MXPA00007709A - Agentes antibacterianos - Google Patents
Agentes antibacterianosInfo
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Abstract
Los compuestos de formula (I) son antibacterianos:en donde R1 representa hidrógeno o alquilo de C1-C6 o alquilo de C1-C6 sustituido por uno o másátomos de halógeno;R2 representa un grupo R10-(X)n - (ALK)M - en donde R10 representa hidrógeno, o un alquilo de C1-C6, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, cicloalquilo, arilo o un grupo heterociclilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido por alquilo de C1-C6, alcoxi de C1-C6, hidroxi, mercapto, alquiltio de C1-C6, amino, halo( que incluye fluoro, cloro, bromo yyodo), trifluorometilo, ciano, nitro, -COOH, -CONH2, - COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, o -CONRARB en donde RA Y RB son independientemente un grupo alquilo de C1-C6, y ALK representa un radical lineal o ramificado divalente de alquileno de C1-C6, alquenileno de C2-C6 o alquinileno de C2- C6, y puede estar interrumpido por uno o más enlaces no adyacentes de -NH-, -O- o - S-, X representa -NH-, -O- o -S-, y m y n son independientemente 0ó1;y A representa un grupo como se define en la especificación.
Description
AGENTES ANTIBACTBRIANOS
DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN
La invención se relaciona con el uso de derivados de
N-formilhidroxilamina como agentes antibacterianos, con una clase novedosa de tales compuestos y con composiciones farmacéuticas y veterinarias que comprenden tales compuestos .
ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN
En general, los patógenos bacterianos se clasifican como grampositivos o gramnegat ivos . Muchos agentes antibacterianos (incluyendo los antibióticos) son específicos contra una u otra clase gram de patógenos. Los agentes antibacterianos efectivos contra patógenos tanto grampositivos como gramnegativos por lo tanto generalmente se considera que tienen una actividad de espectro amplio. Se conocen muchas clases de agentes antibacterianos, que incluyen las penicilinas y cefalosporinas, tetraciclinas, sulfonamidas, monolactamas, fluoroquinolonas y quinolonas, aminoglicósidos, glicopéptidos, macrólidos, polimixinas, lincosamidas, trimetoprim y cloranfenicol. Los mecanismos fundame-ntalee de estas clases antibacterianas varían. REF: 121977
La resistencia bacteriana a muchos antibacterianos conocidos es un problema cada vez mayor. En consecuencia, existe una necesidad continua en la técnica por agentes antibacterianos alternativos, especialmente aquéllos los cuales tienen mecanismos de acción fundamentalmente diferentes de las clases conocidas. Entre los patógenos grampositivos tales como Staphylococci, Streptococci, Mycobacteria y Enterococci, se han producido/han surgido cepas resistentes las cuales los vuelven particularmente difíciles de erradicar. Los ejemplos de tales cepas son Staphylococcus aureus, resistente a meticilina (MRSA) , Staphylococci coagulasa negativos resistentes a meticilina (MRCNS) , Streptococcus pneumoniae resistente a penicilina y Enterococus faecium resistente de manera múltiple. Las bacterias patogénicas con frecuencia son resistentes a los aminoglicósidos, ß-lactamas (penicilinas y cefalosporinas) y algunos tipos de antibióticos de cloranfenicol. Esta resistencia involucra la inactivación enzimática del antibiótico por hidrólisis o por formación de derivados inactivos. La familia de antibióticos de ß-lactama (penicilina y cefalosporina) están caracterizados por la presencia de una estructura de anillo de ß-lactama. La resistencia a esta familia de antibióticos en aislados clínicos se debe principalmente a la producción de una enzima "penicilinasa" ( ß-lactamasa) por bacterias resistentes las
=-'*"" - —
cuales hidrolizan el anillo ß-lactama y por lo tanto elimina su actividad antibacteriana. Recientemente se ha mencionado la germinación de cepas resistentes a vancomicina de enterococci ( oodford N. 1998 Glycopeptide-resistant enterococci: a decade of experience. Journal of Medical Microbiology. 4.7 (10) : 8_9-62) . Los enterococci resistentes a vancomicina son particularmente peligrosos en la medida en que son causas frecuentes de infecciones basadas en hospital y son resistentes inherentemente a la mayor parte de los antibióticos. La vancomicina funciona al unir los residuos terminales D-Ala-D-Ala del precursor del péptido glicano de la pared celular. El alto nivel de resistencia a vancomicina se conoce como VanA y se confiere por genes localizados en un elemento que se puede someter a transposición el cual altera los residuos terminales a D-Ala-D-lac y por lo tanto reducen la afinidad por vancomicina. En vista de la rápida germinación de bacterias resistentes a drogas múltiples, el desarrollo de agentes antibacterianos con modos de acción novedosos que sean efectivos contra el número cada vez mayor de bacterias resistentes, particularmente enterococci resistentes a vancomicina y bacterias resistentes a antibióticos de ß-lactama, tales como Staphylococcus aureus resistente a meticilina, son de máxima importancia.
DESCRIPCIÓN BREVE DE LA INVENCIÓN
Esta invención se basa en el hallazgo de que ciertos derivados de N-formilhidroxilamina tienen actividad antibacteriana, lo que genera una nueva clase de agentes antibacterianos disponible . Los inventores han encontrado que los compuestos con los cuales se relaciona esta invención son antibacterianos con respecto a la gama de organismos grampositivos y gramnegativos . Además, existe evidencia de que algunos compuestos son antibacterianos con respecto a las bacterias las cuales son resistentes a los antibióticos utilizados comúnmente tales como vancomicina y los antibióticos de ß-lactama, por ejemplo Staphylococcus aureus resistente a meticilina. Aunque puede ser de interés establecer el mecanismo de acción de los compuestos con los cuales se relaciona la invención, es su capacidad para inhibir el crecimiento bacteriano lo que los vuelve útiles. Sin embargo, actualmente se considera que su actividad antibacteriana se debe, al menos en parte, a la inhibición intracelular de la enzima bacteriana polipéptido desformilasa (PDF) . Las polipéptido desformilasas bacterianas (PDF) (EC 3.5.1.31) son una familia conservada de metaloenzimas (Reviewed: Meinnel T, Lazennec C, Villoing S, Blanquet S, 1997, Journal of Molecular Biology 267, 749-761) las cuales son
esenciales para viabilidad bacteriana, su función es remover el grupo formilo del residuo metionina N terminal de las proteínas sintetizadas en ribosoma en eubacterias . Mazel et al. (EMBO J. 13(4): 914-923, 1994) recientemente han clonado y caracterizado un PDF de E. coli . Puesto que PDF es esencial para el crecimiento de bacterias y no hay una contraparte eucariótica para PDF, Mazel et al. (ibid), Rajagopalan et al. (J. Am. Chem. Soc. 119 : 12 18-12 19, 1997) y Becker et al., (J. Biol. Chem. 273 (19) :11413-11416, 1998) cada uno ha propuesto que PDF es un excelente objetivo antibacteriano. Previamente se han reivindicado ciertos derivados de N-formilhidroxilamina en las publicaciones de patente incluidas abajo, aunque se han elaborado y descrito específicamente muy pocos ejemplos de tales compuestos:
EP-B-0236872 (Roche) WO 92/09563 (Glycomed) WO 92/04735 (Syntex) WO 95/19965 (Glycomed) WO 95/22966 (Sanofi Winthrop) WO 95/3.709 (Roche) WO 96/23791 (Syntex) WO 96/16027 (Syntex/Agouron) WO 97/03783 (British Biotech) WO 97/18207 (DuPont Merck)
WO 98/38179 (Glaxo Wellcome) WO 98/47863 (Labs Jaquse Logeais)
La utilidad farmacéutica adscrita a los derivados de N-formil hidroxilamina en estas publicaciones es la capacidad para inhibir las metaloproteinasas de matriz (MMP) y en algunos casos la liberación de factor de necrosis tumoral (TNF) , y por lo tanto el tratamiento de enfermedades o condiciones mediadas por estas enzimas, tales como cáncer y artritis reumatoide. Lo que la técnica anterior no describe ni implica es que los derivados de N-formil hidroxilamina tienen actividad antibacteriana . Además de estos, el documento US-A-4, 738, 803 (Roques et al.) también describe derivados de N-formil hidroxilamina, sin embargo, estos compuestos se describen como inhibidores de encefalinasa y se proponen para uso como antidepresores y agentes hipotensivos. Además, WO 97/38705 (Bristol-Myers Squibb) describe ciertos derivados de N-formilhidroxilamina como inhibidores de encefalinasa y enzima convertidora de angiotensina. Esta técnica anterior no describe ni implica que los derivados de N-formilhidroxilamina tengan también actividad antibacteriana .
