附图简述
图1显示西罗莫司、BiolimusA9及相关衍生物的化学结构。
图2显示按照本发明方法制备雷帕霉素衍生物的合成流程。
图3A显示在50-55℃合成的粗的BA9的HPLC分析。图3B显示在40℃合成的粗的BA9的HPLC分析。
发明详述
I.概述
本发明提供了获得包括BiolimusA9(BA9)在内的雷帕霉素衍生物的改进的方法。雷帕霉素衍生化以获得式I化合物的通用流程如图2所示。该方法包括雷帕霉素与适合的三氟甲磺酸酯在受控的温度下反应,然后后处理并分离产物。该方法的不同步骤如本文所述。
已经确定,以前所述的雷帕霉素的40-O-衍生物的合成方法产生了不期望的具有在反应性羟基上修饰的副产物。这些副产物具有与所需产物类似的非极性特性,显著降低产率且使纯化变得复杂。令人惊讶地,已经发现通过控制合成温度,可以实现副产物生成的显著减少。反应条件的细微改变令人惊讶地导致产物的产率及纯度的高增益。这些意想不到的优点在下文中详细描述。
II.定义
“混合在反应混合物中”是指将至少两种不同的物质接触的过程,从而使其混合在一起并可以反应,改变初始反应物中之一或者形成第三种不同种类的产物。然而,应当理解,所得的反应产物可以由所加入试剂之间反应直接生成,或者由来自所加入试剂中的一个或多个的中间体生成,所述中间体能够是在反应混合物中生成的。
“有机溶剂”是指在环境温度和压力下是液体且基本上不含水的含碳物质。有机溶剂的实例包括但不限于甲苯、二氯甲烷、乙酸乙酯、乙腈、四氢呋喃、苯、氯仿、***、二甲基甲酰胺、二甲基亚砜和石油醚。
“有机碱化合物”是指能够接受质子(即氢阳离子)以形成该碱的共轭酸的基于碳的分子。一般而言,用于本发明方法中的有机碱化合物包含至少一个氮杂原子。有机碱化合物的实例包括但不限于Huenig碱(即N,N-二异丙基乙胺)、二甲基吡啶类包括2,6-二甲基吡啶(即2,6-二甲基吡啶)、三乙胺和吡啶。
“分离”是指从包含某化合物和至少一种其它物质的混合物中分离至少一部分该化合物的过程。该被分离的化合物基本上不含存在于混合物中的至少一种其它物质。
“烷基”是指直链或支链的、饱和的、具有标明的碳原子数的脂肪族基团。烷基可以包含任何数量的碳原子,例如C1-2、C1-3、C1-4、C1-5、C1-6、C1-7、C1-8、C1-9、C1-10、C2-3、C2-4、C2-5、C2-6、C3-4、C3-5、C3-6、C4-5、C4-6和C5-6。例如,C1-6烷基包括但不限于甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基、异戊基、己基等。烷基还可指具有至多20个碳原子的烷基基团,例如但不限于庚基、辛基、壬基、癸基等。
“亚烷基”是指直链或支链的、饱和的、具有标明数量的碳原子的脂肪族基团,且连接至少两个其它基团,即二价烃基。与该亚烷基连接的两个部分可以连接在亚烷基基团相同的原子或不同的原子上。例如,直链亚烷基可以是-(CH2)n-的二价基团,其中n是1、2、3、4、5或6。代表性的亚烷基基团包括但不限于亚甲基、亚乙基、亚丙基、亚异丙基、亚丁基、亚异丁基、亚仲丁基、亚戊基和亚己基。
“烯基”是指具有至少两个碳原子和至少一个双键的直链或支链烃。烯基可以包含任何数量的碳,例如C2、C2-3、C2-4、C2-5、C2-6、C2-7、C2-8、C2-9、C2-10、C3、C3-4、C3-5、C3-6、C4、C4-5、C4-6、C5、C5-6和C6。烯基基团可以具有任何合适数量的双键,包括但不限于1、2、3、4、5个或者更多。烯基基团的实例包括但不限于乙烯基、丙烯基、异丙烯基、1-丁烯基、2-丁烯基、异丁烯基、丁二烯基、1-戊烯基、2-戊烯基、异戊烯基、1,3-戊二烯基、1,4-戊二烯基、1-己烯基、2-己烯基、3-己烯基、1,3-己二烯基、1,4-己二烯基、1,5-己二烯基、2,4-己二烯基和1,3,5-己三烯基。
