CN113350347B - 吲唑类化合物的用途 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种式(I)的化合物或其药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、代谢物或前药的新用途,其用于治疗携带TRKA/B/C突变和/或融合基因的疾病,特别是携带TRKA的V573M、F589L、G667C/S突变,TRKB的F633L、G709C突变和/或TRKC的F617L、G696A/C中的一种或两种以上突变的疾病。
Description
技术领域
本申请涉及一种吲唑类化合物的新用途。更具体地,本发明涉及吲唑类化合物在预防或治疗携带TRKA/B/C融合基因和/或突变的激酶活性相关的疾病中的用途。
背景技术
原肌球蛋白相关激酶(Tropomyosin-related kinase),统称为TrK家族蛋白,是一类神经生长因子受体,由高度同源性的原肌球蛋白相关激酶A(TRKA)、原肌球蛋白相关激酶B(TRKB)、原肌球蛋白相关激酶C(TRKC)三种蛋白组成,分别由相应的NTRK1、NTRK2和NTRK3基因编码。1982年,科学家Mariano Barbacid和他的同事在结直肠癌中发现了NTRK1基因,随后确定其为致癌基因。TRK激酶被认为与神经元细胞的生长、分化以及凋亡有关,然而,近几十年的研究结果表明,TRK激酶的部分缺失、发生融合以及过表达以后与多种肿瘤如***状甲状腺癌、胰腺癌、结直肠癌、乳癌、黑色素瘤、非小细胞肺癌、急性髓性白血病、成神经细胞瘤等的发生发展、侵袭转移和恶化等有着密切关系(Emiliano Coccol,MaurizioScaltritil,Alexander Drilon,NTRK fusion-positive cancers and TRK inhibitortherapy.Nat.Rev.Clin.Oncol.2018,15,731-747.)。
通常TRK激酶与相应的配体紧密结合,如神经生长因子NGF与TRKA,脑源性神经营养因子BDNF或者神经营养因子NT-4与TRKB,神经营养因子NT-3与TRKC。NT-3可以结合并激活三种TRK蛋白,但是它与TRKC的结合紧密程度高于TRKA和TRKB。当配体与TRK激酶结合以后,TRK激酶通过二聚而发生自磷酸化,从而激活下游的信号通路,主要包括RAS/RAF/MEK/ERK、PI3K/AKT以及PLCγ信号通路。因此,当TRK功能失调导致下游通道被过度激活时,可能会导致上述癌症的发生。
已报道的TRK激酶抑制剂用于治疗多种癌症以及疼痛。第一代TRK激酶抑制剂用药以后患者会出现耐药突变,而临床上大部分小分子抑制剂主要是第一代TRK激酶抑制剂。为了解决获得性耐药的问题,拜耳和LOXO Oncology公司合作研发的第二点激酶抑制剂LOXO-195(NCT03215511),目前在接受Larotrectinib治疗产生耐药突变的患者上进行治疗,并取得一定的治疗作用。例如在临床I期和II期的NTRK阳性的患者,包括非小细胞肺癌、结直肠癌、胆管癌、胰腺癌、甲状腺癌、肉瘤、胃肠间质瘤等多名患者在接受Larotrectinib治疗后,发现了TRKs突变,主要包括溶剂前沿突变(如TRKA/G595R、TRKC/G623R)、xDFG突变(如TRKA/G667C、TRKA/G667S、TRKC/G696A、TRKC/G696C)以及Gatekeeper突变(TRKA/F589L、TRKC/F617L)等,这些新出现的突变能让Entrectinib和Larotrectinib无法与激酶结合,从而产生耐药。
目前急需开发出能够克服第一代TRK抑制剂Larotrectinib临床上的耐药突变的新型药物,用于治疗与例如TRKA的F589L、V573M、G667C、G667S、G667A突变,TRKB的F633L、G709C突变,和/或TRKC的F617L、G696A、G696C突变相关的疾病,并将这些化合物应用于与这些突变相关的癌症或者其它相关疾病的治疗中。
发明内容
本发明提供一种选择性的激酶抑制剂,包括式(I)的化合物或其药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、代谢物或前药,以及其在制备用于治疗携带TRKA/B/C突变和/或融合基因的疾病的药物中的用途:
其中,
X为-(CH=CH)m-,其中m为0或1;
Y选自-NH-或-(CH2)n-,其中n为0-3的整数;
R1选自任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的吡啶基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的吡唑基、和任选地被1-3个独立的R4基团取代的嘧啶基;
R2选自氢和C1-6烷基;
R3选自任选地被1-2个独立的R5基团取代的C1-6烷基、C1-6烷基氨基、以及任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的萘基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的吡啶基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的哌嗪基、和任选地被1-3个独立的R4基团取代的哌啶基;
R4独立地选自卤素、氨基、C1-6烷基、C3-6环烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、C1-6羟基烷基、C1-6烷基氨基、C2-6烷酰胺基、(4-甲基哌嗪-1-基)甲基、吗啉甲基、吗啉基、4-甲基哌嗪-1-基、4-哌啶基、和4-四氢吡喃基;
R5独立地选自氨基、羟基、和C1-6烷硫基。
在优选的实施方式中,X为-(CH=CH)-。
在另一优选的实施方式中,Y为直接键或-CH2-。
在另外优选的实施方式中,R1选自任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、吡啶基、吡唑基、和嘧啶基,其中R4独立地选自卤素、氨基、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、和(4-甲基哌嗪-1-基)甲基;R1更优选为任选地被甲基、氨基或卤素取代的苯基、2-吡啶基、3-吡啶基、4-吡唑基、和5-嘧啶基;R1特别优选为2-吡啶基。
在另外优选的实施方式中,R2为氢或甲基。
在另外优选的实施方式中,R3选自任选地被1-2个独立的R5基团取代的C1-6烷基、C1-6烷基氨基、以及任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、萘基、吡啶基、哌嗪基、和哌啶基,其中R4独立地选自卤素、氨基、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、和(4-甲基哌嗪-1-基)甲基,R5独立地选自氨基、羟基、和甲硫基;R3更优选为任选地被氨基、羟基、或甲硫基取代的C1-6烷基、二甲氨基、任选地被甲基取代的N-哌嗪基、任选地被卤素、三氟甲基、或甲氧基取代的苯基、萘基、4-吡啶基、3-哌啶基、和任选地被甲基取代的4-哌啶基;R3特别优选为甲基、2-丙基、1-氨基-3-甲硫基-丙基、1-氨基-3-甲基-丁基、甲基取代的N-哌嗪基、甲氧基取代的苯基、4-吡啶基、或4-哌啶基。
在特别优选的实施方式中,当Y为直接键时,R3选自任选地被氨基、羟基、或甲硫基取代的C1-6烷基、和4-吡啶基;当Y为-CH2-时,R3选自任选地被甲氧基取代的苯基、任选地被甲基取代的N-哌嗪基、和任选地被甲基取代的4-哌啶基。
在另一方面,本发明还涉及一种药物组合物,其包括本发明的激酶抑制剂,以及药学上可接受的载体或赋形剂,以及任选的其它治疗剂。
在其他方面,本发明还涉及采用激酶抑制剂或包括其的药物组合物降低或抑制细胞或受试者的TRKA、TRKB、TRKC或者它们的点突变如TRKA的F589L、V573M、G667C、G667S和G667A,TRKB的F633L和G709C突变,和/或TRKC的F617L、G696A和G696C突变激酶活性的方法和用途。
在又一方面,本发明还涉及采用激酶抑制剂或包括其的药物组合物在受试者中预防或治疗与TRKA、TRKB、TRKC或者它们的点突变如TRKA的F589L、V573M、G667C、G667S和G667A,TRKB的F633L和G709C突变,和/或TRKC的F617L、G696A和G696C突变活性相关病症的方法和用途。
附图说明
