CN118291456A - 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 - Google Patents
一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 Download PDFInfo
- Publication number
- CN118291456A CN118291456A CN202410311313.2A CN202410311313A CN118291456A CN 118291456 A CN118291456 A CN 118291456A CN 202410311313 A CN202410311313 A CN 202410311313A CN 118291456 A CN118291456 A CN 118291456A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- nucleotide
- nucleotide sequence
- sirna
- alkyl
- seq
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims description 34
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title description 54
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title description 38
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title description 25
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title description 25
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 803
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 683
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 claims abstract description 408
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 claims abstract description 215
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 claims abstract description 215
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 26
- 208000032928 Dyslipidaemia Diseases 0.000 claims abstract description 17
- 208000017170 Lipid metabolism disease Diseases 0.000 claims abstract description 17
- 102100030970 Apolipoprotein C-III Human genes 0.000 claims abstract description 15
- 108010056301 Apolipoprotein C-III Proteins 0.000 claims abstract description 8
- 108010027070 Apolipoproteins C Proteins 0.000 claims abstract description 7
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 116
- -1 D-4-thioribose Chemical compound 0.000 claims description 106
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 87
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 63
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 61
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 46
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 claims description 43
- 125000001188 haloalkyl group Chemical group 0.000 claims description 42
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 41
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 36
- 125000000008 (C1-C10) alkyl group Chemical group 0.000 claims description 35
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims description 35
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims description 33
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 30
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 25
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 25
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 23
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 22
- 125000005037 alkyl phenyl group Chemical group 0.000 claims description 22
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 21
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 21
- OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N N-Acetyl-D-Galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N 0.000 claims description 18
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 claims description 18
- 125000000548 ribosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 claims description 18
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 17
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims description 16
- 101150001527 APOC3 gene Proteins 0.000 claims description 15
- 125000001153 fluoro group Chemical group F* 0.000 claims description 15
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 15
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 claims description 13
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 claims description 13
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 13
- 102000005427 Asialoglycoprotein Receptor Human genes 0.000 claims description 12
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims description 12
- 108010006523 asialoglycoprotein receptor Proteins 0.000 claims description 12
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 claims description 12
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 claims description 11
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims description 11
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 11
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 claims description 11
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 claims description 11
- 229910052770 Uranium Inorganic materials 0.000 claims description 10
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims description 10
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 claims description 10
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 10
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 claims description 10
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Natural products O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 claims description 9
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 claims description 9
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 9
- 229960003082 galactose Drugs 0.000 claims description 9
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 claims description 9
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims description 9
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 claims description 8
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N Thymine Natural products CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 125000005549 heteroarylene group Chemical group 0.000 claims description 8
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 claims description 8
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 claims description 7
- 125000004450 alkenylene group Chemical group 0.000 claims description 7
- 125000004419 alkynylene group Chemical group 0.000 claims description 7
- 125000000732 arylene group Chemical group 0.000 claims description 7
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 claims description 7
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 claims description 7
- 125000001313 C5-C10 heteroaryl group Chemical group 0.000 claims description 6
- 125000000824 D-ribofuranosyl group Chemical group [H]OC([H])([H])[C@@]1([H])OC([H])(*)[C@]([H])(O[H])[C@]1([H])O[H] 0.000 claims description 6
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- MSWZFWKMSRAUBD-UHFFFAOYSA-N beta-D-galactosamine Natural products NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O MSWZFWKMSRAUBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 claims description 6
- 125000004093 cyano group Chemical group *C#N 0.000 claims description 6
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 claims description 6
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 claims description 6
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 claims description 5
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 claims description 5
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims description 5
- WQZGKKKJIJFFOK-SVZMEOIVSA-N (+)-Galactose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-SVZMEOIVSA-N 0.000 claims description 4
- 125000000027 (C1-C10) alkoxy group Chemical group 0.000 claims description 4
- 108010002913 Asialoglycoproteins Proteins 0.000 claims description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 claims description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 claims description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-UHFFFAOYSA-N alpha-D-glucopyranose Natural products OCC1OC(O)C(O)C(O)C1O WQZGKKKJIJFFOK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 claims description 4
- 229960001031 glucose Drugs 0.000 claims description 4
- MSWZFWKMSRAUBD-GASJEMHNSA-N 2-amino-2-deoxy-D-galactopyranose Chemical compound N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O MSWZFWKMSRAUBD-GASJEMHNSA-N 0.000 claims description 3
- 201000001320 Atherosclerosis Diseases 0.000 claims description 3
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 claims description 3
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N Thiophosphoric acid Chemical group OP(O)(S)=O RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N beta-N-Acetyl-D-neuraminic acid Natural products CC(=O)NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 3
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 claims description 3
- 208000006575 hypertriglyceridemia Diseases 0.000 claims description 3
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims description 3
- SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N sialic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)OC1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N 0.000 claims description 3
- KGSURTOFVLAWDC-DGPNFKTASA-N (2R,3R,4R,5R,6R)-6-(hydroxymethyl)-5-sulfanyloxane-2,3,4-triol Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1S KGSURTOFVLAWDC-DGPNFKTASA-N 0.000 claims description 2
- KNWYARBAEIMVMZ-VFUOTHLCSA-N (2r,3r,4s,5s,6r)-6-(hydroxymethyl)thiane-2,3,4,5-tetrol Chemical compound OC[C@H]1S[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O KNWYARBAEIMVMZ-VFUOTHLCSA-N 0.000 claims description 2
- ZXNYUXIMAXVSFN-VFUOTHLCSA-N 2,2,2-trifluoro-n-[(2r,3r,4r,5r,6r)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](NC(=O)C(F)(F)F)[C@@H](O)[C@H]1O ZXNYUXIMAXVSFN-VFUOTHLCSA-N 0.000 claims description 2
- 208000035150 Hypercholesterolemia Diseases 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-DHVFOXMCSA-N L-galactose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-DHVFOXMCSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-ZZWDRFIYSA-N L-glucose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-ZZWDRFIYSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-JFNONXLTSA-N L-mannopyranose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-JFNONXLTSA-N 0.000 claims description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-OWMBCFKOSA-N L-ribopyranose Chemical compound O[C@H]1COC(O)[C@@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-OWMBCFKOSA-N 0.000 claims description 2
- RTEOJYOKWPEKKN-HXQZNRNWSA-N N-[(3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]propanamide Chemical compound CCC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O RTEOJYOKWPEKKN-HXQZNRNWSA-N 0.000 claims description 2
- FDJKUWYYUZCUJX-VTERZIIISA-N N-glycoloyl-alpha-neuraminic acid Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O[C@@](O)(C(O)=O)C[C@H](O)[C@H]1NC(=O)CO FDJKUWYYUZCUJX-VTERZIIISA-N 0.000 claims description 2
- XCNAXXASMDOJER-DMRKSPOLSA-N [(2R)-2-acetyloxy-2-[(2R,3R,4S,6S)-3,4-diacetyloxy-6-ethylsulfanylthian-2-yl]ethyl] acetate Chemical compound CCS[C@@H]1C[C@H](OC(C)=O)[C@@H](OC(C)=O)[C@H](S1)[C@@H](COC(C)=O)OC(C)=O XCNAXXASMDOJER-DMRKSPOLSA-N 0.000 claims description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-MROZADKFSA-N aldehydo-L-ribose Chemical compound OC[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-MROZADKFSA-N 0.000 claims description 2
- 229930195726 aldehydo-L-xylose Natural products 0.000 claims description 2
- RFSUNEUAIZKAJO-ZXXMMSQZSA-N alpha-D-fructofuranose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 claims description 2
- LKDRXBCSQODPBY-ZXXMMSQZSA-N alpha-D-fructopyranose Chemical compound OC[C@]1(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O LKDRXBCSQODPBY-ZXXMMSQZSA-N 0.000 claims description 2
- AVVWPBAENSWJCB-TVIMKVIFSA-N alpha-D-galactofuranose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AVVWPBAENSWJCB-TVIMKVIFSA-N 0.000 claims description 2
- GZCGUPFRVQAUEE-UHFFFAOYSA-N alpha-D-galactose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C(O)C=O GZCGUPFRVQAUEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-DVKNGEFBSA-N alpha-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-DVKNGEFBSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-PQMKYFCFSA-N alpha-D-mannose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PQMKYFCFSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-FPRJBGLDSA-N beta-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-FPRJBGLDSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-RWOPYEJCSA-N beta-D-mannose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-RWOPYEJCSA-N 0.000 claims description 2
- 229960002246 beta-d-glucopyranose Drugs 0.000 claims description 2
- MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 2-amino-2-deoxy-D-glucopyranose Chemical compound N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 0.000 claims 1
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- PYMYPHUHKUWMLA-WISUUJSJSA-N aldehydo-L-xylose Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WISUUJSJSA-N 0.000 claims 1
- AVVWPBAENSWJCB-DGPNFKTASA-N beta-D-galactofuranose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AVVWPBAENSWJCB-DGPNFKTASA-N 0.000 claims 1
- 229960002442 glucosamine Drugs 0.000 claims 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 abstract description 41
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract description 14
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 384
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 188
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 157
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 147
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 140
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 123
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 112
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 90
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 86
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 72
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 67
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 65
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 65
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 63
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 62
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 62
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 60
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 59
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 59
- 239000002585 base Substances 0.000 description 55
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 55
- 239000000047 product Substances 0.000 description 55
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 49
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 48
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 48
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 45
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 description 44
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 40
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 39
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 36
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 35
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 34
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 34
- VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 4-Dimethylaminopyridine Chemical compound CN(C)C1=CC=NC=C1 VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 33
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 32
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 32
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 31
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 30
- JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N dichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)Cl JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 30
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 30
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 30
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 29
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 28
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 26
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 26
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 26
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 25
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 25
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 25
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 24
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 23
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 23
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 23
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 22
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N N-Methylmorpholine Chemical compound CN1CCOCC1 SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 18
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 17
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 17
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 17
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 16
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 15
- 229960005215 dichloroacetic acid Drugs 0.000 description 15
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 15
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 15
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 150000001350 alkyl halides Chemical class 0.000 description 14
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 14
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 14
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 14
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 13
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 13
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 13
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 13
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 238000005187 foaming Methods 0.000 description 12
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 12
- 239000012046 mixed solvent Substances 0.000 description 12
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 12
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical class O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 12
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 12
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 11
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 11
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 11
- 239000004210 ether based solvent Substances 0.000 description 11
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 11
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 1,2-Dichloroethane Chemical compound ClCCCl WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 10
- 125000002103 4,4'-dimethoxytriphenylmethyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)(C1=C([H])C([H])=C(OC([H])([H])[H])C([H])=C1[H])C1=C([H])C([H])=C(OC([H])([H])[H])C([H])=C1[H] 0.000 description 10
- IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N Dimethyl sulfoxide Chemical compound [2H]C([2H])([2H])S(=O)C([2H])([2H])[2H] IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N 0.000 description 10
- 239000004593 Epoxy Substances 0.000 description 10
- 101000793223 Homo sapiens Apolipoprotein C-III Proteins 0.000 description 10
- BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N Methylamine Chemical compound NC BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 10
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N nitrogen Substances N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-1H-imidazole Chemical compound CN1C=CN=C1 MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 9
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 9
- UNXNGGMLCSMSLH-UHFFFAOYSA-N dihydrogen phosphate;triethylazanium Chemical compound OP(O)(O)=O.CCN(CC)CC UNXNGGMLCSMSLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 9
- FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 2-(chloromethyl)pyridine-3-carbonitrile Chemical compound ClCC1=NC=CC=C1C#N FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- YTPLMLYBLZKORZ-UHFFFAOYSA-N Thiophene Chemical compound C=1C=CSC=1 YTPLMLYBLZKORZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 8
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 8
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 8
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 8
- 230000006870 function Effects 0.000 description 8
- 125000003147 glycosyl group Chemical group 0.000 description 8
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 8
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 8
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 8
- 230000008569 process Effects 0.000 description 8
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 8
- 229940014800 succinic anhydride Drugs 0.000 description 8
- JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N triphenylmethyl chloride Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(Cl)C1=CC=CC=C1 JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- UIIMBOGNXHQVGW-DEQYMQKBSA-M Sodium bicarbonate-14C Chemical class [Na+].O[14C]([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-DEQYMQKBSA-M 0.000 description 7
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 7
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 7
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 7
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 7
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 7
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 7
- AJDPNPAGZMZOMN-UHFFFAOYSA-N diethyl (4-oxo-1,2,3-benzotriazin-3-yl) phosphate Chemical compound C1=CC=C2C(=O)N(OP(=O)(OCC)OCC)N=NC2=C1 AJDPNPAGZMZOMN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 description 7
- 239000005457 ice water Substances 0.000 description 7
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 7
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 7
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 7
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 7
- 150000004713 phosphodiesters Chemical class 0.000 description 7
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 7
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 7
- 238000005486 sulfidation Methods 0.000 description 7
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 7
- 238000004073 vulcanization Methods 0.000 description 7
- JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro-(4-methoxyphenyl)-phenylmethyl]-4-methoxybenzene Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC(OC)=CC=1)C1=CC=CC=C1 JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical group [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N Guanine Natural products O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000002015 acyclic group Chemical group 0.000 description 6
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 6
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 6
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 6
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Natural products NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000011033 desalting Methods 0.000 description 6
- 125000000532 dioxanyl group Chemical group 0.000 description 6
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 6
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 6
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 6
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 6
- 230000009437 off-target effect Effects 0.000 description 6
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 6
- SXADIBFZNXBEGI-UHFFFAOYSA-N phosphoramidous acid Chemical group NP(O)O SXADIBFZNXBEGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 6
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 6
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 5
- GONFBOIJNUKKST-UHFFFAOYSA-N 5-ethylsulfanyl-2h-tetrazole Chemical compound CCSC=1N=NNN=1 GONFBOIJNUKKST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102000018655 Apolipoproteins C Human genes 0.000 description 5
- 101000887162 Gallus gallus Gallinacin-5 Proteins 0.000 description 5
- 101000887166 Gallus gallus Gallinacin-7 Proteins 0.000 description 5
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 101000608768 Rattus norvegicus Galectin-5 Proteins 0.000 description 5
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 5
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 5
- 239000000337 buffer salt Substances 0.000 description 5
- 150000007942 carboxylates Chemical class 0.000 description 5
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 5
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 5
- 125000001028 difluoromethyl group Chemical group [H]C(F)(F)* 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 238000005886 esterification reaction Methods 0.000 description 5
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 5
- 230000002440 hepatic effect Effects 0.000 description 5
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 description 5
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 5
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 5
- 125000004123 n-propyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 5
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 5
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 5
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 5
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 5
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 5
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 5
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 5
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 5
- JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M sodium periodate Chemical compound [Na+].[O-]I(=O)(=O)=O JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 description 5
- 125000002023 trifluoromethyl group Chemical group FC(F)(F)* 0.000 description 5
- KJUGUADJHNHALS-UHFFFAOYSA-N 1H-tetrazole Chemical compound C=1N=NNN=1 KJUGUADJHNHALS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- FZKCAHQKNJXICB-UHFFFAOYSA-N 2,1-benzoxazole Chemical compound C1=CC=CC2=CON=C21 FZKCAHQKNJXICB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- BMTZEAOGFDXDAD-UHFFFAOYSA-M 4-(4,6-dimethoxy-1,3,5-triazin-2-yl)-4-methylmorpholin-4-ium;chloride Chemical compound [Cl-].COC1=NC(OC)=NC([N+]2(C)CCOCC2)=N1 BMTZEAOGFDXDAD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 4
- 108091093094 Glycol nucleic acid Proteins 0.000 description 4
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 4
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 4
- 238000012228 RNA interference-mediated gene silencing Methods 0.000 description 4
- STSCVKRWJPWALQ-UHFFFAOYSA-N TRIFLUOROACETIC ACID ETHYL ESTER Chemical compound CCOC(=O)C(F)(F)F STSCVKRWJPWALQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 4
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 4
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 4
- 150000001721 carbon Chemical group 0.000 description 4
- FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N chloroacetic acid Chemical compound OC(=O)CCl FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 125000004772 dichloromethyl group Chemical group [H]C(Cl)(Cl)* 0.000 description 4
- 150000002118 epoxides Chemical class 0.000 description 4
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 4
- 239000012065 filter cake Substances 0.000 description 4
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 4
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 4
- 125000005059 halophenyl group Chemical group 0.000 description 4
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 description 4
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 description 4
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 4
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 4
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 4
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 4
- 239000007800 oxidant agent Substances 0.000 description 4
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 4
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 4
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 4