“炔基”是指具有至少两个碳原子和至少一个叁键的直链或支链烃。炔基可以包含任何数量的碳,例如C2、C2-3、C2-4、C2-5、C2-6、C2-7、C2-8、C2-9、C2-10、C3、C3-4、C3-5、C3-6、C4、C4-5、C4-6、C5、C5-6和C6。炔基基团的实例包括但不限于乙炔基、丙炔基、1-丁炔基、2-丁炔基、异丁炔基、仲丁炔基、丁二炔基、1-戊炔基、2-戊炔基、异戊炔基、1,3-戊二炔基、1,4-戊二炔基、1-己炔基、2-己炔基、3-己炔基、1,3-己二炔基、1,4-己二炔基、1,5-己二炔基、2,4-己二炔基和1,3,5-己三炔基。
“芳基”是指具有任何合适数量的环原子和任何合适数量的环的芳香环***。芳基基团可以包含任何合适的环原子数,例如6、7、8、9、10、11、12、13、14、15或16个环原子,以及6-10、6-12或6-14个环原子。芳基基团可以是单环、稠和形成双环或三环,或者通过键连接形成联芳基基团。代表性的芳基基团包括苯基、萘基和联苯基。其它芳基基团包括具有亚甲基连接基团的苄基。某些芳基基团具有6-12个环原子,例如苯基、萘基和联苯基。
“烷氧基”是指具有将烷基基团与结合点连接的氧原子的烷基基团:烷基-O-。对于烷基基团,烷氧基基团可以具有任何合适数量的碳原子,例如C1-6。烷氧基基团包括例如甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、丁氧基、2-丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、戊氧基、己氧基等。
“羰基”是指含有碳-氧双键的部分(即-C(O)-)。
“酰基”是指包含如本文所述的羰基基团的部分,所述羰基与如本文所述的烷基基团、烯基基团或炔基基团结合。
“摩尔比”是指第一种物质的摩尔数与第二种物质或任何其它物质的摩尔数的比率。
“色谱”是指通过将混合物应用于固定相并使用流动相将化合物从固定相洗脱的方法,将化合物与混合物中的一种或多种其它化合物分离的过程。色谱的实例包括气相色谱、硅胶色谱、反相色谱和亲和色谱。可以实施色谱例如用以分析化学反应的进程,或者在化学合成后纯化物质。通常情况下,从微克至千克范围的物质的量可以用于色谱分离,但其它量也可以使用。
“固化”是指引起溶液中的化合物结合成该物质的固体形式的过程。溶液中的化合物全部或者其任何部分都可以被固化。该固体形式可以是无定形的或者是结晶物质。“沉淀”是指以无定形的形式固化物质。
“溶解”是指将物质的固体形式溶于溶剂中以形成溶液的过程。固体物质的全部或者其任何部分都可以被溶解。不溶解的物质可以以悬浮液的形式存在于溶剂中。
如本文所用的术语“约”是为了修正数值,表明接近明确值周围的范围。如果“X”是数值,“约X”是指0.9X至1.1X的值,且更加优选地,是0.95X至1.05X的值。任何涉及“约X”之处都具体地至少是指X、0.95X、0.96X、0.97X、0.98X、0.99X、1.01X、1.02X、1.03X、1.04X和1.05X。因此,“约X”是期望为权利要求的限定(例如“0.98X”)而教导和提供书面描述支持。
III.本发明的实施方案
本发明的方法可以用于制备大量的大环内酯衍生物。大环内酯类,包括具有式I和II结构的那些,是聚酮化合物天然产物和特征为大环内酯环的合成类似物。本发明的方法特别是用于制备雷帕霉素衍生物BiolimusA9(BA9)、依维莫司、佐他莫司和坦西莫司。其它大环内酯衍生物也可以使用本发明的方法制备。
因此,本发明的某些实施方案提供了获得具有式I结构的化合物的方法:
该方法包括:
a)将有机溶剂、具有氮杂原子的有机碱化合物、具有式II结构的化合物以及具有式III结构的化合物混合在反应混合物中,
b)将反应混合物的温度保持在约25℃至约55℃;并
c)从反应混合物中分离具有式I结构的化合物;
其中
R1选自Ra-(O)d-Rb的基团,其中Ra是C1-5亚烷基且Rb是C1-5烷基;C1-5亚烷基-OH;C6-10芳基C1-5烷基;C6-10芳基C1-5烷氧基;C1-5烷氧基C1-5烷基;酰基;酰基C1-5烷基;氨基C1-5烷基;C1-5烷基氨基C1-5烷基;酰基氨基C1-5烷基;C1-5烷氧基羰基氨基C1-5烷基;和C6-10芳基;
R2是氢;且
下标d是选自0-1的整数;
由此获得具有式I结构的化合物。
在某些实施方案中,该反应混合物是无色的。在某些实施方案中,该反应的产物是无色的。在某些实施方案中,本发明提供了获得具有式I结构的化合物的方法,
其中该方法包括:
a)将有机溶剂、具有氮杂原子的有机碱化合物、具有式II结构的化合物以及具有式III结构的化合物混合在反应混合物中,
b)将反应混合物的温度保持在约25℃至约55℃,得到无色的反应混合物;并
c)从该无色的反应混合物中分离具有式I结构的化合物;
其中
R1选自Ra-(O)d-Rb的基团,其中Ra是C1-5亚烷基且Rb是C1-5烷基;C1-5亚烷基-OH;C6-10芳基C1-5烷基;C6-10芳基C1-5烷氧基;C1-5烷氧基C1-5烷基;酰基;酰基C1-5烷基;氨基C1-5烷基;C1-5烷基氨基C1-5烷基;酰基氨基C1-5烷基;C1-5烷氧基羰基氨基C1-5烷基;和C6-10芳基;
R2是氢;且
下标d是选自0-1的整数;
由此获得具有式I结构的化合物。
在某些实施方案中,具有式I结构的化合物是
在某些实施方案中,具有式II结构的化合物是雷帕霉素。在某些实施方案中,R1是CH2-CH2-OH。在某些实施方案中,R1是(CH2)e-O-(CH2)f-H,e是选自1-5的整数,且f是选自1-5的整数。在某些实施方案中,R1是CH2-CH2-O-CH2-CH3(即2-乙氧基乙基)。在某些实施方案中,e和f的总和不大于7。
在某些实施方案中,式I化合物是BiolimusA9,还称为:BA9;A9;40-O-(2-乙氧基乙基)-雷帕霉素;42-O-(2-乙氧基乙基)-雷帕霉素;Umirolimus;(3S,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,34aS)-9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-十六氢-9,27-二羟基-3-[(1R)-2-[(1S,3R,4R)-4-(2-乙氧基乙氧基)-3-甲氧基环己基]-1-甲基乙基]-10,21-二甲氧基-6,8,12,14,20,26-六甲基-23,27-环氧-3H吡啶并[2,1-c][1,4]氧杂氮杂环三十一碳十五烯(cyclohentriacontine)-1,5,11,28,29(4H,6H,31H)-五酮;和(1R,9S,12S,15R,16E,18R,19R,21R,23S,24E,26E,28E,30S,32S,35R)-1,18-二羟基-12-[(1R)-2-[(1S,3R,4R)-4-(2-乙氧基乙氧基)-3-甲氧基环己基]-1-甲基乙基]-19,30-二甲氧基-15,17,21,23,29,35-六甲基-11,36-二氧杂-4-氮杂三环[30.3.1.04,9]三十六碳-16,24,26,28-四烯-2,3,10,14,20-五酮。BiolimusA9还已知为CAS号851536-75-9。
任何适合形成式I化合物的三氟甲磺酸酯化合物都可以用于本发明的方法。一般而言,用于本发明的方法的三氟甲磺酸酯具有式III的结构。具有结构R1OSO2CF3(即式III)的三氟甲磺酸酯可以通过将对应的醇(R1OH)与三氟甲磺酸、三氟甲磺酰氯、三氟甲磺酸酐等反应来制备。虽然三氟甲磺酸酯特别是用于制备式I化合物,但其它醇类R1OH的衍生物(包括甲苯磺酸酯、甲磺酸酯和对溴苯磺酸酯)也可以用于本发明的方法。
任何合适的有机碱都可以用于本发明的方法。一般而言,使用具有氮杂原子的碱。合适的碱的实例包括Huenig碱(即N,N-二异丙基乙胺)、二甲基吡啶类包括2,6-二甲基吡啶(即2,6-二甲基吡啶)、三乙胺、三丁基胺、吡啶、2,6-二叔丁基吡啶、1,8-二氮杂二环十一碳-7-烯(DBU)、1,5,7-三氮杂二环(4.4.0)癸-5-烯(TBD)、7-甲基-1,5,7-三氮杂二环(4.4.0)癸-5-烯(MTBD)、1,5-二氮杂二环[4.3.0]壬-5-烯(DBN)、1,1,3,3-四甲基胍(TMG)、2,2,6,6-四甲基哌啶(TMP)、潘必啶(PMP)、1,4-二氮杂二环[2.2.2]辛烷(TED)、喹核碱和可力丁。可以使用两种或多种碱的组合。其它碱也可以适用于本发明的方法。
在某些实施方案中,含有氮杂原子的有机碱化合物具有式IV的结构,
其中Rc、Rd、Re、Rf和Rg各自独立的选自H、C1-5烷基、OH和NH2。在某些实施方案中,该含有氮杂原子的有机碱化合物是选自2,6-二甲基吡啶和Huenig碱。在某些实施方案中,该含有氮杂原子的有机碱化合物是2,6-二甲基吡啶。
包含式II化合物、式III化合物和有机碱的反应混合物可以保持在约25℃至约55℃的温度下足够形成式I化合物的任何时间长度。一般而言,将反应混合物保持在约25℃至约55℃的温度下从几分钟至24小时之间的任何时间。可以保持反应混合物例如约1分钟至约24小时,或者从约30分钟至约18小时,或者从约1小时至约12小时,或者从约2小时至约10小时,或者从约4小时至约6小时。反应混合物可以保持约2、3、4、5、6、7、8、9或10小时。在某些实施方案中,本发明提供了获得具有如上文所述式I结构的化合物的方法,其中在(b)部分保持约2-10小时。
包含式II化合物、式III化合物和有机碱的反应混合物可以保持在任何足够形成式I化合物的温度。一般而言,反应混合物是保持在约25℃至约55℃的温度。反应混合物可以保持在约25℃至约55℃,或约30℃至约55℃、约35℃至约55℃、或约40℃至约55℃、或约45℃至约55℃、或约50℃至约55℃、或约30℃至约50℃、或约35℃至约45℃的温度。反应混合物可以保持在约25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54或55℃。在某些实施方案中,本发明提供了获得具有如上文所述式I结构的化合物的方法,其中在(b)部分中温度保持在约25℃至约40℃。发现反应温度的细微改变将导致不期望的副产物形成的令人惊讶的减少,如下文所详细讨论。
在某些实施方案中,本发明的反应混合物是无色的。在某些实施方案中,所述反应的产物是无色的。“无色的反应混合物”的含义是该反应混合物在560-600nm之间的波长下光密度低于0.5。该光密度可以是例如低于0.5,或低于0.4,或低于0.3,或低于0.2,或低于0.1,或低于0.05。光密度由下式定义:
Aλ=log10(I0/I1),
其中Aλ是在某个光波长(λ)下的吸光度,I1是通过所述材料的辐射(光)的强度(穿透辐射),且I0是通过所述材料前的辐射强度(入射辐射)。光密度可以使用未稀释的反应混合物检测,或者使用用适合的溶剂(例如甲苯等)稀释过的反应混合物的样品检测。“无色的产物”是指在适合的溶剂(例如甲苯等)中的产品溶液在560-600nm之间波长下具有低于0.5的光密度。
任何合适的有机溶剂都可以用于本发明的方法。适合的溶剂包括但不限于甲苯、二氯甲烷、乙酸乙酯、乙腈、四氢呋喃、苯、氯仿、***、二甲基甲酰胺、二甲基亚砜、石油醚及其混合物。在某些实施方案中,该有机溶剂是甲苯或二氯甲烷。溶剂的量不是关键性的,条件是足以将式II化合物转化为式I化合物。一般而言,该溶剂与式II化合物的比率是从约1:1至约1000:1重量。该溶剂与式II化合物的比率可以是例如约100:1或约10:1重量。
任何足以形成式I化合物的式III化合物的量都可以用于本发明的方法。一般而言,在本发明的方法中形成的反应混合物中相对于每当量的式II化合物包含最多约60摩尔当量的式III化合物。具有式III结构的化合物与具有式II结构的化合物的摩尔比可以是例如从约30比1至约60比1。具有式III结构的化合物与具有式II结构的化合物的摩尔比可以是约30比1、或约35比1,或约40比1、或约45比1、或约50比1、或约55比1、或约60比1。在某些实施方案中,具有式III结构的化合物与具有式II结构的化合物的摩尔比是约30比1至约60比1。其它摩尔比也可以适用于本发明的方法。
足以形成式I化合物的任何有机碱的量都可以用于本发明的方法。一般而言,本发明的方法中形成的反应混合物包含相对于每当量的式II化合物最多约120摩尔当量的有机碱。含有氮杂原子的有机碱化合物与具有式II结构的化合物的摩尔比可以是例如从约80比1至约120比1。含有氮杂原子的有机碱化合物与具有式II结构的化合物的摩尔比可以是约80比1、或约85比1,或约90比1、或约95比1、或约100比1、或约105比1、或约110比1、或约115比1、或约120比1。在某些实施方案中,含有氮杂原子的有机碱化合物与具有式II结构的化合物的摩尔比可以是约80-120比1。在某些实施方案中,该比率是104比1。其它摩尔比也可以适用于本发明的方法。含有氮杂原子的有机碱化合物可以一次性加入,或者以两次或多次分批加入。在某些实施方案中,含有氮杂原子的有机碱化合物是分两批加入。
一般而言,本发明的方法包括将式I化合物从反应混合物中分离。式I化合物可以从一种或多种化合物例如溶剂、有机碱化合物、式II化合物或式III化合物中分离。任何适合的分离技术都可以用于分离式I化合物。适合的分离技术包括但不限于过滤固化的式I化合物、离心固化的式I化合物、蒸馏、液体萃取、升华和色谱技术。色谱技术的实例包括但不限于正相柱色谱、反相柱色谱和薄层色谱。两种或多种分离技术可以组合使用来分离式I化合物。在某些实施方案中,分离具有式I结构的化合物包括使用色谱法来分离具有式I结构的化合物。在某些实施方案中,该色谱法是选自柱色谱、硅胶柱色谱、高压液相色谱和薄层色谱。在某些实施方案中,该色谱法是硅胶柱色谱,且该色谱法是通过使用包含一种或多种选自乙酸乙酯、己烷和庚烷的溶剂的流动相来进行。在某些实施方案中,该色谱法是使用己烷和乙酸乙酯的硅胶色谱。
在某些实施方案中,该方法包括任选地固化具有式I结构的化合物。在某些实施方案中,固化具有式I结构的化合物包括:a)将具有式I结构的化合物溶于甲醇中,并且b)从水中沉淀具有式I结构的化合物,从而固化具有式I结构的化合物。在从水中沉淀以前,其它溶剂也可以用于溶解具有式I结构的化合物。