CN106754967A - 一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白质和应用 - Google Patents

一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白质和应用 Download PDF

Info

Publication number
CN106754967A
CN106754967A CN201710044645.9A CN201710044645A CN106754967A CN 106754967 A CN106754967 A CN 106754967A CN 201710044645 A CN201710044645 A CN 201710044645A CN 106754967 A CN106754967 A CN 106754967A
Authority
CN
China
Prior art keywords
gene
seq
rice
oslg1
grain
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201710044645.9A
Other languages
English (en)
Other versions
CN106754967B (zh
Inventor
万建民
江玲
杨晓明
张胜忠
冯志明
刘喜
牟昌龄
牛梅
刘世家
田云录
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Nanjing Agricultural University
Original Assignee
Nanjing Agricultural University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Nanjing Agricultural University filed Critical Nanjing Agricultural University
Priority to CN201710044645.9A priority Critical patent/CN106754967B/zh
Publication of CN106754967A publication Critical patent/CN106754967A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN106754967B publication Critical patent/CN106754967B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明公开了一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白和应用,具体涉及分离、克隆、功能验证及应用,属于植物基因工程技术领域。本发明克隆的基因(OsLG1)的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,其氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。本发明通过对水稻种子粒型基因(OsLG1)的克隆与鉴定,基因的表达分析,验证其功能,发现过量表达OsLG1能一定程度上增加水稻种子长度和粒重,可见该基因在培育高产水稻品种上有一定作用。

Description

一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白质和应用
技术领域
本发明属于基因工程领域,具体涉及一种水稻籽粒发育相关基因OsLG1及其编码蛋白质和应用。
背景技术
水稻(Oryza sativa L.)是世界上最重要的粮食作物之一。随着耕地面积的缩小和世界人口的迅速增长,提高水稻的产量对解决未来全球粮食安全危机具有十分重要的意义。水稻产量由每株穗数,每穗粒数及粒重决定。当每株穗数,每穗粒数到达到一个较好的水平时,粒重成为进一步提高产量的目标性状。
许多参与调控水稻粒型发育的基因和QTL已经被报道。GW2是一个控制籽粒宽度的QTL。GW2编码一个E3泛素连接酶,通过蛋白酶体对其靶蛋白进行降解,从而负调节细胞的***。水稻中GW2功能缺失后不能将泛素标记转移到靶蛋白上,因而使得本应降解的靶蛋白不能被特异识别,进而激活颖花外壳细胞的***,从而增加颖花外壳的宽度。另一方面,灌浆速率也得到了提高,胚乳的大小随之也得到了增加,最终谷壳的宽度、粒重以及产量都得到了增加。水稻中一个控制籽粒宽度的QTL GW8,该基因通过影响粒宽,来调控籽粒的形状、大小及品质。利用水稻品种Basmati385(供体亲本)和HJX74(轮回亲本)构建的近等基因系(NIL),最终将GW8定位在第8染色体一个7.5Kb的区间内,该区间内只存在一个ORF,LOC_Os08g41940ORF。转基因结果表明,基因启动子区域10-bp的缺失,是导致Basmati385籽粒变窄的原因,进一步的利用酵母***验证了转录激活结构域位于基因的N端。通过研究GW8与一个控制粒长的QTL GS3的互作并结合QTL聚合的方法,创造了一个品质优良、产量正常的水稻新品种Huabiao 1。对115个不同水稻品种的GW8基因序列比对发现,一个来自IRAN的水稻品种Amol在miRNA156结合处***了两个碱基,将这个发生变异的染色体片段导入到NIL中,构建了一个新的NIL,NIL-gw8Amol。该家系品质优良,产量与HJX74相近,从而创造了一个新的在育种上有潜在利用价值的家系,NIL-gw8Amol。GW5同样是一个控制籽粒宽度的QTL。GW5编码一个144氨基酸组成的核定位蛋白,该蛋白包含一个核定位信号和一个富精氨酸区域。通过酵母双杂交实验证实GW5与多聚泛素有相互作用,表明GW5可能通过泛素蛋白酶体途径调节粒宽和粒重。因此,GW5可能与GW2有相似的作用。研究人员对近7000份水稻种质资源进行了筛选,找到了一个超级大粒品种N411,将N411与N643杂交构建F2群体,通过QTL鉴定,找到了一个控制籽粒长度的QTL qGL3(OsPPKL1),进一步的精细定位将其定位在第三染色体一个46.6-Kb的区间内,通过测序及转基因分析,确定该基因为OsPPKL1。该基因编码区两个碱基的替换,导致了氨基酸的改变。该基因存在Kelch和PP2A两个功能域,通过转基因证明,Kelch domain的变异,是导致籽粒变大的原因。通过对94份水稻种质资源的基因测序,发现N411中Kelch domain的这处变异是特异性的,表明该基因在水稻中是一个罕见的正向调控籽粒大小的基因。通过Blast,在水稻中找到了两个OsPPKL1的等位基因,OsPPKL2和OsPPKL3,转基因结果表明,OsPPKL2是细胞伸长、***的正调控因子,而OsPPKL1/OsPPKL2是负调控因子。
