TWI309238B - Protein and nucleic acid for glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase (gfd), alcohol dehydrogenase and s-nitrosoglutathione reductase from antrodia camphorata, manufacturing method and uses therefor - Google Patents
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1309238 七、指定代表圖: (一) 本案指定代表圖為: (二) 本代表圖之元件符賴單說明: 示發明特*的化學式 八本案若S^,請揭示最能頻 九、發明說明: ⑽以顯 【發明所屬之技術領域】 胺基酸及其核親。核 宿主細胞及製造方法, 本發明係關於一種樟芝GFD之蛋白質、 苷酸及可供製造該蛋白質之表現載體、 與含有該蛋白質之醫藥組成物。 【先前技術】 棒芝(Antrodiac鄉Aorata)又名牛樟足、牛棒兹報導指出 對肝腫瘤及子宮頸腫瘤的治療非常有效(1,弘+曰 J囚能在台灣 牛樟樹生長,故民間視樟芝為珍寳。因樟芝是菇類唯—能代謝牛 樟樹中大量抑菌性黃樟素而能生長的㈣,因有於他種兹類 的生理機能。樟芝在民間傳統療法上最主要應用於食品中毒,腹 瀉、下腹部疼痛、皮膚癢及肝癌等症狀《在眾多具有生理活性的 成分中,抗氧化物特別受到重視Π),因此針對其抗氧化成分, 其抗氧化成分的分析,在深層培養中被詳細的研究,指出在樟芝 菌絲體的萃取液中,三帖類對於脂質的過氧化作用具有抑制的的 功能’三帖類與多酚化合物對於清除氧自由基扮演極重要的角 色。由於樟芝中含有大量且成分複雜的抗氧化成分,因此一系列 藉由提升抗氧化效果而達到保護正常細胞或毒殺癌化細胞的機 轉’也陸續做了研究(2-6)。以樟芝菌絲體甲醇粹取物在低劑量 下,對肝腫瘤細胞株Hep G2有很強的細胞毒殺作用,其次為水 1309238
萃取部分,但發酵濾液則幾乎不具毒殺性。以C57BL/6* bALB/c 兩種小鼠進行試驗,結過顯示鼠血中TNF-α、IFN-t"和IL-2皆 明顯增加,而IL-4和IL-10則與控制組無明顯差異。此外,樟 芝菌絲體發酵過渡液藉由抗氧化物與清馀自由基的能力,有保護 其肝功能正常的效果。透過樟芝菌絲體萃取液的處理,可避免人 類正常的紅jk球細胞中的GSH與ATP的消耗,並對白血病 leukimia HL-60細胞產生細胞毒性,顯示樟芝菌絲.體可能具有 抗氧化物與抑制腫瘤的效應。樟芝對於肝功能的疾病療效十分良 好,其多醣體對於β型肝炎病毒有明顯的抑制效果。在已發表的 菇類多醣體中,樟芝為第一個被證實其多醣體對於Β型肝炎病毒 有直接抑制效果的物種。但樟芝子實體之研究少有報告,其療效 應高於菌絲體,故以新鮮樟芝子實體為材料。
Glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase (GFD) ’ 是屬於 alcohol dehydrogenase3(ADH3),主要是分解甲 輕(formaldehyde)、酒儉及還原被硝基化之物 (S-nitrososylated proteins),對生物體解毒維持健康扮演重 要角色(7-15)。 GFD可防止甲搭和蛋白質及核酸等反應而傷害到生物体在 植物亦能由GFD而代謝甲醛⑻,有很多生理功能其中一種 是信息傳遞,其能傳遞信息是靠蛋白質進行硝基化 (S-nitrosoylation)與否而達到調控代謝性酵素、結構性蛋白或轉 譯因子。近年的研究報告發現咖,亦具有還原硝基化物 (s-nitr0S0Sylati0n),特別是 s—nitr〇s〇giutath〇ne(GsN〇), 1309238 因此可協助守護生物免受nitrosative stress (11),在真菌 (fungus)中尚未有報告,特別是台灣的樟芝。