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 4
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 4
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 4
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 4
- YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N trichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)(Cl)Cl YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000003866 trichloromethyl group Chemical group ClC(Cl)(Cl)* 0.000 description 4
- KWVJHCQQUFDPLU-YEUCEMRASA-N 2,3-bis[[(z)-octadec-9-enoyl]oxy]propyl-trimethylazanium Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(C[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC KWVJHCQQUFDPLU-YEUCEMRASA-N 0.000 description 3
- KQIGMPWTAHJUMN-UHFFFAOYSA-N 3-aminopropane-1,2-diol Chemical compound NCC(O)CO KQIGMPWTAHJUMN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 3
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010001517 Galectin 3 Proteins 0.000 description 3
- 102100039558 Galectin-3 Human genes 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 3
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 3
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 3
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 3
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 3
- 229910001413 alkali metal ion Inorganic materials 0.000 description 3
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 3
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 3
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical group [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000011203 carbon fibre reinforced carbon Substances 0.000 description 3
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 3
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 3
- 238000006482 condensation reaction Methods 0.000 description 3
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 3
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 3
- BNKAXGCRDYRABM-UHFFFAOYSA-N ethenyl dihydrogen phosphate Chemical compound OP(O)(=O)OC=C BNKAXGCRDYRABM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N folic acid Chemical compound C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 3
- UIZVMOZAXAMASY-UHFFFAOYSA-N hex-5-en-1-ol Chemical compound OCCCCC=C UIZVMOZAXAMASY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 description 3
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 3
- 239000012669 liquid formulation Substances 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 3
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 3
- OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N phosphorous acid Chemical compound OP(O)O OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 3
- 229910001415 sodium ion Inorganic materials 0.000 description 3
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 3
- 239000012265 solid product Substances 0.000 description 3
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 239000012096 transfection reagent Substances 0.000 description 3
- 229910021642 ultra pure water Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000012498 ultrapure water Substances 0.000 description 3
- DKPVADYIAYWCGB-UHFFFAOYSA-N (1-chloro-3,3-diphenylpropyl)benzene Chemical compound C1(=CC=CC=C1)C(CC(Cl)C1=CC=CC=C1)C1=CC=CC=C1 DKPVADYIAYWCGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N (±)-α-Tocopherol Chemical compound OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SCYULBFZEHDVBN-UHFFFAOYSA-N 1,1-Dichloroethane Chemical compound CC(Cl)Cl SCYULBFZEHDVBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PIXGWQWJMXYFMU-UHFFFAOYSA-N 1-(3-chloropentan-3-yl)-2-phenylbenzene Chemical compound C1(=CC=CC=C1)C1=C(C=CC=C1)C(Cl)(CC)CC PIXGWQWJMXYFMU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZAFWPRJYCRGMNS-UHFFFAOYSA-N 1-(chloromethyl)-2,3,4-triethylbenzene Chemical compound CCC1=CC=C(CCl)C(CC)=C1CC ZAFWPRJYCRGMNS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FCEHBMOGCRZNNI-UHFFFAOYSA-N 1-benzothiophene Chemical compound C1=CC=C2SC=CC2=C1 FCEHBMOGCRZNNI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JPSKCQCQZUGWNM-UHFFFAOYSA-N 2,7-Oxepanedione Chemical compound O=C1CCCCC(=O)O1 JPSKCQCQZUGWNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 description 2
- RKVHNYJPIXOHRW-UHFFFAOYSA-N 3-bis[di(propan-2-yl)amino]phosphanyloxypropanenitrile Chemical compound CC(C)N(C(C)C)P(N(C(C)C)C(C)C)OCCC#N RKVHNYJPIXOHRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GXGKKIPUFAHZIZ-UHFFFAOYSA-N 5-benzylsulfanyl-2h-tetrazole Chemical compound C=1C=CC=CC=1CSC=1N=NNN=1 GXGKKIPUFAHZIZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 2
- 229920001661 Chitosan Polymers 0.000 description 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 2
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 2
- GKQLYSROISKDLL-UHFFFAOYSA-N EEDQ Chemical compound C1=CC=C2N(C(=O)OCC)C(OCC)C=CC2=C1 GKQLYSROISKDLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010001496 Galectin 2 Proteins 0.000 description 2
- 108010001515 Galectin 4 Proteins 0.000 description 2
- 102100021735 Galectin-2 Human genes 0.000 description 2
- 102100039556 Galectin-4 Human genes 0.000 description 2
- 101000600434 Homo sapiens Putative uncharacterized protein encoded by MIR7-3HG Proteins 0.000 description 2
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-REOHCLBHSA-N L-Lactic acid Natural products C[C@H](O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 2
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 2
- 101100170604 Mus musculus Dmap1 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 229920002873 Polyethylenimine Polymers 0.000 description 2
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 102100037401 Putative uncharacterized protein encoded by MIR7-3HG Human genes 0.000 description 2
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 2
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 2
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical compound [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FKNQFGJONOIPTF-UHFFFAOYSA-N Sodium cation Chemical group [Na+] FKNQFGJONOIPTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical group [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 2
- 125000005605 benzo group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000499 benzofuranyl group Chemical group O1C(=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 2
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 125000001246 bromo group Chemical group Br* 0.000 description 2
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 2
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 2
- 101150002095 capB gene Proteins 0.000 description 2
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002041 carbon nanotube Substances 0.000 description 2
- 229910021393 carbon nanotube Inorganic materials 0.000 description 2
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 239000012295 chemical reaction liquid Substances 0.000 description 2
- 125000001309 chloro group Chemical group Cl* 0.000 description 2
- 150000001841 cholesterols Chemical class 0.000 description 2
- 238000011097 chromatography purification Methods 0.000 description 2
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000001511 cyclopentyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 2
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 2
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 2
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000010612 desalination reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 2
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 2
- 239000006260 foam Substances 0.000 description 2
- 235000019152 folic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000011724 folic acid Substances 0.000 description 2
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 2
- 238000012226 gene silencing method Methods 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- VANNPISTIUFMLH-UHFFFAOYSA-N glutaric anhydride Chemical compound O=C1CCCC(=O)O1 VANNPISTIUFMLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 102000057403 human APOC3 Human genes 0.000 description 2
- IKGLACJFEHSFNN-UHFFFAOYSA-N hydron;triethylazanium;trifluoride Chemical compound F.F.F.CCN(CC)CC IKGLACJFEHSFNN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 2
- 125000002346 iodo group Chemical group I* 0.000 description 2
- 238000004811 liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 2
- 239000002122 magnetic nanoparticle Substances 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 2
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002950 monocyclic group Chemical group 0.000 description 2
- UMRZSTCPUPJPOJ-KNVOCYPGSA-N norbornane Chemical group C1C[C@H]2CC[C@@H]1C2 UMRZSTCPUPJPOJ-KNVOCYPGSA-N 0.000 description 2
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 2
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 229920000962 poly(amidoamine) Polymers 0.000 description 2
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 description 2
- SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M potassium acetate Chemical compound [K+].CC([O-])=O SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 2
- 239000003223 protective agent Substances 0.000 description 2
- 125000002098 pyridazinyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000004076 pyridyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000168 pyrrolyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000001453 quaternary ammonium group Chemical group 0.000 description 2
- 125000002294 quinazolinyl group Chemical group N1=C(N=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 2
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 2
- YBCAZPLXEGKKFM-UHFFFAOYSA-K ruthenium(iii) chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Cl-].[Ru+3] YBCAZPLXEGKKFM-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 230000001743 silencing effect Effects 0.000 description 2
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 2
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 2
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JHJLBTNAGRQEKS-UHFFFAOYSA-M sodium bromide Chemical compound [Na+].[Br-] JHJLBTNAGRQEKS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 238000005507 spraying Methods 0.000 description 2
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 2
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 2
- 125000000547 substituted alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 239000011593 sulfur Chemical group 0.000 description 2
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 238000007910 systemic administration Methods 0.000 description 2
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 2
- MHYGQXWCZAYSLJ-UHFFFAOYSA-N tert-butyl-chloro-diphenylsilane Chemical compound C=1C=CC=CC=1[Si](Cl)(C(C)(C)C)C1=CC=CC=C1 MHYGQXWCZAYSLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 125000001544 thienyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 2
- 229930192474 thiophene Natural products 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011200 topical administration Methods 0.000 description 2
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 2
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 2
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 2
- FTVLMFQEYACZNP-UHFFFAOYSA-N trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate Chemical compound C[Si](C)(C)OS(=O)(=O)C(F)(F)F FTVLMFQEYACZNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 2
- 239000008215 water for injection Substances 0.000 description 2
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CYNAPIVXKRLDER-LBPRGKRZSA-N (2s)-2-benzamido-3-(4-hydroxy-3-nitrophenyl)propanoic acid Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)C=1C=CC=CC=1)C1=CC=C(O)C([N+]([O-])=O)=C1 CYNAPIVXKRLDER-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 1
- VZSNLZWOUKDPBQ-UHFFFAOYSA-N (3-chloro-1-phenylpropyl)benzene Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(CCCl)C1=CC=CC=C1 VZSNLZWOUKDPBQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006527 (C1-C5) alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004169 (C1-C6) alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- UCTWMZQNUQWSLP-VIFPVBQESA-N (R)-adrenaline Chemical compound CNC[C@H](O)C1=CC=C(O)C(O)=C1 UCTWMZQNUQWSLP-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 229930182837 (R)-adrenaline Natural products 0.000 description 1
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- 125000004973 1-butenyl group Chemical group C(=CCC)* 0.000 description 1
- 125000004972 1-butynyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C#C* 0.000 description 1
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HEOWQJGVSLWLKF-UHFFFAOYSA-N 2-[(2-oxo-1,3,2$l^{5}-dioxaphospholan-2-yl)oxy]ethanamine Chemical compound NCCOP1(=O)OCCO1 HEOWQJGVSLWLKF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MSWZFWKMSRAUBD-VFUOTHLCSA-N 2-amino-2-deoxy-beta-D-galactopyranose Chemical compound N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O MSWZFWKMSRAUBD-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- MLFIYYDKLNZLAO-UHFFFAOYSA-N 2-aminoethane-1,1-diol Chemical compound NCC(O)O MLFIYYDKLNZLAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004777 2-fluoroethyl group Chemical group [H]C([H])(F)C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001494 2-propynyl group Chemical group [H]C#CC([H])([H])* 0.000 description 1
- NOIIUHRQUVNIDD-UHFFFAOYSA-N 3-[[oxo(pyridin-4-yl)methyl]hydrazo]-N-(phenylmethyl)propanamide Chemical compound C=1C=CC=CC=1CNC(=O)CCNNC(=O)C1=CC=NC=C1 NOIIUHRQUVNIDD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000474 3-butynyl group Chemical group [H]C#CC([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- ZOUXTTNTFFBAQN-UHFFFAOYSA-N 3-chloro-3-ethylpentane Chemical compound CCC(Cl)(CC)CC ZOUXTTNTFFBAQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LHMUUYGTNILHKI-UHFFFAOYSA-N 3-chloropentan-3-ylbenzene Chemical compound CCC(Cl)(CC)C1=CC=CC=C1 LHMUUYGTNILHKI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004679 31P NMR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004172 4-methoxyphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(OC([H])([H])[H])=C([H])C([H])=C1* 0.000 description 1
- 125000005986 4-piperidonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 208000035657 Abasia Diseases 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 description 1
- 101100394734 Aspergillus oryzae (strain ATCC 42149 / RIB 40) hepG gene Proteins 0.000 description 1
- 108091032955 Bacterial small RNA Proteins 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000283074 Equus asinus Species 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 1
- 230000005526 G1 to G0 transition Effects 0.000 description 1
- 102100021736 Galectin-1 Human genes 0.000 description 1
- 102400000321 Glucagon Human genes 0.000 description 1
- 108060003199 Glucagon Proteins 0.000 description 1
- AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N Glycolic acid Natural products OCC(O)=O AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000015779 HDL Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010010234 HDL Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 229940121710 HMGCoA reductase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 101100342821 Haemonchus contortus GAL-1 gene Proteins 0.000 description 1
- SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N Hexa-Ac-myo-Inositol Natural products CC(=O)OC1C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C1OC(C)=O SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000614095 Homo sapiens Proton-activated chloride channel Proteins 0.000 description 1
- 208000031226 Hyperlipidaemia Diseases 0.000 description 1
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 description 1
- 235000019766 L-Lysine Nutrition 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 1
- 102000007330 LDL Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010007622 LDL Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 241000282553 Macaca Species 0.000 description 1
- 241000282567 Macaca fascicularis Species 0.000 description 1
- 241000282560 Macaca mulatta Species 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 229920000057 Mannan Polymers 0.000 description 1
- 241001089723 Metaphycus omega Species 0.000 description 1
- SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N N-Methylpyrrolidone Chemical compound CN1CCCC1=O SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N N-Pteroyl-L-glutaminsaeure Natural products C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QOELQYIFQXVVAD-DBKUKYHUSA-N N-[(3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide hydrochloride Chemical compound Cl.C(C)(=O)N[C@H]1C(O)O[C@@H]([C@@H]([C@@H]1O)O)CO QOELQYIFQXVVAD-DBKUKYHUSA-N 0.000 description 1
- SUHOOTKUPISOBE-UHFFFAOYSA-N O-phosphoethanolamine Chemical compound NCCOP(O)(O)=O SUHOOTKUPISOBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GOQNKRPYPIQLQG-UHFFFAOYSA-N OP(O)(O)=S.OP(O)(O)=S Chemical compound OP(O)(O)=S.OP(O)(O)=S GOQNKRPYPIQLQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010033645 Pancreatitis Diseases 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 239000004952 Polyamide Substances 0.000 description 1
- 108010039918 Polylysine Proteins 0.000 description 1
- 102100040631 Proton-activated chloride channel Human genes 0.000 description 1
- 230000006819 RNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 108091030071 RNAI Proteins 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical class O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 102000004338 Transferrin Human genes 0.000 description 1
- 108090000901 Transferrin Proteins 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Chemical class O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 description 1
- 229930003427 Vitamin E Natural products 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 150000001242 acetic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000007960 acetonitrile Chemical class 0.000 description 1
- 125000000641 acridinyl group Chemical group C1(=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3C=C12)* 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- 230000001476 alcoholic effect Effects 0.000 description 1
- 150000001335 aliphatic alkanes Chemical class 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003513 alkali Substances 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 description 1
- HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N alpha-acetylene Natural products C#C HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007112 amidation reaction Methods 0.000 description 1
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 229920003180 amino resin Polymers 0.000 description 1
- 125000004202 aminomethyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N arabinose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N 0.000 description 1
- 239000012300 argon atmosphere Substances 0.000 description 1
- 108010044715 asialofetuin Proteins 0.000 description 1
- 108010084541 asialoorosomucoid Proteins 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 125000002393 azetidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003785 benzimidazolyl group Chemical group N1=C(NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000005870 benzindolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005873 benzo[d]thiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005878 benzonaphthofuranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004619 benzopyranyl group Chemical group O1C(C=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000005874 benzothiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004196 benzothienyl group Chemical group S1C(=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- QRUDEWIWKLJBPS-UHFFFAOYSA-N benzotriazole Chemical compound C1=CC=C2N[N][N]C2=C1 QRUDEWIWKLJBPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012964 benzotriazole Substances 0.000 description 1
- 125000004541 benzoxazolyl group Chemical group O1C(=NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 239000003613 bile acid Substances 0.000 description 1
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 description 1
- 125000005510 but-1-en-2-yl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005514 but-1-yn-3-yl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004369 butenyl group Chemical group C(=CCC)* 0.000 description 1
- 125000000480 butynyl group Chemical group [*]C#CC([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 1
- VPWAVWZPVGDNMN-UHFFFAOYSA-L calcium;2,3-dihydroxypropanoate Chemical compound [Ca+2].OCC(O)C([O-])=O.OCC(O)C([O-])=O VPWAVWZPVGDNMN-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 125000000609 carbazolyl group Chemical group C1(=CC=CC=2C3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 150000001733 carboxylic acid esters Chemical class 0.000 description 1
- 230000001906 cholesterol absorption Effects 0.000 description 1
- 238000013375 chromatographic separation Methods 0.000 description 1
- 125000000259 cinnolinyl group Chemical group N1=NC(=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 239000007859 condensation product Substances 0.000 description 1
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 1
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 1
- 125000001995 cyclobutyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000000596 cyclohexenyl group Chemical group C1(=CCCCC1)* 0.000 description 1
- 125000000113 cyclohexyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000002433 cyclopentenyl group Chemical group C1(=CCCC1)* 0.000 description 1
- 125000001559 cyclopropyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C1([H])* 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 125000005507 decahydroisoquinolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000006837 decompression Effects 0.000 description 1
- 238000006356 dehydrogenation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000412 dendrimer Substances 0.000 description 1
- 229920000736 dendritic polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 125000005509 dibenzothiophenyl group Chemical group 0.000 description 1
- WGLUMOCWFMKWIL-UHFFFAOYSA-N dichloromethane;methanol Chemical compound OC.ClCCl WGLUMOCWFMKWIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 238000004821 distillation Methods 0.000 description 1
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 1
- 238000009509 drug development Methods 0.000 description 1
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 1
- 229960005139 epinephrine Drugs 0.000 description 1
- 238000011067 equilibration Methods 0.000 description 1
- 230000008029 eradication Effects 0.000 description 1
- 229960004756 ethanol Drugs 0.000 description 1
- 125000002534 ethynyl group Chemical group [H]C#C* 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000000556 factor analysis Methods 0.000 description 1
- 229940125753 fibrate Drugs 0.000 description 1
- 125000003983 fluorenyl group Chemical group C1(=CC=CC=2C3=CC=CC=C3CC12)* 0.000 description 1
- 229940014144 folate Drugs 0.000 description 1
- 229960000304 folic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960002737 fructose Drugs 0.000 description 1
- 125000003844 furanonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002541 furyl group Chemical group 0.000 description 1
- WIGCFUFOHFEKBI-UHFFFAOYSA-N gamma-tocopherol Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC1CCC2C(C)C(O)C(C)C(C)C2O1 WIGCFUFOHFEKBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MASNOZXLGMXCHN-ZLPAWPGGSA-N glucagon Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC=1NC=NC=1)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C1=CC=CC=C1 MASNOZXLGMXCHN-ZLPAWPGGSA-N 0.000 description 1
- 229960004666 glucagon Drugs 0.000 description 1
- 229960005150 glycerol Drugs 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 208000019622 heart disease Diseases 0.000 description 1
- 150000002391 heterocyclic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000012510 hollow fiber Substances 0.000 description 1
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 1
- 238000005984 hydrogenation reaction Methods 0.000 description 1
- GPRLSGONYQIRFK-UHFFFAOYSA-N hydron Chemical compound [H+] GPRLSGONYQIRFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002471 hydroxymethylglutaryl coenzyme A reductase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 125000002632 imidazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002636 imidazolinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002883 imidazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 125000003453 indazolyl group Chemical group N1N=C(C2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000003387 indolinyl group Chemical group N1(CCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000003406 indolizinyl group Chemical group C=1(C=CN2C=CC=CC12)* 0.000 description 1
- 125000001041 indolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 1
- CDAISMWEOUEBRE-GPIVLXJGSA-N inositol Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O CDAISMWEOUEBRE-GPIVLXJGSA-N 0.000 description 1
- 229960000367 inositol Drugs 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000004594 isoindolinyl group Chemical group C1(NCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000000904 isoindolyl group Chemical group C=1(NC=C2C=CC=CC12)* 0.000 description 1
- 125000000555 isopropenyl group Chemical group [H]\C([H])=C(\*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000002183 isoquinolinyl group Chemical group C1(=NC=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000005956 isoquinolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004628 isothiazolidinyl group Chemical group S1N(CCC1)* 0.000 description 1
- 125000001786 isothiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003965 isoxazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000842 isoxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000002386 leaching Methods 0.000 description 1
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 1
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 1
- 230000037356 lipid metabolism Effects 0.000 description 1
- 150000002634 lipophilic molecules Chemical class 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 210000005228 liver tissue Anatomy 0.000 description 1
- 210000003712 lysosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000001868 lysosomic effect Effects 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- LUEWUZLMQUOBSB-GFVSVBBRSA-N mannan Chemical class O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]2[C@H](O[C@@H](O[C@H]3[C@H](O[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]3O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O LUEWUZLMQUOBSB-GFVSVBBRSA-N 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 150000002771 monosaccharide derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000002757 morpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 1
- 125000004108 n-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001624 naphthyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 239000002858 neurotransmitter agent Substances 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 description 1
- WXPWPYISTQCNDP-UHFFFAOYSA-N oct-7-en-1-ol Chemical compound OCCCCCCC=C WXPWPYISTQCNDP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005060 octahydroindolyl group Chemical group N1(CCC2CCCCC12)* 0.000 description 1
- 125000005061 octahydroisoindolyl group Chemical group C1(NCC2CCCCC12)* 0.000 description 1
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 1
- 125000001715 oxadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 description 1
