CN115916805A - 具有延伸的氧化还原酶基序的免疫原性肽 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及包含活性提高的氧化还原酶基序和MHC II类T细胞表位的免疫原性肽,及其在对象中调节免疫应答的用途。
Description
背景技术
已经描述了数种策略以防止产生针对抗原的不期望的免疫应答。WO2008/017517描述了使用包含氧化还原酶基序和给定抗原蛋白质的MHC II类抗原的肽的新策略。这些肽将CD4+T细胞转化为具有溶细胞特性的细胞类型,称为溶细胞性CD4+T细胞。这些细胞能够通过触发凋亡来杀伤呈递该肽所源自的抗原的那些抗原呈递细胞(antigen presentingcell,APC)。WO2008/017517表明了用于***反应和自身免疫病(例如I型糖尿病)的这一概念。在此,胰岛素可用作自身抗原。
WO2009101207和Carlier et al.(2012)Plos one 7,10e45366更详细地进一步描述了抗原特异性溶细胞性CD4+细胞。
WO2016059236还公开了包含MHC II类表位的经修饰肽,其中在氧化还原酶基序的附近存在另外的组氨酸。WO2018162498公开了用于治疗糖尿病的包含HCPYC氧化还原酶基序和胰岛素MHC II类T细胞表位的肽。
两种策略均建立于[CST]XXC(SEQ ID NO:1)或CXX[CST](SEQ ID NO:2)类型的4种氨基酸氧化还原酶基序的使用,其中C代表半胱氨酸残基,[CST]代表半胱氨酸、丝氨酸或苏氨酸残基中的任一种以及X代表任何氨基酸残基。为了提高使用这样的免疫原性肽进行治疗的效力,继续寻求更多的活性肽和/或更强效的氧化还原酶基序。
发明概述
本发明提供了新的免疫原性肽,其包含抗原的MHC II类T细胞表位和氧化还原酶氨基酸基序,其中不是碱性氨基酸例如R、K和H并且不是A、D和E的任何氨基酸可紧接在所述基序的N端或C端存在,或者通过一种或更多种另外的氨基酸的存在间接地与所述基序的N端或C端相邻。
本发明涉及以下方面:
方面1:免疫原性肽,所述免疫原性肽包含:
a)氧化还原酶氨基酸基序,
b)抗原蛋白质的T细胞表位,以及
c)在a)与b)之间的0至7个氨基酸的接头,
其中:所述氧化还原酶基序具有以下序列:
Z(B)n[CST]XmC-(SEQ ID NO:96至109)或Z(B)nCXm[CST]-(SEQ ID NO;110至123);
其中Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但优选不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也优选不是氨基酸D(天冬氨酸)、E(谷氨酸)和/或A(丙氨酸);
其中(B)为任何氨基酸序列;
其中n为0至2的整数;
其中X为任何氨基酸;
其中m为0至4的整数,优选其中m为1、2或3,更优选其中m为2;
其中所述氧化还原酶基序中的连字符(-)表示所述氧化还原酶基序与所述表位(b)或所述接头(c)的N端末端或者与所述表位(b)或所述接头(c)的C端末端的连接点。
在一个实施方案中,Z不是W。
在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
方面2:根据方面1所述的免疫原性肽,
其中在所述氧化还原酶基序中:
Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也不是氨基酸A(丙氨酸)、D(天冬氨酸)、和/或E(谷氨酸);并且其中所述T细胞表位为MHC II类表位。
在一个实施方案中,本发明不包括包含作为NKT和MHC II类T细胞表位二者的表位的免疫原性肽。
在一些优选实施方案中,Z选自:W、G、S、T、C、V、L、I、M、P、F、Y、N和Q,最优选Z为P、W或G。
在一个实施方案中,Z不是W。
在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
方面3:根据方面1或2所述的免疫原性肽,其中Z选自包含氨基酸G(甘氨酸)、I(异亮氨酸)、L(亮氨酸)、P(脯氨酸)和V(缬氨酸)的组。
方面4:根据方面1或2所述的免疫原性肽,其中Z选自包含氨基酸W(色氨酸)、F(苯丙氨酸)和Y(酪氨酸)的组。
方面5:根据方面1或2所述的免疫原性肽,其中Z选自包含氨基酸S(丝氨酸)和T(苏氨酸)的组。
方面6:根据方面1或2所述的免疫原性肽,其中Z为M(甲硫氨酸)。
方面7:根据方面1或2所述的免疫原性肽,其中Z选自包含氨基酸N(天冬酰胺)和Q(谷氨酰胺)的组。
方面8:根据方面1至7中任一项所述的免疫原性肽,其中X是除C(半胱氨酸)、S(丝氨酸)或T(苏氨酸)之外的任何氨基酸。
方面9:根据方面1至8中任一项所述的免疫原性肽,其中一个或更多个X为碱性氨基酸,优选其中所述一个X为R,例如在根据方面1或2所述的下式中任一项的基序中:Z(B)nCRC(SEQ ID NO:3至5)、Z(B)nCRXC(SEQ ID NO:6至8)或Z(B)nCRXXC(SEQ ID NO:9至11)。
方面10:根据方面1所述的免疫原性肽,其中抗原蛋白质的所述T细胞表位为NKT细胞表位。
方面11:根据方面10所述的免疫原性肽,其中所述表位的长度为7至30个氨基酸,优选7至25个氨基酸,更优选7至20个氨基酸。
方面12:根据方面10或11所述的免疫原性肽,其长度为10至50个氨基酸,优选10至40个氨基酸,更优选10至30个氨基酸,例如长度为11至50个氨基酸,优选11至40个氨基酸,更优选11至30个氨基酸。
方面13:根据方面2至9中任一项所述的免疫原性肽,其中所述表位的长度为9至30个氨基酸,优选9至25个氨基酸,更优选9至20个氨基酸。
方面14:根据方面2至9或13中任一项所述的免疫原性肽,其长度为12至50个氨基酸,优选12至40个氨基酸,更优选12至30个氨基酸。
方面15:根据方面1至14中任一项所述的免疫原性肽,其中所述抗原蛋白质是自身抗原、可溶性同种因子(soluble allofactor)、由移植物脱落的同种抗原、胞内病原体的抗原、用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的抗原、肿瘤相关抗原或变应原。
方面16:根据方面1至15中任一项所述的免疫原性肽,其中所述接头为0至4个氨基酸。
方面17:根据方面1至16中任一项所述的免疫原性肽,其中所述氧化还原酶基序不天然存在于所述抗原蛋白质中处于T细胞表位的N端或C端11个氨基酸的区域之内。
方面18:根据方面1至17中任一项所述的免疫原性肽,其中所述T细胞表位不天然包含所述氧化还原酶基序。
方面19:根据方面2至9或13至18中任一项所述的免疫原性肽,其中所述基序中的至少一个X为P或Y,或者其中所述氧化还原酶基序选自包含以下的组:Z(B)nCPYC(SEQ IDNO:12至14);Z(B)nCGHC(SEQ ID NO:15至17);Z(B)nCHGC(SEQ ID NO:18至20);Z(B)nCRLC(SEQ ID NO:21至23);Z(B)nCGFC(SEQ ID NO:24至26);Z(B)nCHPC(SEQ ID NO:27至29);Z(B)nCGPC(SEQ ID NO:30至32);Z(B)nCC(SEQ ID NO:33至35);Z(B)nCRC(SEQ ID NO:36至38);Z(B)nCKC(SEQ ID NO:39至41);Z(B)nCRPYC(SEQ ID NO:42至44);Z(B)nCKPYC(SEQ IDNO:45至47);Z(B)nCRGHC(SEQ ID NO:48至50);Z(B)nCKGHC(SEQ ID NO:51至53);Z(B)nCRHGC(SEQ ID NO:54至56);Z(B)nCKHGC(SEQ ID NO:57至59);Z(B)nCRRLC(SEQ ID NO:60至62);Z(B)nCKRLC(SEQ ID NO:63至65);Z(B)nCRGFC(SEQ ID NO:66至68);Z(B)nCKGFC(SEQID NO:69至71);Z(B)nCRHPC(SEQ ID NO:72至74);Z(B)nCKHPC(SEQ ID NO:75至77);Z(B)nCRGPC(SEQ ID NO:78至80);以及Z(B)nCKGPC(SEQ ID NO:81至83)。
方面20:在方面2至9或13至19中任一项所述的一个优选实施方案中,所述免疫原性肽包含以下序列中的任一者:
Z(B)n-CPYC-GW-YRSPFSRVV-HLYR(SEQ ID NO:84至86),
Z(B)n-CPYC-GW-YRSPFSRVV-K(SEQ ID NO:87至89),以及
Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKl-TLF(SEQ ID NO:90至92),
Z(B)n-CPYC-SLQP-LALEGSLQK-RG(SEQ ID NO:93至95),
更优选地,其中在所述序列中的任一项中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
方面21:核酸,其编码根据方面1至20中任一项所述的免疫原性肽,优选地选自分离的脱氧核糖核酸(desoxyribonucleic acid,DNA)、质粒DNA(plasmid DNA,pDNA)、编码DNA(coding DNA,cDNA)、核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)、信使RNA(messenger RNA,mRNA)或其经修饰形式。在一些实施方案中,所述核酸可以是表达盒的一部分,任选地并入可用于基因治疗的(病毒)载体或质粒中,或者可以以包封的或裸露的DNA或RNA的形式存在,以根据药物和基因治疗领域中已知的技术施用。
方面22:根据方面1至20中任一项所述的免疫原性肽或根据方面21所述的核酸,其用于药物,更特别地用于治疗和/或预防以下:自身免疫病、胞内病原体的感染、肿瘤、同种移植排斥、或者针对可溶性同种因子、针对变应原暴露或针对用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的免疫应答。
更特别地,本发明提供了根据方面2至20中任一项所述的免疫原性肽,或编码这样的免疫原性肽的多核苷酸,其用于治疗和/或预防1型糖尿病,其中所述MHC II类T细胞表位是以下的表位:胰岛素(原)、谷氨酸脱羧酶65(glutamic acid decarboxylase 65,GAD65)、胰岛素瘤抗原-2(insulinoma antigen-2,IA-2)、热休克蛋白(heat shock protein,HSP)、胰岛特异性葡萄糖-6-磷酸酶催化亚基相关蛋白(IGRP)、imogen-38锌转运体-8(zinctransporter-8,ZnT8)、胰腺十二指肠同源盒因子1(pancreatic duodenal homeoboxfactor 1,PDX1)、嗜铬粒蛋白A(chromogranin A,CHGA)以及胰岛淀粉样多肽(isletamyloid polypeptide,IAPP)。在一个优选实施方案中,所述表位的最小长度为9个氨基酸,优选9至30个氨基酸,例如9至25或9至20个氨基酸。
更特别地,所述免疫原性肽包含以下序列:Z(B)n-CPYC- SLQP-LALEGSLQK-RG,其中Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
更特别地,本发明提供了根据权利要求2至20中任一项所述的免疫原性肽,或编码这样的免疫原性肽的多核苷酸,其用于治疗或预防脱髓鞘病症,所述脱髓鞘病症由髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein,MOG)自身抗原和/或抗MOG抗体引起或加重,更优选地选自:多发性硬化(Multiple Sclerosis,MS)、视神经脊髓炎(Neuromyelitis Optica,NMO)、视神经炎、急性播散性脑脊髓炎、横贯性脊髓炎、肾上腺脑白质营养不良、消融性白质病和风疹诱导的精神发育迟缓,其中所述MHC II类T细胞表位是髓鞘少突胶质细胞糖蛋白自身抗原的表位。在一个优选实施方案中,所述表位的最小长度为9个氨基酸,优选9至30个氨基酸,例如9至25或9至20个氨基酸。
更特别地,所述免疫原性肽包含序列:Z(B)n-CPYC-VRY- FLRVPSWKI-TLF(SEQ IDNO:90至92)、Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLFK(SEQ ID NO:448至450)或Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLFKK(SEQ ID NO:124至126),其中Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
方面23:用于制备根据方面1至22中任一项所述的免疫原性肽的方法,其包括以下步骤:
(a)提供由所述抗原蛋白质的T细胞表位组成的肽序列,以及
(b)将所述肽序列与所述氧化还原酶基序连接,使得所述基序和所述表位彼此相邻或被至多7个氨基酸的接头隔开。
方面24:用于获得抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞群的方法,所述抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞群针对呈递所述抗原的APC,所述方法包括以下步骤:
-提供外周血细胞;
-使所述细胞与根据方面1至20中任一项所述的免疫原性肽或与根据方面21所述的核酸接触,更特别地所述肽包含:
a)氧化还原酶氨基酸基序,
b)抗原蛋白质的T细胞表位,以及
c)在a)与b)之间的0至7个氨基酸的接头,
其中:所述氧化还原酶基序具有以下序列:
Z(B)n[CST]XmC-(SEQ ID NO:96至109)或Z(B)nCXm[CST]-(SEQ ID NO:110至123;
其中Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但优选不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也优选不是氨基酸D(天冬氨酸)、E(谷氨酸)和/或A(丙氨酸);
其中(B)为任何氨基酸;
其中n为0至2的整数;
其中X为任何氨基酸;
其中m为0至4的整数,优选其中m为1、2或3,更优选其中m为2;
其中所述氧化还原酶基序中的连字符(-)表示所述氧化还原酶基序与所述表位(b)或所述接头(c)的N端末端或者与所述表位(b)或所述接头(c)的C端末端的连接点;以及
-在存在IL-2的情况下扩增所述细胞。
方面25:根据方面24所述的方法,其中在所述氧化还原酶基序中,Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也不是氨基酸A(丙氨酸)、D(天冬氨酸)和/或E(谷氨酸);并且其中所述T细胞表位为MHC II类表位。
在一些优选实施方案中,Z选自:W、G、S、T、C、V、L、I、M、P、F、Y、N和Q,优选其中Z为W、G和P。