GDF亦能代謝較高 濃度的酒精(7),故來自台灣的樟芝GFD,兼具三種去毒功能(去 除曱醛、酒精及還原被硝基化之物),是第一次發現。 GFD相關基因常因來源不同使其蛋白質的穩定性和活性不 同,但樟芝子實體GFD基因產物所知甚少,即使其它生物,亦是 近幾年的報告,因此值得將樟芝子實體GFD基因作有系統的研 究。 以採自鹿谷之新鮮樟芝子實體為材料,抽取RNA,合成cDNA。 藉由EST序列資訊設計引子,用樟芝子實體cDNA為模板,以PCR 增生GFD MA並進行篩選,篩得樟芝子實體GFD之片段DNA,再 進行YRACE和TRACE,最後得到全長GFD之cDNA,繼之與表現 型載体連接,植入酵母菌進行大量生產並純化。GFD基因產物為 蛋白質,分子量40 kDa,而如何植入真核細胞是另一大考驗, 因此在N端分別接上幾個胺酸(Tat),則Tat-GFD產物將容易植 入真核細胞以發揮其功能。值得應用於健康食品,或添加在燙 傷藥膏中以分解NO造成之傷害。 【發明内容】 本發明係提供一種樟芝GFD之蛋白質與核苷酸,及製造該蛋 白質之載體、宿主細胞及方法,與含該蛋白質之組成物。 本發明係由新鮮樟芝子實體之選殖並選擇表現GFD。該蛋 白可去除甲醛、酒精及還原被硝基化之物並藉此值得應用於健 康食品,或添加在烫傷藥膏中。 1309238 本發明提供一種分離核苷酸分子,包含編碼具SEQ ID N0:1 所示樟芝GFD胺基酸序列之核苷酸序列。本文所使用之語詞"核苦 酸分子"意指包括DNA分子(如cDNA或基因組DNA)、RNA分子(如 mRNA)、使用核苷酸同類物所產生的DNA或RNA同類物及其衍生 物、片段及同源物。核苷酸分子可為單股或雙股’但以雙股DNA 較佳。本文所使用之語詞"分離核苷酸"分子意為分離自存於天然 來源之其他核苷酸者。 根據本發明,核苷酸可僅包含編碼樟芝GFD生物活性之部分片 段。本文所使用之語詞”片段"意指編碼仍具生物活性之樟芝GFD 片段之核苷酸序列部分。 根據本發明之一具體實施例中,本發明分離核苷酸分子具有 SEQ ID N0:1之核苷酸序列或其簡併序列(擺動假說,Wobble hypothesis)。在另一具體實施例,本發明分離核苷酸分子包括 如SEQ ID NO: 1所示之核苷酸序列,其全長為1373,轉譯區有1134 bp,可以轉譯出378個胺基酸。本發明核苷酸分子與其他來源的 序列比較,有高的相似性。本發明核酸所編碼之樟芝GFD可分解 曱醛、酒精及還原被硝基化之物,提供了生物體抵抗毒性(甲 醛、酒精及N0)所帶來的破壞與傷害。如熟習該項技術者所認同 者,基於基因密碼的簡併性,可製得許多編碼本發明樟芝GFD蛋 白質之核苷酸。因此,針對一已被鑑定之特定胺基酸序列,熟習 該項技術者可在不改變樟芝GFD蛋白質之胺基酸序列之情況下, 藉簡單修飾一或多個密碼而製出各種不同核苷酸。 根據本發明,編碼樟芝GFD蛋白質之核苷酸可使用標準雜交及 選殖技術來分離。特別的,本發明核苷酸可使用標準選殖及篩選 技術’自新鮮樟芝子實體之cDNA庫分離出來。本發明核苷酸之放 1309238 大可根據PCR放大技術,使用cDNA、mRNA或基因組DNA作為模板及 適當的寡核苷酸引子而得。經放大之核苷酸可選殖至適當載體並 藉DNA序列分析來鑑定。 表現載體及宿主系統 本發明亦提供一表現載體,包含本發明之核苷酸。本發明表 現載體包含一編碼如SEQ ID N0:1所示之蛋白質核苷酸序列。 本文所使用之語詞"表現載體"係可直接表現連接至其上之基 因梭苷酸分子。載體為可自行複製及表現連接於其上之核苷酸 者。一般言之,可用於重組DNA技術之表現載體通常為"載體”形 式,一般為環狀雙股之MA,在其為載體形式時並未融合至染色 體。 本發明編碼G F D蛋白質或其功能相似物之核苷酸序列可*** 適當之表現載體中以表現具生物活性之GFD蛋白質。