RU2010135816A - Двухэтапное обогащение бесклеточной эмбриональной днк в материнской плазме - Google Patents
Двухэтапное обогащение бесклеточной эмбриональной днк в материнской плазме Download PDFInfo
- Publication number
- RU2010135816A RU2010135816A RU2010135816/10A RU2010135816A RU2010135816A RU 2010135816 A RU2010135816 A RU 2010135816A RU 2010135816/10 A RU2010135816/10 A RU 2010135816/10A RU 2010135816 A RU2010135816 A RU 2010135816A RU 2010135816 A RU2010135816 A RU 2010135816A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- biological sample
- dnase
- embryonic
- percentage
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract 51
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract 32
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract 32
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract 32
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims abstract 27
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 claims abstract 22
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 claims abstract 22
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract 11
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims abstract 11
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims abstract 10
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract 8
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims abstract 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims abstract 4
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims abstract 4
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 claims abstract 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 7
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 7
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 claims 4
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims 4
- 230000001338 necrotic effect Effects 0.000 claims 4
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims 3
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 claims 3
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 claims 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims 3
- 238000013412 genome amplification Methods 0.000 claims 2
- 210000005170 neoplastic cell Anatomy 0.000 claims 2
- 230000001613 neoplastic effect Effects 0.000 claims 2
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 claims 2
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Immunology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Способ обогащения эмбриональной нуклеиновой кислоты, включающий этапы, на которых ! - обрабатывают биологический образец материнского организма-«хозяина», включающего бесклеточную эмбриональную нуклеиновую кислоту композицией, включающей средство с активностью ДНКазы, ! - где первое процентное соотношение эмбриональной нуклеиновой кислоты в биологическом образце до обработки ниже второго процентного соотношения эмбриональной нуклеиновой кислоты в биологическом образце после обработки. ! 2. Способ по п.1, где биологический образец представляет собой образец крови материнского организма-«хозяина». ! 3. Способ по п.1, где биологический образец представляет собой образец плазмы или сыворотки материнского организма-«хозяина». ! 4. Способ по п.1, где средство с активностью ДНКазы представляет собой ДНКазу. ! 5. Способ по п.1, где средство с активностью ДНКазы представляет собой ДНКазу, и количество ДНКазы составляет от приблизительно 10 до 200 ед/мкл. ! 6. Способ по п.1, где второе процентное соотношение составляет от приблизительно 10% до 50%. ! 7. Способ по п.1, где второе процентное соотношение составляет, по меньшей мере, 10%, 20%, 30%, 40% или 50%. ! 8. Способ по п.1, где первое процентное соотношение материнской нуклеиновой кислоты в биологическом образце до обработки выше, чем второе процентное соотношение материнской нуклеиновой кислоты в биологическом образце после обработки. ! 9. Способ по п.1, дополнительно включающий этап, на котором амплифицируют эмбриональную нуклеиновую кислоту в биологическом образце после обработки. ! 10. Способ по п.1, дополнительно включающий этап, на котором амплифицируют эмбриональную нуклеиновую
Claims (30)
1. Способ обогащения эмбриональной нуклеиновой кислоты, включающий этапы, на которых
- обрабатывают биологический образец материнского организма-«хозяина», включающего бесклеточную эмбриональную нуклеиновую кислоту композицией, включающей средство с активностью ДНКазы,
- где первое процентное соотношение эмбриональной нуклеиновой кислоты в биологическом образце до обработки ниже второго процентного соотношения эмбриональной нуклеиновой кислоты в биологическом образце после обработки.
2. Способ по п.1, где биологический образец представляет собой образец крови материнского организма-«хозяина».
3. Способ по п.1, где биологический образец представляет собой образец плазмы или сыворотки материнского организма-«хозяина».
4. Способ по п.1, где средство с активностью ДНКазы представляет собой ДНКазу.
5. Способ по п.1, где средство с активностью ДНКазы представляет собой ДНКазу, и количество ДНКазы составляет от приблизительно 10 до 200 ед/мкл.
6. Способ по п.1, где второе процентное соотношение составляет от приблизительно 10% до 50%.
