RU2785737C2 - Chromogranin a as marker of bladder cancer - Google Patents
Chromogranin a as marker of bladder cancer Download PDFInfo
- Publication number
- RU2785737C2 RU2785737C2 RU2018135296A RU2018135296A RU2785737C2 RU 2785737 C2 RU2785737 C2 RU 2785737C2 RU 2018135296 A RU2018135296 A RU 2018135296A RU 2018135296 A RU2018135296 A RU 2018135296A RU 2785737 C2 RU2785737 C2 RU 2785737C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- cga
- level
- bladder cancer
- patients
- mmp7
- Prior art date
Links
- 206010005003 Bladder cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 142
- 201000005112 urinary bladder cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 135
- 102000010792 Chromogranin A Human genes 0.000 title description 150
- 108010038447 Chromogranin A Proteins 0.000 title description 150
- 239000003550 marker Substances 0.000 title description 41
- 230000004083 survival Effects 0.000 claims abstract description 83
- 230000000955 neuroendocrine Effects 0.000 claims abstract description 54
- 210000002966 Serum Anatomy 0.000 claims abstract description 49
- 238000009801 radical cystectomy Methods 0.000 claims abstract description 47
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims abstract description 25
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 18
- 230000034994 death Effects 0.000 claims abstract description 17
- 229940079593 drugs Drugs 0.000 claims abstract description 17
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 claims abstract description 16
- 210000003932 Urinary Bladder Anatomy 0.000 claims abstract description 12
- 210000001124 Body Fluids Anatomy 0.000 claims abstract description 8
- 238000002271 resection Methods 0.000 claims abstract description 7
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 claims abstract description 5
- 102000004318 Matrilysin Human genes 0.000 claims description 123
- 108090000855 Matrilysin Proteins 0.000 claims description 123
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 97
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 claims description 26
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 claims description 20
- 230000002829 reduced Effects 0.000 claims description 5
- 230000000875 corresponding Effects 0.000 claims description 3
- 238000010837 poor prognosis Methods 0.000 claims description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 4
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 74
- 102000004965 antibodies Human genes 0.000 description 48
- 108090001123 antibodies Proteins 0.000 description 48
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 39
- 206010044412 Transitional cell carcinoma Diseases 0.000 description 34
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 30
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 28
- 206010027476 Metastasis Diseases 0.000 description 25
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 24
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 23
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 20
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 20
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 19
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 17
- 210000004369 Blood Anatomy 0.000 description 15
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 15
- 238000000491 multivariate analysis Methods 0.000 description 15
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 15
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 15
- 210000001165 Lymph Nodes Anatomy 0.000 description 13
- 102100014892 MMP7 Human genes 0.000 description 13
- 101700057314 MMP7 Proteins 0.000 description 13
- 108010045030 monoclonal antibodies Proteins 0.000 description 13
- 102000005614 monoclonal antibodies Human genes 0.000 description 13
- 210000003205 Muscles Anatomy 0.000 description 12
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 12
- 102000038129 antigens Human genes 0.000 description 12
- 108091007172 antigens Proteins 0.000 description 12
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 12
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 12
- 210000002700 Urine Anatomy 0.000 description 11
- 210000004027 cells Anatomy 0.000 description 11
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 11
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 11
- 238000002591 computed tomography Methods 0.000 description 10
- 230000001225 therapeutic Effects 0.000 description 10
- 238000008157 ELISA kit Methods 0.000 description 9
- 210000002381 Plasma Anatomy 0.000 description 9
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 9
- 210000004408 Hybridomas Anatomy 0.000 description 8
- 206010061289 Metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 8
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 8
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 8
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 8
- 230000001394 metastastic Effects 0.000 description 8
- 230000004044 response Effects 0.000 description 8
- BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-carboxybutanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]pentanedioic acid Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 7
- VYZAGTDAHUIRQA-WHFBIAKZSA-N L-alanyl-L-glutamic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O VYZAGTDAHUIRQA-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 7
- 102100001256 NUMA1 Human genes 0.000 description 7
- 101700040544 TIMP1 Proteins 0.000 description 7
- 229960000070 antineoplastic Monoclonal antibodies Drugs 0.000 description 7
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 7
- 229960000060 monoclonal antibodies Drugs 0.000 description 7
- 102000016550 Complement Factor H Human genes 0.000 description 6
- 108010053085 Complement Factor H Proteins 0.000 description 6
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 6
- 102100005748 KRT18 Human genes 0.000 description 6
- 108010066327 Keratin-18 Proteins 0.000 description 6
- 102000005712 Keratin-8 Human genes 0.000 description 6
- 108010070511 Keratin-8 Proteins 0.000 description 6
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 6
- 102000007066 Prostate-Specific Antigen Human genes 0.000 description 6
- 108010072866 Prostate-Specific Antigen Proteins 0.000 description 6
- 102100002607 TIMP1 Human genes 0.000 description 6
- 101700065146 TIMP2 Proteins 0.000 description 6
- 102100006014 TIMP2 Human genes 0.000 description 6
- 208000007097 Urinary Bladder Neoplasm Diseases 0.000 description 6
- 201000001528 bladder urothelial carcinoma Diseases 0.000 description 6
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 6
- 230000002596 correlated Effects 0.000 description 6
- 230000036541 health Effects 0.000 description 6
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 5
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 5
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 5
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 5
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 5
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 5
- 238000000034 method Methods 0.000 description 5
- 238000009800 partial cystectomy Methods 0.000 description 5
- 210000001519 tissues Anatomy 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- XZWXFWBHYRFLEF-FSPLSTOPSA-N Ala-His Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 XZWXFWBHYRFLEF-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 4
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- 108010041308 Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 4
- FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N Glu-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 4
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- UJTZHGHXJKIAOS-WHFBIAKZSA-N Ser-Gln Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O UJTZHGHXJKIAOS-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- RZEQTVHJZCIUBT-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Arginine Chemical compound OCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 210000001635 Urinary Tract Anatomy 0.000 description 4
- 102100015249 VEGFA Human genes 0.000 description 4
- 108010073929 Vascular Endothelial Growth Factor A Proteins 0.000 description 4
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- 238000002574 cystoscopy Methods 0.000 description 4
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 4
- 238000002595 magnetic resonance imaging Methods 0.000 description 4
- 201000002120 neuroendocrine carcinoma Diseases 0.000 description 4
- 108091008117 polyclonal antibodies Proteins 0.000 description 4
- 230000002980 postoperative Effects 0.000 description 4
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 4
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 4
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 4
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 4
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 4
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 4
- 238000007473 univariate analysis Methods 0.000 description 4
- VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N (2S)-1-[(2S)-2-azaniumyl-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]pyrrolidine-2-carboxylate Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 3
- QXRNAOYBCYVZCD-BQBZGAKWSA-N (2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN QXRNAOYBCYVZCD-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N Ala-Gly Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- RDIKFPRVLJLMER-BQBZGAKWSA-N Ala-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N RDIKFPRVLJLMER-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 3
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 3
- 102100007326 BIRC5 Human genes 0.000 description 3
- 210000000349 Chromosomes Anatomy 0.000 description 3
- GWQVMPWSEVRGPY-UHFFFAOYSA-N Europium cryptate Chemical compound [Eu+3].N=1C2=CC=CC=1CN(CC=1N=C(C=CC=1)C=1N=C(C3)C=CC=1)CC(N=1)=CC(C(=O)NCCN)=CC=1C(N=1)=CC(C(=O)NCCN)=CC=1CN3CC1=CC=CC2=N1 GWQVMPWSEVRGPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OWOFCNWTMWOOJJ-WDSKDSINSA-N Gln-Glu Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OWOFCNWTMWOOJJ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N Glu-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- CLSDNFWKGFJIBZ-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Lysine Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O CLSDNFWKGFJIBZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N Gly-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N 0.000 description 3
- 102100014263 IGF1R Human genes 0.000 description 3
- 101700025802 IGF1R Proteins 0.000 description 3
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 3
- OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- 229940051875 Mucins Drugs 0.000 description 3
- 102000015728 Mucins Human genes 0.000 description 3
- 108010063954 Mucins Proteins 0.000 description 3
- 101700023323 NUMA1 Proteins 0.000 description 3
- 102000008297 Nuclear Matrix-Associated Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010035916 Nuclear Matrix-Associated Proteins Proteins 0.000 description 3
- SHAQGFGGJSLLHE-BQBZGAKWSA-N Pro-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 SHAQGFGGJSLLHE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- 208000000649 Small Cell Carcinoma Diseases 0.000 description 3
- GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 3
- 230000000240 adjuvant Effects 0.000 description 3
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 3
- 230000002429 anti-coagulation Effects 0.000 description 3
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 3
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 3
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 3
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 3
- 230000036772 blood pressure Effects 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 3
- 230000002124 endocrine Effects 0.000 description 3
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 3
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 3
- 108010078144 glutaminyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 3
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 3
- 201000003445 large cell neuroendocrine carcinoma Diseases 0.000 description 3
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 3
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 3
- 108010044655 lysylproline Proteins 0.000 description 3
- 210000000653 nervous system Anatomy 0.000 description 3
- 201000011519 neuroendocrine tumor Diseases 0.000 description 3
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 3
- 229910052761 rare earth metal Inorganic materials 0.000 description 3
- 150000002910 rare earth metals Chemical class 0.000 description 3
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 3
- 230000000391 smoking Effects 0.000 description 3
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 3
- 210000004881 tumor cells Anatomy 0.000 description 3
- 230000002485 urinary Effects 0.000 description 3
- LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N (2S)-1-[(2S)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- FAQVCWVVIYYWRR-WHFBIAKZSA-N (2S)-2-[[(2S)-2,5-diamino-5-oxopentanoyl]amino]propanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O FAQVCWVVIYYWRR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- KTGFOCFYOZQVRJ-UHFFFAOYSA-N 2-[(2-amino-3-methylpentanoyl)amino]pentanedioic acid Chemical compound CCC(C)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCC(O)=O KTGFOCFYOZQVRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 2-[[(2S)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]acetic acid Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 2qpq Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- MPZWMIIOPAPAKE-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[[1-carboxy-4-(diaminomethylideneamino)butyl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N MPZWMIIOPAPAKE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100007495 AR Human genes 0.000 description 2
- 208000009956 Adenocarcinoma Diseases 0.000 description 2
- HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N Ala-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 2
- 102000004888 Aquaporin 1 Human genes 0.000 description 2
- 108090001004 Aquaporin 1 Proteins 0.000 description 2
- JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- QADCERNTBWTXFV-JSGCOSHPSA-N Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 QADCERNTBWTXFV-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 2
- QCWJKJLNCFEVPQ-WHFBIAKZSA-N Asn-Gln Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O QCWJKJLNCFEVPQ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N Asn-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- SJUXYGVRSGTPMC-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Alanine Chemical compound OC(=O)C(C)NC(=O)C(N)CC(N)=O SJUXYGVRSGTPMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NPDLYUOYAGBHFB-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Arginine Chemical compound NC(=O)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N NPDLYUOYAGBHFB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NTQDELBZOMWXRS-UHFFFAOYSA-N Aspartyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010004992 Bladder adenocarcinoma stage unspecified Diseases 0.000 description 2
- 206010005081 Bladder squamous cell carcinoma stage unspecified Diseases 0.000 description 2
- 102000025380 C-Reactive Protein Human genes 0.000 description 2
- 108010074051 C-Reactive Protein Proteins 0.000 description 2
- ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M CHEMBL593252 Chemical compound [Cl-].C1=CC(N)=CC2=[S+]C3=CC(N)=CC=C3N=C21 ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 208000002458 Carcinoid Tumor Diseases 0.000 description 2
- 206010007275 Carcinoid tumour Diseases 0.000 description 2
- 206010009802 Coagulopathy Diseases 0.000 description 2
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 2
- 102100016692 ESR1 Human genes 0.000 description 2
- 229940088598 Enzyme Drugs 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 102100006565 FLT1 Human genes 0.000 description 2
- LOJYQMFIIJVETK-WDSKDSINSA-N Gln-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O LOJYQMFIIJVETK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- JEFZIKRIDLHOIF-BYPYZUCNSA-N Gln-Gly Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JEFZIKRIDLHOIF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N Glu-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- ARPVSMCNIDAQBO-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Leucine Chemical compound CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O ARPVSMCNIDAQBO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- 102100016400 HBEGF Human genes 0.000 description 2
- 101700029736 HBEGF Proteins 0.000 description 2
- 206010018987 Haemorrhage Diseases 0.000 description 2
- KRBMQYPTDYSENE-BQBZGAKWSA-N His-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CNC=N1 KRBMQYPTDYSENE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- 229940088597 Hormone Drugs 0.000 description 2
- 102000004375 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 1 Human genes 0.000 description 2
- 108090000957 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 1 Proteins 0.000 description 2
- 102000004372 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 2 Human genes 0.000 description 2
- 108090000964 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 2 Proteins 0.000 description 2
- 102000004374 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 3 Human genes 0.000 description 2
- 108090000965 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 3 Proteins 0.000 description 2
- 102000004371 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 5 Human genes 0.000 description 2
- 108090000961 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 5 Proteins 0.000 description 2
- 102000014429 Insulin-like growth factor Human genes 0.000 description 2
- 108050003490 Insulin-like growth factor Proteins 0.000 description 2
- 102000004883 Insulin-like growth factor-binding protein 6 Human genes 0.000 description 2
- 108090001014 Insulin-like growth factor-binding protein 6 Proteins 0.000 description 2
- 102100013180 KDR Human genes 0.000 description 2
- 102100012253 KRT20 Human genes 0.000 description 2
- 108010066370 Keratin-20 Proteins 0.000 description 2
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- LHSGPCFBGJHPCY-STQMWFEESA-N Leu-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 LHSGPCFBGJHPCY-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- JYOAXOMPIXKMKK-UHFFFAOYSA-N Leucyl-Glutamine Chemical compound CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCC(N)=O JYOAXOMPIXKMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000008771 Lymphadenopathy Diseases 0.000 description 2
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N Lys-Pro Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N Lys-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- 102100018200 MMP1 Human genes 0.000 description 2
- 102100016820 MMP10 Human genes 0.000 description 2
- 102100014893 MMP3 Human genes 0.000 description 2
- 102100006844 MMP9 Human genes 0.000 description 2
- 108010016113 Matrix Metalloproteinase 1 Proteins 0.000 description 2
- 108010076497 Matrix Metalloproteinase 10 Proteins 0.000 description 2
- 102000011722 Matrix Metalloproteinase 13 Human genes 0.000 description 2
- 108010076503 Matrix Metalloproteinase 13 Proteins 0.000 description 2
- 102000000424 Matrix Metalloproteinase 2 Human genes 0.000 description 2
- 108010016165 Matrix Metalloproteinase 2 Proteins 0.000 description 2
- 108010016160 Matrix Metalloproteinase 3 Proteins 0.000 description 2
- 108010015302 Matrix Metalloproteinase 9 Proteins 0.000 description 2
- 102000002274 Matrix Metalloproteinases Human genes 0.000 description 2
- 108010000684 Matrix Metalloproteinases Proteins 0.000 description 2
- 102000014867 Matrix metalloproteinase-26 Human genes 0.000 description 2
- 108050005195 Matrix metalloproteinase-26 Proteins 0.000 description 2
- 108020004999 Messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 206010027459 Metastases to lymph node Diseases 0.000 description 2
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 2
- 206010052399 Neuroendocrine tumour Diseases 0.000 description 2
- 241000208125 Nicotiana Species 0.000 description 2
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 2
- 102100012897 PGF Human genes 0.000 description 2
- 101710014083 PGF Proteins 0.000 description 2
- 210000004197 Pelvis Anatomy 0.000 description 2
- 102000017794 Perilipin-2 Human genes 0.000 description 2
- 108010067163 Perilipin-2 Proteins 0.000 description 2
- 102000013566 Plasminogen Human genes 0.000 description 2
- 108010051456 Plasminogen Proteins 0.000 description 2
- WBAXJMCUFIXCNI-WDSKDSINSA-N Ser-Pro Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O WBAXJMCUFIXCNI-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- SBMNPABNWKXNBJ-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Lysine Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CO SBMNPABNWKXNBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000037165 Serum Concentration Effects 0.000 description 2
- 206010041823 Squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 108010002687 Survivin Proteins 0.000 description 2
- 101700045331 TIMP3 Proteins 0.000 description 2
- 101700043787 TIMP4 Proteins 0.000 description 2
- 102100013302 TIMP4 Human genes 0.000 description 2
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 2
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 description 2
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 2
- 108010001801 Tumor Necrosis Factor-alpha Proteins 0.000 description 2
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 2
- UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 2
- 108010053096 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-1 Proteins 0.000 description 2
- 108010053099 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 Proteins 0.000 description 2
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 2
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 2
- 108010044940 alanylglutamine Proteins 0.000 description 2
- 108010080146 androgen receptors Proteins 0.000 description 2
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 2
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 2
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 2
- 238000003149 assay kit Methods 0.000 description 2
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 2
- 201000006587 bladder adenocarcinoma Diseases 0.000 description 2
- 201000006598 bladder squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 230000000740 bleeding Effects 0.000 description 2
- 231100000319 bleeding Toxicity 0.000 description 2
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M buffer Substances [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000007374 clinical diagnostic method Methods 0.000 description 2
- 230000035602 clotting Effects 0.000 description 2
- 230000015271 coagulation Effects 0.000 description 2
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 2
- 238000009799 cystectomy Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N edta Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000002708 enhancing Effects 0.000 description 2
- 108010038795 estrogen receptors Proteins 0.000 description 2
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 2
- 230000002068 genetic Effects 0.000 description 2
- VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N gly ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N gly pro Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine zwitterion Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 2
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 2
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 2
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 description 2
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 2
- 230000003054 hormonal Effects 0.000 description 2
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 108010012058 leucyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 230000003211 malignant Effects 0.000 description 2
- 229920002106 messenger RNA Polymers 0.000 description 2
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000006011 modification reaction Methods 0.000 description 2
- 230000036963 noncompetitive Effects 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic Effects 0.000 description 2
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 2
- 108010018625 phenylalanylarginine Proteins 0.000 description 2
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 2
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 2
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 2
- 238000010791 quenching Methods 0.000 description 2
- 230000000171 quenching Effects 0.000 description 2
- 238000002601 radiography Methods 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 238000003118 sandwich ELISA Methods 0.000 description 2
- 238000007423 screening assay Methods 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 238000002626 targeted therapy Methods 0.000 description 2
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 2
- XMAUFHMAAVTODF-STQMWFEESA-N (2S)-2-[[(2S)-2-amino-3-(1H-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-phenylpropanoic acid Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 XMAUFHMAAVTODF-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- LZDNBBYBDGBADK-KBPBESRZSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-amino-3-methylbutanoyl]amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LZDNBBYBDGBADK-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- JEDIEMIJYSRUBB-FOHZUACHSA-N (3S)-3-[[(2S,3R)-2-amino-3-hydroxybutanoyl]amino]-4-(carboxymethylamino)-4-oxobutanoic acid Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O JEDIEMIJYSRUBB-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- SJPMNHCEWPTRBR-BQBZGAKWSA-N (4S)-4-amino-5-[[(2S)-4-carboxy-1-(carboxymethylamino)-1-oxobutan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O SJPMNHCEWPTRBR-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SNFUTDLOCQQRQD-UHFFFAOYSA-N 2-[(2-amino-4-carboxybutanoyl)amino]-3-methylpentanoic acid Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SNFUTDLOCQQRQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N 2-[[2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]acetyl]amino]acetic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- PABVKUJVLNMOJP-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[(1-carboxy-2-sulfanylethyl)amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CS)C(O)=O PABVKUJVLNMOJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MGHKSHCBDXNTHX-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[(4-amino-1-carboxy-4-oxobutyl)amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O MGHKSHCBDXNTHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000035533 AUC Effects 0.000 description 1
- 210000001015 Abdomen Anatomy 0.000 description 1
- 206010001488 Aggression Diseases 0.000 description 1
- 108010011667 Ala-Phe-Ala Proteins 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- ALZVPLKYDKJKQU-XVKPBYJWSA-N Ala-Tyr Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 ALZVPLKYDKJKQU-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N Alanyl-Arginine Chemical compound CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012114 Alexa Fluor 647 Substances 0.000 description 1
- 102400000068 Angiostatin Human genes 0.000 description 1
- 108010079709 Angiostatins Proteins 0.000 description 1
- OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N Arg-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- BNODVYXZAAXSHW-UHFFFAOYSA-N Arginyl-Histidine Chemical compound NC(=N)NCCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CN=CN1 BNODVYXZAAXSHW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PSZNHSNIGMJYOZ-WDSKDSINSA-N Asp-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PSZNHSNIGMJYOZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- 108010083946 Asp-Tyr-Leu-Lys Proteins 0.000 description 1
- CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- OMSMPWHEGLNQOD-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Phenylalanine Chemical compound NC(=O)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OMSMPWHEGLNQOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VBKIFHUVGLOJKT-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(N)=O VBKIFHUVGLOJKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N Aspartyl-Isoleucine Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N Aspartyl-L-proline Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- 101700054568 BIRC5 Proteins 0.000 description 1
- 210000004900 C-terminal fragment Anatomy 0.000 description 1
- 102100004728 CDH1 Human genes 0.000 description 1
- 101700016900 CDH1 Proteins 0.000 description 1
- 101000006819 CHGA Proteins 0.000 description 1
- 102100016705 COL18A1 Human genes 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 108090000209 Carbonic Anhydrases Proteins 0.000 description 1
- 102000003846 Carbonic Anhydrases Human genes 0.000 description 1
- 208000009458 Carcinoma in Situ Diseases 0.000 description 1
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 1
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 1
- VBIIZCXWOZDIHS-UHFFFAOYSA-N Cysteinyl-Isoleucine Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CS VBIIZCXWOZDIHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010012601 Diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 description 1
- 206010013663 Drug dependence Diseases 0.000 description 1
- 101700041055 ELF3 Proteins 0.000 description 1
- 102000033147 ERVK-25 Human genes 0.000 description 1
- 102000016942 Elastin Human genes 0.000 description 1
- 108010014258 Elastin Proteins 0.000 description 1
- 108010079505 Endostatins Proteins 0.000 description 1
- 206010072082 Environmental exposure Diseases 0.000 description 1
- 210000003414 Extremities Anatomy 0.000 description 1
- 102100013182 FLT4 Human genes 0.000 description 1
- 102100008658 FN1 Human genes 0.000 description 1
- 108010067306 Fibronectins Proteins 0.000 description 1
- SXGAGTVDWKQYCX-BQBZGAKWSA-N Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SXGAGTVDWKQYCX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SSHIXEILTLPAQT-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Aspartate Chemical compound NC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CC(O)=O)C(O)=O SSHIXEILTLPAQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- PNMUAGGSDZXTHX-BYPYZUCNSA-N Gly-Gln Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O PNMUAGGSDZXTHX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000009465 Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 101700042506 HIRUD Proteins 0.000 description 1
- 229960002897 Heparin Drugs 0.000 description 1
- ZFGMDIBRIDKWMY-PASTXAENSA-N Heparin Chemical compound CC(O)=N[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](C(O)=O)O[C@@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](OS(O)(=O)=O)[C@@H](O[C@@H]3[C@@H](OC(O)[C@H](OS(O)(=O)=O)[C@H]3O)C(O)=O)O[C@@H]2O)CS(O)(=O)=O)[C@H](O)[C@H]1O ZFGMDIBRIDKWMY-PASTXAENSA-N 0.000 description 1
- 229940006607 Hirudin Drugs 0.000 description 1
- VHOLZZKNEBBHTH-YUMQZZPRSA-N His-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CNC=N1 VHOLZZKNEBBHTH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- LYCVKHSJGDMDLM-LURJTMIESA-N His-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 LYCVKHSJGDMDLM-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- 229940084986 Human Chorionic Gonadotropin Drugs 0.000 description 1
- 102100005117 IGF2 Human genes 0.000 description 1
- 101700070236 IGF2 Proteins 0.000 description 1
- 102100014738 IGFBP3 Human genes 0.000 description 1
- 101710031099 IGFBP3 Proteins 0.000 description 1
- 102100017930 IGFBP7 Human genes 0.000 description 1
- 101710031112 IGFBP7 Proteins 0.000 description 1
- HZYHBDVRCBDJJV-HAFWLYHUSA-N Ile-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O HZYHBDVRCBDJJV-HAFWLYHUSA-N 0.000 description 1
- TUYOFUHICRWDGA-CIUDSAMLSA-N Ile-Met Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCSC TUYOFUHICRWDGA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- 102000004369 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 4 Human genes 0.000 description 1
- 108090000969 Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 102000020344 Insulin-Like Growth Factor Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091022066 Insulin-Like Growth Factor Binding Proteins Proteins 0.000 description 1
- UWBDLNOCIDGPQE-UHFFFAOYSA-N Isoleucyl-Lysine Chemical compound CCC(C)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCCN UWBDLNOCIDGPQE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100012248 KRT19 Human genes 0.000 description 1
- 101710026204 KRT19 Proteins 0.000 description 1
- HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N L-arginyl-L-glutamic acid Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- ZUKPVRWZDMRIEO-VKHMYHEASA-N L-cysteinylglycine zwitterion Chemical compound SC[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O ZUKPVRWZDMRIEO-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N L-lysyl-L-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 210000004185 Liver Anatomy 0.000 description 1
- 210000004072 Lung Anatomy 0.000 description 1
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- MYTOTTSMVMWVJN-STQMWFEESA-N Lys-Tyr Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MYTOTTSMVMWVJN-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N Lys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 238000000585 Mann–Whitney U test Methods 0.000 description 1
- JHKXZYLNVJRAAJ-WDSKDSINSA-N Met-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JHKXZYLNVJRAAJ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- QTZXSYBVOSXBEJ-WDSKDSINSA-N Met-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O QTZXSYBVOSXBEJ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- MUMXFARPYQTTSL-BQBZGAKWSA-N Met-Gln Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O MUMXFARPYQTTSL-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- OGGRSJFVXREKOR-CIUDSAMLSA-N Met-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCSC OGGRSJFVXREKOR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N Met-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N Met-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- XYVRXLDSCKEYES-JSGCOSHPSA-N Met-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(O)=O)=CNC2=C1 XYVRXLDSCKEYES-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- JMEWFDUAFKVAAT-UHFFFAOYSA-N Methionyl-Asparagine Chemical compound CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC(N)=O JMEWFDUAFKVAAT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AAFYOVPTFNNVDN-UHFFFAOYSA-N N-methyl-N-phenacylnitrous amide Chemical compound O=NN(C)CC(=O)C1=CC=CC=C1 AAFYOVPTFNNVDN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010066427 N-valyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 108010087066 N2-tryptophyllysine Proteins 0.000 description 1
- 208000003788 Neoplasm Micrometastasis Diseases 0.000 description 1
- 206010052639 Nerve injury Diseases 0.000 description 1
- 210000004412 Neuroendocrine Cells Anatomy 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 208000007312 Paraganglioma Diseases 0.000 description 1
- 206010061332 Paraganglion neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 108091005771 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- OZILORBBPKKGRI-RYUDHWBXSA-N Phe-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 OZILORBBPKKGRI-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N Phe-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N Phe-Pro Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N1[C@@H](CCC1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N Pro-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- OCYROESYHWUPBP-CIUDSAMLSA-N Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 OCYROESYHWUPBP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- RVQDZELMXZRSSI-IUCAKERBSA-N Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 RVQDZELMXZRSSI-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- BEPSGCXDIVACBU-UHFFFAOYSA-N Prolyl-Histidine Chemical compound C1CCNC1C(=O)NC(C(=O)O)CC1=CN=CN1 BEPSGCXDIVACBU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 108010026552 Proteome Proteins 0.000 description 1
- 206010037175 Psychiatric disease Diseases 0.000 description 1
- 210000004739 Secretory Vesicles Anatomy 0.000 description 1
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N Ser-Asn Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N Ser-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N Ser-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 102000004584 Somatomedin Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010017622 Somatomedin Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100006015 TIMP3 Human genes 0.000 description 1
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N Tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 1
- WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N Thr-His Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N 0.000 description 1
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N Thr-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 1
- UQTNIFUCMBFWEJ-UHFFFAOYSA-N Threoninyl-Asparagine Chemical compound CC(O)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC(N)=O UQTNIFUCMBFWEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YKRQRPFODDJQTC-UHFFFAOYSA-N Threoninyl-Lysine Chemical compound CC(O)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCCN YKRQRPFODDJQTC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CKHWEVXPLJBEOZ-UHFFFAOYSA-N Threoninyl-Valine Chemical compound CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)C(C)O CKHWEVXPLJBEOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000710779 Trina Species 0.000 description 1
- LCPVBXOHXMBLFW-JSGCOSHPSA-N Trp-Arg Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)=CNC2=C1 LCPVBXOHXMBLFW-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- PWIQCLSQVQBOQV-AAEUAGOBSA-N Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 PWIQCLSQVQBOQV-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 1
- YBRHKUNWEYBZGT-UHFFFAOYSA-N Tryptophyl-Threonine Chemical compound C1=CC=C2C(CC(N)C(=O)NC(C(O)C)C(O)=O)=CNC2=C1 YBRHKUNWEYBZGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N Tyr-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CC=C(O)C=C1 HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- ZSXJENBJGRHKIG-UHFFFAOYSA-N Tyrosyl-Serine Chemical compound OCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010046566 Urinary tract disease Diseases 0.000 description 1
- 208000000207 Urologic Disease Diseases 0.000 description 1
- 210000003741 Urothelium Anatomy 0.000 description 1
- 102100015206 VEGFC Human genes 0.000 description 1
- 101700082383 VEGFC Proteins 0.000 description 1
- 102100009661 VTN Human genes 0.000 description 1
- WITCOKQIPFWQQD-FSPLSTOPSA-N Val-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O WITCOKQIPFWQQD-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- YSGSDAIMSCVPHG-YUMQZZPRSA-N Val-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C YSGSDAIMSCVPHG-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- STTYIMSDIYISRG-WDSKDSINSA-N Val-Ser Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O STTYIMSDIYISRG-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- GVRKWABULJAONN-UHFFFAOYSA-N Valyl-Threonine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NC(C(C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010053100 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-3 Proteins 0.000 description 1
- 108010031318 Vitronectin Proteins 0.000 description 1
- 206010047924 Wheezing Diseases 0.000 description 1
- 238000002679 ablation Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 1
- 108010069020 alanyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010041407 alanylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010070783 alanyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010050122 alpha 1-Antitrypsin Proteins 0.000 description 1
- 229940024142 alpha 1-Antitrypsin Drugs 0.000 description 1
- 102000015395 alpha 1-Antitrypsin Human genes 0.000 description 1
- 230000003276 anti-hypertensive Effects 0.000 description 1
- 108010036226 antigen CYFRA21.1 Proteins 0.000 description 1
- 108010052670 arginyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010072041 arginyl-glycyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010091092 arginyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 239000002585 base Substances 0.000 description 1
- 230000006399 behavior Effects 0.000 description 1
- 230000002146 bilateral Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N calcium cation Chemical compound [Ca+2] BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910001424 calcium ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 201000009030 carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 210000000038 chest Anatomy 0.000 description 1
- 229960005188 collagen Drugs 0.000 description 1
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 1
- 230000002860 competitive Effects 0.000 description 1
- 238000002967 competitive immunoassay Methods 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 108010016616 cysteinylglycine Proteins 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing Effects 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 239000000104 diagnostic biomarker Substances 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- 230000035487 diastolic blood pressure Effects 0.000 description 1
- 238000003748 differential diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 201000009910 diseases by infectious agent Diseases 0.000 description 1
- BQENDLAVTKRQMS-SBBGFIFASA-L disodium;(2S,4aS,6aR,6aS,6bR,8aR,10S,12aS,14bR)-10-(3-carboxylatopropanoyloxy)-2,4a,6a,6b,9,9,12a-heptamethyl-13-oxo-3,4,5,6,6a,7,8,8a,10,11,12,14b-dodecahydro-1H-picene-2-carboxylate Chemical compound [Na+].[Na+].C([C@H]1C2=CC(=O)[C@H]34)[C@@](C)(C([O-])=O)CC[C@]1(C)CC[C@@]2(C)[C@]4(C)CC[C@@H]1[C@]3(C)CC[C@H](OC(=O)CCC([O-])=O)C1(C)C BQENDLAVTKRQMS-SBBGFIFASA-L 0.000 description 1
- 238000001647 drug administration Methods 0.000 description 1
- 229920002549 elastin Polymers 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 210000003890 endocrine cells Anatomy 0.000 description 1
- 210000000750 endocrine system Anatomy 0.000 description 1
- 230000029578 entry into host Effects 0.000 description 1
- 230000028023 exocytosis Effects 0.000 description 1
- 230000037320 fibronectin Effects 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 1
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 108010019832 glycyl-asparaginyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010028188 glycyl-histidyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010082286 glycyl-seryl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- 108010059898 glycyl-tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010010147 glycylglutamine Proteins 0.000 description 1
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 231100000171 higher toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 102000034907 human CHGA protein Human genes 0.000 description 1
- 201000004933 in situ carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 230000002608 insulinlike Effects 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000009114 investigational therapy Methods 0.000 description 1
- 108010044311 leucyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 238000001325 log-rank test Methods 0.000 description 1
- 108010076718 lysyl-glutamyl-tryptophan Proteins 0.000 description 1
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 238000010197 meta-analysis Methods 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010034507 methionyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 239000003068 molecular probe Substances 0.000 description 1
- 238000004802 monitoring treatment efficacy Methods 0.000 description 1
- 230000001537 neural Effects 0.000 description 1
- 230000000926 neurological Effects 0.000 description 1
- 239000002547 new drug Substances 0.000 description 1
- 230000000683 nonmetastatic Effects 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N p-acetaminophenol Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000010198 papillary carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 201000010941 papillary squamous carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000036961 partial Effects 0.000 description 1
- 230000001575 pathological Effects 0.000 description 1
- -1 peptide Proteins 0.000 description 1
- 108010084525 phenylalanyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 1
- 230000003449 preventive Effects 0.000 description 1
- QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N pro glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 239000000092 prognostic biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000002035 prolonged Effects 0.000 description 1
- 108010014614 prolyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive Effects 0.000 description 1
- 230000000637 radiosensitizating Effects 0.000 description 1
- 239000000985 reactive dye Substances 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000000306 recurrent Effects 0.000 description 1
- 230000011514 reflex Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000007127 saponification reaction Methods 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 238000004062 sedimentation Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 108010069117 seryl-lysyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 101710040918 shg Proteins 0.000 description 1
- 238000009097 single-agent therapy Methods 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 201000009032 substance abuse Diseases 0.000 description 1
- 231100000736 substance abuse Toxicity 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 201000010874 syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000035488 systolic blood pressure Effects 0.000 description 1
- 108010072986 threonyl-seryl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 239000003868 thrombin inhibitor Substances 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- 201000001923 urinary system disease Diseases 0.000 description 1
- 201000002327 urinary tract obstruction Diseases 0.000 description 1
- 230000002792 vascular Effects 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N α-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- DXJZITDUDUPINW-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Asparagine Chemical compound NC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O DXJZITDUDUPINW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZQFAGNFSIZZYBA-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Tryptophan Chemical compound C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(CCC(N)=O)N)C(O)=O)=CNC2=C1 ZQFAGNFSIZZYBA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Abstract
Description
Область техники, к которой относится изобретениеThe technical field to which the invention belongs
[0001] Настоящее изобретение относится к области клинической диагностики. В частности, изобретение относится к прогнозированию, оценке риска, стратификации риска, мониторированию и/или контролю терапии рака мочевого пузыря на основании хромогранина A (CgA) в качестве маркера.[0001] The present invention relates to the field of clinical diagnostics. In particular, the invention relates to the prediction, risk assessment, risk stratification, monitoring and/or control of bladder cancer therapy based on chromogranin A (CgA) as a marker.
