DE10110344A1 - Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung coryneformer Bakterien - Google Patents
Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung coryneformer BakterienInfo
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Abstract
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren, bei dem man folgende Schritte durchführt: DOLLAR A a) Fermentation der die gewünschte L-Aminosäure produzierenden coryneformen Bakterien, in denen man zumindest das nadA- und/oder nadC-Gen abschwächt, DOLLAR A (b) Anreicherung der gewünschten L-Aminosäure im Medium oder in den Zellen der Bakterien, und DOLLAR A c) Isolierung der L-Aminosäure, DOLLAR A und gegebenenfalls Bakterien einsetzt, in denen man zusätzlich weitere Gene des Biosyntheseweges der gewünschten L-Aminosäure verstärkt, oder Bakterien einsetzt, in denen die Stoffwechselwege zumindest teilweise ausgeschaltet sind, die die Bildung der gewünschten L-Aminosäure verringern.
Description
Gegenstand der Erfindung ist ein Verfahren zur
fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren, insbesondere
L-Valin und L-Lysin, unter Verwendung coryneformer
Bakterien, in denen das nadA- und/oder nadC-Gen
abgeschwächt ist.
L-Aminosäuren, insbesondere L-Valin und L-Lysin, finden in
der Humanmedizin und in der pharmazeutischen Industrie, in
der Lebensmittelindustrie und ganz besonders in der
Tierernährung Anwendung.
Es ist bekannt, daß Aminosäuren durch Fermentation von
Stämmen coryneformer Bakterien, insbesondere
Corynebacterium glutamicum hergestellt werden. Wegen der
großen Bedeutung wird ständig an der Verbesserung der
Herstellverfahren gearbeitet. Verfahrensverbesserungen
können fermentationstechnische Maßnahmen wie zum Beispiel
Rührung und Versorgung mit Sauerstoff, oder die
Zusammensetzung der Nährmedien wie zum Beispiel die
Zuckerkonzentration während der Fermentation, oder die
Aufarbeitung zur Produktform durch zum Beispiel
Ionenaustauschchromatographie oder die intrinsischen
Leistungseigenschaften des Mikroorganismus selbst
betreffen.
Zur Verbesserung der Leistungseigenschaften dieser
Mikroorganismen werden Methoden der Mutagenese, Selektion
und Mutantenauswahl angewendet. Auf diese Weise erhält man
Stämme, die resistent gegen Antimetabolite wie zum Beispiel
das Lysin-Analogon S-(2-Aminoethyl)-Cystein oder das Valin-
Analogon 2-Thiazolyl-Alanin oder auxotroph für
regulatorisch bedeutsame Metabolite sind und L-Aminosäuren
produzieren.
Seit einigen Jahren werden ebenfalls Methoden der
rekombinanten DNA-Technik zur Stammverbesserung
L-Aminosäure produzierender Stämme von Corynebacterium
glutamicum eingesetzt, indem man einzelne Aminosäure-
Biosynthesegene amplifiziert und die Auswirkung auf die
L-Aminosäure-Produktion untersucht.
Die Erfinder haben sich die Aufgabe gestellt, neue
Grundlagen für verbesserte Verfahren zur fermentativen
Herstellung von L-Aminosäuren mit coryneformen Bakterien
bereitzustellen.
Werden im folgenden L-Aminosäuren oder Aminosäuren erwähnt,
sind damit eine oder mehrere Aminosäuren einschließlich
ihrer Salze, ausgewählt aus der Gruppe L-Asparagin,
L-Threonin, L-Serin, L-Glutamat, L-Glycin, L-Alanin,
L-Cystein, L-Valin, L-Methionin, L-Isoleucin, L-Leucin,
L-Tyrosin, L-Phenylalanin, L-Histidin, L-Lysin, L-Tryptophan
und L-Arginin gemeint. Besonders bevorzugt sind L-Lysin und
L-Valin.
Wenn im Folgenden L-Lysin oder Lysin erwähnt werden, sind
damit nicht nur die Basen, sondern sind auch die Salze wie
z. B. Lysin-Monohydrochlorid oder Lysin-Sulfat gemeint.
Wenn im Folgenden L-Valin oder Valin erwähnt werden, sind
damit auch die Salze wie z. B. Valin-Monohydrochlorid oder
Valin-Sulfat gemeint.
Gegenstand der Erfindung ist ein Verfahren zur
fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren, unter
Verwendung von coryneformen Bakterien, in denen man
zumindest die für die Chinolinsäure-Synthetase A
(Quinolinate-Synthetase A) kodierende Nucleotidsequenz
(nadA-Gen) und/oder die für die Nicotinat-Nucleotid
Pyrophosphorylase kodierende Nucleotidsequenz (nadC-Gen)
abschwächt, insbesondere ausschaltet oder auf niedrigem
Niveau exprimiert.
Gegenstand dieser Erfindung ist weiterhin ein Verfahren zur
fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren in dem folgende
Schritte durchführt werden:
- a) Fermentation der L-Aminosäure produzierenden coryneformen Bakterien, in denen zumindest die für die Chinolinsäure-Synthetase kodierende Nucleotidsequenz (nadA) und/oder die für die kodierende Nucleotidsequenz (nadC), abgeschwächt, insbesondere ausgeschaltet oder auf niedrigem Niveau exprimiert wird;
- b) Anreicherung der L-Aminosäuren im Medium oder in den Zellen der Bakterien; und
- c) Isolierung der produzierten L-Aminosäuren.
Die eingesetzten Stämme produzieren bevorzugt bereits vor
der Abschwächung des nadA- und/oder nadC-Gens
L-Aminosäuren, insbesondere L-Valin oder L-Lysin.
Bevorzugte Ausführungsformen finden sich in den Ansprüchen.
Der Begriff "Abschwächung" beschreibt in diesem
Zusammenhang die Verringerung oder Ausschaltung der
intrazellulären Aktivität eines oder mehrerer Enzyme
(Proteine) in einem Mikroorganismus, die durch die
entsprechende DNA kodiert werden, indem man beispielsweise
einen schwachen Promotor verwendet oder ein Gen bzw. Allel
verwendet, das für ein entsprechendes Enzym mit einer
niedrigen Aktivität kodiert bzw. das entsprechende Gen oder
Enzym (Protein) inaktiviert und gegebenenfalls diese
Maßnahmen kombiniert.
Die Mikroorganismen, die Gegenstand der vorliegenden
Erfindung sind, können Aminosäuren aus Glucose, Saccharose,
Lactose, Fructose, Maltose, Melasse, Stärke, Cellulose oder
aus Glycerin und Ethanol herstellen. Es kann sich um
Vertreter coryneformer Bakterien insbesondere der Gattung
Corynebacterium handeln. Bei der Gattung Corynebacterium
ist insbesondere die Art Corynebacterium glutamicum zu
nennen, die in der Fachwelt für ihre Fähigkeit bekannt ist,
L-Aminosäuren zu produzieren.