7. Способ по п.1, где второе процентное соотношение составляет, по меньшей мере, 10%, 20%, 30%, 40% или 50%.
8. Способ по п.1, где первое процентное соотношение материнской нуклеиновой кислоты в биологическом образце до обработки выше, чем второе процентное соотношение материнской нуклеиновой кислоты в биологическом образце после обработки.
9. Способ по п.1, дополнительно включающий этап, на котором амплифицируют эмбриональную нуклеиновую кислоту в биологическом образце после обработки.
10. Способ по п.1, дополнительно включающий этап, на котором амплифицируют эмбриональную нуклеиновую кислоту в биологическом образце после обработки способом амплификации целого генома (WGA).
11. Способ по п.10, где способ WGA проводят без фрагментации инкубации.
12. Смесь, полученная способом по п.1.
13. Смесь, полученная способом по п.1, где смесь включает, по меньшей мере, 10%, 20%, 30%, 40% или 50% эмбриональной нуклеиновой кислоты.
14. Способ определения присутствия или отсутствия маркера в эмбриональной нуклеиновой кислоте, включающий этапы, на которых
- обрабатывают биологический образец материнского организма-«хозяина», включающего бесклеточную эмбриональную нуклеиновую кислоту, композицией, включающей средство с активностью ДНКазы,
- амплифицируют эмбриональную нуклеиновую кислоту в биологическом образце после обработки и
- определяют присутствие или отсутствие маркера в эмбриональной нуклеиновой кислоте в течение или после амплификации.
15. Способ по п.14, где биологический образец представляет собой образец плазмы или сыворотки.
16. Способ по п.14, где средством является ДНКаза.
17. Способ по п.14, где амплификацию проводят при помощи способа амплификации целого генома (WGA).
18. Способ по п.17, где способ WGA проводят без фрагментации инкубации.
19. Способ по п.14, где процентное соотношение эмбриональной нуклеиновой кислоты после амплификации составляет, по меньшей мере, 10%, 20%, 30%, 40% или 50%.
20. Способ обогащения бесклеточной нуклеиновой кислоты из апоптических или некротических клеток, включающий этапы, на которых
- обрабатывают биологический образец, включающий бесклеточную нуклеиновую кислоту из апоптических или некротических клеток, композицией, включающей средство с активностью ДНКазы,
- где первое процентное соотношение бесклеточной нуклеиновой кислоты из апоптических или некротических клеток до обработки ниже второго процентного соотношения бесклеточной нуклеиновой кислоты из апоптических или некротических клеток в биологическом образце после обработки.
21. Способ по п.20, где биологический образец представляет собой образец крови, образец плазмы или образец сыворотки.
22. Способ по п.20, где средство с активностью ДНКазы представляет собой ДНКазу.
23. Способ по п.20, где средство с активностью ДНКазы представляет собой ДНКазу, и количество ДНКазы составляет от приблизительно 10 до 200 ед/мкл.
24. Способ по п.20, где бесклеточная нуклеиновая кислота взята из опухолевых клеток или неопластических клеток.
25. Способ по п.20, дополнительно включающий этап, на котором амплифицируют бесклеточную нуклеиновую кислоту в биологическом образце после обработки при помощи способа амплификации целого генома (WGA).
26. Способ определения присутствия или отсутствия маркера в опухолевой или неопластической нуклеиновой кислоте, включающий этапы, на которых обрабатывают биологический образец, включающий бесклеточную нуклеиновую кислоту из опухолевых или неопластических клеток, композицией, включающей средство с активностью ДНКазы,
- амплифицируют бесклеточную нуклеиновую кислоту в биологическом образце после обработки и
- определяют присутствие или отсутствие маркера в опухолевой или неопластической нуклеиновой кислоте в течение или после амплификации.
27. Способ по п.26, где биологический образец представляет собой образец крови, образец плазмы или образец сыворотки.
28. Способ по п.26, где средством является ДНКаза.
29. Способ по п.26, где амплификацию проводят при помощи способа амплификации целого генома (WGA).
