EA030276B1 - Способы идентификации страдающих раком пациентов и лечения рака у пациентов, у которых имеется или развивается резистентность к первой терапии рака - Google Patents

Способы идентификации страдающих раком пациентов и лечения рака у пациентов, у которых имеется или развивается резистентность к первой терапии рака Download PDF

Info

Publication number
EA030276B1
EA030276B1 EA201290883A EA201290883A EA030276B1 EA 030276 B1 EA030276 B1 EA 030276B1 EA 201290883 A EA201290883 A EA 201290883A EA 201290883 A EA201290883 A EA 201290883A EA 030276 B1 EA030276 B1 EA 030276B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
kinase
protein kinase
cancer
protein
inhibitor
Prior art date
Application number
EA201290883A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201290883A1 (ru
Inventor
Леви А. Гаррауэй
Кори М. Йоханнессен
Original Assignee
Дана-Фарбер Кэнсер Инститьют, Инк.
Дзе Брод Инститьют, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Дана-Фарбер Кэнсер Инститьют, Инк., Дзе Брод Инститьют, Инк. filed Critical Дана-Фарбер Кэнсер Инститьют, Инк.
Publication of EA201290883A1 publication Critical patent/EA201290883A1/ru
Publication of EA030276B1 publication Critical patent/EA030276B1/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/41—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with two or more ring hetero atoms, at least one of which being nitrogen, e.g. tetrazole
    • A61K31/4164—1,3-Diazoles
    • A61K31/4184—1,3-Diazoles condensed with carbocyclic rings, e.g. benzimidazoles
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10—Transferases (2.)
    • C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10—Transferases (2.)
    • C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C12N9/1205—Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1), e.g. protein kinases
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y207/00—Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
    • C12Y207/11—Protein-serine/threonine kinases (2.7.11)
    • C12Y207/11024—Mitogen-activated protein kinase (2.7.11.24), i.e. MAPK or MAPK2 or c-Jun N-terminal kinase
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers

Abstract

Изобретение относится к медицине. Конкретнее, изобретение относится к способу идентификации индивида, страдающего раком, для которого должно быть эффективно лечение ингибитором RAF и ингибитором MEK, CRAF, CrkL или TPL2/COT путем определения увеличенного числа копий генов, уровня мРНК или белка, либо уровня фосфорилирования одной или более киназ-мишеней MAP3K8 (TPL2/COT), CRKL (CrkL), FGR (Fgr), PRKCE (Prkce), PRKCH (Prkch), ERBB2 (ErbB2), AXL (Axl) или PAK3 (Pak3) по сравнению с аналогичными показателями у индивида, не страдающего раком. Также обеспечивается способ лечения рака, включающий введение индивиду эффективного количества ингибитора RAF и эффективного количества ингибитора MEK или TPL2/COT.

