RU2804815C2 - Combinations of antibodies to staphylococcus aureus - Google Patents

Combinations of antibodies to staphylococcus aureus Download PDF

Info

Publication number
RU2804815C2
RU2804815C2 RU2021112346A RU2021112346A RU2804815C2 RU 2804815 C2 RU2804815 C2 RU 2804815C2 RU 2021112346 A RU2021112346 A RU 2021112346A RU 2021112346 A RU2021112346 A RU 2021112346A RU 2804815 C2 RU2804815 C2 RU 2804815C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
antibody
amino acid
acid sequence
aureus
binding fragment
Prior art date
Application number
RU2021112346A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2021112346A (en
Inventor
Кристин ТКАЧИК
Брет СЕЛЛМАН
Цюнь ДУ
Мелисса ДАМШРОДЕР
Тэйлор КОЭН
Original Assignee
МЕДИММЬЮН, ЭлЭлСи
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by МЕДИММЬЮН, ЭлЭлСи filed Critical МЕДИММЬЮН, ЭлЭлСи
Publication of RU2021112346A publication Critical patent/RU2021112346A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2804815C2 publication Critical patent/RU2804815C2/en

Links

Images

Abstract

FIELD: pharmaceuticals; medicine.
SUBSTANCE: objects 1 and 2 are the methods of treating or preventing a Staphylococcus aureus (S. aureus) infection in an individual, comprising administering to the individual an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin, and the antibody or antigen-binding fragment thereof that bind to S. aureus alpha toxin (AT), and/or an antibody or antigen-binding fragment thereof that bind to S. aureus clumping factor A (ClfA). objects 3 and 4 objects are compositions for the treatment or prevention of infection caused by S. aureus in an individual, containing the above antibodies. objects 5–7 — the use of one of the above antibodies or their antigen-binding fragments for the preparation of a drug for the treatment or prevention of infection caused by S. aureus in an individual, in combination with other antibodies above.
EFFECT: technical result is to provide a wide coverage of strains for the treatment or prevention of infection caused by S. aureus in an individual, a combination of antibodies that target several different bacterial virulence factors through a complementary mechanism of action.
87 cl, 17 dwg, 7 tbl, 11 ex

Description

ПРЕДПОСЫЛКИ ИЗОБРЕТЕНИЯ BACKGROUND OF THE INVENTION

[0001] Инфекции, вызываемые бактериальными патогенами, устойчивыми к противомикробным препаратам (AMR), представляют собой растущую угрозу для здоровья населения. Текущая эпидемия, вызываемая AMR-патогенами, частично вызвана эмпирической терапией антибиотиками широкого спектра действия. Это привело к исследованию способов, специфических в отношении патогенов, включая применение моноклональных антител (mAb), для предотвращения или лечения серьезных бактериальных инфекций. В настоящее время множество моноклональных антител находится на стадии разработки для предупреждения или лечения антибиотикорезистентных бактериальных инфекций (см., например, DiGiandomenico, A., and B.R. Sellman, Curr. Opin. Microbiol., 27: 78-85, (2015)). Такие стратегии пассивной иммунизации обеспечивают немедленный и мощный иммуноглобулиновый ответ против целевого патогена. В идеале моноклональное антитело или смесь моноклональных антител обеспечивают несколько механизмов действия для нейтрализации ключевых механизмов бактериальной вирулентности и усиления врожденного иммунного ответа хозяина, обеспечивая тем самым наибольшую возможность для достижения клинического успеха.[0001] Infections caused by antimicrobial resistant (AMR) bacterial pathogens pose a growing threat to public health. The current epidemic caused by AMR pathogens is driven in part by empiric broad-spectrum antibiotic therapy. This has led to the investigation of pathogen-specific approaches, including the use of monoclonal antibodies (mAbs), to prevent or treat serious bacterial infections. Currently, a variety of monoclonal antibodies are under development for the prevention or treatment of antibiotic-resistant bacterial infections (see, for example, DiGiandomenico, A., and BR Sellman, Curr. Opin. Microbiol ., 27 : 78-85, (2015)). Such passive immunization strategies provide an immediate and potent immunoglobulin response against the target pathogen. Ideally, a monoclonal antibody or mixture of monoclonal antibodies provides multiple mechanisms of action to neutralize key mechanisms of bacterial virulence and enhance the host innate immune response, thereby providing the greatest opportunity for clinical success.

[0002] Staphylococcus aureus представляет собой бактериальный патоген, вызывающий широкий спектр заболеваний, включая инфекции кожи и мягких тканей, эндокардит, остеомиелит, пневмонию и бактериемию (Lowy, FD, N. Engl. J. Med., 339 (8): 520-32 (1998)). Доклинические исследования показывают, что подходы на основе моноклональных антител являются перспективными для профилактики и дополнительной терапии инфекций, вызванных S. aureus (см., например, Hazenbos et al., PLoS Pathog., 9(10):e1003653. doi: 10.1371/journal.ppat.10036532013 (2013); Rouha, H., MAbs, 7(1): 243-254 (2015); Foletti et al., J. Mol. Biol., 425(10): 1641-1654 (2013); Karauzum et al., J Biol Chem., 287(30): 25203-15 (2012); and Hua et al., Antimicrob Agents Chemother., 58(2): 1108-17 (2014)). Однако лечения отдельными антителами может быть недостаточно для борьбы со всеми инфекциями, вызываемыми Staphylococcus aureus. Таким образом, остается потребность в композициях и способах для лечения инфекций, вызываемых Staphylococcus aureus, в частности инфекций, резистентных к существующим в настоящее время антибиотикам, которые обеспечивают широкий охват заболеваний и штаммов. В настоящем изобретении представлены такие композиции и способы.[0002] Staphylococcus aureus is a bacterial pathogen that causes a wide range of diseases, including skin and soft tissue infections, endocarditis, osteomyelitis, pneumonia and bacteremia (Lowy, FD, N. Engl. J. Med ., 339 (8): 520- 32 (1998)). Preclinical studies indicate that monoclonal antibody approaches are promising for the prevention and adjunctive therapy of S. aureus infections (see, e.g., Hazenbos et al., PLoS Pathog ., 9 (10):e1003653. doi: 10.1371/journal .ppat.10036532013 (2013); Rouha, H., MAbs , 7 (1): 243-254 (2015); Foletti et al., J. Mol. Biol ., 425 (10): 1641-1654 (2013) ; Karauzum et al., J Biol Chem ., 287 (30): 25203-15 (2012); and Hua et al., Antimicrob Agents Chem ., 58 (2): 1108-17 (2014)). However, single antibody treatment may not be sufficient to combat all Staphylococcus aureus infections. Thus, there remains a need for compositions and methods for treating infections caused by Staphylococcus aureus , particularly infections resistant to currently available antibiotics that provide broad disease and strain coverage. The present invention provides such compositions and methods.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯBRIEF DESCRIPTION OF THE INVENTION

[0003] В данном документе показано, что комбинации антител, которые нацеливаются на несколько различных факторов бактериальной вирулентности посредством комплементарного механизма действия, могут обеспечить широкий охват штаммов и широкий охват заболеваний. Иллюстративные модели на животных, обеспечивающие широту охвата штаммов и заболеваний, охватываемых комбинациями антител, представленных в данном документе, показаны на фигуре 1. [0003] This document shows that combinations of antibodies that target several different bacterial virulence factors through a complementary mechanism of action can provide broad strain coverage and broad disease coverage. Exemplary animal models providing the breadth of strains and diseases covered by the antibody combinations presented herein are shown in Figure 1.

[0004] В данном документе представлены способы лечения или предотвращения инфекции, вызываемой Staphylococcus aureus (S. aureus), у субъекта, включающие введение субъекту (а) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с альфа-токсином (AT) S. aureus, (b) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с фактором слипания A (ClfA) S. aureus, и (c) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus.[0004] Provided herein are methods of treating or preventing Staphylococcus aureus ( S. aureus ) infection in a subject, comprising administering to the subject(s) an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to S. aureus alpha toxin (AT). (b) an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus clumping factor A (ClfA), and (c) an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin.

[0005] В данном документе также представлены способы лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, у субъекта, включающие введение субъекту антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, и (a) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с альфа-токсином (AT) S. aureus, или (b) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с фактором слипания A (ClfA) S. aureus.[0005] Also provided herein are methods of treating or preventing S. aureus infection in a subject, comprising administering to the subject an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin, and (a) the antibody or an antigen-binding fragment that binds to S. aureus alpha-toxin (AT), or (b) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus clumping factor A (ClfA).

[0006] В данном документе также предусмотрены композиции, содержащие (a) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT S. aureus, (b) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, и (c) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus.[0006] Also provided herein are compositions comprising (a) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT, (b) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA, and (c) an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin.

[0007] В данном документе также представлены композиции, содержащие антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, и (a) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT S. aureus, или (b) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus.[0007] Also provided herein are compositions comprising an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin, and (a) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT, or (b ) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA.

[0008] В определенных случаях композиция предназначена для применения в лечении или предотвращении у субъекта инфекции, вызываемой S. aureus.[0008] In certain instances, the composition is for use in treating or preventing a S. aureus infection in a subject.

[0009] В данном документе также представлены антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связываются с AT S. aureus, для применения в лечении или предотвращении у субъекта инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с ClfA S. aureus, и антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus. [0009] Also provided herein are antibodies and antigen binding fragments thereof that bind to S. aureus AT, for use in treating or preventing a subject from S. aureus infection, in combination with an antibody or antigen binding fragment thereof that binds ClfA S. aureus , and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin.

[0010] В данном документе также представлены антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связываются с ClfA S. aureus, для применения в лечении или предотвращении у субъекта инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с AT S. aureus, и антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus. [0010] Also provided herein are antibodies and antigen binding fragments thereof that bind to S. aureus ClfA for use in treating or preventing a subject from S. aureus infection, in combination with an antibody or antigen binding fragment thereof that binds AT S. aureus , and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin.

[0011] В данном документе также представлены антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, для применения в лечении или предотвращении у субъекта инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с AT S. aureus, и/или антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с ClfA S. aureus. [0011] Also provided herein are antibodies and antigen-binding fragments thereof that bind to at least one S. aureus leukotoxin, for use in the treatment or prevention of S. aureus infection in a subject, in combination with an antibody or antigen-binding fragment thereof, that bind to S. aureus AT, and/or an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA.

[0012] В определенных случаях композиция применяется в получении лекарственного препарата, предназначенного для лечения или предотвращения у субъекта инфекции, вызываемой S. aureus. [0012] In certain cases, the composition is used in the preparation of a medicinal product intended to treat or prevent an infection caused by S. aureus in a subject.

[0013] В данном документе также представлены варианты применения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с AT S. aureus, в получении лекарственного препарата, предназначенного для лечения или предотвращения у субъекта инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с ClfA S. aureus, и антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus. [0013] Also provided herein are embodiments of the use of an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to the AT of S. aureus in the preparation of a medicament intended to treat or prevent an infection caused by S. aureus in a subject in combination with an antibody or antigen-binding fragment thereof. a fragment that binds to S. aureus ClfA, and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin.

[0014] В данном документе также представлены варианты применения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с ClfA S. aureus, в получении лекарственного препарата, предназначенного для лечения или предотвращения у субъекта инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с AT S. aureus, и антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus. [0014] Also provided herein are embodiments of the use of an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA in the preparation of a medicament intended to treat or prevent an S. aureus infection in a subject in combination with an antibody or antigen-binding fragment thereof. a fragment that binds to S. aureus AT, and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin.

[0015] В данном документе также представлены варианты применения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, в получении лекарственного препарата, предназначенного для лечения или предотвращения у субъекта инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с AT S. aureus, и/или антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с ClfA S. aureus. [0015] Also provided herein are embodiments of the use of an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin in the preparation of a medicament for treating or preventing an S. aureus infection in a subject, in combination with an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT, and/or an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA.

[0016] В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, связываются с тем же эпитопом АТS. aureus, что и антитело, содержащее VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:19, и VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:33. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, конкурентно подавляют связывание антитела, содержащего VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:19, и VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:33, с АТ S. aureus. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат определяющую комплементарность область (CDR) 1 вариабельной области тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:1, CDR2 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:2, CDR3 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:3, CDR1 вариабельной области легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:10, CDR2 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:11, и CDR3 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:12. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:19. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:33. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:47. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:52. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL MEDI4893. В определенных случаях CDR представляют собой CDR, определенные по Кабату, CDR, определенные по Чотиа, или CDR, определенные по AbM. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, дополнительно содержат константную область тяжелой цепи. В определенных случаях константная область тяжелой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей тяжелой цепи человеческого иммуноглобулина IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2. В определенных случаях константная область тяжелой цепи представляет собой константную область человеческого IgG1. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, дополнительно содержат константную область легкой цепи. В определенных случаях константная область легкой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей легкой цепи человеческого иммуноглобулина IgGκ и IgGλ. В определенных случаях константная область легкой цепи представляет собой константную область легкой цепи человеческого IgGκ. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, представляют собой антитело класса IgG или его антигенсвязывающий фрагмент. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. Aureus, содержат Fc-область, которая была сконструирована для увеличения времени полужизни. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат Fc-область с мутацией YTE. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, представляют собой моноклональное антитело или антигенсвязывающий фрагмент. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, представляют собой полноразмерное антитело. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит Fab, Fab', F(ab')2, одноцепочечный Fv (scFv), связанный дисульфидной связью Fv, интраантитело, IgGΔCH2, миниантитело, F(ab')3, тетраантитело, триантитело, диантитело, DVD-Ig, Fcab, mAb2, (scFv)2 или scFv-Fc. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, характеризуются аффинностью по отношению к АТ S. aureus, составляющей 80-100 пM. [0016] In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use provided herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to a S. aureus AT binds to the same epitope of the S. aureus AT as the antibody , containing VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:19, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:33. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to a S. aureus AT competitively inhibits the binding of an antibody comprising a VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:19 and a VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:33 to the AT S. aureus . In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT contains a heavy chain variable region (VH) complementarity determining region (CDR) 1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, VH CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:2, CDR3 VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:3, CDR1 of the light chain variable region (VL) containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:10, CDR2 VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:11 , and CDR3 VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:12. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT contains a VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:19. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT contains a VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:33. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to the S. aureus Ab contains a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:47. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT contains a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:52. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus Ab contains CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL and CDR3 VL MEDI4893. In certain cases, the CDRs are Kabat-defined CDRs, Chotia-defined CDRs, or AbM-defined CDRs. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment that binds to the S. aureus Ab further comprises a heavy chain constant region. In certain cases, the heavy chain constant region is selected from the group consisting of the human immunoglobulin heavy chain constant regions IgG 1 , IgG 2 , IgG 3 , IgG 4 , IgA 1 and IgA 2 . In certain cases, the heavy chain constant region is the human IgG 1 constant region. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment that binds to S. aureus Ab further comprises a light chain constant region. In certain cases, the light chain constant region is selected from the group consisting of human immunoglobulin IgGκ and IgGλ light chain constant regions. In certain cases, the light chain constant region is a human IgGκ light chain constant region. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus antibody is an IgG antibody or antigen-binding fragment thereof. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. Aureus antibody contains an Fc region that has been engineered to increase its half-life. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus Ab contains an Fc region with a YTE mutation. In certain cases, the antibody or antigen binding fragment that binds to the S. aureus Ab is a monoclonal antibody or antigen binding fragment. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment that binds to the S. aureus antibody is a full-length antibody. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment comprises a Fab, Fab', F(ab') 2 , single chain Fv (scFv), disulfide bonded Fv, intra-antibody, IgGΔCH2, mini-antibody, F(ab') 3 , tetra-antibody, tri-antibody, di-antibody, DVD-Ig, Fcab, mAb 2 , (scFv) 2 or scFv-Fc. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT has an affinity for S. aureus AT of 80-100 pM.

[0017] В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, связываются с тем же эпитопом ClfA S. aureus, что и антитело, содержащее VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:20, и VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:34. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfAS. aureus, конкурентно подавляют связывание антитела, содержащего VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:20, и VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:34, с ClfA S. aureus. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат CDR1 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:4, CDR2 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:5, CDR3 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:6, CDR1 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:13, CDR2 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:14, и CDR3 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:15. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:20. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:34. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат константный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность CSYHLC (SEQ ID NO:55). В определенных случаях константный домен тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность MHEACSYHLCQKSLSLS (SEQ ID NO:56). В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:49. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:53. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL SAR114-N3Y. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с белком ClfA S. aureus, содержат CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL 11H10, SAR72, SAR80, SAR113, SAR132, SAR352, SAR372, SAR510, SAR547, SAS1, SAS19 или SAS203. В определенных случаях CDR представляют собой CDR, определенные по Кабату, CDR, определенные по Чотиа, или CDR, определенные по AbM. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с ClfA S. aureus, содержат VH и VL, где VH содержит аминокислотную последовательность, представленную под любым из SEQ ID NO:21-31 и 68. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связываются с ClfA S. aureus, содержат VH и VL, где VL содержит аминокислотную последовательность, представленную под любым из SEQ ID NO: 35-45 и 69. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат последовательности VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности, представленные под (a) SEQ ID NO:21 и 35 соответственно, (b) SEQ ID NO:22 и 36 соответственно, (c) SEQ ID NO:23 и 37 соответственно, (d) SEQ ID NO:24 и 38 соответственно, (e) SEQ ID NO:25 и 39 соответственно, (f) SEQ ID NO:26 и 40 соответственно, (g) SEQ ID NO:27 и 41 соответственно, (h) SEQ ID NO:28 и 42 соответственно, (i) SEQ ID NO:29 и 43 соответственно, (j) SEQ ID NO:30 и 44 соответственно, (k) SEQ ID NO:31 и 45 соответственно или (l) SEQ ID NO: 68 и 69 соответственно. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, дополнительно содержат константную область тяжелой цепи. В определенных случаях константная область тяжелой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей тяжелой цепи человеческого иммуноглобулина IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2. В определенных случаях константная область тяжелой цепи представляет собой константную область человеческого IgG1. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, дополнительно содержат константную область легкой цепи. В определенных случаях константная область легкой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей легкой цепи человеческого иммуноглобулина IgGκ и IgGλ. В определенных случаях константная область легкой цепи представляет собой константную область легкой цепи человеческого IgGκ. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат мутацию, которая увеличивает время полужизни по сравнению с таким же антителом без мутации у мышей с человеческим FcRn. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, содержат мутацию, которая увеличивает время полужизни по сравнению с таким же антителом без мутации, и где мутация не подавляет активность OPK по сравнению с таким же антителом или антигенсвязывающим фрагментом без мутации. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, представляют собой моноклональное антитело или антигенсвязывающий фрагмент. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, представляют собой полноразмерное антитело. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, представляют собой антигенсвязывающий фрагмент. В определенных случаях антигенсвязывающий фрагмент содержит Fab, Fab', F(ab')2, одноцепочечный Fv (scFv), связанный дисульфидной связью Fv, интраантитело, IgGΔCH2, миниантитело, F(ab')3, тетраантитело, триантитело, диантитело, DVD-Ig, Fcab, mAb2, (scFv)2 или scFv-Fc. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, характеризуются значениями IC50 по отношению к ClfA001, ClfA002 и ClfA004 в анализе подавления связывания с фибриногеном, которые находятся в пределах 2 мкг/мл друг от друга. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, характеризуются значениями IC50 по отношению к ClfA001, ClfA002 и ClfA004 в анализе подавления связывания с фибриногеном, все из которых находятся в диапазоне от 1 мкг/мл до 5 мкг/мл. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus,, характеризуются значениями аффинности связывания (KD) по отношению к ClfA001, ClfA002 и ClfA004, все из которых находятся в диапазоне от 200 до 350 пM. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, характеризуются значениями аффинности связывания (KD), составляющими менее 1 нM, по отношению ко всем генотипам ClfA. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, имеют чистоту мономера, которая снижается на не более чем 5% после воздействия на антитело или антигенсвязывающий фрагмент типичным белым светом при 2 клк/ч при 230C в течение 14 дней. [0017] In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use provided herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA binds to the same S. aureus ClfA epitope as the antibody , containing VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:20, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:34. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA competitively inhibits the binding of an antibody comprising a VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:20 and a VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:34 to ClfA S. aureus . In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA comprises a CDR1 VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:4, a CDR2 VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:5, a CDR3 VH containing the amino acid sequence under SEQ ID NO:6, CDR1 VL containing the amino acid sequence under SEQ ID NO:13, CDR2 VL containing the amino acid sequence under SEQ ID NO:14, and CDR3 VL containing the amino acid sequence under SEQ ID NO:15. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA comprises a VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:20. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA comprises a VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:34. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA contains a heavy chain constant domain containing the amino acid sequence CSYHLC (SEQ ID NO:55). In certain cases, the heavy chain constant domain contains the amino acid sequence MHEACSYHLCQKSLSLS (SEQ ID NO:56). In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA contains a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:49. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA contains a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:53. In certain cases , the antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA comprises CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL and CDR3 VL of SAR114-N3Y. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus ClfA protein contains CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL and CDR3 VL 11H10, SAR72, SAR80, SAR113, SAR132, SAR352, SAR372, SAR510, SAR547, SAS1, SAS19 or SAS203. In certain cases, the CDRs are Kabat-defined CDRs, Chotia-defined CDRs, or AbM-defined CDRs. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to S. aureus ClfA comprises VH and VL, wherein VH contains the amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 21-31 and 68. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment thereof fragment that specifically binds to S. aureus ClfA comprises VH and VL, wherein VL contains the amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 35-45 and 69. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to ClfA S aureus contain VH and VL sequences containing the amino acid sequences shown at (a) SEQ ID NO:21 and 35, respectively, (b) SEQ ID NO:22 and 36, respectively, (c) SEQ ID NO:23 and 37, respectively , (d) SEQ ID NO:24 and 38 respectively, (e) SEQ ID NO:25 and 39 respectively, (f) SEQ ID NO:26 and 40 respectively, (g) SEQ ID NO:27 and 41 respectively, ( h) SEQ ID NO:28 and 42, respectively, (i) SEQ ID NO:29 and 43, respectively, (j) SEQ ID NO:30 and 44, respectively, (k) SEQ ID NO:31 and 45, respectively, or (l) SEQ ID NO: 68 and 69 respectively. In certain cases, the antibody or antigen binding fragment that binds S. aureus ClfA further comprises a heavy chain constant region. In certain cases, the heavy chain constant region is selected from the group consisting of the human immunoglobulin heavy chain constant regions IgG 1 , IgG 2 , IgG 3 , IgG 4 , IgA 1 and IgA 2 . In certain cases, the heavy chain constant region is the human IgG 1 constant region. In certain cases, the antibody or antigen binding fragment that binds S. aureus ClfA further comprises a light chain constant region. In certain cases, the light chain constant region is selected from the group consisting of human immunoglobulin IgGκ and IgGλ light chain constant regions. In certain cases, the light chain constant region is a human IgGκ light chain constant region. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment that binds to S. aureus ClfA contains a mutation that increases the half-life compared to the same antibody without the mutation in mice with human FcRn. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment that binds S. aureus ClfA contains a mutation that increases the half-life compared to the same antibody without the mutation, and where the mutation does not inhibit OPK activity compared to the same antibody or antigen-binding fragment without the mutation . In certain cases, the antibody or antigen binding fragment that binds to S. aureus ClfA is a monoclonal antibody or antigen binding fragment. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment that binds S. aureus ClfA is a full-length antibody. In certain cases, the antibody or antigen binding fragment that binds to S. aureus ClfA is an antigen binding fragment. In certain cases, the antigen binding fragment contains Fab, Fab', F(ab') 2 , single chain Fv (scFv), disulfide bonded Fv, intra-antibody, IgGΔCH2, mini-antibody, F(ab') 3 , tetra-antibody, tri-antibody, di-antibody, DVD- Ig, Fcab, mAb 2 , (scFv) 2 or scFv-Fc. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA has IC50 values relative to ClfA001, ClfA002, and ClfA004 in the fibrinogen binding inhibition assay that are within 2 μg/ml of each other. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA has IC50 values relative to ClfA001, ClfA002, and ClfA004 in the fibrinogen binding inhibition assay, all of which range from 1 μg/ml to 5 μg/ ml. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA has binding affinity ( KD ) values for ClfA001, ClfA002 and ClfA004, all of which range from 200 to 350 pM. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA exhibits binding affinity ( KD ) values of less than 1 nM to all ClfA genotypes. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment that binds to S. aureus ClfA has a monomer purity that is reduced by no more than 5% after exposing the antibody or antigen-binding fragment to typical white light at 2 kl/h at 23 0 C for 14 days.

[0018] В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, связываются с LukF, LukD и/или HlgB, и/или где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент нейтрализуют LukF, LukD и/или HlgB. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, связываются с LukF, LukD и HlgB, и/или где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент нейтрализуют LukF, LukD и HlgB. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, связываются с тем же эпитопом лейкотоксина S. aureus, что и антитело, содержащее VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:32, и VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:46. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, конкурентно подавляют связывание антитела, содержащего VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:32, и VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:46, с лейкотоксином S. aureus. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат CDR1 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:7, CDR2 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:8, CDR3 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:9, CDR1 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:16, CDR2 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:17, и CDR3 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:18. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:32. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:46. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:50. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:54. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL SAN481-SYT. В определенных случаях CDR представляют собой CDR, определенные по Кабату, CDR, определенные по Чотиа, или CDR, определенные по AbM. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, дополнительно содержат константную область тяжелой цепи. В определенных случаях константная область тяжелой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей тяжелой цепи человеческого иммуноглобулина IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2. В определенных случаях константная область тяжелой цепи представляет собой константную область человеческого IgG1. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, дополнительно содержат константную область легкой цепи. В определенных случаях константная область легкой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей легкой цепи человеческого иммуноглобулина IgGκ и IgGλ. В определенных случаях константная область легкой цепи представляет собой константную область легкой цепи человеческого IgGκ. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, представляют собой антитело класса IgG или его антигенсвязывающий фрагмент. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат Fc-область, которая была сконструирована для увеличения времени полужизни. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат Fc-область с мутацией YTE. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, представляют собой моноклональное антитело или антигенсвязывающий фрагмент. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, представляют собой полноразмерное антитело. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, представляют собой антигенсвязывающий фрагмент. В определенных случаях антигенсвязывающий фрагмент содержит Fab, Fab', F(ab')2, одноцепочечный Fv (scFv), связанный дисульфидной связью Fv, интраантитело, IgGΔCH2, миниантитело, F(ab')3, тетраантитело, триантитело, диантитело, DVD-Ig, Fcab, mAb2, (scFv)2 или scFv-Fc. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, характеризуются аффинностью по отношению к LukF, LukD и HlgAB S. aureus, составляющей менее 75 пM. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, характеризуются сопоставимыми значениями аффинности связывания по отношению к LukF, LukD и HIgB. [0018] In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use provided herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin binds to LukF, LukD, and/or HlgB and/or wherein the antibody or antigen-binding fragment thereof neutralizes LukF, LukD and/or HlgB. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin binds to LukF, LukD and HlgB, and/or where the antibody or antigen-binding fragment thereof neutralizes LukF, LukD and HlgB. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin binds to the same S. aureus leukotoxin epitope as the antibody containing VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:32, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:46. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin competitively inhibits the binding of an antibody comprising a VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:32 and a VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 46, with S. aureus leukotoxin. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin comprises a CDR1 VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:7, a CDR2 VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:8, a CDR3 VH , containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:9, CDR1 VL, containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:16, CDR2 VL, containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:17, and CDR3 VL, containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:18 . In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin comprises a VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:32. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin comprises a VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:46. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin contains a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:50. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin contains a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:54. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin comprises CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL and CDR3 VL of SAN481-SYT. In certain cases, the CDRs are Kabat-defined CDRs, Chotia-defined CDRs, or AbM-defined CDRs. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment that binds to at least one S. aureus leukotoxin further comprises a heavy chain constant region. In certain cases, the heavy chain constant region is selected from the group consisting of the human immunoglobulin heavy chain constant regions IgG 1 , IgG 2 , IgG 3 , IgG 4 , IgA 1 and IgA 2 . In certain cases, the heavy chain constant region is the human IgG 1 constant region. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment that binds to at least one S. aureus leukotoxin further comprises a light chain constant region. In certain cases, the light chain constant region is selected from the group consisting of human immunoglobulin IgGκ and IgGλ light chain constant regions. In certain cases, the light chain constant region is a human IgGκ light chain constant region. In certain cases, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin is an IgG antibody or antigen-binding fragment thereof. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin contains an Fc region that has been engineered to increase its half-life. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin contains an Fc region with a YTE mutation. In certain cases, the antibody or antigen binding fragment that binds to at least one S. aureus leukotoxin is a monoclonal antibody or antigen binding fragment. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment that binds to at least one S. aureus leukotoxin is a full-length antibody. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment that binds to at least one S. aureus leukotoxin is an antigen binding fragment. In certain cases, the antigen binding fragment contains Fab, Fab', F(ab') 2 , single chain Fv (scFv), disulfide bonded Fv, intra-antibody, IgGΔCH2, mini-antibody, F(ab') 3 , tetra-antibody, tri-antibody, di-antibody, DVD- Ig, Fcab, mAb 2 , (scFv) 2 or scFv-Fc. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin has an affinity for S. aureus LukF, LukD and HlgAB of less than 75 pM. In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds at least one S. aureus leukotoxin has comparable binding affinities to LukF, LukD and HIgB.

[0019] В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой сепсис. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой бактериемию. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой пневмонию. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой пневмонию, вызываемую S. aureus, представляющую собой пневмонию в отделении интенсивной терапии (ICU). В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой инфекцию кожи или мягких тканей (SSTI). В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой инфекцию нижних конечностей у больного диабетом. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой язву при синдроме диабетической стопы (DFU). В определенных случаях DFU является неинфицированной. В определенных случаях DFU является инфицированной. В определенных случаях DFU представляет собой DFU 1, 2 или 3 степени. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой инфекцию костей или суставов. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой инфекцию суставов, инфекцию, ассоциированную с медицинским изделием в организме, раневую инфекцию, хирургическую раневую инфекцию или остеомиелит.[0019] In certain cases of the method, composition, antibody or antigen-binding fragment or use presented herein, the infection caused by S. aureus is sepsis. In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, an infection caused by S. aureus constitutes a bacteremia. In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use provided herein, the infection caused by S. aureus is pneumonia. In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the S. aureus infection is S. aureus pneumonia, which is an intensive care unit (ICU) pneumonia. In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment or use thereof provided herein, the infection caused by S. aureus is a skin or soft tissue infection (SSTI). In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen binding fragment or use thereof provided herein, the S. aureus infection is an infection of the lower extremities of a diabetic patient. In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen binding fragment or use thereof provided herein, the S. aureus infection is a diabetic foot ulcer (DFU). In certain cases, DFU is non-infectious. In certain cases, DFU is infected. In certain cases, DFU is grade 1, 2, or 3 DFU. In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen-binding fragment or use thereof provided herein, the infection caused by S. aureus is an infection of the bones or joints. In certain cases of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof or use provided herein, the S. aureus infection is a joint infection, a medical device-associated infection in the body, a wound infection, a surgical wound infection, or osteomyelitis.

[0020] В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, субъектом является субъект хирургического профиля.[0020] In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen binding fragment thereof, or use provided herein, the subject is a surgical subject.

[0021] В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, предусматривает инфекцию антибиотикорезистентным S. aureus.[0021] In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen-binding fragment or use thereof provided herein, an S. aureus infection involves an infection with an antibiotic-resistant S. aureus .

[0022] В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, у субъекта имеется диабет. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, субъекта является человеком.[0022] In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen binding fragment or use thereof provided herein, the subject has diabetes. In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen binding fragment thereof or use provided herein, the subject is a human.

[0023] В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, лечение или предотвращение инфекции, вызываемой S. aureus, включает подавление агглютинации, обусловленной S. аureus, нейтрализацию токсинов, индуцирование опсонофагоцитоза, подавление связывания фибриногена, обусловленного S. aureus, подавление агглютинации, обусловленной S. aureus, подавление образования тромбоэмболических очагов, подавление сепсиса, ассоциированного с S. aureus, или любую комбинацию вышеизложенного. [0023] In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen-binding fragment or use thereof provided herein, treating or preventing S. aureus infection includes inhibiting S. aureus agglutination, neutralizing toxins, inducing opsonophagocytosis, inhibiting binding fibrinogen due to S. aureus , suppression of agglutination due to S. aureus , suppression of the formation of thromboembolic foci, suppression of sepsis associated with S. aureus , or any combination of the above.

[0024] В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, вводят в одной фармацевтической композиции. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, вводят в отдельных фармацевтических композициях. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, вводят в одной фармацевтической композиции. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, вводят в отдельных фармацевтических композициях. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, вводят в одной фармацевтической композиции. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S. aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, вводят в отдельных фармацевтических композициях. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, отдельные фармацевтические композиции вводят одновременно. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, отдельные фармацевтические композиции вводят последовательно. В определенных случаях способа, композиции, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfА S. aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, вводят в одной фармацевтической композиции.[0024] In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus Ab, and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to ClfA S. aureus is administered in a single pharmaceutical composition. In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA are administered in separate pharmaceutical compositions. In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use provided herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus Ab, and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one leukotoxin S aureus , is administered in one pharmaceutical composition. In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use provided herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus Ab, and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one leukotoxin S aureus , are administered in separate pharmaceutical compositions. In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use provided herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA, and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one leukotoxin S aureus , is administered in one pharmaceutical composition. In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use provided herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA, and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one leukotoxin S aureus , are administered in separate pharmaceutical compositions. In certain cases of the method, composition, antibody or antigen binding fragment or use presented herein, separate pharmaceutical compositions are administered simultaneously. In certain instances of a method, composition, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, individual pharmaceutical compositions are administered sequentially. In certain instances of a method, composition, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use provided herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA, and an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin is administered in a single pharmaceutical composition.

[0025] В данном документе также представлены способы лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, у субъекта с диабетом, включающие введение субъекту антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с АТ S. aureus.[0025] Also provided herein are methods of treating or preventing S. aureus infection in a subject with diabetes, comprising administering to the subject an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to the S. aureus Ab.

[0026] В данном документе также представлены антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, которые связываются с АТ S. aureus, для применения в лечении или предотвращении инфекции, вызываемой S. aureus, у субъекта с диабетом. [0026] Also provided herein are antibodies or antigen-binding fragments thereof that bind to S. aureus Abs for use in treating or preventing S. aureus infection in a subject with diabetes.

[0027] В данном документе также представлены варианты применения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с АТ S. aureus, в получении лекарственного препарата, предназначенного для лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, у субъекта с диабетом. [0027] Also provided herein are embodiments of the use of an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus Ab in the preparation of a medicament for treating or preventing S. aureus infection in a subject with diabetes.

[0028] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, связываются с тем же эпитопом АТS. aureus, что и антитело, содержащее VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:19, и VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:33.[0028] In certain instances of a method, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to a S. aureus AT binds to the same epitope of the S. aureus AT as the antibody containing VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:19, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:33.

[0029] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, конкурентно подавляют связывание антитела, содержащего VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:19, и VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:33, с АТ S. aureus.[0029] In certain instances of a method, antibody, or antigen binding fragment thereof, or use provided herein, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to the S. aureus Ab competitively inhibits the binding of an antibody containing a VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO :19, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:33 with S. aureus AT.

[0030] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат CDR1 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:1, CDR2 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:2, CDR3 VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:3, CDR1 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:10, CDR2 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:11, и CDR3 VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:12. [0030] In certain instances of a method, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT comprises a CDR1 VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:1, CDR2 VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:2, CDR3 VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:3, CDR1 VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:10, CDR2 VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:11 , and CDR3 VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:12.

[0031] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат VH, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:19.[0031] In certain instances of a method, antibody, or antigen binding fragment thereof, or use provided herein, the antibody or antigen binding fragment thereof that binds to S. aureus AT comprises a VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:19.

[0032] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат VL, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:33.[0032] In certain instances of a method, antibody or antigen binding fragment thereof, or use provided herein, the antibody or antigen binding fragment thereof that binds to S. aureus AT comprises a VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:33.

[0033] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:47.[0033] In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT comprises a heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:47.

[0034] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:52.[0034] In certain instances of a method, antibody, or antigen binding fragment thereof, or use provided herein, the antibody or antigen binding fragment thereof that binds to S. aureus AT comprises a light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:52.

[0035] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL MEDI4893. В определенных случаях CDR представляют собой CDR, определенные по Кабату, CDR, определенные по Чотиа, или CDR, определенные по AbM.[0035] In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus AT comprises CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL and CDR3 VL MEDI4893. In certain cases, the CDRs are Kabat-defined CDRs, Chotia-defined CDRs, or AbM-defined CDRs.

[0036] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, дополнительно содержат константную область тяжелой цепи. В определенных случаях константная область тяжелой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей тяжелой цепи человеческого иммуноглобулина IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2. В определенных случаях константная область тяжелой цепи представляет собой константную область человеческого IgG1.[0036] In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen-binding fragment that binds to S. aureus Ab further comprises a heavy chain constant region. In certain cases, the heavy chain constant region is selected from the group consisting of the human immunoglobulin heavy chain constant regions IgG 1 , IgG 2 , IgG 3 , IgG 4 , IgA 1 and IgA 2 . In certain cases, the heavy chain constant region is the human IgG 1 constant region.

[0037] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, дополнительно содержат константную область легкой цепи. В определенных случаях константная область легкой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей легкой цепи человеческого иммуноглобулина IgGκ и IgGλ. В определенных случаях константная область легкой цепи представляет собой константную область легкой цепи человеческого IgGκ.[0037] In certain instances of a method, antibody, or antigen binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen binding fragment that binds to S. aureus Ab further comprises a light chain constant region. In certain cases, the light chain constant region is selected from the group consisting of human immunoglobulin IgGκ and IgGλ light chain constant regions. In certain cases, the light chain constant region is a human IgGκ light chain constant region.

[0038] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, представляют собой антитело класса IgG или его антигенсвязывающий фрагмент.[0038] In certain instances of the method, antibody or antigen binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen binding fragment thereof that binds to the S. aureus Ab is an IgG antibody or antigen binding fragment thereof.

[0039] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат Fc-область, которая была сконструирована для увеличения времени полужизни.[0039] In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus Ab contains an Fc region that has been engineered to increase half-life.

[0040] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, содержат Fc-область с мутацией YTE. [0040] In certain instances of a method, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus Ab contains an Fc region with a YTE mutation.

[0041] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, представляют собой моноклональное антитело или антигенсвязывающий фрагмент.[0041] In certain instances of a method, antibody, or antigen binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen binding fragment that binds to the S. aureus Ab is a monoclonal antibody or antigen binding fragment.

[0042] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. аureus, представляют собой полноразмерное антитело.[0042] In certain instances of the method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen-binding fragment that binds to the S. aureus AT is a full-length antibody.

[0043] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, представляют собой антигенсвязывающий фрагмент. В определенных случаях антигенсвязывающий фрагмент содержит Fab, Fab', F(ab')2, одноцепочечный Fv (scFv), связанный дисульфидной связью Fv, интраантитело, IgGΔCH2, миниантитело, F(ab')3, тетраантитело, триантитело, диантитело, DVD-Ig, Fcab, mAb2, (scFv)2 или scFv-Fc. [0043] In certain instances of a method, antibody, or antigen binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen binding fragment that binds to the S. aureus AT is an antigen binding fragment. In certain cases, the antigen binding fragment contains Fab, Fab', F(ab') 2 , single chain Fv (scFv), disulfide bonded Fv, intra-antibody, IgGΔCH2, mini-antibody, F(ab') 3 , tetra-antibody, tri-antibody, di-antibody, DVD- Ig, Fcab, mAb 2 , (scFv) 2 or scFv-Fc.

[0044] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S. aureus, характеризуются аффинностью по отношению к АТ S. aureus, составляющей 80-100 пМ. [0044] In certain instances of a method, antibody or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus Ab has an affinity for S. aureus Ab of 80-100 pM .

[0045] В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой сепсис. В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой бактериемию. В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой пневмонию. В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой пневмонию в ICU. В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой SSTI. В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой инфекцию нижних конечностей у больного диабетом. В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой DFU. В определенных случаях DFU является неинфицированной. В определенных случаях DFU является инфицированной. В определенных случаях DFU представляет собой DFU 1, 2 или 3 степени. В определенных случаях способа, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или применения, представленных в данном документе, инфекция, вызываемая S. aureus, представляет собой инфекцию костей или суставов.[0045] In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, an infection caused by S. aureus constitutes sepsis. In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, an infection caused by S. aureus constitutes a bacteremia. In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the infection caused by S. aureus is pneumonia. In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, S. aureus infection is pneumonia in the ICU. In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the infection caused by S. aureus is an SSTI. In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the S. aureus infection is an infection of the lower extremities of a diabetic patient. In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, an infection caused by S. aureus is a DFU. In certain cases, DFU is non-infectious. In certain cases, DFU is infected. In certain cases, DFU is grade 1, 2, or 3 DFU. In certain instances of a method, antibody, or antigen-binding fragment thereof, or use presented herein, the infection caused by S. aureus is an infection of the bones or joints.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ НЕСКОЛЬКИХ ИЗОБРАЖЕНИЙ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВBRIEF DESCRIPTION OF SEVERAL IMAGES OF GRAPHICS

[0046] На фигуре 1 схематически показано, что с помощью ряда моделей на животных обосновывается применение комбинации антител, направленных против альфа-токсина (AT), фактора слипания A (ClfA) и лейкотоксинов, для достижения широкого охвата штаммов и заболеваний.[0046] Figure 1 schematically shows that a number of animal models support the use of a combination of antibodies directed against alpha toxin (AT), clumping factor A (ClfA) and leukotoxins to achieve broad strain and disease coverage.

[0047] Фигура 2 представляет собой график, показывающий эффективность комбинации антител, направленных против AT, ClfA и лейкотоксинов (MEDI6389), в подавлении гемолиза эритроцитов (RBC) по сравнению с эффективностью антитела, направленного только против AT (MEDI4893*), и с эффективностью комбинации антител, направленных против ClfA (SAR114) и лейкотоксинов (SAN481-SYT*). (См. пример 1.)[0047] Figure 2 is a graph showing the effectiveness of a combination of antibodies directed against AT, ClfA and leukotoxins (MEDI6389) in suppressing hemolysis of red blood cells (RBC) compared to the effectiveness of an antibody directed against AT alone (MEDI4893*), and with the effectiveness combinations of antibodies directed against ClfA (SAR114) and leukotoxins (SAN481-SYT*). (See example 1.)

[0048] Фигура 3 представляет собой график, показывающий эффективность комбинации антител, направленных против AT, ClfA и лейкотоксинов (MEDI6389), в поддержании выживаемости моноцитов по сравнению с эффективностью антитела, направленного только против лейкотоксинов (SAN481-SYT*), и с эффективностью комбинации антител, направленных против AT (MEDI4893*) и ClfA (SAR114). (См. пример 1.)[0048] Figure 3 is a graph showing the effectiveness of a combination of antibodies directed against AT, ClfA and leukotoxins (MEDI6389) in maintaining monocyte survival compared to the effectiveness of an antibody directed only against leukotoxins (SAN481-SYT*) and the effectiveness of the combination antibodies directed against AT (MEDI4893*) and ClfA (SAR114). (See example 1.)