- 125000000160 oxazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002971 oxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- ZJHUBLNWMCWUOV-UHFFFAOYSA-N oxocane-2,8-dione Chemical compound O=C1CCCCCC(=O)O1 ZJHUBLNWMCWUOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001820 oxy group Chemical group [*:1]O[*:2] 0.000 description 1
- 239000006174 pH buffer Substances 0.000 description 1
- 210000004738 parenchymal cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 125000006340 pentafluoro ethyl group Chemical group FC(F)(F)C(F)(F)* 0.000 description 1
- 229940083256 peripheral vasodilators nicotinic acid and derivative Drugs 0.000 description 1
- 125000001791 phenazinyl group Chemical group C1(=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3N=C12)* 0.000 description 1
- 125000001484 phenothiazinyl group Chemical group C1(=CC=CC=2SC3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 125000001644 phenoxazinyl group Chemical group C1(=CC=CC=2OC3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N phenyl(114C)methanol Chemical compound O[14CH2]C1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 239000008055 phosphate buffer solution Substances 0.000 description 1
- 150000008301 phosphite esters Chemical class 0.000 description 1
- FKKCPZSMQFVXFV-UHFFFAOYSA-N phosphonooxymethyl dihydrogen phosphate Chemical compound OP(O)(=O)OCOP(O)(O)=O FKKCPZSMQFVXFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000612 phthaloyl group Chemical group C(C=1C(C(=O)*)=CC=CC1)(=O)* 0.000 description 1
- 125000004193 piperazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003386 piperidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229920002647 polyamide Polymers 0.000 description 1
- 229920000768 polyamine Polymers 0.000 description 1
- 229940113115 polyethylene glycol 200 Drugs 0.000 description 1
- 229940068886 polyethylene glycol 300 Drugs 0.000 description 1
- 229940068918 polyethylene glycol 400 Drugs 0.000 description 1
- 229920000656 polylysine Polymers 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 235000011056 potassium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 1
- LPNYRYFBWFDTMA-UHFFFAOYSA-N potassium tert-butoxide Chemical compound [K+].CC(C)(C)[O-] LPNYRYFBWFDTMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000144977 poultry Species 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 150000003141 primary amines Chemical group 0.000 description 1
- 125000006238 prop-1-en-1-yl group Chemical group [H]\C(*)=C(/[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N propan-1-ol Chemical compound CCCO BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004368 propenyl group Chemical group C(=CC)* 0.000 description 1
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 229960004063 propylene glycol Drugs 0.000 description 1
- 125000002568 propynyl group Chemical group [*]C#CC([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001042 pteridinyl group Chemical group N1=C(N=CC2=NC=CN=C12)* 0.000 description 1
- 230000002685 pulmonary effect Effects 0.000 description 1
- 125000000561 purinyl group Chemical group N1=C(N=C2N=CNC2=C1)* 0.000 description 1
- 125000003373 pyrazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003072 pyrazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003226 pyrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- NRTYMEPCRDJMPZ-UHFFFAOYSA-N pyridine;2,2,2-trifluoroacetic acid Chemical compound C1=CC=NC=C1.OC(=O)C(F)(F)F NRTYMEPCRDJMPZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000719 pyrrolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002096 quantum dot Substances 0.000 description 1
- 125000002943 quinolinyl group Chemical group N1=C(C=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000001567 quinoxalinyl group Chemical group N1=C(C=NC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000004621 quinuclidinyl group Chemical group N12C(CC(CC1)CC2)* 0.000 description 1
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 1
- CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N scyllo-inosotol Natural products OC1C(O)C(O)C(O)C(O)C1O CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002914 sec-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 150000003335 secondary amines Chemical group 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 238000000967 suction filtration Methods 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 238000005987 sulfurization reaction Methods 0.000 description 1
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 150000003512 tertiary amines Chemical class 0.000 description 1
- 125000003718 tetrahydrofuranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001412 tetrahydropyranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000147 tetrahydroquinolinyl group Chemical group N1(CCCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000003831 tetrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 125000001113 thiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001984 thiazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000335 thiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004568 thiomorpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 239000012581 transferrin Substances 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 125000004306 triazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001425 triazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- UFTFJSFQGQCHQW-UHFFFAOYSA-N triformin Chemical compound O=COCC(OC=O)COC=O UFTFJSFQGQCHQW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004043 trisaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000009278 visceral effect Effects 0.000 description 1
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 1
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 1
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 1
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 1
- 229940046009 vitamin E Drugs 0.000 description 1
- 235000019165 vitamin E Nutrition 0.000 description 1
- 239000011709 vitamin E Substances 0.000 description 1
- 239000003643 water by type Substances 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/54—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic compound
- A61K47/549—Sugars, nucleosides, nucleotides or nucleic acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
- A61K31/713—Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
- A61P3/06—Antihyperlipidemics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H1/00—Processes for the preparation of sugar derivatives
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/06—Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite
- A61K47/08—Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite containing oxygen, e.g. ethers, acetals, ketones, quinones, aldehydes, peroxides
- A61K47/10—Alcohols; Phenols; Salts thereof, e.g. glycerol; Polyethylene glycols [PEG]; Poloxamers; PEG/POE alkyl ethers
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/06—Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite
- A61K47/16—Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite containing nitrogen, e.g. nitro-, nitroso-, azo-compounds, nitriles, cyanates
- A61K47/18—Amines; Amides; Ureas; Quaternary ammonium compounds; Amino acids; Oligopeptides having up to five amino acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/06—Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite
- A61K47/28—Steroids, e.g. cholesterol, bile acids or glycyrrhetinic acid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/30—Macromolecular organic or inorganic compounds, e.g. inorganic polyphosphates
- A61K47/34—Macromolecular compounds obtained otherwise than by reactions only involving carbon-to-carbon unsaturated bonds, e.g. polyesters, polyamino acids, polysiloxanes, polyphosphazines, copolymers of polyalkylene glycol or poloxamers
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
- A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
- A61K9/0019—Injectable compositions; Intramuscular, intravenous, arterial, subcutaneous administration; Compositions to be administered through the skin in an invasive manner
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
- C12N2310/315—Phosphorothioates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
- C12N2310/321—2'-O-R Modification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
- C12N2310/322—2'-R Modification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/34—Spatial arrangement of the modifications
- C12N2310/344—Position-specific modifications, e.g. on every purine, at the 3'-end
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/34—Spatial arrangement of the modifications
- C12N2310/346—Spatial arrangement of the modifications having a combination of backbone and sugar modifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/351—Conjugate
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/351—Conjugate
- C12N2310/3515—Lipophilic moiety, e.g. cholesterol
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Obesity (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
本公开提供了一种抑制载脂蛋白C3(ApoC3)基因表达的siRNA,含有该siRNA的药物组合物和缀合物。所述siRNA中的每个核苷酸均为修饰的核苷酸,该siRNA含有正义链和反义链,所述正义链含有核苷酸序列A,所述核苷酸序列A与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,所述反义链含有核苷酸序列B,所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异。本公开提供的siRNA及其药物组合物和缀合物,可以有效治疗和/或预防血脂异常。
Description
本申请是2018年11月29日提交的申请号为PCT/CN2018/118232、发明名称为“一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途”的国际申请的分案申请,所述国际申请于2020年1月20日进入中国国家阶段,其申请号为201880048597.3。
背景技术
血脂异常,又名高脂血症,是脂肪代谢或运转异常,使血浆脂质高于正常值的一种全身性疾病,正严重威胁着全球患者的健康。现有的治疗血脂异常的药物主要有他汀类、胆固醇吸收抑制剂、树脂类、普罗步考、贝特类和烟酸及其衍生物。
载脂蛋白C3(APOC3)在脂质代谢中具有重要作用,携带有APOC3突变基因的人血液循环中APOC3的表达量下降46%,血浆内甘油三酯水平较普通人下降39%,同时较低的血脂水平可使APOC3突变基因携带者患心脏病的风险比非携带者降低35.1%。因此,若能从基因水平沉默基因表达,阻断APOC3的生成,无疑将是最为理想的治疗手段。小干扰RNA(smallinterfering RNA,siRNA)可基于RNA干扰(RNA interference,RNAi)这一机制,以序列特异性的方式抑制或阻断任何感兴趣的目的基因的表达,从而达到治疗疾病的目的。
siRNA稳定化修饰及其递送***是小RNA药物开发中的两个关键技术。
发明内容
在一些实施方案中,本公开提供了一种siRNA缀合物,该缀合物具有式(1)所示的结构:
其中:
n1为选自1-3的整数,n3为选自0-4的整数;
m1、m2和m3独立地为选自2-10的整数;
R10、R11、R12、R13、R14和R15各自独立地为H,或选自于由以下基团所组成的组:C1-C10烷基、C1-C10卤代烷基以及C1-C10烷氧基;
R3为式A59所示结构的基团:
其中,E1为OH、SH或BH2,Nu为siRNA;
所述siRNA中的每个核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸,所述siRNA含有正义链和反义链,所述正义链包含核苷酸序列1,所述反义链包含核苷酸序列2,所述核苷酸序列1和所述核苷酸序列2至少部分地反向互补形成双链区,所述核苷酸序列1与SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列2与SEQ IDNO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:
5'-CAAUAAAGCUGGACAAGAZ-3'(SEQ ID NO:1);
5'-Z'UCUUGUCCAGCUUUAUUG-3'(SEQ ID NO:2);
其中,Z为A,Z'为U,
所述核苷酸序列1中包含位置对应于Z的核苷酸ZA,所述核苷酸序列2中包含位置对应于Z'的核苷酸Z'B,所述Z'B是所述反义链5'末端的第一个核苷酸;
R2是长度为1-20个碳原子的直链亚烷基,其中一个或多个碳原子任选地被选自于以下基团所组成的组中的一个或多个所替换:C(O)、NH、O、S、CH=N、S(O)2、C2-C10亚烯基、C2-C10亚炔基、C6-C10亚芳基、C3-C18亚杂环基和C5-C10亚杂芳基;并且其中,R2可任选地具有由以下基团所组成的组中的任何一个或多个的取代基:C1-C10烷基、C6-C10芳基、C5-C10杂芳基、C1-C10卤代烷基、-OC1-C10烷基、-OC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-OH、-OC1-C10卤代烷基、-SC1-C10烷基、-SC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-SH、-SC1-C10卤代烷基、卤素取代基、-OH、-SH、-NH2、-C1-C10烷基-NH2、-N(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-NH(C1-C10烷基)、氰基、硝基、-CO2H、-C(O)O(C1-C10烷基)、-CON(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-CONH(C1-C10烷基)、-CONH2,-NHC(O)(C1-C10烷基)、-NHC(O)(苯基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(C1-C10烷基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(苯基)、-C(O)C1-C10烷基、-C(O)C1-C10烷基苯基、-C(O)C1-C10卤烷基、-OC(O)C1-C10烷基、-SO2(C1-C10烷基)、-SO2(苯基)、-SO2(C1-C10卤代烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-C10烷基)、-SO2NH(苯基)、-NHSO2(C1-C10烷基)、-NHSO2(苯基)和-NHSO2(C1-C10卤代烷基);
每个L1是长度为1-70个碳原子的直链亚烷基,其中一个或多个碳原子任选地被选自于以下基团所组成的组中的一个或多个所替换:C(O)、NH、O、S、CH=N、S(O)2、C2-C10亚烯基、C2-C10亚炔基、C6-C10亚芳基、C3-C18亚杂环基和C5-C10亚杂芳基;并且其中,L1可任选地具有由以下基团所组成的组中的任何一个或多个的取代基:C1-C10烷基、C6-C10芳基、C5-C10杂芳基、C1-C10卤代烷基、-OC1-C10烷基、-OC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-OH、-OC1-C10卤代烷基、-SC1-C10烷基、-SC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-SH、-SC1-C10卤代烷基、卤素取代基、-OH、-SH、-NH2、-C1-C10烷基-NH2、-N(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-NH(C1-C10烷基)、氰基、硝基、-CO2H、-C(O)O(C1-C10烷基)、-CON(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-CONH(C1-C10烷基)、-CONH2,-NHC(O)(C1-C10烷基)、-NHC(O)(苯基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(C1-C10烷基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(苯基)、-C(O)C1-C10烷基、-C(O)C1-C10烷基苯基、-C(O)C1-C10卤烷基、-OC(O)C1-C10烷基、-SO2(C1-C10烷基)、-SO2(苯基)、-SO2(C1-C10卤代烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-C10烷基)、-SO2NH(苯基)、-NHSO2(C1-C10烷基)、-NHSO2(苯基)和-NHSO2(C1-C10卤代烷基)。
在一些实施方案中,每个L1独立地选自式A1-A26基团中的一种或多种的连接组合:
其中,j1为1-20的整数;j2为1-20的整数;
R’为C1-C10的烷基;
Ra选自式A27-A45基团或其任意组合所组成的组:
Rb为C1-C10的烷基;
表示基团连接至分子其余部分的位点;
M1表示靶向基团。
在一些实施方案中,本公开提供了一种缀合物的制备方法,包括在亚磷酰胺固相合成的条件下,分别按照siRNA正义链和反义链的核苷酸种类和顺序,按照3'到5'的方向将核苷单体依次连接,每个核苷单体的连接包括脱保护、偶联、盖帽、氧化或硫化四步反应;分离出siRNA的正义链和反义链,退火,其中,所述siRNA中的每个核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸,所述siRNA含有正义链和反义链,所述正义链包含核苷酸序列1,所述反义链包含核苷酸序列2,所述核苷酸序列1和所述核苷酸序列2至少部分地反向互补形成双链区,所述核苷酸序列1与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列2与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:
5'-CAAUAAAGCUGGACAAGAZ-3'(SEQ ID NO:1);
5'-Z'UCUUGUCCAGCUUUAUUG-3'(SEQ ID NO:2);
其中,Z为A,Z'为U,
所述核苷酸序列1中包含位置对应于Z的核苷酸ZA,所述核苷酸序列2中包含位置对应于Z'的核苷酸Z'B,所述Z'B是所述反义链5'末端的第一个核苷酸;
并且,该方法还包括在偶联反应条件和偶联试剂存在下,将式(321)所示的化合物与核苷单体或连接在固相载体上的核苷酸序列接触,从而使式(321)所示的化合物经偶联反应连接至核苷酸序列。下文中,式(321)所示的化合物也称作缀合分子。
其中:
R4为能够结合至Nu代表的siRNA的部分。在一些实施方案中,R4为能够通过共价键结合至Nu代表的siRNA的部分。在一些实施方案中,R4为能够经反应而通过磷酸二酯键缀合至Nu代表的siRNA的任意官能团的部分;
每个S1独立地是M1中全部活性羟基被YCOO-基团取代而形成的基团,其中,每个Y独立地选自甲基、三氟甲基、二氟甲基、一氟甲基、三氯甲基、二氯甲基、一氯甲基、乙基、正丙基、异丙基、苯基、卤代苯基以及烷基苯基中的一种;
n1、n3、m1、m2、m3、R10、R11、R12、R13、R14、R15、L1、M1各自的定义和可选择的范围如前所述。
在一些实施方案中,本公开提供了一种能够抑制APOC3基因表达的修饰的siRNA,该siRNA含有正义链和反义链,所述正义链和反义链的每一个核苷酸均为修饰的核苷酸,其中,所述正义链和反义链均包含氟代修饰的核苷酸和非氟代修饰的核苷酸;所述正义链包含核苷酸序列I,所述反义链包含核苷酸序列II,所述核苷酸序列I和所述核苷酸序列II至少部分地反向互补形成双链区,其中,所述核苷酸序列I含有核苷酸序列A,所述核苷酸序列A与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列II含有核苷酸序列B,所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:
5’-CAAUAAAGCUGGACAAGAZ-3’(SEQ ID NO:1);
5’-Z’UCUUGUCCAGCUUUAUUG-3’(SEQ ID NO:2),
其中,Z为A,Z'为U,
所述核苷酸序列A中包含位置对应于Z的核苷酸ZA,所述核苷酸序列B中包含位置对应于Z'的核苷酸Z'B,所述Z'B是所述反义链5'末端的第一个核苷酸;
所述氟代修饰的核苷酸位于核苷酸序列A和核苷酸序列B中,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列A的第7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸;并且,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列B的第2、6、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,本公开提供了一种药物组合物,所述药物组合物含有本公开修饰的siRNA和/或药学上可接受的载体。
在一些实施方案中,本公开提供了一种siRNA缀合物,所述siRNA缀合物含有一种siRNA以及缀合连接至该siRNA的缀合基团,该siRNA含有正义链和反义链,所述正义链和反义链的每一个核苷酸均为修饰的核苷酸,其中,所述正义链和反义链均包含氟代修饰的核苷酸和非氟代修饰的核苷酸;所述正义链包含核苷酸序列I,所述反义链包含核苷酸序列II,所述核苷酸序列I和所述核苷酸序列II至少部分地反向互补形成双链区,其中,所述核苷酸序列I含有核苷酸序列A,所述核苷酸序列A与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列II含有核苷酸序列B,所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:
5’-CAAUAAAGCUGGACAAGAZ-3’(SEQ ID NO:1);
5’-Z’UCUUGUCCAGCUUUAUUG-3’(SEQ ID NO:2),
其中,Z为A,Z'为U,
所述核苷酸序列A中包含位置对应于Z的核苷酸ZA,所述核苷酸序列B中包含位置对应于Z'的核苷酸Z'B,所述Z'B是所述反义链5'末端的第一个核苷酸;
所述氟代修饰的核苷酸位于核苷酸序列A和核苷酸序列B中,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列A的第7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸;并且,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列B的第2、6、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,本公开提供了本公开的修饰的siRNA、药物组合物和/或siRNA缀合物在制备用于治疗和/或预防由载脂蛋白C3(ApoC3)的过量表达引起的血脂异常的药物中的用途。
在一些实施方案中,本公开提供了一种治疗血脂异常的方法,所述方法包括向患有血脂异常的受试者给予有效量的本公开的修饰的siRNA、药物组合物和/或siRNA缀合物。
在一些实施方案中,本公开提供了一种抑制肝细胞APOC3基因表达的方法,该方法包括将有效量的本公开的修饰的siRNA、药物组合物和/或siRNA缀合物与所述肝细胞进行接触。
在一些实施方案中,本公开提供了一种试剂盒,所述试剂盒包含本公开的修饰的siRNA、药物组合物和/或siRNA缀合物。
以引用的方式并入
本说明书中提及的所有出版物、专利以及专利申请均以引用的方式并入本文,其程度与每一单独的出版物、专利以及专利申请均专门并且单独地以引用的方式并入本文的程度相同。
有益效果
在一些实施方案中,本公开提供的siRNA、含该siRNA的组合物或siRNA缀合物可在体内具有更高的稳定性和/或更高的活性。在一些实施方案中,本公开提供的siRNA、siRNA组合物或siRNA缀合物在体内显示出至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或95%的靶基因表达抑制率。在一些实施方案中,本公开提供的siRNA、siRNA组合物或siRNA缀合物在体内显示出至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或95%的APOC3基因表达抑制率。在一些实施方案中,本公开提供的siRNA、siRNA组合物或siRNA缀合物在体内显示出至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或95%的肝内APOC3基因表达抑制率。在一些实施方案中,本公开提供的siRNA、siRNA组合物或siRNA缀合物在体内显示出至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或95%的动物模型中肝内APOC3基因表达抑制率。在一些实施方案中,本公开提供的siRNA、siRNA组合物或siRNA缀合物在体内显示出至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或95%的人类受试者中肝内APOC3基因表达抑制率。在一些实施方案中,本公开提供的siRNA、含该siRNA的组合物或siRNA缀合物未显示出明显脱靶效应。脱靶效应可以是例如抑制非靶基因的基因正常表达。据认为,如果脱靶基因表达的结合/抑制与在靶基因效果相比低于50%、40%、30%、20%或10%时,该脱靶效应就是不显著的。
在一些实施方案中,本公开提供的siRNA缀合物表现出优异的抑制APOC3基因表达的特性:在1mg/kg的剂量下抑制高脂模型小鼠肝脏中至少88%的APOC3基因表达。特别地,与现有技术提供的缀合分子形成的缀合物相比,本公开提供的修饰的siRNA和siRNA缀合物显示出优异的基因抑制率,及低的脱靶效应;并且,本公开提供的siRNA缀合物能够在低给药剂量、低给药频率的情况下,在长达189天的实验时间内持续显示出优异的血脂抑制作用。
上述情况表明,本文提供的siRNA、药物组合物和siRNA缀合物能够有效降低靶细胞基因表达,并且显示出优异的递送潜力。
本公开的其他特征和优点将在随后的具体实施方式部分予以详细说明。
附图说明
图1显示了缀合物F1-F5在体外psiCHECK***中的抑制活性。
图2显示了D14天缀合物1在人APOC3转基因小鼠肝组织中对APCO3mRNA表达量的抑制率。
图3A和3B显示不同剂量缀合物1对血脂的抑制率,以血清总胆固醇(CHO)和甘油三酯(TG)表示。
图4A和4B显示以血清总胆固醇(CHO)和甘油三酯(TG)为指标,不同剂量的缀合物2对血脂的抑制率。
图5A、5B、5C和5D显示了以血清中的总胆固醇(CHO)和甘油三酯(TG)为指标,不同剂量的缀合物1-3对血脂的抑制率。
具体实施方式
以下对本公开的具体实施方式进行详细说明。应当理解的是,此处所描述的具体实施方式仅用于说明和解释本公开,并不用于限制本公开。
在本公开中,APOC3基因是指mRNA序列如Genbank注册号NM_000040.1所示的基因。所述靶mRNA序列如NM_000040.1所示。
定义
在上文及下文中,如无特别说明,大写字母C、G、U、A表示核苷酸的碱基组成;小写字母m表示该字母m左侧相邻的一个核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核苷酸为氟代修饰的核苷酸;小写字母s表示与该字母s左右相邻的两个核苷酸之间为硫代磷酸酯基连接;P1表示该P1右侧相邻的一个核苷酸为5'-磷酸核苷酸或5'-磷酸类似物修饰的核苷酸,字母组合VP表示该字母组合VP右侧相邻的一个核苷酸为乙烯基磷酸酯修饰的核苷酸,字母组合Ps表示该字母组合Ps右侧相邻的一个核苷酸为硫代磷酸酯修饰的核苷酸,大写字母P表示该字母P右侧相邻的一个核苷酸为5'-磷酸核苷酸。
在上文及下文中,所述“氟代修饰的核苷酸”指核苷酸的核糖基2'位的羟基被氟取代形成的核苷酸,“非氟代修饰的核苷酸”指核苷酸的核糖基2'位的羟基被非氟基团取代形成的核苷酸或核苷酸类似物。“核苷酸类似物”指能够在核酸中代替核苷酸,但结构不同于腺嘌呤核糖核苷酸、鸟嘌呤核糖核苷酸、胞嘧啶核糖核苷酸、尿嘧啶核糖核苷酸或胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸的基团。如异核苷酸、桥联的核苷酸(bridged nucleic acid,简称BNA)或无环核苷酸。所述“甲氧基修饰的核苷酸”指核糖基的2'-羟基被甲氧基取代而形成的核苷酸。
在本文的上下文中,“互补”或“反向互补”一词可互相替代使用,并具有本领域技术人员周知的含义,即,在双链核酸分子中,一条链的碱基与另一条链上的碱基以互补的方式相配对。在DNA中,嘌呤碱基腺嘌呤(A)始终与嘧啶碱基胸腺嘧啶(T)(或者在RNA中为尿嘧啶(U))相配对;嘌呤碱基鸟嘌呤(C)始终与嘧啶碱基胞嘧啶(G)相配对。每个碱基对都包括一个嘌呤和一个嘧啶。当一条链上的腺嘌呤始终与另一条链上的胸腺嘧啶(或尿嘧啶)配对,以及鸟嘌呤始终与胞嘧啶配对时,两条链被认为是彼此相互补的,以及从其互补链的序列中可以推断出该链的序列。与此相应地,“错配”在本领域中意指在双链核酸中,对应位置上的碱基并未以互补的形式配对存在。
在上文及下文中,如无特别说明,“基本上反向互补”是指所涉及的两段核苷酸序列之间存在不多于3个的碱基错配;“实质上反向互补”是指两段核苷酸序列之间存在不多于1个的碱基错配;“完全互补”是指两段核苷酸序列之间不存在碱基错配。
在上文及下文中,一个核苷酸序列与另外一个核苷酸序列存在“核苷酸差异”,是指前者与后者相比,相同位置的核苷酸的碱基种类发生了改变,例如,在后者中一个核苷酸碱基为A时,在前者的相同位置处的对应核苷酸碱基为U、C、G或者T的情况下,认定为两个核苷酸序列之间在该位置处存在核苷酸差异。在一些实施方案中,以无碱基核苷酸或其等同物代替原位置的核苷酸时,也可认为在该位置处产生了核苷酸差异。
在上文及下文中,特别是在描述本公开的siRNA、含siRNA的组合物或siRNA缀合物的制备方法时,除非特别说明,所述核苷单体(nucleoside monomer)指,根据欲制备的siRNA或siRNA缀合物中核苷酸的种类和顺序,亚磷酰胺固相合成中使用的修饰或未修饰的核苷亚磷酰胺单体(unmodified or modified RNA phosphoramidites,有时RNAphosphoramidites也称为Nucleoside phosphoramidites)。亚磷酰胺固相合成为本领域技术人员所公知的RNA合成中所用的方法。本公开所用的核苷单体均可商购得到。
在本公开的上下文中,除非另有说明,“缀合”是指两个或多个各自具有特定功能的化学部分之间以共价连接的方式彼此连接;相应地,“缀合物”是指该各个化学部分之间通过共价连接而形成的化合物。进一步地,“siRNA缀合物”表示一个或多个具有特定功能的化学部分共价连接至siRNA上而形成的化合物。在下文中,有时也将本公开的siRNA缀合物简称为“缀合物”。siRNA缀合物应根据上下文,理解为siRNA缀合物的总称、第一种siRNA缀合物或第二种siRNA缀合物。在本公开的上下文中,“缀合分子”应当理解为可通过反应缀合至siRNA,最终形成本公开的siRNA缀合物的特定化合物。
如本文所使用的,不介于两个字母之间或两个符号之间的短横(“-”)是用于指示取代基附着点的位置。例如:-C1-C10烷基-NH2通过C1-C10烷基而附着。
如本文所使用的,“任选的”或“任选地”是指其后描述的事件或状况可以发生或不发生,并且所述描述包括事件或状况发生的情况和其中不发生的情况。例如,“任选的取代的烷基”包括下文定义的“烷基”和“取代烷基”。本领域技术人员将理解的是,对于包含一个或多个取代基的任何基团,这些基团不打算引入空间上不切实际、合成上不可行和/或内在不稳定的任何取代或取代型式。
如本文所使用的,“烷基”是指具有指定数量的碳原子的直链和支链,所述数量通常为1到20个碳原子,例如1至10个碳原子,如1至8个或1至6个碳原子。例如,C1-C6烷基包含1至6个碳原子的直链和支链烷基。当对具有特定数量的碳的烷基残基进行命名时,旨在涵盖所有具有该数量的碳的支链和直链形式;因此,例如,“丁基”意味着包括正丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基;“丙基”包括正丙基和异丙基。亚烷基是烷基的子集,指与烷基相同、但具有两个附着点的残基。
如本文所使用的,“烯基”是指具有至少一个碳-碳双键的不饱和支链或直链烷基,所述碳-碳双键是通过从母体烷基的相邻碳原子中除去一个氢分子而获得的。该基团可以处于双键的顺式或反式构型。典型的烯基基团包括但不限于:乙烯基;丙烯基,如丙-1-烯-1-基、丙-1-烯-2-基、丙-2-烯-1-基(烯丙基)、丙-2-烯-2-基;丁烯基,例如丁-1-烯-1-基、丁-1-烯-2-基、2-甲基丙-1-烯-1-基、丁-2-烯-1-基、丁-2-烯-2-基、丁-1,3-二烯-1-基、丁-1,3-二烯-2-基等等。在某些实施方案中,烯基基团具有2到20个碳原子,而在其他实施方案中,具有2至10个、2至8个或2至6个碳原子。亚烯基是烯基的一个子集,指与烯基相同、但具有两个附着点的残基。
如本文所使用的,“炔基”是指具有至少一个碳-碳三键的不饱和支链或直链烷基,所述碳-碳三键是通过从母体烷基的相邻碳原子中除去两个氢分子而获得的。典型的炔基基团包括但不限于:乙炔基;丙炔基,如丙-1-炔-1-基,丙-2-炔-1-基;丁炔基,例如丁-1-炔-1-基,丁-1-炔-3-基,丁-3-炔-1-基等。在某些实施方案中,炔基具有2到20个碳原子,而在其他实施方案中,具有2至10、2至8或2至6个碳原子。亚炔基是炔基的一个子集,指的是与炔基相同、但有两个附着点的残基。
如本文所使用的,“烷氧基”是指通过氧桥附着的指定数量碳原子的烷基,例如,甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、戊氧基、2-戊氧基、异戊氧基、新戊氧基、己氧基、2-己氧基、3-己氧基、3-甲基戊氧基等。烷氧基通常具有1至10个、1至8个、1至6个,或1至4个通过氧桥附着的碳原子。
如本文所使用的,“芳基”是指衍生自芳香族单环或多环烃环***、通过从环碳原子中除去氢原子而形成的基团。所述芳香族单环或多环烃环***仅含有氢和6至18个碳原子的碳,其中所述环***中的至少一个环是完全不饱和的,即,其根据Hückel理论包含环状、离域的(4n+2)π-电子***。芳基包括但不限于苯基、芴基和萘基等基团。亚芳基是芳基的一个子集,指与芳基相同、但具有两个附着点的残基。
如本文所使用的,“环烷基”是指非芳香碳环,通常具有3至7个环状碳原子。环可以是饱和的,或具有一个或多个碳-碳双键。环烷基的实例包括环丙基、环丁基、环戊基、环戊烯基、环己基和环己烯基,以及桥联和笼状环基团,如降冰片烷(norbornane)。
如本文所使用的,“卤素取代基”或“卤”指氟代、氯代、溴代和碘代,术语“卤素”包括氟、氯、溴和碘。
如本文所使用的,“卤代烷基”是指指定数量的碳原子被一个或多个、直至最大允许数量的卤素原子取代的如上述所定义的烷基。卤代烷基的实例包括但不限于三氟甲基、二氟甲基、2-氟乙基和五氟乙基。
“杂环基”是指一个稳定的3-到18-元非芳香环基,包含2-12个碳原子和1-6个杂原子,所述杂原子选自氮、氧和硫。除非说明书中另有说明,杂环基是单环、双环、三环或四环***,可包括稠环或桥环***。杂环自由基中的杂原子可以任选地被氧化。一个或多个氮原子(如果存在的话)任选地被季铵化。杂环基是部分饱和或完全饱和的。杂环基可以通过环的任何原子附着至分子的其余部分。此类杂环基的实例包括但不限于:二噁烷基、噻吩基[1,3]二硫酰基、十氢异喹啉基、咪唑啉基、咪唑烷基、异噻唑烷基、异恶唑烷基、吗啉基、八氢吲哚基、八氢异吲哚基、2-氧杂哌嗪基、2-氧杂哌啶基、2-氧杂嘧啶基、恶唑烷基、哌啶基、哌嗪基、4-哌啶酮基、吡咯烷基、吡唑烷基、奎宁环基、噻唑烷基、四氢呋喃基、三硫酰基、四氢吡喃基、硫吗啉基、硫杂吗啉基、1-氧杂硫吗啉基和1,1-二氧杂硫吗啉基。
“杂芳基”指由3-至18-元芳香环自由基衍生而成的基团,其包含2个至17个碳原子和选自氮、氧和硫的1至6个杂原子。如本文所使用的,杂芳基可以是单环、双环、三环或四环***,其中环***中的至少一个环是完全不饱和的,即,根据Hückel理论,包含环状离域(4n+2)π-电子体系。杂芳基包括稠环或桥环***。杂芳基中的杂原子被任选地氧化。一个或多个氮原子(如果存在的话)任选地被季铵化。杂芳基通过环中的任何原子附着至分子的其余部分。杂芳基的实例包括但不限于:氮杂环庚三烯基、吖啶基、苯并咪唑基、苯并吲哚基、1,3-苯并二恶唑基、苯并呋喃基、苯并恶唑基、苯并[d]噻唑基、苯并噻二唑基、苯并[b][1,4]二恶唑基、苯并[b][1,4]恶唑基、1,4-苯并二恶唑基、苯并萘并呋喃基、苯并二唑基、苯并二氧杂苯基、苯并吡喃基、苯并吡喃酮基、苯并呋喃基、苯并呋喃酮基、苯并噻吩基、苯并噻吩[3,2-d]嘧啶基、苯并***基、苯并[4,6]咪唑[1,2-a]吡啶基、咔唑基、噌啉基、环戊基[d]嘧啶基、6,7-二氢-5H-环戊基[4,5]噻吩[2,3-d]嘧啶基、5,6-二氢苯并[h]喹唑啉基、5,6-二氢苯并[h]辛诺林基、6,7-二氢-5H-苯并[6,7]环庚[1,2-c]哒嗪基、二苯并呋喃基、二苯并噻吩基、呋喃基、呋喃酮基、呋喃[3,2-c]吡啶基、5,6,7,8,9,10-六氢环庚烷[d]嘧啶基、5,6,7,8,9,10-六氢环辛酸[d]哒嗪基、5,6,7,8,9,10-六氢环辛酸[d]吡啶基、异噻唑基、吲唑基、咪唑基、吲哚基、异吲哚基、二氢吲哚基、异二氢氮茚基、异喹啉基、吲哚嗪基、异恶唑基、5,8-甲基-5,6,7,8-四氢喹唑啉基、萘啶酮基、1,6-萘啶酮基、恶二唑基、2-氧氮杂庚基、恶唑基、恶草酰基、5,6,6a,7,8,9,10,10a-八氢苯并[H]喹唑啉基、1-苯基-1H-吡咯基、吩嗪基、吩噻嗪基、吩恶嗪基、邻苯二甲酰基、蝶啶基、嘌呤基、吡咯基、吡唑基、吡唑并[3,4-d]嘧啶基、吡啶基、吡啶并[3,2-d]嘧啶基、吡啶并[3,4-d]嘧啶基、吡嗪基、嘧啶基、哒嗪基、吡咯基、喹唑啉基、喹喔啉基、喹啉基、异喹啉基、四氢喹啉基、5,6,7,8-四氢喹唑啉基、5,6,7,8-四氢苯并[4,5]噻吩[2,3-d]嘧啶基、6,7,8,9四氢-5H-环庚烷[4,5]噻吩[2,3-d]嘧啶基、5,6,7,8-四氢吡啶并[4,5-c]哒嗪基、噻唑基、噻二唑基、***基、四唑基、三嗪基、噻吩[2,3-d]嘧啶基、噻吩[3,2-d]嘧啶基、噻吩[2,3-c]普萘基和噻吩基。
在本公开中可以使用各种羟基保护基团。一般来说,保护基团使化学官能度对特定的反应条件不敏感,并且可以在分子中的该官能度上附加以及去除,而不实质上损害分子的其余部分。代表性的羟基保护基团公开于Beaucage等人,Tetrahedron 1992,48,2223-2311,以及Greeneand Wuts,Protective Groups in Organic Synthesis,Chapter 2,2ded,John Wiley&Sons,New York,1991中,以引用的方式将上述文献整体并入本文。在一些实施方案中,保护基团在碱性条件下稳定,但可以在酸性条件下脱除。在一些实施方案中,本文可使用的羟基保护基的非排他性实例包括二甲氧基三苯甲基(DMT)、单甲氧基三苯甲基、9-苯基黄嘌呤-9-基(Pixyl)和9-(对甲氧基苯基)黄嘌呤-9-基(Mox)。在一些实施方案中,本文可使用的羟基保护基的非排他性实例包括Tr(三苯甲基)、MMTr(4-甲氧基三苯甲基)、DMTr(4,4’-二甲氧基三苯甲基)和TMTr(4,4’,4”-三甲氧基三苯甲基)。
“受试者”一词,如本文所使用的,指任何动物,例如哺乳动物或有袋动物。本公开的主题包括但不限于人类、非人灵长类(例如,恒河猴或其他类型的猕猴)、小鼠、猪、马、驴、牛、绵羊、大鼠和任何种类的家禽。
如本文所使用的,“治疗方法”、“治疗”、“减轻”、或“改善”可在此处互换使用。这些术语指的是获得有益的或期望的结果的方法,包括但不限于治疗益处。“治疗益处”意味着根除或改善被治疗的潜在障碍。此外,治疗益处通过根除或改善与潜在障碍相关的一个或多个生理症状,从而在受试者中观察到改善而获得,尽管受试者可能仍然受到潜在障碍的折磨。
如本文所使用的,“防止”和“预防”可互换使用。这些术语指获得有益或期望的结果的方法,包括但不限于预防性益处。为了获得“预防性益处”,可将缀合物或组合物给予有罹患特定疾病风险的受试者,或给予报告疾病的一种或多种病理症状的受试者,即便可能该疾病的诊断尚未作出。
修饰的siRNA
本公开的siRNA含有核苷酸基团作为基本结构单元,本领域技术人员公知,所述核苷酸基团含有磷酸基团、核糖基团和碱基,在此不再赘述。
本公开提供了一种能够抑制APOC3基因表达的修饰的siRNA,所述修饰的siRNA含有正义链和反义链,所述正义链和反义链的每一个核苷酸均为修饰的核苷酸,其中,所述正义链和反义链均包含氟代修饰的核苷酸和非氟代修饰的核苷酸;所述正义链包含核苷酸序列I,所述反义链包含核苷酸序列II,所述核苷酸序列I和所述核苷酸序列II至少部分地反向互补形成双链区,其中,所述核苷酸序列I含有核苷酸序列A,所述核苷酸序列A与SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列II含有核苷酸序列B,所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:
5'-CAAUAAAGCUGGACAAGAZ-3'(SEQ ID NO:1);
5'-Z’UCUUGUCCAGCUUUAUUG-3'(SEQ ID NO:2),
其中,Z为A,Z'为U,
所述核苷酸序列A中包含位置对应于Z的核苷酸ZA,所述核苷酸序列B中包含位置对应于Z'的核苷酸Z'B,所述Z'B是所述反义链5'末端的第一个核苷酸;并且,
所述氟代修饰的核苷酸位于核苷酸序列A和核苷酸序列B中,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列A的第7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸;并且,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列B的第2、6、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸。在一些实施方案中,所述核苷酸序列A中氟代修饰的核苷酸不多于5个;所述核苷酸序列B中氟代修饰的核苷酸不多于7个。
在上文与下文中,“位置对应”是指从核苷酸序列相同端起算,处于核苷酸序列中相同的位置。例如,核苷酸序列A的3'端第1个核苷酸是位置对应于SEQ ID NO:1的3'端第1个核苷酸的核苷酸。
在一些实施方案中,所述正义链仅包含核苷酸序列I,所述反义链仅包含核苷酸序列II。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列A与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列之间不多于1个核苷酸差异,和/或所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列之间不多于1个核苷酸差异。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列之间的核苷酸差异包括Z'B位置处的差异,且Z'B选自A、C或G。在一些实施方案中,所述核苷酸差异为Z'B位置处的差异,Z'B选自A、C或G。在一些实施方案中,ZA是与Z'B互补的核苷酸。这些核苷酸差异并不会显著降低siRNA缀合物的靶基因抑制能力,而这些包含核苷酸差异的siRNA缀合物也在本公开的保护范围之内。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列A和所述核苷酸序列B基本上反向互补、实质上反向互补或完全反向互补;所述基本上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于3个的碱基错配;所述实质上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于1个的碱基错配;完全反向互补是指两个核苷酸序列之间没有错配。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列A是SEQ ID NO:60所示的核苷酸序列,核苷酸序列B是SEQ ID NO:61所示的核苷酸序列:
5'-CAAUAAAGCUGGACAAGAZA-3'(SEQ ID NO:60),
5'-Z’BUCUUGUCCAGCUUUAUUG-3'(SEQ ID NO:61);
其中,所述Z'B是反义链5'末端的第一个核苷酸,ZA选自A、U、G或C,并且Z'B是与ZA互补的核苷酸;并且,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列A的第7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸;按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列B的第2、6、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,该siRNA含有正义链和反义链,所述正义链含有一段核苷酸序列I,所述反义链含有一段核苷酸序列II,核苷酸序列I和核苷酸序列II反向互补形成双链区,核苷酸序列I含有如SEQ ID NO:60所示的核苷酸序列,核苷酸序列II含有如SEQ ID NO:61所示的核苷酸序列:
5'-CAAUAAAGCUGGACAAGAZA-3'(SEQ ID NO:60);
5'-Z'BUCUUGUCCAGCUUUAUUG-3'(SEQ ID NO:61),
其中,所述Z'B是反义链5'末端的第一个核苷酸,ZA选自A、U、G或C,并且Z'B是与ZA互补的核苷酸;在一些实施方案中,ZA为A,Z'B为U;
并且,按照5'末端到3'末端的方向,所述siRNA的正义链中SEQ ID NO:60的第7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸;并且,按照5'末端到3'末端的方向,所述siRNA的反义链中SEQ ID NO:61的第2、6、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸。
所述正义链和反义链长度相同或不同,所述正义链的长度为19-23个核苷酸,反义链的长度为19-26个核苷酸。这样,本公开提供的siRNA正义链和反义链的长度比可以是19/19、19/20、19/21、19/22、19/23、19/24、19/25、19/26、20/20、20/21、20/22、20/23、20/24、20/25、20/26、21/20、21/21、21/22、21/23、21/24、21/25、21/26、22/20、22/21、22/22、22/23、22/24、22/25、22/26、23/20、23/21、23/22、23/23、23/24、23/25或23/26。在一些实施方案中,所述siRNA正义链和反义链的长度比为19/21、21/23或23/25。
在一些实施方案中,所述正义链和反义链长度相同,所述核苷酸序列I还含有核苷酸序列III,所述核苷酸序列II还含有核苷酸序列IV,核苷酸序列III和核苷酸序列IV长度各自独立地为1-4个核苷酸;所述核苷酸序列III连接核苷酸序列A的5’末端,所述核苷酸序列IV连接在核苷酸序列B的3’末端;所述核苷酸序列Ⅲ和所述核苷酸序列Ⅳ长度相等。
所述核苷酸序列III和核苷酸序列IV可以互补或不互补,为了增加siRNA的稳定性,在一些实施方案中,核苷酸序列III和核苷酸序列IV至少部分互补;在一些实施方案中,核苷酸序列III和核苷酸序列IV 80%以上的碱基互补,或者90%以上的碱基互补;在一些实施方案中,核苷酸序列III和核苷酸序列IV实质上反向互补或完全反向互补;所述实质上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于1个的碱基错配;完全反向互补是指两个核苷酸序列之间没有错配;在一些实施方案中,核苷酸序列III和核苷酸序列IV完全反向互补。由此,所述siRNA正义链和反义链等长,其长度比为20/20、21/21、22/22或23/23。在一些实施方案中,所述siRNA正义链和反义链的长度比为21/21或23/23。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列III和核苷酸序列IV的长度均为1个核苷酸,核苷酸序列III的碱基为C,核苷酸序列IV的碱基为G;此时,正义链和反义链的长度比为20/20;或者,核苷酸序列III和IV的长度均为2个核苷酸,按照5’末端到3’末端的方向,核苷酸序列III的碱基依次为C、C,核苷酸序列IV的碱基依次为G、G;此时,正义链和反义链的长度比为21/21;或者,核苷酸序列III和IV的长度均为3个核苷酸,按照5’末端到3’末端的方向,核苷酸序列III的碱基依次为U、C、C,核苷酸序列IV的碱基依次为G、G、A;此时,正义链和反义链的长度比为22/22;或者,核苷酸序列III和IV的长度均为4个核苷酸,按照5’末端到3’末端的方向,核苷酸序列III的碱基依次为C、U、C、C,核苷酸序列IV的碱基依次为G、G、A、G;此时,正义链和反义链的长度比为23/23。在一些实施方案中,所述核苷酸序列III和核苷酸序列IV的长度为2个核苷酸,按照5’末端到3’末端的方向,核苷酸序列III的碱基依次为C、C,核苷酸序列IV的碱基依次为G、G;此时,正义链和反义链的长度比为21/21。
在一些实施方案中,核苷酸序列III和核苷酸序列IV的长度相同,并且完全反向互补,因此,给出了核苷酸序列III的碱基,核苷酸序列IV的碱基也就确定了。
在一些实施方案中,所述正义链和反义链长度不同,所述核苷酸序列II还含有核苷酸序列V,核苷酸序列V的长度为1至3个核苷酸,连接在反义链的3’末端,构成反义链的3’悬垂末端。由此,本公开提供的siRNA正义链和反义链的长度比可以是19/20、19/21、19/22、20/21、20/22、20/23、21/22、21/23、21/24、22/23、22/24、22/25、23/24、23/25或23/26。在一些实施方案中,所述核苷酸序列V的长度为2个核苷酸,由此,本公开提供的siRNA正义链和反义链的长度比可以是19/21、21/23或23/25。
所述核苷酸序列V中的每一个核苷酸可以是任意的核苷酸,为了便于合成并节约合成成本,所述核苷酸序列V为连续的2个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸(TT)或连续的2个尿嘧啶核糖核苷酸(UU);为了提高siRNA反义链与靶mRNA的亲和力,核苷酸序列V与靶mRNA的相应位置的核苷酸互补。
在一些实施方案中,所述正义链含有如SEQ ID NO:60所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列:
5’-CAAUAAAGCUGGACAAGAZA-3’(SEQ ID NO:60)
5’-Z'BUCUUGUCCAGCUUUAUUGGG-3’(SEQ ID NO:3)
或者所述正义链含有如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQID NO:5所示的核苷酸序列:
5’-CCCAAUAAAGCUGGACAAGAZA-3’(SEQ ID NO:4)
5’-Z'BUCUUGUCCAGCUUUAUUGGGAG-3’(SEQ ID NO:5)。
其中,所述Z'B是反义链5'末端的第一个核苷酸,ZA选自A、U、G或C,并且Z'B是与ZA互补的核苷酸。
在一些实施方案中,本公开所述的siRNA为siAP1或siAP2:
siAP1
正义链:5’-CAAUAAAGCUGGACAAGAA-3’(SEQ ID NO:6)
反义链:5’-UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGG-3’(SEQ ID NO:7)
siAP2
正义链:5’-CCCAAUAAAGCUGGACAAGAA-3’(SEQ ID NO:8)
反义链:5’-UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGGAG-3’(SEQ ID NO:9)。
在一些实施方案中,按照5'末端到3'末端的方向,在所述正义链中,所述核苷酸序列A的第7、8、9位或者5、7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述正义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸;在所述反义链中,所述核苷酸序列B的第2、6、14、16位或者2、6、8、9、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述反义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸。
氟代修饰的核苷酸指核苷酸的核糖基2'位的羟基被氟取代形成的核苷酸,其具有以下式(107)所示的结构。非氟代修饰的核苷酸指核苷酸的核糖基2'位的羟基被非氟基团取代形成的核苷酸或核苷酸类似物。在一些实施方案中,每一个非氟代修饰的核苷酸独立地选自核苷酸的核糖基2'位的羟基被非氟基团取代形成的核苷酸或核苷酸类似物中的一种。
这些核糖基2'位的羟基被非氟基团取代形成的核苷酸是本领域技术人员所公知的,这些核苷酸可以选自2'-烷氧基修饰的核苷酸、2'-经取代的烷氧基修饰的核苷酸、2'-烷基修饰的核苷酸、2'-经取代的烷基修饰的核苷酸、2'-氨基修饰的核苷酸、2'-经取代的氨基修饰的核苷酸、2'-脱氧核苷酸中的一种。
在一些实施方案中,2'-烷氧基修饰的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸(2'-OMe),如式(108)所示。在一些实施方案中,2'-经取代的烷氧基修饰的核苷酸,例如可以是2'-O-甲氧基乙基修饰的核苷酸(2'-MOE),如式(109)所示。在一些实施方案中,2'-氨基修饰的核苷酸(2'-NH2)如式(110)所示。在一些实施方案中,2'-脱氧核苷酸(DNA)如式(111)所示。
核苷酸类似物指能够在核酸中代替核苷酸,但结构不同于腺嘌呤核糖核苷酸、鸟嘌呤核糖核苷酸、胞嘧啶核糖核苷酸、尿嘧啶核糖核苷酸或胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸的基团。在一些实施方案中,核苷酸类似物可以是异核苷酸、桥联的核苷酸(bridged nucleicacid,简称BNA)或无环核苷酸。
BNA是指受约束的或不能接近的核苷酸。BNA可以含有五元环、六元环、或七元环的具有“固定的”C3'-内切糖缩拢的桥联结构。通常将该桥掺入到该核糖的2'-、4'-位处以提供一个2',4'-BNA核苷酸。在一些实施方案中,BNA可以是LNA、ENA、cET BNA等,其中,LNA如式(112)所示,ENA如式(113)所示,cET BNA如式(114)所示。
无环核苷酸是核苷酸的糖环被打开形成的一类核苷酸。在一些实施方案中,无环核苷酸可以是解锁核酸(UNA)或甘油核酸(GNA),其中,UNA如式(115)所示,GNA如式(116)所示。
上述式(115)和式(116)中,R选自H、OH或烷氧基(O-烷基)。
异核苷酸是指核苷酸中碱基在核糖环上的位置发生改变而形成的化合物。在一些实施方案中,异核苷酸可以是碱基从核糖环的1'-位移动至2'-位或3'-位而形成的化合物,如式(117)或(118)所示。
上述式(117)-式(118)化合物中,Base表示碱基,例如A、U、G、C或T;R选自H、OH、F或者如上所述的非氟基团。
在一些实施方案中,核苷酸类似物选自异核苷酸、LNA、ENA、cET、UNA和GNA中的一种。在一些实施方案中,每一个非氟代修饰的核苷酸均为甲氧基修饰的核苷酸,在上文和下文中,所述甲氧基修饰的核苷酸指核糖基的2'-羟基被甲氧基取代而形成的核苷酸。
在上文及下文中,“氟代修饰的核苷酸”、“2'-氟修饰的核苷酸”、“核糖基团的2'-羟基被氟取代的核苷酸”和“2'-氟代核糖基”意义相同,均指核苷酸的2'-羟基被氟取代,而形成的具有如式(107)所示结构的化合物;“甲氧基修饰的核苷酸”、“2'-甲氧基修饰的核苷酸”、“核糖基团的2'-羟基被甲氧基取代的核苷酸”和“2'-甲氧基核糖基”意义相同,均指核苷酸核糖基团的2'-羟基被甲氧基取代而形成的具有如式(108)所示结构的化合物。
在一些实施方案中,本公开的siRNA是具有以下修饰的siRNA:按照5'末端到3'末端的方向,在所述正义链中,所述核苷酸序列A的第7、8、9位或者第5、7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述正义链中其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;在所述反义链中,所述核苷酸序列B的第2、6、14、16位或者第2、6、8、9、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述反义链中其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,本公开的siRNA是具有以下修饰的siRNA:按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的正义链中核苷酸序列A的第5、7、8和9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链的其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸,并且,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的反义链中核苷酸序列B的第2、6、8、9、14和16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;
或者,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的正义链中核苷酸序列A的第7、8和9位的核苷酸为-氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链的其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸,并且,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的反义链中核苷酸序列B的第2、6、14和16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸。
换句话说,该siRNA的磷酸-糖骨架中的核糖基分别具有如下修饰基团:按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的正义链中核苷酸序列A的第5、7、8和9位的糖基为2’-氟代核糖基,siRNA的正义链的其余位置核苷酸的糖基为2’-甲氧基核糖基,并且,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的反义链中核苷酸序列B的第2、6、8、9、14和16位的糖基为2’-氟代核糖基,siRNA的反义链其余位置核苷酸的糖基为2’-甲氧基核糖基;
或者,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的正义链中核苷酸序列A的第7、8和9位的糖基为2’-氟代核糖基,siRNA的正义链的其余位置核苷酸的糖基为2’-甲氧基核糖基,并且,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的反义链中核苷酸序列B的第2、6、14和16位的糖基为2’-氟代核糖基,siRNA的反义链其余位置核苷酸的糖基为2’-甲氧基核糖基。
在一些实施方案中,所述siRNA分子为siAP1-M1、siAP2-M1、siAP1-M2、siAP2-M2中的任意一种:
siAP1-M1
正义链:5’-CmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’
(SEQ ID NO:10)
反义链:5’-UmUfCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGm-3’(SEQ ID NO:11)
siAP2-M1
正义链:5’-CmCmCmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:12)
反义链:5’-UmUfCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmAmGm-3’
(SEQ ID NO:13)
siAP1-M2
正义链:5’-CmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:14)
反义链:5’-UmUfCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGm-3’(SEQ ID NO:15)
siAP2-M2
正义链:5’-CmCmCmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:16)
反义链:5’-UmUfCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmAmGm-3’(SEQ IDNO:17)
在一些实施方案中,本公开提供的siRNA的正义链和反义链中至少一条单链的磷酸-糖骨架中的磷酸酯基中的至少一部分为具有修饰基团的磷酸酯基。在一些实施方案中,具有修饰基团的磷酸酯基为磷酸酯基中的磷酸二酯键中的至少一个氧原子被硫原子取代而形成的硫代磷酸酯基;在一些实施方案中,所述具有修饰基团的磷酸酯基为具有如式(101)所示结构的硫代磷酸酯基:
这种修饰能稳定siRNA的双链结构,保持碱基配对的高特异性和高亲和力。
在一些实施方案中,本公开提供的siRNA中,硫代磷酸酯基连接存在于由以下位置组成的组中的至少一处:正义链或反义链任意一端的第一个和第二个核苷酸之间;正义链或反义链任意一端的第二个和第三个核苷酸之间;或上述的任意组合。在一些实施方案中,硫代磷酸酯基连接存在于除正义链5'末端以外的全部上述位置处。在一些实施方案中,硫代磷酸酯基连接存在于除正义链3'末端以外的全部上述位置处。在一些实施方案中,硫代磷酸酯基连接存在于以下位置中的至少一处:
所述正义链的5'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述正义链的5'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述正义链的3'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述正义链的3'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述反义链的5'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述反义链的5'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述反义链的3'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;以及所述反义链的3'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间。
在一些实施方案中,所述siRNA为siAP1-M1S、siAP2-M1S、siAP1-M2S、siAP2-M2S中的任意一种:
siAP1-M1S
正义链:5’-CmsAmsAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:18)
反义链:5’-UmsUfsCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmsGmsGm-3’(SEQ IDNO:19)
siAP2-M1S
正义链:5’-CmsCmsCmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’
(SEQ ID NO:20)
反义链:5’-UmsUfsCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmsAmsGm-3’(SEQID NO:21)
siAP1-M2S
正义链:5’-CmsAmsAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:22)
反义链:5’-UmsUfsCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmsGmsGm-3’
(SEQ ID NO:23)
siAP2-M2S
正义链:5’-CmsCmsCmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’
(SEQ ID NO:24)
反义链:5’-UmsUfsCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmsAmsGm-3’(SEQID NO:25)
在一些实施方案中,所述siRNA反义链的5’末端核苷酸为5’-磷酸核苷酸或5’-磷酸类似物修饰的核苷酸。
常用的所述5’-磷酸核苷酸或5’-磷酸类似物修饰的核苷酸是本领域技术人员所公知的,如5'-磷酸核苷酸可具有如下结构:
再如,Anastasia Khvorova and Jonathan K.Watts,The chemical evolutionof oligonucleotide therapies of clinical utility.Nature Biotechnology,2017,35(3):238-48中公开了如下4种5’-磷酸类似物修饰的核苷酸:
其中,R选自H、OH、甲氧基或氟;Base表示碱基,选自A、U、C、G或T。在一些实施方案中,5'-磷酸核苷酸为式(102)所示的含有5'-磷酸修饰的核苷酸,5’-磷酸类似物修饰的核苷酸为含有乙烯基磷酸酯(5’-(E)-vinylphosphonate,E-VP)修饰的核苷酸,如式(103)所示,或者为硫代磷酸酯修饰的核苷酸,如式(105)所示。
在一些实施方案中,本公开提供的siRNA可以为siAP1-M1P1、siAP2-M1P1、siAP1-M2P1、siAP2-M2P1、siAP1-M1SP1、siAP2-M1SP1、siAP1-M2SP1、siAP2-M2SP1中的任意一种:
siAP1-M1P1
正义链:5’-CmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:10)
反义链:5’-P1-UmUfCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGm-3’(SEQ ID NO:26)
siAP2-M1P1
正义链:5’-CmCmCmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:12)
反义链:5’-P1-UmUfCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmAmGm-3’(SEQ IDNO:27)
siAP1-M2P1
正义链:5’-CmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:14)
反义链:5’-P1-UmUfCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGm-3’(SEQ ID NO:28)
siAP2-M2P1
正义链:5’-CmCmCmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:16)
反义链:5’-P1-UmUfCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmAmGm-3’(SEQ IDNO:29)
siAP1-M1SP1
正义链:5’-CmsAmsAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:18)
反义链:5’-P1-UmsUfsCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmsGmsGm-3’(SEQ IDNO:30)
siAP2-M1SP1
正义链:5’-CmsCmsCmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:20)
反义链:5’-P1-UmsUfsCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmsAmsGm-3’(SEQ ID NO:31)
siAP1-M2SP1
正义链:5’-CmsAmsAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:22)
反义链:5’-P1-UmsUfsCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmsGmsGm-3’(SEQ IDNO:32)
siAP2-M2SP1
正义链:5’-CmsCmsCmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:24)
反义链:5’-P1-UmsUfsCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmsAmsGm-3’(SEQ ID NO:33)
本公开的发明人发现,本公开提供的siRNA不仅具有显著增强的血浆和溶酶体稳定性,减少了脱靶效应,还保留很高的基因抑制活性。
本公开提供的siRNA可以通过本领域常规的核酸制备方法(例如固相合成和液相合成的方法)得到。其中,固相合成已经有商业化订制服务。可以通过使用具有相应修饰的核苷单体来将修饰的核苷酸基团引入本公开所述的siRNA中,制备具有相应修饰的核苷单体的方法及将修饰的核苷酸基团引入siRNA的方法也是本领域技术人员所熟知的。
药物组合物
本公开提供了一种药物组合物,该药物组合物含有如上所述的修饰的siRNA和药学上可接受的载体。
所述药学上可接受的载体可以是siRNA给药领域常规使用的载体,例如但不限于磁性纳米粒(magnetic nanoparticles,如基于Fe3O4或Fe2O3的纳米粒)、碳纳米管(carbonnanotubes)、介孔硅(mesoporous silicon)、磷酸钙纳米粒(calcium phosphatenanoparticles)、聚乙烯亚胺(polyethylenimine,PEI)、聚酰胺型树形高分子(polyamidoamine(PAMAM)dendrimer)、聚赖氨酸(poly(L-lysine),PLL)、壳聚糖(chitosan)、1,2-二油酰基-3-三甲铵丙烷(1,2-dioleoyl-3-trimethylammonium-propane,DOTAP)、聚D型或L型乳酸/羟基乙酸共聚物(poly(D&L-lactic/glycolic acid)copolymer,PLGA)、聚(氨乙基乙撑磷酸酯)(poly(2-aminoethyl ethylene phosphate),PPEEA)和聚(甲基丙烯酸-N,N-二甲氨基乙酯)(poly(2-dimethylaminoethylmethacrylate),PDMAEMA)以及它们的衍生物中的一种或多种。
在一些实施方案中,所述药物组合物中,对siRNA和药学上可接受的载体的含量没有特别要求,在一些实施方案中,siRNA与药学上可接受的载体的重量比可以为1:(1-500),在一些实施方案中,上述重量比为为1:(1-50)。
在一些实施方案中,所述药物组合物中,还可以包含药学上可接受的其它辅料,该辅料可以为本领域常规采用的各种制剂或化合物的一种或多种。例如,所述药学上可接受的其它辅料可以包括pH缓冲液、保护剂和渗透压调节剂中的至少一种。
所述pH缓冲液可以为pH值7.5-8.5的三羟甲基胺基甲烷盐酸盐缓冲液和/或pH值5.5-8.5的磷酸盐缓冲液,例如可以为pH值5.5-8.5的磷酸盐缓冲液。
所述保护剂可以为肌醇、山梨醇、蔗糖、海藻糖、甘露糖、麦芽糖、乳糖和葡萄糖中的至少一种。以所述药物组合物的总重量为基准,所述保护剂的含量可以为0.01-30重量%。
所述渗透压调节剂可以为氯化钠和/或氯化钾。所述渗透压调节剂的含量使所述药物组合物的渗透压为200-700毫渗摩尔/千克(mOsm/kg)。根据所需渗透压,本领域技术人员可以容易地确定所述渗透压调节剂的含量。
在一些实施方案中,所述药物组合物可以为液体制剂,例如注射液;也可以为冻干粉针剂,实施给药时与液体辅料混合,配制成液体制剂。所述液体制剂可以但不限于用于皮下、肌肉或静脉注射给药,也可以但不限于通过喷雾给药到肺脏、或通过喷雾经肺脏给药到其它脏器组织(如肝脏)。在一些实施方案中,所述药物组合物用于静脉注射给药。
在一些实施方案中,所述药物组合物可以为脂质体制剂的形式。在一些实施方案中,所述脂质体制剂中使用的药学上可接受的载体包含含胺的转染化合物(下文也可将其称为有机胺)、辅助脂质和/或聚乙二醇化脂质。其中,所述有机胺、辅助脂质和聚乙二醇化脂质可分别选自于CN103380113A(通过引用的方式将其整体并入本文)中所描述的含胺的转染化合物或其药学上可接受的盐或衍生物、辅助脂质和聚乙二醇化脂质中的一种或多种。
在一些实施方案中,所述有机胺可为CN103380113A中描述的如式(201)所示的化合物或其药学上可接受的盐:
其中:
X101和X102各自独立地是O、S、N-A或C-A,其中A是氢或C1-C20烃链;
Y和Z各自独立地是C=O、C=S、S=O、CH-OH或SO2;
R101、R102、R103、R104、R105、R106和R107各自独立地是氢,环状或无环的、被取代的或未被取代的、支链或直链脂族基团,环状或无环的、被取代的或未被取代的、支链或直链杂脂族基团,被取代的或未被取代的、支链或直链酰基,被取代的或未被取代的、支链或直链芳基,被取代的或未被取代的、支链或直链杂芳基;
x是1-10的整数;
n是1-3的整数,m是0-20的整数,p是0或1;其中,如果m=p=0,则R102是氢;
并且,如果n或m中的至少一个是2,那么R103和在式(201)中的氮形成如式(202)或式(203)所示的结构:
其中,g、e和f各自独立地是1-6的整数,“HCC”代表烃链,且每个*N表示在式(201)中的氮原子。
在一些实施方案中,R103是多胺。在其它实施方案中,R103是缩酮。在一些实施方案中,在式(201)中的R101和R102中的每一个独立地是任意的被取代的或未被取代的、支链或直链烷基或烯基,所述烷基或烯基具有3至约20个碳原子,诸如8至约18个碳原子,和0至4个双键,诸如0至2个双键。
在一些实施方案中,如果n和m中的每一个独立地具有1或3的值,那么R103可以是下述式(204)-式(213)中的任一个:
其中,式(204)-式(213)中,g、e和f各自独立地是1-6的整数,每个“HCC”代表烃链,且每个*显示R103与在式(201)中的氮原子的可能连接点,其中在任意*位置上的每个H可以被替换以实现与在式(201)中的氮原子的连接。
其中,式(201)所示化合物可以根据CN103380113A中的描述制备。
在一些实施方案中,所述有机胺为如式(214)所示的有机胺和/或如式(215)所示的有机胺:
所述辅助脂质为胆固醇、胆固醇的类似物和/或胆固醇的衍生物;
所述聚乙二醇化脂质为1,2-二棕榈酰胺-sn-甘油-3-磷脂酰乙醇胺-N-[甲氧基(聚乙二醇)]-2000。
在一些实施方案中,所述药物组合物中,所述有机胺、所述辅助脂质和所述聚乙二醇化脂质三者之间的摩尔比为(19.7-80):(19.7-80):(0.3-50),例如可以为(50-70):(20-40):(3-20)。
在一些实施方案中,由本公开的siRNA与上述含胺的转染试剂形成的药物组合物颗粒具有约30nm至约200nm的平均直径,通常为约40nm至约135nm,更通常地,该脂质体颗粒的平均直径是约50nm至约120nm、约50nm至约100nm、约60nm至约90nm或约70nm至约90nm,例如,该脂质体颗粒的平均直径是约30、40、50、60、70、75、80、85、90、100、110、120、130、140、150或160nm。
在一些实施方案中,由本公开的siRNA与上述含胺的转染试剂形成的药物组合物中,siRNA与全部脂质(例如有机胺、辅助脂质和/或聚乙二醇化脂质)的重量比(重量/重量比)在从约1:1至约1:50、从约1:1至约1:30、从约1:3至约1:20、从约1:4至约1:18、从约1:5至约1:17、从约1:5至约1:15、从约1:5至约1:12、从约1:6至约1:12或从约1:6至约1:10的范围内,例如,本公开的siRNA与全部脂质的重量比为约1:5、1:6、1:7、1:8、1:9、1:10、1:11、1:12、1:13、1:14、1:15、1:16、1:17或1:18。
在一些实施方案中,所述药物组合物在销售时各组分可以独立存在,在使用时可以液体制剂的形式存在。在一些实施方案中,本公开提供的siRNA与上述药学上可接受的载体形成的药物组合物可以按照已知的各种方法制备,只是用本公开提供的siRNA替代现有siRNA即可;在一些实施方案中,可以按照如下方法制备:
将有机胺、辅助脂质和聚乙二醇化脂质按照上述摩尔比悬浮于醇中并混匀得到脂质溶液;醇的用量使得到的脂质溶液的总质量浓度为2-25mg/mL,例如可以为8-18mg/mL。所述醇选自药学上可接受的醇,诸如在室温附近为液体的醇,例如,乙醇、丙二醇、苯甲醇、甘油、聚乙二醇200,聚乙二醇300,聚乙二醇400中的一种或多种,例如可以为乙醇。
将本公开提供的siRNA溶解于缓冲盐溶液中,得到siRNA水溶液。缓冲盐溶液的浓度为0.05-0.5M,例如可以为0.1-0.2M,调节缓冲盐溶液的pH至4.0-5.5,例如可以为5.0-5.2,缓冲盐溶液的用量使siRNA的浓度不超过0.6mg/mL,例如可以为0.2-0.4mg/mL。所述缓冲盐选自可溶性醋酸盐、可溶性柠檬酸盐中的一种或多种,例如可以为醋酸钠和/或醋酸钾。
将脂质溶液和siRNA水溶液混合,将混合后得到的产物在40-60℃孵育至少2分钟,例如可以为5-30分钟,得到孵育后的脂质体制剂。脂质溶液和siRNA水溶液的体积比为1:(2-5),例如可以为1:4。
将孵育后的脂质体制剂浓缩或稀释,去除杂质,除菌,得到本公开提供的药物组合物,其理化参数为pH值为6.5-8,包封率不低于80%,粒径为40-200nm,多分散指数不高于0.30,渗透压为250-400mOsm/kg;例如理化参数可以为pH值为7.2-7.6,包封率不低于90%,粒径为60-100nm,多分散指数不高于0.20,渗透压为300-400mOsm/kg。
其中,浓缩或稀释可以在去除杂质之前、之后或同时进行。去除杂质的方法可以采用现有各种方法,例如可以使用切相流***、中空纤维柱,在100K Da条件下超滤,超滤交换溶液为pH7.4的磷酸盐缓冲液(PBS)。除菌的方法可以采用现有各种方法,例如可以在0.22μm滤器上过滤除菌。
第一种siRNA缀合物
本公开提供了一种siRNA缀合物,所述第一种siRNA缀合物含有上述siRNA以及缀合连接至该siRNA的缀合基团。
一般来说,所述缀合基团包含药学上可接受的至少一个靶向基团和任选的接头(linker),并且,所述siRNA、所述接头和所述靶向基团依次连接。在一些实施方案中,所述靶向基团为1-6个。在一些实施方案中,所述靶向基团为2-4个。所述siRNA分子可以非共价或共价缀合至所述缀合基团,例如可以共价缀合至所述缀合基团。siRNA与缀合基团的缀合位点可以在siRNA正义链的3’端或5’端,也可在反义链的5’端,还可以在siRNA的内部序列中。在一些实施方案中,所述siRNA与缀合基团的缀合位点在siRNA正义链的3’末端。
在一些实施方案中,所述缀合基团可以连接在核苷酸的磷酸基团、2’-位羟基或者碱基上。在一些实施方案中,所述缀合基团还可以连接在3’-位羟基上,此时核苷酸之间采用2’-5’磷酸二酯键连接。当缀合基团连接在siRNA链的末端时,所述缀合基团通常连接在核苷酸的磷酸基团上;当缀合基团连接在siRNA的内部序列时,所述缀合基团通常连接在核糖糖环或者碱基上。各种连接方式可以参考Muthiah Manoharan et.al.siRNA conjugatescarrying sequentially assembled trivalent N-acetylgalactosamine linkedthrough nucleosides elicit robust gene silencing in vivo in hepatocytes.ACSChemical biology,2015,10(5):1181-7.
在一些实施方案中,所述siRNA与缀合基团间可以通过酸不稳定的、或可还原的化学键相连,在细胞内涵体的酸性环境下,这些化学键可降解,从而使siRNA成为自由状态。对于不可降解的缀合方式,缀合基团可连接在siRNA的正义链,从而尽量降低缀合对siRNA活性的影响。
在一些实施方案中,所述药学上可接受的靶向基团可以是siRNA给药领域常规使用的配体,例如WO2009082607A2中描述的各种配体,以引用的方式将其全部公开内容并入本文。
在一些实施方案中,所述药学上可接受的靶向基团可以选自以下靶向分子或其衍生物形成的配体中的一种或多种:亲脂分子,例如胆固醇、胆汁酸、维生素(例如维生素E)、不同链长的脂质分子;聚合物,例如聚乙二醇;多肽,例如透膜肽;适配体;抗体;量子点;糖类,例如乳糖、聚乳糖、甘露糖、半乳糖、N-乙酰半乳糖胺(GalNAc);叶酸(folate);肝实质细胞表达的受体配体,例如去唾液酸糖蛋白、去唾液酸糖残基、脂蛋白(如高密度脂蛋白、低密度脂蛋白等)、胰高血糖素、神经递质(如肾上腺素)、生长因子、转铁蛋白等。
在一些实施方案中,所述的每个配体独立地选自一个能够与细胞表面受体结合的配体,或者,每个配体独立地为与哺乳动物肝细胞表面的去唾液酸糖蛋白受体亲和的配体。在一些实施方案中,至少一个配体是能够与肝细胞表面受体结合的配体。在一些实施方案中,至少一个配体是能够与哺乳动物细胞表面受体结合的配体。在一些实施方案中,至少一个配体是能够与人肝细胞表面受体结合的配体。在一些实施方案中,至少一个配体是能够与肝表面去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)结合的配体。这些配体的种类为本领域技术人员所公知,其作用一般是与靶细胞表面的特异性受体相结合,介导与配体连接的siRNA递送至靶细胞。
在一些实施方案中,所述药学上可接受的靶向基团可以是与哺乳动物肝细胞表面上的去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)结合的任意一种配体。在一些实施方案中,每个配体独立地为去唾液酸糖蛋白,例如去唾液酸血清类粘蛋白(asialoorosomucoid,ASOR)或去唾液酸胎球蛋白(asialofetuin,ASF)。在一些实施方案中,所述配体为糖或糖的衍生物。
在一些实施方案中,至少一个配体是糖。在一些实施方案中,每个配体均是糖。在一些实施方案中,至少一个配体是单糖、多糖、修饰的单糖、修饰的多糖或糖衍生物。在一些实施方案中,至少一个所述配体可以是单糖,双糖或三糖。在一些实施方案中,至少有一个配体是修饰的糖。在一些实施方案中,每一个配体均为修饰的糖。在一些实施方案中,每个配体均独立地选自多糖、修饰的多糖、单糖、修饰的单糖、多糖衍生物或单糖衍生物。在一些实施方案中,每一个或至少一个配体选自由葡萄糖及其衍生物组、甘露聚糖及其衍生物、半乳糖及其衍生物、木糖及其衍生物、核糖及其衍生物、岩藻糖及其衍生物、乳糖及其衍生物、麦芽糖及其衍生物,***糖及其衍生物、果糖及其衍生物和唾液酸组成的组中。
在一些实施方案中,每个所述配体可独立地选自D-吡喃甘露糖、L-吡喃甘露糖、D-***糖、D-呋喃木糖、L-呋喃木糖、D-葡萄糖、L-葡萄糖、D-半乳糖、L-半乳糖、α-D-呋喃甘露糖、β-D-呋喃甘露糖、α-D-吡喃甘露糖、β-D-吡喃甘露糖、α-D-吡喃葡萄糖、β-D-吡喃葡萄糖、α-D-呋喃葡萄糖、β-D-呋喃葡萄糖、α-D-呋喃果糖、α-D-吡喃果糖、α-D-吡喃半乳糖、β-D-吡喃半乳糖、α-D-呋喃半乳糖、β-D-呋喃半乳糖、葡糖胺、唾液酸、半乳糖胺、N-乙酰基半乳糖胺、N-三氟乙酰基半乳糖胺、N-丙酰基半乳糖胺、N-正丁酰基半乳糖胺、N-异丁酰基半乳糖胺、2-氨基-3-O-[(R)-1-羧乙基]-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖、2-脱氧-2-甲基氨基-L-吡喃葡萄糖、4,6-二脱氧-4-甲酰胺基-2,3-二-O-甲基-D-吡喃甘露糖、2-脱氧-2-磺氨基-D-吡喃葡萄糖、N-乙醇酰基-α-神经氨酸、5-硫代-β-D-吡喃葡萄糖、2,3,4-三-O-乙酰基-1-硫代-6-O-三苯甲基-α-D-吡喃葡萄糖苷甲酯、4-硫代-β-D-吡喃半乳糖、3,4,6,7-四-O-乙酰基-2-脱氧-1,5-二硫代-α-D-吡喃葡庚糖苷乙酯、2,5-脱水-D-阿洛糖腈、核糖、D-核糖、D-4-硫代核糖、L-核糖或L-4-硫代核糖。所述配体的其它选择可参见例如CN105378082A的记载,以引用的方式将其全部公开内容并入本文。
在一些实施方案中,所述第一种siRNA缀合物中药学上可接受的靶向基团可以是半乳糖或N-乙酰半乳糖胺,其中,半乳糖或N-乙酰半乳糖胺分子可以是一价、二价、三价、四价。应当理解的是,这里所述的一价、二价、三价、四价分别指siRNA分子与含有作为靶向基团的半乳糖或N-乙酰半乳糖胺分子的缀合基团形成siRNA缀合物后,该siRNA缀合物中siRNA分子与半乳糖或N-乙酰半乳糖胺分子的摩尔比为1:1、1:2、1:3或1:4。在一些实施方案中,所述药学上可接受的靶向基团是N-乙酰半乳糖胺。在一些实施方案中,当本公开所述的siRNA与含有N-乙酰半乳糖胺的缀合基团缀合时,N-乙酰半乳糖胺分子是三价或四价。在一些实施方案中,当本公开所述的siRNA与含有N-乙酰半乳糖胺的缀合基团缀合时,N-乙酰半乳糖胺分子是三价。
靶向基团可经由合适的接头与siRNA分子相连,本领域技术人员可以根据靶向基团的具体类型选择合适的接头。这些接头、靶向基团的种类以及与siRNA的连接方式,可参见WO2015006740A2的公开内容,通过引用的方式将其整体内容并入本文。
在一些实施方案中,当所述靶向基团为N-乙酰半乳糖胺时,合适的接头可以为如式(301)所示的结构:
其中,
k为1-3的整数;
LA为具有如式(302)所示结构的包含酰胺键的链状部分,每个所述LA在其两端分别与一个所述靶向基团和所述LC部分通过醚键相连接:
LB为具有如式(303)所示结构的包含N-酰基吡咯烷的链状部分,所述链状部分在其一端具有羰基并与所述LC部分通过酰胺键相连接,在另一端具有氧基并与所述siRNA通过磷酸酯键相连接:
LC为基于羟甲基氨基甲烷、二羟甲基氨基甲烷或三羟甲基氨基甲烷的2-4价连接基团,所述LC经由氧原子与各个所述LA部分通过醚键相连接,并且经由氮原子与所述LB部分通过酰胺键相连接。
在一些实施方案中,当n=3,LC为基于三羟甲基氨基甲烷的4价连接基团时,由作为接头的-(LA)3三羟甲基氨基甲烷-LB-连接N-乙酰半乳糖胺分子和siRNA分子所形成的第一种siRNA缀合物,其结构如下式(304)所示:
式中,双螺旋结构表示siRNA。
同样,siRNA与缀合基团的缀合位点可以在siRNA正义链的3'端或5'端,也可在反义链的5'端,还可以在siRNA的内部序列中。
在一些实施方案中,本公开所述siRNA的正义链3'末端通过接头-(LA)3三羟甲基氨基甲烷-LB-与三个N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)分子共价缀合,得到siRNA分子与GalNAc分子的摩尔比为1:3的第一种siRNA缀合物,下文也可将其称为(GalNAc)3-siRNA,其结构如下式(305)所示:
其中,双螺旋结构表示所述siRNA,并且所述接头连接至所述siRNA的正义链3'末端。
在一些实施方案中,当所述靶向基团为N-乙酰半乳糖胺时,合适的接头可以为如式(306)所示的结构:
其中,
l为0-3的整数;
*表示接头上通过醚键与靶向基团连接的位点;
#表示接头上通过磷酸酯键与siRNA连接的位点。
在一些实施方案中,当l=2时,所述第一种siRNA缀合物具有如式(307)所示的结构:
其中,双螺旋结构表示所述siRNA,并且所述接头连接至所述siRNA的正义链3'末端。
上述缀合物可以通过现有技术中已经详细描述的方法进行合成。例如,WO2015006740A2中详细描述了多种缀合物的制备方法。通过本领域技术人员熟知的方式,获得本公开的第一种siRNA缀合物。如WO2014025805A1中记载了式(305)所示结构的制备方法,Rajeev等人在ChemBioChem 2015,16,903-908中描述了式(307)所示结构的制备方法。
第二种siRNA缀合物
在一些实施方案中,本公开提供了第二种siRNA缀合物,该第二种siRNA缀合物具有如式(1)所示的结构:
其中:
n1为选自1-3的整数,n3为选自0-4的整数;
m1、m2和m3独立地为选自2-10的整数;
R10、R11、R12、R13、R14和R15各自独立地为H,或选自于由以下基团所组成的组:C1-C10烷基、C1-C10卤代烷基以及C1-C10烷氧基;
R3为式A59所示结构的基团:
其中,E1为OH、SH或BH2,Nu为siRNA;
Nu代表的siRNA中的每个核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸,Nu代表的siRNA含有正义链和反义链,所述正义链包含核苷酸序列1,所述反义链包含核苷酸序列2,所述核苷酸序列1和所述核苷酸序列2至少部分地反向互补形成双链区,所述核苷酸序列1与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列2与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:
5'-CAAUAAAGCUGGACAAGAZ-3'(SEQ ID NO:1),
5'-Z'UCUUGUCCAGCUUUAUUG-3'(SEQ ID NO:2);
其中,Z为A,Z'为U,
所述核苷酸序列1中包含位置对应于Z的核苷酸ZA,所述核苷酸序列2中包含位置对应于Z'的核苷酸Z'B,所述Z'B是所述反义链5'末端的第一个核苷酸;
在上文与下文中,“位置对应”是指从核苷酸序列相同端起算,处于核苷酸序列中相同的位置。例如,核苷酸序列1的3'端第1个核苷酸是位置对应于SEQ ID NO:1的3'端第1个核苷酸的核苷酸。
R2是长度为1-20个碳原子的直链亚烷基,其中一个或多个碳原子任选地被选自于以下基团所组成的组中的一个或多个所替换:C(O)、NH、O、S、CH=N、S(O)2、C2-C10亚烯基、C2-C10亚炔基、C6-C10亚芳基、C3-C18亚杂环基和C5-C10亚杂芳基;并且其中,R2可任选地具有由以下基团所组成的组中的任何一个或多个的取代基:C1-C10烷基、C6-C10芳基、C5-C10杂芳基、C1-C10卤代烷基、-OC1-C10烷基、-OC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-OH、-OC1-C10卤代烷基、-SC1-C10烷基、-SC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-SH、-SC1-C10卤代烷基、卤素取代基、-OH、-SH、-NH2、-C1-C10烷基-NH2、-N(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-NH(C1-C10烷基)、氰基、硝基、-CO2H、-C(O)O(C1-C10烷基)、-CON(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-CONH(C1-C10烷基)、-CONH2,-NHC(O)(C1-C10烷基)、-NHC(O)(苯基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(C1-C10烷基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(苯基)、-C(O)C1-C10烷基、-C(O)C1-C10烷基苯基、-C(O)C1-C10卤烷基、-OC(O)C1-C10烷基、-SO2(C1-C10烷基)、-SO2(苯基)、-SO2(C1-C10卤代烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-C10烷基)、-SO2NH(苯基)、-NHSO2(C1-C10烷基)、-NHSO2(苯基)和-NHSO2(C1-C10卤代烷基)。
每个L1是长度为1-70个碳原子的直链亚烷基,其中一个或多个碳原子任选地被选自于以下基团所组成的组中的一个或多个所替换:C(O)、NH、O、S、CH=N、S(O)2、C2-C10亚烯基、C2-C10亚炔基、C6-C10亚芳基、C3-C18亚杂环基和C5-C10亚杂芳基;并且其中,L1可任选地具有由以下基团所组成的组中的任何一个或多个的取代基:C1-C10烷基、C6-C10芳基、C5-C10杂芳基、C1-C10卤代烷基、-OC1-C10烷基、-OC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-OH、-OC1-C10卤代烷基、-SC1-C10烷基、-SC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-SH、-SC1-C10卤代烷基、卤素取代基、-OH、-SH、-NH2、-C1-C10烷基-NH2、-N(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-NH(C1-C10烷基)、氰基、硝基、-CO2H、-C(O)O(C1-C10烷基)、-CON(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-CONH(C1-C10烷基)、-CONH2,-NHC(O)(C1-C10烷基)、-NHC(O)(苯基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(C1-C10烷基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(苯基)、-C(O)C1-C10烷基、-C(O)C1-C10烷基苯基、-C(O)C1-C10卤烷基、-OC(O)C1-C10烷基、-SO2(C1-C10烷基)、-SO2(苯基)、-SO2(C1-C10卤代烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-C10烷基)、-SO2NH(苯基)、-NHSO2(C1-C10烷基)、-NHSO2(苯基)和-NHSO2(C1-C10卤代烷基)。
在一些实施方案中,L1可选自于由A1-A26基团或其任意组合所组成的组,其中A1-A26的结构和定义如下所示:
其中,j1为1-20的整数;j2为1-20的整数;
R’为C1-C10的烷基;
Ra选自式A27-A45基团或其任意组合所组成的组:
Rb为C1-C10的烷基;表示基团连接至分子其余部分的位点。
技术人员会理解的是,尽管为了方便起见,L1被定义为线性烷基,但是它可能不是线性基团或者名称不同,例如由于上述替换和/或置换而产生的胺或烯基。为了本公开内容的目的,L1的长度是连接两个附着点的链中的原子数。为此目的,将替换所述直链亚烷基的碳原子而得到的环(如亚杂环基或亚杂芳基)计为一个原子。
M1表示靶向基团,其定义和可选择的范围与上述靶向基团相同。在一些实施方案中,每个M1独立地选自对哺乳动物肝脏细胞表面上的去唾液酸糖蛋白受体具有亲合力的配体中的一种。
当M1为对哺乳动物肝脏细胞表面上的去唾液酸糖蛋白受体具有亲合力的配体时,在一些实施方案中,n1可以是1-3的整数,n3可以是0-4的整数,保证所述缀合物中M1靶向基团的个数至少为2;在一些实施方案中,n1+n3≥2,这样可以使得M1靶向基团的个数至少为3,从而使得M1靶向基团与肝表面去唾液酸糖蛋白受体更容易结合,进而促进所述缀合物通过内吞作用进入细胞。实验表明,当M1靶向基团的个数大于3个时,M1靶向基团与肝表面去唾液酸糖蛋白受体结合的容易程度增加并不明显,因此,从合成容易程度、结构/工艺成本和递送效率等多方面综合考虑,在一些实施方案中,n1为1-2的整数,n3为0-1的整数,且n1+n3=2-3。
在一些实施方案中,m1、m2和m3独立地选自2-10的整数时,可以使多个M1靶向基团之间的空间位置适合M1靶向基团与肝表面去唾液酸糖蛋白受体的结合,为了使本公开提供的缀合物更为简单,更容易合成和/或降低成本,在一些实施方案中,m1、m2和m3各自独立地为2-5的整数,在一些实施方案中,m1=m2=m3。
本领域技术人员可以理解,当R10、R11、R12、R13、R14和R15各自独立地选自H、C1-C10烷基、C1-C10卤代烷基、以及C1-C10烷氧基中的一种时,不会改变本公开的缀合物的性质,均可以实现本公开的目的。在一些实施方案中,R10、R11、R12、R13、R14和R15各自独立地选自H、甲基和乙基。在一些实施方案中,R10、R11、R12、R13、R14和R15均为H。
R3为式A59所示结构的基团,其中,E1为OH、SH或BH2,基于制备原料易获取性的考虑,在一些实施方案中,E1为OH或SH。
R2的选择是为了实现与含氮骨架上的N与A59的连接。在本公开的上下文中,“含氮骨架”是指连接有R10、R11、R12、R13、R14和R15的碳原子与N互相连接的链状结构。因此,R2可以是任何能够以适当方式将A59基团连接至含氮骨架上的N的连接基团。在一些实施方案中,在通过固相合成的工艺制备第二种siRNA缀合物的情况下,R2基团中需要同时含有与含氮骨架上的N连接的连接位点和与R3中的P相连接的连接位点。在一些实施方案中,R2中所述与含氮骨架上的N连接的位点与N形成酰胺键,所述与R3上的P连接的位点与P形成磷酸酯键;在一些实施方案中,R2可以是B5、B6、B5’或B6’:
其中,表示基团共价键连接的位点。
q2的取值范围可以是1-10的整数,在一些实施方案中,q2为1-5的整数。
L1的作用是将M1靶向基团与含氮骨架上的N连接,为第二种siRNA缀合物提供肝靶向功能。在一些实施方案中,L1选自式A1-A26基团中的一种或多种的连接组合。在一些实施方案中,L1选自A1、A4、A5、A6、A8、A10、A11和A13中的一种或多种的连接组合。在一些实施方案中,L1选自A1、A4、A8、A10和A11中至少2个的连接组合。在一些实施方案中,L1选自A1、A8、A10中至少2个的连接组合。
在一些实施方案中,L1的长度可以为3-25个原子,3-20个原子、4-15个原子或5-12个原子。在一些实施方案中,L1的长度为3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、11个、12个、13个、14个、15个、16个、17个、18个、19个、20个、21个、22个、23个、24个、25个、30个、35个、40个、45个、50个、55个、60个原子。
技术人员会理解,尽管为了方便起见,L1被定义为线性烷基,但是它可能不是线性基团或者名称不同,例如由于上述替换和/或置换而产生的胺或烯基。为了本公开内容的目的,L1的长度是连接两个附着点的链中的原子数。为此目的,将替换所述直链亚烷基的碳原子而得到的环(如亚杂环基或亚杂芳基)计为一个原子。
在一些实施方案中,j1为2-10的整数,在一些实施方案中,j1为3-5的整数。在一些实施方案中,j2为2-10的整数,在一些实施方案中,j2为3-5的整数。R’为C1-C4的烷基,在一些实施方案中,R’为甲基、乙基和异丙基中的一种。Ra为A27、A28、A29、A30和A31中的一种,在一些实施方案中,Ra为A27或A28。Rb为C1-C5的烷基,在一些实施方案中,Rb为甲基、乙基、异丙基和丁基中的一种。在一些实施方案中,在式A1-A26中各自对j1、j2、R’、Ra、Rb进行选择,以实现M1靶向基团与含氮骨架上的N连接,并使M1靶向基团之间的空间位置更适合M1靶向基团与肝表面去唾液酸糖蛋白受体结合。
在一些实施方案中,该缀合物具有式(3)、(4)、(5)、(6)、(7)、(8)、(9)、(10)、(11)、(12)、(13)、(14)、(15)、(16)、(17)、(18)、(19)、(20)、(21)或(22)所示的结构:
在一些实施方案中,式A59中的P可以连接到Nu代表的siRNA序列中任何可能的位置,例如,式A59中的P可以连接到Nu代表的siRNA正义链或反义链的任何一个核苷酸上;在一些实施方案中,式A59中的P可以连接到Nu代表的siRNA正义链的任何一个核苷酸上。在一些实施方案中,式A59中的P连接到Nu代表的siRNA正义链或反义链的端部;在一些实施方案中,式A59中的P连接到Nu代表的siRNA正义链的端部。Nu代表的siRNA的端部指Nu代表的siRNA正义链或反义链中从其一端起算的前4个核苷酸。在一些实施方案中,式A59中的P连接到Nu代表的siRNA正义链或反义链的末端;在一些实施方案中,式A59中的P连接到Nu代表的siRNA中的正义链的3'末端。在连接至Nu代表的siRNA的正义链的上述位置的情况下,第二种siRNA缀合物进入细胞后,在解旋时,可以释放出单独的siRNA反义链,以阻断APOC3mRNA翻译蛋白质的过程,抑制载脂蛋白C3(ApoC3)基因表达。
在一些实施方案中,式A59中的P可以连接到Nu代表的siRNA中的核苷酸上任何可能的位置,例如,核苷酸的5'位、核苷酸的2'位、核苷酸的3'位或核苷酸的碱基上。在一些实施方案中,式A59中的P可通过形成磷酸二酯键而连接至Nu代表的siRNA中的核苷酸的2'位、3'位或5'位。在一些实施方案中,式A59中的P连接在Nu代表的siRNA正义链3'末端核苷酸的3'羟基脱氢后形成的氧原子上,或者式A59中的P通过取代Nu代表的siRNA正义链中的一个核苷酸的2'-羟基中的氢与核苷酸连接,或者式A59中的P通过取代Nu代表的siRNA正义链5'末端核苷酸的5'羟基中的氢与核苷酸连接。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列1与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列不多于1个核苷酸差异,和/或所述核苷酸序列2与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列不多于1个核苷酸差异。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列2与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列之间的核苷酸差异包括Z'B位置处的差异,且Z'B选自A、C或G;在一些实施方案中,所述核苷酸差异为Z'B位置处的差异,Z'B选自A、C或G;在一些实施方案中,ZA是与Z'B互补的核苷酸。这些核苷酸差异并不会显著降低第二种siRNA缀合物的靶基因抑制能力,而这些包含特定核苷酸差异的第二种siRNA缀合物也在本公开的保护范围之内。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列1和所述核苷酸序列2基本上反向互补、实质上反向互补或完全反向互补。所述基本上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于3个的碱基错配;所述实质上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于1个的碱基错配;完全反向互补是指两个核苷酸序列之间没有错配。
在一些实施方案中,所述正义链还含有核苷酸序列3,所述反义链还含有核苷酸序列4,所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度各自独立地为1-4个核苷酸,并且所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的位置相对应。在一些实施方案中,核苷酸序列4与靶mRNA相应位置的核苷酸至少部分互补,在一些实施方案中,核苷酸序列4与靶mRNA相应位置的核苷酸完全互补。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列3连接在所述核苷酸序列1的5'末端,并且所述核苷酸序列4连接在所述核苷酸序列2的3'末端。在一些实施方案中,所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4长度相等并且反向互补。因此,所述正义链和反义链的长度可以是19-23个核苷酸。
一些实施方案中,所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度均为1个核苷酸,所述核苷酸序列3的碱基为C,此时,所述双链区的长度可以是20个核苷酸,即所述正义链和反义链的长度之比可以是20/20;或者,
所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度均为2个核苷酸,按照5'末端到3'末端的方向,核苷酸序列3的碱基依次为C和C,此时,所述双链区的长度可以是21个核苷酸,即所述正义链和反义链的长度之比可以是21/21;或者,
所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度均为3个核苷酸,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列3的碱基依次为U、C和C,此时,所述双链区的长度可以是22个核苷酸,即所述正义链和反义链的长度之比可以是22/22;或者,
所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度均为4个核苷酸,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列3的碱基依次为C、U、C和C,此时,所述双链区的长度可以是23个核苷酸,即所述正义链和反义链的长度之比可以是23/23。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列3的长度为2个核苷酸,并且按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列3的碱基依次为C和C。
应当理解的是,所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度相同,并且互补,因此,给出了核苷酸序列3的碱基,核苷酸序列4的碱基也就确定了。
在一些实施方案中,式(1)中Nu代表的siRNA中还含有核苷酸序列5,所述核苷酸序列5的长度为1至3个核苷酸,连接在所述反义链的3'末端,从而构成所述反义链的3'突出端。在一些实施方案中,所述核苷酸序列5的长度为1或2个核苷酸。这样,Nu代表的siRNA的正义链和反义链的长度之比可以是19/20、19/21、20/21、20/22、21/22、21/23、22/23、22/24、23/24或23/25。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列5的长度为2个核苷酸,并且按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列5为连续的2个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸、连续的2个尿嘧啶核糖核苷酸、或者与靶mRNA互补的两个核苷酸。因此,在一些实施方案中,Nu代表的siRNA的正义链和反义链的长度之比为19/21或21/23,此时,含有该siRNA的缀合物具有更好的APOC3mRNA沉默活性。
在一些实施方案中,所述正义链含有如SEQ ID NO:60所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列:
5’-CAAUAAAGCUGGACAAGAZA-3’(SEQ ID NO:60);
5’-Z'BUCUUGUCCAGCUUUAUUGGG-3’(SEQ ID NO:3);
或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQID NO:5所示的核苷酸序列:
5’-CCCAAUAAAGCUGGACAAGAZA-3’(SEQ ID NO:4);
5’-Z'BUCUUGUCCAGCUUUAUUGGGAG-3’(SEQ ID NO:5);
其中,所述Z'B是反义链5'末端的第一个核苷酸,ZA选自A、U、G或C,并且Z'B是与ZA互补的核苷酸。
在一些实施方案中,Nu代表的siRNA为siAP1或siAP2:
siAP1
正义链:5’-CAAUAAAGCUGGACAAGAA-3’(SEQ ID NO:6);
反义链:5’-UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGG-3’(SEQ ID NO:7);
siAP2
正义链:5’-CCCAAUAAAGCUGGACAAGAA-3’(SEQ ID NO:8);
反义链:5’-UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGGAG-3’(SEQ ID NO:9)。
如前所述,式(1)中Nu代表的siRNA中的核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸。在一些实施方案中,Nu代表的siRNA中的核苷酸为未经修饰的核苷酸;在一些实施方案中,Nu代表的siRNA中的部分或全部核苷酸为修饰的核苷酸,核苷酸基团上的这些修饰不会导致本公开的第二种siRNA缀合物抑制APOC3基因表达的功能明显削弱或丧失。
在一些实施方案中,缀合物中的siRNA至少含有1个修饰的核苷酸。在本公开的上下文中,所使用的术语“修饰的核苷酸”是指核苷酸的核糖基2'位羟基被其他基团取代形成的核苷酸或核苷酸类似物,或者核苷酸上的碱基是经修饰的碱基的核苷酸。所述修饰的核苷酸不会导致siRNA缀合物抑制基因表达的功能明显削弱或丧失。例如,可以选择J.K.Watts,G.F.Deleavey,and M.J.Damha,Chemically modified siRNA:tools andapplications.Drug Discov Today,2008,13(19-20):842-55中公开的修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,所述正义链或所述反义链中的至少一个核苷酸为修饰的核苷酸,和/或至少一个磷酸酯基为具有修饰基团的磷酸酯基,换句话说,所述正义链和所述反义链中至少一条单链的磷酸-糖骨架中的磷酸酯基和/或核糖基的至少一部分为具有修饰基团的磷酸酯基和/或具有修饰基团的核糖基。
在一些实施方案中,所述正义链和/或所述反义链中的全部核苷酸均为修饰的核苷酸。在一些实施方案,正义链和所述反义链中的每一个核苷酸独立地为氟代修饰的核苷酸或非氟代修饰的核苷酸。
本公开的发明人惊奇地发现,当第二种siRNA缀合物中Nu代表的siRNA是如下siRNA时,在动物实验中获得了血浆中稳定性和基因沉默效率的高度平衡:
在一些实施方案中,所述氟代修饰的核苷酸位于核苷酸序列1和核苷酸序列2中,并且,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列1的第7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸;按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列2的第2、6、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列1中氟代修饰的核苷酸不多于5个;在一些实施方案中,所述核苷酸序列2中氟代修饰的核苷酸不多于7个。
在一些实施方案中,按照5'末端到3'末端的方向,在所述正义链中,所述核苷酸序列1的第7、8、9位或者5、7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述正义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸;按照5'末端到3'末端的方向,在所述反义链中,所述核苷酸序列2的第2、6、14、16位或者2、6、8、9、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述反义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸。
氟代修饰的核苷酸及非氟代修饰的核苷酸各自的定义和可选择的范围如前所述。
在一些实施方案中,按照5’末端到3’末端的方向,Nu代表的siRNA的正义链中核苷酸序列1的第5、7、8和9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链的其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸,并且,按照5’末端到3’末端的方向,Nu代表的siRNA的反义链中核苷酸序列2的第2、6、8、9、14和16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;
或者,按照5’末端到3’末端的方向,Nu代表的siRNA的正义链中核苷酸序列1的第7、8和9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链的其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸,并且,按照5’末端到3’末端的方向,Nu代表的siRNA的反义链中核苷酸序列2的第2、6、14和16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,所述核苷酸具有磷酸基团修饰。在一些实施方案中,磷酸基团修饰为如下式(101)所示的硫代磷酸(phosphorthioate)修饰,即,用一个硫原子取代磷酸二酯键中的非桥氧原子,从而以硫代磷酸二酯键替换磷酸二酯键。该修饰能稳定siRNA的结构,保持碱基配对的高特异性和高亲和力。
在一些实施方案中,Nu代表的siRNA中,硫代磷酸酯基连接存在于由以下位置组成的组中的至少一处:正义链或反义链任意一端的第一个和第二个核苷酸之间;正义链或反义链任意一端的第二个和第三个核苷酸之间;或上述的任意组合。在一些实施方案中,硫代磷酸酯基连接存在于除正义链5'末端以外的全部上述位置处。在一些实施方案中,硫代磷酸酯基连接存在于除正义链3'末端以外的全部上述位置处。在一些实施方案中,硫代磷酸酯基连接存在于以下位置中的至少一处:
