ES2632768T3 - Flujo de trabajo para la detección de ligandos empleando ácidos nucleicos - Google Patents
Flujo de trabajo para la detección de ligandos empleando ácidos nucleicos Download PDFInfo
- Publication number
- ES2632768T3 ES2632768T3 ES12702099.8T ES12702099T ES2632768T3 ES 2632768 T3 ES2632768 T3 ES 2632768T3 ES 12702099 T ES12702099 T ES 12702099T ES 2632768 T3 ES2632768 T3 ES 2632768T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- ligase
- dna ligase
- proteins
- atp
- seq
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6853—Nucleic acid amplification reactions using modified primers or templates
- C12Q1/6855—Ligating adaptors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Immunology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Un método para acoplar al menos dos oligonucleótidos para producir un oligonucleótido acoplado y amplificar el oligonucleótido acoplado, en el que el acoplamiento y la amplificación se producen en una única mezcla de reacción, comprendiendo dicho método las etapas, en combinación, de: a) poner en contacto una proteína diana o analito con al menos una primera y una segunda sonda, teniendo cada sonda una especificidad de unión por la proteína o el analito y estando unida al menos a un tipo de oligonucleótido; b) acoplar entre sí los oligonucleótidos sobre la primera y la segunda sonda empleando (i) una ligasa seleccionada del grupo que consiste en la ligasa de SEQ ID NO:77, la ligasa de SEQ ID NO:78, la ligasa de SEQ ID NO:79, la ligasa de SEQ ID NO:80, la ligasa de SEQ ID NO:81, la ligasa de SEQ ID NO:82, y sus combinaciones, y (ii) un puente oligonucleotídico, en el que dicho puente oligonucleotídico comprende un extremo 3' de cuatro a nueve bases de longitud, y un extremo 5' de cuatro a nueve bases de longitud, para producir un ácido nucleico diana y amplificar el ácido nucleico diana; y, c) detectar el ácido nucleico diana amplificado
Description
5
15
25
35
45
55
5.476.930; Fung et al., patente de EE. UU. n.º 5.593.826; Kool, patente de EE. UU. n.º 5.426.180; Landegren et al., patente de EE. UU. n.º 5.871.921; Xu y Kool, Nucleic Acids Research, 27:875-881 (1999); Higgins et al., Methods in Enzymology, 68:50-71 (1979); Engler et al., The Enzymes, 15-3-29 (1982); y Namsaraev, publicación de patente de EE. UU. 2004/0110213. Se ha indicado la fidelidad de varias ligasas conocidas, basándose, por ejemplo, en la evaluación de las tasas de acoplamiento o de acoplamiento desapareado. Por ejemplo, se ha indicado que la ligasa dependiente de NAD+ de la bacteria hipertermófila Aquifex aeolicus genera productos de acoplamiento erróneo 3' detectables con desapareamientos de C:A, T:G, y G:T (Tong et al., Nucl. Acids Res., 28(6):1447-1454, 2000); se ha indicado que una preparación parcialmente purificada de la ADN ligasa III bovina genera productos de acoplamiento erróneo 3' detectables con desapareamientos de C:T, G:T, y T:G, mientras que la ligasa I humana genera productos de acoplamiento erróneo 3' detectables con desapareamientos de C:T y G:T, pero no de T:G (Husain et al., J. Biol. Chem., 270(16):9683-9690, 1995); y se ha indicado que la ADN ligasa de la bacteria termófila Thermus thermophilus (Tth) genera niveles detectables de productos de acoplamiento erróneo 3' detectables con desapareamientos de T:G y G:T (Luo et al., Nucl. Acids Res., 24(14):3071-3078, 1996). La ADN ligasa del bacteriófago T4 genera productos de acoplamiento erróneo detectables con una amplia gama de sustratos desapareados y parece tener menor fidelidad que las ligasas de especies de Thermus en al menos uno a dos órdenes de magnitud (Landegren et al., Science, 241:1077-1080, 1988; Tong et al., Nucl. Acids Res., 27(3):788-794, 1999).
Un ensayo particularmente útil es el ensayo de acoplamiento de oligonucleótidos (OLA). El OLA es un método conveniente y altamente riguroso que permite la distinción entre variantes de secuencias de ADN conocidas (Landegren, 1988). Por ejemplo, el análisis múltiplex de loci altamente polimorfos es útil para la identificación de individuos, por ejemplo, para ensayos de paternidad y en la ciencia forense, la correspondencia entre donantes y receptores en transplantes de órganos, el diagnóstico de enfermedades genéticas, la prognosis, y el asesoramiento prenatal y otros ensayos con base genética que dependen de la discriminación de diferencias de una sola base en múltiples loci (Delahunty, 1996). Los productos de un OLA múltiplex pueden separarse de modo electroforético y de las sondas no acopladas bajo condiciones desnaturalizantes con detección de fluorescencia (Grossman, 1994). Por ejemplo, dos quimeras de PNA-ADN, una quimera de secuencia de tipo salvaje ("wild-type", WT) y una quimera de secuencia mutante pueden llevar diferentes tintes fluorescentes. Solo cuando la secuencia mutante está presente en la muestra diana es cuando la quimera de secuencia mutante se acopla a la segunda sonda (oligo) acoplada en posición adyacente si el par de bases mutante está en el sitio de acoplamiento. Los productos del acoplamiento pueden separarse basándose en: (i) el tamaño, empleando electroforesis y/o cromatografía y/o (ii) marcadores detectables (Grossman, 1994). Con una pluralidad de tintes fluorescentes como marcadores de quimeras con secuencias que se dirigen a secuencias diana exclusivas, pueden realizarse OLA múltiplex en una sola muestra en un único recipiente. Los requisitos para un OLA múltiplex eficaz incluyen sondas que se asocian y se acoplan de una manera muy específica y rápida. Las quimeras y las secuencias de la segunda sonda pueden seleccionarse de modo que la base mutante, o polimorfismo de una sola base, pueda estar en el 5'-fosfato de la segunda sonda o en el 3'-terminal de la quimera. Se contempla que los experimentos de OLA de la presente invención puedan realizarse sobre soportes sólidos, en los que el ácido nucleico molde, la sonda quimérica de PNA-ADN, o la segunda sonda pueden estar inmovilizados sobre una partícula sólida o esfera, o una superficie sólida porosa o no porosa. Cuando están inmovilizados, el molde, la quimera o la segunda sonda preferiblemente están unidos covalentemente al sustrato sólido, por ejemplo, a través de una unidad de monómero terminal. El sustrato sólido puede ser poliestireno, vidrio de tamaño de poro controlado, gel de sílice, sílice, poliacrilamida, esferas magnéticas, hidroxietilmetacrilato, poliamida, polietileno, polietileoxi, y copolímeros e injertos de cualquiera de los anteriores sustratos sólidos. La configuración o el formato del sustrato sólido puede ser de pequeñas partículas o esferas con un diámetro de aproximadamente 1 a 50 µm, membranas, fritas, portaobjetos, placas, chips fabricados con micromáquinas, capas de alcantiol-oro, superficies no porosas y medios inmovilizantes de polinucleótidos.