Description

Изобретение относится к медицине. Конкретнее, изобретение относится к способу идентификации индивида, страдающего раком, для которого должно быть эффективно лечение ингибитором КАР и ингибитором МЕК, СКАР, СткЬ или ТРЬ2/СОТ путем определения увеличенного числа копий генов, уровня мРНК или белка, либо уровня фосфорилирования одной или более киназмишеней МАР3К8 (ТРЬ2/СОТ), СККЬ (СткЬ), РОК (Рдт), РККСЕ (Ргксе), РККСН (Ртксй), ЕКВВ2 (ЕгЬВ2), АХЬ (Ах1) или РАК3 (Рак3) по сравнению с аналогичными показателями у индивида, не страдающего раком. Также обеспечивается способ лечения рака, включающий введение индивиду эффективного количества ингибитора КАР и эффективного количества ингибитора МЕК или ТРЬ2/ СОТ.
030276 Β1
030276
Релевантные заявки
Согласно 35 О.С. §119(е) по настоящей заявке испрашивается приоритет следующих предварительных заявок на патент США под серийными номерами: 61/312193, поданной 9 марта 2010; 61/312519, поданной 10 марта 2010; 61/326021, поданной 20 апреля 2010 и 61/415569, поданной 19 ноября 2010, полный объем которых включен в настоящее описание в качестве ссылки.
Спонсированное государством исследование или разработка
Настоящее изобретение выполнено при правительственной поддержке по государственным грантам К08 СА115927 и 1ΌΡ20Ό002750, выданным Национальными институтами здоровья. Правительство имеет определенные права на изобретение.
Уровень техники
Онкогенные мутации в серин/треониновой киназе В-КАР (также известной как ВКАР) обнаруживаются в 50-70% злокачественных меланом (Όανίοδ Н. с1 а1., ШШгс. 417, 949-954 (2002)). Результаты доклинических исследований показали, что мутация В-КАР (У600Е) прогнозирует зависимость от сигнального каскада митоген-активированной протеинкиназы (МАРК) в меланоме (НоеШсй К.Р. с1 а1., Сапсег Кекеагсй, 69, 3042-3051 (2009); МсСеппоП и. с1 а1., Ргос. ЫаИ. Асаб. 8ск И8А, 104, 19936-19941 (2007); 8о1й Ό.Β. е1 а1. ВКАР ти1айоп ргебюй кепзйуйу 1о МЕК ίηΗίόίΙίοη. ШШге 439, 358-362 (2006); Аап Р.Т. е1 а1., Се11, 116, 855-867 (2004); \Уе11йгоск С. е1 а1., Сапсег Кек., 64, 2338-2342 (2004)) - наблюдение, которое подтвердилось положительным эффектом ингибиторов КАР или МЕК в клинических испытаниях (Р1айебу К.Т. с! а1., N. Еп§1. I. Меб., 363, 809-819 (2010); 1п£ап1е I. К. е! а1., I. Сйп. Опсо1., 28 (кирр1.), 2503 (2010); 8сй\уаг1/ С.К. е1 а1., I. Сйп. Опсо1. 27 (кирр1.), 3513 (2009)). Однако резистентность бе поуо или приобретенная резистентность часто оказывает отрицательное влияние на клинические ответы на нацеленные противораковые препараты (Епде1тап РА. е1 а1., Заепсе, 316, 1039-1043 (2007); Согге М. Е. е1 а1., Заепсе, 293, 876-880 (2001); Нешпсй М.С. с! а1., I. Сйп. Опсо1., 24, 4764-4774 (2006); Ваий Н., 8ресй1 К. & ИПпсй А., №Циге Кеу. Όπΐβ О^соу., 3, 1001-1010 (2004)). Следовательно, остается потребность в новых способах идентификации механизмов резистентности с целью выявления "лечебных" мишеней для эффективных долгосрочных стратегий лечения, а таже в новых способах идентификации пациентов, которые, вероятно, будут иметь пользу от стратегий лечения, и в способах лечения пациентов с использованием эффективных долгосрочных стратегий лечения.
Сущность изобретения
Настоящее изобретение относится к развитию резистентности к терапевтическим агентам в лечении рака. Следовательно, в одном из аспектов изобретение относится к способу идентификации индивида, у которого имеется рак, в отношении которого, вероятно, лечение комбинированной терапией ингибитором КАР и вторым ингибитором будет эффективно. Способ предусматривает анализ числа копий генов, уровня мРНК или белка, или фосфорилирования одной или более киназ-мишеней, выбранных из группы, состоящей из МАР3К8 (ТРБ2/СОТ), КАР1 (СКАР), СККЬ (СгкЕ), РСК (Р§г), РККСЕ (Ргксе), РККСН (Ргксй), ЕКВВ2 (ЕгйВ2), АХЬ (Ах1) или РАК3 (Рак3), в раковых клетках, полученных от индивида. Способ дополнительно предусматривает сравнение числа копий генов, уровня мРНК или белка, или фосфорилирования с числом копий генов, уровнем мРНК или белка, или фосфорилирования киназы-мишени в клетках, полученных от индивида, не страдающего раком, и соотнесение повышенного числа копий генов или изменения в экспрессии мРНК или сверэкспрессии белка, или фосфорилирования киназымишени в раковых клетках по сравнению с клетками от индивида, не страдающего раком, с индивидом, у которого имеется рак, который, вероятно, будет иметь пользу от лечения комбинированной терапией.
В еще одном аспекте изобретение относится к способу лечения рака у индивида, нуждающегося в этом. Способ предусматривает введение индивиду эффективного количества ингибитора КАР и эффективного количества второго ингибитора, в котором второй ингибитор представляет ингибитор МЕК или ингибитор ТРЙ2/СОТ.
Краткое описание фигур
На фиг. 1 показан функциональный скрининг, основанный на ОКР, с помощью которого идентифицируются киназы СОТ и С-КАР в качестве возбудителей резистентности к ингибированию В-КАР. (а) Схематическое изображение коллекции ОКР киназ СС8В/Института Брода. Указаны группы киназ и номер киназ в группе; (й) клетки А375, экспрессирующие коллекцию ОКР киназ СС8В/Института Брода, анализировали в отношении жизнеспособности после воздействия 1 мкМ РБХ4720 и нормализовали к конститутивно активной МЕК1 (МЕКГОО). Девять ОКР (кружки) были оценены, как имеющие различие в 2 стандартных отклонения (прерывистая линия, 58,64%) со средним значением для всех ОКР (прерывистая линия, 44,26%); (с) указанные ОКР экспрессировали в 5 клеточных линиях В-КАРУ600Е и обрабатывали ДМСО или РБХ47201 в концентрации 1 мкМ. Через 4 суток количественно оценивали жизнеспособность (по сравнению с ДМСО). Ошибки в виде коротких вертикальных отрезков представляют стандартное отклонение между повторностями опыта (п=6); (б) результаты второго скрининга на клетках А375 и 8КМЕЬ28 отдают предпочтение 9 основным кандидатам ОКР по многоточечной шкале концентраций РБХ4720.
На фиг. 2 показана резистентность к ингибированию В-КАР посредством активации пути МАРК. (а) Указанные ОКР экспрессировали в клетках А375. Определяли уровни фосфорилированных МЕК и
- 1 030276
ЕКК после обработки ДМСО в течение 18 ч (-) или РЬХ4720 (концентрации указаны); (Ь) пролиферация клеток А375, экспрессирующих указанные ОКЕ. Ошибки в виде коротких вертикальных отрезков представляют стандартное отклонение между повторностями опыта (п=6); (с) фосфорилирование С-КАЕ (8338) и ЕКК в лизатах клеток А375, экспрессирующих указанные ОКЕ; (к) экспрессия СОТ в лизатах иммортализованных первичных меланоцитов, экспрессирующих ВКАЕУ600Е или пустой вектор. мРНК СОТ содержит внутренний старт-кодон (30М), приводящий к экспрессии двух белковых продуктов различной длины; аминокислоты 1-467 или 30-467, отмеченные стрелками; (е) фосфорилирование СОТ и ЕКК в лизатах клеток А375, экспрессирующих указанные ОКЕ, после истощения В-КАЕ, опосредованного 8ЙРНК (ккВКАЕ), по сравнению с контрольной 8кРНК (ккЬис); (ί) фосфорилирование ЕКК в лизатах клеток А375, экспрессирующих указанные ОКЕ, после истощения С-КАЕ, опосредованного 8кРНК (ккСКАЕ) или контрольной 8кРНК (ккЬис), после обработки в течение 18 ч ДМСО (-) или 1 мкМ РБХ4720 (+).
На фиг. 3 показано, что экспрессия СОТ прогнозирует резистентность к ингибированию В-КАЕ в раковых клеточных линиях. (а) Число копий МАР3К8/СОТ; красные столбики: амплификация СОТ, синие столбики: неаплифицированная СОТ; (Ь) экспрессия СОТ в клеточных линиях В-КАЕУ600Е и (с) кратковременных культурах; (к) 0150 РЬХ4720 в клеточных линиях В-КАЕУ600Е. Цвета обозначения такие же как в п. (а); (е) фосфорилирование МЕК и ЕКК после обработки ДМСО или РЬХ4720 (концентрации указаны); (ί) фосфорилирование ЕКК в лизатах клеток М307 (ΛΖΌ-Ρ; АΖ^6244-резистентных), обработанных ДМСО или 1 мкМ РЬХ4720 (РЬХ) или С1-1040 (С1); (д) экспрессия мРНК СОТ (количественная ОТ/ПЦР) в образцах ткани метастатической меланомы, обработанных РЬХ4032. У пациентов 1 и 3 отбирали многочисленные биопсийные образцы из одного патологического участка. Ошибки в виде коротких вертикальных отрезков представляют 8ЕМ (п=3) И; неопределяемый/недектируемый; (к) фосфорилирование ЕКК и МЕК в клетках КРМ1-7951 после истощения СОТ, опосредованного 8кРНК (ккСОТ), по сравнению с контролем (ккЬис) и обработкой ДМСО (-) или 1 мкМ РЬХ4720 (+). Фосфорилирование ЕКК и МЕК анализировали количественно; (ί) фосфорилирование ЕКК и МЕК в клетках КРМ1-7951 после обработки в течение 1 ч низкомолекулярным ингибитором киназы СОТ. Фосфорилирование ЕКК и МЕК анализировали количественно. (]) Кривые чувствительности панели клеточных линий В-КАЕУ600Е к РЬХ4720. ОИМ8-23 и М307 представляют клеточные линии с экспрессией/амплификацией СОТ и все другие представляют клеточные линии с недектируемой/неизмененной СОТ; (к) селективная экспрессия СОТ и соответствующая активация пути МАРК в метастатической подкожной злокачественной меланоме с приобретенной резистентностью к РЬХ4032 (* означает контрольную полосу, МЕТ-ММ (РЬХ-К); метастатическая злокачественная меланома, РЬХ4032-резистентная).
На фиг. 4 показано, что клеточные линии В-КАЕУ600Е, экспрессирующие СОТ, проявляют резистентность к аллостерическим ингибиторам МЕК. (а) Значения 0150 С1-1040 в панели клеточных линий В-КАЕУ600Е; (Ь) фосфорилирование МЕК и ЕКК в лизатах указанных клеточных линий, обработанных ДМСО или С1-1040 (концентрации указаны); (с) кратное изменение (по сравнению с МЕК1) 0150 РЬХ4720, КАЕ265, С1-1040 и АΖ^6244 для клеток А375, эктопически экспрессирующих указанные ОК8; (к) фосфорилирование ЕКК в клетках А375, экспрессирующих указанные ОК8, после обработки ДМСО или 1 мкМ РЬХ4720, КАЕ265, С1-1040 и ΛΖ^6244; (е) жизнеспособность клеток А375, экспрессирующих указанные ОК8 и обработанных ДМСО, РЬХ4720 (концентрации указаны) и РЬХ4720 в комбинации с С1-1040 и АΖ^6244 (все в концентрации 1 мкМ). Ошибки в виде коротких вертикальных отрезков представляют стандартное отклонение (п=6); (ί) фосфорилирование ЕКК в клетках А375, экспрессирующих указанные ОК8, после обработки ДМСО, РЬХ4720 (1 мкМ) или РЬХ4720 в комбинации с С1-1040 или ΛΖ^6244 (все в концентрации 1 мкМ); (д) клеточные линии с аберрантным числом копий/экспрессией МАР3К8/СОТ являются нечувствительными к аллостерическому ингибитору МЕК-киназы С1-1040 или (к) ΛΖ^6244; (ί) схематическое изображение образования комплексов МАРЗК в ответ на ингибирование В-КАЕ в мутантных клеточных линиях В-КАЕУ600Е. Положения РЬХ4720 в С-КАЕ в сигнальномкомпетентном комплексе (верхняя правая панель), который активируется онкогенными событиями слева от С-КАЕ (нижняя правая панель), тем самым приводя к развитию резистентности. В контексте экспрессии СОТ комплексы, содержащие СОТ/КАЕ, достаточны для активации пути МАРК и опосредуют резистентность (нижняя левая панель).
На фиг. 5 показано схематическое изображение функционального скрининга, основанного на ОКЕ киназ, которые приводят к развитию резистентности к ингибированию В-КАЕ. В-КАЕУ600Е клеточная линия А375 была трансдуцирована лентивирусом с 597 киназами коллекции ОКЕ киназ СС8В/Института Брода. Идентифицировали ОКЕ, оказывающие положительный или отрицательный эффект на пролиферацию обработанных контролем клеток А375, и исключали из конечного анализа. Способствующие развитию резистентности ОКЕ идентифицировали по определению соотношения дифференциальной жизнеспособности клеток, ингибированных В-КАЕ (обработанных РБХ4720) и обработанных контролем. Дифференциальную жизнеспособность нормализовали к конститутивно активной аллели МЕК1, МЕК1|')|'); специфический положительный контроль при анализе.
На фиг. 6 показано, что коллекция ОКЕ киназ СС8В/Института Брода хорошо экспрессируется за счет высокого титра лентивируса. (а) Схематическое изображение лентивирусного экспрессионного век- 2 030276
тора рЬХ-ВЬЛ§Т-У5, использованного для всех ОКТ-скринингов и последующей валидации. (Ь) ОРРмеченные ОКТ с размерами в широких пределах экспрессировали с использованием лентивирусов в клетках 1итка1 и количественно определяли процент клеток, экспрессирующих ОРР/ОКР (например, инфицированных клеток), показывая высокий титр вирусов в пределах размеров ОКР. (с) Экспрессия 96 произвольных ОКР, детектированных ЫСот с антителами к У5-эпитоп-метке, по отношению к клеточной ДНК. Экспрессию детектировали в 83% лунок.
На фиг. 7 показана экспрессия кандидатов ОКР резистентности. Клетки 293Т временно трансфектировали рЬХ-ВЬЛ§Т-У5-ОКР (указан) и экспрессию детектировали с использованием анти-У5-НКРантитела. Клон ЛХЬ является «замкнутым» и содержит стоп-кодон, предшествующий У5-метке. См. фиг. 12, на которой представлено подтверждение экспрессии; (*) в темноте указывает на экспрессию трех ОКР, не видимых на свету.
На фиг. 8 показано, что результаты вторичного скрининга отдают предпочтение 9 основным кандидатам ОКР резистентности к ингибиторам В-КАР. Основные девять ОКР, которые оценили в первичном скрининге, экспрессировали в клетках А375 или §КМЕЬ28, и определяли О150 по пределам концентраций РЬХ4720 из 8 точек.
На фиг. 9 показано влияние экспрессии ОКР на пролиферацию клеточных линий В-КАРУ600Е. Пролиферация по сравнению с МЕК1 (а) клеток А375 или (Ь) §КМЕЬ28, экспрессирующих указанные ОКР через 7 суток роста.
На фиг. 10 показано, что эктопическая экспрессия конститутивно активных МЕК1 (МЕК1СС) и СОТ приводит к повышенной экспрессии рМЕК/рЕКК в клетках А375, в то время как С-КАР снижает уровни рМЕК/рЕКК. Лизаты клеток А375, эктопично экспрессирующих ОРР, МЕК1, МЕКСС, СОТ или С-КАР, анализировали иммуноблоттингом для определения концентраций рЕКК и рМЕК. ОРР и МЕК1 (дорожки 1-3) разделяли с СОТ/С-КАР (дорожки 4-5) для предупреждения сигнала остаточного У5-МЕК1 в результате избытка СОТ или С-КАР, которые экспрессируются на значительно более низких уровнях.
На фиг. 11 показано, что киназная активность СОТ или С-КАР необходима для стабильного фосфорилирования ЕКК в контексте обработки РЬХ4720. Иммуноблоттинг клеток А375, экспрессирующих эктопически (а) МЕК1, СОТ дикого типа или неактивную киназу СОТ (СОТК167К) или (Ь) МЕК1, С-КАР дикого типа или неактивную киназу С-КАР (С-КАРК375М), обработанных 1 мкМ РЬХ4720 в течение 18 ч.
На фиг. 12 показано влияние экспрессии ОКР на сигнальный путь МАРК в контексте ингибитора РЬХ4720 В-КАР-киназы. Путь активации МАРК оценивали иммуноблоттингом рЕКК и рМЕК в клетках А375, экспрессирующих указанные ОКР, в присутствии РЬХ4720 (18 ч, концентрации указаны). (*) указывает на использование антитела к экспрессированной ОКР, но не к У5-эпитопу. ЛХЬ клонировали без У5-метки.
На фиг. 13 показано, что В-КАР ассоциируется с иммунопреципитированной С-КАР в клетках А375 после обработки в течение 18 ч 1 мкМ РЬХ4720 (+) или ДМСО (-); (а) \УС’Е; контрольный цельный клеточный экстракт. Эктопически экспрессированная С-КАР конститутивно ассоциируется с В-КАР и фосфорилируется в 5338, что согасуется с локализацией и активацией в мембране. МЕК1, МЕКСС и СОТэкспрессирующие клетки А375 не показывают активации С-КАР, (Ь).
На фиг. 14 показано, что ретровирусная экспрессия С-КАР дикого типа или усеченного мутанта СКАР с высокой активностью (С-КАР(22^)) придает резистентность клеткам А375 к В-КАР-ингибитору РЬХ4720 (а) и приводит к стабильным уровням рЕКК в контексте обработки РЬХ4720 (1 мкМ, 18 ч); (Ь) уровни экспрессии С-КАР, достигаемые с использованием ретровирусов, достоверно ниже по сравнению с системами на основе лентивирусов, что приводит к более низкому значению 0150 по сравнению с лентивирусной С-КАР.
На фиг. 15 показано влияние В-КАРУ600Е на мРНК СОТ (а) Количественная ОТ/ПЦР экспрессии мРНК СОТ по сравнению с экспрессией мРНК ОАРЭН в транформированных первичных меланоцитах, экспрессирующих В-КАР дикого типа (вектор) или В-КАРУ600Е. Экспрессию СОТ нормализовали к экспрессии в первичных меланоцитах, экспрессирующих вектор. (**) Различие достоверно, р<0,05 (двухсторонний, парный ΐ-тест Стьюдента). Эндогенная мРНК СОТ не детектируется в клетках А375, чувствительных к РЬХ4720, и обработка 1 мкМ РЬХ4720 не оказывает влияния на эктопически экспрессированные уровни мРНК СОТ. Клетки А375, экспрессирующие ОРР или СОТ, обрабатывали в течение 18 ч 1 мкМ РЬХ4720. Обратно транскрибированную мРНК анализировали на экспрессию СОТ, нормализованную к ОАРЭН. в сравнении с А375, экспрессирующими ОРР, обработанными ДМСО. (*) Различие недостоверно, р>0,05 (двухсторонний, парный 1-тест Стьюдента). Ошибки в виде коротких вертикальных отрезков представляют 5ЕМ.
На фиг. 16 показано, что уровни белка В- и С-КАР не требуются для фосфорилирования ЕКК, опосредованного СОТ. Клетки А375, экспрессирующие эктопическую МЕК1 (контроль) или СОТ, последовательно инфицировали лентивирусом, экспрессирующим 8ЙРНК, нацеленной на В-КАР, С-КАР или контрольную 8ЙРНК (кЬЬис), и анализировали на экспрессию указанных белков в присутствии (+) или отсутствии (-) 1 мкМ РЬХ4720 в течение 18 ч.
На фиг. 17 показано, что результаты 8МР-анализа 752 клеточных линий выявили изменения числа
- 3 030276
копий МАР3К8/СОТ. Из 752 клеточных линий, подвергнутых анализу числа копий, 534 также подверглись определению профиля мутации. Тридцать восемь (7,1%) клеток с установленным профилем мутации содержат мутацию В-КАР'600Е. Две клеточные линии (ОИМ§-23, КРМ1-7951, указаны) содержат мутацию В-КАР'600Е вместе с увеличением числа копий МАР3К8/СОТ.
На фиг. 18 показаны изменения МАР3К8/СОТ в раковой клеточной линии ОИМ8-23. (а) КМАсигнал зонда МАР3К8/СОТ (отмечен) в анализе мРНК с использованием микрочипов. ОИМ8-23 представляет основные 2% (из 765 клеточных линий), экспрессирующую мРНК СОТ. (Ь) Экспрессия мРНК СОТ в панели мутантных клеточных линий Β-Ρ.ΛΡν600Ε. (с) Экспрессия эндогенного белка СОТ в клетках ОИМ8-23 по сравнению с эктопически экспрессированной СОТ в клеточных линиях А375 и §КМЕЬ28, как определено анализом указанных клеток иммуноблоттингом.
На фиг. 19 показано, что мРНК и белок СОТ экспрессируются в клеточных линиях и ткани, резистентных к В-КАР-ингибитору. (а) Анализ экспрессии с использованием ОТ/ПЦР мРНК СОТ, нормализованной к ОАРЭН, в панели клеточных линий, краткосрочных культурах и ткани из рецидивирующей, обработанной РЬХ4720, злокачественной меланомы (ММ-К). Соответствующая экспрессия белка в клеточных линиях и краткосрочных культурах показана соответственно на фиг. 3Ь и 3с. (Ь) Вестернблоттинг лизатов первичных меланоцитов (1° Ме1(В-КАР ^Т)), аналогичных участков нормальной кожи (кожа) и метастатической злокачественной меланомы от пациентов (ММ-К; мРНК СОТ, показанные на панели а), клеток А375 и первичных меланоцитов, экспрессирующих В-КАР'600Е (1° Ме1(В-КАР'600Е)).
На фиг. 20 показано, что истощение СОТ оказывает влияние на жизнеспособность клеточной линии КРМ1-7951, амплифицированной СОТ. (а) Количественный анализ жизнеспособности КРМ1-7951 после истощения СОТ, опосредованного лентивирусной 8ЙРНК (ШСОТ), по сравнению с контрольной 8ЙРНК (кЬЬие). Ошибки в виде коротких вертикальных отрезков представляют стандартное отклонение между повторностями. (Ь) Иммуноблоттинг, показывающий относительную экспрессию белка СОТ в клетках КРМ1-7951, экспрессирующих кЬЬие и ШСОТ.
На фиг. 21 показано влияние экспрессии ОКР на значение ΟΙ50 панели ингибиторов пути МАРК в §КМЕЬ28. Половинная максимальная ингибирующая рост концентрация (О150) для §КМЕЬ28, эктопически экспрессирующей МЕК1, МЕК1™ или СОТ, определяли для ингибиторов КАР-киназы РЬХ4720 и КАР265 и ингибиторов МЕК1/2-киназы С1-1040 и А2Э6244. Для каждого соединения определяли изменение ΟΙ50 для МЕК1СС и СОТ (по сравнению с МЕК1).
На фиг. 22 показано, что СОТ может активировать ЕКК посредством МЕК-независимого и МЕКзависимого механизмов. (а) Анализ фосфорилирования ЕКК иммуноблоттингом в лизатах клеток А375 после экспрессии ОРР или СОТ и последующем лентивирусном кЬРНК-зависимом истощении МЕК1, МЕК2 или МЕК1 и МЕК2 (МЕК1+2) по сравнению с контрольной 8ЙРНК (кЬЬие). Левая и правая панели представляют две различных пары кЬРНК-конструкций МЕК1 и МЕК2. (Ь) Анализ фосфорилирования иммуноблоттингом рекомбинантной, неактивной ЕКК (ТЬт202/Тут204) посредством рекомбинантной СОТ в тесте оценки киназной активности ίη νίΐτο.
На фиг. 23 показано, что комбинированное ингибирование пути МАРК эффективно подавляет пролиферацию §КМЕЬ28.
Жизнеспособность (по сравнению с ДМСО) клеток §КМЕЬ28, эктопически экспрессирующих МЕК1, МЕК1СС или СОТ, и обработанных ДМСО, РЬХ4720 (концентрации указаны), РЬХ4720 (1 мкМ) и С1-1040 (1 мкМ) или РЬХ4720 (1 мкМ) и А2Э6244 (1 мкМ). Ошибки в виде коротких вертикальных отрезков представляют стандартное отклонение между повторностями.
На фиг. 24 показано, что сверхэкспрессия СОТ является достаточной для получения раковых клеток меланомы с мутацией В-КАР''"6001''. резистентных к ингибированию В-КАР.
На фиг. 25 показано, что основные девять ОКР, отобранные в первичном скрининге, экспрессировали в (а) §КЕЬ28 (Ь) А375, и показаны значения О150 для 4 ингибиторов пути МАРК (РЬХ4720, КАР265, С1-1040, А2Э6244).
На фиг. 26 показано, что экспрессия СККЬ модифицирует чувствительность к селективному ингибитору В-КАР-киназы РЬХ4720 в панели клеточных линий В-КАР'600Е.
На фиг. 27 показано наличие в МАР3К8/СОТ-амплифицированной/В-КАР'600Е-мутантной раковой клеточной линии ОИМ8-23 конститутивного фосфорилирования ЕКК/МЕК в использованном диапазоне концентраций РЬХ4720.
На фиг. 28 показано, что отсутствие чувствительности к ингибированию пути МАРК соответствует увеличению числа копий МАР3К8/СОТ в подгруппе клеточных линий рака кожи. Показана панель из 20 мутантных клеточных линий В-КАР'600Е и их чувствительность к (а) ингибитору В-КАР-киназы РЬХ4720 и (Ь) ингибитору МЕК-киназы А2Э6244.
Подробное описание изобретения
Настоящее изобретение относится к развитию резистентности к терапевтическим агентам в лечении рака. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к киназам и, в частности, к компонентам пути киназы МАР.
В практике настоящего изобретения будут использоваться, если не указано иное, обычные методы молекулярной биологии, иммунологии, микробиологии, клеточной биологии и рекомбинантной ДНК,
- 4 030276
которые известны специалистам в данной области. См., например, 8атЬгоок, Ргйзск апй Машакз, Мо1еси1аг С1отпд: А БакогаЮгу Мапиа1 (СиггсШ ЕйШоп); СиггсШ Рго1осо1з ίη Мо1еси1аг Вю1о§у (Р.М. АизиЬе1 с1 а1., ейз., (СиггсШ ЕйШоп)); 1ке зепез МеЙюйз ίη Еп/утокду (Асайетк Ргезз, 1пс.): РСК 2: А Ргаскса1 Арргоаск (СиггеШ ЕйШоп) ЛпйЬоШеь А ЬаЬогакгу Мапиа1 апй Атта1 Се11 СиНиге (К. I. Ргезкпеу, ей. (1987)). ОИА С1ошппд: А Ргасйса1 Арргоаск, уо1. Ι&ΙΙ (Ό. О1оуег, ей.); Окдопис1еокйе 8уп1кез1з (Ν. Оак, ей., СиггеШ ЕйШоп); Шскк Аск НуЬпШ/айоп (В. Натез&8. Шддшз, ейз., СиггсШ Ейкоп); Тгапзспркоп апй Тгапз1акоп (В. Натез&Б.Шддшз, ейз., СиггсШ ЕйШоп); Рипйатейа1 Укокду, 2пй Ейкоп, уо1. Ι&ΙΙ (Β.Ν. Р1е1йз апй О.М.Ктре, ейз.).
Каскад митоген-активированной протеинкиназы (МАРК), является критическим внутриклеточным сигнальным путем, который регулирует передачу сигналов, в ответ на различные внеклеточные стимулы, включая факторы роста, цитокины и протоонкогены.
Активация данного пути приводит к активации факторов транскрипции и изменениям в экспрессии генов, что в конечном итоге приводит к изменениям функций клеток, включая пролиферацию, клеток, регуляцию клеточного цикла, выживаемость клеток, ангиогенез и миграцию клеток. Классический сигнальный путь МАРК инициируется рецепторными тирозинкиназами на клеточной поверхности, однако, многие другие молекулы поверхности клеток способны активировать каскад МАРК, включая интегрины, гетеротримерные О-белки и рецепторы цитокинов.
Связывание лигандов с рецептором клеточной поверхности, например, рецептором тирозинкиназы, как правило, приводит к фосфорилированию рецептора. Белок-адаптер ОгЬ2 ассоциирует с фосфорилированным внутриклеточным доменом активированного рецептора, и такая ассоциация стимулирует рекрутинг факторов обмена гуаниннуклеотидов, включающих δΟδ-Ι и СЭС25, к клеточной мембране. Такие факторы обмена гуаниннуклеотидов взаимодействуют с и активируют ОТРазу Каз. Обычные изоформы Каз включают К-Каз, Ν-КаБ, Н-Каз и другие. После активации Каз серин/треониновая киназа КаР (например, А-КаР, В-КаР или КаР-1) рекрутирует к клеточной мембране посредством взаимодействия с Каз. Затем Каз подвергается фосфорилированию. КаР непосредственно активирует МЕЮ и МЕК2 посредством фосфорилирования двух остатков серина в положениях 217 и 221. После активации МЕЮ и МЕК2 фосфорилируют остатки тирозина (Туг-185) и треонина (Ткг-183) в серин/треониновых киназах Егк1 и Егк2, приводя к активации Егк. Активированная Егк регулирует много мишеней в цитозоле и также транслоцируется в ядро, где она фосфорилирует ряд транскрипционных факторов, регулирующих экспрессию генов. Егк-киназа имеет многочисленные мишени, включая ЕРк-Ι, с-Е1з1. с-Е1з2. р90К§Ю, МNКI, МЖ2, М8Ю, М8К2 и ТОВ. Несмотря на то, что вышеуказанный путь является классическим представлением сигнального пути МАРК, имеется значительный «перекрестный разговор» между путем МАРК и другими сигнальными каскадами.
Аберрации в сигнальном пути МАРК играют существенную роль в биологии рака. Измененная экспрессия Каз является частым явлением при многих видах рака, и были также установлены активирующие мутации Каз. Такие мутации обнаружены в 30% всех типов рака, и они являются особенно частыми при карциномах поджелудочной железы (90%) и ободочной кишки (50%). Кроме того, активирующие мутации КаР были установлены при меланоме и раке яичников. Наиболее частая мутация ВКАР¥60С1Е приводит к конститутивной активации пути МАР-киназы выше, и она необходима для пролиферации клеток меланомы, роста на жидком агаре и получения ксенотранспланата опухоли. Основываясь на определенной роли сверхактивации МАРК при раке человека, нацеливание на компоненты пути МАРК с их специфическими ингибиторами является перспективным подходом для лечения рака. Однако у пациентов может иметь место врожденная или приобретенная резистентность к таким многообещающим препаратам. Идентификация киназ-мишеней, диагностических и/или прогностических маркеров и лекарственных препаратов для таких пациентов с врожденной или приобретенной резистентностью описана ниже.
Высокопропускной функциональный скрининг
В некоторых аспектах настоящее изобретение относится к способам идентификации мишеней, способных индуцировать резистентность к клинически эффективным препаратам с использованием высокопропускного скрининга. В некоторых вариантах осуществления способ включает скрининг, основанный на открытой рамке считывания (ОКР) киназ, которые регулируют резистентность к терапевтическим агентам. Способ может включать обеспечение клеточной линии с киназой, о которой известно, что она имеет онкогенную мутацию. Библиотеку ОКР можно по отдельности экспрессировать в клеточной линии таким образом, чтобы можно было оценить дополнительно множество клонов, где каждый клон экспрессирует различную ОКР. На каждый клон можно (1) воздействовать ингибитором известной киназы в клеточной линии и (2) проследить за изменениями роста, основываясь на экспрессии ОКР в клеточной линии без ингибитора. Любые клоны, оказывающие влияние на рост за счет экспрессии одной ОКР, позитивный или негативный рост, элиминируются. Остальные клоны, где каждый экспрессирует различную киназу, затем сравнивают на жизнеспособность между контролем и обработанным клоном и нормализуют к положительному контролю. Повышенная жизнеспособность клеток после обработки ингибитором указывает на ОКР, которая придает резистентность и, следовательно, идентифицирует киназымишени для лечения дополнительным ингибитором. В некоторых вариантах осуществления клоны, имеющие различие в два стандартных отклонения от нормализованного среднего значения, могут представ- 5 030276
лять собой киназы-мишени, указывающие на то, что лечение дополнительным ингибитором является полезным для индивида.
В качестве неограничивающего примера на фиг. 5 приведено схематическое изображение высокопропускного функционального скрининга для киназ, которые индуцируют резистентность к ингибированию В-КАБ. Собирали коллекцию примерно 600 клонов и ОКБ с валидированной последовательностью, составляющую примерно 75% всех аннотированных киназ (Коллекция ОКБ киназ Центра биологии раковых систем (СС8В))/Института Брода, фиг. 1а, 1Ь, табл. 3). Данную широко доступную коллекцию можно быстро перенести в различные экспрессионные векторы для различных конечных применений. Для экспрессии Коллекции ОКБ киназ можно использовать любой тип экспрессионного вектора, известный специалистам в данной области. В качестве неограничивающего примера можно получить селектируемый, меченный эпитопом, лентивирусный экспрессионный вектор, способный продуцировать вирус с высоким титром и обеспечить высокую экспрессию в клетках млекопитающих для экспрессии коллекции киназ (рЬХ-ВьА§Т-У5, фиг. 6а).
Для идентификации киназ, способных обходить ингибирование КАР, упорядоченную коллекцию ОКБ можно стабильно экспрессировать в клетках А375, клеточной линии злокачественной меланомы ВΚΑΡν600Ε, которая является чувствительной к ингибитору КАР-киназы РБХ4720 (фиг. 1а, 1Ь и 6с, табл. 3). Клоны клеток, экспрессирующих ОКБ, обработанные 1 мкМ РБХ4720, подвергают скринингу на жизнеспособность по сравнению с необработанными клетками и нормализуют к специфическому для анализа положительному контролю, ΜΕΚ1 (ΜΕΚ1 ) (табл. 4). ОКБ, которые оказывают отрицательное
влияние на исходную жизнеспособность или пролиферацию, исключают из анализа. Клоны, имеющие различие в более двух стандартных отклонений от нормализованного среднего значения, можно дополнительно оценить для идентификации киназы-мишени, придающей резистентность ко второму ингибитору. В некоторых вариантах осуществления ген, кодирующий киназу-мишень, может представлять собой МАР3К8 (ТРБ2/СОТ), КАБ1 (СКАБ), СККБ (СгкБ), БОК (Бдг), РККСЕ (Ргксе), РККСН (Ргкск), ЕКВВ2 (ЕгЬВ2), АХБ (Ах1) или РАК3 (Рак3). В некоторых вариантах осуществления ген, кодирующий киназу-мишень, может представлять активатор пути МАРК. В некоторых вариантах осуществления ген, кодирующий киназу-мишень, может представлять киназу МАР3, которая непосредственно фосфорилирует и активирует МЕК. В некоторых вариантах осуществления ген, кодирующий киназу-мишень, может кодировать белок-адаптер, который амплифицируется и фосфорилируется в меланоме.
В еще одних вариантах осуществления коллекцию ОКБ можно стабильно экспрессировать в клеточной линии, имеющей другую мутацию в В-КАБ, например, другую мутацию примерно в положении 600, такую как ν600Ι<. ν600Ό и ν600Κ Дополнительные мутации В-КАБ включают мутации, описанные ОаОе5 е! а1., Ха1иге, 417, 949-954, 2002, табл. 1. Можно использовать клеточные линии, которые чувствительны к другим ингибиторам киназы КАБ, включая, не ограничиваясь этим, РБХ4032; ООС-0879; КАБ265; сорафениб; 8В590855 и/или ΖΜ3336372. В некоторых вариантах осуществления коллекцию ОКБ можно стабильно экспрессировать в клеточной линии, обладающей чувствительностью к ингибитору МЕК. Неограничивающие примеры ингибиторов МЕК включают, не ограничиваясь этим, ΛΖΌ6244; С1-1040; РО184352; Р318088; РО98059; РО334581; КЭЕА119; 6-метокси-7-(3-морфолин-4-илпропокси)-4(4-феноксифениламино)хинолин-3 -карбонитрил и 4-[3 -хлор-4-( 1-метил-1Н-имидазол-2-илсульфанил)фениламино]-6-метокси-7-(3-морфолин-4-илпропокси)хинолин-3-карбонитрил. Дополнительные ингибиторы КАБ и МЕК описаны ниже. В качестве неограничивающего примера, примерные ингибиторы КАБ приведены в табл. 1 и примерные ингибиторы МЕК приведены в табл. 2.
- 6 030276
Таблица 1. Примерные ингибиторы КАР
Название Номер по САЗ Структура
1 КАЕ265 927880-90- м-р, р уЛ-О V н у 7 Р Р
2 Сорафениб тозилат Нексавар Вау 43-9006 475207-59-1 СД 0 “"А ° оЛлА»' Η Η СтН8О35
Сорафениб 4- [4-[[4-хлор-З(трифторметил)фенил]карбамоиламино]фенокси]Ν-метилпиридин-2карбоксамид 284461-73-0 χ' н η X '"у·''0 ρ 7 .λ ,Υ .ί Ιί ,,η 0··' "‘Ν' Η
3 ЗВ590885 Оу /=х у ΥΓΧ-ΚΖΡ0 ΗΟΝ
4 РЬХ4720 918505-84-7 Υ νϋ) ο > Η
5 РЬХ4032 1029872-54-5 у ην'5^-\ с|'уу Ν Η
6 СВС-0879 905281-76-7 КЭ“ОО-°н НО
7 ΖΜ 336372 208260-29-1 % 4=0 ΗΝ ο 1
- 7 030276
Таблица 2. Примерные ингибиторы МЕК
Название Номер по САЗ Структура
1 С1-1040/РР184352 21263179-3 1 . 0 0 - - - - -X \ - - - - - „, .....Р 1—
2 ΑΖΡ6244 60614352-6 О'Р°И с, ; :.'Х ^ вг
3 РР318088 39121000-7 9м н ОН Р
4 РР98059 16786921-8 О АД ΝΗ,
5 РР334581 О γ
6 ВГОЕА119 Ν- [3,4-дифтор-2-[(2-фтор4-йодфенил)амино]-6метоксифенил]-1-[(2К) -2,3дигидроксипропил]циклопропансульфонамид 92303238-6 Д он π ΗΝ 0 н к
7 б-метокси-7-(З-морфолин-4илпропокси)-4-(4феноксифениламино)хинолин3-карбонитрил о ОцХ
8 4- [З-хлор-4-(1-метил-1Нимидазол-2илсульфанил)фениламино]-6метокси-7-(З-морфолин-4илпропокси)хинолин-3карбонитрил о Ρ°ΤϊΝΗ
Диагностические/прогностические маркеры врожденной и приобретенной резистентности к нацеленным препаратам
В некоторых аспектах настоящее изобретение относится к способам обнаружения наличия одного или более диагностических или прогностических маркеров в образце (например, биологическом образце от пациента, который страдает раком). Можно использовать различные скрининговые способы, известные специалистам в данной области, для детектирования наличия маркера в образце, включая детектирование ДНК, РНК и белка. Способы, описанные ниже, можно использовать для определения наличия или отсутствия киназы-мишени в образце, полученном от пациента. В некоторых вариантах осуществления
- 8 030276
пациент может иметь врожденную или приобретенную резистентность к препаратам, нацеленным на киназы, включая ингибиторы В-КАЕ или ингибиторы МЕК. Например, у пациента может иметь место врожденная или приобретенная резистентность к ингибиторам В-КАЕ, РЬХ4720 и/или РЬХ4032. В некоторых вариантах осуществления у пациента может иметь место врожденная или приобретенная резистентность к ингибитору МЕК, ΆΖΌ6244. Идентификация одного или более маркеров киназ-мишеней у пациента поможет врачу в составлении протокола лечения пациента. Например, пациента, имеющего один или более маркеров киназ-мишеней, врач может лечить комбинированной терапией, как более подробно описано ниже.
В некоторых вариантах осуществления киназа-мишень может включать, не ограничиваясь этим, МАР3К8 (ТРБ2/СОТ), КАЕ1 (СКАЕ), СККЬ (СгкЬ), ЕСК (Едт), РККСЕ (Ргксе), РККСН (Рткск), ЕКВВ2 (ЕтЬВ2), АХЬ (Ах1) или РАК3 (Рак3). Маркером для киназы-мишени может быть увеличение числа копий генов, увеличение экспрессии белка, фосфорилирование одного или более членов пути МАР, изменение экспрессии мРНК и тому подобное.
В качестве неограничивающего примера у пациента, имеющего онкогенную мутацию в В-КАЕ, идентификация активированной киназы-мишени может быть пригодной для составления протокола лечения пациента. Например, у пациента, имеющего мутацию В-КАЕУ600Е, лечение одним ингибитором КАЕ может указывать на то, что у пациента с течением времени имеется относительно высокий риск развития приобретенной резистентности к лечению. У пациента, имеющего онкогенную мутацию, идентификация активированной киназы-мишени у этого пациента может указывать на включение второго ингибитора в протокол лечения.
