するのに有用なALKを阻害する治療薬は、WHI−131及びWHI−154、又はその類縁体のような、小分子阻害剤を標的にしている。WHI−131及びWHI−154は、ALKの阻害剤を標的にしているキナゾリンタイプの小分子であって、その性質については記述されている。Marzec et al., Lab. Invest. 85(12):1544-54 (2005)を参照されたい。これらの化合物がリンパ腫細胞のアポトーシスを誘発して、増殖を抑制することが示されている。キナーゼの阻害剤を標的としている他の小分子は当該技術分野において公知である。例えば、BCR−ABL融合キナーゼ(他のキナーゼも)のATP−結合部位に特異的に結合してブロックし、それによってこの酵素のリン酸化及び活性化を阻害する、Gleevec(登録商標;STI−571、Imatinib)は市販されていて、その性質はよく知られている。例えば、Dewar et al., Blood 105(8):3127-32(2005) を参照されたい。他のALKの小分子阻害剤は、Novartis, Inc. 及び Cephalon Inc. で現在開発中である。
本発明の方法において有用なALKキナーゼを阻害する治療薬は、ALK活性に必要な臨界的触媒部位又はドメインに特異的に結合して、リガンド、基質又はALKに対する二次タンパク質の接近を妨害することにより、及び/又はその活性に必要な配座由来の酵素を阻害することによりキナーゼを阻害する、抗体を標的とすることもできる。ヒト化された標的に特異的な抗体の産生、スクリーニング及び治療的使用は、十分に記述されている。Merluzzi et al., Adv. Clin. Path. 4(2):77-85 (2000) を参照されたい。ヒト化された標的を特異的に阻害する抗体を高速大量処理で生成及びスクリーニングするための、Morphosys, Inc. の Human Combinatorial Antibody Library (HuCAL(登録商標))のような、市販されている技術及びシステムが入手可能である。
開示される方法の実施に有用なALKを阻害する化合物は、ALKキナーゼそれ自体以外の他のタンパク質又は分子の活性を阻害することによって、ALK活性を間接的に阻害する化合物であってもよい。そのような阻害治療薬は、ALK自体をリン酸化又は脱リン酸化する(そして活性化又は非活性化する)主要な制御キナーゼの活性を調節する、若しくはリガンドの結合を妨げるような阻害剤を標的にすることができる。他の受容体チロシンキナーゼと同様に、ALKは、アダプタータンパク質のネットワークを経て下流のシグナル伝達を、及びSTAT5及びAKTを包含する下流のキナーゼを、制御する。その結果、ALK活性による細胞の生育及び生存の誘発を、これらの相互作用又は下流タンパク質を標的にすることによって、阻害することができる。この方法で使用できるように現在開発中の薬剤に、Wartmaninが含まれる。
ALKを阻害する治療薬は、ALK及び/又はEML4−ALK若しくはTFG−ALK融合遺伝子又は切断されたALK遺伝子をコードする遺伝子の転写を阻害することによってALKキナーゼ活性を阻害する、アンチセンス及び/又は転写の阻害化合物を含んでいてもよい。例えば、癌の治療のためのアンチセンス治療薬による、VEGFER、EGFR、及びIGFR、及びFGFRを包含する、多種の受容体キナーゼの阻害については、既に記述されている。例えば、米国特許第6,734,017号、同第6,710,174号、同第6,617,162号、同第6,340,674号、同第5,783,683号、同第5,610,288号を参照されたい。
RNA干渉過程を経て翻訳を阻害し、それによってALKの活性を阻害する、低分子干渉RNA分子(siRNA)も、望ましく本発明の方法に使用することができる。RNA干渉、及び標的タンパク質をコードするmRNAに相補的な配列を含有する外来性の低分子二本鎖RNAの導入による、標的遺伝子の選択的サイレンシングについては、十分に記述されている。例えば、2004年2月26日公開の米国特許出願公開第20040038921号、"Composition and Method for Inhibiting Expression of a Target Gene", Kreutzer et al.; 2003年6月12日公開の米国特許出願公開第20020086356号、"RNA Sequence-Specific Mediators of RNA Interference", Tuschl et al.; 2004年11月18日公開の米国特許出願公開第20040229266号、"RNA Interference Mediating Small RNA Molecules", Tuschl et al. を参照されたい。
本発明方法の実施に有用なALKキナーゼを阻害する治療用組成物は、経口又は腹腔経路に限定されず、静脈内、筋肉内、腹腔内、皮下、経皮、気管内(エアゾール)、直腸内、膣内及び局所(口腔内、及び舌下を含む)投与を包含する、当該技術分野で公知の何れかの手段で哺乳類に投与することができる。
筋肉内、腹腔内、皮下及び静脈内用途のために、本発明の医薬組成物は一般に、適切なpH及び等張性に緩衝化した、無菌の水性溶液又は懸濁液で提供されるであろう。適切な水性賦形剤は、リンゲル溶液及び生理食塩水を包含する。担体のみで水性緩衝液を構成させることができる(「のみ」とは、ALKを阻害する治療薬の吸収に影響を及ぼすか又は介在するかもしれない、補助剤又は封入剤が存在していないことを意味する)。そのような物質は、例えば、下記するように、リポソーム又はカプシドのような、ミセル構造を包含する。水性懸濁液は、セルロース誘導体、アルギン酸ナトリウム、ポリビニルピロリドン及びトラガカントゴムのような懸濁化剤、及びレシチンのような湿潤剤を含有していてもよい。水性懸濁剤用の適切な保存剤は、p−ヒドロキシ安息香酸エチル及びn−プロピルを包含する。
本発明は、ある側面において、化合物が癌におけるEML4−ALK又はTFG−ALK融合融合ポリペプチド又はALKキナーゼポリペプチドの活性を阻害するか否かを確認することによって、化合物がEML4−ALK又はTFG−ALK融合融合ポリヌクレオチド及び/又は融合ポリペプチドによって特徴付けられる癌の進行を阻害できるか否かを確認する方法を提供する。いくつかの好ましい態様では、ALKの活性の阻害は、骨髄、血液、胸水、又は腫瘍由来の細胞を含有する生体試料を試験することによって確認される。その他の好ましい態様では、ALKの活性の阻害は、本発明の突然変異ALKポリヌクレオチド又はポリペプチドに特異的な試薬を用いて確認される。
A.ヒトNSCLC細胞株のプロファイリング
H2228を含む、22のヒトNSCLC細胞株におけるキナーゼ活性の包括的なリン酸化プロファイルは、複合混合物由来の改変ペプチドの単離及び質量分析によって特徴付けるために、最近記述された有力な技術(「IAP」技術、Rush et al., supra を参照されたい)を用いて、試験を行った。ホスホチロシンに特異的な抗体(CELL SIGNALING TECHNOLOGY, INC., Beverly, MA, 2003/04 Cat. #9411) を用いてIAP技術を実施し、NSCLC細胞株の抽出物由来のホスホチロシンを含有するペプチドを単離し、次いで特徴付けを行った。
全ての細胞培養試薬は Invitrogen, Inc. から入手した。全部で41のヒトNSCLC細胞株を試験した。ヒトNSCLC細胞株、H520、H838、H1437、H1563、H1568、H1792、H1944、H2170、H2172、H2228、H2347、A549、H441、H1703、H1373、及びH358を、American Type Culture Collection から得て、2mMのL−グルタミン、1.5g/Lの重炭酸ナトリウム、4.5g/Lのグルコース、10mMのHEPES、10mMのピルビン酸ナトリウム、ペニシリン/ストレプトマイシンを含有するように調節した、10%FBSを含むRPMI1640培地中で培養した。さらに6つのヒトNSCLC細胞株、HCC78、Cal-12T、HCC366、HCC44及びLOU−NH91、をDSMZから入手して、10%FBS及びペニシリン/ストレプトマイシンを含有するRPMI1640中で培養した。細胞を37℃で5%のCO2インキュベータ中に保持した。
100万個の細胞を尿素溶菌緩衝液(20mMのHepes(pH8.0)、9Mの尿素、1mMのバナジウム酸ナトリウム、2.5mMのピロリン酸ナトリウム、1mMのβ−グリセロリン酸エステル)中に溶解した。溶解物を超音波処理して、遠心分離で透明にした。透明にした溶解物をDTTで還元して、先に記述されているように、ヨードアセトアミドでアルキル化した(Rush et al., Nat. Biotechnol. 23(1):94-101 (2005) を参照されたい)。次いで試料を20mMのHepesで4倍に希釈して尿素の濃度を2Mに下げて、室温で静かに撹拌しながら1晩トリプシンで消化させた。
IP溶出液(100μl)中のペプチドを濃縮して、Stop and Go 抽出チップ(Stage Tips)(Rappsilber et al., Anal. Chem., 75(3):663-70 (2003) を参照されたい)を用いて溶出した抗体から分離した。ペプチドを、7.6μlの0.4%酢酸/0.005%ヘプタフルオロ酪酸(HFBA)中の1μlの60%MeCN、0.1%TFAでマイクロカラムから溶出した。
ペプチド配列を、TurboSequest ソフトウェア(v.27、rev.12)(ThermoFinnigan)及び複合順方向/逆方向IPIヒトタンパク質データベースを用いて、MS/MSスペクトルにアサインした。探索パラメーターは:プロテアーゼとしてトリプシン;1.08Daの前躯体の質量トレーランス;システイン上で静的修正(+57.02146、カルボキサミドメチル化);及びセリン、スレオニン及びチロシン(+79.96633Da、リン酸化)、リジン(+8.01420、13C615N2)、アルギニン(+6.02013、13C6)及びメチオニン(+15.99491、酸化)上で動的修正。ターゲット/デコイデータベース手法を、概算の偽陽性割り当て比が<1%となる、適切なスコア選別基準を確立するために用いた。割り当てには、電荷依存性のXCorr閾値(z=1、XCorr≧1.5、z=2に対して、XCorr≧2.2、z=3に対して、XCorr≧3.3)を上回ることに加えて、ホスホチロシンを含有すること、−5〜+25ppmの質量精度を有すること、及び全て軽(all-light)又は全て重(all-heavy)の形態の何れかのリジン/アルギニン残基を含有することを必要とした。
上記のA欄に詳細に記述したように、IAP技術を引き続いてNSCLC患者由来の154のヒト腫瘍試料群の総括的リン-プロファイルを試験するために適用した。組織を、Second Xiangya Hospital,China から得た。
A.ヒトNSCLC細胞株中の配列決定
NSCLC細胞株H2228中でALKキナーゼの高いリン酸化レベルが検出されたことを考慮して、キメラALK転写物が存在するか否かを判定するために、ALKのキナーゼドメインをコードする配列のcDNA末端の5’迅速増幅を行った。
RNeasy Mini Kit(Quiagen)を、H2228細胞株からRNAを抽出するために用いた。DNAは DNeasy Tissue Kit(Quiagen)を用いて抽出した。cDNA末端の迅速増幅は、5’RACEシステム(Invitrogen)を、cDNA合成用のプライマーALK−GSP1及びネスト化PCR反応用のALK−GSP2及びALK−GSP3で用いて実施した。
図5Aは5’RACEによるEML4−ALK融合遺伝子(短い変異体)の検出及び第2ラウンド後のPCR増幅産物の検出を示している。PCR産物をPCR精製キット(Qiagen)で精製して、ALK−GSP3及びABI3130キャピラリー自動DNAシーケンサー(Applied Biosystems)を用いて配列決定を行った。得られた産物の配列分析は、ALKのキナーゼドメイン及びC末端がEML−4遺伝子のN末端に融合したことを明らかにした(図1A-C、下の図を参照されたい)。EML4−ALK融合遺伝子(短い変異体)はフレーム単位であり、そしてEML−4の最初の233のアミノ酸をALKの終わりの562のアミノ酸と融合した(図1A-C、下の図を参照されたい)。EML−4及びALK遺伝子の両方は染色体2に位置しているので、融合遺伝子はこの2つの遺伝子座の間の遺伝子欠失によって創出された。
ALK−GSP1: 5’−GCAGTAGTTGGGGTTGTAGTC(配列番号9)
ALK−GSP2: 5’−GCGGAGCTTGCTCAGCTTGT(配列番号10)
ALK−GSP3: 5’−TGCAGCTCCTGGTGCTTCC(配列番号11)。
EML−4のN末端が融合タンパク質中に無傷で存在しているかを確認するためにRT−PCR分析を実施した(図6を参照されたい)。cDNAの第1鎖を、SuperScript(登録商標)III 第1鎖合成システム(Invitrogen)をオリゴ(dT)20で用いて2.5mgの全RNAから合成した。次いで、EML4−ALK融合遺伝子をEML−AtgとALK−GSP3のプライマー対を用いて増幅した。EML−4−43とALK−GSP3、及びEML−4−94とALK−GSP3、及びEML−4−202とALK−GSP3のプライマー対を用いて相互融合を検出した。ゲノムPCRについて、Platinum Taq DNAポリメラーゼハイファイ(Invitrogen)を用いて、EML−4atgとALK−tgaのプライマー対で融合遺伝子の増幅を実施した。
