CN114854633B - 一种气球菌及其应用 - Google Patents

Abstract

本发明公开了一种气球菌及其应用，属于微生物技术领域。该气球菌命名为YRD202201CF，分类命名为气球菌Aerococcus sp.，于2022年3月11日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号，邮政编码为100101，保藏编号为CGMCC No.24518。本发明首次公开了从盐碱地土壤中分离的气球菌具有利用多种物质生成碳酸盐矿物的能力，对于深入认识土壤碳转化过程，提升土壤碳储量潜力，固定大气CO₂，减缓大气“温室效应”，缓解全球气候变暖具有重要科学意义。

Description

一种气球菌及其应用

技术领域

本发明属于微生物技术领域，具体涉及一种气球菌及其应用。

背景技术

盐碱地占据全球陆地面积的四分之一，且以每年1-15×10⁶公顷的速度扩张。由于盐碱地多水热资源不协调，且受限于土壤盐碱胁迫，适生植物较少，主要以盐生植物为主，植被稀少，该区域植物对土壤碳储量的贡献有限，且土壤无机碳储量要高于土壤有机碳储量。

目前，微生物形成含碳矿物的能力被广泛研究，受盐碱胁迫的土壤中，是否存在能够形成含碳矿物的微生物，对于认识盐碱地土壤碳库的形成机理，探索盐碱地土壤碳累积过程，具有重要的作用。所以，有必要探究盐碱地土壤中的微生物合成含碳矿物的能力。

发明内容

针对现有技术中的上述不足，本发明提出一种气球菌及其应用，首次公开了从盐碱地土壤中分离的气球菌具有利用多种物质生成碳酸盐矿物的能力。

为了达到上述发明目的，本发明采用的技术方案为：

提供一种气球菌，命名为YRD202201CF，分类命名为气球菌Aerococcus sp.，于2022年3月11日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号，邮政编码为100101，保藏编号为CGMCC No.24518。

进一步地：气球菌的16S rDNA基因序列如SEQ ID No.1所示。

进一步地：气球菌来源于盐碱地土壤。

进一步地：气球菌的筛选方法为：将盐碱地土壤稀释，取土壤稀释液接种至含草酸钙的无机盐MSM培养基中，培养分离获得气球菌。

本发明还提供气球菌在代谢利用草酸钙形成含碳矿物质中的应用。

本发明还提供气球菌在诱导生成碳酸盐矿物中的应用。

进一步地：含碳矿物质包括但不限于含碳无机化合物，如碳酸盐。

进一步地：碳酸盐包括但不限于碳酸钙以及碳酸钙的同质异形体，如球霰石、方解石。

本发明的有益效果为：

本发明首次公开了从盐碱地土壤中分离的气球菌具有利用多种物质生成碳酸盐矿物的能力，对于深入认识土壤碳转化过程，提升土壤碳储量潜力，具有重要应用潜力和科学意义。

附图说明

图1为本发明实施例2中实验组土壤薄层表面电镜扫描图；

图2为本发明实施例2中对照组土壤薄层表面电镜扫描图；

图3为本发明实施例2中实验组土壤薄层表面矿物能量色散衍射分析图；

图4为本发明实施例2中对照组土壤薄层表面矿物能量色散衍射分析图；

图5为本发明实施例3中沉淀物电镜扫描图；

图6为本发明实施例3中沉淀物能量色散衍射分析图。

具体实施方式

下面对本发明的具体实施方式进行描述，以便于本技术领域的技术人员理解本发明，但应该清楚，本发明不限于具体实施方式的范围，对本技术领域的普通技术人员来讲，只要各种变化在所附的权利要求限定和确定的本发明的精神和范围内，这些变化是显而易见的，一切利用本发明构思的发明创造均在保护之列。

若未特别指明，实施例均按照常规实验条件，如Sambrook等分子克隆实验手册(Sambrook J&Russell DW，Molecular Cloning:a Laboratory Manual，2001)，或按照制造厂商说明书建议的条件。

实施例1

菌株YRD202201CF的分离鉴定：

以山东黄河三角洲典型盐碱地的土壤为目标土壤，具体筛选步骤如下：

1、采集0-10cm深度的土壤，取采集的土壤1.0g，加入到9mL灭菌水中，震荡10min，制成土壤溶液。取1mL土壤悬浮液，置于9mL灭菌水中，稀释土壤溶液。重复此操作，将土壤溶液稀释到10^-3倍。取100μL土壤稀释液，接种至含草酸钙的无机盐MSM培养基中，在25℃条件下培养7天。

具体地说，培养基成分为：Na₂HPO₄·2H₂O，3.5g/L；KH₂PO₄，1.0g/L；(NH₄)₂SO₄，0.5g/L；MgCl₂·6H₂O，0.1g/L；Ca(NO₃)₂·4H₂O，0.05g/L；微量元素溶液，1mL/L；CaC₂O₄，2g/L；1.5％琼脂，pH 7.25。

微量元素溶液的配方为：FeSO₄·7H₂O，0.4g/L；ZnSO₄·7H₂O，0.1g/L；MnCl₂·4H₂O，0.3g/L；H₃BO₃，0.3g/L；CuCl₂·2H₂O，0.1g/L；NiCl₂·6H₂O，0.2g/L；NaMoO₄，0.3g/L；CoCl₂·6H₂O，0.1g/L；Na₂SeO₄·2H₂O，0.05g/L。

2、挑取培养基上生长出来的单菌落，涂布于LB培养基上，进一步分离纯化。获得菌株YRD202201CF。

3、对菌株YRD202201CF进行16S rDNA测序：采用通用引物27F和1492R引物对菌株YRD202201CF的基因组DNA进行PCR扩增，将扩增产物进行测序，测序结果如SEQ ID No.1所示。

SEQ ID No.1如下所示：

CGGGGGGGATGCCTATAGATGCAGTCGAGCGAACAGATGAAGTGCTTGCACTTCTGACGTTAGCGGCGAACGGGTGAGTAACACGTAAGGAATCTACCTATAAGCGGGGGATAACATTCGGAAACGGGTGCTAATACCGCATAATATCTTCTTCCGCATGGAAGAAGATTGAAAGACGGCTCTGCTGTCACTTATAGATGACCTTGCGGTGCATTAGTTAGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGACGATGATGCATAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAACTCTGTTATAAGAGAAGAACAAATTGTAGAGTAACTGCTACAGTCTTGACGGTATCTTATCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGGGAGCGCAGGTGGTTTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCACGGCTTAACCGTGGAGGGTCATTGGAAACTGGGAAACTTGAGTACAGAAGAGGAATGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGGAATGCGTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACATTCTGGTCTGTTACTGACACTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAGGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCCGCAGTTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGTCTTGACATCCTTTGACCACCCTAGAGATAGGGCTTTCCCTTCGGGGACAAAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTATTAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCAGCATGCCCCTTATGACTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGATGGTACAACGAGTCGCAAACCCGCGAGGGCAAGCAAATCTCTTAAAGCCATTCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTTGTAACACCCGAAGTCGGTGAGGTAACCTTTATGGAGCCAGCCGCCGAAGGGGGGATAC

利用NCBI数据库，根据菌株16S rDNA基因序列进行BLAST分析，结果表明菌株16SrDNA基因序列与气球菌属同源(与Aerococcus sp.strain201707CJKOP-Y33同源性99.52％，GenBank：CP080013.1)，综合菌株YRD202201CF的形态、结构和生理生化方面的特性，最终确定菌株为气球菌，并命名为YRD202201CF。

实施例2

菌株YRD202201CF利用难利用有机物(草酸钙)形成含碳矿物质：

1、对盐碱地土壤进行酸化、中和、淋溶和烘干处理，获得不含无机碳的土壤。取10g处理后的土壤样品，加入200mg草酸钙粉末作为碳源物质，加入20mg聚乙二醇作为土壤粘结剂，混匀，将混合样品置于50mL去离子水中，在旋涡振荡器上振荡5min，制成悬浊液。取200μL悬浊液置于35mm直径的培养皿中，并在无尘环境中晾干，此时培养皿内形成一个土壤薄层。该薄层为用于观测微生物转化草酸钙为含碳矿物的观测界面。

2、将含有土壤薄层的培养皿，在121℃条件下灭菌30min，以去除杂菌的污染，加入2mL灭菌去离子水使土壤薄层浸润至水中，将菌株YRD202201CF接种至培养皿中，对照组为接种灭活处理的菌株，其他条件都相同。将培养皿封盖处理，置于室内温度下培养3个月。

3、培养结束后，采用扫描电镜和能量色散衍射分析的方法，观测实验组和对照组的土壤薄层上含碳矿物的变化情况。结果如图1和图2所示，通过扫描电镜分析，发现实验组土壤薄层表面有很多矿物质，结构复杂，而对照组表面光滑，仅有少量矿物结构存在。对图1和图2上典型点，进行能量色散衍射分析(图3和图4)，实验组和对照组表面矿物的组成中(表1)，都含有碳、氧、钙、镁、铝、硅等元素，而实验组的含碳量明显高于对照组，即菌株YRD202201CF确实能够形成含碳矿物质。

表1实验组和对照组表面矿物元素组成

实施例3

菌株YRD202201CF利用易利用有机物(碳氮丰富的有机物)生成碳酸盐：

配制液体培养基100mL，置于250mL三角瓶中，在121℃条件下灭菌30min。具体地说，液体培养基成分为：胰蛋白胨10g/L，酵母浸提物5g/L，氯化钠10g/L，氯化钙5g/L。

用接种针将菌株YRD202201CF接种于培养基中，对照组为接种灭活处理的菌株，其余条件均一致，置于室温条件下培养。每隔一周观察是否有沉淀生成，第4周观察发现实验组有沉淀生成，为获取足量沉淀进行后续分析，该过程共培养60天。培养结束后，收集实验组生成的沉淀，并用过氧化氢溶液进行处理，去掉微生物残体等物质，共获得0.2799g沉淀物质，而对照物无沉淀物产生。对沉淀物进行电镜扫描，能量色散衍射分析。

