CN103649303B - 微生物组合物和方法 - Google Patents

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Abstract

本发明包括生物学组合物，方法和制品。所公开的组合物、对场所进行生物治理的方法、影响植物生长的方法、处理表面的方法、处理液体的方法、制备制品的方法、由制备制品的方法所制备的制品、制备食物补充剂的方法、以及用于食品补充的方法包括，分离的细菌、至少一种分离的酵母、以及至少一种分离的菌根真菌，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的。本发明还包括用于制备混合培养物的方法，其包括测量一组微生物的一种或多种酶活性以产生各种微生物的酶谱，和选择微生物，使得各种选择的微生物的酶谱不同于另一种微生物的酶谱。

Description

微生物组合物和方法
相关申请案
本申请要求于2011年1月12日提交的美国临时专利申请第61/432152号的优先权的利益，其以其整体通过引用并入本文。
技术领域
本发明关于包含微生物的组合物和方法，所述组合物和方法例如用于生物治理。更具体地，本发明包括含微生物（比如细菌混合物）的组合物和方法，以用于多种目的。例如，有效地治理土壤和水源和减少化学和有机废物以及降低来自粪肥、化粪池、污水、油沾污和其他污染物的环境风险。另外，本发明的组合物和方法可用于持续地管理土壤和水，以及修复受污染或沾污所影响的生态***。
发明背景
诸如危险的、沾污的或毒性的物质或废物的污染物是美国和世界范围国家的健康和安全问题。政府机构、商业公司、军方和消费者正在寻求可用于去除这些危险的和沾污的物质的更经济有效的技术。并且，环境法规正在作出修改以对土壤和水污染进行可持续的管理。
污染物由行星上的人类活动持续地产生。并且，自然界原因可释放或造成环境中的污染物。油和放射性元素被突然释放到环境中，且自然灾害，诸如洪水，在其水流中造成沾污区域。除了目前产生的废弃物质外，存在来自过去人类和自然界活动的大量污染。
净化环境的成本是惊人的。这些成本是发达国家的经济的浪费，且对于较贫穷的国家几乎是不可逾越的问题。用于去除来自环境的危险的或污染的废物的许多现代技术需要跨越长距离运输并涉及精密的机械或经验丰富的人员，其均增加了成本、环境污染，且不支持地方社区。
废物处理的目前方法通常不足以治理污染的空气、土壤或水。对 于一些废物可使用化学处理，但可能存在由于处理产生的危险的副产物、浸出液或污泥。通过诸如稳定化、固化或封装的方法可分离或改变废物。但是，在这些方法中仅封闭了废物，并未将其销毁或转换。此外，产生了封闭的废物的贮存的问题。
需要的是可进行生物治理的组合物和方法，所述生物治理比如在污染的或沾污的场所进行，或为了治理具有大量不需要的生物物质或其他污染或沾污的化合物的诸如土壤或水的物质，或为了增强局部自然环境的健康和可持续性，所述组合物和方法可应用于多种环境。甚至更理想地，可能是生物治理***，其不仅可能去除或稳定污染的废物，而且还可能能够将一些废物转化为可用的产品。还需要的是用于增强生物过程（比如增强植物生长）的方法和组合物。
发明概要
本发明包括含诸如细菌的微生物的组合物和方法，例如，以用于环境的处理，用于增强的植物生长、污染物的减少、生物治理、不需要的植物或微生物物种的减少和诸如食物补充剂、营养品、药妆品、化妆品和药剂的天然产品的产生。本发明的组合物和方法可包括提供给环境的含微生物的组合物和/或附着、粘附或紧密结合于表面的含微生物的组合物，其中所述表面可以是活的生物体，比如根茎、根丝和/或根，或其他植物或动物表面，或惰性表面比如玻璃珠、壳、植物体、塑料、金属、木材、陶瓷和织造或非织造材料。本发明包括可用于控制和减少静水中的污染和沾污的组合物和方法，所述静水比如封闭的水体，包括但不限于湖泊和池塘。本发明包括可用于控制和减少活水中的污染和沾污的组合物和方法，所述活水比如流动的水体。
本发明包括可用于受烃污染的场所的生物治理的组合物和方法，所述烃包括但不限于，油和有机溶剂，其中场所可包括固体，土壤、液体、水体或固体和液体的混合物。
本发明包括可用于改善和净化烃污染的野生生物的组合物和方法。本发明包括可用于土壤的生物治理的组合物和方法。
本发明包括可用于商业、城市和居民化粪池***的处理或管理， 和生物污泥的减少。
本发明包括可用于城市和工业废水的处理、用于城市和工业废水的处理设备的失败的减少，和城市或工业废水的管理的组合物和方法。本发明包括可用于在工业、矿业、商业、私人或个体工程中使用的水的再循环的组合物和方法。
本发明包括可用于水坝封闭的水的处理的组合物和方法。
本发明包括可用于控制由场所生成的气味，和加速堆肥设施中的微生物进程以及用于处理来自填埋的浸出液的组合物和方法。
本发明包括可用于受烃、溶剂、病原微生物有机体、动物粪便或其他有机废物污染的土壤的去污染的组合物和方法。本发明包括可用于土壤和水的去污染的组合物和方法，尤其是由自然灾害产生的或由居住在无适当的废物控制设施的不卫生的条件下的人产生的污染的土壤或水。
本发明包括可用于动物在其中繁殖、饲养、生活或被屠宰的设施处生成的动物粪便的处理的组合物和方法，所述设施比如农场，和工业农业联合厂，例如，牛奶生产中的乳牛场、鸡或蛋生产设施、猪生产设施、宠物寄养和看护设施，以及其他商业或个体农场或动物收容场所。
本发明包括可用于构建和维持健康土壤环境的组合物和方法。本发明包括用于调节土壤并维持可任选地在最低限度的化学制剂输入下支持植物的生长的平衡的且可持续的土壤生态。本发明增强了植物生长，支持植物成熟和增高的产量，快速的种子发芽和增高的生物量。
本发明包括可用于封闭的环境中的霉菌的治理的组合物和方法，所述封闭的环境比如房间或建筑物，或在外部的位置中，比如在建筑物的表面上，且例如这样的组合物和方法可用于已受洪水的影响的区域或用于高湿度的区域中。
本发明包括用于提高土壤的质量的组合物和方法。本发明包括协助植物生长和增强种子发芽、根部生产、植物的增高的产量、增高的结果、在一个季节或贯穿植物的生产贮藏寿命中植物延长的生产和增 高的植物的萌发势和生物量的组合物和方法。
本发明包括可用于在植物中控制昆虫和昆虫传播疾病的组合物和方法。本发明包括可用于蜜蜂养殖的组合物和方法。
本发明包括可用于水培或气培农业或结合水培和气培方法的受控的植物生长***的技术中的组合物和方法。本发明包括可用于水产养殖或鱼类养殖的组合物和方法。本发明包括可用于垂直耕种的过程的组合物和方法。
本发明包括可用于工业副产物的治理的组合物和方法，所述副产物比如来自建筑工业的副产物，例如，已经处理的木材，来自包括防御来源或医院来源的任何来源的核废物的副产物，和可利用本发明的组合物来处理的其他工业废物。本发明包括可用于养殖或饲养动物的组合物和方法。
本发明包括可用于采矿业的组合物和方法。本发明包括可用于医疗保健业的组合物和方法，例如通过提供从植物或微生物组合物或其组合中提取或纯化的天然来源的产品，包括食物补充剂、营养品、药品、药妆品和化妆品。本发明包括可用作人类或动物消耗或使用的产品中的添加剂的组合物。
本发明包括可用于家用装置诸如家庭用品的组合物和方法。本发明包括可用于多种纳米技术诸如本文所描述的含微生物组合物或微生物的纳米颗粒递送的组合物和方法。
附图简述
图1显示了代表某些细菌的酶活性检验的图表。
图2是显示利用本发明的组合物处理之后大肠杆菌类的减少的图。
图3A和B是显示在利用本发明的组合物处理之后场所中氮转移（A）和硝酸盐增高（B）的图。
图4是显示在利用本发明的组合物处理之后场所中的汞水平的图。
图5是显示在利用本发明的组合物处理之后场所中的甲苯水平的图。
具体实施方式
本发明包括含微生物有机体的组合物和方法，其可用于包括但不限于生物治理和健康生态***的形成维持的方法中。组合物可包括微生物的混合物，包括细菌、真菌、藻类和/或其他内源微生物或外源微生物，其全部形成微生态***，具有其成员的作用。目前认为，虽然不受任何特定理论所束缚地，本发明的组合物和方法增强植物、土壤真菌和土壤细菌的营养根之间天然存在的相互共生。本发明的组合物和方法可包括分离的微生物的混合物，且可用作外源微生物和/或微生物的内源群落的运载体和/或递送***。
本发明的组合物和方法可作用于旁分泌和/或相互再生形式以修复沾污的或污染的环境的微生物和其他植物群。例如，在本发明的组合物中，一种或多种微生物可能能够改变或消除沾污或污染化合物或分子，一种或多种微生物可提供营养并促进健康生态过程，和一种或多种微生物可协助解毒活动并再生自然生态。本发明的微生物可消耗沾污的环境中的特定的物质，并产生代谢的副产物，所述副产物可用作本发明的组合物的其他微生物以及该环境中存在的微生物的营养物。本发明的组合物可提供产生生物剂的微生物，所述生物剂包括但不限于抗生素或表面活性剂。
本发明的组合物包括分离的微生物和含分离的微生物的组合物。本发明的组合物是在布达佩斯条约下由Inocucor Technologies Inc.于2012年1月11日以账号200139保藏于ATCC（美国典型培养物保藏中心，美国弗吉尼亚州马纳萨斯（Manassas，VA，USA）），且给定登录号PTA-12383（分类命名为聚生体：IN-M1（Consortium:IN-M1））的分离的微生物（称作IN-M1）的混合培养物。该组合物包括分离的微生物沼泽红假单胞菌（Rhodopseudomonaspalustris）、枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）、酿酒酵母（Saccharomycescerevisiae）、米曲霉（Aspergillus oryzae）、瑞士乳杆菌（Lactobacillis helveticus）和酪蛋白乳杆菌（Lactobacillus caseii）。本发明的组合物包括含一种或多种分离的微生物的组合物。例如，组合物可包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母（Candida utilis）、乳酸链球菌（Streptococcus lactis）、植物乳杆菌（Lactobacillis planterum）、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌。例如，组合物可包含分离的微生物瑞士乳杆菌，在本文称作IN-LH1，其在布达佩斯条约下由Inocucor Technologies Inc.于2012 年1月11日以账号200139保藏于ATCC（美国典型培养物保藏中心，美国弗吉尼亚州马纳萨斯），且给定登录号PTA-12386（分类命名为瑞士乳杆菌：IN-LHI（Lactobacillus helveticus:IN-LHI））。组合物可包含分离的微生物枯草芽孢杆菌，在本文称作IN-BS1，其在布达佩斯条约下于2012年1月11日由InocucorTechnologies Inc.以账号200139保藏于ATCC（美国典型培养物保藏中心，美国弗吉尼亚州马纳萨斯），且给定登录号PTA-12385（分类命名为枯草芽孢杆菌：IN-BSI（Bacillussubtilis:IN-BSI））。组合物可包含分离的微生物酿酒酵母，在本文称作IN-SC1，其在布达佩斯条约下由Inocucor Technologies Inc.于2012年1月11日以账号200139保藏于ATCC（美国典型培养物保藏中心，美国弗吉尼亚州马纳萨斯），且给定登录号PTA-12384（分类命名为酿酒酵母：IN-SCI（Saccharomyces cerevisiae:IN-SCI））。组合物可包含分离的微生物沼泽红假单胞菌，在本文称作IN-RP1，其在布达佩斯条约下由Inocucor TechnologiesInc.于2012年1月11日以账号200139保藏于ATCC（美国典型培养物保藏中心，美国弗吉尼亚州马纳萨斯），且给定登录号PTA-12387（分类命名为沼泽红假单胞菌：IN-RPI（Rhodopsuedomonas palustris:IN-RPI））。本发明的组合物可包括含以下中的一种或多种的分离的微生物的混合物：瑞士乳杆菌，在本文称作IN-LH1（登录号PTA-12386）、枯草芽孢杆菌，在本文称作IN-BS1（登录号PTA-12385）、酿酒酵母，在本文称作IN-SC1（登录号PTA-12384）、沼泽红假单胞菌，在本文称作IN-RP1（登录号PTA-12387）。本发明的组合物中的分离的微生物的实例包括但不限于沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和/或酪蛋白乳杆菌。根据进行的方法，本发明的组合物可包括这些和其他分离的微生物的不同的量和组合。本发明的组合物可用于本文教导的方法。
可用于本发明的组合物和方法的分离的微生物包括但不限于以下中的一种或多种：
微生物
本发明包括分离的微生物。例如，本发明的分离的微生物是瑞士乳杆菌，在本文称作IN-LH1，其在布达佩斯条约下以账号200139保藏于ATCC，且给定登录号PTA-12386。本发明的分离的微生物是枯草芽孢杆菌，在本文称作IN-BS1，其在布达佩斯条约下以账号200139保藏于ATCC，且给定登录号PTA-12385。本发明的分离的微生物是酿酒酵母，在本文称作IN-SC1，其在布达佩斯条约下以账号200139 保藏于ATCC，且给定登录号PTA-12384。分离的微生物沼泽红假单胞菌，在本文称作IN-RP1，其在布达佩斯条约下于以账号200139保藏于ATCC，且给定登录号PTA-12387。
在一个方面，本发明的分离的微生物可以大型的工业规模数量来培养。例如并且非限制性地，以1000升批量培养微生物的方法包括含以下的培养基：30-70升的非硫磺农业糖蜜，2-5升的麦麸（以体积计0.02-0.05%），2-5升的海草灰（以体积计0.02-0.05%），2-5升的膨润土（以体积计0.02-0.05%），0.5至3升（以体积计0.005-0.03%）鱼乳液（市售有机土壤改良剂，得自Nutrivert,Dunham,Quebec，未巴氏灭菌），0.5至3升大豆粉（以体积计0.005-0.03%），0.4至1.5mg的市售海盐和总20-70升的以1×105至1×107细胞/mL的选定的分离的微生物的菌株，例如，瑞士乳杆菌，（IN-LH1，登录号PTA-12386），枯草芽孢杆菌，（IN-BS1，登录号PTA-12385），酿酒酵母，（IN-SC1，登录号PTA-12384），沼泽红假单胞菌，（IN-RP1登录号PTA-12387），或混合培养物，IN-M1登录号PTA-12383。