DESCRIPCIÓN DETALLADA DE LA INVENCIÓN
De acuerdo con el primer aspecto de la primer invención, se proporciona el uso de un compuesto de fórmula (I) o una sal farmacéutica o veterinariamente aceptable del mismo, en la preparación de una composición antibacteriana:
en donde : R1 representa hidrógeno o alquilo de C[-C6 o alquilo de CÍ-CÜ sustituido por uno o más átomos de halógeno,- R2 representa un grupo R10- (X) „- (ALK). en donde R10 representa hidrógeno o un grupo alquilo de Cj-Cj, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, cicloalquilo, arilo o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido por alquilo de C2-C6, alcoxi de CJ-CJ, hidroxi, mercapto, alquiltio de amino, halo (que incluye fluoro, cloro, bromo y yodo) , trifluorometilo, ciano, nitro, -COOH, -C0NH2, -C00RA, -NHC0RA, -CONHRA, -NHR\ -NRARB, o -C0NRARB
en donde RA y RB son independientemente un grupo alquilo de
C_-C3, y ALK representa un radical lineal o ramificado divalente de alquileno de Cj-Cg, alquenileno de C2-C6 o alquinileno de C2-C6, y el cual puede estar interrumpido por uno o más enlaces adyacentes de -NH- , -O- o -S-, X representa -NH-, -O- o -S-, y m y n son independientemente 0 6 1; y A representa (i) un grupo de fórmula (IA) , (IB) , (IC) o (ID)
(IA) (IB)
(ID) (IC)
en donde :
R3 representa hidrógeno y R4 representa la cadena lateral de un alfa aminoácido natural o no natural, o R3 y R4, cuando se toman junto con los átomos de nitrógeno y carbono a los cuales están unidos respectivamente, forman un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 5 a 8 átomos, anillo el cual está opcionalmente fusionado a un anillo carbocíclico o segundo anillo heterocíclico, R5 y Rß, independientemente representan hidrógeno o alquilo de opcionalmente sustituido, cicloalquilo, arilo, arilalquilo de C^Cj, heterocicliclo o alquilo de Cj-heterocíclico, o R5 y R6, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, forman un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 3 a 8 átomos, anillo el cual está opcionalmente fusionado a un anillo carbocílico o segundo anillo heterocíclico, y R7 representa hidrógeno, alquilo de o un grupo acilo. En otro aspecto, la invención proporciona un método para el tratamiento de infecciones bacterianas en mamíferos humanos y no humanos, el cual comprende administrar un sujeto que padece de tal infección una dosis efectiva antibacteriana de un compuesto de fórmula (I) como se define antes. En un aspecto adicional de la invención, se proporciona un método para el tratamiento de contaminación bacteriana al aplicar una cantidad efectiva antibacteriana de
un compuesto de fórmula (I) como se define en lo anterior al sitio de contaminación. Los compuestos de fórmula (I) como se definen antes se pueden utilizar como componentes de materiales antibacterianos de limpieza o desinfectante. De acuerdo con una modalidad preferida, los diversos aspectos de la invención se pueden aplicar contra bacterias resistentes a vancomicina, quinolona y "ß-lactama" y las infecciones que producen. Respecto a la hipótesis de que los compuestos (I) actúan por inhibición de PDF intracelular, el efecto antibacteriano más potente se puede obtener mediante la utilización de los compuestos los cuales eficientemente pasan a través de la pared celular bacteriana. Por lo tanto, los compuestos los cuales son altamente activos como inhibidores de PDF in vitro y los cuales penetran en las células bacterianas son preferidos para uso de acuerdo con la invención. Se espera que la potencia antibacteriana de los compuestos los cuales son potentes inhibidores de la enzima PDF in vitro, pero que son poco penetrantes en las células, pueden mejorar su uso en forma de un precursor, es decir, un análogo modificado estructuralmente el cual se convierte a la molécula parental de fórmula (I) , por ejemplo por acción enzimática, después de que ha pasado a través de la pared celular bacteriana.
La invención también proporciona compuestos novedosos de fórmula (I) anterior o sales aceptables farmacéutica o veterinariamente de los mismos, en donde: Rx representa hidrógeno, alquilo de Ci-Cj o alquilo de Cj-Cj sustituido con uno o más átomos de halógeno; R2 representa un grupo R10-(ALK)m- en donde R10 representa hidrógeno o un grupo alquilo de C^Cj, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, un cicloalquilo, arilo o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido por alquilo de C^Cj, alcoxi de C^Cj, hidroxi, mercapto, alquiltio de amino, halo (que incluye fluoro, cloro, bromo y yodo) , trifluorometilo, nitro, -COOH, -C0NH2, -COOR\ -NHC0R\ -C0NHRA, -NHR\ -NRARB, O -C0NRARB, en donde RA y RB son independientemente un grupo alquilo de Cj-C6. ALK representa un radical divalente lineal o ramificado de alquileno de Cj-C3, alquenileno de C2-C6, alquinileno de C2-C6, y se pueden interrumpir por uno o más enlaces no adyacentes de -NH- , -O- o -S-, y m representa 0 ó 1; A representa un grupo de fórmula (IA) , (IB), (IC) o
(ID) anteriores en donde: R3 representa hidrógeno y R4 representa la cadena lateral de un alfa aminoácido natural o no natural, o R3 y R4, cuando se toman junto con los átomos de nitrógeno y carbono a los cuales están unidos respectivamente, forman un anillo
heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 5 a 8 átomos, anillo el cual está opcionalmente fusionado a un anillo carbocíclico o segundo anillo heterocíclico, R5 y R6, independientemente representan hidrógeno o alquilo de opcionalmente sustituido, cicloalquilo, arilalquilo de Cj-Cf, heterocíclico no aromático o heterocíclico (alquilo de C^Cs) , o R5 y R6, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, forman un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 3 a 8 átomos, anillo el cual está opcionalmente fusionado a un anillo carbocíclico o un segundo anillo heterocíclico, y R7 representa hidrógeno, alquilo de Cj-C;; o un grupo acilo. CON LA CONDICIÓN DE QUE (i) cuando A es un grupo de fórmula (IA) o (IB) y R2 es alquilo de C2-C5, entonces R4 no es la cadena lateral de un alfa aminoácido natural o la cadena lateral de un alfa aminoácido natural en el cual cualquier sustituyente funcional está protegido, cualquier grupo amino esté acilado y cualquier grupo carboxilo esté estepficado ; (ii) cuando A es un grupo de fórmula (IA) o (IB) entonces R4 no es un grupo biciclicarilmetilo; y (iii) cuando A es un grupo de fórmula (IA) y R2 es ciclopropilmetilo, ciclobutilmetilo o ciclopentilmetilo y uno de R5 y R6 es hidrógeno, entonces R4 no es terbutilo.
Como se utiliza en la presente, el término "alquilo de Cj-C8" significa una porción alquilo de cadena lineal o ramificada que tiene de 1 a 6 átomos de carbono, que incluye, por ejemplo, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, n-butilo, isobutilo, sec-butilo, t-butilo, n-pentilo y n-hexilo. Como se utiliza en la presente, el término "radical alquileno de Cj-Cj divalente" significa una cadena de hidrocarburos saturada de 1 a 6 átomos de carbono y dos valencias no satisfechas. Como se utiliza en la presente, el término "alquenilo de C2-C6" significa una porción alquenilo de cadena lineal o ramificada que tiene de 2 a 6 átomos de carbono que tienen por lo menos un doble enlace de estereoquímica E o Z, cuando sea aplicable. El término incluye, por ejemplo, vinilo, alilo, 1-y 2-butenilo y 2-metil-2-propenilo. Como se utiliza en la presente, el término "radical alquenileno de C2-C6 divalente" significa una cadena de hidrocarburo que tiene de 2 a 6 átomos de carbono, por lo menos un doble enlace y dos valencias no satisfechas . Como se utiliza en la presente, el término "alquinilo de C2-C6" se refiere a una cadena lineal o una cadena ramificada de grupos hidrocarburo que tiene de 2 a 6 átomos de carbono y que tiene además un triple enlace. Este término puede incluir, por ejemplo, etinilo, 1-propinilo, 1- y 2-butinilo, 2-metil-
propinilo, 2-pentinilo, 3-pentinilo, 4-pentinilo, 2-hexinilo, 3-hexinilo, 4-hexinilo y 5-hexinilo. Como se utiliza en la presente, el término "radical alquinileno de C2-C6 divalente" significa una cadena de hidrocarburo que tiene de 2 a 6 átomos de carbono, por lo menos un triple enlace y dos valencias no satisfechas. Como se utiliza en la presente, el término
"cicloalquilo" significa una porción alicíclica saturada que tiene 3-8 átomos de carbono y que incluye, por ejemplo, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciciohexilo, cicloheptilo y ciclooctilo. Como se utiliza en la presente, el término "cicloalquenilo" significa una porción alicíclica insaturada que tiene 3-8 átomos de carbono y que incluye, por ejemplo, ciclopropenilo, ciclobutenilo, ciclopentenilo, ciclohexenilo, cicloheptenilo y ciclooctenilo. En el caso de anillos cicloalquenilo de 5-8 átomos de carbono, el anillo puede contener uno o más dobles enlaces . Como se utiliza en la presente, el término "arilo" se refiere a un grupo aromático carbocíclico mono-, bi- o tricíclico y a los grupos que consisten de dos grupos aromáticos carbocíclicos monocíclicos unidos covalentemente. Los ilustrativos de tales grupos son fenilo, bifenilo y naftilo. Como se utiliza en la presente, el término "heteroarilo" se refiere a un anillo aromático de 5 ó
6 miembros que contiene uno o más heteroátomos, y opcionalmente fusionado a un anillo bencilo piridilo; y a grupos que consisten de 2 anillos aromáticos de 5 ó 6 miembros unidos covalentemente, cada uno con uno o más heteroátomos; y a grupos que consisten de un grupo aromático carbocíclico monocíclico unido covalentemente a anillos aromáticos de 5 ó 6 miembros que contienen uno o más heteroátomos; los ilustrativos de estos grupos son tienilo, furilo, pirrolilo, imidazolilo, bencimidazolilo, tiazolilo, pirazolilo, isoxazolilo, isotiazolilo, triazolilo, tiadiazolilo, oxadiazolilo, piridinilo, piridazinilo, pirimidinilo, pirazinilo, triazinilo,
4- ( [1, 2, 3] -tiadiazolilo-4-il) fenilo y 5-isoxazol-3-iltienilo.