該表現載體 需含有***編碼序列之轉錄及轉譯等必要元件。根據本發明,熟 習技藝人士可利用熟知之方法構築含有編碼GFD蛋白質及適當轉 錄及轉譯控制元件之表現載體。此等方法包括體外重組MA技 術5合成技術及體内基因重組技術等。 本發明另一目的係提供包含表現載體之宿主細胞,該載體包 含編碼GFD蛋白質之核苷酸序列。本文所使用之語詞”宿主細胞" 為可經載體(如質體)感染之宿主細胞。根據本發明,許多宿主系 統可用於包含且表現編碼GFD蛋白質之序列。此等宿主系統包括 但不限於微生物(如以重組質體或表現載體轉形之細菌)、酵母菌 (如以酵母菌表現載體轉形之酵母菌)、或動物細胞系統。本發明 之宿主細胞為大腸桿菌及酵母菌。本發明將GFD蛋白質之cDNA在 大腸桿菌或酵母菌系統表現,確實能表現出具有活性的重組蛋白 1309238 質,經親和性管柱進行快速純化後,獲得純的gfd蛋白質。 根據本發明之一具體實施例:本發明樟芝GFD係以pYEX-Sl 為表現型載體之構築;設計N端含限制酶及N9RI片段(5,GGAATTCG ATG TCC ACA GTA GGA AAA CC 3’)與C端引子含6 His-tag and ibo RI (5, GGAATTCCTA GTG GTG GTG GTG GTG GTG AGA CAT GTC GAC GAC ACA GC 3,),以GFD蛋白質之cDNA為模板與引子進行PCR得到 之DNA。將該DNA送入大腸桿菌中進行篩選,抽取之質體DNA係使 用限制酶及τσ RI處理,所得片段與相同限制酶處理過之pYEX-S 1 接合,送入酵母菌yeast ’並以介質YPD medium (1% yeast extract, 2% peptone, 2% glucose)在30°C 下培養5 D (170 rpm),打破菌 體’以10, OOOxg離心5 min,收集上清液後’經親和性管柱進行 快速純化後。電泳後作蛋白質染色,經10% SDS-PAGE,於40 kDa 處可看到明顯色帶,此即為GFD蛋白質。為方便GFD蛋白質穿過細 胞膜’可在前端接上含有九個胺基酸之Tat,並將接上Tat之GFD 蛋白質DNA送入酵母菌中進行表現。 組成物 本發明亦包括一種醫藥組成物,包含本發明之GFD。除本發明 蛋白質外,該醫藥組成物可含有適當之醫藥上可接受之載劑。 本發明之醫藥組成物可以本技藝已知之方式(例如藉常用方 法)製造,該常用方法包括混合、溶解、製粒、製錠、磨細、乳 化、包膠、包陷及/或冷凍乾燥等步驟。 本發明之醫藥組成物可藉任何途徑投藥,此等途徑包括(但不 限於)口服、靜脈内、肌内、動脈内、穿皮、皮下、腹膜腔内、 鼻内或腸道投與。 皇J性 1309238 本發明樟之來源之樟芝GFD蛋白f,其活性皆比其來源之㈣ 蛋白質為t。因此本發明樟芝來源之樟^gfd蛋白質在醫學、食 品、學術研究等方面更具利用價值及貢獻。 t發明KiFD蛋白質可分解甲链、酒精及還原被石肖基化之 物,提供生物體抵抗(甲輕、酒精及N〇)所帶來的破壞與傷害。本 發明GFD蛋白質應用於健康食品,添加於烫傷藥膏可加速傷口 癒合,在整形外科之皮膚移植及人造皮移植應用中,可藉由gfd ^白質防止移植皮膚之組織壞死’進而加速移植皮膚之缝合。 【實施方式】 下列實例進一步說明本發明,但非欲限制本發明之範圍, 任何熟悉該項技術者所知之替代和改變,均仍涵蓋於本發明 之範圍中’而不偏離本發明之精神和目的。 搜乏子實體總RNA之拙肽 取4 g樟芝子實體以液態氪急速冷凍,於研妹中磨成粉末後取 出’馬上與20 mL的溶解緩衝液lysis buffer(Novalgen’s Straight’s mRNA Isolation System)於30 mL 離心管中混合, 置於4°C下5 min後以9, OOOxg在4°C離心15 min,離心後取上面水 溶液層,大約有20 mL。