CN101688240A - 通过微rna预测癌症患者的治疗后存活预期 - Google Patents
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Abstract
本发明提出基于癌症患者体内微RNA hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平预测癌症患者治疗后的存活预期的方法。
Description
相关申请的交叉引用
本申请要求于2007年4月10日提交的美国临时申请60/910993号的优先权,该临时申请的内容通过引用全文并入本申请中。
背景技术
肺癌,特别是非小细胞肺癌(NSCLC)是全球最常见的癌症死因,参见Jemal等,CA Cancer J.Clin.56:106-130(2006)。早期NSCLC患者经治疗后5年内的复发率约为40%;研究指出,疾病进程可能与临床预后相关,参见Miller,Am.J.Respir.Cell Mol.Biol.33:216-223(2005)。然而,单靠这一因素无法适当地预测临床预后。
研究指出,基因表达谱分析,特别是微RNA(MicroRNA,miRNA)谱分析,可用于癌症诊断及预后,参见Endoh等,J.Clin.Oncol.22:811-819(2004);以及Potti等,N.Engl.J.Med.355:570-580(2006)。例如在确定癌症亚型时,已经发现某些微RNA的表达模式比编码蛋白质的基因更为精确,参见Calin等,Nat.Rev.Cancer 6:857-866(2006);以及Volinia等,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.103:2257-2261(2006)。
微RNA是小型的非蛋白质编码性的RNA,其可通过RNA干扰而在转录后调节数百种基因的表达,因而控制非常多的生化反应路径,例如,细胞增殖、分化及凋亡,参见Calin等,2006。有报道指出,特定微RNA印记(signature),即在一组患者中呈现特定表达模式的一种或多种微RNA与慢性淋巴细胞性白血病、肺腺癌、乳腺癌、胰腺癌及多种癌症的临床预后相关,参见Calin等,2006。鉴别新的微RNA印记具有很大的意义,因为这些微RNA印记可有效地用以预测各种癌症,特别是NSCLC的临床预后。
发明内容
本发明基于特定微RNA,例如hsa-miR137、hsa-miRNA372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平与癌症患者治疗后的存活预期相关的发现。
本发明的一个方面是提供一种用以预测癌症患者的治疗后存活预期的方法。上述方法是根据hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221或hsa-let-7a的表达水平确定标准化的域周期值(-dCt)。若hsa-miR137、hsa-miR182*及hsa-miR372的-dCt值分别等于或小于-8.22、-7.83及-11.25,或若hsa-miR221及hsa-let-7a的-dCt值分别等于或大于-0.57及2.21时,则判定患者治疗后的存活预期尚可接受(a fair prospect)。
本发明的另一个方面,根据四种微RNA的表达水平可以预测癌症患者的治疗后存活预期,上述四种微RNA是选自hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a。具体而言:
1.当评估hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平时,风险评分的计算方式如下:(0.31x hsa-miR372的表达水平)+(0.28x hsa-miR182*的表达水平)+(-0.13x hsa-miR221的表达水平)+(-0.14x hsa-let-7a的表达水平)。风险评分等于或小于-5.90表示患者治疗后的存活预期尚可接受。
2.当评估hsa-miR137、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平时,风险评分的计算方式如下:(0.15x hsa-miR137的表达水平)+(0.28x hsa-miR182*的表达水平)+(-0.13x hsa-miR221的表达水平)+(-0.14x hsa-let-7a的表达水平)。风险评分等于或小于-3.71表示患者治疗后的存活预期尚可接受。
