WO2001031023A1 - Nouveau polypeptide, proteine precurseur humaine 25 de la nucleoproteine ii, et polynucleotide codant pour ce polypeptide - Google Patents

Nouveau polypeptide, proteine precurseur humaine 25 de la nucleoproteine ii, et polynucleotide codant pour ce polypeptide Download PDF

Info

Publication number
WO2001031023A1
WO2001031023A1 PCT/CN2000/000380 CN0000380W WO0131023A1 WO 2001031023 A1 WO2001031023 A1 WO 2001031023A1 CN 0000380 W CN0000380 W CN 0000380W WO 0131023 A1 WO0131023 A1 WO 0131023A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
polypeptide
polynucleotide
precursor protein
human
nucleoprotein
Prior art date
Application number
PCT/CN2000/000380
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
Yumin Mao
Yi Xie
Original Assignee
Shanghai Bio Door Gene Technology Ltd.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Shanghai Bio Door Gene Technology Ltd. filed Critical Shanghai Bio Door Gene Technology Ltd.
Priority to AU12645/01A priority Critical patent/AU1264501A/en
Publication of WO2001031023A1 publication Critical patent/WO2001031023A1/zh

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy

Definitions

  • a polynucleotide encoding these isolated polypeptides, the polynucleotide comprising a nucleotide sequence having at least 91 nucleotides with a nucleotide sequence selected from the group consisting of »/» Identities: (a) a polynucleotide encoding the aforementioned human nucleoprotein II precursor protein 25; (b) a polynucleotide complementary to the polynucleotide (a).
  • the polynucleotide encodes a polypeptide having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2.
  • isolated human nucleoprotein ⁇ precursor protein 25 refers to human nucleoprotein I I precursor protein 25 is substantially free of other proteins, lipids, carbohydrates, or other substances naturally associated with it. Those skilled in the art can purify human nucleoprotein ⁇ precursor protein 25 using standard protein purification techniques. Substantially pure peptides can produce a single main band on a non-reducing polyacrylamide gel. The purity of the human nucleoprotein ⁇ precursor protein 25 can be analyzed by amino acid sequence.
  • a fragment, derivative or analog of the polypeptide of the present invention may be: U) a type in which one or more amino acid residues are replaced with conservative or non-conservative amino acid residues (preferably conservative amino acid residues), and the substituted
  • the amino acid may or may not be encoded by the genetic code; or ( ⁇ ) such that a group on one or more amino acid residues is substituted by another group to include a substituent; or ( ⁇ ⁇ )
  • One, in which the mature polypeptide is fused to another compound such as a compound that prolongs the half-life of the polypeptide, such as polyethylene glycol); or (IV) such a polypeptide sequence in which the additional amino acid sequence is fused into the mature polypeptide (such as the leader sequence or secreted sequence or the sequence used to purify this polypeptide or protease sequence)
  • the leader sequence or secreted sequence or the sequence used to purify this polypeptide or protease sequence such fragments, derivatives and analogs are considered to be within the knowledge of those
  • the invention also relates to variants of the polynucleotides described above, which encode polypeptides or fragments, analogs and derivatives of polypeptides having the same amino acid sequence as the invention.
  • This polynucleotide variant can be a naturally occurring allelic variant or a non-naturally occurring variant.
  • These nucleotide variants include substitution variants, deletion variants, and insertion variants.
  • an allelic variant is an alternative form of a polynucleotide that may be a substitution, deletion, or insertion of one or more nucleotides, but does not substantially change the function of the polypeptide it encodes .
  • “strict conditions” means: (1) hybridization and elution at lower ionic strength and higher temperature, such as 0.2xSSC, 0.1% SDS, 60 ° C; or (2) Add denaturants during hybridization, such as 50% (v / v) formamide, 0.1% calf serum / 0.1% Ficol 1, 42 ° C, etc .; or (3) only between two sequences Crosses occur only when the identity is at least 95%, and more preferably 97%.
  • the polypeptide encoded by the hybridizable polynucleotide has the same biological function and activity as the mature polypeptide shown in SEQ ID NO: 2.
  • Methods known to those skilled in the art can be used to construct expression vectors containing a DNA sequence encoding human nucleoprotein II precursor protein 25 and appropriate transcriptional / translational regulatory elements. These methods include in vitro recombinant DNA technology, DNA synthesis technology, in vivo recombination technology, etc. (Sambroook, et al. Mol ecular Cloning, a Laboratory Manua 1, cold Spring Harbor Laboratory. New York, 1989).
  • the DNA sequence can be operably linked to an appropriate promoter in an expression vector to guide mRNA synthesis. Representative examples of these promoters are: the lac or trp promoter of E.
  • polypeptide of the present invention can also be used for peptide mapping analysis.
  • the polypeptide can be specifically cleaved by physical, chemical or enzymatic analysis, and subjected to one-dimensional or two-dimensional or three-dimensional gel electrophoresis analysis, and more preferably mass spectrometry analysis.
  • the recombinant gene therapy vector can be used to treat diseases caused by abnormal expression or activity of human nuclear protein II precursor protein 25.
  • Virus-derived expression vectors such as retroviruses, adenoviruses, adenovirus-associated viruses, herpes simplex virus, parvoviruses, and the like can be used to transfer polynucleotides encoding human nucleoprotein ⁇ precursor protein 25 into cells.
  • a method for constructing a recombinant viral vector carrying a polynucleotide encoding a human nucleoprotein II precursor protein 25 can be found in the existing literature (Sarabrook, et al.).
  • a polynucleotide encoding human nucleoprotein ⁇ precursor protein 25 can be packaged into liposomes and transferred into cells.
  • a 32P-labeled probe (about 2 x 10 6 cpm / ml) was hybridized with a nitrocellulose membrane to which RNA was transferred at 42 ° C overnight in a solution containing 50% formamide-25mM KH 2 P0 4 (pH7.4) -5 530-5 06111 & ⁇ 1,3 solution and 20 ( ⁇ [111 salmon sperm 0. After hybridization, the filter was washed in 1 X SSC-0.1% SDS at 55 ° C for 30min. Then, Analysis and quantification using Phosphor Imager.
  • Example 5 In vitro expression, isolation and purification of recombinant human nucleoprotein II precursor protein 25