图1a示出化合物9和LOXO-101在BaF3-tel-TRKA细胞肿瘤移植小鼠模型中给药后对小鼠体重的影响;图1b示出化合物9和LOXO-101在BaF3-tel-TRKA细胞肿瘤移植小鼠模型中的肿瘤抑制效果。
图2a示出化合物9和LOXO-195在BaF3-LMNA-TRKA-F589L细胞肿瘤移植小鼠模型中给药后对小鼠体重的影响;图2b示出化合物9和LOXO-195在BaF3-LMNA-TRKA-F589L细胞肿瘤移植小鼠模型中的肿瘤抑制效果。
具体实施方式
术语
除非另外定义,所有本文使用的科技术语都具有与要求保护的主题所属领域的技术人员一般理解相同的含义。
除非另有说明,本发明采用本领域技术范围内的质谱、NMR、HPLC、蛋白质化学、生物化学、重组DNA技术和药理学等常规方法。除非提供具体的定义,否则与本文描述的分析化学、合成有机化学、以及医学和药物化学等化学上相关的命名和实验室操作和技术,是本领域技术人员已知的。一般而言,前述技术和步骤可以通过本领域众所周知的和在各种一般文献和更具体文献中描述的常规方法来实施,这些文献在本说明书中被引用和讨论。
术语“烷基”是指脂肪族烃基团,可以是支链或直链的烷基。根据结构,烷基可以是单价基团或双价基团(即亚烷基)。在本发明中,烷基优选是具有1-8个碳原子的烷基,更优选具有1-6个碳原子的“低级烷基”,甚至更优选具有1-4个碳原子的烷基。典型的烷基包括但不限于甲基、乙基、丙基、丁基、戊基、己基等。应理解,本文提到的“烷基”包括可能存在的所有构型和构象的该烷基,例如本文提到的“丙基”包括正丙基和异丙基,“丁基”包括正丁基、异丁基和叔丁基,“戊基”包括正戊基、异丙基、新戊基、叔戊基、和戊-3-基等。
术语“烷氧基”是指-O-烷基,其中烷基如本文中定义。典型的烷氧基包括但不限于甲氧基、乙氧基、丙氧基、丁氧基、戊氧基、己氧基等。
术语“烷氧基烷基”是指本文定义的烷基被本文定义的烷氧基取代。
术语“环烷基”是指单环或多环基,其仅含有碳和氢。环烷基包括具有3-12个环原子的基团。根据结构,环烷基可以是单价基团或双价基团(例如亚环烷基)。在本发明中,环烷基优选是具有3-8个碳原子的环烷基,更优选具有3-6个碳原子的“低级环烷基”。环烷基的例子包括但不限于,环丙基、环丁基、环戊基、环已基、环庚基、环辛基、环戊烯基、环己烯基、环庚烯基和金刚烷基。
术语“烷基(环烷基)”或“环烷基烷基”是指本文定义的烷基被本文定义的环烷基取代。非限制性的环烷基烷基包括环丙基甲基、环丁基甲基、环戊基甲基、环己基甲基等。
术语“芳香基”是指平面环具有离域的π电子***并且含有4n+2个π电子,其中n是整数。芳香基环可以由五、六、七、八、九或多于九个原子构成。芳香基可以是任选取代的。术语“芳香基”包括碳环芳基(例如苯基)和杂环芳基(或“杂芳基”或“杂芳香基”)基团(例如吡啶)。该术语包括单环或稠环多环(即共用相邻的碳原子对的环)基团。
本文使用的术语“芳基”是指芳香基环中每一个构成环的原子都是碳原子。芳基环可以由五、六、七、八、九或多于九个原子构成。芳基可以是任选取代的。芳基的实例包括但不限于苯基、萘基、菲基、蒽基、芴基和茚基。根据结构,芳基可以是单价基团或双价基团(即亚芳基)。
术语“芳氧基”是指-O-芳基,其中芳基如本文中定义。
术语“杂芳基”是指芳基中包括一个或多个选自氮、氧和硫的环杂原子。含N“杂芳基”部分是指芳香基中环上至少有一个骨架原子是氮原子。根据结构,杂芳基可以是单价基团或双价基团(即亚杂芳基)。杂芳基的实例包括但不限于吡啶基、咪唑基、嘧啶基、吡唑基、***基、吡嗪基、四唑基、呋喃基、噻吩基、异噁唑基、噻唑基、噁唑基、异噻唑基、吡咯基、喹啉基、异喹啉基、吲哚基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、吲唑基、吲嗪基、酞嗪基、哒嗪基、异吲哚基、蝶啶基、嘌呤基、噁二唑基、噻二唑基、呋咱基、苯并呋咱基、苯并噻吩基、苯并噻唑基、苯并噁唑基、喹唑啉基、萘啶基和呋喃并吡啶基等。
术语“烷基(芳基)”或“芳烷基”是指本文定义的烷基被本文定义的芳基取代。非限制性的烷基(芳基)包括苄基、苯乙基等。
术语“烷基(杂芳基)”或“杂芳基烷基”是指本文定义的烷基被本文定义的杂芳基取代。
本文使用的术语“杂烷基”是指本文定义的烷基中的一个或多个骨架链原子是杂原子,例如氧、氮、硫、硅、磷或它们的组合。所述杂原子(一个或多个)可以位于杂烷基内部的任意位置或在杂烷基与分子的其余部分相连的位置。
本文使用的术语“杂环烷基”或“杂环基”是指非芳香基环中一个或多个构成环的原子是选自氮、氧和硫的杂原子。杂环烷基环可以由三、四、五、六、七、八、九或多于九个原子构成。杂环烷基环可以是任选取代的。杂环烷基的实例包括但不限于内酰胺、内酯、环亚胺、环硫代亚胺、环氨基甲酸酯、四氢噻哺、4H-吡喃、四氢吡喃、哌啶、1,3-二噁英、1,3-二噁烷、1,4-二噁英、1,4-二噁烷、哌嗪、1,3-氧硫杂环己烷、1,4-氧硫杂环己二烯、1,4-氧硫杂环己烷、四氢-1,4-噻嗪、2H-1,2-噁嗪、马来酰亚胺、琥珀酰亚胺、巴比妥酸、硫代巴比妥酸、二氧代哌嗪、乙内酰脲、二氢尿嘧啶、吗啉、三噁烷、六氢-1,3,5-三嗪、四氢噻吩、四氢呋喃、吡咯啉、吡咯烷、咪唑烷,吡咯烷酮、吡唑啉、吡唑烷、咪唑啉、咪唑烷、1,3-二氧杂环戊烯、1,3-二氧杂环戊烷、1,3-二硫杂环戊烯、1,3-二硫杂环戊烷、异噁唑啉、异噁唑烷、噁唑啉、噁唑烷、噁唑烷酮、噻唑啉、噻唑烷和1,3-氧硫杂环戊烷。根据结构,杂环烷基可以是单价基团或双价基团(即亚杂环烷基)。
术语“烷基(杂环烷基)”或“杂环烷基烷基”是指本文定义的烷基被本文定义的杂环烷基取代。
术语“烷氧基(杂环烷基)”或“杂环烷基烷氧基”是指本文定义的烷氧基被本文定义的杂环烷基取代。
术语“卤”或“卤素”是指氟、氯、溴和碘。
术语“卤代烷基”、“卤代烷氧基”和“卤代杂烷基”包括烷基、烷氧基或杂烷基的结构,其中至少一个氢被卤原子置换。在某些实施方式中,如果两个或更多氢原子被卤原子置换,所述卤原子彼此相同或不同。
术语“羟基”是指-OH基团。
术语“氰基”是指-CN基团。
术语“酯基”是指具有式-COOR的化学部分,其中R选自烷基、环烷基、芳基、杂芳基(通过环碳连接)和杂环基(通过环碳连接)。
术语“氨基”是指-NH2基团。
术语“氨酰基”是指-CO-NH2基团。
术语“酰胺基”或“酰氨基”是指-NR-CO-R’,其中R和R’各自独立地为氢或烷基。
术语“烷基氨基”是指进一步被一个或两个烷基取代的氨基取代基,具体是指基团-NRR’,其中R和R’各自独立地选自氢或低级烷基,条件是-NRR’不是-NH2。“烷基氨基”包括其中-NH2的氮连接至少一个烷基基团的化合物的基团。烷基氨基基团的例子包括但不限于,甲基氨基、乙基氨基等。“二烷基氨基”包括其中-NH2的氮连接至少两个其它烷基基团的基团。二烷基氨基基团的例子包括但不限于,二甲基氨基、二乙基氨基等。
术语“芳基氨基”和“二芳基氨基”是指进一步被一个或两个芳基取代的氨基取代基,具体是指基团-NRR’,其中R和R’各自独立地选自氢、低级烷基、或芳基,其中N分别连接至少一个或两个芳基基团。
术语“环烷基氨基”是指进一步被一个或两个本文所定义的环烷基取代的氨基取代基。
术语“杂烷基氨基”是指进一步被一个或两个本文所定义的杂烷基取代的氨基取代基。
本文的术语“芳烷基氨基”是指其中R是低级芳烷基且R’是氢、低级烷基、芳基或低级芳烷基的基团-NRR’。
术语“杂芳基氨基”是指进一步被一个或两个本文所定义的杂芳基取代的氨基取代基。
术语“杂环烷基氨基”是指本文定义的氨基被本文定义的杂环烷基取代。
术语“烷基氨基烷基”是指本文定义的烷基被本文定义的烷基氨基取代。
术语“氨基烷基”是指进一步被一个或多个氨基取代的烷基取代基。
术语“氨基烷氧基”是指进一步被一个或多个氨基取代的烷氧基取代基。
术语“羟烷基”或“羟基烷基”是指进一步被一个或多个羟基取代的烷基取代基。
术语“氰基烷基”是指进一步被一个或多个氰基取代的烷基取代基。
术语“酰基”是指有机或无机含氧酸去掉羟基后剩下的一价原子团,通式为R-M(O)-,其中M通常为C。
术语“羰基”是由碳和氧两种原子通过双键连接而成的有机官能团(C=O)。
术语“烷酰基”或“烷基羰基”是指进一步被一个烷基取代的羰基。典型的烷酰基包括但不限于乙酰基、丙酰基、丁酰基、戊酰基、己酰基等。
术语“芳基羰基”是指本文定义的羰基被本文定义的芳基取代。
术语“烷氧基羰基”是指进一步被一个烷氧基取代的羰基。
术语“杂环烷基羰基”是指进一步被一个杂环烷基取代的羰基。
术语“烷基氨基羰基”、“环烷基氨基羰基”、“芳基氨基羰基”、“芳烷基氨基羰基”、“杂芳基氨基羰基”分别是指本文定义的羰基分别被本文定义的烷基氨基、环烷基氨基、芳基氨基、芳烷基氨基、或杂芳基氨基取代。
术语“烷基羰基烷基”或“烷酰基烷基”是指进一步被一个烷基羰基取代的烷基。
