CN111763748A - 一种番红砗磲、无鳞砗磲和砗蚝鉴定的通用单引物、试剂盒和鉴别方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种番红砗磲、无鳞砗磲和砗蚝鉴定的通用单引物、试剂盒和鉴别方法。本发明建立了利用多条下游引物竞争性退火的通用单引物多重PCR检测和鉴别番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝的方法,并经实际样本测试,具有方法简单、结果直观、准确有效、不受环境及发育时期影响、成本低廉等优点。
Description
技术领域:
本发明属于水产生物中的分子鉴别技术领域,具体涉及一种番红砗磲、无鳞砗磲和砗蚝鉴定的通用单引物、试剂盒和鉴别方法。
背景技术:
通用单引物多重PCR技术是在一个PCR反应体系中加入一条通用性引物和多条物种特异性引物,只有与特异性引物配对的序列才能被扩增出来,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,然后与标准片段进行比较,从而实现物种鉴定。通用单引物多重PCR技术具有高效、快速、结果可靠等优点,在物种鉴定中被广泛应用。
砗磲隶属于软体动物门、瓣鳃纲,帘蛤目,砗磲科,是一类热带大型海洋珊瑚礁底栖贝类,也是海洋中最大的双壳贝类。砗磲属于高经济价值物种,是热带海洋生物和渔业经济的物质基础,提供水族观赏、工艺材料、水产食品等资源。另外砗磲也是珊瑚礁关键框架生物,在维护生态***功能方面具有重要的生态价值。番红砗磲(Tridacna crocea)是个体较小的砗磲种类,外形呈卵圆状,足丝孔较宽。番红砗磲是水族馆中优先选择的观赏种类且存在造礁、护礁功能,具有重要的经济价值和生态价值。无鳞砗磲(Tridacna derasa)是砗磲种类中第二大体型的种类,仅次于库氏砗磲,是海产品市场最有潜力的品种。砗蚝(Hippopus hippopus)主要栖息在珊瑚礁砂质底中,是珊瑚礁生态***的主要关键框架生物之一。在砗磲幼体发育阶段,形态特征十分相似,单纯依靠形态特征往往难以鉴别。近年来,基于COI、16S rDNA线粒体基因序列差异的分子生物学被用于砗磲种间鉴定,但这些基因序列之间差异比较小,难以用电泳等简单方法进行区分。急需一种简单高效的方法对番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝个体进行大规模物种鉴定。针对此需要,我们发明了一种通用单引物多重PCR法对番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝进行分子鉴定的方法,可以简单高效地对三种砗磲进行大规模物种鉴定。
发明内容:
本发明目的是提供一种适合于番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝个体鉴定的通用单引物、多重PCR试剂盒及其鉴别方法。本发明中利用该方法对番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝各40个个体进行了分析并发现鉴定效果显著。
本发明的适合于番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝个体鉴定的通用单引物,具体如下:
上游引物F1:AACGGCGGTGTTAAACCTTA,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
下游引物R1:GATAAAATGGATCTATGCGC,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
下游引物R2:ATTTTTCCGAGACAGTTTC,其核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
下游引物R3:CACCATGCGGTTCACCCTG,其核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
本发明的第二个目的是提供一种快速鉴定番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝的试剂盒,其包括上述通用单引物和PCR反应试剂。
本发明的第三个目的是提供一种快速鉴定番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝的鉴别方法,包括以下步骤:
提取待测样品的基因组DNA,用上述通用单引物进行PCR扩增,得到扩增产物,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,待检样品扩增出136bp左右条带的,判定为无鳞砗磲;待检样品扩增出297bp左右条带的,判定为番红砗磲;待检样品扩增出416bp左右条带的,判定为砗蚝。
优选,所述的PCR反应体系的总体积为25μL,包含dNTP Mixture 4μl、10x buffer2.5μl、MgCl2 1μl、上游引物F1 2μl、下游引物R1-R3各1μl、模板DNA 2μl、Taq酶0.5μl、ddH2O 10μl。各组分的终浓度为:DNA模板50ng,Buffer 10mM,上游引物F1 0.2mM,下游引物R1-R3各0.1mM,dNTP 0.2mM,Mg2+ 2.0mM,Taq DNA聚合酶1U,用灭菌水补足25μL。
所述的PCR反应程序为:
反应程序为:94℃预变性2min,94℃变性20s,55℃退火30s,72℃延伸45s,变性至延伸三个步骤重复30次,72℃延伸7min。
PCR扩增产物置于2%琼脂糖凝胶电泳进行分型。
结果判定,对待检样品与阳性对照品分析结果进行比对,待检样品与阳性对照同时扩增出136bp左右条带的,判定为无鳞砗磲;待检样品与阳性对照同时扩增出297bp左右条带的,判定为番红砗磲;待检样品与阳性对照同时扩增出416bp左右条带的,判定为砗蚝。
本发明建立了利用多条下游引物竞争性退火的通用单引物多重PCR检测和鉴别番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝的方法,并经实际样本测试,具有方法简单、结果直观、准确有效、不受环境及发育时期影响、成本低廉等优点。
附图说明
图1为本发明标准品阳性对照及砗磲样品的通用单引物多重PCR扩增产物电泳图,其中:1、无鳞砗磲样品;2、番红砗磲样品;3、砗蚝样品;4、无鳞砗磲、番红砗磲及砗蚝阳性对照;M、100bp Marker。
具体实施方式
以下实施例是对本发明的进一步说明,而不是对本发明的限制。
实施例1:
参见图1,用消毒后的镊子和小剪刀从番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝外套膜上剪取少量组织。向装有外套膜组织的离心管中加入400μl裂解液和10μl蛋白酶K(10mg/ml),在振荡器上混匀,55℃水浴消化,直至组织完全溶解得到第一溶液。加入等体积饱和酚(200μl)、氯仿/异戊醇(24:1)(200μl)混合液抽提三次,每次10000rpm离心10-15min,用移液器吸取上清液。将1mL预冷的无水乙醇加入装有上清液的离心管中,过夜沉淀。最后经70%酒精洗涤,室温晾干后溶于200μL的超纯水中。紫外分光光度计检测DNA浓度和纯度,并用1%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性。由此分别获得番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝的基因组DNA。从三种砗磲提取DNA稀释液中各抽取部分作为模板进行物种鉴定。
分别以三种砗磲的基因组DNA,以及三种砗磲混合后的基因组DNA作为模板,进行PCR扩增反应。PCR反应体系的总体积为25μL,其中PCR体系中各种成分的含量如下表。
其中引物序列为:
上游引物F1:AACGGCGGTGTTAAACCTTA;
下游引物R1(针对T.crocea):GATAAAATGGATCTATGCGC;
下游引物R2(针对T.derasa):ATTTTTCCGAGACAGTTTC;
下游引物R3(针对H.hippopus):CACCATGCGGTTCACCCTG;
反应程序为:94℃预变性2min,94℃变性20s,55℃退火30s,72℃延伸45s,变性至延伸三个步骤重复30次,72℃延伸7min。PCR扩增产物置于2%琼脂糖凝胶电泳进行分型,以100bp Marker为标准分子参照。电压150v电泳10分钟,然后100v电泳20分钟。电泳结果用紫外凝胶成像***分析。根据电泳结果与阳性对照进行比对,从电泳检测结果(图1)可知:1、无鳞砗磲样品;2、番红砗磲样品;3、砗蚝样品;4、无鳞砗磲、番红砗磲及砗蚝阳性对照;M、100bp Marker。
结果判定,对待检样品与阳性对照品分析结果进行比对,待检样品与阳性对照同时扩增出136bp条带的,判定为无鳞砗磲;待检样品与阳性对照同时扩增出297bp条带的,判定为番红砗磲;待检样品与阳性对照同时扩增出416bp条带的,判定为砗蚝。
序列表
<110> 中国科学院南海海洋研究所
<120> 一种番红砗磲、无鳞砗磲和砗蚝鉴定的通用单引物、试剂盒和鉴别方法
<160> 4
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
aacggcggtg ttaaacctta 20
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
gataaaatgg atctatgcgc 20
<210> 3
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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atttttccga gacagtttc 19
<210> 4
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
caccatgcgg ttcaccctg 19
Claims (5)
1.一种适合于番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝个体鉴定的通用单引物,其特征在于,具体如下:
上游引物F1:AACGGCGGTGTTAAACCTTA;
下游引物R1:GATAAAATGGATCTATGCGC;
下游引物R2:ATTTTTCCGAGACAGTTTC;
下游引物R3:CACCATGCGGTTCACCCTG。
2.一种快速鉴定番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的通用单引物和PCR反应试剂。
3.一种快速鉴定番红砗磲、无鳞砗磲、砗蚝的鉴别方法,其特征在于,包括以下步骤:
提取待测样品的基因组DNA,用权利要求1所述的通用单引物进行PCR扩增,得到扩增产物,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,待检样品扩增出136bp左右条带的,判定为无鳞砗磲;待检样品扩增出297bp左右条带的,判定为番红砗磲;待检样品扩增出416bp左右条带的,判定为砗蚝。
4.根据权利要求3所述的鉴别方法,其特征在于,所述的PCR反应体系的总体积为25μL,包含DNA模板50ng,Buffer 10mM,上游引物F10.2mM,下游引物R1-R3各0.1mM,dNTP 0.2mM,Mg2+2.0mM,Taq DNA聚合酶1U,用灭菌水补足25μL。
5.根据权利要求3所述的鉴别方法,其特征在于,所述的PCR反应程序为:反应程序为:94℃预变性2min,94℃变性20s,55℃退火30s,72℃延伸45s,变性至延伸三个步骤重复30次,72℃延伸7min。
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---|---|
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Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN114196640A (zh) * | 2021-12-09 | 2022-03-18 | 中国科学院南海海洋研究所 | 一种源于新型贝类的l-肌肽合成酶atpgd及其应用 |
Citations (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102816762A (zh) * | 2012-09-01 | 2012-12-12 | 中国海洋大学 | 一种砗磲科贝类线粒体coi基因扩增引物 |
CN106399548A (zh) * | 2016-10-28 | 2017-02-15 | 海南大学 | 基于砗磲线粒体16s基因扩增引物及其应用 |
CN106978490A (zh) * | 2017-04-07 | 2017-07-25 | 中国海洋大学 | 一种鉴定砗磲的dna条形码标准检测方法及其应用 |
EP3315612A1 (en) * | 2015-06-24 | 2018-05-02 | Universidad De Chile | Set of primers and method for detecting and identifying mussel species of the genusmytilus |
CN108103211A (zh) * | 2018-01-31 | 2018-06-01 | 中国科学院南海海洋研究所 | 一种鉴定长砗磲、诺瓦砗磲的微卫星引物和鉴定方法 |
CN108950017A (zh) * | 2018-08-08 | 2018-12-07 | 中国科学院南海海洋研究所 | 一种中国南方海区砗磲科物种线粒体16S rRNA基因通用扩增引物及其筛选方法 |
CN110551826A (zh) * | 2019-09-03 | 2019-12-10 | 中国科学院南海海洋研究所 | 鉴定番红砗磲、鳞砗磲及其杂交子一代的微卫星引物、试剂盒和鉴定方法 |
CN110760595A (zh) * | 2019-11-06 | 2020-02-07 | 中国科学院南海海洋研究所 | 一种适用于砗蚝、中国南海常见砗磲种类及其杂交种的鉴定引物和方法 |
-
2020
- 2020-07-14 CN CN202010675140.4A patent/CN111763748B/zh active Active
Patent Citations (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102816762A (zh) * | 2012-09-01 | 2012-12-12 | 中国海洋大学 | 一种砗磲科贝类线粒体coi基因扩增引物 |
EP3315612A1 (en) * | 2015-06-24 | 2018-05-02 | Universidad De Chile | Set of primers and method for detecting and identifying mussel species of the genusmytilus |
CN106399548A (zh) * | 2016-10-28 | 2017-02-15 | 海南大学 | 基于砗磲线粒体16s基因扩增引物及其应用 |
CN106978490A (zh) * | 2017-04-07 | 2017-07-25 | 中国海洋大学 | 一种鉴定砗磲的dna条形码标准检测方法及其应用 |
CN108103211A (zh) * | 2018-01-31 | 2018-06-01 | 中国科学院南海海洋研究所 | 一种鉴定长砗磲、诺瓦砗磲的微卫星引物和鉴定方法 |
CN108950017A (zh) * | 2018-08-08 | 2018-12-07 | 中国科学院南海海洋研究所 | 一种中国南方海区砗磲科物种线粒体16S rRNA基因通用扩增引物及其筛选方法 |
CN110551826A (zh) * | 2019-09-03 | 2019-12-10 | 中国科学院南海海洋研究所 | 鉴定番红砗磲、鳞砗磲及其杂交子一代的微卫星引物、试剂盒和鉴定方法 |
CN110760595A (zh) * | 2019-11-06 | 2020-02-07 | 中国科学院南海海洋研究所 | 一种适用于砗蚝、中国南海常见砗磲种类及其杂交种的鉴定引物和方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
EIZADORA T.YU ET AL.: ""Sequence Variation in the Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer of Tridacna crocea"", 《MAR. BIOTECHNOL.》 * |
HAITAO MA ET AL.: ""Multiplex species-specific PCR identification of native giant clams in the South China Sea: A useful tool for application in giant clam stock management and forensic identification"", 《AQUACULTURE》 * |
高红梅等: ""基于新开发微卫星标记评价番红砗磲两个野生群体的遗传多样性及近缘种通用性检测"", 《水产学报》 * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN114196640A (zh) * | 2021-12-09 | 2022-03-18 | 中国科学院南海海洋研究所 | 一种源于新型贝类的l-肌肽合成酶atpgd及其应用 |
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