在一个实施方案中,本发明不包括包含作为NKT和MHC II类T细胞表位二者的表位的免疫原性肽。
在一个实施方案中,Z不是W。
在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
方面26:用于获得抗原特异性NKT细胞群的方法,所述方法包括以下步骤:
-提供外周血细胞;
-使所述细胞与根据方面1、3至11、13至20中任一项所述的免疫原性肽,或编码所述肽的核酸接触,更特别地所述肽包含:
a)氧化还原酶氨基酸基序,
b)抗原蛋白质的NKT细胞表位,以及
c)在a)与b)之间的0至7个氨基酸的接头
其中:所述氧化还原酶基序具有以下序列:
Z(B)n[CST]XmC-(SEQ ID NO:96至109)或Z(B)nCXm[CST]-(SEQ ID NO:110至123);
其中Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但优选不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也优选不是氨基酸D(天冬氨酸)、E(谷氨酸)和/或A(丙氨酸),并且与所述免疫原性肽的N端或C端末端相对应;
其中(B)为任何氨基酸,其中n为0至2的整数;
其中m为1至4的整数,优选其中m为1、2或3,更优选其中m为2;
其中X为任何氨基酸;
其中所述氧化还原酶基序中的连字符(-)表示所述氧化还原酶基序与所述表位(b)或所述接头(c)的N端末端或者与所述表位(b)或所述接头(c)的C端末端的连接点;
以及
-在存在IL-2的情况下扩增所述细胞。
在一些优选实施方案中,Z选自:G、S、T、C、V、L、I、M、P、F、Y、N和Q,更优选其中Z为P、W或G。
在一个实施方案中,Z不是W。
在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
方面27:用于获得抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞群的方法,所述抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞群针对呈递所述抗原的APC,所述方法包括以下步骤:
-提供根据方面1至9或13至20中任一项所述的免疫原性肽或编码所述肽的多核苷酸,更特别地所述肽包含:
a)氧化还原酶氨基酸基序,
b)抗原蛋白质的MHC II类T细胞表位,以及
c)在a)与b)之间的0至7个氨基酸的接头,
其中:所述氧化还原酶基序具有以下序列:
Z(B)n[CST]XmC-(SEQ ID NO:96至109)或Z(B)nCXm[CST]-(SEQ ID NO:110至123);
其中Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但优选不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也优选不是氨基酸D(天冬氨酸)、E(谷氨酸)和/或A(丙氨酸);
其中(B)为任何氨基酸;
其中n为0至2的整数;
其中X为任何氨基酸;
其中m为0至4的整数,优选其中m为1、2或3,更优选其中m为2;
其中所述氧化还原酶基序中的连字符(-)表示所述氧化还原酶基序与所述表位(b)或所述接头(c)的N端末端或者与所述表位(b)或所述接头(c)的C端末端的连接点;
-将所述肽施用于对象;以及
-从所述对象获得所述抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞群。
在一些优选实施方案中,Z选自:W、G、S、T、C、V、L、I、M、P、F、Y、N和Q,更优选其中Z为G、W或P。
在一个实施方案中,本发明不包括包含作为NKT和MHC II类T细胞表位二者的表位的免疫原性肽。
在一个实施方案中,Z不是W。
在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
方面28:用于获得抗原特异性NKT细胞群的方法,所述方法包括以下步骤:
-提供根据方面1、3至11、13至20中任一项所述的免疫原性肽,或编码所述肽的核酸,更特别地所述肽包含:
a)氧化还原酶基序,
b)抗原蛋白质的NKT细胞表位,以及
c)在a)与b)之间的0至7个氨基酸的接头,
其中Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也不是氨基酸D(天冬氨酸)、E(谷氨酸)和/或A(丙氨酸);
其中(B)为任何氨基酸;
其中n为0至2的整数;
其中X为任何氨基酸;
其中m为0至4的整数,优选其中m为1、2或3,更优选其中m为2;
其中所述氧化还原酶基序中的连字符(-)表示所述氧化还原酶基序与所述表位(b)或所述接头(c)的N端末端或者与所述表位(b)或所述接头(c)的C端末端的连接点;
其中X为任何氨基酸;
其中(B)为任何氨基酸;
-将所述肽施用于对象;以及
-从所述对象获得所述抗原特异性NKT细胞群。
在一些优选实施方案中,Z选自:G、S、T、C、V、L、I、M、P、F、Y、D、E、N和Q,更优选其中Z为G、W或P。
在一个实施方案中,Z不是W。
在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
方面29:可通过方面24至29所述的方法获得的抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞群或NKT细胞群,其用于治疗和/或预防以下:自身免疫病、胞内病原体的感染、肿瘤、同种移植排斥、或者针对可溶性同种因子、针对变应原暴露或针对用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的免疫应答。
方面30:在个体中治疗和/或预防自身免疫病、胞内病原体的感染、肿瘤、同种移植排斥、或者针对可溶性同种因子、针对变应原暴露或针对用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的免疫应答的方法,其包括将根据方面1至20中任一项所述的免疫原性肽、根据方面21所述的核酸或根据方面29所述的细胞群施用于所述个体的步骤。
方面31:在个体中治疗或预防自身免疫病、胞内病原体的感染、肿瘤、同种移植排斥、或者针对可溶性同种因子、针对变应原暴露或针对用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的免疫应答的方法,其包括以下步骤:
-提供所述个体的外周血细胞,
-使所述细胞与根据方面1至20中任一项所述的抗原肽,或根据方面21所述的核酸接触,
-扩增所述细胞,以及
-将所述扩增的细胞施用于所述个体。
方面32:在(人)对象中治疗1型糖尿病的方法,其包括施用治疗有效量的根据方面1至20中任一项所述的免疫原性肽或编码这样的免疫原性肽的多核苷酸,其中所述T细胞表位是以下的MHC II类表位:胰岛素(原)、谷氨酸脱羧酶65(GAD65)、胰岛素瘤抗原-2(IA-2)、热休克蛋白(HSP)、胰岛特异性葡萄糖-6-磷酸酶催化亚基相关蛋白(IGRP)、imogen-38锌转运体-8(ZnT8)、胰腺十二指肠同源盒因子1(PDX1)、嗜铬粒蛋白A(CHGA)以及胰岛淀粉样多肽(IAPP)。在一个优选实施方案中,所述表位的最小长度为9个氨基酸,优选9至30个氨基酸,例如9至25或9至20个氨基酸。
更特别地,所述免疫原性肽包含以下序列:Z(B)n-CPYC- SLQP-LALEGSLQK-RG(SEQID NO:93至95),其中Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
方面33:在(人)对象中治疗或预防由髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(MOG)自身抗原和/或抗MOG抗体引起或加重的脱髓鞘病症的方法,其包括施用治疗有效量的根据方面1至20中任一项所述的免疫原性肽或编码这样的免疫原性肽的多核苷酸,其中所述T细胞表位是髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(MOG)的MHC II类表位。在一个优选实施方案中,所述表位的最小长度为9个氨基酸,优选9至30个氨基酸,例如9至25或9至20个氨基酸。
更优选地选自:多发性硬化(MS)、视神经脊髓炎(NMO)、视神经炎、急性播散性脑脊髓炎、横贯性脊髓炎、肾上腺脑白质营养不良、消融性白质病和风疹诱导的精神发育迟缓。
更优选地,所述免疫原性肽包含序列:Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLF(SEQ IDNO:90至92),Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLFK(SEQ ID NO:448至450)或Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLFKK(SEQ ID NO:124至126),其中Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
在上述方面中任一项的一个实施方案中,本发明不包括包含作为NKT和MHC II类T细胞表位二者的表位的免疫原性肽。
在所述方面中任一项的一个优选实施方案中,接头包含至少1个氨基酸、至少2个氨基酸、至少3个氨基酸或至少4个氨基酸。优选地,所述接头包含1至7个氨基酸,例如2至7个氨基酸、3至7个氨基酸、或4至7个氨基酸。
在所述方面中任一项的另一个实施方案中,X或(B)中的任一者可以是碱性氨基酸。在另一个实施方案中,X或(B)中的任一者是除C、S或T之外的任何氨基酸。在另一个实施方案中,X或(B)中的任一者是除碱性氨基酸之外的任何氨基酸。
本发明的肽的优点是,与现有技术肽相比,已使用这些肽产生的溶细胞性CD4+T细胞具有提高的IFN-γ和sFasL产生。还认为在所述CD4+T细胞中颗粒酶B产生提高。
这些标志物的表达水平提高表明,与现有技术肽相比,本发明的肽产生溶细胞性CD4+T细胞的能力更强。
附图简述
图1:示出了免疫原性肽P91至P108的还原活性的动力学。DTT用作阳性对照,而空白代表测定缓冲液。结果以随时间的相对荧光单位(Relative Fluorescent Units,RFU)表示。在实施例部分详细地描述了该测定。
发明详述
本发明将针对具体实施方案进行描述,但是本发明不限于此并仅由所附权利要求书来限定。权利要求书中的任何引用标记不应被解释为限制范围。仅提供以下术语或定义以帮助理解本发明。除非本文中具体定义,否则本文中使用的所有术语具有如其对于本发明领域技术人员将理解的相同的含义。本文中提供的定义的范围不应被解释为小于本领域普通技术人员所理解的范围。
除非另外指出,否则如对于技术人员将明显的是,可以以自身已知的方式进行并且已经以自身已知的方式进行了未详细具体描述的所有方法、步骤、技术和操作。例如再次参考标准手册,参考以上提及的一般背景技术以及参考其中引用的另外的参考文献。
除非上下文另外明确指出,否则本文中使用的没有数量词修饰的名词包括一个/种和/或更多个/种。当与本文中使用的方面、权利要求或实施方案相关地使用时,术语“任何”是指提及的所述方面、权利要求或实施方案中任何一个(即任一)以及所有组合。
本文中使用的术语“包含”及其变化形式与“包括”及其变化形式或“含有”及其变化形式同义,并且是包含性的或开放式的且不排除另外的、非记载的成员、要素或方法步骤。所述术语还涵盖“基本上由……组成”和“由……组成”的实施方案。
通过端点对数值范围的记载包括各个范围内包括的所有数字和分数,以及所记载的端点。
本文中当涉及可测量值例如参数、量、时间持续时间等时使用的术语“约/大约”意在涵盖指定的值或自指定的值起的+/-10%或更小,优选+/-5%或更小,更优选+/-1%或更小,并且仍更优选+/-0.1%或更小的变化,只要这样的变化适合于在所公开的发明中进行即可。应理解,修饰语“约/大约”所指的值本身也被具体地并且优选地公开。
如在本文中使用的,如在“用于治疗疾病的组合物”中使用的术语“用于”还应公开了相应的治疗方法和相应的用于制造用于治疗疾病的药物的制备用途。
本文中使用的术语“肽”是指包含通过肽键连接的12至200个氨基酸的氨基酸序列的分子,但是其可包含非氨基酸结构。
本文中使用的术语“免疫原性肽”是指具有免疫原性的肽,即包含能够引发免疫应答的T细胞表位的肽。
根据本发明的肽可包含任何常规的20种氨基酸或其经修饰形式,或者可包含通过化学肽合成或通过化学或酶修饰并入的非天然存在的氨基酸。
本文中使用的术语“抗原”是指大分子,通常是蛋白质(具有或不具有多糖)的结构或者由包含一种或更多种半抗原以及包含T或NKT细胞表位的蛋白质组合物构成的结构。
本文中使用的术语“抗原蛋白质”是指包含一个或更多个T或NKT细胞表位的蛋白质。本文中使用的自身抗原或自身抗原蛋白质是指存在于体内的人或动物蛋白质或其片段,其在同一人或动物体内引发免疫应答。
术语“食品或药物抗原蛋白质”是指存在于食品或药物产品(例如疫苗)中的抗原蛋白质。
术语“表位”是指抗原蛋白质的一个或数个部分(其可限定构象表位),其被抗体或其部分(Fab’、Fab2’等)或者呈现于B细胞或T细胞或NKT细胞的细胞表面处的受体特异性识别并结合,并且其能够通过所述结合以诱导免疫应答。
在本发明的上下文中,术语“T细胞表位”是指优势、亚优势或次要的T细胞表位,即抗原蛋白质的一部分,其被在T淋巴细胞的细胞表面处的受体特异性地识别并结合。该术语涵盖本文中定义的NKT细胞表位和MHC II类T细胞表位二者。表位是优势、亚优势还是次要的取决于针对该表位引发的免疫反应。优势性取决于这样的表位在蛋白质的所有可能的T细胞表位中被T细胞识别并能够将其激活的频率。
从抗原蛋白质中鉴定和选择T细胞表位是本领域技术人员已知的。
为了鉴定适合于本发明背景下的表位,通过例如T细胞生物技术测试抗原蛋白质的分离的肽序列,以确定该肽序列是否引发T细胞应答。将发现引发T细胞应答的那些肽序列定义为具有T细胞刺激活性。
人T细胞刺激活性还可通过将从例如患有T1D的个体获得的T细胞与来源于参与T1D的自身抗原的肽/表位一起培养并确定是否响应于该肽/表位而发生T细胞的增殖(如例如通过氚化胸苷的细胞摄取所测量的)来进行测试。可将T细胞对肽/表位的应答的刺激指数作为应答于肽/表位的最大CPM除以对照CPM来计算。等于或大于背景水平两倍的T细胞刺激指数(stimulation index,S.I.)被认为是“阳性”。将阳性结果用于计算受试肽/表位组的每种肽/表位的平均刺激指数。
非天然(或经修饰)的T细胞表位还可任选地针对其与MHC II类分子或CD1d分子的结合亲和力进行测试。这可以以不同的方式进行。例如,通过裂解针对给定II类或CD1d分子呈纯合的细胞获得可溶性HLAII类分子。后者通过亲和色谱进行纯化。将可溶性II类分子或CD1d与经生物素标记的参考肽进行孵育,该肽根据其对该II类分子或CD1d分子的强结合亲和力而产生。然后将待评估II类结合或CD1d结合的肽以不同浓度孵育,并通过添加中性抗生物素蛋白来计算所述肽将参考肽从其II类结合中置换出的能力。
