TW201000635A - Preparation of epsilon-caprolactam from (Z)-6,7-dihydro-1H-azepin-2(5H)-one - Google Patents

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201000635 六、發明說明： 【發明所屬之技彳椅領碱】 本發明係有關於用於自（z)_6,7_二氫-1H-気呷_2 ⑽)-I同 製備ε-己内醯胺之—種方法。本發明進一步關於可用於 内酸胺製備作用之一宿主細胞。 C先前技術】 己内醯胺係可用於製造聚醯胺例如尼龍-6或尼龍6

(己内醯胺與月桂内醯胺之共聚物）之一種内醯胺。技蘇中 知自大批化學製品製備己内醯胺之不同方式，及包括自 酮、甲苯、苯酚、環已醇、苯或環己烷製備己内醯胺之作 用。一般自礦物油取得該等中間化合物。鑑於對於以更具 永續性的技術製備物質之要求的增長，有利地係提 、 "—種 方法，其中己内醯胺係製備自可自一生物來源取得 — < ~^重 中間化合物’或至少製備自使用一生化方法轉化成為已内 醯胺之一種中間化合物。而且，有利地係提供—種方法， 其所需的能源係少於使用來自石化來源的大批化學製品之 習用化學方法。 已知自6-胺基己酸（6-ACA)製備己内醯胺，如第 6，194,572號美國專利中所述。如^/02005/068643中所揭 鉻’可藉由在具ίΧ，β-稀酸醋遥原酶活性的一酵素存在下， 轉化6-胺基己-2-稀酸（6-ΑΗΕΑ)，而以生化方式製備 6-ACA。可自離胺酸製備6-ΑΗΕΑ，如以生化方式或藉由純 化學合成作用。雖然，經由6-ΑΗΕΑ還原作用之6-ACA製備 作用’可藉由W02005/068643中所揭露的方法進行，發明 201000635 者已發現在還原反應條件下，6 - A Η E A可立即及實質地以不 可逆方式環化而形成一種不良的副產物，特別是万-高脯胺 酸。該環化作用可為6-ACA製造作用中之一瓶頸，及導致 產量的顯著損失。 t發明内容3 本發明之一目標係提供用於製備己内醯胺之一種新穎 的方法，其可作為已知方法之替代方案。尤其，其一目標 係提供用於製備一中間化合物之一種新穎的方法，自該中 間化合物可製備己内醯胺。 另一目標係提供克服上所提及的一或多種缺點之一種 新穎的方法。 另一目標係提供用於製備己内醯胺之一種新穎的發酵 方法。 可依據本發明達成之一或多種其他目標，係如後續說 明中所述。 目前已發現可能自一特定的起始化合物，依生物催化 方式製備己内醯胺。 因此，本發明係有關於用於製備ε-己内醯胺之一種方 法，其包括還原（Ζ)-6,7-二氫-1//-氮呼-2(5//)-酮的碳-碳雙 鍵，其中該還原作用係由一種生物催化劑所催化。 本發明係基於可能以生物催化方式自離胺酸或自藉由 離胺酸環化作用可製得的一產物製備己内醯胺之見解。 本發明促成製備實質上不含不良的環狀副產物特別是 β-高脯胺酸之己内醯胺。 201000635 在本發明的一個有利實施例中，己内醯胺係以發酵方 式製備。 c實施方式；1 如用於此之“或”一詞係指“及/或”，除非另外說明之。 如用於此之“ 一（a)”或“一（an)” 一詞係指“至少一”，除非 另外說明之。 當提及一單數名詞（如一化合物、一添加劑等）時，係意 欲包括複數。因此，當提及一特定名詞如“化合物”時，其 係指“至少一種”該名詞，如“至少一種化合物”，除非另外 說明之。 當提及存在立體異構物之一化合物時，該化合物可為 該等立體異構物中之任一者或其組合物。因此，當提及如 存在對映異構物之一種胺基酸時，該胺基酸可為L-對映異 構物、D-對映異構物或其組合物。當存在天然的立體異構 物之情況，該化合物較佳為一種天然的立體異構物。 當在此提及羧酸或羧酸酯如6-ACA、另一種胺基酸或 一脂肪酸時，該等詞係意欲包括質子化羧酸，其等的對應 羧酸酯（其等的共軛鹼）以及其鹽類。當在此提及胺基酸如 6-ACA時，該詞係意欲包括處於其等的兩性離子形式（其中 該胺基係處於質子化形式而該羧酸鹽基係處於去質子化形 式）之胺基酸、其中該胺基係處於質子化形式而該羧基係處 於其中性形式之胺基酸及其中該胺基係處於其中性形式而 該羧酸鹽基係處於去質子化形式之胺基酸，以及其鹽類。 同樣地，當提及一種胺（如離胺酸或另一種胺基酸，或ACL) 5 201000635 時，其係意欲包括質子化胺（典型地為陽離子性如r-nh/) 及未質子化胺(典型地無電荷如r_NH2)。 當芩照括弧内的一酵素類型（EC)提及一酵素時，該酵 素類型係该酵素基於國際生化與分子生物聯盟之命名委員 會（NC-IUBMB)所提供的酵素命名法歸類或可被歸類之一 犬頁型，遠命名法可見於http://wwwchem_qmuiacuk/iubmb/ enzyme/。意欲包括仍未（尚未)被歸類為一特定類型但可如 此被歸類之其他適宜的酵素。 “同源體”一詞’在此係特別用於所具有的序列同一性 至少為30%、較佳至少4〇%、更佳至少6〇%、更佳至少65%、 更佳至少70%、更佳至少75%、更佳至少8〇%、特別是至少 85%、更特別是至少9〇%、至少91%、至少92% '至少93%、 至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至 少99%之多核苷酸或多肽。同源體一詞亦意欲包括因遺傳 密碼退化性而與編碼同一多肽序列的另一種核酸序列（多 核苷酸序列）不同之核酸序列（多核苷酸序列）。 序列同一性或相似性在此界定為藉由比對二或多個多 肽序列或二或多個核酸序列（多核苷酸序列）所測定之該等 序列之間的關係。通常，序列同一性或相似性係比對序列 的全長，然而亦可僅比對彼此對齊的序列之一部份。在技 藝中’“同一性”或“相似性”亦指多肽序列或核酸序列（多核 苷酸序列）之間的序列相關程度，如可藉由該等序列股之間 的匹配程度所測定者。測定同一性或相似性的較佳方法之 設計，係得出測試序列之間的最大匹配裎度。在本發明的 201000635 内文中，測定二個序列之間的同一性與相似性之較佳的電 腦程式方法包括BLASTP與BLASTN (Altschul，S.F.等人於 1990年期刊“j. Mol. Biol.”第215期第403-410頁乙文），其可 自NCBI及其他來源公開取得（美國馬里蘭州20894貝瑟斯塔 (Bethesda)的國家衛生研究院（NIH)所屬國家醫學圖書館 (NLM)與國家生物中心（NCBI)之Altschul，S.等人所著之 BLAST手冊）。使用BLASTP進行多肽序列比對之較佳參數 為空隙開口 10.0、空隙延伸0.5、區段取代矩陣(Bl〇sum) 62 之矩陣。使用BLASTN進行核酸序列比對之較佳參數為空 隙開口 10.0、空隙延伸0.5、DNA全矩陣(DNA同一性矩陣）。 在本發明的一種方法中，使用一種生物催化劑，亦即 該方法的至少一個反應步驟係藉由衍生自一種生物來源例 如一生物體或自其所衍生的一種生物分子之一種生物物質 或部份所催化。該生物催化劑可特別包括一或多種酵素。 該生物催化劑可以任一形式使用。在一實施例中，所用的 一或多種酵素係自天然環境所分離（自製造其的生物體所 分離）’例如以一洛液、一乳化液、—分散液、冷凍乾燥細 胞（的一懸浮液）、一溶胞產物或固定於一支撐物上之形式。 在一貫她例中，一或多種酵素形成—種活的生物體(諸如活 的全細胞）之部份。邊酵素可在細胞内產生催化功能。該酵 素亦可釋出至該細胞所存在之一基質中。 活的細胞可為生長細胞、休止或休眠細胞(如孢子）或處 於固定相的細胞。亦可❹形成1透化（亦即使其成為該 酵素的-受質或該-或多種酵素的一受質先質可滲透的) 7 201000635 細胞部份之一酵素。 用於本發明的—種方法中之—種生物催化劑，原則上 可為任一生物體’或得自或衍生自任一生物體。該生物體 可為真核或原核。尤其’該生物體可選自動物（人類以外， 至少就涉及使用生物體乙節而言）、植物、細菌、古菌、酵 母菌及真菌。一種適宜的生物催化劑或其部份原則上亦可 來自人類。尤其’―酵素可得自或衍生自本發明的方法中 所用之人類細胞物質。 在實細*例中’一種生物催化劑如酵素可源自動物， 特別是來自其一部位如肝、胰、腦、腎或其他器官。該動 物尤其可選自無脊椎海生動物，更特別地選自海綿動物（海 綿動物門（ZWi/era))，尤其選自尋常海綿綱 (Z)㈣、厚星海綿科或碧玉海綿 科（九心e)，如南海海綿物種、厚星海綿屬 物種、f>oec"丨似加屬•種、異缴岭科 及哺乳動物，更特別為選自下列群中之哺乳動 物：兔科(L卬〇π·而e)、鼠科(MimWae)、豬科及牛科 (βον/ίΛϊβ)。 適宜的細菌尤其可選自下列群中：假單胞菌屬 (Pseudomonas)、椁蛰餍、Bacillus)、大腸桿菌屬 (仏c/ieWc/i⑷、蒼白桿菌屬办flCirww)、檸檬酸細菌屬 (C/irakcrer)、克雷白氏桿菌屬（幻⑷、分枝桿菌屬 、普羅威登斯菌屬（尸、無色桿菌 屬（Ac/zromokcier)、紅球菌屬（/^Oi/0COCCl^)、黏球菌屬 201000635 (Myxococc⑽）、腸桿菌屬、嗜曱基菌屬 (Mei/i;y/o/7/zi7i/i)、鏈黴菌屬、無色桿菌屬 (AcAwmokcier)、土壤絲菌屬（TVoca/Άα)、棲熱菌屬（TTzemMi) 及產驗桿菌屬04/ca/i'gewa)。 適宜的真菌尤其可選自下列群中：麴菌屬 (h/?er沖/似）、銀耳屬（7>mw/a)及黑團孢黴屬（pen‘c⑽⑷。 適宜的酵母菌尤其可選自下列群中：念珠菌屬 # (Cawci/i/a)、酵母鹵屬、克魯維酵母屬 (尺/Mjveromyces)、隱球酵母屬（cryp/^CC)CCWiy)及絲孢酵母屬 (Trichosporon)。 嫻熟技藝者將明瞭可在如本發明的一種方法中使用具 有適且活性之一種天然存在的生物催化劑（野生型）或一種 天然存在的生物催化劑之一突變體。可藉由嫻熟技藝者所 知的生物技術，诸如如分子進化或合理設計，增進天然存 在的生物催化劑之性質。可使用嫻熟技藝者所知之突變誘 發技術(隨機突變誘發、定點突變誘發、定向演化、基因重 組等），例如藉由修财作為生物催化劑或可產生生物催化 性部份（諸如-酵素）之—生物體的編碼_人，而製造野生 型生物催化劑之突變體。尤立环佟 砠尤具可修飾^^八，藉此其所編碼 的-酵素與野生型酵素相差至少—個絲酸，因而相較於 野生型，其料的—酵素包括-或多個胺基酸取代作用、 刪除作用及/絲插作用，紐此該突變體結合二或多個原 始酵素之序列，或藉由促成㈣方式所料的臟在一適 宜（宿主）細胞巾之錢。後者可__技藝麵知之方法 9 201000635 達成，諸如密碼子最適化作用或密碼對最適化作用，如基 於如WO 2008/000632中所述之一種方法。w〇 20〇3/〇1〇183 揭露特別適用於製備變異體多核苷酸之一種方法，其使用 多核苷酸的起始族群之突變誘發作用與該突變型多核苦酸 的重組作用之組合。 突變型生物催化劑可具有增進的性質，例如就下列一 或多個方面而言：對於受質之選擇性、活性、安定性、溶 劑耐受性、pH值廓型、溫度廓型、受質廓型、對於抑制作 用之敏感性、輔助因子之使用及受質親和力。藉由採用如 基於嫻熟技藝者所知的該等方法之適宜的高效率筛檢或挑 選方法，可辨識出具有增進的性質之突變體。 當提及來自一特定來源之尤其是一酵素之一種生物催 化劑時，源自一種第一生物體但實際上在一種（經基因修飾 的）第二生物體中製造之尤其是酵素之重組型生物催化 劑，係特定地意欲包括來自該第一生物體之生物催化劑， 尤其是酵素。 用於如本發明的一種方法中之6,7-DAO,原則上可依任 一方式取得。例如，6,7-DAO可依化學方式或生物催化方式 如微生物方式合成。 例如，可基於如Donat與Nelson於期刊“J. 〇rg Chem.“（ 1957年）第22期第1106頁乙文中所述之一種方法製 備6,7-DA0,其内容在此併入本案以為參考資料，尤其就反 應條件方面而言。 此外，6,7-DAO的化學製備作用可基於如Reimschuessel， 10 201000635 Η· Κ·等人於期刊“J. Org. Chem.”（1969年）第34期第969頁乙 文，該文獻之内容在此併入本案以為參考資料，尤其就反 應條件方面而言。基於該方法，嫻熟者將可在氣化氫或溴 化氫（或類似者)存在下，藉由以NaN02進行ACL重氮化作用 而自ACL製備6,7-DAO,藉此所形成的重氮化ACL衍生物分 別在原處轉換為α-氯-或α-溴己内醯胺。可在一消去反應 中，使用如該文獻中所述之2,6-二甲基吡啶，將後者化合物 (或當使用一種不同的酸時之一類似化合物）轉化為 6J-DAO。 在一實施例中，藉由將α-胺基-ε-己内醯胺（ACL)轉化 成為6,7-DAO，而製備6,7-DAO。可藉由移除ACL的oc-胺 基，而製備6,7-DAO。在一實施例中，其係藉由除氨作用而 達成。在另一實施例中，該移除作用包括後續的胺基移轉 作用、酮基還原作用及脫水作用。 在一特定的實施例中，ACL轉化為6,7-DAO之作用，係 在催化該轉化作用的一種生物催化劑存在下進行。 尤其可在包括藉由具有氨裂解酶活性的一種生物催化 劑進行自ACL之生物催化性除氨作用之一種方法中，以生 物催化方式自ACL移除α-胺基，藉此形成6,7-DAO ;或藉由 可催化該消去作用的另一種生物催化劑或可催化該氨基移 除作用之另一種生物催化劑，自ACL移除α-胺基，而自ACL 製備 6,7-DAO。 尤其可藉由包括一種裂解酶（EC 4)之一種生物催化 劑，催化自ACL移除oc-胺基之作用，以產生6,7-DAO。較佳， 11 201000635 使用一種碳-氮裂解酶(EC 4.3)，更佳使用一種氨裂解酶(EC 4.3.1)。 如上所提及，催化ACL轉化為6,7-DAO的作用之一種生 物催化劑，例如可源自一生物體。 亦可能使用如後述之一種挑選方法，選擇適用於將 ACL轉化為6,7-DAO的生物催化劑。 例如，可使用包含可能用於自ACL移除α-胺基的生物 催化劑之一集合庫，選擇一種生物催化劑。在用於尋找適 宜的生物催化劑之一種挑選方法中，該候選生物催化劑與 其中存在ACL及/或ACL的至少一種官能類似物作為唯一的 氮來源之一種培養基接觸。唯有可利用ACL-類似物作為氮 來源之微生物可以生長。 之後，挑選在該培養基中展現生長之一或多種試樣(所 謂的‘生長培養株’）。之後，試驗該等生長培養株中之一或 多者是否具有將ACL轉化為6,7-DAO之活性。選擇性地，尤 其在僅使用一或多種ACL-類似物作為唯一的氮來源之情 況下，首先檢視該生長培養株是否展現轉化一或多種ACL-類似物之活性，之後，對於展現該活性的一或多種培養株， 試驗其等將ACL轉化為6,7-DAO之活性。 因此，就本發明的一特定方面而言，本發明係有關於 用於尋找可催化自ACL移除α-胺基的作用之一種生物催化 劑之一種方法，其包括： -提供包含一或多種細胞培養中的多種候選生物催化劑之 一庫，該培養包括含有α-胺基-ε-己内醢胺及/或其一或多種 12 201000635 類似物作為唯一的氮來源之一培養基； -挑選在該培養基中生長之一或多種候選生物催化劑及 -篩檢在該培養基中生長及在自ACL移除α-胺基的作用中呈 有催化活性之一種生物催化劑。 八 如用於此之“挑選”一詞係界定為一種方法，其中使用 一些特定的條件，測試一或多種生物催化劑之生+ ，生 長作用係表示存在所欲的生物催化性活性。 如用於此之“篩檢，’一詞係界定為一種方法，其中測試 一或多種生物催化劑之一（或多種）所欲的生物催化性轉2 作用。 該庫尤其可為包括微生物的基因體片段 — 種多源基 因庫，該等片段可能已被辨識出或可能尚未被辨識出，及 該等片段已被植入一適宜的微生物體中以供表現，噹如大 腸桿菌屬、假單胞菌屬（仏⑼办所⑽奶卜桿菌 屬⑺⑽7/㈣、鏈黴菌屬伽明⑽或酵母菌"屬 ⑽）。該等片段原則上可源自任—生物體及— 或多種生物體。該生物體可為在現行的條件下可培養或不 可培養者，可具有一特定的棲所，需要特定的環境因子(如 溫度、pH值、光、氧、營養素）或共生夥伴。尤其該生物體 可為一種多細胞生物體諸如海綿、昆蟲、哺乳動物或植物 之内共生體。 在一實施例中，該庫包括含有候選生物催化劑之多種 環境试樣，特別是多種水試樣(如廢水試樣）、堆肥試樣及/ 或土壤s式樣。該試樣包括多種野生型微生物。 13 201000635 在此所用之“ACL的官能類似物”一詞，係指包括該生 物催化劑可辨識的一官能基之類似物。尤其，一官能類似 物可具有L-或D-構形或其任一比例的混合物，及係由在α-位置及選擇性地在内醯胺氮上具有一個附加的碳取代基之 一個7員的α-胺基内醯胺或α-胺基(硫代）内酯所組成。 較佳，所選擇的ACL-類似物係i)引發所欲的ACL氨裂 解酶活性或類似活性，導致自ACL移除α-胺基的作用；及ii) 引發副反應之傾向低。尤其，唯一的氮來源可由化學式I或 II所代表之一或多種化合物組成：