Geeignete Stämme der Gattung Corynebacterium, insbesondere
der Art Corynebacterium glutamicum, sind besonders die
bekannten Wildtypstämme
Corynebacterium glutamicum ATCC13032
Corynebacterium acetoglutamicum ATCC15806
Corynebacterium acetoacidophilum ATCC13870
Corynebacterium melassecola ATCC17965
Corynebacterium thermoaminogenes FERM BP-1539
Brevibacterium flavum ATCC14067
Brevibacterium lactofermentum ATCC13869 und
Brevibacterium divaricatum ATCC14020
und daraus hergestellte L-Aminosäuren produzierende Mutanten bzw. Stämme
wie beispielsweise die L-Lysin produzierenden Stämme
Corynebacterium glutamicum FERM-P 1709
Brevibacterium flavum FERM-P 1708
Brevibacterium lactofermentum FERM-P 1712
Corynebacterium glutamicum FERM-P 6463
Corynebacterium glutamicum FERM-P 6464 und
Corynebacterium glutamicum DSM 5714
oder wie beispielsweise die Valin produzierenden Stämme
Corynebacterium glutamicum DSM 12455
Corynebacterium glutamicum FERM-P 9325
Brevibacterium flavum FERM-P 512
Brevibacterium lactofermentum FERM-P 1845
Brevibacterium lactofermentum FERM-P 9324 und
Brevibacterium lactofermentum FERM-BP 1763.
Corynebacterium glutamicum ATCC13032
Corynebacterium acetoglutamicum ATCC15806
Corynebacterium acetoacidophilum ATCC13870
Corynebacterium melassecola ATCC17965
Corynebacterium thermoaminogenes FERM BP-1539
Brevibacterium flavum ATCC14067
Brevibacterium lactofermentum ATCC13869 und
Brevibacterium divaricatum ATCC14020
und daraus hergestellte L-Aminosäuren produzierende Mutanten bzw. Stämme
wie beispielsweise die L-Lysin produzierenden Stämme
Corynebacterium glutamicum FERM-P 1709
Brevibacterium flavum FERM-P 1708
Brevibacterium lactofermentum FERM-P 1712
Corynebacterium glutamicum FERM-P 6463
Corynebacterium glutamicum FERM-P 6464 und
Corynebacterium glutamicum DSM 5714
oder wie beispielsweise die Valin produzierenden Stämme
Corynebacterium glutamicum DSM 12455
Corynebacterium glutamicum FERM-P 9325
Brevibacterium flavum FERM-P 512
Brevibacterium lactofermentum FERM-P 1845
Brevibacterium lactofermentum FERM-P 9324 und
Brevibacterium lactofermentum FERM-BP 1763.
Es wurde gefunden, daß coryneforme Bakterien nach
Abschwächung des nadA- und/oder nadC-Gens in verbesserter
Weise L-Aminosäuren produzieren.
Die Sequenzen der Gene nadA und nadC sind in der SEQ ID No.
1 und 3 dargestellt und können erfindungsgemäß verwendet
werden. Die Aminosäuresequenzen der dazugehörigen
Genprodukte sind in der SEQ ID No. 2 und 4 dargestellt.
Weiterhin können Allele des nadA- und/ oder nadC-Gens
verwendet werden, die sich aus der Degeneriertheit des
genetischen Codes oder durch funktionsneutrale
Sinnmutationen ("sense mutations") ergeben.
Zur Erzielung einer Abschwächung können entweder die
Expression des nadA- und/oder nadC-Gens oder die
katalytischen Eigenschaften der Genprodukte herabgesetzt
oder ausgeschaltet werden. Gegebenenfalls werden beide
Maßnahmen kombiniert.
Die Genexpression kann durch geeignete Kulturführung oder
durch genetische Veränderung (Mutation) der
Signalstrukturen der Genexpression verringert werden.
Signalstrukturen der Genexpression sind beispielsweise
Repressorgene, Aktivatorgene, Operatoren, Promotoren,
Attenuatoren, Ribosomenbindungsstellen, das Startkodon und
Terminatoren. Angaben hierzu findet der Fachmann z. B. in
der Patentanmeldung WO 96/15246, bei Boyd und Murphy
(Journal of Bacteriology 170: 5949 (1988)), bei Voskuil und
Chambliss (Nucleic Acids Research 26: 3548 (1998), bei
Jensen und Hammer (Biotechnology and Bioengineering 58: 191
(1998)), bei Pátek et al. (Microbiology 142: 1297 (1996))
und in bekannten Lehrbüchern der Genetik und
Molekularbiologie wie z. B. dem Lehrbuch von Knippers
("Molekulare Genetik", 6. Auflage, Georg Thieme Verlag,
Stuttgart, Deutschland, 1995) oder dem von Winnacker ("Gene
und Klone", VCH Verlagsgesellschaft, Weinheim, Deutschland,
1990).
Mutationen, die zu einer Veränderung bzw. Herabsetzung der
katalytischen Eigenschaften von Enzymproteinen führen, sind
aus dem Stand der Technik bekannt; als Beispiele seien die
Arbeiten von Qiu und Goodman (Journal of Biological
Chemistry 272: 8611-8617 (1997)), Sugimoto et al.
(Bioscience Biotechnology and Biochemistry 61: 1760-1762
(1997)) und Möckel ("Die Threonindehydratase aus
Corynebacterium glutamicum: Aufhebung der allosterischen
Regulation und Struktur des Enzyms", Berichte des
Forschungszentrums Jülichs, Jül-2906, ISSN09442952, Jülich,
Deutschland, 1994) genannt. Zusammenfassende Darstellungen
können bekannten Lehrbüchern der Genetik und
Molekularbiologie wie z. B. dem von Hagemann ("Allgemeine
Genetik", Gustav Fischer Verlag, Stuttgart, 1986) entnommen
werden.
Als Mutationen kommen Transitionen, Transversionen,
Insertionen und Deletionen in Betracht. In Abhängigkeit von
der Wirkung des Aminosäureaustausches auf die
Enzymaktivität wird von Fehlsinnmutationen ("missense
mutations") oder Nichtsinnmutationen ("nonsense mutations")
gesprochen. Insertionen oder Deletionen von mindestens
einem Basenpaar in einem Gen führen zu
Rasterverschiebungsmutationen ("frame shift mutations"), in
deren Folge falsche Aminosäuren eingebaut werden oder die
Translation vorzeitig abbricht. Deletionen von mehreren
Kodonen führen typischerweise zu einem vollständigen
Ausfall der Enzymaktivität. Anleitungen zur Erzeugung
derartiger Mutationen gehören zum Stand der Technik und
können bekannten Lehrbüchern der Genetik und
Molekularbiologie wie z. B. dem Lehrbuch von Knippers
("Molekulare Genetik", 6. Auflage, Georg Thieme Verlag,
Stuttgart, Deutschland, 1995), dem von Winnacker ("Gene und
Klone", VCH Verlagsgesellschaft, Weinheim, Deutschland,
1990) oder dem von Hagemann ("Allgemeine Genetik", Gustav
Fischer Verlag, Stuttgart, 1986) entnommen werden.