Tal como se describió anteriormente, el acoplamiento enzimático generalmente se logra empleando una ligasa, que puede ser un polipéptido. Las ligasas adecuadas incluyen, por ejemplo, ácido nucleico ligasa, oligonucleótido ligasa, ADN ligasa, ARN ligasa, y similares. Las ARN ligasas adecuadas incluyen las descritas o empleadas, por ejemplo, en cualquiera de las patentes de EE. UU. n.os 4.582.802; 5.665.545; 6.194.637; 6.444.429; 6.455.274; 6.576.453; 6.635.425; 6.855.523; 7.811.753; y/o cualquiera de las publicaciones de patente de EE. UU. 2004/0171047A1, 2004/0191871A1, US20050266487A1, 2006/0223098A1, 2007/0037190A1, 20080160526A1; 2009/0061481A1, 2010/0099683A1, y/o 2010/0184618A1. Los ejemplos de ADN ligasas pueden incluir, por ejemplo ADN ligasa de T3, ADN ligasa de T4, ADN ligasa de T5, ADN ligasa de T7, ADN ligasa del virus de vaccinia, ADN ligasa de E. coli, ADN ligasa I de mamífero, ADN ligasa II de mamífero, ADN ligasa III de mamífero, ADN ligasa de Tth, ADN ligasa de KOD, una ADN ligasa termoestable y/o sus derivados, fragmentos y/o combinaciones. Las ARN ligasas adecuadas incluyen las descritas o empleadas, por ejemplo, en cualquiera de las patentes de EE. UU. n. os 4.661.450; 5.516.664; 5.602.000; 5.807.674; 6.368.801; 6.492.161; 6.635.453; o cualquiera de las publicaciones de patente de EE. UU. n. os 2003/0082536A1; 2004/0058330A1; 2005/0266439A1; 2005/0074774A1; 2008/0045418A1; 2010/00159526A1. Los ejemplos de ARN ligasas pueden incluir, por ejemplo, ARN ligasa de T4, ARN ligasa del bacteriófago RB69, ARN ligasa del virus de la polihedrosis nuclear Autographa californica, una ARN ligasa termófila, ARN ligasa del bacteriófago RM378, ARN ligasa del bacteriófago TS2126 y/o sus derivados, fragmentos y/o combinaciones.
En algunas realizaciones, la ligasa es una "ligasa de huella pequeña" ("small footprint ligase", SFL). Una SFL tiene la capacidad de acoplarse a polinucleótidos cortos (por ejemplo, al menos aproximadamente 3 nucleótidos). Tal como
12
fragmentos funcionales o variantes. Los ejemplos representativos de SFL incluyen ligasa CV, DLX, DLXd, DLXd2 y ligasa MnM. Una SFL preferida es la ligasa del virus de Chlorella. Se identifican algunos ejemplos de ligasas y se indica su GI o número de registro en la siguiente Tabla 1:
Tabla 1
- PRK08224
-
imagen12 imagen13
- B. Acidobacteria
-
imagen14 imagen15
- Bacteria; grupo de Fibrobacteres/Acidobacteria; Acidobacteria; Acidobacteria no clasificada; Candidatus Koribacter; Candidatus Koribacter versatilis
-
imagen16 imagen17
- Candidatus Solibacter usitatus Ellin6076Candidatus Solibacter (1 proteína)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_826317
- imagen18
-
imagen19 imagen20
- C. Actinobacteria
-
imagen21 imagen22
- Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteria (clase); Actinobacteridae; Actinomycetales; Corynebacterineae; Mycobacteriaceae; Mycobacterium; Mycobacterium marinum
-
imagen23 imagen24
- Mycobacterium gilvum PYR-GCKMycobacterium (26 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001132524
- Mycobacterium vanbaalenii PYR-1Mycobacterium (26 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_956315
- Mycobacterium sp. MCSMycobacterium (26 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_642076
- imagen25
-
imagen26 imagen27
- F. Chlamydiae/Verrucomicrobia
-
imagen28 imagen29
- Bacteria; grupo de Chlamydiae/Verrucomicrobia; Verrucomicrobia; Opitutae; Opitutales; Opitutaceae; Opitutus; Opitutus terrae
-
imagen30 imagen31
- Opitutus terrae PB90-10pitutus (1 proteína)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001821013
- imagen32
-
imagen33 imagen34
- PRK09125
-
imagen35 imagen36
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- O. Betaproteobacteria
-
imagen37 imagen38
- Neisseria meningitidis Z2491Neisseria (7 proteínas)
- ADN ligasa YP_002341892
- Thiobacillus denitrificans ATCC 25259Thiobacillus (1 proteínas)
- ADN ligasa YP_314570
- Variovorax paradoxus S110Variovorax (1 proteínas)
- ADN ligasa YP_002944627
14
- PRK08224
-
imagen39 imagen40
- B. Acidobacteria
-
imagen41 imagen42
- Verminephrobacter eiseniae EF01-2Verminephrobacter (1 proteínas)
- ADN ligasa YP_998235
- imagen43
-
imagen44 imagen45
- P. Deltaproteobacteria
- - -
- Desulfobacterium autotrophicum HRM2Desulfobacterium (1 proteína)
- LigA2 YP_002604477
- Myxococcus xanthus DK 1622Myxococcus (1 proteína)
- ADN ligasa YP_628883
- imagen46
- - -
- Q. Epsilonproteobacteria
-
imagen47 imagen48
- Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168Campylobacter (10 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_002345037
- Sulfurimonas denitrificans DSM 1251Sulfurimonas (1 proteínas)
- ADN ligasa YP_393098
- imagen49
- - -
- R. Gammaproteobacteria
-
imagen50 imagen51
- Aggregatibacter aphrophilus NJ8700Aggregatibacter (2 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_003007537
- Haemophilus influenzae PittEEHaemophilus (3 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001290961
- Shewanella baltica OS195Shewanella (18 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001554317
- Shewanella loihica PV-4Shewanella (18 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001093713
- Vibrio cholerae M66-2Vibrio (9 proteínas)