在此，R與R’獨立地代表一個氫原子，或選擇性地包括一或 多種雜原子之一有機部份。有機部份R與R’中的雜原子可特 別選自氮、硫、氧、氟、氯、溴及碘原子。有機部份R與R’ 尤其可獨立地選自被取代與未被取代的C1-C6烷基。X代表 一個氧原子或一個硫原子。 較佳使用一或多種官能類似物作為唯一的氮來源’因 為當使用ACL時，發明者預計發現一偽陽性之機率較高。 用於尋找可催化ACL轉化為6,7-DAO的一種生物催化 劑之另一種適宜的挑選方法，係基於離胺酸營養缺陷型互 補作用。在此，身為離胺酸營養缺陷型及具有ACL水解酶 14 201000635 活性之一適宜的宿主細胞，係用於基因體或多源基因庫之 表現篩檢。該宿主細胞可為天然存在者，或可經工程建構， 如藉由將大腸桿菌（£· co//)中的lysA基因去活化及表現一 適宜的ACL-水解酶。該宿主細胞然後用於建構如上述之一 庫，造成不同的宿主細胞含有不同的DNA片段。不同的細 胞包括不同的植入基因。 該宿主細胞與包含6,7-DA0作為唯一的離胺酸先質之 一培養基接觸。然後，挑選在該培養基中生長之一或多種 宿主細胞。之後，通常測試一或多種生長宿主細胞是否具 有將6,7-DAO轉化為ACL之催化性活性。之後，測試一或多 種生長的宿主細胞（通常選自該等具有將6,7-DAO轉化為 ACL之催化性活性者）是否具有將ACL轉化為6,7-DA0之催 化性活性。具有該活性的宿主細胞可作為一種生物催化 劑，或可自其取得一種生物催化劑。 因此，本發明係進一步關於檢測可催化α-胺基-ε-己内 醯胺的α-胺基移除作用之一生物催化劑之一種方法，其包 括： -提供離胺酸營養缺陷型宿主細胞，該宿主細胞所包括之一 基因係編碼可催化α-胺基-ε-己内酿胺轉化為L-離胺酸的作 用之一酵素，該宿主細胞所包含之一候選基因係編碼具離 胺酸環化酶活性之一酵素； -該宿主細胞與包含不同的載體之一庫接觸，該載體所含有 的一候選基因係編碼可催化6,7-DAO轉化為ACL的作用之 一酵素，藉此至少一部份的宿主細胞具有該載體； 15 201000635 -將具有該載體的宿主細胞與（Z)-6,7-二氫-1//-氮呼-2(5//)-酮及一種氨來源接觸； -挑選在該培養基中生長之一或多個培養株；及 -篩檢展現生長的該等培養株中之一或多者是否在a-胺基 -ε -己内醯胺的α -胺基生物催化性移除作用方面具有催化性 活性，因該培養株提供可催化a-胺基-ε-己内醯胺的a-胺基 消去作用之生物催化劑。 發明者所預計之另一種適宜的篩檢方法，係基於在一 適宜的宿主生物體中使用一種分子受體與報導子系統。在 技藝中曾述及數種該等系統(Beggah，S.; Vogne，C.; Zenaro, Ε. ; van der Meer，J. R.於 2008 年期刊 “Microbial Biotechnology”第 1(1)期第 68-78頁乙文；Sint Fiet,，S. ; van Beilen, J. B. ; Witholt, B.於2006年期刊 “Proceedings of the National Academy of Sciences” 第 103(6)期第 1693-1698 頁乙 文）。在該一系統中，在此亦稱作受體之一適宜的轉錄調控 子，可與所探討的一化合物諸如6,7-DAO或一類似物結合。 該受體可為如在對於所探討的化合物的專一性與結合親和 力方面具有所欲性質之天然存在的受體。在大部份的情況 下，必須藉由一般技藝中已知的蛋白質工程方法，針對所 探討的特定化合物及受體交互作用進行該等性質之最適 化。在結合之際，該受體自一適宜的啟動子引發轉錄作用， 該啟動子與在此亦稱作報導子之一適宜的報導子基因連 接。適宜的報導子原則上可為引發一種可檢測與較佳可量 化的宿主品系表現型之一基因，諸如製造一色素、一螢光 16 201000635 蛋白、與一營養缺陷型互補的一酵素或一抗生素抗藥性標 記0

可在一宿主中建立該受體/報導子系統，及後續用於篩 檢（如使用一種螢光蛋白諸如一種綠色螢光蛋白作為報導 子之情況）或挑選（如使用一種抗生素抗藥性基因作為報導 子之情況）用於將ACL轉化為6/7-DAO之一種適宜的生物催 化劑。該宿主細胞舆包含ACL或其一類似物之一培養基接 觸。然後，挑選或篩檢該宿主細胞培養之一或多者是否引 發對應於報導子表現作用之一表現型。之後，通常測試古玄 宿主細胞培養之一或多者是否具有將ACL轉化為6,7 da〇 之催化性活性。具有該活性之宿主細胞可作為—種生物催 化劑’或可用於自其取得一種生物催化劑。 因此，本發明亦有關於尋找可催化α-胺基ε_已内醯胺的 α-胺基移除作用之一生物催化劑之一種方法，其包括. -辨識出或工程建構與6,7-DAO專一性結合之—成遍 又體； -將該受體與一適宜的報導子諸如一種0_半乳糖苷酶、綠色 螢光蛋白或一種抗生素抗藥性基因連接； -選擇性地經由一或多回合的蛋白質工程以獲致所#的專 一性（亦即來自天然配位子及/或ACL或類似物之、π虎八無 或低)及對於6,7-DAO或其類似物之所欲的親和士 々，而隶適 化6,7-DAO與該受體之結合作用； -在適於多源基因師檢的一宿主中表現該—受體/极導子. -將該宿主細胞與包含不同的載體之一庫接觸，該栽體所入 有的一 候選基因係編碼可催化6,7-DAO轉化為Acl的作用 17 201000635 之種生物催化劑（諸如 胞包含該載體； —酵素）’藉此至少一部份的 宿主細 :=Γ之宿主細胞與acl或其-類似物接觸； 土； k的報導子之表現作用，挑選或 表現型之-❹種騎株；& H見所欲的 -筛檢該等培養株中之—或多者是否在α_ 的α-胺基生物催化帅除作时面具有催域=内酿胺 培養株提供可催—基_£—己㈣胺的^基2作因該 生物催化劑。 土啕去作用之 、扁碼可催化胺基七己内醯胺轉化為離 -種生物催化劑諸如一酵素之基因，可使用―：乍:： 習用方式而適宜地納入宿主細胞中。 a耩 載體，適宜地將編碼具有離_環化酶活性 々生物催化劑之候選基因納人宿主細财，該載體可相同 或不同於編碼可催化α，胺基_ε_己内醯胺轉化為離胺酸的作 用之一種生物催化劑之載體。 可用於如本發明的一種方法中之ACL ’原則上可依任 一方式製得。例如，可依化學方式或生物催化方式合成 ACL。在一實施例中，ACL係萃取自一種天然來源。例如， 可自包含一ACL部份之一種天然存在的分子，藉由如弱酸 性水解該部份’而製得ACL。例如，自其可製得acl之天 然存在的分子在水解作用之後，係為來自灰色鏈黴菌 (Si/Tpiomyca gWw⑽)之開普拉黴素(capUramyCin);來自屬 於碧玉海綿科的海綿動物之泵阿米德(bengamide) 18 201000635 與異泵阿米德（isobengamide)衍生物；來自海綿 尸oec/n/Zimna屬切以川·種之倍半萜衍生物；來自變綠黏球菌 (Mpococcw Wresce似)之泵阿米德（bengamide)衍生物；來 自深海分離菌PC12/1000-B4 (於1993年期刊“Tetrahedron” 第49(30)期第6569-6574頁乙文）之己内醯亞胺a與B;來自土 壤絲菌屬物種之土壤絲菌素衍生物；及來自真菌 南粱根腐病菌（Per/comk c/rc/naia)之高粱根腐病菌素。 在本發明的一實施例中，ACL係藉由離胺酸的環化作 用而製備，該環化作用係由一種生物催化劑所催化。原則 上，可使用D-離胺酸、L-離胺酸或其混合物。藉由該等的 環化作用，形成D_ACL、L_ACL或其混合物。就實務操作 而言’較佳為L-離胺酸。 用於該環化反應之生物催化劑，較佳包括具離胺酸環 化酶活性之—酵素。例如，所狀具離胺酸環化酶活性的 一酵素可源自如上述之一生物體。 尤其，可催化離胺酸環化為ACL的作用之一酵素，可 為選自下列群中之水解酶(EC3)。該水解酶較佳選自下列群 中：作用在s旨鍵之水解酶（醋酶)(EC31)及作用在碳_氮鍵而 =肽鍵之水解酵素(EC3|S旨酶尤其可選自下列群中續 曰欠解酶(EC 3.1，1)及更特別地為減自旨酶(Ec3丄li)， :佳來自豬肝_。败5類型之一酵素尤其可選自下列群 之主要作用在直鏈醯胺的水解酶(EC 3.5.1)。 =要翻在直鏈醯胺之水解酶諸如醯_，可特別為 白桿菌屬（〇咖〇办⑽叫、紅球菌屬⑽_隱簡）、 19 201000635 腸桿菌屬（E/iierobacier)、棲熱菌屬（TT^rmw·?)、克雷白氏桿 _屬（A7eWe//ct)、麵菌屬（心pergj//WiS·)、嗜曱基菌屬 (Me Α：ν/ο/7/π_/ί^)或分枝桿菌屬·圆)之該等水解 酶。更特別地，主要作用在直鏈醯胺之水解酶諸如醯胺酶， 可來自選自下列群中的一生物體：人蒼白桿菌 (Ochrobactrum anthropi) ' 紅城紅球 erythropolis)、陰溝腸桿菌（Enterobacter cloacae)、棲熱菌屬 (77^清似)物種、土生克雷白氏菌（尺⑼α)、產 酸克雷白氏菌（A：/eWd/a ojcyioca)、小巢狀麴菌（Averg/Z/w nidulans)、食 f 基^ i 菌（Methylophilus methylotrophus) 及耳'"垢分枝桿囷 C^_yco办acien.Mm 。 在ACL進一步用於製備己内醯胺之—種方法中，源自 人蒼白才干囷（0c/zro/?acirwm cmi/irapi) NCIMB 40321 之一種 醯胺酶或源自紅城紅球菌（灿0也c〇CCM5 NCIMB 11540之一種醯胺酶係特別有利的。此外，如us 2005/ 0079595或EP-A 1 409 667中所述，酿胺酶可用於環化 反應中，其等有關於具離胺酸環化酶活性的酵素與編碼該 等酵素的基H]之内容，係在此併人本案以為參考資料。 而且’ EC 3.5類型的-酵素亦可特別地選自下列群中 要作用在環狀醯胺中的碳_氣鍵之水解酶(ec Μ·])，其 亦可稱作内_酶，及更特別選自下列群中之離胺酸内辦 胺酶(EC 3.5.2.11)。 m 尤其，内酿胺酶（亦即作用於環狀酸胺内之水解酶)可選 自L-離胺酸从内酸胺水解酶(EC mu)及卜胺基己酸 20 201000635 鹽-環狀二聚體水解酶(EC 3·5 212)。 在一貫施例中，内醯胺酶及尤其是L-離胺酸内醯胺酶 係選自下列群中：來自麴菌屬《出似）、隱球酵母屬 (Oypio⑺、念珠菌屬而）、檸檬酸細菌屬 (Citrobacter)、轉、抱酵母屬（Trich〇Sp〇r〇n)、銀弄屬（jyemeua) 及普維威登斯囷屬（/>r£m•办的内醯胺酶。更特別地，該 内Sakfe S#可遠自下列群中：源自焦麴徽M麻s)、 黑麴锨（A^pergiY心、羅倫隱球酵母 /"wre仙7)、土生假絲酵母（Qj^/如&麵心⑷、弗氏檸檬酸 菌（Ciirakcier /⑽滅·〇、皮狀絲孢酵母 cutaneum)、銀耳（Treme〖la fuciformis)、金耳（Tremella aurentia)、茶银耳(Jremella foliacea)、银耳餍 subanomalia 種及產驗普羅威登斯菌（/VoWi/⑼c/β a/ca/i/flc/ews)之内醯胺 酶0 在一實施例中，特別是6-胺基己酸鹽-環狀二聚體水解 酶（E C3.5.2.12)之一種内醯胺酶，係來自產鹼桿菌屬 諸如來自内醯胺分解型產鹼桿菌 /actom^yhci)或來自無色桿菌屬（Ac/ir⑽okcier)諸如來自乾 燥無色桿菌〇4c/ir6>m6^ackr以厂仍⑷之一種内醯胺酶。 脂酶尤其可選自源自一哺乳動物之脂酶，諸如緒脂 酶、牛脂酶等。尤其’用於本發明的一種方法中之脂酶， 可為一種姨脂酶。脂酶已商品化，如豬胰脂酶可自羅姆 (R0hm)公司（型錄編號7023C)或自西克瑪（sigma)公司（型錄 編號L-3126)取得。網熟技藝者所知之如可自西克瑪(sigma) 21 201000635 公司取得之商品化的豬肝酯酶(PLE)製劑，如邛自西克瑪 (Sigma)公司取得之懸浮液形式（型錄編號E2884)或粉末形 式（型錄編號E3019) ’通常為緒肝酯酶的酵素、同功酶之混 合物。預計在PLE製劑中之一或多種該等同功酶，係負責離 胺酸轉化為ACL的生物轉化作用。若為所欲者，嫻熟技藝 者知道如何在一適宜的宿主中分離、選殖及/或表現豬肝酯 酶同功酶。 在一實施例中，可在離胺酸的環化作用中使用一種非 核醣體肽合成酶(NRPS)。已知二次代謝產物製造者係經由 非核醣體肽合成酶（NRPS)而合成肽。NRPS係詳述於如 Michael A. Fischbach與Christopher T. Walsh於2006年期刊 “Chem. Rev.”第106期第3468-3496頁之“用於聚酮與非核酷 體肽抗生素之生產線酵素學：邏輯、機械裝置及機制 (Assembly-Line Enzymology for Polyketide and Nonribosomal Peptide Antibiotics: Logic, Machinery, and Mechanisms)”乙文及WO/OO/58478中。在一些情況下，與 NRPS的一些部份類似之生物催化劑，亦在經修韩的胺基酸 (如作為尼可黴素（nikkomycin)X中之咪唾咐li5j部份的先質 之在例如新生徽素與β-經基組胺酸中的胺基氧雜萘鄰酮）之 製造作用中作為二次代謝產物的構造單元。在細菌與較低 等真菌中，二次代謝產物的製造作用所需之生物合成基 因，典型地集聚在該基因體上的一個基因座中。尤其，在 使用NRPS之一實施例中，該NRPS可為一種模組化非核_ 體肽合成酶，其包括一個離胺酸專一性腺苷酸化作用結構 22 201000635 域、一個肽基載體結構域及一個硫代酯酶/環化作用結構 域。 在一特定的實施例中，用於離胺酸環化為ACL的作用 中之一種生物催化劑，可在編碼泵阿米德（bengamide)、土 壤絲菌素、開普拉黴素(capuramycin)、高粱根腐病菌素或 含有二次代謝產物的任一其他ACL或ACL衍生物之生物合 成作用的一基因叢集中發現。該基因叢集可存在於製造該 一化合物之任一微生物或其一種微生物内共生體。藉由一 般技藝中已知的方法，諸如基因體掃描、全基因體定序、 使用退化性引子之聚合酶鏈反應（PCR)，或使用來自已知生 物合成途徑的資訊之南方雜交法，即可辨識出該基因叢 集。一個專一性生物催化劑可包括一個截短型NRPS模組， 其係由對於離胺酸活化作用具專一性之一個腺苷酸化作用 結構域、一個肽基載體結構域及一個專一性環化作用結構 域所組成。預期該環化作用結構域係與催化環狀非核醣體 肽諸如短桿菌酪肽的大環化作用之已知的硫代酯酶同源。 預期對於離胺酸環化作用具專一性之一個環化作用結構域 含有專一性的特徵性序列模組，使其與其他的環化硫代酯 酶或硫代酯酶結構域有所差異。離胺酸環化作用所需的結 構域可由產生一模組化生物催化劑的一個開放閱讀框架所 編碼，或在產生不同蛋白質之不同的開放閱讀框架中編 碼，其等一起形成該生物催化劑。在本發明中使用該種生 物催化劑可為有利的，因為該反應與ATP的水解作用偶合及 因而為（至少實質為）非可逆的。 23 201000635 在一實施例中，藉由化學方式轉化離胺酸而製備 ACL。如實例中所述，其例如可在亞硫醯氣存在下，藉由 一醇諸如曱醇酯化離胺酸，及以一鹼諸如曱氧基鈉中和所 產生的反應混合物，藉此發生環化作用而達成。在198〇年 期刊“Tetrahedron Lett.”第21期第2443-2446頁乙文中曾報 導，可在大幅過量的AhO3存在下，如在回流的曱苯中將L_ 離月女酸環化形成ACL。任擇地，如在等莫耳量或選擇性地 過量的Al2〇3存在下，可在一適宜的醇（例如丨_丙醇、丨丁 醇、1-戊醇或1-己醇）中，藉由將離胺酸與一種氫氧化物諸 如氫氧化鈉回流，而形成acl。 如上所提及’在如本發明的一種方法中，ε己内醯胺 之製備係藉由將(ζ)-6,7_二氫餐氮呼_2(5//)_酮的不飽和碳 -碳雙鍵還原，而產生己内醯胺。 該還原作用係在可催化該還原作用的一種生物催化劑 存在下進订。該生物催化劑較佳具有還原酶活性，特別是 6,7 DAO稀酮還原酶活性’亦即該催化劑可催化6,όα〇中 的碳-碳雙鍵還原作用，藉此形成己内酿胺。 君，尤其’该生物催化劑可包括選自下列氧化還原酶(EC 1) 羊中之肖素’更特別地該氧化還原酶可為作用在提供者 的CH-CH基上之—站 < —種氣化還原酶（EC 1.3)，或為作用在 NADH或NADPH卜夕 , 上之—種氧化還原酶(EC 1.6)。 更詳細地，可係田+ 來自EC 1.3.1之一種氧化還原酶，諸 如-種2-稀酮還原，Eci3丄%)。 EC I’6酵素類型的一特定實例為EC 1.6.99.1之老黃酶 24 201000635 第1型（〇YE1)。用於還原6,7-DAO之生物催化劑可與一輔助 因子組α使用’適宜的辅助因子係技藝中已知及依所用的 生物催化劑（酵素）而定。

