RU2817013C1 - Способ синтеза циклических депсипептидов - Google Patents
Способ синтеза циклических депсипептидов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2817013C1 RU2817013C1 RU2020118660A RU2020118660A RU2817013C1 RU 2817013 C1 RU2817013 C1 RU 2817013C1 RU 2020118660 A RU2020118660 A RU 2020118660A RU 2020118660 A RU2020118660 A RU 2020118660A RU 2817013 C1 RU2817013 C1 RU 2817013C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- group
- alkyl
- precursor
- carboxylic acid
- unprotected
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 128
- 108010002156 Depsipeptides Proteins 0.000 title claims abstract description 59
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 title claims abstract description 37
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 title claims abstract description 33
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 claims abstract description 67
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 claims abstract description 52
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract description 47
- 125000002843 carboxylic acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 42
- PAQZWJGSJMLPMG-UHFFFAOYSA-N 2,4,6-tripropyl-1,3,5,2$l^{5},4$l^{5},6$l^{5}-trioxatriphosphinane 2,4,6-trioxide Chemical group CCCP1(=O)OP(=O)(CCC)OP(=O)(CCC)O1 PAQZWJGSJMLPMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 28
- 238000009833 condensation Methods 0.000 claims abstract description 28
- 230000005494 condensation Effects 0.000 claims abstract description 28
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 claims abstract description 13
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 claims abstract description 11
- -1 sec-hexyl Chemical group 0.000 claims description 172
- 125000004169 (C1-C6) alkyl group Chemical group 0.000 claims description 80
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 79
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 69
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 54
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 50
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 claims description 31
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 claims description 24
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 claims description 22
- OHRURASPPZQGQM-GCCNXGTGSA-N romidepsin Chemical compound O1C(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(=C/C)/NC(=O)[C@H]2CSSCC\C=C\[C@@H]1CC(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N2 OHRURASPPZQGQM-GCCNXGTGSA-N 0.000 claims description 21
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 19
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 18
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 18
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 claims description 15
- 125000006242 amine protecting group Chemical group 0.000 claims description 15
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 claims description 15
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims description 14
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims description 14
- 125000006244 carboxylic acid protecting group Chemical group 0.000 claims description 12
- 125000004178 (C1-C4) alkyl group Chemical group 0.000 claims description 10
- 125000004209 (C1-C8) alkyl group Chemical group 0.000 claims description 10
- 125000002914 sec-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 claims description 10
- 239000007822 coupling agent Substances 0.000 claims description 8
- 238000007327 hydrogenolysis reaction Methods 0.000 claims description 8
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 claims description 7
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims description 7
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 claims description 6
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 claims description 6
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 claims description 6
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 claims description 6
- 125000004066 1-hydroxyethyl group Chemical group [H]OC([H])([*])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 5
- JQCSUVJDBHJKNG-UHFFFAOYSA-N 1-methoxy-ethyl Chemical group C[CH]OC JQCSUVJDBHJKNG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 125000003229 2-methylhexyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 claims description 5
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 claims description 5
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 125000004648 C2-C8 alkenyl group Chemical group 0.000 claims description 5
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 125000004369 butenyl group Chemical group C(=CCC)* 0.000 claims description 5
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000002057 carboxymethyl group Chemical group [H]OC(=O)C([H])([H])[*] 0.000 claims description 5
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 125000000582 cycloheptyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000006622 cycloheptylmethyl group Chemical group 0.000 claims description 5
- 125000000113 cyclohexyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000004210 cyclohexylmethyl group Chemical group [H]C([H])(*)C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000001511 cyclopentyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000004851 cyclopentylmethyl group Chemical group C1(CCCC1)C* 0.000 claims description 5
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims description 5
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 claims description 5
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 125000003187 heptyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000004051 hexyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims description 5
- 125000004029 hydroxymethyl group Chemical group [H]OC([H])([H])* 0.000 claims description 5
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 claims description 5
- 125000004491 isohexyl group Chemical group C(CCC(C)C)* 0.000 claims description 5
- 125000001972 isopentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims description 5
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000004184 methoxymethyl group Chemical group [H]C([H])([H])OC([H])([H])* 0.000 claims description 5
- 125000004372 methylthioethyl group Chemical group [H]C([H])([H])SC([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims description 5
- 125000002347 octyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000001147 pentyl group Chemical group C(CCCC)* 0.000 claims description 5
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 claims description 5
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 5
- 150000003254 radicals Chemical group 0.000 claims description 5
- 125000003548 sec-pentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 claims description 5
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 claims description 5
- DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N Acetamide Chemical compound CC(N)=O DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 125000005931 tert-butyloxycarbonyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(OC(*)=O)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 4
- LMYRWZFENFIFIT-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonamide Chemical compound CC1=CC=C(S(N)(=O)=O)C=C1 LMYRWZFENFIFIT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 claims description 3
- NRKYWOKHZRQRJR-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trifluoroacetamide Chemical compound NC(=O)C(F)(F)F NRKYWOKHZRQRJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- BZDNMSNFLZXRLY-UHFFFAOYSA-N [2-(diphenylphosphanylmethyl)phenyl]methyl-diphenylphosphane Chemical compound C=1C=CC=C(CP(C=2C=CC=CC=2)C=2C=CC=CC=2)C=1CP(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 BZDNMSNFLZXRLY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N acetaldehyde Diethyl Acetal Natural products CCOC(C)OCC DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- PUJDIJCNWFYVJX-UHFFFAOYSA-N benzyl carbamate Chemical compound NC(=O)OCC1=CC=CC=C1 PUJDIJCNWFYVJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 125000000649 benzylidene group Chemical group [H]C(=[*])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 claims description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 claims description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 2
- XBXCNNQPRYLIDE-UHFFFAOYSA-M n-tert-butylcarbamate Chemical compound CC(C)(C)NC([O-])=O XBXCNNQPRYLIDE-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 2
- XKJCHHZQLQNZHY-UHFFFAOYSA-N phthalimide Chemical compound C1=CC=C2C(=O)NC(=O)C2=C1 XKJCHHZQLQNZHY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 230000032050 esterification Effects 0.000 claims 4
- 238000005886 esterification reaction Methods 0.000 claims 4
- PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N iodine Chemical compound II PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 125000002774 3,4-dimethoxybenzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C(OC([H])([H])[H])=C1OC([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 claims 1
- 125000004217 4-methoxybenzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1OC([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 claims 1
- 125000006189 4-phenyl benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 claims 1
- ZMQMTKVVAMWKNY-YSXLEBCMSA-N emodepside Chemical compound C([C@@H]1C(=O)N(C)[C@@H](CC(C)C)C(=O)O[C@H](C)C(=O)N(C)[C@H](C(O[C@H](CC=2C=CC(=CC=2)N2CCOCC2)C(=O)N(C)[C@@H](CC(C)C)C(=O)O[C@H](C)C(=O)N(C)[C@@H](CC(C)C)C(=O)O1)=O)CC(C)C)C(C=C1)=CC=C1N1CCOCC1 ZMQMTKVVAMWKNY-YSXLEBCMSA-N 0.000 abstract description 24
- 108010056417 emodepside Proteins 0.000 abstract description 23
- 229960001575 emodepside Drugs 0.000 abstract description 23
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 13
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract 1
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 77
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 54
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 44
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 36
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 34
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 31
- IMNFDUFMRHMDMM-UHFFFAOYSA-N N-Heptane Chemical compound CCCCCCC IMNFDUFMRHMDMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 30
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 26
- 235000019439 ethyl acetate Nutrition 0.000 description 26
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 26
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 24
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 23
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 23
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 23
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 23
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 21
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 17
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 17
- 239000012065 filter cake Substances 0.000 description 15
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 14
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 14
- 238000001644 13C nuclear magnetic resonance spectroscopy Methods 0.000 description 13
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 239000002585 base Substances 0.000 description 13
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000012299 nitrogen atmosphere Substances 0.000 description 12
- 108010004210 PF 1022A Proteins 0.000 description 11
- YJNUXGPXJFAUQJ-LYWANRAQSA-N PF1022A Chemical compound C([C@@H]1C(=O)N(C)[C@H](C(O[C@H](C)C(=O)N(C)[C@@H](CC(C)C)C(=O)O[C@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N(C)[C@@H](CC(C)C)C(=O)O[C@H](C)C(=O)N(C)[C@@H](CC(C)C)C(=O)O1)=O)CC(C)C)C1=CC=CC=C1 YJNUXGPXJFAUQJ-LYWANRAQSA-N 0.000 description 11
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 11
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 10
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 10
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 9
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N palladium Substances [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 9
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 8
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 8
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 8
- 239000012044 organic layer Substances 0.000 description 8
- 239000000047 product Substances 0.000 description 8
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 8
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 7
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 7
- VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 4-Dimethylaminopyridine Chemical compound CN(C)C1=CC=NC=C1 VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000005587 bubbling Effects 0.000 description 6
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 6
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 6
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 6
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 6
- 238000010898 silica gel chromatography Methods 0.000 description 6
- YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N Morpholine Chemical group C1COCCN1 YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 5
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 5
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 5
- 229940125782 compound 2 Drugs 0.000 description 5
- 229940126214 compound 3 Drugs 0.000 description 5
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 5
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 5
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 5
- LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 1-Ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide Substances CCN=C=NCCCN(C)C LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- GQHTUMJGOHRCHB-UHFFFAOYSA-N 2,3,4,6,7,8,9,10-octahydropyrimido[1,2-a]azepine Chemical compound C1CCCCN2CCCN=C21 GQHTUMJGOHRCHB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- FOAQOAXQMISINY-UHFFFAOYSA-N 4-morpholin-4-ylbenzaldehyde Chemical compound C1=CC(C=O)=CC=C1N1CCOCC1 FOAQOAXQMISINY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 4
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 4
- ZUVPFSOPNMPURJ-LJQANCHMSA-N benzyl (2r)-2-hydroxy-3-(4-morpholin-4-ylphenyl)propanoate Chemical compound C([C@@H](O)C(=O)OCC=1C=CC=CC=1)C(C=C1)=CC=C1N1CCOCC1 ZUVPFSOPNMPURJ-LJQANCHMSA-N 0.000 description 4
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 4
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 4
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 4
- PSHKMPUSSFXUIA-UHFFFAOYSA-N n,n-dimethylpyridin-2-amine Chemical compound CN(C)C1=CC=CC=N1 PSHKMPUSSFXUIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000001325 propanoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 4
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 4
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 4
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ONBQEOIKXPHGMB-VBSBHUPXSA-N 1-[2-[(2s,3r,4s,5r)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-4,6-dihydroxyphenyl]-3-(4-hydroxyphenyl)propan-1-one Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CC(O)=CC(O)=C1C(=O)CCC1=CC=C(O)C=C1 ONBQEOIKXPHGMB-VBSBHUPXSA-N 0.000 description 3
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N N-Methylmorpholine Chemical compound CN1CCOCC1 SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000019445 benzyl alcohol Nutrition 0.000 description 3
- 239000012267 brine Substances 0.000 description 3
- 229940125904 compound 1 Drugs 0.000 description 3
- 229940126142 compound 16 Drugs 0.000 description 3
- 239000010779 crude oil Substances 0.000 description 3
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 3
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 3
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 3
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 3
- SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N (1s,2s,3s,5r)-1-(carboxymethyl)-3,5-bis[(4-phenoxyphenyl)methyl-propylcarbamoyl]cyclopentane-1,2-dicarboxylic acid Chemical compound O=C([C@@H]1[C@@H]([C@](CC(O)=O)([C@H](C(=O)N(CCC)CC=2C=CC(OC=3C=CC=CC=3)=CC=2)C1)C(O)=O)C(O)=O)N(CCC)CC(C=C1)=CC=C1OC1=CC=CC=C1 SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N 0.000 description 2
- KLYQWHCVRZTYEG-GFCCVEGCSA-N (2r)-2-hydroxy-3-(4-morpholin-4-ylphenyl)propanoic acid Chemical compound C1=CC(C[C@@H](O)C(O)=O)=CC=C1N1CCOCC1 KLYQWHCVRZTYEG-GFCCVEGCSA-N 0.000 description 2
- IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N (3S,8S,10R,13S,14S,17S)-17-isoquinolin-7-yl-N,N,10,13-tetramethyl-2,3,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-amine Chemical compound CN(C)[C@H]1CC[C@]2(C)C3CC[C@@]4(C)[C@@H](CC[C@@H]4c4ccc5ccncc5c4)[C@@H]3CC=C2C1 IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N 0.000 description 2
- HVLVVLDGZLLRBJ-UHFFFAOYSA-N (4-methoxyphenyl)methylcarbamic acid Chemical compound COC1=CC=C(CNC(O)=O)C=C1 HVLVVLDGZLLRBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FPBOSUGVPBRYCA-UHFFFAOYSA-N (4-nitrophenyl)methyl carbamate Chemical compound NC(=O)OCC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 FPBOSUGVPBRYCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000229 (C1-C4)alkoxy group Chemical group 0.000 description 2
- SGUVLZREKBPKCE-UHFFFAOYSA-N 1,5-diazabicyclo[4.3.0]-non-5-ene Chemical compound C1CCN=C2CCCN21 SGUVLZREKBPKCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 2-(2-methoxy-5-methylphenyl)ethanamine Chemical compound COC1=CC=C(C)C=C1CCN SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 2-Propenoic acid Natural products OC(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FSVJFNAIGNNGKK-UHFFFAOYSA-N 2-[cyclohexyl(oxo)methyl]-3,6,7,11b-tetrahydro-1H-pyrazino[2,1-a]isoquinolin-4-one Chemical compound C1C(C2=CC=CC=C2CC2)N2C(=O)CN1C(=O)C1CCCCC1 FSVJFNAIGNNGKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FPQQSJJWHUJYPU-UHFFFAOYSA-N 3-(dimethylamino)propyliminomethylidene-ethylazanium;chloride Chemical compound Cl.CCN=C=NCCCN(C)C FPQQSJJWHUJYPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UOQXIWFBQSVDPP-UHFFFAOYSA-N 4-fluorobenzaldehyde Chemical compound FC1=CC=C(C=O)C=C1 UOQXIWFBQSVDPP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DANDTMGGYNCQLG-UHFFFAOYSA-N 4h-1,3-oxazol-5-one Chemical compound O=C1CN=CO1 DANDTMGGYNCQLG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- OJRUSAPKCPIVBY-KQYNXXCUSA-N C1=NC2=C(N=C(N=C2N1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(CP(=O)(O)O)O)O)O)I)N Chemical compound C1=NC2=C(N=C(N=C2N1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(CP(=O)(O)O)O)O)O)I)N OJRUSAPKCPIVBY-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 2
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N Hydrazine Chemical compound NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N Lithium Chemical compound [Li] WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OKJIRPAQVSHGFK-UHFFFAOYSA-N N-acetylglycine Chemical compound CC(=O)NCC(O)=O OKJIRPAQVSHGFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010067902 Peptide Library Proteins 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LNUFLCYMSVYYNW-ZPJMAFJPSA-N [(2r,3r,4s,5r,6r)-2-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[[(3s,5s,8r,9s,10s,13r,14s,17r)-10,13-dimethyl-17-[(2r)-6-methylheptan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1h-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]oxy]-4,5-disulfo Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1C[C@@H]2CC[C@H]3[C@@H]4CC[C@@H]([C@]4(CC[C@@H]3[C@@]2(C)CC1)C)[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H]1O[C@H](COS(O)(=O)=O)[C@@H](OS(O)(=O)=O)[C@H](OS(O)(=O)=O)[C@H]1OS(O)(=O)=O LNUFLCYMSVYYNW-ZPJMAFJPSA-N 0.000 description 2
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 229910052783 alkali metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 150000001340 alkali metals Chemical class 0.000 description 2
- 229910052784 alkaline earth metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 150000001342 alkaline earth metals Chemical class 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 2
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 2
- ZYTLPUIDJRKAAM-QMMMGPOBSA-N benzyl (2s)-2-hydroxypropanoate Chemical compound C[C@H](O)C(=O)OCC1=CC=CC=C1 ZYTLPUIDJRKAAM-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- 150000003938 benzyl alcohols Chemical class 0.000 description 2
- 150000001735 carboxylic acids Chemical class 0.000 description 2
- 229940125773 compound 10 Drugs 0.000 description 2
- 229940126543 compound 14 Drugs 0.000 description 2
- 229940125758 compound 15 Drugs 0.000 description 2
- 229940125898 compound 5 Drugs 0.000 description 2
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 2
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 2
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 2
- 244000079386 endoparasite Species 0.000 description 2
- 125000001301 ethoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])O* 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 238000007306 functionalization reaction Methods 0.000 description 2
- LNTHITQWFMADLM-UHFFFAOYSA-N gallic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC(O)=C(O)C(O)=C1 LNTHITQWFMADLM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 2
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 2
- WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N hydroxymethyl benzene Natural products OCC1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 2
- ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N jdtic Chemical compound C1([C@]2(C)CCN(C[C@@H]2C)C[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]2NCC3=CC(O)=CC=C3C2)=CC=CC(O)=C1 ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N 0.000 description 2
- 150000002596 lactones Chemical group 0.000 description 2
- 229910052744 lithium Inorganic materials 0.000 description 2
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 2
- DUWWHGPELOTTOE-UHFFFAOYSA-N n-(5-chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-3-oxobutanamide Chemical compound COC1=CC(OC)=C(NC(=O)CC(C)=O)C=C1Cl DUWWHGPELOTTOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000655 nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 2
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 2
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Substances [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 2
- 229960002957 praziquantel Drugs 0.000 description 2
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 2
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 2
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 2
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 2
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RIOQSEWOXXDEQQ-UHFFFAOYSA-N triphenylphosphine Chemical compound C1=CC=CC=C1P(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 RIOQSEWOXXDEQQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JIAARYAFYJHUJI-UHFFFAOYSA-L zinc dichloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Zn+2] JIAARYAFYJHUJI-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- AOSZTAHDEDLTLQ-AZKQZHLXSA-N (1S,2S,4R,8S,9S,11S,12R,13S,19S)-6-[(3-chlorophenyl)methyl]-12,19-difluoro-11-hydroxy-8-(2-hydroxyacetyl)-9,13-dimethyl-6-azapentacyclo[10.8.0.02,9.04,8.013,18]icosa-14,17-dien-16-one Chemical compound C([C@@H]1C[C@H]2[C@H]3[C@]([C@]4(C=CC(=O)C=C4[C@@H](F)C3)C)(F)[C@@H](O)C[C@@]2([C@@]1(C1)C(=O)CO)C)N1CC1=CC=CC(Cl)=C1 AOSZTAHDEDLTLQ-AZKQZHLXSA-N 0.000 description 1
- GHYOCDFICYLMRF-UTIIJYGPSA-N (2S,3R)-N-[(2S)-3-(cyclopenten-1-yl)-1-[(2R)-2-methyloxiran-2-yl]-1-oxopropan-2-yl]-3-hydroxy-3-(4-methoxyphenyl)-2-[[(2S)-2-[(2-morpholin-4-ylacetyl)amino]propanoyl]amino]propanamide Chemical compound C1(=CCCC1)C[C@@H](C(=O)[C@@]1(OC1)C)NC([C@H]([C@@H](C1=CC=C(C=C1)OC)O)NC([C@H](C)NC(CN1CCOCC1)=O)=O)=O GHYOCDFICYLMRF-UTIIJYGPSA-N 0.000 description 1
- XJODGRWDFZVTKW-LURJTMIESA-N (2s)-4-methyl-2-(methylamino)pentanoic acid Chemical compound CN[C@H](C(O)=O)CC(C)C XJODGRWDFZVTKW-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- YXJFAOXATCRIKU-VIFPVBQESA-N (2s)-4-methyl-2-[methyl-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]amino]pentanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)N(C)C(=O)OC(C)(C)C YXJFAOXATCRIKU-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- HFVGJVRPXMSSHO-UHFFFAOYSA-N (3,4,5-trioctadecoxyphenyl)methanol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCOC1=CC(CO)=CC(OCCCCCCCCCCCCCCCCCC)=C1OCCCCCCCCCCCCCCCCCC HFVGJVRPXMSSHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N (3S)-3-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[5-[(3aS,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-3-methylbutanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-[1-bis(4-chlorophenoxy)phosphorylbutylamino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound CCCC(NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CCCCC1SC[C@@H]2NC(=O)N[C@H]12)C(C)C)P(=O)(Oc1ccc(Cl)cc1)Oc1ccc(Cl)cc1 QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N 0.000 description 1
- UNILWMWFPHPYOR-KXEYIPSPSA-M 1-[6-[2-[3-[3-[3-[2-[2-[3-[[2-[2-[[(2r)-1-[[2-[[(2r)-1-[3-[2-[2-[3-[[2-(2-amino-2-oxoethoxy)acetyl]amino]propoxy]ethoxy]ethoxy]propylamino]-3-hydroxy-1-oxopropan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-[(2r)-2,3-di(hexadecanoyloxy)propyl]sulfanyl-1-oxopropan-2-yl Chemical compound O=C1C(SCCC(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)COCC(=O)N[C@@H](CSC[C@@H](COC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CO)C(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)COCC(N)=O)CC(=O)N1CCNC(=O)CCCCCN\1C2=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C2CC/1=C/C=C/C=C/C1=[N+](CC)C2=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C2C1 UNILWMWFPHPYOR-KXEYIPSPSA-M 0.000 description 1
- WSULSMOGMLRGKU-UHFFFAOYSA-N 1-bromooctadecane Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCBr WSULSMOGMLRGKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 2-oxoglutaric acid Chemical compound OC(=O)CCC(=O)C(O)=O KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LBVZCSKDTGDAQW-UHFFFAOYSA-N 3-[(2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)phosphanyl]-1,3-oxazolidin-2-one;hydrochloride Chemical compound [Cl-].O=C1OCCN1[PH2+]N1C(=O)OCC1 LBVZCSKDTGDAQW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KLDLRDSRCMJKGM-UHFFFAOYSA-N 3-[chloro-(2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)phosphoryl]-1,3-oxazolidin-2-one Chemical compound C1COC(=O)N1P(=O)(Cl)N1CCOC1=O KLDLRDSRCMJKGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001999 4-Methoxybenzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1OC([H])([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- UDXUSFMBHMHKSX-UHFFFAOYSA-N 5-(chloromethyl)-1,2,3-trioctadecoxybenzene Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCOC1=CC(CCl)=CC(OCCCCCCCCCCCCCCCCCC)=C1OCCCCCCCCCCCCCCCCCC UDXUSFMBHMHKSX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M Bicarbonate Chemical compound OC([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- DRSHXJFUUPIBHX-UHFFFAOYSA-N COc1ccc(cc1)N1N=CC2C=NC(Nc3cc(OC)c(OC)c(OCCCN4CCN(C)CC4)c3)=NC12 Chemical compound COc1ccc(cc1)N1N=CC2C=NC(Nc3cc(OC)c(OC)c(OCCCN4CCN(C)CC4)c3)=NC12 DRSHXJFUUPIBHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229940126657 Compound 17 Drugs 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 1
- 241000243988 Dirofilaria immitis Species 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N Fumaric acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 1
- 239000007821 HATU Substances 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-L Malonate Chemical compound [O-]C(=O)CC([O-])=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N Methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007832 Na2SO4 Substances 0.000 description 1
- 241000244206 Nematoda Species 0.000 description 1
- GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N Nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229910000272 alkali metal oxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910001860 alkaline earth metal hydroxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 229940061720 alpha hydroxy acid Drugs 0.000 description 1
- 150000001280 alpha hydroxy acids Chemical class 0.000 description 1
- 150000001371 alpha-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- AWUCVROLDVIAJX-UHFFFAOYSA-N alpha-glycerophosphate Natural products OCC(O)COP(O)(O)=O AWUCVROLDVIAJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000003368 amide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000921 anthelmintic agent Substances 0.000 description 1
- 229940072107 ascorbate Drugs 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 1
- 229910052788 barium Inorganic materials 0.000 description 1
- DSAJWYNOEDNPEQ-UHFFFAOYSA-N barium atom Chemical compound [Ba] DSAJWYNOEDNPEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000007514 bases Chemical class 0.000 description 1
- 229940050390 benzoate Drugs 0.000 description 1
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 description 1
- AGEZXYOZHKGVCM-UHFFFAOYSA-N benzyl bromide Chemical compound BrCC1=CC=CC=C1 AGEZXYOZHKGVCM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000975 bioactive effect Effects 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 150000001669 calcium Chemical class 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 238000001460 carbon-13 nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 1
- 150000005323 carbonate salts Chemical class 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 229940125797 compound 12 Drugs 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 1
- 239000013058 crude material Substances 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 125000004663 dialkyl amino group Chemical group 0.000 description 1
- RAABOESOVLLHRU-UHFFFAOYSA-N diazene Chemical compound N=N RAABOESOVLLHRU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000071 diazene Inorganic materials 0.000 description 1
- AJDPNPAGZMZOMN-UHFFFAOYSA-N diethyl (4-oxo-1,2,3-benzotriazin-3-yl) phosphate Chemical compound C1=CC=C2C(=O)N(OP(=O)(OCC)OCC)N=NC2=C1 AJDPNPAGZMZOMN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IJKVHSBPTUYDLN-UHFFFAOYSA-N dihydroxy(oxo)silane Chemical compound O[Si](O)=O IJKVHSBPTUYDLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 229940099686 dirofilaria immitis Drugs 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- LGUDKOQUWIHXOV-UHFFFAOYSA-N epsiprantel Chemical compound C1C(C2=CC=CC=C2CCC2)N2C(=O)CN1C(=O)C1CCCCC1 LGUDKOQUWIHXOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005362 epsiprantel Drugs 0.000 description 1
- 125000004185 ester group Chemical group 0.000 description 1
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol Natural products OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003818 flash chromatography Methods 0.000 description 1
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 235000004515 gallic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940074391 gallic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 150000004820 halides Chemical class 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 238000004896 high resolution mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- IXCSERBJSXMMFS-UHFFFAOYSA-N hydrogen chloride Substances Cl.Cl IXCSERBJSXMMFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000041 hydrogen chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N hydroxyacetaldehyde Natural products OCC=O WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000002329 infrared spectrum Methods 0.000 description 1
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 1
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 1
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 description 1
- WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L manganese(2+);methyl n-[[2-(methoxycarbonylcarbamothioylamino)phenyl]carbamothioyl]carbamate;n-[2-(sulfidocarbothioylamino)ethyl]carbamodithioate Chemical compound [Mn+2].[S-]C(=S)NCCNC([S-])=S.COC(=O)NC(=S)NC1=CC=CC=C1NC(=S)NC(=O)OC WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 1
- XELZGAJCZANUQH-UHFFFAOYSA-N methyl 1-acetylthieno[3,2-c]pyrazole-5-carboxylate Chemical compound CC(=O)N1N=CC2=C1C=C(C(=O)OC)S2 XELZGAJCZANUQH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UHAQQEOPMSECSQ-UHFFFAOYSA-N methyl 3,4,5-trioctadecoxybenzoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCOC1=CC(C(=O)OC)=CC(OCCCCCCCCCCCCCCCCCC)=C1OCCCCCCCCCCCCCCCCCC UHAQQEOPMSECSQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 1
- 239000005445 natural material Substances 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 229910017604 nitric acid Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 description 1
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 1
- 239000012454 non-polar solvent Substances 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 1
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 1
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002798 polar solvent Substances 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- VVWRJUBEIPHGQF-MDZDMXLPSA-N propan-2-yl (ne)-n-propan-2-yloxycarbonyliminocarbamate Chemical compound CC(C)OC(=O)\N=N\C(=O)OC(C)C VVWRJUBEIPHGQF-MDZDMXLPSA-N 0.000 description 1
- 238000000425 proton nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 1
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000001542 size-exclusion chromatography Methods 0.000 description 1
- AWUCVROLDVIAJX-GSVOUGTGSA-N sn-glycerol 3-phosphate Chemical compound OC[C@@H](O)COP(O)(O)=O AWUCVROLDVIAJX-GSVOUGTGSA-N 0.000 description 1
- WBHQBSYUUJJSRZ-UHFFFAOYSA-M sodium bisulfate Chemical compound [Na+].OS([O-])(=O)=O WBHQBSYUUJJSRZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229910000342 sodium bisulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 229940086735 succinate Drugs 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 description 1
- 229940095064 tartrate Drugs 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RWRDLPDLKQPQOW-UHFFFAOYSA-N tetrahydropyrrole Substances C1CCNC1 RWRDLPDLKQPQOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004001 thioalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052723 transition metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000003624 transition metals Chemical class 0.000 description 1
- 238000002211 ultraviolet spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000011800 void material Substances 0.000 description 1
- 229910052727 yttrium Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
- 235000005074 zinc chloride Nutrition 0.000 description 1
- 239000011592 zinc chloride Substances 0.000 description 1
Abstract
Изобретение относится к способу синтеза циклических депсипептидов, в частности эмодепсида. Предложен способ синтеза циклических депсипептидов общей формулы (I) в промышленном масштабе из депсипептидов общей формулы (II), где B представляет собой защитную группу аминной группы и A представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты, причем способ включает стадии: удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой B, получая таким образом незащищенную аминную группу; удаления защитной группы карбоновой кислоты, которая защищена группой A, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты; конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты с помощью связывающего агента, при этом связывающий агент добавляют медленно, предпочтительно по каплям, в реакционный раствор, получая таким образом циклический депсипептид (I), в котором R1-R12 определены в формуле изобретения, где связывающий агент представляет собой T3P® (ангидрид пропилфосфоновой кислоты, 2,4,6-трипропил-1,3,5,2,4,6-триоксатрифосфоринан-2,4,6-триоксид, PPACA). 3 н. и 28 з.п. ф-лы, 9 ил., 6 пр.
Description
Настоящее изобретение относится к способу синтеза циклических депсипептидов, в частности эмодепсида, включающему специфические защитные группы TAG карбоновой кислоты.
Эмодепсид (цикло[(R)-лактоил-N-метил-L-лейцил-(R)-3-(п-морфолинофенил)лактоил-N-метил-L-лейцил-(R)-лактоил-N-метил-L-лейцил-(R)-3-(п-морфолинофенил)лактоил-N-метил-L-лейцил) является антигельминтным лекарственным средством, которое эффективно против ряда желудочно-кишечных нематод. Его молекулярная структура, которая изображена ниже, может быть описана как циклические октадепсипептиды, причем депсипептид представляет собой пептид, в котором одна или более его амидных групп заменены соответствующими сложноэфирными группами. В промышленном масштабе эмодепсид может быть получен путем дериватизации встречающегося в природе вещества PF1022A, в котором два атома водорода заменены на морфолиновые кольца.
В WO 93/19053 A1 (EP 0 634 408 A1) раскрыто соединение общей формулы:
где A представляет собой бензильную группу, которая имеет подходящий заместитель (заместители), или фенильную группу, которая может иметь подходящий заместитель (заместители), Aa представляет собой бензильную группу, которая имеет подходящий заместитель (заместители), или фенильную группу, которая может иметь подходящий заместитель (заместители), B и D каждый представляет собой низший алкил, C представляет собой водород или низший алкил, и его фармацевтически приемлемую соль.
В WO 2005/055973 A2 раскрыты трансдермально применяемые средства, содержащие циклические депсипептиды и/или празиквантел, в дополнение к его получению и его применению для борьбы с эндопаразитами. Комбинации эмодепсида и празиквантела или эпсипрантела, а также 1,2-изопропилиденгликоля в качестве эндопаразитицидов раскрыты в WO 2006/094664 A1.
WO 2006/053641 А1 относится к применению эндопаразитицидных депсипептидов для получения фармацевтических препаратов для профилактики вертикальной инфекции эндопаразитами.
Общий синтез, среди прочего, PF1022A и его дериватизация обсуждаются в обзорной статье «Cyclodepsipeptides: A Rich Source of Biologically Active Compounds for Drug Research" by Sivatharushan Sivanathan and Jürgen Scherkenbeck, Molecules 2014, 19, 12368-12420; doi:10.3390/molecules190812368. Для нескольких циклодепсипептидов были установлены общие синтезы как в растворе, так и в твердой фазе, что позволило создать комбинаторные библиотеки. Кроме того, биосинтез специфических циклодепсипептидов был освещен и использован для хемоферментативного получения не встречающихся в природе аналогов. В обзорной статье также обобщены последние литературные данные о циклических тетра-декадепсипептидах, состоящих исключительно из α-амино- и α-гидрокси кислот.
При синтезе полипептидов твердофазная стратегия имеет преимущество, состоящее в простом разделении продуктов реакции, тогда как жидкофазная стратегия имеет преимущество, состоящее в гомогенных условиях реакции. Гибридный подход представляет собой стратегию на основе группы TAG, при которой соединения, имеющие группу TAG, легко отделяются от молекул без группы TAG.
В этом отношении в JP 2000/044493 А1 раскрывается защитная группа для синтеза библиотеки соединений, которая состоит из соединений, способных связываться с соединением, подлежащим защите, при соотношении 1: 1, имеющих одну молекулярную структуру, а также имеющих молекулярную массу >=500, которая состоит из 3,4,5-трис-(н-октадецилокси)бензилового спирта, 3,4,5-трис-(н-октадецилокси)бензилхлорида или метил-3,4,5-трис-(н-октадецилокси)бензоата.
EP 2 003 104 A2 относится к реагенту для органического синтеза, с которым химическая реакция может быть проведена в жидкой фазе, и ненужное соединение (соединения) может быть легко отделено при низких затратах от жидкой фазы после завершения реакции. Сообщается, что реагент для органического синтеза, который изображен ниже, обратимо изменяется из жидкофазного состояния в твердофазное состояние с изменением состава раствора и/или температуры раствора и предназначен для использования в реакциях органического синтеза.
R1 - R5 могут быть одинаковыми или различными и представляют собой водород, галоген, алкильную группу с числом атомов углерода от 1 до 30, которая может иметь группу заместитель, алкоксильную группу с числом атомов углерода от 1 до 30, которая может иметь группу заместитель, арильную группу с числом атомов углерода от 1 до 30, которая может иметь группу заместитель, ацильную группу с числом атомов углерода от 1 до 30, которая может иметь группу заместитель, тиоалкильную группу с числом атомов углерода от 1 до 30, которая может иметь группу заместитель, диалкиламино группу с числом атомов углерода от 1 до 30, которая может иметь группу заместитель, нитрогруппу или аминогруппу; и по меньшей мере два из R1 0 R5 представляют собой группы с числом атомов углерода от 18 до 30, и X представляет собой активный сайт реагента, имеющий один или более атомов, выбранных из группы, состоящей из атома углерода, атома кислорода, атома серы и атома азота.
В публикации "TAG-Assisted Liquid-Phase Peptide Synthesis Using Hydrophobic Benzyl Alcohols as Supports" by Yohei Okada, Hideaki Suzuki, Takashi Nakae, Shuji Fujita, Hitoshi Abe, Kazuo Nagano, Toshihide Yamada, Nobuyoshi Ebata, Shokaku Kim, and Kazuhiro Chiba, The Journal of Organic Chemistry 2013, 78, 320-327; doi: 10.1021/jo302127d; сообщается, что жидкофазный синтез растворимых пептидов с помощью группы TAG был успешно создан на основе простых гидрофобных бензиловых спиртов, которые можно легко получить из природных веществ. Сообщается, что на каждой стадии получают отличные выходы преципитации, сочетая лучшие свойства твердофазных и жидкофазных методик. Сообщается, что этот подход может быть эффективно применен для связываний фрагментов, что позволяет химически синтезировать несколько биоактивных пептидов.
В публикации "A Novel Protecting Group for Constructing Combinatorial Peptide Libraries" by Hitoshi Tamiaki, Tomoyuki Obata, Yasuo Azefu and Kazunori Toma, Bulletin of the Chemical Society of Japan 2001, 74, 733-738; doi http://dx.doi.org/10.1246/bcsj.74.733; раскрывается 3,4,5-трис(октадецилокси)бензиловый спирт, HO-Bzl(OC18)3, который был получен из галлиевой кислоты и стеарилбромида. Применяя обычное постадийное удлинение синтезировали N,C-защищенные пептиды, Fmoc-AAn-…-AA1-OBzl(OC18)3. Замещенный бензиловые сложные эфиры селективно расщепляли с помощью обработкой 4 M хлороводорода в этилацетате с получением Fmoc-AAn-…-AA1-OH и HO-Bzl(OC18)3. Таким образом, замещенная бензильная группа, как сообщается, эффективна для защиты C-концевых карбоксильных групп при жидкофазном пептидном синтезе. Так как замещенная бензильная группа имеет умеренно высокую молекулярную массу, Fmoc-AAn-…-AA1-OBzl(OC18)3, как сообщается, может быть легко очищен посредством эксклюзионной хроматографии по размеру; сообщалось, что все защищенные пептиды подлежат элюированию в долю пустот гель-фильтрационной колонки Sephadex LH-20. Сообщается, что комбинация карбоксил-защищающей группы B Bzl(OC18)3 с простой очисткой гель-фильтрацией дает новый путь для создания комбинаторных пептидных библиотек в фазе раствора.
WO 2017/116702 A1 относится к соединению циклического депсипептида или фармацевтически или ветеринарно приемлемой соли следующей формулы:
В качестве примера, соединение с обозначением 7-34A, как изображено ниже, показывает значение EC50 между 0,1 мкМ и 1,0 мкМ в тесте in vitro против микрофилярии Dirofilaria immitis:
Задача настоящего изобретения состоит в обеспечении улучшенного пути синтеза эмодепсида и родственных циклических депсипептидов. Другая задача настоящего изобретения состоит в обеспечении новых депсипептидов, которые могут быть синтезированы с применением этого пути.
Эта задача решается способом по пункту 1 и депсипептидами согласно пункту 22. Предпочтительные варианты осуществления настоящего изобретения являются объектами зависимых пунктов. Они могут свободно комбинироваться, если из контекста ясно не следует иное.
Соответственно, настоящее изобретение обеспечивает способ синтеза циклических депсипептидов общей формулы (I) из депсипептидов общей формулы (II):
где B представляет собой защитную группу аминной группы, и A представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты,
причем способ включает стадии:
- удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой B, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- удаления защитной группы карбоновой кислоты, которая защищена группой A, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты, получая таким образом циклический депсипептид (I)
где x и y представляют собой, независимо друг от друга, 0, 1 или 2, при условии что x+y ≥ 1 (предпочтительно, x и y представляют собой 1), и R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, R10, R11 и R12 каждый независимо друг от друга представляет собой водород, неразветвленный или разветвленный C1-C8-алкил, в частности метил, этил, пропил, изопропил, бутил, изобутил, втор-бутил, трет-бутил, пентил, изопентил, втор-пентил, гексил, изогексил, втор-гексил, гептил, изогептил, втор-гептил, трет-гептил, октил, изооктил, втор-октил, неразветвленный или разветвленный галогенированный C1-C8 алкил, в частности фторированный втор-бутил, гидрокси-C1-C6-алкил, в частности гидроксиметил, 1-гидроксиэтил, C1-C4-алканоилокси-C1-C6-алкил, в частности ацетоксиметил, 1-ацетоксиэтил, C1-C4-алкокси-C1-C6-алкил, в частности метоксиметил, 1-метоксиэтил, арил-C1-C4-алкилокси-C1-C6-алкил, в частности бензилоксиметил, 1-бензилоксиэтил, меркапто-C1-C6-алкил, в частности меркаптометил, C1-C4-алкилтио-C1-C6-алкил, в частности метилтиоэтил, C1-C4-алкилсульфинил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфинилэтил, C1-C4-алкилсульфонил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфонилэтил, карбокси-C1-C6-алкил, в частности карбоксиметил, карбоксиэтил, C1-C4-алкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности метоксикарбонилметил, этоксикарбонилэтил, C1-C4-арилалкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности бензилоксикарбонилметил, карбамоил-C1-C6-алкил, в частности карбамоилметил, карбамоилэтил, амино-C1-C6-алкил, в частности аминопропил, аминобутил, C1-C4-алкиламино-C1-C6-алкил, в частности метиламинопропил, метиламинобутил, C1-C4-диалкиламино-C1-C6-алкил, в частности диметиламинопропил, диметиламинобутил, гуанидино-C1-C6-алкил, в частности гуанидинопропил, C1-C4-алкоксикарбониламино-C1-C6-алкил, в частности трет-бутоксикарбониламинопропил, трет-бутоксикарбониламинобутил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)амино-C1-C6-алкил, в частности 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминопропил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминобутил, C2-C8-алкенил, в частности винил, аллил, бутенил, C3-C7-циклоалкил, в частности циклопентил, циклогексил, циклогептил, C3-C7-циклоалкил-C1-C4-алкил, в частности циклопентилметил, циклогексилметил, циклогептилметил, бензил, замещенный бензил, фенил, фенил-C1-C4-алкил, в частности фенилметил, который может быть необязательно замещен радикалами из группы, состоящей из галогена, в частности фтора, хлора, брома или иода, гидроксила, C1-C4-алкокси, в частности метокси или этокси, C1-C4-алкила, в частности метила.
Защитные группы A и B могут быть независимы таким образом, что при удалении защитной группы B группа A является стабильной; однако, также является вариантом осуществления настоящего изобретения, когда защитные группы А и В удаляют одновременно.
В способе согласно настоящему изобретению неожиданно было обнаружено, что циклические депсипептиды (I), в частности эмодепсид и близко родственные структуры, могут быть синтезированы с высокими общими выходами.
После удаления защитной группы аминная группа и группа карбоновой кислоты вступают в реакцию с образованием пептидной связи. Подходящие связывающие агенты вместе с основанием, таким как N,N-диизопропилэтиламин, включают PyBOP (бензотриазол-1-ил-окситрипирролидинофосфония гексафторфосфат), BOP ((бензотриазол-1-илокси)трис(диметиламино)фосфония гексафторфосфат), BOP-Cl (бис(2-оксо-3-оксазолидинил)фосфония хлорид), EDCI (1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимид), DEPBT (3-(диэтоксифосфорилокси)-1,2,3-бензотриазин-4(3H)-он), HATU (1-[бис(диметиламино)метилен]-1H-1,2,3-триазоло[4,5-b]пиридиния 3-оксид гексафторфосфат), HBTU (2-(1H-бензотриазол-1-ил)-1,1,3,3-тетраметилурония гексафторфосфат) и, наиболее предпочтительно, T3P® (ангидрид пропилфосфоновой кислоты, 2,4,6-трипропил-1,3,5,2,4,6-триоксатрифосфоринан-2,4,6-триоксид, PPACA).
Согласно одному варианту осуществления способа согласно настоящему изобретению x представляет собой 1, y представляет собой 1, R1, R4, R7 и R10 представляют собой метил, R6 и R12 представляют собой метил, R5 и R11 представляют собой, независимо друг от друга, неразветвленный или разветвленный C1-C4-алкил или неразветвленный или разветвленный галогенированный C1-C4-алкил, и R3 и R9 представляют собой, независимо друг от друга, бензил или замещенный бензил. Согласно одному предпочтительному варианту осуществления настоящего изобретения R3 и/или R9 представляют собой п-морфолино-замещенный бензил.
Согласно варианту осуществления настоящего изобретения группа A является неустойчивой к кислоте, тогда как группа B является неустойчивой к гидрогенолизу. Соответственно, согласно варианту осуществления настоящего изобретения обеспечивается способ синтеза циклических депсипептидов общей формулы (I) из депсипептидов общей формулы (IIa):
где Y представляет собой защитную группу аминной группы, и X представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты,
причем способ включает стадии:
- удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой Y, в присутствии кислоты, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- удаления защитной группы карбоновой кислоты, которая защищена группой X, посредством гидрогенолиза, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты, получая таким образом циклический депсипептид (I)
В способе согласно этому варианту осуществления настоящего изобретения неожиданно было обнаружено, что циклические депсипептиды (I), в частности эмодепсид и близко родственные структуры, могут быть синтезированы с высокими общими выходами.
Термин «гидрогенолиз» следует понимать в его самом широком смысле, и он явно не ограничивается реакцией с газообразным и/или молекулярным водородом, хотя это является одним из вариантов осуществления настоящего изобретения. Подходящим катализом являются Pd, Pd/C, Pt, Pt/C. Термин «гидрогенолиз» также включает реакции, в которых водород образуется in situ или только формально, и где используются реагенты гидрогенолиза, такие как гидразин или диимид и т.д.
Согласно одному варианту осуществления настоящего изобретения X представляет собой замещенную или незамещенную -CH2-арильную группу. Согласно одному варианту осуществления настоящего изобретения X выбирают из группы бензоила (Bn), 4-метокси-бензоила (PMB), 3,4-диметоксибензоила (DPMB), 4-фенил-бензоила (PPB), 2-нафтилметил (Nap), бензилоксиметилацеталя (BOM).
Согласно одному варианту осуществления настоящего изобретения Y представляет собой трет.-бутилоксикарбонил (Boc), тритил (Trt), п-метоксибензилкарбамат (Moz) или п-нитробензилкарбамат (PNZ). Наиболее предпочтительно Y представляет собой Boc.
Согласно другому варианту осуществления способа согласно настоящему изобретению депсипептид общей формулы (IIa) получают из предшественников общих формул (IV) и (III):
посредством:
- в предшественнике (IV), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG2, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- в предшественнике (III), удаления защитной группы карбоновой кислоты, которая защищена группой PG3 в присутствии кислоты, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты, получая таким образом депсипептид (IIa);
где R1 - R12, X, Y, x и y имеют значения, как определено выше (в частности, x и y могут представлять собой 1), PG2 представляет собой защитную группу аминной группы, и PG3 представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты. Способы удаления защитной группы и конденсации могут быть такими же как указано в отношении реакции соединений (IIa) - (I) выше.
Предпочтительно предшественник общей формулы (IV) получают из предшественников общих формул (VI) и (V):
посредством:
- в предшественнике (VI), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG4, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- конденсации незащищенной аминной группы предшественника (VI) и группы карбоновой кислоты предшественника (V), получая таким образом предшественник (IV);
где R7 - R12, X и x имеют значения, как определено выше (в частности, x может представлять собой 1), PG2 имеет значение, как определено выше, и PG4 представляет собой защитную группу аминной группы. Способы удаления защитной группы и конденсации могут быть такими же как указано в отношении реакции соединений (II) - (I) выше.
Также предпочтительно предшественник общей формулы (III) получают из предшественников общих формул (VIII) и (VII):
посредством:
- в предшественнике (VII), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG5, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- конденсации незащищенной аминной группы предшественника (VII) и группы карбоновой кислоты предшественника (VIII), получая таким образом предшественник (III);
где R1 - R6, Y и y имеют значения, как определено выше (в частности, y может представлять собой 1), PG3 имеет значение, как определено выше, и PG5 представляет собой защитную группу аминной группы. Способы удаления защитной группы и конденсации могут быть такими же как указано в отношении реакции соединений (II) - (I) выше.
Также предпочтительно предшественник общей формулы (VI) получают в результате эстерификации предшественника общей формулы (IX) с X-LG:
где R10 - R12 и X имеют значения, как определено выше, и PG4 также имеет значение, как определено выше, и LG представляет собой уходящую группу. Введение защитной группы или группы TAG для группы карбоновой кислоты в (IX) может быть осуществлено с применением стандартных методик, LG часто представляет собой галогенид, особенно хлорид. Альтернативно LG может представлять собой -OH, затем часто применяют стандартные протоколы конденсации.
Также предпочтительно предшественник общей формулы (VII) получают в результате эстерификации предшественника общей формулы (X) с PG3-OH:
где R4 - R6 и y имеют значения, как определено выше, PG3 также имеет значение, как определено выше, и PG5 также имеет значение, как определено выше.
Также предпочтительно предшественники (III) и (IV) являются идентичными.
Также предпочтительно R3 и R9 являются идентичными, R1 и R7 являются идентичными, R2 и R8 являются идентичными, R4 и R10 являются идентичными, R5 и R11 являются идентичными, и R6 и R12 являются идентичными.
Согласно альтернативному варианту осуществления настоящего изобретения группа A является неустойчивой к основанию, тогда как группа B является неустойчивой к кислоте. Поэтому, согласно альтернативному варианту осуществления настоящего изобретения настоящее изобретение обеспечивает способ синтеза циклических депсипептидов общей формулы (I) из депсипептидов общей формулы (IIb):
где PG1 представляет собой защитную группу аминной группы, и TAG представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты,
причем способ включает стадии:
- удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG1, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- удаления защитной группы карбоновой кислоты, которая защищена группой TAG, в присутствии кислоты, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты, получая таким образом циклический депсипептид (I)
Группа TAG содержит фрагмент арил-O-(CH2)n- , причем арил представляет собой ароматический фрагмент, и n представляет собой ≥ 13, x и y представляют собой, независимо друг от друга, 0, 1 или 2, при условии что x+y ≥ 1 (предпочтительно, x и y представляют собой 1) и R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, R10, R11 и R12 каждый независимо друг от друга представляет собой водород, неразветвленный или разветвленный C1-C8-алкил, в частности метил, этил, пропил, изопропил, бутил, изобутил, втор-бутил, трет-бутил, пентил, изопентил, втор-пентил, гексил, изогексил, втор-гексил, гептил, изогептил, втор-гептил, трет-гептил, октил, изооктил, втор-октил, неразветвленный или разветвленный галогенированный C1-C8 алкил, в частности фторированный втор-бутил, гидрокси-C1-C6-алкил, в частности гидроксиметил, 1-гидроксиэтил, C1-C4-алканоилокси-C1-C6-алкил, в частности ацетоксиметил, 1-ацетоксиэтил, C1-C4-алкокси-C1-C6-алкил, в частности метоксиметил, 1-метоксиэтил, арил-C1-C4-алкилокси-C1-C6-алкил, в частности бензилоксиметил, 1-бензилоксиэтил, меркапто-C1-C6-алкил, в частности меркаптометил, C1-C4-алкилтио-C1-C6-алкил, в частности метилтиоэтил, C1-C4-алкилсульфинил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфинилэтил, C1-C4-алкилсульфонил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфонилэтил, карбокси-C1-C6-алкил, в частности карбоксиметил, карбоксиэтил, C1-C4-алкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности метоксикарбонилметил, этоксикарбонилэтил, C1-C4-арилалкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности бензилоксикарбонилметил, карбамоил-C1-C6-алкил, в частности карбамоилметил, карбамоилэтил, амино-C1-C6-алкил, в частности аминопропил, аминобутил, C1-C4-алкиламино-C1-C6-алкил, в частности метиламинопропил, метиламинобутил, C1-C4-диалкиламино-C1-C6-алкил, в частности диметиламинопропил, диметиламинобутил, гуанидино-C1-C6-алкил, в частности гуанидинопропил, C1-C4-алкоксикарбониламино-C1-C6-алкил, в частности трет-бутоксикарбониламинопропил, трет-бутоксикарбониламинобутил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)амино-C1-C6-алкил, в частности 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминопропил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминобутил, C2-C8-алкенил, в частности винил, аллил, бутенил, C3-C7-циклоалкил, в частности циклопентил, циклогексил, циклогептил, C3-C7-циклоалкил-C1-C4-алкил, в частности циклопентилметил, циклогексилметил, циклогептилметил, бензил, замещенный бензил, фенил, фенил-C1-C4-алкил, в частности фенилметил, который может быть необязательно замещен радикалами из группы, состоящей из галогена, в частности фтора, хлора, брома или иода, гидроксила, C1-C4-алкокси, в частности метокси или этокси, C1-C4-алкила, в частности метила.
В способе согласно настоящему изобретению неожиданно было обнаружено, что циклические депсипептиды (I), в частности эмодепсид и близко родственные структуры, могут быть синтезированы с высокими общими выходами, применяя гидрофобные защитные группы TAG для карбоновых кислот. Эти группы могут сделать молекулы, с которыми они связаны («несущие группу TAG» молекулы), нерастворимыми в полярных растворителях, таких как метанол. Следовательно, несущие группу TAG молекулы могут быть осаждены из реакционной смеси, и сама группа TAG, после удаления защитной группы, также может быть отделена с использованием этой методики. Кроме того, гидрофобная группа TAG позволяет несущим группу TAG молекулам растворяться в неполярных растворителях, таких как дихлорметан.
Удаление защитной группы аминной группы путем удаления защитной группы PG1 может быть выполнено с использованием стандартных методик с помощью основания, таких как обработка раствором пиперидина в дихлорметане. Аналогичным образом, удаление защитной группы карбоновых кислот путем удаления группы TAG может быть выполнено с использованием протоколов удаления бензильной группы, таких как обработка раствором трифторуксусной кислоты (TFA) в дихлорметане.
Согласно другому варианту осуществления способа согласно настоящему изобретению PG1 представляет собой 9-флуоренилметоксикарбонил (Fmoc), трет-бутилкарбамат (Boc), бензилкарбамат (Z), ацетамид, трифторацетамид, фталимид, бензил (Bn), трифенилметил (Tr), бензилиден или п-толуолсульфонамид (Ts)
и TAG представляет собой:
или
где m представляет собой от ≥ 15 до ≤ 25, p представляет собой от ≥ 8 до ≤ 18, и q представляет собой от ≥ 15 до ≤ 25. Предпочтительно, m представляет собой 18, 19, 20, 21 или 22, p представляет собой 11, 12 или 13, и q представляет собой 21, 22 или 23.
Согласно другому варианту осуществления способа согласно настоящему изобретению депсипептид общей формулы (IIb) получают из предшественников общих формул (IVb) и (IIIb):
посредством:
- в предшественнике (IVb), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG2, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- в предшественнике (IIIb), удаления защитной группы карбоновой кислоты, которая защищена группой PG3, в присутствии кислоты, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты, получая таким образом депсипептид (IIb);
где R1 - R12, TAG, PG1, x и y имеют значения, как определено выше (в частности, x и y могут представлять собой 1), PG2 представляет собой защитную группу аминной группы, и PG3 представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты. Способы удаления защитной группы и конденсации могут быть такими же как указано в отношении реакции соединений (II) - (I) выше.
Предпочтительно предшественник общей формулы (IVb) получают из предшественников общих формул (Vb) и (Vb):
посредством:
- в предшественнике (VIb), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG4, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- конденсации незащищенной аминной группы предшественника (VIb) и группы карбоновой кислоты предшественника (Vb), получая таким образом предшественник (IVb);
где R7 - R12, TAG и x имеют значения, как определено выше (в частности, x может представлять собой 1), PG2 имеет значение, как определено выше, и PG4 представляет собой защитную группу аминной группы. Способы удаления защитной группы и конденсации могут быть такими же как указано в отношении реакции соединений (IIb) - (I) выше.
Также предпочтительно предшественник общей формулы (IIIb) получают из предшественников общих формул (VIIIb) и (VIIb):
посредством:
- в предшественнике (VIIb), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG5, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- конденсации незащищенной аминной группы предшественника (VIIb) и группы карбоновой кислоты предшественника (VIIIb), получая таким образом предшественник (IIIb);
где R1 - R6, PG1 и y имеют значения, как определено выше (в частности, y может представлять собой 1), PG3 имеет значение, как определено выше, и PG5 представляет собой защитную группу аминной группы. Способы удаления защитной группы и конденсации могут быть такими же как указано в отношении реакции соединений (IIb) - (I) выше.
Также предпочтительно предшественник общей формулы (VIb) получают в результате эстерификации предшественника общей формулы (IXb) с TAG-OH:
где R10 - R12 и TAG имеют значения, как определено выше, и PG4 также имеет значение, как определено выше. Введение защитной группы или введение группы TAG для группы карбоновой кислоты в (IXb) может быть осуществлено с применением стандартной системы для конденсации, такой как DCC/DMAP.
Также предпочтительно предшественник общей формулы (VIIb) получают в результате эстерификации предшественника общей формулы (X) с PG3-OH:
где R4 - R6 и y имеют значения, как определено выше, PG3 также имеет значение, как определено выше, и PG5 также имеет значение, как определено выше.
Также предпочтительно PG3 представляет собой TAG, как определено выше.
Согласно другому варианту осуществления способа согласно настоящему изобретению по меньшей мере одна стадия реакции из стадий реакции, приводящих к получению TAG-несущей молекулы, сопровождается осаждением неочищенного продукта реакции в метаноле, таким образом очищая неочищенный продукт реакции.
Согласно другому варианту осуществления способа согласно настоящему изобретению по меньшей мере одна стадия из стадий реакции, в которых TAG-защищенные группы карбоновой кислоты подвергают удалению защитной группы, сопровождается осаждением отщепленного TAG-OH в метаноле и удалением осадка посредством фильтрации, таким образом очищая неочищенный продукт реакции.
Также предпочтительно предшественники (IIIb) и (IVb) являются идентичными.
Также предпочтительно R3 и R9 являются отличными друг от друга, R1 и R7 являются идентичными, R2 и R8 являются идентичными, R4 и R10 являются идентичными, R5 и R11 являются идентичными, и R6 и R12 являются идентичными.
Согласно другому варианту осуществления способа согласно настоящему изобретению депсипептид выбран из депсипептида общих формул (II-1) - (II-14b):
где в формулах (II-11) - (II-14) -LINK- выбран из:
, где X1 может представлять собой C, N, S, O, X2 и X3 могут представлять собой C или N;
, где X1 может представлять собой C, N, S, O, X2, X3 и X4 могут представлять собой C или N;
, где X1, X2, X3 и X4 могут представлять собой C или N;
и где R13 выбран из SO2NH(CH3), SO2NH2, OC(O)CH3, CF3 или одной из следующих лактоновых структур:
Кроме того, настоящее изобретение обеспечивает способ синтеза циклических депсипептидов общей формулы (1) из депсипептидов общей формулы (IIb):
включающих стадии
обеспечения смеси соединения (IIc) и основания в растворителе, имеющем значение ET(30) от ≥30 до ≤ 43
медленного, предпочтительно по каплям, добавления раствора связывающего агента в растворитель с образованием циклического депсипептида (I),
где x и y представляют собой, независимо друг от друга, 0, 1 или 2, при условии что x+y ≥ 1 (предпочтительно, x и y представляют собой 1), и R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, R10, R11 и R12 каждый независимо друг от друга представляет собой водород, неразветвленный или разветвленный C1-C8-алкил, в частности метил, этил, пропил, изопропил, бутил, изобутил, втор-бутил, трет-бутил, пентил, изопентил, втор-пентил, гексил, изогексил, втор-гексил, гептил, изогептил, втор-гептил, трет-гептил, октил, изооктил, втор-октил, неразветвленный или разветвленный галогенированный C1-C8 алкил, в частности фторированный втор-бутил, гидрокси-C1-C6-алкил, в частности гидроксиметил, 1-гидроксиэтил, C1-C4-алканоилокси-C1-C6-алкил, в частности ацетоксиметил, 1-ацетоксиэтил, C1-C4-алкокси-C1-C6-алкил, в частности метоксиметил, 1-метоксиэтил, арил-C1-C4-алкилокси-C1-C6-алкил, в частности бензилоксиметил, 1-бензилоксиэтил, меркапто-C1-C6-алкил, в частности меркаптометил, C1-C4-алкилтио-C1-C6-алкил, в частности метилтиоэтил, C1-C4-алкилсульфинил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфинилэтил, C1-C4-алкилсульфонил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфонилэтил, карбокси-C1-C6-алкил, в частности карбоксиметил, карбоксиэтил, C1-C4-алкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности метоксикарбонилметил, этоксикарбонилэтил, C1-C4-арилалкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности бензилоксикарбонилметил, карбамоил-C1-C6-алкил, в частности карбамоилметил, карбамоилэтил, амино-C1-C6-алкил, в частности аминопропил, аминобутил, C1-C4-алкиламино-C1-C6-алкил, в частности метиламинопропил, метиламинобутил, C1-C4-диалкиламино-C1-C6-алкил, в частности диметиламинопропил, диметиламинобутил, гуанидино-C1-C6-алкил, в частности гуанидинопропил, C1-C4-алкоксикарбониламино-C1-C6-алкил, в частности трет-бутоксикарбониламинопропил, трет-бутоксикарбониламинобутил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)амино-C1-C6-алкил, в частности 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминопропил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминобутил, C2-C8-алкенил, в частности винил, аллил, бутенил, C3-C7-циклоалкил, в частности циклопентил, циклогексил, циклогептил, C3-C7-циклоалкил-C1-C4-алкил, в частности циклопентилметил, циклогексилметил, циклогептилметил, бензил, замещенный бензил, фенил, фенил-C1-C4-алкил, в частности фенилметил, который может быть необязательно замещен радикалами из группы, состоящей из галогена, в частности фтора, хлора, брома или иода.
Термин «медленно», особенно означает, что и/или включает, что раствор связывающего агента добавляют со скоростью ≤ 2 (мол)% в минуту, предпочтительно ≤ 1 (мол)% в минуту, более предпочтительно ≤ 0,5 (мол)% в минуту.
В способ согласно настоящему изобретению неожиданно было обнаружено, что циклические депсипептиды (I), в частности эмодепсид и близко родственные структуры, могут быть синтезированы с высокими общими выходами. Не связываясь к какой-либо теории, авторы настоящего изобретения полагают, что это связано с плохой растворимостью циклического депсипептида (I) в растворителе в отличие от открытой формы (IIb).
Термин “значение ET(30)” относится к ET(30) согласно Reichardt, Angew. Chem. 1979,119-131, где указаны как метод определения таких значений, так и измеренные значения для многих стандартных растворителей.
Согласно одному варианту осуществления настоящего изобретения значение ET(30) растворителя составляет от ≥ 34 до ≤ 39.
Термин “растворитель” в контексте настоящего изобретения должен также включать смесь растворителей.
Согласно одному варианту осуществления настоящего изобретения растворитель содержит этилацетат, согласно одному варианту осуществления настоящего изобретения растворитель представляет собой этилацетат.
Подходящие связывающие агенты, которые являются вариантами осуществления настоящего изобретения, приведены выше. В соответствии с одним вариантом осуществления настоящего изобретения, связывающий агент содержит T3P, в соответствии с одним вариантом осуществления настоящего изобретения, связывающий агент представляет собой T3P.
Согласно одному варианту осуществления настоящего изобретения соотношение связывающего агента и соединения (IIc) перед реакцией (в моль:моль) составляет от ≥ 1:1 до ≤ 5:1, предпочтительно от ≥ 2:1 до ≤ 3:1.
Согласно одному варианту осуществления настоящего изобретения соотношение основания и соединения (IIb) перед реакцией (в моль:моль) составляет от ≥ 2:1 до ≤ 10:1, предпочтительно от ≥ 4:1 до ≤ 6:1.
