ES2253753T3 - Citocina que induce apoptosis. - Google Patents
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Abstract
UNA NUEVA CITOQUINA DENOMINADA TRAIL INDUCE LA APOPTOSIS DE DETERMINADAS CELULAS DIANA, INCLUYENDO CELULAS CANCERIGENAS Y CELULAS INFECTADAS POR VIRUS. SE DESCUBREN SECUENCIAS DE DNA AISLADAS QUE CODIFICAN TRAIL, JUNTO CON VECTORES DE EXPRESION Y CELULAS HUESPED TRANSFORMADAS UTILES EN LA PRODUCCION DE POLIPEPTIDOS TRAIL. SE PROPORCIONAN ASIMISMO ANTICUERPOS QUE SE UNEN ESPECIFICAMENTE A TRAIL.
Description
Citocina que induce apoptosis.
La muerte celular programada conocida como
apoptosis es distinta de la muerte celular debida a necrosis. La
apoptosis tiene lugar en la embriogénesis, metamorfosis, atrofia
tisular dependiente del sistema endocrino, recambio tisular normal,
y muerte de timocitos inmunitarios (inducida a través de su complejo
antígeno-receptor o mediante glucocorticoides)
(Itoh el al., Cell 66:233, 1991). Durante la maduración de
las células T en el timo, se destruyen las células T que reconocen
autoantígenos a través de un proceso apoptótico, mientras que otras
se seleccionan positivamente. Se ha sugerido la posibilidad de que
algunas células T que reconocen ciertos autoepítopos (por ejemplo,
determinantes antigénicos que se han procesado y presentado de
manera ineficaz de una autoproteína dada) escapen a este proceso de
eliminación y posteriormente desempeñen un papel en enfermedades
autoinmunitarias (Gammon et al., Immunology Today
12:193, 1991).
Se ha informado de que un antígeno de superficie
celular conocido como Fas media en la apoptosis y se cree que
desempeña un papel en la deleción clonal de células T autorreactivas
(Itoh et al., Cell 66:233, 1991;
Watanabe-Fukunage et al., Nature
356:314, 1992). Se ha informado de que reticulando un anticuerpo
monoclonal específico con Fas se induce que varias líneas celulares
experimenten apoptosis (Yonehara et al., J. Exp.
Med., 169:1747, 1989; Trauth et al., Science,
245:301, 1989). Sin embargo, en ciertas condiciones, la unión de un
anticuerpo monoclonal específico a Fas puede tener un efecto
coestimulante sobre células T recién aisladas (Alderson et
al., J. Exp. Med. 178:2231, 1993).
Se han aislado ADN que codifican para un ligando
de Fas de rata (Suda et al., Cell, 75:1169, 1993) y un
ligando de Fas humano (Takahashi et al., International
Immunology 6:1567, 1994). Se ha demostrado que la unión del
ligando de Fas a células que expresan el antígeno Fas induce
apoptosis (Suda et al., anteriormente, y Takahashi et
al., anteriormente).
Es deseable la investigación de la existencia e
identidad de otra(s) molécula(s) que desempeñan un
papel en la apoptosis. La identificación de tales moléculas
proporcionaría un medio adicional de regulación de la apoptosis,
así como proporcionaría una percepción adicional del desarrollo de
autotolerancia del sistema inmunitario y la etiología de las
enfermedades autoinmunitarias.
La presente invención proporciona una proteína
citocina novedosa, así como una ADN aislado que codifica para la
citocina y vectores de expresión que comprenden el ADN aislado. Las
propiedades de la citocina novedosa, que es un miembro de la
familia de ligandos del factor de necrosis tumoral (TNF), incluyen
la capacidad para inducir la apoptosis de ciertos tipos de células
diana. De este modo, esta proteína se designa como ligando inductor
de apoptosis relacionado con TNF (TRAIL). Entre los tipos de células
que se destruyen por el contacto con TRAIL se encuentran células
cancerosas tales como células de leucemia, linfoma y melanoma, y
células infectadas por un virus.
Un método para producir polipéptidos de TRAIL
supone cultivar células huésped transformadas con un vector de
expresión recombinante que contiene ADN que codifica para TRAIL en
condiciones apropiadas para la expresión de TRAIL, entonces
recuperar del cultivo el polipéptido de TRAIL expresado. También se
proporcionan anticuerpos dirigidos contra los polipéptidos de
TRAIL.
La figura 1 presenta los resultados de un ensayo
descrito en el ejemplo 8. El ensayo demostró que un polipéptido de
TRAIL humano soluble indujo la muerte de células Jurkat, que son una
línea celular de leucemia.
La figura 2 presenta los resultados de un ensayo
descrito en el ejemplo 11. El contacto con un polipéptido de TRAIL
humano soluble indujo la muerte de fibroblastos humanos infectados
por citomegalovirus, mientras que no se destruyeron fibroblastos no
infectados de forma viral.
En el presente documento se proporciona una
proteína novedosa designada como TRAIL, junto con un ADN que
codifica para TRAIL y vectores de expresión recombinante que
comprenden ADN de TRAIL. Un método para producir polipéptidos de
TRAIL recombinantes supone cultivar células huésped transformadas
con los vectores de expresión recombinantes en condiciones
apropiadas para la expresión de TRAIL, recuperar el polipéptido de
TRAIL expresado.
La presente invención también proporciona
anticuerpos que unen específicamente proteínas TRAIL. En una
realización, los anticuerpos son anticuerpos monoclonales.
La proteína TRAIL induce la apoptosis de ciertos
tipos de células diana, tales como células transformadas que
incluyen pero que no se limitan a células cancerosas y células
infectadas de forma viral. Tal como se demuestra en los ejemplos 5,
8, 9 y 10 de más adelante, TRAIL induce la apoptosis de líneas
celulares humanas de leucemia, linfoma y melanoma. Entre los usos
de TRAIL se encuentra el uso de destruir células cancerosas. TRAIL
encuentra un uso adicional en el tratamiento de infecciones virales.
La infección por citomegalovirus (CMV) convirtió los fibroblastos
humanos en susceptibles de apoptosis cuando entraron en contacto con
TRAIL, mientras que los fibroblastos sin infectar no se destruyeron
a través del contacto con TRAIL (véase el ejemplo 11).
Se describe el aislamiento de un ADN que codifica
para TRAIL humano en el ejemplo 1 de más adelante. Se presenta la
secuencia de nucleótidos del ADN de TRAIL humano aislado en el
ejemplo 1 en la SEQ ID NO:1, y se presenta la secuencia de
aminoácidos codificada por la misma en la SEQ ID NO: 2. Esta
proteína TRAIL humana comprende un dominio citoplasmático
N-terminal (aminoácidos 1-18), una
región transmembrana (aminoácidos 19-38) y un
dominio extracelular (aminoácidos 39-281). El
dominio extracelular contiene una región de unión a receptores.
Se depositaron células de la cepa DH10B de E.
coli transformadas con un vector recombinante que contiene este
ADN de TRAIL humano en la Colección Americana de Cultivos Tipo el 14
de junio de 1995, y se les asignó el nº de registro 69849. Se hizo
el depósito bajo las condiciones del Tratado de Budapest. El vector
recombinante en la cepa depositada es el vector de expresión pDC409
(descrito en el ejemplo 5). Se digirió el vector con SalI y NotI, y
se ligó el ADN de TRAIL humano que incluye la región codificante
completa mostrada en la SEQ ID NO: 1 en el vector.
Se aisló ADN que codifica para una segunda
proteína TRAIL humana tal como se describe en el ejemplo 2. Se
presenta la secuencia de nucleótidos de este ADN en la SEQ ID NO: 3,
y se presenta la secuencia de aminoácidos codificada por la misma
en la SEQ ID NO: 4. La proteína codificada comprende un dominio
citoplasmático N-terminal (aminoácidos
1-18), un región transmembrana (aminoácidos
19-38) y un dominio extracelular (aminoácidos
39-101).
El ADN de la SEQ ID NO: 3 carece de una parte del
ADN de la SEQ ID NO: 1, y se designa de este modo como el clon de
la variante de deleción de TRAIL humano (huTRAILdv). Los nucleótidos
18 a 358 de la SEQ ID NO: 1 son idénticos a los nucleótidos 8 a 348
del ADN de huTRAILdv de la SEQ ID NO: 3. Faltan los nucleótidos 359
a 506 de la SEQ ID NO: 1 del ADN clonado de la SEQ ID NO: 3. La
deleción provoca un desplazamiento en el marco de lectura, que
tiene como resultado un codón de terminación dentro del marco tras
el aminoácido 101 de la SEQ ID NO: 4. De este modo, el ADN de la
SEQ ID NO: 3 codifica para una proteína truncada. Los aminoácidos 1
a 90 de la SEQ ID NO: 2 son idénticos a los aminoácidos 1 a 90 de la
SEQ ID NO: 4. Sin embargo, debido a la deleción, la parte
C-terminal de la proteína huTRAILdv (aminoácidos 91
a 101 de la SEQ ID NO: 4) difiere de los residuos en las posiciones
correspondientes en la SEQ ID NO: 2. A diferencia de la proteína
huTRAIL de longitud completa, la proteína huTRAILdv truncada no
muestra la capacidad de inducir la apoptosis de las células de
leucemia de células T de la línea de células Jurkat.
También se ha aislado un ADN que codifica para
una proteína TRAIL de ratón, tal como se describe en el ejemplo 3.
Se presenta la secuencia de nucleótidos de este ADN en la SEQ ID NO:
5 y se presenta la secuencia de aminoácidos codificada por la misma
en la SEQ ID NO: 6. La proteína codificada comprende un dominio
citoplasmático N-terminal (aminoácidos
1-17), una región transmembrana (aminoácidos
18-38) y un dominio extracelular (aminoácidos
39-291). Este TRAIL de ratón es idéntico en un 64%
al TRAIL humano de la SEQ ID NO: 2 a nivel de aminoácidos. La región
codificante de la secuencia de nucleótidos de TRAIL de ratón es
idéntica en un 75% a la región codificante de la secuencia de
nucleótidos humana de la SEQ ID NO: 1.
Una realización de la presente invención se
refiere a la proteína TRAIL humana caracterizada por la secuencia
de aminoácidos N-terminal
MetAlaMetMetGluValGlnGlyGlyProSerLeuGlyGlnThr (aminoácidos
1-15 de la SEQ ID NOS: 2 y 4). También se
proporcionan en el presente documento las proteínas TRAIL de ratón
caracterizadas por la secuencia de aminoácidos
N-terminal
MetProSerSerGlyAlaLeuLysAspLeuSerPheSerGlnHis (aminoácidos
1-15 de la SEQ ID NO: 6).
El TRAIL de la presente invención es distinto de
la proteína conocida como ligando Fas (Suda et al.,
Cell, 75:1169, 1993; Takahashi et al.,
International Immunology 6:1567, 1994). El ligando Fas induce
la apoptosis de ciertos tipos de células, a través del receptor
conocido como Fas. Tal como se demuestra en el ejemplo 5, la
apoptosis inducida por TRAIL de las células diana no está mediada
por Fas. La secuencia de aminoácidos de TRAIL humano de la SEQ ID
NO: 2 es idéntica aproximadamente en un 20% a la secuencia de
aminoácidos del ligando Fas humano que se presenta en Takahashi
et al., anteriormente. El dominio extracelular de TRAIL
humano es idéntico aproximadamente en un 28,4% al dominio
extracelular del ligando Fas humano.
Las secuencias de aminoácidos descritas en el
presente documento revelan que TRAIL es un miembro de la familia de
ligandos de TNF (Smith et al., Cell, 73:1349; Suda
et al., Cell, 75:1169, 1993; Smith et al.,
Cell, 76:959, 1994). Las identidades en tanto por ciento
entre la secuencia de aminoácidos del dominio extracelular de TRAIL
humano y la secuencia de aminoácidos del dominio extracelular de
otras proteínas de esta familia son tal como sigue: un 28,4% con el
ligando Fas, un 22,4% con la linfotoxina-\beta, un
22,9% con TNF-\alpha, un 23,1% con
TNF-\beta, un 22,1% con el ligando CD30 y un 23,4%
con el ligando CD40.
Se probó TRAIL para determinar su capacidad para
unir receptores de la familia de receptores TNF-R.
Se llevó a cabo el análisis de unión usando el procedimiento de
autorradiografía de placas de Gearing et al. (EMBO J.
8:3667, 1989). El análisis no reveló una unión detectable de TRAIL
humano a CD30, CD40, 4-1BB, OX40,
TNF-R (forma p80), CD27 o LT\betaR (también
conocido como TNFR-RP) humanos. Los resultados en el
ejemplo 5 indican que TRAIL humano no se une a Fas humano.
Los polipéptidos de TRAIL de la presente
invención incluyen polipéptidos que tienen secuencias de aminoácidos
que difieren de, pero que son altamente homólogas a, aquellas
presentadas en las SEQ ID NO: 2 y 6. Los ejemplos incluyen, pero no
se limitan a, los homólogos derivados de otras especies de
mamíferos, variantes (tanto variantes que se producen de manera
natural como aquellas generadas mediante tecnología de ADN
recombinante) y los fragmentos de TRAIL que conservan una actividad
biológica deseada. Tales polipéptidos muestran una actividad
biológica de las proteínas TRAIL de las SEQ ID NO: 2 y 6, y
preferiblemente comprenden una secuencia de aminoácidos que es
idéntica al menos en un 80% (lo más preferiblemente idéntica al
menos en un 90%) a la secuencia de aminoácidos presentada en la SEQ
ID NO: 2 o SEQ ID NO: 6. Se describen con más detalle estas
realizaciones de la presente invención más adelante.
Se identifican secuencias conservadas localizadas
en la parte C-terminal de las proteínas de la
familia de TNF en Smith et al. (Cell, 73:1349, 1993,
véase la página 1353 y la figura 6); Suda et al.
(Cell, 75:1169, 1993, véase la figura 7); Smith et
al., (Cell, 76:959, 1994, véase la figura 3); y Goodwin
et al. (Eur. J. Immunol., 23:2631, 1003, véase la
figura 7 y las páginas 2638-39), incorporadas como
referencia al presente documento. Entre los aminoácidos en la
proteína TRAIL humana que se conservan (al menos en una mayoría de
los miembros de la familia de TNF) son aquellos en las posiciones
124-125 (AH), 136 (L), 154 (W), 169 (L), 174 (L),
180 (G), 182 (Y), 187 (Q), 190 (F), 193 (Q) y
275-276 (FG) de la SEQ ID NO: 2. Otra característica
estructural de TRAIL es una región espaciadora entre el extremo
C-terminal de la región transmembrana y la parte
del dominio extracelular que se cree que es la más importante para
la actividad biológica. Esta región espaciadora, localizada en el
extremo N-terminal del dominio extracelular,
consiste en los aminoácidos 39 a 94 de la SEQ ID NO: 2. Se
encuentran espaciadores análogos en otros miembros de la familia,
por ejemplo, el ligando CD40. Los aminoácidos 138 a 153
corresponden a un bucle entre las hojas b de la proteína TRAIL
humana plegada (tridimensional).
En el presente documento se proporcionan
proteínas TRAIL unidas a la membrana (que comprenden un dominio
citoplasmático, una región transmembrana y un dominio extracelular)
así como fragmentos de TRAIL que conservan una propiedad biológica
deseada, tal como se describe en el presente documento, de la
proteína TRAIL de longitud completa. En una realización, los
fragmentos de TRAIL son polipéptidos de TRAIL solubles que
comprenden todo o parte del dominio extracelular, pero que carecen
de la región transmembrana que provocaría la retención del
polipéptido sobre una membrana celular. Las proteínas TRAIL
solubles pueden secretarse desde las células en las que se
expresan. Ventajosamente, se fusiona un péptido señal heterólogo al
extremo N-terminal de manera que se secreta TRAIL
soluble con la expresión.
Puede identificarse TRAIL soluble (y distinguirse
de sus homólogos unidos a la membrana no solubles) mediante la
separación de células intactas que expresan la proteína deseada del
medio de cultivo, por ejemplo, mediante centrifugación, y
sometiendo a ensayo el medio (sobrenadante) para la presencia de la
proteína deseada. La presencia de TRAIL en el medio indica que se
secretó la proteína desde las células y de ese modo es una forma
soluble de la proteína TRAIL. La presente invención engloba las
formas solubles que se producen de manera natural de TRAIL.
El uso de las formas solubles de TRAIL es
ventajoso para ciertas aplicaciones. Se facilita la purificación de
las proteínas de las células huésped recombinantes, ya que se
secretan las proteínas desde las células. Adicionalmente, las
proteínas solubles son generalmente más adecuadas para la
administración intravenosa.
Son ejemplos de polipéptidos de TRAIL solubles
aquellos que contienen el dominio extracelular entero (por ejemplo,
aminoácidos 39 a 281 de la SEQ ID NO: 2 o aminoácidos 39 a 291 de la
SEQ ID NO: 6). También se proporcionan fragmentos del dominio
extracelular que conservan una actividad biológica deseada.
Ventajosamente, tales fragmentos incluyen regiones de TRAIL que se
conservan en las proteínas de la familia de ligandos de TNF, tal
como se describe más adelante.
Son ejemplos adicionales de polipéptidos de TRAIL
solubles aquellos que carecen no sólo del dominio citoplasmático y
la región transmembrana, sino también de toda o parte de la región
espaciadora descrita anteriormente. De este modo los polipéptidos
de TRAIL humanos incluyen, pero no se limitan a, los polipéptidos
que comprenden los aminoácidos x a 281, en los que x representa
cualquiera de los aminoácidos en las posiciones 39 a 95 de la SEQ
ID NO: 2. En la realización en la que el residuo 95 es el aminoácido
N-terminal, se ha suprimido la región espaciadora
entera.