Идентификация активированной киназы-мишени может включать анализ числа копий генов и определение увеличения числа копий киназы-мишени. Например, увеличение числа копий МАР3К8 является показателем того, что у пациента имеется врожденная резистентность или развивающаяся приобретенная резистентность, особенно, если пациент также имеет мутацию В-КАЕУ600Е.
В некоторых вариантах осуществления идентификация активированной киназы-мишени может включать анализ фосфорилирования киназы-мишени и/или члена пути киназы МАР. Например, фосфорилирование С-КАЕ в положении §338 является показателем того, что у пациента имеется врожденная резистентность или развивающаяся приобретенная резистентность, особенно, если пациент также имеет мутацию В-КАЕУ600Е. В некоторых вариантах осуществления идентификация увеличения фосфорилирования МЕК/ЕКК может указывать на то, что у пациента имеется врожденная резистентность или развивающаяся приобретенная резистентность. Повышенная экспрессия белка СОТ у пациентов с мутацией ВКАрУ600Е может быть прогнозом наличия резистентности к ингибированию КАЕ и ингибированию МЕК.
Идентификация активированной киназы-мишени может включать анализ экспрессии мРНК киназымишени. Например, повышение экспрессии мРНК СОТ после первоначального лечения первым ингибитором киназы является показателем того, что у пациента имеется или развивается резистентность. В некоторых вариантах осуществления первый ингибитор киназы может представлять ингибитор КАЕ или ингибитор МЕК.
Способы лечения
В различных вариантах осуществления изобретение относится к способу лечения пациента, страдающего раком. Обычно способы включают введение первого ингибитора и второго ингибитора. Один ингибитор может представлять ингибитор КАЕ. Ингибитор КАЕ может представлять собой ингибитор пан-КАЕ или селективный ингибитор КАЕ. Ингибиторы пан-КАЕ включают, не ограничиваясь этим, КАЕ265, сорафениб или §В590885. В некоторых вариантах осуществления ингибитор КАЕ представляет ингибитор В-КАЕ. В некоторых вариантах осуществления селективный ингибитор КАЕ представляет РЬХ4720, РЬХ4032 или ОИС-0879-А. Один ингибитор может быть ингибитором МЕК (см. табл. 2, в которой приведены примеры ингибиторов МЕК). Одним ингибитором может быть ингибитор СОТ. В качестве неограничивающего примера ингибитор СОТ может представлять кЬРНК-ингибитор, как описано ниже, или низкомолекулярный ингибитор СОТ, 4-(3-хлор-4-фторфениламино)-6-(пиридин-3илметиламино)-3-циано-[1,7]нафтиридин (ЕМИ; ингибитор I ТРЬ2; номер по каталогу 616373, РиЬСЬет ГО: 9549300). Ингибиторы по настоящему изобретению ингибируют одну или более киназ-мишеней, включающих МАР3К8 (ТРЬ2/СОТ), КАЕ1 (СКАЕ), СККЬ (СгкЬ), РОК (Едт), РККСЕ (Ргксе), РККСН (Рткск), ЕКВВ2 (ЕгЬВ2), АХЬ (Ах1) или РАК3 (Рак3) или другие киназы-мишени пути МАР.
В некоторых вариантах осуществления обеспечивается комбинированная терапия рака, включающая эффективное количество ингибитора КАЕ и эффективное количество ингибитора МАР3К8 (ТРЬ2/СОТ). Также обеспечивается комбинированная терапия рака, включающая эффективное количество ингибитора КАЕ и эффективное количество ингибитора МЕК. Другие комбинированные терапии включают эффективное количество ингибитора КАЕ и эффективное количество второго ингибитора, нацеленного на ген, мРКН или белок, кодированный одним или более из следующего: МАР3К8 (ТРБ2/СОТ), КАЕ1 (СКАЕ), СККЬ (СгкЬ), ЕОК (Едт), РККСЕ (Ргксе), РККСН (Рткск), ЕКВВ2 (ЕгЬВ2), АХЬ (Ах1) или РАК3 (Рак3). Комбинированная терапия подходит для лечения пациента, у которого злокачественная опухоль содержит клетки с мутантной В-КАЕ и, в частности, клетки с мутантной ВКАЕУ600Е. Также настоящее изобретение относится к комбинированной терапии рака, включающей эф- 9 030276
фективное количество ингибитора КАР и эффективное количество ингибитора МЕК, где у индивида, страдающего раком, имеются клетки с измененной экспрессией или числом копий генов МАР3К8 (ТРЬ2/СОТ). В некоторых вариантах осуществления ингибитор МЕК представляет С4-1040/РЭ184352 или ΑΖΌ6244.
В качестве неограничивающего примера ингибитор МЕК, описанный в данном документе, может представлять С1-1040; ΑΖΌ6244; ΡΌ318088; ΡΌ98059; ΡΌ334581; КЭЕА119; 6-метокси-7-(3-морфолин-4илпропокси)-4-(4-феноксифениламино)хинолин-3-карбонитрил или 4-[3-хлор-4-(1-метил-1Н-имидазол-2илсульфанил) фениламино]-6-метокси-7-(3 -морфолин-4-илпропокси)хинолин-3 -карбонитрил, соединение Коейе КО7420 или их комбинации. Также можно использовать дополнительные ингибиторы МЕК, известные в данной области.
В приведенных в качестве примера вариантах осуществления описанных выше аспектов ингибитор, раскрытый в данном документе, представляет РЬХ4720, РЬХ4032, ΒΑΥ 43-9006 (сорафениб), ΖМ 336372, КАР 265, ААЬ-881, ЬВТ-613, или 08352 ОУР-ААЬ881-Ж) (далее относится к ΑΑΣ881) и ХУР-ЬВТ613-АО-8 (ЬВТ613), которые являются производными изохинолина (Νοναηίδ. СатЬпбде. МА). Дополнительные примерные ингибиторы КАР, пригодные для комбинированной терапии, включают ингибиторы пан-КАР, ингибиторы В-КАР, ингибиторы А-КАР и ингибиторы КАР-1. В приведенных в качестве примера вариантах осуществления ингибиторы КАР, пригодные для комбинированной терапии, включают РБХ4720, РЬХ4032, ΒΑΥ 43-9006 (сорафениб), ΖМ 336372, КАР 265, ААЬ-881, ЬВТ-613 или 08352. Приведенные в качестве примера ингибиторы КАР включают соединения, описанные в публикации РСТ № ^0/2008/028141, полное содержание которой включено в настоящее описание в качестве ссылки. Примерные ингибиторы КАР включают производные хиназолинона, описанные в публикации РСТ № ^0/2006/024836, и производные пиридинилхиназолинамина, описанные в публикации РСТ № ^0/2008/020203, полное содержание которых приведено в данном документе для сведения.
Введение комбинации включает введение комбинации в одной композиции или разовой лекарственной форме, введение отдельных агентов комбинации совместно, но по отдельности, или введение отдельных агентов комбинации последовательно любым подходящим путем. Для дозировок отдельных компонентов комбинации может потребоваться более частое введение одного из агентов по сравнению с другим агентом в комбинации. Следовательно, для обеспечения соответствующего дозирования, упакованные фармацевтические продукты могут содержать одну или более лекарственных форм, которые содержат комбинацию агентов, и одну или более лекарственных форм, которые содержат один из агентов комбинации, но не другой агент(ы) комбинации.
Агенты могут содержать один или более асимметричных элементов, таких как стереогенные центры или стереогенные оси, например, асимметричные атомы углерода, таким образом, что соединения могут находиться в различных стереоизомерных формах. Такие соединения могут представлять, например, рацематы или оптически активные формы. В отношении соединений с двумя или более асимметричными элементами, то такие соединения могут дополнительно представлять смеси диастереоизомеров. Очевидно, понятно, что для соединений, содержащих асимметричные центры, в объем изобретения включаются все их оптические изомеры и смеси. Кроме того, соединения с двойными углеродуглеродными связями могут находиться в Ζ- и Е-формах; все изомерные формы соединений включаются в настоящее изобретение. В таких ситуациях отдельные энантиомеры (оптически активные формы) можно получить асимметричным синтезом, синтезом из оптически чистых предшественников, или разделением рацематов. Разделение рацематов также можно осуществить, например, обычными методами, такими как кристаллизация в присутствии разделяющего агента, или хроматографией с использованием, например, колонки для хиральной ВЭЖХ.
Если не указано иное или четко не определяется по тексту, то обращение к соединениям, пригодным для комбинированной терапии по изобретению, включает свободное основание соединений и все фармацевтически приемлемые соли соединений.
Предпочтительной солью является гидрохлорид.
Термин "фармацевтически приемлемые соли" включает производные раскрытых соединений, когда исходное соединение модифицировано образованием нетоксичной аддитивной соли кислоты или основания, и дополнительно относится к фармацевтически приемлемым сольватам, включающим гидраты, таких соединений и таких солей. Примеры фармацевтически приемлемых солей включают, не ограничиваясь этим, аддитивные соли минеральной или органической кислоты основных остатков, таких как амины; основные или органические аддитивные соли кислых остатков, таких как карбоновые кислоты; и тому подобное, и комбинации, содержащие одну или более указанных выше солей. Фармацевтически приемлемые соли включают нетоксичные соли и четвертичные аммониевые соли исходного соединения, полученные, например, из нетоксичных неорганических или органических кислот. Например, нетоксичные соли кислоты включают, например, полученные из неорганических кислот, таких как хлористоводородная, бромисто-водородная, серная, сульфаминовая, фосфорная и азотная кислоты; другие приемлемые неорганические соли включают соли металлов, такие как соль натрия, соль калия и соль цезия; и соли щелочно-земельных металлов, такие как соль кальция и соль магния; и комбинации, содержащие одну или более указанных выше солей.
- 10 030276
Фармацевтически приемлемые органические соли включают соли, полученные из органических кислот, таких как уксусная, трифторуксусная, пропионовая, янтарная, гликолевая, стеариновая, молочная, яблочная, винная, лимонная, аскорбиновая, памовая, малеиновая, гидроксималеиновая, фенилуксусная, глутаминовая, бензойная, салициловая, метансульфоновая, этансульфоновая, бензиловая, сульфаниловая, 2-ацетоксибензойная, фумаровая, толуолсульфоновая, метансульфоновая, этандисульфоновая, щавелевая, изетионовая, НОО(СН2)ПСООН, где η равно 0-4; соли органических аминов, такие как соль триэтиламина, соль пиридина, соль пиколина, соль этаноламина, соль триэтаноламина, соль дициклогексиламина, соль Ν,Ν'-дибензилэтилендиамина; и соли аминокислот, такие как аргинат, аспаргинат и глутамат, и комбинации, содержащие одну или более из указанных выше солей.
"Эффективное количество" комбинации агентов (например, ингибиторов МЕК и КАЕ, или ингибиторов КАР и СОТ, или КАЕ и ингибитора, нацеленного на МАР3К8 (ТРЬ2/СОТ), КАЕ1 (СКАЕ), СККЬ (СгкЬ), РОК (Едг), РККСЕ (Ргксе), РККСН (Ргкей), ЕКВВ2 (ЕгЬВ2), АХЬ (Ах1) или РАК3 (Рак3), представляет количество, достаточное для обеспечения заметного улучшения по сравнению с клинически наблюдаемыми в исходном периоде признаками и симптомами расстройства, которое подвергается лечению.
Фармацевтические продукты можно вводить с помощью лекарственных форм для перорального введения или других, например, ректально или парентеральной инъекцией.
"Лекарственная форма для перорального введения" предназначена для включения разовой лекарственной формы, прописанной или предназначенной для приема внутрь. Лекарственная форма для перорального введения может содержать и не содержать множество субъединиц, например, таких как микрокапсулы, микротаблетки, упакованные для введения в одной дозе.
Фармацевтические продукты могут высвобождаться в различных формах. "Высвобождаемая форма" предназначена для включения форм с мгновенным высвобождением, быстрым высвобождением, контролируемым высвобождением и замедленным высвобождением.
"Мгновенное высвобождение" предназначено для включения лекарственной формы, приготовленной для обеспечения быстрого растворения активного агента, модификацией нормальной кристаллической формы активного агента с получением более быстрого растворения.
"Быстрое высвобождение" предназначено для включения формы с обычным или немодифицированным высвобождением, когда более чем или примерно 50%, или более предпочтительно примерно 75% активных агентов высвобождается в течение двух часов после введения, предпочтительно в течение 1 ч после введения.
"Замедленное высвобождение" или "растянутое высвобождение" включает высвобождение активных агентов с такой скоростью, что их концентрация в крови (например, в плазме крови) поддерживается в терапевтических пределах, но ниже токсических концентраций по меньшей мере в течение примерно 8 ч, предпочтительно по меньшей мере в течение примерно 12 ч, более предпочтительно в течение примерно 24 ч после введения в стационарном состоянии. Термин "стационарное состояние" означает, что концентрация данного активного агента или комбинации активных агентов в плазме крови достигнута и поддерживается последующими дозами активного агента(ов) на уровне, который равен или выше минимального эффективного терапевтического уровня и ниже минимального токсического уровня данного активного агента(ов) в плазме крови.
В том смысле, в котором в данном документе используются термины "лечить", "подвергать лечению", "проводить лечение" или "лечение", они относятся к облегчению, подавлению или ослаблению по меньшей мере одного симптома заболевания у индивида. Например, в результате лечения может уменьшиться один или несколько симптомов расстройства, или полностью элиминироваться расстройство, такое как рак. В значение термина "лечить" по настоящему изобретению также входит остановка, замедление начала (т. е. период до клинического проявления заболевания) и/или снижение риска развития или ухудшения заболевания. В том смысле, в котором в данном документе используется термин "защищать", он означает предупреждение задержки или лечения, или все, как это подходит, развития или продолжения, или обострения заболевания у индивида. Согласно настоящему изобретению заболевание ассоциируется с раком.
Термины "индивид" или "пациент" предназначен для включения животных, которые способны страдать или болеть раком, или любым расстройством, включающим, прямо или опосредованно, рак. Примеры индивидов включают млекопитающих, например людей, собак, коров, лошадей, свиней, овец, коз, кошек, мышей, кроликов, крыс и трансгенных животных, отличных от человека. В некоторых вариантах осуществления индивид представляет собой человека, например человека, страдающего, имеющего риск заболеть, или потенциально способного болеть раком.
Термин "примерно" или "приблизительно" обычно означает, что данное значение или интервал находятся в пределах 20%, более предпочтительно в пределах 10% и наиболее предпочтительно в пределах 5%. Альтернативно, особенно в биологических системах, термин "примерно" означает примерно 1од (т.е. порядок величины) предпочтительно с показателем два данного значения.
Термины "составляющий", "имеющий", "включающий" или "содержащий" сконструированы в качестве неограничивающих терминов (т.е. означают "включая, но не ограничиваясь этим"), если не указа- 11 030276
но иное. Указание пределов значений в данном документе служит только в качестве стенографического приема обращения по отдельности к каждому отдельному значению, попадающему в пределы, если не указано иное, и каждое отдельное значение включается в определение, как если бы оно цитировалось по отдельности в данном документе.
Как указывалось выше, в одном из аспектов настоящее изобретение относится к комбинации лекарственных средств, подходящих для лечения, профилактики, остановки, замедления начала и/или снижения риска развития или отмены по меньшей мере одного симптома рака у индивида, включающей введение индивиду комбинированной терапии, включающей эффективное количество ингибитора КАР и эффективное количество ингибитора МАР3К8 (ТРБ2/СОТ) или эффективное количество ингибитора КАР и эффективное количество ингибитора МЕК, или эффективное количество ингибитора КАР и эффективное количество второго ингибитора, нацеленного на МАР3К8 (ТРБ2/СОТ), КАР1 (СКАР), СККЬ (СгкЬ), РСК (Рдг), РККСЕ (Ргксе), РККСН (Ргксй), ЕКВВ2 (ЕгЬВ2), АХЬ (Ах1) или РАК3 (Рак3). Предпочтительно такие ингибиторы вводят в терапевтических эффективных дозах, которые при объединении обеспечивают полезный эффект. Введение может быть одновременным или последовательным.
Термин "рак", использованный в данном документе, означает широкий спектр опухолей, включая все солидные опухоли и злокачественные заболевания крови. Примеры таких опухолей включают, но не ограничиваясь этим, лейкозы, миеломы, карциномы, метастатические карциномы, саркомы, аденомы, злокачественные опухоли нервной системы и мочеполовой системы. В приведенных в качестве примера вариантах осуществления вышеуказанные способы пригодны для лечения у взрослых и детей острого лимфобластного лейкоза, острого миелоидного лейкоза, адренокортикальной карциномы, связанного со СПИДом рака, рака ануса, рака червеобразного отростка, астроцитомы, базальноклеточной карциномы, рака желчных протоков, рака мочевого пузыря, рака костей, остеосаркомы, фиброзной гистиоциомы, рака головного мозга, глиомы ствола головного мозга, церебеллярной астроцитомы, злокачественной глиомы, эпендимомы, медуллобластомы, супратенториальных примитивных нейроэктодермальных опухолей, глиомы гипоталамуса, рака молочной железы, рака молочной железы у мужчин, аденомы бронхов, лимфомы Беркитта, карциноидной опухоли, карциномы неизвестного происхождения, лимфомы центральной нервной системы, церебеллярной астроцитомы, злокачественной глиомы, рака шейки матки, рака у детей, хронического лимфоцитарного лейкоза, хронического миелогенного лейкоза, хронических миелопролиферативных расстройств, колоректального рака, кожной Т-клеточной лимфомы, рака эндометрия, эпендимомы, рака пищевода, семейных опухолей Эвинга, экстракраниальной зародышевоклеточной опухоли, экстрагонадальной зародышево-клеточной опухоли, экстрагепацитарного рака желчных протоков, внутриокулярной меланомы, ретинобластомы, рака желчного пузыря, рака желудка, стромальной опухоли желудочно-кишечного тракта, экстракраниальной зародышево-клеточной опухоли, экстрагонадальной зародышево-клеточной опухоли, зародышево-клеточной опухоли яичника, гестационной трофобластной опухоли, глиомы, волосатоклеточного лейкоза, рака головы и шеи, гепатоцеллюлярного рака, ходжкинской лимфомы, неходжкинской лимфомы, гипофаренгиального рака, глиомы гипоталамуса и зрительных путей, внутриокулярной меланомы, опухоли островков Лангерганса, саркомы Капоши, рака почки, рака органов мочевой системы, рака гортани, рака губ и ротовой полости, мелкоклеточного рака легких, немелкоклеточного рака легких, первичной лимфомы центральной нервной системы, макроглобулинемии Вальденстрема, злокачественной фиброзной гистиоцитомы, медуллобластомы, меланомы, клеточной карциномы Меркеля, злокачественной мезотелиомы, плоскоклеточного рака шеи, синдрома множественной эндокринной неоплазии, множественной миеломы, грибовидного микоза, миелодиспластических синдромов, миелопролиферативных расстройств, хронических миелопролиферативных расстройств, рака носовой полости и околоносовых пазух, назофарингеального рака, нейробластомы, орофарингеального рака, рака яичников, рака поджелудочной железы, рака паращитовидной железы, рака полового члена, рака глотки, феохромоцитомы, пинеобластомы и супратенториальных примитивных нейроэктодермальных опухолей, рака гипофиза, плазмоклеточных новообразований, плевропульмональной бластомы, рака предстательной железы, рака прямой кишки, рабдомиосаркомы, рака слюнных желез, саркомы мягких тканей, саркомы матки, синдрома Сезари, рака кожи, не относящегося к меланоме, рака тонкого кишечника, плоскоклеточной карциномы, плоскоклеточной карциномы шеи, супратенториальных примитивных нейроэктодермальных опухолей, рака яичка, рака горла, тимомы и карциномы тимуса, рака щитовидной железы, переходно-клеточного рака, трофобластических опухолей, рака уретры, рака матки, саркомы матки, рака влагалища, рака вульвы и опухоли Вильмса.
В частности, рак может быть связан с мутацией гена В-КАР. Такие виды рака включают меланому, рак молочной железы, колоректальный рак, глиому, рак легких, рак яичника, саркому и рак щитовидной железы.
В конкретном варианте осуществления терапевтическая комбинация, раскрытая в данном документе, является эффективной для лечения рака средней тяжести и тяжелого рака у индивида.
Дозы
Оптимальную дозу комбинации агентов для лечения рака можно определить эмпирически для каждого индивида с использованием известных методов, и она будет зависеть от различных факторов, включая активность агентов; возраст, массу тела, общее состояние здоровья, пол и рацион индивида; время и
- 12 030276
путь введения и другие лекарственные средства, которые принимает индивид. Оптимальные дозы можно установить с использованием обычного тестирования и процедур, хорошо известных в данной области.
Количество комбинации агентов, которые можно объединить с носителями для получения разовой лекарственной формы, будет варьировать в зависимости от индивидуума, который подвергается лечению, и конкретного пути введения. В некоторых вариантах осуществления разовые лекарственные формы, содержащие комбинацию агентов, описанных в данном документе, будут содержать количества каждого агента комбинации, которые обычно вводят, когда агенты вводят по отдельности.
Врач или ветеринарный доктор, специалисты в данной области, могут легко определить и прописать требуемое эффективное количество фармацевтической композиции. Например, врач или ветеринарный доктор может начать лечение с дозировок используемых соединений по настоящему изобретению, в фармацевтической композиции на уровнях, которые ниже чем необходимы для достижения требуемого терапевтического эффекта, и затем постепенно повышать дозу до достижения требуемого эффекта.
В общем, подходящая суточная доза соединения по изобретению будет представлять количество соединения, которое является наиболее низкой дозой, эффективной для получения терапевтического эффекта. Как правило, такая эффективная доза будет зависеть от факторов, описанных выше, и ее может легко определить специалист в данной области.
Обычно терапевтически эффективные дозы соединений по данному изобретению для пациента, при использовании для указанных анальгетических эффектов, будут находиться в пределах от примерно 0,0001 до примерно 1000 мг на кг массы тела в сутки, более предпочтительно от примерно 0,01 до примерно 50 мг на кг в сутки.
Если желательно, то эффективную суточную дозу активного соединения можно вводить в виде двух, трех, четырех, пяти, шести или более субдоз по отдельности с соответствующими интервалами в течение дня, необязательно в разовых лекарственных формах.
Фармацевтические композиции и пути введения
Изобретение относится к фармацевтическим композициям, содержащим комбинацию агентов для лечения рака, например меланомы. Фармацевтические композиции могут дополнительно содержать носитель или наполнитель, стабилизатор, вкусовое вещество и/или краситель.
Изобретение относится к фармацевтическим композициям, содержащим комбинацию агентов, которая может представлять, например, комбинацию двух типов агентов: (1) ингибитор КАЕ и/или фармакологически активные метаболиты, соли, сольваты и рацематы ингибитора, и (2) ингибитор МАР3К8 (ТРЬ2/СОТ) и/или фармакологически активные метаболиты, соли, сольваты и рацематы ингибитора СОТ. В еще одном варианте осуществления можно обеспечить комбинацию агентов для индивида, имеющего клетки с мутантной ВКАЕ или имеющего клетки, сверхэкспрессирующие МАР3К8 (ТРЬ2/СОТ), и она содержит: (1) ингибитор КАЕ и/или фармакологически активные метаболиты, соли, сольваты и рацематы ингибитора, и (2) ингибитор МЕК и/или фармакологически активные метаболиты, соли, сольваты и рацематы ингибитора МЕК.
Комбинацию агентов можно вводить с использованием различных путей введения, известных в данной области. Комбинацию агентов можно вводить людям и другим животным перорально, парентерально, сублингвально, в виде спрея для аэрозольного или ингаляционного введения, ректально, интрацистернально, интравагинально, внутрибрюшинно, буккально или местно в разовых лекарственных формах, содержащих обычные нетоксичные фармацевтически приемлемые носители, адъюванты и растворители, как это требуется. Местное введение также может включать применение трансдермального введения, такого как трансдермальные пластыри или устройства для ионофореза. В том смысле, в котором в данном документе используется термин "парентеральное введение", он включает подкожные инъекции, внутривенную, внутримышечную, интрастернальную инъекцию или инфузионные методы.
Способы получения композиций хорошо известны в данной области, и они описаны, например, в Кетшдои: ТИе §с1еисе аиб Ргасйсе οί Рйагтаеу, Маек РиЪНкЫид Сотрапу, ЕаЧоп. Ра., 194Ь Ебйюи (1995). Фармацевтические композиции для использования в настоящем изобретении могут находиться в виде стерильных, непирогенных жидких растворов или суспензий, покрытых оболочками капсул, суппозиториев, лиофилизованных порошков, трансдермальных пластырей или других форм, известных в данной области.
Инъекционные препараты, например стерильные инъекционные водные или масляные суспензии, можно формулировать согласно способам, известным в данной области, с использованием подходящих диспергирующих и смачивающих агентов, и суспендирующих агентов. Стерильный инъекционный препарат также может представлять стерильный инъекционный раствор, суспензию или эмульсию в нетоксичном, приемлемом для парентерального введения разбавителе или растворителе, например, в виде раствора в 1,3-пропандиоле или 1,3-бутандиоле. Среди приемлемых носителей и растворителей, которые можно использовать, находится вода, раствор Рингера, Фармакопея США, и изотонический раствор хлорида натрия. Кроме того, обычно используют стерильные жирные масла в качестве растворителя или суспендирующей среды. Для этой цели можно использовать любое жирное масло, включая синтетические моно- или диглицериды. В дополнении жирные кислоты, такие как олеиновая кислота, могут найти применение в приготовлении инъекционных препаратов. Инъекционные композиции можно стерилизо- 13 030276
вать, например, фильтрованием через задерживающий бактерии фильтр, или включением стерилизующих агентов в виде стерильных твердых композиций, которые можно растворить или диспергировать в стерильной воде или другой стерильной инъекционной среде перед применением.
Для пролонгации действия лекарственного средства часто желательно замедлить всасывание лекарственного средства из места подкожной или внутримышечной инъекции. Это можно осуществить применением жидкой суспензии кристаллического или аморфного вещества с низкой растворимостью в воде. Тогда скорость всасывания лекарственного средства будет зависеть от скорости его растворения, которая в свою очередь, может зависеть от размера кристаллов и формы кристаллов. Альтернативно замедленное всасывание лекарственного средства для парентерального введения можно обеспечить растворением или суспендированием лекарственного средства в масляном растворителе. Инъекционные формыдепо получают приготовлением матриц из микрокапсул лекарственного средства в биодеградируемых полимерах, таких как полилактид-полигликолид. В зависимости от соотношения лекарственного средства к полимеру и природы конкретного используемого полимера, можно контролировать скорость высвобождения лекарственного средства. Примеры других биодеградируемых полимеров включают поли(ортоэфиры) и поли(ангидриды). Инъекционные композиции-депо также можно приготовить включением лекарственного средства в липосомы или микроэмульсии, которые совместимы с тканями организма.
Композиции для ректального или вагинального введения предпочтительно представляют собой суппозитории, которые можно приготовить смешением соединений по данному изобретению с подходящими, нераздражающими наполнителями или носителями, такими как какао-масло, полиэтиленгликоль или воск для суппозиториев, которые являются твердыми при комнатной температуре, но становятся жидкими при температуре тела и, следовательно, плавятся в полости прямой кишки или влагалища, и высвобождают активное соединение.
Твердые лекарственные формы для перорального введения включают капсулы, таблетки, пилюли, порошки и гранулы. В таких твердых лекарственных формах активное соединение смешивают, по меньшей мере, с одним инертным фармацевтически приемлемым наполнителем или носителем, таким как цитрат натрия или дикальцийфосфат и/или а) наполнители или разбавители, такие как крахмалы, лактоза, сахароза, глюкоза, маннит и кремниевая кислота; Ь) связующие вещества, например, такие как карбоксиметилцелллюлоза, альгинаты, желатин, поливинилпирролидон, сахароза и аравийская камедь; с) увлажняющие вещества, такие как глицерин; ά) разрыхлители, такие как агар-агар, карбонат кальция, картофельный или тапиоковый крахмал, альгиновая кислота, некоторые силикаты и карбонат натрия; е) агенты, задерживающие растворы, такие как парафин; £) усилители всасывания, такие как четвертичные аммониевые соединения; д) смачивающие вещества, например, такие как ацетиловый спирт и глицеролмоностеарат; й) абсорбенты, такие как каолин и бентонитовая глина, и ί) смазывающие вещества, такие как тальк, стеарат кальция, стеарат магния, твердые полиэтиленгликоли, лаурилсульфат натрия и их смеси. В случае капсул, таблеток и пилюль лекарственная форма также может содержать забуферивающие агенты.
Твердые композиции аналогичного типа также можно использовать в качестве наполнителей в мягких и твердых желатиновых капсулах с использованием таких наполнителей, как лактоза или молочный сахар, а также высокомолекулярные полиэтиленгликоли и тому подобное.
Твердые лекарственные формы таблетки, драже, капсулы, пилюли и гранулы можно приготовить с покрытиями и оболочками, такими как кишечные оболочки и другие оболочки, известные в области фармацевтической формуляции. Они могут необязательно содержать замутнитель, и которые также могут представлять собой композицию, которая высвобождает активный ингредиент(ы) только, или предпочтительно, в определенной части кишечного тракта необязательно замедленным образом. Примеры композиций для включения, которые можно использовать, включают полимерные вещества и воска.
Активные соединения также могут находиться в микрокапсулированной форме с одним или более наполнителями, описанными выше. Твердые лекарственные формы таблетки, драже, капсулы, пилюли и гранулы можно приготовить с покрытиями и оболочками, такими как кишечные оболочки, оболочки для контролируемого высвобождения и другие оболочки, известные в области фармацевтической формуляции. В таких твердых лекарственных формах активное соединение можно смешать, по меньшей мере, с одним инертным разбавителем, таким как сахароза, лактоза или крахмал. Такие лекарственные формы могут также содержать, как это имеет место в обычной практике, дополнительные вещества иные, чем инертные разбавители, например, скользящие вещества для таблетирования и другие вспомогательные средства для таблетирования, такие как стеарат магния и микрокристаллическая целлюлоза. В случае капсул, таблеток и пилюль лекарственные формы также могут содержать забуферивающие агенты. Они могут необязательно содержать замутнитель, и которые также могут представлять собой композицию, которая высвобождает активный ингредиент(ы) только, или предпочтительно, в определенной части кишечного тракта необязательно замедленным образом. Примеры композиций для включения, которые можно использовать, включают полимерные вещества и воска.
Жидкие лекарственные формы для перорального введения включают фармацевтически приемлемые эмульсии, микроэмульсии, растворы, суспензии, сиропы и эликсиры. В дополнении к активным соедине- 14 030276
ниям жидкие лекарственные формы могут содержать инертные разбавители, обычно используемые в данной области, например, такие как вода или другие растворители, солюбилизаторы и эмульгаторы, такие как этиловый спирт, изопропиловый спирт, этилкарбонат, ЕЮАс, бензиловый спирт, бензилбензоат, пропиленгликоль, 1,3-бутиленгликоль, диметилформамид, масла (в частности, масло семян хлопчатника, арахисовое, кукурузное, масло зародышей пшеницы, оливковое, касторовое и кунжутное масла), глицерин, тетрагидрофурфуриловый спирт, полиэтиленгликоли и сложные эфиры жирных кислот и сорбитана, и их смеси. Помимо инертных разбавителей композиции для перорального введения также могут содержать адъюванты, такие как смачивающие вещества, эмульгаторы и суспендирующие агенты, подсластители, вкусовые вещества и ароматизаторы.
Лекарственные формы для местного или трансдермального введения соединения по данному изобретению включают мази, пасты, кремы, лосьоны, гели, порошки, растворы, спреи, ингаляторы или пластыри. Активный компонент смешивают в стерильных условиях с фармацевтически приемлемым носителем и любыми необходимыми консервантами или буферами, которые могут потребоваться. Офтальмические композиции, ушные капли и тому подобное также предполагаются для включения в объем данного изобретения.
Мази, пасты, кремы, лосьоны и гели могут содержать в дополнение к активному соединению наполнители, такие как животные и растительные жиры, масла, воска, парафины, крахмал, трагакант, производные целлюлозы, полиэтиленгликоли, силиконы, бентониты, кремниевую кислоту, тальк и оксид цинка, или их смеси.
Композиции по изобретению также можно формулировать для доставки в виде жидкого аэрозоля или сухого порошка для ингаляций. Жидкие аэрозольные композиции можно распылять преимущественно в частицы с размером, которые можно доставлять в концевые и дыхательные бронхиолы.
Аэрозольные композиции по изобретению можно доставлять с использованием образующего аэрозоль устройства, такого как разбрызгивающий распылитель, вибрирующая пористая пластинка или ультразвуковой распылитель, предпочтительно выбранный для обеспечения образования аэрозольных частиц со средним диаметром массы преимущественно в пределах от 1 до 5 мкм. Дополнительно композиция предпочтительно имеет сбалансированную ионную силу, осмолярность и концентрацию хлорида, и наименьший аэрозолируемый объем, способный доставлять эффективную дозу соединений по изобретению в место инфекции. Кроме того, аэрозольная композиция предпочтительно не оказывает отрицательного влияния на функциональное состояние дыхательных путей и не вызывает нежелательных побочных эффектов.
Устройства для аэролизации, подходящие для введения аэрозольных композиций по изобретении, включают, например, разбрызгивающий распылитель, вибрирующую пористую пластинку, ультразвуковые распылители и энергетические ингаляторы для сухих порошков, которые способны распылять композицию по изобретению в аэрозольные частицы со средним диаметром массы преимущественно в пределах от 1 до 5 мкм. Преимущественно в данной заявке означает, что, по меньшей мере, 70%, а предпочтительно более чем 90% всех образованных аэрозольных частиц имеет размер в пределах 1-5 мкм. Разбрызгивающий распылитель работает под давлением воздуха с разбиванием жидкого раствора в аэрозольные капли. Распылители с вибрирующей пористой пластинкой работают при использовании ультразвукового вакуума, образованного быстро вибрирующей пористой пластинкой для вытеснения капель растворителя через пористую пластинку. Ультразвуковой распылитель работает с помощью пьезоэлектрического кристалла, который рассекает жидкость на маленькие аэрозольные капли. Имеются различные подходящие устройства, включая, например, распылители с вибрирующей пористой пластинкой ΑΕΚΌΝΕΒ и ΑΕΚΟΌΟ8Ε (АетоСеи, 1пс., 8иппууа1е, Калифорния), распылители δΙΌΕδΤΚΕΑΜ (МеФс Αίά Иб.. \Уе51 §и88ех, Англия), разбрызгивающие распылители ΡΑΚΙ ЬС и ΡΑΚΙ ЬС δΤΑΚ (Рап Кезрйа!оту Ε^шртеηΐ, 1пс., КюЬтопб, Вирджиния) и ультразвуковые распылители ΑΕΚΟδΟNIС (ЛеУПЫ55 МеШ/1И15сНе Ргобике (Германия) СтЬН, НеШеи, Германия) и υΕΤΚΑΑΙΚΕ (Отгоп НеаИЬсаге, 1пс., Уетпои НШ5, И1шо15).
