RU2778095C2 - Vaccine composition against type a foot-and-mouth disease virus - Google Patents

Vaccine composition against type a foot-and-mouth disease virus Download PDF

Info

Publication number
RU2778095C2
RU2778095C2 RU2020123927A RU2020123927A RU2778095C2 RU 2778095 C2 RU2778095 C2 RU 2778095C2 RU 2020123927 A RU2020123927 A RU 2020123927A RU 2020123927 A RU2020123927 A RU 2020123927A RU 2778095 C2 RU2778095 C2 RU 2778095C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
fmdv
vaccine
amino acid
seq
thr
Prior art date
Application number
RU2020123927A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2020123927A3 (en
RU2020123927A (en
Inventor
Ын-Чин КИМ
Тэ-Ги ОМ
Кюн-Чоо СОН
Мин-Чи КИМ
Original Assignee
Пламблайн Лайф Сайенсиз, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from KR1020180149242A external-priority patent/KR102165358B1/en
Application filed by Пламблайн Лайф Сайенсиз, Инк. filed Critical Пламблайн Лайф Сайенсиз, Инк.
Priority claimed from PCT/KR2018/016826 external-priority patent/WO2019132569A1/en
Publication of RU2020123927A3 publication Critical patent/RU2020123927A3/ru
Publication of RU2020123927A publication Critical patent/RU2020123927A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2778095C2 publication Critical patent/RU2778095C2/en

Links

Images

Abstract

FIELD: biotechnology.
SUBSTANCE: polypeptide containing an amino acid sequence is presented. Polypeptide is capable of providing types of an immune response to foot-and-mouth disease virus (hereinafter – FMDV). Polynucleotide encoding the amino acid sequence of the claimed polypeptide, an expression plasmid containing polynucleotide, a vaccine composition against foot-and-mouth disease (FMD), containing the effective amount of the expression plasmid, and a method for the provision of types of an immune response to FMDV serotype A in a subject, including the administration to the subject of a vaccine composition, are presented.
EFFECT: invention provides for effective protection from Asian topotype of type A foot-and-mouth disease virus found in Korea and neighboring East Asian countries, such as China or Taiwan.
13 cl, 10 dwg, 1 tbl, 5 ex

Description

Область техникиTechnical field

Настоящее изобретение относится к полипептиду, полинуклеотиду, плазмиде и вакцинной композиции, содержащей их, которые участвуют в обеспечении видов иммунного ответа на вирус ящура серотипа A. Также настоящее изобретение относится к способу обеспечения видов иммунного ответа на вирус ящура серотипа A у субъекта. The present invention relates to a polypeptide, a polynucleotide, a plasmid and a vaccine composition containing them that are involved in providing immune responses to foot-and-mouth disease virus serotype A. The present invention also relates to a method of providing immune responses to foot-and-mouth disease virus serotype A in a subject.

Уровень техникиState of the art

Ящур (FMD) представляет собой вирусное заболевание, поражающее парнокопытных животных (Artiodactyla), включая домашний скот, такой как крупный рогатый скот, свиньи, овцы, козы, олени и т.д., и различных диких животных, характеризующееся образованием волдырей во рту, в носу, на сосках, копытах и т.д. FMD очень заразен и характеризуется уровнем смертности 40% или выше, что делает его социально-экономически значимым заболеванием. По этой причине Всемирная организация по охране здоровья животных (OIE) классифицирует и контролирует FMD как заболевание класса А, и в большинстве стран FMD был определен как инфекционное заболевание класса 1. Кроме того, за последнее десятилетие почти на каждом континенте произошла вспышка эпидемии FMD, которая привела к тяжелым экономическим потерям.Foot and mouth disease (FMD) is a viral disease affecting artiodactyl animals (Artiodactyla), including livestock such as cattle, pigs, sheep, goats, deer, etc., and various wild animals, characterized by blistering in the mouth, in the nose, on the nipples, hooves, etc. FMD is highly contagious and is characterized by a mortality rate of 40% or higher, making it a socioeconomically significant disease. For this reason, the World Organization for Animal Health (OIE) classifies and controls FMD as a class A disease, and in most countries, FMD has been defined as a class 1 infectious disease. In addition, over the past decade, almost every continent has experienced an outbreak of an FMD epidemic that led to heavy economic losses.

Вирус ящура (FMDV) представляет собой одноцепочечный РНК-вирус с положительной полярностью, принадлежащий к роду Aphthovirus семейства Picornaviridae. Он не только является высокоинвазивным, но и характеризуется широким спектром инфицирования. Его инкубационный период может варьироваться от животного к животному, но составляет приблизительно от 6 до 10 дней. Также, поскольку он выделяется из организма еще до появления каких-либо клинических симптомов, его распространение может происходить легко. Он передается через дыхательную, пищеварительную, репродуктивную системы и т.д. В частности, вирусы, выделяемые через дыхательную систему, могут распространяться по воздуху на расстояние вплоть до 250 км.Foot-and-mouth disease virus (FMDV) is a single-stranded positive polarity RNA virus belonging to the genus Aphthovirus of the Picornaviridae family. It is not only highly invasive, but also characterized by a wide spectrum of infection. Its incubation period can vary from animal to animal but is approximately 6 to 10 days. Also, since it is excreted from the body before any clinical symptoms appear, it can spread easily. It is transmitted through the respiratory, digestive, reproductive systems, etc. In particular, viruses shed through the respiratory system can spread through the air over distances of up to 250 km.

FMDV разделяют на семь серотипов: O, A, C, SAT1, SAT2, SAT3 и Asia 1 в соответствии с последовательностью кодирующей области VP1, и каждый серотип разделяют на вплоть до приблизительно 80 подтипов в соответствии со свойствами его генов. До настоящего времени FMD, встречающийся в Азии, включая Корею, и в Европе, относился в основном к серотипу О, и, соответственно, в Корее в основном проводилась инокуляция вакциной против серотипа О. Однако, что касается FMD, в последнее время встречающегося в некоторых частях Кореи, было подтверждено, что вирус серотипа А вызвал дополнительную инфекцию. FMDV серотипа А имеет три топотипа: ME-SA (Ближний Восток-Южная Азия), AFRICA (Африка) и ASIA (Азия). Частота мутаций высока даже среди этих топотипов, и, таким образом, во многих случаях невозможно обеспечить защиту от заражений вирусами. Следовательно, необходимо разработать различные вакцины против вируса серотипа А. В частности, FMD, возникший недавно в Корее, был вызван вирусом, принадлежащим к линии Sea-97, и инфицирование этим вирусом происходит постоянно в азиатском регионе. Хотя в настоящее время существует вакцина против FMDV серотипа А, антигенность вируса низкая, и поэтому предполагается, что защитный иммунитет будет относительно низким, даже если вакцина будет инокулирована.FMDV is divided into seven serotypes: O, A, C, SAT1, SAT2, SAT3 and Asia 1 according to the sequence of the VP1 coding region, and each serotype is divided into up to about 80 subtypes according to the properties of its genes. So far, the FMD occurring in Asia, including Korea, and in Europe has been mainly of serotype O, and, accordingly, inoculation with vaccine against serotype O has been mainly carried out in Korea. However, with regard to FMD, recently encountered in some parts of Korea, serotype A virus was confirmed to have caused additional infection. FMDV serotype A has three topotypes: ME-SA (Middle East-South Asia), AFRICA (Africa) and ASIA (Asia). The mutation rate is high even among these topotypes, and thus in many cases it is not possible to provide protection against viral infections. Therefore, it is necessary to develop various vaccines against serotype A virus. In particular, FMD, which recently emerged in Korea, was caused by a virus belonging to the Sea-97 lineage, and infection with this virus occurs constantly in the Asian region. Although there is currently a vaccine against FMDV serotype A, the antigenicity of the virus is low and therefore protective immunity is expected to be relatively low even if the vaccine is inoculated.

Таким образом, существует большая потребность в вакцине против вирусов, принадлежащих к FMDV серотипа A, в частности к линии Sea-97, для эффективного предупреждения FMD и предотвращения экономических потерь, вызванных инфекцией.Thus, there is a great need for a vaccine against viruses belonging to the FMDV serotype A, in particular the Sea-97 lineage, in order to effectively prevent FMD and prevent the economic loss caused by the infection.

Техническая задачаTechnical task

Одной из целей настоящего изобретения является обеспечение полипептида, способного обеспечивать виды иммунного ответа на FMDV серотипа A, и полинуклеотида, кодирующего его.One of the objectives of the present invention is to provide a polypeptide capable of providing immune responses to FMDV serotype A and a polynucleotide encoding the same.

Другой целью настоящего изобретения является обеспечение плазмиды, способной обеспечивать виды иммунного ответа на FMDV серотипа A.It is another object of the present invention to provide a plasmid capable of eliciting immune responses to FMDV serotype A.

Еще одной целью настоящего изобретения является обеспечение вакцинной композиции против FMDV серотипа А.Another object of the present invention is to provide a vaccine composition against FMDV serotype A.

Еще одной целью настоящего изобретения является обеспечение способа обеспечения видов иммунного ответа на FMDV серотипа A у субъекта.Yet another object of the present invention is to provide a method for providing types of immune response to FMDV serotype A in a subject.

Техническое решениеTechnical solution

Для достижения вышеуказанных целей в аспекте настоящего изобретения предусмотрен полипептид, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся идентичностью с ней, составляющей 90% или больше.To achieve the above objects, in an aspect of the present invention, there is provided a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having 90% or more identity therewith.

Аминокислотная последовательность под SEQ ID NO: 1 или аминокислотная последовательность, характеризующуюся идентичностью с ней, составляющей 90% или больше, может представлять собой последовательность, соответствующую области VP1 FMDV серотипа A.The amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, or an amino acid sequence having 90% or more identity with it, may be a sequence corresponding to the FMDV serotype A VP1 region.

Используемый в данном документе термин «идентичность» означает степень, в которой соответствует данная полипептидная последовательность или полинуклеотидная последовательность, и может быть выражен в процентах. В настоящем описании идентичность последовательности, обладающей идентичной или сходной активностью с данной полипептидной последовательностью, может указываться как «% идентичности». Идентичность может быть идентифицирована с применением стандартного программного обеспечения, например, BLAST 2.0, которое вычисляет такие параметры, как балл, идентичность, сходство и т.д., или путем сравнения последовательностей посредством исследования с применением гибридизации, применяемого в строго определенных условиях. Подходящие условия гибридизации, которые должны быть определены, могут быть установлены любым способом, хорошо известным специалисту в данной области техники.As used herein, the term "identity" means the extent to which a given polypeptide sequence or polynucleotide sequence matches and may be expressed as a percentage. As used herein, the identity of a sequence having identical or similar activity to a given polypeptide sequence may be referred to as "% identity". Identity can be identified using standard software, such as BLAST 2.0, which calculates parameters such as score, identity, similarity, etc., or by comparing sequences through a hybridization test used under well-defined conditions. Suitable hybridization conditions to be determined can be established by any method well known to the person skilled in the art.

Предпочтительно, аминокислотная последовательность под SEQ ID NO: 1 может быть получена из азиатского топотипа FMDV серотипа A и более предпочтительно из FMDV ASIA Sea-97 серотипа A. Наиболее предпочтительно аминокислотная последовательность под SEQ ID NO: 1 может быть получена из штаммов GDMM/CHA/2013-S (KF450794), CAM/2/2008 (HQ116294), MAY/4/2012 (KT223560), A/VIT/3/2008 (HQ116371), MAY/97 или VN/T11D/2013. В одном варианте осуществления после изучения консенсусной последовательности в последовательностях областей VP1 вирусов GDMM/CHA/2013-S, CAM/2/2008, MAY/4/2012 и A/VIT/3/2008 несоответствующие сайты и последовательности, важные для выработки нейтрализующих антител, рекомбинировали на основе VP1 вируса VN/T11D/2013 для получения аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 1. Термин «рекомбинировать» или «рекомбинация» означает полусинтез или синтез полинуклеотида или полипептида с другим полинуклеотидом или полипептидом с образованием конфигурации, которая не существует в природе и не встречается в природе.Preferably, the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 can be obtained from the Asian topotype FMDV serotype A, and more preferably from FMDV ASIA Sea-97 serotype A. Most preferably, the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 can be obtained from GDMM/CHA/ strains. 2013-S (KF450794), CAM/2/2008 (HQ116294), MAY/4/2012 (KT223560), A/VIT/3/2008 (HQ116371), MAY/97 or VN/T11D/2013. In one embodiment, after studying the consensus sequence in the sequences of the VP1 regions of the GDMM/CHA/2013-S, CAM/2/2008, MAY/4/2012 and A/VIT/3/2008 viruses, mismatched sites and sequences important for the production of neutralizing antibodies , were recombined based on VP1 of the VN/T11D/2013 virus to obtain the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. The term "recombine" or "recombination" means the semisynthesis or synthesis of a polynucleotide or polypeptide with another polynucleotide or polypeptide to form a configuration that does not exist in nature and does not occur in nature.

Предпочтительно аминокислотная последовательность, характеризующаяся 90% или более идентичностью последовательности аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 1, может представлять собой аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 2. В одном варианте осуществления после изучения консенсусной последовательности в последовательностях областей VP1 вирусов GDMM/CHA/2013-S, CAM/2/2008, MAY/4/2012 и A/VIT/3/2008 несоответствующие сайты и последовательности, важные для выработки нейтрализующих антител, рекомбинировали на основе VP1 вируса MAY/97 для получения аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 2. Preferably, an amino acid sequence having 90% or more sequence identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 may be the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. In one embodiment, after examining the consensus sequence in the sequences of the VP1 regions of the GDMM/CHA/2013 viruses -S, CAM/2/2008, MAY/4/2012 and A/VIT/3/2008 mismatched sites and sequences important for the production of neutralizing antibodies were recombined based on MAY/97 virus VP1 to obtain the amino acid sequence under SEQ ID NO: 2.

Каждая из аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 1 и аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 2 характеризуется высокой идентичностью последовательности FMDV линии Sea-97 ASIA A, которая недавно возникла в Корее, а также вирусам MAY/97 или VN/T11D/2013, находящимся под контролем Агентства карантина и инспекции животных и растений Республики Корея. В частности, аминокислотная последовательность под SEQ ID NO: 1 характеризуется даже более высокой идентичностью последовательности FMDV линии Sea-97 ASIA A, которая недавно возникла в Корее. Соответственно, полипептид, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1 или под SEQ ID NO: 2, может эффективно действовать в качестве антигена, способного обеспечивать виды иммунного ответа на FMDV серотипа A.Each of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 is characterized by high sequence identity of the FMDV line Sea-97 ASIA A, which recently emerged in Korea, as well as the viruses MAY/97 or VN/T11D/2013, under the control of the Animal and Plant Quarantine and Inspection Agency of the Republic of Korea. In particular, the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 has even higher sequence identity for the FMDV lineage Sea-97 ASIA A, which has recently emerged in Korea. Accordingly, a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2 can effectively act as an antigen capable of eliciting immune responses to FMDV serotype A.

Согласно другому аспекту настоящего изобретения в нем предусмотрен полипептид, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся идентичностью с ней, составляющей 90% или больше, и аминокислотную последовательность белков VP2-VP4 FMDV.According to another aspect of the present invention, there is provided a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, or an amino acid sequence having 90% or more identity therewith, and the amino acid sequence of FMDV VP2-VP4 proteins.

Предпочтительно в полипептиде аминокислотная последовательность под SEQ ID NO: 1 или аминокислотная последовательность, характеризующаяся идентичностью с ней, составляющей 90% или больше, может быть связана с аминокислотными последовательностями, соответствующими белкам VP2, VP3 и VP4, полученным из FMDV. Например, они могут быть связаны в следующем порядке: аминокислотная последовательность области VP4 - аминокислотная последовательность области VP2 - аминокислотная последовательность области VP3 - аминокислотная последовательность под SEQ ID NO: 1 (или аминокислотная последовательность под SEQ ID NO: 2). Дополнительная(-ые) аминокислотная(-ые) последовательность(-и) может(-гут) быть включена(-ы) между любыми аминокислотными последовательностями. Например, аминокислотная последовательность сайта расщепления фурином может быть включена между последовательностями любой области VP. Также полипептид может дополнительно содержать лидерную последовательность IgE и/или аминокислотную последовательность 2А. Например, полипептид может содержать лидерную последовательность IgE - аминокислотную последовательность области VP4 - аминокислотную последовательность области VP2 - аминокислотную последовательность области VP3 - аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1 (или аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 2) - аминокислотную последовательность 2А (предпочтительно в указанном выше порядке). В таком случае предпочтительно аминокислотная последовательность сайта расщепления фурином может быть дополнительно включена между последовательностями каждой области.Preferably, in the polypeptide, the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, or an amino acid sequence with 90% or more identity therewith, can be linked to amino acid sequences corresponding to FMDV-derived VP2, VP3 and VP4 proteins. For example, they can be linked in the following order: VP4 region amino acid sequence - VP2 region amino acid sequence - VP3 region amino acid sequence - amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 (or amino acid sequence of SEQ ID NO: 2). Additional(s) amino acid(s) sequence(s) may(-gut) be included(s) between any amino acid sequences. For example, the amino acid sequence of a furin cleavage site can be included between sequences in any VP region. Also, the polypeptide may further comprise an IgE leader sequence and/or a 2A amino acid sequence. For example, the polypeptide may comprise an IgE leader sequence - amino acid sequence of the VP4 region - amino acid sequence of the VP2 region - amino acid sequence of the VP3 region - amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 (or amino acid sequence of SEQ ID NO: 2) - amino acid sequence of 2A (preferably in above order). In such a case, preferably, the amino acid sequence of the furin cleavage site may be further included between the sequences of each region.

Предпочтительно аминокислотные последовательности белков VP2-VP4 могут быть получены из FMDV серотипа A и более предпочтительно из вируса A24/Cruzeiro. Предпочтительно каждая из аминокислотных последовательностей белков VP2-VP4 может представлять собой аминокислотную последовательность соответствующей области, включенной в аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 3. Предпочтительно аминокислотная последовательность, с которой связаны аминокислотные последовательности белков VP2-VP4, может представлять собой аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 3. Аминокислотная последовательность под SEQ ID NO: 3 содержит аминокислотные последовательности белков VP2, VP3 и VP4 и дополнительно содержит аминокислотную последовательность сайта расщепления фурином между каждым белком VP.Preferably, the amino acid sequences of the VP2-VP4 proteins can be derived from FMDV serotype A, and more preferably from the A24/Cruzeiro virus. Preferably, each of the amino acid sequences of the VP2-VP4 proteins may be the amino acid sequence of the corresponding region included in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. Preferably, the amino acid sequence to which the amino acid sequences of the VP2-VP4 proteins are linked may be the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. The amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 contains the amino acid sequences of the VP2, VP3 and VP4 proteins and further contains the amino acid sequence of the furin cleavage site between each VP protein.

Согласно другому аспекту настоящего изобретения в нем предусмотрен полинуклеотид, кодирующий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1.According to another aspect of the present invention, there is provided a polynucleotide encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.

Предпочтительно полинуклеотид, кодирующий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1, может представлять собой или содержать нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 4. Более предпочтительно полинуклеотид, кодирующий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1, может представлять собой последовательность, которая содержит нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 4, модифицированную с целью оптимизации с помощью кодона для животного, у которого необходимо обеспечить виды иммунного ответа. Животное может представлять собой любое животное, у которого может возникнуть или развиться FMD, такое как свиньи, крупный рогатый скот, овцы и т.д., причем предпочтительно свиньи. Предпочтительно полинуклеотид, кодирующий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1, может представлять собой или содержать нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 5.Preferably, the polynucleotide encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 may be or contain the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4. More preferably, the polynucleotide encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 may be a sequence that contains the nucleotide sequence under SEQ ID NO: 4, modified to optimize with a codon for the animal in which it is necessary to provide types of immune response. The animal may be any animal that can develop or develop FMD, such as pigs, cattle, sheep, etc., preferably pigs. Preferably, the polynucleotide encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 may be or contain the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5.

Также в настоящем изобретении предусмотрен полинуклеотид, кодирующий аминокислотную последовательность, характеризующуюся 90% идентичностью с последовательностью под SEQ ID NO: 1. Предпочтительно аминокислотная последовательность, характеризующаяся 90% идентичностью с последовательностью под SEQ ID NO: 1, может представлять собой аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 2. Предпочтительно полинуклеотид, кодирующий аминокислотную последовательность, характеризующуюся 90% идентичностью с последовательностью под SEQ ID NO: 1, может представлять собой или содержать нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 8.Also provided in the present invention is a polynucleotide encoding an amino acid sequence having 90% identity with the sequence of SEQ ID NO: 1. Preferably, an amino acid sequence having 90% identity with the sequence of SEQ ID NO: 1 may be the amino acid sequence of SEQ ID NO: : 2. Preferably, the polynucleotide encoding the amino acid sequence having 90% identity with the sequence of SEQ ID NO: 1 may be or contain the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8.

Согласно другому аспекту настоящего изобретения в нем предусмотрена плазмида, содержащая полинуклеотид, кодирующий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся 90% идентичностью с последовательностью под SEQ ID NO: 1.According to another aspect of the present invention, there is provided a plasmid containing a polynucleotide encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having 90% identity with the sequence of SEQ ID NO: 1.

Термин «плазмида» означает конструкцию ДНК, содержащую последовательность ДНК, функционально связанную с подходящей регуляторной последовательностью, способной экспрессировать ДНК в подходящем хозяине. Плазмида может представлять собой вектор, фаговую частицу или просто потенциальную геномную вставку. В настоящем описании термин «плазмида» может быть взаимозаменяемо использован с термином «вектор» или «вирусный вектор».The term "plasmid" means a DNA construct containing a DNA sequence operably linked to a suitable regulatory sequence capable of expressing the DNA in a suitable host. The plasmid may be a vector, a phage particle, or simply a potential genomic insert. In the present description, the term "plasmid" can be used interchangeably with the term "vector" or "viral vector".

Если не указано иное, полинуклеотиды, включенные в плазмиду по настоящему изобретению, являются такими же, как упомянутые выше. Предпочтительно включенный полинуклеотид может представлять собой нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 или SEQ ID NO: 8 и более предпочтительно нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 5.Unless otherwise indicated, the polynucleotides included in the plasmid of the present invention are the same as those mentioned above. Preferably, the included polynucleotide may be the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, or SEQ ID NO: 8, and more preferably the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 5.

Плазмида может дополнительно содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую белки VP2-VP4 FMDV. В этом случае нуклеотидная последовательность под SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 5 в плазмиде может быть связана с нуклеотидными последовательностями, кодирующими белки VP2-VP4 FMDV, и предпочтительно может быть последовательно связана с нуклеотидными последовательностями, кодирующими белки VP2, VP3 и VP4, полученные из FMDV. Например, плазмида может содержать полинуклеотид, связанный в следующем порядке: нуклеотидная последовательность области VP4 - нуклеотидная последовательность области VP2 - нуклеотидная последовательность области VP3 - нуклеотидная последовательность под SEQ ID NO: 4 или 5 (в направлении от 5' к 3'). Дополнительная(-ые) нуклеотидная(-ые) последовательность(-и) может(-гут) быть включена(-ы) между нуклеотидными последовательностями любой области. Дополнительная нуклеотидная последовательность может представлять собой нуклеотидную последовательность, соответствующую области сайта расщепления фурином.The plasmid may further comprise a nucleotide sequence encoding VP2-VP4 FMDV proteins. In this case, the nucleotide sequence under SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 5 in the plasmid may be linked to nucleotide sequences encoding VP2-VP4 FMDV proteins, and preferably may be sequentially linked to nucleotide sequences encoding VP2, VP3 and VP4 proteins. obtained from FMDV. For example, the plasmid may contain a polynucleotide linked in the following order: nucleotide sequence of the VP4 region - nucleotide sequence of the VP2 region - nucleotide sequence of the VP3 region - nucleotide sequence under SEQ ID NO: 4 or 5 (in the direction from 5' to 3'). Additional(s) nucleotide(s) sequence(s) may(-gut) be included(s) between the nucleotide sequences of any region. The additional nucleotide sequence may be a nucleotide sequence corresponding to the furin cleavage site region.

Предпочтительно нуклеотидная последовательность, кодирующая белки VP2-VP4, может быть получена из FMDV серотипа A и более предпочтительно из вируса A24/Cruzeiro. Предпочтительно каждая из нуклеотидных последовательностей, кодирующих белки VP2-VP4, может представлять собой нуклеотидную последовательность соответствующей области, включенной в нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 6. Также предпочтительно полинуклеотидная последовательность, в которой связаны нуклеотидные последовательности областей VP2, VP3 и VP4, может представлять собой или содержать нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 6.Preferably, the nucleotide sequence encoding the VP2-VP4 proteins can be derived from FMDV serotype A, and more preferably from the A24/Cruzeiro virus. Preferably, each of the nucleotide sequences encoding the VP2-VP4 proteins may be the nucleotide sequence of the corresponding region included in the nucleotide sequence under SEQ ID NO: 6. Also preferably, the polynucleotide sequence in which the nucleotide sequences of the VP2, VP3 and VP4 regions are linked may be itself or contain the nucleotide sequence under SEQ ID NO: 6.

Наиболее предпочтительно плазмида может содержать нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 7. Нуклеотидная последовательность под SEQ ID NO: 7 может содержать нуклеотидные последовательности под SEQ ID NO: 4 или 5 и области VP2, VP3 и VP4, полученные из вируса A24/Cruzeiro. Также нуклеотидная последовательность под SEQ ID NO: 7 может содержать последовательность Kozak.Most preferably, the plasmid may contain the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7. The nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7 may contain the nucleotide sequences of SEQ ID NO: 4 or 5 and the VP2, VP3 and VP4 regions derived from the A24/Cruzeiro virus. Also, the nucleotide sequence under SEQ ID NO: 7 may contain the Kozak sequence.

Согласно другому аспекту настоящего изобретения в нем предусмотрена вакцинная композиция против FMD, содержащая полипептид, полинуклеотид или плазмиду по настоящему изобретению.According to another aspect of the present invention, there is provided an FMD vaccine composition comprising a polypeptide, polynucleotide or plasmid of the present invention.

Если не указано иное, полипептид, полинуклеотид и плазмида в вакцинной композиции против FMD являются такими же, как упомянутые выше.Unless otherwise indicated, the polypeptide, polynucleotide and plasmid in the FMD vaccine composition are the same as those mentioned above.

Термин «вакцина» относится к биологическому препарату, содержащему антиген, обеспечивающий иммунизацию субъекта. То есть вакцина относится к иммуногенному или антигенному веществу, инъецируемому или вводимому человеку или животному для предотвращения инфицирования, в целях обеспечения иммунизации живого организма.The term "vaccine" refers to a biological preparation containing an antigen that provides immunization of the subject. That is, a vaccine refers to an immunogenic or antigenic substance that is injected or administered to a human or animal to prevent infection, in order to provide immunization to a living organism.

Вакцина может представлять собой ДНК-вакцину. Термин «ДНК-вакцина» означает вакцину, которая вызывает иммунный ответ путем искусственной репликации некоторых генов из патогенов, вирусов и т.д. и управления ними. Эти ДНК-вакцины имеют много преимуществ по сравнению с существующими белковыми вакцинами, включая такие преимущества, как (i) ДНК-вакцины могут быть синтезированы с помощью только генетической информации о чистых целевых патогенных антигенах, поэтому нет необходимости работать с самим опасным патогеном, (ii) применяются только некоторые из генов, необходимые для индукции токсичности, поэтому ДНК-вакцина не будет проявлять какой-либо неожиданной токсичности при введении субъекту и (iii) благодаря структурной простоте плазмидной ДНК можно разработать вакцину путем быстрого реагирования на различные инфекционные заболевания, возникающие внезапно.The vaccine may be a DNA vaccine. The term "DNA vaccine" means a vaccine that elicits an immune response by artificially replicating certain genes from pathogens, viruses, etc. and managing them. These DNA vaccines have many advantages over existing protein vaccines, including advantages such as (i) DNA vaccines can be synthesized using only the genetic information of pure target pathogenic antigens, so there is no need to work on the dangerous pathogen itself, (ii ) only some of the genes needed to induce toxicity are applied so that the DNA vaccine will not exhibit any unexpected toxicity when administered to a subject and (iii) due to the structural simplicity of plasmid DNA, a vaccine can be developed by rapidly responding to various infectious diseases that occur suddenly.

Вакцинная композиция против FMD может обеспечивать защитный иммунитет против предпочтительно азиатского топотипа FMDV серотипа A и более предпочтительно линии Sea-97 ASIA FMDV A.The FMD vaccine composition may confer protective immunity against preferably the Asian topotype FMDV serotype A, and more preferably the Sea-97 ASIA FMDV A lineage.

Вакцинная композиция по настоящему изобретению может содержать ветеринарно приемлемый носитель. Термин «ветеринарно приемлемый носитель» включает любые и все растворители, дисперсионные среды, покрытия, иммуноадъюванты, стабилизаторы, разбавители, консерванты, антибактериальные средства, противогрибковые средства, изотонические средства, средства, замедляющие адсорбцию и т.д. Примеры носителей, вспомогательных веществ и разбавителей, которые могут содержаться в вакцинной композиции, включают лактозу, декстрозу, сахарозу, сорбит, маннит, ксилит, мальтит, крахмал, глицерин, гуммиарабик, альгинат, желатин, фосфат кальция, силикат кальция, целлюлозу, метилцеллюлозу, микрокристаллическую целлюлозу, поливинилпирролидон, воду, метилгидроксибензоат, пропилгидроксибензоат, тальк, стеарат магния и минеральное масло. Также вакцинная композиция по настоящему изобретению может быть составлена в виде пероральных лекарственных форм, таких как порошок, гранулы, таблетки, капсулы, суспензии, эмульсии, сиропы, аэрозоли и т.д., или в виде стерильных растворов для инъекций в соответствии с традиционным способом. При составлении вакцинной композиции композиция может быть получена с применением любого разбавителя или вспомогательного вещества, такого как обычно применяемые наполнители, добавки, связующие средства, смачивающие средства, дезинтегранты, поверхностно-активные вещества и т.д.The vaccine composition of the present invention may contain a veterinarily acceptable carrier. The term "veterinarily acceptable carrier" includes any and all solvents, dispersion media, coatings, immunoadjuvants, stabilizers, diluents, preservatives, antibacterial agents, antifungal agents, isotonic agents, adsorption retardants, and the like. Examples of carriers, excipients and diluents that may be contained in a vaccine composition include lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, xylitol, maltitol, starch, glycerin, gum arabic, alginate, gelatin, calcium phosphate, calcium silicate, cellulose, methylcellulose, microcrystalline cellulose, polyvinylpyrrolidone, water, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate and mineral oil. Also, the vaccine composition of the present invention may be formulated into oral dosage forms such as powder, granules, tablets, capsules, suspensions, emulsions, syrups, aerosols, etc., or as sterile injectable solutions according to the conventional method. . When formulating a vaccine composition, the composition may be prepared using any diluent or adjuvant such as commonly used excipients, additives, binders, wetting agents, disintegrants, surfactants, and the like.

Вакцинная композиция может быть введена субъекту в различных формах. «Инъекция» может проводиться любым путем, выбранным из группы, состоящей из подкожной инъекции, внутримышечной инъекции, внутрикожной инъекции, внутрибрюшинной инъекции, назального введения, внутривенной инъекции, трансдермального введения и перорального введения.The vaccine composition may be administered to a subject in various forms. The "injection" may be administered by any route selected from the group consisting of subcutaneous injection, intramuscular injection, intradermal injection, intraperitoneal injection, nasal administration, intravenous injection, transdermal administration, and oral administration.

Вакцинная композиция может содержать один или более адъювантов для улучшения или усиления видов иммунного ответа. Подходящие адъюванты включают пептиды, гидроксид алюминия, фосфат алюминия, оксид алюминия, минеральное масло, такое как Marcol 52, растительное масло, эмульгаторы или поверхностно-активные вещества, такие как лизолецитин, поликатионы, полианионы и т.д.The vaccine composition may contain one or more adjuvants to improve or enhance the types of immune response. Suitable adjuvants include peptides, aluminum hydroxide, aluminum phosphate, alumina, mineral oil such as Marcol 52, vegetable oil, emulsifiers or surfactants such as lysolecithin, polycations, polyanions, etc.

Согласно другому аспекту настоящего изобретения в нем предусмотрен способ обеспечения видов иммунного ответа на FMDV серотипа A у субъекта, включающий введение субъекту вакцинной композиции по настоящему изобретению.According to another aspect of the present invention, there is provided a method of providing an immune response to FMDV serotype A in a subject, comprising administering to the subject a vaccine composition of the present invention.

Если не указано иное, вакцинная композиция в способе обеспечения видов иммунного ответа является такой же, как указанная выше.Unless otherwise indicated, the vaccine composition in the method of providing immune response types is the same as above.

Термин «иммунный ответ» означает активацию иммунной системы хозяина, такого как млекопитающее, в ответ на введение антигена. Иммунный ответ может происходить в виде ответа клеточного иммунитета или ответа гуморального иммунитета, или обоих.The term "immune response" means the activation of the immune system of a host, such as a mammal, in response to the introduction of an antigen. The immune response may be a cellular immune response or a humoral immune response, or both.

В способе обеспечения видов иммунного ответа вакцинная композиция может содержать эффективное количество активных ингредиентов, то есть рекомбинантного полипептида, рекомбинантного полинуклеотида или содержащей их плазмиды, с фармацевтически приемлемым носителем и/или адъювантом. Субъект может представлять собой животное, предпочтительно животное, относящееся к копытным, например, свиньям, крупному рогатому скоту или овцам. Термин «эффективное количество» означает, что ингредиенты вакцины находятся в количестве, достаточном для индуцирования иммунного ответа, специфичного в отношении FMDV серотипа A, у вакцинированного животного. Специалист в данной области техники может легко определить эффективное количество, например, с помощью типичных экспериментов на животных.In a method for providing immune response types, the vaccine composition may contain an effective amount of active ingredients, ie a recombinant polypeptide, a recombinant polynucleotide, or a plasmid containing them, with a pharmaceutically acceptable carrier and/or adjuvant. The subject may be an animal, preferably an ungulate animal such as pigs, cattle or sheep. The term "effective amount" means that the ingredients of the vaccine are in an amount sufficient to induce an immune response specific for FMDV serotype A in the vaccinated animal. One skilled in the art can easily determine the effective amount, for example, using typical animal experiments.

Введение может осуществляться любым путем, подходящим для введения ДНК-вакцины, и может осуществляться, например, посредством подкожной, внутримышечной, внутрибрюшинной или внутривенной инъекции.Administration may be by any route suitable for administering a DNA vaccine and may be, for example, by subcutaneous, intramuscular, intraperitoneal, or intravenous injection.

Вакцинная композиция против FMDV в соответствии с настоящим изобретением может предусматривать вакцинную композицию на основе ДНК, проявляющую высокую иммуногенность в отношении FMDV серотипа A, в частности FMDV линии Sea-97 ASIA A. Соответственно, вакцинная композиция по настоящему изобретению является широко применимой для эффективной защиты против азиатского топотипа FMDV серотипа A, встречающегося в Корее и соседних странах Восточной Азии, Китае, Тайване и т.д.The FMDV vaccine composition of the present invention may include a DNA-based vaccine composition exhibiting high immunogenicity against FMDV serotype A, in particular Sea-97 ASIA A FMDV. Accordingly, the vaccine composition of the present invention is widely applicable for effective protection against Asian topotype FMDV serotype A found in Korea and neighboring East Asian countries, China, Taiwan, etc.

Краткое описание фигурBrief description of the figures

На фигуре 1 показан результат анализа аминокислотных последовательностей VP1 четырех типов FMDV серотипа A (номера доступа в GeneBank: HQ116371, HQ116294, KF450794 и KT223560), которые недавно возникли в Азии.Figure 1 shows the result of analysis of the VP1 amino acid sequences of four FMDV serotype A types (GeneBank accession numbers: HQ116371, HQ116294, KF450794 and KT223560) that have recently emerged in Asia.

На фигуре 2 показан результат выравнивания, при котором изучали сайты (эпитопы), важные для выработки нейтрализующих антител, в несоответствующих сайтах среди аминокислотных последовательностей VP1 четырех типов FMDV серотипа A (номера доступа в GeneBank: HQ116371, HQ116294, KF450794 и KT223560) и вируса A24/Cruzeiro.Figure 2 shows the result of an alignment that examined sites (epitopes) important for the production of neutralizing antibodies in mismatched sites among the VP1 amino acid sequences of four types of FMDV serotype A (GeneBank accession numbers: HQ116371, HQ116294, KF450794 and KT223560) and the A24 virus /Cruzeiro.

На фигуре 3 показан результат выравнивания двух типов вирусов серотипа A (MAY/97 и VN/T11D/2013), находящихся под контролем Агентства карантина и инспекции животных и растений Республики Корея, и вышеуказанных пяти серотипов FMDV.Figure 3 shows the alignment result of two types of serotype A viruses (MAY/97 and VN/T11D/2013) controlled by the Animal and Plant Quarantine and Inspection Agency of the Republic of Korea and the above five FMDV serotypes.

На фигуре 4 показана новая форма аминокислотной последовательности VP1 (тип A-1), полученная на основе вируса MAY/97.Figure 4 shows a new form of the VP1 amino acid sequence (type A-1) derived from the MAY/97 virus.

На фигуре 5 показана новая форма аминокислотной последовательности VP1 (тип A-2), полученная на основе вируса VN/T11D/2013.Figure 5 shows a new form of the VP1 amino acid sequence (type A-2) derived from the VN/T11D/2013 virus.

Фигура 6 представляет собой диаграмму, на которой показана стратегия замены области VP1 pGX9008 новым синтетическим геном VP1.Figure 6 is a diagram showing the strategy for replacing the VP1 region of pGX9008 with a new synthetic VP1 gene.

На фигуре 7 показан результат выравнивания последовательности, идентифицированной посредством секвенирования, и последовательности нового синтетического гена VP1.Figure 7 shows the result of the alignment of the sequence identified by sequencing and the sequence of the new synthetic VP1 gene.

На фигуре 8 показан результат анализа эффекта образования антител у мышей в результате введения вакцины по настоящему изобретению с помощью SPC ELISA.The figure 8 shows the result of the analysis of the effect of formation of antibodies in mice as a result of the introduction of the vaccine of the present invention using SPC ELISA.

На фигуре 9 показан результат анализа эффекта образования антител у карликовых свиней в результате введения вакцины по настоящему изобретению с помощью SPC ELISA.The figure 9 shows the result of the analysis of the effect of formation of antibodies in pygmy pigs as a result of the introduction of the vaccine of the present invention using SPC ELISA.

На фигуре 10 показан эффект образования нейтрализующих антител у карликовых свиней в результате введения вакцины по настоящему изобретению.The figure 10 shows the effect of the formation of neutralizing antibodies in pygmy pigs as a result of the introduction of the vaccine of the present invention.

ПримерыExamples

Далее в данном документе настоящее изобретение описано более подробно с помощью примеров. Однако примеры предназначены только для иллюстрации настоящего изобретения и объем настоящего изобретения не ограничивается ими.Hereinafter, the present invention is described in more detail by way of examples. However, the examples are only intended to illustrate the present invention and the scope of the present invention is not limited thereto.

Пример 1. Анализ идентичности между FMDV серотипа A из Йончхона и pGX9008Example 1 Identity analysis between FMDV serotype A from Yongcheon and pGX9008

С помощью генетического анализа FMD, возникший в Йончхоне, Корея, в феврале 2017 года, идентифицировали как вызванный вирусом серотипа А, и при этом вирус FMD идентифицировали как принадлежащий к линии Sea-97 ASIA A. Кроме того, в результате анализа идентичности вирусу серотипа А, который обнаружили в Азии, провели сравнение 633 нуклеотидных последовательностей области VP1, и результаты показывают 99,8% идентичность вирусу VIT/14/2016, обнаруженному у крупного рогатого скота и свиней во Вьетнаме в 2016 году; 99,7% идентичность вирусу VIT/16/2016 у крупного рогатого скота в Мьянме в 2016 году; и 99,5% идентичность вирусу GDMM/CHA/2013-S у свиней в провинции Гуандун, Китай, в 2013 году.Through genetic analysis, an FMD originating in Yeongcheon, Korea in February 2017 was identified as being caused by the serotype A virus, and the FMD virus was identified as belonging to the Sea-97 ASIA A lineage. , which was found in Asia, compared 633 nucleotide sequences of the VP1 region, and the results show 99.8% identity to the VIT/14/2016 virus found in cattle and pigs in Vietnam in 2016; 99.7% identity to VIT/16/2016 virus in cattle in Myanmar in 2016; and 99.5% identity to the GDMM/CHA/2013-S virus in pigs in Guangdong, China in 2013.

Чтобы проанализировать идентичность между FMDV из Йончхона и pGX9008, на основе которого создана вакцина против FMDV из Южной Америки, использовали последовательность GDMM/CHA/2013-S, доступную из базы данных GB (NCBI). Примерно три нуклеотидные последовательности в FMDV серотипа A из Йончхона отличаются от GDMM/CHA/2013-S, который на 99,5% идентичен FMDV серотипа A из Йончхона. При трансляции в аминокислотные последовательности не более одной последовательности FMDV серотипа A из Йончхона отличается от GDMM/HA/2013-S, но их определяли как практически одинаковые. В результате сравнения аминокислотных последовательностей сайта VP1, который является частью структурного белка P1, у pGX9008 и GDMM/CHA/2013-S идентичность составила 178/211 (84%).To analyze the identity between Yeongcheon FMDV and pGX9008, which is the basis of the South American FMDV vaccine, the GDMM/CHA/2013-S sequence available from the GB database (NCBI) was used. About three nucleotide sequences in FMDV serotype A from Yeongcheon differ from GDMM/CHA/2013-S, which is 99.5% identical to FMDV serotype A from Yeongcheon. When translated into amino acid sequences, no more than one sequence of FMDV serotype A from Yeongcheon differs from GDMM/HA/2013-S, but they were determined to be essentially the same. As a result of comparing the amino acid sequences of the VP1 site, which is part of the P1 structural protein, the identity of pGX9008 and GDMM/CHA/2013-S was 178/211 (84%).

Это означает, что вакцина на основе pGX9008 против FMDV из Южной Америки, используемая в данной области техники, не будет демонстрировать вакцинный эффект против FMD серотипа А, встречающегося в Юго-Восточной Азии, включая Корею, и, следовательно, необходимо разработать вакцину для Кореи или Азии.This means that the pGX9008-based vaccine against FMDV from South America used in the art will not show a vaccine effect against FMD serotype A occurring in Southeast Asia, including Korea, and therefore a vaccine needs to be developed for Korea or Asia.

Пример 2. Анализ последовательности FMDV серотипа A, встречающегося в Азии, для рекомбинации области VP1 pGX9008Example 2 Sequence analysis of FMDV serotype A found in Asia to recombine the VP1 region of pGX9008

Проанализировали отчеты ME о VP1 FMDV серотипа A, в последнее время встречающегося в Азии, с веб-сайта WRLFMD. Отчет об исследовании охватывает в общей сложности 17 стран, включая Вьетнам, Тайвань, Корею, Россию, Лаос, Мьянму, Казахстан, Камбоджу, Малайзию, Монголию, Филиппины, Таиланд, Непал, Японию, Гонконг, Бутан и Бангладеш. Подтверждено, что среди вышеперечисленных стран FMDV серотипа А в последнее время не встречался на Филиппинах, в Тайване, Непале, Японии, Гонконге, Бутане и Бангладеш. Учитывая результаты из отчетов ME, в качестве штамма для рекомбинации области VP1 pGX9008 выбирали четыре штамма, информация о нуклеотидных последовательностях которых доступна из NCBI GeneBank, то есть доступны их номера доступа в GeneBank (см. таблицу 1).Analyzed ME reports of VP1 FMDV serotype A, recently found in Asia, from the WRLFMD website. The study report covers a total of 17 countries, including Vietnam, Taiwan, Korea, Russia, Laos, Myanmar, Kazakhstan, Cambodia, Malaysia, Mongolia, Philippines, Thailand, Nepal, Japan, Hong Kong, Bhutan, and Bangladesh. Among the countries listed above, FMDV serotype A has not been recently reported in the Philippines, Taiwan, Nepal, Japan, Hong Kong, Bhutan and Bangladesh. Based on the results from the ME reports, four strains were chosen as the strain for recombination of the VP1 region of pGX9008, whose nucleotide sequence information is available from the NCBI GeneBank, i.e., their GeneBank accession numbers are available (see Table 1).

Таблица 1Table 1

Figure 00000001
Figure 00000001

Среди исследованных штаммов нуклеотидные последовательности четырех штаммов GDMM/CHA/2013-S (KF450794), CAM/2/2008 (HQ116294), MAY/4/2012 (KT223560), A/VIT/3/2008 (HQ116371) транслировали в аминокислотные последовательности. В результате выравнивания транслированных аминокислотных последовательностей с применением CLUSTAL/MUSCLE подтверждали 22 несовпадения аминокислот. На фигуре 1 показаны данные, резюмирующие результаты выравнивания посредством Jalview.Among the studied strains, the nucleotide sequences of four strains GDMM/CHA/2013-S (KF450794), CAM/2/2008 (HQ116294), MAY/4/2012 (KT223560), A/VIT/3/2008 (HQ116371) were translated into amino acid sequences . Alignment of the translated amino acid sequences using CLUSTAL/MUSCLE confirmed 22 amino acid mismatches. Figure 1 shows data summarizing alignment results by Jalview.

Пример 3. Анализ области, представляющей собой эпитоп, важной для выработки нейтрализующих антителExample 3 Analysis of an epitope region important for the production of neutralizing antibodies

Выравнивание осуществляли путем изучения сайтов (эпитопов), важных для выработки нейтрализующих антител, среди несовпадающих последовательностей, подтвержденных в примере 2, как описано в публикациях (Res Vet Sci. 2017 Dec; 115:374-381., Arch Virol. 2016 Oct; 161(10):2705-16., Virus Res. 2014 Mar 6; 181:72-6. и Vet Microbiol. 2011 Apr 21; 149(1-2):242-7. и т.д.). На фигуре 2 показан результат выравнивания эпитопов в отношении выработки нейтрализующих антител.Alignment was performed by examining sites (epitopes) important for the production of neutralizing antibodies among the mismatched sequences confirmed in example 2, as described in publications (Res Vet Sci. 2017 Dec; 115:374-381., Arch Virol. 2016 Oct; 161 (10):2705-16, Virus Res 2014 Mar 6;181:72-6 and Vet Microbiol 2011 Apr 21;149(1-2):242-7 etc). The figure 2 shows the result of the alignment of epitopes in relation to the production of neutralizing antibodies.

Кроме того, два штамма FMDV серотипа A, находящиеся под контролем Агентства карантина и инспекции животных и растений Республики Корея, т.е. MAY/97 и VN/T11D/2013, выравнивали вместе, и результаты показаны на фиг. 3.In addition, two FMDV serotype A strains under the control of the Animal and Plant Quarantine and Inspection Agency of the Republic of Korea, i.e. MAY/97 and VN/T11D/2013 were aligned together and the results are shown in FIG. 3.

Пример 4. Синтез новой области VP1 FMDV серотипа AExample 4 Synthesis of a new FMDV serotype A VP1 region

4.1. Определение новой последовательности области VP14.1. Definition of a new VP1 region sequence

С GDMM/CHA/2013-S в качестве вируса-мишени для сравнения определяли последовательность области, представляющей собой эпитоп, для MAY/97 и VN/T11D/2013, подлежащих инокуляции, представляющей собой контрольное заражение, и, соответственно, выбирали два типа аминокислотных последовательностей области VP1, содержащих соответствующие им аминокислотные последовательности, в качестве кандидатов для рекомбинации области VP1 pGX9008. Аминокислотную последовательность VP1 на основе вируса MAY/97 называли «A-1 нового типа», и аминокислотную последовательность VP1 на основе VN/T11D/2013 называли «A-2 нового типа». With GDMM/CHA/2013-S as the target virus for comparison, the sequence of the epitope region for MAY/97 and VN/T11D/2013 to be inoculated as challenge was determined, and two types of amino acids were selected accordingly. sequences of the VP1 region containing their respective amino acid sequences as candidates for recombination of the VP1 region of pGX9008. The VP1 amino acid sequence based on the MAY/97 virus was called "new type A-1", and the VP1 amino acid sequence based on VN/T11D/2013 was called "new type A-2".

В результате анализа идентичности последовательностей A-1 нового типа и A-2 нового типа и последовательности традиционного вируса серотипа A получали следующие результаты.As a result of the analysis of the identity of the sequences of A-1 new type and A-2 new type and the sequence of the traditional virus serotype A, the following results were obtained.

Figure 00000002
Figure 00000002

В случае рекомбинации с применением A-2 нового типа можно подтвердить, что идентичность MAY/97 и VN/T11D/2013, подлежащих инокуляции, представляющей собой контрольное заражение, является высокой, и идентичность штамму, недавно возникшему в Корее, также является высокой. Соответственно, получали новую ДНК-вакцину путем рекомбинации области VP1 pGX9008 с применением A-2 нового типа, и подтверждали ее эффективность.In the case of recombination using a new type of A-2, it can be confirmed that the identity of MAY/97 and VN/T11D/2013 to be inoculated as a challenge is high, and the identity of the newly emerged strain in Korea is also high. Accordingly, a new DNA vaccine was prepared by recombining the VP1 region of pGX9008 with the novel type A-2, and its efficacy was confirmed.

4.2. Рекомбинация новой последовательности области VP14.2. Recombination of a new VP1 region sequence

Последовательность оснований под SEQ ID NO: 4 VP1 FMDV, подлежащая конструированию в качестве нового серотипа А, оптимизировали с помощью кодона свиньи. Последовательность гена под SEQ ID NO: 5, оптимизированную с помощью кодона свиньи, применяли для замещения последовательности VP1 pGX9008. На фигуре 6 показана стратегия замещения сайта VP1 pGX9008 сайтом VP1 синтетического гена, оптимизированного с помощью кодона свиньи, в качестве нового серотипа А.The base sequence under SEQ ID NO: 4 VP1 FMDV to be constructed as a new serotype A was optimized with a porcine codon. The porcine codon optimized gene sequence of SEQ ID NO: 5 was used to replace the VP1 sequence of pGX9008. Figure 6 shows the strategy of replacing the VP1 site of pGX9008 with the VP1 site of the porcine codon-optimized synthetic gene as a new serotype A.

Получали плазмиду pUC57-FMD A-2 нового типа, в которой клонирован сайт VP1 синтетического гена, оптимизированного с помощью кодона свиньи, в качестве нового серотипа A. Несколько клонов получали путем лигирования вставки (774 п.о.), полученной путем воздействия на плазмиду pUC57-FMD A-2 нового типа рестриктазы BstBI/XhoI, и векторной основной цепи, полученной путем воздействия на плазмиду pGX9008 рестриктазы BstBI/XhoI.A new type of plasmid pUC57-FMD A-2 was generated in which the VP1 site of the porcine codon-optimized synthetic gene was cloned as a new serotype A. pUC57-FMD A-2 of a new type of restriction enzyme BstBI/XhoI, and a vector backbone obtained by exposing plasmid pGX9008 to BstBI/XhoI restriction enzyme.

Для полученных клонов посредством секвенирования подтвердили, что предполагаемая последовательность pGX-FMD A-2 нового типа включена в клон. В результате выравнивания последовательности, подтвержденной секвенированием, и последовательности FMD A-2 нового типа с оптимизацией с помощью кодона свиньи, подтвердили, что последовательности идентичны на 100% (фиг. 7). Оптимизированную с помощью кодона свиньи последовательность FMD A-2 нового типа в дальнейшем применяли для получения вакцины на основе плазмиды ДНК FMD.For the resulting clones, it was confirmed by sequencing that the putative novel type pGX-FMD A-2 sequence was included in the clone. By aligning the sequence confirmed by sequencing and the new type FMD A-2 sequence with porcine codon optimization, the sequences were confirmed to be 100% identical (FIG. 7). The new-type FMD A-2 sequence optimized with the porcine codon was further used to produce a vaccine based on the FMD DNA plasmid.

Пример 5. Подтверждение эффекта образования антител новой ДНК-вакциныExample 5 Confirmation of the Antibody Effect of the New DNA Vaccine

5.1. Получение вакцины на основе плазмиды ДНК FMD5.1. Obtaining a vaccine based on the DNA plasmid FMD

2,5 л среды LB инокулировали E. coli, содержащей плазмиду ДНК FMD, которая содержит оптимизированную с помощью кодона свиньи последовательность FMD A-2 нового типа, и затем культивировали в течение ночи при 37°С. Затем плазмиду извлекали из культивируемой E. coli с применением набора EndoFree Plasmid Giga kit (QIAGEN, № по кат. 12391). Извлеченную плазмиду растворяли в воде, не содержащей эндотоксинов, и хранили при -70°С. После хранения плазмиду затем применяли в эксперименте для измерения эффекта образования антител у животных (для подтверждения эффекта вакцинации). Далее в данном документе новая ДНК-вакцина, полученная, как указано выше, называется «PLS-A».2.5 L of LB medium was inoculated with E. coli containing an FMD DNA plasmid that contains a novel type porcine codon-optimized FMD A-2 sequence, and then cultured overnight at 37°C. The plasmid was then recovered from cultured E. coli using the EndoFree Plasmid Giga kit (QIAGEN, Cat # 12391). The extracted plasmid was dissolved in endotoxin-free water and stored at -70°C. After storage, the plasmid was then used in an experiment to measure the effect of antibody formation in animals (to confirm the effect of vaccination). Hereinafter, the novel DNA vaccine prepared as above is referred to as "PLS-A".

5.2. Подтверждение эффекта образования антител вакцины у мыши5.2. Confirmation of the effect of vaccine antibody production in mice

5.2.1. ДНК-вакцинация5.2.1. DNA vaccination

Пятнадцать мышей C57BL/6 (самок возрастом 6 недель) разделяли на три группы по пять мышей в группе, и каждую группу инокулировали вакциной по настоящему изобретению, традиционной вакциной и имитационной плазмидой три раза с интервалами, составляющими две недели, как показано ниже. Инокуляцию проводили с применением устройства для электропорации (CELLECTRA 2000), и ДНК-вакцину вводили при концентрации 30 мкг на мышь.Fifteen C57BL/6 mice (female, 6 weeks old) were divided into three groups of five mice per group, and each group was inoculated with the vaccine of the present invention, conventional vaccine and mock plasmid three times at two week intervals as shown below. Inoculation was performed using an electroporation device (CELLECTRA 2000) and the DNA vaccine was administered at a concentration of 30 μg per mouse.

Группа 1 (контрольная группа) - имитационная плазмидная ДНКGroup 1 (control group) - mock plasmid DNA

Группа 2 (группа сравнения) - ДНК FMD серотипа A (A24 cruzeiro из Южной Америки, традиционная вакцина)Group 2 (comparison group) - FMD serotype A DNA (A24 cruzeiro from South America, traditional vaccine)

Группа 3 (экспериментальная группа) - ДНК FMD серотипа A (PLS-A, азиатский тип, вакцина по настоящему изобретению)Group 3 (experimental group) - FMD serotype A DNA (PLS-A, Asian type, vaccine of the present invention)

Кровь собирали с применением ретроорбитального метода отбора проб крови до введения (неделя 0), после второго введения (неделя 3) и после третьего введения (неделя 5). Сыворотку крови отделяли от собранной крови и хранили при -80°С. После хранения сыворотку крови растворяли и подвергали анализу SPC (твердофазная конкуренция) ELISA.Blood was collected using a retroorbital blood sampling method before administration (week 0), after the second administration (week 3) and after the third administration (week 5). Serum was separated from the collected blood and stored at -80°C. After storage, serum was dissolved and subjected to SPC (solid phase competition) ELISA.

5.2.2. Измерение образования антител - анализ SPC ELISA5.2.2. Measuring Antibody Production - SPC ELISA Assay

SPC ELISA проводили с применением набора PrioCHECK FMDV Type A ELISA (Prionics Lelystad B.V / Нидерланды) в соответствии с экспериментальным протоколом, предоставленным изготовителем набора.SPC ELISA was performed using the PrioCHECK FMDV Type A ELISA kit (Prionics Lelystad B.V / The Netherlands) according to the experimental protocol provided by the kit manufacturer.

Результаты показаны на фигуре 8. Как можно увидеть на фиг. 8, вакцина PLS-A по настоящему изобретению была значительно менее времязатратной, чем традиционная вакцина против A24 из Южной Америки в отношении образования антитела и характеризовалась более высоким значением PI ингибирования реакции. В данном случае, чем выше значение PI ингибирования реакции, тем больше продуцировалось антител, специфичных к FMDV серотипа А.The results are shown in Figure 8. As can be seen in FIG. 8, the PLS-A vaccine of the present invention was significantly less time consuming than the traditional South American A24 vaccine in terms of antibody production and had a higher response inhibition PI. In this case, the higher the response inhibition PI value, the more antibodies specific to FMDV serotype A were produced.

Как указано выше, FMD очень заразен и, поскольку вирус FMD выделяется из организма еще до появления каких-либо клинических симптомов, распространение от животного к животному может происходить легко. Также, FMD имеет очень короткий инкубационный период. Следовательно, чтобы продемонстрировать эффективное функциональное действие вакцины против FMD, не только эффект подавления вируса FMD должен быть превосходным, но также к вирусу FMD должны быстро вырабатываться антитела. В случае введения вакцины в соответствии с настоящим изобретением вакцина не только значительно превосходит традиционную вакцину в подавлении вируса FMD, но также обеспечивает выработку антител значительно быстрее, и, таким образом, возможно подавлять инфекцию FMD на ранней стадии. Следовательно, вакцина в соответствии с настоящим изобретением является очень эффективной вакциной против FMD.As stated above, FMD is highly contagious and since the FMD virus is shed from the body before any clinical symptoms appear, spread from animal to animal can occur easily. Also, FMD has a very short incubation period. Therefore, in order to show an effective functional effect of the FMD vaccine, not only the suppression effect of the FMD virus must be excellent, but also antibodies to the FMD virus must be rapidly produced. In the case of administering the vaccine according to the present invention, the vaccine is not only significantly superior to the conventional vaccine in suppressing the FMD virus, but also produces antibodies much faster, and thus it is possible to suppress the FMD infection at an early stage. Therefore, the vaccine according to the present invention is a very effective FMD vaccine.

5.3. Подтверждение эффекта образования антител вакцины у карликовой свиньи5.3. Confirmation of the antibody-forming effect of the vaccine in the pygmy pig

5.3.1. ДНК-вакцинация5.3.1. DNA vaccination

Девять карликовых свиней

Figure 00000003
(самцов возрастом 4 месяца) разделяли на три группы по три карликовые свиньи в группе, и каждую группу инокулировали вакциной три раза с интервалами, составляющими 3 недели, как показано ниже. Вакцину вводили в мышцы внутренней поверхности задних конечностей при концентрации 0,5 мг на карликовую свинью с применением устройства для электропорации (CELLECTRA 2000), и инактивированную вакцину вводили в мышцу задней поверхности шеи в количестве 2 мл. На неделе 9 каждую вакцину дополнительно вводили при концентрации 3 мг на карликовую свинью.Nine pygmy pigs
Figure 00000003
(4 month old males) were divided into three groups of three minipigs per group, and each group was inoculated with the vaccine three times at 3 week intervals as shown below. The vaccine was administered to the muscles of the inner surface of the hind limbs at a concentration of 0.5 mg per minipig using an electroporation device (CELLECTRA 2000), and the inactivated vaccine was administered to the muscle of the hindquarters in an amount of 2 ml. At week 9, each vaccine was additionally administered at a concentration of 3 mg per minipig.

Группа 1 (отрицательный контроль) - имитационная плазмидная ДНКGroup 1 (negative control) - mock plasmid DNA

Группа 2 (положительный контроль) - инактивированная вакцина (доступная от Komipharm, бивалентная вакцина против серотипа O/A) Group 2 (positive control) - inactivated vaccine (available from Komipharm, bivalent vaccine against O/A serotype)

Группа 3 (экспериментальная группа) - ДНК FMD типа A (PLS-A, серотип A, вакцина по настоящему изобретению)Group 3 (experimental group) - FMD type A DNA (PLS-A, serotype A, vaccine of the present invention)

Кровь собирали до введения (неделя 0), после первого введения (неделя 3), после второго введения (неделя 6) и после четвертого введения (неделя 12). Плазму крови отделяли от собранной крови и отделенную плазму крови хранили при -80°С. После хранения плазму крови растворяли и подвергали анализу SPC (твердофазная конкуренция) ELISA.Blood was collected before injection (week 0), after the first injection (week 3), after the second injection (week 6) and after the fourth injection (week 12). The blood plasma was separated from the collected blood and the separated blood plasma was stored at -80°C. After storage, blood plasma was dissolved and subjected to SPC (solid phase competition) ELISA.

5.3.2. Измерение образования антител - анализ SPC ELISA5.3.2. Measurement of Antibody Production - SPC ELISA Assay

SPC ELISA проводили с применением набора PrioCHECK FMDV Type A ELISA (Prionics Lelystad B.V / Нидерланды) в соответствии с экспериментальным протоколом, предоставленным изготовителем набора.SPC ELISA was performed using the PrioCHECK FMDV Type A ELISA kit (Prionics Lelystad B.V / The Netherlands) according to the experimental protocol provided by the kit manufacturer.

Результаты показаны на фигуре 9. В случае вакцины PLS-A по настоящему изобретению на фиг. 9 показано, что значение PI ингибирования реакции заметно увеличилось на неделе 12 после четвертого введения. В частности, значение PI ингибирования реакции было даже выше, чем таковое для инактивированной вакцины, которая представляет собой положительный контроль.The results are shown in Figure 9. In the case of the PLS-A vaccine of the present invention, in FIG. 9 shows that the response inhibition PI value markedly increased at week 12 after the fourth administration. In particular, the PI value for reaction inhibition was even higher than that of the inactivated vaccine, which is a positive control.

5.4. Подтверждение эффекта образования нейтрализующих антител у карликовой свиньи в результате введения вакцины5.4. Confirmation of the effect of the formation of neutralizing antibodies in a pygmy pig as a result of the introduction of a vaccine

5.4.1. ДНК-вакцинация5.4.1. DNA vaccination

Девять карликовых свиней

Figure 00000003
(самок возрастом 4 месяца) разделяли на три группы по три карликовые свиньи в группе, и каждую группу инокулировали вакциной три раза с интервалами, составляющими 3 недели, как показано ниже. ДНК-вакцину вводили в мышцы внутренней поверхности задних конечностей при концентрации 6 мг на карликовую свинью с применением устройства для электропорации (CELLECTRA 2000), и инактивированную вакцину вводили в мышцу задней поверхности шеи в количестве 2 мл.Nine pygmy pigs
Figure 00000003
(4-month-old females) were divided into three groups of three minipigs per group, and each group was inoculated with the vaccine three times at 3-week intervals as shown below. The DNA vaccine was injected into the muscles of the inner surface of the hind limbs at a concentration of 6 mg per minipig using an electroporation device (CELLECTRA 2000), and the inactivated vaccine was injected into the muscles of the back of the neck in an amount of 2 ml.

Группа 1 (отрицательный контроль) - имитационная плазмидная ДНКGroup 1 (negative control) - mock plasmid DNA

Группа 2 (положительный контроль) - инактивированная вакцина (доступная от Komipharm, бивалентная вакцина против серотипа O/A)Group 2 (positive control) - inactivated vaccine (available from Komipharm, bivalent vaccine against O/A serotype)

Группа 3 (экспериментальная группа) - трехвалентная ДНК-вакцина против FMD (PLS-A, серотип А + серотип О + серотип Asia1)Group 3 (experimental group) - trivalent DNA vaccine against FMD (PLS-A, serotype A + serotype O + serotype Asia1)

Для получения трехвалентных вакцин для группы 3 применяли коммерчески доступные серотипы О и Asia1. Кровь собирали после введения (неделя 9). Плазму крови отделяли от собранной крови и отделенную плазму крови хранили при -80°С. В анализе SPC ELISA и реакции нейтрализации отделенную плазму крови растворяли и подвергали реакции нейтрализации VNT.To obtain trivalent vaccines for group 3, commercially available serotypes O and Asia1 were used. Blood was collected after administration (week 9). The blood plasma was separated from the collected blood and the separated blood plasma was stored at -80°C. In the SPC ELISA and neutralization assay, separated blood plasma was dissolved and subjected to a VNT neutralization reaction.

5.4.2. Реакция нейтрализации вируса (реакция нейтрализации VNT)5.4.2. Virus neutralization test (VNT neutralization test)

Реакцию нейтрализации проводили в Центре исследования вакцин против FMD Агентства карантина и инспекции животных и растений Республики Корея с применением анализируемой сыворотки крови в соответствии с руководством OIE.The neutralization reaction was carried out at the FMD Vaccine Research Center of the Animal and Plant Quarantine and Inspection Agency of the Republic of Korea using the analyzed blood serum in accordance with the OIE guidelines.

FMDV серотипа А MAY/97 использовали для VNT для подтверждения титра нейтрализации. A/MAY/97 100 TCID50 разбавляли анализируемой сывороткой крови, положительной сывороткой крови и отрицательной сывороткой крови при соответствующей степени разбавления и проводили реакцию в течение 1 часа. Цитопатический эффект наблюдали после посева клеточной линии LFBK (фетальной клеточной линии почки свиньи) и проведения реакции в течение 2~3 дней. Положительный стандарт титра нейтрализующего антитела составляет 1:16 по стандарту OIE (логарифмическое значение 1,20) и 1:32 у свиней по стандарту Республики Корея (логарифмическое значение 1,51).FMDV serotype A MAY/97 was used for VNT to confirm the neutralization titer. A/MAY/97 100 TCID50 was diluted with the analyzed blood serum, positive blood serum and negative blood serum at the appropriate dilution rate and reacted for 1 hour. A cytopathic effect was observed after seeding the LFBK cell line (fetal porcine kidney cell line) and reacting for 2~3 days. The positive standard for neutralizing antibody titer is 1:16 OIE standard (log value 1.20) and 1:32 in pigs according to the Republic of Korea standard (log value 1.51).

Результаты показаны на фигуре 10. Как можно увидеть на фиг. 10, на неделе 9 после введения трехвалентная ДНК-вакцина, включая PLS-A, показала титр нейтрализующего антитела, составляющий по меньшей мере 1:200 у всех субъектов, что определили как положительный результат.The results are shown in Figure 10. As can be seen in FIG. 10, at week 9 post-administration, the trivalent DNA vaccine, including PLS-A, showed a neutralizing antibody titer of at least 1:200 in all subjects, which was determined to be positive.

Также на фиг. 9 показано сравнение ингибирования реакции (значения PI) между группой положительного контроля с применением бивалентной вакцины и вакциной в соответствии с настоящим изобретением, тогда как на фиг. 10 показано сравнение ингибирования реакции (значения PI) между группой положительного контроля с применением бивалентной вакцины и трехвалентной вакциной, предусматривающей вакцину в соответствии с настоящим изобретением. Подтвердили, что вакцина в соответствии с настоящим изобретением не только оказывает превосходные эффекты в отношении FMDV серотипа A при действии отдельно, но также оказывает превосходные эффекты в отношении FMDV серотипа A даже при действии в форме трехвалентной вакцины в комбинации с другими серотипами. Это означает, что вакцина в соответствии с настоящим изобретением является широко применимой как в виде моновалентной вакцины, так и в виде поливалентной вакцины.Also in FIG. 9 shows a comparison of response inhibition (PI values) between a positive control group using a bivalent vaccine and a vaccine according to the present invention, while FIG. 10 shows a comparison of reaction inhibition (PI values) between a positive control group using a bivalent vaccine and a trivalent vaccine providing a vaccine in accordance with the present invention. It has been confirmed that the vaccine according to the present invention not only has excellent effects against FMDV serotype A when given alone, but also has excellent effects against FMDV serotype A even when given as a trivalent vaccine in combination with other serotypes. This means that the vaccine according to the present invention is widely applicable both as a monovalent vaccine and as a polyvalent vaccine.

--->--->

<110> Пламблайн Лайф Сайенсиз, Инк.<110> Plumbline Life Sciences, Inc.

<120> ВАКЦИННАЯ КОМПОЗИЦИЯ ПРОТИВ ВИРУСА ЯЩУРА ТИПА А<120> VACCINE COMPOSITION AGAINST FMD VIRUS TYPE A

<130> PCT18011<130> PCT18011

<150> KR 10-2017-0184875<150> KR 10-2017-0184875

<151> 2017-12-29<151> 2017-12-29

<150> KR 10-2018-0149242<150> KR 10-2018-0149242

<151> 2018-11-28<151> 2018-11-28

<160> 8<160> 8

<170> KoPatentIn 3.0<170> KoPatentIn 3.0

<210> 1<210> 1

<211> 212<211> 212

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искуственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VP1 A-2 нового типа<223> VP1 A-2 new type

<400> 1<400> 1

Thr Thr Ala Thr Gly Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val GluThr Thr Ala Thr Gly Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Asn Tyr Gly Gly Glu Thr Gln Ala Gln Arg Arg His His Thr Asp ValAsn Tyr Gly Gly Glu Thr Gln Ala Gln Arg Arg His His Thr Asp Val

20 25 30 20 25 30

Gly Phe Leu Met Asp Arg Phe Val Gln Ile Lys Pro Val Ser Pro ThrGly Phe Leu Met Asp Arg Phe Val Gln Ile Lys Pro Val Ser Pro Thr

35 40 45 35 40 45

His Val Ile Asp Leu Met Gln Thr His Gln His Gly Leu Val Gly AlaHis Val Ile Asp Leu Met Gln Thr His Gln His Gly Leu Val Gly Ala

50 55 60 50 55 60

Met Leu Arg Ala Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Val ValMet Leu Arg Ala Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Val Val

65 70 75 80 65 70 75 80

Asn His Thr Gly Asn Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu AlaAsn His Thr Gly Asn Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu Ala

85 90 95 85 90 95

Ala Leu Asn Asn Thr Ser Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Ala Pro PheAla Leu Asn Asn Thr Ser Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Ala Pro Phe

100 105 110 100 105 110

Thr Arg Leu Ala Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala ThrThr Arg Leu Ala Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr

115 120 125 115 120 125

Val Tyr Ser Gly Thr Ser Lys Tyr Ser Thr Pro Gln Thr Arg Arg GlyVal Tyr Ser Gly Thr Ser Lys Tyr Ser Thr Pro Gln Thr Arg Arg Gly

130 135 140 130 135 140

Asp Leu Gly Pro Leu Ala Ala Arg Leu Ala Ala Gln Leu Pro Ala SerAsp Leu Gly Pro Leu Ala Ala Arg Leu Ala Ala Gln Leu Pro Ala Ser

145 150 155 160 145 150 155 160

Phe Asn Phe Gly Ala Ile Arg Ala Thr Glu Ile Gln Glu Leu Leu ValPhe Asn Phe Gly Ala Ile Arg Ala Thr Glu Ile Gln Glu Leu Leu Val

165 170 175 165 170 175

Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala ValArg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Val

180 185 190 180 185 190

Glu Val Ser Ser Gln Asp Arg His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro AlaGlu Val Ser Ser Gln Asp Arg His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro Ala

195 200 205 195 200 205

Lys Gln Leu LeuLys Gln Leu Leu

210 210

<210> 2<210> 2

<211> 212<211> 212

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искуственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VP1 A-1 нового типа<223> VP1 A-1 new type

<400> 2<400> 2

Thr Thr Ala Thr Gly Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val GluThr Thr Ala Thr Gly Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu

1 5 10 15 1 5 10 15

Asn Tyr Gly Gly Glu Thr Gln Ala Gln Arg Arg His His Thr Asp ValAsn Tyr Gly Gly Glu Thr Gln Ala Gln Arg Arg His His Thr Asp Val

20 25 30 20 25 30

Ser Phe Ile Met Asp Arg Phe Val Arg Ile Lys Pro Val Ser Pro ThrSer Phe Ile Met Asp Arg Phe Val Arg Ile Lys Pro Val Ser Pro Thr

35 40 45 35 40 45

His Val Ile Asp Leu Met Gln Thr His Gln His Gly Leu Val Gly AlaHis Val Ile Asp Leu Met Gln Thr His Gln His Gly Leu Val Gly Ala

50 55 60 50 55 60

Met Leu Arg Ala Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Val ValMet Leu Arg Ala Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Val Val

65 70 75 80 65 70 75 80

Asn His Thr Gly Asn Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu AlaAsn His Thr Gly Asn Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu Ala

85 90 95 85 90 95

Ala Leu Asp Asn Thr Ser Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Ala Pro PheAla Leu Asp Asn Thr Ser Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Ala Pro Phe

100 105 110 100 105 110

Thr Arg Leu Ala Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala ThrThr Arg Leu Ala Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr

115 120 125 115 120 125

Val Tyr Asn Gly Thr Ser Lys Tyr Ser Thr Pro Gly Ala Arg Arg GlyVal Tyr Asn Gly Thr Ser Lys Tyr Ser Thr Pro Gly Ala Arg Arg Gly

130 135 140 130 135 140

Asp Leu Gly Ser Leu Ala Ala Arg Leu Ala Ala Gln Leu Pro Ala SerAsp Leu Gly Ser Leu Ala Ala Arg Leu Ala Ala Gln Leu Pro Ala Ser

145 150 155 160 145 150 155 160

Phe Asn Phe Gly Ala Ile Arg Ala Thr Glu Ile Gln Glu Leu Leu ValPhe Asn Phe Gly Ala Ile Arg Ala Thr Glu Ile Gln Glu Leu Leu Val

165 170 175 165 170 175

Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala ValArg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Val

180 185 190 180 185 190

Glu Val Leu Ser Gln Asp Arg His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro AlaGlu Val Leu Ser Gln Asp Arg His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro Ala

195 200 205 195 200 205

Lys Gln Leu LeuLys Gln Leu Leu

210 210

<210> 3<210> 3

<211> 446<211> 446

<212> БЕЛОК<212> PROTEIN

<213> Искуственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> PGX9008 VP4-VP2-VP3<223> PGX9008 VP4-VP2-VP3

<400> 3<400> 3

Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu Asp Arg Ile Leu ThrAsp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu Asp Arg Ile Leu Thr

1 5 10 15 1 5 10 15

Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln Ser Ser Val Gly ValThr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln Ser Ser Val Gly Val

20 25 30 20 25 30

Thr His Gly Tyr Ser Thr Glu Glu Asp His Val Ala Gly Pro Asn ThrThr His Gly Tyr Ser Thr Glu Glu Asp His Val Ala Gly Pro Asn Thr

35 40 45 35 40 45

Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Val Gln Ala Glu Arg Phe Tyr Lys LysSer Gly Leu Glu Thr Arg Val Val Gln Ala Glu Arg Phe Tyr Lys Lys

50 55 60 50 55 60

Tyr Leu Phe Asp Trp Thr Thr Asp Lys Ala Phe Gly His Leu Glu LysTyr Leu Phe Asp Trp Thr Thr Asp Lys Ala Phe Gly His Leu Glu Lys

65 70 75 80 65 70 75 80

Leu Glu Leu Pro Ser Asp His His Gly Val Phe Gly His Leu Val AspLeu Glu Leu Pro Ser Asp His His Gly Val Phe Gly His Leu Val Asp

85 90 95 85 90 95

Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val Glu Val Ser Ala ValSer Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val Glu Val Ser Ala Val

100 105 110 100 105 110

Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val Ala Met Val Pro GluGly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val Ala Met Val Pro Glu

115 120 125 115 120 125

Trp Lys Glu Phe Asp Thr Arg Glu Lys Tyr Gln Leu Thr Leu Phe ProTrp Lys Glu Phe Asp Thr Arg Glu Lys Tyr Gln Leu Thr Leu Phe Pro

130 135 140 130 135 140

His Gln Phe Ile Ser Pro Arg Thr Asn Met Thr Ala His Ile Thr ValHis Gln Phe Ile Ser Pro Arg Thr Asn Met Thr Ala His Ile Thr Val

145 150 155 160 145 150 155 160

Pro Tyr Leu Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr Lys Lys His Lys ProPro Tyr Leu Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr Lys Lys His Lys Pro

165 170 175 165 170 175

Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ser Pro Leu Thr Val Asn Asn ThrTrp Thr Leu Val Val Met Val Val Ser Pro Leu Thr Val Asn Asn Thr

180 185 190 180 185 190

Ser Ala Ala Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile Ala Pro Thr Tyr ValSer Ala Ala Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile Ala Pro Thr Tyr Val

195 200 205 195 200 205

His Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Arg Gly Arg Lys Arg ArgHis Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Arg Gly Arg Lys Arg Arg

210 215 220 210 215 220

Ser Gly Ile Phe Pro Val Ala Cys Ala Asp Gly Tyr Gly Gly Leu ValSer Gly Ile Phe Pro Val Ala Cys Ala Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val

225 230 235 240 225 230 235 240

Thr Thr Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ala Tyr Gly Lys Val Tyr AsnThr Thr Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ala Tyr Gly Lys Val Tyr Asn

245 250 255 245 250 255

Pro Pro Arg Thr Asn Tyr Pro Gly Arg Phe Thr Asn Leu Leu Asp ValPro Pro Arg Thr Asn Tyr Pro Gly Arg Phe Thr Asn Leu Leu Asp Val

260 265 270 260 265 270

Ala Glu Ala Cys Pro Thr Phe Leu Cys Phe Asp Asp Gly Lys Pro TyrAla Glu Ala Cys Pro Thr Phe Leu Cys Phe Asp Asp Gly Lys Pro Tyr

275 280 285 275 280 285

Val Thr Thr Arg Thr Asp Asp Thr Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp LeuVal Thr Thr Arg Thr Asp Asp Thr Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp Leu

290 295 300 290 295 300

Ser Leu Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ser Gly Ile AlaSer Leu Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ser Gly Ile Ala

305 310 315 320 305 310 315 320

Gln Tyr Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met PheGln Tyr Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe

325 330 335 325 330 335

Thr Gly Ser Thr Asp Ser Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Ile ProThr Gly Ser Thr Asp Ser Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Ile Pro

340 345 350 340 345 350

Pro Gly Val Glu Thr Pro Pro Asp Thr Pro Glu Arg Ala Ala His CysPro Gly Val Glu Thr Pro Pro Asp Thr Pro Glu Arg Ala Ala His Cys

355 360 365 355 360 365

Ile His Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe SerIle His Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser

370 375 380 370 375 380

Ile Pro Tyr Val Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp ThrIle Pro Tyr Val Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Thr

385 390 395 400 385 390 395 400

Ala Glu Thr Ile Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Ile Tyr Gln Ile ThrAla Glu Thr Ile Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Ile Tyr Gln Ile Thr

405 410 415 405 410 415

His Gly Lys Ala Glu Asn Asp Thr Leu Val Val Ser Val Ser Ala GlyHis Gly Lys Ala Glu Asn Asp Thr Leu Val Val Ser Val Ser Ala Gly

420 425 430 420 425 430

Lys Asp Phe Glu Leu Arg Leu Pro Ile Asp Pro Arg Gln GlnLys Asp Phe Glu Leu Arg Leu Pro Ile Asp Pro Arg Gln Gln

435 440 445 435 440 445

<210> 4<210> 4

<211> 636<211> 636

<212> ДНК<212> DNA

<213> Искуственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> ДНК VP1 A-2 нового типа<223> DNA VP1 A-2 new type

<400> 4<400> 4

accaccgcca ccggggaatc agcagaccct gtcacaacca ccgttgagaa ctacggtggc 60acccgcca ccggggaatc agcagaccct gtcacaacca ccgttgagaa ctacggtggc 60

gagacacaag cacagcggcg tcaccacacc gacgtcggct tcttaatgga caggttcgtg 120gagacacaag cacagcggcg tcaccacacc gacgtcggct tcttaatgga caggttcgtg 120

cagatcaagc ctgtgagccc cacacatgtc attgacctca tgcagacaca ccaacacggg 180cagatcaagc ctgtgagccc cacacatgtc attgacctca tgcagacaca ccaacacggg 180

ctggtgggcg ccatgttgcg cgcggccacc tactactttt ctgatcttga gattgtggtg 240ctggtgggcg ccatgttgcg cgcggccacc tactactttt ctgatcttga gattgtggtg 240

aaccacacgg gtaacctaac gtgggtaccc aatggagcac ccgaggcagc actgaacaac 300aaccacacgg gtaacctaac gtgggtaccc aatggagcac ccgaggcagc actgaacaac 300

acgagcaacc ccactgctta ccacaaagcg ccgttcacga ggcttgcgct cccctacacc 360acgagcaacc ccactgctta ccacaaagcg ccgttcacga ggcttgcgct cccctacacc 360

gcgccacacc gcgtgctggc aactgtgtac agcgggacga gcaagtactc cacacctcaa 420gcgccacacc gcgtgctggc aactgtgtac agcgggacga gcaagtactc cacacctcaa 420

acacggcgag gtgacctggg tcctctcgcg gcgaggctcg ctgcacagct ccctgcctcc 480acacggcgag gtgacctggg tcctctcgcg gcgaggctcg ctgcacagct ccctgcctcc 480

ttcaacttcg gtgcaattcg ggccacggag atccaagaac tccttgtgcg catgaagcgc 540ttcaacttcg gtgcaattcg ggccacggag atccaagaac tccttgtgcg catgaagcgc 540

gccgagctct actgccccag gccactgttg gcggtggagg tgtcgtcgca agacagacac 600gccgagctct actgccccag gccactgttg gcggtggagg tgtcgtcgca agacagacac 600

aagcagaaaa tcattgcccc tgcaaaacaa ctcctg 636aagcagaaaa tcattgcccc tgcaaaacaa ctcctg 636

<210> 5<210> 5

<211> 636<211> 636

<212> ДНК<212> DNA

<213> Искуственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> Оптимизация с помощью кодона свиньи ДНК VP1 A-2 нового типа<223> Codon optimization of new type porcine DNA VP1 A-2

<400> 5<400> 5

acaacagcca caggagaatc cgccgaccca gtgacaacca ccgtggagaa ctacggagga 60acaacagcca caggagaatc cgccgaccca gtgacaacca ccgtggagaa ctacggagga 60

gagacacagg ctcagcgccg gcaccacacc gacgtgggct tcctgatgga caggttcgtg 120gagacacagg ctcagcgccg gcaccacacc gacgtgggct tcctgatgga caggttcgtg 120

cagatcaagc ccgtgagccc aacccacgtg atcgacctga tgcagaccca ccagcacggc 180180

ctggtgggag ctatgctgag ggctgccacc tactacttct ccgacctgga gatcgtggtg 240ctggtgggag ctatgctgag ggctgccacc tactacttct ccgacctgga gatcgtggtg 240

aaccacaccg gaaacctgac ctgggtgcca aacggagctc cagaggccgc cctgaacaac 300aaccacaccg gaaacctgac ctgggtgcca aacggagctc cagaggccgc cctgaacaac 300

accagcaacc ccaccgccta ccacaaggct ccattcacca ggctggccct gccatacacc 360accagcaacc ccaccgccta ccacaaggct ccattcacca ggctggccct gccatacacc 360

gctccacacc gggtgctggc taccgtgtac tccggcacca gcaagtactc caccccacag 420gctccacacc gggtgctggc taccgtgtac tccggcacca gcaagtactc caccccacag 420

accaggagag gcgacctggg accactggct gctaggctgg ctgctcagct gccagcctcc 480accaggagg gcgacctggg accactggct gctaggctgg ctgctcagct gccagcctcc 480

ttcaacttcg gagctatcag ggctaccgag atccaggagc tgctggtgag gatgaagaga 540ttcaacttcg gagctatcag ggctaccgag atccaggagc tgctggtgag gatgaagaga 540

gccgagctgt actgccccag gccactgctg gctgtggagg tgtccagcca ggacagacac 600gccgagctgt actgccccag gccactgctg gctgtggagg tgtccagcca ggacagacac 600

aagcagaaga tcatcgcccc agccaagcag ctgctg 636aagcagaaga tcatcgcccc agccaagcag ctgctg 636

<210> 6<210> 6

<211> 1338<211> 1338

<212> ДНК<212> DNA

<213> Искуственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> ДНК VP4-VP2-VP3 pGX9008 <223> DNA VP4-VP2-VP3 pGX9008

<400> 6<400> 6

gataagaaaa cagaggaaac caccctgctg gaggacagaa tcctgaccac aagaaacggg 60gataagaaaa cagaggaaac caccctgctg gaggacagaa tcctgaccac aagaaacggg 60

cacactacca gcacaactca gtcttcagtg ggcgtcacac acggatactc aactgaggaa 120cacactacca gcacaactca gtcttcagtg ggcgtcacac acggatactc aactgaggaa 120

gaccatgtgg ccgggccaaa taccagtggc ctggagacac gagtggtcca ggctgaaagg 180gaccagtgg ccgggccaaa taccagtggc ctggagacac gagtggtcca ggctgaaagg 180

ttctacaaga aatatctgtt tgactggacc acagataagg ccttcggcca cctggagaaa 240ttctacaaga aatatctgtt tgactggacc acagataagg ccttcggcca cctggagaaa 240

ctggaactcc cctcagacca ccacggcgtg ttcggccatc tggtcgatag ctacgcctat 300ctggaactcc ccctcagacca ccacggcgtg ttcggccatc tggtcgatag ctacgcctat 300

atgagaaacg gatgggacgt ggaggtctcc gctgtgggca accagttcaa tggcggatgc 360atgagaaacg gatgggacgt ggaggtctcc gctgtgggca accagttcaa tggcggatgc 360

ctgctcgtgg ctatggtgcc cgagtggaag gaatttgata ccagggaaaa ataccagctg 420ctgctcgtgg ctatggtgcc cgagtggaag gaatttgata ccagggaaaa ataccagctg 420

acactcttcc cacaccagtt tatctctcct agaactaaca tgaccgccca tattaccgtg 480acactcttcc cacaccagtt tatctctcct agaactaaca tgaccgccca tattaccgtg 480

ccttatctgg gcgtcaatcg gtacgaccag tataagaaac acaaaccttg gaccctggtg 540ccttatctgg gcgtcaatcg gtacgaccag tataagaaac acaaaccttg gaccctggtg 540

gtcatggtgg tcagtcccct cacagtgaac aatactagcg ccgctcagat caaggtctac 600gtcatggtgg tcagtcccct cacagtgaac aatactagcg ccgctcagat caaggtctac 600

gccaacattg ctccaaccta tgtgcacgtc gcaggagagc tgccttccaa ggaacgggga 660gccaacattg ctccaaccta tgtgcacgtc gcaggagagc tgccttccaa ggaacgggga 660

cgcaaacggc gctctgggat cttcccagtg gcatgtgctg acggatacgg agggctggtc 720cgcaaacggc gctctgggat cttcccagtg gcatgtgctg acggatacgg agggctggtc 720

actaccgacc ctaagaccgc agatcccgcc tacggaaaag tgtataaccc acccaggact 780actaccgacc ctaagaccgc agatcccgcc tacggaaaag tgtataaccc acccaggact 780

aattacccag ggcggttcac caacctgctc gatgtggcag aggcctgccc caccttcctg 840aattacccag ggcggttcac caacctgctc gatgtggcag aggcctgccc caccttcctg 840

tgctttgacg atggcaagcc atacgtgaca actcggacag acgatactcg cctgctcgcc 900tgctttgacg atggcaagcc atacgtgaca actcggacag acgatactcg cctgctcgcc 900

aagtttgacc tgagcctcgc agccaaacac atgtcaaaca cctacctgag tggaatcgcc 960aagtttgacc tgagcctcgc agccaaacac atgtcaaaca cctacctgag tggaatcgcc 960

cagtactata ctcagtattc cgggaccatt aatctgcatt tcatgtttac cggctctaca 1020cagtactata ctcagtattc cgggaccatt aatctgcatt tcatgtttac cggctctaca 1020

gactcaaagg ctcgctacat ggtggcatat atccctcccg gcgtcgagac cccacctgat 1080gactcaaagg ctcgctacat ggtggcatat atccctcccg gcgtcgagac cccacctgat 1080

acacctgaaa gggctgcaca ctgcatccat gccgagtggg acacaggact gaacagcaag 1140acacctgaaa gggctgcaca ctgcatccat gccgagtggg acacaggact gaacagcaag 1140

ttcacttttt ccattcccta cgtgtctgcc gctgactacg cttataccgc atccgatact 1200ttcacttttt ccattcccta cgtgtctgcc gctgactacg cttataccgc atccgatact 1200

gccgaaacca ttaacgtgca gggatgggtc tgtatctacc agattactca cgggaaagcc 1260gccgaaacca ttaacgtgca gggatgggtc tgtatctacc agattactca cgggaaagcc 1260

gagaatgaca ccctggtggt ctccgtgtct gctggcaagg acttcgaact gcgcctccct 1320gagaatgaca ccctggtggt ctccgtgtct gctggcaagg acttcgaact gcgcctccct 1320

atcgatcccc gacagcag 1338atcgatcccc gacagcag 1338

<210> 7<210> 7

<211> 2400<211> 2400

<212> ДНК<212> DNA

<213> Искуственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> VP нового типа для вакцины против FMDV серотипа 2<223> New type VP for FMDV serotype 2 vaccine

<400> 7<400> 7

gccaccatgg attggacatg gattctgttc ctggtggctg ctgctactag agtgcattca 60gccaccatgg attggacatg gattctgttc ctggtggctg ctgctactag agtgcattca 60

ggggccggac agtcttcacc cgcaaccgga tcacagaacc agagtggaaa taccgggagc 120ggggccggac agtcttcacc cgcaaccggga tcacagaacc agagtggaaa taccggggagc 120

atcattaaca attactatat gcagcagtac cagaacagca tggacacaca gctgggggat 180atcattaaca attactatat gcagcagtac cagaacagca tggacacaca gctgggggat 180

aacgccatca gcggcggcag caatgagggc tccacagata ccacatctac tcacactacc 240aacgccatca gcggcggcag caatgaggggc tccacagata ccacatctac tcacactacc 240

aatacccaga acaatgactg gttctctaaa ctggcaagct ccgccttcac cggcctcttt 300aatacccaga acaatgactg gttctctaaa ctggcaagct ccgccttcac cggcctcttt 300

ggagctctgc tcgcaagggg aagaaagagg agaagcgata agaaaacaga ggaaaccacc 360ggagctctgc tcgcaagggg aagaaagagg agaagcgata agaaaacaga ggaaaccacc 360

ctgctggagg acagaatcct gaccacaaga aacgggcaca ctaccagcac aactcagtct 420ctgctggagg acagaatcct gaccacaaga aacgggcaca ctaccagcac aactcagtct 420

tcagtgggcg tcacacacgg atactcaact gaggaagacc atgtggccgg gccaaatacc 480tcagtgggcg tcacacacgg atactcaact gaggaagacc atgtggccgg gccaaatacc 480

agtggcctgg agacacgagt ggtccaggct gaaaggttct acaagaaata tctgtttgac 540agtggcctgg agacacgagt ggtccaggct gaaaggttct acaagaaata tctgtttgac 540

tggaccacag ataaggcctt cggccacctg gagaaactgg aactcccctc agaccaccac 600tggaccacag ataaggcctt cggccacctg gagaaactgg aactcccctc agaccaccac 600

ggcgtgttcg gccatctggt cgatagctac gcctatatga gaaacggatg ggacgtggag 660ggcgtgttcg gccatctggt cgatagctac gcctatatga gaaacggatg ggacgtggag 660

gtctccgctg tgggcaacca gttcaatggc ggatgcctgc tcgtggctat ggtgcccgag 720gtctccgctg tgggcaacca gttcaatggc ggatgcctgc tcgtggctat ggtgcccgag 720

tggaaggaat ttgataccag ggaaaaatac cagctgacac tcttcccaca ccagtttatc 780tggaaggaat ttgataccag ggaaaaatac cagctgacac tcttcccaca ccagtttatc 780

tctcctagaa ctaacatgac cgcccatatt accgtgcctt atctgggcgt caatcggtac 840tctcctagaa ctaacatgac cgcccatatt accgtgcctt atctgggcgt caatcggtac 840

gaccagtata agaaacacaa accttggacc ctggtggtca tggtggtcag tcccctcaca 900gaccagtata agaaacacaa accttggacc ctggtggtca tggtggtcag tcccctcaca 900

gtgaacaata ctagcgccgc tcagatcaag gtctacgcca acattgctcc aacctatgtg 960gtgaacaata ctagcgccgc tcagatcaag gtctacgcca acattgctcc aacctatgtg 960

cacgtcgcag gagagctgcc ttccaaggaa cggggacgca aacggcgctc tgggatcttc 1020cacgtcgcag gagagctgcc ttccaaggaa cggggacgca aacggcgctc tgggatcttc 1020

ccagtggcat gtgctgacgg atacggaggg ctggtcacta ccgaccctaa gaccgcagat 1080ccagtggcat gtgctgacgg atacggaggg ctggtcacta ccgaccctaa gaccgcagat 1080

cccgcctacg gaaaagtgta taacccaccc aggactaatt acccagggcg gttcaccaac 1140cccgcctacg gaaaagtgta taacccaccc aggactaatt acccagggcg gttcaccaac 1140

ctgctcgatg tggcagaggc ctgccccacc ttcctgtgct ttgacgatgg caagccatac 1200ctgctcgatg tggcagaggc ctgccccacc ttcctgtgct ttgacgatgg caagccatac 1200

gtgacaactc ggacagacga tactcgcctg ctcgccaagt ttgacctgag cctcgcagcc 1260gtgacaactc ggacagacga tactcgcctg ctcgccaagt ttgacctgag cctcgcagcc 1260

aaacacatgt caaacaccta cctgagtgga atcgcccagt actatactca gtattccggg 13201320

accattaatc tgcatttcat gtttaccggc tctacagact caaaggctcg ctacatggtg 1380accattaatc tgcatttcat gtttaccggc tctacagact caaaaggctcg ctacatggtg 1380

gcatatatcc ctcccggcgt cgagacccca cctgatacac ctgaaagggc tgcacactgc 1440gcatatatcc ctcccggcgt cgagacccca cctgatacac ctgaaagggc tgcacactgc 1440

atccatgccg agtgggacac aggactgaac agcaagttca ctttttccat tccctacgtg 1500atccatgccg agtgggacac aggactgaac agcaagttca ctttttccat tccctacgtg 1500

tctgccgctg actacgctta taccgcatcc gatactgccg aaaccattaa cgtgcaggga 1560tctgccgctg actacgctta taccgcatcc gatactgccg aaaccattaa cgtgcaggga 1560

tgggtctgta tctaccagat tactcacggg aaagccgaga atgacaccct ggtggtctcc 1620tgggtctgta tctaccagat tactcacggg aaagccgaga atgacaccct ggtggtctcc 1620

gtgtctgctg gcaaggactt cgaactcaga ctccccattg acccaagaca gcagagaggc 1680gtgtctgctg gcaaggactt cgaactcaga ctccccattg acccaagaca gcagagaggc 1680

agaaaaagac gcagcacaac agccacagga gaatccgccg acccagtgac aaccaccgtg 1740agaaaaagac gcagcacaac agccacagga gaatccgccg acccagtgac aaccaccgtg 1740

gagaactacg gaggagagac acaggctcag cgccggcacc acaccgacgt gggcttcctg 1800gagaactacg gaggagagac acaggctcag cgccggcacc acaccgacgt gggcttcctg 1800

atggacaggt tcgtgcagat caagcccgtg agcccaaccc acgtgatcga cctgatgcag 18601860

acccaccagc acggcctggt gggagctatg ctgagggctg ccacctacta cttctccgac 1920acccaccagc acggcctggt gggagctatg ctgagggctg ccacctacta cttctccgac 1920

ctggagatcg tggtgaacca caccggaaac ctgacctggg tgccaaacgg agctccagag 1980ctggagatcg tggtgaacca caccggaaac ctgacctggg tgccaaacgg agctccagag 1980

gccgccctga acaacaccag caaccccacc gcctaccaca aggctccatt caccaggctg 2040gccgccctga acaacaccag caaccccacc gcctaccaca aggctccatt caccaggctg 2040

gccctgccat acaccgctcc acaccgggtg ctggctaccg tgtactccgg caccagcaag 2100gccctgccat acaccgctcc acaccggggtg ctggctaccg tgtactccgg caccagcaag 2100

tactccaccc cacagaccag gagaggcgac ctgggaccac tggctgctag gctggctgct 2160tactccaccc cacagaccag gagaggcgac ctgggaccac tggctgctag gctggctgct 2160

cagctgccag cctccttcaa cttcggagct atcagggcta ccgagatcca ggagctgctg 2220cagctgccag cctccttcaa cttcggagct atcagggcta ccgagatcca ggagctgctg 2220

gtgaggatga agagagccga gctgtactgc cccaggccac tgctggctgt ggaggtgtcc 2280gtgaggatga agagagccga gctgtactgc cccaggccac tgctggctgt ggaggtgtcc 2280

agccaggaca gacacaagca gaagatcatc gccccagcca agcagctgct gcgcggccgg 2340agccaggaca gacacaagca gaagatcatc gccccagcca agcagctgct gcgcggccgg 2340

aaacgacgct ctaattttga cctcctgaaa ctggctggcg atgtggaatc taaccctggc 2400aaacgacgct ctaattttga cctcctgaaa ctggctggcg atgtggaatc taaccctggc 2400

2400 2400

<210> 8<210> 8

<211> 636<211> 636

<212> ДНК<212> DNA

<213> Искуственная последовательность<213> Artificial sequence

<220><220>

<223> ДНК A-1 нового типа<223> DNA A-1 new type

<400> 8<400> 8

accaccgcca ccggggaatc agcagaccct gtcacaacca ccgttgagaa ctacggtggc 60acccgcca ccggggaatc agcagaccct gtcacaacca ccgttgagaa ctacggtggc 60

gagacacaag cacagcggcg tcaccacacc gacgtcagct tcataatgga caggttcgtg 120gagacacaag cacagcggcg tcaccacacc gacgtcagct tcataatgga caggttcgtg 120

cggatcaagc ctgtgagccc cacacatgtc attgacctca tgcagacaca ccaacacggg 180cggatcaagc ctgtgagccc cacacatgtc attgacctca tgcagacaca ccaacacggg 180

ctggtgggcg ccatgttgcg cgcggccacc tactactttt ctgatcttga gattgtggtg 240ctggtgggcg ccatgttgcg cgcggccacc tactactttt ctgatcttga gattgtggtg 240

aaccacacgg gtaacctaac gtgggtaccc aatggagcac ccgaggcagc actggataac 300aaccacacgg gtaacctaac gtgggtaccc aatggagcac ccgaggcagc actggataac 300

acgagcaacc ccactgctta ccacaaagcg ccgttcacga ggcttgcgct cccctacacc 360acgagcaacc ccactgctta ccacaaagcg ccgttcacga ggcttgcgct cccctacacc 360

gcgccacacc gcgtgctggc aactgtgtac aatgggacga gcaagtactc cacacctgga 420gcgccacacc gcgtgctggc aactgtgtac aatgggacga gcaagtactc cacacctgga 420

gcccggcgag gtgacctggg ttctctcgcg gcgagactcg ctgcacagct ccctgcctcc 480gcccggcgag gtgacctggg ttctctcgcg gcgagactcg ctgcacagct ccctgcctcc 480

ttcaacttcg gtgcaattcg ggccacggag atccaggaac tccttgtgcg catgaagcgc 540ttcaacttcg gtgcaattcg ggccacggag atccaggaac tccttgtgcg catgaagcgc 540

gccgagctct actgccccag gccactgttg gcggtggagg tgctgtcgca agacagacac 600gccgagctct actgccccag gccactgttg gcggtggagg tgctgtcgca agacagacac 600

aagcagaaaa tcattgcccc tgcaaaacaa ctcctg 636aagcagaaaa tcattgcccc tgcaaaacaa ctcctg 636

<---<---

Claims (15)

1. Полипептид, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 2,1. A polypeptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2, причем полипептид способен обеспечивать виды иммунного ответа на вирус ящура (FMDV).moreover, the polypeptide is capable of providing types of immune response to foot-and-mouth disease virus (FMDV). 2. Полипептид, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO:2 и аминокислотную последовательность белков VP2-VP4 FMDV, причем полипептид способен обеспечивать виды иммунного ответа на вирус ящура (FMDV).2. A polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2 and the amino acid sequence of VP2-VP4 FMDV proteins, wherein the polypeptide is capable of providing immune responses to foot-and-mouth disease virus (FMDV). 3. Полипептид по п. 2, где белки VP2-VP4 FMDV получены из FMDV серотипа А.3. The polypeptide of claim 2, wherein the VP2-VP4 FMDV proteins are derived from FMDV serotype A. 4. Полинуклеотид, кодирующий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 2,4. Polynucleotide encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2, причем полинуклеотид способен обеспечивать виды иммунного ответа на FMDV.moreover, the polynucleotide is capable of providing types of immune response to FMDV. 5. Плазмида экспрессии, содержащая полинуклеотид по п. 4.5. An expression plasmid containing a polynucleotide according to claim 4. 6. Плазмида экспрессии по п. 5, дополнительно содержащая нуклеотидную последовательность, кодирующую белки VP2-VP4 FMDV.6. An expression plasmid according to claim 5, additionally containing a nucleotide sequence encoding FMDV VP2-VP4 proteins. 7. Плазмида экспрессии по п. 6, где белки VP2-VP4 FMDV получены из FMDV серотипа А.7. An expression plasmid according to claim 6, wherein the VP2-VP4 FMDV proteins are derived from FMDV serotype A. 8. Плазмида экспрессии по п. 5, содержащая нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 7.8. An expression plasmid according to claim 5 containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7. 9. Вакцинная композиция против ящура (FMD), содержащая эффективное количество плазмиды экспрессии по п. 5.9. Vaccine composition against foot-and-mouth disease (FMD) containing an effective amount of the expression plasmid according to claim 5. 10. Вакцинная композиция по п. 9, где вакцина обеспечивает защитный иммунитет против FMDV серотипа А.10. The vaccine composition of claim 9, wherein the vaccine provides protective immunity against FMDV serotype A. 11. Вакцинная композиция по п. 10, где FMDV серотипа А относится к азиатскому топотипу.11. The vaccine composition according to claim 10, wherein the FMDV serotype A refers to the Asian topotype. 12. Вакцинная композиция по п. 9, где вакцина представляет собой моновалентную вакцину или поливалентную вакцину.12. The vaccine composition according to claim 9, wherein the vaccine is a monovalent vaccine or a polyvalent vaccine. 13. Способ обеспечения видов иммунного ответа на FMDV серотипа А у субъекта, включающий введение субъекту вакцинной композиции по п. 9.13. A method of providing types of immune response to FMDV serotype A in a subject, comprising administering to the subject a vaccine composition according to claim 9.
RU2020123927A 2017-12-29 2018-12-28 Vaccine composition against type a foot-and-mouth disease virus RU2778095C2 (en)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR10-2017-0184875 2017-12-29
KR20170184875 2017-12-29
KR10-2018-0149242 2018-11-28
KR1020180149242A KR102165358B1 (en) 2017-12-29 2018-11-28 Vaccine composition for foot and mouth disease virus a serotype
PCT/KR2018/016826 WO2019132569A1 (en) 2017-12-29 2018-12-28 Vaccine composition for foot-and-mouth disease virus type a

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2020123927A3 RU2020123927A3 (en) 2022-01-31
RU2020123927A RU2020123927A (en) 2022-01-31
RU2778095C2 true RU2778095C2 (en) 2022-08-15

Family

ID=

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2273645C2 (en) * 1994-08-17 2006-04-10 Дзе Рокефеллер Юниверсити Obesity polypeptide (ob) (variants), its analogue (variants), and fused protein (variants), nucleic acid isolated molecule, dna molecule, cloning recombinant vector, expression recombinant vector, pharmaceutical composition, monoclonal and polyclonal antibody
RU2502800C2 (en) * 2008-01-15 2013-12-27 Эббви Инк. Improved expression vectors of mammals and their use
KR101578444B1 (en) * 2013-07-01 2015-12-21 대한민국 Recombinant foot-and-mouth disease virus using Korean isolated strain of FMDV A serotype and the manufacturing method

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2273645C2 (en) * 1994-08-17 2006-04-10 Дзе Рокефеллер Юниверсити Obesity polypeptide (ob) (variants), its analogue (variants), and fused protein (variants), nucleic acid isolated molecule, dna molecule, cloning recombinant vector, expression recombinant vector, pharmaceutical composition, monoclonal and polyclonal antibody
RU2502800C2 (en) * 2008-01-15 2013-12-27 Эббви Инк. Improved expression vectors of mammals and their use
KR101578444B1 (en) * 2013-07-01 2015-12-21 대한민국 Recombinant foot-and-mouth disease virus using Korean isolated strain of FMDV A serotype and the manufacturing method

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
WANG M, Protection against Foot-and-Mouth disease virus in Guinea Pigs via Oral Fdministration of Recombinant Lactobacillus plantarum Expressing VPl, PLoS One, 02.12.2015, p. 1-18. *
ФИЛИППОВИЧ Ю.Б. и др. Биохимические основы жизнедеятельности человека. Учебное пособие для вузов. - М.: Владос, 2005. - 407 с. : ил.; см. стр. 49-50, 70. WITKOWSKI A. et al. Conversion of a β-Ketoacyl Synthase to a Malonyl Decarboxylase by Replacement of the Active-Site Cysteine with Glutamine. Biochemistry, 1999, 38, 11643-11650. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN104862286B (en) Porcine pseudorabies virus gene-deleted strain, vaccine composition and its preparation method and application
TWI620574B (en) Synthetic peptide-based emergency vaccine against foot and mouth disease (fmd)
CN106554944B (en) Porcine epidemic diarrhea virus low-virulent strain, vaccine composition prepared from porcine epidemic diarrhea virus low-virulent strain and application of vaccine composition
CN106148287B (en) Porcine epidemic diarrhea virus strain and vaccine composition, preparation method and application thereof
JP2022538673A (en) African swine fever vaccine
KR102165358B1 (en) Vaccine composition for foot and mouth disease virus a serotype
Tan et al. Infectious bronchitis virus poly-epitope-based vaccine protects chickens from acute infection
CN110387355A (en) Express recombinant porcine pseudorabies Strain, the vaccine and its preparation method and application of pig circular ring virus Cap protein gene
AU2016202693B2 (en) Attenuated swine influenza vaccines and methods of making the use thereof
US9913896B2 (en) Attenuated parvovirus vaccine for muscovy duck parvovirus and goose parvovirus (derzsy&#39;s disease)
RU2778095C2 (en) Vaccine composition against type a foot-and-mouth disease virus
US10190099B2 (en) IBV strains and uses thereof
CN100381565C (en) Infectious bursal disease virus (IBDV) mutant expressing virus neutralising epitopes specific for classic-and variant ibdv strains
AU2017367644A1 (en) Attenuated swine influenza vaccines and methods of making and use thereof
JP7350864B2 (en) H52 IBV vaccine with heterologous spike protein
KR102672787B1 (en) Vaccine composition for foot and mouth disease virus
KR20210002050A (en) Vaccine composition for foot and mouth disease virus
CN114146172B (en) Nano antibody vaccine capable of preventing porcine pseudorabies virus infection, preparation method and application
WO2019132569A1 (en) Vaccine composition for foot-and-mouth disease virus type a
KR20070005867A (en) Low pathogenic avian influenza h9n2 virus strain for vaccine preparation, the vaccine, and the preparation method thereof
Salavati et al. A review of the Infectious Bursal Disease (IBD) in Iran
KR20240028924A (en) Porcine Epidemic Diarrhea Virus Inducing Highly Neutralizing Antibodies, and Inactivated Vaccine Composition
박대천 Development and validation of subunit vaccine to prevent porcine epidemic diarrhea via oral vaccination
JP2006524192A (en) Vaccine augmentation factor (VAF) that can improve the efficacy of poultry vaccines