EA035530B1 - Антитела и антигенсвязывающие фрагменты, которые специфично связываются с белком тау, ассоциированным с микротрубочками - Google Patents

Abstract

Изобретение относится к антителам и антигенсвязывающим фрагментам, которые специфично связываются с белком тау, ассоциированным с микротрубочками. Настоящее изобретение также относится к диагностическим, профилактическим и терапевтическим способам, в которых применяются антитела к тау-белку.

Description

Область изобретения

Настоящее изобретение относится к медицине. Настоящее изобретение, в частности, относится к антителам и антигенсвязывающим фрагментам, которые специфично связываются с белком тау, ассоциированным с микротрубочками. Настоящее изобретение также относится к диагностическим, профилактическим и терапевтическим способам, в которых применяются антитела к тау-белку.

Предпосылки изобретения

Деменция является синдромом, который может быть вызван целым рядом прогрессирующих расстройств, влияющих на память, мышление, поведение и способность выполнять повседневные действия. В настоящее время приблизительно 36 млн человек во всем мире страдают от деменции. По прогнозам количество людей с деменцией увеличится в два раза к 2030 г. и больше чем в три раза до 115,4 млн человек к 2050 г. Болезнь Альцгеймера является наиболее распространенным типом деменции. На данный момент у одного из девяти человек в возрасте 65 лет и старше (11 процентов) и почти у половины тех, кто старше 85 лет, имеется болезнь Альцгеймера. Согласно Международной ассоциации болезни Альцгеймера текущие глобальные расходы на уход за этими пациентами превышают $600 млиардов в год. Эти расходы вероятно возрастут даже быстрее, чем распространенность заболевания, особенно в развивающихся странах, так как возникает больше установленных законом систем социальной защиты, и рост доходов приводит к повышению альтернативных издержек (Winblad, B and Jonsson, L, World Alzheimer Report 2010).

В головном мозге пациентов с AD в больших количествах присутствуют две аномальные структуры: амилоидные бляшки и нейрофибриллярные клубки. Особенно это касается определенных областей головного мозга, которые играют важную роль в отношении памяти. Также наблюдается значительная потеря нейронов и синапсов в коре головного мозга и в определенных подкорковых областях. Как количество нейрофибриллярных клубков, так и потеря нейронов возрастают параллельно с продолжительностью и тяжестью заболевания (Gomez-Isla, t. et al, Ann Neurol 1997; 41:17-24) и было показано, что нейрофибриллярная нагрузка коррелирует с когнитивными нарушениями. (Break, H. and Break, E, Neurobiol Aging. 1997 Jul-Aug; 18(4): 351-7.

Нейрофибриллярные клубки являются внутринейрональными очагами, которые состоят из гиперфосфорилированных и нерастворимых скоплений тау-белка, ассоциированного с микротрубочками. Эти скопления являются гистопатологическим отличительным признаком многих нейродегенеративных заболеваний, которые известны под общим названием таупатий. Таупатии включают, например, болезнь Альцгеймера (AD), болезнь Пика (PiD), прогрессирующий надъядерный паралич (PSP), кортикобазальную дегенерацию (CBD) и лобно-височную лобарную дегенерацию (FTLD). При таупатиях у человека патология прогрессирует, распространяясь от одной области головного мозга к другой характерным для конкретного заболевания образом (Break, H. and Break, E, Neurobiol Aging. 1997 Jul-Aug;18(4):351-7, Raj et.al. Neuron 2012; 73:1204-1215, Seeley et. al. Neuron 2009; 62: 42-52., и Zhou et. al., Neuron 2012; 73:12161227), причем основной механизм этого пока не ясен.

Патологический тау-белок связан со многими таупатиями и может быть их причиной. В нормальной форме тау-белок является хорошо растворимым белком, ассоциированным с микротрубочками (Jeganathan et al., Biochemistry 2008; 47:10526-10539.), который связывается с микротрубочками и способствует их сборке (Drechsel et al., Mol Biol Cell 1992; 3: 1141-1154.). Однако при таупатиях тау-белок становится гиперфосфорилированным, что приводит к его отсоединению от микротрубочек и, в конечном итоге, к скоплению в виде нейрофибриллярных клубков, которые визуализируются в пределах дистрофического нейрита и клеточных телец (Mandelkow and Mandelkow, Cold Spring Harbor Perspect Med 2, 2012: a006247). Количество патологического тау-белка коррелирует с прогрессирующей нейрональной дисфункцией, потерей синапсов и функциональными нарушениями у человека и в моделях на трансгенных мышах (Arriagada et al., Neurology. 1992 Mar;42(3 Pt 1): 631-9, Bancher et al., Neurosci Lett 1993; 162:179182., Polydoro et al., J. Neoroscience 2009; 29:10741-10749., и Small and Duff, Neuron. 2008 Nov 26; 60(4): 534-42). При том, что при болезни Альцгеймера мутации тау-белка не наблюдаются, мутации в гене таубелка, по всей видимости, приводят к некоторым формам лобно-височной деменции (Cairns et al., Am J Pathol, 2007; 171: 227-40), при которых проявляются тау-положительные включения, и это означает, что дисфункции тау-белка достаточно для того, чтобы вызвать нейродегенерацию. Более того, патологический тау-белок, по-видимому, является неотъемлемой частью Aβ-индуцированной нейротоксичности в культуре клеток и моделях на трансгенных животных (Rapoport, M, PNAS, 2002; 99:9, 6364-6369., Roberson ED, et al., Science, 2007; 316:750-754, Nicholson AM, and Ferreira A, J Neurosci 2009; 29:46404651, Oakley H, J Neurosci 2006;26(40): 10129-10140.).

Пассивную и активную иммунизацию против тау-белка анализировали на мышах с использованием нескольких разных мышиных моделей, включая разные фосфо-тау-пептиды для активной иммунизации и антитела к тау-белку для пассивной иммунотерапии (Asuni АА, et al., J Neurosci. 2007; 27 (34):91159129., Sigurdsson EM. Curr Alzheimer Res. 2009;6(5):446-450., Boutajangout A, et al, J Neurosci. 2010;30(49): 16559-16566., Rosenmann H., et al. Arch Neurol. 2006; 63(10):1459-1467., Boimel M, et al., Exp Neurol. 2010;224(2): 472-485.). В первом сообщении, описывающем иммунизации с использованием фосфорилированного тау-пептида длиной 30 аминокислот, были показаны влияние на соотношения растворимого и

- 1 035530 нерастворимого тау-белка, уменьшение образования клубка у иммунизированных мышей и функциональные положительные эффекты, наблюдаемые в поведенческом тесте у этих мышей (Boutajangout A. et al., J. Neuroscience, 2010; 30: 16559-16566). Пассивная иммунизация с использованием хорошо изученных антител к тау-белку, которые вступают в реакцию с фосфорилированным Ser396 и Ser404 гиперфосфорилированного тау-белка на раннем патологическом конформационном эпитопе тау-белка, подтвердила результаты, полученные в исследованиях с активной иммунизацией. На мышах, обработанных этими антителами, были показаны значительное снижение количества патологического тау-белка, которое измеряли посредством биохимических способов и гистологических методик, а также значительная отсрочка развития нарушения, связанного с потерей двигательной функции, которую оценивали в поведенческих тестах (Boutajangout A., et al., J Neurochem. 2011; 118(4): 658-667, Chai X., et al. J Biol Chem. 2011; 286(39): 34457-34467.)

На сегодняшний день способы терапии, направленные на тау-белок, анализировали только на мышиных моделях. Но принимая во внимание тяжесть таупатий в целом и затраты общества, связанные с болезнью Альцгеймера в частности, все еще существует потребность в эффективных средствах диагностики, мониторинга, предупреждения и лечения таупатий.

Краткое описание изобретения

Настоящее изобретение предусматривает антитела, содержащие антигенсвязывающую вариабельную область, которая специфично связывается с тау-белком. Настоящее изобретение, в частности, предусматривает антитела к тау-белку и их антигенсвязывающие фрагменты, которые обнаруживают таубелок в нормальной ткани головного мозга человека или обнаруживают отложения тау-белка в ткани головного мозга человека с болезнью Альцгеймера (AD) и с прогрессирующим надъядерным параличем (PSP). В некоторых вариантах осуществления антитела к тау-белку и их антигенсвязывающие фрагменты связываются с рекомбинантным тау-белком и/или PHF-тау-белком в ходе вестерн-блот-анализа.

Настоящее изобретение дополнительно предусматривает химерные антитела, содержащие антигенсвязывающую вариабельную область из встречающегося в природе антитела человека, которая специфично связывается с тау-белком, и рекомбинантную константную область IgG1 человека, где константная область химерного антитела является отличной от встречающегося в природе антитела. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение предусматривает химерные антитела к тау-белку и их антигенсвязывающие фрагменты, которые обнаруживают тау-белок в нормальной ткани головного мозга человека, но не обнаруживают отложения тау-белка в ткани головного мозга человека с болезнью Альцгеймера (AD) и с прогрессирующим надъядерным параличем (PSP).

В некоторых вариантах осуществления (химерные) антитела к тау-белку и их антигенсвязывающие фрагменты связываются с рекомбинантным тау-белком и/или PHF-тау-белком в ходе вестерн-блотанализа. В некоторых вариантах осуществления антитела к тау-белку и их антигенсвязывающие фрагменты не связываются с рекомбинантным тау-белком или PHF-тау-белком в ходе ELISA. Антитела и антигенсвязывающие фрагменты предпочтительно способны специфично связываться с тау-пептидом. В некоторых вариантах осуществления антитела и антигенсвязывающие фрагменты предпочтительно способны специфично связываться с фосфорилированным тау-пептидом, но не связываются с пептидом, когда он не является фосфорилированным. В определенных вариантах осуществления антитела к таубелку не являются встречающимися в природе. Предпочтительно антитела являются антителами человека.

Антитела и антигенсвязывающие фрагменты по настоящему изобретению являются применимыми в качестве диагностических, профилактических и/или терапевтических средств как отдельно, так и в комбинации с другими диагностическими, профилактическими и/или терапевтическими средствами.

Согласно одному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 163, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 164 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 165, CDR1-области легкой цепи с SEQ ID NO: 166, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 167 и CDR3-области легкой цепи с SEQ ID NO: 168.

Другой вариант осуществления настоящего изобретения относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 169, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 170 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 171, CDR1-области легкой цепи с SEQ ID NO: 172, CDR2-области легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-области легкой цепи с SEQ ID NO: 174.

Согласно одному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 175, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 176 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 177, CDR1-области легкой цепи с SEQ ID NO: 178, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 179 и CDR3-области легкой цепи с SEQ ID NO: 180.

Другой вариант осуществления настоящего изобретения относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 181, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 182 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 183, CDR1-области легкой

- 2 035530 цепи с SEQ ID NO: 172, CDR2-области легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-области легкой цепи с

SEQ ID NO: 184.

Другой вариант осуществления настоящего изобретения относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 185, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 186 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 187, CDR1-области легкой цепи с SEQ ID NO: 188, CDR2-области легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-области легкой цепи с SEQ ID NO: 189.

Согласно еще одному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 190, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 191 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 192, CDR1-области легкой цепи с SEQ ID NO: 193, CDR2-области легкой цепи с SEQ ID NO: 194 и CDR3-области легкой цепи с SEQ ID NO: 195.

Согласно еще одному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 196, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 197 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 198, CDR1-области легкой цепи с SEQ ID NO: 199, CDR2-области легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-области легкой цепи с SEQ ID NO: 200.

Согласно еще одному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 213, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 214 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 215, CDR1-области легкой цепи с SEQ ID NO: 216, CDR2-области легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-области легкой цепи с SEQ ID NO: 217.

Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 213, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 214 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 215, CDR1-области легкой цепи с SEQ ID NO: 218, CDR2-области легкой цепи с SEQ ID NO: 174 и CDR3-области легкой цепи с SEQ ID NO: 217.

Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок CDR1-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 219, CDR2-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 220 и CDR3-области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 221, CDR1-области легкой цепи с SEQ ID NO: 218, CDR2-области легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-области легкой цепи с SEQ ID NO: 217.

Настоящее изобретение дополнительно относится к антигенсвязывающим фрагментам указанных выше антител.

Согласно другому аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему антигенсвязывающий участок вариабельной области тяжелой цепи (VH) с SEQ ID NO: 87, 91, 95, 99, 103, 107, 111, 123, 127 или 131 и антигенсвязывающий участок вариабельной области легкой цепи (VL) с SEQ ID NO: 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 124, 128 или 132, и к его антигенсвязывающим фрагментам.

Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 87, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 88, и к его антигенсвязывающим фрагментам. Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 91, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 92, и к его антигенсвязывающим фрагментам. Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к таубелку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 95, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 96, и к его антигенсвязывающим фрагментам. Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 99, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 100, и к его антигенсвязывающим фрагментам. Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 103, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 104, и к его антигенсвязывающим фрагментам. Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 107, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 108, и к его антигенсвязывающим фрагментам. Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 111, и вариабельную область легкой цепи, содержащую

- 3 035530 аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 112, и к его антигенсвязывающим фрагментам. Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 123, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 124, и к его антигенсвязывающим фрагментам. Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к тау-белку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 127, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 128, и к его антигенсвязывающим фрагментам. Согласно дополнительному аспекту настоящее изобретение относится к антителу к таубелку, содержащему вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 131, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 132, и к его антигенсвязывающим фрагментам.

В одном варианте осуществления константная область тяжелой цепи IgG1 состоит из аминокислотной последовательности с SEQ ID NO: 83. В другом варианте осуществления константная область легкой цепи IgG1 состоит из аминокислотной последовательности с SEQ ID NO: 84.

Настоящее изобретение также предусматривает молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие антитела или их антигенсвязывающие фрагменты. Другой аспект настоящего изобретения представлен вектором, содержащим молекулы нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению. Дополнительным объектом настоящего изобретения является клетка-хозяин, содержащая вектор по настоящему изобретению.

Настоящее изобретение также предусматривает способ получения антитела к тау-белку, включающий культивирование клетки-хозяина по настоящему изобретению и выделение антитела, полученного с помощью клетки-хозяина.

Настоящее изобретение дополнительно предусматривает функциональные варианты антител и иммуноконъюгаты, содержащие антитело и/или его антигенсвязывающий фрагмент.

Настоящее изобретение дополнительно предусматривает композиции и наборы, которые содержат одно или несколько антител по настоящему изобретению и/или их антигенсвязывающие фрагменты. Настоящее изобретение дополнительно предусматривает диагностические, профилактические и терапевтические способы, в которых используют антитела к тау-белку. Профилактические и терапевтические способы включают введение людям-субъектам антител к тау-белку и/или их антигенсвязывающих фрагментов для предупреждения или лечения таупатии и/или заболеваний или состояний, опосредованных таубелком, и/или уменьшения интенсивности одного или нескольких симптомов таупатии. Для комбинированной терапии можно применять комбинации множества разных антител к тау-белку и/или их антигенсвязывающих фрагментов с другими антителами к тау-белку. Также предусмотрены композиции, содержащие антитела к тау-белку и/или их антигенсвязывающие фрагменты в комбинации с другими профилактическими или терапевтическими средствами.

В некоторых вариантах осуществления антитела по настоящему изобретению уникальны тем, что вариабельные области выделены из В-клеток памяти, специфичных в отношении тау-белка, от здоровых индивидуумов и обнаруживают отложения тау-белка в головном мозге человека с болезнью Альцгеймера, но не обнаруживают тау-белок в нормальной ткани головного мозга человека и являются фосфозависимыми, а также связываются с тау-пептидом ptau 194-212 (SEQ ID NO: 315), или ptau 200-217 (SEQ ID NO: 319), или ptau 59-78 (SEQ ID NO: 323), или ptau 406-429 (SEQ ID NO: 326). В других вариантах осуществления антитела уникальны тем, что вариабельные области выделены из В-клеток памяти, специфичных в отношении тау-белка, от здоровых индивидуумов, и обнаруживают отложения тау-белка в головном мозге человека с болезнью Альцгеймера, и обнаруживают тау-белок в нормальной (т.е. здоровой) ткани головного мозга человека, и являются преимущественно фосфонезависимыми и связываются с таупептидом tau 204-221 (SEQ ID NO: 318) или tau 221-253 (SEQ ID NO: 367). В некоторых других вариантах осуществления антитела по настоящему изобретению уникальны тем, что вариабельные области выделены из B-клеток памяти, специфичных в отношении тау-белка, от индивидуумов с болезнью Альцгеймера, и являются фосфозависимыми, и связываются с фосфорилированным тау-пептидом ptau 406429 (SEQ ID NO: 326), и не связываются с нефосфорилированным тау-пептидом tau 389-441 (SEQ ID NO: 327)

Краткое описание графических материалов

На фиг. 1a-t показана реактивность CBTAU-7.1, 8.1, 16.1, 18.1, 20.1, 22.1, 24.1, 27.1, 28.1, 41.1, 41.2, 42.1, 43.1, 44.1, 45.1, 46.1, 47.1, 47.2 и 49.1 в отношении соответствующего родственного и неродственного пептида.

На фиг. 2;i-j показана реактивность CBTAU-7.1, 8.1, 16.1, 18.1, 20.1, 22.1, 24.1, 27.1 и 28.1 в отношении рекомбинантного тау-белка (rTau), обогащенных очищенных иммуноаффинным способом спаренных спиральных филаментов (ePHF) и очищенных иммуноаффинным способом спаренных спиральных филаментов (iPHF) в ходе ELISA. В качестве положительного контроля использовали mAb к тау-белку AT8.

На фиг. 3 показана иммунореактивность CBTAU-7.1, 18.1, 22.1, 24.1, 27.1 и 28.1 в отношении rtau,

- 4 035530 ePHF и iPHF в ходе вестерн-блот-анализа.

На фиг. 4a-g показано эпитопное картирование CBTAU-27.1, 28.1, 43.1, 46.1, 47.1, 47.2 и 49.1 с использованием перекрывающихся пептидов, которые соответствуют областям 42-103 и 299-369 tau441 человека.

На фиг. 5a-d показаны результаты иммуногистохимического исследования для mAb CBTAU, подробно описанных в данной заявке. На фиг. 5a-b показано иммуноокрашивание с использованием CBTAU-7.1, 8.1, 16.1, 18.1, 20.1, 22.1, 24.1, 27.1 и 28.1 срезов ткани гиппокампа и кортикальной ткани без AD в сравнении с тканью с AD, соответственно. На фигуре с показано иммуноокрашивание с использованием CBTAU-7.1, 8.1, 16.1, 18.1, 20.1, 22.1 и 24.1 срезов кортикальной ткани без PSP и с PSP. На фиг. 5d показано иммуноокрашивание с использованием CBTAU-43.1, 46.1, 47.2 и 49.1 в отношении срезов кортикальной ткани без AD и с AD.

На фиг. 6a показана иммунореактивность CBTAU-28.1 и контрольных mAb в отношении срезов ткани гиппокампа без AD (мужчина в возрасте 54 лет; без клинических симптомов) и с AD (женщина латиноамериканского происхождения в возрасте 93 лет).

На фиг. 6b показана реактивность CBTAU-28.1 и контрольных mAb в отношении срезов ткани гиппокампа с AD (женщина латиноамериканского происхождения в возрасте 93 лет) в случае обработки фосфатазой из кишечника теленка и без обработки.

На фиг. 7 показана реактивность CBTAU-28.1 и mAb к фосфо-тау-белку, AT8, в отношении iPHF (очищенных иммуноаффинным способом спаренных спиральных филаментов) и образцов iPHF, обработанных фосфатазой из кишечника теленка.

На фиг. 8a-e показана реактивность CBTAU-27.1, 28.1, 43.1, 46.1, 47.1, 47.2 и 49.1 в отношении тауфосфопептидов, подробно описанных в табл. 30-34.

Подробное описание изобретения Определения

Ниже даны определения терминов, используемых в настоящем изобретении.

Предусматривается, что вслед за применяемым в настоящем документе выражением включенный или включающий следуют слова без ограничения.

Используемый в данном документе термин тау-белок используют взаимозаменяемо с конкретным указанием нативной мономерной формы тау-белка. Термин тау-белок также используют для того, чтобы в целом обозначить другие конформеры тау-белка, например олигомеры или агрегаты тау-белка. Термин тау-белок также используют для обозначения совокупности всех типов и форм тау-белка. По причине альтернативного сплайсинга в головном мозге человека присутствует 6 изоформ тау-белка. Эти изоформы различаются отсутствием или наличием одной или двух вставок 29 аминокислот, кодируемых экзонами 2 и 3 в аминоконцевой части, в комбинации с тремя (R1, R3 и R4) или четырьмя (R1-R4) областями повторов в карбоксиконцевой части. Домен, связывающий микротрубочки, кодируется экзоном 10. Изоформы тау-белка у взрослого человека включают самый длинный компонент из 441 аминокислоты (SEQ ID NO: 1), или 4R/2N, компонент из 410 аминокислот (SEQ ID NO: 2), или 3R/2N, компонент из 412 аминокислот (SEQ ID NO: 3), или 4R/1N, компонент из 381 аминокислоты (SEQ ID NO: 4), или 3R/1N, и компонент из 383 аминокислот (SEQ ID NO: 5), или 4R/0N. Самая короткая изоформа из 352 аминокислот (SEQ ID NO: 6), или 3R/0N, обнаружена в головном мозге плода и, таким образом, ее называют эмбриональной изоформой тау-белка.

Аминокислотную последовательность тау-белка дикого типа, представленную изоформой из 441 аминокислоты (SEQ ID NO: 1), также называют tau441, 4R/2N, hTau40, TauF, Tau-4 или полноразмерный тау-белок.

Термин рекомбинантный тау-белок в данном документе относится к самой длинной изоформе тау-белка в головном мозге человека (SEQ ID NO: 1), экспрессированной в E.coli и очищенной до гомогенности или почти до гомогенности (Barghorn S., Meth Mol Biol 2004 299: 35-51). Рекомбинантный таубелок является растворимым и нефосфорилированным.

Термин нейрофибриллярный клубок (NFT) относится к патологическим структурам, впервые описанным Альцгеймером в головном мозге пациента с деменцией. NFT состоит из упорядоченно расположенных субъединиц, которые называются спаренными спиральными филаментами, агрегатами гиперфосфорилированного белка тау, которые наиболее широко известны как основной маркер болезни Альцгеймера.

Используемый в данном документе термин спаренный спиральный филамент тау-белка или PHFтау-белок, относится к широко известным агрегатам тау-белка, которые составляют патологические структуры, называемые нейрофибриллярными клубками (NFT), впервые описанные Альцгеймером в головном мозге пациента с деменцией. Они также присутствуют при многих других заболеваниях, известных как таупатии.

Обогащенный PHF-тау-белок или ePHF тау-белок получают в соответствии с протоколом Greenberg и Davies, как описано в примерах. PHF-тау-белок обогащают при 27200/g из супернатантов, содержащих 0,8М NaCl, за счет использования его нерастворимости в цвиттерионных детергентах (Kosik K. S., et al. (1986) PNAS USA 83, 4044-4048, Rubenstein, R., et al (1986) Brain Res. 372, 80-88) и меркапто- 5 035530 этаноле. В PHF, выделенных с использованием цвиттерионных детергентов, по всей видимости, сохраняются антигенные детерминанты, которые могут быть утрачены в ходе выделения нейрофибриллярных клубков, нерастворимых в SDS, и при этом они схожи по структуре и имеют многие антигенные свойства при сравнении с PHF в NFT. Очищенный иммуноаффинным способом PHF-тау-белок или iPHF таубелок является аффинно очищенным с помощью моноклонального антитела к тау-белку. Такие протоколы предусматривают препараты PHF-тау-белка, в которых сохраняется классическая структура спаренного спирального филамента, определенная с помощью электронной микроскопии, и при этом они являются полностью растворимыми при низких концентрациях SDS (Jicha, G., 1997, 48(2):128-32). PHFтау-белок также образуется из рекомбинантного тау-белка посредством индукции полимеризации in-vitro с использованием гепарина (Mandelkow et al. Methods in Molecular Biology 299:35-51(2004). В качестве альтернативы, PHF-тау-белок выделяют с помощью многих других способов из головного мозга пациентов с AD с использованием протоколов, таких как описанные Rostagna и Ghiso (Rostagna, A. and Ghiso, J., Curr Protoc Cell Biol. Sep 2009; CHAPTER: Unit-3.3333.). Определяют характеристики выделенного PHFтау-белка по его чистоте и состоянию гиперфосфорилирования с использованием антител, которые, как известно, вступают в реакцию с PHF-тау-белком. В стандартном препарате PHF-тау-белка гиперфосфорилированные полосы, мигрирующие при приблизительно 60, 64, 68 и 72 кДа в ходе вестерн-блоттинга (Spillantini and Goedert Trends Neurosci 21:428-33, 1998), обнаруживают посредством антитела AT8, которое специфично связывается с гиперфосфорилированным PHF-тау-белком и не связывается с дефосфорилированным PHF-тау-белком.

Применяемый в данном документе термин антитела следует понимать в широком смысле, и он охватывает молекулы иммуноглобулина или антитела, включая поликлональные антитела, моноклональные антитела, в том числе мышиные, человеческие, адаптированные для человека, гуманизированные и химерные моноклональные антитела, биспецифичные или мультиспецифичные антитела и фрагменты антител. Как правило, антитела представляют собой белки или пептидные цепи, которые проявляют специфичность связывания с определенным антигеном. Структуры антител являются широко известными. Иммуноглобулины можно отнести к пяти основным классам, а именно IgA, IgD, IgE, IgG и IgM, в зависимости от аминокислотной последовательности константного домена тяжелой цепи. IgA и IgG дополнительно подразделены на изотипы IgA1, IgA2, IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4. Легкие цепи антитела любого вида позвоночных животных можно отнести к одному из двух четко различающихся типов, а именно каппа (κ) и лямбда (λ), исходя из аминокислотных последовательностей их константных доменов.

Термин антигенсвязывающие фрагменты означает часть интактного антитела. Примеры фрагментов антител включают Fab, Fab', F(ab')₂ и Fv-фрагменты, CDR, антигенсвязывающий участок, вариабельную область тяжелой или легкой цепи, диатела, триотела, молекулы одноцепочечных антител (scFv) и мультиспецифичные антитела, образованные по меньшей мере из двух интактных антител или их фрагментов, или (поли)пептиды, содержащие по меньшей мере фрагмент иммуноглобулина, которого достаточно для придания (поли)пептиду способности связывать антиген и т.д.

Антигенсвязывающий фрагмент может содержать пептид или полипептид, содержащий аминокислотную последовательность по меньшей мере из 2, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 125, 150, 175, 200 или 250 смежных аминокислотных остатков из аминокислотной последовательности антитела. Антигенсвязывающие фрагменты можно получить путем синтеза или посредством ферментативного или химического расщепления интактных иммуноглобулинов, или их можно получить генноинженерным путем с использованием методик рекомбинантной ДНК. Способы получения хорошо известны из уровня техники и описаны, например, в Antibodies: A Laboratory Manual, Edited by: E. Harlow and D, Lane (1988), Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, которое включено в данный документ посредством ссылки. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут иметь один или несколько участков связывания. При наличии более одного участка связывания участки связывания могут быть идентичны друг другу или они могут отличаться.

Вариабельная область легкой или тяжелой цепи иммуноглобулина состоит из каркасной области, которая прерывается антигенсвязывающими участками. Антигенсвязывающие участки определены с использованием множества терминов, приведенных ниже. (i) Определяющие комплементарность участки (CDR) основаны на вариабельности последовательности (Wu and Kabat J Exp Med 132:211-50, 1970). Как правило, антигенсвязывающий участок имеет три CDR в каждой вариабельной области (HCDR1, HCDR2 и HCDR3 в вариабельной области тяжелой цепи (VH) и LCDR1, LCDR2 и LCDR3 в вариабельной области легкой цепи (VL)) (Kabat et al., Sequences of Proteins of lmmunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md., 1991). (ii) Термин гипервариабельная область, HVR или HV относится к областям вариабельного домена антитела, которые являются гипервариабельными по структуре, как определено Chothia и Lesk (Chothia and Lesk J Mol Biol 96:901-17, 1987). Как правило, антигенсвязывающий участок имеет три гипервариабельные области в каждой VH (H1, H2, H3) и VL (L1, L2, L3). Chothia и Lesk относят структурно консервативные HV к каноническим структурам. Системы нумерации, а также аннотации CDR и HV недавно были пересмотрены Abhinandan и Martin (Abhinandan and Martin Mol Immunol 45:3832-9, 2008). (iii) Другое определение областей, которые образуют антигенсвязывающий участок предложил Lefranc (Lefranc, et al. Dev Camp Immunol 27:55-77, 2003), исходя из

- 6 035530 сравнения V-доменов из иммуноглобулинов и T-клеточных рецепторов. Международная база данных по иммуногенетике (The International ImMunoGeneTics database) (IMGT) (http:_//www imgt_ org) предусматривает стандартизованную нумерацию и определение этих областей. Соответствие между CDR, HV и картированием согласно IMGT описано Lefranc et al. Антигенсвязывающий участок можно также картировать исходя из частоты использования остатков, определяющих специфичность (SDRU) (Almagro J Mol Recognit 17:132-43, 2004), где остатки, определяющие специфичность (SDR), относятся к аминокислотным остаткам иммуноглобулина, которые непосредственно участвуют в контакте с антигеном.