所述正义链的5'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述正义链的5'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述正义链的3'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述正义链的3'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述反义链的5'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述反义链的5'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述反义链的3'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;以及
所述反义链的3'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间。
在一些实施方案中,Nu代表的siRNA分子的反义链序列5'末端核苷酸为5'-磷酸核苷酸或5'-磷酸类似物修饰的核苷酸。
如本领域技术人员所熟知的,5'-磷酸核苷酸可具有以下结构:
同时,常用的所述5'-磷酸类似物修饰的核苷酸的种类是本领域技术人员公知的,例如,Anastasia Khvorova and Jonathan K.Watts,The chemical evolution ofoligonucleotide therapies of clinical utility.Nature Biotechnology,2017,35(3):238-48中公开的如下4种核苷酸:
其中,R表示选自于由H、OH、F和甲氧基所组成的组的基团;
Base表示选自A、U、C、G或T的碱基。
在一些实施方案中,5'-磷酸核苷酸或5'-磷酸类似物修饰的核苷酸为式(102)所示的含有5'-磷酸修饰的核苷酸、式(103)所示的含有乙烯基磷酸酯(E-vinylphosphonate,E-VP)的核苷酸或式(105)所示的含有5'-硫代磷酸修饰的核苷酸。
本公开的发明人意外发现,本公开的第二种siRNA缀合物在具有显著提高的血浆中稳定性、低脱靶效应的同时,还表现出并未明显降低的APOC3 mRNA沉默活性,而且还具有较高的血脂抑制作用。因此,在一些实施方案中,本公开的第二种siRNA缀合物中Nu代表的siRNA可以为siAP1、siAP2、siAP1-M1、siAP2-M1、siAP1-M2、siAP2-M2、siAP1-M1S、siAP2-M1S、siAP1-M2S、siAP2-M2S、siAP1-M1P1、siAP2-M1P1、siAP1-M2P1、siAP2-M2P1、siAP1-M1SP1、siAP2-M1SP1、siAP1-M2SP1、siAP2-M2SP1中的一种,如表1示出。
表1本公开缀合物中的siRNA序列
本公开所述siRNA或siRNA缀合物中,每个相邻核苷酸之间由磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键连接,磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键中的非桥接氧原子或硫原子带有负电荷,它可以以羟基或巯基的形式存在,羟基或巯基中的氢离子也可以部分或全部被阳离子取代。所述阳离子可以是任意的阳离子,如金属阳离子,铵离子NH4 +,有机铵阳离子中的一种。出于提高溶解性考虑,在一种实施方案中,所述阳离子选自碱金属离子、三级胺形成的铵阳离子和季铵阳离子中的一种或多种。碱金属离子可以是K+和/或Na+,三级胺形成的阳离子可以是三乙胺形成的铵离子和/或N,N-二异丙基乙胺形成的铵离子。因此,本公开所述siRNA或第一种或第二种siRNA缀合物可以至少部分以盐的形式存在。在一种方式中,磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键中的非桥接氧原子或硫原子至少部分与钠离子结合,本公开所述siRNA或第一种或第二种siRNA缀合物以钠盐或部分钠盐的形式存在。
本领域技术人员清楚知晓的是,可以通过使用具有相应修饰的核苷单体来将修饰的核苷酸基团引入所述的siRNA中。制备具有相应修饰的核苷单体的方法及将修饰的核苷酸基团引入siRNA的方法也是本领域技术人员所熟知的。所有修饰的核苷单体均可以商购得到或者采用已知方法制备得到。
第二种siRNA缀合物的制备
可以采用任意合理的合成路线制备第二种siRNA缀合物。
在一些实施方案中,第二种siRNA缀合物可以采用如下方法制备,该方法包括在亚磷酰胺固相合成的条件下,分别按照siRNA正义链和反义链的核苷酸种类和顺序,按照3'到5'的方向将核苷单体依次连接,每个核苷单体的连接包括脱保护、偶联、盖帽、氧化或硫化四步反应;分离出siRNA的正义链和反义链,退火,其中,Nu代表的siRNA中的每个核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸,Nu代表的siRNA含有正义链和反义链,所述正义链包含核苷酸序列1,所述反义链包含核苷酸序列2,所述核苷酸序列1和所述核苷酸序列2至少部分地反向互补形成双链区,所述核苷酸序列1与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列2与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:
5'-CAAUAAAGCUGGACAAGAZ-3'(SEQ ID NO:1),
5'-Z'UCUUGUCCAGCUUUAUUG-3'(SEQ ID NO:2);
其中,Z为A,Z'为U,
所述核苷酸序列1中包含位置对应于Z的核苷酸ZA,所述核苷酸序列2中包含位置对应于Z'的核苷酸Z'B,所述Z'B是所述反义链5'末端的第一个核苷酸;
并且,该方法还包括在偶联反应条件和偶联试剂存在下,将式(321)所示的化合物与核苷单体或连接在固相载体上的核苷酸序列接触,从而使式(321)所示的化合物经偶联反应连接至核苷酸序列。下文中,式(321)所示的化合物也称作缀合分子。
其中:
R4为能够结合至Nu代表的siRNA的部分。在一些实施方案中,R4为能够通过共价键结合至Nu代表的siRNA的部分。在一些实施方案中,R4为能够经反应而通过磷酸二酯键缀合至Nu代表的siRNA的任意官能团的部分;
每个S1独立地是M1中全部活性羟基被YCOO-基团取代而形成的基团,其中,每个Y独立地选自甲基、三氟甲基、二氟甲基、一氟甲基、三氯甲基、二氯甲基、一氯甲基、乙基、正丙基、异丙基、苯基、卤代苯基以及烷基苯基中的一种;在一些实施方案中,Y为甲基。
n1、n3、m1、m2、m3、R10、R11、R12、R13、R14、R15、L1、M1各自的定义和可选择的范围如前所述。
R4的选择是为了实现与含氮骨架上的N的连接,并且为合成第二种siRNA缀合物提供合适的反应位点。在一些实施方案中,R4中包括R2连接基团或经保护的R2连接基团,以及可通过反应与siRNA形成A59所示结构的官能团。
在一些实施方案中,R4包含可与Nu代表的siRNA或核苷单体上的基团形成亚磷酸酯的第1官能团以及可与羟基或氨基反应形成共价键的第2官能团或者含有由所述共价键连接的固相载体。在一些实施方案中,所述第1官能团为亚磷酰胺、羟基或被保护的羟基。在一些实施方案中,所述第2官能团为亚磷酰胺、羧酸或羧酸盐。在一些实施方案中,所述第2官能团为经由共价键连接至分子其他部分的固相载体,所述共价键由羟基或氨基形成。在一些实施方案中,所述固相载体经由磷酸酯键、羧酸酯键或酰胺键连接。在一些实施方案中,所述固相载体为树脂。
在一些实施方案中,所述第1官能团含有羟基、-ORk或式(C3)所示的基团;所述第2官能团含有式(C1)、(C2)、(C3)、(C1’)或(C3’)所示的结构:
式中,q1为1-4的整数,X为O或NH,M+为阳离子,Rk为羟基保护基团,SPS表示固相载体,表示基团连接至分子其余部分的位点。
在一些实施方案中,所述第1官能团含有亚磷酰胺基团,如式(C3)所示,该亚磷酰胺基团可以与核苷酸上的任意位置的羟基,如2'位羟基或3'位羟基发生偶联反应形成亚磷酸酯,并经氧化或硫化形成式A59所示的磷酸二酯键或硫代磷酸酯键,将缀合分子缀合至siRNA。此时,即使所述第2官能团并不存在,式(321)化合物也能够缀合至核苷酸,不影响第二种siRNA缀合物的获得。在此情况下,在经由亚磷酰胺固相合成等方法获得siRNA的正义链或反义链后,使式(321)化合物与核苷酸序列中末端核苷酸上的羟基反应,并在后续的氧化或硫化过程中形成磷酸二酯键连接或硫代磷酸酯连接,将式(321)化合物缀合至siRNA。
在一些实施方案中,所述第1官能团含有被保护的羟基。在一些实施方案中,所述第2官能团包含可与固相载体反应的基团,所述反应提供包含固相载体的缀合分子。在一些实施方案中,所述第2官能团含有羧基、羧酸盐或亚磷酰胺,如式(C1)、(C2)或(C3)所示,当所述第2官能团包含羧基或羧酸盐时,式(321)化合物与固相载体,例如树脂上的羟基或氨基进行酯化反应或酰胺化反应,形成经羧酸酯键连接的包含固相载体的缀合分子。当所述第2官能团包含亚磷酰胺官能团时,式(321)化合物与通用固相载体,例如树脂上的羟基发生偶联反应,并经氧化形成经磷酸二酯键连接的包含固相载体的缀合分子。随后,以上述连接固相载体后的产物作为起始,按照亚磷酰胺固相合成方法依次连接核苷单体,获得连接有缀合基团的siRNA的正义链或反义链。在亚磷酰胺固相合成过程中,所述第1官能团发生脱保护,随后在偶联反应条件下与核苷单体上的亚磷酰胺基团发生偶联。
在一些实施方案中,所述第1官能团含有羟基或被保护的羟基;所述第2官能团含有经羧酸酯键连接的固相载体或经酰胺键连接的固相载体、或者经磷酸酯键连接的固相载体,如式(C1’)或(C3’)所示。此时,由式(321)化合物代替固相载体作为起始,按照亚磷酰胺固相合成方法依次连接核苷单体,获得连接有缀合基团的siRNA的正义链或反义链。
在一些实施方案中,羧酸盐可以表示为—COO-M+,其中,M+是阳离子,例如选自金属阳离子,铵阳离子NH4 +,有机铵阳离子中的一种。在一种实施方案中,所述金属离子选自碱金属离子中的一种,如K+或Na+。出于提高溶解性、使反应顺利进行的考虑,在一些实施方案中,有机铵离子为三级胺形成的铵阳离子或季铵阳离子,如,三乙胺形成的铵离子或N,N-二异丙基乙胺形成的铵离子。在一些实施方案中,羧酸盐是三乙胺羧酸盐或N,N-二异丙基乙胺羧酸盐。
在一些实施方案中,R4含有式(B9)、(B10)、(B9’)、(B10’)、(B11)、(B12)、(B11’)或(B12’)所示的结构:
其中,q1为1-4的整数,q2为1-10的整数,X为O或NH,M+为阳离子,Rk为羟基保护基团,SPS表示固相载体,表示基团连接至分子其余部分的位点。在一些实施方案中,q1为1或2。在一些实施方案中,q2为1-5的整数。在一些实施方案中,R4含有式(B9)或(B10)所示的结构。在一些实施方案中,R4含有式(B11)或(B12)所示的结构。
在一些实施方案中,Rk是Tr(三苯甲基)、MMTr(4-甲氧基三苯甲基)、DMTr(4,4’-双甲氧基三苯甲基)、TMTr(4,4’,4’-三甲氧基苯甲基)中的一种或多种。在一些实施方案中,Rk可以是DMTr,即4,4’-双甲氧基三苯甲基(4,4’-dimethoxytrityl)。
L1的定义如前所述。
在一些实施方案中,L1被用于将M1靶向基团连接至含氮骨架上的N原子,从而为第二种siRNA缀合物提供肝靶向功能。在一些实施方案中,L1包含A1-A26中的任一个或其组合。
根据上述描述,本领域技术人员容易理解的是,相较于本领域公知的亚磷酰胺固相合成方法而言,可通过上述第1官能团以及任选的第2官能团,获得将缀合分子连接至核苷酸序列的任意可能的位置的第二种siRNA缀合物,例如,缀合分子连接至核苷酸序列的端部,缀合分子连接至核苷酸序列的末端。相应地,除非另有说明,以下涉及缀合制备的描述中,当提及“脱保护”、“偶联”、“盖帽”、“氧化”、“硫化”等反应时,应当理解为本领域公知的亚磷酰胺核酸固相合成方法中所涉及的反应条件和试剂也同样适用于这些反应。示例性的反应条件和试剂将在后文详细描述。
在一些实施方案中,每个S1独立地是M1。在一些实施方案中,每个S1独立地是M1中至少一个活性羟基被羟基保护基团保护而形成的基团。在一些实施方案中,每个S1独立地是M1中任何存在的活性羟基全部被羟基保护基团保护而形成的基团。在一些实施方案中,任何本领域技术人员已知的羟基保护基团均可被用于保护M1中的活性羟基。在一些实施方案中,被保护的羟基可以式YCOO-表示,其中,每个Y独立地选自于由C1-C10烷基和C6-C10芳基所组成的组,所述C1-C10烷基和C6-C10芳基任选地被一个或多个取代基取代,所述取代基选自于由卤素和C1-C6烷基所组成的组。在一些实施方案中,每个Y独立地选自于由以下基团所组成的组:甲基、三氟甲基、二氟甲基、单氟甲基、三氯甲基、二氯甲基、一氯甲基、乙基、正丙基、异丙基、苯基、卤苯基,以及C1-C6烷基苯基。
在一些实施方案中,每个S1各自独立地选自于由式A46-A54所组成的组:
在一些实施方案中,S1为式A49或A50。
在一些实施方案中,每个Y独立地选自甲基、三氟甲基、二氟甲基、一氟甲基、三氯甲基、二氯甲基、一氯甲基、乙基、正丙基、异丙基、苯基、卤代苯基以及烷基苯基中的一种;在一些实施方案中,Y为甲基。
如前所述,第二种siRNA缀合物的制备方法还包括以下步骤:合成siRNA的另一链(例如,当上述步骤合成了连接有缀合基团的siRNA正义链时,还包括按照固相合成方法合成siRNA的反义链,反之亦然),分离正义链和反义链,以及退火。具体地,在分离步骤中,连接至核苷酸序列和/或缀合分子的固相载体被切割下来,同时必要的保护基团被脱除(此时,式(321)化合物中的各S1基团转化为对应的M1靶向基团),获得连接有缀合基团的siRNA正义链(或反义链)以及对应的反义链(或正义链),正义链与反义链退火形成双链RNA结构,获得第二种siRNA缀合物。
在一些实施方案中,第二种siRNA缀合物的制备方法包含以下步骤:在偶联反应条件和偶联试剂存在下,将式(321)所示的化合物与正义链或反义链的3'端的第一个核苷单体接触,使式(321)所示的化合物连接上序列中第一个核苷酸,在亚磷酰胺固相合成的条件下,按照期望的正义链或反义链核苷酸种类和顺序,按照3'到5'的方向将核苷单体依次连接,合成siRNA的正义链或反义链;其中,(321)化合物为R4中含有第1官能团和第2官能团,第1官能团含有被保护的羟基,第2官能团具有如式(C1’)或(C3’)所示结构的式(321)所示的化合物,与第一个核苷单体连接前,式(321)化合物经过脱保护;每个核苷单体的连接包括脱保护、偶联、盖帽、氧化或硫化四步反应;得到连接有缀合基团的核酸的正义链或反义链;在亚磷酰胺固相合成的条件下,按照反义链或正义链核苷酸种类和顺序,按照3'到5'的方向将核苷单体依次连接,合成核酸的反义链或正义链;每个核苷单体的连接包括脱保护、偶联、盖帽、氧化或硫化四步反应;脱除保护基并与固相载体切割,分离纯化获得核酸的正义链和反义链,退火。
在一些实施方案中,第二种siRNA缀合物的制备方法包含以下步骤:按照该双链siRNA中正义链或反义链的核苷酸种类和顺序,按照3'到5'的方向将核苷单体依次连接,合成正义链和反义链,每个核苷单体的连接包括脱保护、偶联、盖帽、氧化或硫化四步反应,得到连接在固相载体上的正义链和连接在固相载体上的反义链;在偶联反应条件和偶联试剂存在下,将式(321)所示的化合物与连接在固相载体上的正义链或连接在固相载体上的反义链接触,将式(321)化合物连接至正义链或反义链,其中,式(321)化合物是R4中含有第1官能团,第1官能团为亚磷酰胺基团的式(321)化合物;脱除保护基并与固相载体切割,分别分离纯化,获得siRNA的正义链或反义链,退火,其中,Nu代表的siRNA的正义链或反义链上连接有缀合基团。
在一些实施方案中,式A59中的P连接至siRNA中的正义链的3'末端,第二种siRNA缀合物的制备方法包括:
(1)脱除式(321)化合物(其中,式(321)化合物为R4中含有第1官能团和第2官能团,第1官能团含有被保护的羟基ORk,第2官能团具有如式(C1’)或(C3’)所示结构的化合物)中的羟基保护基团Rk;在偶联反应条件和偶联试剂存在下,将脱保护得到的产物与核苷单体接触,得到通过缀合分子连接至固相载体的核苷单体;
(2)以该通过缀合分子连接至固相载体的核苷单体起始,按照3'-5'的方向通过亚磷酰胺固相合成方法合成siRNA的正义链;
(3)通过亚磷酰胺固相合成方法,合成siRNA的反义链;
(4)分离出siRNA的正义链和反义链并退火,获得第二种siRNA缀合物。
其中,在步骤(1)中,脱除式(321)化合物中的保护基团Rk的方法包括在脱保护条件下,将式(321)化合物与脱保护试剂接触。脱保护条件包括温度为0-50℃,在一些实施方案中为15-35℃,反应时间为30-300秒,在一些实施方案中为50-150秒,脱保护试剂可以选自三氟乙酸、三氯乙酸、二氯乙酸、一氯乙酸中的一种或多种,在一些实施方案中为二氯乙酸。脱保护试剂与式(321)化合物的摩尔比为10:1-1000:1,在一些实施方案中为50:1-500:1。
所述偶联反应条件和偶联试剂可使用任何适合于上述偶联反应的条件和试剂。在一些实施方案中,可使用与所采用的固相合成方法中的偶联反应相同的条件与试剂。
在一些实施方案中,所述偶联反应的条件包括反应温度为0-50℃,在一些实施方案中为15-35℃。式(321)化合物与核苷单体的摩尔比为1:1-1:50,在一些实施方案中为1:2-1:5;式(321)化合物和偶联试剂的摩尔比可以为1:1-1:50,在一些实施方案中为1:3-1:10,反应时间为200-3000秒,在一些实施方案中为500-1500秒。偶联试剂选自1H-四氮唑、5-乙硫基1H-四氮唑、5-苄硫基1H-四氮唑中的一种或多种,在一些实施方案中为5-乙硫基1H-四氮唑。所述偶联反应可在有机溶剂中进行,所述有机溶剂选自无水乙腈、无水DMF、无水二氯甲烷中的一种或多种,在一些实施方案中为无水乙腈。相对于式(321)化合物,所述有机溶剂的用量为3-50L/mol,在一些实施方案中为5-20L/mol。
在步骤(2)中,通过亚磷酰胺核酸固相合成的方法,利用上述步骤制备的通过缀合分子连接至固相载体的核苷单体起始,按照3'-5'的方向合成第二种siRNA缀合物的正义链S。此时,缀合基团连接至所得到的正义链的3'末端。
步骤(2)和(3)中所述固相合成的其它条件,包括核苷单体脱保护条件,脱保护试剂种类和用量,偶联反应条件,偶联试剂的种类和用量,盖帽反应的条件,盖帽试剂的种类和用量,氧化反应条件,氧化试剂种类和用量,硫化反应条件,硫化试剂和用量采用本领域中常规使用的各种试剂、用量和条件。
例如,在一些实施方案中,步骤(2)和(3)中所述固相合成可使用如下条件:
核苷单体脱保护条件包括温度为0-50℃,在一些实施方案中为15-35℃,反应时间为30-300秒,在一些实施方案中为50-150秒,脱保护试剂可以选自三氟乙酸、三氯乙酸、二氯乙酸、一氯乙酸、中的一种或多种,在一些实施方案中为二氯乙酸。脱保护试剂与固相载体上4,4'-二甲氧基三苯甲基保护基的的摩尔比可以为2:1-100:1,在一些实施方案中为3:1-50:1。
偶联反应条件包括温度为0-50℃,在一些实施方案中为15-35℃,固相载体上连接的核酸序列与核苷单体的摩尔比可以为1:1-1:50,在一些实施方案中为1:5-1:15;固相载体上连接的核酸序列和偶联试剂的摩尔比为1:1-1:100,在一些实施方案中为1:50-1:80,反应时间和偶联试剂的选择与前述相同。
盖帽反应条件包括温度为0-50℃,在一些实施方案中为15-35℃,反应时间为5-500秒,在一些实施方案中为10-100秒,盖帽试剂的选择与前述相同。盖帽试剂的总量与固相载体上连接的核酸序列的摩尔比为1:100-100:1,在一些实施方案中为1:10-10:1。在盖帽试剂使用等摩尔量的乙酸酐与N-甲基咪唑的情况下,乙酸酐、N-甲基咪唑以及固相载体上连接的核酸序列的摩尔比为1:1:10-10:10:1,在一些实施方案中为1:1:2-2:2:1。
氧化反应条件包括温度为0-50℃,在一些实施方案中为15-35℃,反应时间为1-100秒,在一些实施方案中为5-50秒,氧化试剂在一些实施方案中为碘(在一些实施方案中,以碘水的形式提供)。氧化试剂与偶联步骤中固相载体上连接的核酸序列的摩尔比可以为1:1-100:1,在一些实施方案中为5:1-50:1。在一些实施方案中,所述氧化反应在四氢呋喃:水:吡啶=3:1:1-1:1:3的混合溶剂中进行。硫化反应条件包括温度为0-50℃,在一些实施方案中为15-35℃,反应时间为50-2000秒,在一些实施方案中为100-1000秒,硫化试剂在一些实施方案中为氢化黄原素。硫化试剂与偶联步骤中固相载体上连接的核酸序列的摩尔比为10:1-1000:1,在一些实施方案中为10:1-500:1。在一些实施方案中,所述硫化反应在乙腈:吡啶=1:3-3:1的混合溶剂中进行。
在将所有核苷单体连接之后,退火之前,该方法还包括分离出siRNA的正义链和反义链。分离的方法为本领域技术人员所公知,一般包括将合成得到的核苷酸序列从固相载体上切割下来,脱除碱基上、磷酸基上和配体上的保护基团,纯化和脱盐。
将合成得到的核苷酸序列从固相载体上切割下来,并脱除碱基上、磷酸基上和配体上的保护基团可按照siRNA合成中常规的切割和脱保护方法进行。例如,将得到的连接有固相载体的核苷酸序列与浓氨水接触;在脱保护的过程中,A46-A54基团的保护基团YCOO-转化为羟基,S1基团转化为相应的M1基团,生成式(1)所示的缀合物。其中,所述浓氨水可以是25-30重量%的氨水,浓氨水的用量与目标siRNA序列相比可以为0.2ml/μmol-0.8ml/μmol。
在所合成的核苷酸序列上存在至少一个2'-TBDMS保护时,所述方法还包括将脱除了固相载体的核苷酸序列与三乙胺三氢氟酸盐接触,以脱除该2'-TBDMS保护。此时,所得到的目标siRNA序列中具有游离的2'-羟基的相应核苷。三乙胺三氢氟酸盐纯品的用量与目标siRNA序列相比可以为0.4ml/μmol-1.0ml/μmol。这样即可得到第二种siRNA缀合物。
纯化和脱盐的方法是本领域技术人员熟知的。例如,可利用制备型离子色谱纯化柱,通过NaBr或NaCl的梯度洗脱,完成核酸的纯化;产品收集合并后,可采用反相色谱纯化柱进行脱盐。
这样得到的第二种siRNA缀合物中,核苷酸之间的磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键中的非桥接氧原子或硫原子基本与钠离子结合,第二种siRNA缀合物基本以钠盐形式存在。可以采用熟知的离子交换方法,用氢离子和/或其他阳离子取代所述钠离子,得到其他形式的第二种siRNA缀合物。所述阳离子如前所述。
在合成过程中,可随时对核酸序列的纯度和分子量进行检测,更好地把控合成质量,此类检测的方法为本领域技术人员所公知。例如,可通过离子交换色谱检测核酸纯度,并通过液质联用色谱测定分子量。
退火的方法也是本领域技术人员熟知的。例如,可简单地将所合成的正义链(S链)与反义链(AS链)以等摩尔比混合在注射用水中加热至70-95℃,随后室温冷却,使其通过氢键形成双链结构。这样即可得到第二种siRNA缀合物。
在获得所述缀合物后,在一些实施方案中,还可利用例如液质联用色谱等方法,通过分子量检测等方式对所合成的第二种siRNA缀合物进行表征,确定所合成的siRNA缀合物为目标设计的第二种siRNA缀合物,且所合成的siRNA的序列为期望的siRNA的序列,例如为表1中所列的序列之一。
式(321)所示化合物可以通过以下制备方法得到:该方法包括在有机溶剂中,在酯化反应条件下,以及在碱和成酯催化剂存在下,将式(313)所示化合物与环状酸酐接触,离子交换,分离得到式(321)所示化合物:
其中,n1、n3、m1、m2、m3、R10、R11、R12、R13、R14、R15、L1、S1各自的定义和可选择的范围如前所述;
R6为提供式(321)中R4的基团。在一些实施方案中,R6具有式(A61)所示的结构:
其中,Ri为能够实现与含氮骨架上的N连接、与RkO连接并且连接有一个游离羟基的任意基团,Rk为羟基保护基团。此时,所获得的是R4中含有作为羟基保护基团的第1官能团和第2官能团,所述第2官能团含有如式(C1)或(C2)所示结构的式(321)化合物。
所述酯化反应条件包括反应温度为0-100℃,反应时间为8-48小时,在一些实施方案中,所述酯化反应条件为反应温度为10-40℃,反应时间为20-30小时。
在一些实施方案中,所述有机溶剂包含环氧类溶剂、醚类溶剂、卤代烷类溶剂、二甲基亚砜、N,N-二甲基甲酰胺和N,N-二异丙基乙胺中的一种或多种。在一些实施方案中,所述环氧类溶剂为二氧六环和/或四氢呋喃,所述醚类溶剂为***和/或甲基叔丁基醚,所述卤代烷类溶剂为二氯甲烷、三氯甲烷和1,2-二氯乙烷中的一种或多种。在一些实施方案中,所述有机溶剂为二氯甲烷。相对于所述式(313)所示化合物,所述有机溶剂的用量为3-50L/mol,在一些实施方案中为5-20L/mol。
在一些实施方案中,所述环状酸酐为丁二酸酐、戊二酸酐、己二酸酐或庚二酸酐中的一种,在一些实施方案中为丁二酸酐。所述环状酸酐与所述式(313)所示化合物的摩尔比为1:1-10:1,在一些实施方案中为2:1-5:1。
所述成酯催化剂可以是任何对该酯化反应起到催化作用的催化剂,例如该催化剂可以是4-二甲氨基吡啶。所述催化剂与式(313)所示化合物的摩尔比为1:1-10:1,在一些实施方案中为2:1-5:1。
在一些实施方案中,所述碱可以是任意的无机碱,有机碱或者它们的结合。考虑溶解性和产物稳定性,所述碱可以是例如三级胺类有机碱。在一些实施方案中,所述三级胺类有机碱为三乙胺或N,N-二异丙基乙胺。所述三级胺类有机碱与式(313)所示化合物的摩尔比为1:1-20:1,在一些实施方案中为3:1-10:1。
所述离子交换作用是将式(321)化合物转化为期望的羧酸或羧酸盐的形式,离子交换的方法为本领域技术人员所公知,可以使用合适的离子交换溶液和交换条件,得到前述阳离子为M+的缀合分子,在此不做详述。在一些实施方案中,所述离子交换反应使用三乙胺磷酸盐溶液进行,所述三乙胺磷酸盐溶液的浓度为0.2-0.8M,在一些实施方案中,所述三乙胺磷酸盐溶液的浓度为0.4-0.6M,相对于式(313)化合物,所述三乙胺磷酸盐溶液的用量为3-6L/mol,在进一步的实施方案中为4-5L/mol。
可使用任何合适的分离方法从反应混合物中分离式(321)化合物。在一些实施方案中,可通过蒸发除去溶剂、随后通过色谱方法分离式(321)化合物,例如,可使用如下两种色谱条件进行分离:(1)正相纯化硅胶:200-300目硅胶填料,使用含1wt‰三乙胺的二氯甲烷:甲醇=100:18-100:20梯度洗脱;或者(2)反相纯化:C18、C8反相填料,使用甲醇:乙腈=0.1:1-1:0.1梯度洗脱。在一些实施方案中,可以直接除去溶剂得到式(321)化合物粗产品,该粗产品可以直接用于后续反应。
在一些实施方案中,式(321)化合物的制备方法还进一步包括在缩合反应条件下,在有机溶剂中,在缩合剂和三级胺类有机碱的存在下,将上述离子交换反应得到的产物进一步与含有氨基或羟基的固相载体进行接触。此时,所获得的是R4中含有第1官能团和第2官能团,第1官能团含有羟基保护基团,第2官能团含有如式(C1’)所示结构的式(321)化合物。
所述固相载体为固相合成siRNA中所用的载体中的一种,其中的一些为本领域技术人员所公知。例如,所述固相载体可以选自含有活性羟基或氨基官能团的固相载体,在一些实施方案中,所述固相载体为氨基树脂或羟基树脂。在一些实施方案中,所述氨基或羟基树脂具有如下参数:粒径100-400目(mesh),表面氨基或羟基载量为0.2-0.5mmol/g。所述式(321)所示化合物与固相载体的用量比为10-400μmol化合物/每克固相载体(μmol/g)。在一些实施方案中,所述式(321)所示化合物与固相载体的用量比为50-200μmol/g。
所述有机溶剂可以是本领域技术人员已知的任何合适的溶剂或混合溶剂。在一些实施方案中,所述有机溶剂为乙腈、环氧类溶剂、醚类溶剂、卤代烷类溶剂、二甲基亚砜、N,N-二甲基甲酰胺和N,N-二异丙基乙胺中的一种或多种。在一些实施方案中,所述环氧类溶剂为二氧六环和/或四氢呋喃,所述醚类溶剂为***和/或甲基叔丁基醚,所述卤代烷类溶剂为二氯甲烷、三氯甲烷和1,2-二氯乙烷中的一种或多种。在一些实施方案中,所述有机溶剂为乙腈。相对于式(321)化合物,所述有机溶剂的用量为20-200L/mol,在一些实施方案中为50-100L/mol。
在一些实施方案中,所述缩合剂可以是六氟磷酸苯并***-1-基-氧基三吡咯烷基磷、3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮和/或O-苯并三氮唑-四甲基脲六氟磷酸酯,在一些实施方案中,所述缩合剂为O-苯并三氮唑-四甲基脲六氟磷酸酯。所述缩合剂与式(321)所示化合物的摩尔比为1:1-20:1,在进一步的实施方案中为1:1-5:1。
在一些实施方案中,所述三级胺类有机碱为三乙胺和/或N,N-二异丙基乙胺,在一些实施方案中为N,N-二异丙基乙胺;所述三级胺类有机碱与式(321)所示化合物的摩尔比为1:1-20:1,在一些实施方案中为1:1-5:1。
在一些实施方案中,式(321)化合物的制备方法还可以包括将得到的缩合产物在盖帽反应条件下,在有机溶剂中,与盖帽试剂和酰化催化剂接触,分离得到式(321)所示化合物。所述盖帽反应的作用在于除去任何尚未反应完全的活性反应官能团,以避免在后续反应中产生不必要的副产物。所述盖帽反应的条件包括反应温度为0-50℃,在一些实施方案中为15-35℃,反应的时间为1-10h,在一些实施方案中为3-6h。盖帽试剂可以使用siRNA固相合成中所使用的盖帽试剂,siRNA固相合成中所使用的盖帽试剂为本领域技术人员所公知。
在一些实施方案中,所述盖帽试剂由盖帽试剂1(cap1)和盖帽试剂2(cap2)组成,其中,盖帽试剂1为N-基甲基咪唑,在一些实施方案中以N-甲基咪唑的吡啶/乙腈混合溶液形式提供,其中,吡啶与乙腈的体积比为1:10-1:1,在一些实施方案中为1:3-1:1,吡啶与乙腈的总体积与N-甲基咪唑的体积为1:1-10:1,在一些实施方案中为3:1-7:1。所述盖帽试剂2为乙酸酐。在一些实施方案中,所述盖帽试剂2以乙酸酐的乙腈溶液形式提供,其中,乙酸酐和乙腈的体积为1:1-1:10,在进一步的实施方案中为1:2-1:6。
在一些实施方案中,所述N-甲基咪唑的吡啶/乙腈混合溶液的体积与式(321)化合物的质量之比为5ml/g-50ml/g,在一些实施方案中为15ml/g-30ml/g。所述乙酸酐的乙腈溶液的体积与式(321)化合物的质量之比为0.5ml/g-10ml/g,在一些实施方案中为1ml/g-5ml/g。
在一些实施方案中,盖帽试剂使用等摩尔量的乙酸酐与N-甲基咪唑。在一些实施方案中,所述有机溶剂为乙腈、环氧类溶剂、醚类溶剂、卤代烷类溶剂、二甲基亚砜、N,N-二甲基甲酰胺和N,N-二异丙基乙胺中的一种或多种。在一些实施方案中,所述有机溶剂为乙腈。相对于式(321)化合物,所述有机溶剂的用量为10-50L/mol,在一些实施方案中为5-30L/mol。
在一些实施方案中,所述酰化催化剂可以选自任何可用于成酯缩合或成酰胺缩合的催化剂,例如碱性杂环化合物。在一些实施方案中,所述酰化催化剂为4-二甲氨基吡啶。所述催化剂与式(321)所示化合物的质量之比为0.001:1-1:1,在一些实施方案中为0.01:1-0.1:1。
在一些实施方案中,可使用任何合适的分离方法从反应混合物中分离式(321)化合物。在一些实施方案中,可通过以有机溶剂充分洗涤,并过滤,去除未反应的反应物、过量的盖帽试剂及其它杂质,得到式(321)化合物,所述有机溶剂选自乙腈、二氯甲烷、甲醇,在一些实施方案中为乙腈。
在一些实施方案中,式(321)所示缀合分子的制备方法包括在有机溶剂中,在偶联反应条件下,以及在偶联试剂存在下,将式(313)所示化合物与亚磷酰二胺接触,分离得到式(321)所示化合物。此时,所获得的是R4中含有第1官能团和第2官能团,第1官能团含有羟基保护基团,第2官能团含有如式(C3)所示结构的式(321)化合物。
在一些实施方案中,偶联反应条件包括温度可以为0-50℃,例如为15-35℃,式(313)化合物与亚磷酰二胺的摩尔比可以为1:1-1:50,例如为1:5-1:15;式(313)化合物和偶联试剂的摩尔比可以为1:1-1:100,例如为1:50-1:80;反应时间可以为200-3000秒,例如为500-1500秒。所述亚磷酰二胺例如可使用双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦,其可商购获得或按照本领域中公知的方法合成获得。偶联试剂选自1H-四氮唑、5-乙硫基1H-四氮唑、5-苄硫基1H-四氮唑中的一种或多种,例如为5-乙硫基1H-四氮唑。所述偶联反应可在有机溶剂中进行,所述有机溶剂选自无水乙腈、无水DMF、无水二氯甲烷中的一种或多种,例如为无水乙腈。在一些实施方案中,相对于式(313)化合物,所述有机溶剂的用量为3-50L/mol,例如可以为5-20L/mol。通过进行该偶联反应,式(313)化合物中的羟基与亚磷酰二胺反应形成亚磷酰胺基团。在一些实施方案中,可以直接除去溶剂得到式(321)化合物粗产品,该粗产品可以直接用于后续反应。
在一些实施方案中,式(321)化合物的制备方法还进一步包括以下步骤:在偶联反应条件下,在有机溶剂中,以及在偶联试剂存在下,将分离得到的产物进一步与含有羟基的固相载体进行接触。随后,经盖帽反应、氧化反应,分离得到式(321)化合物。此时,所获得的是R4中含有第1官能团和第2官能团,第1官能团含有羟基保护基团,第2官能团具有如式(C3’)所示结构的式(321)化合物。
在一些实施方案中,所述固相载体为本领域中公知的可用于核酸固相合成的固相载体,例如,可以是经脱保护反应后的市售的通用固相载体(HLUnyLinkerTM300Oligonucleotide Synthesis Support,Kinovate Life Sciences公司,结构如式B80所示):
脱保护反应为本领域技术人员所公知。在一些实施方案中,脱保护条件包括温度为0-50℃,例如为15-35℃;反应时间为30-300秒,例如为50-150秒。脱保护试剂可以选自三氟乙酸、三氯乙酸、二氯乙酸、一氯乙酸中的一种或多种,在一些实施方案中,脱保护试剂为二氯乙酸。脱保护试剂与固定相上的-DMTr(4,4'-二甲氧基三苯甲基)保护基的摩尔比为2:1-100:1,例如为3:1-50:1。通过进行所述脱保护,在所述固相载体表面上获得具有反应活性的游离羟基,便于进行下一步的偶联反应。
偶联反应条件以及偶联试剂的选择可如上所述。通过进行该偶联反应,脱保护反应中形成的游离羟基与亚磷酰胺基团反应形成亚磷酸酯连接。
在一些实施方案中,盖帽反应条件包括温度为0-50℃,例如为15-35℃,反应时间为5-500秒,例如为10-100秒,所述盖帽反应在盖帽试剂存在下进行。盖帽试剂的选择和用量可如上所述。
氧化反应条件包括温度为0-50℃,例如可以为15-35℃,反应时间为1-100秒,例如可以为5-50秒,氧化试剂例如可以为碘(在一些实施方案中,以碘水的形式提供)。在一些实施方案中,氧化试剂与亚磷酸酯基团的摩尔比为1:1-100:1,例如可以为5:1-50:1。在一些实施方案中,所述氧化反应在四氢呋喃:水:吡啶=3:1:1-1:1:3的混合溶剂中进行。
在一些实施方案中,R6为式B7或B8基团中的一种,
其中q2的定义如前所述,
此时,式(313)所示化合物可以通过以下制备方法得到:在有机溶剂中,在成酰胺反应条件下,以及在成酰胺反应缩合剂和三级胺类有机碱存在下,将式(314)所示化合物与式(A-1)所示化合物或式(A-2)化合物接触,随后进行分离:
其中,n1、n3、m1、m2、m3、R10、R11、R12、R13、R14、R15、L1、S1、q2和Rk各自的定义和可选择的范围如前所述。
所述成酰胺反应条件可包括反应温度为0-100℃,反应时间为1-48小时,在一些实施方案中,所述成酰胺反应条件为反应温度为10-40℃,反应时间为2-16小时。
在一些实施方案中,所述有机溶剂为醇类溶剂、环氧类溶剂、醚类溶剂、卤代烷类溶剂、二甲基亚砜、N,N-二甲基甲酰胺和N,N-二异丙基乙胺中的一种或多种。所述醇类溶剂在一些实施方案中为甲醇、乙醇、丙醇中的一种或多种,在一些实施方案中为乙醇。所述环氧类溶剂在一些实施方案中为为二氧六环和/或四氢呋喃。所述醚类溶剂在一些实施方案中为为***和/或甲基叔丁基醚。所述卤代烷类溶剂在一些实施方案中为为二氯甲烷、三氯甲烷和1,2-二氯乙烷中的一种或多种。在一些实施方案中,所述有机溶剂为二氯甲烷。相对于式(314)化合物,有机溶剂用量为3-50L/mol,在进一步的实施方案中为3-20L/mol。
在一些实施方案中,所述成酰胺反应缩合剂为六氟磷酸苯并***-1-基-氧基三吡咯烷基磷、3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮、4-(4,6-二甲氧基三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐、2-乙氧基-1-乙氧碳酰基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)或O-苯并三氮唑-四甲基脲六氟磷酸酯,在进一步的实施方案中为3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮。所述成酰胺反应缩合剂与式(314)所示化合物的摩尔比可以为1:1-10:1,在一些实施方案中为2.5:1-5:1。
在一些实施方案中,所述三级胺类有机碱为三乙胺或N,N-二异丙基乙胺,在进一步的实施方案中为N,N-二异丙基乙胺。所述三级胺类有机碱与式(314)所示化合物的摩尔比为3:1-20:1,在一些实施方案中为5:1-10:1。
在一些实施方案中,式(A-1)和式(A-2)化合物可通过任何适当的方式制备。例如,当Rk为DMTr基团时,可通过甘油酸钙与DMTrCl反应制备式(A-1)化合物;类似地,可先将3-氨基-1,2-丙二醇与环状酸酐接触,随后再与DMTrCl反应制备式(A-2)化合物,所述环状酸酐可以是碳原子数为4-13、在一些实施方案中为4-8的环状酸酐。本领域技术人员容易理解的是,所述环状酸酐的选择对应于(A-2)化合物中q2的不同值,例如,当所述环状酸酐为丁二酸酐时,q2=1,当所述环状酸酐为戊二酸酐时,q2=2,以此类推。
在一些变型中,也可通过使式(314)所示化合物依次与所述环状酸酐、3-氨基-1,2-丙二醇和DMTrCl反应,制备式(313)化合物。本领域技术人员容易理解的是,这些变型不会影响式(313)化合物的结构与功能,并且这些变型是本领域技术人员在上述方法的基础上容易实现的。
与上述类似地,可使用任何合适的分离方法从反应混合物中分离式(313)化合物。在一些实施方案中,可通过蒸发除去溶剂、随后通过色谱方法分离式(313)化合物,例如,可使用如下两种色谱条件进行分离:(1)正相纯化硅胶:200-300目硅胶填料,使用石油醚:乙酸乙酯:二氯甲烷:N,N-二甲基甲酰胺=1:1:1:0.5-1:1:1:0.6梯度洗脱;以及(2)反相纯化:C18、C8反相填料,使用甲醇:乙腈=0.1:1-1:0.1梯度洗脱。在一些实施方案中,可以直接除去溶剂得到式(313)化合物粗产品,该粗产品可以直接用于后续反应。
在一些实施方案中,式(314)所示化合物可以通过以下制备方法得到:该方法包括在有机溶剂中,在脱保护反应条件下,将式(315)所示化合物与卤代乙酸接触,随后进行分离:
其中,R7选自式(330)、(331)、(332)或(333)所示的基团,在一些实施方案中,R7的结构如式(330)所示:
n1、n3、m1、m2、m3、R10、R11、R12、R13、R14、R15、L1、S1各自的定义和可选择的范围如前所述。
所述卤代乙酸选自二氯乙酸、三氯乙酸、一氯乙酸和三氟乙酸中的一种或多种,在一些实施方案中为二氯乙酸。
所述脱保护反应条件包括反应温度为0-100℃,反应时间为0.1-24小时,在一些实施方案中为反应温度为10-40℃,反应时间为0.5-16小时。
在一些实施方案中,所述有机溶剂为环氧类溶剂、醚类溶剂、卤代烷类溶剂、二甲基亚砜、N,N-二甲基甲酰胺和N,N-二异丙基乙胺中的一种或多种。所述环氧类溶剂在一些实施方案中为二氧六环和/或四氢呋喃,所述醚类溶剂在一些实施方案中为***和/或甲基叔丁基醚,所述卤代烷类溶剂在一些实施方案中为二氯甲烷、三氯甲烷和1,2-二氯乙烷中的一种或多种,在一些实施方案中,所述有机溶剂为二氯甲烷。相对于式(315)化合物,有机溶剂用量为3-50L/mol,在进一步的实施方案中为5-20L/mol。
所述卤代乙酸与所述式(315)所示化合物的摩尔比为5:1-100:1,在一些实施方案中为10:1-50:1。
与上述类似地,可使用任何合适的分离方法从反应混合物中分离式(314)化合物。在一些实施方案中,可通过蒸发除去溶剂、随后通过色谱方法分离式(314)化合物,例如,可使用如下两种色谱条件进行分离:(1)正相纯化硅胶:200-300目硅胶填料,使用二氯甲烷:甲醇=100:30-100:40梯度洗脱;以及(2)反相纯化:C18、C8反相填料,使用甲醇:乙腈=0.1:1-1:0.1梯度洗脱。在一些实施方案中,可以直接除去溶剂得到式(314)化合物粗产品,该粗产品可以直接用于后续反应。
式(315)所示化合物可以通过以下制备方法得到:该方法包括在有机溶剂中,在成酰胺反应缩合剂和三级胺类有机碱存在下,在缩合反应条件下,将式(317)所示化合物与式(316)所示化合物接触,随后进行分离:
S1-L1-OH
式(316)
其中,n1、n3、m1、m2、m3、R7、R10、R11、R12、R13、R14、R15、L1、S1各自的定义和可选择的范围如前所述。
式(316)化合物可使用例如J.Am.Chem.Soc.2014,136,16958-16961中所公开的化合物,或者,式(316)化合物可由本领域技术人员通过各种方法制备,例如,可参照美国专利US 8,106,022 B2实施例1中所公开的方法制备某些式(316)化合物,以引用的方式将以上文献的全部内容整体并入本文。
在一些实施方案中,所述缩合反应条件包括反应温度为0-100℃,反应时间为0.1-24小时,在一些实施方案中为反应温度为10-40℃,反应时间为0.5-16小时。
所述式(316)所示化合物与所述式(317)所示化合物的摩尔比可以为2:1-10:1,在一些实施方案中为2.5:1-5:1。
在一些实施方案中,所述有机溶剂为乙腈、环氧类溶剂、醚类溶剂、卤代烷类溶剂、二甲基亚砜、N,N-二甲基甲酰胺和N,N-二异丙基乙胺中的一种或多种,所述环氧类溶剂在一些实施方案中为二氧六环和/或四氢呋喃,所述醚类溶剂在一些实施方案中为***和/或甲基叔丁基醚,所述卤代烷类溶剂在一些实施方案中为二氯甲烷、三氯甲烷和1,2-二氯乙烷中的一种或多种,在一些实施方案中,所述有机溶剂为乙腈。相对于式(317)化合物,所述有机溶剂的用量为3-50L/mol,在一些实施方案中为5-20L/mol。
在一些实施方案中,所述成酰胺反应缩合剂为六氟磷酸苯并***-1-基-氧基三吡咯烷基磷、3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮(DEPBT)、O-苯并三氮唑-四甲基脲六氟磷酸酯或4-(4,6-二甲氧基三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐,在进一步的实施方案中为4-(4,6-二甲氧基三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐。所述成酰胺反应缩合剂与式(317)所示化合物的摩尔比可以为2:1-10:1,在一些实施方案中为2.5:1-5:1。
所述三级胺类有机碱可以为N-甲基吗啉、三乙胺或N,N-二异丙基乙胺,在一些实施方案中为N-甲基吗啉;所述三级胺类有机碱与式(317)所示化合物的摩尔比可以为3:1-20:1,在一些实施方案中为5:1-10:1。
与上述类似地,可使用任何合适的分离方法从反应混合物中分离式(315)化合物。在一些实施方案中,可通过蒸发除去溶剂、随后通过色谱方法分离式(315)化合物例如,可使用如下两种色谱条件进行分离:(1)正相纯化硅胶:200-300目硅胶填料,使用二氯甲烷:甲醇=100:5-100:7梯度洗脱;以及(2)反相纯化:C18、C8反相填料,使用甲醇:乙腈=0.1:1-1:0.1梯度洗脱。在一些实施方案中,可以直接除去溶剂得到式(315)化合物粗产品,该粗产品可以直接用于后续反应。
在一些实施方案中,式(317)化合物与足量的一种式(316)化合物一次反应即生成期望的式(315)化合物,此时,各个S1-L1部分彼此相同。在一些实施方案中,可根据需要,通过使式(317)化合物分批与不同的式(316)化合物,即L1和/或S1不同的式(316)化合物发生反应,使得生成的式(315)化合物中含有两种以上的S1和/或L1。例如,对于1eq的式(317)化合物,可先使其与2eq的第一式(316)化合物接触,在式(317)化合物中的两个末端伯胺基团上连接第一S1-L1部分,随后,使其继续与(n3+n1-1)eq的第二式(316)化合物接触(n3和n1的定义和取值范围如前所述),在式(317)化合物中的(n3+n1-1)个仲胺基团上连接第二S1-L1部分。
在一些实施方案中,式(317)所示化合物可以通过以下制备方法得到:该方法包括在有机溶剂存在下,在脱保护反应条件下,将式(318)所示化合物与甲胺水溶液接触,随后进行分离:
其中,n1、n3、m1、m2、m3、R7、R10、R11、R12、R13、R14、R15各自的定义和可选择的范围如前所述。
所述脱保护反应条件包括反应温度为0-150℃,反应时间为5-72小时,在一些实施方案中为反应温度为20-80℃,反应时间为10-30小时。
所述有机溶剂可选自醇,在一些实施方案中为甲醇、乙醇和异丙醇中的一种,在一些实施方案中为甲醇;相对于式(318)化合物,所述有机溶剂的用量为1-20L/mol,在一些实施方案中为1.5-10L/mol。
所述甲胺水溶液的浓度可以为30-40质量%,甲胺与式(318)所示化合物的摩尔比可以为10:1-500:1,在一些实施方案中为50:1-200:1。
与上述类似地,可使用任何合适的分离方法从反应混合物中分离式(317)化合物。在一些实施方案中,可通过蒸发除去溶剂、随后通过色谱方法分离式(317)化合物例如,可使用如下两种色谱条件进行分离:(1)正相纯化硅胶:200-300目硅胶填料,使用二氯甲烷:甲醇:氨水(25wt%)=1:1:0.05-1:1:0.25梯度洗脱;以及(2)反相纯化:C18、C8反相填料,使用甲醇:乙腈=0.1:1-1:0.1梯度洗脱。在一些实施方案中,可以直接除去溶剂得到式(317)化合物粗产品,该粗产品可以直接用于后续反应。
在一些实施方案中,式(318)所示化合物可以通过以下制备方法得到:该方法包括在有机溶剂存在下,在取代反应条件下,将式(319)所示化合物与三苯基氯甲烷(TrCl)、二苯基乙苯基氯甲烷、苯基二乙苯基氯甲烷或三乙苯基氯甲烷,在一些实施方案中为三苯基氯甲烷(TrCl)接触,随后进行分离:
其中,n1、n3、m1、m2、m3、R10、R11、R12、R13、R14、R15各自的定义和可选择的范围如前所述。
所述取代反应条件可包含反应温度为0-100℃,反应时间为5-72小时,在一些实施方案中,反应条件包含反应温度为10-40℃,反应时间为10-30小时。
三苯基氯甲烷(TrCl)、二苯基乙苯基氯甲烷、苯基二乙苯基氯甲烷或三乙苯基氯甲烷可商购得到,三苯基氯甲烷(TrCl)、二苯基乙苯基氯甲烷、苯基二乙苯基氯甲烷或三乙苯基氯甲烷与式(319)所示化合物的摩尔比可以为1:1-10:1,在一些实施方案中为1:1-3:1。
所述有机溶剂可以为环氧类溶剂、醚类溶剂、卤代烷类溶剂、二甲基亚砜、N,N-二甲基甲酰胺和N,N-二异丙基乙胺中的一种或多种。所述环氧类溶剂在一些实施方案中可以为二氧六环和/或四氢呋喃,所述醚类溶剂在一些实施方案中可以为***和/或甲基叔丁基醚,所述卤代烷类溶剂在一些实施方案中可以为二氯甲烷、三氯甲烷和1,2-二氯乙烷中的一种或多种;在一些实施方案中,所述有机溶剂为二氯甲烷。相对于式(319)化合物,所述有机溶剂的用量可以为3-50L/mol,在一些实施方案中为5-20L/mol。
与上述类似地,可使用任何合适的分离方法从反应混合物中分离式(318)化合物。在一些实施方案中,可通过蒸发除去溶剂、随后通过色谱方法分离式(318)化合物例如,可使用如下两种色谱条件进行分离:(1)正相纯化硅胶:200-300目硅胶填料,使用甲醇:二氯甲烷=0.01:1-0.5:1梯度洗脱;或者使用甲醇:二氯甲烷:乙酸乙酯:石油醚=0.1:1:1:1-1:1:1:1梯度洗脱。以及(2)反相纯化:C18、C8反相填料,使用甲醇:乙腈=0.1:1-1:0.1梯度洗脱。在一些实施方案中,可以直接除去溶剂得到式(318)化合物粗产品,该粗产品可以直接用于后续反应。
在一些实施方案中,式(319)所示化合物可以通过以下制备方法得到:该方法包括在有机溶剂中,在取代反应条件下,将式(320)所示化合物与三氟乙酸乙酯接触,随后进行分离:
其中,n1、n3、m1、m2、m3、R10、R11、R12、R13、R14、R15各自的定义和可选择的范围如前所述。
在一些实施方案中,所述有机溶剂为乙腈、环氧类溶剂、醚类溶剂、卤代烷类溶剂、二甲基亚砜、N,N-二甲基甲酰胺和N,N-二异丙基乙胺中的一种或多种。在一些实施方案中,所述环氧类溶剂为二氧六环和/或四氢呋喃,在一些实施方案中,所述醚类溶剂为***和/或甲基叔丁基醚,在一些实施方案中,所述卤代烷类溶剂为二氯甲烷、三氯甲烷和1,2-二氯乙烷中的一种或多种,在一些实施方案中,所述有机溶剂为乙腈。相对于式(320)化合物,所述有机溶剂的用量可以为1-50L/mol,在一些实施方案中为1-20L/mol。
所述取代反应条件可包括反应温度为0-100℃,反应时间为5-72小时,在一些实施方案中,所述取代反应条件包括反应温度为10-40℃,反应时间为10-30小时。
式(320)化合物可商购获得,或者由本领域技术人员使用已知的方法获得。例如,当m1=m2=m3=3,n1=1,n3=2,且R10、R11、R12、R13、R14、R15均为H时,式(320)化合物可自阿法埃莎公司商购获得。
所述三氟乙酸乙酯与式(320)所示化合物的摩尔比为2:1-10:1,在一些实施方案中为3:1-5:1。
与上述类似地,可使用任何合适的分离方法从反应混合物中分离式(319)化合物。在一些实施方案中,可通过蒸发除去溶剂、随后通过色谱方法分离式(319)化合物例如,可使用如下两种色谱条件进行分离:(1)正相纯化硅胶:200-300目硅胶填料,使用甲醇:二氯甲烷=0.01:1-0.5:1梯度洗脱;或者使用甲醇:二氯甲烷:乙酸乙酯:石油醚=0.1:1:1:1-1:1:1:1梯度洗脱。以及(2)反相纯化:C18、C8反相填料,使用甲醇:乙腈=0.1:1-1:0.1梯度洗脱。在一些实施方案中,可以直接除去溶剂得到式(319)化合物粗产品,该粗产品可以直接用于后续反应。
本公开的第一种或第二种siRNA缀合物也可以与药学上可接受的其它辅料联用,该辅料可以为本领域常规采用的各种制剂或化合物的一种或多种,详情可参见上文关于本公开的药物组合物的描述。
本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物以及第二种siRNA缀合物
的应用
在一些实施方案中,本公开提供了修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物在制备用于治疗和/或预防由所述载脂蛋白C3(ApoC3)的过量表达引起的血脂异常的药物中的用途。
在一些实施方案中,本公开提供了一种治疗载脂蛋白C3(ApoC3)的过量表达引起的血脂异常的方法,该方法包括向受试者给予有效量的本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物。
通过将本公开的siRNA活性成分给予有需要的受试者,可以通过RNA干扰的机制达到治疗血脂异常的目的。因此,本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物可用于预防和/或治疗血脂异常、或用于制备用于预防和/或治疗血脂异常的药物。
所述血脂异常指肝细胞中APOC3基因过度表达引起的血脂异常,通常表现为血液中甘油三酯、胆固醇等脂质和/或脂蛋白中的任一种或全部的水平提高,高水平的血脂与高血压、心血管疾病、糖尿病以及其他病理学病症高度相关。高甘油三酯血症与动脉粥样硬化相关,还会导致胰腺炎。本公开所述的血脂异常包括但不限于高胆固醇血症、高甘油三酯血症或动脉粥样硬化。
本文所使用的术语“给药/给予”是指通过使得至少部分地将本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物定位于期望的位点以产生期望效果的方法或途径,将本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物放置入受试者体内。适于本公开方法的给药途径包括局部给药和全身给药。一般而言,局部给药导致与受试者整个身体相比将更多本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物递送至特定位点;而全身给药导致将本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物递送至受试者的基本整个身体。考虑到本公开旨在提供预防和/或治疗血脂异常的手段,在一些实施方案中为能够将药物递送至肝脏的给药方式。
可通过本领域已知的任何合适途径向受试者给药,所述途径包括但不仅限于:口服或胃肠外途径,如静脉内给药、肌肉内给药、皮下给药、经皮给药、气道给药(气雾剂)、肺部给药、鼻部给药、直肠给药和局部给药(包括口腔含化给药和舌下给药)。给药频率可以是每天、每周、每两周、每三周、每个月或每年1次或多次。
本公开所述的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物的使用剂量可为本领域常规的剂量,所述剂量可以根据各种参数、尤其是受试者的年龄、体重和性别来确定。可在细胞培养或实验动物中通过标准药学程序测定毒性和疗效,例如测定LD50(使50%的群体致死的剂量)和ED50(在量反应中指能引起50%最大反应强度的剂量,在质反应中指引起50%实验对象出现阳性反应时的剂量)。可基于由细胞培养分析和动物研究得到的数据得出人用剂量的范围。
在给予本公开所述的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物时,例如,对于雄性或雌性、6-12周龄、体重18-25g的C57BL/6J或30-45g的ob/ob小鼠,以siRNA的量计:(i)对于第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物,其siRNA用量可以为0.001-100mg/kg体重,在进一步的实施方案中为0.01-50mg/kg体重,在更进一步的实施方案中为0.05-20mg/kg体重,在又进一步的实施方案中为0.1-10mg/kg体重;(ii)对于siRNA与药学上可接受的载体形成的药物组合物,其siRNA用量可以为0.001-50mg/kg体重,在进一步的实施方案中为0.01-10mg/kg体重,在更进一步的实施方案中为0.05-5mg/kg体重,在又进一步的实施方案中为0.1-3mg/kg体重。
在一些实施方案中,本公开提供了一种抑制肝细胞中载脂蛋白C3(ApoC3)基因表达的方法,该方法包括将有效量的本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物与所述肝细胞接触。将本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物导入肝细胞,通过RNA干扰机制达到抑制肝细胞中APOC3基因表达的目的。所述肝细胞可以选自Hep3B、HepG2、Huh7等肝癌细胞系或分离的肝原代细胞。在一些实施方案中,所述细胞为Huh7肝癌细胞。
采用本公开提供的方法抑制APOC3基因在细胞中表达,所提供的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物中的siRNA用量一般是这样的量:其足以减少靶基因的表达,并导致在靶细胞表面处1pM至1μM、或0.01nM至100nM、或0.05nM至50nM或至约5nM的细胞外浓度。达到该局部浓度所需的量将随各种因素而变化,所述因素包括递送方法、递送部位、在递送部位和靶细胞或组织之间的细胞层的数目、递送是局部还是全身等。在递送部位处的浓度可以显著高于在靶细胞或组织的表面处的浓度。
试剂盒
本公开提供了一种试剂盒,所述试剂盒包含有效量的本公开的修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和第二种siRNA缀合物的至少一种。
在一些实施方案中,本文所述的试剂盒可在一个容器中提供修饰的siRNA。在一些实施方案中,本文所述的试剂盒可包含一个提供药学上可接受的赋形剂的容器。在一些实施方案中,所述试剂盒中还可包含其它成分,如稳定剂或防腐剂等。在一些实施方案中,本文所述的试剂盒可在不同于提供本文所述修饰的siRNA的容器以外的其它容器中包含至少一种其它治疗剂。在一些实施方案中,所述试剂盒可包含用于将修饰的siRNA与药学上可接受的载体和/或辅料或其它成分(若有的话)进行混合的说明书。
在本公开的试剂盒中,所述修饰的siRNA和药学上可接受的载体和/或辅料以及所述修饰的siRNA、药物组合物、第一种siRNA缀合物和/或第二种siRNA缀合物和/或缀合物,和/或药学上可接受的辅料可以任何形式提供,例如液体形式、干燥形式或冻干形式。在一些实施方案中,所述修饰的siRNA和药学上可接受的载体和/或辅料以及所述药物组合物和/或缀合物和任选的药学上可接受的辅料基本上纯净和/或无菌。在一些实施方案中,可在本公开的试剂盒中提供无菌水。
下面通过制备例和实施例来进一步说明本公开,但是本公开并不因此而受任何限制。
实施例
以下将通过实施例对本公开进行详细描述。除非特别说明,以下实施例中所用到的试剂、培养基均为市售商品,所用到的核酸电泳、real-time PCR等操作均参照MolecularCloning(Cold Spring Harbor LBboratory Press(1989))所记载的方法进行。
HEK293A细胞由北京大学分子医学研究所核酸技术实验室提供,用含有20%的胎牛血清(FBS,Hyclone公司)及0.2体积%的青链霉素双抗(Penicillin-Streptomycin,Gibco,Invitrogen公司)的DMEM完全培养基(Hyclone公司)培养细胞,于37℃在含5% CO2/95%空气的培养箱中培养。
Huh7细胞购自中国科学院干细胞库,用含有10%的胎牛血清(FBS,Hyclone公司)、1%非必须氨基酸(NEAA,Corning公司)的DMEM完全培养基(Hyclone公司)培养细胞,于37℃在含5% CO2/95%空气的培养箱中培养。
本公开合成的针对APOC3基因的siRNA、siRNA缀合物或作为阴性对照的siRNA、siRNA缀合物转染细胞时,使用LipofectamineTM2000(Invitrogen)作为转染试剂,具体操作参照制造商提供的说明书。
若无其它说明,以下提供的试剂比例均按体积比(v/v)计算。
所使用的动物模型如下:
人APOC3转基因小鼠:B6;CBA-Tg(APOC3)3707Bres/J,购于美国Jackson实验室;
食蟹猴:由苏州华测生物技术有限公司提供。
实验数据均以±SEM表示,数据分析采用Graphpad prism5.0统计分析软件。首先对数据进行正态分布及方差齐性检验。符合正态分布(p>0.20)及方差齐(p>0.10):多组间比较采用单因素方差分析的LSD法进行多重比较,p<0.05认为有统计学意义;不符合正态分布或方差不齐:多组间比较采用非参数检验的Kruskal-Wallis H方法,如果Kruskal-wallis H检验结果显著(p<0.05),再将数据进行秩转换后,进行多组间两两比较,p<0.05认为有统计学意义。
制备例1:缀合物1-3的制备
本制备例合成了缀合物1-3(以下,也分别称为L10-siAP1M2SVP缀合物、L10-siAP1M2SP缀合物和L10-siAP1M2SPs缀合物)。所述缀合物为L-9缀合分子分别与编号为siAP1M2SVP、siAP1M2SP或siAP1M2SPs的siRNA缀合后形成的缀合物。该缀合物中所缀合的siRNA的序列参见表3。
(1-1)L-10化合物的合成
按照以下方法,合成了L-10化合物:
(1-1-1)缀合末端段GAL-5的合成
(1-1-1a)GAL-2的合成
将100.0g GAL-1(N-乙酰-D-半乳糖胺盐酸盐,CAS号:1772-03-8,购自宁波弘翔生化公司,463.8mmol)溶于1000ml无水吡啶,冰水浴下加入540ml乙酸酐(购自Enox公司,5565.6mmol),室温搅拌反应1.5小时。将反应液倒入10L冰水中,减压抽滤,滤饼用2L冰水洗涤后,加乙腈/甲苯混合溶剂(体积比乙腈:甲苯=1:1)至完全溶解,蒸干溶剂,得到白色固体产品GAL-2 130.0g。
(1-1-1b)GAL-3的合成
将步骤(1-1-1a)中获得的GAL-2(35.1g,90.0mmol)溶解于213ml无水1,2-二氯乙烷中,在冰水浴且氮气保护条件下,加入24.0g TMSOTf(CAS号:27607-77-8,购自麦克林公司,108.0mmol),室温反应过夜。
在反应液中加入400ml二氯甲烷稀释,以硅藻土过滤,再加入1L饱和碳酸氢钠水溶液,搅拌均匀,分出有机相,水相用二氯乙烷萃取两次,每次300ml,合并有机相,分别用300ml饱和碳酸氢钠水溶液和300ml饱和食盐水洗涤,分出有机相,无水硫酸钠干燥,减压蒸干溶剂,得到浅黄色粘稠糖稀状产品GAL-3 26.9g。
(1-1-1c)GAL-4的合成
将步骤(1-1-1b)中获得的GAL-3(26.9g,81.7mmol)溶于136ml无水1,2-二氯乙烷中,加入干燥的分子筛粉末30g,再加入9.0g 5-己烯-1-醇(CAS号:821-41-0,购自Adamas-beta公司,89.9mmol),室温下搅拌30分钟,冰浴和氮气保护下加入9.08g TMSOTf(40.9mmol),室温下搅拌反应过夜。过滤除去分子筛粉末,滤液中加入300ml二氯甲烷稀释,以硅藻土过滤,再加入500ml饱和碳酸氢钠水溶液搅拌10分钟洗涤,分出有机相,水相用300ml二氯乙烷萃取一次,合并有机相并分别用300ml饱和碳酸氢钠水溶液和300ml饱和食盐水洗涤,分出有机相,无水硫酸钠干燥,减压蒸干溶剂,得到黄色糖稀状产品GAL-441.3g,不进行纯化直接进行下一步氧化反应。
(1-1-1d)GAL-5的合成
将按照步骤(1-1-1c)中描述的方法得到的GAL-4(14.9g,34.7mmol,)溶于77ml二氯甲烷和77ml乙腈的混合溶剂中,分别加入103ml去离子水和29.7g高碘酸钠(CAS号:7790-28-5,购自阿拉丁公司,138.8mmol),冰水浴下搅拌10分钟,加入三氯化钌(CAS号:14898-67-0,购自安耐吉公司,238mg,1.145mmol),室温反应过夜。反应液加入300ml水稀释搅拌,加饱和碳酸氢钠调pH约为7.5,分出并弃去有机相,水相用二氯甲烷萃取三次,每次200ml,弃去有机相。水相用柠檬酸固体调节pH约为3,用二氯甲烷萃取三次,每次200ml,合并有机相,无水硫酸钠干燥,减压蒸干溶剂,得到白色泡沫状固体产品GAL-5 6.85g。1H NMR(400MHz,DMSO)δ12.01(br,1H),7.83(d,J=9.2Hz,1H),5.21(d,J=3.2Hz,1H),4.96(dd,J=11.2,3.2Hz,1H),4.49(d,J=8.4Hz,1H),4.07-3.95(m,3H),3.92-3.85(m,1H),3.74-3.67(m,1H),3.48-3.39(m,1H),2.20(t,J=6.8Hz,2H),2.11(s,3H),2.00(s,3H),1.90(s,3H),1.77(s,3H),1.55-1.45(m,4H).
