RU2703545C1 - Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости - Google Patents

Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости Download PDF

Info

Publication number
RU2703545C1
RU2703545C1 RU2019117208A RU2019117208A RU2703545C1 RU 2703545 C1 RU2703545 C1 RU 2703545C1 RU 2019117208 A RU2019117208 A RU 2019117208A RU 2019117208 A RU2019117208 A RU 2019117208A RU 2703545 C1 RU2703545 C1 RU 2703545C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
hla
drb1
dqb1
sec
sequence
Prior art date
Application number
RU2019117208A
Other languages
English (en)
Inventor
Александр Евгеньевич Павлов
Мария Александровна Глушкова
Тамара Сергеевна Симакова
Сергей Сергеевич Мозгов
Мария Александровна Логинова
Original Assignee
Общество с ограниченной ответственностью "ПАРСЕК ЛАБ"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Общество с ограниченной ответственностью "ПАРСЕК ЛАБ" filed Critical Общество с ограниченной ответственностью "ПАРСЕК ЛАБ"
Priority to RU2019117208A priority Critical patent/RU2703545C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2703545C1 publication Critical patent/RU2703545C1/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6858—Allele-specific amplification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области биохимии и молекулярной биологии. Предложен набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов главного комплекса гистосовместимости HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 в ходе ПЦР с дальнейшей визуализацией продуктов реакции методом электрофореза в агарозном геле. Изобретение обеспечивает создание новой системы типирования HLA. 4 ил., 7 табл., 2 пр.

Description

Изобретение относится к области биохимии и молекулярной биологии, в частности к набору синтетических олигонуклеотидов. Набор предназначен для определения последовательности генов главного комплекса гистосовместимости – HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) и состоит из следующих праймеров:
HLA-A-F: AGAGAAGCCAATCAGTGTCGTCGCGGTC
HLA-A-R: CTCAGCCCCACCTCTCTGGAACAGG
HLA-B-F: CACCTCCATTCCCAGGGCGAGCTCACT
HLA-B-R: TTCTTTTACTTCAGTGGTGTTCCCCAGATG
HLA-C-F: CTAGAGAAGCCAATCAGCGTCT
HLA-C-R: ACGCAGACACATTCAGGTGCCTTTGC
HLA-DQB1-F1: TTCACCTCAGATGTTCATCCAGTA
HLA-DQB1-F2: TTCACCTCAGATGTTCATCCAGTG
HLA-DQB1-F3: TTCACCTCAAATGTTCATCCAGTG
HLA-DQB1-R: AGTCTTGATCCTCATAGCAGCAAATA
HLA-DRB1-F1: CGCTTTCACTGCTCTTTAAGCT
HLA-DRB1-F2: CACTTTCACTGCTCTTTAAGCT
HLA-DRB1-F3: CACTTTCGCTGCTCTTTAAGCT
HLA-DRB1-R1: CGTCTCTGCAGGCCACAAGCTAT
HLA-DRB1-R2: CGTCTCTGTAGGCCACAAGCTAT.
Цель изобретения – разработка набора синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 главного комплекса гистосовместимости.
Трансплантация гемопоэтических стволовых клеток – метод клеточной терапии, применяющийся для лечения гематологических, онкологических, генетических и ряда других заболеваний путем пересадки гемопоэтических стволовых клеток (ГСК), способных полностью восстановить систему гемопоэза и иммунитета в организме после высокодозной химиотерапии [1, 2, 3].
Риски отторжения трансплантата и возникновения реакции «трансплантат против хозяина» зависят от качества подбора донора ГСК, совместимого по HLA-системе, характеризующейся высокой вариабельностью [4].
По состоянию на 07 февраля 2019 г., число потенциальных доноров ГСК, зарегистрированных в объединенной базе данных о российских донорах BMDS (Bone Marrow Donor Search), составляет 94 204 человека, в неё включены 15 регистров из 11 регионов Российской Федерации [5]. Такое количество безвозмездных доноров на сегодняшний день обеспечило 282 трансплантации ГСК для пациентов российских клиник [6].
В последние пять лет наметился явный прогресс во взаимодействии трансплантационных клиник с BMDS, однако многие российские пациенты по-прежнему зависят от донорского материала, получаемого из-за рубежа, либо вообще остаются без совместимого неродственного донора [6].
Сложившаяся ситуация требует увеличения числа потенциальных доноров ГСК в короткие сроки, а трансплантационные центры диктуют необходимость HLA-типирования доноров молекулярно-генетическими методами как минимум по пяти HLA-локусам. Прогресс в расширении донорской базы ограничивается прежде всего высокой стоимостью реагентов, используемых для проведения массового HLA-типирования доноров и низкой производительностью анализа.
В настоящее время наибольшее распространение в практике получили четыре технологии HLA-типирования: SSP (Sequence Specific Primers), SSO (Sequence Specific Oligonucleotides), SBT (Sequence Based Typing) и NGS (Next Generation Sequence). Метод SSP характеризуется низкой производительностью, SSO – невозможностью определения отдельных точечных вариаций, что особенно актуально в условиях малоизученных популяций, к которым следует отнести и большинство популяций, проживающих на территории РФ [7]. Технология SBT признана «золотым стандартом» HLA-типирования, с точки зрения идентификации новых аллелей, а при использовании современных многокапиллярных секвенаторов обладает и высокой производительностью. Однако даже существенное масштабирование исследований, выполняемых методом SBT, практически не снижает стоимости типирования. При необходимости изучения дополнительных экзонов/интронов затраты на SBT-типирование возрастают. Наиболее перспективным, с точки зрения увеличения производительности и существенного снижения стоимости HLA-типирования, представляется применение технологии массового параллельного секвенирования (MPS - massive parallel sequencing).
Стандартный протокол проведения таргетного MPS исследования включает в себя следующие этапы: таргетное обогащение генов, приготовление библиотек, секвенирование, анализ данных.
Отдаленным аналогом предлагаемого изобретения является набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающего ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1) [8].
Техническим результатом заявляемого изобретения является изучение последовательностей генов HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 главного комплекса гистосовместимости с целью создания системы типирования HLA. Использование предлагаемого набора синтетических олигонуклеотидов позволит проводить таргетную амплификацию при HLA-типировании потенциальных доноров ГСК в высоком разрешении, с возможностью выявления ранее незарегистрированных аллелей.
Для достижения указанного результата проводят ПЦР длинных фрагментов образца ДНК. В отличие от отдалённого аналога, позволяющего получать только последовательность первого интрона генов HLA-A и HLA-DRB1, предлагаемый набор праймеров позволяет определять последовательности всего гена локусов HLA-A, HLA-B, HLA-C (за исключением участка 3’-UTR), участка гена с первого по пятый экзон локуса HLA-DQB1, участка гена со второго по четвертый экзон локуса HLA-DRB1, что сводит число возможных неоднозначностей типирования к минимуму.
В процессе проведения патентно-информационного поиска не выявлено источников, порочащих новизну предполагаемого изобретения.
Заявляемое изобретение разработано в ООО «ПАРСЕК ЛАБ».
Осуществление изобретения:
Материалом для исследования является геномная ДНК человека. Исследуемый препарат ДНК не должен содержать посторонних примесей, соотношение А260/A280 должно составлять 1,7-1,9. Для анализа одного образца требуется 300 нг ДНК (30 мкл ДНК с концентрацией 10нг/мкл для анализа 5 локусов), концентрация геномной ДНК должна быть оценена флуоресцентным методом.
Использование изобретения возможно в двух форматах моноплексный и мультиплексный:
1. Формат – моноплексный.
Для получения последовательностей генов HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 главного комплекса гистосовместимости используется постановка ПЦР длинных фрагментов с помощью набора специфичных праймеров. Дополнительно в реакционную смесь добавляют следующие компоненты: смесь дезоксирибонуклеотидтрифосфатов четырех типов в конечной концентрации каждого 200 мкМ, Taq-полимеразу (AccuPrime или Encyclo), реакционный буфер (600 мМ Tris-SO4, рН=8,9; 180 мМ (NH4)2SO4, 20 мМ Mg2+, 10% глицерол).
В подготовленную реакционную смесь добавляют образец ДНК и проводят ПЦР длинных фрагментов по следующим профилям:
- для локуса HLA-A
Температура Время Количество циклов
94оС 2 мин 1
98оС 10 сек 35
67оС 15 сек
68оС 3 мин
68оС 10 мин 1
4оС не ограничено
- для локуса HLA-B
Температура Время Количество циклов
94оС 2 мин 1
98оС 10 сек 35
60оС 15 сек
68оС 5 мин
68оС 10 мин 1
4оС не ограничено
- для локуса HLA-C
Температура Время Количество циклов
94оС 2 мин 1
98оС 10 сек 35
65оС 15 сек
68оС 5 мин
68оС 10 мин 1
4оС не ограничено
- для локуса HLA-DQB1
Температура Время Количество циклов
94оС 2 мин 1
98оС 10 сек 35
60оС 15 сек
68оС 6 мин
68оС 10 мин 1
4оС не ограничено
- для локуса HLA-DRB1
Температура Время Количество циклов
94оС 2 мин 1
98оС 10 сек 30
62оС 30 сек
68оС 7 мин
68оС 10 мин 1
4оС не ограничено
2. Формат – мультиплексный.
Для получения последовательностей генов HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 главного комплекса гистосовместимости используется постановка ПЦР длинных фрагментов с помощью набора специфичных праймеров. Дополнительно в реакционную смесь добавляют следующие компоненты: смесь дезоксирибонуклеотидтрифосфатов четырех типов в конечной концентрации каждого 200 мкМ, Taq-полимеразу (AccuPrime или Encyclo), реакционный буфер (600 мМ Tris-SO4, рН=8,9; 180 мМ (NH4)2SO4, 20 мМ Mg2+, 10% глицерол).
В подготовленную реакционную смесь добавляют образец ДНК и проводят ПЦР длинных фрагментов по следующему профилю:
Температура Время Количество циклов
94оС 2 мин 1
98оС 10 сек 2
70оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 2
69оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 2
68оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 2
67оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 2
66оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 3
65оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 3
64оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 3
63оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 3
62оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 3
61оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 3
60оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 3
59оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 2
58оС 15 сек
68оС 5,5 мин
98оС 10 сек 2
57оС 15 сек
68оС 5,5 мин
68оС 10 мин 1
4оС не ограничено
Оценку наличия продукта реакции ПЦР длинных фрагментов осуществляют электрофорезом в агарозном геле. Размер ампликона должен соответствовать указанному в таблице:
HLA-локус Размер продукта ПЦР, п.н
HLA-A 3 200
HLA-B 4 609
HLA-C 3 000
HLA-DQB1 6 100
HLA-DRB1 4 300
Примеры визуализации продуктов реакции ПЦР длинных фрагментов с использованием набора синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов главного комплекса гистосовместимости – HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1.
Моноплексный формат:
Figure 00000001
Figure 00000002
Figure 00000003
Мультиплексный формат:
Figure 00000004
Список литературы:
1. Passweg J.R., Baldomero H., Bader P.et al.; European Society for Blood and Marrow Transplantation (EBMT). Hematopoietic SCT in Europe 2013: recent trends in the use of alternative donors showing more haploidentical donors but fewer cord blood transplants. Bone Marrow Transplant. – 2015. – 50 (4). P. 476–82.
2. Syed A. Abutalib, Parameswaran Hari. Clinical Manual of Blood and Bone Marrow Transplantation. – Chichester: Wiley-Blackwell, 2017. – 424 с.
3. Кокорев О.В., Чердынцева Н.В., Зайцев К.В., Волгушев С.В. Теоретические и практические аспекты трансплантации стволовых клеток в онкологии // Сибирский онкологический журнал. – 2005. – № 4 (16). – С. 53–61.
4. Афанасьев Б.В., Зубаровская Л.С., Алянский А.Л. и др. Выбор донора при аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток // Российский журнал детской гематологии и онкологии. – 2016. – Т.3. – С. 30-36.
5. Счетчик регистра (2018). Доступен: http://www.rdkm.rusfond.ru/registr_stat/001 (обновление 10.08.2018).
6. Макаренко О.А., Алянский А.Л., Иванова Н.Е. и др. Эффективность поиска неродственного донора гемопоэтических стволовых клеток с помощью российской поисковой системы Bone Marrow Donor Search: опыт НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой // Клиническая онкогематология. – 2017. -№ 10. – С. 39-44.
7. Логинова М.А., Парамонов И.В. Новые HLA-аллели в российских популяциях // Трансфузиология. – 2016. - №3. Т.17. – С.13-20.
8. Патент Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1). RU 2649064.

Claims (17)

  1. Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов главного комплекса гистосовместимости - HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DRB1 в ходе ПЦР длинных фрагментов (моноплексный и мультиплексный форматы):
  2. HLA-A-F: AGAGAAGCCAATCAGTGTCGTCGCGGTC
  3. HLA-A-R: CTCAGCCCCACCTCTCTGGAACAGG
  4. HLA-B-F: CACCTCCATTCCCAGGGCGAGCTCACT
  5. HLA-B-R: TTCTTTTACTTCAGTGGTGTTCCCCAGATG
  6. HLA-C-F: CTAGAGAAGCCAATCAGCGTCT
  7. HLA-C-R: ACGCAGACACATTCAGGTGCCTTTGC
  8. HLA-DQB1-F1: TTCACCTCAGATGTTCATCCAGTA
  9. HLA-DQB1-F2: TTCACCTCAGATGTTCATCCAGTG
  10. HLA-DQB1-F3: TTCACCTCAAATGTTCATCCAGTG
  11. HLA-DQB1-R: AGTCTTGATCCTCATAGCAGCAAATA
  12. HLA-DRB1-F1: CGCTTTCACTGCTCTTTAAGCT
  13. HLA-DRB1-F2: CACTTTCACTGCTCTTTAAGCT
  14. HLA-DRB1-F3: CACTTTCGCTGCTCTTTAAGCT
  15. HLA-DRB1-R1: CGTCTCTGCAGGCCACAAGCTAT
  16. HLA-DRB1-R2: CGTCTCTGTAGGCCACAAGCTAT
  17. с дальнейшей визуализацией продуктов реакции определенного размера методом электрофореза в агарозном геле, отличающийся возможностью определения последовательности всего гена локусов HLA-A, HLA-B, HLA-C (за исключением участка 3’-UTR), участка гена с первого по пятый экзон локуса HLA-DQB1, участка гена со второго по четвертый экзон локуса HLA-DRB1 в моноплексном и мультиплексном форматах.
RU2019117208A 2019-06-03 2019-06-03 Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости RU2703545C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2019117208A RU2703545C1 (ru) 2019-06-03 2019-06-03 Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2019117208A RU2703545C1 (ru) 2019-06-03 2019-06-03 Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2703545C1 true RU2703545C1 (ru) 2019-10-21

Family

ID=68318153

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019117208A RU2703545C1 (ru) 2019-06-03 2019-06-03 Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2703545C1 (ru)

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3006571A1 (en) * 2013-05-09 2016-04-13 Genodive Pharma Inc. Hla gene multiplex dna typing method and kit
EP2735617B1 (en) * 2011-07-21 2018-02-21 Genodive Pharma Inc. Method and kit for dna typing of hla gene
RU2649064C1 (ru) * 2016-12-08 2018-04-02 Общество с ограниченной ответственностью "Научно-производственная фирма ДНК-Технология" (ООО "НПФ ДНК-Технология") Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1)

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2735617B1 (en) * 2011-07-21 2018-02-21 Genodive Pharma Inc. Method and kit for dna typing of hla gene
EP3006571A1 (en) * 2013-05-09 2016-04-13 Genodive Pharma Inc. Hla gene multiplex dna typing method and kit
RU2649064C1 (ru) * 2016-12-08 2018-04-02 Общество с ограниченной ответственностью "Научно-производственная фирма ДНК-Технология" (ООО "НПФ ДНК-Технология") Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1)

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
MADELEINE M.M. et al. Comprehensive analysis of HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, and HLA-DQB1 loci and squamous cell cervical cancer risk. Cancer Res. 2008 May 1; 68(9): 3532-9. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Huang et al. Single cell transcriptomic analysis of human mesenchymal stem cells reveals limited heterogeneity
CN103890190B (zh) Hla基因的dna分型方法和试剂盒
CN105339508B (zh) Hla基因的多重dna分型方法和试剂盒
EP3075863B1 (en) Simple method and kit for dna profiling of hla genes by high-throughput massively parallel sequencer
Danzer et al. Rapid, scalable and highly automated HLA genotyping using next-generation sequencing: a transition from research to diagnostics
Hickman et al. Analysis of the microglial sensome
US20050250125A1 (en) Method for conducting pharmacogenomics-based studies
Kitcharoen et al. MICA, MICB, and MHC beta block matching in bone marrow transplantation: relevance to transplantation outcome
He et al. Common and well-documented (CWD) alleles of human leukocyte antigen-A,-B,-C,-DRB1, and-DQB1 loci for the Chinese Han population do not quite correlate with the ASHI CWD alleles
de Brito Vargas et al. Remarkably low KIR and HLA diversity in Amerindians reveals signatures of strong purifying selection shaping the centromeric KIR region
JP2023116700A (ja) 主要組織適合遺伝子複合体一塩基多型
Renaud et al. Gene expression profiling in chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy
Assane et al. Human leukocyte antigen–A,–B, and–DRB1 allele and haplotype frequencies in the Mozambican population: A blood donor–based population study
Costantino et al. Human leukocyte antigen allele linkage disequilibrium and haplotype structure in volunteer bone marrow donors of Paraná State
RU2703545C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности генов hla-a, hla-b, hla-c, hla-dqb1, hla-drb1 главного комплекса гистосовместимости
Lahermo et al. MtDNA polymorphism in the Hungarians: comparison to three other Finno‐Ugric‐speaking populations
US10540324B2 (en) Human haplotyping system and method
Bakhit et al. Intrafamilial and interfamilial heterogeneity of PINK1-associated Parkinson's disease in Sudan
CN112609006B (zh) 人类白细胞抗原一步测序分型方法及其应用
Mellet et al. HLA typing: Conventional techniques v. next-generation sequencing
RU2649064C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для определения последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1)
CN112746100A (zh) 用于kir基因分型的引物、试剂盒及方法
Sellami et al. Evidence that erythrocyte DARC-positive phenotype can affect the GVHD occurrence after HLA-identical sibling HSCT
RU2800084C2 (ru) Способ получения молекулярных STR-маркеров Х-хромосомы для идентификации неизвестного индивида и определения биологического родства для работы с образцами малых количеств ДНК и набор олигонуклеотидов для его осуществления
Pinto et al. HLA-Cw* 0409N is associated with HLA-A* 2301 and HLA-B* 4403-carrying haplotypes