RU2020107037A - Способ распознавания бактерий - Google Patents
Способ распознавания бактерий Download PDFInfo
- Publication number
- RU2020107037A RU2020107037A RU2020107037A RU2020107037A RU2020107037A RU 2020107037 A RU2020107037 A RU 2020107037A RU 2020107037 A RU2020107037 A RU 2020107037A RU 2020107037 A RU2020107037 A RU 2020107037A RU 2020107037 A RU2020107037 A RU 2020107037A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- bacteria
- measurement results
- biological sample
- phase
- exponential growth
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
- G01N21/47—Scattering, i.e. diffuse reflection
- G01N21/49—Scattering, i.e. diffuse reflection within a body or fluid
- G01N21/51—Scattering, i.e. diffuse reflection within a body or fluid inside a container, e.g. in an ampoule
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/483—Physical analysis of biological material
- G01N33/487—Physical analysis of biological material of liquid biological material
- G01N33/4875—Details of handling test elements, e.g. dispensing or storage, not specific to a particular test method
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
- G01N33/56911—Bacteria
- G01N33/5695—Mycobacteria
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2201/00—Features of devices classified in G01N21/00
- G01N2201/02—Mechanical
- G01N2201/023—Controlling conditions in casing
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2201/00—Features of devices classified in G01N21/00
- G01N2201/12—Circuits of general importance; Signal processing
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2201/00—Features of devices classified in G01N21/00
- G01N2201/12—Circuits of general importance; Signal processing
- G01N2201/129—Using chemometrical methods
- G01N2201/1296—Using chemometrical methods using neural networks
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Virology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Claims (14)
1. Способ распознавания бактерий в биологическом образце с целью определения, содержит ли данный биологический образец туберкулезные микобактерии или нетуберкулезные микобактерии, характеризующийся тем, что выполняют следующие стадии:
для получения ряда наборов результатов измерений как функции времени образец подвергают ряду нефелометрических измерений,
полученный набор результатов измерений обрабатывают для определения по меньшей мере момента начала фазы экспоненциального роста бактерий, максимальной величины роста бактерий из набора результатов измерений и развития во времени по меньшей мере одного статистического параметра,
из развития во времени упомянутого статистического параметра вычисляют одну или большее количество характеристических величин,
для определения, содержит ли образец туберкулезные микобактерии или нетуберкулезные микобактерии, с помощью одного или большего числа алгоритмов, использующих нейронную сеть, анализируют по меньшей мере момент начала фазы экспоненциального роста бактерий, максимальную величину роста бактерий из набора результатов измерений и вычисленные характеристические величины.
2. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что упомянутый статистический параметр выбирают из группы, содержащей следующие параметры: среднее значение, медиана, стандартное отклонение, дисперсия, или же другие статистические параметры, выводимые из функции автокорреляции упомянутых результатов нефелометрических измерений, которые формируют каждый из упомянутых наборов результатов измерений.
3. Способ по любому из пп. 1 или 2, характеризующийся тем, что определяют момент начала фазы экспоненциального роста бактерий, когда полученное при нефелометрических измерениях среднее значение из группы, состоящей из последнего набора результатов измерений и из числа наборов результатов измерений, полученных перед последним набором результатов измерений, равного от 1 до 12, предпочтительно - равного 9, больше, чем заданное пороговое значение.
4. Способ по любому из пп. 1-3, характеризующийся тем, что упомянутые характеристические величины определяют по величинам среднепрогрессивного значения в развитии во времени стандартного отклонения, рассчитанного от момента начала фазы экспоненциального роста бактерий.
5. Способ по любому из пп. 1-4, характеризующийся тем, что в случае, если фаза экспоненциального роста бактерий начинается прежде предельного срока, составляющего от 2 до 4 суток, то это считают сигналом того, что, биологический образец содержит бактерии-загрязнители.
6. Способ по любому из пп. 1-5, характеризующийся тем, что биологический образец подвергают ряду нефелометрических измерений с частотой замеров от 0,5 кГц до 10 кГц в течение времени от 0,5 с до 5 с.
7. Способ по любому из пп. 1-6, характеризующийся тем, что совокупность наборов результатов измерений получают в заданные интервалы времени для заданных периодов времени длительностью по меньшей мере 11 суток после момента начала фазы экспоненциального роста бактерий.