- ADN ligasa YP_002810248
- imagen52
-
imagen53 imagen54
- PHA0454
-
imagen55 imagen56
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- b. Virus
- - -
- Virus; virus de ADNbc, sin etapa de ARN; Caudovirales; Podoviridae; Autographivirinae; virus similares a phiKMV
-
imagen57
- virus similares al fago de LKD16phiKMV de Pseudomonas (7 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001522807
15
- PRK08224
-
imagen58 imagen59
- B. Acidobacteria
-
imagen60 imagen61
- imagen62
-
imagen63 imagen64
- CLSZ2445448
-
imagen65 imagen66
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- a. Eukaryota
-
imagen67 imagen68
- Eukaryota; Alveolata; Ciliophora; Intramacronucleata; Oligohymenophorea; Peniculida; Parameciidae; Paramecium; Paramecium tetraurelia
-
imagen69 imagen70
- Paramecium tetraurelia strain d4-2Paramecium (5 proteínas)
- ADN ligasa XP_001347270
- imagen71
-
imagen72 imagen73
- PRK07636
-
imagen74 imagen75
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- J. Firmicutes
-
imagen76 imagen77
- Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus; Bacillus clausii
-
imagen78 imagen79
- Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168Bacillus
- ADN ligasa dependiente de ATP NP_389932
- Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Geobacillus
-
imagen80 imagen81
- Geobacillus sp. Y412MC10Geobacillus
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_003240778
- CLSK2551528
-
imagen82 imagen83
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- J. Firmicutes
-
imagen84 imagen85
- Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Geobacillus
-
imagen86 imagen87
- Geobacillus sp. Y412MC10Geobacillus (1 proteína)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_003245332
- imagen88
- - -
- CLSK2470953
-
imagen89 imagen90
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- C. Actinobacteria
-
imagen91 imagen92
16
- Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteria (clase); Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Micrococcaceae; Arthrobacter; Arthrobacter chlorophenolicus
-
imagen93
- Arthrobacter chlorophenolicus A6 (plasmid)Arthrobacter (2 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_002478427
- imagen94
-
imagen95 imagen96
- CLSK2469924
-
imagen97 imagen98
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- J. Firmicutes
-
imagen99 imagen100
- Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Alicyclobacillaceae; Alicyclobacillus; Alicyclobacillus acidocaldarius; Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius
-
imagen101 imagen102
- Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446Alicyclobacillus
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_003185050
- imagen103
-
imagen104 imagen105
- CLSK2340991
-
imagen106 imagen107
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- N. Alphaproteobacteria
-
imagen108 imagen109
- Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Caulobacterales; Caulobacteraceae; Phenylobacterium; Phenylobacterium zucineum
- Phenylobacterium zucineum HLK1 (plásmido)Phenylobacterium (2 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_002128631
- imagen110
- - -
- CLSK2333706
-
imagen111 imagen112
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- J. Firmicutes
-
imagen113 imagen114
- Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptococcaceae; Candidatus Desulforudis; Candidatus Desulforudis audaxviator
- Candidatus Desulforudis audaxviator MP104CCandidatus Desulforudis (1 proteína)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001716762
- imagen115
- - -
- CLSK962101
-
imagen116 imagen117
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
17
- C .Actinobacteria
-
imagen118 imagen119
- Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteria (clase); Actinobacteridae; Actinomycetales; Micromonosporineae; Micromonosporaceae; Salinispora; Salinispora arenicola
- - -
- Salinispora arenicola CNS-205Salinispora (2 proteínas)
- región de la ligasa LigD de ADN polimerasa YP_001539124
- Salinispora tropica CNB-440Salinispora (2 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001160776
- imagen120
- - -
- CLSK915249
-
imagen121 imagen122
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- C. Actinobacteria (véase CLSK2303611 anterior)
-
imagen123 imagen124
- Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteria (clase); Actinobacteridae; Actinomycetales; Streptomycineae; Streptomycetaceae; Streptomyces; Streptomyces coelicolor
-
imagen125 imagen126
- Streptomyces avermitilis MA-4680 (plásmido)Streptomyces (2 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP putativa NP_828839
- Streptomyces sp. HK1 (plásmido)Streptomyces (2 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP putativa YP_001661618
- CLSK862724
-
imagen127 imagen128
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- A. Archaea
-
imagen129 imagen130
- Archaea; Euryarchaeota; Archaeoglobi; Archaeoglobales; Archaeoglobaceae; Archaeoglobus; Archaeoglobus fulgidus
-
imagen131 imagen132
- Archaeoglobus fulgidus DSM 4304Archaeoglobus (1 proteína)
- ADN ligasa, putativa NP_070553
- imagen133
-
imagen134 imagen135
- J. Firmicutes
-
imagen136 imagen137