因此发现并克隆新的调控水稻粒型发育的相关基因,将有助于我们通过基因工程的手段提高水稻产量,缓解粮食危机。
发明内容
本发明的目的在于提供一种水稻籽粒大小相关基因OsLG1的核苷酸序列。其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,含4258核苷酸。
本发明的第二个目的还提供所述水稻籽粒大小基因OsLG1编码的蛋白序列,其氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示,含有281氨基酸。
所述蛋白质的编码基因优选为如下1)或2)或3)或4)所述的DNA分子:
1)SEQ ID NO.1所示的DNA分子;
2)SEQ ID NO.2所示的DNA分子;
3)在严格条件下与1)或2)限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
4)与1)或2)或3)限定的DNA序列具有90%以上同源性,且编码植物种子籽粒大小相关蛋白的DNA分子。
含有以上任一所述基因OsLG1的重组表达载体也属于本发明的保护范围。
可用现有的植物表达载体构建含有所述基因的重组表达载体。所述植物表达载体包括双元农杆菌载体和可用于植物微弹轰击的载体等。所述植物表达载体还可包含外源基因的3’端非翻译区域,即包含聚腺苷酸信号和任何其它参与mRNA加工或基因表达的DNA片段。所述聚腺苷酸信号可引导聚腺苷酸加入到mRNA前体的3’端,如农杆菌冠瘿瘤诱导(Ti)质粒基因(如胭脂合成酶Nos基因)、植物基因(如大豆贮存蛋白基因)3’端转录的非翻译区均具有类似功能。
使用所述基因构建重组植物表达载体时,在其转录起始核苷酸前可加上任何一种增强型启动子或组成型启动子,如花椰菜花叶病毒(CAMV)35S启动子、玉米的泛素启动子(Ubiquitin),它们可单独使用或与其它的植物启动子结合使用;此外,使用本发明的基因构建植物表达载体时,还可使用增强子,包括翻译增强子或转录增强子,这些增强子区域可以是ATG起始密码子或邻接区域起始密码子等,但必需与编码序列的阅读框相同,以保证整个序列的正确翻译。所述翻译控制信号和起始密码子的来源是广泛的,可以是天然的,也可以是合成的。翻译起始区域可以来自转录起始区域或结构基因。
为了便于对转基因植物细胞或植物进行鉴定及筛选,可对所用植物表达载体进行加工,如加入可在植物中表达的编码可产生颜色变化的酶或发光化合物的基因(GUS基因、萤光素酶基因等)、具有抗性的抗生素标记物(庆大霉素标记物、卡那霉素标记物等)或是抗化学试剂标记基因(如抗除莠剂基因)等。从转基因植物的安全性考虑,可不加任何选择性标记基因,直接以逆境筛选转化植株。
所述重组过表达载体可为在用限制性内切酶KpnI和SpeI双酶切载体pCAMBIA1390的重组位点***所述基因(OsLG1)得到的重组质粒。将含有OsLG1的pCAMBIA1390命名为pCAMBIA1390-OsLG1。含有以上任一所述基因(OsLG1)的表达盒及重组菌均属于本发明的保护范围。
扩增所述基因(OsLG1)全长或任一片段以及T-DNA***位点验证的引物对也属于本发明的保护范围,所述的引物对优选POE1/POE2、P1/P2、P1/P3或PC1/PC2中的任意一对;其中POE1序列如SEQ ID NO.4所示,POE2序列如SEQ ID NO.5所示,P1序列如SEQ ID NO.6所示,P2序列如SEQ ID NO.7所示,P3序列如SEQ ID NO.8所示,PC1序列如SEQ ID NO.9所示,PC2序列如SEQ ID NO.10所示。
有益效果:
本发明的水稻籽粒大小相关基因影响水稻种子的形状、大小和粒重。过表达该位点基因可导致种子籽粒变长,粒重增加。所述位点及其编码基因可以应用于植物遗传改良,以获得籽粒变长、粒重增加的转基因水稻植株。
附图说明
图1为亲本Dongjin、Dongjin背景T-DNA***突变体T250种子大小表型分析及数据统计。
A图Unhulled代表未去壳的种子,Hulled代表去壳的种子。图中标尺为5mm。
B,C,D,E图为未去壳种子的粒长(Grain length),粒宽(Grain width),粒厚(Grain thickness)及千粒重(1,000-grain weight)数据测量统计分析柱状图。mm,长度单位毫米的英文缩写,g,重量单位克的英文缩写。
G,H,I,J图为去壳种子的粒长(Grain length),粒宽(Grain width),粒厚(Grainthickness)及千粒重(1,000-grain weight)数据测量统计分析柱状图。mm,长度单位毫米的英文缩写,g,重量单位克的英文缩写。
图2为T-DNA***位置验证图。
A图为T-DNA***的基因(OsLG1)在染色体上位置和T-DNA***位点在所述基因(OsLG1)DNA结构中的位置示意图。
B图为***位点验证电泳图。
图3为过表达载体pCAMBIA1390质粒图谱。
图4为转基因过表达植株的种子大小表型分析。Dongjin为亲本,T250为Dongjin背景T-DNA***突变体,OE-3、OE-5和OE-12为过表达所述基因(OsLG1)三个不同家系植株上收获的种子。Unhulled seeds代表未去壳的种子,Hulled seeds代表去壳的种子。图中标尺为5mm。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。
实施例1、水稻控制籽粒大小基因OsLG1及其编码基因的发现
一、水稻籽粒大小相关突变体的筛选
通过对近500份水稻品种Dongjin的T-DNA***突变体进行鉴定,我们得到了多个水稻籽粒大小发生变化的突变体。从中选择编号为T250的材料做一步研究,即本专利中所保护的水稻籽粒大小基因OsLG1的突变体材料。
从图1中的A图可以看出,突变体T250的种子与野生型Dongjin相比,明显变长。进一步的统计学分析表明,突变体的粒长,粒宽,粒厚与野生型均有一定程度增加,特别是粒长(图1中的B和G图)差异显著,并且千粒重也明显提高(图1中的E和J图)。
二、水稻籽粒大小基因OsLG1的T-DNA***位点验证
根据相关数据库提供的信息,突变体T250中,T-DNA载体***的基因位于水稻第二染色体末端(图2A),即本专利中所述基因OsLG1。该T-DNA载体***到了OsLG1第五外显子的起始位置(图2A)。
为了验证突变体T250中该T-DNA***是否真实存在,根据相关数据库提供的侧翼序列信息和T-DNA***位点附近基因OsLG1的DNA序列信息(SEQ ID NO.1),设计了三条引物P1(SEQ ID NO.6)、P2(SEQ ID NO.7)和P3(SEQ ID NO.8),通过引物组合P1+P2和P1+P3,分别以野生型Dongjin和突变体T250的DNA为模板,进行PCR扩增,经电泳,结果如图2B所示,确定了T-DNA***在突变体T250中真实存在且与数据库提供的信息一致。
上述分析过程的具体方法如下所述:
(1)提取上述野生型Dongjin和突变体T250的总DNA作为模板,具体方法如下:
①取0.2克左右的水稻幼嫩叶片,置于2.0ml Eppendorf管中,管中放置一粒钢珠,把装好样品的Eppendorf管在液氮中冷冻5min,置于2000型GENO/GRINDER仪器上粉碎样品1min。
②加入660μl提取液(含100mM Tris-Hcl(PH 8.0),20mM EDTA(PH 8.0),1.4MNaCl,0.2g/ml CTAB的溶液),漩涡器上剧烈涡旋混匀,冰浴30min。
③加入40μl 20%SDS,65℃温浴10min,每隔两分钟轻轻上下颠倒混匀。
④加入100μl 5M NaCl,温和混匀。
⑤加入100μl 10×CTAB,65℃温浴10min,间断轻轻上下颠倒混匀。
⑥加入900μl氯仿,充分混匀,12000rpm离心3min。
⑦转移上清液至1.5mL Eppendorf管中,加入600μl异丙醇,混匀,12000rpm离心5min。
⑧弃上清液,沉淀用70%(体积百分含量)乙醇漂洗一次,室温凉干。
⑨加入100μl 1×TE(121克Tris溶于1升水中,用盐酸调PH值至8.0得到的溶液)溶解DNA。
⑩取2μl电泳检测DNA质量,并用DU800分光光度仪测定浓度(Beckman InstrumentInc.U.S.A)。
(2)将上述提取的DNA稀释成约20ng/μl,作为模板进行PCR扩增;
PCR反应体系:DNA(20ng/ul)2ul,引物P1(10pmol/ul)2ul,引物P2(10pmol/ul)2ul,引物P3(10pmol/ul)2ul,10xBuffer(MgCl2free)2ul,dNTP(10mM)0.4ul,MgCl2(25mM)1.2ul,rTaq(5u/ul)0.4ul,ddH2O 10ul,总体积20ul。
PCR反应程序:94.0℃变性5min;94.0℃变性30s、55℃退火30s、72℃延伸1min,共循环35次;72℃延伸7min;10℃保存。PCR反应在MJ Research PTC-225热循环仪中进行。
(3)引物设计
根据侧翼序列信息和T-DNA***位点附近基因OsLG1的DNA序列信息(SEQ IDNO.1),利用Primer Premier 5.0软件设计T-DNA***位点验证引物P1(SEQ ID NO.6)、P2(SEQ ID NO.7)和P3(SEQ ID NO.8),并由上海英骏生物技术有限公司合成。将自行设计引物,按照引物组合P1+P2和P1+P3,等比例混合,检测其在Dongjin和T250之间的PCR扩增结果。
(4)PCR产物检测:
扩增产物用1%琼脂糖凝胶电泳分析。以2000bp的DNA Marker为对照比较扩增产物的分子量大小,经EB染色后于紫外灯下观察拍照。
三、水稻籽粒大小基因OsLG1的获得
PCR扩增所用引物序列如下所述:
PC1:
5'—AAGCCATCACAAAACCAGAGAC—3'(SEQ ID NO.9)
PC2:
5'—GGTATTTTCCTATTTCCTAACATCG—3'(SEQ ID NO.10)
以PC1和PC2为引物,以Dongjin的cDNA为模板,进行PCR扩增获得目的基因。该对引物位于SEQ ID NO.2上游-123bp至-100bp和下游278bp至302bp,扩增产物包含了该基因的全部编码区。
扩增反应用KOD酶扩增(购自TOYOBO公司),在PTC-200(MJ Research Inc.)PCR仪上进行:94℃2min;98℃10sec,55℃30sec,68℃2min,35个循环;68℃5min。PCR产物纯化回收,按试剂盒(北京Tiangen公司)步骤进行。PCR产物回收纯化后连接到载体pMb18T载体上(购自TAKARA公司),转化大肠杆菌DH5α感受态细胞(购自Tiangen公司),挑选阳性克隆,进行测序。
序列测定结果表明,PCR反应获得的片段包含SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列,编码281个氨基酸残基组成的蛋白质(见SEQ ID NO.3)。将SEQ ID NO.3所示的蛋白命名为OsLG1(Dongjin)。
实施例2、转基因植物的获得和鉴定
一、重组过表达载体构建
以Dongjin的cDNA为模板,进行PCR扩增获得OsLG1(Dongjin)基因,PCR引物序列如下:
POE1(下划线所示的序列为Kpn I重组位点):
5'—CGGGGTACCCCGATGATGGATGGGCGAGGAAG—3'(SEQ ID NO.4)
POE2(下划线所示的序列为Spe I重组位点):
5'—GGACTAGTCCTTATAATCTTTGCAAGTGTG—3'(SEQ ID NO.5)
上述引物位于SEQ ID NO.2所示基因的编码区起始位置和编码区终止子位置,扩增产物包含了该基因的完整编码区,将PCR产物回收纯化。采用HD Cloning Kit重组试剂盒(Takara公司)将PCR产物克隆到载体pCAMBIA1390(图3)中。
In-Fusion重组反应体系(10μL):PCR产物10-200ng,经Kpn I和Spe I双酶切回收pCAMBIA1390载体50-200ng,5×In-Fusion HD Enzyme Premix 2μL,Deionized water to10μL。枪头吹打混匀后将混合体系50℃反应15min后置于冰上,取2μL反应体系用热激法转化大肠杆菌DH5α感受态细胞(Tiangen公司)。将全部转化细胞均匀涂布在含100mg/L卡那霉素的LB固体培养基上。37℃培养12-16h,挑取克隆阳性克隆,进行测序。
测序结果表明,得到了含有SEQ ID NO.2所示OsLG1(Dongjin)基因的重组表达载体,将含有OsLG1(Dongjin)的pCAMBIA1390命名为pCAMBIA1390-OsLG1(Dongjin)。
二、重组农杆菌的获得
用电击法将pCAMBIA1390-OsLG1(Dongjin)转化农杆菌EHA105菌株(购自美国英俊公司),得到重组菌株,提取质粒进行PCR及酶切鉴定。将PCR及酶切鉴定正确的重组菌株命名为EH-pCAMBIA1390-OsLG1(Dongjin)。
三、转基因植物的获得
将EH-pCAMBIA1390-OsLG1(Dongjin)转化水稻品种Dongjin,具体方法为:
(1)28℃培养EH-pCAMBIA1390-OsLG1(Dongjin)16小时,收集菌体,并稀释到含有100μmol/L的N6液体培养基(Sigma公司,C1416)中至浓度为OD600≈0.5,获得菌液;
(2)将培养至一个月的Dongjin水稻成熟胚胚性愈伤组织与步骤(1)的菌液混合侵染30min,滤纸吸干菌液后转入共培养培养基(N6固体共培养培养基,Sigma公司)中,24℃共培养3天;
(3)将步骤(2)的愈伤接种在含有100mg/L巴龙霉素(Phyto TechnologyLaboratories公司)的N6固体筛选培养基上第一次筛选(16天);
(4)挑取健康愈伤转入含有100mg/L巴龙霉素的N6固体筛选培养基上第二次筛选,每15天继代一次;
(5)挑取健康愈伤转入含有50mg/L巴龙霉素的N6固体筛选培养基上第三次筛选,每15天继代一次;
(6)挑取抗性愈伤转入分化培养基上分化;
得到分化成苗的T0代阳性植株。以Dongjin为阴性对照。
四、转基因植株的鉴定
1、PCR分子鉴定
将步骤三获得的T0代阳性植株提取基因组DNA,以基因组DNA为模板,利用pCAMBIA1390上SEQ ID NO.2***位点左边界附近的引物POE1和SEQ ID NO.2上的引物POE2作为引物对进行扩增(POE1:5'—CGGGGTACCCCGATGATGGATGGGCGAGGAAG—3'(SEQ ID NO.4)和POE2:5'—GGACTAGTCCTTATAATCTTTGCAAGTGTG—3'(SEQ ID NO.5)),扩增长度868bp。PCR反应体系:DNA(20ng/ul)2ul,POE1(10pmol/ul)2ul,POE2(10pmol/ul)2ul,10xBuffer(MgCl2free)2ul,dNTP(10mM)0.4ul,MgCl2(25mM)1.2ul,rTaq(5u/ul)0.4ul,ddH2O 10ul,总体积20ul。扩增反应在PTC-200(MJ Research Inc.)PCR仪上进行:94℃3min;94℃30sec,55℃45sec,72℃1min,35个循环;72℃5min。
用试剂盒(北京Tiangen公司)纯化回收PCR产物。PCR产物用1%的琼脂糖电泳检测。
2、表型鉴定
将经上述鉴定获得的T0代转EH-pCAMBIA1390-OsLG1(Dongjin)阳性植株、野生型Dongjin和突变体T250种植在南京农业大学水稻试验站,分单株收种,种植三代后,获得T3代转EH-pCAMBIA1390-OsLG1(Dongjin)转基因植株。如图4所示,转入转EH-pCAMBIA1390-OsLG1(Dongjin)的转基因植株籽粒长度明显增加。表1为图4中未去壳的种子的粒长(Grainlength)、粒宽(Grain width)和百粒重(100-grain weight)统计数据。mm,长度单位毫米的英文缩写,g,重量单位克的英文缩写。表2为图4中去壳的种子的粒长(Grain length)、粒宽(Grain width)和百粒重(100-grain weight)统计数据。mm,长度单位毫米的英文缩写。g,重量单位克的英文缩写。表1和表2的统计分析数据表明,转EH-pCAMBIA1390-OsLG1(Dongjin)的转基因植株,籽粒长度和百粒重明显增加,说明过表达OsLG1(Dongjin)确实可以增加籽粒长度,提高粒重。
表1
表2
<110> 南京农业大学
<120> 一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白质和应用
<160> 10
<210> 1
<211> 4258
<212> DNA
<213> 稻属水稻(Oryza sativa var. Dongjin)
<220>
<223> 籽粒大小相关基因OsLG1的基因序列
<400> 1
aagactacta tatgaaagtt gttataaaag aatatcttaa tttattttca aattatctaa 60
ttaataatgt gataattcac cgtcttattt tacgtagtag taaatattac ttctttcact 120
ataaaatata agaatctaat actctcacta ttataaatct aaatagagat tctatctaaa 180
tttataatat taaaatgtgt aagttatatt atattaagat ggagaaaata gagtccacac 240
aagtaccaag cctacacaca actacttcct tttgagtttt tacttgcact gtttgatcac 300
tcgtattatt cttaaaaaaa agttaaaatt attattaatt ttttttgact tactttatta 360
tctaaagtaa ttaaagtaca acttttcgtt ttttatattt acataaaaaa atttaataag 420
acgagacgga gggagtaaac gagtacacga cacagcatat atccatgtcc atgtcttccc 480
acggaaactg gcactgttga gctctgaaag ccgagctcaa cacgccacgc cattaacacc 540
acaccccccc gctcataaat gaaaaccgcg cgaaccagaa ccacccctcc ctccctcctc 600
catcaatgaa cctctccacc ccaccccgcg acgcgacgcg acgagccgta caccgaccgc 660
cccgcgccgc tgctgccgga gccggagaga gaagctgaag ccgaagcaga ggcagccgca 720
gcggcaaaac tcaaaagacg tcgtcaaaag ctctgccgcg cttgcagctt tctcgggctc 780
aaggaaaagc catcacaaaa ccagagacac agagagagag agagagaaac tgaagaaagg 840
tggcaactcc tgcagcagct gcagcagcaa ggtatgggca gctcatgacc agcaacagca 900
gcagcagcgt ccaatttctc gtggcgctcg ctcgccattt ctggagtact taaggagttc 960
ttggttttgt tcgttcgtcc ggtagcgcta gtgtttgtgg tttgctggtg ctgtggcgag 1020
gcgatgatgg atgggcgagg aagccaggag gaggagcacc tggatttgat catgcgacac 1080
cacgccagca tggggctgga tcgctgcgag agcgaggttg gcgtgcggtg tccgcgtttg 1140
attcgatcgg atgctggtgg tgatttggcg gtttgatttg gtgtttggtt ctttttagga 1200
ggcgctgggg tcgtcggagt cggagcagcc caccaggccg gcgcggccgc gcggcaagag 1260
gagccgcgcc gccgaggtgc acaacctctc cgagaaggtt agcccggcga cggcgactgc 1320
tacctctcgt gttcctcttg gtatcagctg attttgtggg attgattttg accacggtaa 1380
tttggtgcag aggaggagga gcagaatcaa tgagaagatg aaggccctgc agagcctcat 1440
tcccaactcc agcaaggtag taaaaaaaat tgtctctctt gtttcttact cgattttttg 1500
ttcaacgatt tatacacact attacttgtg ttgctggaag ctaatctctc gagttaattt 1560
ggcgtttatc ttgtgctgat ggtttcattc accgatgcag acggacaaag cctccatgct 1620
tgacgatgcc atcgagtacc tgaagcagct tcagctccag gtccaggtaa gtgtaatgaa 1680
tgttgcattg ttactgaatt gcttgaggat tattttcgca aatccacaga cttaatgctc 1740
caggtatcga caatggatat gtcaagcgtt ttgaatattg agcagctgtg tgctgaagtg 1800
aaatggtact agcatatatg agttaggaca agcttgaagt tctagcatca aaaagtgtac 1860
attagctatc ctaatcacca ttttctgatg gcttactgtc taagcaagat ttagtcggtt 1920
aggacgtcag aaaagaacat tgatctaatc acagcatgcc acattgttgt ttgcacggca 1980
tttgtaagaa aaacaaaatg tatgtattcc acgttactgc agctaatttc tgtttgattg 2040
ctgaattttt gttccagatg ttgtccatga ggaatggtct atatctgccc ccagtgaact 2100
tatctggggc acctgagcat ctgccgatcc cgcaaatgag tgctgcactt gaccagaata 2160
gtgccaaagc atcagatcct tcagttgttt tgcagccggt gaaccagact tcaggagcac 2220
ttcttccatt tgagctggca agccaacata aacctctatt cttaccaggt gttcctaatg 2280
caaccgctct ggagcctcgg ttccttgtag agtcttcgcg ttccaatctt caatccttac 2340
ggttcactga acccgctgag gtaatccttt ttgtcttgta agatcttcag cagtcagcat 2400
actgaacctc tttccttgct aatagaatag cacttcatat ggtcattttt cacttgttgt 2460
atctatttat gttgaagatg atctatcctg atgagatgat gttaaagcac cgcctgactt 2520
cagctagtga gagcacaatt gtgccaggtt agagaacata aactatttcc aataaccaat 2580
agtagtttca gattgcattt ttggtgaaca tttttttaca ttgactgacc ttccctttgc 2640
ttcttcaata ggaaccgatg agaagtcggt taggcagaac acatacatga tgaatgctga 2700
tcgttttgat agatatgcac tcagcaaaga ccagttgcag cacattatgc cgaaaaacac 2760
agaaagtgta cttgatatgc cacacttgca aaggtaaaag cttcttttgc cacttattta 2820
tagtataatg aaagtaggct ccattttcct tatagatagg attatttctt tatagtacac 2880
cataatactt tcctgtgatc ataagcatat tttaaggaaa ctggatttgg atggcctaaa 2940
gattagcgtg cgcctatttt atcttgtttt ttcattaaca tgtttagtaa taaatgaatg 3000
tcccatagca gcaaggtttc ttggtctgac tatcttattc tgagaaatag agaaaggacc 3060
ctaaaattca agctgtaggt agattaaaca gcaagaacta acataatttt gcaaattaga 3120
ctatgcaact gcaattatta gactatgcaa agagcaaatt tcacttatta aaactagtaa 3180
atcagtttgt gacactgttc tccagaattc tgacaaaggt gttaattgtt tcagattata 3240
agctgacgat tcagcttcca atcttggaca ggttgcaaac cagtgacacc aaagttaggg 3300
tcgagggcag aatcaaagta aacccatgat ctaatttcca attggacttg tggagtgcag 3360
agcagatcaa aatcggtgac tggtgatcat gagcagcacc taatctagca ttttacctct 3420
agaacagtag ttatatcttg ttgtgccatt gtactctggt gtgaagtgct ttgtaaaggg 3480
agatctatct ataagctgcc agtaacaatg aacatatccg atgttaggaa ataggaaaat 3540
accatcaaat caaatctata ttgccaatgt aggccggaat tgggagatgt gagatgcctg 3600
tggccactaa ttgaggctgc atagtttgtc tccactgttt taaaaaaaat catttttcat 3660
agcttgtttt gtttcttatc ggttatcaca ggtgacaaca gagagcctaa aatagatgga 3720
aatttggaag ccttctcaaa gatggaaatt tggctttcac agcttgagga tgatagcaat 3780
tctgggtcca aacactgatg aagttagtgt caacccaaag gaagctcctc tcccaacaaa 3840
tatgtaacaa ccgaattgaa caaacaaaca gcagcacaat catgctacag caatgcagtc 3900
ataaactcac aaatctacta aacctaacat tcatcactgt aaatccaagg atttacagaa 3960
gtcacagata caaaggtaaa aagcattccg tcgtaagcga tgataagcat aacatcattt 4020
tgcttacaaa caattgttaa gcaaaggatg atggtctgaa gactaggggg tattttgtca 4080
tatccttatg cgacaatcac gacttcattt cctcatcttc ttcaatcttt ggcgccagat 4140
aaaatctaat gtagcccatc tctgcaatct tatactcaac caccactggc agctcagatg 4200
aaaggctgat tgtaacttgt tcagagagcg ggcttgcctt ggtgaaggag ttcatgta 4258
<210> 2
<211> 846
<212> DNA
<213> 稻属水稻(Oryza sativa var. Dongjin)
<220>
<223> 籽粒大小相关基因OsLG1的CDS序列
<400> 2
atgatggatg ggcgaggaag ccaggaggag gagcacctgg atttgatcat gcgacaccac 60
gccagcatgg ggctggatcg ctgcgagagc gaggaggcgc tggggtcgtc ggagtcggag 120
cagcccacca ggccggcgcg gccgcgcggc aagaggagcc gcgccgccga ggtgcacaac 180
ctctccgaga agaggaggag gagcagaatc aatgagaaga tgaaggccct gcagagcctc 240
attcccaact ccagcaagac ggacaaagcc tccatgcttg acgatgccat cgagtacctg 300
aagcagcttc agctccaggt ccagatgttg tccatgagga atggtctata tctgccccca 360
gtgaacttat ctggggcacc tgagcatctg ccgatcccgc aaatgagtgc tgcacttgac 420
cagaatagtg ccaaagcatc agatccttca gttgttttgc agccggtgaa ccagacttca 480
ggagcacttc ttccatttga gctggcaagc caacataaac ctctattctt accaggtgtt 540
cctaatgcaa ccgctctgga gcctcggttc cttgtagagt cttcgcgttc caatcttcaa 600
tccttacggt tcactgaacc cgctgagatg atctatcctg atgagatgat gttaaagcac 660
cgcctgactt cagctagtga gagcacaatt gtgccaggaa ccgatgagaa gtcggttagg 720
cagaacacat acatgatgaa tgctgatcgt tttgatagat atgcactcag caaagaccag 780
ttgcagcaca ttatgccgaa aaacacagaa agtgtacttg atatgccaca cttgcaaaga 840
ttataa 846
<210> 3
<211> 281
<212> PRT
<213> 稻属水稻(Oryza sativa var. Dongjin)
<220>
<223> 籽粒大小相关基因OsLG1的氨基酸序列
<400> 3
Met Met Asp Gly Arg Gly Ser Gln Glu Glu Glu His Leu Asp Leu Ile
1 5 10 15
Met Arg His His Ala Ser Met Gly Leu Asp Arg Cys Glu Ser Glu Glu
20 25 30
Ala Leu Gly Ser Ser Glu Ser Glu Gln Pro Thr Arg Pro Ala Arg Pro
35 40 45
Arg Gly Lys Arg Ser Arg Ala Ala Glu Val His Asn Leu Ser Glu Lys
50 55 60
Arg Arg Arg Ser Arg Ile Asn Glu Lys Met Lys Ala Leu Gln Ser Leu
65 70 75 80
Ile Pro Asn Ser Ser Lys Thr Asp Lys Ala Ser Met Leu Asp Asp Ala
85 90 95
Ile Glu Tyr Leu Lys Gln Leu Gln Leu Gln Val Gln Met Leu Ser Met
100 105 110
Arg Asn Gly Leu Tyr Leu Pro Pro Val Asn Leu Ser Gly Ala Pro Glu
115 120 125
His Leu Pro Ile Pro Gln Met Ser Ala Ala Leu Asp Gln Asn Ser Ala
130 135 140
Lys Ala Ser Asp Pro Ser Val Val Leu Gln Pro Val Asn Gln Thr Ser
145 150 155 160
Gly Ala Leu Leu Pro Phe Glu Leu Ala Ser Gln His Lys Pro Leu Phe
165 170 175
Leu Pro Gly Val Pro Asn Ala Thr Ala Leu Glu Pro Arg Phe Leu Val
180 185 190
Glu Ser Ser Arg Ser Asn Leu Gln Ser Leu Arg Phe Thr Glu Pro Ala
195 200 205
Glu Met Ile Tyr Pro Asp Glu Met Met Leu Lys His Arg Leu Thr Ser
210 215 220
Ala Ser Glu Ser Thr Ile Val Pro Gly Thr Asp Glu Lys Ser Val Arg
225 230 235 240
Gln Asn Thr Tyr Met Met Asn Ala Asp Arg Phe Asp Arg Tyr Ala Leu
245 250 255
Ser Lys Asp Gln Leu Gln His Ile Met Pro Lys Asn Thr Glu Ser Val
260 265 270
Leu Asp Met Pro His Leu Gln Arg Leu
275 280 285
<210> 4
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> POE1
<400> 4
cggggtaccc cgatgatgga tgggcgagga ag 32
<210> 5
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> POE2
<400> 5
ggactagtcc ttataatctt tgcaagtgtg 30
<210> 6
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> P1
<400> 6
atgccacatt gttgtttgc 19
<210> 7
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> P2
<400> 7
tctacaagga accgaggct 19
<210> 8
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> P3
<400> 8
cggcgtggtg tagagcatta 20
<210> 9
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PC1
<400> 9
aagccatcac aaaaccagag ac 22
<210> 10
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PC2
<400> 10
ggtattttcc tatttcctaa catcg 25

Claims (10)

1.一种水稻粒型基因OsLG1,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.权利要求1所述的水稻粒型基因OsLG1编码的蛋白质,其特征在于氨基酸序列如SEQID NO.3所示。
3.根据权利要求2所述的蛋白质,其特征在于:所述蛋白质的编码基因是如下1)或2)或3)或4)的DNA分子:
1)SEQ ID NO.1所示的DNA分子;
2)SEQ ID NO.2所示的DNA分子;
3)在严格条件下与1)或2)限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
4)与1)或2)或3)限定的DNA序列具有90%以上同源性,且编码水稻种子休眠性蛋白的DNA分子。
4.含有权利要求1所述基因的重组表达载体、表达盒或重组菌。
5.根据权利要求4所述的重组表达载体,其特征在于:所述根据表达载体是在pCAMBIA1390载体的Kpn I和Spe I双酶切位点之间***权利要求1所述基因得到的过表达基因OsLG1的重组质粒。
6.扩增权利要求1所述基因的全长或其任意片段的引物对,其特征在于选自POE1/POE2、P1/P2、P1/P3和PC1/PC2中的任意一对;其中POE1序列如SEQ ID NO.4所示,POE2序列如SEQ ID NO.5所示,P1序列如SEQ ID NO.6所示,P2序列如SEQ ID NO.7所示,P3序列如SEQID NO.8所示,PC1序列如SEQ ID NO.9所示,PC2序列如SEQ ID NO.10所示。
7.权利要求1所述基因,权利要求2所述蛋白质,权利要求4所述重组表达载体、表达盒或重组菌中的至少一种在水稻育种中的应用;优选在培育籽粒变长,粒重增加的转基因水稻中的应用。
8.一种培育水稻长粒,粒重增加,产量提高水稻的方法,是将权利要求1所述基因导入小粒水稻品种中,得到籽粒变长,粒重增加的转基因水稻。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于:权利要求1所述基因通过权利要求4或5所述重组表达载体导入小粒水稻中。
10.一种培育籽粒变长,粒重增加的转基因植物的方法,是过表达目的植物中权利要求1所述基因的表达,得到籽粒变长,粒重增加的转基因植物;所述目的植物为携带权利要求1所述基因的植物。
CN201710044645.9A 2017-01-19 2017-01-19 一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白质和应用 Active CN106754967B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710044645.9A CN106754967B (zh) 2017-01-19 2017-01-19 一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白质和应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710044645.9A CN106754967B (zh) 2017-01-19 2017-01-19 一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白质和应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN106754967A true CN106754967A (zh) 2017-05-31
CN106754967B CN106754967B (zh) 2020-04-28

Family

ID=58943681

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201710044645.9A Active CN106754967B (zh) 2017-01-19 2017-01-19 一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白质和应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN106754967B (zh)

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112225789A (zh) * 2020-10-14 2021-01-15 厦门大学 水稻粒型相关基因OsLa1基因及其编码序列和应用
CN113801885A (zh) * 2021-08-18 2021-12-17 中国水稻研究所 水稻大粒基因lg1及其应用
CN113817754A (zh) * 2021-09-18 2021-12-21 中国水稻研究所 水稻短粒基因shg1及其应用
CN114214340A (zh) * 2021-12-26 2022-03-22 中国水稻研究所 水稻粒型粒重相关基因、蛋白、分子标记及应用
CN115216488A (zh) * 2021-04-21 2022-10-21 中国种子集团有限公司 创制水稻大长粒型新种质或大长粒型矮杆新种质的方法及其应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104789573A (zh) * 2009-04-29 2015-07-22 巴斯夫植物科学有限公司 具有增强的产量相关性状的植物及其制备方法

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104789573A (zh) * 2009-04-29 2015-07-22 巴斯夫植物科学有限公司 具有增强的产量相关性状的植物及其制备方法

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
KAWAHARA Y等: "Oryza sativa Japonica Group DNA, chromosome 2, cultivar: Nipponbare, complete sequence", 《GENBANK DATABASE》 *
KAWAHARA Y等: "PREDICTED: Oryza sativa Japonica Group transcription factor SPATULA (LOC9269153), transcript variant X3, mRNA", 《GENBANK DATABASE》 *
LINES等: "Detection of novel QTLs Regulating Grain Size in Extra-Large Grain Rice (Oryza sativa L.)", 《RICE (N Y)》 *
MAKKENA S等: "The bHLH transcription factor SPATULA regulates root growth by controlling the size of the root meristem", 《BMC PLANT BIOL》 *

Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112225789A (zh) * 2020-10-14 2021-01-15 厦门大学 水稻粒型相关基因OsLa1基因及其编码序列和应用
CN115216488A (zh) * 2021-04-21 2022-10-21 中国种子集团有限公司 创制水稻大长粒型新种质或大长粒型矮杆新种质的方法及其应用
CN113801885A (zh) * 2021-08-18 2021-12-17 中国水稻研究所 水稻大粒基因lg1及其应用
CN113801885B (zh) * 2021-08-18 2023-03-31 中国水稻研究所 水稻大粒基因lg1及其应用
CN113817754A (zh) * 2021-09-18 2021-12-21 中国水稻研究所 水稻短粒基因shg1及其应用
CN113817754B (zh) * 2021-09-18 2023-03-31 中国水稻研究所 水稻短粒基因shg1及其应用
CN114214340A (zh) * 2021-12-26 2022-03-22 中国水稻研究所 水稻粒型粒重相关基因、蛋白、分子标记及应用
CN114214340B (zh) * 2021-12-26 2024-06-11 中国水稻研究所 水稻粒型粒重相关基因、蛋白、分子标记及应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN106754967B (zh) 2020-04-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN103554238B (zh) 一种植物淀粉合成相关蛋白flo6及其编码基因与应用
CN108822194B (zh) 一个植物淀粉合成相关蛋白OsFLO10及其编码基因与应用
CN102618510B (zh) 一种植物雄性育性相关蛋白及其编码基因与应用
CN107759676B (zh) 一种植物直链淀粉合成相关蛋白Du15与其编码基因及应用
CN106432447B (zh) 一种植物淀粉合成相关蛋白OsPKp1及其编码基因与应用
CN106754967A (zh) 一种水稻粒型基因OsLG1及其编码蛋白质和应用
CN108642067A (zh) 一种水稻胚乳粉质相关的基因OsHsp70cp-2及其编码蛋白质和应用
CN101698677A (zh) 一种植物株高相关蛋白及其编码基因与应用
CN102603878B (zh) 一个植物谷蛋白转运储藏相关蛋白OsVps9a 及其编码基因与应用
CN108642065A (zh) 一种水稻胚乳粉质相关基因OsSecY2及其编码蛋白质和应用
CN107475266A (zh) 一种水稻胚乳粉质相关基因OscyMDH及其编码蛋白质和应用
CN104628839B (zh) 一种水稻胚乳造粉体发育相关蛋白及其编码基因和应用
CN107337720A (zh) 一种植物谷蛋白转运储藏相关蛋白OsNHX5及其编码基因与应用
CN107326035B (zh) 一种调控水稻粒型和叶色的去泛素化酶基因ubp5及其应用
CN106589085B (zh) 一种植物淀粉合成相关蛋白OsFLO8及其编码基因与应用
CN106749571A (zh) 一种植物淀粉合成相关蛋白OsNPPR及其编码基因与应用
CN107446031A (zh) 一种植物谷蛋白转运储藏相关蛋白OsVHA‑E1及其编码基因与应用
CN111304219B (zh) 一种分离自水稻wz1中的gl1基因及其在增加水稻粒长中的应用
CN106381299B (zh) 一种水稻种子休眠基因OsQSOXL1及其编码蛋白质和应用
CN106244596A (zh) 一种水稻种子休眠基因OsDOG1L3及其应用
CN106350525B (zh) 一种水稻粒型基因dss及其编码蛋白质和应用
CN105950598B (zh) 一个水稻休眠性相关蛋白及其编码基因与应用
CN110407922A (zh) 水稻耐冷基因qSCT1及其应用
CN106349353B (zh) 一种调控植物淀粉合成相关蛋白OsFSE及其编码基因与应用
CN108795949A (zh) 一种水稻叶色调控相关基因OsWSL6及其编码蛋白质和应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant