CN102369443B - 试样分析芯片、采用该试样分析芯片的试样分析装置和试样分析方法、以及试样分析芯片的制造方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供一种将液体输送到形成于芯片上的加样孔内并进行反应的试样分析芯片,其为送液方法简单且输送到各加样孔的液量之间不存在偏差、且成本低廉的试样分析芯片。本发明的试样分析芯片,包括:多个加样孔(102)和与各加样孔连接的流路,其特征在于,所述流路具有用于向各加样孔输送液体的主流路(103),该主流路设置在比所述加样孔更接近旋转中心侧的位置,且在相邻加样孔之间具有旋转中心方向的一个山部。
Description
技术领域
本发明涉及生化反应的检测或分析等中使用的试样分析芯片和试样分析方法、以及试样分析芯片的制造方法。特别是,涉及能够用于DNA分析的一次性芯片(disposable chip)及其制造方法。
本申请根据2009年3月31日在日本提出的特愿2009-085272号、特愿2009-085273号和特愿2009-085274号主张优先权,并在此援引其内容。
背景技术
以往,例如在DNA反应、蛋白质反应等的生化反应领域中,作为处理微量试样溶液的反应装置,公知的有被称为微全分析***(μ-TAS;TotalAnalysis System)或片上实验室(Lab-on-Chip)的技术。该技术是向一个芯片或盒提供多个反应室(以下也称为“加样孔”)或流路的技术,能够对多个检测体进行分析,或能够进行多个反应。这些技术通过使芯片和盒小型化,由此可以减少药品的使用量,一直被认为具有各种优点。
作为上述优点,例如可举出:由于使以往所使用的强酸或强碱药品的用量微量化,因此能够明显降低对人体或环境的影响;另外,使在生化反应等中使用的高额试剂类的消耗量微量化,由此能够降低进行分析、反应所需的成本。
为了使用芯片或盒进行最有效的生化反应,必须在多个加样孔内分别配置不同种类的药品或检测体、酶,且由一个或多个主导管使与这些药品或检测体、酶发生反应的试剂集中流入到加样孔内,由此进行多个不同的反应。
若使用上述方法,则能够用相同的试剂同时处理多种类的检测体,或者相反地,可对一种类的检测体同时实施多个处理,因此能够大幅度减少以往所需的时间和劳力。
在使用这种方法时,将等量的试样溶液输送到多个反应场所的技术和不使各加样孔的内装物混杂在一起的技术成为重要的技术。作为这种将液体输 送到加样孔内的芯片的现有技术,可举出以下技术。
在专利文献1,在利用离心力从液体储存部向加样孔输送液体的芯片中,为了使加样孔独立,对其流路进行变形、密封。因此,必须具有挤碎流路的机构,难以实现自动化。另外,如果像以往的离心式输液芯片那样,从中央的液体储存部向周围的加样孔进行离心输液时,在各个加样孔的输液量中发生偏差。
在专利文献2中,通过采用穿插自传+公转的离心方法,解决向各个加样孔的输液量的偏差。但是,在该方法中,也需要使芯片发生自传+公转的复杂的机构和空间。
在专利文献3中公开了将多个液体储存部和具有在离心方向上延伸的流路的加样孔加以连接的分析用介质,但在该文献中,并没有关注液体的配液性等,相反地,通过与填充在加样孔内的空气之间的推挤来控制流体。在该方法中,液体储存部和液体储存部之间流路中的液体没有被输送,因此,输送到各个加样孔的液量之间存在较大偏差,在每次反应的结果中都存在偏差。
由此,以往技术中的第一个问题点在于,没有实现液体输送方法简单且各加样孔内的液量偏差较小的芯片。
另外,作为第二个问题点,由于在这些方法中需要将试样物质分配给装置中的多个加样孔,因此存在因腔室间的相互污染而导致错误的试验结果的担忧。
作为解决上述问题的方法,提出了一种密封型芯片,其是至少在一个部件上贴合了实施有流路等加工的两个部件而成。例如,在专利文献1中公开有密封型加工阵列以及试样处理装置,其由提供包括装填室、主导管和工艺处理室(加样孔)的结构的第一主面部件和第二主面部件构成,而且,沿着从装填室延伸的导管配置工艺处理室,且沿着试样处理装置的长度排列装填室、导管和工艺处理室。
在专利文件4所记载的加工阵列中,设置有通过从一个主导管分支的进料导管相连接的多个工艺处理室。因此能够进行用相同的试剂处理多个检测体的操作。为了用这些加工阵列进行最有效的生化反应,首先在多个反应场所配置种类各不相同的药品或检测体、酶。然后,从一个或多个主导管分别将与这些物质发生反应的试剂流入各反应场所。由此,进行多个不同的反应。 通过上述方法,可用相同的试剂同时处理多种检测体,相反地,可对一种检测体同时实施多个处理。由此,能够大幅减少以往所需的时间和劳力。
作为这种方法,例如公开有下述的技术方案:采用具有液体导入口、流路、液体排出口等的微流体芯片,通过冷冻干燥等的方法将反应所需的试剂中的一部分以固体状固定在芯片的流路内,且以液体状输送反应所需的剩余试剂成分,然后使这些成分在流路内接触并发生反应。
另外,在专利文献5公开了由形成有装填室、工艺处理室和流路的树脂基材和平板状的金属基材相贴合而成的试样处理装置。另外,公开了在各工艺处理室进行不同反应等情况下,通过堵塞流路使各工艺处理室形成封闭空间的方法。在该试样处理装置中,使平坦的金属基材变形为能够压入流路内的形状,由此堵塞流路。
然而,记载于专利文献1的加工阵列中第一主面部件和第二主面部件之间使用压敏粘合剂。使用压敏粘合剂时,反应过程中有可能产生来自粘合剂的溶出物而使加样孔内的试剂受到影响。另外,在粘合层的耐热性或耐水性方面容易出现问题,因此专利文献1的构成中通过密封使流路不受来自外部影响的技术方案是不充分的。
另外,在进行生化反应等时,精确控制反应温度或温度条件是极其重要的。专利文献2所记载的试样处理装置中,将金属基材一侧形成为平坦的板状。因此,记载了与热块等之间的附着性得到提高,且适用于进行伴有热循环的反应中的内容。然而,当采用专利文献2所记载的试样处理装置进行反应时,必须堵塞流路以使各工艺处理室形成封闭空间。在该试样处理装置中,将平坦的金属基材变形为能够压入流路内的形状,由此堵塞流路。当如此地变形金属基材时,存在着金属基材的平坦性受损、与热块之间的附着性下降、热响应性不充分、难以在短时间内可靠地进行所需反应的问题。而且,在专利文献2的方法中,若流路的堵塞不充分时,有时因腔室的相互污染而导致错误的试验结果。
现有技术文献
专利文献
专利文献1:日本特表2004-502164号公报
专利文献2:日本特许第3699721号公报
专利文献3:日本特开2008-83017号公报
专利文献4:日本特许第4181046号公报
专利文献5:日本特表2004-502164号公报
发明内容
发明要解决的课题
鉴于上述现有技术的问题点,本发明所要解决的课题在于,提供一种在向加样孔送液的试样分析芯片中,送液方法简单、各加样孔的液量之间不存在偏差、且成本低的试样分析芯片。
另外,本发明的目的在于,提供一种能够易于制造、且在芯片上的加样孔不发生试样污染等的试样分析芯片及其制造方法。
解决课题的方法
为了解决上述问题,
(1)本发明的试样分析芯片,是在基材上具有多个加样孔、与各加样孔连接的流路和用于向流路注入溶液的注入口,并通过旋转该基材,将溶液分配给各个加样孔的试样分析芯片,其特征在于,所述流路具有用于向上述各加样孔输送液体的主流路,该主流路设置在比所述加样孔更接近旋转中心侧的位置,且在相邻加样孔之间具有相对于旋转中心方向的一个山部。
(2)如(1)所述的试样分析芯片,其特征在于,在所述主流路的山部和山部之间的谷部,连接所述加样孔和主流路。
(3)如(1)或(2)所述的试样分析芯片,其特征在于,相对地,所述主流路的宽度在山部较窄、在谷部较宽。
(4)如(1)~(3)中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,所述基材为圆盘状,所述加样孔配置成与所述基材呈同心圆状。
(5)如(1)~(4)中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,具有连接所述主流路和加样孔的侧路。
(6)如(5)所述的试样分析芯片,其特征在于,相对于旋转中心方向倾斜而形成所述侧路。
(7)如(1)~(6)中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,所述 主流路形成为相对于旋转中心方向倾斜。
(8)如(1)~(7)中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,具有用于连接所述主流路和加样孔的侧路,且在所述侧路上设置有用于收集剩余溶液的废液部。
(9)如(8)所述的试样分析芯片,其特征在于,所述废液部包括用于收集废液的废液室、以及对所述侧路进行分支且与所述废液室相连接的废液室分支流路。
(10)如(8)或(9)所述的试样分析芯片,其特征在于,所述侧路形成为相对于旋转中心方向倾斜,且相对于旋转中心方向,所述废液部设置在侧路内侧。
(11)如(9)或(10)所述的试样分析芯片,其特征在于,输送液体时,与所述加样孔连通的分支流路的送液时压力损失小于与所述废液室连通的分支流路的送液时压力损失。
(12)如(11)所述的试样分析芯片,其特征在于,与所述加样孔连接的分支流路的截面积大于所述废液室分支流路的截面积。
(13)如(11)所述的试样分析芯片,其特征在于,与所述加样孔连接的分支流路的表面粗糙度小于废液室分支流路的表面粗糙度。
(14)如(11)所述的试样分析芯片,其特征在于,对废液室分支流路的流路内表面进行疏水处理。
(15)如(11)所述的试样分析芯片,其特征在于,对与所述加样孔连接的分支流路的流路内表面进行亲水处理。
(16)如(1)~(15)中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,所述试样分析芯片具有:形成有所述加样孔和所述流路的第一基材;以及与该基材贴合的第二基材。
(17)如(16)所述的试样分析芯片,其特征在于,所述基材中的任一者由光透过性材料来形成。
(18)如(17)所述的试样分析芯片,其特征在于,第一基材为光透过性树脂材料,第二基材为金属材料。
(19)如(17)所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第一基材由对可见光具有光透过性且对红外线具有光吸收性的树脂构成,所述第二基材是 至少透过波长800nm以上的红外线的板状或膜状。
(20)另如(19)所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第一基材为聚丙烯、聚碳酸酯、丙烯酸树脂中的任意树脂基材。
(21)如(19)或(20)所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第一基材含有在800nm以上的波长区域具有吸收的红外线吸收剂。
(22)如(1)~(3)中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第二基材为聚丙烯、聚碳酸酯、丙烯酸树脂中的任意树脂基材。
(23)如(1)~(22)中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第二基材的厚度为0.05~0.5mm范围。
(24)如(1)~(23)中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,在所述第一基材上设置有用于旋转试样分析芯片的载体部。
(25)一种试样分析芯片的制造方法,是上述(19)~(22)中任一项所述的试样分析芯片的制造方法,其特征在于,从所述第二基材侧照射红外线激光,使所述第一基材和所述第二基材熔融粘接,由此进行贴合。
(26)如(25)所述的试样分析芯片的制造方法,其特征在于,所述红外线激光的波长为800~1200nm范围。
(27)如(25)或(26)所述的试样分析芯片的制造方法,其特征在于,在所述试样分析芯片的制造中,包括贴合所述第一基材和所述第二基材之前,在所述加样孔上固定试剂的工序。
(28)一种试样分析装置,包括:设置(1)~(23)中任一项所述的试样分析芯片并使其旋转的装置;以及用于检测所述加样孔内反应的检测装置。
(29)一种试样分析方法,包括:将溶液注入到(1)~(23)中任一项所述的试样分析芯片的所述主流路的工序;以及使该试样分析芯片旋转,从而将溶液分配给所述各个加样孔的工序。
(30)一种试样分析方法,其特征在于,在(29)所述的试样分析方法中,在将溶液分配给所述加样孔的工序之后,包括将矿物油分配给所述各加样孔的工序。
(31)一种基因分析方法,其特征在于,使用(29)或(30)所述的试样分析方法。
发明的效果
根据本发明第一技术方案的试样分析芯片,能够实现简单、多功能且安全低廉的试样分析芯片。进而可以对一种检测体实施多个处理。
另外,由于主流路在各个加样孔之间相对于旋转中心形成一个山部,因此,可在该主流路的山部切断送液,由此可以减少液体分配的不匀。而且,通过减少该流路山部的截面积,可以进一步减少分配液体时的不均匀。
而且,当任意设置从流路山部到相邻流路山部的主流路的容积时,可将相同容量的试样从夹在上述流路山部之间的流路谷部输送到连通的加样孔中,因此可根据每个加样孔设定所使用的溶液试样量。
另外,根据本发明第二技术方案的试样分析芯片,当通过离心力从主流路向加样孔送液时,对于因送液不匀而发生送液量超过规定量的加样孔来说, 可以将剩余分量的液体丢弃到废液室。因此,只要向所有加样孔输送超过所需液量的液体时,则可以向所有加样孔输送相同量的溶液,由此能够降低配液的偏差。
而且,在用于连通主流路和加样孔的侧路上设置与废液室相连通的分支流路,因此消除试样与其他加样孔之间的接触,由此能够抑制污染的发生。
另外,根据本发明第三技术方案的试样分析芯片,通过简单的构成,可以实现小型且低廉的反应芯片。在本发明的试样分析芯片中,通过将第一基材和第二基材加以组合,并利用红外线激光进行熔融粘接,由此可以实现几乎不会影响到芯片或被固定在芯片上的试剂的密封型芯片。
附图说明
图1为本发明第一实施方式的试样分析芯片的一实施例的俯视图;
图2为本发明第一实施方式的试样分析芯片的一实施例的俯视图;
图3为本发明第一实施方式的试样分析芯片的一实施例的俯视图;
图4为本发明第二实施方式的试样分析芯片的一实施例的俯视图;
图5为表示本发明第二实施方式的试样分析芯片的侧路、废液部和加样孔的配置的俯视图;
图6为本发明第二实施方式的试样分析芯片的一实施例的俯视图;
图7为本发明第二实施方式的试样分析芯片的一实施例的俯视图;
图8为用于说明本发明试样分析芯片的立体图;
图9为用于说明本发明试样分析芯片的剖面图;
图10为本发明第三实施方式的试样分析芯片的立体图;
图11为构成本发明第三实施方式的试样分析芯片的第一基材的俯视图;
图12为本发明第三实施方式的试样分析芯片的一实施例中的流路和加样孔的剖面图;
图13为实施例1的检测结果的图表;
图14为实施例1的阴性对照测量结果的图表;
图15为实施例1的阳性对照测量结果的图表。
具体实施方式
根据附图对本发明的第一实施方式的试样分析芯片进行说明。
图1是表示本发明试样分析芯片的一实施方式的俯视图。本发明的芯片具有:位于基材101上的多个加样孔102;以及用于向加样孔输送溶液的、例如输送液体试剂(溶液)的流路。为了将液体输送到各个加样孔,流路至少包括与各个加样孔连接的一个主流路103,还包括连接主流路和加样孔的侧路105。流路上具有用于注入溶液的注入口。在图1的实施方式中,具有位于主流路端部的注入口(INLET)和位于另一侧端部的、兼任空气脱出口的剩余溶液的出口(OUTLET)。
本发明的试样分析芯片,其是通过旋转该芯片而产生的离心力将液体分配给各个加样孔102的试样分析芯片,因此,优选为中央部具有贯穿旋转轴的点(以下,称为中心点)的圆盘状,但是,只要其形成为能够相对于贯穿芯片的旋转轴旋转即可,没有特别的限制。如果芯片为圆盘状,则能够以其中心为旋转轴,并可在该圆盘状芯片上以同心圆状配置加样孔,由此有效地利用空间。为了将液体均匀分配给加样孔,产生均匀离心力是非常重要的,可将芯片设计成除了INLET/OUTLET107区域之外,以中心点为轴具有旋转对称性,由此可以容易实现上述目的。即,假设有N个加样孔,则就形成N个对称,由此可产生均匀的离心力。当然,要想各加样孔的配液量不同时,则并不限定于此。另外,通过以同心圆状配置加样孔,由此,通过旋转基材,可在一处检测区域实现所有加样孔的分析。
主流路103形成在比加样孔更接近于中心点侧的位置上。而且,本发明的试样分析芯片中,其特征在于,该主流路形成为在相邻加样孔之间具有向中心点方向的一个山部。在此,相邻的加样孔是指,从主流路向加样孔的送液流路位于前后位置的加样孔。另外,具有向中心点方向的山部,是指具有向中心点方向的最大点(主流路山部103a)。如此地,通过在加样孔之间具有向中心点方向的一个山部,由此,被注入到主流路的液体在芯片旋转时,自然而然地在主流路山部被切断,因此可以减少各个加样孔的配液量偏差。
优选加样孔102和主流路103之间的连接部位,即优选主流路103和侧路105之间的连接部位为主流路的山部与山部之间的谷部103b。谷部是指,在主流路的山部与山部之间离中心点距离最远的部位。通过在该部位连接加样孔和主流路,能够减少配液时流向主流路的溶液的残留。
另外,如后述的采用试样分析芯片的处理方法所记载,作为主流路103和加样孔102之间的连接口,在旋转芯片之前的阶段,必须形成为溶液不会浸入加样孔的程度的宽度和截面积。
另外,为了使空气不残留在加样孔102内,优选在加样孔的离中心点最近的点与主流路相连接。即,在形成侧路105的情况下,优选形成为加样孔侧的离中心点最近的点与主流路侧的谷部相连接。
图2是表示本发明试样分析芯片的另一实施方式的俯视图。在图2的实施方式中,主流路的宽度在主流路山部103a狭窄、在主流路谷部103b较宽。由于在相当于主流路山部103a的区域内存在的溶液少时,配液的偏差就小,因此,优选山部的主流路截面积小于其它部分的截面积。所以,优选使山部的流路宽度变窄和/或深度变浅。另外,基于相同理由,优选离山部越近,主流路的截面积就越小。
而且,通过扩大主流路谷部103b的宽度,能够控制流向各加样孔102的配液量。由此,如图3所示的试样分析芯片,将山部与山部之间的流路设置成腔室状,且任意设置从主流路山部到相邻主流路山部的主流路容积,则可将相同容量的试样从被夹在两个山部之间的谷部输送到与之连通的加样孔内,因此能够在各个加样孔设定任意量的溶液。
另外,优选加样孔102的容积为1μL~100μL。若小于1μL,则离心力的作用不充分,难以向加样孔送液,另外,若大于100μL,则有可能出现试剂的混合性下降、或加样孔内温度的均匀性下降的现象。
另外,在图2的实施方式中,侧路105形成为从中心点方向倾斜。如此地,通过将侧路形成为倾斜,在施加离心力时,加样孔的空气沿着侧路内侧向主流路方向移动,另一方面,溶液沿着侧路外侧向加样孔方向移动,由此能够顺利地向加样孔内移动溶液。作为倾斜的角度,优选中心点方向与侧路之间形成的角度为10度~80度。若角度为10度以下,则有时加样孔的排气和向加样孔的溶液流入相互干扰而阻碍溶液的进入,若角度超过80度,则向侧路方向的离心力变弱,有时造成溶液无法向加样孔移动的情况。
图3是本发明的试样分析芯片的又一实施方式。在图3的试样分析芯片中,主流路103的山部相对于中心点方向倾斜,因此相对于侧路105,主流路被设计成其在基材平面上的左右面积不均等。相对于侧路105,左右主流 路中存在主流路宽度狭窄的流路侧和宽的流路侧,且在宽的流路侧形成有作为与加样孔的连接口的侧路105,由此,从加样孔向侧路移动的空气与主流路的溶液发生交替时,在偏向于面积大的主流路侧发生气泡与液体之间的交替。因此,能够减少主流路的残液。如此,通过使与各个加样孔连接的侧路和主流路具有上述构成,且在主流路中以山部为界而交替形成有宽度狭窄的流路侧和宽度宽的流路侧,因此,在各腔室状的主流路上同时发生相同的现象,从而可以减少配液的偏差。
根据附图,对本发明第二实施方式的试样分析芯片进行说明。
图4是表示本发明的试样分析芯片的一实施方式的俯视图。本发明的芯片具有:位于基材101上的多个加样孔102;以及用于向加样孔输送溶液的、例如输送液体试剂(溶液)的流路。为了将液体输送到各个加样孔,流路至少包括与各个加样孔连接的一个主流路103,还包括连接主流路和加样孔的侧路105。流路上具有用于注入溶液的注入口。在图4的实施方式中,具有位于主流路端部的注入口(INLET)和位于另一侧端部的、兼任空气脱出口的剩余溶液的出口(OUTLET)。
本发明的试样分析芯片,其是通过旋转该芯片而产生的离心力将液体分配给各个加样孔102的试样分析芯片,因此,优选为中央部具有贯穿旋转轴的点(以下,称为中心点)的圆盘状,但是,只要其形成为能够相对于贯穿芯片的旋转轴旋转即可,没有特别的限制。如果芯片为圆盘状,则能够以其中心为旋转轴,并可在该圆盘状芯片上以同心圆状配置加样孔,由此有效地利用空间。为了将液体均匀分配给加样孔,产生均匀离心力是非常重要的,可将芯片设计成除了INLET/OUTLET 107区域之外,以中心点为轴具有旋转对称性,由此可以容易实现上述目的。即,假设有N个加样孔,则就形成N个对称,由此可产生均匀的离心力。当然,要想各加样孔的配液量不同时,则并不限定于此。另外,通过以同心圆状配置加样孔,由此,通过旋转基材,可在一处检测区域实现所有加样孔的分析。
主流路103形成在比加样孔102更近于中心点侧的位置。如后述的采用试样分析芯片的处理方法所记载,作为主流路103和加样孔102之间的连接口,在旋转芯片之前的阶段,必须形成为溶液不会浸入加样孔的程度的宽度和截面积。由于关系到表面张力,因此也依赖于所使用的溶液,但例如溶剂 为水时,只要其为2×2mm2以下就可以满足该条件。
优选加样孔102的容积为1μL~100μL。若小于1μL,则离心力的作用不充分,难以向加样孔送液,另外,若大于100μL,则有可能出现试剂的混合性下降、或加样孔内温度的均匀性下降的现象。
另外,为了使空气不残留在加样孔102内,优选在加样孔的离中心点最近的点与主流路相连接。即,优选在加样孔侧的离中心点最近的点,连接侧路105与加样孔。
而且,在本发明的试样分析芯片中,在连接各加样孔102和主流路103的侧路105,每个侧路上都设置有废液部104。废液部可由从侧路分支的废液分支流路104a和与废液分支流路相连接的废液室104b构成。通过在连接加样孔102和主流路103的侧路上设置废液部,当向加样孔输送过量的溶液时,剩余溶液被输送到废液部而被储存,规定容量的溶液被残留在加样孔和加样孔分支流路105a。因此,能够减少由剩余溶液引起的配液偏差。
进行配液时,与废液室104b相比,加样孔102内先充满溶液,由此能够可靠地将溶液试剂填充到各个加样孔内。因此,重要的是,与废液室分支流路相比,使液体更容易地被输送到加样孔分支流路。
作为用以实现上述方式的方法,使加样孔分支流路105a的截面积大于废液室分支流路104a的截面积,由此在输送液体时产生压力损失差,能够将液体优先输送到加样孔内。根据该方法,溶液首先充满加样孔,然后,可将剩余溶液输送到废液室。因此,通过由截面积狭小的废液室分支流路104a和容量大的废液室104b构成废液部,能够容易地将溶液输送到加样孔分支流路侧,且可以调整废液部的容量。另外,剩余溶液的废液量可通过加样孔容量和废液室容量来调节。通过离心力输送液体时,各加样孔之间的偏差越大,废液室的所需容量就越大。
另外,作为其他的方法,通过使加样孔分支流路的流路内表面粗糙度小于废液室分支流路的表面粗糙度,从而在送液时产生压力损失差,能够将液体优先输送到加样孔内。
另外,作为其他的方法,对废液室分支流路的流路表面进行疏水处理,由此在输送液体时产生压力损失差,能够将液体优先输送到加样孔内。另外相反地,对加样孔分支流路的流路表面进行亲水处理,由此在输送液体时产 生压力损失差,能够将液体优先输送到加样孔内。作为疏水处理的方法,通常是采用氟系材料进行涂敷等的方法,该方法的耐药品性强,相反对反应的影响也小。另外,作为亲水处理方法,可举出等离子处理或电晕放电处理等,可以说均为通常所使用的方法。
而且,通过侧路105的形状和废液部104的配置,也可以使溶液优先输送到加样孔侧的分支流路。图5(A)和图5(B)表示由侧路105和加样孔102、废液室104b和废液室分支流路104a构成的废液部的示意图。实线的箭头表示中心点方向(旋转中心方向)。
在图5的各个构成中,侧路105形成为从旋转中心方向倾斜。如此地,通过将侧路形成为倾斜,在施加离心力时,加样孔102的空气沿着侧路内侧向主流路方向移动,另一方面,溶液沿着侧路外侧向加样孔方向移动,由此能够顺利地向加样孔内移动溶液。作为倾斜的角度,优选中心点方向与侧路之间形成的角度为10度~80度。若角度为10度以下,则有时加样孔的排气和向加样孔的溶液流入相互干扰而阻碍溶液的进入,若角度超过80度,则向侧路方向的离心力变弱,有时造成溶液无法向加样孔移动的情况。
在图5(A)和图5(B)中,对于倾斜的侧路105来说,通过废液室分支流路104a,形成有从侧路105向中心点侧分支的废液部104。图5(A)为侧路105直入到加样孔102的图,图5(B)为加样孔侧的侧路(加样孔分支流路105a)在与废液部的分支点上弯曲的图。对于废液室分支流路104a的弯曲,只要其以与分支前的侧路倾斜相同的方向倾斜,则可设置成任意形状。另外,如果废液室分支流路部分的容量足够装填废液量,则也可以不设置位于废液部末端的废液室104b。
如上所述,通过施加于溶液的离心力,溶液能够从由虚线表示的中心点先流入到外侧流路,即先流入到加样孔侧的分支流路,由此加样孔102比废液室104b优先被溶液充满,能够可靠地将溶液试样填充到各加样孔内。另外,当如图5(B)所示地弯曲加样孔侧的流路时,加样孔分支流路105a变小、或者可以在侧路的分支部位直接连接加样孔,因此加样孔被溶液填满后,将剩余溶液输送到废液室的流路会变短,由此可进一步减少流向加样孔的配液偏差。
另一方面,当溶液量少于规定容量的情况下,虽然无法通过废液部减少 各加样孔的试剂容量的偏差,但通过对主流路的形状加点功夫,也可以抑制原先输送液体时会产生的液量偏差。例如,可以采用与本发明第一实施方式的试样分析芯片相组合的试样分析芯片。图6和图7表示这种本发明试样分析芯片的另一实施方式。
另外,对于没有在下述实施方式中进行说明的第一实施方式的试样分析芯片的事项,只要其与第二实施方式不发生矛盾就可以进行组合,并可作为本发明的试样分析芯片。
在图6的试样分析芯片中,主流路103在相邻加样孔之间具有向中心点方向的一个山部。在此,相邻的加样孔是指,从主流路向加样孔的送液流路位于前后位置的加样孔。另外,具有向中心点方向的山部,是指具有向中心点方向的最大点(主流路山部103a)。如此地,通过在加样孔之间具有向中心点方向的一个山部,由此,被注入到主流路的液体在芯片旋转时,自然而然地在主流路山部被切断,因此可以减少各个加样孔的配液量偏差。
优选加样孔102和主流路103的连接部位,即优选主流路103和侧路105之间的连接部位为主流路的山部与山部之间的谷部103b。谷部是指,在主流路的山部与山部之间离中心点距离最远的部位。通过在该部位连接加样孔和主流路,能够减少配液时流向主流路的溶液的残留。
另外,在图6的试样分析芯片中,主流路103的宽度在主流路山部103a狭窄、在主流路谷部103b较宽。由于在相当于主流路山部103a的区域内存在的溶液少时,配液的偏差就小,因此,优选山部的主流路截面积小于其它部分的截面积。所以,优选使山部的流路宽度变窄和/或深度变浅。另外,基于相同理由,优选离山部越近,主流路的截面积就越小。
而且,通过扩大主流路谷部103b的宽度,能够控制流向各加样孔102的配液量。由此,如图2所示的试样分析芯片,将山部与山部之间的流路设置成腔室状,且任意设置从主流路山部到相邻主流路山部的主流路容积,则可将相同容量的试样从被夹在两个山部之间的谷部输送到与之连通的加样孔内,因此能够在各个加样孔设定任意量的溶液。
图7是本发明的试样分析芯片的其他另一个实施方式。在图7的试样分析芯片中,主流路103的山部相对于中心点方向倾斜,因此相对于侧路105,主流路被设计成其在基材平面上的左右面积不均等。相对于侧路105,左右 主流路中存在主流路宽度狭窄的流路侧和宽的流路侧,且在宽的流路侧形成有作为与加样孔的连接口的侧路105,由此,从加样孔向侧路移动的空气与主流路的溶液发生交替时,在偏向于面积大的主流路侧发生气泡与液体之间的交替。因此,能够减少主流路的残液。如此,通过使与各个加样孔连接的侧路和主流路具有上述构成,且在主流路中以山部为界而交替形成有宽度狭窄的流路侧和宽度宽的流路侧,因此,在各腔室状的主流路上同时发生相同的现象,从而可以减少配液的偏差。
接下来,对第一实施方式和第二实施方式的本发明试样分析芯片的制造方法进行说明。
图8为表示本发明的试样分析芯片结构的一实施方式的立体图。
本发明的试样分析芯片可通过在形成有加样孔和流路(包括主流路和侧路)的第一基材401上贴合第二基材402的方式来制造。在第一基材和第二基材中的至少一个基材上具有通过试样分析装置所具有的芯片旋转机构旋转芯片的旋转装置,作为该旋转装置,例如,为用于固定在芯片旋转机构上的载体部405。另外,在第一基材和第二基材中的一个基材上,至少形成一个贯通孔,以用作兼任注入口和空气脱出口的出口(INLET/OUTLET)。在贴合基材时,贯通孔与主流路的端部相一致。以下,为了方便说明,在检测和测量荧光反应等时,将位于测量面的基材一侧作为“上侧”、将位于下侧的一侧作为“下侧”。
作为基材,只要是不影响试剂的基材就没有特别的限制,特别是,如果使用含有聚丙烯、聚碳酸酯、丙烯酸中的任一种的树脂材料,则能够确保良好的可见光透过性。作为聚丙烯,可以使用均聚丙烯或聚丙烯与聚乙烯的无规共聚物。另外,作为丙烯酸,可以使用聚甲基丙烯酸甲酯、或者可以使用甲基丙烯酸甲酯与其他的甲基丙烯酸酯、丙烯酸酯、苯乙烯等单体的共聚体。另外,使用这些树脂材料的情况下,也可以确保芯片的耐热性和强度。作为除树脂材料以外的材料,可举出铝、铜、银、镍、黄铜、金等的金属材料。使用金属材料时,还在热传导率和密封性能方面优异。而且,通过使进行贴合的基材中的至少上侧基材的加样孔底部透明,由此能够从外部进行荧光等的检测和分析。其中,本发明中的“透明”和“光透过性”是指,在检测光的波长区域下的平均透过率为70%以上的情况。如果使用可见光区域(波长 350~780nm)的光透过性材料,则易于辨认芯片内的试剂状态,但并不限定于此。
作为形成加样孔、流路和废液部的基材的加工方法,当为树脂材料时,可以采用注塑成型、真空成型等的各种树脂成型方法或机械切割等。当为金属材料时,可通过实施利用较厚基材的研磨加工或蚀刻、在较薄金属片上实施压力加工或拉伸加工而形成。
另外,作为第一基材,特别是使用含有聚丙烯、聚碳酸酯、丙烯酸中的任一种的树脂材料时,能够确保良好的光透过性、耐热性和强度。另外,当第一基材的厚度为50μm~3mm范围时,能够确保良好的光透过性、耐热性和强度,且能够可靠地进行凹部加工。
另外,当第二基材的厚度为10μm~300μm范围时,可以同时满足第二基材的热传导性和密封性。如果第二基材的厚度大于300μm,则热容量变大,存在热响应性降低的担忧。
图9表示本发明的试样分析芯片的剖面图。在第一基材401上形成有贯通芯片的溶液注入口403、使注入液流入芯片的主流路即沟槽103、与向芯片的外周部延伸的各个加样孔连通的侧路即沟槽105和成为芯片外周部的加样孔的凹槽102。另外,图9的剖面图是表示从注入口(INLET/OUTLET)到加样孔之间路径的示意图,但主流路和侧路的形状并不限定于此。为了使所注入的溶液装满于所有样孔内,主流路的容积必须大于各加样孔容积之和。然而,当加样孔中固定有试剂501时,进入到反应加样孔的液体试剂量会相应地减少,因此也可以相应地减少液体流入流路的容积量。当为了进行荧光反应或测量而在第一基材侧进行检测时,优选加样孔的凹部呈不使光发生散射的平滑形状。
在贴合基材之前,将反应用试剂501固定在加样孔102上。在各个加样孔内可以使用不同的试剂。通过在各个反应加样孔内分别固定不同的试剂,由此能够对一个检测体(试样)实施多个处理。另外,可以将用来进行实际反应的一部分试剂固定在各个加样孔,而剩余的试剂与液体试剂一起导入到加样孔内。
作为试剂501的固定方法,例如可使用下述方法:用移液管等将液体试剂滴加到第一基材的加样孔部分,采用离心装置在2000~3000rpm的条件下, 对第一基材401进行5分钟的离心,由此,以平坦的液面状态残留适量的液体试剂,然后对其进行干燥,由此将试剂固定在加样孔上。
另外,也可以将试剂固定在加样孔后再滴加石蜡502。具体来说,在加热板上熔融石蜡后,用移液管将其滴下,以使其覆盖干燥后的试剂。此时,石蜡经过几秒钟后固化。石蜡具有将试剂固定在加样孔的凹部的作用。
作为贴合基材方法,可举出在一个基材上设置作为粘接层的树脂涂层,并使其熔融而粘接两个基材的方法。优选树脂涂层设置在热传导率高的金属材料基材上并进行熔融粘接。作为树脂涂层的材料,可以使用PET、聚缩醛、聚酯或聚丙烯等的树脂材料。
在上述的贴合方法中,优选作为第一基材使用容易进行微细加工且适合荧光测量的光透过性树脂材料,作为第二基材使用热传导率高、且容易设置树脂涂层并通过熔融粘接进行贴合的金属材料。另外,通过在金属基材表面形成树脂涂层,在选定材料时可以不考虑金属基材自身的耐药品性。
另外,在基材表面形成树脂涂层时,通过作为树脂涂层的底层形成增粘(锚固,anchor)层,由此可采用激光来进行熔融粘接。在增粘层中混合有吸收激光波长光的碳黑(光吸收性材料),通过照射激光产生热,由此能够对树脂涂层进行熔融粘接。或者,也可以通过在树脂涂层中添加碳黑、或将树脂涂层的表面涂覆为黑色的方式来代替在增粘层中添加碳黑。例如,在照射波长为900nm左右的红外激光二极管的光,也可以有效地熔融树脂涂层。与热熔接不同,激光熔接无需加热芯片,因此,可在几乎不会影响到芯片或被固定在芯片上的试剂的情况下,实施基材的贴合,。
根据附图,对本发明第三实施方式的试样分析芯片及其制造方法进行说明。
另外,为了方便说明,在检测荧光反应等时,将位于测量面一侧的基材侧作为“上侧”、将位于下侧的一侧作为“下侧”。
图10是本发明第三实施方式的试样分析芯片的立体图。在图10所示的本发明的试样分析芯片的实施方式中,将上侧的第一基材401’和下侧的第二基材402’加以组合而成,在第一基材上形成有用于输送试剂等溶液的流路、以及使溶液和试剂类发生反应的加样孔。而且,在第一基材或第二基材上,至少设置有一个兼作注入口和空气脱出口的贯通孔403,以将溶液注入到所 形成的流路。
图11例示形成于第一基材上的加样孔102和流路(主流路或注入部103、侧路105)。本发明的芯片包括位于基材101上的外周部的多个加样孔102和将溶液(如液体试剂)输送到加样孔的流路。流路呈图11A或图11B所示的形状,并包括:从注入口注入溶液的主流路或注入部103;以及为了向各加样孔分配液体而连接主流路或注入部与加样孔的侧路105。
另外,本发明第三实施方式的试样分析芯片,只要与第一实施方式和第二实施方式不发生矛盾,就可以进行组合,并将其作为本发明的试样分析芯片。例如,可将主流路103的形状设置成第一实施方式所示的波状,或者也可以设置成侧路105上具有废液部的形状。另外,也可以与除第一实施方式或第二实施方式以外的构成相组合。
本发明的试样分析芯片,是通过旋转该芯片而产生的离心力来将液体分配给各个加样孔102。通过离心力输送液体的优点在于,无需在各个加样孔设置用于排气的开口部,通过离心力将液体试剂与加样孔内的空气发生置换,从而可使液体试剂进入加样孔内。由此,能够提高加样孔的密封性、且能够防止来自外部的污染。由于采用旋转芯片的方式,因此优选芯片的形状为中心部具有旋转轴的贯通点(以下,称为中心点)的圆盘状,但是,只要其能够相对于贯穿芯片的旋转轴旋转即可,没有特别的限制。如果芯片为圆盘状,则可将其中心作为旋转轴,并以与该圆盘状的芯片成为同心圆状方式配置加样孔,因此,空间得到有效利用,且由于以同心圆状来配置加样孔,因此通过旋转基材,可在一个部位的检测区域实现所有加样孔的分析。
作为通过外部的旋转机构旋转芯片的旋转装置,例如图10所示,在第一基材上设置有载体部405。
本发明的试样分析芯片中,第一树脂基材401’为透过可见光的光透过性树脂,且第二树脂基材402’具有红外线透过性。通过具有如此构成,可使用红外线激光熔融第一基材的与第二基材之间的界面部分,并进行粘接,由此可以制造出本发明的芯片。与热熔接相比,激光熔接的最大优点在于,制造芯片时,几乎不会对芯片或被固定在芯片上的试剂造成影响。与使用压敏粘合剂的情况相比,不会发生因粘接剂引起的加样孔内试剂的污染,且能够充分地确保熔熔接后芯片的耐热性和耐水性。以下,进一步详细说明。
为了进行加样孔的荧光测量,位于测量面一侧的第一基材401’中的至少加样孔102部分,必须具有透过750nm以下可见光的光透过性。优选至少对荧光波长具有50%以上的平均透过率,更优选具有70%以上的平均透过率。因此,作为第一基材,优选使用含有聚丙烯、聚碳酸酯、丙烯酸中的任一种的树脂材料。通过使用这些材料,能够确保良好的可见光透过性。作为聚丙烯,可以使用均聚聚丙烯或聚丙烯与聚乙烯的无规共聚物。另外,作为丙烯酸,可以使用聚甲基丙烯酸甲酯、或者可以使用甲基丙烯酸甲酯与其他的甲基丙烯酸酯、丙烯酸酯、苯乙烯等单体的共聚体。另外,使用这些树脂材料,也可以确保芯片的耐热性和强度。
另外,当第一基材401’的厚度为0.05mm~3mm范围的情况下,可以确保可见光透过性、耐热性和强度,且能够可靠地加工流路和加样孔。其中,第一基材可以采用注塑成型、真空成型等的各种树脂成型方法或机械切割等。通过在第一基材侧形成加样孔102、流路和载体部405,由此能够使位于红外线照射侧的第二基材形成为板状或膜状,可以进行后述的无熔接不匀现象的贴合。另外,为了荧光反应等的光学测量,第一基材中的至少加样孔的底部形成为平坦面。
另外,利用红外线激光熔融粘接第一基材401和第二基材402’时,为了提高激光熔接的效率,优选第一基材对红外线激光具有光吸收性。特别是,通过使第一基材中的至少包括贴合面的一部分吸收红外线,由此易于使树脂熔融,并进行粘接。
另外,通过在第一基材401’中含有红外线吸收剂,从而吸收红外线激光,可提高将红外线光能转换成热能的效率。而且,通过含有红外线吸收剂,可以使用不吸收红外线部分的树脂。红外线激光一般通过使用具有750nm以上波长的半导体激光来得到。因此,作为红外吸收剂,可以使用在750nm以上的区域具有最大吸收波长的化合物、即所谓的色素化合物。色素化合物通常可分为染料和颜料两个种类,但从与树脂基材之间的相容性和透明性方面考虑,优选染料型色素化合物。为了确保可见光区域的透明性,优选在750nm以下的可见光区域中吸收尽可能少的红外线吸收剂。作为具体例子,可举出BASF公司的Lumogen(注册商标)IR765、Lumogen(注册商标)IR788等。
例如,当将聚丙烯用作树脂基材时,由于聚丙烯在红外线部分没有吸收, 因此必须在丙烯树脂中添加红外线吸收剂。具体来说,作为其一例,预先相对于100重量份的丙烯树脂添加0.01重量份的红外线吸收剂并进行混合,由此制造出含有红外线吸收剂的丙烯树脂颗粒。利用该颗粒进行注塑成型,由此制造出本实施方式的试样分析芯片的第一基材。另外,预先相对于100重量份的丙烯树脂添加0.1重量份的红外线吸收剂,由此制造出含有红外线吸收剂的丙烯树脂母料。然后,在进行注塑成型时,按规定比例混合上述含红外线吸收剂的丙烯树脂母料和丙烯树脂,并进行注塑成型,由此可以调整红外线吸收剂的含量。
作为第二基材402’必须对红外线激光具有透过性。作为用于第二基材的材料,优选具有与第一基材相同或相近组成的树脂。例如,当第一基材使用聚丙烯时,优选第二基材为均聚聚丙烯或者是聚丙烯与聚乙烯的无规共聚物。一般来讲,组成相同或相近的树脂之间容易粘接。另外,对于组成相同或相近的树脂来说,熔融温度之差一般较小。由此,可以提高激光熔接的效果。
第二基材402’可通过与第一基材相同的方法形成加样孔102、流路和载体部405,但优选两面均为平滑面的板状或膜状的基材。如果为板状或膜状的基材,则不发生因基材的膜厚差等而引起的熔融粘接不匀现象,能够以良好的粘着性贴合第一基材和第二基材。另外,优选第二基材的厚度范围为0.01mm~2mm、更优选的范围为0.05~0.5mm,由此可以确保第二基材的熔接性能和强度。进而,由于第二基材与加热块相接触,因此,当具有上述厚度时,可以获得充分的热效率。
图12是图11B的试样分析芯片沿虚线S的剖面图。为了使所注入的液体试剂充满所有的加样孔,与注入口连通的主流路容积必须大于各个加样孔的容积之和。然而,当试剂被固定在加样孔内时,进入加样孔的液体试剂量也相应地减少,因此也可以减少相应量的主流路容积。
在图12所示的本发明试样分析芯片中,在各加样孔 已固定有试剂。通过在各加样孔中分别固定不同的试剂,可以对一个检测体(试样)实施多个处理。另外,也可以将用来进行实际反应的一部分试剂固定在加样孔内,剩余的试剂与液体试剂一起导入到加样孔内。
在贴合基材之前,将反应用试剂501固定在加样孔102上。在各个加样孔内可以使用不同的试剂。通过在各个反应加样孔内分别固定不同的试剂, 由此能够对一个检测体(试样)实施多个处理。另外,可以将用来进行实际反应的一部分试剂固定在各个加样孔,而剩余的试剂与液体试剂一起导入到加样孔内。由此,提高芯片的保存性,而且,可在各加样孔中进行不同的反应,可同时实施多个检查。
作为试剂501的固定方法,例如可使用下述方法:用移液管等将液体试剂滴加到第一基材401’的加样孔部分,采用离心装置在2000~3000rpm的条件下,对第一基材进行5分钟的离心,由此,以平坦的液面状态残留适量的液体试剂,然后对其进行干燥,由此将试剂固定在加样孔上。
另外,也可以将试剂固定在加样孔后再滴加石蜡502。具体来说,在加热板上熔融石蜡后,用移液管将其滴下,以使其覆盖干燥后的试剂。此时,石蜡经过几秒钟后固化。石蜡具有将试剂固定在加样孔的凹部的作用。
接下来,在本发明的试样分析芯片中,将试剂固定在第一基材侧401’的加样孔102的凹部后,用红外线激光熔融粘接第一基材和第二基材402’,由此制造出密封型的芯片。作为红外线激光,只要其能够熔融第一基材表面即可,没有特别的限制,但红外线波长为800~1200nm时,适合进行激光熔接,因此是优选的。从实用的观点考虑,优选激光熔接机的功率为30以上。例如,功率为30~250W的激光机通常有市售,使用这些激光机一般不会有特殊问题。具体来说,贴合第一基材和第二基材,例如采用波长为808nm左右的红外激光电二极管,激光束从第二基材侧开始按照规定速度进行扫描并照射芯片,由此,将第一基材熔接在第二基材。通过调整激光的输出功率和扫描速度,可以有效地进行激光熔接。通过上述工序,完成试样分析芯片的制造。
接下来,对采用本发明各实施方式的试样分析芯片的试样分析方法进行说明。
本发明的试样分析芯片如可用于DNA、蛋白质等试样的生化物质的检测或分析。在各加样孔102上固定试剂后,将液体试剂分配给各加样孔。此时,各加样孔可以采用不同的试剂。或者将试剂固定在各加样孔,并将液体试剂分配给各个加样孔。此时,各加样孔可以使用不同的试剂。
接下来,对于贴合了第一基材401和第二基材402的本发明的试样分析芯片,首先,从注入口403(107)将试剂等溶液注入到主流路103。在该步骤中,溶液仅充满在主流路内,如上所述,并没有流入侧路。其原因在于, 由于溶液的表面张力和加样孔侧没有空气排出孔,因此存在来自加样孔侧的空气压。用于试样分析方法的试样分析装置中,也可以具有这样的溶液注入装置。
接下来,用于试样分析方法的试样分析装置,具有用于旋转试样分析芯片的芯片旋转机构。在芯片旋转机构中,可以使用公知的通常使用的离心装置。在试样分析装置上设置试样分析芯片,通过旋转机构并在芯片的中心点以芯片的垂直方向为旋转轴,使芯片旋转。作为旋转速度,其必须为下述的旋转速度:作用于溶液的离心力能够克服前述的空气压和表面张力,使溶液流入到加样孔的旋转速度。虽然也与芯片的形态有关,但优选约1000rpm以上的旋转速度。若芯片的旋转速度小于约1000rpm,则存在溶液无法流入加样孔内、且无法达到规定液量的担忧。
进行液体试剂的配液后,在相同工序中也可以将不妨碍试样和试剂的反应的油分配给各个加样孔。通过油的注入,可以防止液体在反应过程中蒸发。与之前配液的溶液相比,油必须使用比重轻于上述溶液的油。其原因在于,旋转芯片并通过离心力进行配液时,在侧路一侧起到各加样孔的塞子(栓)的作用。作为油的种类,只要不妨碍试样和试剂的反应,没有特别的限制,但可以优选使用矿物油或硅油。
将石蜡502用于试剂的固定时,试样分析装置中也可以设置采用由电热线等组成的加热器或珀尔贴元件(Peltier device)的温度控制装置。在石蜡熔点以上的温度下加热芯片,由此可使石蜡熔融,且使试剂和溶液(试样)在加样孔内混合。另外,该温度控制装置,例如,其也可以用于PCR反应等中对试剂反应的控制。
然后,可在加样孔内混合试剂和试样,并通过荧光检测等方法分析出其反应状态。试样分析装置包括在试样分析芯片的基材上侧的加样孔的位置上进行测量的检测装置。通过旋转机构旋转芯片,由此可以测定规定的加样孔。在本发明的试样分析芯片中,通过使基材的上侧透明,可以从芯片的外部进行光学测量。
综上所述,通过在各步骤中具有作用于试样分析芯片的机构,可实现既节省空间又易于进行试样分析的试样分析装置。
以下,对本发明的试样分析方法的实例进行说明。
作为基因分析的一例,例如可举出体细胞突变的检测或生殖细胞突变的检测。根据不同类型的基因,所表达的蛋白质种类等也不同,因此,例如产生的药物代谢酶的作用不同,其结果,最佳给药量或是否容易出现副作用等方面存在个体差异。在医疗现场利用这些情况调查各个患者的“基因型”,由此能够进行个性化医疗。
·SNPs的检测
人类基因组中存在约0.1%的个体所特有的不同的碱基序列,其被称为SNP(Single Nucleotide Polymorphism),是生殖细胞突变的一种。作为SNP的特定方法之一,例如可以利用采用荧光的同源双链优先形成试验(PCR-PHFA(PCR-Preferential Homoduplex Formation Assay))法。PCR-PHFA法由扩增检测突变部位的PCR工序和通过与扩增片段相对应的探针进行竞争性链置换反应的工序组成。根据该方法,通过荧光试剂所发出的光的差异检测出突变,但通过采用本发明的试样分析芯片,各加样孔的配液偏差小,因此,可以准确地检测出SNPs。另外,作为除上述方法以外的SNP检测方法,本发明的试样分析芯片同样也可以用于Invader分析法(注册商标)、Taqman PCR法等。
以下,说明采用本发明、并对涉及到华法林(warfarin)(抗凝血药,用于心脏病或高血压的药物)副作用的SNP使用PCR-PHFA法的分析例。
对从血液等获得的检测体核酸进行精制,并将其作为溶液试样。在注入本发明的试样分析芯片之前或者注入后进行配液之前,对检测体核酸进行扩增。另外,在涉及华法林的SNP检测中,对VKORC1或CYP2C9内的SNP争论较多,而有名的是CYP2C9*2或CYP2C9*3等。通过多重PCR,对来自检测体的、含有这些SNP的基因片段进行扩增。
在上述检测方法中,为了判断出一个SNP,需要两个检测用的加样孔,因此,最好使用针对一个检测体试样形成有10个以上加样孔的试样分析芯片,在各个加样孔上固定进行竞争性链置换反应的、SNP检测用的试剂。
将通过上述PCR扩增了核酸的试样,通过配液填充至各个加样孔内。调整各加样孔的温度,并通过混入到所述试剂的荧光试剂的发光差检测出突变。相对于一个SNP,如果两个加样孔中只有一个加样孔呈阳性反应,则可以判断为均质,如果两个均呈阳性,则可以判断为异质。
·K-ras基因突变的检测
癌细胞上的特有突变、或者对分子靶向药物显示抗性的突变,这些几乎都属于体细胞突变。如果是生殖细胞突变(SNP等),在任意细胞中都可以看到共同的突变,相对于此,体细胞突变仅在发生突变的细胞中看到,未发生突变的细胞(通常为正常细胞)中看不到突变。
即,试样中大部分为正常细胞仅含有一部分突变细胞的情况下,必须检测出存在于大量正常基因中的少许突变基因,这与生殖细胞中的突变检测不同,进一步加大了体细胞的基因突变检测。
K-ras基因是,如果突变存在于癌细胞,则分子靶向药物对大部分患者群无药效的基因,因此希望简单迅速地、价格低廉且高精度地检测出该基因。
以下,对使用PCR-PHFA法的K-ras基因的分析例进行说明。
在上述基因突变的检测用加样孔上固定有包括探针核酸的试剂。K-ras基因的检测有野生型和13种突变,因此优选使用至少形成有14个加样孔的本发明的试样分析芯片,且固定有对应于各加样孔的试剂。
采集大肠癌等的癌细胞,并对检测体核酸进行精制后用作溶液试样。
在注入本发明的试样分析芯片之前,或者注入后进行配液之前,对检测体核酸进行扩增。
将通过上述PCR扩增了核酸的试样,配液填充至各个加样孔内。调整各加样孔的温度,并通过混入到所述试剂的荧光试剂所发出的荧光之差检测突变。
实施例
以下表示本发明中的实施例,但本发明并不限定于此。
实施例1
实施例1表示将本发明的试样分析芯片用作SNPs分析芯片的例子。
作为SNPs芯片基材使用聚丙烯树脂,并通过注塑成型,形成图2所示的具有圆盘状外形且在同心圆上具有波状主流路103、在主流路谷部103b具有连接口的侧路105和在侧路末端具有加样孔102的芯片。该基材(聚丙烯基材)上分别形成有23个加样孔和侧路。另外,主流路的面积有周期性变化,并设置成相邻的主流路山部103a之间的主流路容积达到12μL。
作为与上述聚丙烯基材相贴合的第二基材,使用作为树脂涂层涂覆有聚丙烯树脂的铝薄片基材。树脂涂层的厚度约为0.07mm。树脂涂层的熔点为120度左右,且树脂涂层涂覆在该铝基材上,以使只要加热铝侧就发生熔融。
而且,在铝层和树脂涂层之间设置混合有碳的增粘(锚固)层,通过激光照射产生的热,也可以使树脂涂层熔融。
在该聚丙烯基材上的加样孔,用移液管滴加Invader(インベ一ダ一)反应用探针试剂、DNA聚合酶和卵裂(cleavage)等酶类,并对其进行干燥固定。
使该聚丙烯基材与该铝基材重叠,且将铝基材一侧加热至130度以上,由此使该树脂涂层熔融,并熔接该聚丙烯基材和铝基材。
利用移液管将经过精制的、添加基因组的缓冲溶液作为溶液试样输送到由上述工序制造的芯片上,并填充主流路103。该步骤中试样不流入加样孔和侧路。
另外,上述各试剂类的使用量为下述表1所示。
表1
输送液体后,在以芯片中心为轴、5000rpm的转速条件下旋转芯片,结果,11μL的试样被输送到各个加样孔内。作为使离心力作用于芯片的装置,制造利用了用于化学生物反应中试剂分离等的小型台式离心机的简易离心装置,并使用该装置。离心时的转速,是通过转速测量器进行测量后调整。
另外,对于离心时的芯片旋转方向,可以确定下述情况:相对于侧路倾斜的方向,不管在哪个方向上旋转,在增加转速的过程中还是对芯片内的液体流动带来影响,但对加样孔内的配液偏差不产生影响。
接下来,用相同的方法输送不妨碍反应的矿物油,结果,试样充满在加样孔内,而剩余溶液填满侧路的一半左右,油则填满侧路的另一半和80%的流路谷。
另外,在本实施例中,在22个加样孔上固定用作反应试剂的Invader反应用探针。另外,为了判断反应结果的成功与否,将阴性对照设定在一个部位上用以确认是否存在污染,并在一个芯片上进行反应试验。
对于上述反应容器通过油而处于独立状态的试样分析芯片,交替施加95℃和68℃、并进行35个循环,通过PCR反应扩增试样的基因组。接下来,在63℃的温度下保持30分钟,由此通过酶反应在加样孔内产生荧光检测反应。
另外,此时芯片的聚丙烯基材侧为透明,因此通过聚丙烯基材从外部进行荧光检测。本实施例中,通过组合光电倍增管和光纤的荧光检测装置测定上述荧光反应。
图13和图14是根据本实施例检测出的荧光反应进行的SNPs分析结果的图表。各图表的纵轴为检测出的光强度,表示荧光强度。横轴为时间轴。
图13为进行反应的一个加样孔的结果,规定时间内通过混合的试剂类产生荧光检测反应的情况得到了确认。
图14中,由于是预先没有固定试剂类的加样孔,因此无法检测出荧光反应。由此,可确认没有发生相邻试样的污染。
另外,图15是通过聚丙烯制的管,用通常的方法以最佳的分量比混合试剂类和试样后所获得的检测数据(阳性对照)。若比较图13和图15,则根据图13所示的本实施例在芯片内的反应与图15的反应相一致,因此可以确定本实施例为以最佳分量比进行的反应。由此可知,能够配出所需量的试样。
如本实施例1,在本发明中将适于反应的材料选定为贴合基材,由此能够更简单地、且在短时间内有效地进行反应工序。
实施例2
作为实施例2,对本发明的具有其他流路形状的试样分析芯片进行研究。
本实施例中,制造出具有图3所示形状的试样分析芯片。在实施例1中,为了防止妨碍反应的物质的混入,通过对耐药性高的聚丙烯树脂进行注塑成 型的方式制造出芯片,但是,为了进行流路形状的研究,这次利用 到 的立铣刀对丙烯酸树脂进行机械切割加工,由此形成流路形状。
在实施例1所使用的具有图2形状的试样分析芯片(芯片1)和具有上述图3形状的试样分析芯片(芯片2)中,将用溴酚蓝着色的纯水输送到主流路上,且与实施例1相同地、在5000rpm的转速条件下以圆心状芯片的中心为轴旋转芯片,实施10次后测量偏差。另外,假设所有的试样分析芯片中液体被均匀地输送到各加样孔内时,其液量为12μL。
在芯片1中,送液量的最小值为9.5μL、最大值为14.0μL。相对于此,芯片2中偏差的最小值为11.0μL,最大值为12.5μL,表现出能够大幅抑制配液量偏差。
实施例3
实施例3中,作为本发明的试样分析芯片的第一基材401,使用聚丙烯树脂,并通过注塑成型形成下述芯片:具有图7所示的圆盘状外形,具有同心圆上的波状主流路103、在主流路谷部103具有连接口的侧路105和位于侧路末端的加样孔102,且还包括从侧路分支的加样孔分支流路105a和废液室分支流路104a、以及废液室105b。该基材(聚丙烯基材)上分别形成有23个加样孔和侧路。主流路的面积有周期性变化,主流路的山部与山部之间的谷部103b的容积为15μL,另外,加样孔分支流路容积为2μL、加样孔内容积为11μL、废液室容积为5μL。
作为与上述聚丙烯基材相贴合的第二基材402,使用作为树脂涂层涂覆有聚丙烯树脂的铝薄片基材。树脂涂层的厚度约为0.07mm。树脂涂层的熔点为120度左右,且树脂涂层涂覆在该铝基材上,以使只要加热铝侧就发生熔融。
而且,在铝层和树脂涂层之间设置混合有碳的增粘(锚固)层,通过激光照射产生的热,也可以使树脂涂层熔融。
在该聚丙烯基材上的加样孔,用移液管滴加Invader(インベ一ダ一)反应用探针试剂、DNA聚合酶和卵裂(cleavage)等酶类,并对其进行干燥固定。
使该聚丙烯基材与该铝基材重叠,且将铝基材一侧加热至130度以上,由此使该树脂涂层熔融,并熔接该聚丙烯基材和铝基材。
利用移液管将经过精制的、添加了基因组的缓冲溶液作为溶液试样输送到由上述工序制造的芯片上,并填充主流路103。该步骤中试样不流入加样孔和侧路。
另外,上述各个试剂的使用量与实施例1的表1所记载的使用量相同。
输送液体后,在以芯片中心为轴、5000rpm的转速条件下旋转芯片,由此液体充满各加样孔和加样孔分支流路,废液室中收容有0.5μL~3μL的溶液。11μL的试样被输送到各加样孔内。作为使离心力作用于芯片的装置,制造利用了用于化学生物反应中试剂分离等的小型台式离心机的简易离心装置,并使用该装置。离心时的转速,是通过转速测量器进行测量后调整。
另外,对于离心时的芯片旋转方向,可以确定下述情况:相对于侧路倾斜的方向,不管在哪个方向上旋转,在增加转速的过程中还是对芯片内的液体流动带来影响,但对加样孔内的配液偏差不产生影响。
接下来,用相同的方法输送不妨碍反应的、试剂类表(表1)所述的矿物油,结果,试样充满在加样孔内,而剩余溶液填满侧路的一半左右,矿物油则完全填满加样孔分支流路、废液室分支流路和侧路,以及部分主流路。
另外,在本实施例中,在22个加样孔上固定用作反应试剂的Invader反应用探针。另外,为了判断反应结果的成功与否,将阴性对照设定在一个部位上用以确认是否存在污染,并在一个芯片上进行反应试验。
对于上述反应容器通过油而处于独立状态的试样分析芯片,交替施加95℃和68℃、并进行35个循环,通过PCR反应扩增试样的基因组。接下来,在63℃的温度下保持30分钟,由此通过酶反应在加样孔内产生荧光检测反应。
另外,此时芯片的聚丙烯基材侧为透明,因此通过聚丙烯基材从外部进行荧光检测。本实施例中,通过组合光电倍增管和光纤的荧光检测装置测定上述荧光反应。
测量的结果,与实施例1同样,通过被分配到各加样孔的试剂,在规定时间内由混合的试剂类产生荧光检测反应的情况得到确认,并得到了与通过常规的方式按最佳的分量比混合试剂类和试样后所获得的检测数据相同的结果。另外,在阴性对照的加样孔中没有检测出荧光反应。由此确认了没有发生相邻试样的污染。
实施例4
作为本发明试样分析芯片的实施例,制造了图11(B)和图3所记载的试样分析芯片。采用聚丙烯树脂并通过注塑成型加工第一基材401’。侧路105的宽度约为1mm,加样孔102的上部呈平坦的梯形,加样孔底部的直径约为3mm、容积约为7μL。
由于聚丙烯在红外线部分没有吸收,因此必须在丙烯树脂中添加红外线吸收剂。在本实施例中,相对于100重量份的丙烯树脂预先添加0.01重量份作为红外线吸收剂的BASF公司的Lumogen(注册商标)IR765并进行混合,由此准备含有红外线吸收剂的丙烯树脂颗粒,然后利用该颗粒进行注塑成型,由此制造出上述试样分析芯片的第一基材。
另外,作为第二基材402’使用厚度约为0.15mm的丙烯薄膜。
在第一基材401’上的加样孔,用移液管滴加Invader反应用探针试剂、DNA聚合酶和卵裂(cleavage)等酶类,并对其进行干燥固定。
使第一基材401’和第二基材402’重叠,然后采用波长为808nm、功率为140W的红外激光电二极管,使激光束从第二基材侧开始按照规定速度进行扫描并照射芯片,由此熔接第一基材和第二基材。
利用移液管将经过精制的、添加基因组的缓冲溶液作为溶液试样输送到由上述工序制造的芯片上,并填满主流路103。在该步骤中试样不流入加样孔和侧路。
另外,上述各个试剂的使用量与实施例1的表1所记载的使用量相同。
输送液体后,在以芯片中心为轴、5000rpm的转速条件下旋转芯片,由此,11μL的试样被输送到各加样孔内。作为使离心力作用于芯片的装置,制造利用了在化学生物反应中用于试剂分离等的小型台式离心机的简易离心装置,并使用该装置。离心时的转速,是通过转速测量器进行测量后调整。
接下来,用相同的方法输送不妨碍反应的试剂类表(表1)所记载的矿物油,此时,试样充满在加样孔内、剩余溶液填满一半左右的侧路。
另外,在本实施例中,在22个加样孔上固定用作反应试剂的Invader反应用探针。另外,为了判断反应结果的成功与否,将阴性对照设定在一个部位上用以确认是否存在污染,并在一个芯片上进行反应试验。
对于上述反应容器通过油而处于独立状态的试样分析芯片,交替施加95℃和68℃、并进行35个循环,通过PCR反应扩增试样的基因组。接下来,在63℃的温度下保持30分钟,由此通过酶反应在加样孔内产生荧光检测反应。
另外,此时从芯片的第一基材401’侧的外部进行荧光检测。本实施例中,通过组合光电倍增管和光纤的荧光检测装置测定上述荧光反应。
测定的结果,与实施例1同样,通过被分配到各加样孔的试剂,在规定时间内由混合的试剂类产生荧光检测反应的情况得到确认,并得到了与通过常规的方式按最佳的分量比混合试剂类和试样后所获得的检测数据相同的结果。另外,在阴性对照的加样孔中没有检测出荧光反应。由此确认了没有发生相邻试样的污染。
工业实用性
本发明的反应芯片,例如可用来检测和分析核酸等试样中的生化物质。特别是,由于能够检测出SNP的突变,因此可利用于检测癌细胞等的基因、生殖细胞或体细胞基因的突变的检测方法中。另外,也可以用作混合多个溶液的容器、反应容器。
附图标记的说明
101 基材
102 加样孔
103 主流路
103a 主流路山部
103b 主流路谷部
104 废液部
104a 废液室分支流路
104b 废液室
105a 加样孔分支流路
105 侧路
107 入口/出口
401 第一基材
401’ 第一基材(光透过性树脂)
402 第二基材
402’ 第二基材(红外线透过性树脂)
403 入口/出口(贯通孔)
405 载体部
501 固定试剂类
502 石蜡
Claims (28)
1.一种试样分析芯片,在基材上具有多个加样孔、与各加样孔连接的流路和向流路注入溶液的注入口,并通过旋转该基材,将溶液分配给各个加样孔,其特征在于,
所述基材为圆盘状,所述加样孔配置成与所述基材呈同心圆状,
所述基材具有两个贯通孔,
所述流路具有用于向上述各加样孔输送液体的主流路,该主流路设置在比所述加样孔更接近旋转中心侧的位置,且在相邻加样孔之间具有相对于旋转中心方向的一个山部,在所述主流路的山部和山部之间的谷部连接所述加样孔和主流路,
所述流路具有连接主流路和加样孔的侧路,所述侧路形成为将加样孔侧的离中心点最近的点与所述主流路侧的谷部相连接,
所述主流路在一侧端部具有注入口,在另一侧端部具有兼任剩余溶液脱出口和空气脱出口的出口,
所述两个贯通孔是用作所述注入口和所述出口的贯通孔,
在贴合基材时,所述贯通孔与主流路的端部相一致,
所述芯片除了所述注入口/所述出口(107)区域之外,以中心点为轴具有旋转对称性。
2.如权利要求1所述的试样分析芯片,其特征在于,相对而言,所述主流路的宽度在山部狭窄,在谷部宽。
3.如权利要求1所述的试样分析芯片,其特征在于,相对于旋转中心方向倾斜而形成所述侧路。
4.如权利要求1~3中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,相对于旋转中心方向倾斜而形成所述主流路。
5.如权利要求1~3中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,
具有用于连接所述主流路和加样孔的侧路,
且在所述侧路上设置有用于收集剩余溶液的废液部。
6.如权利要求5所述的试样分析芯片,其特征在于,所述废液部包括用于收集废液的废液室以及对所述侧路进行分支且与所述废液室相连接的废液室分支流路。
7.如权利要求5所述的试样分析芯片,其特征在于,
相对于旋转中心方向倾斜而形成所述侧路,
且相对于旋转中心方向,所述废液部设置在侧路的内侧。
8.如权利要求6或7所述的试样分析芯片,其特征在于,
与所述加样孔连通的分支流路的送液时压力损失小于与所述废液室连通的分支流路的送液时压力损失。
9.如权利要求8所述的试样分析芯片,其特征在于,与所述加样孔连接的分支流路的截面积大于所述废液室分支流路的截面积。
10.如权利要求8所述的试样分析芯片,其特征在于,与所述加样孔连接的分支流路的表面粗糙度小于废液室分支流路的表面粗糙度。
11.如权利要求8所述的试样分析芯片,其特征在于,对废液室分支流路的流路内表面进行疏水处理。
12.如权利要求8所述的试样分析芯片,其特征在于,对与加样孔连接的分支流路的流路内表面进行亲水处理。
13.如权利要求1~3中任一项所述的试样分析芯片,其特征在于,所述试样分析芯片具有:形成有所述加样孔和所述流路的第一基材;以及与该基材贴合的第二基材。
14.如权利要求13所述的试样分析芯片,其特征在于,所述基材中的任一者由光透过性材料形成。
15.如权利要求14所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第一基材为光透过性树脂材料,第二基材为金属材料。
16.如权利要求14所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第一基材由对可见光具有光透过性且对红外线具有光吸收性的树脂构成,所述第二基材是至少透过波长800nm以上的红外线的板状或膜状。
17.如权利要求16所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第一基材为聚丙烯、聚碳酸酯、丙烯酸树脂中的任意树脂基材。
18.如权利要求16或17所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第一基材含有在800nm以上的波长区域具有吸收的红外线吸收剂。
19.如权利要求13所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第二基材为聚丙烯、聚碳酸酯、丙烯酸树脂中的任意树脂基材。
20.如权利要求13所述的试样分析芯片,其特征在于,所述第二基材的厚度为0.05~0.5mm。
21.如权利要求13所述的试样分析芯片,其特征在于,在所述第一基材上设置有用于旋转试样分析芯片的载体部。
22.一种试样分析芯片的制造方法,是权利要求16~20中任一项所述的试样分析芯片的制造方法,其特征在于,
从所述第二基材侧照射红外线激光,使所述第一基材和所述第二基材熔融粘接,并进行贴合。
23.如权利要求22所述的试样分析芯片的制造方法,其特征在于,所述红外线激光的波长为800~1200nm。
24.如权利要求22或23所记载的试样分析芯片的制造方法,其特征在于,
在所述试样分析芯片的制造中,包括贴合所述第一基材和所述第二基材之前,在所述加样孔上固定试剂的工序。
25.一种试样分析装置,包括:
设置权利要求1~21中任一项所述的试样分析芯片并使其旋转的装置;以及
用于检测所述加样孔的反应的检测装置。
26.一种试样分析方法,包括:
将溶液注入到权利要求1~21中任一项所述的试样分析芯片的所述主流路的工序;以及
使该试样分析芯片旋转,从而将溶液分配给所述各加样孔的工序。
27.一种试样分析方法,其特征在于,在权利要求26所述的试样分析方法中,将溶液分配给所述加样孔的工序之后,包括将矿物油分配给所述各加样孔的工序。
28.一种基因分析方法,其特征在于,使用权利要求26或27所述的试样分析方法。
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