RU2703545C1 - Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости - Google Patents
Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости Download PDFInfo
- Publication number
- RU2703545C1 RU2703545C1 RU2019117208A RU2019117208A RU2703545C1 RU 2703545 C1 RU2703545 C1 RU 2703545C1 RU 2019117208 A RU2019117208 A RU 2019117208A RU 2019117208 A RU2019117208 A RU 2019117208A RU 2703545 C1 RU2703545 C1 RU 2703545C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- hla
- drb1
- dqb1
- sec
- sequence
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6858—Allele-specific amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Изобретение относится к области биохимии и молекулярной биологии. Предложен набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов главного комплекса гистосовместимости HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 в ходе ПЦР с дальнейшей визуализацией продуктов реакции методом электрофореза в агарозном геле. Изобретение обеспечивает создание новой системы типирования HLA. 4 ил., 7 табл., 2 пр.
Description
Изобретение относится к области биохимии и молекулярной биологии, в частности к набору синтетических олигонуклеотидов. Набор предназначен для определения последовательности генов главного комплекса гистосовместимости – HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) и состоит из следующих праймеров:
HLA-A-F: AGAGAAGCCAATCAGTGTCGTCGCGGTC
HLA-A-R: CTCAGCCCCACCTCTCTGGAACAGG
HLA-B-F: CACCTCCATTCCCAGGGCGAGCTCACT
HLA-B-R: TTCTTTTACTTCAGTGGTGTTCCCCAGATG
HLA-C-F: CTAGAGAAGCCAATCAGCGTCT
HLA-C-R: ACGCAGACACATTCAGGTGCCTTTGC
HLA-DQB1-F1: TTCACCTCAGATGTTCATCCAGTA
HLA-DQB1-F2: TTCACCTCAGATGTTCATCCAGTG
HLA-DQB1-F3: TTCACCTCAAATGTTCATCCAGTG
HLA-DQB1-R: AGTCTTGATCCTCATAGCAGCAAATA
HLA-DRB1-F1: CGCTTTCACTGCTCTTTAAGCT
HLA-DRB1-F2: CACTTTCACTGCTCTTTAAGCT
HLA-DRB1-F3: CACTTTCGCTGCTCTTTAAGCT
HLA-DRB1-R1: CGTCTCTGCAGGCCACAAGCTAT
HLA-DRB1-R2: CGTCTCTGTAGGCCACAAGCTAT.
Цель изобретения – разработка набора синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 главного комплекса гистосовместимости.
Трансплантация гемопоэтических стволовых клеток – метод клеточной терапии, применяющийся для лечения гематологических, онкологических, генетических и ряда других заболеваний путем пересадки гемопоэтических стволовых клеток (ГСК), способных полностью восстановить систему гемопоэза и иммунитета в организме после высокодозной химиотерапии [1, 2, 3].
Риски отторжения трансплантата и возникновения реакции «трансплантат против хозяина» зависят от качества подбора донора ГСК, совместимого по HLA-системе, характеризующейся высокой вариабельностью [4].
По состоянию на 07 февраля 2019 г., число потенциальных доноров ГСК, зарегистрированных в объединенной базе данных о российских донорах BMDS (Bone Marrow Donor Search), составляет 94 204 человека, в неё включены 15 регистров из 11 регионов Российской Федерации [5]. Такое количество безвозмездных доноров на сегодняшний день обеспечило 282 трансплантации ГСК для пациентов российских клиник [6].
В последние пять лет наметился явный прогресс во взаимодействии трансплантационных клиник с BMDS, однако многие российские пациенты по-прежнему зависят от донорского материала, получаемого из-за рубежа, либо вообще остаются без совместимого неродственного донора [6].
Сложившаяся ситуация требует увеличения числа потенциальных доноров ГСК в короткие сроки, а трансплантационные центры диктуют необходимость HLA-типирования доноров молекулярно-генетическими методами как минимум по пяти HLA-локусам. Прогресс в расширении донорской базы ограничивается прежде всего высокой стоимостью реагентов, используемых для проведения массового HLA-типирования доноров и низкой производительностью анализа.
В настоящее время наибольшее распространение в практике получили четыре технологии HLA-типирования: SSP (Sequence Specific Primers), SSO (Sequence Specific Oligonucleotides), SBT (Sequence Based Typing) и NGS (Next Generation Sequence). Метод SSP характеризуется низкой производительностью, SSO – невозможностью определения отдельных точечных вариаций, что особенно актуально в условиях малоизученных популяций, к которым следует отнести и большинство популяций, проживающих на территории РФ [7]. Технология SBT признана «золотым стандартом» HLA-типирования, с точки зрения идентификации новых аллелей, а при использовании современных многокапиллярных секвенаторов обладает и высокой производительностью. Однако даже существенное масштабирование исследований, выполняемых методом SBT, практически не снижает стоимости типирования. При необходимости изучения дополнительных экзонов/интронов затраты на SBT-типирование возрастают. Наиболее перспективным, с точки зрения увеличения производительности и существенного снижения стоимости HLA-типирования, представляется применение технологии массового параллельного секвенирования (MPS - massive parallel sequencing).
Стандартный протокол проведения таргетного MPS исследования включает в себя следующие этапы: таргетное обогащение генов, приготовление библиотек, секвенирование, анализ данных.
Отдаленным аналогом предлагаемого изобретения является набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающего ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1) [8].
Техническим результатом заявляемого изобретения является изучение последовательностей генов HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 главного комплекса гистосовместимости с целью создания системы типирования HLA. Использование предлагаемого набора синтетических олигонуклеотидов позволит проводить таргетную амплификацию при HLA-типировании потенциальных доноров ГСК в высоком разрешении, с возможностью выявления ранее незарегистрированных аллелей.
Для достижения указанного результата проводят ПЦР длинных фрагментов образца ДНК. В отличие от отдалённого аналога, позволяющего получать только последовательность первого интрона генов HLA-A и HLA-DRB1, предлагаемый набор праймеров позволяет определять последовательности всего гена локусов HLA-A, HLA-B, HLA-C (за исключением участка 3’-UTR), участка гена с первого по пятый экзон локуса HLA-DQB1, участка гена со второго по четвертый экзон локуса HLA-DRB1, что сводит число возможных неоднозначностей типирования к минимуму.
В процессе проведения патентно-информационного поиска не выявлено источников, порочащих новизну предполагаемого изобретения.
Заявляемое изобретение разработано в ООО «ПАРСЕК ЛАБ».
Осуществление изобретения:
Материалом для исследования является геномная ДНК человека. Исследуемый препарат ДНК не должен содержать посторонних примесей, соотношение А260/A280 должно составлять 1,7-1,9. Для анализа одного образца требуется 300 нг ДНК (30 мкл ДНК с концентрацией 10нг/мкл для анализа 5 локусов), концентрация геномной ДНК должна быть оценена флуоресцентным методом.
Использование изобретения возможно в двух форматах моноплексный и мультиплексный:
1. Формат – моноплексный.
Для получения последовательностей генов HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 главного комплекса гистосовместимости используется постановка ПЦР длинных фрагментов с помощью набора специфичных праймеров. Дополнительно в реакционную смесь добавляют следующие компоненты: смесь дезоксирибонуклеотидтрифосфатов четырех типов в конечной концентрации каждого 200 мкМ, Taq-полимеразу (AccuPrime или Encyclo), реакционный буфер (600 мМ Tris-SO4, рН=8,9; 180 мМ (NH4)2SO4, 20 мМ Mg2+, 10% глицерол).
В подготовленную реакционную смесь добавляют образец ДНК и проводят ПЦР длинных фрагментов по следующим профилям:
- для локуса HLA-A
Температура | Время | Количество циклов |
94оС | 2 мин | 1 |
98оС | 10 сек | 35 |
67оС | 15 сек | |
68оС | 3 мин | |
68оС | 10 мин | 1 |
4оС | не ограничено |
- для локуса HLA-B
Температура | Время | Количество циклов |
94оС | 2 мин | 1 |
98оС | 10 сек | 35 |
60оС | 15 сек | |
68оС | 5 мин | |
68оС | 10 мин | 1 |
4оС | не ограничено |
- для локуса HLA-C
Температура | Время | Количество циклов |
94оС | 2 мин | 1 |
98оС | 10 сек | 35 |
65оС | 15 сек | |
68оС | 5 мин | |
68оС | 10 мин | 1 |
4оС | не ограничено |
- для локуса HLA-DQB1
Температура | Время | Количество циклов |
94оС | 2 мин | 1 |
98оС | 10 сек | 35 |
60оС | 15 сек | |
68оС | 6 мин | |
68оС | 10 мин | 1 |
4оС | не ограничено |
- для локуса HLA-DRB1
Температура | Время | Количество циклов |
94оС | 2 мин | 1 |
98оС | 10 сек | 30 |
62оС | 30 сек | |
68оС | 7 мин | |
68оС | 10 мин | 1 |
4оС | не ограничено |
2. Формат – мультиплексный.
Для получения последовательностей генов HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 главного комплекса гистосовместимости используется постановка ПЦР длинных фрагментов с помощью набора специфичных праймеров. Дополнительно в реакционную смесь добавляют следующие компоненты: смесь дезоксирибонуклеотидтрифосфатов четырех типов в конечной концентрации каждого 200 мкМ, Taq-полимеразу (AccuPrime или Encyclo), реакционный буфер (600 мМ Tris-SO4, рН=8,9; 180 мМ (NH4)2SO4, 20 мМ Mg2+, 10% глицерол).
В подготовленную реакционную смесь добавляют образец ДНК и проводят ПЦР длинных фрагментов по следующему профилю:
Температура | Время | Количество циклов |
94оС | 2 мин | 1 |
98оС | 10 сек | 2 |
70оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 2 |
69оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 2 |
68оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 2 |
67оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 2 |
66оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 3 |
65оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 3 |
64оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 3 |
63оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 3 |
62оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 3 |
61оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 3 |
60оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 3 |
59оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 2 |
58оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
98оС | 10 сек | 2 |
57оС | 15 сек | |
68оС | 5,5 мин | |
68оС | 10 мин | 1 |
4оС | не ограничено |
Оценку наличия продукта реакции ПЦР длинных фрагментов осуществляют электрофорезом в агарозном геле. Размер ампликона должен соответствовать указанному в таблице:
HLA-локус | Размер продукта ПЦР, п.н |
HLA-A | 3 200 |
HLA-B | 4 609 |
HLA-C | 3 000 |
HLA-DQB1 | 6 100 |
HLA-DRB1 | 4 300 |
Примеры визуализации продуктов реакции ПЦР длинных фрагментов с использованием набора синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов главного комплекса гистосовместимости – HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1.
Моноплексный формат:
Мультиплексный формат:
Список литературы:
1. Passweg J.R., Baldomero H., Bader P.et al.; European Society for Blood and Marrow Transplantation (EBMT). Hematopoietic SCT in Europe 2013: recent trends in the use of alternative donors showing more haploidentical donors but fewer cord blood transplants. Bone Marrow Transplant. – 2015. – 50 (4). P. 476–82.
2. Syed A. Abutalib, Parameswaran Hari. Clinical Manual of Blood and Bone Marrow Transplantation. – Chichester: Wiley-Blackwell, 2017. – 424 с.
3. Кокорев О.В., Чердынцева Н.В., Зайцев К.В., Волгушев С.В. Теоретические и практические аспекты трансплантации стволовых клеток в онкологии // Сибирский онкологический журнал. – 2005. – № 4 (16). – С. 53–61.
4. Афанасьев Б.В., Зубаровская Л.С., Алянский А.Л. и др. Выбор донора при аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток // Российский журнал детской гематологии и онкологии. – 2016. – Т.3. – С. 30-36.
5. Счетчик регистра (2018). Доступен: http://www.rdkm.rusfond.ru/registr_stat/001 (обновление 10.08.2018).
6. Макаренко О.А., Алянский А.Л., Иванова Н.Е. и др. Эффективность поиска неродственного донора гемопоэтических стволовых клеток с помощью российской поисковой системы Bone Marrow Donor Search: опыт НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой // Клиническая онкогематология. – 2017. -№ 10. – С. 39-44.
7. Логинова М.А., Парамонов И.В. Новые HLA-аллели в российских популяциях // Трансфузиология. – 2016. - №3. Т.17. – С.13-20.
8. Патент Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1). RU 2649064.
Claims (17)
- Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов главного комплекса гистосовместимости - HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 в ходе ПЦР длинных фрагментов (моноплексный и мультиплексный форматы):
- HLA-A-F: AGAGAAGCCAATCAGTGTCGTCGCGGTC
- HLA-A-R: CTCAGCCCCACCTCTCTGGAACAGG
- HLA-B-F: CACCTCCATTCCCAGGGCGAGCTCACT
- HLA-B-R: TTCTTTTACTTCAGTGGTGTTCCCCAGATG
- HLA-C-F: CTAGAGAAGCCAATCAGCGTCT
- HLA-C-R: ACGCAGACACATTCAGGTGCCTTTGC
- HLA-DQB1-F1: TTCACCTCAGATGTTCATCCAGTA
- HLA-DQB1-F2: TTCACCTCAGATGTTCATCCAGTG
- HLA-DQB1-F3: TTCACCTCAAATGTTCATCCAGTG
- HLA-DQB1-R: AGTCTTGATCCTCATAGCAGCAAATA
- HLA-DRB1-F1: CGCTTTCACTGCTCTTTAAGCT
- HLA-DRB1-F2: CACTTTCACTGCTCTTTAAGCT
- HLA-DRB1-F3: CACTTTCGCTGCTCTTTAAGCT
- HLA-DRB1-R1: CGTCTCTGCAGGCCACAAGCTAT
- HLA-DRB1-R2: CGTCTCTGTAGGCCACAAGCTAT
- с дальнейшей визуализацией продуктов реакции определенного размера методом электрофореза в агарозном геле, отличающийся возможностью определения последовательности всего гена локусов HLA-A, HLA-B, HLA-C (за исключением участка 3’-UTR), участка гена с первого по пятый экзон локуса HLA-DQB1, участка гена со второго по четвертый экзон локуса HLA-DRB1 в моноплексном и мультиплексном форматах.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2019117208A RU2703545C1 (ru) | 2019-06-03 | 2019-06-03 | Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2019117208A RU2703545C1 (ru) | 2019-06-03 | 2019-06-03 | Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2703545C1 true RU2703545C1 (ru) | 2019-10-21 |
Family
ID=68318153
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2019117208A RU2703545C1 (ru) | 2019-06-03 | 2019-06-03 | Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2703545C1 (ru) |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3006571A1 (en) * | 2013-05-09 | 2016-04-13 | Genodive Pharma Inc. | Hla gene multiplex dna typing method and kit |
EP2735617B1 (en) * | 2011-07-21 | 2018-02-21 | Genodive Pharma Inc. | Method and kit for dna typing of hla gene |
RU2649064C1 (ru) * | 2016-12-08 | 2018-04-02 | Общество с ограниченной ответственностью "Научно-производственная фирма ДНК-Технология" (ООО "НПФ ДНК-Технология") | Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1) |
-
2019
- 2019-06-03 RU RU2019117208A patent/RU2703545C1/ru active
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2735617B1 (en) * | 2011-07-21 | 2018-02-21 | Genodive Pharma Inc. | Method and kit for dna typing of hla gene |
EP3006571A1 (en) * | 2013-05-09 | 2016-04-13 | Genodive Pharma Inc. | Hla gene multiplex dna typing method and kit |
RU2649064C1 (ru) * | 2016-12-08 | 2018-04-02 | Общество с ограниченной ответственностью "Научно-производственная фирма ДНК-Технология" (ООО "НПФ ДНК-Технология") | Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1) |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
MADELEINE M.M. et al. Comprehensive analysis of HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, and HLA-DQB1 loci and squamous cell cervical cancer risk. Cancer Res. 2008 May 1; 68(9): 3532-9. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Huang et al. | Single cell transcriptomic analysis of human mesenchymal stem cells reveals limited heterogeneity | |
CN103890190B (zh) | Hla基因的dna分型方法和试剂盒 | |
CN105339508B (zh) | Hla基因的多重dna分型方法和试剂盒 | |
EP3075863B1 (en) | Simple method and kit for dna profiling of hla genes by high-throughput massively parallel sequencer | |
Danzer et al. | Rapid, scalable and highly automated HLA genotyping using next-generation sequencing: a transition from research to diagnostics | |
Hickman et al. | Analysis of the microglial sensome | |
US20050250125A1 (en) | Method for conducting pharmacogenomics-based studies | |
Kitcharoen et al. | MICA, MICB, and MHC beta block matching in bone marrow transplantation: relevance to transplantation outcome | |
He et al. | Common and well-documented (CWD) alleles of human leukocyte antigen-A,-B,-C,-DRB1, and-DQB1 loci for the Chinese Han population do not quite correlate with the ASHI CWD alleles | |
de Brito Vargas et al. | Remarkably low KIR and HLA diversity in Amerindians reveals signatures of strong purifying selection shaping the centromeric KIR region | |
JP2023116700A (ja) | 主要組織適合遺伝子複合体一塩基多型 | |
Renaud et al. | Gene expression profiling in chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy | |
Assane et al. | Human leukocyte antigen–A,–B, and–DRB1 allele and haplotype frequencies in the Mozambican population: A blood donor–based population study | |
Costantino et al. | Human leukocyte antigen allele linkage disequilibrium and haplotype structure in volunteer bone marrow donors of Paraná State | |
RU2703545C1 (ru) | Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости | |
Lahermo et al. | MtDNA polymorphism in the Hungarians: comparison to three other Finno‐Ugric‐speaking populations | |
US10540324B2 (en) | Human haplotyping system and method | |
Bakhit et al. | Intrafamilial and interfamilial heterogeneity of PINK1-associated Parkinson's disease in Sudan | |
CN112609006B (zh) | 人类白细胞抗原一步测序分型方法及其应用 | |
Mellet et al. | HLA typing: Conventional techniques v. next-generation sequencing | |
RU2649064C1 (ru) | Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1) | |
CN112746100A (zh) | 用于kir基因分型的引物、试剂盒及方法 | |
Sellami et al. | Evidence that erythrocyte DARC-positive phenotype can affect the GVHD occurrence after HLA-identical sibling HSCT | |
RU2800084C2 (ru) | Способ получения молекулярных STR-маркеров Х-хромосомы для идентификации неизвестного индивида и определения биологического родства для работы с образцами малых количеств ДНК и набор олигонуклеотидов для его осуществления | |
Pinto et al. | HLA-Cw* 0409N is associated with HLA-A* 2301 and HLA-B* 4403-carrying haplotypes |