术语“烷基羰基烷氧基”或“烷酰基烷氧基”是指进一步被一个烷基羰基取代的烷氧基。
术语“杂环烷基羰基烷基”是指进一步被一个杂环烷基羰基取代的烷基。
术语“巯基”是指-SH基团。术语“烷硫基”是指本文所定义的巯基被本文所定义的烷基取代。
术语“砜基”或“磺酰基”是指磺酸失去羟基后的官能团,具体是指-S(=O)2-基团。
术语“亚砜基”或“亚磺酰基”是指-S(=O)-。
术语“氨基砜基”或“氨基磺酰基”是指-S(=O)2-NH2基团。
术语“烷基亚砜基”或“烷基亚磺酰基”是指-S(=O)-R,其中R为烷基。
术语“烷基砜基”或“烷基磺酰基”是指-S(=O)2-R,其中R为烷基。
术语“烷基氨基砜基”是指本文定义的砜基被本文定义的烷基氨基取代。
术语“烷基砜基氨基”或“环烷基砜基氨基”是指本文定义的氨基被本文定义的烷基砜基或环烷基砜基取代。
术语“环烷基砜基”和“环烷基磺酰基”是指-S(=O)2-R,其中R为环烷基。
术语“烷基磺酰胺基”和“环烷基磺酰胺基”是指-NH-S(=O)2-R,其中R分别为烷基和环烷基。
术语“季铵基”是指-N+RR’R”,其中R、R’和R”各自独立地选自具有1-8个碳原子的烷基。
术语“任选”指后面描述的一个或多个事件可以发生或可以不发生,并且包括发生的事件和不发生的事件两者。术语“任选取代的”或“取代的”是指所提及的基团可以被一个或多个额外的基团取代,所述额外的基团各自并且独立地选自烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、羟基、烷氧基、氰基、卤素、酰胺基、硝基、卤代烷基、氨基、甲磺酰基、烷基羰基、烷氧基羰基、杂芳基烷基、杂环烷基烷基、氨酰基、氨基保护基等。其中,氨基保护基优选选自新戊酰基、叔丁氧羰基、苄氧羰基、9-芴甲氧羰基、苄基、对甲氧苄基、烯丙氧羰基、和三氟乙酰基等。
本文使用的术语“酪氨酸蛋白激酶(tyrosine protein kinase,TPK)”是一类催化ATP上γ-磷酸转移到蛋白酪氨酸残基上的激酶,能催化多种底物蛋白质酪氨酸残基磷酸化,在细胞生长、增殖、分化中具有重要作用。
本文使用的术语激酶的“抑制”、“抑制的”或“抑制剂”,是指磷酸转移酶活性被抑制。
本文公开的化合物的“代谢物”是当该化合物被代谢时形成的化合物的衍生物。术语“活性代谢物”是指当该化合物被代谢时形成的化合物的生物活性衍生物。本文使用的术语“被代谢”,是指特定物质被生物体改变的过程总和(包括但不限于水解反应和由酶催化的反应,例如氧化反应)。因此,酶可以产生特定的结构转变为化合物。例如,细胞色素P450催化各种氧化和还原反应,同时二磷酸葡萄糖甘酸基转移酶催化活化的葡萄糖醛酸分子至芳香醇、脂肪族醇、羧酸、胺和游离的巯基的转化。新陈代谢的进一步的信息可以从《ThePharmacological Basis of Therapeutics》,第九版,McGraw-Hill(1996)获得。本文公开的化合物的代谢物可以通过将化合物给予宿主并分析来自该宿主的组织样品、或通过将化合物与肝细胞在体外孵育并且分析所得化合物来鉴别。这两种方法都是本领域已知的。在一些实施方式中,化合物的代谢物是通过氧化过程形成并与相应的含羟基化合物对应。在一些实施方式中,化合物被代谢为药物活性代谢物。本文使用的术语“调节”,是指直接或间接与靶标相互作用,以改变靶标的活性,仅仅举例来说,包括增强靶标的活性、抑制靶标的活性、限制靶标的活性或者延长靶标的活性。
本文使用的术语“靶蛋白”是指能被选择性结合化合物所结合的蛋白质分子或部分蛋白质。在某些实施方式中,靶蛋白是酪氨酸激酶TRKA(野生型或各种突变或其组合)、TRKB(野生型或各种突变或其组合)、TRKC(野生型或各种突变或其组合)。
本文使用的IC50是指在测量这样的效应的分析中获得最大效应的50%抑制的特定测试化合物的量、浓度或剂量。
本文使用的EC50是指测定化合物的剂量、浓度或量,其引起特定测定化合物诱导、刺激或加强的特定反应的50%的最大表达的剂量依赖反应。
本文使用的GI50是指使50%细胞生长被抑制所需的药物浓度,即药物使50%细胞(如癌细胞)的生长得到抑制或控制时的药物浓度。
本发明新型的激酶抑制剂
本发明提供一种新型的激酶抑制剂,包括式(I)的化合物或其药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、代谢物或前体药物,
其中,
X为-(CH=CH)m-,其中m为0或1,当m为0时X表示直接键;
Y选自-NH-或-(CH2)n-,其中n为0-3的整数,当n为0时Y表示直接键;
R1选自任选地被1-3个独立的R4基团取代的芳基和杂芳基;
R2选自氢和C1-6烷基;
R3选自任选地被1-2个独立的R5基团取代的C1-6烷基、C1-6烷基氨基、以及任选地被1-3个独立的R4基团取代的芳基、杂芳基和杂环基;
R4独立地选自卤素、氨基、C1-6烷基、C3-6环烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、C1-6羟基烷基、C1-6烷基氨基、C2-6烷酰胺基、(4-甲基哌嗪-1-基)甲基、吗啉甲基、吗啉基、4-甲基哌嗪-1-基、4-哌啶基、和4-四氢吡哺基;
R5独立地选自氨基、羟基、和C1-6烷硫基。
在优选的实施方式中,X为-(CH=CH)-。
在另一优选的实施方式中,Y为直接键或-CH2-。
在另外优选的实施方式中,R1选自任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、吡啶基、吡唑基、和嘧啶基,其中R4独立地选自卤素、氨基、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、和(4-甲基哌嗪-1-基)甲基;R1更优选为任选地被甲基、氨基或卤素取代的苯基、2-吡啶基、3-吡啶基、4-吡唑基、和5-嘧啶基;R1特别优选为2-吡啶基。
在另外优选的实施方式中,R2为氢或甲基。
在另外优选的实施方式中,R3选自任选地被1-2个独立的R5基团取代的C1-6烷基、C1-6烷基氨基、以及任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、萘基、吡啶基、哌嗪基、和哌啶基,其中R4独立地选自卤素、氨基、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、和(4-甲基哌嗪-1-基)甲基,R5独立地选自氨基、羟基、和甲硫基;R3更优选为任选地被氨基、羟基、或甲硫基取代的C1-6烷基、二甲氨基、任选地被甲基取代的N-哌嗪基、任选地被卤素、三氟甲基、或甲氧基取代的苯基、萘基、4-吡啶基、3-哌啶基、和任选地被甲基取代的4-哌啶基;R3特别优选为甲基、2-丙基、1-氨基-3-甲硫基-丙基、1-氨基-3-甲基-丁基、甲基取代的N-哌嗪基、甲氧基取代的苯基、4-吡啶基、或4-哌啶基。
在特别优选的实施方式中,当Y为直接键时,R3选自任选地被氨基、羟基、或甲硫基取代的C1-6烷基、和4-吡啶基;当Y为-CH2-时,R3选自任选地被甲氧基取代的苯基、任选地被甲基取代的N-哌嗪基、和任选地被甲基取代的4-哌啶基。
对于各个变量,上述基团的任意组合也在本文考虑之中。可以理解的是:本文所提供的化合物上的取代基和取代模式可以由本领域技术人员进行选择,以便提供化学上稳定的且可以使用本领域已知的技术以及本文阐述的技术合成的化合物。
在优选的实施方式中,本发明的抑制剂包括下表1的化合物或其药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、代谢物或前药。
表1
本文描述的是新型的激酶抑制剂。本文也描述了此化合物的药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、药物活性代谢物和前药。
在另外的或进一步的实施方式中,将本文描述的化合物给予有需要的生物体后在其体内代谢产生代谢物,所产生的代谢物然后用于产生期望的效果,包括期望的治疗效果。
本文描述的化合物可以被制成和/或被用作药学可接受的盐。药学可接受的盐的类型包括但不限于:(1)酸加成盐、通过将化合物的游离碱形式与药学可接受的无机酸反应形成,所述无机酸如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸、偏磷酸等;或与有机酸反应形成,所述有机酸如乙酸、丙酸、己酸、环戊烷丙酸、羟基乙酸、丙酮酸、乳酸、丙二酸、苹果酸、柠檬酸、琥珀酸、马来酸、酒石酸、反丁烯二酸、三氟乙酸、苯甲酸、3-(4-羟基苯甲酰基)苯甲酸、肉桂酸、扁桃酸、甲烷磺酸、乙烷磺酸、1,2-乙二磺酸、2-羟基乙磺酸、苯磺酸、甲苯磺酸、4-甲基双环-[2.2.2]辛-2-烯-1-甲酸、2-萘磺酸、叔丁基乙酸、葡庚糖酸、4,4′-亚甲基双-(3-羟基-2-烯-1-甲酸)、3-苯基丙酸、三甲基乙酸、十二烷基硫酸、葡糖酸、谷氨酸、水杨酸、羟基萘酸、硬脂酸、粘康酸等;(2)碱加成盐,其在母体化合物中的酸性质子被金属离子置换时形成,例如碱金属离子(例如锂、钠、钾)、碱土金属离子(例如镁或钙)或铝离子;或与有机碱或无机碱配位,可接受的有机碱包括乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、三甲胺、N-甲基葡萄糖胺等;可接受的无机碱包括氢氧化铝、氢氧化钙、氢氧化钾、碳酸钠、氢氧化钠等。