Como se utiliza en la presente, el término no calificado "heterociclilo" o "heterocíclico" incluye "heteroarilo" como se define en lo anterior, y en particular significa un anillo heterocíclico aromático o no aromático de 5-7 miembros que contiene uno o más heteroátomos que se seleccionan de S, N y 0, y opcionalmente fusionados a un anillo de benceno, que incluyen, por ejemplo pirrolilo, furilo, tienilo, piperidinilo, imidazolilo, oxazolilo, tiazolilo, tiadiazolilo, pirazolilo, piridinilo, pirrolidinilo, pirimidinilo, morfolinilo, piperazinilo, indolilo, bencimidazolilo, maleimido, succinimido, ftalimido y grupos 1, 3-dioxo-l, 3-dihidro-isoindol-2-ilo.
Como se utiliza en la presente, el término "acilo" significa un grupo R20C(0)-, en donde R20 es alquilo de Cj-Cs, alquenilo de C2-C6, cicloalquilo de C3-C7, fenilo, heterocicliclo, fenilalquilo de C1-C6, heterociclilalquilo de CJ-CJ, cicloalquil (C3-C7) alquilo de C_-C6, fenilalquenilo de C2-Cß, heterociclilalquenilo de C2-C6, cicloalquil (C3-C7) alquenilo de C2-C6, cualquiera de los cuales grupos R20 puede estar sustituido. Como se utiliza en la presente, el término "biclicarilmetilo" significa: (i) un grupo metilo sustituido por un grupo arilo monocíclico o heteroarilo el cual a su vez está sustituido por un grupo monocíclico arilo o heteroarilo, o (ii) un grupo metilo sustituido por un grupo arilo monocíclico o heteroarilo al cual está fusionado un segundo grupo arilo monocíclico o heteroarilo; y que incluye biciclicarilmetilo sustituido. Los ejemplos de tales grupos biclcilcarilmetilo incluyen naftilo, indolilo, quinolilo e isoquinolilo. A menos que se especifique de otra manera en el contexto en el cual se presenta, el término "sustituido" como se aplica a cualquier porción en la presente significa sustituido con hasta cuatro sustituyentes, cada uno de los cuales independientemente puede ser alquilo de Cj-Cj, bencilo, alcoxi de C1-C6 , fenoxi, hidroxi, mercapto, alquiltio de C^Cj, amino, halo (que incluye fluoro, cloro, bromo y yodo) ,
trifluorometilo, nitro, -COOH, -CONH2, -CORA, -COOR\ -NHC0RA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, o -CONRARB en donde RA y RB son independientemente un grupo alquilo de C1-C6. En el caso en el que "sustituido" significa bencilo, el anillo fenilo del mismo puede en sí mismo estar sustituido con cualquiera de los anteriores, excepto bencilo. Como se utiliza en la presente, los términos "cadena lateral de un alfa-aminoácido natural" y "cadena lateral de un alfa aminoácido no natural" significa el grupo R* respectivamente en un aminoácido natural y no natural, de fórmula NH2-CH (Rx) -COOH) . Los ejemplos de cadenas laterales de alfa aminoácidos naturales incluyen aquéllos de alanina, arginina, asparagina, ácido aspártico, cisteína, cistina, ácido glutámico, histidina, 5-hidroxilisina, 4-hidroxiprolina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, fenilalanina, prolina, serina, treonina, triptófano, tirosina, valina, ácido tt-aminoadípico, ácido a-amino-n-butírico, 3, 4-dihidroxifenilalanina, homoserina, o-metilserina, ornitina, ácido pipecólico y tirosina. En las cadenas naturales de alfa aminoácidos naturales las cuales contienen sustituyentes funcionales, por ejemplo amino, carboxilo, hidroxi, mercapto, guanidilo, imidazolilo o grupos indolilo tales como en arginina, lisina, ácido glutámico, ácido aspártico, triptófano, histidina,
serina, treonina, tirosina y cisteína, tales sustituyentes funcionales opcionalmente puede estar protegidos . De igual manera, en las cadenas laterales de alfa aminoácidos no naturales las cuales contienen sustituyentes funcionales, por ejemplo grupos amino, carboxilo, hidroxi, mercapto, guanidilo, imidazolilo o indolilo, tales sustituyentes funcionales opcionalmente puede estar protegidos. El término "protegido", cuando se utiliza en relación a un sustituyente funcional en una cadena lateral o un alfa aminoácido natural o no natural, significa un derivado de tal sustituyente el cual es sustancialmente no funcional. Se utiliza ampliamente el manual de T. W. Greene y P. G. Wuts "Protective Groups in Organic Synthesis" Segunda Edición, Wiley, New York, 1991 en donde se revisa el tema. Por ejemplo, los grupos carboxilo pueden ser esterificados (por ejemplo como un éster de alquilo de Cj^-C , los grupos amino se pueden convertir a amidas (por ejemplo como una NHCOCi alquilamida de -C o carbamatos (por ejemplo un carbamato de NHC(=0)0C alquilo de Cj-Cg o de NHC (=0) 0CH2Ph) , los grupos hidroxilo se pueden convertir a éteres (por ejemplo un 01 alquilo de CJ-CJ o un 0 (alquil de Cj-C feniléter) o esteres (por ejemplo un 0C(=0) alquiléster de C¡-C6) , y grupos tiol que se pueden convertir a tioéteres (por ejemplo ter-butil o bencil tioéter) o tioésteres (por ejemplo un SC(=0) alquil tioéster de Cx-Cß) .
Existen varios centros quirales reales o potenciales en los compuestos de acuerdo con la invención debido a la presencia de átomos de carbono asimétricos . La presencia de varios átomos de carbono asimétricos da lugar a numerosos diastereoisómeros con estereoquímica R o S en cada centro quiral. La invención incluye a la totalidad de los diastereoisómeros y las mezclas de los mismos. Actualmente, la estereoconfiguración preferida del átomo de carbono que presenta el grupo R2 es R; la del átomo que presenta el grupo R4 (cuando es asimétrico) es S; y la del átomo de carbono que presenta el grupo Ra (cuando es asimétrico) es R. En los compuestos de fórmula (I) como se define en lo anterior para uso de acuerdo con la invención, y en los compuestos novedosos de la invención de la fórmula (II) como se define en lo anterior (pero sometidas a las condiciones en las que) : Rj puede ser, por ejemplo, hidrógeno, metilo o trifluorometilo. El hidrógeno actualmente es lo que se prefiere. R2 puede ser, por ejemplo: alquilo de Cj-Cj opcionalmente sustituido, alquenilo de C3-Cß, alquinilo de C3-C6 o cicloalquilo; fenilalquilo de Cj-Cj-, fenilalquenilo de C3-C6- o fenilalquinilo de C3-C6-, opcionalmente sustituido en el anillo fenilo;
cicloalquil (alquilo de C,-C6) - , cicloalquil (alquenilo de C3-Cß)- o cicloalquil (alquinilo de C3-C6) - opcionalmente sustituido en el anillo cicloalquilo; heterociclil (alquil deCj-C,)-, heterociclil (alquenil de C3-C6) - o heterociclil (alquinil de C3-Cß) - opcionalmente sustituido en el anillo heterocicliclo; o CH3(CH2)pO(CH2),- o CH3(CH2)pS(CH2)q-, en donde p es 0, 1, 2 ó 3 y q es 1, 2 Ó 3. Los ejemplos específicos de grupos R2 incluyen metilo, etilo, n- e iso-propilo, n- e iso-butilo, n-pentilo, iso-pentilo, 3-metil-but-l-ilo, n-hexilo, n-heptilo, n-acetilo, n-octilo, metilsulfaniletilo, etilsulfanilmetilo, 2-metoxietilo, 2-etoxietilo, 2-etoximetilo, 3 -hidroxipropilo, alilo, 3-fenilprop-3-en-l-ilo, prop-2-in-l-ilo, 3-fenilpro-2-in-l-ilo, 3- (2-clorofenil)prop-2-in-l-ilo, but-2-in-l-ilo, ciclopentilo, ciciohexilo, ciclopentilmetilo, ciclopentiletilo, ciclopentilpropilo, ciclohexilmetilo, ciciohexiletilo, ciclohexilpropilo, furan-2 -ilmetilo, furan-3 -metilo, te rahidrofuran-2-ilmetilo, tetrahidrofuran-2- ilmetilo, piperidinilmetilo, fenilpropilo, 4-clorofenilpropilo, 4-metilfenilpropilo, 4-metoxifenilpropilo, bencilo, 4-clorobencilo, 4-metilbencilo y 4-metoxibencilo. Los grupos preferidos actualmente en R2 son n-propilo, n-butilo, n-pentilo, bencilo y ciclopentilmetilo. En el caso de R3, actualmente se prefiere hidrógeno.