3.当评估hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平时,风险评分的计算方式如下:(0.15x hsa-miR137的表达水平)+(0.31x hsa-miR372的表达水平)+(-0.13x hsa-miR221的表达水平)+(-0.14x hsa-let-7a的表达水平)。风险评分等于或小于-4.87表示患者治疗后的存活预期尚可接受。
4.当评估hsa-miR137、hsa-miR182*、hsa-miR372及hsa-let-7a的表达水平时,风险评分的计算方式如下:(0.15x hsa-miR137的表达水平)+(0.28x hsa-miR182*的表达水平)+(0.31x hsa-miR372的表达水平)+(-0.14x hsa-let-7a的表达水平)。风险评分等于或小于-7.02表示患者治疗后的存活预期尚可接受。
5.当评估hsa-miR137、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-miR372的表达水平时,风险评分的计算方式如下:(0.15x hsa-miR137的表达水平)+(0.28x hsa-miR182*的表达水平)+(-0.13x hsa-miR221的表达水平)+(0.31x hsa-miR372的表达水平)。风险评分等于或小于-6.86表示患者治疗后的存活预期尚可接受。
本发明又一个方面,可以根据上述五种微RNA的表达水平预测癌症患者治疗后的存活预期。风险评分的计算方式如下:(0.15xhsa-miR137的表达水平)+(0.31x hsa-miR372的表达)+(0.28xhsa-miR-182*的表达水平)+(-0.13x hsa-miR221的表达水平)+(-0.14x hsa-let-7a的表达水平)。若癌症患者的风险评分等于或大于-7.1,则该癌症患者治疗后的存活预期尚可接受。
本发明再另一个方面,可以根据hsa-miR221、hsa-miR372及hsa-miR137的表达水平预测癌症患者治疗后的存活预期。风险评分的计算方式如下:(0.15x hsa-miR137的表达水平)+(0.31xhsa-miR372的表达)+(-0.13x hsa-miR221的表达水平)。若癌症患者的风险评分等于或小于-4.7,则该癌症患者治疗后的存活预期尚可接受。
癌症患者「治疗后的存活预期尚可接受」表示此癌症患者治疗后死亡的风险比患相同类型癌症患者的平均死亡风险低至少50%(例如,100%或150%)。
本发明范围内还包括用以检测微RNA表达的试剂盒。在一实施例中,该试剂盒包含能够检测hsa-miR221、hsa-miR372及hsa-miR137的表达的寡核苷酸。在另一种实施例中,该试剂盒包含能够检测选自hsa-miR 137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的至少四种微RNA的表达的寡核苷酸。可将上述试剂盒中任一种所含的寡核苷酸固定于支承组件(例如,聚合物基材)上以形成核酸芯片。
经过治疗(如手术治疗、化学治疗或放射治疗)的所述癌症患者患肺癌(例如,各期的非小细胞肺癌)、白血病、乳腺癌、胰腺癌、腺癌或鳞状细胞癌、结肠癌或肝细胞癌。
下文提出本发明的一种或多种具体实施方式。可由下文说明以及权利要求得知本发明的其它特征、目标及优点。
附图说明
图1为显示微RNA风险评分的分析图,其是根据112名NSCLC患者体内的hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平进行分析。上图:微RNA风险评分分布。中图:患者的死亡/存活状态。下图:患者的微RNA表达谱;由下至上的五行分别为hsa-let-7a、hsa-miR221、hsa-miR372、hsa-miR182*及hsa-miR137;每一列表示一患者。虚线表示将患者区分为低风险及高风险组的截止线(风险评分7.1)。
图2为显示低风险及高风险组的NSCLC患者的整体存活和无复发存活的Kaplan-Meier估计的分析图。图2A显示由训练数据集的56名患者所得的结果,图2B显示由测试数据集中56名患者所得的结果,及图2C显示由独立同龄组(cohort)中62名患者所得的结果。
图3为显示低风险及高风险组的NSCLC患者的整体存活及无复发存活的Kaplan-Meier估计检定的分析图。图3A显示由I期NSCLC患者(n=47)所得的结果,图3B显示由II期NSCLC患者(n=28)所得的结果,图3C显示由III期NSCLC患者(n=37)所得的结果,图3D显示由腺癌患者(n=55)所得的结果以及图3E显示由鳞状细胞癌患者(n=50)所得的结果。
