TW202102226A - 抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物及parp抑制劑之組合 - Google Patents

抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物及parp抑制劑之組合 Download PDF

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Abstract

一種特徵為將抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物與PARP抑制劑進行組合而投予之用於癌症之治療的醫藥組成物、或癌症的治療方法。

Description

抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物及PARP抑制劑之組合
本發明係關於特徵為將特定的抗體-藥物結合物與PARP抑制劑進行組合而投予之用於癌症之治療的醫藥組成物及癌症的治療方法。
抗體-藥物結合物(Antibody-Drug Conjugate;ADC)係被使用於癌症治療等,例如使抗體與具有細胞毒殺活性(Cytotoxic activity)之藥物結合而成者,而該抗體係與於癌細胞表面表現之抗原結合,且藉由該結合而可將抗原內化至細胞內。ADC係藉由效率良好地將藥物輸送至癌細胞,而使藥物蓄積在癌細胞內,可期待使癌細胞死亡。 於作為ADC所使用之藥物為有用者之一,可舉出吡咯并苯二氮呯(PBD)。PBD係藉由與DNA小溝的PuGPu序列等結合而顯示細胞毒性。源自天然的PBD之氨茴黴素(anthramycin)係於1965年首次被發現,那之後發現了各式各樣的源自天然、還有其類似物的PBD(非專利文獻1~4)。 PBD之一般性的結構式係以下式表示。
Figure 02_image009
PBD已知有於各自之A、C環部中於取代基的數目、種類、部位上不同,且各自之B、C環部的不飽和度不同者。 已知PBD藉由成為二聚體結構,而細胞毒性飛躍性地提升(非專利文獻5、6),亦有報告多種使二聚體PBD經ADC化者(專利文獻1~15)。然而,並未知於C2位具有螺環的PBD或其ADC體。 聚(ADP-核醣)聚合酶(PARP)抑制劑,係藉由抑制PARP(尤其是PARP-1及PARP-2)而具有妨礙單股剪切的修復之機能的藥劑。在乳癌或卵巢癌等之一部分的癌症,已知於雙股剪切的修復有異常,而PARP抑制劑被認為對此等之癌症有因合成致死所致之抗腫瘤效果(非專利文獻7~11)。 就PARP抑制劑而言,已知奧拉帕尼(Olaparib)(非專利文獻12)、盧卡帕尼(Rucaparib)(非專利文獻13)、尼拉帕尼(Niraparib)(非專利文獻14)、及他拉唑帕尼(Talazoparib)(非專利文獻15)等。 亦已知藉由併用PARP抑制劑與使用了PBD的ADC,而可得到類似合成致死的效果。例如,於PARP抑制劑會顯示有效性的BRCA2基因剔除DLD1細胞的異體移植模型(Xenograft model)中,奧拉帕尼與ADC的併用效果已被確認。然而,在親株之DLD1細胞的異體移植模型中,並未被承認有併用效果 (非專利文獻16)。又,關於上述具有螺環的PBD或其抗體-藥物結合物,未知有關與PARP抑制劑的併用效果。 [先前技術文獻] [專利文獻]
[專利文獻1]國際公開第2013/173496號 [專利文獻2]國際公開第2014/130879號 [專利文獻3]國際公開第2017/004330號 [專利文獻4]國際公開第2017/004025號 [專利文獻5]國際公開第2017/020972號 [專利文獻6]國際公開第2016/036804號 [專利文獻7]國際公開第2015/095124號 [專利文獻8]國際公開第2015/052322號 [專利文獻9]國際公開第2015/052534號 [專利文獻10]國際公開第2016/115191號 [專利文獻11]國際公開第2015/052321號 [專利文獻12]國際公開第2015/031693號 [專利文獻13]國際公開第2011/130613號 [專利文獻14]國際公開第2005/040170號 [專利文獻15]國際公開第2017/137556號 [非專利文獻]
[非專利文獻1]Angewandte Chemie Internationl Edition 2016,55,2-29 [非專利文獻2]Chemical Reviews 2010, 111, 2815-2864 [非專利文獻3]In Antibiotics III. Springer Verlag, New York, pp.3-11 [非專利文獻4]Accounts of Chemical Research 1986, 19, 230 [非專利文獻5]Journal of the American Chemical Society 1992, 114, 4939 [非專利文獻6]Journal of Organic Chemistry 1996, 61, 8141 [非專利文獻7]Lord CJ, et al., Nature (2012) 481, 287-294. [非專利文獻8]Benafif S, et al., Onco. Targets Ther. (2015) 8, 519-528. [非專利文獻9]Fong PC, et al., N. Engl. J. Med. (2009) 361, 123-134. [非專利文獻10]Fong PC, et al., J. Clin. Oncol. (2010) 28, 2512-2519. [非專利文獻11]Gelmon KA, et al., Lancet Oncol. (2011) 12, 852-861. [非專利文獻12]Menear KA, et al., J. Med. Chem. (2008) 51, 6581-6591. [非專利文獻13]Gillmore AT, et al., Org. Process Res. Dev. (2012) 16, 1897-1904. [非專利文獻14]Jones P, et al., J. Med. Chem. (2009) 52, 7170-7185. [非專利文獻15]Shen Y, et al., Clin. Cancer Res. (2013) 19(18), 5003-5015. [非專利文獻16]Zhong H, et al., Mol Cancer Ther. (2019) 18(1), 89-99.
[發明欲解決之課題]
本發明係提供:特徵為將抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物與PARP抑制劑進行組合而投予之用於癌症之治療的醫藥;特徵為將抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物與PARP抑制劑進行組合而投予之癌症的治療方法。 [用以解決課題之手段]
本發明人等,為了解決上述課題而專心致力進行了探討,其結果,藉由將抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物與PARP抑制劑進行組合而投予,顯示了優異的抗腫瘤效果。又,該結合物即使對於PARP抑制劑並不會顯示敏感性的細胞株及異體移植腫瘤,亦藉由與PARP抑制劑進行組合而投予,而顯示了優異的抗腫瘤效果。本發明係基於前述知識見解而完成。
即,本發明係關於以下之物。 [1]一種醫藥組成物,係包含抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物及/或PARP抑制劑之用於癌症治療的醫藥組成物,其特徵為將該抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物、與該PARP抑制劑進行組合而投予, 該結合物係以下式表示:
Figure 02_image011
Figure 02_image013
Figure 02_image015
、或
Figure 02_image017
於上述所示之各自的結構式中,m1 為1或2的整數, Ab為抗體或該抗體的機能性片段, N297糖鏈為具有以下式表示之結構的N297-(Fuc)MSG1、N297-(Fuc)MSG2或者彼等之混合物、或N297-(Fuc)SG,
Figure 02_image019
Figure 02_image021
Figure 02_image023
式中,波浪線係表示與抗體之Asn297結合, N297糖鏈中的L(PEG)係表示 *-(CH2 CH2 -O)3 -CH2 CH2 -NH-, 此處,右端的胺基與N297糖鏈的β-Man之支鏈之1-3鏈側或/及1-6鏈側的非還原末端的唾液酸之2位的羧酸透過醯胺鍵而結合,左端的星號*係表示與前述式中之***環上之1位或3位的氮原子結合。
[2]如[1]所記載之醫藥組成物,其特徵為抗體與腫瘤細胞所表現之抗原結合,且被併入腫瘤細胞內而內化。
[3]如[1]或[2]所記載之醫藥組成物,其特徵為抗體具有抗腫瘤效果。
[4]如[1]~[3]中任一項所記載之醫藥組成物,其中抗體為抗CLDN6抗體、抗CLDN9抗體、抗CLDN6/CLDN9抗體、抗HER2抗體、抗HER3抗體、抗DLL3抗體、抗FAP抗體、抗CDH11抗體、抗A33抗體、抗CanAg抗體、抗CD19抗體、抗CD20抗體、抗CD22抗體、抗CD25抗體、抗CD30抗體、抗CD33抗體、抗CD37抗體、抗CD56抗體、抗CD70抗體、抗CD98抗體、抗B7-H3抗體、抗TROP2抗體、抗CEA抗體、抗Cripto抗體、抗EphA2抗體、抗FGFR2抗體、抗G250抗體、抗MUC1抗體、抗GPNMB抗體、抗整合素(Integrin)抗體、抗PSMA抗體、抗肌腱蛋白-C(Tenascin-C)抗體、抗SLC44A4抗體、抗間皮素(Mesothelin)抗體、抗EGFR抗體、抗5T4抗體、抗LRRC15抗體、抗DR5抗體、抗CDH3抗體、抗PDPN 抗體、或抗CD123抗體。
[5]如[1]~[4]中任一項所記載之醫藥組成物,其特徵為抗體與CLDN6及/或CLDN9特異性地結合。
[6]如[5]所記載之醫藥組成物,其中抗體係包含以下的(a)或(b)所記載之包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的重鏈以及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3輕鏈而成: (a)由序列識別號9所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號10所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號11所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號5所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號6所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號7所記載之胺基酸序列或於該胺基酸序列中1或2個胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRL3;或 (b)由序列識別號15所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號16所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號17所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號12所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號13所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號14所記載之胺基酸序列構成的CDRL3。
[7]如[6]所記載之醫藥組成物,其中抗體係包含以下的(a)或(b)所記載之包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的重鏈以及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3輕鏈而成: (a)由序列識別號9所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號10所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號11所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號5所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號6所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號7所記載之胺基酸序列或序列識別號8所記載之胺基酸序列構成的CDRL3;或 (b)由序列識別號15所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號16所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號17所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號12所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號13所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號14所記載之胺基酸序列構成的CDRL3。
[8]如[5]~[7]中任一項所記載之醫藥組成物,其中抗體包含以下的(a)或(b)所記載之重鏈可變區、及輕鏈可變區: (a)由序列識別號21所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號19所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區;或 (b)由序列識別號25所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號23所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區。
[9]如[5]~[8]中任一項所記載之醫藥組成物,其包含由選自包含以下的(a)~(e)之群組的胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由選自包含(f)~(k)之群組的胺基酸序列構成的輕鏈可變區: (a)序列識別號54所記載之胺基酸序列; (b)序列識別號58所記載之胺基酸序列; (c)序列識別號62所記載之胺基酸序列; (d)對於(a)~(c)之序列中各CDR序列以外的框架區(framework region)之序列具有至少95%以上之相同性的胺基酸序列; (e)於(a)~(c)之序列中的各CDR序列以外的框架區之序列中有1或數個胺基酸係缺失、經取代或附加的胺基酸序列; (f)序列識別號38所記載之胺基酸序列; (g)序列識別號42所記載之胺基酸序列; (h)序列識別號46所記載之胺基酸序列; (i)序列識別號50所記載之胺基酸序列; (j)對於(f)~(i)之序列中各CDR序列以外的框架區之序列具有至少95%以上之相同性的胺基酸序列;及 (k)於(f)~(i)之序列中的各CDR序列以外的框架區之序列中有1或數個胺基酸係缺失、經取代或附加的胺基酸序列。
[10]如[9]所記載之醫藥組成物,其中抗體包含選自包含以下的(a)~(e)之群組的重鏈可變區及輕鏈可變區: (a)由序列識別號54所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號38所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (b)由序列識別號58所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號42所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (c)由序列識別號54所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號46所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (d)由序列識別號58所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號50所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區;及 (e)由序列識別號62所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號46所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區。
[11]如[5]~[10]中任一項所記載之醫藥組成物,其中抗體為嵌合抗體。
[12]如[5]~[10]中任一項所記載之醫藥組成物,其中抗體為人類化抗體。
[13]如[5]~[12]中任一項所記載之醫藥,其中抗體包含人類IgG1、人類IgG2或人類IgG4的重鏈恆定區。
[14]如[12]或[13]所記載之醫藥組成物,其包含選自包含以下的(a)~(e)之群組的重鏈及輕鏈: (a)由序列識別號52之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號36之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (b)由序列識別號56之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號40之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (c)由序列識別號52之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號44之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (d)由序列識別號56之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號48之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈;及 (e)由序列識別號60之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號44之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈。
[15]如[5]所記載之醫藥組成物,其中抗體會與[6]~[10]及[14]中任一項所記載之抗體於對CLDN6及/或CLDN9之結合上競爭,或會與[6]~[10]及[14]中任一項所記載之抗體所辨識之CLDN6及/或CLDN9上的部位結合。
[16]如[1]~[4]中任一項所記載之醫藥組成物,其中抗體會與HER2特異性地結合。
[17]如[16]所記載之醫藥組成物,其具有抗體依賴性細胞毒殺(ADCC)活性及/或補體依賴性細胞毒殺(CDC)活性。
[18]如[16]所記載之醫藥組成物,其中抗體之重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且包含會造成ADCC及/或CDC活性降低的變異。
[19]如[18]所記載之醫藥組成物,其中抗體之重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且於該重鏈恆定區中藉由EU Index所示之234位及235位的白胺酸被丙胺酸取代。
[20]如[16]或[17]所記載之醫藥組成物,其為包含由序列識別號65所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號64所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成之抗體。
[21]如[16]、[18]及[19]中任一項所記載之醫藥組成物,其為包含由序列識別號75之胺基酸編號20~139所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號73之胺基酸編號21~127所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區之抗體。
[22]如[16]、[18]、[19]及[21]中任意一者所記載之醫藥組成物,其為包含由序列識別號75之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號73之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈之抗體。
[23]如[16]、[18]、[19]及[21]中任意一者所記載之醫藥組成物,其為包含由序列識別號77之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號76之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈之抗體。
[24]如[5]~[23]中任一項所記載之醫藥組成物,其中抗體包含選自包含N-鍵結型糖鏈附加、O-鍵結型糖鏈附加、N末端的處理、C末端的處理、脫醯胺化、天冬胺酸的異構化、甲硫胺酸的氧化、於N末端之甲硫胺酸殘基的附加、脯胺酸殘基的醯胺化、及於重鏈的羧基末端之1個或2個胺基酸殘基的缺失之群組的1或2以上之修飾。
[25]如[24]所記載之醫藥組成物,其係於抗體之重鏈的羧基末端有1個或數個胺基酸殘基缺失。
[26]如[24]或[25]所記載之醫藥組成物,其係於抗體之2條重鏈雙方的羧基末端有1個胺基酸殘基缺失。
[27]如[24]~[26]中任一項所記載之醫藥組成物,其中抗體之重鏈的羧基末端的脯胺酸殘基進一步被醯胺化。
[28]如[1]~[27]中任一項所記載之醫藥組成物,其中N297糖鏈為N297-(Fuc)MSG1。
[29]如[1]~[28]中任一項所記載之醫藥組成物,其中m1 為1的整數。
[30]如[1]~[29]中任一項所記載之醫藥組成物,其中抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物中之抗體每1分子的平均藥物結合數為1~3或3~5。
[31]如[1]~[30]中任一項所記載之醫藥組成物,其中PARP抑制劑為奧拉帕尼、盧卡帕尼、尼拉帕尼、或者他拉唑帕尼、或彼等之藥理上可容許的鹽。
[32]如[1]~[31]中任一項所記載之醫藥組成物,其特徵為於各自不同的製劑作為有效成分而含有抗體-藥物結合物與PARP抑制劑,且同時或於不同時間進行投予。
[33]如[1]~[32]中任一項所記載之醫藥組成物,其係用於選自包含肺癌(非小細胞肺癌、小細胞肺癌等)、腎癌、尿道上皮癌、大腸癌、***癌、多型神經膠質母細胞瘤、卵巢癌(表層上皮性腫瘤、間質性腫瘤、生殖細胞腫瘤等)、胰臟癌、乳癌、黑色素瘤、肝癌、膀胱癌、胃癌、食道癌、子宮體癌、睾丸癌(精細胞瘤、非精細胞瘤)、子宮頸癌、胎盤絨毛癌、腦腫瘤、頭頸部癌以及彼等之轉移性形態之群組的至少一個癌症之治療。
[34]如一種治療方法,其係特徵為將抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物與PARP抑制劑進行組合而投予之癌症的治療方法, 該結合物係以下式表示:
Figure 02_image025
Figure 02_image027
Figure 02_image029
、或
Figure 02_image031
於上述所示之各自的結構式中,m1 為1或2的整數, Ab為抗體或該抗體的機能性片段, N297糖鏈為具有以下式表示之結構的N297-(Fuc)MSG1、N297-(Fuc)MSG2或者彼等之混合物、或N297-(Fuc)SG,
Figure 02_image033
Figure 02_image035
Figure 02_image037
式中,波浪線係表示與抗體之Asn297結合, N297糖鏈中的L(PEG)係表示 *-(CH2 CH2 -O)3 -CH2 CH2 -NH-, 此處,右端的胺基與N297糖鏈的β-Man之支鏈之1-3鏈側或/及1-6鏈側的非還原末端的唾液酸之2位的羧酸透過醯胺鍵而結合,左端的星號*係表示與前述式中之***環上之1位或3位的氮原子結合。
[35]如[34]所記載之治療方法,其特徵為抗體與腫瘤細胞所表現之抗原結合,且被併入腫瘤細胞內而內化。
[36]如[34]或[35]所記載之治療方法,其特徵為抗體具有抗腫瘤效果。
[37]如[34]~[36]中任一項所記載之治療方法,其中抗體為抗CLDN6抗體、抗CLDN9抗體、抗CLDN6/CLDN9抗體、抗HER2抗體、抗HER3抗體、抗DLL3抗體、抗FAP抗體、抗CDH11抗體、抗A33抗體、抗CanAg抗體、抗CD19抗體、抗CD20抗體、抗CD22抗體、抗CD25抗體、抗CD30抗體、抗CD33抗體、抗CD37抗體、抗CD56抗體、抗CD70抗體、抗CD98抗體、抗B7-H3抗體、抗TROP2抗體、抗CEA抗體、抗Cripto抗體、抗EphA2抗體、抗FGFR2抗體、抗G250抗體、抗MUC1抗體、抗GPNMB抗體、抗整合素抗體、抗體PSMA抗體、抗肌腱蛋白-C抗體、抗SLC44A4抗體、抗間皮素抗體、抗EGFR抗體、抗5T4抗體、抗LRRC15抗體、抗DR5抗體、抗CDH3抗體、抗PDPN 抗體、或抗CD123抗體。
[38]如[34]~[37]中任一項所記載之治療方法,其特徵為抗體與CLDN6及/或CLDN9特異性地結合。
[39]如[38]所記載之治療方法,其中抗體係係包含以下的(a)或(b)所記載之包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的重鏈以及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3輕鏈而成: (a)由序列識別號9所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號10所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號11所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號5所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號6所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號7所記載之胺基酸序列或於該胺基酸序列中1或2個胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRL3;或 (b)由序列識別號15所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號16所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號17所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號12所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號13所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號14所記載之胺基酸序列構成的CDRL3。
[40]如[39]所記載之治療方法,其中抗體係包含以下的(a)或(b)所記載之包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的重鏈以及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3輕鏈而成: (a)由序列識別號9所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號10所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號11所記載之胺基酸序列構成的CDRH3;及由序列識別號5所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號6所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號7所記載之胺基酸序列或序列識別號8所記載之胺基酸序列構成的CDRL3;或 (b)由序列識別號15所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號16所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號17所記載之胺基酸序列構成的CDRH3;及由序列識別號12所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號13所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號14所記載之胺基酸序列構成的CDRL3。
[41]如[38]~[40]中任一項所記載之治療方法,其中抗體包含以下的(a)或(b)所記載之重鏈可變區、及輕鏈可變區: (a)抗體為由序列識別號21所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號19所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區;或 (b)抗體為由序列識別號25所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號23所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區。
[42]如[38]~[41]中任一項所記載之治療方法,其包含由選自包含以下的(a)~(e)之群組的胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由選自包含(f)~(k)之群組的胺基酸序列構成的輕鏈可變區: (a)序列識別號54所記載之胺基酸序列; (b)序列識別號58所記載之胺基酸序列; (c)序列識別號62所記載之胺基酸序列; (d)對於(a)~(c)之序列中各CDR序列以外的框架區之序列具有至少95%以上之相同性的胺基酸序列; (e)於(a)~(c)之序列中的各CDR序列以外的框架區之序列中有1或數個胺基酸係缺失、經取代或附加的胺基酸序列; (f)序列識別號38所記載之胺基酸序列; (g)序列識別號42所記載之胺基酸序列; (h)序列識別號46所記載之胺基酸序列; (i)序列識別號50所記載之胺基酸序列; (j)對於(f)~(i)之序列中各CDR序列以外的框架區之序列具有至少95%以上之相同性的胺基酸序列;及 (k)於(f)~(i)之序列中的各CDR序列以外的框架區之序列中有1或數個胺基酸係缺失、經取代或附加的胺基酸序列。
[43]如[42]所記載之治療方法,其中抗體包含選自包含以下的(a)~(e)之群組的重鏈可變區及輕鏈可變區: (a)由序列識別號54所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號38所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (b)由序列識別號58所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號42所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (c)由序列識別號54所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號46所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (d)由序列識別號58所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號50所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區;及 (e)由序列識別號62所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號46所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區。
[44]如[38]~[43]中任一項所記載之治療方法,其中抗體為嵌合抗體。
[45]如[38]~[43]中任一項所記載之治療方法,其中抗體為人類化抗體。
[46]如[38]~[45]中任一項所記載之治療方法,其中抗體包含人類IgG1、人類IgG2或人類IgG4的重鏈恆定區。
[47]如[45]或[46]所記載之治療方法,其包含選自包含以下的(a)~(e)之群組的重鏈及輕鏈: (a)由序列識別號52之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號36之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (b)由序列識別號56之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號40之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (c)由序列識別號52之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號44之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (d)由序列識別號56之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號48之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈;及 (e)由序列識別號60之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號44之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈。
[48]如[38]所記載之治療方法,其中抗體會與[39]~[43]及[47]中任一項所記載之抗體於對CLDN6及/或CLDN9之結合上競爭,或會與[39]~[43]及[47]中任一項所記載之抗體所辨識之CLDN6及/或CLDN9上的部位結合。
[49]如[34]~[37]中任一項所記載之治療方法,其中抗體與HER2特異性地結合。
[50]如[49]所記載之治療方法,其具有抗體依賴性細胞毒殺(ADCC)活性及/或補體依賴性細胞毒殺(CDC)活性。
[51]如[49]所記載之治療方法,其中抗體之重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且包含會造成ADCC及/或CDC活性降低的變異。
[52]如[51]所記載之治療方法,其中抗體之重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且於該重鏈恆定區中藉由EU Index所示之234位及235位的白胺酸被丙胺酸取代。
[53]如[49]或[50]所記載之治療方法,其中抗體包含由序列識別號65所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號64所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成。
[54]如[49]、[51]及[52]中任一項所記載之治療方法,其中抗體包含由序列識別號75之胺基酸編號20~139所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號73之胺基酸編號21~127所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區而成。
[55]如[49]、[51]、[52]及[54]中任意一者所記載之治療方法,其中抗體包含由序列識別號75之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號73之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成。
[56]如[49]、[51]、[52]及[54]中任意一者所記載之治療方法,其中抗體包含由序列識別號77之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號76之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成。
[57]如[38]~[56]中任一項所記載之治療方法,其中抗體包含選自包含N-鍵結型糖鏈附加、O-鍵結型糖鏈附加、N末端的處理、C末端的處理、脫醯胺化、天冬胺酸的異構化、甲硫胺酸的氧化、於N末端之甲硫胺酸殘基的附加、脯胺酸殘基的醯胺化、及於重鏈的羧基末端之1個或2個胺基酸殘基的缺失之群組的1或2以上之修飾。
[58]如[57]所記載之治療方法,其係於抗體之重鏈的羧基末端有1個或數個胺基酸殘基缺失。
[59]如[57]或[58]所記載之治療方法,其係於抗體之2條重鏈雙方的羧基末端有1個胺基酸殘基缺失。
[60]如[57]~[59]中任一項所記載之治療方法,其中抗體之重鏈的羧基末端的脯胺酸殘基進一步被醯胺化。
[61]如[34]~[60]中任一項所記載之治療方法,其中N297糖鏈為N297-(Fuc)MSG1。
[62]如[34]~[61]中任一項所記載之治療方法,其中m1 為1的整數。
[63]如[34]~[62]中任一項所記載之治療方法,其中抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物中之抗體每1分子的平均藥物結合數為1~3或3~5。
[64]如[34]~[63]中任一項所記載之治療方法,其中PARP抑制劑為奧拉帕尼、盧卡帕尼、尼拉帕尼、或者他拉唑帕尼、或彼等之藥理上可容許的鹽。
[65]如[34]~[64]中任一項所記載之治療方法,其係用於選自包含肺癌(非小細胞肺癌、小細胞肺癌等)、腎癌、尿道上皮癌、大腸癌、***癌、多型神經膠質母細胞瘤、卵巢癌(表層上皮性腫瘤、間質性腫瘤、生殖細胞腫瘤等)、胰臟癌、乳癌、黑色素瘤、肝癌、膀胱癌、胃癌、食道癌、子宮體癌、睾丸癌(精細胞瘤、非精細胞瘤)、子宮頸癌、胎盤絨毛癌、腦腫瘤、頭頸部癌以及彼等之轉移性形態之群組的至少一個癌症之治療。
[66]一種包含[1]所記載之抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物的醫藥組成物,其係用以與PARP抑制劑併用。
[67]一種醫藥組成物,其係包含PARP抑制劑,且藉由與[1]所記載之抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物併用,而使該結合物的作用上升。
[68]一種包含PARP抑制劑的醫藥組成物,其係用以與[1]所記載之抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物併用。
[69]一種醫藥組成物,其係包含[1]所記載之抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物,且藉由與PARP抑制劑併用,而使PARP抑制劑的作用上升。
[70]如[1]所記載之醫藥組成物, 其係該吡咯并苯二氮呯衍生物於DNA的小凹槽(minor groove)中不形成交聯的醫藥組成物。
[71]如[1]所記載之醫藥組成物, 其係癌症對PARP抑制劑為非敏感性的醫藥組成物。
[72]如[1]所記載之醫藥組成物, 其係癌症對同源重組(HR)依賴的DNA雙股斷裂(DSB)修復途徑為非依賴的醫藥組成物。 [73]如[34]~[64]中任一項所記載之治療方法,其特徵為於各自不同的製劑作為有效成分而含有[1]所記載之抗體-藥物結合物與PARP抑制劑,且同時或於不同時間進行投予。 [發明之效果]
本發明係作為癌症的治療方法、及/或抗癌劑而為有用。
[用以實施發明的形態]
1.抗體-藥物結合物 本發明中所使用之抗體-藥物結合物,係透過連接子(linker)部分,使抗腫瘤性化合物結合於可辨識腫瘤細胞所表現之抗原或可與該抗原結合之抗體的抗腫瘤性藥物。
本發明之結合物係較佳為以下式表示。
Figure 02_image039
m1 為1或2的整數(較佳為1),D為藥物,L為連結N297糖鏈與D之連接子,Ab為抗體或該抗體的機能性片段,N297糖鏈表示與前述抗體之Asn297之側鏈結合的糖鏈。N297糖鏈可為經重塑的糖鏈。
<藥物> 本發明之藥物D較佳為抗腫瘤性化合物。本抗腫瘤性化合物係本發明之抗體-藥物結合物之連接子的一部分或全部在腫瘤細胞內被切斷,抗腫瘤性化合物部分游離而表現抗腫瘤效果。
作為本發明之藥物D,可舉出包含下式所示之結構的PBD衍生物。
Figure 02_image041
作為本發明之藥物D,可舉出於DNA的小凹槽中不形成交聯的PBD衍生物,但並不受限於此。
本發明之抗體-藥物結合物中之藥物,即PBD衍生物,係較佳為選自以下之群組的任意一者。
Figure 02_image043
此處,式中,星號*係表示與L結合。
本發明之PBD衍生物係如下述部分結構I(a)或I(b)所示地於11’位有不對稱碳存在,故有光學異構物存在。
Figure 02_image045
所以,上述的本發明之PBD衍生物係包含各自的光學異構物及光學異構物之以任意的比例之混合物。PBD衍生物之11’位的絕對構型可藉由結晶性的生成物或中間體或者彼等之衍生物的X射線結晶結構解析或Mosher法等之NMR來決定。那時,可使用以已知構型之具有不對稱中心的試藥所衍生物化之結晶性的生成物或中間體來決定絕對構型。立體異構物可藉由將所合成的本發明之化合物,根據期望而使用通常的光學分割法或分離法進行單離來獲得。
本發明之抗體-藥物結合物、其游離藥物或者其製造中間體中,有時亦有立體異構物或是源自不對稱碳原子的光學異構物、幾何異構物、互變異構物或d型、l型、構型異構物等之光學異構物存在,但此等之異構物、光學異構物及此等之混合物的任一者都包含在本發明中。 就本發明之PBD衍生物的部分結構而言,以上述I(a)為較佳。較佳為選自以下之群組的任意一者。
Figure 02_image047
此處,式中,星號*係表示與L結合。
<連接子結構> 本發明之連接子L為連結N297糖鏈與D之連接子。 該連接子L係以下式表示。 -Lb-La-Lp-NH-B-CH2 -O(C=O)-* 星號*係表示與藥物D之N10’位的氮原子結合,Lb表示結合La與N297糖鏈或經重塑的N297糖鏈之間隔物。
B表示苯基或雜芳基,較佳為1,4-苯基、2,5-吡啶基、3,6-吡啶基、2,5-嘧啶基、2,5-噻吩基,更佳為1,4-苯基。
Lp表示包含可於活體內或標的細胞中切斷之胺基酸序列的連接子。Lp會藉由例如酯酶或肽酶等之酵素的作用而被切斷。 Lp係2至7個(較佳為2至4個)胺基酸所構成的肽殘基。即,會藉由2至7個胺基酸經肽結合之寡肽的殘基所構成。 Lp係於N末端與Lb-La-之La的羰基結合,於C末端與連接子之-NH-B-CH2 -O(C=O)-部分的胺基(-NH-)形成醯胺鍵結。藉由前述酯酶等之酵素,Lp之C末端與-NH-間的結合會被切斷。
構成Lp的胺基酸並不特別被限定,但例如為L-或D-胺基酸,較佳為L-胺基酸。又,α-胺基酸以外,亦可為β-丙胺酸、ε-胺己酸、γ-胺丁酸等之結構的胺基酸,進而亦可為例如經N-甲基化的胺基酸等之非天然型的胺基酸。
Lp的胺基酸序列並不特別被限定,但作為構成的胺基酸,可舉出甘胺酸(Gly;G)、纈胺酸(Val;V)、丙胺酸(Ala;A)、***酸(Phe;F)、麩胺酸(Glu;E)、異白胺酸(Ile;I)、脯胺酸(Pro;P)、瓜胺酸(Cit)、白胺酸(Leu;L)、絲胺酸(Ser;S)、離胺酸(Lys;K)及天冬胺酸(Asp;D)等。在此等之中較佳為甘胺酸(Gly;G)、纈胺酸(Val;V)、丙胺酸(Ala;A)、瓜胺酸(Cit)。 此等之胺基酸可重複,且具有包含經任意地選擇之胺基酸的胺基酸序列。又,可根據胺基酸的種類來控制藥物游離的模式。
作為連接子Lp之具體例,可舉出 -GGVA-、-GG-(D-)VA-、-VA-、-GGFG-、-GGPI-、-GGVCit-、-GGVK-、-GG(D-)PI-、-GGPL-、-EGGVA、-PI-、-GGF-、-DGGF-、(D-)D-GGF-、-EGGF-、-SGGF-、-KGGF-、-DGGFG-、-GGFGG-、-DDGGFG-、-KDGGFG-、-GGFGGGF-。 此處,上述的『(D-)V』意指D-纈胺酸,『(D-)P』意指D-脯胺酸,『(D-)D』意指D-天冬胺酸。
連接子Lp係較佳為以下。 -GGVA-、-GG-(D-)VA-、-VA-、-GGFG-、-GGPI-、-GGVCit-、-GGVK-、-GG(D-)PI-、-GGPL-。
連接子Lp係更佳為以下。 -GGVA-、-GGVCit-、-VA-。
La表示選自以下之群組的任意一者。 -C(=O)-(CH2 CH2 )n2 -C(=O)-、-C(=O)-(CH2 CH2 )n2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 )n3 -C(=O)-、-C(=O)-(CH2 CH2 )n2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 O)n3 -CH2 -C(=O)-、-C(=O)-(CH2 CH2 )n2 -NH-C(=O)-(CH2 CH2 O)n3 -CH2 CH2 -C(=O)-、-(CH2 )n4 -O-C(=O)-。 此處,式中,n2 表示1~3的整數(較佳為1或2),n3 表示1~5的整數(較佳為2~4的整數,更佳為2或4),n4 表示0~2的整數(較佳為0或1)。