Подходящие основания, которые являются вариантами осуществления настоящего изобретения, содержат N,N-диизопропилэтиламин (DIEA), триэтиламин, диметиламинопиридин (DMAP), N-метилморфолин, пиридин, 1,8-диазабицикло[5.4.0]ундец-7-ен (DBU), 1,5-диазабицикло[4.3.0]нон-5-ен (DBN) или их смеси. Наиболее предпочтительным является N,N-диизопропилэтиламин.
Согласно одному варианту осуществления настоящего изобретения температура в ходе добавления связывающего агента составляет ≤ 25C.
Согласно одному варианту осуществления способа согласно настоящему изобретению x представляет собой 1, y представляет собой 1, R1, R4, R7 и R10 представляют собой метил, R6 и R12 представляют собой метил, R5 и R11 представляют собой, независимо друг от друга, неразветвленный или разветвленный C1-C4-алкил или неразветвленный или разветвленный галогенированный C1-C4-алкил, и R3 и R9 представляют собой, независимо друг от друга, бензил или замещенный бензил. Согласно одному предпочтительному варианту осуществления настоящего изобретения R3 и/или R9 представляют собой п-морфолино-замещенный бензил.
Согласно одному варианту осуществления способа согласно настоящему изобретению R3 и R9 являются идентичными, R1 и R7 являются идентичными, R2 и R8 являются идентичными, R4 и R10 являются идентичными, R5 и R11 являются идентичными, и R6 и R12 являются идентичными.
Согласно предпочтительному варианту осуществления настоящего изобретения соединение IIb синтезируют из соединения II или IIa посредством удаления защитной группы A и B или X и Y соответственно. Соединение IIb может быть выделено или применяться in situ для синтеза депсипептида (I).
Настоящее изобретение также относится к линейным или циклическим депсипептидам, выбранным из одной из общих формул (II-1) - (II-14b) или (I-1) - (I-9), как описано ниже, или их фармацевтически или ветеринарно приемлемой соли:
где в формулах (II-11) - (II-14) и (I-1) - (I-9), соответственно:
A, B, X и Y имеют значение, как определено выше,
-LINK- выбран из:
и R13 выбран из SO2NH(CH3), SO2NH2, OC(O)CH3, CF3 или одной из следующих лактоновых структур:
Термины «ветеринарно приемлемая соль» и «фармацевтически приемлемая соль» используются во всем описании для описания любых солей соединений, которые приемлемы для введения для фармацевтических или ветеринарных применений и которые обеспечивают активное соединение при введении.
Ветеринарно приемлемые соли включают соли, полученные из ветеринарно приемлемых неорганических или органических оснований и кислот. Подходящие соли включают соли, включающие щелочные металлы, такие как литий, натрий или калий, щелочноземельные металлы, такие как кальций, магний и барий. Соли, содержащие переходные металлы, включая, но не ограничиваясь этим, марганец, медь, цинк и железо, также являются подходящими. Кроме того, настоящее изобретение охватывает соли, содержащие катионы аммония, а также замещенные катионы аммония, в которых один или несколько атомов водорода замещены алкильными или арильными группами. Особенно пригодны соли, полученные из неорганических кислот, включая, но не ограничиваясь этим, галогенводородные кислоты (HCl, HBr, HF, HI), серную кислоту, азотную кислоту, фосфорную кислоту и тому подобное. Подходящие неорганические соли также включают, но не ограничиваются ими, бикарбонатные и карбонатные соли. В некоторых вариантах примерами ветеринарно и сельскохозяйственно приемлемых солей являются соли присоединения органических кислот, образованные с органическими кислотами, включая, но не ограничиваясь ими, малеат, дималеат, фумарат, тозилат, метансульфонат, ацетат, цитрат, малонат, тартрат, сукцинат, бензоат, аскорбат, α-кетоглутарат и α-глицерофосфат. Конечно, могут быть использованы другие приемлемые органические кислоты.
Соли щелочных металлов (например, натрия, калия или лития) или щелочноземельных металлов (например, кальция) соединений также могут быть получены путем взаимодействия достаточно кислотного остатка при соединениях с гидроксидом щелочного металла или щелочноземельного металла.
Ветеринарно приемлемые соли могут быть получены с использованием стандартных методик, хорошо известных в данной области техники, например, путем взаимодействия достаточно основного соединения, такого как амин, с подходящей кислотной функциональной группой, присутствующей в соединении, или путем взаимодействия подходящей кислоты с подходящей основной функциональной группой на соединениях согласно настоящему изобретению.
Примеры
Настоящее изобретение далее описано со ссылкой на следующие примеры, без ограничения ими.
1. Общий способ
Исходные структурообразующие блоки готовили из имеющихся в продаже реагентов. Если не указано иное, реагенты и растворители были приобретены с наивысшим коммерческим качеством и использовались без дальнейшей очистки. Метанол и сухой толуол, CH2Cl2 были приобретены у Kanto Chemical Co., Inc. Все реакции контролировали с помощью тонкослойной хроматографии (ТСХ) с использованием предварительно покрытых силикагелем 60 F254 пластин Merck (0,25 мм). Флэш-хроматографию проводили на силикагеле Kanto Chemical (Kanto Chemical, силикагель 60N, сферический нейтральный, 0,040-0,050 мм, кат. № 37563-84). 1H и 13C ЯМР спектры записывали на JEOL JNM-ECA-500 (500 МГц для 1H-ЯМР и 125 МГц для 13C-ЯМР). Химические сдвиги выражены в ppm вниз от внутренних пиков растворителя для CDCl3 (1H; δ = 7.26 ppm, 13C; δ = 77.0 ppm), CD3OD (1H; δ = 3.31 ppm, 13C; δ = 49.0 ppm), и значения J приведены в Герцах. Следующие сокращения были использованы для обозначения мультиплетностей: s = синглет, d = дублет, t = триплет, q = квартет, dd = двойной дублет, ddd = двойной дублет дублетов, dt = двойной триплет, dq = двойной квартет, m = мультиплет br = широкий. Все инфракрасные спектры измеряли на спектрометре Horiba FT-210. Масс-спектры высокого и низкого разрешения были измерены на JEOL JMS-AX505 HA, JEOL JMS-700 MStation и JEOL JMS-T100LP. Оптические вращения измеряли с помощью поляриметра JASCO P-1010. Точки плавления измеряли на устройствах YANACO MP-500P или OptiMelt (Stanford Research Systems).
Общий способ удаления защитной группы Fmoc
Субстрат с защитной группой Fmoc растворяли в 5% пиперидине/CH2Cl2 (в общем, 0.05 M для субстрата) при комнатной температуре, и раствор перемешивали в течение 3 ч. Реакционную смесь затем охлаждали до -5°C, и MeOH добавляли (пятикратный избыток реакционного раствора). Полученный гетерогенный раствор перемешивали в течение еще 30 мин при -5°C, и бесцветный осадок фильтровали и промывали с помощью дополнительного MeOH с получением соединения соответствующего амину в виде бесцветного порошка.
Общий способ отщепления функциональной группы TAGa
Несущие TAG субстраты с группой TAGa растворяли в 50% TFA/CH2Cl2 (0.05 M для субстрата) при комнатной температуре, и раствор перемешивали в общем в течение 1 ч. Реакционную смесь затем концентрировали с толуолом (x 3) для удаления TFA. В колбу затем добавляли CH2Cl2 при -5°C, затем MeOH добавляли (пятикратный избыток CH2Cl2). Полученный гетерогенный раствор перемешивали в течение еще 30 мин при -5°C, и бесцветный осадок фильтровали и промывали с помощью дополнительного MeOH. Объединенные фильтраты концентрировали в вакууме. К полученному продукту добавляли 4 M HCl/диоксан (0.05 M для продукта) и концентрировали с толуолом (x 3) с получением соединения соответствующего карбоновой кислоте в виде, в общем, масла коричневого цвета. Неочищенное вещество применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
2. Синтез эмодепсида
Далее описан синтез эмодепсида, применяя соединение бензил (R)-2-гидрокси-3-(4-морфолинофенил)пропаноат (называемое EMD-8), которое синтезируют из п-фторбензальдегида согласно схеме на Фиг. 1. Применяя это соединение, эмодепсид синтезируют согласно схеме на Фиг. 2.
4-Морфолинобензальдегид (EMD-22): В реактор объемом 100 л помещали раствор 4-фторбензальдегида (EMD-21, 3.6 кг, 29.0 моль, 1.0 экв) в 1-метил-2-пирролидине (36 л, 10.0 об), морфолин (7.6 кг, 87 моль, 3.0 экв), K2CO3 (10.0 кг, 72.5 моль, 2.5 экв). Полученную смесь перемешивали в течение по меньшей мере 6 ч при 125~130°C. Реакцию контролировали посредством ТСХ до отсутствия EMD-21. Реакционную смесь разбавляли этилацетатом (18 л, 5 об.), H2O (72 л, 20 об.), и отделяли. Водную фазу экстрагировали с помощью этилацетата (18 л × 2), и объединяли органические фазы, и промывали с помощью H2O (36.0 л × 3). Органические экстракты концентрировали в вакууме при ниже 45°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Остаток элюировали гептаном/этилацетатом (5:1, об./об., 7.2 л) и концентрировали в вакууме при ниже 45°C. Затем, к вышеуказанному остатку добавляли гептан/этилацетат (5:1, об./об., 21.6 л) при 20~25°C. Раствор перемешивали при 20~25°C в течение 16 ч. Смесь фильтровали, и осадок на фильтре промывали с помощью гептана (7.3 л). Твердые вещества сушили в вакууме при 40~45°C. Получали 4.67 кг (84.8%) 4-морфолинобензальдегида (EMD-22) в виде твердого вещества желтого цвета. MS (ES, m/z): 192 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 9.74 (s, 1H), 7.74 (d, J = 8.1 Гц, 2H), 7.07(d, J = 8.4 Гц, 2H), 3.75-3.74 (m, 4H), 3.35-3.33 (m,4H).
( Z )-2-метил-4-(4-морфолинобензилиден)оксазол-5(4H)-он (EMD-22B): В реактор объемом 100 л помещали раствор N-ацетилглицина (1.22 кг, 10.46 моль, 1.0 экв) в тетрагидрофуране (20 л, 10 об.), уксусный ангидрид (3.2 кг, 31.38 моль, 3.0 экв), хлорид цинка (II) (1.48 кг, 10.46 моль, 1.0 экв). Полученную смесь перемешивали при 70°C в течение 1 ч и EMD-22 (2.0 кг, 10.46 моль, 1.0 экв) добавляли. Затем, смесь перемешивали при 70°C в течение еще 16 ч и контролировали посредством LCMS. После охлаждения до 20~25°C, H2O (40 л) добавляли. Затем, смесь перемешивали при 0~5°C в течение 3 ч и фильтровали. Осадок на фильтре промывали с помощью H2O (10 л), и сушили под вакуумом при 40~45°C. Получали 2.29 кг (80.4%) (Z)-2-метил-4-(4-морфолинобензилиден)оксазол-5(4H)-она (EMD-22B) в виде твердого вещества коричневого цвета. MS (ES, m/z): 273 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.84 (s, 1H), 7.47(d, J = 9.0 Гц, 2H), 7.02(d, J = 9.1 Гц, 2H), 3.74-3.71 (m, 4H), 3.32-3.27 (m, 4H).
( E )-2-гидрокси-3-(4-морфолинофенил)акриловая кислота (EMD-23): В реактор объемом 50 л помещали раствор EMD-22B (2.2 кг, 8.08 моль, 1.0 экв) в 1,4-диоксане (8.8 л, 4.0 об.), HCl (8.8 л, 4.0 об.) при 20~25°C. Полученную смесь перемешивали при 80°C в течение 3 ч и контролировали посредством LCMS. После охлаждения до 0~10°C, смесь перемешивали при 0~10°C в течение 16 ч и фильтровали. Осадок на фильтре сушили под вакуумом при 40~45°C. Неочищенный продукт элюировали с помощью H2O (4.4 л) и перемешивали при 0~10°C в течение 2 ч. Смесь отфильтровали, и осадок на фильтре сушили под вакуумом при 40~45°C. Получали 1.17 кг (56.0%) (E)-2-гидрокси-3-(4-морфолинофенил)акриловой кислоты (EMD-23) в виде твердого вещества синевато-серого цвета. MS (ES, m/z): 250 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.66 (d, J = 8.5 Гц, 2H), 6.97(d, J = 8.6 Гц, 2H), 6.35 (s, 1H), 4.05 (s, 1H, -OH), 3.77-3.74 (m, 4H), 3.19-3.16 (m, 4H).
(R)-2-гидрокси-3-(4-морфолинофенил)пропановая кислота (EMD-24): В круглодонную колбу объемом 2 л, продутую азотом и с поддержанием инертной атмосферы азота, помещали раствор EMD-23 (66.0 г, 0.26 моль, 1.0 экв) в N,N-диметилформамиде (660 мл, 10.0 об.), Et3N (107.2 г, 1.06 моль, 4.0 экв), RuCl(R,R)-TsDPEN (1.69 г, 0.0026 моль, 0.01 экв) при 20~25°C. К вышеописанной смеси добавляли муравьиную кислоту (36.59 г, 0.79 моль, 3.0 экв) по каплям в течение 2 ч при 20~25°C в атмосфере N2. Затем, смесь перемешивали при 20~25°C и контролировали посредством LCMS. Реакция была отмечена для M1, которое применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
Бензил (R)-2-гидрокси-3-(4-морфолинофенил)пропаноат (EMD-8): К смеси (M1) добавляли K2CO3 (109.0 г, 0.78 моль, 3.0 экв) и по каплям бензилбромид (54.0 г, 0.32 моль, 1.2 экв) при 20~25°C в течение 1 ч. Затем, смесь перемешивали при 55~60°C в течение еще 16 ч. Реакционную смесь разбавляли этилацетатом (330 мл, 5 об.), H2O (1.2 л, 20 об.), и отделяли. Водную фазу экстрагировали с помощью этилацетата (330 мл × 2), и объединяли органические фазы, и промывали с помощью H2O (660 мл × 3). Органические экстракты концентрировали в вакууме при ниже 45°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Остаток элюировали гептаном/этилацетатом (3:1, об./об., 132 мл) и концентрировали в вакууме при ниже 45°C. Затем, к вышеуказанному остатку добавляли гептан/этилацетат (3:1, об./об., 264 мл) при 20~25°C. Смесь фильтровали, и осадок на фильтре промывали с помощью гептана (132 мл). Твердые вещества сушили в вакууме при 40~45°C. Получали 52 г (58%) бензил(R)-2-гидрокси-3-(4-морфолинофенил)пропаноата (EMD-8) в виде твердого вещества желтого цвета. MS (ES, m/z): 342 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.40-7.27 (m, 5H), 7.05 (d, J = 8.1 Гц, 2H), 6.82 (d, J = 8.1 Гц, 2H), 5.17 (s, 2H), 4.24 (t, J = 7.5 Гц, 1H), 3.74-3.71 (m, 4H), 3.06-3.03 (m, 4H), 2.90-2.73 (m, 2H).
(R)-1-(бензилокси)-3-(4-морфолинофенил)-1-оксопропан-2-ил- N -(трет-бутоксикарбонил)- N -метил-L-лейцинат (EMD-9B): В реактор объемом 50 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-8 (1.96 кг, 5.75 моль, 1.0 экв) в дихлорметане (14.1 л, 10. об.), N-(трет-бутоксикарбонил)-N-метил-L-лейцин (1.41 кг, 5.75 моль, 1.0 экв), DMAP (0.77 кг, 6.32 моль, 1.1 экв), EDCI (1.21 кг, 6.32 моль, 1.1 экв) при 20~25°C. Смесь перемешивали при этой температуре в течение по меньшей мере 3 ч и контролировали посредством LCMS. Смесь концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Остаток растворяли в MTBE (14.1 л) и HCl (вод, 1Н, 14.1 л) и фильтровали. Органический слой промывали с помощью HCl (вод., 1Н, 14.1 л), NaHCO3 (нас., 14.1L × 2), и концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Затем остаток растворяли в гептане/MTBE (28.2 л, 8:1, об./об.), и концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. К вышеуказанному остатку добавляли гептан/MTBE (15.5 л, 8:1, об./об.) при 20~25°C и затравочный кристалл (0.2%, мас/мас), и поддерживали перемешивание всю ночь при 20~25°C. Смесь фильтровали; осадок на фильтре промывали с помощью гептана (7.0 л). Твердые вещества сушили в вакууме при 40~45°C. Получали 2.56 кг (78.3%) (R)-1-(бензилокси)-3-(4-морфолинофенил)-1-оксопропан-2-ил-N-(трет-бутоксикарбонил)-N-метил-L-лейцината (EMD-9B) в виде твердого вещества светло-желтого цвета. MS (ES, m/z): 569 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.38-7.26 (m, 5H), 7.10 (d, J = 8.2 Гц, 2H), 6.96 (d, J = 8.1 Гц, 2H), 5.25-5.22 (m, 1H), 5.12-5.10 (m, 2H), 4.07-3.99 (m, 1 H), 3.79-3.76 (m, 4H), 3.19-2.97 (m, 6H), 2.57 (s, 3H), 1.42-1.34 (m, 11H), 1.24-1.15 (m, 1H), 0.88-0.82 (m, 6H).
(R)-2-(( N -(трет-бутоксикарбонил)- N -метил-L-лейцил)окси)-3-(4-морфолинофенил)пропановая кислота (EMD-10B): В реактор объемом 50 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-9B (400g, 0.7 моль, 1.0 экв) в EtOH (4.0 л, 10.0 об.) при 20~25°C. Реактор вакуумировали и продували азотом три раза, и Pd/C (28.0 г, 7% мас/мас) добавляли. Затем реактор вакуумировали и продували азотом три раза снова, и поддерживали барботирование водорода под поверхностью реакционной смеси. Смесь перемешивали в течение по меньшей мере 4 ч при 20~25°C и контролировали посредством ВЭЖХ. После завершения реакции, барботирование водорода прекращали. Смесь фильтровали через целит (2.0 кг), и остаток на фильтре промывали с помощью EA (0.8 л), и фильтрат концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Получали 317.7 г (94.4%) of (R)-2-((N-(трет-бутоксикарбонил)-N-метил-L-лейцил)окси)-3-(4-морфолинофенил)пропановой кислоты (EMD-10B) в виде масла темно желтого цвета; MS (ES, m/z): 479 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.10 (d, J = 8.4 Гц, 2H), 6.85 (d, J = 8.7 Гц, 2H), 5.03-5.02 (m, 1H), 4.81-4.53 (m, 1H), 3.73 (t, J = 7.2 Гц, 4H), 3.05 (t, J = 7.2 Гц, 4H), 2.96-2.90 (m, 1H), 2.63 (s, 3H), 1.42-1.16 (m, 12 H), 0.89-0.84 (m, 6H).
(R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-илметил-L-лейцинат (EMD-12B): В реактор объемом 10 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор N-(трет-бутоксикарбонил)-N-метил-L-лейцин (240.3 г, 0.98 моль, 1.0 экв) в THF (3.9 л, 16 об.), бензил (S)-2-гидроксипропаноат (176.5 г, 0.98 моль, 1.0 экв), трифенилфосфин (385.1 г, 1.47 моль, 1.5 экв) при 20~25°C. После охлаждения до ниже 10°C, диизопропил азодиформиат (297 г, 1.47 моль, 1.5 экв) добавляли по каплям при перемешивании при ниже 10°C. Затем нагревали до 20~25°C и перемешивали в течение по меньшей мере 2 ч. Реакцию контролировали посредством ВЭЖХ до бензил (S)-2-гидроксипропаноата менее или равного 0.5%. Полученную смесь разбавляли этилацетатом (3.9 л) и промывали с помощью NaHCO3 (нас., 3.9 л × 2), солевым раствором (3.9 L × 2). Органическую фазу концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Остаток обменивали с трет-бутилметиловым простым эфиром (240 мл × 2), концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать, и смешивали с трет-бутилметиловым простым эфиром (960 мл) в течение по меньшей мере 3 ч. Смесь фильтровали, и осадок на фильтре промывали с помощью трет-бутилметилового простого эфира (240 мл). Фильтрат концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Получали неочищенный продукт (R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-ил N-(трет-бутоксикарбонил)-N-метил-L-лейцината (EMD-1B) в виде масла желтого цвета, которое применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
В реактор объемом 10 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-1B в HCl/EA (1.2 л, 5.0 экв) при ниже 25°C. Смесь перемешивали в течение по меньшей мере 1 ч при 20~25°C и контролировали посредством ВЭЖХ до EMD-1B менее или равного 0.5%. Раствор концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Остаток обменивали с трет-бутилметиловым простым эфиром (240 мл × 2), концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать, и растворяли в трет-бутилметиловом простом эфире (1.92 л). Затем добавляли затравочный кристалл (0.1%, мас/мас) и перемешивали в течение по меньшей мере 5 ч при 20~25°C. Смесь фильтровали, и осадок на фильтре промывали с помощью трет-бутилметилового простого эфира (0.24 л). Твердое вещество сушили под вакуумом при 40±5°C, и 270 г неочищенного продукта получали в виде твердого вещества белого цвета. Твердое вещество растворяли в этилацетате (810 мл) при нагревании до 40±5°C, и трет-бутилметиловый простой эфир (4.05 л) добавляли. Затем охлаждали до 20~25°C, и добавляли затравочный кристалл (0.1%. мас/мас). Смесь перемешивали в течение по меньшей мере 5 ч при 20~25°C, фильтровали, осадок на фильтре промывали с помощью трет-бутилметилового простого эфира (0.24 л). Твердое вещество сушили под вакуумом при 40±5°C. Получали 226.7 г (67.3%, две стадии) (R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-илметил-L-лейцината (EMD-12B) в виде твердого вещества белого цвета. MS (ES, m/z): 308 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.41-7.35 (m, 5 H), 5.28 (q, J = 7.1 Гц, 1H), 5.20 (s, 2H), 2.51 (s, 3H), 1.77-1.71 (m, 3H), 1.50-1.48 (m, 3H), 0.90-0.87 (m, 6H).
(R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-ил N-((R)-2-((N-(трет-бутоксикарбонил)-N-метил-L-лейцил)окси)-3-(4-морфолинофенил)пропаноил)-N-метил-L-лейцинат (EMD-13B): В реактор объемом 10 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-10B (275.0 г, 0.57 моль, 1.0 экв) в этилацетате (2.2 л, 8.0 об.), EMD-12B ( 197.7 г, 0.57 моль, 1.0 экв), N,N-диизопропилэтиламин (372.2 г, 2.88 моль, 5.0 экв) при 20~25°C. После охлаждения до 10 ~20°C, ангидрид пропилфосфоновой кислоты (916.4 г, 1.44 моль, 2.5 экв) добавляли по каплям при перемешивании при ниже 25°C. Затем, смесь перемешивали при 20~25°C в течение по меньшей мере 2.5 ч и контролировали посредством ВЭЖХ до EMD-12B равного или менее 1.0%. Раствор разбавляли гептаном (2.75 л) при 0~10°C и медленно гасили с помощью HCl (вод., 1.0Н, 2.75 л). Органическую фазу промывали с помощью HCl (вод., 1.0Н, 2.75 л), NaHCO3 (нас., 2.75 л × 2), и концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Получали 429.8 г (97.4%) (R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-ил N-((R)-2-((N-(трет-бутоксикарбонил)-N-метил-L-лейцил)окси)-3-(4-морфолинофенил)пропаноил)-N-метил-L-лейцинат (EMD-13B) в виде густого масла желтого цвета. MS (ES, m/z): 768 (M+H);
(R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-ил-N-метил-N-((R)-2-((метил-L-лейцил)окси)-3-(4-морфолинофенил)пропаноил)-L-лейцинат (EMD-14B): В реактор объемом 5 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-13B (245 г, 0.32 моль, 1.0 экв) в HCl/EA (735, 3.0 об.) при ниже 25°C. Смесь перемешивали в течение по меньшей мере 1 ч при 20~25°C и контролировали посредством ВЭЖХ до EMD-13B менее или равного 0.5%. Полученный раствор концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать и экстрагировали с помощью этилацетата (245 мл × 2) при ниже 40°C. Остаток растворяли в этилацетате (735 мл) и N,N-диизопропилэтиламин (245 г) добавляли при 20~25°C. Смесь промывали с помощью NaHCO3 (нас., 735 мл × 2). Органический слой концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Получали 186.9 г (89.9%) (R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-ил-N-метил-N-((R)-2-((метил-L-лейцил)окси)-3-(4-морфолинофенил)пропаноил)-L-лейцинат (EMD-14B) в виде масла желтого цвета. MS (ES, m/z): 668 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.41-7.32 (m, 5 H), 7.17 (d, J = 8.5 Гц, 2H), 6.86 (d, J = 8.6 Гц, 2H), 5.50-5.47 (m, 1H), 5.20-5.04 (m, 4H), 4.23-3.99 (m, 1H), 3.74-3.72 (m, 4H), 3.09-2.76 (m, 10H), 2.22-1.99 (m, 3H), 1.63-1.35 (m, 5H), 1.29-1.16 (m, 4H), 0.97-0.70 (m, 12H).
(6S,9R,12S,15R)-6,12-диизобутил-2,2,5,11,15-пентаметил-9-(4-морфолинобензил)-4,7,10,13-тетраоксо-3,8,14-триокса-5,11-диазагексадекан-16-овая кислота (EMD-15B): В реактор объемом 10 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-13B (274.2 г, 0.36 моль, 1.0 экв) в EtOH (2.8 л, 10.0 об.) при 20~25°C. Реактор вакуумировали и продували азотом три раза, и Pd/C (19.2 г, 7% мас/мас) добавляли. Затем реактор вакуумировали и продували азотом три раза снова, и поддерживали барботирование водорода под поверхностью реакционной смеси. Смесь перемешивали в течение по меньшей мере 4 ч при 20~25°C и контролировали посредством ВЭЖХ. После завершения реакции, барботирование водорода прекращали. Смесь фильтровали через целит (2.0 кг), и осадок на фильтре промывали этилацетатом (0.56 л), и фильтрат концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Получали 237.4 г (98.0%)(6S,9R,12S,15R)-6,12-диизобутил-2,2,5,11,15-пентаметил-9-(4-морфолинобензил)-4,7,10,13-тетраоксо-3,8,14-триокса-5,11-диазагексадекан-16-овой кислоты (EMD-15B) в виде масла желтого цвета; MS (ES, m/z): 678 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.15 (d, J = 8.4 Гц, 2H), 6.85 (d, J = 8.3 Гц, 2H), 5.52-5.40 (m, 1H), 5.09-5.02 (m, 1H), 4.91-4.53 (m, 2 H), 3.74-3.72 (m, 4H), 3.15-3.04 (m, 5H), 2.94-2.86 (m, 4H), 2.65-2.64 (m, 3H), 1.43-1.28 (m, 16H), 0.93-0.77 (m, 12H).
(R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-ил N-метил-N-((6S,9R,12S,15R,18S,21R)-6,12,18-триизобутил-2,2,5,11,15,17-гексаметил-9,21-бис(4-морфолинобензил)-4,7,10,13,16,19-гексаоксо-3,8,14,20-тетраокса-5,11,17-триазадокозан-22-оил)-L-лейцинат (EMD-16B): В реактор объемом 10 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-15B (147.6 г, 0.22 моль, 1.0 экв) в этилацетате (2.2 л, 8.0 об.), EMD-14B (145.5 г, 0.22 моль, 1.0 экв), N,N-диизопропилэтиламин (139.6 г, 1.08 моль, 5.0 экв) при 20~25°C. После охлаждения до 10 ~20°C, ангидрид пропилфосфоновой кислоты (346.4 г, 0.54 моль, 2.5 экв) добавляли по каплям при перемешивании при ниже 25°C. Затем, смесь перемешивали при 20~25°C в течение по меньшей мере 2.5 ч и контролировали посредством ВЭЖХ до EMD-12B менее или равного 0.5 %. Раствор разбавляли гептаном (2.2 л) при 0~10°C и медленно гасили с помощью HCl (вод, 1.0 Н, 2.2 л). Органическую фазу промывали с помощью HCl (вод., 1.0Н, 2.2 л), NaHCO3 (нас., 2.2 л × 2), концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать, и экстрагировали с помощью гептана/MTBE (0.44 л, 1.5:1, об./об.) при ниже 40°C. Остаток растворяли в гептане/MTBE (1.65 л, 1.5:1, об./об.), и затравочный кристалл (0.1%, мас/мас) добавляли при 20~25°C. Смесь перемешивали в течение по меньшей мере 16ч при 20~25°C и фильтровали. Осадок на фильтре промывали с помощью гептана (0.66 л), сушили в вакууме при 40~45°C. Получали 242.4 г (83.4%) of (R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-ил N-метил-N-((6S,9R,12S,15R,18S,21R)-6,12,18-триизо-бутил-2,2,5,11,15,17-гексаметил-9,21-бис(4-морфолинобензил)-4,7,10,13,16,19-гексаоксо-3,8,14,20-тетраокса-5,11,17-триазадокозан-22-оил)-L-лейцината (EMD-16B) в виде твердого вещества белого цвета: MS (ES, m/z): 1328 (M+H);
(R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-ил N-((2R,5S,8R,11S,14R,17S)-5,11-диизобутил-6,8,12,19-тетраметил-17-(метиламино)-2,14-бис(4-морфолинобензил)-4,7,10,13,16-пентаоксо-3,9,15-триокса-6,12-диазаикозаноил)-N-метил-L-лейцинат (EMD-20B): В реактор объемом 5 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-16B (376.4 г, 0.28 моль, 1.0 экв) в HCl/EA (1128 мл, 3.0 об.) при ниже 25°C. Смесь перемешивали в течение по меньшей мере 1 ч при 20~25°C и контролировали посредством ВЭЖХ до EMD-16B менее или равного 0.5%. Полученный раствор концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать и экстрагировали с помощью этилацетата (376.4 мл × 2) при ниже 40°C. Остаток растворяли в этилацетате (1128 мл), и N,N-диизопропилэтиламин (376.4 г) добавляли при 20~25°C. Смесь промывали с помощью NaHCO3 (нас., 1128 мл × 2). Органический слой концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Получали 313.56 г (90.1%) of (R)-1-(бензилокси)-1-оксопропан-2-ил N-((2R,5S,8R,11S,14R,17S)-5,11-диизобутил-6,8,12,19-тетраметил-17-(метиламино)-2,14-бис(4-морфолинобензил)-4,7,10,13,16-пентаоксо-3,9,15-триокса-6,12-диазаикозаноил)-N-метил-L-лейцината (EMD-20B) в виде масла желтого цвета; MS (ES, m/z): 1228 (M+H);
(3S,6R,9S,12R,15S,18R,21S,24R)-3,9,15,21-тетраизобутил-8,12,14,20,24-пентаметил-6,18-бис(4-морфолинобензил)-4,7,10,13,16,19,22-гептаоксо-5,11,17,23-тетраокса-2,8,14,20-тетраазапентакозан-25-овая кислота (EMD-18B): В реактор объемом 10 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-20B (313.56 г, 0.26 моль, 1.0 экв) в EtOH (3.2 л, 10.0 об.) при 20~25°C. Реактор вакуумировали и продували азотом три раза, и Pd/C (21.95 г, 7% мас/мас) добавляли. Затем реактор вакуумировали и продували азотом три раза снова, и поддерживали барботирование водорода под поверхностью реакционной смеси. Смесь перемешивали в течение по меньшей мере 4 ч при 20~25°C и контролировали посредством ВЭЖХ до EMD-20B менее или равного 1.0%. После завершения реакции, барботирование водорода прекращали. Смесь фильтровали через целит (2.0 кг), и осадок на фильтре промывали этилацетатом (0.64 л × 3), и фильтрат концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать. Остаток смешивали с этилацетатом (0.7 л) в течение по меньшей мере 3ч и фильтровали; осадок на фильтре промывали этилацетатом (0.32 л × 2). Твердое вещество сушили под вакуумом при 40~45°C. Получали 234.2 г (80.6%) (3S,6R,9S,12R,15S,18R,21S,24R)-3,9,15,21-тетраизобутил-8,12,14,20,24-пентаметил-6,18-бис(4-морфолинобензил)-4,7,10,13,16,19,22-гептаоксо-5,11,17,23-тетраокса-2,8,14,20-тетраазапентакозан-25-овой кислоты (EMD-18B) в виде твердого вещества грязновато-белого цвета; MS (ES, m/z): 1138 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.34-7.16 (m, 8H), 5.68-5.28 (m, 3H), 5.11-5.04 (m, 3H), 4.93-4.86 (m, 1H), 4.03-3.99 (m, 1H), 3.85-3.82 (m, 8H), 3.23-3.22 (m, 8H), 3.23-2.76 (m, 13H), 2.49 (s, 2H), 2.07 (s, 2H), 1.66-1.45 (m, 8H), 1.43-1.16 (m, 10H), 0.99-0.64 (m, 24H).
(3S,6R,9S,12R,15S,18R,21S,24R)-3,9,15,21-тетраизобутил-4,6,10,16,18,22-гексаметил-12,24-бис(4-морфолинобензил)-1,7,13,19-тетраокса-4,10,16,22-тетраазациклотетракозан-2,5,8,11,14,17,20,23-октаон (Эмодепсид): В реактор объемом 10 л, продутый азотом и в котором поддерживается инертная атмосфера азота, помещали раствор EMD-18B (234.2 г, 0.21 моль, 1.0 экв) в этилацетате (3.8 л, 16.0 об.), N,N-диизопропилэтиламин (131.84 г, 1.02 моль, 5.0 экв) при 20~25°C. После охлаждения до 10 ~20°C, ангидрид пропилфосфоновой кислоты (324.5 г, 0.51 моль, 2.5 экв) добавляли по каплям при перемешивании при ниже 25°C. Затем, смесь перемешивали при 20~25°C в течение по меньшей мере 2.5 ч и контролировали посредством ВЭЖХ до EMD-18B менее или равного 0.5 %. Смесь разбавляли гептаном (2.38 л) при 0~10°C и медленно гасили с помощью HCl (вод., 1.0 Н, 2.38 л). Органическую фазу промывали с помощью HCl (вод., 1.0Н, 2.38 л), NaHCO3 (нас., 2.38 л × 2), концентрировали при ниже 40°C до тех пор, пока капли дистиллята не переставали выпадать, и экстрагировали с помощью EtOH (0.48 л × 2) при ниже 40°C. Остаток растворяли в EtOH (0.72 л) при 45~55°C, и затравочный кристалл (0.1%, мас/мас) добавляли при 20~25°C. Смесь перемешивали в течение по меньшей мере 16ч при 20~25°C и фильтровали. Осадок на фильтре промывали с помощью EtOH (0.24L). Твердое вещество сушили под вакуумом при 40±5°C. Неочищенный продукт перекристаллизовывали с этилацетатом. Получали 118.24 г (51.3%) (3S,6R,9S,12R,15S,18R,21S,24R)-3,9,15,21-тетраизобутил-4,6,10,16,18,22-гексаметил-12,24-бис(4-морфолинобензил)-1,7,13,19-тетраокса-4,10,16,22-тетраазациклотетракозан 2,5,8,11,14,17,20,23-октаона (эмодепсид) в виде твердого вещества белого цвета; MS (ES, m/z): 1120 (M+H); 1H ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) 7.16 (d, J = 8.7 Гц, 4H), 6.87 (d, J = 8.2 Гц, 4H), 5.68 (q, J = 8.0 Гц, 1H), 5.51-4.04 (m, 7H), 3.74-3.71 (m, 8H), 3.08-3.04 (m, 8H), 2.99-2.96 (m, 4H), 2.90-2.88 (m, 4H), 2.83-2.82 (m, 4H), 2.78 (s, 2H), 2.70 (s, 2H), 1.78-1.38 (m, 8H), 1.31-1.14 (m, 6H), 0.97-0.69 (m, 28H).
3. Получение PF1022A (способ 1; см. реакционную схему на Фиг. 3 и ЯМР спектр на Фиг. 4)
3-1. Методика синтеза
N
-Fmoc
-N
-MeLeu-D-Lac-O-TAGa
К перемешанному раствору соединения HO-TAGa (1.69 г, 1.85 ммоль) в CH2Cl2 (37 мл) добавляли 0.2 M раствор в толуоле вещества 1 (12.0 мл, 2.40 ммоль), 4-диметиламинопиридин (12 мг, 93.0 мкмоль) и N,N’-дициклогексилкарбодиимид (1.30 г, 2.78 ммоль) при комнатной температуре в атмосфере N2. После перемешивания в течение 2 ч, реакционную смесь затем охлаждали до -5°C, и MeOH (185 мл) добавляли. Полученный гетерогенный раствор перемешивали в течение еще 15 мин при -5°C, и бесцветный осадок фильтровали и промывали с помощью дополнительного MeOH (500 мл) с получением соединения N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa (2.46 г, 100%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления: 44 - 45°C
[α]D 24:-10.2 (c 1.0, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.78-7.74 (сложный m, 2H), 7.60-7.56 (сложный m, 2H), 7.39 (m, 2H), 7.29 (m, 2H), 6.50 (s, 4/3H), 6.48 (s, 2/3H), 5.12-5.00 (сложный m, 4H), 4.67 (dd, J = 6.3, 9.7 Гц, 3/10H), 4.58 (dd, J = 6.3 Гц, 10.9 Гц, 4/10H), 4.50 (dd, J = 6.9 Гц, 10.3 Гц, 6/10H), 4.38-4.34 (сложный m, 9/10H), 4.30 (m, 5/10H), 4.23 (t, J = 6.3 Гц, 3/10H), 3.93 (m, 6H), 2.86 (s, 2H), 2.83 (s 1H), 1.76 (m, 6H), 1.64-1.42 (сложный m, 9H), 1.31-1.14 (сложный m, 87H), 0.96-0.87 (сложный m, 14H), 0.78 (d, J = 6.9 Гц, 1H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1334.0748 (M+, вычислено для C86H143NO9 : 1334.0763)
N
-MeLeu-D-Lac-O-TAGa (1)
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa (1.00 г, 0.749 ммоль) превращали в соединение 1 (816 мг, 98%) в виде бесцветного порошка.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 6.50 (s, 2H), 5.16 (q, J = 6.9 Гц, 1H), 5.08 (d, J = 12.0 Гц, 1H), 5.04 (d, J = 12.0 Гц, 1H), 3.93 (m, 6H), 3.30 (t, J = 7.5 Гц, 1H), 2.37 (s, 3H), 1.75 (m, 6H), 1.53-1.42 (сложный m, 10H), 1.32-1.25 (сложный m, 86H), 0.93-0.86 (сложный m, 15H).
13C-ЯМР (125 МГц, CDCl3) δ : 170.6, 153.3, 138.4, 130.2, 106.4, 73.5, 69.2, 68.9, 67.6, 61.4, 42.2, 34.5, 32.0, 30.4, 29.8 (x2), 29.5 (x2), 26.2, 25.0, 22.8, 22.6, 22.5, 17.1, 14.2.
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1113.0151 [(M+H)+, вычислено для C71H134NO7 : 1113.0160]
N-
Fmoc
-N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-LacO-TAGa (2)
К перемешанному раствору соединения 1 (800 мг, 0.719 ммоль) в CH2Cl2 (25 мл) добавляли вещество 2 (426 мг, 0.827 ммоль), N,N-диизопропилэтиламин (0.429 мл, 2.52 ммоль), и PyBroP (496 мг, 1.222 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 88 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa, с получением соединения 2 (1.11 г, 96%) в виде бесцветного порошка.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.76-7.72 (сложный m, 2H), 7.62-7.40 (сложный m, 2H), 7.39-7.17 (сложный m, 9H), 6.47 (m, 2H), 5.47-5.27 (сложный m, 2H), 5.15-4.97 (сложный m, 4H), 4.69-4.13 (сложный m, 3H), 3.92 (сложный m, 6H), 3.07 (m, 2H), 2.85 (сложный, 6H), 1.80-1.25 (сложный m, 105H), 1.02-0.72 (сложный m, 21H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1632.2163 [(M+Na)+, вычислено для C102H164N2O12Na: 1632.2182]
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-OH (3)
После методики, описанной для общей методики отщепления TAGa, соединение, 2 (614 мг, 0.381 ммоль) превращали в соединение 3 (261 мг, 95%) в виде масла желтого цвета, которое применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-O-TAGa (4)
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение 2 (472 мг, 0.293 ммоль) превращали в соединение 4 (404 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.27 (m, 5H), 6.49 (s, 2H), 5.50 (dd, J = 5.7, 8.6 Гц, 1H), 5.32 (dd, J = 4.6, 10.9 Гц, 1H), 5.09-5.00 (сложный m, 3H), 3.93 (m, 6H), 3.28 (t, J = 6.9 Гц, 1H), 3.09 (m, 2H), 2.92 (s, 3H), 2.27 (s, 3H), 1.82-1.25 (сложный m, 105H), 0.89-0.77 (сложный m, 21H).
13C-ЯМР (125 МГц, CDCl3) δ : 175.6, 175.1, 175.0, 174.8, 170.9, 170.5 (x2), 170.4, 169.8, 169.7, 166.7, 165.1, 153.3, 138.5, 138.3, 135.8 (x2), 130.2, 129.5, 129.3, 128.7, 128.6, 128.5 (x2), 127.2, 107.0, 106.9, 105.4, 78.1, 73.5, 71.9, 71.6, 69.4, 69.2, 68.9, 67.7, 67.5, 66.9, 65.6, 61.3, 61.2, 59.7, 57.7, 54.7, 42.3, 42.2, 42.1, 40.0, 38.8, 37.5, 36.9, 34.4, 34.3, 32.8, 32.0, 31.3, 30.4, 29.8 (x2), 29.6, 29.5 (x2), 26.2, 25.0, 24.8, 24.7, 24.6, 23.4, 22.9, 22.8, 22.5 (x2), 22.4 (x2), 21.9, 21.4, 20.5, 17.0, 16.9, 16.8, 14.2.
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1388.1664 [(M+H)+, вычислено для C87H155N2O10 : 1388.1682]
N-
Fmoc
-N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-O-TAGa (5)
К перемешанному раствору соединения 2 (330 мг, 0.238 ммоль) в CH2Cl2 (4.8 мл) добавляли соединение 3 (221 мг, 0.309 ммоль), N,N-диизопропилэтиламин (0.150 мл, 0.881 ммоль), и PyBroP (197 мг, 0.428 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 42 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa с получением соединения 5 (477 мг, 96%) в виде бесцветного порошка.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.74 (m, 2H), 7.53 (m, 2H), 7.38 (m, 2H), 7.32-7.15 (сложный m, 12H), 6.48 (m, 2H), 5.51-4.96 (сложный m, 10H), 4.70-4.12 (сложный m, 3H), 3.93 (m, 6H), 3.23 (dd, J = 6.9, 13.7 Гц, 1H), 3.08-2.70 (сложный m, 15H), 1.80-1.25 (сложный m, 114H), 0.95-0.78 (сложный m, 33H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 2106.4949 [(M+Na)+, вычислено для C128H202N4O18 Na1: 2106.4912]
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-O-TAGa
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение 5 (450 мг, 0.206 ммоль) превращали в соответствующий амин (398 мг, 98%) в виде бесцветного порошка.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.25 (m, 10H), 6.48 (s, 2H), 5.57-4.99 (сложный m, 9H), 3.93 (m, 6H), 3.26-2.78 (сложный m, 14H), 2.24 (s, 3H), 1.80-1.25 (сложный m, 114H), 0.90-0.78 (сложный m, 33H).
13C-ЯМР (125 МГц, CDCl3) δ : 175.6, 175.2 (x2), 171.5, 171.1, 170.8 (x2), 170.6, 170.5 (x2), 170.3, 153.3, 138.5 (x2), 138.3, 136.1, 135.9, 135.5, 130.2, 130.1, 130.0, 129.8, 129.7, 129.6, 129.4 (x2), 128.8, 128.7, 128.6, 128.5, 127.4 (x2), 127.2, 127.1, 126.9, 126.8, 107.0 (x2), 106.9, 73.5, 72.5, 72.2, 71.7, 71.6, 69.8, 69.4, 69.2, 68.1, 68.0, 67.8, 67.5 (x2), 66.9, 61.4, 57.4, 55.2, 54.8, 54.6 (x2), 38.8, 37.7, 37.6, 37.4 (x2), 37.1 (x2), 37.0, 36.9, 34.7, 34.6, 32.2, 32.0, 31.9, 31.7, 31.6, 31.4, 31.3, 31.2, 30.4, 29.8 (x2), 29.6, 29.5 (x2), 26.2, 24.9, 24.8 (x2), 24.7, 24.6, 24.5, 23.5, 23.4, 23.3, 23.1 (x2), 23.0, 22.8, 22.7, 22.5, 22.4, 22.3, 22.0, 21.5, 21.4, 21.3 (x2), 20.5, 16.9, 16.8, 16.6, 14.2.
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1862.4425 [(M+H)+, вычислено для C113H193N4O16 : 1862.4412]
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-OH
После методики, описанной для общей методики отщепления TAGa, соединение, N -MeLeu-D-PhLac- N -MeLeu-D-Lac- N -MeLeu-D-PhLac- N -MeLeu-D-LacO-TAGa (380 мг, 0.204 ммоль) превращали в соответствующую карбоновую кислоту (198 мг, 98%) в виде масла желтого цвета, которую применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
PF1022A
Реакция для 0.005M концентрации субстрата
Неочищенную смесь из предшествующей реакции (90 мг, 0.0895 ммоль) растворяли в CH2Cl2 (18 мл, 0.005 M). К реакционной смеси добавляли N,N-диизопропилэтиламин (76 мкл, 4.48 ммоль) и PyBOP (93 мг, 0.179 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 48 ч, реакционную смесь гасили посредством насыщенного водного NaHCO3 (18 мл) при 0°С, и эту смесь экстрагировали с помощью CHCl3 (20 мл × 2). Объединенные органические слои промывали с помощью 10% водного NaHSO4 (60 мл) и солевого раствора (60 мл), высушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Неочищенный продукт очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле (CHCl3 : MeOH = 400 : 1 - 40 : 1) с получением PF1022A (55 мг, 65%) в виде бесцветного твердого вещества.
Реакция для 0.05M концентрации субстрата
Согласно методике циклизации, упомянутой выше, неочищенную смесь из предшествующей реакции (90 мг, 0.0895 ммоль) подвергали циклизации в CH2Cl2 (1.8 мл, 0.05 M) с N,N-диизопропилэтиламином (76 мкл, 4.48 ммоль) и PyBOP (93 мг, 0.179 ммоль) при комнатной температуре в течение 48 ч с получением PF1022A (40 мг, 49%) в виде бесцветного твердого вещества.
точка плавления: 100-103°C
[α]22 D : -99.4°C (c 0.06, MeOH)
IR (KBr) : 1743, 1666, 1466, 1412, 1265, 1188, 1126, 1080, 1026, 748, 701
1H-ЯМР (500 МГц, CD3OD) δ : 7.29 (m, 10H), 5.82 (t, J = 7.5 Гц, 1H), 5.72 (m, 2H, ротамер), 5.54 (q, J = 6.9 Гц, 1H), 5.44 (dd, J = 4.6, 11.7 Гц, 1H), 5.40 (dd, J = 4.6, 11.7 Гц, 1H, ротамер), 5.23 (dd, J = 4.6, 11.7 Гц, 1H), 5.18 (q, J = 6.9 Гц, 1H, ротамер), 4.77 (dd, J = 3.4, 11.2 Гц, 1H), 3.14 (m, 4H), 3.00 (s, 5/2H, ротамер), 2.91 (m, 7H, ротамер), 2.82 (s, 5/2H, ротамер), 1.84 (m, 1H), 1.77-1.47 (сложный m, 11H), 1.39 (d, J = 6.3 Гц, 3H), 1.05 (d, J = 6.3 Гц, 3H), 0.98 (d, J = 6.9 Гц, 3H), 0.80 (d, J = 6.3 Гц, 3H), 0.95-0.82 (сложный m, 18H).
13C-ЯМР (125 МГц, CD3OD) δ : 174.4, 173.5, 173.1, 173.1, 172.3, 172.0, 171.0, 170.7, 136.4, 136.2, 130.8, 130.7, 130.7, 129.8, 129.7, 129.7, 128.4, 128.3, 72.5, 72.3, 69.9, 68.5, 58.6, 55.7, 55.5, 55.4, 39.0, 38.9, 38.6, 38.6, 37.8, 37.3, 32.0, 31.3, 31.1, 30.0, 26.2, 26.1, 25.5, 25.2, 23.9, 23.7, 23.7, 23.6, 21.7, 21.6, 21.4, 21.1, 17.5, 17.2.
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 971.5353 [(M+Na)+, вычислено для C52H76N4O12Na1 : 971.5357]
*Литература (J. Antibiot., 1992, 45, 692-697)
точка плавления: 104-106°C
[α]22 D : -102°C (c 0.1, MeOH)
1H-ЯМР (400 МГц, CD3OD) δ : 7.30 - 7.20 (PhH, 10H), 5.80 и 5.75 (CαH-PhLac, 1Hx2), 5.54 и 5.16 (CαH-Lac, 1Hx2), 5.43, 5.42, 5.22 и 4.78 (CαH-Leu, 1Hx4), 3.22-3.15 (CβH2-PhLac, 2Hx2), 3.00, 2.90, 2.88 и 2.80 (N-Me-Leu, 3Hx4), 1.87-1.50 (CβH2-Leu, 2Hx4), 1.40 (CγH-Leu, 1Hx4), 1.38 (CβH3-Lac, 3H), 1.02-0.75 (CδH3-Leu, 6Hx4), 0.88 (CβH3-Lac, 3H).
13C-ЯМР (100 МГц, CD3OD) δ : 174.4, 173.4, 172.4, 172.4, 172.1, 172.1, 171.0, 170.8, 136.5, 136.2, 130.7, 130.7, 130.7, 130.7, 129.7, 129.7, 129.7, 129.7, 128.3, 128.2, 72.5, 72.3, 69.9, 68.4, 58.6, 55.7, 55.5, 55.4, 39.0, 38.9, 38.6, 38.6, 37.9, 37.4, 32.0, 31.3, 31.1, 29.9, 26.2, 26.1, 25.6, 25.2, 23.6, 23.6, 23.5, 23.5, 21.7, 21.6, 21.4, 21.0, 17.5, 17.2.
4. Получение PF1022A (способ 2; см. реакционную схему на Фиг. 5)
4-1. Методика синтеза
N
-Fmoc
-N
-MeLeu-D-PhLac-O-TAGa
К перемешанному раствору соединения HO-TAGa (170 мг, 0.186 ммоль) в CH2Cl2 (3.7 мл) добавляли 0.1 M раствор в толуоле вещества 2 (2.42 мл, 0.242 ммоль), 4-диметиламинопиридин (1.1 мг, 9.30 мкмоль), и N,N’-дициклогексилкарбодиимид (58 мг, 0.279 ммоль) при комнатной температуре в атмосфере N2. После перемешивания в течение 1 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa, с получением соединения N -Fmoc -N -MeLeu-D-PhLac-O-TAGa (266 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления:44 - 45°C
[α]D 27:-6.1 (c 1.74, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.76 (сложный m, 2H), 7.54 (m, 2H), 7.39 (m, 2H), 7.30 (m, 1H), 7.26-7.14 (сложный m, 4H), 7.08 (m, 2H) 6.44 (m, 2H), 5.20 (m, 1H), 5.04-4.94 (сложный m, 3H), 4.61-4.15 (сложный m, 3H), 3.92 (m, 6H), 3.10 (m, 2H), 2.72 (s, 3H), 1.76 (m, 6H), 1.60-1.25 (сложный m, 93H), 0.90-0.71 (сложный m, 15H).
13C-ЯМР (125 МГц, CDCl3) δ : 177.2, 175.2, 169.5, 153.3, 138.4, 135.9, 130.0, 129.6, 129.3, 128.6, 128.4, 127.1, 107.5, 107.2, 73.5, 73.1, 69.2, 67.8, 61.6, 42.5, 37.4, 34.5, 32.0, 30.4, 29.8 (x2), 29.6, 29.5, 26.2, 24.8, 22.8, 22.6, 22.5, 14.2.
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1410.1063 [(M+H)+, вычислено для C92H147NO9 : 1410.1076]
N
-MeLeu-D-PhLac-O-TAGa (6)
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение N -Fmoc- N -MeLeu-D-PhLac-O-TAGa (457 мг, 0.324 ммоль) превращали в соединение 6 (378 мг, 99%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления:48 - 49°C
[α]D 26:+4.2 (c1.10, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.22 (m, 5H), 6.48 (s, 2H), 5.28 (dd, J = 4.0, 10.3 Гц, 1H), 5.08 (d, J = 12.0 Гц, 1H), 5.04 (d, J = 12.0 Гц, 1H), 3.93 (m, 6H), 3.24 (dd, J = 4.0 Гц, 14.3 Гц, 1H), 3.17 (t, J = 6.9 Гц, 1H), 3.07 (dd, J = 9.7, 14.3 Гц, 1H), 2.18 (s, 3H), 1.76 (m, 6H), 1.48-1.25 (сложный m, 93H), 0.90-0.76 (сложный m, 15H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1189.0458 [(M+H)+, вычислено для C77H138NO7 : 1189.0473]
N
-Fmoc
-N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLacO-TAGa (7)
К перемешанному раствору соединения 6 (358 мг, 0.301 ммоль) в CH2Cl2 (6.0 мл) добавляли 0.1 M раствор в толуоле вещества 1 (3.31 мл, 0.331 ммоль), N.N-диизопропилэтиламин (0.15 мл, 0.903 ммоль) и PyBroP (211 мг, 0.452 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 13 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa, с получением соединения 7 (468 мг, 97%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления:47 - 48°C
[α]D 26 : -13.9 (c 1.10, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.75 (m, 2H), 7.59 (m, 2H), 7.39 (m, 2H), 7.30-7.09 (сложный m, 7H), 6.44 (m, 2H), 5.36-4.96 (сложный m, 6H), 4.71-4.24 (сложный m, 3H), 3.93 (t, J = 6.5 Гц, 6H), 3.14 (m, 2H), 2.90-2.81 (сложный s, 6H), 1.80-1.25 (сложный m, 105H), 0.96-0.76 (сложный m, 21H).
13C-ЯМР (125 МГц, CDCl3) δ : 171.6, 171.2, 171.1, 170.9, 169.3, 157.0, 153.3, 144.3, 143.9, 141.4 (x2), 138.4, 135.9, 130.0, 129.9, 129.8, 129.7, 129.6, 129.5, 129.3, 128.7, 128.5, 128.4, 127.7, 127.6, 127.0, 125.3, 125.1, 125.0, 124.9, 120.0, 107.5, 107.2, 74.1, 74.0, 73.9, 73.8, 73.5, 71.3, 69.2, 67.9, 67.7, 57.4, 57.2, 56.7, 56.6 (x2), 54.5 (x2), 47.4 (x2), 47.3, 37.6, 37.3, 37.2, 37.1, 37.0, 32.0, 31.1, 30.7, 30.6 (x2), 30.5, 30.4, 30.3, 30.2, 29.8 (x2), 29.6, 29.5 (x2), 26.2, 24.9, 24.8, 24.7, 24.6, 24.4, 23.4, 23.2, 22.9, 22.8, 22.1, 21.4, 21.2, 16.8, 14.2.
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1609.2274 (M+, вычислено для C102H168N2O12 : 1609.2284)
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLacOH (8)
После методики, описанной для общей методики отщепления TAGa, соединение, 7 (244 мг, 0.152 ммоль) превращали в соединение 8 (106 мг, 97%) в виде масла желтого цвета, которое применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLacO-TAGa (9)
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение 7 (204 мг, 0.127 ммоль) превращали в соединение 9 (176 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления:47 - 48°C
[α]D 26 : -2.1 (c 1.1, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.19 (m, 5H), 6.45 (s, 2H), 5.45 (q, J = 6.9 Гц, 1H), 5.31 (ddd, J = 4.6, 11.2, 19.6 Гц, 1H), 5.22 (dd, J = 5.2, 6.9 Гц, 1H), 5.03 (m, 2H), 3.94 (m, 6H), 3.33-2.95 (сложный m, 3H), 2.80 (s, 3H), 2.38 (s, 3H), 1.82-1.25 (сложный m, 105H), 0.96-0.75 (сложный m, 21H).
13C-ЯМР (125 МГц, CDCl3) δ : 175.0, 171.1, 171.0, 169.2, 153.3, 130.0, 129.8, 129.7, 129.3, 128.7, 128.6, 128.5, 127.4, 127.1, 126.9, 107.5, 107.2, 73.8, 73.5, 71.3, 69.2, 67.9, 67.7, 67.4, 67.3, 61.2, 57.5, 54.6, 42.3, 42.2, 37.3, 37.2, 37.0, 34.6, 32.0, 31.1, 30.4, 29.8 (x2), 29.6, 29.5 (x2), 26.2, 25.0, 24.8, 23.4, 23.0, 22.8, 22.7, 22.4, 22.1, 21.3, 16.9, 16.8, 14.2.
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z: 1388.1676 [(M+H)+, вычислено для C87H155N2O10: 1388.1682]
N-
Fmoc
-N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLac-O-TAGa (10)
К перемешанному раствору соединения 9 (155 мг, 96.2 мкмоль) в CH2Cl2 (1.9 мл) добавляли соединение 8 (103 мг, 0.144 ммоль), N,N-диизопропилэтиламин (73 мкл, 0.434 ммоль) и PyBroP (112 мг, 0.241 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 66 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa, с получением соединения 10 (201 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления:47 - 48°C
[α]D 27:-27.2 (c 1.1, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.75 (m, 2H), 7.59 (m, 2H), 7.38 (m, 2H), 7.30-7.12 (сложный m, 12H), 6.44 (m, 2H), 5.43-4.96 (сложный m, 10H), 4.69-4.22 (сложный m, 3H), 3.93 (m, 6H), 3.24-2.69 (сложный m, 16H), 1.80-1.25 (сложный m, 114H), 0.95-0.75 (сложный m, 33H).
13C-ЯМР (125 МГц, CDCl3) δ : 174.1, 171.5, 171.4, 171.3, 171.2, 171.1 (x2), 170.9, 170.8, 170.7, 170.6, 170.5, 170.4, 170.0, 169.2, 157.0, 156.5, 153.3, 144.3, 144.2, 144.0 (x2), 141.4 (x2), 138.6, 138.4, 136.1, 136.0, 135.9 (x2), 135.7, 135.6, 135.3, 130.0, 129.8, 129.7, 129.6, 129.5, 129.3, 128.8, 128.7, 128.6, 128.4, 127.7, 127.4, 127.1 (x2), 127.0. 125.3, 125.2, 125.1, 125.0, 120.0, 107.5, 107.2, 107.1, 73.9, 73.5, 72.5, 71.3, 69.2, 68.0, 67.7, 57.5, 56.6 (x2), 55.1, 55.0, 54.9, 54.7, 54.4, 47.4, 47.3, 40.9, 40.6, 38.7, 37.6, 37.3, 37.2, 37.1, 32.0, 31.9, 31.7, 31.5, 31.3, 31.2, 31.0, 30.7, 30.6, 30.4, 30.3, 29.8 (x2), 29.6, 29.5 (x2), 25.0, 24.9, 24.8, 24.7, 24.5, 24.4 (x2), 23.4, 23.3, 23.1, 23.0, 22.9, 22.8, 22.3, 22.1, 22.0, 21.3, 21.2, 16.8, 16.6, 16.5, 14.2.
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 2106.4910 [(M+Na)+, вычислено для C128H202N4O18Na: 2106.4912]
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLac-O-TAGa
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение 10 (181 мг, 86.8 мкмоль) превращали в соответствующий амин (163 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления:47 - 48°C
[α]D 27:-18.7 (c 1.3, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.20 (m, 10H), 6.44 (s, 2H), 5.50-4.95 (сложный m, 9H), 3.93 (m, 6H), 3.31-2.72 (сложный m, 14H), 2.36 (m, 3H), 1.80-1.25 (сложный m, 114H), 0.99-0.81 (сложный m, 33H).
13C-ЯМР (125 МГц, CDCl3) δ : 171.4, 171.2, 171.0, 170.9, 170.6, 170.4, 153.3, 138.3, 136.1, 136.0, 135.9, 135.8, 130.0, 129.8 (x2), 129.7, 129.6 (x3), 129.5, 129.4, 129.2, 129.2 (x2), 128.8, 128.7, 128.6, 128.4, 127.4, 127.3, 127.2 (x2), 127.1, 127.0, 107.5, 107.2, 107.1, 73.9, 73.5, 72.3, 72.2, 71.3, 69.2, 68.0 (x2), 67.7, 67.4, 61.3, 55.2, 55.0, 54.8, 54.5, 54.4, 42.4, 40.6, 38.7, 37.7, 37.2, 37.1, 34.7 (x2), 32.0, 31.7, 31.5, 31.0, 30.4, 29.8 (x2), 29.6, 29.5 (x2), 26.2, 25.0, 24.9 (x2), 24.7, 23.5, 23.4 (x2), 23.3, 23.2, 23.0, 22.8, 22.4, 22.1, 21.9, 21.3 (x2), 16.9, 16.8 (x3), 16.7, 16.6, 16.5, 14.2.
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1862.4462 [(M+H)+, вычислено для C113H193N4O16: 1862.4412]
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-PhLac-OH
После методики, описанной для общей методики отщепления TAGa, соединение N -MeLeu-D-Lac- N -MeLeu-D-PhLac- N -MeLeu-D-Lac- N -MeLeu-D-PhLac-O-TAGa (143 мг, 0.768 ммоль) превращали в соответствующую карбоновую кислоту (78 мг, 100%) в виде масла желтого цвета, которую применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
PF1022A
Неочищенную смесь из предшествующей реакции (78 мг, 0.0777 ммоль) растворяли в CH2Cl2 (16 мл, 0.005 M). К реакционной смеси добавляли N,N-диизопропилэтиламин (66 мкл, 0.389 ммоль) и PyBOP (81 мг, 0.155 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 48 ч, реакционную смесь гасили посредством насыщенного водного NaHCO3 (16 мл) при 0°C, и эту смесь экстрагировали с помощью CHCl3 (20 мл × 2). Объединенные органические слои промывали с помощью 10% водного NaHSO4 (60 мл) и солевого раствора (60 мл), высушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Неочищенный продукт очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле (CHCl3 : MeOH = 400 : 1 - 40 : 1) с получением PF1022A (48 мг, 65%) в виде бесцветного твердого вещества.
Все физические данные для синтетического PF1022A совпадают с данным для аутентичного PF1022A.
5. Получение эмодепсида (способ 1; см. реакционные схемы на Фиг. 6, ЯМР спектр на Фиг. 7 и ЖХ-УФ спектр на Фиг. 8)
5-1. Методика синтеза
N
-Fmoc
-N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-O-TAGa (11)
К перемешанному раствору соединения 1 (259 мг, 0.233 ммоль) в CH2Cl2 (4.7 мл) добавляли 0.2 M раствор в толуоле вещества 3 (0.122 мл, 0.244 ммоль), N,N-диизопропилэтиламин (0.12 мл, 0.698 ммоль) и PyBroP (163 мг, 0.349 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания при 40 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa, с получением соединения 11 (395 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.74 (m, 2H), 7.57 (m, 2H), 7.42-7.27 (сложный m, 4H), 7.05 (m, 2H), 6.70 (d, J = 8.6 Гц, 2H), 6.48 (s, 2H), 5.40 (dd, J = 6.9, 8.4 Гц, 3/10H, ротамер), 5.35-5.27 (сложный m, 17/10H), 5.10-4.97 (сложный m, 4H), 4.72-4.12 (сложный m, 3H), 3.93 (m, 6H), 3.75 (m, 4H), 3.00-2.79 (сложный m, 12H), 1.80-1.60 (сложный m, 9H), 1.49-1.42 (сложный m, 9H), 1.27 (сложный m, 87H), 0.93-0.80 (сложный m, 21H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z: 1717.2701 [(M+Na)+, вычислено для C106H171N3O13Na: 1717.2710]
N
-Fmoc
-N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-OH (12)
После методики, описанной для общей методики отщепления TAGa, соединение 11 (210 мг, 0.124 ммоль) превращали в соединение 12 (100 мг, ~0.124 ммоль) в виде масла коричневого цвета. Неочищенный продукт применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-O-TAGa (13)
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение 11 (158 мг, 0.0934 ммоль) превращали в соединение 13 (138 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.15 (m, 2H), 6.83 (d, J = 8.6 Гц, 2H), 6.49 (s, 2H), 5.47 (dd, J = 6.9, 8.0 Гц, 1H), 5.32 (dd, J = 4.9, 11.2 Гц, 1H), 5.09-5.00 (сложный m, 3H), 3.94 (m, 6H), 3.85 (m, 4H), 3.27 (t, J = 6.9 Гц, 1H), 3.13-2.79 (сложный m, 9H), 2.29 (s, 3H), 1.81-1.25 (сложный m, 105H), 1.01-0.78 (сложный m, 21H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z: 1473.2214 [(M+H)+, вычислено для C91H162N3O11 : 1473.2209]
N-
Fmoc
-N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-O-TAGa (14)
К перемешанному раствору соединения 13 (138 мг, 0.934 ммоль) в CH2Cl2 (1.9 мл) добавляли 12 (100 мг, ~0.124 ммоль), N,N-диизопропилэтиламин (48 мкл, 0.280 ммоль) и PyBroP (65 мг, 0.140 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 18 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa, с получением соединения 14 (211 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.75 (m, 2H), 7.58 (m, 2H), 7.42-7.28 (сложный m, 4H), 7.09 (m, 4H), 6.77 (m, 4H), 6.48 (s, 2H), 5.45-5.15 (сложный m, 6H), 5.06-4.97 (сложный m, 4H), 4.73-4.12 (сложный m, 3H), 3.95-3.73 (сложный m, 14H), 3.15-2.73 (сложный m, 24H), 1.80-1.25 (сложный m, 114H), 0.96-0.77 (сложный m, 33H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z: 2276.5962 [(M+Na)+, вычислено для C136H216N6O20Na : 2276.5967]
N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-O-TAGa
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение 14 (211 мг, 0.0934 ммоль) превращали в соответствующий амин (178 мг, 94%) в виде бесцветного порошка.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.15 (m, 4H), 6.82 (m, 4H), 6.49 (s, 2H), 5.14 (t, J = 7.45 Гц, 1H), 5.44-5.09 (сложный m, 5H), 5.07-5.00 (сложный m, 3H), 3.93 (m, 6H), 3.85 (m, 8H), 3.32 (m, 1H), 3.17-2.74 (сложный m, 21H), 2.33 (s, 3H), 1.81-1.64 (сложный m, 12H), 1.55-1.25 (сложный m, 102H), 1.03-0.77 (сложный m, 33H).
HR-MS (FAB, NBA матрикс+NaI) m/z: 2032.5488 [(M+H)+, вычислено для C121H207N6O18 : 2032.5467]
N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-OH
После методики, описанной для общей методики отщепления TAGa, соединение N -MeLeu-D-morphPhLac- N -MeLeu-D-Lac- N -MeLeu-D-morphPhLac- N -MeLeu-D-LacO-TAGa (178 мг, 0.0876 ммоль) превращали в соответствующую карбоновую кислоту (~0.0876 ммоль) в виде неочищенного масла, которое применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
Эмодепсид (условие высокого разбавления с применением PyBOP)
К неочищенной карбоновой кислоте (~0.0876 ммоль) в CH2Cl2 (18 мл, 0.005 M) добавляли N,N-диизопропилэтиламин (0.10 мл, 0.613 ммоль) и PyBOP (91 мг, 0.175 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 19 ч, реакционную смесь гасили посредством насыщенного водного NaHCO3 (18 мл) при 0°C, и эту смесь экстрагировали с помощью CHCl3 (20 мл × 3). Объединенные органические слои промывали с помощью 10% водного NaHSO4 (60 мл) и солевого раствора (60 мл), высушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Неочищенный продукт очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле (CHCl3 : MeOH = 400 : 1 - 100 : 1) с получением эмодепсида (45 мг, 46% для 2 стадий) в виде твердого вещества светло-желтого цвета.
точка плавления:98-103°C
[α]D 24:-40.3 (c 0.67, CHCl3)
IR (чистый) : 2954, 2862, 1743, 1659, 1520, 1458, 1412, 1265, 1234, 1188, 1119, 1072, 1026, 926, 810.
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.14-7.11 (сложный m, 4H), 6.83-6.79 (сложный m), 5.64-5.54 (сложный m), 5.52-5.43, 5.43-5.39, 5.33, 5.18, 5.06 и 4.46 (5 m, 6H), 3.85 (видимо t, 8H), 3.15-3.04 (сложный m, 8H), 3.04-2.92 (сложный m, 4H), 3.00, 2.82, 2.79, 2.72 и 2.71 (5 s, 12H), 1.82-1.24 (сложный m, 18H), 1.03-0.79 (сложный m, 30H).
13C-ЯМР (125 МГц, CDCl3) δ : 171.6, 171.2, 171.0, 170.9, 170.3, 170.2, 170.1, 169.8, 169.7, 150.2, 130.4, 130.2, 115.7, 115.6, 71.2, 70.8, 68.5, 66.8, 66.7, 57.1, 54.0, 53.9, 49.3, 49.2, 38.0, 37.5, 37.1, 36.9, 36.8, 36.7, 36.6, 36.1, 31.1, 30.6, 30.4, 29.7, 29.6, 29.3, 25.0, 24.8, 24.6, 24.5, 24.5, 24.1, 23.6, 23.5, 23.4, 23.3, 23.3, 23.1, 22.6, 21.6, 21.5, 21.1, 21.1, 21.0, 20.8, 17.1, 15.7.
HRMS (ESI) m/z: 1141.6404 [(M+Na)+, вычислено для C60H90N6O14 Na: 1141.6413]
*Литература (Eur. J. Org. Chem., 2012, 1546-1553)
1H-ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ : 7.17-7.09 (m, 4 H, Ar-H), 6.86-6.77 (m, 4 H, Ar-H), 5.67-5.54 (m, 2 H, CαH-Lac), 5.53-5.38, 5.34, 5.19, 5.08 и 4.47 (5 m, 6 H, CαH-Leu, CαH-morphPhLac), 3.88-3.81 (псевдо-t, 8 H, OCH2морфолин), 3.15-3.08 (m, 8 H, N-CH2-morpholine), 3.07-2.85 (m, 4 H, CβH2-morphPhLac), 3.00, 2.83, 2.80, 2.74 и 2.73 (5 s, 12 H, NCH3), 1.83-1.20 (m, 18 H, CβH2-Leu, CγH-Leu, CH3-Lac), 1.05-0.77 (m, 30 H, CδH3-Leu, CβH3-Lac).
13C-ЯМР (100 МГц, CDCl3) δ : 171.7, 171.2, 171.0, 170.6, 170.4, 170.2, 169.8, 141.7, 130.6, 130.4, 116.9, 116.1, 71.3, 70.8, 68.6, 66.9, 66.6, 66.5, 57.1, 54.0, 49.9, 38.1, 37.5, 37.2, 36.7, 36.2, 31.2, 30.5, 29.4, 24.9, 24.7, 24.2, 23.6, 23.5, 23.5, 23.4, 21.2, 21.1, 20.9, 17.1, 15.8.
Эмодепсид (условие медленного добавления с применением T3P)
Отщепление TAGa: К перемешиваемому раствору линейного соединения с TAG (179.0 мг, 0.088 ммоль) в DCM (1.8 мл) добавляли TFA (1.8 мл) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 6 ч при комнатной температуре, раствор концентрировали в вакууме. Полученную смесь растворяли в толуоле (10 мл) и концентрировали при пониженном давлении 3 раза для удаления избытка TFA. Неочищенный остаток растворяли в CH2Cl2 (1.0 мл), затем перекристаллизовали для отщепления TAGa веществ посредством добавления MeOH (8.0 мл) при комнатной температуре. Осадки фильтровали через слой Celite® и промывали с помощью MeOH (20 мл). Объединенные фильтраты концентрировали в вакууме. К полученному продукту добавляли 4 M HCl/диоксан (0.05 M для продукта), затем разбавляли толуолом (10 мл) и концентрировали с получением соединения свободного от соли TFA продукта. Для удаления избытка HCl из неочищенного продукта, продукт снова разбавляли в толуоле (10 мл) и концентрировали при пониженном давлении 2 раза.
Циклизация: К перемешиваемому раствору T3P® (50% в EtOAc, 110 мкл, 0.187 ммоль) в DIPEA (110 мкл, 0.187 ммоль) добавляли по каплям неочищенное линейное соединение (0.088 ммоль) в DCM (1.8 мл, 0.05 M включая промывку) за 2.5 ч при комнатной температуре. После перемешивания в течение 20 ч при комнатной температуре, реакционную смесь гасили с помощью насыщенного водного NaHCO3(3.0 мл), экстрагировали с помощью CHCl3 (2.0 мл × 3). Объединенные органические слои высушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали в вакууме. Неочищенный остаток очистили посредством колоночной хроматографии на силикагеле (CHCl3/MeOH = 100/1) с получением эмодепсида (86.4 мг, 88%) в аморфном виде. Аналитические данные были идентичны данным для аутентичного соединения.
6. Получение эмодепсида (способ 2; см. реакционную схему на Фиг. 9)
N
-Fmoc
-N
-MeLeu-D-morphPhLac-O-TAGa
К перемешанному раствору соединения HO-TAGa (381 мг, 0.417 ммоль) в CH2Cl2 (8.4 мл) добавляли 0.2 M раствор в толуоле вещества 3 (2.71 мл, 0.542 ммоль), 4-диметиламинопиридин (2.5 мг, 20.8 мкмоль) и N,N’-дициклогексилкарбодиимид (129 мг, 0.626 ммоль) при комнатной температуре в атмосфере N2. После перемешивания в течение 1 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa, с получением соединения N -Fmoc -N -MeLeu-D-morphPhLac- O-TAGa (628 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления : 46-47°C
[α]D 27 = -3.1 (c 1.0, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.78 (d, J = 7.5 Гц, 1H), 7.74 (d, J = 7.5 Гц, 1H), 7.57 (m, 2H), 7.39 (m, 2H), 7.27 (m, 2H), 6.98 (d, J = 8.6 Гц, 1H), 6.96 (d, J = 8.6 Гц, 1H), 6.67 (m, 2H), 6.49 (2 s, ротамер 4:3, 2H), 5.17 (2 dd, ротамер, J = 4.0 Гц, 8.0 Гц, 1H), 5.08-4.98 (сложный m, 3H), 4.67-4.13 (сложный m, 3H), 3.93 (m, 6H), 3.73 (m, 4H), 3.08 (dd, J = 4.0 Гц, 14.6 Гц, 1H), 3,07-2.95 (сложный m, 5H), 2.80 (ротамер 4:3, 3H), 1.76 (m, 6H), 1.64-1.53 (сложный m, 3H), 1.45 (m, 6H), 1.28 (сложный m, 84H), 0.93-0.86 (сложный m, 14H), 0.76 (d, J = 6.3 Гц, 1H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z: 1495.1583 (M+, вычислено для C96H154N2O10 : 1495.1604)
N
-MeLeu-D-morphPhLac-O-TAGa (15)
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение N -Fmoc -N -MeLeu-D-morphPhLac-O-TAGa (628 мг, 0.417 ммоль) превращали в соединение 15 (530 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления : 49-50°C
[α]D 27 = +5.7 (c 1.0, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.08 (d, J = 8.6 Гц, 2H), 6.80 (d, J = 8.6 Гц, 2H), 6.51 (s, 2H), 5.24 (dd, J = 4.0, 9.7 Гц, 1H), 5.07 (q, J = 12.0 Гц, 2H), 3.94 (m, 6H), 3.85 (m, 4H), 3.18 (m, 2H), 3.10 (m, 4H), 3.00 (d, J = 10.3, 14.3 Гц, 1H), 2.21 (s, 3H), 1.76 (m, 6H), 1.47 (m, 6H), 1.34-1.25 (сложный m, 87H), 0.88 (t, J = 6.9 Гц, 9H), 0.80 (d, J = 6.9 Гц, 3H), 0.79 (d, J = 6.9 Гц, 3H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z : 1274.0986 [(M+H)+, вычислено для C81H145N2O8 : 1274. 1001]
N
-Fmoc
-N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-O-TAGa (16)
К перемешанному раствору соединения 15 (530 мг, 0.417 ммоль) в CH2Cl2 (8.4 мл) добавляли 0.2 M раствор в толуоле вещества 1 (0.22 мл, 0.44 ммоль), N,N-диизопропилэтиламин (0.212 мл, 1.25 ммоль) и PyBroP (291 мг, 0.62 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 16 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa, с получением соединения 16 (670 мг, 95%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления : 48-49°C
[α]D 27 = -12.4 (c 1.0, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.76 (m, 2H), 7.61 (m, 2H), 7.38 (m, 2H), 7.30 (m, 2H), 7.02 (m, 2H), 6.74 (m, 2H), 6.49 (2 s, ротамер, 2H), 5.38-5.22 (сложный m, 2H), 5.15-4.98 (сложный m, 4H), 4.47 (сложный m, 3H), 3.94 (m, 6H), 3.81 (m, 4H), 3.12-2.78 (сложный m, 12H), 1.82-1.56 (сложный m, 9H), 1.53-1.40 (сложный m, 8H), 1.34-1.26 (сложный m, 88H), 0.98-0.75 (сложный m, 21H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z: 1694.2828 (M+, вычислено для C106H171N3O13 : 1694.2812)
N
-Fmoc-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-OH (17)
После методики, описанной для общей методики отщепления TAGa, соединение 16 (376 мг, 0.222 ммоль) превращали в соединение 17. В случае этого субстрата, для реакции требовалось больше времени, чем в случае общего условия отщепления TAGa (около 1 ч). Реакцию соединения 16 в 50% TFA/CH2Cl2 при комнатной температуре необходимо перемешивать в течение 8 ч, чтобы израсходовать все исходное вещество, и получить продукт 17 (178 мг, 0.222 ммоль) в виде неочищенного масла, которое применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-O-TAGa (18)
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение 16 (290 мг, 0.171 ммоль) превращали в соединение 18 (251 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления : 43-45°C
[α]D 25 = -2.8 (c 1.0, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.07 (d, J = 8.6 Гц, 2H), 6.79 (d, J = 8.6 Гц, 2H), 6.49 (s, 2H), 5.46 (q, J = 6.9 Гц, 1H), 5.33 (dd, J = 5.2, 10.9 Гц, 1H), 5.17 (dd, J = 5.2, 7.5 Гц, 1H), 5.06 (m, 2H), 3.95 (m, 6H), 3.84 (m, 4H), 3.33 (t, J = 7.5 Гц, 1H), 3.11-3.06 (сложный m, 6H), 2.82 (2 s, ротамер 4:1, 3H), 2.40 (s, ротамер, 3H), 1.82-1.59 (сложный m, 10H), 1.52-1.43 (сложный m, 8H), 1.34-1.25 (сложный m, 87H), 0.97-0.86 (сложный m, 21H).
HRMS (FAB, NBA матрикс + NaI) m/z: 1473.2222 [(M+H)+, вычислено для C91H162N3O11 : 1473.2209]
N
-Fmoc-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-O-TAGa (19)
К перемешанному раствору соединения 18 (251 мг, 0.171 ммоль) в CH2Cl2 (3.4 мл) добавляли 17 (178 мг, 0.222 ммоль), N,N-диизопропилэтиламин (87 мкл, 0.513 ммоль) и PyBroP (120 мг, 0.257 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 46 ч, реакционную смесь кристаллизовали посредством методики, описанной в синтезе N -Fmoc -N -MeLeu-D-Lac-O-TAGa с получением соединения 19 (350 мг, 91%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления : 50-52°C
[α]D 25 = -25.5 (c 1.0, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.75 (m, 2H), 7.62 (m, 2H), 7.38 (m, 2H), 7.30 (m, 2H), 7.06 (m, 4H), 6.77 (m, 4H), 6.49 (2 s, ротамер, 2H), 5.42-4.98 (сложный m, 10H), 4.73-4.20 (сложный m, 3H), 3.94 (m, 6H), 3.84 (m, 8H), 3.17-2.66 (сложный m, 24H), 1.80-1.64 (сложный m, 14H), 1.46-1.25 (сложный m, 100H), 1.00-0.77 (сложный m, 33H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z: 2276.5940 [(M+Na)+, вычислено для C136H216N6O20Na : 2276.5967]
N-
MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D- morphPhLac-O-TAGa
После методики, описанной для общей методики удаления защитной группы Fmoc, соединение 19 (114 мг, 0.0505 ммоль) превращали в соответствующий амин (103 мг, 100%) в виде бесцветного порошка.
точка плавления : 45-47°C
[α]D 25 = -19.6 (c 1.0, CHCl3)
1H-ЯМР (500 МГц, CDCl3) δ : 7.76 (m, 4H), 6.79 (m, 4H), 6.48 (s, 2H), 5.50-4.96 (сложный m, 9H), 3.94 (m, 6H), 3.83 (m, 8H), 3.30 (m, 1H), 3.16-2.74 (сложный m, 21H), 2.38 (m, 3H), 1.80-1.55 (сложный m, 9H), 1.47-1.24 (сложный m, 105H), 1.00-0.81 (сложный m, 33H).
HRMS (FAB, NBA матрикс) m/z: 2032.5468 [(M+H)+, вычислено для C121H207N6O18 : 2032.5467]
N-
MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D-morphPhLac-
N
-MeLeu-D-Lac-
N
-MeLeu-D- morphPhLac-OH
После методики, описанной для общей методики отщепления TAGa, соединение, N- MeLeu-D-Lac- N -MeLeu-D-morphPhLac- N -MeLeu-D-Lac- N -MeLeu-D-morph- PhLac-O-TAGa (102 мг, 0.0502 ммоль) превращали в соответствующую карбоновую кислоту. В случае этого субстрата, для реакции требовалось больше времени, чем в случае общего условия отщепления TAGa (около 1 ч). Реакцию в 50% TFA/CH2Cl2 при комнатной температуре было необходимо перемешивать в течение 5 ч, чтобы израсходовать все исходное вещество, и получить желаемый продукт (~0.0502 ммоль) в виде неочищенного масла, которое применяли на следующей стадии без дальнейшей очистки.
Эмодепсид
К неочищенной карбоновой кислоте (~0.0502 ммоль) в CH2Cl2 (10 мл, 0.005 M) добавляли N,N-диизопропилэтиламин (60 мкл, 0.351 ммоль) и PyBOP (52 мг, 0.175 ммоль) при комнатной температуре. После перемешивания в течение 44 ч, реакционную смесь гасили посредством насыщенного водного NaHCO3 (10 мл) при 0°C, и эту смесь экстрагировали с помощью CHCl3 (20 мл × 3). Объединенные органические слои промывали с помощью 10% водного NaHSO4 (60 мл) и солевого раствора (60 мл), высушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Неочищенный продукт очищали посредством колоночной хроматографии на силикагеле (CHCl3 : MeOH = 400 : 1 - 100 : 1) с получением эмодепсида (25 мг, 44% для 2 стадий) в виде твердого вещества светло-коричневого цвета.
Все физические данные для синтетического эмодепсида совпадают с данным для аутентичного соединения.
Сравнительный пример 1
TAG, аналогичную TAGa, но с C12 вместо C18 алкильных цепей (C12-TAG), получали и связывали с N-Fmoc-N-MeLeu-D-Lac-OH (вещество 1) согласно следующей схеме реакции:
Очистка с помощью хроматографии на силикагеле была необходима после каждой стадии реакции. Соединения 2, C12-TAG и соединение 3 не кристаллизуются в метаноле. Это является отличием, например, от методики синтеза N-Fmoc-N-MeLeu-D-Lac-O-TAGa (часть 2.1 выше). C12-TAG в этом сравнительном примере не подходит для предполагаемого синтеза с помощью группы TAG, и дальнейшая функционализация соединения 3 в дальнейшем не исследовалась.
Сравнительный пример 2
Коммерчески доступный C1-TAG связывали с N-Fmoc-N-MeLeu-D-Lac-OH (вещество 1) согласно следующей схеме реакции:
Очищение посредством колоночной хроматографии было необходимо после стадии реакции. Соединения C1-TAG и 6 не кристаллизуются в метаноле. C1-TAG в этом сравнительном примере не подходит для предполагаемого синтеза с помощью группы TAG, и дальнейшая функционализация соединения 6 дополнительно не исследовалась.
Claims (122)
1. Способ синтеза циклических депсипептидов общей формулы (I) в промышленном масштабе из депсипептидов общей формулы (II):
где B представляет собой защитную группу аминной группы и A представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты,
причем способ включает стадии:
- удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой B, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- удаления защитной группы карбоновой кислоты, которая защищена группой A, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты с помощью связывающего агента, при этом связывающий агент добавляют медленно, предпочтительно по каплям, в реакционный раствор, получая таким образом циклический депсипептид (I),
причем R2 и R8, каждый, независимо друг от друга представляют собой водород, неразветвленный или разветвленный C1-C8-алкил, в частности метил, этил, пропил, изопропил, бутил, изобутил, втор-бутил, трет-бутил, пентил, изопентил, втор-пентил, гексил, изогексил, втор-гексил, гептил, изогептил, втор-гептил, трет-гептил, октил, изооктил, втор-октил, неразветвленный или разветвленный галогенированный C1-C8 алкил, в частности фторированный втор-бутил, гидрокси-C1-C6-алкил, в частности гидроксиметил, 1-гидроксиэтил, C1-C4-алканоилокси-C1-C6-алкил, в частности ацетоксиметил, 1-ацетоксиэтил, C1-C4-алкокси-C1-C6-алкил, в частности метоксиметил, 1-метоксиэтил, арил-C1-C4-алкилокси-C1-C6-алкил, в частности бензилоксиметил, 1-бензилоксиэтил, меркапто-C1-C6-алкил, в частности меркаптометил, C1-C4-алкилтио-C1-C6-алкил, в частности метилтиоэтил, C1-C4-алкилсульфинил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфинилэтил, C1-C4-алкилсульфонил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфонилэтил, карбокси-C1-C6-алкил, в частности карбоксиметил, карбоксиэтил, C1-C4-алкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности метоксикарбонилметил, этоксикарбонилэтил, C1-C4-арилалкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности бензилоксикарбонилметил, карбамоил-C1-C6-алкил, в частности карбамоилметил, карбамоилэтил, амино-C1-C6-алкил, в частности аминопропил, аминобутил, C1-C4-алкиламино-C1-C6-алкил, в частности метиламинопропил, метиламинобутил, C1-C4-диалкиламино-C1-C6-алкил, в частности диметиламинопропил, диметиламинобутил, гуанидино-C1-C6-алкил, в частности гуанидинопропил, C1-C4-алкоксикарбониламино-C1-C6-алкил, в частности трет-бутоксикарбониламинопропил, трет-бутоксикарбониламинобутил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)амино-C1-C6-алкил, в частности 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминопропил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминобутил, C2-C8-алкенил, в частности винил, аллил, бутенил, C3-C7-циклоалкил, в частности циклопентил, циклогексил, циклогептил, C3-C7-циклоалкил-C1-C4-алкил, в частности циклопентилметил, циклогексилметил, циклогептилметил, бензил, замещенный бензил, фенил, фенил-C1-C4-алкил, в частности фенилметил, который может быть необязательно замещен радикалами из группы, состоящей из галогена, в частности фтора, хлора, брома или иода,
где x представляет собой 1, y представляет собой 1, R1, R4, R7 и R10 представляют собой метил, R6 и R12 представляют собой метил, R5 и R11 представляют собой, независимо друг от друга, неразветвленный или разветвленный C1-C4-алкил или неразветвленный или разветвленный галогенированный C1-C4-алкил и R3 и R9 представляют собой, независимо друг от друга, бензил или п-морфолино-замещенный бензил и
где связывающий агент представляет собой T3P® (ангидрид пропилфосфоновой кислоты, 2,4,6-трипропил-1,3,5,2,4,6-триоксатрифосфоринан-2,4,6-триоксид, PPACA).
2. Способ по п. 1, причем циклические депсипептиды общей формулы (I) синтезируют из депсипептидов общей формулы (IIa):
где Y представляет собой защитную группу аминной группы и X представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты,
причем способ включает стадии:
- удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой Y, в присутствии кислоты, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- удаления защитной группы группы карбоновой кислоты, которая защищена группой X, посредством гидрогенолиза, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты, получая таким образом циклический депсипептид (I).
3. Способ по п. 1 или 2, причем X представляет собой замещенную или незамещенную -CH2-арильную группу.
4. Способ по любому из пп. 1-3, причем X выбран из группы бензила (Bn), 4-метокси-бензила (PMB), 3,4-диметоксибензила (DPMB), 4-фенил-бензила (PPB), 2-нафтилметила (Nap), бензилоксиметилацеталя (BOM).
5. Способ по любому из пп. 1-4, причем Y представляет собой трет-бутилоксикарбонил (BOC).
6. Способ по любому из пп. 1-5, где депсипептид общей формулы (IIa) получают из предшественников общих формул (IV) и (III):
посредством:
- в предшественнике (IV), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG2, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- в предшественнике (III), удаления защитной группы группы карбоновой кислоты, которая защищена группой PG3, в присутствии кислоты, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты, получая таким образом депсипептид (II);
где R1-R12, X, Y, x и y имеют значения, как определено в любом из пп. 1-3, PG2 представляет собой защитную группу аминной группы и PG3 представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты.
7. Способ по любому из пп. 1-6, где предшественник общей формулы (IV) получают из предшественников общих формул (VI) и (V):
посредством:
- в предшественнике (VI), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG4, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- конденсации незащищенной аминной группы предшественника (VI) и группы карбоновой кислоты предшественника (V), получая таким образом предшественник (IV);
где R7-R12, X и x имеют значения, как определено выше, PG2 имеет значение, как определено выше, и PG4 представляет собой защитную группу аминной группы, причем способы удаления защитной группы и конденсации могут быть такими же, как указано в отношении реакции соединений (II)-(I) выше.
8. Способ по любому из пп. 1-7, где предшественник общей формулы (III) получают из предшественников общих формул (VIII) и (VII):
посредством:
- в предшественнике (VII), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG5, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- конденсации незащищенной аминной группы предшественника (VII) и группы карбоновой кислоты предшественника (VIII), получая таким образом предшественник (III);
где R1-R6 и y имеют значения, как определено в любом из пп. 1-3, PG3 имеет значение, как определено в п. 3, PG1 и PG5 представляют собой защитные группы аминной группы.
9. Способ по любому из пп. 1-8, где предшественник общей формулы (VI) получают в результате эстерификации предшественника общей формулы (IX) с X-LG:
где R10-R12 и X имеют значения, как определено в п. 1 или 2, PG4 имеет значение, как определено в п. 7, и LG представляет собой уходящую группу.
10. Способ по любому из пп. 1-9, где предшественник общей формулы (VII) получают в результате эстерификации предшественника общей формулы (X) с PG3-OH:
где R4-R6 и y имеют значения, как определено в п. 1, PG3 имеет значение, как определено в п. 6, и PG5 имеет значение, как определено в п. 8.
11. Способ по любому из пп. 1-10, где PG3 представляет собой X.
12. Способ по любому из пп. 1-11, где предшественники (III) и (IV) являются идентичными.
13. Способ по любому из пп. 1-12, где R3 и R9 являются идентичными, R2 и R8 являются идентичными, R5 и R11 являются идентичными.
14. Способ по п. 1, включающий стадию синтеза циклических депсипептидов общей формулы (I) из депсипептидов общей формулы (IIb):
где PG1 представляет собой защитную группу аминной группы и TAG представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты,
причем способ включает стадии:
- удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG1, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- удаления защитной группы группы карбоновой кислоты, которая защищена группой TAG, в присутствии кислоты, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты, получая таким образом циклический депсипептид (I);
отличающийся тем, что группа TAG представляет собой:
или ,
при этом m представляет собой от ≥15 до ≤25, p представляет собой от ≥8 до ≤18 и q представляет собой от ≥15 до ≤25.
15. Способ по п. 14, где PG1 представляет собой 9-флуоренилметоксикарбонил (Fmoc), трет-бутилкарбамат (Boc), бензилкарбамат (Z), ацетамид, трифторацетамид, фталимид, бензил (Bn), трифенилметил (Tr), бензилиден или п-толуолсульфонамид (Ts).
16. Способ по п. 14 или 15, где депсипептид общей формулы (IIb) получают из предшественников общих формул (IVb) и (IIIb):
посредством:
- в предшественнике (IVb), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG2, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- в предшественнике (IIIb), удаления защитной группы группы карбоновой кислоты, которая защищена группой PG3, в присутствии кислоты, получая таким образом незащищенную группу карбоновой кислоты;
- конденсации незащищенной аминной группы и незащищенной группы карбоновой кислоты, получая таким образом депсипептид (IIb);
где R1-R12, x и y имеют значения, как определено в п. 1, PG1 имеет значение, как определено в п. 8, TAG имеет значение, как определено в п. 14, и PG2 и PG3 имеют значение, как определено в п. 6.
17. Способ по любому из пп. 14-16, где предшественник общей формулы (IVb) получают из предшественников общих формул (VIb) и (Vb):
посредством:
- в предшественнике (VIb), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG4, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- конденсации незащищенной аминной группы предшественника (VIb) и группы карбоновой кислоты предшественника (Vb), получая таким образом предшественник (IVb);
где R7-R12 и x имеют значения, как определено в п. 1, TAG имеет значение, как определено в п. 14, PG2 имеет значение, как определено в п. 6, и PG4 имеет значение, как определено в п. 7.
18. Способ по любому из пп. 14-17, где предшественник общей формулы (IIIb) получают из предшественников общих формул (VIIIb) и (VIIb):
посредством:
- в предшественнике (VIIb), удаления защитной группы аминной группы, которая защищена группой PG5, в присутствии основания, получая таким образом незащищенную аминную группу;
- конденсации незащищенной аминной группы предшественника (VIIb) и группы карбоновой кислоты предшественника (VIIIb), получая таким образом предшественник (IIIb);
где R1-R6 и y имеют значения, как определено в п. 1, PG1 и PG5 имеют значение, как определено в п. 8, и PG3 имеет значение, как определено в п. 6.
19. Способ по любому из пп. 14-18, где предшественник общей формулы (VIb) получают в результате эстерификации предшественника общей формулы (IXb) с TAG-OH:
где R10-R12 имеют значения, как определено в п. 1, TAG имеет значение, как определено в п. 14, и PG4 имеет значение, как определено в п. 7.
20. Способ по любому из пп. 14-19, где предшественник общей формулы (VIIb) получают в результате эстерификации предшественника общей формулы (Xb) с PG3-OH:
где R4-R6 и y имеют значения, как определено в п. 1, PG3 имеет значение, как определено в п. 6, и PG5 имеет значение, как определено в п. 8.
21. Способ по любому из пп. 14-20, где PG3 представляет собой TAG, как определено в п. 14.
22. Способ по любому из пп. 14-21, где по меньшей мере одна стадия реакции из стадий реакции, приводящих к получению TAG-несущей молекулы, сопровождается осаждением неочищенного продукта реакции в метаноле, таким образом очищая неочищенный продукт реакции.
23. Способ по любому из пп. 14-21, где по меньшей мере одна стадия из стадий реакции, в которых TAG-защищенные группы карбоновой кислоты подвергают удалению защитной группы, сопровождается осаждением отщепленного TAG-OH в метаноле и удалением осадка посредством фильтрации, таким образом очищая неочищенный продукт реакции.
24. Способ по любому из пп. 1-23, где депсипептид (II) выбран из одной из общих формул (II-1)-(II-6b):
,
где B представляет собой защитную группу аминной группы, A представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты, Y представляет собой защитную группу аминной группы, удаляемую в присутствии кислоты, X представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты, удаляемую посредством гидрогенолиза, PG1 представляет собой защитную группу аминной группы и TAG имеет значение, как определено в п. 14.
25. Способ синтеза циклических депсипептидов общей формулы (I) в промышленном масштабе из депсипептидов общей формулы (IIc):
включающий стадии
обеспечения смеси соединения (IIc) и основания в растворителе, имеющем значение ET(30) от ≥30 до ≤43,
медленно, предпочтительно по каплям, добавления раствора связывающего агента в растворителе с образованием циклического депсипептида (I),
причем R2 и R8, каждый независимо друг от друга, представляет собой водород, неразветвленный или разветвленный C1-C8-алкил, в частности метил, этил, пропил, изопропил, бутил, изобутил, втор-бутил, трет-бутил, пентил, изопентил, втор-пентил, гексил, изогексил, втор-гексил, гептил, изогептил, втор-гептил, трет-гептил, октил, изооктил, втор-октил, неразветвленный или разветвленный галогенированный C1-C8 алкил, в частности фторированный втор-бутил, гидрокси-C1-C6-алкил, в частности гидроксиметил, 1-гидроксиэтил, C1-C4-алканоилокси-C1-C6-алкил, в частности ацетоксиметил, 1-ацетоксиэтил, C1-C4-алкокси-C1-C6-алкил, в частности метоксиметил, 1-метоксиэтил, арил-C1-C4-алкилокси-C1-C6-алкил, в частности бензилоксиметил, 1-бензилоксиэтил, меркапто-C1-C6-алкил, в частности меркаптометил, C1-C4-алкилтио-C1-C6-алкил, в частности метилтиоэтил, C1-C4-алкилсульфинил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфинилэтил, C1-C4-алкилсульфонил-C1-C6-алкил, в частности метилсульфонилэтил, карбокси-C1-C6-алкил, в частности карбоксиметил, карбоксиэтил, C1-C4-алкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности метоксикарбонилметил, этоксикарбонилэтил, C1-C4-арилалкоксикарбонил-C1-C6-алкил, в частности бензилоксикарбонилметил, карбамоил-C1-C6-алкил, в частности карбамоилметил, карбамоилэтил, амино-C1-C6-алкил, в частности аминопропил, аминобутил, C1-C4-алкиламино-C1-C6-алкил, в частности метиламинопропил, метиламинобутил, C1-C4-диалкиламино-C1-C6-алкил, в частности диметиламинопропил, диметиламинобутил, гуанидино-C1-C6-алкил, в частности гуанидинопропил, C1-C4-алкоксикарбониламино-C1-C6-алкил, в частности трет-бутоксикарбониламинопропил, трет-бутоксикарбониламинобутил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)амино-C1-C6-алкил, в частности 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминопропил, 9-флуоренилметоксикарбонил(Fmoc)аминобутил, C2-C8-алкенил, в частности винил, аллил, бутенил, C3-C7-циклоалкил, в частности циклопентил, циклогексил, циклогептил, C3-C7-циклоалкил-C1-C4-алкил, в частности циклопентилметил, циклогексилметил, циклогептилметил, бензил, замещенный бензил, фенил, фенил-C1-C4-алкил, в частности фенилметил, который может быть необязательно замещен радикалами из группы, состоящей из галогена, в частности фтора, хлора, брома или иода,
где x представляет собой 1, y представляет собой 1, R1, R4, R7 и R10 представляют собой метил, R6 и R12 представляют собой метил, R5 и R11 представляют собой, независимо друг от друга, неразветвленный или разветвленный C1-C4-алкил или неразветвленный или разветвленный галогенированный C1-C4-алкил и R3 и R9 представляют собой, независимо друг от друга, бензил или замещенный бензил и
где связывающий агент представляет собой T3P® (ангидрид пропилфосфоновой кислоты, 2,4,6-трипропил-1,3,5,2,4,6-триоксатрифосфоринан-2,4,6-триоксид, PPACA).
26. Способ по п. 25, причем значение ET(30) растворителя составляет от ≥34 до ≤39.
27. Способ по п. 25 или 26, причем добавление раствора связывающего агента проводят при скорости ≤2 (мол)% в минуту.
28. Способ по любому из пп. 25-27, причем соотношение основания и соединения (IIb) перед реакцией (в моль:моль) составляет от ≥2:1 до ≤10:1.
29. Способ по любому из пп. 25-28, причем соотношение связывающего агента и соединения (IIb) перед реакцией (в моль:моль) составляет от ≥1:1 до ≤5:1.
30. Способ по любому из пп. 25-29, причем в ходе добавления связывающего агента поддерживают температуру ≤25°C.
31. Линейный депсипептид, выбранный из одной из общих формул (II-1)-(II-6), или его фармацевтически или ветеринарно приемлемая соль:
где B представляет собой защитную группу аминной группы, A представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты, Y представляет собой защитную группу аминной группы, удаляемую в присутствии кислоты, и X представляет собой защитную группу группы карбоновой кислоты, удаляемую посредством гидрогенолиза, PG1 представляет собой защитную группу аминной группы и TAG имеет значение, как определено в п. 14.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP17200415.2 | 2017-11-07 | ||
CN201811254536.0 | 2018-10-25 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2817013C1 true RU2817013C1 (ru) | 2024-04-09 |
Family
ID=
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2015093558A1 (ja) * | 2013-12-18 | 2015-06-25 | Meiji Seikaファルマ株式会社 | 環状デプシペプチド誘導体およびそれを含んでなる有害生物防除剤 |
RU2015100521A (ru) * | 2012-06-13 | 2016-08-10 | Мейдзи Сейка Фарма Ко., Лтд. | Новые циклические депсипептидные производные и средства для борьбы с вредными организмами, включающие такие производные |
WO2016187534A1 (en) * | 2015-05-20 | 2016-11-24 | Merial, Inc. | Anthelmintic depsipeptide compounds |
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2015100521A (ru) * | 2012-06-13 | 2016-08-10 | Мейдзи Сейка Фарма Ко., Лтд. | Новые циклические депсипептидные производные и средства для борьбы с вредными организмами, включающие такие производные |
WO2015093558A1 (ja) * | 2013-12-18 | 2015-06-25 | Meiji Seikaファルマ株式会社 | 環状デプシペプチド誘導体およびそれを含んでなる有害生物防除剤 |
WO2016187534A1 (en) * | 2015-05-20 | 2016-11-24 | Merial, Inc. | Anthelmintic depsipeptide compounds |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Yohei Okada et al "Tag-Assisted Liquid-Phase Peptide Synthesis Using HydrophobicBenzyl Alcohols as Supports", J. Org. Chem. 2013, v.78, 320−327. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EP0685469A1 (en) | Pf1022 derivative, cyclic depsipeptide | |
AU2013328284B2 (en) | Solution phase processes for the manufacture of macrocyclic depsipeptides and new intermediates | |
US9434762B2 (en) | Macrocyclic cysteine protease inhibitors and compositions thereof | |
JP2024009021A (ja) | 環状デプシペプチドを合成する方法 | |
US20220002348A1 (en) | Tailored cyclodepsipeptides as potent non-covalent serine protease inhibitors | |
RU2817013C1 (ru) | Способ синтеза циклических депсипептидов | |
WO2016179398A1 (en) | Isoform-selective lysine deacetylase inhibitors | |
EP2975046A1 (en) | Novel compounds | |
AU666789B2 (en) | 2-amino-6,7-dihydroxy-4-thiaheptanoic acid derivatives, production and use thereof | |
EP3480195A1 (en) | Method for the synthesis of cyclic depsipeptides | |
JP5947821B2 (ja) | セレウリドおよびその誘導体の製造方法、セレウリド製造の為の中間体ならびにセレウリド誘導体 | |
WO2015117094A1 (en) | Compositions and methods for synthesizing (2s,3s)-trans-epoxysuccinyl-l-leucyl-amido-3-methylbutane ethyl ester | |
GB2460180A (en) | Spiruchostatin analogues and their therapeutic use | |
JP6605201B2 (ja) | 糖アミノ酸誘導体または糖ペプチド誘導体の製造方法 | |
Rane et al. | Novel high yielding route for the synthesis of Melphalan dimer impurity G | |
JPH08109180A (ja) | O→n分子内アシル転位型プロドラッグ | |
KR20190043031A (ko) | 아마톡신 유도체 및 이의 제조방법 | |
AU2003236614A1 (en) | N-methyl amino acids |