为了通过例如精细映射技术确定最佳的T细胞表位,通过在肽的氨基或羧基端处添加或缺失氨基酸残基来修饰具有T细胞刺激活性并因此包含至少一个T细胞表位(如通过T细胞生物技术所确定)的肽,并对其进行测试,以确定针对经修饰肽的T细胞反应性的变化。如果如通过T细胞生物技术确定的发现在天然蛋白质序列中共享重叠区域的两种或更多种肽具有人T细胞刺激活性,则可产生包含这样的肽的全部或部分的另外的肽,并且这些另外的肽可通过类似的程序进行测试。按照该技术,选择肽并重组或合成产生。T细胞表位或肽基于多种因素来选择,所述因素包括在个体群体中对肽/表位的T细胞应答的强度(例如,刺激指数)和对肽的T细胞应答的频率。
另外地和/或替代地,可使用一种或更多种体外算法来确定抗原蛋白质中的T细胞表位序列。合适的算法包括但不限于描述于以下中的那些:Zhang et al.(2005)NucleicAcids Res 33,W180-W183(PREDBALB);Salomon&Flower(2006)BMC Bioinformatics 7,501(MHCBN);Schuler etal.(2007)Methods Mol.Biol.409,75-93(SYFPEITHI);Donnes&Kohlbacher(2006)Nucleic Acids Res.34,W194-W197(SVMHC);Kolaskar&Tongaonkar(1990)FEBS Lett.276,172-174;Guan et al.(2003)Appl.Bioinformatics 2,63-66(MHCPred)和及Singh and Raghava(2001)Bioinformatics 17,1236-1237(Propred)。更特别地,这样的算法允许预测抗原蛋白质中将适配于MHC II分子的沟中的或与CD1d分子结合的一个或更多个八肽或九肽序列,并且这对于不同的HLA类型也是如此。
术语“MHC”是指“主要组织相容性抗原”。在人中,MHC基因被称为HLA(“人白细胞抗原(human leukocyte antigen)”)基因。尽管没有始终遵循的惯例,但是一些文献使用HLA来指HLA蛋白分子,而MHC指的是编码HLA蛋白的基因。因此,当在本文中使用时,术语“MHC”和“HLA”是等同的。人中的HLA***在小鼠中具有其等同***,即H2***。最深入研究的HLA基因是九种所谓的经典MHC基因:HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DPA1、HLA-DPB1、HLA-DQA1、HLADQB1、HLA-DRA和HLA-DRB1。在人中,MHC分为三个区域:I、II和III类。A、B和C基因属于MHC I类,而六个D基因属于II类。MHC I类分子由包含3个结构域(α1、α2和α3)的单多态链构成,所述单多态链与细胞表面处的β2微球蛋白缔合。II类分子由2条多态链构成,每条多态链包含2条链(α1和α2,以及β1和β2)。
I类MHC分子几乎在所有有核细胞上表达。
在I类MHC分子情况下呈递的肽片段被CD8+T淋巴细胞(溶细胞性T淋巴细胞或CTL(cytolytic T lymphocyte))识别。CD8+T淋巴细胞频繁成熟为溶细胞性效应物,其可裂解携带刺激性抗原的细胞。II类MHC分子主要在活化的淋巴细胞和抗原呈递细胞上表达。CD4+T淋巴细胞(辅助性T淋巴细胞或Th)通过识别由通常存在于抗原呈递细胞(如巨噬细胞或树突细胞)上的II类MHC分子呈递的独特肽片段而活化。CD4+T淋巴细胞增殖并分泌支持抗体介导和细胞介导的应答的细胞因子,例如IL-2、IFN-γ和IL-4。
功能性HLA的特征在于深结合沟,内源性以及外来的、潜在抗原肽与之结合。该沟的特征还在于明确的形状和物理化学特性。HLAI类结合位点是封闭的,因为肽端被钉到沟的末端中。它们还参与了与保守HLA残基的氢键的网络。鉴于这些限制,结合的肽的长度限制于8、9或10个残基。然而,已显示具有多至12个氨基酸残基的肽也能够结合HLA I类。不同HLA复合物的结构的比较确定了其中肽采用相对线性、延伸的构象或者可涉及中央残基从沟中凸出的一般的结合方式。
与HLAI类结合位点相反,II类位点在两端均开放。这允许肽从实际结合区域中延伸,从而在两端“悬垂(hanging out)”。因此,II类HLA可结合可变长度(9个至超过25个氨基酸残基)的肽配体。类似于HLAI类,II类配体的亲和力由“恒定”和“可变”分量决定。恒定部分再次由HLA II类沟中保守性残基与结合的肽的主链之间形成的氢键网络形成。然而,该氢键模式不限于肽的N端和C端残基,而是分布在整个链上。后者很重要,因为其将复合肽的构象限制为严格线性结合方式。这对于所有II类同种异型均是共同的。决定肽结合亲和力的第二分量是可变的,这是由于II类结合位点中的某些多态性位置。不同的同种异型在沟内形成不同的互补袋,从而解释了肽的亚型依赖性选择或特异性。重要地,对II类袋中持有的氨基酸残基的限制通常比对I类的“更柔和”。在不同的HLA II类同种异型之间,肽存在多得多的交叉反应性。适配于MHC II分子的沟中的MHC II类T细胞表位的+/-9个氨基酸(即8、9或10)的序列通常以P1至P9进行编号。表位的N端另外的氨基酸以P-1、P-2等进行编号,表位的C端氨基酸以P+1、P+2等进行编号。被MHC II类分子识别而不被MHC I类分子识别的肽被称为MHC II类限制性T细胞表位。
术语“NKT细胞表位”是指抗原蛋白质的一部分,其被NKT细胞的细胞表面处的受体特异性地识别并结合。特别地,NKT细胞表位是被CD1d分子结合的表位。NKT细胞表位具有通用基序[FWYHT]-X(2)-[VILM]-X(2)-[FWYHT](SEQ ID NO:127)。该通用基序的一些替代形式在位置1和/或位置7处具有可选项[FWYH],因此为[FWYHT]-X(2)-[VILM]-X(2)-[FWYHT](SEQ ID NO:128)。
该通用基序的一些替代形式在位置1和/或位置7处具有可选项[FWYT],[FWYT]-X(2)-[VILM]-X(2)-[FWYT](SEQ ID NO:129)。该通用基序的一些替代形式在位置1和/或位置7具有可选项[FWY],[FWY]-X(2)-[VILM]-X(2)-[FWY](SEQ ID NO:130)。
无论在位置1和/或7处的氨基酸如何,通用基序的一些替代形式在位置4处具有可选项[ILM],例如[FWYH]-X(2)-[ILM]-X(2)-[FWYH](SEQ ID NO:131)或[FWYHT]-X(2)-[ILM]-X(2)-[FWYHT](SEQ ID NO:132)或[FWY]-X(2)-[ILM]-X(2)-[FWY](SEQ ID NO:133)。
可任意通过使用算法例如ScanProsite De Castro E.et al.(2006)NucleicAcids Res.34(Web Server issue):W362-W365,任意通过人工来扫描以上序列基序的序列来确定蛋白质中的CD1d结合基序。
“自然杀伤T”或“NKT(Natural killer T)”细胞构成识别由非经典MHC复合体分子CD1d呈递的抗原的非常规T淋巴细胞的独特子集。本发明描述了NKT细胞的两个子集。I型NKT细胞,也称为不变型NKT细胞(invariant NKT cell,iNKT),是最丰富的。其特征在于存在由不变型α链构成的α-βT细胞受体(T cell receptor,TCR),小鼠中为Valphal4而人中为Valpha24。尽管存在有限数目的β链,但该α链与变化相关。2型NKT细胞具有α-βTCR,但具有多态性α链。然而,明显的是NKT细胞的其他子集存在,其表型仍未完全限定,但其共享被在CD1d分子情况下呈递的糖脂活化的特征。
NKT细胞通常表达自然杀伤(natural killer,NK)细胞受体(包括NKG2D和NK1.1)的组合。NKT细胞是固有免疫***的一部分,所述固有免疫***可通过其在获得完全效应能力之前不需要扩增的事实而区别于适应性免疫***。它们的介质中的大多数是预形成的,并且不需要转录。已表明NKT细胞是针对胞内病原体的免疫应答和肿瘤排斥中的主要参与者。还提倡它们在控制自身免疫病和移植排斥中的作用。
识别单元CD1d分子的结构与MHC I类分子的结构极为相似,包括β-2微球蛋白的存在。其特征在于以两条α链为界并包含高度疏水性残基的深裂口,其接受脂质链。该裂口在两个末端均打开,使其容纳更长的链。CD1d的标准配体是合成的α半乳糖基神经酰胺(alphagalactosylceramide,αGalCer)。然而,已经描述了许多天然的替代配体,包括糖脂和磷脂、存在于髓磷脂中的天然脂质硫苷脂、微生物磷酸肌醇甘露糖苷和α-葡萄糖醛酸神经酰胺。本领域中目前的共识(Matsuda et al(2008),Curr.Opinion Immunol.,20 358-368;Godfrey et al(2010),Nature rev.Immunol 11,197-206)仍然是CD1d仅结合包含脂质链的配体,或者通常由埋入到CD1d中的脂质尾和从CD1d突出的糖残基头基构成的共同结构。
本文中对于本发明上下文中使用的表位所使用的术语“同源物”是指这样的分子:其与天然存在的表位具有至少50%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少98%氨基酸序列同一性,从而维持表位结合抗体或者B和/或T细胞的细胞表面受体的能力。表位的特定同源物对应于在至多3个,更特别地在至多2个,最特别地在1个氨基酸中修饰的天然表位。
本文中对于本发明的肽使用的术语“衍生物”是指这样的分子:其包含至少肽活性部分(即,氧化还原基序和能够引发溶细胞性CD4+T细胞活性的MHC II类表位),以及作为其补充包含可具有不同的目的,例如使肽稳定或改变肽的药动学或药效学特性的补充部分。
本文中使用的两个序列的术语“序列同一性”是指当两个序列进行比对时具有相同核苷酸或氨基酸的位置的数目除以序列中较短者中核苷酸或氨基酸的数目。特别地,序列同一性为70%至80%、81%至85%、86%至90%、91%至95%、96%至100%、或100%。
本文中使用的术语“肽编码多核苷酸(或核酸)”和“编码肽的多核苷酸(或核酸)”是指这样的核苷酸序列:其当在合适的环境中表达时导致产生相关的肽序列或其衍生物或同源物。这样的多核苷酸或核酸包括编码该肽的正常序列,以及能够表达具有所需活性的肽的这些核酸的衍生物和片段。编码根据本发明的肽或其片段的核酸是编码来源于哺乳动物或对应于哺乳动物的肽或其片段、最特别地是人肽片段的序列。这样的多核苷酸或核酸分子可使用自动合成仪和公知的遗传密码的密码子-氨基酸关系容易地制备。这样的多核苷酸或核酸可被并入到表达载体(包括质粒)中,所述载体适合于在合适的宿主例如细菌(例如大肠杆菌(Escherichia coli))、酵母细胞、人细胞、动物细胞或植物细胞中表达多核苷酸或核酸并产生多肽。对于治疗手段,编码本文中公开的免疫原性肽的多核苷酸可以是表达***、表达盒、表达质粒或表达载体***(例如病毒和非病毒表达***)的一部分。已知用于治疗目的的病毒载体是腺病毒、腺相关病毒(adeno-associated viruse,AAV)、慢病毒和逆转录病毒。也可以使用非病毒载体,并且一些非限制性实例包括:基于转座子的载体***,例如来源于Sleeping Beauty(SB)或PiggyBac(PB)的载体***。核酸也可以通过其他载体例如但不限于纳米粒、阳离子脂质、脂质体等递送。
术语“碱性氨基酸”是指像布朗斯特-劳里碱(Bronsted-Lowry base)和路易斯碱(Lewis base)一样发挥作用的任何氨基酸,并且包括天然的碱性氨基酸,例如精氨酸(R)、赖氨酸(K)或组氨酸(H),或者非天然的碱性氨基酸,例如但不限于:
·赖氨酸变体,如Fmoc-β-Lys(Boc)-OH(CAS号219967-68-7)、Fmoc-Orn(Boc)-OH,也称为L-鸟氨酸或鸟氨酸(CAS号109425-55-0)、Fmoc-β-Homolys(Boc)-OH(CAS号203854-47-1)、Fmoc-Dap(Boc)-OH(CAS号162558-25-0)或Fmoc-Lys(Boc)OH(DiMe)-OH(CAS号441020-33-3);
·酪氨酸/苯丙氨酸变体,如Fmoc-L-3PaI-OH(CAS号175453-07-3)、Fmoc-β-HomoPhe(CN)-OH(CAS号270065-87-7);Fmoc-L-β-HomoAla(4-吡啶基)-OH(CAS号270065-69-5)或Fmoc-L-Phe(4-NHBoc)-OH(CAS号174132-31-1);
·脯氨酸变体,如Fmoc-Pro(4-NHBoc)-OH(CAS号221352-74-5)或Fmoc-Hyp(tBu)-OH(CAS号122996-47-8);
·精氨酸变体,如Fmoc-β-Homoarg(Pmc)-OH(CAS号700377-76-0)。
术语“免疫病症”或“免疫疾病”是指其中免疫***的反应导致或维持生物体中的功能障碍或非生理状况的疾病。免疫病症中包括的尤其是变应性病症和自身免疫病。
本文中使用的术语“变应性疾病”或“变应性病症”是指以免疫***针对称为变应原的特定物质(例如花粉、蜇伤、药物或食物)的超敏反应为特征的疾病。***反应是无论何时特应性个体患者遇到其已经对其过敏的变应原时所观察到的体征和症状的集合,这可导致多种疾病,特别是呼吸***疾病和症状(例如支气管哮喘)的发生。存在多种类型的分类,并且大多数变应性病症具有不同的名称,这取决于其在哺乳动物体内发生的位置。“超敏反应”是在个体中在暴露于个体已经变得对其过敏的抗原时而产生的不期望的(有损害的,产生不适的,并且有时是致命的)反应;“速发型超敏反应”取决于IgE抗体的产生,并因此等同于***反应。
术语“自身免疫病”或“自身免疫病症”是指由于生物体无法将其自身组成部分(下至亚分子水平)识别为“自身”而引起生物体针对其自身细胞和组织的异常免疫应答而导致的疾病。该疾病组可分为两种类别:器官特异性疾病和全身性疾病。
“变应原”被定义为在具有预先倾向性的个体,特别是在具有遗传倾向性的个体(特应性)患者中引发IgE抗体产生的物质,通常是大分子或蛋白质组合物。类似的定义示于Liebers et al.(1996)Clin.Exp.Allergy 26,494-516中。
术语“1型糖尿病”(type 1diabetes,T1D)或“糖尿病1型”(也称为“1型糖尿病(type 1diabetes mellitus)”或“免疫介导的糖尿病”或以前称为“幼年型糖尿病”或“胰岛素依赖型糖尿病”)是一种自身免疫病症,其通常在儿童时期在易感个体中发生。T1D发病机制的基础是通过自身免疫机制破坏大多数产生胰岛素的胰腺β细胞。简言之,生物体丧失了针对负责胰岛素产生的胰腺β细胞的免疫耐受,并诱导主要是细胞介导的、与自身抗体产生相关的免疫应答,从而导致β细胞的自我破坏。