可催化該還原作用之一種生物催化劑可源自諸如上所 提及的一生物體。尤其，該生物催化劑可源自酵母菌、植 物細菌、古菌、真菌或哺乳動物。更特別地，可催化該 還原作用之一種適宜的生物催化劑可源自選自下列群中的 一 «生物·馬其頓假絲酵母（CaMi/a 、乳酸 克魯維酵母（尺/町/〇(：叫、營光假單胞菌 (尸卿cfomo/iiw //t/owc·)、丁香假單胞菌大豆致病變種 (P則如歸价心⑽）、大腸桿菌⑹咖;^ co//)、釀酒酵母（Sacc/mromyca cerev/hae)及枯草桿菌 [Bacillus subtilis)。 在一特定的實施例中’用於催化該還原作用之生物催 化劑包括如序列辨識編號2、4、6、8、1〇、12或14中任 者所示之一胺基酸序列，或其一同源體。 用於本發明内文中之任一生物催化性步驟之反應條件 之選擇，可依用於該生物催化劑及特別是酵素之“木 件、在此所揭露及選擇性地經由一此例杆眘私 ' 一丁貫驗工作所揭露 的資訊而定。 原則上，所用的反應培養基pH值之選擇範圍廣泛 要該生物催化劑在該PH值條件下具活性即可。，只 劑與其他因子而定，可使用鹼性、中性或酸性條^物，化 方法使用一種微生物時，如用於表現催化本、若"亥 货明的一種方 25 201000635 法之一酵素者，所選擇的pH值係使得該微生物體可展現其 一或多種的預期功能。可特別選擇位於中性pH值以下四個 PH值單位至pH值以上二個pH值單位範圍内之阳值，亦即 在25°C之一個實質含水系統之情況下介於pH 3與pH 9之 間。若水是唯一溶劑或主要溶劑（高於5〇重量％，特別是高 於90重置％ ’以全部液體為基礎），則將一系統係視為含水 系統，其中可溶入少量的醇或另—種溶劑（低於5〇重量％， 特別是低於10重量％，以全部液體為基礎)(如作為—種石炭來 源），若所存在的微生物在該濃度仍保有活性。尤其在使用 -種酵母菌及/或-種真®的情況下，酸性條件可能是較佳 的，PH值可特別介於pH3至pH8之範圍，基於25。匸之一個 實質含水純而言。若為所欲者，可使用—酸及/或一驗調 整PH值，或以_酸與一驗之—適宜的組合物加以緩衝。 =上’培育條件之選擇範圍廣泛，只要該生物催化 :顯二充分的活性及/或生長即可，件可選自下列群 中·有氧、限氧及無氧條件。 無氧條件在此界定為無任何氧氣之條件，或其中該生 勿催化劑特別是—種微生物實質地並未消耗，:二 應於耗氧量低於5毫莫耳/公升•小時，，，及通常對 低於2.5毫莫耳/公升丨眭I 弋對應於耗氧量 旲耳以升·小時，或低於1毫莫耳/公斗, 有氧條件係其中在培養基中溶入供7·怖。 的氣水孚夕狄姓甘 …、吸制生長之充分 的乳水千之祕，其可切至州㈣ 量程度，更佳古於川真甘 升•小時的耗氧 更佳阿於20¾莫耳/公升•小時， 毫草耳/八Λ τ 赴至更佳高於50 鼋冥耳/么升•小時，及最佳高於100毫莫耳/八 、斗/公升.小時。 26 201000635 限氧條件係界定為其中耗氧量受限於氧自氣體至液體 的傳輸作用之條件。限氧條件的下限係由無氧條件的上限 所決定，亦即通常至少1毫莫耳/公升.小時，及特別是至少 2.5毫莫耳/公升.小時，或最特別地至少5毫莫耳/公升·小 時。限氧條件的上限係由有氧條件的下限所決定，亦即低 於1〇〇毫莫耳/公升.小時，低於50毫莫耳/公升.小時，低於20 毫莫耳/公升.小時，或低於10毫莫耳/公升.小時。 不論是有氧、無氧或限氧條件，均依該方法的進行條 件而定，特別是依注入氣流的量與組成、所用設備的實際 混合/質量傳輸性質、所用的微生物類型與微生物密度而 定。 原則上，所用的溫度並不具關鍵性，只要該生物催化 劑特別是酵素展現顯著的活性即可。一般而言，溫度可至 少為0°C，特別是至少15°c，更特別是至少20°c。所欲的最 高溫度係依該生物催化劑而定。一般而言，該最高溫度係 技藝中所知，如在商品化生物催化劑的情況係如產品資料 表中所示，或可基於一般知識及在此所揭露的資訊而例行 地測定。該溫度通常為90°C以下，較佳為70°C以下，特別 為50°C以下，更特別為40°C以下。 尤其，若一生物催化性反應係在一宿主生物體外進 行，可使用高濃度（如高於50重量％，或高於90重量％，基 於全部液體）之包含一有機溶劑的一種反應培養基，若所用 的一酵素在該一基質中保有充分的活性。 在一種有利的方法中，己内醯胺之製備係使用己内醯 27 201000635 胺或用於形成己内醯胺的-中間產物（虹、6,7_da〇)之受 質的全細胞生物轉化作用’包括使用-種微生物，其產生 -種離胺酸環化酶與-種氨裂解酶及/或具有自紙移除^ 月女基的活f生之生物催化劑，及_種6,7七八〇烯酮還原酶及/ 或可將6’7-DAO還料己内醯胺的其他生物催化劑;及使用 供微生物用之一種礙來源。 碳來源可特別含有選自下列群中的至少一種化合物： 元醇、夕元知、羧酸、二氧化碳、脂肪酸、甘油酯，及 包括含有該等化合物中的任—者之混合物。適宜的—元醇 包括曱醇與乙醇，適宜的多元醇包括丙三醇與唉水化合 物。適宜的脂肪酸或甘油酿尤其可以食用油及較佳為植物 來源的形式提供。 尤其可使用一種碳水化合物，因為通常可自生物可再 生性來源，諸如一農產品及較佳一種農業廢棄物質，大量 取得碳水化合物。所用的碳水化合物較佳選自下列群中： 葡萄糖、果糖、蔗糖（surose)、乳糖 '簾糖（saccharose)、殿 氣、纖維素及半纖維素。尤其較佳為葡萄糖 '包含葡萄糖 的寡醣類及包含葡萄糖的多醣類。 6,7-DAO濃度可位於廣泛的限值範圍内。較佳的濃度尤 其依所用的生物催化劑而定。同時，在6,7-DAO的製備作用 及其轉化為己内醯胺的作用均以生物催化方式在同一細胞 (在一種細胞内級聯反應中）進行之一種方法，或6,7_DA〇的 製傷作用及其轉化作用均使用催化該反應的酵素（在細胞 外）進行之一種一鍋式方法，其較佳濃度可能不同於其中 28 201000635 6’7-DAO的製備作用未使用—種生物催化劑或其中 6,7-DAO位於一個不同的反應器中之一種方法。 預計6,7-DAO的濃度可位於奈莫耳（nan〇m〇lar)範圍（j 至1000奈莫耳/公升）、微莫耳範圍（1至1000微莫耳/公升）或 笔莫耳/公升範圍（1至1000毫莫耳），或為超過丨莫耳/公升之 一濃度。 尤其’當6,7-DAO的製備作用與轉化作用係在同一細胞 C 巾以細胞内方式進行或在—種—㈣方法中以細胞外方式 進仃時，1奈莫耳/公升以上、1〇〇奈莫耳/公升以上、1微莫 耳/公升以上、10微莫耳/公升以上或1〇〇微莫耳/公升以上之 一浪度，即可提供足以獲致可接受的或有利的轉化率之 6,7-DA〇濃度。當6,7_DA〇的製備作用係在與其轉化作用相 同的細胞中以細胞内方式進行0寺，該濃度尤討為6,7_dao ^細胞内濃度。在該實施例中，6,7__的細胞外漢度可顯 著車父低，甚至為〇 (亦即低於檢測極限）。 I* 在6,7_DA〇係於一生物體内轉化但6,7-DAO的製備作 用係於5玄生物體外進行之情況下，或在6,7 da〇的製備作用 係於-個不同的反應系統進行及6,7_da〇轉化為己内酿胺 的作用係使用自一生物體所分離的一酵素之情況下， Μ-DAO的濃度通常至少為i微莫耳/公升特別是至少卿 破莫耳/公升，更特別是至少1毫莫耳/公升或至少1〇毫莫耳/ 公升（若使用一生物體則為該生物體所存在的培養基中之 細胞外濃度；或在使用自_生物體所分離的一酵素之情況 下則為6,7-DAO在其中進行轉化作用之反應培養基中的濃 29 201000635 度）。 6,7-DAO的濃度上限並非特別具關鍵性。6 7_da〇的浪 度可為超則料/公升、丨料/公相下、㈣是α5莫等/ 公升以下或G.1莫耳/公升以下。如嫻熟者所瞭解，在使用/ 種生物催化性細胞及_是—餘細胞之情況下，通常所 選擇的6，7 - D Α Ο濃度不會對該細胞構成毒性，至少不會達到 損及其生物催化功能至不合格水平之程度。 可使用技藝中已知的分子生物技術，建構包含用於催 化本發明的-種方法中之-反應步驟的—或多種酵素之〆 細胞，特別是一重組型細胞。例如，若意欲在一重組塑細 胞(其可為一種異源系統）中生產一或多種生物催化劑，可使 用該等技術以提供-載體，該載體包含編碼—或多種生物 催化劑之一或多個基因。可使用各包含一或多個基因之一 或多種載體。可使用-或多種賴，各賴包含該等基因 中之-或多者。該載體可包含—或多種調控^素，如可與 編碼一種生物催化劑的一基因操作連接之一或多種啟動 子。 如用於此之“操作連接，，一詞，係指多核苷酸元素（或編 碼序列或核酸序列）以一功能關係之連接。當一核酸序列與 另一核酸序列處於一功能關係時，該核酸序列即為“操作連 接”。例如，若一啟動子或增強子影響一編碼序列的轉錄作 用，其即與該編碼序列操作連接。 如用於此之”啟動子，，一詞，係指其功能係控制—或多 個基因的轉錄作用之一核酸片段，其係位於相對於該基因 30 201000635 轉錄起始位點的轉錄方向之上游，及在結構上係藉由存在 DNA依賴型RNA聚合酶的一個結合位點、轉錄起始位點及 任一其他DNA序列而被辨識出，該等DNA序列包括但不限 於轉錄作用因子結合位點、抑制蛋白與活化蛋白結合位點 及嫻熟技藝者已知直接或間接作用以調控來自該啟動子的 轉錄量之其他任一核苷酸序列。”持續性”啟動子係指在大 部分的環境與發育條件下均具有活性之啟動子。”誘導性” 啟動子係指在環境或發育調控作用下具有活性之啟動子。 當”同源”一詞用於顯示一特定（重組型）核酸或多肽分子與 一特定宿主生物體或宿主細胞之間的關係時，應瞭解其係 指該核酸或多肽分子在自然中係由同種及較佳相同變種或 品系的一宿主細胞或生物體所產生。 可用於促成編碼本發明的一種方法中所用的一種生物 催化劑及特別是一種6,7-DAO烯酮還原酶與選擇性地至少 一種選自氨裂解酶與離胺酸環化酶群中的生物催化劑之核 酸序列表現之啟動子，諸如上述可為編碼待表現的生物催 化劑之該核酸序列（核苷酸序列）所固有者，或對於其所操作 連接的該核酸序列（編碼序列）而言為異源性者。較佳，該啟 動子係同源性，亦即對於該宿主細胞而言為内源性。 若使用一種異源性啟動子（對於編碼所探討的生物催 化劑之核酸序列而言），該異源性啟動子較佳可產生一較高 穩態水平之包含該編碼序列的轉錄本（或每單位時間可產 生較多的轉錄本分子亦即mRNA分子），相較於該編碼序列 所固有的啟動子而言。就該方面而言之適宜的啟動子同時 31 201000635 包括持續性與料性的天然啟動子以及經王程建構的啟動 子’其等係嫻熟技藝者所知。 相對於一種天然宿主細胞而言，“持續性強啟動子，，係 造成mRNA以尚頻率起始之一種啟動子。在格蘭氏陽性微 生物中之該等持續性強啟動子的實例包括sp〇1_26、 SP01-15、veg、/?：vc(丙g同酸羧化酶啟動子）及麵汗。 格蘭氏陽性微生物中的誘導性啟動子之實例包括IPTG 誘導性Pspac啟動子、木質糖誘導性PxylA&動子。 格蘭氏陰性微生物中的持續性與誘導性啟動子之實例 括但不恨於tac、tet、trp-tet、Ipp、lac、Ipp-lac、laclq、 Γ7、73、；Γ3、ga/、、㈣(pBAD)、SP6、x_Prm_Pl。 用於（絲狀）真菌細胞之啟動子係技藝中已知，及例如可 為葡萄糖-6-磷酸鹽去氫酶幻^八啟動子；蛋白酶啟動子諸如 p印A、pepB、pepC ;葡萄糖澱粉酶gMA啟動子；澱粉酶 amyA、<2m;yB啟動子；過氧化氫酶caiR或catA啟動子；葡萄 糖氧化酶goxC啟動子；β-半乳糖苷酶/acA啟動子；α-葡萄 糖苷酶叩/A啟動子；轉譯延伸因子化/Α啟動子；木聚糖酶啟 動子諸如A、x/nB、x/nC、xMD ;纖維素酶啟動子諸如 eg/A，eg/B，;轉錄調控子之啟動子諸如flreA、creA、 j/nR、pacC ' /?riT等或任一其他者’及可見於NCBI網站 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/) ° “異源性，，一詞當用於一核酸（DNA或RNA)或蛋白質 時，係指該核酸或蛋白質並非其所存在的生物體、細胞、 基因體或DNA或RNA序列之天然存在的一部份’或者其所 32 201000635

存在之一細胞或存在於基因體或DNA或RNA序列中之〜戈 多個位置係不同於天然中所發現者。異源性核酸或蛋白質 對於其所導入的細胞而言並非内源性，而是自另—種細胞 '或以合成方式或重組方式製得。雖然並非必然，—# 而言該等核酸所編碼的蛋白質，並非該〇]^八在其中轉錄或 表現之該細胞所正常產生的。相同地，外源性rna所編碼 的蛋白質’並非外源性RNA存在其中之該細胞所正常表現 的。異源核酸與蛋白質亦可稱作外來核酸或蛋白質。對於 在其:表現的細胞而言，經嫻熟技藝者辨識為異源或外來 ，任核酸或蛋白質，在此係涵蓋於異源_或蛋白質一 —如本發明的-種方法可在一種宿主生物體中進行，該 物體可為新穎的。因此’本發明亦有關於一種新穎 之：：胞，其包含可催化6,7侧的碳_碳雙鍵還原作用 ^多種生物催化劑。本發明進—步有關於—種新顆的 夕人峻，其編碼適用於本發明的—種方法中之一峰物催 化劑。尹廿 τ < 王切丨隹 、，該多核㈣可包括如序_料號35至38中 、—者或其非野生型官能類似物所界定之—核酸序列。 所指之_特錢魏序列的官能類似物，係㈣ 二林，、_定核賊序列相同的胺基酸序列或編碼該特 :唆序列的1源體之核㈣序列。尤其，較佳的官 在所探討的—宿主細胞中具有1似、相同或 官能類平之核*酸序列’而其核㈣序列係稱做一 33 201000635 已發現包含如序列辨識編號35至38中之任一者所示的 一核酸序列之一種多核苷酸，其所編碼的生物催化劑在一 適宜的宿主細胞特別是大腸桿菌（£. C6»//)中之表現作用，係 優於野生型基因。 如本發明之一宿主細胞典型地包括一或多種載體，其 包含編碼可催化6,7-DAO的碳-碳雙鍵還原作用之一或多種 生物催化劑（特別是酵素）之一或多種基因。 適用於如本發明的一宿主細胞或載體之一或多種基 因，可特別地選自如上述編碼一種生物催化劑（諸如一酵素） 之基因。在一特定的實施例中，該細胞或載體包含編碼一 種生物催化劑之一核酸序列，該生物催化劑包括由序列辨 識編號2、4、6、8、10、12、14所代表的胺基酸序列或其 同源體。編碼該序列之可能的核酸序列係分別示於序列辨 識編號1、3、5、7、9、11及13中。較佳的序列包括選自下 列群中之核酸序列：序列辨識編號35至38及其非野生型官 能類似物。 如本發明之一宿主細胞包含至少一種重組型載體，其 包括編碼具有6,7-DAO烯酮還原酶活性的一種生物催化劑 (特別是一酵素）之一核酸序列。選擇性地，該細胞包含編碼 具有ACL氨裂解酶活性的一種生物催化劑（特別是一酵素) 之一核酸序列。在一特定的實施例中，重組型載體包含編 碼具有ACL氨裂解酶活性的一種生物催化劑（特別是一酵 素）之一核酸序列，該序列所存在的載體可與編碼具有 0，7-DAO烯酮還原酶活性的生物催化劑之該序列所存在者 34 201000635 相同或不同。 在一實施例中，如本發明之一宿主細胞包含編碼具有 L-離胺酸環化酶活性的一種生物催化劑（特別是一酵素）之 至少一種核酸序列。在一特定的實施例中，所存在的一重 組型載體包含編碼具有L-離胺酸環化酶活性的一種生物催 化劑（特別是一酵素）之核酸序列，該序列所存在的載體可與 編碼具有6,7-DAO稀酮還原酶活性的該生物催化劑之序列 所存在者相同或不同。該基因尤其可包含編碼一種生物催 化劑之由序列辨識編號32、序列辨識編號34或該等序列中 之任一者的同源體所代表之一核酸序列。適宜的核酸序列 之實例係如序列辨識編號31與序列辨識編號3 3所示。 本發明之包含編碼具有6,7-DAO烯酮還原酶活性的一 種生物催化劑之一核酸序列、編碼具有氨裂解酶活性的一 種生物催化劑之一核酸序列及編碼具有離胺酸環化酶活性 的一種生物催化劑之一核酸序列之一細胞，係特別適用於 自離胺酸製備己内醯胺之一種方法，其中避免或至少顯著 地減少純化學（亦即非生物催化）反應步驟。因此，該細胞可 在自離胺酸製備己内醯胺的所有反應步驟中作為一種生物 催化劑；在至少一些實施例中，該等步驟可在細胞内進行。 例如該細胞可為一種天然的微生物或一種重組型生物體。 在該重組型生物體中，存在至少一種、至少二種或至少三 種用於編碼該等生物催化劑（通常為酵素）中之任一者之重 組型核酸序列。 宿主細胞例如可選自下列群中之細菌、酵母菌及真 35 201000635 菌。該宿主細胞尤其可選自下列群中之屬：麴菌屬 (Aspergillus)、青黴屬（penicmium)、酵母菌屬 、克魯維酵母屬（幻町、畢赤氏酵 母菌屬、念珠菌屬、漢遜氏酵母菌屬 {Hansenula)、桿囷屬（如<：//仏·?)、棒狀桿菌屬 圆）、假單胞菌屬（/^ewc/謹⑽㈣、葡萄糖桿 囷屬（GZwcimoZ^cier)及大腸桿菌屬（五此〜也办⑷’其中已植 入與表現如上所提及之一或多種編碼核酸序列。 宿主細胞尤其可選自下列群中：大腸桿菌（心 cW)、枯草桿每似如/⑷、麵胺酸棒狀桿菌 產百青 M (Pem_c////Mm 、釀酒酵母 (kcc/mromyca cerw如e)、多形漢遜氏酵母（说則⑼― ;?o/>w〇a/ia)、白色念珠菌（C⑽心而β⑹⑺似）、乳酸克魯維 酵母(/a^veromyca Me沿)、樹幹畢赤氏酵母(/>,c/n.a对咖也) 及巴斯德畢赤氏酵母(Pi’c/n_a /7i^rc>r/i·)宿主細胞。在一個較 佳的實施例中’該宿主細胞可製造離胺酸(作為一先質）。 邊宿主細胞原則上可為一種天然存在的生物體，或可 為一種經工程建構的生物體。可使用技藝中已知之一種突 變篩檢或代謝工程策略，而工程建構該一生物體。例如該 宿主細胞可選自棒狀桿菌屬（Ci?r}^Mcien__)，特別是麵胺 酸棒狀桿菌（C g/«/v377H_CWW);腸道細菌，特別是大腸桿菌 (£jc/zen‘c/^ co/〇 ;桿菌屬（如c///_，特別是栝草桿菌（β. swhz·/⑷與甲醇芽抱桿菌（及；及酵母菌屬 36 201000635 ，特別是釀酒酵母^ cerW—e)。尤其較佳 為開發用於離胺酸的工業製程之麩胺酸棒狀桿菌（C. g/偷mhm)或曱醇芽孢桿菌⑺㈣从⑽菌株。 在一特定的實施例中，該宿主細胞天然地包含（或可生 _產）適用於催化本發明之一種方法中的一反應步驟之一或 多種酵素。 現今將藉由下列實例說明本發明。 實例 4 通論： 分子與遺傳技術 標準的遺傳與分子生物學技術係一般技藝中已知，及 先前已述及（美國紐約州冷泉港(Cold Spring Harbor)的冷泉 港實驗室出版之Maniatis等人於1982年的“分子選殖：實驗 室手冊(Molecular cloning: a laboratory manual)”乙書；冷泉 港的冷泉港實驗室出版之Miller於1972年的“分子遺傳學實 驗(Experiments in molecular genetics)’，乙書；冷泉港的冷泉 港實驗室出版社發行之Sambrook與Russell於2001年的“分 子選殖：實驗室手冊（Molecular cloning: a laboratory manual)’’（第3版）乙書；美國紐約之格林出版公司（Green Publishing)與威立資訊網路(Wiley-Interscience)公司於 1987 年發行之由F. Ausubel等人編輯的“現行的分子生物學操作 程序（Current protocols in molecular biology)’’乙書）。 質體與嵌插體之辨識 藉由一般技藝中已知的遺傳、生化及/或表型方式，諸 37 201000635 如轉形體對於抗生素之抗藥性、轉形體的PCR診斷分析或 質體DNA的純化作用、純化後的質體DNA之限制分析或 DNA序列分析’而辨識出攜載不同基因的質體。 第1例：自離胺酸之ACL生物催化性合成作用 1.1用於測定離胺酸與ACL之HPLC-MS分析 藉由離胺酸與ACL二者之一外部校正線，進行校正。 洗提出離胺酸之滯留時間（Rt)為2.4分鐘（ESI㈠-MS，m/z 145)，而八0^於4.4分鐘洗提出。卬31(+)15，111/2129)。 在配備有一個四元幫浦、除氣裝置、自動採樣器、柱 式溫箱、具有10-毫米細胞與一個飛行時間質譜儀之二極管 陣列檢測器（DAD)之安捷倫(Agilent) 1100 (德國華德布隆 (Waldbronn)的安捷倫(Agilent)公司）上，進行LC-UV-MS實 驗。 LC-UV-MS的條件為： 管柱： 5〇 X 4.6毫米的紐克石夕（Nucleosil) C18之5 微米（麥伽利與奈格（Machery&Nagel)公司） 前管柱，偶合至内徑為250 X 4.6毫米。百 威(Prevail) C18管柱，5微米（奥泰(Alltech) 公司）。 洗提液： 位於超純水中之0.1%(體積/體積）甲酸 流速： 1毫升/分鐘，在進入質譜儀之前，以1:3剖 分該物流。 梯度： 無梯度 注入體積· 5微升 38 201000635 紫外線檢測作用：未使用紫外線進行檢測 質譜檢測作用：ESI-MS，使用滯留時間〇至4分鐘之負模式 及4至10分鐘之正模式。電喷霧離子化作用 (ESI)採用下列條件：m々5〇 36〇〇，175伏特 碎裂器，350°C的乾燥氣體溫度，每分鐘⑺ 公升氮氣之乾燥氣體，每平方英吋5〇磅錶 壓之喷霧器壓力，及2.5仟伏之毛細管電壓。 1.2生物催化劑之建構 f.' ' 自紅城紅球菌（穴· 仏）NCIMB11540分離染色體

DNA 依據訊傑（QIAGEN)基因體DNA手冊（德國希爾登 (Hilden)的凱傑（QIAGEN)公司）用於自格蘭氏陽性細菌分離 染色體DNA之通用操作程序，自紅城紅球菌⑽―咖⑽ NCIMB 11540分離染色體DNA。藉由採用_種 凱傑（QIAGEN)基因體-頂端（Genomic- tip) 500/G管柱(德國 希爾登(Hilden)的凱傑（QIAGEN)公司）與廠商提供的操作程 序，純化粗製品。 紅城紅球菌（/?. eryi/irapo/⑷離胺酸環化酶基因之pcR擴增 作用： 紅城紅球菌（兄⑷NCIMB 11540離胺酸環 化酶PCR反應的擴增作用所用之引子序列，含有供 (前置引子）與处AI (反置引子）的限制酶位點（劃有底線 者），以容許後續植入質體PMS470M (Balzer等人於1992 年期刊‘‘Nucleic Acids Research” 第 20(8)期第 1851-1858 頁乙 39 201000635 文）。 紅城紅球菌（兄er：v?/zro/7〇Zz_：y)-前置[序列辨識編銳扣] 5，-CTCATATGGCGACAATCCGACCTGACG~3， 紅城紅球菌（兄er;yi/?ra/70/⑷-反置[序列辨識編銳3^ 5’-CTGCATGCTTGTTGTCTGACAGTGCGTC〜3， 依據供應廠商手冊使用辛諾吉（S;y«erg;y)®、& 來合酶（德 國科隆（Cologne)的基因克列夫（GeneCraft)公司、 “ )，以容許 PCR產物的TA-選殖作用。PCR溫度廓型如下：c達 15分鐘；2)於94°C達1分鐘，於60°C達0.5分鐘，於72。匚達4 分鐘（30次）；3)於72°C達10分鐘。PCR反應產物在八 乃析級王复 脂糖凝膠上形成一預期尺寸的明顯帶狀。 將PCR產物植入PCR®II載體（英傑（Invitrogen)公司）中 使用凱快（QIAquick)凝膠萃取套組(德國希爾聲出仙⑻ 的凱傑（QIAGEN)公司），藉由製備級瓊脂糖凝膠電泳純化 15微升的PCR產物。以2微升的DNA溶液作為用於進入 pCR®II質體的英傑（Invitrogen) TA-Topo選殖程序及後續的 大腸桿菌（£.<：(9/〇1'€^10尸’轉形作用之敌插體。藉由在1^/ 氨苄青黴素/IPTG/X-Gal平皿上之白/藍斑篩檢，挑選正殖 株。挑選白斑殖株及加以擊穿，以進行質體分離作用。以 £coRI進行的限制分析顯示殖株pCR_33/3/1攜載具有所欲 尺寸的一嵌插體。以M13前置型（-20)與M13反置塑引子進行 之DNA定序，確認已植入編碼來自紅城紅球菌 NCIMB 11540 [序列辨識編號32] 的一離胺酸環化酶之標的離胺酸環化酶基因[序列辨識編 40 201000635 號31]的正確片段。 將pCR-33/3/l-嵌插體植入PMS47(M8中之作用 藉由標準程序，自大腸桿菌（五.coh·)分離質體 pMS47(M8 (Balzer 等人於 1992 年期刊 “Nucleic Acids Research”第20(8)期第1851-1858頁乙文）。以鳩61與印/^進 行之雙重限制作用產生二個片段’自其從瓊脂糖凝膠洗提 出4比部份。以从化1與处/^1消化？01-33/3/1。分離出一個1.6 kb片段’及使用凱快（QiAqUick)凝膠萃取套組（德國希爾登 (Hilden)的飢傑（QIAGEN)公司）進行純化。直鍵型pMS470 片段與处/iI/iViM基因片段之接合作用，以T4-DNA-接合酶 (英傑（Invitrogen)公司）於16°C進行過夜。藉由大腸桿菌 coh)DH10B的轉形作用，及以£c〇Rl進行具氨苄青黴素抗性 殖株的質體之限制分析，而產生攜載pMS470- 33/3/1/11質 體之一殖株。 大腸桿菌（£· a/〇 DH10B pMS470-33/3/l/ll-l之培育 在一個ISF-200實驗室用發酵器（瑞士巴特明根 (Bottmingen)的英弗斯（Infors)公司）中，以10公升的規模進 行用於製造紅城紅球菌（/?· NCIMB 11540離胺 酸環化酶之發酵作用。使用位於0.5公升的泰瑞菲培養液 (Terrific Broth)(TB ; 12克/公升的胰蛋白脒、24克/公升的酵 母菌萃取物、4克/公升的丙三醇、2.31克/公升的KH2P〇4、 12.54克/公升的UPC)4、pH值為7.0及含有100微克/毫升的 羧苄青黴素）中之過夜(24小時)起始培養體，進行發酵器的 接種作用；起始培養體本身則藉由0.1毫升之大腸桿菌（£ 41 201000635 co/ι·) DH10B PMS470-33/3/1/11-1之個別的丙三醇儲存培養 體而接種。 藉由在OD62〇=0.8的細胞密度添加0.5 mM IPTG(最終濃 度）’而引發紅城紅球菌（兄NCIMB 11540離胺 酸環化酶之表現。在培育20.5小時(OD62〇=6.4)之後，藉由離 心作用（在4°C以12,227x g離心12分鐘）採集細胞。 大腸桿菌（£. co//) DH10B pMS470-33/3/l/ll-l 的無細胞萃 取物之製備作用 以20 mM HEPES缓衝液(pH 7.0)清洗大腸桿菌（£ DH10B pMS470-33/3/im-l (117克）的濕細胞，及再懸浮於 350毫升的〇·ιμ磷酸鉀緩衝液(pH 7.0)中。在1300巴的奈米 喷流均化器（德國韋瑟爾（Wesel)的哈斯科（Haskel)公司） 中’將細胞打破，及後續進行離心（在4°C以32,000χ g離心 60分鐘），以獲得無細胞萃取物（上清液）。無細胞萃取物以 1〇毫升的分量冷凍’及在進一步使用之前，儲存於_2〇。〇。 表現如[序列辨識編號33]中所存在的核酸序列之大腸桿菌 (£·〇?//)之發酵作用 表現如[序列辨識編號33]中所存在之編碼如存在於[序 列辨識編號3 4 ]的離胺酸環化酶之核酸序列的大腸桿菌 (仏細胞’如第7,241,602號美國專利中所述進 行發酵’藉此用於導入輸入體1之輸入廓型係如第7,241,602 號美國專利第1表中所述地使用。 自大腸桿菌（五· co/i·)細胞製備酵素溶液LAM0011之作用 如第7,241,602號美國專利中所述，自表現如[序列辨識 42 201000635 編號33]中所存在的核酸序列之大腸桿菌（五· c〇//)細胞，製備 含有如[序列辨識編號34]中所存在的離胺酸環化酶之酵素 溶液 LAM0011。 1.3自離胺酸之ACL生物催化性合成作用 製備70 mM L-離胺酸鹽酸鹽與1 mM硫酸鋅於1〇〇 mM 鱗酸鈉緩衝液(pH 7.0及含有1 mM硫酸辞）中之_受質容 液。為起始反應’在9毫升的受質溶液中，添加丨毫升之大 腸桿菌（E· DH10B PMS470-33/3/l/ll-l 的無細胞萃取 物，或添加1毫升的酵素溶液LAM0011。將反應混合物置於 一振盪器上及於37°C培養96小時。而且，在相同條件下， 培養一化學空白混合物（缺乏無細胞萃取物）與一生物空白 (由在9毫升之pH 7.0及不具有L-離胺酸鹽酸鹽的5〇 mM磷 酸鈉緩衝中添加1毫升的大腸桿菌（五 PMS470-33/3/1/11-1的無細胞萃取物或添加i毫升的酵素溶 液LAM0011所組成）。在培育96小時之後採集試樣，及藉由 HPLC-MS加以分析。結果摘要於下表中。 第1表：在酵素溶液LAM0011與大腸桿菌（£. co/i·) DH10B pMS470-33/3/l/ll-l的無細胞萃取物存在下之自L-離胺酸 形成ACL的作用 生物催化劑 ACL濃度[毫克/公斤] 酵素溶液LAM0011 4.2 大腸桿菌(£· co/ί) DH10B pMS470- 33/3/1/11-1 的無細胞萃取物 0.2 顯示自L-離胺酸形成ACL的作用，係由第1表中提及之 各生物催化劑所催化。在化學與生物空白試樣中並未檢測 43 201000635 出 ACL。 第2例：自6,7-DAO之己内醯胺生物催化性合成作用 質體與菌株 自英傑（Invitrogen)公司（美國加州卡爾斯巴德 (Carlsbad))取得pBAD/Myc、-HisC。如 W02005/068643 中所述 建構之質體pB AD/Myc-His-DEST，係用於蛋白質表現作 用。在所有選殖程序與標的基因之表現作用中，使用大腸 桿菌（£· co//) TOP10 (美國加州的卡爾斯巴德（Carlsbad)的 英傑（Invitrogen)公司）。 培養基 使用2*TY培養基（16克/公升的胰蛋白腺、10克/公升的 酵母菌萃取物' 5克/公升的氯化鈉），以供大腸桿菌（£. co//) 生長之用。補充抗生素（100微克/毫升的羧苄青黴素、25微 克/毫升的卡那黴素（kanamycin))，以維持質體。為在 pB ADM^C-His-DEST衍生質體中的PBAD啟動子控制下引發 基因表現作用，添加L-***糖至最終濃度為〇 〇2至 0.2%(重量/體積）。 2·1用於測定6,7-DAO與己内醯胺之HPLC-UV-MS分析 校正： 藉由己内醯胺與6,7-DAO二者之一外部校正線，進行校 正。洗提出己内醯胺的滞留時間為24分鐘（m/z 114)，而洗 提出 6,7-DAO為 23分鐘(m/z 112)。 在配備有一個四元幫浦、除氣裝置、自動採樣器、柱 式溫箱、具有10-毫米細胞與一個單一四極式質譜儀之二極 44 201000635 管陣列檢測器（DAD)之安捷倫(Agilent) 1100 (德國華德布 隆(Waldbronn)的安捷倫(Agilent)公司）上，進行LC-UV-MS 實驗。LC-UV-MS條件為： 管柱： C之25〇 X *4毫米百威(Prevail)管柱（奥 泰(Alltech)公司，USA) 洗提液： A=位於超純水中之0.1%(體積/體積）甲酸 B=乙腈(pa，默克(Merck)公司） r 流速： 1毫升/分鐘，在進入質譜儀之前，以1:3剖 分該物流。 梯度： 梯度在t=0分鐘以100%(體積/體積）的A開 始及維持8分鐘，然後在12分鐘内改變至 95%(體積/體積）的b (t=2〇分鐘）。 自20至21分鐘，梯度維持為95%(體積/體積) 的B 〇 注入體積： 5微升 紫外線檢測作用：λ=210、220及250奈米

MS檢測作用：ESI(+)-MS 電喷霧離子化作用（腹)依下列條件於正掃描模式運作‘ 50-1500 ’ 5〇伏特碎裂器，〇.lm々步長，350 °(3的乾燥氣體溫度，每分 β 母刀1 里10公升氮氣之 乾無氣體，每平方笨η 十万央寸50磅錶壓之喷霧器 壓力，及2.5仟伏之毛細管電壓。 2.2生物催化劑之建構 表現建構體之設計 45 201000635 在核醣體結合位點與起始密碼子上游及終止密碼子下 游之所有基因添加αίίβ位點，以促進使用蓋特威(Gateway) 技術（美國加州的卡爾斯巴德（Carlsbad)的英傑（Invitrogen) 公司）之選殖作用。 藉由PCR之選殖作用 編碼馬其頓假絲酵母（(7. AKU4588的老 黃酶OYE之胺基酸序列[序列辨識編號2]之來自馬其頓假絲 酵母（Candida macedoniensis) AKU4588 的 ΟΙΈ1 基因 (ΑΒ126227)[序列辨識編號1]、編碼乳酸克魯維酵母（Λ：. Me心）NRRLY-1140的老黃酶ΚΥΕ1 [序列辨識編號4]之來 自乳酸克魯維酵母（欠/wyveromyca /acib) NRRLY-1140的 基因（L37452)[序列辨識編號3]、編碼螢光假單胞菌（尸. Ι-C的異型生物質還原酶XenB [序列辨識編號6] 之來自螢光假單胞菌 CPwMi/omimct·? //woracewi) Ι-C的 基因（AF154062)[序列辨識編號5]、編碼丁香假單胞菌大豆 致病變種(尸· syr/wgae /?v. g/ycinea)的2-環己稀-1-酮還原酶 Ncr[序列辨識編號8]之來自丁香假單胞菌大豆致病變種 pv. g/yc/wec!)的基因（AF093246)[序 列辨識編號7]、編碼來自大腸桿菌（£. C£)/〇 W3110的N-乙基 順丁烯二醯亞胺還原酶NemA[序列辨識編號10]之來自大 腸桿菌（仏c/^n_c/n_a co//) W3110的 nemA基因（D86931)[序列 辨識編號9]、編碼來自釀酒酵母(5". cerWho^) S288C的老黃 酶OYE2[序列辨識編號12]之來自釀酒酵母 cwWhae) S288C的 OYE2基因（L06124)[序列辨識編號 11] 46 201000635 及編碼來自枯草桿菌（β. ^“如/⑷菌株168的YqjΜ[序列辨識 編號14]之來自枯草桿菌（j5ac///WiS⑽如·/&)菌株168的;ygjM基 因（Z99116)[序列辨識編號π]，係依據廠商說明書’藉由使 用PCR超混合咼保真度（sUpermix High Fidelity)(英傑 (Invitrogen)公司）之聚合酶鏈反應(pcr)，以下列寡核苷酸 而自個別微生物的基因體DNA擴增： 第2表：用於藉由聚合酶鏈反應(PCR)選殖6,7_dA〇烯酮還 原酶基因之引子序列

基因 引子 序列 辨識 編號 核酸序列(5’-3’） 馬其頓假絲酵母（C. macetfon/ensis) AKU4588 的 [序列辨識編號1] Λ* 1 np 則置 15 AGGAGGAATTAACCATGTCGTACATGAACTT TGACCC 反置 16 TTAGTACTTCTTTTCCTCTTTC 乳酸克魯維酵母(欠.Mci/i) NRRLY-1140的Μ/ [序列辨 識編號3] 前置 17 AGGAGGAATTAACCATGTCGTTTATGAACTT TGAACCAAAGCC 反置 18 CTATTTCTTGTAACCCTTGGCAACAGC 營光假單胞菌(A Ι-C的;cenB [序列辨識編號5] 、_- r/a 别置 19 AGGAGGAATTAACCATGGCAACTATTTTCGA TCCGATCAAACTGG 反置 20 TTACAGCGTCGGGTAGTCGATGTAGCCGACC 丁香假單胞菌大豆致病變種 (P. syringae pv. glycinea)的ncr [序列辨識編號7] 前置 21 AGGAGGAATTAACCATGCCGACTCTTTTCGA CCCC 反置 22 CTACTTTTGGTCAGCGGTGGG 大腸桿菌（£. co//) W3110的 nemAt序列辨識編號9] _、>/» rrp 刚置 23 AGGAGGAATTAACCATGTCATCTGAAAAA CTGTATTCCCC 反置 24 TTACAACGTCGGGTAATCGGTATAGC 釀酒酵母(S. cemi/從）S288C 的OKE2 [序列辨識編號]1] 前置 25 AGGAGGAATTAACCATGCCATTTGTTAAGGA CTTTAAGCC 反置 26 TTAATTTTTGTCCCAACCGAGTTTTAGAGC 枯草桿菌(β. 菌株168 的处对[序列辨識編號13] 、! np 月·』置 27 AGGAGGAATTAACCATGGCCAGAAAATTATT TACACC 反置 28 TTACCAGCCTCTTTCGTATTGAAC 表現質體之建構 藉由瓊脂糖凝膠電泳分析PCR反應，及使用凱快 (QIAquick) PCR純化作用套組（德國希爾登(Hilden)的凱傑 47 201000635 (QIAGEN)公司），自凝膠洗提出具有正確尺寸的PCR產物。 如廠商操作程序(www_invitrogen.com)中所述，使用蓋特咸 (Gateway)技術（英傑（Invitrogen)公司），經由所引入的α?出 位點與作為入門載體（entryvector)的pDONR201(英傑 (Invitrogen)公司），將純化後的PCR產物植入pB AD/A^g His-DEST表現載體中。依此方式，分別製得攜載[序列辨識 編號1]的表現載體pBAD-ER_C>^、攜載[序列辨識編號3] 的表現載體pBAD-ER_K/a、攜載[序列辨識編號5]的表現载 體pBAD-ER_P//、攜載[序列辨識編號7]的表現載體 pBAD-ER_/^3；、攜載[序列辨識編號9]的表現載體 pBAD-ER_£co、攜載[序列辨識編號11]的表現載體 pBAD-ERJce及攜載[序列辨識編號13]的表現載體 pBAD-ER_&w。藉由DNA定序，確認所植入基因之序列。 藉由化學勝任的大腸桿菌（E. co/〇 TOP10 (英傑（Invitrogen) 公司）與個別的pBAD-表現載體之轉形作用，獲得對應的表 現菌株。 基因合成作用與質體之建構 依據DNA2.0的標準程序，自DNA2.0與最適於在大腸桿 菌（五· co/i·)中表現之密碼子，製得合成基因。經密碼子最適 化之來自馬其頓假絲酵母macei/om.e/w/x) AKU4588 [序列辨識編號丨⑽仍五基因、來自乳酸克魯維酵 母⑽:⑷NRRLY-1140 [序列辨識編號3]的 AT£7基因、來自螢光假單胞菌（仏⑼如所⑽似 Ι-C [序列辨識編號5]的X⑼β基因、來自丁香假單胞菌大豆 48 201000635 致病變種(尸pv. [序列辨識編 號7]的ncr基因，係分別為密碼子最適化及所產生的序列 列辨識編號35、36、37、38]係藉由DNA合成作用製得。如 廠商操作程序（www.invitrogen· com)中所述，使用蓋特威 (Gateway)技術（英傑（Invitrogen)公司），經由所引入的⑽及 位點與pDONR入門載體（英傑（Invitrogen)公司），將該基因 建構體植入pBAD/M_yc-His-DEST表現載體中。依此方式， 分別製得攜載[序列辨識編號35]的表現載@ pBAD-ER-co_Cma、攜載[序列辨識編號36]的表現载體 pBAD-ER-co_ma、攜載[序列辨識編號37]的表現载體 pBAD-ER-C〇_P//及攜載[序列辨識編號38]的表現载體 pBAD-ER-co_P：?>；。藉由化學勝任的大腸桿菌 μ c〇") TOP10 (英傑（Invitrogen)公司）與個別的pBAD-表現栽 轉形作用，獲得對應的表現菌株。 體之