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Description

一种新的多肽 人核蛋白 I I前休蛋白 25和编码这种多肽的多核苷酸 拮术领域
本发明属于生物技术领域, 具体地说, 本发明描述了一种新的多肽一人核蛋 白 I I前体蛋白 25, 以及编码此多肽的多核苷酸序列。 本发明还涉及此多核苷酸和 多肽的制备方法和应用。
技术背景
细胞活动的主要能量来源于 ATP。 线粒体是糖、 脂肪和氨基酸最终释放能量 的场所。 糖和脂肪等营养物质在细胞质中经过酵解作用产生丙酮酸和脂肪酸, 这 些物质选择性地从细胞质进入线粒体基质中, 经过一系列变化降解为含 2 个碳原 子的单位, 与辅酶 A结合形成乙酰辅酶 A进入三羧酸循环, 三羧酸循环脱下的氢 经线粒体内膜上的电子传递***即呼吸链, 最后传递给氧。 在此过程中, 能量水 平较高的电子, 经过电子传递降到能量较低水平。 其中所释放出的能量以高能磷 酸键形式, 通过 ADP 的磷酸化, 生成含高能磷酸键的 ATP储存于体内。 由上可以 看出, 呼吸链是向生物体提供能量的重要的***, 对生命活动有重大的意义 (细 胞生物学 汪 仁等主编 北京师范大学出版社)。
呼吸链主要由以下几类分子组成: 吡啶核苷酸连接的脱氢酶、 黄素相关的脱 氢酶 (黄素蛋白)、 铁硫蛋白、 辅酶 Q、 细胞色素。
实验证明, 呼吸链的组分均以多分子复合物的形式包埋在线粒体的内膜中(除 辅酶 Q和细胞色素 C外)。
复合物 I是 NADH脱氢酶, 其作用是催化 NADH的 2个电子传递至辅酶 Q;
复合物 Π是琥珀酸脱氢酶, 催化电子从琥珀酸通过 FAD 和铁硫蛋白传递至辅 酶 Q;
复合物 Π Ι是细胞色素 b-c, 其作用是催化电子从辅酶 Q传递至细胞色素 c, 同时发生质子的跨膜转移;
复合物 IV是细胞色素 c氧化酶,用于催化细胞色素 c接受的电子传递给氧 (细 胞生物学 翟中和主编 高等教育出版社)。
在这其中., 复合物 I I I有大约 10-11个亚基。 核蛋白 I I是其中第二大的核编码 的亚基 ( Shimomura, Y and Ozawa , T 1982 Biochem Int 5 , 1-6 ); ( Methods Enzymol 126, 224-237 )e
从鼠的肝 cDNA文库中克隆到了核蛋白 II的前体, 它是一个有 438个氨基酸残 基的多肽, 其分子量大约为 47KD。 根据已有的研究结果, 我们还已经知道了鼠、 人和酵母的核蛋白 II结构上的相同和差异。 具体的研究过程和结果请参考有关文 献 ( Biochemistry International 1990 Vol 20 No 4 pp731-737 ); ( J Biol Chem 1989 264, 13483-13488 )0
核蛋白 II没有氧化还原作用中心, 因此其不直接参与电子传递过程,核蛋白 II 在呼吸链中的作用还处于研究过程中, 分子生物学的一些研究表明, 如果缺乏核 蛋白 Π, 会影响复合物 III的很多亚基的结合 (J Biol Chem 1988 263, 14323-14333 ); (Eur J Biochem 1987 163, 97-103 )。
虽然对核蛋白 II结构和功能的研究都尚未完全清楚, 但基本上我们可以知道, 核蛋白 II在复合物 III (细胞色素还原酶) 中起重要作用, 从而直接影响着呼吸链 的正常功能, 间接调控氧化磷酸化过程、 线粒体的功能, 对生物的能量提供、 生 命活动有极其重要的作用。
根据氨基酸同源比较的结果,本发明的多肽被推断鉴定为一种新的人核蛋白 II 前体蛋白 25 (HCPIIP25), 它的同源蛋白为人的核蛋白 II前体, 蛋白号为 J04973。 发明目的
本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——人核蛋白 II前体蛋白 25以及其 片段、 类似物和衍生物。
本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。
本发明的另一个目的是提供含有编码人核蛋白 Π 前体蛋白 25 的多核苷酸的 重组载体。
本发明的另一个目的是提供含有编码人核蛋白 Π 前体蛋白 25 的多核苷酸的 基因工程化宿主细胞。
本发明的另一个目的是提供生产人核蛋白 Π前体蛋白 25的方法。
本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——人核蛋白 II前体蛋白 25的 抗体。
本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——人核蛋白 Π前体蛋白 25的 模拟化合物、 拮抗剂、 激动剂、 抑制剂。 本发明的另一个目的是提供诊断治疗与人核蛋白 Π 前体蛋白 25异常相关的 疾病的方法。
发明概要
在本发明的第一方面, 提供新颖的分离出的人核蛋白 I I 前体蛋白 25 , 该 多肽是人源的, 它包含: 具有 SEQ ID NO: 2 氨基酸序列的多肽、 或其保守性变 异多肽、 或其活性片段、 或其活性衍生物、 类似物。 较佳地, 该多肽是具有 SEQ ID NO: 2氨基酸序列的多肽。
在本发明的第二方面, 提供编码分离的这些多肽的多核苷酸, 该多核苷酸 包含一核苷酸序列, 该核苷酸序列与选自下组的一种核苷酸序列有至少 91»/»相 同性: (a)编码上述人核蛋白 I I 前体蛋白 25 的多核苷酸; (b)与多核苷酸(a) 互补的多核苷酸。 较佳地, 该多核苷酸编码具有 SEQ ID NO: 2 所示氨基酸序列 的多肽。 更佳地, 该多核苷酸的序列是选自下组的一种: (a)具有 SEQ ID N0: 1 中 2572-3249位的序列; 和(b)具有 SEQ ID NO: 1中 1-3425位的序列。
在本发明的第三方面, 提供了含有上述多核苷酸的载体, 以及被该载体转 化或转导的宿主细胞或者被上述多核苷酸直接转化或转导的宿主细胞。
本发明的其它方面由于本文的技术的公开, 对本领域的技术人员而言是显而 易见的。
附图说明
下列附图用于说明本发明的具体实施方案, 而不用于限定由权利要求书 所界定的本发明范围。
图 1是本发明人核蛋白 Π前体蛋白 25和人核蛋白 I I前体的氨基酸序列同源 性比较图。 上方序列是人核蛋白 I I前体蛋白 25 , 下方序列是人核蛋白 I I前体。 相同氨基酸在两个序列间用单字符氨基酸表示, 相似氨基酸用 "+" 表示。
图 2为分离的人核蛋白 I I前体蛋白 25的聚丙烯酰胺凝胶电泳图(303-?人08 )。
25kDa为蛋白质的分子量。 箭头所指为分离出的蛋白条带。
发明内容
如本发明所用, "分离的" 是指物质从其原始环境中分离出来 (如果是天然的 物质, 原始环境即是天然环境)。 如活体细胞内的天然状态下的多聚核苷酸和多肽 是没有分离纯化的, 但同样的多聚核苷酸或多肽如从天然状态中同存在的其他物 质中分开, 则为分离纯化的。
如本文所用, "分离的人核蛋白 Π 前体蛋白 25" 是指人核蛋白 I I 前体蛋 白 25 基本上不含天然与其相关的其它蛋白、 脂类、 糖类或其它物质。 本领域 的技术人员能用标准的蛋白质纯化技术纯化人核蛋白 Π 前体蛋白 25。 基本上 纯的多肽在非还原聚丙烯酰胺凝胶上能产生单一的主带。 人核蛋白 Π 前体蛋 白 25多肽的纯度能用氨基酸序列分析。