用非氯化的温水将全部加至1000升。培养微生物的方法可包括将糖蜜溶解到一些温水中，将其他成分添加到补给罐中，添加需要的细菌，将温度保持在28-35℃之间，和，之后在轻微搅拌和对pH的监测下，通常在几天内pH降至约3.5-4.0。培养物可孵育几周，通常为5-10周，且可将其装入瓶中，或贮存，产生本发明的组合物。可将组合物装入瓶中或贮存，例如装入室温下的避免日光的密封容器中。在一个方面，培养方法和组合物可包括来自待治理或修复的环境的沾污物的样品，和任选地，样品可包括来自沾污的环境的土著微生物。组合物可包括从待处理和/或待治理的环境中分离的一种内源微生物或内源微生物的群落。
如本文所用的术语“治理”是纠正故障或缺陷的活动或过程，比如以调节、改善、减少、逆转或停止环境损害的方式。在环境治理的情况中，作用于污染物，比如危险的或沾污的物质，其可用化学方法或物理方法来改变，或将其固化或封闭或以其他一些方式从周围环境中 移除。治理可包括减少磷酸盐，且可包括本发明与植物、内源的和外源的天然微生物和动物的结合组合物。如本文所用的“生物治理”意为利用单独的或与惰性结构连接的生物有机体作为***以用于处理、调节或改变污染物，比如危险的或沾污的物质。
如本文所用的“污染物”意为环境中的对该环境中的其他生活的有机体或环境的非生物元素有害的任何分子、化学物质或有机体，且包括高于该环境所需要的量的化合物或分子，即使若该化合物或分子在较低量时本来是无害的，且该术语可与术语“沾污物”互换地使用。生物的、化学的、物理的或放射性的物质（通常在环境中不存在），其在足够的浓度时可通过空气、水、土壤和/或食物对生活的有机体产生不利的影响，所述物质包括在术语污染物或沾污物中。如本文所用的术语“毒性物质”包括在术语污染物中。污染物还可以是以其目前对环境有害的浓度和其组成存在的环境的天然元素。污染物可以是通过人类活动（比如物质的合成）或通过自然原因引入到环境中的元素。如本文所用的术语“污染物”包括区域中存在一种或多种毒性的、危险的或沾污性的物质。
如本文所用的污染物还意为以不需要的浓度或量存在于环境中的任何分子、化学物质或有机体。污染物可不必危害环境的任何成分，但可以不需要的量存在。
如本文所用的术语“环境”通常被定义为场所、外界或人、动物或植物生存或运作的环境，且更具体地在治理的方面而言为污染物位置所限定的区域，且环境可包括生物元素和非生物元素，和在限定的区域中发现的生物元素之间和生物元素与非生物元素之间的相互关系的类型。这三种物理状态，固体、液体和气体可包括在构成环境的元素中。
如本文所用的微生物包括但不限于细菌、病毒、真菌、藻类、酵母、原生动物、蠕虫、螺旋体、包括在分类模式中的单细胞的和多细胞的有机体为原核动物、真核动物、古细菌、细菌和本领域中的那些技术人员已知的那些。微生物还可指分离的微生物且可包括本文所公 开的特定的保藏的组合物或微生物，且本文的目的可被本领域中的那些技术人员所理解。
本发明的组合物包括来自几个属和/或种的分离的微生物的组合。这些分离的微生物以协作的方式生长和生存，原因在于一些属或种可提供对组合中的其他微生物有利的副产物或合成的化合物。在制备混合培养物时，使用一种或多种分离的微生物的个体特性来选择包含在混合培养物中的微生物。例如，特性可包括但不限于由微生物产生的酶，补充另一微生物的新陈代谢、生长或其他活动的能力；补充混合培养物中的其他微生物的代谢途径或酶途径的能力，非孢子形成，在不利的培养基或环境中存活、繁殖或新陈代谢的能力、氧消耗、使用除碳以外的诸如光或化学物质的能量来源的能力，不会捕食混合培养物中的其他微生物，提供环境方面的能力，所述环境方面比如结构（例如通过产生菌丝、细胞延伸、菌毛或通过在环境中形成粘液或生物被膜层来提供）、pH、减小或增强氧水平、二氧化碳水平或其他代谢需求，和已知由一种微生物所生成的可被混合物中的微生物所使用的其他活动。微生物领域中的那些技术人员熟知微生物的这样的特性。一种或多种混合培养物可组合地或单独地、和/或连同其他分离的微生物一起用于本发明的组合物和方法，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物，所述其他分离的微生物比如从待处理的场所或与之相似的场所分离的那些微生物。
例如，在本发明的组合物中，将需要氧进行新陈代谢活动的需氧微生物和使用诸如阳光或在特定的底物存在下的其他能量来源的厌氧微生物相组合而形成组合物。这使得组合物的分离的微生物在不同的环境区域中占据底物。例如，一种或多种混合培养物可组合地或单独地、和/或连同其他微生物一起用于本发明的组合物和方法，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。
组合物可包括兼性微生物，例如，乳杆菌的菌株，其根据环境中 的氧和/或营养物浓度调节代谢活动。虽然不受任何特定理论所束缚地，目前认为组合物中的兼性微生物为本发明的组合物提供了室温下延长的贮藏寿命。例如兼性微生物诸如IN-BS1或IN-LH1可包括在本文所描述的组合物和方法中。
活有机体的所有物种包括相互在遗传上和生物化学上差异但仍在称作种内正常差异谱范围内的单独的有机体。这些个体天然差异可能是基因序列中的非破坏性置换或缺失、基因表达或RNA加工的差异和/或肽合成的差异和/或胞内的细胞加工、膜或分泌的分子的差异的结果。本发明的组合物可包括种的正常差异范围内或无种的正常差异的微生物。这样的微生物的鉴定可通过本领域中的那些技术人员已知的遗传方法、分子生物学方法来检测，和/或通过生物化学检验的方法来检测。
例如，本发明的组合物包含分离的微生物，所述分离的微生物通过分离特定微生物的单独的菌落来选择。鉴定菌落成员，例如，可通过以下来进行：通过一种或多种特性，比如通过检验分离的微生物中存在的酶水平和利用底物的套组中的特定的底物检验活性，以建立分离的微生物的酶谱。这些底物代表待用于诸如植物的有机物质或动物物质的损坏的一般治理目的或用于诸如特定化学物质的损坏的特定治理目的的本发明的组合物中的微生物所需要的生物化学途径的典型样品（cross-section）。一种或多种选择标准（微生物的特性）使能够形成分离的微生物的组合物，所述分离的微生物的组合物提供易于占据环境和进行特定反应的标准化的生态***。例如，一种特性是微生物中的酶和酶的活性，从而检验了提供酶的全部微生物对于底物、酶谱检验的酶活性。可将具有相容的酶谱的微生物相组合以提供用于本文所公开的方法的组合物。互补的酶谱图意为一种微生物的酶谱不同于另一微生物的酶谱，例如，一种微生物具有致命性活性且另一种不具有，或一种微生物在代谢途径中提供另一有机体中缺少的酶，或一种微生物具有+5的纤维素酶活性且另一微生物具有+3或+4的纤维素酶活性。
酶谱的一个实例包括提供底物并记录高活性(+3或更高)之处，和极小活性到无活性(+2及以下)之处。例如，检验乳杆菌且其对于碱性磷酸酶具有+5酶水平和对于脂肪酶为0。在脂肪酶生产为+4或+5时可将这样的乳杆菌与另一微生物混合于本发明的组合物中。例如，可使用诸如IN-LH1的乳杆菌。例如在需要反应以损坏有机物质时组合物中可能需要两种酶活性。利用具有不同特性的微生物允许协作，完成代谢途径以不会进行不完整的生物化学途径，该不完整的生物化学途径留下对环境为非生物可利用的，或非其他微生物种类可作为营养物或益生菌来利用的中间化合物，或不会提供靶向特定沾污物的活性化合物/酶。不完整的生物化学途径还不会为组合物中或接种环境中的不同的物种提供参与营养元素的产生或活化的分子；对损坏的环境的生长和恢复具有旁分泌影响的激素、生长因子、抗杀菌剂等。不完全生物化学途径的另一有害作用是毒性的和/或有气味的中间化合物的产生，如硫化氢。
本发明的分离的微生物的酶谱检验的实例显示于图1中。
例如，通过酶谱表征了从芽孢杆菌物种分离的细菌菌株，特征包括水解纤维物质（纤维素和半纤维素）、蛋白和脂肪的能力；和完成代谢过程中积累的大量中间分子和细胞的降解的能力。这些特征对于有机物质的降解和臭味和其他气体散发的减少或预防是有用的。在0到5的规模上，通过在评估酶反应中颜色改变的经训练的观察，排序+4到+5通常是最佳的，虽然特定的有机体的较低的反应可被接受。例如，可使用如本文所描述的枯草芽孢杆菌IN-BS1的保藏培养物。
酶检验可商购获得，且微生物的检验程序和确定活性水平的方法是本领域中熟知的。其他特性包括，例如，筛查酵母，比如酿酒酵母的发酵酶和具有已知酶谱的芽孢杆菌物种。例如，可使用如本文所用的酿酒酵母微生物IN-SC1的保藏培养物。检验微生物以确定哪种菌株具有参与验证允许鉴定将在用于消化食物中的有机成分的方法中使用的组合物中运作良好的微生物的发酵途径的某些酶的高酶活性，和哪种可使用可利用的有机来源的营养物；单独的菌落的分离和对其进 行酶谱检验允许分离酶的强表达者。并且，利用提供互补的特性的微生物的组合允许彻底地降解有机物质，甚至以跨物种的方式来进行降解。虽然不受任何特定理论所束缚地，据认为在环境中，在包括人类的较高级的有机体中，不同细胞之间的单向和双向相互作用均可有助于微生物生态***中互相依赖的复杂网络。
还不希望受任何特定理论所束缚，据认为鉴定和利用提供互补或相容的谱（比如酶谱或其他活性）的微生物，允许将土著的物种包含在由本发明处理的场所。其他功能性筛查检验可用于表征用于特定沾污物的治理的组合物和用于其他土著微生物的鉴定的土著的互补或相容的特性标准。
可包括在本发明的组合物中的微生物的方面可以是孢子的形成或无孢子的形成（非孢子形成）的特性。例如，可根据当从饥饿培养基移动到富营养培养基时它们的反应来选择细菌分离物。当从饥饿培养基转移到富营养培养基时表现积极生长的分离物，和还表现降低的孢子形成，或在饥饿培养中较低量的孢子形成的分离物，有时对于组合物是最佳的。通过形成孢子存活于不利环境的物种对于本发明的组合物可能是或可能不是最佳的。例如，在不利环境中形成孢子较少且以植物状态存在且然后在最佳环境中大多数表现出积极生长的物种在用于治理有机废物和其他污染物的组合物中可能是更有利的。
用于选择可包括在本发明的组合物中的微生物的特性的一方面为在不同的温度下的微生物的生长。例如，根据其在好氧条件下的不同的温度下生长的能力可选择芽孢杆菌菌株。可使用随时间推移在从15℃-40℃的不同的温度下细菌数目关于OD和pH的生长曲线作为选择的方面。选择的菌株可能能够在硝酸盐的存在下生长，能够在厌氧条件下生长或具有其他选定的特性。例如，可用于本发明的方法和组合物中的芽孢杆菌或紫色硫磺细菌的特征如下：+5水平的纤维素酶，+2到+3水平的蛋白酶，+4的脂肪酶，在8%硝酸盐培养基中生长，在从30℃到40℃的温度的范围中生长，和不形成孢子。例如，如本文所描述地使用分别包括芽孢杆菌和紫色非硫细菌微生物的保藏培养物 IN-BS1和/或IN-RP1。
无论通过利用硝酸盐或亚硝酸盐作为终末电子受体或通过发酵，枯草芽孢杆菌将厌氧生长。两组分的信号转导***是控制厌氧呼吸的调控途径中的早期阶段。厌氧基因调控中的ResD和ResE的基本作用之一是在氧受限时诱导fnr转录。FNR是厌氧诱导的基因（包括呼吸作用硝酸盐还原酶narGHJI的那些）的转录活化器。枯草芽孢杆菌具有两个不同的硝酸盐还原酶，一个用于硝酸盐氮的同化作用，和另一个用于硝酸盐呼吸作用。相反地，一种亚硝酸盐还原酶在亚硝酸盐氮同化作用和亚硝酸盐呼吸作用两者中发挥作用。与许多利用丙酮酸甲酸裂解酶的厌氧微生物不同地，枯草芽孢杆菌可在不存在外部电子受体的情况下进行发酵，其中利用丙酮酸脱氢酶来代谢丙酮酸。枯草芽孢杆菌通常在25-37℃下生长，在15℃-40℃下观察到基因表达。例如，如本文所描述的使用包括具有ATCC编号PTA-12385的枯草芽孢杆菌IN-BS1的保藏培养物。
用来选择用于本文所描述的组合物的微生物的方法包括确定微生物分离物的特性并确定每个分离物的特性谱，比如通过以下来确定：检验酶谱活性、诸如氧水平或温度的不同的条件下的生长特性、在诸如硝酸盐、碳水化合物、矿物质或特定的污染物的特定的培养基条件下的生长和对于特定的微生物的特征性反应，比如形成孢子的能力或在沾污物或污染物的存在下生长的能力。这样的微生物特性的检验是本领域中已知的且任何已知的检验为本发明所考虑。这些检验允许特定的微生物的表征、特定微生物的特征谱的确定和生成本发明的有用的组合物的方法，所述方法包括基于其个体特性选择相容的个体物种的微生物和其在混合物中如何相互作用。例如，当每一种的特征谱在至少一种特性上不同于另一微生物的特性时两种微生物是互补的，或互补可包括其中一种微生物的特性有利于混合物中的第二种微生物或其他微生物的特性或与之相互作用。如本文所用，相容可意为微生物一般可在组合物中共存。在制备混合培养物中本发明的微生物的一个检验标准（特性）是不同物种在一起相互作用。微生物可具有酶谱， 或其他检验和其他特性标准而使其与至少一种其他微生物相容，但当添加到微生物的群落中时第一种微生物可能不能够良好生长，且从而该微生物将不会被选择作为本发明的混合培养组合物的组分。本文所公开的特性可用于选择单独的微生物，或可用于关于混合培养物的适合性表征微生物的混合培养。
如本文所用，微生物并不意为一个单独的微生物，而是多个相同的微生物的群体，比如枯草芽孢杆菌的菌落。微生物的混合物是不同微生物的混合物，比如枯草芽孢杆菌、瑞士乳杆菌、酪蛋白乳杆菌，和混合物可包含不同的物种、菌株、属、类型或分类、分离或鉴定微生物的其他认可的途径。
氧代谢和营养物浓度的选择标准可用于表征本发明的组合物中的微生物。例如，乳杆菌菌株可基于根据生长培养基中的氧浓度或营养物浓度而调控代谢活性的能力来选择，且推而广之，当用于本发明的组合物时，乳杆菌在特定的环境中将具有什么活性。例如，乳杆菌将乳糖和其他糖转化为乳酸。乳酸的产生使乳杆菌环境呈酸性，其抑制了某些有害细菌的生长。培养物中的酸化菌群的大多数通常控制环境的pH。该特性允许进行本发明的方法，当治理环境时，向环境提供低pH，而不必提供非常高的量的组合物。这样的组合物可提供高浓度的酸化微生物和提供具有两年贮藏寿命的以上的组合物。在某些乳杆菌菌株中，例如，植物乳杆菌，当pH低于pH3时乳酸的分泌下调，且当pH太高时上调，而pH4-5是最佳的。
用于本发明的组合物的乳杆菌菌株可根据其协助提供在制剂中提供关于在室温下延长的贮藏寿命的稳定性的组分的能力来选择。例如，若将本发明的组合物贮存于室温下封闭的或密闭的容器中，该组合物的生物活性通过以下来测量：打开该容器并通过已知的微生物稀释步骤再激活组合物，和添加糖蜜（营养物来源）并在30-37℃下孵育。通过在5-7天中观察pH下降至3.7及以下来对其进行监测。在室温下贮存的本发明的组合物的封闭的容器具有2个月以上、4个月以上、6个月以上、8个月以上、10个月以上、1年以上或一年或更长的贮藏 寿命。例如，如本文所描述的使用包括具有ATCC编号PTA-12386的乳杆菌物种IN-LH1的保藏培养物。
有利的酵母、真菌和曲霉提供营养、分泌的酶和网络，该网络在土壤中提供丝状结构并向用于组合物的生物组分和内源性细菌的水或其他液体提供结构。有利的酵母是对于植物或动物为非病原的那些酵母。虽然不受任何理论所束缚地，据认为如菌丝体一样提供结构提高了多种物种在治理环境中发现其优选的环境的能力并使其定殖和生物活性最大化。在本发明的组合物中，酵母、真菌和曲霉提供了用于定居的组分的丝状结构和细胞碎片以维持制剂中存在的厌氧光合细菌。
在本发明的组合物的特定用途中可能是重要的酵母或菌根真菌的特性是对人类和动物为非病原性的和非毒性的。已知土壤中的菌丝体对于通气是重要的，且其分泌破坏真菌的有机营养源的胞外酶且其被环境中的微生物所利用。真菌结合重金属，诸如铯和其他元素，且已知可用于流过菌丝体的水的净化。据认为菌丝体吸引环境中的共生生物（芽孢杆菌属物种，假单胞杆菌属物种等）并提供纤维网络以共存的方式定殖，并提供胞外协作的营养物来源。例如，如本文所描述的使用包括酵母诸如IN-SC1或表达包括细胞色素P450蛋白或结构域和/或镰刀菌酸或土壤菌丝体真菌的酶***的组合物。
本发明包括含光合细菌的组合物。例如，R.palastrus，比如IN-RP1（登录号PTA- 12387）根据其清除有机废物、毒素和烃的能力可作为组合物的组分。向光细菌可以是本发明的组合物的组分。紫色硫磺或非硫磺细菌可用于本发明的组合物中。例如，如本文所描述的可使用包含具有ATCC号PTA-12387的光合细菌，IN-RP1的组合物。
本发明的组合物包含细菌和其他微生物，比如表1中所显示的那些。可用于本发明的细菌包括，但不限于以下，嗜碱芽孢杆菌（Bacillus alcalophilus）、蜂房芽胞杆菌(Bacillus alvei)、解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）、解硫胺素芽胞杆菌(Bacillus aneurinolyticus)、海水芽孢杆菌(Bacillus aquaemaris)、短芽孢杆菌(Bacillus brevis)、热容芽孢杆菌(Bacillus caldolyticus)、中间芽胞杆菌(Bacilluscentrosporus)、蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)、环状芽胞杆菌(Bacillus circulans)、克劳氏芽孢杆菌（Bacillus clausii）、凝结芽孢杆菌（Bacillus coagulans）、坚强芽孢杆菌（Bacillus firmus）、黄热芽孢杆菌(Bacillus flavothermus)、梭形芽孢杆菌(Bacillusfusiformis)、球芽孢杆菌（Bacillus globigii）、耐盐芽孢杆菌（Bacillus halodurans）、下层芽孢杆菌(Bacillus infernos)、幼虫芽胞杆菌(Bacillus larvae)、侧孢芽胞杆菌(Bacillus laterosporus)、迟缓芽胞杆菌(Bacillus lentus)、地衣芽孢杆菌（Bacilluslicheniformis）、巨大芽孢杆菌（Bacillus megaterium）、马铃薯芽孢杆菌(Bacillusmesentericus)、胶质芽孢杆菌(Bacillus mucilaginosus)、蕈状芽孢杆菌（Bacillusmycoides）、纳豆芽孢杆菌(Bacillus natto)、泛养芽胞杆菌(Bacillus pantothenticus)、多粘芽孢杆菌(Bacillus polymyxa)、假炭疽芽孢杆菌(Bacillus pseudoanthracis)、短小芽孢杆菌（Bacillus pumilus）、施氏芽孢杆菌（Bacillus schlegelii）、球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)、耐热芽孢杆菌（Bacillus sporothermodurans）、嗜热脂肪芽胞杆菌(Bacillus stearothermophilus)、枯草芽孢杆菌、热葡糖苷芽孢杆菌（Bacillusthermoglucosidasius）、苏云金芽孢杆菌（Bacillus thuringiensis）、寻常芽孢杆菌(Bacillusvulgatis)和韦氏芽孢杆菌(Bacillus weihenstephanensis)。
本发明包括可用于控制和减少湖泊和池塘的污染和沾污的组合物和方法。更具体地，本发明包括可用于控制和减少池塘污泥的组合物和方法。如本文所用，“池塘污泥”可意为池塘的表面上或池塘的表面下的藻类、浮萍或任何其他有机物质。组合物可包括选择的与特定的微生物物种（例如，芽孢杆菌物种）一起生长的和增强存在于生物废物和有机废物中的天然微生物的生长或活性的有益细菌、酵母和发酵产物的共混物。用于控制和减少湖泊和池塘中的污染或沾污的组合物可包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物一起用于本发明的组合物和方法中的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，和/或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组 合物。
组合物可以是微生物的浓缩溶液，例如每升1×109个细胞，并可以作为浓缩物使用，或进行稀释，例如以约1×101至约1×104的比率稀释，然后喷洒在表面上以及水体的边缘或只是在活化中心（容器）中进行活化（置于营养培养基中并允许由在培养基中稀释的浓缩溶液的等分试样生长）。活化中心是用于使组合物生长的一个或多个容器。向处理位置提供组合物的密封或闭合容器并打开容器，可将组合物在一个或多个活化容器中稀释到培养基中并使微生物在培养基中于30°-37℃下生长数天，诸如5-7天，或直到测得pH值为pH4或3.7或以下为止。组合物的该活化不需要在无菌或清洁条件下进行，并且如果在将要进行治理的场所进行活化将是有益的。这对水处理方法是有益的。一个活化中心可用于例如200-1000升的批量，并可以为能够容易地扩展以增大活化能力的模块化设计。模块大小可以为200-1000升，并且可将多个模块用于活化组合物。组合物的活化不限于使用活化容器，并且组合物可在具有充分允许组合物中的微生物繁殖和生存的大小的任何容器中生长。
在一个方面，活化方法包括1)闭合活化容器上的阀门，2)将10升培养基放入容器中，3)添加20升水，4)添加10升微生物组合物，5)将活化容器充注另外的水达到200升刻度线，6)加热到30°-37℃持续7-10天，8)检测pH值，以及9)在pH处于或低于3.7后使用活化的组合物，例如施加到场所。在一个方面，水体可与浅水池互相连接。在一个方面，组合物和方法可用于控制由水体底部的污泥蓄积产生的气味。处理静水诸如池塘、湖泊或封闭的水体的方法包括使用含微生物的组合物的方法，包括向静水或封闭的水体施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所生长和繁殖的时间；以及减少或消除沾污或污染物质的至少一部分。
本发明包括可用于控制和减少流动水体诸如河、溪流、地下含水层或地下水流中的污染和沾污的组合物和方法。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、 产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。含微生物的组合物可包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，含微生物的组合物可以包含IN-M1，登录号PTA-12383。使用含微生物的组合物的方法包括将有效量的含微生物的组合物施加于流动水；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或在流动水中生长和繁殖的时间；以及减少或消除沾污或污染物质的至少一部分。使用含微生物的组合物处理流动水的方法可包括提供包括附着的或封闭的含微生物的组合物的结构，使得流动流体接触固定的含微生物的组合物；使微生物作用于流动流体；以及减少或消除流动流体或活水中的一种或多种沾污或污染物质。
本发明包括可用于治理被烃和/或重金属和/或不想要的细菌诸如大肠杆菌污染的场所的组合物和方法。在一个方面，组合物可用于将毒性烃转化成无害的氮化合物、二氧化碳和水。组合物可包括其中微生物包括沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。含微生物的组合物可包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，含微生物的组合物可包含IN-M1，登录号PTA-12383。使用含微生物的组合物的方法包括将有效量的含微生物的组合物施加到包含烃和/或重金属和/或大肠杆菌的场所或容器；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除烃和/或重金属和/或诸如大肠杆菌的微生物的至少一部分。
本发明包括可用于采矿业的组合物和方法。在一个方面，该组合物和方法可用于清洁或处理尾矿。在一个方面，该组合物和方法可用 于清洁或处理采矿产生的废水。组合物可使用在淡水、咸水或海水条件、好氧和厌氧条件中的现有设备并与用于受污染的水、污泥、土壤及其混合物的处理或管理中的现有基础设施、现有和新的通气、混合分离与监测***相连接而递送。组合物可包括其中微生物包括沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。含微生物的组合物可包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，含微生物的组合物可包含IN-M1，登录号PTA-12383。使用含微生物的组合物的方法包括将有效量的含微生物的组合物施加到包含由采矿活动产生的污染物的场所或容器；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除由采矿活动产生的污染物诸如尾矿、废水、土壤或设备的至少一部分。
本发明包括可用于被烃诸如油污染的场所、容器或水源的生物治理的组合物和方法。在一个方面，污染可因漏油导致。本发明的组合物可包含处理可刺激受沾污环境中微生物生长的烃和营养物的微生物，以有助于重新建立受影响环境中的植物区系以及保护可能受漏油影响的海产和其他野生生物。包含微生物的组合物可降解存在于漏油场所的烃及其他沾污物，如有机溶剂，并且甚至在存在如表面活性剂的化学品的情况下也可进行降解。本发明的方法可包括：向被油或其他烃污染的场所施加或提供含有油降解性微生物的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及移除所存在的油或烃的至少一部分。组合物可包含与本文所教导的含微生物的组合物组合的能够降解烃的微生物，例如从油或烃污染场所分离的分离微生物，在一个方面，可将组合物直接喷洒到污染场所的油上。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植 物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。含微生物的组合物可包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，含微生物的组合物可包含IN-M1，登录号PTA-12383。例如，含微生物的组合物可包含IN-M1，登录号PTA-12383以及一种或多种烃降解性微生物。使用含微生物的组合物的方法包括向包含油或其他烃以及水和/或土壤的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物，以及减少或消除水和/或土壤中油或其他烃的至少一部分。
本发明包括可用于可受沾污物或污染物影响的野生生物或其他动物的处理的组合物和方法。例如并且非限制性地，组合物和方法包括处理被油或烃污染的鸟类或其他动物或野生生物，从而减少从动物清理掉油或烃所需的时间和处理量。在一个方面，可将含微生物的组合物稀释并使其生长以提供大量的可在约5-10天内直接使用的组合物，或可将含微生物的组合物以浓缩形式使用。在动物处理中使用本文所公开的组合物的方法包括1)任选地稀释组合物并将稀释的溶液喷到动物毛皮或羽毛上，2)使组合物留在动物毛皮或羽毛上一段预定的时间，诸如数分钟到数小时，以及3)冲洗动物或让动物在水池中洗浴，或将动物与组合物接触，包括甚至浓度更稀的含微生物的组合物。可重复该方法。在一个方面，可将组合物的喷淋用于协助移除油或烃残留。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物的变型形式。含微生物的组合物可包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，含微生物的组合物可包含IN-M1，登录号PTA-12383。例如，含微生 物的组合物可包含IN-M1，登录号PTA-12383以及一种或多种烃降解性微生物。使用含微生物的组合物的方法包括向动物施加有效量的含微生物的组合物以及减少或消除污染物的至少一部分，诸如油或其他烃。
本发明包括用于土壤的生物治理的组合物和方法。在一个方面，该组合物和方法可增加土壤的保水率。在一个方面，该组合物和方法可刺激在土壤上或土壤中存活的植物的根部生长。在一个方面，该组合物和方法可降低昆虫侵扰的风险。在一个方面，该组合物和方法可降低患病的风险。在一个方面，该组合物可为土壤通气，降解化学品或有机污染物，并且有助于植物吸收天然存在于土壤中或添加到土壤中的有机营养物。例如并且非限制性地，本发明的组合物和方法可用于消除高尔夫球场轻击区上的褐斑和死草区域。在一个方面，该组合物和方法可减少灌溉土壤的需要以便维持健康的植物生长。组合物可以为浓缩物并且可以作为浓缩物使用，或按100:1至1:300在水中稀释，然后可喷到需要处理的土壤表面上。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。含微生物的组合物可包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，含微生物的组合物可包含IN-M1，登录号PTA-12383。例如，含微生物的组合物可包含IN-M1，登录号和一种或多种微生物，诸如来源于处理场所或类似场所的微生物。使用含微生物的组合物的方法包括向诸如高尔夫球场全部或一部分的场所施加有效量的含微生物的组合物，其中高尔夫球场的草的维持和养护得以改善并且从化学品和合成分子向可持续有机养护的过渡得到此类方法的帮助。
土壤的生物治理还可以包括向可添加到场所的植物或根际提供的含微生物的组合物，或向存在于场所的植物或根际提供含微生物的组 合物。例如，在受到污染或沾污的场所，可将植物种植在受污染或沾污的场所中，其中植物已具有施加到根部的含微生物的组合物。一种含微生物的组合物的合并组合物，所述含微生物的组合物包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，含微生物的组合物可包含与可施加到植物的来源于场所或类似污染场所的生物体组合的IN-M1，登录号PTA-12383。让植物生长，并可在一段时间后收获或移除以从场所移除污染物，而不用移除土壤本身。植物可最终用作生物质燃料源。例如，可使污染场所的植物接触含微生物的组合物，诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，含微生物的组合物可以包含IN-M1，登录号PTA-12383，并且任选地还可以接触土壤。一种含微生物的组合物的合并组合物，诸如包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的含微生物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，含微生物的组合物可包括与可施加到植物的来源于场所或类似污染场所的生物体组合的IN-M1，登录号PTA-12383。
虽然不希望受任何特定理论所束缚，但据认为，本发明的含微生物的组合物刺激植物根际上有益微膜的形成，从而允许土壤和植物中的生物体之间相互作用。该增强的相互作用允许更好地将营养物转移到植物中，其中一些营养物可包括来源于污染的代谢物和/或元素，从而导致快速成熟、开花、更强的分枝能力以及子实体的产量增加。
使用含微生物的组合物，诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物， 已表明通过菌根真菌刺激在有机物质中生长的植物生长；在营养液中的藻华受到抑制；常见植物感染的抑制；以及在高尔夫球场的草坪草上的藻类生长和在生长植物叶子上的霉菌的抑制。
本发明的组合物和方法包括增强种子发芽。向莴苣和其他菜苗(microgreens)的种子提供含微生物的组合物，诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物，表明种子发芽减少了50%。将以1×106个细胞/mL的浓度包含IN-M1的组合物喷到莴苣和类似的绿叶蔬菜种子上。使种子在有机基质上水培发芽，湿重和芽高比未用组合物处理的相同种子平均高20%。如此处理的种子与未处理的种子相比产生了在7天中生物量增加20%的植物。
诸如用于高尔夫球场的草坪草的种子发芽通过用含微生物的组合物处理草坪草种子而得以增强，所述含微生物的组合物诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，将以1×106个细胞/mL的浓度包含IN-M1，登录号 PTA-12383的含微生物的组合物喷到其中种子已在美国南部的高尔夫球场的轻击区上分散开的绿地上。在夏草休眠的时间中定植了肯塔基早熟禾。肯塔基早熟禾生长更快，其发芽从7天加速到5天，并且以比未喷洒种子的地方的草更快的速率定植，时间为3周内，而未处理的种子则为4周。
本发明包括可用于商业和居民化粪池***的处理或管理的组合物和方法。组合物和方法可用于从下水道或化粪池***中减少污泥，从而降低传染病和毒性物质（包括硫化氢、氨和挥发性有机碳）造成的健康风险。组合物和方法可用于控制从商业或居民化粪池***中散发的气味。在一个方面，组合物用于处理管道中所含的生物固体或污泥。在一个方面，方法和组合物可用于处理从下水道和提升站移除的可能 容纳在储存设施中的生物固体或污泥。在一个方面，方法和组合物可用于化粪池渗流或排放场的生物治理。在一个方面，组合物和方法可用于从废水中除去脂肪、油和脂(FOG)。在一个方面，该组合物和方法可用于处理受工业农场的粪肥沾污的水。组合物可以浓缩（参见实施例1）并可作为浓缩物使用或按100:1至1:10000在水中稀释，然后可喷在渗流场或需要治理的区域。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，诸如含微生物的组合物的组合物可包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，含微生物的组合物可包含IN-M1，登录号PTA-12383，可加以使用。使用含微生物的组合物的方法包括向包含污泥的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除污泥的至少一部分。使用含微生物的组合物的方法包括向包含脂肪、油和脂(FOG)的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除FOG的至少一部分。使用含微生物的组合物的方法包括向工业农场废弃物的容纳槽施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除废弃物的至少一部分。组合物可使用现有设备并与用于商业和居民化粪池***的处理或管理中的现有和新的通气、混合分离/过滤与监测***相连接而递送。
如本文所用，施加可将材料与如本文所教导的含微生物的组合物接触。
本发明包括可用于市政或工业废水治理的处理或管理的组合物和方法。在一个方面，该组合物和方法可减少二氧化碳、甲烷、氨、硫 化氢和其他温室气体排放以及产生气味的化合物。在一个方面，该组合物和方法可减少下水道管线、泵/提升站中以及废水处理厂中形成生物膜的细菌和生态破坏（如丝状细菌）。在一个方面，该组合物和方法可减少受沾污水中的生物需氧量和化学需氧量。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，诸如含微生物的组合物的组合物，诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，含微生物的组合物可包含IN-M1，登录号PTA-12383，可加以使用。使用含微生物的组合物的方法包括向市政或工业废水***施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除废弃物的至少一部分。组合物可使用用于市政或工业废水处理的现有或新的设备诸如现有和新的通气***、混合和监测***以及生物过滤器递送。
本发明包括可用于处理和/或回收利用用于工业过程的水的组合物和方法。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。
使用含微生物的组合物的方法包括向包含工业过程中的废弃物的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除废弃物的至少一部分。例如，组合物和方法可在奶生产中用于处理奶场产 生的动物废弃物。该组合物和方法可减少设施、水池中以及污泥或可铺在土壤上作为健康的土壤改良剂的所得堆肥中如二氧化碳、甲烷的温室气体排放以及氨气和其他导致气味的化合物。组合物和方法可作为土壤改良剂改善经处理的生物固体的质量和性能。组合物可使用现有设备并与用于市政或工业废水处理的新通气、混合和监测***相连接而递送。组合物可包括在与现有技术相结合的厌氧和好氧方案中，以及与通气、混合和检测***一起作为单独解决方案和/或***包括在工业废水回收利用中。
本发明包括可用于水坝封闭的水的处理的组合物和方法。在一个方面，组合物和方法用于处理水坝封闭的水，以用于水力发电的目的。例如并且非限制性地，水坝拦住的水的处理可包括减少水源中二氧化碳的输出。组合物可加速埋在水下的植被的降解，因而减少温室气体排放。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。使用含微生物的组合物的方法包括向包含停滞或封闭水的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除释放的或存在的温室气体或二氧化碳的一部分。
本发明包括可用于控制堆肥设施产生的气体的组合物和方法。该组合物和方法可减少二氧化碳、甲烷和其他温室气体排放，以及减少氨和其他导致气味的化合物。该组合物和方法可加速市政和工业规模的堆肥设施中的堆肥过程。该组合物和方法可降低存在的重金属水平，并作为健康的土壤改良剂改善最终产品质量和性能。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、 IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。使用含微生物的组合物的方法包括向包含散发臭味的物质的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物以及减少或消除该场所或容器释放的臭气的至少一部分。
该组合物和方法可降低沥出液的腐蚀性，使得沥出液对过程有益并减少其气味。该组合物和方法可与生物过滤器安装相互作用，从而提升其性能。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。使用含微生物的组合物的方法包括向包含沥出液的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减弱沥出液腐蚀性的至少一部分，使得沥出液的至少一部分对过程有益。组合物可螯合沥出液的全部或一些或可改变或改性沥出液以降低其毒性。
本发明的组合物可使用现有设备，与现有和新的分离有机废弃物管理设施（包括料堆、静压桩和容器设施、厌氧和好氧方案）相连接，与用于通气、碾磨、混合、生物过滤器和监测***的现有设备和新设备或***相连接作为市政或工业规模堆肥设施的单独解决方案和/或***而递送。
本发明包括可用于因自然灾害受到污染的土壤和水去污染的组合物和方法。例如并且非限制性地，自然灾害可以是洪水、地震、飓风、海啸或任何其他自然灾害。在一个方面，组合物和方法可用于抑制在自然灾害后进入水***的病原体的至少一部分。在一个方面，该组合物和方法可用于治理受霍乱弧菌(Vibrio cholerae)污染的水。本发明的组合物可通过直接向水提供含微生物的组合物或通过使用现有***或采用已知递送***而地送进需要治理的水***。水可在诸如容纳槽、水池的现有位置或直接在公共厕所、排水沟或停滞地下水的水源处进 行处理。递送机制可基于不同的情形而优化。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。组合物可包含靶向影响灾民和受卫生状况恶劣困扰的人群的疾病的天然抗生和抗寄生虫生物体。使用含微生物的组合物的方法包括向含有不想要的生物体诸如霍乱弧菌的水的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除诸如霍乱弧菌的微生物的至少一部分。
本发明包括可用于形成和保持健康土壤环境的组合物和方法，从而允许健康的植物生长。暴风雨或水流失在工程水库中或诸如农场上或工业生产基地中的其他位置进行处理，在流失的水到达地表水或污染地下水前，将流失水用本发明的组合物处理。因此，在污染从污染场所转移到其他场所前在源头进行处理有助于形成和维持健康的土壤环境。此类处理可促进分水界域中的植被生长，这将有助于处理流失。在一个方面，组合物和方法可通过在诸如粪池和高尔夫球场的源头污染处进行处理而用于减轻水流失或暴风雨水流失的污染影响。在一个方面，组合物和方法可用于通过处理多孔硬质表面以清理表面孔隙而清除有机碎片并允许暴风雨水渗入透水混凝土的孔隙而减轻水流失或暴风雨水流失的污染影响。
组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1 和/或IN-RP1的组合物。使用含微生物的组合物的方法包括向与暴风雨流失接触的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除在水流失中携带到场所或容器中的污染物的至少一部分。
本发明包括可用于植物生长的水培***的组合物和方法。本发明的方法包括接触水培条件下生长的植物的根部***，或喷洒在水培***中生长的植物的叶子、茎干、果实或根部。可将诸如1×103至5×104个细胞/mL的稀释浓度添加到水培***的循环介质中以减少藻华形成并任选地对循环介质中的植物的根部***进行处理。
用于此类水培***的组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。使用含微生物的组合物的方法包括向植物或植物容器施加有效量的含微生物的组合物，或向用于水培生长条件的循环介质或其他介质提供组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及增强植物在水培***中的生长，并任选地减少介质中或容器或管道上的藻类量或其他不想要的生长。
本发明包括可用于在潮湿或湿度环境后或在潮湿或湿度环境中某一区域霉菌生长治理的组合物和方法。在一个方面，该组合物和方法可用于处理和防止在因溢流而具有持续水渍的任何建筑物中霉菌的生长。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用诸如含微生物的组合物的组合物，诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如 IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。使用含微生物的组合物的方法包括向包含霉菌生长的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物以及减少或消除霉菌生长的至少一部分。
本发明包括用于提高土壤的质量的组合物和方法。在一个方面，该组合物和方法可增加土壤的保水率。在一个方面，该组合物和方法可刺激在土壤上或土壤中存活的植物的根部生长。在一个方面，该组合物和方法可降低昆虫侵扰的风险。在一个方面，该组合物和方法可降低患病的风险。在一个方面，该组合物可为土壤通气，降解化学品或有机污染物，并且有助于植物吸收天然存在于土壤中或添加到土壤中的有机营养物。因此，组合物和方法可用于增强草坪、花、果实、蔬菜、果园或葡萄园、树或森林的生长。在一个方面，组合物和方法可用于温室。在一个方面，组合物和方法可用于艰难环境中的市政和城市片林。在一个方面，组合物和方法可用在其中土壤受到例如盐和油污染的路边。在一个方面，组合物和方法可用在例如其中土壤可受到油、盐或重金属污染的军事设施。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。使用含微生物的组合物的方法包括向包含植物的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及增强植物的生长。使用含微生物的组合物的方法包括向包含土壤或堆肥或其混合物的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及改善土壤质量，诸如保水率、增加的微生物浓度或其他有益的质量。
本发明包括可用于通过定殖或存在于叶表上和植物根部周围的组 合物的微生物而控制昆虫的组合物和方法，从而形成对有害昆虫和真菌孢子的屏障。该组合物和方法可用于抑制例如白粉病和昆虫侵害，有益的微生物物种从而在植物和土壤中定殖。在一个方面，组合物加强植物对抗侵染的免疫***。在一个方面，本发明的组合物可作为活性剂诸如生物杀虫剂或杀幼虫剂（诸如bti）以及天然成分的递送***。据推理，提供本发明的组合物通过组合物中的微生物而提供对病原生物体的竞争性抑制。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，诸如含微生物的组合物的组合物，诸如一种或多种混合培养物，例如IN-M1，或组合地或单独地包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物，和/或与其他微生物一起。使用含微生物的组合物的方法包括向包含植物的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除对植物的病理影响的至少一部分或有助于递送所需的活性剂，诸如杀虫剂、杀幼虫剂或其他所需的活性成分。施加方法包括但不限于喷洒叶子、土壤和果实。
本发明包括可用于蜜蜂养殖的组合物和方法。在一个方面，该组合物和方法可用于控制蜂箱内的蜂螨。在一个方面，向蜂箱内喷洒以5×103至5×104个细胞/mL的浓度溶于水的含微生物的组合物。在另一个方面，含微生物的组合物可用于清洁和擦拭蜂箱。据推理，提供本发明的组合物通过组合物中的有益微生物而提供对病原生物体的竞争性抑制。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，诸如含微生物的组合物的组合物，诸如一种或多种混合培养物，例如IN-M1，或组合地或单独地包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物，和/或与 其他微生物一起。使用含微生物的组合物的方法包括向包含昆虫的场所和容器施加有效量的含微生物的组合物以移除有害的生物体。
本发明包括可用于水培或气培农业技术或垂直耕种方法的组合物和方法。本发明的组合物可加到植物的营养液中，以增加植物对营养物的摄取。组合物还可喷洒在植物表面上和空气中以防止病原生物体在叶子和子实体上定殖或在植物上生长。可向其他表面和植物周围提供本发明的组合物，包括但不限于容器、架子、温室、岩石棉、生长介质表面。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，诸如含微生物的组合物的组合物，诸如一种或多种混合培养物，例如IN-M1，或组合地或单独地包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物，和/或与其他微生物一起。方法可包括向植物与种子的全部或一部分提供含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及增强植物或种子的生物活性，诸如提高发芽率、提高植物的生物量、减少或调节植物或种子的感染、增加坐果率和开花、增强块茎发育、延长植物的生产时间长度、延长经处理植物的生产生命周期、增加营养物摄取；以及处理植物与种子，和与植物或种子接触的流体或表面，诸如介质和容器，以减少所存在的病原性和内源微生物的一部分。
本发明包括可用于水产养殖或鱼类养殖的组合物和方法。在一个方面，含微生物的组合物用于抑制气味。在另一个方面，含微生物的组合物用于降解鱼产生的废物、氨以及抑制藻类。在另一个方面，含微生物的组合物抑制感染并对鱼外皮和消化有益。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，诸如一种或多种混合培养物的组合物，例如IN-M1， 或组合地或单独地包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物，和/或与其他微生物一起。使用含微生物的组合物的方法包括向包含鱼或鱼产生的废物的场所或容器、或养鱼的水施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少气味或不想要的藻类生长，或有助于鱼的生长。
本发明包括可用于来自建筑业的和用在建筑业的工业副产品的去污染的组合物和方法。在一个方面，可将本发明的含微生物的组合物用作混凝土添加剂或在水泥制造过程中加到水泥中以增加渗透性。
本发明包括可用于医疗保健业的组合物和方法。例如并且非限制性地，该组合物和方法可用于提高空气质量、抑制病原体、对医疗保健设施进行清洁和消毒或治理医疗保健设施产生的毒性废弃物。另外，本发明的组合物可有助于人类或动物健康。例如，组合物可用作提取或纯化可用作食品补充剂的活性剂的源材料，用于化妆品，或为营养品、药妆品、益生菌或药物组合物，诸如抗氧化剂和生物物质以及有助于消化过程和胃肠疾病的化合物。组合物可加到食品或化妆品中，或可作为独立于食品的补充剂。组合物可包括从含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和/或酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物中分离的因子或包括所述含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。使用含微生物的组合物的方法包括向场所或容器施加有效量的含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除病原生物体的至少一部分。本发明的组合物可通过定殖在表面上并防止诸如MRSA的病原菌定殖而提供竞争性抑制。本发明的组合物可用于在源头对生物、化学毒性（包括来自癌症患者和其他患者的尿液和其他 生物废弃物）和放射性废弃物（包括放射性核素示踪物）、治疗剂和患者植入物的处理方法，并包括向待处理的场所提供含微生物的组合物；允许组合物保持一段时间，例如在处理场所或表面生长和繁殖的时间；以及减少或消除废弃物或不想要的物质或病原体的至少一部分。
本发明包括可用于运输业的组合物和方法。例如并且非限制性地，该组合物和方法可用于清洁或处理引擎、卡车、火车或飞机产生的柴油泄漏。在一个方面，含微生物的组合物和方法可用于处理在客车、火车或飞机上产生的废水。本发明的组合物可用于来自公共厕所、移动厕所的废弃物，来自运输车辆、船舶等上的厕所设施、餐厅和厨房的油污水（诸如舱底水）、废水的处理方法。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物。
本发明包括可用于养殖或饲养动物的组合物和方法。例如并且非限制性地，动物可作为宠物或作为家畜养殖或饲养，并可以为狗、猫、马、牛、猪或鱼。在一个方面，该组合物和方法可用于控制动物气味。在一个方面，这可通过将组合物喷洒在动物垫料上或直接喷洒在动物上而实现。在一个方面，动物可随它们的食物或水一起摄入本发明的组合物，从而改善它们的健康、消化和气味。组合物可包括含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如一种或多种混合培养物的组合物，例如IN-M1，或组合地或单独地包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物，和/或与其他微生物一起。使用含微生物的组合物的方法包括向与动物接触的场所或容器施加有效量的含微生物的组合物以及减少或消除气味或病原生物体的至少一部分。方法可包括作为动物饲料提供含微生物的组合物。
本发明包括可用作人类或动物消耗或使用的产品中的添加剂的组 合物。例如并且非限制性地，组合物可用作益生菌健康饮品和食品补充剂、含酒精或不含酒精的发酵饮料、发酵食品、色拉调味料、腌泡汁、烹调香料或补充剂、膳食补充剂、香波、肥皂、抗真菌药物、牙膏或漱口水中的添加剂。组合物可包括组合地或单独地含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌或酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。例如，可以使用如实施例1中所教导的浓缩组合物。例如，可以使用诸如含微生物的组合物的组合物，诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物，或含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。使用含微生物的组合物的方法包括向食品、美容剂、清洁剂添加有效量的含微生物的组合物或作为可摄取的组合物提供组合物。食品级产品可通过微生物发酵。
本发明包括可作为药物摄取或应用的组合物。例如并且非限制性地，含微生物的组合物可用作皮肤或毛发疾病或消化疾病的治疗组合物。例如，可以使用诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物的组合物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1的组合物，或含有沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的含微生物的组合物。
本发明包括可用于家用装置诸如家庭用品的组合物和方法。
本文所公开的方法和组合物可包括来自处理场所（诸如植物或动物的生物表面）或环境场所（诸如受污染或沾污的场所）的微生物的使用，并将此类微生物添加到本发明的含微生物的组合物中或与本发明的含微生物的组合物配混。方法包括将从处理场所分离的微生物添 加到组合物中，所述组合物包含组合地或单独地、和/或连同其他微生物形成合并组合物的一种或多种混合培养物，所述一种或多种混合培养物例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1，或沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的组合物。此类合并组合物可在原场所使用以除去污染物，或进行其他所需的处理。这有时被称为原位治理，其利用存在于受污染场所的土著、污染物降解性微生物。这些生物体存在于该场所并且能够很好地降解该场所的元素。一般来讲，当未改变及处于其原始状态时，土著微生物的去污染作用的水平太低且速率太慢而不能对区域进行有效去污染。另外，该生物体可能只能对多种混合物沾污物中的一种污染物产生化学方面的变化，或者只能对化学复杂的污染性分子产生少量的化学变化。天然存在的微生物的生长和活性通过形成包含本发明的含微生物的组合物的合并组合物而增强。制备合并组合物的方法包括饲养来受自污染土壤或水的少量生物体并使其生长，然后将其与含微生物的组合物配混，以刺激天然有益微生物治理社区或微生物的生长。本发明培养的这种合并组合物然后可重新引入受污染的环境或用于其他类似的情形。例如，可将诸如组合地或单独地、和/或连同其他微生物的一种或多种混合培养物（例如IN-M1，或包含IN-LH1、IN-BS1、IN-SC1和/或IN-RP1，或沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌的组合物）的组合物与来自受沾污或污染场所的生物体合并，然后可使合并的组合物在容器中生长或可添加到受污染或沾污的场所，或与原始场所类似的场所，以调节（诸如增强）在该场所发生的分解。
应当理解，已描述的本发明的方面是为了展示本发明原理的其中一些应用。在不脱离本发明的真实精神和范围的情况下，本领域的技术人员可作出许多修改。
本文所用的术语只是为了描述特定方面，并非旨在进行限制。
如在说明书和所附权利要求书中所用，单数形式“一”、“一个/种”和“该/所述”包括多个指代物，除非上下文另有明确指出。因此，例如，提及“药学载体”包括两种或更多种此类载体等的混合物。
如本文所用的词语“或/或者”意指特定列表中的任何一个成员并且还包括该列表成员的任何组合。
范围可在本文表示为从“约”一个特定值和/或至“约”另一个特定值。当表达这样的范围时，另一个实施方案包括从所述一个特定值和/或至另一个特定值。相似地，当通过使用先行词“约”将值表示为近似值时，应当理解，所述特定值形成另一个实施方案。还应当理解，范围每一个的端点在与另一个端点的关系中均是重要的并独立于另一个端点。也应当理解，存在本文所公开的许多值，并且每个值也在本文公开为除了该值本身外还包括“约”该特定值。例如，如果公开了值“10”，则也公开了“约10”。也应当理解，当公开一个值时，也公开了“小于或等于该值”、“大于或等于该值”以及值之间的可能范围，如技术人员适当地理解。例如，如果公开了值“10”，则也公开了“小于或等于10”以及“大于或等于10”。也应当理解，在整个申请中，以许多格式提供了数据，并且该数据代表端点和起点以及数据点任何组合的范围。例如，如果公开了特定数据点“10”和特定数据点15，则应当理解，大于、大于或等于、小于、小于或等于以及等于10和15以及10和15之间也应被视为进行了公开。也应当理解，还公开了两个特定单位之间的每个单位。例如，如果公开了10和15，则也公开了11、12、13和14。
在本说明书及其之后的权利要求书中，将提及许多术语，它们应被定义为具有以下含义：
“任选的”或“任选地”意指随后描述的事件或情况可能发生或可能不发生，并且该描述包括其中所述事件或情况发生的情形以及不发生的情形。
术语“处理/治疗”是指抑制、防止、治愈、逆转、减弱、缓解、最大程度减轻、遏制或阻止状况、污染物、毒物、沾污物的有害作用和/ 或导致状况的减轻、缓解或复原。本领域的技术人员将理解，许多方法和分析可用于评估状况的发展，并且相似地，许多方法和分析可用于评估状况的减轻、缓解或复原。
如本文所用，术语“确定/测定”可指测量或判定活性的质量或量或变化。例如，如本文所用的测定微生物或生长培养物的特征可指技术人员将采取以测量或判定样品中的一些可定量值的步骤。技术人员熟悉测量样品特征的方式。术语“样品”以其来自某更大量的溶液、来自某场所、来自某培养物或其他更大的实体（一部分（即样品）可从该实体取出并任选地作用于该实体）的一部分的普通含义使用。
在此整个申请中，引用了许多出版物。这些出版物的公开内容整体据此以引用方式并入本申请，以更全面地描述本申请所属的现有技术。所公开的参考文献对于在该参考文献所处的句子中讨论的其所含内容也单独地且具体地以引用方式并入本文。
本发明已结合其具体实施方案进行了描述。然而，明显地，可在不脱离本发明的更宽精神和范围的情况下对其作出各种修改和变化。因此，说明书和附图应被视为示例性的而不是限制性的含义。
本发明包括含微生物的组合物以及制备及使用此类组合物的方法。例如，含微生物的组合物包括含有分离的细菌、至少一种分离的酵母以及至少一种分离的菌根真菌的组合物，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌IN-BS1，登录号PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号PTA- 12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号 PTA-12387。含微生物的组合物包括分离的微生物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1登录号PTA-12383。混合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产 朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一种或多种。
使用本发明的组合物的方法包括某一场所的生物治理方法，包括向包含至少一种污染物的场所提供含微生物的组合物，其中含微生物的组合物包含至少一种分离的细菌、至少一种分离的酵母以及至少一种分离的菌根真菌，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的；允许含微生物的组合物的微生物生长和繁殖一段时间；以及减少场所的至少一种污染物的至少一部分。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号 PTA-12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA-12387。含微生物的组合物包括分离的微生物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1，登录号PTA-12383。混合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一种或多种。该方法还可以包括在提供含微生物的组合物后预定的时间，测量场所的至少一种微生物的水平或量并将其与在提供含微生物的组合物前获得的场所的至少一种污染物的水平或量的测量值进行比较。该方法还可以包括在提供含微生物的组合物后预定的时间，评估污染场所的状况的至少一种特征并将其与在提供含微生物的组合物前场所的状况的所述特征进行比较。评估场所的状况的至少一种特征包括测量场所的至少一种特征，其中特征包括场所的颜色、气味、清洁度、植物生长的量、微生物生长的量，动物生长的量，生物固体的量以及将特征测量值与在提供含微生物的组合物前获取的场所状况的所述特征的测量值进行比较，以提供场所状况的变化测量值。场所可包括矿 山、市政水***、受污染的场所、被沾污的场所、化粪池***、高尔夫球场、静水、湖泊、池塘、封闭的水体、活水、溪流、移动的水体、循环的封闭水体、垃圾填埋场渗出液、尾矿、工业废水或土壤、封闭的土体、从受污染的场所取出的封闭物料、水坝后方的水或土壤、农场或动物设施中的水或土壤、农场或植物设施中的水或土壤、诸如垃圾填埋场的垃圾处理厂的水或土壤、市政供水和污水处理***、商业供水和污水处理***、工业供水和污水处理***或私人供水和污水处理***。该方法还可以包括在向场所添加含微生物的组合物前，从场所获得样品并将样品的至少一部分添加到含微生物的组合物中以形成组合的含微生物的组合物，并允许组合的含微生物的组合物中的微生物生长和繁殖。该方法还可以包括从一个场所向另一个场所提供含有一种或多种微生物的组合式含微生物的组合物。
使用本发明组合物的方法包括影响、增强、调节、刺激或辅助植物生长的方法，向植物生长的场所、植物或特定生长阶段的植物或其组合提供含微生物的组合物，其中含微生物的组合物包含至少一种分离的细菌、至少一种分离的酵母以及至少一种分离的菌根真菌，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的；以及允许含微生物的组合物的微生物生长和繁殖一段时间。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号 PTA-12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA-12387。含微生物的组合物包括分离的微生物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1，登录号PTA-12383。混合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一 种或多种。该方法可包括向植物的种子施加含微生物的组合物。该方法可包括向植物的根部施加含微生物的组合物。该方法可包括向植物的叶子和茎干施加含微生物的组合物。该方法可包括增强种子发芽。该方法可包括增强根部生产。该方法可包括与未处理的植物相比增加经处理的植物的单株产量。该方法可包括与未处理的植物相比增加经处理的植物的生物量。该方法可包括与未处理的植物相比增加经处理的植物的果实生产。该方法可包括与未处理的植物相比增加经处理的植物的生产周期。该方法可包括与未处理的植物相比增加经处理的植物的生产生命周期。该方法可包括将所述方法与在水培条件下生长的植物一起使用。该方法可包括将所述方法与在温室中生长的植物一起使用。该方法可包括将所述方法与在田野或室外生长的植物一起使用。该方法包括将所述方法与在气培条件或组合水培与气培条件下生长的植物一起使用。该方法可包括将所述方法与垂直耕种一起使用。
使用本发明的组合物的方法包括处理表面的方法，包括向表面提供含微生物的组合物，其中含微生物的组合物包含至少一种分离的细菌、至少一种分离的酵母以及至少一种分离的菌根真菌，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的；以及允许含微生物的组合物的微生物生长和繁殖一段时间，其中微生物与内生细菌（无论是原来存在的还是随着时间的推移从环境中添加的）竞争至少一种包括物理空间、营养物、水、氧或光或化学能源或它们的组合的环境因素，或者其中含微生物的组合物的微生物捕食并移除原来存在于表面上的微生物。该方法可包括降低原来存在的微生物的数量。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号 PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号PTA-12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA-12387。含微生物的组合物包括分离的微生 物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1，登录号PTA-12383。混合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一种或多种。
使用本发明的组合物的方法包括处理流体的方法，包括向流体提供含微生物的组合物，其中含微生物的组合物包含至少一种分离的细菌、至少一种分离的酵母以及至少一种分离的菌根真菌，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的；以及允许含微生物的组合物的微生物生长和繁殖一段时间，其中微生物与内生细菌（无论是原来存在的还是随着时间的推移从环境中添加的）竞争至少一种包括物理空间、营养物、水、氧或光或化学能源或它们的组合的环境因素，或者其中含微生物的组合物的微生物捕食并移除原来存在于流体中的微生物。该方法包括降低液体中大肠菌群的数量。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号 PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号PTA-12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA-12387。含微生物的组合物包括分离的微生物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1，登录号PTA-12383。混合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一种或多种。
使用本发明的组合物的方法包括制备包含含微生物的组合物的制品，包括：将含微生物的组合物添加到制品的表面上，其中含微生物的组合物包含至少一种分离的细菌、至少一种分离的酵母以及至少一 种分离的菌根真菌，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的。该方法可包括其中对含微生物的组合物和表面进行干燥以将含微生物的组合物附着到表面上的步骤。该方法可包括其中对表面进行处理以有助于含微生物的组合物附着的步骤。该方法可包括添加含微生物的组合物的一种或多种组分以有助于其附着到表面上。
该方法可包括向含微生物的组合物和表面两者添加一种或多种组分以有助于含微生物的组合物附着到表面。此类组分可以是任何有助于含微生物的组合物附着到表面或制品的材料、化合物或分子。例如，胶水、淀粉、天然材料、聚合物材料和已知用于将微生物附着到表面或制品上的材料。该方法可包括其中表面或制品为玻璃珠、惰性材料、织造材料、非织造材料、诸如植物材料的天然材料、椰垫、二氧化硅珠、聚合物材料、植物容器、容器、过滤器结构、多孔惰性粒子或沸石的表面或制品。本发明设想了由附着的本发明含微生物的组合物制备的制品。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号 PTA-12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA-12387。含微生物的组合物包括分离的微生物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1，登录号PTA-12383。混合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一种或多种。
使用本发明的组合物的方法包括制备食品补充剂的方法，包括：使含微生物的组合物生长到特定的细胞浓度，其中含微生物的组合物包含至少一种分离的细菌、至少一种分离的酵母以及至少一种分离的 菌根真菌，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的，以及从微生物或培养基中分离因子。可用作食品补充剂的微生物产生的因子是已知的，并且用于分离它们的方法对本领域的技术人员也是已知的。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号 PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号PTA-12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA-12387。含微生物的组合物包括分离的微生物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1，登录号PTA-12383。混合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一种或多种。
使用本发明的组合物的方法包括制备食品补充剂的方法，包括：使含微生物的组合物生长到特定的细胞浓度，其中含微生物的组合物包含至少一种分离的细菌、至少一种分离的酵母以及至少一种分离的菌根真菌，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的，以及干燥和包装用作食品补充剂的组合物。含微生物的食品补充剂是已知的，并且用于制备和包装它们的方法对本领域的技术人员也是已知的。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号PTA-12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA-12387。含微生物的组合物包括分离的微生物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1，登录 号PTA-12383。混合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一种或多种。本发明设想了包括干燥、冻干、胶囊充填或制备液体产品的包装步骤，并且此类步骤在本领域中是已知的，并可与本文教导的组合物一起使用。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号PTA-12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA-12387。含微生物的组合物包括分离的微生物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1，登录号PTA-12383。混合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一种或多种。
使用本发明组合物的方法包括用于食品补充的方法，包括向动物、植物或人类食物添加含微生物的组合物，所述含微生物的组合物包含分离的细菌、至少一种分离的酵母以及至少一种分离的菌根真菌，其中细菌包括至少一种乳杆菌和至少一种芽孢杆菌，其中细菌基于酶谱进行选择，使得细菌为互补的。乳杆菌可以是瑞士乳杆菌或者乳杆菌可以是瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386。芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌或者芽孢杆菌可以是枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号 PTA-12385。酵母可以是酿酒酵母或者酵母可以是称为IN-SC1的酿酒酵母，登录号PTA-12384。含微生物的组合物可以还包含分离的光合细菌。光合细菌可以是沼泽红假单胞菌或者光合细菌是沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA- 12387。含微生物的组合物包括分离的微生物的混合培养物。混合培养物可以是IN-M1，登录号PTA-12383。混 合培养物可以包含沼泽红假单胞菌、枯草芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、酿酒酵母、米曲霉、产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌、瑞士乳杆菌和酪蛋白乳杆菌，或者含微生物的组合物可以包含本文所公开的微生物的一种或多种。
本发明的方法包括制备混合培养物的方法，包括：测量多种类型或物种的微生物的一种或多种酶活性以形成各微生物的酶谱，其中酶谱包括一种或多种酶和所述一种或多种酶针对特定底物的活性水平；选择a)中的两种或更多种微生物，其中各选定微生物的酶谱不同于另一微生物的酶谱，使得所述谱的至少一种酶和/或所述酶的至少一种酶活性只见于混合培养物中的一种微生物；使选定的微生物在培养基中生长形成孵育混合物。该方法可包括测量孵育混合物的特征。测量孵育混合物的特征可包括测量一种或多种选定微生物被一种或多种其他选定微生物的捕食，测量由一种或多种微生物释放或产生的因子或蛋白、pH变化、或由一种或多种选定微生物分泌的胞外酶及其对一种或多种其他选定微生物的影响，测量混合物中一种或多种选定微生物的每毫升细胞数，测定一种或多种选定微生物的生长速率，或特征和测量值的组合。该方法可包括使用孵育混合物的测得特征确定是否要将一种或多种微生物从孵育混合物中移除或是否要将一种或多种微生物加入孵育混合物。该方法可包括其中当要将一种或多种微生物从孵育混合物中移除时，该方法可包括杀灭孵育混合物以及重复步骤以制备不含所鉴定的不想要的微生物的新孵育混合物。该方法可包括其中当要将一种或多种微生物加入孵育混合物时的步骤，该方法可包括将一种或多种所需的分离微生物加入孵育混合物，以及使混合物生长到预定的细胞浓度以产生混合培养物，以及任选地包装混合培养物的全部或一部分。该方法可包括重复方法步骤一次或多次。该方法可包括使孵育混合物的细胞生长到特定浓度以形成各个混合培养物。该方法可包括制备一个或多个混合培养物以及f)将各个混合培养物组合形成混合培养物。该方法可包括使混合培养物生长到特定浓度；以及包装混合培养物的全部或一部分。该方法可包括使混合培养物生长形成孵 育混合培养物以及测量孵育混合培养物的特征。该方法可包括测量孵育混合培养物的特征的步骤，包括：测量一种或多种选定微生物被一种或多种其他选定微生物的捕食，测量因子、pH变化或由一种或多种选定微生物分泌的胞外酶及其对一种或多种其他选定微生物的影响，测量混合物中一种或多种选定微生物的每毫升细胞数，测定一种或多种选定微生物的生长速率，或测量值的组合。该方法可包括使用孵育混合培养物的测得特征确定是否要将一种或多种微生物从孵育混合培养物中移除或是否要将一种或多种微生物加入孵育混合培养物，或是否不对微生物作出变化。该方法可包括当要将一种或多种微生物从孵育混合培养物中移除时的步骤，该方法还包括杀灭孵育混合培养物；以及重复步骤以制备不含不需要的一种或多种微生物的新孵育混合物。该方法可包括重复方法步骤一次或多次。该方法可包括其中当要将一种或多种微生物加入孵育混合培养物时的步骤，该方法还包括将一种或多种分离的微生物加入孵育混合培养物，以及使孵育混合培养物生长到预定的细胞浓度以产生混合培养物，以及任选地包装混合培养物的全部或一部分。
实施例
实施例1-制备微生物组合物的方法
将诸如细菌或酵母的微生物基于其酶活性谱、其在培养基中的生长能力、其不形成孢子或本文所述的其他标准而选择包含在组合物中。使微生物在该微生物的标准培养基中生长，当达到指数生长期时进行等分和保存。用于使诸如酵母和细菌的微生物生长的培养基是本领域技术人员已知的。
例如，在制备I-M Lab中，将IN-LH1、IN-BS1和酪蛋白乳杆菌每一者的等分试样（5mL浓度为1×106的细胞）加到适合乳杆菌和芽孢杆菌生长的培养基中，诸如水700ml、糖蜜37.5g、膨润土3.75g、海盐3.75g、水720ml。使细菌生长到OD0.752。
在制备I-M PNSB中，将IN-RP1的等分试样（5mL浓度为1×106 的细胞）加到适合光养细菌的培养基中。例如，将水134ml、鱼乳液9ml、IN-SC1培养物(1×106)1ml，体积用水调节到144ml，并使细胞生长到OD0.856。
在制备I-M酵母中，将IN-SC1和米曲霉(OD0.3)(South River Miso Company,Conway,Massachusetts,USA)的等分试样（5mL浓度为1×106的细胞）加到适合酵母的培养基中，诸如水390ml、糖蜜1g、鱼乳液29g、海草灰9g、麦芽精1g。
将体积用水调节到432ml。鱼乳液（市售有机土壤改良剂，得自Nutrivert,Dunham,Quebec，未巴氏灭菌），并使细菌生长到OD0.574。
为了制备诸如含微生物的组合物的组合物，诸如以ATCC保藏号 PTA-12383保藏的IN-M1，使用了混合培养物：三种微生物组分混合培养物。将I-M Lab、I-M PNSB和I-M酵母加到如下所示的含水、糖蜜、矿物粉、海盐和麦麸的培养基中。将三种微生物组分混合物按下表所示的百分比加入。种菌培养物（初始混合培养物）包含IN-RP1、IN-BS1、IN-SC1、米曲霉、IN-LH1和酪蛋白乳杆菌并在无菌条件下制备。
将糖蜜、海盐、麦麸和矿物粉溶于一些温水中并将温度保持在45-50℃。将I-MLAB、I-M PNSB和I-M酵母一起加入单独的容器中并共混。总体积为50L，其中20L为I-M LAB、20L为I-M PNSB以及10L为I-M酵母（包含这三种微生物组合物的组合物可在本文称为种菌培养物）。将该种菌培养物加入培养基主槽中，将水加入达到110L，在轻轻搅拌下将温度保持在37℃，直到pH为pH4.0及以下。
制备第二发酵培养物（混合培养物）以产生每升含有大约十亿个微生物（1×106个细胞/mL）的稳定浓缩培养物（混合培养物）。浓缩组合物可具有3年或以上的储藏期限。将典型的1000升批量的第二发酵培养物用50升种菌培养物（如上所述—20L为I-M LAB、20L为I-M PNSB以及10L为I-M酵母）接种，培养基为50-200升无硫农业糖蜜、3.75升麦麸（以体积计0.02-0.05%）、3.75升海草灰（以体积计0.02-0.05%）、3.75升膨润土（以体积计0.02-0.05%）、1.25升鱼乳液（市售有机土壤改良剂，得自Nutrivert,Dunham,Quebec，未巴氏灭菌）、1.25升大豆粉（以体积计0.005-0.03%）、675mg市售海盐和达到1000L的足够非氯化温水。
接种后5天时pH降至约3.7，使培养物生长，每天轻轻搅拌一次并监测pH。将培养物孵育6周，得到用于以下实施例的含微生物的组合物。将组合物装入瓶中并在室温下的避光密封容器中贮存在缺氧条件下。这种所得的组合物可称为浓缩组合物，细胞浓度为1×106个细胞/mL。
在一个可供选择的方法中，第二发酵培养物可包含一种多种品系的微生物，诸如购自商业实体的那些微生物，和/或从待处理的环境或待治理的场所或类似的环境或场所分离的内源微生物或微生物群落，并可包含存在于受沾污或污染的场所的一种或多种沾污物或污染物。所谓相似的场所是，指该相似的场所具有与存在于待处理、治理或需要向其施加或提供本发明组合物的场所中的污染物相同的污染物或与其化学或物理相似的污染物。
实施例2-组合物的用途以及控制和减少池塘污泥的方法
在第1天，将50升（5×106个细胞/ml）本发明的组合物（其为80升水加10升糖蜜和实施例1浓缩组合物的10L等分试样的封闭容器中诱导生长的结果）以大约100:1-1:10000的稀释度倒入池塘中，并通过泵每天循环和通气三小时。在第14天，将第二个50升的上述组合物加到池塘中，并如之前所述使水体循环和通气。在第25天，浮萍开始相继死去，并可从池塘的表面通过软管移到水沟中。沉淀物的气味也消失。在第30天，对池塘清除藻类和浮萍。第30天后，治理过程继续以改善水质化学，从而降低磷酸盐和氮水平。此外，水清澈度改善，不存在气味，并且有机污泥继续在被微生物消化时浮到池塘表面并可容易地去除。
实施例3-含微生物的组合物的用途和控制浅水池污泥导致的气味的方法
将两个互连的浅水池用实施例1的浓缩组合物接种。在上游水池中，将浓缩的第二发酵产物在水中按1:100稀释，并将15升喷到水池的表面和边缘。未使用通气。在下游水池中，将10升喷到水池表面和水池边缘，并且同样未使用通气。在相邻的化粪池渗流场，将实施例1的5升浓缩组合物喷到渗流场中和周围的地上和草上，在一个小时内，气味平息并持续得到控制。根据需要进一步喷洒渗流场，并且在接下来的数周中，水池中的水澄清。
实施例4-组合物的用途和控制池塘污泥导致的气味的方法
将实施例1的浓缩（1×106个细胞/mL）第二发酵组合物在水中按1:100稀释，并将30升喷到池塘的表面和边缘。未使用通气。在第14天，将待处理的池塘中的30升池水与30ml在环境温度下孵育5天的实施例1的浓缩第二发酵组合物共混，然后喷到池塘的池塘表面和边缘。未使用通气，在初始接种的3小时内，气味平息并持续得到控制。气味的控制和水清澈度在处理后的整个夏季和秋季得以持续。
实施例5-组合物的用途和治理土壤的方法
将实施例1的浓缩（1×106个细胞/mL）组合物的变型形式（其中未将假单胞菌包含在原始组合物中）在水中按1:100稀释，并按每英 亩5加仑喷到高尔夫球场的开球区、绿地和球道上。向诸如开球区和绿地的敏感区域以及热点或褐斑用浓缩的第二发酵产物或按1:100在水中稀释的含微生物组合物的变型形式每周喷洒一次或两次。施加产品后七天，轻击区上的褐斑不再可见。
实施例6-组合物的用途和用于养殖动物的方法
向狗给予实施例1的浓缩（1×106个细胞/mL）组合物作为它们食物中的添加剂，每日两次，剂量为按食物重量计1%。实施例1的浓缩组合物的施用导致体臭减弱、肠胃气胀减轻、牙齿变白以及齿龈炎症状减轻，包括牙石减少以及牙龈红肿减轻。还作为淋浴/冲洗在外部向狗给予了实施例1的浓缩组合物，每周一次，剂量为按体积计3%。使用实施例1的浓缩组合物导致了改善的皮肤状况并控制了狗的皮毛散发的不良气味。
向猫给予实施例1的浓缩（1×106个细胞/mL）组合物作为它们食物中的添加剂，每日两次，剂量为按食物重量计1%。施用实施例1的浓缩组合物改善了口腔异味，并导致了更柔软更光亮的皮毛。
将室内家畜圈栏诸如畜棚、畜栏、垫木屑和木质颗粒喷洒实施例1的浓缩组合物，浓度为按体积计3%。在处理的第一周中，将圈栏每日喷洒两次实施例1的浓缩组合物。在处理的第二周中，将圈栏每日喷洒一次产品。之后，将圈栏每周喷洒一次实施例1的浓缩组合物。使用实施例1的浓缩组合物导致了圈栏中的气味减弱并改善了畜栏和其他环境的清洁状况。
将马每日一次给予50cc实施例1的浓缩（1×106个细胞/mL）组合物，稀释度为按甜菜浆中的重量计3%。使用实施例1的浓缩组合物导致了改善的皮毛，其在3至7天内变得更加光亮。此外，尿在使用2周内变得更清澈，并且粪肥降解得更快。另外，作为淋浴/冲洗在外部向马给予实施例1的组合物，剂量为按体积计3%。外部使用使黑色家蝇远离马匹，并且害怕喷洒标准或天然杀虫剂的马未表现出对使用产品的反应。
作为喷雾在外部给予鹦鹉实施例1的浓缩（1×106个细胞/mL）组 合物，剂量为按体积计1%稀释度。施用实施例1的浓缩组合物后，未从整羽中观察到不良反应。实施例1的浓缩组合物还用于喷洒鹦鹉的笼子。使用实施例1的组合物导致了笼子中的气味和灰尘减少。
实施例7-组合物的用途以及处理和保养居民化粪池***的方法
带有流速为1200升/天的居民化粪池***的家庭在将流出物泵送进渗流场时会开始出现气味窜回窜出住宅的问题。在检查时，注意到30cm的生物固体外壳漂浮在泄放槽中，并且在进出管中存在堵塞。在打破漂浮外壳后，添加250ml实施例1的浓缩（1×106个细胞/mL）组合物。另外，将简单的通气设备放入泄放槽中。注意到住宅中的气味立即减轻。16小时后，没有气味从泵或渗流场散发出来。此外，生物固体外壳被消化。为了结束***的处理，在8周后进行了500ml实施例1的浓缩组合物的进一步接种。
处理化粪池污泥的可供选择的方法可包括处理前的补料和生长活化；这可包括另外的糖蜜或另一碳源。
实施例8-对高尔夫球场草坪的土壤测试增加了磷酸盐含量
在高尔夫球场绿地上，将一半的绿地每周用IN-M1，登录号 PTA-12383（在无氯水中3.8×109个细胞/升）处理一次，持续5周，并包括在球场的标准草坪管理计划中。将绿地正常地用化学肥料和杀虫剂处理。对处理的一半（用Inocul-M处理）和未处理的一半进行了土壤分析。
在用含微生物的组合物，IN-M1，登录号PTA-12383处理后采集的测量值表明土壤中的磷酸盐增加。
实施例10-处理废弃物和除去大肠菌群
设计本研究以监测1×106个细胞/mL的IN-M1对来自城市市政废水处理厂的化粪池污泥大肠菌群污染的影响以及监测多种终点指标，包括大肠菌群、毒性化学和有机化合物。据发现，在7天的处理后，大肠菌群的存在显著减少（以cfu/100mL测量，即集落形成单位），从830万cfu变为100000cfu/100ml。整个处理期为22天。存在硝酸盐浓度的升高，表明生物固体作为土壤改良剂用于农业目的的营养价值升高。存在汞浓度降低的趋势和甲苯浓度的变化。
每立方米化粪池污泥的方案
将每立方米污泥对应0.1L浓缩物（例如1×106个细胞/mL的IN-M1）、+0.2L糖蜜+0.75L水组合在一起。让混合物在环境温度下静置48小时。将混合物与2-4%的化粪池污泥和水在大约2000升的水池或沉降槽中充分组合。就分离的高百分比化粪池污泥而言，样品应当非常彻底地混合，从而确保产品分布在各个地方，以避免可生长病原体的袋坑。将水池单独留置2-6周。
虽然不希望受任何特定理论所束缚，但在水混合物中，生物固体的量逐渐减少，并且据认为有益的微生物在水和沉淀物中定殖并溶解有机质；同时，益生元和信号肽刺激了土著菌群也分解了有机质。
在另一情况中，大肠菌群细菌繁殖因添加0.1L浓缩的IN-M1溶液而受到抑制，将每立方米污泥+0.2L糖蜜+0.75L水组合到一起，并让其在环境温度下发酵22天。组合物可包含螯合来自挥发性有机化合物(VOC)和空气两者的氮的物种，并将其转化成可溶形式。参见图4。
氨结合氮从第7天的58.6%降低到第22天的51.6%；硝酸盐结合水平从处理第7天时的超过6000倍增加到第22天时的大约260万倍。这可以是通过配方中氮固定微生物的作用将氮从挥发性形式（氨）转移到可溶形式（硝酸盐）和/或氮从空气螯合成可溶形式的证据。处理可增强氮向可用作土壤改良剂的可溶形式的快速转化。据认为，相对氮质量差异是由于发酵参数为缺氧的这一事实。参见图3A和B。对于汞和甲苯结果，参见图4和5。

Claims (59)

1.一种含微生物的组合物，包含：分离的微生物IN-M1，登录号PTA-12383的混合培养物，所述混合培养物由下列组成：酿酒酵母，IN-SC1，登录号PTA-12384；瑞士乳杆菌，IN-LH1，登录号PTA-12386；枯草芽孢杆菌，IN-BS1，登录号PTA-12385；沼泽红假单胞菌，IN-RP1，登录号PTA-12387；酪蛋白乳杆菌；和米曲霉。
2.根据权利要求1所述的组合物，所述组合物还包含产朊假丝酵母、乳酸链球菌、植物乳杆菌或菌根真菌，或它们的组合。
3.一种在某一场所进行生物治理的方法，包括：
a)向包含至少一种污染物的场所提供权利要求1或2所述的含微生物的组合物；
b)允许所述含微生物的组合物的微生物生长和繁殖一段时间；以及
c)减少所述场所的至少一种污染物的至少一部分。
4.根据权利要求3所述的方法，还包括d)在提供所述含微生物的组合物后预定的时间，测量所述场所的至少一种污染物的水平或量并将其与在提供所述含微生物的组合物前获得的所述场所的至少一种污染物的水平或量的测量值进行比较。
5.根据权利要求3所述的方法，还包括d)在提供所述含微生物的组合物后预定的时间，评估所述污染场所的状况的至少一种特征并将其与在提供所述含微生物的组合物前所述场所的状况的所述特征进行比较。
6.根据权利要求5所述的方法，其中评估所述场所的状况的至少一种特征包括测量所述场所的至少一种特征，其中特征包括所述场所的颜色、气味、清洁度、植物生长的量、微生物生长的量、动物生长的量、生物固体的量以及将所述特征测量值与在提供所述含微生物的组合物前获取的所述场所的状况的所述特征的测量值进行比较，以提供所述场所的状况变化的测量值。
7.根据权利要求3所述的方法，其中所述场所包括矿山、市政水***、受污染的场所、被沾污的场所、化粪池***、高尔夫球场、静水、湖泊、池塘、封闭的水体、活水、溪流、移动的水体、循环的封闭水体、垃圾填埋场渗出液、尾矿、工业废水或土壤、封闭的土体、从受污染的场所取出的封闭物料、水坝后方的水或土壤、农场或动物设施中的水或土壤、农场或植物设施中的水或土壤或垃圾处理厂的水或土壤。
8.权利要求3所述的方法，其中所述场所是垃圾填埋场、市政水和废物处理***、商业水和废物处理***、工业水和废物处理***，或私人水和废物处理***。
9.根据权利要求3所述的方法，还包括i)在向所述场所添加所述含微生物的组合物前，从所述场所获得样品并将所述样品的至少一部分添加到所述含微生物的组合物中以形成组合的含微生物的组合物，并允许所述组合的含微生物的组合物中的微生物生长和繁殖。
10.根据权利要求9所述的方法，还包括向所述场所提供权利要求9中所定义的组合的含微生物的组合物。
11.一种影响植物生长的方法，包括：
a)向植物生长的场所或容器、植物或特定生长阶段的植物或其组合提供权利要求1或2所述的含微生物的组合物；以及
b)允许所述含微生物的组合物的微生物生长和繁殖一段时间。
12.根据权利要求11所述的方法，其中提供包括将所述含微生物的组合物施加到植物的种子。
13.根据权利要求11所述的方法，其中提供包括将所述含微生物的组合物施加到植物的根部。
14.根据权利要求11所述的方法，其中提供包括将所述含微生物的组合物施加到植物的叶子和茎干。
15.根据权利要求11所述的方法，还包括c)增强种子发芽。
16.根据权利要求11所述的方法，还包括c)增强根部生产。
17.根据权利要求11所述的方法，还包括c)与未处理的植物相比增加经处理的植物的单株产量。
18.根据权利要求11所述的方法，还包括c)与未处理的植物相比增加经处理的植物的生物量。
19.根据权利要求11所述的方法，还包括c)与未处理的植物相比增加经处理的植物的果实生产。
20.根据权利要求11所述的方法，还包括c)与未处理的植物相比增加经处理的植物的生产周期。
21.根据权利要求11所述的方法，还包括c)与未处理的植物相比增加经处理的植物的生产生命周期。
22.根据权利要求11所述的方法，其中所述方法用于在水培条件下生长的植物。
23.根据权利要求11所述的方法，其中所述方法用于在温室中生长的植物。
24.根据权利要求11所述的方法，其中所述方法用于在田野或室外生长的植物。
25.根据权利要求11所述的方法，其中所述方法用于在气培条件或组合水培与气培条件下生长的植物。
26.根据权利要求11所述的方法，其中所述方法用于垂直耕种。
27.一种处理表面的方法，包括：
a)向表面提供权利要求1或2所述的含微生物的组合物；以及
b)允许所述含微生物的组合物的微生物生长和繁殖一段时间。
28.根据权利要求27所述的方法，其中所述微生物与原来存在的或随着时间的推移从环境中添加的内生细菌竞争至少一种包括物理空间、营养物、水、氧或光或化学能源或它们的组合的环境因素，或者其中所述含微生物的组合物的所述微生物捕食并移除原来存在于所述表面上的微生物。
29.根据权利要求27所述的方法，其中所述含微生物的组合物降低原来存在的微生物的数量。
30.一种处理流体的方法，包括：
a)向流体提供权利要求1或2所述的含微生物的组合物；以及
b)允许所述含微生物的组合物的微生物生长和繁殖一段时间。
31.根据权利要求30所述的方法，其中所述微生物与原来存在的或随着时间的推移从环境中添加的内生细菌竞争至少一种包括物理空间、营养物、水、氧或光或化学能源或它们的组合的环境因素，或者其中所述含微生物的组合物的所述微生物捕食并移除原来存在于所述流体中的微生物。
32.根据权利要求30所述的方法，其中所述含微生物的组合物降低所述流体中大肠菌群的数量。
33.一种制备包含含微生物的组合物的制品的方法，包括：
a)向制品的表面添加权利要求1或2所述的含微生物的组合物。
34.根据权利要求33所述的方法，其中对所述含微生物的组合物和表面进行干燥以将所述含微生物的组合物附着到所述表面。
35.根据权利要求33所述的方法，还包括处理所述表面以有助于附着所述含微生物的组合物。
36.根据权利要求33所述的方法，还包括对所述含微生物的组合物添加一种或多种组分以有助于其附着到所述表面。
37.根据权利要求33所述的方法，还包括向所述含微生物的组合物和所述表面两者添加一种或多种组分以有助于所述含微生物的组合物附着到所述表面。
38.根据权利要求33所述的方法，其中所述表面为玻璃珠、惰性材料、织造材料、非织造材料或天然材料。
39.根据权利要求33所述的方法，其中所述表面为植物材料、椰垫、二氧化硅珠、聚合物材料、容器、过滤器结构、多孔惰性粒子或沸石。
40.根据权利要求39所述的方法，其中所述容器为植物容器。
41.一种通过权利要求33所述的方法制备的制品。
42.一种制备食品补充剂的方法，包括：使含微生物的组合物生长到特定的细胞浓度，其中所述含微生物的组合物包含权利要求1或2所述的含微生物的组合物，以及从所述微生物或培养基中分离因子，其中所述因子用作食品补充剂。
43.一种用于食品补充的方法，包括向动物食物添加含微生物的组合物，所述含微生物的组合物包含权利要求1或2所述的含微生物的组合物。
44.一种制备权利要求1或2中所定义的混合培养物的方法，包括：
a)测量多种类型或物种的微生物的一种或多种酶活性以形成各微生物的酶谱，其中酶谱包括一种或多种酶和所述一种或多种酶针对特定底物的活性水平；
b)选择a)中的两种或更多种微生物，其中各选定微生物的酶谱不同于另一微生物的酶谱，使得所述谱的至少一种酶和/或所述酶的至少一种酶活性只见于所述混合培养物中的一种微生物；
c)使所述选定的微生物在培养基中生长形成孵育混合物。
45.根据权利要求44所述的方法，还包括d)测量所述孵育混合物的特征。
46.根据权利要求45所述的方法，其中测量所述孵育混合物的特征包括测量一种或多种选定微生物被一种或多种其他选定微生物的捕食、测量由一种或多种微生物释放或产生的因子或蛋白、pH变化、或由一种或多种选定微生物分泌的胞外酶及其对一种或多种其他选定微生物的影响、测量所述混合物中一种或多种选定微生物的每毫升细胞数、测定一种或多种选定微生物的生长速率，或特征和测量值的组合。
47.根据权利要求45所述的方法，还包括e1)使用所述孵育混合物的测得特征确定是否要将一种或多种微生物从所述孵育混合物中移除或是否要将一种或多种微生物加入所述孵育混合物。
48.根据权利要求47所述的方法，其中当要将一种或多种微生物从所述孵育混合物中移除时，所述方法还包括f1)杀灭c)的所述孵育混合物；以及g1)重复a)至c)的步骤以制备新孵育混合物。
49.根据权利要求47所述的方法，其中当要将一种或多种微生物加入所述孵育混合物时，所述方法还包括将一种或多种分离的微生物加入所述孵育混合物，以及使所述混合物生长到预定的细胞浓度以产生混合培养物，以及任选地包装所述混合培养物的全部或一部分。
50.根据权利要求48所述的方法，其中将杀灭和重复步骤a)至c)的步骤重复一次或多次。
51.根据权利要求44所述的方法，还包括d)使所述孵育混合物生长到特定细胞浓度以形成各个混合培养物。
52.根据权利要求51所述的方法，还包括e)制备一个或多个混合培养物以及f)将各个混合培养物组合形成混合培养物。
53.根据权利要求52所述的方法，还包括f)使所述混合培养物生长到特定浓度；以及g)包装所述混合培养物的全部或一部分。
54.根据权利要求53所述的方法，其中f)还包括i)使所述混合培养物生长形成孵育混合培养物以及测量所述孵育混合培养物的特征。
55.根据权利要求54所述的方法，其中测量所述孵育混合培养物的特征包括测量一种或多种选定微生物被一种或多种其他选定微生物的捕食、测量因子、pH变化或由一种或多种选定微生物分泌的胞外酶及其对一种或多种其他选定微生物的影响、测量所述混合物中一种或多种选定微生物的每毫升细胞数、测定一种或多种选定微生物的生长速率，或测量值的组合。
56.根据权利要求54所述的方法，还包括ii)使用所述孵育混合培养物的测得特征确定是否要将一种或多种微生物从所述孵育混合培养物中移除或是否要将一种或多种微生物加入所述孵育混合培养物，或是否不对微生物作出变化。
57.根据权利要求56所述的方法，其中当要将一种或多种微生物从所述孵育混合培养物中移除时，所述方法还包括iii)杀灭权利要求54的所述孵育混合培养物；以及iv)重复至少权利要求52、53、54和55的步骤，以制备包含权利要求56中所确定的至少一种微生物的新孵育混合物。
58.根据权利要求57所述的方法，其中将杀灭以及重复至少权利要求52、53、54和55的步骤重复一次或多次。
59.根据权利要求56所述的方法，其中当要将一种或多种微生物加入所述孵育混合培养物时，所述方法还包括将一种或多种分离的微生物加入所述孵育混合培养物，以及使所述孵育混合培养物生长到预定的细胞浓度以产生混合培养物，以及任选地包装所述混合培养物的全部或一部分。
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