- Pelotomaculum thermopropionicum SIPelotomaculum (1 proteína)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001211793
- Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223Thermoanaerobacter (2 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_001664477
- imagen138
-
imagen139 imagen140
- CLSK820690
-
imagen141 imagen142
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
18
- A. Archaea
-
imagen143 imagen144
- Archaea; Euryarchaeota; muestras ambientales
-
imagen145 imagen146
- muestras ambienteles RC-I de arqueas metanogénicas no cultivadas (1 proteína)
- ADN ligasa dependiente de ATP YP_686457
- N. Alphaproteobacteria
-
imagen147 imagen148
- Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bradyrhizobiaceae; Bradyrhizobium; Bradyrhizobium japonicum
-
imagen149 imagen150
- Bradyrhizobium japonicum USDA 110Bradyrhizobium (2 proteínas)
- ADN ligasa NP_774671
- Bradyrhizobium sp. BTAilBradyrhizobium (2 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP putativa YP_001243518
- imagen151
-
imagen152 imagen153
- CLSK808255
-
imagen154 imagen155
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- N. Alphaproteobacteria
-
imagen156 imagen157
- Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; grupo de SinorhizobiumlEnsifer; Sinorhizobium; Sinorhizobium medicae
-
imagen158 imagen159
- Sinorhizobium medicae WSM419Sinorhizobium (2 proteínas)
- región de la ligasa LigD de ADN polimerasa YP_001326990
- Sinorhizobium meliloti 1021 (plasmid)Sinorhizobium (2 proteínas)
- proteína de ADN ligasa dependiente de ATP putativa NP_437750
- CLSK806855
-
imagen160 imagen161
- Organismo
- Nombre de la proteína n.º de registro
- N. Alphaproteobacteria
-
imagen162 imagen163
- Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; grupo de Rhizobium/Agrobacterium; Agrobacterium; Agrobacterium tumefaciens
-
imagen164 imagen165
- Agrobacterium tumefaciens str. C58 (plásmido)Agrobacterium (3 proteínas)
- ADN ligasa dependiente de ATP NP_396032
- Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 (plásmido)Rhizobium (10 proteínas)
- proteína del dominio de ligasa LigD de ADN polimerasa YP_002973496
- Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 (plásmido)Rhizobium (10 proteínas)
- proteína del dominio de ligasa LigD de ADN polimerasa YP_002278005
19
Claims (1)
-
imagen1 imagen2
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201161433475P | 2011-01-17 | 2011-01-17 | |
US201161433475P | 2011-01-17 | ||
PCT/US2012/021585 WO2012099896A2 (en) | 2011-01-17 | 2012-01-17 | Workflow for detection of ligands using nucleic acids |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
ES2632768T3 true ES2632768T3 (es) | 2017-09-15 |
Family
ID=45561104
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES12702099.8T Active ES2632768T3 (es) | 2011-01-17 | 2012-01-17 | Flujo de trabajo para la detección de ligandos empleando ácidos nucleicos |
ES17166444T Active ES2728743T3 (es) | 2011-01-17 | 2012-01-17 | Flujo de trabajo para la detección de ligandos utilizando ácidos nucleicos |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES17166444T Active ES2728743T3 (es) | 2011-01-17 | 2012-01-17 | Flujo de trabajo para la detección de ligandos utilizando ácidos nucleicos |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (4) | US20120196294A1 (es) |
EP (3) | EP3216878B1 (es) |
DK (2) | DK2665833T3 (es) |
ES (2) | ES2632768T3 (es) |
WO (1) | WO2012099896A2 (es) |
Families Citing this family (30)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US8835358B2 (en) | 2009-12-15 | 2014-09-16 | Cellular Research, Inc. | Digital counting of individual molecules by stochastic attachment of diverse labels |
EP3263703B1 (en) | 2011-01-17 | 2020-04-22 | Life Technologies Corporation | Enzymatic ligation of nucleic acids |
DK2665833T3 (en) | 2011-01-17 | 2017-07-24 | Life Technologies Corp | WORKING PROCEDURE FOR DETECTING LIGANDS USING NUCLEIC ACIDS |
US10941396B2 (en) | 2012-02-27 | 2021-03-09 | Becton, Dickinson And Company | Compositions and kits for molecular counting |
ES2711168T3 (es) | 2013-08-28 | 2019-04-30 | Becton Dickinson Co | Análisis masivo en paralelo de células individuales |
US9909167B2 (en) * | 2014-06-23 | 2018-03-06 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | On-slide staining by primer extension |
CN106795522A (zh) * | 2014-10-17 | 2017-05-31 | 上海斯丹赛生物技术有限公司 | 定向克隆的方法 |
ES2836802T3 (es) | 2015-02-27 | 2021-06-28 | Becton Dickinson Co | Códigos de barras moleculares espacialmente direccionables |
EP3277843A2 (en) | 2015-03-30 | 2018-02-07 | Cellular Research, Inc. | Methods and compositions for combinatorial barcoding |
WO2016172373A1 (en) | 2015-04-23 | 2016-10-27 | Cellular Research, Inc. | Methods and compositions for whole transcriptome amplification |
WO2017044574A1 (en) | 2015-09-11 | 2017-03-16 | Cellular Research, Inc. | Methods and compositions for nucleic acid library normalization |
US10301677B2 (en) | 2016-05-25 | 2019-05-28 | Cellular Research, Inc. | Normalization of nucleic acid libraries |
US10202641B2 (en) | 2016-05-31 | 2019-02-12 | Cellular Research, Inc. | Error correction in amplification of samples |
US10640763B2 (en) | 2016-05-31 | 2020-05-05 | Cellular Research, Inc. | Molecular indexing of internal sequences |
