RU2008134484A - Новые флуоресцентные белки и способы их применения - Google Patents

Новые флуоресцентные белки и способы их применения Download PDF

Info

Publication number
RU2008134484A
RU2008134484A RU2008134484/13A RU2008134484A RU2008134484A RU 2008134484 A RU2008134484 A RU 2008134484A RU 2008134484/13 A RU2008134484/13 A RU 2008134484/13A RU 2008134484 A RU2008134484 A RU 2008134484A RU 2008134484 A RU2008134484 A RU 2008134484A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
protein
amino acid
fluorescent protein
cell
Prior art date
Application number
RU2008134484/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2395581C2 (ru
Inventor
Сергей Анатольевич ЛУКЬЯНОВ (RU)
Сергей Анатольевич Лукьянов
Дмитрий Михайлович ЧУДАКОВ (RU)
Дмитрий Михайлович Чудаков
Original Assignee
Закрытое Акционерное Общество "Евроген Айпи" (Ru)
Закрытое Акционерное Общество "Евроген Айпи"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Закрытое Акционерное Общество "Евроген Айпи" (Ru), Закрытое Акционерное Общество "Евроген Айпи" filed Critical Закрытое Акционерное Общество "Евроген Айпи" (Ru)
Publication of RU2008134484A publication Critical patent/RU2008134484A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2395581C2 publication Critical patent/RU2395581C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/43504Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates
    • C07K14/43595Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates from coelenteratae, e.g. medusae
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/43504Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

1. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая функциональный флуоресцентный белок и выбранная из группы, состоящей из: ! (а) нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, характеризующейся аминокислотной последовательностью, по существу, соответствующей аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 и 16; ! (b) нуклеиновой кислоты, представленной в SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13 и 15; ! (с) нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, имеющий последовательность, которая, по крайней мере, на 90% идентична аминокислотной последовательности (а), описанной выше; ! (d) нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, имеющий последовательность, которая, по крайней мере, на 85% идентична аминокислотной последовательности (а), описанной выше. ! 2. Выделенная нуклеиновая кислота по п.1 (с, d), где функциональный флуоресцентный белок содержит одну или более замен, выбранных из группы, состоящей из K6T, E36G, R32G, K42R, F53V, K67R, T68A, L79F, I93V, F110L, N112D, I115L, N122R, S131P, R138L, N143S, N143H, N143F, N143Y, G152S, R155E, H157R, S158G, Q159D, Y169H, H171I, C172A, S173N, F174L, K188R, F192V, H193Y, F194Y, H197R, M216V, K220R, R231S и R231K. ! 3. Вектор, включающий молекулу нуклеиновой кислоты по п.1 и элементы репликации вектора в клетке-хозяине, необходимые для амплификации вектора, содержащего нуклеиновую кислоту по п.1, в клетке-хозяине. ! 4. Кассета экспрессии содержащая (а) область инициации транскрипции, функциональную в клетке-хозяине; (b) нуклеиновую кислоту по п.1; и (с) область терминации транскрипции, функциональную в клетке-хозяине, которая будучи интегрированной в геном клетки или при введении в клетку в виде внехромосомного элемента способна обеспечить экспрессию флуоресцирующего белка, кодируемого нуклеиновой кислотой по п.1. ! 5. Клетка или е

Claims (9)

1. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая функциональный флуоресцентный белок и выбранная из группы, состоящей из:
(а) нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, характеризующейся аминокислотной последовательностью, по существу, соответствующей аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 и 16;
(b) нуклеиновой кислоты, представленной в SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13 и 15;
(с) нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, имеющий последовательность, которая, по крайней мере, на 90% идентична аминокислотной последовательности (а), описанной выше;
(d) нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, имеющий последовательность, которая, по крайней мере, на 85% идентична аминокислотной последовательности (а), описанной выше.
2. Выделенная нуклеиновая кислота по п.1 (с, d), где функциональный флуоресцентный белок содержит одну или более замен, выбранных из группы, состоящей из K6T, E36G, R32G, K42R, F53V, K67R, T68A, L79F, I93V, F110L, N112D, I115L, N122R, S131P, R138L, N143S, N143H, N143F, N143Y, G152S, R155E, H157R, S158G, Q159D, Y169H, H171I, C172A, S173N, F174L, K188R, F192V, H193Y, F194Y, H197R, M216V, K220R, R231S и R231K.
3. Вектор, включающий молекулу нуклеиновой кислоты по п.1 и элементы репликации вектора в клетке-хозяине, необходимые для амплификации вектора, содержащего нуклеиновую кислоту по п.1, в клетке-хозяине.
4. Кассета экспрессии содержащая (а) область инициации транскрипции, функциональную в клетке-хозяине; (b) нуклеиновую кислоту по п.1; и (с) область терминации транскрипции, функциональную в клетке-хозяине, которая будучи интегрированной в геном клетки или при введении в клетку в виде внехромосомного элемента способна обеспечить экспрессию флуоресцирующего белка, кодируемого нуклеиновой кислотой по п.1.
5. Клетка или ее потомство, продуцирующие флуоресцентный белок, кодируемый нуклеиновой кислотой по п.1, содержащая экспрессионный кластер по п.4 в виде внехромосомного элемента или элемента, интегрированного в геном этой клетки.
6. Трансгенная клетка или ее потомство, продуцирующие флуоресцентный белок, кодируемый нуклеиновой кислотой по п.1, содержащая экспрессионный кластер по п.4 в виде внехромосомного элемента или элемента, интегрированного в геном этой клетки.
7. Выделенный функциональный флуоресцентный белок, который кодируется нуклеиновой кислотой по п.1, где указанный белок выбран из группы, состоящей из:
(а) белка, характеризующегося аминокислотной последовательностью, по существу, соответствующей аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 и 16;
(b) белка, имеющего последовательность, которая, по крайней мере, на 90% идентична аминокислотной последовательности (а), описанной выше;
(с) белка, имеющего последовательность, которая, по крайней мере, на 85% идентична аминокислотной последовательности (а), описанной выше.
8. Выделенный функциональный флуоресцентный белок, который кодируется нуклеиновой кислотой по п.2 и включает, по крайней мере, одну аминокислотную замену, выбранную из группы, состоящей из K6T, E36G, R32G, K42R, F53V, K67R, T68A, L79F, I93V, F110L, N112D, I115L, N122R, S131P, R138L, N143S, N143H, N143F, N143Y, G152S, R155E, H157R, S158G, Q159D, Y169H, H171I, C172A, S173N, F174L, K188R, F192V, H193Y, F194Y, H197R, M216V, K220R, R231S и R231K.
9. Способ получения флуоресцентного белка, кодируемого нуклеиновой кислотой по п.1, включающий (а) обеспечение молекулы нуклеиновой кислоты по п.1, функционально связанной с подходящими регулирующими экспрессию элементами, (b) экспрессию флуоресцентного белка с указанной молекулой нуклеиновой кислоты, и (с) выделение белка, по существу, не содержащего другие белки.
RU2008134484/13A 2006-01-25 2007-01-09 Новые флуоресцентные белки из entacmaea quadricolor и способ их получения RU2395581C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US76180706P 2006-01-25 2006-01-25
US60/761,807 2006-01-25

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2008134484A true RU2008134484A (ru) 2010-02-27
RU2395581C2 RU2395581C2 (ru) 2010-07-27

Family

ID=38222592

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008134484/13A RU2395581C2 (ru) 2006-01-25 2007-01-09 Новые флуоресцентные белки из entacmaea quadricolor и способ их получения

Country Status (8)

Country Link
US (2) US7638615B1 (ru)
EP (1) EP1994149B1 (ru)
AT (1) ATE483018T1 (ru)
DE (1) DE602007009498D1 (ru)
DK (1) DK1994149T3 (ru)
ES (1) ES2353081T3 (ru)
RU (1) RU2395581C2 (ru)
WO (1) WO2007085923A2 (ru)