La係較佳為表示選自以下之群組的任意一者, -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-、-C(=O)-(CH2 CH2 )2 -C(=O)-、 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 )2 -C(=O)- -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 O)2 -CH2 -C(=O)-、 -C(=O)-CH2 CH2 -NH-C(=O)-(CH2 CH2 O)4 -CH2 CH2 -C(=O)-、 -CH2 -OC(=O)-、及-OC(=O)-。 La係更佳為-C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-、或-C(=O)-(CH2 CH2 )2 -C(=O)-。
Lb的間隔物並不特別被限定,但可舉出例如以下式表示之間隔物。
Figure 02_image049
Figure 02_image051
Figure 02_image053
於上述所示之Lb之各自的結構式中,星號*係表示與La之左端的-(C=O)、或-(CH2 )n4 結合,波浪線表示與Ab之N297糖鏈或經重塑的N297糖鏈結合。 於上述所示之Lb(Lb-1、Lb-2或Lb-3)之各自的結構式中,以疊氮基與DBCO的點擊反應(click reaction)所形成的***環部位係具有幾何異構結構,且於1個Lb中作為此等2種類的結構之任意一者、或彼等之混合物而存在。即,於本發明之抗體-藥物結合物1分子中有2或4個(m1 為1或2)的『-L-D』存在,且2或4個各自的『-L-D』中之L中之各自的Lb(Lb-1、Lb-2或Lb-3)為此等2種類的結構之任意一者,或該二者混在。
L係較佳為以-Lb-La-Lp-NH-B-CH2 -O(C=O)-*表示, B為1,4-苯基。 Lp表示選自以下之群組的任意一者。 -GGVA-、-GG-(D-)VA-、-VA-、-GGFG-、-GGPI-、-GGVCit-、-GGVK-、-GGPL-。 La表示選自以下之群組的任意一者。 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-、-C(=O)-(CH2 CH2 )2 -C(=O)-、 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 )2 -C(=O)-、 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 O)2 -CH2 -C(=O)-、 -C(=O)-CH2 CH2 -NH-C(=O)-(CH2 CH2 O)4 -CH2 CH2 -C(=O)-、-CH2 -OC(=O)-、-OC(=O)-。 Lb表示上述所示之Lb的任意之結構式。
L係更佳為選自以下之群組的任意一者。 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-GGVA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-GG-(D-)VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-(CH2 CH2 )2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-GGPI-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-GGFG-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-GGVCit-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-GGVK-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-GGPL-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 )2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 O)2 -CH2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -NH-C(=O)-(CH2 CH2 O)4 -CH2 CH2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z2 -OC(=O)-GGVA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、-Z3 -CH2 -OC(=O)-GGVA-NH-B-CH2 -OC(=O)-。
此處,Z1 表示上述Lb之以下所示之結構式。
Figure 02_image055
Z2 表示上述Lb之以下所示之結構式。
Figure 02_image057
Z3 表示上述Lb之以下所示之結構式。
Figure 02_image059
B為1,4-苯基。
L係最佳為以下之任一者。 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-GGVA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-(CH2 CH2 )2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-GGVCit-NH-B-CH2 -OC(=O)- -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 )2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -C(=O)-NH-(CH2 CH2 O)2 -CH2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-、及 -Z1 -C(=O)-CH2 CH2 -NH-C(=O)-(CH2 CH2 O)4 -CH2 CH2 -C(=O)-VA-NH-B-CH2 -OC(=O)-。 此處,B為1,4-苯基, Z1 為上述Lb之以下所示之結構式。
Figure 02_image061
<游離藥物> 本發明之抗體-藥物結合物的游離藥物係選自以下之群組的一個。
Figure 02_image063
本發明之游離藥物係本發明之抗體-藥物結合物移行至腫瘤細胞內之後,抗體-藥物結合物中之連接子L部分被切斷而生成。該游離藥物經確認有抗腫瘤細胞效果。
<抗體> 於本發明中,「癌症」與「腫瘤」係以相同意義使用。 於本發明中,「基因」意指包含編碼蛋白質之胺基酸之核苷酸序列的核苷酸或者核苷酸序列、或其互補股(complementary strand),例如,為包含編碼蛋白質之胺基酸之核苷酸序列的核苷酸序列或其互補股之多核苷酸、寡核苷酸、DNA、mRNA、cDNA、RNA等係包含在「基因」的意義中。就「CLDN6基因」而言,可舉出例如,包含編碼CLDN6蛋白質之胺基酸序列之核苷酸序列的DNA、mRNA、cDNA、cRNA等。 於本發明中,「核苷酸」、「多核苷酸」或「核苷酸序列」與「核酸」係同義,例如DNA、RNA、探針、寡核苷酸、多核苷酸、引子等亦包含在「核苷酸」或「核苷酸序列」的意義中。 於本發明中,「多肽」、「肽」、「蛋白質」不區別地使用。 於本發明中,「CLDN6」係與CLDN6蛋白質以相同意義使用。
於本發明中,「細胞」中亦包含動物個體內的細胞、培養細胞。 於本發明中,「細胞毒殺活性」係指以某種形式於細胞引起病理性的變化,且不僅限於直接性的外傷,還指引起DNA的切斷或鹼基之二聚體的形成、染色體的切斷、細胞***裝置的損傷、各種酵素活性的下降等所有的細胞之結構或機能上的損傷。
於本發明中,「抗體之機能性片段」意指亦被稱為「抗體之抗原結合片段」且具有與抗原之結合活性的抗體之部分片段,包含Fab、F(ab’)2、Fv、scFv、雙鏈抗體(diabody)、線狀抗體及由抗體片段所形成的多特異性抗體等。又,抗體之抗原結合片段亦包含將F(ab’)2在還原條件下進行了處理之為抗體之可變區之一價片段的Fab’。但是,只要具有與抗原之結合能力,則不受限於此等之分子。又,此等之抗原結合片段中,不僅是將抗體蛋白質之全長分子以適當的酵素進行了處理者,亦包含使用經以基因工程改變之抗體基因而於適當的宿主細胞中所產生的蛋白質。 本發明之機能性片段係包含:於IgG重鏈的Fc域中保有受到被良好地保存之N鍵結型糖鏈所致修飾的天門冬醯胺(Asn297)及其周邊的胺基酸,且具有與抗原之結合能力的機能性片段。
於本發明中,「抗原決定位」意指特定的抗體(例如,抗CLDN6抗體)會結合之抗原的部分肽或部分立體結構(例如,CLDN6的部分肽或部分立體結構)。為前述之部分肽(例如,CLDN6的部分肽)的抗原決定位,可藉由免疫試驗法等本技術領域中具有通常知識者所熟知的方法來決定。
本發明中之「CDR」意指互補性決定區(CDR:Complementarity determining region)。已知抗體分子之重鏈及輕鏈中有各自3處的CDR。CDR亦被稱為超可變區(hypervariable region),位於抗體之重鏈及輕鏈的可變區內,且為一次結構之變異性特別高的部位,於重鏈及輕鏈的多肽鏈之一次結構上,各自分離在3處。於本說明書中,係針對抗體的CDR,將重鏈的CDR由重鏈胺基酸序列的胺基末端側起表記為CDRH1、CDRH2、CDRH3,將輕鏈的CDR由輕鏈胺基酸序列的胺基末端側起表記為CDRL1、CDRL2、CDRL3。此等之部位在立體結構上彼此接近,且決定對於會結合之抗原的特異性。
於本發明中,「於嚴苛條件下進行雜交」係指於市售的雜交溶液ExpressHyb Hybridization Solution (Clontech公司)中在68℃進行雜交;或以可藉由使用固定了DNA的過濾器於0.7~1.0M的氯化鈉存在下在68℃進行了雜交之後,使用0.1~2倍濃度的SSC溶液(1倍濃度SSC係包含150mM氯化鈉、15mM檸檬酸鈉),在68℃清洗來進行鑑定之條件或與其同等之條件進行雜交。 於本發明中,「1~數個」意指1~10個、1~9個、1~8個、1~7個、1~6個、1~5個、1~4個、1~3個或1~2個。
於本發明中,有時將會辨識或結合CLDN6或者CLDN6及CLDN9的抗體各自標記為「抗CLDN6抗體」、「抗CLDN6/CLDN9抗體」。這種抗體中包含嵌合化抗體、人類化抗體、人類抗體等。有時將會辨識或結合CLDN6及CLDN9的抗體標記為「抗CLDN6抗體」。
本發明之抗體-藥物結合物所使用的抗體意指免疫球蛋白,為含有會與抗原免疫特異性地結合之抗原結合部位的分子。作為本發明之抗體,亦可為IgG、IgE、IgM、IgD、IgA及IgY之任一類(class),但較佳為IgG。又,作為子類(subclass),可為IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2之任一者,但較佳為IgG1、IgG2、IgG4。使用IgG1或IgG4之情形,能夠藉由取代恆定區之胺基酸殘基的一部分來調整效應子機能(參照WO88/07089、WO94/28027、WO94/29351)。
又,使用IgG1作為本發明之抗體的同型之情形,能夠藉由取代恆定區之胺基酸殘基的一部分來調整效應子機能。就降低或減弱了效應子機能之IgG1的變異體而言,可舉出IgG1 LALA(IgG1-L234A,L235A)、IgG1 LAGA(IgG1-L235A,G237A)等,較佳為IgG1 LALA。再者,前述L234A、L235A表示藉由EU index(Proc.Natl. Acad.Sci.U.S.A., Vol. 63, No.1 (May 15, 1969), pp.78-85)所特定之234位、235位的白胺酸被取代為丙胺酸,G237A表示藉由EU index所特定之237位的甘胺酸被取代為丙胺酸。
本發明之抗體係較佳為可將腫瘤細胞當作標的之抗體。 本發明之抗體-藥物結合物由於結合有會發揮抗腫瘤效果之化合物,較佳為抗體本身具有抗腫瘤效果,但並非必要。從使抗腫瘤性化合物的細胞毒殺性於腫瘤細胞中特異性・選擇性地發揮之目的來看,具有抗體或抗體-藥物結合物會內化而移行至腫瘤細胞內之性質為重要而較佳。從抗腫瘤效果的發揮之觀點來看,具有抗體或抗體-藥物結合物會內化而移行至腫瘤細胞內之性質,係於因藥物而特異性・選擇性地給予腫瘤細胞傷害之觀點為重要而較佳。抗體的抗腫瘤活性係指對腫瘤細胞的細胞毒殺活性、抗細胞效果。可使用公知的活體外(in vitro)或活體內(in vivo)的評價系統來確認抗腫瘤活性。抗體的內化能力可利用公知的評價系統來測定。 作為這樣的抗體,可舉出抗腫瘤相關抗原之抗體,可例示抗CLDN6抗體、抗CLDN9抗體、抗CLDN6/CLDN9抗體、抗HER2抗體、抗HER3抗體、抗DLL3(Delta like protein3)抗體、抗A33抗體、抗CanAg抗體、抗CD19抗體、抗CD20抗體、抗CD22抗體、抗CD25抗體、抗CD30抗體、抗CD33抗體、抗CD37抗體、抗CD56抗體、抗CD70抗體、抗CD98抗體、抗B7-H3(CD276)抗體、抗TROP2抗體、抗CEA 抗體、抗Cripto抗體、抗EphA2抗體、抗FGFR2抗體(WO201315206等)、抗G250抗體、抗MUC1抗體(WO2011012309等)、抗GPNMB抗體、抗整合素抗體、抗PSMA抗體、抗肌腱蛋白-C抗體、抗SLC44A4抗體、抗間皮素抗體、抗EGFR抗體、抗5T4 (癌胚胎抗原5T4 (oncofetal antigen 5T4),亦稱TPBG 及滋胚層糖蛋白(trophoblast glycoprotein))抗體、抗LRRC15 (富含亮胺酸重複蛋白15(Leucine-rich repeat-containing protein 15))抗體、抗DR5抗體、抗CDH3(鈣黏蛋白3(cadherin 3))抗體、抗PDPN (平足蛋白(podoplanin)) 抗體、或抗CD123抗體,但不限於此。 作為本發明之抗體,較佳為抗CLDN6抗體、抗CLDN6/CLDN9抗體、抗HER2抗體、抗CD98抗體、抗TROP2抗體,進一步較佳為抗CLDN6抗體、抗HER2抗體(例如,曲妥珠單抗、曲妥珠單抗變異體、曲妥珠單抗變異體2)。
於以下,針對本發明中所使用之抗CLDN6抗體進行說明。 1.CLDN6及CLDN9 CLDN6係屬於密連蛋白(Claudin)家族之由220胺基酸構成的四次跨膜型的蛋白質,於細胞內具有N末端及C末端。 人類CLDN6的胺基酸序列及DNA序列被公開在公共資料庫上,能藉由例如NP_067018(序列識別號1)、NM_021195(序列識別號2(都是NCBI)等之登錄號來參照。 關於人類CLDN6蛋白質之胺基酸序列(以下為「CLDN6胺基酸序列」),細胞外區域係由包含序列表之序列識別號1之胺基酸編號29~81的細胞外域(EC1)、包含胺基酸編號138~160的細胞外域(EC2)所構成。 CLDN9係屬於密連蛋白家族之由217胺基酸構成的四次跨膜型的蛋白質,於細胞內具有N末端及C末端。CLDN9係與CLDN6具有高相同性。 人類CLDN9的胺基酸序列及DNA序列被公開在公共資料庫上,能藉由例如例如NP_066192(序列識別號3)、NM_020982(序列識別號4)(都是NCBI)等之登錄號來參照。
2.抗CLDN6抗體 作為本發明之抗CLDN6抗體之一例,可舉出會辨識由序列表之序列識別號1所示之CLDN6的N末端起第29至81個的胺基酸序列、及第138至160個的胺基酸序列的2個細胞外區域所構成之高次結構,且具有內化活性的抗CLDN6抗體。 本發明之抗CLDN6抗體係可將腫瘤細胞當作標的之抗體,即具備可辨識腫瘤細胞之特性、可與腫瘤細胞結合之特性、還有被併入腫瘤細胞內而內化之特性等。所以,可透過連接子使本發明之抗CLDN6抗體與具有抗腫瘤活性之化合物結合而作成抗體-藥物結合物。 本發明之抗CLDN6抗體亦可具有抗腫瘤活性。
(1)本發明之抗CLDN6抗體具有以下(a)及(b)之特性; (a)會辨識或結合CLDN家族。 本發明之抗體會辨識CLDN家族。換言之,本發明之抗體會與CLDN家族結合。本發明之抗體係較佳為會與CLDN6結合,更佳為會與CLDN6特異性地結合。進而,本發明之抗體亦可會辨識CLDN9或與CLDN9結合。 於本發明中「特異性的辨識」、即「特異性的結合」,係意指並非非特異性的吸附之結合。就結合是否為特異性的判定基準而言,可舉出例如,解離常數(Dissociation Constant:以下,稱為「KD」)。本發明之適合的抗體之對CLDN6及/或CLDN9的KD值為1×10-5 M以下、5×10-6 M以下、2×10-6 M以下或1×10-6 M以下,更佳為5×10-7 M以下、2×10-7 M以下或1×10-7 M以下。 本發明中之抗原與抗體的結合,可藉由ELISA法、RIA法、表面電漿共振(Surface Plasmon Resonance)(以下,稱為「SPR」)解析法等來測定或判定。細胞表面上所表現之抗原與抗體的結合,可藉由流動式細胞測量法等來測定。 (b)具有藉由與CLDN6及/或CLDN9結合而內化至CLDN6及/或CLDN9表現細胞之活性。 (2)CLDN6及/或CLDN9為人類CLDN6及/或人類CLDN9之上述(1)所記載之抗體。
本發明之抗CLDN6單株抗體,可藉由使用融合瘤的方法等來獲得。就抗CLDN6單株抗體之例而言,可舉出小鼠抗CLDN6抗體B1及C7。再者,於本發明中,亦會將該「B1」表記為「B1抗體」,將該「C7」表記為「C7抗體」。 B1抗體之重鏈可變區的鹼基序列被記載於序列表之序列識別號20,胺基酸序列被記載於序列識別號21。又,B1抗體之輕鏈可變區的鹼基序列被記載於序列表之序列識別號18,胺基酸序列被記載於序列識別號19。 B1抗體之CDRH1的胺基酸序列被記載於序列識別號9,CDRH2的胺基酸序列被記載於序列識別號10,CDRH3的胺基酸序列被記載於序列識別號11,CDRL1的胺基酸序列被記載於序列識別號5,CDRL2的胺基酸序列被記載於序列識別號6,CDRL3的胺基酸序列被記載於序列識別號7。 C7抗體之重鏈可變區的鹼基序列被記載於序列表之序列識別號24,胺基酸序列被記載於序列識別號25。又,C7抗體之輕鏈可變區的鹼基序列被記載於序列表之序列識別號22,胺基酸序列被記載於序列識別號23。 C7抗體之CDRH1的胺基酸序列被記載於序列識別號15,CDRH2的胺基酸序列被記載於序列識別號16,CDRH3的胺基酸序列被記載於序列識別號17,CDRL1的胺基酸序列被記載於序列識別號12,CDRL2的胺基酸序列被記載於序列識別號13,CDRL3的胺基酸序列被記載於序列識別號14。
作為本發明之抗CLDN6抗體,可舉出會與和B1抗體或C7抗體相同的抗原決定位結合之抗體。若該抗體與B1抗體或C7抗體所結合之部分肽或部分立體結構結合,則可判定該抗體會與和B1抗體或C7抗體相同的抗原決定位結合。又,可藉由確認該抗體對於B1抗體或C7抗體對CLDN6之結合為競爭(即,該抗體會妨礙B1抗體或C7抗體與CLDN6的結合),而即使未決定具體的抗原決定位之序列或結構,亦判定該抗體會與和抗CLDN6抗體相同的抗原決定位結合。經確認抗原決定位為相同之情形,可強烈期待該抗體具有與B1抗體或C7抗體同等之抗原結合能力、生物活性及/或內化活性。
本發明之抗體中,於上述抗CLDN6的單株抗體之外,亦包含以使對人類之異種抗原性下降等作為目的而經人為改變的基因重組型抗體,例如嵌合(Chimeric)抗體、人類化(Humanized)抗體、人類抗體等。此等之抗體可使用已知的方法來製造。
(1)嵌合抗體 就嵌合抗體而言,可舉出抗體的可變區與恆定區互為異種之抗體,例如於源自小鼠或大鼠抗體的可變區接合了源自人類的恆定區之嵌合抗體。 作為本發明之嵌合抗體所例示之源自小鼠抗人類CLDN6抗體B1抗體的嵌合抗體,係包含以下輕鏈及重鏈之抗體,且亦可具有任意的源自人類的恆定區,該重鏈係包含由序列識別號21所示之胺基酸序列構成的重鏈可變區之重鏈,該輕鏈係包含序列識別號19所示之輕鏈可變區之輕鏈。 作為源自小鼠抗人類CLDN6抗體B1抗體的嵌合抗體之具體例,可舉出源自小鼠抗人類CLDN6抗體B1抗體的嵌合抗體chB1抗體(以下,亦記載為「chB1」。)。chB1抗體的胺基酸序列,可舉出包含以下輕鏈及重鏈之抗體:具有由序列表之序列識別號32的第20~471個的胺基酸殘基構成之胺基酸序列的重鏈、及具有由序列表之序列識別號28的21~234構成之胺基酸序列的輕鏈。 再者,在序列表之序列識別號32所示之重鏈序列,由第1~19個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為訊息序列,由第20~141個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為重鏈可變區,由第142~471個的殘基構成的胺基酸序列為重鏈恆定區。又,在序列表之序列識別號28所示之輕鏈序列中,由第1~20個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為訊息序列,由第21~127個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為輕鏈可變區,由第128~234個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為輕鏈恆定區。 chB1抗體之重鏈及輕鏈之可變區的胺基酸序列被記載於序列表之序列識別號34、序列識別號30。 chB1抗體之重鏈胺基酸序列,係由序列表之序列識別號33所示之核苷酸序列所編碼。由序列表之序列識別號33所示之核苷酸序列的第1~57個的核苷酸構成的核苷酸序列編碼chB1抗體重鏈之訊息序列,由序列表之序列識別號33所示之核苷酸序列的第58~423個的核苷酸構成的核苷酸序列編碼chB1抗體之重鏈可變區,由序列表之序列識別號33所示之核苷酸序列的第424~1413個的核苷酸構成的核苷酸序列編碼chB1抗體之重鏈恆定區。 chB1抗體之重鏈可變區的鹼基序列被記載於序列表之序列識別號35。 chB1抗體之輕鏈胺基酸序列,係由序列表之序列識別號29所示之核苷酸序列所編碼。由序列表之序列識別號29所示之核苷酸序列的第26~85個的核苷酸構成的核苷酸序列編碼chB1抗體輕鏈之訊息序列,由序列表之序列識別號29所示之核苷酸序列的第86~406個的核苷酸構成的核苷酸序列編碼chB1抗體之輕鏈可變區,由序列表之序列識別號29所示之核苷酸序列的第407~727個的核苷酸構成的核苷酸序列編碼chB1抗體之輕鏈恆定區。 chB1抗體之輕鏈可變區的鹼基序列被記載於序列表之序列識別號31。
(2)人類化抗體 就人類化抗體而言,可舉出:僅將互補性決定區(CDR;complementarity determining region)組入了源自人類的抗體而成之抗體(參照Nature(1986)321, p.522-525);藉由CDR移植法而於CDR的序列之外也將一部分的框架的胺基酸殘基移植至人類抗體而成之抗體(WO90/07861號);還有一邊維持對抗原的結合能力且改變了一部分的CDR的胺基酸序列而成之抗體。 CDR的胺基酸序列可藉由Kabat之定義、Chothia之定義、Abm之定義、IMGT等公知的方法來決定,但本發明中之CDR可為藉由任一方法所定義者。 但是,就源自B1抗體或C1抗體的人類化抗體而言,只要保有B1抗體或C1抗體的6種全部的CDR序列且具有CLDN6結合活性,則並不受限於特定的人類化抗體,進而改變了1~數個(較佳為1~2個,更佳為1個)CDR的胺基酸序列之人類化抗體變異體亦只要會辨識CLDN6蛋白質或具有該抗體的CLDN6蛋白質結合活性,則並不受限於特定的人類化抗體。 就本發明之抗CLDN6人類化抗體或其機能性片段而言,可舉出例如,包含以下的重鏈及輕鏈,且會辨識本發明之CLDN6蛋白質或保有該抗體的CLDN6蛋白質結合活性之抗體或該抗體的機能性片段等: 具有包含由序列表之序列識別號9所示之胺基酸序列或該胺基酸序列之1~數個(較佳為1~2個)胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRH1; 由序列表之序列識別號10所示之胺基酸序列或該胺基酸序列之1~數個(較佳為1~2個)胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRH2;及 由序列表之序列識別號11所示之胺基酸序列或該胺基酸序列之1~數個(較佳為1~2個)胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRH3之可變區的重鏈;以及 具有包含由序列表之序列識別號5所示之胺基酸序列或該胺基酸序列之1~數個(較佳為1~2個)胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRL1; 由序列表之序列識別號6所示之胺基酸序列或該胺基酸序列之1~數個(較佳為1~2個)胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRL2;及 由序列表之序列識別號7所示之胺基酸序列或該胺基酸序列之1~數個(較佳為1~2個)胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRL3之可變區的輕鏈。 就上述抗CLDN6人類化抗體或其機能性片段中之CDR的胺基酸取代之例而言,可舉出較佳為上述CDRL3的1~數個(較佳為1~2個)胺基酸取代 ,可例示序列表之序列識別號7之胺基酸編號4號與5號的胺基酸經取代的序列表之序列識別號8所示之CDRL3。
作為具有上述CDRH的人類化抗體之重鏈可變區,可例示序列表之序列識別號54所示之胺基酸序列、序列表之序列識別號58所示之胺基酸序列、及序列表之序列識別號62所示之胺基酸序列,作為具有上述CDRL的人類化抗體之輕鏈可變區,可例示序列表之序列識別號38所示之胺基酸序列、序列表之序列識別號42所示之胺基酸序列、序列表之序列識別號46所示之胺基酸序列、及序列表之序列識別號50所示之胺基酸序列。
作為包含上述重鏈可變區及輕鏈可變區之組合的人類化抗體,較佳可例示: 包含由序列表之序列識別號54所示之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列表之序列識別號38所示之胺基酸序列構成的輕鏈可變區而成的人類化抗體; 包含由序列表之序列識別號58所示之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列表之序列識別號42所示之胺基酸序列構成的輕鏈可變區而成的人類化抗體; 包含由序列表之序列識別號54所示之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列表之序列識別號46所示之胺基酸序列構成的輕鏈可變區而成的人類化抗體; 包含由序列表之序列識別號58所示之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列表之序列識別號50所示之胺基酸序列構成的輕鏈可變區而成的人類化抗體; 包含由序列表之序列識別號62所示之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列表之序列識別號46所示之胺基酸序列構成的輕鏈可變區而成的人類化抗體。
作為包含上述重鏈可變區及輕鏈可變區之組合而成的人類化抗體之全長序列,可例示: 包含由序列表之序列識別號52之胺基酸編號20~471所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號36之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H1L1); 包含由序列表之序列識別號56之胺基酸編號20~471所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號40之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H2L2); 包含由序列表之序列識別號52之胺基酸編號20~471所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號44之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H1L3); 包含由序列表之序列識別號56之胺基酸編號20~471所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號48之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H2L4);或 包含由序列表之序列識別號60之胺基酸編號20~471所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號44之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H3L3)。 再者,在序列表之序列識別號52、56、或60所示之重鏈胺基酸序列中,由第1~19個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為訊息序列,由第20~141個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為重鏈可變區,由第142~471個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為重鏈恆定區。 又,在序列表之序列識別號36、40、44或48所示之輕鏈胺基酸序列中,由第1~20個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為訊息序列,由第21~127個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為輕鏈可變區,由第128~234個的胺基酸殘基構成的胺基酸序列為輕鏈恆定區。
上述人類化抗體H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、H3L3之重鏈的羧基末端,係如後述,可有1或2個胺基酸缺失,該缺失體亦包含在本發明中。 作為缺失體的重鏈,可舉出包含序列表之序列識別號52、56、60之胺基酸編號第20~470個所記載之胺基酸序列的重鏈。 作為該缺失體,可例示 包含由序列表之序列識別號52之胺基酸編號20~470所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號36之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H1L1); 包含由序列表之序列識別號56之胺基酸編號20~470所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號40之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H2L2); 包含由序列表之序列識別號52之胺基酸編號20~470所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號44之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H1L3); 包含由序列表之序列識別號56之胺基酸編號20~470所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號48之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H2L4);或 包含由序列表之序列識別號60之胺基酸編號20~470所示之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列表之序列識別號44之胺基酸編號21~234所示之胺基酸序列構成的輕鏈而成的人類化抗體(H3L3)。
與包含上述重鏈可變區及輕鏈可變區之組合而成的抗體、或包含上述重鏈及輕鏈之組合而成的抗體之胺基酸序列的同一性或相同性為80%以上、較佳為90%以上、更佳為95%以上、進一步較佳為97%以上、最佳為99%以上之抗體,亦只要具有對CLDN6的結合活性,則亦包含在本發明之抗體中。 又,具有由與包含上述重鏈可變區及輕鏈可變區之組合而成的抗體、或包含上述重鏈及輕鏈之組合而成的抗體之CDR相同的胺基酸序列構成的CDR,且除了該抗體之CDR的胺基酸序列之外的胺基酸序列的同一性或相同性為80%以上、較佳為90%以上、更佳為95%以上、進一步較佳為97%以上、最佳為99%以上之抗體,亦只要具有對CLDN6的結合活性,則亦包含在本發明之抗體中。 進而,亦能藉由組合於重鏈或輕鏈之胺基酸序列有1~數個胺基酸殘基經取代、缺失或附加的胺基酸序列,而選擇具有與上述的各抗體同等之生物活性的抗體。又,就本說明書中之胺基酸的取代而言,較佳為保存性胺基酸取代(WO2013154206)。 保存性胺基酸取代係指與胺基酸側鏈有關的胺基酸基團內發生的取代。這種胺基酸取代係較佳為在不使具有原本之胺基酸序列的物質之特性降低的範圍進行。 二種類的胺基酸序列間的相同性,可藉由使用Blast演算法2.2.2版本(Altschul, Stephen F., Thomas L.Madden, Alejandro A.Schaaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.Lipman(1997), 「Gapped BLAST and PSI-BLAST:a new generation of protein database search programs」, Nucleic Acids Res.25:3389-3402)的系統內定參數來決定。Blast演算法亦可藉由以網際網路進入www.ncbi.nlm.nih.gov/blast來使用。
(3)人類抗體 就本發明之抗體而言,進一步可舉出會與CLDN6及/或CLDN9結合之人類抗體。抗CLDN6及/或CLDN9人類抗體意指僅具有源自人類染色體的抗體之基因序列的人類抗體。亦已知抗CLDN6人類抗體可藉由公知的方法來獲得(Nature Genetics(1997)16,p.133-143;Nucl.Acids Res.(1998)26, p.3447-3448;Animal Cell Technology:Basic and Applied Aspects, vol.10, p.69-73;Kluwer Academic Publishers, 1999.;Proc. Natl. Acad. Sci. USA(2000) 97, p.722-727;Investigative Ophthalmology & Visual Science.(2002)43(7), p.2301-2308;Briefings in Functional Genomics and Proteomics(2002), 1(2), p.189-203;Ophthalmology(2002)109(3),p.427-431;WO92/01047;WO92/20791;WO93/06213;WO93/11236;WO93/19172;WO95/01438;WO95/15388;Annu.Rev.Immunol(1994)12, p.433-455;Nature Biotechnology(2005)23(9), p.1105-1116)。
於以下,針對本發明中所使用之抗HER2抗體進行說明。 本發明之抗HER2抗體具有以下的特性。 (1)特徵為具有以下的特性之抗HER2抗體: (a)會與HER2特異性地結合; (b)具有藉由與HER2結合而內化至HER2表現細胞之活性。 (2)上述(1)所記載之抗體,其會與HER2的細胞外域結合。 (3)上述(1)或(2)所記載之抗體,前述抗體為單株抗體。 (4)上述(1)~(3)中任一項所記載之抗體,其具有抗體依賴性細胞毒殺(ADCC)活性及/或補體依賴性細胞毒殺(CDC)活性。 (5)上述(1)~(4)中任一項所記載之抗體,其為小鼠單株抗體、嵌合單株抗體或人類化單株抗體。 (6)上述(1)~(3)及(5)中任一項所記載之抗體,其係重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且包含會造成ADCC及/或CDC活性降低的變異。 (7)上述(6)所記載之抗體,其係重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且藉由EU Index所示之234位及235位的白胺酸被丙胺酸取代。 (8)上述(1)~(5)中任一項所記載之抗體,其為包含由序列識別號65所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號64所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成之抗體。 (9)上述(1)~(3)及(5)~(7)中任一項所記載之抗體,其為包含由序列識別號75之胺基酸編號20~139所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號73之胺基酸編號21~127所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區之抗體。 (10)上述(1)~(3)、(5)~(7)及(9)中任一項所記載之抗體,其為包含由序列識別號75之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號73之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成之抗體。 (11)上述(1)~(3)、(5)~(7)及(9)中任一項所記載之抗體,其為包含由序列識別號77之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號76之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成之抗體。 (12)上述(1)~(11)中任一項所記載之抗體,其係於重鏈羧基末端中1或2個胺基酸缺失。 (13)上述(1)~(5)、(8)及(12)中任一項所記載之抗體,其係包含由序列識別號65之胺基酸編號1~449所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號64之胺基酸編號1~214所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成。 (14)上述(1)~(3)、(5)~(7)、(9)、(10)及(12)中任一項所記載之抗體,其係包含由序列識別號75之胺基酸編號20~468所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號73之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成。 (15)上述(1)~(3)、(5)~(7)、及(9)、(11)及(12)中任一項所記載之抗體,其係包含由序列識別號77之胺基酸編號20~468所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號76之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成。 (16)藉由包含培養宿主細胞之步驟及從該步驟中所得到的培養物採集目的之抗體之步驟的該抗體之製造方法所得之抗體,其中該宿主細胞係藉由含有編碼上述(1)~(15)中任一項所記載之抗體之多核苷酸的表現載體被轉形。 再者,於本案中,將曲妥珠單抗之重鏈恆定區(序列識別號65)的藉由EU Index所示之234位及235位的白胺酸被丙胺酸所取代之抗體,稱為曲妥珠單抗變異體或曲妥珠單抗變異體2。
本發明之抗體中亦包含抗體的修飾體。該修飾體意指對本發明之抗體施予化學性或生物學性的修飾而成者。化學性的修飾體中包含對胺基酸骨架之化學部分的結合、N-鍵結或O-鍵結碳水化物鏈之化學修飾體等。生物學性的修飾體中包含經轉譯後修飾(例如,N-鍵結或O-鍵結型糖鏈附加、N末端或C末端的處理、脫醯胺化、天冬胺酸的異構化、甲硫胺酸的氧化)者、藉由使用原核生物宿主細胞使其表現而於N末端附加有甲硫胺酸殘基者等。又,為了能夠進行本發明之抗體或抗原的檢出或單離而經標識者,例如,酵素標識體、螢光標識體、親和性標識體亦包含在這種修飾體的意義中。這樣的本發明之抗體的修飾體有用於抗體之安定性及血中滯留性的改善、抗原性的降低、抗體或抗原的檢出或單離等。 又,能夠藉由調節與本發明之抗體結合之糖鏈修飾(糖苷化(glycosylation)、脫岩藻糖(fucose)化等),而増強抗體依賴性細胞毒殺活性。就抗體之糖鏈修飾的調節技術而言,已知WO1999/54342、WO2000/61739、WO2002/31140、WO2007133855、WO2013120066等,但並非受限於此等者。本發明之抗體中亦包含該糖鏈修飾經調節之抗體。 於這種修飾,可施予在抗體或其機能性片段中之任意的位置、或亦可施予在期望的位置中,且亦可在1個或2個以上的位置施予相同或2種以上之不同的修飾。 於本發明中「抗體片段的修飾體」,於其意義中亦包含「抗體的修飾體之片段」。
於一旦將抗體基因單離了之後,導入至適當的宿主而製作抗體之情形,可使用適當的宿主與表現載體之組合。就抗體基因之具體例而言,可舉出組合了編碼本說明書中所記載之抗體之重鏈序列等的基因、及編碼輕鏈序列等的基因者。於將宿主細胞轉形之際,重鏈序列基因等與輕鏈序列基因等能夠被***相同的表現載體,而且亦能夠被***不同的表現載體。 使用真核細胞作為宿主之情形,可使用動物細胞、植物細胞、真核微生物。尤其就動物細胞而言,可舉出哺乳類細胞,例如為猴之細胞的COS細胞(Cell(1981)23,p.175-182、ATCC CRL-1650)、小鼠纖維母細胞NIH3T3(ATCC No.CRL-1658)或中國倉鼠卵巢細胞(CHO細胞,ATCC CCL-61)的二氫葉酸還原酵素缺損株(Proc.Natl. Acad.Sci.U.S.A.(1980)77、 p.4126-4220)、FreeStyle 293F細胞(Invitrogen公司)。 使用原核細胞之情形,可舉出例如,大腸菌、枯草菌。 藉由轉形而將為目的之抗體基因導入至此等之細胞,藉由在活體外培養被轉形的細胞,而可得到抗體。於該培養中,會有依抗體之序列而產量不同之情形,能夠從具有同等結合活性的抗體之中以產量為指標而篩選作為醫藥之生產為容易者。是以,本發明之抗體中亦包含:藉由特徵為包含培養上述被轉形的宿主細胞之步驟、及從該步驟中所得到的培養物採集目的之抗體或該抗體的機能性片段之步驟的該抗體之製造方法所得之抗體。
上述抗體基因係較佳為包含以下的(a)~(e)中任一項所記載之多核苷酸的多核苷酸。 (a)編碼B1或者C7抗體、chB1抗體、人類化抗體H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、H3L3、 曲妥珠單抗及其變異體中任一者之抗體之重鏈胺基酸序列的多核苷酸與編碼輕鏈胺基酸序列的多核苷酸之組合; (b)編碼包含B1或者C7抗體、chB1抗體、及、人類化抗體H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、H3L3、 曲妥珠單抗及其變異體中任一者之抗體的CDRH1~CDRH3之重鏈胺基酸序列的多核苷酸與編碼包含CDRL1~CDRL3之輕鏈胺基酸序列的多核苷酸之組合; (c)編碼包含  B1或者C7抗體、chB1抗體、及、人類化抗體H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、H3L3、 曲妥珠單抗及其變異體中任一者之抗體的重鏈可變區之胺基酸序列之重鏈胺基酸序列的多核苷酸與編碼包含輕鏈可變區之胺基酸序列之輕鏈胺基酸序列的多核苷酸之組合; (d)與由和(a)~(c)中任一項所記載之多核苷酸互補的多核苷酸構成之核苷酸於嚴苛條件下進行雜交,且編碼會與CDLN6或HER2結合的抗體之胺基酸序列的多核苷酸;及 (e)編碼於(a)~(c)中任一項所記載之多核苷酸中1~50個、1~45個、1~40個、1~35個、1~30個、1~25個、1~20個、1~15個、1~10個、1~8個、1~6個、1~5個、1~4個、1~3個、1或者2個、或1個胺基酸被取代、缺失、附加或***而成之多肽的胺基酸序列,且編碼會與CLDN6或HER2結合的抗體之胺基酸序列的多核苷酸。 本發明包含:編碼本發明之抗體或者其機能性片段或其修飾體之核苷酸、經***該基因的重組載體、經導入該基因或該載體的細胞。 又,本發明亦包含一種抗體或者其機能性片段或其修飾體之製造方法,其係包含培養前述細胞之步驟、及從其培養物回收抗體或者其機能性片段或其修飾體之步驟。
再者,已知以哺乳類培養細胞所生產的抗體之重鏈的羧基末端之離胺酸殘基缺失(Journal of Chromatography A, 705:129-134(1995)),又已知同為重鏈羧基末端之甘胺酸、離胺酸的2胺基酸殘基缺失,且新位於羧基末端的脯胺酸殘基被醯胺化(Analytical Biochemistry、360:75-83(2007))。但是,此等之重鏈序列的缺失及修飾並不對抗體之抗原結合能力及效應子機能(補體的活性化或抗體依賴性細胞毒殺作用等)發生影響。所以,本發明之抗體中亦包含受到了該修飾之抗體及該抗體之機能性片段,且亦包含於重鏈羧基末端中1或2個胺基酸缺失之缺失體、及經醯胺化之該缺失體(例如,羧基末端部位的脯胺酸殘基經醯胺化之重鏈)等。但是,只要保有抗原結合能力及效應子機能,則本發明之抗體之重鏈的羧基末端之缺失體並不受限於上述的種類。構成本發明之抗體的2條重鏈可為選自包含完全長及上述的缺失體之群組的重鏈之任意一種,且可為組合了任意二種者。各缺失體的量比會受到產生本發明之抗體之哺乳類培養細胞的種類及培養條件影響,但就本發明之抗體的主成分而言,可舉出在2條重鏈雙方,羧基末端的1個胺基酸殘基缺失之情形。
所得到的抗體可純化到均勻為止。抗體的分離、純化只要使用通常的蛋白質所使用的分離、純化方法即可。若適宜選擇、組合例如管柱層析、過濾器過濾、超過濾、鹽析、透析、調製用聚丙烯醯胺凝膠電泳、等電點電泳等,則可分離、純化抗體(Strategies for Protein Purification and Characterization:A Laboratory Course Manual, Daniel R.Marshak et al. eds., Cold Spring Harbor Laboratory Press(1996);Antibodies:A Laboratory Manual.Ed Harlow and David Lane, Cold Spring Harbor Laboratory(1988)),但並非受限於此等者。