药学可接受的盐的相应的平衡离子可以使用各种方法分析和鉴定,所述方法包括但不限于离子交换色谱、离子色谱、毛细管电泳、电感耦合等离子体、原子吸收光谱、质谱或它们的任何组合。
使用以下技术的至少一种回收所述盐:过滤、用非溶剂沉淀接着过滤、溶剂蒸发,或水溶液的情况下使用冻干法。
筛选和表征药学可接受的盐、多晶型和/或溶剂化物可以使用多种技术完成,所述技术包括但不限于热分析、X射线衍射、光谱、显微镜方法、元素分析。使用的各种光谱技术包括但不限于Raman、FTIR、UVIS和NMR(液体和固体状态)。各种显微镜技术包括但不限于IR显微镜检术和拉曼(Raman)显微镜检术。
本发明的药物组合物
本申请还提供药物组合物,其包含至少一种式(I)的化合物或所述化合物的药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、药物活性代谢物或前药、以及药学可接受的载体或赋形剂、以及任选的其它治疗剂。
在治疗过程中,可以根据情况单独或与一种或多种其它的治疗剂组合使用。可以通过注射、口服、吸入、直肠和经皮施用中的至少一种将包含本发明化合物的药物施用给患者。其它的治疗剂可以选自以下药物:免疫抑制剂(例如他克莫司、环抱菌素、雷帕霉素、甲氨蝶岭、环磷酰胺、硫唑嘌呤、巯嘌呤、麦考酚酯或FTY720)、糖皮质激素类药(例如***、醋酸可的松、***龙、甲泼尼龙、***、倍他米松、曲安西龙、氢羟强的松龙、倍氯米松、醋酸氟氢可的松、醋酸脱氧皮质酮、醛固酮)、非甾体抗炎药(例如水杨酸盐、芳基烷酸、2-芳基丙酸、N-芳基邻氨基苯甲酸、昔康类、考昔类或硫酰替苯胺)、***反应疫苗、抗组胺药、抗白三烯药、β-激动剂、茶碱、抗胆碱药或其它选择性激酶抑制剂(例如mTOR抑制剂、c-Met抑制剂)或her2抗体-药物。另外,所提及的其它治疗剂还可以是雷帕霉素(Rapamycin)、克唑替尼(Crizotinib)、他莫昔芬、雷洛昔芬、阿那曲唑、依西美坦、来曲唑、赫赛汀TM(曲妥珠单抗)、格列卫TM(伊马替尼)、紫杉醇TM(紫杉醇)、环磷酰胺、洛伐他汀、美诺四环素(Minosine)、阿糖胞苷、5-氟尿嘧啶(5-FU)、甲氨蝶呤(MTX)、紫杉特尔TM(多西他赛)、诺雷德TM(戈舍瑞林)、长春新碱、长春碱、诺考达唑、替尼泊苷、依托泊苷、健择TM(吉西他滨)、埃博霉素(Epothilone)、诺唯本、喜树碱、柔红霉素(Daunonibicin)、更生霉素、米托蒽醌、安吖啶、多柔比星(亚德里亚霉素)、表柔比星或伊达比星。或者,其它治疗剂也可以是细胞因子例如G-CSF(粒细胞集落刺激因子)。或者,其它治疗剂也可以是,例如但不限于,CMF(环磷酰胺、甲氨蝶呤和5-氟尿嘧啶)、CAF(环磷酰胺、亚德里亚霉素和5-氟尿嘧啶)、AC(亚德里亚霉素和环磷酰胺)、FEC(5-氟尿嘧啶、表柔比星和环磷酰胺)、ACT或ATC(亚德里亚霉素、环磷酰胺和紫杉醇)或CMFP(环磷酰胺、甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶和***)。
在本发明的实施方式中,在根据本发明对患者进行治疗时,给定药物的量取决于诸多因素,如具体的给药方案、疾病或病症类型及其严重性、需要治疗的受治疗者或宿主的独特性(例如体重),但是,根据特定的周围情况,包括例如已采用的具体药物、给药途径、治疗的病症、以及治疗的受治疗者或宿主,施用剂量可由本领域已知的方法常规决定。通常,就成人治疗使用的剂量而言,施用剂量典型地在0.02-5000mg/天,例如约1-1500mg/天的范围。该所需剂量可以方便地被表现为一剂、或同时给药的(或在短时间内)或在适当的间隔的分剂量,例如每天二、三、四剂或更多分剂。本领域技术人员可以理解的是,尽管给出了上述剂量范围,但具体的有效量可根据患者的情况并结合医师诊断而适当调节。
本发明的药物的用途
本发明的激酶抑制剂包括式(I)的化合物或其药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、代谢物或前药、或药物组合物,用于降低或抑制细胞或受试者的TRKA、TRKB、TRKC或者它们的点突变如TRKA的F589L、V573M、G667C、G667S和G667A,TRKB的F633L和G709C突变,和/或TRKC的F617L、G696A和G696C突变激酶活性,并且/或者在受试者中预防或治疗与TRKA、TRKB、TRKC或者它们的点突变如TRKA的F589L、V573M、G667C、G667S和G667A,TRKB的F633L和G709C突变,和/或TRKC的F617L、G696A和G696C突变等激酶活性相关病症。
式(I)的化合物或其药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、代谢物或前药,或其药物组合物可用于治疗、预防或改善一种或多种选自下组的疾病:实体瘤(包括良性或者尤其恶性类型)、尤其肉瘤、胃肠道间质肿瘤(Gastrointestinal Stromal Tumors,GIST)、结直肠癌(colon cancer)、急性粒细胞白血病(Acute Myeloblastic Leukemia,AML)、慢性髓性白血病(Chronic Myelogenous Leukemia,CML)、瘤形成、甲状腺癌、***性肥大细胞病、嗜酸性粒细胞增多综合征、纤维变性、红斑狼疮、移植物抗宿主病、神经纤维瘤、肺高压、阿尔茨海默病、***瘤、无性细胞瘤、肥大细胞肿瘤、肺癌、支气管癌、睾丸上皮内瘤形成、黑色素瘤、乳癌、神经母细胞瘤、***状/滤泡型甲状腺癌、恶性淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、2型多发性内分泌瘤形成、嗜铬细胞瘤、甲状腺癌、甲状旁腺增生/腺瘤、结肠癌、结肠直肠腺瘤、卵巢癌、***癌、成胶质细胞瘤、脑肿瘤、恶性神经胶质瘤、胰腺癌、恶性胸膜间皮瘤、成血管细胞瘤、血管瘤、肾癌、肝癌、肾上腺癌、膀胱癌、胃癌、直肠癌、***癌、***、子宫内膜癌、多发性骨髓瘤、颈和头部肿瘤、以及其他增生性或增殖性疾病或类似疾病、或其组合。特别优选治疗胃肠道间质瘤、结直肠癌、急性粒细胞白血病、慢性髓性白血病、甲状腺癌或类似疾病、或其组合。最优选地,本发明的抑制剂或其药物组合物可用于治疗或预防TRKA的F589L、V573M、G667C、G667S和G667A突变,TRKB的F633L和G709C突变,和/或TRKC的F617L、G696A和G696C突变相关的疾病。
式(I)所述化合物或其药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、代谢物或前药,或其药物组合物可用于治疗、预防或改善选自下组的自身免疫性疾病:关节炎、风湿性关节炎、骨关节炎、狼疮、类风湿性关节炎、炎性肠病、银屑病性关节炎、骨关节炎、斯蒂尔病(Still′sdisease)、青少年关节炎、糖尿病、重症肌无力症、桥本甲状腺炎(Hashimoto′sthyroiditis)、奥德甲状腺炎(Ord′s hyroiditis)、格雷夫斯病(Graves′disease)、类风湿性关节炎综合征(syndrome)、多发性硬化症、传染性神经元炎(Guillain-Barrésyndrome)、急性播散性脑脊髓炎、阿狄森病(Addison′s disease)、视性眼阵孪-肌阵孪综合征、强直性脊椎炎、抗磷脂抗体综合征、再生障碍性贫血、自身免疫性肝炎、乳糜泻(coeliac disease)、古德帕斯彻综合征(Goodpasture′s syndrome)、特发性血小板减少性紫癜、视神经炎、硬皮病、原发性胆汁性肝硬化、莱特尔综合征(Reiter′s syndrome)、高安动脉炎(Takayasu′s arteritis)、颞动脉炎、温型自身免疫性溶血性贫血、韦格纳肉芽肿病(Wegener′s granulomatosis)、银屑病、全身脱毛、贝赫切特病(Behcet′s disease)、慢性疲劳、家族性自主神经功能异常、子宫内膜异位、间质性膀胱炎、神经肌强直、硬皮病或外阴痛。