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7638615B1 (en) * 2006-01-25 2009-12-29 Evrogen IP Joint Stock Company Fluorescent proteins and methods for using same
US8563703B2 (en) 2006-01-25 2013-10-22 Evrogen IP Joint Stock Company Fluorescent proteins and methods for using same
WO2010060618A1 (en) * 2008-11-26 2010-06-03 Universität Ulm Monomeric variants of he tetrameric eqfp611
EP2430156A1 (en) * 2009-05-11 2012-03-21 Evrogen Jsc Modified fluorescent proteins and methods for using same
CN101899118B (zh) * 2010-04-22 2012-05-30 曹利民 一种融合蛋白HABP-mKate及其制备方法和应用
EP2825887A4 (en) * 2012-03-15 2015-08-19 Montana Molecular Llc GENETICALLY ENCODED FLUORESCENT SENSORS FOR DETECTING INTRACELLULAR SIGNALING THROUGH DIACYLGLYCEROL PATHWAYS
US9040248B2 (en) 2012-06-06 2015-05-26 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Kits for detecting and monitoring endocrine disrupting chemicals (EDCs)
EP2695893A1 (en) * 2012-08-09 2014-02-12 Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt GmbH Novel far red fluorescent protein
CA2929392A1 (en) 2013-11-04 2015-05-07 Montana Molecular Llc Genetically encoded fluorescent sensors for detecting ligand bias and intracellular signaling through camp pathways
CN108659110B (zh) * 2017-04-01 2020-11-06 北京义翘神州科技股份有限公司 一种改进的红色荧光蛋白及其应用
WO2022053130A1 (en) 2020-09-09 2022-03-17 Sid Alex Group, S.R.O. Antago-mir-155 for treatment of v-src, c-src-tyrosine kinase-induced cancers