本发明提供了一种新的多肽一 Λ核蛋白 I I前体蛋白 25, 其基本上是由 SEQ ID NO: 2所示的氨基酸序列组成的。 本发明的多肽可以是重组多肽、 天然多肽、 合成 多肽, 优选重组多肽。 本发明的多肽可以是天然纯化的产物, 或是化学合成的产 物, 或使用重组技术从原核或真核宿主 (例如, 细菌、 酵母、 高等植物、 昆虫和 哺乳动物细胞)中产生。 根据重组生产方案所用的宿主, 本发明的多肽可以是糖 基化的, 或可以是非糖基化的。 本发明的多肽还可包括或不包括起始的甲硫氨酸 残基。
本发明还包括人核蛋白 Π 前体蛋白 25 的片段、 衍生物和类似物。 如本发明 所用, 术语 "片段"、 "衍生物" 和 "类似物"是指基本上保持本发明的人核蛋白 Π 前体蛋白 25相同的生物学功能或活性的多肽。 本发明多肽的片段、 衍生物或类似 物可以是: U ) 这样一种, 其中一个或多个氨基酸残基被保守或非保守氨基酸残 基(优选的是保守氨基酸残基)取代, 并且取代的氨基酸可以是也可以不是由遗 传密码子编码的; 或者 (Π ) 这样一种, 其中一个或多个氨基酸残基上的某个基 团被其它基团取代包含取代基; 或者 (Π Ι )这样一种, 其中成熟多肽与另一种化 合物 (比如延长多肽半衰期的化合物, 例如聚乙二醇) 融合; 或者 (IV ) 这样一 种, 其中附加的氨基酸序列融合进成熟多肽而形成的多肽序列 (如前导序列或分 泌序列或用来纯化此多肽的序列或蛋白原序列) 通过本文的阐述, 这样的片段、 衍生物和类似物被认为在本领域技术人员的知识范围之内。
本发明提供了分离的核酸 (多核苷酸), 基本由编码具有 SEQ ID NO: 2 氨基 酸序列的多肽的多核苷酸组成。 本发明的多核苷酸序列包括 SEQ ID N0: 1 的核苷 酸序列。 本发明的多核苷酸是从人胎脑组织的 cDNA文库中发现的。 它包含的多核 苷酸序列全长为 3425 个碱基, 其开放读框( 2572-3249 )编码了 225 个氨基酸。 根据氨基酸序列同源比较发现, 此多肽与人核蛋白 I I 前体有 91%的同源性, 可推 断出该人核蛋白 Π前体蛋白 25具有人核蛋白 I I前体相似的结构和功能。
本发明的多核苷酸可以是 D 形式或是 RNA形式。 DNA形式包括 cDNA、 基因 组 D 或人工合成的 DNA。 DNA可以是单链的或是双链的。 DNA可以是编码链或非 编码链。 编码成熟多肽的编码区序列可以与 SEQ ID N0: 1 所示的编码区序列相同 或者是简并的变异体。 如本发明所用, "简并的变异体" 在本发明中是指编码具有 SEQ ID NO: 2的蛋白质或多肽, 但与 SEQ ID NO: 1所示的编码区序列有差别的核酸 序列。
编码 SEQ ID NO: 2 的成熟多肽的多核苷酸包括: 只有成熟多肽的编码序列; 成熟多肽的编码序列和各种附加编码序列; 成熟多肽的编码序列 (和任选的附加 编码序列) 以及非编码序列。
术语 "编码多肽的多核苷酸" 是指包括编码此多肽的多核苷酸和包括附加编 码和 /或非编码序列的多核苷酸。
本发明还涉及上述描述多核苷酸的变异体, 其编码与本发明有相同的氨基酸 序列的多肽或多肽的片断、 类似物和衍生物。 此多核苷酸的变异体可以是天然发 生的等位变异体或非天然发生的变异体。 这些核苷酸变异体包括取代变异体、 缺 失变异体和***变异体。 如本领域所知的, 等位变异体是一个多核苷酸的替换形 式, 它可能是一个或多个核苷酸的取代、 缺失或***, 但不会从实质上改变其编 码的多肽的功能。
本发明还涉及与以上所描述的序列杂交的多核苷酸(两个序列之间具有至少 50%, 优选具有 70%的相同性)。 本发明特别涉及在严格条件下与本发明所述多核苷 酸可杂交的多核苷酸。 在本发明中, "严格条件" 是指: (1)在较低离子强度和较 高温度下的杂交和洗脱, 如 0. 2xSSC, 0. 1%SDS,60°C;或(2)杂交时加用变性剂, 如 50% (v/v)甲酰胺, 0. 1%小牛血清 /0. l%Ficol l, 42 °C等; 或(3)仅在两条序列之间 的相同性至少在 95%以上,更好是 97%以上时才发生杂交。 并且, 可杂交的多核苷 酸编码的多肽与 SEQ ID NO: 2所示的成熟多肽有相同的生物学功能和活性。
本发明还涉及与以上所描述的序列杂交的核酸片段。 如本发明所用, "核酸片 段"的长度至少含 10个核苷酸, 较好是至少 20-30个核苷酸, 更好是至少 50-60 个核苷酸, 最好是至少 100个核苷酸以上。 核酸片段也可用于核酸的扩增技术(如 PCR)以确定和 /或分离编码人核蛋白 I I前体蛋白 25的多核苷酸。 本发明中的多肽和多核苷酸优选以分离的形式提供, 更佳地被纯化至均质。 本发明的编码人核蛋白 Π前体蛋白 25 的特异的多核苷酸序列能用多种方 法获得。 例如, 用本领域熟知的杂交技术分离多核苷酸。 这些技术包括但不局 限于: 1)用探针与基因组或 cDNA 文库杂交以检出同源的多核苷酸序列, 和 2) 表达文库的抗体筛选以检出具有共同结构特征的克隆的多核苷酸片段。
本发明的 DNA片段序列也能用下列方法获得: 1)从基因组 DNA分离双链 DNA 序列; 2)化学合成 D 序列以获得所述多肽的双链 DNA。
上述提到的方法中, 分离基因组 DM 最不常用。 DNA序列的直接化学合成 是经常选用的方法。 更经常选用的方法是 cDNA序列的分离。 分离感兴趣的 cDNA 的标准方法是从高表达该基因的供体细胞分离 mRNA 并进行逆转录, 形成质粒 或噬菌体 cDNA文库。 提取 mRNA 的方法已有多种成熟的技术, 试剂盒也可从商 业途径获得(Qiagene)。 而构建 cDNA 文库也是通常的方法(Sambrook, et a l. , Molecular Cloning, A Laboratory Manua l , Cold Spr ing Harbor Labora tory. New York, 1989)。还可得到商业供应的 cDNA文库,如 Clontech公司的不同 cDNA 文库。 当结合使用聚合酶反应技术时, 即使极少的表达产物也能克隆。
可用常规方法从这些 cDNA 文库中筛选本发明的基因。 这些方法包括(但不 限于): (1) DM- DM 或 DM-RNA 杂交; (2)标志基因功能的出现或丧失; (3)测 定人核蛋白 I I 前体蛋白 25 的转录本的水平; (4)通过免疫学技术或测定生物 学活性, 来检测基因表达的蛋白产物。 上述方法可单用, 也可多种方法联合应用。
在第(1)种方法中, 杂交所用的探针是与本发明的多核苷酸的任何一部分 同源, 其长度至少 10个核苷酸, 较好是至少 30个核苷酸, 更好是至少 50个 核苷酸, 最好是至少 100 个核苷酸。 此外, 探针的长度通常在 2000 个核苷酸 之内, 较佳的为 1000 个核苷酸之内。 此处所用的探针通常是在本发明的基因 序列信息的基础上化学合成的 DM序列。 本发明的基因本身或者片段当然可以 用作探针。 DNA探针的标记可用放射性同位素, 荧光素或酶(如碱性磷酸酶)等。
在第(4)种方法中, 检测人核蛋白 I I 前体蛋白 25 基因表达的蛋白产物可 用免疫学技术如 Wes tern印迹法, 放射免疫沉淀法, 酶联免疫吸附法(ELISA)等。