L 用於表現6,7-DAO烯酮還原酶蛋白質的大腸桿菌（五.c冲)之 培育 在96深槽式平m中，以含有0.02%(重量/體積）L阿抵 伯糖之940微升培養基進行培育。以96槽式壓印器（瑞士柏 斯菲登(Birsfelden)的科财(Kiihner)公司），將細胞自冷;東儲 存^養中轉移及進行接種。將平皿置於一個迴轉式振盈琴 (科耐（Kiihner)公司；300 rpm，5公分振幅）上，及於25。〇典 養48小時。典型地達到〇d62Q=2-4之細胞密度。 6’7-DAO烯酮還原酶的細胞溶胞產物之製備作用 藉由離心作用採集來自小規模培育之細胞，及將上清 49 201000635 液棄置。離心期間所形成的細胞沈澱於_20°c冷涞至少16小 時’然後在冰上解凍。在各槽中添加5〇〇微升之新製備的溶 胞緩衝液’及藉由劇烈地渦旋該平皿2至5分鐘，讓細胞再 度懸浮。為達成溶胞作用，該平皿於室溫中培養3〇分鐘。 該平皿於4°C與6000 g離心20分鐘，以除去細胞碎片。將上 清液轉移至一新的平皿中，及在進一步使用之前，置於冰 上0 該溶胞緩衝液含有的成份如下表中所示： 第3表 1M MOPS pH 7.5 5毫升 等級II的DNAse第I型（羅奇(Roche)公司） 10毫克 溶菌酶(西克瑪(Sigma)公司） 200毫克 MgS04.7H20 123.2毫克 二硫蘇糖醇(DTT) 154.2毫克 水(MilliQ) 加至100毫升 該溶液係在使用前才新製的。 2.3a自6,7-DAO之己内醯胺生物催化性合成作用 製備一反應混合物，其包含位於pH 7.2的50 mM填酸鉀 緩衝液中之20 mM 6,7-DAO、30 mM 葡萄糖、1 mM NADPH 及10單位/毫升之來自巨型桿菌的D-葡萄糖去氫酶（型錄編號22.10 ;德國尤利希（jtjiich)的尤利 希手性溶液(Julich Chiral Solutions)公司）。為起始反應，在 該反應混合物中添加400微升的細胞溶胞產物，使總體為 550微升。將反應混合物置於一個振盪器上，及於28°c培養 50 201000635 48小日夺。而且’在相同條件下培養一化學空白混合物（缺乏 热細皰萃取物）與一生物空白（具有pBAD/Myc-HisC之大腸 才干菌（£· co/〇 TOP10)。藉由HPLC-MS分析試樣。結果摘要 於下表中。 第4表，在來自不同的6,7-DAO稀自同還原酶的細胞溶胞產物 存在下之自6,7-DAO的己内醯胺形成作用 生物催化劑 --~— 己内醯胺濃度 [毫克/公片] 大腸椁菌(£. co/i) TOPIO pBAD-ER-co Cma — 0.96 coli) TOP 10 pBAD-ER-co_P5)； 0.59 大腸桿菌 co/ί) TOP10 pBAD-ER-co_A：/a 0.31 大腸桿菌(£. co/〇 TOP10 pBAD-ER_£co 0.31 大腸桿菌(五· coZ〇 TOP 10 pBAD-ER-co_/yZ 0.27 大腸桿菌(五_ co") TOPIO pBAD-ER—Sce 0.09 j腸桿菌(£· cW) TOPIO pBAD-ER_5iM 0.08 产;腸桿菌(£. co") TOPIO pBAD/Myc-HisC 白） 0 無(化學空白） 0 顯示自6,7-DAO的己内醯胺形成作用係由該生物催化 劑所催化。 2-3b 6,7-DAO轉化為己内醯胺之生物轉化作用 製備一反應混合物，其組份包括1毫升的大腸桿菌（五. TOPIO pBAD-ER-co—Cma酵素溶液（如上述製備）、 1200單位之來自巨型桿菌•臟)的〇_葡萄糖 去氫酶（型錄編號22.10 ;德國尤利希(Jtilich)的尤利希手性 溶液(Julich Chiral Solutions)公司）、9.1 mM 6,7- DAO (含 有3.5%(重量/重量）己内醯胺之雜質），〇·9 mM NADPH及 51 201000635 100 mM葡萄糖。混合物的總體積為^ 1其升 在37 C培月24小日守之後’採樣進行HpLc_uv_Ms分 析。而且’在相同條件下培養—種化學空白混合物(缺乏無 細胞萃取物）及-種生物空自混合物，及在相同的培育時間 之後採樣。在檢測存在於宿主大腸桿菌（五⑺⑺τ〇ρ1〇中的 任-背景酵素活性方面’係以生物空白細胞作為負對照 組。鑑於該等因素，宿主大腸桿菌疋㈣> TQpiQ已藉由― 空白pBAD載體(pBAD/Myc-HisC)進行轉幵;作用 結果如下：在該反應混合物中，檢測出186毫克/公斤 的己内驢胺。在化學空白中之己内醯胺的 7L5毫克/公斤（因在6J-DAO中存在己内酿胺雜質在生物 空白中’未形成附加的己内醯胺。自此所獲得的結論為： 已以生物催化方式自6,7-DAO轉化得！丨4毫克/公斤的己内 醯胺。

【圖式簡單說明：J (無） 【主要元件符號說明】 (無） 52 201000635 序列清單 <110> DSM IP ASSETS B.V. <120>自（Z)-6,7-二氫-1H-氮呼-2(5H)-酮製備ε-己内醯胺之作用 <130> Ρ84472ΕΡ00 <160> 38 <17Ό>專利申請軟體(Patentln)第3.5版

<210> 1 <211> 1212 <212> DNA <213> 馬其頓假絲酵母(Candida macedoniensis) f 5 <220> <221 > CDS <222> (1)..(1212) <400> 1 atg teg tac atg aac ttt gac cct aag cca ttg gga gac acc aat ate 48

Met Ser Tyr Met Asn Phe Asp Pro Lys Pro Leu Gly Asp Thr Asn lie 1 5 10 15 ttc aag cca ate aag ate ggt aac aat gag eta aaa cac aga gta gtc 96

Phe Lys Pro lie Lys lie Gly Asn Asn Glu Leu Lys His Arg Val Val 20 25 30 atg cca gca ttg act aga atg aga gcc att gca cca gga aac ate cca 144

Met Pro Ala Leu Thr Arg Met Arg Ala lie Ala Pro Gly Asn lie Pro 35 40 45 aac act gaa tgg gcc gag gaa tac tac aga caa cgt tet caa tac cct 192 ( Asn Thr Glu Trp Ala Glu Glu Tyr Tyr Arg Gin Arg Ser Gin Tyr Pro % 50 55 60 ggt acc ett att ate aeg gaa ggt act ttc cct tet geg caa tea ggt 240

Gly Thr Leu lie lie Thr Glu Gly Thr Phe Pro Ser Ala Gin Ser Gly 65 70 75 80 ggt tac cca aat gtg cca ggt ate tgg tee aaa gag caa ttg get gaa 288

Gly Tyr Pro Asn Val Pro Gly lie Trp Ser Lys Glu Gin Leu Ala Glu 85 90 95 tgg aaa aag ate ttc aat gca ate cat gag aac aaa teg ttc gtg tgg 336

Trp Lys Lys lie Phe Asn Ala lie His Glu Asn Lys Ser Phe Val Trp 100 105 110 gtg caa ttg tgg gtt eta ggt aga caa gca tgg cca gaa gtg ttg aag 384

Val Gin Leu Trp Val Leu Gly Arg Gin Ala Trp Pro Glu Val Leu Lys 115 120 125 432 aag gaa ggt ttg cgt tac gat agt get acc gat gac ttg tac atg ggt 1 201000635

Lys Glu Gly Leu Arg Tyr Asp Ser Ala Thr Asp Asp Leu Tyr Met Gly 130 135 140 gaa gaa gaa aaa gag cgt gcc tta aag get aac aac cca cag cac ggt 480

Glu Glu Glu Lys Glu Arg Ala Leu Lys Ala Asn Asn Pro Gin His Gly 145 150 155 160 ate acc aag gaa gaa ate aag cag tac ate aag gag tac gtg gat get 528 lie Thr Lys Glu Glu lie Lys Gin Tyr lie Lys Glu Tyr Val Asp Ala 165 170 175 gcc aag aaa gcc ate gat gca ggt gca gac ggt gtg caa ate cat tet 576

Ala Lys Lys Ala lie Asp Ala Gly Ala Asp Gly Val Gin lie His Ser 180 185 190 gee aac ggt tac ttg ttg aac cag ttt ttg gac cct att tet aac aac 624

Ala Asn Gly Tyr Leu Leu Asn Gin Phe Leu Asp Pro lie Ser Asn Asn 195 200 205 aga acc gac gag tac ggt gga teg ate gag aac cgt geg aga ttc act 672

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Ser Lys Lys Pro Asn Thr Leu lie Gly Tyr Gly Arg Ser Phe lie Ala 340 345 350 aac cca gac ttg gtg tac cgt ttg gaa aag ggt ttg cca ttg aac aag 1104

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Tyr Pro Ser Tyr Glu Glu Ser Val Ala Lys Gly Tyr Lys Lys Glu Glu 385 390 395 400 aag aag tac taa 1212

Lys Lys Tyr

<210> 2 <211> 403 <212> PRT <213〉馬其頓假絲酵母(Candida macedoniensis) <400> 2

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Glu Glu Glu Lys Glu Arg Ala Leu Lys Ala Asn Asn Pro Gin His Gly 145 150 155 lie Thr Lys Glu Glu lie Lys Gin Tyr lie Lys Glu Tyr Val Asp Ala 165 170 175

Ala Lys Lys Ala lie Asp Ala Gly Ala Asp Gly Val Gin lie His Ser 180 185 190

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Glu Lys Arg Ala Arg Ala Gly Lys Arg Leu Ala Phe lie Asp Leu Val 275 280 285

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Leu Arg Val Gly Asn Tyr Ala Leu Asp Pro Asp Gin Ala Thr Leu Asp 325 330 335

Ser Lys Lys Pro Asn Thr Leu lie Gly Tyr Gly Arg Ser Phe lie Ala 340 345 350

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Lys Lys Tyr <210> 3 <211> 1197 <212> DNA <213> 乳酸克魯維酵母(Kluyveromyces lactis) / <220〉 1：· <221 > CDS <222> (1)-(1197) <400〉 3 atg teg ttt atg aac ttt gaa cca aag cca ttg get gat act gat ate Met Ser Phe Met Asn Phe Glu Pro Lys Pro Leu Ala Asp Thr Asp lie 15 10 15 ttc aaa cca ate aag att ggt aac act gaa ttg aag cac agg gtt gtc Phe Lys Pro lie Lys lie Gly Asn Thr Glu Leu Lys His Arg Val Val 20 25 30 atg cct gca ttg aca aga atg aga geg ttg cat cca ggc aac gtt cca Met Pro Ala Leu Thr Arg Met Arg Ala Leu His Pro Gly Asn Val Pro 35 40 45 aac cct gac tgg get gtt gaa tat tac aga caa cgt tcc caa tat cca Asn Pro Asp Trp Ala Val Glu Tyr Tyr Arg Gin Arg Ser Gin Tyr Pro 50 55 60 ggt act atg att ate act gaa ggt get ttc cca tea get cag tea ggt Gly Thr Met lie lie Thr Glu Gly Ala Phe Pro Ser Ala Gin Ser Gly 65 70 75 ggt tac gat aac gca cca ggt gtt tgg age gaa gaa caa ctg get caa Gly Tyr Asp Asn Ala Pro Gly Val Trp Ser Glu Glu Gin Leu Ala Gin 85 90 95 tgg aga aag ate ttc aag gca att cac gac aac aag tet ttt gtt tgg Trp Arg Lys lie Phe Lys Ala lie His Asp Asn Lys Ser Phe Val Trp 100 105 110 gta caa ttg tgg gtt eta ggt aga caa get ttt get gat aac ttg gca Val Gin Leu Trp Val Leu Gly Arg Gin Ala Phe Ala Asp Asn Leu Ala 115 120 125 aga gat gga ttg cgt tat gat agt get tec gat gaa gtg tac atg ggt Arg Asp Gly Leu Arg Tyr Asp Ser Ala Ser Asp Glu Val Tyr Met Gly 48 96 144 192 240 80 288 336 384 5 432 201000635 130 135 140 gaa gat gaa aag gaa cgt gcc ate aga tct aac aac cct cag cat ggt 480

Glu Asp Glu Lys Glu Arg Ala lie Arg Ser Asn Asn Pro Gin His Gly 145 150 155 160 ate acc aag gat gaa att aag cag tat ate agg gac tat gtt gat get 528 lie Thr Lys Asp Glu lie Lys Gin Tyr lie Arg Asp Tyr Val Asp Ala 165 170 175 get aag aag tgt ate gat get ggt gca gat ggt gtt gaa ate cat tee 576

Ala Lys Lys Cys lie Asp Ala Gly Ala Asp Gly Val Glu lie His Ser 180 185 190 get aac ggt tat ttg ttg aat caa ttc eta gac cca ate tee aac aaa 624

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<210> 5 <211> 1050 <212> DNA <2Ί3> 螢光假單胞菌(Pseudomonas fluorescens) <220> <221 > CDS <222> (1)..(1050) <400> 5 atg gca act att ttc gat ccg ate aaa ctg ggc gac etc gag ctg tee Met Ala Thr lie Phe Asp Pro lie Lys Leu Gly Asp Leu Glu Leu Ser 1 5 10 15 aac ege ate ate atg gee ccg ctg act ege tgc ege gee gac gaa ggc Asn Arg lie lie Met Ala Pro Leu Thr Arg Cys Arg Ala Asp Glu Gly 20 25 30 ege gta ccc aac gca ctg atg gee gag tac tac gtg caa cgt gee tee Arg Val Pro Asn Ala Leu Met Ala Glu Tyr Tyr Val Gin Arg Ala Ser 35 40 45 gee ggc ctg att etc age gaa gee act teg gtg aeg ccg atg ggc gtc Ala Gly Leu lie Leu Ser Glu Ala Thr Ser Val Thr Pro Met Gly Val 50 55 60 ggc tat ccg gac acc ccg ggc ate tgg tee aac gat cag gta ege ggc Gly Tyr Pro Asp Thr Pro Gly lie Trp Ser Asn Asp Gin Val Arg Gly 65 70 75 tgg acc aac ate acc aaa gee gta cac get gee ggc ggc aag ate gtc Trp Thr Asn lie Thr Lys Ala Val His Ala Ala Gly Gly Lys lie Val 85 90 95 ctg caa ett tgg cac gtc ggc ege ate teg cac ccg ttg tac ctg aac Leu Gin Leu Trp His Val Gly Arg lie Ser His Pro Leu Tyr Leu Asn 100 105 110 ggc gaa gca ccg gtc geg ccg age gee ate cag cct aaa ggc cac gtc Gly Glu Ala Pro Val Ala Pro Ser Ala lie Gin Pro Lys Gly His Val 115 120 125 age ctg gtg cgt cca ctg gee gat tac ccg act cca ege gee ctg gaa Ser Leu Val Arg Pro Leu Ala Asp Tyr Pro Thr Pro Arg Ala Leu Glu 130 135 140 acc get gaa ate gee gag ate gtc gag gee tac ege acc ggt gee gag Thr Ala Glu lie Ala Glu lie Val Glu Ala Tyr Arg Thr Gly Ala Glu 145 150 155 aac gee aag gee gee ggt ttc gac ggc gtg gaa ate cac ggc gee aac Asn Ala Lys Ala Ala Gly Phe Asp Gly Val Glu lie His Gly Ala Asn 165 170 175 48 96 144 192 240 80 288 336 384 432 480 9 160 528 576 201000635 ggc tac ctg etc gac cag ttc ttg caa age age acc aac cag ege acc Gly Tyr Leu Leu Asp Gin Phe Leu Gin Ser Ser Thr Asn Gin Arg Thr 180 185 190 gac aat tac ggc ggc tee ctg gaa aac cgt geg cgt ctg ttg ctg gaa Asp Asn Tyr Gly Gly Ser Leu Glu Asn Arg Ala Arg Leu Leu Leu Glu 195 200 205 gtg act gat gee geg ate gac gtc tgg ggc gee ggc cgt gtc ggt gtg Val Thr Asp Ala Ala lie Asp Val Trp Gly Ala Gly Arg Val Gly Val 210 215 220 cac ctg gca ccg ege gee gac tee cac gac atg ggc gac gac aac etc His Leu Ala Pro Arg Ala Asp Ser His Asp Met Gly Asp Asp Asn Leu 225 230 235 gee gag acc ttc acc tat gtt get ege gag ctg ggc aag cgt ggc ate Ala Glu Thr Phe Thr Tyr Val Ala Arg Glu Leu Gly Lys Arg Gly lie 245 250 255 gee ttc ate tgc tee ege gag aaa gaa ggc gee gac age etc ggc cca Ala Phe lie Cys Ser Arg Glu Lys Glu Gly Ala Asp Ser Leu Gly Pro 260 265 270 caa ctg aaa gaa gee ttt ggc ggc geg tac ate gee aac gag cgt ttc Gin Leu Lys Glu Ala Phe Gly Gly Ala Tyr lie Ala Asn Glu Arg Phe 275 280 285 acc aag gac age gee aat geg tgg ctg get gaa ggc aag get gac get Thr Lys Asp Ser Ala Asn Ala Trp Leu Ala Glu Gly Lys Ala Asp Ala 290 295 300 gta geg ttc ggc gtg cca ttc att gee aac ccg gac ctg ccg gca ege Val Ala Phe Gly Val Pro Phe lie Ala Asn Pro Asp Leu Pro Ala Arg 305 310 315 ctg aaa gee gat gee ccg ctg aac gag ccg cgt cct gag ctg ttc tat Leu Lys Ala Asp Ala Pro Leu Asn Glu Pro Arg Pro Glu Leu Phe Tyr 325 330 335

ggc aaa ggc ccg gtc ggc tac ate gac tac ccg aeg ctg taa Gly Lys Gly Pro Val Gly Tyr lie Asp Tyr Pro Thr Leu 340 345 <210> 6 <211> 349 <212> PRT <213> 螢光假單胞菌(Pseudomonas fluorescens) <400> 6

Met Ala Thr lie Phe Asp Pro lie Lys Leu Gly Asp Leu Glu Leu Ser 15 10 15 624 672 720 240 768 816 864 912 960 320 1008 1050 10 201000635

Asn Arg lie lie Met Ala Pro Leu Thr Arg Cys Arg Ala Asp Glu Gly 20 25 30

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Asn Ala Lys Ala Ala Gly Phe Asp Gly Val Glu lie His Gly Ala Asn 165 170 175

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Asp Asn Tyr Gly Gly Ser Leu Glu Asn Arg Ala Arg Leu Leu Leu Glu 195 200 205

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Leu Lys Ala Asp Ala Pro Leu Asn Glu Pro Arg Pro Glu Leu Phe Tyr 325 330 335

Gly Lys Gly Pro Val Gly Tyr lie Asp Tyr Pro Thr Leu 340 345 <210> 7 <211> 1083 <212> DNA <213> 丁香假單胞菌(Pseudomonas syringae) <220> <221 > CDS <222> (1)..(1083) <400> 7 atg ccg act ctt ttc gac ccc ttg act ttg ggc gac ctg caa tct cca 48

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Trp Lys Pro Val Thr Gin Ala Val His Glu Ala Gly Gly Arg lie lie 85 90 95 ett cag ttg tgg cat atg ggc cgt acc gtt cat tee age ttt etc ggc 336

Leu Gin Leu Trp His Met Gly Arg Thr Val His Ser Ser Phe Leu Gly 100 105 110 gga gcc aag cca gta teg tee teg gcc acc cgt geg ccg gga cag geg 384

Gly Ala Lys Pro Val Ser Ser Ser Ala Thr Arg Ala Pro Gly Gin Ala 115 120 125 cac acc tac gaa ggc aag caa gac tac gac gag geg egg cct ttg teg 432

His Thr Tyr Glu Gly Lys Gin Asp Tyr Asp Glu Ala Arg Pro Leu Ser 130 135 140 geg gat gaa ate ccg egg eta ttg aac gat tac gaa cac gca geg aaa 480

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Ala Asp Arg Pro Pro Val His Pro Val lie Arg Gin Ala Phe Ser Arg 275 280 285 aeg ctg att etc aac tet gac tac act ttg gaa aeg get cag get gca 912

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Leu Ala Thr Gly Glu Ala Asp Ala lie Thr Phe Gly Arg Pro Phe Leu 305 310 315 320 gee aac cct gac ctg cct cac agg ttt gee gag aga ctg ccg ctg aac 1008 Ala Asn Pro Asp Leu Pro His Arg Phe Ala Glu Arg Leu Pro Leu Asn 325 330 335 1056 1083 aag gac gtg atg gag act tgg tat age cag ggg ccc gaa ggt tat gtg Lys Asp Val Met Glu ThrTrp Tyr Ser Gin Gly Pro Glu Gly Tyr Val 340 345 350 gac tac ccc acc get gac caa aag tag Asp Tyr Pro Thr Ala Asp Gin Lys 355 360

<210> 8 <211> 360 <212> PRT <213> 丁香假單胞菌(Pseudomonas syringae) <400> 8

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Trp Lys Pro Val Thr Gin Ala Val His Glu Ala Gly Gly Arg lie lie 85 90 95

Leu Gin Leu Trp His Met Gly Arg Thr Val His Ser Ser Phe Leu Gly 100 105 110

Gly Ala Lys Pro Val Ser Ser Ser Ala Thr Arg Ala Pro Gly Gin Ala 115 120 125

His Thr Tyr Glu Gly Lys Gin Asp Tyr Asp Glu Ala Arg Pro Leu Ser 14 160201000635 130 135 140

Ala Asp Glu lie Pro Arg Leu Leu Asn Asp Tyr Glu His Ala Ala Lys 145 150 155

Asn Ala Met Ala Ala Gly Phe Asp Gly Val Gin lie His Ala Ala Asn 165 170 175

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Leu Ala Thr Gly Glu Ala Asp Ala lie Thr Phe Gly Arg Pro Phe Leu 305 310 315

Ala Asn Pro Asp Leu Pro His Arg Phe Ala Glu Arg Leu Pro Leu Asn 325 330 335

Lys Asp Val Met Glu Thr Trp Tyr Ser Gin Gly Pro Glu Gly Tyr Val 340 345 350

Asp Tyr Pro Thr Ala Asp Gin Lys 355 360 15 201000635 <210> 9 <211> 1098 <212> DNA <213> 大腸桿菌(Escherichia coli) <220〉 <221 > CDS <222> (1)..(1098) <400> 9 atg tea tet gaa aaa ctg tat tee cca ctg aaa gtg ggc geg ate aeg Met Ser Ser Glu Lys Leu Tyr Ser Pro Leu Lys Val Gly Ala lie Thr 1 5 10 15 geg gca aac cgt att ttt atg gca ccg ctg aeg cgt ctg ege agt att Ala Ala Asn Arg lie Phe Met Ala Pro Leu Thr Arg Leu Arg Ser lie 20 25 30 gaa ccg ggt gac att cct acc ccg ttg atg geg gaa tac tat ege caa Glu Pro Gly Asp lie Pro Thr Pro Leu Met Ala Glu Tyr Tyr Arg Gin 35 40 45 cgt gee agt gee ggt ttg att att agt gaa gee aeg caa att tet gee Arg Ala Ser Ala Gly Leu lie lie Ser Glu Ala Thr Gin lie Ser Ala 50 55 60 cag gca aaa gga tat gca ggt geg cct ggc ate cat agt ccg gag caa Gin Ala Lys Gly Tyr Ala Gly Ala Pro Gly lie His Ser Pro Glu Gin 65 70 75 att gee gca tgg aaa aaa ate acc get ggc gtt cat get gaa aat ggt lie Ala Ala Trp Lys Lys lie Thr Ala Gly Val His Ala Glu Asn Gly 85 90 95 cat atg gee gtg cag ctg tgg cac acc gga ege att tet cac gee age His Met Ala Val Gin Leu Trp His Thr Gly Arg lie Ser His Ala Ser 100 105 110 ctg caa cct ggc ggt cag gca ccg gta geg cct tea gca ett age geg Leu Gin Pro Gly Gly Gin Ala Pro Val Ala Pro Ser Ala Leu Ser Ala 115 120 125 gga aca cgt act tet ctg ege gat gaa aat ggt cag geg ate cgt gtt Gly Thr Arg Thr Ser Leu Arg Asp Glu Asn Gly Gin Ala lie Arg Val 130 135 140 gaa aca tee atg ccg cgt geg ett gaa ctg gaa gag att cca ggt ate Glu Thr Ser Met Pro Arg Ala Leu Glu Leu Glu Glu lie Pro Gly lie 145 150 155 gtc aat gat ttc cgt cag gee att get aac geg cgt gaa gee ggt ttt Val Asn Asp Phe Arg Gin Ala lie Ala Asn Ala Arg Glu Ala Gly Phe 165 170 175 48 96 144 192 240 80 288 336 384 432 480 160 16 528 201000635 gat ctg gta gag etc cac tet get cac ggt tat ttg ctg cat cag ttc 576

Asp Leu Val Glu Leu His Ser Ala His Gly Tyr Leu Leu His Gin Phe 180 185 190 ett tet cct tet tea aac cat cgt acc gat cag tac ggc ggc age gtg 624

Leu Ser Pro Ser Ser Asn His Arg Thr Asp Gin Tyr Gly Gly Ser Val 195 200 205 gaa aat ege gca cgt ttg gta ctg gaa gtg gtc gat gee ggg att gaa 672

Glu Asn Arg Ala Arg Leu Val Leu Glu Val Val Asp Ala Gly lie Glu 210 215 220 gaa tgg ggt gee gat ege att ggc att ege gtt tea cca ate ggt act 720

Glu Trp Gly Ala Asp Arg lie Gly lie Arg Val Ser Pro lie Gly Thr 225 230 235 240 ttc cag aac aca gat aac ggc ccg aat gaa gaa gee gat gca ctg tat 768

Phe Gin Asn Thr Asp Asn Gly Pro Asn Glu Glu Ala Asp Ala Leu Tyr 245 250 255 ctg att gaa caa ctg ggt aaa ege ggc att get tat ctg cat atg tea 816

Leu lie Glu Gin Leu Gly Lys Arg Gly lie Ala Tyr Leu His Met Ser 260 265 270 gaa cca gat tgg geg ggg ggt gaa ccg tat act gat geg ttc ege gaa 864

Glu Pro Asp Trp Ala Gly Gly Glu Pro Tyr Thr Asp Ala Phe Arg Glu 275 280 285 aaa gta ege gee cgt ttc cac ggt ccg att ate ggc gca ggt gca tac 912

Lys Val Arg Ala Arg Phe His Gly Pro lie lie Gly Ala Gly Ala Tyr 290 295 300 aca gta gaa aaa get gaa aeg ctg ate ggc aaa ggg tta att gat geg 960

Thr Val Glu Lys Ala Glu Thr Leu lie Gly Lys Gly Leu lie Asp Ala 305 310 315 320 gtg gca ttt ggt cgt gac tgg att geg aac ccg gat ctg gtc gee ege 1008 Val Ala Phe Gly Arg Asp Trp lie Ala Asn Pro Asp Leu Val Ala Arg 325 330 335 ttg cag ege aaa get gag ett aac cca cag cgt gee gaa agt ttc tac 1056 Leu Gin Arg Lys Ala Glu Leu Asn Pro Gin Arg Ala Glu Ser Phe Tyr 340 345 350 ggt ggc ggc geg gaa ggc tat acc gat tac ccg aeg ttg taa 1098

Gly Gly Gly Ala Glu Gly Tyr Thr Asp Tyr Pro Thr Leu 355 360 365

<210> 10 <211> 365 <212> PRT <2Ί3> 大腸桿菌（Escherichia coli) <400> 10

Met Ser Ser Glu Lys Leu Tyr Ser Pro Leu Lys Val Gly Ala lie Thr 17 201000635 15 10 15

Ala Ala Asn Arg lie Phe Met Ala Pro Leu Thr Arg Leu Arg Ser lie 20 25 30

Glu Pro Gly Asp lie Pro Thr Pro Leu Met Ala Glu Tyr Tyr Arg Gin 35 40 45

Arg Ala Ser Ala Gly Leu lie lie Ser Glu Ala Thr Gin lie Ser Ala 50 55 60

Gin Ala Lys Gly Tyr Ala Gly Ala Pro Gly lie His Ser Pro Glu Gin 65 70 75 80 lie Ala Ala Trp Lys Lys lie Thr Ala Gly Val His Ala Glu Asn Gly 85 90 95

His Met Ala Val Gin Leu Trp His Thr Gly Arg lie Ser His Ala Ser 100 105 110

Leu Gin Pro Gly Gly Gin Ala Pro Val Ala Pro Ser Ala Leu Ser Ala 115 120 125

Gly Thr Arg Thr Ser Leu Arg Asp Glu Asn Gly Gin Ala lie Arg Val 130 135 140

Glu Thr Ser Met Pro Arg Ala Leu Glu Leu Glu Glu lie Pro Gly lie 145 150 155 160

Val Asn Asp Phe Arg Gin Ala lie Ala Asn Ala Arg Glu Ala Gly Phe 165 170 175

Asp Leu Val Glu Leu His Ser Ala His Gly Tyr Leu Leu His Gin Phe 180 185 190

Leu Ser Pro Ser Ser Asn His Arg Thr Asp Gin Tyr Gly Gly Ser Val 195 200 205

Glu Asn Arg Ala Arg Leu Val Leu Glu Val Val Asp Ala Gly lie Glu 210 215 220

Glu Trp Gly Ala Asp Arg lie Gly lie Arg Val Ser Pro lie Gly Thr 225 230 235 240 18 201000635

Phe Gin Asn Thr Asp Asn Gly Pro Asn Glu Glu Ala Asp Ala Leu Tyr 245 250 255 Leu lie Glu Gin Leu Gly Lys Arg Gly lie Ala Tyr Leu His Met Ser 260 265 270 Glu Pro Asp Trp Ala Gly Gly Glu Pro Tyr Thr Asp Ala Phe Arg Glu 275 280 285 Lys Val Arg Ala Arg Phe His Gly Pro lie lie Gly Ala Gly Ala Tyr 290 295 300 〆 Thr Val Glu Lys Ala Glu Thr Leu lie Gly Lys Gly Leu lie Asp Ala 4 305 310 315 320

Val Ala Phe Gly Arg Asp Trp lie Ala Asn Pro Asp Leu Val Ala Arg 325 330 335

Leu Gin Arg Lys Ala Glu Leu Asn Pro Gin Arg Ala Glu Ser Phe Tyr 340 345 350

Gly Gly Gly Ala Glu Gly Tyr Thr Asp Tyr Pro Thr Leu 355 360 365

<210> 11 <211> 1203 <212> DNA <213> 釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) <220> <221 > CDS <222> (1)..(1203) <400> 11 atg cca ttt gtt aag gac ttt aag cca caa get ttg ggt gac acc aac Met Pro Phe Val Lys Asp Phe Lys Pro Gin Ala Leu Gly Asp Thr Asn 15 10 15 tta ttc aaa cca ate aaa att ggt aac aat gaa ett eta cac cgt get Leu Phe Lys Pro lie Lys lie Gly Asn Asn Glu Leu Leu His Arg Ala 20 25 30 gtc att cct cca ttg act aga atg aga gcc caa cat cca ggt aat att Val lie Pro Pro Leu Thr Arg Met Arg Ala Gin His Pro Gly Asn lie 35 40 45 48 96 19 144 201000635 cca aac aga gac tgg gcc gtt gaa tac tac get caa cgt get caa aga 192

Pro Asn Arg Asp Trp Ala Val Glu Tyr Tyr Ala Gin Arg Ala Gin Arg 50 55 60 cca gga acc ttg att ate act gaa ggt acc ttt ccc tet cca caa tet 240

Pro Gly Thr Leu lie lie Thr Glu Gly Thr Phe Pro Ser Pro Gin Ser 65 70 75 80 ggg ggt tac gac aat get cca ggt ate tgg tee gaa gaa caa att aaa 288

Gly Gly Tyr Asp Asn Ala Pro Gly lie Trp Ser Glu Glu Gin lie Lys 85 90 95 gaa tgg acc aag att ttc aag get att cat gag aat aaa teg ttc gca 336

Glu Trp Thr Lys lie Phe Lys Ala lie His Glu Asn Lys Ser Phe Ala 100 105 110 tgg gtc caa tta tgg gtt eta ggt tgg get get ttc cca gac acc ett 384

Trp Val Gin Leu Trp Val Leu Gly Trp Ala Ala Phe Pro Asp Thr Leu 115 120 125 get agg gat ggt ttg cgt tac gac tee get tet gac aac gtg tat atg 432

Ala Arg Asp Gly Leu Arg Tyr Asp Ser Ala Ser Asp Asn Val Tyr Met 130 135 140 aat gca gaa caa gaa gaa aag get aag aag get aac aac cca caa cac 480

Asn Ala Glu Gin Glu Glu Lys Ala Lys Lys Ala Asn Asn Pro Gin His 145 150 155 160 agt ata aca aag gat gaa att aag caa tac gtc aaa gaa tac gtc caa 528

Ser lie Thr Lys Asp Glu lie Lys Gin Tyr Val Lys Glu Tyr Val Gin 165 170 175 get gcc aaa aac tee att get get ggt gcc gat ggt gtt gaa ate cac 576

Ala Ala Lys Asn Ser lie Ala Ala Gly Ala Asp Gly Val Glu lie His 180 185 190 age get aac ggt tac ttg ttg aac cag ttc ttg gac cca cac tee aat 624

Ser Ala Asn Gly Tyr Leu Leu Asn Gin Phe Leu Asp Pro His Ser Asn 195 200 205 aac aga acc gat gag tat ggt gga tee ate gaa aac aga gcc cgt ttc 672

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Thr Leu Glu Val Val Asp Ala Val Val Asp Ala lie Gly Pro Glu Lys 225 230 235 240 gtc ggt ttg aga ttg tet cca tat ggt gtc ttc aac agt atg tet ggt 768

Val Gly Leu Arg Leu Ser Pro Tyr Gly Val Phe Asn Ser Met Ser Gly 245 250 255 ggt get gaa acc ggt att gtt get caa tat get tat gtc tta ggt gaa 816

Gly Ala Glu Thr Gly lie Val Ala Gin Tyr Ala Tyr Val Leu Gly Glu 260 265 270 eta gaa aga aga get aaa get ggc aag cgt ttg get ttc gtc cat eta 864 20 201000635

Leu Glu Arg Arg Ala Lys Ala Gly Lys Arg Leu Ala Phe Val His Leu 275 280 285 gtt gaa cct cgt gtc acc aac cca ttt tta act gaa ggt gaa ggt gaa 912

Val Glu Pro Arg Val Thr Asn Pro Phe Leu Thr Glu Gly Glu Gly Glu 290 295 300 tac aat gga ggt age aac aaa ttt get tat tet ate tgg aag ggc cca 960

Tyr Asn Gly Gly Ser Asn Lys Phe Ala Tyr Ser lie Trp Lys Gly Pro 305 310 315 320 att att aga get ggt aac ttt get ctg cac cca gaa gtt gtc aga gaa 1008 lie lie Arg Ala Gly Asn Phe Ala Leu His Pro Glu Val Val Arg Glu 325 330 335 gag gtg aag gat cct aga aca ttg ate ggt tac ggt aga ttt ttt ate 1056

Glu Val Lys Asp Pro Arg Thr Leu lie Gly Tyr Gly Arg Phe Phe lie 340 345 350 tet aat cca gat ttg gtt gat cgt ttg gaa aaa ggg tta cca tta aac 1104

Ser Asn Pro Asp Leu Val Asp Arg Leu Glu Lys Gly Leu Pro Leu Asn 355 360 365 aaa tat gac aga gac act ttc tac aaa atg tea get gag gga tac att 1152

Lys Tyr Asp Arg Asp Thr Phe Tyr Lys Met Ser Ala Glu Gly Tyr lie 370 375 380 gac tac cct aeg tac gaa gaa get eta aaa etc ggt tgg gac aaa aat 1200

Asp Tyr Pro Thr Tyr Glu Glu Ala Leu Lys Leu Gly Trp Asp Lys Asn 385 390 395 400 1203 taa

<210> 12 <211> 400 <212> PRT

<213> 釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) <400> 12

Met Pro Phe Val Lys Asp Phe Lys Pro Gin Ala Leu Gly Asp Thr Asn 15 10 15

Leu Phe Lys Pro lie Lys lie Gly Asn Asn Glu Leu Leu His Arg Ala 20 25 30

Val lie Pro Pro Leu Thr Arg Met Arg Ala Gin His Pro Gly Asn lie 35 40 45

Pro Asn Arg Asp Trp Ala Val Glu Tyr Tyr Ala Gin Arg Ala Gin Arg 50 55 60 21 201000635

Pro Gly Thr Leu lie lie Thr Glu Gly Thr Phe Pro Ser Pro Gin Ser 65 70 75 80

Gly Gly Tyr Asp Asn Ala Pro Gly lie Trp Ser Glu Glu Gin lie Lys 85 90 95

Glu Trp Thr Lys lie Phe Lys Ala lie His Glu Asn Lys Ser Phe Ala 100 105 110

Trp Val Gin Leu Trp Val Leu Gly Trp Ala Ala Phe Pro Asp Thr Leu 115 120 125

Ala Arg Asp Gly Leu Arg Tyr Asp Ser Ala Ser Asp Asn Val Tyr Met 130 135 140

Asn Ala Glu Gin Glu Glu Lys Ala Lys Lys Ala Asn Asn Pro Gin His 145 150 155 160

Ser lie Thr Lys Asp Glu lie Lys Gin Tyr Val Lys Glu Tyr Val Gin 165 170 175

Ala Ala Lys Asn Ser lie Ala Ala Gly Ala Asp Gly Val Glu lie His 180 185 190

Ser Ala Asn Gly Tyr Leu Leu Asn Gin Phe Leu Asp Pro His Ser Asn 195 200 205

Asn Arg Thr Asp Glu Tyr Gly Gly Ser lie Glu Asn Arg Ala Arg Phe 210 215 220

Thr Leu Glu Val Val Asp Ala Val Val Asp Ala lie Gly Pro Glu Lys 225 230 235 240

Val Gly Leu Arg Leu Ser Pro Tyr Gly Val Phe Asn Ser Met Ser Gly 245 250 255

Gly Ala Glu Thr Gly lie Val Ala Gin Tyr Ala Tyr Val Leu Gly Glu 260 265 270

Leu Glu Arg Arg Ala Lys Ala Gly Lys Arg Leu Ala Phe Val His Leu 275 280 285

Val Glu Pro Arg Val Thr Asn Pro Phe Leu Thr Glu Gly Glu Gly Glu 22 320201000635 290 295 300

Tyr Asn Gly Gly Ser Asn Lys Phe Ala Tyr Ser lie Trp Lys Gly Pro 305 310 315 lie lie Arg Ala Gly Asn Phe Ala Leu His Pro Glu Val Val Arg Glu 325 330 335

Glu Val Lys Asp Pro Arg Thr Leu lie Gly Tyr Gly Arg Phe Phe lie 340 345 350

Ser Asn Pro Asp Leu Val Asp Arg Leu Glu Lys Gly Leu Pro Leu Asn 355 360 365

Lys Tyr Asp Arg Asp Thr Phe Tyr Lys Met Ser Ala Glu Gly Tyr lie 370 375 380 400

Asp Tyr Pro Thr Tyr Glu Glu Ala Leu Lys Leu Gly Trp Asp Lys Asn 385 390 395

<210> 13 <211> 1017 <212> DNA <213> 枯草桿菌(Bacillus subtilis) <220> <221 > CDS <222> (1)..(1017)

<400> 13 48 96 144 192 atg gcc aga aaa tta ttt aca cct att aca att aaa gat atg acg tta Met Ala Arg Lys Leu Phe Thr Pro lie Thr lie Lys Asp Met Thr Leu 15 10 15 aaa aac cgc att gtc atg teg cca atg tgc atg tat tet tet cat gaa Lys Asn Arg lie Val Met Ser Pro Met Cys Met Tyr Ser Ser His Glu 20 25 30 aag gac gga aaa tta aca ccg ttc cac atg gca cat tac ata teg cgc Lys Asp Gly Lys Leu Thr Pro Phe His Met Ala His Tyr lie Ser Arg 35 40 45 gca ate ggc cag gtc gga ctg att att gta gag geg tea geg gtt aac Ala lie Gly Gin Val Gly Leu lie lie Val Glu Ala Ser Ala Val Asn 50 55 60 cct caa gga ega ate act gac caa gac tta ggc att tgg age gac gag Pro Gin Gly Arg lie Thr Asp Gin Asp Leu Gly lie Trp Ser Asp Glu 65 70 75 23 240 80 201000635 cat att gaa ggc ttt gca aaa ctg act gag cag gtc aaa gaa caa ggt 288

His lie Glu Gly Phe Ala Lys Leu Thr Glu Gin Val Lys Glu Gin Gly 85 90 95 tea aaa ate ggc att cag ett gee cat gee gga cgt aaa get gag ett 336

Ser Lys lie Gly lie Gin Leu Ala His Ala Gly Arg Lys Ala Glu Leu 100 105 110 gaa gga gat ate ttc get cca teg geg att geg ttt gac gaa caa tea 384

Glu Gly Asp lie Phe Ala Pro Ser Ala lie Ala Phe Asp Glu Gin Ser 115 120 125 gca aca cct gta gaa atg tea gca gaa aaa gta aaa gaa aeg gtc cag 432

Ala Thr Pro Val Glu Met Ser Ala Glu Lys Val Lys Glu Thr Val Gin 130 135 140 gag ttc aag caa geg get gee ege gca aaa gaa gee ggc ttt gat gtg 480

Glu Phe Lys Gin Ala Ala Ala Arg Ala Lys Glu Ala Gly Phe Asp Val 145 150 155 160 att gaa att cat geg geg cac gga tat tta att cat gaa ttt ttg tet 528 lie Glu lie His Ala Ala His Gly Tyr Leu lie His Glu Phe Leu Ser 165 170 175 ccg ett tee aac cat ega aca gat gaa tat ggc ggc tea cct gaa aac 576

Pro Leu Ser Asn His Arg Thr Asp Glu Tyr Gly Gly Ser Pro Glu Asn 180 185 190 ege tat cgt ttc ttg aga gag ate att gat gaa gtc aaa caa gta tgg 624

Arg Tyr Arg Phe Leu Arg Glu lie lie Asp Glu Val Lys Gin Val Trp 195 200 205 gac ggt cct tta ttt gtc cgt gta tet get tet gac tac act gat aaa 672

Asp Gly Pro Leu Phe Val Arg Val Ser Ala Ser Asp Tyr Thr Asp Lys 210 215 220 ggc tta gac att gee gat cac ate ggt ttt gca aaa tgg atg aag gag 720

Gly Leu Asp lie Ala Asp His lie Gly Phe Ala Lys Trp Met Lys Glu 225 230 235 240 cag ggt gtt gac tta att gac tgc age tea ggc gee ett gtt cac gca 768

Gin Gly Val Asp Leu lie Asp Cys Ser Ser Gly Ala Leu Val His Ala 245 250 255 gac att aac gta ttc cct ggc tat cag gtc age ttc get gag aaa ate 816

Asp lie Asn Val Phe Pro Gly Tyr Gin Val Ser Phe Ala Glu Lys lie 260 265 270 cgt gaa cag geg gac atg get act ggt gee gtc ggc atg att aca gac 864

Arg Glu Gin Ala Asp Met Ala Thr Gly Ala Val Gly Met lie Thr Asp 275 280 285 ggt tea atg get gaa gaa att ctg caa aac gga cgt gee gac etc ate 912

Gly Ser Met Ala Glu Glu lie Leu Gin Asn Gly Arg Ala Asp Leu lie 290 295 300 24 1017 201000635 ttt ate ggc aga gag ett ttg egg gat cca ttt ttt gca aga act get 960

Phe lie Gly Arg Glu Leu Leu Arg Asp Pro Phe Phe Ala Arg Thr Ala 305 310 315 320 geg aaa cag etc aat aca gag att ccg gee cct gtt caa tac gaa aga 1008

Ala Lys Gin Leu Asn Thr Glu lie Pro Ala Pro Val Gin Tyr Glu Arg 325 330 335

ggc tgg taa GlyTrp <210> 14 <211> 338 <212> PRT <213> 枯草桿菌(Bacillus subtilis) <400> 14

Met Ala Arg Lys Leu Phe Thr Pro lie Thr lie Lys Asp Met Thr Leu 15 10 15

Lys Asn Arg lie Val Met Ser Pro Met Cys Met Tyr Ser Ser His Glu 20 25 30

Lys Asp Gly Lys Leu Thr Pro Phe His Met Ala His Tyr lie Ser Arg 35 40 45

Ala lie Gly Gin Val Gly Leu lie lie Val Glu Ala Ser Ala Val Asn 50 55 60

Pro Gin Gly Arg lie Thr Asp Gin Asp Leu Gly lie Trp Ser Asp Glu 65 70 75 80

His lie Glu Gly Phe Ala Lys Leu Thr Glu Gin Val Lys Glu Gin Gly 85 90 95

Ser Lys lie Gly lie Gin Leu Ala His Ala Gly Arg Lys Ala Glu Leu 100 105 110

Glu Gly Asp lie Phe Ala Pro Ser Ala lie Ala Phe Asp Glu Gin Ser 115 120 125

Ala Thr Pro Val Glu Met Ser Ala Glu Lys Val Lys Glu Thr Val Gin 130 135 140

Glu Phe Lys Gin Ala Ala Ala Arg Ala Lys Glu Ala Gly Phe Asp Val 25 201000635 145 150 155 160 lie Glu lie His Ala Ala His GlyTyr Leu He His Glu Phe Leu Ser 165 170 175

Pro Leu Ser Asn His Arg Thr Asp Glu Tyr Gly Gly Ser Pro Glu Asn 180 185 190

Arg Tyr Arg Phe Leu Arg Glu lie lie Asp Glu Val Lys Gin Val Trp 195 200 205

Asp Gly Pro Leu Phe Val Arg Val Ser Ala Ser Asp Tyr Thr Asp Lys 210 215 220

Gly Leu Asp lie Ala Asp His lie Gly Phe Ala Lys Trp Met Lys Glu 225 230 235 240

Gin Gly Val Asp Leu lie Asp Cys Ser Ser Gly Ala Leu Val His Ala 245 250 255

Asp lie Asn Val Phe Pro Gly Tyr Gin Val Ser Phe Ala Glu Lys lie 260 265 270

Arg Glu Gin Ala Asp Met Ala Thr Gly Ala Val Gly Met lie Thr Asp 275 280 285

Gly Ser Met Ala Glu Glu He Leu Gin Asn Gly Arg Ala Asp Leu He 290 295 300

Phe lie Gly Arg Glu Leu Leu Arg Asp Pro Phe Phe Ala Arg Thr Ala 305 310 315 320

Ala Lys Gin Leu Asn Thr Glu lie Pro Ala Pro Val Gin Tyr Glu Arg 325 330 335

Gly Trp <210> 15 <211> 37 <212> DNA <213> 人工 26 <220> 201000635 <223> 引子 <400> 15 agga99aatt aaccatgtcg tacatgaact ttgaccc

<210> 16 <211> 22 <212> DNA <213> 人工 <220> <223> 引子 <400> 16 ttagtacttc ttttcctctt tc

<210> 17 <211> 43 <212> DNA <213> 人工 <220> <223> 引子 <400> 17 a99aggaatt aaccatgtcg tttatgaact ttgaaccaaa gcc <210> 18 <211> 27 <212> DNA <213> 人工 <220>

<223> 引子 <400> 18 ctatttcttg taacccttgg caacagc <210> 19 <211> 45 <212> DNA <213> 人工 <220> <223> 引子 <400> 19 agga9gaatt aaccatggca actattttcg atccgatcaa actgg

<210> 20 <211> 31 <212> DNA 201000635 <213> 人工 <220> <223> 引子 <400> 20 ttacagcgtc gggtagtcga tgtagccgac c 31 <210> <211> <212> <213> 21 35 DNA 人工 <220> <223> 引子 <400> 21 aggaggaatt aaccatgccg actcttttcg acccc 35 <210> <211> <212> <213> 22 21 DNA 人工 <220> <223> 引子 <400> 22 ctacttttgg tcagcggtgg g 21 <210> <211> <212> <213> 23 40 DNA 人工 <220> <223> 引子 <400> 23 aggaggaatt aaccatgtca tctgaaaaac tgtattcccc 40 <210> <211> <212> <213> 24 40 DNA 人工 <220> <223> 引子 <400> 24 aggaggaatt aaccatgtca tctgaaaaac tgtattcccc 40 28 201000635 <210> 25 <211> <212> <213> 40 DNA 人工 <220> <223> 引子 <400> 25 aggaggaatt aaccatgcca tttgttaagg actttaagcc <210> 26 <211> <212> <213> 30 DNA 人工 <220〉 / <223> 引子 <400> 26 ttaatttttg tcccaaccga gttttagagc <210> 27 <211> <212> <213> 37 DNA 人工 <220> <223> 引子 <400> 27 aggaggaatt aaccatggcc agaaaattat ttacacc <210> 28 ί: <211> <212> <213> 24 DNA 人工 <220> <223> 引子 <400> 28 ttaccagcct ctttcgtatt gaac <210> 29 <211> <212> <213> 27 DNA 人工 <220> <223> 引子 <400> 29 201000635 27 ctcatatggc gacaatccga cctgacg

<210> 30 <211> 28 <212> DNA <213> 人工 <220> <223> 引子 <400> 30 ctgcatgctt gttgtctgac agtgcgtc 28

<210> 31 <211> 1566 <212> DNA <213> 紅城紅球菌(Rhodococcus erythropolis) <220> <221 > CDS <222> (1)..(1566) <400> 31 atg gcg aca ate ega cct gac gac aaa gca ata gac gee gee gca agg 48

Met Ala Thr lie Arg Pro Asp Asp Lys Ala lie Asp Ala Ala Ala Arg 15 10 15 cat tac ggc ate act etc gac aaa aca gee egg etc gag tgg ccg gca 96

His Tyr Gly lie Thr Leu Asp Lys Thr Ala Arg Leu Glu Trp Pro Ala 20 25 30 ctg ate gac gga gca ctg ggc tee tac gac gtc gtc gac cag ttg tac 144

Leu lie Asp Gly Ala Leu Gly Ser Tyr Asp Val Val Asp Gin Leu Tyr 35 40 45 gee gac gag gcg acc ccg ccg acc aeg tea ege gag cac gcg gtg cca 192

Ala Asp Glu Ala Thr Pro Pro Thr Thr Ser Arg Glu His Ala Val Pro 50 55 60 240 80 288 336 agt gcg age gaa aat cct ttg age get tgg tat gtg acc acc age ate Ser Ala Ser Glu Asn Pro Leu Ser Ala Trp Tyr Val Thr Thr Ser lie 65 70 75 ccg ccg aeg teg gac ggc gtc ctg acc ggc ega ege gtg gcg ate aag Pro Pro Thr Ser Asp Gly Val Leu Thr Gly Arg Arg Val Ala lie Lys 85 90 95 gac aac gtg acc gtg gee gga gtt ccg atg atg aac gga tet egg aeg Asp Asn Val Thr Val Ala Gly Val Pro Met Met Asn Gly Ser Arg Thr 100 105 110 gta gag gga ttt act ccg tea ege gac gcg act gtg gtc act ega eta Val Glu Gly Phe Thr Pro Ser Arg Asp Ala Thr Val Val Thr Arg Leu 115 120 125 30 384 480 432 201000635 ctg gcg gcc ggt gca acc gtc gcg ggc aaa get gtg tgt gag gac ctg Leu Ala Ala Gly Ala Thr Val Ala Gly Lys Ala Val Cys Glu Asp Leu 130 135 140 tgt ttc tcc ggt teg age ttc aca ccg gca age gga ccg gtc ege aat Cys Phe Ser Gly Ser Ser Phe Thr Pro Ala Ser Gly Pro Val Arg Asn 145 150 155 cca tag gac egg cag ege gaa gca ggt gga tea tec ggc ggc agt gca Pro Trp Asp Arg Gin Arg Glu Ala Gly Gly Ser Ser Gly Gly Ser Ala 165 170 175 gca etc gtc gca aac ggt gac gtc gat ttt gcc ate ggc ggg gat caa Ala Leu Val Ala Asn Gly Asp Val Asp Phe Ala lie Gly Gly Asp Gin 180 185 190 ggc gga teg ate egg ate ccg gcg gca ttc tgc ggc gtc gtc ggg cac Gly Gly Ser lie Arg lie Pro Ala Ala Phe Cys Gly Val Val Gly His 195 200 205 aag ccg aeg ttc ggg etc gtc ccg tat acc ggt gca ttt ccc ate gag Lys Pro Thr Phe Gly Leu Val Pro Tyr Thr Gly Ala Phe Pro lie Glu 210 215 220 ega aca ate gac cat etc ggc ccg ate aca ege aeg gtc cac gat gca Arg Thr lie Asp His Leu Gly Pro lie Thr Arg Thr Val His Asp Ala 225 230 235 gca ctg atg etc teg gtc ate gcc ggc ege gac ggt aac gac cca ege Ala Leu Met Leu Ser Val lie Ala Gly Arg Asp Gly Asn Asp Pro Arg 245 250 255 caa gcc gac agt gtc gaa gca ggt gac tat ctg tec acc etc gac tec Gin Ala Asp Ser Val Glu Ala Gly Asp Tyr Leu Ser Thr Leu Asp Ser 260 265 270 gat gtg gac ggc ctg ega ate gga ate gtt ega gag gga ttc ggg cac Asp Val Asp Gly Leu Arg lie Gly lie Val Arg Glu Gly Phe Gly His 275 280 285 gcg gtc tea cag ccc gag gtc gac gac gca gtc ege gca gcg gca cac Ala Val Ser Gin Pro Glu Val Asp Asp Ala Val Arg Ala Ala Ala His 290 295 300 agt ctg acc gaa ate ggt tgc aeg gta gag gaa gta aac ate ccg tag Ser Leu Thr Glu lie Gly Cys Thr Val Glu Glu Val Asn lie Pro Trp 305 310 315 cat ctg cat get ttc cac ate tgg aac gtg ate gcc aeg gac ggt ggt His Leu His Ala Phe His lie Trp Asn Val lie Ala Thr Asp Gly Gly 325 330 335 gcc tac cag atg ttg gac ggc aac gga tac ggc atg aac gcc gaa ggt Ala Tyr Gin Met Leu Asp Gly Asn Gly Tyr Gly Met Asn Ala Glu Gly 340 345 350 160 528 576 624 672 720 240 768 816 864 912 960 320 1008 31 1056 201000635 ttg tac gat ccg gaa ctg atg gca cac ttt get tet ega ege att cag 1104

Leu Tyr Asp Pro Glu Leu Met Ala His Phe Ala Ser Arg Arg lie Gin 355 360 365 cac gee gac get ctg tee gaa acc gtc aaa ctg gtg gee ctg acc ggc 1152 His Ala Asp Ala Leu Ser Glu Thr Val Lys Leu Val Ala Leu Thr Gly 370 375 380 cac cac ggc ate acc acc etc ggc ggc geg age tac ggc aaa gee egg 1200

His His Gly lie Thr Thr Leu Gly Gly Ala Ser Tyr Gly Lys Ala Arg 385 390 395 400 aac etc gta ccg ett gee ege gee gee tac gac act gee ttg aga caa 1248

Asn Leu Val Pro Leu Ala Arg Ala Ala Tyr Asp Thr Ala Leu Arg Gin 405 410 415 ttc gac gtc ctg gtg atg cca aeg ctg ccc tac gtc gca tee gaa ttg 1296

Phe Asp Val Leu Val Met Pro Thr Leu Pro Tyr Val Ala Ser Glu Leu 420 425 430 ccg geg aag gac gta gat cgt gca acc ttc ate acc aag get etc ggg 1344

Pro Ala Lys Asp Val Asp Arg Ala Thr Phe lie Thr Lys Ala Leu Gly 435 440 445 atg ate gee aac aeg gca cca ttc gac gtg acc gga cat ccg tee ctg 1392

Met lie Ala Asn Thr Ala Pro Phe Asp Val Thr Gly His Pro Ser Leu 450 455 460 tee gtt ccg gee ggc ctg gtg aac ggg ett ccg gtc gga atg atg ate 1440

Ser Val Pro Ala Gly Leu Val Asn Giy Leu Pro Val Gly Met Met lie 465 470 475 480 acc ggc aga cac ttc gac gat geg aca gtc ett cgt gtc gga ege gca 1488

Thr Gly Arg His Phe Asp Asp Ala Thr Val Leu Arg Val Gly Arg Ala 485 490 495 ttc gaa aag ett ege ggc geg ttt ccg aeg ccg gee gaa ege gee tee 1536 Phe Glu Lys Leu Arg Gly Ala Phe Pro Thr Pro Ala Glu Arg Ala Ser 500 505 510 aac tet gca cca caa etc age ccc gee tag 1566

Asn Ser Ala Pro Gin Leu Ser Pro Ala 515 520

<210> 32 <211> 521 <212> PRT <213> 紅城紅球菌(Rhodococcus erythropolis) <400〉 32

Met Ala Thr lie Arg Pro Asp Asp Lys Ala lie Asp Ala Ala Ala Arg 15 10 15

His Tyr Gly lie Thr Leu Asp Lys Thr Ala Arg Leu Glu Trp Pro Ala 32 201000635 20 25 30

Leu lie Asp Gly Ala Leu Gly Ser Tyr Asp Val Val Asp Gin Leu Tyr 35 40 45

Ala Asp Glu Ala Thr Pro Pro Thr Thr Ser Arg Glu His Ala Val Pro 50 55 60

Ser Ala Ser Glu Asn Pro Leu Ser Ala Trp Tyr Val Thr Thr Ser lie 65 70 75 80

Pro Pro Thr Ser Asp Gly Val Leu Thr Gly Arg Arg Val Ala lie Lys 85 90 95

Asp Asn Val Thr Val Ala Gly Val Pro Met Met Asn Gly Ser Arg Thr 100 105 110

Val Glu Gly Phe Thr Pro Ser Arg Asp Ala Thr Val Val Thr Arg Leu 115 120 125

Leu Ala Ala Gly Ala Thr Val Ala Gly Lys Ala Val Cys Glu Asp Leu 130 135 140

Cys Phe Ser Gly Ser Ser Phe Thr Pro Ala Ser Gly Pro Val Arg Asn 145 150 155 160

Pro Trp Asp Arg Gin Arg Glu Ala Gly Gly Ser Ser Gly Gly Ser Ala

165 170 175

Ala Leu Val Ala Asn Gly Asp Val Asp Phe Ala lie Gly Gly Asp Gin 180 185 190

Gly Gly Ser lie Arg lie Pro Ala Ala Phe Cys Gly Val Val Gly His 195 200 205

Lys Pro Thr Phe Gly Leu Val Pro Tyr Thr Gly Ala Phe Pro lie Glu 210 215 220

Arg Thr lie Asp His Leu Gly Pro lie Thr Arg Thr Val His Asp Ala 225 230 235 240

Ala Leu Met Leu Ser Val lie Ala Gly Arg Asp Gly Asn Asp Pro Arg 245 250 255 33 201000635

Gin Ala Asp Ser Val Glu Ala Gly Asp Tyr Leu Ser Thr Leu Asp Ser 260 265 270

Asp Val Asp Gly Leu Arg lie Gly lie Val Arg Glu Gly Phe Gly His 275 280 285

Ala Val Ser Gin Pro Glu Val Asp Asp Ala Val Arg Ala Ala Ala His 290 295 300 320

Ser Leu Thr Glu lie Gly Cys Thr Val Glu Glu Val Asn lie Pro Trp 305 310 315

His Leu His Ala Phe His lie Trp Asn Val lie Ala Thr Asp Gly Gly 325 330 335

Ala Tyr Gin Met Leu Asp Gly Asn Gly Tyr Giy Met Asn Ala Glu Gly 340 345 350

Leu Tyr Asp Pro Glu Leu Met Ala His Phe Ala Ser Arg Arg lie Gin 355 360 365

His Ala Asp Ala Leu Ser Glu Thr Val Lys Leu Val Ala Leu Thr Gly 370 375 380 400

His His Gly He Thr Thr Leu Gly Gly Ala Ser Tyr Gly Lys Ala Arg 385 390 395

Asn Leu Val Pro Leu Ala Arg Ala Ala Tyr Asp Thr Ala Leu Arg Gin 405 410 415

Phe Asp Val Leu Val Met Pro Thr Leu Pro Tyr Val Ala Ser Glu Leu 420 425 430

Pro Ala Lys Asp Val Asp Arg Ala Thr Phe lie Thr Lys Ala Leu Gly 435 440 445

Met lie Ala Asn Thr Ala Pro Phe Asp Val Thr Gly His Pro Ser Leu 450 455 460

Ser Val Pro Ala Gly Leu Val Asn Gly Leu Pro Val Gly Met Met lie 465 470 475 34 480 201000635

Thr Gly Arg His Phe Asp Asp Ala Thr Val Leu Arg Val Gly Arg Ala 485 490 495

Phe Glu Lys Leu Arg Gly Ala Phe Pro Thr Pro Ala Glu Arg Ala Ser 500 505 510

Asn Ser Ala Pro Gin Leu Ser Pro Ala 515 520

<210> 33 <211> 945 <212> DNA <213> 人蒼白桿菌(Ochrobactrum anthropi) ' <220> <221 > CDS <222> (1)..(945) <400> 33 atg tgc aat aat tgc cat tac acc att cac ggc egg cat cat cat ttc Met Cys Asn Asn Cys His Tyr Thr lie His Gly Arg His His His Phe 15 10 15 ggc tag gac aac teg ttc cag ccg get gaa aeg gtc geg ccc ggc teg Gly Trp Asp Asn Ser Phe Gin Pro Ala Glu Thr Val Ala Pro Gly Ser 20 25 30 acc ctg aaa ttc gaa tgt ctg gac age ggc gca ggc cac tat cat ege Thr Leu Lys Phe Glu Cys Leu Asp Ser Gly Ala Gly His Tyr His Arg 35 40 45 , ggc age aca gtc gee gat gtg teg aeg atg gat ttt tee aag gtc aat i Gly Ser Thr Val Ala Asp Val Ser Thr Met Asp Phe Ser Lys Val Asn 50 55 60 ccg gtt acc ggc ccc ate ttc gtc gat gga gee aaa ccg ggc gat gtc Pro Val Thr Gly Pro lie Phe Val Asp Gly Ala Lys Pro Gly Asp Val 65 70 75 ctg aaa ate acc ate cac cag ttc gag cca tea ggc ttc ggc tgg aeg Leu Lys lie Thr lie His Gin Phe Glu Pro Ser Gly Phe Gly Trp Thr 85 90 95 gca aat att ccg ggc ttc ggt ett etc gee gac gac ttc aag gaa ccg Ala Asn lie Pro Gly Phe Gly Leu Leu Ala Asp Asp Phe Lys Glu Pro 100 105 110 geg eta gca ttg tgg aac tac aat ccc aca aeg ctg gag cca gca etc Ala Leu Ala Leu Trp Asn Tyr Asn Pro Thr Thr Leu Glu Pro Ala Leu 115 120 125 ttc gga gag cgt geg ege gtg ccg ctg aag ccg ttc gee gga acc ate 48 96 144 192 240 80 288 336 384 432 35 480 201000635

Phe Gly Glu Arg Ala Arg Val Pro Leu Lys Pro Phe Ala Gly Thr lie 130 135 140 160 528 ggc gtc gca ccg gcg gaa aag ggc ctg cat teg gtc gta cca ccg cgt Gly Val Ala Pro Ala Glu Lys Gly Leu His Ser Val Val Pro Pro Arg 145 150 155 cgt gtc ggc ggc aat etc gac ate ege gat ett gca gee gga acc aeg Arg Val Gly Gly Asn Leu Asp lie Arg Asp Leu Ala Ala Gly Thr Thr 165 170 175 ett tat ctg ccg ate gaa gtc gaa ggc get ttg ttc tee att ggt gat 576

Leu Tyr Leu Pro lie Glu Val Glu Gly Ala Leu Phe Ser lie Gly Asp 180 185 190 acc cat gcg gca cag ggc gac ggc gaa gtg tgc ggc acc gee ate gaa 624

Thr His Ala Ala Gin Gly Asp Gly Glu Val Cys Gly Thr Ala lie Glu 195 200 205 age gcg atg aat gtc get ctg aeg ctg gat etc ate aag gat aeg cca 672

Ser Ala Met Asn Val Ala Leu Thr Leu Asp Leu lie Lys Asp Thr Pro 210 215 220 ctg aag atg ccc egg ttc acc aeg ccg ggg cca gtg aeg egg cac etc 720

Leu Lys Met Pro Arg Phe Thr Thr Pro Gly Pro Val Thr Arg His Leu 225 230 235 240 gat acc aag ggt tac gaa gtc acc acc ggt ate ggg tee gat ctg tgg 768

Asp Thr Lys Gly Tyr Glu Val Thr Thr Gly lie Gly Ser Asp Leu Trp 245 250 255 gaa ggc gcg aaa gee gee etc tee aac atg ate gac ett ett tgc cag 816

Glu Gly Ala Lys Ala Ala Leu Ser Asn Met lie Asp Leu Leu Cys Gin 260 265 270 aeg cag aac etc aac ccg gtg gat gee tat atg etc tgc teg gee tgc 864

Thr Gin Asn Leu Asn Pro Val Asp Ala Tyr Met Leu Cys Ser Ala Cys 275 280 285 ggt gat ctg cgt ate age gaa ate gtc gat cag ccg aac tgg gtc gta 912

Gly Asp Leu Arg lie Ser Glu lie Val Asp Gin Pro Asn Trp Val Val 290 295 300 teg ttc tac ttc ccg cgt tee gtt ttc gaa taa 945

Ser Phe Tyr Phe Pro Arg Ser Val Phe Glu 305 310

<210> 34 <211> 314 <212> PRT <213> 人蒼白桿菌(Ochrobactrum anthropi) <400> 34

Met Cys Asn Asn Cys His Tyr Thr lie His Gly Arg His His His Phe 1 5 10 15 36 201000635

Gly Trp Asp Asn Ser Phe Gin Pro Ala Glu Thr Val Ala Pro Gly Ser 20 25 30

Thr Leu Lys Phe Glu Cys Leu Asp Ser Gly Ala Gly His Tyr His Arg 35 40 45

Gly Ser Thr Val Ala Asp Val Ser Thr Met Asp Phe Ser Lys Val Asn 50 55 60

Pro Val Thr Gly Pro lie Phe Val Asp Gly Ala Lys Pro Gly Asp Val 65 70 75

Leu Lys lie Thr lie His Gin Phe Glu Pro Ser Gly Phe Gly Trp Thr 85 90 95

Ala Asn lie Pro Gly Phe Gly Leu Leu Ala Asp Asp Phe Lys Glu Pro 100 105 110

Ala Leu Ala Leu Trp Asn Tyr Asn Pro Thr Thr Leu Glu Pro Ala Leu 115 120 125

Phe Gly Glu Arg Ala Arg Val Pro Leu Lys Pro Phe Ala Gly Thr lie 130 135 140

Gly Val Ala Pro Ala Glu Lys Gly Leu His Ser Val Val Pro Pro Arg 145 150 155

Arg Val Gly Gly Asn Leu Asp lie Arg Asp Leu Ala Ala Gly Thr Thr 165 170 175

Leu Tyr Leu Pro lie Glu Val Glu Gly Ala Leu Phe Ser lie Gly Asp 180 185 190

Thr His Ala Ala Gin Gly Asp Gly Glu Val Cys Gly Thr Ala lie Glu 195 200 205

Ser Ala Met Asn Val Ala Leu Thr Leu Asp Leu lie Lys Asp Thr Pro 210 215 220

Leu Lys Met Pro Arg Phe Thr Thr Pro Gly Pro Val Thr Arg His Leu 225 230 235 37 201000635

Asp Thr Lys Gly Tyr Glu Val Thr Thr Gly lie Gly Ser Asp Leu Trp 245 250 255

Glu Gly Ala Lys Ala Ala Leu Ser Asn Met lie Asp Leu Leu Cys Gin 260 265 270

Thr Gin Asn Leu Asn Pro Val Asp Ala Tyr Met Leu Cys Ser Ala Cys 275 280 285

Gly Asp Leu Arg lie Ser Glu lie Val Asp Gin Pro Asn Trp Val Val 290 295 300

Ser Phe Tyr Phe Pro Arg Ser Val Phe Glu 305 310 <210> 35 <211> 1212 <212> DNA <213> 人工 <220> <223> 來自馬其頓假絲酵母(Candida macedoniensis)之密碼子最適化OYE基因 <400> 35 atgtcctaca tgaactttga cccgaaaccg ctgggggata ccaacatctt caaaccgatt 60 aaaatcggta ataacgaact gaagcaccgt gttgtaatgc cggcgctgac gcgtatgcgt 120 gcaattgccc cgggtaacat tccgaacacc gaatgggctg aagaatacta tcgccagcgt 180 tctcagtacc cgggcactct gatcatcacc gaaggcacct tcccgtccgc gcagtctggt 240 ggttatccga atgttccggg tatttggtct aaggaacagc tggctgaatg gaagaaaatc 300 ttcaatgcga ttcacgaaaa caaaagcttc gtttgggttc aactgtgggt gctgggccgt 360 caggcttggc cggaagttct gaagaaagaa gggctgcgtt atgactccgc gaccgatgac 420 ctgtatatgg gtgaggaaga aaaagaacgc gcactgaaag caaacaaccc acaacacggg 480 attaccaagg aagaaattaa acagtacatc aaagagtatg ttgatgcggc gaaaaaggct 540 atcgacgccg gtgctgacgg cgtgcagatc cattccgcca acggttacct gctgaaccag 600 ttcctggacc cgatctccaa taaccgtacc gatgaatacg gtggctctat cgaaaatcgc 660 gctcgtttca ccctggaagt agttgacgcc gttgttgacg ccgtgggcgc ggagcgtacc 720 tccatccgct tctctccgta cggaacgttc ggtactatgt ccggaggcga gaacccggga 780 atcgtggctc aatacgctta cgttattggt gaactggaga aacgcgcacg cgctggtaaa 840 38 201000635 cgcctggcgt tcatcgatct ggtggaaccg cgcgttactg atccgttcct gccggagttt 900 gaaaaatggt ttaaagaagg taccaacgag ttcatctaca gcatttggaa aggtccggta 960 ctgcgtgttg gcaattatgc cctggacccg gaccaggcga ctctggatag caaaaagccg 1020 aacacgctga ttggctatgg tcgcagcttc atcgccaatc cagacctggt gtaccgcctg 1080 gaaaaaggac tgcctctgaa caaatatgac cgcaacactt tctacacttt cactaaggaa 1140 ggatacactg actacccgtc ctacgaggaa tctgtagcaa aagggtataa aaaggaagaa 1200 aagaaatact aa 1212 <210> 36 <211> 1197 <212> DNA <213> 人工 <220> <223>來自乳酸克魯維酵母(Kluyveromyces lactis) NRRL Y-1140之密碼子最適化 KYE1基因 <400> 36 atgagcttta tgaatttcga gcctaaaccg ctggccgata ctgatatctt caagccgatc 60 aaaattggta ataccgagct gaaacaccgt gtagttatgc cggctctgac tcgtatgcgc 120 gcgctgcatc caggtaacgt gccgaacccg gactgggctg ttgaatacta ccgtcagcgt 180 tcccaatatc ctggcaccat gatcatcact gaaggtgctt ttccgtctgc ccagtctggt 240 ggctacgata atgctcctgg cgtttggtct gaggaacaac tggcccagtg gcgcaagatc 300 tttaaagcga tccatgacaa caaaagcttc gtctgggtac agctgtgggt tctgggtcgt 360 caggcgttcg cagataacct ggctcgcgac ggtctgcgtt acgattctgc ctccgacgaa 420 gtttacatgg gtgaagatga gaaagaacgc gccatccgtt ccaacaaccc gcaacacggt 480 atcacgaaag atgaaatcaa gcagtacatc cgtgactacg tggacgcagc taaaaagtgt 540 atcgacgcgg gcgctgatgg tgttgaaatt cactctgcaa acggctacct gctgaaccag 600 tttctggacc ctatctccaa caaacgtact gacgaatatg gcggttctat cgagaatcgt 660 gcccgcttcg tactggaagt agttgacgcg gttgtggacg cggtgggcgc ggagcgtacc 720 agcattcgtt tcagcccata tggcgtattc ggtactatgt ccggtgtttc cgacccggtt 780 ctggttgcac agttcgcata tgtcctggcg gaactggaaa aacgtgcaaa agctggtaaa 840 cgtctggcat acgttgacct ggtggaaccg cgtgtaacct ccccattcca gccggaattt 900 gaaggctggt ataaaggcgg caccaacgaa ttcgtataca gcgtttggaa aggtaacgtt 960 39 201000635 ctgcgcgttg gcaactacgc tctggatccg gacgctgcaa ttaccgactc taaaaacccg 1020 aataccctga tcggctacgg ccgtgctttc atcgctaacc ctgatctggt agaacgtctg i〇8〇 gagaaaggcc tgcctctgaa ccagtacgat cgtccttcct tttacaaaat gtccgccgag 114〇 ggttatatcg attatccgac ttatgaagaa gcggttgcta agggctataa aaagtaa 1197

<210> 37 <211> 1050 <212> DNA <213> 人工 <220> <223>來自螢光假單胞菌(Pseudomonas fluorescens) l-C之密碼子最適化xenB基因 <400> 37 atggcgacta tttttgaccc gattaaactg ggagatctgg aactgtctaa ccgcattatc 60 atggcgccgc tgacccgttg ccgtgcggat gagggccgcg ttccaaatgc tctgatggct 120 gagtactatg tgcagcgtgc gtccgcaggt ctgattctgt ctgaagcgac ctccgtgact 180 cctatggggg taggctaccc ggatacgccg ggtatttggt ccaatgacca ggtgcgtgga 240 tggacgaaca tcaccaaagc tgttcacgca gcaggcggta agatcgttct gcaactgtgg 300 cacgttggcc gtatttccca cccgctgtac ctgaacggag aggcgccggt agctccgtct 360 gctatccaac cgaaaggtca tgtatccctg gtgcgtccgc tggctgatta tcctactccg 420 cgtgcgctgg aaaccgcgga gattgcggaa atcgttgaag catatcgtac gggagccgaa 480 aacgcgaaag ctgcgggctt tgacggcgtc gaaatccatg gcgctaacgg ttatctgctg 540 gatcagtttc tgcaaagctc cacgaatcag cgtaccgaca actacggcgg atctctggaa 600 aaccgtgcgc gcctgctgct ggaagtaacc gacgccgcaa ttgatgtgtg gggagccggc 660 cgtgttggtg ttcacctggc tcctcgtgcg gatagccacg acatgggtga cgacaacctg 720 gcagaaacct tcacttatgt ggctcgcgaa ctgggaaaac gcgggatcgc attcatctgt 780 tctcgcgaaa aagaaggtgc cgactccctg ggcccgcaac tgaaggaagc ctttggaggc 840 gcttatattg cgaacgagcg ttttaccaaa gattctgcaa acgcgtggct ggcggaaggt 900 aaagcagatg cagttgcgtt tggcgttccg ttcattgcca accctgacct gccggctcgc 960 ctgaaggcag acgctcctct gaacgaacct cgcccggaac tgttctacgg caaaggtccg 1020 gtgggatata tcgattaccc gaccctgtaa 1050 <210> 38 40 201000635 <211> 1083 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> 來自丁香假單胞菌大豆致病變種(Pseudomonas syringae pv. glycinea)之密瑪子 最適化ncr基因 <400> 38 atgccaactc tgtttgaccc gctgactctg ggcgacctgc aatccccgaa ccgtgttctg 60 atggctcctc tgacccgtgg acgtgccacc cgtgagcacg tgccgaccga gctgatgatc 120 gaatactata cccagcgcgc gagcgcaggc ctgatcatca ccgaagccac gggcatcacc 180 caggaaggtc tgggctggcc gtatgctccg gggatctggt ccgacgagca ggtggaagcc 240 tggaaaccgg tgactcaggc tgtacatgaa gcgggtggac gcattatcct gcaactgtgg 300 f - ' cacatgggtc gcaccgttca ttcttctttc ctgggtggcg caaaacctgt ttctagctcc 360 gcaacccgtg caccgggaca ggctcacact tacgaaggga aacaggatta cgacgaagcg 420 cgtccgctga gcgccgatga aattccgcgt ctgctgaacg attatgagca cgctgccaaa 480 aacgcaatgg cagcaggctt cgatggtgtc cagattcacg ccgctaacgg ctatctgatc 540 gaccaatttc tgcgtgataa ctccaacgtt cgcggggacg catacggtgg ctctatcgag 600 aaccgtattc gcctgctggt tgaagttacc cgtcgtgttg ccgaaaccgt gggagccgag 660 aaaaccggtg tgcgtctgtc cccgaatggc gactcccagg gggtgaacga ttctaaccca 720 gaaccgctgt tttctgcggc ggctaaagca ctggatgaga ttggtatcgc ccacctggaa 780 ctgcgtgaac cgggctatga aggcactttt ggcaaagctg accgtccgcc ggtacatcca 840 1 gtcatccgtc aggcattttc tcgtaccctg atcctgaaca gcgattacac gctggaaacc 900 gcacaggctg cactggcaac cggtgaagct gatgctatta cttttggccg tccgtttctg 960 gcgaaccctg acctgccgca tcgtttcgcg gaacgtctgc cgctgaacaa ggatgttatg 1020 gaaacctggt actctcaggg accggagggt tacgtagatt atccaaccgc agatcagaaa 1080 taa 1083 41

Claims (1)

1 1201000635 七、申請專利範圍： 1. 一種用於製備ε_己内醯胺之方法，其包括還原（之）6 二氫-1Η-氮呼_2(5//)_酮的碳^炭雙鍵，其中 ， , /、 '^還原作用 係由一種生物催化劑所催化。 2. 如申請專利範圍第涓之方法，其中該生物催化劍具有 (Ζ)-6,7-二氫氮呼_2(5")-酮烯酮還原酶活性。 3. 如申請專利範圍第2項之方法，其中該生物催化劑包括 選自氧化還原酶(EC1)群中的一酵素。 4. 如申請專利範圍第3項之方法，其中該氧化還原酶係選 自下列群中：作用在CH_CH提供者的氧化還原酶敗=) 與作用在NADH或NADPH的氧化還原酶(Ec丨…。_ 5. 如申請專利範圍第4項之方法，其中該氧化 , k席％係選 自下列群中：2-烯酮還原酶(EC 1.3.I·33)與老黃^ 1.6.99.1)。 汽酶(EC 6. 如申請專利範圍第2至5項中任一項之方法，其中疒在有 該酵素之一輔助因子，特別是選自下列群中的—輔助 子：NADPH、NADH、FADH及醌類。 7. 如申清專利範圍前述任一項之方法，其中該 卞糸1糸選自 可催化(Z)-6,7-二氫-1//-氮呼_2(5//)-酮烯_還原作用的 酵素群，該酵素係來自選自下列群中的一生物體戈一生 物體部份者··念珠菌屬（Candida)、免魯維降母屬 、酵母菌屬、假單胞菌 屬、大腸桿菌屬及桿菌屬 (Bacillus)。 201000635 8. 如申請專利範圍前述任一 句人搞女 、心万去，其中該生物催化劑 1〇二種多肽，該多肽包括由序列辨識編號2、4、6、8、 9如申q14或其—同源體所代表的—胺基酸序列。 9. 如申明專利範圍第8項之 ^ k 其中該胺基酸序列與該 序列辨識編號中之任一去 0Λ〇7 者所具有的序列同一性至少為 。，特财至少9Q%，更特別是至少％%。

1〇.t申請專職圍前述任—奴方法，其中财法係在-含水環境中進行。 11.如申凊專利範圍前述任—項之方法，其中藉由自胺基 心己内酿胺移除α_胺基而製備(ζ)_6,7_二氫.氮呼 -2(5//)-酉同。 其中該α-胺基-ε- 12.如申凊專利範圍前述任一項之方法 己内酿胺係製備自離胺酸。 13·種重組型伯主細胞，其包含編碼具有（办6,7_二氣指_ 氮呼-2(5//)-酮稀酮還原酶活性的一種生物催化劑之一 核酸序列。 士 U利li ®第13項之宿主細胞，其巾具有浠酮還原 酶活性的邊生物催化劑包含如序列辨識編號35至38中 的任一者或其一非野生型官能類似物所界定之一核酸 序列D 15.如申請專利範圍第13或14項之宿主細胞，其包含編碼具 有L-離胺酸環化酶活性的一種生物催化劑之一核酸序 列。 16.如申請專利範圍第13、14或15項之宿主細胞，其中該宿 201000635 主細胞係選自下列群中之屬：包括麴菌屬 (Aspergillus)、黃卷t M (Penicillium)、酵母菌屬 、克魯維酵母屬、畢赤 氏酵母菌屬（尸i_c/n_a)、念珠菌屬（CimiZ/i/a)、漢遜氏酵母 菌屬、桿菌屬、棒狀桿_屬 (CV?7«e/?acieWwm)及大腸桿菌屬。 17. —種多核苷酸，其包含如序列辨識編號35至38中的任一 者或其一非野生型官能類似物所界定之一核酸序列。 201000635 四、指定代表圖： (一) 本案指定代表圖為：第（ ）圖。（無) (二) 本代表圖之元件符號簡單說明： 五、本案若有化學式時，請揭示最能顯示發明特徵的化學式：