Соединения по изобретению также можно получать для применения в виде порошков и спреев для местного применения, которые могут содержать, в дополнении к соединениям по данному изобретению, наполнители, такие как лактоза, тальк, кремниевая кислота, гидроксид алюминия, силикаты кальция и порошок полиамида, и смеси этих соединений. Спреи могут дополнительно содержать обычные пропелленты, такие как хлорфторуглероды.
Трансдермальные пластыри имеют дополнительное преимущество, которое заключает в обеспечении контролируемой доставки соединения в организм. Такие лекарственные формы можно приготовить растворением или диспергированием соединения в необходимой среде. Также можно использовать усилители всасывания для повышения проникновения потока соединения через кожу. Скорость можно контролировать обеспечением мембраны, контролирующей скорость, или диспергированием соединения в полимерном матриксе или геле. Соединения по настоящему изобретению также можно вводить в виде липосом. Как это известно в данной области, липосомы обычно получают из фосфолипидов или других липидных веществ. Липосомы образуются в виде моно- или мультиламелярных жидких кристаллов, которые диспергированы в водной среде. Можно использовать любой нетоксичный, физиологически при- 15 030276
емлемый и метаболизируемый липид, способный образовывать липосомы. Настоящие композиции в липосомной форме могут содержать, в дополнении к соединению по настоящему изобретению, стабилизаторы, консерванты, наполнители и тому подобное. Предпочтительными липидами являются фосфолипиды и фосфатидилхолины (лецитины), природные или синтетические. В данной области известны способы приготовления липосом. См., например, Ргексо!! (ей.), "МеШойк ίη Се11 Вю1оду", νοί. XIV, Аеайеш1с Ргекк, №\υ Уогк, 1976, р. 33 е! кед.
Примеры
Пример 1. Основанный на ОКБ функциональный скрининг идентифицирует специфические киназы в качестве индукторов резистентности к ингибированию В-КАБ
Для идентификации киназ, способных "обходить" ингибирование КАР, собирали 597 клонов ОКБ киназ с валидированной последовательностью, представляющих примерно 75% аннотированных киназ (Коллекция ОКБ киназ Центра биологии раковых систем (СС8В)/Института Брода) и стабильно экспрессировали в клетках А375, клеточной линии злокачественной меланомы Β-ΚΑΡν600Ε, которая чувствительна к ингибитору КАР-киназы РБХ4720 (Тка ί. е! а1., Ргос. Ναΐί. Асай. 8с1 И8А, 105, 3041-3046 (2008)) (фиг. 1а, 1Ь, табл. 3, фиг. 6с). Клетки, экспрессирующие ОКБ, обработанные 1 мкМ РБХ4720, подвергали скринингу на жизнеспособность в сравнении с необработанными клетками и нормализовали к специфическому для анализа положительному контролю, МЕК1 (МЕК1 ) (Етегу С.М. е! а1.,
Ргос. №И. Асай. 8с1 И8А, 106, 20411-20416 (2009) (табл. 4 и обобщенные данные на фиг. 5). Девять ОКБ придавали резистентность на уровне, превышающем два стандартных отклонения от среднего значения (фиг. 1Ь и табл. 4), и были отобраны для последующего анализа (фиг. 7). Три из девяти кандидатов ОКБ представляли собой рецепторные тирозинкиназы, что подчеркивает роль данного класса киназ для исследования путей резистентности. Эффекты резистентности подтверждали и отдавали предпочтение по мультиточечной шкале концентраций РБХ4720 в клеточных линиях В-КАБν600Ε А375 и 8КМЕБ28. 8ег/ТЬг киназы киназы киназ МАР (МАР3К) МАР3К8 (СОТ/Тр12) и КАБ1 (С-КАБ) рассматривались в качестве основных кандидатов для обеих клеточных линий; данные ОКБ приводили к сдвигу С150 РБХ4720 в 10-600 раз, не оказывая влияния на жизнеспособность (табл. 5 и фиг. 8 и 9). СККБ, ОКБ которая сдвигала С150 РБХ4720 в меньшей степени (в 9,7 раз на клетках 8КМЕБ28; фиг. 8), кодирует белокадаптер, фосфорилированный с участием тирозинкиназы, такой как ВСК-АВБ (Виде К.В. е! а1., Се11 Соттип. 81дпа1 7, 13 (2009)), но теряет присущую киназную активность. СОТ и С-КАБ снижали чувствительность многочисленных клеточных линий В-КАБ'Е600Е' к РБХ4720 (фиг. 1с), тем самым подтверждая способность данных киназ опосредовать резистентность к ингибированию КАБ. Результаты второго скрининга А375 и 8КМЕБ28 выделили 9 основных ОКБ кандидатов по мультиточечной шкале концентраций РБХ4720 (фиг. 1й).
Интересно, что две основных валидированных киназы, обе, являются 8ег/ТЬг киназами МАР (МАР3К), о которых известно, что они активируют сигнальный путь МЕК/ЕКК в нескольких контекстах. Подобно В-КАБ, С-КАБ представляет МАР3К в каноническом каскаде МАРК (МсКау М.М. апй Моткоп ΌΧ., Опсодепе, 26, 3113-3121 (2007)), об участии которой в развитии резистентности, ассоциированной с последовательным отбором в условиях ш νίΙΐΌ с использованием ингибитора пан-КАБ, сообщалось ранее (Моп1ади1 С. е! а1., Сапсег Кек., 68, 4853-4861 (2008)). СОТ (белковый продукт гена МАР3К8 человека) наиболее полно охарактеризован как МАР3К (8а1тегоп А. е! а1., ЕМВО Т, 15, 817-826 (1996)) ниже от сигнального пути №КВ в воспалительных клетках (Вапедее А. е! а1., Ргос. №!1. Асай. 8с1 И8А, 103, 3274-329 (2006)); однако его функциональная роль при раке человека ранее не исследовалась.
Пример 2. Резистентность к ингибированию В-КАБ посредством активации пути МАРК
Также исследовали, насколько сверхэкспрессия данных генов была достаточной для активации пути МАРК. В исходном периоде экспрессия СОТ приводила к усилению фосфорилирования ЕКК путем, сравнимым с МЕК1СС, совпадающим с активацией пути МАР киназы (фиг. 2а и 10). Сверхэкспрессия СОТ и С-КАБ дикого типа приводила к конститутивному фосфорилированию ЕКК и МЕК в присутствии РБХ4720, в то время как производные с отсутствием киназной активности не оказывали влияния (фиг. 2а и 11). Таким образом, СОТ и С-КАБ индуцируют резистентность к ингибированию КАБ преимущественно через путь реактивации сигнального пути МАРК. Примечательно, что девять кандидатов ОКБ, отобранных в первоначальном скрининге, подгруппа (3), не давали стабильного фосфорилирования ЕКК/МЕК после ингибирования КАБ, на основании чего можно предположить о независимом от пути МАРК изменении чувствительности к лекарственным средствам (фиг. 12).
Пример 3. Активация С-КАБ и гетеродимеризация с В-КАБ
Активация С-КАБ и гетеродимеризация с В-КАБ составляют критические компоненты клеточного ответа на ингибирование В-КАБ. В клетках А375 эндогенные гетеродимеры С-КАБ:В-КАБ являются определяемыми и индуцибельными после обработки РБХ4720 (фиг. 13). Однако фосфорилирование эндогенной С-КАБ в 8338 событие, необходимое для активации С-КАБ - остается низким (фиг. 13). В противоположность эктопически экспрессированная С-КАБ была фосфорилирована в положении 8338 (фиг. 13), и фенотип ее резистентности к РБХ4720 ассоциирован со стабильной активацией МЕК/ЕКК (фиг. 2а и 13). Кроме того, эктопическая экспрессия усеченного мутанта С-КАБ с высокой активностью (СКАБ(\722)) была более эффективной по сравнению с С-КАБ дикого типа в опосредовании резистентно- 16 030276
сти к РЬХ4720 и активации ЕКК (фиг. 14), дополнительно указывая на то, что повышенная активность СКАР регулирует резистентность к данному агенту. Согласуясь с этой моделью, онкогенные аллели ΝΚΆδ и ККА8 придавали резистентность к РЬХ4720 клеткам А375 (фиг. 2Ь) и обеспечивали стабильное фосфорилирование С-КАР(§338) и ЕКК в контексте обработки лекарственным средством (фиг. 2с). Таким образом, несмотря на то, что генетические изменения, которые вызывают активацию С-КАР (например, онкогенные мутации КА8), показывают тенденцию к наличию взаимного исключения с мутацией ВКАР'600Е, такие совместно имеющие события являются преимущественными в контексте развития приобретенной резистентности к ингибированию В-КАР.
Пример 4. исследование экспрессии СОТ в меланоме
Несмотря на то, что С-КАР ранее связывали с меланомой и зависимостью пути МАРК (Моп!ади! С. е! а1., 2008; КатгеШ Р.А., Ое№со1а О.М. е! а1., 2009; Оита/ Ν. е! а1., Сапсег Ке8. 66, 9483-9491 (2006); На!/АаАПои О. е! а1., №1иге (2010); НеНогп 8.1. е! а1., Се11, 140, 209-221 (2010); Роийкакок Р.1. е! а1., №Чиге (2010)), СОТ не описана как киназа, ассоциированная с меланомой.
Исследовали роль СОТ в меланоме и определяли ее экспрессию в меланоцитах человека. Первичные иммортализованные меланоциты (В-КАР дикого типа) экспрессировали СОТ (фиг. 26), хотя, эктопическая экспрессия В-КАР';600Е приводила к снижению уровня мРНК СОТ (фиг. 15) и делала белок СОТ практически недетектируемым (фиг. 26). В противоположность, в то время как эктопически экспрессированная СОТ была слабо детектируемой в клетках А375 (фиг. 2а, 2е), истощение эндогенного ВКАР'600Е, опосредованное 8ЙРНК, вызывало повышение уровня белка СОТ, которое коррелировало со степенью нокдауна В-КАР (фиг. 2е). Кроме того, обработка клеток А375, экспрессирующих СОТ, РЬХ4720 приводила к зависимому от концентрации повышению белка СОТ (фиг. 2а) без воздействия на уровни мРНК эктопической СОТ (фиг. 15). Онкогенная В-КАР отменяет экспрессию СОТ в основном через измененную стабильность белка (фиг. 2а, 26, 2! и 15), и ингибирование В-КАР потенцирует рост клеток, экспрессирующих СОТ, во время обработки. Примечательно, что ни С-КАР, ни В-КАР одни или в комбинации были необходимыми для фосфорилирования ЕКК в контексте экспрессии СОТ, даже в присутствии РЬХ4720 (фиг. 2е, 2£ и фиг. 16). Как показано, экспрессия СОТ является достаточной для индукции активации пути киназы МАР независимым от КАР образом.
Пример 5. Экспрессия СОТ прогнозирует резистентность к ингибированию В-КАР в раковых клеточных линиях
Исследовали, насколько клеточные линии, экспрессирующие повышенные уровни СОТ в исходных В-КАР';600Е. проявляют резистентность 6е поуо к обработке РЬХ4720. Для идентификации таких случаев панель клеточных линий подвергали скринингу на увеличение числа копий МАР3К8/СОТ, совпадающего с мутацией В-КАР'600Е. Из 534 клеточных линий, которые подверглись анализу числа копий и определению профиля мутаций, 38 клеточных линий (7,1%), содержали мутацию В-К.АР';600Е. В данной подгруппе две клеточные линии - ОИМ8-23 (рак ободочной кишки) и КРМ1-7951 (меланома) - также показывали наличие увеличения хромосомных копий, занимающих локус МАР3К8/СОТ (фиг. 3а и 17) и высокую экспрессию белка СОТ (фиг. 3Ь и 18). Панель кратковременных культур меланомы также подвергали скринингу на экспрессию белка СОТ. Одна из этих линий экспрессировала СОТ:М307, кратковременная культура, полученная из опухоли В-КАР'''6001''. у которой развилась резистентность к аллостерическому ингибированию МЕК после первоначальной стабилизации заболевания (фиг. 3 с). Все три клеточные линии были устойчивыми к обработке РЬХ4720, имея значения О150 в пределах 8-10 мкМ (фиг. 36) и показывая стабильное фосфорилирование в контексте ингибирования В-КАР (фиг. 3е, 3£). ОИМ8-23 и КРМ1-7951 являются клеточными линиями пути МАРК, которые не подвергались воздействию ингибитора; таким образом, данные результаты показывают, что СОТ придает резистентность 6е поуо к ингибированию КАР (феномен, наблюдаемый примерно в 10% меланом с мутацией В-КАР'600Е).
Пример 6. Экспрессия СОТ у пациентов, подвергшихся лечению ингибитором КАР
Исследовали экспрессию СОТ в контексте резистентности к клиническому ингибитору киназы КАР, РЬХ4720, при получении биопсийного материала от 3 пациентов с метастатической меланомой ВКар'600Е. в каждом случае материал представлял собой замороженный, совпадающий по патологическому очагу биопсийный материал, полученный до и во время лечения ("до лечения" и "во время лечения"; фиг. 3д, табл. 6); кроме того, одна проба содержала два независимых биопсийных образца из одного и того же места рецидивирующей опухоли ("после рецидива"; фиг. 3д). Согласуясь с данными, полученными на экспериментальных моделях, представленными выше, результаты ОТ-ПЦР в режиме реального времени (дКТ/РСК) выявили повышенную экспрессию мРНК СОТ одновременно с обработкой РЬХ4720 в 2 из 3 случаев. Уровни мРНК СОТ были еще более повышены в образце рецидивирующей опухоли по сравнению с периодом до лечения и во время лечения (фиг. 3§, пациент №1). В дополнительной непарной биопсийной пробе рецидивирующей злокачественной меланомы имела место повышенная экспрессия мРНК СОТ по сравнению с уровнями, наблюдаемыми в СОТ-амплифицированных клеточных линиях, резистентных к ингибитору КАР (фиг. 19). В данном образце также отмечали высокую активацию пути МАРК и повышенную экспрессию В-КАР, С-КАР и СОТ по сравнению с аналогичными участками здоровой кожи или клеточными линиями В-КАР'600Е (фиг. 19). Результаты секвенирования данной опухоли не выявили дополнительных мутаций в ВКАР, NКΑ§ или ККА8 (данные не представле- 17 030276
ны). Данные этих анализов обеспечили клиническое доказательство того, что СОТ-зависимые механизмы функционируют в злокачественных меланомах, резистентных к РБХ4720.
Пример 7. СОТ-регуляция фосфорилирования МЕК/ЕКК
Исследовали, насколько СОТ активно регулирует фосфорилирование МЕК/ЕКК в клетках ВКАБ^600® с естественной повышенной экспрессией СОТ посредством введения кЬРНК- конструкций, нацеленных на СОТ в клетках КРМ1-7951. Истощение СОТ подавляло жизнеспособность КРМ1-7951 (фиг. 20) и снижало фосфорилирование ЕКК (фиг. 3П); таким образом, нацеленная киназная активность СОТ ингибирует фосфорилирование МЕК/ЕКК в раковых клетках со сверхэкспрессией или амплификацией СОТ.
Кроме того, нацеленная киназная активность СОТ в присутствии ингибитора В-КАБ (РБХ4720) подавляет фосфорилирование МЕК/ЕКК (фиг. 3Ь). Обработка клеток КРМ1-7951 низкомолекулярным ингибитором СОТ-киназы (\Ууе11г„ АЬЬо! соединение ГО 9549300) (Оеогде Ό. е! а1., Вюогд. Меб. СЬет. Бе!!., 18, 4952-4955 (2008); Нгга1а К. е! а1., Вю1. РЬагт. Ви11., 33, 133-137 (2010); Бее К.М. е! а1., Сапсег Кек., 69, 8043-8049 (2009)) приводила к зависимому от концентрации ингибированию фосфорилирования МЕК и ЕКК, обеспечивая дополнительное доказательство того, что СОТ вносит свой вклад в активацию МЕК/ЕКК в данных клетках (фиг. 3г).
Пример 8. Клеточные линии В-КАБ^00®, экспрессирующие СОТ, проявляют резистентность к аллостерическим ингибиторам МЕК
Анализировали, насколько раковые клетки, экспрессирующие СОТ, остаются чувствительными к ингибированию пути МАРК в мишени ниже от СОТ и КАБ. Клеточные линии ОИМ8-23 и КРМ1-7951 оценивали на чувствительность к ингибитору МЕК1/2, С1-1040. Обе клеточные линии были устойчивы к ингибированию МЕК (фиг. 4а) и демонстрировали стабильное фосфорилирование ЕКК даже в присутствии 1 мкМ С1-1040 (фиг. 4Ь). Эктопическая экспрессия СОТ в клетках А375 и 8КМЕБ28 также придавала пониженную чувствительность к ингибиторам МЕК, С1-1040 и ΛΖ^6244. предполагая, что одна экспрессия СОТ была достаточной для индукции данного фенотипа (фиг. 4с, 4б и 21). Аналогично результатам, полученным с фармакологическими ингибиторами МЕК, нокдаун МЕК1/2 только умеренно подавлял СОТ-опосредованное фосфорилирование ЕКК в клетках А375 (фиг. 22). Эти данные свидетельствуют о том, что СОТ активирует ЕКК посредством МЕК-независимого и МЕК-зависимого механизмов. Кроме того, проводили оценку киназной активности в условиях ίη νί!το с использованием рекомбинантной СОТ и ЕКК1, и его результаты показали, что рекомбинантная СОТ индуцировала фосфорилирование рТЬг202/Туг204 ЕКК1 в условиях ίη νί!το (фиг. 22). Таким образом, экспрессия СОТ потенцирует активацию ЕКК зависимым от МЕК путем.
Пример 9. Комбинированное ингибирование пути МАРК подавляет пролиферацию клеток
Применение ингибиторов КАБ и МЕК в комбинации может превысить резистентность к этим отдельным агентам, как показано на фиг. 23. Исследовали, насколько комбинированное ингибирование КАБ/МЕК может обойти СОТ-индуцированную резистентность. В случае эктопической экспрессии СОТ воздействие ΛΖ^6244 или С1-1040 в комбинации с РБХ4720 (1 мкМ каждого) подавляло рост клеток и экспрессию рЕКК более эффективно, чем один агент РБХ4720 даже в концентрации 10 мкМ (фиг. 4е, 4ί и 23). Эти данные подчеркивают важность данного пути в опухолевых клетках В-КΛБV600Ε и показывают, что двойное ингибирование В-КАБ/МЕК помогает обойти резистентность к ингибиторам КАБ.
Методы
Коллекция открытых рамок считывания киназ Центра биологии раковых систем (СС8В)/Института Брода
Собирали библиотеку из 597 ОКБ киназ в ЕпЬу векторах рЭОИК-223 (Ιηνίίτο^η). Отдельные клоны секвенировали по концам с использованием вектор-специфических праймеров в обоих направлениях. Отбрасывали клоны с существенными отклонениями от известных в литературе последовательностей. ЕпЬу клоны и последовательности доступны в Аббдепе (Ь!1р://ууу.аббдепе.огд./Ьитап_кгпа8е8). Киназные ОКБ собирали из многочисленных источников; 337 киназ выделяли в виде отдельных клонов из коллекции ОКБеоте 5.1 (Ьйр://ЬогбЬ.бРсг.Ьагхагб.еби), 183 киназы клонировали из РНК ткани здорового человека (АтЬюп) обратной транскрипцией и последующей амплификацией ПЦР для добавления последовательностей Оа!еуау (1^Ьтодеп), 64 киназы клонировали из матриц, полученных из Института Протеомики Гарвардского Университета (Н1Р) и 13 киназ клонировали в систему Оа!еуау из матриц, полученных из сотрудничающих лабораторий. Совместимый с системой Оа!еуау лентивирусный вектор рБХВ1ак!Ю5 был получен на основе рБКО.1. Проводили БК ферментные клоназные реакции рекомбинации для введения 597 киназ в рБХ-В1а8!Ю5 согласно протоколу изготовителя ОтЦгодеп).
Высокопропускной скрининг ОКБ
Клетки меланомы А375 высевали в 384-луночный микротитрационный планшет (500 клеток на лунку). На следующие сутки клетки заражали упакованной в лентивирус библиотекой ОКБ киназ в присутствии 8 мкг/мл полибрена. Через 48 ч после заражения среду заменяли на обычную культуральную среду (2 повторности), содержащую 1 мкМ РБХ4720 (2 повторности, 2 временные точки), или среду, содержащую 10 мкг/мл бластицидина (2 повторности). Через 4 и 6 суток оценивали рост клеток с использованием Се11 Тг!ег-О1о (Рготеда) согласно инструкциям изготовителя. Полный эксперимент прово- 18 030276
дили дважды.
Идентификация ОКР кандидатов резистентности
Необработанные значения люминесценции переводили в М1сто8ой Ехсе1. Эффективность инфицирования определяли по проценту от необработанных средних значений люминесценции двух определений в отобранных бластицидином клетках по сравнению с неотобранными клетками. ОКР с эффективностью инфицирования менее 0,70 исключали из дальнейшего анализа вместе с любой ОКР, имеющей стандартное отклонение >15000 необработанных единиц люминесценции между двумя определениями. Для идентификации ОКР, экспрессия которых оказывает отрицательное влияние на пролиферацию, проводили сравнение необработанных средних значений люминесценции двух определений отдельных ОКР со средним значением и стандартным отклонением всех обработанных контролем клеток через ζ-балл или стандартный балл, как показано ниже.
σ
где χ - средняя необработанная люминесценция для данной ОКР,
μ - средняя необработанная люминесценция всех ОКР и
σ - стандартное отклонение необработанной люминесценции всех лунок.
Любую отдельную ОКР со значением ζ-балла >+2 или <-2 признавали, как оказывающую отрицательное влияние на пролиферацию и исключали из конечного анализа. Дифференциальную пролиферацию определяли по проценту от необработанных средних значений люминесценции двух определений в обработанных РЬХ4720 клетках (1 мкМ) по сравнению с необработанными клетками. Затем дифференциальную пролиферацию нормализовали к положительному контролю для резистентности РЬХ4720, М1К1 ' (МЕК1СС), с дифференциальной пролиферацией МЕК1СС = 1,0 МЕК1СС, нормализованная
дифференциальная пролиферация для каждой отдельной ОКР в виде среднего значения по данным двух определений с двумя временными точками для каждого опыта (сутки 4 и сутки 6). Затем рассчитывали ζбалл, как описано выше для средней нормализованной дифференциальной пролиферации МЕК1СС. ОКР с ζ-баллом >2 рассматривали в качестве положительного результата и тестировали во вторичном скрининге.
Экспрессия ОКР и хНРНК
ОКР экспрессировали из экспрессионных плазмид рЬХ-В1а81-У5 (лентивирусный) или р\2Ь-В1а81, рВАВЕ-Риго или рВАВЕ-зеоцин. Для лентивирусной трансдукции клетки 293Т трансфектировали 1 мкг рЕХ-В1а81-У5-ОКР или рЬКО. 1-8ЬКЫА, 900 нг Δ8.9 (дад, ро1) и 100 нг У5У-О с использованием 6 мкл реагента для трансфекции Ридепе6 (КосЬе). Вирусный супернатант собирали через 72 ч после трансфекции. Клетки млекопитающих заражали в разведении вируса 1:10-1:20 в 6-луночных планшетах в присутствии 5 мкг/мл полибрена и центрифугировали при 2250 об/мин в течение 1 ч при 37°С. Через 24 ч после заражения добавляли бластицидин (рЬХ-В1а81-У5, 10 мкг/мл) или риго (РЬКО.1, 0,75 мкг/мл) и клетки отбирали через 48 ч. Для продукции ретровируса клетки 293Т трансфектировали 1 мкг ретровирусной плазмиды-ОКР, 1 мкг рСЬ-АМРНО и 100 нг У5У-О, как описано выше. Клетки инфицировали супернатантом, содержащим ретровирус, в разведении 1:2 в присутствии 5 мкг/мл полибрена в течение ночи с последующей заменой среды на культуральную среду. Заражение повторяли еще раз (в целом дважды) с последующим отбором, как описано выше.
Вторичный скрининг
Клетки А375 (1,5х103) и §КМЕЬ28 (3х103) высевали в 96-луночные планшеты на 18 ч. Лентивирус, экспрессирующий ОКР, добавляли в разведении 1:10 в присутствии 8 мкг/мл полибрена и центрифугировали при 2250 об/мин и при 37°С в течение 1 ч. После центрифугирования среду, содержащую вирус, заменяли на обычную культуральную среду и инкубировали в течение 18 ч. Через 24 ч после заражения добавляли ДМСО (1:1000) или 10хРЬХ4720 (в ДМСО) до конечной концентрации 100; 10; 1; 0,1; 0,01; 0,001; 0,0001 или 0,00001 мкМ. Жизнеспособность клеток оценивали с использованием \5Т-1 (КосЬе) согласно рекомендациям изготовителя через 4 суток после добавления РЬХ4720.
Клеточные линии и реагенты
Все клетки А375, §КМЕЬ28, 8КМЕЬ30, СОЬО-679, \М4511и, 8КМЕЬ5, Ма1те 3М, 8КМЕЬ30, \М3627, \М1976, \М3163, \М3130, \М3629, \М3453, \М3682 и \М3702 культивировали в среде КРМ1 (Се11дго), 10% РВ5 и 1% смесь пенициллин/стрептомицин. Клетки М307 выращивали в среде КРМ1 (Се11дго), 10% РВ5 и 1% смесь пенициллин/стрептомицин с добавлением 1 мМ пирувата натрия. Клетки 293Т и ОИМ8-23 выращивали в среде ЭМЕМ (Се11дго), 10% РВ5 и 1% смесь пенициллин/стрептомицин. Клетки КРМ1-7951 (АТСС) культивировали в среде МЕМ (Се11дго), 10% РВ5 и 1% смесь пенициллин/стрептомицин. Первичные меланоциты дикого типа культивировали в среде НАМ'к Р10 (Се11дго), 10% РВ5 и 1% смесь пенициллин/стрептомицин. Первичные меланоциты, экспрессирующие В-КΛРV600Е, выращивали в среде Т1УА [среда НАМ'к Р10 (Се11дго), 7% РВ5, 1% смесь пенициллин/стрептомицин, 2 мМ глутамина (Се11дго), 100 мкМ 1ВМХ, 50 нг/мл ТРА, 1 мМ бЬсАМР (§1дта) и 1 мкМ ванадата натрия]. С1-1040 (РиЬСЬет ГО:6918454) получали из 8ЬапдЬш ЬесЬеп 1п1етпа1юпа1 Тгабшд Со., А2Э6244 (РиЬСЬет ГО: 10127622) из 5е11еск СЬетюак и РБХ4720 (РиЬСЬет ГО: 24180719) из 5у- 19 030276
тап818. КАЕ265 (РиЬСЬет ΙΌ: 11656518) был любезно предоставлен ΝοναΠίδ РНагта АО. Если не указано иное, то все обработки лекарственным средством проходили в течение 16 ч. Активированные аллели ΝΡΛ8 и ККА8 были описаны ранее (ВоеЬт 1.8. е! а1., Се11, 129, 1065-1079 (2007); ЬипбЬегд А.8. е! а1., Опсодепе, 21, 4577-4586 (2002)).
Фармакологические тесты ингибирования роста
Культивированные клетки высевали в 96-луночные планшеты (3000 клеток на лунку) для всех клеточных линий меланомы; 1500 клеток высевали для А375. Через 24 ч после посева готовили серийные разведения соответствующего соединения в ДМСО, и добавляли к клеткам, с получением конечных концентраций лекарственного средства в пределах от 100 мкМ до 1x105 мкМ с конечным объемом ДМСО, не превышающим 1%. Клетки инкубировали в течение 96 ч после добавления лекарственного средства. Жизнеспособность клеток оценивали с использованием теста оценки жизнеспособности А8Т1 (КосЬе). Жизнеспособность рассчитывали в виде процента от контроля (необработанные клетки) после вычитания фона. Минимум шесть повторностей проводили для каждой клеточной линии и комбинации лекарственных средств. Данные тестов по оценке ингибирования роста моделировали с использованием кривой нелинейной регрессии с сигмоидальной функцией доза-ответ. Строили эти кривые и определяли значения О150 с использованием ОгарЬРаб Ргйт 5 для Атбо\У5 (ОгарЬРаб). Сигмоидальные кривые ответа, которые пересекали точку 50% ингибирования при концентрации равной или выше 10 мкМ, имели значения О150, соответствующие >10 мкМ. Для опытов с одной концентрацией следовали идентичному протоколу с использованием одной дозы указанного лекарственного средства (1 мкМ, если не указано иное).
Иммуноблоттинг и иммунопреципитация
Клетки промывали дважды охлажденным на льду РВ8 и лизировали 1% буфером ΝΓ-40 [150 мМ №С1, 50 мМ Трис, рН 7,5, 2 мМ ЭДТА, рН 8, 25 мМ NаЕ и 1% ΝΓ-40], содержащим 2х ингибиторов протеазы (КосЬе) и 1х смеси ингибиторов фосфатазы I и II (Са1ВюСЬет). Лизаты количественно анализировали (тест Брэдфорда), нормализовали, восстанавливали, денатурировали (95°С) и разделяли электрофорезом в 8Б8 геле в 10% Трис/глициновых гелях (1пуйгодеп). Белок переносили на мембраны РУБЕ и зондировали первичными антителами, распознающими рЕКК1/2 (Τ202/Υ204), рМЕК1/2 (8217/221), МЕК1/2, МЕК1, МЕК2, С-КАЕ (хозяин кролик), рС-КАЕ (р8338) (Се11 81дпаЬпд ТесЬпо1оду; 1:1000), У5НКР (1пуйгодеп (1:5000); СОТ (1:500), В-КАЕ (1:2000), актин (1:1000), актин-НКР (1:1000; 8ап!а Сгс)), СКАЕ (хозяин мышь; 1:1000; ВБ Тгапкбисйоп ЬаЬк), винкулин (81дта; 1:20000), АХЬ (1:500; К&Б 8уЧет5). После инкубации с соответствующим вторичным антителом (антикроличий, антимышиный 1дО, НКР-конъюгированный; разведение 1:1000, Се11 81дпаЬпд ТесЬпо1оду или антикозий 1дО, НКРконъюгированный; разведение 1:1000, 8ап!а Сги/). белки детектировали хемилюминесцентным анализом (Иегсе). Иммунопреципитацию проводили в течение ночи при 4°С в 1% лизирующем буфере ΝΓ-40, как описано выше, в концентрации 1 мкг/мкл общего белка с использованием антитела, распознающего СКАЕ (1:50; Се11 81дпаЬпд ТесЬпо1оду). Комплексы антитело: антиген иммобилизовали на агарозе с белком А (25 мкл, 50% суспензия; Р1егсе) в течение 2 ч при 4°С. Шарики центрифугировали и промывали три раза лизирующим буфером, и элюировали и денатурировали (95°С) в 2х восстановленном буфере для проб ЦпуЬгодеп). Иммуноблоттинг проводили, как описано выше. Определение фосфобелка проводили с использованием №Н 1таде ί.
Лизаты опухоли и аналогичных участков здоровой кожи получали механической гомогенизацией ткани в К1РА [50 мМ Трис (рН 7,4), 150 мМ №С1, 1 мМ ЭДТА, 0,1% 8Б8, 1,0% Nа^ОС, 1,0% Тритон-Х100, 25 мМ NаЕ, 1 мМ №3УО4], содержащей ингибиторы протеаз и фосфатаз, как описано выше.
Последующую нормализацию и иммуноблоттинг проводили, как описано выше.
Биопсийный материал опухоли меланомы
Биопсийный материал опухоли состоял из удаленной ткани без идентификации, которую получали с информированного согласия пациента и характеризовали согласно протоколу 02-017 (парные образцы, Ма88асЬи8ей8 Оепега1 Но§рЬа1) и 07-087 (непарный образец, Бапа-ЕагЬег Сапсег 1п8Йи1е). Для парных образцов пробы "во время лечения" отбирали через 10-14 суток после начала лечения РБХ4032 (табл. 6).
Ингибирование киназной активности СОТ
Адгезированные клетки КРМ1-7951 дважды промывали 1х РВ8 и инкубировали в течение ночи в бессывороточной культуральной среде. Затем 4-(3-хлор-4-фторфениламино)-6-(пиридин-3илметиламино)-3-циано-[1,7]нафтиридин (ЕМБ; ингибитор I ТРЬ2; Са!#: 616373, РиЬСЬет 1Б: 9549300) суспендировали в ДМСО в указанных концентрациях, добавляли к клеткам на 1 ч, после чего готовили белковые экстракты, как описано выше.
Количественная ОТ-ПЦР
мРНК экстрагировали из клеточных линий и свежезамороженных опухолей с использованием набора К№а§у (01адеп). Общую фракцию мРНК для последующей обратной транскрипции с использованием 8ирег5спр1 III Е1г81-81гапб 8уп1Ье818 8ирегМ1х ЦпуЬгодеп) для клеточных линий и непарных опухолевых образцов, и набор 8ирег5спр1 УШО с^NА 8уп1Ье818 Дпуйгодеп) для парных замороженных опухолевых образцов. 5 мкл реакционной смеси ОТ использовали для количественной ПЦР с использованием смеси 8ΥВК Огееп РСК МаЧег М1х и ген-специфических праймеров в трех параллелях с использованием
- 20 030276
системы ΑΒΙ 7300 геа1 ТЁше РСК. Праймерами, использованными для детектирования, были следующие праймеры: _
Праймер Последовательность ЗЕО ΙΌ ΝΟ:
прямой праймер СОТ СААСТСААСАСССАССАСТΤТ ЗЕО ΙΌ ΝΟ: 1
обратный праймер СОТ ССААССАААТССТССАСАСТТС ЗЕО ΙΌ ΝΟ: 2
прямой праймер ТВР ССССАААСССССААТАТААТСС ЗЕО ΙΌ ΝΟ: 3
обратный праймер ТВР САСТСТТСТТСАСТСТТСССТС ЗЕО ΙΌ ΝΟ: 4
прямой праймер САРРН САТСАТСТСТССССССТСТ ЗЕО ΙΌ ΝΟ: 5
обратный праймер САРРН ССТССТААССАСТТССТССТ ЗЕО ΙΌ N0: 6
Тест оценки киназной активности в условиях ΐη νίίτο
Тесты оценки киназной активности в условиях ΐπ νίίτο проводили, как описано ранее с использованием в каждом случае 1 мкг СОТ (аминокислоты 30-397, Κ&Ό ЗузЁешз) и неактивной ЕКК1 (МЁШроге).
Тесты оценки жизнеспособности клеток
Адгезированные клетки КРМ1-7 951 заражали вирусом, экспрессирующим зйРНК к СОТ или люциферазе, как описано выше. После отбора клетки высевали (1,5х105 клеток/лунку) в 24-луночном планшете в четырех параллелях. Подсчитывали число жизнеспособных клеток посредством вытеснения трипанового синего с использованием анализатора νΐ-СЕЕЕ Се11 УЁаЬЁ1Ё1у Апа!у/ег согласно указаниям изготовителя. Рассчитывали среднее число клеток для четырех параллелей и нормализовали относительно контрольной зйРНК.
Энциклопедия раковых клеточных линий (ССЬЕ)
Проект энциклопедия раковых клеточных линий (ССЕЕ) представляет собой результат сотрудничества Института Брода, Νοναιΐιΐδ ШзОкПез Гог ВЁошеОЁеа1 Кезеагсй (ΝΙΒΚ) и СепошЁез 1пз1ЁШ1е оГ Ше Νοναΐ'ίΐδ Кезеагсй ЕоипОаЁЁоп (ΘΝΕ) с целью проведения подробной генетической и фармакологической характеристики большой панели моделей рака человека для разработки интегрированного компьютерного анализа, который связал бы различную фармакологическую чувствительность с геномными паттернами и перенес интегративную геномику клеточных линий в группирование пациентов, страдающих раком. Для этого исследования использовали данные по числу хромосомных копий и экспрессии генов, доступную онлайн на йЦр://ффф.Ьгоа0Ёпз1Ё1и1е.огд/едЁ-ЬЁп/еапеег/0а1азе1з.едЁ.
Профилирование экспрессии раковых клеточных линий
Анализ олигонуклеотидных микрочипов проводили с использованием СепеСйЁр Нитап Сепоше И133 Р1из 2.0 АГГутейтх ехргеззЁоп аггау (АГГутеЁгЁх). Образцы превращали в меченые фрагментированные кРНК, следуя протоколу АГГушейэх для применения в экспрессионном микрочипе.
Использованные конструкции зЬРИК (рЕКО.1)
Использованные ДНК-последовательности для получения зйРНК-конструкций были следующими:
- 21 030276
8НРНК Идентификатор ТКС Номер ΝΜ Последовательность 8ΕΟΙΒ ΝΟ:
зЬЬис ΤΒΓΝ 0000072243 ΝΑ СТТСОАААТОТССОТТСООТТ 8Е0ГО ΝΟ: 7
δΗΒΚΑΡ(Ι) ΤΚΟΝ 0000006289 ΝΜ 004333.21106§1с1 СТТСОАААТОТССОТТСООТТ 8Е0ГО ΝΟ: 8
5ЬВКАР(2) ΤΒΓΝ 0000006291 ΝΜ 004333.22267§1с1 ОСТООТТТССАААСАОАООАТ ЗЕО ГО ΝΟ: 9
5йСКАР(1) ΤΚΟΝ 0000001066 ΝΜ 002880.x1236§1с1 СООАОАТОТТОСАОТАААОАТ ЗЕО ГО ΝΟ: 10
5ЙСКАР(2) ΤΒΓΝ 0000001068 ΝΜ 002880.x1529§1с1 ОАОАСАТОАААТССААСААТА ЗЕО ГО ΝΟ: 11
5ЬМЕК1(1) ΤΚΟΝ 0000002332 ΝΜ 002755.x1015§1с1 ОАТТАСАТАОТСААСОАОССТ ЗЕО ГО ΝΟ: 12
§ЬМЕК1(2) ΤΒΓΝ 0000002329 ΝΜ 002755.x45581с1 ОСТТСТАТООТОСОТТСТАСА ЗЕО ГО ΝΟ: 13
§ЬМЕК2(1) ΤΚΟΝ 0000007007 ΝΜ 030662.21219§1с1 ТООАСТАТАТТОТОААСОАОС ЗЕО ГО ΝΟ: 14
8ЬМЕК2(2) ΤΕΕΝ 0000007005 ΝΜ 030662.2847з1с1 ССААСАТССТСОТОААСТСТА ЗЕО ГО ΝΟ: 15
5ЬСОТ(1) ΤΕί'Ν 0000010013 ΝΜ 005204.x1826§1с1 СААОАОССОСАОАССТАСТАА ЗЕО ГО ΝΟ: 16
8ЬСОТ(2) ΤΒΓΝ 0000196518 ΝΜ 005204.2280981с! ОАТОАОААТОТОАССТТТААО ЗЕО ГО ΝΟ: 17
Определения и раскрытия, приведенные в данном документе, определяют и заменяют все другие, включенные для сведения. Несмотря на то, что изобретение описано в данном документе при обращении к его предпочтительным вариантам осуществления, специалистам в данной области, очевидно, понятно, что могут быть сделаны добавления, модификации, замены и удаления, не описанные конкретно, не отступая от сущности и объема изобретения, которые определяются прилагаемой формулой изобретения. Следовательно, полагается, что приведенное выше подробное описание следует в большей степени рассматривать в качестве иллюстративного, чем ограничивающего, и что его следует понимать, как это имеет место в последующей формуле изобретения, включая все эквивалентные варианты, которая предназначена для определения сущности и объема данного изобретения.
Таблица 3. Описание библиотеки ОКР киназ ССЗВ/Института Брода и классификация ОКР
Сокращения: К8/ТК (рецепторная серин/треониновая киназа); КТК (рецепторная тирозинкиназа); НК8/ТК (нерецепторная серин/треониновая киназа); НКТК (нерецепторная тирозинкиназа)_
Ген человека ΙΌ гена ОПИСАНИЕ Класс киназы
ААК1 22848 АР2-ассоциированная киназа 1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
АВЫ 25 гомолог 1 онкогена вируса лейкоза мышей Абельсона ν-аЫ протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
АВВ2 27 гомолог 2 онкогена вируса лейкоза мышей Абельсона (агд, связанный с лейкозом Абельсона ген) протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
АСУК1 90 рецептор активина А типа I протеинкиназа (КЗ/ТК)
АСУК1В 91 рецептор активина А типа ΙΒ протеинкиназа (КЗ/ТК)
АСУВ1С 130399 рецептор активина А типа 1С протеинкиназа (КЗ/ТК)
АСУК2А 92 рецептор активина А типа II протеинкиназа (КЗ/ТК)
АСУВ2В 93 рецептор активина А типа ИВ протеинкиназа (КЗ/ТК)
АСУКЫ 94 рецептор активина А типа I1-подобный 1 протеинкиназа (КЗ/ТК)
АРСК1 57143 киназа 1, содержащая домен аагГ протеинкиназа
АОСК2 90956 киназа 2, содержащая домен аагГ протеинкиназа
АОСК4 79934 киназа 4, содержащая домен аагГ протеинкиназа
аврск 83440 АРР-зависимая глюкокиназа родственная киназе
АВКВК1 156 бета-адренергическая рецепторная киназа 1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
- 22 030276
- 23 030276
вив! 699 гомолог 1 почкования ВиВ1, неингибируемый бензимидазолами (дрожжевой) протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
ΒϋΒΙΒ 701 гомолог 1 бета почкования ВиВ1, неингибируемый бензимидазолами (дрожжевой) протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
С1ог£57 84284 открытая рамка считывания 57 хромосомы 1; С1ог£57 родственная киназе
С9ог£95 54981 открытая рамка считывания 95 хромосомы 9; С9ог£95 родственная киназе
С9ог£98 158067 открытая рамка считывания 98 хромосомы 9; С9ог£98 нуклеотидкиназа
САВС1 56997 шаперон, активность АВС1 комплекс-подобная Ьс1 (5. ротЬе) протеинкиназа
САВМ1 801 кальмодулин 1 (фосфорилазкиназа дельта) родственная киназе
САВМ2 805 калмодулин 2 (фосфорилазкиназа дельта) родственная киназе
САВМЗ 808 кальмодулин 3 (фосфорилазкиназа дельта) родственная киназе
САМК1 8536 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа I протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САМК1В 57118 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа Ю протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САМК1С 57172 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа 1С протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САМК2А 815 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа (СаМ киназа) II альфа протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САМК2В 816 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа (СаМ киназа) II бета протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САМК2О 817 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа (СаМ киназа) II дельта протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САМК2С 818 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа (СаМ киназа) II гамма протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САМК4 814 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа IV протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САМКК1 84254 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа 1, альфа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
САМКК2 10645 кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа 2, бета протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САМКУ 79012 гипотетический белок МСС8407 протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
САВКИ 84433 член 11 семейства каспазных соединительных доменов; САЕО11 нуклеотидкиназа
САККВ 23729 углевод-киназа-подобная углевод-киназа
САЗК 8573 кальций/кальмодулин-зависимая серинпротеинкиназа (семейство МАСиК) нуклеотидкиназа
ССВ2 6347 лиганд 2 хемокина (СС-С мотив); ССЬ2 протеинкиназа
ССВ 4 6351 лиганд 4 хемокина (СС-С мотив); ССЬ4 протеинкиназа (НТК)
ССКК 23552 связанная с клеточным циклом киназа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СВ2 914 антиген СО2 (р50), рецептор эритроцитов барана; Сй2 протеинкиназа
СВС2 983 белок 2 цикла деления клеток, С1 в 3 и С2 в М протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
СОС2В1 984 белок 2-подобный 1 цикла деления клеток (белки Р1ТЗЫ2Е) протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
СВС2В2 985 белок 2-подобный 2 цикла деления клеток (белки Р1ТЗЫ2Е) протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
СВС2В6 23097 белок 2-подобный 6 цикла деления клеток (СРК8-подобный) протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
СОС42ВРС 55561 связывающаяся с СРС42 протеинкиназа гамма (РМРК-подобная) протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
СВС7 8317 протеинкиназа 7 СВС7 цикла деления клеток (3. сегечгзгае) протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
СОКЮ 8558 циклин-зависимая киназа 10 (СРС2-подобная) протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
СОК2 1017 циклин-зависимая киназа 2 протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
СОКЗ 1018 циклин-зависимая киназа 3 протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
СйК4 1019 циклин-зависимая киназа 4 протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
- 24 030276
СОК5 1020 циклин-зависимая киназа 5 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СОК5К1 8851 циклин-зависимая киназа 5, регуляторная субъединица (р35) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СОК6 1021 циклин-зависимая киназа 6 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СОК7 1022 циклин-зависимая киназа 7 (гомолог МО15, Хепориз 1аеч1з, сбкактивирующая киназа) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СОК8 1024 циклин-зависимая киназа 8 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СОК9 1025 циклин-зависимая киназа 9 (С0С2-связанная киназа) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
спкы 8814 циклин-зависимая киназа-подобная 1 (С0С2-связанная киназа) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СОКИ 2 8999 циклин-зависимая киназа-подобная 2 (С0С2-связанная киназа) протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
сокьз 51265 циклин-зависимая киназа-подобная 3 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СВКВ4 344387 циклин-зависимая киназа-подобная 4 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СО КВ 5 6792 циклин-зависимая киназа-подобная 5 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СНЕК1 1111 гомолог чекпойнт-контроля СНК1 (3. ротЬе) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СНЕК2 11200 гомолог чекпойнт-контроля СНК2 (3. ротЬе) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СНКА 1119 холинкиназа альфа родственная киназе
С1В1 10519 белок 1, связывающий кальций и интегрин (кальмирин); С1В1 родственный киназе
С1В4 130106 белок, связывающий кальций и интегрин член 4 семейства; С1В4 родственный киназе
СКВ 1152 креатинкиназа, головной мозг родственная киназе
СКМ 1158 креатинкиназа, мышцы родственная киназе
СКМТ1А 548596 креатинкиназа, митохондриальная 1А; СКМТ1А родственная киназе
СКМТ2 1160 креатинкиназа, митохондриальная 2 (саркомерная) родственная киназе
СК31В 1163 регуляторная субъединица 1В протеинкиназы СОС28 протеинкиназа
СК32 1164 регуляторная субъединица 2 протеинкиназы СОС28 протеинкиназа
СВК1 1195 СОС-подобная киназа 1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СВК2 1196 СОС-подобная киназа 2 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СВКЗ 1198 СОС-подобная киназа 3 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СОАЗУ 80347 Коэнзим А-синтаза; СОАЗУ родственная киназе
СОВ4АЗВР 10087 белок, связывающийся с коллагеном типа IV, альфа 3 (антиген Гудпастера); СОЬ4АЗВР протеинкиназа
СРКВ 1399 гомолог СТ10 онкогена вируса саркомы ν-сгк, подобный птичьему; СККЬ родственный киназе
СЗЕ1Р 1436 рецептор колониестимулирующего фактора 1, ранее известный как гомолог онкогена вируса саркомы кошек МакДоноха (ν-йтз) протеинкиназа (КТК)
СЗК 1445 тирозинкиназа с-згс протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
03ΝΚ1Α1 1452 казеинкиназа 1 альфа 1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
03ΝΚ1Α1Β 122011 казеинкиназа 1, альфа 1-подобная протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
сзикю 1453 казеинкиназа 1, дельта протеинкиназа (ΝΗ3/ΤΚ)
03ΝΚ1Ε 1454 казеинкиназа 1, эпсилон протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СЗШС1 53944 казеинкиназа 1, гамма 1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
СЗЕ1К1С2 1455 казеинкиназа 1, гамма 2 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
- 25 030276
СЗШК!<зз 1456 казеинкиназа 1, гамма 3 протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
С5К1К2А1 1457 казеинкиназа 2, альфа полипептид 1 протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
СЗКГК2В 1460 казеинкиназа 2, бета полипептид протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΌΑΚ 26007 гомолог дигидроксиацетонкиназы 2 (3. сегечгзгае); ΏΑΚ родственный киназе
ΌΑΡΚ1 1612 гибель-ассоциированная протеинкиназа 1 протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΌΑΡΚ2 23604 гибель-ассоциированная протеинкиназа 2 протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΌΑΡΚ3 1613 гибель-ассоциированная протеинкиназа 3 протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΌΟΑΚΌ 79877 дефосфо-СоА-киназа домен-содержащая; ϋ6ΑΚϋ родственная киназе
ВСАМКВ2 166614 гипотетический белок МСС45428 протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ВСК 1633 дезоксицитидинкиназа нуклеотидкиназа
ΌΌΡ1 780 член 1 семейства рецептора домена дискоидина протеинкиназа (НТК)
ΌΌΡ2 4921 член 2 семейства рецептора домена дискоидина протеинкиназа (НТК)
Ό3ΚΑ 1606 диацилглицерокиназа альфа 80 кДа родственная киназе
Ό3ΚΒ 1607 диацилглицерокиназа бета 90 кДа родственная киназе
Ό3Κ<3 1608 диацилглицерокиназа гамма 90 кДа родственная киназе
Ό3ΚΚ 139189 диацилглицерокиназа каппа; ЙСКК родственная киназе
Ό3ΚΖ 8525 диацилглицерокиназа зета 104 кДа родственная киназе
ΰαυοκ 1716 дезоксигуанозинкиназа нуклеотидкиназа
ΌΚΡΖρ434Β1231 91156 еЕЕ1А2-связывающий белок; ϋΚΓΖρ434Β1231 протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΒΚΕΖρΊ 61Ρ0423 157285 гипотетический белок ΏΚΓΖρ761Ρ0423 протеинкиназа (ВЗ/ТК)
ΒΒ31 1739 диски, большой гомолог 1 (ОгозорйНа) ; ОЬС1 нуклеотидкиназа
ввез 1741 диски, большой гомолог 3 (нейроэндокрин-б1д, ОгозорйНа) ; ОЬСЗ нуклеотидкиназа
ΒΤΥΜΚ 1841 дезокситимидилаткиназа (тимидилаткиназа) нуклеотидкиназа
ΒΥΡΚ1Α 1859 регулируемая киназа 1А для тирозин-(Υ)-фосфорилирования с двойной специфичностью протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΒΥΡΚ1Β 9149 регулируемая киназа 1В для тирозин-(Υ)-фосфорилирования с двойной специфичностью протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΒΥΡΚ2 8445 регулируемая киназа 2 для тирозин-(Υ)-фосфорилирования с двойной специфичностью протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΒΥΡΚ3 8444 регулируемая киназа 3 для тирозин-(Υ)-фосфорилирования с двойной специфичностью протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΒΥΡΚ4 8798 регулируемая киназа 4 для тирозин-(Υ)-фосфорилирования с двойной специфичностью протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΕΕΕ2Κ 29904 эукариотический фактор-2 элонгации киназы протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ЕСЕК 1956 рецептор эпидермального фактора роста (гомолог онкогена вируса эритробластного лейкоза птиц (ν-егЬ-Ь) протеинкиназа (ВТК)
ΕΙΕ2ΑΚ1 27102 гем-регулируемая киназа фактора 2-альфа инициации протеинкиназа (ΝΒ3/ΤΚ)
ΕΙΕ2ΑΚ4 415116 серин-треонин-протеинкиназа ргт-З протеинкиназа (ВЗ/ТК)
ΕΡΗΑ1 2041 ЕРН-рецептор А1 протеинкиназа (ВТК)
ΕΡΗΑ2 1969 ЕРН-рецептор А2 протеинкиназа (ВТК)
ΕΡΗΑ3 2042 ЕРН-рецептор АЗ протеинкиназа (ВТК)
- 26 030276
ЕРНА4 2043 ЕРН-рецептор А4 протеинкиназа (НТК)
ЕРНА6 285220 ЕРН-рецептор А6 протеинкиназа (НТК)
ЕРНВ1 2047 ЕРН-рецептор В1 протеинкиназа (НТК)
ЕРНВ4 2050 ЕРН-рецептор В4 протеинкиназа (НТК)
ЕРНВб 2051 ЕРН-рецептор В6 протеинкиназа (НТК)
ЕРВВ2 2064 гомолог 2 онкогена вируса эритробластного лейкоза ч-егЬ-Ь2, нейро/глиобластомы (птиц) протеинкиназа (НТК)
ЕРВВЗ 2065 гомолог 3 онкогена вируса эритробластного лейкоза ч-егЬ-Ь2 (птиц) протеинкиназа (НТК)
ЕРВВ4 2066 гомолог 4 онкогена вируса эритробластного лейкоза ν-егЬ-а (птиц) протеинкиназа (НТК)
ΕΡΝ1 2081 сигнальный белок 1 из эндоплазматического ретикулума в ядро протеинкиназа
ΕΤΝΚ1 55500 этаноламинкиназа 1 родственная киназе
ΕΤΝΚ2 55224 этаноламинкиназа 2 родственная киназе
ЕХ03С10 5394 компонент 10 экзосомы; ЕХОЗСЮ протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ЕАЗТК 10922 ЕАЗТ киназа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ЕАЗТКВ1 79675 домены ЕАЗТ киназы 1; ЕАЗТКО1 протеинкиназа
ΡΑ3ΤΚΌ2 22868 домены ЕАЗТ киназы 2; ΕΑ3ΤΚΌ2 протеинкиназа
ЕАЗТКВЗ 79072 домены ЕАЗТ киназы 3; ΕΑ3ΤΚΌ3 протеинкиназа
ЕАЗТ КВ 5 60493 домены ЕАЗТ киназы 5; ΕΑ3ΤΚΌ5 протеинкиназа
РЕР 2241 тирозинкиназа £ег (£рз/£ез связанная) (фосфопротеин ΝΟΡ94) протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
РЕЗ 2242 онкоген саркомы кошек протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
РСРР1 2260 рецептор 1 фактора роста фибробластов (£тз-связанная тирозинкиназа 2, синдром Пфейффера) протеинкиназа (НТК)
РСРР2 2263 рецептор 2 фактора роста фибробластов (черепно-лицевой дизостоз, синдром Пфейффера и Джексона-Вейсса) протеинкиназа (НТК)
РЗРРЗ 2261 рецептор 3 фактора роста фибробластов (ахондроплазия, танатофорный дварфизм) протеинкиназа (НТК)
РСРРВ1 53834 рецептор-подобный 1 фактор роста фибробластов; ЕСЕКЫ протеинкиназа (НТК)
РЗР 2268 гомолог онкогена вируса саркомы кошек Гарднера-Рашида (ч-£дг) протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
РВЛ098 6 55277 гипотетический белок ЕЬЛ0986; ЕЬЛ0986 углевод-киназа
Е1Л23356 84197 гипотетический белок ЕЬЛ3356 протеинкиназа
Р1Л25006 124923 гипотетический белок ЕЬЛ5006 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
Е1Л40852 285962 гипотетический белок ЕЬЛ0852 протеинкиназа
Ρ1ΤΤ1 2321 £тз-связанная тирозинкиназа 1 (рецептор васкулярного эндотелиального фактора роста/фактора проницаемости сосудов) протеинкиназа (НТК)
РЬТЗ 2322 £тз-связанная тирозинкиназа 3 протеинкиназа (НТК)
РЬТ4 2324 £тз-связанная тирозинкиназа 4 протеинкиназа (НТК)
ΡΝ3Κ 64122 фруктозамин-3-киназа родственная киназе
ΡΝ3ΚΚΡ 79672 фруктозамин-3-киназа-связанный белок родственный киназе
РРК 2444 £уп-связанная киназа протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
рик 197258 фукокиназа родственная киназе
- 27 030276
ΕΧΝ 2395 фратаксин; ΓΧΝ родственный киназе
ΕΥΝ 2534 ΓΥΝ онкоген, связанный с ЗКС, ГСК, ΥΕ3 протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
2ΑΕΚ1 2584 галактокиназа 1 углевод-киназа
2ΑΕΚ2 2585 галактокиназа 2 углевод-киназа
еск 2645 глюкокиназа (гексокиназа 4, юношеский диабет с началом в зрелом возрасте типа 2) углевод-киназа
зк 2710 глицерокиназа углевод-киназа
ек2 2712 глицерокиназа 2 углевод-киназа
зк5 256356 гипотетический белок МСС40579; МСС40579 углевод-киназа
зьустк 132158 глицераткиназа углевод-киназа
3ΝΕ 10020 глюкозамин(υϋΡ-Ν-ацетил)-2-эпимераза/Ы-ацетилманнозаминкиназа углевод-киназа
зпкб 2870 сопряженная с С-белком рецепторная киназа 6 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
екк7 131890 сопряженная с С-белком рецепторная киназа 7 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
3532 83903 каспин протеинкиназа (КЗ/ТК)
25КЗА 2931 гликогенсинтазакиназа 3 альфа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
2ТР2Н1 2965 общий фактор транскрипции ΙΙΗ, полипептид 1, 62 кДа; СТЕ2Н1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
зик! 2987 гуанилаткиназа 1 нуклеотидкиназа
ИСК 3055 гемопоэтическая клеточная киназа протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
ΗΙΡΚ1 204851 протеинкиназа 1, взаимодействующая с гомеодоменом протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΗΙΡΚ2 28996 протеинкиназа 2, взаимодействующая с гомеодоменом протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΗΙΡΚ3 10114 протеинкиназа 3, взаимодействующая с гомеодоменом протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΗΙΡΚ4 147746 протеинкиназа 4, взаимодействующая с гомеодоменом протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
НК1 3098 гексокиназа 1 углевод-киназа
НК2 3099 гексокиназа 2 углевод-киназа
НКЗ 3101 гексокиназа 3 (лейкоциты) углевод-киназа
НКРС1 80201 домен-содержащая гексокиназа 1; НКЙС1 углевод-киназа
Н5РВ8 26353 белок 8 теплового шока 22 кДа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
Ι2Ρ1Ρ 3480 рецептор инсулиноподобного фактора роста 1 протеинкиназа (КТК)
ΙΗΡΚ1 9807 инозитолгексафосфаткиназа 1 родственная киназе
ΙΗΡΚ2 51447 инозитолгексафосфаткиназа 2 липидкиназа
ΙΗΡΚ3 117283 инозитолгексафосфаткиназа 3 липидкиназа
ΙΚΒΚΕ 9641 киназа эпсилон, ингибитор энхансера гена полипептида легкой цепи каппа в В-клетках протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΙΒΚ 3611 интегрин-связанная киназа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΙΝ5ΡΡ 3645 рецептор, связанный с инсулиновым рецептором протеинкиназа (КТК)
ΙΡΜΚ 253430 инозитол-полифосфат-муль тикиназа липидкиназа
ΙΡΡΚ 64768 инозитол 1,3,4,5,6-пентакисфосфат-2-киназа; ΙΡΡΚ липидкиназа
ΙΡΑΚ2 3656 киназа 2, ассоциированная с рецептором интерлейкина-1 протеинкиназа (КЗ/ТК)
- 28 030276
ΙΡΑΚ3 11213 киназа 3, ассоциированная с рецептором интерлейкина-1 протеинкиназа (КЗ/ТК)
ΙΡΑΚ4 51135 киназа 4, ассоциированная с рецептором интерлейкина-1 протеинкиназа (КЗ/ТК)
ΙΤΟΒ1ΒΡ3 27231 белок 3, связывающийся с интегрином бета 1; 1ТСВ1ВРЗ родственный киназе
ΙΤΚ 3702 1Ь-2-индуцибельная Т-клеточная киназа протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
ΙΤΡΚΒ 3707 инозитол 1,4,5-трифосфат-З-киназа В родственная киназе
σΑκι 3716 Янус-киназа 1 (протеинтирозинкиназа) протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
σΑΚ2 3717 Янус-киназа 2 (протеинтирозинкиназа) протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
σΑΚ3 3718 Янус-киназа 3 (протеинтирозинкиназа, лейкоциты) протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
ΚΟΡ 3791 рецептор, содержащий инсертный домен киназы (рецепторная тирозинкиназа типа III) протеинкиназа (КТК)
ΚΗΚ 3795 кетогексокиназа (фруктокиназа) углевод-киназа
ΚΙΑΑ0999 23387 белок ΚΙΑΑ0999 протеинкиназа (КЗ/ТК)
ΚΙΑΑ2002 79834 белок ΚΙΑΑ2002 протеинкиназа (КЗ/ТК)
Κ3Ρ 8844 киназный супрессор газ протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
Κ3Ρ2 283455 киназный супрессор Каз-2 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΒΑΤ 31 9113 гомолог 1 большого опухолевого супрессора, ЬАТЗ, (ОгозорШа) протеинкиназа (ΝΚ.3/ΤΚ)
ΒΑΤ 5 2 26524 гомолог 2 большого опухолевого супрессора, ЬАТЗ, (ОгозорЬИа) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ВСК 3932 лимфоцит-специфическая протеинтирозинкиназа протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
ΒΙΜΚ1 3984 киназа 1, содержащая ЫМ-домен протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΒΙΜΚ2 3985 киназа 2, содержащая ЫМ-домен протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ВМТК2 22853 тирозинкиназа 2 1етиг протеинкиназа (КТК)
ВОС220686 220686 гипотетический белок ЙОС220686; ЬОС220686 родственный киназе
ВОС340156 340156 гипотетический белок ЬОС340156 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ВОС340371 340371 гипотетический белок ЬОС340371 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ВОС375133 375133 аналогичная фосфатидилинозитол-4-киназе альфа липидкиназа
ВОС388957 388957 аналогичная ВМР2 индуцибельной киназе протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ВОС389599 389599 аналогичная хромосомной области при амиотрофическом латеральном склерозе 2 (ювенильном), кандидат 2; 1ЬР-взаимодействующий белок 1ЬР1РА протеинкиназа
ВОС390877 390877 аналогичная аденилаткиназе (ЕС 2.7.4.3), цитозольной - обычный карп нуклеотидкиназа
ВОС442075 442075 аналогичная серин/треониновой киназе, устанавливает полярность эмбриона протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ВОС54ЮЗ 54103 гипотетический белок ЬОС54ЮЗ; ЬОС54103 протеинкиназа (КТК)
ВОС646505 646505 аналогичная протеинкиназе СЬКЗ с двойной специфичностью (СЬСподобная киназа 3); неклассифицированная протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ВОС64727 9 647279 аналогичная киназе 3, регулирующей МАР/аффинность микротубул; неклассифицированная протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ВОС648152 648152 аналогичная белку, связанному с атаксией-телеангиэктазией и КабЗ; неклассифицированная протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ВОС649288 649288 аналогичная митохондриальной аденилаткиназе изоферменту 4; (аденилаткиназа 3-подобная 1) нуклеотидкиназа
- 29 030276
РОС650122 650122 аналогичная РТК2 холинкиназе альфа изоформе а; неклассифицированная родственная киназе
РОС652722 652722 аналогичная РТК2 протеинтирозинкиназе 2 изоформе а; неклассифицированная протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
РОС652 7 99 652799 аналогичная предшественнику рецептора фактора роста тучных/стволовых клеток (5СГЕ) (с-кИз) (антиген СР 117); неклассифицированная протеинкиназа (НТК)
РОС653052 653052 аналогичная протеинкиназе 2, взаимодействующей с гомеодоменом (ЪН1Рк2); неклассифицированная протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РОС653155 653155 аналогичная гомологу В фактора 4 процессинга пре-мРНК; неклассифицированная протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РОС727 761 727761 аналогичная дезокситимидилаткиназе (тимидилаткиназе); неклассифицированная нуклеотидкиназа
БОС730000 730000 аналогичная семенники-специфической серинкиназе 6; неклассифицированная протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РОС732306 732306 аналогичная связанной с коровьей оспой киназой 2; неклассифицированная протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РОС91461 91461 гипотетический белок ВС007901 протеинкиназа (ΝκΤΚ)
РОС91807 91807 киназа легких цепей миозина (МЬСК) протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ьреик 136332 гуанилаткиназа с богатыми лейцином повторами, домен-содержащая; ьксик нуклеотидкиназа
ЬРРРРС 10128 протеинкиназа, богатая лейцином, содержащая РРК-мотив; ЬКРРКС протеинкиназа (К5/ТК)
БРРК2 120892 киназа 2 с богатыми лейцином повторами протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ΡΥΚ5 92335 протеинкиназа ЬУК5 протеинкиназа
ΡΥΝ 4067 гомолог, связанный с онкогеном вируса саркомы Ямагучи ч-уез-1 протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
МАЗИ 9223 ассоциированная с мембраной гуанилаткиназа 1, содержащай домены и ΡϋΖ; МАС11 нуклеотидкиназа
МАК 4117 киназа, ассоциированная с мужскими половыми клетками протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАР2К1 5604 митоген-активированная протеинкиназа киназы 1 протеинкиназа
МАР2К1ΙΡ1 8649 белок 1, взаимодействующий с митоген-активированной протеинкиназой киназы 1 протеинкиназа
МАР2К2 5605 митоген-активированная протеинкиназа киназы 2 протеинкиназа
МАР2К5 5607 митоген-активированная протеинкиназа киназы 5 протеинкиназа
МАР2К6 5608 митоген-активированная протеинкиназа киназы 6 протеинкиназа
МАР2К7 5609 митоген-активированная протеинкиназа киназы 7 протеинкиназа
МАРЗК11 4296 митоген-активированная протеинкиназа киназы 11 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРЗК12 7786 митоген-активированная протеинкиназа киназы 12 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРЗК14 9020 митоген-активированная протеинкиназа киназы 14 протеинкиназа
МАРЗК15 389840 белок ГЬЛ6518 протеинкиназа
МАРЗК2 10746 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназы 2 протеинкиназа
МАРЗК5 4217 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназы 5 протеинкиназа
МАРЗК6 9064 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназы 6 протеинкиназа
МАРЗК7 6885 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназы 7 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРЗК8 1326 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназы 8 протеинкиназа
- 30 030276
МАР4К1 11184 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназа киназы 1 протеинкиназа
МАР4К2 5871 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназа киназы 2 протеинкиназа
МАР4КЗ 8491 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназа киназы 3 протеинкиназа
МАР4К4 9448 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназа киназы 4 протеинкиназа
МАР4К5 11183 митоген-активированная протеинкиназа киназа киназа киназы 5 протеинкиназа
МАРК1 5594 митоген-активированная протеинкиназа 1 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРК10 5602 митоген-активированная протеинкиназа 10 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРК12 6300 митоген-активированная протеинкиназа 12 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРК13 5603 митоген-активированная протеинкиназа 13 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРК14 1432 митоген-активированная протеинкиназа 14 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРК15 225689 регулируемая внеклеточным сигналом киназа 8 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРКЗ 5595 митоген-активированная протеинкиназа 3 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРК4 5596 митоген-активированная протеинкиназа 4 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРК6 5597 митоген-активированная протеинкиназа 6 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ΜΆΡΚ8 5599 митоген-активированная протеинкиназа 8 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРК9 5601 митоген-активированная протеинкиназа 9 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРКАРК2 9261 митоген-активированная протеинкиназа-активированная протеинкиназа 2 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРКАРКЗ 7867 митоген-активированная протеинкиназа-активированная протеинкиназа 3 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРКАРК5 8550 митоген-активированная протеинкиназа-активированная протеинкиназа 5 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРК2 2011 киназа 2, регулирующая аффинность МАР/микротубул протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАРКЗ 4140 киназа 3, регулирующая аффинность МАР/микротубул протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАЗТ1 22983 серин/треониновая киназа 1, ассоциированная с микротубулами протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАЗТ2 23139 серин/треониновая киназа 2, ассоциированная с микротубулами протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАЗТЬ 84930 подобная серин/треониновой киназе, ассоциированной с микротубулами протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МАТ К 4145 ассоциированная с мегакариоцитами тирозинкиназа протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
МЕРТК 10461 с-шег протоонкогенная тирозинкиназа протеинкиназа (КТК)
МЕТ 4233 теб протоонкоген (рецептор фактора роста гепатоцитов) протеинкиназа (КТК)
МЗС16169 93627 гипотетический белок МСС16169 протеинкиназа
МСС42105 167359 гипотетический белок МСС42105 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ΜΙΝΚ1 50488 т1ззбареп/Ы1К-связанная киназа протеинкиназа
ΜΚΝΚ1 8569 серин/треониновая киназа 1, взаимодействующая с МАР-киназой протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ΜΚΝΚ2 2872 серин/треониновая киназа 2, взаимодействующая с МАР-киназой протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
Μ0ΡΝ2 378464 киназа 2, содержащая ΜΟΚΝ-повторы; ΜΟΚΝ2 родственная киназе
МОЗ 4342 гомолог онкогена вируса саркомы мышей Молони ν-тоз протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
МРР1 4354 мембранный белок, пальмитоилированный 1, 55 кДа; МРР1 протеинкиназа
МРР2 4355 мембранный белок, пальмитоилированный 2 (член 2 субсемейства МАСРГК р55); МРР2 нуклеотидкиназа
МРРЗ 4356 мембранный белок, пальмитоилированный 3 (член 3 субсемейства МАСиК р55); МРРЗ нуклеотидкиназа
- 31 030276
МРР4 58538 мембранный белок, пальмитоилированный 4 (член 4 субсемейства МАСИК р55); МРР4 нуклеотидкиназа
МРР5 64398 мембранный белок, пальмитоилированный 5 (член 5 субсемейства МАСИК р55); МРР5 нуклеотидкиназа
МРР6 51678 мембранный белок, пальмитоилированный 6 (член 6 субсемейства МАСИК р55); МРР6 нуклеотидкиназа
МРР7 143098 мембранный белок, пальмитоилированный 7 (член 7 субсемейства МАСИК р55); МРР7 нуклеотидкиназа
М5Т1Р 4486 рецептор фактора 1, стимулирующего макрофаги (с-теб-связанная тирозинкиназа) протеинкиназа (НТК)
мизк 4593 рецепторная тирозинкиназа скелетных мышц протеинкиназа (НТК)
ШК 4598 мевалонаткиназа (мевалоновая ацидурия) родственная киназе
ΜΥΡΚ2 85366 киназа 2 легких цепей миозина, скелетные мышцы протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
ΜΥ03Β 140469 миозин ΙΙΙΒ протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
ΝΑΌΚ 65220 ΝΑϋ-киназа родственная киназе
ΝΑΰΚ 55577 Ν-ацетилглюкозаминкиназа родственная киназе
ΝΕΚ10 152110 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 10 протеинкиназа
ΝΕΚ11 79858 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 11 протеинкиназа
ΝΕΚ2 4751 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 2 протеинкиназа
ΝΕΚ3 4752 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 3 протеинкиназа
ΝΕΚ4 6787 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 4 протеинкиназа
ΝΕΚ5 341676 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 5 протеинкиназа
ΝΕΚ6 10783 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 6 протеинкиназа
ΝΕΚ7 140609 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 7 протеинкиназа
ΝΕΚ8 284086 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 8 протеинкиназа
ΝΕΚ9 91754 ΝΙΜΑ (печег ίη тгбозгз депе а)-родственная киназе 9 протеинкиназа
кими-Р1 64149 протеинкиназа И)ти-К1 протеинкиназа
ΝΒΚ 51701 пето-подобная киназа протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
ΝΜΕ1 4830 нуклеозид-дифосфаткиназа 1 нуклеотидкиназа
ΝΜΕ1-ΝΜΕ2 654364 белок ΝΜΕ1-ΝΜΕ2; ΝΜΕ1-ΝΜΕ2 нуклеотидкиназа
ΝΜΕ2 4831 НуКлеоЗИд—дИфоофатКИНаЗа 2 НуКлеготИдКИНсйЗсА
ΝΜΕ3 4832 нуклеозид-дифосфаткиназа 3 нуклеотидкиназа
ΝΜΕ4 4833 нуклеозид-дифосфаткиназа 4 нуклеотидкиназа
ΝΜΕ5 8382 белок, экспрессированный в клетках с низким метастатическим потенциалом 5 (нуклеозид-дифосфаткиназа) нуклеотидкиназа
ΝΜΕ6 10201 белок, экспрессированный в клетках с низким метастатическим потенциалом 6 (нуклеозид-дифосфаткиназа) нуклеотидкиназа
ΝΜΕ7 29922 белок, экспрессированный в клетках с низким метастатическим потенциалом 7 (нуклеозид-дифосфаткиназа) нуклеотидкиназа
ΝΡΡ2 4882 рецептор натрийуретического пептида В/гуанилатциклаза В (рецептор атрионатрийуретического пептида В) протеинкиназа
ΝΡΒΡ 29959 ядерный рецептор связывающего белка протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
- 32 030276
ΝΤΡΚ1 4914 нейротрофическая рецепторная тирозинкиназа типа 1 протеинкиназа (НТК)
ΝΤΡΚ2 4915 нейротрофическая рецепторная тирозинкиназа типа 2 протеинкиназа (НТК)
ΝΤΡΚ3 4916 нейротрофическая рецепторная тирозинкиназа типа 3 протеинкиназа (НТК)
ΝϋΑΚ2 81788 вероятный ортолог крысиной 5ЫЕ1/АМР-активированной протеинкиназы протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ΝΌΡ62 23636 нуклеопорин 62 кДа; Ν11Ρ62 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ΝΥΌ-3Ρ25 89882 протеинкиназа ΝΥΏ-5Ρ25 протеинкиназа
0X3 Ρ1 9943 реакционный белок 1 окислительного стресса протеинкиназа
ΡΑΚΙ 5058 р21/Сбс42/Еас1-активированная киназа 1 (гомолог 5ТЕ20, дрожжи) протеинкиназа
ΡΑΚ2 5062 р21 (СРКША) -активированная киназа 2 протеинкиназа
ΡΑΚ3 5063 ρ21 (СРКША)-активированная киназа 3 протеинкиназа
ΡΑΚ4 10298 р21 (СРКША) -активированная киназа 4 протеинкиназа
ΡΑΚ6 56924 р21(ΟϋΚΝΙΑ)-активированная киназа 6 протеинкиназа
ΡΑΚ7 57144 р21 (СРКША)-активированная киназа 7 протеинкиназа
ΡΑΝΚ2 80025 пантотенат-киназа 2 (синдром Галлевордена-Шпатца) родственная киназе
ΡΑΝΚ3 79646 пантотенат-киназа 3 родственная киназе
ΡΑΝΚ4 55229 пантотенат-киназа 4 родственная киназе
ΡΑΡ331 9061 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфатсинтаза 1; РАР551 родственная киназе
ΡΑΡ332 9060 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфатсинтаза 2; РАР552 родственная киназе
ΡΒΚ 55872 протеинкиназа, происходящая из Т-ЬАК-клеток протеинкиназа
РСК2 5106 фосфоенолпируваткарбоксикиназа 2 (митохондриальная) родственная киназе
РСТК1 5127 протеинкиназа 1 РСТА1КЕ протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
РСТК2 5128 протеинкиназа 2 РСТА1ЕЕ протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
РСТКЗ 5129 протеинкиназа 3 РСТА1ЕЕ протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ΡΌΟΡΚΑ 5156 рецептор фактора роста тромбоцитов, альфа полипептид протеинкиназа (НТК)
ΡΌΟΡΚΒ 5159 рецептор фактора роста тромбоцитов, бета полипептид протеинкиназа (НТК)
ΡΌΟΡΚΒ 5157 рецептор-подобный фактор роста тромбоцитов; РЬСЕРЬ протеинкиназа (НТК)
ΡΰΙΚΙΒ 149420 киназа 1-подобная, взаимодействующая с РЬЫМ1 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ΡΌΚ1 5163 пируватдегидрогеназа-киназа, изофермент 1 протеинкиназа
ΡΒΚ2 5164 пируватдегидрогеназа-киназа, изофермент 2 протеинкиназа
ΡΌΚ3 5165 пируватдегидрогеназа-киназа, изофермент 3 протеинкиназа
ΡΌΚ4 5166 пируватдегидрогеназа-киназа, изофермент 4 протеинкиназа
ΡΌΡΚ1 5170 3-фосфоинозитид-зависимая протеинкиназа-1 протеинкиназа
ΡΰΧΚ 8566 пиридоксаль(пиридоксин, витамин В6)-киназа родственная киназе
ΡΡΚΡΒ1 5207 6-фосфофрукто-2-киназа/фруктоза-2,6-бифосфатаза 1 углевод-киназа
ΡΡΚΡΒ2 5208 6-фосфофрукто-2-киназа/фруктоза-2,6-бифосфатаза 2 углевод-киназа
ΡΡΚΡΒ3 5209 6-фосфофрукто-2-киназа/фруктоза-2,6-бифосфатаза 3 углевод-киназа
ΡΡΚΒ 5211 фосфофруктокиназа печени углевод-киназа
ΡΡΚΜ 5213 фосфофруктокиназа, мышцы углевод-киназа
- 33 030276
РРКР 5214 фосфофруктокиназа тромбоцитов углевод-киназа
РРТК1 5218 протеинкиназа 1 ΡΕΤΑΙΕΕ протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
РСК1 5230 фосфоглицераткиназа 1 углевод-киназа
РСК2 5232 фосфоглицераткиназа 2 углевод-киназа
РНКА1 5255 фосфорилазкиназа, альфа 1 (мышцы) протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
РНКА2 5256 фосфорилазкиназа, альфа 2 (печень) протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
РНКВ 5257 фосфорилазкиназа, бета протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
РНКС1 5260 фосфорилазкиназа, гамма 1 (мышцы) протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
РНКС2 5261 фосфорилазкиназа, гамма 2 (семенники) протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ΡΙ4Κ2Β 55300 фосфатидилинозитол-4-киназа типа II бета липидкиназа
ΡΙ4ΚΙΙ 55361 фосфатидилинозитол-4-киназа типа II липидкиназа
ΡΙ КЗ С 2(3 5288 фосфоинозитид-3-киназа, класс 2, гамма-полипептид липидкиназа
Р1КЗСЗ 5289 фосфоинозитид-3-киназа, класс 3 липидкиназа
Р1КЗСА 5290 фосфоинозитид-3-киназа, каталитическая, альфа-полипептид липидкиназа
Р1КЗСВР 5291 фосфоинозитид-3-киназа, каталитическая, бета-полипептид липидкиназа
Р1КЗСЗ 5294 фосфоинозитид-3-киназа, каталитическая, гамма-полипептид липидкиназа
ΡΙΚ3Κ1 5295 фосфоинозитид-3-киназа, регуляторная субъединица 1 (р85 альфа) липидкиназа
ΡΙΚ3Κ3 8503 фосфоинозитид-3-киназа, регуляторная субъединица 3 (р55, гамма) липидкиназа
ΡΙΚ3Κ4 30849 фосфоинозитид-3-киназа, регуляторная субъединица 4, р150 липидкиназа
ΡΙΚ3Κ5 23533 фосфоинозитид-3-киназа, регуляторная субъединица 5, р101 липидкиназа
Р1К4СА 5297 фосфатидилинозитол-4-киназа, каталитическая, альфа-полипептид липидкиназа
Р1К4СВ 5298 фосфатидилинозитол-4-киназа, каталитическая, бета-полипептид липидкиназа
ΡΙΜ1 5292 онкоген ρίπι-Ι протеинкиназа (Е5/ТК)
ΡΙΜ2 11040 онкоген р1т-2 протеинкиназа (Е5/ТК)
ΡΙΝΚ1 65018 ΡΤΕΝ-индуцированная умозрительная киназа 1 протеинкиназа (Е5/ТК)
ΡΙΡ5Κ1Α 8394 фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназа, тип I, альфа липидкиназа
ΡΙΡ5Κ1Β 8395 фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназа, тип I, бета липидкиназа
ΡΙΡ5Κ2Α 5305 фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназа, тип II, альфа липидкиназа
Р1Р5К2С 79837 фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназа, тип II, гамма родственная киназе
ΡΙΡ5Κ3 200576 фосфатидилинозитол-3-фосфат/фосфатидилинозитол-5-киназа, тип III липидкиназа
ΡΙΡ5ΚΒ1 138429 фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназа-подобная 1 липидкиназа
РКВК 5313 пируваткиназа, печень и эритроциты углевод-киназа
РКМ2 5315 пируваткиназа, мышцы углевод-киназа
ΡΚΜΥΤ1 9088 мембрана-ассоциированная тирозин- и треонин-специфическая сбс2ингибирующая киназа протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
рвли 5328 активатор плазминогена, урокиназа родственная киназе
РВК1 5347 ро1о-подобная киназа 1 ( РгозорШа) протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
РВК2 10769 ро1о-подобная киназа 2 ( РгозоркИа) протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
- 34 030276
протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ЕТК)
протеинкиназа (ЕТК)
протеинкиназа (ЕТК)
родственная киназе
протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
нуклеотидкиназа
протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΕ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
- 35 030276
РРКС1 5592 протеинкиназа, сСМР-зависимая, тип I протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
РРКС2 5593 протеинкиназа, сСМР-зависимая, тип II протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
РРКК 5610 интерферон-индуцируемая, зависимая от двухцепочечной РНК протеинкиназа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
РРКХ 5613 Х-сцепленная протеинкиназа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΡΡΚΥ 5616 Υ-сцепленная протеинкиназа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