(1-1-2)M-11-T3的合成:
将J-0(1.883g,10mmol,商购自阿法埃莎公司)溶于25ml乙腈中,加入三乙胺(4.048g,40mmol)冰水浴冷却至0℃,加入三氟乙酸乙酯(5.683g,40mmol),室温下反应22h,减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥18h,得到5.342g粗品固体M-11-T3,不经进一步纯化地直接用于后续反应。MS m/z:C15H22F9N4O3,[M+H]+,理论:477.35,实测:477.65。
(1-1-3)M-11-T3-Tr的合成:
将M-11-T3粗品(5.342g,10mmol)溶于50ml二氯甲烷,向反应液中加入TrCl(3.345g,12mmol)和三乙胺(1.518g,15mmol),室温下搅拌反应20h,用饱和碳酸氢钠洗涤反应液2次,每次20ml,20ml饱和食盐水洗涤1次,有机相用无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干有机溶剂,真空油泵发泡干燥过夜,得到粗品固体M-11-T3-Tr 7.763g。MS m/z:C34H36F9N4O3,[M+Na]+,理论:741.25,实测:741.53。粗品固体M-11-T3-Tr不经纯化地继续用于下一步M-18-Tr的合成。
(1-1-4)M-18-Tr的合成:
将步骤(1-1-3)中获得的M-11-T3-Tr粗品(7.763g,10mmol)溶于100ml甲醇,再加入100ml甲胺水溶液(40质量%),在50℃搅拌反应23h,过滤除去不溶颗粒物,减压蒸干溶剂,加入200ml体积比为1:1的二氯甲烷:甲醇混合溶剂,用50ml饱和碳酸氢钠洗涤,水相再用二氯甲烷(DCM)萃取3次,每次50ml,合并有机相,用无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥过夜,用200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷:甲醇:氨水(25wt%)=1:1:0.05-1:1:0.25梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥得到纯品M-18-Tr 2.887g。1H NMR(400MHz,DMSO)δ7.47-7.39(m,6H),7.32-7.24(m,6H),7.19-7.12(m,3H),2.60-2.47(m,4H),2.46-2.19(m,13H),1.70-1.55(m,4H),1.40(p,J=6.8Hz,2H).MS m/z:C28H39N4,[M+H]+,理论:431.65,实测:432.61。
(1-1-5)L-5-Tr的合成:
将步骤(1-1-4)中获得的M-18-Tr(2.02g,4.69mmol)与步骤(1-1-1)中获得的GAL-5(6.93g,15.48mmol)混合溶于47ml乙腈,加入N-甲基吗啉(3.13g,30.96mmol)和4-(4,6-二甲氧基三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐(DMTMM,4.28g,15.48mmol),室温搅拌反应2h。以200ml二氯甲烷稀释反应液,100ml饱和碳酸氢钠溶液洗涤有机相,100ml饱和食盐水洗涤有机相,有机相用无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂得粗品。200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷:甲醇=100:5-100:7梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干得到纯品L-5-Tr 7.49g。1H NMR(400MHz,DMSO)δ7.83-7.10(m,4H),7.67-7.60(m,1H),7.44-7.34(m,6H),7.33-7.24(m,6H),7.20-7.15(m,3H),5.22(s,3H),4.97(d,J=11.3Hz,3H),4.49(d,J=8.4Hz,3H),4.06-3.07(m,9H),3.95-3.83(m,3H),3.77-3.64(m,3H),3.45-3.35(m,3H),3.12-2.87(m,8H),2.30-2.15(m,3H),2.11-1.98(m,22H),1.95-1.84(m,11H),1.81-1.61(m,14H),1.54-1.36(m,14H).MS m/z:C85H119N7O30,[M+H]+,理论:1718.81,实测:1718.03。
(1-1-6)L-8的合成:
将步骤(1-1-5)中得到的L-5-Tr(5.94g,3.456mmol)溶于69ml二氯甲烷,再加入二氯乙酸(13.367g,103.67mmol),室温下反应2h,加入100ml二氯甲烷稀释反应液,再加饱和碳酸氢钠溶液洗涤调节pH=7-8之间,水相以二氯甲烷萃取6次,每次30ml,合并有机相,用无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂得粗品。纯化使用200-300目正相硅胶,以10wt%三乙胺中和硅胶酸性,1wt‰三乙胺平衡柱子,以二氯甲烷:甲醇=100:30-100:40梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品L-8 4.26g。1H NMR(400MHz,DMSO)δ7.84(d,J=9.0Hz,3H),7.27-7.23(m,1H),7.13-7.18(m,1H),5.22(d,J=3.1Hz,3H),4.97(dd,J=11.3,3.1Hz,3H),4.48(d,J=8.4Hz,3H),4.09-3.98(m,9H),3.88(dd,J=19.3,9.3Hz,3H),3.75-3.66(m,3H),3.44-3.38(m,3H),3.17-3.30(m,4H),3.10-2.97(m,4H),2.35-2.20(m,6H),2.15-2.08(m,9H),2.07-1.98(m,13H),1.94-1.87(m,9H),1.81-1.74(m,9H),1.65-1.42(m,18H).MS m/z:C85H119N7O30,[M+H]+,理论:1477.59,实测:1477.23。
(1-1-7a)A-1的合成
将DMTrCl(4,4'-双甲氧基三苯甲基氯,38.12g,112.5mmol)溶于450ml无水吡啶中,加入DL-甘油酸钙水合物(12.88g,45.0mmol),在45℃反应22h,将反应液过滤,滤饼用200ml DCM淋洗,滤液减压浓缩至干,剩余物用500ml二氯甲烷重新溶解,0.5M三乙胺磷酸盐(pH=7-8)洗涤2次,每次200ml,水相以二氯甲烷萃取2次,每次200ml,合并有机相,用无水硫酸钠干燥,过滤,减压蒸干溶剂,200-300目正相硅胶柱纯化,以石油醚:乙酸乙酯:二氯甲烷:甲醇=1:1:1:0.35-1:1:1:0.55梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂,500ml二氯甲烷重新溶解,以200ml 0.5M三乙胺磷酸盐洗涤1次,水相用二氯甲烷萃取2次,每次200ml,合并有机相,无水硫酸钠干燥,过滤,减压蒸干溶剂,真空油泵减压下过夜,得到白色固体产品A-1 20.7g。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.46(ddd,J=6.5,2.3,1.1Hz,1H),7.40-7.28(m,7H),6.89-6.81(m,4H),4.84(d,J=5.0Hz,1H),4.36-4.24(m,1H),4.29(s,6H),3.92(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),3.67(dd,J=12.3,7.0Hz,1H),2.52(q,J=6.3Hz,6H),1.03(t,J=6.3Hz,9H).MS m/z:C24H23O6,[M-H]-,理论:407.15,实测:406.92。
(1-1-7b)L-7的合成:
将步骤(1-1-6)中获得的L-8(2.262g,1.532mmol)和步骤(1-1-7a)中获得的A-1(2.342g,4.596mmol)混合,溶于16ml二氯甲烷,加入3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮(DEPBT)(1.375g,4.596mmol),再加入二异丙基乙胺(1.188g,9.191mmol),25℃下搅拌反应2h,用10ml饱和碳酸氢钠洗涤有机相,水相以二氯甲烷萃取3次,每次10ml,以10ml饱和食盐水洗涤有机相,水相以二氯甲烷萃取2次,每次10ml,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥过夜,得到粗品4.900g。柱纯化使用120g 200-300目正相硅胶,以20ml三乙胺中和硅胶酸性,以含1wt%三乙胺的石油醚平衡柱子,以石油醚:乙酸乙酯:二氯甲烷:N,N-二甲基甲酰胺=1:1:1:0.5-1:1:1:0.6梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品L-7 2.336g。1H NMR(400MHz,DMSO)δ7.90-7.78(m,4H),7.75-7.64(m,1H),7.38-7.18(m,9H),6.91-6.83(m,4H),5.25-5.10(m,4H),4.97(dd,J=11.2,3.2Hz,3H),4.48-4.30(m,4H),4.02(s,9H),3.93-3.84(m,3H),3.76-3.66(m,9H),3.45-3.35(m,3H),3.24-2.98(m,10H),2.30-2.20(m,2H),2.11-1.88(m,31H),1.80-1.40(m,28H).MS m/z:C90H128N7O35,[M-DMTr]+,理论:1564.65,实测:1564.88。
(1-1-8)L-9的合成:
将步骤(1-1-7b)中获得的L-7(2.300g,1.26mmol)、丁二酸酐(0.378g,3.78mmol)和4-二甲氨基吡啶(DMAP,0.462g,3.78mmol)混合溶于13ml二氯甲烷,再加入二异丙基乙胺(DIEA,0.814g,6.30mmol),25℃下搅拌24h,5ml0.5M三乙胺磷酸盐洗涤反应液,水相以二氯甲烷萃取3次,每次5ml,合并有机相减压蒸干得到2.774g粗品。柱纯化使用60g 200-300目正相硅胶,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷平衡柱子,以含1wt‰三乙胺的二氯甲烷:甲醇=100:18-100:20梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品L-9缀合分子1.874g。1H NMR(400MHz,DMSO)δ8.58(d,J=4.2Hz,1H),7.94-7.82(m,3H),7.41-7.29(m,5H),7.22(d,J=8.1Hz,5H),6.89(d,J=8.3Hz,4H),5.49-5.37(m,1H),5.21(d,J=3.0Hz,3H),4.97(d,J=11.1Hz,3H),4.49(d,J=8.2Hz,3H),4.02(s,9H),3.88(dd,J=19.4,9.4Hz,3H),3.77-3.65(m,9H),3.50-3.39(m,6H),3.11-2.90(m,5H),2.61-2.54(m,4H),2.47-2.41(m,2H),2.26-2.17(m,2H),2.15-1.95(m,22H),1.92-1.84(m,9H),1.80-1.70(m,10H),1.65-1.35(m,17H),1.31-1.19(m,4H),0.96(t,J=7.1Hz,9H).MS m/z:C94H132N7O38,[M-DMTr]+,理论:1664.72,实测:1665.03。
(1-1-9)L-10化合物的合成:
此步骤中,通过将L-9缀合分子连接至固相载体,制备了L-10化合物。
将步骤(1-1-8)中获得的L-9缀合分子(0.233g,0.1126mmol)、O-苯并三氮唑-四甲基脲六氟磷酸酯(HBTU,0.064g,0.1689mmol)和二异丙基乙胺(DIEA,0.029g,0.2252mmol)混合,溶于19ml乙腈,室温搅拌5分钟,向反应液中加入氨甲基树脂(0.901g,100-200目,氨基载量400μmol/g,购自南开和成公司),25℃下进行摇床反应,转速220转/分钟,反应15h后过滤,滤饼以DCM淋洗2次,每次30ml,乙腈淋洗3次,每次30ml,30ml***淋洗1次,真空油泵干燥2h,随后再按照表2中示出的投料配比加入原料(CapA、CapB、4-二甲氨基吡啶(DMAP)和乙腈)进行盖帽反应。25℃下置于摇床上,转速200转/分钟,反应5h,反应液过滤,滤饼用乙腈淋洗3次,每次30ml,抽滤至干,真空油泵减压下干燥过夜,得到L-10化合物(即,连接固相载体的L-9缀合分子)1.100g,载量90.8μmol/g。
表2盖帽反应投料配比
原料 | 用量 | 规格 | 批号 | 生产厂家 |
CapA | 20ml | —— | —— | —— |
CapB | 2.3ml | —— | —— | —— |
DMAP | 0.01g | 分析纯 | I1422139 | Aladdin |
乙腈 | 2.3ml | 光谱纯 | O15161001 | 上海星可 |
其中,CapA和CapB为盖帽试剂溶液,CapA为20体积%N-甲基咪唑的吡啶/乙腈混合溶液,吡啶与乙腈的体积比为3:5;CapB为20体积%乙酸酐的乙腈溶液。
(1-2)合成缀合物1-3的正义链
缀合物1-3的正义链序列相同,故其制备方法也相同。
通过固相亚磷酰胺法,利用上述步骤制备的L-10化合物起始循环,按照正义链核苷酸排布顺序自3'-5'方向逐一连接核苷单体。每连接一个核苷单体都包括脱保护、偶联、盖帽、氧化或硫化四步反应。其中,两个核苷酸之间采用磷酸酯连接时,连接后一个核苷单体时,包括脱保护、偶联、盖帽、氧化四步反应。两个核苷酸之间采用硫代磷酸酯连接时,连接后一个核苷单体时,包括保护、偶联、盖帽、硫化四步反应。合成条件给定如下:
核苷单体以0.1M浓度的乙腈溶液提供,每一步的脱保护反应的条件相同,即温度为25℃,反应时间为70秒,脱保护试剂为二氯乙酸的二氯甲烷溶液(3%v/v),二氯乙酸与固相载体上4,4'-二甲氧基三苯甲基保护基的摩尔比为5:1。
每一步偶联反应条件均相同,包括温度为25℃,固相载体上连接的核酸序列与核苷单体的摩尔比为1:10,固相载体上连接的核酸序列和偶联试剂的摩尔比为1:65,反应时间为600秒,偶联试剂为5-乙硫基-1H-四氮唑的0.5M乙腈溶液。
每一步盖帽条件均相同,包括温度为25℃,反应时间为15秒。盖帽试剂溶液为摩尔比为1:1的CapA和CapB的混合溶液,盖帽试剂与固相载体上连接的核酸序列的摩尔比为乙酸酐:N-甲基咪唑:固相载体上连接的核酸序列=1:1:1。
每一步氧化反应条件相同,包括温度为25℃,反应时间为15秒,氧化试剂为浓度为0.05M的碘水。碘与偶联步骤中固相载体上连接的核酸序列的摩尔比为30:1。反应在四氢呋喃:水:吡啶=3:1:1的混合溶剂中进行。
每一步硫化反应的条件相同,包括温度为25℃,反应时间为300秒,硫化试剂为氢化黄原素。硫化试剂与偶联步骤中固相载体上连接的核酸序列的摩尔比为120:1。反应在乙腈:吡啶=1:1的混合溶剂中进行。
切割和脱保护条件如下:将合成的连接有载体的核苷酸序列加入浓度为25wt%的氨水中,氨水用量为0.5ml/μmol,在55℃反应16h,除去液体,真空浓缩至干。
纯化与脱盐:利用制备型离子色谱纯化柱(Source 15Q),通过NaCl的梯度洗脱,完成核酸的纯化。具体而言为:洗脱剂A:20mM磷酸钠(pH 8.1),溶剂为水/乙腈=9:1(体积比);洗脱剂B:1.5M氯化钠,20mM磷酸钠(pH 8.1),溶剂为水/乙腈=9:1(体积比);洗脱梯度:洗脱剂A:洗脱剂B=100:0-50:50梯度洗脱。收集产品洗脱液后合并,采用反相色谱纯化柱进行脱盐,具体条件包括采用葡聚糖凝胶柱进行脱盐,填料为葡聚糖凝胶G25,以去离子水洗脱。
检测:使用离子交换色谱(IEX-HPLC)检测纯度,使用液质联用(LC-MS)分析分子量。正义链分子量的理论值为7649.55,对于缀合物1的正义链批次,实测值为7649.1;对于缀合物2和3的正义链批次,实测值为7648.8。实测值与理论值相符,表明所合成的是3'末端缀合了L-9缀合分子的正义链S。
(1-3)合成反义链
(1-3A)缀合物1反义链的制备
通过固相亚磷酰胺法,利用通用固相载体(UnyLinkerTMloadedHLSolid Supports,Kinovate Life Sciences公司)起始循环,合成缀合物1的反义链AS。固相合成方法中的脱保护、偶联、盖帽、氧化或硫化反应条件,切割和脱保护,纯化与脱盐条件与合成正义链相同。
检测:纯度采用离子交换色谱(IEX-HPLC)进行检测;分子量采用液质联用(LC-MS)进行分析。理论值6991.46,实测值6991.0。实测值与理论值相符,表明所合成的是具有目标序列的反义链AS。
其中,乙烯基磷酸酯修饰的2'-甲氧基修饰尿嘧啶核苷单体(VP-Um)按照以下方法合成:
(1-3-1)VP-U-2的合成
按照以下方法,合成了VP-U-2分子:
将2'-甲氧基修饰的尿嘧啶核苷(2'-OMe-U,51.30g,91.6mmol),叔丁基二苯基氯硅烷(TBDPSCl,50.35g,183.2mmol),咪唑(12.47g,183.2mmol)混合溶于450ml N,N-二甲基甲酰胺(DMF),室温下搅拌反应20h。蒸除DMF,用600ml二氯甲烷溶解后加300ml饱和碳酸氢钠洗涤,水相再用二氯甲烷(DCM)萃取3次,每次300ml,合并有机相,用5%草酸洗涤至水相pH<5,蒸发溶剂至干后获得VP-U-1粗品直接用于随后VP-U-2的合成。
将VP-U-1粗品用100ml二氯甲烷溶解后,外加冰浴搅拌10分钟,再加入预先在4℃冰箱冷藏好的450ml 2%对甲苯磺酸溶液(溶剂为体积比3:7的甲醇-二氯甲烷混合溶剂),反应10分钟。再加入200ml饱和碳酸氢钠淬灭反应,有机相加入饱和碳酸氢钠水溶液洗涤至pH=8。合并水相,用二氯甲烷萃取2次,每次200ml,合并有机相,再用200ml饱和食盐水洗涤一次,蒸发溶剂至干。200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以石油醚:乙酸乙酯:二氯甲烷:甲醇=1:1:1:0.05-1:1:1:0.25梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥得到纯品VP-U-2共40.00g。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.96(d,J=7.8Hz,1H),7.64(dtd,J=5.1,4.0,2.2Hz,4H),7.41-7.30(m,6H),6.79(d,J=4.7Hz,1H),5.73(d,J=7.6Hz,1H),4.94(t,J=7.0Hz,1H),4.12(td,J=4.6,3.9Hz,1H),4.05(dd,J=4.8,4.0Hz,1H),3.96(t,J=4.7Hz,1H),3.68(ddd,J=11.8,7.0,4.6Hz,1H),3.57-3.46(m,1H),3.39(s,3H),1.05(s,8H).MS m/z:C26H33N2O6Si,[M+H]+,理论:497.21,实测:497.45。
(1-3-2)VP-U-4的合成:
将VP-U-2(19.84g,40.0mmol),二环己基碳二亚胺(DCC,16.48g,80.0mmol),吡啶(4.20g,53.2mmol),三氟乙酸(6.61g,53.2mmol)混合溶于200ml二甲基亚砜(DMSO),室温下搅拌反应20h。另取亚甲基二磷酸四乙酯(21.44g,74.4mmol)溶于120ml THF,冰浴降温,在冰浴温度下加入t-BuOK(11.36g,101.2mmol),先在冰浴温度下反应10min,再升至室温反应0.5h,然后加入至前述反应液中,约1h加完,冰浴温度下反应1h,再升至室温反应18h。加水淬灭反应,水相以二氯甲烷提取3次,每次200ml。合并有机相,用200ml饱和食盐水水洗一次后蒸发溶剂至干。用200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以石油醚:乙酸乙酯=1:1-1:4梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥得到纯品VP-U-4共14.00g。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.96(d,J=7.8Hz,1H),7.64(dtd,J=5.1,4.0,2.2Hz,4H),7.41-7.30(m,6H),6.82-6.71(m,2H),5.90(ddd,J=25.9,15.0,1.0Hz,1H),5.73(d,J=7.6Hz,1H),4.36-4.21(m,3H),4.18(t,J=4.9Hz,1H),4.05(ddq,J=9.7,8.5,6.9Hz,2H),3.87(t,J=4.8Hz,1H),3.39(s,3H),1.32(td,J=6.9,0.7Hz,6H),1.05(s,8H).MS m/z:C31H42N2O8PSi,[M+H]+,理论:629.24,实测:629.51。
(1-3-3)VP-U-5的合成:
将VP-U-4(14.00g,22.29mmol)溶于100ml四氢呋喃,加入三乙胺三氢氟酸(17.96g,111.45mmol),室温搅拌20h反应完全。直接蒸发溶剂至干,再用二氯甲烷溶解随后蒸干2次,每次使用50ml二氯甲烷,得到粗品。用200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以石油醚:乙酸乙酯:二氯甲烷:甲醇=1:1:1:0.05-1:1:1:0.25梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥得到纯品VP-U-5共6.70g。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.96(d,J=7.8Hz,1H),6.77(dd,J=15.0,6.2Hz,1H),5.99-5.82(m,2H),5.73(d,J=7.6Hz,1H),5.27(d,J=5.1Hz,1H),5.10(dd,J=5.3,4.7Hz,1H),4.29(ddq,J=9.8,8.6,7.0Hz,2H),4.17(ddd,J=6.2,5.2,1.0Hz,1H),4.12-3.98(m,3H),3.39(s,2H),1.32(td,J=6.9,0.6Hz,6H).MS m/z:C15H24N2O8P,[M+H]+,理论:391.13,实测:391.38。
(1-3-4)VP-U-6的合成:
在氩气保护条件下向10ml无水二氯甲烷中加入VP-U-5(391mg,1.0mmol)、三氟乙酸吡啶盐(0.232g,1.2mmol)、N-甲基咪唑(0.099g,1.2mmol),双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦(0.452g,1.5mmol),室温搅拌反应5小时。蒸除溶剂至干,柱层析纯化(200-300目正相硅胶,二氯甲烷:乙腈(含0.5wt%三乙胺)=3:1-1:3梯度洗脱),收集产物洗脱液,浓缩除去溶剂,得到目标产物VP-U-6共508mg。31P NMR(161MHz,DMSO-d6)δ150.34,150.29,17.07,15.50.MS m/z:C24H41N4O9P2,[M+H]+,理论:591.23,实测:591.55。表明VP-U-6是目标产物VP-Um,作为核苷单体参与RNA链合成。
(1-3B)缀合物2反义链的制备
缀合物2的反义链与缀合物1的反义链的区别仅在于5'-末端第一个核苷酸修饰不同。按照固相亚磷酰胺法制备反义链时,最后连接的核苷单体为2'-甲氧基修饰尿嘧啶核苷单体(Um),再经脱保护、偶联、盖帽、氧化四步反应将CPR-I单体(苏州吉玛,货号Cat#13-2601-XX)连接至反义链5'末端,形成5'-磷酸酯修饰。
(CPR-I)
合成中,使用的通用固相载体,脱保护、偶联、盖帽、氧化或硫化反应条件,切割和脱保护,纯化与脱盐条件与合成正义链相同。
采用离子交换色谱(IEX-HPLC)检测纯度;采用液质联用(LC-MS)分析分子量,理论值6995.47,实测值6994.8。实测值与理论值相符,表明所合成的是具有目标序列的反义链AS。
(1-3C)缀合物3反义链的制备
采用与缀合物2反义链相同的合成工艺,区别在于连接CPR-I单体时,以硫化反应条件代替上述氧化反应条件,制得具有5'-硫代磷酸酯修饰的缀合物3反义链。
采用离子交换色谱(IEX-HPLC)检测纯度;采用液质联用(LC-MS)分析分子量,理论值7011.53,实测值7010.9。实测值与理论值相符,表明所合成的是具有目标序列的反义链AS。
(1-4)合成缀合物1-3
对于缀合物1,将S链与AS链分别溶于注射用水中,得到40mg/mL的溶液,以等摩尔比混合,50℃加热15min,室温冷却后,使它们通过氢键形成双链结构。使用超纯水(Milli-Q超纯水仪自制,电阻率18.2MΩ*cm(25℃))将缀合物稀释至浓度为0.2mg/mL后,利用液质联用仪(LC-MS,Liquid Chromatography-Mass Spectrometry,购于Waters公司,型号:LCTPremier)进行分子量检测。实测值与理论值一致,说明所合成的缀合物1是目标设计的带有L-9缀合分子的双链核酸序列。
对于缀合物2-3,采用相同的方法制备并检测分子量,实测值与理论值一致,说明所合成的缀合物是目标设计的带有L-9缀合分子的双链核酸序列。缀合物1-4的结构如式(3)所示。
制备例2:缀合物4-21以及对比缀合物1-2的制备
采用与制备例1相同的方法,合成了对比缀合物1-2,预期能够制得缀合物4-21,不同的是:1)所述siRNA分别为表3中所示的对应于对比缀合物1-2以及缀合物4-21的序列;2)当目标序列中含有未修饰的核苷酸时,切割与脱保护条件中,在氨水处理后,相对于单链核酸的量,用0.4ml/μmol N-甲基吡咯烷酮溶解产品,随后加入0.3ml/μmol三乙胺和0.6ml/μmol三乙胺三氢氟酸盐,以脱除核糖上的2'-TBDMS保护。
表3:siRNA缀合物
制备例3:P10-siAP1M2SP缀合物(缀合物22)的制备(3-1)P-10化合物的合成
按照以下方法,合成了P-10化合物:
(3-1-1)GAL5-C4-1的合成
向40ml N,N-二甲基甲酰胺中加入按照上述(1-1-1)中描述的方法得到的GAL-5(13.43g,30.0mmol)、4-氨基酸叔丁酯盐酸盐(5.87g,30.0mmol)、O-苯并三氮唑-四甲基脲六氟磷酸酯(13.65g,36.0mmol)和二异丙基乙胺(11.63g,90.0mmol),溶解均一后室温搅拌反应5小时。向反应液中加入300ml饱和碳酸氢钠水溶液,用乙酸乙酯萃取3次,每次200ml,合并有机相,用200ml饱和食盐水洗涤一次,分出有机相,再用无水硫酸钠干燥,减压蒸除溶剂至干得到30.3g油状物粗品GAL5-C4-1,直接进行下一步反应。
(3-1-2)GAL5-C4-2的合成
将步骤(3-1-1)中获得的GAL5-C4-1粗品(30.3g,30mmol)溶于180ml甲酸中,室温搅拌反应16小时。蒸发溶剂至干,柱层析纯化(200-300目正相硅胶,二氯甲烷:甲醇=100:18-100:20梯度洗脱),收集反应洗脱液,浓缩除去溶剂,得到目标产物GAL5-C4-2共14.84g。
(3-1-3)P-6的合成:
将按照步骤(1-1-4)中描述的方法得到的M-18-Tr(2.02g,4.69mmol)与将步骤(3-1-2)中获得的GAL5-C4-2(8.24g,15.48mmol,由两批产物合并获得)混合溶于47ml乙腈,再加入N-甲基吗啉(3.13g,30.96mmol),最后加入4-(4,6-二甲氧基三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐(DMTMM,4.28g,15.48mmol),室温搅拌反应2h。以20ml二氯甲烷稀释反应液,10ml饱和碳酸氢钠溶液洗涤有机相,10ml饱和食盐水洗涤有机相,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂得粗品,200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷:甲醇=100:5-100:7梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干得到纯品P-6共8.27g。
(3-1-4)P-7的合成:
将按照上述(3-1-3)中得到的P-6(6.82g,3.456mmol)溶于69ml二氯甲烷,再加入二氯乙酸(13.367g,103.67mmol),室温下反应2h。加入100ml二氯甲烷稀释反应液,再加入饱和碳酸氢钠溶液洗涤调节pH=7-8之间,水相以二氯甲烷萃取6次,每次30ml,合并有机相,无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂得粗品。用200-300目正相硅胶纯化,以10wt%三乙胺中和硅胶酸性,以1wt‰三乙胺平衡柱子,二氯甲烷:甲醇=100:30-100:40梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到P-7共4.82g。MS m/z:C78H127N10O33,[M+H]+,理论:1732.91,实测:1735.73。
(3-1-5)P-8的合成:
将P-7(2.653g,1.532mmol)和A-1(2.342g,4.596mmol)混合溶于16ml二氯甲烷,加入3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮(DEPBT)(1.375g,4.596mmol),再加入二异丙基乙胺(1.188g,9.191mmol),25℃下搅拌反应2h。用10ml饱和碳酸氢钠洗涤有机相,水相以二氯甲烷萃取3次,每次10ml,10ml饱和食盐水洗涤有机相,水相以二氯甲烷萃取2次,每次10ml,合并有机相,用无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥过夜得到粗品。柱纯化使用120g 200-300目正相硅胶,以20ml三乙胺中和硅胶酸性,以含1wt%三乙胺的石油醚平衡柱子,以石油醚:乙酸乙酯:二氯甲烷:N,N-二甲基甲酰胺=1:1:1:0.5-1:1:1:0.6梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品P-8共2.793g。
(3-1-6)P-9的合成:
将P-8(490mg,0.231mmol)、丁二酸酐(69mg,0.693mmol)和4-二甲氨基吡啶(DMAP,68mg,0.554mmol)混合溶于2.3ml二氯甲烷,再加入二异丙基乙胺(DIEA,149mg,1.155mmol),25℃下搅拌反应21h。50ml二氯甲烷稀释反应液,再加入100ml 0.5M三乙胺磷酸盐洗涤反应液,水相以二氯甲烷萃取3次,每次10ml,合并有机相,减压蒸干得到粗品。柱纯化使用80g 200-300目正相硅胶,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷平衡柱子,以含1wt‰三乙胺的二氯甲烷:甲醇=100:18-100:20梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品P-9缀合分子共200mg。MS m/z:C106H153N10O41,[M-DMTr]+,理论:1921.05,实测:1920.97。
(3-1-7)P-10的合成:
通过与制备例1中步骤(1-1-9)相同的方法,制备P-10。不同的是以P-9缀合分子代替L-9缀合分子,得到连接固相载体的P-9缀合分子。
(3-2)合成P10-siAP1M2SVP缀合物
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3A)、(1-4)相同的方法,制备缀合物22,不同的是以P-10化合物代替L-10化合物起始正义链合成。预期可以得到P10-siAP1M2SVP缀合物,其结构如式(4)所示。
制备例4:R5-siAP1M2SVP缀合物(缀合物23)的制备
(4-1)R-5化合物的合成
按照以下方法,合成了R-5化合物:
(4-1-1)GAL-C7-1的合成
将按照步骤(1-1-1b)中描述的方法得到的GAL-3(26.4g,80.2mmol)溶于134ml无水1,2-二氯乙烷中,加入分子筛粉末60g,再加入7-辛烯-1-醇(11.3g,88.2mmol),室温下搅拌反应10分钟,冰浴和氮气保护下加入三氟甲基磺酸三甲基硅酯(8.9g,40.1mmol),室温搅拌反应24小时。过滤除去分子筛粉末,滤液中加入500ml饱和碳酸氢钠水溶液洗涤,分出有机相,水相用100ml二氯甲烷萃取一次,合并有机相并用250ml饱和食盐水洗涤一次,分出有机相,用无水硫酸钠干燥,减压蒸除溶剂至干得到黄色糖稀状产品GAL-C7-1 33.3g,不进行纯化直接进行下一步氧化反应。
(4-1-2)GAL-C7-2的合成
将按照步骤(4-1-1)中得到的GAL-C7-1(33.3g,72.8mmol)溶于160ml二氯甲烷和160ml乙腈的混合溶剂中,分别加入216ml水和高碘酸钠固体(62.3g,291.2mmol),冰水浴下搅拌10分钟,加入催化剂三氯化钌(498mg,2.4mmol)自然升至室温搅拌反应23小时。反应液加入200ml水稀释搅拌,加饱和碳酸氢钠调节pH值为7.5,分掉有机相,水相再用二氯甲烷萃取三次,弃去有机相,水相用柠檬酸固体调节pH约为3,用二氯甲烷萃取三次,每次200ml,合并有机相,无水硫酸钠干燥,减压蒸除溶剂后柱层析(200-300目正相硅胶,二氯甲烷:甲醇=100:18-100:20梯度洗脱)纯化得到白色泡沫状固体产品GAL-C7-2 22.4g。MS m/z:C21H32NO11,[M+H]+,理论:476.50,实测:475.94。
(4-1-3)R-1的合成:
将按照步骤(1-1-4)中描述的方法得到的M-18-Tr(2.02g,4.69mmol)与GAL-C7-2(7.36g,15.48mmol)混合溶于47ml乙腈,再加入N-甲基吗啉(3.13g,30.96mmol),最后加入4-(4,6-二甲氧基三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐(DMTMM,4.28g,15.48mmol),室温搅拌反应2h。以200ml二氯甲烷稀释反应液,100ml饱和碳酸氢钠溶液洗涤有机相,100ml饱和食盐水洗涤有机相,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂得粗品,200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,二氯甲烷:甲醇=100:5-100:7梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干得到纯品R-1 7.82g。
(4-1-4)R-2的合成:
将R-1(6.23g,3.456mmol)溶于69ml二氯甲烷,再加入二氯乙酸(13.367g,103.67mmol),室温下反应2h。加入100ml二氯甲烷稀释反应液,再加饱和碳酸氢钠溶液洗涤调节pH=7-8之间,水相以二氯甲烷萃取6次,每次30ml,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂得粗品。200-300目正相硅胶,以10wt%三乙胺中和硅胶酸性,以1wt‰三乙胺平衡柱子,二氯甲烷:甲醇=100:30-100:40梯度洗脱,减压蒸干溶剂得到纯品R-24.49g。
(4-1-5)R-3的合成:
将R-2(2.391g,1.532mmol)和A-1(2.342g,4.596mmol)混合溶于16ml二氯甲烷,加入3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮(DEPBT)(1.375g,4.596mmol),再加入二异丙基乙胺(1.188g,9.191mmol),25℃下搅拌反应2h。用10ml饱和碳酸氢钠洗涤有机相,水相以二氯甲烷萃取3次,每次10ml,以10ml饱和食盐水洗涤有机相,水相以二氯甲烷萃取2次,每次10ml,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥过夜得到粗品。柱纯化使用120g 200-300目正相硅胶,以20ml三乙胺中和硅胶酸性,以含1wt%三乙胺的石油醚平衡柱子,石油醚:乙酸乙酯:二氯甲烷:N,N-二甲基甲酰胺=1:1:1:0.5-1:1:1:0.6梯度洗脱,减压蒸干溶剂得到纯品R-3 2.642g。
(4-1-6)R-4的合成:
将R-3(795mg,0.4074mmol)、丁二酸酐(82mg,0.8148mmol)和4-二甲氨基吡啶(DMAP,100mg,0.8148mmol)混合溶于4ml二氯甲烷,再加入二异丙基乙胺(DIEA,100mg,0.8148mmol),25℃下搅拌反应18h。5ml 0.5M三乙胺磷酸盐洗涤反应液,水相以二氯甲烷萃取3次,每次5ml,合并有机相减压蒸干得到粗品。柱纯化使用30g 200-300目正相硅胶,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷平衡柱子,含1wt‰三乙胺的二氯甲烷:甲醇=100:18-100:20梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品R-4缀合分子505mg。
(4-1-7)R-5缀合分子的合成:
通过与制备例1中步骤(1-1-9)相同的方法,制备R-5。不同的是以R-4缀合分子代替L-9缀合分子,得到连接固相载体的R-4缀合分子。
(4-2)合成R5-siAP1M2SVP缀合物
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3A)、(1-4)相同的方法,制备缀合物23,不同的是以R-5化合物代替L-10化合物起始正义链合成。预期可以得到R5-siAP1M2SVP缀合物,其结构如式(7)所示。
制备例5:LA5-siAP1M2SVP缀合物(缀合物24)的制备
按照以下工艺路线,预期能够合成LA-5化合物:
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3A)、(1-4)相同的方法,制备缀合物24,不同的是以LA-5化合物代替L-10化合物起始正义链合成。预期可以得到LA5-siAP1M2SVP缀合物,其结构如式(12)所示。
制备例6:LB5-siAP1M2SVP缀合物(缀合物25)的制备
(6-1)LB-5化合物的合成
按照以下方法,合成了LB-5化合物:
(6-1-1)LB-1的合成:
将按照步骤(1-1-6)中描述的方法得到的L-8(5.0g,3.386mmol)、己二酸酐(870mg,6.772mmol)和4-二甲氨基吡啶(DMAP,827mg,6.772mmol)混合溶于130ml二氯甲烷,再加入二异丙基乙胺(DIEA,2.2g,16.931mmol),25℃下搅拌反应4h。加入70ml二氯甲烷稀释反应液,以0.5M三乙胺磷酸盐洗涤反应液,水相以二氯甲烷萃取4次,每次10ml,合并有机相减压蒸干得到粗品。柱纯化使用120g 200-300目正相硅胶,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷平衡柱子,石油醚:乙酸乙酯:二氯甲烷:甲醇=1:1:1:0.2-1:1:1:1梯度洗脱,减压蒸干溶剂得到纯品LB-1 4.267g。
(6-1-2)LB-2的合成:
将按照步骤(6-1-1)中描述的方法得到的LB-1(4.697g,2.753mmol,由两批次产物合并而得)、3-氨基-1,2-丙二醇(313mg,3.442mmol)、4-(4,6-二甲氧基三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐(DMTMM,953mg,3.442mmol)和N-甲基吗啉(700mg,6.884mmol)先后加入30ml乙腈和3ml甲醇的混合液中,室温搅拌反应过夜。蒸发溶剂至干,柱层析(200-300目正相硅胶,二氯甲烷:甲醇=1:0.07-1:0.5梯度洗脱)纯化,收集产物洗脱液,浓缩除去溶剂,得到目标产物LB-2 3.27g。
(6-1-3)LB-3的合成:
将LB-2(2.27g,1.353mmol)用14ml无水吡啶溶解。再加入4,4'-双甲氧基三苯甲基氯(688mg,2.03mmol)室温下搅拌反应过夜。加150ml甲醇淬灭,蒸发溶剂至干。柱层析(200-300目正相硅胶,二氯甲烷:甲醇=1:0.05-1:0.2梯度洗脱)纯化,收集产物洗脱液,浓缩除去溶剂,得到目标产物LB-3 1.647g。
(6-1-4)LB-4的合成:
将LB-3(822mg,0.415mmol)、丁二酸酐(83g,0.83mmol)和4-二甲氨基吡啶(DMAP,102mg,0.83mmol)混合溶于4ml二氯甲烷,再加入DIEA(270mg,2.075mmol),25℃下搅拌反应过夜。0.5M三乙胺磷酸盐洗涤反应液3次,水相以二氯甲烷萃取3次,每次2ml,合并有机相减压蒸干得到粗品。柱纯化使用200-300目正相硅胶,以5wt%三乙胺中和硅胶酸性,以石油醚平衡柱子,用含1wt‰三乙胺的二氯甲烷:甲醇=100:5-100:20梯度洗脱,减压蒸干溶剂得到纯品LB-4缀合分子787mg。
(6-1-5)LB-5的合成:
通过与制备例1中步骤(1-1-9)相同的方法,制备LB-5。不同的是以LB-4缀合分子代替L-9缀合分子,得到连接固相载体的LB-4缀合分子。
(6-2)合成LB5-siAP1M2SVP缀合物
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3A)、(1-4)相同的方法,制备缀合物25,不同的是以LB-5化合物代替L-10化合物起始正义链合成。预期可以得到LB5-siAP1M2SVP,其结构如式(13)所示。
制备例7:V8-siAP1M2SVP缀合物(缀合物26)的合成
按照以下工艺路线,预期能够合成V-8化合物:
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3A)、(1-4)相同的方法,制备缀合物26,不同的是以V-8化合物代替L-10化合物起始正义链合成。预期可以得到V8-siAP1M2SVP,其结构如式(14)所示。
制备例8:W8-siAP1M2SVP缀合物(缀合物27)的制备
(8-1)W-8化合物的合成
按照以下方法,合成了W-8化合物:
(8-1-1)W-1的合成:
将W-0(2.024g,10mmol)溶于25ml乙腈中,再加三乙胺(4.048g,40mmol),冰水浴冷却至0℃左右,加入三氟乙酸乙酯(5.683g,40mmol),室温下反应22h。减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥18h,得到5.835g粗品固体W-1。
(8-1-2)W-2的合成:
将W-1粗品(5.835g,10mmol)溶于50ml二氯甲烷,向反应液中加入TrCl(3.345g,12mmol)和三乙胺(1.518g,15mmol),室温下搅拌反应20h。用20ml饱和碳酸氢钠洗涤反应液2次,用20ml饱和食盐水洗涤1次,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干有机溶剂,真空油泵发泡干燥过夜,得到粗品固体W-2 8.012g。不经处理,进行下一步脱保护反应。
(8-1-3)W-3的合成:
将W-2粗品(8.012g,10mmol)溶于100ml甲醇,再加入100ml甲胺水溶液(40wt%),在50℃下搅拌反应23h。过滤除去不溶颗粒物,减压蒸干溶剂,加入200ml体积比为1:1的DCM-甲醇混合溶剂,以50ml饱和碳酸氢钠洗涤有机相,水相再用二氯甲烷萃取3次,每次50ml,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥过夜,200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷:甲醇:氨水(25wt%)=1:1:0.05-1:1:0.25梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥得到纯品W-33.062g。
(8-1-4)W-4的合成:
将W-3(0.675g,1.517mmol)与GAL-C7-2(2.60g,5.46mmol)混合溶于47ml乙腈,再加二异丙基乙胺(1.57g,12.14mmol),最后加入3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮(DEPBT,1.816g,6.04mmol),室温搅拌反应2.5h。以100ml二氯甲烷稀释反应液,80ml饱和碳酸氢钠溶液洗涤有机相,80ml饱和食盐水洗涤有机相,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂得粗品,200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷:甲醇=100:5-100:7梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干得到纯品W-4 1.610g。
(8-1-5)W-5的合成:
将W-4(1.61g,0.886mmol)溶于125ml二氯甲烷,再加入二氯乙酸(3.5ml,42.43mmol),室温下反应1h。加入150ml吡啶中和反应液,减压蒸干溶剂得粗品。200-300目正相硅胶,10wt%三乙胺中和硅胶酸性,1wt‰三乙胺平衡柱子,二氯甲烷:甲醇=100:30-100:40梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品W-5 1.26g。
(8-1-6)W-6的合成:
将W-5(1.25g,0.793mmol)和按照步骤(1-1-7a)中描述的方法得到的A-1(1.21g,2.38mmol)混合溶于12ml二氯甲烷,加入3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮(DEPBT,0.712g,2.38mmol),再加入二异丙基乙胺(0.615g,4.76mmol),25℃下搅拌反应3h。用80ml饱和碳酸氢钠洗涤有机相,水相以二氯甲烷萃取3次,每次10ml,合并有机相并以10ml饱和食盐水洗涤,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥过夜得到粗品。柱纯化使用185g 200-300目正相硅胶,20ml三乙胺中和硅胶酸性,以含1wt%三乙胺的石油醚平衡柱子,以石油醚:乙酸乙酯:二氯甲烷:N,N-二甲基甲酰胺=1:1:1:0.1-1:1:0.7梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品W-61.57g。
(8-1-7)W-7的合成:
将W-6(1.238g,0.63mmol)、丁二酸酐(0.189g,1.89mmol)和4-二甲氨基吡啶(DMAP,0.231g,1.89mmol)混合溶于7ml二氯甲烷,再加入DIEA(0.407g,3.15mmol),25℃下搅拌反应24h。以5ml 0.5M三乙胺磷酸盐洗涤反应液,水相以二氯甲烷萃取3次,每次5ml,合并有机相减压蒸干得到粗品。柱纯化使用30g200-300目正相硅胶,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,二氯甲烷平衡柱子,以含1wt‰三乙胺的二氯甲烷:甲醇=100:18-100:20梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品W-7缀合分子1.033g。MS m/z:C101H146N7O38,[M-DMTr]+,理论:1763.92,实测:1763.21。
(8-1-8)W-8的合成:
通过与制备例1中步骤(1-1-9)相同的方法,制备W-8。不同的是以W-7缀合分子代替L-9缀合分子,得到连接固相载体的W-7缀合分子。
(8-2)合成W8-siAP1M2SVP缀合物
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3A)、(1-4)相同的方法,制备缀合物27,不同的是以W-8化合物代替L-10化合物起始正义链合成。预期可以得到W8-siAP1M2SVP,其结构如式(15)所示。
制备例9:X8-siAP1M2SVP缀合物(缀合物28)的制备
按照以下工艺路线,预期能够合成X-8化合物:
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3A)、(1-4)相同的方法,制备缀合物28,不同的是以X-8化合物代替L-10化合物起始正义链合成。预期可以得到X8-siAP1M2SVP,其结构如式(21)所示。
制备例10Z5-siAP1M2SVP缀合物(缀合物29)的制备
(10-1)Z-5化合物的合成
按照以下方法,合成了Z-5化合物:
(10-1-1)Z-1的合成:
将按照步骤(8-1-3)中描述的方法得到的W-3(1.50g,3.37mmol)与按照步骤(3-1-2)中描述的方法得到的GAL5-C4-2(7.18g,13.48mmol)混合溶于34ml二氯甲烷,再加入二异丙基乙胺(3.48g,26.96mmol),最后加入3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮(DEPBT,4.04g,13.48mmol),室温搅拌反应4.5h。以100ml二氯甲烷稀释反应液,80ml饱和碳酸氢钠溶液洗涤有机相,80ml饱和食盐水洗涤有机相,合并有机相并以无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂得粗品,200-300目正相硅胶柱纯化,石油醚装柱,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,以二氯甲烷:甲醇=30:1-15:1梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干得到纯品Z-13.97g。MS m/z:C98H143N10O33,[M+H]+,理论:1987.98,实测:1987.90。
(10-1-2)Z-2的合成:
将Z-1(3.97g,2.00mmol)溶于250ml二氯甲烷,再加入二氯乙酸(10.941g,84.85mmol),室温下反应1h。加入吡啶中和反应液至中性,减压蒸干溶剂得粗品。220g 200-300目正相硅胶装柱,10%吡啶中和硅胶酸性,1‰吡啶平衡柱子,二氯甲烷:甲醇=10:1-2:1梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品Z-2 3.49g。MS m/z:C79H129N10O33,[M+H]+,理论:1746.94,实测:1746.90。
(10-1-3)Z-3的合成:
将Z-2(3.49g,2.0mmol)和按照步骤(1-1-7a)中描述的方法得到的A-1(3.06g,6.0mmol)混合溶于30ml二氯甲烷,加入3-二乙氧基磷酰基-1,2,3-苯唑4(3H)-酮(DEPBT,1.80g,6.0mmol),再加入二异丙基乙胺(1.55g,12.0mmol),25℃下搅拌反应3h。100ml二氯甲烷稀释反应液,用饱和碳酸氢钠洗涤有机相2次,每次30ml,水相以10二氯甲烷萃取,合并有机相并以50ml饱和食盐水洗涤,合并有机相无水硫酸钠干燥,过滤后减压蒸干溶剂,真空油泵发泡干燥过夜得到粗品。柱纯化使用200g 200-300目正相硅胶,20ml三乙胺中和硅胶酸性,以含1wt%三乙胺的石油醚平衡柱子,二氯甲烷:甲醇=25:1-15:1梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品Z-3 2.2g。MS m/z:C103H151N10O38,[M+H]+,理论:2136.02,实测:2136.20。
(10-1-4)Z-4的合成:
将Z-3(2.10g,0.983mmol)溶解在含有DIEA(0.635g,4.915mmol)的14.8ml二氯甲烷中,加入4-二甲氨基吡啶(DMAP,240mg,1.966mmol)搅拌澄清后,加入丁二酸酐(197mg,1.966mmol),25℃下搅拌反应18h。加入50ml二氯甲烷稀释反应液,以80ml 0.5M三乙胺磷酸盐洗涤有机相,水相以二氯甲烷萃取2次,每次50ml,合并有机相减压蒸干得到粗品。柱纯化使用188g 200-300目正相硅胶,以1wt%三乙胺中和硅胶酸性,二氯甲烷平衡柱子,以含1wt‰三乙胺的二氯甲烷:甲醇=10:1-3:1梯度洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂得到纯品Z-4缀合分子1.95g。MS m/z:C107H155N10O41,[M+H]+,理论:1935.07,实测:1935.29。
(10-1-5)Z-5的合成
通过与制备例1中步骤(1-1-9)相同的方法,制备Z-5。不同的是以Z-4缀合分子代替L-9缀合分子,得到连接固相载体的Z-4缀合分子。
(10-2)合成Z5-siAP1M2SVP缀合物