ALK−GSP3: 5’−TGCAGCTCCTGGTGCTTCC(配列番号12)
EML4−Atg: 5’−CGCAAGATGGACGGTTTGGC(配列番号13)
EML4−43: 5’−TGTTCAAGATCGCCTGTCAGCTCT(配列番号14)
EML4−94: 5’−TGAAATCACTGTGCTAAAGGCGGC(配列番号15)
EML4−202: 5’−AAGCCCTCGAGCAGTTATTCCCAT(配列番号16)
ALK−Tga: 5’−GAATTCCGCCGAGCTCAGGGCCCAG(配列番号17)。
同様に、患者CS010/11、CS045、及びCS110由来のヒトNSCLC腫瘍試料中で高いリン酸化レベルのALKキナーゼが検出されたことを考慮して、キメラALK転写物がこれらの腫瘍中に存在したか否かを判定するために、ALKのキナーゼドメインをコードする配列のcDNA末端の5’迅速増幅を行った。
TFG−F1:5’−TTTGTTAATGGCCAGCCAAGACCC−3(配列番号28)。
ALKの切断/融合形態がNSCLC細胞株H2228、更に患者CS010/11、CS045、及びCA110由来のNSCLC腫瘍試料における、細胞の生育及び生存を促進していることを確認するために、これらの細胞及び腫瘍の生育を阻害するsiRNAの(ALKに対する)能力を試験することができる。
突然変異ALK融合タンパク質がNSCLC細胞株H2228及び患者CS010/11、CS045、及びCS110由来のNSCLC腫瘍株の生育及び生存を促進していることを更に確認するために、WI−131及び/又はWI−154のようなALKキナーゼの標的阻害剤で細胞を処理してもよい。WI−131及びWI−154はキナゾリンタイプのALKキナーゼの小分子阻害剤であって、T細胞リンパ腫においてNPM−ALK融合タンパク質に対するそれらの活性については記述されている。Marzec et al., supra. を参照されたい。
1つ又はそれ以上のALK融合タンパク質の発現が正常細胞を癌表現型に転換できるかを確認するために、3T#細胞を、EML4−ALK(短い変異体及び長い変異体)又はTFG−ALK融合タンパク質をそれぞれ発現する、上記(実施例2)のcDNA構築物で形質転換してもよい。
ヒトNSCLC腫瘍試料中のEML4−ALK融合タンパク質(短い変異体)の存在を、既述のようにして、蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)アッセイを用いて検出した。例えば、Verma et al. HUMAN CHROMOSOMES: A MANUAL OF BASIC TECHNIQUES, Pergamon Press, New York, N.Y. (1988) を参照されたい。200を超えるパラフィン包埋ヒトNSCLC腫瘍試料を試験した。
ヒト固形腫瘍試料中の1つ又はそれ以上のALK融合タンパク質の存在は、既述のように、ゲノム又は逆転写酵素(RT)ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)の何れかを用いても検出することができる。例えば、Cools et al., N. Engl. J. Med. 348:1201-12014 (2003) を参照されたい。つまり例を挙げると、標準的な技術を用いて、例えばNSCLCを有する患者から固形腫瘍試料を得てもよい。切断されたALKキナーゼ又はEML4−ALK融合タンパク質(短い変異体又は長い変異体)又はTFG−ALK融合タンパク質に対するPCRプローブを構築する。RNeasy Mini Kit(Qiagen)を、腫瘍試料からRNAを抽出するために用いてもよい。DNAは 、DNeasy Tissue Kit (Quiagen)を用いて抽出してもよい。RT−PCRについては、第1鎖は、例えば、SuperScript(登録商標)III 第1鎖合成システム(Invitrogen)をオリゴ(dT)20で用いて、例えば2.5μgの全RNAから合成される。
Claims (43)
- (a)配列番号1又は配列番号18のアミノ酸配列を含有している微小管結合タンパク質様4/未分化リンパ腫キナーゼ(Echinoderm Microtubule-Associated Protein-Like 4/Anaplastic Lymphoma Kinase; EML4−ALK)融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列;
(b)EML4−ALK融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、そのヌクレオチド配列は配列番号2又は配列番号19のヌクレオチド配列を含有している;
(c)EML−4のN−末端アミノ酸配列(配列番号3の残基1−233又は配列番号3の残基1−495)及びALKのキナーゼドメイン(配列番号5の残基1116−1383)を含有しているEML4−ALK融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列;
(d)EML−4のN−末端ヌクレオチド配列(配列番号4の1−700ヌクレオチド又は配列番号4の1−1486ヌクレオチド)及びALKのキナーゼドメインヌクレオチド配列(配列番号6の3348−4149ヌクレオチド)を含有しているヌクレオチド配列;
(e)EML4−ALK融合ポリヌクレオチドの融合接合部(配列番号2の700−701ヌクレオチド又は配列番号19の1486−1487ヌクレオチド)を包含するする少なくとも6つの隣接ヌクレオチドを含有しているヌクレオチド配列;
(f)EML4−ALK融合ポリペプチドの融合接合部(配列番号1の残基233−234又は配列番号18の残基495−496)を包含する少なくとも6つの隣接アミノ酸を含有しているポリペプチドをコードするヌクレオチド配列;及び
(g)(a)〜(f)のヌクレオチド配列の何れかと相同性があるヌクレオチド配列:
よりなる群から選ばれる配列と少なくとも95%の相同性を有するヌクレオチド配列を含有している、単離されたポリヌクレオチド。 - ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で請求項1に記載のポリヌクレオチドにハイブリダイズする単離されたポリヌクレオチドであって、当該ハイブリダイズする単離されたポリヌクレオチドがストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でA残基のみ又はT残基のみを含有するヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドにハイブリダイズしない、単離されたポリヌクレオチド。
- 当該ポリヌクレオチドが更に検出可能な標識を含有している、請求項2に記載の単離されたポリヌクレオチド。
- 請求項1に記載の単離された核酸分子をベクターに挿入することを含有してなる、組み換えベクターを形成する方法。
- 請求項4に記載の方法で作成された組み換えベクター。
- 請求項5に記載の組み換えベクターを宿主細胞に導入することを含有してなる、組み換え宿主細胞を作成する方法。
- 請求項6に記載の方法で形成された組み換え宿主細胞。
- 当該方法がEML4−ALK融合ポリペプチドの発現に適している条件下で、請求項7に記載の組み換え宿主細胞を培養し、そして当該ポリペプチドを回収することを含有してなる、組み換えEML4−ALK融合ポリペプチド又は切断された活性ALKポリペプチドを作成する方法。
- (a)配列番号1又は配列番号18のアミノ酸配列を含有している、EML4−ALK融合ポリペプチドをコードするアミノ酸配列;
(b)EML−4のN−末端アミノ酸配列(配列番号3の残基1−233又は配列番号3の残基1−495)及びALKのキナーゼドメイン(配列番号5の残基1116−1383)を含有している、EML4−ALK融合ポリペプチドをコードするアミノ酸配列;及び
(c)EML4−ALK融合ポリペプチドの融合接合部(配列番号1の残基233−234又は配列番号18の残基495−496)を包含する少なくとも6つの隣接アミノ酸を含有しているポリペプチドをコードするアミノ酸配列:
よりなる群から選ばれる配列に少なくとも95%の相同性を有するアミノ酸配列を含有している、単離されたポリペプチド。 - 請求項5に記載の組み換えベクター又は請求項7に記載の組み換え宿主細胞を用いて作成された組み換えEML4−ALK融合ポリペプチド又は切断された活性ALKポリペプチド。
- 請求項9に記載のEML4−ALK融合ポリペプチドに特異的に結合するか又はこれを検出するが、野生型のEML−4又は野生型のALKの何れとも結合しないか又はこれを検出しない、単離された試薬。
- 当該試薬が抗体又は重同位体標識化(AQUA)ペプチドである、請求項11に記載の単離された試薬。
- 当該試薬がポリメラーゼ連鎖反応(PCR)プローブ又は蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)プローブである、請求項11に記載の単離された試薬。
- 当該ペプチドがEML4−ALK融合ポリペプチドの融合接合部又は野生型ALKの切断点のアミノ酸配列を含有している、請求項12に記載の重同位体標識化(AQUA)ペプチド。
- 当該方法が工程:
(a)哺乳類の癌から生体試料を得ること;及び
(b)融合ポリヌクレオチド、又はALKの部分と二次タンパク質の部分を含有している、そのコードされた融合ポリペプチドを検出する少なくとも1つの試薬を用いて、ALK突然変異ポリヌクレオチド及び/又はそのコードされた突然変異ALKポリペプチドが当該生体試料中に存在するか否かを判定すること:
を含有してなる、哺乳類の癌から得られる生体試料における、突然変異ALKポリヌクレオチド又はそれがコードする突然変異ALKポリペプチドの存在を検出する方法。 - 当該癌が固形腫瘍、肉腫又は癌腫である、請求項15に記載の方法。
- 当該癌腫が肺癌である、請求項16に記載の方法。
- 当該肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である、請求項17に記載の方法。
- 当該突然変異ALKポリペプチドが、ALK(配列番号5)の残基1116−1383と当該二次タンパク質の部分を含有している融合ポリペプチドである、請求項15に記載の方法。
- 当該二次タンパク質が、EML−4(配列番号3)及びTRK−融合遺伝子(TFG)タンパク質(配列番号22)よりなる群から選ばれる、請求項15又は16に記載の方法。
- 当該融合ポリペプチドがEML−4(配列番号3)の残基1−233又は残基1−495、又はTFG(配列番号22)の残基1−138を含有している、請求項20に記載の方法。
- 当該融合ポリヌクレオチドが、EML4−ALK融合ポリヌクレオチド(配列番号2又は19)又はTFG−ALK融合ポリヌクレオチド(配列番号21)を含有している、請求項15に記載の方法。
- 当該融合ポリペプチドが、EML4−ALK融合ポリペプチド(配列番号1又は18)又はTFG−ALK融合ポリペプチド(配列番号20)を含有している、請求項15に記載の方法。
- 当該融合ポリヌクレオチドが、請求項1に記載の融合ポリヌクレオチドである、請求項15に記載の方法。
- 当該融合ポリペプドが、請求項9に記載の融合ポリペプドである、請求項15に記載の方法。
- 当該試薬が、請求項1に記載のポリヌクレオチド及び/又は請求項11に記載の少なくとも1つの試薬を含有している、請求項15に記載の方法。
- 当該試薬が、TFG−ALK融合ポリペプチド(配列番号20)又はTFG−ALK融合ポリヌクレオチド(配列番号21)と特異的に結合するか又はこれを検出するが、野生型のTFG又は野生型のALKの何れとも結合しないか又は検出しない単離された試薬を含有している、請求項15に記載の方法。
- 当該試薬が抗体又は重同位体標識化(AQUA)ペプチドである、請求項27に記載の方法。
- 当該試薬がポリメラーゼ連鎖反応(PCR)プローブ又は蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)プローブである、請求項27に記載の方法。
- 当該重同位体標識化(AQUA)ペプチドがTGF−ALK融合ポリペプチドの融合接合部又は野生型ALKの切断点のアミノ酸配列を含有している、請求項28に記載の方法。
- 当該方法が、フローサイトメトリー(FC)、免疫組織化学的検査(IHC)、又は免疫蛍光法(IF)のアッセイ形式で実施される、請求項15に記載の方法。
- 当該方法が、蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)又はポリメラーゼ連鎖反応(PCR)のアッセイ形式で実施される、請求項15に記載の方法。
- 当該ALK融合ポリペプチドの活性を検出する、請求項15に記載の方法。
- 当該方法が、当該癌におけるALK融合ポリペプチドの発現及び/又は活性を当該化合物が阻害するか否かを判定する工程を含有してなる、化合物がALK融合ポリペプチドの発現を特徴としている哺乳類の固形腫瘍の進展を阻害するか否かを判定する方法。