РРРР4В 8899 гомолог В фактора процессинга пре-мРНК РКР4 (дрожжи) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
РРР31 5631 фосфорибозилпирофосфатсинтетаза 1; РКР31 родственная киназе
РРР31В1 221823 фосфорибозилпирофосфатсинтетаза 1-подобная 1; РКР31Ы родственная киназе
РРР32 5634 фосфорибозилпирофосфатсинтетаза 2; РКР32 родственная киназе
РЗКН1 5681 протеинсериновая киназа Н1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
РТК2 5747 РТК2 протеинтирозиновая киназа 2 протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
РТК2В 2185 РТК2В протеинтирозиновая киназа 2 бета протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
РТК6 5753 РТК6 протеинтирозиновая киназа 6 протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
РТК7 5754 РТК7 протеинтирозиновая киназа 7 протеинкиназа (КТК)
РТК9 5756 РТК9 протеинтирозиновая киназа 9 протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
РХК 54899 серин/треониновая киназа, содержащая домен РХ родственная киназе
РАР1 5894 гомолог 1 онкогена вируса лейкоза мышей ц-га£-1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
РАСЕ 5891 антиген опухоли почки протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
РВКЗ 64080 рибокиназа нуклеотидкиназа
РЕТ 5979 протоонкоген ге£ (множественная эндокринная неоплазия и медуллярная карцинома 1 щитовидной железы, болезнь Гиршспрунга) протеинкиназа (КТК)
РЕК 55312 рибофлавинкиназа родственная киназе
ΡΙΟΚ1 83732 ΚΙΟ киназа 1 (дрожжевая) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΡΙ0Κ2 55781 ΚΙΟ киназа 2 (дрожжевая) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΡΙ0Κ3 8780 ΚΙΟ киназа 3 (дрожжевая) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΡΙΡΚ1 8737 рецептор(ΤΝΓΚ3Γ)-взаимодействующая серин-треониновая киназа 1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΡΙΡΚ2 8767 рецептор-взаимодействующая серин-треониновая киназа 2 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ΡΙΡΚ5 25778 рецептор-взаимодействующая протеинкиназа 5 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РКНВЗ 84206 протеинкиназа, содержащая «безымянный палец» и домен КН, 3; ККНРЗ протеинкиназа
Р0Р2 4920 рецепторный тирозинкиназа-подобный орфановый рецептор 2 протеинкиназа (КТК)
РР2 6102 пигментный ретинит 2 (Х-сцепленный рецессивный); КР2 нуклеотидкиназа
РР6-213Н19.1 51765 Мз£3- и 50К1-связанная киназа протеинкиназа
РР36КА1 6195 киназа рибосомального белка 36, 90 кДа, полипептид 1 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РР36КА2 6196 киназа рибосомального белка 36, 90 кДа, полипептид 2 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ΡΡ36ΚΑ3 6197 киназа рибосомального белка 36, 90 кДа, полипептид 3 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РР36КА4 8986 киназа рибосомального белка 36, 90 кДа, полипептид 4 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РР36КА5 9252 киназа рибосомального белка 36, 90 кДа, полипептид 5 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
- 36 030276
РР36КА6 27330 киназа рибосомального белка 56, 90 кДа, полипептид 6 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РР36КВ1 6198 киназа рибосомального белка 56, 70 кДа, полипептид 1 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РР36КВ2 6199 киназа рибосомального белка 56, 70 кДа, полипептид 2 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ЕР36КС1 26750 киназа рибосомального белка 56, 52 кДа, полипептид 1 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
РР36КВ1 83694 киназа рибосомального белка 56-подобная 1 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ЗСУВ1 57410 5СУ1-подобная 1 (5. сегечгзгае) протеинкиназа (ΝΕΤΚ)
ЗСУВ2 55681 гипотетический белок ЕЬЛ0074 протеинкиназа (ΝΕΤΚ)
ЗСУВЗ 57147 эзрин-связывающий партнер РАСЕ-1 протеинкиназа (ΝΕΤΚ)
3ΕΡΗ32 22928 селен-фосфатсинтетаза 2; 5ЕРН52 родственная киназе
зек 6446 сывороточная/регулируемая глюкокортикоидами киназа протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
зек2 10110 сывороточная/регулируемая глюкокортикоидами киназа 2 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
зекз 23678 сывороточная/регулируемая глюкокортикоидами киназа-подобная протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗНЗВР4 23677 5НЗ-домен-связывающий белок 4; 5НЗВР4 протеинкиназа (ΝΕΤΚ)
ЗНЗВР5 9467 5НЗ-домен-связывающий белок 5 (ВТК-ассоциированный); 5НЗВР5 родственный киназе
ЗНЗВР5В 80851 5НЗ-домен-связывающий белок 5-подобный; 5НЗВР5Ь родственный киназе
ЗВ АМР 6 114836 член 6 семейства 5ΙΑΜ; 5ΙΑΜΕ6 протеинкиназа (НТК)
3ΝΡ1ΒΚ 150094 5ЫЕ1-подобная киназа протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
3ΝΡΚ 54861 5ЫЕ1-связанная киназа протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
3ΝΧ1 6 64089 сортинг нексин 16; 5ΝΧ16 родственный киназе
ЗРНК1 8877 сфингозинкиназа 1 углевод-киназа
ЗРНК2 56848 сфингозинкиназа 2 углевод-киназа
ЗРС 6714 гомолог онкогена вируса саркомы ν-зсг (Шмидта-Руппина А-2) (птичий) протеинкиназа (ΝΕΤΚ)
ЗРРК1 6732 5ЕК5 протеинкиназа 1 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗРРК2 6733 5ЕК5 протеинкиназа 2 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗРРКЗ 26576 серин/треониновая киназа 23 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗТК11 6794 серин/треониновая киназа 11 (синдром Пейтца-Джигерса) протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗТК16 8576 серин/треониновая киназа 16 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗТК17В 9262 серин/треониновая киназа 17Ь (индуцирующая апоптоз) протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗТК1 9 8859 серин/треониновая киназа 19 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗТК24 8428 серин/треониновая киназа 24 (гомолог 5ТЕ20, дрожжевая) протеинкиназа
ЗТК25 10494 серин/треониновая киназа 25 (гомолог 5ТЕ20, дрожжевая) протеинкиназа
ЗТКЗ 6788 серин/треониновая киназа 3 (гомолог 5ТЕ20, дрожжевая) протеинкиназа
ЗТКЗ2А 202374 серин/треониновая киназа 32А протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗТКЗ2В 55351 серин-треониновая киназа 32В протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗТКЗ2С 282974 серин-треониновая киназа 32С протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗТКЗЗ 65975 серин-треониновая киназа 33 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
ЗТКЗ 6 27148 серин-треониновая киназа 36 (слитый гомолог, ОгозорДИа) протеинкиназа (Е5/ТК)
ЗТКЗ 8 11329 серин-треониновая киназа 38 протеинкиназа (ΝΕ5/ΤΚ)
- 37 030276
зткзвв 23012 серин-треониновая киназа 38-подобная протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ЗТК4 0 83931 Зег/Тйг-подобная киназа протеинкиназа
3ΤΥΚ1 55359 протеинкиназа 3ΤΥΚ1 протеинкиназа (КТК)
ЗУК 6850 тирозинкиназа селезенки протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
ТАОКЗ 51347 ТАО киназа 3 протеинкиназа
ТВК1 29110 ΤΑΝΚ-связывающая киназа 1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ТЕС 7006 протеинтирозиновая киназа бес протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
ТЕЗК1 7016 семенники-специфическая киназа 1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ТЕЗК2 10420 семенники-специфическая киназа 2 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ТСЕВК1 7046 рецептор 1 трансформирующего фактора роста бета (рецептор активина А типа ΙΙ-подобная киназа, 53 кДа) протеинкиназа (КЗ/ТК)
ТСЕВК2 7048 рецептор II трансформирующего фактора роста бета (70/80 кДа) протеинкиназа (КЗ/ТК)
ТСЕВКЗ 7049 рецептор III трансформирующего фактора роста бета (бета-гликан 300 кДа); ТСЕВКЗ протеинкиназа (КЗ/ТК)
ΤΙΕ1 7075 тирозинкиназа с иммуноглобулин-подобным и ЕСЕ-подобным доменами 1 протеинкиназа (КТК)
ТК1 7083 тимидинкиназа 1, растворимая нуклеотидкиназа
ТВК1 9874 боиз1еб-подобная киназа 1 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ТВК2 11011 боиз1еб-подобная киназа 2 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ΤΝΚ1 8711 тирозинкиназа, нерецепторная, 1 протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
ΤΝΝΙ3Κ 51086 взаимодействующая с ΤΝΝΙ3 киназа протеинкиназа
ТР53КК 112858 ТР53-регулирующая киназа протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ТРК1 27010 тиаминпирофосфокиназа 1 родственная киназе
ТРР 7175 транслоцированная промоторная область (к активированному МЕТ онкогену) ; ТРР. протеинкиназа (КТК)
ΤΡΙΒ1 10221 бггЬЫез гомолог 1 (РгозорДИа) протеинкиназа
ΤΡΙΒ2 28951 бггЬЫез гомолог 2 (РгозорДИа) протеинкиназа
ΤΡΙΒ3 57761 бггЬЫез гомолог 3 (РгозорДИа) протеинкиназа
ΤΡΙΜ2 7 5987 тройной мотив-содержащая протеинкиназа 27; ΤΚΙΜ27 протеинкиназа (КТК)
ТРРМ7 54822 кратковременный рецепторный потенциальный катионный канал, субсемейство М, член 7 протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ТЗЗК1 83942 серин-треониновая киназа 22Ό (ассоциированная со спермиогенезом) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ТЗЗК2 23617 серин-треониновая киназа 22В (ассоциированная со спермиогенезом) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ТЗЗКЗ 81629 серин-треониновая киназа 22С (ассоциированная со спермиогенезом) протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ТЗЗК6 83983 серин-треониновая протеинкиназа 55ТК протеинкиназа (ΝΚ3/ΤΚ)
ттк 7272 протеинкиназа ТТК протеинкиназа
ТМЕ2 11344 РТК9Ь протеинтирозиновая киназа 9-подобная (Аб-связанный белок) протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
ТХК 7294 тирозинкиназа ТХК протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
тхквсз 51314 тиоредоксин-домен-содержащая нуклеотидкиназа 3 (сперматозоиды); ΤΧΝϋΟ3 нуклеотидкиназа
ΤΥΚ2 7297 тирозинкиназа 2 протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
- 38 030276
ΤΥΡ03 7301 протеинтирозиновая киназа ΤΥΚΟ3 протеинкиназа (КТК)
искг 7371 уридинцитидинкиназа 2 нуклеотидкиназа
инмк1 127933 киназа 1 с мотивом гомологии и2АГ (ИНМ) протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
иъкг 9706 ипс-51-подобная киназа 2 (С. е1едапз) протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
иькз 25989 белок ϋΚΓΖΡ4346131 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
иьк4 54986 гипотетический белок ГЬЯ20574 протеинкиназа
νκκι 7443 связанная с коровьей оспой киназа 1 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
УКК2 7444 связанная с коровьей оспой киназа 2 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
УККЗ 51231 связанная с коровьей оспой киназа 3 протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ШК1 65125 протеинкиназа 1, дефицитная по лизину протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ШК4 65266 протеинкиназа 4, дефицитная по лизину протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ХРСС6ВР1 91419 ХКССб-связывающий белок 1; ХКСС6ВР1 протеинкиназа
ΧΥΒΒ 9942 гомолог ксилулокиназы (Н. 1п£1иепгае) углевод-киназа
ΥΕ51 7525 гомолог 1 онкогена вируса саркомы Ямагучи ч-уез-1 протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
ΥΞΚ4 80122 гипотетический белок ГЬЯ23074 протеинкиназа
ΖΑΚ 51776 киназа ΑΖΚ, содержащая стерильный альфа—мотив и «лейциновую застежку» протеинкиназа (ΝΚ5/ΤΚ)
ΖΑΡ70 7535 протеинкиназа 70 кДа, ассоциированная с зета-цепью (ТСК) протеинкиназа (ΝΚΤΚ)
Таблица 4. Ранжирование средней дифференциальной пролиферации (1 мкМ РЬХ4720/контроль) для 597 ОКЕ киназ относительно МЕК ΌΌ
Ранг Ген Среднее значение Стандартное отклонение Ζ-балл Примечания
- АЬЬ ОКЕЗ 44,26% 7,19% -
1 МЕК ΌΌ 100,00% 6, 54% 7,75 положительный контроль
2 ΚΑΕΙ 86,80% 18,00% 5,92
3 РККСЕ 74,76% 8,78% 4,24
4 МАРЗК8 67,51% 10,03% 3,23
5 РККСН 67,37% 17,56% 3,21
6 ЕСК 65,03% 20,76% 2,89
7 СККЬ 64,74% 19,66% 2,85
8 РАКЗ 60,33% 13,59% 2,23
9 АХЬ 59,75% 10,23% 2,15
10 ЬСК 59,47% 15,66% 2,11 летальный
11 ЕРВВ2 59,32% 9, 39% 2,09 2 ЗБ = 58,64%
12 ΡΚΚΟζ) 55,40% 11,97% 1,55
13 ΝΜΕ3 55,10% 15,46% 1,51
14 МОЗ 55,04% 11,84% 1,50
15 КНК 55,03% 14,75% 1,50
16 ТЬЕ1 54,65% 15,26% 1,44 пролиферативный
17 РККАС2 54,23% 7,15% 1,39
18 ЕОС914 61 53,75% 12,45% 1,32
19 ΤΥΚΟ3 53,64% 10,57% 1,30
20 СВКЗ 53,55% 13,92% 1,29
21 РЬМ2 53,36% 10,78% 1,27
22 СЬВ4 53,31% 12,21% 1,26
23 РРР32 53,24% 14,53% 1,25
- 39 030276
24 РККСВ1 53,12% 7,74% 1,23
25 АСУК1В 53,08% 9, 53% 1,23
26 ΕΤΝΚ2 52,85% 12,63% 1,19
27 ВТ КЗ 6 52,85% 15,28% 1,19
28 ΌΌΡ1 52,78% 15,54% 1,19
29 РККСА 52,47% 13,38% 1,14
30 ΑϋΡΚΒ 52,22% 11,80% 1,11
31 САМК4 52,14% 9, 09% 1,10
32 ВАРК1 51,94% 11,43% 1,07
33 Аиккс 51,89% 11,23% 1,0 6 пролиферативный
34 1СР1К 51,35% 10,70% 0,99
35 ΕΝ3Κ 51,27% 12,65% 0,97
36 ЕОС646505 50,97% 16,89% 0,93
37 Р1КЗСВ 50,90% 12,87% 0,92
38 ΥΕ31 50,68% 9, 51% 0,89
39 ЕОС340156 50,59% 14,63% 0,88
40 МАР4К5 50,57% 35,45% 0,88
41 АВЕ1 50,55% 19,09% 0,87
42 ΜΑΡ2Κ1ΙΡ1 50,47% 11,54% 0,86
43 РРКАР1В 50,34% 8,31% 0,84
44 КР36КА1 50,12% 12,28% 0,81
45 ТЗЗК6 50,10% 11,70% 0,81
46 ΝΕΚ9 50,04% 14,37% 0,80
47 ΌΡΟΙ 49,98% 12,07% 0,80
48 РТК6 49,93% 10,93% 0,79
49 ЗСУЕ2 49,85% 12,51% 0,78
50 ВТК 11 49,82% 12,10% 0,77
51 С9ог£98 49,82% 10,38% 0,77
52 РСК2 49,77% 12,93% 0,77
- 40 030276
53 ΝΤΡΚ2 49,77% 10,02% 0,77
54 ΤΡΙΜ2 7 49,69% 10,38% 0,75
55 ΕΝ3ΚΡΡ 49,69% 11,83% 0,75
56 САМК2И 49,61% 11,93% 0,74
57 АВРК2 49,56% 10,41% 0,74
58 ВОС652722 49,52% 13,10% 0,73
59 ВАТ32 49,49% 12,45% 0,73
60 ЗТКЗ 49,48% 10,15% 0,73
61 СВС42ВРС 49,44% 10,19% 0,72
62 НКВС1 49,44% 11,53% 0,72
63 СВК7 49,42% 14,45% 0,72 пролиферативный
64 ШК4 49,37% 14,07% 0,71
65 РРРЕ4В 49,36% 12,18% 0,71
66 МАРКАРК2 49,30% 12,83% 0,70
67 МЕК Ш 49,29% 14,33% 0,70 отрицательный контроль
68 РРР31 49,28% 12,09% 0,70
69 ВТК 49,22% 14,59% 0,69
70 ΜΥΟ3Β 49,19% 11,05% 0,69
71 ТЕЗК1 49,18% 12,19% 0,68
72 ΡΒΧΝΑ3 49,11% 9, 04% 0,67
73 СВК2 49,09% 8,01% 0,67
74 РРКРВ1 49,02% 14,04% 0,66
75 ΏΑΚ 49,00% 12,68% 0,66
76 ΙΤΡΚΒ 48,99% 16,62% 0,66
77 СНЕК1 48,98% 14,41% 0,66
78 МЕРТК 48,94% 12,88% 0,65
79 ΙΚΒΚΕ 48,83% 12,46% 0,63
80 САРВ11 48,83% 15,02% 0,63
- 41 030276
81 ΡΑΝΚ3 48,78% 9, 70% 0,63
82 ТКРВ2 48,76% 10,71% 0,63
83 СИС7 48,74% 9, 83% 0,62
84 Р1КЗСЗ 48,69% 12,05% 0,62
85 рреик 48,60% 11,29% 0,60
86 ЗСУРЗ 48,58% 10,86% 0,60
87 МАРЗК14 48,57% 8,10% 0,60
88 РОС730000 48,57% 13,36% 0,60
89 РОС442075 48,55% 10,75% 0,60
90 РОС54ЮЗ 48,50% 10,77% 0,5 9
91 ΝΡΚ2 48,49% 13,29% 0,59
92 СОР 4АЗВР 48,49% 11,10% 0,59
93 ΜΥΡΚ2 48,49% 11,83% 0,59
94 03ΝΚ2Β 48,48% 11,52% 0,59
95 САРКР 48,47% 9, 19% 0,58
96 ТР53РК 48,44% 14,25% 0,58 пролиферативный
97 ррксе 48,42% 8,31% 0,58
98 АРК 48,39% 14,07% 0,57
99 ΕΤΝΚ1 48,37% 11,25% 0,57
100 ΒΥΡΚ2 48,36% 11,80% 0,57
101 ΌΟΚΑ 48,31% 10,71% 0,56
102 ΑΌΡΟΚ 48,30% 13,36% 0,56
103 РККАВ2 48,29% 10,75% 0,56
104 ϋΡΚ3 48,28% 11,18% 0,56
105 ΚΙΑΑ2ΟΟ2 48,28% 12,39% 0,56
106 РРАКЗ 48,26% 10,96% 0,56
107 ΤΥΚ2 48,24% 10,88% 0,55
108 МАР2К7 48,23% 12,06% 0,55
109 ΝΚΒΡ 48,18% 13,40% 0,54
- 42 030276
110 СИК2 48,14% 14,65% 0,54
111 ΜΟΡΝ2 47,98% 11,36% 0,52
112 ЕРНВ4 47,92% 12,52% 0,51
113 ррксг 47,88% 12,68% 0,50
114 РЕК 47,85% 10,44% 0,50
115 РАСЕ 47,83% 10,46% 0,50
116 ЕОС91807 47,80% 11,25% 0,49
117 Р1КЗСС 47,76% 11,25% 0,49
118 Р1КЗС2С 47,74% 10,75% 0,48
119 арзс 47,71% 10,26% 0,48
120 СВЕШАН 47,66% 10,26% 0,47
121 АЕ32СР7 47,65% 11,56% 0,47
122 ΕΙΗ40852 47,62% 12,34% 0,47
123 ЕОС390877 47,61% 11,43% 0,46
124 ΤΡΙΒ1 47,59% 12,91% 0,46
125 ТРР 47,58% 13,00% 0,46
126 РР36КЕ1 47,57% 12,33% 0,46
127 ССРК 47,56% 10,28% 0,46
128 ΡΏΡΚ1 47,53% 10,42% 0,45
129 ΕΑ3ΤΚΏ5 47,52% 10,70% 0,45
130 СРКВЗ 47,49% 13,14% 0,45
131 ΏΤΥΜΚ 47,49% 10,60% 0,45
132 МРРЗ 47,47% 10,65% 0,45
133 НЗРВ8 47,46% 11,73% 0,44
134 ΝΜΕ6 47,44% 14,48% 0,44
135 ΝΕΚ3 47,42% 15,46% 0,44
136 ΡΙΚ3Ρ4 47,41% 11,14% 0,44
137 МСС16169 47,41% 13,90% 0,44
138 0ХЗР1 47,40% 11,68% 0,44
- 43 030276
139 МАЗ ТЕ 47,35% 10,28% 0,43
140 РЫСК 47,35% 10,15% 0,43
141 АВСК2 47,32% 15,57% 0,43
142 3ΝΧ16 47,26% 12,76% 0,42
143 ИСК 47,24% 23,41% 0,41
144 СВКВ2 47,21% 10,60% 0,41
145 ΝΕΚ11 47,20% 14,68% 0,41
146 ВМР2К 47,15% 11,18% 0,40
147 вив! 47,15% 11,76% 0,40
148 ΡΙΝΚ1 47,13% 11,38% 0,4 0
149 РВКЗ 47,08% 8,73% 0,39
150 ВОС732306 47,03% 8, 82% 0,39
151 РКВК 47,03% 12,10% 0,38
152 ΏΥΚΚ1Α 47,01% 12,69% 0,38
153 КР36КА4 47,01% 11,70% 0,38
154 веке 46,94% 12,71% 0,37
155 3ΌΚ5Κ1 46,93% 9, 40% 0,37
156 ЕВЕ25ОО6 46,87% 11,64% 0,36
157 РВК 46,86% 14,05% 0,36
158 АСУК1С 46,82% 9, 98% 0,35
159 ЕВТ1 46,78% 10,42% 0,35
160 ΡΒΧΝΑ4Β 46,76% 9, 39% 0,35
161 МУК 46,71% 9,26% 0,34
162 ΒΙΜΚ2 46,70% 11,29% 0,34
163 ΒΥΚΚ1Β 46,68% 20,75% 0,34
164 МАККЗ 46,67% 11,71% 0,34 пролиферативный
165 ВМРК1В 46,66% 12,24% 0,33
166 ΝϋΡ62 46,63% 9, 92% 0,33
167 σΑΚ2 46,62% 12,50% 0,33
44
030276
168 МАРК12 46,55% 9, 98% 0,32
169 ВВР2 46,54% 7, 99% 0,32
170 МАК 46,52% 15,42% 0,31
171 СВУСТК 46,50% 13,19% 0,31
172 АК1 46,47% 9, 68% 0,31
173 МАРК15 46,47% 11,14% 0,31
174 МАЗТ1 46,45% 10,77% 0,30
175 РАР332 46,39% 11,53% 0,30
176 СЗЕ1К 46,34% 12,86% 0,29
177 ТРК1 46,29% 9, 52% 0,28
178 РАК4 46,24% 9, 98% 0,28
179 ΝΑ3Κ 46,21% 12,34% 0,27
180 СИК8 46,20% 7, 68% 0,27
181 ЗТК40 46,19% 12,92% 0,27
182 С1В1 46,10% 10,92% 0,26
183 РВК1 46,08% 9, 99% 0,25
184 ΡΡσ23356 46,04% 10,45% 0,25
185 ВОС220 68 6 46,04% 9, 31% 0,25
186 РРКАВ1 46,03% 12,00% 0,25
187 ДАКЗ 46,02% 10,17% 0,24
188 ΝΜΕ1 46,02% 13,01% 0,24
189 ΝΜΕ5 46,00% 11,53% 0,24
190 ЕЕР 45,97% 9, 92% 0,24
191 АКЗВ1 45,97% 10,39% 0,24
192 РРКС2 45,90% 13,24% 0,23
193 РР6213Н19.1 45,88% 12,83% 0,22
194 АКТЗ 45,87% 11,32% 0,22
195 РЗКН1 45,86% 10,16% 0,22
45
030276
196 РККАК2В 45,84% 13,05% 0,22
197 рик 45,81% 10,94% 0,22
198 АВСК4 45,79% 11,25% 0,21
199 ТЕС 45,78% 11,46% 0,21
200 РККАС1 45,77% 11,08% 0,21
201 ΕΧΝ 45,77% 12,03% 0,21
202 ААК1 45,68% 11,49% 0,20
203 САМК2В 45,67% 19,84% 0,20
204 С0А5У 45,64% 11,07% 0,19
205 РРКАСЗ 45,63% 10,21% 0,19
206 ΝΜΕ7 45,58% 10,18% 0,18
207 ВМТК2 45,58% 12,15% 0,18
208 ΡΑΝΚ2 45,57% 11,72% 0,18
209 РРКВЗ 45,47% 13,14% 0,17
210 РНКА2 45,47% 10,92% 0,17
211 5 РАМЕ 6 45,46% 9, 67% 0,17
212 5КРК1 45,46% 12,54% 0,17
213 ΗΙΡΚ1 45,42% 12,59% 0,16
214 ЕРНА1 45,39% 10,59% 0,16
215 ШК1 45,38% 13,79% 0,15
216 ΡΏΙΚΙΒ 45,33% 12,31% 0,15
217 ВМР2КВ 45,33% 10,08% 0,15
218 МАРЗК5 45,32% 14,13% 0,15
219 ЕРНА2 45,30% 12,87% 0,14
220 ССВ2 45,29% 9, 71% 0,14
221 ΒΌΚΒΙ 45,25% 10,13% 0,14
222 ΝΕΜυ-ΡΙ 45,23% 8,13% 0,13
223 ВОС652799 45,18% 10,30% 0,13
224 еик! 45,15% 12,23% 0,12
- 46 030276
225 ΝΜΕ4 45,12% 13,03% 0,12
226 Υ3Κ4 45,11% 13,47% 0,12
227 ΝΕΚ2 45,11% 9, 38% 0,12
228 С9ог£95 45,10% 9, 38% 0,12
229 СЕ С 2 45,05% 11,95% 0,11
230 ЕСЕК2 45,01% 11,23% 0,10
231 ΙΡΜΚ 44,98% 10,67% 0,10
232 ЗТК32С 44,98% 12,10% 0,10
233 ΡΙΡ5Κ2Α 44,92% 14,55% 0,09
234 РРКХ 44,90% 10,44% 0,0 9
235 ТКРМ7 44,80% 10,36% 0,07
236 ЕЕЛ098 6 44,74% 10,95% 0,07
237 3ΝΕ1ΒΚ 44,74% 12,70% 0,07
238 МАР3Кб 44,71% 9, 75% 0,06
239 ЕСС653052 44,70% 14,56% 0,06
240 ΙΡΑΚ2 44,69% 11,61% 0,06
241 ΧΥΕΒ 44,68% 11,47% 0,06
242 РТК7 44,67% 14,55% 0,06
243 ΡΚΜΥΤ1 44,66% 13,74% 0,05
244 ЗРНК2 44,63% 10,35% 0,05
245 ΝΜΕ2 44,63% 11,57% 0,05
246 РККАА1 44,62% 15,03% 0,05
247 МАРК14 44,60% 10,77% 0,05
248 ΝΤΚΚ3 44,58% 13,43% 0,04
249 РККАСВ 44,58% 9, 30% 0,04
250 ВОС650122 44,56% 11,24% 0,04
251 СЕК6 44,51% 10,74% 0, 03
252 АМНР2 44,48% 11,11% 0,03
253 ΙΡΡΚ 44,42% 10,63% 0,02
- 47 030276
254 АК7 44,41% 10,36% 0,02
255 ΡΙΡ5ΚΒ1 44,36% 11,74% 0,01
256 ВОС340371 44,30% 16,04% 0,01
257 ΒΚΕΖρ434Β 1231 44,29% 12,21% 0,00
258 ΡΡΚΑΑ2 44,28% 11,42% 0,00
259 ΕΑΒΤΚΏΙ 44,28% 10,73% 0,00
260 АКАЕ 44,27% 14,40% 0,00 семейство КАР
261 НКЗ 44,26% 14,83% 0,00
262 КЗР2 44,25% 10,28% 0,00
263 РАК7 44,24% 18,45% 0,00
264 СТЕ2Н1 44,23% 10,90% 0,00
265 РР36КВ2 44,23% 9, 32% -0,01
266 РАК6 44,21% 13,83% -0,01
267 ΙΡΑΚ4 44,18% 10,27% -0,01
268 ΝΡΚ 44,18% 12,92% -0,01
269 ΕΥΝ 44,14% 12,43% -0,02
270 ΒΜΡΚ2 44,14% 12,20% -0,02
271 СВК4 44,13% 10,47% -0,02
272 3ΤΚ32Α 44,07% 13,93% -0,03
273 ΤΝΚ1 44,06% 10,80% -0,03
274 3ΤΚ24 43,99% 10,79% -0,04
275 ϋ3ΝΚ2Α1 43,99% 11,97% -0,04
276 ΑΚ3 43,98% 11,16% -0,04
277 ΤΤΚ 43,93% 10,47% -0,05
278 РСК2 43,91% 13,31% -0,05
279 САВК1 43,89% 10,14% -0,05
280 ΌΥΡΚ3 43,89% 9, 32% -0,05
281 ΕΙΕ2ΑΚ4 43,83% 11,00% -0,06
- 48 030276
282 РВК1 43,79% 13,31% -0,07
283 ΕΙΕ2ΑΚ1 43,79% 12,02% -0,07
284 РККАСС 43,79% 11,37% -0,07
285 ΒϋΒΙΒ 43,74% 10,69% -0,07
286 РКМ2 43,74% 14,46% -0,07
287 ВРРРРС 43,64% 10,87% -0,09
288 ЕРНА6 43,63% 12,60% -0,09
289 НК2 43,58% 12,55% -0,10
290 МЕТ 43,55% 10,99% -0,10
291 СК32 43,53% 7,83% -0,10
292 ВОС375133 43,53% 10,05% -0,10
293 ΒΙΜΚ1 43,52% 12,43% -0,10
294 Т71Е2 43,50% 11,71% -0,11
295 РСТК2 43,47% 12,02% -0,11
296 В САКВ 43,43% 11,61% -0,12
297 ΡΒΧΝΒ2 43,41% 11,85% -0,12
298 МЗТ1Р 43,35% 11,99% -0,13
299 РККАК1А 43,35% 9, 03% -0,13
300 3ΕΡΗ32 43,32% 9, 68% -0,13
301 ЗРНК1 43,31% 9, 87% -0,13
302 ССР 4 43,30% 11,83% -0,13
303 ΚΙΑΑ0999 43,28% 9, 68% -0,14
304 РВСЕКВ 43,23% 11,93% -0,14
305 ВРЗК1 43,21% 14,17% -0,15
306 ВРАЕ 43,21% 12,56% -0,15 семейство КАР
307 мизк 43,20% 11,03% -0,15
308 ΤΝΝΙ3Κ 43,20% 10,46% -0,15
309 екг 43,18% 15,15% -0,15
310 СКВ 43,14% 9, 45% -0,16
- 49 030276
311 Ώ6ΚΒ 43,12% 11,62% -0,16
312 ВОС648152 42,99% 11,15% -0,18
313 РР36КА5 42,87% 11,23% -0,19
314 САЗК 42,87% 12,05% -0,19
315 РНКА1 42,86% 10,10% -0,20
316 АК2 42,84% 9, 83% -0,20
317 ΡΙΜ1 42,81% 14,09% -0,20
318 ΖΑΡ7Ο 42,81% 12,10% -0,20
319 ΡΝΚΡ 42,79% 12,95% -0,20
320 сркю 42,78% 9, 77% -0,21
321 СНЕК2 42,77% 12,86% -0,21
322 САМК2А 42,72% 11,68% -0,21
323 САМК2С 42,70% 9, 66% -0,22
324 ΑΒΡΒΚ2 42,70% 12,56% -0,22
325 ΝΕΚ8 42,69% 9, 88% -0,22
326 ΡΡΚΡ 42,69% 10,65% -0,22
327 СНКА 42,66% 12,84% -0,22
328 АСУРВ1 42,65% 10,85% -0,22
329 ΡΡΚΥ 42,63% 11,80% -0,23
330 ΤΡΙΒ3 42,62% 11,45% -0,23
331 ΡΡΚΒ2 42,59% 10,48% -0,23
332 ΡΙΡ5Κ3 42,57% 9, 78% -0,24
333 ВОС727761 42,56% 14,17% -0,24
334 ΡΤΚ2Β 42,50% 15,72% -0,25
335 ΜΡΡ2 42,48% 10,73% -0,25
336 СЗЫК1А1 42,47% 13,54% -0,25
337 ΡΤΚ9 42,42% 11,31% -0,26
338 3ΤΚ25 42,41% 12,54% -0,26
339 РЕКЕ 42,39% 12,01% -0,26
- 50 030276
340 ЗТК19 42,35% 11,20% -0,27
341 ΡΙ4ΚΙΙ 42,30% 14,04% -0,27
342 НК1 42,26% 12,73% -0,28
343 ликкл 42,21% 14,80% -0,29
344 СК5 42,21% 10,98% -0,29
345 МАРЗК7 42,20% 13,13% -0,29
346 РРТК1 42,18% 12,49% -0,29
347 ΕΚΝ1 42,17% 13,74% -0,29
348 ЗТКЗЗ 42,17% 13,22% -0,29
349 ЗУК 42,13% 12,42% -0,30
350 САВК2 42,13% 11,34% -0,30
351 ТЗЗК1 42,12% 11,98% -0,30
352 МАРК6 42,11% 10,58% -0,30
353 Α33ΙΖ 42,07% 10,61% -0,30
354 РРКР 42,07% 14,99% -0,31
355 РХК 42,05% 14,69% -0,31
356 ΡΙ4Κ2Β 42,05% 11,84% -0,31
357 Р1Р5К2С 42,02% 9, 50% -0,31
358 РРКРВЗ 42,00% 12,79% -0,31
359 ТЗЗКЗ 41,97% 14,82% -0,32
360 МРР6 41,97% 12,68% -0,32
361 МРР4 41,87% 12,27% -0,33
362 ВОС653155 41,85% 11,50% -0,34
363 АВРК1 41,82% 12,37% -0,34
364 3ΌΚ9 41,76% 10,32% -0,35
365 ΡΌΚ3 41,66% 10,87% -0,36
366 СКМТ2 41,66% 12,57% -0,36
367 САМК1С 41,63% 12,06% -0,37
368 МАРКАРКЗ 41,61% 13,19% -0,37
- 51 030276
369 Р1К4СВ 41,55% 14,29% -0,38
370 РКР31В1 41,54% 11,08% -0,38
371 РАЗТК 41,49% 12,56% -0,39
372 САМКШ 41,49% 11,54% -0,39
373 МАР.К2 41,48% 14,28% -0,39
374 ΡΏΚ4 41,43% 13,43% -0,39
375 ΝΕΚ7 41,36% 9, 57% -0,40
376 МАРК4 41,34% 10,83% -0,41
377 Р1К4СА 41,32% 11,99% -0,41
378 σΑΚΙ 41,31% 11,56% -0,41
379 ΡΏΧΚ 41,30% 11,93% -0,41
380 ТСРВР2 41,25% 15,85% -0,42
381 РНКВ 41,25% 10,81% -0,42
382 ивкг 41,24% 15,35% -0,42
383 ΜΚΝΚ1 41,21% 13,08% -0,42
384 СВС2В6 41,17% 10,91% -0,43
385 СЗЫК1СЗ 41,13% 10,53% -0,44
386 САМК1 41,08% 11,68% -0,44
387 Β3ΚΖ 41,07% 12,69% -0,44
388 зек 40,91% 11,92% -0,47
389 ТВК1 40,83% 14,81% -0,48
390 ΙΒΚ 40,81% 12,62% -0,48
391 3ΤΚ32Β 40,80% 11,79% -0,48
392 ΤΧΝΌ33 40,78% 12,24% -0,48
393 КР36КВ1 40,72% 10,13% -0,49
394 ΖΑΚ 40,71% 10,32% -0,49
395 ΒΥΚΚ4 40,66% 12,59% -0,50
396 1ТСВ1ВРЗ 40,57% 11,99% -0,51
397 МРР1 40,53% 10,94% -0,52
- 52 030276
398 ΗΙΡΚ2 40,49% 11,06% -0,52
399 МАРК13 40,46% 12,06% -0,53
400 ТК1 40,39% 11,04% -0,54
401 ЗНЗВР4 40,36% 12,11% -0,54
402 СКМ 40,29% 12,70% -0,55
403 ЕСЕРВ1 40,23% 16,94% -0,56
404 МАРК10 40,23% 12,29% -0,56
405 САВМ2 40,16% 8, 64% -0,57
406 САЕМЗ 40,12% 11,85% -0,58
407 3ΤΥΚ1 40,09% 11,47% -0,58
408 СВКВ4 40,08% 11,01% -0,58
409 ΝΑΌΚ 40,08% 11,89% -0,58
410 МРР7 40,06% 11,72% -0,59
411 САМКУ 40,03% 12,16% -0,59
412 ЕХСЗС1О 40,02% 12,78% -0,59
413 С В КВ 5 39,98% 10,10% -0,60
414 3ΤΚ38 39,90% 9, 61% -0,61
415 ΙΝ3ΚΚ 39,90% 15,08% -0,61
416 РСК 39,86% 10,23% -0,61
417 ТВК2 39,80% 14,66% -0,62
418 РСТКЗ 39,66% 10,48% -0,64
419 ВОС388957 39,65% 10,97% -0,64
420 РАР331 39,59% 13,48% -0,65
421 АСУР2В 39,56% 14,70% -0,65
422 ΝΜΕ1-ΝΜΕ2 39,53% 12,01% -0,66
423 ΝΕΚ1Ο 39,50% 13,78% -0,66
424 МАРЗК11 39,47% 9, 33% -0,67
425 РМУК 39,46% 10,19% -0,67
426 МАРК9 39,45% 12,74% -0,67
- 53 030276
427 ΜΚΝΚ2 39,39% 13,54% -0,68
428 СКК7 39,34% 14,98% -0,68
429 ΚΙΟΚ2 39,27% 11,79% -0, 69
430 ОСКК 39,27% 9, 02% -0,69
431 АСУ ΚΙ 39,15% 13,96% -0,71
432 ТЕК1 39,11% 15,46% -0,72
433 ΣΑΤ31 39,05% 10,46% -0,73
434 5 СУК 1 39,01% 11,41% -0,73
435 ТЕЗК2 38,93% 13,30% -0,74
436 ΏβϋΟΚ 38,90% 14,54% -0,7 5
437 РСК1 38,87% 12,26% -0,75
438 МАС11 38,87% 12,66% -0,75
439 3ΝΚΚ 38,79% 11,61% -0,76
440 САКМ1 38,65% 10,26% -0,78
441 ΚΣΟΚ1 38,58% 12,39% -0,79
442 ЕЕЕ2К 38,56% 11,96% -0,79
443 МАРК8 38,45% 10,51% -0,81
444 33ΝΚ1Ώ 38,44% 15,60% -0,81
445 ϋΚΚ4 38,42% 12,02% -0,81
446 3ΤΚ38Σ 38,33% 12,63% -0,83
447 ΚΙΟΚ3 38,21% 12,80% -0,84
448 ΜΙΝΚ1 38,00% 14,94% -0,87
449 КОК2 37,95% 15,32% -0,88
450 РТК2 37,93% 10,59% -0,88
451 ΡΙΚ3Κ5 37,84% 13,17% -0,89
452 ΑΣΏΗ18Α1 37,81% 15,66% -0,90
453 ΝΥΏ-3Ρ25 37,79% 13,52% -0,90
454 МАР4КЗ 37,76% 9, 58% -0,90
455 АСК 37,61% 13,89% -0,92
- 54 030276
456 СЗКЗА 37,56% 14,44% -0,93
457 ВМРК1А 37,56% 16,10% -0,93
458 ЗТК16 37,53% 11,09% -0,94
459 ΡΑ3ΤΚΏ2 37,50% 8,53% -0,94
460 МАР4К4 37,39% 15,68% -0,96
461 ВРР.К2 37,38% 10,11% -0,96
462 тсрврз 37,33% 11,04% -0,96
463 РВСЕРВ 37,29% 16,90% -0,97
464 ввез 37,09% 12,08% -1,00
465 РРКРВ2 36,99% 10,37% -1,01
466 АКТ1 36,66% 13,43% -1,06
467 РККС1 36,54% 11,44% -1,07
468 ΝΕΚ4 36,50% 13,19% -1,08
469 РККВ1 36,45% 14,57% -1,09
470 ЗКРК2 36,37% 12,38% -1,10
471 ЗНЗВР5 36,37% 17,17% -1,10
472 СВК1 36,06% 11,13% -1,14
473 ек 35,86% 17,33% -1,17
474 ΙΗΡΚ1 35,53% 12,15% -1,21
475 ΙΗΡΚ3 35,48% 9, 30% -1,22
476 ΡΒΑϋ 35,36% 13,10% -1,24
477 ТАОКЗ 35,29% 14,78% -1,25
478 РАК2 35,20% 12,51% -1,26
479 вмх 35,12% 12,94% -1,27
480 ВАРК2 35,01% 13,92% -1,29
481 СЗЕВК1Е 34,83% 15,21% -1,31
482 МАРКЗ 34,75% 19,93% -1,32 летальный
483 МАРЗК15 34,40% 16,76% -1,37 летальный
484 МРР5 34,35% 11,80% -1,38
- 55 030276
485 МАЗТ2 34,08% 16,10% -1,42
486 СКК6 34,04% 15,82% -1,42
487 ΰΚΡΖρ761Ρ 0423 33,93% 13,58% -1,44
488 νρκι 33,87% 9,28% -1,45
489 РСАМКР2 33,77% 11,96% -1,46
490 ΙΗΡΚ2 33,75% 9,56% -1,46
491 ΜΑΤ К 33,44% 10,25% -1,51
492 ΡΡ2 33,20% 13,41% -1,54
493 ΜΑΡ2Κ2 32,98% 15,34% -1,57
494 иск2 32,82% 13,75% -1,59
495 ΝΕΚ6 32,74% 15,85% -1,60
496 РРКС1 32,52% 14,60% -1, 63
497 ΜΑΡ3Κ12 32,49% 15,33% -1,64
498 РСТК1 32,48% 13,21% -1,64
499 МСС42105 32,36% 13,85% -1,66
500 МАР2Кб 32,32% 11,92% -1,66
501 ЗНЗВР5В 32,11% 15,55% -1,69
502 ЕЕЗ 32,07% 11,04% -1,70
503 ΚΚΗΏ3 31,89% 12,45% -1,72
504 РРКАСА 31,76% 18,45% -1,74 летальный
505 МАР4К1 31,51% 13,69% -1,77
506 СЗЫК1С1 30,32% 14,90% -1,94
507 МАРКАРК5 30,15% 13,47% -1,96
508 СЗК 29,83% 14,11% -2,01 летальный
509 ΒΡΌ3 29,16% 8,83% -2,10
510 ΑΌΡΒΚ1 29,00% 16,93% -2,12
511 ВКЗК2 28,64% 13,09% -2,17
512 αόεκι 28,30% 13,52% -2,22
- 56 030276
513 ϋ3ΝΚ1<32 26,81% 14,42% -2,43
514 СКМТ1А 26,80% 12,42% -2,43
515 Τ33Κ2 25,66% 13,30% -2,59 летальный
516 СВ2 25,01% 14,99% -2,68
517 ΡΙΡ5Κ1Α 24,76% 15,49% -2,71
518 РНКС1 23,31% 14,24% -2,91
519 ΑΒΒ2 низкий выход ДНК рЬХ
520 АСУР2А низкий выход ДНК рЬХ
521 ΒΒΚ низкий выход ДНК рЬХ
522 СВС2В1 низкий выход ДНК рЬХ
523 ЕСЕР низкий выход ДНК рЬХ
524 ΕΡΗΑ3 низкий выход ДНК рЬХ
525 ΕΡΗΒ1 низкий выход ДНК рЬХ
526 ΕΡΒΒ4 низкий выход ДНК рЬХ
527 ΕΑ3ΤΚΌ3 низкий выход ДНК рЬХ
528 ЕСЕР1 низкий выход ДНК рЬХ
529 ΕΒΤ3 низкий выход ДНК рЬХ
530 ΕΒΤ4 низкий выход ДНК рЬХ
531 ΗΙΡΚ3 низкий выход ДНК рЬХ
532 Κ3Ρ низкий выход ДНК рЬХ
533 ΒΥΝ низкий выход ДНК рЬХ
534 ΡΑΝΚ4 низкий выход ДНК рЬХ
535 ΡΌΟΕΡΑ низкий выход ДНК рЬХ
536 ΡΒΚ4 низкий выход ДНК рЬХ
537 ΡΕΤ низкий выход ДНК рЬХ
538 зекз низкий выход ДНК рЬХ
539 ЗРС низкий выход ДНК рЬХ
540 τχκ низкий выход ДНК рЬХ
- 57 030276
541 ΒΚΏ4 неопределенная эффективность <70%
542 САМКК2 неопределенная эффективность <70%
543 СК51В неопределенная эффективность <70%
544 СВКЗ неопределенная эффективность <70%
545 ΏΑΡΚ3 неопределенная эффективность <70%
546 ЕРНА4 неопределенная эффективность <70%
547 ЕРНВ6 неопределенная эффективность <70%
548 ЕСЕКЗ неопределенная эффективность <70%
549 ЕКК неопределенная эффективность <70%
550 еск неопределенная эффективность <70%
551 СЫЕ неопределенная эффективность <70%
552 ΗΙΡΚ4 неопределенная эффективность <70%
553 ΙΤΚ неопределенная эффективность <70%
554 КВК неопределенная эффективность <70%
555 ВОС389599 неопределенная эффективность <70%
556 ВОС649288 неопределенная эффективность <70%
557 МАРЗК2 неопределенная эффективность <70%
558 ΝΕΚ5 неопределенная эффективность <70%
559 ΝΤΚΚ1 неопределенная эффективность <70%
- 58 030276
560 ΡΑΚΙ неопределенная эффективность <70%
561 РНКС2 неопределенная эффективность <70%
562 Р1КЗСА неопределенная эффективность <70%
563 ΡΙΚ3Ρ3 неопределенная эффективность <70%
564 ΡΙΡ5Κ1Β неопределенная эффективность <70%
565 ΡΙΡΚ1 неопределенная эффективность <70%
566 ΡΙΡΚ2 неопределенная эффективность <70%
567 ΡΡ36ΚΑ2 неопределенная эффективность <70%
568 РР36КС1 неопределенная эффективность <70%
569 3ΤΚ17В неопределенная эффективность <70%
570 ТСЕВР1 неопределенная эффективность <70%
571 инмк! неопределенная эффективность <70%
572 ХРСС6ВР1 неопределенная эффективность <70%
573 в скок 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
574 С1ог£57 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
575 САМКК1 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
576 СРС2В2 5ΤΌΕν (стандартное отклонение) для повторностей
577 СВК5 5ΤΌΕν (стандартное отклонение) для повторностей
578 ЕРВВЗ 5ΤΌΕν (стандартное отклонение) для повторностей
- 59 030276
579 С8С2 5ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
580 РОС647279 5ΤΟΕν (стандартное отклонение) для повторностей
581 ΡΥΚ5 5ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
582 ΜΆΡΚ1 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей летальный
583 МАР2К5 5ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
584 МАР4К2 ΕΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
585 ΝϋΑΚ2 ΕΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
586 ΡΌΚ2 ΒΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей летальный
587 ΡΡΚΜ. ЗТОЕУ (стандартное отклонение) для повторностей
588 ΡΙΚ3Ρ1 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
589 РЬК2 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
590 РККАК2А ЗТПЕУ (стандартное отклонение) для повторностей
5 91 ΚΡ36ΚΑ3 5ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
592 РР56КА6 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
593 5СК2 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
594 ЗРРКЗ 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
595 νκκι 3ΤΟΕΥ (стандартное отклонение) для повторностей
596 УКК2 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
5 97 УККЗ 3ΤϋΕν (стандартное отклонение) для повторностей
- 60 030276
Таблица 5. Результаты вторичного скрининга, количественно определяющего изменение значения О150 РБХ4720, индуцированного 9 основными кандидатами ОКР резистентности
Вторичный скрининг
А375
5КМЕЬ28
Ген 61бо (мкМ) Кратное изменение ΟΙ50 Номер Ген 01бо (мкМ) Кратное изменение 01бо Номер
МАРЗК8 >100,0 598 1 МАРЗК8 >100,0 -100 1
КАР1 >100,0 598 2 КАР1 >10,0 >10 2
СККР >10,0 59,8 3 СККВ 9,7 9,7 3
рек >10,0 59,8 4 рек 5 5 4
РККСЕ 4,41 26,4 5 РККСН 2,26 2,26 5
РККСН 4,14 24,7 6 РККСЕ 1,91 1,91 6
ЕКВБ2 1,33 7,95 7 АХР 1,18 1,18 7
АХЪ 1 5,98 8 ЕКВВ2 1 1 8
ΡΆΚ3 0,4934 2,95 9 ΡΆΚ3 0,9041 0,9041 9
Контроли Контроли
Моек
МЕК1
МЕК ΏΏ
0,1528
0,1671
4,8
0,91
1
28
(-)
(+)
Моек
МЕК1
0,5287
1
8,29
1,89
1
8,29
(-)
(+)
Таблица 6. Характеристики пациента
Пациент Ткань Возраст (годы) Пол Положение биопсии Время с момента постановки первичного диагноза (годы) Время с момента постановки диагноза метастазов (годы) Ответ Статус по ВКАР (до лечения) Статус по ВКАР (на момент лечения/ после ответа) Статус по ΝΚΑ5 Статус по ККА5 Статус по рМЕК Статус по рЕКК
РН биопсия 49 Женщина Спина 5 3 Частичный У600Е Ν/Α Ν/Α Ν/Α Ν/Α Ν/Α
ткани ответ
Р12 биопсия 67 Мужчина Спина 2 0 Частичный У600Е Ν/Α Ν/Α Ν/Α Ν/Α Ν/Α
ткани ответ
би и ИЯ Частичный
Ρί3 68 Мужчина Нога 11 0 У600Е Ν/Α Ν/Α Ν/Α Ν/Α Ν/Α
ткани ответ
мм-к биопсия 38 Мужчина Подмышечная 0 0 Частичный У600Е У600Е АУТ АУТ * *
ткани впадина ответ
Кратко- Подмышечный Стабильное КеТ
М3 07 временная 59 Мужчина лимфатический 4 4 заболевание У600Е У600Е Ν/Α Ν/Α (14) **
культура узел
* см. фиг. 20
** см. фиг. 3£
Ν/А - данные отсутствуют \Т - дикий тип
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> Оагга^ау, Ьеуг А. 1оЬаппеззеп, Согу М.
<120> СПОСОБЫ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ РАКА У ПАЦИЕНТОВ, У КОТОРЫХ ИМЕЕТСЯ ИЛИ
РАЗВИВАЕТСЯ РЕЗИСТЕНТНОСТЬ К ПЕРВОЙ ТЕРАПИИ РАКА
<130> 14293/79 (80)
<150> ϋδ 61/312,193
<151> 2010-03-09
<150> ϋδ 61/312,519
<151> 2010-03-10
- 61 030276
<150> и§ 61/326,021
<151> 2010-04-20
<150> и§ 61/415,569
<151> 2010-11-19
<160> 17
<170> Ра1еп11п уегеюп 3.5
<210> 1
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетический прямой праймер СОТ
<400> 1
сааддаада дссадсадй ΐ
21
<210> 2
<211> 22
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетический обратный праймер СОТ
<400> 2
дсаадсаай сс1ссасад11с
22
<210> 3
<211> 22
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетический прямой праймер ТВР
<400> 3
сссдааасдс сдаа1а1аа1 сс
22
<210> 4
<211> 22
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетический обратный праймер ТВР
<400> 4
дайдйсб саскйддс 1с
<210> 5 <211> 19 <212> ДНК
22
- 62 030276
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетический прямой праймер СЛРБН
<400> 5
са1са1с1с1 дссссс1с1 19
<210> 6
<211> 20
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетический обратный праймер СЛРБН
<400> 6
удусыаус а§П§ёХёёХ 20
<210> 7
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция 8ЙРНК зЬЬис
<400> 7
сйсдаааЛ (ссдИсдД ΐ 21
<210> 8
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция 8ЙРНК 8ЙВКЛР(1)
<400> 8
сйсдаааЛ (ссдИсдД ΐ 21
<210> 9
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция 8ЙРНК 8ЙВКЛР(2)
<400> 9
дЛддШсс ааасададда ΐ 21
<210> 10
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
- 63 030276
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция 8кРНК 8кСКАЕ(1)
<400> 10
сддада(дй дсад!ааада ΐ 21
<210> 11
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция ккРНК §кСКАЕ(2)
<400> 11
дадаса(даа а1ссаасаа1 а 21
<210> 12
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция 8кРНК 8кМЕК1(1)
<400> 12
дайаса(ад (саасдадсс ΐ 21
<210> 13
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция 8ЙРНК 8ЙМЕК1(2)
<400> 13
дскс1а(дд 1дсдйс(ас а 21
<210> 14
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция 8ЙРНК 8ЙМЕК2(1)
<400> 14
1ддас1а1а1 1д(даасдад с 21
<210> 15
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция 8ЙРНК 8ЙМЕК2(2)
- 64 030276
<400> 15
ссааса!сс1 сд!даас!с1 а 21
<210> 16
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция кЬРНК §БСОТ(1)
<400> 16
саададссдс адасс!ас!а а 21
<210> 17
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> синтетическая ДНК-конструкция 8ЙРНК §БСОТ(2)
<400> 17
да!дадаа!д 1дасс1йаа д 21