KR102522023B1 (ko) | 2016-09-26 | 2023-04-17 | 셀룰러 리서치, 인크. | 바코딩된 올리고뉴클레오티드 서열을 갖는 시약을 이용한 단백질 발현의 측정 |
CN110382708A (zh) | 2017-02-01 | 2019-10-25 | 赛卢拉研究公司 | 使用阻断性寡核苷酸进行选择性扩增 |
CN110719959B (zh) * | 2017-06-05 | 2021-08-06 | 贝克顿迪金森公司 | 针对单细胞的样品索引 |
JP7358388B2 (ja) | 2018-05-03 | 2023-10-10 | ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー | 反対側の転写物末端における分子バーコーディング |
US11773441B2 (en) | 2018-05-03 | 2023-10-03 | Becton, Dickinson And Company | High throughput multiomics sample analysis |
EP3861134A1 (en) | 2018-10-01 | 2021-08-11 | Becton, Dickinson and Company | Determining 5' transcript sequences |
CN112969789A (zh) | 2018-11-08 | 2021-06-15 | 贝克顿迪金森公司 | 使用随机引发的单细胞全转录组分析 |
EP3894552A1 (en) | 2018-12-13 | 2021-10-20 | Becton, Dickinson and Company | Selective extension in single cell whole transcriptome analysis |
CN113574178A (zh) | 2019-01-23 | 2021-10-29 | 贝克顿迪金森公司 | 与抗体关联的寡核苷酸 |
WO2020214642A1 (en) | 2019-04-19 | 2020-10-22 | Becton, Dickinson And Company | Methods of associating phenotypical data and single cell sequencing data |
WO2021016239A1 (en) | 2019-07-22 | 2021-01-28 | Becton, Dickinson And Company | Single cell chromatin immunoprecipitation sequencing assay |
US11773436B2 (en) | 2019-11-08 | 2023-10-03 | Becton, Dickinson And Company | Using random priming to obtain full-length V(D)J information for immune repertoire sequencing |
WO2021146207A1 (en) | 2020-01-13 | 2021-07-22 | Becton, Dickinson And Company | Methods and compositions for quantitation of proteins and rna |
EP4150118A1 (en) | 2020-05-14 | 2023-03-22 | Becton Dickinson and Company | Primers for immune repertoire profiling |
US11932901B2 (en) | 2020-07-13 | 2024-03-19 | Becton, Dickinson And Company | Target enrichment using nucleic acid probes for scRNAseq |
US11739443B2 (en) | 2020-11-20 | 2023-08-29 | Becton, Dickinson And Company | Profiling of highly expressed and lowly expressed proteins |
Family Cites Families (116)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US1009396A (en) | 1911-06-03 | 1911-11-21 | Arthur E Fahrman | Perforating-machine. |
NL154598B (nl) | 1970-11-10 | 1977-09-15 | Organon Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van laagmoleculire verbindingen en van eiwitten die deze verbindingen specifiek kunnen binden, alsmede testverpakking. |
US3817837A (en) | 1971-05-14 | 1974-06-18 | Syva Corp | Enzyme amplification assay |
US3939350A (en) | 1974-04-29 | 1976-02-17 | Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Fluorescent immunoassay employing total reflection for activation |
US3996345A (en) | 1974-08-12 | 1976-12-07 | Syva Company | Fluorescence quenching with immunological pairs in immunoassays |
US4277437A (en) | 1978-04-05 | 1981-07-07 | Syva Company | Kit for carrying out chemically induced fluorescence immunoassay |
US4275149A (en) | 1978-11-24 | 1981-06-23 | Syva Company | Macromolecular environment control in specific receptor assays |
US4257774A (en) | 1979-07-16 | 1981-03-24 | Meloy Laboratories, Inc. | Intercalation inhibition assay for compounds that interact with DNA or RNA |
US4366241A (en) | 1980-08-07 | 1982-12-28 | Syva Company | Concentrating zone method in heterogeneous immunoassays |
CA1190838A (en) | 1981-07-17 | 1985-07-23 | Cavit Akin | Homogeneous nucleic acid hybridization diagnostics by non-radiative energy transfer |
US4816567A (en) | 1983-04-08 | 1989-03-28 | Genentech, Inc. | Recombinant immunoglobin preparations |
US4661450A (en) | 1983-05-03 | 1987-04-28 | Molecular Genetics Research And Development Limited Partnership | Molecular cloning of RNA using RNA ligase and synthetic oligonucleotides |
US4582802A (en) | 1983-09-30 | 1986-04-15 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Stimulation of enzymatic ligation of DNA by high concentrations of nonspecific polymers |
US4883750A (en) | 1984-12-13 | 1989-11-28 | Applied Biosystems, Inc. | Detection of specific sequences in nucleic acids |
US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US4965188A (en) | 1986-08-22 | 1990-10-23 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme |
US5079352A (en) | 1986-08-22 | 1992-01-07 | Cetus Corporation | Purified thermostable enzyme |
US5618711A (en) | 1986-08-22 | 1997-04-08 | Hoffmann-La Roche Inc. | Recombinant expression vectors and purification methods for Thermus thermophilus DNA polymerase |
US4889818A (en) | 1986-08-22 | 1989-12-26 | Cetus Corporation | Purified thermostable enzyme |
US6127155A (en) | 1986-08-22 | 2000-10-03 | Roche Molecular Systems, Inc. | Stabilized thermostable nucleic acid polymerase compositions containing non-ionic polymeric detergents |
US4988617A (en) | 1988-03-25 | 1991-01-29 | California Institute Of Technology | Method of detecting a nucleotide change in nucleic acids |
GB8823869D0 (en) | 1988-10-12 | 1988-11-16 | Medical Res Council | Production of antibodies |
US5035996A (en) | 1989-06-01 | 1991-07-30 | Life Technologies, Inc. | Process for controlling contamination of nucleic acid amplification reactions |
US5210015A (en) | 1990-08-06 | 1993-05-11 | Hoffman-La Roche Inc. | Homogeneous assay system using the nuclease activity of a nucleic acid polymerase |
US5625126A (en) | 1990-08-29 | 1997-04-29 | Genpharm International, Inc. | Transgenic non-human animals for producing heterologous antibodies |
US5545806A (en) | 1990-08-29 | 1996-08-13 | Genpharm International, Inc. | Ransgenic non-human animals for producing heterologous antibodies |
US5661016A (en) | 1990-08-29 | 1997-08-26 | Genpharm International Inc. | Transgenic non-human animals capable of producing heterologous antibodies of various isotypes |
US5633425A (en) | 1990-08-29 | 1997-05-27 | Genpharm International, Inc. | Transgenic non-human animals capable of producing heterologous antibodies |
DE69127627T2 (de) | 1990-08-29 | 1998-02-19 | Genpharm Int | Produktion und Nützung nicht-menschliche transgentiere zur Produktion heterologe Antikörper |
US5426180A (en) | 1991-03-27 | 1995-06-20 | Research Corporation Technologies, Inc. | Methods of making single-stranded circular oligonucleotides |
US5994056A (en) | 1991-05-02 | 1999-11-30 | Roche Molecular Systems, Inc. | Homogeneous methods for nucleic acid amplification and detection |
US5516664A (en) | 1992-12-23 | 1996-05-14 | Hyman; Edward D. | Enzymatic synthesis of repeat regions of oligonucleotides |
EP0682715B1 (en) | 1993-01-15 | 2006-04-05 | The Public Health Research Institute of the City of New York, Inc. | Diagnostic assays and kits for detecting rna using rna binary probes and an rna-directed rna ligase |
JP3778925B2 (ja) | 1993-01-15 | 2006-05-24 | ザ パブリック ヘルス リサーチ インスティチュート オブ ザ シティー オブ ニューヨーク インク | 高感度核酸サンドイッチハイブリダイゼーション検定法及びキット |
US5593826A (en) | 1993-03-22 | 1997-01-14 | Perkin-Elmer Corporation, Applied Biosystems, Inc. | Enzymatic ligation of 3'amino-substituted oligonucleotides |
ATE246702T1 (de) | 1993-04-12 | 2003-08-15 | Univ Northwestern | Verfahren zur darstellung von oligonukleotiden |
US5767259A (en) | 1994-12-27 | 1998-06-16 | Naxcor | Oligonucleotides containing base-free linking groups with photoactivatable side chains |
US5436134A (en) | 1993-04-13 | 1995-07-25 | Molecular Probes, Inc. | Cyclic-substituted unsymmetrical cyanine dyes |
US5658751A (en) | 1993-04-13 | 1997-08-19 | Molecular Probes, Inc. | Substituted unsymmetrical cyanine dyes with selected permeability |
US5925517A (en) | 1993-11-12 | 1999-07-20 | The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. | Detectably labeled dual conformation oligonucleotide probes, assays and kits |
US5538848A (en) | 1994-11-16 | 1996-07-23 | Applied Biosystems Division, Perkin-Elmer Corp. | Method for detecting nucleic acid amplification using self-quenching fluorescence probe |
US6821727B1 (en) | 1993-11-15 | 2004-11-23 | Applera Corporation | Hybridization assay using self-quenching fluorescence probe |
SE9400522D0 (sv) | 1994-02-16 | 1994-02-16 | Ulf Landegren | Method and reagent for detecting specific nucleotide sequences |
KR100230718B1 (ko) | 1994-03-16 | 1999-11-15 | 다니엘 엘. 캐시앙, 헨리 엘. 노르호프 | 등온 가닥 변위 핵산 증폭법 |
US5942391A (en) | 1994-06-22 | 1999-08-24 | Mount Sinai School Of Medicine | Nucleic acid amplification method: ramification-extension amplification method (RAM) |
US6455274B1 (en) | 1994-11-08 | 2002-09-24 | Human Genome Sciences, Inc. | Human DNA Ligase IV |
US5665545A (en) | 1994-11-28 | 1997-09-09 | Akzo Nobel N.V. | Terminal repeat amplification method |
US5801155A (en) | 1995-04-03 | 1998-09-01 | Epoch Pharmaceuticals, Inc. | Covalently linked oligonucleotide minor grove binder conjugates |
US5773258A (en) | 1995-08-25 | 1998-06-30 | Roche Molecular Systems, Inc. | Nucleic acid amplification using a reversibly inactivated thermostable enzyme |
US5854033A (en) | 1995-11-21 | 1998-12-29 | Yale University | Rolling circle replication reporter systems |
EP2573101B1 (en) | 1996-02-09 | 2016-04-20 | Cornell Research Foundation, Inc. | Detection of nucleic acid sequence differences using the ligase detection reaction with addressable arrays |
DE69738687D1 (de) | 1996-04-12 | 2008-06-26 | Phri Properties Inc | Sonden, kits und assays |
EP0912761A4 (en) | 1996-05-29 | 2004-06-09 | Cornell Res Foundation Inc | DETERMINATION OF DIFFERENCES IN THE NUCLEIC ACID SEQUENCE BY MEANS OF A COMBINATION OF LIGASE DETERMINATION AND POLYMERASE CHAIN REACTION |
US6312892B1 (en) | 1996-07-19 | 2001-11-06 | Cornell Research Foundation, Inc. | High fidelity detection of nucleic acid differences by ligase detection reaction |
EP1025120B1 (en) | 1997-10-27 | 2010-08-18 | Boston Probes, Inc. | Methods, kits and compositions pertaining to pna molecular beacons |
US6485901B1 (en) | 1997-10-27 | 2002-11-26 | Boston Probes, Inc. | Methods, kits and compositions pertaining to linear beacons |
US6872521B1 (en) | 1998-06-16 | 2005-03-29 | Beckman Coulter, Inc. | Polymerase signaling assay |
US6037130A (en) | 1998-07-28 | 2000-03-14 | The Public Health Institute Of The City Of New York, Inc. | Wavelength-shifting probes and primers and their use in assays and kits |
US6238927B1 (en) | 1998-10-05 | 2001-05-29 | Mosaic Technologies, Incorporated | Reverse displacement assay for detection of nucleic acid sequences |
US6949370B1 (en) * | 1998-10-30 | 2005-09-27 | Cornell Research Foundation, Inc. | High fidelity thermostable ligase and uses thereof |
US6194637B1 (en) | 1998-11-17 | 2001-02-27 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Maize DNA ligase I orthologue and uses thereof |
