CN107345934A - 一种长牡蛎微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染方法 - Google Patents

一种长牡蛎微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染方法 Download PDF

Info

Publication number
CN107345934A
CN107345934A CN201610295844.2A CN201610295844A CN107345934A CN 107345934 A CN107345934 A CN 107345934A CN 201610295844 A CN201610295844 A CN 201610295844A CN 107345934 A CN107345934 A CN 107345934A
Authority
CN
China
Prior art keywords
polyacrylamide gel
microsatellite
gel electrophoresis
silver
staining
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201610295844.2A
Other languages
English (en)
Inventor
李琪
宋俊霖
于红
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Ocean University of China
Original Assignee
Ocean University of China
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ocean University of China filed Critical Ocean University of China
Priority to CN201610295844.2A priority Critical patent/CN107345934A/zh
Publication of CN107345934A publication Critical patent/CN107345934A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N27/00Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
    • G01N27/26Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating electrochemical variables; by using electrolysis or electrophoresis
    • G01N27/416Systems
    • G01N27/447Systems using electrophoresis
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N1/00Sampling; Preparing specimens for investigation
    • G01N1/28Preparing specimens for investigation including physical details of (bio-)chemical methods covered elsewhere, e.g. G01N33/50, C12Q
    • G01N1/30Staining; Impregnating ; Fixation; Dehydration; Multistep processes for preparing samples of tissue, cell or nucleic acid material and the like for analysis

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Electrochemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

本发明涉及一种适用于长牡蛎的微卫星聚丙烯酰胺凝胶电泳的快速银染方法,所述方法包括以下步骤:聚丙烯酰胺凝胶电泳结束后,取下凝胶,浸泡在染液中3min;将凝胶放入蒸馏水中冲洗10s;随后取出凝胶,放入显影液中4min;将显影成功的胶冲洗干净。将传统的固定、三次冲洗、染色、显影、定影、冲洗等6个步骤缩减为四个步骤,染色液与显影液可反复使用3次,同时银染效果也得到了保证,与传统方法相比大大节省了时间与成本。

Description

一种长牡蛎微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染方法
技术领域
本发明涉及一种水产动物的聚丙烯酰胺凝胶电泳的快速银染法。
背景技术
长牡蛎(Crassostrea gigas)是我国乃至世界上最重要的经济贝类之一。虽然传统选育工作已经积极开展,但我国长牡蛎的遗传基础仍然为野生型。缺乏良种、单产低等问题严重影响长牡蛎养殖业的发展。因此,亟需培育出产量高、品质好的长牡蛎优良品种,保证长牡蛎养殖产业的可持续健康发展。随着分子生物学技术的飞速发展,分子标记辅助选择育种和种群多样性研究成为一种有效的方法,为优良品种的快速培育提供了技术保障。目前,结合分子标记辅助育种技术,培育出生长快、品质好的新品种对于实现牡蛎养殖业健康可持续发展具有重要意义。
微卫星标记是一种共显性的分子标记,具有变异程度高,在基因组中分布广泛,符合孟德尔遗传,易于PCR扩增等特点,是最常使用的分子标记之一,已成功应用在水产动物的遗传育种等领域。微卫星标记作为分子遗传学研究的有利手段,为长牡蛎遗传多样性监测、家系鉴定、遗传图谱构建及QTL定位等研究提供了有力工具。
聚丙烯酰胺凝胶电泳(简称为PAGE)是以聚丙烯酰胺凝胶作为介质的一种常用电泳技术,其结合银染法进行标记检测,是分子生物学和基因工程研究上不可缺少的实验技术。基于银染法的聚丙烯酰胺凝胶电泳,检测灵敏度和分辨率都比较高,特别适合于微卫星标记扩增产物的检测。微卫星标记的传统分析方法是对每个标记的PCR扩增产物在变性或者非变性的聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳,然后利用银染的方式对电泳结果进行显色,进而获得所需要的目的条带。银染的原理是首先用固定剂将核酸分子固定到凝胶上,然后使银染剂中的银离子与之牢固结合,再通过还原剂将银离子还原,从而发生银棕色显色反应。然而,聚丙烯酰胺凝胶银染的常规方法操作繁琐、耗时长,染色方法的改良可以更加行之有效、简便快捷的应用于长牡蛎微卫星分子标记分析。
发明内容
基于传统聚丙烯酰胺凝胶银染法操作繁琐、耗时长的缺陷,对染色方法的改进可以节约时间并降低成本。
本发明具体的技术方案如下:
1、电泳完成后,将凝胶放入染色液中进行染色;
2、将凝胶从染色液中取出,用去离子水冲洗干净;
3、将凝胶放入显影液中;
4、将显影完成的凝胶冲洗干净;
5、烘干读数。
本发明有下述几方面优点:
将传统方法的固定、三次冲洗、染色、显影、定影、冲洗等6个步骤缩减为四个步骤,相比于传统方法所需要的1小时30分钟缩减为10分钟之内,而且染色液和显影液均可重复利用3次。
下面通过具体实施例对本发明作进一步详细阐述。
附图说明:
图1显示为长牡蛎微卫星标记快速银染法的显色效果。
实施例1:
(1)使用苯酚氯仿法提取长牡蛎的DNA。
(2)用常规的微卫星标记进行PCR扩增反应
PCR扩增程序为:94℃ 2 min;94℃变性45s,退火45s(不同引物退火温度不同),72℃延伸1min,共35个循环;72℃延伸10s,12℃保存。
(3)取PCR产物加等体积变性剂进行聚丙烯酰胺凝胶电泳。
(4)聚丙烯酰氨凝胶的银染
聚丙烯酰氨凝胶电泳结束后,取下凝胶,浸泡在染液(0.2%硝酸银,0.5%醋酸)中3min;将凝胶放入蒸馏水中冲洗10 s;随后取出凝胶放入显影液(1%氢氧化钠,0.4%甲醛)中4min,显色完成。最后,将凝胶放入蒸馏水中冲洗干净(2min),晾干读带。染液与显影液均可重复使用3次。
通过该银染方法来处理聚丙烯酰胺凝胶,具有条带显色良好,条带清晰,操作时间短且程序简单,染色液及显影液容易保存等优点,是一种及其为理想的染色放大。本发明的银染过程可在10 min内完成,且染色液与显影液均可使用3次,显著提高了实验效率,节省实验成本。

Claims (4)

1.一种用于长牡蛎微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染方法,步骤如下:
将电泳好的PAGE胶,放入染液染色3min;将从染液中取出的胶放入蒸馏水中冲洗10s;将从蒸馏水中取出的胶放入显影液中4min,将显影完成的胶用蒸馏水冲洗干净。
2.依据权利要求1所述的微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染检测方法,其特征是:染液为0.2%硝酸银,0.5%醋酸。
3.依据权利要求1所述的微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染检测方法,其特征是:显影液为1%氢氧化钠,0.4%甲醛。
4.依据权利要求1所述的微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染检测方法,其特征是:染液与显影液均可用3次。
CN201610295844.2A 2016-05-07 2016-05-07 一种长牡蛎微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染方法 Pending CN107345934A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610295844.2A CN107345934A (zh) 2016-05-07 2016-05-07 一种长牡蛎微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610295844.2A CN107345934A (zh) 2016-05-07 2016-05-07 一种长牡蛎微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染方法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN107345934A true CN107345934A (zh) 2017-11-14

Family

ID=60254221

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610295844.2A Pending CN107345934A (zh) 2016-05-07 2016-05-07 一种长牡蛎微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN107345934A (zh)

Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101113474A (zh) * 2007-07-27 2008-01-30 中国人民解放军军事医学科学院卫生学环境医学研究所 Bpde致癌相关基因的全基因组筛选方法
CN101354348A (zh) * 2008-08-28 2009-01-28 云南省农业科学院甘蔗研究所 一种甘蔗分子标记page凝胶超快速银染检测方法
CN101353702A (zh) * 2008-09-08 2009-01-28 厦门大学 西氏鲍与皱纹盘鲍杂交种的dna分子鉴定方法
CN101597648A (zh) * 2009-06-26 2009-12-09 集美大学 大黄鱼异质雌核发育二倍体的筛选方法
CN101634615A (zh) * 2008-07-25 2010-01-27 中国水产科学研究院长江水产研究所 一种聚丙烯酰胺凝胶的银染方法
CN102747160A (zh) * 2012-07-18 2012-10-24 中国水产科学研究院黄海水产研究所 一种对虾msap技术分析体系的建立方法
CN102787172A (zh) * 2012-09-06 2012-11-21 江苏省农业科学院 利用ssr引物鉴定大麦品种的方法及其应用
CN104458388A (zh) * 2014-12-01 2015-03-25 中国农业科学院棉花研究所 一种page的高效银染方法

Patent Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101113474A (zh) * 2007-07-27 2008-01-30 中国人民解放军军事医学科学院卫生学环境医学研究所 Bpde致癌相关基因的全基因组筛选方法
CN101634615A (zh) * 2008-07-25 2010-01-27 中国水产科学研究院长江水产研究所 一种聚丙烯酰胺凝胶的银染方法
CN101354348A (zh) * 2008-08-28 2009-01-28 云南省农业科学院甘蔗研究所 一种甘蔗分子标记page凝胶超快速银染检测方法
CN101353702A (zh) * 2008-09-08 2009-01-28 厦门大学 西氏鲍与皱纹盘鲍杂交种的dna分子鉴定方法
CN101597648A (zh) * 2009-06-26 2009-12-09 集美大学 大黄鱼异质雌核发育二倍体的筛选方法
CN102747160A (zh) * 2012-07-18 2012-10-24 中国水产科学研究院黄海水产研究所 一种对虾msap技术分析体系的建立方法
CN102787172A (zh) * 2012-09-06 2012-11-21 江苏省农业科学院 利用ssr引物鉴定大麦品种的方法及其应用
CN104458388A (zh) * 2014-12-01 2015-03-25 中国农业科学院棉花研究所 一种page的高效银染方法

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
S.O. BYUN ET AL.: "An effective method for silver-staining DNA in large numbers of polyacrylamide gels", 《ANALYTICAL BIOCHEMISTRY》 *
王凤格 等: "一种改进的玉米SSR标记的PAGE/快速银染检测新方法", 《农业生物技术学报》 *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Collins et al. Polymorphisms in grapevine DNA detected by the RAPD PCR technique
CN104357553B (zh) 一种黄颡鱼微卫星家系鉴定方法
CN108048449B (zh) 一种提取基因组dna的试剂盒
CN105154550B (zh) 一种利用est-ssr分子标记快速鉴定西瓜品种珍甜1217纯度的方法
CN104561355B (zh) 一种用于魁蚶家系鉴定的多重pcr方法
CN105176989A (zh) 一种鉴别暗纹东方鲀和条纹东方鲀鱼苗的引物和方法
CN109722486B (zh) 西瓜种脐斑性状主效基因及检测该主效基因的分子标记和应用
CN103789441B (zh) 一种用于鉴别两个海马种群的ssr分子标记方法
CN106148526B (zh) 一种与西瓜果肉硬度相关的分子标记Hf1-Indel及其应用
CN108165647A (zh) 一种用于鉴定不结球白菜苏州青、矮脚黄、乌塌菜的分子标记方法
CN110964798A (zh) 一种利用trap分子标记技术鉴定东北林蛙遗传性别的方法
CN102912017B (zh) 一种快速准确鉴定乌鳢、斑鳢及杂交鳢的方法
CN102041310B (zh) 一种检测鸡玫瑰冠性状的方法
CN112626262A (zh) 一种与萝卜花瓣色泽基因连锁的InDel分子标记、引物及其应用
CN111286545B (zh) 一种三疣梭子蟹耐盐碱的分子标记c0及其应用
CN106350606B (zh) 一种用于日本沼虾生长性状分析的微卫星标记及其应用
CN105755116B (zh) 与中华绒螯蟹性早熟与否相连锁的微卫星标记的引物及其应用
CN107345934A (zh) 一种长牡蛎微卫星聚丙烯酰氨凝胶电泳的快速银染方法
CN103667272A (zh) 与中华绒螯蟹生长性状相关的est-ssr分子标记及应用
CN111254203A (zh) 一种三疣梭子蟹耐盐碱的分子标记c325及其应用
CN110452992A (zh) 一种凡纳滨对虾est微卫星位点引物的标记方法
CN111593128B (zh) 一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用方法
CN109207628A (zh) 一种适用于检测紫色萝卜的分子标记及应用
CN111286546B (zh) 一种三疣梭子蟹耐盐碱的分子标记c1480及其应用
CN108148913A (zh) 一种快速鉴别日本条鳎和缨鳞条鳎的分子生物学方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20171114

RJ01 Rejection of invention patent application after publication