特别地,本发明的式(I)的化合物或其药学可接受的盐、溶剂化物、酯、酸、代谢物或前药,或其药物组合物可用于治疗以下与TRKA、TRKB、TRKC或者它们的点突变如TRKA的F589L、V573M、G667C、G667S和G667A,TRKB的F633L和G709C突变,和/或TRKC的F617L、G696A和G696C突变等激酶活性相关病症:***状甲状腺癌、胰腺癌、结直肠癌、乳癌、黑色素瘤、非小细胞肺癌、急性髓性白血病、成神经细胞瘤、疼痛、皮炎或哮喘。
化合物的制备
使用本领域技术人员已知的标准合成技术或使用本领域已知的方法与本文描述的方法组合,可以合成式(I)的化合物。另外,本文给出的溶剂、温度和其它反应条件可以根据本领域技术而改变。作为进一步的指导,也可以利用以下的合成方法。
所述反应可以按顺序使用,以提供本文描述的化合物;或它们可以用于合成片段,所述片段通过本文描述的方法和/或本领域已知的方法随后加入。
在某些实施方式中,本文提供的是本文描述的激酶抑制剂化合物的制备方法及其使用方法。在某些实施方式中,本文描述的化合物可以使用以下合成的方案合成。可以使用与下述类似的方法,通过使用适当的可选择的起始原料,合成化合物。
用于合成本文描述的化合物的起始原料可以被合成或可以从商业来源获得。本文描述的化合物和其它相关具有不同取代基的化合物可以使用本领域技术人员已知的技术和原料合成。制备本文公开的化合物的一般方法可以来自本领域已知的反应,并且该反应可以通过由本领域技术人员所认为适当的试剂和条件修改,以引入本文提供的分子中的各种部分。
如果需要,反应产物可以使用常规技术分离和纯化,包括但不限于过滤、蒸馏、结晶、色谱等方法。这些产物可以使用常规方法表征,包括物理常数和图谱数据。
制备式(I)的化合物的合成方案的非限制性实施例参见以下合成路线。
实施例1:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-
基)-4-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)苯甲酰胺
N-(4-甲基噻唑-2-基)乙酰胺:在100mL圆底烧瓶中加入4-甲基噻唑-2-胺(2g)后加入无水二氯甲烷(50mL)、三乙胺(3.9mL),慢慢滴加乙酰氯(1.5mL)。反应体系在室温下、氩气保护反应4小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用饱和碳酸氢钠中和至pH>10后,用乙酸乙酯萃取。有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。粗品经加压硅胶柱层析提纯后得纯品,MS(ESI)m/z(M+1)+:157.05。
(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)乙酰胺:在圆底烧瓶中加入N-(4-甲基噻唑-2-基)乙酰胺(1.0g)后加入二甲亚砜(20mL)、(E)-6-碘-3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑(3.1g)、四三苯基膦钯(0.37g)和碳酸铯(6.2g)。反应体系在氩气保护下加热至130℃反应14小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用水稀释后用乙酸乙酯萃取。有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。粗品经加压硅胶柱层析提纯后得纯品,MS(ESI)m/z(M+1)+:460.18。
(E)-4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-胺:在100mL圆底烧瓶中加入(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)乙酰胺(2.0g)、乙醇(20mL)和6摩尔/升盐酸(15mL)。反应体系在氩气保护下加热至90℃反应14小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用饱和碳酸氢钠中和至pH>10后,有固体析出,过滤,得粗品。粗品经乙酸乙酯洗涤,得纯品,MS(ESI)m/z(M+1)+:334.11。
(E)-6-(2-氨基-4-甲基噻唑-5-基)-3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-1-甲酸叔丁酯:在50mL圆底烧瓶中加入(E)-4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-胺(1g)后加入无水N,N-二甲基甲酰胺(10mL)、三乙胺(0.9mL)、二碳酸二叔丁酯(1.0g)。反应体系在室温下、氩气保护反应4小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用饱和碳酸氢钠中和至pH>10后用乙酸乙酯萃取水相。有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。粗品经加压硅胶柱层析提纯后得纯品,MS(ESI)m/z(M+1)+:434.17。
(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)-4-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)苯甲酰胺(1):在圆底烧瓶中加入(E)-6-(2-氨基-4-甲基噻唑-5-基)-3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-1-甲酸叔丁酯(0.05g)后加入N,N-二甲基甲酰胺(5mL)、4-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)苯甲酸(0.03g)、2-(7-氧化苯并三氮唑)-N,N,N′,N′-四甲基脲六氟磷酸酯(0.07g)和三乙胺(0.03mL)。反应体系在氩气保护下室温搅拌14小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用水稀释后用乙酸乙酯萃取。有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。
粗品溶于无水二氯甲烷(2毫升),加入三氟乙酸(1毫升)。反应体系在氩气保护下室温搅拌14小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用水稀释后用饱和碳酸氢钠溶液中和至pH>10。水相用乙酸乙酯萃取,有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。粗品经加压硅胶柱层析提纯后得化合物1,MS(ESI)m/z(M+1)+:550.24。
实施例2:(E)-4-氯-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻
唑-2-基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺
实施例2的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:540.09。
实施例3:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-
基)-2-(3-(三氟甲基)苯基)乙酰胺
实施例3的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:520.14。
实施例4:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-
基)异烟酰胺
实施例4的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:439.14。
实施例5:(E)-N-(5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)乙酰 胺
实施例5的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:361.11。
实施例6:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-
基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺
实施例6的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:506.13。
实施例7:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-
基)-2-(蓁-1-基)乙酰胺
实施例7的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:502.17。
实施例8:(E)-2-(3,4-甲氧基苯基)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-
1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)乙酰胺
实施例8的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:512.18。
实施例9:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-
基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺
实施例9的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:474.21。
实施例10:(E)-2-(3-氯苯基)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲
唑-6-基)噻唑-2-基)乙酰胺
实施例10的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:486.12。
实施例11:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-
2-基)-2-(哌啶-4-基)乙酰胺
实施例11的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:459.20。
实施例12:(E)-2-(二甲氨基)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲
唑-6-基)噻唑-2-基)乙酰胺
实施例12的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:419.17。
实施例13:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-
2-基)-2-(哌啶-3-基)乙酰胺
实施例13的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:459.20。
实施例14:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-
2-基)哌啶-4-甲酰胺
实施例14的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:445.18。
实施例15:(E)-2-氨基-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-
基)噻唑-2-基)-4-(甲硫基)丁酰胺
实施例15的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:465.16。
实施例16:(E)-1-甲基-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-
基)噻唑-2-基)哌啶-4甲酰胺
实施例16的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:458.20。
实施例17:(E)-2-氨基-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6- 基)噻唑-2-基)丙酰胺
实施例17的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:405.15。
实施例18:(E)-2-氧基-4-甲基-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲
唑-6-基)噻唑-2-基)戊酰胺
实施例18的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:447.20。
实施例19:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-
2-基)异丁酰胺
实施例19的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:404.16。
实施例20:(E)-2-氨基-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-
基)噻唑-2-基)-3-苯基丙酰胺
实施例20的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:481.18。
实施例21:N-(4-甲基-5-(3-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-
基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺
2-(4-甲基哌嗪-1-基)-N-(4-甲基噻唑-2-基)乙酰胺(21a):在圆底烧瓶中加入4-甲基噻唑-2-胺(1.0g)后加入N,N-二甲基甲酰胺(20mL)、2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酸(1.5g)、2-(7-氧化苯并三氮唑)-N,N,N′,N′-四甲基脲六氟磷酸酯(5.0g)和三乙胺(2.5mL)。反应体系在氩气保护下室温搅拌14小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用水稀释后用乙酸乙酯萃取。有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。粗品经加压硅胶柱层析提纯后得纯品,MS(ESI)m/z(M+1)+:255.13。
N-(4-甲基-5-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺(21b):在圆底烧瓶中加入2-(4-甲基哌嗪-1-基)-N-(4-甲基噻唑-2-基)乙酰胺(1.0g)后加入二甲亚砜(10mL)、6-碘-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑(1.3g)、四三苯基膦钯(0.45g)和碳酸铯(3.8g)。反应体系在氩气保护下加热至130℃反应14小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用水稀释后用乙酸乙酯萃取。有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。粗品经加压硅胶柱层析提纯后得纯品,MS(ESI)m/z(M+1)+:455.23。
N-(5-(1H-吲唑-6-基)-4-甲基噻唑-2-基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺(21c):在50mL圆底烧瓶中加入N-(4-甲基-5-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺(1.0g)、乙醇(10mL)和6摩尔/升盐酸(5mL)。反应体系在氩气保护下加热至90℃反应14小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用饱和碳酸氢钠中和至pH>10后,有固体析出,过滤,得粗品。粗品经乙酸乙酯洗涤,得纯品,MS(ESI)m/z(M+1)+:371.17。
N-(5-(3-碘-1H-吲唑-6-yl)-4-甲基噻唑-2-基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺(21d):在50mL圆底烧瓶中加入N-(5-(1H-吲唑-6-基)-4-甲基噻唑-2-基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺(0.6g)后加入N,N-二甲基甲酰胺(10mL)、碘(0.8g)和氢氧化钾(0.4g)。反应体系在氩气保护下室温搅拌8小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用水稀释后,水相用乙酸乙酯萃取,有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。粗品经加压硅胶柱层析提纯后得纯品,MS(ESI)m/z(M+1)+:497.06。
N-(5-(1-乙酰基-3-碘-1H-吲唑-6-基)-4-甲基噻唑-2-基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺(21e):在50mL圆底烧瓶中加入N-(5-(3-碘-1H-吲唑-6-yl)-4-甲基噻唑-2-基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺(0.5g)后加入无水二氯甲烷(10mL)、三乙胺(0.3mL)、乙酰氯(0.1g)。反应体系在室温下、氩气保护反应4小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用饱和碳酸氢钠中和至pH>10后用乙酸乙酯萃取。有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。粗品经加压硅胶柱层析提纯后得纯品,MS(ESI)m/z(M+1)+:538.07。
N-(4-甲基-5-(3-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺(21):在圆底烧瓶中加入N-(5-(1-乙酰基-3-碘-1H-吲唑-6-基)-4-甲基噻唑-2-基)-2-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺(0.1g)后加入1,4-二氧六环(10mL)、水(2mL)、(1-甲基-1H-吡唑-4-基)硼酸(0.03g)、四三苯基膦钯(0.02g)和碳酸钾(0.07g)。反应体系在氩气保护下加热至80℃反应14小时。反应结束后,体系在减压下蒸干溶剂,所得物用水稀释后用乙酸乙酯萃取。有机相分别用水、饱和食盐水洗涤后用无水硫酸钠干燥。有机相经过滤,减压蒸干后得粗品。粗品经加压硅胶柱层析提纯后得化合物21,MS(ESI)m/z(M+1)+:451.21。
实施例22:(E)-2-羟基-4-甲基-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲
唑-6-基)噻唑-2-基)戊酰胺
实施例22的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:448.18。
实施例23:N-(5-(3-(2-氨基嘧啶-5-基)-1H-吲唑-6-基)-4-甲基噻唑-2-基)-2-
(4-甲基哌嗪-1-基)乙酰胺
实施例23的合成通过使用类似于实施例21中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:464.20。
实施例24:N-(4-甲基-5-(3-(吡啶-3-基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)-2-(4-甲基
哌嗪-1-基)乙酰胺
实施例24的合成通过使用类似于实施例21中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:448.19。
实施例25:N-(5-(3-(5-氟吡啶-3-基)-1H-吲唑-6-基)-4-甲基噻唑-2-yl)-2-(4-
甲基哌嗪-1-基)乙酰胺
实施例25的合成通过使用类似于实施例21中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:466.18。
实施例26:N-(5-(3-(3-氟苯基)-1H-吲唑-6-基)-4-甲基噻唑-2-基)-2-(4-甲基
哌嗪-1-基)乙酰胺
实施例26的合成通过使用类似于实施例21中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:465.19。
实施例27:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-
2-基)-2-(1-甲基哌啶-4-基)乙酰胺
实施例27的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:473.21。
实施例28:N-(4-甲基-5-(3-(吡啶-3-基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-2-基)-2-(3-(三
氟甲基)苯基)乙酰胺
实施例28的合成通过使用类似于实施例21中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:494.13。
实施例29:(E)-1-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-其)噻唑-
2-基)-3-(3-(三氟甲基)苯基)脲
实施例29的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:521.14。
实施例30:(E)-N-(4-甲基-5-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)噻唑-
2-基)乙酰胺
实施例30的合成通过使用类似于实施例1中所述的步骤完成。MS(ESI)m/z(M+1)+:376.13。
实施例31:对癌细胞增殖的影响
通过测试本发明的化合物对癌细胞生长的影响,进一步评估文中化合物对癌细胞增殖的抑制作用、及其对抑制癌细胞增殖的选择性。
本实施例中选用了带有荧光素的人结直肠癌细胞KM-12-LUC(表达TPM3-NTRK1基因)(购自Japanese Collection of Research Bioresources Cell Bank,日本)、和小鼠原B细胞BaF3(购自ATCC)。此外,本实施例还选用了小鼠BaF3-tel-TRKA(稳定表达TRKA野生型激酶)、BaF3-LMNA-TRKA(稳定表达LMNA-TRKA融合激酶)、BaF3-LMNA-TRKA/V573M(稳定表达TRKA/V573M突变激酶)、BaF3-LMNA-TRKA/F589L(稳定表达TRKA/F589L突变激酶)、BaF3-LMNA-TRKA/G667C(稳定表达TRKA/G667C突变激酶)、BaF3-LMNA-TRKA/G667S(稳定表达TRKA/G667S突变激酶)、BaF3-tel-TRKB(稳定表达TRKB野生型激酶)、BaF3-tel-TRKB/F633L(稳定表达TRKB/F633L突变型激酶)、BaF3-tel-TRKB/G709C(稳定表达TRKB/G709C突变型激酶)、BaF3-tel-TRKC(稳定表达TRKC野生型激酶)、BaF3-tel-TRKC/F617L(稳定表达TRKC/F617L突变型激酶)、BaF3-tel-TRKC/G696A(稳定表达TRKC/G696A突变型激酶)、BaF3-tel-TRKC/G696C(稳定表达TRKC/G696C突变型激酶)。上述细胞系均由本实验室构建,构建方法为:经PCR分别扩增人类TRKA、TRKB、TRKC、TRKA/V573M、TRKA/F589L、TRKA/G667C、TRKA/G667S、TRKB/F633L、TRKB/G709C、TRKC/F617L、TRKC/G696A、TRKC/G696C激酶区序列,并分别***到带有N端TEL片段和/或LMNA片段和/或TPR片段的MSCV-Puro载体(购自Clontech),通过逆转录病毒方法,稳定转入小鼠BaF3细胞,并且撤除IL-3生长因子,最终得到依赖TRKA、TRKB、TRKC、TRKA/V573M、TRKA/F589L、TRKA/G667C、TRKA/G667S、TRKB/F633L、TRKB/G709C、TRKC/F617L、TRKC/G696A、TRKC/G696C转入蛋白的细胞系。
在实施例中将不同浓度(0.000508μM、0.00152μM、0.00457μM、0.0137μM、0.0411μM、0.123μM、0.370μM、1.11μM、3.33μM、10μM于DMSO中)的本发明化合物及对照化合物LOXO-101、LOXO-195(购自中国,MedChem Express)分别加入到上述细胞中,并孵育72小时,通过CCK-8(购自中国,MedChem Express)细胞活力检测试剂盒(CCK-8可被活细胞中的脱氢酶还原为具有高度水溶性的黄色甲瓒产物,生成的甲瓒物数量与活细胞的数量成正比)对孵育后的细胞进行检测,通过酶标仪对活细胞的数目进行定量,并计算各个化合物和对照化合物的GI50(结果示于表2至表4中)。