將水溶液吸至50 mL falcon中加入3 mg magnetight particles 混勻,置於4 °C下以磁座需住 magnetight particles,以 1.5 mL wash buffer 洗蘇三次,在 60°〇以0.5‘水洗離即為抓人(10叩),加入0.1¥〇1.3 113〇(11111〇 acetatp 和 0.8 vol.isopropanol 置於-75°C 20 min,隨後以 12, 000 rpm在4°C下離心15 min ’以70% ethanol共清洗三次’乾 11 '1309238 燥後儲存於-70°C備用。 樟芝 5’-RACE-Ready cDNA與 3’-RACE-Ready cMA之合成: Based on BD Biosciences Clontech5s SMART RACE cDNA Amplification Kit. 5’-RACE-Ready cDNA : 將下列所有反應溶液加入於1. 5 mL的微量試管中並在冰上完 成:
mRNA (ug/uL) (1 ug) 1 uL
5’-CDS primer 1 uL
Smart II A Oligo 1 uL.
H20 2 uL
總計 5 uL
3 5-RACE-Ready cDNA: mRNA (ug/uL) (1 ug) 1 uL
3 ’ - CD S primerA 1 uL
H2 〇 3 uL
總計 5 uL 均勻混合反應溶液,並稍微離心後置於72°C恆溫水浴槽中2 min。作用後將離心管置於冰上2 min。加入2uL 5X first-strand buffer > 1 uL 20 mM DTT * 1 uL 10 mM dNTP mix > 1 uL powerscript reverse transcriptase 於42°C 恆溫水浴槽中 1. 5 h。後加入200 uL tricine-EDTA buffer於72°C恆溫水浴槽中7 min後儲存於 12 *1309238 -70°C備用。 樟芝GFD基因的選殖 彖 藉由樟芝EST序列資訊設計引子,用樟芝5’-RACE-ReadycDNA 與3’-RACE-Ready cDNA為模板,以PCR增生GFD相關基因DNA並進 行篩選,得樟芝GFD基因之片段DNA,再進行YRACE與3’-RACE,最 後得到全長GFD之cDNA。 GFD cDNA之表現 經由PCR、膠體之製備及電泳、次選殖、在酵母菌表現型載體 (pYEX-Sl)之構築、及蛋白質的誘發與樣品的電泳分析等程式達 成。 PCR程式 將下列反應試料加至0. 5mL微量試管中,依序加入下列試劑:
模板 ΜΑ 0. 2 ug 5’ -正義引子 10. pno 1 3'-反義引子 10 p m o 1 OX Taq DNA聚合酶緩衝液 5 uL 15 mM MgCh 6uL Taq DNA 聚合酶 2.5 units 10 mM dNTP 1.5 uL 加入無菌水至總計 50 uL 加入50~100 uL礦物油,進行25 cycles of PCR(94 °Cfor 30 13 *1309238 min, 50°Cfor 3 min, 72°Cfor 1.5 min) PCR反應結束後,可得 DM產物,經回收後可用來進行下一步的實驗,例如進行DNA重 組,分析其序列θ 膠體之製備及電泳 所用之膠體為1. 0%瓊脂醣膠,倒入IX TAE缓衝液以能完 全覆蓋住膠。取15 uL PCR產物,加上其1/10體積的追蹤染劑, 注入孔中,另外也注入6 uL之1 kb DNA標記用來瞭解DM樣品的 大小,接著以100伏特的電壓進行電泳,待DNA染料移動至膠之 2/3處,即可中止電泳。將完成泳之膠以溴乙唆(EtBr)染色15 min 後,放入水中退染,之後即可置於紫外光源箱下觀察。 次選殖 1. PCR產物輿載體接合輿宿主細胞韓形 取1 uL PCR產物,加入1 uL鹽溶液,1 uL的無菌水與0.5 uL的 pCR4之後,於室溫下反應5 min以進行連接。