CN102994425A - 一种基因重组大肠杆菌及其高效生产普鲁兰酶的方法 - Google Patents

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CN102994425A CN2012104817493A CN201210481749A CN102994425A CN 102994425 A CN102994425 A CN 102994425A CN 2012104817493 A CN2012104817493 A CN 2012104817493A CN 201210481749 A CN201210481749 A CN 201210481749A CN 102994425 A CN102994425 A CN 102994425A
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聂尧
徐岩
严伟
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Jiangnan University
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Jiangnan University
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Abstract

一种基因重组大肠杆菌及其高效生产普鲁兰酶的方法,属于微生物发酵技术领域。本发明将质粒pET20b(+)的信号肽PelB与长野芽孢杆菌(Bacillusnaganoensis)CCTCC NO:M2012388普鲁兰酶基因pul连接,并共同***表达载体pET28a(+)中,构建带有信号肽和目的基因的重组菌株E.coliBL21(DE3)/pET28a(+)-PelB-pul。将自诱导培养和添加甘氨酸调控细胞透性的策略用于胞外普鲁兰酶的发酵生产,采用乳糖浓度10g/L的自诱导培养基,于37℃、200rpm震荡培养约2h后,添加终浓度6g/L的甘氨酸并转入20℃下培养70h,胞外普鲁兰酶酶活达505U/mL,比野生菌出发菌株的酶活力提高1260倍。本发明的应用具有重要意义。

Description

一种基因重组大肠杆菌及其高效生产普鲁兰酶的方法
技术领域
一种基因重组大肠杆菌及其高效生产普鲁兰酶的方法,属于微生物发酵生产普鲁兰酶的技术领域。
背景技术
普鲁兰酶(pullulanase, EC.3.2.1.41)是一类可以特异性水解普鲁兰、支链淀粉及其极限糊精中的α-1,6-糖苷键的脱支酶。在淀粉糖化过程中,普鲁兰酶与糖化酶共同作用,普鲁兰酶切割支链淀粉分支点,糖化酶只需切割线性的低聚糖,即可显著地提高淀粉的水解效率。使用普鲁兰酶不仅可降低糖化酶用量,还可使DE值提高到97%以上,提高水解产物葡萄糖或麦芽糖的质量和纯度。
目前已发现多种产普鲁兰酶的微生物,但大部分都无法应用于工业生产,主要原因有:(1)酶的耐热耐酸性差,淀粉的糖化过程在55℃-60℃、pH 4.5-5.0的范围内进行,而大多数种类的普鲁兰酶在此范围内活性很低;(2)酶活水平低,很多普鲁兰酶产生菌胞外分泌普鲁兰酶的能力不强,分泌的普鲁兰酶又容易遭到蛋白酶的降解,因此难以进行工业化生产。目前,普鲁兰酶的工业化生产菌株极少,只有诺维信公司和杰能科公司有能力工业化生产并销售此酶。诺维信公司的普鲁兰酶产品占领了中国乃至世界95%以上的市场份额,其价格相当昂贵。我国关于普鲁兰酶的研究主要集中在产普鲁兰酶菌株的筛选和优化等方面,效果均不太理想。随着基因工程技术的发展,利用基因工程技术改造菌种,进一步提高酶的产量及活性,降低生产成本成为可能,并在世界范围内越来越得到重视。近几年,我国学者利用基因工程技术构建基因工程菌株,取得了一定的效果。例如,2006年,夏子芳用大肠杆菌表达***表达海栖热胞菌普鲁兰酶基因,得到少量酶活;2008年,张明焱在大肠杆菌表达***中表达Bacillus licheniforms的普鲁兰酶编码基因,获得5.6 U/mL酶活;2010年,王淑军等从深海古菌Thermococcus siculi HJ21中PCR扩增出一种新的普鲁兰酶基因,并在大肠杆菌中得到表达,但酶活较低。综上所述,在普鲁兰酶的微生物发酵生产过程中,不论是野生菌还是工程菌,主要存在的问题就是胞外酶活较低,造成了普鲁兰酶的生产成本上升,形成工业化生产的障碍。
本发明利用基因工程表达调控技术,构建了适用于普鲁兰酶表达分泌的基因工程菌株,在自诱导培养基中实现过量表达普鲁兰酶,并通过添加甘氨酸改变细胞通透性而进一步提高胞外普鲁兰酶的产量,为工业化生产奠定了基础。
发明内容
(1)要解决的技术问题
本发明的目的是提供基因重组大肠杆菌及其高效生产普鲁兰酶的方法。本发明目的不仅仅在于通过微生物菌株发酵生产胞外普鲁兰酶,而是通过构建适合的大肠杆菌表达***将具有优良的耐酸耐热性能的长野芽孢杆菌普鲁兰酶基因在大肠杆菌中获得高效重组表达,而且利用自诱导培养基并通过添加甘氨酸调控细胞透性的策略进一步提高重组大肠杆菌生产胞外普鲁兰酶的能力和产量,从而开发新型重组普鲁兰酶的生产工艺和应用价值。
(2)技术方案
本发明首先构建表达长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388普鲁兰酶基因的重组大肠杆菌,将来源于长野芽孢杆菌的普鲁兰酶基因在大肠杆菌中进行重组表达,在此基础上,将重组大肠杆菌在自诱导培养基中发酵培养以高效表达普鲁兰酶,并通过添加甘氨酸获得胞外普鲁兰酶的高效生产。
一种长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)LBMAE-1,已保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号CCTCC NO:M 2012388;
来源于CCTCC NO:M 2012388菌株的普鲁兰酶基因pul,其核苷酸序列为SEQ ID NO: 1,其氨基酸序列为SEQ ID NO: 2。
用CCTCC NO:M 2012388菌株构建重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul的方法,将来源于CCTCC NO:M 2012388菌株的普鲁兰酶基因pul在大肠杆菌中进行重组表达;步骤为:
一、普鲁兰酶基因pul的获得
CCTCC NO:M 2012388培养基:CaCl2 0.25 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,
(NH42SO4 0.2 g/L,酵母提取物 2 g/L,无水葡萄糖 5 g/L,KH2PO4 3 g/L,无机盐溶液1 mL/L,用双蒸水配制,pH 5.0。无机盐溶液:ZnSO4·7H2O 0.1 g/L,MnCl2·H2O 0.03 g/L,H3BO3 0.3 g/L,CoCl2·6H2O 0.2 g/L,CuCl2·2H2O 0.01 g/L,NiCl2·6H2O 0.02 g/L,Na2MoO4·2H2O 0.03 g/L。
将CCTCC NO:M 2012388菌种接种于含有25 mL培养基的250 mL摇瓶中,于37℃、200 rpm振荡培养72 h。培养结束后,将菌体离心并用生理盐水洗涤两次,收集细胞利用基因组DNA提取试剂盒Genomic DNA Extraction Miniprep System(VIOGENE公司)提取基因组DNA。
合成引物1:5’- gaacaGGATCCagatgggaacaccacaaaC -3’,
合成引物2:5’- attccctcgagtttaccatcagatgggct -3’。
引物1含有BamHI限制性酶切位点,引物2含有XhoI限制性酶切位点。
PCR反应体系:ddH2O 37 μL,10×Reaction Buffer 5 μL,dNTP(25 mmol/L)0.5 μL,引物1(50 pmol/μL)1 μL,引物2(50 pmol/μL) 1 μL,基因组DNA 5 μL,Taq DNA polymerase(5 U/μL)0.5 μL。
以CCTCC NO:M 2012388基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增普鲁兰酶基因。PCR反应过程:95℃预变性5 min;95℃ 1 min、60℃ 0.5 min、72℃ 2 min,进行30个循环;72℃延伸10 min。
利用3S Spin Agarose Gel DNA Purification Kit(上海申能***生物科技有限公司)纯化DNA片断。
DNA溶液中加入1/10体积的乙酸钠溶液(3 mol/L,pH 5.2)和2倍体积无水乙醇,-20℃沉淀1h。12000 rpm于4℃离心30 min。加入75%乙醇500 μL洗涤,12000 rpm于4℃离心30 min,无菌操作台吹干后溶于适量TE缓冲液中,所得普鲁兰酶基因pul立即使用或-20℃保存。
二、含有普鲁兰酶基因pul的重组大肠杆菌的构建
目的基因pul及质粒pET20b(+)的酶切
利用质粒提取试剂盒Mini-Plasmid Rapid Isolation Kit(北京博大泰克生物基因技术有限公司)提取质粒pET20b(+)。
按照水、缓冲液、PCR产物或质粒DNA、酶的顺序加到Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机内离心2s使液体集中于管底,37℃水浴3h,在管中加入1/10的Loading Buffer或将管置于65℃保温10min,终止酶切反应。酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析并切胶回收目的片段,浓缩。
反应体系组成:10×H Buffer 4 μL,基因组DNA 10 μL,BamHI 2 μL,XhoI 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL。
目的基因pul与质粒pET20b(+)的连接
将目的基因pul与质粒pET20b(+)连接,反应体系组成如下:质粒pET20b(+) 0.8 μL,目的基因pul4.2 μL,Ligation Solution 5 μL。混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接反应12小时,得重组质粒pET20b(+)-pul
重组质粒pET20b(+)-pul转化大肠杆菌
在100 μL大肠杆菌E. coli BL21(DE3)感受态细胞悬液中加入10 μL重组质粒pET20b(+)-pul,轻轻混匀,冰浴中静置30分钟。转入42℃水浴中,热击90s。快速转移至冰浴中,冷却2min。加入700 μL的LB液体培养基,37℃、100 rpm摇床温育培养1h。培养后菌液3000 rpm离心2min,弃上清600 μL,剩余菌液混匀后涂布到含有50 μg/mL 氨苄抗生素的LB平板上,37℃倒置培养。获得含有目的普鲁兰酶基因pul的重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET20b(+)-pul
带有信号肽PelB的目的基因与质粒pET28a(+)的连接
将重组质粒pET20b(+)-pul及表达载体pET28a(+)分别用限制性内切酶XbaI及XhoI分步单酶切。按照水、缓冲液、重组质粒pET20b(+)-pul或表达载体pET28a(+)、酶的顺序加到Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机内离心2s使液体集中于管底,37℃水浴3h,在管中加入1/10的Loading Buffer或将管置于65℃保温10min,终止酶切反应。酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析并切胶回收目的片段,浓缩。反应体系组成:10×H Buffer 4 μL,pET20b(+)-pul或pET28a(+) 10 μL,XbaI 2 μL,XhoI 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL。
将胶回收线性化的目标片段PelB-pul与pET28a(+)载体连接,反应体系组成如下:载体pET28a(+) 1 μL,目标片段PelB-pul4 μL,Ligation Solution 5 μL。混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接反应12小时,得重组质粒pET28a(+)-PelB-pul
重组质粒pET28a(+)-PelB-pul转化大肠杆菌
在100 μL大肠杆菌E. coli BL21(DE3)感受态细胞悬液中加入10 μL pET28a(+)-PelB-pul,轻轻混匀,冰浴中静置30min。转入42℃水浴中,热击90s。快速转移至冰浴中,冷却2min。加入700 μL的LB液体培养基,37℃、100 rpm摇床温育培养1h。培养后菌液3000 rpm离心2min,弃上清600 μL,剩余菌液混匀后涂布到含有50 μg/mL 卡那霉素的LB平板上,37℃倒置培养。获得含有目的普鲁兰酶基因pul的重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul
三、重组大肠杆菌的培养和胞外普鲁兰酶的生产
自诱导培养
自诱导培养基(g/L):β-乳糖 1~50,无水葡萄糖0.5,甘油5,KH2PO6.8,MgSO0.24,胰蛋白胨10,酵母提取物5,Na2HPO7.1,Na2SO0.71,NH4Cl 2.67,痕量元素溶液 400 μL/L,pH 7.5~8.0。
痕量元素溶液(g/L):FeCl3 8.125,CaCl2 2.22,MnCl2 2.52,ZnSO4 1.61,CoCl2 0.26,CuCl2 0.27,NiCl2 0.26,Na2MoO4 0.41,Na2SeO3 0.346,H3BO3 0.124,HCl 2.19。
将重组菌E.coliBL21(DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul于含有50 μg/mL卡那霉素的LB固体培养基上过夜活化培养,从固体平板上挑取单个菌落接种于3 mL含有50 μg/mL卡那霉素的液体LB培养基中于37℃、200 rpm振荡培养,随时监测培养基中OD600的变化情况,待OD600达到2~3时,按5%~10%接种量接种于50 mL含50 μg/mL卡那霉素的自诱导培养基中,于10~40℃、200rpm震荡培养2~20h后,添加终浓度1~25 g/L的甘氨酸,温度转为10~40℃培养60~70h。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10min后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定。
分别考察了诱导温度、甘氨酸使用浓度、37℃下培养时间和乳糖浓度的影响,最终确定了自诱导条件为:自诱导培养基中乳糖浓度为10 g/L,在37℃下培养2h后,添加终浓度6 g/L的甘氨酸并转入20℃下培养70h。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10min后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定。
采用优化的自诱导培养基和发酵产酶条件后,胞外普鲁兰酶酶活可达到505 U/mL。
普鲁兰酶测定方法
取100 μL用100 mM、pH 5.0的醋酸缓冲液适当稀释的酶液与等体积的溶于100 mM、pH 5.0醋酸缓冲液中的10 g/L 普鲁兰相混合于50 ℃水浴中保温30min。加入DNS试剂300 μL摇匀,置于沸水中煮沸15min,取出以流动水迅速冷却后,于540 nm波长处,以0.5 cm比色杯,测定反应液的吸光度值。
酶活单位定义:在上述指定的条件下,每min催化分解普鲁兰多糖生成相当于1 μmol葡萄糖的还原糖所需的酶为1个酶活单位(U)。
(3)有益效果
成功克隆了长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC NO:M 2012388普鲁兰酶编码基因,该基因全长2781 bp,编码926个氨基酸残基,其基因的核苷酸序列为:SEQ ID NO:1,其氨基酸组成为SEQ ID NO:2。
将质粒pET20b(+)的信号肽PelB与长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC NO:M 2012388普鲁兰酶编码基因pul连结,并共同***表达载体pET28a(+)中,转化入相应表达宿主E. coli BL21(DE3)中成功构建带有信号肽和目的基因pul的重组菌株E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul
将自诱导培养基和添加甘氨酸调控细胞透性的策略用于重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul的培养和普鲁兰酶的发酵产酶,优化自诱导培养基和发酵产酶条件后,胞外普鲁兰酶酶活可以达到505 U/mL,比长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388出发菌株的酶活力(0.4 U/mL)提高1260倍。这些工作为重组大肠杆菌高效生产胞外普鲁兰酶提供了有效策略,对于开发新型重组胞外普鲁兰酶的生产工艺和应用价值具有重要意义。
生物材料样品保藏:长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)LBMAE-1已进行保藏,保藏单位:中国典型培养物保藏中心,简写CCTCC,地址:中国武汉武汉大学,保藏编号CCTCC NO:M 2012388,保藏日期为2012年9月28日。
具体实施方式
实施例1 
LB培养基:胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物5 g/L,NaCl 10 g/L,pH7.0。需要时使用前加入卡那霉素(50 μg/mL),固体培养基添加15 g/L琼脂粉。
挑取重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul阳性克隆单菌落接种于3 mL含50 μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,于37℃,200 rpm振荡培养过夜。取1 mL培养液转接于50 mL含50 μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养至OD600约为0.6。向培养物中加入诱导物IPTG至终浓度0.8 mmol/L,在培养温度30℃下进行诱导培养12h。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10min后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定。利用LB培养基和IPTG诱导方式,获得胞外重组普鲁兰酶活力为8 U/mL。
实施例2
LB培养基:胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物5 g/L,NaCl 10 g/L,pH7.0。需要时使用前加入卡那霉素(50 μg/mL),固体培养基添加15 g/L琼脂粉。
挑取重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul阳性克隆单菌落接种于3 mL含50 μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,于37℃,200 rpm振荡培养过夜。取1 mL培养液转接于50 mL含50 μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养至OD600约为0.6。向培养物中加入诱导物IPTG至终浓度0.4 mmol/L,在培养温度30℃下进行诱导培养12h。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10min后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定。利用LB培养基和IPTG诱导方式,获得胞外重组普鲁兰酶活力为11 U/mL。
实施例3
自诱导培养基(g/L):β-乳糖 10,无水葡萄糖0.5,甘油5,KH2PO6.8,MgSO0.24,胰蛋白胨10,酵母提取物5,Na2HPO7.1,Na2SO0.71,NH4Cl 2.67,痕量元素溶液 400 μL /L,pH 7.5~8.0。痕量元素溶液(g/L):FeCl3 8.125,CaCl2 2.22,MnCl2 2.52,ZnSO4 1.61,CoCl2 0.26,CuCl2 0.27,NiCl2 0.26,Na2MoO4 0.41,Na2SeO3 0.346,H3BO3 0.124,HCl 2.19。
重组菌E.coliBL21(DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul菌液接种于50 mL含50mg/L卡那霉素的自诱导培养基中,于37℃、200rpm震荡培养3小时后,添加终浓度6 g/L的甘氨酸,温度转为20℃培养60小时。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定。采用自诱导培养基和优化的发酵产酶条件后,胞外普鲁兰酶酶活可达到306.5 U/mL。
实施例4
自诱导培养基(g/L):β-乳糖 10,无水葡萄糖0.5,甘油5,KH2PO6.8,MgSO0.24,胰蛋白胨10,酵母提取物5,Na2HPO7.1,Na2SO0.71,NH4Cl 2.67,痕量元素溶液 400 μL/L,pH 7.5~8.0。痕量元素溶液(g/L):FeCl3 8.125,CaCl2 2.22,MnCl2 2.52,ZnSO4 1.61,CoCl2 0.26,CuCl2 0.27,NiCl2 0.26,Na2MoO4 0.41,Na2SeO3 0.346,H3BO3 0.124,HCl 2.19。
重组菌E.coliBL21(DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul菌液接种于50 mL含50mg/L卡那霉素的自诱导培养基中,于37℃、200rpm震荡培养2h后,添加终浓度6 g/L的甘氨酸,温度转为20℃培养60h。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定。采用自诱导培养基和优化的发酵产酶条件后,胞外普鲁兰酶酶活可达到440.7 U/mL。
实施例5
自诱导培养基(g/L):β-乳糖 10,无水葡萄糖0.5,甘油5,KH2PO6.8,MgSO0.24,胰蛋白胨10,酵母提取物5,Na2HPO7.1,Na2SO0.71,NH4Cl 2.67,痕量元素溶液 400 μL/L,pH 7.5~8.0。痕量元素溶液(g/L):FeCl3 8.125,CaCl2 2.22,MnCl2 2.52,ZnSO4 1.61,CoCl2 0.26,CuCl2 0.27,NiCl2 0.26,Na2MoO4 0.41,Na2SeO3 0.346,H3BO3 0.124,HCl 2.19。
重组菌E.coliBL21(DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul菌液接种于50 mL含50mg/L卡那霉素的自诱导培养基中,于37℃、200rpm震荡培养3h后,添加终浓度6 g/L的甘氨酸,温度转为20℃培养70h。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定。采用自诱导培养基和优化的发酵产酶条件后,胞外普鲁兰酶酶活可达到405.2 U/mL。
实施例6
自诱导培养基(g/L):β-乳糖 10,无水葡萄糖0.5,甘油5,KH2PO6.8,MgSO0.24,胰蛋白胨10,酵母提取物5,Na2HPO7.1,Na2SO0.71,NH4Cl 2.67,痕量元素溶液 400 μL/L,pH 7.5~8.0。痕量元素溶液(g/L):FeCl3 8.125,CaCl2 2.22,MnCl2 2.52,ZnSO4 1.61,CoCl2 0.26,CuCl2 0.27,NiCl2 0.26,Na2MoO4 0.41,Na2SeO3 0.346,H3BO3 0.124,HCl 2.19。
重组菌E.coliBL21(DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul菌液接种于50 mL含50mg/L卡那霉素的自诱导培养基中,于37℃、200rpm震荡培养2h后,添加终浓度6 g/L的甘氨酸,温度转为20℃培养70h。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定。采用自诱导培养基和优化的发酵产酶条件后,胞外普鲁兰酶酶活可达到505 U/mL。
<210> SEQ ID NO: 1
<211> 2781
<212> DNA
<213> 长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC NO:M 2012388
 
<214>
gatgggaaca ccacaaacat cgtagtccat tattttcgtc ctagtgggga ttatacggat     60
tggaatcttt ggatgtggcc ggagaacggt gatggggctg agtatgattt taatcaaccg    120
actgattctt atggggaggt tgcaagtgtg gacattcctg gaaacccaag tcaagtaggg    180
attattgtcc gtaaaggaaa ttgggatgcg aaagacattg atagtgaccg ctacatcgat    240
ttaagcaaag ggcatgagat ttggctcgtc caaggaaaca gccagatttt ctatagtgaa    300
aaggatgctg aggcagccgc acaacctgct gtaagtaacg cttatttaga tgcttccaac    360
caagtgttgg tcaagcttag ccagccgttt actcttggtg aaggttcaag cggttttacg    420
gttcatgatg acacagcaaa taaggatatt ccagttacat ctgttagtga tgccaatcag    480
gtaacggctg ttttagcagg tactttccag catatttttg gggggagtga ttgggcaccg    540
gataatcaca atactttact aaaaaaggtg aatagcaatc tctatcaatt ttcaggaaat    600
cttcctgaag gaaactacca atataaagtg gctttaaatg atagctggaa taatccgagc    660
tacccatctg ataacattaa tttgacagtg ccagctggtg gtgcccatgt tacattttct    720
tatatcccat ccacccatgc tgtttatgac acgattaaca atcctaatgc ggatttacaa    780
gtagatagca gcggtgttaa gacggatctc gtggcggtta ctcttggaga aaatcctgat    840
gtaagccata ccctgtccat tcaaacagag gactatcagg caggacaggt catacctcgt    900
aaggtgcttg attcatccca gtactactat tccggagatg atctcgggaa tacctataca    960
aagaatgcaa ctacctttaa ggtctgggcg cctacatcca ctcaagtaaa tgtccttctt   1020
tataatagtg caaccggcgc ggtaactaaa acggttccaa tgaccgcatc aggccatggt   1080
gtatgggaag caacagtcaa ccaagacctt gaaaattggt attacatgta tgaggtaaca   1140
ggacaaggct caacccgaac ggctgttgat ccgtatgcaa cagctattgc accaaacgga   1200
acgagaggca tgattgtgga cctagccaaa acagacccgg ccggatggga gagtgacaaa   1260
catattacgc caaagaatat agaagatgaa gtcatctatg aaatggatgt tcgtgacttt   1320
tccatcgact ctaattcggg tatgaaaaat aaaggaaagt atttggcact tacagaaaaa   1380
ggaactaaag gccctgacaa tgtaaagaca ggggtagatt ccttaaaaca acttgggatt   1440
actcatgttc agcttcagcc tgttttcgca tttaatagtg tcaatgaaaa cgatccaact   1500
caatataatt ggggttatga ccctcgcaac tacaatgttc ctgagggaca atatgctact   1560
aatgcaaacg gaacaactcg gattaaagag tttaaggaaa tggttctttc actccatcag   1620
gaccacattg gggttaatat ggatgttgtt tataatcata cctttgccac gcaaatctct   1680
gacttcgata agattgtacc agaatattac taccgcacgg atgatgctgg taactacact   1740
aacggctcag gtactggaaa cgaaatcgca gccgaaagac caatggttca aaaatttatt   1800
atcgattcac ttaagttttg ggtcaatgag taccacgttg acggtttccg ttttgactta   1860
atggcgttgc ttggaaaaga tacaatgtct aaagctgcca cgcagcttca tgccattgat   1920
ccaggaattg ctctctacgg tgagccatgg acaggaggaa catccgcgct gccagccgat   1980
cagcttttaa caaaaggagc tcaaaaaggc atgggagtgg ctgtatttaa tgacaatctg   2040
cgaaacggtt tggacggcag tgtctttgat tcatctgctc aaggttttgc gacaggtgct   2100
actggtttaa cggatgctat taaaaatgga gttgaaggaa gtattaatga cttcaccgct   2160
tcaccaggcg agacgatcaa ctatgtcaca agtcatgata actataccct ttgggacaag   2220
attgcccaaa gcaatccaaa cgattctgaa gcggatcgaa ttaaaatgga tgagctcgct   2280
caagcgatcg tcatgacctc acaaggcatt cctttcatgc agggcgggga agaaatgctt   2340
cgtacgaaag gcggcaacga caatagctat aatgctggtg atgtagtgaa cgagtttgat   2400
tggagcagaa aagctcaata tccagatgtt ttcaattatt atagcgggct gattcatctt   2460
cgtcttgatc acccagcctt ccgcatgacg acagctaatg aaatcaatag ccacctccaa   2520
ttcctaaata gcccagagaa cacagtggcc tatgaattat ctgatcatgc aaataaagat   2580
acatggggta atattgtggt tatttataat ccaaataaaa cggcagaaac cattaatttg   2640
ccaagcggga aatgggaaat caatgcgacg agcggtaagg tgggagaatc cacacttggt   2700
caagcagagg gcagtgttca agttccaggc atatctatga tgattcttca tcaagaagta   2760
agcccatctg atggtaaata g                                             2781
 
<210> SEQ ID NO: 2
<211> 926
<212> PRT
<213> 长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC NO:M 2012388
 
<400>1
Asp Gly Asn Thr Thr Asn Ile Val Val His Tyr Phe Arg Pro Ser
1                    5                      10                     15
Gly Asp Tyr Thr Asp Trp Asn Leu Trp Met Trp Pro Glu Asn Gly
                    20                      25                     30
Asp Gly Ala Glu Tyr Asp Phe Asn Gln Pro Thr Asp Ser Tyr Gly
                    35                      40                     45
Glu Val Ala Ser Val Asp Ile Pro Gly Asn Pro Ser Gln Val Gly
                    50                      55                     60
Ile Ile Val Arg Lys Gly Asn Trp Asp Ala Lys Asp Ile Asp Ser
                    65                      70                     75
Asp Arg Tyr Ile Asp Leu Ser Lys Gly His Glu Ile Trp Leu Val
                    80                      85                     90
Gln Gly Asn Ser Gln Ile Phe Tyr Ser Glu Lys Asp Ala Glu Ala
                    95                     100                    105
Ala Ala Gln Pro Ala Val Ser Asn Ala Tyr Leu Asp Ala Ser Asn
                   110                     115                    120
Gln Val Leu Val Lys Leu Ser Gln Pro Phe Thr Leu Gly Glu Gly
                   125                     130                    135
Ser Ser Gly Phe Thr Val His Asp Asp Thr Ala Asn Lys Asp Ile
                   140                     145                    150
Pro Val Thr Ser Val Ser Asp Ala Asn Gln Val Thr Ala Val Leu
                   155                     160                    165
Ala Gly Thr Phe Gln His Ile Phe Gly Gly Ser Asp Trp Ala Pro
                   170                     175                    180
Asp Asn His Asn Thr Leu Leu Lys Lys Val Asn Ser Asn Leu Tyr
                   185                     190                    195
Gln Phe Ser Gly Asn Leu Pro Glu Gly Asn Tyr Gln Tyr Lys Val
                   200                     205                    210
Ala Leu Asn Asp Ser Trp Asn Asn Pro Ser Tyr Pro Ser Asp Asn
                   215                     220                    225
Ile Asn Leu Thr Val Pro Ala Gly Gly Ala His Val Thr Phe Ser
                   230                     235                    240
Tyr Ile Pro Ser Thr His Ala Val Tyr Asp Thr Ile Asn Asn Pro
                   245                     250                    255
Asn Ala Asp Leu Gln Val Asp Ser Ser Gly Val Lys Thr Asp Leu
                   260                     265                    270
Val Ala Val Thr Leu Gly Glu Asn Pro Asp Val Ser His Thr Leu
                   275                     280                    285
Ser Ile Gln Thr Glu Asp Tyr Gln Ala Gly Gln Val Ile Pro Arg
                   290                     295                    300
Lys Val Leu Asp Ser Ser Gln Tyr Tyr Tyr Ser Gly Asp Asp Leu
                   305                     310                    315
Gly Asn Thr Tyr Thr Lys Asn Ala Thr Thr Phe Lys Val Trp Ala
                   320                     325                    330
Pro Thr Ser Thr Gln Val Asn Val Leu Leu Tyr Asn Ser Ala Thr
                   335                     340                    345
Gly Ala Val Thr Lys Thr Val Pro Met Thr Ala Ser Gly His Gly
                   350                     355                    360
Val Trp Glu Ala Thr Val Asn Gln Asp Leu Glu Asn Trp Tyr Tyr
                   365                     370                    375
Met Tyr Glu Val Thr Gly Gln Gly Ser Thr Arg Thr Ala Val Asp
                   380                     385                    390
Pro Tyr Ala Thr Ala Ile Ala Pro Asn Gly Thr Arg Gly Met Ile
                   395                     400                    405
Val Asp Leu Ala Lys Thr Asp Pro Ala Gly Trp Glu Ser Asp Lys
                   410                     415                    420
His Ile Thr Pro Lys Asn Ile Glu Asp Glu Val Ile Tyr Glu Met
                   425                     430                    435
Asp Val Arg Asp Phe Ser Ile Asp Ser Asn Ser Gly Met Lys Asn
                   440                     445                    450
Lys Gly Lys Tyr Leu Ala Leu Thr Glu Lys Gly Thr Lys Gly Pro
                   455                     460                    465
Asp Asn Val Lys Thr Gly Val Asp Ser Leu Lys Gln Leu Gly Ile
                   470                     475                    480
Thr His Val Gln Leu Gln Pro Val Phe Ala Phe Asn Ser Val Asn
                   485                     490                    495
Glu Asn Asp Pro Thr Gln Tyr Asn Trp Gly Tyr Asp Pro Arg Asn
                   500                     505                    510
Tyr Asn Val Pro Glu Gly Gln Tyr Ala Thr Asn Ala Asn Gly Thr
                   515                     520                    525
Thr Arg Ile Lys Glu Phe Lys Glu Met Val Leu Ser Leu His Gln
                   530                     535                    540
Asp His Ile Gly Val Asn Met Asp Val Val Tyr Asn His Thr Phe
                   545                     550                    555
Ala Thr Gln Ile Ser Asp Phe Asp Lys Ile Val Pro Glu Tyr Tyr
                   560                     565                    570
Tyr Arg Thr Asp Asp Ala Gly Asn Tyr Thr Asn Gly Ser Gly Thr
                   575                     580                    585
Gly Asn Glu Ile Ala Ala Glu Arg Pro Met Val Gln Lys Phe Ile
                   590                     595                    600
Ile Asp Ser Leu Lys Phe Trp Val Asn Glu Tyr His Val Asp Gly
                   605                     610                    615
Phe Arg Phe Asp Leu Met Ala Leu Leu Gly Lys Asp Thr Met Ser
                   620                     625                    630
Lys Ala Ala Thr Gln Leu His Ala Ile Asp Pro Gly Ile Ala Leu
                   635                     640                    645
Tyr Gly Glu Pro Trp Thr Gly Gly Thr Ser Ala Leu Pro Ala Asp
                   650                     655                    660
Gln Leu Leu Thr Lys Gly Ala Gln Lys Gly Met Gly Val Ala Val
                   665                     670                    675
Phe Asn Asp Asn Leu Arg Asn Gly Leu Asp Gly Ser Val Phe Asp
                   680                     685                    690
Ser Ser Ala Gln Gly Phe Ala Thr Gly Ala Thr Gly Leu Thr Asp
                   695                     700                    705
Ala Ile Lys Asn Gly Val Glu Gly Ser Ile Asn Asp Phe Thr Ala
                   710                     715                    720
Ser Pro Gly Glu Thr Ile Asn Tyr Val Thr Ser His Asp Asn Tyr
                   725                     730                    735
Thr Leu Trp Asp Lys Ile Ala Gln Ser Asn Pro Asn Asp Ser Glu
                   740                     745                    750
Ala Asp Arg Ile Lys Met Asp Glu Leu Ala Gln Ala Ile Val Met
                   755                     760                    765
Thr Ser Gln Gly Ile Pro Phe Met Gln Gly Gly Glu Glu Met Leu
                   770                     775                    780
Arg Thr Lys Gly Gly Asn Asp Asn Ser Tyr Asn Ala Gly Asp Val
                   785                     790                    795
Val Asn Glu Phe Asp Trp Ser Arg Lys Ala Gln Tyr Pro Asp Val
                   800                     805                    810
Phe Asn Tyr Tyr Ser Gly Leu Ile His Leu Arg Leu Asp His Pro
                   815                     820                    825
Ala Phe Arg Met Thr Thr Ala Asn Glu Ile Asn Ser His Leu Gln
                   830                     835                    840
Phe Leu Asn Ser Pro Glu Asn Thr Val Ala Tyr Glu Leu Ser Asp
                   845                     850                    855
His Ala Asn Lys Asp Thr Trp Gly Asn Ile Val Val Ile Tyr Asn
                   860                     865                    870
Pro Asn Lys Thr Ala Glu Thr Ile Asn Leu Pro Ser Gly Lys Trp
                   875                     880                    885
Glu Ile Asn Ala Thr Ser Gly Lys Val Gly Glu Ser Thr Leu Gly
                   890                     895                    900
Gln Ala Glu Gly Ser Val Gln Val Pro Gly Ile Ser Met Met Ile
                   905                     910                    915
Leu His Gln Glu Val Ser Pro Ser Asp Gly Lys ***
                   920                     925 926

Claims (4)

1.一种长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)LBMAE-1,已保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号CCTCC NO:M 2012388;
来源于CCTCC NO:M 2012388菌株的普鲁兰酶基因pul,其核苷酸序列为SEQ ID NO: 1,其氨基酸序列为SEQ ID NO: 2。
2.用权利要求1所述CCTCC NO:M 2012388菌株构建重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul的方法,其特征在于将来源于CCTCC NO:M 2012388菌株的普鲁兰酶基因pul在大肠杆菌中进行重组表达;步骤为:
(1)普鲁兰酶基因pul的获得
CCTCC NO:M 2012388培养基:CaCl2 0.25 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,(NH4)2SO4 0.2 g/L,酵母提取物 2 g/L,无水葡萄糖 5 g/L,KH2PO4 3 g/L,无机盐溶液1 mL/L,用双蒸水配制,pH 5.0;
无机盐溶液:ZnSO4·7H2O 0.1 g/L,MnCl2·H2O 0.03 g/L,H3BO3 0.3 g/L,CoCl2·6H2O 0.2 g/L,CuCl2·2H2O 0.01 g/L,NiCl2·6H2O 0.02 g/L,Na2MoO4·2H2O 0.03 g/L;
将CCTCC NO:M 2012388菌种接种于含有25 mL培养基的250 mL摇瓶中,于37℃、200 rpm振荡培养72 h,培养结束后,将菌体离心并用生理盐水洗涤两次,收集细胞,利用VIOGENE公司的基因组DNA提取试剂盒Genomic DNA Extraction Miniprep System提取基因组DNA;
引物1:5’- gaacaGGATCCagatgggaacaccacaaaC -3’,
引物2:5’- attccctcgagtttaccatcagatgggct -3’;
引物1含有BamHI限制性酶切位点,引物2含有XhoI限制性酶切位点;
PCR反应体系:ddH2O 37 μL,10×Reaction Buffer 5 μL,25 mmol/L的dNTP 0.5 μL,50 pmol/μL的引物1取1 μL,50 pmol/μL的引物2取1 μL,基因组DNA 5 μL,5 U/μL的Taq DNA polymerase 0.5 μL;
以CCTCC NO:M 2012388基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增普鲁兰酶基因,PCR反应过程:95℃预变性5 min;95℃ 1 min、60℃ 0.5 min、72℃ 2 min,进行30个循环;72℃延伸10 min;
利用上海申能***生物科技有限公司的3S Spin Agarose Gel DNA Purification Kit纯化DNA片断:
DNA溶液中加入1/10体积pH 5.2、3 mol/L的乙酸钠溶液和2倍体积无水乙醇,-20℃沉淀1h,12000 rpm于4℃离心30 min,加入75%乙醇500 μL洗涤,12000 rpm于4℃离心30 min,无菌操作台吹干后溶于适量TE缓冲液中,所得普鲁兰酶基因pul立即使用或-20℃保存;
(2)含有普鲁兰酶基因pul的重组大肠杆菌的构建
目的基因pul及质粒pET20b(+)的酶切:
利用北京博大泰克生物基因技术有限公司的质粒提取试剂盒Mini-Plasmid Rapid Isolation Kit提取质粒pET20b(+);
按照水、缓冲液、PCR产物或质粒DNA、酶的顺序加到Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机内离心2s使液体集中于管底,37℃水浴3h,在管中加入1/10的Loading Buffer或将管置于65℃保温10min,终止酶切反应,酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析并切胶回收目的片段,浓缩;
反应体系组成:10×H Buffer 4 μL,基因组DNA 10 μL,BamHI 2 μL,XhoI 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL;
目的基因pul与质粒pET20b(+)的连接:
将目的基因pul与质粒pET20b(+)连接,反应体系组成如下:质粒pET20b(+) 0.8 μL,目的基因pul 4.2 μL,Ligation Solution 5 μL,混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接反应12h,得重组质粒pET20b(+)-pul
重组质粒pET20b(+)-pul转化大肠杆菌:
在100 μL大肠杆菌E. coli BL21(DE3)感受态细胞悬液中加入10 μL重组质粒pET20b(+)-pul,轻轻混匀,冰浴中静置30min,转入42℃水浴中,热击90s;快速转移至冰浴中,冷却2 min,加入700 μL的LB液体培养基,37℃、100 rpm摇床温育培养1h,培养后菌液3000 rpm离心2 min,弃上清600 μL,剩余菌液混匀后涂布到含有50 μg/mL 氨苄抗生素的LB平板上,37℃倒置培养,获得含有目的普鲁兰酶基因pul的重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET20b(+)-pul
带有信号肽PelB的目的基因与质粒pET28a(+)的连接:
将重组质粒pET20b(+)-pul及表达载体pET28a(+)分别用限制性内切酶XbaI及XhoI分步单酶切,按照水、缓冲液、重组质粒pET20b(+)-pul或表达载体pET28a(+)、酶的顺序加到Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机内离心2s使液体集中于管底,37℃水浴3h,在管中加入1/10的Loading Buffer或将管置于65℃保温10 min,终止酶切反应;酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析并切胶回收目的片段,浓缩;反应体系组成:10×H Buffer 4 μL,pET20b(+)-pul或pET28a(+) 10 μL,XbaI 2 μL,XhoI 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL;
将胶回收线性化的目标片段PelB-pul与pET28a(+)载体连接,反应体系组成如下:载体pET28a(+) 1 μL,目标片段PelB-pul 4 μL,Ligation Solution 5 μL,混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接反应12h,得重组质粒pET28a(+)-PelB-pul
重组质粒pET28a(+)-PelB-pul转化大肠杆菌:
在100 μL大肠杆菌E. coli BL21(DE3)感受态细胞悬液中加入10 μL pET28a(+)-PelB-pul,轻轻混匀,冰浴中静置30 min,转入42℃水浴中,热击90s,快速转移至冰浴中,冷却2 min,加入700 μL的LB液体培养基,37℃、100 rpm摇床温育培养1h,培养后菌液3000 rpm离心2 min,弃上清600 μL,剩余菌液混匀后涂布到含有50 μg/mL 卡那霉素的LB平板上,37℃倒置培养,获得含有目的普鲁兰酶基因pul的重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul
3.用权利要求2所述重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul生产胞外普鲁兰酶的方法,其特征在于:自诱导培养
自诱导培养基g/L:β-乳糖 1~50,无水葡萄糖0.5,甘油5,KH2PO6.8,MgSO4  0.24,胰蛋白胨10,酵母提取物5,Na2HPO7.1,Na2SO0.71,NH4Cl 2.67,痕量元素溶液 400 μL/L,用双蒸水配制,pH 7.5~8.0;
痕量元素溶液g/L:FeCl3 8.125,CaCl2 2.22,MnCl2 2.52,ZnSO4 1.61,CoCl2 0.26,CuCl2 0.27,NiCl2 0.26,Na2MoO4 0.41,Na2SeO3 0.346,H3BO3 0.124,HCl 2.19;
将重组菌E.coli BL21(DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul于含有50 μg/mL卡那霉素的LB固体培养基上过夜活化培养,从固体平板上挑取单个菌落接种于3 mL含有50 μg/mL卡那霉素的液体LB培养基中于37℃、200 rpm振荡培养,随时监测培养基中OD600的变化情况,待OD600达到2~3时,按5%~10%接种量接种于50 mL含50 μg/mL卡那霉素的自诱导培养基中,于10~40℃、200rpm震荡培养2~20h后,添加终浓度1~25g/L的甘氨酸,温度转为10~40℃培养60~70h;培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10 min后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定。
4.根据权利要求3所述重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/ pET28a(+)-PelB-pul生产胞外普鲁兰酶的方法,其特征在于:分别考察了诱导温度、甘氨酸使用浓度、37℃下培养时间和乳糖浓度的影响,最终确定了自诱导条件为:自诱导培养基中乳糖浓度为10 g/L,在37℃下培养2h后,添加终浓度6g/L的甘氨酸并转入20℃下培养70h;培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10 min后得发酵上清用于菌株胞外酶活的测定;胞外普鲁兰酶酶活达505 U/mL。
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