Claims (1)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Способ идентификации индивида, который страдает раком, для которого должно быть эффективно лечение комбинированной терапией ингибитором КАЕ и ингибитором МЕК, сКАЕ, СгкЬ или ТРЬ2/СОТ, включающий определение числа копий генов, уровня мРНК или белка либо уровня фосфорилирования одной или более киназ-мишеней, выбранных из МАР3К8 (ТРЬ2/СОТ), СККЬ (СгкЬ), ЕОК (Едг), РККСЕ (Ргксе), РККСН (Ргксй), ЕКВВ2 (ЕгЬВ2), АХЬ (Ах1) или РАК3 (Рак3), в раковых клетках, полученных от индивида, и сравнение полученных данных с числом копий генов, уровнем мРНК или белка либо уровнем фосфорилирования киназы-мишени в клетках, полученных от индивида, который не страдает раком; причем увеличение числа копий генов, уровня мРНК или белка либо уровня фосфорилирования киназы-мишени в клетках индивида, который страдает раком, по сравнению с клетками от индивида, который не страдает раком, указывает на индивида, для которого должно быть эффективно лечение комбинированной терапией.
    2. Способ по п.1, дополнительно включающий анализ образца нуклеиновой кислоты, полученного из раковых клеток, на наличие мутантной молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид ВКАЕ, с мутацией в положении 600, причем наличие мутантной молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид В-КАЕ, указывает на индивида, страдающего раком, для которого будет эффективно лечение комбинированной терапией.
    3. Способ по п.2, в котором указанная мутация в положении 600 представляет собой У600Е.
    4. Способ по п.1, включающий анализ числа копий гена, уровня мРНК и белка МАР3К8 (ТРЬ/СОТ).
    5. Способ по п.1, в котором ингибитор КАЕ представляет собой ингибитор В-КАЕ или ингибитор пан-КАЕ.
    6. Способ по п.1, в котором ингибитор КАЕ выбран из КАЕ265, сорафениба, 8В590885, РЬХ4720, РБХ4032, ОИС-0879 и 2М336372.
    7. Способ по п.1, в котором индивид имеет врожденную резистентность к ингибитору КАЕ или у него имеется вероятность развития резистентности к ингибитору КАЕ.
    8. Способ по п.1, в котором рак выбран из меланомы, рака молочной железы, колоректальных раков, глиомы, рака легких, рака яичников, саркомы и рака щитовидной железы.
    9. Способ по п.8, в котором рак является меланомой.
    10. Способ лечения рака у индивида, нуждающегося в этом, причем рак имеет активированную киназу в клетках рака индивида, включающий
    - 65 030276
    определение числа копий генов, уровня мРНК или белка либо уровня фосфорилирования одной или более киназ-мишеней, выбранных из МАР3К8 (ТРЬ2/СОТ), СККЬ (СгкЬ), ЕОК (Е§г), РККСЕ (Ргксе), РККСН (РгксЬ), ЕКВВ2 (ЕгЬВ2), АХЬ (Ах1) или РАК3 (Рак3), в раковых клетках, полученных от индивида, и сравнение полученных данных с числом копий генов, уровнем мРНК или белка либо уровнем фосфорилирования киназы-мишени в клетках, полученных от индивида, который не страдает раком, для идентификации активированной киназы-мишени в клетках рака; и
    введение индивиду с увеличенным числом копий генов, уровнем мРНК или белка либо уровнем фосфорилирования киназы-мишени в раковых клетках эффективного количества ингибитора КАЕ и эффективного количества ингибитора МЕК или ингибитора ТРЬ2/СОТ.
    11. Способ по п.10, в котором у индивида имеются раковые клетки, содержащие мутацию в полипептиде В-КАЕ.
    12. Способ по п.11, в котором у индивида имеются раковые клетки, содержащие мутацию У600Е в полипептиде В-КАЕ.
    13. Способ по п.10, в котором ингибитор КАЕ выбран из КАЕ265, сорафениба, 8В590885, РЬХ4720, РЬХ4032, ОЭС-0879 и 2М336372.
    14. Способ по п.10, в котором ингибитор МЕК выбран из СЕ1040/РП184352; А2П6244; РО318088; РО98059; РО334581; КОЕА119; 6-метокси-7-(3-морфолин-4-илпропокси)-4-(4-феноксифениламино)хинолин3- карбонитрила и 4-[3 -хлор-4-(1-метил-1 Н-имидазол-2-илсульфанил)фениламино]-6-метокси-7-(3-морфолин4- илпропокси)хинолин-3 -карбонитрила.
    15. Способ по п.10, в котором индивид имеет вероятность развития резистентности к ингибитору
    КАЕ.
    16. Способ по п.10, в котором рак выбран из меланомы, рака молочной железы, колоректальных раков, глиомы, рака легких, рака яичников, саркомы и рака щитовидной железы.
    17. Способ по п.10, в котором рак является меланомой.
    18. Способ по п.10, в котором индивид имеет вероятность развития резистентности к ингибитору МЕК.
    19. Способ по п.10, в котором второй ингибитор представляет собой ингибитор ТРЕ2/СОТ.
    ССЗВ/Коллекция киназ
    ОКР института Брода (597)
    карбогидрат-киназа (28) нуклеотидкиназа (39) рецепторная Зег/ТМг киназа (26) рецепторная Туг киназа (53) нерецепторная Зег/ТКг киназа (250) нерецепторная Туг киназа (38) липидкиназа(24) протеинкиназа (80) связанная киназа (59)
    - 66 030276
    А376 АКЫЕ128 СОЮ-679 АМ451Ы АКМЕ15 Вторичный скрининг
    А375 5 КМ Е128 Ген <3150 (мкМ) кратное изменение Ранг Ген <3150 (мкМ) кратное изменение Ранг - 0,1528 0,91 - 0,4751 0,4791 МЕК1 0,1671 1 Г) МЕК1 1,0 1 И МЕКОО 4,8 28 (+) МЕКОО 8,29 8,29 м МАРЗК8 >100,0 -600 1 МАРЗК8 >100,0 -100 1 КАР! >100,0 -600 2 КАР1 >100.0 -100 2 СРК1 >10,0 -60 3 СКК1 9,70 9,7 3 рек >10,0 -60 4 рек 5,0 5 4 РККСЕ 4,41 -26 5 РККСН 2,26 2,26 5 рккен 4,14 -25 6 РККСЕ 1,91 1,91 6 ЕКВВ2 1,33 -8 7 АХ<_ 1,18 1,18 7 ΑΧ Ι- 1,00 -6 8 ЕКВВ2 1,00 1,00 8 ΡΑΙΟ 0,4934 -3 9 РАКЗ 0,9041 0,9041 9
EA201290883A 2010-03-09 2011-03-09 Способы идентификации страдающих раком пациентов и лечения рака у пациентов, у которых имеется или развивается резистентность к первой терапии рака EA030276B1 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US31219310P 2010-03-09 2010-03-09
US31251910P 2010-03-10 2010-03-10
US32602110P 2010-04-20 2010-04-20
US41556910P 2010-11-19 2010-11-19
PCT/US2011/027689 WO2011112678A1 (en) 2010-03-09 2011-03-09 Methods of diagnosing and treating cancer in patients having or developing resistance to a first cancer therapy