Eine gebräuchliche Methode, Gene von C. glutamicum zu
mutieren, ist die von Schwarzer und Pühler (Bio/Technology
9, 84-87 (1991)) beschriebene Methode der Gen-Unterbrechung
("gene disruption") und des Gen-Austauschs ("gene
replacement").
Bei der Methode der Gen-Unterbrechung wird ein zentraler
Teil der Kodierregion des interessierenden Gens in einen
Plasmidvektor kloniert, der in einem Wirt (typischerweise
E. coli), nicht aber in C. glutamicum replizieren kann. Als
Vektoren kommen beispielsweise pSUP301 (Simon et al.,
Bio/Technology 1, 784-791 (1983)), pK18mob oder pK19mob
(Schäfer et al., Gene 145, 69-73 (1994)), pK18mobsacB oder
pK19mobsacB (Jäger et al., Journal of Bacteriology 174:
5462-65 (1992)), pGEM-T (Promega corporation, Madison, WI,
USA), pCR2.1-TOPO (Shuman (1994). Journal of Biological
Chemistry 269: 32678-84; US-Patent 5,487,993), pCR®Blunt
(Firma Invitrogen, Groningen, Niederlande; Bernard et al.,
Journal of Molecular Biology, 234: 534-541 (1993)) oder
pEM1 (Schrumpf et al. 1991, Journal of Bacteriology
173: 4510-4516) in Frage. Der Plasmidvektor, der das
zentrale Teil der Kodierregion des Gens enthält, wird
anschließend durch Konjugation oder Transformation in den
gewünschten Stamm von C. glutamicum überführt. Die Methode
der Konjugation ist beispielsweise bei Schäfer et al.
(Applied and Environmental Microbiology 60, 756-759 (1994))
beschrieben. Methoden zur Transformation sind
beispielsweise bei Thierbach et al. (Applied Microbiology
and Biotechnology 29, 356-362 (1988)), Dunican und Shivnan
(Bio/Technology 7, 1067-1070 (1989)) und Tauch et al. (FEMS
Microbiological Letters 123, 343-347 (1994)) beschrieben.
Nach homologer Rekombination mittels eines "cross-over"-
Ereignisses wird die Kodierregion des betreffenden Gens
durch die Vektorsequenz unterbrochen und man erhält zwei
unvollständige Allele, denen jeweils das 3'- bzw. das 5'-
Ende fehlt. Diese Methode wurde beispielsweise von
Fitzpatrick et al. (Applied Microbiology and Biotechnology
42, 575-580 (1994)) zur Ausschaltung des recA-Gens von C.
glutamicum verwendet.
Beispielhaft ist in Fig. 1 das Plasmid pCR2.1nadAint
dargestellt mit Hilfe dessen das Verfahren der
Unterbrechung des nadA-Gens durchgeführt werden kann.
Plasmid pCR2.1nadAint enthält einen, als nadAint-Fragment
bezeichneten, zentralen Teil des nadA-Gens, der in SEQ ID
No. 5 dargestellt ist.
Beispielhaft ist weiterhin in Fig. 2 das Plasmid
pCR2.1nadCint dargestellt mit Hilfe dessen das Verfahren
der Unterbrechung des nadC-Gens durchgeführt werden kann.
Plasmid pCR2.1nadCint enthält einen, als nadCint-Fragment
bezeichneten, zentralen Teil des nadC-Gens, der in SEQ ID
No. 6 dargestellt ist.
Bei der Methode des Genaustausches ("gene replacement")
wird eine Mutation wie z. B. eine Deletion, Insertion oder
Basenaustausch in dem interessierenden Ben in-vitro
hergestellt. Das hergestellte Allel wird wiederum in einen
für C. glutamicum nicht replikativen Vektor kloniert und
dieser anschließend durch Transformation oder Konjugation
in den gewünschten Wirt von C. glutamicum überführt. Nach
homologer Rekombination mittels eines ersten, Integration
bewirkenden "cross-over"-Ereignisses und eines geeigneten
zweiten, eine Exzision bewirkenden "cross-over"-Ereignisses
im Zielgen bzw. in der Zielsequenz erreicht man den Einbau
der Mutation bzw. des Allels. Diese Methode wurde
beispielsweise von Peters-Wendisch et al. (Microbiology
144, 915-927 (1998)) verwendet, um das pyc-Gen von C.
glutamicum durch eine Deletion auszuschalten.
In das nadA- und/oder nadC-Gen kann auf diese Weise eine
Deletion, Insertion oder ein Basenaustausch eingebaut
werden.
Zusätzlich kann es für die Produktion von L-Aminosäuren
vorteilhaft sein, zusätzlich zur Abschwächung des nadA-
und/oder nadC-Gens, eines oder mehrere Enzyme des
jeweiligen Biosyntheseweges, der Glykolyse, der
Anaplerotik, des Zitronensäure-Zyklus, des Pentosephosphat-
Zyklus, des Aminosäure-Exports und gegebenenfalls
regulatorische Proteine zu verstärken, insbesondere
überzuexprimieren.
Der Begriff "Verstärkung" bzw. "Verstärken" beschreibt in
diesem Zusammenhang die Erhöhung der intrazellulären
Aktivität eines oder mehrerer Enzyme bzw. Proteine in einem
Mikroorganismus, die durch die entsprechende DNA kodiert
werden, indem man beispielsweise die Kopienzahl des Gens
bzw., der Gene erhöht, einen starken Promotor oder ein Gen
verwendet, das für ein entsprechendes Enzym bzw. Protein
mit einer hohen Aktivität kodiert und gegebenenfalls diese
Maßnahmen kombiniert.
So kann für die Herstellung von L-Lysin neben der
Abschwächung des nadA- und/oder nadC-Gens eines oder
mehrere der Gene ausgewählt aus der Gruppe
- - das für eine feed-back resistente Aspartatkinase kodierende Gen lysC (Accession No. P26512),
- - das für die Dihydrodipicolinat-Synthase kodierende Gen dapA (EP-B 0 197 335),
- - das für die Glyceraldehyd-3-Phosphat Dehydrogenase kodierende Gen gap (Eikmanns (1992). Journal of Bacteriology 174: 6076-6086),
- - gleichzeitig das für die Pyruvat Carboxylase kodierende Gen pyc (DE-A-198 31 609),
- - das für die Malat : Chinon Oxidoreduktase kodierende Gen mqo (Molenaar et al., European Journal of Biochemistry 254, 395-403 (1998)),
- - das für die Glucose-6-Phosphat Dehydrogenase kodierende Gen zwf (JP-A-09224661),
- - gleichzeitig das für den Lysin-Export kodierende Gen lysE (DE-A-195 48 222),
- - das für das Zwa1-Protein kodierende Gen zwa1 (DE: 199 59 328.0, DSM 13115)
- - das für die Triosephosphat Isomerase kodierende Gen tpi (Eikmanns (1992), Journal of Bacteriology 174: 6076-6086), und
- - das für die 3-Phosphoglycerat Kinase kodierende Gen pgk (Eikmanns (1992), Journal of Bacteriology 174: 6076-6086),
verstärkt, insbesondere überexprimiert werden.