Pueden prepararse los fragmentos de TRAIL,
incluyendo los polipéptidos solubles, mediante cualquiera de varias
técnicas convencionales. Puede subclonarse una secuencia de ADN que
codifica para un fragmento de TRAIL deseado en un vector de
expresión para la producción del fragmento de TRAIL. Ventajosamente
se fusiona la secuencia de ADN que codifica para TRAIL a una
secuencia que codifica para un péptido señal o líder adecuado. Puede
sintetizarse químicamente el fragmento de ADN que codifica para
TRAIL deseado usando técnicas conocidas. También pueden producirse
los fragmentos de ADN mediante la digestión con una endonucleasa de
restricción de una secuencia de ADN clonada de longitud completa, y
aislarse mediante electroforesis en geles de agarosa. Si es
necesario, pueden ligarse los oligonucleótidos que reconstruyen el
extremo terminal 5' ó 3', hasta un punto deseado, a un fragmento de
ADN generado mediante digestión con enzimas de restricción. Tales
oligonucleótidos pueden contener adicionalmente un sitio de
escisión por una endonucleasa de restricción en el sentido de 5' de
la secuencia codificante deseada, y colocar un codón de iniciación
(ATG) en el extremo N-terminal de la secuencia
codificante.
También puede emplearse el procedimiento bien
conocido de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para aislar y
amplificar una secuencia de ADN que codifica para un fragmento de
proteína deseado. Se emplean oligonucleótidos que definen los
extremos terminales deseados del fragmento de ADN como cebadores 5'
y 3'. Los oligonucleótidos pueden contener adicionalmente sitios de
reconocimiento para endonucleasas de restricción, para facilitar la
inserción del fragmento de ADN amplificado en un vector de
expresión. Se describen las técnicas de PCR en Saiki et al.,
Science 239:487 (1988); Recombinant DNA Methodology,
Wu et al., eds, Academia Press, Inc., San Diego (1989),
págs. 189-196; y PCR Protocols: A Guide to
Methods and Applications, Innis et al., eds., Academia
Press, Inc. (1990).
Tal como se entenderá por el experto en la
técnica, se identifica la región transmembrana de cada proteína
TRAIL tratada anteriormente según los criterios convencionales para
la identificación de ese tipo de dominio hidrófobo. Los límites
exactos de una región transmembrana pueden variar ligeramente (lo
más probablemente en no más de cinco aminoácidos en cada extremo)
de los presentados anteriormente. Se dispone de programas
informáticos útiles para la identificación de tales regiones
hidrófobas en proteínas.
El ADN de TRAIL de la presente invención incluye
ADNc, ADN sintetizado químicamente, ADN aislado mediante PCR, ADN
genómico y combinaciones de los mismos. Puede aislarse ADN genómico
de TRAIL mediante la hibridación con el ADNc de TRAIL descrito en
el presente documento usando técnicas convencionales. También se
engloba por la presente invención el ARN transcrito a partir del
ADN de TRAIL.
Una búsqueda del banco de datos del NCBI
identificó cinco etiquetas de secuencias expresadas (EST) que tienen
regiones de identidad con ADN de TRAIL. Estas EST (números de
registro del NCBI T90422, T82085, T10524, R31020 y Z36726) son
todas fragmentos de ADNc humano. Los registros del NCBI no describen
ningún polipéptido codificado por las EST, y no indica cuál podría
ser el marco de lectura, si lo hubiera. Sin embargo, incluso si se
usa el conocimiento del marco de lectura revelado en el presente
documento mediante la descripción de las regiones codificantes de
TRAIL completas para expresar las EST, ninguno de los polipéptidos
codificados tendría la propiedad de inducir apoptosis de los
polipéptidos TRAIL presentes reivindicados. En otras palabras, si se
insertaran cada una de las cinco EST en los vectores de expresión
en el sentido de 3' de un codón iniciador de metionina, en el marco
de lectura elucidado en el presente documento, ninguno de los
polipéptidos expresados resultantes contendría una parte suficiente
del dominio extracelular de TRAIL para inducir la apoptosis de
células Jurkat.
Ciertas realizaciones de la presente invención
proporcionan ADN aislado que comprende una secuencia de nucleótidos
seleccionada del grupo que consiste en los nucleótidos 88 a 933 de
la SEQ ID NO: 1 (región codificante de TRAIL humano); los
nucleótidos 202 a 933 de la SEQ ID NO: 1 (que codifican para el
dominio extracelular de TRAIL humano); los nucleótidos 47 a 922 de
la SEQ ID NO: 5 (región codificante de TRAIL de ratón); y los
nucleótidos 261 a 922 de la SEQ ID NO: 5 (que codifica para el
dominio extracelular de TRAIL de ratón). También se proporcionan
ADN que codifican para los fragmentos biológicamente activos de las
proteínas de las SEQ ID NOS: 2 y 6. Realizaciones adicionales
incluyen secuencias que comprenden los nucleótidos 370 a 930 de la
SEQ ID NO:1 y los nucleótidos 341 a 919 de la SEQ ID NO: 5, que
codifican para los polipéptidos de TRAIL solubles humanos y murinos
particulares, respectivamente, descritos en el ejemplo 7.
Debido a la degeneración del código genético, dos
secuencias de ADN pueden diferir, pero codificar para la misma
secuencia de aminoácidos. De este modo, la presente invención
proporciona secuencias de ADN aisladas que codifican para TRAIL
biológicamente activo, seleccionadas del ADN que comprende la región
codificante de un ADNc de TRAIL humano o murino, o fragmentos de
las mismas, y ADN que es degenerado como resultado del código
genético para la secuencia de ADN de TRAIL nativo.
También se proporcionan en el presente documento
polipéptidos de TRAIL purificados, tanto recombinantes como no
recombinantes. También están dentro del alcance de la presente
invención las variantes y derivados de las proteínas TRAIL nativas
que conservan una actividad biológica deseada. En una realización,
la actividad biológica de una variante de TRAIL es esencialmente
equivalente a la actividad biológica de una proteína TRAIL nativa.
Una actividad biológica deseada de TRAIL es la capacidad para
inducir la muerte en células Jurkat. Se conocen bien los
procedimientos de ensayo para detectar la apoptosis de células
diana. Entre las características de la muerte celular a través de
apoptosis se encuentra el desarrollo escalonado de ADN ("DNA
laddering"), y se reconoce como uno de los fenómenos observables
que distinguen la muerte celular apoptótica de la muerte celular
necrótica. Ejemplos de técnicas de ensayo adecuadas para la
detección de la muerte o apoptosis de células diana incluyen
aquellas descritas en los ejemplos 5 y 8 a 11. Otra propiedad de
TRAIL es la capacidad para unirse a células Jurkat.
Pueden obtenerse variantes de TRAIL mediante
mutaciones de secuencias de nucleótidos de TRAIL nativo, por
ejemplo. Una variante de TRAIL, tal como se denomina en el presente
documento, es un polipéptido sustancialmente homólogo a un TRAIL
nativo, pero que tiene una secuencia de aminoácidos diferente a las
de TRAIL nativo por una o una pluralidad de deleciones, inserciones
o sustituciones. Las secuencias de ADN que codifican para TRAIL de
la presente invención engloban secuencias que comprenden una o más
adiciones, deleciones o sustituciones de nucleótidos en comparación
con una secuencia de ADN de TRAIL nativo, pero que codifica para una
proteína TRAIL que es de manera esencial biológicamente equivalente
a la proteína TRAIL nativa.
La variante de la secuencia de aminoácidos o de
ADN es idéntica al menos en un 80% a la secuencia de TRAIL nativa,
lo más preferiblemente idéntica al menos en un 90%. Puede
determinarse el grado de homología (identidad en tanto por ciento)
entre una secuencia nativa y una mutante, por ejemplo, mediante la
comparación de las dos secuencias usando programas informáticos
empleados comúnmente para este fin. Un programa adecuado es el
programa informático GAP, versión 6.0, descrito por Devereux et
al. (Nucl. Acids. Res. 12:387, 1984) y disponible del Grupo
Informático de Genética de la Universidad de Wisconsin (UWGCG). El
programa GAP utiliza el método de alineamiento de Needleman y
Wunsch (J. Mol. Biol. 48:443, 1970), tal como se revisó por
Smith y Waterman (Adv. Appl. Math 2:482, 1981). Brevemente,
el programa GAP define la identidad como el número de símbolos
alineados (es decir, nucleótidos o aminoácidos) que son idénticos,
dividido entre el número total de símbolos en la secuencia más
corta de las dos. Los parámetros por defecto preferidos del programa
GAP incluyen: (1) una matriz de comparación unaria (que contiene un
valor de 1 para las identidades y 0 para las no identidades) para
nucleótidos, y la matriz de comparación ponderada de Gribskov y
Burgess, Nucl. Acids Res. 14:6745, 1986, tal como se
describe en Schwartz y Dayhoff, eds., Atlas of Protein Sequence
and Structure, National Biomedical Research Foundation, págs.
353-358, 1979; (2) una penalización de 3,0 para cada
hueco y una penalización adicional de 0,10 para cada símbolo en
cada hueco; y (3) ninguna penalización para huecos finales.
Pueden llevarse a cabo alteraciones de la
secuencia de aminoácidos nativa mediante cualquiera de varias
técnicas conocidas. Pueden introducirse mutaciones en loci
particulares mediante la síntesis de oligonucleótidos que contienen
una secuencia mutante, flanqueada por sitios de restricción que
permiten el ligamiento de fragmentos de la secuencia nativa. Tras
el ligamiento, la secuencia reconstruida resultante codifica para un
análogo que tiene la inserción, sustitución o deleción de
aminoácidos deseada.
Alternativamente, pueden emplearse procedimientos
de mutagénesis específica de sitio dirigida a oligonucleótidos para
proporcionar un gen alterado que tiene codones particulares
alterados según la sustitución, deleción o inserción requerida. Las
técnicas para hacer tales alteraciones incluyen aquellas descritas
por Walter et al. (Gene 42:133, 1986); Bauer et
al. (Gene 37:73, 1985); Craik (BioTechniques, enero de 1985,
12-19); Smith et al. (Genetic
Engineering: Principles and Methods, Plenum Press, 1981); y las
patentes de los EE.UU. números 4.518.584 y 4.737.462, que se
incorporan como referencia al presente documento.
Las variantes pueden comprender secuencias
sustituidas de manera conservativa, lo que significa que se
sustituyen uno o más residuos de aminoácidos de un polipéptido de
TRAIL nativo por residuos diferentes, pero que el polipéptido de
TRAIL nativo sustituido de manera conservativa conserva una
actividad biológica deseada que es esencialmente equivalente a la
de un polipéptido de TRAIL nativo. Los ejemplos de sustituciones
conservativas incluyen la sustitución de aminoácidos que no alteran
la estructura secundaria y/o terciaria de TRAIL. Otros ejemplos
suponen la sustitución de aminoácidos fuera del dominio de unión a
receptores, cuando la actividad biológica deseada es la capacidad
para unirse a un receptor en las células diana e inducir la
apoptosis de las células diana. Puede sustituirse un aminoácido
dado por un residuo que tenga características fisicoquímicas
similares, por ejemplo, sustituyendo un residuo alifático por otro
(tal como Ile, Val, Leu o Ala por otro), o la sustitución de un
residuo polar por otro (tal como entre Lys y Arg; Glu y Asp; o Gln y
Asn). Se conocen bien otras sustituciones conservativas tales, por
ejemplo, sustituciones de regiones enteras que tienen
características de hidrofobicidad similares. Pueden probarse
polipéptidos de TRAIL que comprenden sustituciones de aminoácidos
conservativas en uno de los ensayos descritos en el presente
documento para confirmar que se conserva una actividad biológica
deseada de un TRAIL nativo. Se engloban en la presente invención las
secuencias de ADN que codifican para polipéptidos de TRAIL que
contienen tales sustituciones de aminoácidos conservativas.
Se ha identificado aminoácidos conservados
localizados en la parte C-terminal de proteínas en
la familia de TNF, y que se cree que son importantes para la
actividad biológica. Se tratan estas secuencias conservadas en
Smith et al. (Cell, 73:1349, 1993, véase la página
1353 y la figura 6); Suda et al. (Cell, 75:1169,
1993, véase la figura 7); Smith et al., (Cell, 76:959,
1994, véase la figura 3); y Goodwin et al. (Eur. J.
Immunol., 23:2631, 1003, véase la figura 7 y las páginas
2638-39). Ventajosamente, no se alteran los
aminoácidos conservados cuando se generan secuencias sustituidas de
manera conservativa. Si se alteran, se sustituyen los aminoácidos
que se encuentran en posiciones equivalentes en otros miembros de la
familia de TNF.
También puede modificarse TRAIL para crear
derivados de TRAIL mediante la formación de conjugados covalentes o
agregativos con otros restos químicos, tales como los grupos
glucosilo, lípidos, fosfato, grupos acetilo y similares. Pueden
prepararse derivados covalentes de TRAIL mediante el enlace de
restos químicos a grupos funcionales en las cadenas laterales de
aminoácidos de TRAIL o en el extremo N-terminal o
extremo C-terminal de un polipéptido de TRAIL o del
dominio extracelular del mismo. Otros derivados de TRAIL dentro del
alcance de esta invención incluyen los conjugados covalentes o
agregativos de TRAIL o sus fragmentos con otras proteínas o
polipéptidos, tales como mediante la síntesis en cultivo
recombinante como fusiones en el extremo N-terminal
o C-terminal. Por ejemplo, el conjugado puede
comprender una secuencia de polipéptidos señal o líder (por ejemplo
el líder de factor \alpha de Saccharomyces) en el extremo
N-terminal de un polipéptido de TRAIL. El péptido
señal o conductor dirige de manera conjunta a la traducción o
posterior a la traducción la transferencia del conjugado desde su
sitio de síntesis hasta un sitio dentro o fuera de la membrana
celular o pared celular.
Las fusiones de polipéptidos de TRAIL pueden
comprender péptidos añadidos para facilitar la purificación e
identificación de TRAIL. Tales péptidos incluyen, por ejemplo,
poli-His o los péptidos de identificación antigénica
descritos en la patente de los EE.UU. número 5.011.912 y en Hopp
et al., Bio/Technology 6:1204, 1988. Un péptido tal
es el péptido FLAG®,
Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys
(DYKDDDDK) (SEQ ID NO: 7), que es altamente antigénico y
proporciona un epítopo unido reversiblemente por un anticuerpo
monoclonal específico, permitiendo de este modo un ensayo rápido y
una purificación fácil de la proteína recombinante expresada. Esta
secuencia también se escinde específicamente mediante la
enteroquinasa mucosa bovina en el residuo inmediatamente tras el
apareamiento Asp-Lys. Las proteínas de fusión
terminadas en este péptido también pueden ser resistentes a la
degradación intracelular en E. coli.
Un hibridoma murino designado como 4E11 produce
un anticuerpo monoclonal que une el péptido DYKDDDDK (SEQ ID NO: 7)
en presencia de ciertos cationes metálicos divalentes (tal como se
describe en la patente de los EE.UU. 5.011.912), y se ha depositado
en la Colección Americana de Cultivos Tipo bajo el número de
registro HB 9259. Los sistemas de expresión útiles para producir
proteínas recombinantes fusionadas al péptido FLAG®, así como los
anticuerpos monoclonales que unen el péptido y que son útiles en la
purificación de proteínas recombinantes, están disponible de
Eastman Kodak Company, Scientific Imaging Systems, New Haven,
Connecticut.
La presente invención incluye adicionalmente
polipéptidos de TRAIL con o sin glucosilación del patrón nativo
asociada. El TRAIL expresado en sistemas de expresión de levaduras o
mamíferos puede ser similar o significativamente diferente de un
polipéptido TRAIL nativo en el peso molecular y el patrón de
glucosilación, dependiendo de la elección del sistema de expresión.
La expresión de polipéptidos de TRAIL en sistemas de expresión
bacteriana, tales como E. coli, proporcionan moléculas no
glucosiladas.
Los sitios de glucosilación en el dominio
extracelular de TRAIL pueden modificarse para impedir la
glucosilación mientras que se permite la expresión de un hidrato de
carbono reducido, homogéneo, usando sistemas de expresión de
levaduras o mamíferos. Los sitios de N-glucosilación
en polipéptidos eucariotas se caracterizan por un triplete de
aminoácidos Asn-X-Y, en el que X es
cualquier aminoácido a excepción de Pro e Y es Ser o Thr.
Modificaciones apropiadas en la secuencia de nucleótidos que
codifica para este triplete tendrán como resultado sustituciones,
adiciones o deleciones que evitan el acoplamiento de los residuos de
hidrato de carbono a la cadena lateral de Asn. Los procedimientos
conocidos para inactivar los sitios de
N-glucosilación en proteínas incluyen aquellos
descritos en la patente de los EE.UU. 5.071.972 y en el documento EP
276.846. Se encuentra un sitio de N-glucosilación
potencial en las posiciones 109-111 en la proteína
humana de la SEQ ID NO: 2 y en las posiciones 52-54
en la proteína murina de la SEQ ID NO: 6.
En otro ejemplo, pueden alterarse las secuencias
que codifican para residuos de Cys que no son esenciales para la
actividad biológica para provocar que los residuos de Cys se
eliminen o sustituyan por otros aminoácidos, evitando la formación
de puentes disulfuro intramoleculares incorrectos con la
renaturalización. Se preparan otros variantes mediante la
modificación de residuos de aminoácidos dibásicos adyacentes para
aumentar la expresión en sistemas de levaduras en los que está
presente la actividad de la proteasa KEX2. El documento 212.914
describe el uso de la mutagénesis específica de sitio para inactivar
los sitios de procesamiento de la proteasa KEX2 en una proteína. Se
inactivan los sitios de procesamiento de la proteasa KEX2 mediante
la deleción, adición o sustitución de residuos para alterar los
apareamientos Arg-Arg, Arg-Lys y
Lys-Arg para eliminar la aparición de estos
residuos básicos adyacentes. Los apareamientos son considerablemente
menos susceptibles a la escisión por KEX2, y la conversión de
Arg-Lys o Lys-Arg en
Lys-Lys representa un enfoque conservativo y
preferido para inactivar los sitios KEX2. Se encuentran sitios de
procesamiento de la proteasa KEX2 potenciales en las posiciones
89-90 y 149-150 en la proteína de la
SEQ ID NO: 2, y en las posiciones 85-86,
135-136 y 162-163 en la proteína de
la SEQ ID NO:6.