具体实施方式
本申请提供一种用以根据与临床预后相关的一种或多种微RNA的表达模式预测癌症患者的临床预后(例如,治疗后的存活预期)的方法。
可利用以下方法识别与临床预后相关的一种或多种微RNA。
募集一组经过治疗的癌症患者。将患相同类型癌症的患者随机分配至训练组及测试组。利用本领域中已知的方法(例如,实时PCR或微阵列分析)测定上述二组中患者癌症组织/细胞(例如,活组织检查样本、甲醛固定-石蜡包埋组织或冷冻组织中包含的组织或细胞)中多种微RNA的表达水平。因此测定的各微RNA的表达水平通过相同患者体内的内部对照(例如小的核RNA,如U1、U2或U6)的表达水平进行标准化,以得到标准化的表达水平。
利用统计分析法,如Cox回归分析,来分析由训练组取得的微RNA标准化表达水平以确定何种或哪些微RNA与癌症患者的临床预后(例如,治疗后的存活)相关。在一实施例中,由单变量Cox回归分析得到的危险比(hazard ratio)用来鉴别与由于癌症复发或任何其它原因导致的死亡相关的微RNA。参见Cox,J.Royal StatisticalSociety Series B 34:187-220(1972)。若微RNA的危险比小于1,则将该微RNA视为保护型微RNA,而若微RNA的危险比大于1,则将该微RNA视为风险型微RNA。
一旦识别与临床预后相关的微RNA(例如,保护型及风险型微RNA),则可通过相关领域中已知的统计分析方法确定微RNA的表达模式与临床预后之间的相关性。在一实施例中,根据一种或多种保护型和/或风险型微RNA的表达水平来计算各患者的风险评分,然后确定风险评分值与患者治疗后的存活期之间的关系。利用上述方法确定的相关性在测试组中确认以证实微RNA表达模式的确与研究中的临床预后相关。优选地,进一步在独立同龄组中验证上述相关性,所述独立同龄组包括患与训练组及测试组中的患者相同类型的癌症的许多患者。
在确认之后,优选验证之后,可利用所识别的微RNA根据其表达模式来预测具有相同类型癌症的患者的临床预后。举例而言,可建构一数学公式,将这些微RNA的表达水平以及在上述统计分析中的显著性同时纳入考虑。按照这一数学公式,可计算患者的风险评分。风险评分值即表明患者的临床预后。
亦可利用与癌症患者的临床预后相关的微RNA来识别癌症治疗的潜在靶标,参见Czech,N.Engl.J.Med.354:1194-1195(2006)。可利用微RNA靶标预测算法来识别这些微RNA的靶基因,例如PicTar,参见Krek等,Nat.Genet.37:495-500(2005);TargetScan,参见Lewis等,Cell 115:787-798(2003);miRNAMap,参见Hsu等,Nucleic Acids Res.34:D135-139(2006);miRBase,参见Griffiths-Jones等,Nucleic Acids Res.34:D140-144(2006);GenMAPP,参见http://www.genmapp.org;及Reactome,参见http://www.reactome.org。这些基因及其产物为癌症治疗的潜在靶标或药物。
不需要进一步的详细说明,上述说明已认为足以使本发明能够实现。下文实施例阐明可用以预测NSCLC患者治疗后存活预期的微RNA印记。本实施例仅为说明性质,而非以任何方式限制本说明书的任何其它部分。将本说明书中提及的所有公开文献整体纳入作为本发明的参照文献。
材料及方法
(a)患者及组织样本
由台中荣民总医院募集已经过手术治疗的连续112名NSCLC患者。将这些患者随机分配至训练组数据集(n=56)及测试组数据集(n=56)中。此外,由台湾大学附设医学院募集同样也经过手术治疗的连续62名NSCLC患者,利用这62名患者作为独立同龄组。从本研究募集的所有患者取得肺癌组织冷冻样本。所有患者皆为汉族华人。
(b)微RNA谱分析
利用ABI PRISM 7900实时PCR***以及TaqMan MicroRNAAssays Human Panel-Early Access Kit试剂盒进行微RNA表达谱分析。TaqMan试剂盒包含用以确定157种成人微RNA的引物(AppliedBiosystems)。首先利用TaqMan微RNA RT试剂及对该微RNA特异性的引物来扩增各微RNA的cDNA,并利用TaqMan 2x UniversalPCR Master mix进一步进行扩增。在扩增过程中,将荧光染料掺入cDNA产物中。各微RNA的表达水平(以域周期(Ct)值来表示)是根据掺入cDNA产物中的荧光染料产生的荧光水平确定的。Ct是指荧光量超过固定域限值的分数。之后利用U6的Ct值对各微RNA的Ct值进行标准化。U6是微RNA定量分析中的常用内部对照。参见Jiang等,Nucleic Acids Res.33:5394-5403(2005);及Yanaihara等,CancerCell 9:189-198(2006)。具体而言,标准化Ct值(-dCt)的计算方式如下:-dCt=(Ct微RNA-CtU6)。
(c)统计分析
利用由单变量Cox回归分析所得的危险比来识别表达水平与患者的治疗后死亡/存活状态相关的微RNA。为了减少假阳性结果,利用置换检验(permutation test)来评估各微RNA的单变量Cox回归值的P值,其中将患者的存活期连同审查(censoring)状态随机排列总计10,000次迭代。
建构数学公式以计算各患者的风险评分。上述公式需考虑经确认与治疗后死亡/存活状态相关的一种或多种微RNA的表达水平以及由上述单变量Cox回归分析所得的回归系数。参见Lossos等,N.Engl.J.Med.350:1828-1837;及Cox,1972。患者的风险评分与患者的治疗后存活期相关:风险评分较高的患者预期治疗后存活期较短;而风险评分较低的患者预期治疗后存活期较长。
根据患者的风险评分将所有参与本研究的患者分到高风险组及低风险组中。在分析高风险组与低风险组之间患者特征的差异时,对于连续变量利用Student’s t检验进行分析,对于分类变量利用Fisher’s确切检验进行分析。利用Kaplan-Meier法来估计上述两个组中患者的整体存活状态以及无复发存活状态。利用对数秩检验(log-rank test)来分析两个组中患者之间的关于整体存活状态以及无复发存活状态的差异。利用上述方法从训练数据集得到的所有结果在测试数据集的患者中以及独立同龄组的患者中进行验证。
进行多变量Cox比例危险回归分析及逐步变量选择法以评估与患者存活状态相关的个别预后因子的贡献程度。利用微RNA印记风险评分、年龄、性别、癌症分期及组织学分析作为共变量。利用SAS软件(9.1版,SAS Institute Inc.)进行所有上述分析。进行双侧检验,且P值<0.05表示结果具有统计学上的显著性。
进行上述方法的更多细节可以在Yu等,Cancer Cell 13,48-57(2008)中找到。
结果
(a)用以预测NSCLC患者的整体存活状态及无复发存活状态的微RNA印记的识别及确认
下面表1显示分配到训练数据集中的56位NSCLC患者以及分配到测试数据集中的56位NSCLC患者的临床特征。就临床特征的角度而言,上述两组数据集中的患者间并不具有显著差异。
利用上文所述的方法确定所有患者体内微RNA的表达水平。将从训练数据集获得的结果进行单变量Cox回归分析以识别其表达水平与治疗后死亡/存活状态相关的微RNA。据发现,五种微RNA(即hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a)与训练数据集中的患者的整体存活状态相关。其中,前面三种微RNA为高风险微RNA,而后面两种为保护型微RNA。
根据这五种微RNA的表达水平,利用下列公式计算患者的风险评分:(0.15×hsa-miR-137的表达水平)+(0.31×hsa-miR-372的表达水平)+(0.28×hsa-miR-182*的表达水平)+(-0.13×hsa-miR-221的表达水平)+(-0.14×hsa-let-7a的表达水平)。将风险评分大于7.1的患者分配到高风险组,和将风险评分小于7.1的患者分配到低风险组。
表1:112名NSCLC患者的临床病理特征
下面表2总结了高风险及低风险组中患者的临床特征。
表2:高风险及低风险数据集中NSCLC患者的临床特征
图1显示训练及测试数据集中NSCLC患者的风险评分、存活状态及微RNA表达谱。高风险评分的患者高水平地表达三种高风险微RNA的任一种且低水平地表达两种保护型微RNA的任一种。相反地,低风险评分的患者低水平地表达高风险微RNA的任一种且高水平地表达保护型微RNA的任一种。
在训练数据集中,高风险组患者与低风险组患者相比,前者的治疗后存活期较短。参见图2A,高风险组患者的整体存活期的中位数为约20个月,而低风险组患者的整体存活期的中位数则大于50个月。至于无复发存活期的中位数,高风险组为约10个月,而低风险组则大于45个月(参见图2A)。上述结果表明,利用前述五种微RNA的表达模式(即,微RNA印记)(依据所述表达模式将患者分配到高风险组或低风险组中)与癌症患者的治疗后存活期相关。
在测试数据集中确认微RNA印记及存活预期间的所述关联性。与由训练数据集所得的结果相类似,由测试数据集所得的结果也显示出低风险组患者在治疗后存活期远高于高风险组患者(参见图2B)。在高风险组中,整体存活期的中位数为约25个月,且无复发存活期的中位数为约14个月。在低风险组患者中,整体存活期及无复发存活期的中位数分别大于50个月及40个月。所有上述结果皆具有统计上的显著性。
多变量Cox回归分析显示,在下面表3所列的因素中,仅上述微RNA印记与NSCLC患者的整体存活状态相关(危险比[HR]=10.31,P=0.002)。
表3:NSCLC患者微RNA印记及存活状态的多变量Cox回归*分析
(b)在独立同龄组中验证用于存活状态预测的微RNA印记
在包括62名NSCLC患者的独立同龄组中验证上述微RNA印记用于预测治疗后存活预期的用途。
上表2中总结了此62名患者的临床特征。利用上文所述的方法根据患者的五种微RNA的表达模式来计算各患者的风险评分。将风险评分大于7.1的患者分配到高风险组,且将风险评分小于7.1的患者分配到低风险组。如图2C所示,高风险组患者与低风险组患者相比,前者的治疗后存活期较短,就整体存活期中位数而言为40个月对大于120个月,就无复发存活期中位数而言为20个月对48个月。多变量Cox回归分析显示,微RNA印记及癌症分期与整体存活状态及无复发存活状态相关(参见上表3)。
这些结果证实可运用微RNA印记来预测癌症患者的治疗后存活预期。
(c)不同疾病分期以及组织学亚型的NSCLC患者的微RNA印记与治疗后存活预期之间的关联性
利用上文所述的方法,根据患者的微RNA印记将不同癌症分期以及不同组织学亚型的NSCLC患者分配到高风险组及低风险组中。如图3A所示,低风险组患者在治疗后的存活时间比高风险组患者更长。参见图3A至图3E。这些结果表明,微RNA印记亦可用于预测不同癌症分期(即I、II或III期)以及不同组织学亚型(即腺癌或鳞状细胞癌亚型)的NSCLC患者的治疗后存活预期。
(d)微RNA印记作为NSCLC患者存活的预测器
单变量Cox回归分析表明,五种微RNA(即hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221或hsa-let-7a)中各微RNA的表达水平均与NSCLC存活状态相关(参见下面表4)。对数秩分析表明,由全部五种微RNA组成的微RNA印记最适合用于预测患者存活状态(同样参见下面表4)。
此外,单变量Cox回归分析显示由上述五种微RNA中任何四种组成的微RNA印记亦与患者治疗后存活状态相关(参见下面表5)。
表4:利用NSCLC患者中五种微RNA印记与个别微RNA表达对比
的Kaplan-Meier存活分析的对数秩检验的P值
*:基于中位数划分成二组
表5:NSCLC患者中五种微RNA印记相对于四种微RNA印记的
Kaplan-Meier存活分析的对数秩检验的P值
(e)微RNA的推定基因靶标
利用GeneSpring路径注释软件(pathway annotatedsoftware)(Silicon Genetics)来预测五种微RNA可能涉及的推定路径,并将如此得到的结果总结于下表6及表7中。
表6:预测的微RNA的靶基因
*由五种算法(PicTar、TargetScan、Miranda、MirBase以及CRSD)中至少三种来进行预测
根据KEGG(http://www.genome.jp/kegg/)、GenMAPP(http://www.genemapp.org/)以及Reactome(http://www.reactome.org/)进行分析
表7:受微RNA影响的预测路径
*仅列出受到本发明探讨的五种微RNA中至少三种调控的路径
(f)由3-微RNA的微RNA印记的Kaplan-Meier存活分析
利用Kaplan-Meier存活分析,也发现由hsa-miR221、hsa-miR372及hsa-miR137组成的3-微RNA印记与患者的治疗后存活状态相关。从下面可以看出,这些结果具有统计学上的显著性。
训练数据集(n=56):
在整体存活预期分析中,P值=0.0013
在无复发存活预期分析中,P值=0.0437
测试数据集(n=56):
在整体存活预期分析中,P值=0.1468
在无复发存活预期分析中,P值=0.0841
独立同龄组(n=62):
在整体存活预期分析中,P值=0.0359
在无复发存活预期分析中,P值=0.0985
训练数据集及测试数据集(n=112):
在整体存活预期分析中,P值=0.0011
在无复发存活预期分析中,P值=0.0119
由对数秩检验求得P值以检验高风险及低风险患者组间的不同存活曲线。
其它具体实施方式
说明书公开的所有特征可以任意组合。本说明书中公开的各特征可以利用达成相同、等同或类似目的的替代性特征来取代。因此,除非另为相反的明示,所公开的各特征仅为一系列等同或类似特征的上位概念的实例。
从以上说明中,本领域技术人员可以很容易地确定本发明的基本特征。并且可以在不脱离本发明的精神和范围的情况下对本发明做出各种变化和改进以适应各种不同用作和状态。举例而言,也可以制备与上述噁二唑(oxadiazole)化合物结构类似的化合物,并筛选上述的活性和用于实施本发明。因此本发明的保护范围也包括其它的实施方式。
Claims (28)
1.一种用以预测癌症患者治疗后的存活预期的方法,该方法包括:
检测经治疗的癌症患者体内的微RNA hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平;
根据这些微RNA的表达水平计算该患者的风险评分;以及
根据该风险评分的值确定该癌症患者治疗后的存活预期。
2.如权利要求1所述的方法,其中该风险评分的计算方式如下:
(0.15 x hsa-miR137的表达水平)+(0.31 x hsa-miR372的表达水平)+(0.28 x hsa-miR182*的表达水平)+(-0.13 x hsa-miR221的表达水平)+(-0.14 x let-7a的表达水平)。
3.如权利要求2所述的方法,其中风险评分等于或小于-7.1表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
4.如权利要求1所述的方法,其中该患者患肺癌、白血病、乳腺癌、胰腺癌、腺癌、鳞状细胞癌、结肠癌或肝细胞癌。
5.如权利要求1所述的方法,其中该患者患非小细胞肺癌。
6.如权利要求5所述的方法,其中该患者处于非小细胞肺癌的I期、II期或III期。
7.如权利要求1所述的方法,其中该患者经过手术治疗、化学治疗、放射治疗或上述的组合。
8.一种用以预测癌症患者治疗后的存活预期的方法,该方法包括:
检测经治疗的癌症患者体内的微RNA的表达水平,其中所述微RNA是选自由hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*及hsa-miR221组成的组;
根据该微RNA的表达水平确定该微RNA的-dCt值;以及
根据该微RNA的该-dCt值预测治疗后的存活预期。
9.如权利要求8所述的方法,其中hsa-miR137的-dCt值等于或小于-8.22表示该患者治疗后存活预期尚可接受。
10.如权利要求8所述的方法,其中hsa-miR182*的-dCt值等于或小于-7.83表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
11.如权利要求8所述的方法,其中hsa-miR221的-dCt值等于或大于-0.57表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
12.如权利要求8所述的方法,其中hsa-miR372的-dCt值等于或小于-11.25表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
13.如权利要求8所述的方法,其中该患者患肺癌、白血病、乳腺癌、胰腺癌、腺癌、鳞状细胞癌、结肠癌或肝细胞癌。
14.如权利要求8所述的方法,其中该患者患非小细胞肺癌。
15.如权利要求14所述的方法,其中该患者处于非小细胞肺癌的I期、II期或III期。
16.如权利要求8所述的方法,其中该患者经过手术治疗、化学治疗、放射治疗或上述的组合。
17.一种用以预测癌症患者治疗后的存活预期的方法,该方法包括:
检测经治疗的癌症患者体内的let-7a的表达水平;
根据let-7a的表达水平确定let-7a的-dCt值;以及
根据let-7a的该-dCt值预测治疗后的存活预期,其中该-dCt值等于或大于2.21表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
18.一种用以预测癌症患者治疗后的存活预期的方法,该方法包括:
检测经治疗的癌症患者体内的四种微RNA的表达水平,该四种微RNA选自由hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a组成的组;
根据该微RNA的表达水平计算风险评分;以及
根据该风险评分的值确定治疗后的存活预期。
19.如权利要求18所述的方法,其中测定hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平,且风险评分的计算方式如下:(0.31 x hsa-miR372的表达水平)+(0.28 x hsa-miR182*的表达水平)+(-0.13 x hsa-miR221的表达水平)+(-0.14 x hsa-let-7a的表达水平);其中该风险评分等于或小于-5.90表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
20.如权利要求18所述的方法,其中测定hsa-miR137、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平,且风险评分的计算方式如下:(0.15 x hsa-miR137的表达水平)+(0.28 x hsa-miR182*的表达水平)+(-0.13 x hsa-miR221的表达水平)+(-0.14 x hsa-let-7a的表达水平);其中该风险评分等于或小于-3.71表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
21.如权利要求18所述的方法,其中测定hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达水平,且风险评分的计算方式如下:(0.15 x hsa-miR137的表达水平)+(0.31 x hsa-miR372的表达水平)+(-0.13 x hsa-miR221的表达水平)+(-0.14 x hsa-let-7a的表达水平);其中该风险评分等于或小于-4.87表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
22.如权利要求18所述的方法,其中测定hsa-miR137、hsa-miR182*、hsa-miR372及hsa-let-7a的表达水平,且风险评分的计算方式如下:(0.15 x hsa-miR137的表达水平)+(0.28 x hsa-miR182*的表达水平)+(0.31 x hsa-miR372的表达水平)+(-0.14 x hsa-let-7a的表达水平);其中该风险评分等于或小于-7.02表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
23.如权利要求18所述的方法,其中测定hsa-miR137、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-miR372的表达水平,且风险评分的计算方式如下:(0.15 x hsa-miR137的表达水平)+(0.28 x hsa-miR182*的表达水平)+(-0.13 x hsa-miR221的表达水平)+(0.31 x hsa-miR372的表达水平);其中该风险评分等于或小于-6.86表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
24.一种用以预测癌症患者治疗后的存活预期的方法,该方法包括:
检测经治疗的癌症患者体内的hsa-miR221、hsa-miR372及hsa-miR137的表达水平;
根据该微RNA的表达水平计算风险评分;以及
根据该风险评分值确定治疗后的存活预期。
25.如权利要求24所述的方法,其中该风险评分的计算方式如下:(0.15 x hsa-miR137的表达水平)+(0.31 x hsa-miR372的表达)+(-0.13 x hsa-miR221的表达水平);该风险评分等于或小于-4.7表示该患者治疗后的存活预期尚可接受。
26.一种用以检测微RNA表达的试剂盒,其中该试剂盒包含能够检测hsa-miR221、hsa-miR372及hsa-miR137的表达的寡核苷酸。
27.一种用以检测微RNA表达的试剂盒,其中该试剂盒包含能够检测至少四种微RNA的表达的寡核苷酸,该微RNA选自由hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a组成的组。
28.如权利要求27所述的试剂盒,其中该试剂盒包含能够检测hsa-miR137、hsa-miR372、hsa-miR182*、hsa-miR221及hsa-let-7a的表达的寡核苷酸。
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