[0049] Фигура 4 представляет собой график, показывающий эффективность комбинации антител, направленных против AT, ClfA и лейкотоксинов (MEDI6389), в подавлении связывания фибриногена (Fg) по сравнению с эффективностью антитела, направленного только против ClfA (SAR114), и эффективностью комбинации антител, направленных против AT (MEDI4893*) и лейкотоксинов (SAN481-SYT*). (См. пример 1.)[0049] Figure 4 is a graph showing the effectiveness of a combination of antibodies directed against AT, ClfA and leukotoxins (MEDI6389) in inhibiting fibrinogen (Fg) binding compared to the effectiveness of an antibody directed only against ClfA (SAR114) and the effectiveness of the antibody combination , directed against AT (MEDI4893*) and leukotoxins (SAN481-SYT*). (See example 1.)

[0050] На фигуре 5 представлен график и изображения, показывающие, что комбинация SAN481-SYT* и MEDI4893* превосходит по активности SAN481-SYT* или MEDI4893* по отдельности в модели дермонекроза с изолятом раны, вызываемой S. aureus. (См. пример 2.)[0050] Figure 5 provides a graph and images showing that the combination of SAN481-SYT* and MEDI4893* is superior to SAN481-SYT* or MEDI4893* alone in a S. aureus wound isolate model of dermonecrosis. (See example 2.)

[0051] На фигуре 6 представлены графики, показывающие, что нейтрализация AT, ClfA и лейкотоксинов необходима для защиты на модели бактериемии кролика. (См. пример 3.) [0051] Figure 6 provides graphs showing that neutralization of AT, ClfA, and leukotoxins is required for protection in a rabbit bacteremia model. (See example 3.)

[0052] На фигуре 7 представлены графики, сравнивающие эффективность комбинации антител, направленных против AT, ClfA и лейкотоксинов (MEDI6389), в отношении двух разных бактериальных инфекций кровотока: HA-MRSA NRS382 (верхняя панель) и CA-MRSA SF8300 (нижняя панель). (См. пример 4.)[0052] Figure 7 presents graphs comparing the effectiveness of a combination of antibodies directed against AT, ClfA and leukotoxins (MEDI6389) against two different bacterial bloodstream infections: HA-MRSA NRS382 (top panel) and CA-MRSA SF8300 (bottom panel). . (See example 4.)

[0053] На фигуре 8 представлен график и изображения, показывающие, что смешанная инфекция, вызываемая S. aureus (SA), Pseudomonas aeruginosa (PA) и Streptococcus pyogenes (SP), приводила к замедленному закрытию кожных поражений в модели дермонекроза у мышей с диабетом по сравнению с инфекцией, вызываемой только SA. На изображениях показаны поражения на 43 день после внутрикожного заражения. (См. пример 5.)[0053] Figure 8 is a graph and images showing that mixed infection with S. aureus (SA), Pseudomonas aeruginosa (PA), and Streptococcus pyogenes (SP) resulted in delayed closure of skin lesions in a diabetic mouse model of dermonecrosis compared with infection caused by SA alone. Images show lesions at day 43 post-intradermal infection. (See example 5.)

[0054] На фигуре 9 представлены графики и изображения, показывающие, что комбинация антител, направленных против AT, ClfA и лейкотоксинов (MEDI6389), приводит к улучшению заживления ран, вызванных смешанными бактериальными инфекциями. (См. пример 5.)[0054] Figure 9 presents graphs and images showing that a combination of antibodies directed against AT, ClfA and leukotoxins (MEDI6389) leads to improved healing of wounds caused by mixed bacterial infections. (See example 5.)

[0055] На фигуре 10 представлено выравнивание последовательностей HIgB (SEQ ID NO:59), LukF (SEQ ID NO:60) и LukD (SEQ ID NO:61).[0055] Figure 10 shows the sequence alignment of HIgB (SEQ ID NO:59), LukF (SEQ ID NO:60) and LukD (SEQ ID NO:61).

[0056] На фигурах 11A-G показано, что повышенные уровни глюкозы коррелируют с более тяжелыми инфекциями, вызываемыми S. aureus. (A и B). После инфицирования S. aureus у мышей db/db (A) и STZ (B) с диабетом наблюдалась повышенная смертность по сравнению с контрольными животными, не страдающими диабетом. (C) После инфицирования S. aureus у мышей db/db с диабетом наблюдались такие же уровни S. aureus в почках, как и у контрольных животных, не страдающих диабетом. (D) После инфицирования S. aureus у мышей STZ с диабетом в почках наблюдались такие же уровни S. aureus в почках, как и у контрольных животных, не страдающих диабетом. (E, F и G) Лечение розиглитазоном в течение 1 недели до инфицирования S. aureus приводило к снижению уровней глюкозы в циркулирующей крови (E) и увеличению выживаемости (F), но не влияло на бактериальную нагрузку в почках (G). (См. пример 7.) [0056] Figures 11A-G show that elevated glucose levels correlate with more severe infections caused byS. aureus. (A and B). After infectionS. aureus in micedb/db(A) and STZ (B) diabetic animals had increased mortality compared to nondiabetic control animals. (C) After infectionS. aureus in micedb/dbwith diabetes similar levels were observedS. aureus in the kidneys, as in control animals without diabetes. (D) After infectionS. aureus STZ mice with diabetes had similar levels in their kidneysS. aureus in the kidneys, as in control animals without diabetes. (E, F, and G) Treatment with rosiglitazone for 1 week before infection.S. aureusresulted in decreased circulating glucose levels (E) and increased survival (F) but had no effect on renal bacterial load (G). (See example 7.)

[0057] На фигурах 12A-D показано, что системная инфекция у хозяина с диабетом приводит к AT-зависимому увеличению уровней циркулирующих NET. (A) После инфицирования S. aureus с помощью ELISA обнаруживали повышенные сывороточные уровни NET у мышей с диабетом по сравнению с контрольными животными, не страдающими диабетом. (B) Нейтрализация альфа-токсина (AT) S. aureus с помощью моноклонального антитела к альфа-токсину MEDI4893* приводила к значительному снижению количества комплексов NE-DNA в сыворотке крови у мышей с диабетом через 48 часов после инфицирования. (C) После инфицирования S. aureus с помощью вестерн-блоттинга показано повышенное содержание цитринулированного гистона H3 (H3cit) у мышей с диабетом по сравнению с контрольными животными, не страдающими диабетом. (D) Нейтрализация АТ S. aureus приводила к увеличению выживаемости мышей с диабетом, инфицированных S. aureus. (См. пример 8.)[0057] Figures 12A-D show that systemic infection in a diabetic host results in an AT-dependent increase in circulating NET levels. (A) After infectionS. aureus found increased serum NET levels in diabetic mice compared with nondiabetic controls using ELISA. (B) Neutralization of alpha toxin (AT)S. aureususing the alpha-toxin monoclonal antibody MEDI4893* resulted in a significant reduction in serum NE-DNA complexes in diabetic mice 48 hours post-infection. (C) After infectionS. aureus Western blot analysis showed increased levels of citrinulated histone H3 (H3cit) in diabetic mice compared with nondiabetic controls. (D) AT neutralizationS. aureusled to increased survival of diabetic mice infected withS. aureus. (See example 8.)

[0058] На фигурах 13A-D показано, что у мышей db/db с диабетом повышено количество нейтрофилов низкой плотности (LDN). (A) После инфицирования S. aureus количество LDN в крови инфицированных мышей db/db с диабетом было значительно увеличено по сравнению с неинфицированными мышами db/db или контрольными животными, не страдающими диабетом. (B) Лечение розиглитазоном в течение 1 недели до инфицирования S. aureus приводило к снижению LDN через 48 часов после инфицирования. (C и D) Нейтрализация АТ S. aureus до инфицирования приводила к снижению LDN (C), но не влияла на общее количество нейтрофилов (D) у мышей db/db с диабетом. (См. пример 9.) [0058] On the figures 13A-D show that in micedb/dbwith diabetes, the number of low-density neutrophils (LDN) is increased. (A) After infectionS. aureus amount of LDN in the blood of infected micedb/db with diabetes was significantly increased compared to uninfected micedb/db or non-diabetic control animals. (B) Treatment with rosiglitazone for 1 week before infectionS. aureusresulted in decreased LDN 48 h postinfection. (C and D) AT neutralizationS. aureusbefore infection led to a decrease in LDN (C) but did not affect the total number of neutrophils (D) in micedb/db with diabetes. (See example 9.)

[0059] На фигуре 14 показано, что после инфицирования S. aureus у мышей STZ с диабетом наблюдалось повышение количества нейтрофилов низкой плотности LDN. (См. пример 9.) [0059] Figure 14 shows that after infectionS. aureus at diabetic STZ mice exhibited increased numbers of LDN low-density neutrophils. (See example 9.)

[0060] На фигуре 15A-D показано, что доставка TGFβ-нейтрализующего антитела до инфицирования является защитной для мышей с диабетом. (A) TGFβ значительно увеличивал количество LDN в крови db/db с диабетом, но не в крови контрольных животных, не страдающих диабетом. (B и C) Доставка TGFβ-нейтрализующего антитела, обеспеченная до инфицирования S. aureus, приводила к снижению количества LDN в крови (B), но не влияла на количество бактерий в почках (C). (D) Доставка TGFβ-нейтрализующего антитела, обеспеченная до инфицирования, приводила к увеличению выживаемости мышей db/db с диабетом. (См. пример 10.) [0060] On the figure 15A-D show that delivery of a TGFβ neutralizing antibody prior to infection is protective in diabetic mice. (A) TGFβ significantly increased the amount of LDN in the blooddb/db with diabetes, but not in the blood of nondiabetic control animals. (B and C) Delivery of TGFβ-neutralizing antibody achieved prior to infection.S. aureus, led to a decrease in the amount of LDN in the blood (B), but did not affect the number of bacteria in the kidneys (C). (D) Delivery of TGFβ-neutralizing antibody provided prior to infection resulted in increased survival of micedb/dbwith diabetes. (See example 10.)

[0061] На фигурах 16A-E показано, что блокирование пути αVβ6/8 до инфицирования является защитным у мышей с диабетом. (A) Количество β8-положительных воспалительных моноцитов и дендритных клеток (DC) увеличивалось в печени мышей db/db с диабетом, но не у мышей C57BKS после инфицирования. (B) Экспрессия интегрина увеличивалась на поверхности моноцитов, а общее количество DC (но не плотность β8 на DC) возрастало. (C) Нейтрализация αVβ6/8 перед инфицированием приводила к снижению LDN в кровотоке по сравнению с введением антитела к αVβ6 или контрольного антитела (c-IgG). (D) Нейтрализация αVβ6/8 перед инфицированием не влияла на количество бактерий в почках. (E) Нейтрализация αVβ6/8 перед инфицированием приводила к увеличению выживаемости по сравнению с введением контрольного антитела (c-IgG). (См. пример 10.) [0061] Figures 16A-E show that blocking the αVβ6/8 pathway prior to infection is protective in diabetic mice. (A) The number of β8-positive inflammatory monocytes and dendritic cells (DCs) increased in the livers of diabetic db/db mice but not in C57BKS mice after infection. (B) Integrin expression increased on the surface of monocytes, and the total number of DCs (but not the density of β8 per DC) increased. (C) Neutralization of αVβ6/8 before infection resulted in decreased circulating LDN compared with administration of anti-αVβ6 antibody or control antibody (c-IgG). (D) Neutralization of αVβ6/8 before infection did not affect bacterial counts in the kidney. (E) Neutralization of αVβ6/8 before infection resulted in increased survival compared with control antibody (c-IgG). (See example 10.)

[0062] На фигурах 17A-C показано, что AT влияет на активацию TGFβ независимо от экспрессии αVβ8 на клетках врожденного иммунитета. (A) Уровни pSMAD были выше в печени инфицированных мышей с диабетом по сравнению с наивными мышами с диабетом и инфицированными мышами, не страдающими диабетом. (B) Нейтрализация AT приводила к значительному снижению уровней pSMAD в печени. (C) Нейтрализация AT не приводила к изменению количества клеток врожденного иммунитета, экспрессирующих αVβ8. (См. пример 11.) [0062] Figures 17A-C show that AT affects TGFβ activation independent of αVβ8 expression on innate immune cells. (A) Levels of pSMAD were higher in the livers of infected diabetic mice compared with naïve diabetic mice and infected nondiabetic mice. (B) Neutralization of AT resulted in a significant reduction in liver pSMAD levels. (C) Neutralization of AT did not change the number of innate immune cells expressing αVβ8. (See example 11.)

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

[0063] В настоящем изобретении представлены комбинации антител и их антигенсвязывающих фрагментов (например, моноклональных антител и их антигенсвязывающих фрагментов), которые связываются с альфа-токсином (AT), фактором слипания A (ClfA) и по меньшей мере одним лейкотоксином Staphylococcus aureus (S. aureus). В настоящем изобретении также представлены способы применения таких комбинаций, например, для лечения или предупреждения инфекций, вызываемых S. aureus. [0063] The present invention provides combinations of antibodies and antigen-binding fragments thereof (e.g., monoclonal antibodies and antigen-binding fragments thereof) that bind to alpha toxin (AT), clumping factor A (ClfA), and at least one Staphylococcus aureus leukotoxin ( S .aureus ). The present invention also provides methods for using such combinations, for example, to treat or prevent infections caused by S. aureus .

ОпределенияDefinitions

[0064] Используемый в данном документе термин “альфа-токсин” или “AT” относится к полипептидам бактериального альфа-токсина, включая без ограничения нативные полипептиды альфа-токсина и изоформы полипептидов альфа-токсина. Термин “альфа-токсин” охватывает полноразмерные непроцессированные полипептиды альфа-токсина, а также формы полипептидов альфа-токсина, которые появляются в результате процессинга внутри клетки. Используемый в данном документе термин "альфа-токсин S. aureus" относится к полипептиду, содержащему следующую аминокислотную последовательность: adsdiniktgttdigsnttvktgdlvtydkengmhkkvfysfiddknhnkkllvirtkgtiagqyrvyseeganksglawpsafkvqlqlpdnevaqisdyyprnsidtkeymstltygfngnvtgddtgkiggliganvsightlkyvqpdfktilesptdkkvgwkvifnnmvnqnwgpydrdswnpvygnqlfmktrngsmkaadnfldpnkassllssgfspdfatvitmdrkaskqqtnidviyervrddyqlhwtstnwkgtntkdkwtdrsserykidwekeemtn (SEQ ID NO:57). Мутант H35L альфа-токсина S. aureus имеет последовательность adsdiniktgttdigsnttvktgdlvtydkengmlkkvfysfiddknhnkkllvirtkgtiagqyrvyseeganksglawpsafkvqlqlpdnevaqisdyyprnsidtkeymstltygfngnvtgddtgkiggliganvsightlkyvqpdfktilesptdkkvgwkvifnnmvnqnwgpydrdswnpvygnqlfmktrngsmkaadnfldpnkassllssgfspdfatvitmdrkaskqqtnidviyervrddyqlhwtstnwkgtntkdkwtdrsserykidwekeemtn (SEQ ID NO:58).[0064] As used herein, the term “alpha toxin” or “AT” refers to bacterial alpha toxin polypeptides, including, without limitation, native alpha toxin polypeptides and isoforms of alpha toxin polypeptides. The term “alpha toxin” covers full-length, full-length alpha toxin polypeptides, as well as forms of alpha toxin polypeptides that result from intracellular processing. As used herein, the term " S. aureus alpha toxin" refers to a polypeptide containing the following amino acid sequence: adsdiniktgttdigsnttvktgdlvtydkengmhkkvfysfiddknhnkkllvirtkgtiagqyrvyseeganksglawpsafkvqlqlpdnevaqisdyyprnsidtkeymstltygfngnvtgddtgki ggliganvsightlkyvqpdfktilesptdkkvgwkvifnnmvnqnwgpydrdswnpvygnqlfmktrngsmkaadnfldpnkassllssgfspdfatvitmdrkaskqqtnidviyervrddyqlhwtstnwkgtntkdkwtdrsserykidwekeemtn (SEQ ID NO:57). The S. aureus alpha toxin H35L mutant has the sequence adsdiniktgttdigsnttvktgdlvtydkengmlkkvfysfiddknhnkkllvirtkgtiagqyrvyseeganksglawpsafkvqlqlpdnevaqisdyyprnsidtkeymstltygfngnvtgddtgkiggliganvsightlkyvqpdfktilesptdk (SEQ ID NO:58).

[0065] Термины “полинуклеотид альфа-токсина”, “нуклеотид альфа-токсина” или “нуклеиновая кислота альфа-токсина” относятся к полинуклеотиду, кодирующему альфа-токсин. [0065] The terms “alpha toxin polynucleotide”, “alpha toxin nucleotide” or “alpha toxin nucleic acid” refer to a polynucleotide encoding an alpha toxin.

[0066] Используемый в данном документе термин “фактор слипания A” или “ClfA” относится к полипептидам бактериального фактора слипания A, включая без ограничения нативные полипептиды фактора слипания A и изоформы полипептидов фактора слипания A. Термин “фактор слипания A” охватывает полноразмерные непроцессированные полипептиды фактора слипания A, а также формы полипептидов фактора слипания A, которые появляются в результате процессинга внутри клетки. Термины “полинуклеотид фактора слипания A”, “нуклеотид фактора слипания А” или “нуклеиновая кислота фактора слипания А” относятся к полинуклеотиду, кодирующему альфа-токсин. [0066] As used herein, the term “clustering factor A” or “ClfA” refers to bacterial clumping factor A polypeptides, including, without limitation, native clumping factor A polypeptides and isoforms of clumping factor A polypeptides. The term “clumping factor A” includes full-length full-length polypeptides clumping factor A, as well as forms of clumping factor A polypeptides that result from processing within the cell. The terms “adhesion factor A polynucleotide”, “adhesion factor A nucleotide” or “adhesion factor A nucleic acid” refer to a polynucleotide encoding an alpha toxin.

[0067] Используемый в данном документе термин “лейкотоксин” относится к полипептидам бактериального лейкотоксина, включая без ограничения нативные полипептиды лейкотоксина и изоформы полипептидов лейкотоксина. Термин “лейкотоксин” охватывает полноразмерные непроцессированные полипептиды лейкотоксина, а также формы полипептидов лейкотоксина, которые появляются в результате процессинга внутри клетки. Лейкотоксины включают LukSF, лейкотоксин ED (LukED), HlgAB, HlgCB) и лейкотоксин AB (LukAB, также известный как LukGH). Используемый в данном документе термин "HIgB S. aureus" относится к полипептиду, содержащему аминокислотную последовательность SEQ ID NO:59. Используемый в данном документе термин "LukF S. aureus" относится к полипептиду, содержащему аминокислотную последовательность SEQ ID NO:60. Используемый в данном документе термин "LukD S. aureus" относится к полипептиду, содержащему аминокислотную последовательность SEQ ID NO:61. Используемый в данном документе термин "HIgB S. aureus" относится к полипептиду, содержащему аминокислотную последовательность SEQ ID NO:59. (См. фигуру 10.) Термины “полинуклеотид лейкотоксина”, “нуклеотид лейкотоксина” или “нуклеиновая кислота лейкотоксина” относятся к полинуклеотиду, кодирующему лейкотоксин. [0067] As used herein, the term “leukotoxin” refers to bacterial leukotoxin polypeptides, including, without limitation, native leukotoxin polypeptides and isoforms of leukotoxin polypeptides. The term “leukotoxin” includes full-length, full-length leukotoxin polypeptides, as well as forms of leukotoxin polypeptides that result from processing within the cell. Leukotoxins include LukSF, leukotoxin ED (LukED), HlgAB, HlgCB) and leukotoxin AB (LukAB, also known as LukGH). As used herein, the term “ S. aureus HIgB” refers to a polypeptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:59. As used herein, the term " S. aureus LukF" refers to a polypeptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:60. As used herein, the term " S. aureus LukD" refers to a polypeptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:61. As used herein, the term “ S. aureus HIgB” refers to a polypeptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:59. (See Figure 10.) The terms “leukotoxin polynucleotide”, “leukotoxin nucleotide” or “leukotoxin nucleic acid” refer to a polynucleotide encoding a leukotoxin.

[0068] Термин “антитело” обозначает молекулу иммуноглобулина, которая распознает мишень, такую как белок, полипептид, пептид, углевод, полинуклеотид, липид или комбинации вышеуказанных, и специфично связывается с ней посредством по меньшей мере одного антигенраспознающего участка в вариабельной области молекулы иммуноглобулина. Используемый в данном документе термин “антитело” охватывает интактные поликлональные антитела, интактные моноклональные антитела, химерные антитела, гуманизированные антитела, человеческие антитела, слитые белки, содержащие антитело, а также любую другую модифицированную молекулу иммуноглобулина при условии, что антитела проявляют требуемую биологическую активность. Антитело может относиться к любому из пяти основных классов иммуноглобулинов: IgA, IgD, IgE, IgG и IgM или их подклассов (изотипов) (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2) на основании идентичности их константных доменов тяжелой цепи, обозначаемых соответственно как альфа, дельта, эпсилон, гамма и мю. Разные классы иммуноглобулинов имеют различные и хорошо известные структуры субъединиц и трехмерные пространственные конфигурации. Антитела могут быть "голыми" или конъюгированными с другими молекулами, такими как токсины, радиоактивные изотопы и т.д.[0068] The term “antibody” refers to an immunoglobulin molecule that recognizes a target, such as a protein, polypeptide, peptide, carbohydrate, polynucleotide, lipid, or combinations thereof, and specifically binds thereto through at least one antigen recognition site in the variable region of the immunoglobulin molecule. As used herein, the term “antibody” includes intact polyclonal antibodies, intact monoclonal antibodies, chimeric antibodies, humanized antibodies, human antibodies, antibody-containing fusion proteins, as well as any other modified immunoglobulin molecule, provided that the antibodies exhibit the desired biological activity. An antibody may belong to any of the five major classes of immunoglobulins: IgA, IgD, IgE, IgG and IgM or their subclasses (isotypes) (for example, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 and IgA2) based on the identity of their heavy chain constant domains, denoted respectively as alpha, delta, epsilon, gamma and mu. Different classes of immunoglobulins have different and well-known subunit structures and three-dimensional spatial configurations. Antibodies can be "naked" or conjugated to other molecules such as toxins, radioactive isotopes, etc.

[0069] Термин "моноклональные антитела", используемый в данном документе, относится к антителам, которые продуцируются одним клоном B-клеток и связываются с одним и тем же эпитопом. И наоборот, термин "поликлональные антитела" относится к популяции антител, которые продуцируются различными B-клетками и связываются с различными эпитопами одного и того же антигена. [0069] The term “monoclonal antibodies” as used herein refers to antibodies that are produced by a single clone of B cells and bind to the same epitope. Conversely, the term "polyclonal antibodies" refers to a population of antibodies that are produced by different B cells and bind to different epitopes of the same antigen.

[0070] Термин “фрагмент антитела” относится к части интактного антитела. “Антигенсвязывающий фрагмент”, “антигенсвязывающий домен” или “антигенсвязывающая область” относится к части интактного антитела, которая связывается с антигеном. Антигенсвязывающий фрагмент может содержать области интактного антитела, распознающие антиген (например, определяющие комплементарность области (CDR)). Примеры антигенсвязывающих фрагментов антител включают без ограничения Fab-, Fab'-, F(ab')2- и Fv-фрагменты, линейные антитела и одноцепочечные антитела. Антигенсвязывающий фрагмент антитела может быть получен у любого вида животных, таких как грызуны (например, мышь, крыса или хомяк) и у людей, или может быть получен искусственно. [0070] The term “antibody fragment” refers to a portion of an intact antibody. “Antigen binding fragment”, “antigen binding domain” or “antigen binding region” refers to the portion of an intact antibody that binds an antigen. The antigen binding fragment may contain regions of the intact antibody that recognize the antigen (eg, complementarity determining regions (CDRs)). Examples of antigen binding antibody fragments include, but are not limited to, Fab, Fab', F(ab')2 and Fv fragments, linear antibodies and single chain antibodies. The antigen-binding antibody fragment can be obtained from any animal species, such as rodents (e.g. mouse, rat or hamster) and in humans, or can be obtained artificially.

[0071] Полное антитело, как правило, состоит из четырех полипептидов: двух идентичных копий полипептида тяжелой (H) цепи и двух идентичных копий полипептида легкой (L) цепи. Каждая из тяжелых цепей содержит одну N-концевую вариабельную (VH) область и три C-концевых константных (CH1, CH2 и CH3) области, и каждая легкая цепь содержит одну N-концевую вариабельную (VL) область и одну C-концевую константную (CL) область. Вариабельные области каждой пары легкой и тяжелой цепей образуют антигенсвязывающий сайт антитела. Области VH и VL характеризуются одинаковой общей структурой, при этом каждая область содержит четыре каркасные области, последовательности которых являются относительно консервативными. Используемый в данном документе термин “каркасная область” относится к относительно консервативным аминокислотным последовательностям в вариабельной области, которые расположены между гипервариабельными или определяющими комплементарность областями (CDR). В каждом вариабельном домене присутствуют четыре каркасных области, которые обозначены FR1, FR2, FR3 и FR4. Каркасные области образуют β-складки, которые обеспечивают структурный каркас вариабельной области (см., например C.A. Janeway et al. (eds.), Immunobiology, 5th Ed., Garland Publishing, New York, NY (2001)). Три CDR, известные как CDR1, CDR2 и CDR3, образуют “гипервариабельную область” антитела, которая отвечает за связывание антигена.[0071] A complete antibody typically consists of four polypeptides: two identical copies of a heavy (H) chain polypeptide and two identical copies of a light (L) chain polypeptide. Each of the heavy chains contains one N-terminal variable (VH) region and three C-terminal constant (CH1, CH2 and CH3) regions, and each light chain contains one N-terminal variable (VL) region and one C-terminal constant ( CL) area. The variable regions of each pair of light and heavy chains form the antigen-binding site of the antibody. The VH and VL regions have the same overall structure, with each region containing four framework regions whose sequences are relatively conserved. As used herein, the term “framework region” refers to the relatively conserved amino acid sequences in the variable region that are located between the hypervariable or complementarity determining regions (CDRs). Each variable domain contains four framework regions, which are designated FR1, FR2, FR3 and FR4. The framework regions form β-sheets, which provide the structural framework of the variable region (see, for example, CA Janeway et al. (eds.), Immunobiology , 5th Ed., Garland Publishing, New York, NY (2001)). Three CDRs, known as CDR1, CDR2 and CDR3, form the “hypervariable region” of the antibody, which is responsible for antigen binding.

[0072] Термины “VL” и “домен VL” используются взаимозаменяемо для обозначения вариабельной области легкой цепи антитела.[0072] The terms “VL” and “VL domain” are used interchangeably to refer to the light chain variable region of an antibody.

[0073] Термины “VH” и “VH домен” используются взаимозаменяемо для обозначения вариабельной области тяжелой цепи антитела. [0073] The terms “VH” and “VH domain” are used interchangeably to refer to the variable region of the heavy chain of an antibody.

[0074] Выражение “нумерация по Кабату” и подобные выражения известны в данной области техники и относятся к системе нумерации аминокислотных остатков в вариабельных областях тяжелой и легкой цепей антитела или его антигенсвязывающего фрагмента. В определенных случаях CDR могут быть определены в соответствии с системой нумерации по Кабату (см., например, Kabat EA & Wu TT (1971) Ann NY Acad Sci 190: 382-391 and Kabat EA et al., (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242). Согласно используемой системы нумерации по Кабату CDR в молекуле тяжелой цепи антитела, как правило, присутствуют в положениях аминокислот с 31 по 35, которые необязательно могут включать одну или две дополнительные аминокислоты, следующие после 35 (обозначены в схеме нумерации по Кабату как 35A и 35B) (CDR1), положениях аминокислот с 50 по 65 (CDR2) и положениях аминокислот с 95 по 102 (CDR3). Используя систему нумерации по Кабату, CDR в молекуле легкой цепи антитела, как правило, присутствуют в положениях аминокислот с 24 по 34 (CDR1), в положениях аминокислот с 50 по 56 (CDR2) и в положениях аминокислот с 89 по 97 (CDR3). В конкретном варианте осуществления CDR антител, описанных в данном документе, были определены в соответствии со схемой нумерации по Кабату. [0074] The expression “Kabat numbering” and similar expressions are known in the art and refer to a system for numbering amino acid residues in the variable regions of the heavy and light chains of an antibody or antigen binding fragment thereof. In certain cases, CDRs may be defined according to the Kabat numbering system (see, for example, Kabat EA & Wu TT (1971) Ann NY Acad Sci 190: 382-391 and Kabat EAet al., (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242). According to the Kabat numbering system used, CDRs in an antibody heavy chain molecule are typically present at amino acid positions 31 to 35, which may optionally include one or two additional amino acids following 35 (referred to as 35A and 35B in the Kabat numbering scheme) (CDR1), amino acid positions 50 to 65 (CDR2), and amino acid positions 95 to 102 (CDR3). Using the Kabat numbering system, CDRs in an antibody light chain molecule are typically present at amino acid positions 24 to 34 (CDR1), amino acid positions 50 to 56 (CDR2), and amino acid positions 89 to 97 (CDR3). In a specific embodiment, the CDRs of the antibodies described herein have been defined according to the Kabat numbering scheme.

[0075] В отличие от этого Чотиа ссылается на расположение структурных петель (Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)). Конец петли CDR-H1 по Чотиа при нумерации с использованием системы нумерации по Кабату варьирует от H32 до H34 в зависимости от длины петли (это обусловлено тем, что в соответствии со схемой нумерации по Кабату вставки расположены в H35A и H35B; при этом если не присутствуют ни 35A, ни 35B, то петля заканчивается на 32; если присутствует только 35A, то петля заканчивается на 33; если присутствуют как 35A, так и 35B, то петля заканчивается на 34). Определение гипервариабельных участков по AbM представляет собой компромисс между определением CDR по Кабату и структурных петель по Чотиа и применяется в программном обеспечении для моделирования антител AbM от Oxford Molecular.[0075] In contrast, Chothia refers to the arrangement of structural loops (Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)). The Chotia CDR-H1 loop end when numbered using the Kabat numbering system varies from H32 to H34 depending on the length of the loop (this is because the Kabat numbering scheme places the inserts at H35A and H35B; if not present neither 35A nor 35B, then the loop ends on 32; if only 35A is present, then the loop ends on 33; if both 35A and 35B are present, then the loop ends on 34). The AbM definition of hypervariable regions is a compromise between Kabat's CDR and Chotia's structural loops and is used in Oxford Molecular's AbM antibody modeling software.

[0076] Используемый в данном документе термин “константная область” или “константный домен” являются взаимозаменяемыми и имеют свое значение, общепринятое в данной области техники. Константная область представляет собой часть антитела, например, карбокси-концевую часть легкой и/или тяжелой цепи, которая не вовлечена непосредственно в связывание антитела с антигеном, но может проявлять различные эффекторные функции, такие как взаимодействие с Fc-рецептором. Константная область молекулы иммуноглобулина обычно имеет более консервативную аминокислотную последовательность по сравнению с вариабельным доменом иммуноглобулина. [0076] As used herein, the term “constant region” or “constant domain” are used interchangeably and have their meaning as commonly understood in the art. The constant region is part of an antibody, e.g. the carboxy-terminal part of the light and/or heavy chain, which is not directly involved in the binding of the antibody to the antigen, but may exhibit various effector functions, such as interaction with the Fc receptor. The constant region of an immunoglobulin molecule usually has a more conserved amino acid sequence compared to the variable domain of an immunoglobulin.

[0077] Используемый в данном документе “термин тяжелая цепь”, когда он используется в отношении антитела, может относиться к любому отдельному типу, например, альфа (α), дельта (δ), эпсилон (ε), гамма (γ) и мю (µ), исходя из аминокислотной последовательности константного домена, которые дают начало классам антител IgA, IgD, IgE, IgG и IgM соответственно, включая подклассы IgG, например, IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4. Аминокислотные последовательности тяжелых цепей хорошо известны в данной области техники. В конкретных вариантах осуществления тяжелая цепь представляет собой человеческую тяжелую цепь.[0077] As used herein, “heavy chain”, when used in reference to an antibody, can refer to any one type, e.g. alpha (α), delta (δ), epsilon (ε), gamma (γ) and mu (µ), based on the amino acid sequence of the constant domain, which give rise to the antibody classes IgA, IgD, IgE, IgG and IgM, respectively, including subclasses IgG, for example IgG1, IgG2, IgG3 and IgG4. The amino acid sequences of the heavy chains are well known in the art. In specific embodiments, the heavy chain is a human heavy chain.

[0078] Используемый в данном документе термин “легкая цепь” при использовании в отношении антитела может относиться к любому отдельному типу, например, каппа (κ) или лямбда (λ), исходя из аминокислотной последовательности константных доменов. Аминокислотные последовательности легких цепей хорошо известны в данной области техники. В конкретных вариантах осуществления легкая цепь представляет собой человеческую легкую цепь. [0078] As used herein, the term “light chain” when used in reference to an antibody can refer to any one type, e.g. kappa (κ) or lambda (λ), based on the amino acid sequence of the constant domains. The amino acid sequences of the light chains are well known in the art. In specific embodiments, the light chain is a human light chain.

[0079] “Химерное” антитело относится к антителу или его фрагменту, содержащему как человеческие области, так и области, отличные от человеческих. “Гуманизированное” антитело представляет собой антитело, содержащее каркас человеческого антитела и по меньшей мере одну CDR, полученную из антитела, отличного от человеческого, или произошедшую из него. Антитела, отличные от человеческих, включают антитела, выделенные у любого животного, отличного от человека, такого как, например, грызун (например, мышь или крыса). Гуманизированное антитело может содержать одну, две или три CDR, полученных из антитела, отличного от человеческого, или произошедших из него. Полностью человеческое антитело не содержит аминокислотных остатков, полученных от животного, отличного от человека, или произошедших из него. Следует принимать во внимание, что полностью человеческие и гуманизированное антитела несут меньший риск индуцирования иммунных ответов у людей, чем мышиные или химерные антитела (см., например, Harding et al., mAbs, 2(3): 256-26 (2010)).[0079] A “chimeric” antibody refers to an antibody or fragment thereof containing both human and non-human regions. A “humanized” antibody is an antibody comprising a human antibody framework and at least one CDR derived from or derived from a non-human antibody. Non-human antibodies include antibodies isolated from any non-human animal, such as, for example, a rodent (eg, mouse or rat). A humanized antibody may contain one, two or three CDRs derived from or derived from a non-human antibody. A fully human antibody does not contain amino acid residues derived from or derived from a non-human animal. It should be appreciated that fully human and humanized antibodies carry less risk of inducing immune responses in humans than murine or chimeric antibodies (see, for example, Harding et al., mAbs , 2 (3): 256-26 (2010)) .

[0080] Используемый в данном документе термин “эпитоп” относится к локализованной области антигена, с которой может специфически связываться антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. Эпитоп может представлять собой, например, смежные аминокислоты полипептида (линейный или смежный эпитоп), или эпитоп может, например, собираться из двух или более несмежных областей полипептида или полипептидов (конформационный, нелинейный, прерывистый или несмежный эпитоп). В определенных вариантах осуществления эпитоп, с которым связывается антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, можно определить, например, с помощью ЯМР-спектроскопии, рентгеноструктурных кристаллографических исследований, анализов ELISA, водородно-дейтериевого обмена в сочетании с масс-спектрометрией (например, жидкостной хроматографией-масс-спектрометрией с электрораспылением), анализов сканирования олигопептидов на основе матрицы и/или картирующего мутагенеза (например, сайт-направленного картирующего мутагенеза). Для рентгеновской кристаллографии кристаллизацию можно выполнять с использованием любой из известных в данной области техники методик (например, Giegé R et al., (1994) Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 50(Pt 4): 339-350; McPherson A (1990) Eur J Biochem 189: 1-23; Chayen NE (1997) Structure 5: 1269-1274; McPherson A (1976) J Biol Chem 251: 6300-6303). Кристаллы антитело/его антигенсвязывающий фрагмент: антиген можно изучать с использованием хорошо известных рентгеноструктурных методик и можно уточнять с использованием компьютерного программного обеспечения, такого как X-PLOR (Yale University, 1992, распространяется Molecular Simulations, Inc.; см., например, Meth Enzymol (1985) volumes 114 & 115, eds Wyckoff HW et al.,; US 2004/0014194) и BUSTER (Bricogne G (1993) Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 49(Pt 1): 37-60; Bricogne G (1997) Meth Enzymol 276A: 361-423, ed. Carter CW; Roversi P et al., (2000) Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 56(Pt 10): 1316-1323). Исследования по картирующему мутагенезу можно выполнить с использованием любого способа, известного специалисту в данной области техники. См., например, Champe M et al., (1995) J Biol Chem 270: 1388-1394 и Cunningham BC & Wells JA (1989) Science 244: 1081-1085 для описания методов мутагенеза, включая методы мутагенеза с аланиновым сканированием.[0080] As used herein, the term “epitope” refers to a localized region of an antigen to which an antibody or antigen-binding fragment thereof can specifically bind. An epitope may be, for example, contiguous amino acids of a polypeptide (linear or contiguous epitope), or an epitope may, for example, be assembled from two or more non-contiguous regions of a polypeptide or polypeptides (conformational, non-linear, discontinuous or non-contiguous epitope). In certain embodiments, the epitope to which an antibody or antigen-binding fragment thereof binds can be determined, for example, by NMR spectroscopy, X-ray crystallographic studies, ELISA assays, hydrogen-deuterium exchange coupled with mass spectrometry (e.g., liquid chromatography-electrospray mass spectrometry), matrix-based oligopeptide scanning assays, and/or mapping mutagenesis (e.g. site-directed mapping mutagenesis). For X-ray crystallography, crystallization can be performed using any of the techniques known in the art (for example, Giege Ret al., (1994) Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 50(Pt 4): 339-350; McPherson A (1990) Eur J Biochem 189: 1–23; Chayen NE (1997) Structure 5: 1269-1274; McPherson A (1976) J Biol Chem 251: 6300–6303). Antibody/antigen-binding fragment crystals: Antigen can be studied using well-known X-ray diffraction techniques and can be refined using computer software such as X-PLOR (Yale University, 1992, distributed by Molecular Simulations, Inc.; see, e.g. Meth Enzymol (1985) volumes 114 & 115, eds Wyckoff HWet al.,; US 2004/0014194) and BUSTER (Bricogne G (1993) Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 49(Pt 1): 37-60; Bricogne G (1997) Meth Enzymol 276A: 361-423, ed. Carter CW; Roversi Pet al., (2000) Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 56(Pt 10): 1316–1323). Mapping mutagenesis studies can be performed using any method known to one skilled in the art. Cm., For example, Champe Met al., (1995) J Biol Chem 270: 1388-1394 and Cunningham BC & Wells JA (1989) Science 244: 1081-1085 for a description of mutagenesis methods, including alanine scanning mutagenesis methods.

[0081] Антитело, которое “связывается с тем же эпитопом”, что и референтное антитело, относится к антителу, которое связывается с теми же аминокислотными остатками, что и референтное антитело. Способность антитела связываться с тем же эпитопом, что и референтное антитело, можно определить с помощью анализа на основе водородно-дейтериевого обмена (см. Coales et al. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2009; 23: 639-647) или рентгеновской кристаллографии. [0081] An antibody that “binds to the same epitope” as a reference antibody refers to an antibody that binds to the same amino acid residues as the reference antibody. The ability of an antibody to bind to the same epitope as a reference antibody can be determined using a hydrogen-deuterium exchange assay (see Coales et al. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2009; 23: 639-647) or x-ray crystallography.

[0082] Используемые в данном документе термины “иммуноспецифически связывается”, “иммуноспецифически распознает”, “специфически связывает” и “специфически распознает” являются аналогичными терминами в контексте антител или их антигенсвязывающих фрагментов. Эти термины указывают на то, что антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с эпитопом посредством своего антигенсвязывающего домена, и что связывание предполагает некоторую степень комплементарности между антигенсвязывающим доменом и эпитопом. Соответственно, например, антитело, которое “специфически связывается” с первым лейкотоксином S. aureus, может также связываться с другими лейкотоксинами S. aureus, но степень связывания с неродственным белком, отличным от лейкотоксина, составляет менее приблизительно 10% от связывания антитела с первым лейкотоксином S. aureus при измерении, например, с помощью радиоиммунологического анализа (RIA), твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA), анализа связывания BiaCore или Оctet. [0082] As used herein, the terms “immunospecifically binds,” “immunospecifically recognizes,” “specifically binds,” and “specifically recognizes” are analogous terms in the context of antibodies or antigen-binding fragments thereof. These terms indicate that the antibody or antigen-binding fragment thereof binds to an epitope through its antigen-binding domain, and that binding involves some degree of complementarity between the antigen-binding domain and the epitope. Accordingly, for example, an antibody that “specifically binds” to the first S. aureus leukotoxin may also bind to other S. aureus leukotoxins, but the extent of binding to an unrelated protein other than the leukotoxin is less than about 10% of the antibody binding to the first leukotoxin S. aureus when measured, for example, by radioimmunoassay (RIA), enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), BiaCore binding assay or Octet.

[0083] Утверждается, что антитело "конкурентно подавляет" связывание референтного антитела с данным эпитопом, если оно преимущественно связывается с этим эпитопом или перекрывающимся эпитопом в такой степени, что оно до некоторой степени блокирует связывание референтного антитела с эпитопом. Конкурентное подавление можно определить с помощью любого способа, известного в данной области техники, например, с помощью конкурентных анализов ELISA. Можно сказать, что антитело конкурентно подавляет связывание референтного антитела с данным эпитопом на по меньшей мере 90%, на по меньшей мере 80%, на по меньшей мере 70%, на по меньшей мере 60% или на по меньшей мере 50%.[0083] An antibody is said to “competitively inhibit” the binding of a reference antibody to a given epitope if it preferentially binds to that epitope or overlapping epitope to such an extent that it blocks the reference antibody from binding to the epitope to some extent. Competitive inhibition can be determined using any method known in the art, for example, using competitive ELISA assays. The antibody can be said to competitively inhibit the binding of a reference antibody to a given epitope by at least 90%, at least 80%, at least 70%, at least 60%, or at least 50%.

[0084] Термин “последовательность нуклеиновой кислоты” предназначен для охвата полимера ДНК или РНК, т. е. полинуклеотида, который может быть одноцепочечным или двухцепочечным, и который может содержать неприродные или измененные нуклеотиды. Термины “нуклеиновая кислота” и “полинуклеотид”, используемые в данном документе, относятся к полимерной форме нуклеотидов любой длины, или к рибонуклеотидам (РНК), или к дезоксирибонуклеотидам (ДНК). Эти термины относятся к первичной структуре молекулы и, таким образом, включают двух- и одноцепочечную ДНК, а также двух- и одноцепочечную РНК. В качестве эквивалентов термины включают аналоги РНК или ДНК, полученные из аналогов нуклеотидов и модифицированных полинуклеотидов, таких как без ограничения метилированные и/или кэпированные полинуклеотиды. Нуклеиновые кислоты, как правило, связаны через фосфатные связи с образованием последовательностей нуклеиновых кислот или полинуклеотидов, хотя в данной области техники известны многие другие связи (например, фосфоротиоаты, боранофосфаты и т. п.).[0084] The term “nucleic acid sequence” is intended to cover a polymer of DNA or RNA, that is, a polynucleotide that may be single-stranded or double-stranded, and which may contain unnatural or altered nucleotides. The terms “nucleic acid” and “polynucleotide” as used herein refer to the polymeric form of nucleotides of any length, either ribonucleotides (RNA) or deoxyribonucleotides (DNA). These terms refer to the primary structure of the molecule and thus include double- and single-stranded DNA as well as double- and single-stranded RNA. As equivalents, the terms include RNA or DNA analogues derived from nucleotide analogues and modified polynucleotides, such as, but not limited to, methylated and/or capped polynucleotides. Nucleic acids are typically linked through phosphate bonds to form nucleic acid or polynucleotide sequences, although many other linkages are known in the art (eg, phosphorothioates, boranophosphates, etc.).