So kann für die Herstellung von L-Valin neben der
Abschwächung des nadA- und/oder nadC-Gens eines oder
mehrere der Gene ausgewählt aus der Gruppe
- - das für eine feed-back resistente Aspartatkinase kodierende Gen lysC (Accession No. P26512),
- - das für die Homoserin-Dehydrogenase kodierende Gen hom (EP-A 0131171),
- - das für eine feed-back resistente Homoserin-Dehydrogenase kodierende Allel hom(Fbr) (Reinscheid et al. (1991) Journal of Bacteriology 173: 3228-3230),
- - das für die Threonin-Dehydratase kodierende Gen ilvA (Möckel et al., Journal of Bacteriology (1992) 8065-8072)), oder das für eine feed-back resistente Threonin- Dehydratase kodierende Allel ilvA(Fbr) (Möckel et al., (1994) Molecular Microbiology 13: 833-842),
- - das für die Acetohydroxysäure-Synthase kodierenden Gen ilvBN (EP-B 0356739),
- - das für die Dihydroxysäuredehydratase kodierende Gen ilvD (Sahm und Eggeling (1999) Applied and Environmental Microbiology 65: 1973-1979),
- - das für die Glucose-6-Phosphat Dehydrogenase kodierende Gen zwf (JP-A-09224661),
- - gleichzeitig die für den Valin-Export kodierenden Gene brnF- und/oder brnE (DE: 199 51 708.8), und
- - das für das Zwa1-Protein kodierende Gen zwa1 (DE: 199 59 328.0, DSM 13115)
verstärkt, insbesondere überexprimiert werden.
Weiterhin kann es für die Produktion von Aminosäuren,
insbesondere L-Lysin und L-Valin, vorteilhaft sein,
zusätzlich zur Abschwächung des nadA- und/oder nadC-Gens
gleichzeitig eines oder mehrere der Gene, ausgewählt aus
der Gruppe
- - das für die Phosphoenolpyruvat-Carboxykinase kodierende Gen pck (DE 199 50 409.1, DSM 13047),
- - das für die Glucose-6-Phosphat-Isomerase kodierende Gen pgi (US 09/396,478, DSM 12969),
- - das für die Pyruvat-Oxidase kodierende Gen poxB (DE: 199 51 975.7, DSM 13114),
- - das für das Zwa2-Protein kodierende Gen zwa2 (DE: 199 59 327.2, DSM 13113)
abzuschwächen, insbesondere die Expression zu verringern.
Schließlich kann es für die Produktion von Aminosäuren,
vorteilhaft sein, neben der Abschwächung des nadA- und/oder
nadC-Gens unerwünschte Nebenreaktionen auszuschalten
(Nakayama: "Breeding of Amino Acid Producing Micro
organisms", in: Overproduction of Microbial Products,
Krumphanzl, Sikyta, Vanek (eds.), Academic Press, London,
UK, 1982).
Die erfindungsgemäß hergestellten Mikroorganismen sind
ebenfalls Gegenstand der Erfindung und können
kontinuierlich oder diskontinuierlich im batch-Verfahren
(Satzkultivierung) oder im fed batch (Zulaufverfahren) oder
repeated fed batch Verfahren (repetitives Zulaufverfahren)
zum Zwecke der Produktion von L-Aminosäuren kultiviert
werden. Eine Zusammenfassung über bekannte
Kultivierungsmethoden ist im Lehrbuch von Chmiel
(Bioprozesstechnik 1. Einführung in die
Bioverfahrenstechnik (Gustav Fischer Verlag, Stuttgart,
1991)) oder im Lehrbuch von Storhas (Bioreaktoren und
periphere Einrichtungen (Vieweg Verlag,
Braunschweig/Wiesbaden, 1994)) beschrieben.
Das zu verwendende Kulturmedium muß in geeigneter Weise den
Ansprüchen der jeweiligen Stämme genügen. Beschreibungen
von Kulturmedien verschiedener Mikroorganismen sind im
Handbuch "Manual of Methods for General Bacteriology" der
American Society for Bacteriology (Washington D. C., USA,
1981) enthalten.
Als Kohlenstoffquelle können Zucker und Kohlehydrate wie
z. B. Glucose, Saccharose, Lactose, Fructose, Maltose,
Melasse, Stärke und Cellulose, Öle und Fette wie z. B.
Sojaöl, Sonnenblumenöl, Erdnußöl und Kokosfett, Fettsäuren
wie z. B. Palmitinsäure, Stearinsäure und Linolsäure,
Alkohole wie z. B. Glycerin und Ethanol und organische
Säuren wie z. B. Essigsäure verwendet werden. Diese Stoffe
können einzeln oder als Mischung verwendet werden.
Als Stickstoffquelle können organische Stickstoffhaltige
Verbindungen wie Peptone, Hefeextrakt, Fleischextrakt,
Malzextrakt, Maisquellwasser, Sojabohnenmehl und Harnstoff
oder anorganische Verbindungen wie Ammoniumsulfat,
Ammoniumchlorid, Ammoniumphosphat, Ammoniumcarbonat und
Ammoniumnitrat verwendet werden. Die Stickstoffquellen
können einzeln oder als Mischung verwendet werden.
Als Phosphorquelle können Phosphorsäure,
Kaliumdihydrogenphosphat oder Dikaliumhydrogenphosphat oder
die entsprechenden Natrium haltigen Salze verwendet werden.
Das Kulturmedium muß weiterhin Salze von Metallen enthalten
wie z. B. Magnesiumsulfat oder Eisensulfat, die für das
Wachstum notwendig sind. Schließlich können essentielle
Wuchsstoffe wie Aminosäuren und Vitamine zusätzlich zu den
oben genannten Stoffen eingesetzt werden. Dem Kulturmedium
können überdies geeignete Vorstufen zugesetzt werden. Die
genannten Einsatzstoffe können zur Kultur in Form eines
einmaligen Ansatzes hinzugegeben oder in geeigneter Weise
während der Kultivierung zugefüttert werden.
Zur pH-Kontrolle der Kultur werden basische Verbindungen
wie Natriumhydroxid, Kaliumhydroxid, Ammoniak bzw.
Ammoniakwasser oder saure Verbindungen wie Phosphorsäure
oder Schwefelsäure in geeigneter Weise eingesetzt. Zur
Kontrolle der Schaumentwicklung können Antischaummittel wie
z. B. Fettsäurepolyglykolester eingesetzt werden. Zur
Aufrechterhaltung der Stabilität von Plasmiden können dem
Medium geeignete selektiv wirkende Stoffe wie z. B.
Antibiotika hinzugefügt werden. Um aerobe Bedingungen
aufrechtzuerhalten, werden Sauerstoff oder Sauerstoff
haltige Gasmischungen wie z. B. Luft in die Kultur
eingetragen. Die Temperatur der Kultur liegt normalerweise
bei 20°C bis 45°C und vorzugsweise bei 25°C bis 40°C. Die
Kultur wird solange fortgesetzt, bis sich ein Maximum des
gewünschten Produktes gebildet hat. Dieses Ziel wird
normalerweise innerhalb von 10 Stunden bis 160 Stunden
erreicht.
Methoden zur Bestimmung von L-Aminosäuren sind aus dem
Stand der Technik bekannt. Die Analyse kann so wie bei
Spackman et al. (Analytical Chemistry, 30, (1958), 1190)
beschrieben durch Anionenaustauschchromatographie mit
anschließender Ninhydrin Derivatisierung erfolgen, oder sie
kann durch reversed phase HPLC erfolgen, so wie bei
Lindroth et al. (Analytical Chemistry (1979) 51: 1167-1174)
beschrieben.
Die vorliegende Erfindung wird im Folgenden anhand von
Ausführungsbeispielen näher erläutert.
Chromosomale DNA aus Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
wird wie bei Tauch et al. (1995, Plasmid 33: 168-179)
beschrieben isoliert und mit dem Restriktionsenzym Sau3AI
(Amersham Pharmacia, Freiburg, Deutschland,
Produktbeschreibung Sau3AI, Code no. 27-0913-02) partiell
gespalten. Die DNA-Fragmente werden mit shrimp alkalischer
Phosphatase (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Deutschland,
Produktbeschreibung SAP, Code no. 1758250)
dephosphoryliert. Die DNA des Cosmid-Vektors SuperCos1
(Wahl et al. (1987) Proceedings of the National Academy of
Sciences USA 84: 2160-2164), bezogen von der Firma
Stratagene (La Jolla, USA, Produktbeschreibung SuperCos1
Cosmid Vektor Kit, Code no. 251301) wird mit dem
Restriktionsenzym XbaI (Amersham Pharmacia, Freiburg,
Deutschland, Produktbeschreibung XbaI, Code no. 27-0948-02)
gespalten und ebenfalls mit shrimp alkalischer Phosphatase
dephosphoryliert.
Anschließend wird die Cosmid-DNA mit dem Restriktionsenzym
BamHI (Amersham Pharmacia, Freiburg, Deutschland,
Produktbeschreibung BamHI, Code no. 27-0868-04) gespalten.
Die auf diese Weise behandelte Cosmid-DNA wird mit der
behandelten ATCC13032-DNA gemischt und der Ansatz mit T4-
DNA-Ligase (Amersham Pharmacia, Freiburg, Deutschland,
Produktbeschreibung T4-DNA-Ligase, Code no.27-0870-04)
behandelt. Das Ligationsgemisch wird anschließend mit Hilfe
des Gigapack II XL Packing Extracts (Stratagene, La Jolla,
USA, Produktbeschreibung Gigapack II XL Packing Extract,
Code no. 200217) in Phagen verpackt.
Zur Infektion des E. coli Stammes NM554 (Raleigh et al.
1988, Nucleic Acid Research 16: 1563-1575) werden die Zellen
in 10 mM MgSO4 aufgenommen und mit einem Aliquot der
Phagensuspension vermischt. Infektion und Titerung der
Cosmidbank werden wie bei Sambrook et al. (1989, Molecular
Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor)
beschrieben durchgeführt, wobei die Zellen auf LB-Agar
(Lennox, 1955, Virology, 1: 190) mit 100 mg/l Ampicillin
ausplattiert werden. Nach Inkubation über Nacht bei 37°C
werden rekombinante Einzelklone selektioniert.
Die Cosmid-DNA einer Einzelkolonie wird mit dem Qiaprep
Spin Miniprep Kit (Product No. 27106, Qiagen, Hilden,
Germany) nach Herstellerangaben isoliert und mit dem
Restriktionsenzym Sau3AI (Amersham Pharmacia, Freiburg,
Deutschland, Produktbeschreibung Sau3AI, Product No. 27-
0913-02) partiell gespalten. Die DNA-Fragmente werden mit
shrimp alkalischer Phosphatase (Roche Diagnostics GmbH,
Mannheim, Deutschland, Produktbeschreibung SAP, Product No.
1758250) dephosphoryliert. Nach gelelektrophoretischer
Auftrennung erfolgt die Isolierung der Cosmidfragmente im
Größenbereich von 1500 bis 2000 bp mit dem QiaExII Gel
Extraction Kit (Product No. 20021, Qiagen, Hilden,
Germany).
Die DNA des Sequenziervektors pZero-1, bezogen von der
Firma Invitrogen (Groningen, Niederlande,
Produktbeschreibung Zero Background Cloning Kit, Product
No. K2500-01), wird mit dem Restriktionsenzym BamHI
(Amersham Pharmacia, Freiburg, Deutschland,
Produktbeschreibung BamHI, Product No. 27-0868-04)
gespalten. Die Ligation der Cosmidfragmente in den
Sequenziervektor pZero-1 wird wie von Sambrook et al.
(1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring
Harbor) beschrieben durchgeführt, wobei das DNA-Gemisch mit
T4-Ligase (Pharmacia Biotech, Freiburg, Deutschland) über
Nacht inkubiert wird. Dieses Ligationsgemisch wird
anschließend in den E. coli Stamm DH5αMCR (Grant, 1990,
Proceedings of the National Academy of Sciences U. S. A.,
87: 4645-4649) elektroporiert (Tauch et al. 1994, FEMS
Microbiol Letters, 123: 343-7) und auf LB-Agar (Lennox,
1955, Virology, 1: 190) mit 50 mg/l Zeocin ausplattiert.
Die Plasmidpräparation der rekombinanten Klone erfolgt mit
dem Biorobot 9600 (Product No. 900200, Qiagen, Hilden,
Deutschland). Die Sequenzierung erfolgt nach der Dideoxy-
Kettenabbruch-Methode von Sanger et al. (1977, Proceedings
of the National Academy of Sciences U. S. A., 74: 5463-5467)
mit Modifikationen nach Zimmermann et al. (1990, Nucleic
Acids Research, 18: 1067). Es wird der "RR dRhodamin
Terminator Cycle Sequencing Kit" von PE Applied Biosystems
(Product No. 403044, Weiterstadt, Deutschland) verwendet.
Die gelelektrophoretische Auftrennung und Analyse der
Sequenzierreaktion erfolgt in einem "Rotiphorese NF
Acrylamid/Bisacrylamid" Gel (29 : 1) (Product No. A124.1,
Roth, Karlsruhe, Germany) mit dem "ABI Prism 377"
Sequenziergerät von PE Applied Biosystems (Weiterstadt,
Deutschland).
Die erhaltenen Roh-Sequenzdaten werden anschließend unter
Anwendung des Staden-Programpakets (1986, Nucleic Acids
Research, 14: 217-231) Version 97-0 prozessiert. Die
Einzelsequenzen der pZerol-Derivate werden zu einem
zusammenhängenden Contig assembliert. Die computergestützte
Kodierbereichsanalyse wird mit dem Programm XNIP (Staden,
1986, Nucleic Acids Research, 14: 217-231) angefertigt.
Die erhaltene Nukleotidsequenz ist in SEQ ID No. 1
dargestellt. Die Analyse der Nukleotidsequenz ergibt ein
offenes Leseraster von 1287 Basenpaaren, welches als nadA-
Gen bezeichnet wird. Das nadA-Gen kodiert für ein Protein
von 428 Aminosäuren.
Die Isolierung und Sequenzierung des nadC-Gens wird wie in
Beispiel 2 beschrieben durchgeführt.
Die erhaltene Nukleotidsequenz ist in SEQ ID No. 3
dargestellt. Die Analyse ergibt ein offenes Leseraster von
840 Basenpaaren, welches als nadC-Gen bezeichnet wird. Das
nadC-Gen kodiert für ein Polypeptid von 279 Aminosäuren.
Aus dem Stamm ATCC 13032 wird nach der Methode von Eikmanns
et al. (Microbiology 140: 1817-1828 (1994)) chromosomale
DNA isoliert. Aufgrund der aus Beispiel 2 für C.
glutamicum bekannten Sequenz des nadA-Gens werden die
folgenden Oligonukleotide als Primer für die Polymerase
Kettenreaktion ausgewählt:
nadAint1 (dargestellt in SEQ ID No. 7)
5' AAG CGA TTG TGT TCT GCG GT 3'
nadAint2 (dargestellt in SEQ ID No. 8)
5' TCG AGG CAG AAG ATG GTG TG 3'
nadAint1 (dargestellt in SEQ ID No. 7)
5' AAG CGA TTG TGT TCT GCG GT 3'
nadAint2 (dargestellt in SEQ ID No. 8)
5' TCG AGG CAG AAG ATG GTG TG 3'
Die dargestellten Primer werden von der Firma ARK,
Scientific GmbH Biosystems (Darmstadt, Deutschland)
synthetisiert und nach der Standard-PCR-Methode von Innis
et al. (PCR protocols. A guide to methods and applications,
1990, Academic Press) mit Pwo-Polymerase der Firma
Boehringer die PCR Reaktion durchgeführt. Mit Hilfe der
Polymerase-Kettenreaktion wird ein 780 bp großes DNA-
Fragment isoliert, welches ein internes Fragment des nadA-
Gens ist. Es ist in der SEQ ID No. 5 dargestellt.
Das amplifizierte DNA Fragment wird mit dem TOPO TA Cloning
Kit der Firma Invitrogen Corporation (Carlsbad, CA, USA;
Katalog Nummer K4500-01) in den Vektor pCR2.1-TOPO (Mead at
al. (1991) Bio/Technology 9: 657-663) ligiert. Anschließend
wird der E. coli Stamm DH5αmcr mit dem Ligationsansatz
(Hanahan, In: DNA cloning. A practical approach. Vol. I.
IRL-Press, Oxford, Washington DC, USA, 1985)
elektroporiert. Die Selektion von Plasmid-tragenden Zellen
erfolgt durch Ausplattieren des Transformationsansatzes auf
LB Agar (Sambrook et al., Molecular cloning: a laboratory
manual. 2nd Ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold
Spring Harbor, N. Y., 1989), der mit 25 mg/l Kanamycin
supplementiert wird. Plasmid-DNA wird aus einer
Transformante mit Hilfe des QIAprep Spin Miniprep Kit der
Firma Qiagen isoliert und durch Restriktion mit dem
Restriktionsenzym EcoRI und anschließender Agarosegel-
Elektrophorese (0,8%) überprüft. Das Plasmid wird
pCR2.1nadAint genannt. Es ist in Fig. 1 dargestellt.
Wie in Beispiel 3 beschrieben wird aus dem Stamm ATCC 13032
nach der Methode von Eikmanns et al. (Microbiology 140:
1817-1828 (1994)) chromosomale DNA isoliert. Aufgrund der
aus Beispiel 3 für C. glutamicum bekannten Sequenz des
nadC-Gens werden die folgenden Oligonukleotide als Primer
für die Polymerase Kettenreaktion ausgewählt:
nadCintl (dargestellt in SEQ ID No. 9)
5' AGC TGA GCG CCA AGG TTG TT 3'
nadCint2 (dargestellt in SEQ ID No. 10)
5' CGA TGA GCT GAT CAA TGG TG 3'
nadCintl (dargestellt in SEQ ID No. 9)
5' AGC TGA GCG CCA AGG TTG TT 3'
nadCint2 (dargestellt in SEQ ID No. 10)
5' CGA TGA GCT GAT CAA TGG TG 3'
Die dargestellten Primer werden von der Firma ARK,
Scientific GmbH Biosystems (Darmstadt, Deutschland)
synthetisiert und nach der Standard-PCR-Methode von Innis
et al. (PCR protocols. A guide to methods and applications,
1990, Academic Press) mit Pwo-Polymerase der Firma
Boehringer die PCR Reaktion durchgeführt. Mit Hilfe der
Polymerase-Kettenreaktion wird ein 582 bp großes DNA-
Fragment isoliert, welches ein internes Fragment des nadC-
Gens ist. Es ist in der SEQ ID No. 6 dargestellt.
Das amplifizierte DNA Fragment wird mit dem TOPO TA Cloning
Kit der Firma Invitrogen Corporation (Carlsbad, CA, USA;
Katalog Nummer K4500-01) in den Vektor pCR2.1-TOPO (Mead at
al. (1991) Bio/Technology 9: 657-663) ligiert. Anschließend
wird der E. coli Stamm DH5αmcr mit dem Ligationsansatz
(Hanahan, In: DNA cloning. A practical approach. Vol. I.
IRL-Press, Oxford, Washington DC, USA, 1985)
elektroporiert. Die Selektion von Plasmid-tragenden Zellen
erfolgt durch Ausplattieren des Transformationsansatzes auf
LB Agar (Sambrook et al., Molecular cloning: a laboratory
manual. 2nd Ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold
Spring Harbor, N. Y., 1989), der mit 25 mg/l Kanamycin
supplementiert wird. Plasmid-DNA wird aus einer
Transformante mit Hilfe des QIAprep Spin Miniprep Kit der
Firma Qiagen isoliert und durch Restriktion mit dem
Restriktionsenzym EcoRI und anschließender Agarosegel-
Elektrophorese (0,8%) überprüft. Das Plasmid wird
pCR2.1nadCint genannt. Es ist in Fig. 2 dargestellt.
Der in Beispiel 4 genannte Vektor pCR2.1nadAint wird nach
der Elektroporationsmethode von Tauch et. al. (FEMS
Microbiological Letters, 123: 343-347 (1994)) in
Corynebacterium glutamicum DM678 elektroporiert.
Der Corynebacterium glutamicum Stamm DM678 wurde durch
mehrfache Mutagenese und Selektion aus Stamm ATCC13032
hergestellt. Dieser Stamm ist Methionin-sensitiv. Eine
Reinkultur des Stammes DM678 wurde am 15. Juni 1999 bei der
Deutschen Sammlung für Mikroorganismen und Zellkulturen
(DSM, Braunschweig, Deutschland) als DSM12866 hinterlegt.
Der Vektor pCR2.1nadAint kann in DM678 nicht selbständig
replizieren und bleibt nur dann in der Zelle erhalten, wenn
er ins Chromosom von DM678 integriert hat. Die Selektion
von Klonen mit ins Chromosom integriertem pCR2.1nadAint
erfolgt durch Ausplattieren des Elektroporationsansatzes
auf LB Agar (Sambrook et al., Molecular Cloning: A
Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory
Press, Cold Spring Harbor, N. Y.), der mit 15 mg/l Kanamycin
supplementiert ist.
Für den Nachweis der Integration wird das nadAint-Fragment
nach der Methode "The DIG System Users Guide for Filter
Hybridization" der Firma Boehringer Mannheim GmbH
(Mannheim, Deutschland, 1993) mit dem Dig-
Hybridisierungskit der Firma Boehringer markiert.
Chromosomale DNA eines potentiellen Integranten wird nach
der Methode von Eikmanns et al. (Microbiology 140: 1817-1828
(1994)) isoliert und jeweils mit den
Restriktionsenzymen SalI, SacI und HindIII geschnitten.
Die entstehenden Fragmente werden mit Agarosegel-
Elektrophorese aufgetrennt und mit dem Dig-Hybrisierungskit
der Firma Boehringer bei 68°C hybridisiert. Das in Beispiel
4 genannte Plasmid pCR2.1nadAint hat innerhalb des
chromosomalen nadA-Gens ins Chromosom von DM678 inseriert.
Der Stamm wird als DM678::pCR2.1nadAint bezeichnet.
Der in Beispiel 6 erhaltene C.glutamicum Stamm
DM678::pCR2.1nadAint wurde zunächst auf Agarplatte mit dem
entsprechenden Antibiotikum (Hirn-Herz Agar mit 25 mg/l
Kanamycin) für 24 Stunden bei 33°C inkubiert. Ausgehend von
dieser Agarplatte wurde eine Vorkultur angeimpft (40 ml
Medium im 500 ml Erlenmeyerkolben). Als Medium für die
Vorkultur wurde das Medium SK65 verwendet.
CSL (Corn Steep Liquor) | 25 g/l |
Glucose | 23 g/l |
Pepton aus Casein | 20 g/l |
Pepton aus Fleisch | 20 g/l |
Ammoniumsulfat | 8 g/l |
Harnstoff | 3 g/l |
AL=L<Salze: | |
KH2PO4 | 2,0 g/l |
MgSO4.7 H2O | 0,5 g/l |
FeSO4.7 H2O | 10 mg/l |
CuSO4 | 1,0 mg/ml |
ZnSO4 | 10 mg/l |
Thiamin.HCl (sterilfiltriert) | 0,5 mg/l |
Biotin (sterilfiltriert) | 0,2 mg/l |
CaCO3 | 1,6 g/l |
Die Vorkultur wurde 20 Stunden bei 33°C bei 170 rpm auf dem
Schüttler inkubiert.
2,5 g dieser Vorkultur wurde in 831 g des
Fermentationsmediums M1-457 angeimpft. Die
Anzuchtfermentation wurde in 2 l Rührreaktor-Fermentern der
Firma B. Braun (BBI, Deutschland, Melsungen, Modell Biostat
MD) durchgeführt. Das Medium M1-457 enthielt die in Tabelle
1 aufgeführten Bestandteile. Der Fermenter wurde nach
Befüllen mit dem Medium für 30 Minuten bei 121°C
sterilisiert. Lediglich Stärkehydrolysat, Ca-Pantothenat
und Thiamin wurden sterilfiltriert nach dem autoklavieren
zugegeben. Die Kultur wurde bei einer Temperatur von 32°C,
einer Belüftung von 1 l/min., einer minimalen
Rührergeschwindigkeit von 800 rpm und einem pH von 7,0 und
einem Sauerstoffpartialdruck von 20% der Luftsättigung bis
zum Verbrauch des vorgelegten Zuckers kultiviert. Die
Kultur wurde anschließend für weitere 38 Stunden bei einer
Temperatur von 34°C, einem Sauerstoffpartialdruck von 20%
der Luftsättigung und einem pH-Wert von pH 7,0 bis zum
Erreichen einer OD660 von 30,5 kultiviert. Während dieser
Zeit wurden 273,6 g des Mediums M2-242 mit einer Glucose-
Konzentration von 506,3 g/l, einer
Ammoniumsulfatkonzentration von 35,7 g/l und einer KH2PO4
Konzentration von 1,342 g/l zugefüttert.
Anschließend wurden die optische Dichte (OD) mit einem
Digitalphotometer vom Typ LP1W der Firma Dr. Bruno Lange
GmbH (Berlin, Deutschland) bei einer Meßwellenlänge von 660
nm und die Konzentration an gebildetem L-Valin mittels ASA
bestimmt.
In der Fermentationsendprobe wurde nach Ende der
Fermentation eine L-Valin Konzentration von 160 mg/l
festgestellt. In einer Parallelfermentation mit dem
Kontrollstamm C. glutamicum DM678 konnte kein L-Valin
nachgewiesen werden.
Fig. 1 Karte des Plasmides pCR2.1nadAint
Die verwendeten Abkürzungen und Bezeichnungen haben
folgende Bedeutung. Bei der Angabe der Basenpaarzahlen
handelt es sich um Näherungswerte, die im Rahmen der
Reproduzierbarkeit von Messungen erhalten werden.
Kam: Resistenzgen für Kanamycin
Amp: Resistenzgen für Ampicillin
ColEI ori: Replikationsursprung ColEI aus Escherichia coli
EcoRI: Schnittstelle des Restriktionsenzyms EcoRI
nadAint: internes Fragment des nadA-Gens
Kam: Resistenzgen für Kanamycin
Amp: Resistenzgen für Ampicillin
ColEI ori: Replikationsursprung ColEI aus Escherichia coli
EcoRI: Schnittstelle des Restriktionsenzyms EcoRI
nadAint: internes Fragment des nadA-Gens
Fig. 2 Karte des Plasmides pCR2.1nadCint
Die verwendeten Abkürzungen und Bezeichnungen haben
folgende Bedeutung. Bei der Angabe der Basenpaarzahlen
handelt es sich um Näherungswerte, die im Rahmen der
Reproduzierbarkeit von Messungen erhalten werden.
Kam: Resistenzgen für Kanamycin
Amp: Resistenzgen für Ampicillin
ColEI ori: Replikationsursprung ColEI aus Escherichia coli
EcoRI: Schnittstelle des Restriktionsenzyms EcoRI
nadCint internes Fragment des nadC-Gens
Kam: Resistenzgen für Kanamycin
Amp: Resistenzgen für Ampicillin
ColEI ori: Replikationsursprung ColEI aus Escherichia coli
EcoRI: Schnittstelle des Restriktionsenzyms EcoRI
nadCint internes Fragment des nadC-Gens
Claims (9)
1. Verfahren zur fermentativen Herstellung von
L-Aminosäuren, insbesondere L-Lysin und L-Valin,
dadurch gekennzeichnet, daß man
folgende Schritte durchführt,
- a) Fermentation der die gewünschte L-Aminosäure produzierenden coryneformen Bakterien, in denen man zumindest das nadA- und/oder nadC-Gen abschwächt,
- b) Anreicherung des gewünschten Produkts im Medium oder in den Zellen der Bakterien, und
- c) Isolierung der L-Aminosäure.
2. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man Bakterien
einsetzt, in denen man zusätzlich weitere Gene des
Biosyntheseweges der gewünschten L-Aminosäure
verstärkt.
3. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man Bakterien
einsetzt, in denen die Stoffwechselwege zumindest
teilweise ausgeschaltet sind, die die Bildung der
gewünschten L-Aminosäure verringern.
4. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man die Expression
des (der)Polynukleotides (e), das (die) für das nadA-
und/oder nadC-Gen kodiert, verringert.
5. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man die
regulatorischen/katalytischen Eigenschaften des
Polypeptids (Enzymproteins) verringert, für das das
Polynukleotid nadA und/oder nadC kodiert.
6. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man für die
Herstellung von L-Lysin coryneforme Mikroorganismen
fermentiert, in denen man gleichzeitig eines oder
mehrere der Gene, ausgewählt aus der Gruppe
- 1. 6.1 das für eine feed-back resistente Aspartatkinase kodierende Gen lysC,
- 2. 6.2 das für die Dihydrodipicolinat-Synthase kodierende Gen dapA,
- 3. 6.3 das für die Glyceraldehyd-3-Phosphat Dehydrogenase kodierende Gen gap,
- 4. 6.4 das für die Pyruvat Carboxylase kodierende Gen pyc,
- 5. 6.5 das für die Malat : Chinon Oxidoreduktase kodierende Gen mqo,
- 6. 6.6 das für die Glucose-6-Phosphat Dehydrogenase kodierende Gen zwf,
- 7. 6.7 gleichzeitig das für den Lysin-Export kodierende Gen lysE,
- 8. 6.8 das für das Zwa1-Protein kodierende Gen zwa1
- 9. 6.9 das für die Triosephosphat Isomerase kodierende Gen tpi, und
- 10. 6.10 das für die 3-Phosphoglycerat Kinase kodierende Gen pgk,
7. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man für die
Herstellung von L-Valin coryneforme Mikroorganismen
fermentiert, in denen man gleichzeitig eines oder
mehrere der Gene, ausgewählt aus der Gruppe
- 1. 7.1 das für eine feed-back resistente Aspartatkinase kodierende Gen lysC,
- 2. 7.2 das für die Homoserin-Dehydrogenase kodierende Gen hom,
- 3. 7.3 das für eine feed-back resistente Homoserin- Dehydrogenase kodierende Allel hom(Fbr),
- 4. 7.4 das für die Threonin-Dehydratase kodierende Gen ilvA, oder das für eine feed-back resistente Threonin- Dehydratase kodierende Allel ilvA(Fbr),
- 5. 7.5 das für die Acetohydroxysäure-Synthase kodierenden Gen ilvBN,
- 6. 7.6 das für die Dihydroxysäuredehydratase kodierende Gen ilvD,
- 7. 7.7 das für die Glucose-6-Phosphat Dehydrogenase kodierende Gen zwf,
- 8. 7.8 gleichzeitig die für den Valin-Export kodierenden Gene brnF- und/oder brnE, und
- 9. 7.9 das für das Zwa1-Protein kodierende Gen zwa1 verstärkt, insbesondere überexprimiert.
8. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man zur Herstellung
von L-Aminosäuren coryneforme Mikroorganismen
fermentiert, in denen man gleichzeitig eines oder
mehrere der Gene, ausgewählt aus der Gruppe
- 1. 8.1 das für die Phosphoenolpyruvat-Carboxykinase kodierende pck-Gen,
- 2. 8.2 das für die Glucose-6-Phosphat Isomerase kodierende pgi-Gen
- 3. 8.3 das für die Pyruvat-Oxidase kodierende Gen poxB, oder
- 4. 8.4 das für das Zwa2-Protein kodierende Gen zwa2 abschwächt.
9. Verfahren gemäß einem oder mehreren der vorhergehenden
Ansprüche, dadurch gekennzeichnet,
daß man Mikroorganismen der Art Corynebacterium
glutamicum einsetzt.
Priority Applications (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE10110344A DE10110344A1 (de) | 2000-11-10 | 2001-03-03 | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung coryneformer Bakterien |
US09/816,079 US20020168732A1 (en) | 2000-11-10 | 2001-03-26 | Process for the fermentative preparation of L-amino acids using coryneform bacteria |
EP01993698A EP1414985A2 (de) | 2000-11-10 | 2001-10-22 | Verfahren zur fermentativen herstellung von l-aminosäuren unter verwendung coryneformer bakterien |
PCT/EP2001/012176 WO2002038788A2 (en) | 2000-11-10 | 2001-10-22 | Process for the fermentative preparation of l-amino acids using coryneform bacteria |
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DE10110344A DE10110344A1 (de) | 2000-11-10 | 2001-03-03 | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung coryneformer Bakterien |
Publications (1)
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ID=7662903
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DE10110344A Withdrawn DE10110344A1 (de) | 2000-11-10 | 2001-03-03 | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung coryneformer Bakterien |
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Country | Link |
---|---|
DE (1) | DE10110344A1 (de) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2811028B1 (de) * | 2013-06-03 | 2017-02-01 | Evonik Degussa GmbH | Verfahren zur Herstellung von L-Valin unter Verwendung rekombinanter Corynebakterien enthaltend das durch Propionat induzierbare ilvBN-Operon |
-
2001
- 2001-03-03 DE DE10110344A patent/DE10110344A1/de not_active Withdrawn
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2811028B1 (de) * | 2013-06-03 | 2017-02-01 | Evonik Degussa GmbH | Verfahren zur Herstellung von L-Valin unter Verwendung rekombinanter Corynebakterien enthaltend das durch Propionat induzierbare ilvBN-Operon |
US10113190B2 (en) | 2013-06-03 | 2018-10-30 | Evonik Degussa Gmbh | Method for producing L-leucine, L-valine, L-isoleucine, α-ketoisovalerate, α-keto-beta-methylvalerate, or α-ketoisocaproate using recombinant Corynebacteria that contain the ilvBN operon which can be induced by propionate |
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