在本文中脱髓鞘疾病或病症框架中使用的术语“脱髓鞘”是指包围神经元轴突的髓鞘的损伤和/或降解,其结果是形成病变或斑块。由于脱髓鞘,沿受影响神经的信号传导受损,并可导致神经症状,例如感觉、运动、认知和/或其他神经功能的缺陷。患有髓鞘疾病的患者的具体症状将依赖于疾病和疾病进展状态而变化。这些可包括视力模糊和/或复视、共济失调、阵挛、构音障碍、疲劳、笨拙、手麻痹、轻偏瘫、生殖器感觉缺失、运动失调、感觉异常、眼麻痹、肌肉协调受损、肌无力、感觉丧失、视力受损、神经症状、行走方式(步态)不稳定、痉挛性轻截瘫、失禁、听力障碍、言语障碍等。脱髓鞘疾病可分为中枢神经***脱髓鞘疾病和周围神经***脱髓鞘疾病。或者,脱髓鞘疾病可根据脱髓鞘的原因进行分类:髓磷脂的破坏(脱髓鞘性髓鞘破裂),或髓鞘异常和变性(脱髓鞘性脑白质营养不良)。在本领域中,MS被认为是中枢神经***的脱髓鞘病症(Lubetzki and Stankoff.(2014).Handb ClinNeuro.122,89-99)。这样的脱髓鞘疾病和病症的另一些具体但非限制性实例包括:视神经脊髓炎(NMO)、急性炎性脱髓鞘性多发性神经病(acute inflammatory demyelinatingpolyneuropathy,AIDP)、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病(Chronic inflammatorydemyelinating polyneuropathy,CIDP)、急性横贯性脊髓炎、进行性多灶性白质脑病(progressive multifocal leucoencephalopathy,PML)、急性播散性脑脊髓炎(acutedisseminated encephalomyelitis,ADEM)或其它遗传性脱髓鞘病症。
术语“多发性硬化”,在本文和本领域中缩写为“MS”,其表示影响中枢神经***的自身免疫病。MS被认为是年轻的成年人中最常见的非创伤性致残性疾病(Dobson andGiovannoni,(2019)Eur.j.Neurol.26(1),27-40),以及影响中枢神经***的最常见的自身免疫病症(Berer and Krishnamoorthy(2014)FEBS Lett.588(22),4207-4213)。MS自身可通过从身体到心理到精神的问题的大量不同症状在对象中表现出来。典型的症状包括视力模糊和/或复视、肌无力、一只眼失明以及协调和感觉困难。在大多数情况下,MS可被视为两个阶段的疾病,其中早期炎症导致疾病复发-缓解,并且延迟神经变性导致非复发进展,即继发进展型和原发进展型MS。虽然本领域中正在取得进展,但该疾病的决定性潜在原因迄今仍不明确,并且超过150个单核苷酸多态性与MS易感性相关(International MultipleSclerosis Genetics Consortium Nat Genet.(2013).45(11):1353-60)。已报道,维生素D缺乏、吸烟、紫外线B(ultraviolet B,UVB)暴露、儿童肥胖和感染EB(Epstein-Barr)病毒都有助于疾病发生(Ascherio(2013)Expert Rev Neurother.13(12增刊),3-9)。
因此,MS可被视为是存在于从复发(其中炎症是主要特征)延伸到进展(主要是神经变性)范围内的单个疾病。因此,明显的是,本文中使用的术语多发性硬化涵盖了属于任何种类的疾病过程分类的任何类型的多发性硬化。特别地,本发明被设想作为被诊断或怀疑患有临床孤立综合征(clinically Isolated Syndrome,CIS)、复发-缓解型MS(relapse-remitting MS,RRMS)、继发进展型MS(secondary progressive MS,SPMS)、原发进展型MS(primary progressive MS,PPMS)以及甚至怀疑MS的放射学孤立综合征(radiologyisolated syndrome,RIS)的患者的强效治疗策略。虽然RIS严格来说不被认为是MS的疾病进程,但其用于对在脑和/或脊髓的磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)上显示异常的对象进行分类,该异常对应于MS病变,并且不能通过其他诊断初步解释。CIS是由中枢神经***的炎症和脱髓鞘引起的神经症状的首次病变(根据限定持续超过24小时)。根据RIS,被分类为CIS的对象可能或可能不继续发展为MS,其中在脑MRI上显示出MS样病变的对象更有可能发生MS。RRMS是MS最常见的疾病进程,并且85%的患有MS的对象被诊断为RRMS。鉴于本发明,被诊断为RRMS的患者是优选的患者组。RRMS的特征在于新的或增加的神经症状的发作,或者换言之复发或加重。在RRMS中,所述复发之后是症状的部分或完全缓解期,并且在这些缓解期内没有经历和/或观察到疾病进展。RRMS还可被分为活动性RRMS(复发和/或新的MRI活性的证据)、非活动性RRMS、恶化的RRMS(在复发之后在特定时间段内残疾增加)或未恶化的RRMS。被诊断为部分RRMS的对象将进展至SPMS疾病进程,其特征在于神经功能随时间的进行性恶化,即残疾的累积。可对SPMS进行亚分类,例如活动性SPMS(复发和/或新的MRI活动性)、非活动性SPMS、进展型SPMS(疾病随时间恶化)或非进展型SPMS。最后,PPMS是特征为以下的MS疾病进程:神经功能恶化,并因此从症状发作就有残疾的累积,而没有早期复发或缓解。还可以形成PPMS亚组,例如活动性PPMS(偶尔复发和/或新的MRI活性)、非活动性PPMS、进展型PPMS(疾病随时间恶化的证据,而不论新的MRI活性)和非进展型PPMS。一般而言,MS疾病进程的特征在于在复发和缓解期方面、在严重程度(在复发的情况下)和持续时间二者方面存在显著的对象间差异。
数种疾病改善治疗适合于MS,并因此本发明可用作替代治疗策略,或者与这些现有治疗组合。活性药物成分的一些非限制性实例包括干扰素β-1a、干扰素β-1b、醋酸格拉替雷(glatiramer acetate)、醋酸格拉替雷、聚乙二醇干扰素β-1a、特立氟胺(teriflunomide)、芬戈莫德(fingolimod)、克拉屈滨(cladribine)、西尼莫德(siponimod)、富马酸二甲酯、富马酸地洛西美酯_(diroximel fumarate)、奥扎莫德(ozanimod)、阿仑单抗(alemtuzumab)、米托蒽醌(mitoxantrone)、奥美珠单抗(ocrelizumab)和那他珠单抗(natalizumab)。或者,本发明可用于与旨在复发管理的治疗或药物例如但不限于甲基***龙、***和促肾上腺皮质激素(adrenocorticotropichormone,ACTH)组合。此外,本发明可用于与旨在减轻特定症状的治疗组合。一些非限制性实例包括旨在改善或避免选自以下的症状的药物:膀胱问题、肠功能障碍、抑郁、头晕、眩晕、情绪变化、疲劳、瘙痒、疼痛、性问题、痉挛、震颤和行走困难。
MS的特征在于三个交织在一起的标志性特征:1)中枢神经***中的病变形成,2)炎症,以及3)神经元髓鞘的降解。尽管传统上被认为是中枢神经***和白质的脱髓鞘疾病,但是最近的报道称皮质和深层灰质的脱髓鞘可超过白质脱髓鞘(Kutzelnigg et al.(2005).Brain.128(11),2705-2712)。关于MS是如何在分子水平上引起的已经假设了两个主要的假定。普遍接受的“由外向内假说”是基于外周自身反应效应物CD4+T细胞的活化,所述T细胞迁移至中枢神经***并启动疾病过程。一旦进入中枢神经***,所述T细胞被APC局部重新活化,并募集另外的T细胞和巨噬细胞以形成炎性病变。值得注意的是,MS病变已显示出包含CD8+T细胞(主要存在于病变边缘处)和CD4+T细胞(存在于病变的更中心)。这些细胞被认为引起脱髓鞘、少突胶质细胞破坏和轴突损伤,导致神经功能障碍。另外,免疫调节网络被触发以限制炎症并启动修复,这导致至少部分髓鞘再生,其由临床缓解反映。尽管如此,在没有适当的治疗的情况续爱,进一步的攻击通常导致疾病的进展。
MS发作被认为在检测到第一个临床症状之前很久就开始了,如患者MRI上通常出现明显更老和不活跃的病变所证明的。由于诊断方法发展的进步,MS现在甚至可以在疾病的临床表现(即症状前MS)之前被检测到。在本发明的背景下,“MS的治疗”和类似表达设想了针对症状性MS和症状前MS二者的治疗和治疗策略。特别地,当致耐受性肽和/或致溶细胞性CD4+T细胞被用于治疗症状前MS患者时,疾病被阻止在这样的早期阶段,使得可部分或甚至完全避免临床表现。术语“MS”也涵盖其中对象对干扰素β的治疗没有完全应答的MS。
术语“视神经脊髓炎”或“NMO”和“NMO谱系障碍(NMO Spectrum Disorder,NMOSD)”,也称为“德维克病(Devic’s disease)”,是指其中白细胞和抗体主要攻击视神经和脊髓,但也可攻击脑的自身免疫病(综述于Wingerchuk 2006,Int MS J.2006May;13(2):42-50中)。视神经受损产生肿胀和炎症,其导致疼痛和视力丧失;脊髓受损导致腿或臂无力或瘫痪、感觉丧失以及膀胱和肠道功能问题。NMO是复发-缓解型疾病。在复发期间,视神经和/或脊髓的新的损伤可导致累积性残疾。与MS不同,该疾病没有进展型阶段。因此,防止攻击对于良好的长期结局至关重要。在与抗MOG抗体相关的情况下,认为抗MOG抗体可引触发对髓鞘的攻击,导致脱髓鞘。在大多数情况下,NMO的原因是由对自身抗原的特异性攻击。多至三分之一的对象可对针对称为髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(MOG)的髓鞘的组分的自身抗体呈阳性。患有抗MOG相关NMO的人同样具有横贯性脊髓炎和视神经炎的发作。在本申请的框架内特别设想的是由MOG自身抗原诱导的和/或由抗MOG抗体引起的NMO。许多NMO患者产生针对抗水通道蛋白-4(Aquaporin-4,AQP4)的自身抗体。
术语“治疗有效量”是指在患者中产生期望的治疗或预防作用的本发明的肽或其衍生物的量。例如,对于疾病或病症,其是在某种程度上降低该疾病或病症的一种或更多种症状,并且更特别地使与该疾病或病症相关或为其成因的生理或生物化学参数部分或完全地恢复至正常的量。通常来说,治疗有效量是将导致正常生理状况的改善或恢复的本发明的肽或其衍生物的量。例如,当用于治疗性治疗受免疫病症影响的哺乳动物时,其为每日量肽/所述哺乳动物的kg体重。或者,在通过基因治疗施用的情况下,调节裸DNA或病毒载体的量以确保本发明肽、其衍生物或同源物的相关剂量的局部产生。
当涉及肽时,术语“天然”是指序列与天然存在的蛋白质(野生型或突变体)的片段相同的事实。与此相比之下,术语“人工”是指本身在自然界中不存在的序列。通过有限的修饰,例如在天然存在的序列中改变/缺失/***一个或更多个氨基酸或通过添加/去除天然存在的序列的N端或C端氨基酸来从天然序列获得人工序列。
在这种情况下,已经认识到通常在表位扫描的情况下从抗原产生肽片段。巧合的是,这样的肽可在其序列中包含T细胞表位(MHC II类表位或CD1d结合表位),以及在其附近的具有如本文所限定的经修饰的氧化还原基序的序列。或者,可在所述表位与所述氧化还原酶基序之间具有至多11个氨基酸、至多7个氨基酸、至多4个氨基酸、至多2个氨基酸、或者甚至0个氨基酸(换言之,表位与氧化还原酶基序序列彼此紧邻)的氨基酸序列。在一个优选实施方案中,不要求保护这样的天然存在的肽。
在本文中,氨基酸以其全名、其三字母缩写或其单字母缩写来指代。
氨基酸序列的基序根据Prosite的格式写于本文中。基序用于描述在序列特定部分处的某种序列多样性。符号X或B用于在本文中接受任何氨基酸的位置。符号Z用于在本文中接受不是碱性氨基酸例如R、K或H,或者不是W或A的任何氨基酸的位置。可替代氨基酸可通过在方括号(“[]”)之间列出给定位置的可接受氨基酸来指明。例如:[CST]代表选自Cys、Ser或Thr的氨基酸。被排除为可选项的氨基酸可通过在波形括号(“{}”)之间将其列出来指明。例如:{AM}代表除Ala和Met之外的任何氨基酸。基序中的不同元件任选地由连字符(-)使彼此隔开。为了区分氨基酸,可将氧化还原酶基序之外的那些称为外部氨基酸,将氧化还原基序内的那些称为内部氨基酸。
包含T细胞表位,例如MHC II类T细胞表位或NKT细胞表位(或CD1d结合肽表位)和具有还原活性的经修饰的肽基序序列的肽能够分别产生针对抗原呈递细胞的抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞、溶细胞性NKT细胞的群。
因此,以其最广泛的意义上讲,本发明涉及包含具有触发免疫反应潜能的抗原(自身或非自身)的至少一种T细胞表位(MHC II类T细胞表位或NKT细胞表位)以及对肽二硫键具有还原活性的经修饰的硫还原酶序列基序的肽。T细胞表位和经修饰的氧化还原基序序列可以在肽中彼此紧邻或任选地被一个或更多个氨基酸(所谓的接头序列)隔开。任选地,该肽另外地包含内体靶向序列和/或另外的“侧翼”序列。
本发明的肽包含具有触发免疫反应潜能的抗原(自身或非自身)的T细胞表位和经修饰的氧化还原基序。该肽中基序序列的还原活性可针对其还原巯基的能力来测定,例如在其中胰岛素的溶解度在还原之后改变的胰岛素溶解度测定中,或者用经荧光标记的底物例如胰岛素来测定。这样的测定的一个实例使用荧光肽,并且描述于Tomazzolli et al.(2006)Anal.Biochem.350,105-112中。当具有FITC标记的两个肽通过二硫桥彼此共价连接时,其会自猝灭。在被根据本发明的肽还原之后,还原的单独肽再次变为具有荧光。
经修饰的氧化还原基序可位于T细胞表位的氨基端侧或T细胞表位的羧基端处。
具有还原活性的肽片段见于硫还原酶中,所述硫还原酶是小的二硫化物还原酶,包括谷氧还蛋白、核氧化还原蛋白、硫氧还蛋白和其他硫醇/二硫化物氧化还原酶(Holmgren(2000)Antioxid.Redox Signal.2,811-820;Jacquot et al.(2002)Biochem.Pharm.64,1065-1069)。它们是多功能的、普遍存在的并且存在于许多原核生物和真核生物中。已知它们通过保守性活性结构域共有序列中的氧化还原活性半胱氨酸对蛋白质(例如酶)上的二硫键发挥还原活性,这从例如Fomenko et al.((2003)Biochemistry42,11214-11225;Fomenko et al.(2002)Prot.Science 11,2285-2296)中公知,其中X代表任何氨基酸。以及WO2008/017517包含在位置1和/或4处的半胱氨酸。因此,基序为CXX[CST](SEQ ID NO:2)或[CST]XXC(SEQ ID NO:1)。这样的结构域还存在于较大的蛋白质,例如蛋白质二硫化物异构酶(protein disulfide isomerase,PDI)和磷酸肌醇特异性磷脂酶C中。本发明已经对所述基序进行了重新设计,以寻求更大的效力和活性
如更进一步详细说明的,本发明的肽可通过允许并入非天然氨基酸的化学合成来制备。因此,在以上记载的氧化还原经修饰氧化还原基序中的“C”代表半胱氨酸或具有硫醇基团的另一氨基酸,例如巯基缬氨酸(mercaptovaline)、同型半胱氨酸或其他具有硫醇官能团的天然或非天然的氨基酸。为了具有还原活性,经修饰的氧化还原基序中存在的半胱氨酸不应作为胱氨酸二硫桥的一部分出现。尽管如此,氧化还原经修饰氧化还原基序可包含经修饰的半胱氨酸,例如甲基化半胱氨酸,其在体内被转化为具有游离硫醇基团的半胱氨酸。
肽还可包含修饰以提高稳定性或溶解度,例如N端NH2基团或C端COOH基团的修饰(例如,将COOH修饰成CONH2基团)。
在包含经修饰的氧化还原基序的本发明肽中,基序的位置使得当表位适配于MHC沟或结合CD1d受体时,基序保持在MHC或CD1d受体结合沟的外部。经修饰的氧化还原基序紧邻肽内的表位序列定位[换言之,基序与表位之间存在具有零个氨基酸的接头序列],或者通过包含具有7个氨基酸或更少的氨基酸序列的接头与T细胞表位隔开。更特别地,接头包含1、2、3、4、5、6或7个氨基酸。一些具体实施方案是在表位序列与经修饰的氧化还原基序序列之间存在0、1或2个氨基酸的接头的肽。除肽接头之外,其他有机化合物也可以用作接头,以将肽的各部分彼此连接(例如,将经修饰的氧化还原基序序列与T细胞表位序列连接)。
本发明的肽还可在包含T细胞表位和经修饰的氧化还原基序的序列的N端或C端包含另外的短氨基酸序列。这样的氨基酸序列在本文中通常被称为“侧翼序列”。侧翼序列可位于表位与内体靶向序列之间和/或位于经修饰的氧化还原基序与内体靶向序列之间。在不包含内体靶向序列的某些肽中,短氨基酸序列可存在于肽中经修饰的氧化还原基序和/或表位序列的N端和/或C端。更特别地,侧翼序列是1至7个氨基酸的序列,最特别地是1、2、3、4个氨基酸,最优选2个氨基酸的序列。特别优选的侧翼序列是单或双赖氨酸残基(K或KK)。
经修饰的氧化还原基序可位于表位的N端。或者,经修饰的氧化还原基序可位于表位的C端。
在本发明的某些实施方案中,提供了包含一个表位序列和经修饰的氧化还原基序序列的肽。在另一些具体实施方案中,经修饰的氧化还原基序在肽中出现数次(1、2、3、4或甚至更多次),例如作为可彼此被一个或更多个氨基酸隔开的经修饰的氧化还原基序的重复,或作为彼此紧邻的重复。或者,在T细胞表位序列的N端和C端两处均提供一个或更多个经修饰的氧化还原基序。
针对本发明的肽设想的另一些变体包括包含T细胞表位序列的重复的肽,其中每个表位序列在经修饰的氧化还原基序之前和/或之后(例如“经修饰的氧化还原基序-表位”的重复或“经修饰的氧化还原基序-表位-经修饰的氧化还原基序”的重复)。本文中,经修饰的氧化还原基序全部均可具有相同的序列,但这不是必须的。值得注意的是,包含本身含有经修饰的氧化还原基序的表位的肽的重复序列也将导致包含“表位”和“经修饰的氧化还原基序”二者的序列。在这样的肽中,一个表位序列中的经修饰的氧化还原基序用作在第二表位序列之外的经修饰的氧化还原基序。
通常来说,本发明的肽仅包含一个T细胞表位。如下所述,蛋白质序列中的T细胞表位可通过功能测定和/或二氧化硅预测测定中的一种或更多种来确定。T细胞表位序列中的氨基酸根据其在MHC蛋白结合沟中的位置进行编号。肽中存在的T细胞表位由7至30个氨基酸,例如8至25个氨基酸,还更特别地8至16个氨基酸组成,还最特别地由8、9、10、11、12、13、14、15或16个氨基酸组成。
在一个更具体的实施方案中,T细胞表位由7、8或9个氨基酸的序列组成。在另一个具体实施方案中,T细胞表位是由MHC II类分子呈递至T细胞的表位[MHC II类限制性T细胞表位]。通常来说,T细胞表位序列是指适配于MHC II蛋白的裂隙中的八肽序列或更具体地九肽序列。
在一个更具体的实施方案中,T细胞表位由7、8或9个氨基酸的序列组成。在另一个具体实施方案中,T细胞表位是由CD1d分子呈递的表位[NKT细胞表位]。通常来说,NKT细胞表位序列是指与CD1d蛋白结合并由其呈递的7个氨基酸的肽序列。
本发明肽的T细胞表位可对应于蛋白质的天然表位序列,或者可以是其经修饰形式,只要经修饰的T细胞表位保持其结合在MHC裂隙内或结合CD1d受体的能力即可,类似于天然T细胞表位序列。经修饰的T细胞表位可与天然表位具有相同的针对MHC蛋白或CD1d受体的结合亲和力,但也可具有降低的亲和力。特别地,经修饰肽的结合亲和力小于原始肽的不小于10倍,更特别地不小于5倍。本发明的肽对蛋白质复合物具有稳定作用。因此,肽-MHC或CD1d复合物的稳定作用补偿了经修饰的表位对MHC或CD1d分子的降低的亲和力。
肽中包含T细胞表位和还原性化合物的序列还可与促进肽被摄取到晚期内体中以进行加工并在MHC II类决定簇中呈递的氨基酸序列(或另一有机化合物)连接。晚期内体靶向通过蛋白质的胞质尾中存在的信号介导,并且对应于良好鉴定的肽基序。晚期内体靶向序列允许对抗原来源T细胞表位进行加工并通过MHC II类分子有效呈递。这样的内体靶向序列包含在例如gp75蛋白(Vijayasaradhi et al.(1995)J.Cell.Biol.130,807-820)、人CD3γ蛋白、HLA-BM 11(Copier et al.(1996)J.lmmunol.157,1017-1027)、DEC205受体的胞质尾(Mahnke et al.(2000)J.Cell Biol.151,673-683)中。用作对内体的分拣信号的肽的另一些实例公开于Bonifacio and Traub(2003)Annu.Rev.Biochem.72,395-447的综述中。或者,该序列可以是来自蛋白质的亚优势或次要T细胞表位的序列,其促进晚期内体中的摄取而不克服针对抗原的T细胞应答。晚期内体靶向序列可位于抗原来源肽的氨基端处或羧基端处,以有效摄取和加工,并且也可通过侧翼序列(例如多至10个氨基酸的肽序列)偶联。当出于靶向目的使用次要T细胞表位时,后者通常位于抗原来源肽的氨基端末端处。
或者,本发明涉及包含赋予与CD1d分子结合之能力的疏水性残基的肽的产生。在施用之后,这样的肽被APC摄取,引导至晚期内体,在此它们被装载到CD1d上并呈递在APC表面处。所述疏水性肽的特征在于对应于通用序列[FW]-XX-[ILM]-XX-[FWTH](SEQ ID NO:134)或[FWTH]-XX-[ILM]-XX-[FW](SEQ ID NO:135)的基序,其中位置P1和P7被疏水性残基例如苯丙氨酸(F)或色氨酸(W)占据。然而,P7在其接受苯丙氨酸或色氨酸的替代疏水性残基例如苏氨酸(T)或组氨酸(H)的意义上是允许的。P4位被脂肪族残基例如异亮氨酸(I)、亮氨酸(L)或甲硫氨酸(M)占据。本发明涉及由天然地构成CD1d结合基序的疏水性残基构成的肽。在一些实施方案中,所述基序的氨基酸残基是经修饰的,通常通过用提高与15CD1d结合之能力的残基进行替换来修饰。在一个具体实施方案中,对基序进行修饰以使其与通用基序[FW]-XX-[ILM]-XX-[FWTH](SEQ ID NO:134)更紧密地配合。更特别地,产生肽以在第7位包含F或W。
因此,本发明设想了抗原蛋白质的肽及其在引发特异性免疫反应中的用途。这些肽可对应于在其序列中包含即被至多10个,优选7个氨基酸或更少的氨基酸隔开的还原性化合物和T细胞表位的蛋白质片段。或者,并且对于大多数抗原蛋白质,本发明的肽通过将还原性化合物,更特别地如本文中所述的还原性经修饰氧化还原基序与抗原蛋白质的T细胞表位的N端或C端偶联(与其直接相邻或具有至多10个,更特别至多7个氨基酸的接头)来产生。此外,与天然存在的序列相比,可对蛋白质的T细胞表位序列和/或经修饰的氧化还原基序进行修饰和/或可引入一个或更多个侧翼序列和/或靶向序列(或对其进行修饰)。因此,根据在目的抗原蛋白质的序列中是否可发现本发明的特征,本发明的肽可包含“人工的”或“天然存在的”序列。
本发明的肽的长度可显著变化。肽的长度可以为13或14个氨基酸不等,即由8至9个氨基酸的表位、与其相邻的具有组氨酸的5个氨基酸的经修饰的氧化还原基序组成,多至20、25、30、40或50个氨基酸。例如,肽可包含40个氨基酸的内体靶向序列、约2个氨基酸的侧翼序列、5个氨基酸的如本文中所述的基序、4个氨基酸的接头和9个氨基酸的T细胞表位肽。
因此,在一些具体实施方案中,完整的肽由13个氨基酸多至20、25、30、40、50、75或100个氨基酸组成。更特别地,在还原性化合物是如本文中所述的经修饰的氧化还原基序的情况下,无内体靶向序列的包含任选地通过接头连接的表位和经修饰的氧化还原基序的(人工或天然的)序列(本文中称为“表位-经修饰的氧化还原基序”序列)的长度是至关重要的。“表位-经修饰的氧化还原基序”的长度更特别地为13、14、15、16、17、18或19个氨基酸。这样的13或14至19个氨基酸的肽可任选地与尺寸较不关键的内体靶向信号偶联。
如上所述,在一些具体实施方案中,本发明的肽包含与T细胞表位序列连接的如本文中所述的还原性经修饰的氧化还原基序。
在另一些具体实施方案中,本发明的肽是包含T细胞表位的肽,该T细胞表位不包含其天然序列中具有氧化还原特性的氨基酸序列。
然而,在一些替代实施方案中,T细胞表位可包含确保表位与MHC裂隙或与CD1d分子结合的任何氨基酸序列。在抗原蛋白质的目的表位在其表位序列中包含例如本文中所述的经修饰的氧化还原基序的情况下,根据本发明的免疫原性肽包含如本文中所述的经修饰的氧化还原基序和/或与表位序列N端或C端偶联的另一还原性序列的序列,使得(与埋入在裂隙中的表位中存在的经修饰的氧化还原基序相反),连接的经修饰的氧化还原基序可确保还原活性。
因此,T细胞表位和基序彼此紧邻或彼此隔开,并且不重叠。为了评估“紧邻”或“隔开”的概念,确定适配于MHC裂隙或CD1d分子中的8或9个氨基酸的序列,并确定该八肽或九肽与氧化还原基序四肽或包含组氨酸的经修饰的氧化还原基序五肽之间的距离。
通常,本发明的肽不是天然的(因此无这样的蛋白质片段),而是人工肽,其除T细胞表位之外还包含如本文中所述的经修饰的氧化还原基序,其中经修饰的氧化还原基序通过由多至7个,最特别地多至4个或多至2个氨基酸组成的接头与T细胞表位直接隔开。
已经显示,在向哺乳动物施用(即注射)包含氧化还原酶基序和MHC II类T细胞表位的肽(或包含这样的肽的组合物)之后,该肽引发识别抗原来源T细胞表位的T细胞的活化,并通过还原表面受体向T细胞提供另外的信号。这种超最佳活化产生获得针对呈递T细胞表位的细胞的溶细胞特性以及针对旁观者T细胞的抑制特性的T细胞。
另外,已经显示,在向哺乳动物施用(即注射)包含氧化还原酶基序和NKT细胞表位的肽(或包含这样的肽的组合物)之后,该肽引发识别抗原来源T细胞表位的T细胞的活化,并通过与CD1d表面受体结合而向T细胞提供另外的信号。这种活化产生获得针对呈递T细胞表位的细胞的溶细胞特性的NKT细胞。以该方式,本发明中所述的包含抗原来源的T细胞表位和在表位之外的经修饰氧化还原基序的肽或包含所述肽的组合物可用于哺乳动物(包括人)的直接免疫接种。因此,本发明提供了用作药物的本发明的肽或其衍生物。因此,本发明提供了包括将一种或更多种根据本发明的肽施用于有此需要的患者的治疗方法。
本发明提供了这样的方法,通过该方法,可通过用小肽进行免疫接种来引发赋有溶细胞特性的抗原特异性T细胞。已经发现包含以下的肽分别引发溶细胞性CD4+T细胞或NKT细胞:(i)编码来自抗原的T细胞表位的序列和(ii)具有氧化还原特性的共有序列,以及所述肽进一步任选地还包含促进该肽被摄取到晚期内体中以进行有效MHC II类呈递或CD1d受体结合的序列。
在治疗和预防免疫反应中,本发明的肽的免疫原性特性是特别令人感兴趣的。
本文中所述的肽用作药物,更特别地用于制造用于在哺乳动物中,更特别地在人中预防或治疗免疫病症的药物。
本发明描述了通过使用本发明的肽、其同源物或衍生物来治疗或预防需要这样的治疗或预防的哺乳动物的免疫病症的方法,所述方法包括将治疗有效量的本发明的肽、其同源物或衍生物施用于患有免疫病症或处于免疫病症风险之中的所述哺乳动物例如以减轻免疫病症的症状的步骤。设想了对人和动物(例如宠物和农场动物)二者的治疗。在一个实施方案中,待治疗的哺乳动物是人。以上提及的免疫病症在一个具体实施方案中选自变应性疾病和自身免疫病。
本发明的肽或包含如本文中所限定的这样的肽的药物组合物优选地通过皮下或肌内施用来施用。优选地,可将肽或包含这样的肽的药物组合物皮下(sub-cutaneously,SC)注射在上臂(肘与肩之间中部)的侧部的区域中。当需要两次或更多次分开的注射时,其可伴随地在两臂中进行施用。
根据本发明的肽或包含这样的肽的药物组合物以治疗有效剂量施用。一些示例性但非限制性的剂量方案为50至1500μg,优选100至1200μg。一些更具体的剂量方案可以为50至250μg、250至450μg、或850至1300μg,这取决于患者的状况和疾病的严重程度。剂量方案可包含以单剂量或以2、3、4、5或更多剂量同时地或连续地施用。一些示例性的非限制性施用方案如下:
-低剂量方案,其包含以两次各自分开注射25μg(各自100μL)SC施用50μg的肽,随后以两次各自分开注射12.5μg(各自50μL)三次连续注射25μg的肽。
-中剂量方案,其包含以两次各自分开注射75μg(各自300μL)SC施用150μg的肽,随后以两次各自分开注射37.5μg(各自150μL)三次连续施用75μg的肽。
-高剂量方案,其包含以两次各自分开注射225μg(各自900μL)SC施用450μg的肽,随后以两次各自分开注射112.5μg(各自450μL)三次连续施用225μg的肽。
包含已知氧化还原酶基序和T细胞表位的免疫原性肽的一个示例性剂量方案可见于ClinicalTrials.gov上的标识符NCT03272269下。
本发明提供了包含任选地被0至7个氨基酸的接头隔开的改善氧化还原酶基序与抗原蛋白质的T细胞表位的免疫原性肽。
术语“氧化还原酶基序”、“巯醇-氧化还原酶基序”、“硫还原酶基序”、“硫氧化还原基序”或“氧化还原基序”在本文中用作同义术语,并且是指参与将电子从一个分子(还原剂,也称为氢或电子供体)转移至另一分子(氧化剂,也称为氢或电子接受体)的基序。
在一些优选实施方案中,所述氧化还原酶基序选自包含以下一般氨基酸序列的组:
Z(B)n[CST]XmC-(SEQ ID NO:96至109)或Z(B)nCXm[CST]-(SEQ ID NO:110至123)
其中Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但优选不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也优选不是氨基酸D(天冬氨酸)、E(谷氨酸)和/或A(丙氨酸);
其中(B)为任何氨基酸序列
其中n为0至2的整数;
其中X为任何氨基酸;
其中m为0至4的整数,优选其中m为1、2或3,更优选其中m为2;其中所述氧化还原酶基序中的连字符(-)表示所述氧化还原酶基序与所述表位(b)或所述接头(c)的N端末端或者与所述表位(b)或所述接头(c)的C端末端的连接点。
优选地,所述Z选自:W、G、S、T、C、V、L、I、M、P、F、Y、N和Q,或为任何非天然的非碱性氨基酸。
优选地,所述X选自:G、A、V、L、I、M、F、W、P、S、T、C、Y、N、Q、D和E。
在所述肽的另一个具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。在一些优选实施方案中,X是除C、S或T之外的任何氨基酸。
在一个优选实施方案中,X是除如本文中所限定的碱性氨基酸或非天然碱性氨基酸之外的任何氨基酸。
在一个优选实施方案中,免疫原性肽可包含1至7个氨基酸的侧翼氨基酸序列,最特别地1、2、3或4个氨基酸,最优选2个氨基酸的序列。在一些特别优选的实施方案中,所述侧翼序列包含一个或两个或更多个K残基(赖氨酸氨基酸残基)或者由其组成。
在一个优选实施方案中,所述氧化还原酶基序是Z(B)n[CST]PYC(SEQ ID NO:136至138)或Z(B)nCPY[CST](SEQ ID NO:139至141),例如Z(B)nCPYC(SEQ ID NO:142至144)、Z(B)nSPYC(SEQ ID NO:145至147)、Z(B)nTPYC(SEQ ID NO:148至150)、Z(B)nCPYC(SEQ IDNO:151至153)、Z(B)nCPYS(SEQ ID NO:154至156)或Z(B)nCPYT(SEQ ID NO:157至159)。在这些基序中的任一个中,Z可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,例如R、K和H,并且任选地也不包括D、E和/或A。在这些基序中的任一个中,(B)可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,并且n为0至2的整数。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
