CN109901281B - 一种穆勒显微偏振像差校准方法及装置 - Google Patents
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Abstract
本发明公开一种穆勒显微偏振像差校准方法及装置,所述方法包括如下步骤:S1、分别对标准样本和实验样本进行如下图像采集步骤:使光在经过起偏模块、样本、物镜、检偏模块后到达CCD,利用CCD进行图像采集;其中样本是指所述标准样本和实验样本;S2、数据采集完整之后对数据进行处理,其算法为特征值校准法,最后计算空气实验样本的穆勒矩阵;其中标准样本包括:空气标准样本、0°偏振片标准样本、90°偏振片标准样本和30°波片标准样本。本发明以特征值校准法为基础,并采用四种标准样本用以校准,保证了穆勒显微镜的测量精度和稳定性。
Description
技术领域
本发明涉及一种穆勒显微偏振像差校准方法及装置。
背景技术
穆勒显微镜是穆勒矩阵测量技术、穆勒矩阵参数提取技术和显微成像技术的结合,使用穆勒显微镜对生物样本进行偏振成像,能够在得到样本图像信息的同时得到生物样本的完整的穆勒矩阵。另外使用穆勒矩阵分解技术和穆勒矩阵变换技术对样本的穆勒矩阵进行处理,即可从样本的穆勒矩阵中提取出和生物微观结构密切相关又有明确物理意义的偏振成像参数,比如描述生物样本纤维化程度和纤维化方向的定量参数。这些参数可以有效地辅助进行病理诊断和对生物生长过程的研究,且与传统的病理检测和生物生长过程研究方法相比,具有更高的灵敏度和分辨率。所以穆勒显微镜在生物领域,尤其是癌症检测方面有着良好的应用前景。
现有技术中,一般选用双旋转波片装置作为穆勒显微成像设备中的偏振调制模块。使用该装置对样本进行穆勒矩阵测量的过程中存在着一些缺点:(1)穆勒矩阵测量精度依赖于偏振器件的制造精度,存在来自偏振片的透射率和消光比以及波片的透射率参数不理想带来的***误差。(2)如果不能实现光路精准调节,测量结果中就会有由于偏振器件初始位置不准确带来的***误差。(3)偏振调制的精度依赖对波片快轴方向的精确控制,所以测量结果中还存在由于波片快轴方向控制误差带来的测量误差。
穆勒显微成像设备中其数据处理方法为傅里叶变换法,同时也有基于该数据处理方法的校准算法来减小上述缺点带来的误差,但是该校准算法也存在着缺陷,包括信息丢失、二次误差传递、偏振器件初始位置受限,并且该校准算法未考虑在显微镜***中聚光镜和物镜带来的影响,使得算法***模型不完善,未能克服聚光镜和物镜带来的偏振像差。
发明内容
本发明的目的是提出一种穆勒显微偏振像差校准方法及装置,保证穆勒显微镜的测量精度和稳定性。
为此,本发明的穆勒显微偏振像差校准方法包括如下步骤:S1、分别对标准样本和实验样本进行如下图像采集步骤:使光在经过起偏模块、样本、物镜、检偏模块后到达CCD,利用CCD进行图像采集;其中样本是指所述标准样本和实验样本;S2、数据采集完整之后对数据进行处理,其算法为特征值校准法,最后计算空气实验样本的穆勒矩阵;其中标准样本包括:空气标准样本、0°偏振片标准样本、90°偏振片标准样本和30°波片标准样本。
在本发明实施例中,还包括如下特征:
起偏模块和检偏模块中波片采用各自独立旋转的偏振调制。
起偏模块和检偏模块当中的波片分别处于35°、70°、105°和140°时CCD进行图像采集,共采集16组图像。
偏振器件初始时刻主轴方向均平行,起偏和检偏模块中波片转速比为1:1。
每次旋转的角度基数的为35°及其整数倍。
起偏模块和检偏模块中波片转速比取整数转速比。
初始时刻使波片快轴方向与第一个偏振片透光轴方向平行,第二个偏振片透光轴与第一个偏振片透光轴正交。
本发明还提出一种穆勒显微偏振像差校准装置,包括:依次设置在光路上的起偏模块、样本、物镜、检偏模块后到达CCD,利用CCD进行图像采集;其中样本是指所述标准样本和实验样本;数据采集完整之后对数据进行处理的数据处理装置,其中算法为特征值校准法,用于计算空气实验样本的穆勒矩阵;其中,标准样本包括:空气标准样本、0°偏振片标准样本、90°偏振片标准样本和30°波片标准样本。
本发明上述技术方案以特征值校准法为基础,并采用四种标准样本用以校准,保证了穆勒显微镜的测量精度和稳定性。
附图说明
图1是本发明实施例整体示意图。
图2是本发明实施例光路***模型示意图。
图3是本发明实施例流程示意图。
图4a是波片旋转角度基数仪器矩阵对条件数的影响示意图。
图4b是波片旋转角度基数仪器矩阵对误差传递系数的影响示意图。
图5a是波片转速比仪器矩阵对条件数的影响示意图。
图5b是波片转速比仪器矩阵对误差传递系数的影响示意图。
图6a、6b、6c、6d、6e、6f分别为偏振器件初始时刻主轴方向对仪器矩阵对条件数(图6a、6b、6c)和误差传递系数(图6d、6e、6f)的影响。
具体实施方式
本发明下述实施例使用特征值校准法实现穆勒矩阵的测量和校准,通过以下描述我们将看到,该校准方法具有如下几个优点:(1)使用多种穆勒矩阵已知的标准样本来实现对起偏模块和检偏模块的完全建模和校准,所以没有建模误差。(2)偏振器件初始位置,偏振器件的制造误差,***的偏振像差等误差因素都已经被包含在***模型中且通过校准算法实现校准,所以对***光路调节和器件选型方面要求降低。(3)通过对***模型的完善和算法修正,可以有效克服偏振像差。
下面分几个方面对实施例进行具体描述。
整体方法概述
如图1所示为本实施例的整体方案,光在经过起偏模块、样本、物镜、检偏模块后到达CCD,CCD进行图像采集,分别对标准样本(空气标准样本、0°偏振片标准样本、90°偏振片标准样本、30°波片标准样本)和实验样本(空气实验样本)进行上述步骤。数据采集完整之后对数据进行处理,其算法为特征值校准法,最后计算空气实验样本的穆勒矩阵。
光路***构成
如图2所示为本实施例的光路***模型,主要器件为光源、起偏模块(偏振片和波片组成)、样品(校准标准样本为空气标准样本、0°偏振片标准样本、90°偏振片标准样本、30°波片标准样本)、检偏模块(波片和偏振片组成)物镜和CCD。
机械部件具体步骤
波片每次旋转的角度基数、波片转速比、波片的相位延迟量、初始时刻偏振器件的主轴方向、一次完整测量中的光强测量次数是基于双旋转波片装置的穆勒矩阵测量方案中需要确定的问题。为了尽可能减小特征值校准法中需要进行建模的***参数个数以简化校准过程,本发明实施例采用起偏模块和检偏模块中波片各自独立旋转的偏振调制方案。为起偏和检偏模块分别选取4个快轴角度,总计进行16次的偏振调制。考虑到偏振器件的可得性,选取四分之一波片作为起偏模块和检偏模块中的波片。
如流程图3所示,起偏模块和检偏模块当中的波片分别处于35°、70°、105°和140°时CCD进行图像采集,共采集16组图像。
算法设计
本发明实施例使用仪器矩阵条件数和测量过程中的误差传递系数做为设计指标,完成对测量方案的设计。首先按照偏振器件初始时刻主轴方向均平行,起偏和检偏模块中波片转速比为1:1的前提分析波片每次旋转的角度基数对仪器矩阵条件数和误差传递系数的影响。
图4a、4b为仪器矩阵条件数和误差传递系数随波片每次旋转的角度基数的变化曲线图。其中两个子图中横坐标均表示弧度制的角度基数,图4a中纵坐标表示仪器矩阵条件数,图4b中纵坐标表示测量过程中的误差传递系数。为了更好地展示数据,将纵坐标限定在(0,300)以内。从图1中可以看出角度基数的最优值为35°及其整数倍(从图4a和4b中纵坐标最小值对应的横坐标为0.61rad及其整数倍,0.61rad即35°左右,实际上在程序中找到最小值点就是35°,图中是用曲线对应的横坐标数值)。
选取波片每次旋转的角度基数为35°,之后分析波片转速比对仪器矩阵条件数和误差传递系数的影响并绘制图5a、5b。其中图5a展示了仪器矩阵条件数随波片转速比的变化(设定一个转速基数,横坐标表示起偏中波片对应这个基数的旋转倍数,左侧纵坐标表示检偏中波片对应这个基数的旋转倍数,则横坐标与左侧纵坐标的数值就是这两个波片的转速比),图5b展示了误差传递系数随波片转速比的变化。为了突出有效数据,只对仪器矩阵条件数和误差传递系数小于25的部分进行了绘图。从图5a、5b中可以看出,起偏模块和检偏模块中波片转速比取整数转速比为最优设计值(图5a、5b中冷色调(蓝色)表示数值小,对应的起偏和检偏的倍数为1:1,1:2,1:3,2:1等整数倍数值)。
最后分析初始时刻偏振器件的主轴方向对仪器矩阵条件数和误差传递系数的影响,并绘制图6a、6b、6c、6d、6e、6f。使用α2、α3、α4表示初始时刻后三个偏振器件主轴方向相对于第一个偏振片透光轴方向的相对角度位置,则图6a、6b、6c依次描述了α2、α3、α4对仪器矩阵条件数的影响,图6d、6e、6f依次描述了α2、α3、α4对误差传递系数的影响。从图6a、6b、6c、6d、6e、6f中可以发现,不同于起偏模块和检偏模块中两个波片同步旋转的测量方案,在两个波片独立旋转的测量方案中,α2、α3、α4的取值对测量过程的误差传递规律有影响(α2、α3、α4变化时,仪器矩阵条件数或是误差传递系数也发生变化,纵坐标数值大,表示造成的误差会变大),且初始时刻装置中两个波片快轴方向和第二个偏振片透光轴方向相对第一个偏振片透光轴方向平行或正交时仪器矩阵条件数和误差传递系数最小(纵坐标的仪器矩阵条件数或是误差传递系数数值最小时,对应横坐标数值为0.5π的整数倍或是π的整数倍,即相对位置是垂直或是平行)。在实际应用中,我们初始时刻使波片快轴方向与第一个偏振片透光轴方向平行,第二个偏振片透光轴与第一个偏振片透光轴正交的装置设计方案。
基于上述设计,本实施例特征值校准法基本算法如下:
采用16次偏振调制和光强测量时,***传递函数可以表示为:
D=TMW (1-1)
其中矩阵W表示起偏模块产生的4次偏振调制信息与入射光强的相乘后得到的矩阵,矩阵T表示检偏模块进行的4次偏振调制,D表示光强,M表示样品穆勒矩阵。
对空气标准样本测量时有:
D1=TMairW=TW. (1-2)
对于其他的标准样本有:
Di=TMiW. (1-3)
定义Ci:
Ci=D1 -1Di=W-1MiW. (1-4)
则有:
MiW-WCi=0. (1-5)
使用克罗内克积对上式进行变形,记vec(K)表示矩阵K所有元素组成的列向量,则有:
从上式中可以看出如果Hi是自共轭矩阵,那么vec(W)在Hi的零特征值对应的特征空间内。对上式进行进一步变形并且采用多种标准样本进行方程式叠加可以使vec(W)前边的系数矩阵的零空间具有唯一的特征值,此时就可以解出vec(W)。构建出的方程组如下:
L·vec(W)=0. (1-7)
其中:
L=H1 TH1+…+Hn THn. (1-8)
最后根据vec(W)重新排列得到W并计算出矩阵T:
T=D1W-1. (1-9)
在T与W都构建完整后,对于其他待测样品,则有Md=T-1DdW-1,以此计算得到待测样品的穆勒矩阵Md。
在特征值校准法实验中,需要对除空气外的标准样本的偏振特性参数进行标定。包括线偏振片透光轴方向、透光率和波片快轴方向、透光率、真实相位延迟量的标定。注意到矩阵Ci与Mi相似,所以两者有同样的特征值。对于偏振片和波片,其穆勒矩阵均可以用如下式子表示:
其4个特征值为:
使用以上特征值可以实现对偏振片透光率和波片透光率以及相位延迟量的标定。特征值校准法修正步骤:
在显微镜当中,实际上加入了聚光镜和显微物镜元件,在特征值校准法的基本算法中只考虑了基础的起偏和检偏模块的穆勒矩阵,所以还需要进行模型的完善和算法修正。考虑显微物镜和聚光镜的穆勒矩阵分别为MObj和MCon,其偏振特性参数与式(1-10)所表示类似,则对于式(1-1),其完整表达式应为D=TMObjMMConW=TModMWMod (1-12)
其中TMod=TMObj,WMod=MConW,则接下来的计算步骤与式(1-2)至(1-9)相似,这是起偏和检偏模块的穆勒矩阵有所改变,但是由于MObj和MCon为满秩矩阵,重点在于计算标准样品的特征值,而在进行计算时可发现其特征值并不改变,所以可以沿用式(1-2)至(1-9)的计算步骤,以此消除聚光镜和显微物镜处大入射角造成的偏振像差的影响。
本发明上述实施例以特征值校准法为基础,考虑聚光镜和物镜的误差源,对***进行模型完善,对仪器矩阵实现全参数建模,同时对算法进行数学公式上的修正,在算法上消除***的偏振像差,利用仪器矩阵进行基于该算法的偏振器件初始位置和数据测量方案的设计(参见算法设计部分和流程图),并采用四种标准样本用以校准(如整体方案图所示),实现分别采用4倍、10倍、20倍和40倍物镜时对于空气实验样本的测量误差在0.01以内,其穆勒矩阵元素标准差最大值为0.0053,保证了穆勒显微镜的测量精度和稳定性。
Claims (10)
1.一种穆勒显微偏振像差校准方法,包括如下步骤:
S1、分别对标准样本和实验样本进行如下图像采集步骤:使光在经过起偏模块、样本、聚光镜、物镜、检偏模块后到达CCD,利用CCD进行图像采集;其中样本是指所述标准样本和实验样本;
S2、数据采集完整之后对数据进行处理,其算法为特征值校准法,最后计算空气实验样本的穆勒矩阵;
其中标准样本包括:空气标准样本、0°偏振片标准样本、90°偏振片标准样本和30°波片标准样本;
步骤S2通过特征值校准法消除聚光镜和显微物镜处大入射角造成的偏振像差的影响;
其中,物镜和聚光镜的穆勒矩阵分别为MObj和MCon,***传递函数为D=TMObjMMConW=TModMWMod其中TMod=TMObj,WMod=MConW,
采用16次偏振调制和光强测量时,矩阵W表示起偏模块产生的4次偏振调制信息与入射光强的相乘后得到的矩阵,矩阵T表示检偏模块进行的4次偏振调制,D表示光强,M表示样本穆勒矩阵;
其中,以特征值校准法为基础,考虑聚光镜和物镜的误差源,对仪器矩阵实现全参数建模,采用四种标准样本用以校准,实现分别采用4倍、10倍、20倍和40倍物镜时的校准。
2.如权利要求1所述的穆勒显微偏振像差校准方法,其特征在于:起偏模块和检偏模块中波片采用各自独立旋转的偏振调制。
3.如权利要求1所述的穆勒显微偏振像差校准方法,其特征在于:起偏模块和检偏模块当中的波片分别处于35°、70°、105°和140°时CCD进行图像采集,共采集16组图像。
4.如权利要求1所述的穆勒显微偏振像差校准方法,其特征在于:偏振器件初始时刻主轴方向均平行,起偏和检偏模块中波片转速比为1:1。
5.如权利要求2所述的穆勒显微偏振像差校准方法,其特征在于:每次旋转的角度基数为35°及其整数倍。
6.如权利要求2所述的穆勒显微偏振像差校准方法,其特征在于:起偏模块和检偏模块中波片转速比取整数转速比。
7.如权利要求2所述的穆勒显微偏振像差校准方法,其特征在于:初始时刻使波片快轴方向与第一个偏振片透光轴方向平行,第二个偏振片透光轴与第一个偏振片透光轴正交。
8.一种穆勒显微偏振像差校准装置,其特征在于,包括:
依次设置在光路上的起偏模块、样本、聚光镜、物镜、检偏模块后到达CCD,利用CCD进行图像采集;其中样本是指标准样本和实验样本;
数据采集完整之后对数据进行处理的数据处理装置,其中算法为特征值校准法,用于计算空气实验样本的穆勒矩阵;其中,
标准样本包括:空气标准样本、0°偏振片标准样本、90°偏振片标准样本和30°波片标准样本;
数据处理装置通过特征值校准法消除聚光镜和显微物镜处大入射角造成的偏振像差的影响;
其中,物镜和聚光镜的穆勒矩阵分别为MObj和MCon,***传递函数为D=TMObjMMConW=TModMWMod其中TMod=TMObj,WMod=MConW,
采用16次偏振调制和光强测量时,矩阵W表示起偏模块产生的4次偏振调制信息与入射光强的相乘后得到的矩阵,矩阵T表示检偏模块进行的4次偏振调制,D表示光强,M表示样本穆勒矩阵;
其中,以特征值校准法为基础,考虑聚光镜和物镜的误差源,对仪器矩阵实现全参数建模,采用四种标准样本用以校准,实现分别采用4倍、10倍、20倍和40倍物镜时的校准。
9.如权利要求8所述的穆勒显微偏振像差校准装置,其特征在于,起偏模块和检偏模块中波片采用各自独立旋转的偏振调制。
10.如权利要求8所述的穆勒显微偏振像差校准装置,其特征在于,起偏模块和检偏模块当中的波片分别处于35°、70°、105°和140°时CCD进行图像采集,共采集16组图像。
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