表2的结果表明,本发明的化合物对于TRK具有很强的抑制活性。进一步地,如表3所示,在对突变型TRKA激酶进行检测后,发现本发明的化合物对于TRKA/V573M、TRKA/F589L、TRKA/G667C、TRKA/G667S都有很强的抑制作用,对于第一代TRK抑制剂LOXO-101的耐药点突变,本发明的化合物能够克服上述突变后对于第一代TRK抑制剂LOXO-101的耐药性问题,在细胞上的作用结果也优于第二代TRK抑制剂LOXO-195。另外,如表4所示,本发明的化合物对于野生型和突变型的TRKB和TRKC也有很强的抑制作用。
表2.本发明的化合物对于TRKA的抑制活性
表3.本发明的化合物对于TRKA野生型以及相关突变型的抑制活性
表4.本发明的化合物对于TRKB/C野生型以及相关突变型的抑制活性
进一步检测了本发明的化合物9对于带有荧光素标签的结直肠癌细胞系人结直肠癌细胞KM-12-LUC(表达TPM3-NTRK1基因)的抗增殖作用。表5所示的结果表明,本发明的化合物9能够抑制该细胞的增殖,同时选用了第一代和第二代的TRK抑制剂LOXO-101和LOXO-195作为对照化合物,并且化合物9的抑制作用优于两个对照化合物。
表5.本发明的化合物对于人结直肠癌细胞KM-12-LUC的抗增殖作用
GI50/μM | KM-12-LUC |
化合物9 | 0.002 |
LOXO-101 | 0.011 |
LOXO-195 | 0.005 |
实施例32:动物实验
在本实施例中,分别测试化合物9及对照化合物LOXO-101和LOXO-195在BaF3-tel-TRKA、BaF3-LMNA-TRKA-F589L的小鼠模型中的实验结果。
实验步骤如下:
(1)从北京维通利华实验动物有限责任公司购买饲养4-6周龄的Bal b/c雌性裸鼠,饲养于SPF级实验室中,饮水及垫料均经高压消毒无菌处理,有关小鼠的所有操作均在无菌条件下进行。
(2)第0天分别在所有小鼠左侧背部皮下分别注入约5×106个BaF3-tel-TRKA和5×106个BaF3-LMNA-TRKA-F589L细胞(由本实验室构建)。
(3)从第6天开始,每天使对应小鼠口服给药甲基纤维素(HKI)溶媒(5只小鼠);剂量为40mg/kg、80mg/kg鼠重的化合物9每天一次(各5只小鼠);剂量为80mg/kg鼠重的LOXO-101每天两次(购自MedChemExpress,中国)(5只小鼠)。对于BaF3-LMNA-TrKA-F589L的小鼠模型从第6天开始,每天使对应小鼠口服给药甲基纤维素(HKI)溶媒(5只小鼠);剂量为剂量为40mg/kg、80mg/kg的化合物9每天一次(各5只小鼠);剂量为80mg/kg鼠重的LOXO-195每天两次(5只小鼠)。
(4)从第6天(开始,每天用游标卡尺测量皮下肿瘤的长/宽,并每天记录小鼠体重,分别确定化合物9、LOXO-101、LOXO-195对小鼠体重的影响。
(5)统计内皮下肿瘤生长趋势,肿瘤体积计算方法:长×宽×宽/2mm3。
实验结果如图1a-b和2a-b所示。化合物9在BaF3-tel-TrKA的小鼠肿瘤模型中,每天用药剂量为40mg/kg时已经表现出很好的抑制小鼠肿瘤的效果,且随着用药天数的增加,化合物9对小鼠肿瘤的抑制作用愈发显著,并且优于对照化合物LOXO-101的80mg/kg每天两次给药的效果。化合物9在BaF3-LMNA-TrKA-F589L的小鼠肿瘤模型中,化合物9在每天给药剂量为40mg/kg时已经表现出很好的抑制小鼠肿瘤的效果,优于对照化合物LOXO-195的80mg/kg每天两次给药的效果。
本发明提供一种吲唑类抑制剂化合物的新用途,其可以用于降低或抑制细胞或受试者的携带TRKA/B/C突变和/或融合基因,例如TRKA的V573M、F589L、G667C/S突变,TRKB的F633L和G709C突变,和/或TRKC的F617L、G696A和G696C突变的激酶活性,并且/或者在受试者中预防或治疗与TRKA/B/C突变和/或融合基因,例如TRKA的V573M、F589L、G667C/S突变,TRKB的F633L、G709C突变和/或TRKC的F617L、G696A/C突变的活性相关病症。因而,本发明适于工业应用。
尽管本文对本发明作了详细说明,但本发明不限于此,本技术领域的技术人员可以根据本发明的原理进行修改,因此,凡按照本发明的原理进行的各种修改都应当理解为落入本发明的保护范围。
Claims (11)
1.一种式(I)的化合物或其药学可接受的盐,在制备用于治疗携带TRKA/B/C突变和/或融合基因的疾病的药物中的用途,所述疾病选自***状甲状腺癌、胰腺癌、结直肠癌、乳癌、黑色素瘤、非小细胞肺癌、急性髓性白血病、成神经细胞瘤、疼痛、皮炎和哮喘,
其中,
X为-(CH=CH)m-,其中m为0或1;
Y选自-NH-或-(CH2)n-,其中n为0-3的整数;
R1选自任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的吡啶基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的吡唑基、和任选地被1-3个独立的R4基团取代的嘧啶基;
R2选自氢和C1-6烷基;
R3选自任选地被1-2个独立的R5基团取代的C1-6烷基、C1-6烷基氨基、以及任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的萘基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的吡啶基、任选地被1-3个独立的R4基团取代的哌嗪基、和任选地被1-3个独立的R4基团取代的哌啶基;
R4独立地选自卤素、氨基、C1-6烷基、C3-6环烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、C1-6羟基烷基、C1-6烷基氨基、C2-6烷酰胺基、(4-甲基哌嗪-1-基)甲基、吗啉甲基、吗啉基、4-甲基哌嗪-1-基、4-哌啶基、和4-四氢吡喃基;
R5独立地选自氨基、羟基、和C1-6烷硫基;
所述烷基氨基是指进一步被一个或两个烷基取代的氨基取代基。
2.根据权利要求1所述的用途,其中X为-(CH=CH)-。
3.根据权利要求1所述的用途,其中Y为直接键或-CH2-。
4.根据权利要求1所述的用途,其中R1选自任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、吡啶基、吡唑基、和嘧啶基,其中R4独立地选自卤素、氨基、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、和(4-甲基哌嗪-1-基)甲基。
5.根据权利要求4所述的用途,其中R1选自任选地被甲基、氨基或卤素取代的苯基、2-吡啶基、3-吡啶基、4-吡唑基、和5-嘧啶基。
6.根据权利要求1所述的用途,其中R2为氢或甲基。
7.根据权利要求1所述的用途,其中R3选自任选地被1-2个独立的R5基团取代的C1-6烷基、C1-6烷基氨基、以及任选地被1-3个独立的R4基团取代的苯基、萘基、吡啶基、哌嗪基、和哌啶基,其中R4独立地选自卤素、氨基、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、和(4-甲基哌嗪-1-基)甲基,R5独立地选自氨基、羟基、和甲硫基。
8.根据权利要求7所述的用途,其中R3选自任选地被氨基、羟基、或甲硫基取代的C1-6烷基、二甲氨基、任选地被甲基取代的N-哌嗪基、任选地被卤素、三氟甲基、或甲氧基取代的苯基、萘基、4-吡啶基、3-哌啶基、和任选地被甲基取代的4-哌啶基。
9.根据权利要求1所述的用途,其中当Y为直接键时,R3选自任选地被氨基、羟基、或甲硫基取代的C1-6烷基、和4-吡啶基;当Y为-CH2-时,R3选自任选地被甲氧基取代的苯基、任选地被甲基取代的N-哌嗪基、和任选地被甲基取代的4-哌啶基。
11.根据权利要求1-10中任一项所述的用途,其中所述疾病是携带选自TRKA的V573M、F589L、G667C、和/或G667S突变,TRKB的F633L、和/或G709C突变,以及TRKC的F617L、G696A、和/或G696C突变中的一种或两种以上突变的疾病。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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