También se engloban las variantes de TRAIL que se
producen de manera natural en la presente invención. Son ejemplos
de tales variantes las proteínas que resultan de acontecimientos
alternativos de corte y empalme de ARNm (ya que el TRAIL está
codificado por un gen multi-exon) o de la escisión
proteolítica de la proteína TRAIL, en la que se conserva una
actividad biológica deseada. El corte y empalme alternativo de ARNm
puede dar una proteína TRAIL truncada pero biológicamente activa,
tal como una forma soluble de la proteína que se produce de manera
natural, por ejemplo. Las variaciones atribuibles a la proteolisis
incluyen, por ejemplo, diferencias en los extremos N o
C-terminal con la expresión en diferentes tipos de
células huésped, debido a la eliminación proteolítica de uno más
aminoácidos terminales de la proteína TRAIL. Además, la escisión
proteolítica puede liberar una forma soluble de TRAIL de una forma
unida a la membrana de la proteína. También se engloban las
variantes alélicas mediante la presente invención.
La presente invención engloba los polipéptidos de
TRAIL en forma de oligómeros, tales como dímeros, trímeros u
oligómeros superiores. Los oligómeros pueden formarse mediante
enlaces disulfuro entre residuos de cisteína en diferentes
polipéptidos de TRAIL, o mediante interacciones no covalentes entre
las cadenas polipeptídicas de TRAIL, por ejemplo. En otras
realizaciones, los oligómeros comprenden desde dos hasta cuatro
polipéptidos de TRAIL unidos a través de interacciones covalentes o
no covalentes entre restos peptídicos fusionados a los polipéptidos
de TRAIL. Tales péptidos pueden ser ligadores peptídicos
(espaciadores) o péptidos que tienen la propiedad de promover la
oligomerización. Las cremalleras de leucina y ciertos polipéptidos
derivados de anticuerpos se encuentran entre los péptidos que
pueden promover la oligomerización de polipéptidos de TRAIL unidos
a ellos, tal como se describe con más detalle a continuación.
Preferiblemente los polipéptidos de TRAIL son solubles.
Se ha descrito la preparación de proteínas de
fusión que comprenden polipéptidos heterólogos fusionados a varias
partes de los polipéptidos derivados de anticuerpos (incluyendo el
dominio Fc), por ejemplo, por Ashkenazi et al. (PNAS
USA 88:10535, 1991); Byrn et al. (Nature 344:667,
1990); y Hollenbaugh y Aruffo ("Construction of Immunoglobulin
Fusion Proteins", en Current Protocols in Immunology,
Suplemento 4, páginas 10.19.1-10.19.11, 1992),
incorporados como referencia al presente documento. En una
realización de la invención, se crea un dímero de TRAIL mediante la
fusión de TRAIL a un polipéptido de la región Fc derivado de un
anticuerpo. El término "polipéptido de Fc" incluye formas
nativas y muteínas, así como los polipéptidos de Fc truncados que
contienen la región bisagra que promueve la dimerización.
Preferiblemente se fusiona el polipéptido Fc a un TRAIL soluble
(por ejemplo, que comprende sólo el dominio extracelular).
Se inserta una fusión génica que codifica para la
proteína de fusión TRAIL/Fc en un vector de expresión apropiado. Se
permite que las proteínas de fusión TRAIL/Fc se ensamblen de manera
muy parecida a las moléculas de anticuerpos, con lo que se forman
enlaces disulfuro intercatenarios entre los polipéptidos de Fc,
produciendo TRAIL divalente. En otras realizaciones, puede
sustituirse el TRAIL por la parte variable de una cadena de
anticuerpos pesada o ligera. Si las proteínas de fusión están
compuestas tanto por cadenas pesadas como ligeras de un anticuerpo,
es posible que formen un oligómero de TRAIL con hasta cuatro
regiones extracelulares de TRAIL.
Un polipéptido Fc adecuado es el polipéptido de
la región Fc nativo derivado de una IgG1 humana, que se describe en
la solicitud PCT WO 93/10151, incorporada como referencia al
presente documento. Otro polipéptido de Fc útil es la muteína de Fc
descrita en la patente de los EE.UU. 5.457.035. La secuencia de
aminoácidos de la muteína es idéntica a la de la secuencia Fc
nativa presentada en el documento WO 93/10151, excepto porque se ha
cambiado el aminoácido 19 de Leu a Ala, se ha cambiado el aminoácido
20 de Leu a Glu, y se ha cambiado el aminoácido 22 de Gly a Ala.
Esta muteína de Fc muestra una afinidad reducida por receptores de
inmunoglobulinas.
Alternativamente, el TRAIL oligomérico puede
comprender dos o más polipéptidos de TRAIL solubles unidos a través
de ligadores peptídicos. Los ejemplos incluyen aquellos ligadores
peptídicos descritos en la patente de los Estados Unidos 5.073.627
(incorporada como referencia al presente documento). Pueden
producirse las proteínas de fusión que comprenden polipéptidos de
TRAIL múltiples separados mediante ligadores peptídicos usando la
tecnología de ADN recombinante convencional.
Otro método para preparar polipéptidos de TRAIL
oligoméricos supone el uso de una cremallera de leucina. Los
dominios de cremallera de leucina son péptidos que promueven la
oligomerización de las proteínas en las que se encuentran.
Originalmente se identificaron las cremalleras de leucina en varias
proteínas de unión al ADN (Landschulz et al., Science
240:1759, 1988), y se han encontrado desde entonces en una variedad
de proteínas diferentes. Entre las cremalleras de leucina conocidas
se encuentran los péptidos que se producen de manera natural y los
derivados de los mismos que dimerizan o trimerizan. Son ejemplos de
dominios de cremallera de leucina adecuados para producir proteínas
TRAIL oligoméricas solubles aquellas descritas en la solicitud PCT
WO 94/10308, incorporada como referencia al presente documento. Las
proteínas de fusión recombinantes que comprenden un polipéptido de
TRAIL fusionado a un péptido que dimeriza o trimeriza en solución se
expresan en células huésped adecuadas, y el TRAIL oligomérico
soluble resultante se recupera del sobrenadante del cultivo.
Se cree que ciertos miembros de la familia de
proteínas de TNF existen en forma trimérica (Beutler y Huffel,
Science 264:667, 1994; Banner et al., Cell
73:431, 1993). De este modo, el TRAIL trimérico puede ofrecer la
ventaja de una actividad biológica aumentada. Son restos de
cremallera de leucina preferidos aquellos que preferencialmente
forman trímeros. Un ejemplo es una cremallera de leucina derivada de
la proteína surfactante pulmonar D (SPD), tal como se describe en
Hoppe et al. (FEBS Letters 344:191, 1994) y en la
solicitud de patente de los EE.UU. con número de serie 08/446.922,
incorporada como referencia al presente documento. Pueden emplearse
otros péptidos derivados de proteínas triméricas que se producen de
manera natural en la preparación de TRAIL trimérico.
Tal como se describe en el ejemplo 7, un
polipéptido de TRAIL-Flag® soluble expresado en
células CV-1/EBNA formó espontáneamente oligómeros
que se cree que son una mezcla de dímeros y trímeros. Se aumentó el
efecto citotóxico de este TRAIL-Flag® soluble en el
ensayo del ejemplo 8 mediante la inclusión de un anticuerpo
anti-Flag®, posiblemente porque el anticuerpo
facilitó la reticulación de los complejos de TRAIL/receptor. En una
realización de la invención, se aumenta la actividad biológica del
TRAIL mediante el empleo de TRAIL junto con un anticuerpo que puede
reticular TRAIL. Pueden ponerse en contacto las células que van a
destruirse tanto con un polipéptido de TRAIL soluble como con un
anticuerpo tal.
Como ejemplo, se ponen en contacto células
cancerosas o infectadas de forma viral con un anticuerpo
anti-Flag® y un polipéptido de
TRAIL-Flag® soluble. Preferiblemente, se emplea un
fragmento de anticuerpo que carece de la región Fc. Las formas
bivalentes del anticuerpo pueden unir los restos de Flag® de dos
polipéptidos de TRAIL-Flag® solubles que se
encuentran en dímeros o trímeros separados. Puede mezclarse o
incubarse el anticuerpo con un polipéptido de
TRAIL-Flag® antes de la administración in
vivo.
La presente invención proporciona vectores de
expresión recombinante para la expresión de TRAIL, y células
huésped transformadas con los vectores de expresión. Puede emplearse
cualquier sistema de expresión adecuado. Los vectores incluyen un
ADN que codifica para un polipéptido de TRAIL, operativamente unido
a secuencias de nucleótidos reguladores de la transcripción o la
traducción adecuados, tales como aquellos derivados de un gen de
mamífero, microbiano, viral o de insecto. Los ejemplos de secuencias
reguladoras incluyen promotores de la transcripción, operadores o
potenciadores, un sitio de unión ribosómica a ARNm y secuencias
apropiadas que controlan el inicio y la terminación de la
transcripción y la traducción. Las secuencias de nucleótidos están
operativamente unidas cuando la secuencia reguladora se relaciona
funcionalmente con la secuencia de ADN de TRAIL. De este modo, una
secuencia de nucleótidos del promotor está operativamente unida a
una secuencia de ADN de TRAIL si la secuencia de nucleótidos
promotora controla la transcripción de la secuencia de ADN de
TRAIL. Generalmente se incorporan al vector de expresión un origen
de replicación que le confiere la capacidad para replicarse en las
células huésped deseadas, y un gen de selección mediante el cual se
identifican los transformantes.
Además, puede incorporarse a los vectores de
expresión un secuencia que codifica para un péptido señal apropiado.
Puede fusionarse una secuencia de ADN para un péptido señal (líder
secretor) dentro del marco para la secuencia de TRAIL de manera que
el TRAIL se traduce inicialmente como una proteína de fusión que
comprende el péptido señal. Un péptido señal que es funcional en
las células huésped pretendidas promueve la secreción extracelular
del poli-
péptido de TRAIL. El péptido señal se escinde del polipéptido de TRAIL con la secreción del TRAIL desde la célula.
péptido de TRAIL. El péptido señal se escinde del polipéptido de TRAIL con la secreción del TRAIL desde la célula.
Las células huésped adecuadas para la expresión
de polipéptidos de TRAIL incluyen procariotas, levaduras o células
eucariotas superiores. Se describen vectores de clonación y
expresión apropiados para su uso con huéspedes celulares
bacterianos, fúngicos, de levaduras y de mamíferos, por ejemplo, en
Pouwels et al. Cloning Vectors: A Laboratory Manual,
Elsevier, Nueva York, (1985). También podrían emplearse sistemas de
traducción sin células para producir polipéptidos de TRAIL usando
ARN derivados de constructos descritos en el presente documento.
Las procariotas incluyen microorganismos
gram-negativos o gram-positivos, por
ejemplo, E. coli o Bacilli. Las células huésped
procariotas adecuadas para la transformación incluyen, por ejemplo,
E. coli, Bacillus subtilis, Salmonella
typhimurium, y otras especies varias dentro de los géneros
Pseudomonas, Streptomyces y Staphylococcus. En
una célula huésped procariota, tal como E. coli, un
polipéptido de TRAIL puede incluir un residuo de metionina
N-terminal para facilitar la expresión del
polipéptido recombinante en la célula huésped procariota. Puede
escindirse la Met N-terminal del polipéptido de
TRAIL recombinante expresado.
Generalmente los vectores de expresión para su
uso en células huésped procariotas comprenden uno o más genes
marcadores de selección fenotípicos. Un gen marcador de selección
fenotípico es, por ejemplo, un gen que codifica para una proteína
que confiere resistencia a los antibióticos o que proporciona una
necesidad autotrófica. Los ejemplos de vectores de expresión útiles
para células huésped procariotas incluyen aquellos derivados de los
plásmidos disponibles comercialmente tales como el vector de
clonación pBR322 (ATCC 37017). pBR322 contiene genes para la
resistencia a la ampicilina y tetraciclina y proporciona de este
modo medios simples para identificar las células transformadas. Se
inserta un promotor apropiado y una secuencia de ADN de TRAIL en el
vector pBR322. Otros vectores disponibles comercialmente incluyen,
por ejemplo, pKK223-3 (Pharmacia Fine Chemicals,
Uppsala, Suecia) y pGEM1 (Promega Biotec, Madison, WI, EE.UU.).
Las secuencias promotoras usadas comúnmente para
vectores de expresión de células huésped procariotas recombinantes
incluyen \beta-lactamasa (penicilinasa), sistema
de promotor de lactosa (Chang et al., Nature 275:615,
1978; y Goeddel et al., Nature 281:544, 1979),
sistema de promotor de triptófano (trp) (Goeddel et al.,
Nucl. Acids Res. 8:4057, 1980; y documento
EP-A-36776) y promotor tac
(Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold
Spring Harbor Laboratory, pág. 412, 1982). Un sistema de expresión
de células huésped procariotas particularmente útil emplea un
promotor del fago \lambda P_{L} y una secuencia represora
termolábil cI857ts. Los vectores plásmidos disponibles de la
Colección Americana de Cultivos Tipo que incorpora derivados del
promotor \lambda P_{L} incluyen el plásmido pHUB2 (residente
en las cepas de E. coli JMB9, ATCC 37092) y pPLc28 (residente
en E. coli RR1, ATCC 53082).
Alternativamente, puede expresarse TRAIL en
células huésped de levaduras, preferiblemente del género
Saccharomyces (por ejemplo, S. cerevisiae). También
pueden emplearse otros géneros de levadura, tales como Pichia
o Kluyveromyces. Los vectores de levaduras contendrán a
menudo una secuencia de origen de replicación de un plásmido de
levadura 2 \mu, una secuencia de replicación autónoma (ARS), una
región promotora, secuencias para poliadenilación, secuencias para
la terminación de la transcripción y un gen marcador de selección.
Las secuencias promotoras adecuadas para los vectores de levaduras
incluyen, entre otros, promotores para metalotioneína,
3-fosfoglicerato quinasa (Hitzemann et al.,
J. Bio. Chem. 255:2073, 1980) u otras enzimas glucolíticas
(Hess et al., J. Adv. Enzyme Reg. 7:149, 1968; y
Holland et al., Biochem. 17:4900, 1978), tales como
enolasa, gliceraldehído-3-fosfato
deshidrogenasa, hexoquinasa, piruvato descarboxilasa,
fosfofructoquinasa,
glucosa-6-fosfato isomerasa,
3-fosfoglicerato mutasa, piruvato cinasa,
triosafosfato isomerasa, fosfoglucosa isomerasa y glucocinasa. Se
describen adicionalmente otros vectores y promotores adecuados para
su uso en la expresión de levaduras en Hitzeman, documento
EPA-73.657. Otra alternativa es el promotor ADH2
represible por glucosa descrito por Russell et al. (J.
Biol. Chem. 258:2674, 1982) y Beier et al. (Nature
300:724, 1982). Pueden construirse vectores lanzadera replicables
tanto en levaduras como en E. coli mediante la inserción de
secuencias de ADN de pBR322 para la selección y replicación en E.
coli (gen Amp^{r} y origen de replicación) en los vectores de
levaduras descritos anteriormente.
Puede emplearse la secuencia líder de factor
\alpha de levaduras para la secreción directa del polipéptido de
TRAIL. A menudo se inserta la secuencia líder de factor \alpha
entre la secuencia promotora y la secuencia del gen estructural.
Véase, por ejemplo, Kurjan et al., Cell 30:933, 1982 y
Bitter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:5330,
1984. Otras secuencias líder adecuadas para facilitar la secreción
de polipéptidos recombinantes de huéspedes de levaduras se conocen
por aquellos expertos en la técnica. Puede modificarse una secuencia
líder cerca de su extremo 3' para contener uno o más sitios de
restricción. Esto facilitará la fusión de la secuencia líder al gen
estructural.
Los protocolos de transformación de levaduras se
conocen por aquellos expertos en la técnica. Uno de tales
protocolos se describe por Hinnen et al., Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 75:1929, 1978. El protocolo de Hinnen et
al. selecciona transformantes Trp^{+} en un medio selectivo,
en el que el medio selectivo consiste en el 0,67% de una base
nitrogenada de levaduras, el 0,5% de ácidos casamino, el 2% de
glucosa, 10 \mug/ml de adenina y 20 \mug/ml de uracilo.
Pueden hacerse crecer células huésped de
levaduras transformadas mediante vectores que contienen una
secuencia promotora ADH2 para inducir la expresión en un medio
"rico". Un ejemplo de medio rico es uno que consiste en el 1%
de extracto de levaduras, el 2% de peptona y el 1% de glucosa
complementado con 80 \mug/ml de adenina y 80 \mug/ml de
uracilo. La desrepresión del promotor ADH2 tiene lugar cuando se
agota la glucosa del medio.
También podrían emplearse sistemas de cultivo de
células huésped de mamíferos o insectos para expresar los
polipéptidos de TRAIL recombinantes. Los sistemas de baculovirus
para la producción de proteínas heterólogas en células de insecto
se revisan por Luckow y Summers, Bio/Technology 6:47 (1988).
También pueden emplearse líneas celulares establecidas de origen
mamífero. Los ejemplos de líneas celulares de células huésped de
mamíferos adecuadas incluyen la línea COS-7 de
células de riñón de mono (ATCC CRL 1651) (Gluzman et al.,
Cell 23:175, 1981), células L, células C127, células 3T3
(ATCC CCL 163), células de ovario de hámster chino (CHO), células
HeLa y líneas celulares BHK (ATCC CRL 10), y la línea celular
CVI/EBNA derivada de la línea celular de riñón del mono verde
africano CVI (ATCC CCL 70) tal como se describe por McMahan et
al. (EMBO J. 10:2821, 1991).
Pueden cortarse las secuencias de control de la
transcripción y la traducción para vectores de expresión de células
huésped de mamíferos de los genomas virales. Las secuencias
promotoras usado comúnmente y secuencias potenciadoras se derivan
de los virus del polioma, adenovirus 2, virus de simio 40 (SV40) y
citomegalovirus humano. Pueden usarse las secuencias de ADN
derivadas del genoma viral SV40, por ejemplo, origen SV40, promotor
temprano y tardío, potenciador y sitios de corte y empalme y de
poliadenilación, para proporcionar otros elementos genéticos para
la expresión de una secuencia de gen estructural en una célula
huésped de mamífero. Son particularmente útiles los promotores
virales tempranos y tardíos porque ambos se obtienen fácilmente a
partir de un genoma viral como un fragmento que también puede
contener un origen viral de replicación (Fiers et al.,
Nature 273:113, 1978). También pueden usarse fragmentos de
SV40 más pequeños o más grandes, siempre que se incluya la
secuencia de aproximadamente 250 pb, que se extiende desde el sitio
Hind III hacia el sitio Bgl I localizado en el origen
viral SV40 del sitio de replicación.