<N297糖鏈> 近年,有報告藉由酵素反應等來重塑不均勻的抗體之糖蛋白質,且均勻地導入具有官能基之糖鏈的方法(ACS Chemical Biology 2012, 7, 110;ACS Medicinal Chemistry Letters 2016, 7, 1005;Bioconjugate Chemistry 2015, 26, 2233;Angew. Chem. Int. Ed. 2016, 55, 2361-2367;US2016361436)。
本發明之糖鏈的重塑,係首先利用水解酵素,切除附加在蛋白質(抗體等)之不均勻的糖鏈,只留下末端的GlcNAc,調製附加了GlcNAc之均勻的蛋白質部分(以下,稱為「接受體」)。接著,準備已另行調製的任意糖鏈(以下,稱為「供予體」),使用醣基轉移酶連結此接受體與供予體。藉此而可合成具有任意糖鏈結構的均勻的糖蛋白質。
於本發明中,「糖鏈」意指2個以上的單醣藉由醣苷鍵結而被結合的結構單元。有時將具體的單醣或糖鏈,如例如”GlcNAc-”、”MSG-”地標記作為縮寫。在結構式中以此等之縮寫記載之情形,在還原末端歸屬於與別的結構單元之醣苷鍵結的氧原子或氮原子,除了有特別的定義之情形,被表示為不包含在表示該糖鏈之縮寫中者。
於本發明中,成為糖鏈的基本單元之單醣的記載,除了另外規定之情形,方便上,於其環結構中,將與構成環的氧原子結合且與羥基(或歸屬於醣苷鍵結的氧原子)直接結合之碳原子表記為1位(僅於唾液酸為2位)。實施例化合物之名稱係以化學結構整體來命名,此規則並不一定適用。
於本發明中,將糖鏈記載為記號(例如,GLY、SG、MSG、GlcNAc等)之情形,除了被另外定義之情形,係將到還原末端之碳為止當成包含在該記號中者,歸屬於N-或O-醣苷鍵結的N或O係當成該記號中所不包含者。係使到還原末端之碳為止當成包含在該記號中者,而使歸屬於N-或O-醣苷鍵結的N或O為該記號中所不包含者。
於本發明中,只要沒有特別的記載,則於胺基酸之側鏈中與糖鏈連結之情形的部分結構,係將側鏈部分以括弧表示,例如,使其表記為如「(SG-)Asn」。
本發明之抗體-藥物結合物係以下式表示。
Figure 02_image065
抗體Ab或其機能性片段係自N297糖鏈或經重塑的N297糖鏈與L結合,較佳為自Ab之經重塑的糖鏈與L結合。
本發明中之Ab的糖鏈為N鍵結型糖鏈或O鍵結型糖鏈,較佳為N鍵結型糖鏈。 N鍵結型糖鏈係藉由N醣苷鍵結,O鍵結型糖鏈係藉由O醣苷鍵結,而與抗體之胺基酸側鏈結合。
IgG係於其重鏈的Fc域中之第297位的天門冬醯胺殘基(以下,稱為「Asn297或N297」)具有被良好地保存的N鍵結型糖鏈,已知對抗體分子之活性或動態等有貢獻(Biotechnol.Prog.、2012,28, 608-622; Anal.Chem., 2013,85,715-736)。
IgG的恆定區中之胺基酸序列係被良好地保存,於Edelman et al.,(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A., Vol.63, No.1(May 15,1969),p.78-85)中,各自的胺基酸以Eu編號(Eu INDEX)特定。例如,於Fc域中附加有N鍵結型糖鏈之Asn297係與Eu編號中297位相當者,即使有因分子的片段化或區域缺失而實際的胺基酸位置有變動之情形,胺基酸係藉由以Eu編號表示而無歧義地被特定。
於於本發明之抗體-藥物結合物中,較佳為抗體或其機能性片段係自會與該Asn297之側鏈結合的糖鏈(以下,稱為「N297糖鏈」)與L結合,更佳為抗體或其機能性片段係自前述N297糖鏈與L結合,該N297糖鏈係經重塑的糖鏈。
SGP係唾液酸醣肽(Sialyl GlycoPeptide)的簡稱,為N鍵結型複合糖鏈的代表性者。SGP係可從雞卵的卵黃,按照例如WO2011/0278681中記載的方法來單離、純化。又,SGP的純化品已市售(東京化成(股)、(股)伏見製藥所),且可購入。已市售二唾液酸八醣(Disialyloctasaccharide)(東京化成(股))等,其僅由在SG之糖鏈部分中還原末端的GlcNAc有一個缺失了的糖鏈(以下為「SG(10)」)構成。
於本發明中,係將僅在SG(10)之β-Man的支鏈之任意一者有非還原末端的唾液酸缺失之糖鏈結構稱為MSG(9),各自將僅於支鏈的1-3糖鏈具有唾液酸者表記為MSG1,將僅於支鏈的1-6糖鏈具有唾液酸者表記為MSG2。
本發明之經重塑的糖鏈為N297-(Fuc)MSG1、N297-(Fuc)MSG2、或者N297-(Fuc)MSG1與N297-(Fuc)MSG2的混合物、或N297-(Fuc)SG,較佳為N297-(Fuc)MSG1、N297-(Fuc)MSG2或N297-(Fuc)SG,更佳為N297-(Fuc)MSG1或N297-(Fuc)MSG2。
N297-(Fuc)MSG1係以以下的結構式或配列式表示。
Figure 02_image067
Figure 02_image069
上述式中,波浪線係表示與抗體之Asn297結合, L(PEG)表示*-(CH2 CH2 -O)3 -CH2 CH2 -NH-,右端的胺基與N297糖鏈的β-Man之支鏈之1-3鏈側的非還原末端的唾液酸之2位的羧酸透過醯胺鍵結結合,左端的星號*係表示與前述連接子L的Lb之1,2,3-***環上之1位或3位的氮原子結合,n5 為2~10的整數,較佳為2~5的整數。
N297-(Fuc)MSG2係以以下的結構式或配列式表示。
Figure 02_image071
Figure 02_image073
上述式中,波浪線係表示與抗體之Asn297結合, L(PEG)表示*-(CH2 CH2 -O)3 -CH2 CH2 -NH-,右端的胺基與N297糖鏈的β-Man之支鏈之1-6鏈側的非還原末端的唾液酸之2位的羧酸透過醯胺鍵結結合,左端的星號*係表示與前述連接子L的Lb之1,2,3-***環上之1位或3位的氮原子結合,n5 為2~10的整數,較佳為2~5的整數。
N297-(Fuc)SG係以以下的結構式或配列式表示。
Figure 02_image075
Figure 02_image077
上述式中,波浪線係表示與抗體之Asn297結合, L(PEG)表示*-(CH2 CH2 -O)3 -CH2 CH2 -NH-,表示右端的胺基與N297糖鏈的β-Man之支鏈之1-3鏈側及1-6鏈側二者的非還原末端的唾液酸之2位的羧酸作醯胺鍵結,左端的星號*係表示與前述連接子L的Lb之1,2,3-***環上之1位或3位的氮原子結合,n5 為2~10的整數,較佳為2~5的整數。
本發明之抗體-藥物結合物中之抗體的N297糖鏈為N297-(Fuc)MSG1或者N297-(Fuc)MSG2或彼等之混合物之情形,抗體因是二聚體,所以抗體-藥物結合物會成為2個藥物連接子(-L-D)經結合而成的分子(上述m1 =1)(參照圖1)。 例如,實施例19:ADC1係N297糖鏈為N297-(Fuc)MSG1之情形。
本發明之抗體-藥物結合物中之抗體的N297糖鏈為N297-(Fuc)SG之情形,抗體因是二聚體,所以抗體-藥物結合物會成為4個藥物連接子(-L-D)經結合而成的分子(上述m1 =2)。
N297糖鏈係較佳為N297-(Fuc)MSG1或者N297-(Fuc)MSG2或N297-(Fuc)SG,更佳為N297-(Fuc)MSG1或者N297-(Fuc)MSG2,最佳為N297-(Fuc)MSG1。 本發明之抗體-藥物結合物中之抗體的N297糖鏈為N297-(Fuc)MSG1或者N297-(Fuc)MSG2或N297-(Fuc)SG之情形,可取得均勻品質的ADC。
本發明提供包含以下i)~iii)之步驟的糖鏈重塑抗體或該抗體的機能性片段的製造方法。 i)培養上述的宿主細胞(例如、動物細胞(CHO細胞等)),從所得到的培養物採集目的之抗體之步驟; ii)以水解酵素處理步驟i)中所得到的抗體,製造N297糖鏈為(Fucα1,6)GlcNAc的抗體((Fucα1,6)GlcNAc-抗體)之步驟(圖3A), 較佳為進而將該反應液藉由包含利用氫氧磷灰石管柱之純化之步驟,而純化(Fucα1,6)GlcNAc-抗體之步驟;及 iii)於MSG(9)或SG(10)的唾液酸之2位的羧酸之羰基導入具有疊氮基的PEG連接子-(N3 -L(PEG)),且醣基轉移酶存在下,使(Fucα1,6)GlcNAc-抗體與還原末端經
Figure 109110172-A0304-12-0059-1
唑啉化的糖鏈供予體分子進行反應,合成於唾液酸導入有疊氮基的糖鏈重塑抗體之步驟。 又,藉由這種製造方法而得之糖鏈重塑抗體或者其機能性片段、或彼等之修飾體亦包含在本發明中。
前述本抗體-藥物結合物的製造中間體具有會與DBCO(Dibenzocyclooctyne)等之疊氮基反應的炔烴結構(參照實施例2-1,化合物3-14)。所以,可藉由使該製造中間體與前述i)~iii)之步驟中所得到的於糖鏈的唾液酸導入有具有疊氮基的PEG連接子而成之MSG1型、MSG2型或SG型糖鏈重塑抗體或該抗體的機能性片段進行反應,而製造本發明之抗體-藥物結合物。
於本發明之N297糖鏈中,還原末端附加了岩藻糖的GlcNAc-(Fucα1,6)GlcNAc)係源自動物細胞中所產生的抗體,但非還原末端側之糖鏈係較佳為經與上述之MSG(MSG1、MSG2)或SG同樣的糖鏈結構所重塑者。任一者皆利用結合於該非還原末端的唾液酸2位之羧酸,而與L(PEG)結合。 具有這樣的MSG(MSG1、MSG2)或SG型N297糖鏈的糖鏈重塑抗體,係可依據例如WO2013/120066等中記載的方法 ,而以如圖3所示之方法來製造。依據公知的方法而使用動物細胞作為宿主,而使為基因重組蛋白質的抗體產生之情形(上述步驟i),N297糖鏈係具有附加了岩藻糖之N鍵結型糖鏈結構作為基本結構,但可作為具有包含於非還原末端的結構或構成糖有進行了各種修飾的各式各樣的結構之糖鏈的抗體或其片段的混合物來獲得(圖3A的IV)。如此地在動物細胞所產生的抗體,係藉由以EndoS等水解酵素進行處理,而還原末端之幾丁二糖結構的GlcNAcβ1-4GlcNAc之間的醣苷鍵結被水解,可得到作為N297糖鏈而具有僅具有(Fucα1,6)GlcNAc之單一的糖鏈結構之抗體分子(稱為「(Fucα1,6)GlcNAc-抗體」,參照圖2的A)(圖3A)(上述步驟ii))。
就用於N297糖鏈之水解反應的酵素而言,可使用保有了Endo S或其水解活性之變異酵素(mutant enzyme)等。
可藉由使用EndoS D233Q或EndoS D233Q/Q303L變異體之類的醣基轉移酶(WO2017010559等),使藉由上述的水解反應而得之(Fucα1,6)GlcNAc-抗體作為糖鏈接受體分子,與MSG(MSG1、MSG2)或SG型糖鏈供予體分子進行反應,來獲得具有由上述之結構構成之MSG(MSG1、MSG2)或SG型N297糖鏈的抗體(參照圖2的B)(圖3B)(上述步驟iii)-1、iii)-2)。
抗體-藥物結合物中之抗體每1分子的藥物結合數m1 為1之情形,作為糖鏈而採用具有MSG(MSG1、MSG2)之糖鏈供予體分子。這樣的糖鏈係可以市售的monosialo-Asn free(1S2G/1G2S-10NC-Asn,糖鏈工學研究所(股),以下,稱為「(MSG-)Asn」)為原料,依據實施例3中記載的方法分離(MSG-)Asn1或(MSG2-)Asn而採用,亦可不分離而以混合物來採用。
抗體-藥物結合物中之抗體每1分子的藥物結合數m1 為2之情形,於此醣基轉移反應係使用具有SG(10)之糖鏈供予體分子作為糖鏈。這樣的SG(10)糖鏈,可使用例如自SGP藉由水解等所取得者,亦可使用市售的二唾液酸八醣(東京化成工業(股))之類的SG(10)糖鏈。
供予體分子中所包含的MSG(MSG1、MSG2)或SG型糖鏈具有於其唾液酸之2位包含疊氮基的連接子(N3 -L(PEG))。
供予體分子中所包含的MSG(MSG1、MSG2)或SG型糖鏈之還原末端的GlcNAc,係較佳為使用以例如由2-氯-1,3-二甲基-1H-苯并咪唑-3-鎓-氯化物處理所得到的
Figure 109110172-A0304-12-0059-1
唑啉化之類的形式被活性化者(J.Org.Chem.,2009,74(5),2210-2212)。
就用於醣基轉移反應的酵素(醣基轉移酶)而言,若為具有會使複合型糖鏈轉移至N297糖鏈之活性者,可採用各式各樣者,但較佳者為EndoS D233Q,其係藉由將EndoS的第233位的Asp取代為Gln而抑制了水解反應之變異體。關於使用了EndoS D233Q的醣基轉移反應,係被記載於WO2013/120066等。又,亦可利用對於EndoS D233Q進一步施加了變異之EndoS D233Q/Q303L之類的變異體酵素(WO2017010559)。
抗體之糖鏈重塑(糖水解、及糖鏈轉移反應)後之抗體的純化操作係以反應中所使用的低分子化合物及酵素的分離為目的,於這樣的純化,係通常使用膠體過濾層析、離子交換層析、親和性層析等,但亦可進一步進行利用氫氧磷灰石管柱之追加純化。即,本發明係提供一種抗體-藥物結合物的製造方法,其係於從抗體之糖水解後的反應液之中間體的純化步驟中,包含進一步利用氫氧磷灰石管柱之純化步驟。若按照糖鏈重塑報告例(JACS. 2012, 134,12308-12318.;Angew. Chem. Int. Ed. 2016, 55, 2361-2367),則只是將以水解酵素處理了抗體而成之反應液以蛋白質A管柱(親和性層析管柱)進行純化,但已判明了以此純化方法並無法完全去除水解酵素(EndoS等),殘留酵素會影響而對接下來的醣基轉移反應造成影響。此處,探討了純化法之結果,藉由將以水解酵素處理了抗體而成之反應液以蛋白質A管柱、氫氧磷灰石管柱(CHT管柱,Bio-Rad Laboratories, Inc.)的順序進行純化,而無殘留酵素之影響,且接下來的糖鏈轉移反應的反應效率提升了。
本發明之抗體-藥物結合物,最佳為選自以下之群組之1的抗體-藥物結合物。
Figure 02_image079
Figure 02_image081
Figure 02_image083
Figure 02_image085
於上述所示之各自的結構式中,m1 係表示1或2的整數(較佳為m1 為1的整數),且 抗體Ab為抗CLDN6抗體、抗CLDN9抗體、抗CLDN6/CLDN9抗體、抗HER2抗體、抗HER3抗體、抗DLL3抗體、抗FAP抗體、抗CDH11抗體、抗A33抗體、抗CanAg抗體、抗CD19抗體、抗CD20抗體、抗CD22抗體、抗CD25抗體、抗CD30抗體、抗CD33抗體、抗CD37抗體、抗CD56抗體、抗CD70抗體、抗CD98抗體、抗B7-H3抗體、抗TROP2抗體、抗CEA抗體、抗Cripto抗體、抗EphA2抗體、抗FGFR2抗體、抗G250抗體、抗MUC1抗體、抗GPNMB抗體、抗整合素抗體、抗PSMA抗體、抗肌腱蛋白-C抗體、抗SLC44A4抗體、抗間皮素抗體、抗EGFR抗體、抗5T4抗體、抗LRRC15抗體、抗DR5抗體、抗CDH3抗體、抗PDPN抗體、或抗CD123抗體(較佳為前述抗CLDN6抗體或抗HER2抗體), N297糖鏈表示N297-(Fuc)MSG1、N297-(Fuc)MSG2或者彼等之混合物或N297-(Fuc)SG(較佳為N297-(Fuc)MSG1)中任一者, L(PEG)係表示*-(CH2 CH2 -O)3 -CH2 CH2 -NH-,右端的胺基與N297糖鏈的β-Man之支鏈之1-3鏈側或/及1-6鏈側(較佳為1-3鏈側)的非還原末端的唾液酸之2位的羧酸透過醯胺鍵結結合,左端的星號表示與前述結構式中之***環上之1位或3位的氮原子結合。 方便上,作為上述最佳的抗體-藥物結合物,而記載了於結合物1分子中具有2或4個(m2 =1或2)「N297糖鏈已與L中的Lb之***環上的1位之氮原子結合的『-(N297糖鏈)-L-D』(『(N297糖鏈)-(N1Lb)L-D』)」、或具有2或4個(m2=1或2)「已與3位之氮原子結合的『-(N297糖鏈)-L-D』(『(N297糖鏈)-(N3Lb)L-D』)」之結構,但亦包含於結合物1分子中具有『(N297糖鏈)-(N1Lb)L-D』(m2 =1之情形為1個,m2 =2之情形為1、2、3個)及『(N297糖鏈)-(N3Lb)L-D』(m2 =1之情形為1個,m2 =2之情形為3、2、1個)之二者的抗體-藥物結合物。即,於結合物1分子中只有『(N297糖鏈)-(N1Lb)L-D』或『(N297糖鏈)-(N3Lb)L-D』之任意一者,或該二者混在。
於本發明之抗體-藥物結合物、其游離藥物或者其製造中間體,亦有時有立體異構物或是源自不對稱碳原子的光學異構物、幾何異構物、互變異構物或d型、l型、構型異構物等之光學異構物存在,但此等之異構物、光學異構物及此等之混合物的任一者都包含在本發明中。
本發明之抗體-藥物結合物,由於顯示強的腫瘤活性(活體內抗腫瘤活性、活體外抗細胞活性)、良好的體內動態及物性,且安全性高,所以作為醫藥品而為有用的。
於本發明之抗體-藥物結合物中,對抗體1分子的藥物之結合數係會影響其有效性、安全性的重要因子。抗體-藥物結合物的製造係以藥物之結合數成為固定數目的方式,規定進行反應的原料・試藥之使用量等反應條件而實施,但與低分子化合物的化學反應並不同,通常以經不同數目的藥物結合而成之混合物獲得。對抗體1分子的藥物之結合數可特定為平均值,即平均藥物結合數(DAR:Drug to Antibody Ratio)。對抗體分子的吡咯并苯二氮呯衍生物之結合數係能夠控制,作為每1抗體的平均藥物結合數(DAR),可使1至10之範圍的吡咯并苯二氮呯衍生物結合,較佳為1至8個,更佳為1至5個。 於本發明之抗體-藥物結合物中,抗體自抗體之經重塑的糖鏈與L結合之情形,抗體藥物結合物中之抗體每1分子的藥物結合數m2 為1或2的整數。該糖鏈為N297糖鏈且糖鏈為N297-(Fuc)MSG1、N297-(Fuc)MSG2或N297-(Fuc)MSG1與N297-(Fuc)MSG2的混合物之情形,m2 為1,DAR為1~3之範圍(較佳為1.0~2.5之範圍,更佳為1.2~2.2或者1.6~2.2之範圍)。N297糖鏈為N297-(Fuc)SG之情形,m2 為2,DAR為3~5之範圍(較佳為3.2~4.8之範圍,更佳為3.5~4.2之範圍)。 再者,若為本技術領域中具有通常知識者,則可從本案之實施例之記載來設計使必要之數目的藥物與抗體結合之反應,可取得控制了吡咯并苯二氮呯衍生物之結合數的抗體。
再者,本發明之抗體-藥物結合物、游離藥物或製造中間體,會有藉由放置於大氣中、或再結晶,而吸收水分,吸附水附著或成為水合物之情形,該種包含水的化合物及鹽亦包含在本發明中。
本發明之抗體-藥物結合物、游離藥物或製造中間體具有胺基等鹼性基之情形,可根據期望而作成醫藥上可容許之鹽。就該種鹽而言,可舉出例如鹽酸鹽、氫碘酸鹽等氫鹵酸鹽;硝酸鹽、過氯酸鹽、硫酸鹽、磷酸鹽等無機酸鹽;甲烷磺酸鹽、三氟甲烷磺酸鹽、乙烷磺酸鹽等之低級烷烴磺酸鹽;苯磺酸鹽、對甲苯磺酸鹽等芳基磺酸鹽;甲酸、乙酸、蘋果酸、富馬酸鹽、琥珀酸鹽、檸檬酸鹽、酒石酸鹽、草酸鹽、馬來酸鹽等有機酸鹽;及鳥胺酸鹽、麩胺酸鹽、天冬胺酸鹽等胺基酸鹽。
本發明之抗體-藥物結合物、游離藥物或製造中間體具有羧基等酸性基之情形,一般而言能夠形成鹼加成鹽。就醫藥上可容許之鹽而言,可舉出例如,鈉鹽、鉀鹽、鋰鹽等鹼金屬鹽;鈣鹽、鎂鹽等鹼土類金屬鹽;銨鹽等無機鹽;二苄基胺鹽、
Figure 109110172-A0304-12-0020-6
啉鹽、苯基甘胺酸烷基酯鹽、乙二胺鹽、N-甲基還原葡糖胺(N-methylglucamine)鹽、二乙基胺鹽、三乙基胺鹽、環己基胺鹽、二環己基胺鹽、N,N’-二苄基乙二胺鹽、二乙醇胺鹽、N-苄基-N-(2-苯基乙氧基)胺鹽、哌
Figure 109110172-A0304-12-0000-4
鹽、四甲基銨鹽、參(羥基甲基)胺基甲烷鹽等有機胺鹽等。
本發明之抗體-藥物結合物、游離藥物或製造中間體,亦有時藉由吸收空氣中的水分等而以水合物存在。就本發明之溶劑合物而言,若為醫藥上可容許之者,則並不特別被限定,但具體而言,較佳為水合物、乙醇合物、2-丙醇合物等。又,在於本發明之抗體-藥物結合物、游離藥物或製造中間體中有氮原子存在之情形,亦可成為N-氧化物,且此等溶劑合物及N-氧化物亦包含在本發明之範圍中。
又,本發明中亦包含多種經放射性或非放射性同位素所標識的化合物。亦可於構成本發明之抗體-藥物結合物、游離藥物或製造中間體的原子之1以上含有原子同位素的非天然比例。就原子同位素而言,可舉出例如,重氫(2 H)、氚(3 H)、碘-125(125 I)或碳-14(14 C)等。又,本發明化合物可藉由例如氚(3 H)、碘-125(125 I)或碳-14(14 C)之類的放射性同位素被放射性標識。經放射性標識的化合物係作為治療或預防劑、研究試藥,例如試驗試藥、及診斷劑,例如活體內影像診斷劑而為有用的。本發明之抗體-藥物結合物之所有的同位素變異種,不論是否為放射性而包含在本發明之範圍中。 [製造方法]
R法:抗體的調製 糖鏈重塑抗體,可依據例如WO2013/120066等中記載的方法,而以如圖3所示之方法來製造。
於上述的糖鏈重塑抗體的調製中,抗體水溶液的濃縮、濃度測定、緩衝液交換可按照以下的共通操作A至C來進行。 (共通操作A:抗體水溶液的濃縮) 於Amicon Ultra(30,000至50,000 MWCO,Millipore Co.)的容器內放入抗體或抗體-藥物結合物溶液,以使用了離心機(Allegra X-15R,Beckman Coulter,Inc.)的離心操作(以2000G至4000G離心5至20分鐘),濃縮了抗體及後述的抗體-藥物結合物溶液。 (共通操作B:抗體的濃度測定) 使用UV測定器(Nanodrop 1000,Thermo Fisher Scientific Inc.),按照製造商規定的方法,進行了抗體濃度的測定。於那時,對每個抗體使用了不同的280nm吸光係數(1.3mLmg-1 cm-1 至1.8mLmg-1 cm-1 )。 (共通操作C:抗體的緩衝液交換) 抗體水溶液,係加入緩衝溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)、磷酸緩衝液(pH6.0)等),使用共通操作A進行了濃縮。進行了此操作數次之後,使用共通操作B進行抗體濃度的測定,使用緩衝溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)、磷酸緩衝液(pH6.0)等)而將抗體濃度調整為10mg/mL。
S法:結合(conjugation) 本製造法係使上述的糖鏈重塑抗體與製造中間體(2)藉由SPAAC反應(strain-promoted alkyne azide cycloaddition: JACS. 2004, 126,15046-15047)結合,製造抗體-藥物結合物的方法。
Figure 02_image087
式中Ab表示糖鏈重塑抗體, La’、Lp’、B’與La、Lp、B同義, J表示以下所示之任意的結構式, 式中,星號表示與La’結合。
Figure 02_image089
J-La’-Lp’-NH-B’-CH2 -O(C=O)-PBD可藉由實施例2-1~2-6中記載的方法等來合成。
SPAAC反應會藉由混合抗體Ab的緩衝溶液(乙酸鈉溶液、磷酸鈉、硼酸鈉溶液等或彼等之混合物)、與已使化合物(2) 溶解於適當的溶劑(二甲基亞碸(DMSO)、二甲基甲醯胺(DMF)、二甲基乙醯胺(DMA)、N-甲基-2-吡啶酮(NMP)、丙二醇(PG)等或彼等之混合物)而成之溶液而進行。 相對於抗體1莫耳,化合物(2)為2莫耳至過量莫耳,較佳為1莫耳至30莫耳,有機溶劑的比率係較佳為相對於抗體的緩衝液為1至200%v/v。反應溫度為0℃至37℃,較佳為10℃至25℃,反應時間為1至150小時,較佳為6小時至100小時。反應時的pH係較佳為5至9。
抗體-藥物結合物可藉由前述之共通操作A至C及後述之共通操作D至F,而進行緩衝液交換、純化、抗體濃度、及抗體每一分子的藥物平均結合數之測定,進行抗體-藥物結合物化合物(ADC)的鑑定。
共通操作D:抗體-藥物結合物的純化 以市售之含山梨糖醇(5%)的乙酸緩衝液(10mM,pH5.5;本說明書中稱為ABS),使NAP-25管柱平衡化。於此NAP-25管柱裝入抗體-藥物結合物反應水溶液(約1.5~2.5mL),以製造商規定之量的緩衝液使其溶出,以分取了抗體劃分。藉由合計2至3次反覆進行將此分取劃分再次裝入NAP-25管柱並以緩衝液使其溶出的膠體過濾純化操作,而獲得了經除去未結合之藥物連接子或二甲基亞碸、丙二醇的抗體-藥物結合物。因應需要而藉由共通操作A及C來調製了抗體-藥物結合物溶液的濃度。 共通操作E:抗體-藥物結合物中之抗體濃度的測定 抗體-藥物結合物中之結合藥物濃度可使用下述所示之朗伯-比爾定律(Lambert-Beer law)來算出。 於以下呈示使用了朗伯-比爾定律的式(I)。
Figure 02_image091
此處,A280表示抗體-藥物結合物水溶液之280nm中的吸光度,ε280表示抗體-藥物結合物之280nm中的莫耳吸光係數,C(mol・L-1 )表示抗體-藥物結合物的莫耳濃度。 從上述式(I),抗體-藥物結合物的莫耳濃度C(mol・L-1 )可由以下的式(II)求得。
Figure 02_image093
可進一步於兩邊乘上抗體-藥物結合物的莫耳質量MW(g・mol-1 ),以求出抗體-藥物結合物的重量濃度C’(mg・mL-1 )的(式(III))。
Figure 02_image095
於以下,記載有關用於上述式而應用於本實施例之各值。 吸光度A280使用了抗體-藥物結合物水溶液之280nm中的UV吸光度的實測值。莫耳質量MW(g・mol-1 ),係使用由抗體的胺基酸序列所求得之抗體分子量的計算推定值作為抗體-藥物結合物的莫耳質量之近似值。光徑長度l(cm)係以1cm進行了測定。 抗體藥物結合物的莫耳吸光係數ε280可藉由以下的式(IV)求得。
Figure 02_image097
此處,εAb,280 表示280nm中的抗體的莫耳吸光係數,εDL,280 表示280nm中的藥物的莫耳吸光係數。 εAb,280 可藉由已知的計算方法(Protein Science, 1995, vol.4, 2411-2423)從抗體的胺基酸序列推定。於實施例中,曲妥珠單抗的莫耳吸光係數係使用了εAb,280 =215400(計算推定值)。CLDN6抗體的莫耳吸光係數係使用了εAb,280 =221340(計算推定值),TROP2抗體的莫耳吸光係數係使用了εAb,280 =226400(計算推定值),CD98抗體的莫耳吸光係數係使用了εAb,280 =240400(計算推定值),LPS抗體的莫耳吸光係數係使用了εAb,280 =230300(計算推定值),曲妥珠單抗變異體的莫耳吸光係數係使用了εAb,280 =215057(計算推定值)。 εDL,280 係使用了從每次以UV測定得到的實測值所算出者。即使用了:藉由測定使結合物前驅物(藥物)經溶解為某莫耳濃度而成之溶液的吸光度,且應用朗伯-比爾定律、式(I)所得之值。
(共通操作F:抗體-藥物結合物中之抗體每一分子的藥物平均結合數之測定) 抗體-藥物結合物中之抗體每一分子的藥物平均結合數,可藉由使用以下方法的高效液相層析(HPLC)分析求得。 [F-1.HPLC分析用樣品的調製(抗體-藥物結合物的還原)] 將抗體-藥物結合物溶液(約1mg/mL,60μL)與二硫蘇糖醇(DTT)水溶液(100mM,15μL)混合。藉由將混合物在37℃保溫30分鐘,將切斷了抗體-藥物結合物之L鏈及H鏈間的雙硫鍵結的樣品用於HPLC分析。
[F-2.HPLC分析] 以下述之測定條件進行HPLC分析。 HPLC系統:Agilent 1290 HPLC系統(Agilent Technologies) 檢測器:紫外吸收光度計(測定波長:280nm、329nm) 管柱:BEH Phenyl(2.1×50mm,1.7μm,Waters Acquity) 管柱溫度:75℃ 移動相A:0.1%三氟乙酸(TFA)、15%異丙醇水溶液 移動相B:0.075%TFA、15%異丙醇乙腈溶液 梯度程式:14%-36%(0分-15分)、36%-80%(15-17分)、80%-14%(17分-17.1分)、14%-14%(17.1分-23分) 樣品注入量:5Μl
[F-3.資料解析] 〔F-3-1〕相對於未結合藥物的抗體之H鏈(H0 ),有藥物結合的H鏈(有1個藥物結合的H鏈:H1 、有2個藥物結合的H鏈:H2 ),係疏水性會與所結合之藥物的數目成比例地增加,而滯留時間變大,因此會以L0 、H0 、H1 、H2 、的順序被溶出。可藉由L0 及H0 之滯留時間比較而將檢出波峰分配為L0 、H0 、H1 、H2 之任一者。又,藥物的結合以藥物之特徴性的329nm的波長吸收亦可確認。 〔F-3-2〕因於藥物連接子有UV吸收,故因應藥物連接子之結合數,而使用L鏈、H鏈及藥物連接子的莫耳吸光係數,按照下式來進行波峰面積值的校正。
Figure 02_image099
此處,各抗體中之L鏈及H鏈的莫耳吸光係數(280nm)可使用:藉由已知的計算方法(Protein Science, 1995, vol.4, 2411-2423),而從各抗體之L鏈及H鏈的胺基酸序列所推定之值。曲妥珠單抗之情形,按照其胺基酸序列,而以推定值使用了81290作為H鏈的莫耳吸光係數。同樣地,CLDN6抗體之情形,使用了77280作為H鏈的莫耳吸光係數,TROP2抗體之情形,使用了68990作為H鏈的莫耳吸光係數,CD98抗體之情形,使用了78500作為H鏈的莫耳吸光係數,LPS抗體之情形,使用了77470作為H鏈的莫耳吸光係數,曲妥珠單抗變異體之情形,使用了81488作為H鏈的莫耳吸光係數,藥物連接子的莫耳吸光係數(280nm)係使用了為結合物前驅物之化合物(1)之實測的莫耳吸光係數(280nm)。
〔F-3-3〕按照下式來計算相對於波峰面積校正值合計之各鏈波峰面積比(%)。
Figure 02_image101
〔F-3-4〕按照下式來計算抗體-藥物結合物中之抗體每一分子的藥物平均結合數。
平均藥物結合數=(H0 波峰面積比×0+H1 波峰面積比×1+H2 波峰面積比×2)/100×2
2.PARP抑制劑 於本發明中「PARP抑制劑」係指藉由抑制PARP(聚腺苷5’二磷酸(ADP)核醣聚合酶)而具有妨礙單股剪切的修復之機能的藥劑(Benafif S, et al., Onco. Targets Ther. (2015) 8, 519-528.)(Fong PC, et al., N. Engl. J. Med. (2009) 361, 123-134.)(Gelmon KA, et al., Lancet Oncol. (2011) 12, 852-861.)。於PARP有複數之亞型存在,但本發明中之PARP抑制劑較佳為會抑制PARP-1及PARP-2。本發明中之PARP抑制劑若為藉由抑制PARP而具有妨礙單股剪切的修復之機能的藥劑,則未被限定,但可舉出較佳為奧拉帕尼(Olaparib)(Menear KA, et al., J. Med. Chem. (2008) 51, 6581-6591.)、盧卡帕尼(Rucaparib)(Gillmore AT, et al., Org. Process Res. Dev. (2012) 16, 1897-1904.)、尼拉帕尼(Niraparib)(Jones P, et al., J. Med. Chem. (2009) 52, 7170-7185.)、他拉唑帕尼(Talazoparib)(Shen Y, et al., Clin. Cancer Res. (2013) 19(18), 5003-15.)、維利帕尼(Veliparib)、帕米帕利(Pamiparib)、及氟唑帕利(Fluzoparib)、以及彼等之藥理上可容許的鹽,可舉出更佳為奧拉帕尼、盧卡帕尼、尼拉帕尼、及他拉唑帕尼、以及彼等之藥理上可容許的鹽。
本發明中之PARP抑制劑的「藥理上可容許的鹽」可為酸加成鹽與鹼加成鹽之任一者,但較佳為酸加成鹽,可舉出例如樟腦磺酸鹽(camsylate)(樟腦磺酸鹽(camphor sulfonate))、甲烷磺酸鹽、三氟甲烷磺酸鹽、及乙烷磺酸鹽等之低級烷烴磺酸鹽;甲苯磺酸鹽(對甲苯磺酸鹽)、及苯磺酸鹽等芳基磺酸鹽;磷酸鹽、硝酸鹽、過氯酸鹽、及硫酸鹽等之無機酸鹽;鹽酸鹽、氫溴酸鹽、氫碘酸鹽、及氫氟酸鹽等之氫鹵酸鹽;乙酸鹽、蘋果酸鹽、富馬酸鹽、琥珀酸鹽、檸檬酸鹽、酒石酸鹽、草酸鹽、及馬來酸鹽等之有機酸鹽;以及鳥胺酸鹽、麩胺酸鹽、及天冬胺酸鹽等之胺基酸鹽。
又,PARP抑制劑及其藥理上可容許的鹽亦有時作為溶劑合物存在,此等之溶劑合物亦包含在本發明中之PARP抑制劑及其藥理上可容許的鹽中。
3.醫藥 以下,針對本發明之特徵為將抗體-藥物結合物與PARP抑制劑進行組合而投予之醫藥組成物及治療方法(亦包含預防)進行說明。
本發明之醫藥組成物及治療方法,可為特徵為於各自不同的製劑作為有效成分而含有抗體-藥物結合物與PARP抑制劑,且同時或於不同時間進行投予者;亦可為特徵為於單一之製劑作為有效成分而含有抗體-藥物結合物與PARP抑制劑,且進行投予者。
本發明之醫藥組成物及治療方法可使用於癌症的治療用,較佳為使用於為了選自包含乳癌、胃癌(有時亦稱為胃腺癌)、大腸癌(有時亦稱為結腸直腸癌,包含結腸癌及直腸癌)、肺癌(包含小細胞肺癌及非小細胞肺癌)、食道癌、頭頸部癌(包含唾液腺癌及咽頭癌)、胃食道接合部腺癌、膽道癌(包含膽管癌)、佩吉特氏病、胰臟癌、卵巢癌、子宮癌肉瘤、尿道上皮癌、***癌、膀胱癌、胃腸間質腫瘤、消化道間質腫瘤、子宮頸癌、扁平上皮癌、腹膜癌、肝臟癌、肝細胞癌、子宮體癌、腎臟癌、外陰部癌、甲狀腺癌、陰莖癌、白血病、惡性淋巴瘤、漿細胞瘤、骨髓瘤、多形性膠質母細胞瘤、骨肉瘤、及黑色素瘤之群組的至少一個之治療,更佳為使用於為了選自包含乳癌、胃癌、大腸癌、肺癌、食道癌、唾液腺癌、胃食道接合部腺癌、膽道癌、佩吉特氏病、胰臟癌、卵巢癌、膀胱癌、***癌、及子宮癌肉瘤之群組的至少一個癌症的治療。
本發明中所使用之抗體-藥物結合物之中,尤其以具有何種抗體之抗體-藥物結合物為適合者,係可藉由檢查癌症的種類、或腫瘤標記來決定。例如,就本發明之抗CLDN6抗體-藥物結合物所適用之癌症的種類而言,可舉出肺癌(非小細胞肺癌、小細胞肺癌等)、腎癌、尿道上皮癌、大腸癌、***癌、多型神經膠質母細胞瘤、卵巢癌(表層上皮性腫瘤、間質性腫瘤、生殖細胞腫瘤等)、胰臟癌、乳癌、黑色素瘤、肝癌、膀胱癌、胃癌、食道癌等、子宮體癌、睾丸癌(精細胞瘤、非精細胞瘤)、子宮頸癌、胎盤絨毛癌、腦腫瘤、頭頸部癌以及彼等之轉移性形態等,就抗HER2抗體-藥物結合物所適用之癌症的種類而言,可舉出肺癌、尿道上皮癌、大腸癌、***癌、卵巢癌、胰臟癌、乳癌、膀胱癌、胃癌、胃腸間質腫瘤、子宮頸癌、食道癌、扁平上皮癌、腹膜癌、肝臟癌、肝細胞癌、結腸癌、直腸癌、結腸直腸癌、子宮內膜癌、子宮癌、唾液腺癌、腎臟癌、外陰部癌、甲狀腺癌、或陰莖癌以及彼等之轉移性形態等,但若為在成為治療對象的癌細胞中表現抗體-藥物結合物中之抗體可辨識之蛋白質的癌細胞,則不受限於此等。
在幾個實施形態中,癌症係對同源重組(HR)依賴的DNA雙股斷裂(DSB)修復途徑為非依賴的。對DSB修復途徑為非依賴的,係意指DSB修復途徑可為野生型或變異型(HR之機能缺失或降低)之任一者。就可於HR中作用之基因而言,可舉出BRCA1、BRCA2、BLM、RBBP8、DNA聚合酶δ(POLD1~4)、POLH、DNA2、EME1、ERCC1、EXO1、FANCM、GEN1、MRE11、MUS81、NBS1、PALB2、PCNA、RAD50、RAD51、RAD51AP1、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD54、RAD54B、RM11、RM12、RPA、RTEL1、SLX1、SLX2、SLX4、TOP2A、XPF、XRCC2、XRCC3等。較佳為癌症對BRCA1或BRCA2為非依賴的。
本發明之抗體-藥物結合物與PARP抑制劑係藉由進行組合而投予,而無論DSB修復途徑的變異之有無,會顯示細胞增殖抑制效果。
於某種實施形態中,癌症係對PARP抑制劑為非敏感性,或癌症係對PARP抑制劑為非敏感性且對同源重組(HR)依賴的DNA雙股斷裂(DSB)修復途徑為非依賴的。
於其他實施形態中,係一種用於癌症治療的醫藥組成物或癌症的治療方法,其特徵為將包含於DNA小凹槽中不形成交聯的PBD衍生物之抗體-藥物結合物、與PARP抑制劑進行組合而投予; 而癌症對PARP抑制劑為非敏感性,或對同源重組(HR)依賴的DNA雙股斷裂(DSB)修復途徑為非依賴的,或對PARP抑制劑為非敏感性且對同源重組(HR)依賴的DNA雙股斷裂(DSB)修復途徑為非依賴的。
本發明之醫藥組成物及治療方法可較佳對哺乳動物使用,可更佳對人類使用。
本發明之醫藥組成物及治療方法的抗腫瘤效果,係例如可藉由以下來確認:作成對受檢動物移植了癌細胞的模型,且測定藉由施予本發明之醫藥組成物及治療方法所得之腫瘤體積的減少或續命效果。而且,可藉由與以本發明中所使用之抗體-藥物結合物及PARP抑制劑各自的單獨投予之抗腫瘤效果進行比較,而確認本發明中所使用之抗體-藥物結合物及PARP抑制劑的併用效果。
又,本發明之醫藥組成物及治療方法的抗腫瘤效果,可於臨床試驗中藉由固體腫瘤的療效評價標準(Response Evaluation Criteria in Solid Tumors(RECIST))評價法、WHO評價法、Macdonald評價法、體重量測、及其他的手法來確認,且可藉由 完全緩解(Complete response;CR)、部分緩解(Partial response;PR)、惡化(Progressive disease;PD)、客觀緩解率(Objective Response Rate;ORR)、緩解持續時間(Duration of response;DoR)、無進展生存期(Progression-Free Survival;PFS)、總生存期(Overall Survival;OS)等之指標來判定。 可藉由上述的方法,而針對本發明之醫藥組成物及治療方法的抗腫瘤效果,確認相對於既存之癌症治療用醫藥組成物及治療方法的優勢。
本發明之醫藥組成物及治療方法可延遲癌細胞的成長,抑制增殖,進而破壞癌細胞。可藉由此等之作用,而於癌症患者中達成自癌症所致症狀的解放、或QOL的改善,且保持癌症患者的生命而達成治療效果。即使於未達到癌細胞的破壞之情形,亦可藉由癌細胞之增殖的抑制或控制,而於癌症患者中達成更高的QOL並且達成更長期的生存。
本發明之醫藥組成物,對於患者除了可作為全身療法應用之外,可局部性地應用於癌症組織而期待治療效果。
本發明之醫藥組成物可含有1種以上之藥學上適合性的成分且進行投予。藥學上適合性的成分,可因應本發明中所使用之抗體-藥物結合物及PARP抑制劑的投予量或投予濃度等,而從此領域中所通常使用的製劑添加物等適宜選擇來應用。例如,本發明中所使用之抗體-藥物結合物,可作為包含組胺酸緩衝劑等緩衝劑、蔗糖或海藻糖等賦形劑、以及聚山梨醇酯80或20等之界面活性劑的醫藥組成物而進行投予。本發明中所使用之包含抗體-藥物結合物的醫藥組成物,較佳可作為注射劑來使用,更佳可作為水性注射劑或冷凍乾燥注射劑來使用,進一步更佳可作為冷凍乾燥注射劑來使用。
本發明中所使用之包含抗體-藥物結合物的醫藥組成物為水性注射劑之情形,較佳可以適當的稀釋液來稀釋了之後,點滴投予至靜脈內。就稀釋液而言,可舉出葡萄糖溶液、或生理食鹽液等,可舉出較佳為葡萄糖溶液,可舉出更佳為5%葡萄糖溶液。
本發明中所使用之包含抗體-藥物結合物的醫藥組成物為冷凍乾燥注射劑之情形,較佳可藉由注射用水來溶解了之後,將必要量以適當的稀釋液稀釋了之後,點滴投予至靜脈內。就稀釋液而言,可舉出葡萄糖溶液、或生理食鹽液等,可舉出較佳為葡萄糖溶液,可舉出更佳為5%葡萄糖溶液。
就為了投予本發明之醫藥組成物而可使用的導入途徑而言,可舉出例如,靜脈內、皮內、皮下、肌肉內、及腹腔內之途徑,可舉出較佳為靜脈內之途徑。
醫藥組成物的組成及濃度亦因投予方法而變化,但本發明之醫藥組成物中所包含的抗體-藥物結合物,係抗體-藥物結合物對抗原之親和性,亦即,於對抗原之解離常數(Kd值)之觀點,親和性越高(Kd值低),就越可以少量的投予量亦可使藥效發揮。所以,於決定抗體-藥物結合物的投予量之時,亦可根據抗體-藥物結合物與抗原的親和性之狀況來設定投予量。於對人類投予本發明之抗體-藥物結合物之際,係例如,若1次或是以1~180天1次的間隔複數次投予約0.001~100mg/kg即可。
本發明之PARP抑制劑可對人類以1~7日1~2次的間隔來投予,較佳為以1日1次、或1日2次的間隔來投予。又,本發明中所使用之PARP抑制劑可以每1次0.1mg~3000mg的投予量來投予,較佳為以每1次0.25mg~600mg的投予量來投予。
本發明中所使用之PARP抑制劑為奧拉帕尼或其藥理上可容許的鹽之情形,較佳可每1次將100mg、150mg、200mg、或300mg的投予量以1日2次的間隔來經口投予。
本發明中所使用之PARP抑制劑為盧卡帕尼或其藥理上可容許的鹽之情形,較佳可每1次將200mg、250mg、300mg、400mg、500mg或600mg的投予量以1日2次的間隔來經口投予。
本發明中所使用之PARP抑制劑為尼拉帕尼或其藥理上可容許的鹽之情形,較佳可每1次將100mg、200mg、或300mg的投予量以1日1次的間隔來經口投予。
本發明中所使用之PARP抑制劑為他拉唑帕尼或其藥理上可容許的鹽之情形,較佳可每1次將0.25mg、0.5mg、或1mg的投予量以1日1次的間隔來經口投予。
本發明之醫藥組成物及治療方法,可進一步含有本發明之抗體-藥物結合物及PARP抑制劑以外的癌症治療劑。本發明之醫藥組成物及治療方法,亦可與其他癌症治療劑併用而投予,可藉此而使抗腫瘤效果増強。以這種目的而被使用的其他癌症治療劑,可與本發明之醫藥組成物同時地、分別地、或連續地來投予至個體,亦可變更各自的投予間隔來投予。就這種癌症治療劑而言,若具有抗腫瘤活性之藥劑,則並不被限定,但可舉出例如,選自包含愛萊諾迪肯(Irinotecan,CPT-11)、順鉑(Cisplatin)、卡鉑(Carboplatin)、奧沙利鉑(Oxaliplatin)、氟尿嘧啶(Fluorouracil,5-FU)、吉西他濱(Gemcitabine)、卡培他濱(Capecitabine)、阿黴素(Doxorubicin)、泛艾黴素(Epirubicin)、環磷醯胺(Cyclophosphamide)、絲裂黴素 C (Mitomycin C)、替加氟(Tegafur)-吉美拉西(Gimeracil)-奧替拉西(Oteracil)複合劑、西妥昔單抗(Cetuximab)、帕尼單抗(Panitumumab)、貝伐單抗(Bevacizumab)、雷莫蘆單抗(Ramucirumab)、瑞格非尼(Regorafenib)、三氟胸苷(Trifluridine)-胸苷磷酸化酶抑制劑(Tipiracil)複合劑、吉非替尼(Gefitinib)、厄洛替尼(Erlotinib)、阿法替尼(Afatinib)、氨甲蝶呤(Methotrexate)、培美曲塞(Pemetrexed)、曲妥珠單抗、帕妥珠單抗(Pertuzumab)、及拉帕替尼(Lapatinib)之群組的至少一個。
本發明之醫藥組成物及治療方法亦可與放射線療法組合而使用。例如,癌症患者於接受利用本發明之醫藥組成物的治療之前及/或後、或是同時,接受放射線療法。 本發明之醫藥組成物及治療方法亦可作為與外科手術組合而成之輔助化學療法來使用。本發明之醫藥組成物,可於外科手術之前以使腫瘤的大小減小之目的被投予(稱為術前輔助化學療法、或新輔助療法),亦可於外科手術後,以防止腫瘤的復發之目的被投予(稱為術後輔助化學療法、或輔助療法)。 [實施例]
藉由以下所示之例來具體地說明本發明,但本發明並非受限於此等者。又,此等於任何意義中都不被限定地解釋。
參考例1:抗HER2抗體曲妥珠單抗 抗HER2抗體係參照US5821337製作。於序列識別號64及序列識別號65呈示了曲妥珠單抗的輕鏈及重鏈之胺基酸序列。
參考例2:抗TROP2抗體hRS7 抗TROP2抗體係參照WO2003/074566、WO2015/098099(參考例1)而製作。於序列識別號68及序列識別號69呈示了hRS7的輕鏈及重鏈之胺基酸序列。
〔製造中間體(藥物連接子)之合成〕 實施例1 [實施例1-1:中間體1]
Figure 02_image103
步驟1:(6S)-6-(羥甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚烷-5-甲酸苄酯(1-2) 對5-苄基 6-甲基(6S)-5-氮雜螺[2.4]庚烷-5,6-二甲酸酯(1-1)(104mmol,WO2012087596)的四氫呋喃(500mL)溶液,於0℃少量少量地加入了硼氫化鋰(4.30g,178mmol)。於0℃攪拌了30分鐘之後,於室溫攪拌了2小時。於0℃加入水(180mL)、2當量鹽酸(186mL),進行了減壓蒸餾。以乙酸乙酯4次萃取所得到的殘渣,以飽和食鹽水清洗了有機層之後,以無水硫酸鈉進行了乾燥。進行減壓蒸餾,將所得到的殘渣(1-2)(27.9g,90%)直接用於接下來的反應。
步驟2:(6S)-6-({[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚烷-5-甲酸苄酯(1-3) 對上述步驟1中所得到的化合物(1-2)(27.9g,107mmol)與咪唑(14.5g,214mmol)的二氯甲烷(300mL)溶液,於室溫加入三級丁基二甲基氯矽烷(24.2g,160mmol),於室溫攪拌了18小時。以飽和檸檬酸水溶液、飽和碳酸氫鈉水溶液、飽和食鹽水清洗反應溶液,以無水硫酸鈉進行了乾燥之後,進行了減壓蒸餾。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0(v/v)~50:50(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(1-3)(32.5g,81%)。 1H-NMR(CDCl3)δ:7.39-7.34(5H,m),5.23-5.11(2H,m),4.10-3.48(4H,m),3.16-3.14(1H,m),2.15-2.04(1H,m),1.81-1.77(1H,m),0.91-0.88(9H,m),0.65-0.55(4H,m),0.08-0.01(6H,m). MS (APCI)m/z:376(M+H)+
步驟3:(6S)-6-({[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚烷(1-4) 對上述步驟2中所得到的化合物(1-3)(32.5g,86.5mmol)的乙醇(400mL)溶液,於室溫加入7.5%鈀碳觸媒(54%水分,5.00g),於室溫,於氫氣體環境下攪拌了6小時。將反應溶液進行矽藻土過濾,將濾液進行減壓蒸餾,獲得了目的物(1-4)(21.3g,定量的)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:3.79-3.77(1H,m),3.71-3.69(1H,m),3.65-3.60(1H,m),3.01-2.98(2H,m),1.81-1.71(2H,m),0.90(9H,s),0.65-0.57(4H,m),0.08(3H,s),0.07(3H,s). MS(APCI、ESI)m/z:242(M+H)+
