CN107148282A - 结合cxcr3的抗原结合蛋白 - Google Patents

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Abstract

本文公开了与抗‑CXCR3抗体相关或源自抗‑CXCR3抗体的组合物和方法。更具体地,本文公开了结合CXCR3的全人抗体、这类抗体的CXCR3‑结合片段和衍生物及包含这类片段的CXCR3‑结合多肽。再进一步,本文公开了编码这类抗体、抗体片段和衍生物及多肽的核酸,包含这类多核苷酸的细胞,制备这类抗体、抗体片段和衍生物及多肽的方法,和使用这类抗体、抗体片段和衍生物及多肽的方法,包括治疗或诊断患有CXCR3相关障碍和病症(包括各种炎性障碍和各种癌症)的受试者的方法。

Description

结合CXCR3的抗原结合蛋白
技术领域
本公开提供了与抗-CXCR3抗体相关或源自抗-CXCR3抗体的组合物和方法。更具体地,本公开提供了结合CXCR3的人抗体、CXCR3-结合片段和这类片段的衍生物及包含这类片段的CXCR3-结合多肽。再进一步地,本公开提供了编码这类抗体、抗体片段和衍生物及多肽的核酸,包含这类多核苷酸的细胞,制备这类抗体、抗体片段和衍生物及多肽的方法,及使用这类抗体、抗体片段和衍生物及多肽的方法,包括治疗或诊断患有CXCR3相关障碍和病症(包括各种炎性障碍和各种癌症)的受试者的方法。
背景技术
C-X-C趋化因子受体-3(CXCR3)在某些白细胞(如活化T细胞和NK细胞)上表达。CXCR3受体结合配体如干扰素γ诱导的10kD蛋白(IP-10)、γ干扰素诱导的单核因子(MIG;Mig)、干扰素诱导的T-细胞α化学引诱物(I-TAC)和B细胞吸引趋化因子(BCA-1)。某些形式的CXCR3也结合血小板因子-4(PF-4,Lasagni等,J.Exp.Med.197:1537-1549,2003)。一些CXCR3配体(IP-10、MIG和I-TAC)的表达在组织中通过干扰素或肿瘤坏死因子(炎症的强力介质)诱导(Farber,J.M.J.Leukoc.Biol.61:246-257',2007;Piali等Eur.J.Immunol.28:961-972,1998和Cole等J.Exp.Med.187:2009-2021,1998)。由于这些发现,已经推测在炎症过程中,CXCR3的配体的表达上调,导致CXCR3+淋巴细胞募集到发炎的组织中。浸润的CXCR3+淋巴细胞可造成炎症的不利病理作用。因此,抑制CXCR3的活性可具有有益的抗炎作用。因此,存在着对抑制CXCR3功能的治疗剂的需要。
趋化因子与其受体之间的相互作用是白细胞迁移的控制中的重要步骤。趋化因子也介导多种不依赖于趋化性的作用,包括细胞相关细胞因子反应的诱导和增强。
人细胞表面蛋白CD183是具有对三种趋化因子(包括IP10(干扰素-γ-诱导的10kDa蛋白)、Mig(干扰素-γ-诱导的单核因子)和I-TAC(干扰素诱导的T细胞ot-化学引诱物))的选择性的G蛋白偶联受体。这三种趋化因子属于"CXC"趋化因子的结构亚族,其中单一氨基酸残基分隔四个高度保守的Cys残基中的前两个。历史上,CD183是第三个发现的CXC趋化因子受体,且因此CD183通常称为"CXCR3"。趋化因子与CXCR3的结合诱导参与白细胞迁移、最显著地整联蛋白激活、细胞骨架变化和趋化迁移的细胞反应。CXCR3在效应/记忆T细胞上和/或许多类型的发炎组织中存在的T细胞(例如,T-辅助1细胞或Th1细胞和CD8+Tc1细胞)中表达。另外,IP10、Mig和I-TAC通常通过炎性病灶中的局部细胞产生,表明CXCR3及其趋化因子参与白细胞到炎症部位的募集。因此,CXCR3是开发可以用于多样的炎症及免疫疾病和障碍如类风湿性关节炎、多发性硬化、克罗恩氏病、炎性肠病、慢性阻塞性肺病、银屑病、1型糖尿病和移植排斥的治疗和诊断的抗体和拮抗剂的靶标。因为CXCR3在B-细胞淋巴瘤的亚组上表达,CXCR3也可以是用于治疗和诊断淋巴瘤和白血病的靶标。
因此,本领域中存在着对于可用作治疗剂的改进的抗-CXCR3抗体的需要。
发明内容
本公开提供了以至少10-6M的结合亲和力结合CXCR3表位的IgG类的全人抗体,其具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.25、SEQ IDNO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ IDNO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.18、SEQ IDNO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.30、SEQ IDNO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.37及其组合。优选地,该全人抗体具有重链和轻链两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2(本文中称为32B12)、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4(本文中称为32D12)、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6(本文中称为H1)、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8(本文中称为B7)、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10(本文中称为C12)、SEQ ID NO.11/SEQ IDNO.12(本文中称为D12)、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14(本文中称为E1)、SEQ ID NO.15/SEQID NO.16(本文中称为G12)、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18(本文中称为3A3)、SEQ IDNO.19/SEQ ID NO.20(本文中称为3A5)、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22(本文中称为3A11)、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24(本文中称为3B12)、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26(本文中称为3C11)、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28(本文中称为4C3)、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30(本文中称为B12)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32(本文中称为C4)、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.33(本文中称为F7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34(本文中称为2A3)、SEQ ID NO.31/SEQID NO.35(本文中称为3A7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36(本文中称为3A8)、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.37(本文中称为4D5)及其组合。
本公开提供了全人抗体Fab片段,其具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域,其中所述重链可变域序列与选自以下的氨基酸序列至少95%同一:SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQ IDNO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQ IDNO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQ IDNO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQ IDNO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQ IDNO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQ IDNO.37及其组合。优选地,全人抗体Fab片段具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ IDNO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ IDNO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37及其组合。
本公开提供了单链人抗体,其具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域及连接所述重链和轻链可变域区域的肽接头,其中所述重链可变域序列与选自以下的氨基酸序列至少95%同一:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ IDNO.9、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ IDNO.21、SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ IDNO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ IDNO.2、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ IDNO.14、SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ IDNO.26、SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ IDNO.35、SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.37及其组合。优选地,所述全人单链抗体具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述单链全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ IDNO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ IDNO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ IDNO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.37及其组合。
本公开还提供了用于治疗广谱哺乳动物癌症的方法,包括施用有效量的抗-CXCR3多肽,其中所述抗-CXCR3多肽选自以至少10-6M的结合亲和力结合CXCR3表位的IgG类的全人抗体、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域的全人抗体Fab片段、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域及连接所述重链和轻链可变域区域的肽接头的单链人抗体,及其组合;
其中所述全人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合;
其中所述全人抗体Fab片段具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ IDNO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合;和
其中所述单链人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ IDNO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合。
优选地,所述全人抗体具有重链和轻链两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2(本文中称为32B12)、SEQ ID NO.3/SEQ IDNO.4(本文中称为32D12)、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6(本文中称为H1)、SEQ ID NO.7/SEQID NO.8(本文中称为B7)、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10(本文中称为C12)、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12(本文中称为D12)、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14(本文中称为E1)、SEQ IDNO.15/SEQ ID NO.16(本文中称为G12)、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18(本文中称为3A3)、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20(本文中称为3A5)、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22(本文中称为3A11)、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24(本文中称为3B12)、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26(本文中称为3C11)、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28(本文中称为4C3)、SEQ ID NO.29/SEQ IDNO.30(本文中称为B12)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32(本文中称为C4)、SEQ ID NO.31/SEQID NO.33(本文中称为F7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34(本文中称为2A3)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35(本文中称为3A7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36(本文中称为3A8)、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.37(本文中称为4D5)及其组合。优选地,全人抗体Fab片段具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQID NO.1/SEQ ID NO.2(本文中称为32B12)、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4(本文中称为32D12)、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6(本文中称为H1)、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8(本文中称为B7)、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10(本文中称为C12)、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12(本文中称为D12)、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14(本文中称为E1)、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16(本文中称为G12)、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18(本文中称为3A3)、SEQ ID NO.19/SEQ IDNO.20(本文中称为3A5)、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22(本文中称为3A11)、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24(本文中称为3B12)、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26(本文中称为3C11)、SEQ IDNO.27/SEQ ID NO.28(本文中称为4C3)、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30(本文中称为B12)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32(本文中称为C4)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33(本文中称为F7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34(本文中称为2A3)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35(本文中称为3A7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36(本文中称为3A8)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37(本文中称为4D5)及其组合。优选地,所述全人单链抗体具有具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述单链全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ IDNO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18、SEQ IDNO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24、SEQ IDNO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37及其组合。
优选地,待治疗的广谱哺乳动物癌症是CXCR3-阳性癌症。优选地,待治疗的广谱哺乳动物癌症选自白血病、淋巴瘤、癌瘤(cancinomas)、***癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、子宫内膜癌、卵巢癌、胃癌、头颈癌、黑素瘤、骨肉瘤、肠和结肠癌,及各种转移性癌。
本公开还提供了用于治疗炎性障碍的方法,包括施用有效量的抗-CXCR3多肽,其中所述抗-CXCR3多肽选自以至少10-6M的结合亲和力结合CXCR3表位的IgG类的全人抗体、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域的全人抗体Fab片段、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域及连接所述重链和轻链可变域区域的肽接头的单链人抗体,及其组合;
其中所述全人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合;
其中所述全人抗体Fab片段具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ IDNO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合;和
其中所述单链人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ IDNO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合。
优选地,所述全人抗体具有重链和轻链两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2(本文中称为32B12)、SEQ ID NO.3/SEQ IDNO.4(本文中称为32D12)、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6(本文中称为H1)、SEQ ID NO.7/SEQID NO.8(本文中称为B7)、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10(本文中称为C12)、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12(本文中称为D12)、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14(本文中称为E1)、SEQ IDNO.15/SEQ ID NO.16(本文中称为G12)、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18(本文中称为3A3)、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20(本文中称为3A5)、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22(本文中称为3A11)、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24(本文中称为3B12)、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26(本文中称为3C11)、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28(本文中称为4C3)、SEQ ID NO.29/SEQ IDNO.30(本文中称为B12)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32(本文中称为C4)、SEQ ID NO.31/SEQID NO.33(本文中称为F7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34(本文中称为2A3)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35(本文中称为3A7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36(本文中称为3A8)、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.37(本文中称为4D5)及其组合。优选地,所述全人抗体Fab片段具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2(本文中称为32B12)、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4(本文中称为32D12)、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6(本文中称为H1)、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8(本文中称为B7)、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10(本文中称为C12)、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12(本文中称为D12)、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14(本文中称为E1)、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16(本文中称为G12)、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18(本文中称为3A3)、SEQ ID NO.19/SEQ IDNO.20(本文中称为3A5)、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22(本文中称为3A11)、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24(本文中称为3B12)、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26(本文中称为3C11)、SEQ IDNO.27/SEQ ID NO.28(本文中称为4C3)、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30(本文中称为B12)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32(本文中称为C4)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33(本文中称为F7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34(本文中称为2A3)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35(本文中称为3A7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36(本文中称为3A8)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37(本文中称为4D5)及其组合。优选地,所述全人单链抗体具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述单链全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.19/SEQID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25/SEQID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31/SEQID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.31/SEQID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37及其组合。
优选地,待治疗的炎性障碍选自类风湿性关节炎、多发性硬化、克罗恩氏病、格雷夫斯氏病、舍格伦综合征、炎性肠病、慢性阻塞性肺病、银屑病、1型糖尿病、移植排斥、慢性丙型肝炎、疟疾和动脉粥样硬化。
附图说明
图1显示抗-CXCR3抗体32B12与CHO-CXCR3细胞的结合。
具体实施方式
本公开提供了以10-6M或更小的结合亲和力结合CXCR3表位的IgG类的全人抗体,其具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ IDNO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13、SEQ IDNO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.25、SEQ IDNO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.18、SEQ IDNO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.30、SEQ IDNO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.37及其组合。优选地,全人抗体具有重链和轻链两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2(本文中称为32B12)、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4(本文中称为32D12)、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6(本文中称为H1)、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8(本文中称为B7)、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10(本文中称为C12)、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12(本文中称为D12)、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14(本文中称为E1)、SEQ ID NO.15/SEQ IDNO.16(本文中称为G12)、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18(本文中称为3A3)、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20(本文中称为3A5)、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22(本文中称为3A11)、SEQ IDNO.23/SEQ ID NO.24(本文中称为3B12)、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26(本文中称为3C11)、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28(本文中称为4C3)、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30(本文中称为B12)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32(本文中称为C4)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33(本文中称为F7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34(本文中称为2A3)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35(本文中称为3A7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36(本文中称为3A8)、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.37(本文中称为4D5)及其组合。
本公开提供了全人抗体Fab片段,其具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域,其中所述重链可变域序列与选自以下的氨基酸序列至少95%同一:SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQ IDNO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQ IDNO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQ IDNO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQ IDNO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQ IDNO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQ IDNO.37及其组合。优选地,全人抗体Fab片段具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ IDNO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ IDNO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37及其组合.