R4 puede ser, por ejemplo, el grupo caracterizante de un a-aminoácido natural, por ejemplo bencilo o 4-metoxifenilmetilo, en el cual cualquier grupo funcional puede estar protegido, cualquier grupo amino puede estar acilado y cualquier grupo carboxi presente puede estar amidado; o un grupo -[Alk]nR, es un grupo alquileno de C1-Cí o alquenileno de C2-C6, opcionalmente interrumpido por uno o más átomos de -0- o -S-, o grupos -N(R12) - [en donde R12 es un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo de Cj-C , n es 0 ó 1 y R9 es hidrógeno o un grupo fenilo opcionalmente sustituido, arilo, heterociclilo, cicloalquilo o cicloalquenilo (únicamente cuando n es 1) R9 adicionalmente puede ser hidroxi, mercapto, alquiltio de C_-C6, amino, halo, trifluorometilo, nitro, -COOH, -C0NH2, -C00RA, -NHC0RA, -C0NHRA, -NHR\ -NRARB, o -C0NRARB en donde RA y RB son independientemente un grupo alquilo de o un grupo bencilo sustituido en el anillo fenilo por un grupo de fórmula -0CH2C0Rß en donde RB es hidroxilo, amino, alcoxi de Ci-C3, fenilalcoxi de C^Cj, alquilamino de ^Cs, di (alquil de C3-C6) amino, fenilalquilamino de C^Cs,- o un grupo alquilo de C1-C6 heterocíclico, ya sea que esté no sustituido o mono- o di-sustituido en el anillo heterocíclico con halo, nitro, carboxi, alcoxi de Cj-C^ ciano, alcanoilo de Cj-C3, trifluorometilalquilo de Cj-Cj, hidroxi,
formilo, amino, alquilamino de dialquil amino, mercapto, alquiltio de hidroxialquilo de Cx-C6, mercaptoalquilo de O alquil (Ci- ) fenilmetilo,- o un grupo -CR„R_RC en el cual: cada uno de Ra, Rb y Rc es independientemente hidrógeno, alquilo de C[-Cg, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, fenilalquilo de Cj-Cg, cicloalquilo de C3-C8; o R. es hidrógeno y R„ y Rb son independientemente fenilo o heteroarilo tal como piridilo; o R_ es hidrógeno, alquilo de Cj-Cg, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, fenilalquilo de C3-C6 o cicloalquilo de C3-Cß, y R, y Rb junto con el átomo de carbono al cual están unidos, forman un cicloalquilo de 3 a 8 miembros o un anillo heterocíclico de 5 a 6 miembros; o Ra, Rb y Rc junto con el átomo de carbono al cual están unidos, forman un anillo tricíclico (por ejemplo adamantilo) ; o Ra y Rb, son cada uno independientemente alquilo de Cj-Cg, alquenilo de C2-C3, alquinilo de C2-C3, fenilalquilo de C1-Ce o un grupo como se define para R= abajo, diferente de hidrógeno, o R, y Rb, junto con el átomo de carbono al cual están unidos, forman un anillo cicloalquilo o heterocíclico, y R. es hidrógeno, -OH, -SH, halógeno, -CN, -C02H, perfluoroalquilo de d-C,, -CH2OH, -C02 alquilo de Cj-C8, -O alquilo de d-Cg, -O alquenilo de C2-C6, -S alquilo de Cj-Cg, -SO
alquilo de Cj-Cg, -S02 alquilo de d-Cg, -S alquenilo de C2-Cß, -SO alquenilo de C2-C6, -S02 alquenilo de C2-C6 o un grupo -Q-W, en donde Q representa un enlace -0-, -S-, -SO- o -S02- y W representa un grupo fenilo, fenilalquilo, cicloalquilo de C3-CB, cicloalquilalquilo de C3-C„, cicloalquenilo de C4-C8, cicloalquenilalquilo de C4-Cß, heteroarilo o heteroarilalquilo, grupo W el cual opcionalmente está sustituido por uno o más sustituyentes que se seleccionan independientemente de hidroxilo, halógeno, -CN, -C02H, -C02 alquilo de d-Cg, -C0NH2, -CONH alquilo de Cx-C6, -CONH (alquil de Cj-Cg , -CHO, -CH20H, perfluoroalquilo de C^-C,, -0 alquilo de d-Cg, -S alquilo de Cj-Cg, -SO alquilo de -S02 alquilo de Cj-Cg, -N02, -NH2, -NH alquilo de Cj-Cg, -N (alquilo de Cj-Cg);,, -NHCO alquilo de Cj-Cg, alquilo de Cj-Cg, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, cicloalquilo de C3-Cß, cicloalquenilo de C4-Ca, fenilo o bencilo. Los ejemplos de grupos R4 particulares incluyen metilo, etilo, bencilo, 4-clorobencilo, 4-hidroxibencilo, fenilo, ciciohexilo, ciclohexilmetilo, piridin-3-ilmetilo, ter-butoximetilo, naftilmetilo, iso-butilo, sec-butilo, ter-butilo, 1-benciltio-l-metiletilo, 1-metiltio-l-metiletilo, 1-mercapto-1-metiletilo, 1-metoxi-l-metiletilo, 1-hidroxi-l-metiletilo, 1-fluoro-1-metiletilo, hidroximetilo, 2 -hidroxietilo, 2-carboxietilo, 2-metilcarbamoiletilo, 2-carbamoiletilo y 4-
aminobutilo. Los grupos R4 actualmente preferidos incluyen terbutilo, isobutilo, bencilo y metilo. R3 y R4 cuando se toman junto con los átomos de nitrógeno y de carbono a los cuales están unidos respectivamente, pueden formar un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 5 a 8 átomos. Por ejemplo, R3 y R„ pueden formar un puente entre los átomos de nitrógeno y carbono a los cuales están unidos, el puente está representado por el radical divalente -(CH2)3.6-, o - ( CH2 ) r- 0 - ( CH2 ) ,- , o - (CH¡),-S- (CH¡1 ,- , en donde r y s son cada uno independientemente 1, 2 ó 3, con la condición de que r+s = 2, 3, 4 ó 5. Rs Y R6 pueden ser independientemente, por ejemplo, hidrógeno, metilo, etilo, terbutilo, ciclopentilo, ciciohexilo, 1, 1, 3 , 3-tetrametilbutilo, bencilo o 2-hidroxietilo; o R5 y R6, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, pueden formar un anillo N-heterocíclico monocíclico de 5 a 8 miembros, saturado, el cual está unido vía el átomo de N y el cual opcionalmente contiene -N(RX1)- en donde R„ es hidrógeno o alquilo de Cj-Cg, bencilo, acilo o un grupo protector de amino, 0, S, SO o S02 como un miembro de anillo y/o está opcionalmente sustituido por uno o más átomos de C por hidroxi, alquilo de C1-C6, hidroxialquil de C1-C€- , alcoxi de C1-C6 , oxo, oxo cetalizado, amino, mono (alquil de d-Cg) amino, di (alquil de d-Cg) amino, carboxi, alcoxicarbonilo de d-Cg,
hidroximetilo, alcoximetilo de d-Cg, carbamoilo, mono (alquil de Cj-Cg) carbamoilo , di (alquil de Cj-Cg) carbamoilo o hidroxiimino . Los ejemplos de tales anillos son 1-pirrolidinilo sustituido o no sustituido, piperidin-1-ilo, 1-pi?erazinilo, hexahidro-1-piridazinilo, morf olin-4-ilo, tetrahidro-1 , 4-tiazin-4-ilo,- 1-óxido de tecrahidro-1, -tiazin- -ilo, 1,1-dióxido de tetrahidro-1, 4-tiazin-4-ilo, hexahidroazipino u octahidroazocino. Los ejemplos sustituidos de lo anterior son 2 - (metilcarbamoil ) -1-pirrolidinilo, 2 - (hidroximetil ) -1-pirrol idinilo , 4 -hidroxipiperidino , 2 - (metilcarbamoil) piperidino, 4-hidroxiiminopiperidino, 4-metoxipiperidino, 4-metilpiperidin-l-ilo, 4-bencilpiperidin-l-ilo, 4-acetilpiperidin-l-ilo, 4-metil-l-piperazinilo, 4-fenil-1-piperazinilo, 1 , 4 -dioxa- 8 -azaspiro [4 , 5 ] decan- 8 - ilo , hexahidro-3- (metilcarbamoil) -2-piridazinilo y hexahidro-1- (benciloxicarbonil) -2-piridazinilo,decahidroisoquinolin-2-ilo y 1,2,3, 4-tetrahidroisoquinolin-2-ilo. Cuando A es un grupo de la fórmula (IA) , actualmente se prefiere que R5 sea metilo o hidrógeno y que R6 sea metilo.