- 当該ALK融合ポリペプチドが、ALK(配列番号5)の残基1116−1383と当該二次タンパク質の部分を含有している、請求項34に記載の方法。
- 当該二次タンパク質が、EML−4(配列番号3)及びTRK−融合遺伝子(TFG)タンパク質(配列番号22)よりなる群から選ばれる、請求項34に記載の方法。
- 当該融合ポリペプチドがEML−4(配列番号3)の残基1−233又は残基1−495、又はTFG(配列番号22)の残基1−138を含有している、請求項36に記載の方法。
- 当該ALK融合ポリペプチドの発現及び/又は活性の阻害が、請求項1に記載のポリヌクレオチドを検出する少なくとも1つの試薬及び/又は請求項11に記載の少なくとも1つの試薬及び/又はTFG−ALK融合ポリヌクレオチド又はポリペプチドを検出する少なくとも1つの試薬を用いて判定される、請求項34に記載の方法。
- 当該方法が、当該癌における当該EML4−ALK融合ポリペプチドの発現及び/又は活性を阻害する工程を含有してなる、EML4−ALK融合ポリペプチドを発現する癌の進展を阻害する方法。
- 当該方法が、当該癌における当該TFG−ALK融合ポリペプチドの発現及び/又は活性を阻害する工程を含有してなる、TFG−ALK融合ポリペプチドを発現する固形腫瘍の進展を阻害する方法。
- 当該癌又は当該固形腫瘍が肺癌である、請求項39又は40に記載の方法。
- 当該肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である、請求項41に記載の方法。
- 当該EML4−ALK融合ポリペプチド又は当該TFG−ALK融合ポリペプチドの発現及び/又は活性が、WHI−131及び/又はWHI−154、又はその類縁体を含有している組成物で阻害される、請求項39又は40に記載の方法。
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
PCT/US2007/009273 WO2008127248A1 (en) | 2007-04-13 | 2007-04-13 | Gene defects and mutant alk kinase in human solid tumors |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014067990A Division JP6141224B2 (ja) | 2014-03-28 | 2014-03-28 | ヒト固形腫瘍における遺伝子欠失及び突然変異alkキナーゼ |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2010501175A true JP2010501175A (ja) | 2010-01-21 |
JP5562640B2 JP5562640B2 (ja) | 2014-07-30 |
Family
ID=39864195
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009525538A Active JP5562640B2 (ja) | 2007-04-13 | 2007-04-13 | ヒト固形腫瘍における遺伝子欠失及び突然変異alkキナーゼ |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP2016089B1 (ja) |
JP (1) | JP5562640B2 (ja) |
KR (3) | KR101362284B1 (ja) |
CN (2) | CN101466721B (ja) |
AU (1) | AU2007351581B2 (ja) |
CA (2) | CA2648864C (ja) |
DK (1) | DK2016089T3 (ja) |
ES (1) | ES2458497T3 (ja) |
HK (1) | HK1122040A1 (ja) |
WO (1) | WO2008127248A1 (ja) |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2009100783A (ja) * | 2006-10-11 | 2009-05-14 | Astellas Pharma Inc | Eml4−alk融合遺伝子 |
WO2011102507A1 (ja) * | 2010-02-22 | 2011-08-25 | 富士レビオ株式会社 | 癌遺伝子の同定方法、癌遺伝子発現細胞の樹立方法、および癌遺伝子標的薬のスクリーニング方法 |
JP2014505870A (ja) * | 2010-12-29 | 2014-03-06 | エクスプレッション、パソロジー、インコーポレイテッド | Her3タンパク質SRM/MRMアッセイ |
EP2990493A1 (en) | 2014-09-01 | 2016-03-02 | ARKRAY, Inc. | Primer reagent for amplifying alk fusion gene, alk fusion gene amplification reagent kit including the same, and alk fusion gene amplification method and alk fusion gene analysis method using the same |
JP2016052301A (ja) * | 2014-09-01 | 2016-04-14 | アークレイ株式会社 | Alk融合遺伝子を増幅するためのプライマー試薬、それを含むalk融合遺伝子の増幅試薬キット、それを用いたalk融合遺伝子の増幅方法および分析方法 |
JP2016519287A (ja) * | 2013-03-15 | 2016-06-30 | エクスプレッション、パソロジー、インコーポレイテッドExpression Pathology, Inc. | 癌療法を示すためのsrmアッセイ |
JP7385191B2 (ja) | 2019-08-30 | 2023-11-22 | 学校法人同志社 | Eml4-alk阻害ペプチドおよびこれを含む肺がん治療薬 |
Families Citing this family (23)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20120208824A1 (en) * | 2006-01-20 | 2012-08-16 | Cell Signaling Technology, Inc. | ROS Kinase in Lung Cancer |