Уровень техники для изобретения State of the art for the invention
[0002] Рак пузыря (рак мочевого пузыря) является наиболее распространенным злокачественным новообразованием мочевыводящих путей. Принимая во внимание новые диагностированные случаи и его высокую частоту рецидивов, рак мочевого пузыря является одной из наиболее распространенных злокачественных опухолей во всем мире (Chamie et al. 2011, Goodison, Rosser and Urquidi 2013). Западные страны поражены в большей степени, и мужчины имеют в 3-4 раза более высокий риск развития по сравнению с женщинами (Burger et al. 2013a).[0002] Bladder cancer (bladder cancer) is the most common malignant neoplasm of the urinary tract. Considering newly diagnosed cases and its high recurrence rate, bladder cancer is one of the most common malignancies worldwide (Chamie et al. 2011, Goodison, Rosser and Urquidi 2013). Western countries are more affected, and men have a 3-4 times higher risk of developing compared to women (Burger et al. 2013a).
На основании клеток, которые становятся злокачественными, можно различать различные типы рака мочевого пузыря. Наиболее распространенным типом рака мочевого пузыря является переходноклеточная карцинома (90%), за которой следуют плоскоклеточная карцинома и аденокарцинома (2-5%). Менее 1% рака мочевого пузыря возникает из нейроэндокринных клеток (Bertaccini et al. 2008, Pompas-Veganzones, Gonzalez-Peramato and Sanchez-Carbayo 2014). При диагностике приблизительно 70-75% пациентов имеют поверхностный рак мочевого пузыря (стадии Ta-T1), также известный как не мышечно-инвазивный рак мочевого пузыря (NMIBC). 25-30% пациентов имеют мышечно-инвазивный рак мочевого пузыря (MIBC, стадии T2-T4) и/или метастазирующий рак мочевого пузыря (Clark et al. 2013, Mossanen and Gore 2014).Based on the cells that become cancerous, different types of bladder cancer can be distinguished. The most common type of bladder cancer is transitional cell carcinoma (90%), followed by squamous cell carcinoma and adenocarcinoma (2-5%). Less than 1% of bladder cancer arises from neuroendocrine cells (Bertaccini et al. 2008, Pompas-Veganzones, Gonzalez-Peramato and Sanchez-Carbayo 2014). At diagnosis, approximately 70-75% of patients have superficial bladder cancer (stages Ta-T1), also known as non-muscle invasive bladder cancer (NMIBC). 25-30% of patients have muscle-invasive bladder cancer (MIBC, stages T2-T4) and/or metastatic bladder cancer (Clark et al. 2013, Mossanen and Gore 2014).
Частота рецидивов и/или прогрессирования рака мочевого пузыря является чрезвычайно высокой, где 50-70% пациентов с NMIBC могут иметь рецидив, прогрессирование или возникновение нового заболевания в пределах 5-7 лет после лечения (Clark et al. 2013), и 10% - 30% этих рецидивов являются инвазивными (Chamie et al. 2011, Goodison et al. 2013, Witjes et al. 2014). Приблизительно в половине (43%) случаев MIBC присутствовали неинвазивные опухоли при диагностике, которые прогрессировали несмотря на органосохраняющее лечение (EAU Guidelines on Muscle-invasive and Metastatic Bladder Cancer 2014).The recurrence and/or progression rate of bladder cancer is extremely high, where 50-70% of NMIBC patients may relapse, progress, or develop new disease within 5-7 years of treatment (Clark et al. 2013), and 10% - 30% of these relapses are invasive (Chamie et al. 2011, Goodison et al. 2013, Witjes et al. 2014). Approximately half (43%) of MIBC cases had non-invasive tumors at diagnosis that progressed despite organ-sparing treatment (EAU Guidelines on Muscle-invasive and Metastatic Bladder Cancer 2014).
[0003] В настоящее время, ключевым элементом диагностики и наблюдения рака мочевого пузыря является гистопатологическое исследование биоптатов уротелия мочевого пузыря в ходе цистоскопии/трансуретральной резекции опухоли мочевого пузыря (TURBT). Цистоскопия в белом свете является полезным диагностическим инструментом в руках медицинских работников, но имеет большие ограничения. Действительно, она часто недооценивает стадии опухолей, что может привести к недостаточному лечению (Cauberg Evelyne, de la Rosette and de Reijke 2011). Она также является умеренно чувствительной, дорогой и инвазивной. Некоторые чрезвычайно редкие осложнения, такие как перфорация из-за запирательного рефлекса, кровотечение, ТУР-синдром, обструкция мочевыводящих путей, перфорация (вне- или внутрибрюшинная) и инфекции, могут возникать в ходе этой процедуры.[0003] Currently, a key element in the diagnosis and surveillance of bladder cancer is histopathological examination of biopsy specimens of bladder urothelium during cystoscopy/transurethral resection of a bladder tumor (TURBT). White light cystoscopy is a useful diagnostic tool in the hands of medical professionals, but has major limitations. Indeed, she often underestimates the stages of tumors, which can lead to undertreatment (Cauberg Evelyne, de la Rosette and de Reijke 2011). It is also moderately sensitive, expensive and invasive. Some extremely rare complications such as perforation due to the obturator reflex, bleeding, TUR syndrome, urinary tract obstruction, perforation (extra- or intraperitoneal), and infections may occur during this procedure.
Цитология мочи, полученной естественным путем (VUC), также является широко используемым способом диагностики и наблюдения NMIBC с высокой специфичностью, но низкой чувствительностью при высокодифференцированных опухолях (низкой степени злокачественности). Ее точность лежит в диапазоне от только 20 до 40% для опухолей на ранней стадии (AUA Guidelines 2007-2014, Goodison et al., 2013). Для нее показана лучшая точность для опухолей высокой степени злокачественности и в частности, для карциномы in situ. Это свойство делает ее дополнительным инструментом для трансуретральной резекции (см. ниже). Цистоскопия и VUC позволяют первичную диагностику и первичную оценку признаков опухолей, включая количество, тип, степень злокачественности и оцененную стадию.Natural urine cytology (VUC) is also a widely used method for diagnosing and monitoring NMIBC, with high specificity but low sensitivity in well-differentiated (low-grade) tumors. Its accuracy ranges from only 20 to 40% for early stage tumors (AUA Guidelines 2007-2014, Goodison et al., 2013). It has shown better accuracy for high grade tumors and in situ carcinoma in particular. This property makes it an additional tool for transurethral resection (see below). Cystoscopy and VUC allow primary diagnosis and initial assessment of signs of tumors, including number, type, grade, and stage assessed.
Компьютерную томографию (КТ) и магнитно-резонансную томографию (ЯМР) также можно использовать для оценки первичной опухоли. Однако, во вплоть до 40% случаев, они недооценивают заболевания и могут только с ограничениями различать стадии опухолей Ta-T3a (степень точности лежит в диапазоне 55-92%), даже хотя опубликована лучшая точность различения инвазивных от неинвазивных (Maurer et al. 2013).Computed tomography (CT) and magnetic resonance imaging (MRI) can also be used to evaluate the primary tumor. However, in up to 40% of cases, they underestimate disease and can only discriminate between stages of Ta-T3a tumors with limitations (accuracy ranges from 55-92%), even though better accuracy in distinguishing invasive from non-invasive has been published (Maurer et al. 2013 ).
Оценка статуса метастазирования, и особенно состояния узлов, является ключевым пунктом прогностической оценки рака мочевого пузыря. Метастазирование в лимфатические узлы увеличивается от низкой частоты 5-10% для не мышечно-инвазивных опухолей мочевого пузыря до 15-20% для поверхностных мышечно-инвазивных опухолей, до 25-30% для глубоких мышечно-инвазивных опухолей и до >40% для внепузырных опухолей (Shariat et al. 2012). Диагностика отдаленного или регионарного метастазирующего рака мочевого пузыря по большей части основана на множество способов визуализации, включая радиографию, ультразвуковое исследование, компьютерную томографию (КТ) и магнитно-резонансную томографию (ЯМР). Ультразвуковое исследование является самым простым, наиболее неинвазивным, и экономически эффективным, но зависит от квалификации оператора. КТ и ЯМР также являются неинвазивными, и хотя чувствительность этих способов недавно была улучшена, их эффективность остается недостаточной.Assessment of metastasis status, and especially the condition of the nodes, is a key point in the prognostic evaluation of bladder cancer. Metastasis to the lymph nodes increases from a low incidence of 5–10% for non-muscle invasive bladder tumors to 15–20% for superficial muscle invasive tumors, up to 25–30% for deep muscle invasive tumors, and up to >40% for non-muscle invasive tumors. tumors (Shariat et al. 2012). Diagnosis of distant or regional metastatic bladder cancer is largely based on a variety of imaging modalities, including radiography, ultrasound, computed tomography (CT), and magnetic resonance imaging (MRI). Ultrasound is the simplest, most noninvasive, and cost effective, but depends on the skill of the operator. CT and NMR are also non-invasive, and although the sensitivity of these methods has recently been improved, their effectiveness remains insufficient.
В случае, если первичный диагноз является положительным по раку мочевого пузыря вне зависимости от статуса метастазирования, проводят трансуретральную резекцию опухоли мочевого пузыря (TURBT). Этот лечебно-диагностический способ является начальной терапевтической стадией, характеризующейся эндоскопической абляцией всей опухоли. Он подтверждает диагноз и позволяет более точную оценку стадии опухоли, особенно глубину инвазии стенки мочевого пузыря. Однако, TURBT ассоциирована со значительным риском недооценки, особенно для опухолей T1 (Babjuk 2009).If the initial diagnosis is positive for bladder cancer, regardless of metastatic status, transurethral resection of the bladder tumor (TURBT) is performed. This therapeutic and diagnostic method is the initial therapeutic stage, characterized by endoscopic ablation of the entire tumor. It confirms the diagnosis and allows a more accurate assessment of the stage of the tumor, especially the depth of invasion of the bladder wall. However, TURBT is associated with a significant risk of underestimation, especially for T1 tumors (Babjuk 2009).
Более того, из-за неполной резекции, рост рецидивирующей опухоли можно наблюдать в течение первого года (Kamat et al. 2013, Babjuk 2009). По этой причине повторную TURBT или максимальную TURBT настоятельно рекомендуют в руководствах (Brausi et al. 2011).Moreover, due to incomplete resection, recurrent tumor growth can be observed within the first year (Kamat et al. 2013, Babjuk 2009). For this reason, repeated TURBT or maximum TURBT is strongly recommended in guidelines (Brausi et al. 2011).
[0004] В то время как течением заболевания пациентов с NMIBC часто можно безопасно управлять посредством «точной» TURBT с наличием или отсутствием дополнительных терапевтических мер (например, иммунотерапии, химиотерапии), радикальная цистэктомия (RCE) с двусторонним удалением тазовых лимфатических узлов (PLND) стала стандартом лечения для пациентов с MIBC (Clark et al. 2013, Witjes et al. 2014). Для некоторых неоадъювантных химиотерапевтических средств показано преимущество для выживаемости (Sharma, Ksheersagar and Sharma 2009), и они рекомендованы для избранных пациентов. RCE рекомендована также для имеющих высокую степень злокачественности и/или невосприимчивых NMIBC и карциномы in situ (CIS). Множество пациентов с радикальным хирургическим вмешательством подвергают отведению мочи или реконструкции новообразованного мочевого пузыря. В руководстве Национальной всеобщей онкологической сети (NCCN) рекомендовано, что пациентов без поражения лимфатических узлов с наиболее высоким риском по патологическим оценкам можно подвергать дополнительной адъювантной радиотерапии с радиосенсибилизирующей терапией или химиотерапией. Однако, эти дополнительные виды терапии могут усиливать токсичность и сопутствующие заболевания (Clark et al. 2013).[0004] While the course of the disease in patients with NMIBC can often be safely managed by "fine" TURBT with or without additional therapeutic measures (e.g., immunotherapy, chemotherapy), radical cystectomy (RCE) with bilateral removal of pelvic lymph nodes (PLND) has become the standard of care for patients with MIBC (Clark et al. 2013, Witjes et al. 2014). Some neoadjuvant chemotherapeutic agents have shown a survival advantage (Sharma, Ksheersagar and Sharma 2009) and are recommended for selected patients. RCE is also recommended for highly malignant and/or refractory NMIBCs and carcinomas in situ (CIS). Many radical surgery patients undergo urinary diversion or neobladder reconstruction. National Comprehensive Cancer Network (NCCN) guidelines recommend that patients without lymph node involvement at highest pathological risk may be treated with additional adjuvant radiotherapy with radiosensitization therapy or chemotherapy. However, these additional therapies may exacerbate toxicity and comorbidities (Clark et al. 2013).
После только RCE в общей группе рака мочевого пузыря (BCa) (всех стадий и степеней злокачественности), значения 5-летней общей выживаемости, безрецидивной выживаемости и онкоспецифической выживаемости составляли только 57%, 48% и 67%, соответственно, с частотой отдаленных и местных рецидивов 37% и 6%, соответственно (Yafi et al. 2011).After RCE alone in the total bladder cancer (BCa) group (all stages and grades), 5-year overall survival, disease-free survival, and cancer-specific survival were only 57%, 48%, and 67%, respectively, with late and local recurrences 37% and 6%, respectively (Yafi et al. 2011).
Преимущества стандартного удаления тазовых лимфатических узлов (PLND) для выживаемости пациентов для случаев MIBC показаны в большой степени, и PLND в настоящее время является неотъемлемой частью RC, рекомендованной на основе консенсуса в руководствах. Однако, его преимущество в способе хирургической монотерапии является умеренным, и лимфаденэктомию (LND) часто рассматривают больше как диагностическую/прогностическую (может предоставлять состояние узлов), чем терапевтическую (Skinner and Sagalowsky 2014). Действительно, регионарная LND является необходимой стадией в оценке стадий из-за ограничений чувствительности современных способов визуализации. Несмотря на совершенствование хирургической техники, визуализации, периоперационного управления течением заболевания и способов терапии, приблизительно у 50% пациентов развиваются метастазы, и они умирают от рака мочевого пузыря (Stein JP, Skinner DG 2006).The survival benefit of standard pelvic lymph node removal (PLND) for MIBC cases has been shown to a large extent, and PLND is now an integral part of the RC recommended by consensus in the guidelines. However, its advantage in a surgical monotherapy modality is modest, and lymphadenectomy (LND) is often considered more diagnostic/prognostic (may provide nodal status) than therapeutic (Skinner and Sagalowsky 2014). Indeed, regional LND is a necessary step in staging due to the sensitivity limitations of current imaging modalities. Despite advances in surgical technique, imaging, perioperative disease management, and therapies, approximately 50% of patients develop metastases and die from bladder cancer (Stein JP, Skinner DG 2006).
Таким образом, неоадъювантные/адъювантные химиотерапевтические средства или радиотерапию и PLND, или расширенную LND предусматривают (Skinner and Sagalowsky 2014) для улучшения выживаемости пациентов с высоким риском. Однако, из-за увеличения токсичности, риска возникновения сопутствующих заболеваний и стоимости, преимущества этих серьезных вмешательств необходимо тщательно взвешивать с учетом изменений качества жизни и потенциальных осложнений, включая кровотечение, повреждение нерва, лимфокистоз или тромбы в конечностях (Scarpato et al. 2015), и предназначать их только для случаев с наивысшим риском.Thus, neoadjuvant/adjuvant chemotherapeutic agents or radiotherapy and PLND or extended LND are contemplated (Skinner and Sagalowsky 2014) to improve the survival of high-risk patients. However, due to increased toxicity, risk of comorbidities, and cost, the benefits of these major interventions must be carefully weighed against changes in quality of life and potential complications, including bleeding, nerve injury, lymphocystosis, or thrombi in the extremities (Scarpato et al. 2015), and assign them only to cases with the highest risk.
Одной из проблем для этого вида злокачественных новообразований на поздних стадиях является ответ на вопрос: какое лечение предназначено для какого пациента?One of the challenges for this type of advanced cancer is answering the question: which treatment is for which patient?
[0005] После RCE с LND или без LND, спиральная КТ представляет собой предпочтительный способ визуализации для идентификации метастазирования в легких, лимфатических узлах и печени (ICUD-EAU Bladder cancer Edition 2012), и в руководствах EAU рекомендовано раз в 3-4 месяца сканирование брюшной полости, верхних мочевыводящих путей (UUT), таза и радиография или КТ грудной клетки (Sharma et al. 2009) в течение первого года, раз в 6 месяцев до третьего года, и после этого периода мониторирование посредством ежегодной визуализации по клиническим показаниям. Для RCE с кожным отведением мочи (UD) рекомендована также промывочная цитология мочеиспускательного канала каждые шесть - 12 месяцев (Sharma et al. 2009). Частота и способы последующего наблюдения после радикальной цистэктомии не строго согласуются между руководствами, однако, только немногим отличаются.[0005] After RCE with or without LND, helical CT is the preferred imaging modality for identifying lung, lymph node, and liver metastasis (ICUD-EAU Bladder cancer Edition 2012), and EAU guidelines recommend scanning every 3-4 months abdomen, upper urinary tract (UUT), pelvis, and radiography or chest CT (Sharma et al. 2009) during the first year, every 6 months until the third year, and after this period, monitoring through annual imaging as clinically indicated. For RCE with cutaneous diversion (UD), a urethral flush cytology every six to 12 months is also recommended (Sharma et al. 2009). The frequency and methods of follow-up after radical cystectomy are not strictly consistent between guidelines, however, they differ only slightly.
[0006] Отдаленный рецидив обычно возникает в пределах 24 месяцев, где боле высокая стадия и состояние лимфатических узлов являются наиболее важными факторами риска. Рецидив в тазе, как правило, возникает (у 5-15% пациентов) в пределах 6-18 месяцев после хирургической операции, снова в зависимости от исходной стадии и состояния лимфатических узлов. Вторичные опухоли мочеиспускательного канала являются редкими, возникающими через 1-3 года после цистэктомии, и имеют плохой показатель выживаемости. Рецидив в верхних мочевыводящих путях наблюдают редко, и обычно он проявляется поздно (через 28-49 месяцев после цистэктомии) (Witjes et al. 2014). Наконец, некоторые поздние рецидивы могут возникать через более чем 10 лет, тогда после RCE пациенты нуждаются также в очень длительном наблюдении.[0006] Distant recurrence usually occurs within 24 months, where higher stage and lymph node status are the most important risk factors. Recurrence in the pelvis usually occurs (in 5-15% of patients) within 6-18 months after surgery, again depending on the initial stage and the condition of the lymph nodes. Secondary urethral tumors are rare, occurring 1–3 years after cystectomy, and have a poor survival rate. Upper urinary tract recurrence is rare and usually occurs late (28–49 months after cystectomy) (Witjes et al. 2014). Finally, some late recurrences may occur after more than 10 years, in which case patients also require very long follow-up after RCE.
[0007] Из-за прогностической гетерогенности как NMIBC, так и MIBC, в руководствах по лечению рака мочевого пузыря подчеркнута важность и неудовлетворенная необходимость лучшего прогнозирования (руководства EAU). Для NMIBC доступны таблицы риска для улучшения лечебных решений и/или последующего наблюдения (Vedder et al. 2014). Однако, систему оценки Европейской организации по исследованию и лечению онкологических заболеваний (EORTC), рекомендованную в руководствах EAU и AUA, редко используют в повседневной практике.[0007] Due to the prognostic heterogeneity of both NMIBC and MIBC, guidelines for the treatment of bladder cancer emphasize the importance and unmet need for better prognosis (EAU guidelines). Risk tables are available for NMIBC to improve treatment decisions and/or follow-up (Vedder et al. 2014). However, the European Organization for Research and Treatment of Cancer (EORTC) scoring system recommended in the EAU and AUA guidelines is rarely used in daily practice.
В ряде недавних публикаций показано, что эти модели не являются очень надежными. Например, Vedder et al. опубликовали, что система оценки может целесообразно прогнозировать прогрессирование, но не рецидив (Vedder et al. 2014).A number of recent publications have shown that these models are not very reliable. For example, Vedder et al. published that the scoring system can reasonably predict progression but not recurrence (Vedder et al. 2014).
Завышенная оценка рецидива и прогрессирования по таблице EORTC также показана при NMIBC, также в подгруппе после лечения BCG (Fernandez-Gomez et al., 2011).An overestimation of recurrence and progression on the EORTC table is also shown in NMIBC, also in the subgroup after BCG treatment (Fernandez-Gomez et al., 2011).
Наконец, Xylinas et al. показали, что система оценки EORTC имеет плохую дискриминацию как для рецидива, так и для прогрессирования, и подчеркнули необходимость улучшения современных прогностических инструментов (Xylinas et al. 2013).Finally, Xylinas et al. showed that the EORTC scoring system has poor discrimination for both recurrence and progression, and highlighted the need to improve current prognostic tools (Xylinas et al. 2013).
До настоящего времени не существует таблицы или системы оценки для специфической оценки прогноза MIBC, таких, чтобы управлять выбором лечения. Присутствие метастазов в регионарном лимфатическом узле является наиболее сильным прогностическим фактором для рецидива опухоли и специфической для заболевания выживаемости (DSS) у пациентов для MIBC (Skinner and Sagalowsky 2014). Однако, приблизительно половина поверхностных опухолей может иметь микрометастазы, не детектируемые посредством инструментов визуализации, в то время как только 25% пациентов после радикального хирургического вмешательства имеют метастазы в лимфатических узлах (LN) на время хирургического вмешательства (Svatek et al. 2010, EAU Guidelines on Muscle-invasive and Metastatic Bladder Cancer 2014).To date, there is no table or scoring system for specifically assessing MIBC prognosis such as to guide treatment choice. The presence of regional lymph node metastases is the strongest predictor of tumor recurrence and disease-specific survival (DSS) in patients for MIBC (Skinner and Sagalowsky 2014). However, approximately half of superficial tumors may have micrometastases undetectable by imaging tools, while only 25% of radical surgery patients have lymph node (LN) metastases at the time of surgery (Svatek et al. 2010, EAU Guidelines on Muscle-invasive and Metastatic Bladder Cancer 2014).
Даже несмотря на то, что специфическая для заболевания выживаемость (DSS) лежит в диапазоне от 85% до 90% после радикальной цистэктомии из-за CIS, раннюю радикальную цистэктомию можно рассматривать как избыточное лечение приблизительно у 50% пациентов (Burger et al. 2013b).Even though disease-specific survival (DSS) ranges from 85% to 90% after radical cystectomy for CIS, early radical cystectomy can be considered overtreatment in approximately 50% of patients (Burger et al. 2013b) .
[0008] Рак мочевого пузыря представляет собой гетерогенную неоплазию, нуждающуюся в крупномасштабном алгоритме лечения (последовательное химическое или биологическое лечение, радиотерапия и хирургические вмешательства) и обширном длительном наблюдении. Опухоли со сходной гистологией могут иметь различное клиническое развитие, и эти нюансы являются критическими для правильного управления течением заболевания. Его комплексность приводит к прямой и опосредованной экономической нагрузке и делает его наиболее дорогостоящим злокачественным новообразованием применительно к стоимости медицинской помощи в течении жизни при пересчете на пациента (Brausi 2013, Chamie et al. 2011, Goodison et al. 2013, Mossanen and Gore 2014). В 2010 г. стоимость медицинской помощи при BCa составляла приблизительно 4 миллиарда $ в США (Mossanen and Gore 2014) и 3 миллиарда € в 2012 г. в Европейском союзе (EU), включая непосредственно стационарное лечение как основной компонент стоимости (насчитывающий 58%). Общая экономическая нагрузка составляла 5 миллиардов € в EU (Leal et al. 2015). В США оцененная стоимость управления течением заболевания в течение жизни индивидуума с BCa лежит в диапазоне от 96000 $ до 280000 $ (Hansel et al. 2013). Медицинские затраты, ассоциированные с диагнозом MIBC, составляют приблизительно $150000, однако, из-за длительного клинического течения заболевания на ранних стадиях, его преобладания относительно MIBC и его процедурно ориентированного наблюдения, экономическую нагрузку NMIBC, как правило, считают более повышенной (Svatek et al. 2014).[0008] Bladder cancer is a heterogeneous neoplasia requiring a large-scale treatment algorithm (sequential chemical or biological treatment, radiotherapy and surgical interventions) and extensive long-term follow-up. Tumors with similar histology may have different clinical developments, and these nuances are critical for proper disease management. Its complexity leads to a direct and indirect economic burden and makes it the most costly malignancy in terms of lifetime cost of care per patient (Brausi 2013, Chamie et al. 2011, Goodison et al. 2013, Mossanen and Gore 2014). In 2010, the cost of care for BCa was approximately $4 billion in the US (Mossanen and Gore 2014) and €3 billion in 2012 in the European Union (EU), including hospital care itself as the main cost component (counting 58%) . The total economic burden was €5 billion in the EU (Leal et al. 2015). In the US, the estimated lifetime cost of disease management for an individual with BCa ranges from $96,000 to $280,000 (Hansel et al. 2013). The medical costs associated with a diagnosis of MIBC are approximately $150,000, however, due to the long clinical course of the disease in the early stages, its prevalence relative to MIBC, and its procedurally oriented follow-up, the economic burden of NMIBC is generally considered to be greater (Svatek et al. 2014).
Недооценка стадии опухоли является основным ограничением современных диагностических и прогностических инструментов. Более того, до настоящего времени не существует надежных инструментов ни для прогнозирования прогрессирования NMIBC до MIBC, ни для прогнозирования исхода MIBC.Underestimation of tumor stage is a major limitation of current diagnostic and prognostic tools. Moreover, to date, there are no reliable tools for predicting the progression of NMIBC to MIBC, nor for predicting the outcome of MIBC.
[0009] Использование биомаркеров для прогнозирования или стратификации риска для пациентов с раком мочевого пузыря может помочь терапевту начать подходящее лечение и уменьшить затраты, ассоциированные с наблюдением пациента.[0009] The use of biomarkers to predict or stratify risk for patients with bladder cancer can help the physician initiate appropriate treatment and reduce the costs associated with patient follow-up.
Некоторые коммерчески определяемые маркеры мочи получили одобрение FDA для диагностики и/или последующего наблюдения рака мочевого пузыря, но не вошли в клиническую практику. В отличие от этого, в настоящее время никакие прогностические маркеры крови или мочи не одобрены национальными институтами здравоохранения или не рекомендованы в каких-либо руководствах. Это не согласуется со стратегией управления течением заболевания BCA на основании глобального риска.Some commercially determined urine markers have received FDA approval for the diagnosis and/or follow-up of bladder cancer but have not entered clinical practice. In contrast, no blood or urine predictive markers are currently endorsed by the National Institutes of Health or recommended in any guidelines. This is inconsistent with the BCA disease management strategy based on global risk.
[0010] В недавнем крупном мета-анализе (Schmitz-Drager et al. 2015), эффективность большинства коммерчески доступных маркеров (BTA Stat®, NMP22, включая BladderCheck® и FISH Urovysion™) сравнивали с VUC. Он подтверждает, что эти молекулярные маркеры имеют намного лучшую чувствительность, особенно для опухолей высокого риска (pT1G3, CIS), чем цитология мочи, несмотря на отсутствие продемонстрированного использования для прогнозирования. Однако, он также подтверждает, что более низкие специфичность и воспроизводимость таких маркеров являлись основным ограничением. Кроме того, эти маркеры не имели прогностической ценности.[0010] In a recent large meta-analysis (Schmitz-Drager et al. 2015), the efficacy of most commercially available markers (BTA Stat®, NMP22, including BladderCheck® and FISH Urovysion™) was compared with VUC. He confirms that these molecular markers have much better sensitivity, especially for high-risk tumors (pT1G3, CIS) than urine cytology, despite no demonstrated predictive use. However, he also confirms that the lower specificity and reproducibility of such markers was a major limitation. In addition, these markers had no predictive value.
[0011] Хромогранин A (CgA) представляет собой гликопротеин, обычно экспрессированный на нейроэндокринных (NE) клетках. CgA является составляющим секреторных гранул большинства продуцирующих пептид эндокринных клеток (Chuang и Liao 2003). Он физиологически высвобождается посредством экзоцитоза и может быть детектирован в крови. Когда опухоль развивается в нейроэндокринной ткани, она становится основным источником циркулирующего CgA. Секреция CgA в мочевом пузыре ассоциирована с редкими случаями нейроэндокринных дифференцированных опухолей, которые, как известно, имеют плохой прогноз (Alijo Serrano et al. 2007, Bertaccini et al. 2008). Маркеры нейроэндокринной ткани, например, CgA, часто используют для различения нейроэндокринной карциномы (NEC) и переходноклеточной карциномы (TCC), и используют для подтверждения диагноза NEC и как правило, для мелкоклеточного рака мочевого пузыря (SCBC) (Bertaccini et al. 2008, Cerulli et al. 2012, Iczkowski et al. 1999) или параганглиом (Bagchi et al. 2015, Feng et al. 2013).[0011] Chromogranin A (CgA) is a glycoprotein commonly expressed on neuroendocrine (NE) cells. CgA is a constituent of the secretory granules of most peptide-producing endocrine cells (Chuang and Liao 2003). It is physiologically released by exocytosis and can be detected in the blood. When a tumor develops in neuroendocrine tissue, it becomes the main source of circulating CgA. CgA secretion in the bladder is associated with rare cases of differentiated neuroendocrine tumors, which are known to have a poor prognosis (Alijo Serrano et al. 2007, Bertaccini et al. 2008). Neuroendocrine tissue markers, such as CgA, are often used to distinguish between neuroendocrine carcinoma (NEC) and transitional cell carcinoma (TCC), and are used to confirm the diagnosis of NEC and typically for small cell bladder cancer (SCBC) (Bertaccini et al. 2008, Cerulli et al. 2012, Iczkowski et al. 1999) or paraganglioma (Bagchi et al. 2015, Feng et al. 2013).
Однако показано, что CgA экспрессируется в ткани нейроэндокринной злокачественной опухоли мочевого пузыря (NEBC), но до настоящего времени, ни в одном исследовании не оценивали прогностический эффект уровней CgA в ткани и сыворотке ни для нейроэндокринных, ни для уротелиальных BCA.However, CgA has been shown to be expressed in neuroendocrine bladder cancer (NEBC) tissue, but to date, no study has evaluated the predictive effect of tissue and serum CgA levels for either neuroendocrine or urothelial BCAs.
Более того, присутствие как мелких клеток, так и переходных клеток, также не прогнозировало исходы (Chuang and Liao 2003).Moreover, the presence of both small cells and transitional cells also did not predict outcomes (Chuang and Liao 2003).
Chuang et al. показали, что CgA был экспрессирован в 4 из 10 образцов ткани SCBC, но не обнаружили ассоциаций с прогнозом для пациентов. Однако, из-за небольшого количества случаев и гетерогенной когорты, это исследование имеет ограниченную надежность (Chuang and Liao 2003).Chuang et al. showed that CgA was expressed in 4 out of 10 SCBC tissue samples but found no association with patient prognosis. However, due to the small number of cases and the heterogeneous cohort, this study has limited reliability (Chuang and Liao 2003).
Для CgA не показали какой-либо связи с выживаемостью при крупноклеточной и мелкоклеточной нейроэндокринной карциноме мочевого пузыря. В одном исследовании, единственным прогностическим фактором для выживаемости оставалась классификация TNM (Alijo-Serrano, 2007). Авторы не рассматривали CgA в качестве полезного для прогностических целей. Кроме того, Soukup et al. недавно обнаружили, что CgA в моче не был связан ни с присутствием первичного NMIBC, ни с рецидивом злокачественной опухоли (Soukup et al. 2015). Тем не менее, Bertaccini et al. обнаружили, что через 1 месяц после цистопростатэктомии из-за мелкоклеточной уротелиальной карциномы (SCUC), уровень CgA в сыворотке уменьшался в 10 раз по сравнению с уровнем до операции, но не оценивали ни предоперационный прогноз, ни значение при последующем наблюдении (Bertaccini et al. 2008).CgA has not been shown to be associated with survival in large and small cell neuroendocrine carcinoma of the bladder. In one study, TNM classification remained the only predictor of survival (Alijo-Serrano, 2007). The authors did not consider CgA to be useful for prognostic purposes. In addition, Soukup et al. recently found that urinary CgA was not associated with either the presence of primary NMIBC or cancer recurrence (Soukup et al. 2015). However, Bertaccini et al. found that 1 month after cystoprostatectomy for small cell urothelial carcinoma (SCUC), serum CgA levels decreased 10-fold compared to preoperative levels, but neither preoperative prognosis nor follow-up value was assessed (Bertaccini et al. 2008).
[0012] Матриксная металлопротеиназа-7 (MMP7) описана в качестве независимого маркера в сыворотке и моче для метастазов в лимфатических узлах (Gunes et al. 2013, Jager et al. 2013, Szarvas et al. 2010, Szarvas et al. 2011b), а также в качестве независимого прогностического маркера для BCa перед хирургической операцией (Svatek et al. 2010, Szarvas et al. 2010, Szarvas et al. 2011a). Высокие уровни MMP-7 также описаны в качестве независимого фактора риска плохой выживаемости при специфических видах метастазирующего рака мочевого пузыря (El Demery et al. 2014). См. также WO 2007/144144 A1.[0012] Matrix metalloproteinase-7 (MMP7) has been described as an independent marker in serum and urine for lymph node metastases (Gunes et al. 2013, Jager et al. 2013, Szarvas et al. 2010, Szarvas et al. 2011b), and as an independent predictive marker for BCa before surgery (Svatek et al. 2010, Szarvas et al. 2010, Szarvas et al. 2011a). High levels of MMP-7 have also been described as an independent risk factor for poor survival in specific types of metastatic bladder cancer (El Demery et al. 2014). See also WO 2007/144144 A1.
[0013] Настоящее изобретение основано на неожиданном обнаружении того, что хромогранин A имеет высокую прогностическую ценность при не нейроэндокринном раке мочевого пузыря. Таким образом, он может помочь преодолеть вышеуказанные недостатки диагностических инструментов предшествующей области техники для рака мочевого пузыря.[0013] The present invention is based on the unexpected finding that chromogranin A has a high prognostic value in non-neuroendocrine bladder cancer. Thus, it can help overcome the above disadvantages of prior art diagnostic tools for bladder cancer.
Сущность изобретенияThe essence of the invention
[0014] Настоящее изобретение относится к применению хромогранина A (CgA) в качестве маркера (в частности, прогностического маркера) для рака мочевого пузыря, в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря, и предпочтительно, уротелиальной карциномы. В частности, CgA можно использовать в качестве маркера в анализе in vitro для прогнозирования, оценки риска, стратификации риска, мониторирования и/или контроля терапии рака мочевого пузыря, в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря и предпочтительно, уротелиальной карциномы.[0014] The present invention relates to the use of chromogranin A (CgA) as a marker (particularly a prognostic marker) for bladder cancer, in particular non-neuroendocrine bladder cancer, and preferably urothelial carcinoma. In particular, CgA can be used as a marker in an in vitro assay to predict, assess risk, risk stratify, monitor and/or control therapy for bladder cancer, in particular non-neuroendocrine bladder cancer and preferably urothelial carcinoma.
[0015] Изобретение, кроме того, относится к способу прогнозирования, оценки риска, стратификации риска, мониторирования и/или контроля терапии рака мочевого пузыря, в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря и предпочтительно, уротелиальной карциномы, у субъекта, включающему определение уровня CgA и необязательно, MMP7 в образце физиологической жидкости указанного субъекта. Настоящее изобретение, кроме того, относится к применению диагностических наборов, содержащих одно или несколько антител, специфических для CgA, для прогнозирования, оценки риска, стратификации риска, мониторирования и/или контроля терапии рака мочевого пузыря, в частности не нейроэндокринного рака мочевого пузыря и предпочтительно, уротелиальной карциномы, у субъекта. Изобретение относится также к способам лечения рака мочевого пузыря, в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря и предпочтительно, уротелиальной карциномы, у субъекта, в которых определяют уровень CgA в образце от указанного субъекта.[0015] The invention further relates to a method for predicting, assessing risk, risk stratifying, monitoring and/or controlling therapy for bladder cancer, in particular non-neuroendocrine bladder cancer and preferably urothelial carcinoma, in a subject, including determining the level of CgA and optionally, MMP7 in a bodily fluid sample of said subject. The present invention further relates to the use of diagnostic kits containing one or more CgA-specific antibodies for predicting, risk assessment, risk stratification, monitoring and/or therapy control of bladder cancer, in particular non-neuroendocrine bladder cancer, and preferably , urothelial carcinoma, in a subject. The invention also relates to methods for treating bladder cancer, in particular non-neuroendocrine bladder cancer and preferably urothelial carcinoma, in a subject, in which the level of CgA in a sample from said subject is determined.
Описание чертежейDescription of drawings
Фигура 1: Концентрация CgA в сыворотке для контроля и случаевFigure 1: Serum CgA concentration for controls and cases
Фигура 2: Прогностическая ценность уровней CgA и MMP-7, и их комбинации у пациентов, подвергнутых хирургическому лечению (TURBT или RCE) (кривые Каплана-Мейера с логарифмическими ранговыми критериями). DSS: специфическая для заболевания выживаемость.Figure 2: Predictive value of CgA and MMP-7 levels and their combination in patients undergoing surgical treatment (TURBT or RCE) (Kaplan-Meier curves with log-rank tests). DSS: disease-specific survival.
Фигура 3: Прогностическая ценность уровней CgA и MMP7, и их комбинаций в подгруппе пациентов, подвергнутых лечению RCE (кривые Каплана-Мейера с логарифмическими ранговыми критериями)Figure 3: Predictive value of CgA and MMP7 levels and their combinations in a subgroup of patients treated with RCE (Kaplan-Meier curves with log-rank tests)
Подробное описание изобретенияDetailed description of the invention
[0016] Настоящее изобретение относится к применению хромогранина A (CgA) в качестве маркера для рака мочевого пузыря (в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря и предпочтительно, уротелиальной карциномы), в частности в качестве прогностического маркера для рака мочевого пузыря, в частности, для не нейроэндокринного рака мочевого пузыря, предпочтительно, уротелиальной карциномы. Таким образом, CgA можно использовать в качестве маркера в анализе in vitro для прогнозирования, оценки риска, стратификации риска, мониторирования и/или контроля терапии рака мочевого пузыря, в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря, предпочтительно, уротелиальной карциномы. Иными словами, CgA оказался хорошим биомаркером для оценки тяжести заболевания у пациентов с раком мочевого пузыря, в частности, у пациентов с не нейроэндокринным раком мочевого пузыря, предпочтительно, у пациентов с уротелиальной карциномой. CgA можно, таким образом, также использовать в управлении течением заболевания пациентов («ведении пациентов») с раком мочевого пузыря, в частности, не нейроэндокринным раком мочевого пузыря и предпочтительно, уротелиальной карциномой.[0016] The present invention relates to the use of chromogranin A (CgA) as a marker for bladder cancer (in particular, non-neuroendocrine bladder cancer and preferably urothelial carcinoma), in particular as a prognostic marker for bladder cancer, in particular, for non-neuroendocrine bladder cancer, preferably urothelial carcinoma. Thus, CgA can be used as a marker in an in vitro assay to predict, assess risk, risk stratify, monitor and/or control therapy for bladder cancer, in particular non-neuroendocrine bladder cancer, preferably urothelial carcinoma. In other words, CgA proved to be a good biomarker for assessing disease severity in patients with bladder cancer, in particular in patients with non-neuroendocrine bladder cancer, preferably in patients with urothelial carcinoma. CgA can thus also be used in the management of the disease of patients ("patient management") with bladder cancer, in particular non-neuroendocrine bladder cancer and preferably urothelial carcinoma.
[0017] Настоящее изобретение относится к способам прогнозирования для субъектов с раком мочевого пузыря (в частности, субъектов с не нейроэндокринным раком мочевого пузыря, предпочтительно, субъектов с уротелиальной карциномой), включающим стадию определения уровня CgA (и необязательно, MMP7) в образце физиологической жидкости указанного субъекта. Изобретение, в частности, относится к способу прогнозирования, оценки риска, стратификации риска, мониторирования и/или контроля терапии рака мочевого пузыря (в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря, предпочтительно, уротелиальной карциномы) у субъекта, включающему стадию определения уровня CgA в образце физиологической жидкости указанного субъекта. Необязательно, уровень MMP7, кроме того, определяют в том же или другом образце от указанного субъекта. Уровень CgA (и необязательно, MMP7, в зависимости от ситуации) в образце от субъекта в одном аспекте является показателем тяжести и агрессивности рака мочевого пузыря (в частности не нейроэндокринного рака мочевого пузыря, предпочтительно, уротелиальной карциномы) и/или исхода для субъекта. Увеличенный уровень CgA (и необязательно, MMP7, в зависимости от ситуации) в образце от субъекта, по сравнению с контрольным уровнем или предопределенным порогом, является показателем плохого исхода для субъекта. Например, уровень CgA в образце от субъекта является показателем для общей выживаемости субъекта или специфической для заболевания выживаемости субъекта, или выживаемости субъекта без прогрессирования.[0017] The present invention relates to predictive methods for subjects with bladder cancer (in particular, subjects with non-neuroendocrine bladder cancer, preferably subjects with urothelial carcinoma), including the step of determining the level of CgA (and optionally, MMP7) in a sample of physiological fluid specified subject. The invention particularly relates to a method for predicting, risk assessment, risk stratification, monitoring and/or control of therapy for bladder cancer (in particular, non-neuroendocrine bladder cancer, preferably urothelial carcinoma) in a subject, comprising the step of determining the level of CgA in the sample bodily fluid of said subject. Optionally, the level of MMP7 is further determined in the same or a different sample from the specified subject. The level of CgA (and optionally MMP7, as the case may be) in a sample from a subject is, in one aspect, indicative of the severity and aggressiveness of the bladder cancer (particularly non-neuroendocrine bladder cancer, preferably urothelial carcinoma) and/or outcome for the subject. An increased level of CgA (and optionally MMP7, as the case may be) in a sample from a subject, compared to a control level or a predetermined threshold, is indicative of a poor outcome for the subject. For example, the level of CgA in a sample from a subject is indicative of the subject's overall survival, or disease-specific survival of the subject, or progression-free survival of the subject.
[0018] В некоторых вариантах осуществления сначала определяют уровень CgA в образце от субъекта и затем проводят дополнительные тесты, если уровень CgA выше предопределенного порога в другом образце от того же субъекта, например, затем определяют уровень MMP7, чтобы уточнить или подтвердить первоначальный прогноз, основанный на уровне CgA. В других, более предпочтительных, вариантах осуществления сначала определяют уровень MMP7 в образце от субъекта и затем проводят дополнительные тесты, если уровень MMP7 выше предопределенного порога в другом образце от того же субъекта, например, затем определяют уровень CgA, чтобы уточнить или подтвердить первоначальный прогноз, основанный на уровне MMP7. Таким образом, уровни MMP7 и CgA можно использовать вместе, чтобы уточнить первоначальный прогноз, основанный только на одном из этих двух маркеров.[0018] In some embodiments, first determine the level of CgA in a sample from the subject and then perform additional tests if the level of CgA is above a predetermined threshold in another sample from the same subject, for example, then determine the level of MMP7 to refine or confirm the initial prediction based on at the CGA level. In other more preferred embodiments, first determine the level of MMP7 in a sample from the subject and then perform additional tests if the level of MMP7 is above a predetermined threshold in another sample from the same subject, for example, then determine the level of CgA to refine or confirm the initial prediction, based on MMP7 level. Thus, MMP7 and CgA levels can be used together to refine an initial prediction based on only one of these two markers.
[0019] Термин «рак пузыря» (также обозначаемый как «рак мочевого пузыря») в контексте настоящего изобретения предпочтительно относится к раку мочевого пузыря не нейроэндокринного происхождения. Таким образом, предпочтительно, «рак мочевого пузыря» не является нейроэндокринной опухолью (NET). Термин «нейроэндокринный» относится к нервному или эндокринному влиянию, и в частности, к взаимодействию между нервной и эндокринной системой. В частности, термин «нейроэндокринный» относится к клеткам, высвобождающим гормон в кровь в ответ на нервный стимул. «Нейроэндокринные злокачественные опухоли», следовательно, представляют собой злокачественные неоплазии, возникающие из клеток эндокринной (гормональной) и нервной систем. Нейроэндокринный рак мочевого пузыря включает, например, мелкоклеточную карциному (SCC), карциноидную опухоль и крупноклеточную нейроэндокринную карциному (LCNEC).[0019] The term "bladder cancer" (also referred to as "bladder cancer") in the context of the present invention preferably refers to bladder cancer of non-neuroendocrine origin. Thus, preferably, "bladder cancer" is not a neuroendocrine tumor (NET). The term "neuroendocrine" refers to neural or endocrine influences, and in particular to the interaction between the nervous and endocrine systems. In particular, the term "neuroendocrine" refers to cells that release a hormone into the blood in response to a nerve stimulus. "Neuroendocrine malignancies", therefore, are malignant neoplasias arising from cells of the endocrine (hormonal) and nervous systems. Neuroendocrine cancer of the bladder includes, for example, small cell carcinoma (SCC), carcinoid tumor, and large cell neuroendocrine carcinoma (LCNEC).
Таким образом, «рак мочевого пузыря» в настоящем описании предпочтительно относится к раку мочевого пузыря, не возникающему из клеток эндокринной (гормональной) и нервной систем. Таким образом, предпочтительно в настоящем описании, рак мочевого пузыря не представляет собой мелкоклеточную карциному, не представляет собой карциноидную опухоль и не представляет собой крупноклеточную нейроэндокринную карциному. Рак мочевого пузыря в контексте настоящего изобретения предпочтительно выбран из группы, состоящей из переходноклеточной карциномы (TCC) (т.е. уротелиальной карциномы (UC) мочевого пузыря, также известной как карцинома из уротелиальных клеток (UCC)), плоскоклеточной карциномы и аденокарциномы, более предпочтительно, рак мочевого пузыря в контексте настоящего изобретения представляет собой переходноклеточную карциному. Термин «уротелиальная» конкретно относится к карциноме уротелия, обозначая TCC мочевыделительной системы. Таким образом, уротелиальная карцинома в контексте настоящего изобретения означает уротелиальную карциному мочевого пузыря. Переходноклеточная карцинома (= уротелиальная карцинома) может представлять собой поверхностный рак мочевого пузыря (т.е. не мышечно-инвазивный рак мочевого пузыря (NMIBC)) или мышечно-инвазивный рак мочевого пузыря (MIBC). NMIBC может, например, представлять собой папиллярную карциному или плоскую карциному (например, карциному in situ (CIS)). Как правило, уротелиальную карциному мочевого пузыря можно, например, также классифицировать как микропапиллярную, гнездовую, плазмоцитоидную, саркоматоидную или другие варианты, или она может иметь смешанную гистологию. Микропапиллярный или гнездовой варианты уротелиальной карциномы являются особенно агрессивными.Thus, "bladder cancer" as used herein preferably refers to bladder cancer not arising from cells of the endocrine (hormonal) and nervous systems. Thus, preferably in the present description, the bladder cancer is not a small cell carcinoma, is not a carcinoid tumor, and is not a large cell neuroendocrine carcinoma. Bladder cancer in the context of the present invention is preferably selected from the group consisting of transitional cell carcinoma (TCC) (i.e. urothelial carcinoma (UC) of the bladder, also known as urothelial cell carcinoma (UCC)), squamous cell carcinoma and adenocarcinoma, more preferably, bladder cancer in the context of the present invention is a transitional cell carcinoma. The term "urothelial" specifically refers to urothelial carcinoma, denoting TCC of the urinary system. Thus, urothelial carcinoma in the context of the present invention means bladder urothelial carcinoma. Transitional cell carcinoma (=urothelial carcinoma) can be superficial bladder cancer (ie non-muscle invasive bladder cancer (NMIBC)) or muscle invasive bladder cancer (MIBC). The NMIBC may, for example, be papillary carcinoma or squamous carcinoma (eg, carcinoma in situ (CIS)). Generally, bladder urothelial carcinoma can, for example, also be classified as micropapillary, nested, plasmacytoid, sarcomatoid, or other variants, or it can have a mixed histology. Micropapillary or nested variants of urothelial carcinoma are particularly aggressive.
Эти виды рака мочевого пузыря можно, например, классифицировать в соответствии с таблицей TNM от UICC/AJCC (Международного союза по борьбе с онкологическими заболеваниями/Американского объединенного онкологического комитета) и оценивать по степени злокачественности в соответствии с классификациями WHO 1973-2004.These bladder cancers can, for example, be classified according to the UICC/AJCC (International Union Against Cancer/American Joint Committee on Cancer) TNM chart and graded according to grade according to the WHO 1973-2004 classifications.
[0020] Субъект в контексте настоящего изобретения страдает не нейроэндокринным раком мочевого пузыря и/или имеет диагноз не нейроэндокринный рак мочевого пузыря до указанного определения уровня CgA. Предпочтительно, в настоящем описании, субъект не имеет нейроэндокринный рак мочевого пузыря (т.е. не страдает нейроэндокринным раком мочевого пузыря). Таким образом, предпочтительно, у субъекта не диагностирован нейроэндокринный рак мочевого пузыря.[0020] A subject in the context of the present invention suffers from non-neuroendocrine bladder cancer and/or is diagnosed with non-neuroendocrine bladder cancer prior to said CgA level determination. Preferably, in the present description, the subject does not have neuroendocrine bladder cancer (ie does not suffer from neuroendocrine bladder cancer). Thus, preferably, the subject is not diagnosed with neuroendocrine bladder cancer.
[0021] Термин «субъект» в настоящем описании относится к живому человеку или не относящемуся к человеку животному, предпочтительно, млекопитающему, наиболее предпочтительно, человеку. Субъект предпочтительно представляет собой пациента. Термин «пациент», как применяют в настоящем документе, относится к живому человеку или не относящемуся к человеку животному (наиболее предпочтительно, человеку), который получает медицинскую помощь или который должен получать медицинскую помощь из-за заболевания, в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря. Это включает индивидуумов без установленного заболевания, у которых исследуют признаки патологии. Таким образом, способы и анализы, описанные в настоящем документе применимы как к заболеванию человека, так и к ветеринарному заболеванию.[0021] The term "subject" as used herein refers to a living human or non-human animal, preferably a mammal, most preferably a human. The subject is preferably a patient. The term "patient" as used herein refers to a living human or non-human animal (most preferably a human) who is receiving medical care or who is about to receive medical care due to a disease, in particular non-neuroendocrine cancer of the urinary tract. bubble. This includes individuals without established disease who are examined for signs of pathology. Thus, the methods and assays described herein are applicable to both human disease and veterinary disease.
[0022] Термин «уровень» в контексте настоящего изобретения относится к концентрации (предпочтительно, выраженной как масса/объем; масс./об.; например, как «нг/мл») маркера (например, CgA и/или MMP7), полученной из образца от субъекта, например, пациента с раком мочевого пузыря.[0022] The term "level" in the context of the present invention refers to the concentration (preferably expressed as mass/volume; wt./vol.; for example, as "ng/ml") of the marker (for example, CgA and/or MMP7) obtained from a sample from a subject, such as a patient with bladder cancer.
[0023] «Диагноз» в контексте настоящего изобретения относится к распознаванию и (ранней) детекции заболевания или клинического состояния у субъекта и может также включать дифференциальную диагностику. Также оценку тяжести заболевания или клинического или гистопатологического состояния можно в конкретных вариантах осуществления включать в термин «диагностика».[0023] "Diagnosis" in the context of the present invention refers to the recognition and (early) detection of a disease or clinical condition in a subject and may also include differential diagnosis. Also, an assessment of the severity of a disease or clinical or histopathological condition may, in specific embodiments, be included in the term "diagnosis".
«Прогноз» относится к прогнозированию исхода или специфического риска для субъекта, страдающего конкретным заболеванием или клиническим состоянием, в настоящем описании, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря. Это может включать оценку шанса восстановления или шанса неблагоприятного исхода для указанного субъекта."Prognosis" refers to predicting the outcome or specific risk for a subject suffering from a particular disease or clinical condition, as used herein, not neuroendocrine bladder cancer. This may include an assessment of the chance of recovery or the chance of a poor outcome for said subject.
[0024] «Мониторирование» или «мониторирование терапии» относится к отслеживанию уже диагностированного заболевания, нарушения, осложнения или риска, например, для анализа прогрессирования заболевания (в настоящем описании: не нейроэндокринного рака мочевого пузыря) или влияния конкретного лечения на прогрессирование заболевания или нарушения. По настоящему изобретению, термин «стратификация риска» относится к группировке субъектов в различные группы риска в соответствии с их прогнозами на будущее. Стратификация риска также относится к стратификации для принятия профилактичеких и/или терапевтических мер.[0024] "Monitoring" or "monitoring therapy" refers to tracking an already diagnosed disease, disorder, complication or risk, for example, to analyze the progression of a disease (in the present description: not neuroendocrine bladder cancer) or the effect of a particular treatment on the progression of a disease or disorder . According to the present invention, the term "risk stratification" refers to the grouping of subjects into different risk groups according to their predictions for the future. Risk stratification also refers to stratification for taking preventive and/or therapeutic measures.
[0025] Термин «управление течения заболеванием пациента» в контексте настоящего изобретения относится к:[0025] The term "managing the course of a patient's disease" in the context of the present invention refers to:
• решению о поступлении в больницу или отделение интенсивной терапии,• the decision to enter a hospital or intensive care unit,
• решению о перемещении пациента в специализированную больницу или в специализированное отделение больницы,• the decision to transfer the patient to a specialized hospital or to a specialized department of a hospital,
• оценке для ранней выписки из отделения интенсивной терапии или больницы,• assessment for early discharge from the intensive care unit or hospital,
• распределению ресурсов (например, штата врачей и/или медицинских сестер, диагностических, терапевтических, хирургических средств).• allocation of resources (eg staff of physicians and/or nurses, diagnostic, therapeutic, surgical facilities).
[0026] Термин «оценка тяжести заболевания» относится к оценке статуса заболевания у пациента, включающей гистопатологию опухоли, статус метастазирования и прогрессирование заболевания, вероятность неблагоприятных событий (включая смерть), вероятность высоких затрат на госпитализированного пациента и вероятность длительной госпитализации.[0026] The term "assessing the severity of the disease" refers to assessing the disease status of a patient, including tumor histopathology, metastatic status and disease progression, the likelihood of adverse events (including death), the likelihood of high costs per hospitalized patient, and the likelihood of prolonged hospitalization.
[0027] Термин «исход» в контексте настоящего изобретения относится к степени тяжести заболевания, например, к состоянию здоровья пациента через определенное время, например, через 3 суток, 5 суток, 10 суток, 14 суток, 20 суток, 3 недели, 4 недели, 30 суток, 45 суток, 60 суток, 90 суток, 3 месяца, 6 месяцев, 1 год, 2 года или 5 лет. Исход можно выражать как показатель (процент) в популяции (например, в исследуемой группе или в группе лечения) или как показатель для индивидуума (т.е. вероятность для конкретного субъекта или пациента). Таким образом, «общий исход» можно выражать как «показатель общей выживаемости», который представляет собой процент людей в группе (например, в исследуемой группе или в группе лечения), которые все еще живы в течение конкретного периода времени, после того, как у них диагностировано заболевание, или их начали подвергать лечению заболевания, такого как, в настоящем случае, не нейроэндокринный рак мочевого пузыря. Показатель общей выживаемости часто указывают как показатель пятилетней выживаемости, который представляет собой процент людей в исследуемой группе или в группе лечения, которые живы через пять лет после того, как им поставили диагноз, или их начали подвергать лечению заболевания. Таким образом, «общий исход» или «общая выживаемость» для конкретного субъекта или пациента представляет собой вероятность выжить в течение конкретного периода времени, т.е. он относится к ожидаемой продолжительности жизни указанного субъекта или пациента.[0027] The term "outcome" in the context of the present invention refers to the severity of the disease, for example, the state of health of the patient after a certain time, for example, after 3 days, 5 days, 10 days, 14 days, 20 days, 3 weeks, 4 weeks , 30 days, 45 days, 60 days, 90 days, 3 months, 6 months, 1 year, 2 years or 5 years. Outcome can be expressed as a rate (percentage) in a population (eg, study or treatment group) or as a rate for an individual (ie, probability for a particular subject or patient). Thus, "overall outcome" can be expressed as "overall survival", which is the percentage of people in a group (for example, in the study group or in the treatment group) who are still alive for a specific period of time, after having they are diagnosed with a disease, or they are being treated for a disease, such as, in the present case, non-neuroendocrine bladder cancer. Overall survival is often quoted as a five-year survival rate, which is the percentage of people in a study or treatment group who are alive five years after they are diagnosed or have been treated for a disease. Thus, "overall outcome" or "overall survival" for a particular subject or patient is the probability of surviving over a particular period of time, i.e. it refers to the life expectancy of said subject or patient.
«Специфическую для заболевания выживаемость» можно выражать как «показатель специфической для заболевания выживаемости», который представляет собой процент людей в популяции (например, в исследуемой группе или в группе лечения), которые не умерли от специфического заболевания в определенный период времени. Период времени обычно начинается на время диагностики или начала лечения и заканчивается на время смерти. Пациентов, которые умерли от причин, отличных от исследуемого заболевания (в настоящем описании: не нейроэндокринного рака мочевого пузыря) не учитывают в этом измерении. Таким образом, «специфические для заболевания» выживаемость или исход для индивидуального субъекта или пациента означает вероятность не умереть от не нейроэндокринного рака мочевого пузыря в определенный период времени."Disease-specific survival" can be expressed as a "disease-specific survival rate", which is the percentage of people in a population (eg, study or treatment group) who do not die from a specific disease in a given time period. The time period usually begins at the time of diagnosis or treatment and ends at the time of death. Patients who died from causes other than the disease under investigation (in the present description: non-neuroendocrine bladder cancer) are not included in this measurement. Thus, "disease-specific" survival or outcome for an individual subject or patient means the probability of not dying from non-neuroendocrine bladder cancer in a given time period.
«Выживаемость без прогрессирования» представляет собой продолжительность периода времени во время и после лечения заболевания, такого как не нейроэндокринный рак мочевого пузыря, который субъект или пациент проживает с заболеванием, но оно не становится хуже. «Прогрессирование» может, например, представлять собой появление новой опухоли (в первичном или отдаленном участке) («рецидив») или увеличение размера, гистологической стадии, степени злокачественности или симптома, в частности, после данного излечивающего или паллиативного лечения. Прогрессирование можно, например, детектировать радиографически или биохимически. Например, в случае NMIBC, прогрессирование может относится к прогрессированию от стадии Ta до T1, до T2, до T3, до T4; или от стадии G1/2 до G3, или от стадии LN0 до LN+, или от стадии M0 до M+. Для не метастазирующего MIBC, прогрессирование может относится к послеоперационному рецидиву, прогрессированию от стадии LN0 to LN+ или от стадии M0 to M+. Специфическую для заболевания смерть также можно рассматривать как прогрессирование. При метастазирующем MIBC, прогрессирование можно, например, детектировать радиографически, например, в соответствии с критериями RECIST."Progression-free survival" is the length of time during and after treatment for a disease, such as non-neuroendocrine bladder cancer, that a subject or patient lives with the disease without getting worse. "Progression" may, for example, be the appearance of a new tumor (at a primary or distant site) ("relapse") or an increase in size, histological stage, grade, or symptom, particularly after a given curative or palliative treatment. Progression can, for example, be detected radiographically or biochemically. For example, in the case of NMIBC, progression may refer to progression from stage Ta to T1, to T2, to T3, to T4; or from stage G1/2 to G3, or from stage LN0 to LN+, or from stage M0 to M+. For non-metastatic MIBC, progression may refer to postoperative recurrence, progression from LN0 to LN+, or from M0 to M+. Disease-specific death can also be considered as progression. In metastatic MIBC, progression can, for example, be detected radiographically, for example according to the RECIST criteria.
В некоторых аспектах, плохой исход представляет собой, например, увеличенный риск уменьшения ожидаемой продолжительности жизни, увеличенный риск прогрессирования, увеличенный риск связанной со злокачественной опухолью смерти и/или увеличенный риск рецидива после хирургического лечения и/или лечения с использованием лекарственного средства, и/или радиотерапии.In some aspects, poor outcome is, for example, increased risk of reduced life expectancy, increased risk of progression, increased risk of cancer-related death, and/or increased risk of recurrence after surgery and/or drug treatment, and/or radiotherapy.
[0028] Способы и применения по настоящему изобретению можно использовать в различных ситуациях и на различных стадиях заболевания, например, перед вмешательством или после вмешательства. Термины «перед вмешательством», «проведенный перед вмешательством» и «до вмешательства» в настоящем описании относятся к времени до того, как начали вмешательство для лечения не нейроэндокринного рака мочевого пузыря. Под «вмешательством» понимают любое медицинское вмешательство, используемое для модификации исхода для состояния здоровья. Это определение включает введение лекарственного средства, хирургические процедуры, применение устройств, виды лечения для коррекции поведения, изменение ухода и т.п. Предпочтительно, образец отбирают после поступления пациента в больницу или перед подтверждением диагноза не нейроэндокринного рака мочевого пузыря.[0028] The methods and uses of the present invention can be used in various situations and at various stages of the disease, for example, before intervention or after intervention. The terms "pre-intervention", "performed before the intervention" and "before the intervention" in the present description refer to the time before the start of the intervention for the treatment of non-neuroendocrine bladder cancer. An “intervention” is any medical intervention used to modify a health outcome. This definition includes drug administration, surgical procedures, device use, behavior modification treatments, care modification, and the like. Preferably, the sample is taken after the patient is admitted to the hospital or before the diagnosis of non-neuroendocrine bladder cancer is confirmed.
Например, в одном аспекте у субъекта диагностирован не нейроэндокринный рак мочевого пузыря, и его (до настоящего времени) не подвергали хирургическому лечению указанного не нейроэндокринного рака мочевого пузыря. В таком случае, способы по изобретению можно использовать для прогнозирования исхода или для выбора подходящего лечения (например, вида хирургического вмешательства).For example, in one aspect, the subject is diagnosed with non-neuroendocrine bladder cancer and has not (to date) been subjected to surgical treatment for said non-neuroendocrine bladder cancer. In such a case, the methods of the invention can be used to predict outcome or to select an appropriate treatment (eg, type of surgery).
Термины «после вмешательства», «проведенный после вмешательства» и «за вмешательством» относятся к времени после того, как начали вмешательство или лечение.The terms "post-intervention", "post-intervention" and "post-intervention" refer to the time after the intervention or treatment was started.
Например, в одном аспекте, субъекта уже подвергали хирургическому лечению указанного не нейроэндокринного рака мочевого пузыря, например, радикальной цистэктомии указанного не нейроэндокринного рака мочевого пузыря. В таком случае, способы по изобретению можно использовать для прогнозирования исхода и/или для выбора подходящего последующего лечения, и/или для мониторирования субъекта (например, по прогрессированию заболевания). Таким образом, уровень CgA (и любого другого дополнительного маркера, включая MMP7, в зависимости от ситуации) можно использовать для послеоперационного контроля. Термин «послеоперационный контроль» в контексте настоящего изобретения относится к мониторированию указанного субъекта после хирургической процедуры у указанного субъекта.For example, in one aspect, the subject has already undergone surgical treatment of said non-neuroendocrine bladder cancer, such as radical cystectomy of said non-neuroendocrine bladder cancer. In such a case, the methods of the invention can be used to predict outcome and/or to select an appropriate follow-up treatment, and/or to monitor the subject (eg, disease progression). Thus, the level of CgA (and any other additional marker, including MMP7, depending on the situation) can be used for postoperative control. The term "postoperative control" in the context of the present invention refers to the monitoring of the specified subject after a surgical procedure in the specified subject.
[0029] «Прогнозирование» в контексте настоящего изобретения в одном случае относится к прогнозированию осложнения, прогрессирования или симптома до того, как другие симптомы или маркеры станут очевидными или значительно изменятся. В контексте настоящего изобретения, такие термины, как «прогностическая ценность» относятся к статистической значимости конкретного определенного результата измерения. Таким образом, увеличение прогностической ценности или прогностической мощности в контексте настоящего изобретения означает, что вероятность правильного диагноза, прогноза, стратификации или т.п., основанная на конкретном значении, определенном из измерения уровня конкретного маркера в образце, увеличивается.[0029] "Prediction" in the context of the present invention, in one case, refers to predicting a complication, progression, or symptom before other symptoms or markers become apparent or change significantly. In the context of the present invention, terms such as "predictive value" refer to the statistical significance of a specific, defined measurement result. Thus, an increase in predictive value or predictive power in the context of the present invention means that the probability of a correct diagnosis, prognosis, stratification, or the like, based on a particular value determined from measuring the level of a particular marker in a sample, is increased.
[0030] Как описано в настоящем описании выше, уровень CgA в образце от указанного субъекта (так же как уровни любых других дополнительных маркеров, таких как MMP7) можно сравнивать с контрольным уровнем или предопределенным порогом. Эти контрольные уровни или предопределенные пороги могут представлять собой абсолютные значения или относительные значения.[0030] As described herein above, the level of CgA in a sample from a specified subject (as well as the levels of any other additional markers such as MMP7) can be compared to a control level or a predetermined threshold. These reference levels or predefined thresholds may be absolute values or relative values.
В зависимости от конкретного применения, контрольный уровень может представлять собой уровень CgA в наиболее раннем образце от того же самого субъекта, например, контрольный уровень может представлять собой уровень CgA в образце, взятом от того же самого субъекта до хирургического вмешательства (например, RCE), и определенный уровень может происходить из образца, взятого после хирургического лечения (например, RCE). То же самое применимо для других маркеров, которые можно дополнительно определять, например, MMP7.Depending on the specific application, the control level may be the CgA level in the earliest sample from the same subject, for example, the control level may be the CgA level in a sample taken from the same subject prior to surgery (e.g., RCE), and a certain level may be derived from a sample taken after surgical treatment (eg, RCE). The same applies for other markers that can be further defined, such as MMP7.
Предопределенный порог для уровня CgA можно, например, выбирать в диапазоне от 100 нг/мл до 431 нг/мл, предпочтительно, в диапазоне от 103 нг/мл до 191 нг/мл, более предпочтительно, от 130 нг/мл до 160 нг/мл, и наиболее предпочтительно, 147 нг/мл. Выбор порога для специфического применения может быть основан, например, на желательной специфичности и/или избирательности анализа; см. ниже.The predetermined threshold for the level of CgA can, for example, be selected in the range from 100 ng/ml to 431 ng/ml, preferably in the range from 103 ng/ml to 191 ng/ml, more preferably from 130 ng/ml to 160 ng/ml ml, and most preferably 147 ng/ml. The choice of threshold for a particular application may be based, for example, on the desired specificity and/or selectivity of the assay; see below.
[0031] Как описано в настоящем описании выше, в дополнение к уровню CgA, уровень других маркеров, в частности, биомаркеров, можно определять у того же самого субъекта, предпочтительно, в одном и том же образце. Одним маркером, как оказалось, обладающим особенной ценностью вместе с CgA, является матриксная металлопротеиназа-7 (MMP7). Таким образом, в контексте настоящего изобретения, предпочтительно, дополнительно уровень матриксной металлопротеиназы 7 (MMP7) определяют в указанном образце от указанного субъекта или в другом образце от указанного субъекта, и уровень MMP7 в образце от субъекта является показателем тяжести не нейроэндокринного рака мочевого пузыря и/или исхода для субъекта. Увеличенный уровень MMP7 в образце от субъекта по сравнению с контрольным уровнем или предопределенным порогом может являться показателем плохого исхода для субъекта, в частности, увеличенного риска уменьшения ожидаемой продолжительности жизни, увеличенного риска прогрессирования, увеличенного риска связанной с злокачественной опухолью смерти и/или увеличенного риска рецидива после хирургического лечения и/или лечения с использованием лекарственного средства, и/или радиотерапии. Уровень MMP7 в одном и том же образце или в другом образце от субъекта может в одном аспекте является показателем общей выживаемости субъекта или специфической для заболевания выживаемости субъекта, или выживаемости субъекта без прогрессирования. Предварительно определенный порог для уровня MMP7 можно, например, выбирать в диапазоне от 4,4 до 21 нг/мл, предпочтительно, в диапазоне от 5,4 до 10,1 нг/мл, более предпочтительно, в диапазоне от 6 до 9 нг/мл. Наиболее предпочтительно, предопределенный порог для уровня MMP7 составляет 7,75 нг/мл. Выбор порога для конкретного применения может быть основан. например, на желательной специфичности и/или избирательности анализа; см. ниже.[0031] As described in the present description above, in addition to the level of CgA, the level of other markers, in particular biomarkers, can be determined in the same subject, preferably in the same sample. One marker that has proven to be of particular value along with CgA is matrix metalloproteinase-7 (MMP7). Thus, in the context of the present invention, preferably, additionally, the level of matrix metalloproteinase 7 (MMP7) is determined in the specified sample from the specified subject or in another sample from the specified subject, and the level of MMP7 in the sample from the subject is an indicator of the severity of non-neuroendocrine bladder cancer and/ or outcome for the subject. An increased level of MMP7 in a sample from a subject compared to a control level or a predetermined threshold may be indicative of a poor outcome for the subject, in particular an increased risk of reduced life expectancy, an increased risk of progression, an increased risk of cancer-related death, and/or an increased risk of recurrence after surgical treatment and/or drug treatment and/or radiotherapy. The level of MMP7 in the same sample or in a different sample from a subject may, in one aspect, be indicative of the subject's overall survival, or disease-specific survival of the subject, or progression-free survival of the subject. The predetermined threshold for the MMP7 level may, for example, be selected in the range of 4.4 to 21 ng/mL, preferably in the range of 5.4 to 10.1 ng/mL, more preferably in the range of 6 to 9 ng/mL. ml. Most preferably, the predetermined threshold for the MMP7 level is 7.75 ng/mL. The choice of threshold for a particular application may be based. for example, the desired specificity and/or selectivity of the assay; see below.
[0032] В конкретном варианте осуществления способов по настоящему изобретению,[0032] In a specific embodiment of the methods of the present invention,
(i) уровень CgA в указанном образце выше предопределенного порога для CgA является показателем высокого риска связанной с злокачественной опухолью смерти после хирургического лечения (например, TURBT, частичной цистэктомии (PCE), RCE, RCE в комбинации с регионарной или расширенной LND, метастазэктомии), или видов лечения с использованием лекарственных средств (химиотерапии, направленной терапии, иммунотерапии) или радиотерапии и(i) a CgA level in said sample above a predetermined threshold for CgA is indicative of a high risk of cancer-related death after surgical treatment (eg, TURBT, partial cystectomy (PCE), RCE, RCE in combination with regional or extended LND, metastasectomy), or treatments using drugs (chemotherapy, targeted therapy, immunotherapy) or radiotherapy, and
(ii) уровень CgA в указанном образце выше предопределенного порога для CgA и уровень MMP7 в указанном образце выше предопределенного порога для MMP7 является показателем очень высокого риска связанной с злокачественной опухолью смерти и более короткой продолжительности жизни после хирургического лечения (например, TURBT, PCE, RCE, RCE в комбинации с регионарной или расширенной LND, метастазэктомии), или видов лечения с использованием лекарственных средств (химиотерапии, направленной терапии, иммунотерапии), или радиотерапии.(ii) the CgA level in said sample is above a predetermined CgA threshold and the MMP7 level in said sample is above a predetermined MMP7 threshold is indicative of a very high risk of cancer-related death and shorter life expectancy after surgical treatment (e.g., TURBT, PCE, RCE , RCE in combination with regional or extended LND, metastasectomy), or drug treatments (chemotherapy, targeted therapy, immunotherapy), or radiotherapy.
[0033] С использованием способов по настоящему изобретению, медицинский работник является способным выбирать наиболее подходящее лечение на основании определенного для пациента риска. Как описано, изобретение относится к послеопрационному, неинвазивному, недорогому и простому для манипуляций инструменту для мониторированя эффективности лечения и рецидивов рака мочевого пузыря, в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря и предпочтительно, уротелиальной карциномы. Например, уровень CgA и необязательно, MMP7, можно определять в через регулярные интервалы времени в ходе последующего наблюдения, и контрольный уровень может представлять собой уровень, определенный до указанного хирургического лечения и/или на начальной стадии последующего наблюдения.[0033] Using the methods of the present invention, the medical professional is able to select the most appropriate treatment based on the patient's perceived risk. As described, the invention relates to a post-operative, non-invasive, inexpensive and easy-to-handle instrument for monitoring treatment efficacy and recurrence in bladder cancer, in particular non-neuroendocrine bladder cancer and preferably urothelial carcinoma. For example, the level of CgA and optionally, MMP7, can be determined at regular intervals during follow-up, and the control level can be the level determined prior to said surgical treatment and/or at the initial stage of follow-up.
[0034] В одном конкретном аспекте, предоперационный уровень (предпочтительно, уровень в сыворотке) CgA используют в качестве маркера для общей и специфической для заболевания выживаемости у пациентов после хирургического вмешательства (например, RCE). В конкретном аспекте изобретения MMP7 используют в качестве дополнительного маркера для плохой специфической для заболевания выживаемости у пациентов, подвергнутых лечению RCE. MMP7 можно также использовать в качестве дополнительного маркера для мышечно-инвазивной опухоли и/или метастазирования.[0034] In one specific aspect, preoperative level (preferably serum level) of CgA is used as a marker for overall and disease-specific survival in patients after surgery (eg, RCE). In a specific aspect of the invention, MMP7 is used as an additional marker for poor disease-specific survival in patients treated with RCE. MMP7 can also be used as an additional marker for muscle invasive tumor and/or metastasis.
[0035] Как обсуждали, в дополнение к определению уровня CgA, дополнительно можно определять уровень других маркеров, в частности, биомаркеров (включая MMP7), и другие клинические параметры для субъекта. Такой клинический параметр(ы) для субъекта можно, например, выбирать из группы, состоящей из гистологического подтипа опухоли, статуса метастазирования (в лимфатических узлах и отдаленного), лимфаденопатии, курения или употребления табака, возраста, пола, семейного анамнеза, этнической принадлежности, массы тела, индекса массы тела (BMI), цистоскопических данных, цитологии мочи (VUC), ультразвукового исследования, сканирования КТ, ЯМР и TURBT, и кровяного давления. В конкретном варианте осуществления, дополнительно определяют по меньшей мере один клинический параметр, выбранный из группы, включающий возраст, пол, систолическое кровяное давление, диастолическое кровяное давление, антигипертензивное лечение, анамнез заболеваний мочевыводящих путей и их лечения, инсульт в анамнезе, свистящее дыхание, индекс массы тела, частоту сердечных сокращений, температуру, присутствие сахарного диабета и текущую привычку к курению.[0035] As discussed, in addition to determining the level of CgA, you can additionally determine the level of other markers, in particular, biomarkers (including MMP7), and other clinical parameters for the subject. Such clinical parameter(s) for a subject may, for example, be selected from the group consisting of histological tumor subtype, metastasis status (lymph node and distant), lymphadenopathy, smoking or tobacco use, age, sex, family history, ethnicity, weight body mass index (BMI), cystoscopic data, urine cytology (VUC), ultrasound, CT, MRI and TURBT scans, and blood pressure. In a specific embodiment, at least one clinical parameter selected from the group including age, gender, systolic blood pressure, diastolic blood pressure, antihypertensive treatment, history of urinary tract disease and treatment, history of stroke, wheezing, index body weight, heart rate, temperature, presence of diabetes and current smoking habit.
[0036] Кроме того, уровень маркера, выбранного из группы, состоящей из родственного фактору комплемента H белка и фактора комплемента H, белка ядерного матрикса BLCA-4, сурвивина (BIRC5, EPR-1), цитокератина 8 (CK8), цитокератина 18 (CK18), цитокератина 20 (CK20), белка CEA и ассоциированных с клетками опухоли мочевого пузыря муцинов, изменений на хромосомах 3, 7, 17 и 9p21, белка CEA (CEA), CYFRA 21-1 (CK19), карбоангидразы, неврологического сенсорного белка (NSE), c-реактивного белка (CRP), белка 22 ядерного митотического аппарата (NMP22), щелочной фосфатазы, матриксной металлопротеиназаы 1 (MMP-1), матрикснойметаллопротеиназы 2 (MMP-2), матриксной металлопротеиназы 3 (MMP-3), матриксной металлопротеиназы 9 (MMP-9), матриксной металлопротеиназы 10 (MMP-10), матриксной металлопротеиназы 13 (MMP-13), матриксной металлопротеиназы 26 (MMP-26), тканевого ингибитора металлопротеиназ 1 (TIMP-1), тканевого ингибитора металлопротеиназ 2 (TIMP-2), тканевого ингибитора металлопротеиназ 3 (TIMP-3), тканевого ингибитора металлопротеиназ 4 (TIMP-4), альфа-1-антитрипсина, фактора роста эндотелия сосудов (VEGF), плацентарного фактора роста (PLGF), рецептора 1 фактора роста эндотелия сосудов (VEGFR-1), растворимого рецептора 1 фактора роста эндотелия сосудов (sVEGFR-1, sfLT-1), рецептора 2 фактора роста эндотелия сосудов (VEGFR-2), рецептора 3 растворимого фактора роста эндотелия сосудов (sVEGFR-3), фактора роста эндотелия сосудов A (VEGFA), фактора роста эндотелия сосудов C (VEGFC), связывающего инсулиноподобный фактор роста белка 1 (IGFBP-1), связывающего инсулиноподобный фактор роста белка 2 (IGFBP-2), связывающего инсулиноподобный фактор роста белка 3 (IGFBP-3), связывающего инсулиноподобный фактор роста белка 4 (IGFBP-4), связывающего инсулиноподобный фактор роста белка 5 (IGFBP-5), связывающего инсулиноподобный фактор роста белка 6 (IGFBP-6), трансформирующего фактора роста β (TGF-β), инсулиноподобного фактора роста (IGF), рецептора инсулиноподобного фактора роста (IGFR), инсулиноподобного фактора роста 1 (IGF-1), рецептора инсулиноподобного фактора роста 1 (IGF1R), эндотелиального фактора роста (EGF), рецептора эндотелиального фактора роста (EGFR), связывающего прогепарин подобного EGF фактора роста (proHB-EGF), связывающего мРНК инсулиноподобного фактора роста 2 белка 3 (IGFBP3), связывающего мРНК инсулиноподобного фактора роста 2 белка 7 (IGFBP7), ангиостатина, эндостатина, плазминогена (PLG), аквапорина 1 (AQP-1), перилипина 2 (PLIN-2), хорионического гонадотропина человека (hCG), рецептора андрогенов (AR), рецептора эстрогенов (ER), простатспецифического антигена (PSA), свободного простатспецифического антигена (свободного PSA), общего простатспецифического антигена антиген (общего PSA), фактора некроза опухоли α (TNFα), E-кадгерина, эластина, фибронектина, коллагенв и витронектина, можно определять в указанном образце или другом образце от субъекта. Среди них, предпочтительные дополнительные маркеры выбраны из родственного фактору комплемента H белка и фактора комплемента H, белка ядерного матрикса BLCA-4, цитокератина 8 (CK8), цитокератина 18 (CK18), белка CEA и ассоциированных с клетками опухоли мочевого пузыря муцинов, изменений на хромосомах 3, 7, 17 и 9p21, белка CEA (CEA), белка 22 ядерного митотического аппарата (NMP22), щелочной фосфатазы, тканевого ингибитора металлопротеиназ 1 (TIMP-1) и тканевого ингибитора металлопротеиназ 2 (TIMP-2).[0036] In addition, the level of a marker selected from the group consisting of complement factor H-related protein and complement factor H, nuclear matrix protein BLCA-4, survivin (BIRC5, EPR-1), cytokeratin 8 (CK8), cytokeratin 18 ( CK18), cytokeratin 20 (CK20), CEA protein and bladder tumor cell-associated mucins, changes on chromosomes 3, 7, 17 and 9p21, CEA protein (CEA), CYFRA 21-1 (CK19), carbonic anhydrase, neurological sensor protein (NSE), c-reactive protein (CRP), nuclear mitotic apparatus protein 22 (NMP22), alkaline phosphatase, matrix metalloproteinase 1 (MMP-1), matrix metalloproteinase 2 (MMP-2), matrix metalloproteinase 3 (MMP-3), matrix metalloproteinase 9 (MMP-9), matrix metalloproteinase 10 (MMP-10), matrix metalloproteinase 13 (MMP-13), matrix metalloproteinase 26 (MMP-26), tissue inhibitor of metalloproteinases 1 (TIMP-1), tissue inhibitor of metalloproteinases 2 (TIMP-2), tissue inhibitor of metalloproteinases 3 (TIMP- 3), tissue inhibitor of metalloproteinases 4 (TIMP-4), alpha-1 antitrypsin, vascular endothelial growth factor (VEGF), placental growth factor (PLGF), vascular endothelial growth factor receptor 1 (VEGFR-1), soluble factor receptor 1 vascular endothelial growth factor receptor 2 (VEGFR-2), soluble vascular endothelial growth factor receptor 3 (sVEGFR-3), vascular endothelial growth factor A (VEGFA), endothelial growth factor Vascular C (VEGFC), insulin-like growth factor-binding protein 1 (IGFBP-1), insulin-like growth factor-binding protein 2 (IGFBP-2), insulin-like growth factor-binding protein 3 (IGFBP-3), insulin-like growth factor-binding protein 4 (IGFBP -4), insulin-like growth factor-binding protein 5 (IGFBP-5), insulin-like growth factor-binding protein 6 (IGFBP-6), transforming growth factor β (TGF-β), insulin-like growth factor (IGF), insulin-like growth factor receptor ( IGFR), in sulin-like growth factor 1 (IGF-1), insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R), endothelial growth factor (EGF), endothelial growth factor receptor (EGFR), proheparin-binding EGF-like growth factor (proHB-EGF), insulin-like factor mRNA-binding growth 2 protein 3 (IGFBP3), mRNA-binding insulin-like growth factor 2 protein 7 (IGFBP7), angiostatin, endostatin, plasminogen (PLG), aquaporin 1 (AQP-1), perilipin 2 (PLIN-2), human chorionic gonadotropin (hCG ), androgen receptor (AR), estrogen receptor (ER), prostate-specific antigen (PSA), free prostate-specific antigen (free PSA), total prostate-specific antigen antigen (total PSA), tumor necrosis factor α (TNFα), E-cadherin, elastin , fibronectin, collagen and vitronectin, can be determined in the specified sample or another sample from the subject. Among them, preferred additional markers are selected from complement factor H-related protein and complement factor H, nuclear matrix protein BLCA-4, cytokeratin 8 (CK8), cytokeratin 18 (CK18), CEA protein and bladder tumor cell associated mucins, changes in
[0037] Термин «биомаркер» (биологический маркер) относится к поддающимся измерению и количественной оценке биологическим параметрам (например, концентрации специфического фермента, концентрации специфического гормона, распределению фенотипа специфического гена в популяции, присутствию биологических веществ), которые служат показателями связанных с состоянием здоровья и физиологией оценок, таких как риск заболевания, психиатрические нарушения, воздействие окружающей среды и его эффекты, диагноз заболевания, метаболические процессы, наркотическая зависимость и токсикомания, беременность, развитие линии клеток, эпидемиологические исследования и т.д. Кроме того, биомаркер определяют как характеристику, которую объективно измеряют и оценивают в качестве показателя нормальных биологических процессов, патогенных процессов или фармакологических ответов на терапевтическое вмешательство. Биомаркер можно измерять в биологическом образце (например, цельной крови, сыворотке, плазме, моче), он может представлять собой запись показаний, полученную для индивидуума (кровяное давление, ЭКГ или холтеровское мониторирование ЭКГ), или он может представлять собой тест визуализации (эхокардиограмму или сканирование КТ) (Vasan et al. 2006, Circulation 113:2335-2362). Биомаркеры могут указывать на множество характеристик состояния здоровья или заболевания, включая уровень или тип воздействия фактора окружающей среды, генетическую предрасположенность, генетические ответы на воздействия, биомаркеры субклинического или клинического заболевания, или показатели ответа на терапию. Таким образом, упрощенным способом понимания биомаркеров является понимание в качестве показателей признака заболевания (фактора риска или биомаркера риска), состояния заболевания (доклинического или клинического), или скорости развития заболевания (прогрессирования). Соответственно, биомаркеры можно классифицировать как предшествующие биомаркеры (идентифицирующие риск развития заболевания), скринирующие биомаркеры (скринирующие субклиническое заболевание), диагностические биомаркеры (распознающие явное заболевание), определяющие степень биомаркеры (категоризирующие тяжесть заболевания), или прогностические биомаркеры (прогнозирующие будущее течение заболевания, включая рецидив и ответ на терапию, и мониторирующие эффективность терапии). Биомаркеры могут также служить суррогатными конечными точками. Суррогатная конечная точка представляет собой точку, которую можно использовать в качестве исхода в клинических исследованиях для оценки безопасности и эффективности лекарственных средств вместо измерения действительного представляющего интерес исхода. Лежащим в основе принципом является то, что изменения суррогатной конечной точки следуют близко с изменениями представляющего интерес исхода. Суррогатные конечные точки имеют то преимущество, что их можно получать в более короткие временные рамки и с меньшими затратами, чем конечные точки, такие как заболеваемость и смертность, требующие крупных клинических исследований для оценки. Дополнительная ценность суррогатных конечных точек включает тот факт, что они находятся ближе к представляющему интерес воздействию/вмешательству, и их можно проще причинно-следственно связать с ним, чем более отдаленные клинические события. Важным недостатком суррогатных конечных точек является то, что если на представляющий интерес клинический исход влияют многочисленные клинические факторы (в дополнение к суррогатной конечной точке), остаточное искажение может уменьшать обоснованность суррогатной конечной точки. Предположили, что обоснованность суррогатной конечной точки является большей, если она может объяснить по меньшей мере 50% эффекта воздействия или вмешательства на представляющий интерес исход. Например, биомаркер может представлять собой белок, пептид или молекулу нуклеиновой кислоты.[0037] The term "biomarker" (biological marker) refers to measurable and quantifiable biological parameters (for example, the concentration of a specific enzyme, the concentration of a specific hormone, the distribution of the phenotype of a specific gene in a population, the presence of biological substances) that serve as indicators of health-related and physiology of assessments such as disease risk, psychiatric disorders, environmental exposure and its effects, disease diagnosis, metabolic processes, drug dependence and substance abuse, pregnancy, cell line development, epidemiological studies, etc. In addition, a biomarker is defined as a characteristic that is objectively measured and evaluated as an indicator of normal biological processes, pathogenic processes, or pharmacological responses to a therapeutic intervention. A biomarker can be measured in a biological sample (e.g., whole blood, serum, plasma, urine), it can be a record of readings obtained from an individual (blood pressure, ECG, or ECG Holter monitoring), or it can be an imaging test (an echocardiogram or CT scan) (Vasan et al. 2006, Circulation 113:2335-2362). Biomarkers can indicate many characteristics of a health condition or disease, including the level or type of exposure to an environmental factor, genetic predisposition, genetic responses to exposures, biomarkers of subclinical or clinical disease, or measures of response to therapy. Thus, a simplified way of understanding biomarkers is to understand as indicators a sign of a disease (risk factor or biomarker), disease state (preclinical or clinical), or rate of disease development (progression). Accordingly, biomarkers can be classified as antecedent biomarkers (identifying the risk of developing a disease), screening biomarkers (screening for subclinical disease), diagnostic biomarkers (recognizing overt disease), grade-determining biomarkers (categorizing disease severity), or prognostic biomarkers (predicting the future course of a disease, including relapse and response to therapy, and monitoring the effectiveness of therapy). Biomarkers can also serve as surrogate endpoints. A surrogate endpoint is a point that can be used as an outcome in clinical trials to evaluate the safety and efficacy of medicines, instead of measuring the actual outcome of interest. The underlying principle is that changes in the surrogate endpoint follow closely with changes in the outcome of interest. Surrogate endpoints have the advantage that they can be obtained in a shorter time frame and at lower cost than endpoints such as morbidity and mortality, which require large clinical trials to evaluate. The added value of surrogate endpoints includes the fact that they are closer to the intervention/intervention of interest and can be more easily causally linked to it than more distant clinical events. An important disadvantage of surrogate endpoints is that if the clinical outcome of interest is influenced by multiple clinical factors (in addition to the surrogate endpoint), residual confounding may reduce the validity of the surrogate endpoint. It was suggested that the validity of a surrogate endpoint is greater if it can explain at least 50% of the effect of the treatment or intervention on the outcome of interest. For example, the biomarker may be a protein, peptide, or nucleic acid molecule.
Национальный институт здравоохранения (NIH) определяет биомаркер как биологический маркер, который объективно измеряют и оценивают как показатель нормального биологического процесса, патогеного процесса или фармакологических ответов на терапевтические вмешательства (Danesh et al. Clin Pharmacol Ther 2001. 169:416-468).The National Institutes of Health (NIH) defines a biomarker as a biological marker that is objectively measured and evaluated as an indicator of a normal biological process, a pathogenic process, or pharmacological responses to therapeutic interventions (Danesh et al. Clin Pharmacol Ther 2001. 169:416-468).
Некоторые из маркеров (в частности, биомаркеров) представляют собой «маркеры злокачественных опухолей», т.е. они представляют собой маркеры, ассоциированные с диагнозом и/или прогнозом злокачественной опухоли, в настоящем описании: не нейроэндокринного рака мочевого пузыря.Some of the markers (particularly biomarkers) are "cancer markers", ie. they are markers associated with the diagnosis and/or prognosis of a malignant tumor, in the present description: not neuroendocrine bladder cancer.
[0038] Способы по настоящему изобретению могут включать начальную стадию получения образца физиологической жидкости от указанного субъекта. Термин «образец», как используют в контексте настоящего изобретения, относится к образцу физиологической жидкости, полученной для целей диагностики, прогнозирования или оценки представляющего интерес субъекта, такого как пациент. Предпочтительные тестируемые образцы включают (цельную) кровь, сыворотку, плазму и мочу. Некоторые тестируемые образцы более просто анализируют после процедуры фракционирования или очистки, например, разделения цельной крови на компоненты сыворотки или плазмы. Таким образом, в предпочтительном варианте осуществления изобретения, образец выбран из группы, содержащей образец (цельной) крови, образец сыворотки, образец плазмы и образец мочи или экстракт любого из вышеупомянутых образцов. Предпочтительно, образец представляет собой образец цельной крови, наиболее предпочтительно, образец сыворотки или образец плазмы. Как применяют в настоящем документе, «образец цельной крови» обозначает не переработанный или по существу не переработанный образец крови. Когда это целесообразно, образец может являться необходимым гомогенизировать, или экстрагировать растворителем перед использованием по настоящему изобретению, чтобы получить жидкий образец. Жидкий образец, таким образом, может представлять собой раствор или суспензию. Жидкие образцы можно подвергать одной или нескольким предварительным обработкам перед использованием по настоящему изобретению. Такие предварительные обработки включают, но без ограничения, разведение, фильтрацию, центрифугирование, концентрирование, седиментацию, преципитацию или диализ. Предварительные обработки могут также включать добавление в раствор химических или биохимических веществ, таких как кислоты, основания, буферы, соли, растворители, реакционноспособные красители, детергенты, эмульгаторы или хелаторы.[0038] The methods of the present invention may include the initial step of obtaining a sample of physiological fluid from the specified subject. The term "sample", as used in the context of the present invention, refers to a sample of physiological fluid obtained for the purposes of diagnosis, prediction or evaluation of a subject of interest, such as a patient. Preferred test samples include (whole) blood, serum, plasma and urine. Some test samples are more simply analyzed after a fractionation or purification procedure, such as separation of whole blood into serum or plasma components. Thus, in a preferred embodiment of the invention, the sample is selected from the group consisting of a (whole) blood sample, a serum sample, a plasma sample and a urine sample or an extract of any of the above samples. Preferably, the sample is a whole blood sample, most preferably a serum sample or a plasma sample. As used herein, "whole blood sample" means an unprocessed or substantially unprocessed blood sample. When appropriate, the sample may need to be homogenized or solvent extracted prior to use in the present invention in order to obtain a liquid sample. The liquid sample thus may be a solution or a suspension. Liquid samples may be subjected to one or more pre-treatments prior to use in the present invention. Such pretreatments include, but are not limited to, dilution, filtration, centrifugation, concentration, sedimentation, precipitation, or dialysis. Pre-treatments may also include the addition of chemical or biochemical agents to the solution, such as acids, bases, buffers, salts, solvents, reactive dyes, detergents, emulsifiers, or chelators.
«Плазма» в контексте настоящего изобретения представляет собой фактически бесклеточный супернатант крови, содержащей антикоагулянт, полученный после центрифугирования. Иллюстративные антикоагулянты включают связывающие ион кальция соединения, такие как ЭДТА или цитрат, и ингибиторы тромбина, такие как гепаринаты или гирудин. Бесклеточную плазму можно получать посредством центрифугирования подвергнутой воздействию антикоагулянта крови (например, подвергнутой воздействию цитрата, ЭДТА или гепарина крови) в течение по меньшей мере 15 минут при 2000-3000 g. Таким образом, является предпочтительным, чтобы образцы плазмы, используемые в контексте настоящего изобретения, подвергали центрифугированию при более чем 1500 g в течение 30 мин, предпочтительно, по меньшей мере при 2000 g в течение по меньшей мере 30 мин, более предпочтительно, по меньшей мере при 3000 g в течение по меньшей мере 20 мин, наиболее предпочтительно, по меньшей мере при 3000 g в течение по меньшей мере 30 мин."Plasma" in the context of the present invention is actually a cell-free supernatant of blood containing an anticoagulant obtained after centrifugation. Exemplary anticoagulants include calcium ion binding compounds such as EDTA or citrate and thrombin inhibitors such as heparinates or hirudin. Cell-free plasma can be obtained by centrifuging anticoagulant-exposed blood (eg, citrate, EDTA, or heparin-exposed blood) for at least 15 minutes at 2000-3000 g. Thus, it is preferred that plasma samples used in the context of the present invention are subjected to centrifugation at more than 1500 g for 30 minutes, preferably at least 2000 g for at least 30 minutes, more preferably at least at 3000 g for at least 20 minutes, most preferably at least 3000 g for at least 30 minutes.
«Сыворотка» в контексте настоящего изобретения представляет собой неразведенную, внеклеточную часть крови после завершения адекватного свертывания. Свертывание обычно завершается через 30 мин. Сыворотку можно получать посредством центрифугирования коагулированного образца в течение по меньшей мере 10 минут при минимальной скорости 1500 g. Таким образом, является предпочтительным, чтобы образцы сыворотки, используемые в контексте настоящего изобретения, подвергали центрифугированию по меньшей мере при 1500 g в течение по меньшей мере 10 мин, предпочтительно в течение по меньшей мере 15 мин, более предпочтительно, в течение по меньшей мере 20 мин. Наиболее предпочтительно, образец сыворотки подвергают центрифугированию по меньшей мере при 3000 g в течение по меньшей мере 20 мин."Serum" in the context of the present invention is the undiluted, extracellular portion of the blood after adequate clotting has been completed. Clotting is usually completed after 30 minutes. Serum can be obtained by centrifuging the coagulated sample for at least 10 minutes at a minimum speed of 1500 g. Thus, it is preferred that serum samples used in the context of the present invention are centrifuged at at least 1500 g for at least 10 minutes, preferably for at least 15 minutes, more preferably for at least 20 min. Most preferably, the serum sample is centrifuged at at least 3000 g for at least 20 minutes.
[0039] Уровень CgA можно определять с использованием соответствующих анализов. «Анализ» или «диагностический анализ» может относиться к любому типу, используемому в области диагностики. Такой анализ может быть основан на связывании подлежащего детекции аналита с одним или несколькими связывающими зондами с определенной аффинностью. Что касается взаимодействия между связывающими молекулами и молекулами-мишенями или представляющими интерес молекулами, константа аффинности предпочтительно превышает 108 M-1.[0039] The level of CgA can be determined using appropriate assays. "Analysis" or "diagnostic analysis" can refer to any type used in the field of diagnostics. Such an assay may be based on the binding of the analyte to be detected to one or more binding probes with a certain affinity. With regard to the interaction between binding molecules and target molecules or molecules of interest, the affinity constant preferably exceeds 10 8 M -1 .
[0040] Предпочтительные способы детекции включают иммуноанализы в различных форматах, например, таких как радиоиммунный анализ (RIA), хемилюминесцентные и флюоресцентные иммуноанализы, твердофазные иммуноферментные анализы (ELISA), массивы на основе бусин с Luminex, анализы микромассивов белка, форматы экспресс-анализа или анализа на месте оказания медицинской помощи (PoC), например, такие как тесты на иммунохроматографических полосках, и автоматизированные системы иммуноанализа, например, такие как система BRAHMS KRYPTOR. Особенно предпочтительными являются форматы тестов PoC; например, см. St. John & Price, Clin Biochem Rev. 2014 Aug; 35(3): 155-167. Кроме того, способы масс-спектрометрии можно использовать для детекции и количественной оценки CgA, MMP7 и/или дополнительных биомаркеров, например, можно использовать количественный контроль избирательных реакций (qSRM). Для масс-спектрометрических измерений, химическую дериватизацию обычно проводят перед анализом и количественной оценкой белка-мишени.[0040] Preferred detection methods include immunoassays in various formats, such as, for example, radioimmunoassay (RIA), chemiluminescent and fluorescent immunoassays, enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA), Luminex bead arrays, protein microarray assays, rapid assay formats, or point-of-care (PoC) assays, such as, for example, immunochromatographic strip tests; and automated immunoassay systems, such as, for example, the BRAHMS KRYPTOR system. Particularly preferred are PoC test formats; for example, see St. John & Price, Clin Biochem Rev. 2014 Aug; 35(3): 155-167. In addition, mass spectrometry techniques can be used to detect and quantify CgA, MMP7 and/or additional biomarkers, for example selective response quantification (qSRM) can be used. For mass spectrometric measurements, chemical derivatization is usually performed prior to analysis and quantification of the target protein.
[0041] Иммуноанализы могут представлять собой гомогенные или гетерогенные анализы, конкурентные и не конкурентные анализы. В особенно предпочтительном варианте осуществления, анализ находится в форме сэндвич-анализа, который представляет собой не конкурентный иммуноанализ, в котором молекула, подлежащая детекции и/или количественной оценке, связывается с первым антителом и с вторым антителом. Первое антитело может являться связанным с твердой фазой, например, бусиной, поверхностью лунки или другого контейнера, чипом или полоской, и второе антитело представляет собой антитело, которое является меченным, например, с использованием красителя, радиоактивного изотопа или реакционноспособной или каталитически активной группы. Затем количество меченого антитела, связанного с аналитом, измеряют подходящим способом. Общая композиция и способы, вовлеченные в «сэндвич-анализы», хорошо разработаны и известны специалисту в данной области ((The Immunoassay Handbook, Ed. David Wild, Elsevier LTD, Oxford; 3rd ed. (May 2005), ISBN-13: 978-0080445267; Hultschig C et al., Curr Opin Chem Biol. 2006 Feb;10(1):4-10, содержание которого приведено в настоящем документе в качестве ссылки).[0041] Immunoassays can be homogeneous or heterogeneous assays, competitive or non-competitive assays. In a particularly preferred embodiment, the assay is in the form of a sandwich assay, which is a non-competitive immunoassay in which the molecule to be detected and/or quantified binds to a first antibody and a second antibody. The first antibody may be associated with a solid phase, such as a bead, the surface of a well or other container, a chip, or a strip, and the second antibody is an antibody that is labeled, such as with a dye, a radioactive isotope, or a reactive or catalytically active group. The amount of labeled antibody bound to the analyte is then measured in an appropriate manner. The general composition and methods involved in "sandwich assays" are well established and known to those skilled in the art ((The Immunoassay Handbook, Ed. David Wild, Elsevier LTD, Oxford; 3rd ed. (May 2005), ISBN-13: 978 -0080445267; Hultschig C et al., Curr Opin Chem Biol 2006 Feb;10(1):4-10, the contents of which are incorporated herein by reference).
[0042] В особенно предпочтительном варианте осуществления анализ включает две связывающие молекулы, предпочтительно, антитела, которые обе присутствуют в форме дисперсий в жидкой реакционной смеси, где первый метящий компонент присоединен к первой связывающей молекуле, где указанный первый метящий компонент является частью системы мечения, основанной на гашении или усилении флуоресценции или хемилюминесценции, и второй метящий компонент указанной системы мечения присоединен к второй связывающей молекуле, так что при связывании обеих связывающих молекул с аналитом образуется поддающийся измерению сигнал, позволяющий детекцию сформированных сэндвич-комплексов в растворе, содержащем образец.[0042] In a particularly preferred embodiment, the assay comprises two binding molecules, preferably antibodies, both of which are present in the form of dispersions in a liquid reaction mixture, where the first labeling component is attached to the first binding molecule, where the specified first labeling component is part of a labeling system based on quenching or enhancing fluorescence or chemiluminescence, and the second labeling component of said labeling system is attached to a second binding molecule such that upon binding of both binding molecules to the analyte, a measurable signal is generated allowing detection of the formed sandwich complexes in the solution containing the sample.
Даже более предпочтительно, указанная система мечения содержит криптаты редкоземельных металлов или хелаты редкоземельных металлов в комбинации с флуоресцентным красителем или хемилюминесцентным красителем, в частности, красителем цианинового типа.Even more preferably, said labeling system comprises rare earth metal cryptates or rare earth metal chelates in combination with a fluorescent dye or a chemiluminescent dye, in particular a cyanine type dye.
[0043] В контексте способов по настоящему изобретению, уровень CgA и/или MMP7 предпочтительно определяют с использованием иммуноанализа. Пригодные иммуноанализы и антитела для детекции CgA описаны, например, в WO 2015/158701 A1 и Popovici et al. (2014. Clin Biochem 47: 87-91) (содержание которых, таким образом, приведено в качестве ссылки). Например, можно использовать анализ хромогранина A B·R·A·H·M·S KRYPTOR (B·R·A·H·M·S GmbH, Hennigsdorf, Germany). Дополнительные коммерческие анализы для детекции хромогранина A являются доступными и могут быть использованы: в анализе Cis-Bio ELISA (Cisbio Bioassays, Codolet, France) используют два моноклональных антитела, нацеленные против эпитопов, соответствующих аминокислотам 145-197 и 219-234, в анализе DAKO ELISA (Dako Denmark A/S, Glostrup, Denmark) используют поликлональные антитела кролика, нацеленные против C-концевого фрагмента 23 кДа, в сэндвич-анализе ELISA Euro-Diagnostica NEOLISA™ (Euro Diagnostica AB, Malmö, Sweden) используют два моноклональных антитела, нацеленные против эпитопов, соответствующих аминокислотам 236-251 и 264-279 (см. также WO 2011/135035 A1 и WO 99/58980 A1).[0043] In the context of the methods of the present invention, the level of CgA and/or MMP7 is preferably determined using an immunoassay. Suitable immunoassays and antibodies for the detection of CgA are described, for example, in WO 2015/158701 A1 and Popovici et al. (2014. Clin Biochem 47: 87-91) (the contents of which are hereby incorporated by reference). For example, you can use the analysis of chromogranin A B·R·A·H·M·S KRYPTOR (B·R·A·H·M·S GmbH, Hennigsdorf, Germany). Additional commercial assays for the detection of chromogranin A are available and can be used: the Cis-Bio ELISA assay (Cisbio Bioassays, Codolet, France) uses two monoclonal antibodies targeting epitopes corresponding to amino acids 145-197 and 219-234, the DAKO assay ELISA (Dako Denmark A/S, Glostrup, Denmark) uses a rabbit polyclonal antibody targeted against the 23 kDa C-terminal fragment, the Euro-Diagnostica NEOLISA™ sandwich ELISA (Euro Diagnostica AB, Malmö, Sweden) uses two monoclonal antibodies, targeted against epitopes corresponding to amino acids 236-251 and 264-279 (see also WO 2011/135035 A1 and WO 99/58980 A1).
Пригодные иммуноанализы для детекции MMP7 описаны, например, в WO 2007/144144 A1 (содержание которого, таким образом, приведено в качестве ссылки).Suitable immunoassays for the detection of MMP7 are described, for example, in WO 2007/144144 A1 (the contents of which are thus incorporated by reference).
Коммерчески доступные анализы для MMP7 включают в себя: набор Human Total MMP-7 Quantikine ELISA или анализ для скрининга Human Magnetic Luminex Screening Assay или анализ для скрининга Human Luminex Screening Assay или анализ активности MMP-7 человека Human MMP-7 Luminex Performance Assay, или анализ активности MMP-7 человека Human MMP-7 Magnetic Luminex Performance Assay, или анализ общей MMP-7 человека Human Total MMP-7 DuoSet ELISA, или готовый набор для анализа активности MMP человека Human MMP Premixed Luminex Performance Assay Kit или набор Proteome Profiler Human Protease Array Kit (R&D Systems Minneapolis, MN 55413, USA), набор для ELISA общей MMP-7 человека Human Total MMP-7 ELISA Kit (Aviva Systems Biology Corporation, San Diego, CA 92121, USA), набор для ELISA MMP7 (человека) MMP7 (Human) ELISA Kit (Abnova, Taipei 114, Taiwan), набор для ELISA MMP7/матрилизина человека Human MMP7/Matrilysin ELISA Kit (сэндвич-ELISA) (LifeSpan Biosciences, Seattle, Washington 98121, USA), набор для ELISA MMP7 человека MMP7 Human ELISA Kit (Abcam, Cambridge, United Kingdom), набор для флуориметрического анализа MMP-7 SensoLyte® 490 MMP-7 Assay Kit *Fluorimetric* (ANASPEC, Fremont, CA 94555, USA), анализы Bio-Plex Pro™ для MMP и TIMP человека (Bio-Rad Laboratories, Inc., Hercules, CA, U.S.A.), набор для ELISA матриксной металлопротеиназы 7 (MMP7) ELISA Kit for Matrix Metalloproteinase 7 (MMP7) (Wuhan USCN Business Co., Ltd., Wuhan City, China).Commercially available assays for MMP7 include: Human Total MMP-7 Quantikine ELISA Kit or Human Magnetic Luminex Screening Assay or Human Luminex Screening Assay or Human MMP-7 Activity Assay Human MMP-7 Luminex Performance Assay, or Human MMP-7 Magnetic Luminex Performance Assay, or Human Total MMP-7 DuoSet ELISA, or Human MMP Premixed Luminex Performance Assay Kit, or Human Proteome Profiler Kit Protease Array Kit (R&D Systems Minneapolis, MN 55413, USA), ELISA kit for human total MMP-7 Human Total MMP-7 ELISA Kit (Aviva Systems Biology Corporation, San Diego, CA 92121, USA), ELISA kit for MMP7 (human ) MMP7 (Human) ELISA Kit (Abnova, Taipei 114, Taiwan), Human MMP7/Matrilysin ELISA Kit (Sandwich ELISA) (LifeSpan Biosciences, Seattle, Washington 98121, USA), on MMP7 Human ELISA Kit (Abcam, Cambridge, United Kingdom), MMP-7 SensoLyte® 490 MMP-7 Assay Kit *Fluorimetric* (ANASPEC, Fremont, CA 94555, USA), Bio- Plex Pro™ for Human MMP and TIMP (Bio-Rad Laboratories, Inc., Hercules, CA, U.S.A.), Matrix Metalloproteinase 7 (MMP7) ELISA Kit ELISA Kit for Matrix Metalloproteinase 7 (MMP7) (Wuhan USCN Business Co., Ltd ., Wuhan City, China).
[0044] Иммуноанализы для детекции CgA, описанные в WO 2015/158701 A1, являются предпочтительными в контексте настоящего изобретения. Они основаны на использовании двух антител против CgA (сэндвич-иммуноанализ). (Первые и/или вторые) антитела или их антигенсвязывающие фрагменты или производные из способа иммуноанализа, как описано в WO 2015/158701 A1, могут, например, представлять собой поликлональные антитела, моноклональные антитела или генетически модифицированные моноклональные антитела. Указанное первое антитело является специфическим для эпитопа в последовательности CgA (SEQ ID NO:1), предпочтительно, в последовательности, охватывающей аминокислоты 124-144 из SEQ ID NO:1. Первое антитело, предпочтительно, представляет собой моноклональное антитело. Указанное второе антитело является специфическим для эпитопа в последовательности CgA (SEQ ID NO:1), предпочтительно, в последовательности, охватывающей аминокислоты 280-301 из SEQ ID NO:1. Второе антитело предпочтительно представляет собой моноклональное антитело. В конкретном иммуноанализе, первое антитело является специфическим для эпитопа в последовательности CgA (SEQ ID NO:1), охватывающей аминокислотные остатки 124-144, и второе антитело является специфическим для эпитопа в последовательности CgA (SEQ ID NO:1), охватывающей аминокислотные остатки 280-301. Первое и второе антитела, предпочтительно, представляют собой моноклональные антитела. Первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное можно, например, получать в линии клеток гибридомы 537/H2, депонированной как DSM ACC3231. Антитело, полученное в линии клеток гибридомы 537/H2, специфически связывается с аминокислотными остатками 124-144 из последовательности CgA (SEQ ID NO:1). Второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное можно, например, получать в линии клеток гибридомы 541/E2, депонированной как DSM ACC3232. Антитело, полученное в линии клеток гибридомы 541/E2, специфически связывается с аминокислотными остатками 280-301 из последовательности CgA (SEQ ID NO:1). В конкретном варианте осуществления иммуноанализа, первое антитело получено в линии клеток гибридомы 537/H2, депонированной как DSM ACC3231, и второе антитело получено в линии клеток гибридомы 541/E2, депонированной как DSM ACC3232.[0044] The CgA detection immunoassays described in WO 2015/158701 A1 are preferred in the context of the present invention. They are based on the use of two antibodies against CgA (sandwich immunoassay). The (first and/or second) antibodies or antigen-binding fragments or derivatives thereof from an immunoassay method as described in WO 2015/158701 A1 may, for example, be polyclonal antibodies, monoclonal antibodies or genetically modified monoclonal antibodies. Said first antibody is specific for an epitope in the CgA sequence (SEQ ID NO:1), preferably in the sequence spanning amino acids 124-144 of SEQ ID NO:1. The first antibody is preferably a monoclonal antibody. Said second antibody is specific for an epitope in the CgA sequence (SEQ ID NO:1), preferably in the sequence spanning amino acids 280-301 of SEQ ID NO:1. The second antibody is preferably a monoclonal antibody. In a particular immunoassay, the first antibody is specific for an epitope in the CgA sequence (SEQ ID NO:1) spanning amino acid residues 124-144 and the second antibody is specific for an epitope in the CgA sequence (SEQ ID NO:1) spanning amino acid residues 280 -301. The first and second antibodies are preferably monoclonal antibodies. The first antibody, or an antigen-binding fragment or derivative thereof, can, for example, be produced in a 537/H2 hybridoma cell line deposited as DSM ACC3231. The antibody produced in the 537/H2 hybridoma cell line specifically binds to amino acid residues 124-144 of the CgA sequence (SEQ ID NO:1). The second antibody, or antigen-binding fragment or derivative thereof, can, for example, be produced in the 541/E2 hybridoma cell line deposited as DSM ACC3232. The antibody produced in the 541/E2 hybridoma cell line specifically binds to amino acid residues 280-301 of the CgA sequence (SEQ ID NO:1). In a specific embodiment of the immunoassay, the first antibody is generated in a 537/H2 hybridoma cell line deposited as DSM ACC3231 and the second antibody is generated in a 541/E2 hybridoma cell line deposited as DSM ACC3232.
[0045] Биомаркеры, такие как CgA, могут являться фрагментированными на более короткие пептиды или белки. Таким образом, в некоторых случаях также фрагменты CgA или других пептидных биомаркеров, таких как MMP7, можно детектировать, и их уровень в образце можно определять. Термин «фрагмент» относится к более мелким белкам или пептидам, которые можно получать из более крупных белков или пептидов, которые, таким образом, содержат частичную последовательность более крупного белка или пептида. Указанные фрагменты можно получать из более крупных белков или пептидов посредством сапонификации одной или нескольких из их пептидных связей. Указанные пептидные фрагменты предпочтительно имеют длину по меньшей мере от приблизительно 15 до приблизительно 20 аминокислот, более предпочтительно, по меньшей мере от приблизительно 25 до приблизительно 45 аминокислот.[0045] Biomarkers such as CgA may be fragmented into shorter peptides or proteins. Thus, in some cases also fragments of CgA or other peptide biomarkers such as MMP7 can be detected and their level in the sample can be determined. The term "fragment" refers to smaller proteins or peptides that can be obtained from larger proteins or peptides, which thus contain a partial sequence of a larger protein or peptide. These fragments can be obtained from larger proteins or peptides by saponification of one or more of their peptide bonds. Said peptide fragments are preferably at least about 15 to about 20 amino acids in length, more preferably at least about 25 to about 45 amino acids in length.
[0046] Измеренные уровни маркеров (CgA, MMP7 и других, в зависимости от ситуации) можно коррелировать с конкретным диагнозом и/или прогнозом, например, с использованием конкретного математического алгоритма. В контексте настоящего изобретения, «алгоритм» или «математический алгоритм» относится к использованию математического или статистического способа или модели, используемых для сравнения конкретного измеренного значения со значениями в эталонной популяции, для стратификации указанного измеренного значения. Это может, например, представлять собой медиану уровня конкретной молекулы в ансамбле подвергнутых предварительному определению образцов, что означает, что измеренный уровень указанной молекулы сравнивают с математической медианой уровня указанной молекулы в данном количестве образцов. Количество образцов, используемых для определения медианы, не является конкретно ограниченным, однако, должно быть достаточным, чтобы обеспечивать статистическую значимость медианы. Количество образцов, используемых для определения медианы, может даже увеличиваться с течением времени, поскольку значения результатов дальнейших измерений для клинических образцов добавляют, чтобы увеличивать статистическую значимость медианы. Предпочтительно, количество образцов выбирают таким образом, чтобы обеспечивать статистическую значимость медианы. Таким образом, указанную медиану используют в качестве эталонного значения, посредством чего измеренный уровень вышеупомянутой молекулы можно статистически коррелировать с конкретным физиологическим состоянием, например, предрасположенностью к неблагоприятному исходу для пациента, в зависимости от относительного уровня выше или ниже медианы, и степени отклонения измеренного значения от указанной медианы. Вместо медианы, другие статистические способы, такие как определения квантилей (например, квартилей или процентилей), или математические модели, предпочтительно, регрессию Кокса, можно использовать аналогично вышеприведенному описанию, чтобы получать вышеупомянутое эталонное значение и/или иным образом определять значимость измеренного значения применительно к физиологическому статусу данного субъекта, от которого получен образец. Указанные математические или статистические способы или модели хорошо известны специалисту в данной области, и их использование в контексте медицинских применений хорошо разработано.[0046] Measured levels of markers (CgA, MMP7, and others, as appropriate) can be correlated with a specific diagnosis and/or prognosis, for example, using a specific mathematical algorithm. In the context of the present invention, "algorithm" or "mathematical algorithm" refers to the use of a mathematical or statistical method or model used to compare a particular measured value with values in a reference population to stratify said measured value. This may, for example, be the median of the level of a particular molecule in an ensemble of predetermined samples, which means that the measured level of said molecule is compared to the mathematical median of the level of said molecule in a given number of samples. The number of samples used to determine the median is not particularly limited, but should be sufficient to ensure that the median is statistically significant. The number of samples used to determine the median may even increase over time as further measurement values for clinical samples are added to increase the statistical significance of the median. Preferably, the number of samples is chosen such that the median is statistically significant. Thus, said median is used as a reference value, whereby the measured level of the aforementioned molecule can be statistically correlated with a specific physiological state, for example, a predisposition to an adverse outcome for the patient, depending on the relative level above or below the median, and the degree of deviation of the measured value from specified median. Instead of the median, other statistical methods, such as quantile determinations (e.g., quartiles or percentiles), or mathematical models, preferably Cox regression, can be used similarly to the above description to obtain the above reference value and/or otherwise determine the significance of the measured value in relation to the physiological status of the subject from which the sample was obtained. These mathematical or statistical methods or models are well known to the person skilled in the art and their use in the context of medical applications is well established.
[0047] Термин «коррелированный» или «корреляция», как применяют в настоящем документе применительно к использованию диагностического и прогностического маркера(маркеров), относится к сравнению присутствия или уровня маркера(маркеров) у пациента с его присутствием или уровнем у индивидуумов, как известно, страдающих от, или, как известно, подверженных риску данного состояния. Уровень маркера в образце от пациента можно сравнивать с уровнем, как известно, ассоциированным со специфическим диагнозом. Говорят, что уровень маркера в образце коррелирован с диагнозом; то есть, специалист в данной области может использовать уровень маркера для определения того, страдает ли пациент специфическим типом заболевания, и принимать соответствующие ответные меры. Альтернативно, уровень маркера в образце можно сравнивать с уровнем маркера, как известно, ассоциированным с хорошим исходом (например, отсутствием заболевания и т.д.). В предпочтительных вариантах осуществления, панель уровней маркеров коррелирует с глобальной вероятностью или конкретным исходом.[0047] The term "correlated" or "correlation" as used herein in relation to the use of a diagnostic and prognostic marker(s) refers to comparing the presence or level of a marker(s) in a patient with its presence or level in individuals known to suffering from, or known to be at risk for, the condition. The level of the marker in a sample from a patient can be compared to a level known to be associated with a specific diagnosis. The level of the marker in the sample is said to be correlated with the diagnosis; that is, one of skill in the art can use the level of the marker to determine if a patient is suffering from a particular type of disease and take appropriate responses. Alternatively, the level of the marker in the sample can be compared to the level of the marker known to be associated with a good outcome (eg, absence of disease, etc.). In preferred embodiments, the bar of marker levels correlates with a global probability or a particular outcome.
[0048] В других вариантах осуществления, отношение правдоподобия положительного результата исследования, отношение правдоподобия отрицательного результата исследования, отношение шансов или отношение рисков используют в качестве показателя способности теста предсказывать риск или диагностировать заболевание. В случае отношения правдоподобия положительного результата исследования, значение 1 показывает, что положительный результат является равновероятным среди субъектов как в «пораженной заболеванием», так и в «контрольной» группах; значение больше чем 1 показывает, что положительный результат является более вероятным в пораженной заболеванием группе; и значение меньше чем 1 показывает, что положительный результат является более вероятным в контрольной группе. В случае отношения правдоподобия отрицательного результата исследования, значение 1 показывает, что отрицательный результат является равновероятным среди субъектов как в «пораженной заболеванием», так и в «контрольной» группах; значение больше чем 1 показывает, что отрицательный результат является более вероятным в тестируемой группе; и значение меньше чем 1 показывает, что отрицательный результат является более вероятным в контрольной группе. В конкретных предпочтительных вариантах осуществления, выбирают маркеры и/или панели маркеров, предпочтительно, имеющие отношение правдоподобия положительного или отрицательного результата исследования по меньшей мере приблизительно 1,5 или более или приблизительно 0,67 или менее, более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 2 или более или приблизительно 0,5 или менее, еще более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 5 или более или приблизительно 0,2 или менее, даже более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 10 или более или приблизительно 0,1 или менее, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 20 или более или приблизительно 0,05 или менее. Термин «приблизительно» в этом контексте относится к +/- 5% от данного измерения.[0048] In other embodiments, a positive likelihood ratio, a negative likelihood ratio, an odds ratio, or a hazard ratio is used as an indicator of a test's ability to predict risk or diagnose a disease. In the case of a likelihood ratio of a positive study result, a value of 1 indicates that a positive result is equally likely among subjects in both the "diseased" and "control" groups; a value greater than 1 indicates that a positive result is more likely in the affected group; and a value less than 1 indicates that a positive result is more likely in the control group. In the case of a likelihood ratio of a negative test result, a value of 1 indicates that a negative result is equally likely among subjects in both the "diseased" and "control" groups; a value greater than 1 indicates that a negative result is more likely in the test group; and a value less than 1 indicates that a negative result is more likely in the control group. In particular preferred embodiments, markers and/or marker panels are selected, preferably having a positive or negative likelihood ratio of at least about 1.5 or more or about 0.67 or less, more preferably at least about 2 or more or about 0.5 or less, even more preferably at least about 5 or more or about 0.2 or less, even more preferably at least about 10 or more or about 0.1 or less, and most preferably , at least about 20 or more, or about 0.05 or less. The term "approximately" in this context refers to +/- 5% of a given measurement.
[0049] В случае отношения шансов, значение 1 показывает, что положительный результат является равновероятным среди субъектов как в «пораженной заболеванием», так и в «контрольной» группах; значение больше чем 1 показывает, что положительный результат является более вероятным в пораженной заболеванием группе; и значение меньше чем 1 показывает, что положительный результат является более вероятным в контрольной группе. В конкретных предпочтительных вариантах осуществления, выбирают маркеры и/или панели маркеров, предпочтительно, имеющие отношение шансов по меньшей мере приблизительно 2 или более, или приблизительно 0,5 или менее, более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 3 или более или приблизительно 0,33 или менее, еще более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 4 или более или приблизительно 0,25 или менее, даже более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 5 или более, или приблизительно 0,2 или менее, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 10 или более или приблизительно 0,1 или менее. Термин «приблизительно» в этом контексте относится к +/- 5% от данного измерения.[0049] In the case of an odds ratio, a value of 1 indicates that a positive result is equally likely among subjects in both the "diseased" and "control" groups; a value greater than 1 indicates that a positive result is more likely in the affected group; and a value less than 1 indicates that a positive result is more likely in the control group. In specific preferred embodiments, markers and/or marker panels are selected, preferably having an odds ratio of at least about 2 or more, or about 0.5 or less, more preferably at least about 3 or more, or about 0.33 or less, even more preferably at least about 4 or more, or about 0.25 or less, even more preferably at least about 5 or more, or about 0.2 or less, and most preferably at least about 10 or more, or about 0.1 or less. The term "approximately" in this context refers to +/- 5% of a given measurement.
[0050] В случае отношения рисков, значение 1 показывает, что относительный риск конечной точки (например, смерти) является равным как в «пораженной заболеванием», так и в «контрольной» группах; значение больше чем 1 показывает, что риск является более высоким в пораженной заболеванием группе; и значение меньше чем 1 показывает, что риск является более высоким в контрольной группе. В конкретных предпочтительных вариантах осуществления, выбирают маркеры и/или панели маркеров, предпочтительно, имеющие отношение рисков по меньшей мере приблизительно 1,1 или более, или приблизительно 0,91 или менее, более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 1,25 или более, или приблизительно 0,8 или менее, еще более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 1,5 или более, или приблизительно 0,67 или менее, даже более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 2 или более, или приблизительно 0,5 или менее, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 2,5 или более или приблизительно 0,4 или менее. Термин «приблизительно» в этом контексте относится к +/- 5% от данного измерения.[0050] In the case of a hazard ratio, a value of 1 indicates that the relative risk of an endpoint (eg, death) is equal in both the "diseased" and "control" groups; a value greater than 1 indicates that the risk is higher in the affected group; and a value less than 1 indicates that the risk is higher in the control group. In specific preferred embodiments, markers and/or marker panels are selected, preferably having a hazard ratio of at least about 1.1 or more, or about 0.91 or less, more preferably at least about 1.25 or more, or about 0.8 or less, even more preferably at least about 1.5 or more, or about 0.67 or less, even more preferably at least about 2 or more, or about 0.5 or less, and most preferably at least about 2.5 or more, or about 0.4 or less. The term "approximately" in this context refers to +/- 5% of a given measurement.
[0051] Чувствительность и специфичность диагностического и/или прогностического теста зависит от большего, чем просто аналитическое «качество» теста, они также зависят от определения того, что составляет аномальный результат. На практике, рабочие характеристические кривые (кривые ROC), как правило, рассчитывают посредством нанесения на график значения переменной в зависимости от ее относительной частоты в «нормальной» (т.е., по-видимому, здоровой) и «пораженной заболеванием» популяциях (т.е., у пациентов, страдающих раком мочевого пузыря, в частности, не нейроэндокринным раком мочевого пузыря и предпочтительно, уротелиальной карциномой). Для любого конкретного маркера, распределение уровней маркера для субъектов с заболеванием и без, вероятно, могут перекрываться. В таких условиях, тест не отличает абсолютно норму от заболевания со 100% точностью, и область перекрывания показывает, где тест не может отличать норму от заболевания. Выбирают порог, выше которого (или ниже которого, в зависимости от того, как маркер изменяется при заболевании) тест рассматривают как аномальный, и ниже которого тест рассматривают как нормальный. Площадь под кривой ROC является показателем вероятности того, что наблюдаемое измерение может позволять корректную идентификацию состояния. Кривые ROC можно использовать, даже когда результаты теста не обязательно дают точное количество. При условии, что можно ранжировать результаты, можно получать кривую ROC. Например, результаты теста для «пораженных заболеванием» образцов можно ранжировать в соответствии со степенью (например, 1=низкая, 2=нормальная, и 3=высокая). Это ранжирование можно коррелировать с результатами в «нормальной» популяции, и получать кривую ROC. Эти способы хорошо известны в данной области (см., например, Hanley et al.1982. Radiology 143: 29-36). Предпочтительно, для кривых ROC получают AUC больше чем приблизительно 0,5, более предпочтительно, больше чем приблизительно 0,7, еще более предпочтительно, больше чем приблизительно 0,8, даже более предпочтительно, больше чем приблизительно 0,85, и наиболее предпочтительно, больше чем приблизительно 0,9. Термин «приблизительно» в этом контексте относится к +/- 5% от данного измерения.[0051] The sensitivity and specificity of a diagnostic and/or predictive test depends on more than just the analytical "quality" of the test, they also depend on determining what constitutes an abnormal result. In practice, operating characteristic curves (ROC curves) are typically calculated by plotting the value of a variable against its relative frequency in "normal" (i.e. apparently healthy) and "diseased" populations ( i.e., in patients suffering from bladder cancer, in particular non-neuroendocrine bladder cancer and preferably urothelial carcinoma). For any particular marker, the distribution of marker levels for subjects with and without disease is likely to overlap. Under such conditions, the test does not absolutely distinguish normal from disease with 100% accuracy, and the area of overlap indicates where the test cannot distinguish normal from disease. A threshold is chosen above which (or below which, depending on how the marker changes with disease) a test is considered abnormal, and below which a test is considered normal. The area under the ROC curve is a measure of the likelihood that the observed measurement can allow correct identification of the condition. ROC curves can be used even when test results do not necessarily give an accurate count. As long as you can rank the results, you can get the ROC curve. For example, test results for "diseased" samples can be ranked according to grade (eg, 1=low, 2=normal, and 3=high). This ranking can be correlated with the results in the "normal" population, and get the ROC curve. These methods are well known in the art (see, for example, Hanley et al. 1982. Radiology 143: 29-36). Preferably, ROC curves produce an AUC greater than about 0.5, more preferably greater than about 0.7, even more preferably greater than about 0.8, even more preferably greater than about 0.85, and most preferably, greater than about 0.9. The term "approximately" in this context refers to +/- 5% of a given measurement.
[0052] Горизонтальная ось кривой ROC представляет (1-специфичность), которая увеличивается с долей ложноположительных результатов. Вертикальная ось кривой представляет чувствительность, которая увеличивается с долей истинно положительных результатов. Таким образом, для конкретного выбранного порога отсечения, можно определять значение (1-специфичность), и можно получать соответствующую чувствительность. Площадь под кривой ROC является мерой вероятности того, что измеренный уровень маркера может позволять корректную идентификацию заболевания или состояния. Таким образом, площадь под кривой ROC можно использовать для определения эффективности теста.[0052] The horizontal axis of the ROC curve represents (1-specificity), which increases with the proportion of false positives. The vertical axis of the curve represents sensitivity, which increases with the proportion of true positives. Thus, for a particular cut-off threshold chosen, a value (1-specificity) can be determined and an appropriate sensitivity can be obtained. The area under the ROC curve is a measure of the likelihood that the measured level of a marker may allow the correct identification of a disease or condition. Thus, the area under the ROC curve can be used to determine the effectiveness of the test.
[0053] В конкретных вариантах осуществления, выбирают маркеры и/или панели маркеров, чтобы они имели по меньшей мере приблизительно 70% чувствительность, более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 80% чувствительность, даже более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 85% чувствительность, еще более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 90% чувствительность, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 95% чувствительность, в сочетании с по меньшей мере приблизительно 70% специфичностью, более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 80% специфичностью, даже более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 85% специфичностью, еще более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 90% специфичностью, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 95% специфичностью. В особенно предпочтительных вариантах осуществления, как чувствительность, так и специфичность составляют по меньшей мере приблизительно 75%, более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 80%, даже более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 85%, еще более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 90%, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере приблизительно 95%. Термин «приблизительно» в этом контексте относится к +/- 5% от данного измерения.[0053] In specific embodiments, markers and/or marker panels are selected to have at least about 70% sensitivity, more preferably at least about 80% sensitivity, even more preferably at least about 85% sensitivity, even more preferably at least about 90% sensitivity, and most preferably at least about 95% sensitivity, combined with at least about 70% specificity, more preferably at least about 80% specificity, even more preferably, at least about 85% specificity, even more preferably at least about 90% specificity, and most preferably at least about 95% specificity. In particularly preferred embodiments, both sensitivity and specificity are at least about 75%, more preferably at least about 80%, even more preferably at least about 85%, even more preferably at least about 90 %, and most preferably at least about 95%. The term "approximately" in this context refers to +/- 5% of a given measurement.
[0054] Подходящие пороговые уровни для «стратификации субъектов» на различные группы (категории) следует определять для каждой конкретной комбинации уровня CgA, дополнительных маркеров (таких как MMP7) и/или параметров, лекарственных средств и заболевания. Это можно, например, осуществлять посредством группировки эталонной популяции пациентов в соответствии с их уровнем CgA на конкретные квантили, например, квартили, квинтили, или даже в соответствии с подходящими процентилями. Для каждой из квантилей или групп выше и ниже определенных процентилей, можно рассчитывать отношения рисков, сравнивающие риск неблагоприятного исхода, т.е. «неблагоприятный эффект», например, в отношении показателя выживаемости, между теми пациентами, которым вводили конкретное лекарственное средство, и теми, которым не вводили. По такому сценарию, отношение рисков (HR) выше 1 указывает на более высокий риск неблагоприятного исхода для пациентов, которых подвергали лечению, чем для пациентов, которых не подвергали. HR ниже 1 указывает на благоприятные эффекты конкретного лечения в группе пациентов. HR около 1 (например, +/- 0,1) указывает на отсутствие увеличения риска, но также на отсутствие преимущества от лекарственного средства для конкретной группы пациентов. Посредством сравнения HR между конкретными квантилями пациентов друг с другом и с HR общей популяции пациентов, является возможным идентифицировать те квантили пациентов, которые имеют увеличенный риск, и те, которые получают преимущество от лекарственного средства, и таким образом стратифицировать субъектов в соответствии с настоящим изобретением.[0054] Appropriate threshold levels for "stratification of subjects" into different groups (categories) should be determined for each specific combination of CgA level, additional markers (such as MMP7) and/or parameters, drugs and diseases. This can, for example, be done by grouping a reference population of patients according to their CgA level into specific quantiles, eg quartiles, quintiles, or even according to suitable percentiles. For each of the quantiles or groups above and below certain percentiles, hazard ratios can be calculated comparing the risk of a poor outcome, i.e. an "adverse effect", for example, in terms of survival rate, between those patients who were administered a particular drug and those who were not. In this scenario, a hazard ratio (HR) greater than 1 indicates a higher risk of adverse outcome for treated patients than for untreated patients. An HR below 1 indicates beneficial effects of a particular treatment in a group of patients. An HR of about 1 (eg +/- 0.1) indicates no increase in risk, but also no benefit from the drug for a particular patient population. By comparing the HR between specific patient quantiles with each other and with the HR of the general patient population, it is possible to identify those patient quantiles that are at increased risk and those that benefit from the drug, and thus stratify the subjects according to the present invention.
[0055] Термин «стратификация по терапевтическому лечению» или «стратификация терапии» в контексте настоящего изобретения относится к оценке подходящего терапевтического лечения для указанного пациента. Подклассификация относится к дополнительному определению диагноза в соответствии с подклассами диагностированного заболевания, нарушения, осложнения или риска, например, к определению в соответствии с мягкой и тяжелой формами заболевания. Термин «мониторирование терапии» в контексте настоящего изобретения относится к контролю и/или корректировке терапевтического лечения указанного пациента.[0055] The term "therapeutic treatment stratification" or "therapy stratification" in the context of the present invention refers to the evaluation of an appropriate therapeutic treatment for a specified patient. Subclassification refers to an additional definition of a diagnosis according to subclasses of the diagnosed disease, disorder, complication, or risk, such as a definition according to mild and severe disease. The term "monitoring therapy" in the context of the present invention refers to the control and/or adjustment of therapeutic treatment of the specified patient.
[0056] Настоящее изобретение также относится к способам лечения не нейроэндокринного рака мочевого пузыря, где уровень CgA (и необязательно, дополнительных маркеров и/или клинических параметров, таких как уровень MMP7) определяют, чтобы определить наиболее подходящее лечение. Например, пациент, имеющий, в соответствии с определенным увеличенным уровнем CgA, относительно плохой прогноз, может получать преимущество от более агрессивного лечения, например, частичной цистэктомии вместо TURBT или трехкомпонентного сохранения мочевого пузыря, RCE вместо TURBT или трехкомпонентного лечения с сохранением мочевого пузыря, или частичной цистэктомии, RCE в комбинации с PLND вместо RCE, расширенной или суперрасширенной LND вместо PLND, адъювантной химиотерапии или радиотерапии вместо одного хирургического вмешательства, дополнительной метастазэктомии. Этого пациента с высоким риском можно также выбирать для клинических исследований, тестирующих новые лекарственные средства.[0056] The present invention also relates to methods for treating non-neuroendocrine bladder cancer, wherein CgA levels (and optionally, additional markers and/or clinical parameters such as MMP7 levels) are determined to determine the most appropriate treatment. For example, a patient having a relatively poor prognosis according to a certain elevated CgA level may benefit from more aggressive treatment, such as partial cystectomy instead of TURBT or triple bladder sparing, RCE instead of TURBT or triple bladder sparing treatment, or partial cystectomy, RCE in combination with PLND instead of RCE, extended or super-expanded LND instead of PLND, adjuvant chemotherapy or radiotherapy instead of one surgery, additional metastasectomy. This high-risk patient may also be selected for clinical trials testing new drugs.
[0057] Кроме того, настоящее изобретение относится к использованию наборов, содержащих антитела, специфические для CgA, и необязательно, антитела, специфические для MMP7, для прогнозирования, оценки риска, стратификации риска, мониторирования и/или контроля терапии рака мочевого пузыря, в частности, не нейроэндокринного рака мочевого пузыря и предпочтительно, уротелиальной карциномы. Наборы могут также содержать дополнительные компоненты, такие как буферы и инструкции для использования. Предпочтительный набор для детекции CgA описан в WO 2015/158701 A1 и содержит[0057] In addition, the present invention relates to the use of kits containing antibodies specific for CgA, and optionally antibodies specific for MMP7, for predicting, risk assessment, risk stratification, monitoring and/or control of bladder cancer therapy, in particular , non neuroendocrine bladder cancer and preferably urothelial carcinoma. Kits may also contain additional components such as buffers and instructions for use. A preferred CgA detection kit is described in WO 2015/158701 A1 and contains
(i) первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное, являющееся специфическим для CgA или его фрагмента; и(i) a first antibody or antigen-binding fragment or derivative thereof that is specific for CgA or a fragment thereof; and
(ii) второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное, являющееся специфическим для CgA или его фрагмента.(ii) a second antibody or antigen-binding fragment or derivative thereof that is specific for CgA or a fragment thereof.
Первое и второе антитела из набора, предпочтительно, являются специфическими для одних и тех же фрагмента или фрагментов CgA. Например, (i) первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное являются специфическими для эпитопа, содержащегося внутри последовательности из SEQ ID NO:1; и/или (ii) второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное являются специфическими для эпитопа, содержащегося внутри последовательности из SEQ ID NO:1. Предпочтительно, первое антитело из набора представляет собой моноклональное антитело против CgA, полученное в линии клеток гибридомы 537/H2, депонированной как DSM ACC3231, и/или второе антитело представляет собой моноклональное антитело против CgA, полученное в линии клеток гибридомы 541/E2, депонированной как DSM ACC3232.The first and second antibodies of the set are preferably specific for the same CgA fragment or fragments. For example, (i) the first antibody or antigen-binding fragment or derivative thereof is specific for an epitope contained within the sequence of SEQ ID NO:1; and/or (ii) the second antibody, or antigen-binding fragment or derivative thereof, is specific for an epitope contained within the sequence of SEQ ID NO:1. Preferably, the first antibody of the kit is an anti-CgA monoclonal antibody generated in a 537/H2 hybridoma cell line deposited as DSM ACC3231 and/or the second antibody is an anti-CgA monoclonal antibody generated in a 541/E2 hybridoma cell line deposited as DSM ACC3232.
Набор может содержать одно или несколько антител для детекции MMP7. Например, набор (кроме того) содержитThe kit may contain one or more antibodies for detecting MMP7. For example, the set (in addition) contains
(i) первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное, являющееся специфическим для MMP7 или ее фрагмента; и(i) a first antibody or antigen-binding fragment or derivative thereof that is specific for MMP7 or a fragment thereof; and
(ii) второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное, являющееся специфическим для MMP7 или ее фрагмента.(ii) a second antibody or antigen-binding fragment or derivative thereof that is specific for MMP7 or a fragment thereof.
Первое и второе антитела из набора, предпочтительно, являются специфическими для одних и тех же фрагмента или фрагментов MMP7. Например, (i) первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное являются специфическими для эпитопа, содержащегося внутри последовательности из SEQ ID NO:2; и/или (ii) второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или производное являются специфическими для эпитопа, содержащегося внутри последовательности из SEQ ID NO:2.The first and second antibodies of the set are preferably specific for the same fragment or fragments of MMP7. For example, (i) the first antibody or antigen-binding fragment or derivative thereof is specific for an epitope contained within the sequence of SEQ ID NO:2; and/or (ii) the second antibody, or antigen-binding fragment or derivative thereof, is specific for an epitope contained within the sequence of SEQ ID NO:2.
[0058] Настоящее изобретение в предпочтительных аспектах относится к:[0058] The present invention relates in preferred aspects to:
1. Применению хромогранина A (CgA) в качестве прогностического маркера для рака мочевого пузыря.1. The use of chromogranin A (CgA) as a prognostic marker for bladder cancer.
2. Применению в соответствии с аспектом 1, где рак мочевого пузыря представляет собой не нейроэндокринный рак мочевого пузыря.2. Use according to aspect 1, wherein the bladder cancer is non-neuroendocrine bladder cancer.
3. Применению в соответствии с аспектом 1, где рак мочевого пузыря выбран из группы, состоящей из уротелиальной карциномы мочевого пузыря, плоскоклеточной карциномы мочевого пузыря и аденокарциномы мочевого пузыря, предпочтительно, где рак мочевого пузыря представляет собой уротелиальную карциному мочевого пузыря.3. The use according to aspect 1 wherein the bladder cancer is selected from the group consisting of bladder urothelial carcinoma, bladder squamous cell carcinoma and bladder adenocarcinoma, preferably wherein the bladder cancer is bladder urothelial carcinoma.
4. Применению в соответствии с аспектом 3, где рак мочевого пузыря представляет собой не мышечно-инвазивный рак мочевого пузыря (NMBC) или мышечно-инвазивный рак мочевого пузыря (MIBC).4. Use according to aspect 3, wherein the bladder cancer is non-muscle invasive bladder cancer (NMBC) or muscle invasive bladder cancer (MIBC).
5. Применению в соответствии с аспектами 1-4, где CgA используют в качестве маркера в анализе in vitro для прогнозирования, оценки риска, стратификации риска, мониторирования и/или контроля терапии рака мочевого пузыря.5. The use according to aspects 1-4 wherein CgA is used as a marker in an in vitro assay for predictive, risk assessment, risk stratification, monitoring and/or control of bladder cancer therapy.
6. Способу прогнозирования, оценки риска, стратификации риска, мониторирования и/или контроля терапии рака мочевого пузыря у субъекта, включающему стадию определения уровня CgA в образце физиологической жидкости указанного субъекта.6. A method for predicting, assessing risk, risk stratifying, monitoring and/or controlling therapy for bladder cancer in a subject, comprising the step of determining the level of CgA in a sample of body fluid of said subject.
7. Способу в соответствии с аспектом 6, где рак мочевого пузыря представляет собой не нейроэндокринный рак мочевого пузыря.7. The method of aspect 6 wherein the bladder cancer is non-neuroendocrine bladder cancer.
8. Способу по п.5 или 6, где рак мочевого пузыря выбран из группы, состоящей из уротелиальной карциномы мочевого пузыря, плоскоклеточной карциномы мочевого пузыря и аденокарциномы мочевого пузыря, предпочтительно, где рак мочевого пузыря представляет собой уротелиальную карциному мочевого пузыря.8. The method of claim 5 or 6 wherein the bladder cancer is selected from the group consisting of bladder urothelial carcinoma, bladder squamous cell carcinoma and bladder adenocarcinoma, preferably wherein the bladder cancer is bladder urothelial carcinoma.
9. Способу в соответствии с аспектом 8, где рак мочевого пузыря представляет собой не мышечно-инвазивный рак мочевого пузыря (NMBC) или мышечно-инвазивный рак мочевого пузыря (MIBC).9. The method of aspect 8 wherein the bladder cancer is non-muscle invasive bladder cancer (NMBC) or muscle invasive bladder cancer (MIBC).
10. Способу в соответствии с аспектами 6-9, где уровень CgA в образце от субъекта является показателем тяжести рака мочевого пузыря и/или исхода для субъекта.10. The method according to aspects 6-9, wherein the level of CgA in a sample from a subject is indicative of bladder cancer severity and/or outcome for the subject.
11. Способу в соответствии с аспектом 10, где увеличенный уровень CgA в образце от субъекта по сравнению с контрольным уровнем или предопределенным порогом является показателем плохого исхода для субъекта.11. The method of aspect 10 wherein an increased level of CgA in a sample from a subject compared to a control level or a predetermined threshold is indicative of poor outcome for the subject.
12. Способу в соответствии с аспектом 10, где уровень CgA в образце от субъекта является показателем для общей выживаемости субъекта или специфической для заболевания выживаемости субъекта, или выживаемости субъекта без прогрессирования.12. The method of aspect 10, wherein the level of CgA in the sample from the subject is indicative of the subject's overall survival, or the subject's disease-specific survival, or the subject's progression-free survival.
13. Способу в соответствии с аспектом 12, где плохой исход представляет собой увеличенный риск уменьшенной ожидаемой продолжительности жизни, увеличенный риск прогрессирования, увеличенный риск связанной со злокачественной опухолью смерти и/или увеличенный риск рецидива после хирургического лечения и/или лечения с использованием лекарственного средства, и/или радиотерапии.13. The method of aspect 12, wherein the poor outcome is an increased risk of reduced life expectancy, an increased risk of progression, an increased risk of cancer-related death, and/or an increased risk of recurrence after surgery and/or drug treatment, and/or radiotherapy.
14. Способу в соответствии с любым из аспектов 6-13, где у субъекта диагностирован рак мочевого пузыря, и где субъекта не подвергали хирургическому лечению указанного рака мочевого пузыря.14. The method according to any one of aspects 6-13, wherein the subject is diagnosed with bladder cancer and wherein the subject has not undergone surgical treatment for said bladder cancer.
15. Способу в соответствии с любым из аспектов 6-13, где субъекта подвергали хирургическому лечению указанного рака мочевого пузыря.15. The method according to any one of aspects 6-13, wherein the subject has undergone surgical treatment of said bladder cancer.
16. Способу в соответствии с аспектом 15, где субъекта подвергали радикальной цистэктомии указанного рака мочевого пузыря.16. The method of aspect 15 wherein the subject has undergone a radical cystectomy of said bladder cancer.
17. Способу в соответствии с любым из аспектов 11-16, где предопределенный порог для уровня CgA выбран в диапазоне от 100 нг/мл до 431 нг/мл, предпочтительно, в диапазоне от 103 нг/мл до 191 нг/мл, более предпочтительно, от 130 нг/мл до 160 нг/мл, и наиболее предпочтительно, порог составляет 147 нг/мл.17. The method according to any one of aspects 11-16, wherein the predetermined threshold for CgA level is selected in the range of 100 ng/mL to 431 ng/mL, preferably in the range of 103 ng/mL to 191 ng/mL, more preferably , from 130 ng/ml to 160 ng/ml, and most preferably, the threshold is 147 ng/ml.
18. Способу по любому из аспектов 6-17, где кроме того, уровень матриксной металлопротеиназы 7 (MMP7) определяют в указанном образце от указанного субъекта, и где уровень MMP7 в образце от субъекта является показателем тяжести рака мочевого пузыря и/или исхода для субъекта.18. The method of any one of aspects 6-17, wherein further, the level of matrix metalloproteinase 7 (MMP7) is determined in said sample from said subject, and wherein the level of MMP7 in the sample from the subject is indicative of bladder cancer severity and/or outcome for the subject .
19. Способу в соответствии с аспектом 18, где увеличенный уровень MMP7 в образце от субъекта по сравнению с контрольным уровнем или предопределенным порогом является показателем плохого исхода для субъекта, в частности, увеличенного риска уменьшенной ожидаемой продолжительности жизни, увеличенного риска прогрессирования, увеличенного риска связанной с злокачественной опухолью смерти и/или увеличенного риска рецидива после хирургического лечения и/или лечения с использованием лекарственного средства, и/или радиотерапии.19. The method of aspect 18 wherein an increased level of MMP7 in a sample from a subject compared to a control level or a predetermined threshold is indicative of a poor outcome for the subject, in particular an increased risk of reduced life expectancy, an increased risk of progression, an increased risk of associated cancer death and/or increased risk of recurrence after surgery and/or drug treatment and/or radiotherapy.
20. Способу в соответствии с аспектом 18, где уровень MMP7 в образце от субъекта является показателем для общей выживаемости субъекта или специфической для заболевания выживаемости субъекта, или выживаемости субъекта без прогрессирования.20. The method of aspect 18, wherein the level of MMP7 in the sample from the subject is indicative of the subject's overall survival, or the subject's disease-specific survival, or the subject's progression-free survival.
21. Способу в соответствии с аспектом 19, где предопределенный порог для уровня MMP7 выбран в диапазоне от 4,4 до 21 нг/мл, предпочтительно, в диапазоне от 5,4 до 10,1 нг/мл, более предпочтительно, в диапазоне от 6 до 9 нг/мл, наиболее предпочтительно, предопределенный порог для уровня MMP7 составляет 7,75 нг/мл.21. The method according to aspect 19, wherein the predetermined threshold for the MMP7 level is selected in the range of 4.4 to 21 ng/mL, preferably in the range of 5.4 to 10.1 ng/mL, more preferably in the range of 6 to 9 ng/ml, most preferably, the predetermined threshold for the MMP7 level is 7.75 ng/ml.
22. Способу в соответствии с любым из аспектов 11-21, где22. The method in accordance with any of aspects 11-21, where
(i) уровень CgA в указанном образце выше предопределенного порога для CgA является показателем высокого риска связанной со злокачественной опухолью смерти после хирургического лечения и/или лечения с использованием лекарственного средства, и/или радиотерапии, и(i) a CgA level in said sample above a predetermined threshold for CgA is indicative of a high risk of cancer-related death following surgery and/or drug treatment and/or radiotherapy, and
(ii) уровень CgA в указанном образце выше предопределенного порога для CgA и уровень MMP7 в указанном образце или другом образце от того же субъекта выше предопределенного порога для MMP7 является показателем очень высокого риска связанной со злокачественной опухолью смерти и более короткой продолжительности жизни после хирургического лечения и/или лечения с использованием лекарственного средства, и/или радиотерапии.(ii) the CgA level in said sample is above a predetermined CgA threshold and the MMP7 level in said sample or another sample from the same subject is above a predetermined MMP7 threshold is indicative of a very high risk of cancer-related death and shorter life expectancy after surgical treatment, and /or drug treatment and/or radiotherapy.
23. Способу в соответствии с любым из аспектов 11-22, где уровень CgA и необязательно, MMP7 определяют через регулярные интервалы времени в ходе последующего наблюдения, и где контрольный уровень представляет собой соответствующий уровень, определенный до указанного хирургического лечения и/или на начальной стадии последующего наблюдения.23. The method according to any one of aspects 11-22, wherein the CgA level and optionally MMP7 is determined at regular intervals during follow-up, and where the control level is the appropriate level determined prior to said surgical treatment and/or at the initial stage follow-up.
24. Способу в соответствии с любым из аспектов 6-23, где дополнительно определяют клинический параметр для субъекта, выбранный из группы, состоящей из гистологического подтипа опухоли, статуса метастазирования (в лимфатических узлах и отдаленного), лимфаденопатии, курения или употребления табака, возраста, пола, семейного анамнеза, этнической принадлежности, массы тела, индекса массы тела (BMI), цистоскопических данных, цитологии мочи (VUC), ультразвукового исследования, сканирования КТ, ЯМР и TURBT, и кровяного давления.24. The method according to any one of aspects 6-23, further comprising determining a clinical parameter for the subject selected from the group consisting of tumor histological subtype, metastasis status (lymph node and distant), lymphadenopathy, smoking or tobacco use, age, gender, family history, ethnicity, body weight, body mass index (BMI), cystoscopy, urine cytology (VUC), ultrasound, CT, MRI, and TURBT scans, and blood pressure.
25. Способу в соответствии с любым из аспектов 6-24, где дополнительно определяют уровень маркера, выбранного из группы, состоящей из родственного фактору комплемента H белка и фактора комплемента H, белка ядерного матрикса BLCA-4, цитокератина 8 (CK8), цитокератина 18 (CK18), белка CEA и ассоциированных с клетками опухоли мочевого пузыря муцинов, изменений на хромосомах 3, 7, 17 и 9p21, белка CEA (CEA), белка 22 ядерного митотического аппарата (NMP22), щелочной фосфатазы, тканевого ингибитора металлопротеиназ 1 (TIMP-1) и тканевого ингибитора металлопротеиназ 2 (TIMP-2) в указанном образце или другом образце от субъекта.25. The method according to any of aspects 6-24 further comprising determining the level of a marker selected from the group consisting of complement factor H related protein and complement factor H, nuclear matrix protein BLCA-4, cytokeratin 8 (CK8), cytokeratin 18 (CK18), CEA protein and bladder tumor cell-associated mucins, changes on
26. Способу в соответствии с любым из аспектов 6-25, где образец происходит из физиологической жидкости, выбранной из цельной крови, сыворотки, плазмы и мочи.26. The method according to any one of aspects 6-25, wherein the sample is from a bodily fluid selected from whole blood, serum, plasma, and urine.
27. Способу в соответствии с любым из аспектов 6-26, где уровень CgA и/или MMP7 определяют с использованием иммуноанализа.27. The method according to any one of aspects 6-26, wherein the level of CgA and/or MMP7 is determined using an immunoassay.
28. Способу по аспекту 27, где иммуноанализ выбран из группы, состоящей из радиоиммунного анализа (RIA), хемилюминесцентного и флюоресцентного иммуноанализа, иммуноферментного анализа (EIA), твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA), анализа массива на основе бусин с Luminex, анализа микромассива белка и теста на иммунохроматографических полосках.28. The method of aspect 27 wherein the immunoassay is selected from the group consisting of radioimmunoassay (RIA), chemiluminescent and fluorescent immunoassay, enzyme immunoassay (EIA), ELISA, Luminex bead array assay, protein microarray assay and test on immunochromatographic strips.
29. Способу по аспекту 28, где иммуноанализ представляет собой сэндвич-иммуноанализ с использованием первого и второго антитела, специфических для CgA.29. The method of aspect 28 wherein the immunoassay is a sandwich immunoassay using first and second antibodies specific for CgA.
30. Способу в соответствии с аспектом 29, отличающемуся тем, что одно из антител является меченым, а другое антитело является связанным с твердой фазой или может быть избирательно связано с твердой фазой.30. The method according to aspect 29, wherein one of the antibodies is labeled and the other antibody is solid phase bound or may be selectively bound to the solid phase.
31. Способу иммуноанализа в соответствии с аспектом 30, где первое и второе антитело присутствуют в форме дисперсий в жидкой реакционной смеси, и где первый метящий компонент, являющийся частью системы мечения, основанной на гашении или усилении флуоресценции или хемилюминесценции, связан с первым антителом, и второй метящий компонент указанной системы мечения связан с вторым антителом, так что после связывания обоих антител с CgA образуется поддающийся измерению сигнал, позволяющий детекцию полученных сэндвич-комплексов в измеряемом растворе.31. The method of immunoassay according to aspect 30, wherein the first and second antibodies are present in the form of dispersions in a liquid reaction mixture, and where the first labeling component, which is part of a labeling system based on quenching or enhancing fluorescence or chemiluminescence, is associated with the first antibody, and the second labeling component of said labeling system is coupled to the second antibody so that after binding of both antibodies to CgA, a measurable signal is generated allowing detection of the resulting sandwich complexes in the measured solution.
32. Способу иммуноанализа в соответствии с аспектом 31, отличающемуся тем, что система мечения содержит криптаты или хелаты редкоземельных металлов в комбинации с флуоресцентным красителем или хемилюминесцентным красителем, в частности, красителем цианинового типа.32. An immunoassay method according to aspect 31, wherein the labeling system comprises rare earth metal cryptates or chelates in combination with a fluorescent dye or a chemiluminescent dye, in particular a cyanine type dye.
33. Способу использования уровней хромогранина A (CgA) в образце физиологической жидкости субъекта в качестве прогностического маркера для рака мочевого пузыря.33. A method of using chromogranin A (CgA) levels in a subject's body fluid sample as a prognostic marker for bladder cancer.
Процитированные ссылкиCited links
[0059] Полное содержание ссылок, процитированных в настоящем описании, таким образом, приведено в качестве ссылки.[0059] The entire contents of the references cited in the present description are hereby incorporated by reference.
Alijo Serrano, F., N. Sanchez-Mora, J. Angel Arranz, C. Hernandez & E. Alvarez-Fernandez (2007) Large cell and small cell neuroendocrine bladder carcinoma: immunohistochemical and outcome study in a single institution. Am J Clin Pathol, 128, 733-9.Alijo Serrano, F., N. Sanchez-Mora, J. Angel Arranz, C. Hernandez & E. Alvarez-Fernandez (2007) Large cell and small cell neuroendocrine bladder carcinoma: an immunohistochemical and outcome study in a single institution. Am J Clin Pathol, 128, 733-9.
Babjuk, M. (2009) Transurethral Resection of Non-muscle-invasive Bladder Cancer. European Urology Supplements, 8, 542-548.Babjuk, M. (2009) Transurethral Resection of Non-muscle-invasive Bladder Cancer. European Urology Supplements, 8, 542-548.
Bagchi, A., K. Dushaj, A. Shrestha, A. L. Leytin, S. A. Bhuiyan, F. Radparvar, S. Topchik, S. S. Tuli, P. Kim & S. Bakshi (2015) Urinary bladder paraganglioma presenting as micturition-induced palpitations, dyspnea, and angina. Am J Case Rep, 16, 283-6.Bagchi, A., K. Dushaj, A. Shrestha, A. L. Leytin, S. A. Bhuiyan, F. Radparvar, S. Topchik, S. S. Tuli, P. Kim & S. Bakshi (2015) Urinary bladder paraganglioma presenting as micturition-induced palpitations, dyspnea, and angina. Am J Case Rep, 16, 283-6.
Bertaccini, A., D. Marchiori, A. Cricca, M. Garofalo, C. Giovannini, F. Manferrari, T. G. Gerace, R. Pernetti & G. Martorana (2008) Neuroendocrine carcinoma of the urinary bladder: case report and review of the literature. Anticancer Res, 28, 1369-72.Bertaccini, A., D. Marchiori, A. Cricca, M. Garofalo, C. Giovannini, F. Manferrari, T. G. Gerace, R. Pernetti & G. Martorana (2008) Neuroendocrine carcinoma of the urinary bladder: case report and review of the literature. Anticancer Res, 28, 1369-72.
Brausi, M., J. A. Witjes, D. Lamm, R. Persad, J. Palou, M. Colombel, R. Buckley, M. Soloway, H. Akaza & A. Bohle (2011) A review of current guidelines and best practice recommendations for the management of nonmuscle invasive bladder cancer by the International Bladder Cancer Group. J Urol, 186, 2158-67.Brausi, M., J. A. Witjes, D. Lamm, R. Persad, J. Palou, M. Colombel, R. Buckley, M. Soloway, H. Akaza & A. Bohle (2011) A review of current guidelines and best practice recommendations for the management of nonmuscle invasive bladder cancer by the International Bladder Cancer Group. J Urol, 186, 2158-67.
Brausi, M. A. (2013) Primary prevention and early detection of bladder cancer: two main goals for urologists. Eur Urol, 63, 242-3.Brausi, M. A. (2013) Primary prevention and early detection of bladder cancer: two main goals for urologists. Eur Urol, 63, 242-3.
Burger, M., J. W. Catto, G. Dalbagni, H. B. Grossman, H. Herr, P. Karakiewicz, W. Kassouf, L. A. Kiemeney, C. La Vecchia, S. Shariat & Y. Lotan (2013a) Epidemiology and risk factors of urothelial bladder cancer. Eur Urol, 63, 234-41.Burger, M., J. W. Catto, G. Dalbagni, H. B. Grossman, H. Herr, P. Karakiewicz, W. Kassouf, L. A. Kiemeney, C. La Vecchia, S. Shariat & Y. Lotan (2013a) Epidemiology and risk factors of urothelial bladder cancer. Eur Urol, 63, 234-41.
Burger, M., W. Oosterlinck, B. Konety, S. Chang, S. Gudjonsson, R. Pruthi, M. Soloway, E. Solsona, P. Sved, M. Babjuk, M. A. Brausi, C. Cheng, E. Comperat, C. Dinney, W. Otto, J. Shah, J. Thurof, J. A. Witjes & C. International Consultation on Urologic Disease-European Association of Urology Consultation on Bladder (2013b) ICUD-EAU International Consultation on Bladder Cancer 2012: Non-muscle-invasive urothelial carcinoma of the bladder. Eur Urol, 63, 36-44.Burger, M., W. Oosterlinck, B. Konety, S. Chang, S. Gudjonsson, R. Pruthi, M. Soloway, E. Solsona, P. Sved, M. Babjuk, M. A. Brausi, C. Cheng, E. Comperat, C. Dinney, W. Otto, J. Shah, J. Thurof, J. A. Witjes & C. International Consultation on Urologic Disease-European Association of Urology Consultation on Bladder (2013b) ICUD-EAU International Consultation on Bladder Cancer 2012: Non -muscle-invasive urothelial carcinoma of the bladder. Eur Urol, 63, 36-44.
Cauberg Evelyne, C. C., J. J. de la Rosette & T. M. de Reijke (2011) Emerging optical techniques in advanced cystoscopy for bladder cancer diagnosis: A review of the current literature. Indian J Urol, 27, 245-51.Cauberg Evelyne, C. C., J. J. de la Rosette & T. M. de Reijke (2011) Emerging optical techniques in advanced cystoscopy for bladder cancer diagnosis: A review of the current literature. Indian J Urol, 27, 245-51.
Cerulli, C., G. M. Busetto, G. Antonini, R. Giovannone, M. Di Placido, G. Soda, E. De Berardinis & V. Gentile (2012) Primary metastatic neuroendocrine small cell bladder cancer: a case report and literature review. Urol Int, 88, 365-9.Cerulli, C., G. M. Busetto, G. Antonini, R. Giovannone, M. Di Placido, G. Soda, E. De Berardinis & V. Gentile (2012) Primary metastatic neuroendocrine small cell bladder cancer: a case report and literature review . Urol Int, 88, 365-9.
Chamie, K., C. S. Saigal, J. Lai, J. M. Hanley, C. M. Setodji, B. R. Konety, M. S. Litwin & P. Urologic Diseases in America (2011) Compliance with guidelines for patients with bladder cancer: variation in the delivery of care. Cancer, 117, 5392-401.Chamie, K., C. S. Saigal, J. Lai, J. M. Hanley, C. M. Setodji, B. R. Konety, M. S. Litwin & P. Urologic Diseases in America (2011) Compliance with guidelines for patients with bladder cancer: variation in the delivery of care. Cancer, 117, 5392-401.
Chuang, C. K. & S. K. Liao (2003) A retrospective immunohistochemical and clinicopathological study of small cell carcinomas of the urinary tract. Chang Gung Med J, 26, 26-33.Chuang, C. K. & S. K. Liao (2003) A retrospective immunohistochemical and clinicopathological study of small cell carcinomas of the urinary tract. Chang Gung Med J, 26, 26-33.
Clark, P. E., N. Agarwal, M. C. Biagioli, M. A. Eisenberger, R. E. Greenberg, H. W. Herr, B. A. Inman, D. A. Kuban, T. M. Kuzel, S. M. Lele, J. Michalski, L. C. Pagliaro, S. K. Pal, A. Patterson, E. R. Plimack, K. S. Pohar, M. P. Porter, J. P. Richie, W. J. Sexton, W. U. Shipley, E. J. Small, P. E. Spiess, D. L. Trump, G. Wile, T. G. Wilson, M. Dwyer & M. Ho (2013) Bladder cancer. J Natl Compr Canc Netw, 11, 446-75.Clark, P. E., N. Agarwal, M. C. Biagioli, M. A. Eisenberger, R. E. Greenberg, H. W. Herr, B. A. Inman, D. A. Kuban, T. M. Kuzel, S. M. Lele, J. Michalski, L. C. Pagliaro, S. K. Pal, A. Patterson, E. R. Plimack, K. S. Pohar, M. P. Porter, J. P. Richie, W. J. Sexton, W. U. Shipley, E. J. Small, P. E. Spiess, D. L. Trump, G. Wile, T. G. Wilson, M. Dwyer & M. Ho (2013) Bladder cancer. J Natl Compr Canc Netw, 11, 446-75.
El Demery, M., G. Demirdjian-Sarkissian, S. Thezenas, W. Jacot, Y. Laghzali, B. Darbouret, S. Culine, X. Rebillard & P.-J. Lamy (2014) Serum Matrix Metalloproteinase-7 is an independent prognostic biomarker in advanced bladder cancer. Clinical and Translational Medicine, 3.El Demery, M., G. Demirdjian-Sarkissian, S. Thezenas, W. Jacot, Y. Laghzali, B. Darbouret, S. Culine, X. Rebillard & P.-J. Lamy (2014) Serum Matrix Metalloproteinase-7 is an independent prognostic biomarker in advanced bladder cancer. Clinical and Translational Medicine, 3.
Feng, N., X. Li, H. D. Gao, Z. L. Liu, L. J. Shi & W. Z. Liu (2013) Urinary bladder malignant paraganglioma with vertebral metastasis: a case report with literature review. Chin J Cancer, 32, 624-8.Feng, N., X. Li, H. D. Gao, Z. L. Liu, L. J. Shi & W. Z. Liu (2013) Urinary bladder malignant paraganglioma with vertebral metastasis: a case report with literature review. Chin J Cancer, 32, 624-8.
Fernandez-Gomez, J., R. Madero, E. Solsona, M. Unda, L. Martinez-Pineiro, A. Ojea, J. Portillo, M. Montesinos, M. Gonzalez, C. Pertusa, J. Rodriguez-Molina, J. E. Camacho, M. Rabadan, A. Astobieta, S. Isorna, P. Muntanola, A. Gimeno, M. Blas, J. A. Martinez-Pineiro & O. Club Urologico Espanol de Tratamiento (2011) The EORTC tables overestimate the risk of recurrence and progression in patients with non-muscle-invasive bladder cancer treated with bacillus Calmette-Guerin: external validation of the EORTC risk tables. Eur Urol, 60, 423-30.Fernandez-Gomez, J., R. Madero, E. Solsona, M. Unda, L. Martinez-Pineiro, A. Ojea, J. Portillo, M. Montesinos, M. Gonzalez, C. Pertusa, J. Rodriguez-Molina , JE Camacho, M. Rabadan, A. Astobieta, S. Isorna, P. Muntanola, A. Gimeno, M. Blas, JA Martinez-Pineiro & O. Club Urologico Espanol de Tratamiento (2011) The EORTC tables overestimate the risk of recurrence and progression in patients with non-muscle-invasive bladder cancer treated with bacillus Calmette-Guerin: external validation of the EORTC risk tables. Eur Urol, 60, 423-30.
Goodison, S., C. J. Rosser & V. Urquidi (2013) Bladder cancer detection and monitoring: assessment of urine- and blood-based marker tests. Mol Diagn Ther, 17, 71-84.Goodison, S., C. J. Rosser & V. Urquidi (2013) Bladder cancer detection and monitoring: assessment of urine- and blood-based marker tests. Mol Diagn Ther, 17, 71-84.
Gunes, M., A. S. Kemik, N. Pirincci, I. Gecit, K. Taken, M. B. Yuksel, M. Kaba & R. Eryilmaz (2013) Preoperative levels of matrix metalloproteinase-7 and -9 and tissue inhibitor of matrix metalloproteinase-1 relation to pathologic parameters in bladder carcinoma patients. Asian Pac J Cancer Prev, 14, 873-6.Gunes, M., A. S. Kemik, N. Pirincci, I. Gecit, K. Taken, M. B. Yuksel, M. Kaba & R. Eryilmaz (2013) Preoperative levels of matrix metalloproteinase-7 and -9 and tissue inhibitor of matrix metalloproteinase- 1 relation to pathologic parameters in bladder carcinoma patients. Asian Pac J Cancer Prev, 14, 873-6.
Hansel, D. E., J. S. Miller, M. S. Cookson & S. S. Chang (2013) Challenges in the Pathology of Non-Muscle-invasive Bladder Cancer: A Dialogue Between the Urologic Surgeon and the Pathologist. Urology.Hansel, D. E., J. S. Miller, M. S. Cookson & S. S. Chang (2013) Challenges in the Pathology of Non-Muscle-invasive Bladder Cancer: A Dialogue Between the Urologic Surgeon and the Pathologist. Urology.
Iczkowski, K. A., J. H. Shanks, W. C. Allsbrook, A. Lopez-Beltran, C. G. Pantazis, T. R. Collins, R. W. Wetherington & D. G. Bostwick (1999) Small cell carcinoma of urinary bladder is differentiated from urothelial carcinoma by chromogranin expression, absence of CD44 variant 6 expression, a unique pattern of cytokeratin expression, and more intense gamma-enolase expression. Histopathology, 35, 150-6.Iczkowski, K. A., J. H. Shanks, W. C. Allsbrook, A. Lopez-Beltran, C. G. Pantazis, T. R. Collins, R. W. Wetherington & D. G. Bostwick (1999) Small cell carcinoma of the urinary bladder is differentiated from urothelial carcinoma by chromogranin expression, absence of CD44 variant 6 expression, a unique pattern of cytokeratin expression, and more intense gamma-enolase expression. Histopathology, 35, 150-6.
Jager, T., S. Tschirdewahn, F. Vom Dorp, G. Piechotta, H. Rubben & T. Szarvas (2013) [Siliconchiptechnology-based MMP-7 analysis in urine: An option for preoperative identification of lymph node metastasis in bladder cancer]. Urologe A, 52, 853-8.Jager, T., S. Tschirdewahn, F. Vom Dorp, G. Piechotta, H. Rubben & T. Szarvas (2013) [Siliconchiptechnology-based MMP-7 analysis in urine: An option for preoperative identification of lymph node metastasis in bladder cancer]. Urologie A, 52, 853-8.
Kamat, A. M., P. K. Hegarty, J. R. Gee, P. E. Clark, R. S. Svatek, N. Hegarty, S. F. Shariat, E. Xylinas, B. J. Schmitz-Drager, Y. Lotan, L. C. Jenkins, M. Droller, B. W. van Rhijn, P. I. Karakiewicz & C. International Consultation on Urologic Disease-European Association of Urology Consultation on Bladder (2013) ICUD-EAU International Consultation on Bladder Cancer 2012: Screening, diagnosis, and molecular markers. Eur Urol, 63, 4-15.Kamat, A. M., P. K. Hegarty, J. R. Gee, P. E. Clark, R. S. Svatek, N. Hegarty, S. F. Shariat, E. Xylinas, B. J. Schmitz-Drager, Y. Lotan, L. C. Jenkins, M. Droller, B. W. van Rhijn, P. I. Karakiewicz & C. International Consultation on Urologic Disease-European Association of Urology Consultation on Bladder (2013) ICUD-EAU International Consultation on Bladder Cancer 2012: Screening, diagnosis, and molecular markers. Eur Urol, 63, 4-15.
Leal, J., R. Luengo-Fernandez, R. Sullivan & J. A. Witjes (2015) Economic Burden of Bladder Cancer Across the European Union. Eur Urol.Leal, J., R. Luengo-Fernandez, R. Sullivan & J. A. Witjes (2015) Economic Burden of Bladder Cancer Across the European Union. EUR Urol.
Maurer, T., T. Horn, M. Heck, J. Gschwend, M. Eiber & A. Beer (2013) Current Staging Procedures in Urinary Bladder Cancer. Diagnostics, 3, 315-324.Maurer, T., T. Horn, M. Heck, J. Gschwend, M. Eiber & A. Beer (2013) Current Staging Procedures in Urinary Bladder Cancer. Diagnostics, 3, 315-324.
Mossanen, M. & J. L. Gore (2014) The burden of bladder cancer care: direct and indirect costs. Curr Opin Urol.Mossanen, M. & J. L. Gore (2014) The burden of bladder cancer care: direct and indirect costs. Curr Opin Urol.
Pompas-Veganzones, N., P. Gonzalez-Peramato & M. Sanchez-Carbayo (2014) The neuroendocrine component in bladder tumors. Curr Med Chem, 21, 1117-28.Pompas-Veganzones, N., P. Gonzalez-Peramato & M. Sanchez-Carbayo (2014) The neuroendocrine component in bladder tumors. Curr Med Chem, 21, 1117-28.
Scarpato, K. R., A. K. Morgans & K. A. Moses (2015) Optimal management of muscle-invasive bladder cancer - a review. Res Rep Urol, 7, 143-51.Scarpato, K. R., A. K. Morgans & K. A. Moses (2015) Optimal management of muscle-invasive bladder cancer - a review. Res Rep Urol, 7, 143-51.
Schmitz-Drager, B. J., M. Droller, V. B. Lokeshwar, Y. Lotan, M. A. Hudson, B. W. van Rhijn, M. J. Marberger, Y. Fradet, G. P. Hemstreet, P. U. Malmstrom, O. Ogawa, P. I. Karakiewicz & S. F. Shariat (2015) Molecular markers for bladder cancer screening, early diagnosis, and surveillance: the WHO/ICUD consensus. Urol Int, 94, 1-24.Schmitz-Drager, B. J., M. Droller, V. B. Lokeshwar, Y. Lotan, M. A. Hudson, B. W. van Rhijn, M. J. Marberger, Y. Fradet, G. P. Hemstreet, P. U. Malmstrom, O. Ogawa, P. I. Karakiewicz & S. F. Shariat (2015) Molecular markers for bladder cancer screening, early diagnosis, and surveillance: the WHO/ICUD consensus. Urol Int, 94, 1-24.
Shariat, S. F., B. Ehdaie, M. Rink, E. K. Cha, R. S. Svatek, T. F. Chromecki, H. Fajkovic, G. Novara, S. G. David, S. Daneshmand, Y. Fradet, Y. Lotan, A. I. Sagalowsky, T. Clozel, P. J. Bastian, W. Kassouf, H. M. Fritsche, M. Burger, J. I. Izawa, D. Tilki, F. Abdollah, F. K. Chun, G. Sonpavde, P. I. Karakiewicz, D. S. Scherr & M. Gonen (2012) Clinical nodal staging scores for bladder cancer: a proposal for preoperative risk assessment. Eur Urol, 61, 237-42.Shariat, S. F., B. Ehdaie, M. Rink, E. K. Cha, R. S. Svatek, T. F. Chromecki, H. Fajkovic, G. Novara, S. G. David, S. Daneshmand, Y. Fradet, Y. Lotan, A. I. Sagalowsky, T. Clozel , P. J. Bastian, W. Kassouf, H. M. Fritsche, M. Burger, J. I. Izawa, D. Tilki, F. Abdollah, F. K. Chun, G. Sonpavde, P. I. Karakiewicz, D. S. Scherr & M. Gonen (2012) Clinical nodal staging scores for bladder cancer: a proposal for preoperative risk assessment. Eur Urol, 61, 237-42.
Sharma, S., P. Ksheersagar & P. Sharma (2009) Diagnosis and treatment of bladder cancer. Am Fam Physician, 80, 717-23.Sharma, S., P. Ksheersagar & P. Sharma (2009) Diagnosis and treatment of bladder cancer. Am Fam Physician, 80, 717-23.
Skinner, E. C. & A. I. Sagalowsky (2014) Is extended lymphadenectomy of beneficial therapeutic value for T2 urothelial cancer? J Urol, 191, 1206-8.Skinner, E. C. & A. I. Sagalowsky (2014) Is extended lymphadenectomy of beneficial therapeutic value for T2 urothelial cancer? J Urol, 191, 1206-8.
Soukup, V., M. Kalousova, O. Capoun, R. Sobotka, Z. Breyl, M. Pesl, T. Zima & T. Hanus (2015) Panel of Urinary Diagnostic Markers for Non-Invasive Detection of Primary and Recurrent Urothelial Urinary Bladder Carcinoma. Urol Int, 95, 56-64.Soukup, V., M. Kalousova, O. Capoun, R. Sobotka, Z. Breyl, M. Pesl, T. Zima & T. Hanus (2015) Panel of Urinary Diagnostic Markers for Non-Invasive Detection of Primary and Recurrent Urothelial Urinary Bladder Carcinoma. Urol Int, 95, 56-64.
Svatek, R. S., B. K. Hollenbeck, S. Holmang, R. Lee, S. P. Kim, A. Stenzl & Y. Lotan (2014) The Economics of Bladder Cancer: Costs and Considerations of Caring for This Disease. Eur Urol.Svatek, R. S., B. K. Hollenbeck, S. Holmang, R. Lee, S. P. Kim, A. Stenzl & Y. Lotan (2014) The Economics of Bladder Cancer: Costs and Considerations of Caring for This Disease. EUR Urol.
Svatek, R. S., J. B. Shah, J. Xing, D. Chang, J. Lin, D. J. McConkey, X. Wu & C. P. Dinney (2010) A multiplexed, particle-based flow cytometric assay identified plasma matrix metalloproteinase-7 to be associated with cancer-related death among patients with bladder cancer. Cancer, 116, 4513-9.Svatek, R. S., J. B. Shah, J. Xing, D. Chang, J. Lin, D. J. McConkey, X. Wu & C. P. Dinney (2010) A multiplexed, particle-based flow cytometric assay identified plasma matrix metalloproteinase-7 to be associated with cancer-related death among patients with bladder cancer. Cancer, 116, 4513-9.
Szarvas, T., M. Becker, F. vom Dorp, C. Gethmann, M. Totsch, A. Bankfalvi, K. W. Schmid, I. Romics, H. Rubben & S. Ergun (2010) Matrix metalloproteinase-7 as a marker of metastasis and predictor of poor survival in bladder cancer. Cancer Sci, 101, 1300-8.Szarvas, T., M. Becker, F. vom Dorp, C. Gethmann, M. Totsch, A. Bankfalvi, K. W. Schmid, I. Romics, H. Rubben & S. Ergun (2010) Matrix metalloproteinase-7 as a marker of metastasis and predictor of poor survival in bladder cancer. Cancer Sci, 101, 1300-8.
Szarvas, T., T. Jager, M. Becker, S. Tschirdewahn, C. Niedworok, I. Kovalszky, H. Rubben, S. Ergun & F. vom Dorp (2011a) Validation of circulating MMP-7 level as an independent prognostic marker of poor survival in urinary bladder cancer. Pathol Oncol Res, 17, 325-32.Szarvas, T., T. Jager, M. Becker, S. Tschirdewahn, C. Niedworok, I. Kovalszky, H. Rubben, S. Ergun & F. vom Dorp (2011a) Validation of circulating MMP-7 level as an independent prognostic marker of poor survival in urinary bladder cancer. Pathol Oncol Res, 17, 325-32.
Szarvas, T., B. B. Singer, M. Becker, F. Vom Dorp, T. Jager, A. Szendroi, P. Riesz, I. Romics, H. Rubben & S. Ergun (2011b) Urinary matrix metalloproteinase-7 level is associated with the presence of metastasis in bladder cancer. BJU Int, 107, 1069-73.Szarvas, T., B. B. Singer, M. Becker, F. Vom Dorp, T. Jager, A. Szendroi, P. Riesz, I. Romics, H. Rubben & S. Ergun (2011b) Urinary matrix metalloproteinase-7 level is associated with the presence of metastasis in bladder cancer. BJU Int, 107, 1069-73.
Vedder, M. M., M. Marquez, E. W. de Bekker-Grob, M. L. Calle, L. Dyrskjot, M. Kogevinas, U. Segersten, P. U. Malmstrom, F. Algaba, W. Beukers, T. F. Orntoft, E. Zwarthoff, F. X. Real, N. Malats & E. W. Steyerberg (2014) Risk prediction scores for recurrence and progression of non-muscle invasive bladder cancer: an international validation in primary tumours. PLoS One, 9, e96849.Vedder, M. M., M. Marquez, E. W. de Bekker-Grob, M. L. Calle, L. Dyrskjot, M. Kogevinas, U. Segersten, P. U. Malmstrom, F. Algaba, W. Beukers, T. F. Orntoft, E. Zwarthoff, F. X. Real, N. Malats & E. W. Steyerberg (2014) Risk prediction scores for recurrence and progression of non-muscle invasive bladder cancer: an international validation in primary tumors. PLoS One, 9, e96849.
Witjes, J. A., E. Comperat, N. C. Cowan, M. De Santis, G. Gakis, T. Lebret, M. J. Ribal, A. G. Van der Heijden & A. Sherif (2014) EAU guidelines on muscle-invasive and metastatic bladder cancer: summary of the 2013 guidelines. Eur Urol, 65, 778-92.Witjes, J. A., E. Comperat, N. C. Cowan, M. De Santis, G. Gakis, T. Lebret, M. J. Ribal, A. G. Van der Heijden & A. Sherif (2014) EAU guidelines on muscle-invasive and metastatic bladder cancer: summary of the 2013 guidelines. Eur Urol, 65, 778-92.
Xylinas, E., M. Kent, L. Kluth, A. Pycha, E. Comploj, R. S. Svatek, Y. Lotan, Q. D. Trinh, P. I. Karakiewicz, S. Holmang, D. S. Scherr, M. Zerbib, A. J. Vickers & S. F. Shariat (2013) Accuracy of the EORTC risk tables and of the CUETO scoring model to predict outcomes in non-muscle-invasive urothelial carcinoma of the bladder. Br J Cancer, 109, 1460-6.Xylinas, E., M. Kent, L. Kluth, A. Pycha, E. Comploj, R. S. Svatek, Y. Lotan, Q. D. Trinh, P. I. Karakiewicz, S. Holmang, D. S. Scherr, M. Zerbib, A. J. Vickers & S. F. Shariat (2013) Accuracy of the EORTC risk tables and of the CUETO scoring model to predict outcomes in non-muscle-invasive urothelial carcinoma of the bladder. Br J Cancer, 109, 1460-6.
Yafi, F. A., A. G. Aprikian, J. L. Chin, Y. Fradet, J. Izawa, E. Estey, A. Fairey, R. Rendon, I. Cagiannos, L. Lacombe, J. B. Lattouf, D. Bell, D. Drachenberg & W. Kassouf (2011) Contemporary outcomes of 2287 patients with bladder cancer who were treated with radical cystectomy: a Canadian multicentre experience. BJU Int, 108, 539-45.Yafi, F. A., A. G. Aprikian, J. L. Chin, Y. Fradet, J. Izawa, E. Estey, A. Fairey, R. Rendon, I. Cagiannos, L. Lacombe, J. B. Lattouf, D. Bell, D. Drachenberg & W Kassouf (2011) Contemporary outcomes of 2287 patients with bladder cancer who were treated with radical cystectomy: a Canadian multicentre experience. BJU Int, 108, 539-45.
ПоследовательностиSequences
Последовательность 1 (SEQ ID NO:1): Хромогранин A (CgA) человека без сигнального пептида (номер доступа в UniProt P10645):Sequence 1 (SEQ ID NO:1): Human chromogranin A (CgA) without signal peptide (UniProt accession number P10645):
1 11 21 31 411 11 21 31 41
LPVNSPMNKG DTEVMKCIVE VISDTLSKPS PMPVSQECFE TLRGDERILSLPVNSPMNKG DTEVMKCIVE VISDTLSKPS PMPVSQECFE TLRGDERILS
51 61 71 81 9151 61 71 81 91
ILRHQNLLKE LQDLALQGAK ERAHQQKKHS GFEDELSEVL ENQSSQAELKILRHQNLLKE LQDLALQGAK ERAHQQKKHS GFEDELSEVL ENQSSQAELK
101 111 121 131 141101 111 121 131 141
EAVEEPSSKD VMEKREDSKE AEKSGEATDG ARPQALPEPM QESKAEGNNQEAVEEPSSKD VMEKREDSKE AEKSGEATDG ARPQALPEPM QESKAEGNNQ
151 161 171 181 191151 161 171 181 191
APGEEEEEEE EATNTHPPAS LPSQKYPGPQ AEGDSEGLSQ GLVDREKGLSAPGEEEEEEE EATNTHPPAS LPSQKYPGPQ AEGDSEGLSQ GLVDREKGLS
201 211 221 231 241201 211 221 231 241
AEPGWQAKRE EEEEEEEEAE AGEEAVPEEE GPTVVLNPHP SLGYKEIRKGAEPGWQAKRE EEEEEEEEAE AGEEAVPEEE GPTVVLNPHP SLGYKEIRKG
251 261 271 281 291251 261 271 281 291
ESRSEALAVD GAGKPGAEEA QDPEGKGEQE HSQQKEEEEE MAVVPQGLFRESRSEALAVD GAGKPGAEEA QDPEGKGEQE HSQQKEEEEE MAVVPQGLFR
301 311 321 331 341301 311 321 331 341
GGKSGELEQE EERLSKEWED SKRWSKMDQL AKELTAEKRL EGQEEEEDNRGGKSGELEQE EERLSKEWED SKRWSKMDQL AKELTAEKRL EGQEEEEDNR
351 361 371 381 391351 361 371 381 391
DSSMKLSFRA RAYGFRGPGP QLRRGWRPSS REDSLEAGLP LQVRGYPEEKDSSMKLSFRA RAYGFRGPGP QLRRGWRPSS REDSLEAGLP LQVRGYPEEK
401 411 421 431401 411 421 431
KEEEGSANRR PEDQELESLS AIEAELEKVA HQLQALRRGKEEEGSANRR PEDQELESLS AIEAELEKVA HQLQALRRG
Последовательность 2 (SEQ ID NO:2): Матриксная металлопротеиназа 7 (MMP7) человека (номер доступа в UniProt P09237)Sequence 2 (SEQ ID NO:2): Human matrix metalloproteinase 7 (MMP7) (UniProt accession number P09237)
1 11 21 31 411 11 21 31 41
MRLTVLCAVC LLPGSLALPL PQEAGGMSEL QWEQAQDYLK RFYLYDSETKMRTVLCAVC LLPGSLALPL PQEAGGMSEL QWEQAQDYLK RFYLYDSETK
51 61 71 81 9151 61 71 81 91
NANSLEAKLK EMQKFFGLPI TGMLNSRVIE IMQKPRCGVP DVAEYSLFPNNANSLEAKLK EMQKFFGLPI TGMLNSRVIE IMQKPRCGVP DVAEYSLFPN
101 111 121 131 141101 111 121 131 141
SPKWTSKVVT YRIVSYTRDL PHITVDRLVS KALNMWGKEI PLHFRKVVWGSPKWTSKVVT YRIVSYTRDL PHITVDRLVS KALNMWGKEI PLHFRKVVWG
151 161 171 181 191151 161 171 181 191
TADIMIGFAR GAHGDSYPFD GPGNTLAHAF APGTGLGGDA HFDEDERWTDTADIMIGFAR GAHGDSYPFD GPGNTLAHAF APGTGLGGDA HFDEDERWTD
201 211 221 231 241201 211 221 231 241
GSSLGINFLY AATHELGHSL GMGHSSDPNA VMYPTYGNGD PQNFKLSQDDGSSLGINFLY AATHELGHSL GMGHSSDPNA VMYPTYGNGD PQNFKLSQDD
251 261251 261
IKGIQKLYGK RSNSRKKIKGIQKLYGK RSNSRKK
ПримерыExamples
Пример 1: Детекция хромогранина A и MMP7 у пациентов с раком мочевого пузыря Example 1 : Detection of chromogranin A and MMP7 in patients with bladder cancer
Дизайн исследованияStudy design
[0060] Образцы сыворотки собирали у 188 пациентов, которых подвергали хирургическому лечению рака мочевого пузыря (BCa): трансуретральной резекции o мочевого пузыря (TURB) или радикальной цистэктомии (RCE). Пациентов регистрировали в Department of Urology of the University Hospital Duisburg-Essen между августом 2008 г. и ноябрем 2011. Критериями для регистрации для исследования являлись гистопатологичекий диагноз переходноклеточной карциномы мочевого пузыря, отсутствие другой опухоли в анамнезе, отсутствие химиотерапии перед хирургией, доступность образца сыворотки и потенциал для отслеживания. Нейроэндокринного рака мочевого пузыря не диагностировано в популяции. Гистологическую степень злокачественности и T-стадию классифицировали по классификации WHO от 1973 г. и 2004 г., и классификации 2009 TNM, соответственно. Образцы сыворотки от 97 здоровых индивидуумов без злокачественной опухоли в анамнезе использовали в качестве контроля.[0060] Serum samples were collected from 188 patients undergoing bladder cancer (BCa) surgery: transurethral resection of the bladder (TURB) or radical cystectomy (RCE). Patients were enrolled at the Department of Urology of the University Hospital Duisburg-Essen between August 2008 and November 2011. Enrollment criteria for the study were a histopathological diagnosis of transitional cell carcinoma of the bladder, no history of another tumor, no chemotherapy prior to surgery, availability of a serum sample, and tracking potential. Neuroendocrine bladder cancer is not diagnosed in the population. Histological grade and T-stage were classified according to the 1973 and 2004 WHO classification and the 2009 TNM classification, respectively. Serum samples from 97 healthy individuals with no history of malignancy were used as controls.
[0061] Исследование проведено в соответствии с этическими стандартами Хельсинкской декларации и одобрено советом по этике больницы. Образцы центрифугировали при 1500 об./мин в течение 15 минут, немедленно разделяли на аликвоты и сохраняли при -80°C до анализа.[0061] The study was conducted in accordance with the ethical standards of the Declaration of Helsinki and approved by the hospital ethics board. Samples were centrifuged at 1500 rpm for 15 minutes, immediately aliquoted and stored at -80° C. until analysis.
Клинические характеристики пациентов представлены в таблице 1.The clinical characteristics of the patients are presented in Table 1.
[0062] Конечными точками этого исследования являлись общая и специфическая для злокачественной опухоли выживаемость. Причину смерти получали из свидетельств о смерти. Медиана последующего наблюдении для всех пациентов составляла 24 месяца, и медиана последующего наблюдения у выживших составляла 31 месяц. Пятьдесят шесть из 188 пациентов умерли в ходе периода последующего наблюдения, 39 из них - в связи с BCa.[0062] The endpoints of this study were overall and cancer-specific survival. The cause of death was obtained from death certificates. The median follow-up for all patients was 24 months, and the median follow-up for survivors was 31 months. Fifty-six of 188 patients died during the follow-up period, 39 of them due to BCa.
Детекция хромогранина AChromogranin A detection
[0063] Уровни хромогранина A измеряли в полностью автоматизированном устройстве B.R.A.H.M.S KRYPTOR® (Thermo Scientific B.R.A.H.M.S GmbH, Hennigsdorf/Berlin, Germany) с использованием усовершенствованного гомогенного флуоресцентного сэндвич-иммуноанализа, выпущенного на рынок под ссылкой CgA II #839.050 (патентная заявка WO 2015/158701 A1).[0063] Chromogranin A levels were measured in a fully automated B.R.A.H.M.S KRYPTOR® device (Thermo Scientific B.R.A.H.M.S GmbH, Hennigsdorf/Berlin, Germany) using an advanced homogeneous fluorescence sandwich immunoassay marketed under CgA II #839.050 (patent application WO 2015/ 158701 A1).
[0064] В этой системе используют чувствительную технологию усиленного излучения криптата с временным разрешением (TRACE®) на основе безызлучательного переноса энергии между донором (криптатом европия) и акцептором (XL665). В анализе используют два моноклональных антитела мыши. Эпитоп антитела LK2H10 локализован между последовательностью аминокислот 280-301, и эпитоп моноклонального антитела PHE5 локализован между аминокислотами 124-144. Коэффициент изменчивости (CV) между анализами составляет ≤ 12%, и CV внутри анализа для анализа Kryptor составляет ≤ 7%. Функциональная чувствительность анализа составляет 13,7 нг/мл, и предел количественного определения составляет 13,71 нг/мл.[0064] This system uses time-resolved cryptate enhanced emission (TRACE®) sensitive technology based on non-radiative energy transfer between a donor (europium cryptate) and an acceptor (XL665). Two mouse monoclonal antibodies are used in the assay. The LK2H10 antibody epitope is located between amino acids 280-301, and the PHE5 monoclonal antibody epitope is between amino acids 124-144. The coefficient of variation (CV) between runs is ≤ 12% and the intra-run CV for the Kryptor assay is ≤ 7%. The functional sensitivity of the assay is 13.7 ng/mL and the limit of quantitation is 13.71 ng/mL.
Детекция MMP7MMP7 detection
[0065] Уровни MMP-7 измеряли в полностью автоматизированном устройстве B.R.A.H.M.S KRYPTOR® (Thermo Scientific B.R.A.H.M.S GmbH, Hennigsdorf/Berlin, Germany) с использованием прототипа усовершенствованного гомогенного флуоресцентного сэндвич-иммуноанализа (еще не выпущенного на рынок).[0065] MMP-7 levels were measured in a fully automated B.R.A.H.M.S KRYPTOR® device (Thermo Scientific B.R.A.H.M.S GmbH, Hennigsdorf/Berlin, Germany) using a prototype advanced homogeneous fluorescence sandwich immunoassay (not yet marketed).
[0066] В этой системе используют чувствительную технологию усиленного излучения криптата с временным разрешением (TRACE®) на основе безызлучательного переноса энергии между донором (криптатом европия) и акцептором (XL665). В анализе используют поликлональное антитело козы и моноклональное антитело мыши против MMP7 человека, меченные криптатом европия -EuC- (Cis Bio International, Bagnols/Cèze, France) и Alexa Fluor 647 (Molecular Probes - Life technologies, Eugene, USA), в качестве донора, соответственно. Эпитопы поликлональных и моноклональных антител не описаны. Рекомбинантный MMP-7 (R&D Systems Europe), разведенный в сыворотке новорожденных телят (Trina Bioreactives AG, Nänikon, Switzerland), использовали в качестве калибратора. Коэффициент изменчивости (CV) между анализами составляет ≤ 11%, и CV внутри анализа для анализа Kryptor составляет ≤ 9%. Функциональная чувствительность анализа составляет 1,95 нг/мл[0066] This system uses time-resolved cryptate enhanced emission (TRACE®) sensitive technology based on non-radiative energy transfer between a donor (europium cryptate) and an acceptor (XL665). The assay uses a goat polyclonal antibody and a mouse monoclonal antibody against human MMP7 labeled with europium cryptate -EuC- (Cis Bio International, Bagnols/Cèze, France) and Alexa Fluor 647 (Molecular Probes - Life technologies, Eugene, USA) as donor , respectively. Epitopes of polyclonal and monoclonal antibodies are not described. Recombinant MMP-7 (R&D Systems Europe) diluted in neonatal calf serum (Trina Bioreactives AG, Nänikon, Switzerland) was used as calibrator. The coefficient of variation (CV) between runs is ≤ 11% and the intra-run CV for the Kryptor assay is ≤ 9%. The functional sensitivity of the assay is 1.95 ng/mL
Измеренияmeasurements
[0067] Одиночные измерения проводили автоматически посредством инкубации 50 мкл каждого образца от пациента с 50 мкл раствора каждого конъюгированного антитела при 37°C в течение 29 мин. Для оценки воспрозводимости и повторяемости, по 2 и 3 образца для контроля качества (QC) измеряли в двух повторах для каждого проведения анализа CgA и MMP7, соответственно.[0067] Single measurements were performed automatically by incubating 50 μl of each patient sample with 50 μl of each conjugated antibody solution at 37° C. for 29 minutes. To assess reproducibility and repeatability, 2 and 3 quality control (QC) samples were measured in duplicate for each run of CgA and MMP7 assays, respectively.
Статистический анализStatistical analysis
[0068] Отсутствие нормального распределения данных концентрации в сыворотке (контролируемого посредством критерия Шапиро-Уилка) указывает на использование непараметрического двухстороннего критерия суммы рангов Уилкоксона (критерия Манна-Уитни) для сравнений независимых групп.[0068] The lack of a normal distribution of serum concentration data (controlled by the Shapiro-Wilk test) indicates the use of a non-parametric two-tailed Wilcoxon rank sum test (Mann-Whitney test) for independent group comparisons.
Для однофакторного и многофакторного анализа пациентов подразделяли на группы с низкой и высокой концентрацией применительно к их уровням CgA и MMP7. Пороги отсечения определяли для максимизации прогностической ценности, это соответствует 147 нг/мл для CGA (80-й процентиль) и 7,75 нг/мл для MMP7 (66-й процентиль). Однофакторный анализ специфической для заболевания выживаемости проводили с использованием как логарифмического рангового критерия Каплана-Мейера, так и однофакторного анализа Кокса. Для многофакторного анализа использовали регрессионную модель пропорциональных рисков Кокса. Во всех тестах значение p по меньшей мере 0,05 рассматривали как значимое. Все статистические анализы выполняли с использованием пакета программного обеспечения SPSS, версии 21.0 (Chicago, IL, USA).For univariate and multivariate analysis, patients were subdivided into low and high concentration groups with respect to their CgA and MMP7 levels. Cut-off thresholds were determined to maximize predictive value, which corresponds to 147 ng/ml for CGA (80th percentile) and 7.75 ng/ml for MMP7 (66th percentile ). One-way analysis of disease-specific survival was performed using both the Kaplan-Meier log-rank test and one-way Cox analysis. Cox proportional hazards regression model was used for multivariate analysis. In all tests, a p value of at least 0.05 was considered significant. All statistical analyzes were performed using the SPSS software package, version 21.0 (Chicago, IL, USA).
Пример 2: Предоперационная прогностическая ценность CgA в популяции, подвергнутой лечению с использованием хирургии (исследование из примера 1) Example 2 Preoperative Predictive Value of CgA in a Population Treated Using Surgery (Study from Example 1)
Сравнение уровней CgA в сыворотке между образцами для опухоли и контрольными образцамиComparison of serum CgA levels between tumor and control samples
[0069] Концентрации CgA были значимо увеличены в образцах сыворотки от пациентов с опухолью по сравнению с контролем (медиана 3,9 нг/мл по сравнению с 29,4 нг/мл, соответственно, P < 0,0001, фигура 1).[0069] CgA concentrations were significantly increased in serum samples from tumor patients compared to controls (median 3.9 ng/mL versus 29.4 ng/mL, respectively, P < 0.0001, Figure 1).
Концентрация CgA и клинико-патологические параметрыCgA concentration and clinicopathological parameters
[0070] У пациентов с опухолью, концентрации CgA являлись значимо более высокими у более старших пациентов и у мужчин (p=0,026 и p=0,009 соответственно, таблица 2). Концентрации CgA коррелировали со стадиями и степенями злокачественности, но не с метастазированием (таблица 2).[0070] In tumor patients, CgA concentrations were significantly higher in older patients and in men (p=0.026 and p=0.009, respectively, Table 2). CgA concentrations correlated with stages and grades of malignancy, but not with metastasis (Table 2).
Прогностическая ценность уровней CgA в популяции, подвергнутой лечению с использованием хирургииPredictive value of CgA levels in a population treated with surgery
[0071] Однофакторный анализ: Результаты однофакторного анализа перечислены в таблице 3 и на фигуре 2. Возраст пациентов не влиял на общую или специфическую для заболевания выживаемость, в отличие от пола, который вносил вклад в специфическую для заболевания выживаемость (HR=0,447, CI 0,247-0,918, p=0,027). Стадия, степень злокачественности и метастазирование опухолей являются значимыми прогностическими факторами общей и специфической для заболевания выживаемости (P≤0,001, таблица 3). Уровень CgA в сыворотке также является сильным прогностическим фактором общей и специфической для заболевания выживаемости. Высокая концентрация CgA в сыворотке являлась значимо ассоциированной с плохой общей и специфической для заболевания выживаемостью у пациентов, подвергнутых лечению посредством хирургии (HR=2,553, 95% CI, 1,406-4,566, p=0,002 и HR=2,295, 95% CI, 1,106-4,764, p=0,026, соответственно, таблица 3; и p=0,021, фигура 2). Более того, CgA являлся также значимым прогностическим фактором общей выживаемости при учете в качестве непрерывной переменной (HR= 1,001, 95% CI, 1,000-1,002, p=0,024).[0071] Univariate Analysis: The results of the univariate analysis are listed in Table 3 and Figure 2. Patient age did not affect overall or disease-specific survival, in contrast to gender, which contributed to disease-specific survival (HR=0.447, CI 0.247 -0.918, p=0.027). Stage, grade, and metastasis of tumors are significant predictors of overall and disease-specific survival (P≤0.001, Table 3). Serum CgA is also a strong predictor of overall and disease-specific survival. High serum CgA was significantly associated with poor overall and disease-specific survival in patients treated with surgery (HR=2.553, 95% CI, 1.406-4.566, p=0.002 and HR=2.295, 95% CI, 1.106- 4.764, p=0.026, respectively, Table 3; and p=0.021, Figure 2). Moreover, CgA was also a significant predictor of overall survival when adjusted as a continuous variable (HR=1.001, 95% CI, 1.000-1.002, p=0.024).
[0072] Многофакторный анализ: Результаты многофакторного анализа представлены в таблице 4. Многофакторный анализ показал, что высокая концентрация CgA в сыворотке является независимым от стадии, степени злокачественности и метастазирования прогностическим фактором общей и специфической для заболевания выживаемости (HR=3,424, 95% CI, 1,856-6,319, p<0,001 и HR=3,629; 95% CI, 1,692-7,784; P=0,001, соответственно, таблица 4).[0072] Multivariate analysis: The results of multivariate analysis are presented in Table 4. Multivariate analysis showed that high serum CgA concentration is independent of stage, grade and metastasis as a predictor of overall and disease-specific survival (HR=3.424, 95% CI, 1.856-6.319, p<0.001 and HR=3.629; 95% CI, 1.692-7.784; P=0.001, respectively, Table 4).
Показатель двадцатимесячной выживаемости после лечения составлял 87% у пациентов с низкой предоперационной концентрацией CgA по сравнению с 70% у пациентов с высоким предоперационным уровнем CgA (фигура 2).The 20-month post-treatment survival rate was 87% in patients with low preoperative CgA levels compared to 70% in patients with high preoperative CgA levels (Figure 2).
Пациенты с высокой предоперационной концентрацией CgA подвержены высокому риску смерти, связанной с раком мочевого пузыря, и общей смертности, и могут получать преимущество от более агрессивного или экспериментального лечения, как описано в разделе [0054].Patients with high preoperative CgA concentrations are at high risk of bladder cancer-related and all-cause mortality, and may benefit from more aggressive or experimental treatment, as described in section [0054].
Предоперационная прогностическая ценность уровней CgA и MMP7 в популяции, подвергнутой лечению с использованием хирургииPreoperative predictive value of CgA and MMP7 levels in the population treated with surgery
[0073] Сравнение уровней MMP7 в сыворотке между образцами для опухоли и контрольными образцами:[0073] Comparison of serum MMP7 levels between tumor and control samples:
Концентрации MMP7 в сыворотке измеряли в той же самой популяции. Концентрации MMP7 были значимо увеличены в образцах сыворотки от пациентов с опухолью по сравнению с контролем (медиана 2,9 нг/мл по сравнению с 4,4 нг/мл, соответственно, P < 0,001).Serum MMP7 concentrations were measured in the same population. MMP7 concentrations were significantly increased in serum samples from tumor patients compared to controls (median 2.9 ng/mL versus 4.4 ng/mL, respectively, P < 0.001).
Концентрация MMP7 и клинико-патологические параметрыMMP7 concentration and clinicopathological parameters
[0074] У пациентов с опухолью, концентрации MMP7 являлись значимо более высокими у более старших пациентов (p < 0,001, таблица 5), но не у мужчин. Концентрации MMP7 были ассоциированы с присутствием мышечно-инвазивной опухоли и метастазирования (p=0,008, p=0,05, соответственно, таблица 5), но не со степенью злокачественности.[0074] In tumor patients, MMP7 concentrations were significantly higher in older patients (p < 0.001, Table 5), but not in males. MMP7 concentrations were associated with the presence of muscle-invasive tumor and metastasis (p=0.008, p=0.05, respectively, Table 5), but not with the grade of malignancy.
Прогностическая ценность уровней MMP7 в популяции, подвергнутой лечению с использованием хирургииPredictive value of MMP7 levels in a population treated with surgery
[0075] Однофакторный анализ: Результаты однофакторного анализа представлены в таблице 3 и на фигуре 2.[0075] One-way analysis: The results of one-way analysis are presented in Table 3 and Figure 2.
Уровень MMP7 в сыворотке является значимым прогностическим фактором общей и специфической для заболевания выживаемости. Высокая концентрация MMP7 в сыворотке являлась значимо ассоциированной с плохой общей и специфической для заболевания выживаемостью у пациентов, подвергнутых лечению посредством хирургии (HR=3,764, 95% CI, 1,983-7,148, p<0,001 и HR=3,905, 95% CI, 2,291-6,655, p<0,001 соответственно, Таблица 3; и p < 0,001, Фигура 2).Serum MMP7 levels are a significant predictor of overall and disease-specific survival. High serum MMP7 was significantly associated with poor overall and disease-specific survival in patients treated with surgery (HR=3.764, 95% CI, 1.983-7.148, p<0.001 and HR=3.905, 95% CI, 2.291- 6.655, p<0.001, respectively, Table 3; and p<0.001, Figure 2).
[0076] Многофакторный анализ: Многофакторный анализ показал, что высокая концентрация MMP7 в сыворотке является независимым от стадии, степени злокачественности и метастазирования прогностическим фактором общей и специфической для заболевания выживаемости (HR=2,750, 95% CI 1,557-4,855, p<0,001 и HR=2,324; 95% CI, 1,187-4,548; P=0,014, соответственно, таблица 6).[0076] Multivariate analysis: Multivariate analysis showed that high serum concentration of MMP7 is independent of stage, grade, and metastasis as a predictor of overall and disease-specific survival (HR=2.750, 95% CI 1.557-4.855, p<0.001 and HR =2.324; 95% CI, 1.187-4.548; P=0.014, respectively, Table 6).
Показатель двадцатимесячной выживаемости составлял 89% у пациентов с низкой предоперационной концентрацией MMP7 по сравнению с 59% у пациентов, имевших высокую предоперационную концентрацию (фигура 2).The twenty-month survival rate was 89% in patients with low preoperative MMP7 concentrations compared to 59% in patients with high preoperative concentrations (Figure 2).
Прогностическая ценность комбинированных уровней CgA и MMP7 в популяции, подвергнутой лечению с использованием хирургииPredictive value of combined CgA and MMP7 levels in a population treated with surgery
[0077] Многофакторный анализ показал, что высокая концентрация MMP7 и высокая концентрация CgA в сыворотке являются независимым от стадии, степени злокачественности и метастазирования прогностическим фактором общей и специфической для заболевания выживаемости (таблица 9). Высокая концентрация CgA в сыворотке в комбинации с высокими концентрациями MMP7 являлись ассоциированными с плохой специфической для заболевания выживаемостью у пациентов, подвергнутых лечению посредством хирургии (p < 0,001, фигура 2).[0077] Multivariate analysis showed that high concentration of MMP7 and high concentration of CgA in serum are stage, grade and metastasis independent predictor of overall and disease-specific survival (table 9). High serum CgA concentrations in combination with high MMP7 concentrations were associated with poor disease-specific survival in patients treated with surgery (p < 0.001, figure 2).
Показатель двадцатимесячной выживаемости после лечения составлял более 90% у пациентов с низкими предоперационными концентрациями CgA и MMP7, по сравнению с 71% у пациентов с повышенной концентрацией одного маркера в сыворотке и 50% с повышенной концентрацией как CgA, так и MMP7 (фигура 2).The 20-month post-treatment survival rate was over 90% in patients with low preoperative CgA and MMP7 levels, compared to 71% in patients with elevated serum levels of one marker and 50% with elevated levels of both CgA and MMP7 (Figure 2).
Пациенты с высокой предоперационной концентрацией CgA и MMP7 подвержены высокому риску связанной с раком мочевого пузыря и общей смертности, и могут получать преимущество от более агрессивного или экспериментального лечения, как описано в разделе [0054].Patients with high preoperative CgA and MMP7 concentrations are at high risk of bladder cancer-related and overall mortality, and may benefit from more aggressive or experimental treatment, as described in section [0054].
Пример 3: Предоперационная прогностическая ценность CgA/MMP7 в популяции, подвергнутой RCE (исследование из примера 1) Example 3 : Preoperative Predictive Value of CgA/MMP7 in an RCE Population (Study from Example 1)
[0078] Стратификация риска для пациентов, подвергнутых лечению посредством радикальной цистэктомии, представляет особенный интерес. Таким образом, авторы настоящего изобретения анализировали также прогностическую значимость уровней CgA, сфокусировавшись единственно на этой группе.[0078] Risk stratification for patients treated by radical cystectomy is of particular interest. Thus, the authors of the present invention also analyzed the predictive value of CgA levels, focusing solely on this group.
Прогностическая ценность уровней CgA для пациентов, подвергнутых лечению RCEPredictive value of CgA levels in treated patients RCE
[0079] Высокая концентрация CgA в сыворотке являлась сильным независимым прогностическим фактором для общей и специфической для заболевания выживаемости (HR=2,405, 95 CI 1,000-5,784, p=0,050 и HR=4,003, 95% CI 1,491-10,748, p=0,006, соответственно, таблица 7). Высокая концентрация CgA являлась значимо ассоциированной с плохой специфической для заболевания выживаемостью у пациентов, подвергнутых лечению посредством радикальной цистэктомии (p=0,008, фигура 3).[0079] High serum CgA was a strong independent predictor of overall and disease-specific survival (HR=2.405, 95 CI 1.000-5.784, p=0.050 and HR=4.003, 95% CI 1.491-10.748, p=0.006, respectively, table 7). High CgA was significantly associated with poor disease-specific survival in patients treated with radical cystectomy (p=0.008, figure 3).
Показатель двадцатимесячной выживаемости после радикальной цистэктомии составлял 76% у пациентов, для которых показана низкая предоперационная концентрация CgA по сравнению с 33% у пациентов, для которых показана высокая предоперационная концентрация.The 20-month survival rate after radical cystectomy was 76% in patients in whom a low preoperative CgA concentration was indicated, compared with 33% in patients in whom a high preoperative concentration was indicated.
Пациенты с высокой предоперационной концентрацией CgA подвержены высокому риску связанной с раком мочевого пузыря и общей смертности, и могут получать преимущество от более агрессивного или экспериментального лечения, как описано в разделе [0054].Patients with high preoperative CgA concentrations are at high risk of bladder cancer-related and overall mortality, and may benefit from more aggressive or experimental treatment, as described in section [0054].
Прогностическая ценность уровней MMP7 для пациентов, подвергнутых лечению RCEPredictive value of MMP7 levels in patients treated with RCE
[0080] Высокая концентрация MMP7 в сыворотке являлась сильным независимым прогностическим фактором для общей и специфической для заболевания выживаемости (HR=2,456, 95% CI 1,294-4,662, p=0,006 и HR=2,195, 95% CI 1,057-4,560, p=0,035 соответственно, таблица 8). Высокая концентрация MMP7 являлась значимо ассоциированной с плохой специфической для заболевания выживаемостью у пациентов, подвергнутых лечению посредством радикальной цистэктомии (p=0,028, фигура 3)[0080] High serum MMP7 was a strong independent predictor of overall and disease-specific survival (HR=2.456, 95% CI 1.294-4.662, p=0.006 and HR=2.195, 95% CI 1.057-4.560, p=0.035 respectively, table 8). High concentration of MMP7 was significantly associated with poor disease-specific survival in patients treated with radical cystectomy (p=0.028, figure 3)
[0081] Показатель двадцатимесячной выживаемости после радикальной цистэктомии составлял 78% у пациентов, для которых показаны низкие предоперационные уровни MMP7, по сравнению с 54% у пациентов, имеющих высокую предоперационную концентрацию MMP7 (фигура 3).[0081] The twenty-month survival rate after radical cystectomy was 78% in patients showing low preoperative MMP7 levels compared to 54% in patients with high preoperative MMP7 levels (Figure 3).
Прогностическая ценность комбинированных уровней CgA и MMP7 для пациентов, подвергнутых лечению RCEPredictive value of combined CgA and MMP7 levels in patients treated with RCE
[0082] Многофакторный анализ показал, что высокая концентрация MMP7 и высокая концентрация CgA в сыворотке являются независимым от стадии, степени злокачественности и метастазирования прогностическим фактором общей и специфической для заболевания выживаемости (таблица 10). Высокая концентрация CgA в сыворотке в комбинации с высокой концентрацией MMP7 являлись значимо ассоциированными с плохой специфической для заболевания выживаемостью у пациентов, подвергнутых лечению посредством радикальной цистэктомии (p=0,001, фигура 3).[0082] Multivariate analysis showed that high concentration of MMP7 and high concentration of CgA in serum are stage, grade and metastasis independent predictor of overall and disease-specific survival (table 10). High serum CgA in combination with high MMP7 was significantly associated with poor disease-specific survival in patients treated with radical cystectomy ( p =0.001, Figure 3).
Показатель двадцатимесячной выживаемости после радикальной цистэктомии составлял 79% у пациентов с низкими предоперационными уровнями CgA и MMP7, по сравнению с 47% у пациентов с повышенным уровнем одного маркера в сыворотке и 20% с повышенными уровнями как CgA, так и MMP7.The 20-month survival rate after radical cystectomy was 79% in patients with low preoperative CgA and MMP7 levels, compared with 47% in patients with elevated serum levels of one marker and 20% with elevated levels of both CgA and MMP7.
Пациенты с высокой предоперационной концентрацией CgA и MMP7 подвержены высокому риску связанной с раком мочевого пузыря и общей смертности, и могут получать преимущество от более агрессивного или экспериментального лечения, как описано в разделе [0056].Patients with high preoperative CgA and MMP7 concentrations are at high risk of bladder cancer-related and overall mortality, and may benefit from more aggressive or experimental treatment, as described in section [0056].
Таблицыtables
Таблица 1: Клинические характеристики пациентовTable 1: Clinical characteristics of patients
NA: неприменимоNA: not applicable
Таблица 2: Ассоциация концентрации CgA и клинико-патологических параметров популяции опухолейTable 2: Association of CgA concentration and clinicopathological parameters of the tumor population
Таблица 3: Ассоциация уровней CgA, уровней MMP7 и клинико-патологических параметров с прогнозом для пациентов (однофакторный анализ)Table 3: Association of CgA levels, MMP7 levels, and clinicopathological parameters with patient prognosis (univariate analysis)
Таблица 4: Ассоциация уровней CgA и клинико-патологических параметров с прогнозом для пациентов (многофакторный анализ)Table 4: Association of CgA levels and clinicopathological parameters with patient prognosis (multivariate analysis)
Таблица 5: Ассоциация концентрации MMP7 с клинико-патологическими параметрами пациентовTable 5: Association of MMP7 concentration with clinicopathological parameters of patients
Таблица 6: Ассоциация уровней MMP7 и клинико-патологических параметров с прогнозом для пациентов (многофакторный анализ)Table 6: Association of MMP7 levels and clinicopathological parameters with patient prognosis (multivariate analysis)
Таблица 7: Ассоциация уровней CgA и клинико-патологических параметров с прогнозом для пациентов в популяции, подвергнутой лечению RCE (многофакторный анализ)Table 7: Association of CgA levels and clinicopathological parameters with patient prognosis in the RCE-treated population (multivariate analysis)
Таблица 8: Ассоциация уровней MMP7 и клинико-патологических параметров с прогнозом для пациентов в популяции, подвергнутой лечению RCE (многофакторный анализ)Table 8: Association of MMP7 levels and clinicopathological parameters with patient prognosis in the RCE-treated population (multivariate analysis)
Таблица 9: Ассоциация уровней MMP7 и CgA, и клинико-патологических параметров с прогнозом для пациентов (многофакторный анализ)Table 9: Association of MMP7 and CgA levels, and clinicopathological parameters with patient prognosis (multivariate analysis)
Таблица 10: Ассоциация уровней MMP7 и CgA, и клинико-патологических параметров с прогнозом для пациентов в популяции, подвергнутой лечению RCE (многофакторный анализ)Table 10: Association of MMP7 and CgA levels and clinicopathological parameters with patient prognosis in the RCE-treated population (multivariate analysis)
--->--->
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙSEQUENCE LIST
<110> Cézanne S.A.S.<110> Cézanne S.A.S.
<120> Хромогранин A как маркер рака мочевого пузыря<120> Chromogranin A as a marker of bladder cancer
<130> Z1039 PCT BLN<130> Z1039 PCT BLN
<150> EP 16 15 9474.2<150>EP 16 15 9474.2
<151> 2016-03-09<151> 2016-03-09
<160> 2<160> 2
<170> BiSSAP 1.3<170> BiSSAP 1.3
<210> 1<210> 1
<211> 439<211> 439
<212> PRT<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<220> <220>
<223> Хромогранин A (CgA) человека без сигнального пептида<223> Human chromogranin A (CgA) without signal peptide
<400> 1<400> 1
Leu Pro Val Asn Ser Pro Met Asn Lys Gly Asp Thr Glu Val Met Lys Leu Pro Val Asn Ser Pro Met Asn Lys Gly Asp Thr Glu Val Met Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Ile Val Glu Val Ile Ser Asp Thr Leu Ser Lys Pro Ser Pro Met Cys Ile Val Glu Val Ile Ser Asp Thr Leu Ser Lys Pro Ser Pro Met
20 25 30 20 25 30
Pro Val Ser Gln Glu Cys Phe Glu Thr Leu Arg Gly Asp Glu Arg Ile Pro Val Ser Gln Glu Cys Phe Glu Thr Leu Arg Gly Asp Glu Arg Ile
35 40 45 35 40 45
Leu Ser Ile Leu Arg His Gln Asn Leu Leu Lys Glu Leu Gln Asp Leu Leu Ser Ile Leu Arg His Gln Asn Leu Leu Lys Glu Leu Gln Asp Leu
50 55 60 50 55 60
Ala Leu Gln Gly Ala Lys Glu Arg Ala His Gln Gln Lys Lys His Ser Ala Leu Gln Gly Ala Lys Glu Arg Ala His Gln Gln Lys Lys His Ser
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Phe Glu Asp Glu Leu Ser Glu Val Leu Glu Asn Gln Ser Ser Gln Gly Phe Glu Asp Glu Leu Ser Glu Val Leu Glu Asn Gln Ser Ser Gln
85 90 95 85 90 95
Ala Glu Leu Lys Glu Ala Val Glu Glu Pro Ser Ser Lys Asp Val Met Ala Glu Leu Lys Glu Ala Val Glu Glu Pro Ser Ser Lys Asp Val Met
100 105 110 100 105 110
Glu Lys Arg Glu Asp Ser Lys Glu Ala Glu Lys Ser Gly Glu Ala Thr Glu Lys Arg Glu Asp Ser Lys Glu Ala Glu Lys Ser Gly Glu Ala Thr
115 120 125 115 120 125
Asp Gly Ala Arg Pro Gln Ala Leu Pro Glu Pro Met Gln Glu Ser Lys Asp Gly Ala Arg Pro Gln Ala Leu Pro Glu Pro Met Gln Glu Ser Lys
130 135 140 130 135 140
Ala Glu Gly Asn Asn Gln Ala Pro Gly Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Ala Glu Gly Asn Asn Gln Ala Pro Gly Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu
145 150 155 160 145 150 155 160
Glu Ala Thr Asn Thr His Pro Pro Ala Ser Leu Pro Ser Gln Lys Tyr Glu Ala Thr Asn Thr His Pro Pro Ala Ser Leu Pro Ser Gln Lys Tyr
165 170 175 165 170 175
Pro Gly Pro Gln Ala Glu Gly Asp Ser Glu Gly Leu Ser Gln Gly Leu Pro Gly Pro Gln Ala Glu Gly Asp Ser Glu Gly Leu Ser Gln Gly Leu
180 185 190 180 185 190
Val Asp Arg Glu Lys Gly Leu Ser Ala Glu Pro Gly Trp Gln Ala Lys Val Asp Arg Glu Lys Gly Leu Ser Ala Glu Pro Gly Trp Gln Ala Lys
195 200 205 195 200 205
Arg Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Ala Glu Ala Gly Glu Glu Arg Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Ala Glu Ala Gly Glu Glu
210 215 220 210 215 220
Ala Val Pro Glu Glu Glu Gly Pro Thr Val Val Leu Asn Pro His Pro Ala Val Pro Glu Glu Glu Gly Pro Thr Val Val Leu Asn Pro His Pro
225 230 235 240 225 230 235 240
Ser Leu Gly Tyr Lys Glu Ile Arg Lys Gly Glu Ser Arg Ser Glu Ala Ser Leu Gly Tyr Lys Glu Ile Arg Lys Gly Glu Ser Arg Ser Glu Ala
245 250 255 245 250 255
Leu Ala Val Asp Gly Ala Gly Lys Pro Gly Ala Glu Glu Ala Gln Asp Leu Ala Val Asp Gly Ala Gly Lys Pro Gly Ala Glu Glu Ala Gln Asp
260 265 270 260 265 270
Pro Glu Gly Lys Gly Glu Gln Glu His Ser Gln Gln Lys Glu Glu Glu Pro Glu Gly Lys Gly Glu Gln Glu His Ser Gln Gln Lys Glu Glu Glu
275 280 285 275 280 285
Glu Glu Met Ala Val Val Pro Gln Gly Leu Phe Arg Gly Gly Lys Ser Glu Glu Met Ala Val Val Pro Gln Gly Leu Phe Arg Gly Gly Lys Ser
290 295 300 290 295 300
Gly Glu Leu Glu Gln Glu Glu Glu Arg Leu Ser Lys Glu Trp Glu Asp Gly Glu Leu Glu Gln Glu Glu Glu Arg Leu Ser Lys Glu Trp Glu Asp
305 310 315 320 305 310 315 320
Ser Lys Arg Trp Ser Lys Met Asp Gln Leu Ala Lys Glu Leu Thr Ala Ser Lys Arg Trp Ser Lys Met Asp Gln Leu Ala Lys Glu Leu Thr Ala
325 330 335 325 330 335
Glu Lys Arg Leu Glu Gly Gln Glu Glu Glu Glu Asp Asn Arg Asp Ser Glu Lys Arg Leu Glu Gly Gln Glu Glu Glu Glu Asp Asn Arg Asp Ser
340 345 350 340 345 350
Ser Met Lys Leu Ser Phe Arg Ala Arg Ala Tyr Gly Phe Arg Gly Pro Ser Met Lys Leu Ser Phe Arg Ala Arg Ala Tyr Gly Phe Arg Gly Pro
355 360 365 355 360 365
Gly Pro Gln Leu Arg Arg Gly Trp Arg Pro Ser Ser Arg Glu Asp Ser Gly Pro Gln Leu Arg Arg Gly Trp Arg Pro Ser Ser Arg Glu Asp Ser
370 375 380 370 375 380
Leu Glu Ala Gly Leu Pro Leu Gln Val Arg Gly Tyr Pro Glu Glu Lys Leu Glu Ala Gly Leu Pro Leu Gln Val Arg Gly Tyr Pro Glu Glu Lys
385 390 395 400 385 390 395 400
Lys Glu Glu Glu Gly Ser Ala Asn Arg Arg Pro Glu Asp Gln Glu Leu Lys Glu Glu Glu Gly Ser Ala Asn Arg Arg Pro Glu Asp Gln Glu Leu
405 410 415 405 410 415
Glu Ser Leu Ser Ala Ile Glu Ala Glu Leu Glu Lys Val Ala His Gln Glu Ser Leu Ser Ala Ile Glu Ala Glu Leu Glu Lys Val Ala His Gln
420 425 430 420 425 430
Leu Gln Ala Leu Arg Arg Gly Leu Gln Ala Leu Arg Arg Gly
435 435
<210> 2<210> 2
<211> 267<211> 267
<212> PRT<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<220> <220>
<223> Матриксная металлопротеиназа 7 (MMP7) человека<223> Human matrix metalloproteinase 7 (MMP7)
<400> 2<400> 2
Met Arg Leu Thr Val Leu Cys Ala Val Cys Leu Leu Pro Gly Ser Leu Met Arg Leu Thr Val Leu Cys Ala Val Cys Leu Leu Pro Gly Ser Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Leu Pro Leu Pro Gln Glu Ala Gly Gly Met Ser Glu Leu Gln Trp Ala Leu Pro Leu Pro Gln Glu Ala Gly Gly Met Ser Glu Leu Gln Trp
20 25 30 20 25 30
Glu Gln Ala Gln Asp Tyr Leu Lys Arg Phe Tyr Leu Tyr Asp Ser Glu Glu Gln Ala Gln Asp Tyr Leu Lys Arg Phe Tyr Leu Tyr Asp Ser Glu
35 40 45 35 40 45
Thr Lys Asn Ala Asn Ser Leu Glu Ala Lys Leu Lys Glu Met Gln Lys Thr Lys Asn Ala Asn Ser Leu Glu Ala Lys Leu Lys Glu Met Gln Lys
50 55 60 50 55 60
Phe Phe Gly Leu Pro Ile Thr Gly Met Leu Asn Ser Arg Val Ile Glu Phe Phe Gly Leu Pro Ile Thr Gly Met Leu Asn Ser Arg Val Ile Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Ile Met Gln Lys Pro Arg Cys Gly Val Pro Asp Val Ala Glu Tyr Ser Ile Met Gln Lys Pro Arg Cys Gly Val Pro Asp Val Ala Glu Tyr Ser
85 90 95 85 90 95
Leu Phe Pro Asn Ser Pro Lys Trp Thr Ser Lys Val Val Thr Tyr Arg Leu Phe Pro Asn Ser Pro Lys Trp Thr Ser Lys Val Val Thr Tyr Arg
100 105 110 100 105 110
Ile Val Ser Tyr Thr Arg Asp Leu Pro His Ile Thr Val Asp Arg Leu Ile Val Ser Tyr Thr Arg Asp Leu Pro His Ile Thr Val Asp Arg Leu
115 120 125 115 120 125
Val Ser Lys Ala Leu Asn Met Trp Gly Lys Glu Ile Pro Leu His Phe Val Ser Lys Ala Leu Asn Met Trp Gly Lys Glu Ile Pro Leu His Phe
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Val Val Trp Gly Thr Ala Asp Ile Met Ile Gly Phe Ala Arg Arg Lys Val Val Trp Gly Thr Ala Asp Ile Met Ile Gly Phe Ala Arg
145 150 155 160 145 150 155 160
Gly Ala His Gly Asp Ser Tyr Pro Phe Asp Gly Pro Gly Asn Thr Leu Gly Ala His Gly Asp Ser Tyr Pro Phe Asp Gly Pro Gly Asn Thr Leu
165 170 175 165 170 175
Ala His Ala Phe Ala Pro Gly Thr Gly Leu Gly Gly Asp Ala His Phe Ala His Ala Phe Ala Pro Gly Thr Gly Leu Gly Gly Asp Ala His Phe
180 185 190 180 185 190
Asp Glu Asp Glu Arg Trp Thr Asp Gly Ser Ser Leu Gly Ile Asn Phe Asp Glu Asp Glu Arg Trp Thr Asp Gly Ser Ser Leu Gly Ile Asn Phe
195 200 205 195 200 205
Leu Tyr Ala Ala Thr His Glu Leu Gly His Ser Leu Gly Met Gly His Leu Tyr Ala Ala Thr His Glu Leu Gly His Ser Leu Gly Met Gly His
210 215 220 210 215 220
Ser Ser Asp Pro Asn Ala Val Met Tyr Pro Thr Tyr Gly Asn Gly Asp Ser Ser Asp Pro Asn Ala Val Met Tyr Pro Thr Tyr Gly Asn Gly Asp
225 230 235 240 225 230 235 240
Pro Gln Asn Phe Lys Leu Ser Gln Asp Asp Ile Lys Gly Ile Gln Lys Pro Gln Asn Phe Lys Leu Ser Gln Asp Asp Ile Lys Gly Ile Gln Lys
245 250 255 245 250 255
Leu Tyr Gly Lys Arg Ser Asn Ser Arg Lys Lys Leu Tyr Gly Lys Arg Ser Asn Ser Arg Lys Lys
260 265 260 265
<---<---
Claims (11)
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP16159474 | 2016-03-09 | ||
EP16159474.2 | 2016-03-09 | ||
PCT/EP2017/055279 WO2017153381A1 (en) | 2016-03-09 | 2017-03-07 | Chromogranin a as a marker for bladder cancer |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2018135296A RU2018135296A (en) | 2020-04-09 |
RU2018135296A3 RU2018135296A3 (en) | 2020-06-18 |
RU2785737C2 true RU2785737C2 (en) | 2022-12-12 |
Family
ID=
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2454181C1 (en) * | 2010-11-10 | 2012-06-27 | Пётр Витальевич Глыбочко | Method of diagnosing stage of urinary bladder cancer invasion |
WO2015158701A1 (en) * | 2014-04-15 | 2015-10-22 | Cézanne S.A.S. | Immunoassay and antibodies for the detection of chromogranin a |
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2454181C1 (en) * | 2010-11-10 | 2012-06-27 | Пётр Витальевич Глыбочко | Method of diagnosing stage of urinary bladder cancer invasion |
WO2015158701A1 (en) * | 2014-04-15 | 2015-10-22 | Cézanne S.A.S. | Immunoassay and antibodies for the detection of chromogranin a |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Bertaccini A.D. et al. Neuroendocrine carcinoma of the urinary bladder: case report and review of the literature // Anticancer Res, 28, 2008, р.1369-1372. Reina J.J. Second Primary Malignancies in Patients With Neuroendocrine Tumors // Clin Transl Oncol, 16(10), 2014, р.921-926. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20190361028A1 (en) | Free ngal as a biomarker for cancer | |
EP3427058B1 (en) | Chromogranin a as a marker for bladder cancer | |
Morrissey et al. | Sensitivity and specificity of urinary neutrophil gelatinase-associated lipocalin and kidney injury molecule-1 for the diagnosis of renal cell carcinoma | |
JP4847873B2 (en) | Methods for diagnosing and prognosing cancer of epithelial origin | |
Shimura et al. | Urinary ADAM12 and MMP-9/NGAL complex detect the presence of gastric cancer | |
US20090075307A1 (en) | Methods for identifying patients with an increased likelihood of having ovarian cancer and compositions therefor | |
US20070218512A1 (en) | Methods related to mmp26 status as a diagnostic and prognostic tool in cancer management | |
US20140045196A1 (en) | Methods of prognosis and diagnosis of cancer | |
Schönemeier et al. | Urinary peptide analysis differentiates pancreatic cancer from chronic pancreatitis | |
ES2974307T3 (en) | PERM as a marker of endometrial cancer | |
Ando et al. | Elevated ratio of C-type lectin-like receptor 2 level and platelet count (C2PAC) aids in the diagnosis of post-operative venous thromboembolism in IDH-wildtype gliomas | |
JP2018504595A (en) | Prostate cancer marker and use thereof | |
RU2785737C2 (en) | Chromogranin a as marker of bladder cancer | |
Zhigang et al. | Serum insulin‐like growth factor I/free prostate specific antigen (IGF‐I/fPSA) ratio enhances prostate cancer detection in men with total PSA 4.0–10.0 ng/ml | |
US20220390453A1 (en) | Ovarian cancer biomarker and methods of using same | |
US20210181200A1 (en) | Ovarian cancer biomarker and methods of using same | |
EP3067698A1 (en) | Pd-ecgf as biomarker of cancer | |
CA3163199A1 (en) | Ovarian cancer biomarker and methods of using same | |
US20130095483A1 (en) | Predictive biomarkers for breast cancer | |
Lee et al. | Comparison between a novel salivary marker and several clinical prognosticators in oral cavity cancer | |
Trimboli et al. | Procalcitonin: Are We Ready for Clinical Use? | |
Duffy | Serum markers in breast cancer: are they of value and will they get better? |