本公开提供了单链人抗体,其具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域及连接所述重链和轻链可变域区域的肽接头,其中所述重链可变域序列与选自以下的氨基酸序列至少95%同一:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ IDNO.9、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ IDNO.21、SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ IDNO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ IDNO.2、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ IDNO.14、SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ IDNO.26、SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ IDNO.35、SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.37及其组合。优选地,全人单链抗体具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述单链全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ IDNO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18、SEQ IDNO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24、SEQ IDNO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37及其组合。
本公开还提供了用于治疗广谱哺乳动物癌症或炎性疾病或自身免疫性疾病的方法,包括施用有效量的抗-CXCR3多肽,其中所述抗-CXCR3多肽选自以至少10-6M的结合亲和力结合CXCR3表位的IgG类的全人抗体、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域的全人抗体Fab片段、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域及连接所述重链和轻链可变域区域的肽接头的单链人抗体,及其组合;
其中全人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQID NO.37及其组合;
其中全人抗体Fab片段具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ IDNO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合;和
其中单链人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQID NO.37及其组合。
优选地,全人抗体具有重链和轻链两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ IDNO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ IDNO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ IDNO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ IDNO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ IDNO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.37及其组合。优选地,全人抗体Fab片段具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ IDNO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ IDNO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37及其组合。优选地,全人单链抗体具有具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述单链全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ IDNO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ IDNO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ IDNO.17/SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ IDNO.23/SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ IDNO.29/SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.37及其组合。
优选地,待治疗的广谱哺乳动物癌症是CXCR3-阳性癌症。优选地,待治疗的广谱哺乳动物癌症选自白血病、淋巴瘤、癌瘤、***癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、子宫内膜癌、卵巢癌、胃癌、头颈癌、黑素瘤、骨肉瘤、肠和结肠癌,及各种转移性癌。优选地,待治疗的炎性障碍选自类风湿性关节炎、多发性硬化、克罗恩氏病、格雷夫斯氏病、舍格伦综合征、炎性肠病、慢性阻塞性肺病、银屑病、1型糖尿病、移植排斥、慢性丙型肝炎、疟疾和动脉粥样硬化。
“抗原结合蛋白”是包含与抗原结合的部分和,任选地,允许抗原结合部分采取促进抗原结合蛋白与抗原的结合的构象的骨架或框架部分的蛋白质。抗原结合蛋白的例子包括抗体、抗体片段(例如,抗体的抗原结合部分)、抗体衍生物和抗体类似物。抗原结合蛋白可以包含,例如,具有移植的CDR或CDR衍生物的替代性蛋白质骨架或人工骨架。这些骨架包括,但不限于抗体衍生的骨架(包含引入以例如使抗原结合蛋白的三维结构稳定的突变)以及完全合成的骨架(包含,例如,生物相容性聚合物)。参见,例如,Korndorfer等,2003,Proteins:Structure,Function,and Bioinformatics,第53卷,第1期:121-129;Roque等,2004,Biotechnol.Prog.20:639-654。此外,可以使用肽抗体模拟物(“PAM”)以及基于抗体模拟物的骨架(利用纤维连接蛋白组分作为骨架)。
抗原结合蛋白可以具有,例如,天然存在的免疫球蛋白的结构。“免疫球蛋白”是四聚体分子。在天然存在的免疫球蛋白中,每个四聚体由两个相同的多肽链对组成,每对具有一条“轻”链(约25kDa)和一条“重”链(约50-70kDa)。每条链的氨基端部分包括主要负责抗原识别的约100至110个或更多个氨基酸的可变区。每条链的羧基端部分限定主要负责效应子功能的恒定区。人轻链分类为κ或λ轻链。重链分类为μ、δ、γ、α或ε,并分别定义抗体同种型为IgM、IgD、IgG、IgA和IgE。在轻链和重链内,可变区和恒定区通过约12个或更多个氨基酸的“J”区连接,并且重链还包括约10个或更多个氨基酸的“D”区。通常参见,FundamentalImmunology,第7章(Paul,W.编辑,第二版,Raven出版社,N.Y.(1989))(通过引用结合其全部内容用于所有目的)。每个轻/重链对的可变区形成抗体结合位点,使得完整的免疫球蛋白具有两个结合位点。
天然存在的免疫球蛋白链的可变区表现出相同的总体结构:具有通过三个高变区(也称为互补决定区或CDR)连接的相对保守的框架区(FR)。从N端至C端,轻链和重链都包含结构域FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3和FR4。每个结构域的氨基酸按照Kabat等在Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,US Dept.of Health andHuman Services,PHS,NIH,NIH出版号91-3242,1991中的定义命名。免疫球蛋白链中氨基酸的其它编号***包括IMGT.RTM.(国际ImMunoGeneTics信息***;Lefranc等,Dev.Comp.Immunol.29:185-203;2005)和AHo(Honegger和Pluckthun,J.Mol.Biol.309(3):657-670;2001)。
可以从含有具有变化的抗原特异性的免疫球蛋白的来源比如血清或血浆获得抗体。如果将这样的抗体进行亲和纯化,它们可以针对特定的抗原特异性富集。通常由少于约10%的对特定抗原具有特异性结合活性的抗体制备这类富集的抗体制剂。使这些制剂进行若干轮亲和纯化可以提高对抗原具有特异性结合活性的抗体的比例。以这种方式制备的抗体通常称为“单特异性的”。单特异性抗体制剂可以由约10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%或99.9%的对特定抗原具有特异性结合活性的抗体构成。
除非另有说明,“抗体”是指完整的免疫球蛋白或与完整抗体为特异性结合而竞争的其抗原结合部分。可以通过重组DNA技术或通过完整抗体的酶促或化学切割产生抗原结合部分。抗原结合部分包括,特别是,Fab、Fab'、F(ab')2、Fv、域抗体(dAb)和互补决定区(CDR)片段、单链抗体(scFv)、嵌合抗体、双抗体(diabodies)、三抗体(triabodies)、四抗体(tetrabodies)和含有至少足以赋予多肽特异性抗原结合的免疫球蛋白部分的多肽。
Fab片段为具有VL、VH、CL和CH1结构域的单价片段;F(ab')2片段为具有通过在铰链区的二硫键连接的2个Fab片段的双价片段;Fd片段具有VH和CH1结构域;Fv片段具有抗体单臂的VL和VH结构域;并且dAb片段具有VH结构域、VL结构域或者VH或VL结构域的抗原结合片段(美国专利号6,846,634、6,696,245,美国专利申请公开号2002/02512、2004/0202995、2004/0038291、2004/0009507、2003/0039958和Ward等,Nature 341:544-546,1989)。
单链抗体(scFv)为其中VL和VH区通过接头(例如,合成的氨基酸残基的序列)连接以形成连续的蛋白链(其中该接头足够长以允许蛋白链自身回折并形成单价抗原结合位点)的抗体(Bird等,1988,Science 242:423-26和Huston等,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-83)。双抗体为包含2条多肽链的二价抗体,其中每条多肽链包含由接头连接的VH和VL结构域,该接头太短而不允许相同链上的2个结构域之间配对,因此使得每个结构域与在另一多肽链上的互补结构域配对(Holliger等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-48,1993和Poljak等,Structure 2:1121-23,1994)。如果双抗体的两条多肽链是相同的,那么由其配对产生的双抗体将具有2个相同的抗原结合位点。具有不同序列的多肽链可以用于形成具有2个不同抗原结合位点的双抗体。类似地,三抗体和四抗体分别为包含3条和4条多肽链并分别形成3个和4个抗原结合位点(其可以是相同的或不同的)的抗体。
可以利用Kabat等(同上)、Lefranc等(同上)和/或Honegger和Pluckthun(同上)描述的***确定给定抗体的互补决定区(CDR)和框架区(FR)。可以将一个或多个CDR共价或非共价地整合到分子中以使其成为抗原结合蛋白。抗原结合蛋白可以使CDR作为较大多肽链的部分并入,可以共价地将CDR连接至另一多肽链,或可以非共价地整合CDR。CDR允许抗原结合蛋白特异性地结合特定的目标抗原。
抗原结合蛋白可以具有一个或多个结合位点。如果存在多于一个结合位点,那么结合位点可以彼此相同或可以不同。例如,天然存在的人免疫球蛋白通常具有两个相同的结合位点,而“双特异性”或“双功能”抗体具有两个不同的结合位点。
术语“人抗体”包括具有源自人免疫球蛋白序列的一个或多个可变区和恒定区的所有抗体。在一个实施方式中,所有的可变域和恒定域源自人免疫球蛋白序列(全人抗体)。这些抗体可以以多种方式制备,其实例如下文所述,包括通过用目标抗原对小鼠(其经遗传修饰以表达来源于人重链和/或轻链编码基因的抗体)进行免疫。
人源化抗体的序列与来源于非人物种的抗体的序列不同在于一个或多个氨基酸置换、删除和/或添加,以使得在施用于人类受试者时,人源化抗体与非人物种的抗体相比较少可能诱导免疫应答和/或诱导较不严重的免疫应答。在一个实施方式中,非人物种抗体的重链和/或轻链的框架和恒定域中的某些氨基酸突变以产生人源化抗体。在另一实施方式中,来自人抗体的恒定域与非人物种的可变域融合。在另一实施方式中,改变非人抗体的一个或多个CDR序列中的一个或多个氨基酸残基以降低非人抗体在施用于人类受试者时可能的免疫原性,其中改变的氨基酸残基对于抗体与其抗原的免疫特异性结合不是关键的,或对氨基酸序列进行的改变是保守性改变,使得人源化抗体与抗原的结合不会比非人抗体与抗原的结合明显更差。如何制备人源化抗体的例子可以在美国专利号6,054,297、5,886,152和5,877,293中找到。
术语“嵌合抗体”指的是含有来自一个抗体的一个或多个区域和来自一个或多个其它抗体的一个或多个区域的抗体。在一个实施方式中,一个或多个CDR来源于人抗-CXCR3抗体。在另一实施方式中,所有的CDR来源于人抗-CXCR3抗体。在另一实施方式中,来自多于一个人抗-CXCR3抗体的CDR在嵌合抗体中混合并匹配。例如,嵌合抗体可以包含来自第一人抗PAR-2抗体的轻链的CDR1,来自第二人抗-CXCR3抗体的轻链的CDR2和CDR3,以及来自第三抗-CXCR3抗体的重链的CDR。其它组合是可能的。
此外,框架区可以来源于相同抗-CXCR3抗体中的一个、源自一个或多个不同抗体(比如人抗体)或源自人源化抗体。在嵌合抗体的一个例子中,重链和/或轻链的一部分与来自特定物种或者属于特定抗体类别或子类的抗体相同、同源或来源于该抗体,而链的其余部分与来自另一物种或者属于另一抗体类别或子类的抗体相同、同源或来源于该抗体。也包括这些抗体的表现出所需生物活性(即,特异性结合CXCR3的能力)的片段。
“中和抗体”或“抑制性抗体”为使用例如本文实施例中描述的那些分析,在过量的抗-CXCR3抗体降低激活的量至少约20%时抑制CXCR3的激活的抗体。在各种实施方式中,抗原结合蛋白降低CXCR3的激活的量至少30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%和99.9%。
本领域技术人员可以根据本说明书的教导并使用本领域已知技术容易地制备抗体片段或类似物。片段或类似物的优选氨基端和羧基端存在于功能域的边界附近。可以通过将核苷酸和/或氨基酸序列数据与公共或专有序列数据库比较来识别结构域和功能域。计算机化的比较方法可用于识别在已知结构和/或功能的其它蛋白质中存在的序列基序或预测的蛋白质构象结构域。识别折叠成已知三维结构的蛋白质序列的方法是已知的。参见,Bowie等,1991,Science 253:164。
“CDR移植抗体”是包含来源于特定物种或同种型的抗体的一个或多个CDR和相同或不同物种或同种型的另一抗体的框架的抗体。
“多特异性抗体”是识别在一个或多个抗原上的超过一个表位的抗体。这种类型的抗体的子类为“双特异性抗体”,其识别在相同或不同抗原上的2个不同的表位。
如果抗原结合蛋白以1纳摩尔或更小的解离常数结合抗原(例如,人CXCR3),那么该抗原结合蛋白“特异性地结合”该抗原。
“抗原结合结构域”、“抗原结合区”或“抗原结合位点”为含有与抗原相互作用并造成抗原结合蛋白对抗原的特异性和亲和力的氨基酸残基(或其它部分)的抗原结合蛋白的部分。对于特异性地结合其抗原的抗体,这包括其CDR域中至少一个的至少一部分。
“表位”为分子的被抗原结合蛋白(例如,抗体)结合的部分。表位可以包括分子的非连续部分(例如在多肽中,在多肽的一级序列中非连续的但在多肽的三级和四级结构的情况下彼此足够接近以被抗原结合蛋白结合的氨基酸残基)。
两个多核苷酸或两个多肽序列的“百分同一性”通过利用GAP计算机程序(GCGWisconsin Package的部分,版本10.3(Accelrys,圣地亚哥,加利福尼亚州))使用其默认参数比较该序列来确定。
术语“多核苷酸”、“寡核苷酸”和“核酸”在全文中可互换地使用并包括DNA分子(例如,cDNA或基因组DNA)、RNA分子(例如,mRNA)、用核苷酸类似物(例如,肽核酸和非天然存在的核苷酸类似物)产生的DNA或RNA的类似物及其杂合体。核酸分子可以为单链或双链的。在一个实施方式中,本发明的核酸分子包含编码抗体或其片段、衍生物、突变蛋白或变体的连续开放阅读框。
如果两个单链多核苷酸的序列可以按反平行定向对齐以使得一个多核苷酸中的每个核苷酸与另一多核苷酸中的其互补核苷酸相对的而没有引入空位和在任一序列的5'或3'端没有未配对的核苷酸,那么这两个单链多核苷酸是彼此的“互补序列”。如果两个多核苷酸可以在中等严格条件下彼此杂交,那么一个多核苷酸与另一多核苷酸“互补”。因此,多核苷酸可以与另一多核苷酸互补而不是其互补序列。
“载体”为可以用于将与其连接的另一核酸引入细胞中的核酸。一种类型的载体为“质粒”,其指的是可以将另外的核酸片段接合至其中的线性或环状双链DNA分子。另一类型的载体为病毒载体(例如,复制缺陷型逆转录病毒、腺病毒和腺相关病毒),其中可将另外的DNA片段引入到病毒基因组中。某些载体能够在其所引入的宿主细胞中自主复制(例如,包含细菌复制起点的细菌载体和附加型哺乳动物载体)。其它载体(例如,非附加型哺乳动物载体)在引入宿主细胞中后被整合到宿主细胞的基因组中,且由此与宿主基因组一起复制。“表达载体”为可以指导选定多核苷酸的表达的载体类型。
如果调控序列影响核苷酸序列的表达(例如,表达的水平、时机或位置),那么该核苷酸序列“可操作地连接”于调控序列。“调控序列”为影响其可操作地连接的核酸的表达(例如,表达的水平、时机或位置)的核酸。调控序列可以,例如,直接在所调节的核酸上,或通过一个或多个其它分子(例如,结合于该调控序列和/或该核酸的多肽)的作用施加其影响。调控序列的例子包括启动子、增强子和其它表达控制元件(例如,聚腺苷酸化信号)。调控序列的另外的例子在,例如,Goeddel,1990,Gene Expression Technology:Methods inEnzymology 185,Academic Press,San Diego,Calif.和Baron等,1995,Nucleic AcidsRes.23:3605-06中描述。
“宿主细胞”为可以用于表达核酸(例如,本发明的核酸)的细胞。宿主细胞可以是原核细胞,例如,大肠杆菌,或其可以是真核细胞,例如,单细胞真核生物(例如,酵母或其它真菌)、植物细胞(例如,烟草或番茄植物细胞)、动物细胞(例如,人细胞、猴细胞、仓鼠细胞、大鼠细胞、小鼠细胞或昆虫细胞)或杂交瘤。宿主细胞的例子包括COS-7猴肾细胞系(ATCCCRL 1651)(参见Gluzman等,1981,Cell 23:175)、L细胞、C127细胞、3T3细胞(ATCC CCL163)、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或其衍生物如Veggie CHO和相关细胞系(其在无血清培养基中生长)(参见Rasmussen等,1998,Cytotechnology 28:31)或CHO株DX-B11(其为DHFR缺陷的)(参见Urlaub等,1980,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4216-20)、HeLa细胞、BHK(ATCCCRL 10)细胞系、来源于非洲绿猴肾细胞系CV1的CV1/EBNA细胞系(ATCC CCL 70)(参见McMahan等,1991,EMBO J.10:2821)、人胚肾细胞(比如293、293EBNA或MSR293)、人表皮A431细胞,人Colo205细胞、其它转化的灵长类细胞系、正常二倍体细胞、来源于原代组织、原代外植体的体外培养物的细胞株、HL-60、U937、HaK或Jurkat细胞。通常,宿主细胞是可用多肽编码核酸(其随后可以在宿主细胞中表达)转化或转染的培养细胞。短语“重组宿主细胞”可以用于表示已经用待表达的核酸转化或转染的宿主细胞。宿主细胞也可以为包含核酸,但除非将调控序列引入到该宿主细胞中以使该调控序列可操作地与该核酸连接,不以所需的水平表达该核酸的细胞。应该理解,术语宿主细胞不仅仅指特定的受试细胞,还指这种细胞的后代或潜在的后代。因为在后续的世代中可能由于例如突变或环境影响而出现一些变化,因此实际上这类后代可能与亲本细胞不相同,但仍然包含在本文使用的该术语的范围内。
优选地,待治疗的哺乳动物癌症选自卵巢、结肠、乳腺或肝癌细胞系,骨髓瘤,神经母细胞源的CNS肿瘤,单核细胞性白血病,B-细胞源白血病,T-细胞源白血病,B-细胞源淋巴瘤,T-细胞源淋巴瘤,肥大细胞源的肿瘤及其组合。
可以利用本领域已知的任何标准方法产生本公开的多肽。在一个实例中,通过重组DNA方法将编码多肽的核酸序列(例如,cDNA)***到重组表达载体中并且在促进表达的条件下表达DNA序列来产生该多肽。
可以化学合成编码本文公开的各种多肽中任何一种的核酸。可以选择密码子使用以改善在细胞中的表达。这类密码子选择取决于选择的细胞类型。已经开发了用于大肠杆菌和其它细菌以及哺乳动物细胞、植物细胞、酵母细胞和昆虫细胞的专用的密码子选择模式。参见,例如:Mayfield等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.2003,100(2):438-42、Sinclair等,Protein Expr.Purif.2002(1):96-105、Connell N D.Curr.Opin.Biotechnol.2001,12(5):446-9、Makrides等,Microbiol.Rev.1996,60(3):512-38和Sharp等,Yeast.1991,7(7):657-78。
用于核酸操作的一般技术在,例如,Sambrook等,Molecular Cloning:ALaboratory Manual,Vols.1-3,Cold Spring Harbor Laboratory Press,2ed.,1989或F.Ausubel等,Current Protocols in Molecular Biology(Green Publishing andWiley-Interscience:NewYork,1987)及其定期更新中描述,其内容通过引用结合于本文中。编码多肽的DNA可操作地连接至源自哺乳动物、病毒或昆虫基因的合适的转录或翻译调控元件。这些调控元件包括转录启动子、任选的控制转录的操纵子序列、编码合适的mRNA核糖体结合位点的序列及控制转录和翻译的终止的序列。在宿主中复制的能力(通常由复制起点赋予)和帮助识别转化体的选择基因另外地并入。
重组DNA也可以包括可以用于纯化蛋白质的任何类型的蛋白质标签序列。蛋白质标签的例子包括,但不限于组氨酸标签、FLAG标签、myc标签、HA标签或GST标签。用于细菌、真菌、酵母和哺乳动物细胞宿主的合适的克隆和表达载体可以在Cloning Vectors:ALaboratory Manual,(Elsevier,N.Y.,1985)中找到。
利用适合于宿主细胞的方法将表达构建体引入宿主细胞中。本领域已知将核酸引入宿主细胞中的多种方法,包括但不限于:电穿孔,采用氯化钙、氯化铷、磷酸钙、DEAE-葡聚糖或其它物质的转染,基因枪法,脂质转染和感染(其中载体是传染剂)。合适的宿主细胞包括原核细胞、酵母、哺乳动物细胞或细菌细胞。
合适的细菌包括革兰氏阴性或革兰氏阳性有机体,例如,大肠杆菌或芽孢杆菌属。酵母,优选来自酵母属物种,比如酿酒酵母,也可用于产生多肽。各种哺乳动物或昆虫细胞培养***也可以用于表达重组蛋白。Luckow和Summers综述了在昆虫细胞中用于产生异源蛋白质的杆状病毒***(Bio/Technology,6:47,1988)。合适的哺乳动物宿主细胞系的例子包括内皮细胞、COS-7猴肾细胞、CV-1、L细胞、C127、3T3、中国仓鼠卵巢(CHO)、人胚肾细胞、HeLa、293、293T和BHK细胞系。纯化的多肽通过培养合适的宿主/载体***以表达重组蛋白来制备。对于许多应用,本文公开的许多多肽的小尺寸使得在大肠杆菌中表达成为优选的表达方法。然后从培养基或细胞提取物纯化蛋白质。
本文公开的蛋白质也可以使用细胞翻译***产生。为了此类目的,必须修饰编码多肽的核酸以允许进行体外转录而产生mRNA并且允许利用mRNA在特定的无细胞***(真核的,比如哺乳动物或酵母无细胞翻译***,或原核的,比如,细菌无细胞翻译***)中的无细胞翻译。
CXCR3-结合多肽也可以通过化学合成产生(例如,通过在Solid Phase PeptideSynthesis,2nd ed.,1984,The Pierce Chemical Co.,Rockford,Ill中描述的方法)。也可以通过化学合成产生对蛋白质的修饰。
本公开的多肽可以通过蛋白质化学领域公知的蛋白质分离/纯化方法进行纯化。非限制性例子包括萃取、重结晶、盐析(例如,用硫酸铵或硫酸钠)、离心、透析、超滤、吸附色谱、离子交换色谱、疏水性色谱、正相色谱、反相色谱、凝胶过滤、凝胶渗透色谱、亲和色谱、电泳、逆流分布或这些的任意组合。纯化后,可以通过本领域已知的多种方法中的任何一种,包括但不限于,过滤和透析,使多肽交换到不同的缓冲液中和/或浓缩。
纯化的多肽优选至少85%纯,更优选至少95%纯,并且最优选至少98%纯。无论纯度的确切数值如何,多肽都足够纯以用作药物产品。
多肽的翻译后修饰
在某些实施方式中,本发明的结合多肽可以进一步包括翻译后修饰。示例性的蛋白质翻译后修饰包括磷酸化、乙酰化、甲基化、ADP-核糖基化、泛素化、糖基化、羰基化、SUMO化、生物素化或者多肽侧链或疏水性基团的添加。结果,修饰的可溶性多肽可含有非氨基酸成分,例如脂质、多糖或单糖和磷酸类。糖基化的优选形式是唾液酸化,其将一个或多个唾液酸部分与多肽缀合。唾液酸部分改善溶解性和血清半衰期,同时还降低该蛋白质的可能的免疫原性。参见Raju等,Biochemistry.2001,31;40(30):8868-76。
在一个具体的实施方式中,所述可溶性多肽的修饰形式包括将所述可溶性多肽连接至非蛋白质性的聚合物。在一个具体的实施方式中,该聚合物为聚乙二醇("PEG")、聚丙二醇或聚氧化烯类,以如美国专利号4,640,835、4,496,689、4,301,144、4,670,417、4,791,192或4,179,337中所述的方式。修饰多肽的实例包括PEG化抗体。
PEG是可在市场上买到或可以根据本领域公知的方法通过乙二醇的开环聚合制备(Sandler和Karo,Polymer Synthesis,Academic Press,New York,Vol.3,138-161页)的水溶性聚合物。术语“PEG”广泛地用于涵盖任何聚乙二醇分子而不涉及大小或在PEG末端的修饰,并且可以由下式表示:X-O(CH2CH2O)n-1CH2CH2OH(1),其中n为20至2300,并且X为H或末端修饰,例如:C1-4烷基。在一个实施方式中,本发明的PEG在一端以羟基或甲氧基封端,即,X为H或CH3("甲氧基PEG")。PEG可以包含结合反应所需的进一步的化学基团,其由分子的化学合成产生,或者是使分子的部分具有最佳距离的间隔物。另外,这种PEG可以由一条或多条连接在一起的PEG侧链组成。具有多于一条PEG链的PEG被称为多臂或枝化PEG。枝化PEG可以通过,例如,将聚环氧乙烷添加到各种多元醇(包括甘油、季戊四醇和山梨糖醇)上而制备。例如,四臂的枝化PEG可以由季戊四醇和环氧乙烷制备。例如,EP-A0473084和美国专利号5,932,462描述了枝化PEG。PEG的一种形式包括由赖氨酸的伯氨基基团连接的两个PEG侧链(PEG2)(Monfardini等,Bioconjugate Chem.6(1995)62-69)。
虽然PEG是公知的,但这是首次证明PEG化的10Fn3多肽可以被PEG化并保留配体结合活性。在优选的实施方式中,PEG化的10Fn3多肽通过定点PEG化产生,特别是通过PEG与N-或C-末端的半胱氨酸部分的偶联。因此,本公开提供了具有改善的药代动力学性质的靶标结合10Fn3多肽,该多肽包含:具有约80-约150个氨基酸的10Fn3结构域,其中所述10Fn3结构域的至少一个环参与靶标结合;和共价结合的PEG部分,其中所述10Fn3多肽以小于100nM的KD结合靶标并在哺乳动物中具有小于30mL/hr/kg的清除率。PEG部分可以通过定点PEG化附接于10Fn3多肽,如通过附接于Cys残基,其中该Cys残基可以位于10Fn3多肽的N-末端或在N-末端与最N-末端的β或β-样链之间或者位于10Fn3多肽的C-末端或在C-末端与最C-末端的β或β-样链之间。Cys残基也可以位于其它位置,特别是不参与靶标结合的任何环。PEG部分也可以通过其它化学作用附接,包括通过与胺偶联。
PEG与肽或蛋白质的偶联一般包括PEG的活化和活化的PEG-中间体直接与靶蛋白/肽或与接头的偶联,接头随后活化并与靶蛋白/肽偶联(参见Abuchowski等,J.Biol.Chem.,252,3571(1977)和J.Biol.Chem.,252,3582(1977),Zalipsky等和Harris等,in:Poly(ethylene glycol)Chemistry:Biotechnical and Biomedical Applications;(J.M.Harris编辑)Plenum Press:New York,1992;第21和22章)。注意到包含PEG分子的结合多肽也称为偶联蛋白,而缺乏附接的PEG分子的蛋白可称为未偶联的。
可以选择多种分子量形式的PEG用于与CXCR3-结合多肽偶联,例如,约1,000道尔顿(Da)-100,000Da(n是20-2300)。PEG中重复单元的数目"n"对于以道尔顿描述的分子量是近似的。优选的是活化的接头上的PEG的总分子量适合于药物用途。因此,在一个实施方式中,PEG分子的分子量不超过100,000Da。例如,如果三个PEG分子附接于接头,其中各PEG分子具有12,000Da的相同分子量(各n为约270),则接头上的PEG的总分子量为约36,000Da(总n为约820)。附接于接头的PEG的分子量也可以不同,例如,在接头上的三个分子中,两个PEG分子各自可以是5,000Da(各n为约110)和一个PEG分子可以是12,000Da(n为约270)。
在本公开的具体实施方式中,CXCR3结合多肽与下式的一个聚(乙二醇)基团共价连接:-CO-(CH2)x-(OCH2CH2)m-OR,其中聚(乙二醇)基团的-CO(即,羰基)与结合多肽的一个氨基形成酰胺键;R是低级烷基;x是2或3;m是约450-约950;且n和m选择为使得偶联物减去结合多肽的分子量为约10-40kDa。在一个实施方式中,结合多肽的赖氨酸的6-氨基是可用(游离)的氨基。
以上偶联物可以更具体地通过下式(II)表示:P-NHCO-(CH2)x-(OCH2CH2)m-OR(II),其中P是如本文所述的结合多肽的基团(即,没有如式(II)中所示与羰基形成酰胺键的一个或多个氨基基团);和其中R是低级烷基;x是2或3;m是约450-约950且选择为使得偶联物减去结合多肽的分子量是约10-约40kDa。如本文使用的,"m"的给定范围具有定向的含义。"m"的范围在任何情况下和精确地通过PEG基团的分子量确定。
本领域技术人员可以基于,例如,PEG化结合多肽如何治疗地使用、所需剂量、循环时间、对蛋白水解的抗性、免疫原性和其它考虑因素来选择合适的PEG的分子量。对于PEG及其用于增强蛋白质性质的用途的讨论,参见Katre,Advanced Drug Delivery Reviews 10:91-114(1993)。
在一个实施方式中,PEG分子可以被活化以与结合多肽上的氨基反应,如与赖氨酸反应(Bencham等,Anal.Biochem.,131,25(1983);Veronese等,Appl.Biochem.,11,141(1985);Zalipsky等,Polymeric Drugs and Drug Delivery Systems,adrs 9-110 ACSSymposium Series469(1999);Zalipsky等,Europ.Polym.J.,19,1177-1183(1983);Delgado等,Biotechnology and Applied Biochemistry,12,119-128(1990))。
在一个具体实施方式中,PEG的碳酸酯用于形成PEG-结合多肽偶联物。Ν,Ν'-二琥珀酰亚胺基碳酸酯(DSC)可以用于与PEG的反应中以形成活性的混合PEG-琥珀酰亚胺基碳酸酯,其可以随后与接头的亲核基团或结合多肽的氨基反应(参见美国专利号5,281,698和5,932,462)。在相似类型的反应中,1,1'-(二苯并***基)碳酸酯和二-(2-吡啶基)碳酸酯可以与PEG反应以分别形成PEG-苯并***基和PEG-吡啶基混合碳酸酯(美国专利号5,382,657)。
10Fn3多肽的PEG化可以按照现有技术的方法进行,例如通过结合多肽与亲电子活性PEG(供应商:Shearwater Corp.,USA,www.shearwatercorp.com)的反应。本发明的优选PEG试剂是,例如,N-羟基琥珀酰亚胺基丙酸酯(PEG-SPA)、丁酸酯(PEG-SBA)、PEG-琥珀酰亚胺基丙酸酯或分支的N-羟基琥珀酰亚胺如mPEG2-NHS(Monfardini等,BioconjugateChem.6(1995)62-69)。这样的方法可以用于在结合多肽赖氨酸的f-氨基或结合多肽的N-末端氨基处PEG化。
在另一个实施方式中,PEG分子可以与结合多肽上的巯基偶联(Sartore等,Appl.Biochem.Biotechnol.,27,45(1991);Morpurgo等,Biocon.Chem.,7,363-368(1996);Goodson等,Bio/Technology(1990)8,343;美国专利号5,766,897)。美国专利号6,610,281和5,766,897描述了可以与巯基偶联的示例性的反应性PEG物质。
在其中PEG分子与结合多肽上的半胱氨酸残基偶联的一些实施方式中,半胱氨酸残基是结合多肽原有的,而在其它实施方式中,一个或多个半胱氨酸残基经工程化而进入到结合多肽中。突变可以引入结合多肽编码序列中以产生半胱氨酸残基。这可以,例如,通过使一个或多个氨基酸残基突变为半胱氨酸而实现。用于突变为半胱氨酸残基的优选氨基酸包括丝氨酸、苏氨酸、丙氨酸和其它亲水性残基。优选地,待突变为半胱氨酸的残基是表面暴露的残基。本领域中公知用于基于蛋白质的一级结构预测残基的表面可接近性的算法。或者,表面残基可以通过比较结合多肽的氨基酸序列来预测,条件是结合多肽基于其进行设计和进化的框架晶体结构已经被解析(参见Himanen等,Nature.(2001)20-27;414(6866):933-8)且因此表面暴露的残基已经被确定。在一个实施方式中,半胱氨酸残基在或接近N-和/或C-末端处或在环区域内引入结合多肽中。
在一些实施方式中,PEG化的结合多肽包含共价附接于N-末端氨基酸的α氨基的PEG分子。位点特异性的N-末端还原胺化描述于Pepinsky等,(2001)JPET,297,1059和美国专利号5,824,784中。PEG-醛利用其它可用亲核氨基用于蛋白质的还原胺化的用途描述于美国专利号4,002,531、Wieder等,(1979)J.Biol.Chem.254,12579和Chamow等,(1994)Bioconjugate Chem.5,133中。
在另一个实施方式中,PEG化的结合多肽包含共价附接于接头的一个或多个PEG分子,该接头随之附接于结合多肽N-末端的氨基酸残基的α氨基。这种方式公开于美国专利公开2002/0044921和WO094/01451中。
在一个实施方式中,结合多肽在C-末端PEG化。在具体的实施方式中,蛋白质通过引入叠氮基-甲硫氨酸和随后通过Staudinger反应偶联甲基-PEG-三芳基膦化合物而PEG化。这种C-末端偶联方法描述于Cazalis等,Bioconjug.Chem.2004;15(5):1005-1009中。
结合多肽的单PEG化也可以按照WO94/01451中描述的一般方法产生。WO94/01451描述了用于制备具有修饰的末端氨基酸α-碳反应性基团的重组多肽的方法。该方法的步骤包括形成重组多肽和在N-末端α-胺和C-末端α-羧基处用一个或多个生物添加的保护基团对其进行保护。多肽然后可以与化学保护剂反应以选择性地保护反应性侧链基团并由此防止侧链基团被改变。多肽然后用对于生物保护基团特异性的切割试剂切割以形成未保护的末端氨基酸α-碳反应性基团。未保护的末端氨基酸α-碳反应性基团用化学修饰剂进行修饰。侧链保护的末端修饰单拷贝多肽然后在侧链基团处脱保护以形成末端修饰的重组单拷贝多肽。方法中步骤的数量和顺序可以变化以实现多肽的N-和/或C-末端氨基酸处的选择性修饰。
偶联反应中结合多肽与活化PEG的比率可以为约1:0.5-1:50、约1:1-1:30或约1:5-1:15。各种水性缓冲液可以用于本方法中以催化PEG共价添加到结合多肽。在一个实施方式中,所使用的缓冲液的pH为约7.0-9.0。在另一个实施方式中,pH是在略碱性范围内,例如,约7.5-8.5。可以使用具有接近于中性pH范围的pKa的缓冲液,例如磷酸盐缓冲剂。
本领域中已知的常规分离和纯化技术可用于纯化PEG化的结合多肽,如尺寸排阻(例如,凝胶过滤)和离子交换色谱。产物也可以使用SDS-PAGE分离。可以分离的产物包括单-、二-、三-、多-或未-PEG化的结合多肽以及游离的PEG。单-PEG偶联物的百分比可以通过汇合洗脱峰周围的较宽级分来控制以提高组合物中单-PEG的百分比。约90%的单-PEG偶联物代表了产率和活性的良好平衡。其中例如,至少92%或至少96%的偶联物是单-PEG种类的组合物可能是希望的。在本发明的实施方式中,单-PEG偶联物的百分比为90%至96%。
在一个实施方式中,本发明的PEG化结合多肽包含一个、两个或更多个PEG部分。在一个实施方式中,PEG部分结合于在蛋白质的表面上和/或远离接触靶配体的表面的氨基酸残基。在一个实施方式中,PEG-结合多肽中PEG的综合或总分子量为约3,000Da-60,000Da,任选地约10,000Da-36,000Da。在一个实施方式中,PEG化结合多肽中的PEG基本上是线性的、直链PEG。
在本发明的一个实施方式中,PEG化结合多肽中的PEG在室温下8-16小时内使用羟胺分析(例如,450mM羟胺(pH 6.5))不从PEG化氨基酸残基水解,且因此是稳定的。在一个实施方式中,组合物的超过80%是稳定的单-PEG-结合多肽,更优选至少90%,和最优选至少95%。
在另一个实施方式中,本发明的PEG化结合多肽优选保留至少25%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%或100%的与未修饰蛋白质相关的生物活性。在一个实施方式中,生物活性是指其结合CXCR3的能力,如通过KD、kon或koff评价的。在一个具体实施方式中,PEG化结合多肽蛋白相对于未PEG化结合多肽显示出与CXCR3的结合的提高。
相对于未修饰的结合多肽的清除率,PEG修饰的多肽的血清清除率可以降低约10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或甚至90%。PEG修饰的多肽的半衰期(t1/2)可以相对于未修饰蛋白质的半衰期增加。相对于未修饰的结合多肽的半衰期,PEG结合多肽的半衰期可以增加至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%或500%,或者甚至1000%。在一些实施方式中,在体外测定蛋白质半衰期,比如,在缓冲盐水溶液中或在血清中。在其它实施方式中,蛋白质半衰期是体内半衰期,比如在动物的血清或其它体液中的蛋白质半衰期。
治疗性制剂和施用方式
本公开特征在于用于治疗响应于CXCR3生物活性的抑制的病症或预防前期病症的方法。优选的实例是特征为炎症或细胞过度增殖的病症。施用的技术和剂量根据特定多肽的类型和所治疗的特定病症而不同,但可以由技术人员容易地确定。通常,管理机构要求用作治疗剂的蛋白质试剂进行配制以具有可接受的低热原水平。因此,治疗性制剂与其它制剂的区别通常在于:其基本上是无热原的,或者至少包含的热原不超过由适当的管理机构(例如,FDA)确定的可接受的热原水平。
本公开的治疗性组合物可以以单位剂量形式与药学上可接受的稀释剂、载体或赋形剂一起施用。作为非限制性的例子,可以肠胃外(例如,静脉内、皮下)、口服或局部施用。此外,可以采用任何基因治疗技术(使用编码本发明多肽的核酸),例如裸DNA递送、重组基因和载体、基于细胞的递送,包括患者细胞的离体操作,等。
该组合物可以是用于口服施用的丸剂、片剂、胶囊、液体或持续释放片剂,或者用于静脉内、皮下或肠胃外施用的液体,或者用于局部施用的凝胶、洗剂、软膏、霜剂或者聚合物或其它持续释放媒介的形式。
在例如"Remington:The Science and Practice of Pharmacy"(20th ed.,A.R.Gennaro A R.编辑,2000,Lippincott Williams&Wilkins,Philadelphia,Pa.)中可以找到本领域公知的用于制备制剂的方法。用于肠胃外施用的制剂可以,例如,含有赋形剂、无菌水、盐水、聚烷撑二醇比如聚乙二醇、植物来源的油或氢化萘类。生物相容性的、可生物降解的交酯聚合物、丙交酯/乙交酯共聚物或聚氧乙烯-聚氧丙烯共聚物可以用于控制化合物的释放。纳米颗粒制剂(例如,可生物降解的纳米颗粒、固体脂质纳米颗粒、脂质体)可用于控制化合物的生物分布。其它潜在有用的肠胃外递送体系包括乙烯-乙酸乙烯酯共聚物颗粒、渗透泵、可植入式输注***和脂质体。制剂中化合物的浓度根据多种因素变化,包括待施用药物的剂量和施用途径。
多肽可任选地作为药学上可接受的盐施用,比如在制药工业中常用的无毒的酸加成盐或金属复合物。酸加成盐的例子包括有机酸,比如乙酸、乳酸、扑酸、马来酸、柠檬酸、苹果酸、抗坏血酸、琥珀酸、苯甲酸、棕榈酸、辛二酸、水杨酸、酒石酸、甲磺酸、甲苯磺酸或三氟乙酸等;聚合酸如单宁酸、羧甲基纤维素等;和无机酸,如盐酸、氢溴酸、硫酸、磷酸等。金属复合物包括锌、铁等等。在一个实例中,多肽在乙酸钠存在的情况下配制以提高热稳定性。
用于口服使用的制剂包括在与非毒性的药学上可接受的赋形剂的混合物中包含活性成分的片剂。这些赋形剂可以是,例如,惰性稀释剂或填充剂(例如,蔗糖和山梨醇)、润滑剂、助流剂和抗粘剂(例如,硬脂酸镁、硬脂酸锌、硬脂酸、硅石、氢化植物油或滑石)。
用于口服使用的制剂也可以作为可咀嚼片剂,或作为硬明胶胶囊(其中活性成分与惰性固体稀释剂混合)或作为软明胶胶囊剂(其中活性成分与水或油介质混合)提供。
治疗有效剂量是指产生施用所要达到的治疗效果的剂量。确切的剂量取决于待治疗的病症,并且可以由本领域技术人员利用已知技术确定。通常,多肽以每天约0.01g/kg至约50mg/kg,优选每天0.01mg/kg至约30mg/kg,最优选每天0.1mg/kg至约20mg/kg施用。多肽可以每天(例如,每天一次、二次、三次或四次)或优选以较低频率(例如、每周、每两周、每三周、每月或每季度)给予。此外,如本领域已知的,根据年龄以及体重、一般健康状况、性别、饮食、给药时间、药物相互作用和疾病的严重程度做出调整可能是必要的,并且将由本领域技术人员通过常规实验确定。
示例性用途
本文描述的CXCR3结合蛋白及其相关变体可用于多种治疗和诊断应用中。这些包括通过竞争或阻断与CXCR3的结合抑制CXCR3的生物学活性以及向细胞(优选表达CXCR3的细胞)递送细胞毒性部分或成像部分。这些分子的小尺寸和稳定结构对于药物的制造可能是特别有价值的,从身体的快速清除对于其中快速清除是希望的某些应用或者使用具有这样的特性的分子配制成合适的或改进的新型递送***是特别有价值的。
基于其作为CXCR3生物活性的抑制剂的效力,本公开的多肽对于多种癌症病症以及由癌症产生的并发症如胸膜积液和腹水、结肠直肠癌、白血病、淋巴瘤、头颈癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)和胰腺癌是有效的。癌症的非限制性实例包括膀胱癌、血癌、骨癌、脑癌、乳腺癌、软骨癌、结肠癌、肾癌、肝癌、肺癌、***癌、神经组织癌、卵巢癌、胰腺癌、***癌、骨骼肌癌、皮肤癌、脊髓癌、脾癌、胃癌、睾丸癌、胸腺癌、甲状腺癌、气管癌、泌尿生殖道癌、输尿管癌、尿道癌、子宫癌或***癌。
CXCR3结合多肽可单独或与一种或多种另外的治疗如化疗、放疗、免疫疗法、外科手术介入或这些方法的任何组合联合施用。如上所述的,长期治疗在其它治疗策略的情况下作为辅助疗法同样是可能的。优选地,在乳腺癌中,联合疗法是与赫塞汀或其它Her-2疗法。
在这些方法的某些实施方式中,可以一起(同时地)或在不同时间(依次地)施用一种或多种多肽治疗剂。此外,多肽治疗剂可以与用于治疗癌症或抑制血管生成的另一类型的化合物一起施用。
在某些实施方式中,可以单独使用本发明的所述抗-CXCR3抗体药剂。或者,所述药剂可以与针对增殖性障碍(例如,肿瘤)的治疗或预防的其他常规抗癌治疗途径组合使用。例如,这些方法可用于癌症预防、癌症术后复发和转移的预防以及作为其他常规癌症疗法的辅助治疗。本公开认为,常规癌症疗法(例如化疗、放疗、光疗、免疫疗法和手术)的效力可以通过使用所述多肽治疗剂来增强。
众多的常规化合物已被证明具有抗肿瘤活性。这些化合物已被用作化疗中的药剂以收缩实体肿瘤、预防肿瘤转移和进一步生长或降低白血病或骨髓恶性肿瘤中的恶性细胞数量。虽然化疗对治疗各种类型的恶性肿瘤有效,但许多抗肿瘤化合物会导致有害副作用。已证明,当结合两种或更多种不同治疗时,治疗可能协同地作用并允许降低每种治疗的剂量,由此降低每种化合物在较高剂量下产生的有害副作用。在其他情况中,难于以一种疗法治疗的恶性肿瘤可能响应于两种或更多种不同治疗的组合疗法。
当本发明的多肽治疗剂伴随地或相继地与另一常规抗肿瘤剂组合施用时,这种治疗剂可发现为提高抗肿瘤剂的疗效或克服这种抗肿瘤剂的细胞抗性。这允许减小抗肿瘤剂的剂量,由此减轻有害副作用,或恢复抗肿瘤剂在抗性细胞中的效力。
可用于组合抗肿瘤疗法的药物化合物包括(仅举例说明):氨鲁米特、安吖啶、阿那曲唑、天冬酰胺酶、卡介苗、比卡鲁胺、博来霉素、布舍瑞林、白消安、喜树碱、卡培他滨、卡铂、卡莫司汀、苯丁酸氮芥、顺铂、克拉屈滨、氯膦酸盐、秋水仙碱、环磷酰胺、环丙孕酮、阿糖胞苷、达卡巴嗪、更生霉素、柔红霉素、双烯雌酚、己烯雌酚、多西他赛、多柔比星、表柔比星、***、雌莫司汀、依托泊苷、依西美坦、非格司亭、氟达拉滨、氟氢可的松、氟尿嘧啶、氟***、氟他胺、吉西他滨、染料木黄酮、戈舍瑞林、羟基脲、伊达比星、异环磷酰胺、伊马替尼、干扰素、伊立替康、ironotecan、来曲唑、亚叶酸、亮丙瑞林、左旋咪唑、洛莫司汀、氮芥、甲羟孕酮、甲地孕酮、美法仑、巯基嘌呤、美司钠、甲氨蝶呤、丝裂霉素、米托坦、米托蒽醌、尼鲁米特、诺考达唑、奥曲肽、奥沙利铂、紫杉醇、帕米膦酸、喷司他丁、普卡霉素、卟吩姆、丙卡巴肼、雷替曲塞、利妥昔单抗、链佐星、苏拉明、他莫昔芬、替莫唑胺、替尼泊苷、睾酮、硫鸟嘌呤、噻替派、二氯二茂钛、拓扑替康、曲妥珠单抗、维甲酸、长春花碱、长春新碱、长春地辛和长春瑞滨。
某些化疗抗肿瘤化合物可以通过其作用机理分类到例如下列组中:抗代谢物/抗癌剂如嘧啶类似物(5-氟尿嘧啶、氟尿苷、卡培他滨、吉西他滨和阿糖胞苷)和嘌呤类似物、叶酸拮抗剂和相关抑制剂(巯基嘌呤、硫鸟嘌呤、喷司他丁和2-氯脱氧腺苷(克拉屈滨));抗增殖/抗有丝***剂,包括天然产物如长春花生物碱(长春花碱、长春新碱和长春瑞滨)、微管破坏剂如紫杉烷(紫杉醇、多西他赛)、长春新碱、长春花碱、诺考达唑、埃博霉素和诺维本、epidipodophyllotoxins(依托泊苷、替尼泊苷)、DNA损伤剂(放线菌素、安吖啶、蒽环类、博来霉素、白消安、喜树碱、卡铂、苯丁酸氮芥、顺铂、环磷酰胺、癌得星、更生霉素、柔红霉素、多柔比星、表柔比星、六甲蜜胺、奥沙利铂、异环磷酰胺、美法仑、氮芥(merchlorehtamine)、丝裂霉素、米托蒽醌、亚硝基脲、普卡霉素、丙卡巴肼、泰素、泰索帝、替尼泊苷、三亚乙基硫代磷酰胺和依托泊苷(VP16));抗生素类如更生霉素(放线菌素D)、柔红霉素、多柔比星(阿霉素)、伊达比星、蒽环类、米托蒽醌、博来霉素、普卡霉素(光神霉素)和丝裂霉素;酶(L-天冬酰胺酶,其***性地代谢L-天冬酰胺并剥夺无合成自身的天冬酰胺的能力的细胞);抗血小板药物;抗增殖/抗有丝***烷化剂如氮芥类(氮芥、环磷酰胺和类似物、美法仑、苯丁酸氮芥)、乙烯亚胺类和甲基三聚氰胺类(六甲蜜胺和噻替派)、烷基磺酸酯-白消安、亚硝基脲(卡莫司汀(BCNU)及类似物、链佐星)、trazenes-达卡巴嗪(DTIC);抗增殖/抗有丝***抗代谢物如叶酸类似物(甲氨蝶呤);铂配位络合物(顺铂、卡铂)、丙卡巴肼、羟基脲、米托坦、氨鲁米特;激素类、激素类似物(***、他莫昔芬、戈舍瑞林、比卡鲁胺、尼鲁米特)和芳香酶抑制剂(来曲唑、阿那曲唑);抗凝剂(肝素、合成肝素盐和其他凝血酶抑制剂);纤维蛋白溶解剂(例如组织纤维溶酶原活化剂、链激酶和尿激酶)、阿司匹林、双嘧达莫、噻氯匹定、氯吡格雷、阿昔单抗;抗迁移剂;抗分泌剂(breveldin);免疫抑制剂(环孢霉素、他克莫司(FK-506)、西罗莫司(雷帕霉素)、硫唑嘌呤、霉酚酸酯);抗血管生成化合物(TNP-470、染料木黄酮)和生长因子抑制剂(例如,VEGF抑制剂、成纤维细胞生长因子(FGF)抑制剂);血管紧张素受体阻断剂;一氧化氮供体;反义寡核苷酸;抗体(曲妥珠单抗);细胞周期抑制剂和分化诱导剂(维甲酸);mTOR抑制剂、拓扑异构酶抑制剂(多柔比星(阿霉素)、安吖啶、喜树碱、柔红霉素、更生霉素、eniposide、表柔比星、依托泊苷、伊达比星和米托蒽醌、拓扑替康、伊立替康)、皮质类固醇类(可的松、***、氢化可的松、甲基强的松龙、***和***龙);生长因子信号转导激酶抑制剂;线粒体功能障碍诱导剂和半胱天冬酶活化剂;和染色质破坏剂。
根据组合疗法的性质,可以在施用其他疗法的同时和/或之后施用该多肽治疗剂。多肽治疗剂的施用可以以单剂量或多剂量进行。在一些情况中,多肽治疗剂的施用开始于常规疗法之前的至少数天;而在其他情况中,施用在紧接传统疗法之前或在施用传统疗法的同时开始。
在诊断应用的一个实例中,来自疑似患有特征为不当的血管生成的病症的患者的生物样品如血清或组织活检样品与本公开的可检测地标记的多肽接触以检测CXCR3的水平。该检测的CXCR3水平然后与也接触标记多肽的正常样品中检测的CXCR3水平比较。CXCR3水平的至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%的提高可以考虑为诊断指标。
在某些实施方式中,CXCR3结合多肽进一步附接于能够被检测的标记(例如,该标记可以是放射性同位素、荧光化合物、酶或辅酶因子)。活性部分可以是放射活性试剂,例如放射性重金属如铁螯合物,钆或锰的放射性螯合物,氧、氮、铁、碳或钆的正电子发射体,43K、52Fe、57Co、67Cu、67Ga、68Ga、123I、125I、131I、132I或99Tc。可以使用固定于这样的部分的结合剂来作为成像剂,并以对于哺乳动物(例如人类)中的诊断目的有效的量来施用,然后检测该成像剂的定位和累积。可以用放射性闪烁摄影术、核磁共振成像、计算机断层扫描或正电子成像术来检测该成像剂的定位和累积。针对CXCR3的CXCR3结合多肽的免疫闪烁成像可以用于检测和/或诊断癌症和脉管***。例如,以99锝、111铟或125碘标记的任何针对CXCR3标志物的结合多肽可以有效地用于这种成像。对于本领域技术人员来说显而易见的,待施用的放射性同位素的量取决于该放射性同位素。本领域普通技术人员可以容易地根据用作活性部分的给定放射性核素的比活性和能量来计算待施用的成像剂的量。典型地,施用每剂成像剂0.1-100毫居,优选1-10毫居,最通常2-5毫居。因此,根据本发明可用作成像剂的组合物(其包含与放射性部分偶联的靶向部分)包含0.1-100毫居,在一些实施方式中优选为1-10毫居,在一些实施方式中优选为2-5毫居,在一些实施方式中更优选为1-5毫居。
CXCR3结合多肽还可用于向表达CXCR3的细胞或组织递送另外的治疗剂(包括但不限于药物化合物、化疗化合物和放疗化合物)。在一个实例中,该CXCR3结合多肽与化疗剂融合以将该化疗剂靶向递送至表达CXCR3的肿瘤细胞或组织。
CXCR3结合多肽可用于多种应用中,包括研究、诊断和治疗应用。例如,其可用于分离和/或纯化受体或其部分,以及用于研究受体结构(例如构象)和功能。
在某些方面,各种结合多肽可用于检测或测量CXCR3的表达,例如,在内皮细胞(例如,静脉内皮细胞)上或在用CXCR3基因转染的细胞上。因此,它们也在用于诊断或研究目的的诸如细胞分选和成像的应用(例如,流式细胞术和荧光激活细胞分选)中有用。
在某些实施方式中,为了诊断的目的,可以标记或不标记结合多肽或其片段。通常,诊断分析需要检测由结合多肽与CXCR3的结合产生的复合物的形成。与抗体类似,可以直接标记结合多肽或片段。可以采用多种标记,包括,但不限于:放射性核素、荧光剂、酶、酶底物、酶辅因子、酶抑制剂和配体(如,生物素、半抗原)。本领域技术人员已知许多合适的免疫分析法(参见,例如,美国专利号3,817,827、3,850,752、3,901,654和4,098,876)。在未标记时,结合多肽可以用于分析中,比如凝集分析。未标记的结合多肽也可以与另外(一种或多种)合适的试剂结合使用,该试剂可以用于检测结合多肽,比如,与结合多肽反应的标记抗体或其它合适的试剂(例如,标记的蛋白A)。
在一个实施方式中,本发明的结合多肽可以用于酶免疫分析法中,其中所述多肽与酶偶联。当包含CXCR3蛋白的生物样品与所述结合多肽组合时,在结合多肽和CXCR3蛋白之间发生结合。在一个实施方式中,含有表达CXCR3蛋白的细胞(例如,内皮细胞)的样品与所述抗体组合,并且在结合多肽和携带被该结合多肽识别的CXCR3蛋白的细胞之间发生结合。这些结合的细胞可以与未结合的试剂分离并且可以测定特异地结合细胞的结合多肽-酶偶联物的存在,例如,通过将样品与酶的底物(其在受到酶的作用时产生颜色变化或其它可检测的变化)接触。在另一实施方式中,所述结合多肽可以是未标记的,并且可以加入识别所述结合多肽的第二标记多肽(例如,抗体)。
在某些方面,还可以制备用于检测生物样品中CXCR3蛋白的存在的试剂盒。这些试剂盒将包括与CXCR3蛋白或所述受体的部分结合的CXCR3结合多肽,以及一种或多种适于检测结合多肽和受体蛋白或其部分之间的复合物的存在的辅助试剂。本发明的多肽组合物可以单独地或与对于其它表位特异性的另外的抗体组合以冻干形式提供。结合多肽和/或抗体(其可以是标记或未标记的)可以与辅助成分(例如,缓冲剂如Tris、磷酸盐和碳酸盐,稳定剂,赋形剂,杀生物剂和/或惰性蛋白质,例如,牛血清白蛋白)一起包括在试剂盒中。例如,结合多肽和/或抗体可以作为与辅助成分的冻干混合物提供,或辅助成分可以单独地提供用于由使用者组合。一般地,这些辅助材料基于活性结合多肽或抗体的量以小于约5%重量存在,且通常基于多肽或抗体浓度以至少约0.001%重量的总量存在。当采用能够与结合多肽结合的第二抗体时,这种抗体可以在试剂盒中提供,例如在单独的小瓶或容器中。第二抗体(如果存在)通常是标记的,并且可以以与上文描述的抗体制剂相似的方式配制。
类似地,本公开还提供了检测和/或定量CXCR3的表达的方法,其中包含细胞或其部分(例如,膜部分)的组合物在适合于结合的条件下与结合CXCR3或受体的部分的结合多肽接触,并监测该结合。检测到指示结合多肽与CXCR3或其部分之间的复合物的形成的结合多肽表明受体的存在。多肽与细胞的结合可以通过标准方法测定,如工作实施例中描述的那些。该方法可用于检测来自个体的细胞上的CXCR3表达。任选地,可以评估内皮细胞表面上CXCR3的定量表达,例如,通过流式细胞术,且染色强度可与疾病易感性、进展或风险相关联。
本公开还提供了检测哺乳动物对某些疾病的易感性的方法。举例来说,该方法可用于基于细胞上存在的CXCR3的量和/或哺乳动物中CXCR3-阳性细胞的数量检测哺乳动物对进展的疾病的易感性。
使用标准的一字母或三字母的缩写表示多肽序列。除非另有说明,每条多肽序列具有左侧的氨基端和右侧的羧基端;各单链核酸序列和各双链核酸序列的顶部链具有左侧的5'端和右侧的3'端。还可以通过解释特定多肽序列与参考序列如何不同来描述该特定多肽序列。
除非另有说明,以下术语应该理解为具有下面的意思:
术语"CXCR3抑制剂"和"CXCR3拮抗剂"可互换使用。各自是可检测地抑制CXCR3的至少一种功能的分子。相反地,“CXCR3激动剂”是可检测地提高CXCR3的至少一种功能的分子。由CXCR3抑制剂引起的抑制无需是完全的,只要其可使用测定方法检测。可以使用CXCR3功能的任何测定法,本文提供了其实例。可被CXCR3抑制剂抑制或被CXCR3激动剂提高的CXCR3功能的例子包括:癌细胞生长或细胞凋亡(程序性细胞死亡)等等。CXCR3抑制剂和CXCR3激动剂的类型的实例包括,但不限于CXCR3结合多肽如抗原结合蛋白(例如,CXCR3抑制性抗原结合蛋白)、抗体、抗体片段和抗体衍生物。
术语“肽”、“多肽”和“蛋白质”各自指包含通过肽键彼此接合的两个或更多个氨基酸残基的分子。这些术语包含,例如,天然和人工蛋白质、蛋白质片段和蛋白质序列的多肽类似物(比如突变蛋白、变体和融合蛋白)以及翻译后或者以其它方式共价或非共价地修饰的蛋白质。肽、多肽或蛋白质可以为单体的或多聚的。
多肽(例如,抗体)的“变体”包括其中相对于另一多肽序列,一个或多个氨基酸残基***氨基酸序列中、从氨基酸序列删除和/或被置换的氨基酸序列。公开的变体包括,例如,融合蛋白。
多肽的“衍生物”为已经进行化学修饰的多肽(例如,抗体),例如,通过与另一化学部分(比如,聚乙二醇或白蛋白,例如,人血清白蛋白)偶联、磷酸化和糖基化。除非另有说明,除了包括两条全长重链和两条全长轻链的抗体之外,术语“抗体”包括其衍生物、变体、片段或突变蛋白,其例子在下文有描述。
“抗原结合蛋白”是包含与抗原结合的部分和,任选地,允许抗原结合部分采取促进抗原结合蛋白与抗原结合的构象的骨架或框架部分的蛋白质。抗原结合蛋白的例子包括抗体、抗体片段(例如,抗体的抗原结合部分)、抗体衍生物和抗体类似物。抗原结合蛋白可以包括,例如,具有移植的CDR或CDR衍生物的替代性蛋白质骨架或人工骨架。这些骨架包括,但不限于抗体衍生的骨架(包含引入以例如使抗原结合蛋白的三维结构稳定的突变)以及完全合成的骨架(包含,例如,生物相容性聚合物)。参见,例如,Korndorfer等,2003,Proteins:Structure,Function,and Bioinformatics,第53卷,第1期:121-129;Roque等,2004,Biotechnol.Prog.20:639-654。此外,可以使用肽抗体模拟物(“PAM”)以及基于抗体模拟物的骨架(利用纤维连接蛋白组分作为骨架)。
抗原结合蛋白可以具有,例如,天然存在的免疫球蛋白的结构。“免疫球蛋白”是四聚体分子。在天然存在的免疫球蛋白中,每个四聚体由两个相同的多肽链对组成,每对具有一条“轻”链(约25kDa)和一条“重”链(约50-70kDa)。每条链的氨基端部分包括主要负责抗原识别的约100至110个或更多个氨基酸的可变区。每条链的羧基端部分限定主要负责效应子功能的恒定区。人轻链分类为κ或λ轻链。重链分类为μ、δ、γ、α或ε,并分别定义抗体同种型为IgM、IgD、IgG、IgA和IgE。优选地,本文公开的抗-CXCR3抗体的特征在于在重链VH和轻链VL氨基酸序列中的其可变域区域序列。优选的抗体为A6,其为κIgG抗体。在轻链和重链内,可变区和恒定区通过约12个或更多个氨基酸的“J”区连接,其中重链还包括约10个或更多个氨基酸的“D”区。通常参见,Fundamental Immunology,第7章(Paul,W.编辑,第二版.Raven出版,N.Y.(1989))。每个轻/重链对的可变区形成抗体结合位点,使得完整的免疫球蛋白具有两个结合位点。
“多特异性抗体”是识别在一个或多个抗原上的超过一个表位的抗体。该类型抗体的子类为“双特异性抗体”,其识别在相同或不同抗原上的2个不同的表位。
如果抗原结合蛋白以1纳摩尔或更小的解离常数结合抗原(例如,人CXCR3),那么其“特异性地结合”该抗原。
“抗原结合结构域”、“抗原结合区”或“抗原结合位点”为含有与抗原相互作用并造成抗原结合蛋白对抗原的特异性和亲和力的氨基酸残基(或其它部分)的抗原结合蛋白的部分。对于特异性地结合其抗原的抗体,这包括其CDR结构域中至少一个的至少部分。
“表位”为分子的被抗原结合蛋白(例如,被抗体)结合的部分。表位可以包括分子的非连续部分(例如在多肽中,在多肽的一级序列中不连续但在多肽的三级和四级结构的情况下彼此足够接近从而能够被抗原结合蛋白结合的氨基酸残基)。
两个多核苷酸或两个多肽序列的“百分同源性”通过利用GAP计算机程序(GCGWisconsin Package的部分,版本10.3(Accelrys,圣地亚哥,加利福尼亚州))使用其默认参数比较序列来确定。
“宿主细胞”为可以用于表达核酸的细胞。宿主细胞可以是原核细胞,例如,大肠杆菌,或其可以是真核细胞,例如,单细胞真核生物(例如,酵母或其它真菌)、植物细胞(例如,烟草或番茄植物细胞)、动物细胞(例如,人细胞、猴细胞、仓鼠细胞、大鼠细胞、小鼠细胞或昆虫细胞)或杂交瘤。宿主细胞的例子包括COS-7猴肾细胞系(ATCC CRL 1651)(参见Gluzman等,1981,Cell 23:175)、L细胞、C127细胞、3T3细胞(ATCC CCL 163)、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或其衍生物如Veggie CHO和相关细胞系(其在无血清培养基中生长)(Rasmussen等,1998,Cytotechnology 28:31)或CHO株DX-B11(其是DHFR缺陷的)(Urlaub等,1980,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4216-20)、HeLa细胞、BHK(ATCC CRL 10)细胞系、源于非洲绿猴肾细胞系CV1的CV1/EBNA细胞系(ATCC CCL 70)(McMahan等,1991,EMBO J.10:2821)、人胚肾细胞(如293、293EBNA或MSR 293)、人表皮A431细胞、人Colo205细胞、其它转化的灵长类细胞系、正常二倍体细胞、来源于原代组织、原代外植体的体外培养物的细胞株、HL-60、U937、HaK或Jurkat细胞。通常,宿主细胞是可以用多肽编码核酸(其随后可以在宿主细胞中表达)转化或转染的培养细胞。短语“重组宿主细胞”可以用于表示已经用待表达的核酸转化或转染的宿主细胞。宿主细胞也可以为包含核酸但除非将调控序列引入到该宿主细胞中以使得该调控序列可操作地与该核酸连接,否则不以所需的水平表达该核酸的细胞。应该理解,术语宿主细胞不仅仅指特定的受试细胞,还指这种细胞的后代或潜在的后代。因为某些改变可能由于例如突变或环境影响而在后续的世代中出现,因此实际上,这些后代可能与亲本细胞不相同,但仍然包括在本文使用的该术语的范围内。
抗原结合蛋白
抗原结合蛋白(例如,抗体、抗体片段、抗体衍生物、抗体突变蛋白和抗体变体)为结合CXCR3(优选地,人CXCR3)的多肽。抗原结合蛋白包括抑制CXCR3的生物活性的抗原结合蛋白。
包含一个或多个抗原结合蛋白的寡聚体可以用作CXCR3拮抗剂。寡聚体可以为共价连接或非共价连接的二聚体、三聚体或更高级的寡聚体的形式。考虑使用包含两个或更多个抗原结合蛋白的寡聚体,一个例子是同源二聚体。其它寡聚体包括异源二聚体、同源三聚体、异源三聚体、同源四聚体、异源四聚体等。
一个实施方式涉及包括通过在与抗原结合蛋白融合的肽部分之间的共价或非共价相互作用连接的多个抗原结合蛋白的寡聚体。这类肽可以是肽接头(间隔物),或具有促进低聚化的性质的肽。亮氨酸拉链和来源于抗体的某些多肽属于能够促进与其连接的抗原结合蛋白的低聚化的肽,如下文更详细描述的。
在特定实施方式中,寡聚体包含两个至四个抗原结合蛋白。寡聚体的抗原结合蛋白可以是任何形式的,如上述形式的任何一种,例如,变体或片段。优选地,寡聚体包含具有CXCR3结合活性的抗原结合蛋白。
在一个实施方式中,寡聚体使用源自免疫球蛋白的多肽制备。例如,Ashkenazi等,1991,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:10535、Byrn等,1990,Nature 344:677和Hollenbaugh等,1992"Construction of Immunoglobulin Fusion Proteins",in Current Protocolsin Immunology,Suppl.4,第10.19.1-10.19.11页已经描述了包含与抗体来源的多肽的各种不同部分(包括Fc结构域)融合的某些异源多肽的融合蛋白的制备。
一个实施方式涉及通过将抗-CXCR3抗体的CXCR3结合片段与抗体的Fc区融合产生的包含两个融合蛋白的二聚体。可以通过例如,将编码融合蛋白的基因融合体***合适的表达载体中,在用重组表达载体转化的宿主细胞中表达该基因融合体和使表达的融合蛋白非常像抗体分子一样组装,由此在Fc部分之间形成链间二硫键以产生二聚体来制备该二聚体。
术语“Fc多肽”包括源自抗体Fc区的多肽的天然和突变蛋白形式。也包括含有促进二聚化的铰链区的这种多肽的截短形式。包含Fc部分的融合蛋白(以及由其形成的寡聚体)具有如下优势:易于通过在蛋白A或蛋白G柱上的亲和色谱纯化。
制备低聚抗原结合蛋白的另一方法包括使用亮氨酸拉链。亮氨酸拉链结构域为促进其中存在亮氨酸拉链结构域的蛋白质的低聚化的肽。亮氨酸拉链最初在几种DNA结合蛋白中识别(Landschulz等,1988,Science 240:1759),并且此后在多种不同的蛋白质中发现。已知的亮氨酸拉链中有二聚化或三聚化的天然存在的肽及其衍生物。WO 94/10308描述了适于产生可溶性低聚蛋白质的亮氨酸拉链结构域的例子,并且Hoppe等,1994,FEBSLetters 344:191中描述了来源于肺表面活性蛋白D(SPD)的亮氨酸拉链。Fanslow等,1994,Semin.Immunol.6:267-78中描述了修饰的亮氨酸拉链的使用,该修饰的亮氨酸拉链允许与其融合的异源蛋白质稳定地三聚化。在一种方法中,在合适的宿主细胞中表达包含与亮氨酸拉链肽融合的抗CXCR3抗体片段或衍生物的重组融合蛋白,并从培养物上清液回收形成的可溶性低聚化抗-CXCR3抗体片段或衍生物。
可以通过常规技术产生本发明的抗原结合蛋白的抗原结合片段。这些片段的例子包括,但不限于Fab和F(ab')2片段。
本公开提供了结合CXCR3的单克隆抗体。单克隆抗体可以利用本领域已知的任何技术产生,例如,通过使在完成免疫方案后从转基因动物中收集的脾细胞永生化。可以使用本领域已知的任何技术使脾细胞永生化,例如,通过使脾细胞与骨髓瘤细胞融合以产生杂交瘤。在产生杂交瘤的融合过程中使用的骨髓瘤细胞优选为不产生抗体的,具有高融合效率和酶缺陷的(这使得该骨髓瘤细胞不能在仅支持期望的融合细胞(杂交瘤)生长的某些选择培养基中生长)。在小鼠融合中使用的合适的细胞系的例子包括Sp-20、P3-X63/Ag8、P3-X63-Ag8.653、NS1/1.Ag 41、Sp210-Ag14、FO、NSO/U、MPC-11、MPC11-X45-GTG1.7和S194/5XX0 Bul;在大鼠融合中使用的细胞系的例子包括R210.RCY3、Y3-Ag 1.2.3、IR983F和48210。可用于细胞融合的其它细胞系为U-266、GM1500-GRG2、LICR-LON-HMy2和UC729-6。
针对CXCR3的抗原结合蛋白可以用于例如,在体外或体内检测CXCR3多肽的存在的分析中。也可以采用该抗原结合蛋白通过免疫亲和色谱来纯化CXCR3蛋白。阻断性抗原结合蛋白可以用于本文公开的方法中。可以使用作为CXCR3拮抗剂发挥作用的抗原结合蛋白治疗任何CXCR3诱导的病症,包括但不限于各种癌症。
抗原结合蛋白可以在体外过程中使用,或体内施用以抑制CXCR3诱导的生物活性。因此,可以治疗(直接或间接地)由CXCR3的蛋白水解活化引起或恶化的病症,本文提供了其实例。在一个实施方式中,本发明提供治疗方法,包括对需要的哺乳动物体内施用有效降低CXCR3诱导的生物活性的量的CXCR3阻断性抗原结合蛋白。
抗原结合蛋白包括抑制CXCR3的生物活性的全人单克隆抗体。
可以通过许多常规技术的任何一种制备抗原结合蛋白。例如,它们可以从天然表达该抗原结合蛋白的细胞纯化(例如,抗体可以从产生抗体的杂交瘤纯化),或利用本领域已知的任何技术在重组表达体系中产生。参见,例如,Monoclonal Antibodies,Hybridomas:A New Dimension in Biological Analyses,Kennet等(编辑),Plenum出版社,纽约(1980)和Antibodies:A Laboratory Manual,Harlow and Land(编辑),ColdSpring Harbor Laboratory出版社,冷泉港实验室,纽约(1988)。
可以使用本领域已知的任何表达***制备本发明的重组多肽。通常,用包含编码所需多肽的DNA的重组表达载体转化宿主细胞。可以采用的宿主细胞包括原核细胞、酵母或高等真核细胞。原核细胞包括革兰氏阴性或革兰氏阳性有机体,例如,大肠杆菌或芽孢杆菌。高等真核细胞包括昆虫细胞和哺乳动物来源的已建立细胞系。合适的哺乳动物宿主细胞系的例子包括COS-7系猴肾细胞(ATCC CRL1651)(Gluzman等,1981,Cell 23:175)、L细胞、293细胞、C127细胞、3T3细胞(ATCC CCL 163)、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、HeLa细胞、BHK(ATCC CRL 10)细胞系和如McMahan等,1991,EMBO J.10:2821所述的源自非洲绿猴肾细胞系CV1的CV1/EBNA细胞系(ATCC CCL 70)。Pouwels等(Cloning Vectors:A LaboratoryManual,Elsevier,N.Y.,1985)描述了用于细菌、真菌、酵母和哺乳动物细胞宿主的合适的克隆和表达载体。
转化的细胞可以在促进多肽表达的条件下培养,并且多肽通过常规蛋白质纯化过程回收。一种这样的纯化过程包括使用亲和色谱,例如在CXCR3的全部或部分(例如,细胞外结构域)与其结合的基质上。本文考虑使用的多肽包括基本上没有污染的内源物质的基本上同源的重组哺乳动物抗-CXCR3抗体多肽。
可以通过许多已知技术中的任何一种制备抗原结合蛋白并针对所需的性质进行筛选。某些技术包括分离编码目标抗原结合蛋白(例如,抗-CXCR3抗体)的多肽链(或其部分)的核酸,和通过重组DNA技术操纵该核酸。例如,核酸可以另一目标核酸融合,或被改变(例如,通过诱突或其它常规技术)以添加、删除或置换一个或多个氨基酸残基。
单链抗体可以通过经由氨基酸桥(短肽接头)连接重链和轻链可变域(Fv区)片段而得到单多肽链来形成。这样的单链Fv(scFv)通过将编码肽接头的DNA融合在编码两个可变域多肽(VL和VH)的DNA之间制备。取决于在两个可变域之间的柔性接头的长度,得到的多肽可以本身回折以形成抗原结合单体,或其可以形成多聚体(例如,二聚体、三聚体或四聚体)(Kortt等,1997,Prot.Eng.10:423;Kortt等,2001,Biomol.Eng.18:95-108)。通过将不同的包含VL和VH的多肽组合,可以形成结合不同表位的多聚scFv(Kriangkum等,2001,Biomol.Eng.18:31-40)。为产生单链抗体而开发的技术包括在美国专利4,946,778;Bird,1988,Science 242:423;Huston等,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879;Ward等,1989,Nature 334:544和de Graaf等,2002,Methods Mol.Biol.178:379-87中描述的那些技术。
已知用于从目标抗体衍生不同亚类或同种型的抗体(即,亚类转换)的技术。因此,例如,可以从IgM抗体衍生IgG抗体,反之亦然。这些技术允许制备具有给定抗体(亲本抗体)的抗原结合性质,但也展示与不同于亲本抗体的抗体同种型或亚类相关的生物学性质的新抗体。可以采用重组DNA技术。在这些过程中可以采用编码特定抗体多肽的克隆DNA,例如,编码所需同种型的抗体的恒定结构域的DNA(Lantto等,2002,Methods Mol.Biol.178:303-16)。此外,如果IgG4是需要的,那么在铰链区中引入点突变(CPSCP->CPPCP)(Bloom等,1997,Protein Science 6:407)以减轻形成H链内二硫键(其可以导致IgG4抗体的异质性)的趋势也可能是理想的。
在特定实施方式中,本发明的抗原结合蛋白对CXCR3的结合亲和力(Ka)为至少106。在其它实施方式中,抗原结合蛋白的Ka为至少107、至少108、至少109或至少1010。在另一实施方式中,该抗原结合蛋白表现的Ka与本文实施例中描述的抗体的Ka基本上相同。
在另一实施方式中,本公开提供了对CXCR3具有低解离速率的抗原结合蛋白。在一个实施方式中,该抗原结合蛋白的Koff为1×10-4至10-1或更小。在另一实施方式中,该Koff为5×10-5至10-1或更小。在另一实施方式中,该Koff与本文描述的抗体的Koff基本上相同。在另一实施方式中,该抗原结合蛋白以与本文描述的抗体基本上相同的Koff结合CXCR3。
在另一方面,本公开提供抑制CXCR3的活性的抗原结合蛋白。在一个实施方式中,该抗原结合蛋白的IC50为1000nM或更小。在另一实施方式中,该IC50为100nM或更小;在另一实施方式中,该IC50为10nM或更小。在另一实施方式中,该IC50与在实施例中描述的抗体的IC50基本上相同。在另一实施方式中,该抗原结合蛋白以与本文描述的抗体基本上相同的IC50抑制CXCR3的活性。
在另一方面,本公开提供了结合在细胞表面上表达的人CXCR3的抗原结合蛋白,且在如此结合时,其抑制细胞中的CXCR3信号传导活性而不导致细胞表面上CXCR3量的显著下降。可以使用任何测定或估算细胞表面上和/或内部的CXCR3量的方法。在其它实施方式中,抗原结合蛋白与CXCR3表达细胞的结合导致少于约75%、50%、40%、30%、20%、15%、10%、5%、1%或0.1%的细胞表面CXCR3内化。
在另一方面,本公开提供了在体外或体内(例如,当施用于人类受试者时)具有至少一天的半衰期的抗原结合蛋白。在一个实施方式中,抗原结合蛋白的半衰期为至少三天。在另一实施方式中,抗原结合蛋白的半衰期为四天或更长。在另一实施方式中,该抗原结合蛋白的半衰期为八天或更长。在另一实施方式中,抗原结合蛋白被衍生化或修饰以使得其相比于未衍生化或未修饰的抗原结合蛋白具有更长的半衰期。在另一实施方式中,抗原结合蛋白含有一个或多个点突变以增加血清半衰期,比如在WO00/09560中所述,该文献通过引入并入本文。
本公开进一步提供了多特异性抗原结合蛋白,例如,双特异性抗原结合蛋白,比如,通过两个不同的抗原结合位点或区域结合CXCR3的两个不同表位,或结合CXCR3的表位和另一分子的表位的抗原结合蛋白。此外,本文公开的双特异性抗原结合蛋白可以包含来自本文描述的抗体之一的CXCR3结合位点和来自本文描述抗体中另一种(包括通过引用其它公开文献在本文中描述的那些)的第二CXCR3结合位点。可选地,双特异性抗原结合蛋白可以包含来自本文描述的抗体之一的抗原结合位点和来自本领域已知的另一CXCR3抗体或来自通过已知的方法或本文描述的方法制备的抗体的第二抗原结合位点。
本领域已知许多用于制备双特异性抗体的方法。这些方法包括如Milstein等,1983,Nature 305:537描述的杂种-杂交瘤的使用及抗体片段的化学偶联(Brennan等,1985,Science 229:81;Glennie等,1987,J.Immunol.139:2367;美国专利号6,010,902)。此外。可以通过重组手段产生双特性抗体,例如,通过利用亮氨酸拉链部分(即,来自Fos和Jun蛋白,其优先形成异源二聚体;Kostelny等,1992,J.Immunol.148:1547)或如美国专利号5,582,996中描述的其它“锁和钥”相互作用的结构域结构。另外的有用技术包括美国专利号5,959,083和5,807,706中描述的那些技术。
在另一方面,该抗原结合蛋白包括抗体的衍生物。衍生化的抗体可以包含任何赋予该抗体所需的性质(比如,在特定用途中增加的半衰期)的分子或物质。衍生化的抗体可以包含,例如,可检测(或标记)的部分(例如,放射性的、比色的、抗原的或酶的分子),可检测的珠(例如,磁珠或电子致密(例如,金)珠)或者结合另一分子的分子(例如,生物素或链霉亲和素),治疗或诊断部分(例如,放射性的、细胞毒性的或药学活性的部分),增加抗体对特定用途(例如,施用于受试者如人类受试者,或其它体内或体外用途)的适用性的分子。可以用于抗体衍生化的分子的例子包括白蛋白(例如,人血清白蛋白)和聚乙二醇(PEG)。可以利用本领域公知的技术制备白蛋白连接的和聚乙二醇化的抗体衍生物。在一个实施方式中,抗体与转甲状腺素蛋白(TTR)或TTR变体缀合或以其他方式连接。TTR或TTR变体可以用例如选自以下的化学物质进行化学修饰:葡聚糖、聚(n-乙烯基吡咯烷酮)、聚乙二醇、丙二醇均聚物、聚环氧丙烷/环氧乙烷共聚物、聚氧乙烯化多元醇和聚乙烯醇。
95%同源性
本公开提供了结构上特征为其可变结构域区域的氨基酸序列的多种抗体。但是,氨基酸序列可以发生一些改变而同时保留它们与其特异性靶标的高结合水平。更具体地,可变结构域区域的许多氨基酸可以用保守置换进行改变且可预期所得的抗体的结合特性与野生型抗体序列的结合特性没有不同。抗体可变结构域中具有许多不与抗原直接相互作用或影响抗原结合且对于确定抗体结构不关键的氨基酸。例如,任何公开的抗体中预测的非关键氨基酸残基优选用来自同一类别的另一氨基酸残基替换。鉴别不消除抗原结合的氨基酸保守置换的方法是本领域中公知的(参见,例如,Brummell等,Biochem.32:1180-1187(1993);Kobayashi等Protein Eng.12(10):879-884(1999)和Burks等Proc.Natl.Acad.Sci.USA 94:412-417(1997))。Near等Mol.Immunol.30:369-377,1993解释了如何通过定点诱变影响或不影响结合。Near等仅突变他们认为具有改变抗原结合的高可能性的残基。大多数对结合亲和力(Near等,表3)和与不同形式的地高辛的结合具有轻度的或负面的影响(Near等,表2)。
适应症
在一个方面,本公开提供了治疗受试者的方法。该方法对于受试者可以,例如,具有总体上有益健康的作用,例如,其可以提高受试者的预期寿命。或者,该方法可以,例如,治疗、预防、治愈、缓解或改善("治疗")疾病、障碍、状况或病态("病症")。待治疗的病症包括特征在于不适当的CXCR3表达或活性的病症。在一些这样的病症中,表达或活性水平太高,且治疗包括施用如本文所述的CXCR3拮抗剂。障碍或病症是癌症相关的。特别地,那些癌症包括,但不限于乳腺癌、肺癌、卵巢癌和结肠癌及各种骨髓瘤。
可用本公开的抗原结合蛋白治疗或预防的特定医学状况和疾病包括各种癌症。
治疗方法和抗原结合蛋白的施用
本文所提供的某些方法包括向受试者施用CXCR3结合性抗原结合蛋白,从而降低CXCR3诱导的在特定病症中发挥作用的生物反应。在特定实施方式中,本发明的方法包括使内源性CXCR3与CXCR3结合性抗原结合蛋白接触,例如,通过施用于受试者或通过活体外过程。
术语“治疗”涵盖缓解或预防障碍的至少一种症状或其他方面,或减轻疾病严重程度等。抗原结合蛋白不需要实现完全治愈或根除疾病的每一种症状或表现以构成可行的治疗剂。如相关领域所公认的,用作治疗剂的药物可以减轻给定疾病状态的严重程度,而不需要根除障碍的每一表现以被看作是有用的治疗剂。类似地,预防性施用的治疗不需要完全有效地预防病症的发作以构成可行的预防剂。只要降低疾病的影响(例如,通过降低其症状数量或严重程度,或通过提高另一治疗的有效性,或通过产生另一有益效果),或降低受试者体内疾病发生或恶化的可能性就足够了。本发明的一个实施方式涉及包括向患者施用CXCR3拮抗剂的方法,其施用量和时间足以使得反映特定障碍的严重程度的指标得到超过基线的持续改善。
如相关领域中理解的,含有本公开的抗体及其片段的药物组合物以适用于其适应症的方式向受试者施用。可以用任何适当的技术施用药物组合物,包括但不限于,肠胃外、局部或通过吸入。如果注射,则药物组合物可以通过例如关节内、静脉内、肌肉内、病灶内、腹膜内或皮下途径,通过浓注或持续输注来施用。可设想局部施用,例如在疾病或损伤的部位,如作为经皮递送和从植入物持续释放。通过吸入递送包括例如经鼻或经口吸入、使用喷雾器、吸入气雾剂形式的拮抗剂,等等。其他可选形式包括眼药水;口服制剂包括丸剂、糖浆剂、锭剂或咀嚼胶;和局部制剂如洗剂、凝胶剂、喷雾剂和油膏剂。
也设想抗原结合蛋白在活体外过程中的用途。例如,可以使患者的血液或其他体液在活体外与结合CXCR3的抗原结合蛋白接触。该抗原结合蛋白可以与适当的不溶性基质或固体支持材料结合。
有利地,抗原结合蛋白以包含一种或多种附加组分(如生理学可接受的载体、赋形剂或稀释剂)的组合物的形式施用。任选地,该组合物还包含一种或多种生理活性药剂,例如,第二炎症或免疫抑制物质、抗血管生成物质、镇痛物质等等,本文中提供了其非穷尽的实例。在各种特定实施方式中,该组合物除CXCR3结合抗原结合蛋白外,还包含1、2、3、4、5或6种生理活性药剂。
联合疗法
在另一个方面,本公开提供了用CXCR3抑制性抗原结合蛋白和一种或多种其他治疗来治疗受试者的方法。在一个实施方式中,这种联合疗法通过例如攻击肿瘤中的多个位点或分子靶标来实现协同效应或累加效应。可以与本发明结合使用的联合疗法的类型包括抑制或活化(在适宜情况下)单一疾病相关途径中的多个节点、靶细胞中的多个途径或靶组织中的多个细胞类型。
在另一个实施方式中,联合治疗方法包括向受试者施用本文所述的2、3、4、5、6或更多种CXCR3激动剂或拮抗剂。在另一个实施方式中,该方法包括向受试者施用共同抑制或活化(直接或间接地)CXCR3介导的信号转导的两种或更多种治疗。这些方法的实例包括使用两种或更多种CXCR3抑制性抗原结合蛋白的组合、CXCR3抑制性抗原结合蛋白和一种或多种其他具有抗癌性质的治疗部分(例如,细胞毒素剂和/或免疫调节剂)的组合,或CXCR3抑制性抗原结合蛋白和一种或多种其他治疗(例如,手术或放疗)的组合。此外,可以将一种或多种抗CXCR3抗体或抗体衍生物与一种或多种分子或其他治疗结合使用,其中所述其他分子和/或治疗并不直接结合或影响CXCR3,但该组合有效地治疗或预防所治疗的病症。在一个实施方式中,一种或多种分子和/或治疗治疗或预防在治疗期间由一种或多种其他分子或治疗引起的病症,例如恶心、疲乏、脱发、恶病质、失眠等。在其中使用分子和/或其他治疗的组合的每种情况中,单个分子和/或治疗可以在有效的任意时间长度上以任意顺序施用,例如同时、相继或交替施用。在一个实施方式中,治疗方法包括完成以第一分子或其他疗法完成的第一疗程,接着开始第二疗程。治疗的第一疗程结束和第二疗程初始之间的时长可以是允许总疗程有效的任意时长,例如数秒、数分钟、数小时、数天、数周、数月或甚至数年。
在另一个实施方式中,该方法包括施用一种或多种本文所述的CXCR3拮抗剂和一种或多种其它治疗(例如,治愈性或缓解性治疗)。在方法包括向受试者施用超过一种治疗的情况下,应理解施用的顺序、时机、次数、浓度和体积仅受到医学需要和治疗限度的限制,即,两种治疗可施用于受试者,例如,同时、相继、交替或按照任何其它方案。
实施例1
本实施例显示测定抗-CXCR3抗体与稳定细胞系上表达的CXCR3的特异性结合的细胞结合分析。CHO-CXCR3细胞使用非酶Cell Dissociation Buffer–PBS基的(LifeTechnologies#13151-014)从培养瓶脱离。细胞以1x106细胞/ml重悬在FACS缓冲液(PBS中的2%胎牛血清)中且50μl(0.5x105细胞)等分到96-孔板的孔中。同时,表达不相关蛋白的CHO细胞以相同的方式处理。给出两种不同的终浓度(最通常5和10g/ml)的等份抗体添加到细胞并在4℃下孵育1小时和然后用FACS缓冲液洗涤两次。细胞重悬在以1:500在FACS缓冲液中稀释的50μl山羊抗-人IgG(γ-链特异性的)-PE偶联二抗(Southern Biotech#2040-09)中。细胞在4℃下再孵育30min且然后用FACS缓冲液洗涤1x。细胞重悬在30μl最终体积的FACS缓冲液中并使用Intellicyt Flow Cytometer分析。FL-2H通道中的中位荧光使用FlowJo软件确定。各抗体和CHO-CXCR3细胞系的结合与其和对照CHO细胞系的结合进行比较。显示出与CHO-CXCR3细胞的特异性结合的抗体列表显示于表1中。
表1.结合CHO-CXCR3的抗体
名称 与hu-CXCR3 CHO的结合
B2
C12
F7
2A3
3A3
3A11
3C11
4D5
32B12
32D12
H1
C4
3A7
3A8
3A5
实施例2
本实施例显示测定抗-CXCR3抗体与人CXCR3的结合的EC50的细胞结合分析。本实施例显示这些抗体在最大细胞结合和达到50%结合饱和的浓度(EC50)方面的结合特性。在本实施例中,CHO-CXCR3细胞使用非酶Cell Dissociation Buffer–PBS基的(LifeTechnologies#13151-014)从培养瓶脱离。细胞以1x 106细胞/ml重悬在FACS缓冲液(PBS中的2%胎牛血清)中且50μl(0.5x105细胞)等分到96-孔板的孔中。铺板的细胞离心且丢弃上清液。细胞一式三份重悬在含有系列稀释浓度的抗体的30μl FACS缓冲液中。板在4℃下孵育1小时和然后用FACS缓冲液洗涤两次。细胞重悬在以1:500在FACS缓冲液中稀释的50μl山羊抗-人IgG(γ-链特异性的)-PE偶联二抗(Southern Biotech#2040-09)中。细胞在4℃下再孵育30min且然后用FACS缓冲液洗涤1x。细胞重悬在30μl最终体积的FACS缓冲液中并使用Intellicyt Flow Cytometer分析。FL-2H通道中的中位荧光使用FlowJo软件确定,且EC50值通过在GraphPad Prism中对数据作图和使用可变斜率非线性回归分析来确定。结果显示于表2中。
表2.抗-CXCR3抗体对人CXCR3的EC50
名称 EC50(nM),hu-CXCR3 CHO
B2 0.7
C12 15
F7 5
2A3 11
3A3 0.5
3A11 1.2
3C11 0.6
4D5 7
32B12 1
32D12 4
实施例3
本实施例显示测定抗-CXCR3抗体与鼠CXCR3的结合的EC50的细胞结合分析。本实施例显示这些抗体在最大细胞结合和达到50%结合饱和的浓度(EC50)方面的结合特性。在本实施例中,鼠B16-F10细胞(ATCC,#CRL-6475)使用非酶Cell Dissociation Buffer–PBS基的(Life Technologies#13151-014)从培养瓶脱离。收获细胞、洗涤和以1x106细胞/ml重悬在FACS缓冲液(PBS中的2%胎牛血清)中且50μl(0.5x105细胞)等分到96-孔板的孔中。铺板的细胞离心且丢弃上清液。细胞一式三份重悬在含有系列稀释浓度的抗体的30μl FACS缓冲液中。板在4℃下孵育1小时和然后用FACS缓冲液洗涤两次。细胞重悬在以1:500在FACS缓冲液中稀释的50μl山羊抗-人IgG(γ-链特异性的)-PE偶联二抗(Southern Biotech#2040-09)中。细胞在4℃下再孵育30min且然后用FACS缓冲液洗涤1x。细胞重悬在30μl最终体积的FACS缓冲液中并使用Intellicyt Flow Cytometer分析。FL-2H通道中的中位荧光使用FlowJo软件确定,且EC50值通过在GraphPad Prism中对数据作图和使用可变斜率非线性回归进行分析来确定。结果显示于表3中。
表3.抗-CXCR3抗体对鼠CXCR3的EC50
名称 EC50(nM),mur CXCR3
32B12 25
实施例4
在本实施例中,CHO-CXCR3细胞使用非酶Cell Dissociation Buffer–PBS基的(Life Technologies#13151-014)从培养瓶脱离。细胞以1x106细胞/ml重悬在具有叠氮化钠的FACS缓冲液(PBS中的2%胎牛血清)中且对于各抗体将800μl等分到管中。添加抗体到5μg/ml的终浓度并在室温下孵育1h。样品置于冰上且在各个不同时间点将105μl等份加入到96-孔板中的190μl FACS缓冲液中和离心3min。丢弃上清液,细胞重悬于105μl的FACS缓冲液中,重复的等份(50μl)添加到含有150μl FACS缓冲液的另一96-孔板并在室温下孵育。在收集所有时间点后,板离心3min,丢弃上清液且细胞重悬于以1:500在FACS缓冲液中稀释的50μl山羊抗-人IgG(γ-链特异性的)-PE偶联二抗(Southern Biotech#2040-09)中。细胞在4℃下孵育30min且然后用FACS缓冲液洗涤1x。细胞重悬在30μl最终体积的FACS缓冲液中并使用Intellicyt Flow Cytometer分析。克隆32B12随时间的结合显示于图1中。
实施例5
本实施例显示使用抗-CXCR3抗体的钙分析。CHO-CXCR3细胞(用人CXCR3基因转染的CHO细胞)用于钙分析中。等份的0.1x105细胞接种到384孔板(#781091,Greiner)每孔的20μl生长培养基中并孵育20小时。生长培养基是F-12K(#21127,Life Technologies)加10%FBS。5μl的系列稀释的抗体添加到20μl细胞中并在室温下孵育20min。然后25μl的Calcium 4Assay试剂盒(R8142,Molecular Devices),包括0.5mM丙磺舒(Sigma#P8761-25G),添加到与抗体预孵育的25μl细胞。在37℃5%CO2下1h孵育接着在室温下15分钟孵育后,12.5μl的5X剂量的配体作为挑战激动剂在FlexStation3上检测过程中添加到板的各孔。分析中使用的各配体的终浓度是200nM的CXCL9(#300-26,PeproTech)、164nM的CXCL10(#300-12,PeproTech)和60nM的CXCL11(#300-46,PeproTech)。表中显示的各抗体的IC50值使用Prism5计算。各抗体与相应的配体的IC50显示于表4中。各IC50值代表平均值(n=2)。对照抗体来自R&D(Cat#MAB160,R&D)。
表4:使用CHO-CXCR3细胞的钙流分析中抗-CXCR3抗体的IC50[nM]
CXCL9 CXCL10 CXCL11
R&D mAb n.d. n.d. 23
32B12 37 7 16
32D12 n.d. n.d. 19
n.d.=未测定
实施例6
本实施例描述了使用激活的人T细胞的趋化分析。通过抗-CD3(1ng/ml)激活2天的人原代T细胞用于制备。趋化分析使用具有2个通过5-μm聚碳酸酯膜分隔的隔室的96-孔趋化室(ChemoTX;NeuroProbe,Gaithersburg,MD)建立。用于趋化性的分析缓冲液是RPMI加0.5%BSA。系列稀释浓度的抗体在室温下与激活的T细胞(25μl分析缓冲液中的0.1x106细胞)预孵育20min。配体CXCL9(30nM)、CXCL10(12.5nM)和CXCL11(0.3nM)分别加载到下室中的板的孔中,而与抗体预孵育的细胞加载到膜的顶部上。在37℃,5%CO2下2h孵育后,下室中迁移的细胞转移到不透明的白色96-孔板并在室温下与CellTiter GLo(Cat#G7571,Promega)孵育10min。从各孔中的细胞产生的发光信号通过荧光板阅读仪(FlexStation3,Molecular Device)检测。表中所示的各mAb的IC50值通过Prism5计算。各mAb针对相应的配体的IC50在表5中显示。各IC50值表示平均值(n=2)。对照抗体来自R&D(Cat#MAB 160,R&D)。
表5:使用激活的T细胞的趋化分析中抗-CXCR3抗体的IC50[nM]
CXCL9 CXCL10 CXCL11
R&D mAb 1 1.8 0.4
32B12 0.6 0.2 0.3
32D12 2.5 0.03 3.4
序列表

Claims (18)

1.一种IgG类的全人抗体,其以至少10-6M的结合亲和力结合CXCR3表位,其具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ IDNO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ IDNO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ IDNO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ IDNO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ IDNO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ IDNO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.37及其组合。
2.权利要求1所述的全人抗体,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2(本文中称为32B12)、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4(本文中称为32D12)、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6(本文中称为H1)、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8(本文中称为B7)、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10(本文中称为C12)、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12(本文中称为D12)、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14(本文中称为E1)、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16(本文中称为G12)、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18(本文中称为3A3)、SEQ ID NO.19/SEQ IDNO.20(本文中称为3A5)、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22(本文中称为3A11)、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24(本文中称为3B12)、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26(本文中称为3C11)、SEQ IDNO.27/SEQ ID NO.28(本文中称为4C3)、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30(本文中称为B12)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32(本文中称为C4)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33(本文中称为F7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34(本文中称为2A3)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35(本文中称为3A7)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36(本文中称为3A8)、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37(本文中称为4D5)及其组合。
3.一种全人抗体Fab片段,其具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域,其中所述重链可变域序列与选自以下的氨基酸序列至少95%同一:SEQ ID NO.1、SEQ IDNO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13、SEQ IDNO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.25、SEQ IDNO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ IDNO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.18、SEQ IDNO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.30、SEQ IDNO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.37及其组合。
4.权利要求3所述的全人抗体Fab片段,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ IDNO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ IDNO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ IDNO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ IDNO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ IDNO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.37及其组合。
5.一种单链人抗体,其具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域及连接所述重链和轻链可变域区域的肽接头,其中所述重链可变域序列与选自以下的氨基酸序列至少95%同一:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ IDNO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合。
6.权利要求5所述的单链全人抗体,其中所述单链全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ IDNO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ IDNO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ IDNO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ IDNO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ IDNO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.37及其组合。
7.权利要求5所述的单链全人抗体,其中所述单链全人抗体具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述单链全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ IDNO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18、SEQ IDNO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24、SEQ IDNO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37及其组合。
8.一种用于治疗广谱哺乳动物癌症或治疗炎性疾病或自身免疫性疾病的方法,包括施用有效量的抗-CXCR3多肽,其中所述抗-CXCR3多肽选自以至少10-6M的结合亲和力结合CXCR3表位的IgG类的全人抗体、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域的全人抗体Fab片段、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域及连接所述重链和轻链可变域区域的肽接头的单链人抗体,及其组合;
其中所述全人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQID NO.37及其组合;
其中所述全人抗体Fab片段具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ IDNO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合;和
其中所述单链人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQID NO.37及其组合。
9.权利要求8所述的用于治疗广谱哺乳动物癌症的方法,其中所述全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ IDNO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ IDNO.17/SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ IDNO.23/SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ IDNO.29/SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.37及其组合。
10.权利要求8所述的用于治疗广谱哺乳动物癌症的方法,其中所述全人抗体Fab片段具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ IDNO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ IDNO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ IDNO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ IDNO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ IDNO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.37及其组合。
11.权利要求8所述的用于治疗广谱哺乳动物癌症的方法,其中所述单链全人抗体具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述单链全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ IDNO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ IDNO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ IDNO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ IDNO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.37及其组合。
12.权利要求8所述的用于治疗广谱哺乳动物癌症的方法,其中待治疗的广谱哺乳动物癌症是CXCR3-阳性癌症。
13.权利要求8所述的用于治疗广谱哺乳动物癌症的方法,其中所述广谱哺乳动物癌症选自癌瘤、白血病、淋巴瘤、***癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、子宫内膜癌、卵巢癌、胃癌、头颈癌、黑素瘤、骨肉瘤、肠和结肠癌和各种转移性癌。
14.一种用于治疗炎性障碍的方法,包括施用有效量的抗-CXCR3多肽,其中所述抗-CXCR3多肽选自以至少10-6M的结合亲和力结合CXCR3表位的IgG类的全人抗体、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域的全人抗体Fab片段、具有来自重链的可变域区域和来自轻链的可变域区域及连接所述重链和轻链可变域区域的肽接头的单链人抗体,及其组合;
其中所述全人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQID NO.37及其组合;
其中所述全人抗体Fab片段具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ IDNO.11、SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.23、SEQ ID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ IDNO.16、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ IDNO.28、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ IDNO.36、SEQ ID NO.37及其组合;和
其中所述单链人抗体具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的重链可变域序列:SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQID NO.13、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQID NO.25、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33及其组合,且具有与选自以下的氨基酸序列至少95%同一的轻链可变域序列:SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4、SEQID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36、SEQID NO.37及其组合。
15.权利要求14所述的用于治疗炎性障碍的方法,其中所述全人抗体具有重链和轻链两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37及其组合。
16.权利要求14所述的用于治疗炎性障碍的方法,其中所述全人抗体Fab片段具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6、SEQID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12、SEQ IDNO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ ID NO.18、SEQ IDNO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ ID NO.24、SEQ IDNO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ ID NO.30、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.34、SEQ IDNO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.37及其组合。
17.权利要求14所述的用于治疗炎性障碍的方法,其中所述单链全人抗体具有重链可变域区域和轻链可变域区域两者,其中所述单链全人抗体具有选自以下的重链/轻链可变域序列:SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5/SEQ IDNO.6、SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11/SEQ IDNO.12、SEQ ID NO.13/SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17/SEQ IDNO.18、SEQ ID NO.19/SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21/SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23/SEQ IDNO.24、SEQ ID NO.25/SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27/SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29/SEQ IDNO.30、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.34、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.31/SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.31/SEQ IDNO.37及其组合。
18.权利要求14所述的用于治疗炎性障碍的方法,其中待治疗的炎性障碍选自类风湿性关节炎、多发性硬化、克罗恩氏病、格雷夫斯氏病、舍格伦综合征、炎性肠病、慢性阻塞性肺病、银屑病、1型糖尿病、移植排斥、慢性丙型肝炎、疟疾和动脉粥样硬化。
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