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3A)、(1-4)相同的方法,制备缀合物29,不同的是以Z-5化合物代替L-10化合物起始正义链合成。预期可以得到Z5-siAP1M2SVP缀合物,其结构如式(22)所示。
制备例11:缀合物F1-F5的制备
本制备例合成了缀合物F1-F5(以下,也分别称为FIN-siAP1M1SVP、FIN-siAP1M1S、FIN-siAP2M1SVP、FIN-siAP2M1S和FIN-siAP2M2S缀合物)。该缀合物中所缀合的siRNA的序列参见表3。
(11-1)FIN-2缀合分子的合成
参照Rajeev等人,ChemBioChem 2015,16,903-908中描述的制备方法,按照以下工艺路线,合成了FIN-2缀合分子:
(11-1-1)PRO-10的合成
(11-1-1a)PRO-7的合成
将2.93g PRO-6(L-羟基脯氨酸,CAS号:51-35-4,购自安耐吉公司,22.4mmol)溶于22.5ml 1,4-dioxane(1,4-二氧六环,CAS号:123-91-1)中,加入34ml 10%(w/w)Na2CO3的水溶液,呈悬浊液状态,将6.95g Fmoc-Cl(氯甲酸-9-芴基甲酯,CAS号:28920-43-6,购自安耐吉公司,26.8mmol)溶于34ml1,4-dioxane,冰浴下加入到上述悬浊液中,自然升至室温反应过夜。将反应液倒入150ml冰水中,用甲基叔丁基醚萃取三次,每次100ml,弃去有机相,水相用浓HCl调节至pH≤5,用100ml乙酸乙酯萃取两次,合并有机相,无水硫酸钠干燥,减压蒸干溶剂得到白色泡沫状固体产品PRO-7 7.83g。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.91(t,J=7.2Hz,2H),7.67(d,J=7.5Hz,2H),7.48-7.39(m,2H),7.38-7.27(m,2H),5.17(s,1H),4.27(s,2H),4.23-4.11(m,2H),3.55-3.41(m,3H),2.31-2.10(m,1H),2.08-1.88(m,1H)。HRMS(ESI)m/z C20H19NO5[M-H]-理论352.1190,实测352.1033。
(11-1-1b)PRO-8的合成
将7.83g PRO-7(22.2mmol)溶于80ml THF(CAS号:109-99-9)中,油浴加热到65℃,回流状态下加入36.6ml 2mol/L的BH3-Me2S的THF溶液(CAS号13292-87-0,购自百灵威公司,73.2mmol),继续回流反应3小时。倒出反应液,用甲醇溶解剩余固体,搅拌下加入甲醇至反应液无气体放出并继续搅拌30分钟,减压蒸除溶剂后用石油醚提纯三次后得白色固体产物PRO-8 7.1g。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.91(t,J=6.7Hz,2H),7.67(d,J=7.2Hz,2H),7.49-7.39(m,2H),7.38-7.26(m,2H),5.18(dd,J=6.1,3.8Hz,1H),4.28(s,2H),4.23-4.13(m,2H),3.55-3.38(m,2H),2.32-2.11(m,1H),2.08-1.89(m,1H)。HRMS(ESI)m/zC20H21NO4[M+Na]+理论362.1368,实测362.1012。
(11-1-1c)PRO-9的合成
将7.1g PRO-8(21mmol)溶于100ml吡啶中,加入14.2g DMTr-Cl(4,4'-双甲氧基三苯甲基氯,42mmol),室温下搅拌反应5小时。减压蒸除溶剂,粗品用乙酸乙酯溶解后过滤除去盐类杂质,减压蒸除溶剂后硅胶柱纯化,硅胶柱预先用吡啶碱化后DCM溶解粗品上样,先用含1%(v/v)吡啶的DCM洗脱DMTr-Cl,随后用乙酸乙酯洗脱产物,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂,得白色固体产物PRO-9 8.2g;HRMS(ESI)m/z C41H39NO6[M+Na]+理论664.2675,实测664.2348;C18 RP-HPLC(批号JJS160324-1)纯度94.20%。
(11-1-1d)PRO-10的合成
将8.2g PRO-9(12.8mmol)溶于64ml DMF(N,N-二甲基甲酰胺)中,加入40ml哌啶(384mmol),室温下搅拌反应30分钟。反应液倒入300ml冰水中,乙酸乙酯萃取三次,每次150ml,合并有机相,用200ml饱和食盐水洗涤后,有机相以无水硫酸钠干燥,减压蒸除溶剂后硅胶柱纯化,硅胶柱预先用吡啶碱化后DCM溶解粗品上样,先用含1%(v/v)吡啶的DCM洗脱Fmoc,随后用乙酸乙酯洗脱产物,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂,得白色固体产物PRO-10 4.65g。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.40(d,J=7.2Hz,2H),7.35-7.18(m,7H),6.93-6.84(m,4H),4.56(d,J=3.9Hz,1H),4.12(s,1H),3.74(s,6H),3.46-3.37(m,1H),2.88(ddd,J=18.5,10.0,5.5Hz,2H),2.75(dd,J=8.7,5.8Hz,1H),2.62(dd,J=11.0,2.7Hz,1H),1.74-1.65(m,1H),1.40(ddd,J=12.9,8.5,5.9Hz,1H);HRMS(ESI)m/zC26H29NO4[M+Na]+理论442.1994,实测442.1999;C18 RP-HPLC(批号JJS160329-1)纯度97.07%。
(11-1-2)FIN-1的合成
将按照(1-1-1)中描述的方法得到的GAL-5(4.5g,10mmol)溶于40ml DMF中,依次加入3.9g DIEA(N,N-二异丙基乙胺,CAS号:7087-68-5,购自阿拉丁公司,30mmol)和3.8gHBTU(苯并三氮唑-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐,CAS号:94790-37-2,商购自阿拉丁公司,11mmol),室温下搅拌10分钟,将步骤(11-1-1d)中获得的PRO-10(4.2g,10mmol)溶于40mlDMF中,随后加入到上述反应液中,反应液中加入无水硫酸钠干燥,室温搅拌2小时。将反应液倒入120ml冰水中,用乙酸乙酯萃取三次,每次60ml,合并有机相,分别用20ml水、20ml饱和食盐水洗涤,分出有机相并以无水硫酸钠干燥,减压蒸除溶剂,硅胶柱纯化,硅胶柱预先用吡啶碱化后上样,用含1体积%三乙胺和1体积%甲醇的二氯甲烷(DCM)溶液洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸干溶剂,得到浅黄色泡沫状固体产品FIN-1 6.5g。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.83(d,J=9.2Hz,1H),7.32(t,J=6.6Hz,4H),7.20(td,J=8.9,3.5Hz,5H),6.93-6.84(m,4H),5.21(d,J=3.2Hz,1H),5.04-4.90(m,2H),4.49(s,1H),4.40(d,J=4.4Hz,0.8H),4.31(d,J=5.0Hz,0.2H),4.15(s,1H),4.03(s,3H),3.93(s,1H),3.74(s,7H),3.59(dt,J=12.0,6.0Hz,1H),3.50-3.40(m,1H),3.39-3.25(m,3H),3.13(dd,J=8.9,5.2Hz,1H),3.00(dq,J=9.3,5.3,4.3Hz,1H),2.22(s,2H),2.07(s,3H),1.99(s,3H),1.90(s,4H),1.74(s,3H),1.50(s,3H),1.36(s,1H)。C18 RP-HPLC(批号LJ160422)纯度95.45%。
(11-1-3)FIN-2的合成
将步骤(11-1-2)中获得的FIN-1(3.0g,3.53mmol)与乙腈共沸除水,减压抽干,溶于10ml DMF,氮气保护下加入2.13g PA(双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦,购自Adamas公司,商品编号11356B,7.06mmol)、346mg四唑(CAS号:288-94-8,购自阿拉丁公司,4.94mmol),室温下搅拌反应,补加10ml DMF,继续搅拌反应1小时。减压蒸除溶剂后以硅胶柱色谱纯化,硅胶柱预先用吡啶碱化后DCM溶解粗品上样,乙酸乙酯洗脱,收集产物洗脱液,减压蒸除溶剂,得无色糖浆状粗品4.5g。粗品用50体积%乙腈水溶液溶解至完全溶解,用C-18,330g,中压纯化柱纯化样品,柱子先用1体积%吡啶的乙腈溶液碱化,梯度洗脱收集产品峰,减压蒸除溶剂得白色粉末产品FIN-2缀合分子2.2g。31P NMR(162MHz,CDCl3)δ148.04,147.94,147.62,147.19,磷谱纯度92%;C18 RP-HPLC纯度90.54%。
(11-2)FIN-2缀合分子连接到固相载体
采用核酸固相合成方法,将步骤(11-1-3)中得到的FIN-2缀合分子,通过三次循环,连接到通用固相载体(UnyLinkerTMloadedHL Solid Supports)上,从而实现缀合基团(FIN_FIN_FIN)连接在RNA正义链的3'末端。
参照Rajeev等人,ChemBioChem 2015,16,903-908中描述的制备方法进行上述连接,具体而言,首先,由上述通用固相载体开始,脱除固相载体上的羟基保护基团,在偶联反应条件和偶联试剂存在下与FIN-2缀合分子接触发生偶联,经盖帽反应和氧化反应后,获得连接至固相载体的FIN缀合分子;脱除该连接至固相载体的FIN缀合分子上的羟基保护基团DMTr,与FIN-2缀合分子接触发生偶联,进行盖帽反应和氧化反应,并再重复一次上述脱保护-偶联-盖帽-氧化步骤,连接第三个FIN-2缀合分子,获得连接在固相载体上的的缀合基团(FIN_FIN_FIN)。
上述反应中,所述的脱保护、偶联、盖帽、氧化的反应条件、溶剂和试剂用量与前述步骤(1-2)中描述的核酸固相合成方法相同。
(11-3)缀合物F1-F5的合成
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3)、(1-4)相同的方法,制备题述缀合物,不同的是:1)以步骤(11-2)得到的化合物起始合成正义链;2)缀合的siRNA具有表3中所示的对应于缀合物F1-F5的序列。
利用液质联用仪(LC-MS,Liquid Chromatography-Mass Spectrometry,购于Waters公司,型号:LCT Premier)进行分子量检测。其结果,实测值与理论值相符,从而确定所合成的缀合物是目标设计的化合物,其结构如式(307)所示。
制备例12:对比缀合物3的制备
本制备例合成了对比缀合物3,该缀合物中所缀合的siRNA的序列参见表3。该缀合物与美国申请15/597,225中化合物AD-69535的结构相同。
(12-1)(GalNAc)3缀合分子的合成
按照WO2014025805A1所述的制备方法合成化合物30,即,含有如上文所述的接头-(LA)3三羟甲基氨基甲烷-LB-以及作为靶向基团的N-乙酰半乳糖胺分子(其中,每个LA可连接一个N-乙酰半乳糖胺分子,因而一个接头可连接三个N-乙酰半乳糖胺分子)的缀合分子,也称(GalNAc)3缀合分子,所述化合物30的结构如下式所示:
(12-2)(GalNAc)3缀合分子连接到固相载体
通过与制备例1中步骤(1-1-9)相同的方法,将(GalNAc)3缀合分子连接到固相载体,得到连接固相载体的(GalNAc)3缀合分子。
(12-3)对比缀合物1的合成
通过与制备例1中步骤(1-2)、(1-3)、(1-4)相同的方法,制备对比缀合物1,不同的是:1)以步骤(12-2)得到的化合物起始正义链合成;2)缀合的siRNA具有表3中编号为(GalNAc)3-69535所示的序列。
利用液质联用仪(LC-MS,Liquid Chromatography-Mass Spectrometry,购于Waters公司,型号:LCT Premier)进行分子量检测。其结果,实测值与理论值相符,从而确定所合成的缀合物是目标设计的化合物,其结构如式(305)所示。
在上述本公开的缀合物制备完成后,使用标准手段冻干为固体粉末保存备用。在使用时,可使用例如注射用水将其重新溶解为所需浓度的溶液使用。
实验例1:本实验考察本公开的siRNA缀合物在体外(in vitro)的抑制活性
实验例1-1:体外psiCHECK***中的在靶活性
本实验例考察了缀合物F1-F5在体外psiCHECK***中的在靶活性(on-targetactivity),即测定了缀合物F1-F5靶向完全匹配目标序列(其核苷酸序列与所述缀合物反义链的全长核苷酸序列完全互补)的活性。
根据Kumico Ui-Tei et.al.,Functional dissection of siRNA sequence bysystematic DNA substitution:modified siRNA with a DNA seed arm is a powerfultool for mammalian gene silencing with significantly reduced off-targeteffect.Nucleic Acids Research,2008.36(7),2136-2151描述的方法,构建检测质粒,与待评价的siRNA缀合物共转染至HEK293A细胞中,通过双萤光素酶报告基因的表达水平,来反应siRNA缀合物的在靶活性。
具体步骤如下:
[1]构建检测质粒
采用psiCHECKTM-2(PromegaTM)质粒构建在靶质粒,该质粒含有一个目标序列,该目标序列与待测缀合物中的反义链的所有21个核苷酸序列完全互补。将目标序列克隆到psiCHECKTM-2质粒的Xho I/Not I位点。
[2]转染
在96孔板中,根据LipofectamineTM2000(Invitrogen公司)的使用说明,分别共转染siRNA缀合物和上述质粒,其中每孔转染质粒10ng,使用LipofectamineTM2000 0.2μL,缀合物的终浓度(以siRNA的浓度计算)依次为0.5nM、0.1nM和0.02nM。各组以无缀合物处理为对照。每组3个复孔。
NC为吉玛公司与目的基因序列无同源性的通用阴性对照B01001。
[3]检测
共转染24小时后,使用双萤光素酶报告基因检测试剂盒(Dual luciferasereporter gene assay kit,Promega公司,cat.E2940),根据使用说明书裂解HEK293A细胞,检测双萤光素酶报告基因的表达水平。以海肾萤光素酶蛋白水平相对于萤火虫萤光素酶蛋白水平进行标准化。结果如图1所示。
结果表明,缀合物F1-F5都具有较好的体外抑制活性,高浓度下,各缀合物的抑制率为87%-97%。
实验例1-2:体外psiCHECK***中IC50的测定
本实验例考察了缀合物1在体外psiCHECK***中的IC50。
采用与实验例1-1相同的方法构建缀合物1的在靶质粒,缀合物1的终浓度(以siRNA的浓度计算)自1nM起始,倍比稀释11个浓度,至0.001nM。根据采用不同缀合物浓度所测得的活性结果,利用Graphpad 5.0软件log(inhibitor)vs.response蛋白水平相对于萤火虫萤光素酶蛋功能来拟合剂量-效应曲线,根据剂量-效应曲线计算缀合物1的IC50值。
式中:
Y是残留mRNA的表达水平,
X为转染siRNA浓度的对数值,
Bot是稳态期底部的Y值,
Top是稳态期顶部的Y值,
LogIC50是当Y在底部到顶部之间一半时的X值,而HillSlope则是曲线的斜率。
检测可得,缀合物1在体外psiCHECK***中的IC50为0.0174nM,说明本公开的siRNA缀合物在体外具有较高活性。
实验例1-3:体外细胞系中IC50的测定
本实验例考察了缀合物2在体外Huh7细胞中对APOC3 mRNA表达量的抑制效率。
使用LipofectamineTM2000将缀合物2转染至人类肝癌细胞株Huh7中,siRNA缀合物终浓度(以siRNA的量计)自3nM起始,3倍稀释7个浓度,至0.004nM。每个浓度2个复孔。
通过实时荧光定量PCR(Quantitative Real-Time PCR)分别检测转染了各浓度的缀合物2的Huh7细胞中APOC3 mRNA的表达量。具体步骤为:培养转染的细胞24小时后,使用Trizol(Thermo Fisher公司)根据总RNA提取的标准操作步骤提取细胞中的总RNA;分别取1μg总RNA,使用反转录试剂盒(Promega公司,货号A3500)按其说明书的操作方法反转录得到cDNA。使用2×Ultra SYBR Mixture(with ROX)(北京康为世纪生物科技有限公司,货号CW0956)试剂盒,以cDNA为模板按照说明书的步骤进行APOC3 mRNA表达量的检测。其中,用于扩增APOC3和作为内参基因的β-actin的PCR引物如表4所示。
表4:检测引物的序列
APOC3 mRNA表达量按如下等式计算:APOC3 mRNA表达量=[(测试组APOC3 mRNA的表达量/测试组β-Actin mRNA的表达量)/(对照组APOC3 mRNA的表达量/对照组β-ActinmRNA的表达量)]×100%。
缀合物对APOC3 mRNA表达量的抑制率按如下等式计算:抑制率=(1-APOC3 mRNA表达量)×100%。其中,各测试组为分别经各浓度缀合物2处理的Huh7细胞,对照组为未经缀合物2处理的Huh7细胞。
根据采用不同浓度缀合物2所测得的对APOC3 mRNA表达量的抑制率,采用与实验例1-2相同的方法计算IC50,可得缀合物2在体外Huh7细胞中的IC50为0.0085nM,说明本公开的siRNA缀合物在体外具有较高活性。
实验例2:本实验考察本公开的siRNA缀合物在体内(in vivo)对APOC3 mRNA表达量的抑制效率
实验例2-1:本实验例考察缀合物1在人APOC3转基因小鼠体内对肝脏组织中APOC3mRNA表达量的抑制率。
将人APOC3转基因小鼠(B6;CBA-Tg(APOC3)3707Bres/J)按照甘油三酯含量大于2mmol/L随机分组,每组5只,分别向每组小鼠给予缀合物1、对比缀合物1以及生理盐水NS。所有动物根据体重计算药量,采用皮下注射方式单次给药,siRNA缀合物给药剂量(以siRNA的量计)为1mg/kg和0.1mg/kg两个剂量组,缀合物分别以0.2mg/ml和0.02mg/ml浓度的0.9%氯化钠水溶液提供,给药体积为5mL/kg。给药后14天处死小鼠,收集肝脏,用RNAlater(Sigma Aldrich公司)保存;随后用组织匀浆仪匀浆肝组织,再用Trizol(ThermoFisher公司)根据总RNA提取的标准操作步骤提取得到肝组织总RNA。
采用与实验例1-3相同的实时荧光定量PCR方法检测肝组织中APOC3 mRNA的表达量。在该荧光定量PCR法中,以β-肌动蛋白(β-actin)基因作为内参基因,使用针对APOC3的引物和针对β-肌动蛋白的引物分别检测APOC3和β-肌动蛋白的表达量。
检测引物的序列参见表5。
表5:检测引物的序列
肝中APOC3 mRNA的表达量以及缀合物对APOC3 mRNA的抑制率计算同实验例1-3。其中,对照组为本实验中施以生理盐水的对照组小鼠,各测试组为分别施以不同siRNA缀合物的给药组小鼠。结果示于图2中。
结果显示,缀合物1对转基因鼠中的人APOC3基因具有显著的抑制作用。
实验例2-2:本实验例考察缀合物1在食蟹猴体内对肝脏组织中APOC3 mRNA表达量的抑制率,以及对血脂水平的影响。
该实验例委托苏州华测生物技术有限公司进行。将2-4kg年龄为3-5岁的食蟹猴随机分为2组,每组一雄一雌,分别给予缀合物1以及对比缀合物2。所有动物根据体重计算药量,采用皮下注射方式单次给药,siRNA缀合物给药剂量(以siRNA的量计)为3mg/kg,缀合物分别以3mg/ml浓度的氯化钠注射液(山东科伦药业有限公司)的形式提供,给药体积为1mL/kg。首次给药当天定义为试验第1天(D1)、给药前1天为第0天(D0)。
给药前与给药后第7、14、21、28天对动物进行静脉采血,在各时间点检测血清待测物含量,待测物指血脂(总胆固醇CHO、甘油三酯TG)和转氨酶(谷草转氨酶AST、谷丙转氨酶ALT)。待测物进行标准化处理,各待测物的抑制率按如下等式计算:抑制率=(1-给药后测试组待测物含量/给药前测试组待测物含量)×100%。其中,对甘油三酯的抑制率见表6。
表6:TG含量及其抑制率
通过检测给药后各检测点转氨酶含量,未发现肝功能异常。
给药后第28天处死动物,摘取肝脏。大体观察,未发现显著异常。采用与实验例2-1相同的方法提取肝组织RNA,检测肝中APOC3 mRNA的表达量。检测引物的序列参见表7。
表7:检测引物的序列
实时荧光定量PCR检测可得,相对于对比缀合物2,缀合物1对雌性动物的APOC3mRNA的抑制率为55.3%;对雄性动物的APOC3 mRNA的抑制率为78.5%。
该实验显示,缀合物1对非人灵长类中的APOC3基因同样具有显著的抑制作用,并对血清TG也有显著的抑制作用,同时并未检测到肝功异常。
实验例3:本实验考察本公开的siRNA缀合物在体内(in vivo)对血脂含量的影响
实验例3-1:本实验例考察缀合物1在人APOC3转基因小鼠体内对血清中总胆固醇(CHO)和甘油三酯(TG)含量的影响。
将人APOC3转基因小鼠(B6;CBA-Tg(APOC3)3707Bres/J)按照TG含量>2mmol/L进行随机分组,每组7只,分组如下:(1)生理盐水对照组;(2)缀合物1 3mg/kg组;(3)缀合物11mg/kg组。所有动物根据体重计算药量,采用皮下注射方式单次给药,siRNA缀合物分别以0.6mg/ml和0.2mg/ml浓度的0.9%氯化钠水溶液提供,给药体积为5mL/kg。
分别于给药前(记为第0天),及给药后第7、14、21、28、35、42、49、63、77、91、112、133、147、154、161、175、189天对小鼠眼眶静脉丛取血,在各时间点检测血清CHO和TG水平。
眼眶取血每次约100μL,离心后血清不少于20μL,进一步使用PM1P000/3全自动血清生化仪(SABA,意大利)检测血清中总胆固醇(CHO)和甘油三酯(TG)的含量。
标准化的血脂水平=(给药后测试组血脂含量/给药前测试组血脂含量)×100%。
血脂水平的抑制率=(1-给药后测试组血脂含量/给药前测试组血脂含量)×100%。血脂指总胆固醇或甘油三酯。
检测结果示于图3A和3B中。
由图3A和3B可以看出,在给药后不同时间点,缀合物1显示出明显的降低小鼠血清中TG和CHO的效果,效果能长达189天;表明其能够在长时间内稳定高效地抑制APOC3基因的表达。
实验例3-2:本实验例考察了缀合物2在人APOC3转基因小鼠体内对血清中总胆固醇(CHO)和甘油三酯(TG)含量的影响。
按照与实验例3-1相同的方法进行检测,区别在于,每组小鼠8只,所给予的缀合物为缀合物2;以0.1、0.3、1、3、9mg/kg五个剂量组分别给药,给药体积不变,相应调整缀合物溶液浓度;测试持续至给药后第112天。结果示于图4A和4B中。
由图4A和4B的结果可知,缀合物2能够在长达112天的时间内显著降低转基因小鼠中的TG和CHO水平,并且该降低效果存在明显的剂量依赖效应。
实验例3-3:本实验例比较了缀合物1-3在人APOC3转基因小鼠体内对血清中总胆固醇(CHO)和甘油三酯(TG)含量的影响。
采用与实验例3-1相同的方法对小鼠血清总胆固醇(CHO)和总血脂(TG)进行测量,区别在于:每组小鼠6只,分别给予缀合物1、2和3以及对比缀合物3,每一种缀合物按1mg/kg和3mg/kg两个剂量组给药,给药体积不变,相应调整缀合物溶液浓度;测试时间直至给药后第112天。结果参见图5A-图5D。
由图5A-图5D的结果可知,在长达112天的时间内,本公开的缀合物1-3在不同剂量下均显示出对转基因小鼠中血脂的持续降低作用,该降低的持续效果总体上优于对比缀合物3。
上述结果表明,本公开提供的缀合物能够有效降低肝脏中APOC3 mRNA的表达,降低血液中总胆固醇、甘油三酯含量,可预防和/或治疗血脂异常,具有良好的临床应用前景。
以上详细描述了本公开的一些实施方案,但是,本公开并不限于上述实施方案中的具体细节,在本公开的技术构思范围内,可以对本公开的技术方案进行多种简单变型,这些简单变型均属于本公开的保护范围。
另外需要说明的是,在上述一些实施方案中所描述的各个具体技术特征,在不矛盾的情况下,可以通过任何合适的方式进行组合,为了避免不必要的重复,本公开对各种可能的组合方式不再另行说明。
此外,本公开的各种不同的实施方案之间也可以进行任意组合,只要其不违背本公开的思想,其同样应当视为本公开所公开的内容。
Claims (15)
1.一种siRNA缀合物,该缀合物具有式(1)所示的结构:
其中,
n1为选自1-3的整数,n3为选自0-4的整数;
m1、m2和m3独立地为选自2-10的整数;
R10、R11、R12、R13、R14和R15各自独立地为H,或选自于由以下基团所组成的组:C1-C10烷基、C1-C10卤代烷基以及C1-C10烷氧基;
R3为式A59所示结构的基团:
其中,E1为OH、SH或BH2,Nu为siRNA;
所述siRNA中的每个核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸,所述siRNA含有正义链和反义链,所述正义链包含核苷酸序列1,所述反义链包含核苷酸序列2,所述核苷酸序列1和所述核苷酸序列2至少部分地反向互补形成双链区,所述核苷酸序列1与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列2与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:
5'-CAAUAAAGCUGGACAAGAZ-3'(SEQ ID NO:1),
5'-Z'UCUUGUCCAGCUUUAUUG-3'(SEQ ID NO:2);
其中,Z为A,Z'为U,
所述核苷酸序列1中包含位置对应于Z的核苷酸ZA,所述核苷酸序列2中包含位置对应于Z'的核苷酸Z'B,所述Z'B是所述反义链5'末端的第一个核苷酸;
R2是长度为1-20个碳原子的直链亚烷基,其中一个或多个碳原子任选地被选自于以下基团所组成的组中的一个或多个所替换:C(O)、NH、O、S、CH=N、S(O)2、C2-C10亚烯基、C2-C10亚炔基、C6-C10亚芳基、C3-C18亚杂环基和C5-C10亚杂芳基;并且其中R2可任选地具有由以下基团所组成的组中的任何一个或多个的取代基:C1-C10烷基、C6-C10芳基、C5-C10杂芳基、C1-C10卤代烷基、-OC1-C10烷基、-OC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-OH、-OC1-C10卤代烷基、-SC1-C10烷基、-SC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-SH、-SC1-C10卤代烷基、卤素取代基、-OH、-SH、-NH2、-C1-C10烷基-NH2、-N(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-NH(C1-C10烷基)、氰基、硝基、-CO2H、-C(O)O(C1-C10烷基)、-CON(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-CONH(C1-C10烷基)、-CONH2,-NHC(O)(C1-C10烷基)、-NHC(O)(苯基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(C1-C10烷基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(苯基)、-C(O)C1-C10烷基、-C(O)C1-C10烷基苯基、-C(O)C1-C10卤烷基、-OC(O)C1-C10烷基、-SO2(C1-C10烷基)、-SO2(苯基)、-SO2(C1-C10卤代烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-C10烷基)、-SO2NH(苯基)、-NHSO2(C1-C10烷基)、-NHSO2(苯基)和-NHSO2(C1-C10卤代烷基);
每个L1是长度为1-70个碳原子的直链亚烷基,其中一个或多个碳原子任选地被选自于以下基团所组成的组中的一个或多个所替换:C(O)、NH、O、S、CH=N、S(O)2、C2-C10亚烯基、C2-C10亚炔基、C6-C10亚芳基、C3-C18亚杂环基和C5-C10亚杂芳基;并且其中,L1可任选地具有由以下基团所组成的组中的任何一个或多个的取代基:C1-C10烷基、C6-C10芳基、C5-C10杂芳基、C1-C10卤代烷基、-OC1-C10烷基、-OC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-OH、-OC1-C10卤代烷基、-SC1-C10烷基、-SC1-C10烷基苯基、-C1-C10烷基-SH、-SC1-C10卤代烷基、卤素取代基、-OH、-SH、-NH2、-C1-C10烷基-NH2、-N(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-NH(C1-C10烷基)、氰基、硝基、-CO2H、-C(O)O(C1-C10烷基)、-CON(C1-C10烷基)(C1-C10烷基)、-CONH(C1-C10烷基)、-CONH2,-NHC(O)(C1-C10烷基)、-NHC(O)(苯基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(C1-C10烷基)、-N(C1-C10烷基)C(O)(苯基)、-C(O)C1-C10烷基、-C(O)C1-C10烷基苯基、-C(O)C1-C10卤烷基、-OC(O)C1-C10烷基、-SO2(C1-C10烷基)、-SO2(苯基)、-SO2(C1-C10卤代烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-C10烷基)、-SO2NH(苯基)、-NHSO2(C1-C10烷基)、-NHSO2(苯基)和-NHSO2(C1-C10卤代烷基);
表示基团连接至分子其余部分的位点;
M1表示靶向基团。
2.根据权利要求1所述的siRNA缀合物,其中,每个L1独立地选自式A1-A26基团中的一种或多种的连接组合:
其中,j1为1-20的整数;j2为1-20的整数;
R’为C1-C10的烷基;
Ra选自式A27-A45基团或其任意组合所组成的组:
Rb为C1-C10的烷基;或者,
L1选自A1、A4、A5、A6、A8、A10、A11、A13中的一种或多种的连接组合;或者,L1选自A1、A4、A8、A10和A11中至少2个的连接组合;或者,L1选自A1、A8、A10中至少2个的连接组合;或者,
L1的长度为3-25个原子;或者,L1的长度为4-15个原子;或者,
j1为2-10的整数,j2为2-10的整数,R’为C1-C4的烷基,Ra为A27、A28、A29、A30和A31中的一种,Rb为C1-C5的烷基;或者,j1为3-5的整数,j2为3-5的整数,R’为甲基、乙基和异丙基中的一种,Ra为A27或A28,Rb为甲基、乙基、异丙基和丁基中的一种;或者,
n1为1-2的整数,n3为0-1的整数,且n1+n3=2-3;或者,
m1、m2和m3各自独立地为2-5的整数;或者,m1=m2=m3。
3.根据权利要求1或2所述的siRNA缀合物,其中,每个所述靶向基团独立地为与哺乳动物肝细胞表面的去唾液酸糖蛋白受体亲和的配体;或者,每个所述靶向基团独立地为去唾液酸糖蛋白或糖;或者,每个所述靶向基团独立地选自D-吡喃甘露糖、L-吡喃甘露糖、D-***糖、D-呋喃木糖、L-呋喃木糖、D-葡萄糖、L-葡萄糖、D-半乳糖、L-半乳糖、α-D-呋喃甘露糖、β-D-呋喃甘露糖、α-D-吡喃甘露糖、β-D-吡喃甘露糖、α-D-吡喃葡萄糖、β-D-吡喃葡萄糖、α-D-呋喃葡萄糖、β-D-呋喃葡萄糖、α-D-呋喃果糖、α-D-吡喃果糖、α-D-吡喃半乳糖、β-D-吡喃半乳糖、α-D-呋喃半乳糖、β-D-呋喃半乳糖、葡糖胺、唾液酸、半乳糖胺、N-乙酰半乳糖胺、N-三氟乙酰基半乳糖胺、N-丙酰基半乳糖胺、N-正丁酰基半乳糖胺、N-异丁酰基半乳糖胺、2-氨基-3-O-[(R)-1-羧乙基]-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖、2-脱氧-2-甲基氨基-L-吡喃葡萄糖、4,6-二脱氧-4-甲酰胺基-2,3-二-O-甲基-D-吡喃甘露糖、2-脱氧-2-磺氨基-D-吡喃葡萄糖、N-乙醇酰基-α-神经氨酸、5-硫代-β-D-吡喃葡萄糖、2,3,4-三-O-乙酰基-1-硫代-6-O-三苯甲基-α-D-吡喃葡萄糖苷甲酯、4-硫代-β-D-吡喃半乳糖、3,4,6,7-四-O-乙酰基-2-脱氧-1,5-二硫代-α-D-吡喃葡庚糖苷乙酯、2,5-脱水-D-阿洛糖腈、核糖、D-核糖、D-4-硫代核糖、L-核糖、L-4-硫代核糖中的一种;或者,至少一个或每个所述靶向基团为半乳糖或N-乙酰半乳糖胺。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的siRNA缀合物,其中,R10、R11、R12、R13、R14和R15独立地为H、甲基或乙基;或者,
R2上同时含有与含氮骨架上的N连接的位点和与R3中的P连接的位点;或者,
R2上所述与含氮骨架上的N连接的位点与N形成酰胺键,所述与R3中的P连接的位点与P形成磷酸酯键;或者,R2选自B5、B6、B5’或B6’:
其中,表示基团共价键连接的位点,q2为1-10的整数;或者,q2为1-5的整数。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的siRNA缀合物,其中,该缀合物具有式(3)、(4)、(5)、(6)、(7)、(8)、(9)、(10)、(11)、(12)、(13)、(14)、(15)、(16)、(17)、(18)、(19)、(20)、(21)或(22)所示的结构:
6.根据权利要求1-5中任一项所述的siRNA缀合物,其中,式A59中的P连接到siRNA正义链或反义链的端部,所述端部指所述正义链或反义链中从其一端起算的前4个核苷酸;或者,式A59中的P连接到所述siRNA正义链或反义链的末端;或者,式A59中的P连接到所述siRNA正义链的3'末端;或者,式A59中的P通过形成磷酸二酯键而连接至所述siRNA中的核苷酸的2'位、3'位或5'位。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的siRNA缀合物,其中,所述核苷酸序列1与SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列不多于1个核苷酸差异,和/或所述核苷酸序列2与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列不多于1个核苷酸差异;或者,所述核苷酸序列2与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列之间的核苷酸差异包括Z'B位置处的差异,且Z'B选自A、C或G;或者,
ZA是与Z'B互补的核苷酸;或者,
所述核苷酸序列1和所述核苷酸序列2基本上反向互补、实质上反向互补或完全反向互补;所述基本上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于3个的碱基错配;所述实质上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于1个的碱基错配;完全反向互补是指两个核苷酸序列之间没有错配。
8.根据权利要求1-7所述的siRNA缀合物,其中,所述正义链还含有核苷酸序列3,所述反义链还含有核苷酸序列4,所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度各自为1-4个核苷酸,所述核苷酸序列3连接在所述核苷酸序列1的5'末端,并且所述核苷酸序列4连接在所述核苷酸序列2的3'末端,所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4长度相等并且实质上反向互补或完全反向互补;所述实质上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于1个的碱基错配;完全反向互补是指两个核苷酸序列之间没有错配;或者,
所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度均为1个核苷酸,所述核苷酸序列3的碱基为C;或者,所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度均为2个核苷酸,按照5'末端到3'末端的方向,核苷酸序列3的碱基依次为C和C;或者,所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度均为3个核苷酸,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列3的碱基依次为U、C和C;或者,所述核苷酸序列3和所述核苷酸序列4的长度均为4个核苷酸,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列3的碱基依次为C、U、C和C。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的siRNA缀合物,其中,所述siRNA还含有核苷酸序列5,所述核苷酸序列5的长度为1至3个核苷酸,连接在所述反义链的3'末端,从而构成所述反义链的3'突出端;或者,
所述核苷酸序列5的长度为2个核苷酸,并且按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列5为连续的2个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸、连续的2个尿嘧啶核糖核苷酸、或者与靶mRNA互补的两个核苷酸;或者,
所述正义链含有如SEQ ID NO:60所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列:
5’-CAAUAAAGCUGGACAAGAZA-3’(SEQ ID NO:60);
5’-Z'BUCUUGUCCAGCUUUAUUGGG-3’(SEQ ID NO:3);
或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ IDNO:5所示的核苷酸序列:
5’-CCCAAUAAAGCUGGACAAGAZA-3’(SEQ ID NO:4);
5’-Z'BUCUUGUCCAGCUUUAUUGGGAG-3’(SEQ ID NO:5);
其中,所述Z'B是反义链5'末端的第一个核苷酸,ZA选自A、U、G或C,并且Z'B是与ZA互补的核苷酸;或者,
所述siRNA为siAP1或siAP2:
siAP1
正义链:5’-CAAUAAAGCUGGACAAGAA-3’(SEQ ID NO:6);
反义链:5’-UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGG-3’(SEQ ID NO:7);
siAP2
正义链:5’-CCCAAUAAAGCUGGACAAGAA-3’(SEQ ID NO:8);
反义链:5’-UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGGAG-3’(SEQ ID NO:9)。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的siRNA缀合物,其中,所述正义链或所述反义链中的至少一个核苷酸为修饰的核苷酸,和/或至少一个磷酸酯基为具有修饰基团的磷酸酯基;或者,
所述正义链和所述反义链中的每一个核苷酸独立地为氟代修饰的核苷酸或非氟代修饰的核苷酸,氟代修饰的核苷酸指核苷酸的核糖基2'位的羟基被氟取代形成的核苷酸,非氟代修饰的核苷酸指核苷酸的核糖基2'位的羟基被非氟基团取代形成的核苷酸或核苷酸类似物;或者,
所述氟代修饰的核苷酸位于核苷酸序列1和核苷酸序列2中,并且,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列1的第7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸;按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列2的第2、6、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸;或者,
按照5'末端到3'末端的方向,在所述正义链中,所述核苷酸序列1的第7、8、9位或者5、7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述正义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸;在所述反义链中,所述核苷酸序列2的第2、6、14、16位或者2、6、8、9、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述反义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸;或者,
每一个非氟代修饰的核苷酸独立地选自核苷酸的核糖基2'位的羟基被非氟基团取代形成的核苷酸或核苷酸类似物中的一种;或者,
核苷酸的核糖基2'位的羟基被非氟基团取代形成的核苷酸选自2'-烷氧基修饰的核苷酸、2'-经取代的烷氧基修饰的核苷酸、2'-烷基修饰的核苷酸、2'-经取代的烷基修饰的核苷酸、2'-氨基修饰的核苷酸、2'-经取代的氨基修饰的核苷酸、2'-脱氧核苷酸中的一种;核苷酸类似物选自异核苷酸、LNA、ENA、cET、UNA和GNA中的一种;或者,
每一个非氟代修饰的核苷酸均为甲氧基修饰的核苷酸,所述甲氧基修饰的核苷酸指核糖基的2'-羟基被甲氧基取代而形成的核苷酸;或者,
按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的正义链中核苷酸序列1的第5、7、8和9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链的其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸,并且,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的反义链中核苷酸序列2的第2、6、8、9、14和16位的核苷酸为-氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;
或者,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的正义链中核苷酸序列1的第7、8和9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链的其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸,并且,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的反义链中核苷酸序列2的第2、6、14和16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;或者,
所述siRNA为siAP1-M1、siAP2-M1、siAP1-M2、siAP2-M2中的任意一种:siAP1-M1
正义链:
5’-CmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:10)
反义链:
5’-UmUfCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGm-3’(SEQ ID NO:11)
siAP2-M1
正义链:
5’-CmCmCmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:12)
反义链:
5’-UmUfCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmAmGm-3’(SEQ ID NO:13)
siAP1-M2
正义链:
5’-CmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:14)
反义链:
5’-UmUfCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGm-3’(SEQ ID NO:15)
siAP2-M2
正义链:
5’-CmCmCmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SE Q ID NO:16)
反义链:
5’-UmUfCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmAmGm-3’(SEQ ID NO:17)
其中,大写字母C、G、U、A表示核苷酸的碱基组成;小写字母m表示该字母m左侧相邻的一个核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核苷酸为氟代修饰的核苷酸。
11.根据权利要求10所述的siRNA缀合物,其中,所述具有修饰基团的磷酸酯基为具有如式(101)所示结构的硫代磷酸酯基:
或者,
所述siRNA中,硫代磷酸酯基连接存在于由以下位置组成的组中的至少一处:
所述正义链的5'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述正义链的5'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述正义链的3'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述正义链的3'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述反义链的5'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述反义链的5'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述反义链的3'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;以及
所述反义链的3'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;或者,
所述siRNA为siAP1-M1S、siAP2-M1S、siAP1-M2S、siAP2-M2S中的任意一种:
siAP1-M1S
正义链:
5’-CmsAmsAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:18)
反义链:
5’-UmsUfsCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmsGmsGm-3’(SE Q ID NO:19)
siAP2-M1S
正义链:
5’-CmsCmsCmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SE Q ID NO:20)
反义链:
5’-UmsUfsCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmsAmsGm-3’(SEQ ID NO:21)
siAP1-M2S
正义链:
5’-CmsAmsAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:22)
反义链:
5’-UmsUfsCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmsGmsGm-3’(SEQ ID NO:23)
siAP2-M2S
正义链:
5’-CmsCmsCmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:24)
反义链:
5’-UmsUfsCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmsAms Gm-3’(SEQ ID NO:25)
其中,大写字母C、G、U、A表示核苷酸的碱基组成;小写字母m表示该字母m左侧相邻的一个核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核苷酸为氟代修饰的核苷酸;小写字母s表示与该字母s左右相邻的两个核苷酸之间的连接为硫代磷酸酯基连接。
12.根据权利要求1-11中任一项所述的siRNA缀合物,其中,所述反义链的5'末端核苷酸为5'-磷酸核苷酸或5'-磷酸类似物修饰的核苷酸;或者,
所述siRNA为siAP1-M1P1、siAP2-M1P1、siAP1-M2P1、siAP2-M2P1、siAP1-M1SP1、siAP2-M1SP1、siAP1-M2SP1、siAP2-M2SP1中的任意一种:siAP1-M1P1
正义链:
5’-CmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:10)
反义链:
5’-P1-UmUfCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGm-3’(SE Q ID NO:26)siAP2-M1P1
正义链:
5’-CmCmCmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:12)
反义链:
5’-P1-UmUfCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmAmGm-3’(SEQ ID NO:27)
siAP1-M2P1
正义链:
5’-CmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:14)
反义链:
5’-P1-UmUfCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGm-3’(SEQ ID NO:28)
siAP2-M2P1
正义链:
5’-CmCmCmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SE Q ID NO:16)
反义链:
5’-P1-UmUfCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmAmG m-3’(SEQ ID NO:29)
siAP1-M1SP1
正义链:
5’-CmsAmsAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:18)
反义链:
5’-P1-UmsUfsCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmsGmsGm-3’(SEQ ID NO:30)
siAP2-M1SP1
正义链:
5’-CmsCmsCmAmAmUmAfAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SE Q ID NO:20)
反义链:
5’-P1-UmsUfsCmUmUmGfUmCfCfAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmsAms Gm-3’(SEQ ID NO:31)
siAP1-M2SP1
正义链:
5’-CmsAmsAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:22)
反义链:
5’-P1-UmsUfsCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmsGmsGm-3’(SEQ ID NO:32)
siAP2-M2SP1
正义链:
5’-CmsCmsCmAmAmUmAmAmAfGfCfUmGmGmAmCmAmAmGmAmAm-3’(SEQ ID NO:24)
反义链:
5’-P1-UmsUfsCmUmUmGfUmCmCmAmGmCmUmUfUmAfUmUmGmGmGmsA msGm-3’(SEQ ID NO:33)
其中,大写字母C、G、U、A表示核苷酸的碱基组成;小写字母m表示该字母m左侧相邻的一个核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核苷酸为氟代修饰的核苷酸;P1表示该字母P1右侧相邻的一个核苷酸为5'-磷酸核苷酸或5'-磷酸类似物修饰的核苷酸;或者,
所述5'-磷酸核苷酸或5'-磷酸类似物修饰的核苷酸为具有由以下式(102)-式(106)中的一个表示的核苷酸:
其中,R表示选自于由H、OH、F和甲氧基所组成的组的基团;
Base表示选自A、U、C、G或T的碱基。
13.权利要求1-12中任意一项所述的siRNA缀合物在制备用于治疗和/或预防由载脂蛋白C3(ApoC3)的过量表达引起的血脂异常的药物中的用途;
优选的,所述血脂异常为高胆固醇血症、高甘油三酯血症或动脉粥样硬化。
14.一种抑制肝细胞APOC3基因表达的方法,其中,该方法用于非治疗目的并且包括将有效量的权利要求1-12中任意一项所述的siRNA缀合物与所述肝细胞进行接触。