Family Cites Families (51)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5583024A (en) * 1985-12-02 1996-12-10 The Regents Of The University Of California Recombinant expression of Coleoptera luciferase
US5221623A (en) 1986-07-22 1993-06-22 Boyce Thompson Institute For Plant Research, Inc. Use of bacterial luciferase structural genes for cloning and monitoring gene expression in microorganisms and for tagging and identification of genetically engineered organisms
US5739409A (en) * 1987-06-19 1998-04-14 The Regents Of The University Of California Endogenously sweetened transgenic plant products
US5182202A (en) * 1987-11-30 1993-01-26 Kikkoman Corporation Purified luciferase from luciola cruciata
US5256558A (en) * 1989-05-03 1993-10-26 The Trustees Of Rockefeller University Gene encoding plant asparagine synthetase
US5292658A (en) * 1989-12-29 1994-03-08 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Boyd Graduate Studies Research Center Cloning and expressions of Renilla luciferase
US5484956A (en) * 1990-01-22 1996-01-16 Dekalb Genetics Corporation Fertile transgenic Zea mays plant comprising heterologous DNA encoding Bacillus thuringiensis endotoxin
US5219737A (en) * 1990-03-27 1993-06-15 Kikkoman Corporation Mutant luciferase of a firefly, mutant luciferase genes, recombinant dnas containing the genes and a method of producing mutant luciferase
US5767367A (en) 1990-06-23 1998-06-16 Hoechst Aktiengesellschaft Zea mays (L.) with capability of long term, highly efficient plant regeneration including fertile transgenic maize plants having a heterologous gene, and their preparation
DK0537270T3 (da) 1990-07-02 1999-06-07 Univ California Påvisning af analytter ved overføring af fluorescensenergi
US5229285A (en) * 1991-06-27 1993-07-20 Kikkoman Corporation Thermostable luciferase of firefly, thermostable luciferase gene of firefly, novel recombinant dna, and process for the preparation of thermostable luciferase of firefly
DE4207358A1 (de) 1992-03-04 1993-09-09 Inst Genbiologische Forschung Expressionskassette und plasmide zur schliesszellenspezifischen expression und ihre verwendung zur herstellung transgener pflanzenzellen und pflanzen
US5633155A (en) 1992-08-19 1997-05-27 Jinro Limited Expression vector for phytolacca antiviral protein and process for preparing transgenic plant transformed therewith
DE4234131C2 (de) 1992-10-09 1995-08-24 Max Planck Gesellschaft Transgener pathogen-resistenter Organismus
JP2651651B2 (ja) * 1993-04-21 1997-09-10 チッソ株式会社 蛍酵素ルシフェラーゼ遺伝子
US5576198A (en) * 1993-12-14 1996-11-19 Calgene, Inc. Controlled expression of transgenic constructs in plant plastids
US5869255A (en) 1994-02-01 1999-02-09 The Regents Of The University Of California Probes labeled with energy transfer couples dyes exemplified with DNA fragment analysis
US5654419A (en) * 1994-02-01 1997-08-05 The Regents Of The University Of California Fluorescent labels and their use in separations
JP3448090B2 (ja) 1994-02-16 2003-09-16 浜松ホトニクス株式会社 エネルギー移動検出法およびその装置
US5750870A (en) 1994-06-17 1998-05-12 Agritope, Inc. Plant genetic transformation methods and transgenic plants
US5650135A (en) * 1994-07-01 1997-07-22 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Non-invasive localization of a light-emitting conjugate in a mammal
KR970007864B1 (ko) * 1994-07-21 1997-05-17 진로 주식회사 섬자리공의 항바이러스성 단백질(pip)을 발현하는 식물체의 제조방법
JP3466765B2 (ja) 1994-07-27 2003-11-17 キッコーマン株式会社 ビオチン化ホタルルシフェラーゼ、ビオチン化ホタルルシフェラーゼ遺伝子、新規な組み換え体dna、ビオチン化ホタルルシフェラーゼの製造法及び生物発光分析法
US5795737A (en) 1994-09-19 1998-08-18 The General Hospital Corporation High level expression of proteins
US5750868A (en) 1994-12-08 1998-05-12 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Reversible nuclear genetic system for male sterility in transgenic plants
US5629470A (en) 1995-01-20 1997-05-13 Rutgers, The State University Of New Jersey Transgenic plants and plant cells with enhanced pathogen resistance and related methods
KR20040041639A (ko) 1995-04-24 2004-05-17 크로막솜 코포레이티드 새로운 대사 경로를 만들고 이를 스크리닝하는 방법
US5674731A (en) 1995-04-27 1997-10-07 Life Technologies, Inc. Regeneration of both plant tissues and transgenic plant tissues using a new plant hormone, 5-bromoindole-3-acetic acid
US6008373A (en) 1995-06-07 1999-12-28 Carnegie Mellon University Fluorescent labeling complexes with large stokes shift formed by coupling together cyanine and other fluorochromes capable of resonance energy transfer
US5728528A (en) * 1995-09-20 1998-03-17 The Regents Of The University Of California Universal spacer/energy transfer dyes
US5968738A (en) 1995-12-06 1999-10-19 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Two-reporter FACS analysis of mammalian cells using green fluorescent proteins
JP3439221B2 (ja) 1995-12-18 2003-08-25 ワシントン ユニヴァーシティ 蛍光共鳴エネルギー移動を利用する核酸分析方法
US6803188B1 (en) 1996-01-31 2004-10-12 The Regents Of The University Of California Tandem fluorescent protein constructs
US5804387A (en) 1996-02-01 1998-09-08 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University FACS-optimized mutants of the green fluorescent protein (GFP)
US5945526A (en) 1996-05-03 1999-08-31 Perkin-Elmer Corporation Energy transfer dyes with enhanced fluorescence
US5863727A (en) 1996-05-03 1999-01-26 The Perkin-Elmer Corporation Energy transfer dyes with enhanced fluorescence
US5989835A (en) 1997-02-27 1999-11-23 Cellomics, Inc. System for cell-based screening
US5866336A (en) 1996-07-16 1999-02-02 Oncor, Inc. Nucleic acid amplification oligonucleotides with molecular energy transfer labels and methods based thereon
US5972638A (en) 1997-01-31 1999-10-26 Lockheed Martin Energy Research Corp. Method for detection of buried explosives using a biosensor
US6130313A (en) 1997-10-02 2000-10-10 Clontech Laboratories, Inc. Rapidly degrading GFP-fusion proteins
WO2000003245A1 (en) 1998-05-28 2000-01-20 Chugai Pharmaceutical Company Limited Peptide ligands for the human fibroblast growth factor (fgf) receptor
US6501003B1 (en) 1998-07-08 2002-12-31 Wisconsin Alumni Research Foundation Transgentic mouse expressing green fluorescent protein in glial cells
EP1095277B1 (en) 1998-07-13 2003-01-22 Cellomics, Inc. A system for cell-based screening
US5998146A (en) 1998-07-17 1999-12-07 Wallac Oy Homogeneous luminescence assay method based on energy transfer
AU6048599A (en) 1998-09-18 2000-04-10 Cellomics, Inc. A system for cell-based screening
AU752677B2 (en) 1998-09-22 2002-09-26 Cellomics, Inc. Miniaturized cell array methods and apparatus for cell-based screening
ATE225406T1 (de) 1998-10-30 2002-10-15 Cellomics Inc Ein screeningsystem auf zellbasis
US6469154B1 (en) 1999-05-21 2002-10-22 The Regents Of The University Of California Fluorescent protein indicators
US6699687B1 (en) 1999-05-21 2004-03-02 The Regents Of The University Of California Circularly permuted fluorescent protein indicators
JP2004536571A (ja) * 2001-02-21 2004-12-09 クローンテック ラボラトリーズ インク. 非凝集性蛍光性タンパク質およびその使用方法
US7638615B1 (en) 2006-01-25 2009-12-29 Evrogen IP Joint Stock Company Fluorescent proteins and methods for using same