R7 puede ser, por ejemplo hidrógeno, o un grupo
R20C(O)- en donde R20 es un grupo alquilo de Cj-Cg tal como metilo o etilo.
Los ejemplos específicos de compuestos útiles como agentes antibacterianos de acuerdo con la invención incluyen aquéllos de los ejemplos específicos en la presente. Loe compuestos novedosos preferidos de la invención incluyen: (lS-dimetilcarbamoil-etil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico (ÍS -dimetil carbamoil -2 , 2-dimetilpropil) -amida del ácido 2R (o ? ) - [( formi 1 - hidroxi - amino ) -met i 1 ] - 3 -ciclopentilpropiónico y sus sales aceptables farmacéutica y veterinariamente . Los compuestos con los cuales se relaciona la invención se pueden preparar al desproteger un compuesto N-formil-N-hidroxiamino O protegido de fórmula (II) :
en la cual R1# R2 y A son como se definen en la fórmula general
(I) y R25 es un grupo protector de hidroxi removible para dejar un grupo hidroxi por hidrogenólisis o por hidrólisis. Bencilo
es un grupo Rs preferido para remoción por hidrogenólisis y terbutilo y tetrahidropiranilo son grupos preferidos para remoción por hidrólisis acida. Los compuestos de fórmula (II) en donde A es un grupo de fórmula (IA) , (IB) , (IC) o (ID) se puede preparar al provocar que un ácido de la fórmula (III) o un derivado activado del mismo reaccione con una amina de la fórmula (IVA) , (IVB) , (IVC) o (IVD) respectivamente
(IVD) (IVC)
en donde Rlf R2, R3, R4, R5, R6 y R7 son como se definen en la fórmula general (I) excepto que el grupo -OH en (IVB) y cualquier sustituyente en Rlf R2, R3, R4, R5, R6 y R7 los cuales son potencialmente reactivos en la reacción de acoplamiento, en sí mismos se deben proteger de tal reacción y R5 es como se define en relación a la fórmula (II) anterior y opcionalmente remover grupos protectores del grupo -OH en (IVB) y R1; R2, R3,
Se pueden preparar los compuestos de fórmula (III) por N-formilación, por ejemplo utilizando anhídrido acético y ácido fórmico, o 1-formilbenzotriazol de compuestos de fórmula (V)
en donde R1( R2 y R25 son como se definen en relación a la fórmula (II) y X es ya sea un grupo auxiliar quiral o un grupo OR26, en donde R26 es hidrógeno o un grupo protector de hidroxi. En el caso en el que X sea un grupo OR26 o un grupo auxiliar quiral del grupo protector de hidroxi o auxiliar, se remueve después de la etapa de formilación para proporcionar el
compuesto de fórmula (V) . Los auxiliares quirales adecuados incluyen oxazolidinonas sustituidas las cuales se pueden remover por hidrólisis en presencia de base. En un procedimiento alternativo, los compuestos de fórmula general (II) se pueden preparar por N-formilación, por ejemplo utilizando anhídrido acético y ácido fórmico o 1-formilbenzotriazol, de compuestos de fórmula (VI)
en donde R1( R2 y R25 y A son como se definen en relación a la fórmula (II) . Los compuestos de fórmula (VI) , en donde A es un grupo de fórmulas (IA) , (IB) , (IC) o (ID) se puede preparar al provocar que un ácido de la fórmula general (VII) o un derivado activado del mismo
en donde R1# R2 y R25 son como se definen en relación a la fórmula (II) , reaccione con una amina de la fórmula (IVA) , (IVB) , (IVC) o (IVD) respectivamente como se define en lo anterior. Alternativamente, los compuestos de la fórmula general (VI) se pueden preparar por reducción de una oxima de la fórmula general (VIII) .
Los agentes reductores incluyen ciertos hidruros de metal (por ejemplo cianoborohidruro de sodio en ácido acético, trietilsilano o borano/piridina) e hidrógeno en presencia de un catalizador adecuado. En un procedimiento alternativo, los compuestos de fórmula general (II) , en donde Rx y R2 son como se definen en la fórmula general (I) , R2S es un grupo protector de hidroxi como se define en lo anterior y A es un grupo de fórmula (IA) , en donde R3, R4 y R5 son como se definen en la fórmula general (IA) y R6 es hidrógeno, se pueden preparar por una reacción de Ugi de 4 componentes de ácido carboxílico de la fórmula general
(III) como se define en lo anterior, una amina de la fórmula (IX) , un aldehido de la fórmula (X) y un isonitrilo de la fórmula (XI)
R3—NH2 (IX) R —CHO (X) R5 CN (XI)
en donde R3, R4 y R5 son como se definen en lo anterior. Se puede preparar un compuesto de la fórmula general (V) por reducción de una oxima de la fórmula general (XI)
en donde R1# R2 y R25 son como se definen en lo anterior y X ya sea un grupo OR26 como se define antes o un auxiliar quiral. Los agentes reductores incluyen ciertos hidruros de metal (por ejemplo cianoborohidruro de sodio en ácido acético.
trietilsilano o borano/piridina) e hidrógeno en presencia de un catalizador adecuado. Después de la reducción, cuando el grupo X es un auxiliar quiral, opcionalmente se puede convertir a un grupo OR26. Se puede preparar un compuesto de fórmula general (XI) por reacción de un compuesto ß-cetocarbonilo de la fórmula general (XII)
en donde R1# R2 y X son como se definen en lo anterior, con una hidroxilamina 0 protegida. Los compuestos ß-cetocarbonil (XII) se pueden preparar en forma racémica por formulación o acilación de un compuesto carbonilo de la fórmula general (XIII)
en donde R2 y X son como se definen en lo anterior, con un compuesto de la fórmula general (XIV)
en donde R1 es como se define antes y Z es un grupo saliente tal como halógeno o alcoxi, en presencia de una base. Otro método para la preparación de un compuesto de la fórmula general (V) es por la adición de Michael de un derivado de hid oxilamina a compuestos carbonilo a, ß-insaturados de fórmula general (XV)
en donde Rlf R2 y X son como se definen antes. Después de la reacción de adición de Michael, cuando el grupo X es un auxiliar quiral, opcionalmente se puede convertir un grupo OR26.
Los compuestos carbonilo , ß-insaturados (XV) se pueden preparar por métodos estándar. Las sales de los compuestos de la invención incluyen sales de adición de ácido fisiológicamente aceptables, por ejemplo clorhidratos, bromhidratos, sulfatos, metansulfonatos, p-toluensulfonatos, fosfatos, acetatos, citratos, succinatos, lactatos, tartratos, fumaratos y maleatos. Las sales también se pueden formar con bases, por ejemplo sales de sodio, potasio, magnesio y calcio. Las composiciones con las cuales se relaciona la invención se pueden preparar para administración por cualquier vía consistente con las propiedades farmacocinéticas del ingrediente o ingredientes activos . Las composiciones administrables oralmente pueden estar en forma de tabletas, cápsulas, polvos, granulos, grageas, preparaciones líquidas o en gel, tales como soluciones o suspensiones orales, tópicas o estériles parenterales. Las tabletas y cápsulas para administración oral pueden estar en forma de presentación de dosis unitaria, y pueden contener excipientes convencionales tales como agentes aglutinantes, por ejemplo jarabe, acacia, gelatina, sorbitol, tragacanto o polivinilpirrolidona; materiales de relleno, por ejemplo lactosa, azúcar, almidón de maíz, fosfato de calcio, sorbitol o glicina; lubricantes para tableteado, por ejemplo estearato de magnesio, talco, polietilenglicol o sílice; desintegrantes,
por ejemplo almidón de papa o agentes humectantes aceptables tales como laurilsulfato de sodio. Las tabletas pueden ser recubiertas de acuerdo con los métodos bien conocidos en la práctica farmacéutica normal. Las preparaciones líquidas orales pueden estar en forma de, por ejemplo, suspensiones acuosas u oleosas, soluciones, emulsiones, jarabes o elíxires, o se pueden presentar como un producto seco para reconstitución con agua u otro vehículo adecuado antes de su uso. Tales preparaciones líquidas pueden contener aditivos convencionales tales como agentes que mejoren la suspensión, por ejemplo, sorbitol, jarabe, metilcelulosa, jarabe de glucosa, grasas comestibles hidrogenadas y gelatina,- agentes emulsificantes por ejemplo lecitina, monooleato de sorbitano o acacia; vehículos no acuosos (los cuales pueden incluir aceites comestibles) , por ejemplo aceite de almendra, aceite de coco fraccionado, esteres oleosos tales como glicerina, propilenglicol o alcohol etílico; conservadores, por ejemplo p-hidroxibenzoato de metilo o de propilo o ácido sórbico; y si se desea agentes saborizantes o que imparten color, convencionales. Para aplicación tópica a la piel, los ingredientes activos pueden constituirse en una crema, loción o ungüento. Las formulaciones de crema o ungüento las cuales se pueden utilizar para el medicamento son formulaciones convencionales bien conocidas en la técnica, por ejemplo como se describe en
libros de texto estándar de farmacéutica tales como el British Pharmacopoeia . El ingrediente o ingredientes activos también se pueden administrar parenteralmente en un medio estéril . Dependiendo del vehículo y la concentración utilizada, el medicamento se puede suspender o disolver en el vehículo. Ventajosamente, también se pueden disolver en el vehículo adyuvantes tales como un anestésico local, un conservador y agentes amortiguadores. La infusión intravenosa es otra vía de administración para los compuestos utilizados de acuerdo con la invención. Las dosificaciones seguras y efectivas para diferentes clases de pacientes y para diferentes estados de enfermedad se determinarán por ensayo clínico según se requiera en la técnica. Se comprenderá que el nivel de dosis específico para cualquier paciente particular dependerá de diversos factores que incluyen la actividad del compuesto específico utilizado, la edad, peso corporal, salud general, sexo, dieta, tiempo de administración, vía de administración, velocidad de excreción, combinación con otros medicamentos y la gravedad de la enfermedad particular que se está sometiendo a terapia. El hallazgo de que estos compuestos con actividad inhibidora de PDF puede inhibir o habitar el crecimiento bacteriano, permite un enfoque novedoso para identificar nuevos agentes antibacterianos mediante pruebas de análisis de
compuestos para determinar actividad como inhibidores de PDF ia vi tro, seguido por la confirmación de su capacidad antibacteriana utilizando estudios de inhibición de crecimiento bacteriano. Este hallazgo también vuelve disponible (i) el uso de compuestos con actividad inhibidora PDF como agentes antibacterianos, y (ii) un método para el tratamiento de infección bacteriana o contaminación al aplicar o administrar un compuesto el cual inhibe la actividad de PDF bacteriana.
De acuerdo con un aspecto adicional de la invención por lo tanto, se proporciona un método para la identificación de compuestos antibacterianos, que comprende pruebas de análisis de compuestos para determinar su capacidad para inhibir PDF in vi tro, seleccionar aquéllos compuestos los cuales muestren tal capacidad y probar estos para determinar su capacidad de inhibir el crecimiento bacteriano. La capacidad para inhibir el crecimiento bacteriano se puede llevar a cabo utilizando estudios de inhibición de crecimiento bacteriano en placa o en cultivo en caldo, clásicos, tales como los realizados en los ejemplos biológicos en la presente. Un análisis de inhibición de PDF in vi tro adecuado puede comprender mezclar juntos PDF, un sustrato de PDF, preferiblemente, etiquetado con un marcador detectable, y un compuesto de prueba, y determinar, después de una duración de tiempo adecuada, si la presencia del compuesto de prueba inhibe o no la capacidad de PDF a desformilar el sustrato.
En una modalidad preferida, el sustrato separado se detecta con un marcador fluorogénico tal como fluorescamina.
Al remover el grupo formilo de la metionina N terminal del sustrato PDF, el grupo amino libre reacciona con fluorescamína lo que genera un producto fluorescente. Un análisis alternativa involucra determinar si una proteína expresada por bacterias que expresa PDF endógena (o que se expresa de manera recombinante) , cuando crece en presencia del compuesto de prueba, proporciona un sustrato adecuado para el secuenciado N terminal o proporciona una cantidad menor de sustrato, que la proteína expresada de la misma bacteria que crece en ausencia del compuesto de prueba. Tal método se puede basar en los utilizados en los Ejemplos biológicos en la presente. La persona experta en la técnica será capaz de desarrollar, sin capacidad inventiva, métodos alternativos para el análisis del compuesto de prueba para determinar su capacidad para inhibir PDF bacteriana. El antibiótico natural actinonina (véase, por ejemplo J.C.S Perkin I, 1975, 819) es un derivado de ácido hidroxámico de estructura (A) :
Además de actinonina, también se ha demostrado que varios análogos estructurales de actinonina tienen actividad antibacteriana (véase, por ejemplo Broughton et al. (Devlin et al. Journal of the Chemical Society. Perkin Transactions 1 (9):830-841, 1975; Broughton et al. Journal of the Chemical Society. Perkin Transactiosn 1 (9):857-860, 1975). Hasta ahora, no se conoce el mecanismo subyacente a la actividad antibacteriana de actinonina. Los presentes inventores han encontrado que la actinonina inhibe la actividad de PDF bacteriana. El grupo metilestatina de compuestos comparten muchas similitudes estructurales con la actinonina. Ambas son moléculas peptídicas con grupos de unión metálicos de ácido hidroxámico funcionales (Ogita et al., J. Antibiotics. 45(11) : 1723-1732; Tanzawa et al . , J. Antibiotics. 45(11): 1733-1737; Haruyama et al., J. Antibiotics. 47(12) :1473-1480; Tamaki et al., J. Antibiotics. 47 (12) : 1481-1492) . Las matlistatinas
y sus análogos estructurales cercanos están caracterizadas por la presencia en la molécula de un grupo piperazin-1, 6-diilo divalente, es decir,
En vista de su estrecha similitud estructural con actinonina, la observación de que la actinonina inhibe PDF implica que los compuestos de matlistatina también pueden inhibir PDF. De acuerdo con un aspecto adicional de la presente invención, se proporciona el uso de un compuesto el cual inhibe la actividad de PDF bacteriana, en la preparación de una composición o agente antibacteriano, con la condición de que (i) el compuesto no sea de fórmula (XI)
RCO-CH(W) -NH-CO-CH(Y) -CH2-CO-NH-OH (XI)
en donde,
(a) R es un grupo amino cíclico, W es hidrógeno, metilo, isopropilo, isobutilo o bencilo, e Y es hidrógeno, alquilo de d-Cg, fenilo, bencilo, 4-clorofenilmetilo, 4-nitrofenilmetilo o 4-aminofenilmetilo; o (b) R es 2-piridilamino o 2-tiazolilamino, W es isopropilo e Y es n-pentilo; o (c) R es dietilamino, W es metilo o isopropilo e Y es n-pentilo; o (ii) el compuesto no es uno que contenga un grupo piperazin-1, 6-diilo divalente, es decir, un grupo de fórmula (XII) :
De acuerdo con un aspecto adicional de la invención, se proporciona un método para tratar una infección o contaminación bacteriana por administración a un paciente que padece tal infección o contaminación, o aplicar al sitio de tal infección o contaminación una cantidad efectiva antibacteriana de un compuesto el cual inhibe la actividad de la enzima PDF bacteriana, con la condición de que el compuesto no sea uno
proporcionado en las exclusiones en el párrafo inmediatamente precedente. Estas exclusiones eliminan a la actinonina y sus análogos activos antibacterianos como se describen en Devlin et al . , Journal of the Chemical Society. Perkin Transactions 1 (9) :830-841, 1975 y Broughton et al. Journal of the Chemical Society. Perkin Transactions 1 (9):857-860, 1975 y los compuestos de matlistatina descritos en Ogita et al., J. Antibiotics. 45 (11) :1723-1732; Tanzawa et al., J. Antibiotics 45(11) :1733-1737; Haruyama et al . , J. Antibiotics.47(12) :1473-1480 y Tamaki et al., J. Antibiotics. 47 (12) : 1481-1492. Los siguientes ejemplos ilustran modalidades de la invención. Se preparan L- ter-leucina-N-metilamida y L-ter-leucina-N,N-dimetilamida y otros derivados de aminoácidos, de acuerdo con los métodos establecidos en la literatura. Las siguientes abreviaturas se han utilizado a través de la misma: DMF N, N-dimetilformamida EDC clorhidrato de N-etil-N1 - (3-dimetilaminopropil) - carbodiimida HOAt l-hidroxi-7-azabenzotriazol HOBt 1-hidroxibenzotriazol CLAP Cromatografía líquida de alta resolución LREM Espectrometría de masas de baja resolución
CCD Cromatografía en capa delgada Se registran los espectros de RMN *H y 13C utilizando un espectrómetro Bruker AC 250E a 250.1 y 62.9 MHz, respect ivametne . Los espectros de masas se obtienen utilizando un espectrómetro Perkin Elmer Sciex API 165 utilizando modos de ion tanto positivos como negativos. Los espectros infrarrojos se registran en un espectrómetro Perkin Elmer PE 1600 FTIR.
Ejemplo 1
(2, 2-dimetil-lS-metil-carbamoil-propil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Se prepara el compuesto del título de acuerdo con la ruta indicada en el Esquema 1 y como se describe con detalle en lo siguiente:
Esquema 1
Reactivos y condiciones: A, piperidina, HCHO, EtOH, 80°C, o/ ; B. H2N0Bzl, 80°C o/n,- C, HCOOH, Ac20; d. Pentafluorofenol , EDC, CH2C12; E. H-ter-LeuNHMe, DMF, 35°C; F. H2, 10% Pd/C, EtOAc/EtOH.