步驟4:[(6S)-6-({[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基](5-甲氧基-2-硝基-4-{[三(丙烷-2-基)矽基]氧基}苯基)甲酮(1-5) 對5-甲氧基-2-硝基-4-{三(丙烷-2-基)矽基]氧基}苯甲酸(52.2g,141mmol,US20150283262)與1-羥基苯并***一水合物(23.8g,155mmol)的二氯甲烷(500mL)溶液,於冰冷卻下加入了N,N’-二環己碳二亞胺(35.0g,170mmol)。於室溫攪拌了反應混合物。羧酸消失後,於-60℃徐緩地滴入了上述步驟3中所得到的化合物(1-4)(34.1g,141mmol)與三乙胺(29.4mL,212mmol)的二氯甲烷(100mL)溶液。於室溫攪拌了反應溶液一晩之後,對反應混合物加入飽和碳酸氫鈉水溶液,以氯仿萃取了反應混合物。以水及飽和食鹽水清洗有機層,以無水硫酸鎂進行了乾燥。對進行減壓蒸餾而得到的殘渣加入乙酸乙酯與二***,藉由過濾而除去固體成分,將濾液進行減壓蒸餾,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0(v/v)~25:75(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(1-5)(55.0g,66%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.72-7.66(1H,m),6.80-6.73(1H,m), 4.53-4.49(1H,m),4.04-3.95(1H,m),3.91-3.88(3H,m),3.59-3.54(1H,m),3.36-3.25(0.5H,m),3.01-2.96(1.5H,m),2.24-2.20(0.3H,m),2.09-2.05(0.7H,m),2.00-1.97(0.7H,m), 1.69-1.67(0.3H,m),1.32-1.24(3H,m),1.12-1.05(18H,m), 0.93-0.91(6H,m),0.79-0.77(3H,m),0.71-0.62(2H,m),0.57-0.40(2H,m),0.12-0.10(4H,m),0.11-0.15(2H,m). MS(APCI、ESI)m/z:593(M+H)+
步驟5:(2-胺基-5-甲氧基-4-{[三(丙烷-2-基)矽基]氧基}苯基)[(6S)-6-({[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基]甲酮(1-6) 對上述步驟4中所得到的化合物(1-5)(55.0g,92.8mmol)的乙醇(300mL)溶液,於氮氣體環境下加入了7.5%鈀碳(10.0g)。立即將氮氣球更換為氫氣球,於氫氣體環境下,在室溫激烈地攪拌了反應混合物。原料消失後,過濾反應混合物,將濾液進行減壓蒸餾,將所得到的目的物(1-6)(52.2g,100%)直接用於接下來的反應。 1H-NMR(CDCl3 )δ:6.71(1H,s),6.25(1H,s),4.55-4.28(2H,m),3.97(1H,m),3.75-3.62(3H,m),3.70(3H,s), 3.09-3.07(1H,m),2.24-2.19(1H,m),1.81-1.68(1H,m),1.27-1.22(3H,m),1.09-1.05(18H,m),0.90(9H,s),0.65-0.46 (4H,m),0.07-0.03(6H,m). MS(APCI、ESI)m/z:563(M+H)+
步驟6:N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-[4-({[(2-{[(6S)-6-({[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基]羰基}-4-甲氧基-5-{[三(丙烷-2-基)矽基]氧基}苯基)胺甲醯基]氧基}甲基)苯基]-L-丙胺醯胺(1-7) 對上述步驟5中所得到的化合物(1-6)(18.6g,33.0mmol)及三乙胺(6.26mL,45.2mmol)的THF(300mL)溶液,於乙醇-冰浴,徐緩地添加了三光氣(4.22g,14.2mmol)。添加後,對經冰冷卻的反應混合物,徐緩地滴入了N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-[4-(羥甲基)苯基]-L-丙胺醯胺(11.4g,30.2mmol,WO2011130598)與三乙胺(6.26mL,45.2mmol)的四氫呋喃(100mL)、N,N-二甲基甲醯胺(30mL)混合溶液。滴入後,移開冰浴,於氮氣體環境下,於40℃攪拌了反應混合物。原料消失後,對反應混合物加入水 ,以乙酸乙酯萃取了反應混合物。以飽和食鹽水清洗有機層,以無水硫酸鈉進行了乾燥。過濾後、以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0(v/v)~40:60(v/v)]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(1-7)(23.5g,74%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:8.99(1H,m),8.58(1H,s),7.80 (1H,s),7.55-7.53(2H,m),7.34-7.32(2H,m),6.77-6.75 (2H,m),5.94-5.87(1H,m),5.40-5.38(1H,m),5.33-5.29(1H,m),5.23-5.21(1H,m),5.13(1H,m),5.10 (2H,m),4.69-4.64(1H,m),4.62-4.52(2H,m),4.06-4.03(1H,m),3.98(1H,m),3.76-3.65(6H,m), 3.04(1H,m), 2.28-2.26(1H,m),2.18-2.13(1H,m), 1.46(3H,m),1.32-1.25(3H,m),1.11-1.09(18H,m),0.99-0.84(15H,m),0.65-0.40(4H,m),0.08-0.00(6H,m). MS(APCI、ESI)m/z:966(M+H)+
步驟7:N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-[4-({[(2-{[(6S)-6-(羥甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基]羰基}-4-甲氧基-5-{[三(丙烷-2-基)矽基]氧基}苯基)胺甲醯基]氧基}甲基)苯基]-L-丙胺醯胺(1-8) 上述步驟6中所得到的化合物(1-7)(23.5g,24.3mmol)的四氫呋喃(50mL)、甲醇(50mL)、水(44mL)溶液,於室溫下加入了乙酸(200mL)。於室溫攪拌了反應混合物。原料消失後,以乙酸乙酯萃取了反應混合物。以水及飽和食鹽水清洗有機層,以無水硫酸鈉進行了乾燥。過濾後,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0(v/v)~0:100(v/v)]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(1-8)(18.0g,87%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:8.64-8.62(1H,m),8.50(1H,m), 7.69(1H,m),7.55-7.53(2H,m),7.34-7.32(2H,m),6.79-6.75(3H,m),5.91-5.89(1H,m),5.39(1H,m),5.32-5.29 (1H,m),5.23-5.21(1H,m),4.68-4.54(4H,m),4.31(1H,m), 4.06-4.04(1H,m),3.81-3.79(3H,m),3.76(3H,s),3.63-3.61(1H,m),3.13-3.11(1H,m),2.16-2.13(1H,m),1.87-1.81(2H,m),1.46-1.43(3H,m),1.30-1.24(3H,m),1.12-1.08(18H,m),0.98-0.91(6H,m),0.63-0.45(4H,m). MS(APCI、ESI)m/z:852(M+H)+
步驟8:N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-5’-側氧-8’-{[三(丙烷-2-基)矽基]氧基}-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(1-9) 對二甲基亞碸(3.75mL,52.8mmol)的二氯甲烷(300mL)溶液,於氮氣體環境下,於-78℃徐緩地滴入了草醯氯(2.17mL,25.3mmol)。滴入後,於-78℃攪拌了反應混合物。對反應混合物徐緩地滴入了上述步驟7中所得到的化合物(1-8)(18.0g,21.1mmol)的二氯甲烷(50.0mL)溶液。對反應溶液於-78℃加入了三乙胺(14.6mL,105mmol)。添加後,移開冷媒浴,徐緩地升溫至室溫為止。原料消失後,對反應混合物加入水,以氯仿(200mL)萃取了反應混合物。以水及飽和食鹽水清洗有機層,以無水硫酸鎂進行了乾燥。過濾後,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0(v/v)~0:60(v/v)]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(1-9)(16.5g,92%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:8.51-8.36(1H,m),7.54-7.38(2H,m), 7.22-7.07(3H,m),6.73-6.64(1H,m),5.94-5.87(2H,m),5.33-5.22(3H,m),5.09(1H,m),4.97(1H,m),4.64-4.58(4H,m), 4.02-4.00(1H,m),3.86-3.83(3H,m),3.75-3.70(1H,m),3.61-3.54(2H,m),3.38-3.29(1H,m),2.40(1H,m),2.16-2.14 (1H,m),1.74-1.71(1H,m),1.44(3H,m),1.18-1.16(3H,m), 1.05-1.00(18H,m),0.97-0.92(6H,m),0.72-0.60(4H,m). MS(APCI、ESI)m/z:850(M+H)+
步驟9:N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-{[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}-7’-甲氧基-5’-側氧-8’-{[三(丙烷-2-基)矽基]氧基}-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(1-10) 對上述步驟8中所得到的化合物(1-9)(12.0g,14.1mmol)及2,6-二甲吡啶(6.58mL,56.5mmol)的二氯甲烷(200mL)溶液,於氮氣體環境下,於0℃徐緩地滴入了三氟甲磺酸三級丁基二甲基矽烷(9.73mL,42.3mmol)。冰冷卻下,於攪拌了10分鐘之後,移開冰浴,於室溫進行了攪拌。原料消失後,對反應混合物加入水,以氯仿萃取了反應混合物。以水及飽和食鹽水進行清洗,以無水硫酸鈉進行了乾燥。過濾後,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0(v/v)~25:75(v/v)]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(1-10)(8.12g,60%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:8.67-8.45(1H,m),7.50-7.44(2H,m), 7.19(1H,s),7.13(2H,m),6.95(2H,m),6.62-6.57(2H,m), 6.01(1H,m),5.95-5.86(1H,m),5.33-5.13(3H,m), 4.82(1H,m),4.65-4.54(3H,m),4.03-4.01(1H,m),3.84-3.82(3H,m),3.73-3.66(1H,m),3.50-3.48(1H,m), 3.27(1H,m),2.37-2.33(1H,m),2.19-2.13(1H,m),1.54-1.43(3H,m),1.22-1.13(3H,m),1.10-1.00(18H,m),0.97-0.91(6H,m),0.81(9H,s),0.76-0.59(4H,m),0.19-0.09(6H,m). MS(APCI、ESI)m/z:964(M+H)+
步驟10:N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-{[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}-8’-羥基-7’-甲氧基-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(1-11) 對上述步驟9中所得到的化合物(1-10)(8.12g,8.42mmol)的N,N-二甲基甲醯胺(90mL)、水(2mL)溶液,加入乙酸鋰(0.611g,9.26mmol),在室溫下進行了攪拌。原料消失後,對反應混合物加入水,以乙酸乙酯萃取了反應混合物。以水及飽和食鹽水清洗有機層,以無水硫酸鈉進行了乾燥。過濾後,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0(v/v)~0:100(v/v)]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(1-11)(5.48g,81%)。1 H-NMR(400MHz,CDCl3, 20.9℃)δ:8.76-8.60(1H,m), 7.45-7.44(2H,m),7.21(1H,s),7.10-7.09(2H,m),6.81-6.74(1H,m),6.65(1H,s),6.23(1H,s),6.01-5.99(1H,m),5.95-5.84(1H,m),5.41-5.20(2H,m),5.16(1H,m), 4.84(1H,m), 4.67-4.54(4H,m),4.05-4.03(1H,m), 3.87(3H,s),3.71 (1H,m),3.55-3.51(1H,m), 3.26(1H,m),2.35(1H,m),2.18-2.12(1H,m),1.55-1.42(4H,m),0.97-0.92(6H,m),0.81 (9H,s),0.76-0.61(4H,m),0.20-0.06(6H,m) MS(APCI、ESI)m/z:808(M+H)+
1 H-NMR(500MHz,CDCl3, 27℃)δ:8.76(1H,s), 7.43(2H,brd),7.20(1H,s),7.08(2H,d,J=8.3Hz),7.00(1H,br),6.66(1H,s),6.44(1H,s),6.00(1H,H-11’,d,J11’,11’a= 9.2Hz),5.89(1H,m),5.53(1H,brd),5.30(1H,d,J=17.2Hz),5.20(1H,d,J=10.3Hz),5.15(1H,d,JABq=12.5Hz),4.85(1H,d,JABq=12.5Hz),4.66(1H,m),4.60-4.52(2H,m),4.07 (1H,m),3.84(3H,s),3.71(1H,H-3’β,d,Jgem=11.7Hz),3.53 (1H,H-11’a,m),3.26(1H,H-3’α,d,Jgem=11.7Hz),2.35 (1H,H-1’β,dd,J1’ β,11’a=8.30Hz,Jgem=13.1Hz),2.14 (1H,m),1.54(1H,H-1’ α,d,Jgem=13.1Hz),1.41(3H,d,J= 6.90Hz),0.95(3H,d,J=6.80Hz),0.92(3H,d,J=6.80Hz),0.81(9H,s),0.80-0.70(1H,m),0.70-0.59(3H,m),0.2-0.06(6H,m)
針對化合物(1-11)而由以selective 1D ROESY光譜所得到的關連(下圖),進行了11’ 位的絕對構型之解析。認為於1’α-H與11’-H、 3’α-H與11’-H、及1’β-H與3’ β-H之間有關連,因而得知11’位的絕對構型為S配置。
Figure 02_image105
所以,得知化合物(1-11)、具有與其相同絕對構型的化合物(1-9)及化合物(1-10)、使用化合物(1-11)所合成之化合物(3-11)、化合物(3-12)、化合物(3-13)及藥物連接子1(化合物(3-14))、化合物(4-9)、化合物(4-10)、化合物(4-11)及藥物連接子2(化合物(4-12))、以及、化合物(6-10)、化合物(6-11)、化合物(6-12)及藥物連接子4(化合物(6-13))中之11’位的絕對構型為S配置。又,決定了以同樣的合成手法所得之化合物(5-9)、化合物(5-10)及藥物連接子3(化合物(5-11))之11’位的絕對構型為S 配置。
[實施例1-2:中間體2]
Figure 02_image107
步驟1:N-[4-(11,12-二脫氫二苯并[b,f]吖
Figure 109110172-003-043-1
-5(6H)-基)-4-側氧丁醯基]甘胺醯甘胺酸(2-2) 對甘胺醯甘胺酸(0.328g,2.49mmol)、N,N-二異丙基乙胺(0.433mL,2.49mmol)的N,N-二甲基甲醯胺(20mL)溶液,於室溫加入1-{[4-(11,12-二脫氫二苯并[b,f]吖
Figure 109110172-003-043-1
-5(6H)-基)-4-側氧丁醯基]氧基}吡咯啶-2,5-二酮(2-1)(1.00g,2.49mmol,Click Chemistry Tools)、水(10mL),於同溫度攪拌了一晩。進行減壓蒸餾,以矽膠管柱層析[氯仿~氯仿:甲醇:水=7:3:1(v/v/v)的分配有機層]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(0.930g,89%)。 1H-NMR(DMSO-D6)δ:12.58(1H,s),8.14-8.12(1H,m),8.08-8.07(1H,m),7.69-7.68(1H,m),7.62-7.61(1H,m),7.53-7.45(3H,m),7.40-7.29(3H,m),5.05-5.01(1H,m),3.73-3.72(2H,m),3.66-3.60(3H,m),2.66-2.60(1H,m),2.33-2.24(1H,m),2.08-2.04(1H,m),1.81-1.77(1H,m). MS(APCI、ESI)m/z:420[(M+H)+].
實施例2 [實施例2-1:藥物連接子1]
Figure 02_image109
步驟1:(2R,11aS)-2-{[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}-8-羥基-7-甲氧基-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-2,3-二氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5,11(10H,11aH)-二酮(3-2) 對(2R,11aS)-8-(苄氧基)-2-{[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}-7-甲氧基-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-2,3-二氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5,11(10H,11aH)-二酮(3-1)(25.5g,41.6mmol,WO2016149546)的四氫呋喃(150mL)、乙醇(150mL)溶液,於氮氣體環境下,加入了5%鈀碳(54%水分、10.0g)之後,於氫氣體環境下,於室溫攪拌了反應溶液三天。對反應溶液加入氯仿,進行了矽藻土過濾之後,將濾液進行了減壓蒸餾。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0(v/v)~50:50(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-2)(19.4g,89%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.36(1H,s),7.25(1H,s), 6.01(1H,s),5.45-5.43(1H,m),4.69-4.67(1H,m),4.60-4.55(1H,m),4.23-4.21(1H,m),3.96(3H,s),3.76-3.68(2H,m),3.63-3.61(1H,m),3.56-3.53(1H,m),2.88-2.83(1H,m),2.03-2.00(1H,m),1.00-0.98(2H,m),0.87 (9H,s),0.10(6H,s),0.02(9H,s). MS(APCI、ESI)m/z:523(M+H)+
步驟2:(2R,11aS)-8-[(5-溴戊基)氧基]-2-{[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}-7-甲氧基-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-2,3-二氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5,11(10H,11aH)-二酮(3-3) 對上述步驟1中所得到的化合物(3-2)(10.8g,20.7mmol)的N,N-二甲基甲醯胺(30mL)溶液,在室溫加入了1,5-二溴戊烷(23.8g,103mmol)、碳酸鉀(3.43g,24.8mmol)。在室溫攪拌了3小時之後,對反應溶液加入水 ,以乙酸乙酯進行了萃取。以飽和食鹽水清洗所得到的有機層,以硫酸鈉進行了乾燥之後,進行了減壓蒸餾。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=90:10(v/v)~50:50(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-3)(14.5g,定量的)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.34(1H,s),7.21(1H,s),5.52-5.49(1H,m),4.63-4.62(1H,m),4.58-4.55(1H,m),4.24-4.22(1H,m),4.07-4.04(2H,m),3.92(3H,s),3.82-3.64(3H,m),3.56-3.53(1H,m),3.45-3.43(2H,m),2.86-2.84(1H,m),2.04-2.00(1H,m),1.97-1.87(4H,m),1.66-1.62(2H,m),1.01-0.98(2H,m),0.87(9H,s),0.10(6H,s), 0.04(9H,s) MS(APCI、ESI)m/z:673[81Br,(M+H)+],671[79Br, (M+H)+].
步驟3:(2R,11aS)-8-[(5-溴戊基)氧基]-2-羥基-7-甲氧基-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-2,3-二氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5,11(10H,11aH)-二酮(3-4) 對上述步驟2中所得到的化合物(3-3)(21.5mmol)的四氫呋喃(40mL)溶液,於0℃加入了1mol/L的四丁基氟化銨四氫呋喃溶液(28.0mL,28.0mmol)。於室溫30分鐘攪拌了之後,對反應溶液加入水,以乙酸乙酯進行萃取,以飽和食鹽水清洗了所得到的有機層。以硫酸鈉進行了乾燥之後,進行了減壓蒸餾。以矽膠管柱層析[氯仿:甲醇=97.5:2.5(v/v)~92.5:7.5(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-4)(11.3g,94%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.34(1H,s),7.21(1H,s),5.53-5.50(1H,m),4.69-4.64(2H,m),4.32-4.30(1H,m),4.10-4.00(2H,m),3.91(3H,s),3.88-3.75(2H,m),3.73-3.64(2H,m),3.45-3.44(2H,m),2.99-2.96(1H,m),2.15-2.09(1H,m),1.99-1.85(5H,m),1.68-1.62(2H,m),1.01-0.95(2H,m),0.04(9H,s). MS(APCI、ESI)m/z:559[81Br,(M+H)+],557[79Br, (M+H)+].
步驟4:(11aS)-8-[(5-溴戊基)氧基]-7-甲氧基-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-2,5,11(3H,10H,11aH)-三酮(3-5) 使上述步驟3中所得到的化合物(3-4)(11.3g,20.2mmol)、溴化四丁銨(0.325g,1.01mmol)、溴化鉀(0.240g,2.02mmol,)溶解於飽和碳酸氫鈉水溶液(60mL)、二氯甲烷(60mL),於0℃加入nor-AZADO(0.0279g,0.202mmol)、次氯酸鈉五水合物(2.03g,27.2mmol),於0℃攪拌了30分鐘。因有原料殘存,於0℃加入次氯酸鈉五水合物(1.00g,13.4mmol),於0℃攪拌了15分鐘。進而於0℃加入次氯酸鈉五水合物(0.300g,4.03mmol),於0℃攪拌15分鐘,以TLC確認了原料的消失。對反應溶液加入硫代硫酸鈉水溶液,以氯仿進行萃取,以硫酸鈉乾燥了所得到的有機層。進行減壓蒸餾,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=75:25(v/v)~40:60(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-5)(9.74g,87%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.33(1H,s),7.24(1H,s),5.56-5.53(1H,m),4.71-4.69(1H,m),4.66-4.63(1H,m),4.27-4.22(1H,m),4.12-4.02(2H,m),3.93-3.88(4H,m),3.82-3.75(1H,m),3.69-3.67(1H,m),3.61-3.56(1H,m),3.46-3.44(2H,m),2.82-2.77(1H,m),1.97-1.89(4H,m),1.68-1.64(2H,m),1.05-0.93(2H,m),0.04(9H,s). MS(APCI、ESI)m/z:557[81Br,(M+H)+],555 [79Br,(M+H)+].
步驟5:(11aS)-8-[(5-溴戊基)氧基]-7-甲氧基-5,11-二側氧-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-2-基 三氟甲磺酸酯(3-6) 對上述步驟4中所得到的化合物(3-5)(9.74g,17.5mmol)的二氯甲烷(160mL)溶液,於-40℃加入2,6-二甲吡啶(8.17mL,70.1mmol),於-40℃攪拌了10分鐘。於-40℃對反應溶液加入三氟甲磺酸酐(8.85mL,52.6mmol),於-40℃攪拌了30分鐘。對反應溶液加入10%檸檬酸水溶液,以氯仿進行萃取,以硫酸鈉乾燥了所得到的有機層。進行減壓蒸餾,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=95:5→70:35]純化了所得到的殘渣之後,以NH2矽膠層析[己烷:乙酸乙酯=95:5(v/v)~65:35(v/v)]進行純化,獲得了目的物(3-6)(7.10g,59%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.32(1H,s),7.24(1H,s),7.15-7.14(1H,m),5.56-5.53(1H,m),4.70-4.68(1H,m),4.66-4.63(1H,m),4.11-4.01(2H,m),3.94-3.90(4H,m),3.84-3.75(1H,m),3.73-3.68(1H,m),3.46-3.44(2H,m),3.18-3.14(1H,m),1.96-1.88(4H,m),1.69-1.61(2H,m),1.02-0.92(2H,m),0.04(9H,s). MS(APCI、ESI)m/z:689[81Br,(M+H)+],687[79Br, (M+H)+].
步驟6:(11aS)-8-[(5-溴戊基)氧基]-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5,11(10H,11aH)-二酮(3-7) 對上述步驟5中所得到的化合物(3-6)(2.00g,2.91mmol)、4-甲氧基苯基硼酸(0.884g,5.82mmol)、四(三苯膦)鈀(0)(0.336g,0.291mmol)、碳酸鈉(1.23g,11.6mmol)的混合物,於室溫加入了甲苯(20mL)、乙醇(10mL)、水(10mL)。於室溫攪拌了反應溶液30分鐘之後,以乙酸乙酯萃取反應溶液,以水、飽和食鹽水進行了清洗。以硫酸鈉乾燥有機層後,進行了減壓蒸餾。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=90:10(v/v)~50:50(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-7)(1.71g,91%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.38-7.37(3H,m),7.33(1H,s),7.25 (1H,s),6.89-6.88(2H,m),5.56-5.54(1H,m),4.71-4.68(1H,m),4.65-4.62(1H,m),4.09-4.04(2H,m),3.96-3.91(4H,m),3.85-3.66(5H,m),3.46-3.45(2H,m),3.16-3.12(1H,m),1.99-1.94(4H,m),1.69-1.64(2H,m),1.00-0.98(2H,m),0.04(9H,s). MS(APCI、ESI)m/z:647[81Br,(M+H)+],645[79Br, (M+H)+].
步驟7:(11aS)-8-[(5-溴戊基)氧基]-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-1,11a-二氫-5H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5-酮(3-8) 將上述步驟6中所得到的化合物(3-7)(0.789g,1.22mmol)溶解於乙醇(10mL)、四氫呋喃(10mL),於0℃加入2.0M的硼氫化鋰四氫呋喃溶液(6.11mL,12.2mmol),於0℃攪拌了3小時。對反應溶液加入水,以氯仿進行萃取,以硫酸鈉乾燥了所得到的有機層。進行減壓蒸餾,將所得到的殘渣溶解於二氯甲烷(10mL)、乙醇(20mL)、水(10mL),於室溫加入矽膠(4g),在室溫攪拌了4天。藉由過濾除去矽膠,加入水,以氯仿進行萃取,以硫酸鈉乾燥了所得到的有機層。進行減壓蒸餾,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=60:40(v/v)~25:75(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-8)(0.496g,81%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.90-7.89(1H,m),7.53(1H,s),7.40-7.40(1H,m),7.35-7.34(2H,m),6.92-6.90(2H,m),6.83-6.81(1H,m),4.43-4.40(1H,m),4.13-4.06(2H,m),3.96 (3H,s),3.84(3H,s),3.61-3.57(1H,m),3.47-3.36(3H,m), 2.00-1.92(4H,m),1.67-1.63(2H,m). MS(APCI、ESI)m/z:501[81Br,(M+H)+],499[79Br, (M+H)+].
步驟8:(11aS)-8-[(5-溴戊基)氧基]-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-1,10,11,11a-四氫-5H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5-酮(3-9) 對上述步驟7中所得到的化合物(3-8)(0.496g,0.992mmol)的二氯甲烷(20mL)溶液,於0℃加入了三乙醯氧基硼氫化鈉(0.421g,1.99mmol)。於室溫攪拌了2小時之後,加入飽和碳酸氫鈉水溶液,以氯仿進行了萃取。以硫酸鈉乾燥有機層,進行了減壓蒸餾之後,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=60:40(v/v)~25:75(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-9)(0.426g,86%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.53-7.53(2H,m),7.32-7.30(2H,m),6.89-6.87(2H,m),6.05(1H,s),4.33-4.27(2H,m),4.00-3.98(2H,m),3.86(3H,s),3.82(3H,s),3.57-3.55(2H,m),3.42-3.38(3H,m),2.76-2.72(1H,m),1.96-1.88(4H,m),1.65-1.62(2H,m). MS(APCI、ESI)m/z:503[81Br,(M+H)+],501[79Br,(M+H)+].
步驟9:丙-2-烯-1-基 (11aS)-8-[(5-溴戊基)氧基]-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-11,11a-二氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-10(5H)-甲酸酯(3-10) 對上述步驟8中所得到的化合物(3-9)(0.426g,0.849mmol)的二氯甲烷(30mL)溶液,於0℃加入吡啶(0.102mL1.27mmol)、氯甲酸丙烯酯(0.374mL,3.54mmol),於0℃攪拌了15分鐘。對反應溶液加入10%檸檬酸水溶液,以氯仿進行萃取,以飽和碳酸氫鈉水溶液清洗所得到的有機層後,以硫酸鈉進行了乾燥。進行減壓蒸餾,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=90:10(v/v)~50:50(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-10)(0.465g,94%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.38(1H,s),7.31-7.29(2H,m),7.26-7.25(1H,m),6.89-6.87(2H,m),6.71(1H,s),5.80-5.78(1H,m),5.14-5.11(2H,m),4.65-4.62(1H,m),4.39-4.26(3H,m),4.03-4.01(2H,m),3.92(3H,s),3.82(3H,s),3.66-3.64(1H,m),3.46-3.44(2H,m),3.30-3.27(1H,m),2.72-2.68(1H,m),1.96-1.88(4H,m),1.68-1.60(2H,m). MS(APCI、ESI)m/z:587[81Br,(M+H)+],585[79Br, (M+H)+].
步驟10:N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-{[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}-7’-甲氧基-8’-{[5-({(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-10-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基}氧基)戊基]氧基}-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(3-11) 對實施例1-1步驟10中所得到的化合物(1-11)(0.130g,0.161mmol)與上述步驟9中所得到的化合物(3-10)(0.104g,0.177mmol)的N,N-二甲基甲醯胺(3mL)溶液,於室溫加入碳酸鉀(0.0266g,0.193mmol),於室溫攪拌了一晩。以乙酸乙酯稀釋反應溶液,以水、飽和食鹽水進行了清洗了之後,以硫酸鈉進行了乾燥。進行了減壓蒸餾之後,以NH2 -矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=70:30(v/v)~0:100(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-11)(0.184g,87%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:8.76(1H,s),7.58-7.56(2H,m), 7.39(1H,s),7.32-7.30(2H,m),7.26-7.24(2H,m),7.19-7.17(3H,m),6.90-6.88(2H,m),6.78(1H,s),6.68-6.66(1H,m),6.37(1H,s),5.99-5.93(3H,m),5.34-5.20(6H,m),4.66-4.01(11H,m),3.90(3H,s), 3.89(3H,s),3.78-3.54(9H,m),3.31-3.28(2H,m),2.73-2.69(1H,m),2.38-2.35(1H,m),2.19-2.13(1H,m),1.82-1.80(2H,m),1.46-1.29(6H,m),0.98-0.90(6H,m), 0.83(9H,s),0.69-0.63(4H,m),0.19-0.16(6H,m). MS(APCI、ESI)m/z:1312(M+H)+
步驟11:N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-{[5-({(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-10-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基}氧基)戊基]氧基}-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(3-12) 對上述步驟10中所得到的化合物(3-11)(0.1837g,0.140mmol)與乙酸(0.048mL,0.840mmol)的四氫呋喃(5.00mL)溶液,於室溫加入1mol/L的四丁基氟化銨四氫呋喃溶液(0.700mL,0.700mmol),於室溫攪拌了3小時。以乙酸乙酯稀釋反應溶液,以飽和碳酸氫鈉水溶液、飽和食鹽水清洗了有機層之後,以硫酸鈉進行了乾燥。進行了減壓蒸餾之後,以矽膠層析[氯仿:甲醇=99.5:0.5(v/v)~95:5(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-12)(0.178g,定量的)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:8.86(1H,s),7.60-7.59(2H,m), 7.39(1H,s),7.32-7.20(7H,m),6.90-6.88(2H,m), 6.78(1H,s),6.68(1H,s),6.38(1H,s),5.90-5.87(3H,m),5.39-5.22(6H,m),4.72-4.02(11H,m),3.90(3H,s),3.88(3H,s), 3.83(3H,s),3.70-3.63(6H,m),3.32-3.29(3H,m),2.73-2.69(1H,m),2.43-2.40(1H,m),2.12-2.06(1H,m),1.77-1.74(2H,m),1.39-1.25(6H,m),0.96-0.89(6H,m),0.73-0.66(4H,m). MS(APCI、ESI)m/z:1198(M+H)+
步驟12:L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-[(5-{[(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基]氧基}戊基)氧基]-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(3-13) 對上述步驟11中所得到的化合物(3-12)(0.140mmol)的二氯甲烷(2mL)溶液,於室溫加入吡咯啶(0.0579mL,0.700mmol)、四(三苯膦)鈀(0)(0.0162g,0.0140mmol),於室溫攪拌了15分鐘。進行了減壓蒸餾之後,以矽膠層析[氯仿:甲醇=99.5:0.5(v/v)~92.5:7.5(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-13)(0.143g, 99%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:9.12(1H,s),7.94-7.92(1H,m),7.57-7.53(4H,m),7.33-7.31(2H,m),7.20-7.18(3H,m),6.90-6.88(2H,m),6.36(1H,s),6.07(1H,s),5.91-5.88(1H,m),5.47-5.44(1H,m),5.21-5.13(1H,m),4.66-4.58(3H,m), 4.32(1H,s),4.03-3.49(17H,m),3.38-3.29(4H,m),3.15-3.14(1H,m),2.77-2.73(1H,m),2.57(2H,s),2.43-2.40(1H,m),2.32-2.27(1H,m),1.81-1.39(8H,m),0.98-0.96(3H,m),0.85-0.83(3H,m),0.75-0.62(4H,m). MS(APCI、ESI)m/z:1030(M+H)+
步驟13:N-[4-(11,12-二脫氫二苯并[b,f]吖
Figure 109110172-003-043-1
-5(6H)-基)-4-側氧丁醯基]甘胺醯甘胺醯-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-[(5-{[(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基]氧基}戊基)氧基]-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(3-14) 對實施例1-2步驟1中所得到的化合物(2-2)(0.0640g, 0.153mmol)、N‐乙氧基羰基‐2-乙氧基‐1,2‐二氫喹啉(0.0446g, 0.180mmol)的混合物,於室溫加入二氯甲烷(2mL),於室溫攪拌了15分鐘。對反應溶液加入上述步驟12中所得到的化合物(3-13)(0.143g, 0.139mmol)的二氯甲烷(2mL)溶液,於室溫攪拌了五小時之後,進行了減壓蒸餾。以矽膠層析[氯仿:甲醇=99.5:0.5(v/v)~92.5:7.5(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(3-14)(0.103g, 52%)。 1H-NMR(DMSO-D6)δ:9.93(1H,s),8.21-8.16(2H,m), 8.07-8.04(1H,m),7.83-7.64(2H,m),7.60-7.55(3H,m),7.51-7.28(10H,m),7.19-7.16(2H,m),7.10-7.04(1H,m),6.92-6.90(2H,m),6.76-6.70(1H,m),6.39(1H,s),5.77-5.75(1H,m),5.21-5.18(1H,m),5.03-4.99(1H,m),4.82-4.79(1H,m),4.37-4.35(1H,m),4.21-4.20(2H,m),4.02-3.24(26H,m),3.16-3.13(1H,m),2.79-2.59(2H,m),2.39-2.28(2H,m),2.05-1.97(2H,m),1.91-1.77(4H,m),1.57-1.54(3H,m),1.28-1.23(3H,m),0.85-0.80(6H,m),0.67-0.61(4H,m). MS(APCI、ESI)m/z:1431(M+H)+
[實施例2-2:藥物連接子2]
Figure 02_image111
步驟1:(2R,11aS)-8-(3-溴丙氧基)-2-{[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}-7-甲氧基-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-2,3-二氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5,11(10H,11aH)-二酮(4-1) 使實施例2-1步驟1中所得到的化合物(3-2)(5.06g,9.67mmol)和1,3-二溴丙烷(4.93mL,48.4mmol),與實施例2-1步驟2同樣地進行反應,獲得了目的物(4-1)(4.85g,78%)。 MS(APCI、ESI)m/z:645[81Br,(M+H)+],643[79Br, (M+H)+].
步驟2:(2R,11aS)-8-(3-溴丙氧基)-2-羥基-7-甲氧基-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-2,3-二氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5,11(10H,11aH)-二酮(4-2) 使上述步驟1中所得到的化合物(4-1)(4.85g,7.54mmol) 與實施例2-1步驟3同樣地進行反應,獲得了目的物(4-2)(4.05g,定量的)。 MS(APCI、ESI)m/z:531[81Br,(M+H)+],529[79Br, (M+H)+].
步驟3:(11aS)-8-(3-溴丙氧基)-7-甲氧基-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-2,5,11(3H,10H,11aH)-三酮(4-3) 使上述步驟2中所得到的化合物(4-2)(7.54mmol),與實施例2-1步驟4同樣地進行反應,獲得了目的物(4-3)(3.73g,93%)。 1H-NMR(CDCl3)δ:7.34(1H,s),7.29(1H,s),5.56-5.53(1H,m),4.72-4.69(1H,m),4.67-4.61(1H,m),4.23-4.17(3H,m),3.97-3.88(4H,m),3.82-3.75(1H,m),3.74-3.56(4H,m),2.82-2.77(1H,m),2.43-2.38(2H,m),1.06-0.94(2H,m),0.08-0.00(9H,m).
步驟4:(11aS)-8-(3-溴丙氧基)-7-甲氧基-5,11-二側氧-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-2-基 三氟甲磺酸酯(4-4) 使上述步驟3中所得到的化合物(4-3)(3.73g,7.08mmol),與實施例2-1步驟5同樣地進行反應,獲得了目的物(4-4)(3.27g,70%)。 MS(APCI、ESI)m/z:661[81Br,(M+H)+],659[79Br, (M+H)+].
步驟5:(11aS)-8-(3-溴丙氧基)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基-10-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5,11(10H,11aH)-二酮(4-5) 使上述步驟4中所得到的化合物(4-4)(3.27g,4.96mmol),與實施例2-1步驟6同樣地進行反應,獲得了目的物(4-5)(2.49g,81%)。 MS(APCI、ESI)m/z:619[81Br,(M+H)+],617 [79Br,(M+H)+].
步驟6:(11aS)-8-(3-溴丙氧基)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-1,11a-二氫-5H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5-酮(4-6) 使上述步驟5中所得到的化合物(4-5)(2.49g,4.04mmol),與實施例2-1步驟7同樣地進行反應,獲得了目的物(4-6)(1.59g,84%)。 MS(APCI、ESI)m/z:473[81Br,(M+H)+],471[79Br,(M+H)+].
步驟7:(11aS)-8-(3-溴丙氧基)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-1,10,11,11a-四氫-5H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-5-酮(4-7) 使上述步驟6中所得到的化合物(4-6)(1.59g,3.38mmol),與實施例2-1步驟8同樣地進行反應,獲得了目的物(4-7)(1.39g,87%)。 MS(APCI、ESI)m/z:475[81Br,(M+H)+],473[79Br, (M+H)+].
步驟8:丙-2-烯-1-基 (11aS)-8-(3-溴丙氧基)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-11,11a-二氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-10(5H)-甲酸酯(4-8) 使上述步驟7中所得到的化合物(4-7)(1.40g,2.95mmol),與實施例2-1步驟9同樣地進行反應,獲得了目的物(4-8)(0.885g,54%)。 MS(APCI、ESI)m/z:559[81Br,(M+H)+],557[79Br, (M+H)+].
步驟9:N-{[(丙-2-烯-1-基)氧基]羰基}-L-纈胺醯基-N-[4-({[(11’S,11’aS)-11’-{[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}-7’-甲氧基-8’-(3-{[(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-10-{[(丙-2-烯-1-基)氧基]羰基}-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基]氧基}丙氧基)-5’-側氧-11’,11’a-二氫-1’H,3’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-羰基]氧基}甲基)苯基]-L-丙胺醯胺(4-9) 使上述步驟8中所得到的化合物(4-8)(0.0381g,0.0683mmol)和實施例1-1步驟10中所得到的化合物(1-11)(0.0552g、0.0683mmol),與實施例2-1步驟10同樣地進行反應,獲得了目的物(4-9)(0.0712g,81%)。 MS(APCI、ESI)m/z:1284(M+H)+.
步驟10:N-{[(丙-2-烯-1-基)氧基]羰基}-L-纈胺醯基-N-[4-({[(11’S,11’aS)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-(3-{[(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-10-{[(丙-2-烯-1-基)氧基]羰基}-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基]氧基}丙氧基)-5’-側氧-11’,11’a-二氫-1’H,3’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-羰基]氧基}甲基)苯基]-L-丙胺醯胺(4-10) 使上述步驟9中所得到的化合物(4-9)(0.0712g,0.0554mmol),與實施例2-1步驟11同樣地進行反應,獲得了目的物(4-10)(0.0671g,定量的)。 MS(APCI、ESI)m/z:1170(M+H)+.
步驟11:L-纈胺醯基-N-[4-({[(11’S,11’aS)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-(3-{[(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基]氧基}丙氧基)-5’-側氧-11’,11’a-二氫-1’H,3’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-羰基]氧基}甲基)苯基]-L-丙胺醯胺(4-11) 使上述步驟10中所得到的化合物(4-10)(0.0571mmol),與實施例2-1步驟12 同樣地進行反應,獲得了目的物(4-11)(0.0574g,99%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:9.16(1H,s),7.93-7.91(1H,m),7.55-7.52(1H,m),7.50-7.47(3H,m),7.35-7.32(2H,m),7.21 (1H,s),7.13-7.11(2H,m),6.90-6.87(2H,m),6.40 (1H,s),6.08(1H,s),5.90-5.87(1H,m),5.37-5.34(1H,m), 4.73-4.53(3H,m),4.23-4.08(5H,m),3.89(3H,s),3.82(3H,s), 3.78-3.72(5H,m),3.57-3.51(3H,m),3.38-3.30(3H,m),2.76-2.71(1H,m),2.36-2.24(4H,m),1.78-1.42(6H,m),1.00-0.98(3H,m),0.87-0.84(3H,m),0.74-0.62(4H,m). MS(APCI、ESI)m/z:1002(M+H)+.
步驟12:N-[4-(11,12-二脫氫二苯并[b,f]吖
Figure 109110172-003-043-1
-5(6H)-基)-4-側氧丁醯基]甘胺醯甘胺醯-L-纈胺醯基-N-[4-({[(11’S,11’aS)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-(3-{[(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基]氧基}丙氧基)-5’-側氧-11’,11’a-二氫-1’H,3’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-羰基]氧基}甲基)苯基]-L-丙胺醯胺(4-12) 使上述步驟11中所得到的化合物(4-11)(0.189g,0.189mmol)和實施例1-2步驟1中所得到的化合物(2-2)(0.087g、0.207mmol),與實施例2-1步驟13同樣地進行反應,獲得了目的物(4-12)(0.169g,64%)。 MS(APCI、ESI)m/z:1402(M+H)+.
[實施例2-3:藥物連接子3]
Figure 02_image113
步驟1:(6S,6’S)-5,5’-{1,5-戊二基雙[氧基(5-甲氧基-2-硝基苯-4,1-二基)羰基]}雙(5-氮雜螺[2.4]庚烷-6-甲酸二甲酯)(5-2) 對4,4’-[1,5-戊二基雙(氧基)]雙(5-甲氧基-2-硝基苯甲酸)(5-1)(5.41g,10.9mmol,Journal of Medicinal Chemistry 2004,47,1161)的二氯甲烷(50mL)溶液,於0℃加入草醯氯(5.63mL,65.7mmol),滴入了N,N-二甲基甲醯胺(0.0844mL,1.09mmol)。將反應溶液升溫至室溫為止,攪拌了2小時。將進行減壓蒸餾而得到的殘渣溶解於二氯甲烷(100mL),於氮氣體環境下,在-40℃滴入至(6S)-5-氮雜螺[2.4]庚烷-6-甲酸甲酯鹽酸鹽(4.28g,24.1mmol,Tetrahedron Letters 2012. 53. 3847)與三乙胺(6.07mL,43.8mmol)的二氯甲烷溶液(100mL)。將反應溶液升溫至0℃而攪拌了2小時。對反應混合物加入1當量鹽酸(100mL),以水、飽和食鹽水清洗有機層,以無水硫酸鈉進行了乾燥。進行減壓蒸餾,獲得了目的物(5-2)(8.40g,定量的)。 MS(APCI、ESI)m/z:769(M+H)+.
步驟2:{1,5-戊二基雙[氧基(5-甲氧基-2-硝基苯-4,1-二基)]}雙{[(6S)-6-(羥甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基]甲酮}(5-3) 對上述步驟1中所得到的化合物(5-2)(8.40g,10.9mmol)的四氫呋喃(100mL)溶液,加入硼氫化鋰(714mg,32.8mmol),於0℃攪拌30分鐘,升溫至室溫而攪拌了1小時。於0℃加入了1當量鹽酸之後,以乙酸乙酯進行萃取,以飽和食鹽水進行了清洗之後,以無水硫酸鈉進行了乾燥。於減壓下餾出溶劑,而獲得了目的物(5-3)(7.70g,99%)。 MS(APCI、ESI)m/z:713(M+H)+.
步驟3:戊烷-1,5-二基雙[氧基(5-甲氧基-2-硝基苯-4,1-二基)羰基(6S)-5-氮雜螺[2.4]庚烷-5,6-二基甲烷二基]二乙酸酯(5-4) 將上述步驟2中所得到的化合物(5-3)(7.70g、10.8mmol)溶解於吡啶(20mL)及乙酸酐(10mL,105.9mmol),而於室溫進行了攪拌。進行減壓蒸餾,而獲得了目的物(5-4)(8.38g,97%)。 MS(APCI、ESI)m/z:797(M+H)+.
步驟4:1,5-戊二基雙[氧基(2-胺基-5-甲氧基苯-4,1-二基)羰基(6S)-5-氮雜螺[2.4]庚烷-5,6-二基甲烷二基]二乙酸酯(5-5) 對上述步驟3中所得到的化合物(5-4)(8.28g,10.4mmol)的N,N-二甲基甲醯胺(100mL)溶液,加入了5%鈀碳(54%水分,1.00g)之後,於氫氣體環境下,於室溫激烈地攪拌了反應溶液6小時。進行了矽藻土過濾之後,以矽膠管柱層析[氯仿:甲醇=100:0(v/v)~90:10(v/v)]純化將濾液減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(5-5)(5.05g,66%)。 MS(APCI、ESI)m/z:737(M+H)+.
步驟5:{(6S)-5-[4-({5-[4-({(6S)-6-[(乙醯氧基)甲基]-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基}羰基)-5-胺基-2-甲氧基苯氧基]戊基}氧基)-5-甲氧基-2-{[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]胺基}苯甲醯基]-5-氮雜螺[2.4]庚-6-基}甲基乙酸酯(單烯丙氧基羰基體)(5-6) 對上述步驟4中所得到的化合物(5-5)(5.05g,6.85mmol)的二氯甲烷(100mL)溶液,加入吡啶(1.10mL,13.7mmol),於氮氣體環境下,於-78℃加入氯甲酸丙烯酯(0.725mL,6.85mmol),攪拌了2小時。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=70:30(v/v)~100:0(v/v)、氯仿:甲醇=100:0(v/v)~90:10(v/v)]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了為目的物之單烯丙氧基羰基體(5-6)(2.63g,47%)。 MS(APCI、ESI)m/z:821(M+H)+.
步驟6:N-[(2-丙烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-{4-[({[2-({(6S)-6-[(乙醯氧基)甲基]-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基}羰基)-5-({5-[4-({(6S)-6-[(乙醯氧基)甲基]-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基}羰基)-2-甲氧基-5-{[(2-丙烯-1-基氧基)羰基]胺基}苯氧基]戊基}氧基)-4-甲氧基苯基]胺甲醯基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(5-7) 使上述步驟5中所得到的單烯丙氧基羰基體(5-6)(2.00g,2.44mmol)和N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-[4-(羥甲基)苯基]-L-丙胺醯胺(1.10g,2.92mmol,WO2011130598),與實施例1-1步驟6同樣地進行反應,獲得了目的物(5-7)(2.64g,89%)。 MS(APCI、ESI)m/z:1224(M+H)+.
步驟7:N-[(2-丙烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-[4-({[(2-{[(6S)-6-(羥甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基]羰基}-5-{[5-(4-{[(6S)-6-(羥甲基)-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基]羰基}-2-甲氧基-5-{[(2-丙烯-1-基氧基)羰基]胺基}苯氧基)戊基]氧基}-4-甲氧基苯基)胺甲醯基]氧基}甲基)苯基]-L-丙胺醯胺(5-8) 對上述步驟6中所得到的化合物(5-7)(2.64g,2.16mmol)的甲醇(10mL)溶液,加入碳酸鉀(1.49g,10.8mmol),在室溫攪拌了3小時。對反應混合物加入飽和氯化銨水溶液(100mL),以乙酸乙酯進行了萃取。以無水硫酸鈉乾燥了有機層。進行減壓蒸餾,而獲得了目的物(5-8)(2.21g,90%)。 MS(APCI、ESI)m/z:1140(M+H)+.
步驟8:N-[(2-丙烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-8’-{[5-({(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-5’-側氧-10’-[(2-丙烯-1-基氧基)羰基]-5’,10’,11’,11a’-四氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-8’-基}氧基)戊基]氧基}-7’-甲氧基-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(5-9) 對上述步驟7中所得到的化合物(5-8)(2.03g,1.78mmol)的二氯甲烷(50mL)溶液,加入戴斯-馬丁氧化劑(Dess-Martin Periodinane)(1.59g,3.74mmol),在室溫攪拌了一晩。對反應混合物加入飽和碳酸氫鈉水溶液(100mL),以氯仿進行了萃取了。以無水硫酸鈉乾燥了有機層。以矽膠管柱層析[氯仿:甲醇=100:0(v/v)~90:10(v/v)]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(5-9)(2.05g,定量的)。 MS(APCI、ESI)m/z:1136(M+H)+.
步驟9:L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-[(5-{[(11a’S)-7’-甲氧基-5’-側氧-5’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-8’-基]氧基}戊基)氧基]-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(5-10) 使上述步驟8中所得到的化合物(5-9)(2.05g,1.80mmol)與實施例2-1步驟12同樣地進行反應,獲得了目的物(5-10)(1.02g,60%)。 MS(APCI、ESI)m/z:950(M+H)+.
步驟10:N-[4-(11,12-二脫氫二苯并[b,f]吖
Figure 109110172-003-043-1
-5(6H)-基)-4-側氧丁醯基]甘胺醯甘胺醯-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-[(5-{[(11a’S)-7’-甲氧基-5’-側氧-5’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-8’-基]氧基}戊基)氧基]-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(5-11) 將上述步驟9中所得到的化合物(5-10)(0.710g,0.747mmol)與實施例1-2步驟1中所得到的化合物(2-2)(0.313g、0.747mmol)溶解於二氯甲烷(1.5mL)與甲醇(0.1mL)的混合溶劑。加入4-(4,6-二甲氧基-1,3,5-三
Figure 109110172-A0304-12-0000-4
-2-基)-4-甲基
Figure 109110172-A0304-12-0020-6
啉鎓氯化物(0.264g,0.897mmol),在室溫攪拌了1小時。以矽膠管柱層析[氯仿:甲醇=100:0(v/v)~80:20(v/v)]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(5-11)(0.671g,66%)。 1H-NMR(DMSO-D6)δ:9.91(1H,s),8.32(1H,s),8.23-7.91(3H,m),7.81-7.19(14H,m),7.04(1H,m),6.80-6.62(3H,m),5.77-5.75(1H,m),5.20(1H,m),5.01 (1H,m),4.79(1H,m),4.46-4.35(1H,m),4.04(4H,m),3.86-3.38(18H,m),3.22-3.15(2H,m),2.67-2.63(1H,m),2.46-2.23(3H,m),2.09-1.91(2H,m),1.80-1.78(5H,m),1.57 (3H,m),1.27(3H,s),1.11-1.04(1H,m),0.87-0.79(6H,m), 0.63-0.55(6H,m). MS(APCI、ESI)m/z:1351(M+H)+.
[實施例2-4:藥物連接子4]
Figure 02_image115
步驟1:(6S)-5-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯甲醯基]-5-氮雜螺[2.4]庚烷-6-甲酸甲酯(6-2) 對4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯甲酸(6-1)(6.07g,20.0mmol,Tetrahedron 1995,51,5617)、N,N-二甲基甲醯胺(1.08mL,13.9mmol)的二氯甲烷(100mL)溶液,於冰冷卻下花費5分鐘而滴入了草醯氯(3.43mL,40.0mmol)。於室溫攪拌了反應溶液5小時之後,進行減壓蒸餾,使所得到的殘渣溶解於二氯甲烷(20mL),進行了減壓蒸餾。於3次反覆進行了此操作之後,使殘渣懸浮於二氯甲烷(5mL),對其加入過量的二***與己烷,進行過濾,於減壓下使其乾燥,藉此而得到了粗醯基氯化物。使所得到的粗醯基氯化物溶解於二氯甲烷,冷卻至-40℃(乾冰-乙腈浴),徐徐地加入了(6S)-5-氮雜螺[2.4]庚烷-6-甲酸甲酯鹽酸鹽(4.22g,22.0mmol,Tetrahedron Letters 2012.53.3847)、三乙胺(3.36mL,24.2mmol)。花費一晩來將反應混合物升溫至室溫為止。對反應混合物加入1當量鹽酸,以二氯甲烷萃取了反應混合物。以水,飽和碳酸氫鈉水溶液及飽和食鹽水清洗有機層,以無水硫酸鈉進行了乾燥。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0~50:50]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(6-2)(6.55g,80%)。 MS(APCI、ESI)m/z:441(M+H)+
步驟2:(11a’S)-8’-(苄氧基)-7’-甲氧基-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-5’,11’(10’H,11a’H)-二酮(6-3) 對上述步驟1中所得到的化合物(6-2)(6.55g,16.0mmol)的乙醇(150mL)、四氫呋喃(150mL)溶液,於氮氣體環境下,加入了雷氏鎳(7.00g)。對反應混合物加入聯胺一水合物(7mL),徐徐地升溫至50℃為止。於50℃攪拌了2小時之後,加入雷氏鎳(3.00g)、聯胺一水合物(3mL),攪拌了1小時。對反應混合物加入THF(100mL),進行了矽藻土過濾。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0~25:75]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(6-3)(4.42g,73%)。 MS(APCI、ESI)m/z:379(M+H)+
步驟3:(11a’S)-8’-(苄氧基)-7’-甲氧基-10’-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-5’,11’(10’H,11a’H)-二酮(6-4) 對上述步驟2中所得到的化合物(6-3)(10.0g,26.4mmol)的四氫呋喃(150mL)溶液,於-40℃徐緩地滴入了2.6mol/L的正丁基鋰正己烷溶液(12.0mL,31.8mmol)。於-40℃攪拌了反應溶液15分鐘之後,徐緩地滴入了2-(氯甲氧基)乙基三甲基矽烷(5.57mL,31.7mmol)。於室溫攪拌了反應溶液3小時之後,加入水,以乙酸乙酯進行了萃取。以水及飽和食鹽水清洗有機層,以無水硫酸鈉進行了乾燥。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0~30:70]純化進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(6-4)(11.8g,88%)。 MS(APCI、ESI)m/z:509(M+H)+
步驟4:(11a’S)-8’-羥基-7’-甲氧基-10’-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-5’,11’(10’H,11a’H)-二酮(6-5) 對上述步驟3中所得到的化合物(6-4)(18.7g,36.8mmol)的四氫呋喃(50mL)、乙醇(100mL)溶液,於氮氣體環境下加入了5%的鈀碳觸媒(5.00g)。立即將氮氣球更換為氫氣球,於氫氣體環境下攪拌了反應混合物6小時。對反應混合物加入氯仿而進行稀釋,進行了矽藻土過濾之後,以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0~25:75]純化將濾液進行減壓蒸餾而得到的殘渣,獲得了目的物(6-5)(15.1g,98%)。 MS(APCI、ESI)m/z:419(M+H)+
步驟5:(11a’S)-8’-[(5-溴戊基)氧基]-7’-甲氧基-10’-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]甲基}-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-5’,11’(10’H,11a’H)-二酮(6-6) 使上述步驟4中所得到的化合物(6-5)(2.77g,6.62mmol)與實施例2-1步驟2同樣地進行反應,獲得了目的物(6-6)(3.31g,88%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.36(1H,s),7.25(1H,s), 5.55(1H,m),4.65(1H,m),4.24-4.23(1H,m),4.11-4.03(2H,m),3.93(3H,s),3.85-3.78(1H,m),3.72-3.69(2H,m),3.46-3.39(3H,m),2.47-2.44(1H,m),2.25-2.22(1H,m),1.95-1.91(4H,m),1.67-1.59(1H,m),1.03-0.95(2H,m),0.90-0.85(1H,m),0.70-0.66(4H,m), 0.05(9H,s).
步驟6:(11a’S)-8’-[(5-溴戊基)氧基]-7’-甲氧基-1’,11a’-二氫-5’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-5’-酮(6-7) 使上述步驟5中所得到的化合物(6-6)(3.31g,5.83mmol),與實施例2-1步驟7同樣地進行反應,獲得了目的物(6-7)(1.11g,45%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.81(1H,m),7.53(1H,s), 6.82(1H,s),4.13-4.06(2H,m),3.97(3H,s),3.88-3.83(1H,m),3.69(1H,m),3.52-3.39(3H,m),2.55-2.52(1H,m),2.06-1.89(5H,m),1.67-1.63(2H,m),0.76-0.72(4H,m).
步驟7:(11a’S)-8’-[(5-溴戊基)氧基]-7’-甲氧基-1’,10’,11’,11a’-四氫-5’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-5’-酮(6-8) 使上述步驟6中所得到的化合物(6-7)(2.56g,6.08mmol),與實施例2-1步驟8同樣地進行反應,獲得了目的物(6-8)(1.15g,45%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.60(1H,s),6.07(1H,s),4.11-4.04(1H,m),3.99(2H,m),3.87-3.84(1H,m),3.85(3H,s), 3.73(1H,m),3.58-3.53(2H,m),3.47-3.42(3H,m),2.03-1.78(6H,m),1.65-1.63(2H,m),0.77-0.56(4H,m).
步驟8:丙-2-烯-1-基 (11a’S)-8’-[(5-溴戊基)氧基]-7’-甲氧基-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-甲酸酯(6-9) 使上述步驟7中所得到的化合物(6-8)(1.15g,2.72mmol),與實施例2-1步驟9同樣地進行反應,獲得了目的物(6-9)(1.14g,82%)。 1H-NMR(CDCl3)δ:7.23(1H,s),6.69(1H,s), 5.79(1H,s),5.13-5.10(2H,m),4.68-4.66(1H,m),4.48-4.45(2H,m),4.01(2H,m),3.92(3H,s),3.76(1H,m),3.54-3.37(3H,m),2.39(1H,m),1.95-1.90(4H,m),1.68-1.61(3H,m),1.44(1H,m),0.75-0.66(4H,m).
步驟9:N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-{[三級丁基(二甲基)矽基]氧基}-7’-甲氧基-8’-{[5-({(11a’S)-7’-甲氧基-5’-側氧-10’-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-5’,10’,11’,11a’-四氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-8’-基}氧基)戊基]氧基}-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基] 苯基}-L-丙胺醯胺(6-10) 使上述步驟8中所得到的化合物(6-9)(0.374g,0.737mmol)和實施例1-1步驟10中所得到的化合物(1-11)(0.452g、0.56mmol),與實施例2-1步驟10同樣地進行反應,獲得了目的物(6-10)(0.589g,65%)。 MS(APCI、ESI)m/z:1234(M+H)+
步驟10:N-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-{[5-({(11a’S)-7’-甲氧基-5’-側氧-10’-[(丙-2-烯-1-基氧基)羰基]-5’,10’,11’,11a’-四氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-8’-基}氧基)戊基]氧基}-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(6-11) 使上述步驟9中所得到的化合物(6-10)(0.589g,0.477mmol),與實施例2-1步驟11同樣地進行反應,獲得了目的物(6-11)(0.382g,71%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:8.90(1H,s),7.55(2H,m),7.25-7.21(2H,m),6.74(2H,m),6.38(1H,s),5.90-5.87(5H,m),5.33-5.09(8H,m),4.66-4.60(8H,m),3.98-3.91(10H,m),3.77-3.30(12H,m),2.42-2.36(2H,m),1.77-1.39(6H,m),0.91-0.70(14H,m).
步驟11:L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-[(5-{[(11a’S)-7’-甲氧基-5’-側氧-5’,10’,11’,11a’-四氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-8’-基]氧基}戊基)氧基]-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(6-12) 使上述步驟10中所得到的化合物(6-11)(0.382g,0.341mmol),與實施例2-1步驟12同樣地進行反應,獲得了目的物(6-12)(0.200g,62%)。 MS(APCI、ESI)m/z:952(M+H)+
步驟12:N-[4-(11,12-二脫氫二苯并[b,f]吖
Figure 109110172-003-043-1
-5(6H)-基)-4-側氧丁醯基]甘胺醯甘胺醯-L-纈胺醯基-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-羥基-7’-甲氧基-8’-[(5-{[(11a’S)-7’-甲氧基-5’-側氧-5’,10’,11’,11a’-四氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-8’-基]氧基}戊基)氧基]-5’-側氧-11’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-10’(5’H)-基]羰基}氧基)甲基]苯基}-L-丙胺醯胺(6-13) 使上述步驟11中所得到的化合物(6-12)(0.0560g,0.0588mmol)和實施例1-2步驟1中所得到的化合物(2-2)(0.022g、0.053mmol),與實施例2-1步驟13同樣地進行反應,獲得了目的物(6-13)(0.0500g,63%)。 MS(APCI、ESI)m/z:1354(M+H)+
〔糖鏈供予體之合成〕 實施例3:[N3 -PEG(3)]-MSG1-Ox
Figure 02_image117
步驟1:(MSG1-)Asn 將為市售品之monosialo-Asn free(1S2G/1G2S-10NC-Asn,糖鏈工學研究所(股)製)(稱為「(MSG-)Asn」)(500mg)以下列條件進行逆相HPLC分離純化,分離成作為第一主峰(1st main peak)被溶出的(MSG1-)Asn(滯留時間15~19分鐘附近)與作為第二主峰(2nd main peak)被溶出的(MSG2-)Asn(滯留時間21~26分鐘附近)。使用0.1%甲酸水溶液作為溶析液,於裝置使用ELS-PDA觸發器分取系統(JASCO Corporation製),於管柱使用Inertsil ODS-3(10um、30Φx250mm,GL SCIENCES INC.製),使流速為30mL/分鐘。分取在溶出中被UV檢出(210nm)之最初的波峰,進行冷凍乾燥,而獲得了目的物(238mg)。
步驟2:MSG1 使上述步驟1中所得到的化合物(229mg)溶解於200mM磷酸緩衝溶液(pH6.25)(1145μL),加入EndoM(東京化成工業(股)製,1U/mL))水溶液(100μL),在35℃保溫了6天。反應結束後,將反應液使用VIVASPIN 15R(Hydrosart膜,30K,6,000xG)進行超過濾,將所得到的通過液進行了逆相HPLC分離純化。使用0.1%三氟乙酸水溶液作為溶析液,於裝置使用了ELS-PDA觸發器分取系統(JASCO Corporation製),於管柱使用了Inertsil ODS-3(GL SCIENCES INC.製)。分取在溶出中被UV檢出(210nm)之目的物的波峰,進行冷凍乾燥,獲得了目的物(117mg)。
步驟3:[N3 -PEG(3)]-MSG1 於5ml取樣管(INA・OPTIKA CO.,LTD)加入11-疊氮基-3,6,9-三氧雜十一烷-1-胺(0.108mL,0.541mmol)與上述步驟2中所得到的MSG1(117mg,0.068mmol)的水溶液(1.2mL),於攪拌了1小時之後,進行了冷凍乾燥。於冷凍乾燥後的5ml取樣管加入O-(7-氮雜苯并***-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲六氟磷酸鹽(103mg,0.27mmol)的N,N-二甲基甲醯胺溶液(1.2mL)與二異丙基乙胺(0.046mL,0.27mmol),在37℃攪拌了3小時。反應結束後,將反應液移至預先加入了二***(20ml)的離心管(50ml)。利用小型離心機(日立工機,CF16RX)使固形物沈澱,除去了上清液。進一步加入二***(10ml)而離心分離操作後,進行了傾析。接著,將加入乙腈(10mL),離心分離後,進行傾析之操作二次反覆進行了之後,進行減壓下乾燥,獲得了粗生成物。將所得到的固形物以與上述步驟2同樣的條件進行逆相HPLC純化,獲得了目的物(94.2mg)。
步驟4:[N3 -PEG(3)]-MSG1-Ox 於5mL取樣管(INA・OPTIKA CO.,LTD製)加入了上述步驟3中所合成的化合物(100mg)、2-氯-1,3-二甲基-1H-苯并咪唑-3-鎓-氯化物(伏見製藥所製,56mg,0.257mmol)的水溶液(520μl)。對冰冷卻後的反應液加入磷酸三鉀(165mg,0.78mmol)的水溶液(520μl),在冰冷卻下攪拌了3小時。將所得到的反應液使用Amicon Ultra(Ultracel 30K,Merck Millipore製)進行超過濾,去除了固形物。以膠體過濾層析純化了該通過液。於裝置使用Purif-Rp2(SHOKO SCIENTIFIC製),於管柱使用HiPrep 26/10 Desalting(GE HEALTHCARE製),於移動相使用0.03%NH3 水溶液,使流速為10mL/分鐘,使分級容量為10mL。將包含在溶出中被UV檢出(220nm)之目的物的區分收集成一個,加入1N氫氧化鈉水溶液(104μl,0.104mmol)而進行冷凍乾燥,獲得了目的物(84mg)。
實施例4:[N3 -PEG(3)]-MSG-Ox
Figure 02_image119
步驟1:(MSG-)Asn的調製 使為市售品之1S2G/1G2S-10NC-Asn-Fmoc(糖鏈工學研究所(股)製)(稱為「Fmoc-(MSG-)Asn」)(1000mg)溶解於乙醇/水(1/1)(10mL),加入1當量之氫氧化鈉水溶液(1.75mL,4當量),在室溫攪拌了3小時。反應結束後,將反應液使用Amicon Ultra(30K,Millipore Co.製)進行超過濾,去除固形物,對所得到的通過液加入了1N鹽酸(832μl,1.9當量)。使用高速濃縮裝置V-10(Biotage公司製)而去除了溶劑。加入乙腈而使用高速濃縮裝置V-10(Biotage公司製),於去除了溶劑之後,進行了逆相HPLC分離純化。以0.1%三氟乙酸水溶液與0.1%三氟乙酸乙腈溶液作為溶析液,於裝置使用Purif-Rp2(SHOKO SCIENTIFIC製),於管柱使用了Inertsil ODS-3(GL SCIENCES製)。將包含在溶出中被UV檢出(220nm)之目的物的區分收集成一個,進行了冷凍乾燥。再次使其溶解於純水時以pH試紙確認到為酸性,所以加入18%   氨水(150μl),以pH試紙確認變成鹼性,再次進行了冷凍乾燥。將所得到的目的物(840mg)直接用於接下來的反應。
步驟2:MSG之合成 使步驟1中所得到的化合物(840mg)溶解於200mM磷酸緩衝溶液(pH6.25)(6000μL),加入EndoM(東京化成工業(股)製、1U/mL))水溶液(200μL),在28℃保溫了26小時。因反應未完成,所以加入EndoM(東京化成工業(股)製,1U/mL))水溶液(50μL),於28℃保溫了2小時之後,到反應完成為止放置在室溫。反應結束後,將反應液使用Amicon Ultra(30K,Millipore Co.製)進行了超過濾。對所得到的通過液加入三氟乙酸(80μl),進行了逆相HPLC分離純化。以0.1%三氟乙酸水溶液與0.1%三氟乙酸乙腈溶液作為溶析液,於裝置使用Purif-Rp2(SHOKO SCIENTIFIC製),於管柱使用了Inertsil ODS-3(GL SCIENCES製)。將包含在溶出中被UV檢出(220nm)之目的物的區分收集成一個,進行了冷凍乾燥。以除去殘留三氟乙酸之目的,再度使其溶解於純水,獲得了為無色固體的目的化合物(618mg)。 ESI-MS: Calcd for C66 H110 N4 O49 : [M+H]+ 1743.62, Found 1743.63
步驟3:[N3 -PEG(3)]-MSG之合成 使用上述步驟2中所得到的化合物(120mg),而按照與實施例3步驟3同樣的手法,獲得了目的物(88.6mg)。 ESI-MS: Calcd for C73 H124 N8 O51 :[M+2H]2+ 965.37, Found 965.37
步驟4[N3 -PEG(3)]-MSG-Ox之合成 使用上述步驟3中所得到的所合成的化合物(100mg),而按照與實施例3步驟4同樣的手法,獲得了目的物(88mg)。
實施例5:[N3 -PEG(3)]2 -SG(10)-Ox
Figure 02_image121
步驟1:[N3 -PEG(3)]2 -SG(10) 於5ml取樣管(INA・OPTIKA CO.,LTD)加入11-疊氮基-3,6,9-三氧雜十一烷-1-胺(0.096mL,0.485mmol)、二唾液酸八醣(50mg,0.24mmol)的水溶液(0.5mL),於攪拌了1小時之後,進行了冷凍乾燥。於冷凍乾燥後的5ml取樣管加入O-(7-氮雜苯并***-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲六氟磷酸鹽(92mg,0.24mmol)的N,N-二甲基甲醯胺溶液(0.6mL)與二異丙基乙胺(0.042mL,0.24mmol),在37℃攪拌了4小時。反應結束後,將反應液移至預先加入了二***(20ml)的離心管(50ml)。利用小型離心機(日立工機,CF16RX)使固形物沈澱,除去了上清液。加入二***(20ml)而進行了傾析。接著,於加入乙腈(20mL)而進行了傾析之後,進行減壓下乾燥,獲得了粗生成物。使所得到的固形物溶解於適量的0.2%三氟乙酸水溶液,進行了逆相HPLC分離純化。以0.1%三氟乙酸水溶液與0.1%三氟乙酸乙腈溶液作為溶析液,於裝置使用Purif-Rp2(SHOKO SCIENTIFIC製),於管柱使用了Inertsil ODS-3(GL SCIENCES製)。將包含在溶出中被UV檢出(220nm)之目的物的區分收集成一個,進行冷凍乾燥而獲得了目的物(42mg)。
步驟2:[N3 -PEG(3)]2 -SG(10)-Ox 於5mL取樣管(INA・OPTIKA CO.,LTD製)加入了上述步驟1中所合成的化合物(40mg)、2-氯-1,3-二甲基-1H-苯并咪唑-3-鎓-氯化物(伏見製藥所製,17.9mg,0.083mmol)的水溶液(200μl)。對冰冷卻後的反應液加入磷酸三鉀(52.6mg,0.25mmol)的水溶液(200μl),在冰冷卻下攪拌了2小時。將所得到的反應液使用Amicon Ultra(Ultracel 30K,Merck Millipore製)進行超過濾,去除了固形物。以膠體過濾層析純化了該通過液。於裝置使用Purif-Rp2(SHOKO SCIENTIFIC製),於管柱使用HiPrep 26/10 Desalting(GE HEALTHCARE製),於移動相使用0.03%-NH3 水溶液,使流速為10mL/分鐘,使分級容量為10mL。將包含在溶出中被UV檢出(220nm)之目的物的區分收集成一個,加入1N氫氧化鈉水溶液(33μl,0.033mmol)而進行冷凍乾燥,獲得了目的物(34mg)。
實施例6:產生小鼠抗CLDN6抗體B1的融合瘤(218B1)及產生小鼠抗CLDN6抗體C7的融合瘤(218C7) 6-1.小鼠的免疫與融合瘤之取得 1-1)用於小鼠免疫之細胞的準備 於將2×106 個或者5×106 個NOR-P1細胞(人類胰臟癌細胞株,RIKEN RCB-2139)以RPMI-1640(Roswell Park Memorial Institute-1640)10%FBS(胎牛血清)(+)培養基(10ml或者20ml)培養5天後進行回收,以PBS(磷酸緩衝生理食鹽水)清洗2次,再懸浮於PBS(300μl)中。
1-2)對小鼠的免疫 對BALB/c小鼠(12週齡),第1~5次的免疫係以約1週間隔將NOR-P1細胞(2×106 個)對腹腔內進行了免疫。於第5次的免疫起約2週後,將NOR-P1細胞(5×106 個)對腹腔內進行了免疫。於第6次的免疫起約3週後,將NOR-P1細胞(2×106 個)對腹腔內進行了免疫。第8~10次係以約2週間隔將2×106 個NOR-P1細胞對腹腔內進行了免疫。在第10次的約3週後(第11次)及其3日後(第12次,最後免疫),係將5×106 個NOR-P1細胞對腹腔內進行了免疫。脾臟細胞係於最後免疫起3日後摘除了。
1-3)經免疫之小鼠的脾臟細胞的準備 摘除已完成免疫之小鼠的脾臟,磨碎而懸浮於RPMI1640 10%FBS(+)培養基。將細胞懸浮液送入了細胞過濾器(70μm,BD Falcon社)之後,以1500rpm於室溫離心5分鐘而廢棄了上清液。加入Tris-NH4 Cl溶液(20mM Tris-HCl pH7.2,77.6mM NH4 Cl,20mL),在室溫處理了5分鐘。加入PBS(20mL),以1500rpm於室溫離心了5分鐘。於廢棄了上清液之後,加入了RPMI1640 FBS(+)培養基(10ml)。
1-4)骨髓瘤細胞的準備 於將P3U1細胞(小鼠骨髓瘤細胞株)以RPMI1640 FBS(+)培養基培養了5天之後進行回收,再懸浮於RPMI1640 FBS(+)培養基(20ml)。
1-5)細胞融合 將脾臟細胞與骨髓瘤細胞以成為5:1的方式進行混合,以1500rpm於室溫離心了5分鐘。於以RPMI1640 FBS(-)培養基(10ml)清洗了2次之後,使進行了離心分離(1500rpm,5分鐘)。所得到的沈澱劃分之細胞群充分散開了之後,一邊攪拌一邊花費約1分鐘而徐徐地加入了聚乙二醇-1500(PEG-1500,1ml)。於攪拌了3分30秒鐘之後,在室溫靜置了30秒鐘。然後,對該細胞液花費1分鐘而加入了RPMI培養基10%低IgG胎牛血清(+)(10ml)。將該細胞懸浮液離心分離(1500rpm,5分鐘),徐緩地使所得到的沈澱劃分之細胞散開了之後,徐緩地懸浮於HAT培養基(包含10%低IgG胎牛血清、HAT培養基添加劑、5%BriClone的RPMI1640培養基,200ml)中。將該懸浮液對96孔培養用盤各分注200μl/孔,在37℃、5%CO2 的培養箱中培養了6天。
1-6)融合瘤的篩選/探針的準備 以抗體的內化及免疫毒素活性之測定為目的而製作了為重組複合蛋白質的DT3C。此DT3C係以基因工程融合了白喉毒素(DT)的觸媒區與鏈球菌G蛋白的抗體結合區之蛋白質。DT3C係與抗體的Fc部分特異性地結合,若被併入細胞內則藉由蛋白質合成抑制而誘導細胞死亡。可藉由使用此系統而同時觀察抗體的內化與免疫毒素所致殺細胞效果(Yamaguchi, M. et al., Biochemical and  Biophysical Research Communications 454 (2014) 600-603)。
1-7)利用DT3C之融合瘤的篩選 將4μg/ml的DT3C(25μl)加入96孔盤中,進一步加入步驟1-5中所取得之融合瘤的培養上清液(25μl),在室溫培養了30分鐘。接種2×105 個/ml(RPMI培養基10%低IgG胎牛血清(+))的NOR-P1細胞(50μl),在37℃ CO2 培養箱培養了3天。藉由培養後的顯微鏡觀察,而判定了下述之孔為陽性:顯示了使用陰性對照抗體之際的附著細胞數之約25%以下的附著細胞數。經選取之殖株係進行1~2次次選殖(subcloning),樹立了8株單株的融合瘤細胞株。
6-2:融合瘤所產生之抗體會結合之抗原的鑑定 針對實施例6-1中所調製之融合瘤所產生之抗體之中2個殖株218B1及218C7進行了抗原的鑑定。 2-1)使用了經生物素標識之細胞表面蛋白質的218B1抗體及218C7抗體的免疫沉澱 去除2×106 個NTERA-2細胞(人類睾丸癌細胞株,ATCC CRL-1973)的培養上清液,以PBS清洗了2次。將EZ-Link Sulfo-NHS-生物素(Thermo Fisher SCIENTIFIC公司)以0.1mg/ml的濃度懸浮於PBS。於去除了PBS之後,加入生物素/PBS溶液,在振盪器上培養了30分鐘之後,以100mM甘胺酸/PBS溶液(25ml)清洗2次,然後,以PBS(10ml)清洗了1次。將清洗後的細胞再懸浮於200μl的溶解緩衝液(150mM氯化鈉、50mM Tris-HCl pH7.4、1%DDM、蛋白酶抑制劑,Complete EDTA free(Roche公司)1粒/50ml)中,在4℃處理了30分鐘。進行離心分離(13000rpm,20分鐘,4℃)而調製了細胞溶解液。對細胞溶解液加入將G蛋白瓊脂糖凝膠(Protein G Sepharose)(Protein G Sepharose 4 Fast Flow(GE Healthcare公司))的緩衝液取代為溶解緩衝液而得到的G蛋白瓊脂糖凝膠/溶解緩衝液(50%漿液,30μl),在4℃旋轉了30分鐘之後,在4℃離心1分鐘,回收了上清液。對此上清液加入218B1抗體或是218C7抗體(約3μg),在4℃旋轉了30分鐘之後加入G蛋白瓊脂糖凝膠/溶解緩衝液(50%漿液,60μl),在4℃旋轉了1小時。以溶解緩衝液(1ml)清洗了G蛋白瓊脂糖凝膠6次之後,再懸浮於1×SDS樣品緩衝液(BioRad公司)。在100℃處理了懸浮液5分鐘之後,回收溶液,作成了SDS-PAGE(聚丙烯醯胺凝膠電泳)用的樣品。
2-2)SDS-PAGE及西方印漬術 將2-1)中調製的SDS-PAGE樣品使用SuperSep Ace 5-20%(Wako公司)而以50mV疊加了30分鐘之後,以200mV進行了泳動1小時之後,自凝膠對膜以12mV進行了47分鐘印漬。以PBS-T(PBS(-)-0.02% Tween 20)清洗了膜之後,進行了1小時阻斷。於將膜以PBS-T進行了3次5分鐘清洗之後,使與鏈親和素-山葵過氧化酶結合物(Streptavidin-horseradish peroxidase conjugate)(GE Healthcare公司,以PBS-T稀釋為2000倍而使用)進行了1小時反應。於將膜以PBS-T進行了2次5分鐘清洗之後,使用增強化學螢光(enhanced chemiluminecscence,ECL)法而檢出了目的之條帶。於使用了218B1抗體及218C7抗體的的任一情形,都與有無DTT的添加無關,而有分子量18kDa的條帶被檢出。
2-3)使用了細胞蛋白質的218B1抗體及218C7抗體的免疫沉澱產物之質量分析 回收2×107 個NTERA-2細胞,以PBS清洗了2次。使用細胞刮刀(cell scraper)來回收細胞,以1500rpm離心了5分鐘。於去除了上清液之後,再懸浮於2ml的溶解緩衝液中,在4℃處理了30分鐘。進行離心分離(13000rpm,20分鐘,4℃)而調製了細胞溶解液。對細胞溶解液加入G蛋白瓊脂糖凝膠/溶解緩衝液(50%漿液,180μl),在4℃旋轉了30分鐘之後,在4℃離心1分鐘,回收了上清液。對此上清液加入218B1抗體(約9μg),在4℃旋轉了30分鐘之後,加入G蛋白瓊脂糖凝膠/溶解緩衝液(50%漿液,180μl),在4℃旋轉了1小時。以溶解緩衝液(1ml) G蛋白瓊脂糖凝膠清洗了6次之後,再懸浮於1×SDS樣品緩衝液。在100℃處理了懸浮液5分鐘之後,回收溶液,作成了SDS-PAGE用的樣品。以與2-2)同樣的方法進行SDS-PAGE,將泳動凝膠進行了CBB染色。從泳動凝膠切出相當於18kDa的部分,用於質量分析。質量分析的結果,判明了該凝膠片包含密連蛋白-6。
2-4)FACS解析 由於從質量分析已預測到218B1抗體及218C7抗體之抗原為密連蛋白-6,因此進行了藉由cDNA之基因導入的強制表現解析。FACS解析的結果,在人類密連蛋白-6表現CHO-K1細胞,218B1抗體及218C7抗體顯示了強陽性反應,所以表示了218B1抗體及218C7抗體之抗原為密連蛋白-6。
2-5)從融合瘤培養上清液之抗體的純化 將產生小鼠抗CLDN6抗體B1的融合瘤(218B1)及產生小鼠抗CLDN6抗體C7的融合瘤(218C7),以含10%的胎牛血清、Ultra-Low IgG(Thermo Fisher Scientific)的Hybridoma-SFM(Thermo Fisher Scientific)進行了培養。藉由離心來回收培養上清液,以0.45μm的過濾器(Corning公司製)進行了過濾。以rProtein A親和性層析(4~6℃下)1階段步驟,從培養上清液純化了抗體。在4~6℃下實施了rProtein A親和性層析純化後的緩衝液取代步驟。在最初,對已填充經以PBS平衡化之MabSelectSuRe(GE Healthcare Bioscience公司製)的管柱導入了培養上清液。培養液全部進到管柱之後,以管柱容量2倍以上的PBS清洗了管柱。接著以2M精胺酸鹽酸鹽溶液(pH4.0)進行溶出,收集了包含抗體的劃分。將該劃分藉由透析(Thermo Scientific公司,Slide-A-Lyzer Dialysis Cassette)而進行了對PBS(-)的液取代。在最後以Centrifugal UF Filter Device VIVASPIN20(分級分子量UF10K,Sartorius公司,4℃下)進行濃縮,將IgG濃度調製為1mg/mL以上。以Minisart-Plus filter(Sartorius公司)進行過濾,作成了純化樣品。
實施例7:小鼠抗CLDN6抗體B1及C7的活體外評價 7-1:利用流動式細胞測量術之小鼠抗CLDN6抗體的結合能力評價 藉由流動式細胞測量術法評價了實施例6中所製作之小鼠抗CLDN6抗體的人類CLDN6及家族分子CLDN3、CLDN4、CLDN9結合性。使用Lipofectamine 2000(Thermo Fisher Scientific),將自Origene公司所購入的human CLDN3/pCMV6-Entry、human CLDN4/pCMV6-Entry、 human CLDN6/pCMV-Entry、human CLDN9/pCMV6-Entry、 或pCMV6-Entry暫時性地導入293T細胞(Thermo Fisher Scientific HCL4517),在37℃、5%CO2 的條件下培養了一晩之後,調製了細胞懸浮液。離心經基因導入的293T細胞懸浮液,去除了上清液之後,以終濃度30μg/mL、10μg/mL、3.3μg/mL、 1.1μg/mL加入小鼠抗CLDN6抗體(殖株編號為B1、C7)、或小鼠IgG1對照抗體(R&D Systems)而懸浮,在4℃靜置了1小時。以含5%之胎牛血清(Hyclone)的Dulbecco’s磷酸鹽緩衝液(Sigma-Aldrich)(以下為含5%FBS之PBS)清洗了2次之後,加入以含5%FBS之PBS進行了500倍稀釋的FLUORESCEIN-CONJUGATED GOAT IGG FRACTION TO MOUSE IGG(WHOLE MOLECULE)(MP BIOMEDICALS)而懸浮,在4℃靜置了1小時。以含5%FBS之PBS清洗了2次之後,以流式細胞儀(FC500,Beckman Coulter)進行了檢出。資料解析以FlowJo(TreeStar) 進行。再者,各基因導入的確認,係於將細胞以含0.25%Tween20之PBS進行了滲透處理之後,使用小鼠抗FLAG抗體(Sigma-Aldrich)進行。將結果呈示於圖11。於圖11之圖中,縱軸呈示表示抗體結合量之FITC的螢光強度,橫軸呈示抗體濃度。所製作之小鼠抗CLDN6抗體係與人類CLDN6和人類CLDN9相同程度地結合,對於人類CLDN3、人類CLDN4則並未結合。小鼠對照IgG1對於任一細胞都未結合。
7-2:抗體內化活性 小鼠抗CLDN6抗體B1及C7的內化活性,係使用經結合會抑制蛋白質合成之毒素(皂草素(saporin))的抗小鼠IgG試藥Mab-ZAP(ADVANCED TARGETING SYSTEMS),而進行了評價。此評價中,依賴於小鼠抗CLDN6抗體的內化活性而Mab-ZAP被併入細胞內,會抑制蛋白質合成的皂草素於細胞內被釋放,因此細胞增殖會被抑制。 將為人類CLDN6陽性細胞之人類絨毛膜癌株的JEG-3(ATCC HTB-36)、為人類CLDN6陽性細胞之人類卵巢癌株的NIH:OVCAR-3 (ATCC HTB-161)、或為人類CLDN6陰性細胞之人類胰臟癌株的BxPC-3(ATCC CRL-1687),以2x103 細胞/孔接種於96孔細胞培養用微量盤,而在37℃、5%CO2 的條件下培養了一晩。次日,添加 以終濃度成為1nM的方式將小鼠抗CLDN6抗體、或小鼠IgG1抗體(R&D Systems)與Mab-ZAP(終濃度:0.5nM)、或未結合毒素的AffiniPure Goat Anti-Mouse IgG, Fcγ Fragment Specific (Jackson ImmunoResearch)(終濃度:0.5nM)進行了混合的混合溶液,在37℃、5%CO2 的條件下培養了5天。生存細胞數係以使用了CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay(Promega)的ATP活性之定量進行了測定。抗CLDN6抗體添加所致的細胞增殖抑制作用,係以使混合溶液非添加孔之值為100%的相對生存率求得。將結果呈示於圖12。小鼠抗CLDN6抗體(B1、C7)對於人類CLDN6陽性細胞株JEG-3與NIH:OVCAR-3,係認為有細胞增殖抑制效果。另一方面,對於人類CLDN6陰性細胞株BxPC-3,則不認為有細胞增殖抑制效果。又,小鼠IgG1抗體對於任一細胞株都不認為有細胞增殖抑制效果。此結果,所製作之抗CLDN6抗體(B1、C7)具有內化活性,被認為適合作為抗體-藥物結合物用的抗體。
實施例8:編碼小鼠抗CLDN6抗體B1及C7之可變區之cDNA的核苷酸序列的決定 8-1:編碼B1抗體之可變區之cDNA的核苷酸序列的決定 8-1-1:產生B1抗體的融合瘤之總RNA的調製 為了增幅編碼B1抗體之可變區之cDNA,使用TRIzol Reagent(Ambion社)而自產生B1抗體的融合瘤調製了總RNA。 8-1-2:利用5’-RACE PCR的編碼B1抗體之輕鏈可變區之cDNA的增幅與序列的決定 編碼輕鏈可變區之cDNA的增幅,係使用實施例8-1-1中調製的總RNA之約1μg與SMARTer RACE 5’/3’ Kit(Clontech公司)實施。作為用以將編碼B1抗體之輕鏈基因之可變區之cDNA以PCR進行增幅的引子,係使用了UPM (附屬於Universal Primer A Mix:SMARTer RACE 5’/3’ Kit)、及由公知的小鼠輕鏈的恆定區之序列所設計的引子。 於質體選殖以5’-RACE PCR進行了增幅的編碼輕鏈之可變區之cDNA,接著實施了編碼輕鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列的定序解析。 將所決定的編碼B1抗體之輕鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列呈示於序列識別號18,將胺基酸序列呈示於序列識別號19。 8-1-3:利用5’-RACE PCR的編碼B1抗體之重鏈可變區之cDNA的增幅與序列的決定 編碼重鏈可變區之cDNA的增幅,係使用實施例8-1-1中調製的總RNA之約1μg與SMARTer RACE 5’/3’ Kit(Clontech公司)實施。作為用以將編碼LB1抗體之重鏈基因之可變區之cDNA以PCR進行增幅的引子,係使用了UPM(附屬於Universal Primer A Mix:SMARTer RACE 5’/3’ Kit)、及由公知的小鼠重鏈的恆定區之序列所設計的引子。 於質體選殖以5’-RACE PCR進行了增幅的編碼重鏈之可變區之cDNA,接著實施了編碼重鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列的定序解析。將所決定的編碼B1抗體之重鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列呈示於序列識別號20,將胺基酸序列呈示於序列識別號21。
8-2:編碼C7抗體之可變區之cDNA的核苷酸序列的決定 以與實施例8-1同樣的方法實施。將所決定的編碼C7抗體之輕鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列呈示於序列識別號22,將胺基酸序列呈示於序列識別號23。將編碼重鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列呈示於序列識別號24,將胺基酸序列呈示於序列識別號25。
實施例9:嵌合化抗CLDN6抗體chB1的製作 9-1:嵌合化抗CLDN6抗體chB1的表現載體之構築 9-1-1:嵌合化及人類化輕鏈表現載體pCMA-LK之構築 將以限制酵素XbaI及PmeI消化質體pcDNA3.3-TOPO/LacZ(Invitrogen公司)而得之約5.4kb的片段、與序列識別號26所示之包含編碼人類輕鏈訊息序列及人類κ鏈恆定區之DNA序列的DNA片段,使用In-Fusion HD PCR選殖套組(Clontech公司)來結合,而製作了pcDNA3.3/LK。藉由自pcDNA3.3/LK去除新黴素(neomycin)表現單元而構築了pCMA-LK。 9-1-2:嵌合化及人類化IgG1LALA型重鏈表現載體pCMA-G1LALA之構築 將以XbaI及PmeI消化pCMA-LK而除去了輕鏈訊息序列及人類κ鏈恆定區的DNA片段、與以序列識別號27表示的包含編碼人類重鏈訊息序列及人類IgG1LALA恆定區之DNA序列的DNA片段,使用In-Fusion HD PCR選殖套組(Clontech公司) 來結合,而構築了pCMA-G1LALA。 9-1-3:嵌合化chB1重鏈表現載體之構築 合成了序列識別號33所示之chB1重鏈之核苷酸序列的核苷酸編號36至440所示之DNA片段(GENEART公司)。使用In-Fusion HD PCR選殖套組(Clontech公司),在以限制酵素BlpI剪切了pCMA-G1LALA之處,***所合成的DNA片段,藉此而構築了chB1重鏈表現載體。將chB1重鏈之胺基酸序列呈示於序列識別號32。 9-1-4:嵌合化chB1輕鏈表現載體之構築 合成了序列識別號29所示之包含編碼chB1輕鏈之DNA序列的DNA片段(GENEART公司)。使用In-Fusion HD PCR選殖套組(Clontech公司),將所合成的DNA片段、與以XbaI及PmeI消化pCMA-LK而除去了輕鏈訊息序列及人類κ鏈恆定區的DNA片段結合,藉此而構築了chB1輕鏈表現載體。將chB1輕鏈之胺基酸序列呈示於序列識別號28。
9-2:嵌合化抗CLDN6抗體chB1的生產及純化 9-2-1:嵌合化抗體chB1的生產 FreeStyle 293F細胞(Invitrogen公司)係按照手冊,進行了繼代、培養。將對數增殖期之1.2×109 個FreeStyle 293F細胞(Invitrogen公司)接種於3L Fernbach錐形瓶(CORNING社),以FreeStyle293 expression medium表現培養基(Invitrogen公司)進行稀釋而調製為2.0×106 細胞/mL。對40mL的Opti-Pro SFM培養基(Invitrogen公司)加入0.24mg的重鏈表現載體與0.36mg的輕鏈表現載體與1.8mg的聚伸乙亞胺(Polyscience #24765),而平穩地攪拌,進一步於放置了5分鐘之後,對FreeStyle 293F細胞添加。在37℃、8%CO2 培養箱以90rpm振盪培養4小時後,添加600mL的EX-CELL VPRO培養基(SAFC Biosciences公司)、18mL的GlutaMAX I(GIBCO公司)、及30mL的Yeastolate Ultrafiltrate (GIBCO公司),將在37℃、8%CO2 培養箱以90rpm振盪培養7天而得到的培養上清液,以Disposable Capsule Filter(Advantec #CCS-045-E1H)進行了過濾。將所取得的嵌合化抗CLDN6抗體命名為「chB1」。 9-2-2:嵌合化抗體chB1的純化 以rProtein A親和性層析的1階段步驟,從實施例9-2-1中所得到的培養上清液純化了抗體。對已填充經以PBS平衡化之MabSelectSuRe的管柱(GE Healthcare Bioscience公司製)導入了培養上清液之後,以管柱容量2倍以上的PBS清洗了管柱。接著以2M精胺酸鹽酸鹽溶液(pH4.0)進行溶出,收集了包含抗體的劃分。將該劃分藉由透析(Thermo Scientific公司,Slide-A-Lyzer Dialysis Cassette)而進行了對PBS(-)的緩衝液取代。以Centrifugal UF Filter Device VIVASPIN20(分級分子量UF10K,Sartorius公司)濃縮抗體,將IgG濃度調製為1mg/mL以上。在最後以Minisart-Plus filter(Sartorius公司)進行過濾,作成了純化樣品。
實施例10:人類化抗CLDN6抗體的製作 10-1:抗CLDN6抗體的人類化體設計 10-1-1:嵌合化抗體chB1之可變區的分子模型 chB1之可變區的分子模型係利用了作為同源模型而公知的方法(Methods in Enzymology,203,121-153,(1991))。以對chB1的重鏈與輕鏈之可變區具有高序列相同性之Protein Data Bank中所登錄(Nuc.Acid Res.35,D301-D303(2007))的結構(PDB ID:1XIW)為模板,使用市售的蛋白質立體結構解析程式BioLuminate(Schrodinger公司製)進行。 10-1-2:人類化胺基酸序列的設計 chB1係藉由CDR接枝(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86,10029-10033(1989))而進行了人類化。於Kabat et al.(Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed.Public Health Service National Institutes of Health,Bethesda,MD.(1991))中所既定之人類的gamma鏈亞群1及kappa鏈亞群1的共通序列,由於對chB1的框架區具有高相同性,因此分別被選擇作為重鏈與輕鏈的接受體。應移入至接受體上的供予體殘基,係以由Queen et al.(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86,10029-10033(1989))所賦予之基準等為參考而分析三次元模型,以進行了選擇。再者,由於CDRL3富含疏水性的胺基酸,因此也設計了對CDRL3導入了變異的人類化輕鏈。
10-2:chB1重鏈的人類化 將所設計的3種重鏈命名為hH1、hH2及hH3。將hH1的重鏈全長胺基酸序列記載於序列識別號52。將編碼序列識別號52之胺基酸序列的核苷酸序列記載於序列識別號53。將hH2的重鏈全長胺基酸序列記載於序列識別號56。將編碼序列識別號56之胺基酸序列的核苷酸序列記載於序列識別號57。將hH3的重鏈全長胺基酸序列記載於序列識別號60。將編碼序列識別號60之胺基酸序列的核苷酸序列記載於序列識別號61。
10-3:chB1輕鏈的人類化 將所設計的4種輕鏈命名為hL1、hL2、hL3及hL4。將hL1的輕鏈全長胺基酸序列記載於序列識別號36。將編碼序列識別號36之胺基酸序列的核苷酸序列記載於序列識別號37。將hL2的輕鏈全長胺基酸序列記載於序列識別號40。將編碼序列識別號40之胺基酸序列的核苷酸序列記載於序列識別號41。將hL3的輕鏈全長胺基酸序列記載於序列識別號44。編碼序列識別號44之胺基酸序列的核苷酸序列係記載於序列識別號45。將hL4的輕鏈全長胺基酸序列記載於序列識別號48。將編碼序列識別號48之胺基酸序列的核苷酸序列記載於序列識別號49。
10-4:利用重鏈及輕鏈之組合之人類化抗體的設計 將包含hH1及hL1的抗體稱為「H1L1抗體」或「H1L1」。將包含hH2及hL2的抗體稱為「H2L2抗體」或「H2L2」。將包含hH1及hL3的抗體稱為「H1L3抗體」或「H1L3」。將包含hH2及hL4的抗體稱為「H2L4抗體」或「H2L4」。將包含hH3及hL3的抗體稱為「H3L3抗體」或「H3L3」。
10-5:人類化抗CLDN6抗體的製作 10-5-1:人類化重鏈表現載體之構築 10-5-1-1:hH1表現載體之構築 合成了序列識別號53所示之hH1的核苷酸序列之核苷酸編號36至440所示之DNA片段(GENEART公司)。以與實施例9-1-3同樣的方法構築了hH1表現載體。 10-5-1-2:hH2表現載體之構築 合成了序列識別號57所示之hH2的核苷酸序列之核苷酸編號36至440所示之DNA片段(GENEART公司)。以與實施例9-1-3同樣的方法構築了hH2表現載體。 10-5-1-3:hH3表現載體之構築 合成了序列識別號61所示之hH2的核苷酸序列之核苷酸編號36至440所示之DNA片段(GENEART公司)。以與實施例9-1-3同樣的方法構築了hH3表現載體。 10-5-2:人類化輕鏈表現載體之構築 10-5-2-1:hL1表現載體之構築 合成了序列識別號37所示之hL1的核苷酸序列之核苷酸編號37至402所示之DNA片段(GENEART公司)。使用In-Fusion HD PCR選殖套組(Clontech公司),在以限制酵素BsiWI剪切了pCMA-LK之處,***所合成的DNA片段,藉此而構築了hL1表現載體。 10-5-2-2:hL2表現載體之構築 合成了序列識別號41所示之hL2的核苷酸序列之核苷酸編號37至402所示之DNA片段(GENEART公司)。以與實施例10-5-2-1同樣的方法構築了hL2表現載體。 10-5-2-3:hL3表現載體之構築 合成了序列識別號45所示之hL3的核苷酸序列之核苷酸編號37至402所示之DNA片段(GENEART公司)。以與實施例10-5-2-1同樣的方法構築了hL3表現載體。 10-5-2-4:hL4表現載體之構築 合成了序列識別號49所示之hL4的核苷酸序列之核苷酸編號37至402所示之DNA片段(GENEART公司)。以與實施例10-5-2-1同樣的方法構築了hL4表現載體。 10-5-3:人類化抗體的調製 10-5-3-1:人類化抗體H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、及H3L3的生產 以與實施例9-2-1同樣的方法進行了生產。藉由對應於實施例10-4中所示之重鏈與輕鏈之組合的重鏈表現載體與輕鏈表現載體之組合,而生產了H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、及H3L3。 10-5-3-2:人類化抗體H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、及H3L3的2階段純化 以rProtein A親和性層析與陶瓷氫氧磷灰石的2階段步驟純化了實施例10-5-3-1中所得到的培養上清液。對已填充經以PBS平衡化之MabSelectSuRe的管柱(GE Healthcare Bioscience公司製)導入了培養上清液之後,以管柱容量2倍以上的PBS清洗了管柱。接著以2M精胺酸鹽酸鹽溶液(pH4.0)溶出了抗體。將包含抗體的劃分藉由透析(Thermo Scientific公司,Slide-A-Lyzer Dialysis Cassette)而進行對PBS的緩衝液取代,以5mM磷酸鈉/50mM MES/pH7.0的緩衝液稀釋了5倍之後,導入了以5mM NaPi/50mM MES/30mM氯化鈉/pH7.0的緩衝液進行了平衡化的陶瓷氫氧磷灰石管柱(日本Bio-Rad,Bio-Scale CHT Type-1 Hydroxyapatite Column)。實施藉由氯化鈉之直線性濃度梯度溶出,收集了包含抗體的劃分。將該劃分藉由透析(Thermo Scientific公司,Slide-A-Lyzer Dialysis Cassette)而進行了對HBSor(25mM組胺酸/5%山梨糖醇,pH6.0)的緩衝液取代。以Centrifugal UF Filter Device VIVASPIN20(分級分子量UF10K,Sartorius公司)濃縮抗體,將IgG濃度調製為50mg/mL。在最後以Minisart-Plus filter(Sartorius公司)進行過濾,作成了純化樣品。
實施例11:利用流動式細胞測量術之人類化抗CLDN6抗體的結合能力評價 藉由流動式細胞測量術法來評價了實施例10中所製作之人類化抗CLDN6抗體的人類CLDN6及家族分子CLDN3、CLDN4、CLDN9結合性。使用了以與實施例7-1同樣的手法經暫時性地基因導入的293T細胞。對導入了人類CLDN6或人類CLDN9基因之細胞,係以終濃度100nM、20nM、4nM、0.8nM加入人類化抗CLDN6抗體H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、及H3L3、或人類IgG1對照抗體(CALBIOCHEM)而懸浮,在4℃靜置了30分鐘。對導入了人類CLDN3、人類CLDN4基因、或空的載體之細胞,係以終濃度100nM加入人類化抗CLDN6抗體H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、及H3L3而懸浮,在4℃靜置了30分鐘。以含5%之胎牛血清(Hyclone)的Dulbecco’s磷酸鹽緩衝液(Sigma-Aldrich)(以下為含5%FBS之PBS)進行了清洗之後,加入以含5%FBS之PBS進行了150倍稀釋的FITC AffiniPureF(ab’)2 Fragment Goat Anti-Human IgG(H+L) (Jackson ImmunoResearch)而懸浮,在4℃靜置了30分鐘。以含5%FBS之PBS進行了清洗之後,以流式細胞儀(FC500;Beckman Coulter)進行了檢出。資料解析以FlowJo(TreeStar)進行,算出了顯示抗體的結合量之FITC的平均螢光強度(MFI)。將結果呈示於圖13。於圖13之圖中,橫軸呈示抗體濃度,縱軸呈示MFI。所製作之人類化抗CLDN6抗體係與人類CLDN6和人類CLDN9相同程度地結合,對於人類CLDN3、人類CLDN4則並未結合。人類對照IgG1對於任一細胞都未結合。
〔糖鏈重塑抗體的調製〕 實施例12:糖鏈轉換1(T-SG)
Figure 02_image123
步驟1:(Fucα1,6)GlcNAc-曲妥珠單抗的調製 將參考例3中調製的曲妥珠單抗溶液22mg/mL的(25mM組胺酸溶液(pH6.0)、5%山梨糖醇溶液)(45.5mL)使用共通操作C,而分二次進行了對50mM磷酸緩衝液(pH6.0)的緩衝液交換。對所得到的28.1mg/mL的曲妥珠單抗溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0)(18mL)與28.0mg/mL的相同溶液(18mL),各自加入1.26mL、1.27mL 的2.0mg/mL野生型EndoS溶液(PBS),在37℃保溫了4小時。使用Experion電泳站(BIO-RAD製)來確認了反應的進行狀況。反應結束後,按照以下的方法,進行了利用親和性層析之純化與利用氫氧磷灰石管柱之純化。
(1)利用親和性層析之純化 純化裝置:AKTA pure150(GE HEALTHCARE製) 管柱:HiTrap rProtein A FF(5mL)(GE HEALTHCARE製) 流速:5mL/分鐘(進料時為1.25mL/分鐘) 將上述所得反應液分複數次進行了純化。管柱係2連結,對管柱的結合時,係對管柱上部添加反應液,將結合緩衝液(20mM磷酸緩衝液(pH6.0))以1.25mL/分鐘通入2CV,進而以5mL/分鐘通入了5CV。中間清洗時係通入了15CV清洗溶液(20mM磷酸緩衝液(pH7.0)、0.5M氯化鈉溶液)。溶出時係通入了6CV溶出緩衝液(ImmunoPure IgG溶析緩衝液,PIERCE製)。將溶出液以1M Tris緩衝液(pH9.0)立即進行了中和。針對在溶出中被UV檢出(280nm)之區分,使用微量分光光度計Xpose(Trinean製)、及Experion電泳站(BIO-RAD製)來進行了確認。將包含目的物的區分,使用共通操作C,而進行了對5mM磷酸緩衝液50mM 2-
Figure 109110172-A0304-12-0020-6
啉基乙磺酸(MES)溶液(pH6.8)的緩衝液交換。
(2)利用氫氧磷灰石層析之純化 純化裝置:AKTA avant25(GE HEALTHCARE製) 管柱:Bio-Scale Mini CHT Type I匣筒(5mL)(BIO-RAD製) 流速:5mL/分鐘(進料時為1.25mL/分鐘) 將管柱2連結,將上述(1)中所得到的溶液分複數次進行了純化。對管柱的上部添加溶液,將A液(5mM磷酸緩衝液50mM-
Figure 109110172-A0304-12-0020-6
啉基乙磺酸(MES)溶液(pH6.8))以1.25mL/分鐘通入2CV,進而以5mL/分鐘通入了3CV。然後,使用A液及B液(5mM磷酸緩衝液50mM-
Figure 109110172-A0304-12-0020-6
啉基乙磺酸(MES)溶液(pH6.8)、2M氯化鈉溶液)進行了溶出。溶出條件為A液:B液=100:0~0:100(15CV)。進一步通入了5CV清洗溶液(500mM磷酸緩衝液(pH6.5))。 將包含目的物的區分,使用共通操作C而進行緩衝液交換,獲得了25.5mg/mL的(Fucα1,6)GlcNAc-曲妥珠單抗溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(35mL)。
步驟2:曲妥珠單抗[SG-(N3 )2 ]2 的調製 對上述步驟1中所得到的23.9mg/mL(Fucα1,6)GlcNAc-曲妥珠單抗溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(3.37mL),加入實施例5步驟2中所合成的化合物(12.9mg)的50mM磷酸緩衝液(pH6.0)溶液(0.258mL)、4.90mg/mL的EndoS D233Q/Q303L溶液(PBS)(0.328mL),在30℃保溫了4.5小時。將以下的操作進行了2批。使用Experion電泳站(BIO-RAD製)來確認了反應的進行狀況。反應結束後,與上述步驟1同樣地進行了利用親和性層析之純化與利用氫氧磷灰石層析之純化之後,將包含目的物的區分,使用共通操作C,而對磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)進行緩衝液交換,獲得了10.0mg/mL的曲妥珠單抗[SG-(N3 )2 ]2 溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0))(15.5mL)。
實施例13:糖鏈轉換2(T-MSG)
Figure 02_image125
步驟1:曲妥珠單抗[MSG-N3 ]2 將以下的操作進行了5批。使用實施例12步驟1中所得到的化合物(20mg/mL,15.0mL),而使用實施例4步驟4中所得到的化合物(25.5mg)作為糖鏈供予體,在30℃保溫3小時,進行了與實施例12步驟2同樣的操作。合併5批,而獲得了1 4.4mg/mL曲妥珠單抗[MSG-N3 ]2 溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0))(93.5mL)。
實施例14:糖鏈轉換3(T-MSG1)
Figure 02_image127
步驟1:曲妥珠單抗[MSG1-N3 ]2 將以下的操作進行了2批。使用實施例12步驟1中所得到的化合物(25.5mL,7.8mL),而使用實施例3步驟4中所得到的化合物(25.5mg)作為糖鏈供予體,在30℃保溫3小時,進行了與實施例12步驟2同樣的操作。合併2批,而獲得了10.6mg/mL 曲妥珠單抗[MSG1-N3 ]2 溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0))(31mL)。
實施例15:糖鏈轉換4(CLDN6-MSG1(H1L1))
Figure 02_image129
步驟1:(Fucα1,6)GlcNAc-抗CLDN6抗體(H1L1) 使用實施例10中調製的抗CLDN6抗體(H1L1)溶液ca.37.7mg/mL(25mM組胺酸溶液(pH6.0)、5%山梨糖醇溶液)(2.5mL),進行與實施例12步驟1同樣的操作,獲得了19.2mg/mL的(Fucα1,6)GlcNAc-抗CLDN6抗體(H1L1)溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(4.8mL)。
步驟2:抗CLDN6抗體(H1L1)-[MSG1-N3 ]2 使用上述步驟1中所得到的19.2mg/mL (Fucα1,6) GlcNAc-抗CLDN6(H1L1)抗體溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(4.8mL),而使用實施例3步驟4中所得到的化合物(25.5mg)作為糖鏈供予體,進行與實施例12步驟2同樣的操作,藉此而獲得了10.2mg/mL抗CLDN6抗體(H1L1)-[MSG1-N3 ]2 溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0))(7.2mL)。
實施例16:糖鏈轉換5(CLDN6-MSG1(H2L2)) 步驟1:(Fucα1,6)GlcNAc-抗CLDN6抗體(H2L2) 使用實施例10中調製的抗CLDN6抗體(H2L2)溶液ca.20mg/mL(25mM組胺酸溶液(pH6.0)、5%山梨糖醇溶液)(6mL),進行與實施例12步驟1同樣的操作,獲得了21.84mg/mL的(Fucα1,6)GlcNAc-抗CLDN6抗體(H2L2)溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(5.7mL)。
步驟2:抗CLDN6抗體(H2L2)-[MSG1-N3 ]2 使用上述步驟1中所得到的21.8mg/mL (Fucα1,6) GlcNAc-抗CLDN6(H2L2)抗體溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(5.7mL),而使用實施例3步驟4中所得到的化合物(25.5mg)作為糖鏈供予體,進行與實施例12步驟2同樣的操作,藉此而獲得了10.2mg/mL抗CLDN6抗體(H2L2)-[MSG1-N3 ]2 溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0))(11.1mL)。
實施例17:糖鏈轉換6(CLDN6-MSG1(H1L3)) 步驟1:(Fucα1,6)GlcNAc-抗CLDN6抗體(H1L3) 使用實施例10中調製的抗CLDN6抗體(H1L3)溶液ca.39.4mg/mL(25mM組胺酸溶液(pH6.0)、5%山梨糖醇溶液)(3mL),進行與實施例12步驟1同樣的操作,獲得了39.2mg/mL的(Fucα1,6)GlcNAc-抗CLDN6抗體(H1L3)溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(4.5mL)。
步驟2:抗CLDN6抗體(H1L3)-[MSG1-N3 ]2 使用上述步驟1中所得到的39.2mg/mL (Fucα1,6) GlcNAc-抗CLDN6(H1L3)抗體溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(4.5mL),而使用實施例3步驟4中所得到的化合物(25.5mg)作為糖鏈供予體,進行與實施例12步驟2同樣的操作,藉此而獲得了9.83mg/mL抗CLDN6抗體(H1L3)-[MSG1-N3 ]2 溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0))(7.2mL)。
實施例18:糖鏈轉換7(TROP2-MSG1) 步驟1:(Fucα1,6)GlcNAc-抗Trop2抗體 使用參考例2中調製的抗Trop2抗體溶液ca.20mg/mL (25mM組胺酸溶液(pH6.0)、5%山梨糖醇溶液)(6mL),進行與實施例12步驟1同樣的操作,獲得了21.69mg/mL的(Fucα1,6)GlcNAc-抗Trop2抗體溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(3.3mL)。
步驟2:抗Trop2抗體-[MSG1-N3 ]2 使用上述步驟1中所得到的21.69mg/mL (Fucα1,6)GlcNAc-抗Trop2抗體溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(3.35mL),而使用實施例3步驟4中所得到的化合物(25.5mg)作為糖鏈供予體,進行與實施例12步驟2同樣的操作,藉此而獲得了10.3mg/mL的抗Trop2抗體-[MSG1-N3 ]2 溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0))(6.4mL)。
〔ADC之合成〕 於實施例19~23呈示ADC1~ADC6的調製方法。實施例19~23的反應式中之R基,係任一者皆為下式所示者。
Figure 02_image131
(實施例19~23各自的步驟1中所得之化合物,係如上述式所示地具有***環的幾何異構物,且混合而保有由作為上述R所示之2種類的結構構成的藥物連接子。)
實施例19:ADC1
Figure 02_image133
步驟1:抗體與藥物連接子的結合 對實施例15步驟2中所得到的抗體的磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)溶液(10.2mg/mL,2.50mL),於室溫加入1,2-丙二醇(2.29mL)、含10mM實施例2-1步驟13中所得到的化合物(3-14)的二甲基亞碸溶液(0.206mL,相對於抗體1分子為12當量),使用試管旋轉器(MTR-103,AS ONE CORPORATION),於室溫使反應進行了48小時。 純化操作:將上述溶液使用共通操作D進行純化,獲得了14.5mL含有目的之化合物的溶液。 特性評價:使用共通操作E、F而獲得了下述之特性值。 抗體濃度:1.54mg/mL;抗體產量:22.3mg(89%);抗體每一分子的藥物平均結合數(n):1.9
實施例20:ADC2
Figure 02_image135
步驟1:抗體與藥物連接子的結合 對實施例14步驟1中所得到的抗體的磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)溶液(10.2mg/mL,1.00mL),於室溫加入1,2-丙二醇(0.917mL)、含10mM實施例2-1步驟13中所得到的化合物(3-14)的二甲基亞碸溶液(0.0825mL,相對於抗體1分子為12當量),使用試管旋轉器(MTR-103,AS ONE CORPORATION),於室溫使反應進行了2天。 純化操作:將上述溶液使用共通操作D進行純化,獲得了6.00mL含有目的之化合物的溶液。 特性評價:使用共通操作E、F而獲得了下述之特性值。 抗體濃度:1.41mg/mL;抗體產量:8.45mg(85%);抗體每一分子的藥物平均結合數(n):1.9
實施例21:ADC3
Figure 02_image137
步驟1:抗體與藥物連接子的結合 對實施例18步驟2中所得到的抗體的磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)溶液(10mg/mL,1.00mL),於室溫加入1,2-丙二醇(0.917mL)、含10mM實施例2-1步驟13中所得到的化合物(3-14)的二甲基亞碸溶液(0.0825mL,相對於抗體1分子為12當量),使用試管旋轉器(MTR-103,AS ONE CORPORATION),於室溫使反應進行了2天。 純化操作:將上述溶液使用共通操作D進行純化,獲得了6.00mL含有目的之化合物的溶液。 特性評價:使用共通操作E、F而獲得了下述之特性值。 抗體濃度:1.47mg/mL;抗體產量:8.8mg(88%);抗體每一分子的藥物平均結合數(n):1.9
實施例22:ADC4
Figure 02_image139
步驟1:抗體與藥物連接子的結合 對實施例16步驟2中所得到的抗體的磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)溶液(9.96mg/mL,2.50mL),於室溫加入1,2-丙二醇(2.29mL)、含10mM實施例2-1步驟13中所得到的化合物(3-14)的二甲基亞碸溶液(0.206mL,相對於抗體1分子為12當量),使用試管旋轉器(MTR-103,AS ONE CORPORATION),於室溫使反應進行了48小時。 純化操作:將上述溶液使用共通操作D進行純化,獲得了14.5mL含有目的之化合物的溶液。 特性評價:使用共通操作E、F而獲得了下述之特性值。 抗體濃度:1.52mg/mL;抗體產量:22.0mg(88%);抗體每一分子的藥物平均結合數(n):1.9
實施例23:ADC5
Figure 02_image141
步驟1:抗體與藥物連接子的結合 對實施例17步驟2中所得到的抗體的磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)溶液(9.83mg/mL,2.50mL),於室溫加入1,2-丙二醇(2.29mL)、含10mM實施例2-1步驟13中所得到的化合物(3-14)的二甲基亞碸溶液(0.206mL,相對於抗體1分子為12當量),使用試管旋轉器(MTR-103,AS ONE CORPORATION),於室溫使反應進行了48小時。 純化操作:將上述溶液使用共通操作D進行純化,獲得了14.5mL含有目的之化合物的溶液。 特性評價:使用共通操作E、F而獲得了下述之特性值。 抗體濃度:1.45mg/mL;抗體產量:21.0mg(84%);抗體每一分子的藥物平均結合數(n):1.9
〔吡咯并苯二氮呯衍生物之合成〕 實施例24:吡咯并苯二氮呯衍生物A 按照下述之流程圖來合成了藥物1。
Figure 02_image143
步驟1:化合物7-1 使實施例1-1步驟5中所得到的化合物(1-6)(4.59g,8.15mmol),與實施例2-1步驟9同樣地進行反應,獲得了目的物(7-1)(4.86g,92%)。 MS(APCI、ESI)m/z:647(M+H)+
步驟2:化合物7-2 使上述步驟1中所得到的化合物(7-1)(4.86g,7.51mmol),與實施例1-1步驟7同樣地進行反應,獲得了目的物(7-2)(3.42g,86%)。 MS(APCI、ESI)m/z:533(M+H)+
步驟3:化合物7-3 使上述步驟2中所得到的化合物(7-2)(6.68g,12.5mmol),與實施例1-1步驟8同樣地進行反應,獲得了目的物(7-3)(6.44g,97%)。 MS(APCI、ESI)m/z:531(M+H)+
步驟4:化合物7-4 使上述步驟3中所得到的化合物(7-3)(3.24g,6.10mmol),與實施例1-1步驟9同樣地進行反應,獲得了目的物(7-4)(3.86g,98%)。 MS(APCI、ESI)m/z:645(M+H)+
步驟5:化合物7-5 使上述步驟4中所得到的化合物(7-4)(4.49g,6.96mmol),與實施例1-1步驟10同樣地進行反應,獲得了目的物(7-5)(3.24g,95%)。 MS(APCI、ESI)m/z:489(M+H)+
步驟6:化合物7-6 使上述步驟5中所得到的化合物(7-5)(0.080g,0.164mmol),與實施例2-1步驟10同樣地進行反應,獲得了目的物(7-6)(0.160g,98%)。 MS(APCI、ESI)m/z:993(M+H)+
步驟7:化合物7-7 使上述步驟6中所得到的化合物(7-6)(160mg,0.161mmol),與實施例2-1步驟11同樣地進行反應,獲得了目的物(7-7)(141mg,定量的)。 MS(APCI、ESI)m/z:879(M+H)+
步驟8:(11a’S)-7’-甲氧基-8’-[(5-{[(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基]氧基}戊基)氧基]-1’,11a’-二氫-5’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-5’-酮(7-8) 使上述步驟7中所得到的化合物(7-7)(141mg,0.161mmol),與實施例2-1步驟12同樣地進行反應,獲得了目的物(7-8)(109.8mg,99%)。1 H-NMR(DMSO-D6 )δ:7.92-7.91(1H,m),7.45(1H,s),7.39-7.37(2H,m),7.33(1H,s), 7.29(1H,s),6.92-6.89(2H,m),6.85(1H,s),6.56-6.54(1H,m), 6.31(1H,s),4.19-4.12(2H,m),4.05-3.99(1H,m),3.95-3.93(2H,m),3.82-3.79(4H,m),3.76(3H,s),3.66(3H,s),3.52-3.46(3H,m),3.30-3.21(2H,m),2.78-2.74(1H,m),2.45-2.42(1H,m),2.06-2.05(1H,m),1.89-1.82(4H,m),1.60-1.58(2H,m),0.80-0.63(4H,m). MS(APCI、ESI)m/z:693(M+H)+
實施例27:吡咯并苯二氮呯衍生物B
Figure 02_image145
步驟1:化合物8-1 對實施例2-4步驟1中所得到的化合物(6-2)(6.49g,14.7mmol)的四氫呋喃(147mL)溶液,在0℃加入硼氫化鋰(0.642g,29.5mmol),在室溫攪拌了2小時。對反應溶液加入1當量鹽酸,以乙酸乙酯進行了萃取。以飽和食鹽水清洗所得到的有機層,以硫酸鎂進行了乾燥之後,進行了減壓蒸餾。所得到的殘渣(6.94g,定量的)不純化而在下個步驟使用。 MS(APCI、ESI)m/z:413(M+H)+
步驟2:化合物8-2 使上述步驟1中所得到的化合物(8-1)(4.50g,11.0mmol),與實施例1步驟8同樣地進行反應,獲得了目的物(8-2)(1.94g,43%)。 MS(APCI、ESI)m/z:411(M+H)+
步驟3:化合物8-3 對上述步驟2中所得到的化合物(8-2)(1.94g,4.73mmol)的四氫呋喃(25mL)、乙酸乙酯(25mL)、甲醇(25mL)的混合溶液,於氮氣體環境下,加入了5%鈀碳(54%水分,1.0g)之後,將反應溶液於氫氣體環境下,於室溫攪拌了22小時。將反應溶液進行了矽藻土過濾之後,減壓蒸餾了濾液。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=80:20(v/v)~0:100(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(8-3)(1.20g,93%)。 MS(APCI、ESI)m/z:275(M+H)+
步驟4:化合物8-4 使實施例24步驟5中所得到的化合物(7-5)(0.300g,0.614mmol),與實施例2-1步驟2同樣地進行反應,獲得了目的物(8-4)(0.388g,99%)。 MS(APCI、ESI)m/z:639[81 Br,(M+H)+ ],637[79 Br, (M+H)+ ].
步驟5:化合物8-5 使上述步驟4中所得到的化合物(8-4)(0.203g, 0.318mmol)和上述步驟3中所得到的化合物(0.131g,0.478mmol),與實施例2-1步驟10同樣地進行反應,獲得了目的物(8-5)(0.0880g,33%)。 MS(APCI、ESI)m/z:831(M+H)+
步驟6:化合物8-6 使上述步驟5中所得到的化合物(8-5)(0.0880g,0.106mmol),與實施例2-1步驟11同樣地進行反應,獲得了目的物(8-6)(0.0500g、66%)。 MS(APCI、ESI)m/z:717(M+H)+
步驟7:(11a’S)-7’-甲氧基-8’-[(5-{[(11a’S)-7’-甲氧基-5’-側氧-5’,11a’-二氫-1’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-8’-基]氧基}戊基)氧基]-1’,10’,11’,11a’-四氫-5’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-5’-酮(8-7) 使上述步驟6中所得到的化合物(8-6)(0.0500g、0.0698mmol)與實施例2-1步驟12同樣地進行反應,獲得了目的物(8-7)(0.0330g,77%)。1 H-NMR(CDCl3 )δ:7.80(1H,m),7.58(1H,s),7.52(1H,s), 6.81(1H,s),6.05(1H,s),4.17-3.97(5H,m),3.94(3H,s),3.87 (1H,m),3.84(3H,s),3.72-3.68(3H,m),3.51-3.45(5H,m), 2.54-2.51(1H,m),2.03-1.90(6H,m),1.75-1.68(2H,m), 0.66(8H,m). MS(APCI、ESI)m/z:615(M+H)+
實施例28:吡咯并苯二氮呯衍生物C
Figure 02_image147
步驟1:化合物(9-1) 使實施例2-1步驟1中所得到的化合物(3-2)(5.00g,9.66mmol)與實施例2-1步驟3同樣地進行反應,獲得了目的物(9-1)(3.95g,100%)。 MS(APCI,ESI)m/z:409(M+H)+
步驟2:化合物(9-2) 對上述步驟1中所得到的化合物(9-1)(3.95g,9.67mmol)的二氯甲烷(97mL)溶液,加入咪唑(1.65g,24.2mmol)、三異丙基氯矽烷(2.46mL,11.6mmol)與二甲基甲醯胺(5mL),在室溫攪拌了21小時。對反應溶液加入水,以氯仿進行萃取,以水清洗所得到的有機層,進行了減壓蒸餾。以矽膠管柱層析[己烷:乙酸乙酯=100:0(v/v)~20:80(v/v)]純化所得到的殘渣,獲得了目的物(9-2)(4.78g,87%)。 MS(APCI,ESI)m/z:565(M+H)+
步驟3:化合物(9-3) 使上述步驟2中所得到的化合物(9-2) (4.78g,8.43mmol),與實施例2-1步驟4同樣地進行反應,獲得了目的物(9-3)(2.36g,50%)。 MS(APCI,ESI)m/z:563(M+H)+
步驟4:化合物(9-4) 使上述步驟3中所得到的化合物(9-3)(1.53g,2,72mmol)與實施例2-1步驟5同樣地進行反應,獲得了目的化合物(9-4)(1.27g,69%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.31(2H,s),7.15(1H,m),5.52 (1H,m),4.65(1H,m),4.57(1H,m),3.95-3.89(1H,m),3.87 (3H,s),3.75-3.58(2H,m),3.18-3.14(1H,m),1.33-1.25 (3H,m),1.10(18H,m),1.00-0.96(2H,m),0.03(9H,s).
步驟5:化合物(9-5) 使上述步驟4中所得到的化合物(9-4)(0.519g,0.747mmol),與實施例2-1步驟6同樣地進行反應,獲得了目的化合物(9-5)(0.511g,定量的)。 MS(APCI,ESI)m/z:653[(M+H)+]
步驟6:化合物(9-6) 使上述步驟5中所得到的化合物(9-5) (0.178g,0.272mmol),與實施例2-1步驟7同樣地進行反應,獲得了目的化合物(9-6)(0.094g,68%)。 MS(APCI,ESI)m/z:507[(M+H)+]
步驟7:化合物(9-7) 使用上述步驟6中所得到的化合物(9-6) (0.063g,0.124mmol),與實施例2-1步驟8同樣地進行反應,獲得了目的化合物(9-7)(0.046g,72%)。 MS(APCI,ESI)m/z:509[(M+H)+]
步驟8:化合物(9-8) 使用上述步驟7中所得到的化合物(10-7) (0.046g,0.090mmol),與實施例2-1步驟9同樣地進行反應,獲得了目的化合物(9-8)(0.03g,56%)。 MS(APCI,ESI)m/z:593[(M+H)+]
步驟9:化合物(9-9) 使上述步驟8中所得到的化合物(10-8) (0.030g,0.050mmol),與實施例2-1步驟10同樣地進行反應,獲得了目的化合物(9-9)(0.015g,0.034mmol)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.39-7.25(4H,m),6.92-6.78(3H,m),6.03-5.92(1H,m),5.86-5.68(1H,m),5.20-5.07(2H,m),4.66-4.57(1H,m),4.52-4.40(1H,m),4.40-4.27(1H,m),4.27-4.16(1H,m),3.95(3H,s),3.82(3H,s),3.66-3.59(1H,m),3.32-3.21(1H,m),2.74-2.64(1H,m). MS(APCI,ESI)m/z:437[(M+H)+]
步驟10:化合物(9-10) 使實施例7步驟5中所得到的化合物(7-5) (0.131g,0.268mmol)與實施例2-2步驟1同樣地進行反應,獲得了目的物(9-10)(0.086g,52%)。 MS(APCI,ESI)m/z:611[81Br,(M+H)+],609[79Br,(M+H)+]
步驟11:化合物(9-11) 使用上述步驟10中所得之化合物(10-10) (0.015g,0.034mmol)、和上述步驟9中所得之化合物(10-9)(0.030g,0.048mmol),與實施例2-1步驟10同樣地進行反應,獲得了目的化合物(9-11)(0.032g,96%)。 MS(APCI,ESI)m/z:965[(M+H)+]
步驟12:化合物(9-12) 使上述步驟11中所得到的化合物(9-11) (0.031g,0.032mmol)與實施例2-1步驟11同樣地進行反應,獲得了目的物(9-12)(0.026g,95%)。 MS(APCI,ESI)m/z:851[(M+H)+]
步驟13:(11a’S)-7’-甲氧基-8’-(3-{[(11aS)-7-甲氧基-2-(4-甲氧基苯基)-5-側氧-5,10,11,11a-四氫-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯-8-基]氧基}丙氧基)-1’,11a’-二氫-5’H-螺[環丙烷-1,2’-吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮呯]-5’-酮(9-13) 使上述步驟12中所得到的化合物(10-12) (0.026g,0.030mmol)與實施例2-1步驟12同樣地進行反應,獲得了目的物(9-13)(0.018g,88%)。 1H-NMR(CDCl3 )δ:7.80(1H,m),7.54-7.51(3H,m),7.33-7.29(2H,m),6.91-6.85(3H,m),6.14(1H,s),4.35-4.17 (6H,m),3.95(3H,s),3.85(3H,s),3.82(3H,s),3.76-3.25 (5H,m),2.79-2.69(1H,m),2.52(1H,m),2.45-2.35 (1H,m),2.03-1.96(1H,m),1.28-1.23(2H,m),0.78-0.69 (4H,m). MS(APCI,ESI)m/z:665[(M+H)+]
實施例29:細胞增殖抑制試驗(1) 將自ATCC(美國菌種保存中心)取得之人類肺癌細胞株Calu-6用於評價。以10%的胎牛血清(GE Healthcare)與含MEM非必需胺基酸溶液(Thermo Fisher Scientific)及丙酮酸鈉(Thermo Fisher Scientific)的MEM(Thermo Fisher Scientific,以下為EMEM培養基),以成為1.25×104 細胞/mL的方式進行調製,對96孔細胞培養用微量盤各添加了80μL。細胞添加後,在37℃、5%CO2 下培養了一晩。 次日,對微量盤各添加了10μL經以EMEM培養基稀釋為100pM、50pM、25pM、12.5pM、6.25pM、3.13pM、1.56pM、0.78pM的吡咯并苯二氮呯衍生物A、B、或C。對吡咯并苯二氮呯衍生物的非添加孔,係各添加了10μL EMEM培養基。進一步對微量盤各添加了10μL經以EMEM培養基調製為2μM的奧拉帕尼。對奧拉帕尼非添加孔,係各添加了10μL EMEM培養基。然後,將微量盤在37℃、5%CO2 下培養了6天。培養後,從培養箱取出微量盤而在室溫靜置了30分鐘。添加與培養液等量的CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay(Promega),而以盤混合器(plate mixer)進行了攪拌。在室溫靜置10分鐘後,以盤檢測儀(plate reader)(PerkinElmer)測量了發光量。
衍生物A、B、或C添加孔的活細胞率係以下式算出了。 活細胞率(%)=a÷b×100 a:衍生物A、B、或C添加孔的發光量之平均值 b:培養基添加孔的發光量之平均值 IC50 值係以下式算出了。 IC50 (nM) =antilog((50-d)×(LOG10 (b)-LOG10 (a))÷(d-c)+LOG10 (b)) a:衍生物A、B、或C的濃度a b:衍生物A、B、或C的濃度b c:添加了濃度a的衍生物A、B、或C之時的活細胞率 d:添加了濃度b的衍生物A、B、或C之時的活細胞率 a、b係包夾活細胞率50%的2點而a>b。
又,衍生物A、B、或C與2μM奧拉帕尼同時添加孔的活細胞率係以下式算出了。 活細胞率(%)=a÷b×100 a:衍生物A、B、或C與2μM奧拉帕尼同時添加孔的發光量之平均值 b:2μM奧拉帕尼添加孔的發光量之平均值 IC50 值係以下式算出了。 IC50 (nM) =antilog((50-d)×(LOG10 (b)-LOG10 (a))÷(d-c)+LOG10 (b)) a:衍生物A、B、或C的濃度a b:衍生物A、B、或C的濃度b c:添加了濃度a的衍生物A、B、或C與2μM奧拉帕尼之時的活細胞率 d:添加了濃度b的衍生物A、B、或C與2μM奧拉帕尼之時的活細胞率 a、b係包夾活細胞率50%的2點而a>b。
對於Calu-6細胞,2μM奧拉帕尼並未顯示增殖抑制效果(增殖抑制率小於10%)。另一方面,衍生物A、B、或C於單獨添加時,分別顯示了IC50 值6.8pM、119.8pM、113.0pM的增殖抑制效果,於2μM奧拉帕尼同時添加時,分別顯示了IC50 值4.3pM、79.4pM、89.4pM的增殖抑制效果。與個別的藥劑單獨相比,在併用顯示了優異的增殖抑制效果。
實施例30:細胞增殖抑制試驗(2) 將自ATCC(美國菌種保存中心)取得之人類咽癌細胞株FaDu用於評價。以10%的胎牛血清(GE Healthcare)與含MEM非必需胺基酸溶液(Thermo Fisher Scientific)及丙酮酸鈉(Thermo Fisher Scientific)的MEM(Thermo Fisher Scientific,以下為EMEM培養基),以成為6.25×103 細胞/mL的方式進行調製,對96孔細胞培養用微量盤各添加了80μL。細胞添加後,在37℃、5%CO2 下培養了一晩。 次日,對微量盤各添加了10μL經以EMEM培養基稀釋為100pM、50pM、25pM、12.5pM、6.25pM、3.13pM、1.56pM、0.78pM的吡咯并苯二氮呯衍生物A、B、或C。對吡咯并苯二氮呯衍生物的非添加孔,係各添加了10μL EMEM培養基。進一步對微量盤各添加了10μL經以EMEM培養基調製為1μM的奧拉帕尼。對奧拉帕尼非添加孔,係各添加了10μL EMEM培養基。然後,將微量盤在37℃、5%CO2 下培養了6天。培養後,從培養箱取出微量盤而在室溫靜置了30分鐘。添加與培養液等量的CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay(Promega),而以盤混合器進行了攪拌。在室溫靜置10分鐘後,以盤檢測儀(PerkinElmer)測量了發光量。
衍生物A、B、或CD添加孔的活細胞率係以下式算出了。 活細胞率(%)=a÷b×100 a:衍生物A、B、或C添加孔的發光量之平均值 b:培養基添加孔的發光量之平均值 IC50 值係以下式算出了。 IC50 (nM) =antilog((50-d)×(LOG10 (b)-LOG10 (a))÷(d-c)+LOG10 (b)) a:衍生物A、B、或C的濃度a b:衍生物A、B、或C的濃度b c:添加了濃度a的衍生物A、B、或C之時的活細胞率 d:添加了濃度b的衍生物A、B、或C之時的活細胞率 a、b係包夾活細胞率50%的2點而a>b。
又,衍生物A、B、或C與1μM奧拉帕尼同時添加孔的活細胞率係以下式算出了。 活細胞率(%)=a÷b×100 a:衍生物A、B、或C與1μM奧拉帕尼同時添加孔的發光量之平均值 b:1μM奧拉帕尼添加孔的發光量之平均值 IC50 值係以下式算出了。 IC50 (nM) =antilog((50-d)×(LOG10 (b)-LOG10 (a))÷(d-c)+LOG10 (b)) a:衍生物A、B、或C的濃度a b:衍生物A、B、或C的濃度b c:添加了濃度a的衍生物A、B、或C與1μM奧拉帕尼之時的活細胞率 d:添加了濃度b的衍生物A、B、或C與1μM奧拉帕尼之時的活細胞率 a、b係包夾活細胞率50%的2點而a>b。
對於FaDu細胞,1μM奧拉帕尼並未顯示增殖抑制效果(增殖抑制率小於10%)。另一方面,衍生物A、B、或C於單獨添加時,分別顯示了IC50 值8.6pM、123.2pM、73.2pM的增殖抑制效果,於1μM奧拉帕尼同時添加時,分別顯示了IC50 值4.4pM、71.9pM、44.5pM的增殖抑制效果。與個別的藥劑單獨相比,在併用顯示了優異的增殖抑制效果。
實施例31:細胞增殖抑制試驗(3) 將自ATCC(美國菌種保存中心(American Type Culture Collection))取得之人類咽癌細胞株FaDu用於評價。以10%的胎牛血清(GE Healthcare)與含MEM非必需胺基酸溶液(Thermo Fisher Scientific)及丙酮酸鈉(Thermo Fisher Scientific)的MEM(Thermo Fisher Scientific,以下為EMEM培養基),以成為6.25×103 細胞/mL的方式進行調製,對96孔細胞培養用微量盤各添加了80μL。細胞添加後,在37℃、5%CO2 下培養了一晩。 次日,對微量盤各添加了10μL經以EMEM培養基稀釋為100pM、50pM、25pM、12.5pM、6.25pM、3.13pM、1.56pM、0.78pM的吡咯并苯二氮呯衍生物A、B、或C。對吡咯并苯二氮呯衍生物的非添加孔,係各添加了10μL EMEM培養基。進一步對微量盤各添加了10μL經以EMEM培養基調製為2nM的他拉唑帕尼。對他拉唑帕尼非添加孔,係各添加了10μL EMEM培養基。然後,將微量盤在37℃、5%CO2 下培養了6天。培養後,從培養箱取出微量盤而在室溫靜置了30分鐘。添加與培養液等量的CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay(Promega),而以盤混合器進行了攪拌。在室溫靜置10分鐘後,以盤檢測儀(PerkinElmer)測量了發光量。
衍生物A、B、或C添加孔的活細胞率係以下式算出了。 活細胞率(%)=a÷b×100 a:衍生物A、B、或C添加孔的發光量之平均值 b:培養基添加孔的發光量之平均值 IC50 值係以下式算出了。 IC50 (nM) =antilog((50-d)×(LOG10 (b)-LOG10 (a))÷(d-c)+LOG10 (b)) a:衍生物A、B、或C的濃度a b:衍生物A、B、或C的濃度b c:添加了濃度a的衍生物A、B、或C之時的活細胞率 d:添加了濃度b的衍生物A、B、或C之時的活細胞率 a、b係包夾活細胞率50%的2點而a>b。
又,衍生物A、B、或C與2nM他拉唑帕尼同時添加孔的活細胞率係以下式算出了。 活細胞率(%)=a÷b×100 a:衍生物A、B、或C與2nM他拉唑帕尼同時添加孔的發光量之平均值 b:2nM他拉唑帕尼添加孔的發光量之平均值 IC50 值係以下式算出了。 IC50 (nM) =antilog((50-d)×(LOG10 (b)-LOG10 (a))÷(d-c)+LOG10 (b)) a:衍生物A、B、或C的濃度a b:衍生物A、B、或C的濃度b c:添加了濃度a的衍生物A、B、或C與2nM他拉唑帕尼之時的活細胞率 d:添加了濃度b的衍生物A、B、或C與2nM他拉唑帕尼之時的活細胞率 a、b係包夾活細胞率50%的2點而a>b。
對於FaDu細胞,2nM他拉唑帕尼並未顯示增殖抑制效果(增殖抑制率小於10%)。另一方面,衍生物A、B、或C於單獨添加時,分別顯示了IC50 值7.7pM、121.2pM、83.1pM的增殖抑制效果,於2nM他拉唑帕尼同時添加時,分別顯示了IC50 值4.7pM、82.1pM、51.2pM的增殖抑制效果。與個別的藥劑單獨相比,在併用顯示了優異的增殖抑制效果。
實施例32:細胞增殖抑制試驗(4) 將自ATCC(美國菌種保存中心)所購入的人類卵巢癌株SK-OV-3細胞用於評價。以含10%的胎牛血清(GE Healthcare)的McCoy‘s 5A(Modified)Medium(Thermo Fisher Scientific,以下為McCoy’s 5A培養基),以成為1.25×104 C ells/mL的方式進行調製,對96孔細胞培養用微量盤各添加了80μL。細胞添加後,在37℃、5%CO2 下培養了一晩。 次日,對微量盤各添加了10μL經以McCoy’s 5A培養基稀釋為100pM、50pM、25pM、12.5pM、6.25pM、3.13pM、1.56pM、0.78pM的吡咯并苯二氮呯衍生物A。對吡咯并苯二氮呯衍生物A非添加孔,係各添加了10μL McCoy’s 5A培養基。進一步對微量盤各添加了10μL經以McCoy’s 5A培養基調製為5nM的他拉唑帕尼。對他拉唑帕尼非添加孔,係各添加了10μL McCoy’s 5A培養基。然後,將微量盤在37℃、5%CO2 下培養了6天。培養後,從培養箱取出微量盤而在室溫靜置了30分鐘。添加與培養液等量的CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay(Promega),而以盤混合器進行了攪拌。在室溫靜置10分鐘後,以盤檢測儀(PerkinElmer)測量了發光量。
衍生物A添加孔的活細胞率係以下式算出了。 活細胞率(%)=a÷b×100 a:衍生物A添加孔的發光量之平均值 b:培養基添加孔的發光量之平均值 IC50 值係以下式算出了。 IC50 (nM) =antilog((50-d)×(LOG10 (b)-LOG10 (a))÷(d-c)+LOG10 (b)) a:衍生物A的濃度a b:衍生物A的濃度b c:添加了濃度a的衍生物A之時的活細胞率 d:添加了濃度b的衍生物A之時的活細胞率 a、b係包夾活細胞率50%的2點而a>b。
又,衍生物A與5nM他拉唑帕尼同時添加孔的活細胞率係以下式算出了。 活細胞率(%)=a÷b×100 a:衍生物A與5nM他拉唑帕尼同時添加孔的發光量之平均值 b:5nM他拉唑帕尼添加孔的發光量之平均值 IC50 值係以下式算出了。 IC50 (nM) =antilog((50-d)×(LOG10 (b)-LOG10 (a))÷(d-c)+LOG10 (b)) a:衍生物A的濃度a b:衍生物A的濃度b c:添加了濃度a的衍生物A與5nM他拉唑帕尼之時的活細胞率 d:添加了濃度b的衍生物A與5nM他拉唑帕尼之時的活細胞率 a、b係包夾活細胞率50%的2點而a>b。
對於SK-OV-3細胞,5nM他拉唑帕尼並未顯示增殖抑制效果(增殖抑制率小於10%)。另一方面,衍生物A於單獨添加時,顯示了IC50 值8.1pM的增殖抑制效果,於5nM他拉唑帕尼同時添加時,顯示了IC50 值4.6pM的增殖抑制效果。與個別的藥劑單獨相比,在併用顯示了優異的增殖抑制效果。
實施例33:抗腫瘤試驗(1) 小鼠:將5-6週齡的雌BALB/c裸鼠(CHARLES RIVER LABORATORIES JAPAN, INC.)用於實驗。 測定・計算式:於所有的研究中,以電子式數位卡尺(CD-15CX,Mitutoyo Corp.)在1週中測定腫瘤的長徑及短徑2次,計算了腫瘤體積(mm3 )。計算式係如以下所示。 腫瘤體積(mm3 )=1/2×長徑(mm)×[短徑(mm)]2 抗CLDN6抗體-藥物結合物ADC1、抗HER2抗體-藥物結合物ADC2及抗TROP2抗體-藥物結合物ADC3係以ABS緩衝液(10mM乙酸緩衝液(pH5.5),5%山梨糖醇)稀釋,將10mL/kg之液量進行了尾靜脈內投予。奧拉帕尼係以二甲基亞碸(DMSO)溶解,以10% 2-羥基-丙基-β-環糊精(SIGMA-ALDRICH)/Dulbecco’s磷酸鹽緩衝液稀釋了之後,將10mL/kg之液量進行了腹腔內投予。他拉唑帕尼係以DMSO溶解,以10%N,N-二甲基乙醯胺/5%Kolliphor HS15(SIGMA-ALDRICH)/Dulbecco’s磷酸鹽緩衝液稀釋,將10mL/kg之液量進行了經口投予。尼拉帕尼係以DMSO溶解,以0.5%甲基纖維素稀釋,將10mL/kg之液量進行了經口投予。以上的方法,係在實施例34~37為共通。 將自ATCC(美國菌種保存中心)所購入的人類胰臟癌細胞株CFPAC-1懸浮於生理食鹽水,將5.0×106 個細胞皮下移植至雌裸鼠的右體側部,於移植10日後實施了隨機分組(第0日)。ADC2係於第0日以0.2mg/kg之用量進行了投予。他拉唑帕尼係第0至5日,以0.8mg/kg之用量進行了投予。設定了各自的單劑投予組與併用投予組、及作為對照組的無藥物處置(No treatment)之組 將ADC2與他拉唑帕尼的併用效果呈示於圖1。圖中,橫軸呈示細胞移植後的日數,縱軸呈示腫瘤體積。他拉唑帕尼單劑投予的試驗最終日(第35日)之腫瘤增殖抑制率(Tumor Growth Inhibition,TGI)為17%。由ADC2的單劑投予所致之TGI為94%。另一方面,在ADC2與他拉唑帕尼的併用投予,係認為有比他拉唑帕尼單劑投予還顯著優異的腫瘤增殖抑制效果(P<0.005。藉由Dunnett’s檢定算出。以下相同。)。又,認為有比ADC2單劑投予還顯著優異的腫瘤增殖抑制效果(P<0.05),腫瘤增殖抑制率為(TGI,99%)。又,於任一單劑及併用投予組中,並未認為有體重減少等之特別醒目的所見。
實施例34:抗腫瘤試驗(2) 將自DSMZ((德國微生物及細胞保存中心)Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH)所購入的人類乳癌株JIMT-1細胞懸浮於生理食鹽水而將5×106 個細胞皮下移植至雌裸鼠的右體側部,於移植10日後實施了隨機分組(第0日)。抗HER2抗體-藥物結合物ADC2係於第0日以0.2mg/kg之用量進行了投予。PARP抑制劑係將奧拉帕尼以50mg/kg之用量或將他拉唑帕尼以0.8mg/kg之用量,於第0至5日進行了投予。設定了各自的單劑投予組、ADC2與PARP抑制劑的併用投予組、及作為對照組的ABS緩衝液投予組。 將ADC2與奧拉帕尼的併用效果呈示於圖2。圖中,橫軸呈示細胞移植後的日數,縱軸呈示腫瘤體積。在奧拉帕尼單劑投予,並不認為有腫瘤增殖抑制效果。由ADC2的單劑投予所致之試驗最終日(第43日)之腫瘤增殖抑制率(Tumor Growth Inhibition,TGI)為75%。另一方面,在ADC2與奧拉帕尼的併用投予,係認為有比奧拉帕尼單劑投予還顯著優異的腫瘤增殖抑制效果(P<0.005)。又,腫瘤增殖抑制率比ADC2單劑投予還高(TGI,82%),認為有強的併用效果。又,於任一單劑及併用投予組中,並未認為有體重減少等之特別醒目的所見。 將ADC2與他拉唑帕尼的併用效果呈示於圖3。圖中,橫軸呈示細胞移植後的日數,縱軸呈示腫瘤體積。在他拉唑帕尼單劑投予,並不認為有腫瘤增殖抑制效果。由ADC2的單劑投予所致之試驗最終日(第43日)之腫瘤增殖抑制率(Tumor Growth Inhibition,TGI)為75%。另一方面,在ADC2與他拉唑帕尼的併用投予,係認為有比他拉唑帕尼單劑投予還顯著優異的腫瘤增殖抑制效果(P<0.005)。又,認為有比ADC2單劑投予還顯著優異的腫瘤增殖抑制效果(P<0.05),腫瘤增殖抑制率為(TGI,91%)。又,於任一單劑及併用投予組中,並未認為有體重減少等之特別醒目的所見。
實施例35:抗腫瘤試驗(3) 將自ATCC(美國菌種保存中心)取得之人類咽癌細胞株FaDu懸浮於生理食鹽水,將3.0×106 個細胞皮下移植至雌裸鼠的右體側部,於移植10日後實施了隨機分組(第0日)。抗TROP2抗體-藥物結合物ADC3係於第0日以0.2mg/kg之用量進行了投予。PARP抑制劑係將奧拉帕尼以50mg/kg之用量或將他拉唑帕尼以0.8mg/kg之用量,於第0至5日進行了投予。設定了各自的單劑投予組、ADC3與PARP抑制劑的併用投予組、及作為對照組的ABS緩衝液投予組。 將ADC3與奧拉帕尼的併用效果呈示於圖4。圖中,橫軸呈示細胞移植後的日數,縱軸呈示腫瘤體積。奧拉帕尼單劑投予的試驗最終日(第25日)之腫瘤增殖抑制率(Tumor Growth Inhibition,TGI)為7%。由ADC3的單劑投予所致之試驗最終日之腫瘤增殖抑制率(Tumor Growth Inhibition,TGI)為67%。另一方面,在ADC3與奧拉帕尼的併用投予,係認為有比奧拉帕尼單劑投予還顯著優異的腫瘤增殖抑制效果(P<0.005)。又,認為有比ADC3單劑投予還顯著優異的腫瘤增殖抑制效果(P<0.05),腫瘤增殖抑制率為(TGI,76%)。又,於任一單劑及併用投予組中,並未認為有體重減少等之特別醒目的所見。 將ADC3與他拉唑帕尼的併用效果呈示於圖5。圖中,橫軸呈示細胞移植後的日數,縱軸呈示腫瘤體積。他拉唑帕尼單劑投予的試驗最終日(第25日)之腫瘤增殖抑制率(Tumor Growth Inhibition,TGI)為33%。由ADC3的單劑投予所致之試驗最終日之腫瘤增殖抑制率(Tumor Growth Inhibition,TGI)為67%。另一方面,在ADC3與他拉唑帕尼的併用投予,係認為有比他拉唑帕尼單劑投予還顯著優異的腫瘤增殖抑制效果(P<0.005)。又,認為有比ADC3單劑投予還顯著優異的腫瘤增殖抑制效果(P<0.005),腫瘤增殖抑制率為(TGI,83%)。又,於任一單劑及併用投予組中,並未認為有體重減少等之特別醒目的所見。
實施例36:抗腫瘤試驗(4) 將自ATCC(美國菌種保存中心)所購入的人類卵巢癌細胞株OV-90懸浮於基質膠(Matrigel)(CORNING),將2.5×106 個細胞皮下移植至雌裸鼠的右體側部,於移植18日後實施了隨機分組(第0日)。抗CLDN6抗體-藥物結合物ADC1係於第0日以0.3mg/kg之用量進行了投予。尼拉帕尼係第0至5日,以75mg/kg之用量進行了投予。設定了各自的單劑投予組及併用投予組、及作為對照組的無藥物處置(No treatment)之組。 將ADC1與尼拉帕尼的併用結果呈示於圖42。圖中,橫軸呈示細胞移植後的日數,縱軸呈示腫瘤體積。由尼拉帕尼單劑投予所致之第21日時間點的腫瘤增殖抑制率(Tumor Growth Inhibition、TGI)為1%,在第21日時間點並未認為有體重減少等之醒目的所見。ADC1單劑投予組及ADC1與尼拉帕尼的併用投予組之第第21日時間點的TGI,任一者皆為96%,在第21日時間點並未認為有體重減少等之醒目的所見。另一方面,在第53日時間點,在ADC1與尼拉帕尼的併用投予,係與ADC1單劑投予相比而認為有腫瘤增殖抑制效果。在第53日時間點,並未認為有由ADC1單劑投予、及ADC1與尼拉帕尼的併用投予所致之體重減少等之醒目的所見。 再者,本實施例中所使用的ADC1,係使用抗CLDN6(H1L1)抗體,而按照與實施例15及實施例19同樣的方法製作了。
實施例37:抗腫瘤試驗(5) 將自ATCC(美國菌種保存中心)所購入的人類卵巢癌細胞株OV-90懸浮於基質膠(CORNING),將2.5×106 個細胞皮下移植至雌裸鼠的右體側部,於移植13~18日後實施隨機分組(第0日)。抗CLDN6抗體-藥物結合物ADC1係於第0日以0.2mg/kg之用量進行投予。PARP   抑制劑係將奧拉帕尼以50mg/kg之用量或將他拉唑帕尼以0.8mg/kg之用量,於第0至5日進行投予。設定各自的單劑投予組、ADC1與PARP抑制劑的併用投予組、及作為對照組的無藥物處置(No treatment)之組。
實施例38:曲妥珠單抗變異體-[MSG1-N3 ]2 或曲妥珠單抗變異體2-[MSG1-N3 ]2 步驟1:(Fucα1,6)GlcNAc-曲妥珠單抗變異體的調製 對曲妥珠單抗變異體(輕鏈:序列識別號73, 重鏈:序列識別號75)溶液ca.22.3mg/mL(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(2.69mL),加入0.156mL之7.7mg/mL野生型EndoS溶液(PBS),在37℃保溫了4小時。使用Experion電泳站(BIO-RAD製)來確認了反應的進行狀況。反應結束後,按照以下的方法,進行了利用親和性層析之純化與利用氫氧磷灰石管柱之純化。 (1)利用親和性層析之純化 純化裝置:AKTA avant(GE HEALTHCARE製) 管柱:HiTrap rProtein A FF(5mL)(GE HEALTHCARE製) 流速:5mL/分鐘(進料時為1.25mL/分鐘) 將上述所得反應液分複數次進行了純化。對管柱的結合時,係對管柱上部添加反應液,將結合緩衝液(20mM磷酸緩衝液(pH6.0))以1.25mL/分鐘通入4CV(Column Volume),進而以5mL/分鐘通入了5CV。中間清洗時係通入了15CV清洗溶液(20mM磷酸緩衝液(pH7.0)、0.5M氯化鈉溶液)。溶出時係通入了6CV溶出緩衝液(ImmunoPure IgG溶析緩衝液,PIERCE製)。將溶出液以1M Tris緩衝液(pH9.0)立即進行了中和。將包含目的物的區分,使用共通操作C,而進行了對5mM磷酸緩衝液50mM-
Figure 109110172-A0304-12-0020-6
啉基乙磺酸(MES)溶液(pH6.8)的緩衝液交換。 (2)利用氫氧磷灰石層析之純化 純化裝置:AKTA avant(GE HEALTHCARE製) 管柱:Bio-Scale Mini CHT Type I匣筒(5mL)(BIO-RAD製) 流速:5mL/分鐘(進料時為1.25mL/分鐘) 對管柱的上部添加上述(1)中所得到的溶液,將A液(5mM磷酸緩衝液50mM-
Figure 109110172-A0304-12-0020-6
啉基乙磺酸(MES)溶液(pH6.8))以1.25mL/分鐘通入4CV,進而以5mL/分鐘通入了3CV。然後,使用A液與B液(5mM磷酸緩衝液50mM-
Figure 109110172-A0304-12-0020-6
啉基乙磺酸(MES)溶液(pH6.8)、2M氯化鈉溶液)進行了溶出。溶出條件為A液:B液=100:0~0:100(15CV)。進一步通入了5CV清洗溶液(500mM磷酸緩衝液(pH6.5))。 將包含目的物的區分,使用共通操作C而進行緩衝液交換,獲得了6.08mg/mL的(Fucα1,6)GlcNAc-曲妥珠單抗變異體溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(6.10mL)。
步驟2:曲妥珠單抗變異體-[MSG1-N3 ]2 的調製 使用上述步驟1中所得到的6.08mg/mL (Fucα1,6)GlcNAc-曲妥珠單抗變異體溶液(50mM磷酸緩衝液(pH6.0))(6.10mL),加入實施例3步驟4中所合成的化合物(9.78mg)的50mM磷酸緩衝液(pH6.0)溶液(0.200mL)、5.80mg/mL的EndoS D233Q/Q303L溶液(PBS)(0.128mL),在30℃保溫了3小時。使用Experion電泳站(BIO-RAD製)來確認了反應的進行狀況。反應結束後,與上述步驟1同樣地進行了利用親和性層析之純化與利用氫氧磷灰石層析之純化之後,將包含目的物的區分,使用共通操作C,而對磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)進行緩衝液交換,獲得了10.2mg/mL的曲妥珠單抗變異體-[MSG1-N3 ]2 溶液(磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0))(3.65mL)。 使用曲妥珠單抗變異體2(輕鏈:序列識別號76, 重鏈:77),進行與實施例38之步驟1及2同樣的操作,藉此而獲得了曲妥珠單抗變異體2-[MSG1-N3 ]2
實施例39:ADC6
步驟1:抗體與藥物連接子的結合 對實施例38步驟2中所得到的曲妥珠單抗變異體-[MSG1-N3 ]2 的磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)溶液(10.0mg/mL,0.40mL),於室溫加入1,2-丙二醇(0.767mL)、實施例2-1步驟13中所得到的化合物(3-14)的10mM二甲基亞碸溶液(0.033mL,相對於抗體1分子為12當量),使用試管旋轉器(MTR-103,AS ONE CORPORATION),於室溫使反應進行了48小時。 純化操作:將上述溶液使用後述之共通操作D進行純化,獲得了7.00mL含有目的之化合物的溶液。 特性評價:使用共通操作E、F而獲得了下述之特性值。 抗體濃度:0.48mg/mL;抗體產量:3.39mg(85%);抗體每一分子的平均藥物結合數(n):1.7
實施例40:ADC7 步驟1-1:抗體與藥物連接子的結合(ADC7) 對實施例38中所得到的曲妥珠單抗變異體2-[MSG1-N3 ]2 的磷酸緩衝生理食鹽水(pH6.0)溶液(10.0mg/mL,0.50mL),於室溫加入1,2-丙二醇(0.486mL)、實施例2-1步驟13中所得到的化合物(3-14)的10mM二甲基亞碸溶液(0.014mL,相對於抗體1分子為4當量),使用試管旋轉器(MTR-103,AS ONE CORPORATION),於室溫使反應進行了40小時。 純化操作:將上述溶液使用後述之共通操作D進行純化,獲得了2.50mL含有目的之化合物的溶液。 特性評價:使用共通操作E、F而獲得了下述之特性值。 抗體濃度:1.12mg/mL;抗體產量:2.80mg(56%);抗體每一分子的平均藥物結合數(n):1.8 [產業上利用之可能性]
藉由使用本發明之抗體-藥物結合物、抗體及/或PBD衍生物等,而能夠治療或預防各種癌症。 [序列表非關鍵詞文字]
序列識別號1:人類CLDN6之胺基酸序列 序列識別號2:編碼人類CLDN6之胺基酸序列之cDNA的核苷酸序列 序列識別號3:人類CLDN9之胺基酸序列 序列識別號4:編碼人類CLDN9之胺基酸序列之cDNA的核苷酸序列 序列識別號5:B1抗體輕鏈之CDRL1的胺基酸序列 序列識別號6:B1抗體輕鏈之CDRL2的胺基酸序列 序列識別號7:B1抗體輕鏈之CDRL3的胺基酸序列 序列識別號8:人類化B1抗體輕鏈L4之CDRL3的胺基酸序列 序列識別號9:B1抗體重鏈之CDRH1的胺基酸序列 序列識別號10:B1抗體重鏈之CDRH2的胺基酸序列 序列識別號11:B1抗體重鏈之CDRH3的胺基酸序列 序列識別號12:C7抗體輕鏈之CDRL1的胺基酸序列 序列識別號13:C7抗體輕鏈之CDRL2的胺基酸序列 序列識別號14:C7抗體輕鏈之CDRL3的胺基酸序列 序列識別號15:C7抗體重鏈之CDRH1的胺基酸序列 序列識別號16:C7抗體重鏈之CDRH2的胺基酸序列 序列識別號17:C7抗體重鏈之CDRH3的胺基酸序列 序列識別號18:編碼B1抗體輕鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列 序列識別號19:B1抗體輕鏈之可變區的胺基酸序列 序列識別號20:編碼B1抗體重鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列 序列識別號21:B1抗體重鏈之可變區的胺基酸序列 序列識別號22:編碼C7抗體輕鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列 序列識別號23:C7抗體輕鏈之可變區的胺基酸序列 序列識別號24:編碼C7抗體重鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列 序列識別號25:C7抗體重鏈之可變區的胺基酸序列 序列識別號26:包含編碼人類輕鏈訊息序列及人類κ鏈恆定區之DNA序列的DNA片段 序列識別號27:包含編碼人類重鏈訊息序列及人類IgG1LALA恆定區之DNA序列的DNA片段 序列識別號28:chB1輕鏈之胺基酸序列 序列識別號29:包含編碼chB1輕鏈之胺基酸序列之DNA序列的DNA片段 序列識別號30:chB1輕鏈之可變區的胺基酸序列 序列識別號31:編碼chB1輕鏈可變區的核苷酸序列 序列識別號32:chB1重鏈之胺基酸序列 序列識別號33:編碼chB1重鏈的核苷酸序列 序列識別號34:chB1重鏈之可變區的胺基酸序列 序列識別號35:編碼chB1重鏈之可變區的核苷酸序列 序列識別號36:人類化抗體輕鏈hL1的胺基酸序列 序列識別號37:編碼人類化抗體輕鏈hL1的核苷酸序列 序列識別號38:人類化抗體輕鏈hL1之可變區的胺基酸序列 序列識別號39:編碼人類化抗體輕鏈hL1之可變區的核苷酸序列 序列識別號40:人類化抗體輕鏈hL2的胺基酸序列 序列識別號41:編碼人類化抗體輕鏈hL2的核苷酸序列 序列識別號42:人類化抗體輕鏈hL2之可變區的胺基酸序列 序列識別號43:編碼人類化抗體輕鏈hL2之可變區的核苷酸序列 序列識別號44:人類化抗體輕鏈hL3的胺基酸序列 序列識別號45:編碼人類化抗體輕鏈hL3的核苷酸序列 序列識別號46:人類化抗體輕鏈hL3之可變區的胺基酸序列 序列識別號47:編碼人類化抗體輕鏈hL3之可變區的核苷酸序列 序列識別號48:人類化抗體輕鏈hL4的胺基酸序列 序列識別號49:編碼人類化抗體輕鏈hL4的核苷酸序列 序列識別號50:人類化抗體輕鏈hL4之可變區的胺基酸序列 序列識別號51:編碼人類化抗體輕鏈hL4之可變區的核苷酸序列 序列識別號52:人類化抗體重鏈hH1的胺基酸序列 序列識別號53:編碼人類化抗體重鏈hH1的核苷酸序列 序列識別號54:人類化抗體重鏈hH1之可變區的胺基酸序列 序列識別號55:編碼人類化抗體重鏈hH1之可變區的核苷酸序列 序列識別號56:人類化抗體重鏈hH2的胺基酸序列 序列識別號57:編碼人類化抗體重鏈hH2的核苷酸序列 序列識別號58:人類化抗體重鏈hH2之可變區的胺基酸序列 序列識別號59:編碼人類化抗體重鏈hH2之可變區的核苷酸序列 序列識別號60:人類化抗體重鏈hH3的胺基酸序列 序列識別號61:編碼人類化抗體重鏈hH3的核苷酸序列 序列識別號62:人類化抗體重鏈hH3之可變區的胺基酸序列 序列識別號63:編碼人類化抗體重鏈hH3之可變區的核苷酸序列 序列識別號64:曲妥珠單抗輕鏈之胺基酸序列 序列識別號65:曲妥珠單抗重鏈之胺基酸序列 序列識別號66:抗LPS抗體(h#1G5-H1L1)輕鏈之胺基酸序列 序列識別號67:抗LPS抗體(h#1G5-H1L1)重鏈之胺基酸序列 序列識別號68:抗TROP2抗體(hRS7)輕鏈之胺基酸序列 序列識別號69:抗TROP2抗體(hRS7)重鏈之胺基酸序列 序列識別號70:抗CD98抗體(hM23-H1L1)輕鏈之胺基酸序列 序列識別號71:抗CD98抗體(hM23-H1L1)重鏈之胺基酸序列 序列識別號72:編碼曲妥珠單抗變異體輕鏈的核苷酸序列 序列識別號73:曲妥珠單抗變異體輕鏈之胺基酸序列 序列識別號74:編碼曲妥珠單抗變異體重鏈的核苷酸序列 序列識別號75:曲妥珠單抗變異體重鏈之胺基酸序列 序列識別號76:曲妥珠單抗變異體2輕鏈之胺基酸序列 序列識別號77:曲妥珠單抗變異體2重鏈之胺基酸序列
無。
[圖1]為呈示了經皮下移植人類胰臟癌細胞株CFPAC-1細胞之小鼠中的抗HER2抗體-藥物結合物ADC2及他拉唑帕尼各自的單劑投予組、以及HER2抗體-藥物結合物ADC2與他拉唑帕尼的併用投予組之腫瘤增殖抑制效果之圖。 [圖2]為呈示了經皮下移植人類乳癌株JIMT-1細胞之小鼠中的抗HER2抗體-藥物結合物ADC2及奧拉帕尼各自的單劑投予組、以及HER2抗體-藥物結合物ADC2與奧拉帕尼的併用投予組之腫瘤增殖抑制效果之圖。 [圖3]為呈示了經皮下移植人類乳癌株JIMT-1細胞之小鼠中的抗HER2抗體-藥物結合物ADC2及他拉唑帕尼各自的單劑投予組、以及抗HER2抗體-藥物結合物ADC2與他拉唑帕尼的併用投予組之腫瘤增殖抑制效果之圖。 [圖4]為呈示了經皮下移植人類咽癌細胞株FaDu之小鼠中的抗TROP2抗體-藥物結合物ADC3及奧拉帕尼各自的單劑投予組、以及抗TROP2抗體-藥物結合物ADC3與奧拉帕尼的併用投予組之腫瘤增殖抑制效果之圖。 [圖5]為呈示了經皮下移植人類咽癌細胞株FaDu之小鼠中的抗TROP2抗體-藥物結合物ADC3及他拉唑帕尼各自的單劑投予組、以及抗TROP2抗體-藥物結合物ADC3與他拉唑帕尼的併用投予組之腫瘤增殖抑制效果之圖。 [圖6]係呈示人類CLDN6之全長胺基酸序列(序列識別號1)及全長cDNA的鹼基序列(序列識別號2)。 [圖7]係呈示人類CLDN9之全長胺基酸序列(序列識別號3)及全長cDNA的鹼基序列(序列識別號4)。 [圖8]係呈示B1抗體輕鏈之CDRL1~3的胺基酸序列(序列識別號5~7)。 [圖9]係呈示人類化B1抗體輕鏈L4之CDRL3的胺基酸序列(序列識別號8)。 [圖10]係呈示B1抗體重鏈之CDRH1~3的胺基酸序列(序列識別號9~11)。 [圖11]係呈示C7抗體輕鏈之CDRL1~3的胺基酸序列(序列識別號12~14)。 [圖12]係呈示C7抗體重鏈之CDRH1~3的胺基酸序列(序列識別號15~17。 [圖13]係呈示編碼B1抗體輕鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列(序列識別號18)及B1抗體輕鏈之可變區的胺基酸序列(序列識別號19)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖14]係呈示編碼B1抗體重鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列(序列識別號20)及B1抗體重鏈之可變區的胺基酸序列(序列識別號21)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖15]係呈示編碼C7抗體輕鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列(序列識別號22)及C7抗體輕鏈之可變區的胺基酸序列(序列識別號23)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖16]係呈示編碼C7抗體重鏈之可變區之cDNA的核苷酸序列(序列識別號24)及C7抗體重鏈之可變區的胺基酸序列(序列識別號25)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖17]係呈示chB1輕鏈之胺基酸序列(序列識別號28)及包含編碼chB1輕鏈之胺基酸序列之DNA序列的DNA片段(序列識別號29)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖18]係呈示chB1輕鏈之可變區的胺基酸序列(序列識別號30)及編碼chB1輕鏈可變區的核苷酸序列(序列識別號31)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖19]係呈示chB1重鏈之胺基酸序列(序列識別號32)及編碼chB1重鏈的核苷酸序列(序列識別號33)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖20]係呈示chB1重鏈之可變區的胺基酸序列(序列識別號34)及編碼chB1重鏈之可變區的核苷酸序列(序列識別號35)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖21]係呈示人類化抗體輕鏈hL1的胺基酸序列(序列識別號36)及編碼人類化抗體輕鏈hL1的核苷酸序列(序列識別號37)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖22]係呈示人類化抗體輕鏈hL1之可變區的胺基酸序列(序列識別號38)及編碼人類化抗體輕鏈hL1之可變區的核苷酸序列(序列識別號39)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖23]係呈示人類化抗體輕鏈hL2的胺基酸序列(序列識別號40)及編碼人類化抗體輕鏈hL2的核苷酸序列(序列識別號41)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖24]係呈示人類化抗體輕鏈hL2之可變區的胺基酸序列(序列識別號42)及編碼人類化抗體輕鏈hL2之可變區的核苷酸序列(序列識別號43)。 [圖25]係呈示人類化抗體輕鏈hL3的胺基酸序列(序列識別號44)及編碼人類化抗體輕鏈hL3的核苷酸序列(序列識別號45)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖26]係呈示人類化抗體輕鏈hL3之可變區的胺基酸序列(序列識別號46)及編碼人類化抗體輕鏈hL3之可變區的核苷酸序列(序列識別號47)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖27]係呈示人類化抗體輕鏈hL4之胺基酸序列(序列識別號48)及編碼人類化抗體輕鏈hL4的核苷酸序列(序列識別號49)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖28]係呈示人類化抗體輕鏈hL4之可變區的胺基酸序列(序列識別號50)及編碼人類化抗體輕鏈hL4之可變區的核苷酸序列(序列識別號51)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖29]係呈示人類化抗體重鏈hH1的胺基酸序列(序列識別號52)及編碼人類化抗體重鏈hH1的核苷酸序列(序列識別號53)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖30]係呈示人類化抗體重鏈hH1之可變區的胺基酸序列(序列識別號54)及編碼人類化抗體重鏈hH1之可變區的核苷酸序列(序列識別號55)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖31]係呈示人類化抗體重鏈hH2的胺基酸序列(序列識別號56)及編碼人類化抗體重鏈hH2的核苷酸序列(序列識別號57)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖32]係呈示人類化抗體重鏈hH2之可變區的胺基酸序列(序列識別號58)及編碼人類化抗體重鏈hH2之可變區的核苷酸序列(序列識別號59)。 [圖33]係呈示人類化抗體重鏈hH3的胺基酸序列(序列識別號60)及編碼人類化抗體重鏈hH3的核苷酸序列(序列識別號61)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖34]係呈示人類化抗體重鏈hH3之可變區的胺基酸序列(序列識別號62)及編碼人類化抗體重鏈hH3之可變區的核苷酸序列(序列識別號63)。胺基酸序列中之底線係表示CDR序列。 [圖35]係呈示B1抗體及C7抗體之藉由流動式細胞測量術所測得的對人類CLDN6及家族分子CLDN3、CLDN4、CLDN9的結合能力。 [圖36]係呈示B1抗體及C7抗體之藉由Mab-ZAP所測得的抗體內化活性能力。 [圖37]係呈示人類化抗CLDN6抗體H1L1、H2L2、H1L3、H2L4、及H3L3利用之藉由流動式細胞測量術所測得的對CLDN6及家族分子的結合能力。 [圖38]係呈示曲妥珠單抗(Trastuzumab)輕鏈之胺基酸序列(序列識別號64)及重鏈之胺基酸序列(序列識別號65)。 [圖39]係呈示曲妥珠單抗變異體之輕鏈之胺基酸序列(序列識別號73)及重鏈之胺基酸序列(序列識別號75)。 [圖40]係呈示為人類嵌合化抗CLDN6抗體chB1之重鏈的chB1_H、為人類化抗體重鏈之hH1、hH2及hH3的胺基酸序列之比較之圖。「・」係表示和chB1_H相同的胺基酸殘基,記載著胺基酸殘基之處係表示經取代的胺基酸殘基。 [圖41]係呈示為人類嵌合化抗CLDN6抗體chB1之輕鏈的chB1_L、為人類化抗體輕鏈的hL1、hL2、hL3及hL4的胺基酸序列之比較之圖。「・」係表示和chB1_L相同的胺基酸殘基,記載著胺基酸殘基之處係表示經取代的胺基酸殘基。 [圖42]為呈示了經皮下移植人類卵巢癌細胞株OV-90之小鼠中的抗CLDN6抗體-藥物結合物ADC1及尼拉帕尼各自的單劑投予組、以及抗CLDN6抗體-藥物結合物ADC1與尼拉帕尼的併用投予組之腫瘤增殖抑制效果之圖。
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無。

Claims (73)

  1. 一種醫藥組成物,係包含抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物及/或PARP抑制劑之用於癌症治療的醫藥組成物,其特徵為將該抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物、與該PARP抑制劑進行組合而投予, 該結合物係以下式表示,
    Figure 03_image149
    Figure 03_image151
    Figure 03_image153
    或、
    Figure 03_image155
    於上述所示之各自的結構式中,m1 為1或2的整數, Ab為抗體或該抗體的機能性片段, N297糖鏈為具有以下式表示之結構的N297-(Fuc)MSG1、N297-(Fuc)MSG2或者彼等之混合物、或N297-(Fuc)SG,
    Figure 03_image157
    Figure 03_image159
    Figure 03_image161
    式中,波浪線係表示與抗體之Asn297結合, N297糖鏈中的L(PEG)係表示 *-(CH2 CH2 -O)3 -CH2 CH2 -NH-, 此處,右端的胺基與N297糖鏈的β-Man之支鏈之1-3鏈側或/及1-6鏈側的非還原末端的唾液酸之2位的羧酸透過醯胺鍵而結合,左端的星號*係表示與前述式中之***環上之1位或3位的氮原子結合。
  2. 如請求項1之醫藥組成物,其中抗體與腫瘤細胞所表現之抗原結合,且被併入腫瘤細胞內而內化。
  3. 如請求項1或2之醫藥組成物,其中抗體具有抗腫瘤效果。
  4. 如請求項1至3中任一項之醫藥組成物,其中抗體為抗CLDN6抗體、抗CLDN9抗體、抗CLDN6/CLDN9抗體、抗HER2抗體、抗HER3抗體、抗DLL3抗體、抗FAP抗體、抗CDH11抗體、抗A33抗體、抗CanAg抗體、抗CD19抗體、抗CD20抗體、抗CD22抗體、抗CD25抗體、抗CD30抗體、抗CD33抗體、抗CD37抗體、抗CD56抗體、抗CD70抗體、抗CD98抗體、抗B7-H3抗體、抗TROP2抗體、抗CEA抗體、抗Cripto抗體、抗EphA2抗體、抗FGFR2抗體、抗G250抗體、抗MUC1抗體、抗GPNMB抗體、抗整合素(Integrin)抗體、抗PSMA抗體、抗肌腱蛋白-C(Tenascin-C)抗體、抗SLC44A4抗體、抗間皮素(Mesothelin)抗體、抗EGFR抗體、抗5T4抗體、抗LRRC15抗體、抗DR5抗體、抗CDH3抗體、抗PDPN 抗體、或抗CD123抗體。
  5. 如請求項1至4中任一項之醫藥組成物,其中抗體與CLDN6及/或CLDN9特異性地結合。
  6. 如請求項5之醫藥組成物,其中抗體係包含以下的(a)或(b)所記載之包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的重鏈以及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3輕鏈而成: (a)由序列識別號9所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號10所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號11所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號5所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號6所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號7所記載之胺基酸序列或於該胺基酸序列中1或2個胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRL3;或 (b)由序列識別號15所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號16所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號17所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號12所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號13所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號14所記載之胺基酸序列構成的CDRL3。
  7. 如請求項6之醫藥組成物,其中抗體係包含以下的(a)或(b)所記載之包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的重鏈以及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3輕鏈而成: (a)由序列識別號9所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號10所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號11所記載之胺基酸序列構成的CDRH3;及由序列識別號5所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號6所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號7所記載之胺基酸序列或序列識別號8所記載之胺基酸序列構成的CDRL3;或 (b)由序列識別號15所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號16所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號17所記載之胺基酸序列構成的CDRH3;及由序列識別號12所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號13所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號14所記載之胺基酸序列構成的CDRL3。
  8. 如請求項5至7中任一項之醫藥組成物,其中抗體包含以下的(a)或(b)所記載之重鏈可變區、及輕鏈可變區: (a)由序列識別號21所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號19所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區;或 (b)由序列識別號25所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號23所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區。
  9. 如請求項5至8中任一項之醫藥組成物,其包含由選自包含以下的(a)~(e)之群組的胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由選自包含(f)~(k)之群組的胺基酸序列構成的輕鏈可變區: (a)序列識別號54所記載之胺基酸序列; (b)序列識別號58所記載之胺基酸序列; (c)序列識別號62所記載之胺基酸序列; (d)對於(a)~(c)之序列中各CDR序列以外的框架區(framework region)之序列具有至少95%以上之相同性的胺基酸序列; (e)於(a)~(c)之序列中的各CDR序列以外的框架區之序列中有1或數個胺基酸係缺失、經取代或附加的胺基酸序列; (f)序列識別號38所記載之胺基酸序列; (g)序列識別號42所記載之胺基酸序列; (h)序列識別號46所記載之胺基酸序列; (i)序列識別號50所記載之胺基酸序列; (j)對於(f)~(i)之序列中各CDR序列以外的框架區之序列具有至少95%以上之相同性的胺基酸序列;及 (k)於(f)~(i)之序列中的各CDR序列以外的框架區之序列中有1或數個胺基酸係缺失、經取代或附加的胺基酸序列。
  10. 如請求項9之醫藥組成物,其中抗體包含選自包含以下的(a)~(e)之群組的重鏈可變區及輕鏈可變區: (a)由序列識別號54所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號38所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (b)由序列識別號58所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號42所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (c)由序列識別號54所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號46所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (d)由序列識別號58所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號50所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區;及 (e)由序列識別號62所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號46所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區。
  11. 如請求項5至10中任一項之醫藥組成物,其中抗體為嵌合抗體。
  12. 如請求項5至10中任一項之醫藥組成物,其中抗體為人類化抗體。
  13. 如請求項5至12中任一項之醫藥組成物,其中抗體包含人類IgG1、人類IgG2或人類IgG4的重鏈恆定區。
  14. 如請求項12或13之醫藥組成物,其包含選自包含以下的(a)~(e)之群組的重鏈及輕鏈: (a)由序列識別號52之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號36之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (b)由序列識別號56之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號40之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (c)由序列識別號52之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號44之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (d)由序列識別號56之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號48之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈;及 (e)由序列識別號60之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號44之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈。
  15. 如請求項5之醫藥組成物,其中抗體會與如請求項6至10及14中任一項之抗體於對CLDN6及/或CLDN9之結合上競爭,或會與如請求項6至10及14中任一項之抗體所辨識之CLDN6及/或CLDN9上的部位結合。
  16. 如請求項1至4中任一項之醫藥組成物,其中抗體會與HER2特異性地結合。
  17. 如請求項16之醫藥組成物,其具有抗體依賴性細胞毒殺(ADCC)活性及/或補體依賴性細胞毒殺(CDC)活性。
  18. 如請求項16之醫藥組成物,其中抗體之重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且包含會造成ADCC及/或CDC活性降低的變異。
  19. 如請求項18之醫藥組成物,其中抗體之重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且於該重鏈恆定區中藉由EU Index所示之234位及235位的白胺酸被丙胺酸取代。
  20. 如請求項16或17之醫藥組成物,其為包含由序列識別號65所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號64所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成之抗體。
  21. 如請求項16、18及19中任一項之醫藥組成物,其為包含由序列識別號75之胺基酸編號20~139所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號73之胺基酸編號21~127所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區之抗體。
  22. 如請求項16、18、19及21中任一項之醫藥組成物,其為包含由序列識別號75之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號73之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈之抗體。
  23. 如請求項16、18、19及21中任一項之醫藥組成物,其為包含由序列識別號77之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號76之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈之抗體。
  24. 如請求項5至23中任一項之醫藥組成物,其中抗體包含選自包含N-鍵結型糖鏈附加、O-鍵結型糖鏈附加、N末端的處理、C末端的處理、脫醯胺化、天冬胺酸的異構化、甲硫胺酸的氧化、於N末端之甲硫胺酸殘基的附加、脯胺酸殘基的醯胺化、及於重鏈的羧基末端之1個或2個胺基酸殘基的缺失之群組的1或2以上之修飾。
  25. 如請求項24之醫藥組成物,其係於抗體之重鏈的羧基末端有1個或數個胺基酸殘基缺失。
  26. 如請求項24或25之醫藥組成物,其係於抗體之2條重鏈雙方的羧基末端有1個胺基酸殘基缺失。
  27. 如請求項24至26中任一項之醫藥組成物,其中抗體之重鏈的羧基末端的脯胺酸殘基進一步被醯胺化。
  28. 如請求項1至27中任一項之醫藥組成物,其中N297糖鏈為N297-(Fuc)MSG1。
  29. 如請求項1至28中任一項之醫藥組成物,其中m1 為1的整數。
  30. 如請求項1至29中任一項之醫藥組成物,其中抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物中之抗體每1分子的平均藥物結合數為1~3或3~5。
  31. 如請求項1至30中任一項之醫藥組成物,其中PARP抑制劑為奧拉帕尼(Olaparib)、盧卡帕尼(Rucaparib)、尼拉帕尼(Niraparib)、或者他拉唑帕尼(Talazoparib)、或彼等之藥理上可容許的鹽。
  32. 如請求項1至31中任一項之醫藥組成物,其係於各自不同的製劑作為有效成分而含有抗體-藥物結合物與PARP抑制劑,且同時或於不同時間進行投予。
  33. 如請求項1至32中任一項之醫藥組成物,其係用於選自包含肺癌(非小細胞肺癌、小細胞肺癌等)、腎癌、尿道上皮癌、大腸癌、***癌、多型神經膠質母細胞瘤、卵巢癌(表層上皮性腫瘤、間質性腫瘤、生殖細胞腫瘤等)、胰臟癌、乳癌、黑色素瘤、肝癌、膀胱癌、胃癌、食道癌、子宮體癌、睾丸癌(精細胞瘤、非精細胞瘤)、子宮頸癌、胎盤絨毛癌、腦腫瘤、頭頸部癌以及彼等之轉移性形態之群組的至少一個癌症之治療。
  34. 一種治療方法,其係特徵為將抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物與PARP抑制劑進行組合而投予之癌症的治療方法, 該結合物係以下式表示,
    Figure 03_image163
    Figure 03_image165
    Figure 03_image167
    或、
    Figure 03_image169
    於上述所示之各自的結構式中,m1 為1或2的整數, Ab為抗體或該抗體的機能性片段, N297糖鏈為具有以下式表示之結構的N297-(Fuc)MSG1、N297-(Fuc)MSG2或者彼等之混合物、或N297-(Fuc)SG,
    Figure 03_image171
    Figure 03_image173
    Figure 03_image175
    式中,波浪線係表示與抗體之Asn297結合, N297糖鏈中的L(PEG)係表示 *-(CH2 CH2 -O)3 -CH2 CH2 -NH-, 此處,右端的胺基與N297糖鏈的β-Man之支鏈之1-3鏈側或/及1-6鏈側的非還原末端的唾液酸之2位的羧酸透過醯胺鍵而結合,左端的星號*係表示與前述式中之***環上之1位或3位的氮原子結合。
  35. 如請求項34之治療方法,其中抗體與腫瘤細胞所表現之抗原結合,且被併入腫瘤細胞內而內化。
  36. 如請求項34或35之治療方法,其中抗體具有抗腫瘤效果。
  37. 如請求項34至36中任一項之治療方法,其中抗體為抗CLDN6抗體、抗CLDN9抗體、抗CLDN6/CLDN9抗體、抗HER2抗體、抗HER3抗體、抗DLL3抗體、抗FAP抗體、抗CDH11抗體、抗A33抗體、抗CanAg抗體、抗CD19抗體、抗CD20抗體、抗CD22抗體、抗CD25抗體、抗CD30抗體、抗CD33抗體、抗CD37抗體、抗CD56抗體、抗CD70抗體、抗CD98抗體、抗B7-H3抗體、抗TROP2抗體、抗CEA抗體、抗Cripto抗體、抗EphA2抗體、抗FGFR2抗體、抗G250抗體、抗MUC1抗體、抗GPNMB抗體、抗整合素抗體、抗體PSMA抗體、抗肌腱蛋白-C抗體、抗SLC44A4抗體、抗間皮素抗體、抗EGFR抗體、抗5T4抗體、抗LRRC15抗體、抗DR5抗體、抗CDH3抗體、抗PDPN 抗體、或抗CD123抗體。
  38. 如請求項34至37中任一項之治療方法,其中抗體與CLDN6及/或CLDN9特異性地結合。
  39. 如請求項38之治療方法,其中抗體係包含以下的(a)或(b)所記載之包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的重鏈以及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3輕鏈而成: (a)由序列識別號9所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號10所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號11所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號5所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號6所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號7所記載之胺基酸序列或於該胺基酸序列中1或2個胺基酸經取代之胺基酸序列構成的CDRL3;或 (b)由序列識別號15所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號16所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號17所記載之胺基酸序列構成的CDRH3,以及由序列識別號12所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號13所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號14所記載之胺基酸序列構成的CDRL3。
  40. 如請求項39之治療方法,其中抗體係包含以下的(a)或(b)所記載之包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的重鏈以及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3輕鏈而成: (a)由序列識別號9所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號10所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號11所記載之胺基酸序列構成的CDRH3;及由序列識別號5所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號6所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號7所記載之胺基酸序列或序列識別號8所記載之胺基酸序列構成的CDRL3;或 (b)由序列識別號15所記載之胺基酸序列構成的CDRH1、由序列識別號16所記載之胺基酸序列構成的CDRH2及由序列識別號17所記載之胺基酸序列構成的CDRH3;及由序列識別號12所記載之胺基酸序列構成的CDRL1、由序列識別號13所記載之胺基酸序列構成的CDRL2及由序列識別號14所記載之胺基酸序列構成的CDRL3。
  41. 如請求項38至40中任一項之治療方法,其中抗體包含以下的(a)或(b)所記載之重鏈可變區、及輕鏈可變區: (a)抗體為由序列識別號21所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號19所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區;或 (b)抗體為由序列識別號25所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號23所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區。
  42. 如請求項38至41中任一項之治療方法,其包含由選自包含以下的(a)~(e)之群組的胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由選自包含(f)~(k)之群組的胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (a)序列識別號54所記載之胺基酸序列; (b)序列識別號58所記載之胺基酸序列; (c)序列識別號62所記載之胺基酸序列; (d)對於(a)~(c)之序列中各CDR序列以外的框架區之序列具有至少95%以上之相同性的胺基酸序列; (e)於(a)~(c)之序列中的各CDR序列以外的框架區之序列中有1或數個胺基酸係缺失、經取代或附加的胺基酸序列; (f)序列識別號38所記載之胺基酸序列; (g)序列識別號42所記載之胺基酸序列; (h)序列識別號46所記載之胺基酸序列; (i)序列識別號50所記載之胺基酸序列; (j)對於(f)~(i)之序列中各CDR序列以外的框架區之序列具有至少95%以上之相同性的胺基酸序列、及 (k)於(f)~(i)之序列中的各CDR序列以外的框架區之序列中有1或數個胺基酸係缺失、經取代或附加的胺基酸序列。
  43. 如請求項42之治療方法,其中抗體包含選自包含以下的(a)~(e)之群組的重鏈可變區及輕鏈可變區: (a)由序列識別號54所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號38所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (b)由序列識別號58所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號42所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (c)由序列識別號54所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號46所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區; (d)由序列識別號58所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號50所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區;及 (e)由序列識別號62所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號46所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區。
  44. 如請求項38至43中任一項之治療方法,其中抗體為嵌合抗體。
  45. 如請求項38至43中任一項之治療方法,其中抗體為人類化抗體。
  46. 如請求項38至45中任一項之治療方法,其中抗體包含人類IgG1、人類IgG2或人類IgG4的重鏈恆定區。
  47. 如請求項45或46之治療方法,其包含選自包含以下的(a)~(e)之群組的重鏈及輕鏈: (a)由序列識別號52之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號36之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (b)由序列識別號56之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號40之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (c)由序列識別號52之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號44之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈; (d)由序列識別號56之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號48之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈;及 (e)由序列識別號60之胺基酸編號20~471所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號44之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈。
  48. 如請求項38之治療方法,其中抗體會與如請求項39至43及47中任一項之抗體於對CLDN6及/或CLDN9之結合上競爭,或會與如請求項39至43及47中任一項之抗體所辨識之CLDN6及/或CLDN9上的部位結合。
  49. 如請求項34至37中任一項之治療方法,其中抗體會與HER2特異性地結合。
  50. 如請求項49之治療方法,其具有抗體依賴性細胞毒殺(ADCC)活性及/或補體依賴性細胞毒殺(CDC)活性。
  51. 如請求項49之治療方法,其中抗體之重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且包含會造成ADCC及/或CDC活性降低的變異。
  52. 如請求項51之治療方法,其中抗體之重鏈恆定區為人類IgG1的重鏈恆定區,且於該重鏈恆定區中藉由EU Index所示之234位及235位的白胺酸被丙胺酸取代。
  53. 如請求項49或50之治療方法,其中抗體包含由序列識別號65所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號64所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成。
  54. 如請求項49、51及52中任一項之治療方法,其中抗體包含由序列識別號75之胺基酸編號20~139所記載之胺基酸序列構成的重鏈可變區、及由序列識別號73之胺基酸編號21~127所記載之胺基酸序列構成的輕鏈可變區而成。
  55. 如請求項49、51、52及54中任一項之治療方法,其中抗體包含由序列識別號75之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號73之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成。
  56. 如請求項49、51、52及54中任一項之治療方法,其中抗體包含由序列識別號77之胺基酸編號20~469所記載之胺基酸序列構成的重鏈、及由序列識別號76之胺基酸編號21~234所記載之胺基酸序列構成的輕鏈而成。
  57. 如請求項38至56中任一項之治療方法,其中抗體包含選自包含N-鍵結型糖鏈附加、O-鍵結型糖鏈附加、N末端的處理、C末端的處理、脫醯胺化、天冬胺酸的異構化、甲硫胺酸的氧化、於N末端之甲硫胺酸殘基的附加、脯胺酸殘基的醯胺化、及於重鏈的羧基末端之1個或2個胺基酸殘基的缺失之群組的1或2以上之修飾。
  58. 如請求項57之治療方法,其係於抗體之重鏈的羧基末端有1個或數個胺基酸殘基缺失。
  59. 如請求項57或58之治療方法,其係於抗體之2條重鏈雙方的羧基末端有1個胺基酸殘基缺失。
  60. 如請求項57至59中任一項之治療方法,其中抗體之重鏈的羧基末端的脯胺酸殘基進一步被醯胺化。
  61. 如請求項34至60中任一項之治療方法,其中N297糖鏈為N297-(Fuc)MSG1。
  62. 如請求項34至61中任一項之治療方法,其中m1 為1的整數。
  63. 如請求項34至62中任一項之治療方法,其中抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物中之抗體每1分子的平均藥物結合數為1~3或3~5。
  64. 如請求項34至63中任一項之治療方法,其中PARP抑制劑為奧拉帕尼、盧卡帕尼、尼拉帕尼、或者他拉唑帕尼、或彼等之藥理上可容許的鹽。
  65. 如請求項34至64中任一項之治療方法,其係用於選自包含肺癌(非小細胞肺癌、小細胞肺癌等)、腎癌、尿道上皮癌、大腸癌、***癌、多型神經膠質母細胞瘤、卵巢癌(表層上皮性腫瘤、間質性腫瘤、生殖細胞腫瘤等)、胰臟癌、乳癌、黑色素瘤、肝癌、膀胱癌、胃癌、食道癌、子宮體癌、睾丸癌(精細胞瘤、非精細胞瘤)、子宮頸癌、胎盤絨毛癌、腦腫瘤、頭頸部癌以及彼等之轉移性形態之群組的至少一個癌症之治療。
  66. 一種包含如請求項1之抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物的醫藥組成物,其係用以與PARP抑制劑併用。
  67. 一種醫藥組成物,其係包含PARP抑制劑,且藉由與如請求項1之抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物併用,而使該結合物的作用上升。
  68. 一種包含PARP抑制劑的醫藥組成物,其係用以與如請求項1之抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物併用。
  69. 一種醫藥組成物,其係包含如請求項1之抗體-吡咯并苯二氮呯衍生物結合物,且藉由與PARP抑制劑併用,而使PARP抑制劑的作用上升。
  70. 如請求項1之醫藥組成物,其係該吡咯并苯二氮呯衍生物於DNA的小凹槽(minor groove) 中不形成交聯的醫藥組成物。
  71. 如請求項1之醫藥組成物,其中癌症係對PARP抑制劑為非敏感性的醫藥組成物。
  72. 如請求項1之醫藥組成物,其中癌症係對同源重組(HR)依賴的DNA雙股斷裂(DSB)修復途徑為非依賴的醫藥組成物。
  73. 如請求項34至64中任一項之治療方法,其中於各自不同的製劑作為有效成分而含有如請求項1之抗體-藥物結合物與PARP抑制劑,且同時或於不同時間進行投予。
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