RU2646101C2 - Способ оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение - Google Patents
Способ оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение Download PDFInfo
- Publication number
- RU2646101C2 RU2646101C2 RU2016117883A RU2016117883A RU2646101C2 RU 2646101 C2 RU2646101 C2 RU 2646101C2 RU 2016117883 A RU2016117883 A RU 2016117883A RU 2016117883 A RU2016117883 A RU 2016117883A RU 2646101 C2 RU2646101 C2 RU 2646101C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- group
- sodium citrate
- indole
- assimilating
- bacteria
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 25
- 241000305071 Enterobacterales Species 0.000 title claims abstract description 19
- 150000001860 citric acid derivatives Chemical class 0.000 title 1
- SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N Indole Chemical compound C1=CC=C2NC=CC2=C1 SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 56
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 claims abstract description 31
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims abstract description 31
- RWSOTUBLDIXVET-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen sulfide Chemical compound S RWSOTUBLDIXVET-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 28
- PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N indole Natural products CC1=CC=CC2=C1C=CN2 PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 28
- RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N indolenine Natural products C1=CC=C2CC=NC2=C1 RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 28
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims abstract description 27
- 229910000037 hydrogen sulfide Inorganic materials 0.000 claims abstract description 23
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims abstract description 18
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims abstract description 8
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims abstract description 8
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 8
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 8
- 241001494522 Citrobacter amalonaticus Species 0.000 claims abstract description 5
- 241000588919 Citrobacter freundii Species 0.000 claims abstract description 5
- 241000588917 Citrobacter koseri Species 0.000 claims abstract description 5
- 241000920610 Citrobacter youngae Species 0.000 claims abstract description 5
- 241000588697 Enterobacter cloacae Species 0.000 claims abstract description 5
- 241000588915 Klebsiella aerogenes Species 0.000 claims abstract description 5
- 241000588749 Klebsiella oxytoca Species 0.000 claims abstract description 5
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 claims abstract description 5
- 241000588770 Proteus mirabilis Species 0.000 claims abstract description 5
- 241000607715 Serratia marcescens Species 0.000 claims abstract description 5
- 241001622809 Serratia plymuthica Species 0.000 claims abstract description 5
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims abstract description 4
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 claims abstract description 4
- 241000588747 Klebsiella pneumoniae Species 0.000 claims abstract description 4
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 claims abstract description 4
- 241000588767 Proteus vulgaris Species 0.000 claims abstract description 4
- 241000588768 Providencia Species 0.000 claims abstract description 4
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 4
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 claims abstract description 4
- 229940092559 enterobacter aerogenes Drugs 0.000 claims abstract description 4
- 239000008101 lactose Substances 0.000 claims abstract description 4
- 229940007042 proteus vulgaris Drugs 0.000 claims abstract description 4
- PRWXGRGLHYDWPS-UHFFFAOYSA-L sodium malonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC([O-])=O PRWXGRGLHYDWPS-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims abstract description 4
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 claims abstract description 4
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 claims abstract description 3
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 3
- SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N L-rhamnopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N 0.000 claims abstract description 3
- PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N L-rhamnose Natural products CC(O)C(O)C(O)C(O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 3
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims abstract description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 3
- 241000607720 Serratia Species 0.000 claims 1
- 241000894007 species Species 0.000 abstract description 9
- 208000027244 Dysbiosis Diseases 0.000 abstract description 4
- 241000881771 Serratia rubidaea Species 0.000 abstract description 4
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 abstract description 4
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 abstract description 3
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 abstract description 2
- 230000019086 sulfide ion homeostasis Effects 0.000 abstract description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 230000007140 dysbiosis Effects 0.000 description 3
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 3
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 2
- 208000028774 intestinal disease Diseases 0.000 description 2
- 244000005706 microflora Species 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 201000008283 Atrophic Rhinitis Diseases 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588923 Citrobacter Species 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 241000588914 Enterobacter Species 0.000 description 1
- 241000588748 Klebsiella Species 0.000 description 1
- 206010035664 Pneumonia Diseases 0.000 description 1
- 244000110797 Polygonum persicaria Species 0.000 description 1
- 241000588769 Proteus <enterobacteria> Species 0.000 description 1
- 206010039088 Rhinitis atrophic Diseases 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 230000000721 bacterilogical effect Effects 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 230000008676 import Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000009331 sowing Methods 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Virology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
Изобретение относится к медицинской микробиологии. Проводится идентификациия цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, изолированных при микробиологической диагностике дисбиотических состояний кишечника (дисбактериозов) у детей и взрослых. Способ включает пересев изучаемой колонии микроорганизмов, выросших на среде Эндо или Симмонса, пересев для первичной и последующей идентификации производится с использованием тестов: индолообразования, продукции сероводорода, подвижности и утилизации цитрата натрия. По характеру изменения изучаемые микроорганизмы в начале подразделяются на шесть условных групп. В дальнейшем в зависимости от принадлежности к определенной группе используются основной и при необходимости дополнительный для каждой группы тест, а именно: лизин и при необходимости мочевина - для I группы, включающей неподвижные бактерии, не продуцирующие индол и сероводород и ассимилирующие цитрат натрия при росте на среде Симмонса: Klebsiella pneumoniae с подвидами: ssp.pneumoniae, ssp.ozenae, ssp.rhinoscleromatis. Лизин и при необходимости последовательно сорбит, аргинин и рамноза - для III группы, включающей подвижные бактерии, не продуцирующие индол и сероводород и ассимилирующие цитрат натрия: Enterobacter cloacae ssp.cloacae, Enterobacter aerogenes, Serratia marcescens, Serratia plymuthica и Serratia rubidaea. Фенилаланин, а в дальнейшем малонат натрия - для IV группы, включающей подвижные штаммы, продуцирующие индол и не продуцирующие сероводород, а также ассимилирующие цитрат натрия: Citrobacter amalonaticus, Citrobacter koseri, а также бактерии рода Providencia. Фенилаланин и в дальнейшем лактоза - для VI группы, включающей бактерии подвижные, не продуцирующие индол и продуцирующие сероводород, в большинстве ассимилирующие цитрат натрия: Proteus mirabilis, Citrobacter freundii, Citrobacter youngae. Бактерии II и V группы идентифицируются только по первичным тестам и включают неподвижные штаммы, продуцирующие индол, не продуцирующие сероводород и ассимилирующие цитрат натрия: Klebsiella oxytoca (II группа), а также подвижные штаммы, продуцирующие индол и сероводород и в большинстве ассимилирующие цитрат натрия: Proteus vulgaris (V группа). Изобретение позволяет увеличить идентификацию путем определения рода, вида и подвида цитрат-ассимилирующих энтеробактерий. 1 табл.
Description
Изобретение относится к области медицины и может найти применение в медицинской микробиологии при идентификации цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, изолированных при микробиологической диагностике дисбиотических состояний кишечника (дисбактериозов) у детей и взрослых, а также заболеваний; обусловленных этими энтеробактериями.
К цитрат-ассимилирующим бактериям семейства Enterobacte cloasae относятся представители различных родов и видов, обладающие способностью использовать цитрат натрия как единственный источник углерода. При посеве такого микроорганизма на питательную среду, содержащую цитрат натрия (среду Симмонса), в ходе реакции происходит сдвиг pН в щелочную сторону, в результате чего среда окрашивается в ярко-синий цвет (исходная среда имеет зеленую окраску).
К наиболее часто встречаемым в медицинской практике цитрат-ассимилирующим энтеробактериям относятся: род Клебсиелла -K.pneumoniae (с подвидами пневмонии, озены и риносклероматис), K.oxytoca; род Цитробактер - C.amalonaticus, C.freundii, C.koseri, C.youngae; род Энтеробактер - E.aerogenes, Е.cloacae; род Серрация - S.marcescens, S.plymuthica, S.rubidaea; род Провиденция; род Протеус - P.vulgaris, P.mirabilis.
Эти микроорганизмы являются условно-патогенными. Они в незначительных количествах могут находиться в толстом отделе кишечника человека, составляя его так называемую «нормальную» микрофлору. При дисбиотических нарушениях кишечника (дисбактериозе) количество условно-патогенной микрофлоры и в том числе цитрат-ассимилирующих бактерий может значительно увеличиться и превысить возрастную норму, что выявляется при целенаправленной микробиологической диагностике и требует соответствующего лечения. Кроме того, нельзя не учитывать и факт значительного увеличения изоляции при дисбактериозах кишечника многокомпонентных микробных ассоциаций, в состав которых, как правило, входят цитрат-ассимилирующие бактерии, а также возможности этих микроорганизмов вызывать инфекционные заболевания с кишечной и внекишечной локализацией.
Идентификации как таковой группы цитрат-ассимилирующих бактерий, дающих возможность определить не только род, но и вид, а иногда и подвид, используя при этом ограниченный набор тестов, в доступной нам литературе не встретилось.
Наибольшую популярность в последние годы приобрели автоматические бактериологические анализаторы для микрообъемной идентификации, в том числе энтеробактерий. В нашей стране широкое распространение получил метод идентификации бактерий с помощью баканализатора Vitek-2 Compact (производства фирмы Bio Merieux, Франция). Подобной техникой оснащены крупные лаборатории и медицинские центры. Такого типа баканализаторы позволяют быстро, без значительных физических затрат и при этом с большой точностью идентифицировать значительное число известных микроорганизмов. Однако большим недостатком идентификации микроорганизмов с помощью этого баканализатора является высокая стоимость как самой аппаратуры, так и расходных материалов к ней, что делает невозможным исследование большого объема материала; кроме того, такая аппаратура едва ли доступна для маленьких лабораторий или других небольших медучреждений. При использовании подобных анализаторов для идентификации цитрат-ассимилирующих энтеробактерий происходит необоснованный расход тест-систем, так как для каждого штамма микроорганизма аппарат использует 64 диагностических теста, тогда как цитрат-ассимилирующие бактерии не требуют такого количества, а могут быть определены с помощью гораздо меньшего набора, что позволяет значительно удешевить их идентификацию, сохранив при этом достаточно высокую точность.
Известен ряд методов идентификации энтеробактерий, число и эффективность которых из года в год повышается. Наиболее востребованными и достаточно точными являются макро- и микрообъемные методы биохимической идентификации (использование СИБов - системы индикаторных бумажных, ПБДЭ - пластин биохимических, диагностирующих энтеробактерий - обе системы производства «Микроген», г. Нижний Новгород). Однако обе эти системы не лишены недостатков, так, для системы ПБДЭ необходимо наличие большого числа (20) лунок с субстратами и требуется использование таких тестов, которые при идентификации цитрат-ассимилирующих бактерий могут быть опущены или заменены другими. Кроме того, при использовании этой системы нередко бывают затруднения при учете результатов в связи с недостаточным размером лунки, что сказывается как на точности посева, так и учета результатов.
Наиболее близким способом к заявляемому является способ использования СИБов, дающий возможность провести идентификацию с помощью 13 тестов, но он неудобен технически, требует значительных затрат рабочего времени, лабораторной посуды с предварительным ее мытьем, заготовкой, стерилизацией и некоторыми другими манипуляциями, что также увеличивает время выполнения исследования, трудозатраты и в конечном итоге его стоимость. Кроме того, способ с использованием СИБов обладает низкой глубиной идентификации: он предназначен только для межродовой и межвидовой идентификации и не способен определить подвид микроорганизма.
Техническим результатом заявленного решения является увеличение глубины идентификации путем определения рода, вида и подвида цитрат-ассимилирующих энтеробактерий.
Технический результат достигается тем, что в способе оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение, включающем пересев изучаемой колонии микроорганизмов, выросших на среде Эндо или Симмонса, пересев для первичной и последующей идентификации производится с использованием ограниченного набора тестов: индолообразования, продукции сероводорода, подвижности и утилизации цитрата натрия, по характеру изменения которых изучаемые микроорганизмы в начале подразделяются на шесть условных групп, а в дальнейшем, в зависимости от принадлежности к определенной группе, используются основной и при необходимости дополнительный для каждой группы тест, а именно лизин и при необходимости мочевина - для I группы, включающей неподвижные бактерии, не продуцирующие индол и сероводород и ассимилирующие цитрат натрия при росте на среде Симмонса: Klebsiella pneumoniae с подвидами: ssp.pneumoniae, ssp.ozenae, ssp.rhinoscleromatis; лизин и при необходимости последовательно сорбит, аргинин и рамноза - для III группы, включающей подвижные бактерии, не продуцирующие индол и сероводород и ассимилирующие цитрат натрия: Enterobacter cloacae ssp.cloacae, Enterobacter aerogenes, Serratia marcescens, Serratia plymuthica и Serratia rubidaea; фенилаланин, а в дальнейшем малонат натрия - для IV группы, включающей подвижные штаммы, продуцирующие индол и не продуцирующие сероводород, а также ассимилирующие цитрат натрия: Citrobacter amalonaticus, Citrobacter koseri, а также бактерии рода Providencia; фенилаланин и в дальнейшем лактоза - для VI группы, включающей бактерии подвижные, не продуцирующие индол и продуцирующие сероводород, в большинстве ассимилирующие цитрат натрия: Proteus mirabilis, Citrobacter freundii, Citrobacter youngae; бактерии II и V группы идентифицируются только по первичным тестам и включают неподвижные штаммы, продуцирующие индол, не продуцирующие сероводород и ассимилирующие цитрат натрия: Klebsiella oxytoca (II группа), а также подвижные штаммы, продуцирующие индол и сероводород и в большинстве ассимилирующие цитрат натрия: Proteus vulgaris (V группа).
Способ оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение, осуществляют следующим образом.
Чистую культуру изучаемого микроорганизма, выросшую на чашечных средах Эндо или Симмонса, засевают на мясо-пептонный бульон (для определения продукции индола и сероводорода), на 0,3% мясо-пептонный агар (для определения подвижности) и на пробирочную среду Симмонса (для определения утилизации цитрата натрия). В том случае, если изучаемый штамм изолирован со среды Симмонса, посев на эту среду в пробирке не делается. После инкубации посевов в термостате при 37°С в течение 18-20 час производят учет результатов; при этом идентифицируемые микроорганизмы в зависимости от изменения указанных субстратов могут быть отнесены к одной из шести групп.
К I группе относятся неподвижные бактерии, не продуцирующие индол и сероводород и ассимилирующие цитрат натрия при росте на среде Симмонса - Klebsiella pneumoniae с подвидами (ssp.pneumoniae, ssp.ozenae, ssp.rhinoscleromatis), основным тестом для дифференциации которых является лизин, а дополнительным - мочевина.
Ко II группе относятся неподвижные бактерии, продуцирующие индол, не продуцирующие сероводород и ассимилирующие цитрат натрия; в эту группу входит только единственный вид - Klebsiella oxytoca, который окончательно дифференцируется уже по первичным тестам.
III группа включает подвижные бактерии, не продуцирующие индол и сероводород и ассимилирующие цитрат натрия - Enterobacter cloacae ssp.cloacae, Enterobacter aerogenes, Serratia marcescens, Serratia plymuthica и Serratia rubidaea, основной дифференцирующий тест группы - лизин, дополнительные тесты - сорбит и аргинин и при необходимости дальнейшей идентификации - рамноза.
IV группа включает подвижные штаммы, продуцирующие индол и не прдуцирующие сероводород, а также ассимилирующие цитрат натрия - Citrobacter amalonaticus, Citrobacter koseri, а также бактерии рода Providencia. Основной дифференцирующий тест группы - фенилаланин, дополнительный - малонат натрия.
V группа объединяет подвижные штаммы, продуцирующие индол и сероводород и ассимилирующие цитрат натрия; сюда, как и во II группу, относится единственный вид - Proteus vulgaris, который дифференцируется по первичным четырем тестам (отдельные штаммы этого микроорганизма могут не утилизировать цитрат натрия).
Роды и виды бактерий, составляющие VI группу, подвижны, не продуцируют индол и продуцируют сероводород, в большинстве утилизируют цитрат натрия - Proteus mirabilis, Citrobacter freundii, Citrobacter youngae. Основной дифференцирующий тест группы - фенилаланин, дополнительный - лактоза. Кроме того, осуществление заявляемого способа представлено в табличной форме (см. приложение).
Для сравнения основных параметров предлагаемого способа было произведено параллельное изучение одних и тех же штаммов цитрат-ассимилирующих энтеробактерий с использованием трех способов: с помощью индикаторных дисков (СИБ) производства «Микроген», Нижний Новгород, баканализатора Vitek-2 Compact 30 производства фирмы «Bio Merieux, Франция, и предлагаемого способа. Результаты отражены в таблице 1. 
Результаты, полученные при этом, свидетельствуют о высокой точности предлагаемого способа, практически не уступающей способам сравнения. Кроме того, предлагаемый способ дает возможность идентифицировать большинство микроорганизмов не только до рода и вида, но и до подвида так же, как при использовании высокоточного способа с использованием баканализатора Vitek-2 Compact 30, тогда как способ с использованием СИБов идентифицирует только до рода и вида. Количество используемых тестов значительно меньше у предлагаемого способа, чем у способов сравнения. Стоимость исследования одного микроорганизма у предлагаемого способа в 1,5 раза меньше, чем при применении СИБов, и в 5,4 раза ниже, чем при использовании баканализатора Vitek-2 Compact 30. Кроме того, предлагаемый способ поможет проводить идентификацию цитрат-ассимилирующих штаммов энтеробактерий без использования импортной техники и расходных материалов, что является своего рода средством импортозамещения.
В течение 2015-2016 годов с помощью предлагаемого метода нами было идентифицировано 250 штаммов цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, изолированных от лиц с дисбиотическими нарушениями кишечника
Способ оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение, позволяющее увеличить глубину идентификации путем определения рода, вида и подвида цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, найдет применение в микробиологической диагностике.
Claims (1)
- Способ оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение, включающий пересев изучаемой колонии микроорганизмов, выросших на среде Эндо или Симмонса, отличающийся тем, что пересев для первичной и последующей идентификации производится с использованием ограниченного набора тестов: индолообразования, продукции сероводорода, подвижности и утилизации цитрата натрия, по характеру изменения которых изучаемые микроорганизмы в начале подразделяются на шесть условных групп, а в дальнейшем, в зависимости от принадлежности к определенной группе, используются основной и при необходимости дополнительный для каждой группы тест, а именно лизин и при необходимости мочевина - для I группы, включающей неподвижные бактерии, не продуцирующие индол и сероводород и ассимилирующие цитрат натрия при росте на среде Симмонса: Klebsiella pneumoniae с подвидами: ssp. pneumoniae, ssp. ozenae, ssp. rhinoscleromatis; лизин и при необходимости последовательно сорбит, аргинин и рамноза - для III группы, включающей подвижные бактерии, не продуцирующие индол и сероводород и ассимилирующие цитрат натрия: Enterobacter cloacae ssp. cloacae, Enterobacter aerogenes, Serratia marcescens, Serratia plymuthica и Serratia rabidaea; фенилаланин, а в дальнейшем малонат натрия - для IV группы, включающей подвижные штаммы, продуцирующие индол и не продуцирующие сероводород, а также ассимилирующие цитрат натрия: Citrobacter amalonaticus, Citrobacter koseri, а также бактерии рода Providencia; фенилаланин и в дальнейшем лактоза - для VI группы, включающей бактерии подвижные, не продуцирующие индол и продуцирующие сероводород, в большинстве ассимилирующие цитрат натрия: Proteus mirabilis, Citrobacter freundii, Citrobacter youngae; бактерии II и V группы идентифицируются только по первичным тестам и включают неподвижные штаммы, продуцирующие индол, не продуцирующие сероводород и ассимилирующие цитрат натрия: Klebsiella oxytoca (II группа), а также подвижные штаммы, продуцирующие индол и сероводород и в большинстве ассимилирующие цитрат натрия: Proteus vulgaris (V группа).
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2016117883A RU2646101C2 (ru) | 2016-05-05 | 2016-05-05 | Способ оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2016117883A RU2646101C2 (ru) | 2016-05-05 | 2016-05-05 | Способ оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2016117883A RU2016117883A (ru) | 2017-11-10 |
| RU2646101C2 true RU2646101C2 (ru) | 2018-03-01 |
Family
ID=60264074
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2016117883A RU2646101C2 (ru) | 2016-05-05 | 2016-05-05 | Способ оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2646101C2 (ru) |
-
2016
- 2016-05-05 RU RU2016117883A patent/RU2646101C2/ru active
Non-Patent Citations (5)
| Title |
|---|
| Идентификация энтеробактерий и стафилококков. Информационные материалы. Нижний Новгород, 2007, с. 6-27. * |
| Идентификация энтеробактерий и стафилококков. Информационные материалы. Нижний Новгород, 2007, с. 6-27. СИВОЛОДСКИЙ Е.П. Систематика и идентификация энтеробактерий. 3-е издание., Санкт- Петербург, 2011, с. 7-20. Методы бактериологического исследования в клинической микробиологии. Методические рекомендации, 1983, с. 10-37. Методические рекомендации по микробиологической диагностике заболеваний, вызываемых энтеробактериями, 1984 с. 5-33. * |
| Методические рекомендации по микробиологической диагностике заболеваний, вызываемых энтеробактериями, 1984 с. 5-33. * |
| Методы бактериологического исследования в клинической микробиологии. Методические рекомендации, 1983, с. 10-37. * |
| СИВОЛОДСКИЙ Е.П. Систематика и идентификация энтеробактерий. 3-е издание., Санкт- Петербург, 2011, с. 7-20. * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2016117883A (ru) | 2017-11-10 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Kilian et al. | Rapid Identification of Enterobacteriaceae: II. Use of a β‐glucuronidase Detecting Agar Medium (PGUA Agar) for the Identification of E. coli in Primary Cultures of Urine Samples | |
| US6046021A (en) | Comparative phenotype analysis of two or more microorganisms using a plurality of substrates within a multiwell testing device | |
| CN104105795B (zh) | 检测沙门氏菌属微生物的方法 | |
| US6472201B1 (en) | Comparative phenotype analysis | |
| WO1989004372A1 (en) | Rapid process for detecting pathogenic microorganisms | |
| Carricajo et al. | Comparative evaluation of five chromogenic media for detection, enumeration and identification of urinary tract pathogens | |
| JP6132852B2 (ja) | サルモネラ微生物の検出方法 | |
| CN101970682A (zh) | 检测和/或鉴别艰难梭状芽孢杆菌的方法 | |
| Lakshmi et al. | Utility of Urichrom II–A Chromogenic Medium for Uropathogens | |
| Al-Oqaili et al. | Antimicrobial susceptibility and molecular characterization for some virulence factors of Proteus Mirabilis isolated from patients in AlQadisiyah Province/Iraq | |
| RU2646101C2 (ru) | Способ оптимальной идентификации наиболее часто встречающихся цитрат-ассимилирующих энтеробактерий, имеющих медицинское значение | |
| Rank | Chromogenic agar media in the clinical, food, and environmental testing arenas, part I | |
| RU2668406C1 (ru) | Способ первичного посева биоматериала, выделенного из нижних дыхательных путей пациентов с муковисцидозом | |
| Chen et al. | Evaluation of a revised US Food and Drug Administration method for the detection and isolation of Enterobacter sakazakii in powdered infant formula: precollaborative study | |
| RU2416635C2 (ru) | Хромогенная питательная среда для выявления и идентификации клебсиелл | |
| Tebbutt | Evaluation of some methods for the laboratory identification of Haemophilus influenzae. | |
| SU988865A1 (ru) | Способ идентификации у.pSeUDo-тULеRеULоSIS U у.ентеRосоLIтIса | |
| Yagupsky et al. | Clinical evaluation of a novel chromogenic agar dipslide for diagnosis of urinary tract infections | |
| RU2604789C1 (ru) | Питательная среда для выращивания бактерий | |
| RU2822665C2 (ru) | Набор штаммов бактерий для обучения вопросам микробиологии и методам лабораторной диагностики туляремии | |
| RU2484141C1 (ru) | Элективно-дифференциальная питательная среда для выделения холерных вибрионов (варианты) | |
| RU2711954C1 (ru) | Способ предварительной идентификации нетуберкулезных микобактерий с использованием универсальной хромогенной среды | |
| Priya et al. | Biofilm formation by Streptococcus serotypes on dental plaques | |
| Anwer et al. | Characterization and Isolation of different strains (E. coli) from patients with Urinary Tract Infection | |
| RU2235785C2 (ru) | Питательная среда для выделения бактерий рода yersinia |