15.一种试剂盒,其中,该试剂盒包含权利要求1-12中任意一项所述的siRNA缀合物。
Applications Claiming Priority (6)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201711249345 | 2017-12-01 | ||
CN2017112493450 | 2017-12-01 | ||
CN201711486999 | 2017-12-29 | ||
CN2017114869995 | 2017-12-29 | ||
PCT/CN2018/118232 WO2019105419A1 (zh) | 2017-12-01 | 2018-11-29 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
CN201880048597.3A CN110997917B (zh) | 2017-12-01 | 2018-11-29 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201880048597.3A Division CN110997917B (zh) | 2017-12-01 | 2018-11-29 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN118291456A true CN118291456A (zh) | 2024-07-05 |
Family
ID=66664715
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201880048597.3A Active CN110997917B (zh) | 2017-12-01 | 2018-11-29 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
CN202410311313.2A Pending CN118291456A (zh) | 2017-12-01 | 2018-11-29 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201880048597.3A Active CN110997917B (zh) | 2017-12-01 | 2018-11-29 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US11660347B2 (zh) |
EP (1) | EP3719127A4 (zh) |
JP (1) | JP7365052B2 (zh) |
CN (2) | CN110997917B (zh) |
TW (1) | TW201925471A (zh) |
WO (1) | WO2019105419A1 (zh) |
Families Citing this family (20)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110997919B (zh) | 2017-12-01 | 2024-04-02 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 双链寡核苷酸、含双链寡核苷酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
WO2019105414A1 (zh) * | 2017-12-01 | 2019-06-06 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
EP3719127A4 (en) | 2017-12-01 | 2021-10-20 | Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. | NUCLEIC ACID, COMPOSITION AND CONJUGATE WITH IT, MANUFACTURING METHOD AND USE |
JP7436030B2 (ja) | 2017-12-29 | 2024-02-21 | スーチョウ リボ ライフ サイエンス カンパニー、リミテッド | 複合体及びその調製方法と使用 |
CN111655849B (zh) | 2018-08-21 | 2024-05-10 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的药物组合物和缀合物及其用途 |
CN111655297A (zh) | 2018-09-30 | 2020-09-11 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 一种siRNA缀合物及其制备方法和用途 |
CN112423795A (zh) * | 2018-12-28 | 2021-02-26 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
CN112423794A (zh) * | 2018-12-28 | 2021-02-26 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
CA3147725A1 (en) * | 2019-08-05 | 2021-02-11 | Arrowhead Pharmaceuticals, Inc. | Methods for the treatment of apoc3-related diseases and disorders |
WO2022028457A1 (zh) * | 2020-08-04 | 2022-02-10 | 上海拓界生物医药科技有限公司 | 抑制凝血因子XI表达的siRNA、组合物及其医药用途 |
WO2023284763A1 (zh) * | 2021-07-16 | 2023-01-19 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 双链寡核苷酸、含双链寡核苷酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
KR20240034787A (ko) * | 2021-07-16 | 2024-03-14 | 쑤저우 리보 라이프 사이언스 컴퍼니, 리미티드 | 핵산, 이를 함유하는 조성물 및 접합체, 제조 방법 및 용도 |
WO2023011597A1 (en) * | 2021-08-04 | 2023-02-09 | Hepagene Therapeutics (HK) Limited | Ligand conjugates for delivery of therapeutically active agents |
TW202342747A (zh) * | 2021-12-03 | 2023-11-01 | 大陸商中天(上海)生物科技有限公司 | 具有高穩定性和基因沉默活性的小干擾rna分子的修飾模式 |
WO2023109938A1 (zh) * | 2021-12-16 | 2023-06-22 | 上海拓界生物医药科技有限公司 | 一种dsRNA、其制备方法及应用 |
WO2023109945A1 (zh) * | 2021-12-16 | 2023-06-22 | 上海拓界生物医药科技有限公司 | 一种dsRNA、其制备方法及应用 |
TW202334424A (zh) * | 2021-12-16 | 2023-09-01 | 大陸商上海拓界生物醫藥科技有限公司 | 一種dsrna、其製備方法及應用 |
TW202340469A (zh) * | 2022-01-20 | 2023-10-16 | 大陸商上海拓界生物醫藥科技有限公司 | 一種dsrna、其應用及製備方法 |
WO2023246935A1 (zh) * | 2022-06-23 | 2023-12-28 | 安沛治疗有限公司 | 包含喹啉修饰的靶特异性核酸分子 |
WO2024002093A1 (zh) * | 2022-06-27 | 2024-01-04 | 大睿生物医药科技(上海)有限公司 | 抑制载脂蛋白C3表达的siRNA |
Family Cites Families (133)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20030206887A1 (en) | 1992-05-14 | 2003-11-06 | David Morrissey | RNA interference mediated inhibition of hepatitis B virus (HBV) using short interfering nucleic acid (siNA) |
WO2000027795A1 (en) | 1998-11-12 | 2000-05-18 | Invitrogen Corporation | Transfection reagents |
WO2006006948A2 (en) | 2002-11-14 | 2006-01-19 | Dharmacon, Inc. | METHODS AND COMPOSITIONS FOR SELECTING siRNA OF IMPROVED FUNCTIONALITY |
ATE517992T1 (de) | 2002-11-14 | 2011-08-15 | Dharmacon Inc | Funktionelle und hyperfunktionelle sirna |
CN1257284C (zh) | 2003-03-05 | 2006-05-24 | 北京博奥生物芯片有限责任公司 | 一种体外阻断乙肝病毒表达的方法 |
EP2666858A1 (en) | 2003-04-17 | 2013-11-27 | Alnylam Pharmaceuticals Inc. | Modified iRNA agents |
EP1752536A4 (en) | 2004-05-11 | 2008-04-16 | Alphagen Co Ltd | POLYNUCLEOTIDE CAUSING RNA INTERFERENCE AND METHOD OF REGULATING GENE EXPRESSION WITH THE USE OF THE SAME |
US8394947B2 (en) | 2004-06-03 | 2013-03-12 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Positionally modified siRNA constructs |
CA2576233C (en) | 2004-08-10 | 2016-03-15 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Conjugate comprising an antagomir and a ligand |
KR101012595B1 (ko) | 2005-03-09 | 2011-02-07 | 재단법인 목암생명공학연구소 | 작은 간섭 rna 및 이를 포함하는 b형 간염 바이러스 치료용 약학 조성물 |
CN101484588B (zh) | 2006-05-11 | 2013-11-06 | 阿尔尼拉姆医药品有限公司 | 抑制pcsk9基因表达的组合物和方法 |
EP2052079A2 (en) | 2006-07-17 | 2009-04-29 | Sirna Therapeutics Inc. | Rna interference mediated inhibition of proprotein convertase subtilisin kexin 9 (pcsk9) gene expression using short interfering nucleic acid (sina) |
WO2008109369A2 (en) | 2007-03-02 | 2008-09-12 | Mdrna, Inc. | Nucleic acid compounds for inhibiting tnf gene expression and uses thereof |
EP2231195B1 (en) | 2007-12-04 | 2017-03-29 | Arbutus Biopharma Corporation | Targeting lipids |
AU2014208251B2 (en) | 2007-12-04 | 2016-07-14 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Carbohydrate conjugates as delivery agents for oligonucleotides |
CA2713379A1 (en) | 2008-01-31 | 2009-11-05 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Optimized methods for delivery of dsrna targeting the pcsk9 gene |
CN104975020B (zh) | 2008-02-11 | 2020-01-17 | 菲奥医药公司 | 经修饰的RNAi多核苷酸及其用途 |
CN101603042B (zh) | 2008-06-13 | 2013-05-01 | 厦门大学 | 可用于乙型肝炎病毒感染治疗的rna干扰靶点 |
WO2010012244A1 (zh) | 2008-08-01 | 2010-02-04 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 乙型肝炎病毒基因的小核酸干扰靶位点序列和小干扰核酸及组合物和应用 |
MX2011004097A (es) | 2008-10-15 | 2011-07-28 | Isis Pharmaceuticals Inc | Modulacion de la expresion del factor 11. |
JP2012511915A (ja) | 2008-12-17 | 2012-05-31 | コモンウェルス サイエンティフィック アンド インダストリアル リサーチ オーガニゼイション | 鳥類の性別の調節方法 |
EP2405921A4 (en) * | 2009-01-26 | 2013-05-22 | Protiva Biotherapeutics Inc | COMPOSITIONS AND METHODS FOR INACTIVATION OF APOLIPOPROTEIN C-III EXPRESSION |
WO2010101951A1 (en) | 2009-03-02 | 2010-09-10 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Nucleic acid chemical modifications |
US20120083522A1 (en) | 2009-04-15 | 2012-04-05 | Isis Pharmaceuitcals, Inc. | Modulation of inflammatory responses by factor xi |
KR101224828B1 (ko) | 2009-05-14 | 2013-01-22 | (주)바이오니아 | siRNA 접합체 및 그 제조방법 |
WO2010147992A1 (en) | 2009-06-15 | 2010-12-23 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Methods for increasing efficacy of lipid formulated sirna |
MX2011013421A (es) | 2009-06-15 | 2012-03-16 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Arnds formulado con lipido de direccionamiento del gen pcsk9. |
WO2011005786A2 (en) | 2009-07-06 | 2011-01-13 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for enhancing production of a biological product |
WO2011038031A1 (en) | 2009-09-22 | 2011-03-31 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Dual targeting sirna agents |
US8653047B2 (en) | 2010-01-08 | 2014-02-18 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Modulation of angiopoietin-like 3 expression |
CN102140460B (zh) | 2010-01-29 | 2012-12-12 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 小干扰核酸和药物组合物及其制药应用 |
CN102140459B (zh) | 2010-01-29 | 2013-04-03 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 一种小干扰核酸和药物组合物及其制药应用 |
CN102140458B (zh) | 2010-01-29 | 2013-05-22 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 小干扰核酸和药物组合物及其制药应用 |
CN102140461B (zh) | 2010-01-29 | 2012-12-05 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 小干扰核酸和药物组合物及其制药应用 |
SG183374A1 (en) | 2010-02-24 | 2012-09-27 | Arrowhead Res Corp | Compositions for targeted delivery of sirna |
AU2011238501A1 (en) | 2010-04-09 | 2012-08-30 | Merck Sharp & Dohme Corp. | Novel single chemical entities and methods for delivery of oligonucleotides |
KR101869570B1 (ko) | 2010-04-28 | 2018-06-20 | 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 | 변형된 뉴클레오사이드 및 그로부터 제조된 올리고머 화합물 |
WO2011154331A1 (en) | 2010-06-10 | 2011-12-15 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Polymers for delivery of nucleic acids |
CN102344477B (zh) | 2010-07-27 | 2015-04-08 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 一种核苷酸和/或寡核苷酸及其制备方法 |
CN108676800B (zh) | 2010-08-17 | 2022-11-11 | 瑟纳治疗公司 | 使用短干扰核酸(siNA)的乙型肝炎病毒(HBV)基因表达的RNA干扰介导的抑制 |
AU2011302152B2 (en) | 2010-09-15 | 2015-06-11 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Modified iRNA agents |
EP2633046A4 (en) | 2010-10-29 | 2015-05-06 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | COMPOSITIONS AND METHODS FOR INHIBITING PCSK9 GENES |
JP2014508102A (ja) | 2010-11-15 | 2014-04-03 | ライフ テクノロジーズ コーポレーション | アミン含有トランスフェクション試薬ならびにそれを生成および使用するための方法 |
US8501930B2 (en) | 2010-12-17 | 2013-08-06 | Arrowhead Madison Inc. | Peptide-based in vivo siRNA delivery system |
BR122020024394B1 (pt) | 2010-12-29 | 2021-05-11 | F. Hoffmann-La Roche Ag | conjugado e composição farmacêutica |
IL269565B2 (en) | 2011-01-06 | 2024-06-01 | Dyax Corp | KALLIKREIN PLASMA BINDING PROTEINS |
EP3674409A1 (en) | 2011-03-29 | 2020-07-01 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for inhibiting expression of tmprss6 gene |
CN102719434A (zh) | 2011-03-31 | 2012-10-10 | 百奥迈科生物技术有限公司 | 抑制rna干扰脱靶效应的特异性修饰 |
CN102727907B (zh) | 2011-04-13 | 2015-03-11 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 一种小干扰rna药物的给药***和制剂 |
KR20190062511A (ko) * | 2011-04-27 | 2019-06-05 | 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 | 아포지방단백질 ciii (apociii) 발현의 조정 |
EP2723758B1 (en) | 2011-06-21 | 2018-06-20 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Angiopoietin-like 3 (angptl3) irna compostions and methods of use thereof |
ES2690538T3 (es) | 2011-06-30 | 2018-11-21 | Arrowhead Pharmaceuticals, Inc. | Composiciones y métodos para inhibir la expresión génica del virus de la hepatitis B |
CN103073726B (zh) | 2011-10-26 | 2015-09-23 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 嵌段共聚物与液体组合物和核酸制剂及其制备方法和应用 |
EA032088B1 (ru) | 2011-10-27 | 2019-04-30 | Массачусетс Инститьют Оф Текнолоджи | Аминокислотные производные, функционализованные на n-конце, способные образовывать микросферы, инкапсулирующие лекарственное средство |
AU2012327227A1 (en) | 2011-11-07 | 2013-05-23 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Administration of Factor XI antisense oligonucleotides |
AR090905A1 (es) | 2012-05-02 | 2014-12-17 | Merck Sharp & Dohme | Conjugados que contienen tetragalnac y peptidos y procedimientos para la administracion de oligonucleotidos, composicion farmaceutica |
DK2879718T3 (da) | 2012-08-06 | 2023-06-19 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Proces til fremstilling af kulhydratkonjugerede RNA-stoffer |
CN104884618A (zh) | 2012-11-15 | 2015-09-02 | 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 | 寡核苷酸缀合物 |
FR2998748B1 (fr) | 2012-11-23 | 2015-04-10 | Commissariat Energie Atomique | Dispositif et procede de retransmission de donnees dans un commutateur reseau |
JP6574383B2 (ja) | 2012-12-05 | 2019-09-11 | アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッドAlnylam Pharmaceuticals, Inc. | PCSK9iRNA組成物及びその使用方法 |
CA2893801A1 (en) | 2013-01-30 | 2014-08-07 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Lna oligonucleotide carbohydrate conjugates |
PL2970974T3 (pl) | 2013-03-14 | 2018-01-31 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Kompozycje komponentu C5 dopełniacza iRNA i sposoby ich zastosowania |
RU2650510C2 (ru) | 2013-05-01 | 2018-04-16 | Ионис Фармасьютикалз, Инк. | Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина c-iii |
TW201515650A (zh) | 2013-05-06 | 2015-05-01 | 艾爾妮蘭製藥公司 | 遞送經脂質調配之核酸分子之劑量及方法 |
CN104107437B (zh) | 2013-06-09 | 2015-08-26 | 厦门成坤生物技术有限公司 | 一种用于治疗乙型病毒性肝炎的rna干扰组合物及其制备方法 |
AU2014284152B2 (en) * | 2013-06-21 | 2020-01-23 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for modulation of target nucleic acids |
EP3019595A4 (en) | 2013-07-09 | 2016-11-30 | THERAPEUTIC USES OF A GENERIC CHANGE WITH CRISPR / CAS SYSTEMS | |
CA3177846A1 (en) | 2013-07-11 | 2015-01-15 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotide-ligand conjugates and process for their preparation |
EP3027222A1 (en) | 2013-07-31 | 2016-06-08 | QBI Enterprises Ltd. | Sphingolipid-polyalkylamine-oligonucleotide compounds |
RU2712559C9 (ru) | 2013-08-28 | 2020-10-08 | Ионис Фармасьютикалз, Инк. | Модуляция экспрессии прекалликреина (пкк) |
EP3066215B1 (en) | 2013-11-06 | 2019-04-24 | The United States of America, represented by the Secretary, Department of Health and Human Services | Method for subtyping lymphoma types by means of expression profiling |
PL3087183T3 (pl) | 2013-12-24 | 2021-01-11 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Modulacja ekspresji białka angiopoetynopodobnego 3 |
KR20220107077A (ko) | 2014-01-21 | 2022-08-01 | 다케다 파머수티컬 컴패니 리미티드 | 혈장 칼리크레인 결합 단백질 및 유전성 혈관부종을 치료하는 데 있어서의 이의 용도 |
WO2015113922A1 (en) | 2014-01-30 | 2015-08-06 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Poly oligomer compound with biocleavable conjugates |
WO2015148580A2 (en) * | 2014-03-25 | 2015-10-01 | Arcturus Therapeutics, Inc. | Una oligomers having reduced off-target effects in gene silencing |
EP3862362A3 (en) | 2014-05-01 | 2021-10-27 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Conjugates of modified antisense oligonucleotides and their use for modulating pkk expression |
BR112016024850B1 (pt) | 2014-05-01 | 2021-07-06 | Ionis Pharmaceuticals, Inc | compostos e composições para modulação da expressão de angptl3 e seus usos |
CN107109405A (zh) | 2014-06-06 | 2017-08-29 | 索尔斯蒂斯生物有限公司 | 具有生物可逆性和非生物可逆性基团的多核苷酸构建体 |
WO2016011123A1 (en) * | 2014-07-16 | 2016-01-21 | Arrowhead Research Corporation | Organic compositions to treat apoc3-related diseases |
SG11201701166UA (en) | 2014-08-20 | 2017-03-30 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Modified double-stranded rna agents |
CN104232644B (zh) | 2014-09-03 | 2016-10-12 | 浙江大学 | 一种特异抑制XOR基因表达的siRNA及其应用 |
JOP20200092A1 (ar) | 2014-11-10 | 2017-06-16 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | تركيبات iRNA لفيروس الكبد B (HBV) وطرق لاستخدامها |
CN113846101A (zh) * | 2014-11-17 | 2021-12-28 | 阿尔尼拉姆医药品有限公司 | 载脂蛋白C3(APOC3)iRNA组合物及其使用方法 |
SG10202013032YA (en) | 2014-12-15 | 2021-02-25 | Univ Emory | Phosphoramidates for the treatment of hepatitis b virus |
US10036017B2 (en) | 2015-02-17 | 2018-07-31 | Dicerna Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions for the specific inhibition of complement component 5(C5) by double-stranded RNA |
MX2017011422A (es) | 2015-03-17 | 2017-11-10 | Arrowhead Pharmaceuticals Inc | Composiciones y metodos para inhibir la expresion del gen del factor xii. |
CA2979998A1 (en) | 2015-03-20 | 2016-09-29 | Protiva Biotherapeutics, Inc. | Compositions and methods for treating hypertriglyceridemia |
CA2982450A1 (en) | 2015-04-13 | 2016-10-20 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Angiopoietin-like 3 (angptl3) irna compositions and methods of use thereof |
AU2016257996A1 (en) | 2015-05-06 | 2017-10-26 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Factor XII (Hageman Factor) (F12), Kallikrein B, Plasma (Fletcher Factor) 1 (KLKB1), and Kininogen 1 (KNG1) iRNA compositions and methods of use thereof |
CN104922141B (zh) | 2015-05-28 | 2016-05-25 | 厦门成坤生物技术有限公司 | 一种用于治疗乙型病毒性肝炎的siRNA组合物 |
EP3315608B1 (en) | 2015-06-26 | 2020-09-16 | Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. | Sirna, pharmaceutical composition and conjugate which contain sirna, and uses thereof |
CA2996722A1 (en) | 2015-07-17 | 2017-01-26 | Arcturus Therapeutics, Inc. | Compositions and agents against hepatitis b virus and uses thereof |
TW201718620A (zh) | 2015-07-27 | 2017-06-01 | 阿尼拉製藥公司 | 黃嘌呤脫氫酶(XDH)iRNA組成物及其使用方法 |
EP3329003A2 (en) | 2015-07-29 | 2018-06-06 | Arbutus Biopharma Corporation | Compositions and methods for silencing hepatitis b virus gene expression |
WO2017027350A2 (en) | 2015-08-07 | 2017-02-16 | Arrowhead Pharmaceuticals, Inc. | Rnai therapy for hepatitis b virus infection |
CN114469984A (zh) | 2015-08-25 | 2022-05-13 | 阿尔尼拉姆医药品有限公司 | 用于治疗前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶kexin(pcsk9)基因相关障碍的方法和组合物 |
WO2017055627A1 (en) | 2015-10-02 | 2017-04-06 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Apoc3 mutations for the diagnosis and therapy of hereditary renal amyloidosis disease |
EP3387129A1 (en) | 2015-12-10 | 2018-10-17 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | STEROL REGULATORY ELEMENT BINDING PROTEIN (SREBP) CHAPERONE (SCAP) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF |
US10883107B2 (en) | 2016-01-08 | 2021-01-05 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Polynucleotide agents targeting factor XII (hageman factor) (F12) and methods of use thereof |
JP6853193B2 (ja) | 2016-01-29 | 2021-03-31 | 協和キリン株式会社 | 核酸複合体 |
MA45295A (fr) | 2016-04-19 | 2019-02-27 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Composition d'arni de protéine de liaison de lipoprotéines haute densité (hdlbp/vigiline) et procédés pour les utiliser |
KR20220148299A (ko) | 2016-04-28 | 2022-11-04 | 리제너론 파아마슈티컬스, 인크. | 가족성 고콜레스테롤혈증을 지닌 환자를 치료하는 방법 |
JOP20170161A1 (ar) | 2016-08-04 | 2019-01-30 | Arrowhead Pharmaceuticals Inc | عوامل RNAi للعدوى بفيروس التهاب الكبد ب |
AU2017312116A1 (en) | 2016-08-17 | 2019-03-07 | Solstice Biologics, Ltd. | Polynucleotide constructs |
EP3506913A4 (en) | 2016-09-02 | 2020-06-10 | Arrowhead Pharmaceuticals, Inc. | TARGETING LIGANDS |
AU2017346879B2 (en) | 2016-10-18 | 2023-11-30 | Novartis Ag | Methods for preventing cardiovascular events through proprotein convertase subtilisin kexin 9 (PCSK9) protein reduction |
CN113652431A (zh) | 2016-12-21 | 2021-11-16 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种小干扰核酸和药物组合物及其用途 |
CN108239644B (zh) * | 2016-12-23 | 2021-05-28 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种小干扰核酸和药物组合物及其用途 |
CN108265052B (zh) | 2016-12-30 | 2021-05-28 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种小干扰核酸和药物组合物及其用途 |
AU2018213379A1 (en) | 2017-01-30 | 2019-07-18 | Arrowhead Pharmaceuticals Inc. | Compositions and methods for inhibition of factor XII gene expression |
WO2018191278A2 (en) | 2017-04-11 | 2018-10-18 | Arbutus Biopharma Corporation | Targeted compositions |
CN108929870B (zh) | 2017-05-19 | 2020-01-24 | 百奥迈科生物技术有限公司 | 抑制HBV的siRNA分子及其应用 |
TW201908483A (zh) * | 2017-06-02 | 2019-03-01 | 新加坡商波濤生命科學有限公司 | 寡核苷酸組合物及其使用方法 |
WO2019105414A1 (zh) | 2017-12-01 | 2019-06-06 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
JP7273417B2 (ja) | 2017-12-01 | 2023-05-15 | スーチョウ リボ ライフ サイエンス カンパニー、リミテッド | 核酸、当該核酸を含む組成物および複合体ならびに調製方法と使用 |
CN111050807B (zh) | 2017-12-01 | 2024-05-28 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
WO2019105403A1 (zh) | 2017-12-01 | 2019-06-06 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
EP3719127A4 (en) | 2017-12-01 | 2021-10-20 | Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. | NUCLEIC ACID, COMPOSITION AND CONJUGATE WITH IT, MANUFACTURING METHOD AND USE |
CN110997919B (zh) * | 2017-12-01 | 2024-04-02 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 双链寡核苷酸、含双链寡核苷酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
EP3719125A4 (en) | 2017-12-01 | 2021-09-08 | Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. | NUCLEIC ACID, COMPOSITION AND CONJUGATE IN CONTAINER, AND PROCESS FOR PREPARATION AND USE |
JP7436030B2 (ja) | 2017-12-29 | 2024-02-21 | スーチョウ リボ ライフ サイエンス カンパニー、リミテッド | 複合体及びその調製方法と使用 |
CN111655849B (zh) | 2018-08-21 | 2024-05-10 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的药物组合物和缀合物及其用途 |
CN111655297A (zh) | 2018-09-30 | 2020-09-11 | 苏州瑞博生物技术有限公司 | 一种siRNA缀合物及其制备方法和用途 |
US20220062323A1 (en) | 2018-11-02 | 2022-03-03 | Arbutus Biopharma Corporation | Bivalent targeted conjugates |
CN112423795A (zh) | 2018-12-28 | 2021-02-26 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
CN112423794A (zh) * | 2018-12-28 | 2021-02-26 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
CN113330117B (zh) | 2019-01-18 | 2024-05-28 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 |
CN111979237A (zh) | 2019-05-22 | 2020-11-24 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 核酸、含有该核酸的药物组合物与siRNA缀合物及制备方法和用途 |
CN111973618B (zh) | 2019-05-23 | 2024-02-02 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 核酸、药物组合物与siRNA缀合物及制备方法和用途 |
CN111973617A (zh) | 2019-05-23 | 2020-11-24 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途 |
CN111973619B (zh) | 2019-05-23 | 2024-01-30 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 核酸、含有该核酸的药物组合物与siRNA缀合物及制备方法和用途 |
WO2020238763A1 (zh) | 2019-05-24 | 2020-12-03 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途 |
CN113795582B (zh) | 2019-05-24 | 2024-05-24 | 苏州瑞博生物技术股份有限公司 | 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途 |
-
2018
- 2018-11-29 EP EP18883982.3A patent/EP3719127A4/en active Pending
- 2018-11-29 US US16/758,532 patent/US11660347B2/en active Active
- 2018-11-29 CN CN201880048597.3A patent/CN110997917B/zh active Active
- 2018-11-29 JP JP2020529410A patent/JP7365052B2/ja active Active
- 2018-11-29 WO PCT/CN2018/118232 patent/WO2019105419A1/zh unknown
- 2018-11-29 CN CN202410311313.2A patent/CN118291456A/zh active Pending
- 2018-11-30 TW TW107143005A patent/TW201925471A/zh unknown
-
2023
- 2023-04-17 US US18/301,845 patent/US20230355775A1/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN110997917B (zh) | 2024-04-09 |
WO2019105419A1 (zh) | 2019-06-06 |
EP3719127A1 (en) | 2020-10-07 |
CN110997917A (zh) | 2020-04-10 |
US20230355775A1 (en) | 2023-11-09 |
US20200360522A1 (en) | 2020-11-19 |
TW201925471A (zh) | 2019-07-01 |
JP7365052B2 (ja) | 2023-10-19 |
US11660347B2 (en) | 2023-05-30 |
EP3719127A4 (en) | 2021-10-20 |
JP2021503929A (ja) | 2021-02-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN110997917B (zh) | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN110945130B (zh) | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN110944675B (zh) | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN110945131B (zh) | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN110997919B (zh) | 双链寡核苷酸、含双链寡核苷酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN110945132B (zh) | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN111050807B (zh) | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN116375774A (zh) | 缀合物及其制备方法和用途 | |
WO2020135673A1 (zh) | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN111973618B (zh) | 核酸、药物组合物与siRNA缀合物及制备方法和用途 | |
CN111973619B (zh) | 核酸、含有该核酸的药物组合物与siRNA缀合物及制备方法和用途 | |
CN113330117B (zh) | 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN111377985B (zh) | 化合物和缀合物及其制备方法和用途 | |
CN113795582B (zh) | 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN118256498A (zh) | 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN113795280B (zh) | 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN113891939B (zh) | 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN113614230B (zh) | 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途 | |
CN111377984B (zh) | 化合物和缀合物及其制备方法和用途 | |
CN113811613B (zh) | 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination |