JP2008048735A - 非平面状の固体支持体を用いた微生物の分離方法及び分離装置 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】微生物を含む試料から微生物を分離する方法であって、非平面状の固体支持体と、微生物を含む試料とをpH3.0〜6.0で接触させる段階を含む、微生物の分離方法である。
【選択図】図3
Description
本実施例では、入口と出口とが備えられ、サイズが10mm×23mmであるシリコン材質のチップ上にピラーのアレイが形成されているチャンバを備えた流動装置に、細菌細胞を含む試料を流しながら、細胞を前記固体支持体上に付着させ、流れ出る試料中の細胞の数をコロニー計数を通じて決定し、これから前記固体支持体による細菌細胞の捕捉効率を計算した。前記ピラーアレイにおいて、隣接するピラー間の距離は12μmであり、ピラー高さが100μmであり、各ピラーの断面は、一辺の長さが25μmの正方形である。
本実施例では、入口と出口とが備えられ、サイズが10mm×23mmであるシリコン材質のチップ上にピラーのアレイが形成されているチャンバを備えた流動装置に、細菌細胞を含む試料を流しながら、細菌細胞を前記固体支持体上に付着させ、流れ出る試料中の細菌細胞の数を、コロニー計数を通じて決定し、これから前記固体支持体による細菌細胞の捕捉効率を計算した。前記ピラーアレイにおいて、隣接するピラー同士の間の距離は12μmであり、ピラー高さが100μmであり、各ピラーの断面は、一辺の長さが25μmの正方形である。
本実施例では、サイズが25.4mm×25.4mmである平らなSiO2層からなる表面を有するシリコンチップ、前記チップ上にそれぞれPEIM、OTC、及びDFSがコーティングされている表面を有する基板に、細菌細胞を含む試料を加えて細菌細胞を前記固体支持体上に付着させ、洗浄した後、顕微鏡を通じて細菌細胞の付着挙動を観察した。
本実施例では、入口と出口とが備えられており、サイズが10mm×23mmであるシリコン基板上にピラーのアレイが形成された表面を有するチャンバを備えた流動装置に、細菌細胞を含む試料を流しながら、細胞を固体支持体上に付着させ、流れ出る試料中の細胞の数をコロニー計数を通じて決定し、これから前記固体支持体による細菌細胞の捕捉効率を計算した。前記ピラーアレイにおいて、隣接するピラー同士の間の距離は12μmであり、ピラー高さが100μmであり、各ピラーの断面は、一辺の長さが25μmの正方形である。
本実施例では、入口と出口とが備えられており、サイズが10mm×23mmであるシリコンチップ上に、ピラーのアレイが形成された表面を有するチャンバを備えた流動装置に、細菌細胞を含む試料を流しながら、細胞を前記固体支持体上に付着させ、流れ出る試料中の細胞の数をコロニー計数を通じて決定し、これから前記固体支持体による細胞捕捉効率を計算した。前記ピラーアレイにおいて、隣接するピラー同士の間の距離は12μmであり、ピラー高さが100μmであり、各ピラーの断面は、一辺の長さが25μmの正方形である。
本実施例では、入口と出口とが備えられており、サイズが10mm×23mmであるシリコンチップ上にピラーのアレイが形成された表面を有するチャンバを備えた流動装置に、細菌細胞を含む試料を流しながら、細菌細胞を前記固体支持体上に付着させ、流れ出る試料中の細菌細胞の数を、コロニー計数を通じて決定し、これから前記固体支持体による細菌細胞の捕捉効率を計算した。前記ピラーアレイにおいて、隣接するピラー同士の間の距離は12μmであり、ピラー高さが100μmであり、各ピラーの断面は、一辺の長さが25μmの正方形である。
本実施例では、入口と出口とが備えられており、サイズが10mm×23mmであるシリコンチップ上にピラーのアレイが形成された表面を有するチャンバを備えた流動装置に、細菌細胞を含む試料を流しながら、細胞を前記固体支持体上に付着させ、流れ出る試料中の細菌細胞の数を、コロニー計数を通じて決定し、これから前記固体支持体による細菌細胞の捕捉効率を計算した。前記ピラーアレイにおいて、隣接するピラー間の距離は12μmであり、ピラー高さが100μmであり、各ピラーの断面は一辺の長さが25μmの正方形である。
本実施例では、入口と出口とが備えられており、サイズが10mm×23mmであるシリコンチップ上にピラーのアレイが形成されている表面を有するチャンバを備えた流動装置に、細菌細胞を含む試料を流しながら、細菌細胞を前記固体支持体上に付着させ、流れ出る試料中の細胞の数を、コロニー計数を通じて決定し、これから前記固体支持体による細菌細胞の捕捉効率を計算した。前記ピラーアレイにおいて、隣接するピラー同士の間の距離は12μmであり、ピラー高さが100μmであり、各ピラーの断面は、一辺の長さが25μmの正方形である。
Claims (26)
- 微生物を含む試料から微生物を分離する方法であって、
非平面状の固体支持体と、微生物を含む試料とをpH3.0〜6.0で接触させる段階を含む、微生物の分離方法。 - 前記微生物が、細菌、真菌及びウイルスからなる群から選択される1種以上である、請求項1に記載の方法。
- 前記試料が、生物学的試料である、請求項1または2に記載の方法。
- 前記試料が、血液、尿、または唾液である、請求項3に記載の方法。
- 前記試料が、リン酸緩衝液または酢酸緩衝液で希釈されてなる、請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法。
- 前記試料と前記リン酸緩衝液または酢酸緩衝液との体積比率が、1:1〜1:10である、請求項5に記載の方法。
- 前記試料が、10〜500mMの塩濃度を有する、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記試料が、50〜300mMの塩濃度を有する、請求項7に記載の方法。
- 前記非平面状の固体支持体は、表面に複数個のピラーが形成されたピラー構造を有する固体支持体、表面にビーズ形状を有する固体支持体、または表面に複数個の孔隙が形成された篩構造を有する固体支持体である、請求項1〜8のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ピラーの高さと前記ピラーの断面の長さとの比が、1:1〜20:1である、請求項9に記載の方法。
- 前記ピラー構造において、前記ピラーの高さと隣接する前記ピラーの距離との比率が1:1〜25:1である、請求項9または10に記載の方法。
- 前記ピラー構造において、前記ピラーと隣接する前記ピラーとの距離が5〜100μmである、請求項9〜11のいずれか1項に記載の方法。
- 前記非平面状の固体支持体が疎水性であり、70°〜95°の水接触角を有する、請求項1〜12のいずれか1項に記載の方法。
- 前記疎水性の固体支持体は、表面をオクタデシルジメチル(3−トリメトキシシリルプロピル)アンモニウム、トリデカフルオロテトラヒドロオクチルトリメトキシシラン、CF3(CF2) 3CH2CH2Si(OCH3)3、CF3(CF2)5CH2CH2Si(OCH3)3、CF3(CF2)7CH2CH2Si(OCH3)3、CF3(CF2)9CH2CH2Si(OCH3)3、(CF3) 2CF(CF2)4CH2CH2Si(OCH3)3、(CF3) 2CF(CF2)6CH2CH2Si(OCH3)3、(CF3) 2CF(CF2)8CH2CH2Si(OCH3)3、CF3(C6H4)C2H4Si(OCH3)3、CF3(CF2) 3(C6H4)C2H4Si(OCH3)3、CF3(CF2) 5(C6H4)C2H4Si(OCH3)3、CF3(CF2) 7(C6H4)C2H4Si(OCH3)3、CF3(CF2) 3CH2CH2SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 5CH2CH2SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 7CH2CH2SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2)9CH2CH2SiCH3(OCH3)2、(CF3) 2CF(CF2) 4CH2CH2SiCH3(OCH3)2、(CF3) 2CF(CF2) 6CH2CH2SiCH3(OCH3)2、(CF3) 2CF(CF2)8CH2CH2SiCH3(OCH3)2、CF3(C6H4)C2H4SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 3(C6H4)C2H4SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 5(C6H4)C2H4SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 7(C6H4)C2H4SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 3CH2CH2Si(OCH2CH3)3、CF3(CF2)5CH2CH2Si(OCH2CH3)3、及びCF3(CF2) 7CH2CH2Si(OCH2CH3)3からなる群から選択された物質でコーティングすることにより得られる、請求項13に記載の方法。
- 前記非平面状の固体支持体は、表面にアミン系の官能基を一以上有する、請求項1〜14のいずれか1項に記載の方法。
- 前記アミン系の官能基を一以上有する表面は、ポリエチレンイミントリメトキシシラン、アミノプロピルトリエトキシシラン、N−[3−(トリメトキシシリル)−プロピル]エチレンジアミン、及びN−トリメトキシシリルプロピル−N,N,N−塩化トリメチルアンモニウムからなる群から選択された物質でコーティングすることにより得られる、請求項15に記載の方法。
- 前記接触の段階後に、前記非平面状の固体支持体に結合していない物質を洗浄する段階をさらに含む、請求項1〜16のいずれか1項に記載の方法。
- 微生物を含む試料から微生物を分離する装置であって、
非平面状の固体支持体を含む容器と、
前記容器に備え付けられる試料注入部と、
前記容器に備え付けられる緩衝液保存部と、
を含む、微生物の分離装置。 - 前記非平面状の固体支持体は、表面に複数個のピラーが形成されたピラー構造を有する固体支持体、表面にビーズ形状を有する固体支持体、または表面に複数個の孔隙が形成された篩構造を有する固体支持体である、請求項18に記載の装置。
- 前記ピラーの高さと前記ピラーの断面の長さとの比が1:1〜20:1である、請求項18または19に記載の装置。
- 前記ピラー構造において、前記ピラーの高さと隣接する前記ピラーの距離との比率が1:1〜25:1である、請求項19または20に記載の装置。
- 前記ピラー構造において、隣接する前記ピラー同士の間の距離が5〜100μmである、請求項19〜21のいずれか1項に記載の装置。
- 前記非平面状の固体支持体が疎水性であり、70°〜95°の水接触角を有する、請求項18〜22のいずれか1項に記載の装置。
- 前記疎水性の固体支持体は、表面をオクタデシルジメチル(3−トリメトキシシリルプロピル)アンモニウム、トリデカフルオロテトラヒドロオクチルトリメトキシシラン、CF3(CF2) 3CH2CH2Si(OCH3)3、CF3(CF2)5CH2CH2Si(OCH3)3、CF3(CF2)7CH2CH2Si(OCH3)3、CF3(CF2)9CH2CH2Si(OCH3)3、(CF3) 2CF(CF2)4CH2CH2Si(OCH3)3、(CF3) 2CF(CF2)6CH2CH2Si(OCH3)3、(CF3) 2CF(CF2)8CH2CH2Si(OCH3)3、CF3(C6H4)C2H4Si(OCH3)3、CF3(CF2) 3(C6H4)C2H4Si(OCH3)3、CF3(CF2) 5(C6H4)C2H4Si(OCH3)3、CF3(CF2) 7(C6H4)C2H4Si(OCH3)3、CF3(CF2) 3CH2CH2SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 5CH2CH2SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 7CH2CH2SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2)9CH2CH2SiCH3(OCH3)2、(CF3) 2CF(CF2) 4CH2CH2SiCH3(OCH3)2、(CF3) 2CF(CF2) 6CH2CH2SiCH3(OCH3)2、(CF3) 2CF(CF2)8CH2CH2SiCH3(OCH3)2、CF3(C6H4)C2H4SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 3(C6H4)C2H4SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 5(C6H4)C2H4SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 7(C6H4)C2H4SiCH3(OCH3)2、CF3(CF2) 3CH2CH2Si(OCH2CH3)3、CF3(CF2)5CH2CH2Si(OCH2CH3)3、及びCF3(CF2) 7CH2CH2Si(OCH2CH3)3からなる群から選択された物質でコーティングすることにより得られる、請求項23に記載の装置。
- 前記非平面状の固体支持体は、表面にアミン系の官能基を一以上有する、請求項18〜24のいずれか1項に記載の装置。
- 前記アミン系の官能基を一以上有する表面は、ポリエチレンイミントリメトキシシラン、アミノプロピルトリエトキシシラン、N−[3−(トリメトキシシリル)−プロピル]エチレンジアミン、及びN−トリメトキシシリルプロピル−N,N,N−塩化トリメチルアンモニウムからなる群から選択された物質でコーティングすることにより得られる、請求項25に記載の装置。
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KR1020060079054A KR100813264B1 (ko) | 2006-08-21 | 2006-08-21 | 비평면 형상의 고체 지지체를 이용하여 미생물로부터핵산을 증폭하는 방법 |
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