ETAPA A: ácido 2-butilacrílico
Se disuelve ácido butilmalónico (25 g, 156 mmoles) en 250 ml de etanol y se agrega una solución de formaldehído 37% (15.45 ml, 156 mmoles) seguido por piperidina (47 ml, 624 mmoles) . La mezcla se agita durante la noche a 80 °C bajo un condensador de reflujo. Los solventes se remueven bajo presión reducida y el residuo se diluye con ácido clorhídrico 1 M y se extrae con diclorometano (3 x 30 ml) . Los extractos orgánicos combinados se lavan con salmuera, se secan sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtran y evaporan para proporcionar el producto deseado como un aceite amarillo (25 g, con solvente residual) . -R N: d (CDC13) , 10.04 (1H, s amplio) , 6.22 (1H, s) , 5.57 (1H, d, J = 1.3 Hz), 2.30 (2H, t, J = 6.9 Hz), 1.38 (4H, m) y 0.91 (3H, t, J = 7.2 Hz) .
ETAPA B: ácido 2RS- (benciloxiammometil) -hexanoico
Una mezcla de ácido 2 -butilacrí lico (3.43 g,
27.1 mmoles) y O-bencilhidroxilamina (5 g, 40.65 mmoles) se calienta a 80 °C durante la noche. La mezcla se enfría a temperatura ambiente, se diluye con 40 ml de acetato de etilo y se lava con ácido clorhídrico 1M (3 x 20 ml) , la solución saturada de carbonato ácido de sodio (2 x 20 ml) y salmuera
(2 x 20 ml) , se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y evapora para dejar el compuesto del título como un sólido blanco (2.62 g, 39%). "H-RMN: d (CDC13) , 8.05 (1H s amplio), 7.35 (5H, m) , 5.00 (2H, m) , 3.28 (2H, m) , 2.98 1H, m) , 1.31 (6H, m) y 0.88 (3H, t, J = 5.0 Hz) .
ETAPA C: ácido 2RS- [ (benciloxiformilamino) -metil] -hexanoico
Se disuelve ácido 2RS (benciloxiaminometil) -hexanoico (2.62 g, 10.51 motóles) en ácido fórmico (4 ml, 105 mmoles) y anhídrido acético (1.9 ml, 21.02 mmoles) y se agita durante la noche a temperatura ambiente. La solución se diluye con 40 ml de acetato de etilo, se lava con agua (40 ml) , 20 ml de una solución saturada de carbonato ácido de sodio y 20 ml de salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y evapora para dejar el producto deseado como un aceite amarillo (2.9 g, 99%). -RMN: d (CDC13, rotámeros), 8.21 (0.5H,
S) , 8.14 (0.5H, s) , 7.37 (5H, m) , 4.98 (2H, m) , 3.86 (1H, m) ,
3.27 (0.5H, dd, J = 6.0, 14.0 Hz) , 2.93 (0.5H, m) , 2.77 (1H, m) , 1.50 (2H, m) , 1.30 (4H, m) y 0.88 (3H, m) .
ETAPA D : é s t e r p en t a f 1 u o r o f e n í 1 i c o de l á c i do 2 R S -[ (benciloxiformilamino) -metil] -hexanoico
Se disuelve ácido 2RS- [ (benciloxiformilamino) -metil] hexanoico (30.72 g, 110 mmoles) y pentafluorofenol (26.31 g, 143 mmoles) en 150 ml de diclorometano, y la solución se agita y se enfría en un baño de hielo durante la adición de EDC (25.3 g, 131 mmoles) . Se permite que la mezcla de reacción se calienta hasta la temperatura ambiente y se agita durante la noche. La solución se lava sucesivamente con ácido clorhídrico 1 M (2 x 50 ml) , carbonato de sodio 0.5 M (2 x 50 ml) y 50 ml de salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro y se filtra. El filtrado se evapora bajo presión reducida y el residuo se purifica por cromatografía instantánea (gel de sílice, diclorometano) , para proporcionar el compuesto del título como un aceite incoloro (15.0 g, 31%). -R N: d (CDC13 rotámeros), 8.17 (1H, s amplio), 7.37 (5H, m) , 4.95 -4.70 (2H m amplio), 4.10 - 3.75 (2 H, m amplio), 3.10 (1H, s amplio), 1.88 - 1.55 (2H, m) , 3.39 (4H, m) y 0.92 (3H, t, J = 7.0 Hz) .
ETAPA E: (2 , 2 -dimetil-1-metilcarbamoilpropil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (benciloxiformilamino) -metil] -hexanoico
Se disuelve el éster pentafluorofenílico del ácido
2RS- [ (benciloxiformilamino) -metil] -hexanoico (5 g, 11 mmoles) y ter-leucina N-metilamida (1.62 g, 11 mmoles) en 60 ml de DMF, y la mezcla se agita durante la noche a 35 °C. El solvente se
remueve bajo presión reducida y el residuo se vuelve a disolver en diclorometano. La solución se lava sucesivamente con carbonato de sodio 0.5 M, ácido clorhídrico 1.0 M y salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro y se filtra. Los dos productos diastereoisoméricos se separan por cromatografía instantánea (gel de sílice, gradiente de elución con 30% a 0% de hexano en acetato de etilo) . Diastereómero A (Rf superior) : ?-RMN: d (CDC13, rotámeros), 8.12, 7.87 (1H, s 2amplio) , 7.27 (5H, m) , 6.26 (1H, d, J = 8.7 Hz) , 5.78 (1H, s amplio), 4.91 - 4.60 (2H, m amplio), 4.15 (1H, d, J = 9.2 Hz) , 3.75 (2H, m amplio), 2.79 (3H, d, J = 4.8 Hz) , 2.56 (1H, m) , 1.60 - 1.35 (2H, m amplio), 1.24 (4H, m) , 0.96 (9H, s) y 0.86 (3H, t, J = 6.7 Hz) , Diastereómero B (inferior R£) : 1H-RMN: d (CDC13, rotámeros), 8.16, 7.88 (1H, s 2amplio) , 7.27 (5H, m) , 6.28 (1H, d, J = 8.9 Hz) , 5.70 - 5.44 (1H, s amplio), 4.98 - 4.61 (2H, m amplio), 4.14 (1H, d, J = 9.2 Hz) , 3.78 - 3.62 (2H, m amplio), 2.85 - 2.60 (3H, amplio) , 2.47 (1H, m) , 1.72 - 1.25 (6H, m amplio) , 0.98 (9H, s) y 0.88 (3H, t, J = 6.7 Hz) .
ETAPA F: (2 , 2-dimetil-lS-metilcaramoilpropil) -amida del ácido 2R (o S) - t (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Se disuelve (2 , -dimetil-l-metilcarbamoilpropil) -amida del ácido 2- [ (benciloxiformilamino) -metil] -hexanoico
(diastereómero A) (1.0 g, 2.5 mmoles) en una mezcla de 20 ml de acetato de etilo y 1 ml de etanol, y la solución se coloca bajo una atmósfera de argón. Se agrega paladio 10% en carbón y se burbujea una corriente de vapor fino e hidrógeno gaseoso a través de la suspensión. Después de 40 minutos, el análisis por CCD muestra que la totalidad del material inicial se ha consumido dejando especies más polares, positivas de cloruro férrico. El sistema se purga con argón antes de remover el catalizador por filtración. El filtrado se evapora a sequedad para dejar el compuesto del título como una espuma blancuzca (810 mg, que incluye un solvente residual) . lH-R N: d ((CD3)2SO, rotámeros), 9.81, 9.41 (1H, s 2amplio) , 7.82 - 7.60 (3H, m) , 4.04 (1H, d, J = 9.3 Hz) , 3.50 - 3.02 (2H, m) , 3.87 - 2.60 (1H, m) , 2.41 (3H, d, J = 4.5 Hz) , 1.39 - 0.93 6H, m) , 0.75 (9H, s) y 0.67 (3H, t, J = 5.7 Hz). "C-RMN: d ( (CD3)2SO) , 172.5, 170.2, 157.5, 59.9, 42.8, 33.3, 29.0, 28.4, 28.2, 26.4, 24.8, 21.7 y 13.3. IR (KBr disco), vms;t 3309, 2959, 2873, 1646 y 1540 cm"1.