8. Способ по любому из пп. 1-7, характеризующийся тем, что выполняют по меньшей мере стадию проверки, на которой определяют, обладают ли содержащиеся в биологическом образце микобактерии резистентностью к одному или большему числу антибиотиков, определяют, обладают ли микобактерии множественной лекарственной резистентностью, или определяют единичную или перекрестную резистентность по мере роста бактерий.
9. Способ по любому из пп. 1-8, характеризующийся тем, что биологический образец не вступает в контакт с окружающей средой в течение выполнения всей стадии культивирования и процедуры распознавания бактерий.
10. Способ по любому из пп. 1-9, характеризующийся тем, что упомянутый ряд нефелометрических измерений выполняют с помощью автоматического сканирующего нефелометра, а обработку данных, расчеты и анализ выполняют с помощью устройства обработки данных, обеспечивающего возможность определять упомянутые статистические параметры, рассчитывать упомянутые характеристические величины из по меньшей мере одного набора результатов измерений и определять, содержит ли биологический образец туберкулезные микобактерии или нетуберкулезные микобактерии.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| IT102017000081630A IT201700081630A1 (it) | 2017-07-18 | 2017-07-18 | Metodo di rilevazione batterica |
| IT102017000081630 | 2017-07-18 | ||
| PCT/IT2018/050133 WO2019016842A1 (en) | 2017-07-18 | 2018-07-18 | METHOD FOR DETECTING BACTERIA |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2020107037A true RU2020107037A (ru) | 2021-08-18 |
| RU2020107037A3 RU2020107037A3 (ru) | 2021-10-14 |
Family
ID=60628043
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2020107037A RU2020107037A (ru) | 2017-07-18 | 2018-07-18 | Способ распознавания бактерий |
Country Status (8)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20200208191A1 (ru) |
| EP (1) | EP3655762B1 (ru) |
| CN (1) | CN111051861A (ru) |
| BR (1) | BR112020001105A2 (ru) |
| IT (1) | IT201700081630A1 (ru) |
| RU (1) | RU2020107037A (ru) |
| WO (1) | WO2019016842A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA202000995B (ru) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP3906526A4 (en) * | 2019-03-13 | 2022-03-02 | Tomocube, Inc. | IDENTIFICATION OF MICROORGANISMS USING THREE-DIMENSIONAL QUANTITATIVE PHASE IMAGING |
Family Cites Families (14)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6432665B1 (en) * | 2000-02-03 | 2002-08-13 | Becton, Dickinson And Company | Method of detecting microorganisms utilizing transparent sample container |
| US7339671B2 (en) * | 2004-01-20 | 2008-03-04 | Hong Peng | Apparatus and method for monitoring biological cell culture |
| ITUD20040170A1 (it) * | 2004-08-25 | 2004-11-25 | Alifax Technology Srl | Dispositivo integrato per analisi diagnostiche, e relativo procedimento |
| CN102272602B (zh) * | 2008-10-31 | 2014-03-12 | 生物梅里埃公司 | 微生物的分离和鉴定方法 |
| IT1392994B1 (it) * | 2009-02-25 | 2012-04-02 | Alifax Holding S P A | Procedimento per l'indagine batteriologica su un campione biologico e relativo dispositivo |
| IT1393218B1 (it) * | 2009-02-25 | 2012-04-11 | Alifax Holding S P A | Apparecchiatura per analizzare un campione biologico |
| US8058022B2 (en) * | 2009-07-27 | 2011-11-15 | Indian Institute Of Science | Diagnosis and monitoring of mycobacterium tuberculosis infection |
| US8709712B2 (en) * | 2010-05-06 | 2014-04-29 | University Of Witwatersrand, Johannesburg | Method for identifying bacteria in a sample |
| EP2710138A4 (en) * | 2011-05-13 | 2015-01-07 | Univ Virginia Patent Found | COMPOSITIONS AND METHODS FOR A MYCOBACTERIUM / TUBERCULOSIS DRUG APPLICATION TEST |
| JP6204374B2 (ja) * | 2011-12-19 | 2017-09-27 | オプティカル・ダイアグノスティクス・リミテッド | 培養下での微生物を識別するための分光学的な手段および方法 |
| WO2014059357A1 (en) * | 2012-10-11 | 2014-04-17 | Institute For Systems Biology | Automated quantification of microorganism growth parameters through temporally resolved microscopic imaging |
| US9677109B2 (en) * | 2013-03-15 | 2017-06-13 | Accelerate Diagnostics, Inc. | Rapid determination of microbial growth and antimicrobial susceptibility |
| WO2014210327A1 (en) * | 2013-06-27 | 2014-12-31 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Methods and systems for determining m. tuberculosis infection |
| US20160007840A1 (en) * | 2014-07-10 | 2016-01-14 | The Board Of Trustees Of The University Of Illinois | Handheld Device for Identification of Microbiological Constituents in the Middle Ear |
-
2017
- 2017-07-18 IT IT102017000081630A patent/IT201700081630A1/it unknown
-
2018
- 2018-07-18 RU RU2020107037A patent/RU2020107037A/ru not_active Application Discontinuation
- 2018-07-18 EP EP18749577.5A patent/EP3655762B1/en active Active
- 2018-07-18 CN CN201880058715.9A patent/CN111051861A/zh active Pending
- 2018-07-18 BR BR112020001105-3A patent/BR112020001105A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2018-07-18 WO PCT/IT2018/050133 patent/WO2019016842A1/en unknown
- 2018-07-18 US US16/632,872 patent/US20200208191A1/en not_active Abandoned
-
2020
- 2020-02-17 ZA ZA2020/00995A patent/ZA202000995B/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| ZA202000995B (en) | 2022-07-27 |
| BR112020001105A2 (pt) | 2020-07-21 |
| EP3655762B1 (en) | 2021-04-07 |
| EP3655762A1 (en) | 2020-05-27 |
| IT201700081630A1 (it) | 2019-01-18 |
| WO2019016842A1 (en) | 2019-01-24 |
| RU2020107037A3 (ru) | 2021-10-14 |
| US20200208191A1 (en) | 2020-07-02 |
| CN111051861A (zh) | 2020-04-21 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN109840549B (zh) | 一种病虫害识别方法和装置 | |
| Fontana et al. | An innovative approach to predict the growth in intensive poultry farming | |
| CN107229999B (zh) | 作物产量的预测方法、***、计算机设备及可读存储介质 | |
| RU2020116147A (ru) | Устройство для возделывания растений | |
| JP2015146183A5 (ru) | ||
| CN104523265B (zh) | 异常心电数据的判断方法和装置 | |
| Knight et al. | Classification threshold and training data affect the quality and utility of focal species data processed with automated audio-recognition software | |
| ATE546906T1 (de) | Verfahren und vorrichtung zur automatisierten identifikation von signalkenngrössen | |
| CN107463904A (zh) | 一种确定事件周期值的方法及装置 | |
| RU2014127514A (ru) | Способ и устройство для обнаружения движения лифта | |
| JP2015528910A5 (ru) | ||
| RU2020107037A (ru) | Способ распознавания бактерий | |
| JP2017111145A5 (ru) | ||
| US11398032B2 (en) | Image analysis system, culture management system, image analysis method, culture management method, cell group structure method, and program | |
| Bitterlin et al. | Ecological and life history correlates of changes in avian migration timing in response to climate change | |
| WO2017063516A1 (zh) | 噪音信号确定方法、语音去噪方法及装置 | |
| JP5509153B2 (ja) | 歩容解析方法、歩容解析装置及びそのプログラム | |
| Brabant et al. | Comparing the results of four widely used automated bat identification software programs to identify nine bat species in coastal Western Europe | |
| CN113791650A (zh) | 一种臭氧浓度的调节方法及*** | |
| CN111128150A (zh) | 一种唤醒智能语音设备的方法及装置 | |
| EP2505217A3 (en) | Automated biological sample collection system and method | |
| Palahin et al. | Modeling of joint signal detection and parameter estimation on the background of non-Gaussian noise | |
| FR3080188B1 (fr) | Dispositif, procede et produit programme d'ordinateur de validation de donnees fournies par une sonde pluviometrique | |
| EP3739338A3 (en) | Methods for predicting immunotherapy response of subject having cancer | |
| CN113657315B (zh) | 人脸图像的质量筛选方法、装置、设备及存储介质 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20220215 |