在一个优选实施方案中,所述氧化还原酶基序是Z(B)n[CST]HGC(SEQ ID NO:160至162)或Z(B)nCHG[CST](SEQ ID NO:163至165),例如Z(B)nCHGC(SEQ ID NO:166至168)、Z(B)nSHGC(SEQ ID NO:169至171)、Z(B)nTHGC(SEQ ID NO:172至174)、Z(B)nCHGC(SEQ IDNO:175至177)、Z(B)nCHGS(SEQ ID NO:178至180)或Z(B)nCHGT(SEQ ID NO:181至183)。在这些基序中的任一个中,Z可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,例如R、K和H,并且任选地也不包括D、E和/或A。在这些基序中的任一个中,(B)可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,并且n为0至2的整数。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
在一个优选实施方案中,所述氧化还原酶基序是Z(B)n[CST]GPC(SEQ ID NO:184至186)或Z(B)nCGP[CST](SEQ ID NO:187至189),例如Z(B)nCGPC(SEQ ID NO:190至192)、Z(B)nSGPC(SEQ ID NO:193至195)、Z(B)nTGPC(SEQ ID NO:196至198)、Z(B)nCGPC(SEQ IDNO:199至201)、Z(B)nCGPS(SEQ ID NO:202至204)或Z(B)nCGPT(SEQ ID NO:205至207)。在这些基序中的任一个中,Z可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,例如R、K和H,并且任选地也不包括D、E和/或A。在一些具体实例中,Z为K、R或如本文中所限定的非天然氨基酸。在这些基序中的任一个中,(B)可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,并且n为0至2的整数。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
在一个优选实施方案中,所述氧化还原酶基序是Z(B)n[CST]GHC(SEQ ID NO:208至210)或Z(B)nCGH[CST](SEQ ID NO:211至213),例如Z(B)nCGHC(SEQ ID NO:214至216)、Z(B)nSGHC(SEQ ID NO:217至219)、Z(B)nTGHC(SEQ ID NO:220至222)、Z(B)nCGHC(SEQ IDNO:223至225)、Z(B)nCGHS(SEQ ID NO:226至228)或Z(B)nCGHT(SEQ ID NO:229至231)。在这些基序中的任一个中,Z可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,例如R、K和H,并且任选地也不包括D、E和/或A。在这些基序中的任一个中,(B)可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,并且n为0至2的整数。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
在一个优选实施方案中,所述氧化还原酶基序是Z(B)n[CST]GFC(SEQ ID NO:232至234)或Z(B)nCGF[CST](SEQ ID NO:235至237),例如Z(B)nCGFC(SEQ ID NO:238至240)、Z(B)nSGFC(SEQ ID NO:241至243)、Z(B)nTGFC(SEQ ID NO:244至246)、Z(B)nCGFC(SEQ IDNO:247至249)、Z(B)nCGFS(SEQ ID NO:250至252)或Z(B)nCGFT(SEQ ID NO:253至255)。在这些基序中的任一个中,Z可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,例如R、K和H,并且任选地也不包括D、E和/或A。在这些基序中的任一个中,(B)可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,并且n为0至2的整数。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
在一个优选实施方案中,所述氧化还原酶基序是Z(B)n[CST]RLC(SEQ ID NO:256至258)或Z(B)nCRL[CST](SEQ ID NO:259至261),例如Z(B)nCRLC(SEQ ID NO:262至264)、Z(B)nSRLC(SEQ ID NO:265至267)、Z(B)nTRLC(SEQ ID NO:268至270)、Z(B)nCRLC(SEQ IDNO:271至273)、Z(B)nCRLS(SEQ ID NO:274至276)或Z(B)nCRLT(SEQ ID NO:277至279)。在这些基序中的任一个中,Z可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,例如R、K和H,并且任选地也不包括D、E和/或A。在这些基序中的任一个中,(B)可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,并且n为0至2的整数。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、KW、KP、RW、RP、HW、HP、PH、WH、PK、WK、PR和WR。
在一个优选实施方案中,所述氧化还原酶基序是Z(B)n[CST]HPC(SEQ ID NO:280至282)或Z(B)nCHP[CST](SEQ ID NO:283至285),例如Z(B)nCHPC(SEQ ID NO:286至288)、Z(B)nSHPC(SEQ ID NO:289至291)、Z(B)nTHPC(SEQ ID NO:292至294)、Z(B)nCHPC(SEQ IDNO:295至297)、Z(B)nCHPS(SEQ ID NO:298至300)或Z(B)nCHPT(SEQ ID NO:301至303)。在这些基序中的任一个中,Z可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,例如R、K和H,并且任选地也不包括D、E和/或A。在这些基序中的任一个中,(B)可以为任何氨基酸,优选不是碱性氨基酸,并且n为0至2的整数。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
根据本发明的免疫原性肽的一些具体实例如下:
Z(B)n-CPYC-V-QYIKANSKFIGIT-EL(SEQ ID NO:304至306),其中Z(B)n如本文中所限定,其中-CPYC-(SEQ ID NO:307)代表硫氧化还原基序,其中-V-是接头,其中-QYIKANSKFIGIT-(SEQ ID NO:308)是破伤风毒素的T细胞表位,并且其中-EL是C端侧翼序列。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
Z(B)n-CHGC-V-QYIKANSKFIGIT-EL(SEQ ID NO:309至311),其中Z(B)n如本文中所限定,其中-CHGC-(SEQ ID NO:312)代表硫氧化还原基序,其中-V-是接头,其中-QYIKANSKFIGIT-(SEQ ID NO:308)是破伤风毒素的T细胞表位,并且其中-EL是C端侧翼序列。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
Z(B)n-CPYC-GG-FIGLMYY(SEQ ID NO:313至315),其中Z(B)n如本文中所限定,其中-CPYC-(SEQ ID NO:307)代表硫氧化还原基序,其中-GG-是接头,其中-FIGLMYY-(SEQ IDNO:316)是腺病毒(Ad5)六邻体蛋白的NKT细胞表位,并且其中没有C端侧翼序列。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
Z(B)n-CPYC-GW-YRSPFSRVV-HLYR(SEQ ID NO:317至319),其中Z(B)n如本文中所限定,其中-CPYC-(SEQ ID NO:307)代表硫氧化还原基序,其中-GW-是接头,其中-YRSPFSRVV-(SEQ ID NO:320)是MOG蛋白的T细胞表位,并且其中-HLYR(SEQ ID NO:321)是C端侧翼序列。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
Z(B)n-CPYC-GW-YRSPFSRVV-K(SEQ ID NO:322至324)或Z(B)n-CPYC-GW-YRSPFSRVV-KK(SEQ ID NO:325至327),其中Z(B)n如本文中所限定,其中-CPYC-(SEQ IDNO:307)代表硫氧化还原基序,其中-GW-是接头,其中-YRSPFSRVV-(SEQ ID NO:320)是MOG蛋白的T细胞表位,并且其中-K或-KK是C端侧翼序列。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLF(SEQ ID NO:328至330),其中Z(B)n如本文中所限定,其中-CPYC-(SEQ ID NO:307)代表硫氧化还原基序,其中-VRY-是接头,其中-FLRVPSWKI-(SEQ ID NO:331)是MOG蛋白的T细胞表位,并且其中-TLF是C端侧翼序列。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。C端侧翼序列TLF可以通过一个或两个K残基进行补充。
Z(B)n-CPYC-SLQP-LALEGSLQK-RG(SEQ ID NO:332至334),其中Z(B)n如本文中所限定,其中-GPYC-(SEQ ID NO:307)代表硫氧化还原基序,其中-SLQP-(SEQ ID NO:335)是接头,其中-LALEGSLQK-(SEQ ID NO:336)是胰岛素(原)蛋白的MHC II类T细胞表位,并且其中-RG是C端侧翼序列。在所述肽的一些优选实施方案中,Z(B)n不具有以下序列:K;KH;R;或RH。
在一个特别优选的实施方案中,Z为W或P,并且n为0,例如在序列:W-CPYC-SLQP-LALEGSLQK-RG(SEQ ID NO:337)和P-CPYC-SLQP-LALEGSLQK-RG(SEQ ID NO:338)中。在所述肽的另一些具体实施方案中,Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
本发明的肽还可用于用于在样品中检测II类限制性CD4+T细胞的体外诊断方法中。在该方法中,使样品与MHC II类分子和根据本发明的肽的复合物接触。通过测量复合物与样品中细胞的结合来检测CD4+T细胞,其中复合物与细胞结合表明样品中存在CD4+T细胞。该复合物可以是肽与MHC II类分子的融合蛋白。或者,复合物中的MHC分子是四聚体。该复合物可作为可溶性分子提供或可与载体连接。
本发明的肽还可用于用于在样品中检测NKT细胞的体外诊断方法中。在该方法中,使样品与CD1d分子和根据本发明的肽的复合物接触。通过测量复合物与样品中细胞的结合来检测NKT细胞,其中复合物与细胞结合表明样品中存在NKT细胞。该复合物可以是肽与CD1d分子的融合蛋白。
因此,在一些具体实施方案中,本发明的治疗和预防方法包括施用如本文中所述的免疫原性肽,其中所述肽包含在待治疗的疾病中发挥作用的抗原蛋白质的T细胞表位(例如如上所述的那些)。在另一些具体实施方案中,使用的表位是优势表位。
根据本发明的肽可通过合成其中T细胞表位和经修饰的氧化还原基序被0至5个氨基酸隔开的肽来制备。在某些实施方案中,经修饰的氧化还原基序可通过在表位序列之外引入1、2或3个突变来获得,以保持如在蛋白质中出现的序列背景。通常来说,参考作为天然序列的一部分的九肽在P-2和P-1中以及在P+10和P+11中的氨基酸被保持在肽序列中。这些侧翼残基通常使与MHC II类或CD1d分子的结合稳定。在另一些实施方案中,表位的N端或C端序列与包含T细胞表位序列的抗原蛋白质的序列不相关。
因此,基于用于设计肽的以上方法,通过化学肽合成、重组表达方法或在更特殊的情况下,蛋白质的蛋白水解或化学片段化来产生肽。
如以以上方法产生的肽可在体外和体内方法中测试T细胞表位之存在,并且可在体外测定中测试其还原活性。作为最终的品质控制,可以在体外测定中测试所述肽,以验证该肽是否可产生通过针对呈递包含表位序列的抗原的抗原呈递细胞的凋亡途径而具有溶细胞性的CD4+T或NKT细胞,所述表位序列也存在于具有经修饰的氧化还原基序的肽中。
本发明的肽可使用重组DNA技术在细菌、酵母、昆虫细胞、植物细胞或哺乳动物细胞中产生。鉴于肽的长度有限,其可通过化学肽合成来制备,其中肽通过将不同的氨基酸彼此偶联来制备。化学合成特别适合于包含例如D-氨基酸、具有非天然存在的侧链的氨基酸或具有经修饰的侧链的天然氨基酸,例如甲基化半胱氨酸。
化学肽合成方法已充分描述,并且可从公司例如Applied Biosystems和其他公司订购肽。
肽合成可以以固相肽合成(solid phase peptide synthesis,SPPS)或与液相肽合成相反的方式来进行。最著名的SPPS方法是t-Boc和Fmoc固相化学:
在肽合成期间,使用了数个保护基。例如,羟基和羧基官能团通过叔丁基保护,赖氨酸和色氨酸通过t-Boc基团保护,以及天冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸和组氨酸通过三苯甲基保护,以及精氨酸通过pbf基团保护。如果合适,在合成之后,这样的保护基可以留在肽上。可使用如Kent(Schnelzer&Kent(1992)lnt.J.Pept.Protein Res.40,180-193)最初所描述的以及例如Tam et al.(2001)Biopolymers 60,194-205中综述的连接策略(两个未经保护的肽片段的化学选择性偶联)将肽彼此连接以形成更长的肽,这为实现蛋白质合成提供了巨大的潜能,这超出了SPPS的范围。通过该方法已经成功地合成了尺寸为100至300个残基的许多蛋白质。由于SPPS的巨大进步,合成肽在生物化学、药理学、神经生物学、酶学和分子生物学的研究领域中继续发挥着越来越至关重要的作用。
或者,所述肽可通过在包含编码核苷酸序列的合适的表达载体中使用编码本发明的肽的核酸分子来合成。这样的DNA分子可使用自动化DNA合成仪和遗传密码的公知的密码子-氨基酸关系来容易地制备。使用寡核苷酸探针和常规杂交方法,这样的DNA分子也可作为基因组DNA或作为cDNA获得。可将这样的DNA分子并入到表达载体(包括质粒)中,其适合于在合适的宿主例如细菌(例如大肠杆菌)、酵母细胞、动物细胞或植物细胞中表达DNA和产生多肽。
对目的肽的物理和化学特性(例如溶解度、稳定性)进行检查以确定该肽是否/是否将适合于用于治疗组合物中。通常来说,这通过调节肽的序列来优化。任选地,可在合成之后使用本领域已知的技术对肽进行修饰(化学修饰,例如添加/缺失官能团)。
包含标准氧化还原酶基序和MHC II类T细胞表位的免疫原性肽的作用机制被以上引用的PCT申请WO2008/017517和本发明人的公开物中公开的实验数据证实。包含标准氧化还原酶基序和CD1d结合NKT-细胞表位的免疫原性肽的作用机制被以上引用的PCT申请WO2012/069568和本发明人的公开物中公开的实验数据证实。
本发明提供了用于在体内或体外产生抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞(当使用如本文中公开的包含MHC II类表位的免疫原性肽时)或抗原特异性溶细胞性NKT细胞(当使用如本文中公开的包含结合CD1d分子的NKT细胞表位的免疫原性肽时)的方法。
本发明描述了用于产生抗原特异性CD4+T细胞或NKT细胞的体内方法。一个具体实施方案涉及用于通过用如本文中所述的本发明的肽免疫接种动物(包括人)并随后从经免疫接种的动物分离CD4+T细胞或NKT细胞来产生或分离CD4+T细胞或NKT细胞的方法。本发明描述了用于产生针对APC的抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞或NKT细胞的体外方法。本发明提供了用于产生针对APC的抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞和NKT细胞的方法。
在一个实施方案中,提供了这样的方法,其包括分离外周血细胞,通过根据本发明的免疫原性肽体外刺激细胞群,以及扩增经刺激的细胞群,更特别地在存在IL-2的情况下进行。根据本发明的方法的优点是产生高数目的CD4+T细胞,并且可产生对抗原蛋白质具有特异性的CD4+T细胞(通过使用包含抗原特异性表位的肽)。
在一个替代实施方案中,CD4+T细胞可以在体内产生,即通过向对象注射本文中所述的免疫原性肽,以及收集体内产生的溶细胞性CD4+T细胞。
可通过本发明的方法获得的针对APC的抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞在预防变应性反应和治疗自身免疫病中向哺乳动物施用免疫治疗是特别令人感兴趣的。设想了使用同种细胞和自体细胞二者。
溶细胞性CD4+T细胞群如下文中所述获得。
在一个实施方案中,本发明提供了扩增特异性NKT细胞的方法,其结果是活性提高,包括但不限于:
(i)细胞因子产生提高
(ii)抗原呈递细胞的接触依赖性消除和可溶性因子依赖性消除提高。因此,结果是对胞内病原体、自身抗原、同种因子、变应原、肿瘤细胞的应答更加有效,以及更加有效地抑制了针对移植物和在基因治疗/基因疫苗接种中使用的病毒蛋白的免疫应答。
本发明还涉及在体液或器官中鉴定具有所需特性的NKT细胞。该方法包括通过其表面表型(包括NK1.1、CD4、NKG2D和CD244的表达)鉴定NKT细胞。然后使细胞与限定为能够由CD1d分子呈递的肽的NKT细胞表位接触。然后将细胞在存在IL-2或IL-15或IL-7的情况下进行体外扩增。
如本文中所述的抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞或NKT细胞可用作药物,更特别地用于过继细胞治疗,更特别地用于治疗急性变应性反应和自身免疫病(例如多发性硬化)的复发。如所述产生的分离的溶细胞性CD4+T细胞或NKT细胞或细胞群,更特别地抗原特异性溶细胞性CD4+T细胞或NKT细胞群用于制造用于预防或治疗免疫病症的药物。公开了通过使用分离的或产生的溶细胞性CD4+T细胞或NKT细胞的治疗方法。
如WO2008/017517中说明的,针对APC的溶细胞性CD4+T细胞可基于细胞的表达特征区别于天然Treg细胞。更特别地,与天然Treg细胞群相比,溶细胞性CD4+T细胞群显示出以下特征中的一种或更多种:
在活化之后表面标志物(包括CD103、CTLA-4、Fasl和ICOS)的表达提高,CD25中等表达,CD4、ICOS、CTLA-4、GITR表达以及CD127(IL7-R)低表达或不表达,CD27不表达,转录因子T-bet和egr-2(Krox-20)表达但转录阻遏物Foxp3不表达,高IFN-γ产生,以及无或仅痕量的IL-10、IL-4、IL-5、IL-13或TGF-β。
此外,溶细胞性T细胞表达CD45RO和/或CD45RA,不表达CCR7、CD27,并且呈现高水平的颗粒酶B和其他颗粒酶以及Fas配体。
如WO2008/017517中说明的,针对APC的溶细胞性NKT细胞可基于细胞的表达特征区别于非溶细胞性NKT细胞。更特别地,与非溶细胞性NKT细胞群相比,溶细胞性CD4+NKT细胞群显示出以下特征中的一种或更多种:NK1.I、CD4、NKG2D和CD244表达。
本发明的肽在施用于活动物、通常是人之后引发对旁观者T细胞发挥抑制活性的特异性T细胞。
在一些具体实施方案中,本发明的溶细胞性细胞群的特征在于FasL和/或干扰素γ表达。在一些具体实施方案中,本发明的溶细胞性细胞群的特征还在于颗粒酶B表达。
该机制还蕴含并且实验结果表明,本发明的肽尽管包含某抗原的特定T细胞表位但可用于预防或治疗由针对相同抗原的其他T细胞表位的免疫反应引发的病症,或者在某些情况下,甚至用于治疗由针对其他不同抗原的其他T细胞表位的免疫反应引发的病症,如果它们将通过相同的机制由MHC II类分子或CD1d分子在被本发明的肽活化的T细胞附近呈递的话。
公开了具有上述特征的另外是抗原特异性的,即能够抑制抗原特异性免疫应答的细胞类型的分离的细胞群。
本发明提供了包含一种或更多种根据本发明的肽的药物组合物,其还包含可药用载体。如上所述,本发明还涉及用作药物的组合物或涉及通过使用所述组合物治疗哺乳动物的免疫病症的方法,以及涉及所述组合物用于制造用于预防或治疗免疫病症的药物的用途。所述药物组合物可例如是适合于治疗或预防免疫病症,尤其是空气传播性和食源性***反应以及变应源疾病的疫苗。作为药物组合物的本文中进一步描述的一个实例,将根据本发明的肽吸附在适合于施用于哺乳动物的佐剂,例如氢氧化铝(明矾)上。通常来说,50μg的吸附在明矾上的肽通过皮下途径以2周的间隔注射3次。对于本领域技术人员应明显的是,其他施用途径也是可以的,包括经口、鼻内或肌内。同样,注射次数和注射量可根据待治疗的病症而变化。此外,可使用除明矾之外的其他佐剂,只要它们促进MHC II类呈递中的肽呈递和T细胞活化即可。因此,尽管活性成分可单独地施用,但它们通常作为药物制剂存在。本发明的针对兽用和针对人用二者的制剂均包含至少一种如上所述的活性成分以及一种或更多种可药用载体。本发明涉及包含与可药用载体混合的作为活性成分的一种或更多种根据本发明的肽的药物组合物。本发明的药物组合物应包含治疗有效量的活性成分,例如下文中对于治疗或预防方法所指明的。任选地,所述组合物还包含其他治疗成分。合适的其他治疗成分以及其取决于其所属类别的常用剂量对于本领域技术人员是公知的,并且可选自用于治疗免疫病症的其他已知药物。
本文中使用的术语“可药用载体”意指与活性成分一起配制的任何材料或物质,以便例如通过溶解、分散或扩散所述组合物而利于其应用于或散布于待治疗的部位,和/或在不损害其效力的情况下利于其储存、运输或处理。它们包括任何和所有的溶剂、分散介质、包衣、抗细菌和抗真菌剂(例如酚、山梨酸、氯丁醇)、等张剂(例如糖或氯化钠)等。另外的成分可包含在内以便控制组合物中免疫原性肽的作用持续时间。可药用载体可以是固体或液体或已被压缩至形成液体的气体,即本发明的组合物可适合地用作浓缩剂、乳剂、溶液剂、颗粒剂、粉剂(dust)、喷雾剂、气雾剂、混悬剂、软膏剂、乳膏剂、片剂、丸剂或散剂。用于药物组合物及其制剂的合适的药用载体对于本领域技术人员是公知的,并且在本发明中对其选择没有特别限制。它们还可包括添加剂,例如润湿剂、分散剂、黏着剂(sticker)、黏合剂、乳化剂、溶剂、包衣、抗细菌和抗真菌剂(例如酚、山梨酸、氯丁醇)、等张剂(例如糖或氯化钠)等,只要它们与药学实践一致即可,即对哺乳动物不会造成永久损害的载体和添加剂。本发明的药物组合物可以以任何已知的方式来制备,例如通过以一步或多步程序将活性成分与所选择的载体材料和(合适的话)另一些添加剂例如表面活性剂均匀地混合,对其进行包衣和/或研磨来制备。它们也可通过微粉化来制备,例如鉴于以通常直径为约1μm至10μm的微球体形式获得它们,即制造用于控释或缓释活性成分的微胶囊剂。
待用于本发明药物组合物中的合适的表面活性剂,也称为乳化剂(emulgent)或乳化剂(emulsifier),是具有良好的乳化、分散和/或润湿特性的非离子、阳离子和/或阴离子材料。合适的阴离子表面活性剂包括水溶性皂剂和水溶性合成表面活性剂二者。合适的皂剂是高级脂肪酸(C10至C22)的碱金属或碱土金属盐、未经取代或经取代的铵盐,例如油酸或硬脂酸的钠盐或钾盐,或者可从椰子油或牛油中获得的天然脂肪酸混合物的钠盐或钾盐。合成表面活性剂包括聚丙烯酸的钠盐或钙盐;脂肪磺酸盐和硫酸盐;磺化苯并咪唑衍生物和烷基芳基磺酸盐。脂肪磺酸盐或硫酸盐通常为以下形式:碱金属或碱土金属盐、未经取代的铵盐或被具有8至22个碳原子的烷基或酰基基团取代的铵盐,例如木质素磺酸或十二烷基磺酸的钠盐或钙盐,或从天然脂肪酸中获得的脂肪醇硫酸盐的混合物、硫酸或磺酸酯的碱金属或碱土金属盐(例如月桂基硫酸钠)和脂肪醇/环氧乙烷加成物的磺酸。合适的磺化苯并咪唑衍生物通常包含8至22个碳原子。烷基芳基磺酸盐的一些实例是十二烷基苯磺酸或二丁基-萘磺酸或萘-磺酸/甲醛缩合产物的钠盐、钙盐或链烷醇胺(alcanolamine)盐。同样合适的是相应的磷酸盐,例如磷酸酯和对壬基苯酚与环氧乙烷和/或环氧丙烷的加成物或磷脂的盐。用于该目的的合适的磷脂是脑磷脂或卵磷脂类型的天然(起源于动物或植物细胞)或合成的磷脂,例如如磷脂酰-乙醇胺、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰甘油、溶血卵磷脂、心磷脂、二辛基磷脂酰胆碱、二棕榈酰基磷脂酰胆碱,及其混合物。
合适的非离子表面活性剂包括烷基酚、脂肪醇、脂肪酸、分子中包含至少12个碳原子的脂肪族胺或酰胺、烷基芳烃磺酸盐和二烷基磺基琥珀酸盐的聚乙氧基化和聚丙氧基化衍生物,例如脂肪族和脂环族醇、饱和和不饱和脂肪酸和烷基酚的聚乙二醇醚衍生物,所述衍生物通常在(脂肪族)烃部分中包含3至10个乙二醇醚基和8至20个碳原子,以及在烷基酚的烷基部分中包含6至18个碳原子。另一些合适的非离子表面活性剂是聚环氧乙烷与聚丙二醇、在烷基链中包含1至10个碳原子的乙二胺基聚丙二醇的水溶性加成物,该加成物包含20至250个乙二醇醚基和/或10至100个丙二醇醚基。这样的化合物通常包含1至5个乙二醇单元/丙二醇单元。非离子表面活性剂的一些代表性实例是壬基酚-聚乙氧基乙醇、蓖麻油聚乙醇醚、聚丙烯/聚环氧乙烷加成物、三丁基苯氧基聚乙氧基乙醇、聚乙二醇和辛基苯氧基聚乙氧基乙醇。聚乙烯脱水山梨糖醇的脂肪酸酯(例如聚氧乙烯脱水山梨糖醇三油酸酯)、甘油、脱水山梨糖醇、蔗糖和季戊四醇也是合适的非离子表面活性剂。合适的阳离子表面活性剂包括具有4个任选地被卤素、苯基、经取代的苯基或羟基取代的烃基团的季铵盐,特别是卤化物;例如包含作为N-取代基的至少一个C8C22烷基基团(例如鲸蜡基、月桂基、棕榈酰基、肉豆蔻基、油烯基等),以及作为另一些取代基的未经取代或卤代的低级烷基、苄基和/或羟基-低级烷基基团的季铵盐。
适合于该目的的表面活性剂的更详细描述可见于例如“McCutcheon’sDetergentsand Emulsifiers Annual”(MC Publishing Crop.,Ridgewood,New Jersey,1981),“Tensid-Taschenbucw”,2nd ed.(Hanser Verlag,Vienna,1981)和“Encyclopaedia ofSurfactants,(Chemical Publishing Co.,New York,1981)中。根据本发明的肽、其同源物或衍生物(以及其全部包括在术语“活性成分”中的生理学上可接受的盐或药物组合物)可通过适合于待治疗病症和适合于化合物(此处为待施用的蛋白质和片段)的任何途径施用。可行的途径包括区域性、全身性、经口(固体形式或吸入)、直肠、经鼻、表面(包括经眼、***和舌下)、***和肠胃外(包括皮下、肌内、静脉内、皮内、动脉内、鞘内和硬膜外)。优选的施用途径可随着例如接受者的病症或随着待治疗的疾病而变化。如本文中所述,在与制剂的其他成分相容并且对其接受者无害的意义上,载体最佳地是“可接受的”。所述制剂包括适合于以下的制剂:经口、直肠、经鼻、表面(包括***和舌下)、***或肠胃外(包括皮下、肌内、静脉内、皮内、动脉内、鞘内和硬膜外)施用。
适合于肠胃外施用的制剂包括可包含抗氧化剂、缓冲剂、抑菌剂和使制剂与预期接受者的血液等张的溶质的水性和非水性无菌注射溶液剂;以及可包含助悬剂和增稠剂的水性和非水性无菌混悬剂。所述制剂可存在于单位剂量或多剂量容器(例如密封的安瓿和小瓶)中,并且可在仅需在使用之前立即添加无菌液体载体(例如注射用水)的冷冻干燥(冻干)条件下储存。临时注射溶液剂和混悬剂可由前述类型的无菌粉末、颗粒剂和片剂制备。
典型的单位剂量制剂是包含如本文中以上所记载的每日剂量或单位每日亚剂量的,或其合适分数的活性成分的制剂。应理解,除以上特别提及的成分之外,鉴于所讨论的制剂的类型,本发明的制剂还可包含本领域中的其他常规试剂,例如适合于经口施用的那些可包括矫味剂。根据本发明的肽、其同源物或衍生物可用于提供包含作为活性成分的一种或更多种本发明化合物的控释药物制剂(“控释制剂”),其中活性成分的释放可被控制和调节以允许较少频率的给药或改善给定本发明化合物的药动学或毒性谱。适于经口施用的其中包含一种或更多种本发明化合物的离散单元的控释制剂可根据常规方法制备。另外的成分可包含在内以便控制组合物中活性成分的作用持续时间。因此,可通过选择合适的聚合物载体例如如聚酯、聚氨基酸、聚乙烯吡咯烷酮、乙烯-乙酸乙烯酯共聚物、甲基纤维素、羧甲基纤维素、硫酸鱼精蛋白等来获得控释组合物。药物释放的速率和作用的持续时间也可通过将活性成分并入到颗粒(例如微胶囊、微球体、微乳剂、纳米粒、纳米胶囊剂等)中来控制。根据施用途径,药物组合物可能需要保护性包衣。适合于注射的药物形式包括无菌水溶液剂或分散体以及用于其临时制备的无菌粉末。因此,用于该目的的典型载体包括生物相容性水性缓冲剂、乙醇、甘油、丙二醇、聚乙二醇等,及其混合物。鉴于以下事实:当组合使用数种活性成分时,它们不一定在待治疗的哺乳动物中同时直接发挥其联合治疗作用,相应的组合物也可以呈以下形式:包含在分开但邻近的贮室或区室中的两种成分的医学药盒或包装。因此,在后一种情况下,每种活性成分可以以适合于不同于其他成分之施用途径的施用途径的方式来配制,例如它们之一可以是经口或肠胃外制剂的形式,而另一种是用于静脉内注射的安瓿剂或气雾剂的形式。