US6383752B1 (en) | 1999-03-31 | 2002-05-07 | Hybridon, Inc. | Pseudo-cyclic oligonucleobases |
US6492161B1 (en) | 1999-06-02 | 2002-12-10 | Prokaria Ltd. | Bacteriophage RM 378 of a thermophilic host organism |
US6528254B1 (en) | 1999-10-29 | 2003-03-04 | Stratagene | Methods for detection of a target nucleic acid sequence |
KR100315063B1 (ko) | 1999-11-10 | 2001-11-26 | 박호군 | 초고온 세균 아퀴펙스 파이로필러스의 dna 리가제유전자 및 이로부터 발현되는 단백질 |
SE516272C2 (sv) * | 2000-02-18 | 2001-12-10 | Ulf Landegren | Metoder och kit för analytdetektion mha proximitets-probning |
US7306904B2 (en) * | 2000-02-18 | 2007-12-11 | Olink Ab | Methods and kits for proximity probing |
US6368801B1 (en) | 2000-04-12 | 2002-04-09 | Molecular Staging, Inc. | Detection and amplification of RNA using target-mediated ligation of DNA by RNA ligase |
US6479262B1 (en) | 2000-05-16 | 2002-11-12 | Hercules, Incorporated | Solid phase enzymatic assembly of polynucleotides |
AU2001265121A1 (en) | 2000-05-30 | 2001-12-11 | Applera Corporation | Methods for detecting target nucleic acids using coupled ligation and amplification |
US6596490B2 (en) | 2000-07-14 | 2003-07-22 | Applied Gene Technologies, Inc. | Nucleic acid hairpin probes and uses thereof |
US6569927B1 (en) | 2000-10-06 | 2003-05-27 | Uniroyal Chemical Company, Inc. | Thermoplastic resins stabilized by blends of sterically hindered phenols, secondary amines, and lactones |
US6350580B1 (en) | 2000-10-11 | 2002-02-26 | Stratagene | Methods for detection of a target nucleic acid using a probe comprising secondary structure |
US6312929B1 (en) | 2000-12-22 | 2001-11-06 | Cepheid | Compositions and methods enabling a totally internally controlled amplification reaction |
US6635425B2 (en) | 2001-01-05 | 2003-10-21 | Molecular Staging, Inc. | 5′-thio phosphate directed ligation of oligonucleotides and use in detection of single nucleotide polymorphisms |
US6593091B2 (en) | 2001-09-24 | 2003-07-15 | Beckman Coulter, Inc. | Oligonucleotide probes for detecting nucleic acids through changes in flourescence resonance energy transfer |
US6589250B2 (en) | 2001-11-20 | 2003-07-08 | Stephen A. Schendel | Maxillary distraction device |
US20040171047A1 (en) | 2002-05-22 | 2004-09-02 | Dahl Gary A. | Target-dependent transcription |
EP1546313B1 (en) | 2002-09-20 | 2008-04-02 | Prokaria ehf. | Thermostable rna ligase from thermus phage |
US20040058330A1 (en) | 2002-09-20 | 2004-03-25 | Prokaria, Ltd. | Methods of use for thermostable RNA ligases |
JP2006500959A (ja) | 2002-09-30 | 2006-01-12 | パラレル バイオサイエンス, インコーポレイテッド | 動的サンプリング結合によるポリヌクレオチド合成および標識化 |
US20040191871A1 (en) | 2003-03-25 | 2004-09-30 | Hyman Edward David | Method for plasmid preparation by conversion of open circular plasmid |
CN101410530B (zh) * | 2003-04-18 | 2013-03-27 | 贝克顿·迪金森公司 | 免疫-扩增 |
US7255994B2 (en) | 2003-06-10 | 2007-08-14 | Applera Corporation | Ligation assay |
US7198900B2 (en) | 2003-08-29 | 2007-04-03 | Applera Corporation | Multiplex detection compositions, methods, and kits |
US7387887B2 (en) | 2004-04-20 | 2008-06-17 | University Of Utah Research Foundation | Nucleic acid melting analysis with saturation dyes |
US7914987B2 (en) * | 2004-06-14 | 2011-03-29 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods and compositions for use in analyte detection using proximity probes |
US7811753B2 (en) | 2004-07-14 | 2010-10-12 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for repairing degraded DNA |
US7579153B2 (en) | 2005-01-25 | 2009-08-25 | Population Genetics Technologies, Ltd. | Isothermal DNA amplification |
AU2006210553A1 (en) | 2005-02-01 | 2006-08-10 | Ab Advanced Genetic Analysis Corporation | Reagents, methods and libraries for bead-based sequencing |
US20080045418A1 (en) | 2005-02-04 | 2008-02-21 | Xia Xueliang J | Method of labeling and profiling rnas |
EP1866434B1 (en) | 2005-02-19 | 2013-06-05 | Avacta Group plc | Isothermal nucleic acid amplification |
JP2008534015A (ja) | 2005-03-31 | 2008-08-28 | ハミルトン ソーン バイオサイエンシーズ インコーポレイテッド | 環状化可能な核酸プローブ及び増幅法 |
EP2070945A1 (en) | 2005-06-16 | 2009-06-17 | Nationwide Children's Hospital, Inc. | Genes of an otitis media isolate of nontypeable haemophilus influenzae |
JP4486009B2 (ja) | 2005-08-10 | 2010-06-23 | 株式会社日立製作所 | Dnaリガーゼ変異体 |
US20080293051A1 (en) * | 2005-08-30 | 2008-11-27 | Board Of Regents, The University Of Texas System | proximity ligation assay |
GB0605584D0 (en) * | 2006-03-20 | 2006-04-26 | Olink Ab | Method for analyte detection using proximity probes |
WO2007121489A2 (en) | 2006-04-19 | 2007-10-25 | Applera Corporation | Reagents, methods, and libraries for gel-free bead-based sequencing |
EP2049688B1 (en) * | 2006-08-01 | 2018-01-24 | Applied Biosystems, LLC | Detection of analytes and nucleic acids |
US8263332B2 (en) | 2006-10-12 | 2012-09-11 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Mismatched end DNA ligase |
US8262900B2 (en) | 2006-12-14 | 2012-09-11 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for measuring analytes using large scale FET arrays |
JP2008245604A (ja) | 2007-03-30 | 2008-10-16 | Hitachi Ltd | 高効率耐熱性dnaリガーゼ |
WO2008124838A1 (en) | 2007-04-10 | 2008-10-16 | University Of Maryland, Baltimore | Compounds that inhibit human dna ligases and methods of treating cancer |
US20090197254A1 (en) | 2007-12-14 | 2009-08-06 | Ming-Chou Lee | Variant scorpion primers for nucleic acid amplification and detection |
JP5774474B2 (ja) | 2008-05-02 | 2015-09-09 | エピセンター テクノロジーズ コーポレーションEpicentre Technologies Corporation | Rnaへの選択的な5’ライゲーションによるタグの付加 |
GB0810573D0 (en) | 2008-06-10 | 2008-07-16 | Univ Westminster | Anti-bacterial ligase inhibitors |
US8530156B2 (en) | 2008-08-08 | 2013-09-10 | President And Fellows Of Harvard College | Chemically cleavable phosphoramidite linkers for sequencing by ligation |
US8790873B2 (en) | 2009-01-16 | 2014-07-29 | Affymetrix, Inc. | DNA ligation on RNA template |
WO2010111674A2 (en) | 2009-03-27 | 2010-09-30 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for single molecule sequencing using energy transfer detection |
DK2446062T3 (da) | 2009-06-26 | 2014-10-06 | Univ California | Fremgangsmåder og systemer til phylogenetisk analyse |
CA2767408C (en) * | 2009-07-06 | 2018-01-23 | Trilink Biotechnologies | Chemically modified ligase cofactors, donors and acceptors |
EP2464755B1 (en) | 2009-11-05 | 2016-03-09 | Epicentre Technologies Corporation | Methods and kits for 3'-end-tagging of rna |
CN103370425B (zh) | 2010-12-17 | 2019-03-19 | 生命技术公司 | 用于核酸扩增的方法、组合物、***、仪器和试剂盒 |
EP3263703B1 (en) | 2011-01-17 | 2020-04-22 | Life Technologies Corporation | Enzymatic ligation of nucleic acids |
DK2665833T3 (en) | 2011-01-17 | 2017-07-24 | Life Technologies Corp | WORKING PROCEDURE FOR DETECTING LIGANDS USING NUCLEIC ACIDS |
-
2012
- 2012-01-17 DK DK12702099.8T patent/DK2665833T3/en active
- 2012-01-17 EP EP17166444.4A patent/EP3216878B1/en active Active
- 2012-01-17 DK DK17166444.4T patent/DK3216878T3/da active
- 2012-01-17 ES ES12702099.8T patent/ES2632768T3/es active Active
- 2012-01-17 EP EP19166484.6A patent/EP3567121B1/en active Active
- 2012-01-17 US US13/352,237 patent/US20120196294A1/en not_active Abandoned
- 2012-01-17 EP EP12702099.8A patent/EP2665833B1/en active Active
- 2012-01-17 WO PCT/US2012/021585 patent/WO2012099896A2/en active Application Filing
- 2012-01-17 ES ES17166444T patent/ES2728743T3/es active Active
-
2015
- 2015-12-01 US US14/955,386 patent/US10472671B2/en active Active
-
2019
- 2019-10-18 US US16/656,839 patent/US11072824B2/en active Active
-
2021
- 2021-07-01 US US17/305,239 patent/US20210324460A1/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP3216878B1 (en) | 2019-04-03 |
DK3216878T3 (da) | 2019-06-11 |
EP3216878A1 (en) | 2017-09-13 |
US20200048695A1 (en) | 2020-02-13 |
DK2665833T3 (en) | 2017-07-24 |
WO2012099896A3 (en) | 2012-09-20 |
EP2665833B1 (en) | 2017-04-19 |
ES2728743T3 (es) | 2019-10-28 |
US10472671B2 (en) | 2019-11-12 |
EP3567121A1 (en) | 2019-11-13 |
WO2012099896A2 (en) | 2012-07-26 |
US20120196294A1 (en) | 2012-08-02 |
US20160153035A1 (en) | 2016-06-02 |
US20210324460A1 (en) | 2021-10-21 |
EP3567121B1 (en) | 2023-08-30 |
US11072824B2 (en) | 2021-07-27 |
EP2665833A2 (en) | 2013-11-27 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
ES2632768T3 (es) | Flujo de trabajo para la detección de ligandos empleando ácidos nucleicos | |
US20210198661A1 (en) | Direct oligonucleotide synthesis on cells and biomolecules | |
ES2811518T3 (es) | Preparación de bibliotecas de ácido nucleico marcado usando protocolo de adición en un solo tubo | |
US20240002930A1 (en) | Enzymatic ligation of nucleic acids | |
Guo et al. | Rapid, accurate determination of multidrug resistance in M. tuberculosis isolates and sputum using a biochip system | |
JP2014514930A (ja) | 生物試料中の核酸配列を検出および同定するための組成物および方法 | |
EP2877604A1 (en) | Single cell analysis using sequence tags | |
JPH06319527A (ja) | ミコバクテリアの溶菌方法 | |
EP2557156A1 (en) | Primer and probe for detecting chlamydia trachomatis, and method for detecting chlamydia trachomatis using same | |
ES2864855T3 (es) | Métodos para la detección y análisis de mycobacterium tuberculosis | |
Kleyer et al. | Rapid shifts in bacterial community assembly under static and dynamic hydration conditions in porous media | |
JP2008526215A (ja) | 改変PolIIIレプリカーゼおよびその使用 | |
Meyer et al. | Chain-terminating dinucleoside tetraphosphates are substrates for DNA polymerization by human immunodeficiency virus type 1 reverse transcriptase with increased activity against thymidine analogue-resistant mutants | |
JP7409944B2 (ja) | 細胞内構成物質の抽出方法 | |
KR102593021B1 (ko) | mecA 유전자 증폭용 프라이머 페어, mecA 유전자 검출 키트 및 mecA 유전자 검출 방법 | |
US20120052497A1 (en) | Method of simultaneously amplifying target sequences from salmonella spp. and e. coli o157:h7 and kit therefor | |
Sharma et al. | Molecular mycobacteriology and expansion in disease diagnosis | |
CN115362266A (zh) | Phi29突变体及其用途 | |
Ishino et al. | Application of environmental DNA resources to create useful DNA polymerases with different properties | |
Kyrizaki | A potential role Of SNF4 In transcriptional regulation | |
Kweon et al. | Detection of Mycobacterium kansasii Using DNA-DNA Hybridization with rpoB Probe | |
BRPI0204901B1 (pt) | método para amplificar e identificar sequências de nucleotídeos e kit para uso na amplificação e identificação de sequências de nucleotídeos |