30. Способ по п.26, где способ WGA проводят без фрагментации инкубации.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US2487208P | 2008-01-30 | 2008-01-30 | |
| US61/024,872 | 2008-01-30 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2010135816A true RU2010135816A (ru) | 2012-03-10 |
Family
ID=40913506
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2010135816/10A RU2010135816A (ru) | 2008-01-30 | 2009-01-30 | Двухэтапное обогащение бесклеточной эмбриональной днк в материнской плазме |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20110183338A1 (ru) |
| EP (1) | EP2245195B1 (ru) |
| JP (1) | JP2011510660A (ru) |
| CN (1) | CN102016069A (ru) |
| BR (1) | BRPI0906641A2 (ru) |
| CA (1) | CA2713545A1 (ru) |
| ES (1) | ES2389038T3 (ru) |
| MX (1) | MX2010008374A (ru) |
| RU (1) | RU2010135816A (ru) |
| WO (1) | WO2009097511A2 (ru) |
Families Citing this family (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ES2564656T3 (es) * | 2009-10-26 | 2016-03-28 | Lifecodexx Ag | Medios y métodos para el diagnóstico no invasivo de la aneuploidía cromosómica |
| US9926593B2 (en) * | 2009-12-22 | 2018-03-27 | Sequenom, Inc. | Processes and kits for identifying aneuploidy |
| US10131947B2 (en) * | 2011-01-25 | 2018-11-20 | Ariosa Diagnostics, Inc. | Noninvasive detection of fetal aneuploidy in egg donor pregnancies |
| GB2488358A (en) * | 2011-02-25 | 2012-08-29 | Univ Plymouth | Enrichment of foetal DNA in maternal plasma |
| TR201908019T4 (tr) | 2012-10-19 | 2019-06-21 | Univ Wayne State | Doğum öncesi teşhis için servikal mukusta fetal trofoblast hücrelerinin tanımlanması ve analizi. |
| US9644232B2 (en) | 2013-07-26 | 2017-05-09 | General Electric Company | Method and device for collection and amplification of circulating nucleic acids |
| GB2524948A (en) * | 2014-03-07 | 2015-10-14 | Oxford Gene Technology Operations Ltd | Detecting Increase or Decrease in the Amount of a Nucleic Acid having a Sequence of Interest |
| DK3204536T3 (da) | 2014-10-10 | 2020-03-30 | Univ Wayne State | Fremgangsmåde til analyse af RNA fra føtale ekstravilløse trophoblastceller |
| CN108473932B (zh) | 2015-09-09 | 2022-07-15 | 集联健康有限公司 | 用于样品收集、稳定化和保存的***、方法和装置 |
| EP3440209A4 (en) * | 2016-04-06 | 2019-11-27 | Wayne State University | ISOLATION AND ANALYSIS OF FETAL DNA FROM EXTRAVILLE THROPHOBLAST CELLS RECOVERED FROM THE ENDOZERVICAL CHANNEL |
Family Cites Families (6)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ES2191759T3 (es) * | 1995-07-13 | 2003-09-16 | Koninkl Philips Electronics Nv | Metodo y sistema para la repeticion de datos entre agrupamientos logicamente sucesivos. |
| GB0016742D0 (en) * | 2000-07-10 | 2000-08-30 | Simeg Limited | Diagnostic method |
| CN1930303B (zh) * | 2003-10-08 | 2013-11-20 | 波士顿大学信托人 | 染色体异常的产前诊断试剂盒 |
| JP5629051B2 (ja) * | 2005-03-18 | 2014-11-19 | ザ チャイニーズ ユニバーシティー オブ ホンコンＴｈｅ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｏｆ Ｈｏｎｇｋｏｎｇ | 出生前診断およびモニタリングのためのマーカー |
| CN101016562A (zh) * | 2006-02-08 | 2007-08-15 | 陈熹 | 一种富集孕妇血浆中胎儿游离dna的方法 |
| CN1978668A (zh) * | 2006-12-18 | 2007-06-13 | 中国人民解放军第三军医大学第三附属医院 | 从孕妇血浆中检测胎儿父系dna单核苷酸差异的方法 |
-
2009
- 2009-01-30 EP EP09705752A patent/EP2245195B1/en not_active Not-in-force
- 2009-01-30 CA CA2713545A patent/CA2713545A1/en not_active Abandoned
- 2009-01-30 BR BRPI0906641A patent/BRPI0906641A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2009-01-30 JP JP2010545199A patent/JP2011510660A/ja not_active Withdrawn
- 2009-01-30 MX MX2010008374A patent/MX2010008374A/es active IP Right Grant
- 2009-01-30 ES ES09705752T patent/ES2389038T3/es active Active
- 2009-01-30 RU RU2010135816/10A patent/RU2010135816A/ru not_active Application Discontinuation
- 2009-01-30 WO PCT/US2009/032614 patent/WO2009097511A2/en active Application Filing
- 2009-01-30 CN CN2009801116591A patent/CN102016069A/zh active Pending
- 2009-01-30 US US12/865,381 patent/US20110183338A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP2245195B1 (en) | 2012-06-20 |
| WO2009097511A3 (en) | 2010-01-07 |
| MX2010008374A (es) | 2010-10-07 |
| US20110183338A1 (en) | 2011-07-28 |
| WO2009097511A2 (en) | 2009-08-06 |
| ES2389038T3 (es) | 2012-10-22 |
| EP2245195A2 (en) | 2010-11-03 |
| CA2713545A1 (en) | 2009-08-06 |
| CN102016069A (zh) | 2011-04-13 |
| EP2245195A4 (en) | 2011-03-09 |
| BRPI0906641A2 (pt) | 2019-09-10 |
| JP2011510660A (ja) | 2011-04-07 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2010135816A (ru) | Двухэтапное обогащение бесклеточной эмбриональной днк в материнской плазме | |
| US11634767B2 (en) | Compositions, methods and systems for processing or analyzing multi-species nucleic acid samples | |
| WO2008008515A3 (en) | Methods and compositions for detecting rare cells from a biological sample | |
| EP1630237A3 (en) | Isolation of nucleic acid fragments by hybridisation to a solid support | |
| NZ597138A (en) | Method and kit for detecting microorganisms | |
| EP1944364A4 (en) | RNA EXTRACTION METHOD AND RNA PROOF METHOD | |
| CN110982876A (zh) | 病毒核酸检测的预处理方法、预处理液、试剂盒及其用途 | |
| CN105039538B (zh) | 一种用于血液直接荧光pcr扩增的反应液及其试剂盒 | |
| CN110656187B (zh) | 多重raa以及多重pcr检测病变组织或犬粪便中棘球绦虫的试剂盒及检测方法 | |
| CN105506129A (zh) | 一种rna类样本保存稀释液及其制备 | |
| EP2243832A3 (en) | Sample preparation method incorporating an alkaline shock | |
| CN108949748B (zh) | 一种痰液液化及核酸保护试剂 | |
| Yu et al. | Comparative evaluation of three preprocessing methods for extraction and detection of influenza A virus nucleic acids from sputum | |
| CN105524916A (zh) | 一种dna类样本保存稀释液及其制备 | |
| CN108935444A (zh) | 一种rna样本保存液及其应用方法 | |
| KR101777168B1 (ko) | 별도의 세포 용해 과정 없이 핵산을 추출하기 위한 검체 수송 배지 조성물 및 이의 용도 | |
| CN112608978A (zh) | 一种新型核酸免提取保存液 | |
| CN111719015A (zh) | 一种人类免疫缺陷病毒hiv-1的检测试剂盒 | |
| CN105255855A (zh) | 在固体表面保存核酸的方法及其保存液 | |
| CN103215389B (zh) | 猪繁殖与呼吸综合症和猪乙型脑炎双重一步法rt-pcr诊断试剂盒 | |
| KR20110060156A (ko) | 핵산 추출용 조성물과 이를 이용한 핵산 추출방법 및 핵산의 증폭방법 | |
| ATE455867T1 (de) | Echtzeit-pcr unter zusatz von pyrophosphatase | |
| US11814750B2 (en) | Compositions, methods and systems for processing or analyzing multi-species nucleic acid samples | |
| CN108531563A (zh) | 多孔微球的用途及裂解液以及裂解液的使用方法 | |
| WO2023011660A1 (en) | Compositions for liquefying a viscous biological sample, combination products, liquefying agents, and kits thereof, and methods and application thereof |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20130819 |