结果如图5所示，通过扫描电镜分析，发现实验生成的沉淀为半球状，且半球状结构层层叠在一起，其上有孔洞结构，是微生物作用的直接证据，说明微生物在其生命过程中，其周围的环境不断有沉淀物质生成，层层叠起，聚其周围；如图6及表2所示，根据能量色散衍射分析，沉淀的主要成分为碳、氧、钙，且通过原子百分比和重量百分比分析为碳酸钙，表明菌株YRD202201CF具有生成含碳矿物的能力。此外，通过X射线衍射分析，发现，这些碳酸钙主要由80％的球霰石和20％的方解石构成，证明菌株YRD202201CF确实形成了碳酸盐矿物晶体。

表2含碳矿物元素组成分析表(重量和原子数)

本发明首次公开了从盐碱地土壤中分离的气球菌具有利用多种物质生成碳酸盐矿物的能力，对于深入认识土壤碳转化过程，提升土壤碳储量潜力，具有重要科学意义。

于本领域技术人员而言，显然本发明不限于上述示范性实施例的细节，而且在不背离本发明的精神或基本特征的情况下，能够以其他的具体形式实现本发明。因此，无论从哪一点来看，均应将实施例看作是示范性的，而且是非限制性的，本发明的范围由所附权利要求而不是上述说明限定，因此旨在将落在权利要求的等同要件的含义和范围内的所有变化囊括在本发明内。不应将权利要求中的任何附图标记视为限制所涉及的权利要求。

此外，应当理解，虽然本说明书按照实施方式加以描述，但并非每个实施方式仅包含一个独立的技术方案，说明书的这种叙述方式仅仅是为清楚起见，本领域技术人员应当将说明书作为一个整体，各实施例中的技术方案也可以经适当组合，形成本领域技术人员可以理解的其他实施方式。

序列表

<110> 中国科学院地理科学与资源研究所

<120> 一种气球菌及其应用

<141> 2022-05-09

<160> 1

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 1450

<212> DNA

<213> 气球菌YRD202201CF(Aerococcus sp. YRD202201CF)

<400> 1

cgggggggat gcctatagat gcagtcgagc gaacagatga agtgcttgca cttctgacgt 60

tagcggcgaa cgggtgagta acacgtaagg aatctaccta taagcggggg ataacattcg 120

gaaacgggtg ctaataccgc ataatatctt cttccgcatg gaagaagatt gaaagacggc 180

tctgctgtca cttatagatg accttgcggt gcattagtta gttggtgggg taacggccta 240

ccaagacgat gatgcatagc cgacctgaga gggtgatcgg ccacattggg actgagacac 300

ggcccaaact cctacgggag gcagcagtag ggaatcttcc gcaatgggcg aaagcctgac 360

ggagcaatgc cgcgtgagtg aagaaggcct tcgggtcgta aaactctgtt ataagagaag 420

aacaaattgt agagtaactg ctacagtctt gacggtatct tatcagaaag ccacggctaa 480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggat ttattgggcg 540

taaagggagc gcaggtggtt tcttaagtct gatgtgaaag cccacggctt aaccgtggag 600

ggtcattgga aactgggaaa cttgagtaca gaagaggaat gtggaactcc atgtgtagcg 660

gtggaatgcg tagatatatg gaagaacacc agtggcgaag gcgacattct ggtctgttac 720

tgacactgag gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc 780

cgtaaacgat gagtgctagg tgttggaggg tttccgccct tcagtgccgc agttaacgca 840

ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga 900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaagt 960

cttgacatcc tttgaccacc ctagagatag ggctttccct tcggggacaa agtgacaggt 1020

ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc 1080

aacccctatt attagttgcc agcattcagt tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa 1140

accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcatgcccc ttatgacttg ggctacacac 1200

gtgctacaat ggatggtaca acgagtcgca aacccgcgag ggcaagcaaa tctcttaaag 1260

ccattctcag ttcggattgc aggctgcaac tcgcctgcat gaagccggaa tcgctagtaa 1320

tcgtggatca gcacgccacg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca 1380

ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt gaggtaacct ttatggagcc agccgccgaa 1440

ggggggatac 1450

Claims (5)

1.一种气球菌(Aerococcus sp.)，其特征在于：所述气球菌命名为YRD202201CF，分类命名为气球菌Aerococcus sp.，于2022年3月11日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号，邮政编码为100101，保藏编号为CGMCC No.24518。

2.权利要求1所述的气球菌在代谢利用草酸钙形成含碳矿物质中的应用。

3.根据权利要求2所述的气球菌在代谢利用草酸钙形成含碳矿物质中的应用，其特征在于：所述含碳矿物质包括但不限于含碳无机化合物。

4.权利要求1所述的气球菌在诱导碳酸盐矿物生成中的应用。

5.根据权利要求4所述的气球菌在诱导碳酸盐矿物生成中的应用，其特征在于：所述碳酸盐包括但不限于碳酸钙以及碳酸钙的同质异形体。

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