Pueden construirse los vectores de expresión para
su uso en células huésped de mamíferos tal como se describe en
Okayama y Berg (Mol. Cell. Biol. 3:280, 1983), por ejemplo.
Sustancialmente puede construirse un sistema útil para la expresión
estable de alto nivel de ADNc de mamíferos en células epiteliales
mamarias murinas C127, tal como se describe en Cosman et al.
(Mol. Immunol. 23:935, 1986). Se ha depositado como ATCC
39890 un vector de alta expresión, PMLSV N1/N4, descrito en Cosman
et al., Nature 312:768, 1984. Se describen vectores
de expresión de mamíferos adicionales en el documento
EP-A-0367566, y en el documento WO
91/18982. Como alternativa, el vector puede derivarse de un
retrovirus. Se describen sistemas de expresión adecuados
adicionales más adelante en los ejemplos.
Un sistema de expresión preferido emplea células
de ovario de hámster chino (CHO) y un vector de expresión designado
como PG5.7. Se describe este vector de expresión en la solicitud de
patente de los EE.UU. con número de serie 08/586.509, presentada el
11 de enero de 1996, que se incorpora como referencia al presente
documento. Los componentes de PG5.7 incluyen un fragmento del ADN
genómico de células CHO, seguido de un promotor derivado de CMV,
que está seguido de una secuencia que codifica para un líder
triparental de adenovirus, que a su vez está seguido de una
secuencia que codifica para la dihidrofolato reductasa (DHFR). Se
insertaron estos componentes en el vector plásmido pGEM1 (Promega,
Madison, WI). Puede insertarse el ADN que codifica para un
polipéptido de TRAIL (o proteína de fusión que contiene TRAIL)
entre las secuencias que codifican para el líder triparental y
DHFR. Puede añadirse metrotexato al medio de cultivo para aumentar
los niveles de expresión, tal como se reconoce en el campo.
El fragmento de ADN genómico de células CHO en el
vector PG5.7 aumenta la expresión de TRAIL. Se depositó un lisado
de fago que contiene un fragmento de ADN genómico aislado procedente
de células CHO en la Colección Americana de Cultivos Tipo el 4 de
enero de 1996, y se le asignó el número de registro ATCC 97411. El
vector PG5.7 contiene los nucleótidos 8671 a 14507 del inserto de
ADN genómico de CHO en el depósito de la cepa ATCC 97411.
Para la expresión de TRAIL, puede añadirse una
proteína de tipo II que carece de una secuencia señal nativa, una
secuencia señal heteróloga o líder funcional en células huésped de
mamífero. Los ejemplos incluyen la secuencia señal para
interleucina-7 (IL-7) descrita en la
patente de los EE.UU. 4.965.195, la secuencia señal para el
receptor de interleucina-2 descrita en Cosman et
al., Nature 312:768 (1984); el péptido señal del
receptor de interleucina-4 descrito en el documento
EP 367.566; el péptido señal del receptor de
interleucina-1 de tipo I descrito en la patente de
los EE.UU 4.968.607; y el péptido señal del receptor de
interleucina-1 de tipo II descrito en el documento
EP 460.846.
Un sistema de expresión preferido emplea una
secuencia líder derivada de citomegalovirus (CMV). El ejemplo 7
ilustra el uso de uno de tales líderes. En el ejemplo 7, se
transformaron las células huésped de mamífero con un vector de
expresión que codifica para el péptido Met Ala Arg Arg Leu Trp Ile
Leu Ser Leu Leu Ala Val Thr Leu Thr Val Ala Leu Ala Ala Pro Ser Gln
Lys Ser Lys Arg Arg Thr Ser Ser (SEQ ID NO: 9) fusionado al extremo
N-terminal de un octapéptido designado como FLAG®
(SEQ ID NO: 7, descrita anteriormente), que a su vez está fusionado
al extremo N-terminal de un polipéptido de TRAIL
soluble. Los residuos 1 a 29 de la SEQ ID NO: 9 constituyen una
secuencia líder derivada de CMV, mientras que los residuos 30 a 32
están codificados por los oligonucleótidos empleados en la
construcción del vector de expresión descrito en el ejemplo 7. En
una realización, se coloca el ADN que codifica para un péptido de
poli-His (por ejemplo, un péptido que contiene seis
residuos de histidina) entre las secuencias que codifican para el
líder de CMV y el péptido FLAG®.
Los sistemas de expresión que emplean tales
péptidos líder derivados de CMV son útiles para la expresión de
proteínas distintas de TRAIL. Se proporcionan en el presente
documento vectores de expresión que comprenden una secuencia de ADN
que codifica para los aminoácidos 1 a 29 de la SEQ ID NO: 9. En otra
realización, el vector comprende una secuencia que codifica para
los aminoácidos 1 a 28 de la SEQ ID NO: 9. El ADN que codifica para
una proteína heteróloga deseada se coloca en el sentido de 3' de, y
en el mismo marco de lectura que, el ADN que codifica para el
líder. Puede estar codificados residuos adicionales (por ejemplo,
aquellos codificados por los ligadores o cebadores) por el ADN
colocado entre las secuencias que codifican para el líder y la
proteína heteróloga deseada, tal como se ilustra mediante el vector
descrito en el ejemplo 7. Tal como se entiende en el campo
pertinente, los vectores de expresión comprenden promotores y
cualquier otra secuencia de regulación deseada, operativamente
unidos a las secuencias que codifican para el líder y la proteína
heteróloga.
Puede escindirse el péptido líder presentado en
la SEQ ID NO: 9 tras el residuo de arginina en la posición 29 para
producir la forma madura secretada de una proteína fusionada a él.
Alternativamente o adicionalmente, la escisión puede tener lugar
entre los aminoácidos 20 y 21, o entre los aminoácidos 28 y 29, de
la SEQ ID NO; 9.
El experto en la técnica reconocerá que
la(s) posición(ones) en la(s) que se escinde el
péptido señal puede(n) variar según factores tales como el
tipo de células huésped empleadas, si el TRAIL humano o murino se
expresa mediante el vector, y similares. El análisis mediante un
programa informático revela que el sitio de escisión primario puede
encontrarse entre los residuos 20 y 21 de la SEQ ID NO: 9. También
se predice que la escisión entre los residuos 22 y 23, y entre los
residuos 27 y 28 es posible. Para ilustrar, la expresión y secreción
de un polipéptido de TRAIL murino soluble dio como resultado la
escisión de un péptido señal derivado de CMV en múltiples
posiciones. Las tres especies más destacadas de proteína secretada
(en orden descendente) resultaron de la escisión entre los
aminoácidos 20 y 21 de la SEQ ID NO: 9, la escisión entre los
aminoácidos 22 y 23, y la escisión entre los aminoácidos 27 y
28.
Un método para producir una proteína heteróloga
recombinante supone cultivar células huésped de mamífero
transformadas con un vector de expresión tal en condiciones que
promueven la expresión y secreción de la proteína heteróloga, y
recuperar la proteína del medio de cultivo. Pueden usarse los
sistemas de expresión que emplean líderes de CMV para producir
cualquier proteína deseada, los que ejemplos de los cuales incluyen,
pero no se limitan a, factores estimulantes de colonia,
interferones, interleucinas, otras citocinas y receptores de
citocinas.
La presente invención proporciona proteínas TRAIL
purificadas que pueden producirse mediante sistemas de expresión
recombinantes tal como se describieron anteriormente o purificadas
de células que se producen de manera natural. El grado de pureza
deseado puede depender del uso pretendido de la proteína. Se desea
un grado de pureza relativamente alto cuando hay que administrar la
proteína in vivo, por ejemplo. Ventajosamente, se purifican
los polipéptidos de TRAIL de manera que no se detectan bandas de
proteína correspondientes a otras proteínas mediante electroforesis
en gel de poliacrilamida-SDS
(SDS-PAGE). Se reconocerá por un experto en el campo
pertinente que pueden detectarse múltiples bandas que corresponden
a la proteína TRAIL mediante SDS-PAGE, debido a la
glucosilación diferencial, las variaciones en el procesamiento
posterior a la traducción, y similares, tal como se trató
anteriormente. Se considera que hay que purificar una preparación
de proteína TRAIL hasta que no se visualicen bandas correspondientes
a proteínas diferentes (que no son TRAIL). Lo más preferiblemente,
se purifica TRAIL hasta la homogeneidad sustancial, tal como se
indica mediante una banda de proteína simple con análisis mediante
SDS-PAGE. Puede visualizarse la banda de proteína
mediante tinción con plata, tinción con azul de Coomassie, o (si la
proteína está radiomarcada) mediante autorradiografía.
Un procedimiento para la producción de la
proteína TRAIL comprende cultivar una célula huésped transformada
con un vector de expresión que comprende una secuencia de ADN que
codifica para TRAIL en condiciones tales que se exprese TRAIL. La
proteína TRAIL se recupera entonces del cultivo (del medio de
cultivo o los extractos celulares). Tal como reconocerá un experto
en la técnica, los procedimientos para purificar el TRAIL
recombinante variarán según factores tales como el tipo de células
huésped empleadas y de si se secreta o no TRAIL en el medio de
cultivo.
Por ejemplo, cuando se emplean sistemas de
expresión que secretan la proteína recombinante, el medio de cultivo
puede en primer lugar concentrarse utilizando un filtro de
concentración de proteínas disponible comercialmente, por ejemplo,
una unidad de ultrafiltración de Amicon o Millipore Pellicon. Tras
la etapa de concentración, el concentrado puede aplicarse a una
matriz de purificación tal como un medio de filtración en gel.
Alternativamente, puede emplearse una resina de intercambio
aniónico, por ejemplo, una matriz o un sustrato que tenga grupos
dietilaminoetilo (DEAE) colgantes. Las matrices pueden ser de
acrilamida, agarosa, dextrano, celulosa u otros tipos empleados
comúnmente en la purificación de proteínas. Alternativamente, puede
emplearse una etapa de intercambio catiónico. Los intercambiadores
catiónicos adecuados incluyen diversas matrices insolubles que
comprenden grupos sulfopropilo o carboximetilo. Se prefieren los
grupos sulfopropilo. Finalmente, pueden emplearse una o más etapas
de cromatografía líquida de alta resolución en fase inversa
(RP-HPLC) que emplean medios hidrófobos para
RP-HPLC (por ejemplo, gel de sílice que tiene grupos
metilo u otros grupos alifáticos colgantes) para purificar
adicionalmente TRAIL. Pueden emplearse algunas o todas las etapas de
purificación anteriores, en diversas combinaciones, para
proporcionar una proteína TRAIL purificada.
Puede aislarse la proteína recombinante producida
en un cultivo bacteriano mediante la perturbación inicial de las
células huésped, centrifugación, extracción a partir de los
sedimentos celulares si se trata de un polipéptido insoluble o a
partir del líquido sobrenadante si se trata de un polipéptido
soluble, seguido por una o más etapas de concentración,
precipitación salina ("salting-out"),
intercambio iónico, cromatografía de purificación por afinidad o de
exclusión por tamaños. Finalmente, puede emplearse
RP-HPLC para las etapas de purificación finales.
Las células microbianas pueden perturbarse mediante cualquier método
conveniente, incluyendo ciclos de
congelación-descongelación, sonicación, perturbación
mecánica o uso de agentes de lisis celular.
Se emplean preferiblemente células huésped de
levaduras transformadas para expresar TRAIL como un polipéptido
secretado. Esto simplifica la purificación. El polipéptido
recombinante secretado a partir de una fermentación de células
huésped de levaduras puede purificarse mediante métodos análogos a
los descritos por Urdal et al. (J. Chromatog.
296:171, 1984). Urdal et al. describen dos etapas
secuenciales de HPLC en fase inversa para la purificación de
IL-2 humana recombinante en una columna de HPLC
preparativa.
Alternativamente, los polipéptidos de TRAIL
pueden purificarse mediante cromatografía de inmunoafinidad. Puede
prepararse una columna de afinidad que contiene un anticuerpo que se
une a TRAIL mediante procedimientos convencionales y emplearse en
la purificación de TRAIL. El ejemplo 4 describe un procedimiento
para generar anticuerpos monoclonales dirigidos contra TRAIL.
La muerte celular programada (apoptosis) se
produce durante la embriogénesis, metamorfosis, atrofia tisular
dependiente del sistema endocrino, recambio tisular normal, y muerte
de timocitos inmunitarios. La regulación de la muerte celular
programada es vital para el funcionamiento normal del sistema
inmunitario. Para ilustrar, las células T que reconocen
autoantígenos se destruyen mediante el proceso apoptótico durante la
maduración de las células T en el timo, mientras que otras células
T se seleccionan positivamente. Se ha propuesto la posibilidad de
que algunas células T que reconocen ciertos autoepítopos (por
ejemplo, determinantes antigénicos que se han procesado y
presentado de manera ineficaz de una autoproteína dada) escapen a
este proceso de eliminación y posteriormente desempeñen un papel en
enfermedades autoinmunitarias (Gammon et al., Immunology
Today 12:193, 1991).
La apoptosis insuficiente se ha implicado en
ciertos estados, aunque los niveles elevados de muerte celular
apoptótica se han asociado con otras enfermedades. Se reconoce la
conveniencia de identificar y utilizar agentes que regulan la
apoptosis en el tratamiento de tales trastornos (Kromer, Advances
in Immunology, 58:211, 1995; Groux et al., J. Exp.
Med. 175:331, 1992; Sachs y Lotem, Blood 82:15,
1993).
La resistencia anómala de las células T hacia
experimentar apoptosis se ha relacionado con linfocitosis,
linfadenopatía, esplenomegalia, acumulación de células T
autorreactivas, enfermedad autoinmunitaria, desarrollo de leucemia
y desarrollo de linfoma (Kromer, anteriormente; véanse especialmente
las páginas 214-215). Por el contrario, se ha
sugerido que la apoptosis excesiva de las células T desempeña un
papel en linfocitopenia, inmunodeficiencia sistémica e
inmunodeficiencia específica, siendo ejemplos específicos los
estados inmunodeficientes inducidos por virus asociados con
mononucleosis infecciosa e infección por citomegalovirus, e
inmunosupresión mediada por tumor (Kromer, anteriormente; véase
especialmente la página 214). La reducción de células T CD4^{+}
en los individuos infectados por VIH puede atribuirse a la muerte
celular inducida por activación inapropiada (AICD) mediante
apoptosis (Groux et al., J. Exp. Med. 175:331,
1992).
Tal como se demuestra en los ejemplos 5 y 8,
TRAIL induce apoptosis de la línea celular de leucemia aguda de
células T designada como Jurkat clon E6-1. TRAIL es
por tanto, un reactivo de investigación útil en estudios de
apoptosis, incluyendo la regulación de la muerte celular programada.
Puesto que las células Jurkat son una línea celular de leucemia que
surge de las células T, el TRAIL de la presente invención encuentra
uso en estudios del papel que TRAIL puede desempeñar en la
apoptosis de otras células T transformadas, tales como otros tipos
de células malignas que surgen de las células T.
TRAIL se une a células Jurkat, además de inducir
la apoptosis de las mismas. TRAIL no provocó la muerte de timocitos
murinos recién aislados ni de células T de sangre periférica (PBT)
recién extraídas de un donante humano sano. Se derivan varios usos
de estas propiedades.
Los polipéptidos de TRAIL pueden utilizarse para
purificar células de leucemia, o cualquier otro tipo celular al que
se una TRAIL. Las células de leucemia pueden aislarse de la sangre
de un paciente, por ejemplo. En una realización, las células se
purifican mediante cromatografía de afinidad, utilizando una matriz
de cromatografía que tiene TRAIL unido a la misma. El TRAIL unido a
la matriz de cromatografía puede ser una proteína de longitud
completa, un fragmento de TRAIL que comprende el dominio
extracelular, una proteína de fusión que contiene TRAIL, u otro
polipéptido de TRAIL adecuado descrito en el presente documento. En
una realización, una proteína de fusión soluble de TRAIL/Fc está
unida a una columna de proteína A o proteína G a través de la
interacción del resto Fc con la proteína A o proteína G.
Alternativamente, puede utilizarse TRAIL en el aislamiento de
células de leucemia mediante citometría de flujo.
Se espera que las células de leucemia así
purificadas mueran tras la unión de TRAIL, pero las células muertas
portarán aún los antígenos de superficie celular y pueden emplearse
como inmunógenos en la derivación de anticuerpos
anti-leucemia. Las células de leucemia, o un
antígeno de la superficie celular deseado aislado de las mismas,
encuentran un uso adicional en el desarrollo de vacunas.
Puesto que TRAIL se une y destruye las células de
leucemia (la línea celular Jurkat), TRAIL también puede ser útil en
el tratamiento de la leucemia. Un método terapéutico supone poner en
contacto células de leucemia con una cantidad eficaz de TRAIL. En
una realización, se pone en contacto la sangre de un paciente con
leucemia ex vivo con un polipéptido de TRAIL. El TRAIL puede
inmovilizarse sobre una matriz adecuada. TRAIL se une a las células
de leucemia, extrayéndolas así de la sangre del paciente antes de
devolver la sangre al paciente.
Alternativa o adicionalmente, puede ponerse en
contacto la médula ósea extraída de un paciente con leucemia con
una cantidad de TRAIL eficaz en la inducción de la muerte de las
células de leucemia en la médula ósea. La médula ósea puede
aspirarse desde el esternón o las crestas ilíacas, por ejemplo, y
ponerse en contacto con TRAIL para purgar las células de leucemia.
La médula así tratada se devuelve al paciente.
TRAIL también se une a, e induce la apoptosis de,
células de melanoma y linfoma (véanse los ejemplos 5, 9 y 10). Por
tanto, los usos de TRAIL que son análogos a los descritos
anteriormente para las células de leucemia son aplicables a células
de linfoma y melanoma. Los polipéptidos de TRAIL pueden emplearse en
el tratamiento del cáncer, incluyendo pero sin limitarse a,
leucemia, linfoma y melanoma. En una realización, el linfoma es
linfoma de Burkitt. La tabla I en el ejemplo 9 muestra que TRAIL
tiene un efecto citotóxico sobre varias líneas celulares de linfoma
de Burkitt. El virus de Epstein-Barr es un agente
etiológico del linfoma de Burkitt.
Los polipéptidos de TRAIL también encuentran uso
en el tratamiento de infecciones virales. El contacto con TRAIL
produjo la muerte de las células infectadas por citomegalovirus,
pero no del mismo tipo celular cuando no están infectadas, tal como
se describe en el ejemplo 11. La capacidad de TRAIL para destruir
células infectadas por otros virus puede confirmarse utilizando el
ensayo descrito en el ejemplo 11. Tales virus incluyen, pero no se
limitan a, virus de la encefalomiocarditis, virus de la enfermedad
de Newcastle, virus de la estomatitis vesicular, virus del herpes
simple, adenovirus 2, virus de la diarrea viral bovina y virus de
Epstein-Barr.
Se administra una cantidad eficaz de TRAIL a un
mamífero, incluyendo un ser humano, afectado por una infección
viral. En una realización, se emplea TRAIL junto con interferón para
tratar una infección viral. En el experimento descrito en el
ejemplo 11, el pretratamiento de células infectadas por CMV con
\gamma-interferón aumentó el nivel de destrucción
de las células infectadas, que estaba mediada por TRAIL. TRAIL puede
administrarse junto con otros agentes que ejercen un efecto
citotóxico sobre células cancerígenas o células infectadas por
virus.
En otra realización, se utiliza TRAIL para
destruir células infectadas de manera viral en preparaciones
celulares, tejidos u órganos que van a trasplantarse. Para
ilustrar, puede ponerse en contacto médula ósea con TRAIL para
destruir células infectadas por virus que puede estar presentes en
ella, antes de que la médula ósea se trasplante al
receptor.
receptor.
El TRAIL de la presente invención puede
utilizarse en el desarrollo de tratamientos para cualquier trastorno
mediado (directa o indirectamente) por cantidades defectuosas o
ineficaces de TRAIL. Se administra una cantidad terapéuticamente
eficaz de proteína TRAIL purificada a un paciente afectado con tal
trastorno. Alternativamente, pueden emplearse secuencias de ADN de
TRAIL en el desarrollo de un enfoque de terapia génica para tratar
tales trastornos. La descripción en el presente documento de
secuencias de nucleótidos de TRAIL nativo permite la detección de
genes de TRAIL defectuosos y la sustitución de los mismos por genes
normales que codifican para TRAIL. Los genes defectuosos pueden
detectarse en ensayos de diagnóstico in vitro, y mediante
comparación de la secuencia de nucleótidos de TRAIL nativo descrita
en el presente documento con la de un gen derivado de una persona
de la que se sospecha que alberga un defecto en este gen.
La presente invención proporciona composiciones
farmacéuticas que comprenden TRAIL purificado y un vehículo,
diluyente o excipiente fisiológicamente aceptable. Los vehículos,
diluyentes y excipientes adecuados son no tóxicos para los
receptores a las dosificaciones y concentraciones empleadas. Tales
composiciones pueden comprender tampones, antioxidantes tales como
ácido ascórbico, polipéptidos de bajo peso molecular (menos de
aproximadamente 10 residuos), proteínas, aminoácidos, hidratos de
carbono incluyendo glucosa, sacarosa o dextrinas, agentes quelantes
tales como EDTA, glutatión y otros estabilizadores y excipientes
empleados comúnmente en las composiciones farmacéuticas. La
solución salina tamponada neutra o la solución salina mezclada con
albúmina de suero conespecífica están entre los diluyentes
apropiados. La composición puede formularse como un liofilizado
utilizando soluciones de excipientes adecuados (por ejemplo,
sacarosa) como diluyentes.
Para uso terapéutico, se administran las
proteínas purificadas de la presente invención a un paciente,
preferiblemente un ser humano, para el tratamiento de una manera
apropiada para la indicación. Así, por ejemplo, las composiciones
farmacéuticas pueden administrarse localmente, mediante inyección
intravenosa, infusión continua, liberación sostenida desde
implantes u otra técnica adecuada. Las dosificaciones y la
frecuencia de administración adecuadas dependerán, naturalmente, de
factores tales como la naturaleza y gravedad de la indicación que se
esté tratando, la respuesta deseada, el estado del paciente,
etcétera.
La proteína TRAIL empleada en las composiciones
farmacéuticas preferiblemente está purificada de tal manera que la
proteína TRAIL está sustancialmente libre de otras proteínas de
origen natural o endógeno, conteniendo preferiblemente menos de
aproximadamente un 1% en masa de contaminantes proteicos residuales
de procesos de producción. Sin embargo, tales composiciones pueden
contener otras proteínas añadidas como estabilizadores, vehículos,
excipientes o coproductos terapéuticos.
Los ADN que codifican para TRAIL descritos en el
presente documento encuentran un uso en la producción de
polipéptidos de TRAIL, tal como se trató anteriormente. Los
fragmentos de las secuencias de nucleótidos de TRAIL también son
útiles. En una realización, tales fragmentos comprenden al menos
aproximadamente 17 nucleótidos consecutivos, más preferiblemente al
menos 30 nucleótidos consecutivos, del ADN de TRAIL humano o murino
descrito en el presente documento. Se proporcionan en el presente
documento complementos de ADN o ARN de dichos fragmentos,
junto con formas tanto monocatenarias como bicatenarias del ADN de TRAIL de las SEQ ID NOS: 1, 3 y 5.
junto con formas tanto monocatenarias como bicatenarias del ADN de TRAIL de las SEQ ID NOS: 1, 3 y 5.
Entre los usos de tales fragmentos de ácido
nucleico de TRAIL se encuentran su uso como sonda o como cebadores
en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Como ejemplo, puede
emplearse una sonda correspondiente al dominio extracelular de
TRAIL. Las sondas encuentran uso en la detección de la presencia de
ácidos nucleicos de TRAIL en ensayos in vitro y en tales
procedimientos como Northern y Southern blot. También pueden
identificarse los tipos celulares que expresan TRAIL. Tales
procedimientos se conocen bien y el experto en la técnica puede
elegir una sonda de longitud adecuada, dependiendo de la aplicación
pretendida particular. Para PCR, se emplean los cebadores 5' y 3'
correspondientes a los extremos terminales de una secuencia de ADN
de TRAIL deseada para aislar y amplificar esa secuencia, utilizando
técnicas convencionales.
Otros fragmentos útiles de ácidos nucleicos de
TRAIL son oligonucleótidos antisentido o sentido que comprenden una
secuencia de ácido nucleico monocatenario (o bien ARN o bien ADN)
que puede unirse a las secuencias ARNm de TRAIL (sentido) o ADN de
TRAIL (antisentido) objetivo. Tal fragmento comprende generalmente
al menos aproximadamente 14 nucleótidos, preferiblemente desde
aproximadamente 14 hasta aproximadamente 30 nucleótidos. La
capacidad para crear un oligonucleótido antisentido o sentido,
basado en una secuencia de ADNc para una proteína dada, se describe
en, por ejemplo, Stein y Cohen, Cancer Res. 48:2659, 1988 y
van der Krol et al., Biotechniques 6:958, 1988.
La unión de los oligonucleótidos antisentido o
sentido a secuencias de ácido nucleico objetivo da como resultado
la formación de dúplex que bloquean la traducción (ARN) o
transcripción (ADN) mediante uno de varios medios, incluyendo el
aumento de degradación de los dúplex, la terminación prematura de la
transcripción o traducción, o mediante otros medios. Los
oligonucleótidos antisentido pueden utilizarse, por tanto, para
bloquear la expresión de las proteínas TRAIL.
Los oligonucleótidos antisentido o sentido
comprenden además oligonucleótidos que tienen estructuras de
azúcar-fosfodiéster modificadas (u otros enlaces de
azúcar, tales como los descritos en el documento WO91/06629) y en
los que tales enlaces de azúcar son resistentes a nucleasas
endógenas. Tales oligonucleótidos con enlaces de azúcar resistentes
son estables in vivo (es decir, pueden resistir la
degradación enzimática) pero conservan la especificidad de
secuencia para poder unirse a secuencias de nucleótidos objetivo.
Otros ejemplos de oligonucleótidos antisentido o sentido incluyen
aquellos oligonucleótidos que están unidos covalentemente a restos
orgánicos, tales como los descritos en el documento WO 90/10448 y
otros restos que aumentan la afinidad del oligonucleótido por una
secuencia de ácido nucleico objetivo, tal como
poli(L-lisina). Aún adicionalmente, pueden
unirse agentes de intercalación, tales como elipticina, y agentes
alquilantes o complejos metálicos a los oligonucleótidos
antisentido o sentido para modificar las especificidades de unión
del oligonucleótido antisentido o sentido por la secuencia de
nucleótidos objetivo.
Los oligonucleótidos antisentido o sentido pueden
introducirse en una célula que contiene la secuencia de ácido
nucleico objetivo mediante cualquier método de transferencia génica,
incluyendo por ejemplo, transfección de ADN mediada por CaPO_{4},
electroporación u otros vectores de transferencia génica tales como
el virus de Epstein-Barr. Los oligonucleótidos
antisentido o sentido se introducen preferiblemente en una célula
que contiene la secuencia de ácido nucleico objetivo mediante la
inserción del oligonucleótido antisentido o sentido en un vector
retroviral adecuado, poniendo luego en contacto la célula con el
vector retroviral que contiene la secuencia insertada, o bien in
vivo o bien ex vivo. Los vectores retrovirales adecuados
incluyen, pero no se limitan a, el retrovirus murino
M-MuLV, N2 (un retrovirus derivado de
M-MuLV) o los vectores de doble copia designados
como DCT5A, DCT5B y DCT5C (véase la solicitud PCT WO 90/13641).
Alternativamente, pueden utilizarse otras secuencias promotoras
para expresar el oligonucleótido.
Los oligonucleótidos antisentido o sentido pueden
introducirse también en una célula que contiene la secuencia de
nucleótidos objetivo mediante la formación de un conjugado con una
molécula de unión a ligandos, tal como se describe en el documento
WO 91/04753. Las moléculas de unión a ligandos adecuadas incluyen,
pero no se limitan a, receptores de la superficie celular, factores
de crecimiento, otras citocinas, u otros ligandos que se unan a los
receptores de la superficie celular. Preferiblemente, la conjugación
de la molécula de unión a ligandos no interfiere sustancialmente en
la capacidad de la molécula de unión a ligandos para unirse a su
correspondiente molécula o receptor, o bloquear la entrada del
oligonucleótido antisentido o sentido o su versión conjugada en la
célula.
Alternativamente, puede introducirse un
oligonucleótido antisentido o sentido en una célula que contiene la
secuencia de ácido nucleico objetivo mediante la formación de un
complejo oligonucleótido-lípido, tal como se
describe en el documento WO 90/10448. El complejo de oligonucleótido
antisentido o sentido-lípido se disocia
preferiblemente dentro de la célula por una lipasa endógena.
Las proteínas TRAIL de la presente invención, o
fragmentos inmunogénicos de las mismas, pueden emplearse en la
generación de anticuerpos. La presente invención proporciona así
anticuerpos que unen específicamente TRAIL, es decir, los
anticuerpos se unen a TRAIL a través de los sitios de unión de
antígenos del anticuerpo (opuesto a la unión no específica).
Pueden prepararse anticuerpos monoclonales y
policlonales mediante técnicas convencionales. Véase, por ejemplo,
Monoclonal Antibodies, Hybridomas: A New Dimension in Biological
Analyses, Kennet et al. (eds.), Plenum Press, Nueva York
(1980); y Antibodies: A Laboratory Manual, Harlow y Land
(eds.), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor,
NY, (1988). La producción de anticuerpos monoclonales que son
inmunorreactivos con TRAIL se ilustra adicionalmente en el ejemplo
4 más adelante.
Los fragmentos de unión a antígenos de tales
anticuerpos, que pueden producirse mediante técnicas convencionales,
también se engloban por la presente invención. Ejemplos de tales
fragmentos incluyen, pero no se limitan a, fragmentos Fab,
F(ab') y F(ab')_{2}. También se proporcionan
fragmentos y derivados de anticuerpos producidos mediante técnicas
de ingeniería genética.
Los anticuerpos monoclonales de la presente
invención incluyen anticuerpos quiméricos, por ejemplo, versiones
humanizadas de anticuerpos monoclonales murinos. Tales anticuerpos
humanizados pueden prepararse mediante técnicas conocidas, y
ofrecen la ventaja de una inmunogenicidad reducida cuando se
administran los anticuerpos a seres humanos. En una realización, un
anticuerpo monoclonal humanizado comprende la región variable de un
anticuerpo murino (o sólo el sitio de unión a antígenos del mismo) y
una región constante derivada de un anticuerpo humano.
Alternativamente, un fragmento de anticuerpo humanizado puede
comprender el sitio de unión a antígenos de un anticuerpo
monoclonal murino y un fragmento de región variable (que carece del
sitio de unión a antígenos) derivado de un anticuerpo humano. Los
procedimientos para la producción de anticuerpos quiméricos y
monoclonales modificados mediante ingeniería genética adicionales
incluyen los descritos en Riechmann et al. (Nature
332:323, 1988), Liu et al. (PNAS 84:3439, 1987),
Larrick et al. (Bio/Technology 7:934, 1989) y Winter
y Harris (TIPS 14:139, mayo de 1993).
Entre los usos de los anticuerpos se encuentra el
uso en ensayos para detectar la presencia de polipéptidos de TRAIL,
o bien in vitro o bien in vivo. Los anticuerpos
encuentran un uso adicional en la purificación de TRAIL mediante
cromatografía de afinidad.
Aquellos anticuerpos que adicionalmente pueden
bloquear la unión de TRAIL a las células diana pueden utilizarse
para inhibir una actividad biológica de TRAIL. Un método terapéutico
supone la administración in vivo de tal anticuerpo en una
cantidad eficaz para inhibir una actividad biológica mediada por
TRAIL. Los trastornos mediados o agravados por TRAIL, directa o
indirectamente, se tratan así. Generalmente, se prefieren los
anticuerpos monoclonales para su uso en tales métodos
terapéuticos.
Los anticuerpos dirigidos contra TRAIL pueden ser
útiles para tratar microangiopatías trombóticas. Un trastorno de
este tipo es la púrpura trombocitopénica trombótica (PTT) (Kwaan, H.
C., Semin. Hematol., 24:71, 1987; Thompson et al.
Blood, 80:1890, 1992). Se han notificado tasas de mortalidad
asociadas con PTT crecientes por los centros de control de
enfermedades de los EE.UU. (Torok et al., Am. J.
Hematol. 50:84, 1995).
El plasma de pacientes afectados con PTT
(incluyendo pacientes VIH^{+} y VIH^{-}) induce la apoptosis de
células endoteliales humanas de origen microvascular dérmico, pero
no a las de origen de vasos grandes (Laurence et al.,
Blood, 87:3245, 15 de abril de 1996). Por tanto, se cree que
el plasma de pacientes con PTT contiene uno o más factores que
inducen directa o indirectamente la apoptosis. En el ensayo descrito
en el ejemplo 13 más adelante, los anticuerpos policlonales
producidos contra TRAIL inhibieron la apoptosis inducida por plasma
de PTT de las células endoteliales microvasculares dérmicas. Los
datos presentados en el ejemplo 13 sugieren que TRAIL está presente
en el suero de los pacientes con PTT, y puede desempeñar un papel
en la inducción de la apoptosis de las células endoteliales
microvasculares.
Otra microangiopatía trombótica es el síndrome
hemolítico-urémico (SHU) (Moake, J. L.,
Lancet, 343:393, 1994; Melynck et al., (Arch.
Intern. Med., 155:2077, 1995; Thompson et al.,
anteriormente). Una realización de la invención se refiere al uso
de un anticuerpo anti-TRAIL para tratar el estado
que a menudo se denomina como "SHU de adulto" (aun cuando
también puede atacar a niños). Un trastorno conocido como SHU de la
infancia/asociado a diarrea difiere en la etiología del SHU de
adulto.
Otros estados caracterizados por la coagulación
de pequeños vasos sanguíneos pueden tratarse utilizando anticuerpos
anti-TRAIL. Tales estados incluyen, pero no se
limitan a los siguientes. Se cree que los problemas cardiacos
observados en aproximadamente el 5 - 10% de los pacientes
pediátricos con SIDA suponen la coagulación de pequeños vasos
sanguíneos. La rotura de la microvasculatura en el corazón se ha
notificado en pacientes con esclerosis múltiple. Como ejemplo
adicional, se contempla el tratamiento del lupus eritematoso
sistémico (LES).
En una realización, se pone en contacto la sangre
o el plasma de un paciente con un anticuerpo
anti-TRAIL ex vivo. El anticuerpo
(preferiblemente un anticuerpo monoclonal) puede unirse a una matriz
de cromatografía adecuada mediante procedimientos convencionales.
La sangre o plasma del paciente fluye a través de una columna de
cromatografía que contiene el anticuerpo unido a la matriz, antes de
devolverse al paciente. El anticuerpo inmovilizado se une a TRAIL,
eliminando así la proteína TRAIL de la sangre del paciente.
En una realización alternativa, los anticuerpos
se administran in vivo, en cuyo caso se emplean de manera
deseada anticuerpos bloqueantes. Tales anticuerpos pueden
identificarse utilizando cualquier procedimiento de ensayo
adecuado, tal como probar los anticuerpos para determinar su
capacidad para inhibir la unión de TRAIL a las células diana.
Alternativamente, los anticuerpos bloqueantes pueden identificarse
en ensayos para determinar la capacidad para inhibir un efecto
biológico de la unión de TRAIL a células diana. El ejemplo 12
ilustra un método adecuado de identificación de anticuerpos
bloqueantes, en el que se someten a ensayo los anticuerpos para
determinar la capacidad para inhibir la lisis mediada por TRAIL de
células Jurkat.
La presente invención proporciona así un método
para tratar una microangiopatía trombótica, que supone el uso de
una cantidad eficaz de un anticuerpo dirigido contra TRAIL. Los
anticuerpos de la presente invención pueden emplearse en
procedimientos in vivo o ex vivo, para inhibir el daño
mediado por TRAIL a (por ejemplo, apoptosis de) las células
endoteliales microvasculares.
Los anticuerpos anti-TRAIL pueden
emplearse junto con otros agentes útiles en el tratamiento de un
trastorno particular. En un estudio in vitro notificado por
Laurence et al. (Blood 87:3245, 1996), se consiguió
cierta reducción de la apoptosis mediada por plasma de PTT de las
células endoteliales microvasculares utilizando un anticuerpo
bloqueante anti-Fas, ácido aurintricarboxílico o
plasma normal empobrecido en crioprecipitado.
Por tanto, puede tratarse un paciente con un
agente que inhiba la apoptosis mediada por el ligando de Fas de
células endoteliales, en combinación con un agente que inhiba la
apoptosis mediada por TRAIL de células endoteliales. En una
realización, se administran un anticuerpo bloqueante
anti-TRAIL y un anticuerpo bloqueante
anti-Fas ambos a un paciente afectado por un
trastorno caracterizado por microangiopatía trombótica, tal como
PTT o SHU. Ejemplos de anticuerpos monoclonales bloqueantes
dirigidos contra el antígeno Fas (CD95) se describen en la
publicación de solicitud PCT número WO 95/10540, incorporada como
referencia al presente documento.
En el presente documento, se proporcionan
composiciones farmacéuticas que comprenden un anticuerpo que es
inmunorreactivo con TRAIL y un diluyente, excipiente o vehículo
adecuado. Los componentes adecuados de tales composiciones son tal
como se describieron anteriormente para las composiciones que
contienen proteínas TRAIL.
Se facilitan los siguientes ejemplos para
ilustrar realizaciones particulares de la presente invención, y no
han de considerarse como limitantes del alcance de la invención.
Se aisló el ADN que codifica para una proteína
TRAIL humana de la presente invención mediante el siguiente
procedimiento. Se realizó una búsqueda con el programa TBLASTN de la
base de datos dbEST en el Centro Nacional de Información
Biotecnológica (NCBI - National Center for Biological Information),
utilizando la secuencia de búsqueda LVVXXXGLYYVYXQVXF (SEQ ID NO:
8). Esta secuencia se basa en la región más conservada de la familia
de ligandos de TNF (Smith et al., Cell, 73:1349,
1993). Se identificó un archivo de etiqueta de la secuencia
expresada (EST - expressed sequence tag), número de registro de
GenBank Z36726, utilizando estos parámetros de búsqueda. El archivo
GenBank indicó que esta EST se obtenía a partir de una biblioteca de
ADNc de aurícula de corazón humano.
Se sintetizaron dos oligonucleótidos de 30 pb
basados en secuencias de los extremos 3' y 5' de este archivo EST.
El oligonucleótido del extremo 3' tenía la secuencia
TGAAATCGAAAGTATGTTTGGGAATAGATG (complemento de los nucleótidos 636
a 665 de la SEQ ID NO: 1) y el oligonucleótido 5' fue
TGACGAAGAGAGTATGAA
CAGCCCCTGCTG (nucleótidos 291 a 320 de la SEQ ID NO: 1). Se marcaron los oligonucleótidos en el extremo 5' con ^{32}P \gamma-ATP y polinucleótido cinasa. Se examinaron dos bibliotecas de ADNc de \lambdagt10 mediante métodos convencionales con una mezcla equimolar de estos oligonucleótidos marcados como sonda. Una biblioteca fue una biblioteca de ADNc estirado en 5' de corazón humano (Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA). La otra fue una biblioteca de linfocito de sangre periférica (LSP) preparada tal como sigue: se obtuvieron LSP a partir de voluntarios humanos normales y se trataron con 10 ng/ml de OKT3 (un anticuerpo anti-CD3) y 10 ng/ml de IL-2 humana durante seis días. Se lavaron las células de LSP y se estimularon con 500 ng/ml de ionomicina (Calbiochem) y 10 ng/ml de PMA durante 4 horas. Se aisló ARN mensajero de las células de LSP estimuladas. Se empaquetó ADNc sintetizado sobre el molde de ARNm en vectores de fago \lambdagt10 (Gigapak®, Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA).
CAGCCCCTGCTG (nucleótidos 291 a 320 de la SEQ ID NO: 1). Se marcaron los oligonucleótidos en el extremo 5' con ^{32}P \gamma-ATP y polinucleótido cinasa. Se examinaron dos bibliotecas de ADNc de \lambdagt10 mediante métodos convencionales con una mezcla equimolar de estos oligonucleótidos marcados como sonda. Una biblioteca fue una biblioteca de ADNc estirado en 5' de corazón humano (Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA). La otra fue una biblioteca de linfocito de sangre periférica (LSP) preparada tal como sigue: se obtuvieron LSP a partir de voluntarios humanos normales y se trataron con 10 ng/ml de OKT3 (un anticuerpo anti-CD3) y 10 ng/ml de IL-2 humana durante seis días. Se lavaron las células de LSP y se estimularon con 500 ng/ml de ionomicina (Calbiochem) y 10 ng/ml de PMA durante 4 horas. Se aisló ARN mensajero de las células de LSP estimuladas. Se empaquetó ADNc sintetizado sobre el molde de ARNm en vectores de fago \lambdagt10 (Gigapak®, Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA).
Se colocaron en placas los fagos recombinantes
sobre E. coli de la cepa C600-HFL y se
examinaron utilizando técnicas de hibridación en placa habituales.
Se sacaron filtros de nitrocelulosa de estas placas por duplicado,
y se hibridaron con los oligonucleótidos marcados con ^{32}P
durante la noche a 67ºC en una solución de Tris 60 mM pH 8,0, EDTA
2 mM, 5 x solución de Denhardt, 6 x SSC,
n-lauroilsarcosina 1 mg/ml, NP40 0,5%, y ADN de
esperma de salmón SS 4 \mug/ml. Entonces se lavaron los filtros
con 3 x SSC a 67ºC durante treinta minutos.
A partir de la biblioteca de ADNc estirado en 5'
de corazón, se obtuvo una placa positiva de entre aproximadamente
un millón de placas. Este clon no incluía el extremo 3' del gen.
Utilizando la biblioteca de LSP, se obtuvieron aproximadamente 50
placas positivas de entre 500.000 placas. Se eligieron quince de
estas placas positivas de la primera vuelta, y se amplificaron los
insertos de las reservas enriquecidas utilizando cebadores de
oligonucleótido diseñados para amplificar insertos de fago. Se
resolvieron los productos resultantes mediante electroforesis en
gel de agarosa al 1,5%, se transfirieron a nitrocelulosa, y se
analizaron mediante la técnica de transferencia Southern habitual
utilizando los oligonucleótidos de 30 meros marcados con ^{32}P
como sondas. Se purificaron las dos selecciones de placa que
produjeron las bandas más grandes mediante el análisis Southern
mediante un examen secundario, y se obtuvieron placas de fagos
aislados utilizando los mismos procedimientos descritos
anteriormente.
Se preparó ADN a partir de los fagos aislados
mediante el método de lisis en placa, y se cortaron los insertos de
ADNc con EcoRI, se purificaron mediante electroforesis utilizando
agarosa al 1,5% en tampón de
tris-borato-EDTA, y se ligaron al
plásmido pBluescript® SK(+). Entonces se secuenciaron estos insertos
mediante métodos convencionales, y se alinearon las secuencias
resultantes.
Se presenta la secuencia de nucleótidos de un ADN
de TRAIL humano en la SEQ ID NO: 1 y se presenta la secuencia de
aminoácidos codificada por el mismo en la SEQ ID NO: 2. Esta
proteína TRAIL humana comprende un dominio citoplásmico
N-terminal (aminoácidos 1-18), una
región transmembrana (aminoácidos 19-38), y un
dominio extracelular (aminoácidos 39-281). El peso
molecular calculado de esta proteína es de 32.508 daltones.
Se depositaron las células E. coli de la
cepa DH10B transformadas con un vector recombinante que contiene
este ADN de TRAIL en la Colección Americana de Cultivos Tipo el 14
de junio de 1995, y se asignó el número de registro 69849. El
depósito se realizó bajo los términos del Tratado de Budapest. El
vector recombinante en la cepa depositada es el vector de expresión
pDC409 (descrito en el ejemplo 5). Se digirió el vector con SalI y
NotI, y se ligó el ADN de TRAIL humano que incluye la región
codificadora entera mostrada en la SEQ ID NO: 1 al vector
digerido.
Se aisló ADN que codifica para una segunda
proteína TRAIL humana tal como sigue. Esta TRAIL truncada no muestra
poder inducir la apoptosis de células Jurkat.
El análisis PCR, utilizando los 30 meros
descritos en el ejemplo 1 como cebadores de 5' y 3', indicó que 3
de cada 14 de las selecciones de placa de la primera vuelta en el
ejemplo 1 contenían formas acortadas del ADN de TRAIL. Se aisló una
de las formas acortadas del gen, se ligó al vector de clonación
pBluescript® SK(+) (Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA) y se
secuenció.
Se presenta la secuencia de nucleótidos de este
ADN en la SEQ ID NO: 3. Se presenta la secuencia de
aminoácidos codificada por el mismo en la SEQ ID NO: 4. La proteína
codificada comprende un dominio citoplásmico
N-terminal (aminoácidos 1-18), una
región transmembrana (aminoácidos 19-38), y un
dominio extracelular (aminoácidos 39-101).
El ADN de la SEQ ID NO: 3 carece de los
nucleótidos 359 a 506 del ADN de la SEQ ID NO: 1, y por tanto se
designa como el clon de variante de deleción de TRAIL humana
(huTRAILdv). La deleción provoca un desplazamiento en el marco de
lectura, lo que da como resultado un codón de terminación dentro del
marco tras el aminoácido 101 de la SEQ ID NO: 4. Por tanto, el ADN
de la SEQ ID NO: 3 codifica para una proteína truncada. Los
aminoácidos 1 a 90 de la SEQ ID NO: 2 son idénticos a los
aminoácidos 1 a 90 de la SEQ ID NO: 4. Sin embargo, debido a la
deleción, la parte C-terminal de la proteína
huTRAILdv (aminoácidos 91 a 101 de la SEQ ID NO: 4) difiere de los
residuos en las posiciones correspondientes en la SEQ ID NO:2.
La proteína huTRAILdv carece de las regiones
conservadas descritas anteriormente encontradas en el extremo
C-terminal de los miembros de la familia de TNF de
proteínas. El no poder provocar la muerte apoptótica de las células
Jurkat por parte de esta proteína huTRAILdv confirma además la
importancia de estas regiones conservadas para la actividad
biológica.
Se aisló el ADN que codifica para un TRAIL murino
mediante el siguiente procedimiento. Se preparó una biblioteca de
ADNc que comprendía ADNc derivado del la línea celular T de ratón
7B9 en el vector \lambdaZAP tal como se describe por Mosley et
al. (Cell 59:335, 1989). Se transfirió ADN de la
biblioteca sobre filtros de nitrocelulosa mediante técnicas
convencionales.
Se utilizaron sondas de ADN de TRAIL humano para
identificar ADNc de ratón de hibridación sobre los filtros. Se
utilizaron dos sondas separadas, en dos vueltas de examen. Se
emplearon productos de reacción de PCR de aproximadamente 400 pb de
longitud, aislados y amplificados utilizando el ADN de TRAIL humano
como modelo, como sonda en la primera vuelta de examen. Estos
productos de PCR consistían en un fragmento de la región
codificadora de TRAIL humano. La sonda utilizada en la segunda
vuelta del examen consistía en la región codificadora entera del
ADN de TRAIL humano de la SEQ ID NO: 1. Se utilizó un kit de
marcación de ADN cebado aleatorio (Stratagene, La Jolla, CA) para
radiomarcar las sondas.
Se llevó a cabo la hibridación a 37ºC en
formamida al 50%, seguido de lavado con 1 x SSC, SDS al 0,1% a 50ºC.
Se aisló un ADNc de ratón que dio positivo en ambas vueltas de
examen.
Se presenta la secuencia de nucleótidos de este
ADN en la SEQ ID NO: 5 y se presenta la secuencia de aminoácidos
codificados por el mismo en la SEQ ID NO: 6. La proteína codificada
comprende un dominio citoplásmico N-terminal
(aminoácidos 1-17), una región transmembrana
(aminoácidos 18-38), y un dominio extracelular
(aminoácidos 39-291). Este TRAIL de ratón es
idéntico en un 64% a TRAIL humano de la SEQ ID NO: 2, a nivel de
aminoácidos. La región codificadora de la secuencia de nucleótidos
de TRAIL de ratón es idéntica en un 75% a la región codificadora de
la secuencia de nucleótidos humana de la SEQ ID NO: 1.
Este ejemplo ilustra la preparación de
anticuerpos monoclonales que se unen específicamente a TRAIL.
Inmunógenos adecuados que pueden emplearse para generar tales
anticuerpos incluyen, pero no se limitan a, la proteína TRAIL
purificada o un fragmento inmunogénico de la misma (por ejemplo, el
dominio extracelular), proteínas de fusión que contienen
polipéptidos de TRAIL (por ejemplo, proteínas de fusión solubles
TRAIL/Fc), y células que expresan TRAIL recombinante sobre la
superficie celular.
Técnicas conocidas para producir anticuerpos
monoclonales incluyen aquellas descritas en la patente de los EE.UU
4.411.993. Resumidamente, se inmunizan ratones con TRAIL como
inmunógeno emulsificado en adyuvante de Freund completo, e
inyectado en cantidades que oscilan desde 10-100
\mug por vía subcutánea o intraperitoneal. Diez o doce días
después, se reforzaron los animales inmunizados con TRAIL adicional
emulsificado en adyuvante de Freund incompleto. Se refuerza a los
ratones periódicamente a partir de ese momento con un programa de
inmunización semanal o bisemanal. Se toman muestras de suero
periódicamente mediante hemorragia retroorbital o escisión de la
punta de la cola para análisis mediante ensayo de transferencia en
mancha o ELISA (enzyme-linked
immuno-sorbent assay - ensayo de inmunoabsorción
unido a enzimas) de anticuerpos contra TRAIL.
Siguiendo a la detección de un título de
anticuerpo apropiado, se proporciona a los animales que dan positivo
una última inyección intravenosa de TRAIL en solución salina. Tres
o cuatro días después, se sacrifica a los animales, se recogen
células del bazo, y se fusionan células del bazo con una línea
celular de mieloma murina tal como NS1 o, preferiblemente, P3x63Ag
8.653 (ATCC CRL 1580). Las fusiones generan células de hibridoma,
que se colocan en múltiples placas de microvaloración en un medio
HAT (hipoxantina, aminopterina y timidina) selectivo para inhibir
la proliferación de células no fusionadas, híbridos de mieloma e
híbridos de células del bazo.
Se examina la reactividad frente a TRAIL
purificada de las células de hibridoma mediante ELISA mediante
adaptaciones de las técnicas descritas por Engvall et al.
(Immunochem. 8:871, 1971) y en la patente de los EE.UU.
4.703.004. Pueden inyectarse las células de hibridoma positivas por
vía intraperitoneal en ratones BALB/c singénicos para producir
ascitis que contiene concentraciones elevadas de anticuerpos
monoclonales anti-TRAIL. Alternativamente, pueden
hacerse crecer las células de hibridoma in vitro en frascos o
frascos rotativos mediante diversas técnicas. Pueden purificarse
los anticuerpos monoclonales producidos en ascitis de ratón mediante
precipitación con sulfato de amonio, seguida de cromatografía de
exclusión en gel. Alternativamente, puede utilizarse cromatografía
de afinidad basada en la unión del anticuerpo a la proteína A o la
proteína G, así como la cromatografía de afinidad basada en la
unión a TRAIL.
Se expresó TRAIL humano y se probó su capacidad
para inducir apoptosis. Se sintetizaron oligonucleótidos que
correspondían a los extremos 3' y 5' de la región codificadora del
gen de TRAIL humano, con sitios de restricción SalI y NotI
incorporados en los extremos de los oligonucleótidos. Se amplificó
la región codificadora del gen de TRAIL humano mediante técnicas de
PCR habituales, utilizando estos oligonucleótidos como cebadores.
Se digirieron los productos de reacción de PCR con las endonucleasas
de restricción SalI y NotI, luego se insertaron en un vector
digerido con SalI/NotI pDC409. pDC409 es un vector de expresión para
uso en células de mamíferos, pero también puede replicarse en
células E. coli.
pDC409 se deriva de un vector de expresión
designado como pDC406 (descrito por McMahan et al. EMBO
J. 10:2821, 1991, y en la solicitud PCT WO 91/18982,
incorporados como referencia al presente documento). pDC406
contiene orígenes de replicación derivados de SV40, virus
Epstein-Barr y pBR322, y es un derivado de
HAV-EO descrito por Dower et al. J.
Immunol. 142:4314 (1989). pDC406 difiere de
HAV-EO por la deleción de un intrón presente en la
secuencia líder triparental de adenovirus 2 en
HAV-EO. Se transcribe y traduce el ADN insertado en
un sitio de clonación múltiple (que contiene varios sitios de
escisión de endonucleasa de restricción) utilizando elementos
reguladores derivados de VIH y adenovirus. El vector contiene
también un gen que confiere resistencia a la ampicilina.
pDC409 difiere de pDC406 en que se ha suprimido
un sitio Bgl II fuera del mcs (sitio de clonación múltiple) de
manera que el sitio Bgl II en el mcs es el único. Se han añadido dos
sitios Pme 1 y un sitio Srf 1 al mcs, y se han posicionado tres
codones de terminación (TAG) en el sentido de 3' del mcs para
funcionar en los tres marcos de lectura. Se ha añadido un
cebador/promotor T7 para ayudar en el procedimiento de secuenciación
del ADN.
Se derivó la línea celular de riñón de mono
CV-1/EBNA-1 (ATCC CRL 10478)
mediante transfección de la línea celular CV-1
(ATCC CCL 70) con un gen que codifica para
antígeno-1 nuclear del virus
Epstein-Barr (EBNA-1) que expresa
constitutivamente EBNA-1 llevado desde el
potenciador/promotor intermedio temprano del CMV (citomegalovirus)
humano, tal como describe McMahan et al., anteriormente. El
gen del EBNA-1 permite una replicación episomal de
vectores de expresión, tales como pDC409, que contienen el origen
EBV (virus Epstein-Barr) de replicación.
Se transfectaron las células CV1/EBNA dejadas
crecer en frascos T175 con 15 \mug o bien de pDC409 "vacío" o
bien pDC409 que contiene la región que codifica para TRAIL humano.
Se cultivaron las células transformadas durante tres días a 37ºC y
CO_{2} al 10%. Entonces se lavaron las células con PBS, se
incubaron durante 20 minutos a 37ºC en EDTA 50 mM, se rasparon del
frasco con un raspador de células, y se lavaron una vez con PBS. A
continuación, se fijaron las células en PBS con paraformaldehído al
1% durante 10 minutos a 4ºC, y se lavaron 3 veces con PBS.
Se utilizaron células Jurkat como células diana
en este ensayo, para determinar si las células que expresan TRAIL
podrían inducir apoptosis en las mismas. La línea celular Jurkat,
clon E6-1, es una línea celular de leucemia de
células T aguda humana disponible de la Colección Americana de
Cultivos Tipo bajo el número de registro ATCC TIB 152, y descrita
por Weiss et al. (J. Immunol.
133:123-128, 1984). Se cultivaron las células
Jurkat en medio RPMI complementado con suero bovino fetal al 10% y
10 \mug/ml de estreptomicina y penicilina hasta una densidad de
200.000 a 500.000 células por ml. Se cultivaron conjuntamente cuatro
millones de estas células por pocillo en una placa de 6 pocillos
con 2,5 ml de medio con diversas combinaciones de células fijadas,
sobrenadantes de células transfectadas con ligando Fas, y diversos
anticuerpos, tal como se indica a continuación.
Tras cuatro horas, se lavaron las células una vez
con PBS y se sedimentaron a 1.200 rpm durante 5 minutos en una
centrifugadora de mesa. Se resuspendieron los sedimentos y se
incubaron durante diez minutos a 4ºC en 500 \mul de tampón que
consistía en Tris-HCl 10 mM, EDTA 10 mM, pH 7,5, y
Tritón X-100 al 0,2%, que lisa las células pero
deja los núcleos intactos. Entonces se centrifugó el lisado a 4ºC
durante diez minutos en una micro-centrífuga a
14.000 rpm. Se retiraron los sobrenadantes y se extrajo tres veces
con 1 ml de 25:24:1 fenol - cloroformo - alcohol isoamílico,
seguido de precipitación con NaOAC y etanol en presencia de 1 \mug
de vehículo glucógeno (Sigma).
Se volvieron a suspender los sedimentos
resultantes en Tris-HCl 10 mM, EDTA 10 mM, pH 7,5, y
se incubaron con 10 \mug/ml de RNasa A a 37ºC durante 20 minutos.
Entonces se resolvieron las soluciones de ADN mediante
electroforesis en gel de agarosa al 1,5% en tampón de
Tris-borato-EDTA, tintadas con
bromuro de etidio y fotografiadas mientras se
trans-iluminaban con luz UV.
Los resultados fueron los siguientes. Las células
CV1/EBNA transfectadas tanto con pDC409 como con
pDC409-TRAIL no produjeron desarrollo escalonado
del ADN detectable. Las células fijadas a
pDC409-TRAIL cultivadas conjuntamente con células
Jurkat produjeron desarrollo escalonado del ADN, pero las células
fijadas a pDC409 cultivadas conjuntamente con células Jurkat
no.
También se observó desarrollo escalonado del ADN
cuando se cultivaron conjuntamente las células Jurkat con
sobrenadantes concentrados a partir de células COS transfectadas con
ADN que codifica para ligando Fas humano en pDC409. Se cree que los
sobrenadantes contienen ligando Fas soluble que se libera
proteolíticamente de la superficie celular. El desarrollo
escalonado del ADN inducido por el ligando Fas pudo bloquearse
añadiendo 10 \mug/ml de un anticuerpo monoclonal bloqueante
soluble dirigido contra Fas. Este mismo anticuerpo no pudo inhibir
el desarrollo escalonado de ADN Jurkat por las células
pDC409-TRAIL, lo que indica que TRAIL no induce la
apoptosis a través de Fas.
En el mismo procedimiento de ensayo, células
CV1/EBNA fijadas transfectadas con pDC409-TRAIL
indujeron el desarrollo escalonado del ADN en células U937. U937
(ATCC CRL 1593) es una línea celular de linfoma histiocítico
humano. La razón de efector con respecto a células diana era de 1:4
(la misma que en el ensayo con células diana Jurkat).
La fragmentación de ADN celular en un motivo
conocido como desarrollo escalonado del ADN es distintiva de la
apoptosis. En el ensayo precedente, TRAIL indujo la apoptosis de una
línea celular de leucemia y una línea celular de linfoma.
Se analizó la expresión de TRAIL en varios tipos
de tejidos diferentes con un procedimiento de northern blot
convencional. Se obtuvieron northern blot que contenían ARN poli A+
a partir de una variedad de tejidos de seres humanos adultos
(northern blot de tejido múltiple I y II) de Clonetech (Palo Alto,
CA). Se prepararon otras transferencias mediante la resolución de
muestras de ARN sobre un gel de agarosa-formaldehído
al 1,1%, transfiriendo sobre Hybond-N tal como
recomienda el fabricante (Amersham Corporation), y tintándolas con
azul de metileno para monitorizar las concentraciones de ARN. Se
detectaron las transferencias con una ribosonda de ARN antisentido
que correspondía a la región codificadora entera de TRAIL
humano.
Se detectó ARN de TRAIL humano en linfocitos de
sangre periférica, colón, intestino delgado, ovario, próstata,
timo, bazo, placenta, pulmón, riñón, corazón, páncreas, y músculo
esquelético. Se encontró que los transcriptos de TRAIL eran
abundantes en la línea celular de linfoma anaplástico de células
grandes Karpas 299 (Fischer et al. Blood, 72:234,
1988) y en células T amigdalinas. El mensaje de TRAIL estaba
presente en menor grado en la línea celular de linfoma Burkitt
designada Raji.
No se detectó ARNm de TRAIL en testículos,
cerebro, o hígado, o en varias líneas celulares T. Se detectaron
pocos o ningún transcripto de TRAIL en células T de sangre
periférica recién aislada (PBT), o bien estimuladas o bien no
estimuladas con PMA e ionóforo de calcio durante 20 horas.
Se preparó un polipéptido de TRAIL humano soluble
que comprendía los aminoácidos 95 a 281 de la SEQ ID NO: 2 tal como
sigue. Este polipéptido es un fragmento del dominio extracelular,
que carece de la región espaciadora tratada anteriormente.
Se construyó un vector de expresión que
codificaba para TRAIL humano soluble mediante la fusión de ADN
dentro del marco que codifica para las siguientes secuencias de
aminoácidos (enumeradas desde el extremo terminal N- hasta el C-):
una secuencia líder derivada a partir de citomegalovirus (CMV)
humano, un epítopo sintético designado Flag®, y los aminoácidos
95-281 de TRAIL humano. El octapéptido Flag® (SEQ ID
NO: 7) facilita la purificación de proteínas fusionadas al mismo,
tal como se describe anteriormente por Hopp et al.
(Biotechnology 6:1204-1210, 1988).
Se aisló el fragmento de ADN que codifica para
TRAIL y se amplificó mediante reacción en cadena de la polimerasa
(PCR), utilizando cebadores de oligonucleótidos que definían los
términos de un fragmento de ADN que codificaba para los aminoácidos
95-281 de la SEQ ID NO: 2. El cebador 3' fue un
31-mero que añadía adicionalmente un sitio NotI en
el sentido de 3' de la secuencia que codificaba para TRAIL. El
cebador 5' añadió un sitio SpeI y una secuencia que codificaba para
el epítopo Flag® en el sentido 5' de la secuencia que codificaba
para TRAIL. Se llevó a cabo una PCR mediante procedimientos
convencionales, utilizando el ADNc de TRAIL humano descrito
anteriormente como modelo.
Se digirieron los productos de reacción con SpeI
y NotI, y se insertaron en el vector de expresión pDC409 (descrito
en el ejemplo 5), que se había escindido con SalI y NotI. También se
ligaron al vector oligonucleótidos hibridados que forman un
fragmento SalI-SpeI que codifica para un líder de
marco de lectura abierto de CMV. Se presenta la secuencia de
aminoácidos del líder derivado de CMV como SEQ ID NO: 9. Los
aminoácidos 1 a 29 de la SEQ ID NO: 9 se codifican por ADN de CMV,
mientras que los aminoácidos 30 a 32 se codifican por los
oligonucleótidos empleados en la construcción del vector. Se
transfectaron células de E. coli con la mezcla de
ligamiento, y se aisló el vector de expresión recombinante deseado a
partir de las mismas.
Se transfectaron células de
CV1-EBNA (ATCC CRL 10478; descritas en el ejemplo 5)
con el vector recombinante, que se designa
pDC409-Flag-shTRAIL, y se hicieron
crecer para permitir la expresión y secreción del polipéptido
Flag®-TRAIL soluble. Se recogieron los sobrenadantes del cultivo 3
días después de la transfección y se aplicaron a una columna que
contenía un anticuerpo anti-Flag® designado M2
inmovilizado sobre un soporte sólido. Entonces se lavó la columna
con PBS. El anticuerpo M2 monoclonal se describe por Hopp et
al. anteriormente, y está disponible de Kodak Scientific
Imaging Systems, New Haven, Connecticut. Se eluyeron fracciones de
800 \mul de la columna con citrato 50 mM, y se neutralizaron
inmediatamente en 0,45 ml de Tris 1 M (pH 8). Se ajustaron las
fracciones a glicerol al 10% y se almacenaron a -20ºC hasta que se
necesitaron.
Este TRAIL humano/Flag® recombinante soluble
expresado en células CV1/EBNA tiene un peso molecular aparente de
28 kD cuando se analiza mediante electroforesis de gel de
poliacrilamida - SDS (SDS - PAGE). El resto Flag® contribuye con
unos 880 daltones de manera estimada al peso molecular total. El
análisis por filtración en gel de Flag®/TRAIL soluble purificado
sugiere que la molécula es multimérica en solución con un tamaño de
\sim80kD. Aunque no se desea limitarse por la teoría, el análisis
por filtración en gel sugiere que el TRAIL humano/Flag®
recombinante soluble formó de manera natural una combinación de
dímeros y trímeros, predominando los trímeros.
Se construyó un vector de expresión designado
pDC409 - Flag - smTRAIL, que codifica para un CMV líder
- Flag® - proteína TRAIL murina soluble, mediante procedimientos análogos. Se aisló un fragmento de ADN que codificaba para un polipéptido de TRAIL murino soluble y se amplificó mediante PCR. Se emplearon oligonucleótidos que definían los términos de ADN que codifica para los aminoácidos 99 a 291 de la secuencia de TRAIL murina de la SEQ ID NO: 6 como los cebadores 5' y 3' de la PCR.
- Flag® - proteína TRAIL murina soluble, mediante procedimientos análogos. Se aisló un fragmento de ADN que codificaba para un polipéptido de TRAIL murino soluble y se amplificó mediante PCR. Se emplearon oligonucleótidos que definían los términos de ADN que codifica para los aminoácidos 99 a 291 de la secuencia de TRAIL murina de la SEQ ID NO: 6 como los cebadores 5' y 3' de la PCR.
En el ejemplo 5, las células que expresaban TRAIL
humano inducían la apoptosis de células Jurkat (una línea celular
de leucemia). En el siguiente estudio, un polipéptido de TRAIL
humano soluble destruyó células Jurkat.
Se hicieron crecer células Jurkat hasta una
densidad de 200.000 a 500.000 células por ml en medio RPMI
complementado con suero bovino fetal al 10%, estreptomicina 100
\mug/ml, y penicilina 100 \mug/ml. Se incubaron las células (en
placas de 96 pocillos con 50.000 células por pocillo en un volumen
de 100 \mul) durante veinte horas con los reactivos indicados en
la figura 1. "sobre. TRAIL" se refiere a sobrenadante
condicionado (10 \mul por pocillo) a partir de células CV1/EBNA
transfectadas con pDC409 - Flag - shTRAIL (véase ejemplo 7).
"sobre. control" se refiere a sobrenadante a partir de células
CV1/EBNA transfectadas con vector vacío. En los que se indique, se
añadió anticuerpo anti-Flag® inmovilizado M2
("Inm. M2") con una concentración de 10 \mug/ml en un volumen
de 100 \mul por pocillo y se dejó adherir o bien durante la noche
a 4ºC o bien durante 2 horas a 37ºC, tras lo cual se aspiraron los
pocillos y se lavaron dos veces con PBS para retirar anticuerpo no
unido. Se incluyeron células Jurkat tratadas con ligando Fas o M3,
un anticuerpo monoclonal bloqueante dirigido contra Fas, (Alderson
et al. J. Exp. Med., 181:71, 1995; y solicitud PCT WO
95/10540) en el ensayo tal como se indica.
Se evaluó la actividad metabólica de las células
así tratadas mediante conversión metabólica de tinte azul alamar,
en el siguiente procedimiento. Se midió la conversión de azul alamar
mediante la adición de 10 \mul de tinte azul alamar (Biosource
International, Camarillo, CA) por pocillo, y la sustracción de la
densidad óptica (DO) a 550-600 nm en el momento en
el que se añadió el tinte de la DO a 550-600 nm tras
cuatro horas. No se traza ninguna conversión de tinte como 0 por
ciento de viabilidad, y se traza el nivel de conversión de tinte en
ausencia de TRAIL como 100 por ciento de viabilidad. Se calculó el
porcentaje de viabilidad mediante la multiplicación de la razón de
tinción de cultivos experimental frente a control por 100.
Los resultados se representan en la figura 1. Las
barras de error representan la desviación estándar de las medidas
de cuatro pocillos independientes, y los valores son la media de
estas medidas.
El sobrenadante que contenía TRAIL provocó una
reducción significativa de la viabilidad de las células Jurkat. Una
reducción superior de la viabilidad celular resultó a partir del
contacto con una combinación de sobrenadante que contenía TRAIL y
anticuerpo anti-Flag® inmovilizado M2.Una posible
explicación es que M2 facilita la reticulación de los complejos
Flag®/receptor de TRAIL, incrementando así la fuerza de la
señalización.
El ligando Fas demostró poder destruir células
Jurkat. El anticuerpo anti-Fas M3 inhibió la
actividad del ligando Fas, pero no la actividad de TRAIL.
Con el fin de confirmar que los cambios en la
conversión de tinte en el ensayo de azul alamar se debían a muerte
celular, se confirmó la disminución de la viabilidad celular
inducida por TRAIL mediante la tinción de las células con azul
trípano.
En los ejemplos 5 y 8, TRAIL indujo la apoptosis
de una línea celular de leucemia (Jurkat) y una línea celular de
linfoma (U937). El siguiente estudio demuestra además que TRAIL
puede destruir células de leucemia y de
linfoma.
linfoma.
Se hicieron crecer las líneas celulares humanas
indicadas en la tabla I hasta una densidad de 200.000 a 500.000
células por ml en medio RPMI complementado con suero bovino fetal al
10%, estreptomicina 100 \mug/ml, y penicilina 100 \mug/ml. Se
incubaron las células (en placas de 96 pocillos con 50.000 células
por pocillo en un volumen de 100 \mul) durante veinte horas con
sobrenadantes condicionados (10 \mul por pocillo) a partir de
células CV1/EBNA transfectadas con pDC409 - Flag - shTRAIL.
Se evaluó la actividad metabólica mediante
conversión de tinte azul alamar, con el procedimiento de ensayo
descrito en el ejemplo 8. Los resultados se presentan en la tabla
I.
Con el fin de confirmar que los cambios en la
conversión de tinte en el ensayo de azul alamar se debían a muerte
celular, se confirmó la disminución de la viabilidad celular
inducida por TRAIL mediante la tinción de las células con azul
trípano. La tinción violeta cristal, realizada tal como se describe
por Flick y Gifford (J. Immunol. Methods
68:167-175, 1984), también confirmó los resultados
observados en el ensayo de azul alamar. Se confirmó la naturaleza
apoptótica de la muerte celular mediante tinción con azul trípano y
la visualización de la fragmentación apoptótica mediante
microscopía.
Tal como se muestra en la tabla I, muchas líneas
celulares cancerosas eran sensibles a la destrucción mediada por
TRAIL. La susceptibilidad de tipos de células adicionales a la
apoptosis mediada por TRAIL puede determinarse utilizando los
procedimientos de ensayo descritos en esta sección de ejemplos.
TRAIL no mostró ningún efecto citotóxico
significativo sobre las líneas celulares THP-1,
K562, Karpas 299, y MP-1. Se estableció K299,
también conocida como Karpas 299, (DSM-ACC31) a
partir de sangre periférica de un varón diagnosticado con un grado
elevado de linfoma anaplástico de células grandes (Fischer et
al. Blood, 72:234, 1988). MP-1 es una
línea celular B transformada por EBV derivada espontáneamente
(Goodwin et al., Cell, 73:447, 1993). Aunque no se
desea limitarse por la teoría, es posible que estas cuatro líneas
celulares no expresen un receptor para TRAIL, o se caractericen por
una regulación por incremento de un gen que inhibe la
apoptosis.
\vskip1.000000\baselineskip
Línea celular | Descripción | Porcentaje de viabilidad^{a} |
Bjab | Linfoma Burkitt | 0,5 \pm 3,8 |
Ramos | Linfoma Burkitt | 12,1 \pm 2,1 |
U937 | Linfoma histiocítico | 25,2 \pm 8,2 |
HL60 | Leucemia promielocítica | 59,5 \pm 3,2 |
Raji | Linfoma Burkitt | 64,9 \pm 4,5 |
Daudi | Linfoma Burkitt | 70,2 \pm 4,2 |
THP-1 | Línea celular monocítica | 92,3 \pm 6,8 |
K562 | Leucemia mielógena crónica | 97,1 \pm 4,8 |
K299 | Linfoma anaplástico de células grandes | 99,0 \pm 4,3 |
MP-1 | Línea celular B espontánea | 104,9 \pm 11,7 |
^{a} Los resultados son medias \pm EEM de 4 pocillos para cada punto de datos |
Se probó la reactividad cruzada entre especies de
TRAIL humano y murino tal como sigue. Se incubó TRAIL humano y
murino con la línea celular de melanoma humano A375 (ATCC CRL 1619).
Ya que esta es una línea celular adherente, se utilizó un ensayo de
violeta cristal, en vez de azul alamar, para determinar la
viabilidad celular. Se hicieron crecer las células A375 en DMEM
complementado con suero bovino fetal al 10%, estreptomicina 100
\mug/ml, y penicilina 100 \mug/ml. Se incubaron las células (en
placas de 96 pocillos con 10.000 células por pocillo en un volumen
de 100 \mul) durante 72 horas con el TRAIL murino soluble descrito
en el ejemplo 7. Se realizó tinción con violeta cristal tal como se
describe por Flick y Gifford (J. Immunol. Methods
68:167-175, 1984). Los resultados demostraron que
el TRAIL tanto humano como murino era activo en estas células
humanas, ya que el TRAIL humano y murino destruía células A375.
Se probó si el TRAIL humano podía actuar sobre
células murinas, utilizando la línea celular de fibroblastos murina
L929. La incubación de células L929 con TRAIL o bien humano o bien
murino dio como resultado una disminución en la tinción con violeta
cristal, demostrando por tanto que el TRAIL humano y murino son
activos sobre (la apoptosis inducida de) células murinas. Además de
violeta cristal, se confirmó la muerte celular mediante tinción con
azul trípano.
El siguiente experimento demuestra que el Flag®
soluble - proteína TRAIL humana preparado en el ejemplo 7 tiene un
efecto citotóxico sobre células infectadas por virus.
Se hicieron crecer fibroblastos gingivales
humanos normales hasta confluencia sobre placas de 24 pocillos en
CO_{2} al 10% y medio DMEM complementado con suero bovino fetal al
10%, estreptomicina 100 \mug/ml, y penicilina 100 \mug/ml. Se
trataron las muestras de los fibroblastos tal como se indica en la
figura 2. Las concentraciones de citocinas fueron de 10 ng/ml para
\gamma-interferón y de 30 ng/ml para Flag® soluble
- TRAIL humana. Todas las muestras que recibieron TRAIL también
recibieron un exceso del doble en peso de anticuerpo
anti-Flag® M2 (descrito anteriormente), que
potencia la actividad de TRAIL (presumiblemente mediante
reticulación).
El tratamiento previo de las células con las
citocinas indicadas fue de 20 horas. Para infectar células por
citomegalovirus (CMV), se aspiraron los medios de cultivo y se
infectaron las células por CMV en DMEM con una MDI (multiplicidad
de infección) aproximada de 5. Tras dos horas se sustituyó el medio
que contenía virus por DMEM y se añadieron citocinas tal como se
indica. Tras 24 horas, se tiñeron las células con tinte violeta
cristal tal como se describe (Flick y Gifford, 1984, anteriormente).
Se lavaron dos veces las células teñidas con agua, se rompieron en
200 \mul de desoxicolato de sodio al 2%, se diluyeron 5 veces en
agua, y se tomó la DO a 570 nm. Se calculó el porcentaje de tinción
máxima mediante la normalización de las DO con la muestra que
mostró la tinción superior. Se obtuvieron resultados similares a
partir de varios experimentos independientes.
Los resultados presentados en la figura 2
demuestran que TRAIL destruía específicamente fibroblastos
infectados por CMV. Esta muerte celular se potenciaba por el
tratamiento previo de las células con
\gamma-interferón. No resultó ninguna muerte
significativa de fibroblastos no infectados por virus del contacto
con TRAIL.
Pueden identificarse anticuerpos bloqueantes
dirigidos contra TRAIL mediante la prueba de anticuerpos para
determinar si pueden inhibir una actividad biológica particular de
TRAIL. En el siguiente ensayo, se probó un anticuerpo monoclonal
para determinar si podía inhibir la apoptosis mediada por TRAIL de
células Jurkat. La línea celular Jurkat se describe en el ejemplo
5.
Se empleó una línea celular de hibridoma que
produce un anticuerpo monoclonal cultivado contra proteína de
fusión soluble TRAIL humana/Flag® en este ensayo. Se incubaron
sobrenadantes de los cultivos de hibridoma con Flag®/TRAIL humano
soluble 20 ng/ml reticulado con anticuerpo monoclonal
anti-Flag® M2 40 ng/ml, en medio RPMI completo en
una placa de microvaloración de 96 pocillos. Se añadió una cantidad
equivalente de medio de cultivo de hibridoma nuevo a los cultivos
de control. La proteína de fusión soluble TRAIL humana/Flag® y el
anticuerpo monoclonal designado M2 se describen en el ejemplo 7.
Se empleó el sobrenadante del hibridoma con una
dilución de 1:50 (v/v) (concentración inicial), y con diluciones en
serie dobles de la misma. Tras incubar a 37ºC, con CO_{2} al 10%,
durante 30 minutos, se añadieron 50.000 células Jurkat por pocillo,
y se continuó la incubación durante 20 horas.
Entonces se evaluó la viabilidad celular midiendo
la conversión metabólica de tinte de azul alamar. Se describe un
procedimiento de ensayo de conversión de azul alamar en el ejemplo
8. Se encontró que el anticuerpo monoclonal inhibía la apoptosis de
células Jurkat inducida por Flag®/TRAIL humano soluble.
Se trataron células endoteliales microvasculares
humanas de origen dérmico durante 16-18 horas con
plasma de pacientes con púrpura trombocitopénica trombótica (PTT) o
con plasma de control, o bien solas o bien en presencia de
antisuero policlonal anti-TRAIL. Se empleó una
dilución de 1:2.000 del antisuero. El plasma era de pacientes con
PTT, designados número 1 y número 2 a continuación. Las células
empleadas en los ensayos eran MVEC-1 (HMVEC 2753,
compradas de Clonetics, San Diego, CA) y MVEC-2
(DHMVEC 30282, compradas de Cell Systems, Kirkland, WA). Los
cultivos de estas células pueden mantenerse tal como se describe por
Laurence et al. (Blood, 87:3245,
1996).
1996).
Los resultados fueron tal como sigue. Los datos
mostrados son de histogramas de ADN de células teñidas con yoduro
de propidio, y "pico A_{0}" representa el pico apoptótico
(véase Oyaizu et al., Blood, 82:3392, 1993; Nicoletti
et al., J. Immunol. Methods, 139:271, 1991; y Laurence
et al., Blood, 75:696, 1990).
\newpage
CE microvasculares | Plasma (al 1%) | Anticuerpo | % del pico A_{0} | |
Experimento 1 | ||||
MVEC-1 dérmica | control | - | 0 | |
MVEC-1 dérmica | PTT (nº 1) | - | 19,5 | |
MVEC-1 dérmica | PTT (nº 1) | + | 0,3 | |
Experimento 2 | ||||
MVEC-2 dérmica | control | - | 0 | |
MVEC-2 dérmica | PTT (nº 2) | - | 20,0 | |
MVEC-2 dérmica | PTT (nº 2) | Control Ab | 13,1 | |
MVEC-2 dérmica | PTT (nº 2) | + | 0,2 | |
Experimento 3 | ||||
MVEC-1 dérmica | PTT (nº 1) | - | 50,1 | |
MVEC-1 dérmica | PTT (nº 1) | + | 10,6 | |
Experimento 4 | ||||
MVEC-2 dérmica | control | - | 0 | |
MVEC-2 dérmica | PTT (nº 1) | - | 13,9 | |
MVEC-2 dérmica | PTT (nº 1) | Control Ab | 14,1 | |
MVEC-2 dérmica | PTT (nº 1) | + | 0,6 |
Los datos revelan que el plasma derivado de
pacientes con PTT induce la apoptosis de células endoteliales
microvasculares de origen dérmico. Esta apoptosis se inhibió
mediante anticuerpos policlonales dirigidos contra TRAIL.
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Immunex Corporation.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TITULO DE LA INVENCIÓN: Citocina Que Induce Apoptosis
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 9
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Kathryn A. Anderson, Immunex Corporation
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 51 University Street
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Seattle
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: WA
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 98101
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE EN ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: Apple Macintosh
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: Apple 7.5.2
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: Microsoft Word, versión 6.0.1
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS ACTUALES DE LA SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: -falta por asignar-
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 25 de junio de 1996
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE SOLICITUD ANTERIORES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: US 08/496.632
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 29 de junio de 1995
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE SOLICITUD ANTERIORES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: US 08/548.368
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 1 de noviembre de 1995
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL ABOGADO / AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Anderson, Kathryn A.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 32.172
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA / EXPEDIENTE: 2835 - WO
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN SOBRE COMUNICACIONES TELEFÓNICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: (206) 587-0430
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FAX: (206) 233-0644
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TELEX: 756822
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:
1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1751 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc a ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: huAIC
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE / CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 88..933
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:
2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 281 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:
3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1521 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc a ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: HuAIC-dv
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE / CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 78..383
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:
4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 101 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:
5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1366 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc a ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: MuAIC
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE / CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 47..919
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:
6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 291 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:
7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 8 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: no relevante
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: no relevante
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: péptido FLAG
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:
8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: no relevante
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: no relevante
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: péptido conservado
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Val Val Xaa Xaa Xaa Gly Leu Tyr Tyr Val
Tyr Xaa Gln Val Xaa}
\sac{Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:
9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: no relevante
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: no relevante
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: líder de CMV
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Ala Arg Arg Leu Trp Ile Leu Ser Leu Leu
Ala Val Thr Leu Thr}
\sac{Val Ala Leu Ala Ala Pro Ser Gln Lys Ser Lys
Arg Arg Thr Ser Ser}
Claims (36)
1. ADN aislado que codifica para un polipéptido
de TRAIL, en el que dicho polipéptido de TRAIL comprende una
secuencia de aminoácidos que es idéntica al menos en un 80% a una
secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en los
aminoácidos 1 a 281 de la SEQ. ID NO: 2 y los aminoácidos 1 a 291 de
la SEQ. ID NO: 6, en los que dicho polipéptido de TRAIL puede
inducir la apoptosis de células Jurkat.
2. ADN aislado según la reivindicación 1, en el
que dicho polipéptido de TRAIL comprende una secuencia de
aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en los aminoácidos 1
a 281 de la SEQ. ID NO: 2 y los aminoácidos 1 a 291 de la SEQ. ID
NO: 6.
3. ADN aislado que codifica para un polipéptido
de TRAIL soluble, en el que dicho polipéptido de TRAIL soluble
comprende una secuencia de aminoácidos que es idéntica al menos en
un 80% a una secuencia seleccionada de:
- (a)
- el dominio extracelular de la proteína TRAIL humana de la SEQ. ID NO: 2;
- (b)
- el dominio extracelular de la proteína TRAIL murina de la SEQ. ID NO: 6;
- (c)
- un fragmento del dominio extracelular de (a) o (b) en el que el fragmento puede inducir la apoptosis de células Jurkat;
en el que dicho polipéptido TRAIL
soluble puede inducir la apoptosis de células
Jurkat.
4. ADN según la reivindicación 3, en el que dicho
polipéptido de TRAIL soluble comprende una secuencia de aminoácidos
seleccionada del grupo que consiste en:
- (a)
- el dominio extracelular de TRAIL humano (aminoácidos 39 a 281 de la SEQ. ID NO: 2); y
- (b)
- un fragmento de dicho dominio extracelular, en el que dicho fragmento puede inducir la apoptosis de células Jurkat.
5. ADN según la reivindicación 4, en el que dicho
polipéptido de TRAIL soluble comprende la secuencia de aminoácidos
x a 281 de la SEQ. ID NO: 2, en la que x representa número entero de
desde 39 hasta 95.
6. ADN según la reivindicación 5, en el que dicho
polipéptido de TRAIL soluble comprende la secuencia de aminoácidos
95 a 281 de la SEQ. ID NO: 2.
7. ADN según la reivindicación 3, en el que dicho
polipéptido de TRAIL soluble comprende una(s)
sustitución(ones) conservativa(s) en una secuencia de
aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en:
- (a)
- el dominio extracelular de TRAIL humano (aminoácidos 39 a 281 de la SEQ. ID NO: 2), en el que el dominio extracelular puede inducir la apoptosis de células Jurkat; y
- (b)
- un fragmento de dicho dominio extracelular, en el que el fragmento puede inducir la apoptosis de células Jurkat
en el que TRAIL sustituido de
manera conservativa puede inducir la apoptosis de células
Jurkat.
8. Vector de expresión que comprende un ADN según
una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7.
9. Procedimiento para la preparación de un
polipéptido de TRAIL, que comprende cultivar una célula huésped
transformada con un vector según la reivindicación 8 en condiciones
que promueven la expresión de TRAIL, y que recuperan el polipéptido
de TRAIL.
10. Polipéptido de TRAIL purificado que comprende
una secuencia de aminoácidos que es idéntica al menos en un 80% a
una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en
los aminoácidos 1 a 281 de la SEQ. ID NO: 2 y los aminoácidos 1 a
291 de la SEQ. ID NO: 6, en el que dicho polipéptido de TRAIL puede
inducir la apoptosis de células Jurkat.
11. Polipéptido de TRAIL purificado según la
reivindicación 10, que comprende una secuencia de aminoácidos
seleccionada del grupo que consiste en los aminoácidos 1 a 281 de la
SEQ. ID NO: 2 y los aminoácidos 1 a 291 de la SEQ. ID NO: 6.
12. Polipéptido de TRAIL humano codificado por el
inserto de ADN del vector recombinante depositado en la cepa ATCC
69849.
\newpage
13. Polipéptido de TRAIL soluble purificado que
comprende una secuencia de aminoácidos que es idéntica al menos en
un 80% a una secuencia seleccionada del grupo que consiste en:
- (a)
- el dominio extracelular de TRAIL humano de la SEQ. ID NO: 2;
- (b)
- el dominio extracelular de TRAIL murino de la SEQ. ID NO: 6;
- (c)
- un fragmento del dominio extracelular de (a) o (b) en el que el fragmento puede inducir la apoptosis de células Jurkat;
en el que dicho polipéptido de
TRAIL soluble puede inducir la apoptosis de células
Jurkat.
14. Polipéptido de TRAIL según la reivindicación
13, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del
grupo que consiste en:
- (a)
- el dominio extracelular de TRAIL humano (aminoácidos 39 a 281 de la SEQ. ID NO: 2); y
- (b)
- un fragmento de dicho dominio extracelular, en el que dicho fragmento puede inducir la apoptosis de células Jurkat.
15. Polipéptido de TRAIL según la reivindicación
14, que comprende la secuencia de aminoácidos x a 281 de la SEQ. ID
NO:2, en la que x representa un número entero de desde 39 hasta
95.
16. Polipéptido de TRAIL según la reivindicación
15, que comprende los aminoácidos 95 a 281 de la SEQ. ID NO:2.
17. Polipéptido de TRAIL según la reivindicación
13, en el que dicho polipéptido de TRAIL soluble comprende
una(s) sustitución(ones) conservativa(s) en una
secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste
en:
- (a)
- el dominio extracelular de TRAIL humano (aminoácidos 39 a 281 de la SEQ. ID NO:2) en el que el dominio extracelular puede inducir la apoptosis de células Jurkat; y
- (b)
- un fragmento de dicho dominio extracelular, en el que el fragmento puede inducir la apoptosis de células Jurkat;
en el que TRAIL sustituido de
manera conservativa puede inducir la apoptosis de células de
Jurkat.
18. Oligómero que comprende desde dos hasta tres
polipéptidos de TRAIL solubles según una cualquiera de las
reivindicaciones 13 a 17.
19. Trímero de TRAIL que comprende tres
polipéptidos de TRAIL solubles según la reivindicación 16.
20. Anticuerpo que es inmunorreactivo con un
polipéptido de TRAIL según una cualquiera de las reivindicaciones
10 a 17; o un fragmento de unión de antígenos de dicho
anticuerpo.
21. Anticuerpo según la reivindicación 20, en el
que dicho anticuerpo es un anticuerpo monoclonal.
22. Anticuerpo monoclonal según la
reivindicación 21, en el que dicho anticuerpo es específico para el
polipéptido de TRAIL humano de la SEQ. ID NO: 2 o el polipéptido de
TRAIL murino de la SEQ. ID NO:6.
23. ADN aislado que codifica para un polipéptido
de TRAIL, en el que dicho polipéptido de TRAIL es un fragmento de
la proteína TRAIL humana de la SEQ. ID NO: 2 o un fragmento de la
proteína TRAIL murina de la SEQ. ID NO: 6, en el que dicho
fragmento puede inducir la apoptosis de células Jurkat.
24. Polipéptido de TRAIL purificado, en el que
dicho polipéptido de TRAIL es un fragmento de la proteína TRAIL
humana de la SEQ. ID NO: 2 o un fragmento de la proteína TRAIL
murina de la SEQ. ID NO: 6, en el que dicho fragmento puede inducir
la apoptosis de células Jurkat.
25. Proteína de fusión que comprende un
polipéptido de TRAIL según cualquiera de las reivindicaciones 10 a
17 ó 24, fusionada a un polipéptido heterólogo.
26. Proteína de fusión según la reivindicación
25, en la que dicho polipéptido heterólogo promueve la
oligomerización.
27. Oligómero según la reivindicación 18, que
comprende tres polipéptidos de TRAIL solubles.
28. Composición que comprende un polipéptido de
TRAIL, oligómero o proteína de fusión según una cualquiera de las
reivindicaciones 10 a 19 ó 24 a 27, y un vehículo, diluyente o
excipiente fisiológicamente aceptable.
29. Composición que comprende un oligómero según
la reivindicación 27, y un vehículo, diluyente o excipiente
fisiológicamente aceptable.
30. Polipéptido de TRAIL, oligómero o proteína de
fusión según una cualquiera de las reivindicaciones 10 a 19 ó 24 a
27, para su uso en medicina humana.
31. Polipéptido de TRAIL, oligómero o proteína de
fusión según una cualquiera de las reivindicaciones 10 a 19 ó 24 a
27, para su uso en la inducción de la apoptosis de células
diana.
32. Polipéptido de TRAIL, oligómero o proteína de
fusión según la reivindicación 31, en el/la que dichas células
diana son células cancerosas.
33. Polipéptido de TRAIL, oligómero o proteína de
fusión según la reivindicación 31, en el/la que dichas células
diana son células infectadas de forma viral.
34. Polipéptido de TRAIL, oligómero o proteína de
fusión, según la reivindicación 32 ó 33, en el/la que dicho
oligómero es un trímero.
35. Anticuerpo según la reivindicación 20, 21 ó
22 para su uso en medicina humana.
36. Anticuerpo según la reivindicación 20, 21 ó
22 para su uso en la inhibición de una actividad biológica de un
polipéptido de TRAIL.
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