[0085] Инфекция, вызываемая S. aureus, может проявляться, например, в виде инфекции кожи или мягких тканей (SSTI) или бактериемии. Бактерии S. aureus могут распространяться с кровотоком и инфицировать определенные участки тела, вызывая пневмонию, пневмонию в ICU, инфекцию нижних конечностей у больного диабетом, диабетическую язву стопы (DFU), инфекцию костей или суставов, инфекцию, ассоциированную с медицинским изделием в организме, раневую инфекцию, хирургическую раневую инфекцию или остеомиелит.[0085] Infection caused by S. aureus may present, for example, as a skin or soft tissue infection (SSTI) or bacteremia. Bacteria S. aureus can spread through the bloodstream and infect specific areas of the body, causing pneumonia, pneumonia in the ICU, lower extremity infection in a diabetic patient, diabetic foot ulcer (DFU), bone or joint infection, infection associated with a medical device in the body, wound infection, surgical wound infection or osteomyelitis.

[0086] Термины “трансфекция”, “трансформация” или “трансдукция”, используемые в данном документе, относятся к введению одного или нескольких экзогенных полинуклеотидов в клетку-хозяина с использованием физических или химических методов. Многие методы трансфекции известны в данной области техники и включают, например, совместное осаждение ДНК фосфатом кальция (см., например Murray E.J. (ed.), Methods in Molecular Biology, Vol. 7, Gene Transfer and Expression Protocols, Humana Press (1991)); DEAE-декстраном; электропорацию; катионную трансфекцию, опосредованную липосомами; бомбардировку микрочастицами с помощью частиц вольфрама (Johnston, Nature, 346: 776-777 (1990)); и совместное осаждение ДНК фосфатом стронция (Brash et al., Mol. Cell Biol., 7: 2031-2034 (1987)). Фаговые или вирусные векторы могут быть введены в клетки-хозяева после роста инфекционных частиц в подходящих упаковывающих клетках, многие из которых являются коммерчески доступными.[0086] The terms “transfection,” “transformation,” or “transduction” as used herein refer to the introduction of one or more exogenous polynucleotides into a host cell using physical or chemical methods. Many transfection methods are known in the art and include, for example, calcium phosphate co-precipitation of DNA (see, for example, Murray EJ (ed.), Methods in Molecular Biology, Vol. 7, Gene Transfer and Expression Protocols , Humana Press (1991) ); DEAE-dextran; electroporation; liposome-mediated cationic transfection; microparticle bombardment using tungsten particles (Johnston, Nature , 346 : 776-777 (1990)); and co-precipitation of DNA with strontium phosphate (Brash et al., Mol. Cell Biol. , 7 : 2031-2034 (1987)). Phage or viral vectors can be introduced into host cells following growth of infectious particles in suitable packaging cells, many of which are commercially available.

[0087] Используемые в данном документе термины “лечение”, “осуществление лечения” и т.п. относятся к получению необходимого фармакологического и/или физиологического эффекта. В одном варианте осуществления эффект является терапевтическим, т.е. эффект обеспечивает частичное или полное излечение заболевания и/или неблагоприятного симптома, относящегося к заболеванию. [0087] As used herein, the terms “treatment,” “providing treatment,” and the like. refer to obtaining the desired pharmacological and/or physiological effect. In one embodiment, the effect is therapeutic, i.e. the effect provides partial or complete cure of the disease and/or an adverse symptom related to the disease.

[0088] “Терапевтически эффективное количество” относится к количеству, эффективному в дозах и в течение периодов времени, необходимых для достижения требуемого терапевтического результата (например, лечения инфекции, вызываемой S. aureus). Терапевтически эффективное количество может варьироваться в соответствии с такими факторами, как состояние заболевания, возраст, пол и вес индивидуума и способность антитела или антигенсвязывающего фрагмента вызывать необходимый ответ у индивидуума. [0088] “Therapeutically effective amount” refers to an amount effective in doses and for periods of time necessary to achieve the desired therapeutic result (eg, treatment of an infection caused by S. aureus ). The therapeutically effective amount may vary according to factors such as the disease state, age, sex and weight of the individual and the ability of the antibody or antigen binding fragment to elicit the desired response in the individual.

[0089] “Профилактически эффективное количество” относится к количеству, эффективному в дозах и в течение периодов времени, необходимых для достижения требуемого профилактического результата (например, предупреждения инфекции, вызываемой S. aureus, или возникновения заболевания).[0089] “Prophylactically effective amount” refers to an amount effective at doses and for periods of time necessary to achieve the desired prophylactic result (eg, preventing S. aureus infection or disease).

[0090] Выражения “вводить”, “осуществление введения”, “введение” и т.п., используемые в данном документе, относятся к способам, которые можно применять для осуществления доставки лекарственного средства, например, комбинации антител к S. aureus или их антигенсвязывающих фрагментов к требуемому месту биологического действия (например, внутривенное введение). Методики введения, которые можно использовать со средствами и способами, описанными в данном документе, можно найти, например, в Goodman and Gilman, The Pharmacological Basis of Therapeutics, текущее издание, Pergamon и в Remington’s, Pharmaceutical Sciences, текущее издание, Mack Publishing Co., Easton, Pa. [0090] The expressions “administering,” “administering,” “administering,” and the like, as used herein, refer to methods that can be used to deliver a drug, such as a combination of antibodies toS. aureus or antigen-binding fragments thereof to the desired site of biological action (eg, intravenous administration). Administration techniques that can be used with the tools and methods described herein can be found, for example, at Goodman and Gilman,The Pharmacological Basis of Therapeutics, current edition, Pergamon and at Remington's,Pharmaceutical Sciences, current edition, Mack Publishing Co., Easton, Pa.

[0091] Введение "в комбинации с" одним или несколькими дополнительными терапевтическими средствами включает одновременное (совместное) или последовательное введение в любом порядке. [0091] Administration "in combination with" one or more additional therapeutic agents includes simultaneous (co-) or sequential administration in any order.

[0092] Используемые в настоящем изобретении и формуле изобретения формы единственного числа включают формы множественного числа, если из контекста явно не следует иное.[0092] As used in the present invention and claims, the singular forms include the plural forms unless the context clearly requires otherwise.

[0093] Если конкретно не указано или не очевидно из контекста, используемый в данном документе союз "или" понимают как включающий. Выражение "и/или", используемое в данном документе в такой фразе, как "A и/или B", предназначено для включения "как А, так и В", "А или В", "А" и "В". Аналогичным образом термин "и/или", используемый в такой фразе, как "A, B и/или C", предназначен для охвата каждого из следующих вариантов осуществления: А, В и С; А, В или С; А или С; А или В; В или С; А и С; А и В; В и С; А (отдельно); В (отдельно) и С (отдельно).[0093] Unless specifically stated or obvious from the context, the conjunction “or” as used herein is understood to be inclusive. The expression "and/or" as used herein in a phrase such as "A and/or B" is intended to include "both A and B", "A or B", "A" and "B". Likewise, the term “and/or” as used in a phrase such as “A, B and/or C” is intended to cover each of the following embodiments: A, B and C; A, B or C; A or C; A or B; B or C; A and C; A and B; B and C; A (separately); B (separately) and C (separately).

Антитела к Staphylococcus aureus и их комбинацииAntibodies to Staphylococcus aureus and their combinations

[0094] В данном документе предусмотрено, что антитела и их антигенсвязывающие фрагменты (например, моноклональные антитела и фрагменты), которые связываются с белками S. aureus, можно использовать в комбинации. В частности, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связываются с белком, представляющим собой альфа-токсин (AT) S. aureus, антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связываются с белком, представляющим собой фактор слипания А (ClfA) S. aureus, и антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связываются с по меньшей мере одним белком, представляющим собой лейкотоксин S. aureus, можно успешно использовать в комбинации. [0094] This document provides that antibodies and antigen-binding fragments (eg, monoclonal antibodies and fragments) that bind to S. aureus proteins can be used in combination. In particular, antibodies and antigen-binding fragments thereof that bind to S. aureus alpha-toxin (AT) protein, antibodies and antigen-binding fragments thereof that bind to S. aureus clumping factor A (ClfA) protein, and antibodies and antigen-binding fragments thereof that bind to at least one S. aureus leukotoxin protein can be advantageously used in combination.

[0095] Альфа-токсин (AT) является ключевым фактором вирулентности при некоторых заболеваниях, вызываемых S. aureus, включая пневмонию, инфекции кожи и мягких тканей (SSTI) и бактериемию (Bubeck Wardenburg, J. and O. Schneewind, J. Exp. Med., 205: 287-294 (2008); Inoshima et al., J. Invest. Dermatol., 132: 1513-1516 (2012) и Foletti et al., выше). Пассивная иммунизация моноклональными антителами к AT снижала тяжесть заболевания в моделях пневмонии и дермонекроза (Hua et al., Antimicrob. Agents Chemother., 58: 1108-1117 (2014); Tkaczyk et al., Clin. Vaccine Immunol., 19: 377-385 (2012) и Ragle, B.E. and J. Wardenburg Bubeck, Infect. Immun., 77: 2712-2718 (2009)), а вакцинация анатоксином AT, содержащим мутацию H35L (ATH35L), защищала от смерти в мышиных моделях бактериемии с летальным исходом и пневмонии (Bubeck Wardenburg выше, Foletti et al. выше, Hua et al. выше, Ragle выше, Menzies, B.E. and D.S Kernodle, Infect. Immun., 77: 2712-2718 (2009) и Adhikari et al., PLoS One, 7: e38567 (2012)). AT способствует множеству аспектов патогенеза, обусловленного S. aureus, во время бактериемии и сепсиса, включая стимуляцию гипервоспалительного ответа, характерного для сепсиса, и активацию ADAM10-опосредованного расщепления эндотелиальных плотных контактов, что приводит к нарушению целостности сосудов (Powers et al., J. Infect. Dis., 206: 352-356 (2012); Wilke, G.A. and J. Bubeck Wardenburg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 107: 13473-13478 (2010) и Becker et al., J Innate Immun., 6: 619-631 (2014)). Также было продемонстрировано, что AT нацеливается на тромбоциты, что предотвращает восстановление поврежденного эндотелиального барьера и способствует дисфункции органов за счет образования агрегатов тромбоцитов и нейтрофилов (Powers et al., Cell Host Microbe, 17: 775-787 (2015)). Структура и функция альфа-токсина подробно описаны, например, в Bhakdi, S. and J. Tranum-Jensen, Microbiol. Mol. Biol. Rev., 55(4): 733-751 (1991).[0095] Alpha toxin (AT) is a key virulence factor in several diseases caused byS. aureus, including pneumonia, skin and soft tissue infections (SSTI) and bacteremia (Bubeck Wardenburg, J. and O. Schneewind,J. Exp. Med.,205: 287-294 (2008); Inoshima et al.J. Invest. Dermatol.,132: 1513-1516 (2012) and Foletti et al., higher). Passive immunization with anti-AT monoclonal antibodies reduced disease severity in models of pneumonia and dermonecrosis (Hua et al.,Antimicrob. Agents Chemother.,58: 1108-1117 (2014); Tkaczyk et al.Clin. Vaccine Immunol.,19: 377-385 (2012) and Ragle, B.E. and J. Wardenburg Bubeck,Infect. Immun.,77: 2712-2718 (2009)), and vaccination with AT toxoid containing the H35L mutation (ATH35L) protected against death in mouse models of fatal bacteremia and pneumonia (Bubeck Wardenburg above, Foletti et al. above, Hua et al. above, Ragle above, Menzies, B.E. and D.S Kernodle,Infect. Immun.,77: 2712-2718 (2009) and Adhikari et al.,PLoS One,7: e38567 (2012)). AT contributes to multiple aspects of pathogenesis due toS. aureus, during bacteremia and sepsis, including stimulation of the hyperinflammatory response characteristic of sepsis and activation of ADAM10-mediated breakdown of endothelial tight junctions, leading to compromised vascular integrity (Powers et al.,J. Infect. Dis.,206: 352-356 (2012); Wilke, G. A. and J. Bubeck Wardenburg,Proc. Natl. Acad. Sci. USA,107: 13473-13478 (2010) and Becker et al.,J Innate Immun.,6: 619-631 (2014)). AT has also been demonstrated to target platelets, which prevents repair of the damaged endothelial barrier and promotes organ dysfunction through the formation of platelet and neutrophil aggregates (Powers et al.,Cell Host Microbe,17: 775-787 (2015)). The structure and function of alpha toxin are described in detail, for example, in Bhakdi, S. and J. Tranum-Jensen,Microbiol. Mol. Biol. Rev.,55(4): 733-751 (1991).

[0096] Моноклональные и поликлональные антитела, которые связывают AT, известны в данной области техники (см., например, Hua et al., Antimicrob. Agents Chemother., 58(2): 1108-1117 (2014) и Oganesyan et al., J. Biol. Chem., 289: 29874-29880 (2014)) и коммерчески доступны от, например, Sigma Aldrich (Сент-Луис, Миссури) и AbCam (Кембридж, Массачусетс). Иллюстративные антитела, которые связываются с AT, раскрыты, например, в патентных документах WO 2012/109285 и WO 2014/074540 (которые оба включены в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте).[0096] Monoclonal and polyclonal antibodies that bind AT are known in the art (see, for example, Hua et al., Antimicrob. Agents Chemother ., 58 (2): 1108-1117 (2014) and Oganesyan et al. , J. Biol. Chem ., 289 : 29874–29880 (2014)) and are commercially available from, for example, Sigma Aldrich (St. Louis, MO) and AbCam (Cambridge, MA). Exemplary antibodies that bind to AT are disclosed, for example, in patent documents WO 2012/109285 and WO 2014/074540 (both of which are incorporated herein by reference in their entirety).

[0097] В одном случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с альфа-токсином (AT) S. aureus, содержат, состоят по сути из или состоят из (i) полипептида тяжелой цепи, содержащего аминокислотную последовательность CDR1 под SEQ ID NO:1, аминокислотную последовательность CDR2 под SEQ ID NO:2 и аминокислотную последовательность CDR3 под SEQ ID NO:3, и (ii) полипептида легкой цепи, содержащего аминокислотную последовательность CDR1 под SEQ ID NO:10, аминокислотную последовательность CDR2 под SEQ ID NO:11 и аминокислотную последовательность CDR3 под SEQ ID NO:12. В другом случае полипептид тяжелой цепи антитела или антигенсвязывающего фрагмента (например, моноклонального антитела или фрагмента), который специфически связывается с АТ S. aureus, содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности вариабельной области под SEQ ID NO:19. В другом случае полипептид легкой цепи антитела или антигенсвязывающего фрагмента (например, моноклонального антитела или фрагмента), который специфически связывается с АТ S. aureus, содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности вариабельной области под SEQ ID NO:33. В другом случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с АТ S. aureus, содержат, состоят по сути из или состоят из вариабельной области тяжелой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:19, и вариабельной области легкой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:33. В другом случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с АТ S. aureus, содержат, состоят по сути из или состоят из тяжелой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:47, и/или вариабельной области легкой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:52. [0097] In one instance, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to S. aureus alpha toxin (AT) contains, consists essentially of, or consists of (i) a heavy chain polypeptide containing the amino acid sequence of CDR1 of SEQ ID NO:1, the amino acid sequence of CDR2 of SEQ ID NO:2 and the amino acid sequence of CDR3 of SEQ ID NO:3, and (ii) a light chain polypeptide containing the amino acid sequence of CDR1 of SEQ ID NO:10, amino acid the CDR2 sequence of SEQ ID NO:11 and the amino acid sequence of CDR3 of SEQ ID NO:12. In another embodiment, the heavy chain polypeptide of an antibody or antigen binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to the S. aureus AT contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of the variable region of SEQ ID NO:19. In another embodiment, the light chain polypeptide of an antibody or antigen binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to the S. aureus AT contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of the variable region of SEQ ID NO:33. Alternatively, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to the S. aureus Ab contains, consists essentially of, or consists of a heavy chain variable region that contains, consists essentially of, or consists of an amino acid the sequence of SEQ ID NO:19, and a light chain variable region that contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO:33. In another case, an antibody or antigen-binding fragment (for example, a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to the S. aureus AT contains, consists essentially of, or consists of a heavy chain that contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence below SEQ ID NO:47, and/or a light chain variable region that contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO:52.

[0098] Было продемонстрировано, что среди многих поверхностных адгезинов S. aureus фактор слипания A (ClfA) играет важную роль в серьезных инфекциях кровотока (Foster et al., Nat. Rev. Microbiol., 12: 49-62 (2014) и Murphy et al., Hum. Vaccin., 7(Suppl): 51-59 (2011)). ClfA связывает фибриноген и способствует как прикреплению бактерий к фибриногену, так и слипанию бактерий, поэтому оба действия являются ключевыми в развитии инфекции кровотока, вызванной S. aureus (Vaudaux et al., Infect. Immun., 63: 585-590 (1995); McDevitt et al., Mol. Microbiol., 11: 237-248 (1994) и McDevitt et al., Eur. J. Biochem., 247: 416-424 (1997)). ClfA, связанный с фибрином или фибриногеном в месте повреждения, или нанесенный на постоянное устройство, может способствовать слипанию бактерий (Foster et al., выше) и скоплению бактерий, что, как считается, увеличивает бактериальную инвазивность (McDevitt et al., Eur. J. Biochem., 247: 416-424 (1997); McAdow et al., PLoS Pathog., 7:e1002307 (2011); Flick et al., Blood, 121: 1783-1794 (2013) и Rothfork et al., J. Immunol., 171: 5389-5395 (2003)). Также сообщалось, что ClfA нарушает депонирование комплемента, необходимое для опсонофагоцитарного уничтожения бактерий (OPK) (Hair et al., Infect. Immun., 78: 1717-1727 (2010)). В соответствии с этими наблюдениями, изогенные мутанты ΔclfA проявляли пониженную вирулентность в моделях инфекции (McAdow et al., выше; Josefsson et al., PLoS One, 3: e2206 (2008) и Josefsson et al., J Infect. Dis., 184: 1572-1580 (2001)). Кроме того, пассивная иммунизация человеческим обогащенным внутривенным (в/в) иммуноглобулином (Ig) (INH-A21 или Veronate) или моноклональным антителом (тефибазумабом или аурексисом) к ClfA улучшала исходы заболевания у пациентов с инфекциями кровотока, вызванными S. aureus (Vernachio et al., Antimcirob. Agents Chemother., 47: 3400-3406 (2003) и Vernachio et al., Antimicrob. Agents Chemother., 50: 511-518 (2006)). Однако эти препараты на основе антител не улучшили результаты клинических исследований профилактики или вспомогательной терапии ванкомицином для предотвращения или лечения бактериемии, вызванной S. aureus, у младенцев с очень низкой массой тела при рождении (DeJonge et al., J. Pediatr., 151: 260-265 (2007); Capparelli et al., Antimicrob. Agents Chemother., 49: 4121-4127 (2005) и Bloom et al., Pediatr. Infect. Dis., 24: 858-866 (2005)). Структура и функция ClfA подробно описаны, например, в McDevitt et al., Mol. Microbiol., 11: 237-248 (1994)).[0098] It has been demonstrated that among many surface adhesinsS. aureus clumping factor A (ClfA) plays an important role in serious bloodstream infections (Foster et al.,Nat. Rev. Microbiol.,12: 49-62 (2014) and Murphy et al.,Hum. Vaccin.,7(Suppl): 51-59 (2011)). ClfA binds fibrinogen and promotes both bacterial attachment to fibrinogen and bacterial adhesion, so both actions are key in the development of bloodstream infection caused byS. aureus (Vaudaux et al.Infect. Immun.,63: 585-590 (1995); McDevitt et al.Mol. Microbiol.,eleven: 237-248 (1994) and McDevitt et al.,Eur. J. Biochem.,247: 416-424 (1997)). ClfA bound to fibrin or fibrinogen at the site of injury, or applied to a permanent device, may promote bacterial aggregation (Foster et al., above) and bacterial accumulation, which is thought to increase bacterial invasiveness (McDevitt et al.,Eur. J. Biochem.,247: 416-424 (1997); McAdow et al.PLoS Pathog.,7:e1002307 (2011); Flick et al.Blood,121: 1783-1794 (2013) and Rothfork et al.,J. Immunol.,171: 5389-5395 (2003)). ClfA has also been reported to disrupt complement deposition required for opsonophagocytic killing of bacteria (OPK) (Hair et al.,Infect. Immun.,78: 1717-1727 (2010)). Consistent with these observations, isogenic ΔclfA mutants exhibited reduced virulence in infection models (McAdow et al., higher; Josefsson et al.PLoS One,3: e2206 (2008) and Josefsson et al.,J Infect. Dis.,184: 1572-1580 (2001)). In addition, passive immunization with human enriched intravenous (IV) immunoglobulin (Ig) (INH-A21 or Veronate) or monoclonal antibody (tefibazumab or aurexis) to ClfA improved disease outcomes in patients with bloodstream infections caused byS. aureus (Vernachio et al.Antimcirob. Agents Chemother.,47: 3400-3406 (2003) and Vernachio et al.,Antimicrob. Agents Chemother.,50: 511-518 (2006)). However, these antibody drugs did not improve the results of clinical trials of vancomycin prophylaxis or adjuvant therapy to prevent or treat bacteremia caused byS. aureus, in very low birth weight infants (DeJonge et al.J.Pediatr..,151: 260-265 (2007); Capparelli et al., Antimicrob. Agents Chemother., 49: 4121-4127 (2005) and Bloom et al.,Pediatr. Infect. Dis.,24: 858-866 (2005)). The structure and function of ClfA are described in detail, for example, in McDevitt et al.,Mol. Microbiol.,eleven: 237-248 (1994)).

[0099] Моноклональные и поликлональные антитела, которые связывают ClfA, известны в данной области техники (см., например патент США 7364738; Hall et al., Infect. Immun., 71(12): 6864-6870 (2003) и Vernachio et al., Antimicrob. Agents Chemother., 47(11): 3400-3406 (2003)) и коммерчески доступны от, например, Creative Biolabs (Ширли, Нью-Йорк). Иллюстративные антитела, которые связываются с ClfA, раскрыты, например, в патентных документах WO 2014/074540 и US 62/70262 (которые оба включены в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте).[0099] Monoclonal and polyclonal antibodies that bind ClfA are known in the art (see, for example, US Pat. No. 7,364,738; Hall et al., Infect. Immun ., 71 (12): 6864-6870 (2003) and Vernachio et al. al., Antimicrob. Agents Chemother ., 47 (11): 3400-3406 (2003)) and are commercially available from, for example, Creative Biolabs (Shirley, New York). Exemplary antibodies that bind to ClfA are disclosed, for example, in patent documents WO 2014/074540 and US 62/70262 (both of which are incorporated herein by reference in their entirety).

[00100] В одном случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с фактором слипания А (ClfA) S. aureus, содержат, состоят по сути из или состоят из (i) полипептида тяжелой цепи, содержащего аминокислотную последовательность CDR1 под SEQ ID NO:4, аминокислотную последовательность CDR2 под SEQ ID NO:5 и аминокислотную последовательность CDR3 под SEQ ID NO:6, и (ii) полипептида легкой цепи, содержащего аминокислотную последовательность CDR1 под SEQ ID NO:13, аминокислотную последовательность CDR2 под SEQ ID NO:14 и аминокислотную последовательность CDR3 под SEQ ID NO:15. В другом случае полипептид тяжелой цепи антитела или антигенсвязывающего фрагмента (например, моноклонального антитела или фрагмента), который специфически связывается с ClfA S. aureus, содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности вариабельной области под SEQ ID NO:20. В другом случае полипептид легкой цепи антитела или антигенсвязывающего фрагмента (например, моноклонального антитела или фрагмента), который специфически связывается с ClfA S. aureus, содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности вариабельной области под SEQ ID NO:34. В другом случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с ClfA S. aureus, содержат, состоят по сути из или состоят из вариабельной области тяжелой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:20, и вариабельной области легкой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:34. В определенных случаях антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с ClfA S. aureus, содержат константный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность CSYHLC (SEQ ID NO:55), MHEACSYHLCQKSLSLS (SEQ ID NO:56) или аминокислоты 233-454 из SEQ ID NO:49. В другом случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с ClfA S. aureus, содержат, состоят по сути из или состоят из тяжелой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:49, и/или вариабельной области легкой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:53. [00100] In one embodiment, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to S. aureus clumping factor A (ClfA) contains, consists essentially of, or consists of (i) a heavy chain polypeptide containing the amino acid sequence of CDR1 of SEQ ID NO:4, the amino acid sequence of CDR2 of SEQ ID NO:5 and the amino acid sequence of CDR3 of SEQ ID NO:6, and (ii) a light chain polypeptide containing the amino acid sequence of CDR1 of SEQ ID NO:13, amino acid the CDR2 sequence of SEQ ID NO:14 and the amino acid sequence of CDR3 of SEQ ID NO:15. In another instance, a heavy chain polypeptide of an antibody or antigen binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to S. aureus ClfA contains, consists essentially of, or consists of the variable region amino acid sequence of SEQ ID NO:20. In another embodiment, a light chain polypeptide of an antibody or antigen binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to S. aureus ClfA contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of the variable region of SEQ ID NO:34. In another instance, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to S. aureus ClfA contains, consists essentially of, or consists of a heavy chain variable region that contains, consists essentially of, or consists of an amino acid the sequence of SEQ ID NO:20, and a light chain variable region that contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO:34. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds S. aureus ClfA contains a heavy chain constant domain containing the amino acid sequence CSYHLC (SEQ ID NO:55), MHEACSYHLCQKSLSLS (SEQ ID NO:56 ) or amino acids 233-454 of SEQ ID NO:49. In another case, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to S. aureus ClfA contains, consists essentially of, or consists of a heavy chain that contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence below SEQ ID NO:49, and/or a light chain variable region that contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO:53.

[00101] В другом случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с ClfA S. aureus (например, антитело с CDR, VH и/или VL или тяжелой или легкой цепями из SAR114-N3Y), характеризуются значениями IC50 по отношению к ClfA001, ClfA002 и ClfA004 в анализе подавления связывания фибриногена, которые находятся в пределах 2 мкг/мл друг от друга. Например, IC50 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по отношению ко всем ClfA001, ClfA002 и ClfA004 могут находиться в диапазоне от 1 мкг/мл до 5 мкг/мл. Все значения аффинности связывания (KD) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по отношению к ClfA001, ClfA002 и ClfA004 могут находиться в диапазоне от 200 до 350 пМ.[00101] Alternatively, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to S. aureus ClfA (e.g., an antibody with CDR, VH and/or VL or heavy or light chains from SAR114-N3Y) characterized by IC50 values for ClfA001, ClfA002, and ClfA004 in the fibrinogen binding inhibition assay that are within 2 μg/mL of each other. For example, the IC 50 of an antibody or an antigen binding fragment thereof to ClfA001, ClfA002 and ClfA004 may all range from 1 μg/ml to 5 μg/ml. The binding affinities ( KD ) of an antibody or antigen binding fragment thereof for ClfA001, ClfA002 and ClfA004 may all range from 200 to 350 pM.

[00102] В другом случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с ClfA S. aureus (например, антитело с CDR, VH и/или VL или тяжелой или легкой цепями из SAR114-N3Y), характеризуются мономерной чистотой, которая снижается на не более чем 5% после воздействия типичным белым светом при 2 клк/ч при температуре 23°C в течение 14 дней. [00102] Alternatively, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to S. aureus ClfA (e.g., an antibody with CDR, VH and/or VL or heavy or light chains from SAR114-N3Y) characterized by a monomeric purity that decreases by no more than 5% after exposure to typical white light at 2 klx/h at 23°C for 14 days.

[00103] Лейкотоксины представляют собой еще один тип фактора вирулентности S. aureus. Лейкотоксины нацелены на разрушение широкого спектра иммунных клеток. Лейкотоксины включают лейкоцидин Пантона-Валентайна (LukSF-PV, также известный как LukSF), лейкотоксин ED (LukED), гамма-гемолизин (который существует в виде двух токсинов: HlgAB и HlgCB) и лейкотоксин AB (LukAB, также известный как LukGH). В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином, связываются с LukF, LukD и/или HIgAB. В определенных случаях антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином, связываются с LukF, LukD и HIgB. [00103] Leukotoxins are another type of S. aureus virulence factor. Leukotoxins target a wide range of immune cells. Leukotoxins include Panton-Valentine leukocidin (LukSF-PV, also known as LukSF), leukotoxin ED (LukED), gamma-hemolysin (which exists as two toxins: HlgAB and HlgCB), and leukotoxin AB (LukAB, also known as LukGH). In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one leukotoxin binds to LukF, LukD and/or HIgAB. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one leukotoxin binds to LukF, LukD and HIgB.

[00104] В одном случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат, состоят по сути из или состоят из (i) полипептида тяжелой цепи, содержащего аминокислотную последовательность CDR1 под SEQ ID NO:7, аминокислотную последовательность CDR2 под SEQ ID NO:8 и аминокислотную последовательность CDR3 под SEQ ID NO:9, и (ii) полипептида легкой цепи, содержащего аминокислотную последовательность CDR1 под SEQ ID NO:16, аминокислотную последовательность CDR2 под SEQ ID NO:17 и аминокислотную последовательность CDR3 под SEQ ID NO:18. В другом случае полипептид тяжелой цепи антитела или антигенсвязывающего фрагмента (например, моноклонального антитела или фрагмента), который специфически связывается с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности вариабельной области под SEQ ID NO:32. В другом случае полипептид легкой цепи антитела или антигенсвязывающего фрагмента (например, моноклонального антитела или фрагмента), который специфически связывается с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности вариабельной области под SEQ ID NO:46. В другом случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат, состоят по сути из или состоят из вариабельной области тяжелой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:32, и вариабельной области легкой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:46. В другом случае антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые специфически связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат, состоят по сути из или состоят из тяжелой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:50, и/или вариабельной области легкой цепи, которая содержит, состоит по сути из или состоит из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO:54. [00104] In one instance, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to at least one S. aureus leukotoxin contains, consists essentially of, or consists of (i) a heavy chain polypeptide containing an amino acid the CDR1 sequence of SEQ ID NO:7, the amino acid sequence of CDR2 of SEQ ID NO:8 and the amino acid sequence of CDR3 of SEQ ID NO:9, and (ii) a light chain polypeptide containing the amino acid sequence of CDR1 of SEQ ID NO:16, the amino acid sequence CDR2 under SEQ ID NO:17 and the amino acid sequence of CDR3 under SEQ ID NO:18. In another instance, a heavy chain polypeptide of an antibody or antigen binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to at least one S. aureus leukotoxin contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of the variable region of SEQ ID NO: 32. In another embodiment, a light chain polypeptide of an antibody or antigen binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to at least one S. aureus leukotoxin contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of the variable region of SEQ ID NO: 46. In another instance, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to at least one S. aureus leukotoxin contains, consists essentially of, or consists of a heavy chain variable region that contains, consists essentially of or consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO:32, and a light chain variable region that contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO:46. In another case, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that specifically binds to at least one S. aureus leukotoxin contains, consists essentially of, or consists of a heavy chain that contains, consists essentially of, or consists of of the amino acid sequence of SEQ ID NO:50, and/or a light chain variable region that contains, consists essentially of, or consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO:54.

[00105] Последовательности иллюстративных антител к AT, к ClFA и к лейкотоксину представлены ниже. Дополнительные антитела к AT представлены, например, в патенте США № 9527905, который включен в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. В определенных случаях описанные в данном документе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с AT, ClfA или по меньшей мере одним лейкотоксином и содержат шесть CDR антитела, перечисленных в двух таблицах ниже (т. е. три CDR VH антитела, перечисленных в первой таблице, и три CDR VL того же антитела, перечисленных во второй таблице). [00105] The sequences of exemplary anti-AT, anti-ClFA, and anti-leukotoxin antibodies are provided below. Additional antibodies to AT are presented, for example, in US patent No. 9527905, which is incorporated herein by reference in its entirety. In certain cases, an antibody or antigen-binding fragment thereof described herein binds AT, ClfA, or at least one leukotoxin and contains the six antibody CDRs listed in the two tables below (i.e., the three VH antibody CDRs listed in the first table and three VL CDRs of the same antibody listed in the second table).

[00106] Антитело к AT MEDI4893 представляет собой вариант MEDI4893* или “LC10” с увеличенным временем полужизни (YTE), описанный ранее в публикациях международных патентных заявок WO 2012/109285 и WO 2014/074540 (которые обе включены в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте). Антитело к ClfA SAR114-N3Y описано в предварительной заявке на патент США № 62/702762. Антитело к лейкотоксину SAN481-SYT представляет собой вариант SAN481-SYT* с увеличенным временем полужизни (YTE). SAN481-SYT* не содержит мутацию YTE. [00106] Anti-AT antibody MEDI4893 is an extended half-life (YTE) variant of MEDI4893* or “LC10” previously described in international patent application publications WO 2012/109285 and WO 2014/074540 (both of which are incorporated herein by reference in in its entirety). The anti-ClfA antibody SAR114-N3Y is described in US Provisional Patent Application No. 62/702762. The leukotoxin antibody SAN481-SYT is a variant of SAN481-SYT* with an extended half-life (YTE). SAN481-SYT* does not contain the YTE mutation.

Аминокислотные последовательности CDR VH Amino acid sequences of CDR VH

Название антителаAntibody name Мишень для антителаAntibody target CDR1 VHCDR1 VH
(SEQ ID NO:)(SEQ ID NO:) CDR2 VHCDR2 VH
(SEQ ID NO:)(SEQ ID NO:) CDR3 VHCDR3 VH
(SEQ ID NO:)(SEQ ID NO:) MEDI4893 и MEDI4893*MEDI4893 and MEDI4893* ATAT SHDMH (SEQ ID NO:1)SHDMH (SEQ ID NO:1) GIGTAGDTYYPDSVKG (SEQ ID NO:2)GIGTAGDTYYPDSVKG (SEQ ID NO:2) DRYSPTGHYYGMDV
(SEQ ID NO:3)DRYSPTGYYGMDV
(SEQ ID NO:3) SAR114
и SAR114-N3YSAR114
and SAR114-N3Y ClfAClfA NSYWS (SEQ ID NO:4)NSYWS (SEQ ID NO:4) YLYSSGRTNYTPSLKS (SEQ ID NO:5)YLYSSGRTNYTPSLKS (SEQ ID NO:5) THLGGFHYGGGFWFDP (SEQ ID NO:6)THLGGFHYGGGFWFDP (SEQ ID NO:6) 11H1011H10 ClfAClfA SFAMS (SEQ ID NO:62)SFAMS (SEQ ID NO:62) AISGSGGNTYYADSVKG (SEQ ID NO:63)AISGSGGNTYYADSVKG (SEQ ID NO:63) IAFDI (SEQ ID NO:64)IAFDI (SEQ ID NO:64) SAN481-SYT и SAN481-SYT*SAN481-SYT and SAN481-SYT* ЛейкотоксинLeukotoxin TYAMH (SEQ ID NO:7)TYAMH (SEQ ID NO:7) VTSFDGSNEYYIDSVKG (SEQ ID NO:8)VTSFDGSNEYYIDSVKG (SEQ ID NO:8) DEYTGGWYSVGY (SEQ ID NO:9)DEYTGGWYSVGY (SEQ ID NO:9)

Аминокислотные последовательности CDR VLAmino acid sequences of CDR VL

АнтителоAntibody Мишень для антителаAntibody target CDR1 VLCDR1 VL
(SEQ ID NO:)(SEQ ID NO:) CDR2 VLCDR2 VL
(SEQ ID NO:)(SEQ ID NO:) CDR3 VLCDR3 VL
(SEQ ID NO:)(SEQ ID NO:) MEDI4893 и MEDI4893*MEDI4893 and MEDI4893* ATAT RASQSISSWLA
(SEQ ID NO:10)RASQSISSWLA
(SEQ ID NO:10) KASSLES (SEQ ID NO:11)KASSLES (SEQ ID NO:11) KQYADYWT
(SEQ ID NO:12)KQYADYWT
(SEQ ID NO:12) SAR114
и
SAR114-N3YSAR114
And
SAR114-N3Y ClfAClfA RASQSITSYLN
(SEQ ID NO:13)RASQSITSYLN
(SEQ ID NO:13) ASSSLQS (SEQ ID NO:14)ASSSLQS (SEQ ID NO:14) QESYSTPPT (SEQ ID NO15)QESYSTPPT (SEQ ID NO15) 11H1011H10 ClfAClfA RASQGIRNDLG (SEQ ID NO:65)RASQGIRNDLG (SEQ ID NO:65) VASSLQS (SEQ ID NO:66)VASSLQS (SEQ ID NO:66) LQHNSYPFT (SEQ ID NO:67)LQHNSYPFT (SEQ ID NO:67) SAN481-SYT и SAN481-SYT *SAN481-SYT and SAN481-SYT * ЛейкотоксинLeukotoxin SGSSYNIGSNYVY (SEQ ID NO:16)SGSSYNIGSNYVY (SEQ ID NO:16) RSIQRPS (SEQ ID NO:17)RSIQRPS (SEQ ID NO:17) AAWDDSLRAWV (SEQ ID NO:18)AAWDDSLRAWV (SEQ ID NO:18)

[00107] В определенных случаях описанные в данном документе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с AT, ClfA или по меньшей мере одним лейкотоксином и содержат VH антитела, перечисленного в следующей таблице, например, в комбинации с VL. [00107] In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof described herein binds AT, ClfA, or at least one leukotoxin and contains the VH of an antibody listed in the following table, for example, in combination with VL.

Аминокислотная последовательность вариабельной области тяжелой цепи (VH)Amino acid sequence of the variable heavy chain (VH) region

АнтителоAntibody Мишень для антителаAntibody target Аминокислотная последовательность VH (SEQ ID NO)Amino acid sequence of VH (SEQ ID NO) MEDI4893 и MEDI4893*MEDI4893 and MEDI4893* ATAT EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSHDMHWVRQATGKGLEWVSGIGTAGDTYYPDSVKGRFTISRENAKNSLYLQMNSLRAGDTAVYYCARDRYSPTGHYYGMDVWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO:19)EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSHDMHWVRQATGKGLEWVSGIGTAGDTYYPDSVKGRFTISRENAKNSLYLQMNSLRAGDTAVYYCARDRYSPTGHYYGMDVWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO:19) SAR114
и
SAR114-N3YSAR114
And
SAR114-N3Y ClfAClfA QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSIQNSYWSWIRQPPGKGLEWIGYLYSSGRTNYTPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARTHLGGFHYGGGFWFDPWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:20)QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSIQNSYWSWIRQPPGKGLEWIGYLYSSGRTNYTPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARTHLGGFHYGGGFWFDPWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:20) 11H1011H10 ClfAClfA EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSFAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGNTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKIAFDIWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO:68)EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSFAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGNTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKIAFDIWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO:68) SAR72SAR72 ClfAClfA EVQLVESGGGLVKPGGSLRVSCAASGFSFRNALMSWVRQAPGKGLEWVGRSKTDGGTTDYAAPVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCTTGPGGGPPGDYYYDGMDVWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO:21)EVQLVESGGGLVKPGGSLRVSCAASGFSFRNALMSWVRQAPGKGLEWVGRSKTDGGTTDYAAPVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCTTGPGGGPPGDYYYDGMDVWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO:21) SAR80SAR80 ClfAClfA EVQLVESGGDLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDAWMTWVRQAPGKGLEWVGRIRSKTAGGTTDYAAPVKGRFTISRDDSKNTLYLQMTSLKIEDTALYYCMTDGLGLLNFGDSDPHHYWGQGTRVTVSS (SEQ ID NO:22)EVQLVESGGDLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDAWMTWVRQAPGKGLEWVGRIRSKTAGGTTDYAAPVKGRFTISRDDSKNTLYLQMTSLKIEDTALYYCMTDGLGLLNFGDSDPHHYWGQGTRVTVSS (SEQ ID NO:22) SAR113SAR113 ClfAClfA EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKAXGYXFTSYWIGWVRQVPGKGLEWMGIIYPGDSDTRHSPSFQGQVTISVDKSISTAYLQWSSLKASDSAMYYCARHQSGSHGFDAFEIWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO:23)EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKAXGYXFTSYWIGWVRQVPGKGLEWMGIIYPGDSDTRHSPSFQGQVTISVDKSISTAYLQWSSLKASDSAMYYCARHQSGSHGFDAFEIWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO:23) SAR132SAR132 ClfAClfA EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYNFTNYWIAWVRQMPGKGLEWMGIIYSGDSDTRYSPSFLGQVSISVDKSFTTAYLQWRSLKASDTAMYYCARRPGGQKPYDYWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:24)EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYNFTNYWIAWVRQMPGKGLEWMGIIYSGDSDTRYSPSFLGQVSISVDKSFTTAYLQWRSLKASDTAMYYCARRPGGQKPYDYWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:24) SAR352SAR352 ClfAClfA EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFNNAWMSWVRQAPGKGLEWVGRIKSETAGGTTDYAAPVKGRFSISRDDSRNTLYLEMNSLKTEDTAVYYCTTDSYTPLEEPCPNGVCYTYYYYGMDVWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO:25)EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFNNAWMSWVRQAPGKGLEWVGRIKSETAGGTTDYAAPVKGRFSISRDDSRNTLYLEMNSLKTEDTAVYYCTTDSYTPLEEPCPNGVCYTYYYYGMDVWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO:25) SAR372SAR372 ClfAClfA EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFIFNRYSMNWVRQAPGKGLEWVSYISSSSSPIYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRDEDTAVYYCASRVTLGLEFDFWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:26)EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFIFNRYSMNWVRQAPGKGLEWVSYISSSSSPIYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRDEDTAVYYCASRVTLGLEFDFWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:26) SAR510SAR510 ClfAClfA QVTLRESGPALVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTSGMCVGWIRQPPGKALEWLALIEWDDDKYYNTSLKTRLSISKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTGTYYCARHSSSSRGFDYWGQGALVTVSS (SEQ ID NO:27)QVTLRESGPALVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTSGMCVGWIRQPPGKALEWLALIEWDDDKYYNTSLKTRLSISKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTGTYYCARHSSSSRGFDYWGQGALVTVSS (SEQ ID NO:27) SAR547SAR547 ClfAClfA EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTTYWIAWVRQMPGKGLEWMGIIYPGDSDTRYSPSFQGQVTISADKSTATAYLQWSSLNASDSAMYYCARQGGSHGYDAFHMWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO:28)EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTTYWIAWVRQMPGKGLEWMGIIYPGDSDTRYSPSFQGQVTISADKSTATAYLQWSSLNASDSAMYYCARQGGSHGYDAFHMWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO:28) SAS1SAS1 ClfAClfA EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFTFSTYALNWVRQAPGKGLEWVAGINGTGYNTYYADSVRGRFTISRDNSKNTVTLEMNSLRVEDTATYYCHKVPWWGQGTLVSVSS (SEQ ID NO: 29)EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCTASGTFFSTYALNWVRQAPGKGLEWVAGINGTGYNTYYADSVRGRFTISRDNSKNTVTLEMNSLRVEDTATYYCHKVPWWGQGTLVSVSS (SEQ ID NO: 29) SAS19SAS19 ClfAClfA QVQLQESGPRLVKPSETLSLTCFVSGGSINNSYWTWIRQPPGQGLEWIGFVFSSGRTNYSPSLKSRVTISVDTSKNLFSLRLTSVTAADTAVYFCARQVHYDFWSGYSLTKTNWFDPWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:30)QVQLQESGPRLVKPSETLSLTCFVSGGSINNSYWTWIRQPPGQGLEWIGFVFSSGRTNYSPSLKSRVTISVDTSKNLFSLRLTSVTAADTAVYFCARQVHYDFWSGYSLTKTNWFDPWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:30) SAS203SAS203 ClfAClfA QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCVVSGGSINNSYWTWIRQPPGQGLEWIGFVYSSGRTYYSPSLKSRVTISVDTSKNFFSLRLNSVTAADTAVYFCARQVHYDLWSGYSLTKTNWFDPWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:31)QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCVVSGGSINNSYWTWIRQPPGQGLEWIGFVYSSGRTYYSPSLKSRVTISVDTSKNFFSLRLNSVTAADTAVYFCARQVHYDLWSGYSLTKTNWFDPWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:31) SAN481-SYT и SAN481-SYT*SAN481-SYT and SAN481-SYT* ЛейкотоксинLeukotoxin QLQLVESGGGAVQPGRSLKLSCAASGFTFSTYAMHWVRQAPGRGLEWVAVTSFDGSNEYYIDSVKGRFTISRDNTKNTLYLQMTGLRVEDTALYFCARDEYTGGWYSVGYWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:32)QLQLVESGGGAVQPGRSLKLSCAASGTFFSTYAMHWVRQAPGRGLEWVAVTSFDGSNEYYIDSVKGRFTISRDNTKNTLYLQMTGLRVEDTALYFCARDEYTGGWYSVGYWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:32)

[00108] В определенных случаях описанные в данном документе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с AT, ClfA или по меньшей мере одним лейкотоксином и содержат VL антитела, перечисленного в следующей таблице, например, в комбинации с VH, необязательно VH того же указанного антитела, перечисленного в предыдущей таблице.[00108] In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof described herein binds AT, ClfA, or at least one leukotoxin and contains the VL of an antibody listed in the following table, for example, in combination with a VH, optionally a VH of the same specified antibody, listed in the previous table.

Аминокислотная последовательность вариабельной области легкой цепи (VL)Amino acid sequence of the variable light chain (VL) region

АнтителоAntibody Мишень для антителаAntibody target Аминокислотная последовательность VL (SEQ ID NO)Amino acid sequence of VL (SEQ ID NO) MEDI4893 и MEDI4893*MEDI4893 and MEDI4893* ATAT DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSISSWLAWYQQKPGKAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCKQYADYWTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:33)DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSISSWLAWYQQKPGKAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCKQYADYWTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:33) SAR114
и
SAR114-N3YSAR114
And
SAR114-N3Y ClfAClfA DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSITSYLNWYQQKPGKAPKLLIYASSSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQESYSTPPTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:34)DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSITSYLNWYQQKPGKAPKLLIYASSSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQESYSTPPTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:34) 11H1011H10 ClfAClfA DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGIRNDLGWYQQKPGKAPKRLIYVASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCLQHNSYPFTFGPGTKVDIK (SEQ ID NO:69)DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGIRNDLGWYQQKPGKAPKRLIYVASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCLQHNSYPFTFGPGTKVDIK (SEQ ID NO:69) SAR72SAR72 ClfAClfA SYELTQPPSVSVSPGQTARITCSGDAVPKKYAYWYQQKSGQAPVLVIYEDKKRPSGIPERFSGSSSGTMATLTISGAQVEDEADYYCYSTDSSEGVFGGGTKLTVL (SEQ ID NO:35)SYELTQPPSVSVSPGQTARITCSGDAVPKKYAYWYQQKSGQAPVLVIYEDKKRPSGIPERFSGSSSGTMATLTISGAQVEDEADYYCYSTDSSEGVFGGGTKLTVL (SEQ ID NO:35) SAR80SAR80 ClfAClfA SYELTQPPSVSVSPGQTARITCSGDALPKKYAYWYQQKSGQAPVLVIHEDTKRPSGIPERFSGSSSGTMATLTISGAQVEDEADYHCYSTDSSGVVFGGGTKLTVL (SEQ ID NO:36)SYELTQPPSVSVSPGQTARITCSGDALPKKYAYWYQQKSGQAPVLVIHEDTKRPSGIPERFSGSSSGTMATLTISGAQVEDEADYHCYSTDSSGVVFGGGTKLTVL (SEQ ID NO:36) SAR113SAR113 ClfAClfA DIVLTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQGVLSRSNNKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASTRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNNLRTFGQGTKVEIR (SEQ ID NO:37)DIVLTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQGVLSRSNNKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASTRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNNLRTFGQGTKVEIR (SEQ ID NO:37) SAR132SAR132 ClfAClfA DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQRISNWLAWYQKKPGKAPKLLIYKASTLESEVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDLATYYCHQYISYYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO:38)DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQRISNWLAWYQKKPGKAPKLLIYKASTLESEVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDLATYYCHQYISYYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO:38) SAR352SAR352 ClfAClfA QSVLTQPPSVSAAPGEKVTISCSGSSSNIGANSVSWYQQFPGTAPKLLIYDNDKRPSGVPDRFSGSKSGTSATLGITGLQTGDEADYYCGTWVGILSAGWVFGGGTKLTVL (SEQ ID NO:39)QSVLTQPPSVSAAPGEKVTISCSGSSSNIGANSVSWYQQFPGTAPKLLIYDNDKRPSGVPDRFSGSKSGTSATLGITGLQTGDEADYYCGTWVGILSAGWVFGGGTKLTVL (SEQ ID NO:39) SAR372SAR372 ClfAClfA EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSNLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISSLKPEDFAVYYCQLRSNWAYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO:40)EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSNLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISSLKPEDFAVYYCQLRSNWAYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO:40) SAR510SAR510 ClfAClfA SYGLTQPPSVSVSPGQTARITCSGDALAKQYVYWYQQKPGQAPVLVIDKDRERPSGIPERFSGSSSGTTVTLTISGVQAEDEADYYCQSADSSRTYVFGTGTKVTVL (SEQ ID NO: 41)SYGLTQPPSVSVSPGQTARITCSGDALAKQYVYWYQQKPGQAPVLVIDKDRERPSGIPERFSGSSSGTTTVTLTISGVQAEDEADYYCQSADSSRTYVFGTGTKVTVL (SEQ ID NO: 41) SAR547SAR547 ClfAClfA DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCRSSQSLVHSDGNTYLNWFQQRPGQSPRRLIYKVSNRDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQGTHLTWTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:42)DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCRSSQSLVHSDGNTYLNWFQQRPGQSPRRLIYKVSNRDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQGTHLTWTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:42) SAS1SAS1 ClfAClfA DIVLTQSPESLAVSLGERATISCKSSQSLFFKSNNKNYLAWYQQKPGQPPKVIIYWASTRESGVPARFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYFCHQYYSTQYSFGQGTKLEIK (SEQ ID NO:43)DIVLTQSPESLAVSLGERATISCKSSQSLFFKSNNKNYLAWYQQKPGQPPKVIIYWASTRESGVPARFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYFCHQYYSTQYSFGQGTKLEIK (SEQ ID NO:43) SAS19SAS19 ClfAClfA DIQMTQSPSSLSASVGDTVTITCRTSQSISNFLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRVNGSTSGTEFTLTLSSLQPEDFATYYCQQSYSTPWTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:44)DIQMTQSPSSLSASVGDTVTITCRTSQSISNFLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRVNGSTSGTEFTLTLSSLQPEDFATYYCQQSYSTPWTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:44) SAS203SAS203 ClfAClfA DIQMTQSPSSLSASVGDTVTITCRTSQSISNFLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFNGSTSGTDFTLTLSSLQPEDFATYYCQQSYSTPWTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:45)DIQMTQSPSSLSASVGDTVTITCRTSQSISNFLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFNGSTSGTDFTLTLSSLQPEDFATYYCQQSYSTPWTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:45) SAN481-SYT и SAN481-SYT*SAN481-SYT and SAN481-SYT* ЛейкотоксинLeukotoxin QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSYNIGSNYVYWYQQFPGTAPKLLISRSIQRPSGVPDRFSGSKSVTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDSLRAWVFGGGTKLTVL (SEQ ID NO:46)QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSYNIGSNYVYWYQQFPGTAPKLLISRSIQRPSGVPDRFSGSKSVTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDSLRAWVFGGGTKLTVL (SEQ ID NO:46)

[00109] В определенных случаях описанные в данном документе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с AT, ClfA или по меньшей мере одним лейкотоксином и содержат тяжелую цепь антитела, перечисленного в следующей таблице, например, в комбинации с легкой цепью.[00109] In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof described herein binds to AT, ClfA, or at least one leukotoxin and contains the heavy chain of an antibody listed in the following table, for example, in combination with a light chain.

Аминокислотные последовательности полноразмерной тяжелой цепиAmino acid sequences of the full-length heavy chain

АнтителоAntibody Мишень для антителаAntibody target Аминокислотная последовательность полноразмерной тяжелой цепи (SEQ ID NO)Full Length Heavy Chain Amino Acid Sequence (SEQ ID NO) MEDI4893MEDI4893 ATAT EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSHDMHWVRQATGKGLEWVSGIGTAGDTYYPDSVKGRFTISRENAKNSLYLQMNSLRAGDTAVYYCARDRYSPTGHYYGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLYITREPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:47)EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSHDMHWVRQATGKGLEWVSGIGTAGDTYYPDSVKGRFTISRENAKNSLYLQMNSLRAGDTAVYYCARDRYSPTGHYYGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYIC NVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLYITREPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQ PENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:47) MEDI4893*MEDI4893* ATAT EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSHDMHWVRQATGKGLEWVSGIGTAGDTYYPDSVKGRFTISRENAKNSLYLQMNSLRAGDTAVYYCARDRYSPTGHYYGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:48)EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSHDMHWVRQATGKGLEWVSGIGTAGDTYYPDSVKGRFTISRENAKNSLYLQMNSLRAGDTAVYYCARDRYSPTGHYYGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYIC NVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQ PENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:48) SAR114-N3YSAR114-N3Y ClfAClfA QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSIQNSYWSWIRQPPGKGLEWIGYLYSSGRTNYTPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARTHLGGFHYGGGFWFDPWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEACSYHLCQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:49)QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSIQNSYWSWIRQPPGKGLEWIGYLYSSGRTNYTPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARTHLGGFHYGGGFWFDPWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVP SSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFY PSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEACSYHLCQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:49) SAR114SAR114 ClfAClfA QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSIQNSYWSWIRQPPGKGLEWIGYLYSSGRTNYTPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARTHLGGFHYGGGFWFDPWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:70)QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSIQNSYWSWIRQPPGKGLEWIGYLYSSGRTNYTPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARTHLGGFHYGGGFWFDPWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVP SSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFY PSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:70) SAN481-SYTSAN481-SYT ЛейкотоксинLeukotoxin QLQLVESGGGAVQPGRSLKLSCAASGFTFSTYAMHWVRQAPGRGLEWVAVTSFDGSNEYYIDSVKGRFTISRDNTKNTLYLQMTGLRVEDTALYFCARDEYTGGWYSVGYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLYITREPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:50)QLQLVESGGGAVQPGRSLKLSCAASGFTFSTYAMHWVRQAPGRGLEWVAVTSFDGSNEYYIDSVKGRFTISRDNTKNTLYLQMTGLRVEDTALYFCARDEYTGGWYSVGYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTY ICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLYITREPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNG QPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:50) SAN481-SYT*SAN481-SYT* ЛейкотоксинLeukotoxin QLQLVESGGGAVQPGRSLKLSCAASGFTFSTYAMHWVRQAPGRGLEWVAVTSFDGSNEYYIDSVKGRFTISRDNTKNTLYLQMTGLRVEDTALYFCARDEYTGGWYSVGYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:51)QLQLVESGGGAVQPGRSLKLSCAASGFTFSTYAMHWVRQAPGRGLEWVAVTSFDGSNEYYIDSVKGRFTISRDNTKNTLYLQMTGLRVEDTALYFCARDEYTGGWYSVGYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTY ICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNG QPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO:51)

[00110] В определенных случаях описанные в данном документе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с AT, ClfA или по меньшей мере одним лейкотоксином и содержат легкую цепь антитела, перечисленного в следующей таблице, например, в комбинации с тяжелой цепью, необязательно тяжелой цепью того же указанного антитела, перечисленного в предыдущей таблице.[00110] In certain cases, an antibody or antigen binding fragment thereof described herein binds AT, ClfA, or at least one leukotoxin and contains a light chain of an antibody listed in the following table, for example, in combination with a heavy chain, optionally a heavy chain of the same the specified antibody listed in the previous table.

Аминокислотные последовательности полноразмерной легкой цепиAmino acid sequences of the full-length light chain

АнтителоAntibody Мишень для антителаAntibody target Аминокислотная последовательность полноразмерной легкой цепи (SEQ ID NO)Full Length Light Chain Amino Acid Sequence (SEQ ID NO) MEDI4893 и MEDI4893*MEDI4893 and MEDI4893* ATAT DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSISSWLAWYQQKPGKAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCKQYADYWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGE (SEQ ID NO:52)DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSISSWLAWYQQKPGKAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCKQYADYWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKV YACEVTHQGLSSPVTKSFNRGE (SEQ ID NO:52) SAR114-N3YSAR114-N3Y ClfAClfA DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSITSYLNWYQQKPGKAPKLLIYASSSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQESYSTPPTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:53)DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSITSYLNWYQQKPGKAPKLLIYASSSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQESYSTPPTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKH KVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:53) SAN481-SYT и SAN481-SYT*SAN481-SYT and SAN481-SYT* ЛейкотоксинLeukotoxin QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSYNIGSNYVYWYQQFPGTAPKLLISRSIQRPSGVPDRFSGSKSVTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDSLRAWVFGGGTKLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS (SEQ ID NO:54)QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSYNIGSNYVYWYQQFPGTAPKLLISRSIQRPSGVPDRFSGSKSVTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDSLRAWVFGGGTKLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTH EGSTVEKTVAPTECS (SEQ ID NO:54)

[00111] В определенных аспектах CDR антитела или его антигенсвязывающего фрагмента могут быть определены в соответствии со схемой нумерации по Чотиа, которая относится к местоположению структурных петель иммуноглобулина (см., например, Chothia C & Lesk AM, (1987), J Mol Biol 196: 901-917; Al-Lazikani B et al., (1997) J Mol Biol 273: 927-948; Chothia C et al., (1992) J Mol Biol 227: 799-817; Tramontano A et al., (1990) J Mol Biol 215(1): 175-82 и патент США № 7709226). Как правило, при использовании системы нумерации по Кабату петля по Чотиа CDR-H1 присутствует на аминокислотах тяжелой цепи в положениях с 26 по 32, 33 или 34, петля по Чотиа CDR-H2 присутствует на аминокислотах тяжелой цепи в положениях с 52 по 56, и петля по Чотиа CDR-H3 присутствует на аминокислотах тяжелой цепи в положениях с 95 по 102, тогда как петля по Чотиа CDR-L1 присутствует на аминокислотах легкой цепи в положениях с 24 по 34, петля по Чотиа CDR-L2 присутствует на аминокислотах легкой цепи в положениях с 50 по 56 и петля по Чотиа CDR-L3 присутствует на аминокислотах легкой цепи в положениях с 89 по 97. Конец петли CDR-H1 по Чотиа при нумерации с использованием системы нумерации по Кабату варьирует от H32 до H34 в зависимости от длины петли (это обусловлено тем, что в соответствии со схемой нумерации по Кабату вставки расположены в H35A и H35B; при этом если не присутствуют ни 35A, ни 35B, то петля заканчивается на 32; если присутствует только 35A, то петля заканчивается на 33; если присутствуют как 35A, так и 35B, то петля заканчивается на 34). [00111] In certain aspects, the CDRs of an antibody or antigen-binding fragment thereof may be defined according to the Chotia numbering scheme, which refers to the location of immunoglobulin structural loops (see, For example, Chothia C & Lesk AM, (1987), J Mol Biol 196: 901-917; Al-Lazikani Bet al., (1997) J Mol Biol 273: 927-948; Chothia Cet al., (1992) J Mol Biol 227: 799-817; Tramontano Aet al., (1990) J Mol Biol 215(1): 175-82 and US Patent No. 7709226). Typically, when using the Kabat numbering system, the Chotia loop CDR-H1 is present on heavy chain amino acids at positions 26 to 32, 33, or 34, the Chotia loop CDR-H2 is present on heavy chain amino acids at positions 52 to 56, and the Chotia loop CDR-H3 is present on the heavy chain amino acids at positions 95 to 102, while the Chotia loop CDR-L1 is present on the light chain amino acids at positions 24 to 34, the Chotia loop CDR-L2 is present on the light chain amino acids at positions 50 to 56 and the Chotia loop CDR-L3 is present on the light chain amino acids at positions 89 to 97. The end of the CDR-H1 Chotia loop when numbered using the Kabat numbering system ranges from H32 to H34 depending on the length of the loop ( this is because, in accordance with the Kabat numbering scheme, the inserts are located at H35A and H35B; if neither 35A nor 35B is present, then the loop ends at 32; if only 35A is present, then the loop ends at 33; if both 35A and 35B are present, then the loop ends at 34).

[00112] В определенных аспектах в данном документе представлены комбинации антител и их антигенсвязывающих фрагментов, которые содержат CDR VH и VL по Чотиа антител MEDI4893, SAR114-N3Y и/или SAN481-SYT. В определенных вариантах осуществления антитела или их антигенсвязывающие фрагменты содержат одну или несколько CDR, в которых CDR по Чотиа и Кабату имеют одинаковую аминокислотную последовательность. В определенных вариантах осуществления, в данном документе предусмотрены антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые содержат комбинации CDR по Кабату и CDR по Чотиа. [00112] In certain aspects, provided herein are combinations of antibodies and antigen binding fragments thereof that comprise the VH and VL Chotia CDRs of antibodies MEDI4893, SAR114-N3Y, and/or SAN481-SYT. In certain embodiments, the antibodies or antigen binding fragments thereof comprise one or more CDRs, wherein the Chotia and Kabat CDRs have the same amino acid sequence. In certain embodiments, provided herein are antibodies and antigen binding fragments thereof that contain combinations of Kabat CDRs and Chotia CDRs.

[00113] В определенных случаях CDR антитела или его антигенсвязывающего фрагмента могут быть определены в соответствии с системой нумерации IMGT, как описано в Lefranc MP, (1999) The Immunologist 7: 132-136 and Lefranc M-P et al., (1999) Nucleic Acids Res 27: 209-212. В соответствии со схемой нумерации IMGT VH-CDR1 находится в положениях 26-35, VH-CDR2 находится в положениях 51-57, VH-CDR3 находится в положениях 93-102, VL-CDR1 находится в положениях 27-32, VL-CDR2 находится в положениях 50-52 и VL-CDR3 находится в положениях 89-97. В конкретном варианте осуществления в данном документе представлены комбинации антител и их антигенсвязывающих фрагментов, которые содержат CDR VH и VL согласно IMGT антител MEDI4893, SAR114-N3Y и/или SAN481-SYT, например, как описано в Lefranc M-P (1999) выше и Lefranc M-P et al., (1999) выше).[00113] In certain cases, the CDR of an antibody or antigen binding fragment thereof may be determined in accordance with the IMGT numbering system as described in Lefranc MP, (1999) The Immunologist 7: 132-136 and Lefranc M-Pet al., (1999) Nucleic Acids Res 27: 209-212. According to the IMGT numbering scheme, VH-CDR1 is in positions 26-35, VH-CDR2 is in positions 51-57, VH-CDR3 is in positions 93-102, VL-CDR1 is in positions 27-32, VL-CDR2 is in positions 50-52 and VL-CDR3 is in positions 89-97. In a specific embodiment, provided herein are combinations of antibodies and antigen binding fragments thereof that comprise the VH and VL CDRs of the IMGT antibodies MEDI4893, SAR114-N3Y and/or SAN481-SYT, for example as described in Lefranc M-P (1999) supra and Lefranc M-Pet al., (1999) higher).

[00114] В определенных случаях CDR антитела или его антигенсвязывающего фрагмента могут быть определены согласно MacCallum RM et al., (1996) J Mol Biol 262: 732-745. См. также, например, Martin A. “Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains,” in Antibody Engineering, Kontermann and Dübel, eds., Chapter 31, pp. 422-439, Springer-Verlag, Berlin (2001). В конкретном варианте осуществления в данном документе представлены комбинации антител или их антигенсвязывающих фрагментов, которые содержат CDR VH и VL антител MEDI4893, SAR114-N3Y и/или SAN481-SYT, определенные посредством способа, описанного в MacCallum RM et al.[00114] In certain cases, the CDR of an antibody or antigen binding fragment thereof may be determined according to MacCallum RMet al., (1996) J Mol Biol 262: 732-745. See also, For example, Martin A. “Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains,” inAntibody Engineering, Kontermann and Dübel, eds., Chapter 31, pp. 422-439, Springer-Verlag, Berlin (2001). In a specific embodiment, provided herein are combinations of antibodies or antigen-binding fragments thereof that comprise the VH and VL CDRs of antibodies MEDI4893, SAR114-N3Y, and/or SAN481-SYT, determined by the method described in MacCallum RMet al.

[00115] В определенных случаях CDR антитела или его антигенсвязывающего фрагмента могут быть определены в соответствии со схемой нумерации AbM, которая относится к гипервариабельным областям AbM, которые представляют собой компромисс между CDR по Кабату и структурными петлями по Чотиа и используются в программном обеспечении для моделирования антител AbM от Oxford Molecular (Oxford Molecular Group, Inc.). В конкретном варианте осуществления в данном документе представлены комбинации антител или их антигенсвязывающих фрагментов, которые содержат CDR VH и VL антител MEDI4893, SAR114-N3Y и/или SAN481-SYT, определенные в соответствии со схемой нумерации AbM.[00115] In certain cases, the CDRs of an antibody or an antigen binding fragment thereof may be defined according to the AbM numbering scheme, which refers to the hypervariable regions of the AbM, which represent a compromise between the Kabat CDRs and the Chotia structural loops and are used in antibody modeling software AbM from Oxford Molecular (Oxford Molecular Group, Inc.). In a specific embodiment, provided herein are combinations of antibodies or antigen-binding fragments thereof that comprise the VH and VL CDRs of antibodies MEDI4893, SAR114-N3Y, and/or SAN481-SYT, defined in accordance with the AbM numbering scheme.

[00116] В другом аспекте антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), описанные в данном документе, могут содержать константную область (Fc) любого подходящего класса (IgG, IgA, IgD, IgM и IgE), которая была модифицирована для улучшения времени полужизни антитела или антигенсвязывающего фрагмента, (например, моноклонального антитела или фрагмента). Например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), описанные в данном документе, могут содержать Fc, которая содержит мутацию, продлевающую время полужизни, по сравнению с таким же антителом без мутации. [00116] In another aspect, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) described herein may comprise a constant region (Fc) of any suitable class (IgG, IgA, IgD, IgM, and IgE) that has been modified to improve the half-life of an antibody or antigen-binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment). For example, an antibody or antigen-binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) described herein may contain an Fc that contains a mutation that prolongs the half-life compared to the same antibody without the mutation.

[00117] Конструирование Fc-области широко используется в данной области техники для увеличения времени полужизни терапевтических антител и защиты от разрушения in vivo. В некоторых вариантах осуществления Fc-область антитела IgG или антигенсвязывающего фрагмента может быть модифицирована для увеличения аффинности молекулы IgG по отношению к неонатальному Fc-рецептору (FcRn), который опосредует катаболизм IgG и защищает молекулы IgG от разрушения. Подходящие аминокислотные замены или модификации Fc-области известны в данной области техники и включают, например, тройную замену M252Y/S254T/T256E (обозначаемую как “YTE”) (см., например патент США № 7658921; публикацию заявки на патент США № 2014/0302058 и Yu et al., Antimicrob. Agents Chemother., 61(1): e01020-16 (2017)). В определенных аспектах антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые связываются с АТ S. aureus, содержат Fc-область, содержащую мутацию YTE. В определенных аспектах антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат Fc-область, содержащую мутацию YTE. В определенных аспектах антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые связываются с АТ S. aureus, содержат Fc-область, содержащую мутацию YTE, и антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, содержат Fc-область, содержащую мутацию YTE. [00117] Engineering of the Fc region is widely used in the art to increase the half-life of therapeutic antibodies and protect against degradation in vivo . In some embodiments, the Fc region of an IgG antibody or antigen binding fragment may be modified to increase the affinity of the IgG molecule for the neonatal Fc receptor (FcRn), which mediates IgG catabolism and protects the IgG molecules from destruction. Suitable amino acid substitutions or modifications of the Fc region are known in the art and include, for example, the triple substitution M252Y/S254T/T256E (referred to as “YTE”) (see, for example, US Patent No. 7658921; US Patent Application Publication No. 2014/ 0302058 and Yu et al., Antimicrob. Agents Chemother ., 61 (1): e01020-16 (2017)). In certain aspects, an antibody or antigen-binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) that binds to S. aureus Ab contains an Fc region containing a YTE mutation. In certain aspects, an antibody or antigen-binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) that binds to at least one S. aureus leukotoxin contains an Fc region containing a YTE mutation. In certain aspects, an antibody or antigen binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that binds to the S. aureus Ab comprises an Fc region containing a YTE mutation and an antibody or antigen binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) that binds to at least one S. aureus leukotoxin, contain an Fc region containing a YTE mutation.

[00118] В другом аспекте Fc-область может содержать последовательность CSYHLC (называемую “N3Y”; SEQ ID NO:55). В определенных аспектах антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), которые связываются с ClfA S. aureus, содержат Fc-область, содержащую Fc-вариант N3Y. [00118] In another aspect, the Fc region may contain the sequence CSYHLC (referred to as “N3Y”; SEQ ID NO:55). In certain aspects, an antibody or antigen-binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) that binds S. aureus ClfA comprises an Fc region containing an N3Y Fc variant.

[00119] В другом аспекте антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), описанные в данном документе, могут содержать константную область (Fc) любого подходящего класса (IgG, IgA, IgD, IgM и IgE), которая была модифицирована для улучшения эффекторных функций (например, опсонофагоцитарного уничтожения бактерий (OPK)), где время полужизни антитела или антигенсвязывающего фрагмента (например, моноклонального антитела или фрагмента) необязательно также улучшено. Например, описанные в данном документе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент) могут содержать Fc, которая содержит мутацию, которая увеличивает время полужизни по сравнению с таким же антителом без мутации, и где мутация не подавляет активность OPK по сравнению с таким же антителом или антигенсвязывающим фрагментом без мутации. Fc-вариант N3Y, в частности, проявляет улучшенные фармакокинетические (PK) свойства (например, персистирование в сыворотке крови) и эффекторные функции (например, опсонофагоцитарное уничтожение бактерий (OPK)) в определенных антителах по сравнению с вариантами YTE. [00119] In another aspect, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) described herein may comprise a constant region (Fc) of any suitable class (IgG, IgA, IgD, IgM, and IgE) that has been modified to improve effector functions (eg, opsonophagocytic killing of bacteria (OPK)), where the half-life of the antibody or antigen binding fragment (eg, monoclonal antibody or fragment) is optionally also improved. For example, an antibody or antigen-binding fragment (e.g., a monoclonal antibody or fragment) described herein may contain an Fc that contains a mutation that increases the half-life compared to the same antibody without the mutation, and where the mutation does not inhibit OPK activity compared to the same antibody or antigen-binding fragment without mutation. The N3Y Fc variant in particular exhibits improved pharmacokinetic (PK) properties (eg, serum persistence) and effector functions (eg, opsonophagocytic bacterial killing (OPK)) in certain antibodies compared to YTE variants.

[00120] Антитело или антигенсвязывающий фрагмент (например, моноклональное антитело или фрагмент), описанные в данном документе, могут представлять собой человеческое антитело, гуманизированное антитело, антитело, отличное от человеческого, или химерное антитело, или могут быть получены из них. В одном аспекте описанные в данном документе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент являются полностью человеческим антителом.[00120] An antibody or antigen binding fragment (eg, a monoclonal antibody or fragment) described herein may be or be derived from a human antibody, a humanized antibody, a non-human antibody, or a chimeric antibody. In one aspect, the antibody or antigen binding fragment thereof described herein is a fully human antibody.

[00121] Человеческое антитело, антитело, отличное от человеческого, химерное антитело или гуманизированное антитело можно получить посредством любых способов, в том числе с помощью in vitro источников (например, гибридомы или клеточной линии, рекомбинантно продуцирующей антитело) и in vivo источников (например, грызунов, миндалин человека). Способы получения антител известны в данной области техники и описаны, например, в Köhler and Milstein, Eur. J. Immunol., 5: 511-519 (1976); Harlow and Lane (eds.), Antibodies: A Laboratory Manual, CSH Press (1988) и Janeway et al. (eds.), Immunobiology, 5 th Ed., Garland Publishing, New York, N.Y. (2001)). В определенных вариантах осуществления человеческое антитело или химерное антитело можно получить с использованием трансгенного животного (например, мыши), в котором один или несколько генов эндогенного иммуноглобулина заменены одним или несколькими генами человеческого иммуноглобулина. Примеры трансгенных мышей, у которых гены эндогенных антител эффективно заменены генами человеческих антител, включают без ограничения, Medarex HUMAB-MOUSE™, Kirin TC MOUSE™ и Kyowa Kirin KM-MOUSE™ (см., например Lonberg, Nat. Biotechnol., 23(9): 1117-25 (2005) и Lonberg, Handb. Exp. Pharmacol., 181: 69-97 (2008)). Гуманизированное антитело может быть получено с использованием любой подходящей методики, известной в данной области техники (см., например An, Z. (ed.), Therapeutic Monoclonal Antibodies: From Bench to Clinic, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, N.J. (2009)), включая, например, пересадку CDR, отличных от человеческих, на каркас человеческого антитела (см., например Kashmiri et al., Methods, 36(1): 25-34 (2005) и Hou et al., J. Biochem., 144(1): 115-120 (2008)). В одном варианте осуществления гуманизированное антитело можно получить с использованием способов, описанных, например, в публикации заявки на патент США 2011/0287485 A1.[00121] A human antibody, a non-human antibody, a chimeric antibody, or a humanized antibody can be produced by any means, including in vitro sources (e.g., a hybridoma or cell line recombinantly producing the antibody) and in vivo sources (e.g., rodents, human tonsils). Methods for producing antibodies are known in the art and are described, for example, in Köhler and Milstein, Eur. J. Immunol ., 5 : 511-519 (1976); Harlow and Lane (eds.), Antibodies: A Laboratory Manual , CSH Press (1988) and Janeway et al. (eds.), Immunobiology, 5th Ed . , Garland Publishing, New York, NY (2001)). In certain embodiments, a human antibody or chimeric antibody can be produced using a transgenic animal (eg, mouse) in which one or more endogenous immunoglobulin genes are replaced with one or more human immunoglobulin genes. Examples of transgenic mice in which endogenous antibody genes are effectively replaced with human antibody genes include, but are not limited to, Medarex HUMAB-MOUSE™, Kirin TC MOUSE™, and Kyowa Kirin KM-MOUSE™ (see, for example, Lonberg, Nat. Biotechnol ., 23 ( 9): 1117-25 (2005) and Lonberg, Handb. Exp. Pharmacol ., 181 : 69-97 (2008)). The humanized antibody can be prepared using any suitable technique known in the art (see, for example, An, Z. (ed.), Therapeutic Monoclonal Antibodies: From Bench to Clinic , John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ (2009)), including, for example, grafting non-human CDRs onto a human antibody scaffold (see, for example, Kashmiri et al., Methods , 36 (1): 25-34 (2005) and Hou et al., J Biochem , 144 (1): 115-120 (2008). In one embodiment, a humanized antibody can be prepared using methods described, for example, in US Patent Application Publication 2011/0287485 A1.

Нуклеиновые кислоты, векторы и клетки-хозяеваNucleic acids, vectors and host cells

[00122] Также в данном документе представлены одна или несколько выделенных последовательностей нуклеиновых кислот, которые кодируют антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA, или антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином (где необязательно одно или несколько антител или их антигенсвязывающих фрагментов представляют собой моноклональное антитело или фрагмент). [00122] Also provided herein are one or more isolated nucleic acid sequences that encode an antibody or antigen binding fragment thereof that binds AT, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds ClfA, or an antibody or antigen binding fragment thereof that binds at least one leukotoxin (wherein optionally one or more antibodies or antigen binding fragments thereof are a monoclonal antibody or fragment).

[00123] В настоящем изобретении дополнительно представлены один или несколько векторов, содержащих одну или несколько последовательностей нуклеиновых кислот, кодирующих антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA, и/или антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином (где необязательно одно или несколько антител или их антигенсвязывающих фрагментов представляют собой моноклональное антитело или фрагмент). Вектор может быть, например, плазмидой, эписомой, космидой, вирусным вектором (например, ретровирусным или аденовирусным) или фагом. Подходящие векторы и способы получения векторов хорошо известны в данной области техники (см., например, Sambrook et al., Molecular Cloning, a Laboratory Manual, 3 rd edition, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (2001) и Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, Greene Publishing Associates and John Wiley & Sons, New York, N.Y. (1994)).[00123] The present invention further provides one or more vectors containing one or more nucleic acid sequences encoding an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds AT, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds ClfA, and/or an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds an antigen binding fragment that binds to at least one leukotoxin (wherein optionally one or more antibodies or antigen binding fragments thereof are a monoclonal antibody or fragment). The vector may be, for example, a plasmid, episome, cosmid, viral vector (eg, retroviral or adenoviral) or phage. Suitable vectors and methods for producing vectors are well known in the art (see, for example, Sambrook et al., Molecular Cloning, a Laboratory Manual, 3rd edition , Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY (2001) and Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology , Greene Publishing Associates and John Wiley & Sons, New York, NY (1994)).

[00124] В дополнение к последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA, и/или антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином (где необязательно одно или несколько антител или их антигенсвязывающих фрагментов представляют собой моноклональное антитело или фрагмент), вектор предпочтительно содержит последовательности контроля экспрессии, такие как промоторы, энхансеры, сигналы полиаденилирования, терминаторы транскрипции, внутренние участки посадки рибосомы (IRES) и т.п., которые обеспечивают экспрессию кодирующей последовательности в клетке-хозяине. Примеры последовательностей контроля экспрессии известны в данной области техники и описаны, например, в Goeddel, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology, Vol. 185, Academic Press, San Diego, Calif. (1990).[00124] In addition to a nucleic acid sequence encoding an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds AT, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds ClfA, and/or an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds at least one leukotoxin (where optionally one or more antibodies or antigen binding fragments thereof are a monoclonal antibody or fragment), the vector preferably contains expression control sequences such as promoters, enhancers, polyadenylation signals, transcription terminators, internal ribosome entry sites (IRES), and the like. , which provide expression of the coding sequence in the host cell. Examples of expression control sequences are known in the art and are described, for example, in Goeddel, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology , Vol. 185, Academic Press, San Diego, Calif. (1990).

[00125] Вектор(ы), содержащий(-е) нуклеиновую(-ые) кислоту(-ы), кодирующую(-ие) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA, или антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином (где необязательно одно или несколько антител или их антигенсвязывающих фрагментов представляют собой моноклональное антитело или фрагмент), можно вводить в клетку-хозяина, которая способна экспрессировать кодируемые им полипептиды, включающую любую подходящую прокариотическую или эукариотическую клетку. Таким образом, в настоящем изобретении предусматривается изолированная клетка, содержащая вектор. Клетки-хозяева, которые можно использовать, включают клетки, которые легко и стабильно растут, имеют достаточно высокие темпы роста, хорошо охарактеризованные системы экспрессии и легко и эффективно трансформируются или трансфицируются. Примеры подходящих прокариотических клеток включают без ограничения клетки из родов Bacillus (такие как Bacillus subtilis и Bacillus brevis), Escherichia (такие как E. coli), Pseudomonas, Streptomyces, Salmonella и Erwinia. Особенно применимые прокариотические клетки включают разные штаммы Escherichia coli (например, K12, HB101 (ATCC № 33694), DH5a, DH10, MC1061 (ATCC № 53338) и CC102). Подходящие эукариотические клетки известны в данной области техники и включают, например, дрожжевые клетки, клетки насекомых и клетки млекопитающих. В одном варианте осуществления вектор экспрессируется в клетках млекопитающих. Ряд подходящих клеток-хозяев млекопитающих известен в данной области техники, и многие из них доступны в Американской коллекции типовых культур (ATCC, Манассас, Виргиния). Примеры подходящих клеток млекопитающих включают без ограничения клетки яичника китайского хомячка (СНО) (АТСС № CCL61), СНО DHFR-клетки (Urlaub et al, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 97: 4216-4220 (1980)), клетки почки эмбриона человека (HEK) 293 или 293T (ATCC № CRL1573) и клетки 3T3 (ATCC № CCL92). Другими подходящими клеточными линиями млекопитающих являются линии клеток COS-1 обезьяны (ATCC № CRL1650) и COS-7 (ATCC № CRL1651), а также линия клеток CV-1 (ATCC № CCL70). Желательно, чтобы клетка млекопитающего являлась клеткой человека. Например, клетка млекопитающего может быть лимфоидной клеткой человека или лимфоидной клеткой, полученной из клеточной линии, такой как линия клеток пре-В-лимфоцитов, линия клеток PER.C6® (Crucell Holland BV, Нидерланды) или клетки почки эмбриона человека (HEK) 293 или 293T (ATCC № CRL1573).[00125] Vector(s) containing nucleic acid(s) encoding an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds AT, an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds ClfA , or an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one leukotoxin (wherein optionally one or more antibodies or antigen-binding fragments thereof are a monoclonal antibody or fragment), can be introduced into a host cell that is capable of expressing the polypeptides encoded therein, including any suitable prokaryotic or eukaryotic cell. Thus, the present invention provides an isolated cell containing a vector. Host cells that can be used include cells that grow easily and stably, have sufficiently high growth rates, well-characterized expression systems, and are easily and efficiently transformed or transfected. Examples of suitable prokaryotic cells include, but are not limited to, cells from the genera Bacillus (such as Bacillus subtilis and Bacillus brevis ), Escherichia (such as E. coli ), Pseudomonas , Streptomyces , Salmonella and Erwinia . Particularly useful prokaryotic cells include various strains of Escherichia coli (eg, K12, HB101 (ATCC No. 33694), DH5a, DH10, MC1061 (ATCC No. 53338) and CC102). Suitable eukaryotic cells are known in the art and include, for example, yeast cells, insect cells and mammalian cells. In one embodiment, the vector is expressed in mammalian cells. A number of suitable mammalian host cells are known in the art, and many are available from the American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, VA). Examples of suitable mammalian cells include, but are not limited to, Chinese hamster ovary (CHO) cells (ATCC No. CCL61), CHO DHFR cells (Urlaub et al, Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 97 : 4216-4220 (1980)), cells human embryonic kidney (HEK) 293 or 293T (ATCC No. CRL1573) and 3T3 cells (ATCC No. CCL92). Other suitable mammalian cell lines are the simian COS-1 (ATCC No. CRL1650) and COS-7 (ATCC No. CRL1651) cell lines, as well as the CV-1 cell line (ATCC No. CCL70). Preferably, the mammalian cell is a human cell. For example, the mammalian cell may be a human lymphoid cell or a lymphoid cell derived from a cell line such as a pre-B lymphocyte cell line, the PER.C6® cell line (Crucell Holland BV, The Netherlands) or human embryonic kidney (HEK) 293 cells or 293T (ATCC No. CRL1573).

[00126] Последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая аминокислоты любого из антител или антигенсвязывающих фрагментов (необязательно моноклональных антител или фрагментов), описанных в данном документе, может быть введена в клетку посредством трансфекции, трансформации или трансдукции. [00126] A nucleic acid sequence encoding the amino acids of any of the antibodies or antigen binding fragments (optionally monoclonal antibodies or fragments) described herein can be introduced into a cell by transfection, transformation, or transduction.

Фармацевтические композиции и способы применения комбинаций антител к Staphylococcus aureus Pharmaceutical compositions and methods of using combinations of antibodies to Staphylococcus aureus

[00127] В настоящем изобретении представлена композиция, содержащая эффективное количество любого из антител или их антигенсвязывающих фрагментов, описанных в данном документе, или их комбинации и фармацевтически приемлемый носитель. В одном варианте осуществления, например, композиция может содержать первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (необязательно моноклональное), которые специфически связываются с белком, представляющим собой альфа-токсин S. aureus, как описано выше, второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (необязательно моноклональное), которые специфически связываются с белком, представляющим собой ClfA S. aureus, и третье антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (необязательно моноклональное), которые специфически связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus, как описано выше, и фармацевтически приемлемый носитель. В качестве альтернативы композиция может содержать фармацевтически приемлемый носитель и любое одно или любые два из (i) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые специфически связываются с AT S. aureus, (ii) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые специфически связываются с ClfA S. aureus, (iii) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые специфически связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S. aureus. [00127] The present invention provides a composition containing an effective amount of any of the antibodies or antigen binding fragments thereof described herein, or a combination thereof, and a pharmaceutically acceptable carrier. In one embodiment, for example, the composition may comprise a first antibody or antigen binding fragment thereof (optionally monoclonal) that specifically binds to S. aureus alpha toxin protein as described above, a second antibody or antigen binding fragment thereof (optionally monoclonal) that specifically bind to the S. aureus ClfA protein, and a third antibody or antigen binding fragment thereof (optionally monoclonal) that specifically binds to at least one S. aureus leukotoxin as described above, and a pharmaceutically acceptable carrier. Alternatively, the composition may contain a pharmaceutically acceptable carrier and any one or any two of (i) an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to S. aureus AT , (ii) an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to ClfA S. aureus , (iii) an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to at least one S. aureus leukotoxin.

[00128] В другом аспекте композиция может содержать последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие AT-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент, ClfA-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент и/или лейкотоксин-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент, или один или несколько векторов, содержащих такие последовательности нуклеиновой кислоты. В одном аспекте композиция представляет собой фармацевтически приемлемую (например, физиологически приемлемую) композицию, которая содержит носитель, такой как фармацевтически приемлемый (например, физиологически приемлемый) носитель, и последовательность(-и) нуклеиновой кислоты AT-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента, ClfA-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента и/или антитела к лейкотоксину или антигенсвязывающего фрагмента, или вектор(ы). [00128] In another aspect, the composition may contain nucleic acid sequences encoding an AT-binding antibody or antigen-binding fragment, a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment, and/or a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment, or one or more vectors containing such nucleic acid sequences. acids. In one aspect, the composition is a pharmaceutically acceptable (e.g., physiologically acceptable) composition that contains a carrier, such as a pharmaceutically acceptable (e.g., physiologically acceptable) carrier, and an AT binding antibody or antigen binding fragment nucleic acid sequence(s), ClfA- binding antibody or antigen binding fragment and/or anti-leukotoxin antibody or antigen binding fragment, or vector(s).

[00129] В контексте настоящего изобретения можно использовать любой подходящий носитель, и такие носители хорошо известны в данной области техники. Выбор носителя будет частично определен конкретным местом, куда можно вводить композицию, и конкретным способом, используемым для введения композиции. Композиция необязательно может быть стерильной. Композиция может быть заморожена или лиофилизирована для хранения и восстановлена​в подходящем стерильном носителе перед использованием. Композиции могут быть получены в соответствии с традиционными методиками, описанными, например, в Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21st Edition, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, PA (2001).[00129] Any suitable carrier can be used in the context of the present invention, and such carriers are well known in the art. The choice of carrier will be determined in part by the particular site at which the composition may be administered and the particular method used to administer the composition. The composition may not necessarily be sterile. The composition may be frozen or lyophilized for storage and reconstituted in a suitable sterile vehicle before use. The compositions can be prepared in accordance with traditional techniques described, for example, in Remington: The Science and Practice of Pharmacy , 21st Edition, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, PA (2001).

[00130] Желательно, чтобы композиция содержала AT-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент, ClfA-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент и лейкотоксин-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент в количестве, которое эффективно для лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus. В другом аспекте композиция содержит АТ-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент в количестве, которое эффективно для лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с ClfA-связывающим антителом или антигенсвязывающим фрагментом и лейкотоксин-связывающим антителом или антигенсвязывающим фрагментом. В другом аспекте композиция содержит ClfA-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент в количестве, которое эффективно для лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с AT-связывающим антителом или антигенсвязывающим фрагментом и лейкотоксин-связывающим антителом или антигенсвязывающим фрагментом. В другом аспекте композиция содержит лейкотоксин-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент в количестве, которое эффективно для лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с AT-связывающим антителом или антигенсвязывающим фрагментом и ClfA-связывающим антителом или антигенсвязывающим фрагментом. В другом аспекте композиция содержит АТ-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент и ClfA-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент в количестве, которое эффективно для лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с лейкотоксин-связывающим антителом или антигенсвязывающим фрагментом. В другом аспекте композиция содержит АТ-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент и лейкотоксин-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент в количестве, которое эффективно для лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с ClfA-связывающим антителом или антигенсвязывающим фрагментом. В другом аспекте композиция содержит ClfA-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент и лейкотоксин-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент в количестве, которое эффективно для лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, в комбинации с AT-связывающим антителом или антигенсвязывающим фрагментом. [00130] Desirably, the composition contains an AT-binding antibody or antigen-binding fragment, a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment, and a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment in an amount that is effective for treating or preventing infection caused by S. aureus . In another aspect, the composition contains an AT-binding antibody or antigen-binding fragment in an amount that is effective for treating or preventing infection caused by S. aureus, in combination with a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment and a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment. In another aspect, the composition contains a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment in an amount that is effective for treating or preventing infection caused by S. aureus , in combination with an AT-binding antibody or antigen-binding fragment and a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment. In another aspect, the composition contains a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment in an amount that is effective for treating or preventing infection caused by S. aureus , in combination with an AT-binding antibody or antigen-binding fragment and a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment. In another aspect, the composition contains an AT-binding antibody or antigen-binding fragment and a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment in an amount that is effective for treating or preventing infection caused by S. aureus in combination with a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment. In another aspect, the composition contains an AT-binding antibody or antigen-binding fragment and a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment in an amount that is effective for treating or preventing infection caused by S. aureus in combination with a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment. In another aspect, the composition contains a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment and a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment in an amount that is effective for treating or preventing infection caused by S. aureus in combination with an AT-binding antibody or antigen-binding fragment.

[00131] С этой целью раскрытый способ включает введение терапевтически эффективного количества или профилактически эффективного количества AT-связывающего антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, ClfA-связывающего антитела или его антигенсвязывающего фрагмента и лейкотоксин-связывающего антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или композиции, содержащей любое из вышеуказанных антител или фрагментов (включая моноклональные антитела или фрагменты) или их комбинацию. [00131] To this end, the disclosed method includes administering a therapeutically effective amount or a prophylactically effective amount of an AT binding antibody or an antigen binding fragment thereof, a ClfA binding antibody or an antigen binding fragment thereof, and a leukotoxin binding antibody or an antigen binding fragment thereof, or a composition containing any of the above antibodies or fragments (including monoclonal antibodies or fragments) or a combination thereof.

[00132] В настоящем изобретении представлен способ лечения или предотвращения инфекции, вызываемой Staphylococcus aureus (S. aureus), у субъекта (например, человека), который включает введение AT-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента, ClfA-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента и/или лейкотоксин-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента, описанных в данном документе, нуждающемуся в этом субъекту, вследствие чего обеспечивается лечение или предупреждение у субъекта инфекции, вызываемой S. aureus. В настоящем изобретении также представлено применение AT-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента, ClfA-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента и/или лейкотоксин-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента, описанных в данном документе, или композиции, содержащей любое из антител или их фрагментов, описанных в данном документе, или их комбинацию в изготовлении лекарственного препарата, предназначенного для лечения или предупреждения инфекции, вызываемой S. aureus. [00132] The present invention provides a method of treating or preventing Staphylococcus aureus ( S. aureus ) infection in a subject (e.g., a human), which comprises administering an AT binding antibody or antigen binding fragment, a ClfA binding antibody or antigen binding fragment, and/ or a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment described herein to a subject in need thereof, thereby providing treatment or prevention in the subject of an infection caused by S. aureus . The present invention also provides the use of an AT binding antibody or antigen binding fragment, a ClfA binding antibody or antigen binding fragment, and/or a leukotoxin binding antibody or antigen binding fragment described herein, or a composition containing any of the antibodies or fragments thereof described in herein, or a combination thereof in the manufacture of a medicinal product intended to treat or prevent infection caused by S. aureus .

[00133] Как описано в данном документе, Staphylococcus aureus является основным патогеном человека, вызывающим широкий спектр клинических инфекций. S. aureus является основной причиной бактериемии и инфекционного эндокардита, а также костно-суставных, кожных инфекций и инфекций мягких тканей, плевропульмональных инфекций и инфекций, вызванных медицинским изделием в организме. Примерно 30% человеческой популяции колонизированы S. aureus (Wertheim et al., Lancet Infect. Dis., 5: 751-762 (2005)). Симптомы кожных инфекций, вызванных S. aureus, включают, например, фурункулы, воспаление тканей и импетиго. S. aureus также может вызывать пищевое отравление, заражение крови (также известное как бактериемия), синдром токсического шока и септический артрит. Эпидемиология, патофизиология и клинические проявления инфекций, вызываемых S. aureus, подробно описаны, например, в Tong et al., Clin. Microbiol. Rev., 28(3): 603-661 (2015), и были секвенированы геномы нескольких различных штаммов S. aureus (см., например GenBank/EMBL № доступа BX571856, BX571857, BX571858, FN433596, FN433597, FN433598, HE681097, FR821777, FR821778, FR821779 и FR821780). Как обсуждается в данном документе, субъект (например, человек) может иметь диабет. [00133] As described herein, Staphylococcus aureus is a major human pathogen causing a wide range of clinical infections. S. aureus is a leading cause of bacteremia and infective endocarditis, as well as osteoarticular, skin and soft tissue infections, pleuropulmonary infections, and infections caused by medical devices in the body. Approximately 30% of the human population is colonized with S. aureus (Wertheim et al., Lancet Infect. Dis ., 5 : 751-762 (2005)). Symptoms of skin infections caused by S. aureus include, for example, boils, tissue inflammation, and impetigo. S. aureus can also cause food poisoning, blood poisoning (also known as bacteremia), toxic shock syndrome, and septic arthritis. The epidemiology, pathophysiology and clinical manifestations of infections caused by S. aureus are described in detail, for example, in Tong et al., Clin. Microbiol. Rev. , 28 (3): 603-661 (2015), and the genomes of several different strains of S. aureus have been sequenced (see e.g. GenBank/EMBL accession no. BX571856, BX571857, BX571858, FN433596, FN433597, FN433598, HE681097, FR8217 77 , FR821778, FR821779 and FR821780). As discussed herein, a subject (eg, a human) may have diabetes.

[00134] В определенных случаях терапевтически эффективное количество AT-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента, ClfA-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента или лейкотоксин-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента представляет собой количество, которого достаточно для подавления сепсиса, ассоциированного с S. aureus, подавления агглютинации, обусловленной S. aureus, подавления образования тромбоэмболических очагов, нейтрализации альфа-токсина, нейтрализации LukSF, HlgAB, HlgCB и LukED, индуцирования опсонофагоцитоза, подавления связывания фибриногена, обусловленного S. aureus, подавления агглютинации, обусловленной S. aureus, или любой комбинации вышеперечисленного у человека.[00134] In certain cases, a therapeutically effective amount of an AT-binding antibody or antigen-binding fragment, a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment, or a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment is an amount that is sufficient to suppress S. aureus -associated sepsis, suppress agglutination caused by S. aureus , suppression of thromboembolic lesion formation, neutralization of alpha-toxin, neutralization of LukSF, HlgAB, HlgCB and LukED, induction of opsonophagocytosis, suppression of fibrinogen binding due to S. aureus , suppression of agglutination due to S. aureus , or any combination of the above in person.

[00135] В качестве альтернативы фармакологический и/или физиологический эффект может быть профилактическим, т. е. эффект обеспечивает полное или частичное предотвращение возникновения заболевания или его симптома. В данном отношении раскрытый способ включает введение “профилактически эффективного количества” AT-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента, ClfA-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента и/или лейкотоксин-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента (включая моноклональные антитела или фрагменты). [00135] Alternatively, the pharmacological and/or physiological effect may be prophylactic, that is, the effect provides complete or partial prevention of the occurrence of a disease or symptom thereof. In this regard, the disclosed method involves administering a “prophylactically effective amount” of an AT-binding antibody or antigen-binding fragment, a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment, and/or a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment (including monoclonal antibodies or fragments).

[00136] Терапевтическую или профилактическую эффективность можно контролировать путем периодической оценки пациентов, получающих лечение. При повторных введениях в течение нескольких дней или дольше, в зависимости от состояния, лечение можно повторять до тех пор, пока не произойдет требуемое подавление симптомов заболевания. Однако могут быть полезны и другие схемы приема, которые входят в объем настоящего изобретения. Необходимая доза может быть доставлена посредством​однократного болюсного введения композиции, многократного болюсного введения композиции или непрерывного инфузионного введения композиции.[00136] Therapeutic or prophylactic effectiveness can be monitored by periodic evaluation of patients receiving treatment. With repeated administrations over several days or longer, depending on the condition, treatment can be repeated until the desired suppression of disease symptoms occurs. However, other dosage regimens may be useful and are within the scope of the present invention. The required dose may be delivered by a single bolus of the composition, multiple bolus doses of the composition, or a continuous infusion of the composition.

[00137] Способ лечения или предотвращения инфекции, вызываемой S. aureus, может включать введение AT-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента, ClfA-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента и/или лейкотоксин-связывающего антитела или антигенсвязывающего фрагмента в одной композиции или в разных композициях. Когда субъекту вводят отдельные композиции, каждую из композиций можно вводить одновременно или последовательно в любом порядке. [00137] A method of treating or preventing an infection caused by S. aureus may include administering an AT-binding antibody or antigen-binding fragment, a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment, and/or a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment in one composition or in different compositions. When separate compositions are administered to a subject, each of the compositions may be administered simultaneously or sequentially in any order.

[00138] Композиция(-и), содержащая(-ие) эффективное количество любого из описанных в данном документе антител или их антигенсвязывающих фрагментов или их комбинации, последовательность(-и) нуклеиновой кислоты, кодирующей любое из вышеперечисленных, или вектор, содержащий последовательность нуклеиновой кислоты, может(могут) быть введена(введены) субъекту, такому как человек, с использованием стандартных методик введения, включая внутривенный, внутрибрюшинный, подкожный и внутримышечный пути введения. Композиция может быть подходящей для парентерального введения. Используемый в данном документе термин “парентеральный” включает внутривенное, внутримышечное, подкожное и внутрибрюшинное введение. В некоторых вариантах осуществления композицию вводят субъекту с использованием периферической системной доставки путем внутривенной, внутрибрюшинной или подкожной инъекции.[00138] Composition(s) containing an effective amount of any of the antibodies or antigen-binding fragments thereof described herein, or a combination thereof, a nucleic acid sequence(s) encoding any of the foregoing, or a vector containing a nucleic acid sequence acids may be administered to a subject, such as a human, using standard administration techniques, including intravenous, intraperitoneal, subcutaneous and intramuscular routes. The composition may be suitable for parenteral administration. As used herein, the term “parenteral” includes intravenous, intramuscular, subcutaneous and intraperitoneal administration. In some embodiments, the composition is administered to a subject using peripheral systemic delivery by intravenous, intraperitoneal, or subcutaneous injection.

[00139] AT-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент, ClfA-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент и/или лейкотоксин-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент или композиция(ии), содержащая(-ие) их, может(могут) быть введена(-ны) отдельно или в комбинации с другими лекарственными средствами (например, в качестве адъюванта), обычно используемыми для лечения инфекций, вызываемых S. aureus. Композиция(ии), содержащая(-ие) AT-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент, ClfA-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент и/или лейкотоксин-связывающее антитело или антигенсвязывающий фрагмент, может(могут) использоваться в комбинации, например, с одним или несколькими антибиотиками, такими как устойчивый к пенициллиназе β-лактамный антибиотик (например, оксациллин или флуклоксациллин). Гентамицин можно использовать для лечения серьезных инфекций, таких как эндокардит. Однако большинство штаммов S. aureus в настоящее время устойчивы к пенициллину, и двое из 100 человек являются носителями метициллин-резистентных штаммов S. aureus (MRSA). Инфекции, вызываемые MRSA, как правило, лечат ванкомицином, а незначительные кожные инфекции можно лечить мазью с тройным антибиотиком.[00139] An AT-binding antibody or antigen-binding fragment, a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment, and/or a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment, or composition(s) containing them, may be administered ) alone or in combination with other drugs (eg, as an adjuvant) commonly used to treat infections caused by S. aureus . Composition(s) containing an AT-binding antibody or antigen-binding fragment, a ClfA-binding antibody or antigen-binding fragment, and/or a leukotoxin-binding antibody or antigen-binding fragment may be used in combination with, for example, one or more antibiotics such as a penicillinase-resistant β-lactam antibiotic (eg, oxacillin or flucloxacillin). Gentamicin can be used to treat serious infections such as endocarditis. However, most strains of S. aureus are now resistant to penicillin, and two in 100 people carry methicillin-resistant S. aureus (MRSA). MRSA infections are usually treated with vancomycin, and minor skin infections can be treated with triple antibiotic ointment.

[00140] Следующие примеры дополнительно иллюстрируют настоящее изобретение, но, разумеется, их не следует рассматривать как каким-либо образом ограничивающие его объем.[00140] The following examples further illustrate the present invention, but, of course, they should not be construed as limiting its scope in any way.

ПРИМЕР 1 EXAMPLE 1

[00141] В данном примере демонстрируется, что антитела, которые связываются с альфа-токсином (AT), фактором слипания A (ClfA) и лейкотоксинами, не влияют на активность друг друга in vitro при использовании в комбинации. [00141] This example demonstrates that antibodies that bind to alpha toxin (AT), clumping factor A (ClfA) and leukotoxins do not interfere with each other's activity in vitro when used in combination.

[00142] Было проведено несколько экспериментов, чтобы определить, будет ли использование в комбинации антител, связывающихся с AT, ClfA и лейкотоксинами, препятствовать проявлению активности в любого из этих отдельных анализов. В этих экспериментах антитела MEDI4893*, SAR114 и SAN481-SYT* использовались в комбинации и совокупности называются “MEDI6389”. [00142] Several experiments were conducted to determine whether the use of AT, ClfA, and leukotoxin binding antibodies in combination would interfere with activity in any of these individual assays. In these experiments, antibodies MEDI4893*, SAR114 and SAN481-SYT* were used in combination and are collectively referred to as “MEDI6389”.

[00143] Был проведен анализ подавления гемолиза эритроцитов (RBC), чтобы определить, препятствуют ли антитела SAR114 к ClfA или SAN481-SYT* к лейкотоксину проявлению активности MEDI4893*. Промытые эритроциты кролика (50 мкл) инкубировали с нативным альфа-токсином (0,1 мкг/мл в 25 мкл) и 25 мкл серийно разведенных MEDI4893*, SAN481_SYT*+SAR114 или тройной комбинации mAb (MEDI6389), что показано на фигуре 2. Нерелевантное mAb c-IgG использовали в качестве отрицательного контроля. После 2 ч инкубации при 37°C измеряли высвобождение гемоглобина в 50 мл супернатантов при OD450 нм. % подавления гемолиза определяли как: 100*[(ODAT+mAb)/(ODAT отдельно)]. Результаты, показанные на фигуре 2 и в таблице 1 ниже, демонстрируют, что применение трех антител в комбинации (MED6389) было приблизительно так же эффективно в отношении подавления гемолиза эритроцитов, как и применение отдельно MEDI4893*. [00143] A red blood cell (RBC) hemolysis inhibition assay was performed to determine whether SAR114 anti-ClfA or SAN481-SYT* anti-leukotoxin antibodies interfere with the activity of MEDI4893*. Washed rabbit red blood cells (50 μl) were incubated with native alpha-toxin (0.1 μg/ml in 25 μl) and 25 μl of serially diluted MEDI4893*, SAN481_SYT*+SAR114, or the triple mAb combination (MEDI6389) as shown in Figure 2. An irrelevant c-IgG mAb was used as a negative control. After 2 h of incubation at 37°C, hemoglobin release was measured in 50 ml of supernatants at OD450 nm. % suppression of hemolysis was determined as: 100*[(OD AT+mAb )/(OD AT alone )]. The results shown in Figure 2 and Table 1 below demonstrate that use of the three antibodies in combination (MED6389) was approximately as effective in inhibiting red blood cell hemolysis as MEDI4893* alone.

[00144] Был проведен анализ жизнеспособности моноцитов, чтобы определить, препятствуют ли антитела MEDI4893* к AT или SAR114 к ClfA проявлению активности SAN481-SYT*. Линию человеческих моноцитарных клеток HL-60 (5e4/лунка/25 мкл) инкубировали в течение 2 ч при 37°C со смесью LukS+LukF (100 нг/мл каждого) и с серийно разведенными, как показано на фигуре 3, SAN481_SYT*, MEDI4893*+SAR114 или тройной комбинацией mAb (MEDI6389). Нерелевантное mAb c-IgG использовали в качестве отрицательного контроля. Жизнеспособность клеток количественно определяли путем измерения люминесцентного сигнала в анализе Cell Glo (Promega) в соответствии с инструкциями производителя. % жизнеспособности рассчитывали следующим образом: 100*[(ODклеток+LukSF+mAb)/(ODклеток отдельно)]. Результаты, показанные на фигуре 3 и в таблице 1 ниже, демонстрируют, что применение трех антител в комбинации (MED6389) было приблизительно так же эффективно в отношении поддержания жизнеспособности моноцитов, как и применение отдельно SAN481-SYT*.[00144] A monocyte viability assay was performed to determine whether MEDI4893* anti-AT or SAR114 anti-ClfA antibodies interfere with the expression of SAN481-SYT* activity. The human monocytic cell line HL-60 (5e4/well/25 μl) was incubated for 2 h at 37°C with LukS+LukF (100 ng/ml each) and serially diluted as shown in Figure 3, SAN481_SYT*, MEDI4893*+SAR114 or triple mAb combination (MEDI6389). An irrelevant c-IgG mAb was used as a negative control. Cell viability was quantified by measuring the luminescence signal in a Cell Glo assay (Promega) according to the manufacturer's instructions. % viability was calculated as follows: 100*[(OD cells+LukSF+mAb )/(OD cells alone )]. The results shown in Figure 3 and Table 1 below demonstrate that use of the three antibodies in combination (MED6389) was approximately as effective in maintaining monocyte viability as SAN481-SYT* alone.

[00145] Был проведен анализ подавления связывания фибриногена, чтобы определить, препятствуют ли антитела MEDI4893* к AT или SAN481-SYT* к лейкотоксину проявлению активности SAR114. Покрытый фибриногеном 96-луночный планшет (4 мкг/мл) блокировали с использованием PBS 2% BSA и после промывки инкубировали в течение 1 ч при комнатной температуре с биотинилированным ClfA001 (2 мкг/мл) и серийно разведенными SAR114, MEDI4893*+SAN481_SYT* или тройной комбинацией mAb (MEDI6389), что показано на фигуре 4. После 3 промывок планшеты инкубировали со стрептавидин-фикоэритрином при 1:10000 в течение 1 ч и после добавления 100 мкл TMB и 100 мкл 0,2 M H2S04 считывали сигнал при OD450нм. Нерелевантное mAb c-IgG использовали в качестве отрицательного контроля. Процент (%) подавления связывания фибриногена рассчитывали как: 100*[(OD ClfA+mAb)/(OD ClfA отдельно)]. Результаты, показанные на фигуре 4 и в таблице 1 ниже, демонстрируют, что применение трех антител в комбинации (MED6389) было приблизительно так же эффективно в отношении подавления связывания фибриногена, как и применение отдельно SAR114. [00145] A fibrinogen binding inhibition assay was performed to determine whether MEDI4893* anti-AT or SAN481-SYT* anti-leukotoxin antibodies interfere with the expression of SAR114 activity. A fibrinogen-coated 96-well plate (4 μg/ml) was blocked with PBS 2% BSA and, after washing, incubated for 1 h at room temperature with biotinylated ClfA001 (2 μg/ml) and serially diluted SAR114, MEDI4893*+SAN481_SYT* or triple mAb combination (MEDI6389), as shown in Figure 4. After 3 washes, the plates were incubated with streptavidin-phycoerythrin at 1:10000 for 1 hour and after adding 100 μl TMB and 100 μl 0.2 MH 2 S0 4 the signal was read at OD 450nm . An irrelevant c-IgG mAb was used as a negative control. The percentage (%) of suppression of fibrinogen binding was calculated as: 100*[(OD ClfA+mAb )/(OD ClfA alone )]. The results shown in Figure 4 and Table 1 below demonstrate that use of the three antibodies in combination (MED6389) was approximately as effective in inhibiting fibrinogen binding as SAR114 alone.

Таблица 1. Table 1.

IC50 (мкг/мл)IC50 (µg/ml) MEDI4893*MEDI4893* SAN481-SYT*SAN481-SYT* SAR114SAR114 MEDI6389MEDI6389 Анализ RBCRBC analysis 0,17310.1731 0,16350.1635 Жизнеспособность моноцитовViability of monocytes 0,2250.225 0,22460.2246 Связывание FgFg binding 3,023.02 2,632.63

[00146] Применение комбинации из трех антител (MEDI6389) не подавляло активность MEDI4893 в анализе RBC, активность SAN481* в анализе жизнеспособности моноцитов или связывание Fg с SAR114. [00146] Use of a combination of three antibodies (MEDI6389) did not inhibit the activity of MEDI4893 in the RBC assay, the activity of SAN481* in the monocyte viability assay, or Fg binding to SAR114.

ПРИМЕР 2 EXAMPLE 2

[00147] В данном примере демонстрирует, что комбинация антител, которые связываются с альфа-токсином (AT) и лейкотоксинами, превосходит любое антитело по отдельности в модели заживления ран. [00147] This example demonstrates that a combination of antibodies that bind to alpha toxin (AT) and leukotoxins is superior to either antibody alone in a wound healing model.

[00148] В этих экспериментах самок мышей Balb/c в возрасте 6-7 недель (n=5) иммунизировали внутрибрюшинно с использованием (i) 0,5 мг/кг контрольного антитела (c-IgG), (ii) 0,1 мг/кг антитела MEDI4893* к AT, (iii) 0,5 мг/кг антитела SAN481-SYT* к лейкотоксину или (iv) одновременно MEDI4893* (0,1 мг/кг) и SAN481-SYT* (0,5 мг/кг). Затем через 24 ч мышей внутрикожно инфицировали изолятом 1447526, полученным из раны (5e7 КОЕ в 50 мкл PBS). [00148] In these experiments, 6-7 week old female Balb/c mice (n=5) were immunized intraperitoneally with (i) 0.5 mg/kg control antibody (c-IgG), (ii) 0.1 mg /kg MEDI4893* anti-AT antibody, (iii) 0.5 mg/kg SAN481-SYT* anti-leukotoxin antibody or (iv) simultaneously MEDI4893* (0.1 mg/kg) and SAN481-SYT* (0.5 mg/ kg). Mice were then intradermally infected 24 h later with wound-derived isolate 1447526 (5e7 CFU in 50 μl PBS).

[00149] Образование очагов поражения контролировали в течение 17 дней и результаты показаны на фигуре 5. Размеры очагов поражения были значительно меньше у мышей, получавших комбинацию антител к AT и к лейкотоксину, чем у мышей, получавших любое из антител по отдельности (p<0,05 и обозначено (*)). Изображения на фигуре 5 показывают очаги поражения на 7 день после инфицирования. [00149] Lesion formation was monitored for 17 days and the results are shown in Figure 5. Lesion sizes were significantly smaller in mice receiving the combination of anti-AT and anti-leukotoxin antibodies than in mice receiving either antibody alone (p<0 .05 and designated (*)). The images in Figure 5 show lesions at day 7 postinfection.

ПРИМЕР 3 EXAMPLE 3

[00150] В данном примере демонстрируется, что нейтрализация альфа-токсина (AT), фактора слипания A (ClfA) и лейкотоксинов необходима для защиты in vivo в модели бактериемии кроликов.[00150] This example demonstrates that neutralization of alpha toxin (AT), clumping factor A (ClfA), and leukotoxins is required for in vivo protection in a rabbit bacteremia model.

[00151] В этих экспериментах 3-месячным самкам кроликов (n=7) внутривенно вводили (i) контрольное антитело IgG, (ii) антитело SAN481-SYT* к лейкотоксину, (iii) SAN481-SYT* и антитело SAR114 к ClfA, (iv) SAR114 и антитело MEDI4893* к AT, (v) SAN481-SYT* и MEDI4893* или (vi) SAN481-SYT*, SAR114 и MEDI4893*, т.е. MEDI6389. Все антитела вводили в дозе 5 мг/кг, кроме контрольного антитела, которое вводили в дозе 15 мг/кг. Затем через 12 часов кроликов внутривенно инфицировали CA-MRSA SF8300. [00151] In these experiments, 3-month-old female rabbits (n=7) were intravenously administered (i) control IgG antibody, (ii) anti-leukotoxin antibody SAN481-SYT*, (iii) SAN481-SYT* and anti-ClfA antibody SAR114, ( iv) SAR114 and anti-AT antibody MEDI4893*, (v) SAN481-SYT* and MEDI4893* or (vi) SAN481-SYT*, SAR114 and MEDI4893*, i.e. MEDI6389. All antibodies were administered at a dose of 5 mg/kg, except for the control antibody, which was administered at a dose of 15 mg/kg. Rabbits were then infected intravenously with CA-MRSA SF8300 12 h later.

[00152] Выживаемость контролировали в течение четырех дней после заражения, и комбинация SAN481-SYT*, SAR114 и MEDI4893* (MEDI6389) или MEDI4893*+SAN481_SYT* значительно улучшала выживаемость по сравнению с c-IgG, что показано посредством логарифмического рангового критерия Мантеля-Кокса (р=0,0001). Результаты показаны на фигуре 6. В особенности следует отметить, что ни целенаправленное воздействие на AT и ClfA, ни целенаправленное воздействие на лейкотоксины недостаточно для защиты в данной модели летальной бактериемии кроликов. [00152] Survival was monitored for four days post-infection, and the combination of SAN481-SYT*, SAR114 and MEDI4893* (MEDI6389) or MEDI4893*+SAN481_SYT* significantly improved survival compared to c-IgG, as shown by the Mantel log-rank test. Cox (p=0.0001). The results are shown in Figure 6. In particular, it is noteworthy that neither targeting AT and ClfA nor targeting leukotoxins was sufficient to provide protection in this rabbit lethal bacteremia model.

ПРИМЕР 4 EXAMPLE 4

[00153] В данном примере демонстрируется, что нейтрализация альфа-токсина (AT), фактора слипания A (ClfA) и лейкотоксинов необходима для защиты in vivo в модели инфекции кровотока у кроликов.[00153] This example demonstrates that neutralization of alpha toxin (AT), clumping factor A (ClfA), and leukotoxins is required for in vivo protection in a rabbit model of bloodstream infection.

[00154] В данных экспериментах трехмесячным самкам кроликов (n=12) внутривенно вводили 15 мг/кг (i) контрольного антитела IgG, (ii) антитела SAN481-SYT* к лейкотоксину, (iii) антитела SAR114 к ClfA и антитела MEDI4893* к AT, (iv) SAN481-SYT* и MEDI4893* или (vi) SAN481-SYT*, SAR114 и MEDI4893*, т.e. MEDI6389. Затем через 12 часов кроликов инфицировали путем внутривенного введения HA-MRSA NRS382 или CA-MRSA SF8300. [00154] In these experiments, three-month-old female rabbits (n=12) were intravenously administered 15 mg/kg of (i) control IgG antibody, (ii) anti-leukotoxin antibody SAN481-SYT*, (iii) anti-ClfA antibody SAR114, and anti-Leukotoxin antibody MEDI4893* AT, (iv) SAN481-SYT* and MEDI4893* or (vi) SAN481-SYT*, SAR114 and MEDI4893*, i.e. MEDI6389. Rabbits were then infected 12 h later by intravenous injection of HA-MRSA NRS382 or CA-MRSA SF8300.

[00155] Выживаемость контролировали в течение четырех дней после заражения, а результаты показаны на фигуре 7. Комбинация SAN481-SYT*, SAR114 и MEDI4893*(MEDI6389) или MEDI4893*+SAN481_SYT* значительно улучшала выживаемость по сравнению с c-IgG, что показано посредством логарифмического рангового критерия Мантеля-Кокса (p=0,0015 для NRS382 и p=0,0001 для SF8300), и она была наиболее эффективной в увеличении выживаемости после введения бактерий HA-MRSA NRS382 или CA-MRSA SF8300. [00155] Survival was monitored for four days postinfection and the results are shown in Figure 7. The combination of SAN481-SYT*, SAR114 and MEDI4893*(MEDI6389) or MEDI4893*+SAN481_SYT* significantly improved survival compared to c-IgG, as shown by Mantel-Cox log-rank test (p=0.0015 for NRS382 and p=0.0001 for SF8300), and was most effective in increasing survival after administration of HA-MRSA NRS382 or CA-MRSA SF8300 bacteria.

ПРИМЕР 5 EXAMPLE 5

[00156] В данном примере демонстрирует, что комбинация антител, которые связываются с альфа-токсином (AT), фактором слипания A (ClfA) и лейкотоксинами (MEDI6389), улучшает заживление ран, возникающих в результате смешанных бактериальных инфекций, в модели дермонекроза у мышей с диабетом. [00156] This example demonstrates that a combination of antibodies that bind to alpha toxin (AT), clumping factor A (ClfA) and leukotoxins (MEDI6389) improves wound healing resulting from mixed bacterial infections in a mouse model of dermonecrosis with diabetes.

[00157] Смешанные бактериальные инфекции сравнивали с инфекциями, вызванными одной бактерией, у семинедельных самцов (n=10) мышей с диабетом 2 типа (BKS.Cg-m +/+ Lepr db ). Мышей внутрикожно инфицировали смесью S. aureus (SA; 5e6 КОЕ), Pseudomonas aeruginosa (A; 5 КОЕ) и Streptococcus pyogenes (SP; 1e1 КОЕ) до 50 мкл в PBS или SA (5e6 КОЕ). Размеры очагов поражения контролировали в течение 43 дней. Результаты, показанные на фигуре 8, демонстрируют, что смешанные инфекции приводят к задержке времени закрытия раны в этой модели дермонекроза у мышей с диабетом по сравнению с инфекциями, которые обусловлены только заражением SA.[00157] Mixed bacterial infections were compared with single bacterial infections in seven-week-old male (n=10) type 2 diabetic mice (BKS.Cg- m +/+ Lepr db ). Mice were infected intradermally with a mixture of S. aureus (SA; 5e6 CFU), Pseudomonas aeruginosa (A; 5 CFU), and Streptococcus pyogenes (SP; 1e1 CFU) to 50 μl in PBS or SA (5e6 CFU). The size of the lesions was monitored for 43 days. The results shown in Figure 8 demonstrate that mixed infections result in delayed wound closure time in this diabetic mouse model of dermonecrosis compared to infections that are due to SA infection alone.

[00158] Исследовали влияние комбинации MEDI6389 (содержащей mAb к AT MEDI4893*, mAb к ClfA SAR114 и mAb к лейкотоксину SAN481_SYT*) на время закрытия раны и бактериальную нагрузку. Мышей пассивно иммунизировали внутрибрюшинно с использованием MEDI6389 (каждое mAb в дозе 15 мг/кг) или контрольного IgG c-IgG (15 мг/кг) и через 24 часа внутрикожно инфицировали SA/SP/PA. За очагами поражениями наблюдали в течение 43 дней, а на 7, 14 и 21 дни количество бактерий подсчитывали в очагах поражения кожи. Результаты, показанные на фигуре 9, демонстрируют, что MED6389 улучшает заживление ран и снижает количество бактерий в смешанных бактериальных очагах поражения кожи в данной модели дермонекроза у мышей с диабетом. [00158] The effect of the combination MEDI6389 (containing AT mAb MEDI4893*, ClfA mAb SAR114 and leukotoxin mAb SAN481_SYT*) on wound closure time and bacterial load was studied. Mice were passively immunized intraperitoneally with MEDI6389 (each mAb at 15 mg/kg) or control IgG c-IgG (15 mg/kg) and 24 h later intradermally infected with SA/SP/PA. The lesions were observed for 43 days, and the number of bacteria in the skin lesions was counted on days 7, 14, and 21. The results shown in Figure 9 demonstrate that MED6389 improves wound healing and reduces bacterial counts in mixed bacterial skin lesions in this diabetic mouse model of dermonecrosis.

ПРИМЕР 6 EXAMPLE 6

[00159] В данном примере представлены материалы и методики, использованные в примерах 7-11. [00159] This example presents the materials and techniques used in Examples 7-11.

Модель системной инфекции Systemic infection model in vivoin vivo

[00160] Замороженные чистые культуры S. aureus USA300 штамма SF8300 размораживали и разводили до соответствующего инокулята в стерильном PBS, pH 7,2 (Invitrogen) (Hua et al., Antimicrob Agents Chemother. 58:1108-17 (2014)). Свободных от патогенной микрофлоры 7-8-недельных самок мышей BKS.Cg-Dok7<m>+/+Lepr, db>/J (db/db), C57BKS, C57BL/6J - STZ и C57BL/6J (The Jackson Laboratory) на короткий срок анестезировали и поддерживали на 3% изофлуране (Butler Schein™ Animal Health) с кислородом при скорости 3 л/мин и внутривенно инфицировали. Все бактериальные суспензии вводили в 100 мкл PBS. В выбранных экспериментах нейтрализующие антитела MEDI4893*, антитела к αVβ6/8, антитела к αVβ6, c-IgG (антитела MedImmune), антитела к TGFβ (клон 1D11.16.8, BioXcell) или контрольный мышиный IgG1 вводили (15 мг/кг) в 0,5 мл внутрибрюшинно (в/б) за 24 часа до заражения. Розиглитазон (Sigma-Aldrich) вводили (10 мг/кг) перорально в течение 7 дней. Мышей инфицировали через 24 часа после введения последней дозы розиглитазона. Животных умерщвляли с использованием CO2 в указанные моменты времени и для анализа отбирали кровь, печень или почки. Бактериальную нагрузку в почках определяли путем посева серийных разведений образцов на TSA. [00160] Frozen pure cultures of S. aureus USA300 strain SF8300 were thawed and diluted to the appropriate inoculum in sterile PBS, pH 7.2 (Invitrogen) (Hua et al., Antimicrob Agents Chemother. 58: 1108-17 (2014)). Pathogen-free 7-8 week old female mice BKS.Cg-Dok7<m>+/+Lepr, db>/J ( db/db ), C57BKS, C57BL/6J - STZ and C57BL/6J (The Jackson Laboratory) were briefly anesthetized and maintained on 3% isoflurane (Butler Schein™ Animal Health) with oxygen at 3 L/min and infected i.v. All bacterial suspensions were injected into 100 μl of PBS. In selected experiments, neutralizing antibodies MEDI4893*, anti-αVβ6/8, anti-αVβ6, c-IgG (MedImmune antibodies), anti-TGFβ (clone 1D11.16.8, BioXcell) or control mouse IgG1 were administered (15 mg/kg) at 0 .5 ml intraperitoneally (i.p.) 24 hours before infection. Rosiglitazone (Sigma-Aldrich) was administered (10 mg/kg) orally for 7 days. Mice were infected 24 hours after the last dose of rosiglitazone. Animals were sacrificed using CO 2 at the indicated time points and blood, liver or kidneys were collected for analysis. Kidney bacterial load was determined by plating serial dilutions of samples on TSA.

ELISA-анализ NETELISA NET assay

[00161] Для измерения NET использовали гибридный набор из 2 различных наборов ELISA. Планшеты исходно покрывали захватывающим антителом к эластазе (R&D Systems). Свежие образцы сыворотки крови добавляли в покрытые лунки, затем инкубировали и промывали. Затем использовали антитело к DNA-POD (Roche) для обнаружения ДНК в захваченных белках в лунках. Планшеты обрабатывали раствором ABTS и стоп-раствором ABTS. Поглощение измеряли при 405 нм на планшет-ридере с использованием программного обеспечения SoftMax Pro.[00161] A hybrid of 2 different ELISA kits was used to measure NET. The plates were initially coated with elastase capture antibody (R&D Systems). Fresh serum samples were added to coated wells, then incubated and washed. An anti-DNA-POD antibody (Roche) was then used to detect DNA in the captured proteins in the wells. The plates were treated with ABTS solution and ABTS stop solution. Absorbance was measured at 405 nm on a plate reader using SoftMax Pro software.

Очистка HDN и LDNCleaning HDN and LDN

[00162] Нейтрофилы высокой и низкой плотности (HDN и LDN) выделяли из цельной крови. После умерщвления кровь отбирали и покрывали histopaque 1077 (Sigma-Aldrich). Клетки разделяли центрифугированием (500 g, 30 минут). Нижнюю фракцию обрабатывали лизирующим буфером ACK (Thermo Fisher Scientific) для удаления эритроцитов из нейтрофилов с высокой плотностью. Верхнюю фракцию (PBMC) промывали 2 раза PBS и нейтрофилы низкой плотности выделяли с использованием набора EasySep Mouse Neutrophil Enrichment Kit (Stemcell Technologies). Очищенные популяции клеток лизировали для анализа белков или РНК.[00162] High and low density neutrophils (HDN and LDN) were isolated from whole blood. After sacrifice, blood was collected and covered with histopaque 1077 (Sigma-Aldrich). Cells were separated by centrifugation (500 g, 30 minutes). The lower fraction was treated with ACK lysis buffer (Thermo Fisher Scientific) to remove high-density red blood cells from neutrophils. The upper fraction (PBMC) was washed 2 times with PBS and low-density neutrophils were isolated using the EasySep Mouse Neutrophil Enrichment Kit (Stemcell Technologies). Purified cell populations were lysed for protein or RNA analysis.

Проточная цитометрияFlow cytometry

[00163] Цельную кровь или очищенные клетки низкой плотности дважды промывали ледяным буфером для FACS (PBS с 5% фетальной бычьей сывороткой и 0,1% азидом натрия). Fc-рецепторы блокировали антителами к CD16/CD32 мыши (eBioscience) и клетки окрашивали антителами к мышиному CD45 (конъюгированные с PE, клон FA-11), CD11c (конъюгированные с APC-Cy5.5 или FITC, клон N418), CD11b (конъюгированные с BV605, клон M1/70), Ly6-G (конъюгированные с BV421 или PE-Cy7, клон 1A8) и Ly6-C. Изображения клеток получали с использованием проточного цитометра LSR II (BD Biosciences) и анализировали посредством FlowJo. К каждому образцу добавляли известную концентрацию счетных гранул (Bangs Laboratories) для подсчета количества клеток. [00163] Whole blood or low density purified cells were washed twice with ice-cold FACS buffer (PBS with 5% fetal bovine serum and 0.1% sodium azide). Fc receptors were blocked with antibodies to mouse CD16/CD32 (eBioscience) and cells were stained with antibodies to mouse CD45 (PE-conjugated, clone FA-11), CD11c (APC-Cy5.5 or FITC-conjugated, clone N418), CD11b (conjugated with BV605, clone M1/70), Ly6-G (conjugated to BV421 or PE-Cy7, clone 1A8) and Ly6-C. Cell images were acquired using an LSR II flow cytometer (BD Biosciences) and analyzed by FlowJo. A known concentration of counting beads (Bangs Laboratories) was added to each sample to count the number of cells.

Вестерн-блоттингWestern blotting

[00164] Клетки лизировали буфером Ripa (ThermoFisher Scientific), содержащим ингибитор протеаз cOmplete™ (Sigma), и замораживали. В выбранных экспериментах осуществляли иммунопреципитацию IP3R с использованием антитела к IP3R (Abcam, кат. № ab5804) и набора для иммунопреципитации белка G Dynabeads (ThermoFisher Scientific). Равные количества белка разделяли на 4-12% гелях бис-трис NuPage и переносили на PVDF-мембраны (ThermoFisher Scientific). Иммунодетекцию выполняли с использованием антитела к H3Cit (Abcam, кат. № ab5103), антитела к лактоферрину (Abcam, кат. № ab77705), антитела к MMP9 (Abcam, кат. № ab38898), антитела к IP3R (Abcam, кат. № ab5804), антитела к P-Ser/Thr (Abcam, кат. № ab17464) и антитела к актину (Sigma, кат. № A3854). Визуальный анализ белков проводили посредством системы визуализации Odyssey (Li-COR).[00164] Cells were lysed with Ripa buffer (ThermoFisher Scientific) containing cOmplete™ protease inhibitor (Sigma) and frozen. In selected experiments, IP3R immunoprecipitation was performed using IP3R antibody (Abcam, cat. no. ab5804) and Dynabeads Protein G Immunoprecipitation Kit (ThermoFisher Scientific). Equal amounts of protein were separated on 4–12% NuPage Bis-Tris gels and transferred to PVDF membranes (ThermoFisher Scientific). Immunodetection was performed using anti-H3Cit antibody (Abcam, cat. no. ab5103), anti-lactoferrin antibody (Abcam, cat. no. ab77705), anti-MMP9 antibody (Abcam, cat. no. ab38898), anti-IP3R antibody (Abcam, cat. no. ab5804 ), anti-P-Ser/Thr antibody (Abcam, cat. no. ab17464), and anti-actin antibody (Sigma, cat. no. A3854). Protein visualization was performed using the Odyssey Imaging System (Li-COR).

ПРИМЕР 7 EXAMPLE 7

[00165] В данном примере демонстрируется, что повышенные уровни глюкозы коррелируют с более тяжелыми инфекциями, вызываемыми S. aureus. [00165] This example demonstrates that elevated glucose levels correlate with more severe S. aureus infections.

[00166] Две модели диабета у мышей, STZ-индуцированного и у db/db, использовали для изучения влияния диабета в отношении системного ответа на системную инфекцию, вызываемую S. aureus. В каждой модели у мышей с диабетом уровень глюкозы не натощак превышал 450 дг/мл, в то время как уровни у контрольных животных, не страдающих диабетом, составляли менее 200 дг/мл. Мышей инфицировали с использованием 5e7 КОЕ S. aureus (USA300, SF8300). Забор КОЕ проводили из почек через 48 часов после инфицирования, а смертность контролировали в течение 14 дней. Повышенную смертность наблюдали как в модели STZ (P=0,0011), так и в модели db/db (P=0,0241) по сравнению с контрольными животными, не страдающими диабетом (фиг. 11A и 11B). Следует отметить, что это не коррелировало с различием в КОЕ бактерий, выделенных из почек через 48 часов после инфицирования (фиг. 11C и 11D). Чтобы подтвердить, что повышенная смертность является следствием повышенного уровня глюкозы у хозяина с диабетом, мышей лечили розиглитазоном в течение 1 недели до заражения для снижения уровней глюкозы в циркулирующей крови (фиг. 11E). Розиглитазон значительно снизил смертность (P=0,0041) после заражения S. aureus, однако бактериальная нагрузка в почках не изменилась (фиг. 11F и 11G). [00166] Two mouse models of diabetes, STZ-induced and db/db , were used to study the effect of diabetes on the systemic response to systemic S. aureus infection. In each model, diabetic mice had nonfasting glucose levels greater than 450 dg/mL, while levels in nondiabetic controls were less than 200 dg/mL. Mice were infected with 5e7 CFU of S. aureus (USA300, SF8300). CFU were collected from kidneys 48 hours after infection, and mortality was monitored for 14 days. Increased mortality was observed in both the STZ model (P=0.0011) and the db/db model (P=0.0241) compared to non-diabetic controls (FIGS. 11A and 11B). It should be noted that this did not correlate with differences in CFU of bacteria isolated from kidneys 48 hours postinfection (Fig. 11C and 11D). To confirm that the increased mortality was a consequence of elevated glucose levels in the diabetic host, mice were treated with rosiglitazone for 1 week before infection to reduce circulating glucose levels (Fig. 11E). Rosiglitazone significantly reduced mortality (P=0.0041) following S. aureus challenge, but kidney bacterial load was unchanged (Figures 11F and 11G).

[00167] Также следует отметить, что у мышей с диабетом не наблюдалось нарушения клиренса по сравнению с контрольными животными, не страдающими диабетом. Это подчеркивает вклад чрезмерного воспаления или патологически усиленного ответа организма хозяина в повышение смертности. [00167] It is also noteworthy that diabetic mice did not exhibit impaired clearance compared to nondiabetic controls. This highlights the contribution of excessive inflammation or pathologically enhanced host responses to increased mortality.

ПРИМЕР 8 EXAMPLE 8

[00168] В данном примере демонстрируется, что у мышей с диабетом возникает усиленный NETоз. [00168] This example demonstrates that diabetic mice experience increased NETosis.

[00169] Нейтрофилы в организме хозяина, страдающего диабетом, или при повышенном уровне глюкозы становятся все более склонными к NETозу. На популяции с диабетом было показано, что высвобождение NET ухудшает заживление ран у мышей, а присутствие NET в сыворотке крови коррелирует с незаживающими ранами у пациентов (Fadini, G. P. et al., Diabetes 65: 1061-1071 (2016) и Wong, S. L. et al., Nat Med 21: 815-819 (2015)). Нейтрофилы также высвобождают NET в ответ на бактериальную инфекцию, поэтому было высказано предположение, что инфекция, вызываемая S. aureus, приведет к увеличению системного высвобождения NET у мышей с диабетом. Комплексы нейтрофильной эластазы и двухцепочечной ДНК используют для измерения образования NET и количественно оценивают с помощью ELISA (Fadini, G. P. et al., Diabetes 65: 1061-1071 (2016)). Значительное увеличение (P=0,0003) NET в сыворотке крови наблюдали у мышей с диабетом, внутривенно инфицированных S. aureus, в течение 24 часов, тогда как значительного увеличения у контрольных мышей, не страдающих диабетом, не наблюдалось (фиг. 12A). Уровни циркулирующих NET не отличались у неинфицированных мышей с диабетом и без диабета. [00169] Neutrophils in a host with diabetes or elevated glucose levels become increasingly prone to NETosis. In diabetic populations, NET release has been shown to impair wound healing in mice, and the presence of NETs in serum correlates with non-healing wounds in patients (Fadini, GP et al. , Diabetes 65 : 1061-1071 (2016) and Wong, SL et al. al. , Nat Med 21 : 815-819 (2015)). Neutrophils also release NETs in response to bacterial infection, so it has been hypothesized that S. aureus infection would lead to increased systemic NET release in diabetic mice. Neutrophil elastase-dsDNA complexes are used to measure NET formation and quantified by ELISA (Fadini, GP et al. , Diabetes 65 : 1061-1071 (2016)). A significant increase (P=0.0003) in serum NETs was observed in diabetic mice intravenously infected with S. aureus for 24 hours, whereas no significant increase was observed in nondiabetic control mice (Fig. 12A). Levels of circulating NETs did not differ between uninfected diabetic and nondiabetic mice.

[00170] Альфа-токсин (AT), высвобождаемый S. aureus, связывается с рецептором ADAM10 на поверхности тромбоцитов. (Нейтрофилы не экспрессируют ADAM10.) В ответ на AT тромбоциты агрегируют и связываются с циркулирующими нейтрофилами, что приводит к активации передачи сигналов, опосредованной каспазой-1, и продуцированию NET (Powers, M. E. et al., Cell Host Microbe 17: 775-787 (2015) и Surewaard, B. G. J. et al. Cell Host Microbe 24: 271-284 (2018)). В соответствии с этими результатами нейтрализация AT моноклональным антителом MEDI4893* значительно снижает количество комплексов NE-ДНК в сыворотке крови через 48 часов после инфицирования у животных с диабетом (фиг. 12B). Повышение AT-зависимого продуцирования NET было подтверждено через 48 часов после инфицирования увеличением количества цитринулированного гистона H3 (H3cit) в печени, что обнаружено посредством вестерн-блоттинга (фиг. 12C). Визуальный анализ срезов печени, иммуногистохимически окрашенных антителом к Ly6G для маркировки нейтрофилов и антителом к H3cit, также показала повышение AT-зависимых NET (т. е. меньшее окрашивание антителом к H3cit в печени мышей, получавших MEDI4893*) (Cohen TS, et al. Staphylococcus aureus drives expansion of low density neutrophils in diabetic mice. JCI 2019, в печати). Нейтрализация AT значительно увеличивала выживаемость (P=0,0255) мышей с диабетом, инфицированных S. aureus (фиг. 12D). Эти данные показывают, что системная инфекция у хозяина с диабетом приводит к AT-зависимому увеличению уровней циркулирующих NET, которое может подавляться путем использования MEDI4893*. [00170] Alpha toxin (AT) releasedS. aureus, binds to the ADAM10 receptor on the surface of platelets. (Neutrophils do not express ADAM10.) In response to AT, platelets aggregate and associate with circulating neutrophils, resulting in activation of caspase-1-mediated signaling and production of NETs (Powers, M.E.et al.,Cell Host Microbe 17: 775-787 (2015) and Surewaard, B. G. J.et al.Cell Host Microbe 24: 271-284 (2018)). Consistent with these results, neutralization of AT with the monoclonal antibody MEDI4893* significantly reduced the amount of NE-DNA complexes in serum 48 hours postinfection in diabetic animals (Fig. 12B). The increase in AT-dependent NET production was confirmed 48 hours postinfection by an increase in the amount of citrinulated histone H3 (H3cit) in the liver, as detected by Western blotting (Fig. 12C). Visual analysis of liver sections immunohistochemically stained with anti-Ly6G antibody to label neutrophils and anti-H3cit antibody also showed increased AT-dependent NETs (i.e., less anti-H3cit staining in the livers of MEDI4893*-treated mice) (Cohen TS,et al.Staphylococcus aureus drives expansion of low density neutrophils in diabetic mice. JCI 2019, in press). Neutralization of AT significantly increased survival (P=0.0255) of diabetic mice infected withS. aureus (Fig. 12D).These data indicate that systemic infection in a diabetic host results in an AT-dependent increase in circulating NET levels, which can be suppressed by use of MEDI4893*.

ПРИМЕР 9 EXAMPLE 9

[00171] В данном примере демонстрируется, что нейтрофилы низкой плотности коррелируют с повышенным NETозом. [00171] This example demonstrates that low density neutrophils correlate with increased NETosis.

[00172] Подобно макрофагам нейтрофилы можно разделить на разные классы на основе функциональных характеристик. Было показано, что тяжелые ожоги изменяют фенотип циркулирующих нейтрофилов и влияют на экспрессию TLR, продуцирование цитокинов и их способность управлять поляризацией макрофагов (Tsuda, Y. et al. Immunity 21: 215-226 (2004)). Нейтрофилы уникальны тем, что их можно разделить по плотности клеток. Нейтрофилы высокой плотности являются противоопухолевыми фагоцитарными клетками, тогда как нейтрофилы низкой плотности считаются проопухолевыми клетками с дефектом фагоцитарной активности (Sagiv, J. Y. et al. Cell Rep 10: 562-573 (2015)). Хотя Tsuda et. al. не измеряли плотность нейтрофилов, выделенных у мышей, восприимчивых к инфекции S. aureus, форма ядер в этих нейтрофилах была похожа на форму ядер в клетках низкой плотности (Sagiv, J. Y. et al. Cell Rep 10: 562-573 (2015) и Fridlender, Z. G. et al. Cancer Cell 16: 183-194 (2009)). Формы ядер в нейтрофилах, полученных от мышей, не страдающих диабетом, и мышей с диабетом, также имели разительные различия. Ядро в клетках, выделенных у мышей, не страдающих диабетом, было многодольчатым или круглым, в то время как в крови мышей с диабетом наблюдали большое количество клеток с кольцевидными ядрами (Cohen TS, et al. Staphylococcus aureus drives expansion of low density neutrophils in diabetic mice. JCI 2019, в печати). Данные структуры были аналогичны структурам, описанным Tsuda et. al, которые обнаруживаются в клетках, выделенных у мышей, восприимчивых к S. aureus, указывая на то, что у мышей с диабетом может быть повышенное количество нейтрофилов низкой плотности или нейтрофилов с нарушенной иммунной функцией. [00172] Like macrophages, neutrophils can be divided into different classes based on functional characteristics. Severe burns have been shown to alter the phenotype of circulating neutrophils and affect TLR expression, cytokine production, and their ability to drive macrophage polarization (Tsuda, Y. et al. Immunity 21 : 215-226 (2004)). Neutrophils are unique in that they can be separated by cell density. High-density neutrophils are anti-tumor phagocytic cells, whereas low-density neutrophils are considered pro-tumor cells with a defect in phagocytic activity (Sagiv, JY et al. Cell Rep 10 : 562-573 (2015)). Although Tsuda et. al. did not measure the density of neutrophils isolated from mice susceptible to S. aureus infection, the shape of the nuclei in these neutrophils was similar to the shape of the nuclei in low-density cells (Sagiv, JY et al. Cell Rep 10 : 562-573 (2015) and Fridlender, ZG et al Cancer Cell 16 : 183-194 (2009)). The shapes of the nuclei in neutrophils obtained from nondiabetic and diabetic mice also had striking differences. Nuclei in cells isolated from nondiabetic mice were multilobed or round, while in the blood of diabetic mice a large number of cells with ring-shaped nuclei were observed (Cohen TS, et al . Staphylococcus aureus drives expansion of low density neutrophils in diabetic mice . JCI 2019, in press). These structures were similar to those described by Tsuda et. al that are found in cells isolated from mice susceptible to S. aureus , indicating that diabetic mice may have increased numbers of low-density neutrophils or neutrophils with impaired immune function.

[00173] Избыточное продуцирование NET является характеристикой нейтрофилов низкой плотности (LDN), и была выдвинута гипотеза, что большее количество LDN у инфицированных мышей с диабетом ответственно за увеличение количества NET (Villanueva, E. et al. J Immunol 187: 538-552 (2011)). Кровь отбирали у мышей C57BKS и db/db через 48 часов после в/в заражения и анализировали на присутствие LDN. Количество LDN в крови инфицированных мышей db/db было значительно увеличено по сравнению с неинфицированными мышами db/db (P < 0,0001), а также инфицированными контрольными мышами C57BKS (P=0,0003) (фиг. 13A). У мышей C57BKS не наблюдалось увеличения LDN (фиг. 13A). Аналогичное увеличение наблюдалось у мышей с STZ-индуцированным диабетом, но не у контрольных мышей C57BL/6 (фиг. 14). Снижение уровней глюкозы с использованием розиглитазона до инфицирования приводило к значительному (P=0,0116) уменьшению LDN через 48 часов после инфицирования (фиг. 13B). [00173] Excessive production of NETs is a characteristic of low-density neutrophils (LDN), and it has been hypothesized that the greater amount of LDN in infected diabetic mice is responsible for the increased number of NETs (Villanueva, E. et al. J Immunol 187 :538-552 ( 2011)). Blood was collected from C57BKS and db/db mice 48 hours after i.v. challenge and analyzed for the presence of LDN. The amount of LDN in the blood of infected db/db mice was significantly increased compared with uninfected db/db mice (P < 0.0001) as well as infected control C57BKS mice (P = 0.0003) (Fig. 13A). No increase in LDN was observed in C57BKS mice (Figure 13A). A similar increase was observed in STZ-induced diabetic mice, but not in control C57BL/6 mice (Fig. 14). Lowering glucose levels using rosiglitazone before infection resulted in a significant (P=0.0116) decrease in LDN 48 hours after infection (Fig. 13B).

[00174] Чтобы гарантировать, что наблюдения не основываются на дегранулированных нейтрофилах, LDN и нейтрофилы высокой плотности (HDN) выделяли из крови инфицированных мышей db/db и измеряли количества лактоферрина (вторичные гранулы) и MMP9 (третичные гранулы) посредством вестерн-блоттинга. Наблюдались эквивалентные количества обоих показателей, указывая на то, что LDN имеют сходное содержание гранул по сравнению с HDN (Cohen TS, et al. Staphylococcus aureus drives expansion of low density neutrophils in diabetic mice. JCI 2019, в печати). Нейтрализация AT предотвращала системное высвобождение NET, поэтому оценивали влияние AT на количество LDN. Измеряли LDN в крови у мышей db/db, обработанных c-IgG или MEDI4893* за 24 часа до инфицирования и инфицированных S. aureus в течение 48 часов. Наблюдали значительное снижение LDN у мышей, которым профилактически вводили MEDI4893* (фиг. 13C), в то время как общее количество нейтрофилов не изменялось (фиг. 13D), указывая на то, что AT способствует увеличению числа LDN.[00174] To ensure that the observations were not based on degranulated neutrophils, LDN and high-density neutrophils (HDN) were isolated from the blood of infected db/db mice and the amounts of lactoferrin (secondary granules) and MMP9 (tertiary granules) were measured by Western blotting. Equivalent amounts of both were observed, indicating that LDN have similar granule content compared to HDN (Cohen TS, et al . Staphylococcus aureus drives expansion of low density neutrophils in diabetic mice . JCI 2019, in press). Neutralization of AT prevented systemic release of NETs, so the effect of AT on the amount of LDN was assessed. Blood LDN was measured in db/db mice treated with c-IgG or MEDI4893* 24 hours before infection and infected with S. aureus for 48 hours. A significant reduction in LDN was observed in mice prophylactically treated with MEDI4893* (Figure 13C), while total neutrophil counts were not affected (Figure 13D), indicating that AT promotes an increase in LDN counts.

[00175] Эти данные показывают, что LDN вносят вклад в патологический процесс, связанный с инфекцией S. aureus у больных диабетом, и что эти LDN связаны с чрезмерным высвобождением NET как в печени, ключевом органе-мишени системных инфекций, так и системно в крови. Кроме того, MEDI4893* снижает LDN у мышей с диабетом. [00175] These data indicate that LDNs contribute to the pathological process associated with S. aureus infection in diabetic patients, and that these LDNs are associated with excessive release of NETs both in the liver, a key target organ of systemic infections, and systemically in the blood . Additionally, MEDI4893* reduced LDN in diabetic mice.

ПРИМЕР 10 EXAMPLE 10

[00176] В данном примере демонстрирует, что TGFß способствует увеличению количества LDN. [00176] This example demonstrates that TGFß promotes an increase in LDN.

[00177] TGFβ задействован в качестве центрального регулятора фенотипа нейтрофилов, и в моделях опухолей он может управлять фенотипическим переключением нейтрофилов высокой плотности на нейтрофилы низкой плотности (Sagiv, J. Y. et al. Cell Rep 10: 562-573 (2015) и Fridlender, Z. G. et al. Cancer Cell 16: 183-194 (2009). Sagiv et. al. продемонстрировали, что добавление TGFβ к крови, отобранной у мышей с опухолью, но не у наивных мышей, приведет к увеличению количества LDN in vitro (там же). Это исследование повторили с кровью мышей, не страдающих диабетом, и мышей с диабетом. Добавление TGFβ к крови животных с диабетом приводило к значительному увеличению (P=0,0021) количества LDN (фиг. 15A). Такой же эффект не наблюдали в крови животных, не страдающих диабетом. На основе этих данных in vitro, демонстрирующих, что TGFβ может приводить к увеличению количества LDN, протестировали его необходимость для их индуцирования путем блокирования in vivo. Мышей с диабетом профилактически обработали нейтрализующими антителами к TGFβ за 24 часа до инфицирования S. aureus. Количество LDN в кровотоке было значительно снижено (P=0,0003) за счет подавления TGFβ, в то время как количество бактерий в почках было одинаковым между группами (фиг. 15B и 15C). Выживаемость значительно улучшалась (P=0,0072) при нейтрализации TGFβ (фиг. 15D). Визуальный анализ NET в печени продемонстрировал потерю NET при нейтрализации TGFβ (Cohen TS, et al. Staphylococcus aureus drives expansion of low density neutrophils in diabetic mice. JCI 2019, в печати). Эти данные свидетельствуют о том, что снижение LDN путем блокирования TGFβ может способствовать выживаемости.[00177] TGFβ is implicated as a central regulator of neutrophil phenotype, and in tumor models it can drive the phenotypic switch from high-density neutrophils to low-density neutrophils (Sagiv, J. Y.et al. Cell Rep 10: 562-573 (2015) and Fridlender, Z. G.et al. Cancer Cell 16: 183-194 (2009). Sagiv et. al. demonstrated that adding TGFβ to blood collected from tumor-bearing mice, but not from naïve mice, would increase the amount of LDNin vitro (there same). This study was repeated with blood from nondiabetic and diabetic mice. Addition of TGFβ to the blood of diabetic animals resulted in a significant increase (P=0.0021) in the amount of LDN (Fig. 15A). The same effect was not observed in the blood of nondiabetic animals. Based on this datain vitro, demonstrating that TGFβ can lead to an increase in LDN, tested its requirement for their induction by blockingin vivo. Diabetic mice were treated prophylactically with neutralizing antibodies to TGFβ 24 hours before infection.S. aureus. The amount of LDN in the bloodstream was significantly reduced (P=0.0003) by suppression of TGFβ, while the amount of bacteria in the kidney was similar between groups (Fig. 15B and 15C). Survival was significantly improved (P=0.0072) with TGFβ neutralization (Fig. 15D). Imaging analysis of NETs in the liver demonstrated loss of NETs upon neutralization of TGFβ (Cohen TS,et al.Staphylococcus aureus drives expansion of low density neutrophils in diabetic mice. JCI 2019, in press). These data suggest that reducing LDN by blocking TGFβ may promote survival.

[00178] TGFβ секретируется в форме пробелка (про-TGFβ) и требует расщепления для активации. Связывание про-TGFβ интегрином αVβ8 было сопряжено с его активацией и предотвращением колита, а его экспрессия на субпопуляциях дендритных клеток и моноцитов возрастает в ответ на воспаление (Travis, M. A. et al. Nature 449: 361-365 (2007) и Kelly, A. et al. J Exp Med, doi:10.1084/jem.20171491 (2018)). Чтобы определить, влияет ли инфекция, вызываемая S. aureus, на экспрессию интегрина αVβ8, клетки врожденного иммунитета выделяли из печени и селезенки мышей C57BKS и db/db через 24 часа после инфицирования и анализировали экспрессию αVβ8 посредством проточной цитометрии. Количество β8-положительных воспалительных моноцитов и дендритных клеток увеличивалось в печени мышей db/db, но не мышей C57BKS, после инфицирования (фиг. 16A). Примечательно, что хотя экспрессия интегрина на поверхности моноцитов увеличивалась, увеличивалось общее количество DC, а не плотность β8 (фиг. 16B). Чтобы продемонстрировать функциональную значимость αVβ8 в данной модели, мышей профилактически обрабатывали антителами, нейтрализующими αVβ6/8, αVβ6, или c-IgG, и инфицировали S. aureus. Через сорок восемь часов после инфицирования уровни LDN были значительно снижены (P=0,0090) в кровотоке у мышей, обработанных нейтрализующим αVβ6/8 антителом, по сравнению с c-IgG (фиг. 16C). Нейтрализация только αVβ6 не уменьшала количество данных клеток. Подавление интегрина не влияло на количество бактерий в почках через 48 часов после инфицирования (фиг. 16D). Выживаемость была значительно улучшена у мышей, обработанных антителом к αVβ6/8, по сравнению с мышами, обработанными c-IgG (фиг. 16E). Следовательно, согласуясь с прямой нейтрализацией TGFβ, блокирование интегрина, ответственного за активацию данного пути, было защитным у мышей с диабетом.[00178] TGFβ is secreted in the form of a proprotein (pro-TGFβ) and requires cleavage for activation. Binding of pro-TGFβ by the αVβ8 integrin has been associated with its activation and prevention of colitis, and its expression on subsets of dendritic cells and monocytes increases in response to inflammation (Travis, M.A. et al. Nature 449 : 361-365 (2007) and Kelly, A. et al. J Exp Med , doi:10.1084/jem.20171491 (2018)). To determine whether S. aureus infection affects αVβ8 integrin expression, innate immune cells were isolated from the liver and spleen of C57BKS and db/db mice 24 h postinfection and analyzed αVβ8 expression by flow cytometry. The number of β8-positive inflammatory monocytes and dendritic cells increased in the liver of db/db mice, but not C57BKS mice, after infection (Fig. 16A). Notably, although integrin expression on the surface of monocytes increased, the total number of DCs increased, but not β8 density (Fig. 16B). To demonstrate the functional significance of αVβ8 in this model, mice were prophylactically treated with antibodies neutralizing αVβ6/8, αVβ6, or c-IgG and infected with S. aureus . Forty-eight hours postinfection, LDN levels were significantly reduced (P=0.0090) in the circulation of mice treated with αVβ6/8 neutralizing antibody compared with c-IgG (Figure 16C). Neutralization of αVβ6 alone did not reduce the number of these cells. Integrin suppression had no effect on the number of bacteria in the kidneys 48 hours postinfection (Fig. 16D). Survival was significantly improved in mice treated with anti-αVβ6/8 antibody compared to mice treated with c-IgG (Fig. 16E). Therefore, consistent with direct neutralization of TGFβ, blocking the integrin responsible for activating this pathway was protective in diabetic mice.

[00179] Эти данные показывают, что нейтрализация αVβ6/8 или TGFβ предотвращает повышение LDN и снижает смертность. Эти данные также показывают, что дендритные клетки играют ключевую роль в патогенезе инфекции у больных диабетом из-за их способности активировать TGFβ и способствовать увеличению количества LDN. [00179] These data indicate that neutralization of αVβ6/8 or TGFβ prevents the increase in LDN and reduces mortality. These data also indicate that dendritic cells play a key role in the pathogenesis of infection in diabetic patients due to their ability to activate TGFβ and promote LDN expansion.

ПРИМЕР 11 EXAMPLE 11

[00180] В данном примере демонстрирует, что AT управляет активацией TGFß. [00180] This example demonstrates that AT drives the activation of TGFß.

[00181] Было высказано предположение о том, что AT влияет на количество LDN, воздействуя на путь TGFβ. После активации TGFβ связывается со своим рецепторным комплексом, активирует факторы транскрипции SMAD и управляет экспрессией зависимых генов. Следовательно, активацию передачи сигналов SMAD обычно используют в качестве косвенного измерения активации TGFβ. Уровни pSMAD анализировали в печени мышей с диабетом и без диабета, инфицированных (24 часа) S. aureus. Значительное повышение уровней pSMAD наблюдали в печени инфицированных мышей с диабетом по сравнению с «наивными» мышами с диабетом (P <0,0001) и инфицированными мышами, не страдающими диабетом (P=0,0338) (фиг. 17A). У мышей с диабетом MEDI4893* приводило к значительному снижению (P <0,0001) уровней pSMAD в печени, указывая на то, что AT вносит вклад в активацию передачи сигналов TGFβ (фиг. 17B). Нейтрализация AT не приводила к изменению количества клеток врожденного иммунитета, экспрессирующих αVβ8 (фиг. 17C). Эти данные показывают, что AT влияет на активацию TGFβ посредством механизма, который не зависит от экспрессии αVβ8 на клетках врожденного иммунитета. Соответственно, нейтрализация AT, который является ключевым фактором вирулентности S. aureus, ограничивает активацию передачи сигналов TGFβ и, таким образом, приводит к снижению количества LDN и высвобождения NET. [00181] It has been suggested that AT influences the amount of LDN by affecting the TGFβ pathway. Once activated, TGFβ binds to its receptor complex, activates SMAD transcription factors, and controls the expression of dependent genes. Therefore, activation of SMAD signaling is commonly used as an indirect measure of TGFβ activation. pSMAD levels were analyzed in the livers of diabetic and nondiabetic mice infected (24 h) with S. aureus . Significant increases in pSMAD levels were observed in the livers of infected diabetic mice compared to naive diabetic mice (P < 0.0001) and infected nondiabetic mice (P = 0.0338) (Fig. 17A). In diabetic mice, MEDI4893* resulted in a significant reduction (P < 0.0001) in liver pSMAD levels, indicating that AT contributes to the activation of TGFβ signaling (Fig. 17B). Neutralization of AT did not change the number of innate immune cells expressing αVβ8 (Fig. 17C). These data indicate that AT influences TGFβ activation through a mechanism that is independent of αVβ8 expression on innate immune cells. Accordingly, neutralization of AT, which is a key virulence factor of S. aureus , limits the activation of TGFβ signaling and thus results in decreased LDN and NET release.

[00182] Эти данные показывают, что помимо связывания с ADAM10 на тромбоцитах, AT может действовать посредством второго пути, который изменяет фенотип нейтрофилов и последующий ответ на инфекцию, вызываемую S. aureus. У хозяина с диабетом АТ-зависимая активация передачи сигналов TGFβ запускает увеличение количества LDN. Таким образом, AT способствует как увеличению популяции LDN, которые спонтанно высвобождают NET, так и активации тромбоцитов, которые могут связывать и дополнительно активировать нейтрофилы. [00182] These data indicate that in addition to binding to ADAM10 on platelets, AT may act through a second pathway that modifies neutrophil phenotype and subsequent response to S. aureus infection. In the diabetic host, AT-dependent activation of TGFβ signaling triggers an increase in LDN. Thus, AT promotes both an increase in the population of LDNs, which spontaneously release NETs, and activation of platelets, which can bind and further activate neutrophils.

[00183] Все ссылки, включая публикации, заявки на патенты и патенты, цитируемые в данном документе, включены в данный документ посредством ссылки в той же степени, как если бы каждый документ был конкретно и отдельно указан как включенный посредством ссылки и был представлен во всей своей полноте в данном документе.[00183] All references, including publications, patent applications and patents cited herein, are incorporated herein by reference to the same extent as if each document had been specifically and separately identified as being incorporated by reference and had been presented in its entirety in its entirety in this document.

[00184] Использование выражений и терминов в единственном числе и выражения “по меньшей мере один” и подобных определений в контексте описания настоящего изобретения (особенно в контексте нижеследующей формулы изобретения) должно истолковываться как охватывающее как единственное число, так и множественное число, если в данном документе не указано иное или иное явно не противоречит контексту. Использование выражения “по меньшей мере один”, после которого следует перечень из одного или нескольких элементов (например, “по меньшей мере один из A и B”) подразумевает один элемент, выбранный из списка элементов (A или B), или любую комбинацию из двух или более из перечисленных элементов (A и B), если в данном документе не указано иное или иное явно не противоречит контексту. Выражения “состоящий”, “имеющий”, “включающий” и “содержащий” следует понимать, как открытые термины (т.е. означающие “включающий без ограничения”), если не указано иное. Предусматривается, что приведение диапазонов значений в данном документе служит исключительно в качестве способа сокращения индивидуального указания каждого отдельного значения, входящего в данный диапазон, если в данном документе не указано иное, и каждое отдельное значение включено в настоящее описание, как если бы оно было индивидуально упомянуто в данном документе. Все способы, описанные в данном документе, могут выполняться в любом подходящем порядке, если в данном документе не указано иное или иное явно не противоречит контексту. Применение всех возможных примеров или иллюстративных фраз (например, “такой как”), предусмотренных в данном документе, предназначено исключительно для лучшего освещения настоящего изобретения, а не для формулирования ограничения объема настоящего изобретения, если не заявлено иное. Никакая фраза в настоящем описании не должна толковаться как указание, что какой-либо незаявленный элемент является существенным для осуществления настоящего изобретения на практике.[00184] The use of expressions and terms in the singular and the expression “at least one” and similar definitions in the context of the description of the present invention (especially in the context of the following claims) should be construed to include both the singular and the plural, if in this the document does not indicate otherwise or otherwise is clearly inconsistent with the context. The use of the expression “at least one” followed by a list of one or more elements (for example, “at least one of A and B”) implies one element selected from a list of elements (A or B), or any combination of two or more of the listed elements (A and B), unless otherwise stated herein or otherwise clearly inconsistent with the context. The expressions “consisting of,” “having,” “including,” and “comprising” are to be understood as open-ended terms (i.e., meaning “including without limitation”) unless otherwise indicated. It is intended that the statements of ranges of values herein serve solely as a means of abbreviating the individual indication of each individual value included within a given range unless otherwise indicated herein, and each individual value is included herein as if it were individually mentioned. in this document. All methods described herein may be performed in any suitable order unless otherwise indicated herein or otherwise clearly inconsistent with the context. The use of all possible examples or illustrative phrases (eg, “such as”) provided herein is intended solely to better illuminate the present invention and not to state a limitation on the scope of the present invention, unless otherwise stated. Nothing in this specification should be construed as indicating that any unstated element is essential to the practice of the present invention.

[00185] Предпочтительные варианты осуществления данного изобретения описаны в данном документе, включая лучший вариант, известный авторам настоящего изобретения, для осуществления настоящего изобретения. Варианты этих предпочтительных вариантов осуществления могут стать очевидными для специалистов в данной области техники после ознакомления с вышеуказанным описанием. Авторы настоящего изобретения ожидают, что специалисты в данной области техники используют такие варианты как подходящие, и авторы настоящего изобретения предполагают, что настоящее изобретение будет реализовано на практике иначе, чем конкретно описано в данном документе. Соответственно, настоящее изобретение включает все модификации и эквиваленты объекта, упомянутого в прилагаемой формуле изобретения, как это разрешено действующим законодательством. Более того, любая комбинация вышеописанных элементов во всех возможных их вариантах охватывается настоящим изобретением, если в данном документе не указано иное или иное явно не противоречит контексту.[00185] Preferred embodiments of the present invention are described herein, including the best embodiment known to the inventors of the present invention for carrying out the present invention. Variations of these preferred embodiments may become apparent to those skilled in the art upon reading the foregoing description. The present inventors expect that those skilled in the art will make use of such embodiments as appropriate, and the present inventors expect that the present invention will be practiced differently than specifically described herein. Accordingly, the present invention includes all modifications and equivalents to the subject matter mentioned in the appended claims as permitted by applicable law. Moreover, any combination of the above-described elements, in all possible variations thereof, is encompassed by the present invention unless otherwise indicated herein or otherwise clearly inconsistent with the context.

--->--->

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙLIST OF SEQUENCES

<110> МЕДИММЬЮН, ЭлЭлСи<110> MEDIMMUNE, LLS

<120> КОМБИНАЦИИ АНТИТЕЛ К STAPHYLOCOCCUS AUREUS<120> COMBINATIONS OF ANTIBODIES TO STAPHYLOCOCCUS AUREUS

<130> 2943.102PC03<130> 2943.102PC03

<150> US 62/833,297<150>US 62/833,297

<151> 2019-04-12<151> 2019-04-12

<150> US 62/743,490<150> US 62/743,490

<151> 2018-10-09<151> 2018-10-09

<160> 70 <160> 70

<170> PatentIn версия 3.5<170> PatentIn version 3.5

<210> 1<210> 1

<211> 5<211> 5

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR1<223> VH CDR1

<400> 1<400> 1

Ser His Asp Met His Ser His Asp Met His

1 5 15

<210> 2<210> 2

<211> 16<211> 16

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR2<223> VH CDR2

<400> 2<400> 2

Gly Ile Gly Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys Gly Gly Ile Gly Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

<210> 3<210> 3

<211> 14<211> 14

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR3<223> VH CDR3

<400> 3<400> 3

Asp Arg Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr Gly Met Asp Val Asp Arg Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr Gly Met Asp Val

1 5 10 1 5 10

<210> 4<210> 4

<211> 5<211> 5

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR1<223> VH CDR1

<400> 4<400> 4

Asn Ser Tyr Trp Ser Asn Ser Tyr Trp Ser

1 5 15

<210> 5<210> 5

<211> 16<211> 16

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR2<223> VH CDR2

<400> 5<400> 5

Tyr Leu Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Thr Pro Ser Leu Lys Ser Tyr Leu Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Thr Pro Ser Leu Lys Ser

1 5 10 15 1 5 10 15

<210> 6<210> 6

<211> 16<211> 16

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR3<223> VH CDR3

<400> 6<400> 6

Thr His Leu Gly Gly Phe His Tyr Gly Gly Gly Phe Trp Phe Asp Pro Thr His Leu Gly Gly Phe His Tyr Gly Gly Gly Phe Trp Phe Asp Pro

1 5 10 15 1 5 10 15

<210> 7<210> 7

<211> 5<211> 5

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR1<223> VH CDR1

<400> 7<400> 7

Thr Tyr Ala Met His Thr Tyr Ala Met His

1 5 15

<210> 8<210> 8

<211> 17<211> 17

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR2<223> VH CDR2

<400> 8<400> 8

Val Thr Ser Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ile Asp Ser Val Lys Val Thr Ser Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ile Asp Ser Val Lys

1 5 10 15 1 5 10 15

Gly Gly

<210> 9<210> 9

<211> 12<211> 12

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR3<223> VH CDR3

<400> 9<400> 9

Asp Glu Tyr Thr Gly Gly Trp Tyr Ser Val Gly Tyr Asp Glu Tyr Thr Gly Gly Trp Tyr Ser Val Gly Tyr

1 5 10 1 5 10

<210> 10<210> 10

<211> 11<211> 11

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR1<223> VL CDR1

<400> 10<400> 10

Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Trp Leu Ala Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Trp Leu Ala

1 5 10 1 5 10

<210> 11<210> 11

<211> 7<211> 7

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR2<223> VL CDR2

<400> 11<400> 11

Lys Ala Ser Ser Leu Glu Ser Lys Ala Ser Ser Leu Glu Ser

1 5 15

<210> 12<210> 12

<211> 8<211> 8

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR3<223> VL CDR3

<400> 12<400> 12

Lys Gln Tyr Ala Asp Tyr Trp Thr Lys Gln Tyr Ala Asp Tyr Trp Thr

1 5 15

<210> 13<210> 13

<211> 11<211> 11

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR1<223> VL CDR1

<400> 13<400> 13

Arg Ala Ser Gln Ser Ile Thr Ser Tyr Leu Asn Arg Ala Ser Gln Ser Ile Thr Ser Tyr Leu Asn

1 5 10 1 5 10

<210> 14<210> 14

<211> 7<211> 7

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR2<223> VL CDR2

<400> 14<400> 14

Ala Ser Ser Ser Leu Gln Ser Ala Ser Ser Ser Leu Gln Ser

1 5 15

<210> 15<210> 15

<211> 9<211> 9

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR3<223> VL CDR3

<400> 15<400> 15

Gln Glu Ser Tyr Ser Thr Pro Pro Thr Gln Glu Ser Tyr Ser Thr Pro Pro Thr

1 5 15

<210> 16<210> 16

<211> 13<211> 13

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR1<223> VL CDR1

<400> 16<400> 16

Ser Gly Ser Ser Tyr Asn Ile Gly Ser Asn Tyr Val Tyr Ser Gly Ser Ser Tyr Asn Ile Gly Ser Asn Tyr Val Tyr

1 5 10 1 5 10

<210> 17<210> 17

<211> 7<211> 7

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR2<223> VL CDR2

<400> 17<400> 17

Arg Ser Ile Gln Arg Pro Ser Arg Ser Ile Gln Arg Pro Ser

1 5 15

<210> 18<210> 18

<211> 11<211> 11

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR3<223> VL CDR3

<400> 18<400> 18

Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Arg Ala Trp Val Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Arg Ala Trp Val

1 5 10 1 5 10

<210> 19<210> 19

<211> 122<211> 122

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 19<400> 19

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser His Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser His

20 25 30 20 25 30

Asp Met His Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Asp Met His Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Ser Gly Ile Gly Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys Ser Gly Ile Gly Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys

50 55 60 50 55 60

Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Glu Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Glu Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu

65 70 75 80 65 70 75 80

Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Gly Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Gly Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala

85 90 95 85 90 95

Arg Asp Arg Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Arg Asp Arg Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp

100 105 110 100 105 110

Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser

115 120 115 120

<210> 20<210> 20

<211> 124<211> 124

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 20<400> 20

Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Gln Asn Ser Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Gln Asn Ser

20 25 30 20 25 30

Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile

35 40 45 35 40 45

Gly Tyr Leu Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Thr Pro Ser Leu Lys Gly Tyr Leu Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Thr Pro Ser Leu Lys

50 55 60 50 55 60

Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser Leu Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser Leu

65 70 75 80 65 70 75 80

Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala

85 90 95 85 90 95

Arg Thr His Leu Gly Gly Phe His Tyr Gly Gly Gly Phe Trp Phe Asp Arg Thr His Leu Gly Gly Phe His Tyr Gly Gly Gly Phe Trp Phe Asp

100 105 110 100 105 110

Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120 115 120

<210> 21<210> 21

<211> 126<211> 126

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 21<400> 21

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Arg Val Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Phe Arg Asn Ala Ser Leu Arg Val Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Phe Arg Asn Ala

20 25 30 20 25 30

Leu Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Leu Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Gly Arg Ser Lys Thr Asp Gly Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Ala Pro Val Gly Arg Ser Lys Thr Asp Gly Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Ala Pro Val

50 55 60 50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95 85 90 95

Thr Thr Gly Pro Gly Gly Gly Pro Pro Gly Asp Tyr Tyr Tyr Asp Gly Thr Thr Gly Pro Gly Gly Gly Pro Pro Gly Asp Tyr Tyr Tyr Asp Gly

100 105 110 100 105 110

Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser

115 120 125 115 120 125

<210> 22<210> 22

<211> 127<211> 127

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 22<400> 22

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Asp Leu Val Lys Pro Gly Gly Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Asp Leu Val Lys Pro Gly Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ala Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ala

20 25 30 20 25 30

Trp Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Trp Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Gly Arg Ile Arg Ser Lys Thr Ala Gly Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Ala Gly Arg Ile Arg Ser Lys Thr Ala Gly Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Ala

50 55 60 50 55 60

Pro Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr Pro Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Tyr Leu Gln Met Thr Ser Leu Lys Ile Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Leu Tyr Leu Gln Met Thr Ser Leu Lys Ile Glu Asp Thr Ala Leu Tyr

85 90 95 85 90 95

Tyr Cys Met Thr Asp Gly Leu Gly Leu Leu Asn Phe Gly Asp Ser Asp Tyr Cys Met Thr Asp Gly Leu Gly Leu Leu Asn Phe Gly Asp Ser Asp

100 105 110 100 105 110

Pro His His Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Arg Val Thr Val Ser Ser Pro His His Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Arg Val Thr Val Ser Ser

115 120 125 115 120 125

<210> 23<210> 23

<211> 122<211> 122

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<220><220>

<221> другой_признак<221> other_sign

<222> (25)..(25)<222> (25)..(25)

<223> Xaa может представлять собой любую втречающуюся в природе аминокислоту<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid

<220><220>

<221> другой_признак<221> other_sign

<222> (28)..(28)<222> (28)..(28)

<223> Xaa может представлять собой любую втречающуюся в природе аминокислоту<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid

<400> 23<400> 23

Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Ala Xaa Gly Tyr Xaa Phe Thr Ser Tyr Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Ala Xaa Gly Tyr Xaa Phe Thr Ser Tyr

20 25 30 20 25 30

Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Val Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Val Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met

35 40 45 35 40 45

Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg His Ser Pro Ser Phe Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg His Ser Pro Ser Phe

50 55 60 50 55 60

Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Val Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Val Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Ser Ala Met Tyr Tyr Cys Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Ser Ala Met Tyr Tyr Cys

85 90 95 85 90 95

Ala Arg His Gln Ser Gly Ser His Gly Phe Asp Ala Phe Glu Ile Trp Ala Arg His Gln Ser Gly Ser His Gly Phe Asp Ala Phe Glu Ile Trp

100 105 110 100 105 110

Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser

115 120 115 120

<210> 24<210> 24

<211> 119<211> 119

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 24<400> 24

Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Asn Phe Thr Asn Tyr Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Asn Phe Thr Asn Tyr

20 25 30 20 25 30

Trp Ile Ala Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met Trp Ile Ala Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met

35 40 45 35 40 45

Gly Ile Ile Tyr Ser Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe Gly Ile Ile Tyr Ser Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe

50 55 60 50 55 60

Leu Gly Gln Val Ser Ile Ser Val Asp Lys Ser Phe Thr Thr Ala Tyr Leu Gly Gln Val Ser Ile Ser Val Asp Lys Ser Phe Thr Thr Ala Tyr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Gln Trp Arg Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys Leu Gln Trp Arg Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys

85 90 95 85 90 95

Ala Arg Arg Pro Gly Gly Gln Lys Pro Tyr Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Ala Arg Arg Pro Gly Gly Gln Lys Pro Tyr Asp Tyr Trp Gly Gln Gly

100 105 110 100 105 110

Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 115

<210> 25<210> 25

<211> 136<211> 136

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 25<400> 25

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Asn Ala Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Asn Ala

20 25 30 20 25 30

Trp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Trp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Gly Arg Ile Lys Ser Glu Thr Ala Gly Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Ala Gly Arg Ile Lys Ser Glu Thr Ala Gly Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Ala

50 55 60 50 55 60

Pro Val Lys Gly Arg Phe Ser Ile Ser Arg Asp Asp Ser Arg Asn Thr Pro Val Lys Gly Arg Phe Ser Ile Ser Arg Asp Asp Ser Arg Asn Thr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Tyr Leu Glu Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr Leu Tyr Leu Glu Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr

85 90 95 85 90 95

Tyr Cys Thr Thr Asp Ser Tyr Thr Pro Leu Glu Glu Pro Cys Pro Asn Tyr Cys Thr Thr Asp Ser Tyr Thr Pro Leu Glu Glu Pro Cys Pro Asn

100 105 110 100 105 110

Gly Val Cys Tyr Thr Tyr Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Val Cys Tyr Thr Tyr Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln

115 120 125 115 120 125

Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser

130 135 130 135

<210> 26<210> 26

<211> 119<211> 119

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 26<400> 26

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ile Phe Asn Arg Tyr Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ile Phe Asn Arg Tyr

20 25 30 20 25 30

Ser Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Ser Tyr Ile Ser Ser Ser Ser Ser Pro Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Ser Tyr Ile Ser Ser Ser Ser Ser Pro Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60 50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Asp Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Asp Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95 85 90 95

Ala Ser Arg Val Thr Leu Gly Leu Glu Phe Asp Phe Trp Gly Gln Gly Ala Ser Arg Val Thr Leu Gly Leu Glu Phe Asp Phe Trp Gly Gln Gly

100 105 110 100 105 110

Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 115

<210> 27<210> 27

<211> 120<211> 120

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 27<400> 27

Gln Val Thr Leu Arg Glu Ser Gly Pro Ala Leu Val Lys Pro Thr Gln Gln Val Thr Leu Arg Glu Ser Gly Pro Ala Leu Val Lys Pro Thr Gln

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser

20 25 30 20 25 30

Gly Met Cys Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu Gly Met Cys Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu

35 40 45 35 40 45

Trp Leu Ala Leu Ile Glu Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Thr Ser Trp Leu Ala Leu Ile Glu Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Thr Ser

50 55 60 50 55 60

Leu Lys Thr Arg Leu Ser Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val Leu Lys Thr Arg Leu Ser Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val

65 70 75 80 65 70 75 80

Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Gly Thr Tyr Tyr Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Gly Thr Tyr Tyr

85 90 95 85 90 95

Cys Ala Arg His Ser Ser Ser Ser Arg Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Cys Ala Arg His Ser Ser Ser Ser Arg Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln

100 105 110 100 105 110

Gly Ala Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Ala Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120 115 120

<210> 28<210> 28

<211> 121<211> 121

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 28<400> 28

Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Thr Tyr Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Thr Tyr

20 25 30 20 25 30

Trp Ile Ala Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met Trp Ile Ala Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met

35 40 45 35 40 45

Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe

50 55 60 50 55 60

Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Thr Ala Thr Ala Tyr Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Thr Ala Thr Ala Tyr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Gln Trp Ser Ser Leu Asn Ala Ser Asp Ser Ala Met Tyr Tyr Cys Leu Gln Trp Ser Ser Leu Asn Ala Ser Asp Ser Ala Met Tyr Tyr Cys

85 90 95 85 90 95

Ala Arg Gln Gly Gly Ser His Gly Tyr Asp Ala Phe His Met Trp Gly Ala Arg Gln Gly Gly Ser His Gly Tyr Asp Ala Phe His Met Trp Gly

100 105 110 100 105 110

Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser

115 120 115 120

<210> 29<210> 29

<211> 112<211> 112

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 29<400> 29

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr

20 25 30 20 25 30

Ala Leu Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Leu Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Ala Gly Ile Asn Gly Thr Gly Tyr Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Ala Gly Ile Asn Gly Thr Gly Tyr Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60 50 55 60

Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val Thr Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val Thr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Glu Met Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Leu Glu Met Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys

85 90 95 85 90 95

His Lys Val Pro Trp Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Ser Val Ser Ser His Lys Val Pro Trp Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Ser Val Ser Ser

100 105 110 100 105 110

<210> 30<210> 30

<211> 128<211> 128

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 30<400> 30

Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Arg Leu Val Lys Pro Ser Glu Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Arg Leu Val Lys Pro Ser Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Phe Val Ser Gly Gly Ser Ile Asn Asn Ser Thr Leu Ser Leu Thr Cys Phe Val Ser Gly Gly Ser Ile Asn Asn Ser

20 25 30 20 25 30

Tyr Trp Thr Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile Tyr Trp Thr Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile

35 40 45 35 40 45

Gly Phe Val Phe Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Ser Pro Ser Leu Lys Gly Phe Val Phe Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Ser Pro Ser Leu Lys

50 55 60 50 55 60

Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Leu Phe Ser Leu Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Leu Phe Ser Leu

65 70 75 80 65 70 75 80

Arg Leu Thr Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys Ala Arg Leu Thr Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys Ala

85 90 95 85 90 95

Arg Gln Val His Tyr Asp Phe Trp Ser Gly Tyr Ser Leu Thr Lys Thr Arg Gln Val His Tyr Asp Phe Trp Ser Gly Tyr Ser Leu Thr Lys Thr

100 105 110 100 105 110

Asn Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Asn Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120 125 115 120 125

<210> 31<210> 31

<211> 128<211> 128

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 31<400> 31

Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Val Val Ser Gly Gly Ser Ile Asn Asn Ser Thr Leu Ser Leu Thr Cys Val Val Ser Gly Gly Ser Ile Asn Asn Ser

20 25 30 20 25 30

Tyr Trp Thr Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile Tyr Trp Thr Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile

35 40 45 35 40 45

Gly Phe Val Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Tyr Tyr Ser Pro Ser Leu Lys Gly Phe Val Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Tyr Tyr Ser Pro Ser Leu Lys

50 55 60 50 55 60

Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Phe Phe Ser Leu Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Phe Phe Ser Leu

65 70 75 80 65 70 75 80

Arg Leu Asn Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys Ala Arg Leu Asn Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys Ala

85 90 95 85 90 95

Arg Gln Val His Tyr Asp Leu Trp Ser Gly Tyr Ser Leu Thr Lys Thr Arg Gln Val His Tyr Asp Leu Trp Ser Gly Tyr Ser Leu Thr Lys Thr

100 105 110 100 105 110

Asn Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Asn Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120 125 115 120 125

<210> 32<210> 32

<211> 121<211> 121

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 32<400> 32

Gln Leu Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Ala Val Gln Pro Gly Arg Gln Leu Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Ala Val Gln Pro Gly Arg

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr

20 25 30 20 25 30

Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Ala Val Thr Ser Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ile Asp Ser Val Ala Val Thr Ser Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ile Asp Ser Val

50 55 60 50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Leu Tyr Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Gln Met Thr Gly Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Leu Gln Met Thr Gly Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Phe Cys

85 90 95 85 90 95

Ala Arg Asp Glu Tyr Thr Gly Gly Trp Tyr Ser Val Gly Tyr Trp Gly Ala Arg Asp Glu Tyr Thr Gly Gly Trp Tyr Ser Val Gly Tyr Trp Gly

100 105 110 100 105 110

Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120 115 120

<210> 33<210> 33

<211> 106<211> 106

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 33<400> 33

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Trp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Trp

20 25 30 20 25 30

Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45 35 40 45

Tyr Lys Ala Ser Ser Leu Glu Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Lys Ala Ser Ser Leu Glu Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60 50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Asp Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Lys Gln Tyr Ala Asp Tyr Trp Thr Asp Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Lys Gln Tyr Ala Asp Tyr Trp Thr

85 90 95 85 90 95

Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105 100 105

<210> 34<210> 34

<211> 107<211> 107

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 34<400> 34

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Thr Ser Tyr Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Thr Ser Tyr

20 25 30 20 25 30

Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45 35 40 45

Tyr Ala Ser Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Ala Ser Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60 50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Glu Ser Tyr Ser Thr Pro Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Glu Ser Tyr Ser Thr Pro Pro

85 90 95 85 90 95

Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105 100 105

<210> 35<210> 35

<211> 106<211> 106

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 35<400> 35

Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Pro Gly Gln Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Pro Gly Gln

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Ala Arg Ile Thr Cys Ser Gly Asp Ala Val Pro Lys Lys Tyr Ala Thr Ala Arg Ile Thr Cys Ser Gly Asp Ala Val Pro Lys Lys Tyr Ala

20 25 30 20 25 30

Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Ser Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Ser Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr

35 40 45 35 40 45

Glu Asp Lys Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser Glu Asp Lys Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser

50 55 60 50 55 60

Ser Ser Gly Thr Met Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Ala Gln Val Glu Ser Ser Gly Thr Met Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Ala Gln Val Glu

65 70 75 80 65 70 75 80

Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Tyr Ser Thr Asp Ser Ser Glu Gly Val Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Tyr Ser Thr Asp Ser Ser Glu Gly Val

85 90 95 85 90 95

Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105 100 105

<210> 36<210> 36

<211> 106<211> 106

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 36<400> 36

Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Pro Gly Gln Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Pro Gly Gln

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Ala Arg Ile Thr Cys Ser Gly Asp Ala Leu Pro Lys Lys Tyr Ala Thr Ala Arg Ile Thr Cys Ser Gly Asp Ala Leu Pro Lys Lys Tyr Ala

20 25 30 20 25 30

Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Ser Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile His Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Ser Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile His

35 40 45 35 40 45

Glu Asp Thr Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser Glu Asp Thr Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser

50 55 60 50 55 60

Ser Ser Gly Thr Met Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Ala Gln Val Glu Ser Ser Gly Thr Met Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Ala Gln Val Glu

65 70 75 80 65 70 75 80

Asp Glu Ala Asp Tyr His Cys Tyr Ser Thr Asp Ser Ser Gly Val Val Asp Glu Ala Asp Tyr His Cys Tyr Ser Thr Asp Ser Ser Gly Val Val

85 90 95 85 90 95

Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105 100 105

<210> 37<210> 37

<211> 113<211> 113

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 37<400> 37

Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Gly Val Leu Ser Arg Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Gly Val Leu Ser Arg

20 25 30 20 25 30

Ser Asn Asn Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Asn Asn Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln

35 40 45 35 40 45

Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val

50 55 60 50 55 60

Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr

65 70 75 80 65 70 75 80

Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln

85 90 95 85 90 95

Tyr Tyr Asn Asn Leu Arg Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Tyr Tyr Asn Asn Leu Arg Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile

100 105 110 100 105 110

Arg Arg

<210> 38<210> 38

<211> 106<211> 106

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 38<400> 38

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Arg Ile Ser Asn Trp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Arg Ile Ser Asn Trp

20 25 30 20 25 30

Leu Ala Trp Tyr Gln Lys Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Ala Trp Tyr Gln Lys Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45 35 40 45

Tyr Lys Ala Ser Thr Leu Glu Ser Glu Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Lys Ala Ser Thr Leu Glu Ser Glu Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60 50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Asp Asp Leu Ala Thr Tyr Tyr Cys His Gln Tyr Ile Ser Tyr Tyr Thr Asp Asp Leu Ala Thr Tyr Tyr Cys His Gln Tyr Ile Ser Tyr Tyr Thr

85 90 95 85 90 95

Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys

100 105 100 105

<210> 39<210> 39

<211> 111<211> 111

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 39<400> 39

Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Ala Ala Pro Gly Glu Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Ala Ala Pro Gly Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Lys Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ala Asn Lys Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ala Asn

20 25 30 20 25 30

Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu

35 40 45 35 40 45

Ile Tyr Asp Asn Asp Lys Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Ile Tyr Asp Asn Asp Lys Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser

50 55 60 50 55 60

Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Thr Leu Gly Ile Thr Gly Leu Gln Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Thr Leu Gly Ile Thr Gly Leu Gln

65 70 75 80 65 70 75 80

Thr Gly Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gly Thr Trp Val Gly Ile Leu Thr Gly Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gly Thr Trp Val Gly Ile Leu

85 90 95 85 90 95

Ser Ala Gly Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Ser Ala Gly Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105 110 100 105 110

<210> 40<210> 40

<211> 107<211> 107

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 40<400> 40

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Asn Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Asn

20 25 30 20 25 30

Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile

35 40 45 35 40 45

Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly

50 55 60 50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Lys Pro Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Lys Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Leu Arg Ser Asn Trp Ala Tyr Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Leu Arg Ser Asn Trp Ala Tyr

85 90 95 85 90 95

Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys

100 105 100 105

<210> 41<210> 41

<211> 107<211> 107

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 41<400> 41

Ser Tyr Gly Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Pro Gly Gln Ser Tyr Gly Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Pro Gly Gln

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Ala Arg Ile Thr Cys Ser Gly Asp Ala Leu Ala Lys Gln Tyr Val Thr Ala Arg Ile Thr Cys Ser Gly Asp Ala Leu Ala Lys Gln Tyr Val

20 25 30 20 25 30

Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Asp Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Asp

35 40 45 35 40 45

Lys Asp Arg Glu Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser Lys Asp Arg Glu Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser

50 55 60 50 55 60

Ser Ser Gly Thr Thr Val Thr Leu Thr Ile Ser Gly Val Gln Ala Glu Ser Ser Gly Thr Thr Val Thr Leu Thr Ile Ser Gly Val Gln Ala Glu

65 70 75 80 65 70 75 80

Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Ser Ala Asp Ser Ser Arg Thr Tyr Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Ser Ala Asp Ser Ser Arg Thr Tyr

85 90 95 85 90 95

Val Phe Gly Thr Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Val Phe Gly Thr Gly Thr Lys Val Thr Val Leu

100 105 100 105

<210> 42<210> 42

<211> 112<211> 112

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 42<400> 42

Asp Val Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Leu Gly Asp Val Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Leu Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser

20 25 30 20 25 30

Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asn Trp Phe Gln Gln Arg Pro Gly Gln Ser Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asn Trp Phe Gln Gln Arg Pro Gly Gln Ser

35 40 45 35 40 45

Pro Arg Arg Leu Ile Tyr Lys Val Ser Asn Arg Asp Ser Gly Val Pro Pro Arg Arg Leu Ile Tyr Lys Val Ser Asn Arg Asp Ser Gly Val Pro

50 55 60 50 55 60

Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile

65 70 75 80 65 70 75 80

Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Gly Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Gly

85 90 95 85 90 95

Thr His Leu Thr Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr His Leu Thr Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105 110 100 105 110

<210> 43<210> 43

<211> 113<211> 113

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 43<400> 43

Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Glu Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Glu Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Glu Arg Ala Thr Ile Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Phe Phe Lys Glu Arg Ala Thr Ile Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Phe Phe Lys

20 25 30 20 25 30

Ser Asn Asn Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Asn Asn Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln

35 40 45 35 40 45

Pro Pro Lys Val Ile Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val Pro Pro Lys Val Ile Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val

50 55 60 50 55 60

Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr

65 70 75 80 65 70 75 80

Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Phe Cys His Gln Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Phe Cys His Gln

85 90 95 85 90 95

Tyr Tyr Ser Thr Gln Tyr Ser Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Tyr Tyr Ser Thr Gln Tyr Ser Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile

100 105 110 100 105 110

Lys Lys

<210> 44<210> 44

<211> 107<211> 107

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 44<400> 44

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Asp Thr Val Thr Ile Thr Cys Arg Thr Ser Gln Ser Ile Ser Asn Phe Asp Thr Val Thr Ile Thr Cys Arg Thr Ser Gln Ser Ile Ser Asn Phe

20 25 30 20 25 30

Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45 35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Val Asn Gly Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Val Asn Gly

50 55 60 50 55 60

Ser Thr Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Leu Ser Ser Leu Gln Pro Ser Thr Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Leu Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Trp Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Trp

85 90 95 85 90 95

Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105 100 105

<210> 45<210> 45

<211> 107<211> 107

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 45<400> 45

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Asp Thr Val Thr Ile Thr Cys Arg Thr Ser Gln Ser Ile Ser Asn Phe Asp Thr Val Thr Ile Thr Cys Arg Thr Ser Gln Ser Ile Ser Asn Phe

20 25 30 20 25 30

Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45 35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Asn Gly Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Asn Gly

50 55 60 50 55 60

Ser Thr Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Leu Ser Ser Leu Gln Pro Ser Thr Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Leu Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Trp Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Trp

85 90 95 85 90 95

Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105 100 105

<210> 46<210> 46

<211> 110<211> 110

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 46<400> 46

Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln

1 5 10 15 1 5 10 15

Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Tyr Asn Ile Gly Ser Asn Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Tyr Asn Ile Gly Ser Asn

20 25 30 20 25 30

Tyr Val Tyr Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu Tyr Val Tyr Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu

35 40 45 35 40 45

Ile Ser Arg Ser Ile Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Ile Ser Arg Ser Ile Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser

50 55 60 50 55 60

Gly Ser Lys Ser Val Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg Gly Ser Lys Ser Val Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg

65 70 75 80 65 70 75 80

Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu

85 90 95 85 90 95

Arg Ala Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Arg Ala Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105 110 100 105 110

<210> 47<210> 47

<211> 452<211> 452

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность полноразмерной тяжелой цепи<223> Amino acid sequence of full-length heavy chain

<400> 47<400> 47

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser His Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser His

20 25 30 20 25 30

Asp Met His Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Asp Met His Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Ser Gly Ile Gly Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys Ser Gly Ile Gly Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys

50 55 60 50 55 60

Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Glu Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Glu Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu

65 70 75 80 65 70 75 80

Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Gly Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Gly Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala

85 90 95 85 90 95

Arg Asp Arg Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Arg Asp Arg Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp

100 105 110 100 105 110

Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro

115 120 125 115 120 125

Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr

130 135 140 130 135 140

Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr

145 150 155 160 145 150 155 160

Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro

165 170 175 165 170 175

Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr

180 185 190 180 185 190

Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn

195 200 205 195 200 205

His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser

210 215 220 210 215 220

Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu

225 230 235 240 225 230 235 240

Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu

245 250 255 245 250 255

Tyr Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Tyr Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser

260 265 270 260 265 270

His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu

275 280 285 275 280 285

Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr

290 295 300 290 295 300

Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn

305 310 315 320 305 310 315 320

Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro

325 330 335 325 330 335

Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln

340 345 350 340 345 350

Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val

355 360 365 355 360 365

Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val

370 375 380 370 375 380

Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro

385 390 395 400 385 390 395 400

Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr

405 410 415 405 410 415

Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val

420 425 430 420 425 430

Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu

435 440 445 435 440 445

Ser Pro Gly Lys Ser Pro Gly Lys

450 450

<210> 48<210> 48

<211> 452<211> 452

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность полноразмерной тяжелой цепи<223> Amino acid sequence of full-length heavy chain

<400> 48<400> 48

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser His Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser His

20 25 30 20 25 30

Asp Met His Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Asp Met His Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Ser Gly Ile Gly Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys Ser Gly Ile Gly Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys

50 55 60 50 55 60

Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Glu Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Glu Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu

65 70 75 80 65 70 75 80

Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Gly Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Gly Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala

85 90 95 85 90 95

Arg Asp Arg Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Arg Asp Arg Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp

100 105 110 100 105 110

Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro

115 120 125 115 120 125

Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr

130 135 140 130 135 140

Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr

145 150 155 160 145 150 155 160

Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro

165 170 175 165 170 175

Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr

180 185 190 180 185 190

Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn

195 200 205 195 200 205

His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser

210 215 220 210 215 220

Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu

225 230 235 240 225 230 235 240

Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu

245 250 255 245 250 255

Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser

260 265 270 260 265 270

His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu

275 280 285 275 280 285

Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr

290 295 300 290 295 300

Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn

305 310 315 320 305 310 315 320

Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro

325 330 335 325 330 335

Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln

340 345 350 340 345 350

Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val

355 360 365 355 360 365

Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val

370 375 380 370 375 380

Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro

385 390 395 400 385 390 395 400

Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr

405 410 415 405 410 415

Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val

420 425 430 420 425 430

Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu

435 440 445 435 440 445

Ser Pro Gly Lys Ser Pro Gly Lys

450 450

<210> 49<210> 49

<211> 454<211> 454

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность полноразмерной тяжелой цепи<223> Amino acid sequence of full-length heavy chain

<400> 49<400> 49

Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Gln Asn Ser Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Gln Asn Ser

20 25 30 20 25 30

Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile

35 40 45 35 40 45

Gly Tyr Leu Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Thr Pro Ser Leu Lys Gly Tyr Leu Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Thr Pro Ser Leu Lys

50 55 60 50 55 60

Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser Leu Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser Leu

65 70 75 80 65 70 75 80

Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala

85 90 95 85 90 95

Arg Thr His Leu Gly Gly Phe His Tyr Gly Gly Gly Phe Trp Phe Asp Arg Thr His Leu Gly Gly Phe His Tyr Gly Gly Gly Phe Trp Phe Asp

100 105 110 100 105 110

Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys

115 120 125 115 120 125

Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly

130 135 140 130 135 140

Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro

145 150 155 160 145 150 155 160

Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr

165 170 175 165 170 175

Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val

180 185 190 180 185 190

Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn

195 200 205 195 200 205

Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro

210 215 220 210 215 220

Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu

225 230 235 240 225 230 235 240

Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp

245 250 255 245 250 255

Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp

260 265 270 260 265 270

Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly

275 280 285 275 280 285

Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn

290 295 300 290 295 300

Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp

305 310 315 320 305 310 315 320

Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro

325 330 335 325 330 335

Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu

340 345 350 340 345 350

Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn

355 360 365 355 360 365

Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile

370 375 380 370 375 380

Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr

385 390 395 400 385 390 395 400

Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys

405 410 415 405 410 415

Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys

420 425 430 420 425 430

Ser Val Met His Glu Ala Cys Ser Tyr His Leu Cys Gln Lys Ser Leu Ser Val Met His Glu Ala Cys Ser Tyr His Leu Cys Gln Lys Ser Leu

435 440 445 435 440 445

Ser Leu Ser Pro Gly Lys Ser Leu Ser Pro Gly Lys

450 450

<210> 50<210> 50

<211> 451<211> 451

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность полноразмерной тяжелой цепи<223> Amino acid sequence of full-length heavy chain

<400> 50<400> 50

Gln Leu Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Ala Val Gln Pro Gly Arg Gln Leu Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Ala Val Gln Pro Gly Arg

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr

20 25 30 20 25 30

Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Ala Val Thr Ser Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ile Asp Ser Val Ala Val Thr Ser Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ile Asp Ser Val

50 55 60 50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Leu Tyr Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Gln Met Thr Gly Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Leu Gln Met Thr Gly Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Phe Cys

85 90 95 85 90 95

Ala Arg Asp Glu Tyr Thr Gly Gly Trp Tyr Ser Val Gly Tyr Trp Gly Ala Arg Asp Glu Tyr Thr Gly Gly Trp Tyr Ser Val Gly Tyr Trp Gly

100 105 110 100 105 110

Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser

115 120 125 115 120 125

Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala

130 135 140 130 135 140

Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val

145 150 155 160 145 150 155 160

Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala

165 170 175 165 170 175

Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val

180 185 190 180 185 190

Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His

195 200 205 195 200 205

Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys

210 215 220 210 215 220

Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly

225 230 235 240 225 230 235 240

Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Tyr Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Tyr

245 250 255 245 250 255

Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His

260 265 270 260 265 270

Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val

275 280 285 275 280 285

His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr

290 295 300 290 295 300

Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly

305 310 315 320 305 310 315 320

Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile

325 330 335 325 330 335

Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val

340 345 350 340 345 350

Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser

355 360 365 355 360 365

Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu

370 375 380 370 375 380

Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro

385 390 395 400 385 390 395 400

Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val

405 410 415 405 410 415

Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met

420 425 430 420 425 430

His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser

435 440 445 435 440 445

Pro Gly Lys Pro Gly Lys

450 450

<210> 51<210> 51

<211> 451<211> 451

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность полноразмерной тяжелой цепи<223> Amino acid sequence of full-length heavy chain

<400> 51<400> 51

Gln Leu Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Ala Val Gln Pro Gly Arg Gln Leu Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Ala Val Gln Pro Gly Arg

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr

20 25 30 20 25 30

Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Ala Val Thr Ser Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ile Asp Ser Val Ala Val Thr Ser Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ile Asp Ser Val

50 55 60 50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Leu Tyr Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Gln Met Thr Gly Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Leu Gln Met Thr Gly Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Phe Cys

85 90 95 85 90 95

Ala Arg Asp Glu Tyr Thr Gly Gly Trp Tyr Ser Val Gly Tyr Trp Gly Ala Arg Asp Glu Tyr Thr Gly Gly Trp Tyr Ser Val Gly Tyr Trp Gly

100 105 110 100 105 110

Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser

115 120 125 115 120 125

Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala

130 135 140 130 135 140

Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val

145 150 155 160 145 150 155 160

Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala

165 170 175 165 170 175

Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val

180 185 190 180 185 190

Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His

195 200 205 195 200 205

Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys

210 215 220 210 215 220

Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly

225 230 235 240 225 230 235 240

Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met

245 250 255 245 250 255

Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His

260 265 270 260 265 270

Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val

275 280 285 275 280 285

His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr

290 295 300 290 295 300

Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly

305 310 315 320 305 310 315 320

Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile

325 330 335 325 330 335

Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val

340 345 350 340 345 350

Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser

355 360 365 355 360 365

Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu

370 375 380 370 375 380

Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro

385 390 395 400 385 390 395 400

Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val

405 410 415 405 410 415

Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met

420 425 430 420 425 430

His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser

435 440 445 435 440 445

Pro Gly Lys Pro Gly Lys

450 450

<210> 52<210> 52

<211> 212<211> 212

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность полноразмерной легкой цепи<223> Amino acid sequence of full-length light chain

<400> 52<400> 52

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Trp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Trp

20 25 30 20 25 30

Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45 35 40 45

Tyr Lys Ala Ser Ser Leu Glu Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Lys Ala Ser Ser Leu Glu Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60 50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Asp Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Lys Gln Tyr Ala Asp Tyr Trp Thr Asp Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Lys Gln Tyr Ala Asp Tyr Trp Thr

85 90 95 85 90 95

Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro

100 105 110 100 105 110

Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr

115 120 125 115 120 125

Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys

130 135 140 130 135 140

Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu

145 150 155 160 145 150 155 160

Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser

165 170 175 165 170 175

Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala

180 185 190 180 185 190

Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe

195 200 205 195 200 205

Asn Arg Gly Glu Asn Arg Gly Glu

210 210

<210> 53<210> 53

<211> 214<211> 214

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность полноразмерной легкой цепи<223> Amino acid sequence of full-length light chain

<400> 53<400> 53

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Thr Ser Tyr Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Thr Ser Tyr

20 25 30 20 25 30

Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45 35 40 45

Tyr Ala Ser Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Ala Ser Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60 50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Glu Ser Tyr Ser Thr Pro Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Glu Ser Tyr Ser Thr Pro Pro

85 90 95 85 90 95

Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala

100 105 110 100 105 110

Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly

115 120 125 115 120 125

Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala

130 135 140 130 135 140

Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln

145 150 155 160 145 150 155 160

Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser

165 170 175 165 170 175

Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr

180 185 190 180 185 190

Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser

195 200 205 195 200 205

Phe Asn Arg Gly Glu Cys Phe Asn Arg Gly Glu Cys

210 210

<210> 54<210> 54

<211> 216<211> 216

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность полноразмерной легкой цепи<223> Amino acid sequence of full-length light chain

<400> 54<400> 54

Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln

1 5 10 15 1 5 10 15

Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Tyr Asn Ile Gly Ser Asn Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Tyr Asn Ile Gly Ser Asn

20 25 30 20 25 30

Tyr Val Tyr Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu Tyr Val Tyr Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu

35 40 45 35 40 45

Ile Ser Arg Ser Ile Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Ile Ser Arg Ser Ile Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser

50 55 60 50 55 60

Gly Ser Lys Ser Val Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg Gly Ser Lys Ser Val Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg

65 70 75 80 65 70 75 80

Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu

85 90 95 85 90 95

Arg Ala Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly Gln Arg Ala Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly Gln

100 105 110 100 105 110

Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser Glu Glu Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser Glu Glu

115 120 125 115 120 125

Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp Phe Tyr Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp Phe Tyr

130 135 140 130 135 140

Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro Val Lys Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro Val Lys

145 150 155 160 145 150 155 160

Ala Gly Val Glu Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn Lys Tyr Ala Gly Val Glu Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn Lys Tyr

165 170 175 165 170 175

Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys Ser His Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys Ser His

180 185 190 180 185 190

Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val Glu Lys Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val Glu Lys

195 200 205 195 200 205

Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser

210 215 210 215

<210> 55<210> 55

<211> 6<211> 6

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Fc-область<223> Fc region

<400> 55<400> 55

Cys Ser Tyr His Leu Cys Cys Ser Tyr His Leu Cys

1 5 15

<210> 56<210> 56

<211> 17<211> 17

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> константный домен тяжелой цепи<223> heavy chain constant domain

<400> 56<400> 56

Met His Glu Ala Cys Ser Tyr His Leu Cys Gln Lys Ser Leu Ser Leu Met His Glu Ala Cys Ser Tyr His Leu Cys Gln Lys Ser Leu Ser Leu

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Ser

<210> 57<210> 57

<211> 293<211> 293

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Альфа-токсин S. aureus<223> S. aureus alpha toxin

<400> 57<400> 57

Ala Asp Ser Asp Ile Asn Ile Lys Thr Gly Thr Thr Asp Ile Gly Ser Ala Asp Ser Asp Ile Asn Ile Lys Thr Gly Thr Thr Asp Ile Gly Ser

1 5 10 15 1 5 10 15

Asn Thr Thr Val Lys Thr Gly Asp Leu Val Thr Tyr Asp Lys Glu Asn Asn Thr Thr Val Lys Thr Gly Asp Leu Val Thr Tyr Asp Lys Glu Asn

20 25 30 20 25 30

Gly Met His Lys Lys Val Phe Tyr Ser Phe Ile Asp Asp Lys Asn His Gly Met His Lys Lys Val Phe Tyr Ser Phe Ile Asp Asp Lys Asn His

35 40 45 35 40 45

Asn Lys Lys Leu Leu Val Ile Arg Thr Lys Gly Thr Ile Ala Gly Gln Asn Lys Lys Leu Leu Val Ile Arg Thr Lys Gly Thr Ile Ala Gly Gln

50 55 60 50 55 60

Tyr Arg Val Tyr Ser Glu Glu Gly Ala Asn Lys Ser Gly Leu Ala Trp Tyr Arg Val Tyr Ser Glu Glu Gly Ala Asn Lys Ser Gly Leu Ala Trp

65 70 75 80 65 70 75 80

Pro Ser Ala Phe Lys Val Gln Leu Gln Leu Pro Asp Asn Glu Val Ala Pro Ser Ala Phe Lys Val Gln Leu Gln Leu Pro Asp Asn Glu Val Ala

85 90 95 85 90 95

Gln Ile Ser Asp Tyr Tyr Pro Arg Asn Ser Ile Asp Thr Lys Glu Tyr Gln Ile Ser Asp Tyr Tyr Pro Arg Asn Ser Ile Asp Thr Lys Glu Tyr

100 105 110 100 105 110

Met Ser Thr Leu Thr Tyr Gly Phe Asn Gly Asn Val Thr Gly Asp Asp Met Ser Thr Leu Thr Tyr Gly Phe Asn Gly Asn Val Thr Gly Asp Asp

115 120 125 115 120 125

Thr Gly Lys Ile Gly Gly Leu Ile Gly Ala Asn Val Ser Ile Gly His Thr Gly Lys Ile Gly Gly Leu Ile Gly Ala Asn Val Ser Ile Gly His

130 135 140 130 135 140

Thr Leu Lys Tyr Val Gln Pro Asp Phe Lys Thr Ile Leu Glu Ser Pro Thr Leu Lys Tyr Val Gln Pro Asp Phe Lys Thr Ile Leu Glu Ser Pro

145 150 155 160 145 150 155 160

Thr Asp Lys Lys Val Gly Trp Lys Val Ile Phe Asn Asn Met Val Asn Thr Asp Lys Lys Val Gly Trp Lys Val Ile Phe Asn Asn Met Val Asn

165 170 175 165 170 175

Gln Asn Trp Gly Pro Tyr Asp Arg Asp Ser Trp Asn Pro Val Tyr Gly Gln Asn Trp Gly Pro Tyr Asp Arg Asp Ser Trp Asn Pro Val Tyr Gly

180 185 190 180 185 190

Asn Gln Leu Phe Met Lys Thr Arg Asn Gly Ser Met Lys Ala Ala Asp Asn Gln Leu Phe Met Lys Thr Arg Asn Gly Ser Met Lys Ala Ala Asp

195 200 205 195 200 205

Asn Phe Leu Asp Pro Asn Lys Ala Ser Ser Leu Leu Ser Ser Gly Phe Asn Phe Leu Asp Pro Asn Lys Ala Ser Ser Leu Leu Ser Ser Gly Phe

210 215 220 210 215 220

Ser Pro Asp Phe Ala Thr Val Ile Thr Met Asp Arg Lys Ala Ser Lys Ser Pro Asp Phe Ala Thr Val Ile Thr Met Asp Arg Lys Ala Ser Lys

225 230 235 240 225 230 235 240

Gln Gln Thr Asn Ile Asp Val Ile Tyr Glu Arg Val Arg Asp Asp Tyr Gln Gln Thr Asn Ile Asp Val Ile Tyr Glu Arg Val Arg Asp Asp Tyr

245 250 255 245 250 255

Gln Leu His Trp Thr Ser Thr Asn Trp Lys Gly Thr Asn Thr Lys Asp Gln Leu His Trp Thr Ser Thr Asn Trp Lys Gly Thr Asn Thr Lys Asp

260 265 270 260 265 270

Lys Trp Thr Asp Arg Ser Ser Glu Arg Tyr Lys Ile Asp Trp Glu Lys Lys Trp Thr Asp Arg Ser Ser Glu Arg Tyr Lys Ile Asp Trp Glu Lys

275 280 285 275 280 285

Glu Glu Met Thr Asn Glu Glu Met Thr Asn

290 290

<210> 58<210> 58

<211> 293<211> 293

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Мутантный альфа-токсин H35L S. aureus<223> S. aureus H35L alpha toxin mutant

<400> 58<400> 58

Ala Asp Ser Asp Ile Asn Ile Lys Thr Gly Thr Thr Asp Ile Gly Ser Ala Asp Ser Asp Ile Asn Ile Lys Thr Gly Thr Thr Asp Ile Gly Ser

1 5 10 15 1 5 10 15

Asn Thr Thr Val Lys Thr Gly Asp Leu Val Thr Tyr Asp Lys Glu Asn Asn Thr Thr Val Lys Thr Gly Asp Leu Val Thr Tyr Asp Lys Glu Asn

20 25 30 20 25 30

Gly Met Leu Lys Lys Val Phe Tyr Ser Phe Ile Asp Asp Lys Asn His Gly Met Leu Lys Lys Val Phe Tyr Ser Phe Ile Asp Asp Lys Asn His

35 40 45 35 40 45

Asn Lys Lys Leu Leu Val Ile Arg Thr Lys Gly Thr Ile Ala Gly Gln Asn Lys Lys Leu Leu Val Ile Arg Thr Lys Gly Thr Ile Ala Gly Gln

50 55 60 50 55 60

Tyr Arg Val Tyr Ser Glu Glu Gly Ala Asn Lys Ser Gly Leu Ala Trp Tyr Arg Val Tyr Ser Glu Glu Gly Ala Asn Lys Ser Gly Leu Ala Trp

65 70 75 80 65 70 75 80

Pro Ser Ala Phe Lys Val Gln Leu Gln Leu Pro Asp Asn Glu Val Ala Pro Ser Ala Phe Lys Val Gln Leu Gln Leu Pro Asp Asn Glu Val Ala

85 90 95 85 90 95

Gln Ile Ser Asp Tyr Tyr Pro Arg Asn Ser Ile Asp Thr Lys Glu Tyr Gln Ile Ser Asp Tyr Tyr Pro Arg Asn Ser Ile Asp Thr Lys Glu Tyr

100 105 110 100 105 110

Met Ser Thr Leu Thr Tyr Gly Phe Asn Gly Asn Val Thr Gly Asp Asp Met Ser Thr Leu Thr Tyr Gly Phe Asn Gly Asn Val Thr Gly Asp Asp

115 120 125 115 120 125

Thr Gly Lys Ile Gly Gly Leu Ile Gly Ala Asn Val Ser Ile Gly His Thr Gly Lys Ile Gly Gly Leu Ile Gly Ala Asn Val Ser Ile Gly His

130 135 140 130 135 140

Thr Leu Lys Tyr Val Gln Pro Asp Phe Lys Thr Ile Leu Glu Ser Pro Thr Leu Lys Tyr Val Gln Pro Asp Phe Lys Thr Ile Leu Glu Ser Pro

145 150 155 160 145 150 155 160

Thr Asp Lys Lys Val Gly Trp Lys Val Ile Phe Asn Asn Met Val Asn Thr Asp Lys Lys Val Gly Trp Lys Val Ile Phe Asn Asn Met Val Asn

165 170 175 165 170 175

Gln Asn Trp Gly Pro Tyr Asp Arg Asp Ser Trp Asn Pro Val Tyr Gly Gln Asn Trp Gly Pro Tyr Asp Arg Asp Ser Trp Asn Pro Val Tyr Gly

180 185 190 180 185 190

Asn Gln Leu Phe Met Lys Thr Arg Asn Gly Ser Met Lys Ala Ala Asp Asn Gln Leu Phe Met Lys Thr Arg Asn Gly Ser Met Lys Ala Ala Asp

195 200 205 195 200 205

Asn Phe Leu Asp Pro Asn Lys Ala Ser Ser Leu Leu Ser Ser Gly Phe Asn Phe Leu Asp Pro Asn Lys Ala Ser Ser Leu Leu Ser Ser Gly Phe

210 215 220 210 215 220

Ser Pro Asp Phe Ala Thr Val Ile Thr Met Asp Arg Lys Ala Ser Lys Ser Pro Asp Phe Ala Thr Val Ile Thr Met Asp Arg Lys Ala Ser Lys

225 230 235 240 225 230 235 240

Gln Gln Thr Asn Ile Asp Val Ile Tyr Glu Arg Val Arg Asp Asp Tyr Gln Gln Thr Asn Ile Asp Val Ile Tyr Glu Arg Val Arg Asp Asp Tyr

245 250 255 245 250 255

Gln Leu His Trp Thr Ser Thr Asn Trp Lys Gly Thr Asn Thr Lys Asp Gln Leu His Trp Thr Ser Thr Asn Trp Lys Gly Thr Asn Thr Lys Asp

260 265 270 260 265 270

Lys Trp Thr Asp Arg Ser Ser Glu Arg Tyr Lys Ile Asp Trp Glu Lys Lys Trp Thr Asp Arg Ser Ser Glu Arg Tyr Lys Ile Asp Trp Glu Lys

275 280 285 275 280 285

Glu Glu Met Thr Asn Glu Glu Met Thr Asn

290 290

<210> 59<210> 59

<211> 300<211> 300

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> HIgB S. aureus<223> HIgB S. aureus

<400> 59<400> 59

Gly Glu Gly Lys Ile Thr Pro Val Ser Val Lys Lys Val Asp Asp Lys Gly Glu Gly Lys Ile Thr Pro Val Ser Val Lys Lys Val Asp Asp Lys

1 5 10 15 1 5 10 15

Val Thr Leu Tyr Lys Thr Thr Ala Thr Ala Asp Ser Asp Lys Phe Lys Val Thr Leu Tyr Lys Thr Thr Ala Thr Ala Asp Ser Asp Lys Phe Lys

20 25 30 20 25 30

Ile Ser Gln Ile Leu Thr Phe Asn Phe Ile Lys Asp Lys Ser Tyr Asp Ile Ser Gln Ile Leu Thr Phe Asn Phe Ile Lys Asp Lys Ser Tyr Asp

35 40 45 35 40 45

Lys Asp Thr Leu Val Leu Lys Ala Thr Gly Asn Ile Asn Ser Gly Phe Lys Asp Thr Leu Val Leu Lys Ala Thr Gly Asn Ile Asn Ser Gly Phe

50 55 60 50 55 60

Val Lys Pro Asn Pro Asn Asp Tyr Asp Phe Ser Lys Leu Tyr Trp Gly Val Lys Pro Asn Pro Asn Asp Tyr Asp Phe Ser Lys Leu Tyr Trp Gly

65 70 75 80 65 70 75 80

Ala Lys Tyr Asn Val Ser Ile Ser Ser Gln Ser Asn Asp Ser Val Asn Ala Lys Tyr Asn Val Ser Ile Ser Ser Gln Ser Asn Asp Ser Val Asn

85 90 95 85 90 95

Val Val Asp Tyr Ala Pro Lys Asn Gln Asn Glu Glu Phe Gln Val Gln Val Val Asp Tyr Ala Pro Lys Asn Gln Asn Glu Glu Phe Gln Val Gln

100 105 110 100 105 110

Asn Thr Leu Gly Tyr Thr Phe Gly Gly Asp Ile Ser Ile Ser Asn Gly Asn Thr Leu Gly Tyr Thr Phe Gly Gly Asp Ile Ser Ile Ser Asn Gly

115 120 125 115 120 125

Leu Ser Gly Gly Leu Asn Gly Asn Thr Ala Phe Ser Glu Thr Ile Asn Leu Ser Gly Gly Leu Asn Gly Asn Thr Ala Phe Ser Glu Thr Ile Asn

130 135 140 130 135 140

Tyr Lys Gln Glu Ser Tyr Arg Thr Thr Leu Ser Arg Asn Thr Asn Tyr Tyr Lys Gln Glu Ser Tyr Arg Thr Thr Leu Ser Arg Asn Thr Asn Tyr

145 150 155 160 145 150 155 160

Lys Asn Val Gly Trp Gly Val Glu Ala His Lys Ile Met Asn Asn Gly Lys Asn Val Gly Trp Gly Val Glu Ala His Lys Ile Met Asn Asn Gly

165 170 175 165 170 175

Trp Gly Pro Tyr Gly Arg Asp Ser Phe His Pro Thr Tyr Gly Asn Glu Trp Gly Pro Tyr Gly Arg Asp Ser Phe His Pro Thr Tyr Gly Asn Glu

180 185 190 180 185 190

Leu Phe Leu Ala Gly Arg Gln Ser Ser Ala Tyr Ala Gly Gln Asn Phe Leu Phe Leu Ala Gly Arg Gln Ser Ser Ala Tyr Ala Gly Gln Asn Phe

195 200 205 195 200 205

Ile Ala Gln His Gln Met Pro Leu Leu Ser Arg Ser Asn Phe Asn Pro Ile Ala Gln His Gln Met Pro Leu Leu Ser Arg Ser Asn Phe Asn Pro

210 215 220 210 215 220

Glu Phe Leu Ser Val Leu Ser His Arg Gln Asp Gly Ala Lys Lys Ser Glu Phe Leu Ser Val Leu Ser His Arg Gln Asp Gly Ala Lys Lys Ser

225 230 235 240 225 230 235 240

Lys Ile Thr Val Thr Tyr Gln Arg Glu Met Asp Leu Tyr Gln Ile Arg Lys Ile Thr Val Thr Tyr Gln Arg Glu Met Asp Leu Tyr Gln Ile Arg

245 250 255 245 250 255

Trp Asn Gly Phe Tyr Trp Ala Gly Ala Asn Tyr Lys Asn Phe Lys Thr Trp Asn Gly Phe Tyr Trp Ala Gly Ala Asn Tyr Lys Asn Phe Lys Thr

260 265 270 260 265 270

Arg Thr Phe Lys Ser Thr Tyr Glu Ile Asp Trp Glu Asn His Lys Val Arg Thr Phe Lys Ser Thr Tyr Glu Ile Asp Trp Glu Asn His Lys Val

275 280 285 275 280 285

Lys Leu Leu Asp Thr Lys Glu Thr Glu Asn Asn Lys Lys Leu Leu Asp Thr Lys Glu Thr Glu Asn Asn Lys

290 295 300 290 295 300

<210> 60<210> 60

<211> 302<211> 302

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> LukF S. aureus<223> LukF S. aureus

<400> 60<400> 60

Gly Ala Gln His Ile Thr Pro Val Ser Glu Lys Lys Val Asp Asp Lys Gly Ala Gln His Ile Thr Pro Val Ser Glu Lys Lys Val Asp Asp Lys

1 5 10 15 1 5 10 15

Ile Thr Leu Tyr Lys Thr Thr Ala Thr Ser Asp Ser Asp Lys Leu Lys Ile Thr Leu Tyr Lys Thr Thr Ala Thr Ser Asp Ser Asp Lys Leu Lys

20 25 30 20 25 30

Ile Ser Gln Ile Leu Thr Phe Asn Phe Ile Lys Asp Lys Ser Tyr Asp Ile Ser Gln Ile Leu Thr Phe Asn Phe Ile Lys Asp Lys Ser Tyr Asp

35 40 45 35 40 45

Lys Asp Thr Leu Ile Leu Lys Ala Ala Gly Asn Ile Tyr Ser Gly Tyr Lys Asp Thr Leu Ile Leu Lys Ala Ala Gly Asn Ile Tyr Ser Gly Tyr

50 55 60 50 55 60

Thr Lys Pro Asn Pro Lys Asp Thr Ile Ser Ser Gln Phe Tyr Trp Gly Thr Lys Pro Asn Pro Lys Asp Thr Ile Ser Ser Gln Phe Tyr Trp Gly

65 70 75 80 65 70 75 80

Ser Lys Tyr Asn Ile Ser Ile Asn Ser Asp Ser Asn Asp Ser Val Asn Ser Lys Tyr Asn Ile Ser Ile Asn Ser Asp Ser Asn Asp Ser Val Asn

85 90 95 85 90 95

Val Val Asp Tyr Ala Pro Lys Asn Gln Asn Glu Glu Phe Gln Val Gln Val Val Asp Tyr Ala Pro Lys Asn Gln Asn Glu Glu Phe Gln Val Gln

100 105 110 100 105 110

Gln Thr Val Gly Tyr Ser Tyr Gly Gly Asp Ile Asn Ile Ser Asn Gly Gln Thr Val Gly Tyr Ser Tyr Gly Gly Asp Ile Asn Ile Ser Asn Gly

115 120 125 115 120 125

Leu Ser Gly Gly Gly Asn Gly Ser Lys Ser Phe Ser Glu Thr Ile Asn Leu Ser Gly Gly Gly Asn Gly Ser Lys Ser Phe Ser Glu Thr Ile Asn

130 135 140 130 135 140

Tyr Lys Gln Glu Ser Tyr Arg Thr Ser Leu Asp Lys Arg Thr Asn Phe Tyr Lys Gln Glu Ser Tyr Arg Thr Ser Leu Asp Lys Arg Thr Asn Phe

145 150 155 160 145 150 155 160

Lys Lys Ile Gly Trp Asp Val Glu Ala His Lys Ile Met Asn Asn Gly Lys Lys Ile Gly Trp Asp Val Glu Ala His Lys Ile Met Asn Asn Gly

165 170 175 165 170 175

Trp Gly Pro Tyr Gly Arg Asp Ser Tyr His Ser Thr Tyr Gly Asn Glu Trp Gly Pro Tyr Gly Arg Asp Ser Tyr His Ser Thr Tyr Gly Asn Glu

180 185 190 180 185 190

Met Phe Leu Gly Ser Arg Gln Ser Asn Leu Asn Ala Gly Gln Asn Phe Met Phe Leu Gly Ser Arg Gln Ser Asn Leu Asn Ala Gly Gln Asn Phe

195 200 205 195 200 205

Leu Glu Tyr His Lys Met Pro Val Leu Ser Arg Gly Asn Phe Asn Pro Leu Glu Tyr His Lys Met Pro Val Leu Ser Arg Gly Asn Phe Asn Pro

210 215 220 210 215 220

Glu Phe Ile Gly Val Leu Ser Arg Lys Gln Asn Ala Ala Lys Lys Ser Glu Phe Ile Gly Val Leu Ser Arg Lys Gln Asn Ala Ala Lys Lys Ser

225 230 235 240 225 230 235 240

Lys Ile Thr Val Thr Tyr Gln Arg Glu Met Asp Arg Tyr Thr Asn Phe Lys Ile Thr Val Thr Tyr Gln Arg Glu Met Asp Arg Tyr Thr Asn Phe

245 250 255 245 250 255

Trp Asn Gln Leu His Trp Ile Gly Asn Asn Tyr Lys Asp Glu Asn Arg Trp Asn Gln Leu His Trp Ile Gly Asn Asn Tyr Lys Asp Glu Asn Arg

260 265 270 260 265 270

Ala Thr His Thr Ser Ile Tyr Glu Val Asp Trp Glu Asn His Thr Val Ala Thr His Thr Ser Ile Tyr Glu Val Asp Trp Glu Asn His Thr Val

275 280 285 275 280 285

Lys Leu Ile Asp Thr Gln Ser Lys Glu Lys Asn Pro Met Ser Lys Leu Ile Asp Thr Gln Ser Lys Glu Lys Asn Pro Met Ser

290 295 300 290 295 300

<210> 61<210> 61

<211> 302<211> 302

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> LukD S. aureus<223> LukD S. aureus

<400> 61<400> 61

Gly Ala Gln His Ile Thr Pro Val Ser Glu Lys Lys Val Asp Asp Lys Gly Ala Gln His Ile Thr Pro Val Ser Glu Lys Lys Val Asp Asp Lys

1 5 10 15 1 5 10 15

Ile Thr Leu Tyr Lys Thr Thr Ala Thr Ser Asp Asn Asp Lys Leu Asn Ile Thr Leu Tyr Lys Thr Thr Ala Thr Ser Asp Asn Asp Lys Leu Asn

20 25 30 20 25 30

Ile Ser Gln Ile Leu Thr Phe Asn Phe Ile Lys Asp Lys Ser Tyr Asp Ile Ser Gln Ile Leu Thr Phe Asn Phe Ile Lys Asp Lys Ser Tyr Asp

35 40 45 35 40 45

Lys Asp Thr Leu Val Leu Lys Ala Ala Gly Asn Ile Asn Ser Gly Tyr Lys Asp Thr Leu Val Leu Lys Ala Ala Gly Asn Ile Asn Ser Gly Tyr

50 55 60 50 55 60

Lys Lys Pro Asn Pro Lys Asp Tyr Asn Tyr Ser Gln Phe Tyr Trp Gly Lys Lys Pro Asn Pro Lys Asp Tyr Asn Tyr Ser Gln Phe Tyr Trp Gly

65 70 75 80 65 70 75 80

Gly Lys Tyr Asn Val Ser Val Ser Ser Glu Ser Asn Asp Ala Val Asn Gly Lys Tyr Asn Val Ser Val Ser Ser Glu Ser Asn Asp Ala Val Asn

85 90 95 85 90 95

Val Val Asp Tyr Ala Pro Lys Asn Gln Asn Glu Glu Phe Gln Val Gln Val Val Asp Tyr Ala Pro Lys Asn Gln Asn Glu Glu Phe Gln Val Gln

100 105 110 100 105 110

Gln Thr Leu Gly Tyr Ser Tyr Gly Gly Asp Ile Asn Ile Ser Asn Gly Gln Thr Leu Gly Tyr Ser Tyr Gly Gly Asp Ile Asn Ile Ser Asn Gly

115 120 125 115 120 125

Leu Ser Gly Gly Leu Asn Gly Ser Lys Ser Phe Ser Glu Thr Ile Asn Leu Ser Gly Gly Leu Asn Gly Ser Lys Ser Phe Ser Glu Thr Ile Asn

130 135 140 130 135 140

Tyr Lys Gln Glu Ser Tyr Arg Thr Thr Ile Asp Arg Lys Thr Asn His Tyr Lys Gln Glu Ser Tyr Arg Thr Thr Ile Asp Arg Lys Thr Asn His

145 150 155 160 145 150 155 160

Lys Ser Ile Gly Trp Gly Val Glu Ala His Lys Ile Met Asn Asn Gly Lys Ser Ile Gly Trp Gly Val Glu Ala His Lys Ile Met Asn Asn Gly

165 170 175 165 170 175

Trp Gly Pro Tyr Gly Arg Asp Ser Tyr Asp Pro Thr Tyr Gly Asn Glu Trp Gly Pro Tyr Gly Arg Asp Ser Tyr Asp Pro Thr Tyr Gly Asn Glu

180 185 190 180 185 190

Leu Phe Leu Gly Gly Arg Gln Ser Ser Ser Asn Ala Gly Gln Asn Phe Leu Phe Leu Gly Gly Arg Gln Ser Ser Ser Asn Ala Gly Gln Asn Phe

195 200 205 195 200 205

Leu Pro Thr His Gln Met Pro Leu Leu Ala Arg Gly Asn Phe Asn Pro Leu Pro Thr His Gln Met Pro Leu Leu Ala Arg Gly Asn Phe Asn Pro

210 215 220 210 215 220

Glu Phe Ile Ser Val Leu Ser His Lys Gln Asn Asp Thr Lys Lys Ser Glu Phe Ile Ser Val Leu Ser His Lys Gln Asn Asp Thr Lys Lys Ser

225 230 235 240 225 230 235 240

Lys Ile Lys Val Thr Tyr Gln Arg Glu Met Asp Arg Tyr Thr Asn Gln Lys Ile Lys Val Thr Tyr Gln Arg Glu Met Asp Arg Tyr Thr Asn Gln

245 250 255 245 250 255

Trp Asn Arg Leu His Trp Val Gly Asn Asn Tyr Lys Asn Gln Asn Thr Trp Asn Arg Leu His Trp Val Gly Asn Asn Tyr Lys Asn Gln Asn Thr

260 265 270 260 265 270

Val Thr Phe Thr Ser Thr Tyr Glu Val Asp Trp Gln Asn His Thr Val Val Thr Phe Thr Ser Thr Tyr Glu Val Asp Trp Gln Asn His Thr Val

275 280 285 275 280 285

Lys Leu Ile Gly Thr Asp Ser Lys Glu Thr Asn Pro Gly Val Lys Leu Ile Gly Thr Asp Ser Lys Glu Thr Asn Pro Gly Val

290 295 300 290 295 300

<210> 62<210> 62

<211> 5<211> 5

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR1<223> VH CDR1

<400> 62<400> 62

Ser Phe Ala Met Ser Ser Phe Ala Met Ser

1 5 15

<210> 63<210> 63

<211> 17<211> 17

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR2<223> VH CDR2

<400> 63<400> 63

Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys

1 5 10 15 1 5 10 15

Gly Gly

<210> 64<210> 64

<211> 5<211> 5

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VH CDR3<223> VH CDR3

<400> 64<400> 64

Ile Ala Phe Asp Ile Ile Ala Phe Asp Ile

1 5 15

<210> 65<210> 65

<211> 11<211> 11

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR1<223> VL CDR1

<400> 65<400> 65

Arg Ala Ser Gln Gly Ile Arg Asn Asp Leu Gly Arg Ala Ser Gln Gly Ile Arg Asn Asp Leu Gly

1 5 10 1 5 10

<210> 66<210> 66

<211> 7<211> 7

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR2<223> VL CDR2

<400> 66<400> 66

Val Ala Ser Ser Leu Gln Ser Val Ala Ser Ser Leu Gln Ser

1 5 15

<210> 67<210> 67

<211> 9<211> 9

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VL CDR3<223> VL CDR3

<400> 67<400> 67

Leu Gln His Asn Ser Tyr Pro Phe Thr Leu Gln His Asn Ser Tyr Pro Phe Thr

1 5 15

<210> 68<210> 68

<211> 114<211> 114

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VН<223> Amino acid sequence VH

<400> 68<400> 68

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe

20 25 30 20 25 30

Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45 35 40 45

Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60 50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95 85 90 95

Ala Lys Ile Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ala Lys Ile Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val

100 105 110 100 105 110

Ser Ser Ser Ser

<210> 69<210> 69

<211> 107<211> 107

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность VL<223> Amino acid sequence VL

<400> 69<400> 69

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Arg Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Arg Asn Asp

20 25 30 20 25 30

Leu Gly Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Arg Leu Ile Leu Gly Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Arg Leu Ile

35 40 45 35 40 45

Tyr Val Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Val Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60 50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Leu Gln His Asn Ser Tyr Pro Phe Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Leu Gln His Asn Ser Tyr Pro Phe

85 90 95 85 90 95

Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys

100 105 100 105

<210> 70<210> 70

<211> 454<211> 454

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Аминокислотная последовательность полноразмерной легкой цепи<223> Amino acid sequence of full-length light chain

<400> 70<400> 70

Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Gln Asn Ser Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Gln Asn Ser

20 25 30 20 25 30

Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile

35 40 45 35 40 45

Gly Tyr Leu Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Thr Pro Ser Leu Lys Gly Tyr Leu Tyr Ser Ser Gly Arg Thr Asn Tyr Thr Pro Ser Leu Lys

50 55 60 50 55 60

Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser Leu Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser Leu

65 70 75 80 65 70 75 80

Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala

85 90 95 85 90 95

Arg Thr His Leu Gly Gly Phe His Tyr Gly Gly Gly Phe Trp Phe Asp Arg Thr His Leu Gly Gly Phe His Tyr Gly Gly Gly Phe Trp Phe Asp

100 105 110 100 105 110

Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys

115 120 125 115 120 125

Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly

130 135 140 130 135 140

Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro

145 150 155 160 145 150 155 160

Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr

165 170 175 165 170 175

Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val

180 185 190 180 185 190

Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn

195 200 205 195 200 205

Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro

210 215 220 210 215 220

Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu

225 230 235 240 225 230 235 240

Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp

245 250 255 245 250 255

Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp

260 265 270 260 265 270

Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly

275 280 285 275 280 285

Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn

290 295 300 290 295 300

Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp

305 310 315 320 305 310 315 320

Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro

325 330 335 325 330 335

Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu

340 345 350 340 345 350

Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn

355 360 365 355 360 365

Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile

370 375 380 370 375 380

Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr

385 390 395 400 385 390 395 400

Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys

405 410 415 405 410 415

Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys

420 425 430 420 425 430

Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu

435 440 445 435 440 445

Ser Leu Ser Pro Gly Lys Ser Leu Ser Pro Gly Lys

450 450

<---<---

Claims (310)

1. Способ лечения или профилактики инфекции, вызываемой Staphylococcus aureus (S.aureus) у индивида, включающий введение индивиду1. A method of treating or preventing an infection caused by Staphylococcus aureus ( S. aureus ) in an individual, comprising administering to the individual (а) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с альфа-токсином S.aureus (AT) и содержат(a) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus alpha-toxin (AT) and contains область, определяющая комплементарность вариабельной области тяжелой цепи (VH) (CDR)1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1,a heavy chain variable region (VH) complementarity determining region (CDR)1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:1, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:2, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:3,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:3, CDR1 вариабельной области легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:10,The light chain variable region (VL) CDR1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:10, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:11, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:11, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:12,VL CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:12, (b) антителa или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с фактором слипания А S.aureus (ClfA) и содержат(b) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus clumping factor A (ClfA) and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:4, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:5,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:5, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:6, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:13,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:13, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:14, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:14, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:15, иVL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:15, and (c) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются по меньшей мере с одним лейкотоксином S.aureus и содержат(c) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:7,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:7, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:8,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:8, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:9,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:9, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:16,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:16, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:17, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:17, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:18.VL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:18. 2. Способ лечения или профилактики инфекции, вызываемой Staphylococcus aureus (S.aureus) у индивида, включающий введение индивиду антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются по меньшей мере с одним лейкотоксином S.aureus, и2. A method of treating or preventing an infection caused by Staphylococcus aureus ( S. aureus ) in an individual, comprising administering to the individual an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin, and (а) антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с альфа-токсином S.aureus (AT) и содержат(a) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus alpha-toxin (AT) and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:1, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:2, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:3,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:3, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:10,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:10, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:11, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:11, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:12, илиVL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:12, or (b) антителa или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с фактором слипания А S.aureus (ClfA) и содержат(b) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus clumping factor A (ClfA) and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:4, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:5,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:5, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:6, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:13,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:13, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:14, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:14, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:15.VL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:15. 3. Композиция для лечения или профилактики инфекции, вызываемой S.aureus, у индивида, содержащая (а) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus и содержат3. A composition for the treatment or prevention of infection caused by S. aureus in an individual, containing (a) an antibody or an antigen-binding fragment that binds to the S. aureus AT and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:1, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:2, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:3,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:3, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:10,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:10, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:11, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:11, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:12,VL CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:12, (b) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus и содержат(b) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:4, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:5,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:5, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:6, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:13,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:13, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:14, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:14, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:15, иVL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:15, and (c) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с одним лейкотоксином S.aureus и содержат(c) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:7,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:7, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:8,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:8, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:9,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:9, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:16,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:16, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:17, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:17, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:18.VL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:18. 4. Композиция для лечения или профилактики инфекции S.aureus у индивида, содержащая антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с одним лейкотоксином S.aureus, и (а) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus и содержат4. A composition for the treatment or prevention of S.aureus infection in an individual, comprising an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S.aureus leukotoxin, and (a) an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to the S.aureus AT and contain VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:1, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:2, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:3,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:3, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:10,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:10, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:11, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:11, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:12, илиVL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:12, or (b) антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus и содержат(b) an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:4, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:5,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:5, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:6, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:13,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:13, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:14, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:14, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:15.VL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:15. 5. Применение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с альфа-токсином S.aureus (AT) и содержат5. Use of an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus alpha toxin (AT) and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:1, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:2, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:3,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:3, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:10,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:10, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:11, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:11, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:12,VL CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:12, для получения лекарственного средства для лечения или профилактики инфекции, вызываемой S.aureus, у индивида, в комбинации с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с ClfA S.aureus и содержатfor the preparation of a medicament for the treatment or prevention of infection caused by S. aureus in an individual, in combination with an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:4, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:5,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:5, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:6, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:13,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:13, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:14, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:14, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:15, иVL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:15, and антителом или его антигенсвязывающем фрагментом, которые связываются по меньшей мере с одним лейкотоксином S.aureus и содержатan antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:7,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:7, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:8,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:8, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:9,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:9, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:16,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:16, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:17, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:17, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:18.VL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:18. 6. Применение антителa или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются с ClfA S.aureus и содержат6. Use of an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S.aureus ClfA and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:4, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:5,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:5, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:6, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:13,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:13, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:14, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:14, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:15VL CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:15 для получения лекарственного средства для лечения или профилактики инфекции, вызываемой S.aureus, у индивида, в комбинации с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с АТ S.aureus и содержатfor the preparation of a medicinal product for the treatment or prevention of infection caused by S. aureus in an individual, in combination with an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus antibody and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:1, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:2, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:3,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:3, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:10,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:10, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:11, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:11, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:12,VL CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:12, и антителом или его антигенсвязывающем фрагментом, которые связываются по меньшей мере с одним лейкотоксином S.aureus и содержатand an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:7,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:7, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:8,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:8, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:9,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:9, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:16,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:16, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:17, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:17, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:18.VL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:18. 7. Применение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые связываются по меньшей мере с одним лейкотоксином S.aureus и содержат7. The use of an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:7,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:7, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:8,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:8, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:9,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:9, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:16,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:16, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:17, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:17, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:18VL CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:18 для получения лекарственного средства для лечения или профилактики инфекции, вызываемой S.aureus, у индивида, в комбинации с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с АТ S.aureus и содержатfor the preparation of a medicinal product for the treatment or prevention of infection caused by S. aureus in an individual, in combination with an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus antibody and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:1, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:2, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:3,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:3, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:10,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:10, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:11, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:11, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:12, и/илиVL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:12, and/or антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые связываются с ClfA S.aureus и содержатan antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA and contains VH CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4,VH CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:4, VH CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:5,VH CDR2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:5, VH CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6,VH CDR3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:6, VL CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:13,VL CDR1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO:13, VL CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:14, иVL CDR2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:14, and VL CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:15.VL CDR3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:15. 8. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-7,8. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 7, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus, содержатwhere the antibody or its antigen-binding fragment, which binds to the S. aureus AT, contains VH, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:19 иVH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:19 and VL, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:33.VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:33. 9. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-8,9. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 8, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus, содержатwhere the antibody or its antigen-binding fragment, which binds to the S. aureus AT, contains тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:47, иa heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:47, and легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:52.light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:52. 10. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-9,10. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 9, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus, также содержат константную область тяжелой цепи.wherein the antibody or antigen binding fragment that binds to the S. aureus AT also contains a heavy chain constant region. 11. Способ, композиция или применение по п.10,11. Method, composition or use according to claim 10, где константная область тяжелой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей тяжелой цепи иммуноглобулина человека IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2.wherein the heavy chain constant region is selected from the group consisting of human immunoglobulin heavy chain constant regions IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 and IgA2. 12. Способ, композиция или применение по п.10,12. Method, composition or use according to claim 10, где константная область тяжелой цепи представляет собой константную область IgG1 человека.wherein the heavy chain constant region is a human IgG1 constant region. 13. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-4,13. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 4, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus, также содержат константную область легкой цепи.wherein the antibody or antigen binding fragment that binds to the S. aureus AT also contains a light chain constant region. 14. Способ, композиция или применение по п.13,14. Method, composition or use according to claim 13, где константная область легкой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей легкой цепи иммуноглобулина человека IgGk и IgGλ.wherein the light chain constant region is selected from the group consisting of human immunoglobulin light chain constant regions IgGk and IgGλ. 15. Способ, композиция или применение по п.13,15. Method, composition or use according to claim 13, где константная область легкой цепи представляет собой константную область легкой цепи IgGk человека.wherein the light chain constant region is a human IgGk light chain constant region. 16. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-15,16. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 15, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus, представляют собой антитело IgG или его антигенсвязывающий фрагмент.wherein the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus AT is an IgG antibody or antigen-binding fragment thereof. 17. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-16,17. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus, содержат область Fc, которая была сконструирована для улучшения периода полураспада.wherein the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus Ab contains an Fc region that has been engineered to improve half-life. 18. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-17,18. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 17, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus, содержат область Fc с мутацией YTE.wherein the antibody or antigen-binding fragment thereof, which binds to the S. aureus AT, contains an Fc region with a YTE mutation. 19. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-18,19. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 18, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus, представляют собой моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.wherein the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus AT is a monoclonal antibody or antigen-binding fragment thereof. 20. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-19,20. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 19, где антитело, или антигенсвязывающий фрагмент, которые связывают с АТ S.aureus, является полноразмерным антителом.where the antibody, or antigen-binding fragment, which binds to the S. aureus AT is a full-length antibody. 21. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-19,21. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 19, где антигенсвязывающий фрагмент, или антитело, который связывается с АТ S.aureus, представляет собой антигенсвязывающий фрагмент.wherein the antigen binding fragment, or antibody, which binds to the S. aureus AT is an antigen binding fragment. 22. Способ, композиция или применение по п.21,22. The method, composition or use according to claim 21, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus,where is an antibody or antigen-binding fragment that binds to the S. aureus AT, где антигенсвязывающий фрагмент содержит Fab, Fab', F(ab')2, одноцепочечный Fv (scFv), дисульфид-связанный Fv, интраантитело, IgGΔCH2, миниантитело, F(ab')3, тетраантитело, триантитело, диантитело, DVD-Ig, Fcab, mАb2, (scFv)2, или scFv-Fc.where the antigen binding fragment contains Fab, Fab', F(ab') 2 , single chain Fv (scFv), disulfide-linked Fv, intra-antibody, IgGΔCH2, mini-antibody, F(ab') 3 , tetra-antibody, tri-antibody, di-antibody, DVD-Ig, Fcab, mAb 2 , (scFv) 2 , or scFv-Fc. 23. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-22,23. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 22, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с АТ S.aureus, имеет аффинность 80-100 пМ в отношении АТ S.aureus.where the antibody or antigen-binding fragment thereof, which binds to S.aureus AT, has an affinity of 80-100 pM for S.aureus AT. 24. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-23,24. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 23, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, содержатwherein the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA contains VH, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:20, иVH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:20, and VL, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:34.VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:34. 25. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-24,25. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 24, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, содержат константную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность CSYHLC (SEQ ID NO:55).wherein the antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA comprises a heavy chain constant region containing the amino acid sequence CSYHLC (SEQ ID NO:55). 26. Способ, композиция или применение по п.25,26. The method, composition or use according to claim 25, где указанная константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность MHEACSYHLCQKSLSLS (SEQ ID NO:56).wherein said heavy chain constant region contains the amino acid sequence MHEACSYHLCQKSLSLS (SEQ ID NO:56). 27. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-26,27. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 26, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, содержатwherein the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA contains тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:49, иa heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:49, and легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:53.light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:53. 28. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-24,28. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 24, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, также содержат константную область тяжелой цепи.wherein the antibody or antigen binding fragment that binds S. aureus ClfA also contains a heavy chain constant region. 29. Способ, композиция или применение по п.28,29. The method, composition or use according to claim 28, где константная область тяжелой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей тяжелой цепи иммуноглобулина человека IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2.wherein the heavy chain constant region is selected from the group consisting of human immunoglobulin heavy chain constant regions IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 and IgA2. 30. Способ, композиция или применение по п.28,30. The method, composition or use according to claim 28, где константная область тяжелой цепи представляет собой константную область IgG1 человека.wherein the heavy chain constant region is a human IgG1 constant region. 31. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-30,31. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 30, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, также содержат константную область легкой цепи.wherein the antibody or antigen binding fragment that binds S. aureus ClfA also contains a light chain constant region. 32. Способ, композиция или применение по п.31,32. The method, composition or use according to claim 31, где константная область легкой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей легкой цепи иммуноглобулина человека IgGk и IgGλ.wherein the light chain constant region is selected from the group consisting of human immunoglobulin light chain constant regions IgGk and IgGλ. 33. Способ, композиция или применение по п.31,33. The method, composition or use according to claim 31, где константная область легкой цепи представлет собой константную область легкой цепи IgGk человека.wherein the light chain constant region is a human IgGk light chain constant region. 34. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-33,34. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 33, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, содержат мутацию, которая повышает период полураспада по сравнению с тем же антителом без мутации в человеческом FcRn мыши.wherein the antibody or antigen binding fragment that binds to S. aureus ClfA contains a mutation that increases the half-life compared to the same antibody without the mutation in the mouse human FcRn. 35. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-34,35. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 34, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, содержат мутацию, которая повышает период полураспада по сравнению с тем же антителом без мутации, иwherein the antibody or antigen-binding fragment that binds S. aureus ClfA contains a mutation that increases the half-life compared to the same antibody without the mutation, and где мутация не ингибирует активность OPK по сравнению с таким же антителом или антигенсвязывающим фрагментом без мутации.where the mutation does not inhibit OPK activity compared to the same antibody or antigen binding fragment without the mutation. 36. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-35,36. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 35, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, представляют собой моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.wherein the antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA is a monoclonal antibody or antigen binding fragment thereof. 37. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-36,37. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 36, где антитело, или антигенсвязывающий фрагмент, которые связывают с ClfA S.aureus, является полноразмерным антителом.wherein the antibody, or antigen binding fragment, that binds S. aureus ClfA is a full length antibody. 38. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-36,38. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 36, где антигенсвязывающий фрагмент, или антитело, который связывается с ClfA S.aureus, представляет собой антигенсвязывающий фрагмент.wherein the antigen binding fragment, or antibody, that binds to S. aureus ClfA is an antigen binding fragment. 39. Способ, композиция или применение по п.38,39. The method, composition or use according to claim 38, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus,where is an antibody or antigen-binding fragment that binds S. aureus ClfA , где антигенсвязывающий фрагмент содержит Fab, Fab', F(ab')2, одноцепочечный Fv (scFv), дисульфид-связанный Fv, интраантитело, IgGΔCH2, миниантитело, F(ab')3, тетраантитело, триантитело, диантитело, DVD-Ig, Fcab, mАb2, (scFv)2, или scFv-Fc.where the antigen binding fragment contains Fab, Fab', F(ab') 2 , single chain Fv (scFv), disulfide-linked Fv, intra-antibody, IgGΔCH2, mini-antibody, F(ab') 3 , tetra-antibody, tri-antibody, di-antibody, DVD-Ig, Fcab, mAb 2 , (scFv) 2 , or scFv-Fc. 40. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-39,40. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 39, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, имеют IC50 по отношению к ClfA001, ClfA002 и ClfA004 в анализе подавления связывания с фибриногеном, которые находятся в пределах 2 мкг/мл друг от друга.wherein an antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA has an IC50 relative to ClfA001, ClfA002 and ClfA004 in a fibrinogen binding inhibition assay that are within 2 μg/ml of each other. 41. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-40,41. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 40, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, имеют IC50 по отношению к ClfA001, ClfA002 и ClfA004 в анализе подавления связывания с фибриногеном, которые находятся в пределах 1 мкг/мл - 5 мкг/мл.wherein an antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA has an IC50 to ClfA001, ClfA002 and ClfA004 in a fibrinogen binding inhibition assay that is in the range of 1 μg/ml - 5 μg/ml. 42. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-41,42. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 41, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, имеют аффинность связывания (KD) по отношению к ClfA001, ClfA002 и ClfA004, каждый из которых находится в пределах 200-350 пM.wherein the antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA has a binding affinity (KD) for ClfA001, ClfA002 and ClfA004, each of which is in the range of 200-350 pM. 43. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-42,43. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 42, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, имеют аффинность связывания (KD), составляющим менее 1 нM, по отношению ко всем генотипам ClfA.wherein an antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA has a binding affinity (KD) of less than 1 nM to all ClfA genotypes. 44. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-43,44. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 43, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, имеют чистоту мономера, которая снижается на не более чем 5% после воздействия на антитело или антигенсвязывающий фрагмент типичным белым светом при 2 кЛк/ч при 23°C в течение 14 дней.wherein the antibody or antigen-binding fragment that binds to S. aureus ClfA has a monomer purity that is reduced by no more than 5% after exposing the antibody or antigen-binding fragment to typical white light at 2 kLx/h at 23°C for 14 days. 45. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-44,45. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 44, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с одним лейкотоксином S.aureus, содержатwherein an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds at least one S. aureus leukotoxin comprises VH, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:32, иVH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:32, and VL, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:46.VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:46. 46. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-45,46. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 45, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с одним лейкотоксином S.aureus, содержатwherein an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds at least one S. aureus leukotoxin comprises тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:50, иa heavy chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:50, and легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:54.light chain containing the amino acid sequence of SEQ ID NO:54. 47. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-45,47. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 45, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с лейкотоксином S.aureus, также содержат константную область тяжелой цепи.wherein the antibody or antigen binding fragment that binds at least S. aureus leukotoxin also contains a heavy chain constant region. 48. Способ, композиция или применение по п.47,48. The method, composition or use according to claim 47, где константная область тяжелой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей тяжелой цепи иммуноглобулина человека IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2.wherein the heavy chain constant region is selected from the group consisting of the human immunoglobulin heavy chain constant regions IgG 1 , IgG 2 , IgG 3 , IgG 4 , IgA 1 and IgA 2 . 49. Способ, композиция или применение по п.47,49. The method, composition or use according to claim 47, где константная область тяжелой цепи представляет собой константную область IgG1 человека.wherein the heavy chain constant region is a human IgG1 constant region. 50. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-49,50. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 49, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с лейкотоксином S.aureus, также содержат константную область легкой цепи.wherein an antibody or antigen binding fragment that binds at least S. aureus leukotoxin also contains a light chain constant region. 51. Способ, композиция или применение по п.50,51. The method, composition or use according to claim 50, где константная область легкой цепи выбрана из группы, состоящей из константных областей легкой цепи иммуноглобулина человека IgGk и IgGλ.wherein the light chain constant region is selected from the group consisting of human immunoglobulin light chain constant regions IgGk and IgGλ. 52. Способ, композиция или применение по п.50,52. The method, composition or use according to claim 50, где константная область легкой цепи представляет собой константную область легкой цепи IgGk человека.wherein the light chain constant region is a human IgGk light chain constant region. 53. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-52,53. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 52, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с лейкотоксином S.aureus, представляют собой антитело IgG или его антигенсвязывающий фрагмент.wherein the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds at least S. aureus leukotoxin is an IgG antibody or antigen-binding fragment thereof. 54. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-53,54. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 53, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с лейкотоксином S.aureus, содержат область Fc, которая была сконструирована для улучшения периода полураспада.wherein an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds at least S. aureus leukotoxin contains an Fc region that has been engineered to improve half-life. 55. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-54,55. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 54, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с лейкотоксином S.aureus, содержат область Fc с мутацией YTE.wherein the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds at least S. aureus leukotoxin contains an Fc region with a YTE mutation. 56. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-55,56. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 55, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются по меньшей мере с лейкотоксином S.aureus, представляют собой моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.wherein the antibody or antigen binding fragment thereof that binds at least S. aureus leukotoxin is a monoclonal antibody or antigen binding fragment thereof. 57. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-56,57. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 56, где антитело, или его антигенсвязывающий фрагмент, которое связывается по меньшей мере с лейкотоксином S.aureus, является полноразмерным антителом.wherein the antibody, or antigen-binding fragment thereof, that binds at least to S. aureus leukotoxin is a full-length antibody. 58. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-56,58. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 56, антигенсвязывающий фрагмент, или антитело, который связывается по меньшей мере с лейкотоксином S.aureus, представляет собой антигенсвязывающий фрагмент.an antigen binding fragment, or antibody, that binds to at least S. aureus leukotoxin is an antigen binding fragment. 59. Способ, композиция или применение по п.58,59. The method, composition or use according to claim 58, где антигенсвязывающий фрагмент содержит Fab, Fab', F(ab')2, одноцепочечный Fv (scFv), дисульфид-связанный Fv, интраантитело, IgGΔCH2, миниантитело, F(ab')3, тетраантитело, триантитело, диантитело, DVD-Ig, Fcab, mАb2, (scFv)2, или scFv-Fc.where the antigen binding fragment contains Fab, Fab', F(ab') 2 , single chain Fv (scFv), disulfide-linked Fv, intra-antibody, IgGΔCH2, mini-antibody, F(ab') 3 , tetra-antibody, tri-antibody, di-antibody, DVD-Ig, Fcab, mAb2, (scFv) 2 , or scFv-Fc. 60. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-59,60. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 59, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S.aureus, имеют аффинность по отношению к LukF, LukD и HlgB S.aureus, составляющую менее 75 пМ.wherein the antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin has an affinity for S. aureus LukF, LukD and HlgB of less than 75 pM. 61. Способ, композиция или применение по любому из пп.1-60,61. Method, composition or use according to any one of claims 1 to 60, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S.aureus, имеют сходную аффинность связывания по отношению к LukF, LukD и HIgB.wherein an antibody or antigen binding fragment thereof that binds at least one S. aureus leukotoxin has similar binding affinity to LukF, LukD and HIgB. 62. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-61,62. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-61, где инфекция, вызываемая S.aureus, представляет собой сепсис.where infection caused by S. aureus is sepsis. 63. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-61,63. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-61, где инфекция, вызываемая S.aureus, представляет собой бактериемию.where infection due to S. aureus is a bacteremia. 64. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-61,64. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-61, где инфекция, вызываемая S.aureus, представляет собой пневмонию.where the infection caused by S. aureus is pneumonia. 65. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-61,65. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-61, где инфекция, вызываемая S.aureus, представляет собой пневмонию в ICU.where S. aureus infection is pneumonia in the ICU. 66. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-61,66. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-61, где инфекция, вызываемая S.aureus, представляет собой инфекцию кожи или мягких тканей (SSTI).where the infection caused by S. aureus is a skin or soft tissue infection (SSTI). 67. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-61,67. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-61, где инфекция, вызываемая S.aureus, представляет собой инфекцию нижних конечностей у больного диабетом.where the infection caused by S. aureus is an infection of the lower extremities in a diabetic patient. 68. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-61,68. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-61, где инфекция, вызываемая S.aureus, представляет собой язву диабетической стопы (DFU).where the infection caused by S. aureus is a diabetic foot ulcer (DFU). 69. Способ, композиция или применение по п.68,69. The method, composition or use according to claim 68, где DFU является неинфицированной.where DFU is uninfected. 70. Способ, композиция или применение по п.68,70. The method, composition or use according to claim 68, где DFU является инфицированной.where DFU is infected. 71. Способ, композиция или применение по п.68,71. The method, composition or use according to claim 68, где DFU представляет собой DFU 1, 2 или 3 степени.where DFU is grade 1, 2 or 3 DFU. 72. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-61,72. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-61, где инфекция, вызываемая S.aureus, представляет собой инфекцию костей или суставов.where the infection caused by S. aureus is an infection of the bones or joints. 73. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-61,73. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-61, где инфекция, вызываемая S.aureus, представляет собой инфекцию суставов, инфекцию, ассоциированную с медицинским изделием в организме, раневую инфекцию, хирургическую раневую инфекцию или остеомиелит.wherein the S. aureus infection is a joint infection, a medical device-associated infection in the body, a wound infection, a surgical wound infection, or osteomyelitis. 74. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-73,74. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-73, где индивидом является объект хирургического вмешательства.where the individual is the object of surgical intervention. 75. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-74,75. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-74, где инфекция, вызываемая S.aureus, включает инфекцию антибиотикорезистентным S.aureus.wherein infection with S. aureus includes infection with antibiotic-resistant S. aureus . 76. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-75,76. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-75, где индивид страдает диабетом.where the individual suffers from diabetes. 77. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-76,77. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-76, где индивидом является человек.where the individual is a person. 78. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-77,78. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-77, где лечение или профилактика инфекции, вызываемой S.aureus, включает подавление агглютинации, обусловленной S. аureus, нейтрализацию токсинов, индуцирование опсонофагоцитоза, подавление связывания фибриногена, обусловленного S.aureus, подавление агглютинации, обусловленной S.aureus, подавление образования тромбоэмболических очагов, подавление сепсиса, ассоциированного с S.aureus, или любую комбинацию вышеизложенного.wherein treatment or prevention of S. aureus infection includes inhibition of S. aureus agglutination, neutralization of toxins, induction of opsonophagocytosis, inhibition of S. aureus fibrinogen binding, inhibition of S. aureus agglutination, inhibition of thromboembolic lesion formation, suppression of sepsis , associated with S. aureus , or any combination of the above. 79. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-78,79. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-78, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT S.aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, вводят в одной фармацевтической композиции.wherein an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA are administered in one pharmaceutical composition. 80. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-78,80. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-78, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT S.aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, вводят в отдельных фармацевтических композициях.wherein an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus AT and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA are administered in separate pharmaceutical compositions. 81. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-78,81. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-78, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT S.aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S.aureus, вводят в одной фармацевтической композиции.wherein an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus AT and an antibody or an antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin are administered in a single pharmaceutical composition. 82. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-78,82. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-78, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT S.aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S.aureus, вводят в отдельных фармацевтических композициях.wherein an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to the S. aureus AT and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin are administered in separate pharmaceutical compositions. 83. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-78,83. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-78, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S.aureus, вводят в одной фармацевтической композиции.wherein an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA and an antibody or antigen-binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin are administered in a single pharmaceutical composition. 84. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-78,84. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-78, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S.aureus, вводят в отдельных фармацевтических композициях.wherein an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to S. aureus ClfA and an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to at least one S. aureus leukotoxin are administered in separate pharmaceutical compositions. 85. Способ, композиция или применение по любому из пп.80, 82 и 84,85. The method, composition or use according to any one of claims 80, 82 and 84, где отдельные фармацевтические композиции вводят одновременно.wherein the individual pharmaceutical compositions are administered simultaneously. 86. Способ, композиция или применение по любому из пп.80, 82 и 84,86. The method, composition or use according to any one of claims 80, 82 and 84, где отдельные фармацевтические композиции вводят последовательно.wherein the individual pharmaceutical compositions are administered sequentially. 87. Способ, композиция или применение по любому из пп.1, 2 и 5-78,87. Method, composition or use according to any one of claims 1, 2 and 5-78, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с AT S.aureus, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ClfA S.aureus, и антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с по меньшей мере одним лейкотоксином S.aureus, вводят в одной фармацевтической композиции.wherein an antibody or antigen binding fragment thereof that binds to S. aureus AT, an antibody or antigen binding fragment thereof that binds S. aureus ClfA, and an antibody or antigen binding fragment thereof that binds at least one S. aureus leukotoxin are administered to one pharmaceutical composition.
RU2021112346A 2018-10-09 2019-10-08 Combinations of antibodies to staphylococcus aureus RU2804815C2 (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US62/743,490 2018-10-09
US62/833,297 2019-04-12

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2021112346A RU2021112346A (en) 2022-11-14
RU2804815C2 true RU2804815C2 (en) 2023-10-06

Family

ID=

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013141730A1 (en) * 2012-03-19 2013-09-26 Tecnifar-Indústria Técnica Farmacêutica, S.A. Compositions comprising cocktails of antibacterial phages and uses thereof for the treatment of bacterial infections
WO2015089073A2 (en) * 2013-12-09 2015-06-18 New York University Compositions and methods for phagocyte delivery of anti-staphylococcal agents
WO2016166223A1 (en) * 2015-04-17 2016-10-20 Arsanis Biosciences Gmbh Anti-staphylococcus aureus antibody combination preparation
WO2017075188A2 (en) * 2015-10-30 2017-05-04 Medimmune, Llc Methods of using anti-alpha toxin antibody

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013141730A1 (en) * 2012-03-19 2013-09-26 Tecnifar-Indústria Técnica Farmacêutica, S.A. Compositions comprising cocktails of antibacterial phages and uses thereof for the treatment of bacterial infections
WO2015089073A2 (en) * 2013-12-09 2015-06-18 New York University Compositions and methods for phagocyte delivery of anti-staphylococcal agents
WO2016166223A1 (en) * 2015-04-17 2016-10-20 Arsanis Biosciences Gmbh Anti-staphylococcus aureus antibody combination preparation
WO2017075188A2 (en) * 2015-10-30 2017-05-04 Medimmune, Llc Methods of using anti-alpha toxin antibody

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
TKACZYK C. et al. Multimechanistic monoclonal antibodies (MAbs) targeting Staphylococcus aureus alpha-toxin and clumping factor A: activity and efficacy comparisons of a MAb combination and an engineered bispecific antibody approach // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2017. - Vol. 61. - No. 8. - Art. e00629-17. PAVON J. A. et al. Analysis of monoclonal antibody oxidation by simple mixed mode chromatography // Journal of Chromatography A. - 2016. - Vol. 1431. - P. 154-165. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6694269B2 (en) S. Antibodies to S. aureus surface determinants
US11168133B2 (en) Combinations of anti-Staphylococcus aureus antibodies
JP7459075B2 (en) Antibodies directed against Staphylococcus aureus leukotoxin
US11970527B2 (en) Antibody directed against S. aureus clumping factor A (ClfA)
US11932683B2 (en) Cellular factors involved in the cytotoxicity of Staphylococcus aureus leukocidins: novel therapeutic targets
WO2021052461A1 (en) Anti-alpha-hemolysin antibody and use thereof
EP2841101B1 (en) Compositions and methods related to antibodies that neutralize coagulase activity during staphylococcus aureus disease
CN107614517B (en) Antibodies against infectious diseases
RU2804815C2 (en) Combinations of antibodies to staphylococcus aureus
RU2818805C2 (en) STAPHYLOCOCCUS AUREUS CLUMPING FACTOR A (ClfA) ANTIBODY
RU2805969C2 (en) Antibodies against staphylococcus aureus leukotoxins
RU2808018C2 (en) Antibodies to surface determinants of s. aureus