US8168383B2 (en) | 2006-04-14 | 2012-05-01 | Cell Signaling Technology, Inc. | Gene defects and mutant ALK kinase in human solid tumors |
SI2450437T1 (sl) | 2006-04-14 | 2017-12-29 | Cell Signaling Technology Inc. | Okvarjenost genov in mutantna ALK kinaza v človeških solidnih tumorjih |
TWI389893B (zh) | 2007-07-06 | 2013-03-21 | Astellas Pharma Inc | 二(芳胺基)芳基化合物 |
US20110110923A1 (en) * | 2008-02-12 | 2011-05-12 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Fish assay for eml4 and alk fusion in lung cancer |
RU2562144C2 (ru) * | 2009-05-15 | 2015-09-10 | Инсайт Дженетикс, Инк. | Способы и композиции, связанные со слиянием алк, для диагностики и лечения рака |
TWI518325B (zh) * | 2010-02-04 | 2016-01-21 | 自治醫科大學 | 對alk抑制劑具有先抗性或後抗性癌症的識別、判斷和治療 |
CN101955995B (zh) * | 2010-06-17 | 2013-06-26 | 江苏迈迪基因生物科技有限公司 | 淋巴瘤相关的融合基因的诊断试剂盒 |
KR101264810B1 (ko) * | 2010-11-25 | 2013-05-15 | 한국과학기술연구원 | Alk 유전자의 재배열 검출방법 및 이를 이용한 암 진단방법 |
CN102719525B (zh) * | 2012-04-12 | 2014-06-04 | 厦门艾德生物医药科技有限公司 | 用于检测eml4-alk融合基因突变的引物、探针及检测试剂盒 |
US9084456B1 (en) * | 2012-05-28 | 2015-07-21 | Jack Zemer | Linkage for jewelry components |
US10072298B2 (en) | 2013-04-17 | 2018-09-11 | Life Technologies Corporation | Gene fusions and gene variants associated with cancer |
CN105378110A (zh) * | 2013-04-17 | 2016-03-02 | 生命技术公司 | 与癌症相关的基因融合体和基因变异体 |
EP3122901B1 (en) * | 2014-03-27 | 2018-08-15 | Life Technologies Corporation | Gene fusions and gene variants associated with cancer |
WO2016106701A1 (zh) * | 2014-12-31 | 2016-07-07 | 深圳华大基因股份有限公司 | 检测非小细胞肺癌的qRT-PCR引物、探针、芯片、试剂盒、应用和方法 |
CN105254764A (zh) * | 2015-08-27 | 2016-01-20 | 上海康岱生物医药技术有限公司 | ACVR1-Fc融合蛋白及其制法和用途 |
WO2017153932A1 (en) | 2016-03-10 | 2017-09-14 | Novartis Ag | Strn-alk fusion as a therapeutic target in gastric cancer |
WO2017175111A1 (en) | 2016-04-04 | 2017-10-12 | Novartis Ag | Strn-alk fusion as a therapeutic target in colorectal cancer |
US11505830B2 (en) * | 2017-05-31 | 2022-11-22 | Roche Molecular Systems, Inc. | Multiplex PCR detection of ALK, RET, and ROS fusions |
KR101987065B1 (ko) * | 2017-08-07 | 2019-06-10 | 주식회사 싸이토젠 | Eml4-alk유전자 변이 분석방법 |
KR102182850B1 (ko) * | 2018-11-19 | 2020-11-25 | 경북대학교 산학협력단 | Tfg 나노 입자 또는 tfmg 나노 입자를 포함하는 암 치료용 또는 암 전이 억제용 조성물 |
CN112794914B (zh) * | 2019-11-14 | 2022-09-16 | 深圳华大生命科学研究院 | 一种基于噬菌体展示技术开发的alk纳米抗体及其应用 |
CN113130001B (zh) * | 2021-03-31 | 2023-07-18 | 甘肃中医药大学 | 一种天然化合物与抗肿瘤化合物配伍的筛选方法 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2005056752A2 (en) * | 2003-10-24 | 2005-06-23 | Gencia Corporation | Methods and compositions for delivering polynucleotides |
JP2008295444A (ja) * | 2006-10-11 | 2008-12-11 | Astellas Pharma Inc | Eml4−alk融合遺伝子 |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5529925A (en) * | 1993-12-03 | 1996-06-25 | St. Jude Children's Research Hospital | Nucleic acid sequences and fusion proteins present in human t(2;5) lymphoma |
US7300753B2 (en) * | 1998-09-04 | 2007-11-27 | John Rush | Immunoaffinity isolation of modified peptides from complex mixtures |
US20030099974A1 (en) * | 2001-07-18 | 2003-05-29 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Novel genes, compositions, kits and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of breast cancer |
EP1501351A2 (en) * | 2002-04-17 | 2005-02-02 | Richard Metz | Short fragment homologous replacement to provide bse resistant cattle |
EP1663992A1 (en) * | 2003-09-18 | 2006-06-07 | Novartis AG | 2,4-di (phenylamino) pyrimidines useful in the treatment of proliferative disorders |
EP1914240B1 (en) * | 2006-10-11 | 2009-12-02 | Astellas Pharma Inc. | EML4-ALK fusion gene |
-
2007
- 2007-04-13 ES ES07775495.0T patent/ES2458497T3/es active Active
- 2007-04-13 KR KR1020127030790A patent/KR101362284B1/ko active IP Right Grant
- 2007-04-13 CN CN2007800214314A patent/CN101466721B/zh active Active
- 2007-04-13 JP JP2009525538A patent/JP5562640B2/ja active Active
- 2007-04-13 CA CA2648864A patent/CA2648864C/en active Active
- 2007-04-13 DK DK07775495.0T patent/DK2016089T3/da active
- 2007-04-13 CA CA2982018A patent/CA2982018C/en active Active
- 2007-04-13 KR KR1020117024131A patent/KR101274092B1/ko active IP Right Grant
- 2007-04-13 AU AU2007351581A patent/AU2007351581B2/en active Active
- 2007-04-13 CN CN202010990009.7A patent/CN112057625A/zh active Pending
- 2007-04-13 WO PCT/US2007/009273 patent/WO2008127248A1/en active Application Filing
- 2007-04-13 EP EP07775495.0A patent/EP2016089B1/en active Active
- 2007-04-13 KR KR1020087025813A patent/KR20100005180A/ko active Search and Examination
-
2009
- 2009-01-30 HK HK09100885.9A patent/HK1122040A1/xx unknown
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2005056752A2 (en) * | 2003-10-24 | 2005-06-23 | Gencia Corporation | Methods and compositions for delivering polynucleotides |
JP2008295444A (ja) * | 2006-10-11 | 2008-12-11 | Astellas Pharma Inc | Eml4−alk融合遺伝子 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
JPN6011058552; Boyle M. B. 'Voltage-dependent sodium channel alpha subunit', Medline [online], 2006年10月31日, Medl * |
JPN6011058555; Anticancer Res. vol.25, 2005, p.1193-6 * |
Cited By (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2009100783A (ja) * | 2006-10-11 | 2009-05-14 | Astellas Pharma Inc | Eml4−alk融合遺伝子 |
WO2011102507A1 (ja) * | 2010-02-22 | 2011-08-25 | 富士レビオ株式会社 | 癌遺伝子の同定方法、癌遺伝子発現細胞の樹立方法、および癌遺伝子標的薬のスクリーニング方法 |
US9157905B2 (en) | 2010-02-22 | 2015-10-13 | Fujirebio Inc. | Method for identifying oncogene, method for establishing oncogene-expressing cell, and method of screening oncogene targeting drug |
JP2014505870A (ja) * | 2010-12-29 | 2014-03-06 | エクスプレッション、パソロジー、インコーポレイテッド | Her3タンパク質SRM/MRMアッセイ |
US9869680B2 (en) | 2010-12-29 | 2018-01-16 | Expression Pathology, Inc. | HER3 protein SRM/MRM assay |
JP2016519287A (ja) * | 2013-03-15 | 2016-06-30 | エクスプレッション、パソロジー、インコーポレイテッドExpression Pathology, Inc. | 癌療法を示すためのsrmアッセイ |
EP2990493A1 (en) | 2014-09-01 | 2016-03-02 | ARKRAY, Inc. | Primer reagent for amplifying alk fusion gene, alk fusion gene amplification reagent kit including the same, and alk fusion gene amplification method and alk fusion gene analysis method using the same |
JP2016052301A (ja) * | 2014-09-01 | 2016-04-14 | アークレイ株式会社 | Alk融合遺伝子を増幅するためのプライマー試薬、それを含むalk融合遺伝子の増幅試薬キット、それを用いたalk融合遺伝子の増幅方法および分析方法 |
US10597725B2 (en) | 2014-09-01 | 2020-03-24 | Arkray, Inc. | Primer reagent for amplifying ALK fusion gene, ALK fusion gene amplification reagent kit including the same, and ALK fusion gene amplification method and ALK fusion gene analysis method using the same |
JP7385191B2 (ja) | 2019-08-30 | 2023-11-22 | 学校法人同志社 | Eml4-alk阻害ペプチドおよびこれを含む肺がん治療薬 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU2007351581A1 (en) | 2008-10-23 |
CN101466721A (zh) | 2009-06-24 |
KR20110117734A (ko) | 2011-10-27 |
CN101466721B (zh) | 2013-08-21 |
KR20130004522A (ko) | 2013-01-10 |
EP2016089B1 (en) | 2014-01-15 |
KR101362284B1 (ko) | 2014-02-12 |
CA2982018C (en) | 2023-10-17 |
KR20100005180A (ko) | 2010-01-14 |
ES2458497T3 (es) | 2014-05-05 |
DK2016089T3 (da) | 2014-04-22 |
EP2016089A1 (en) | 2009-01-21 |
KR101274092B1 (ko) | 2013-06-25 |
CA2648864A1 (en) | 2008-10-23 |
CA2648864C (en) | 2017-11-21 |
CN112057625A (zh) | 2020-12-11 |
HK1122040A1 (en) | 2009-05-08 |
CA2982018A1 (en) | 2008-10-23 |
AU2007351581B2 (en) | 2011-12-01 |
JP5562640B2 (ja) | 2014-07-30 |
WO2008127248A1 (en) | 2008-10-23 |
EP2016089A4 (en) | 2009-10-21 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11505833B2 (en) | Compositions for detecting mutant anaplastic lymphoma kinase in lung cancer | |
JP5562640B2 (ja) | ヒト固形腫瘍における遺伝子欠失及び突然変異alkキナーゼ | |
US10955416B2 (en) | Compositions for detecting mutant anaplastic lymphoma kinase in human lung cancer | |
JP6740172B2 (ja) | ヒト固形腫瘍における遺伝子欠失及び突然変異alkキナーゼ | |
JP6141224B2 (ja) | ヒト固形腫瘍における遺伝子欠失及び突然変異alkキナーゼ | |
JP2022184916A (ja) | ヒト固形腫瘍における遺伝子欠失及び突然変異alkキナーゼ | |
AU2012261697A1 (en) | Gene defects and mutant alk kinase in human solid tumors |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20111115 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20120201 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20120208 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20120515 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20130108 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20130326 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20130402 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20130701 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20140107 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20140328 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20140513 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20140611 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5562640 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |