CN104593481A - 应用候选基因策略快速鉴定大豆抗白粉病基因 - Google Patents

应用候选基因策略快速鉴定大豆抗白粉病基因 Download PDF

Info

Publication number
CN104593481A
CN104593481A CN201310524946.3A CN201310524946A CN104593481A CN 104593481 A CN104593481 A CN 104593481A CN 201310524946 A CN201310524946 A CN 201310524946A CN 104593481 A CN104593481 A CN 104593481A
Authority
CN
China
Prior art keywords
gene
powdery mildew
soybean
mlo
resistance
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201310524946.3A
Other languages
English (en)
Inventor
钱春桃
其他发明人请求不公开姓名
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Jiangsu Changshu Modern Agricultural Industrial Park Development Co Ltd
Original Assignee
Jiangsu Changshu Modern Agricultural Industrial Park Development Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Jiangsu Changshu Modern Agricultural Industrial Park Development Co Ltd filed Critical Jiangsu Changshu Modern Agricultural Industrial Park Development Co Ltd
Priority to CN201310524946.3A priority Critical patent/CN104593481A/zh
Publication of CN104593481A publication Critical patent/CN104593481A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13—Plant traits

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Artificial Intelligence (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Bioethics (AREA)
  • Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
  • Data Mining & Analysis (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Evolutionary Computation (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Software Systems (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明是快速鉴定大豆抗白粉病基因；涉及到植物比较基因组学，遗传学和生物信息学等学科知识，属于植物生物技术科学领域。该发明主要步骤为：1)大豆全基因组序列的下载及MLO型基因的采集；2)MLO型基因的鉴定；3)MLO型基因***发育关系；4)MLO型白粉病基因的比对。该发明有效的缩短了大豆白粉病基因挖掘周期，有利于白粉病基因的快速鉴定；通过鉴定的候选白粉病基因开发相应的共分离功能性标记(SNP、SCAR等)，还可以快速的用于抗白粉病基因的分子标记辅助选择，准确性高；结合其它抗病基因分子标记可进行多抗性育种材料的创制，缩短育种年限，提高育种效率；为阐述大豆抗白粉病分子机制奠定了基础。

Description

应用候选基因策略快速鉴定大豆抗白粉病基因
技术领域
本发明是借助于大豆测序全基因组序列，利用植物比较基因组学、遗传学、生物信息学和候选基因策略等方法快速鉴定大豆白粉病基因，主要涉及到大豆全基因组序列的下载，候选基因的鉴定，基因的比对，聚类等手段，进而鉴定出白粉病基因，属于植物生物技术科学领域。
背景技术
大豆白粉病是一种有真菌引起的病害，是影响世界大豆生产的主要病害之一，也是威胁我国大豆生产的一种常见病害。白粉病主要危害大豆叶片，不为害豆荚，叶柄及茎秆极少发病。感病初期，叶上出现斑点圆形，具黑暗绿晕圈。之后逐渐长满白色粉状物，后期白色粉状物上出现黑褐色球状颗粒物，最后病叶变黄脱落，严重影响植株生长发育。实践证明，防治大豆白粉病最经济、有效、环保的方法是培育抗白粉病的品种。而大豆白粉病抗病基因的鉴定、定位和克隆，是培育抗病品种的重要基础。
MLO是植物特有的一类抗病基因，其编码的产物可以直接引起抗病反应，但到目前为止只在大麦中发现存在这样的基因，它编码一个7次跨膜的蛋白，显性基因的表达产物可能是细胞程序化死亡和防御反应的负调控因子，当它处于隐性时即可表现广谱的抗病性，具有极大的应用前景。因此挖掘大豆中的MLO型抗病基因对大豆抗白粉病育种具有重要的意义。
MLO型抗病基因是植物特异的一类抗病基因。研究者最早发现MLO(Mildew resistancelocus o)基因对白粉病抗性是始于1937-1938年，由德国人在埃塞俄比亚采集了很多品种的大麦，其中的两个株系对白粉病菌(Blumeria graminis f.sp.hordei)所有已知的生理小种都具有高效抗性。进一步研究表明，大麦中MLO基因的隐性突变mlo可以使大麦对几乎所有已知大麦白粉病菌的生理小种产生持久、广谱的抗性。最近，研究者发现很多植物的抗白粉病基因都是MLO型基因控制，如番茄，豌豆、拟南芥、蔷薇、辣椒、百脉根等等。因此挖掘植物中的MLO型抗病基因对植物抗白粉病育种具有重要的作用。
目前，常用挖掘抗病基因常用的方法有图位克隆，转座子标签等方法。但是由于大豆的基础研究不够深入，因此利用这些方法不仅时间长而且很难准确地克隆这些基因。因此，如何快速鉴定大豆中的MLO型抗病基因将成为大豆抗白粉病育种的重要前提。
植物比较基因组学(Comparative Genomics)是基于基因组测序基础上，对已知的基因和基因组结构进行比较，来了解基因的功能、表达机理和物种进化的学科。利用模式植物基因组与其它植物基因组之间编码顺序上和结构上的同源性，克隆其他植物基因，揭示基因功能和分子机制，阐明物种进化关系及基因组的内在结构。本专利所采用的方法及思路：模式植物拟南芥基因组研究已经揭示了MLO型基因的功能，利用基因其顺序上的同源性克隆大豆MLO型抗病基因，根据模式植物拟南芥实验***上的优越性和已知MLO型抗病基因的特点，快速“捕捉”大豆抗白粉病基因。近年来，大豆基因组测序的完成为我们快速挖掘大豆白粉病基因提供了条件。本专利介绍了以大豆全基因组序列为前提，结合比较基因组学、遗传学、基因组学、生物信息学和候选基因策略等知识，快速挖掘白粉病基因。
发明内容
技术问题
本发明的目的是提供一种通过结合植物比较基因组学、植物遗传学、基因组学和生物信息学等知识，快速挖掘大豆抗白粉病基因。其结果一方面可用于大豆白粉病基因紧密连锁分子标记的开发，进行分子标记辅助选择育种，另一方面也为其他作物白粉病基因鉴定提供参考依据。
技术方案
主要原理：第一个植物抗白粉病基因(MLO)是从大麦中克隆的，研究发现此基因是一类特殊的抗病基因，不同于先前克隆的大多数NBS(nucleotide-binding site)类型抗病基因；随后，研究者相继从番茄、拟南芥、豌豆、辣椒、百脉根等植物中克隆了白粉病基因，研究发现这些基因编码的都是MLO型抗病基因。随后，众多研究者通过多次试验证实MLO型抗病基因已经成为植物特有的一类抗白粉病基因。进一步发现，植物MLO类型基因是一个基因家族；而且对来源于不同物种的MLO基因家族进行***发育关系分析发现，不同物种中抗白粉病基因总是聚类一起，成为一类，这一类MLO基因都具有抗白粉病基因序列的典型特征。大豆基因组测序的完成为挖掘白粉病基因提供了一条便利途径。因此，可以借助于已经测序的大豆全基因组中MLO基因家族和已经克隆的MLO白粉病基因的***发育关系以及对于维持白粉病基因MLO重要功能的氨基酸保守性来鉴定大豆白粉病基因。
主要步骤如下：
1)大豆全基因组序列的下载及其MLO型基因的采集
首先从大豆测序基因组数据库(http：//www.phytozome.net/search.php)下载大豆全基因组序列；使用“DNATOOLS”软件对获得的大豆全基因组氨基酸序列数据建立数据库，然后用pfam数据库(蛋白家族数据库，http：//pfamjanelia.org/search/sequence)中的隐马尔可夫模型(HMM)对MLO结构域的氨基酸序列与已建立的大豆全基因组氨基酸序列数据库进行Blastp(E-value＝0.001)序列比对，初步筛选出候选基因序列。其次，利用已经公布的MLO型基因序列，对大豆基因组数据库进行BLAST比对，获得候选基因序列。
2)大豆MLO型基因家族的鉴定
将上述结果中得到的同源核苷酸序列的候选基因，通过Pfam(E-value＝1.0)进行分析，去除无‘MLO’结构域的基因序列(图1)。再将候选抗病基因序列通过MEGA3.1软件提供的ClustalW工具(多序列比对程序)进行多序列比对，去除重复序列。
3)通过植物MLO型基因的***发育关系鉴定候选的大豆MLO型白粉病基因
由于先前的研究已经证明，双子叶植物MLO型白粉病基因位于植物MLO基因***发育树同一区组，因此在***发育关系研究中，我们把拟南芥的MLO型基因家族和一些其他作物的MLO型抗白粉病基因和大豆MLO型基因一起聚类分析，以获得候选的大豆抗白粉病基因(图2)。
4)大豆白粉病基因与已知的植物MLO白粉病基因的比对
利用BioXM2.6软件将大豆候选的MLO型白粉病基因和拟南芥、番茄、豌豆、大麦的MLO白粉病基因的氨基酸序列转换成Fasta格式的文件，将这些文件导入BioEdit7.0软件，运用此软件中Clustal软件进行多序列比对，揭示候选白粉病基因重要氨基酸残基及区域的保守性。从而进一步鉴定大豆候选的白粉病基因(图3)。
本发明的积极效果：
1)缩短了大豆白粉病基因挖掘周期，有利于白粉病基因的快速鉴定。采用常规方法(图位克隆、转座子标签等)挖掘抗白粉病基因不仅耗时耗力、效率低，且难以成功。本发明基于植物比较基因组学、遗传学、生物信息学方法快速挖掘大豆白粉病基因，不仅可以缩短时间，还可以提高白粉病基因鉴定效率。
2)大豆(Glycine max)属于蝶形花科大豆属，是全世界广泛种植的重要作物之一。由于大豆遗传基础狭窄，种质资源多样性低，因此通过常规的分子标记(RAPD、ISSR、SSR、AFLP等)鉴定大豆白粉病基因比较困难。通过鉴定的候选白粉病基因开发相应的共分离功能性标记(SNP、SCAR等)，可以快速的用于抗病基因的分子标记辅助选择，，进行多抗性育种材料的创制，可以缩短育种年限，提高育种效率。
3)为阐述大豆抗白粉病分子机制奠定了基础。大豆抗白粉病基因的鉴定，通过转基因技术、RNAi、病毒诱导的基因沉默(virus induced gene silencing，VIGS)技术等研究抗白粉病的分子机制提供了基因资源，有利于快速阐述大豆抗白粉病的作用机理。
附图说明
图1大豆MLO基因的鉴定；
本图显示的是24个MLO型基因鉴定结果，每一个基因都含有一个‘MLO’保守结构域。
图2植物MLO基因家族的***发育关系分析及其大豆MLO型白粉病基因的鉴定；
拟南芥是植物科学研究的模式植物，在构建***发育树中，拟南芥的15个MLO型基因(其中3个基因是白粉病基因：AtMLO02，AtMLO06和AtMLO12)、番茄抗白粉病基因(S1MLO)、大麦白粉病基因(HvMLO和HvMLO02)和豌豆的白粉病基因(PsMLO)被选择用来和大豆MLO型基因聚类分析。共鉴定出1个大豆候选的MLO型白粉病基因。图中斜体标记的基因就是候选大豆白粉病基因。
图3大豆MLO型白粉病基因的比对分析；
1个大豆白粉病基因与大麦(HvMLO)、番茄(S1MLO)、豌豆(PsMLO)、拟南芥白粉病基因(AtMLO02，AtMLO06和AtMLO12)进行比对，鉴定白粉菌侵染有重要作用的氨基酸残基和区域的保守型。图中TM1-TM7表示大豆MLO型白粉病基因的7个转模区域；黑色圆点表示白粉菌侵染重要的氨基酸残基；CaMBD表示钙调蛋白结合区；I和II表示对白粉菌侵染重要的氨基酸区域。
具体实施方式
抗病基因的鉴定在作物抗病遗传理论研究和抗病品种选育中具有重要的作用。本方法可以快速鉴定出大豆白粉病基因。具体实施过程如下：
1)大豆MLO型基因的采集
为了获得大豆全部的MLO型基因家族成员，我们首先以拟南芥的MLO型基因，番茄、豌豆、蔷薇、辣椒、百脉根的抗白粉病MLO基因序列构建HMM模型，从大豆基因组序列中收索MLO型基因；其次以不同作物中已经发表的MLO基因序列作为靶序列(来自DFCI数据库：TC171015，TC267529，DFCI：TC327983，TC289653，TC312087，TC132500，TC133436，TC317623，TC317025，TC315947，TC325903，TC315944，TC315912，TC322759，TC322059，TC330654，TC282713，TC293173，TC281861，TC283253，TC283383，TC285032，TC290021，TC302716，TC283487，TC282866，TC283441，TC281428，TC285118，TC285090；来自GenBank数据库：AY967408，AF384145，AF384144，AY029312-AY029315，AY029317-AY029319，Z95352，AF369563-AF369565，AF369567，AF369569-AF369576，Z83834，Z95496，AY581255)，对大豆数据库(http：//www.phytozome.net/search.php)进行BLAST比对，选择相似度最高的序列进行下载，共获得了24条候选的MLO型基因(Glyma01g36170；Glyma01g37000；Glyma03g22960；Glyma03g33660；Glyma04g00370；Glyma04g01710；Glyma04g01730；Glyma06g00440；Glyma06g01800；Glyma06g01820；Glyma06g38140；Glyma08g20120；Glyma09g32920；Glyma11g09270；Glyma11g15920；Glyma12g29080；Glyma12g35160；Glyma13g30760；Glyma13g35390；Glyma15g08530；Glyma15g13070；Glyma16g08900；Glyma16g21510；Glyma19g36370；)。
2)大豆MLO型基因保守结构域的鉴定
为了进一步验证这些MLO基因准确性，我们对这24个候选的MLO基因进行保守结构域“MLO’的鉴定。以每一个候选的MLO型基因的氨基酸序列为基准，在PFAM(http：//pfam.sanger.ac.uk/)网站上进行‘MLO’保守结构域的鉴定，结果表明，每一个MLO型基因都具有一个或者多个‘MLO’结构域(图1)。
3)大豆MLO型基因的***发育关系分析
在先前的研究中，发现双子叶植物白粉病基因聚合成一个区组；因此，在构建***发育树中，我们选择了模式植物拟南芥的15个MLO型基因(其中3个基因是白粉病基因：AtMLO02，AtMLO06和AtMLO12)、番茄抗白粉病基因、大麦白粉病基因和豌豆的白粉病基因和大豆MLO型基因聚类分析一起聚类分析。将大豆MLO型基因和其他作物白粉病基因蛋白质序列进行多序列联配(采用Clustal X1.83软件进行)，并利用Genedoc软件(http：//www.nrbsc.org/gfx/genedoc/index.html)显示多序列联配的结果。将Clustal多序列联配的结果输出到MEGA4.0软件中，并利用此软件分别构建了邻接树(neighbor-joining，NJ)，利用Bootstrapping方法对这些进化树进行了评估。结果发现在双子叶植物抗白粉病基因区组内，存在1个大豆候选的MLO型白粉病基因(见图2)。
4)大豆MLO型抗病基因的比对
在大麦MLO型白粉病基因研究中，研究中相继发现了一些重要区域和单个氨基酸，它们对大麦白粉菌侵染有着不可替代的作用。为了鉴定1个候选的大豆白粉病基因中，这些重要区域和氨基酸是否高度保守，我们对来自拟南芥的3个抗白粉病基因(AtMLO02、AtMLO6和AtMLO12)、番茄白粉病基因(S1MLO)、豌豆白粉病基因(PsMLO)进行了氨基酸序列比对分析。发现大豆1个候选的白粉病基因与已知的MLO型白粉病基因7个跨膜区，30个重要的氨基酸残基，1个钙调蛋白结合区(CaMBD)和两个与白粉菌识别起重要作用的区域(I和II)高度保守(图3)。表明1基因是大豆MLO型抗白粉病基因。

Claims (2)

1.大豆抗白粉病基因，其特征在于选自下列1个基因或其之一：
Glyma11g15920
氨基酸序列：
MAGGSGGRNLEETPTWAVSAVCFVLILISIIIEHIIHLIGKWLKKKHKTALYESLEKIKSELMLLGFISLLLTVGQGPISRICISEKVAGTWHPCDDSSSIHESDTEESENVNGTNSRRLLAAFYGSDDVNPRRVLAGGGTDKCREGKVPFVSSDGIHQLHIFIFVLAVFHVLYCILTMALGRAKMKRWKRWEEETKTPEYQFSHDPERFRFARETSFGRRHLSFWTKNPVLMWIVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFIMAHLAPQSHSKFDFRKYIKRSLDEDFKVVVGISPPFWFFAVLFLLLNTHGKQLRPFLIYILTMMCLNYAWTGWYSYLWLPFIPLIIILLVGTKLQVIITEMGLRIQQRGEVLKGVPLVQPGDHLFWFNRPGLILYLINFVLFQNAFQLAFFAWSALQFGIKSCFHSHTEDVVIRITMGVLIQILC SYVTLPLYALVTQMGSTMKPTIFNDRVAVALRNWHQTAKKHIRQNRVGPLSLSGTPTSSRPTTPSHHLSPVHLLRYYRSEIDSFPASPRRSNFDDNNMDSPSPSYSLHQLPPQTTATTNDSANDNNATTHHEIVVVHSKEFSFDKRPTSSSGNT
核苷酸序列：
ATGGCAGGAGGAAGCGGAGGAAGAAACTTGGAGGAAACGCCTACATGGGCTGTCTCCGCTGTTTGTTTTGTTTTGATCTTAATCTCTATAATCATCGAGCACATCATCCATCTCATAGGAAAGTGGTTGAAGAAGAAGCACAAAACAGCTCTGTACGAGTCACTTGAAAAGATCAAATCAGAGCTTATGTTATTGGGGTTCATATCGTTGCTTCTAACGGTAGGACAAGGTCCAATATCAAGAATATGCATTTCAGAAAAAGTTGCAGGGACATGGCACCCCTGCGACGATAGTAGCAGCATCCACGAGTCAGATACTGAAGAATCAGAAAACGTAAACGGAACCAATAGCCGCAGATTATTGGCGGCGTTCTATGGTTCAGACGACGTAAATCCACGACGTGTTTTGGCGGGAGGAGGAACCGACAAGTGTCGTGAGGGTAAAGTCCCGTTTGTGTCATCGGATGGCATTCATCAACTCCATATATTTATCTTCGTGCTGGCTGTTTTTCATGTCCTTTACTGCATTCTCACTATGGCTCTGGGCAGAGCAAAGATGAAAAGGTGGAAGCGATGGGAAGAGGAAACCAAGACACCAGAATACCAATTTTCACACGATCCTGAGAGATTCAGATTTGCGAGGGAGACATCTTTTGGAAGAAGACATTTGAGTTTCTGGACCAAAAATCCTGTCCTCATGTGGATTGTTTGTTTCTTTAGGCAATTTGTGCGGTCAGTTCCTAAAGTGGATTACTTGACCTTAAGACATGGATTTATCATGGCACATTTGGCTCCTCAAAGTCACTCGAAGTTTGATTTTCGGAAATATATAAAACGATCACTGGACGAGGATTTCAAAGTCGTAGTTGGAATCAGTCCTCCATTCTGGTTCTTCGCAGTGCTGTTTCTGCTCTTAAACACTCATGGTAAGCAACTACGACCCTTTTTAATTTATATACTTACTATGATGTGTCTCAATTATGCATGGACAGGGTGGTACTCTTATCTGTGGCTGCCATTCATTCCTTTGATTATAATCTTGTTAGTGGGAACCAAGCTTCAAGTGATCATAACCGAGATGGGTCTAAGAATTCAACAAAGAGGAGAGGTCCTCAAGGGTGTGCCCTTGGTTCAGCCAGGGGATCATTTGTTCTGGTTTAACCGACCTGGCCTTATTCTTTACCTTATCAATTTTGTGCTCTTTCAGAATGCTTTTCAGCTGGCTTTCTTCGCATGGTCTGCGCTTCAGTTTGGGATTAAATCCTGTTTCCATTCGCACACGGAGGACGTGGTGATCAGAATCACAATGGGGGTCCTTATTCAAATCCTCTGCAGCTACGTTACTCTTCCTCTCTACGCTCTAGTGACACAGATGGGTTCAACAATGAAGCCAACGATATTCAACGATAGAGTAGCGGTAGCGTTGCGGAATTGGCACCAGACAGCGAAGAAGCACATAAGACAGAACCGTGTGGGGCCGCTGTCGTTGTCGGGGACTCCGACGTCGAGCAGGCCCACAACCCCAAGTCACCACCTGTCCCCGGTGCACCTCTTGCGATACTACCGCTCCGAAATCGACAGCTTCCCCGCGTCTCCGCGAAGGTCAAACTTCGACGATAATAATATGGATTCTCCTTCTCCTTCCTATTCGCTCCACCAATTGCCACCACAAACAACAGCAACAACCAATGACTCCGCCAATGATAATAACGCCACCACACACCATGAGATTGTCGTGGTGCACAGCAAGGAGTTTTCGTTTGATAAAAGACCTACCAGTAGTAGTGGTAATACGTAA。
2.权利要求1所述快速鉴定大豆白粉病基因的应用，包括：
1)携带有抗白粉病MLO基因的育种材料的创制或者新品种创制：利用权利1所给出的MLO基因源为亲本材料，在杂交、回交后代中，可以获得转育有MLO抗性基因的育种材料。
2)抗白粉病基础理论研究：对权利1的MLO型抗白粉病基因进行分子标记分析；对该基因进行分子作图或者基因定位；对该基因进行克隆以及基因间互作分析。
3)抗白粉病转基因研究：利用权利要求1所给出的MLO型白粉病基因进行转基因研究。
CN201310524946.3A 2013-10-30 2013-10-30 应用候选基因策略快速鉴定大豆抗白粉病基因 Pending CN104593481A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201310524946.3A CN104593481A (zh) 2013-10-30 2013-10-30 应用候选基因策略快速鉴定大豆抗白粉病基因

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201310524946.3A CN104593481A (zh) 2013-10-30 2013-10-30 应用候选基因策略快速鉴定大豆抗白粉病基因

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN104593481A true CN104593481A (zh) 2015-05-06

Family

ID=53119533

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201310524946.3A Pending CN104593481A (zh) 2013-10-30 2013-10-30 应用候选基因策略快速鉴定大豆抗白粉病基因

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN104593481A (zh)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108690883A (zh) * 2018-08-17 2018-10-23 华南农业大学 一种辅助鉴定待测大豆的大豆白粉病抗性的分子标记rmd7
CN109022449A (zh) * 2018-07-25 2018-12-18 沈阳农业大学 黄瓜CsMLO1基因及其沉默表达载体构建方法、应用
CN111996275A (zh) * 2020-08-14 2020-11-27 华南农业大学 一种辅助鉴定待测大豆的白粉病抗性的分子标记rmd16

Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102703463A (zh) * 2012-03-31 2012-10-03 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 运用比较基因组学快速鉴定百脉根抗白粉病基因
CN102703462A (zh) * 2012-03-31 2012-10-03 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 二穗短柄草抗白粉病基因快速鉴定
CN102703464A (zh) * 2012-03-31 2012-10-03 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 枳mlo型抗白粉病基因快速鉴定
CN102719447A (zh) * 2012-03-31 2012-10-10 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 亚麻mlo型抗白粉病基因快速鉴定
CN102719446A (zh) * 2012-03-31 2012-10-10 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 甜橙mlo型抗白粉病基因快速鉴定
CN102719448A (zh) * 2012-03-31 2012-10-10 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 应用生物信息学快速鉴定番木瓜抗白粉病基因
CN102719445A (zh) * 2012-03-31 2012-10-10 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 运用比较基因组学快速鉴定蒺藜苜蓿白粉病基因
CN102796745A (zh) * 2012-03-31 2012-11-28 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 运用比较基因组学快速鉴定木薯白粉病基因

Patent Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102703463A (zh) * 2012-03-31 2012-10-03 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 运用比较基因组学快速鉴定百脉根抗白粉病基因
CN102703462A (zh) * 2012-03-31 2012-10-03 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 二穗短柄草抗白粉病基因快速鉴定
CN102703464A (zh) * 2012-03-31 2012-10-03 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 枳mlo型抗白粉病基因快速鉴定
CN102719447A (zh) * 2012-03-31 2012-10-10 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 亚麻mlo型抗白粉病基因快速鉴定
CN102719446A (zh) * 2012-03-31 2012-10-10 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 甜橙mlo型抗白粉病基因快速鉴定
CN102719448A (zh) * 2012-03-31 2012-10-10 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 应用生物信息学快速鉴定番木瓜抗白粉病基因
CN102719445A (zh) * 2012-03-31 2012-10-10 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 运用比较基因组学快速鉴定蒺藜苜蓿白粉病基因
CN102796745A (zh) * 2012-03-31 2012-11-28 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 运用比较基因组学快速鉴定木薯白粉病基因

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
JEREMY SCHMUTZ ET AL.: "Genome sequence of the palaeopolyploid soybean", 《NATURE》 *

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109022449A (zh) * 2018-07-25 2018-12-18 沈阳农业大学 黄瓜CsMLO1基因及其沉默表达载体构建方法、应用
CN109022449B (zh) * 2018-07-25 2021-03-23 沈阳农业大学 黄瓜CsMLO1基因及其沉默表达载体构建方法、应用
CN108690883A (zh) * 2018-08-17 2018-10-23 华南农业大学 一种辅助鉴定待测大豆的大豆白粉病抗性的分子标记rmd7
CN108690883B (zh) * 2018-08-17 2020-09-15 华南农业大学 一种辅助鉴定待测大豆的大豆白粉病抗性的分子标记rmd7
CN111996275A (zh) * 2020-08-14 2020-11-27 华南农业大学 一种辅助鉴定待测大豆的白粉病抗性的分子标记rmd16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Du et al. Resequencing of 243 diploid cotton accessions based on an updated A genome identifies the genetic basis of key agronomic traits
Yang et al. Improved pea reference genome and pan-genome highlight genomic features and evolutionary characteristics
CN102719448A (zh) 应用生物信息学快速鉴定番木瓜抗白粉病基因
CN102703463A (zh) 运用比较基因组学快速鉴定百脉根抗白粉病基因
Kudapa et al. Functional genomics to study stress responses in crop legumes: progress and prospects
CN102796745A (zh) 运用比较基因组学快速鉴定木薯白粉病基因
CN102703462A (zh) 二穗短柄草抗白粉病基因快速鉴定
CN102719447A (zh) 亚麻mlo型抗白粉病基因快速鉴定
CN102719445A (zh) 运用比较基因组学快速鉴定蒺藜苜蓿白粉病基因
CN102703464A (zh) 枳mlo型抗白粉病基因快速鉴定
Kumar et al. Genomics‐assisted lentil breeding: Current status and future strategies
CN102719446A (zh) 甜橙mlo型抗白粉病基因快速鉴定
Gupta et al. Toward climate-resilient lentils: challenges and opportunities
CN104593481A (zh) 应用候选基因策略快速鉴定大豆抗白粉病基因
Fick et al. Partially resistant avocado rootstock Dusa® shows prolonged upregulation of nucleotide binding-Leucine rich repeat genes in response to Phytophthora cinnamomi infection
CN104593480A (zh) 运用比较基因组学快速鉴定菜豆抗白粉病基因
CN104611408A (zh) 西瓜mlo型抗白粉病基因快速鉴定
CN104611407A (zh) 运用比较基因组学快速鉴定草莓白粉病基因
CN104561024A (zh) 甜瓜mlo型抗白粉病基因快速鉴定
Gupta et al. Conventional and biotechnological approaches for targeted trait improvement in lentil
CN104593379A (zh) 运用比较基因组学快速鉴定大白菜抗白粉病基因
CN104611409A (zh) 运用比较基因组学快速鉴定荠菜抗白粉病基因
CN104561035A (zh) 高粱抗白粉病基因快速鉴定
CN104561034A (zh) 谷子抗白粉病基因快速鉴定
CN104561033A (zh) 小麦mlo型白粉病基因的快速鉴定

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication
WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication

Application publication date: 20150506