取前述已接合好妁 重組DNA,加入18 uL TOPO 10活性細胞中,置於冰上30 min,後 置於42°0的水浴中3〇56(:進行熱休克後立即置於冰上2 111丨11,加入 150 uL SOC培養基,在37°C下振盪培養60 min,將其均勻塗布 在含有50ug/mL抗生素ampicillin的LB瓊脂聽的培養皿,在37 °C培養12-16 h之後,挑選50-80個單一菌株於新的ampicillin 之LB瓊脂醣上,待進一步實驗。 2. 菌體之轉印與放射性探針之製備 1309238 將轉印紙覆於培養皿表面,並以針頭紮洞作定位之後,取出 轉印紙,此時培養m上的菌落轉印到轉印紙上,轉印工作完成。 準備一淺盤,上覆3 mm濾紙,倒入變性溶液(0. 5 M NaoH,1. 5 Μ NaCl),倒入量以能充分濕潤3 mm濾紙,將轉印紙以吸附菌面朝 上,放在濕潤之濾紙之上7 min,接著取另一淺盤以中和溶液(1 MTris-HCl, 1 M NaCl,pH7. 5)充分濕潤濾、紙之上7 min。重覆中 和液步驟之後,將轉印紙置於烘箱中,以60-70°C烘乾。之後, 將轉印紙放於紫外交聯儀機器中,進行網狀連結15 sec,待進一 步以放射性探針來篩選。 放射性探針之製備
寡核苦酸(3 pmole/uL) 0· 5 uL 10X T4聚核普酸酶缓衝液 3. 0 uL 聚核普酸酶 (12 unit) 1. 5 uL [r-32p] ATP 3. 5 uL H2O 21. 5 uL 總計 30. 0 uL 混合均勻,置於37°C下反應30 min後。即完成放射性探針之 製備,將放射性探針加入雜交溶液中,用來篩選所要的目標基因。 3.目標基因DNA之選殖 取出前述之轉印紙,加入以1.5X SSC及0.1% SDS配製成的洗 劑,在44°C下震搖30 mi η,倒掉洗劑,加入不含放射性探針的雜 15 1309238 交溶液(5X SSC,5X Denhardt,0.5% SDS,100 ug/mL sperm DNA),此一過程稱之為預雜交。倒出雜交溶液,加入含有放射性 探針之雜交溶液,置於44°C水浴震搖16 h以上,倒出含有放射性 探針之雜交溶液’用前述洗劑,在44°C震搖15 min,重覆此一步 驟2-4次。壓乾轉印紙,進行自動放射顯影,沖片後,挑出正反 應株。 4.細菌晳體之純化與檢視 挑出正反應株養於含ampicillin(50 ug/mL)之LB,於37°C下 培養6-8 h。以10, 〇〇〇xg離心3min,取得菌體沈澱物,加入200 uL 再懸浮溶液(50 mM Tris,pH 7. 5, 10 mM EDTA)振盪,使菌體懸 浮狀態。加入200 uL溶裂液(0. 2 M NaOH, 1% SDS),輕輕的混勻’ 使菌體能被完全溶掉,質體能溶離出來。加入200 uL中和液(1.32 Μ醋酸卸),而後以12, OOOxg離心10 min,取上清液,注於0.5 mL 離心管(含DNA吸附膜),以12, 000xg離心lmin,使DNA能吸附於 膜上,之後加入mL的洗滌溶液,以12, 000xg離心2 min後。 再以12, 000xg離心2 min以去除殘留的酒精,最後加入50 uL的熱 水(60°C )靜置30 sec後,以12, 000xg離心2 min,收集離心下來 的質體DNA作質體之限制反應與電泳分析。即取MA以及適量的 限制酶,加上10 X reactin缓衡液,最後加無菌水使體積為 uL,在適當的溫度下反應2 h,以1%瓊脂醣膠電泳分析,以確定 嵌^入DNA的大小。 16 1309238 5.序列之判譫 利用ABI PRISM 377-96 DNA定序儀進行自動定序。 在酵母菌表現裀盤體之構築:
表現載體為pYEX-Sl,GFD係以pYEX-Sl為表現型載體之構築; 設計N端含限制酶及^ RI片段(5,GGAATTCG ATG TCC ACA GTA GGA AAA CC)與C端引子含6 His-tag and 价σ RI (5’ GGAATTCCTA GTG GTG GTG GTG GTG GTG AGA CAT GTC GAC GAC ACA GC 3,),以GFD 蛋白質之cDNA為模板與引子進行PCR得到之DNA。將該DNA送入大 腸桿菌中進行篩選,抽取之質體DNA係使用限制酶及RI處理, 所得片段與相同限制酶處理過之pYEX-Sl接合,送入yeast,並以 YPD medium (1% yeast extract, 2% peptone, 2% glucose)在
30°C下培養5 D (170 rpm),打破菌體’以i〇,〇〇〇xg離心5 min ’ 收集上清液後,經親和性管柱進行快速純化後。電泳後作蛋白質 染色,經10%SDS-PAGE,於40 kDa處可看到明顯色帶,此即為GFD 蛋白質。更佳的,為方便GFD蛋白質穿過細胞膜,可在前端接上 含有九個胺基酸之Tat,並將接上Tat之GFD蛋白質DNA送入酵母 菌中進行表現。 將其轉殖入酵母菌[trp一ada…ura—]作為表現宿主。pYEX-Sl (皆先以及RI處理連接),取前述已接合好的重組洲人,加入酵 母菌活性細胞中’篩選挑出正反應株以進行蛋白質表現。 在酵母菌棘形 17 1309238 1.製備轉形細, ⑴方法1 :選取單-菌落並完全的在YPD培養皿上劃線,在 28-32。〇培養8〜96h,從細菌培養基表層刮取菌,加入Yeastern 商品scos混合液至no a使試管中細菌濃度達5 χΐ〇7個/試 管。 ⑵方法2 :選取單-新鮮菌落加入w〇此γρ])培養液中於 28〜32 t:搖晃培養20, he將培養液加人ι〇 ι〇〇虹則培 養液中靜置8〜24h ’以2000 x g離心1〇山,去掉上清夜,以 無菌水清洗兩次去除殘餘的YPD培養液,將沈澱物混合擾摔入 110-115 μι SCOS混合液直至細菌濃度達5 χ1〇7個/試管。 2.製備SCOS混釦饬 在1. 5 mL試管中力认100 A SC0S緩衝夜,加入5 A i Μ術 (保存於-2G,加人5 ss DNA (保存於—抓),加入質 體DNA (不超過5μΙ〇。 3. 製備乾式遠擇性斑基m 完全乾燥的培養皿在Yeastern,s沉卯轉形系統中可提供良好 的轉形反應,因此建議在將培養皿叠置前先將無蓋培養I至於無 菌操作臺内lh左右,待其完全乾燥。 4. SCOS轉里 (1)將scos混合液與酵母菌懸浮細胞混合攪拌製成sc〇s轉形混 合液。 18 1309238 (2) 將試管加蓋,置於45. 5°C 10〜60 min。 (3) 將轉形混合液直接塗敷於乾燥培養皿[YNBD (1_ 7 g yeast nitrogen base, 5 g ammonium sulfate, 20 g glucose, 15 g agarose in 1 L water) containing 20 ug Trp/mL],此程式 20 sec内完成,將培養皿置於28-32 °C2~4天。 蛋白質表現 取單_;*菌落(1〜2 111111)於10瓜]^¥1^人.1'11)(1.7 8 76381;1111:1'〇忌611 base, 5 g asparagine, 20 g glucose in one L) containing 20 ug Trp/mL培養液,此容器使用125 mL燒瓶,並於30 °C培養箱中 以250 rpm震盪培養過夜,次日再加入5 mL培養液使ODeoo達到〇丄 時並繼續以30 °C、250 rpm震盪培養72 h後,再加入10 mL γΡΐ) 並繼續以30°C、250 rpm震盥培養48 h。 將所有菌液以5000xg、4°C離心10 min,收取菌加入〇 5 〇· •呂坡 璃球及2 niL PBS(pH8. 0),打破菌體,以10, 〇〇〇xg離心5 min , "故 集上清液後,再加入2 mL緩衝液,重覆此一萃取步驟,最後用2虹 緩衝液再萃取一次,一共收集6 mL上清液,此為粗蛋白質樣品 待進一步的電泳,電泳之膠體大小為1〇 cmx8cmx〇. 75匪。 1.電泳勝體的匍借 將鋁板與玻板拭淨後,和隔條組合好,放入製膠模型. '’再 依下表所列之用量配製膠體溶液:分離凝膠,混勻並注入模型 中,再加入適當的水壓平,約經過1 h,膠體形成後,再注入堆 19 1309238 積凝膠,並插上槽梳,待成膠即可。
取適量樣品與樣品載入缓衝液混勻後注入膠體孔洞中,以100 伏特電壓進行電泳,native-PAGE約需65 min,SDS-PAGE約需130 min後中止電泳,取下膠體,進行Coomassie blue染色:將膠體 浸於染劑中,均勻搖動30 min,移去染劑,用水清洗一次後,加 入退染劑,退染12 h即可。 UFD之純化 因 C 端帶有 6 個 His,以 Ni2+-nitrilotriacetic acid Sepharose superflow來進行親和性管柱純化如下:3 mL的樹脂 管柱,用5 vol.的PBS平衡,之後將6 mL的粗蛋白質樣品注入並 收集流下來的液體約6 mL。再以3 vol. PBS含20 mM imidazole 洗管柱,繼之以1.5 mL PBS含100 mM imidazole沖提,共收集6 個部分,其中有2値部分共3 mL有收集到蛋白貧,因為含有 imidazole,所以需經過透析除去。 透析液:將樣品約3 mL裝入透析膜中,以透析夾夾好,放入 含200 mL 1/3 PBScontaining 1 mM DTT and 5%glycerol透析液 的燒杯中,於4°C下透析4h以上,重覆此透析步驟即可分裝待進 一步分析。 5.GFD之蛋白質含晉 先製作蛋白質標準曲線(BSA standard curve):即分別取蛋 20 1309238 白質標準品(BSA,0_ 5 mg/mL)卜2、3、4、5、6 uL於其所對應之 滅菌水中,使最後體積達800 uL,之後分別加入呈色劑200 uL 室溫下反應5 min,測ODmnm並依吸光值求出蛋白質標準曲線。將 採收之樣品依相同方法測得吸光值即可由標準曲線求得蛋白質 含量。 6.活性測定 GFD活染:(1)首先將完成電泳之膠體,浸泡於70 mM potassium phosphate buffer (pH8.0), 0.5 M potassium chloride, 4.8 mM formaldehyde and ImM reduced GSH的水溶 液中,25°C搖動5 min後,分別加入不同量NAD、nitroblue tetrazolium、phenazine methosulfate 使最終濃度為 1.2 mM, 0. 4 mg/mL、0· 03 mg/mL,膠體於37°C搖動1 h後,以去離子水清 洗膠體後,呈現紫色帶之區域為具有GFD活性之處。 GSN0R活染:(2)將完成電泳之膠體,浸泡於0. 1 Μ potassium phosphate buffer (pH 8.0),2 mM NADH 水溶液中, 置於冰上15 min後,去除excess buffer,膠體覆上含有3 mMGSNO 的滤紙15 min後,除去爐紙,膠體在ultraviolet light上可觀 看NADH fluorescence消失的情形。 GFD 活性測定:(3)依據 Uotila and Koivusalo (13)作部分 修改,在 100 uL 反應液中:〇. 25〜1 pg GFD,100 mM potassium phosphate buffer (pH 8. 0), 1 mM HMGSH [GSH and formaldehyde 21 1309238 (1:1)在 25°C 混合 5 min 使產生 HMGSH],2 mM NAD·在 340 nm 測NAD被還原的量以換算GFD之活性(12-13)。 7. GFD性質 熱穩定性 分別取適量GFD於1.5 mL試管中,各5管,分別於50 °C加 熱 0、2、4、8、16 min 後,置於冰上,進行 10% native-gel 電 泳,分別作蛋白質染色(2 ug)及活性測試(2 ug)。結果顯示此 甚為安定,在50 °C加熱其活性減少一半所需時間為5 min。 pH的影響 分別取適量液,於1. 5 mL試管中,共6管,加入不同pH值缓 衝液:0. 2 Μ檸檬酸鈉緩衝液(pH 2. 3、or 5. 4),0. 2 M Tris-Hcl 緩衝液(pH 7. 8、or 9.0),0.2 M甘胺酸NaOH 緩衝液(pH 10. 4 or 11.2),在37 °C下反應lh後,置於冰上,分別進行10% nat i ve-ge 1電泳後作蛋白質染色(2 ug)及活性測試(2 ug)。結果 顯示此甚為安定,顯示以酸鹼處理很安定,尤其至pH7. 8〜pHll 處理lh對活性並沒有影響。 SDS的影響 分別取適量液,於1.5 mL試管中,共5管,分別加入不同量 的20 % SDS,使SDS最終濃度為0、1、2、3、4%,在37 °C下反應 lh後,分別進行10% native-gel電泳後作蛋白質染色(2 ug)及活 性測試(2 ug)。結果顯示SDS的處理不安定。 22 1309238 咪唑的影響 分別取適量GFD’於1>5 mL試管中,共5管,分別加入不同量 的咪唑,使咪唑最終濃度為0、0.2、0_4、〇_8、K6 M,在37。〇 下反應lh後,分別進行10% native-gel電泳後作蛋白質染色(2 ug) 及活性測試(2 ug)。結果顯示以咪唑的處理亦很安定,必須高至 0.8 Μ時對活性才有抑制(30%)。 香白酸的影響 分別取適量GFD ’於1.5 mL試管中,共4管,分別加入相當 GFD量1/20的胰蛋白酶或胰凝乳蛋白酶於Tri-HC1緩衝液(pH 8 · 5 含 2 0 niM CaC I2)分別在 37 C 下反應 i〇、20、40 min,分 別進行10% native-gel電泳後作蛋白質染色(2 ug)及活性測試 (2 ug)。結果顯示以胰蛋白酶的處理40 min候,活性不變。 動力學 GFD 之動力學結果:The Lineweaver-Burke plot of the velocity (1/V。)對 1/HMGSH 為 1^=^.0.615 mM 和 Vmax= 128 μΜ/min,the. velocity (1/V。)對 1/NAD+為 Km= 1.105 mM 和 \^眶=131 μΜ/min。
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1309238
、申請專 ;ί '〜種選白 ,. ---一J ^選自棒芝同時具有去甲醛、酒精及還原硝基化之 、(glutathi〇ne_dependent formaldehyde 炫 e h V* _ r〇genase’ GFD),其胺基酸序列係如SEQ IDN0:2所示。 ' 之同時具有去甲醛、酒精及還原硝基化之 苷質(GFD)之核苷酸,其包含一核苷酸序列,該核 序歹J係如SEQ Π) N〇:1所示,可用以編碼如申請專 麵固第i項所述 、抱姓 J疋之樟芝GFD之胺基酸序列。 據申請專利範圍 社 固第2項所述之樟芝GFD之分離核 核酸係在酵母菌中進行表現及量 甘酸,其中該分離 化 4 :::現载體,其包含如申請專利範圍第3項之嫩序列。 、1製造:其包含如申請專利範圍第4項之載體。 之蛋白質表狀條件MU、胞,柯細由雜紐分和 b)自該宿主細胞培養液中回收該蛋白質。
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