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201290883A1 EA201290883A1 (ru) 2013-04-30
EA030276B1 true EA030276B1 (ru) 2018-07-31

Family

ID=43837946

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201290883A EA030276B1 (ru) 2010-03-09 2011-03-09 Способы идентификации страдающих раком пациентов и лечения рака у пациентов, у которых имеется или развивается резистентность к первой терапии рака

Country Status (12)

Country Link
US (3) US20130059851A1 (ru)
EP (1) EP2545187B1 (ru)
JP (1) JP5985401B2 (ru)
KR (1) KR20120139767A (ru)
CN (1) CN103038364A (ru)
AU (1) AU2011224410B2 (ru)
BR (1) BR112012022801B8 (ru)
CA (1) CA2791247C (ru)
EA (1) EA030276B1 (ru)
ES (1) ES2714875T3 (ru)
MX (1) MX343368B (ru)
WO (1) WO2011112678A1 (ru)

Families Citing this family (34)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7723477B2 (en) 2005-10-31 2010-05-25 Oncomed Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting Wnt-dependent solid tumor cell growth
RU2579897C2 (ru) 2008-09-26 2016-04-10 Онкомед Фармасьютикалс, Инк. Агенты, связывающие рецептор "frizzled", и их применение
TWI535445B (zh) 2010-01-12 2016-06-01 安可美德藥物股份有限公司 Ｗｎｔ拮抗劑及治療和篩選方法
MX347515B (es) 2010-04-01 2017-04-28 Oncomed Pharmaceuticals Inc * Agentes que se unen al receptor encrespado y usos de los mismos.
AU2012240240A1 (en) * 2011-04-04 2013-05-09 Netherlands Cancer Institute Methods and compositions for predicting resistance to anticancer treatment with protein kinase inhibitors
US10202643B2 (en) 2011-10-31 2019-02-12 University Of Utah Research Foundation Genetic alterations in glioma
EP2788378A4 (en) * 2011-12-09 2015-09-09 Oncomed Pharm Inc ASSOCIATION THERAPY FOR THE TREATMENT OF CANCER
PL2831589T3 (pl) 2012-03-28 2018-10-31 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Mutanty C-RAF, które nadają oporność na inhibitory RAF
CN110251512A (zh) 2012-08-17 2019-09-20 霍夫曼-拉罗奇有限公司 包括给药cobimetinib和威罗菲尼的黑色素瘤的组合疗法
US9266959B2 (en) 2012-10-23 2016-02-23 Oncomed Pharmaceuticals, Inc. Methods of treating neuroendocrine tumors using frizzled-binding agents
WO2014121196A1 (en) 2013-02-04 2014-08-07 Oncomed Pharmaceuticals, Inc. Methods and monitoring of treatment with a wnt pathway inhibitor
US9168300B2 (en) 2013-03-14 2015-10-27 Oncomed Pharmaceuticals, Inc. MET-binding agents and uses thereof
US10968484B2 (en) 2013-03-15 2021-04-06 The Broad Institute, Inc. Methods of identifying responses to map kinase inhibition therapy
WO2014204261A1 (ko) * 2013-06-21 2014-12-24 사회복지법인 삼성생명공익재단 Tpl2의 발현억제제 또는 활성억제제를 유효성분으로 포함하는 신세포암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물
US20170242015A1 (en) * 2014-09-17 2017-08-24 Institut Curie Map3k8 as a marker for selecting a patient affected with an ovarian cancer for a treatment with a mek inhibitor
KR20160129609A (ko) 2015-04-30 2016-11-09 삼성전자주식회사 Ｂｒａｆ 저해제를 포함하는 세포 또는 개체의 노화를 감소시키기 위한 조성물 및 그의 용도
KR20200022527A (ko) 2015-07-06 2020-03-03 길리애드 사이언시즈, 인코포레이티드 Cot 조정제로서의 6-아미노-퀴놀린-3-카르보니트릴
AU2016290820B2 (en) 2015-07-06 2019-03-07 Gilead Sciences, Inc. Cot modulators and methods of use thereof
GB201520178D0 (en) * 2015-11-16 2015-12-30 Univ London Queen Mary Method
CN105695616A (zh) * 2016-04-22 2016-06-22 王冬国 诊断甲状腺癌的分析标志物及其应用
JP6776378B2 (ja) 2016-06-30 2020-10-28 ギリアード サイエンシーズ， インコーポレイテッド Ｃｏｔモジュレーターとしての４，６−ジアミノキナゾリン類およびその使用方法
US20190167776A1 (en) * 2016-08-05 2019-06-06 Duke University Camkk2 inhibitor compositions and methods of using the same
CA3045744A1 (en) 2016-12-20 2018-06-28 Eth Zurich Identification of drugs targeting non-genetic drug tolerance programs in cancer
US10793901B2 (en) * 2016-12-28 2020-10-06 Roche Molecular Systems, Inc. Reversibly protected nucleotide reagents with high thermal stability
BR112019014593A2 (pt) 2017-01-17 2020-02-18 Heparegenix Gmbh Inibidor de mkk4 e os sais, solvatos e isômeros ópticos farmaceuticamente aceitáveis do mesmo, composto e os sais, solvatos e isômeros ópticos farmaceuticamente aceitáveis do mesmo e método de inibição seletiva da proteína quinase mkk4 em relação às proteínas quinases jnk1 e mkk7
CN111601615A (zh) * 2017-11-02 2020-08-28 乔治亚大学研究基金公司 与轮状病毒产量增加有关的方法和组合物
CN108872438B (zh) * 2018-08-06 2021-01-15 杭州迪相实业有限公司 一种外泌体中肺癌标志物gk5快速检测试剂盒
US20230183204A9 (en) * 2018-11-07 2023-06-15 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Benzimidazole derivatives and aza-benzimidazole derivatives as janus kinase 2 inhibitors and uses thereof
WO2020176693A2 (en) * 2019-02-26 2020-09-03 Cell Response, Inc. Methods for treating map3k8 positive cancers
TW202235416A (zh) 2019-06-14 2022-09-16 美商基利科學股份有限公司 Cot 調節劑及其使用方法
CN110862968A (zh) * 2019-10-30 2020-03-06 中国农业科学院兰州兽医研究所 Map3k8基因敲除pk-15细胞系的构建方法及其应用
EP4126231A1 (en) 2020-03-30 2023-02-08 Gilead Sciences, Inc. Solid forms of (s)-6-(((1-(bicyclo[1.1.1]pentan-1-yl)-1h-1,2,3-triazol-4-yl)2-methyl-1-oxo-1,2- dihydroisoquinolin-5-yl)methyl)))amino)8-chloro-(neopentylamino)quinoline-3-carb onitrile a cot inhibitor compound
KR20220160645A (ko) 2020-04-02 2022-12-06 길리애드 사이언시즈, 인코포레이티드 Cot 저해제 화합물의 제조 방법
TW202204350A (zh) 2020-05-06 2022-02-01 美商雅捷可斯治療公司 作為ｊａｋ２抑制劑之６－雜芳基氧基苯并咪唑及氮雜苯并咪唑

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1803821A2 (en) * 2002-06-05 2007-07-04 Cedars-Sinai Medical Center Methods for managing kinase inhibitor therapy
WO2010068738A1 (en) * 2008-12-10 2010-06-17 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Mek mutations conferring resistance to mek inhibitors

Family Cites Families (94)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS57501692A (ru) 1980-09-24 1982-09-16
ATE53862T1 (de) 1982-01-22 1990-06-15 Cetus Corp Verfahren zur charakterisierung von hla und die darin benutzten cdns-testmittel.
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
CA1284931C (en) 1986-03-13 1991-06-18 Henry A. Erlich Process for detecting specific nucleotide variations and genetic polymorphisms present in nucleic acids
CA1338457C (en) 1986-08-22 1996-07-16 Henry A. Erlich Purified thermostable enzyme
EP0266032A1 (en) 1986-08-29 1988-05-04 Beecham Group Plc Modified fibrinolytic enzyme
US7705215B1 (en) 1990-04-17 2010-04-27 Dekalb Genetics Corporation Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof
FR2650840B1 (fr) 1989-08-11 1991-11-29 Bertin & Cie Procede rapide de detection et/ou d'identification d'une seule base sur une sequence d'acide nucleique, et ses applications
US6004744A (en) 1991-03-05 1999-12-21 Molecular Tool, Inc. Method for determining nucleotide identity through extension of immobilized primer
GB9222888D0 (en) 1992-10-30 1992-12-16 British Tech Group Tomography
AT404556B (de) 1995-11-23 1998-12-28 Pharma Consult Gmbh Einrichtung zum dichten verschliessen eines glas- oder kunststoffbehälters zur aufnahme flüssiger pharmazeutischer produkte
GB2323845A (en) 1997-03-31 1998-10-07 Merck & Co Inc MEK inhibiting lactones
US6506798B1 (en) 1997-07-01 2003-01-14 Warner-Lambert Company 4-Arylamino, 4-aryloxy, and 4-arylthio diarylamines and derivatives thereof as selective MEK inhibitors
PT993439E (pt) 1997-07-01 2004-12-31 Warner Lambert Co Derivados de acido 4-bromo ou 4-iodofenilaminobenzidroxamico e sua utilizacao como inibidores de mek
US6821963B2 (en) 1997-07-01 2004-11-23 Warner-Lambert Company 4-Bromo or 4-iodo phenylamino benzhydroxamic acid derivatives and their use as MEK inhibitors
US6310060B1 (en) 1998-06-24 2001-10-30 Warner-Lambert Company 2-(4-bromo or 4-iodo phenylamino) benzoic acid derivatives and their use as MEK inhibitors
ES2274572T3 (es) 1997-07-01 2007-05-16 Warner-Lambert Company Llc Derivados de acido 2-(4-bromo- o 4-yodo-fenilamino) benzoico y su uso como inhibidor de mek.
US20040171632A1 (en) 1998-12-22 2004-09-02 Gowan Richard Carleton Combination chemotherapy
NZ512859A (en) 1998-12-22 2004-06-25 Warner Lambert Co Combination chemotherapy
AU2482800A (en) 1999-01-13 2000-08-01 Warner-Lambert Company Sulphohydroxamic acids and sulphohydroxamates and their use as mek inhibitors
PL348870A1 (en) 1999-01-13 2002-06-17 Warner Lambert Co 1-heterocycle substituted diarylamines
JP2000212157A (ja) 1999-01-13 2000-08-02 Warner Lambert Co ジアリ―ルアミン
JP2000204079A (ja) 1999-01-13 2000-07-25 Warner Lambert Co ジアリ―ルアミン
ES2247859T3 (es) 1999-01-13 2006-03-01 Warner-Lambert Company Llc Benzoheterociclos y su uso como inhibidores de mek.
JP2000204077A (ja) 1999-01-13 2000-07-25 Warner Lambert Co ジアリ―ルアミン
CA2348236A1 (en) 1999-01-13 2000-07-20 Stephen Douglas Barrett 4-arylamino, 4-aryloxy, and 4-arylthio diarylamines and derivatives thereof as selective mek inhibitors
CA2349832A1 (en) 1999-01-13 2000-07-20 Warner-Lambert Company Benzenesulfonamide derivatives and their use as mek inhibitors
JP2000204075A (ja) 1999-01-13 2000-07-25 Warner Lambert Co ジアリ―ルアミン
EE05450B1 (et) 2000-07-19 2011-08-15 Warner-Lambert Company 4-jodofenlaminobenshdroksaamhapete oksgeenitud estrid, nende kristallvormid ja farmatseutilised kompositsioonid ning kasutamine
CA2463101A1 (en) 2001-10-23 2003-05-01 Applied Research Systems Ars Holding N.V. Azole derivatives and pharmaceutical compositions containing them
WO2003047523A2 (en) 2001-12-04 2003-06-12 Onyx Pharmaceuticals, Inc. Raf-mek-erk pathway inhibitors to treat cancer
WO2003047585A1 (en) 2001-12-05 2003-06-12 Astrazeneca Ab Pharmaceutical compositions comprising benzofuranyl substituted 3-cyanoquinoline derivatives and their use for the treatment of solid tumours
WO2003047583A1 (en) 2001-12-05 2003-06-12 Astrazeneca Ab Pharmaceutical compositions comprising benzofuranyl substituted 3-cyanoquinoline derivatives and their use for the treatment of solid tumours
DOP2003000556A (es) 2002-01-23 2003-10-31 Warner Lambert Co Esteres hidroxamato de acido n-(4-fenil-sustituido)-antranilico.
BR0307060A (pt) 2002-01-23 2004-10-26 Warner Lambert Co ésteres hidroxamato do ácido n-(fenil 4-substituìdo)-antranìlico
PA8569201A1 (es) 2002-03-13 2004-05-21 Array Biopharma Inc "derivados de bencimidazol n3 alquilado como inhibidores de mek" "n3 alkylated benzimimidazole derivatives as mek inhibitors"
US6989451B2 (en) 2002-06-04 2006-01-24 Valeant Research & Development Heterocyclic compounds and uses thereof
WO2004030620A2 (en) 2002-09-30 2004-04-15 Bristol-Myers Squibb Company Novel tyrosine kinase inhibitors
US20060270643A1 (en) 2002-10-31 2006-11-30 Chawnshang Chang Hyfroxyflutamide induced pathways related to androgen receptor negative prostate cancer cells
GB0225579D0 (en) 2002-11-02 2002-12-11 Astrazeneca Ab Chemical compounds
WO2004044219A2 (en) 2002-11-12 2004-05-27 Mercury Therapeutics, Inc. Xanthene compounds for cancer chemotherapy
US20050004186A1 (en) 2002-12-20 2005-01-06 Pfizer Inc MEK inhibiting compounds
AU2004218914A1 (en) * 2003-03-11 2004-09-23 Novartis Ag Use of isoquinoline derivatives for treating cancer and MAP kinase related diseases
WO2005000818A1 (en) 2003-06-27 2005-01-06 Warner-Lambert Company Llc 5-substituted-4-`(substituted phenyl)!amino!-2-pyridone deviatives for use as mek inhibitors
US20050049276A1 (en) 2003-07-23 2005-03-03 Warner-Lambert Company, Llc Imidazopyridines and triazolopyridines
WO2005007616A1 (en) 2003-07-23 2005-01-27 Warner-Lambert Company Llc Diphenylamino ketone derivatives as mek inhibitors
MXPA06000921A (es) 2003-07-24 2006-03-30 Warner Lambert Co Derivados de benzamidazoles como inhibidores de mek.
US7538120B2 (en) 2003-09-03 2009-05-26 Array Biopharma Inc. Method of treating inflammatory diseases
US7144907B2 (en) 2003-09-03 2006-12-05 Array Biopharma Inc. Heterocyclic inhibitors of MEK and methods of use thereof
EP1674452A4 (en) 2003-09-19 2007-10-10 Chugai Pharmaceutical Co Ltd NOVEL 4-PHENYLAMINO-BENZALDOXIME DERIVATIVE AND ITS USE AS MEK INHIBITOR
JP4755991B2 (ja) 2003-10-16 2011-08-24 ノバルティス バクシンズ アンド ダイアグノスティックス，インコーポレーテッド Ｒａｆキナーゼインヒビターとしての置換ベンゾアゾールおよびその使用
US7732616B2 (en) 2003-11-19 2010-06-08 Array Biopharma Inc. Dihydropyridine and dihydropyridazine derivatives as inhibitors of MEK and methods of use thereof
US7772234B2 (en) 2003-11-19 2010-08-10 Array Biopharma Inc. Bicyclic inhibitors of MEK and methods of use thereof
US7517994B2 (en) 2003-11-19 2009-04-14 Array Biopharma Inc. Heterocyclic inhibitors of MEK and methods of use thereof
TW200529846A (en) 2004-02-20 2005-09-16 Wyeth Corp 3-quinolinecarbonitrile protein kinase inhibitors
PL1761528T3 (pl) 2004-06-11 2008-05-30 Japan Tobacco Inc Pochodne 5-amino-2,4,7-triokso-3,4,7,8-tetrahydro-2H-pirydo[2,3-D]pirymidyny i związki pokrewne do leczenia raka
US7378423B2 (en) 2004-06-11 2008-05-27 Japan Tobacco Inc. Pyrimidine compound and medical use thereof
TWI361066B (en) 2004-07-26 2012-04-01 Chugai Pharmaceutical Co Ltd 5-substituted-2-phenylamino benzamides as mek inhibitors
CN101006085A (zh) 2004-08-17 2007-07-25 霍夫曼-拉罗奇有限公司 取代的乙内酰脲类
PL1781649T3 (pl) 2004-08-17 2009-01-30 Hoffmann La Roche Podstawione hydantoiny
CA2578283A1 (en) 2004-08-25 2006-03-02 Targegen, Inc. Heterocyclic compounds and methods of use
CN101654452A (zh) 2004-08-25 2010-02-24 塔尔基公司 杂环化合物和应用方法
KR20070055575A (ko) 2004-09-01 2007-05-30 아스트라제네카 아베 퀴나졸리논 유도체 및 이의 ｂ―ｒａｆ 억제제로서의 용도
JP2006083133A (ja) 2004-09-17 2006-03-30 Sankyo Co Ltd スルファミド誘導体医薬組成物
TW200621766A (en) 2004-09-17 2006-07-01 Hoffmann La Roche Substituted hydantoins
DK1802579T3 (da) 2004-10-20 2014-01-20 Merck Serono Sa Derivater af 3-arylaminopyridin
CA2587178A1 (en) 2004-11-24 2006-06-01 Laboratoires Serono S.A. Novel 4-arylamino pyridone derivatives as mek inhibitors for the treatment of hyperproliferative disorders
DE602005016718D1 (de) 2004-12-01 2009-10-29 Merck Serono Sa Coinsins Ä1,2,4ütriazoloä4,3-aüpyridin-derivative zur behandlung hyperproliferativer erkrankungen
US7429667B2 (en) 2005-01-20 2008-09-30 Ardea Biosciences, Inc. Phenylamino isothiazole carboxamidines as MEK inhibitors
DK1922307T3 (da) 2005-05-18 2012-04-02 Array Biopharma Inc Heterocykliske inhibitorer af MEK og fremgangsmåder til anvendelse heraf
WO2006133417A1 (en) 2005-06-07 2006-12-14 Valeant Pharmaceuticals International Phenylamino isothiazole carboxamidines as mek inhibitors
US8101799B2 (en) 2005-07-21 2012-01-24 Ardea Biosciences Derivatives of N-(arylamino) sulfonamides as inhibitors of MEK
MX2008002114A (es) 2005-07-21 2008-04-17 Ardea Biosciences Inc Inhibidores de n-(arilamino)-sulfonamida de mek.
WO2007025090A2 (en) 2005-08-25 2007-03-01 Kalypsys, Inc. Heterobicyclic and - tricyclic inhibitors of mapk/erk kinase
JP5129143B2 (ja) 2005-10-07 2013-01-23 エグゼリクシス， インコーポレイテッド Ｍｅｋインヒビターおよびその使用方法
EP1966155A1 (en) 2005-12-21 2008-09-10 AstraZeneca AB Tosylate salt of 6- (4-br0m0-2-chl0r0phenylamin0) -7-fluoro-n- (2-hydroxyethoxy) -3-methyl-3h-benzimi dazole- 5 - carboxamide , mek inhibitor useful in the treatment of cancer
US7612212B2 (en) 2006-02-22 2009-11-03 Hoffmann-La Roche Inc. Substituted hydantoins
US20090163525A1 (en) 2006-04-05 2009-06-25 Astrazeneca Ab Substituted quinazolines with anti-cancer activity
WO2007121269A2 (en) 2006-04-11 2007-10-25 Ardea Biosciences, Inc. N-aryl-n'alkyl sulfamides as mek inhibitors
EP2012786B1 (en) 2006-04-18 2010-10-06 Ardea Biosciences, Inc. Pyridone sulfonamides and pyridone sulfamides as mek inhibitors
WO2007123939A2 (en) 2006-04-19 2007-11-01 Laboratoires Serono S.A. Novel arylamino n-heteraryls as mek inhibitors
EA200802050A1 (ru) 2006-04-19 2009-04-28 Лаборатуар Сероно Са Новые гетероарилзамещенные ариламинопиридиновые производные в качестве мек ингибиторов
EP2056829B9 (en) 2006-08-16 2012-09-26 Exelixis, Inc. Using pi3k and mek modulators in treatments of cancer
WO2008020203A1 (en) 2006-08-17 2008-02-21 Astrazeneca Ab Pyridinylquinaz0linamine derivatives and their use as b-raf inhibitors
BRPI0714635A2 (pt) 2006-08-21 2013-06-18 Genentech Inc compostos, composiÇço farmacÊutica, mÉtodo para inibir, o crescimento celular anormal ou tratar uma disfunÇço hiperproliferativa, mÉtodo para tratar uma doenÇa inflamatària e mÉtodo para tratar uma doenÇa autoimune
EP2069359B1 (en) 2006-08-21 2014-11-12 Genentech, Inc. Aza-benzothiophenyl compounds and methods of use
WO2008028141A2 (en) 2006-08-31 2008-03-06 Array Biopharma Inc. Raf inhibitor compounds and methods of use thereof
EP2113500A1 (en) 2006-10-31 2009-11-04 Takeda Pharmaceutical Company Limited MAPK/ERK kinase inhibitors
AU2007325123B2 (en) 2006-11-30 2012-12-13 Genentech, Inc. AZA-indolyl compounds and methods of use
PL2101759T3 (pl) 2006-12-14 2019-05-31 Exelixis Inc Sposoby stosowania inhibitorów MEK
WO2008120004A1 (en) 2007-04-02 2008-10-09 Astrazeneca Ab Combination of a mek- inhibitor and a b-raf inhibitor for the treatment of cancer
WO2009002607A1 (en) * 2007-05-01 2008-12-31 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Compositions and methods for identifying transforming and tumor suppressor genes
CA2924418A1 (en) * 2007-07-30 2009-02-05 Jean-Michel Vernier Derivatives of n-(arylamino) sulfonamides including polymorphs as inhibitors of mek as well as compositions, methods of use and methods for preparing the same
KR101729116B1 (ko) 2009-10-16 2017-05-02 노바르티스 아게 조 합 물

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1803821A2 (en) * 2002-06-05 2007-07-04 Cedars-Sinai Medical Center Methods for managing kinase inhibitor therapy
WO2010068738A1 (en) * 2008-12-10 2010-06-17 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Mek mutations conferring resistance to mek inhibitors

Non-Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
CORY M. JOHANNESSEN, JESSE S. BOEHM, SO YOUNG KIM, SAPANA R. THOMAS, LESLIE WARDWELL, LAURA A. JOHNSON, CAROLINE M. EMERY, NICOLAS: "COT drives resistance to RAF inhibition through MAP kinase pathway reactivation", NATURE, MACMILLAN JOURNALS LTD, LONDON, GB, vol. 468, no. 7326, 16 December 2010 (2010-12-16), GB, pages 968 - 972, XP002633499, ISSN: 0028-0836, DOI: 10.1038/NATURE09627 *
EMERY C M ET AL: "MEK1 mutations confer resistance to MEK and B-RAF inhibition", PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES, NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES, US, vol. 106, no. 48, 1 December 2009 (2009-12-01), US, pages 20411 - 20416, XP002569027, ISSN: 0027-8424, DOI: 10.1073/pnas.0905833106 *
MOLHOEK KERRINGTON R; BRAUTIGAN DAVID L; SLINGLUFF CRAIG L JR: "Synergistic inhibition of human melanoma proliferation by combination treatment with B-Raf inhibitor BAY43-9006 and mTOR inhibitor Rapamycin", JOURNAL OF TRANSLATIONAL MEDICINE, BIOMED CENTRAL, vol. 3, no. 1, 28 October 2005 (2005-10-28), pages 39, XP021009887, ISSN: 1479-5876, DOI: 10.1186/1479-5876-3-39 *
POULIKOS I. POULIKAKOS, CHAO ZHANG, GIDEON BOLLAG, KEVAN M. SHOKAT & NEAL ROSEN: "RAF inhibitors transactivate RAF dimers and ERK signalling in cells with wild-type BRAF", NATURE, MACMILLAN JOURNALS LTD, LONDON, GB, vol. 464, no. 7287, 18 March 2010 (2010-03-18), GB, pages 427 - 431, XP002633498, ISSN: 0028-0836, DOI: 10.1038/NATURE08902 *
RAMIN NAZARIAN, HUBING SHI, QI WANG, XIANGJU KONG, RICHARD C. KOYA, HANE LEE, ZUGEN CHEN, MI-KYUNG LEE, NARSIS ATTAR, HOOMAN SAZEG: "Melanomas acquire resistance toB-RAF(V600E) inhibition by RTK or N-RAS upregulation", NATURE, MACMILLAN JOURNALS LTD, LONDON, GB, vol. 468, no. 7326, 16 December 2010 (2010-12-16), GB, pages 973 - 979, XP002633500, ISSN: 0028-0836, DOI: 10.1038/NATURE09626 *
STEVEN J.M. JONES, JANESSA LASKIN, YVONNE Y. LI, OBI L. GRIFFITH, JIANGHONG AN, MIKHAIL BILENKY, YARON S. BUTTERFIELD, TIMOTHEE CE: "Evolution of an adenocarcinoma in response to selection by targeted kinase inhibitors", GENOME BIOLOGY, BIOMED CENTRAL LTD., LONDON, GB, vol. 11, no. 8, 9 August 2010 (2010-08-09), GB, pages R82 - R82-12, XP002633496, ISSN: 1465-6906, DOI: 10.1186/gb-2010-11-8-r82 *
TAP WILLIAM D, GONG KE-WEI, DERING JUDY, ET AL: "Pharmacodynamic Characterization of the Efficacy Signals Due to Selective BRAF Inhibition with PLX4032 in Malignant Melanoma", NEOPLASIA, NEOPLASIA PRESS, ANN ARBOR, MI, US, vol. 12, no. 8, 1 August 2010 (2010-08-01), US, pages 637 - 649, XP002633497, ISSN: 1522-8002, DOI: 10.1593/NEO.10414 *

Also Published As

Publication number Publication date
AU2011224410B2 (en) 2015-05-28
WO2011112678A1 (en) 2011-09-15
US20130059851A1 (en) 2013-03-07
BR112012022801B8 (pt) 2019-10-29
BR112012022801A2 (pt) 2017-01-10
CA2791247C (en) 2019-05-14
KR20120139767A (ko) 2012-12-27
CN103038364A (zh) 2013-04-10
MX2012010420A (es) 2012-11-30
US20170268069A1 (en) 2017-09-21
BR112012022801B1 (pt) 2019-10-15
EA201290883A1 (ru) 2013-04-30
CA2791247A1 (en) 2011-09-15
JP5985401B2 (ja) 2016-09-06
AU2011224410A1 (en) 2012-09-20
MX343368B (es) 2016-11-01
US20210404014A1 (en) 2021-12-30
JP2013526843A (ja) 2013-06-27
EP2545187B1 (en) 2018-09-05
EP2545187A1 (en) 2013-01-16
ES2714875T3 (es) 2019-05-30
US11078540B2 (en) 2021-08-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EA030276B1 (ru) Способы идентификации страдающих раком пациентов и лечения рака у пациентов, у которых имеется или развивается резистентность к первой терапии рака
US20240093310A1 (en) C-RAF Mutants that Confer Resistance to RAF Inhibitors
Shelton et al. The epidermal growth factor receptor gene family as a target for therapeutic intervention in numerous cancers: what’s genetics got to do with it?
JP2019512021A (ja) Ｃｄｋ４活性のマーカーとしてのｐ２７チロシンリン酸化およびそれを使用するための方法
KR101793127B1 (ko) Ret 억제제 및 egfr 억제제의 조합물을 유효성분으로 포함하는 비소세포폐암 치료용 조성물
Zhao et al. PTPN9 dephosphorylates FGFR2pY656/657 via interaction with ACAP1 and ameliorates pemigatinib effect in cholangiocarcinoma
Heppler Identifying Therapeutic Vulnerabilities in Cancers Driven by the Oncogenic Transcription Factor STAT3
Maity et al. Novel CDK12/13 Inhibitors AU-15506 and AU-16770 Are Potent Anti-Cancer Agents in EGFR Mutant Lung Adenocarcinoma with and without Osimertinib Resistance. Cancers 2023, 15, 2263
KR101462329B1 (ko) 디스코이딘 도메인 리셉터 2의 ｊｍ2 도메인의 발현 촉진제를 유효성분으로 포함하는 암의 예방 또는 치료용 조성물
JP2024052068A (ja) がんの治療に用いるための組成物
LaPak Insights into the Function and Regulation of PAK5 in Melanoma
Carmo et al. Genetics and Biology of Glioblastoma Multiforme
Gao Identifiying oncogenic drivers in NSCLC cells harboring EGFR kinase domain mutation with resistance to EGFR TKI and mesenchymal phenotype

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM AZ BY KZ KG MD TJ TM

MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): RU