RU2288265C2 - Способ получения l-треонина - Google Patents

Способ получения l-треонина Download PDF

Info

Publication number
RU2288265C2
RU2288265C2 RU2004127987/13A RU2004127987A RU2288265C2 RU 2288265 C2 RU2288265 C2 RU 2288265C2 RU 2004127987/13 A RU2004127987/13 A RU 2004127987/13A RU 2004127987 A RU2004127987 A RU 2004127987A RU 2288265 C2 RU2288265 C2 RU 2288265C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
threonine
strain
tdc
gene
recombinant
Prior art date
Application number
RU2004127987/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2004127987A (ru
Inventor
Дзэ Уонг ПАК (KR)
Дзэ Уонг ПАК
Буонг Чон ЛИ (KR)
Буонг Чон ЛИ
Дэ Чеол КИМ (KR)
Дэ Чеол КИМ
Дзин Хо ЛИ (KR)
Дзин Хо ЛИ
Дзэ Уонг ЧО (KR)
Дзэ Уонг ЧО
Уонг Хун ПАК (KR)
Уонг Хун ПАК
Original Assignee
Чеил Джеданг Корпорейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Чеил Джеданг Корпорейшн filed Critical Чеил Джеданг Корпорейшн
Publication of RU2004127987A publication Critical patent/RU2004127987A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2288265C2 publication Critical patent/RU2288265C2/ru

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88Lyases (4.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/08Lysine; Diaminopimelic acid; Threonine; Valine

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)

Abstract

Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой способ получения L-треонина. Согласно способу ген треониндегидратазы (tdc), присутствующий в геномной ДНК микроорганизма, частично инактивируют с использованием рекомбинантной технологии. Штамм микроорганизма E.coli pGm TN-PPC12 (КСММ-10236) трансформируют фрагментом ДНК Δtdc::loxpKan и получают штамм E.coli TRN212 (КССМ-10353). Данный штамм культивируют для получения L-треонина. Заявленное изобретение позволяет значительно увеличить выход L-треонина. 3 н.п. ф-лы, 3 ил., 4 табл.

Description

Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение относится к получению L-треонина с использованием микроорганизмов. Более конкретно, настоящее изобретение относится к способу получения L-треонина с высоким выходом с использованием микроорганизма, в котором ген (tdc) треониндегидратазы геномной ДНК микроорганизма частично дезактивируют с использованием рекомбинантной технологии, вследствие чего существенно повышается выход L-треонина.
Описание уровня техники
L-треонин, являющийся представителем незаменимых аминокислот, широко используется в качестве кормовых и пищевых добавок, а также в качестве жидких сред и синтетических материалов медицинского и фармацевтического назначения. L-треонин получают ферментацией с использованием синтетических мутантов - производных Escherichia Coli, Corynobacterium, Serratia, и Providencia дикого типа. Известно, что такие мутанты включают устойчивые к аналогам аминокислот и лекарственным препаратам мутанты, а также их синтетические формы, наделенные ауксотрофными свойствами по диаминопимелиновой кислоте, метионину, лизину или изолейцину (выложенная заявка на патент Японии № hei 2-219582, Appl., Microbiolo. Biotechnol., 29, 550-553 (1988) и корейская патентная публикация №92-8365). В заявке на патент Кореи №90-22965 описывается продуцирующий L-треонин штамм TF4076 (KFCC10718), являющийся ауксотрофным по метионину и устойчивым к действию аналогов треонина (AHV: α-амино-β-гидроксивалериановая кислота), аналогов лизина (АЕС: S-(2-аминоэтил)-L-цистеин), аналогов изолейцина (α-аминомасляная кислота) и метиониновых аналогов (этионин).
Общий подход к повышению уровня экспрессии конкретного гена предусматривает использование плазмиды, делающей большее число копий с целью увеличения числа генов в микроорганизме (Sambrook et al., Molecular cloning, Second Edition, 1989, 1.3-1.5). Ген-мишень интегрируется в плазмиду, а микроорганизм-хозяин трансформируется рекомбинантной плазмидой с целью увеличения числа генов в микроорганизме-хозяине в соответствии с копийностью плазмиды. Об определенном успехе в подходе такого типа, предпринятом для увеличения продуктивности треонина, сообщается в US Patent №5538873. Однако большинство методов, использующих такие рекомбинантные плазмиды, характеризуются сверхпродукцией конкретного гена, что нежелательно для микроорганизма-хозяина и создает проблемы, связанные с неустойчивостью плазмиды, вследствие чего может происходить потеря плазмиды в ходе культивирования рекомбинантного штамма.
Для решения такой проблемы были предложены методы, предусматривающие добавление антибиотиков в культурную среду или использование плазмиды с регулируемой экспрессией (Sambrook et al., Molecular cloning, Second Edition, 1989, 1.5-1.6&1.9-1.11). Согласно методу, в котором для получения конкретного продукта используют плазмиду с регулируемой экспрессией, культивирование клеток проводят в условиях отсутствия экспрессии на стадии роста с целью минимизации ущерба для микроорганизма-хозяина, и после полного развития микроорганизма индуцируется временная (транзиторная) экспрессия. Однако большинство плазмид с регулируемой экспрессией может использоваться лишь в том случае, когда конечный продукт представляет собой белок.
Продукция первичных метаболитов тесно связана с ростом микроорганизмов, вследствие чего трудно повысить выход первичных метаболитов, если на стадии роста не происходит экспрессии генов-мишеней. Именно это происходит при продуцировании треонина, являющегося первичным метаболитом.
Для компенсации такого недостатка специфический ген биосинтеза треонина включают в хромосомную ДНК с целью продуцирования треонина (US Patent №5939307). Однако такой подход предусматривает замену хромосомного гена на ген с заменой на индуцибельный промотор, и трудно ожидать, что это может существенно увеличить экспрессию гена треонинового оперона.
В связи с этим сущность настоящего изобретения состоит в инактивации треонин-дегидратазного (tdc) гена в хромосоме, участвующей в одном из путей деградации треоинина, с целью ингибирования деградации треонина при сохранении других видовых функций микроорганизма-хозяина и, тем самым, обеспечения повышенного выхода треонина.
Большинство современных генно-инженерных методов, используемых для повышения выхода треоинина, сфокусированы на биосинтетическом пути его получения, начинающегося с оксалоацетата. Однако в настоящем изобретении также предусматривается использование активности треонин-дегидратазного (tdc) гена, вовлеченного в путь деградации треонина, с целью эффективного и существенного увеличения выхода L-треонина.
Раскрытие изобретения
Цель настоящего изобретения, направленная на решение отмеченных выше проблем, заключается в разработке способа высокоэффективного продуцирования L-треонина, исключающего проблемы, связанные с нестабильностью плазмиды и ингибированием микробного роста, возникающие при использовании штаммов, несущих рекомбинантную плазмиду, и обеспечивающего существенное увеличение продуктивности L-треонина в результате подавления активности треонин-дегидратазы.
Для достижения целей настоящего изобретения разработана рекомбинантная плазмида, включающая инактивированный ген tdc (треониндегидратаза).
Для достижения целей настоящего изобретения, в соответствии с одним из его воплощений, tdc-оперон треонин-продуцирующего микроорганизма может инактивироваться путем расщепления сайта в tdc В и tdc С tdc-оперона и вставки кассеты с антибиотическим маркером в сайт расщепления. Предпочтительным треонин-продуцирующим микроорганизмом является штамм E.coli.
В соответствие с другим воплощением настоящего изобретения штамм E.coli может обладать устойчивостью в отношении аналогов треонина, аналогов лизина, аналогов изолейцина и аналогов метионина. Согласно другому воплощению настоящего изобретения одна или более дополнительных копий каждого из генов фосфоенолпируваткарбоксилазы (ррс) и треонинового оперона интегрируются в хромосомную ДНК штамма E.coli. Предпочтительно использовать E.coli с названием pGmTN-PPC12 и каталожным № КССМ-10326.
Кроме этого, настоящее изобретение обеспечивает штамм E.coli, трансформированный описанной выше рекомбинантной плазмидой. Фрагмент гена tdc В и tdc С, содержащий антибиотический маркер, который происходит из рекомбинантной плазмиды, может быть вставлен в геном штамма E.coli. Предпочтительный фрагмент гена tdc В и tdc С, включающий антибиотическитй маркер, представляет собой Δtdc::loxpKan, изображенный на фигуре 2. Наиболее предпочтительный штамм E.coli имеет название TRN212 и каталожный номер КССМ-10353.
Цель настоящего изобретения достигается с помощью способа получения L-треонина, в котором используют указанный выше штамм E.coli, имеющий название TRN212 и каталожный номер КССМ-10353.
Далее приводится более подробное описание настоящего изобретения.
Известно несколько путей метаболизма L-треонина (Neihardt FC et al. (eds) Escherichia coli и Salmonella: Cellular and Molecular Biology, 2nd edn. ASM Press., Washington D.C., pp.369-370), три из которых являются основными: первый путь с участием треонин-дегидрогеназы, катализирующей разложение треонина с образованием α-амино-β-кетобутирата, который затем превращается в ацетил-СоА и глицин или подвергается дальнейшему разложению с образованием аминоацетона и превращением в пируват; второй путь с участием треониндегидратазы, дающей α-кетобутират, который метаболизируется до пропионил-СоА и далее до сукцинил-Со-А, являющегося интермедиатом цикла трикарбоновых кислот (ЦТК); и третий путь, протекающий с участием треонинальдолазы.
Настоящее изобретение отличается тем, что с целью максимального накопления L-треонина в пути метаболизма L-треонина подавляется активность треонин-дегидратазы.
В способе продуцирования L-треонина согласно настоящему изобретению в качестве штамма, продуцирующего L-треонин, используют штамм pGmTN-PPC12 (КССМ-10136, Korean Patent Application №01-6976, поданная заявителем по настоящей заявке), производный от E.coli TF4076 (KFCC10718, Korean Patent Application №90-22965). Штамм pGmTN-PPC12 (КССМ-10136) получали инсерцией гена фосфоенолпируваткарбоксилазы (ррс) из хромосомы штамма-продуцента L-треонина E.coli TF4076 (KFCC10718) с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР) и треонинового оперона, клонированного из той же хромосомы, в хромосому штамма-хозяина E.coli TF4076, вследствие чего в штамме TF4076 содержится удвоенное количество гена ррс и треонинонового оперона относительно их количества в хромосомной ДНК. Штамм pGmTN-PPC12 способен усиливать экспрессию гена ррс, участвующего в конверсии фосфоенолпирувата (PEP) в предшественник биосинтеза треонина, оксалоацетат, а также генов, кодирующих ферменты, участвующие в синтезе треонина из оксалоацетата, включающих thrA (аспартокиназа I-гомосериндегидрогеназа), thrB (гомосеринкиназа) и thrC (треонинсинтаза) и, таким образом, способен повышать выход продукции L-треонина. Штамм pGmTN-PPC12 депонирован в Korean Collection for Type Cultures (KCTC) 5 января 2001 г. и ему присвоен каталожный номер КССМ 10236.
Согласно настоящему изобретению ген треониндегидратазы (tdc), участвующей в пути метаболизма треонина, из pGmTN-PPC12 (КССМ-10136) подвергают инактивации, тем самым повышая выход L-треонина.
Известно, что треониндегидратаза представляет собой оперон, экспрессируемый в условиях низкого уровня содержания кислорода и высокой концентрации треонина. Экспрессия tdc-оперона также индуцируется при низких содержаниях глюкозы, что имеет место во второй половине ферментации. В связи с этим для обнаружения высокопроизводительных штаммов-продуцентов треонина необходимо инактивировать треониндегидратазу.
Краткое описание чертежей
Фигура 1 изображает способ конструирования рекомбинантной плазмиды pT7Blue/tdc.
Фигура 2 изображает способ конструирования рекомбинантной плазмиды pT7Δtdc::loxpKan и фрагмента ДНК Δtdc:: loxpKan; a
на фигуре 3 представлены результаты анализа саузерн-блоттинг, полученные визуальным сканированием с использованием системы формирования изображений FLA-5000 (FUJIFILM), где зоны 1 и 4 показывают размер маркеров, а зоны 2 и 4 относятся к TRN212(KCCM-10353) и хозяйскому штамму pGmTN-PPC12.
Осуществление изобретения
Описание предпочтительного варианта реализации изобретения
Ниже приведено подробное описание способа получения L-треонина согласно настоящему изобретению.
1. Конструирование рекомбинантной плазмиды
Хромосомную ДНК выделяли из штамма-продуцента треонина. Используя хромосомную ДНК в качестве матрицы, получили рекомбинантную плазмиду pT7Blue/tdc, включающую tdc В и tdc A tdc оперона. Для этой цели можно использовать любой клонирующий вектор без всякого ограничения, однако предпочтительным является клонирующий вектор рТ7Вluе.
Рекомбинантную плазмиду pT7Δtdc::loxpKan, содержащую дефектный ген tdc, получали интеграцией канамицин-устойчивого фрагмента гена, содержащего сайты lox р, в рекомбинантную плазмиду pT7Blue/tdc.
2. Интеграция рекомбинантной плазмиды и скрининг
Е.coli трансформировали рекомбинантной плазмидой pT7Δtdc::loxpKan. Плазмидную ДНК выделяли и переваривали в присутствии рестрикционного фермента, и фрагменты ДНК (Δtdc::loxpKan) выделяли из перевара электрофорезом. Этот процесс проиллюстрирован на фигуре 2.
Штамм-продуцент треонина подвергали трансформации полученным фрагментом ДНК Δtdc::loxpKan. Трансформацию осуществляли посредством гомологической рекомбинации, позволяющей проводить замену природной области гена tdc штамма Е.coli фрагментом рекомбинантной ДНК pT7Δtdc::loxpKan.
Полученный в результате трансформант инокулировали на канамицин-содержащую твердую среду с целью сбора колоний. Наконец, получали целевой рекомбинантный штамм, содержащий инактивированный ген tdc.
Ген tdc в рекомбинантном штамме остается дефицитным, несмотря на пролиферацию штамма, при отличной продуктивности L-треонина, превышающей на 20% продуктивность штамма-хозяина.
Рекомбинантная плазмида может быть выделена из трансформированного штамма с использованием известных методов, например с помощью раствора щелочи (Sambrook et al., Molecular cloning, vol.1, 1.25-1.28). Так, раствор 1 (50 мМ глюкозы, 25 мМ Трис-HCl и 10 мМ ЭДТА) добавляют для ослабления клеточной мембраны трансформанта, раствор 2 (0,2N NaOH, 1% SDS) добавляют для разрушения клеточной мембраны и денатурации клеточных компонентов - белка и хромосомы, а раствор 3 (5М ацетата калия, уксусная кислота) добавляют для коагуляции всех компонентов, за исключением рекомбинантной плазмиды. Фракцию, содержащую рекомбинантную плазмиду, отделяют центрифугированием, после чего рекомбинантную плазмиду осаждают добавлением этанола и собирают.
Далее настоящее изобретение обсуждается со ссылкой на следующие примеры. Следующие ниже примеры приведены лишь в целях иллюстрации и не ограничивают объем изобретения.
Пример 1: конструирование рекомбинантной плазмиды и нокаут гена tdc
Геномную ДНК pGmTN-PPC (КССМ-10136), штамма-продуцента треонина, выделяли с использованием системы QIAGEN Genomic-tip. Фрагмент гена размером около 3,1 т.п.о. tdc-оперона (5295 п.о.), содержащий tdc В и tdc С, амплифицировали посредством полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием геномиой ДНК в качестве матрицы. В качестве праймеров использовали 5'-agg agg gga tec ggt atg tct tct gag gcg-3' и 5'-agg agg gaa ttc ate ggc aac agg cac ag-3'. ПЦР осуществляли за 30 циклов амплификации, причем каждый цикл включал денатурацию в течение 30 секунд при 94°С, отжиг в течение 30 секунд при 56°С и достраивание в течение 3 минут 30 секунд при 72°С.
Продукты ПЦР подвергали электрофорезу в 0,7% агарозном геле с целью элюирования полос желаемого размера. Элюированные полосы в течение ночи при 16°С подвергали лигированию по тупым концам с клонирующим вектором pT7Blue (Novagen Со) с получением рекомбинантной плазмиды pT7Blue/tdc (см. фигуру 1). E.coli DH5α трансформировали полученной рекомбинантной плазмидой pT7Blue/tdc, высевали на твердую среду, содержащую 50 мг/л ампициллина и инкубировали при 37°С в течение ночи.
Колонии отбирали с помощью зубочистки из культуры, инокулировали в 3 мл жидкой среды и инкубировали в течение ночи при перемешивании со скоростью 200 об/мин. Плазмидную ДНК выделяли из культуры с использованием мини-препаративного набора QIAGEN и определяли размер плазмидной ДНК. Плазмидную ДНК переваривали рестрикционными ферментами Sma I и Pst I и подвергали электрофорезу в 0,7% агарозном геле для того, чтобы убедиться, что ее ориентация представляет собой tdc R-A-B-C. Идентифицированную плазмидную ДНК pT7Blue/tdc переваривали рестрикционными ферментами Bgl II и Нра I (каждый размером около 1,1 т.п.о.), и перевар наносили на 0,7% агарозный гель с целью элюирования полос размером 4,9 т.п.о. Для получения тупых концов проводили реакцию между элюированными полосами и фрагментом Кленова. Канамицин-устойчивый фрагмент гена размером около 1,7 т.п.о., содержащий сайт lox р, полученный путем реакции плазмиды pUG6 (Ulrich et al., A new efficient gene disruption cassette for repeated use in budding yeast, Nucleic Acids Research, 1996, 24, pp.2519-2524) с рестрикционными ферментами Hinc II и EcoR V, лигировали с изолированным фрагментом pT7Blue/tdc, используя метод лигирования по тупым концам, в результате чего получали рекомбинантную плазмиду pT7Δtdc::loxpKan.
Пример 2: скрининг штамма, интегрированного с рекомбинантной плазмидой
E.coli DH5α трансформировали рекомбинантной плазмидой pT7Δtdc::loxpKan, высевали на твердую среду, содержащую 50 мг/л ампициллина и 15 мг/л канамицина и инкубировали при 37°С в течение ночи. Колонии отбирали из культуры, инокулировали в 3 мл жидкой среды, содержащей ампициллин и канамицин, и инкубировали в течение ночи при перемешивании со скоростью 200 об/мин. Плазмидную ДНК выделяли из культуры с помощью мини-препаративного набора QIAGEN и определяли размер плазмиды. Плазмидную ДНК переваривали рестрикционным ферментом и наносили на 0,7% агарозный гель для определения ориентации. Идентифицированную плазмидную ДНК переваривали рестрикционным ферментом Pvu II и подвергали электрофорезу в 0,7% агарозном геле с целью элюирования фрагмента ДНК (Δtdc::loxpKan) размером около 3840 т.п.о. Штамм-продуцент треонина pGmTN-PPC12 трансформировали ДНК-фрагментом Δtdc::loxpKan методом электропорации и высевали на канамицин-содержащую твердую среду с целью скрининга колоний, получая рекомбинантные штаммы с инактивированным геном tdc.
Пример 3: сравнение полученных рекомбинантных штаммов по продуктивности треонина при культивировнии в колбе
Тридцать отдельных колоний рекомбинантных штаммов, культивированных на твердой среде примера 2, содержащей канамицин, подвергали скринингу в Эрленмейровских колбах на продуктивность по L-треонину с использованием сред для титрования треонина. Состав используемой в каждом случае среды для титрования треонина приведен в таблице 1.
Таблица 1.
Состав титрованной по треонину среды
Компонент Количество в литре
Глюкоза 70 г
(NH4)2SO4 28 г
KH2PO4 1,0 г
MgSO4.7H2O 0,5 г
FeSO4.7H2O 5 мг
MnSO4.8H2O 5 мг
Карбонат кальция 30 г
L-метионин 0,15 г
Дрожжевой экстракт 2 г
рН7,0
Отдельные колонии культивировали в инкубаторе на твердой среде LB при 32°С в течение ночи. 25 мл среды для титрования инокулировали петлей каждой культуры и проводили инкубацию в течение 48 часов при 32°С и скорости перемешивания 250 об/мин. Результаты анализа представлены в таблице 2. Было установлено, что 28 из тридцати колоний новых рекомбинантных штаммов демонстрируют отличную продуктивность, включая восемь колоний, продуцирующих 26 г/л или более треонина, в сравнении со штаммом-хозяином, pGmTN-PPC12, продуцирующим 23 г/л треонина. Был зарегистрирован рекомбинантный штамм, обозначенный как "TRN212", обеспечивающий наивысшую продуктивность по L-треонину, 27 г/л, и выход на 17,4% больший, чем штамм-хозяин. Мутантный штамм TRN212 был депонирован 19 февраля 2002 г. в Korean Collection for Type Cultures (КСТС), и ему был присвоен каталожный номер КСТС-10353.
Таблица 2.
Результаты титрования рекомбинантных штаммов в колбе
Концентрация L-треонина 20-23 г/л 23-24,5 г/л 24,5-26 г/л 26 г/л или более
Число колоний 2 9 11 8
Пример 4: Подтверждение нокаута гена tdc с использованием Саузерн-блоттинг-анализа
Саузерн-блоттинг проводили с целью подтверждения специфического нокаута гена tdc в рекомбинантном штамме, полученном в примере 3. Штамм-хозяин pGmTN-PPC12 и рекомбинантный штамм TRN212 (КССМ-10353) инкубировали в течение ночи при перемешивании со скоростью 200 об/мин в 30 мл жидкой среды, и геномную ДНК выделяли с использованием набора QIAGEN Genomic kit 20. Выделенную геномную ДНК переваривали рестрикционным ферментом EcoRI и подвергали электрофорезу в 0,7% агарозном геле с целью разделения фрагментов ДНК по размеру. Разделенные по размеру фрагменты ДНК закрепляли на нейлоновой мембране (YOUNG Sci. Biodyne В membrane) путем капиллярного переноса в течение ночи (Molecular cloning. Vol.1, 6.31-6.38) подвергнутого электрофорезу геля с последующим высушиванием и УФ-облучением (120 мДж/см2, SpectroLinker™) с целью иммобилизации фрагментов ДНК на нейлоновой мембране (Molecular Cloning, Vol.1, 6.45). Фрагменты ДНК, прикрепленные к нейлоновой мембране, подвергали 2-х часовой предгибридизации в предгибризационном буфере I (Roche# 1093657) при 55°С, после чего гибридизовали в гибридизационной печи (BAMBINO 230300) при добавлении ранее полученного денатурированного ДНК-зонда.
Используемый денатурированный зонд получали следующим образом. Плазмиду pUG6, выделенную с использованием набора QIAGEN, переваривали рестрикционными ферментами Hind II и EcoR V с получением канамицин-устойчивого фрагмента гена размером около 1,7 т.п.о., содержащим сайт lox р. Такой фрагмент гена нагревали в кипящей воде при 100°С в течение 5 минут и охлаждали льдом в течение 5 минут с целью генерации одноцепочных ДНК. Проводили реакцию с одноцепочными ДНК при 37°С в течение ночи с использованием набора DIG Labelling and Detection kit (Roche #1093657) с целью получения ДНК-зондов с интегрированным DIG-UDP.
После гибридизации фрагменты ДНК, неспецифически связанные с мембраной, удаляли с использованием промывочных растворов I и II (Roche #1093657). После этого в целях маскировки мембраны обрабатывали в течение 30 минут при комнатной температуре предгибридизационным буфером (Roche #1093657) 2 и в течение 30 минут при комнатной температуре проводили реакцию с анти DIG-антителом, специфически связывающимся с DIG-UTP. Анти-DIG антитело, неспецифически связанное с мембраной, удаляли с использованием промывочного раствора III (Roche #1093657), и мембрану подвергали окрашиванию с помощью набора Labelling and Detection kit (Roche #1093657) до проявления окрашенных полос. Полученные результаты представлены на фигуре 3. В отсутствие канамицинового гена полосы не обнаруживались для штамма-хозяина pGmTN-РРС12 (зона 1). В отличие от этого, как и ожидалось, на дорожке 2 для нового рекомбинантного штамма настоящего изобретения, TRN212 (КССМ-10353), наблюдалась полоса размером около 7 т.п.о. Фрагмент гена tdc размером около 5,3 т.п.о., получающийся при переваривании рестрикционным ферментом EcoR V, и ген устойчивости к канамицину размером около 1,7 т.п.о. составляют около 7,0 т.п.о. Дорожки 1 и 4 представляют маркеры размера.
Пример 5: сравнение продуктивности по L-треонину с использованием ферментеров
Проводили сравнение продуктивности по L-треонину в ферментере емкостью 5 л при использовании штамма-хозяина pGmTN-PPC12 и рекомбинантного штамма TRN212 (КССМ-10353), содержащего инактивированный ген tdc, который был подвергнут скринингу в примере 2 и тесту на подтверждение нокаута гена в примере 4. Состав исходной среды приведен в таблице 3. LB среда, дополненная 10 г/л глюкозы и 0,1 г/л L-метионина, использовалась в качестве посевной среды, а исходный объем инокулята в ферментер задавали как 3-5% об. целевой исходной культуры. Каждый раз глюкозу добавляли до конечной концентрации 5 мас.%, проводили добавление всего 6 раз, при этом добавляли 1 мас.% КН2PO4. Каждое добавление глюкозы определялось исчерпанием глюкозы. Начальный объем культуры составлял 1,5 л, конечный объем - 3,0 л. Общая концентрация глюкозы, добавленной в ходе ферментации, составляла 250 г/л. В ходе ферментации среду перемешивали со скоростью 700-1000 об/мин, температуру контролировали на значении 32 С, рН устанавливали равным 7,0 с помощью 25-28% водного раствора аммиака. Скорость потока воздуха составляла 0,5 объема на объем в минуту (vvm). Полученные результаты представлены в таблице 4. Как следует из таблицы 4, штамм-хозяин TRN212 продуцирует 93,5 г/л L-треонина с выходом 37,4% в расчете на израсходованную глюкозу. В отличие от этого, рекомбинантный штамм TRN212 продуцирует 112 г/л L-треонина с выходом 45,3%, что на 21% выше, чем выход в случае штамма-хозяина TRN212. Кроме того, сходный профиль ферментации наблюдался в присутствии штамма-хозяина и рекомбинантного штамма без снижения потребления сахара в ходе ферментации, что часто происходит с рекомбинантными штаммами за счет ингибирования роста.
Таблица 3.
Состав исходной среды в 5-литровом ферментере
Компонент Количество в литре
Глюкоза 50 г
КН2PO4 4 г
(NH4)2SO4 6 г
Дрожжевой экстракт 3 г
MgSO4·7H2O 2 г
L-метионин 1 г
FeSO4·7H2O 40 мг
MnSO4·8H2O 10 мг
CaCI2·2H2O 40 мг
CoCI2·6Н2О 4 мг
Н3ВО3 5 мг
Na2MoO4·2H2O 2 мг
ZnSO4·7H2O 2 мг
pH7,0
Таблица 4.
Результаты ферментативного образования треонина рекомбинантными штаммами
Штамм Треонин (г/л) Время ферментации (час) Выход (%)
PGmTN-PPC12 93,5 78 37,4
TRN212 112 77 45,2
При использовании нового рекомбинантного штамма настоящего изобретения при получении L-треонина как количество, так и выход увеличиваются более чем на 20% по сравнению со штаммом-хозяином, при этом в ходе ферментации не снижается потребление сахара, что часто наблюдается при использовании рекомбинантных штаммов за счет ингибирования роста.

Claims (3)

1. Рекомбинантная плазмида pT7Δtdc::loxpKan, содержащая инактивированный ген tdc (треониндегидратаза).
2. Штамм-продуцент L-треонина E.coli TRN212 (КССМ-10353), полученный трансформацией штамма E.coli pGmTN-PPC12 (KCMM-10236) фрагментом ДНК Δtdc::loxpKan.
3. Способ получения L-треонина, включающий культивирование штамма E.coli TRN212 (каталожный номер КССМ-10353) в культуральной среде и извлечение из нее наработанного и накопленного L-треонина.
RU2004127987/13A 2002-03-21 2002-05-16 Способ получения l-треонина RU2288265C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR10-2002-0015380A KR100451299B1 (ko) 2002-03-21 2002-03-21 L―쓰레오닌의 제조방법
KR2002-15380 2002-03-21

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2004127987A RU2004127987A (ru) 2005-06-10
RU2288265C2 true RU2288265C2 (ru) 2006-11-27

Family

ID=27786040

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2004127987/13A RU2288265C2 (ru) 2002-03-21 2002-05-16 Способ получения l-треонина

Country Status (9)

Country Link
EP (1) EP1347057B1 (ru)
JP (1) JP4034737B2 (ru)
KR (1) KR100451299B1 (ru)
CN (1) CN1194088C (ru)
AT (1) ATE405667T1 (ru)
AU (1) AU2002256930A1 (ru)
DE (1) DE60228402D1 (ru)
RU (1) RU2288265C2 (ru)
WO (1) WO2003080843A1 (ru)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR100505797B1 (ko) * 2002-10-11 2005-08-04 씨제이 주식회사 염색체 상의 fadR 유전자가 불활성화된 L-쓰레오닌 생성 변이 미생물과 이를 이용한 L-쓰레오닌의 제조방법
KR100498971B1 (ko) * 2003-04-04 2005-07-04 씨제이 주식회사 염색체 내 tdcBC 및 pckA 유전자가 불활성화된 미생물 및 이를 이용하여 L-쓰레오닌을 제조하는 방법
JP4380305B2 (ja) * 2003-11-21 2009-12-09 味の素株式会社 発酵法によるl−アミノ酸の製造法
KR100576342B1 (ko) * 2004-02-05 2006-05-03 씨제이 주식회사 galR 유전자가 불활성화된 L-쓰레오닌 생성 미생물,그를 제조하는 방법 및 상기 미생물을 이용한L-쓰레오닌의 제조방법
KR100608085B1 (ko) * 2004-02-05 2006-08-02 씨제이 주식회사 tyrR 유전자가 불활성화된 L-쓰레오닌 생성 미생물,그를 제조하는 방법 및 상기 미생물을 이용한L-쓰레오닌의 제조방법
KR100596372B1 (ko) * 2004-12-06 2006-07-04 씨제이 주식회사 염색체 상의 lysR유전자가 불활성화된 L-쓰레오닌생성 미생물, 그를 제조하는 방법 및 상기 미생물을이용한 L-쓰레오닌의 제조방법
KR100837842B1 (ko) 2006-08-10 2008-06-13 씨제이제일제당 (주) 아스파테이트 세미알데히드 디하이드로게나아제 활성이증가된 l-쓰레오닌 생산 미생물 및 이를 이용한l-쓰레오닌 생산 방법
KR101804017B1 (ko) * 2015-10-23 2017-12-04 씨제이제일제당 (주) L-쓰레오닌을 생산하는 재조합 미생물 및 이를 이용하여 l-쓰레오닌을 생산하는 방법
CN109554322B (zh) * 2018-12-03 2020-08-04 江南大学 一种高产l-苏氨酸的重组大肠杆菌及其构建方法
CN109735478B (zh) * 2019-01-28 2021-03-30 江南大学 一株高产l-苏氨酸基因工程菌的构建方法及其应用
CN116555131A (zh) * 2022-01-27 2023-08-08 廊坊梅花生物技术开发有限公司 一种重组微生物及其构建方法和应用
CN116606785A (zh) * 2022-02-08 2023-08-18 廊坊梅花生物技术开发有限公司 一种修饰的棒状杆菌属微生物及其应用与构建方法

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3891417T1 (de) * 1988-10-25 1991-01-10 Vnii Genetiki Selektsii Promy Stamm der bakterien escherichia coli bkiim b-3996, produziert von l-threonin
DE4400926C1 (de) * 1994-01-14 1995-06-01 Forschungszentrum Juelich Gmbh Herstellung von L-Isoleucin mittels rekombinanter Mikroorganismen mit deregulierter Threonindehydratase
US5939307A (en) * 1996-07-30 1999-08-17 The Archer-Daniels-Midland Company Strains of Escherichia coli, methods of preparing the same and use thereof in fermentation processes for l-threonine production
DE19907567B4 (de) * 1999-02-22 2007-08-09 Forschungszentrum Jülich GmbH Verfahren zur mikrobiellen Herstellung von L-Valin

Also Published As

Publication number Publication date
CN1446914A (zh) 2003-10-08
WO2003080843A1 (en) 2003-10-02
AU2002256930A1 (en) 2003-10-08
RU2004127987A (ru) 2005-06-10
JP2005520548A (ja) 2005-07-14
JP4034737B2 (ja) 2008-01-16
DE60228402D1 (de) 2008-10-02
ATE405667T1 (de) 2008-09-15
CN1194088C (zh) 2005-03-23
EP1347057B1 (en) 2008-08-20
EP1347057A1 (en) 2003-09-24
KR100451299B1 (ko) 2004-10-06
KR20030075902A (ko) 2003-09-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP0358940B1 (en) DNA fragment coding for phosphoenolpyruvat corboxylase, recombinant DNA carrying said fragment, strains carrying the recombinant DNA and method for producing L-aminino acids using said strains
JP2817400B2 (ja) 物質の製造法
RU2207376C2 (ru) Способ получения l-аминокислоты методом ферментации, штамм бактерии escherichia coli - продуцент l-аминокислоты (варианты)
EP1561811B1 (en) Method of producing L-threonine using a microorganism having inactivated galR gene.
KR100823044B1 (ko) 트레오닌 및 이소류신의 제조방법
US20090093030A1 (en) fadR KNOCK-OUT MICROORGANISM AND METHODS FOR PRODUCING L-THREONINE
RU2288265C2 (ru) Способ получения l-треонина
US7074602B2 (en) Method for producing L-threonine
US20020028490A1 (en) Process for the production of L-amino acids by fermentation using coryneform bacteria
RU2339699C2 (ru) РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДА pT7ΔpckA::loxpcat ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ L-ТРЕОНИНА В КЛЕТКАХ Escherichia coli, И РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ Escherichia coli FTR2717 (KCCM-10475) - ПРОДУЦЕНТ L-ТРЕОНИНА
US7378267B1 (en) Method for L-threonine production
KR100608084B1 (ko) iclR 유전자가 불활성화된 L-쓰레오닌을 생산하는 미생물, 그를 제조하는 방법 및 그를 이용한 L-쓰레오닌의 제조방법
US7368266B2 (en) Method for L-threonine production

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20090517