如在本发明中所获得的溶细胞性CD4+T细胞在MHC-II类依赖性同源活化之后诱导APC凋亡,影响树突细胞和B细胞二者,如在体外和在体内所表明的,以及(2)在不存在IL-10和/或TGF-β的情况下通过接触依赖性机制抑制旁观者T细胞。如WO2008/017517中详细讨论的,溶细胞性CD4+T细胞可区别于天然Treg和适应性Treg二者。
本发明的免疫原性肽包含赋予与CD1d分子结合之能力的疏水性残基。在施用之后,被APC吸收,引导至晚期内体,在此其被装载到CD1d上并呈递在APC表面处。一旦被CD1d分子呈递,肽中的硫还原酶基序就会增强使NKT细胞活化的能力,从而成为溶细胞性NKT细胞。所述免疫原性肽激活细胞因子(例如IFN-γ)的产生,其将激活其他效应细胞,包括CD4+T细胞和CD8+T细胞。如WO2012/069568中详细讨论的,CD4+和CD8+T细胞二者均可参与消除呈递抗原的细胞。
现在将通过以下实施例对本发明进行举例说明,所述实施例在无任何限制意图的情况下提供。此外,本文中所述的所有参考文献均通过引用明确地包含在本文中。
实施例
实施例1:肽设计
为了评估另外的侧翼氨基酸对与T细胞表位相连的氧化还原酶基序的活性的影响,合成了以下肽(表1至6),并将其与包含侧翼不为一种或更多种氨基酸或者侧翼为H的氧化还原酶基序的免疫原性肽进行比较。所有受试肽均包含接头、T细胞表位以及任选地C端侧翼序列。
实施例2:评估肽的还原活性的方法
肽的还原酶活性使用在Tomazzolli et al.(2006)Anal.Biochem.350,105-112中所述的荧光测定进行确定。当具有FITC标签的两个肽通过二硫桥彼此共价连接时,其会自猝灭。在被根据本发明的肽还原之后,还原的单独肽再次变得具有荧光。使用这些肽进行的所有测试均以一式两份进行,并且每个测试进行两次。对照实验用二硫苏糖醇(100%还原活性)和水(0%还原活性)进行。
测试本发明的肽的还原活性。
图1示出了肽91至108的还原活性的动力学(参见表6)。与除具有包含带负电的氨基酸E或D的氧化还原酶基序的肽(肽106和107)之外的具有基序HCPYC的现有技术肽(肽108,SEQ ID NO:447)相比,所有受试肽均表现出更高的还原活性。在氧化还原酶基序之前具有大量疏水性氨基酸(例如W、P或G)的免疫原性肽表现出最高的还原活性。
实施例3:溶细胞性CD4+T细胞系的干扰素γ释放
干扰素γ是表征溶细胞性CD4+T细胞的重要标志物。
特异性CD4+T细胞系可通过用免疫原性肽引发和刺激来自T1D患者(T1D07)的原初CD4+T细胞系来获得。在多次(例如)12次刺激之后,可以将细胞与用所述免疫原性肽装载(2μM)的自体LCL B细胞共培养。在24小时之后,收集上清液并通过多重测定测量IFN-γ。
实施例4:溶细胞性CD4+T细胞系的FasL释放
可将最初用如上实施例3中所述的免疫原性肽产生的T细胞系分开并用所述免疫原性肽在4次连续体外刺激期间进行刺激,使用自体LCL B细胞系作为APC。在每次刺激(总共4次)的第11天,在用由自体B细胞呈递的其相应的肽再次刺激之后,测试细胞的FasL。在共培养24小时(刺激1和2)或72小时(刺激3和4)之后收集上清液。
Claims (28)
1.免疫原性肽,所述免疫原性肽包含:
a)氧化还原酶氨基酸基序,
b)抗原蛋白质的MHC II类T细胞表位,以及
c)在a)与b)之间的0至7个氨基酸的接头,
其中:所述氧化还原酶基序具有以下序列:
Z(B)n[CST]XmC-或Z(B)nCXm[CST]-;
其中Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也不是氨基酸D(天冬氨酸)、E(谷氨酸)和/或A(丙氨酸);
其中(B)为任何氨基酸;
其中n为0至2的整数;
其中X为任何氨基酸;
其中m为2、0、1或3;
其中所述氧化还原酶基序中的连字符(-)表示所述氧化还原酶基序与所述表位(b)或所述接头(c)的N端末端或者与所述表位(b)或所述接头(c)的C端末端的连接点。
2.根据权利要求1所述的免疫原性肽,其中Z选自:W、G、S、T、C、V、L、I、M、P、F、Y、N和Q。
3.根据权利要求1或2所述的免疫原性肽,其中Z选自包含氨基酸G、W和P的组。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的免疫原性肽,其中m为2。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的免疫原性肽,其中X是除C、S或T之外的任何氨基酸。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的免疫原性肽,其中一个或更多个X为碱性氨基酸,优选其中所述一个或更多个X为R。
7.根据权利要求1至5中任一项所述的免疫原性肽,其中所述氧化还原酶基序为Z(B)nCRC(SEQ ID NO:3至5)、Z(B)nCRXC(SEQ ID NO:6至8)或Z(B)nCRXXC(SEQ ID NO:9至11)。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的免疫原性肽,其中所述表位的长度为9至30个氨基酸,优选9至25个氨基酸,更优选9至20个氨基酸。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的免疫原性肽,其长度为12至50个氨基酸,优选12至40个氨基酸,更优选12至30个氨基酸。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的免疫原性肽,其中所述抗原蛋白质是自身抗原、可溶性同种因子、由移植物脱落的同种抗原、胞内病原体的抗原、用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的抗原、肿瘤相关抗原或变应原。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的免疫原性肽,其中所述接头为0至4个氨基酸。
12.根据权利要求1至11中任一项所述的免疫原性肽,其中所述氧化还原酶基序不天然存在于所述抗原蛋白质中处于MHC II类T细胞表位的N端或C端11个氨基酸的区域之内。
13.根据权利要求1至12中任一项所述的免疫原性肽,其中所述MHC II类T细胞表位不天然包含所述氧化还原酶基序。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的免疫原性肽,其中硫氧化还原基序中的至少一个X为P或Y。
15.根据权利要求1至14中任一项所述的免疫原性肽,其中所述硫氧化还原基序选自:Z(B)nCPYC(SEQ ID NO:12至14);Z(B)nCGHC(SEQ ID NO:15至17);Z(B)nCHGC(SEQ ID NO:18至20);Z(B)nCRLC(SEQ ID NO:21至23);Z(B)nCGFC(SEQ ID NO:24至26);Z(B)nCHPC(SEQ IDNO:27至29);Z(B)nCGPC(SEQ ID NO:30至32);Z(B)nCC(SEQ ID NO:33至35);Z(B)nCRC(SEQID NO:36至38);Z(B)nCKC(SEQ ID NO:39至41);Z(B)nCRPYC(SEQ ID NO:42至44);Z(B)nCKPYC(SEQ ID NO:45至47);Z(B)nCRGHC(SEQ ID NO:48至50);Z(B)nCKGHC(SEQ ID NO:51至53);Z(B)nCRHGC(SEQ ID NO:54至56);Z(B)nCKHGC(SEQ ID NO:57至59);Z(B)nCRRLC(SEQID NO:60至62);Z(B)nCKRLC(SEQ ID NO:63至65);Z(B)nCRGFC(SEQ ID NO:66至68);Z(B)nCKGFC(SEQ ID NO:69至71);Z(B)nCRHPC(SEQ ID NO:72至74);Z(B)nCKHPC(SEQ ID NO:75至77);Z(B)nCRGPC(SEQ ID NO:78至80);以及Z(B)nCKGPC(SEQ ID NO:81至83)。
16.根据权利要求1至15中任一项所述的免疫原性肽,其选自包含以下序列中任一者的肽:
Z(B)n-CPYC-GW-YRSPFSRVV-HLYR(SEQ ID NO:84至86)、
Z(B)n-CPYC-GW-YRSPFSRVV-K(SEQ ID NO:87至89)、
Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLF(SEQ ID NO:90至92)、
Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLFK(SEQ ID NO:448至450)、
Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLFKK(SEQ ID NO:124至126)以及
Z(B)n-CPYC-SLQP-LALEGSLQK-RG(SEQ ID NO:93至95)。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的免疫原性肽,其中Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
18.多核苷酸,其编码权利要求1至17中任一项所述的肽,其中所述多核苷酸选自包含DNA、pDNA、cDNA、RNA和mRNA、或其经修饰形式的组。
19.根据权利要求1至17中任一项所述的免疫原性肽或根据权利要求18所述的多核苷酸,其用于药物。
20.根据权利要求1至17和19中任一项所述的免疫原性肽或者根据权利要求18或19所述的多核苷酸,其用于治疗和/或预防以下:自身免疫病、胞内病原体的感染、肿瘤、同种移植排斥、或者针对可溶性同种因子、针对变应原暴露或针对用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的免疫应答。
21.根据权利要求1至17中任一项所述的免疫原性肽或编码这样的免疫原性肽的多核苷酸,其用于治疗或预防1型糖尿病,所述免疫原性肽包含以下序列:Z(B)n-CPYC-SLQP-LALEGSLQK-RG(SEQ ID NO:93至95),其中Z(B)n选自:
W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
22.根据权利要求1至17中任一项所述的免疫原性肽或编码这样的免疫原性肽的多核苷酸,其用于治疗或预防脱髓鞘病症,所述脱髓鞘病症由髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(MOG)自身抗原和/或抗MOG抗体引起或加重,更优选地选自:多发性硬化(MS)、视神经脊髓炎(NMO)、视神经炎、急性播散性脑脊髓炎、横贯性脊髓炎、肾上腺脑白质营养不良、消融性白质病和风疹诱导的精神发育迟缓,所述免疫原性肽包含序列:Z(B)n-CPYC-VRY-FLRVPSWKI-TLF(SEQ ID NO:90至92),其中Z(B)n选自:W、P、G、KW、KP、KG、RW、RP、RG、HW、HP、HG、PH、WH、GH、PK、WK、GK、PR、WR和GR。
23.用于制备根据权利要求1至17中任一项所述的免疫原性肽的方法,其包括以下步骤:
(a)提供由所述抗原蛋白质的MHCII类T细胞表位组成的肽序列,以及
(b)将所述肽序列与所述氧化还原酶基序连接,使得所述基序和所述表位彼此相邻或被至多7个氨基酸的接头隔开。
24.用于获得抗原特异性溶细胞性CD4+ T细胞群的方法,所述抗原特异性溶细胞性CD4+ T细胞群针对呈递所述抗原的APC,所述方法包括以下步骤:
-提供外周血细胞;
-使所述细胞与根据权利要求1至17中任一项所述的免疫原性肽或与编码这样的免疫原性肽的多核苷酸接触,
-更特别地,所述肽包含:
a)氧化还原酶基序,
b)抗原蛋白质的MHC II类T细胞表位,以及
c)在a)与b)之间的O至7个氨基酸的接头,
其中:所述氧化还原酶基序具有以下序列:
Z(B)n[CST]XmC-或Z(B)nCXm[CST]-;
其中Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也不是氨基酸D(天冬氨酸)、E(谷氨酸)和/或A(丙氨酸);
其中(B)为任何氨基酸;
其中n为0至2的整数;
其中X为任何氨基酸;
其中m为2、0、1或3;
其中所述氧化还原酶基序中的连字符(-)表示所述氧化还原酶基序与所述表位(b)或所述接头(c)的N端末端或者与所述表位(b)或所述接头(c)的C端末端的连接点;以及
-在存在IL-2的情况下扩增所述细胞。
25.用于获得抗原特异性溶细胞性CD4+ T细胞群的方法,所述抗原特异性溶细胞性CD4+ T细胞群针对呈递所述抗原的APC,所述方法包括以下步骤:
-提供根据权利要求1至17中任一项所述的免疫原性肽或提供有编码这样的免疫原性肽的多核苷酸,
更特别地,所述肽包含:
a)氧化还原酶基序,
b)抗原蛋白质的MHC II类T细胞表位,以及
c))在a)与b)之间的0至7个氨基酸的接头,
其中:所述氧化还原酶基序具有以下序列:
Z(B)n[CST]XmC-或Z(B)nCXm[CST]-;
其中Z为任何氨基酸或非天然氨基酸,但不是碱性氨基酸例如R(精氨酸)、K(赖氨酸)和H(组氨酸),也不是氨基酸D(天冬氨酸)、E(谷氨酸)和/或A(丙氨酸);
其中(B)为任何氨基酸;
其中n为0至2的整数;
其中X为任何氨基酸;
其中m为2、0、1或3;
其中所述氧化还原酶基序中的连字符(-)表示所述氧化还原酶基序与所述表位(b)或所述接头(c)的N端末端或者与所述表位(b)或所述接头(c)的C端末端的连接点;
-将所述肽或所述多核苷酸施用于对象;以及
-从所述对象获得所述抗原特异性溶细胞性CD4+ T细胞群。
26.可通过权利要求24或25所述的方法获得的抗原特异性溶细胞性CD4+ T细胞群,其用于治疗和/或预防以下:自身免疫病、胞内病原体的感染、肿瘤、同种移植排斥、或者针对可溶性同种因子、针对变应原暴露或针对用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的免疫应答。
27.在个体中治疗和/或预防自身免疫病、胞内病原体的感染、肿瘤、同种移植排斥、或者针对可溶性同种因子、针对变应原暴露或针对用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的免疫应答的方法,其包括将根据权利要求1至17中任一项所述的免疫原性肽、编码这样的免疫原性肽的多核苷酸、或根据权利要求26所述的细胞群施用于所述个体的步骤。
28.在个体中治疗或预防自身免疫病、胞内病原体的感染、肿瘤、同种移植排斥、或者针对可溶性同种因子、针对变应原暴露或针对用于基因治疗或基因疫苗接种的病毒载体的免疫应答的方法,其包括以下步骤:
-提供所述个体的外周血细胞,
-使所述细胞与根据权利要求1至17中任一项所述的免疫原性肽或与编码这样的免疫原性肽的多核苷酸接触,
-扩增所述细胞,以及
-将所述扩增的细胞施用于所述个体。
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