Kabat et al. также определили систему нумерации для последовательностей вариабельного домена, которая является применимой к любому антителу. Специалист в данной области техники может однозначно применить эту систему нумерации по Kabat по отношению к любой последовательности вариабельного домена, не полагаясь на какие-либо экспериментальные данные, помимо самой последовательности. Используемая в данном документе нумерация по Kabat относится к системе нумерации, изложенной в Kabat et al., U.S. Dept. of Health and Human Services, Sequence of Proteins of Immunological Interest (1983). Если конкретно не указано иное, упоминание нумерации определенных положений остатков аминокислот в антителе или антигенсвязывающем фрагменте, варианте или их производном по настоящему изобретению соответствует системе нумерации по Kabat, которая однако является теоретической и, в то же время, может не применяться к каждому антителу по настоящему изобретению. Например, в зависимости от положения первого CDR, следующие CDR могут быть сдвинуты в любом направлении.

Каркас или каркасная последовательность являются остальными последовательностями в пределах вариабельной области антитела, помимо тех, которые определены как последовательности антигенсвязывающего участка. Поскольку точное определение антигенсвязывающего участка можно получить при помощи множества методик картирования, как описано выше, точная каркасная последовательность зависит от определения антигенсвязывающего участка.

Используемый в данном документе термин моноклональное антитело (mAb) означает антитело (или фрагмент антитела), полученное из популяции практически однородных антител. Моноклональные антитела являются высокоспецифичными, при этом они обычно направлены против одной антигенной детерминанты.

Согласно одному аспекту антитело по настоящему изобретению является химерным человеческим антителом. Таким образом, в соответствии с настоящим изобретением термины химерное человеческое антитело, или рекомбинантное человеческое антитело и т.п. используют для обозначения связывающей молекулы с антигенсвязывающими свойствами, которая происходит из человеческой клетки, т.е. антигенсвязывающий участок которой происходит из нуклеиновых кислот, полученных из человеческой клетки, такой как B-клетка, или частичную cDNA которой клонировали из mRNA человеческой клетки, например человеческой B-клетки памяти. Химерное антитело все еще является человеческим, даже если в антителе были произведены аминокислотные замены, например, для улучшения биофизических или фармакокинетических характеристик. По сравнению с искусственно образованными антителами, подобными человеческим антителам, такими как фрагменты одноцепочечного антитела (scFv), полученные из фагового дисплея библиотеки антител или от мыши, экспрессирующей ксеногенные последовательности, химерное человеческое антитело по настоящему изобретению характеризуется (i) антигенсвязывающей областью, полученной с использованием иммунного ответа человека вместо имитации с использованием животных, т.е. антигенсвязывающая область была образована в ответ на природный таубелок с его соответствующей конформацией в организме человека, и/или (ii) защитой индивидуума, или оно, по меньшей мере, является значимым для выявления присутствия тау-белка.

Антитела, которые происходят из библиотек иммуноглобулинов человека или из животных, трансгенных по одному или нескольким иммуноглобулинам человека и не экспрессирующих эндогенные иммуноглобулины, как описано ниже и, например, в патенте США № 5939598, выданном Kucherlapati et al., обозначают антитела, подобные человеческим антителам, с тем, чтобы отличить их от антител, полученных от человека, по настоящему изобретению.

Например, спаривание тяжелой и легкой цепей антител, подобных человеческим антителам, таких как синтетические и частично синтетические антитела, обычно выделенные из фагового дисплея, не обязательно отражает встречающееся в природе спаривание, которое происходит во встречающейся в природе B-клетке человека. Соответственно Fab- и scFv-фрагменты, полученные из библиотек с рекомбинантной экспрессией, использование которых является общеизвестным из предшествующего уровня техники, можно рассматривать как искусственные со всеми возможными ассоциированными с этим эффектами в отношении иммуногенности и стабильности. В отличие от этого настоящее изобретение предусматривает антигенсвязывающие области антител с созревшей аффинностью к тау-белку от выбранных субъектов-людей, причем в некоторых вариантах осуществления они рекомбинантно экспрессируются как химеры с константной областью из обычного IgG1.

Используемый в данном документе термин функциональный вариант относится к антителу, которое содержит нуклеотидную и/или аминокислотную последовательность, которая изменена на один или несколько нуклеотидов и/или аминокислот в сравнении с нуклеотидными и/или аминокислотными по

- 7 035530 следовательностями эталонного антитела, и которое способно конкурировать за специфичное связывание с партнером по связыванию, т.е. тау-белком, с эталонным антителом. Другими словами, модификации аминокислотной и/или нуклеотидной последовательности эталонного антитела существенно не влияют или не изменяют характеристики связывания антитела, кодируемого нуклеотидной последовательностью или содержащего аминокислотную последовательность, т.е. антитело все еще способно специфично распознавать и связывать свою мишень. Функциональный вариант может иметь модификации в консервативной последовательности, в том числе нуклеотидные и аминокислотные замены, присоединения и делеции. Примеры функциональных вариантов включают снижение риска наличия свободного цистеина или аминокислоты с потенциальной посттрансляционной модификацией в гипервариабельной области, а также конструирование Fc для увеличения/снижения аффинности связывания антитела IgG с FcRn, увеличения/снижения периода полужизни в сыворотке.

Функциональный вариант также может быть образован из антитела в виде химерного или нехимерного изотипа человеческого IgG2, IgG3 или IgG4 или в виде химерного или нехимерного изотипа, полученного от другого вида. Функциональный вариант также может представлять собой мутацию или мутации константных областей для увеличения образования биспецифичных антител. Эти модификации можно вводить с помощью стандартных методик, известных из уровня техники, таких как ПЦР, сайтнаправленный мутагенез и ненаправленный опосредованный ПЦР мутагенез, и они могут включать природные, а также неприродные нуклеотиды и аминокислоты.

Используемый в данном документе термин специфичное связывание или специфичное распознавание, который относится к взаимодействию антитела с его партнером по связыванию, например, с антигеном, означает, что взаимодействие зависит от присутствия определенной аминокислотной последовательности или структуры, например, антигенной детерминанты или эпитопа, у партнера по связыванию. Другими словами, антитело предпочтительно связывается с партнером по связыванию или распознает его, даже если партнер по связыванию присутствует в смеси с другими молекулами или организмами. Связывание может быть опосредовано ковалентными или нековалентными взаимодействиями или их комбинацией. Другими словами, термин специфичное связывание или специфичное распознавание означает, что антитело обладает специфичной иммунореактивностью по отношению к антигенной детерминанте или эпитопу и не является иммунореактивным по отношению к другим антигенным детерминантам или эпитопам. Антитело, которое (иммуно)специфично связывается с антигеном, может связываться с другими пептидами или полипептидами с более низкой аффинностью, как определено, например, посредством радиоиммунных анализов (RIA), иммуноферментных анализов (ELISA), BIACORE или других анализов, известных из уровня техники. Антитела или их фрагменты, которые специфично связываются с антигеном, могут характеризоваться перекрестной реактивностью с родственными антигенами, несущими такой же эпитоп.

Предпочтительно антитела или их фрагменты, которые специфично связываются с антигеном, не проявляют перекрестную реактивность с другими антигенами.

Используемый в данном документе термин эпитоп означает ту часть антигена, с которой контактируют петли CDR антитела.

Структурный эпитоп состоит из приблизительно 15-22 контактных остатков на поверхности антигена и включает много аминокислотных остатков, которые контактируют с большой группой остатков в CDR, совместно именуемых паратопом антитела. Непосредственный контакт между остатками эпитопа и паратопа осуществляется посредством электростатических сил, таких как водородные связи, солевые мостики, ван-дер-ваальсовы силы на гидрофобных поверхностях и геометрическая комплементарность. Зона взаимодействия имеет также связанные молекулы воды или другие кофакторы, которые способствуют специфичности и аффинности взаимодействий антиген-антитело. Энергия связывания комплекса антиген-антитело в основном опосредована небольшой совокупностью контактных остатков в зоне взаимодействия эпитопа-паратопа. Данные остатки, важные с точки зрения энергии связывания часто находятся в центре зоны взаимодействия эпитопа-паратопа и составляют функциональный эпитоп. Контактные остатки на периферии зоны взаимодействия, как правило, вносят незначительные вклады в энергию связывания; при этом их замены зачатую слабо влияют на связывание с антигеном. Таким образом, связывание или функциональная активность эпитопа предусматривает небольшую совокупность остатков, важных с точки зрения энергии связывания, расположенных в центре структурного эпитопа, с которыми контактируют CDR, определяющие специфичность.

Определение функционального эпитопа на антигенном белке можно произвести с использованием нескольких способов, включая аланин-сканирующий мутагенез, или путем определения кристаллической структуры антигена с использованием антитела.

Эпитоп может быть линейным по своей природе или прерывистым эпитопом, например, конформационный эпитоп, который образован посредством пространственных взаимоотношений между несмежными аминокислотами антигена, а не линейным рядом аминокислот. Конформационный эпитоп предусматривает эпитопы, возникшие вследствие укладки антигена, при которой аминокислоты из различных участков линейной последовательности антигена находятся в непосредственной близости в 3-мерном пространстве. Для прерывистых эпитопов возможно получить связывание одного или нескольких линей- 8 035530 ных пептидов с уменьшенной аффинностью к так называемому частичному эпитопу, например, распределенному по разным областям последовательности белка (Cragg, M. S. (2011) Blood 118 (2): 219-20).

Используемый в данном документе термин аффинность относится к степени силы связывания отдельного эпитопа или частичного эпитопа с CDR связывающей молекулы, например, молекулы иммуноглобулина; см., например, Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. (1988) на стр. 27-28. Используемый в данном документе термин авидность относится к общей стабильности комплекса между популяцией иммуноглобулинов и антигеном, то есть к объединенной силе функционального взаимодействия смеси иммуноглобулинов с антигеном; см., например, Harlow на страницах 29-34. Авидность связана как с аффинностью отдельных молекул иммуноглобулина в популяции со специфичными эпитопами, так и с валентностью иммуноглобулинов и антигена. Например, взаимодействие между бивалентным моноклональным антителом и антигеном с высокоповторяющейся структурой эпитопа, например, полимером, будет характеризоваться высокой авидностью.

Аффинность или авидность антитела к антигену можно определить экспериментально с использованием подходящего способа; см., например, Berzofsky et al., Antibody-Antigen Interactions в Fundamental Immunology, Paul, W. E., Ed., Raven Press New York, N.Y. (1984), Kuby, Janisimmunology, W.H. Freeman and Company New York, N Y (1992), и способов, описанных в данном документе. Общие методики измерения аффинности антитела к антигену включают ELISA, RIA и поверхностный плазмонный резонанс. Измеренная аффинность определенного взаимодействия антитело-антиген может варьироваться при измерении в разных условиях, например, концентрация солей, pH. Таким образом, измерения аффинности и других антигенсвязывающих параметров, например KD, IC50, предпочтительно проводят со стандартными растворами антитела и антигена и стандартным буфером.

Антитела или антигенсвязывающие фрагменты или их варианты по настоящему изобретению можно также описать или определить с точки зрения их способности специфично обнаруживать присутствие антигена. Термин обнаруживать или обнаружение используют в наиболее широком смысле, так что он охватывает количественные, полуколичественные или качественные измерения в отношении целевой молекулы. Согласно одному аспекту антитела, описанные в данном документе, могут обеспечивать только определение наличия или отсутствия тау-полипептида в биологическом образце, например, посредством иммуногистохимической методики, и, таким образом, тау-полипептид является поддающимся обнаружению или, в качестве альтернативы, не поддающимся обнаружению в образце, как определено посредством данного способа.

Используемый в данном документе термин фосфоспецифичное антитело или фосфозависимое антитело означает специфичное антитело, в котором по меньшей мере часть или целый эпитоп основан на фосфорилированном аминокислотном остатке.

Фосфоспецифичное или фосфозависимое антитело не обнаруживает нефосфорилированный антиген. Термин фосфоселективное антитело означает специфичное антитело, которое предпочтительно связывается с фосфорилированным остатком и имеет более высокую аффинность к фосфорилированному, чем к нефосфорилированному антигену. Термин нефосфоселективное антитело или фосфонезависимое означает специфичное антитело, которое предпочтительно связывается с нефосфорилированным остатком и имеет более высокую аффинность к нефосфорилированному, чем к фосфорилированному антигену. В определенных вариантах осуществления антитела к тау-белку по настоящему изобретению или их антигенсвязывающие фрагменты являются фосфозависимыми. В других определенных вариантах осуществления антитела к тау-белку по настоящему изобретению или их антигенсвязывающие фрагменты являются фосфонезависимыми.

Термин полинуклеотид предназначен для охвата как единичной нуклеиновой кислоты, так и множества нуклеиновых кислот, и относится к выделенной молекуле или конструкции нуклеиновой кислоты, например информационной РНК (mRNA) или плазмидной ДНК (pDNA). Полинуклеотид может содержать обычную фосфодиэфирную связь или нетрадиционную связь (например, амидную связь, такую как обнаруженная в пептидных нуклеиновых кислотах (PNA)). Термин молекула нуклеиновой кислоты относится к любой одной или нескольким частям нуклеиновой кислоты, например фрагментам ДНК или РНК, присутствующим в полинуклеотиде. Под выделенной нуклеиновой кислотой или полинуклеотидом подразумевают молекулу нуклеиновой кислоты, ДНК или РНК, которая была извлечена из ее нативной окружающей среды. Например, рекомбинантный полинуклеотид, кодирующий антитело, содержащийся в векторе, считается выделенным для целей настоящего изобретения.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид или нуклеиновая кислота представляет собой ДНК. В случае ДНК, полинуклеотид, содержащий нуклеиновую кислоту, которая кодирует полипептид, обычно может содержать промотор и/или другие элементы контроля транскрипции или трансляции, функционально связанные с одной или несколькими кодирующими областями. Функциональная связь наблюдается, когда область, кодирующая продукт гена, например полипептид, ассоциирована с одним или несколькими регуляторными последовательностями таким образом, чтобы экспрессия продукта гена находилась под влиянием или контролем регуляторной последовательности(ей). Таким образом, промоторная область будет функционально связанной с нуклеиновой кислотой, которая кодирует полипептид, если промотор был способен к осуществлению транскрипции этой нуклеиновой кислоты. Промотор мо- 9 035530 жет являться клеточно-специфичным промотором, который управляет транскрипцией ДНК на существенном уровне только в предварительно определенных клетках. Другие элементы контроля транскрипции, кроме промотора, например энхансеры, операторы, репрессоры и сигналы терминации транскрипции, могут быть функционально связанными с полинуклеотидом для управления клеточно-специфичной транскрипцией. В данном документе раскрыты подходящие промоторы и другие области контроля транскрипции.

Используемые в данном документе термины лечить или лечение относятся к терапевтическому лечению, а также профилактическим или превентивным мерам, где целью является предупреждение или замедление (уменьшение) нежелательного физиологического изменения или расстройства, такого как развитие паркинсонизма или болезни Альцгеймера. Благоприятные или желательные клинические результаты включают без ограничения ослабление симптомов, уменьшение степени заболевания, стабилизированное (т.е. не ухудшающееся) состояние заболевания, отсрочку или замедление прогрессирования заболевания, улучшение или временное облегчение состояния заболевания и ремиссию (либо частичную, либо полную), которые являются либо поддающимися обнаружению, либо не поддающимися обнаружению. Лечение также может означать продление выживания по сравнению с ожидаемой выживаемостью без получения лечения. Нуждающиеся в лечении включают тех, у кого уже имеются состояние или расстройство, а также лиц, склонных к развитию состояния или расстройства, или тех, у кого необходимо предотвратить проявление состояния или расстройства. Используемый в данном документе термин лекарственный препарат относится к средству, используемому для лечения нежелательного физиологического изменения или расстройства.

Под субъектом, или индивидуумом, или животным, или пациентом, или млекопитающим подразумевается любой субъект, в частности субъект, являющийся млекопитающим, например пациентчеловек, для которого необходимы диагностика, прогнозирование, предупреждение или терапия.

Описание

Тау-белок является часто встречающимся белком центральной и периферической нервной системы, характеризующимся множеством широко известных изоформ. В CNS человека по причине альтернативного сплайсинга существуют шесть основных изоформ тау-белка, которые варьируются по размеру от 352 до 441 (Hanger, et al. Trends Mol Med 15:112-9, 2009). Эти изоформы отличаются одна от другой по подвергающемуся регуляции включению 0-2№концевых вставок и 3 или 4 тандемно расположенных повторов, связывающихся с микротрубочками, и при этом они упоминаются как ON3R (SEQ ID NO: 6), 1N3R (SEQ ID NO: 4), 2N3R (SEQ ID NO: 2), ON4R (SEQ ID NO: 5), 1N4R (SEQ ID NO: 3) и 2N4R (SEQ ID NO: 1). Используемый в данном документе термин рекомбинантный тау-белок относится к изоформе тау-белка с SEQ ID NO: 1, которая лишена фосфорилирования и других посттрансяционных модификаций. Тау-белок может быть рекомбинантно экспрессирован в больших количествах, например, в E.coli, бакуловирусе, млекопитающем или бесклеточных системах. Рекомбинантный тау-белок может быть рекомбинантно экспрессирован и очищен посредством стандартных способов. (Barghorn, et al 2004, Meth Mol Biol 35-51).

Тау-белок связывает микротрубочки и регулирует транспорт груза в клетках, процесс, который может модулироваться с помощью фосфорилирования тау-белка, которое наблюдается в случае многих из 79 потенциальных сайтов фосфорилирования серина (Ser) и треонина (Thr). Тау-белок подвергается высокому уровню фосфорилирования в ходе развития головного мозга. Степень фосфорилирования снижается в зрелом возрасте. Некоторые сайты фосфорилирования расположены в пределах доменов связывания микротрубочек тау-белка, и было показано, что повышение уровня фосфорилирования тау-белка приводит к отрицательной регуляции связывания микротрубочек. Например, Ser262 и Ser396, которые расположены в пределах мотивов связывания микротрубочек или примыкают к ним, являются гиперфосфорилированными в тау-белках аномальных спаренных спиральных филаментов (PHF), основном компоненте нейрофибриллярных клубков (NFT) в головном мозге пациентов с AD. PHF являются филаментными агрегатами тау-белков, которые являются аномально гиперфосфорилированными и могут быть окрашены специфичными антителами к тау-белку и обнаружены посредством световой микроскопии. То же самое справедливо и для так называемых прямых филаментов тау-белка. PHF образуют перекрученные ленты, состоящие из двух филаментов, перекрученных один вокруг другого с периодичностью приблизительно 80 нм. Эти патологические особенности обычно называют тау-белок-патологией, таупатологией или патологией, связанной с тау-белком. Для более подробного описания нейропатологических особенностей таупатий см. Lee et al., Annu. Rev. Neurosci. 24 (2001), 1121-1159, и Gotz, Brain. Res. Rev. 35 (2001), 266-286, содержание раскрытия которого включено в данный документ посредством ссылки. Физиологический тау-белок стабилизирует микротрубочки в нейронах. Патологическое фосфорилирование приводит к локализации и агрегации аномального тау-белка, который вызывает дестабилизацию микротрубочек и нарушение клеточного транспорта. Агрегированный тау-белок является нейротоксичным in vitro (Khlistunova et al., J. Biol. Chem. 281 (2006), 1205-1214). Разновидности, точно являющиеся нейротоксичными, остаются неустановленными, однако, так же, как и механизм(ы), посредством которых они приводят к гибели нейронов. Агрегаты тау-белка можно наблюдать в качестве главного компонента нейрофибриллярных клубков (NFT) при многих таупатиях, таких как болезнь Альцгеймера

- 10 035530 (AD), лобно-височные деменции, надъядерный паралич, болезнь Пика, заболевания, характеризующиеся появлением аргирофильных зерен (AGD), кортикобазальная дегенерация, FTDP-17, болезнь Паркинсона, деменция боксеров (обзор в Gendron and Petrucelli, Mol. Neurodegener. 4:13 (2009)). Помимо этих наблюдений, появляется доказательство того, что гибель нейронов, опосредованная тау-белком, может наблюдаться даже при отсутствии образования клубков. Растворимые разновидности фосфо-тау-белка присутствуют в CSF (Aluise et al., Biochim. Biophys. Acta. 1782 (2008), 549-558). Агрегаты тау-белка могут передавать неправильно уложенное состояние с внешней стороны во внутреннюю часть клетки и передавать его между клетками, которые совместно культивируются (Frost et al., J. Biol. Chem. 284 (2009), 1284512852).

Помимо участия в нейродегенеративных таупатиях наблюдались изменения в фосфорилировании тау-белка во время и после ишемии/реперфузии и после травмы головы вследствие удара, что свидетельствует о том, что тау-белок играет важную роль в нейрональном повреждении и клинической патофизиологии нейроваскулярных расстройств, таких как ишемический инсульт (Zheng et al., J. Cell. Biochem. 109 (2010), 26-29), а также изменения тау-белка обнаружены при хронической травматической энцефалопатии, таупатии у спортсменов, получивших сотрясение головного мозга, и военных ветеранов с черепно-мозговой травмой (TBI).

Настоящее изобретение предусматривает моноклональные антитела, при этом антитела связываются с отложениями тау-белка в ткани головного мозга человека с AD.

В определенных вариантах осуществления антитела a) связываются с отложениями тау-белка в ткани головного мозга человека с AD и b) не связываются с тау-белком в нормальной ткани головного мозга.

В определенных вариантах осуществления антитела a) связываются с отложениями тау-белка в ткани головного мозга человека с AD, b) не связываются с тау-белком в нормальной ткани головного мозга человека и c) не связываются с отложениями тау-белка в ткани головного мозга с прогрессирующим надъядерным параличем (PSP).

В определенных вариантах осуществления антитела a) образуют иммунный комплекс с отложениями тау-белка в ткани головного мозга человека с AD и b) не образуют иммунный комплекс с тау-белком в нормальной ткани головного мозга человека.

В определенных вариантах осуществления антитела являются химерными антителами.

В определенных вариантах осуществления антитела являются химерными антителами, содержащими антигенсвязывающую вариабельную область из антитела человека, которая специфично связывается с тау-белком, и рекомбинантную константную область IgG1 человека, и при этом химерные антитела являются отличными от антитела человека.

В некоторых вариантах осуществления антитела являются химерными антителами, содержащими антигенсвязывающую вариабельную область из антитела человека, которая специфично связывается с тау-белком, и рекомбинантную константную область IgG1 человека, при этом константная область химерного антитела является отличной от константной области антитела человека.

В некоторых вариантах осуществления антитела являются химерными антителами, содержащими встречающуюся в природе антигенсвязывающую вариабельную область человека, которая специфично связывается с тау-белком, и рекомбинантную константную область антитела IgG1 человека.

В определенных вариантах осуществления антитела являются химерными антителами, содержащими встречающиеся в природе вариабельные области легкой и тяжелой цепей из антитела человека и константные области тяжелой и легкой цепей рекомбинантного IgG1 человека.

В определенных вариантах осуществления антитела являются химерными антителами, содержащими вариабельные области тяжелой и легкой цепей из встречающегося в природе антитела человека и константные области тяжелой и легкой цепей рекомбинантного IgG1 человека.

В некоторых вариантах осуществления антитела являются химерными антителами, содержащими вариабельные области тяжелой и легкой цепей из антитела человека и константные области тяжелой и легкой цепей рекомбинантного IgG1 человека.

В определенных вариантах осуществления антитела не являются встречающимися в природе.

Человеческие антитела к тау-белку, раскрытые в данном документе, специфично связываются с таубелком и его эпитопами и с различными конформациями тау-белка и его эпитопов. Например, в данном документе раскрыты антитела, которые специфично связываются с патологически модифицированными изоформами тау-белка и агрегатами тау-белка. В одном примере антитело к тау-белку, раскрытое в данном документе, связывается с тау-белком или его эпитопом и не демонстрирует связывания с другими белками, превышающего фоновый уровень приблизительно в 3 раза. Антитело, которое специфично связывается или селективно связывается с конформером тау-белка, относится к антителу, которое не связывается со всеми конформациями тау-белка, т.е. не связывается по меньшей мере с одним другим конформером тау-белка, таким как рекомбинантный тау-белок.

Вариабельные домены химерных моноклональных антитела к тау-белку по настоящему изобретению могут происходить из группы здоровых субъектов-людей, у которых проявляется специфичный иммунный ответ по отношению к тау-белку, или из субъекта, пораженного болезнью Альцгеймера. Антите

- 11 035530 ла к тау-белку по настоящему изобретению можно также называть антителами, полученными от человека для того, чтобы подчеркнуть, что эти антигенсвязывающие области антитела действительно были экспрессированы субъектами и не были выделены, например, из человеческого иммуноглобулина, экспрессирующего фаговую библиотеку, что до сих пор являлось единственным обычным способом попытки получения антител, подобных человеческим антителам. Например, антитела по настоящему изобретению отличаются от mAb AT8, MC1 и AT100 тем, что они являются антителами, полученными от человека.

Антитела к тау-белку по настоящему изобретению можно охарактеризовать по их связывающим свойствам в отношении рекомбинантного тау-белка в ходе ELISA. Рекомбинантный тау-белок, полученный посредством очистки из Е.соН, характеризуется высоким уровнем растворимости благодаря его гидрофильным свойствам. У него отсутствует фосфорилирование остатков Ser, Thr и Tyr, что является характерным для тау-белка, наблюдаемого при таупатиях. В одном варианте осуществления настоящего изобретения моноклональные антитела к тау-белку, раскрытые в данном документе, не связываются специфично с рекомбинантным тау-белком в ходе ELISA. В другом варианте осуществления настоящего изобретения моноклональные антитела к тау-белку связываются с рекомбинантным тау-белком в ходе ELISA.

В одном варианте осуществления было показано, что антитело к тау-белку по настоящему изобретению специфично связывается с фосфорилированным тау-пептидом с SEQ ID NO: 315, или SEQ ID NO: 365. В другом варианте осуществления было показано, что антитело к тау-белку по настоящему изобретению связывается как с фосфорилированным тау-пептидом с SEQ ID NO: 317, так и с нефосфорилированным тау-пептидом с SEQID NO: 318 или как с фосфорилированным пептидом с SEQ ID NO: 329, так и нефосфорилированным тау-пептидом с SEQ ID NO: 367.

Антитела к тау-белку, раскрытые в данном документе, в определенных вариантах осуществления специфично связываются с тау-пептидом в ходе ELISA с применением пептидов. В одном варианте осуществления антитело к тау-белку связывается с тау-пептидом, например, GTPGSRSRTPSLPTPPTR (SEQ ID NO: 318), что соответствует аминокислотам 204-221 tau441. В другом варианте осуществления антитело к тау-белку связывается с тау-пептидом, например GEPPKSGDRSGYSSPGSPGTPGSRSRTPSLPTPPTREPKKVAVVRTPPKSPSSAKSRLQTAPVP MPDL (SEQ ID NO: 367), что соответствует аминокислотам 221-253 tau441. Антитело к тау-белку по настоящему изобретению не похоже на ранее раскрытые моноклональные антитела человека к тау-белку (US20130295021), которые, как сообщалось, связываются с различными тау-пептидами. Моноклональные антитела NI-105.4E4, NI105.4A3 и NI-105.4E4 связываются с пептидами 329-351+387-397, 337-343 и 35-49 tau441 соответственно.

Антитела к тау-белку по настоящему изобретению можно охарактеризовать по их связывающим свойствам в отношении PHF-тау-белка в ходе ELISA. Антитела к PHF-тау-белку клона AT8 связываются с PHF-тау-белком и широко используются для обнаружения PHF-тау-белка в нейрофибриллярных клубках в образцах от пациентов с болезнью Альцгеймера. AT8 является фосфоспецифичным моноклональным антителом и связывается с фосфорилированным Ser202 и Thr205 PHF-тау-белка, и при этом согласно многим публикациям оно используется в ELISA, иммуногистохимии, иммуноблоттинге, вестернблоттинге и подобных применениях. Клон AT8 распознает тау-белок при болезни Альцгеймера, а также PHF-тау-белок в ходе ELISA и не связывает нефосфорилированный тау-белок от здоровых индивидуумов или рекомбинантный тау-белок. В одном примере антитело к тау-белку по настоящему изобретению не связывается с PHF-тау-белком в ходе ELISA. В другом примере антитело к тау-белку по настоящему изобретению связывается с PHF-тау-белком в ходе ELISA.

Антитела к тау-белку по настоящему изобретению можно охарактеризовать по их связывающим свойствам в отношении PHF-тау-белка и рекомбинантного тау-белка посредством вестерн-блоттинга. При нейродегенеративных расстройствах в агрегации тау-белков с образованием PHF участвует несколько механизмов (фосфорилирование, убиквитинирование, окисление, гликирование). Эти патологические тау-белки визуализируются в ходе вестерн-блоттинга как три основные полосы от 55 до 69 кДа и минорная полоса в 74 кДа. Тау-белок 55 является результатом фосфорилирования самой короткой изоформы (SEQ ID NO: 6), тау-белок 64 - фосфорилирования вариантов тау-белка с одним кассетным экзоном (SEQ ID NO: 4 и/или SEQ ID NO: 5), тау-белок 69 фосфорилирования вариантов тау-белка с двумя кассетными экзонами (SEQ ID NO: 2 и/или SEQ ID NO: 3). Фосфорилирование самой длинной изоформы тау-белка (SEQ ID NO: 1) приводит к образованию дополнительного гиперфосфорилированного варианта - таубелка 74. В определенных вариантах осуществления антитела к тау-белку связываются с PHF-тау-белком в ходе вестерн-блот-анализа.

Антитела к тау-белку можно применять в иммуногистохимическом (IHC) исследовании срезов ткани нормального головного мозга или головного мозга с AD и охарактеризовать посредством такого исследования. Антитела к фосфо-тау-белку, в частности, указывают на нейрофибриллярную патологию с высоким уровнем чувствительности и специфичности, в то время как в нормальном здоровом головном мозге обнаружение тау-белка не наблюдается. Клинико-патологические исследования продемонстрировали, что отложения или скопления фосфо-тау-белка более точно соответствуют клиническим признакам по сравнению со скоплениями амилоида-β, и при этом постадийное прогрессирование от трансэнтори

- 12 035530 нальной до лимбической и до изокортикальной областей является основой для определения стадий AD [R.J. Castellani, et al., Acta Neuropathol (Berl) 111, 503(2006); H. Break and E. Break, Acta Neuropathol (Berl) 82, 239 (1991). Моноклональные антитела к тау-белку, которые часто используются в иммуногистохимическом исследовании, включают AT8 (тау-белок p202/p205), AT180 (тау-белок p231), AT270 (тау-белок p181), AT100 (pT212 и S214) и MC-1 (Mercken M, et al., 1992 Acta Neuropatho 84:265-272, ZhengFischhofer 1998 Eur J Biochem 252:542-552, Goedert M, et al. 1994 Biochem J 301: 871-877). В одном варианте осуществления моноклональные антитела к тау-белку по настоящему изобретению обнаруживают тау-белок в нормальной (т.е. здоровой) ткани головного мозга человека и обнаруживают отложения таубелка в ткани головного мозга человека с AD. В другом примере антитела к тау-белку по настоящему изобретению обнаруживают отложения тау-белка в ткани головного мозга человека с AD, но не обнаруживают тау-белок в нормальной ткани головного мозга человека.

Антитела к тау-белку по настоящему изобретению можно применять в иммуногистохимическом исследовании в отношении дополнительных таупатий, включающих прогрессирующий надъядерный паралич, болезнь Пика и другие, и охарактеризовать посредством такого исследования. Патологические филаментные включения тау-белка в PSP состоят из ошибочно фосфорилированных тау-белков, но при этом наблюдается преимущественное накопление аномальных изоформ тау-белка 4R. Панель моноклональных антител к тау-белкам, включая Alz50, Tau-2, T46, PHF-1, PHF-6, 12E8, PHF-1, RD4 и AT8, используют для характеристики отложений при PSP (J Neuropathol Exp Neurol. 1998 (6): 588-601.). Все моноклональные антитела окрашивают внутринейрональные и глиальные включения, однако 12E8 и PHF-6 окрашивают их с меньшей интенсивностью. Эти антитела обнаруживают разные эпитопы тау-белка, например фосфоспецифичные, специфичные к изоформе, а также обнаруживают отложения тау-белка в головном мозге с AD. RD3, моноклональное антитело к тау-белку, которое специфично обнаруживает изоформу тау-белка с 3 повторами, демонстрирует ограниченное IHC обнаружение PSP, но интенсивно окрашивает отложения тау-белка в тканях головного мозга человека с AD. Ограниченное обнаружение PSP этим антителом обусловлено сниженными уровнями изоформы тау-белка с 3 повторами при PSP (De Silva, R. et al., Neuropath and Appl Neurobio (2003) 29(3)288-302). В одном варианте осуществления антитела к тау-белку по настоящему изобретению обнаруживают отложения тау-белка в ткани головного мозга человека с AD, но не обнаруживают тау-белок в нормальной ткани головного мозга человека и не обнаруживают отложения тау-белка в головном мозге человека с PSP.

В определенных вариантах осуществления антитело содержит тяжелую цепь, содержащую: a) CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 163, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 164 и CDR3область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 165, b) CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 169, CDR2область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 170 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 171, c) CDR1область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 175, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 176 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 177, d) CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 181, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 182 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 183, e) CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 185, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 186 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 187, f) CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 190, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 191 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 192, g) CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 196, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 197 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 198, h) CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 213, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 214 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 215, i) CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 219, CDR2область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 220 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 221. В определенных вариантах осуществления антитело содержит легкую цепь, содержащую:

a) CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 166, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 167 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 168,

b) CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 172, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 174,

c) CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 178, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 179 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 180,

d) CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 172, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 184,

e) CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 188, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 189,

f) CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 193, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 194 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 195,

g) CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 199, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 200,

h) CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 216, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 217 и

i) CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 218, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 217.

- 13 035530

В определенных вариантах осуществления антитело выбрано из группы, состоящей из: а) антитела, содержащего, CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 163, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 164 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 165, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 166, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 167 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 168; b) антитела, содержащего CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 169, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 170 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 171, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 172, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 174; c) антитела, содержащего CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 175, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 176 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 177, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 178, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 179 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 180; d) CDR1область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 181, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 182 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 183, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 172, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 184; e) антитела, содержащего CDR1область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 185, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 186 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 187, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 188, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 189; f) антитела, содержащего CDR1область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 190, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 191 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 192, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 193, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 194 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 195; g) антитела, содержащего CDR1область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 196, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 197 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 198, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 199, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 200; h) антитела, содержащего CDR1область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 213, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 214 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 215, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 216, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 217; i) антитела, содержащего CDR1область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 213, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 214 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 215, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 218, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 174 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 217; j) антитела, содержащего CDR1область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 219, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 220 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 221, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 218, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 217.

В определенных вариантах осуществления антитело содержит вариабельную область тяжелой цепи, выбранную из группы, состоящей из аминокислотной последовательности с SEQ ID NO: 87, 91, 95, 99, 103, 107, 111, 123, 127 и 131. В определенных вариантах осуществления антитело содержит вариабельную область легкой цепи, выбранную из группы, состоящей из аминокислотной последовательности с SEQ ID NO: 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 124, 128, 132.

В некоторых вариантах осуществления предложены антигенсвязывающие фрагменты вышеописанных антител.

Антигенсвязывающие фрагменты предпочтительно связываются с одним и тем же эпитопом. Моноклональные антитела к тау-белку и антигенсвязывающие фрагменты по настоящему изобретению связываются с разными эпитопами в сравнении с эпитопами для известных человеческих антител к таубелку, таких как, например, NI-105.4E4 и NI-105.4A3. Связывание с другим эпитопом подразумевает, что антитело связывается с другими критически важными аминокислотными остатками по сравнению с известными антителами.

В некоторых вариантах осуществления антитела действуют синергически, если применяются в комбинации с другими антителами, связывающими тау-белок. Используемый в данном документе термин синергический означает, что комбинированный эффект антител или антигенсвязывающих фрагментов, если их применяют в комбинации, превышает их аддитивные эффекты при отдельном применении. Способ расчета синергии осуществляют с помощью показателя аддитивности. Общее представление о показателе аддитивности (CI) было описано у Chou and Talalay (Adv Enzyme Regul., 22:27-55, 1984).

В некоторых вариантах осуществления антитела и антигенсвязывающие фрагменты предназначены для применения в качестве лекарственного препарата и предпочтительно для применения в диагностике, терапевтическом и/или профилактическом лечении нейродегенеративных заболеваний. Человеческие антитела к тау-белку по настоящему изобретению или их фрагменты, включая Fab, (Fab')₂, scFvфрагменты или антитела, содержащие антигенсвязывающие участки антител по настоящему изобретению, можно использовать для лечения, уменьшения или предупреждения симптомов у пациентов с нейродегенеративным заболеванием, которое предполагает накопление тау-белка или патологического таубелка или агрегацию тау-белка в пределах головного мозга, например, у пациентов, страдающих AD, а также любой другой таупатией или другой патологией, связанной с тау-белком, при которой тау-белок может сверхэкспрессироваться. Без ограничения конкретной теорией предполагается, что антитела по настоящему изобретению могут проявлять благоприятный эффект за счет уменьшения или устранения патологического тау-белка или агрегации тау-белка и, следовательно, количества PHF-тау-белка в голов- 14 035530 ном мозге. Антитела по настоящему изобретению можно использовать для лечения пациента-животного, относящегося к любой систематической группе. Примеры таких животных включают млекопитающих, таких как люди, грызуны, собаки, кошки и сельскохозяйственные животные. Например, антитела по настоящему изобретению пригодны для получения лекарственного препарата для лечения AD, где лекарственный препарат получают для введения в дозах, определенных в данном документе.

Другой вариант осуществления настоящего изобретения представляет собой способ уменьшения агрегации тау-белка у пациентов, нуждающихся в этом, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества выделенного антитела по настоящему изобретению в течение времени, достаточного для уменьшения агрегации тау-белка. Другой вариант осуществления настоящего изобретения представляет собой способ лечения или уменьшения симптомов нейродегенеративного заболевания, которое предполагает агрегацию тау-белка у пациента, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества выделенного антитела по настоящему изобретению в течение времени, достаточного для лечения или уменьшения симптомов нейродегенеративного заболевания. Другой вариант осуществления настоящего изобретения представляет собой способ уменьшения количества тау-белка у пациентов, нуждающихся в этом, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества выделенного антитела по настоящему изобретению в течение времени, достаточного для уменьшения количества тау-белка.

В любом из указанных выше вариантов осуществления нейродегенеративное заболевание, которое предполагает агрегацию тау-белка, является таупатией. Используемый в данном документе термин таупатия охватывает любое нейродегенеративное заболевание, которое предполагает патологическую агрегацию тау-белка в пределах головного мозга. В дополнение к семейной и спорадической AD, другими иллюстративными таупатиями являются лобно-височная деменция с паркинсонизмом, связанная с хромосомой 17 (FTDP-17), прогрессирующий надъядерный паралич, кортикобазальная дегенерация, болезнь Пика, прогрессирующий подкорковый глиоз, деменция, характеризующаяся только клубками, диффузные нейрофибриллярные клубки с кальцификацией, деменция, характеризующаяся появлением аргирофильных зерен, комплекс боковой амиотрофический склероз-паркинсонизм-деменция, синдром Дауна, синдром Герстмана-Штраусслера-Шейнкера, болезнь Галлервордена-Шпатца, миозит с включенными тельцами, болезнь Крейтцфельдта-Якоба, мультисистемная атрофия, болезнь Ниманна-Пика типа C, прион-протеинцеребральная амилоидная ангиопатия, подострый склерозирующий лейкоэнцефалит, миотоническая дистрофия, негуанамианная болезнь двигательных нейронов с нейрофибриллярными клубками, постэнцефалитический паркинсонизм и хроническая травматическая энцефалопатия, такая как деменция боксеров (болезнь боксеров). (Morris, et al. Neuron 70:410-26, 2011).

Поведенческий фенотип, связанный с тау-белком, включает когнитивные нарушения, ранее изменение личности и расторможенность, апатию, абулию, мутизм, апраксию, персеверацию, стереотипные движения/стереотипное поведение, гиперорализм, неорганизованность, неспособность планировать или организовывать последовательные задания, эгоизм/бесчувственность, антисоциальные черты, отсутствие эмпатии, запинание, неграмотную речь с частыми инверсионными ошибками, но относительно сохранившимся пониманием, нарушение понимания и нехватку словарного запаса, медленно прогрессирующую нестабильность походки, ретропульсию, замирание, частое падение, аксиальную ригидность, нечувствительную к леводопе, надъядерный паралич взора, подергивания глазных яблок с прямоугольным сигналом, медленные вертикальные саккады, псевдобульбарный синдром, апраксию конечностей, дистонию, потерю кортикальной чувствительности и тремор.

Пациенты, подлежащие лечению, включают индивидуумов, у которых не наблюдаются симптомы, с риском возникновения AD или другой таупатии, а также пациентов, у которых в настоящее время проявляются симптомы. Пациенты, подлежащие лечению, включают индивидуумов с известным генетически обусловленным риском возникновения AD, таким как семейный анамнез AD или присутствие генетических факторов риска в геноме. Типичными факторами риска являются мутации в белкепредшественнике амилоида (АРР), особенно в положении 717 и положениях 670 и 671 (мутации Hardy и Swedish, соответственно). Другими факторами риска являются мутации в генах пресенилина, PS1, и PS2, и ApoE4, семейный анамнез гиперхолестеринемии или атеросклероза. Индивидуумов, которые в настоящее время страдают AD, можно отличить от индивидуумов с типичной деменцией по наличию факторов риска, описанных выше. Кроме того, доступен ряд диагностических тестов для выявления индивидуумов с AD. Они включают измерение уровней тау-белка и Aβ42 в спинномозговой жидкости. Повышенные уровни тау-белка и пониженные уровни Aβ42 означают наличие AD. Индивидуумов, страдающих AD, можно также диагностировать посредством критериев Ассоциации AD и родственных заболеваний.

Другой вариант осуществления настоящего изобретения представляет собой способ уменьшения количества тау-белка у пациентов, нуждающихся в этом, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества выделенного антитела к тау-белку по настоящему изобретению в течение времени, достаточного для уменьшения количества тау-белка. Пациенты, подлежащие лечению, могут страдать от болезни, ассоциированной со сверхэкспрессией тау-белка. Некоторые мутации, включая мутации в интроне 10, индуцируют повышенные уровни функционально нормальной изоформы тау-белка с четырьмя повторами, что приводит к нейродегенерации. Сверхэкспрессия изоформы человеческого тау- 15 035530 белка с четырьмя повторами, в особенности в нейронах трансгенной мыши, ведет к развитию аксональной дегенерации в головном мозге и спинном мозге. В модели зарегистрировали аксональную дилатацию с накоплением нейрофиламентов, митохондрий и везикул. Аксонопатия и сопутствующая дисфункция сенсомоторных способностей зависели от дозы трансгена. При помощи этих результатов было доказано, что всего лишь повышения концентрации изоформы тау-белка с четырьмя повторами достаточно для повреждения нейронов в центральной нервной системе без образования внутринейрональных нейрофибриллярных клубков (Spittaels, et al., Am J Pathology 155(6) 2153-2165, 1999).

Введение/ фармацевтические композиции

Антитела к тау-белку по настоящему изобретению пригодны для использования в качестве как терапевтического, так и профилактического средства для лечения или предупреждения нейродегенеративных заболеваний, которые предполагают накопление тау-белка и/или патологическую агрегацию таубелка, таких как AD, или другие таупатии, или болезни, ассоциированные с тау-белком. У пациентов, у которых не наблюдаются симптомы, лечение можно начинать в любом возрасте (например, в возрасте приблизительно 10, 15, 20, 25, 30 лет). Как правило, однако, не обязательно начинать лечение до тех пор, пациент не достигнет приблизительно 40, 50, 60 или 70 лет. Лечение обычно предусматривает многократные дозы в течение некоторого периода времени. Лечение можно контролировать путем осуществления анализа ответов с участием антител, или активированных T-клеток, или B-клеток в отношении терапевтического средства в зависимости от времени. Если уровень ответа понижается, назначается введение бустерной дозы.

При применении в профилактических целях фармацевтические композиции или лекарственные препараты вводятся пациенту, предрасположенному к AD или другим болезням с вовлечением тау-белка или иным образом имеющему риск их возникновения, в количестве, достаточном для устранения или уменьшения риска, уменьшения тяжести или отсрочки начала заболевания, включая биохимические, гистологические и/или поведенческие симптомы заболевания, его осложнения и промежуточные патологические фенотипы, которые проявляются в ходе развития заболевания. При применении в терапевтических целях композиции или лекарственные препараты вводятся пациенту с подозрением на такое заболевание или пациенту, уже страдающему ним, в количестве, достаточном для уменьшения, приостановки или отсрочки любых симптомов заболевания (биохимических, гистологических и/или поведенческих). Введение терапевтического средства может уменьшить или устранить умеренное когнитивное нарушение у пациентов, у которых еще не развилась патология, характерная для болезни Альцгеймера. Количество, достаточное для осуществления терапевтического или профилактического лечения, определяется как терапевтически или профилактически эффективная доза. В обеих из профилактического и терапевтического режимов композиции или лекарственные препараты, как правило, вводят в нескольких дозах до достижения достаточного иммунного ответа.

Антитела к тау-белку или их фрагменты по настоящему изобретению можно вводить в комбинации с другими средствами, которые являются эффективными для лечения родственных нейродегенеративных заболеваний. В случае AD антитела по настоящему изобретению можно вводить в комбинации со средствами, которые уменьшают или предотвращают отложение бета-амилоида Αβ). Возможно, что патологии с PHF-тау-белком и Aβ являются синергичными. Таким образом, комбинированная терапия, нацеленная на устранение патологий, связанных как с PHF-тау-белком, так и с Aβ одновременно, может быть более эффективна, чем целенаправленное воздействие на каждую из них по отдельности.

В случае болезни Паркинсона и родственных нейродегенеративных заболеваний также возникает способ терапии путем иммуномодуляции для устранения агрегированных форм белка ЬЬЬ-синуклеина. Комбинированная терапия, которая нацелена на устранение как тау-белка, так и белка ЬЬЬ-синуклеина одновременно, может быть более эффективной, чем целенаправленное воздействие на каждый белок по отдельности. В способах по настоящему изобретению терапевтически эффективное количество антитела для лечения или уменьшения тяжести симптомов таупатии можно определить с помощью стандартных методик исследования. Например, дозу антитела можно определить путем введения средства в соответствующих животных моделях, хорошо известных из уровня техники.

Кроме того, для определения оптимальных диапазонов доз можно необязательно использовать анализы in vitro. Специалисты в данной области техники могут сделать выбор конкретной эффективной дозы (например, с помощью клинических исследований) с учетом нескольких факторов. Такие факторы включают заболевание, которое подлежит лечению или предупреждению, связанные с ним симптомы, массу тела пациента, иммунный статус пациента и другие факторы, известные специалисту в данной области техники. Точная доза для использования в составе также будет зависеть от пути введения и тяжести заболевания, и она должна быть определена в соответствии с заключением лечащего врача и обстоятельствами для каждого пациента. Эффективные дозы можно экстраполировать исходя из кривых дозаответ, полученных из тест-систем in vitro или на животных моделях. Способ введения антител по настоящему изобретению для терапевтического применения может представлять собой любой подходящий путь, посредством которого средство доставляют хозяину.

Фармацевтические композиции на основе этих антител пригодны для парентерального введения, например, внутрикожного, внутримышечного, интраперитонеального, внутривенного, подкожного, ин- 16 035530 траназального или интракраниального, или их можно вводить в спинномозговую жидкость головного мозга или спинного мозга.

Антитела по настоящему изобретению можно получить в виде фармацевтических композиций, содержащих эффективное количество антитела в качестве активного ингредиента в фармацевтически приемлемом носителе. Термин носитель относится к разбавителю, вспомогательному средству, наполнителю или среде, с которыми вводится антитело. Такие фармацевтические среды могут представлять собой жидкости, такие как вода и масла, включая масла, полученные из нефти, животного, растительного или синтетического происхождения, такие как арахисовое масло, соевое масло, минеральное масло, кунжутное масло и тому подобное. Например, можно использовать 0,4% солевой раствор и 0,3% глицин. Эти растворы являются стерильными и, как правило, не содержат твердые частицы. Они могут быть стерилизованы с помощью обычных, хорошо известных методик стерилизации (например, фильтрации). Композиции могут содержать фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества, которые необходимы для приблизительного соответствия физиологическим условиям, например, для доведения pH, и буферные вещества, стабилизирующие, загущающие, смазывающие и красящие вещества и т.д. Концентрация антител по настоящему изобретению в таком фармацевтическом составе может варьироваться в широком диапазоне, т.е. от менее чем приблизительно 0,5%, обычно приблизительно 1% или по меньшей мере приблизительно 1% вплоть до 15 или 20% по весу, и при этом она будет выбрана, в первую очередь, исходя из требуемой дозы, значений объема текучей среды, значений вязкости и т.д., в зависимости от конкретного выбранного способа введения.

Лечение можно проводить в режиме введения с одной дозой или в режиме введения с несколькими дозами, при котором исходный курс лечения может состоять из 1-10 отдельных доз, с последующими другими дозами, вводимыми в последующие временные интервалы, которые необходимы для поддержания и/или усиления ответа, например, через 1-4 месяца вводят вторую дозу и, при необходимости, последующую^) дозу(ы) через несколько месяцев. Примеры приемлемых схем лечения включают: (i) 0, 1 месяц и 6 месяцев, (ii) 0, 7 день и 1 месяц, (iii) 0 и 1 месяц, (iv) 0 и 6 месяцев, или другие схемы, достаточные для получения необходимых ответов, которые, как ожидается, приведут к уменьшению симптомов заболевания или уменьшению тяжести заболевания. Таким образом, фармацевтическую композицию по настоящему изобретению для внутримышечной инъекции можно получить с содержанием 1 мл стерильной буферной воды и от приблизительно 1 нг до приблизительно 100 мг, от приблизительно 50 нг до приблизительно 30 мг или от приблизительно 5 до приблизительно 25 мг антитела по настоящему изобретению. Подобным образом, фармацевтическую композицию по настоящему изобретению для внутривенной инфузии можно получить с содержанием приблизительно 250 мл стерильного раствора Рингера и от приблизительно 1 до приблизительно 30 мг или от приблизительно 5 до приблизительно 25 мг антитела по настоящему изобретению. Широко известны актуальные способы получения композиции для парентерального введения, которые более подробно описаны, например, в Remington's Pharmaceutical Science, 15th ed., Mack Publishing Company, Easton, PA.

Антитела по настоящему изобретению можно лиофилизировать для хранения и повторно растворить в подходящем носителе непосредственно перед использованием. Было показано, что эта методика эффективна в случае антитела и других препаратов, содержащих белки, и при этом можно использовать известные из уровня техники методики лиофилизации и восстановления.

Способы диагностики и наборы

Антитела по настоящему изобретению можно использовать в способах диагностики AD или другой таупатии у субъекта. Этот способ включает обнаружение у субъекта присутствия тау-белка с помощью диагностического реактива, такого как антитело или его фрагмент по настоящему изобретению. Таубелок можно обнаружить в биологическом образце от субъекта (например, в крови, моче, спинномозговой жидкости) посредством приведения в контакт биологического образца с диагностическим реактивом, представляющим собой антитело, и обнаружения связывания диагностического реагента, представляющего собой антитело, с PHF-тау-белком в образце от субъекта. Анализы для осуществления обнаружения включают хорошо известные способы, такие как ELISA, иммуногистохимия, вестерн-блоттинг или in vivo визуализация. Иллюстративными диагностическими антителами являются антитела CBTAU-7.1, CBTAU-8.1, CBTAU-16.1, CBTAU-18.1, CBTAU-20.1, CBTAU-22.1, CBTAU-24.1, CBTAU-41.1, CBTAU41.2 и CBTAU-42.1 по настоящему изобретению, и при этом они относятся к типу K IgG1.

Диагностические антитела или подобные реактивы можно вводить путем внутривенной инъекции в организм пациента или непосредственно в головной мозг любым подходящим путем, посредством которого средство доставляют хозяину, как проиллюстрировано выше. Доза антитела должна находиться в тех же диапазонах, что и для способов лечения. Как правило, антитело является меченым, хотя в некоторых способах первичное антитело с аффинностью к тау-белку является немеченым, и при этом вторичное средство для мечения используют для связывания с первичным антителом. Выбор метки зависит от средств обнаружения. Например, флуоресцентная метка подходит для оптического обнаружения. Использование парамагнитных меток подходит для томографического обнаружения без хирургического вмешательства. Радиоактивные метки также можно обнаружить с использованием PET или SPECT.

Диагностику осуществляют путем сравнения количества, размера и/или интенсивности для мече- 17 035530 ных тау-белков, накопления тау-белка, агрегатов тау-белка и/или нейрофибриллярных клубков в образце от субъекта или в субъекте с соответствующими исходными значениями. Исходные значения могут представлять собой средние уровни в популяции индивидуумов без заболевания. Исходные значения также могут отражать предыдущие уровни, определенные у одного и того же субъекта.

Способы диагностики, описанные выше, можно также использовать для контроля ответа субъекта на терапию путем обнаружения присутствия тау-белка у субъекта до, во время или после лечения. Изменение значений может быть по отношению к исходному уровню сигналов для ответа на лечение. Значения также могут временно изменяться в биологических жидкостях по мере того, как головной мозг очищается от патологического тау-белка.

Настоящее изобретение дополнительно относится к набору для осуществления вышеописанных способов диагностики и контроля. Обычно такие наборы содержат диагностический реактив, такой как антитела по настоящему изобретению, и необязательно детектируемую метку. Диагностическое антитело само по себе может содержать детектируемую метку (например, флуоресцентную молекулу, биотин и т.д.), которая поддается непосредственному обнаружению или обнаружению с помощью вторичной реакции (например, реакции со стрептавидином). В качестве альтернативы, можно использовать второй реагент, содержащий детектируемую метку, при этом второй реагент обладает специфичностью связывания с первичным антителом. В диагностический набор, пригодный для измерения уровня тау-белка в биологическом образце, можно включать антитела для набора, предварительно связанные с твердой фазой, например, с лунками микротитрационного планшета.

Содержание всех приведенных в данной заявке документов (включая ссылки на литературные источники, выданные патенты, опубликованные заявки на патенты и одновременно находящиеся на рассмотрении заявки на патенты), таким образом, специально включены в данный документ посредством ссылки.

Примеры

Пример 1. Конструирование и мечение тау-пептида

Гиперфосфорилирование тау-белка, которое приводит к высвобождению из микротрубочек и приводит к деполимеризации, является патологическим признаком, встречающимся при болезни Альцгеймера (AD) и других родственных таупатиях. По мере того, как баланс свободного тау-белка к тау-белку, связанному с микротрубочками смещается в сторону первого, считается, что неассоциированный таубелок накапливается в неправильно свернутом, агрегированном состоянии. Предполагается, что в процессе развития болезни тау-белок принимает различные конформации с прогрессированием от растворимых димерных и олигомерных форм к нерастворимым агрегатам более высокого порядка, таким как спаренные спиральные филаменты (PHF) и нейрофибриллярные клубки (NFT). Однако точные формы тау-белка, которые вносят вклад в развитие патологии и, следовательно, оптимальные для терапевтического целенаправленного воздействия, остаются неизвестными. Следовательно, попытки целенаправленного воздействия на тау-белок, способствующий развитию заболевания, часто ограничены выбором цели. В целях получения новых молекул, связывающих тау-белок, вариабельные области антитела к таубелку выделяли из человеческих B-клеток памяти с помощью фосфорилированных и нефосфорилированных тау-пептидов в качестве антигенов-приманок с использованием подхода с использованием одиночных клеток.

В свойственном человеку спектре антител, вероятно, редко встречаются человеческие B-клетки памяти к тау-белку; поэтому было решено пометить приманки с тау-белком самыми яркими флуорофорами. Все тау-пептиды синтезировали с аминоконцевой группой биотина, с тем чтобы способствовать мечению двумя яркими флуорофорами, стрептавидином-APC или стрептавидином-PE (также называемыми тау-пептидными тетрамерами). Каждый тау-пептид метили обоими флуорофорами, с тем чтобы увеличить отношение сигнал-шум во время скрининга в отношении человеческих B-клеток памяти (подробно описано в примере 2) из образцов от доноров. Меченые тау-пептидные тетрамеры получали путем перемешивания биотинилированного пептида при молярном отношении пептида к стрептавидиновой метке 35:1 в течение ночи при 4°C посредством осторожного перемешивания. Свободный пептид удаляли путем разделения на колонке BioSpin 30 (Biorad). Все тау-пептидные тетрамеры хранили при 4°C в течение до 2 месяцев.

Пример 2. Выделение B-клеток памяти, специфичных к тау-белку, посредством FAC-сортинга с использованием меченых пептидных тетрамеров

Моноклональные антитела к тау-белку выделяли из B-клеток памяти (CD22+CD19+CD27+IgG+), выделенных из мононуклеарных клеток периферической крови (PBMC), которые были получены от доноров крови человека, у которых не проявляются симптомы (без AD), причем кровь была получена из Банка крови Сан-Диего и Службы нормальной донорской крови TSRI. Кроме того, образцы крови пациентов с AD получали от CRO, Quintiles, причем выделяли три антитела, подробно описанные в данной части документа. PBMC выделяли на Ficoll-Paque Plus (GE Healthcare) и криоконсервировали при 50 миллионах клеток на мл в 90% FBS и 10% DMSO. Аликвоту плазмы крови инактивировали нагреванием при 56°C и хранили при -20°C для последующей оценки реактивности плазмы крови.

Для каждого эксперимента по сортингу PBMC от 3-4 доноров оттаивали и перемещали в пробирки,

- 18 035530 содержащие предварительно нагретую полную RPMI (RPMI, 10% инактивированной нагреванием FBS и 1% пенициллина/стрептомицина), промывали и инкубировали по отдельности при 37°C в течение 16 ч. Объединенные PBMC обогащали в отношении зрелых B-клеток с помощью положительного отбора с использованием CD22+ магнитных шариков (Miltenyi Biotec). Клетки ресуспендировали в забуференном Tris солевом растворе с pH 7,4, содержащем 2 мМ EDTA и 0,25% бычьего сывороточного альбумина фракции V (TBS Buffer). Клетки окрашивали внеклеточными маркерами IgG-FITC, CD19-PerCPCy5.5 и CD27-PECy7 (все от BD Biosciences), для того чтобы пометить B-клетки. Отбирали десять миллионов клеток и в качестве отрицательного контроля использовали конъюгаты, меченые биотином и стрептавидином. Оставшиеся клетки инкубировали с пулом из десяти тау-пептидных тетрамеров с двойной меткой (SA-APC и SA-PE) при 16,8 нМ каждого. Клетки инкубировали в течение 60 мин при 4°C с осторожным перемешиванием, дважды промывали и повторно суспендировали при 20 млн клеток на мл в TBSбуфере. Перед сортингом добавляли DAPI (Thermo Fisher) в качестве маркера живых клеток, и клетки сортировали с помощью Beckman Coulter MoFlo XDP. Образцы отрицательного контроля использовали для определения неспецифичного связывания и соотношения сигнал-шум. CD19+, IgG+, CD27hi и положительные в отношении двух антигенов клетки собирали, помещали в отдельные лунки 96-луночного планшета для ПЦР и хранили при -80°C.

Пример 3. Выделение генов тяжелой и легкой цепи из одиночных B-клеток, специфичных к таубелку

Как подробно описано в примере 2, B-клетки памяти с реактивностью к тау-пептидным тетрамерам идентифицировали, выделяли и сортировали в отдельные микротитрационные лунки. cDNA тяжелой и легкой цепи выделяли посредством двухстадийного подхода, основанного на ПЦР, из отдельных Bклеток, и при этом последовательности вариабельного домена клонировали и экспрессировали in vitro в качестве полноразмерных рекомбинантных антител IgG1 и, таким образом, они представляли собой человеческие химерные антитела.

Синтез первой цепи cDNA

Первую цепь комплементарной ДНК (cDNA) получали из одиночных отсортированных клеток в соответствии с протоколом производителя (Superscript III, Invitrogen Corp.) со следующими модификациями: в каждую лунку, содержащую одну B-клетку, добавляли 0,5 мкл 10% NP-40, 1,0 мкл олиго-dT, 1,0 мкл dNTP и инкубировали образцы при 65°C в течение 5 мин. После инкубирования образцы помещали на лед на 1 мин. В каждую лунку добавляли следующее: 2,0 мкл DTT, 4,0 мкл MgCl₂, 1,0 мкл Superscript RT и 0,5 мкл RNaseOut. Образцы инкубировали при 50°C в течение 50 мин с последующим инкубированием при 85°C в течение 5 мин.

Стадия I. Амплификация

Для исходной ПЦР (стадия I) 2,5 мкл препарата cDNA использовали в качестве матрицы для амплификации тяжелой и легкой каппа- или лямбда-цепей. Использовали пулы праймеров, специфичных к лидерным областям тяжелой цепи антитела (праймеры CB-5'LVH, табл. 1), легкой каппа-цепи (праймеры CB-5'LVk, табл. 2) и легкой лямбда-цепи (праймеры CB-5' LVlam, табл. 3). На стадии I ПЦР-реакции использовали один обратный праймер, специфичный к CHI-области, CK и CL-областям тяжелой цепи, легкой каппа-цепи и легкой лямбда-цепи, соответственно.

_________Таблица 1. Прямые праймеры для VH на стадии I__________

ID праймера	ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК (5’-3’)	SEQ ID NO:
СВ-5'LVHla	ATGGACTGGACCTGGAGGTTCCTC	7
СВ-5'LVHlb	ATGGACTGGACCTGGAGGATCCTC	8
СВ-5'LVHlc	ATGGACTGGACCTGGAGGGTCTTC	9
СВ-5'LVHld	ATGGACTGGACCTGGAGCATCC	10
СВ-5'LVH2	GGACATACTTTGTTCCACGCTCCTGC	11
СВ-5'LVH3a	AGGT GT CCAGT GT CAGGT GCAGC	12
СВ-5'LVH3b	AGGT GT CCAGT GT GAGGT GCAGC	13
СВ-5'LVH3c	AGGT GT CCAGT GT CAGGTACAGC	14
СВ-5'LVH4	GCAGCTCCCAGATGGGTCCTG	15
СВ-5'LVH5	TCAACCGCCATCCTCGCCCTC	16
СВ-5'LVH6	GTCTGTCTCCTTCCTCATCTTCCTGC	17
3 'CgCHl	GGAAGGTGTGCACGCCGCTGGTC	18

- 19 035530

Таблица 2. Прямые праймеры для VK на стадии I

ID праймера	ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК (5’-3’)	SEQ ID NO:
СВ-5'LVkla	ATGAGGGTCCCCGCTCAGCTC	19
СВ-5'LVklb	ATGAGGGTCCCTGCTCAGCTC	20
СВ-5'LVklc	ATGAGAGTCCTCGCTCAGCTC	21
СВ-5'LVk2	TGGGGCTGCTAATGCTCTGG	22
СВ-5'LVk3	CCTCCTGCTACTCTGGCTCCCAG	23
СВ-5'LVk4	TCTCTGTTGCTCTGGATCTCTGGTGC	24
СВ-5'LVk5	CTCCTCAGCTTCCTCCTCCTTTGG	25
СВ-5'LVk6	AACTCATTGGGTTTCTGCTGCTCTGG	26
3'Ck-Rev543	GTTTCTCGTAGTCTGCTTTGCTCAGC	27
3'Ck-Rev494	GTGCTGTCCTTGCTGTCCTGCTC	28
3'Ck-Rev	GCACTCTCCCCTGTTGAAGCTCTTTG	29

Таблица 3. Прямые праймеры для VL на стадии I (5'-3')

Primer ID	DNA SEQUENCE (5'-3')	SEQ ID NO:
CB-5' L Vlaml	CTCCTCGCTCACTGCACAGG	30
CB-5' L Vlam2	CTCCTCTCTCACTGCACAGG	31
CB-5' L Vlam3	CTCCTCACTCGGGACACAGG	32
CB-5' L Vlam4	ATGGCCTGGACCCCTCTCTG	33
CB-5' L Vlam5	ATGGCATGGATCCCTCTCTTCCTC	34
3'C1 -Rev	CACTAGTGTGGCCTTGTTGGCTTG	35

Стадия II. Амплификация

Для стадии II 2,5 мкл ПЦР-продукта из стадии I использовали в качестве матрицы для амплификации вариабельных областей тяжелой цепи и легких каппа- или лямбда-цепей. Для получения ДНК из вариабельных областей использовали пул прямых и обратных праймеров, специально сконструированных для области каркаса 1 тяжелой цепи (праймеры pCB-IgG-VH и 3'SalIJH, табл. 4), легкой каппа-цепи (праймеры pCB-IgG-VK и 3'Jk, табл. 5) и легкой лямбда-цепи антитела (праймеры CB-VL и 3'Clam для стадии II, табл. 6). Кроме того, праймеры из стадии II были сконструированы для введения сайтов рестрикции XbaI (прямые праймеры VK и VL) и XhoI (праймеры 3'SalIJH) для последующего клонирования. После реакций амплификации на стадии II ПЦР-продукты вариабельного домена тяжелой и легкой цепи анализировали с использованием 1% агарозного геля. Фрагменты вариабельной области тяжелой и легкой цепи очищали в соответствии с протоколом производителя (Qiagen) и использовали на стадии III ПЦР-реакции.

Таблица 4. Прямые и обратные праймеры для VH на стадии II

ID праймера	ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК (5’ - 3’)	SEQ ID NO:
pCB-IgG-VHla	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTGCAGCTGGTGCAGTC	36
pCB-IgG-VHlb	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTCCAGCTGGTGCAGTC	37
pCB-IgG-VHlc	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTTCAGCTGGTGCAGTC	38
pCB-IgG-VHld	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTCCAGCTTGTGCAGTC	39
pCB-IgG-VH2a	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTCACCTTGAGGGAGTCTGG	40
pCB-IgG-VH2b	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTCACCTTGAAGGAGTCTGG	41
pCB-IgG-VH3a	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTGCAGCTGGTGGAGTC	42
pCB-IgG-VH3b	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCGAGGTGCAGCTGTTGGAGTC	43
pCB-IgG-VH3c	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCGAGGTGCAGCTGGTGGAGTC	44
pCB-IgG-VH3d	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTACAGCTGGTGGAGTCTG	45
pCB-IgG-VH4a	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGSTGCAGCTGCAGGAG	46
pCB-IgG-VH4b	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTGCAGCTACAGCAGTGG	47
pCB-IgG-VH5	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCGAGGTGCAGCTGGTGCAGTC	48
pCB-IgG-VH6	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTACAGCTGCAGCAGTCAG	49

- 20 035530

pCB-IgG-VH7	CCTGTCTGGAATTCAGCATGGCCCAGGTGCAGCTGGTGCAATCTG	50
3'SallJH 1/2/4/5	TCGGGCCTCGAGACTCACCTGAGGAGACGGTGACCAG	51
3 'SallJHS	TCGGGССTCGAGACTСACСTGAAGAGACGGTGAGCATTG	52
3 'SalIJH6	TCGGGCCTCGAGACTCACCTGAGGAGACGGTGACCGTG	53

Таблица 5. Прямые и обратные праймеры для VK на стадии II

ID праймера	ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК (5'-3')	SEQ ID NO:
pCB-IgG-VKla	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGACATCCAGATGACCCAGTCTCC	54
pCB-IgG-VKlb	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGACATCCAGTTGACCCAGTCTCC	55
pCB-IGG-VKlc	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGCCATCCAGTTGACCCAGTCTCC	56
pCB-IGG-VK2a	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGATRTTGTGATGACTCAGTCTCCAC TC	57
pCB-IgG-VK3a	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGAAATTGTGTTGACGCAGTCTCCAG	58
pCB-IgG-VK3b	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGAAATTGTGTTGACACAGTCTCCAG	59
pCB-IgG-VK3c	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGAAATAGTGATGACGCAGTCTCCAG	60
pCB-IgG-VK4	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGACATCGTGATGACCCAGTCTCC	61
pCB-IgG-VK5	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGAAACGACACTCACGCAGTCTCC	62
pCB-IgG-VK6	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGGAAATTGTGCTGACTCAGTCTCCAG	63
3'Jkl Rev Ila	CGCAAAGTGCACTTACGTTTGATTTCCACCTTGGTCCCTTGGC	64
3'Jk2 Rev lib	CGCAAAGTGCACTTACGTTTGATCTCCAGCTTGGTCCCCTGGC	65
3'Jk4 Rev lie	CGCAAAGTGCACTTACGTTTGATATCCACTTTGGTCCCAGGGC	66
3'Jk3 Rev lie	CGCAAAGTGCACTTACGTTTGATCTCCACCTTGGTCCCTCCGC	67
3'Jk5 Rev lid	CGCAAAGTGCACTTACGTTTAATCTCCAGTCGTGTCCCTTGGC	68

Таблица 6. Прямые и обратные праймеры для VL на стадии II

ID праймера	ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК (5'-3')	EQ ID NO:
CB-VL1	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGAATTTTATGCTGACTCAGCCCCACTC	69
CB-VL2	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGTCCTATGTGCTGACTCAGCC	70
CB-VL3	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGCAGTCTGTGCTGACGCAGCC	71
CB-VL4	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGCAGTCTGTCGTGACGCAGCC	72
CB-VL5	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGCAGTCTGCCCTGACTCAGCC	73
CB-VL6	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGTCTTCTGAGCTGACTCAGGACC	74
CB-VL7	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCGTCCTATGAGCTGACTCAGCCACC	75
3'Clam для	CTCAGAGGAGGGYGGGAACAGAGTGAC	76

стадии II

Стадия III. Амплификация: ПЦР с перекрывающимися праймерами

Для стадии III фрагменты ДНК вариабельной области тяжелой и легкой цепи, полученные на ста дии II, соединяли в одну кассету с помощью ПЦР с перекрывающимися праймерами с использованием следующего: 1) каппа-линкера или лямбда-линкера (способ получения линкера см. ниже), который отжигается на 3'-конце фрагмента легкой цепи из стадии II и на 5'-конце фрагмента тяжелой цепи из стадии II и содержит константную область либо каппа-, либо лямбда-цепи, 2) прямого перекрывающегося праймера с сайтом рестрикции XbaI и 3) обратного праймера с сайтом рестрикции XhoI. В результате этой реакции получают ампликон из приблизительно 2400 п.о. или 2200 п.о. (т.е. кассету) для каппа-или лямбдацепей, соответственно, состоящую из вариабельной области легкой цепи, линкера и вариабельной области тяжелой цепи. После амплификации продукт ПЦР-реакции с перекрывающимися праймерами очищали посредством ПЦР в соответствии с инструкциями производителя (Qiagen PCR Purification Kit).

Получение линкера

Линкерный фрагмент амплифицировали при помощи pCB-IgG, причем вектор с двумя промоторами из CMV получали в лаборатории и использовали в качестве матрицы для экспрессии генов как тяжелой, так и легкой цепи, и при этом праймеры приведены в табл. 7. Длина линкерного фрагмента составляла 1765 или 1536 пар оснований для каппа- или лямбда-линкера, соответственно. Каппа-линкер содержал, в направлении от 5' к 3', последовательность интрона, за которой следовала константная область каппацепи, поли^Дпоследовательность терминации и последовательность промотора цитомегаловируса, обеспечивающая возможность экспрессии рекомбинантных антител с одного вектора. Лямбда-линкер

- 21 035530 содержал константную область лямбда-цепи, поли(А)-последовательность терминации и последовательность промотора цитомегаловируса. Использовали стандартный обратный праймер (Linker_VH_HAVT20_pCB-IgG-R) и каппа-специфичный прямой праймер (Linker_CK_intron_pCB-IgG-F) (табл. 7). Амплифицированный фрагмент отделяли с использованием 1% агарозного геля и очищали в соответствии с протоколом производителя (Qiagen Gel Extraction Kit).

Таблица 7. Линкер и перекрывающиеся праймеры

ID праймера	ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ (5’-3’)	SEQ ID NO:
Linker_VH_HAVT20_pCB-IgG-R	GGCCATGCTGAATTCCAGACAGG	78
Linker_CK_intron_pCB-IgG-F	AAACGTAAGTGCACTTTGCGGCCGCTAGG	79
Linker_CL_intron_pCB-IgGF_opt	ACTCTGTTCCCRCCCTCCTCTGAGG	80
pCB-overlap F	CCGGTCTAGAGTTTTCCATGGCG	81
pCB-overlap R	TCGGGCCTCGAGACTCACC	82

Клонирование в вектор для экспрессии последовательностей млекопитающего

После очистки продукта, полученного в результате ПЦР с перекрывающимися праймерами, фрагмент расщепляли посредством XhoI и XbaI и затем отделяли с использованием 1% агарозного геля. Полосу, соответствующую перекрывающейся кассете (~2,4 т.п.о.), очищали и лигировали в вектор экспрессии IgG1, pCB-IgG. Гены вариабельных цепей антител субклонировали в этот вектор и осуществляли рекомбинантную экспрессию антител в виде IgG1, независимо от их первоначального (нативного) изотипа. (Пример аминокислотной последовательности константной области тяжелой цепи IgG1 показан в SEQ ID NO: 83 и аминокислотной последовательности константной области легкой каппа-цепи показан в SEQ ID NO: 84). Все трансформации проводили с использованием клеток DH5a Max Efficiency (Invitrogen Corp.) и выделяли с использованием 250 мкл SOC в течение 1 ч при 37°C. Приблизительно 100 мкл выделенных клеток высевали на чашки Петри с карбенициллином, дополненным 20 мМ глюкозы. Чашки Петри инкубировали в течение ночи при 37°C для обеспечения роста колоний. Оставшуюся смесь выделенных клеток культивировали с использованием 4 мл среды Super Broth (SB), дополненной 50 мкг/мл карбенициллина и инкубировали в течение ночи при 37°C со встряхиванием при 250 об./мин. На следующий день с каждой чашки Петри отбирали 5 колоний и выращивали в 3 мл среды SB, дополненной 50 мкг/мл карбенициллина в течение ночи при 37°C.

Ночные культуры использовали для получения плазмидной ДНК (Qiagen).

Пример 4. Секвенирование последовательностей антител, идентификация последовательностей зародышевого типа и подтверждение реактивности в отношении тау-пептида в супернатанте трансфекции

Для экспрессии IgG1 получали плазмидную ДНК из вышеупомянутых 4 мл культур с использованием минипрепов (Qiagen) и использовали для трансфицирования клеток 293Expi с применением ExpiFectamine согласно протоколам производителя (Invitrogen, Corp.). Продолжительность трансфекции составляла минимум 72 ч в 10 мл культурах, с тем чтобы обеспечить достаточную экспрессию IgG1. Клеточную среду собирали после трансфекции и центрифугировали, с тем чтобы удалить клетки и дебрис. Количественное определение в супернатантах проводили с использованием сенсорных наконечников с белком A на системе Octet Red (ForteBio). Каждый супернатант затем исследовали посредством ELISA с пептидом-приманкой, для того чтобы подтвердить присутствие антител с реактивностью в отношении тау-белка. Получали плазмидную ДНК с использованием минипрепа (Qiagen) из четырех отдельно отобранных культур из примера 3, и при этом тяжелые и легкие цепи секвенировали с использованием праймеров pC9_seq_HC-R (5'CATGTCACCGGGGTGTGG3')(SEQ ID NO: 85) и pC9_seq_LC-R (5'TCACAGGGGATGTTAGGGACA3')(SEQ ID NO: 86). Для последующих экспериментов выбрали один клон из четырех.

При помощи белковой и нуклеотидной последовательности вариабельной области тяжелой и легкой цепи клонов антител CBTAU-7.1 (SEQ ID NO: 87, 88, 89, 90), CBTAU-8.1 (SEQ ID NO: 91, 92, 93, 94), CBTAU-16.1 (SEQ ID NO: 95, 96, 97, 98), CBTAU-18.1 (SEQ ID NO: 99, 100, 101, 102), CBTAU-20.1 (SEQ ID NO: 103, 104, 105, 106), CBTAU-22.1 (SEQ ID NO: 107, 108, 109, 110), CBTAU-24.1 (SEQ ID NO: 111, 112, 113, 114), CBTAU-27.1 (SEQ ID NO: 115, 116, 117, 118), CBTAU-28.1 (SEQ ID NO: 119, 120, 121, 122), CBTAU-41.1 (SEQ ID NO: 123, 124, 125, 126), CBTAU-41.2 (SEQ ID NO: 127, 128, 129, 130), CBTAU-42.1 (SEQ ID NO: 131, 132, 133, 134), CBTAU-43.1 (SEQ ID NO: 135, 136, 137, 138), CBTAU-44.1 (SEQ ID NO: 139, 140, 141, 142), CBTAU-45.1 (SEQ ID NO: 143, 144, 145, 146), CBTAU-46.1 (SEQ ID NO: 147, 148, 149, 150), CBTAU-47.1 (SEQ ID NO: 151, 152, 153, 154), CBTAU-47.2 (SEQ ID NO: 155, 156, 157, 158) и CBTAU-49.1 (SEQ ID NO: 159, 160, 161, 162) определяли новые CDR для выбранных антител к тау-белку (табл. 8).

Получали антитело к тау-белку CBTAU-7.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 87, и VL с SEQ ID NO: 88, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-8.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 91 и VL с SEQ ID NO: 92, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к таубелку CBTAU-16.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 95, и VL с SEQ ID NO: 96, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-18.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 99, и VL с

- 22 035530

SEQ ID NO: 100, и константную область IgGl человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-20.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 103, и VL с SEQ ID NO: 104, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-22.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 107, и VL с SEQ ID NO: 108, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-24.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 111, и VL с SEQ ID NO: 112, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к таубелку CBTAU-2 7.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 115, и VL с SEQ ID NO: 116, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-28.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 119, и VL с SEQ ID NO: 120, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-41.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 123, и VL с SEQ ID NO: 124, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-41.2, содержащее VH с SEQ ID NO: 127, и VL с SEQ ID NO: 128, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-42.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 131, и VL с SEQ ID NO: 132, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к таубелку CBTAU-43.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 135, и VL с SEQ ID NO: 136, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-44.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 139, и VL с SEQ ID NO: 140, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-45.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 143, и VL с SEQ ID NO: 144, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-46.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 147, и VL с SEQ ID NO: 148, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU-47.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 151, и VL с SEQ ID NO: 152, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к таубелку CBTAU-47.2, содержащее VH с SEQ ID NO: 155, и VL с SEQ ID NO: 156, и константную область IgG1 человека. Получали антитело к тау-белку CBTAU 49.1, содержащее VH с SEQ ID NO: 159, и VL с SEQ ID NO: 160, и константную область IgG1 человека.

Таблица 8. Аминокислотные последовательности CDR вариабельной области тяжелой и легкой цепи

Клон	Область аминокислот таубелка	CDR1 (SEQ ID NO:)	CDR2 (SEQ ID NO:)	CDR3 (SEQ ID NO:)
CBTAU 7.1	194-212	SYWMH (163)	RINSDGSDTNYADSVKG (164)	GRSYGFFDY (165)
RASQIISSNYLA (166)	GASS RAT (167)	QQYGTSPRT (168)
CBTAU 8.1	194-212	TYGMH (169)	VIWFDGNNKYYADSVKG (170)	DWWEAGCRPCYFFDY (171)
KSSQSVLYSSNNKNYLA (172)	WASTRES (173)	QQYYSPPLT (174)
CBTAU 16.1	204-221	DYWMS (175)	NINQDGSAAYYVDSVRG (176)	DAHYYDRNRNNYYYYFDF (177)
RASQSVGANLA (178)	SASTRAT (179)	QQYNNWPRT (180)
CBTAU 18.1	200-217	SGNYYWS (181)	RMSSSGSTNYNPSLKS (182)	ESGSSWQNHYYYYGMDV (183
KSSQSVLYSSNNKNYLA (172)	WASTRES (173)	QQYYSTPLT (184)
CBTAU 20.1	58-78	NYAMS (185)	GISSDGNTFYADSVKG (186)	ESGRWGGGTLYGAHY (187)
KSSQSLLYNSNNKNYLT (188)	WASTRES (173)	QQYYSSPLT (189)

- 23 035530

CBTAU 22.1	406-429	DYNVH (190)	RISPNSGGTKYAQKFQG (191)	GHCDGTTCSRAY (192)
RSSQSLLHRSGHKYLH (193)	LGSNRAS (194)	MQTLQTPWT (195)
CBTAU 24.1	221-245	GYYLH (196)	WVNPRSGGTSYPPKFQG (197)	GRIPDVTAFDI (198)
KSSESLLYDSNNKNYLA (199)	WASTRES (173)	QQYFSTPWT (200)
CBTAU 27.1	299-328	DYWTA (201)	IIYSGDSDTRYHPSVQG (202)	LDARVDAGWQLDS (203)
KSSQSVFSRDNNKNYLA (204)	WASSRES (205)	QHYFNTPHN (206)
CBTAU 28.1	52-71	NYWIG (207)	IIYPGDSDTRYSPPFQG (208)	VGRPSKGGWFDP (209)
ESSQTLLYSSNEKNYLA (210)	WASTPES (211)	QQYYNSPYT (212)
CBTAU 41.1	406-429	DSYMS (213)	YISRSSSHTNYADSVKG (214)	VQTTMIEGKTKLNYFDY (215)
ESSHSLLYRSNNRNYLA (216)	WASTRES (173)	QQFYTTPYT (217)
CBTAU 41.2	406-429	DSYMS (213)	YISRSSSHTNYADSVKG (214)	VQTTMIEGKTKLNYFDY (215)
ESSHSLLYRSNNKNYLA (218)	WASTRES (173)	QQFYTTPYT (217)
CBTAU 42.1	406-429	KAWMS (219)	RIKSKVDGETTDYAAPV RG (220)	LIHCDLSACLPHF (221)
ESSHSLLYRSNNKNYLA (218)	WASTRES (173)	QQFYTTPYT (217)
CBTAU 43.1	299-328	NYWIA (222)	IIYPGDSDTTYSPSFQG (223)	LPRTDGDNSIGYFEY (224)
KSSQSVLYSSNSENYLA (225)	WASTRES (173)	QQYYSTPFT (226)
CBTAU 44.1	406-429	SYSMN (227)	YISSSTTTIYYADSVKG (228)	VPAPRLGGSYTY (229)
RASQSVSSSYLA	GASSRAT	QQYGTSPLT
		(230)	(167)	(231)
CBTAU 45.1	406-429	DAWMS (232)	RIKSKNVGETTDYAEHV RG (233)	GLGGGTYG (234)
RSSAGLRNNDGDILLS (235)	RVSRRDS (236)	MRGPY (237)
CBTAU 46.1	82-103	IYEMN (238)	YITNRGSTIYYADSVKG (239)	PRIGARVFDV (240)
KSSQTLLYKSNNENYLA (241)	WASTRES (173)	QQYFTTALT (242)
CBTAU 47.1	52-71	DHWIG (243)	IIFPEDSDTRYSGSFEG (244)	VSWRKGGWFDP (245)
KSSQSLLYTSNNKNYLA (246)	WASTRES (173)	QQYYNSPYT (212)
CBTAU 47.2	52-71	DHWIG (243)	IIFPGDSDIRYSPSFEG (247)	VAWRKGGWFDS (248)
KSTQSLLWSANNKNYLA (249)	WASTRES (173)	QQYYNSPYT (212)
CBTAU 49.1	52-71	SYWIG (250)	IIYPDDSDTRYNASLEG (251)	RDRNCSGTTCYPRWFDS (252)
KSSQSLFYSGNSKDFLA (253)	WASTRDS (254)	HQYHSTPLS (255)

Антитело CBTAU-7.1 содержит CDRl-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 163, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 164 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 165, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 166, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 167 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 168. Антитело CBTAU-8.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 169, CDR2

- 24 035530 область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 170 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 171, CDRl-область легкой цепи с SEQ ID NO: 172, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 174. Антитело CBTAU-16.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 175, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 176 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 177, CDR1область легкой цепи с SEQ ID NO: 178, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 179 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 180. Антитело CBTAU-18.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 181, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 182 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 183, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 172, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3область легкой цепи с SEQ ID NO: 184. Антитело CBTAU-20.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 185, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 186 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 187, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 188, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 189. Антитело CBTAU-22.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 190, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 191 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 192, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 193, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 194 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 195. Антитело CBTAU-24.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 196, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 197 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 198, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 199, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 200. Антитело CBTAU-27.1 содержит CDR1область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 201, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 202 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 203, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 204, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 205 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 206. Антитело CBTAU-28.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 207, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 208 и CDR3область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 209, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 210, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 211 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 212. Антитело CBTAU-41.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 213, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 214 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 215, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 216, CDR2область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 217. Антитело CBTAU-41.2 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 213, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 214 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 215, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 218, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 174 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 217. Антитело CBTAU-42.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 219, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 220 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 221, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 218, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 217. Антитело CBTAU-43.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 222, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 223 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 224, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 225, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 226. Антитело CBTAU-44.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 227, CDR2область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 228 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 229, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 230, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 167 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 231. Антитело CBTAU-45.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 232, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 233 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 234, CDR1область легкой цепи с SEQ ID NO: 235, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 236 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 237. Антитело CBTAU-4 6.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 238, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 239 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 240, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 241, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3область легкой цепи с SEQ ID NO: 242. Антитело CBTAU-47.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 243, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 244 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 245, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 246, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 212. Антитело CBTAU-47.2 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 243, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 247 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 248, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 249, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 212. Антитело CBTAU-49.1 содержит CDR1-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 250, CDR2-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 251 и CDR3-область тяжелой цепи с SEQ ID NO: 252, CDR1-область легкой цепи с SEQ ID NO: 254, CDR2-область легкой цепи с SEQ ID NO: 254 и CDR3-область легкой цепи с SEQ ID NO: 255.

Нуклеотидные последовательности вариабельных областей тяжелой и легкой цепи моноклональных антител к тау-белку сравнивали с известными последовательностями зародышевого типа посредством IgBLAST, инструмента анализа последовательностей вариабельного домена иммуноглобулинов, доступного в NCBI. (Nucleic Acids Res. 2013 Jul;41(Web Server issue):W34-40). Выравнивания последовательностей областей каркаса H1 и L1 тяжелой и легкой цепи с их соответствующей предложенной последовательностью зародышевой типа и ПЦР-праймером приведены в табл. 9. Подтвержденные последовательности увеличены в масштабе для экспрессии и очистки (подробно описано в примере 5). Выбранные

- 25 035530 клоны размножали в 50 мл культуры, и при этом получали плазмидную ДНК с использованием мидипрепа (набор Machery Nagel Midi Prep). Плазмидную ДНК затем использовали для трансфекции 30 мл культуры клеток 293Expi, как подробно описано в примере 5.

Таблица 9. Нуклеиновые кислоты каркаса H1 и L1, выровненные с последовательностью зародышевого типа и праймером (Аминокислоты, приведенные выше) Различия отмечены нижним регистром букв. Нативный относится к антителу

шАЬ	SEQ ID NO	Аминоконцевая последовательность белка и N-концевая последовательность нуклеиновой кислоты
CBTAU-7.1
VH	87	(Q V Q L V Е S)
pCB-IgGVHlb	37	CAGGTCCAGCTGGTGCAGTC
CBTAU-7.1VH	89	CAGGTCCAGCTGGTGGAGTCCGGGGGAGGCTTAGTTCAGCCTGGGGGGTCCCTG AGACTCTCCT
IGHV374*01.	256	gAGGTgCAGCTGGTGGAGTCCGGGGGAGGCTTAGTTCAGCCTGGGGGGTCCCTG AGACTCTCCT
VH нативного 7.1	257	(е V Q L V Е )
VL	88	(D I V М Т Q S Р)
pCB-IgG-Vk4	61	GACAT C GT GAT GAC C CAGT СТ С C
CBTAU-7.1	90	GACATCGTGATGACCCAGTCTCCAGACACCCTGTCTTTGTCTCCAGGGGAGAGA GCCACCCTCT
IGKV3- NL5*01	258	GAaATtGTGtTGACgCAGTCTCCAGcCACCCTGTCTTTGTCTCCAGGGGAaAGA GCCACCCTCT
VL нативного 7.1	259	(e I V 1 T Q S P)

CBTAU-8.1
VH	I91	1 (Q V A L V E S)

- 26 035530

pCB-IgGVH3a	42	CAGGTGCAGCTGGTGGAGTC
CBTAU-8.1 VH	93	CAGGTGCAGCTGGTGGAGTCGAGGGGAGGCGTGGTCCAGCCTGGGACGTCCCTG AGACTCTCCT
IGHV3-33*01	260	CAGGTGCAGCTGGTGGAGTCtgGGGGAGGCGTGGTCCAGCCTGGGACGTCCCTG AGACTCTCCT
VH нативного 8.1	261	(Q V A L V E S)
VL	92	(E T T L T Q S P)
pCB-IgG-Vk5	62	GAAACGACACTCACGCAGTCTCC
CBTAU-8.1 VL	94	GAAACGACACTCACGCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATCA
IGKV4-l*01	262	GAcAtcgtgaTgACcCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATCA
VL нативного 8.1	263	(d i v m T Q S P)

CBTAU-16.1
VH	95	(E V Q L V Q)
pCB-IgG-VH5	48	GAGGTGCAGCTGGTGCAGTC
CBTAU-16.1 VH	97	GAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGGTCCCTG AGACTCTCCT
IGHV3-64*01	264	GAGGTGCAGCTGGTGgAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGGTCCCTG AGACTCTCCT
VH нативного 16.1	265	(E V Q L V e S)
VL	96	(E I V Μ T Q S P)
pCB-IgG- VK3c	60	GAAATAGTGATGACGCAGTCTCCGG
CBTAU- 16.1VL	98	GAAATAGTGATGACGCAGTCTCCGGCCACCCTGTCTGTGTCTCCAGGGGAAAGA GCCACCCTCT
IGKV3-15*01	266	GAAATAGTGATGACGCAGTCTCCaGCCACCCTGTCTGTGTCTCCAGGGGAAAGA GCCACCCTCT
VL нативного 16.1	267	(E I V Μ T Q S P)

CBTAU-18.1
VH	99	(Q V Q L L E S)
		Нет точного соответствия праймера

- 27 035530

CBTAU-18.1 VH	101	CAGGTGCAGCTGTTGGAGTCGGGCCCAGGACTGGTGAACCCTTCACAGACCCTG TCCCTCACCT
IGHV4-31*05	268	CAGGTGCAGCTGcaGGAGTCGGGCCCAGGACTGGTGAAGCCTTCACAGACCCTG TCCCTCACCT
VH нативного 18.1	269	(Q V Q L q E S)
VL	100	(E I V L T Q S P)
pCB-IgG- VK3b	59	GAAAT T GT GT T GACACAGT CT C CAG
CBTAU-18.1 VL	102	GAAATTGTGTTGACACAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCAACATTA
IGKV4-l*01	262	GAcATcGTGaTGACcCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCAcCATcA
VL нативного 18.1	270	(d I V m T Q S P)

CBTAU-20.1
VH	103	(Q V Q L V E S)
pCB-IgG- VH3d	45	CAGGTACAGCTGGTGGAGTCTG
CBTAU-20.1 VH	105	CAGGTACAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTG AGACTCTCCT
IGHV3-23*04	271	gAGGTgCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTG AGACTCTCCT
VH нативного 20.1	272	(e V Q L V E S)
VL	104	(D I Q Μ T Q S P)
pCB-IgG- VKla	54	GACAT С CAGAT GACCCAGTCTCC
CBTAU-20.1 VL	106	GACATCCAGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATCA
IGKV4-l*01	262	GACATCgtGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATCA
VL нативного 20.1	273	(D I ν Μ T Q S P)

CBTAU-22.1

- 28 035530

VH	107	(Q V Q L V Q S)
pCB-IgG- VHla	36	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTC
CBTAU-22.1 VH	109	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGGGCTGAGGTGAAGAAGCCTGGGGCCCCAGTG AAGGTCTC
IGHV1-2*O2	274	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGGGCTGAGGTGAAGAAGCCTGGGGCCtCAGTG AAGGTCTC
VH нативного 22.1	275	(Q V Q L V Q S)
VL	108	(DVVMTQSPL)
		Нет точного соответствия праймера
CBTAU-22.1 VL	110	GATGTTGTGATGACGCAGTCTCCACTCTCCCTGCCCGTCACCCCTGGAGAGCCG GCCTCCATC
IGKV2-28*01	276	GATaTTGTGATGACtCAGTCTCCACTCTCCCTGCCCGTCACCCCTGGAGAGCCG GCCTCCATC
VL нативного 22.1	277	(DiVMTQSPL)

CBTAU-24.1
VH	111	(Q V Q L V S G)
pCB-IgG- VHld	39	CAGGTCCAGCTTGTGCAGTC
CBTAU-24.1 VH	113	CAGGTCCAGCTTGTGCAGTCTGGGGCTGAGGTGAAGAAGCCTGGGGCCTCAGTG AAGGTCTCC
IGHV1-3*O1	278	CAGGTCCAGCTTGTGCAGTCTGGGGCTGAGGTGAAGAAGCCTGGGGCCTCAGTG AAGGTtTCC
VH нативного 24.1	279	(Q V Q L V S G)
VL	112	(D I Q Μ T Q S P)
pCB-IgG- VKla	54	GACAT С CAGAT GACCCAGTCTCC
CBTAU-24.1 VL	114	GACATCCAGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
IGKV4-l*01	262	GACATCgtGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
VL нативного 24.1	280	(D I ν Μ T Q S P)

- 29 035530

CBTAU27.1
VH	115	(Q V Q L V E S)
pCB-IgG- VH3a	42	CAGGTGCAGCTGGTGGAGTC
CBTAU27.1 VH	117	CAGGTTCAGCTGGTGGAGTCTGGACCGGAGATGAGAAAGCCCGGGGAGTCTCTG AAAATTTCC
IGHV5-51*01	281	gAGGTgCAGCTGGTGcAGTCTGGAgCaGAGgTGAaAAAGCCCGGGGAGTCTCTG AAgATcTCC
VH нативного 27.1	282	(e V Q L V q S)
VL	116	(D I Q L T Q S P)
pCB-IgG- VKlb	55	GACAT C CAGT T GAC C CAGT СТ С C
CBTAU27.1 VL	118	GACATCCAGTTGACCCAGTCTCCAGATTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGCGG GCCACCATC
IGKV4-l*01	262	GACATCgtGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
VL нативного 27.1	283	(D I v m T Q S)P

CBTAU28.1
VH	119	(Q V Q L Q Q S)
pCB-IgG-VH6	49	CAGGTaCAGCTgCAGCAGTCAG
CBTAU2 8.1 VH	121	CAGGTGCAGCTACAGCAGTCAGGAGCAGAAGTGAAAAAGCCCGGGGAGTCTCTG AAGATCTCC
IGHV5-51*01	281	gAGGTGCAGCTggtGCAGTCtGGAGCAGAAGTGAAAAAGCCCGGGGAGTCTCTG AAGATCTCC
VH нативного 28.1	284	(e V Q L v Q S)
VL	120	(D I Q Μ T Q S P)
pCB-IgG- VKla	54	GACAT С CAGAT GACCCAGTCTCC
CBTAU2 8.1 VL	122	GACATCCAGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
IGKV4-l*01	262	GACATCgtGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
VL нативного 28.1	285	(D I ν Μ T Q S P)

- 30 035530

CBTAU41.1
VH	123	(E V Q L L E S)
pCB-IgG- VH3b	43	GAGGTGCAGCTGTTGGAGTC
CBTAU41.1 VH	125	GAGGTGCAGCTGTTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCAAGCCTGGAGGGTCCCTG AGACTCTCC
IGHV3-ll*06	286	cAGGTGCAGCTGgTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCAAGCCTGGAGGGTCCCTG AGACTCTCC
VH нативного 41.1	287	(q V Q L ν E S)
VL	124	(D I Q Μ T Q S P)
pCB-IgG- VKla	54	GACAT С CAGAT GACCCAGTCTCC
CBTAU41.1 VL	126	GACATCCAGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GTCACCATC
IGKV4-l*01	262	GACATCgtGATGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GTCACCATC
VL нативного 41.1	288	(D I ν Μ T Q S P)

CBTAU41.2
VH	127	(E V Q L V Q S)
pCB-IgG- VH3b	43	GAGGTGCAGCTGGTGCAGTC
CBTAU41.2 VH	129	GAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCAAGCCTGGAGGGTCCCTG AGACTCTCC
IGHV3-ll*06	286	cAGGTGCAGCTGGTGgAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCAAGCCTGGAGGGTCCCTG AGACTCTCC
VH нативного 41.2	289	(q V Q L ν E S)
VL	128	(A I Q L T Q S P)
pCB-IgG- VKlc	56	GCCATCCAGTTGACCCAGTCTCC
CBTAU41.2 VL	130	GCCATCCAGTTGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GTCACCATC
IGKV4-l*01	262	gaCATCgtGaTGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GTCACCATC
VL	290	(d I v m T Q S P)

- 31 035530

нативного 41.2

CBTAU42.1
VH	131	(Q L V Q S E G)
pCB-IgG- VHla-c	36	CAGCTGGTGCAGTC
CBTAU42.1 VH	133	CAGCTGGTGCAGTCTGAGGGAGGCCTGGCAGAGCCTGGGGGGTCCCTTAGACTC
IGHV3-15*01	291	CAGCTGGTGgAGTCTGgGGGAGGCCTGGCAGAGCCTGGGGGGTCCCTTAGACTC
VH нативного 42.1	292	(Q L V e S g g)
VL	132	(E I V L T Q S P)
pCB-IgG- VK3a	58	GAAATTGTGTTGAGGCAGTCTCGAG
CBTAU41.1 VL	134	GAAATTGTGTTGACGCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GTCACCATC
IGKV4-l*01	262	GAcATcGTGaTGACcCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GTCACCATC
VL нативного 42.1	293	(d I V m T Q S P)

CBTAU43.1
VH	135	(Q V Q L V Q S)
pCB-IgG- VHla	36	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTC
CBTAU43.1 VH	137	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGAGGAGAGGTGAAAAAGCCGGGGGAGTCTCTG AAGATCTCC
IGHV5-51*03	294	gAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGAGGAGAGGTGAAAAAGCCGGGGGAGTCTCTG AAGATCTCC
VH нативного 43.1	295	(e V Q L V Q S)
VL	136	(E I V L T Q S P)
pCB-IgG- VK3b	59	GAAAT T GT GT T GACACAGT CT C GAG
CBTAU43.1 VL	138	GAAATTGTGTTGACACAGTCTCCAGCCTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
IGKV4-l*01	262	GAcATcGTGaTGACcCAGTCTCCAGCCTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG

- 32 035530

		GCCACCATC
VL нативного 43.1	296	(d I V m T Q S P)

CBTAU44.1
VH	139	(E V Q L V E S)
pCB-IgG- VH3c	44	GAGGTGCAGCTGGTGGAGTC
CBTAU44.1 VH	141	GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTG AGACTCTCC
IGHV3-48*01	297	GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTG AGACTCTCC
VH нативного 44.1	298	(E V Q L V E S)
VL	140	(D I Q Μ T Q S)
pCB-IgG- VKla	54	GACAT С CAGAT GACCCAGTCTCC
CBTAU44.1 VL	142	GACATCCAGATGACCCAGTCTCCAGGCACCCTGTCTTTGTCTCCAGGGGAAAGA GCCACCCTC
IGKV3-20*01	299	GAaATtgtGtTGACgCAGTCTCCAGGCACCCTGTCTTTGTCTCCAGGGGAAAGA GCCACCCTC
VL нативного 44.1	300	(e I v L T Q S)

CBTAU45.1
VH	143	(E V Q L V E S)
pCB-IgG- VH3c	44	GAGGTGCAGCTGGTGGAGTC
CBTAU45.1 VH	145	GAAATTGTGTTGACACAGTCTCCACTCTCCCTGCCCGCCACCCTTGGACAGCCG GCCTCCATC
IGHV3-15*02	301	GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGACTTGGTAAAGCCTGGGGGGTCCCTT AGACTCTCC
VH нативного 45.1	302	(E V Q L V E S)
VL	144	(E I V L T Q S P)
pCB-IgG- VK3b	59	GAAAT T GT GT T GACACAGT CT C CAG
CBTAU45.1	146	GAAATTGTGTTGACACAGTCTCCACTCTCCCTGCCCGCCACCCTTGGACAGCCG

- 33 035530

VL		GCCTCCATC
IGKV2-30*01	303	GAtgTTGTGaTGACtCAGTCTCCACTCTCCCTGCCCGCCACCCTTGGACAGCCG GCCTCCATC
VL нативного 45.1	304	(d ν V m T Q S P)

CBTAU46.1
VH	147	(Q V Q L V E S)
pCB-IgG- VH3d	45	CAGGTACAGCTGGTGGAGTCTG
CBTAU46.1 VH	149	CAGGTACAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGAGAGTCCCTG AGACTCTCC
IGHV3-48*03	305	gAGGTgCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGAGAGTCCCTG AGACTCTCC
VH нативного 46.1	306	(E V Q L V E S)
VL	148	(D I Q L T Q S P)
pCB-IgG- VKlb	55	GACAT C CAGT T GAG C CAGT СТ С C
CBTAU46.1 VL	150	GACATCCAGTTGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
IGKV4-l*01	262	GACATCgtGaTGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
VL нативного 46.1	307	(D I v m T Q S P)

CBTAU47.1
VH	151	(Q V Q L V Q S)
pCB-IgG- VHla	36	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTC
CBTAU47.1 VH	153	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGAGCAGTGGTGAAAAAGCCCGGGGAGTCTCTG AAGATCTC
IGHV5-51*01	308	gAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGAGCAGTGGTGAAAAAGCCCGGGGAGTCTCTG AAGATCTC
VH нативного 47.1	309	(E V Q L V Q S)
VL	152	(A I Q L T Q S P)
pCB-IgG-	56	GCCATCCAGTTGACCCAGTCTCC

- 34 035530

VKlc
CBTAU44.1 VL	154	GCCATCCAGTTGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
IGKV4-l*01	262	GaCATCgtGaTGACCCAGTCTCCAGACTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
VL нативного 47.1	310	(d I v m T Q S P)

CBTAU47.2
VH	155	(Q V Q L V E S)
pCB-IgG- VH3d	45	CAGGTACAGCTGGTGGAGTCTG
CBTAU47.1 VH	157	CAGGTACAGCTGGTGGAGTCTGGAGCAGAACTGAAAAAGCCCGGGGAGTCTCTG AAGATCTCC
IGHV5-51*01	281	gAGGTgCAGCTGGTGcAGTCTGGAGCAGAACTGAAAAAGCCCGGGGAGTCTCTG AAGATCTCC
Native 47.2 VH	311	(e V Q L V q S)
VL	156	(E I V Μ T Q S P)
pCB-IgG- VK3c	60	GAAATAGT GAT GACGCAGT CT CCAG
CBTAU44.1 VL	158	GAAATTGTGATGACCCAGTCTCCAGAGTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
IGKV4-l*01	262	GAcATcGTGATGACCCAGTCTCCAGAGTCCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
VL нативного 47.2	312	(d I V Μ T Q S P)

CBTAU49.1
VH	159	(Q V Q L V Q S)
pCB-IgG- VHla	36	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTC
CBTAU49.1 VH	161	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGGGCAGAGGTGAAAAAGCCGTGGGAGTCTCTG AAGATCTCC
IGHV5-51*03	294	gAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGGGCAGAGGTGAAAAAGCCGTGGGAGTCTCTG AAGATCTCC
VH нативного 49.1	313	(e V Q L V Q S)
VL	160	(E I V L T Q S P)

pCB-IgG-VK6	63	GAAATTGTGCTGACTCAGTCTCCAG
CBTAU49.1 VL	162	GAAATTGTGCTGACTCAGTCTCCAGACTTCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
IGKV4-l*01	262	GAcATcGTGaTGACcCAGTCTCCAGACTTCCTGGCTGTGTCTCTGGGCGAGAGG GCCACCATC
VL нативного 49.1	314	(d I V m T Q S P)

Исследовали реактивность супернатантов IgG1, полученного в результате трансфекции, в отношении тау-пептидов посредством ELISA. Сначала 96-луночные планшеты с половинным объемом лунки для ELISA (Costar) покрывали 50 мкл бычьего актина (1 мкг/мл, Sigma) в качестве отрицательного контроля и антителом козы к F(ab)₂-фрагменту человека, очищенным аффинной хроматографией (2 мкг/мл, Jackson Immunoresearch) для подтверждения получения антитела. Планшеты покрывали в TBS в течение ночи при 4°C. На следующий день планшеты промывали 5 раз TBS/0,05% Tween (TBS-T) и блокировали 150 мкл TBS-T плюс 2,5% BSA (блокирующий буфер) в течение 2 ч. Тау-пептиды захватывали на планшетах, покрытых стрептавидином (Pierce) в концентрации 0,43 мкМ в 100 мкл TBS. Тау-пептиды, используемые для настройки анализа ELISA, были такими же, как и приманки в соответствующем эксперименте по сортингу. Планшеты, покрытые тау-пептидом, затем инкубировали при комнатной темпера

- 35 035530 туре в течение 1,5 ч. Все планшеты затем промывали 5 раз TBS/0,05% Tween, и блокировали 150 мкл и 300 мкл (только планшеты с тау-пептидом) блокирующего буфера, и инкубировали при комнатной температуре в течение 2 ч. Супернатанты с IgG, полученным в результате трансфекции, разводили до 5 мкг/мл (исходя из количественной оценки при помощи Octet Red) и титровали в 5 раз в TBS/0,25% BSA. Мышиное антитело к актину (Sigma, № по кат. А3853) использовали в концентрации 1,25 мкг/мл в качестве положительного контроля для планшетов, покрытых бычьим актином. Коммерческие антитела использовали в концентрации 1 мкг/мл в качестве положительного контроля для анализа ELISA, включая моноклональное антитело AT8 (Thermo, MN1020), моноклональное антитело AT100 (Thermo, MN1060) и моноклональное антитело AT180 (Thermo, MN1040). Первичные антитела инкубировали в течение 2 ч. при комнатной температуре и промывали 5 раз в TBS-T. В конечном итоге, Fab-антитело козы к IgG человека или конъюгированное с HRP антитело козы к IgG мыши (Jackson Labs) использовали при 1:2000 и 1:4000, соответственно, и инкубировали в течение 1 ч. при комнатной температуре. Планшеты промывали 5 раз в TBS-T и проявляли субстратом для пероксидазы SureBlue Reserve TMB Microwell (KPL). Реакцию останавливали посредством добавления 50 и 100 мкл (планшеты с пептидами) TMB Stop Solution (KPL) и измеряли поглощение при 450 нм с использованием планшет-ридера для ELISA. Результаты для супернатантов с указанными выше активностями связывания затем повторно подтверждали в независимом исследовании посредством ELISA. После повторного подтверждения выбирали клон для последующей экспрессии IgG и очистки (пример 5).

Пример 5. Экспрессия IgG1 и очистка клонированных химерных mAb к тау-белку

После скрининга посредством ELISA и подтверждения реактивности антител выбранные клоны экспрессировали как IgG1, как указано в примере 4. Среду для культуры клеток собирали и центрифугировали, чтобы удалить клетки, по прошествии от не менее 72 ч до не более 168 ч. Очищенные образцы надосадочной жидкости затем дважды пропускали через колонку с белком A на сефарозе (GE Healthcare Life Sciences) и промывали в 50 мл PBS. IgG затем элюировали 10 мл элюирующего буфера для IgG (Pierce) и нейтрализовали Tris с pH 8,0, а затем в течение ночи диализировали против PBS. Диализированные образцы концентрировали с использованием ультрацентрифужного блока с MWCO 10000 (Amicon) до конечного объема приблизительно 1 мл, и значения концентрации антител определяли с помощью сенсорных наконечников с белком A, используя IgG человека в качестве стандарта, на Octet Red384 (ForteBio). Очищенные антитела дополнительно подвергали контролю качества посредством осуществления SDS-PAGE в невосстанавливающих и восстанавливающих условиях и посредством эксклюзионной хроматографии.

- 36 035530

Пример 6. Связывание с IgG

Реактивность по отношению к тау-пептидам IgGl, полученным и подвергнутым контролю качества, как описано выше, тестировали посредством ELISA в отношении их способности связываться с определенным(определенными) родственным(родственными) пептидом(пептидами), а также неродственным пептидом (табл. 10). 96-луночные планшеты для ELISA (Costar) или планшеты, покрытые стрептавидином (Pierce), покрывали соответственно антигеном (бычьим актином и антителом козы к F (ab)2фрагменту человека, очищенным аффинной хроматографией) или тау-пептидами, как подробно описано в примере 4. Очищенные IgG к тау-белку разводили до 5 мкг/мл в TBS, содержащем 0,25% BSA, и титровали в 5-кратных разведениях. Контрольные антитела и вторичные антитела использовали, как подробно описано в примере 4. Реактивность антител при 1 мкг/мл определяли посредством ELISA и оценивали как отсутствие связывания (-), слабую (-/+), среднюю (+) или сильную (++). (-) для среднего значения двух показателей O.D. при 450 нм < 0,3; (-/+) для >0,5 и <1,0; (+) для >1,0 и <1,5; (++) для >1,5. Таблица 10

Родственные и неродственные пептиды, используемые в ELISA

шАЬ	Пептид	Последовательность пептида (pX) обозначает фосфорилированную аминокислоту	SEQ ID NO	Результаты
CBTAU- 7.1	ptau 194-212 (pS202,рТ205)	RSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	315	+
tau 194-212	RSGYSSPGSPGTPGSRSRT	316	-
CBTAU- 8.1	ptau 194-212 (pS202,рТ205)	RSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	315	-/+
tau 194-212	RSGYSSPGSPGTPGSRSRT	316	-
CBTAU- 16.1	ptau 204-221 (pT212,pS214)	GTPGSRSR(pT)P(pS)LPTPPTR	317	++
tau 204-221	GTPGSRSRTPSLPTPPTR	318	++
CBTAU- 18.1	ptau 200-217 (pS210)	PGSPGTPGSR(pS)RTPSLPT	319	-/+
tau 200-217	PGSPGTPGSRSRTPSLPT	320	-
tau 186-253	GEPPKSGDRSGYSSPGSPGTPGSRSRTPSLPTP PTREPKKVAWRTPPKSPSSAKSRLQTAPVPMP	321	-

- 37 035530

		DL
CBTAU- 20.1	ptau 58-76 (pS68,pT69)	EPGSETSDAK(pS)(pT)PTAEDVT	322	++
ptau 59-78 (pT69, pT71)	PGSETSDAKS(pT)P(pT)AEDVTAP	323	++
ptau 61-78 (pT71)	SETSDAKSTP(pT)AEDVTAP	324	-/ +
tau 42-103	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAED VTAPLVDEGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	325	-
CBTAU- 22.1	ptau 406-429 (pS416,pS422)	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA	326	++
tau 389-441	GAEIVYKSPWSGDTSPRHLSNVSSTGSIDMVD SPQLATLADEVSASLAKQGL	327	-
CBTAU- 24.1	ptau 221-245 (pT231,pS238)	REPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS)AKSRLQT	328	++
ptau 228-245 (pS238)	WRTPPKSPS (pS)AKSRLQT	329	++
ptau 225-245 (pS235,pS238)	KVAWRTPPK(pS) PS (pS)AKSRLQT	330	++
tau 186-253	GEPPKSGDRSGYSSPGSPGTPGSRSRTPSLPTP PTREPKKVAWRTPPKSPSSAKSRLQTAPVPMP DL	321	++
CBTAU- 27.1	tau 299-369	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCGSLGNIHHK PGGGQVEVKSEKLDFKDRVQSKIGSLDNITHVP GGGNK	331	+
ptau 194-212 (pS202,pT205)	RSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	315	-
CBTAU- 28.1	tau 42-103	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAED VTAPLVDEGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	325	++
ptau 257-272	KSKIG(pS)TENLKHQPGG	332	-
CBTAU- 41.1	ptau 406-429 (p416, p422)	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA	326	+
tau 389-441	GAEIVYKSPWSGDTSPRHLSNVSSTGSIDMVD SPQLATLADEVSASLAKQGL	327	-
CBTAU- 41.2	ptau 406-429 (p416, p422)	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA	326	+
tau 389-441	GAEIVYKSPWSGDTSPRHLSNVSSTGSIDMVD SPQLATLADEVSASLAKQGL	327	-
CBTAU- 42.1	ptau 406-429 (p416, p422)	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA	326	++

- 38 035530

	tau 389-441	GAEIVYKSPWSGDTSPRHLSNVSSTGSIDMVD SPQLATLADEVSASLAKQGL	327	-
CBTAU- 43.1	tau 299-369	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCGSLGNIHHK PGGGQVEVKSEKLDFKDRVQSKIGSLDNITHVP GGGNK	331	+
ptau 194-212 (pS202,рТ205)	RSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	315	-
CBTAU- 44.1	ptau 406-429 (p416, p422)	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA	326	-/ +
tau 389-441	GAEIVYKSPWSGDTSPRHLSNVSSTGSIDMVD SPQLATLADEVSASLAKQGL	327	-
CBTAU- 45.1	ptau 406-429 (p416, p422)	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA	326	++
tau 389-441	GAEIVYKSPWSGDTSPRHLSNVSSTGSIDMVD SPQLATLADEVSASLAKQGL	327	-
CBTAU- 46.1	tau 42-103	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAED VTAPLVDEGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	325	+
ptau 224-241 (pT231, pS235)	KKVAWR(pT) PPK(pS) PSSAKS	333	-
CBTAU- 47.1	tau 42-103	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAED VTAPLVDEGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	325	++
ptau 257-272 (pS262)	KSKIG(pS)TENLKHQPGG	332	-
CBTAU- 47.2	tau 42-103	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAED VTAPLVDEGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	325	++
ptau 257-272 (pS262)	KSKIG(pS)TENLKHQPGG	332	-
CBTAU- 49.1	tau 42-103	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAED VTAPLVDEGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	325	++
ptau 224-241 (pT231, pS235)	KKVAWR(pT) PPK(pS) PSSAKS	333	-
АТ 8	ptau 194-212 (pS202,pT205)	RSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	315	++
tau 194-212	RSGYSSPGSPGTPGSRSRT	316	-

*Аминокислотный участок в изоформе tau441 человека

Результаты показаны на фиг. 1a-t. Описанные в данном документе mAb к тау-белку можно подразделить на две основные группы: те, которые вступают в реакцию только с фосфорилированными пептидами (фосфозависимые mAb), и те, которые вступают в реакцию как с фосфорилированными, так и с нефосфорилированными пептидами (фосфонезависимые mAb). mAb к тау-белку CBTAU-7.1, CBTAU8.1, CBTAU-18.1 и CBTAU-22.1 выделяли из индивидуумов без AD, используя подход, подробно описанный в примере 3. Эти mAb являются фосфозависимыми и, как показано посредством ELISA (фиг. 1), вступают в реакцию только с фосфорилированным пептидом, но не с нефосфорилированным пептидом, охватывающим этот участок, и не с нефосфорилированным вариантом этого пептида. mAb к тау-белку CBTAU-7.1 и CBTAU-8.1 вступают в специфичную реакцию с фосфорилированным пептидом, содержащим AT8-связывающий эпитоп. Этот пептид охватывает аминокислоты с 194 по 212 и содержит фосфорилированные остатки в положениях 202 и 205. CBTAU-18.1 вступает в реакцию с фосфорилированным пептидом, охватывающим аминокислоты 200-217 с фосфорилированным сериновым остатком в положении 210. Наконец, CBTAU-22.1 вступает в реакцию с пептидом, охватывающим аминокислоты 406-429, с двумя фосфорилированными сериновыми остатками в положениях 416 и 422.

Аналогично, CBTAU-20.1 был идентифицирован у индивидуума без AD и является преимущественно фосфозависимым, так как он вступает в реакцию с тремя различными фосфорилированными пеп

- 39 035530 тидами, охватывающими аминокислоты 59-77. Два из этих пептидов характеризуются двойным фосфорилированием, один в положениях 68 и 69 и второй в положениях 69 и 71. CBTAU-20.1 также вступает в реакцию с третьим пептидом, который характеризуется одинарным фосфорилированием в положении 71, что позволяет предположить, что фосфорилирование треонина 71 является достаточным и важным для реактивности CBTAU-20.1. CBTAU-20.1 проявляет слабую реактивность по отношению к нефосфорилированному пептиду, охватывающему участок 42-103.

Подобно вышеупомянутым mAb, CBTAU-16.1 и CBTAU-24.1 также выделяли из индивидуумов без AD; однако, оба mAb являются фосфонезависимыми и, как было видно из ELISA, вступают в реакцию как с фосфорилированным, так и с нефосфорилированным пептидом, охватывающим определенный участок. CBTAU-16.1 вступает в реакцию с аминокислотным участком 204-221, тогда как CBTAU-24.1 вступает в реакцию с тремя различными пептидами, охватывающими аминокислоты 221-245. Кроме того, два дополнительных mAb к тау-белку (CBTAU-27.1 и CBTAU-28.1) идентифицировали посредством скрининга, проводимого с образцами из доноров без AD с использованием нефосфорилированных пептидов длиной 60-70 аминокислот, соответствующих аминокислотным участкам 42-103 и 299-369 соответственно; следовательно, оба mAb являются специфичными к нефосфорилированному тау-белку.

В заключение, mAb CBTAU 41.1, 41.2, 42.1, 43.1, 44.1, 45.1, 46.1, 47.1, 47.2 и 49.1 идентифицировали посредством небольшого исследования, в котором скринингу подвергали 25 молодых индивидуумов без AD (18-27 лет), 25 индивидуумов без AD (55+ лет), и 25 индивидуумов с AD (55+ лет). Набор пептидов, которые использовали для этого исследования, включал 8 фосфорилированных пептидов (в том числе родственный пептид для CBTAU-22.1) и 2 нефосфорилированных пептида (родственные пептиды для CBTAU-27.1 и CBTAU-28.1). mAb CBTAU 41.1, 41.2 и 42.1 выделяли из доноров с AD и подвергали реакции с родственным пептидом для CBTAU-22.1. Аналогично CBTAU-22.1, эти mAb являются фосфозависимыми, как показано на фиг. 1j-l. У индивидуумов без AD (55+ лет) идентифицировали два дополнительных mAb (CBTAU-44.1 и CBTAU-45.1) с реактивностью по отношению к родственному пептиду для CBTAU-22.1. Как и ожидалось, эти два антитела также являлись фосфозависимыми (фиг. 1n-o). CBTAU43.1 также идентифицировали посредством скрининга, проводимого с индивидуумами без AD (55+ лет); однако, mAb было выделено с помощью родственного пептида для CBTAU-27.1 и является специфичным к нефосфорилированному тау-белку (фиг. 1m). В заключение, CBTAU-46.1, 47.1, 47.2 и 49.1 были выделены из индивидуумов без AD (18-27 лет) с реактивностью по отношению к пептиду для CBTAU28.1 и, аналогично CBTAU-28.1, являются специфичными к нефосфорилированному тау-белку (фиг. 1ps).

Пример 7. Реактивность по отношению к парным спиральным филаментам и рекомбинантному таубелку, определяемая посредством ELISA

Для того, чтобы дополнительно охарактеризовать специфичность некоторых химерных антител, тестировали их реактивность по отношению к рекомбинантному тау-белку, обогащенным и очищенным иммуноаффинным способом парным спиральным филаментам посредством ELISA.

PHF-тау-белок очищали иммуноаффинным способом в соответствии с протоколом Greenberg и Davies. Вкратце, кортикальные ткани, соответствующие индивидуумам с болезнью Альцгеймера, гомогенизировали в 10 объемах холодного буфера (10 мМ Tris, pH 7,4, 1 мМ EGTA, 0,8М NaCl и 10% сахарозы) и центрифугировали при 27200/g в течение 20 мин. при 4°C. К надосадочной жидкости добавляли Nлаурилсаркозин и 2-меркаптоэтанол для достижения конечной концентрации 1% (вес/об.) и 1% (об./об.) соответственно. Смесь инкубировали при 37°C в течение 2-2,5 ч с постоянным покачиванием, после чего следовало центрифугирование при 108000*g в течение 30 мин. при комнатной температуре. Осадок, содержащий PHF-тау-белок, промывали 3 раза в PBS и растворяли в PBS без ингибиторов белков и дополнительно центрифугировали при 12000*g в течение 5 мин. Выделенную надосадочную жидкость, содержащую обогащенный PHF-тау-белок (ePHF-тау-белок), подвергали иммуноаффинной очистке на колонке для аффинной хроматографии с hTau10 и элюировали с помощью 3М или 4М KSCN в течение ночи при 4°C, после чего следовал диализ против 1 л PBS при 4°C с 3 заменами буфера. hTaulO является антителом, образованным в собственной лаборатории при иммунизации рекомбинантным тау-белком. Оно связывается как с рекомбинантным, так и с PHF-тау-белком по аминоконцевому эпитопу. Очищенный иммуноаффинным способом PHF-тау-белок (iPHF-тау-белок) концентрировали с помощью устройства для центрифужной фильтрации от Sartorius.

Для ELISA 96-луночные планшеты для связывания с половинным объемом лунок (Costar) покрывали 50 мкл антигена в TBS (2 мкг/мл рекомбинантного тау-белка, 2 мкг/мл бычьего актина и антитела козы к F(ab)₂-фрагменту человека, очищенного аффинной хроматографией, 1 мкг/мл аффинно очищенных парных спиральных филаментов и 1 мкг/мл моноклонального антитела к тау-белку HT7 (Thermo Scientific, MN1000)). На следующий день планшеты промывали в TBS-T и затем блокировали 150 мкл TBS с 2,5% BSA в течение 2 ч при RT. После блокирования ePHF-тау-белок захватывали в течение 2 ч. при RT на планшете, покрытом антителом к тау-белку. Очищенные IgG к тау-белку разводили до 10 мкг/мл в TBS с 0,25% BSA и IgG титровали в 5-кратных разведениях при RT в течение 2 ч AT8 (10 мкг/мл) использовали в качестве положительного контроля для iPHF-тау-белка и захваченного ePHF-тау-белка. Планшеты промывали 5 раз в TBS-T, и добавляли вторичные антитела, разведенные в TBS с 0,25% BSA,

- 40 035530 и инкубировали при RT в течение 1 ч. Антитело козы к F(ab')2 IgG человека (Jackson Labs) использовали в разведении 1:2000, и антитело козы к иммуноглобулинам мыши, конъюгированное с HRP (Jackson Labs), использовали в разведении 1:4000 (используемом для антитела к актину в качестве контроля). После инкубирования планшеты промывали 4 раза в TBS-T и проявляли субстратом пероксидазы для микролунок SureBlue Reserve TMB (KPL) в течение примерно 2 мин. Реакцию немедленно останавливали посредством добавления останавливающего раствора TMB (KPL), и измеряли поглощение при 450 нм, используя планшет-ридер для ELISA.

Результаты показаны на фиг. 2a-j. Как и ожидалось, посредством ELISA было выявлено, что фосфозависимые mAb CBTAU-7.1, CBTAU-8.1 и CBTAU-18.1 не вступают в реакцию с рекомбинантным таубелком (фиг. 2a, b, d). CBTAU-20.1 проявляет незначительную реактивность по отношению к рекомбинантному тау-белку, что согласуется с его слабой реактивностью по отношению к нефосфорилированному пептиду, охватывающему участок 42-103. Примечательно, что эти фосфозависимые mAb не проявляют какую-либо реактивность по отношению к парным спиральным филаментам (т.е. ePHF-тау-белку и iPHF-тау-белку), за исключением CBTAU-7.1, которое проявляет незначительную реактивность по отношению к ePHF-тау-белку при более высоких концентрациях антитела.

Наконец, фосфозависимое CBTAU-22.1 не проявляет реактивность по отношению к рекомбинантному тау-белку, но вступает в реакцию как с iPHF-тау-белком, так и с ePHF-тау-белком (фиг. 2f).

Фосфонезависимые mAb к тау-белку CBTAU-16.1 и CBTAU-2 4.1 вступают в реакцию как с рекомбинантным тау-белком, так и с обоими форматами парных спиральных филаментов (т.е. iPHF-тау-белком и ePHF-тау-белком; фиг. 2c и g). CBTAU-28.1 проявляет сильное связывание с рекомбинантным таубелком при слабой иммунореактивности к обоим форматам PHF-тау-белка (фиг. 2i). В заключение, CBTAU-27.1 проявляет слабую иммунореактивность по отношению как к рекомбинантному тау-белку, так и к PHF-тау-белку (фиг. 1h).

Пример 8. Реактивность по отношению к парным спиральным филаментам и рекомбинантному таубелку, определяемая посредством вестерн-блот-анализа

Для расширения наблюдений связывания rTau и PHF в ELISA и исследования того, играет ли вторичная структура роль в реактивности, рекомбинантный тау-белок, обогащенные и очищенные иммуноаффинным способом парные спиральные филаменты тестировали посредством вестерн-блот-анализа. Примерно 0,5 мкг iPHF, ePHF и 1 мкг rTau в 1X конечной концентрации буфера для образца NuPAGE LDS (конечная концентрация 0,5% LDS) (Novex, NP0007) нагревали при 70°C в течение 10 мин. Образцы загружали в 26-луночный 4-12% гель Bis-Tris Novex NuPAGE (Invitrogen) с подвижным буфером MOPS SDS (Novagen, NP0001) и затем переносили на нитроцеллюлозную мембрану. Мембрану блокировали в течение ночи в 1X Tris-буферизированном физиологическом растворе (TBS) с 0,05% Tween20 и 4% обезжиренного сухого молока. mAb CBTAU использовали в качестве первичных при 25 мкг/мл в 1X TBS с 0,05% Tween20 и 4% обезжиренного сухого молока и инкубировали в течение 2 ч при комнатной температуре. Затем мембрану промывали 3 раза, каждый раз в течение 5 мин, в 1X TBS с 0,05% Tween20. Очищенное аффинной хроматографией конъюгированное с пероксидазой антитело козы к IgG человека, специфичное к Fcy-фрагменту (Jackson ImmunoResearch), затем использовали в качестве вторичного в разведении 1:2000 в 1X TBS с 0,05% Tween20 и 4% обезжиренного сухого молока и инкубировали в течение 45 мин при RT. Мембрану промывали 3 раза, каждый раз в течение 5 мин, и проявляли с использованием набора Supersignal West Pico (Pierce).

Результаты вестерн-блот-анализа показаны на фиг. 3. На фиг. показана реактивность трех контрольных антител AT8, AT100 и HT7 (соответственно двух специфичных к фосфо-тау-белку и специфичного к общему тау-белку). Как для AT8, так и для AT100 показана характеристика PHF-тау-белка в виде трех полос, которые соответствуют приблизительно 68, 64 и 60 кДа. В отличие от результатов ELISA, посредством вестерн-блоттинга было выявлено, что фосфозависимые mAb CBTAU-7.1 и CBTAU18.1 вступают в реакцию как с iPHF-тау-белком, так и с ePHF-тау-белком, что позволяет предположить, что эпитопы для этих моноклональных антител недоступны, когда тау-белок принимает конформации более высокого порядка, присутствующие в PHF-тау-белке. Однако, эти эпитопы становятся доступными в сильных денатурирующих условиях SDS-PAGE. CBTAU-27.1 проявляет связывание с рекомбинантным тау-белком и PHF, выявляемое в ходе вестерн-блоттинга, но слабую реактивность по отношению к ним, определяемую в ходе ELISA, что позволяет предположить, что эпитоп для этого антитела доступен только в сильных денатурирующих условиях. CBTAU-28.1 вступает в интенсивную реакцию с рекомбинантным тау-белком, выявляемую в ходе как вестерн-блоттинга, так и ELISA, и также проявляет реактивность по отношению к PHF-тау-белку, определяемую в ходе обоих анализов. CBTAU-28.1 вступает в реакцию с участком E1/E2 тау-белка (аминокислоты 42-103), который присутствует не во всех изоформах тау-белка; таким образом, с помощью CBTAU-28.1 обнаруживают только полосы 68 и 64 кДа PHFтау-белка. В заключение, CBTAU-22.1 и CBTAU-24.1 демонстрируют аналогичные результаты в анализе ELISA, вступая в реакцию соответственно с PHF-тау-белком, но не с рекомбинантным тау-белком либо как с PHF-тау-белком, так и с рекомбинантным тау-белком.

- 41 035530

Пример 9. Реактивность по отношению к пептидным фрагментам тау-белка, определяемая в ходе

ELISA

Для определения характеристик специфичности выделенных антител, проводили тестирования их реактивности по отношению к фосфорилированным и нефосфорилированным тау-пептидам (табл. 11-21, фиг. 4а^) посредством ELISA. Биотинилированные тау-пептиды синтезировали в промышленных масштабах и растворяли в воде при 1 нг/мл и замораживали при -80°C. Вкратце, 96-луночные планшеты для связывания стрептавидина (Thermo-Fisher) покрывали 2 мкг/мл тау-пептидов, разведенных в TBS, и инкубировали в течение ночи при 4°C. На следующий день планшеты промывали в TBS-T и затем блокировали 2,5% BSA в TBS в течение 2 ч при RT. После блокирования очищенные IgG к тау-белку разводили до 2 мкг/мл (или до 5 мкг/мл и титровали в 5-кратных разведениях для более тонкого картирования CBTAU-27.1, 28.1, 43.1, 46.1, 47.1, 47.2 и 49.1, используя последовательности пептидов из табл. 15-20) в TBS с 0,25% BSA и инкубировали при RT в течение 2 ч. Химеризированный человеческими участками вариант IgG AT8 (при 2 мкг/мл), описанный в примере 11, использовали в качестве положительного контроля в каждом эксперименте по картированию. Планшеты промывали 5 раз в TBS-T, после чего добавляли вторичное антитело [антитело козы к F(ab')₂ IgG человека (Jackson Labs) в разведении 1:2000], разведенное в TBS с 0,25% BSA, и инкубировали при RT в течение 1 ч. После инкубирования планшеты промывали 4 раза в TBS-T и проявляли субстратом пероксидазы для микролунок SureBlue Reserve TMB (KPL) в течение примерно 90 с. Реакцию немедленно останавливали посредством добавления останавливающего раствора TMB (KPL), и измеряли поглощение при 450 нм, используя планшет-ридер для ELISA. Каждый эксперимент проводили в трех повторностях в три разных дня. Реактивность считали положительной, если значения OD были равными или превышающими 0,4 в анализе ELISA. Для определения реактивности каждого mAb по отношению к фосфорилированным и нефосфорилированным таупептидам определяли реактивность антител при 2 мкг/мл посредством ELISA и оценивали как отсутствие связывания (-), слабую (-/+), среднюю (+) или сильную (++). (-) для среднего значения двух показателей O.D. при 450 нм <0,3; (-/+) для >0,5 и <1,0; (+) для >1,0 и <1,5; (++) для >1,5. Для более тонкого картирования CBTAU-27.1, 28.1, 43.1, 46.1, 47.1, 47.2 и 49.1 (подробно описанного в табл. 15-20) определяли реактивность антител при 1 мкг/мл посредством ELISA и оценивали как отсутствие связывания (-), слабую (-/+), среднюю (+) или сильную (++). (-) для среднего значения трех показателей O.D. при 450 нм <0,3; (-/+) для >0,5 и <1,0; (+) для >1,0 и <1,5; (++) для >1,5.

Таблица 11. CBTAU-7.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида (pX) обозначает фосфорилированную аминокислоту	Результаты
tau 186-253	321	GEPPKSGDRSGYSSPGSPGTPGSRSRTPSLPTPPTREP KKVAWRT P PKS P S SAKS RLQTAPVPMPDL	-
ptau 187-212	334	EPPKSGDRSG(pY)SSPGSPG(pT)PGSRSRT	-/+
ptau 188-205	335	PPKSGDRSGY(pS)SPGSPGT	-
ptau 188-206	336	PPKSGDRSGY(pS(pS)PGSPGTP	-
ptau 188-209	337	PPKSGDRSGY(pS)SPG(pS)PGTPGSR	++
ptau 188-212	338	PPKSGDRSGY(pS)SPGSPG(pT)PGSRSRT	-/+
ptau 189-206	339	PKSGDRSGYS(pS)PGSPGTP	-
ptau 189-209	340	PKSGDRSGYS(pS)PG(pS)PGTPGSR	-
ptau 189-212	341	PKSGDRSGYS(pS)PGSPG(pT)PGSRSRT	+
tau 190-209	342	KSGDRSGYSSPGSPGTPGSR	-
ptau 192-209	343	GDRSGYSSPG(pS)PGTPGSR	-
ptau 192-212	344	GDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	+
ptau 192-215	345	GDRSGYSSPG(pS)PGTPG(pS)RSRTPSL	-
ptau 192-217	346	GDRSGYSSPG(pS)PGTPGSR(pS)RTPSLPT	-
ptau 194-212	315	RSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	+
tau 194-212	316	RSGYSSPGSPGTPGSRSRT	-

- 42 035530

Таблица 12. CBTAU-18.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида (pX) обозначает фосфорилированную аминокислоту	Результаты
		GEPPKSGDRSGYSSPGSPGTPGSRSRTPSLPTPPTREPK	—
ptau 186-253	321	KVAWRTPPKSPSSAKSRLQTAPVPMPDL
ptau 192-217	346	GDRSGYSSPG(pS)PGTPGSR(pS)RTPSLPT	++
ptau 194-212	315	RSGYSSPG(pS)PG(pT)GSRSRT	-
tau 194-212*	316	RSGYSSPGSPGTPGSRSRT	-
ptau 195-212	347	SGYSSPGSPG(pT)PGSRSRT	-
ptau 195-215	348	SGYSSPGSPG(pT)PG(pS)RSRTPSL	-
ptau 195-217	349	SGYSSPGSPG(pT)PGSR(pS)RTPSLPT	++
ptau 195-219	350	SGYSSPGSPG(pT)PGSRSR(pT)PSLPTPP	-
tau 195-214	351	SGYSSPGSPGTPGSRSRTPS	-
ptau 198-215	352	SSPGSPGTPG(pS)RSRTPSL	-
ptau 198-217	353	SSPGSPGTPG(pS)R(pS)RTPSLPT	++
ptau 198-219	354	SSPGSPGTPG(pS)RSR(pT)PSLPTPP	-/+
ptau 198-221	355	SSPGSPGTPG(pS)RSRTP(pS)LPTPPTR	-
tau 198-217	356	SSPGSPGTPGSRSRTPSLPT	-
ptau 200-217	319	PGSPGTPGSR(pS)RTPSLPT	+
tau 200-217	320	PGSPGTPGSRSRTPSLPT	-
ptau 200-219	357	PGSPGTPGSR(pS)R(pT)PSLPTPP	-/+
ptau 200-221	358	PGSPGTPGSR(pS)RTP(pS)LPTPPTR	-
ptau 200-224	359	PGSPGTPGSR(pS)RTPSLP(pT)PPTREPK	-

Таблица 13. CBTAU-22.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида (pX) обозначает фосфорилированную аминокислоту	Результаты
ptau 404-421	360	SPRHLSNVSS(pT)GSIDMVD	-
ptau 404-429	361	SPRHLSNVSS(pT)GSIDMVD(pS)PQLATLA	++
tau 405-423	362	PRHLSNVSSTGSIDMVDSP	-
ptau 406-423	363	RHLSNVSSTG(pS)IDMVDSP	-
ptau 406-429	326	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA	++
tau 409-428	364	SNVSSTGSIDMVDSPQLATL	-
ptau 412-429	365	SSTGSIDMVD(pS)PQLATLA	++
ptau 412-434	366	SSTGSIDMVD(pS)PQLA(pT)LADEVSA	++

Таблица 14. CBTAU-24.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида (pX) обозначает фосфорилированную аминокислоту	Результаты
tau 221-253	367	GEPPKSGDRSGYSSPGSPGTPGSRSRTPSLPTPPTREP KKVAWRTPPKSPSSAKSRLQTAPVPMPDL	++
ptau 221-238	368	REPKKVAWR (pT) PPKSPSS	-
ptau 221-242	369	REPKKVAWR (pT) PPK(pS) PSSAKSR	-
ptau 221-244	370	REPKKVAWR (pT) PPKSP (pS) SAKSRLQ	-
ptau 221-245	328	REPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS)AKSRLQT	++
ptau 225-242	371	KVAWRTPPK(pS) PSSAKSR	-
ptau 225-244	372	KVAWRTPPK(pS) P (pS) SAKSRLQ	-/+
ptau 225-245	330	KVAWRTPPK(pS) PS (pS)AKSRLQT	++
ptau 227-244	373	AWRTPPKSP (pS) SAKSRLQ	++
ptau 227-245	374	AWRTPPKSP (pS) (pS)AKSRLQT	++
ptau 228-245	329	WRTPPKSPS (pS) AKSRLQT	++

- 43 035530

Таблица 15. CBTAU-27.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида (pX) обозначает фосфорилированную аминокислоту	Результаты
		Кластер 1
tau 299-369	331	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCGSLGNIHHKPGGGQV EVKSEKLDFKDRVQSKIGSLDNITHVPGGGNK	++
		Cluster 2
ptau 404-421 р414	360	SPRHLSNVSS(рТ)GSIDMVD	-
ptau 404-429 р414, 422	361	SPRHLSNVSS(pT)GSIDMVD(pS)PQLATLA	-/+
ptau 406-423 р416	363	RHLSNVSSTG(pS)IDMVDSP	-
ptau 406-429 р416, 422	326	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA	-/+
ptau 412-429 р422	365	SSTGSIDMVD(pS)PQLATLA	-/+
ptau 412-434 р422, 427	366	SSTGSIDMVD(pS)PQLA(pT)LADEVSA	-/+
tau 299-318	375	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKV	+
tau 309-328	376	VYKPVDLSKVTSKCGSLGNI	-/ +
tau 319-338	377	TSKCGSLGNIHHKPGGGQVE	-
tau 329-348	378	HHKPGGGQVEVKSEKLDFKD	-
tau 339-358	379	VKSEKLDFKDRVQSKIGSLD	-
tau 349-369	380	RVQSKIGSLDNITHVPGGGNK	-

Таблица 16. CBTAU-28.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида	Результаты
tau 42-103	325	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAEDVTAPL VDEGAPGKQAAAQPHT EIPEGTTA	++
tau 42-61	381	GLKESPLQTPTEDGSEEPGS	-
tau 52-71	382	TEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
ptau 58-75	383	EPGSETSDAK(pS)TPTAEDV	-
tau 62-81	384	ETSDAKSTPTAEDVTAPLVD	-
tau 72-91	385	AE DVTAP LVD E GAP GKQAAA	-
tau 82-103	386	EGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	-

Таблица 17. CBTAU-43.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID	Последовательность пептида	Результаты
	NO.
		HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCGSLGNIHHKPGGG
tau 299-369	331
		QVEVKSEKLDFKDRVQSKIGSLDNITHVPGGGNK
tau 299-318	375	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKV	++
tau 309-328	376	VYKPVDLSKVTSKCGSLGNI	++
tau 319-338	377	TSKCGSLGNIHHKPGGGQVE	-
tau 329-348	378	HHKPGGGQVEVKSEKLDFKD	-
tau 339-358	379	VKSEKLDFKDRVQSKIGSLD	-
tau 349-369	380	RVQSKIGSLDNITHVPGGGNK	-

- 44 035530

Таблица 18. CBTAU-46.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида	Результаты
tau 42-103	325	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAEDVTAPL VDEGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA.	++
tau 42-61	381	GLKESPLQTPTEDGSEEPGS	-
tau 52-71	382	TEDGSEEPGSETSDAKSTPT	-
tau 62-81	384	E T S DAK S T P TAE DVTAP LVD	-
tau 72-91	385	AEDVTAPLVDEGAPGKQAAA	-
tau 82-103	386	EGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	++

Таблица 19. CBTAU-47.1 и CBTAU-47.2: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида	Результаты
tau 42-103	325	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAEDVTAPL VDEGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	++
tau 42-61	381	GLKESPLQTPTEDGSEEPGS	-
tau 52-71	382	TEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 62-81	384	ETSDAKSTPTAEDVTAPLVD	-
tau 72-91	385	AE DVTAP LVD E GAP GKQAAA	-
tau 82-103	386	EGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	-

Таблица 20. CBTAU-49.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида	Результаты
tau 42-103	325	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTAEDVTAPL VDEGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	++
tau 42-61	381	GLKESPLQTPTEDGSEEPGS	-
tau 52-71	382	TEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 62-81	384	ETSDAKSTPTAEDVTAPLVD	-
tau 72-91	385	AE DVTAP LVD E GAP GKQAAA	-
tau 82-103	386	EGAPGKQAAAQPHTEIPEGTTA	-

Таблица 21. AT8: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.	Последовательность пептида (pX) обозначает фосфорилированную аминокислоту	Результат
ptau 189-212	341	PKSGDRSGYS(pS)PGSPG(pT)PGSRSRT	-
tau 192-211	387	GDRSGYSSPGSPGTPGSRSR	-
ptau 192-209	343	GDRSGYSSPG(pS)PGTPGSR	-
ptau 192-212	344	GDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++
ptau 192-215	345	GDRSGYSSPG(pS)PGTPG(pS)RSRTPSL	-
ptau 192-217	346	GDRSGYSSPG(pS)PGTPGSR(pS)RTPSLPT	--
ptau 194-212	315	RSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++
tau 194-212*	316	RSGYSSPGSPGTPGSRSRT	-
ptau 195-212	347	SGYSSPGSPG(pT)PGSRSRT	-

Несмотря на то, что CBTAU-7.1 выделяли с использованием пептида, содержащего эпитоп для AT8 (табл. 21; 192-212; pS202, pT205), фосфорилированные остатки, способствующие связыванию CBTAU7.1, оказались беспорядочно расположенными, включающими положения S202+T205, но также и комбинации S198+S202, S198+T205, S199+T205 и, возможно, Y197+T205. Нефосфорилированные пептиды не проявляли реактивность по отношению к CBTAU-7.1. Для CBTAU-18.1 установили, что минимальный эпитоп состоит из аминокислот 198-217 и зависит от pS210, но не в тех случаях, когда T212, S214 или T217 также являлись фосфорилированными. Установили, что реактивность CBTAU-22.1 зависит от pS422, при этом для антитела CBTAU-24.1 было выявлено сильное связывание с его соответствующим нефосфорилированным пептидом, и на него, таким образом, не влияет фосфорилирование.

CBTAU-27.1 и CBTAU-43.1 выделяли с использованием нефосфорилированного пептида, охватывающего аминокислоты 299-369. Примечательно, что для перекрывающихся пептидов в пределах этого участка были выявлены аналогичные требования к связыванию обоих mAb (т.е. CBTAU-27.1 и CBTAU43.1 вступали в реакцию с пептидами, охватывающими соответственно аминокислоты 299-318 и 309- 45 035530

328), что позволяет предположить, что эпитоп для обоих mAb находится в пределах участка 299-328 в tau441 (фиг. 4a и c).

CBTAU-28.1, 46.1, 47.1, 47.2 и 49.1 выделяли из образцов донора-человека с использованием пептида, охватывающего участок 42-103 в tau441. Тестирования реактивности каждого mAb в отношении меньшего набора перекрывающихся пептидов показали связывание для CBTAU-47.1, 47.2 и 49.1, аналогичное CBTAU-28.1 (т.е. реактивность по отношению к пептиду, охватывающему участок 52-71), что позволяет предположить сравнимые требования к связыванию; однако, CBTAU-4 6.1 связывается с участком, расположенным в C-концевом направлении относительно участка для вышеупомянутых mAb (т.е. 82-103; фиг. 4b и d-g)

Пример 10. Аланиновое сканирование пептидных эпитопов

Для определения дополнительных характеристик специфичности и вклада аминокислот в связывание каждого выделенного mAb проводили тестирования их реактивности по отношению к тау-пептидам посредством ELISA при замещении аланином в каждом положении. Все протоколы экспериментов были идентичны примеру 9. Реактивность антител при 1 мкг/мл определяли посредством ELISA и оценивали как отсутствие связывания (-), слабую (-/+), среднюю (+) или сильную (++). (-) для среднего значения двух показателей O.D. при 450 нм <0,3; (-/+) для >0,5 и <1,0; (+) для >1,0 и <1,5; (++) для >1,5. Результаты для каждого антитела показаны в табл. 22-29.

Таблица 22. Результаты аланинового сканирования для CBTAU-7.1 и CBTAU-8.1

Участок (Таи441)	SEQ ID NO	Пептидная последовательность (pX) обозначает фосфорилированную аминокислоту	Резуль- таты 7.1	Резуль- таты 8.1
ptau 187-212	334	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (А187)	388	APPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	+	++
ptau 187-212 (A188)	389	EAPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	+	++
ptau 187-212 (A189)	390	EPAKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	+	++
ptau 187-212 (A190)	391	EPPASGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212	392	EPPKAGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++

- 46 035530

(A191)
ptau 187-212 (A192)	393	EPPKSADRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (A193)	394	EPPKSGARSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (A194)	395	EPPKSGDASGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (A195)	396	EPPKSGDRAGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (A196)	397	EPPKSGDRSAYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (A197)	398	EPPKSGDRSGASSPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (A198)	399	EPPKSGDRSGYASPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (A199)	400	EPPKSGDRSGYSAPG(pS)PG(pT)PGSRSRT	+	++
ptau 187-212 (A200)	401	EPPKSGDRSGYSSAG(pS)PG(pT)PGSRSRT	+	++
ptau 187-212 (A201)	402	EPPKSGDRSGYSSPA(pS)PG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (A202)	403	EPPKSGDRSGYSSPGAPG(pT)PGSRSRT	+	++
ptau 187-212 (A203)	404	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)AG(pT)PGSRSRT	++	++
ptau 187-212 (A204)	405	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PA(pT)PGSRSRT	-/+	+
ptau 187-212 (A205)	406	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PGAPGSRSRT	-/+	-/+
ptau 187-212 (A206)	407	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)AGSRSRT	-/+	-
ptau 187-212 (A207)	408	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PASRSRT	++	-/+
ptau 187-212 (A208)	409	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGARSRT	++	++
ptau 187-212 (A209)	410	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSASRT	++	-
ptau 187-212	411	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRART	++	++

(A210)
ptau 187-212 (A211)	412	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSAT	++	++
ptau 187-212 (A212)	413	EPPKSGDRSGYSSPG(pS)PG(pT)PGSRSRA	++	++

- 47 035530

Таблица 23. Результаты аланинового сканирования для CBTAU-22.1

Участок (Таи441)	SEQ ID NO	Последовательность пептида обозначает фосфорилиров аминокислоту	(pX) анную	Результаты
ptau 406-	429	326	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (А406)	406-429	414	AHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A407)	406-429	415	RALSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A408)	406-429	416	RHASNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A409)	406-429	417	RHLANVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A410)	406-429	418	RHLSAVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A411)	406-429	419	RHLSNASSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A412)	406-429	420	RHLSNVASTG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A413)	406-429	421	RHLSNVSATG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A414)	406-429	422	RHLSNVSSAG(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A415)	406-429	423	RHLSNVSSTA(pS)IDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A416)	406-429	424	RHLSNVSSTGAIDMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A417)	406-429	425	RHLSNVSSTG(pS)ADMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A418)	406-429	426	RHLSNVSSTG(pS)IAMVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A419)	406-429	427	RHLSNVSSTG(pS)IDAVD(pS)PQLATLA		++
ptau (A420)	406-429	428	RHLSNVSSTG(pS)IDMAD(pS)PQLATLA		++
ptau (A421)	406-429	429	RHLSNVSSTG(pS)IDMVA(pS)PQLATLA		-/+
ptau (A422)	406-429	430	RHLSNVSSTG(pS)IDMVDAPQLATLA		-
ptau 429(A423)	406-	431	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)AQLATLA		++
ptau (A424)	406-429	432	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PALATLA		++
ptau (A425)	406-429	433	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQAATLA		++
ptau (A427)	406-429	434	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLAALA		++
ptau (A428)	406-429	435	RHLSNVSSTG(pS)IDMVD(pS)PQLATAA		++

- 48 035530

Таблица 24. Результаты аланинового сканирования для CBTAU-24.1

Участок (Таи441)	SEQ ID NO	Последовательность пептида (pX) обозначает фосфорилированную аминокислоту	Результаты
ptau 221-245	328	REPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (А222)	436	RAPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A223)	437	REAKKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A224)	438	REPAKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A225)	439	REPKAVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A226)	440	REPKKAAWR (pT) PPKSPS (pS)AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A228 )	441	REPKKVAAVR(pT)PPKSPS(pS)AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A229)	442	REPKKVAVAR(pT)PPKSPS(pS)AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A230)	443	REPKKVAWA (pT) PPKSPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A231)	444	REPKKVAWRAPPKSPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A232)	445	REPKKVAWR (pT)APKSPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A233)	446	REPKKVAWR (pT) PAKSPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A234)	447	REPKKVAWR (pT) PPASPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A235)	448	REPKKVAWR (pT) PPKAPS (pS) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A236)	449	REPKKVAWR (pT) PPKSAS (pS) AKSRLQT	-
ptau 221-245 (A237)	450	REPKKVAWR (pT) PPKSPA (pS ) AKSRLQT	++
ptau 221-245 (A238)	451	REPKKVAWR (pT) PPKSPSAAKSRLQT	++
ptau 221-245 (A240)	452	REPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AASRLQT	++
ptau 221-245 (A241)	453	REPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKARLQT	++
ptau 221-245 (A242)	454	REPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKSALQT	++
ptau 221-245 (A243)	455	REPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKSRAQT	++
ptau 221-245 (A244)	456	REPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKSRLAT	++
ptau 221-245 (A245)	457	REPKKVAWR (pT) PPKSPS (pS) AKSRLQA	++

- 49 035530

Таблица 25. Результаты аланинового сканирования для CBTAU-27.1

Участок (Таи441)	SEQ ID NO:	Последовательность пептида	Результаты
tau 299-323	458	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(А299)	459	AVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A300)	460	HAPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A301)	461	HVAGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A302)	462	HVPAGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A303)	463	HVPGAGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A304)	464	HVPGGASVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A305)	465	HVPGGGAVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A306)	466	HVPGGGSAQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A307)	467	HVPGGGSVAIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A308)	468	HVPGGGSVQAVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A309)	469	HVPGGGSVQIAYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A310)	470	HVPGGGSVQIVAKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A311)	471	HVPGGGSVQIVYAPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A312)	472	HVPGGGSVQIVYKAVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A313)	473	HVPGGGSVQIVYKPADLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A314)	474	HVPGGGSVQIVYKPVALSKVTSKCG	-/ +
tau 299-323(A315)	475	HVPGGGSVQIVYKPVDASKVTSKCG	-
tau 299-323(A316)	476	HVPGGGSVQIVYKPVDLAKVTSKCG	++
tau 299-323(A317)	477	HVPGGGSVQIVYKPVDLSAVTSKCG	-
tau 299-323(A318)	478	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKATSKCG	++
tau 299-323(A319)	479	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVASKCG	++
tau 299-323(A320)	480	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTAKCG	++
tau 299-323(A321)	481	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSACG	++
tau 299-323 (A322)	482	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKAG	++
tau 299-323(A323)	483	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCA	++

Таблица 26. Результаты аланинового сканирования для CBTAU-28.1

Участок (Tau441)	SEQ ID NO	Последовательность пептида	Результаты
tau 52-71	382	TEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A52)	484	AEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A53)	485	TADGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A54)	486	TEAGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A55)	487	TEDASEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A56)	488	TEDGAEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A57)	489	TEDGSAEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A58)	490	TEDGSEAPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A59)	491	TEDGSEEAGSETSDAKSTPT	-/ +
tau 52-71 (A60)	492	TEDGSEEPASETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A61)	493	TEDGSEEPGAETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A62)	494	TEDGSEEPGSATSDAKSTPT	-
tau 52-71 (A63)	495	TEDGSEEPGSEASDAKSTPT	-/ +
tau 52-71 (A64)	496	TEDGSEEPGSETADAKSTPT	++
tau 52-71 (A65)	497	TEDGSEEPGSETSAAKSTPT	-
tau 52-71 (A67)	498	TEDGSEEPGSETSDAASTPT	-
tau 52-71 (A68)	499	TEDGSEEPGSETSDAKATPT	++
tau 52-71 (A69)	500	TEDGSEEPGSETSDAKSAPT	++
tau 52-71 (A70)	501	TEDGSEEPGSETSDAKSTAT	++
tau 52-71 (A71)	502	TEDGSEEPGSETSDAKSTPA	++

- 50 035530

Таблица 27. Результаты аланинового сканирования для CBTAU-43.1

Участок (Таи441)	SEQ ID NO:	Последовательность пептида	Результаты
tau 299-323	458	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(А299)	459	AVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A300)	460	HAPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A301)	461	HVAGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A302)	462	HVPAGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A303)	463	HVPGAGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A304)	464	HVPGGASVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A305)	465	HVPGGGAVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A306)	466	HVPGGGSAQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A307)	467	HVPGGGSVAIVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A308)	468	HVPGGGSVQAVYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A309)	469	HVPGGGSVQIAYKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A310)	470	HVPGGGSVQIVAKPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A311)	471	HVPGGGSVQIVYAPVDLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A312)	472	HVPGGGSVQIVYKAVDLSKVTSKCG	-/+
tau 299-323(A313)	473	HVPGGGSVQIVYKPADLSKVTSKCG	++
tau 299-323(A314)	474	HVPGGGSVQIVYKPVALSKVTSKCG	++
tau 299-323(A315)	475	HVPGGGSVQIVYKPVDASKVTSKCG	-
tau 299-323(A316)	476	HVPGGGSVQIVYKPVDLAKVTSKCG	++
tau 299-323(A317)	477	HVPGGGSVQIVYKPVDLSAVTSKCG	-
tau 299-323(A318)	478	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKATSKCG	++
tau 299-323(A319)	479	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVASKCG	++
tau 299-323(A320)	480	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTAKCG	++
tau 299-323(A321)	481	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSACG	++
tau 299-323(A322)	482	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKAG	++
tau 299-323(A323)	483	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCA	++

Таблица 28. Результаты аланинового сканирования для CBTAU-47.1 и 47.2

Участок (Tau441)	SEQ ID NO	Последовательность пептида	Результаты CBTAU-47.1	Результаты CBTAU-47.2
tau 52-71	382	TEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A52)	484	AEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A53)	485	TADGSEEPGSETSDAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A54)	486	TEAGSEEPGSETSDAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A55)	487	TEDASEEPGSETSDAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A56)	488	TEDGAEEPGSETSDAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A57)	489	TEDGSAEPGSETSDAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A58)	490	TEDGSEAPGSETSDAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A59)	491	TEDGSEEAGSETSDAKSTPT	-	-
tau 52-71 (A60)	492	TEDGSEEPASETSDAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A61)	493	TEDGSEEPGAETSDAKSTPT	-/+	++
tau 52-71 (A62)	494	TEDGSEEPGSATSDAKSTPT	-	-
tau 52-71 (A63)	495	TEDGSEEPGSEASDAKSTPT	-	-
tau 52-71 (A64)	496	TEDGSEEPGSETADAKSTPT	++	++
tau 52-71 (A65)	497	TEDGSEEPGSETSAAKSTPT	-	-

- 51 035530

tau 52-71 (А67)	498	TEDGSEEPGSETSDAASTPT	-	-
tau 52-71 (А68)	499	TEDGSEEPGSETSDAKATPT	++	++
tau 52-71 (А69)	500	TEDGSEEPGSETSDAKSAPT	++	++
tau 52-71 (A70)	501	TEDGSEEPGSETSDAKSTAT	++	++
tau 52-71 (A71)	502	TEDGSEEPGSETSDAKSTPA	++	++

Таблица 29. Результаты аланинового сканирования для CBTAU-49.1

Участок (Tau441)	SEQ ID NO	Последовательность пептида	Результаты
tau 52-71	382	TEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A52)	484	AEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A53)	485	TADGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A54)	486	TEAGSEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A55)	487	TEDASEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A56)	488	TEDGAEEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A57)	489	TEDGSAEPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A58)	490	TEDGSEAPGSETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A59)	491	TEDGSEEAGSETSDAKSTPT	-
tau 52-71 (A60)	492	TEDGSEEPASETSDAKSTPT	++
tau 52-71 (A61)	493	TEDGSEEPGAETSDAKSTPT	-
tau 52-71 (A62)	494	TEDGSEEPGSATSDAKSTPT	-
tau 52-71 (A63)	495	TEDGSEEPGSEASDAKSTPT	+
tau 52-71 (A64)	496	TEDGSEEPGSETADAKSTPT	+
tau 52-71 (A65)	497	TEDGSEEPGSETSAAKSTPT	-
tau 52-71 (A67)	498	TEDGSEEPGSETSDAASTPT	-
tau 52-71 (A68)	499	TEDGSEEPGSETSDAKATPT	+
tau 52-71 (A69)	500	TEDGSEEPGSETSDAKSAPT	+
tau 52-71 (A70)	501	TEDGSEEPGSETSDAKSTAT	+
tau 52-71 (A71)	502	TEDGSEEPGSETSDAKSTPA	+

Несмотря на то, что CBTAU-7.1 и CBTAU-8.1 выделяли с использованием тау-фосфопептида, содержащего эпитоп для AT8 (т.е. pS202, pT205), оба mAb характеризовались различными требованиями к эпитопу в соответствии с результатами аланинового сканирования (табл. 22). В дополнение к S202 и T205, замены в положениях G204 и P206 приводят к ослаблению связывания CBTAU-7.1. В противоположность этому замены на аланин в положениях G204, T205, P206 и R209 уменьшали реактивность CBTAU-8.1 по отношению к пептиду, а замена S202A не имела эффекта. Как и AT8, оба mAb являются фосфозависимыми, но требуют дополнительных (нефосфорилированных остатков) для связывания. Результаты аланинового сканирования для CBTAU-22.1 показали зависимость от фосфорилирования в S422 (табл. 23), так как замена в этом положении полностью подавляла связывание. Замена в D421 приводила к ослаблению, но не к полному подавлению связывания. В заключение, результаты аланинового сканирования для CBTAU-24.1 показали, что P236 является единственным критически важным для связывания остатком (табл. 24).

Для картирования критически важных контактных остатков для CBTAU-27.1 и 43.1 также проводили аланиновое сканирование в пределах участка 299-323 тау-белка (табл. 25 и табл. 27 соответственно). Было показано, что критически важными контактными остатками для связывания CBTAU-27.1 являются D314, L315 и K317. Результаты позволяют предположить, что остатки D314 и K317 могут обеспечивать взаимодействия между эпитопом и остатками CDR в mAb посредством образования солевых мостиков. Хотя CBTAU-43.1 выделяли с использованием родственного пептида для CBAU-27.1, критически важные остатки в соответствии с аланиновым сканированием были разными. В дополнение к L315 и K317, было показано, что пролин в положении 312 является важным контактным остатком для связывания CBTAU-43.1. Наконец, также проводили аланиновое сканирование для CBTAU-28.1, а также для CBTAU-47.1, 47.1 и 49.1 (табл. 26, 28, 29). Как показано в примере 9, mAb CBTAU 47.1, 47.2, 49.1 по результатам картирования соответствовали тому же пептидному участку, что и CBTAU-28.1 (т.е. 52-71). Примечательно, что все mAb обладали требованиями к связыванию, идентичными CBTAU-28.1. Было показано, что критически важными контактными остатками являются P59, S61, E62, T63, D65 и K67. Было обнаружено, что некоторые из этих остатков являются заряженными, что подразумевает важные взаимодействия по типу солевых мостиков между эпитопом и mAb.

Пример 11. Иммуногистохимическое исследование

Полагают, что тау-патология инициируется в пределах энторинальной области коры (EC) и распространяется вдоль соединительных нейронных путей в гиппокампе перед переходом в кору. Для опреде

- 52 035530 ления реактивности выделенных IgG к отложениям патогенного тау-белка вдоль этих нейронных путей ткани гиппокампа получали от 82-летнего здорового мужчины (без AD; Abcam, № по кат. ab4305) и 88летнего мужчины с болезнью Альцгеймера (AD; Abcam, № по кат. ab4583) (Abcam). Кортикальные ткани получали от 71-летнего здорового (без AD) индивидуума и 71-летнего индивидуума с болезнью Альцгеймера (AD) (Banner Sun Health). В дополнение к AD, существует много неврологических нарушений, которые характеризуются тау-патологией, также известных как таупатии. Для расширения полученных результатов авторы настоящего изобретения тестировали выделенные mAb в тканях, полученных из лобных долей с прогрессирующим надъядерным параличом (PSP) и непрогрессирующим надъядерным параличом (без PSP), полученных соответственно от 73-летнего мужчины и 81-летней женщины (Biochain). Ткани головного мозга депарафинировали и регидратировали путем промывания дважды в течение 10 мин. в ксилоле (VWR International) с последующим промыванием дважды в течение 3 мин в 100% этаноле, дважды в течение 3 мин. в 95% этаноле, трижды в течение 3 мин в 70% этаноле и один раз в течение 30 с в дистиллированной H₂O с использованием набора для окрашивания микропрепаратов Tissue-Tek® (VWR International). Срезы тканей подвергали демаскированию антигена под действием тепла с использованием цитратного буфера (10 мМ лимонной кислоты, pH 6,0) для обнажения антигенных детерминант. Срезы затем инкубировали с блокирующим буфером [10% нормальной козьей сыворотки (Jackson ImmunoResearch, Inc.), 1% BSA и 0,3% Triton-X100 в PBS)] при RT в течение 1 ч. Избыток воды удаляли, и срезы тканей обводили гидрофобным барьерным карандашом ImmEdge (Vector Labs). Готовили влажную камеру путем покрытия нижней части ванночки для окрашивания H₂O и срезы затем 3 раза промывали в PBS в течение 5 мин путем отсасывания. Активность эндогенной пероксидазы гасили в 10% H₂O₂ в течение 30 мин при RT. После гашения микропрепараты 3 раза промывали в PBS в течение 5 мин путем отсасывания. Микропрепараты затем блокировали в течение 1 ч при RT раствором 10% нормальной козьей сыворотки, 0,3% TritonX-100, 1% BSA в 1X PBS. Первичные антитела метили биотином, используя набор для мечения IgG человека Zenon (Life Technologies) согласно инструкциям производителя. В качестве отрицательного контроля использовали антитело человека, специфичное к RSV. Химеризированный человеческим Fc-участком вариант IgG AT8 использовали в качестве положительного контроля. После мечения первичные антитела разводили по отдельности в блокирующем буфере в концентрациях 5 и 20 мкг/мл. Для экспериментов по конкуренции пептидов 13,3 мкМ родственного пептида (т.е. пептида, используемого для выделения mAb в экспериментах по сортировке) предварительно инкубировали с первичным антителом в течение 30 мин при RT перед инкубированием со срезами тканей. Срезы тканей инкубировали при RT в течение 2 ч со 100 мкл разведенного первичного антитела, меченного биотином, или антитела, за которое конкурируют пептиды. После удаления антитела путем отсасывания проводили вторую фиксацию среза ткани в 4% формальдегиде в PBS, и его инкубировали в течение 15 мин при RT. Срезы 3 раза промывали в PBS в течение 5 мин путем отсасывания. Срезы затем инкубировали в течение 30 мин вместе со стрептавидиновым субстратом реагентом Vectastain ABC (Vector Labs) перед промыванием в PBS. Затем ткани проявляли субстратом DAB (Vector Labs) в присутствии никеля. Срезы затем 2 раза промывали в ddH₂O и оставляли для полного высушивания при RT перед заливкой в 50 мкл стабильной заливочной среды VectaMount (Vector Labs). В заключение, срезы тканей подвергали контрастному окрашиванию гематоксилином (Vector Labs).

Иллюстративные изображения получали с помощью прямого микроскопа Olympus BX-41, используя программное обеспечение MetaMorph.

Результаты иммуногистохимического исследования показаны на фиг. 5a-d. CBTAU-7.1 и CBTAU8.1 продемонстрировали положительную специфичную иммунореактивность в тканях головного мозга с AD, но не в тканях здорового головного мозга, что позволяет предположить связывание с отложениями патогенного тау-белка, присутствующими в пораженных тканях головного мозга. Эти антитела узнают AT8-положительные клубки из тау-белка и нейтрофильные нити в подобластях гиппокампа (фиг. 5a; энторинальная область коры) и коре головного мозга (фиг. 5b). Кроме того, в нескольких экспериментах в цитоплазме и отростках нейронов неизменно обнаруживали положительную иммунореактивность. Кроме того, CBTAU-18.1, 22.1 и 24.1 также тестировали в отношении срезов тканей гиппокампа и кортикальных тканей (фиг. 5a-b). Аналогично CBTAU-7.1 и CBTAU-8.1, все mAb вступали в специфичную реакцию с тау-белком в срезах тканей с AD, но не с тау-белком в срезах тканей без AD. Примечательно, что CBTAU-24.1, не специфичное к фосфорилированному тау-белку, вступает в специфичную реакцию с патологическим тау-белком в срезах тканей с AD, но не с тау-белком в срезах тканей без AD. В заключение, CBTAU-16.1 и CBTAU-20.1 проявляют реактивность по отношению к тау-белку в срезах тканей как без AD, так и с AD.

Кроме того, CBTAU-7.1, 8.1, 16.1, 18.1, 20.1, 22.1 и 24.1 тестировали в срезах кортикальных тканей, соответствующих прогрессирующему надъядерному параличу (фиг. 5c). В отличие от AT8, CBTAU-7.1 и CBTAU-8.1 не смогли обнаружить клубки из тау-белка в головном мозге человека с PSP, что позволяет предположить, что эпитоп для обоих mAb отсутствует при PSP. CBTAU-16.1 и CBTAU-20.1 демонстрировали положительную иммунореактивность по отношению к тау-белку в кортикальных срезах головного мозга без PSP и с PSP, что позволяет предположить связывание как с нормальными формами таубелка, так и с патогенными формами тау-белка. В срезах головного мозга без AD эти антитела продемон

- 53 035530 стрировали положительное иммуноокрашивание тау-белка в цитоплазме и отростках нейронов (фиг. 5a и 5b), при этом оба mAb обнаруживали клубки и нейтрофильные нити в срезах головного мозга с AD аналогично AT8. Аналогичную AT8 иммунореактивность по отношению к клубкам из тау-белка также обнаружили в срезах тканей головного мозга с PSP, что позволяет предположить, что как CBTAU-16.1, так и CBTAU-20.1 узнают типичные формы патогенного тау-белка при других таупатиях, отличных от AD. Кроме того, CBTAU-22.1 и CBTAU-24.1 демонстрировали иммунореактивность исключительно в тканях головного мозга с AD при положительной иммунореактивности к клубкам и нейтрофильным нитям. CBTAU-18.1 демонстрировало слабую иммунореактивность в тканях головного мозга без AD, но вступало в более интенсивную реакцию в образцах тканей с AD. CBTAU-18.1, CBTAU-22.1 и CBTAU-24.1 также обладали положительной реактивностью по отношению к клубкам из тау-белка в срезах тканей головного мозга с PSP (фиг. 5c).

CBTAU-27.1 и CBTAU-28.1 демонстрировали селективное иммуноокрашивание в срезах тканей головного мозга без AD с диффузным иммуноокрашиванием в цитоплазме и отростках нейронов. Примечательно, что оба антитела не смогли продемонстрировать иммунореактивность в срезах тканей с AD (как в тканях гиппокампа, так и в кортикальных тканях), определяя новый эпитоп, который утрачивается в ходе прогрессирования заболевания. В отличие от большинства mAb человека к тау-белку, идентифицированных авторами настоящего изобретения, CBTAU-27.1 и CBTAU-28.1 выделяли путем скрининга образцов доноров с использованием набора нефосфорилированных пептидов, охватывающих весь участок tau441 человека. Эти антитела не требуют фосфорилирования для связывания (фиг. 1) и, как показано на фиг. 2, не вступают в реакцию с PHF, что выявляется в ходе ELISA. Поэтому наблюдаемый для этих двух mAb диффузный характер иммуноокрашивания был ожидаемым. Кроме того, CBTAU-43.1, которое изначально выделили с использованием родственного пептида для CBTAU-27.1, тестировали в отношении срезов кортикальной ткани. CBTAU-43.1 вступало в реакцию аналогично CBTAU-27.1, окрашивая тау-белок в срезах тканей без AD, но не тау-белок в срезах тканей с AD. Аналогичным образом, CBTAU-46.1, 47.2 (тестировали только один вариант) и 49.1, которые выделяли с использованием родственного пептида для CBTAU-28.1, вступали в специфичную реакцию с тау-белком в срезах тканей без AD, но не в срезах тканей с AD (фиг. 5d). Интересно отметить, что все эти mAb имеют общие последовательности зародышевого типа генов тяжелой и легкой цепей (т.е. VH5-51 и VK4-1), связываются с одними и теми же участками в тау-белке и, как показано на фиг. 5d, обладают аналогичными иммуногистохимическими свойствами.

Результаты иммуногистохимического исследования, представленные в данном документе для CBTAU-7.1, 8.1, 18.1, 22.1, 24.1, 27.1 и 28.1, были подтверждены по нескольким участкам образцов головного мозга и тканей, соответствующих нескольким индивидуумам без AD и с AD. Иммунореактивность mAb CBTAU 43.1, 46.1, 47.2 и 49.1 была в свое время подтверждена при использовании того же образца ткани и еще не была подтверждена на образцах, соответствующих другим индивидуумам с AD и без AD.

Пример 12. IHC с дефосфорилированием

Учитывая, что результаты IHC для CBTAU-28.1 продемонстрировали иммунореактивность по отношению к тау-белку в срезах тканей без AD, но не к тау-белку в срезах тканей с AD, авторы настоящего изобретения выдвинули гипотезу, что утрата этого эпитопа в ходе прогрессирования заболевания была результатом модификации(модификаций) (т.е. фосфорилирования). Для тестирования этой гипотезы срезы тканей головного мозга человека дефосфорилировали перед оцениванием иммунореактивности CBTAU-28.1. Залитые в парафин срезы тканей головного мозга человека (Abcam, № по кат. ab4305, от 54-летнего мужчины без клинических симптомов в сравнении с Abcam, № по кат. ab4583, от 93-летней женщины латиноамериканского происхождения с болезнью Альцгеймера) депарафинировали и регидратировали путем промывания дважды в течение 10 мин в ксилоле (VWR International) с последующим промыванием дважды в течение 3 мин в 100% этаноле, дважды в течение 3 мин в 95% этаноле, трижды в течение 3 мин в 70% этаноле и один раз в течение 30 с в дистиллированной H2O с использованием набора для окрашивания микропрепаратов Tissue-Tek® (VWR International). Чтобы свести к минимуму неспецифичное связывание антитела, тканям при промываниях никогда не позволяли высохнуть. Срезы тканей подвергали демаскированию антигена под действием тепла с использованием цитратного буфера (лимонная кислота, pH 6,0) для обнажения антигенных детерминант. Избыток воды удаляли и срезы тканей обводили гидрофобным барьерным карандашом ImmEdge (Vector Labs). Готовили влажную камеру путем покрытия нижней части ванночки для окрашивания H2O и срезы затем 3 раза промывали в PBS в течение 5 мин путем отсасывания. Активность эндогенной пероксидазы гасили в H₂O₂ в течение 15 мин при RT. После гашения микропрепараты 3 раза промывали в PBS в течение 5 мин путем отсасывания. Срезы после этого обрабатывали 130 единицами/мл кишечной щелочной фосфатазы теленка (CIAP) в течение 2,5 ч при 32°C. Микропрепараты затем блокировали в течение 1 ч при RT раствором 10% нормальной козьей сыворотки, 0,3% TritonX-100, 1% BSA в 1X PBS. Муринизированное антитело CBTAU28.1 (муринизированный Fc-участок) и контрольные mAb AT8 и изотипический контроль (mAb 4.1 к RSV) инкубировали в течение ночи на срезах гиппокампа в конечной концентрации 1 мкг/мл. Срезы промывали и инкубировали с антителом, специфичным к Fcy-фрагменту иммуноглобулина мыши, в те- 54 035530 чение 2 ч при комнатной температуре. Образцы проявляли раствором субстрата пероксидазы DAB в присутствии никеля. Образцы подвергали контрастному окрашиванию гематоксилином (Vector Labs). Иллюстративные изображения получали с помощью прямого микроскопа Olympus BX-41, используя программное обеспечение MetaMorph.

Результаты показаны на фиг. 6a и b. Как и ожидалось, CBTAU-28.1 вступает в реакцию с таубелком, присутствующем в срезах тканей гиппокампа без AD, но не вступает в реакцию с тау-белком в срезах тканей с AD. В противоположность этому, контрольное mAb AT8 не вступает в реакцию с таубелком в срезах без AD, но однозначно вступает в реакцию с отложениями патогенного тау-белка, присутствующими в срезах тканей с AD (фиг. 6a). Однако, предварительная обработка срезов тканей с AD фосфатазой восстанавливает реактивность CBTAU-28.1, позволяя ему окрашивать отложения патогенного тау-белка, присутствующие в этих срезах. Как и ожидалось, реактивность AT8 при предварительной обработке срезов тканей с AD фосфатазой снижалась (фиг. 6b).

Пример 13. ELISA с дефосфорилированием

Для подтверждения результатов из примера 12 дефосфорилированные парные спиральные филаменты тестировали на реактивность по отношению к CBTAU-28.1 посредством ELISA. 96-луночные планшеты для связывания с половинным объемом лунок (Costar) покрывали 50 мкл антигена в TBS (2 мкг/мл бычьего актина и антитела козы к F(ab)₂-фрагменту человека, очищенного аффинной хроматографией, и 1 мкг/мл аффинно очищенных парных спиральных филаментов iPHF, подвергнутых и не подвергнутых предварительной обработке кишечной фосфатазой теленка CIP). iPHF, обработанный фосфатазой, получали следующим образом. Образцы iPHF ресуспендировали в 1X буфере NEB 4 (50 мМ ацетата калия, 20 мМ Tris-ацетата, 10 мМ ацетата магния и 1 мМ DTT) в конечной концентрации 0,05 мкг/мл. Добавляли одну единицу CIP на мкг iPHF (CIP, NEB, № по кат. M0290S). Образцы iPHF инкубировали с CIP в течение 90 мин при 37°C перед покрыванием планшетов для связывания для ELISA. После связывания антигена в течение ночи планшеты промывали в TBS-T и затем блокировали 150 мкл TBS с 2,5% BSA в течение 2 ч при RT. Очищенные контрольные IgG и IgG к тау-белку CBTAU-28.1 титровали в 5-кратных разведениях, начиная с 25 мкг/мл в TBS/0,25% BSA, и инкубировали в течение 1,5 ч. Планшеты промывали 4 раза в TBS-T, и добавляли вторичное антитело (антитело к Fab человека, конъюгированное с HRP, Jackson Immunoresearch, № по кат. 109-036-097) и инкубировали при RT в течение 45 мин. После инкубирования планшеты промывали 4 раза в TBS-T и проявляли субстратом пероксидазы для микролунок SureBlue Reserve TMB (KPL) в течение примерно 2 мин. Реакцию немедленно останавливали посредством добавления останавливающего раствора TMB (KPL) и измеряли поглощение при 450 нм, используя планшет-ридер для ELISA. Для каждой экспериментальной точки использовали три повторности.

Результаты показаны на фиг. 7. Как раньше было показано в примере 7, CBTAU-28.1, в отличие от AT8, вступает в слабую реакцию с iPHF, что выявляется в ходе ELISA. Однако, дефосфорилирование iPHF с помощью CIP восстанавливает реактивность CBTAU-28.1 по отношению к образцам филаментов. Как и ожидалось, реактивность контрольного mAb AT8 по отношению к фосфо-тау-белку устраняется после дефосфорилирования iPHF с помощью CIP.

Пример 14. Реактивность CBTAU-27.1, 28.1, 43.1, 47.1, 47.2 и 49.1 по отношению к фосфопептидам

Результаты иммуногистохимического исследования для CBTAU-27.1 (а также CBTAU-43.1) и CBTAU-28.1 (а также CBTAU-46.1, 47.2, 49.1) позволяют предположить, что эти mAb вступают в реакцию с эпитопом на тау-белке, который присутствует в срезах нормальных тканей без AD, но утрачивается или маскируется в ходе формирования заболевания (фиг. 5). Авторы настоящего изобретения выдвинули гипотезу, что это было обусловлено явлением фосфорилирования в пределах участка, которое приводит к маскировке эпитопа(эпитопов). Эксперименты, освещенные в примерах 12 и 13, показали, что это действительно было справедливым для 28.1. Таким образом, авторы настоящего изобретения желали конкретно определить сайт(сайты), которые могут быть потенциально намечены для фосфорилирования и обуславливать утрату реактивности CBTAU-28.1. Поскольку 47.1, 47.2 и 49.1 связываются с тем же участком на тау-белке, что и CBTAU-28.1 (т.е. 52-71), авторы настоящего изобретения решили протестировать также и эти mAb в данных экспериментах. Кроме того, авторы настоящего изобретения также произвели те же действия для CBTAU-43.1 и CBTAU-27.1, поскольку они ведут себя аналогично CBTAU-28.1, что выявляется в ходе IHC.

Тау-пептиды с одинарным и двойным фосфорилированием были предназначены для охвата всех потенциальных сайтов фосфорилирования в участках 52-71 и 299-323 (участках связывания для CBTAU28.1 и CBTAU-27.1 соответственно). mAb CBTAU-27.1 и CBTAU-43.1 тестировали в отношении пептидов, перечисленных в табл. 30 и 32. 96-луночные планшеты для ELISA, покрытые стрептавидином (Pierce), покрывали фосфорилированными тау-пептидами, как подробно описано в примере 9. Очищенные IgG к тау-белку разводили до 5 мкг/мл в TBS, содержащем 0,25% BSA, и титровали в 5-кратных разведениях. Контрольное антитело и вторичные антитела использовали, как подробно описано в примере 9. Реактивность антител при 1 мкг/мл определяли посредством ELISA и оценивали как отсутствие связывания (-), слабую (-/+), среднюю (+) или сильную (++). (-) для среднего значения двух показателей O.D. при 450 нм <0,3; (-/+) для >0,5 и <1,0; (+) для >1,0 и <1,5; (++) для >1,5. Результаты для каждого антитела по

- 55 035530 казаны в табл. 30-34 и на фиг. 8.

Таблица 30. CBTAU-27.1: Пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.		Результат
tau 299-369	331	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCGSLGNIH HKPGGGQVEVKSEKLDFKDRVQSKIGSLDNI THVPGGGNK	++
tau 299-323	458	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
ptau 299-323 р305	503	HVPGGG(pS)VQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
ptau 299-323 рЗЮ	504	HVPGGGSVQIV(pY)KPVDLSKVTSKCG	++
ptau 299-323 р316	505	HVPGGGSVQIVYKPVDL(pS)KVTSKCG	-
ptau 299-323 р319	506	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKV(pT)SKCG	++
ptau 299-323 р320	507	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVT(pS)KCG	++
ptau 299-323 р305, 310	508	HVPGGG(pS)VQIV(pY)KPVDLSKVTSKCG	++
ptau 299-323 р305, 316	509	HVPGGG(pS)VQIVYKPVDL(pS)KVTSKCG	-
ptau 299-323 р305, 320	510	HVPGGG(pS)VQIVYKPVDLSKV(pT)SKCG	++
ptau 299-323 р305, 321	511	HVPGGG(pS)VQIVYKPVDLSKVT(pS)KCG	++
ptau 299-323 рЗЮ, 316	512	HVPGGGSVQIV(pY)KPVDL(pS)KVTSKCG	-
ptau 299-323 рЗЮ, 320	513	HVPGGGSVQIV(pY)KPVDLSKV(pT)SKCG	++
ptau 299-323 рЗЮ, 321	514	HVPGGGSVQIV(pY)KPVDLSKVT(pS)KCG	++
ptau 299-323 р316, 320	515	HVPGGGSVQIVYKPVDL(pS)KV(pT)SKCG	-
ptau 299-323 р316, 321	516	HVPGGGSVQIVYKPVDL(pS)KVT(pS)KCG	-
ptau 299-323 р320, 321	517	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKV(pT)(pS)KCG	-/+

Таблица 31. CBTAU-28.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.		Результат
		GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPT
tau 42-103	325	AE D VT AP L VD E GAP GKQAAAQ Ρ HT	++
		EIPEGTTA
tau 48-71	518	LQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
ptau 48-71 (p71)	519	LQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTP(pT)	++
ptau 48-71 (p63)	520	LQTPTEDGSEEPGSE(pT)SDAKSTPT	-
ptau 48-71 (p61)	521	LQTPTEDGSEEPG(pS)ETSDAKSTPT	-
ptau 48-71 (p56)	522	LQTPTEDG(pS)EEPGSETSDAKSTPT	++
ptau 48-71 (p52)	523	LQTP(pT)EDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
ptau 48-71 (p68)	524	LQTPTEDGSEEPGSETSDAK(pS)TPT	++
ptau 48-71 (p69)	525	LQTPTEDGSEEPGSETSDAKS(pT)PT	++
ptau 48-71 (p64)	526	LQTPTEDGSEEPGSET(pS)DAKSTPT	++
ptau 48-71 (p61,p64)	527	LQTPTEDGSEEPG(pS)ET(pS)DAKSTPT	-
ptau 48-71 (p61,p63)	528	LQTPTEDGSEEPG(pS)E(pT)SDAKSTPT	-
ptau 48-71 (p63,p64)	529	LQTPTEDGSEEPGSE(pT)(pS)DAKSTPT	-

- 56 035530

Таблица 32. CBTAU-43.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.		Результат
		HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCGSLGNIH
tau 299-369	331	HKPGGGQVEVKSEKLDFKDRVQSKIGSLDNI	++
		THVPGGGNK
tau 299-323	458	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
ptau 299-323 р305	503	HVPGGG(pS)VQIVYKPVDLSKVTSKCG	++
ptau 299-323 рЗЮ	504	HVPGGGSVQIV(pY)KPVDLSKVTSKCG	++
ptau 299-323 р316	505	HVPGGGSVQIVYKPVDL(pS)KVTSKCG	-
ptau 299-323 р319	506	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKV(pT)SKCG	++
ptau 299-323 р320	507	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKVT(pS)KCG	++
ptau 299-323 р305,
310	508	HVPGGG(pS)VQIV(pY)KPVDLSKVTSKCG	++
ptau 299-323 р305,		—
316	509	HVPGGG(pS)VQIVYKPVDL(pS)KVTSKCG	-
ptau 299-323 р305,		—
	510	HVPGGG(pS)VQIVYKPVDLSKV(pT)SKCG
320
ptau 299-323 р305,
321	511	HVPGGG(pS)VQIVYKPVDLSKVT(pS)KCG	++
ptau 299-323 рЗЮ,		—
316	512	HVPGGGSVQIV(pY)KPVDL(pS)KVTSKCG	-
ptau 299-323 рЗЮ,		—
320	513	HVPGGGSVQIV(pY)KPVDLSKV(pT)SKCG	++
ptau 299-323 рЗЮ,		—
321	514	HVPGGGSVQIV(pY)KPVDLSKVT(pS)KCG	++
ptau 299-323 р316,		—
320	515	HVPGGGSVQIVYKPVDL(pS)KV(pT)SKCG	-/+
ptau 299-323 р316,		—
321	516	HVPGGGSVQIVYKPVDL(pS)KVT(pS)KCG	-
ptau 299-323 р320,	517	HVPGGGSVQIVYKPVDLSKV(pT)(pS)KCG	++
Id_________			_________________________________________________________________________________________________1

- 57 035530

Таблица 33. CBTAU-47.1 и CBTAU-47.2: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.		Результат для CBTAU-47.1	Результат для CBTAU-47.2
tau 42-103	325	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSET S DAK S T P TAE DVTAP LVD E GAP GKQAAAQPHTIPEGTTA	++	++
tau 48-71	518	LQTPTEDGSEEPGSETSDAKST PT	++	++
ptau 48-71 (р71)	519	LQTPTEDGSEEPGSETSDAKST P(pT)	++	++
ptau 48-71 (рбЗ)	520	LQTPTEDGSEEPGSE(pT)SDA KSTPT	-	-
ptau 48-71 (р61)	521	LQTPTEDGSEEPG(pS)ETSDA KSTPT	-	-
ptau 48-71 (р56)	522	LQTPTEDG(pS)EEPGSETSDA KSTPT	++	++
ptau 48-71 (р52)	523	LQTP(pT)EDGSEEPGSETSDA KSTPT	++	++
ptau 48-71 (р68 )	524	LQTPTEDGSEEPGSETSDAK(p S) TPT	++	++
ptau 48-71 (р69)	525	LQTPTEDGSEEPGSETSDAKS( pT) PT	++	++
ptau 48-71 (Ser64)	526	LQTPTEDGSEEPGSET(pS) DA KSTPT	++	++
ptau 48-71 (p61,Ser64)	527	LQTPTEDGSEEPG(pS)ET(pS )DAKSTPT	-	-
ptau 48-71 (p61,p63)	528	LQTPTEDGSEEPG(pS)E(pT) SDAKSTPT	-	-
ptau 48-71 (p63,p64)	529	LQTPTEDGSEEPGSE(pT)(pS )DAKSTPT	-	-

Таблица 34. CBTAU-4 9.1: пептиды для определения реактивности в ходе ELISA

Пептид	SEQ ID NO.		Результат
tau 42-103	325	GLKESPLQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPTA E DVTAP LVD E GAP GKQAAAQ P HT ElPEGTTA	++
tau 48-71	518	LQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
ptau 48-71 (p71)	519	LQTPTEDGSEEPGSETSDAKSTP(pT)	++
ptau 48-71 (p63)	520	LQTPTEDGSEEPGSE(pT)SDAKSTPT	-
ptau 48-71 (p61)	521	LQTPTEDGSEEPG(pS)ETSDAKSTPT	-
ptau 48-71 (p56)	522	LQTPTEDG(pS)EEPGSETSDAKSTPT	++
ptau 48-71 (p52)	523	LQTP(pT)EDGSEEPGSETSDAKSTPT	++
ptau 48-71 (p68)	524	LQTPTEDGSEEPGSETSDAK(pS)TPT	++
ptau 48-71 (p69)	525	LQTPTEDGSEEPGSETSDAKS(pT)PT	-/+
ptau 48-71 (Ser64)	526	LQTPTEDGSEEPGSET(pS)DAKSTPT	++
ptau 48-71 (p61,Ser64)	527	LQTPTEDGSEEPG(pS)ET(pS)DAKSTPT	-
ptau 48-71 (p61,p63)	528	LQTPTEDGSEEPG(pS)E(pT)SDAKSTPT	-
ptau 48-71 (p63,p64)	529	LQTPTEDGSEEPGSE(pT)(pS)DAKSTPT	-

Результаты для CBTAU-27.1 и CBTAU-43.1 демонстрируют, что фосфорилирование по S316 является достаточным для полного подавления реактивности (табл. 30 и табл. 32). Это позволяет предположить, что утрата реактивности по отношению к тау-белку в срезах тканей с AD (пример 11) может быть результатом фосфорилирования по S316, явления, которое может происходить на ранней стадии течения заболевания. Для CBTAU-28.1, 47.1, 47.2, 49.1 фосфорилирование по S61 либо T63 является достаточным для полного подавления реактивности. В совокупности результаты для CBTAU-28.1, 47.1, 47.2 и 49.1 позволяют предположить, что фосфорилирование по S61 и/или T63 является механизмом, который обуславливает утрату этого эпитопа в ходе течения заболевания.

Пример 15. Образование химерных mAb мыши/человека и изотипов mAb человека к тау-белку

Для тестирования эффективности mAb человека к тау-белку в мышиной модели таупатии образо

- 58 035530 вывали химерные антитела мыши/человека посредством замены Fc-участка человека на Fc IgGl мыши. Вкратце, CH1-участок IgG1 человека амплифицировали из вектора pCB-IgG, используя праймеры прямой Step1HMchim и обратный Step1HMchim (табл. 35), с образованием фрагмента размером 0,95 т.п.о., содержащего сайт 5'-XhoI (фрагмента 1). CH2- и CH3-домены (Fc-участок) IgG1 мыши амплифицировали из синтезированной генетической конструкции, используя праймеры прямой Step2HMchim и обратный Step2HMchim (табл. 30), с образованием фрагмента размером 0,82 т.п.о. (фрагмента 2). Третий фрагмент (фрагмент 3), который включает в себя сайт 3'-DraIII, образовывали путем амплификации поли-Aучастка вектора pCB-IgG, используя праймеры прямой Step3HMchim и обратный Step3HMchim (табл. 30). Эти три фрагмента соединяли в одну кассету посредством ПЦР с перекрывающимися праймерами с образованием перекрывающегося фрагмента размером 2,3 т.п.о, содержащего CH1 человека, за которым расположены CH2-CH3-домены мыши. Перекрывающийся фрагмент затем клонировали с помощью сайтов XhoI и DraIII в вектор pCB-IgG CBTAU-7.1 с образованием химерного CBTAU-7.1 мыши/человека, содержащего вариабельный, CH1-, шарнирный и Ck-участки человека, за которыми расположены CH2 и CH3-участки мыши. Химерные CBTAU-22.1, 24.1, 27.1, 28.1, 47.1, 47.2, 46.1, 49.1 и 43.1 затем образовывали путем расщепления химерной конструкции CBTAU-7.1 и конструкций pCB-IgG CBTAU mAb человека с помощью XhoI и XbaI, и соответствующие фрагменты субклонировали. Нуклеотидные последовательности для всех конструкций проверяли согласно стандартным методикам, известным специалистам в данной области. Химерные антитела затем экспрессировали и очищали, как подробно описано в примере 5, используя белок G на агарозе вместо белка A.

Таблица 35. Праймеры для получения химерных форм мыши/человека

ID праймера последовательность ДНК (5'-3') SEQ ID NO:

Прямой SteplHMchim TCTCCGCCGGTGAGTCTCGAGGC 530

Обратный SteplHMchim TGTCCCTGGATGCAGGCTACTCTAGG 531

Прямой Step2HMchim AGAGTAGCCTGCATCCAGGGACAG 532

Обратный Step2HMchim TCTAGATCATTTACCAGGAGAGTGGGAGAG 533

Прямой Step3HMchim TCTCCTGGTAAATGATCTAGAGTTTAAACCGCTG 534

Обратный Step3HMchim ATGGCCCACTACGTGAACCATCACC 535

Пример 16. Получение изотипов IgG2, 3 и 4

Как упоминалось в примере 3, все mAb CBTAU клонировали и экспрессировали в виде химерного IgG1 человека независимо от их изначального изотипа. Для образования дополнительных вариантов изотипов человека (т.е. IgG2/3/4) участки CH1-CH3, соответствующие каждому изотипу IgG человека, амплифицировали посредством ПЦР из синтезированной генетической конструкции, содержащей соответствующие последовательности константного участка, шарнирного участка и интрона. ПЦР-ампликоны содержали сайты 5'-XhoI и 3'-DraIII, используемые для субклонирования фрагментов в соответствующую конструкцию антитела pCB-IgG CBTAU. Таким образом, для каждого mAb к тау-белку образовывали варианты изотипов IgG2, 3 и 4 человека.

Пример 17. Образование вариантов химерных моноклональных антител к тау-белку со сниженным риском и сконструированным Fc

Вариабельные участки тяжелой и легкой цепи (VH и VL) для каждого клона антитела к тау-белку, выделенного в примере 3, анализировали на наличие свободных цистеиновых остатков и потенциальных сайтов посттрансляционных модификаций, включающих сайты гликозилирования, дезамидирования и оксидирования. Для изменения этих сайтов использовали аминокислотные мутации, состоящие из структурно консервативных замен и/или замен в последовательностях зародышевого типа. Неконсервативные цистеиновые остатки в вариабельных участках подвергали мутации по типу замены на серин. Для сайтов гликозилирования использовали несколько мутаций, включая замену аспарагина на консервативный глутамин или мутации в последовательностях зародышевого типа. Модификации в сайтах дезамидирования включали замену аспарагиновой кислоты на аспарагин и серина или аланина на глицин. Сайты потенциального оксидирования не подвергали модификации. Для повышения аффинности связывания с FcRn и увеличения таким образом периода полужизни mAb IgG1 in vivo создавали несколько мутаций, расположенных на границе между CH2 и CH3-участком. Эти мутации включали M252Y/S254T/T256E в комбинации с H433K/N434F (Vaccaro C. et al., 2005) или T250Q/M428L (Hinton PR. et al., 2004), которые, как было показано, усиливают связывание IgG1 с FcRn. Все замены создавали путем сайт-направленного мутагенеза согласно инструкциям производителя (QuickChange II, Agilent Technologies, № по кат. 200521). Нуклеотидные последовательности для всех конструкций проверяли согласно стандартным методикам, известным специалистам в данной области техники.

Claims (10)

1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ

   1. Моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которое:

   а) связывается с отложениями тау-белка в ткани головного мозга человека с болезнью Альцгеймера (AD),

   b) не связывается с тау-белком в нормальной ткани головного мозга человека и

   c) не связывается с отложениями тау-белка в ткани головного мозга с прогрессирующим надъядерным параличом (PSP), где антитело содержит область CDR1 тяжелой цепи с SEQ ID NO: 163, область CDR2 тяжелой цепи с SEQ ID NO: 164 и область CDR3 тяжелой цепи с SEQ ID NO: 165, область CDR1 легкой цепи с SEQ ID NO: 166, область CDR2 легкой цепи с SEQ ID NO: 167 и область CDR3 легкой цепи с SEQ ID NO: 168, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент является фосфоспецифическим.
2. 2. Моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которое:

   a) связывается с отложениями тау-белка в ткани головного мозга человека с болезнью Альцгеймера (AD),

   b) не связывается с тау-белком в нормальной ткани головного мозга человека и

   c) не связывается с отложениями тау-белка в ткани головного мозга с прогрессирующим надъядерным параличом (PSP), где антитело содержит область CDR1 тяжелой цепи с SEQ ID NO: 169, область CDR2 тяжелой цепи с SEQ ID NO: 170 и область CDR3 тяжелой цепи с SEQ ID NO: 171, область CDR1 легкой цепи с SEQ ID NO: 172, область CDR2 легкой цепи с SEQ ID NO: 173 и область CDR3 легкой цепи с SEQ ID NO: 174, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент является фосфоспецифическим.
3. 3. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.1 или 2.
4. 4. Вектор экспрессии, содержащий нуклеиновую кислоту по п.3.
5. 5. Клетка-хозяин для продукции антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по п.1 или 2, содержащая вектор по п.4.
6. 6. Способ получения антитела или антигенсвязывающего фрагмента по п.1 или 2, включающий культивирование клетки-хозяина по п.5 и выделение антитела или его фрагмента, полученных с помощью клетки-хозяина.
7. 7. Фармацевтическая композиция для лечения болезни Альцгеймера, расстройства памяти и/или когнитивных расстройств, ассоциированных с тау-белком, содержащая антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1 или 2 и по меньшей мере один фармацевтически приемлемый наполнитель.
8. 8. Применение антитела или антигенсвязывающего фрагмента по п.1 в качестве лекарственного препарата для лечения болезни Альцгеймера, расстройств памяти и/или когнитивных расстройств.
9. 9. Применение антитела или антигенсвязывающего фрагмента по п.2 в качестве лекарственного препарата для лечения болезни Альцгеймера, расстройств памяти и/или когнитивных расстройств.
10. 10. Способ обнаружения болезни Альцгеймера, расстройств памяти и/или когнитивных расстройств, ассоциированных с тау-белком, включающий:

    a) детекцию тау-белка путем приведения биологического образца в контакт с диагностирующим реагентом, который представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.1 или 2, и

    b) обнаружение связывания диагностического антитела-реагента с тау-белком в образце.