Also Published As

Publication number Publication date
DE602007009498D1 (de) 2010-11-11
US20100015701A1 (en) 2010-01-21
WO2007085923A3 (en) 2007-10-18
WO2007085923A8 (en) 2009-07-30
EP1994149A2 (en) 2008-11-26
ES2353081T3 (es) 2011-02-25
DK1994149T3 (da) 2011-01-17
US20110070625A1 (en) 2011-03-24
WO2007085923A2 (en) 2007-08-02
ATE483018T1 (de) 2010-10-15
RU2395581C2 (ru) 2010-07-27
EP1994149B1 (en) 2010-09-29
US7638615B1 (en) 2009-12-29
US8138320B2 (en) 2012-03-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2008134484A (ru) Новые флуоресцентные белки и способы их применения
Lassila et al. Assembly of robust bacterial microcompartment shells using building blocks from an organelle of unknown function
Völkel et al. Interaction proteomics: characterization of protein complexes using tandem affinity purification–mass spectrometry
Petrovská et al. Inside a plant nucleus: discovering the proteins
Shim et al. Proposed systematic nomenclature for orbitides
Buttress et al. Histone H2B. 8 compacts flowering plant sperm through chromatin phase separation
Baba et al. CRK5 protein kinase contributes to the progression of embryogenesis of Arabidopsis thaliana
Sandoval et al. Stable native RIP 9 complexes associate with C‐to‐U RNA editing activity, PPR s, RIP s, OZ 1, ORRM 1 and ISE 2
Shimizu et al. Experimental determination of proline hydroxylation and hydroxyproline arabinogalactosylation motifs in secretory proteins
EP2261362A3 (en) Methods for improving crop plant architecture and yield
MX2019009045A (es) Nuevas luciferasas y metodos para su uso.
WO2007052102A3 (en) Modified green fluorescent proteins and methods for using same
WO2003042401A3 (en) Novel chromophores/fluorophores and methods for using the same
ATE337336T1 (de) Nukleinsäuren, die für stichodactylidae chromoproteine kodieren
Voronina et al. New group of transmembrane proteins associated with desiccation tolerance in the anhydrobiotic midge Polypedilum vanderplanki
Xiong et al. Chloroform-assisted phenol extraction improving proteome profiling of maize embryos through selective depletion of high-abundance storage proteins
RU2005123689A (ru) Флуоресцирующие белки из веслоногих ракообразных и способы их применения
Floriano et al. The evolution of intramitochondriality in Midichloria bacteria
Nemoto et al. Identification of a frustule-associated protein of the marine pennate diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
CA2434737A1 (en) Non aggregating fluorescent proteins and methods for using the same
Li et al. Convergent evolution of hetero‐oligomeric cellulose synthesis complexes in mosses and seed plants
Buttress et al. A histone variant condenses flowering plant sperm via chromatin phase separation
Azevedo et al. UAP56 associates with DRM2 and is localized to chromatin in Arabidopsis
CA2467383A1 (en) Rapidly maturing fluorescent proteins and methods for using the same
Fernandes Insights into rRNA binding and lncRNAs in Brassicaceae