应 用 PCR 技术 扩增 DNA/RNA 的 方 法 (Sa iki, et a l. Sc ience 1985; 230: 1350- 1354)被优选用于获得本发明的基因。 特别是很难从文库中得 到全长的 cDNA时,可优选使用 RACE法(RACE - cDNA末端快速扩增法),用于 PCR 的引物可根据本文所公开的本发明的多核苷酸序列信息适当地选择, 并可用常 规方法合成。 可用常规方法如通过凝胶电泳分离和纯化扩增的 DNA/RNA片段。
如上所述得到的本发明的基因, 或者各种 DNA 片段等的多核苷酸序列可用 常规方法如双脱氧链终止法(Sanger et al. PNAS , 1977 , 74: 5463-5467)测 定。 这类多核苷酸序列测定也可用商业测序试剂盒等。 为了获得全长的 cDNA 序列, 测序需反复进行。 有时需要测定多个克隆的 cDM 序列, 才能拼接成全 长的 cDNA序列。
本发明也涉及包含本发明的多核苷酸的载体, 以及用本发明的载体或直接 用人核蛋白 I I 前体蛋白 25编码序列经基因工程产生的宿主细胞, 以及经重组 技术产生本发明所述多肽的方法。
本发明中, 编码人核蛋白 I I前体蛋白 25的多核苷酸序列可***到载体中, 以构成含有本发明所述多核苷酸的重组载体。 术语 "载体" 指本领域熟知的细 菌质粒、 噬菌体、 酵母质粒、 植物细胞病毒、 哺乳动物细胞病毒如腺病毒、 逆 转录病毒或其它载体。 在本发明中适用的载体包括但不限于: 在细菌中表达的 基于 T7 启动子的表达载体(Rosenberg, et a l . Gene, 1987, 56: 125); 在哺 乳动物细胞中表达的 pMSXND 表达载体(Lee and Nathans, J Bio Chem. 263: 3521, 1988)和在昆虫细胞中表达的来源于杆状病毒的载体。 总之, 只要能 在宿主体内复制和稳定, 任何质粒和载体都可以用于构建重组表达载体。 表达 载体的一个重要特征是通常含有复制起始点、 启动子、 标记基因和翻译调控元件。
本领域的技术人员熟知的方法能用于构建含编码人核蛋白 I I 前体蛋白 25 的 DNA序列和合适的转录 /翻译调控元件的表达载体。这些方法包括体外重组 DNA 技术、 DNA合成技术、 体内重组技术等(Sambroook, et a l. Mol ecular Cloning, a Laboratory Manua l, cold Spr ing Harbor Laboratory. New York, 1989)。 所述的 DNA序列可有效连接到表达载体中的适当启动子上, 以指导 mRNA合成。 这些启动子的代表性例子有: 大肠杆菌的 lac 或 trp 启动子; λ噬菌体的 PL 启动子; 真核启动子包括 CMV 立即早期启动子、 HSV 胸苷激酶启动子、 早期和 晚期 SV40启动子、 反转录病毒的 LTRs 和其它一些已知的可控制基因在原核细 胞或真核细胞或其病毒中表达的启动子。 表达载体还包括翻译起始用的核糖体 结合位点和转录终止子等。 在载体中***增强子序列将会使其在高等真核细胞 中的转录得到增强。 增强子是 DNA表达的顺式作用因子, 通常大约有 10到 300 个碱基对, 作用于启动子以增强基因的转录。 可举的例子包括在复制起始点晚 期一侧的 1 00 到 270个碱基对的 SV40增强子、 在复制起始点晚期一侧的多瘤 增强子以及腺病毒增强子等。
此外, 表达载体优选地包含一个或多个选择性标记基因, 以提供用于选择 转化的宿主细胞的表型性状, 如真核细胞培养用的二氢叶酸还原酶、 新霉素抗 性以及绿色荧光蛋白(GFP) , 或用于大肠杆菌的四环素或氨苄青霉素抗性等。
本领域一般技术人员都清楚如何选择适当的载体 /转录调控元件 (如启动 子、 增强子等) 和选择性标记基因。
本发明中, 编码人核蛋白 Π前体蛋白 25 的多核苷酸或含有该多核苷酸的 重组载体可转化或转导入宿主细胞, 以构成含有该多核苷酸或重组载体的基因 工程化宿主细胞。 术语 "宿主细胞" 指原核细胞, 如细菌细胞; 或是低等真核 细胞, 如酵母细胞; 或是高等真核细胞, 如哺乳动物细胞。 代表性例子有: 大 肠杆菌, 链霉菌属; 细菌细胞如鼠伤寒沙门氏菌; 真菌细胞如酵母; 植物细胞; 昆虫细胞如果蝇 S2或 Sf 9 ; 动物细胞如 CH0、 COS或 Bowes黑素瘤细胞等。
用本发明所述的 D 序列或含有所述 DNA序列的重组载体转化宿主细胞可 用本领域技术人员熟知的常规技术进行。 当宿主为原核生物如大肠杆菌时, 能 吸收 DNA 的感受态细胞可在指数生长期后收获, 用 (:12法处理, 所用的步骤 在本领域众所周知。 可供选择的是用 MgCl2。 如果需要, 转化也可用电穿孔的 方法进行。 当宿主是真核生物, 可选用如下的 DNA转染方法: 磷酸钙共沉淀法, 或者常规机械方法如显微注射、 电穿孔、 脂质体包装等。
通过常规的重组 DNA技术, 利用本发明的多核苷酸序列可用来表达或生产 重组的人核蛋白 I I 前体蛋白 25 (Sc i ence, 1984 ; 224: 1431)。 一般来说有以 下步骤:
(1) 用本发明的编码人 人核蛋白 I I前体蛋白 25 的多核苷酸 (或变异体), 或用含有该多核苷酸的重组表达载体转化或转导合适的宿主细胞;
(2) 在合适的培养基中培养宿主细胞;
(3) 从培养基或细胞中分离、 纯化蛋白质。 在步骤 (2 ) 中, 根据所用的宿主细胞, 培养中所用的培养基可选自各种 常规培养基。 在适于宿主细胞生长的条件下进行培养。 当宿主细胞生长到适当 的细胞密度后, 用合适的方法(如温度转换或化学诱导)诱导选择的启动子, 将 细胞再培养一段时间。
在步骤 ( 3 ) 中, 重组多肽可包被于细胞内、 或在细胞膜上表达、 或分泌 到细胞外。 如果需要, 可利用其物理的、 化学的和其它特性通过各种分离方法 分离和纯化重组的蛋白。 这些方法是本领域技术人员所熟知的。 这些方法包括 但并不限于: 常规的复性处理、 蛋白沉淀剂处理(盐析方法)、 离心、 渗透破菌、 超声波处理、 超离心、 分子筛层析(凝胶过滤)、 吸附层析、 离子交换层析、 高 效液相层析(HPLC)和其它各种液相层析技术及这些方法的结合。
本发明的多肽(人核蛋白 Π前体蛋白) 所形成的人的核蛋白 I I, 是呼吸链中 细胞色素还原酶的重要组分, 是由细胞核编码的细胞色素还原酶的亚基之一, 分 子生物学的一些研究表明, 如果缺乏核蛋白 I I, 会影响复合物 I I I的很多亚基的结 合, 可以推测, 核蛋白 π虽然没有氧化还原作用中心, 不直接参与电子传递过程, 但其对于保持复合物 I I I (细胞色素还原酶) 的稳定性和正常功能有重要作用。
对本发明多肽功能和结构的研究还有待进一步深入, 根据上述的本发明多肽 的功能, 本发明的多肽可用于诊断和治疗很多疾病, 如恶性肿瘤, 内分泌***疾 病, 神经***疾病, 免疫性疾病, 人获得性免疫缺乏综合症 (AIDS ) 等等。
本发明的多肽可以调控一些激素等小分子的表达, 从而起到对内分泌***疾 病的治疗功能, 包括: 垂体瘤 (泌乳素瘤), 巨人症和肢端肥大症, 腺垂体机能减 退症, 垂体性侏儒症, 尿崩症, 抗利尿激素分泌不当综合症, 甲亢, 甲减, 单纯 性甲状腺肿, 甲状腺炎, 皮质醇增多症, 原发性醛固酮增多症, 嗜铬细胞瘤, 原 发性慢性肾上腺皮质机能减退症, 原发性甲状旁腺机能亢进症, 甲状旁腺机能减 退症, 异位激素分泌综合症等等。
各种肿瘤包括: 包括上皮组织 (如基底上皮、 鳞形上皮、 粘液细胞等等)、 (如 纤维组织、 脂肪组织、 软骨组织、 平滑肌组织、 血管和***内皮组织等等)、 造血组 织 (如 B细胞、 T细胞、 组织细胞等等)、 中枢神经组织、 周围神经组织、 内分泌组织、 性腺组织、 特殊组织 (如牙组织等等) 来源的肿瘤, 例如, 胃癌、 肝癌、 大肠癌、 乳 腺癌、 肺癌、 ***癌、 ***、 胰腺癌、 食道癌等等。 本发明的多肽是一种免疫调节剂, 具有免疫促进或免疫抑制作用。 本发明的 多肽可用于一些疾病的治疗, 这些疾病包括免疫反应的无反应性, 或异常免疫反 应, 或宿主防卫无效。 本发明的多肽和其抗体对免疫组织的损伤、 缺陷或失调类 疾病也有作用, 特别是对于造血***疾病 (如恶性贫血), 皮肤病 (如牛皮癣), 自身免疫病 (如类风湿性关节炎), 放射性疾病以及免疫淋巴细胞的生成和调节有 极为密切的关系。
本发明也提供了筛选化合物以鉴定提高(激动剂)或阻遏(拮抗剂)人核蛋白
I I前体蛋白 25 的药剂的方法。 激动剂提高人核蛋白 I I前体蛋白 25刺激细胞 增殖等生物功能, 而拮抗剂阻止和治疗与细胞过度增殖有关的紊乱如各种癌 症。 例如, 能在药物的存在下, 将哺乳动物细胞或表达人核蛋白 Π前体蛋白 25 的膜制剂与标记的人核蛋白 Π 前体蛋白 25 —起培养。 然后测定药物提高或阻 遏此相互作用的能力。
人核蛋白 Π前体蛋白 25 的拮抗剂包括筛选出的抗体、 化合物、 受体缺失 物和类似物等。 人核蛋白 Π 前体蛋白 25 的拮抗剂可以与人核蛋白 I I 前体蛋 白 25 结合并消除其功能, 或是抑制该多肽的产生, 或是与该多肽的活性位点 结合使该多肽不能发挥生物学功能。
在筛选作为拮抗剂的化合物时, 可以将人核蛋白 I I前体蛋白 25加入生物 分析测定中, 通过测定化合物对人核蛋白 Π前体蛋白 25和其受体之间相互作 用的影响来确定化合物是否是拮抗剂。 用上述筛选化合物的同样方法, 可以筛 选出起拮抗剂作用的受体缺失物和类似物。 能与人核蛋白 I I 前体蛋白 25结合 的多肽分子可通过筛选由各种可能组合的氨基酸结合于固相物组成的随机多肽 库而获得。 筛选时, 一般应对人核蛋白 Π前体蛋白 25分子进行标记。
本发明提供了用多肽, 及其片段、 衍生物、 类似物或它们的细胞作为抗原 以生产抗体的方法。 这些抗体可以是多克隆抗体或单克隆抗体。 本发明还提供 了针对人核蛋白 I I前体蛋白 25抗原决定簇的抗体。 这些抗体包括(但不限于): 多克隆抗体、 单克隆抗体、 嵌合抗体、 单链抗体、 Fab 片段和 Fab 表达文库产 生的片段。
多克隆抗体的生产可用人核蛋白 Π 前体蛋白 25直接注射免疫动物 (如家 兔, 小鼠, 大鼠等) 的方法得到, 多种佐剂可用于增强免疫反应, 包括但不限 于弗氏佐剂等。 制备人核蛋白 Π 前体蛋白 25 的单克隆抗体的技术包括但不限 于杂交瘤技术(Kohler and Mi l s te in. Nature, 1975, 256: 495-497) , 三瘤技 术, 人 Β-细胞杂交瘤技术, EBV-杂交瘤技术等。 将人恒定区和非人源的可变区 结合的嵌合抗体可用已有的技术生产(Morr i son e t a l , PNAS, 1985, 81: 6851)„ 而已有的生产单链抗体的技术(U. S. Pat No. 4946778)也可用于生产抗人核蛋 白 Π前体蛋白 25的单链抗体。
抗人核蛋白 I I前体蛋白 25 的抗体可用于免疫组织化学技术中, 检测活检 标本中的人核蛋白 I I前体蛋白 25。
与人核蛋白 I I前体蛋白 25结合的单克隆抗体也可用放射性同位素标记, 注入体内可跟踪其位置和分布。 这种放射性标记的抗体可 ^为一种非创伤性诊 断方法用于肿瘤细胞的定位和判断是否有转移。
抗体还可用于设计针对体内某一特殊部位的免疫毒素。 如人核蛋白 Π 前 体蛋白 25高亲和性的单克隆抗体可与细菌或植物毒素(如白喉毒素, 蓖麻蛋白, 红豆碱等)共价结合。 一种通常的方法是用巯基交联剂如 SPDP, 攻击抗体的氨 基, 通过二硫键的交换, 将毒素结合于抗体上, 这种杂交抗体可用于杀灭人核 蛋白 I I前体蛋白 25阳性的细胞。
本发明中的抗体可用于治疗或预防与人核蛋白 Π 前体蛋白 25 相关的疾 病。 给予适当剂量的抗体可以刺激或阻断人核蛋白 Π前体蛋白 25的产生或活性。
本发明还涉及定量和定位检测人核蛋白 Π前体蛋白 25水平的诊断试验方 法。 这些试验是本领域所熟知的, 且包括 FISH 测定和放射免疫测定。 试验中 所检测的人核蛋白 I I前体蛋白 25水平,可以用作解释人核蛋白 I I前体蛋白 25 在各种疾病中的重要性和用于诊断人核蛋白 I I前体蛋白 25起作用的疾病。
本发明的多肽还可用作肽谱分析, 例如, 多肽可用物理的、 化学或酶进行 特异性切割, 并进行一维或二维或三维的凝胶电泳分析,更好的是进行质谱分析。
编码人核蛋白 I I前体蛋白 25 的多核苷酸也可用于多种治疗目的。 基因治 疗技术可用于治疗由于人核蛋白 Π 前体蛋白 25 的无表达或异常 /无活性表达 所致的细胞增殖、 发育或代谢异常。 重组的基因治疗载体 (如病毒载体)可设计 用于表达变异的人核蛋白 Π前体蛋白 25, 以抑制内源性的人核蛋白 I I前体蛋 白 25 活性。 例如, 一种变异的人核蛋白 I I 前体蛋白 25 可以是缩短的、 缺失 了信号传导功能域的人核蛋白 Π 前体蛋白 25 , 虽可与下游的底物结合, 但缺 乏信号传导活性。 因此重组的基因治疗载体可用于治疗人核蛋白 I I前体蛋白 25 表达或活性异常所致的疾病。 来源于病毒的表达载体如逆转录病毒、 腺病毒、 腺病毒相关病毒、 单纯疱疹病毒、 细小病毒等可用于将编码人核蛋白 Π 前体 蛋白 25 的多核苷酸转移至细胞内。 构建携带编码人核蛋白 I I 前体蛋白 25 的 多核苷酸的重组病毒载体的方法可见于已有文献(Sarabrook, et al. )。 另外重 组编码人核蛋白 Π前体蛋白 25的多核苷酸可包装到脂质体中转移至细胞内。
多核苷酸导入组织或细胞内的方法包括: 将多核苷酸直接注入到体内组织 中; 或在体外通过载体(如病毒、 噬菌体或质粒等)先将多核苷酸导入细胞中, 再将细胞移植到体内等。
抑制人核蛋白 I I前体蛋白 25 mRNA的寡核苷酸(包括反义 RNA和 DNA)以及 核酶也在本发明的范围之内。 核酶是一种能特异性分解特定 RNA的酶样 RNA分 子, 其作用机制是核酶分子与互补的靶 RNA 特异性杂交后进行核酸内切作用。 反义的 RNA和 DNA及核酶可用已有的任何 RNA或 DNA合成技术获得, 如固相磷 酸酰胺化学合成法合成寡核苷酸的技术已广泛应用。 反义 RNA 分子可通过编码 该 RNA的 D 序列在体外或体内转录获得。 这种 DNA序列已整合到载体的 RNA 聚合酶启动子的下游。 为了增加核酸分子的稳定性, 可用多种方法对其进行修 饰, 如增加两侧的序列长度, 核糖核苷之间的连接应用磷酸硫酯键或肽键而非 磷酸二酯键。
编码人核蛋白 I I前体蛋白 25的多核苷酸可用于与人核蛋白 I I前体蛋白 25 的相关疾病的诊断。 编码人核蛋白 Π 前体蛋白 25 的多核苷酸可用于检测人核 蛋白 Π前体蛋白 25的表达与否或在疾病状态下人核蛋白 I I前体蛋白 25的异 常表达。 如编码人核蛋白 I I前体蛋白 25的 DNA序列可用于对活检标本进行杂 交以判断人核蛋白 I I 前体蛋白 25 的表达状况。 杂交技术包括 Southern 印迹 法, Nor thern 印迹法、 原位杂交等。 这些技术方法都是公开的成熟技术, 相关 的试剂盒都可从商业途径得到。 本发明的多核苷酸的一部分或全部可作为探针 固定在微阵列(Microarray)或 D 芯片(又称为 "基因芯片" )上, 用于分析组 织中基因的差异表达分析和基因诊断。 用人核蛋白 I I 前体蛋白 25特异的引物 进行 RNA-聚合酶链反应(RT-PCR)体外扩增也可检测人核蛋白 I I前体蛋白 25的 转录产物。
检测人核蛋白 Π 前体蛋白 25基因的突变也可用于诊断人核蛋白 I I 前体 蛋白 25 相关的疾病。 人核蛋白 I I 前体蛋白 25 突变的形式包括与正常野生型 人核蛋白 Π前体蛋白 25 DNA序列相比的点突变、 易位、 缺失、 重组和其它任 何异常等。 可用已有的技术如 Southern 印迹法、 D 序列分析、 PCR和原位杂 交检测突变。 另外, 突变有可能影响蛋白的表达, 因此用 Northern 印迹法、 Wes tern印迹法可间接判断基因有无突变。
本发明的序列对染色体鉴定也是有价值的。 该序列会特异性地针对某条 人染色体具***置且并可以与其杂交。 目前, 需要鉴定染色体上的各基因的具 ***点。 现在, 只有很少的基于实际序列数据(重复多态性)的染色体标记物可 用于标记染色***置。 根据本发明, 为了将这些序列与疾病相关基因相关联, 其重要的第一步就是将这些 DNA序列定位于染色体上。
简而言之, 根据 cDNA制备 PCR引物(优选 15-35bp), 可以将序列定位于染 色体上。 然后, 将这些引物用于 PCR筛选含各条人染色体的体细胞杂合细胞。 只有那些含有相应于引物的人基因的杂合细胞会产生扩增的片段。
体细胞杂合细胞的 PCR定位法, 是将 D 定位到具体染色体的快捷方法。 使用本发明的寡核苷酸引物, 通过类似方法, 可利用一组来自特定染色体的片 段或大量基因组克隆而实现亚定位。 可用于染色体定位的其它类似策略包括原 位杂交、 用标记的流式分选的染色体预筛选和杂交预选, 从而构建染色体特异 的 cDNA库。
将 cDNA克隆与中期染色体进行荧光原位杂交(FISH) , 可以在一个步骤中 精确地进行染色体定位。 此技术的综述, 参见 Verma等, Human Chromosomes: a Manua l of Bas ic Techniques, Pergamon Pres s, New York (1988)。
一旦序列被定位到准确的染色***置, 此序列在染色体上的物理位置就 可以与基因图数据相关联。 这些数据可见于例如, V. Mckus ick, Mende l ian Inher i tance in Man (可通过与 Johns Hopkins Univers i ty Welch Medi ca l Library联机获得)。 然后可通过连锁分析, 确定基因与业已定位到染色体区域 上的疾病之间的关系。
接着, 需要测定患病和未患病个体间的 cDNA或基因组序列差异。 如果在 一些或所有的患病个体中观察到某突变, 而该突变在任何正常个体中未观察 到, 则该突变可能是疾病的病因。 比较患病和未患病个体, 通常涉及首先寻找 染色体中结构的变化, 如从染色体水平可见的或用基于 cDM序列的 PCR可检测 的缺失或易位。 根据目前的物理作图和基因定位技术的分辨能力, 被精确定位 至与疾病有关的染色体区域的 cDNA, 可以是 50至 500个潜在致病基因间之一种 (假定 1兆碱基作图分辨能力和每 20kb对应于一个基因)。
可以将本发明的多肽、 多核苷酸及其模拟物、 激动剂、 拮抗剂和抑制剂与 合适的药物载体组合后使用。 这些载体可以是水、 葡萄糖、 乙醇、 盐类、 缓冲 液、 甘油以及它们的组合。 组合物包含安全有效量的多肽或拮抗剂以及不影响 药物效果的载体和赋形剂。 这些组合物可以作为药物用于疾病治疗。
本发明还提供含有一种或多种容器的药盒或试剂盒, 容器中装有一种或多 种本发明的药用组合物成分。 与这些容器一起, 可以有由制造、 使用或销售药 品或生物制品的政府管理机构所给出的指示性提示, 该提示反映出生产、 使用 或销售的政府管理机构许可其在人体上施用。 此外, 本发明的多肽可以与其它 的治疗化合物结合使用。
药物组合物可以以方便的方式给药, 如通过局部、 静脉内、 腹膜内、 肌内、 皮下、 鼻内或皮内的给药途径。 人核蛋白 Π 前体蛋白 25 以有效地治疗和 /或 预防具体的适应症的量来给药。 施用于患者的人核蛋白 Π 前体蛋白 25 的量和 剂量范围将取决于许多因素, 如给药方式、 待治疗者的健康条件和诊断医生的 判断。
实施例
下面结合具体实施例, 进一步阐述本发明。 应理解, 这些实施例仅用于说明 本发明而不用于限制本发明的范围。 下列实施例中未注明具体条件的实验方法, 通常按照常规条件如 Sambrook 等人, 分子克隆: 实验室手册(New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)中所述的条件, 或按照制造厂商所建议 的条件。
实施例 1 人核蛋白 Π前体蛋白 25的克隆
用异硫氰酸胍 /酚 /氯仿一步法提取人胎脑总 RNA。 用 Quik mRNA Isolat ion Ki t ( Qiegene 公司产品)从总 RNA中分离 poly (A) m通。 2ug poly (A) mRNA经逆转录 形成 cDM。用 Smar t cDNA克隆试剂盒(购自 C 1 ont ech |^cDM片段定向***到 pBSK (+) 载体 (Clontech公司产品)的多克隆位点上, 转化 DH5 α , 细菌形成 cDNA文库。 用 Dye terminate cycle react ion sequenc ing ki t (Perkin - Elmer公司产品) 和 ABI 377 自动测序仪 (Perkin-Elmer公司)测定所有克隆的 5'和 3'末端的序列。将测定的 cDNA 序列与已有的公共 D 序列数据库 (Genebank )进行比较, 结果发现其中一个克隆 0077C07的 cDNA序列为新的 DNA。 通过合成一系列引物对该克隆所含的*** cDNA片 段进行双向测定。结果表明, 0077C07克隆所含的全长 cDNA为 3425bp (如 Seq ID N0: l 所示) , 从第 2572bp至 3249bp有一个 678bp的开放阅读框架 ( 0RF ) , 编码一个新 的蛋白质 (如 Seq ID NO: 2所示) 。 我们将此克隆命名为 pBS- 0077C07 , 编码的蛋 白质命名为人核蛋白 I I前体蛋白 25。 实施例 2 cDNA 克隆的同源检索
将本发明的人核蛋白 Π前体蛋白 25的序列及其编码的蛋白序列, 用 Blas t程序 (Bas ic local a l ignment search tool) [Al tschul, SF et al.
J. Mol. Biol. 1990; 215: 403-10], 在 Genbank、 Swi ssport等数据库进行同源检索。 与本发明的人核蛋白 I I前体蛋白 25同源性最高的基因是一种已知的人核蛋白 I I前 体, 其编码的蛋白在 Genbank的准入号为 J04973。 蛋白质同源结果示于图 1 , 两者 高度同源, 其相同性为 90%。
实施例 3 用 RT-PCR方法克隆编码人核蛋白 I I前体蛋白 25的基因
用胎脑细胞总 RNA为模板,以 ol igo-dT为引物进行逆转录反应合成 cDM,用 Qiagene的试剂盒纯化后,用下列引物进行 PCR扩增:
Pr imer 1: 5'- TGACTACTTCACCCTTGGTGAA -3' (SEQ ID NO: 3)
Pr imer2: 5,- TTAAACAGAATGTTTTATTGAC -3' (SEQ ID NO: 4)
Pr imerl为位于 SEQ ID NO: 1的 5,端的第 lbp开始的正向序列;
Pr imer2为 SEQ ID NO: 1的中的 3,端反向序列。
扩增反应的条件: 在 50 μ 1的反应体积中含有 50mmol/L KC1, 10mmol/L Tri s- Cl, (pH8. 5) , 1. 5mmol/L MgCl2, 200 μ mol/L dNTP, l Opmol引物, 1U的 Taq DM聚合 酶 (Clontech公司产品)。 在 PE9600型 DNA热循环仪 (Perkin- Elmer公司)上按下列条 件反应 25个周期: 94°C 30sec; 55°C 30sec; 72。C 2min。 在 RT- PCR时同时设 β -act in 为阳性对照和模板空白为阴性对照。 扩增产物用 QIAGEN公司的试剂盒纯化, 用 TA 克隆试剂盒连接到 PCR载体上(Invitrogen公司产品) 。 DNA序列分析结果表明 PCR 产物的 DNA序列与 SEQ ID NO: 1所示的 l-3425bp完全相同。 实施例 4 Northern 印迹法分析人核蛋白 II前体蛋白 25基因的表达 用一步法提取总 RNA [Anal. Biochera 1987, 162, 156-159] 0 该法包括酸性硫 氰酸胍苯酚 -氯仿抽提。 即用 4M异硫氰酸胍 -25mM柠檬酸钠, 0.2M乙酸纳 ( PH4.0 ) 对组织进行匀浆, 加入 1倍体积的苯酚和 1/5体积的氯仿-异戊醇 (49: 1 ) , 混合 后离心。 吸出水相层, 加入异丙醇 (0.8体积) 并将混合物离心得到 RNA沉淀。 将 得到的 RNA沉淀用 70%乙醇洗涤, 干燥并溶于水中。 用 20μ8 ΙΝΑ, 在含 20mM 3- (Ν- 吗啉代) 丙磺酸(pH7.0) - 5mM乙酸钠 -ImM EDTA-2.2M甲醛的 1.2%琼脂糖凝胶上进 行电泳。 然后转移至硝酸纤维素膜上。 用 ct-32P dATP通过随机引物法制备 32P-标记 的 DNA探针。 所用的 DNA探针为图 1所示的 PCR扩增的人核蛋白 II前体蛋白 25编码区 序列(2572bp至 3249bp)。 将 32P-标记的探针 (约 2 χ 106cpm/ml ) 与转移了 RNA的硝 酸纤维素膜在一溶液中于 42°C杂交过夜, 该溶液包含 50%甲酰胺 -25mM KH2P04 (pH7.4 ) -5 530-5 06111&^1,3溶液和20(^ [111鲑精0 。 杂交之后, 将滤膜 在 1 X SSC-0.1%SDS中于 55。C洗 30min。 然后, 用 Phosphor Imager进行分析和定量。 实施例 5 重组人核蛋白 II前体蛋白 25的体外表达、 分离和纯化
根据 SEQ ID NO: 1和图 1所示的编码区序列, 设计出一对特异性扩增引物, 序 列如下:
Priraer3: 5'- CCCGCTAGCATGACAGCCTGTTCGATACGTTAG-3' Nhel -3, ( Seq ID No: 5 ) Primer4: 5'- CCCCTCGAGTTACAACTCATCAACAAAAGGTGT-3' Xhol -3, ( Seq ID No: 6 ) 此两段引物的 5'端分别含有 Nhel和 Xhol酶切位点, 其后分别为目的基因 5,端 和 3'端的编码序列, Nhel和 Xhol酶切位点相应于表达载体质粒 pET-28b(+) (Novagen 公司产品, Cat. No.69865.3)上的选择性内切酶位点。 以含有全长目的基因的 pBS - 0077C07质粒为模板,进行 PCR反应。 PCR反应条件为: 总体积 50 μ 1中含 pBS- 0077C07 质粒 10pg、 引物 Primer- 3和 Primer - 4分另1 J为 10pmol、 Advantage polymerase Mix (Clontech公司产品) 1 μ 1。 循环参数: 94。C 20s, 60。C 30s, 68。C 2 min,共 25个 循环。 用 Nhel和 Xhol分别对扩增产物和质粒 pET- 28 (+)进行双酶切,分别回收大片 段,并用 T4连接酶连接。 连接产物转化用氯化钙法大肠杆细菌 DH5 α,在含卡那霉素
(终浓度 30 g/nil ) 的 LB平板培养过夜后, 用菌落 PCR方法筛选阳性克隆, 并进行 测序。 挑选序列正确的阳性克隆(PET-0077C07 )用氯化钙法将重组质粒转化大肠 杆菌 BL21 (DE3) plySs (Novagen公司产品)。 在含卡那霉素 (终浓度 30 g/ml ) 的 LB 液体培养基中, 宿主菌 BL21 ( pET-0077C07 )在 37°C培养至对数生长期, 加入 IPTG 至终浓度 1腿 ol/L, 继续培养 5小时。 离心收集菌体, 经超声波破菌,离心收集上清 液, 用能与 6个组氨酸(6His-Tag ) 结合的亲和层析柱 Hi s. Bind Quick Cartr idge
( Novagen公司产品)进行层析, 得到了纯化的目的蛋白人核蛋白 I I前体蛋白 25。 经 SDS-PAGE电泳, 在 25kDa处得到一单一的条带 (图 2 ) 。 将该条带转移至 PVDF膜 上用 Edams水解法进行 N-端氨基酸序列分析, 结果 N-端 15个氨基酸与 SEQ ID NO: 2 所示的 N-端 15个氨基酸残基完全相同。 实施例 6 抗人核蛋白 I I前体蛋白 25抗体的产生
用多肽合成仪(PE公司产品)合成下述人核蛋白 I I前体蛋白 25特异性的多肽: NH2-Met-Thr-Ala-Phe-Ser-Leu-Thr-Ala-Glu-Arg-Ser-Ser-Ser-Leu-Cys-C00H (SEQ ID NO: 7)。 将该多肽^别与血蓝蛋白和牛血清白蛋白耦合形成复合, 方法参 见: Avrameas, et al. Immunochemi s try, 1969; 6: 430 用 4mg上述血蓝蛋白多肽复 合物加上完全弗氏佐剂免疫家兔, 15天后再用血蓝蛋白多肽复合物加不完全弗氏 佐剂加强免疫一次。 采用经 15 g/ml牛血清白蛋白多肽复合物包被的滴定板做 ELISA测定兔血清中抗体的滴度。 用蛋白 A-Sepharose从抗体阳性的家兔血清中分 离总 IgG。 将多肽结合于溴化氰活化的 Sepharose4B柱上, 用亲和层析法从总 IgG中 分离抗多肽抗体。免疫沉淀法证明纯化的抗体可特异性地与人核蛋白 I I前体蛋白 25 结合。

Claims

权利要隶
1、 一种分离的多肽-人核蛋白 Π前体蛋白 25 , 其特征在于它包含有: SEQ ID NO: 2所示的氨基酸序列的多肽、 或其多肽的活性片段、 类似物或衍生物。
2、 如权利要求 1所述的多肽, 其特征在于所述多肽、 类似物或衍生物的氨基 酸序列具有与 SEQ ID NO: 2所示的氨基酸序列至少 95%的相同性。
3、 如权利要求 2所述的多肽, 其特征在于它包含具有 SEQ ID NO: 2所示的氨 基酸序列的多肽。
4、 一种分离的多核苷酸, 其特征在于所述多核苷酸包含选自下组中的一种:
(a) 编码具有 SEQ ID NO: 2 所示氨基酸序列的多肽或其片段、 类似物、 衍生 物的多核苷酸;
(b) 与多核苷酸(a ) 互补的多核苷酸; 或
(c) 与 (a )或 (b )有至少 91%相同性的多核苷酸。
5、如权利要求 4所述的多核苷酸,其特征在于所述多核苷酸包含编码具有 SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列的多核苷酸。
6、如权利要求 4所述的多核苷酸,其特征在于所述多核苷酸的序列包含有 SEQ ID NO: 1中 2572-3249位的序列或 SEQ ID NO: 1中 1-3425位的序列。
7、 一种含有外源多核苷酸的重组载体, 其特征在于它是由权利要求 4-6中的 任一权利要求所述多核苷酸与质粒、 病毒或运载体表达载体构建而成的重组载体。
8、 一种含有外源多核苷酸的遗传工程化宿主细胞, 其特征在于它是选自于下 列一种宿主细胞:
(a) 用权利要求 7所述的重组载体转化或转导的宿主细胞; 或
(b) 用权利要求 4- 6中的任一权利要求所述多核苷酸转化或转导的宿主细胞。
9、 一种具有人核蛋白 Π前体蛋白 25活性的多肽的制备方法, 其特征在于所 述方法包括:
(a) 在表达人核蛋白 I I前体蛋白 25条件下, 培养权利要求 8所述的工程化 宿主细胞;
(b) 从培养物中分离出具有人核蛋白 I I前体蛋白 25活性的多肽。
10、 一种能与多肽结合的抗体,其特征在于所述抗体是能与人核蛋白 I I 前体 蛋白 25特异性结合的抗体。
11、 一类模拟或调节多肽活性或表达的化合物, 其特征在于它们是模拟、 促 进、 拮抗或抑制人核蛋白 I I前体蛋白 25的活性的化合物。
12、 如权利要求 11所述的化合物, 其特征在于它是 SEQ ID NO: 1所示的多核 苷酸序列或其片段的反义序列。
13、 一种权利要求 11所述化合物的应用, 其特征在于所述化合物用于调节人 核蛋白 Π前体蛋白 25在体内、 体外活性的方法。
14、 一种检测与权利要求 1-3 中的任一权利要求所述多肽相关的疾病或疾病 易感性的方法, 其特征在于其包括检测所述多肽的表达量, 或者检测所述多肽的 活性, 或者检测多核苷酸中引起所述多肽表达量或活性异常的核苷酸变异。
15、 如权利要求 1-3 中的任一权利要求所述多肽的应用, 其特征在于它应用 于筛选人核蛋白 I I 前体蛋白 25 的模拟物、 激动剂, 拮抗剂或抑制剂; 或者用于 肽指紋图谱鉴定。
16、 如权利要求 4-6 中的任一权利要求所述的核酸分子的应用, 其特征在于 它作为引物用于核酸扩增反应, 或者作为探针用于杂交反应, 或者用于制造基因 芯片或微阵列。
17、 如权利要求 1-6及 11 中的任一权利要求所述的多肽、 多核苷酸或化合物 的应用, 其特征在于用所述多肽、 多核苷酸或其模拟物、 激动剂、 拮抗剂或抑制 剂以安全有效剂量与药学上可接受的载体组成作为诊断或治疗与人核蛋白 I I 前体 蛋白 25异常相关的疾病的药物组合物。
18、 权利要求 1-6及 11中的任一权利要求所述的多肽、 多核苷酸或化合物的 应用, 其特征在于用所述多肽、 多核苷酸或化合物制备用于治疗如恶性肿瘤, 血 液病, HIV感染和免疫性疾病和各类炎症的药物。
PCT/CN2000/000380 1999-10-28 2000-10-27 Nouveau polypeptide, proteine precurseur humaine 25 de la nucleoproteine ii, et polynucleotide codant pour ce polypeptide WO2001031023A1 (fr)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
AU12645/01A AU1264501A (en) 1999-10-28 2000-10-27 A novel polypeptide-human nucleoprotein ii precursor protein 25 and the polynucleotide encoding said polypeptide

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN99119894.8 1999-10-28
CN 99119894 CN1302877A (zh) 1999-10-28 1999-10-28 一种新的多肽——人核蛋白ii前体蛋白25和编码这种多肽的多核苷酸

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2001031023A1 true WO2001031023A1 (fr) 2001-05-03

Family

ID=5281185

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/CN2000/000380 WO2001031023A1 (fr) 1999-10-28 2000-10-27 Nouveau polypeptide, proteine precurseur humaine 25 de la nucleoproteine ii, et polynucleotide codant pour ce polypeptide

Country Status (3)

Country Link
CN (1) CN1302877A (zh)
AU (1) AU1264501A (zh)
WO (1) WO2001031023A1 (zh)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN100417726C (zh) * 2006-03-08 2008-09-10 哈尔滨工业大学 人源参与微丝组装调控的核蛋白及其制备和应用方法

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
DATABASE EMBL [online] "BTCYTBC12", Database accession no. X59693 *
DATABASE GENBANK [online] 27 April 1993 (1993-04-27), "HUMCOR2M", Database accession no. J04973 *
DATABASE GENBANK [online] Database accession no. AC004069 *

Also Published As

Publication number Publication date
AU1264501A (en) 2001-05-08
CN1302877A (zh) 2001-07-11

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2001038371A1 (fr) Nouveau polypeptide glutamate arnt synthetase 58 d'origine humaine et polycnucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001031023A1 (fr) Nouveau polypeptide, proteine precurseur humaine 25 de la nucleoproteine ii, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001038387A1 (fr) Nouveau polypeptide, proteine de 37 kda, parent de l'oxydase cytochrome humaine, et polynucleotide codant pour ledit polypeptide
WO2001038524A1 (fr) Nouveau polypeptide, proteine humaine 21 fixatrice de calcium, de la famille s100, et polynucleotide codant pour ledit polypeptide
WO2001029228A1 (fr) Nouveau polypeptide, caseine kinase humaine 48, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001031030A1 (fr) Nouveau polypeptide, phosphodiesterase 21 humaine de type acide sphingomyelinase, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001038540A1 (fr) Nouveau polypeptide, la methionyl arnt synthetase humaine de 29 kda, et polynucleotide codant pour ledit polypeptide
WO2001031024A1 (fr) Nouveau polypeptide, threonine synthetase 71, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001032862A1 (fr) Nouveau polypeptide, proteine humaine 20 ribosome s4, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001038545A1 (fr) Nouveau polypeptide, acetyle galactosyle transferase 45 humain et polynucleotide codant ce polypeptide
WO2001032863A1 (fr) Nouveau polypeptide, proteine humaine 12 associee a l'apoptose (sag), et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001032699A1 (fr) Nouveau polypeptide, nouvelle udp glucose-glycoproteine glucosyltransferase (« biohugtr »), et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001030824A1 (fr) Nouveau polypeptide, sous-unite d'hydrogenase nadp 50, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001038369A1 (fr) Nouveau polypeptide porteur tricarboxylate 39 du rat- et polynucleotide codant ledit polypeptide
WO2001030822A1 (fr) Nouveau polypeptide, pyrophosphatase humaine 26 dutp, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001027285A1 (fr) Nouveau polypeptide, methyltransferase humaine dpb 41 et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001030818A1 (fr) Nouveau polypeptide, proteine de liaison 33 a l'arn, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001031032A1 (en) Novel polypeptide, human vacuolar h+-atpase c subunit 42 and polynucleotide encoding it
WO2001030821A1 (fr) Nouveau polypeptide, arn cyclase humaine 41, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001029229A1 (fr) Nouveau polypeptide, proteine humaine 20 de liaison de retinoblastome et polynucleotide le codant
WO2001030837A1 (fr) Nouveau polypeptide, galectine 15, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001030832A1 (fr) Nouveau polypeptide, proteine a doigt de zinc hkznf-23, et un polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001030835A1 (fr) Nouveau polypeptide, pogo transposase humaine 14, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001030840A1 (fr) Nouveau polypeptide, une proteine 57 a doigt de zinc, et polynucleotide codant pour ce polypeptide
WO2001030834A1 (fr) Nouveau polypeptide, proteine 33 a doigt de zinc, et polynucleotide codant pour ce polypeptide

Legal Events

Date Code Title Description
AK Designated states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AE AG AL AM AT AU AZ BA BB BG BR BY BZ CA CH CR CU CZ DE DK DM DZ EE ES FI GB GD GE GH GM HR HU ID IL IN IS JP KE KG KP KR KZ LC LK LR LS LT LU LV MA MD MG MK MN MW MX MZ NO NZ PL PT RO RU SD SE SG SI SK SL TJ TM TR TT TZ UA UG US UZ VN YU ZA ZW

AL Designated countries for regional patents

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): GH GM KE LS MW MZ SD SL SZ TZ UG ZW AM AZ BY KG KZ MD RU TJ TM AT BE CH CY DE DK ES FI FR GB GR IE IT LU MC NL PT SE BF BJ CF CG CI CM GA GN GW ML MR NE SN TD TG

121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
DFPE Request for preliminary examination filed prior to expiration of 19th month from priority date (pct application filed before 20040101)
REG Reference to national code

Ref country code: DE

Ref legal event code: 8642

122 Ep: pct application non-entry in european phase
NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: JP