La (2 , 2-dimetil-l-metilcarbamoilpropil) -amida del ácido 2- [ (benciloxiformilamino) -metil] -hexanoico (diastereómero B) (1.0 g, 2.5 mmoles) se desprotege de manera similar para proporcionar el diastereómero B del compuesto del título (740 mg, 97%). -RMN: d ((CD3)2S0, rotámeros), 9.75, 9.30 (1H, s 2 amplio), 7.81 - 7.42 (3H, m) , 4.04 (1H, d, J = 9.5 Hz) , 3.53 - 3.02 (2H, m) , 2.80 - 2.55 (1H, m) , 2.41 (3H, d, J = 4.5 Hz), 1.33 - 0.82 (6H, m) , 0.72 (9H, s) y 0.67 (3H, t, J = 6.7
Hz) . "C-RMN: d ((CD3)2SO), rotámeros), 172.6, 170.4, 161.7, 157.0, 59.8, 34.0, 29.4, 28.6, 26.7, 25.2, 22.1 y 14.1. IR (KBr disco), vm„ 3312, 2959, 1640, 1541, 1369 y 1240 crn"1.
Ejemplo 2
(2, 2-dimetil-lS-ter-butilcarbamoilpropil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Los compuestos del título se preparan por analogía con el Ejemplo 1, utilizando L- ter-leucina-N- ter-butilamida en lugar de L- ter-leucina-N-metilamida en la Etapa E. Los diastereoisómeros no son separables por cromatografía instantánea (gel de sílice, acetato de etilo) en la Etapa E y se convierten a una mezcla de los derivados de N-formilhidroxilamina deseados por hidrogenólisis . Sólido blanco. "C-RMN: d ((CD3)2SO), rotámeros), 172.8, 172.5, 170.1, 169.6,
161.6, 156.9, 59.9, 59.7, 51.9, 51.7, 50.2, 49.6, 48.3, 43.2,
43.1, 42.7, 34.2, 34.0, 29.6, 29.3, 29.2, 28.8, 28.6, 26.7,
22.2, 22.1, 20.3 y 13.9. IR (KBr disco) , vax 3311, 2964, 1639, 1548, 1456, 1394, 1364 y 1226 Cir.1.
Ejemplo 3
(lS-metil-2-morfolin-4-il-2-oxoetil) -amida del ácido 2R (o S)-[ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Una solución del éster pentafluorofenílico del ácido 2RS- [ (benciloxiformilamino) -metil] -hexanoico (Ejemplo 1, Etapa D) (445 mg, 1 mmol) en 5 ml de DMF se agrega a L alanina-N-morfolinoamida (158 mg, 1 mmol) en un tubo de ebullición y se agita a 35 °C durante la noche. Se remueve la DMF in vacuo y el residuo se vuelve a disolver en 2 ml de diclorometano y
se hace pasar a través de un cartucho de purificación (Isolute-NH2) , eluyendo con 4 ml de diclorometano con el fin de remover el pentafluorofenol . El diclorometano se remueve bajo presión reducida y el residuo se vuelve a disolver en 2 ml de ácido fórmico y 2 ml de acetato de etilo. La solución después se trata con 200 mg de paladio 10% en carbón y se agita a temperatura ambiente durante 2 horas. El catalizador se remueve por filtración a través de Celite, se lava con metanol y los solventes se remueven in vacuo . Los compuestos se purifican por CLAP en fase inversa (gradiente de elución, acetonitrilo 10-90%/agua) . Diastereómero A: "H-RMN: d (CD3OD) , 8.03 (0.5H, s) , 7.84 (0.5H, s) , 4.75 (1H, m) , 3.65 (8H, m) , 3.39 (1H, m) , 3.24 (1H, dd, J = 4.0, 13.2 Hz), 2.84 (1H, m) , 1.57 (2H, ) , 1.34 (7H, m) , y 0.92 (3H, m) . LRMS: -ve ion 328 [M-H] . Diastereoisómero B: 'H-RMN: d (CD3OD) , 3.66 (8H, m) , 3.41 (1H, dd, J = 9.98, 13.1Hz), 3.23 (1H, m) , 2.90 (0.5H, m) , 2.71 (0.5H, m) , 1.62 (2H, m) , 1.33 (7H, m) y 0.92 (3H, t, J = 6.7 Hz), LRMS: -ve ion 328 [M-H]. Se preparan los compuestos de los ejemplos 4 a 12 por analogía con el Ejemplo 3 utilizando el componente amina apropiado en lugar de L-alanina-N-morfolinoamida. Cuando se preparan ambos diastereoisómeros, el diastereoisómero A es el que eluye más rápido y el más potente contra PDF in vi tro. En algunos casos únicamente se toma el diastereómero que corre más rápido hacia el producto final.
Ejemplo 4
( ÍS -dimetilcarbamoiletil ) -amida del ácido 2R (o S) [ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Diastereómero A: -RMN: d (CD3OD) , 4.72 (1H, m) , 3.53 (1H, dd, J = 8.9, 13.0 Hz), 3.23 (1H, m) , 3.14 (3H, s) , 2.95 (3H, s) , 2.83 (0.5H, m) , 2.74 (0.5H, m) , 1.57 (2H, m) , 1.33 (7H, m) y 0.92 (3H, m) . LREM: +ve ion 288 [M+H], -ve ion 286 [M-H]. Diastereoisómero B: "H-RMN: d (CD3OD) , 4.74 (1H, m) , 3.41 (1H, dd, J = 9.9, 13.0 Hz), 3.25 (1H, dd, J = 4.0, 13.1 Hz) , 3.15 (3H, s), 2.97 (3H, s), 2.89 (0.5H, m) , 2.72 (0.5H, m) , 1.53 (2H, m) , 1.33 (7H, m) y 0.93 (3H, t, J = 6.7 Hz) . LREM: +ve ion 310 [M+Na] , -ve ion 286 [M-H] .
Ejemplo 5
(lS-hidroximetil-3-metil-butil) -amida del ácido 2R (o S) [ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Diastereoisómero A: -RMN: d (CD3OD) , 4.07 (1H, m) , 3.55 (1H, m) , 3.45 (2H, m) , 3.20 (1H, m) , 2.85 (0.5H, m) , 2.80 (0.5H, m) ,
1.60 (3H, m) , 1.35 (6H, m) y 0.93 (9H, m) . LREM: +ve ion 289
[M+H] , -ve ion 287 [M-H] . Diastereoisómero B: 'H-RMN: d (CD30D) , 4.07 (1H, m) , 3.59 (1H, m) , 3.45 (2H, m) , 3.24 (1H, m) , 2.70 (1H, m) , 1.62 (3H, m) , 1.35 (6H, m) y 0.93 (9H, m) . LREM: +ve ion 311 [M+Na], 289
[M+H] , -ve ion 287 [M-H] .
Ejemplo 6
(lS-hidroximetil-2-f eniletil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (f ormilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Diastereoisómero A: -RMN: d (CD30D) , 7.24 (5H, m) , 4.15 (1H, m) , 3.54 (2H, d, J = 5.4Hz), 3.38 (1H, dd, J = 7.8, 13.1 Hz), 3.14 (1H, dd, J = 4.7, 13.2 Hz), 2.95 (1H, dd, J = 7.3, 13.7 Hz), 2.68 (2H, m) , 1.58 (2H, m) , 1.32 (4H, m) , y 0.91 (3H, t, J = 6.7 Hz) . LREM: +ve ion 345 [M+Na], 323 [M+H], -ve ion 321 [M-H] . Diastereoisómero B: LREM: +ve ion 345 [M+Na], 323 [M+H], -ve ion 321 [M-H] .
Ejemplo 7
[2, 2-dimetil-lS-?iridin-2-il-carbamoil) -propil] -amida del ácido 2R (o S) -[ (formilhidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Diastereoisómero A: aceite incoloro 'H-RMN: d (CD3OD) , 8.34 (1H, m) , 8.06 (1H, m) , 7.90 (1H, m) , 7.33 (1H, m) , 4.45 (1H, s) , 3.55 (1H, dd, J = 8.3, 13.2 Hz), 3.25 (1H, m) , 3.05 (1H, m) ,
1.61 (2H, m) , 1.32 (4H, m) , 1.11 (9H, s) y 0.85 (3H, m) . LREM: +ve ion 379 [M+H] , -ve ion 377 [M-H] . Diastereoisómero B: aceite incoloro. ^-RMN: d (CD30D) , 8.33 (1H, m) , 8.20 (0.5H, m) , 7.93 (1H, m) , 7.41 (0.5H, m) , 7.28 (1H, m) , 4.48 (1H, s) , 3.52 (1H, dd, J = 8.8, 13.1 Hz), 3.23 (1H, dd, J = 3.9, 13.1 Hz) , 3.05 (0.5H, m) , 2.87 (0.5H, m) ,
1.62 (2H, m) , 1.36 (4H, m) , 1.11 (9H, s) y 0.93 (3H, m) . LREM: +ve ion 393 [M+Na] , 379 [M+H] , -ve ion 377 [M-H] .
Ejemplo 8
(lS-dimetilcarbamoil-2-metilpropil) -amida del ácido 2R (o S)-[ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Diastereoisómero A: aceite incoloro. LRMS: +ve ion 338 [M+Na], -ve ion 319 [M-H] .
Ejemplo 9
(lS-dimetilcarbamoil-2-feniletil) -amida del ácido 2R (o S)-[ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Diastereoisómero A: aceite incoloro. LRMS: +ve ion 386 [M+Na] -ve ion 362 [M-H] . Diastereoisómero B: aceite incoloro. LRMS: +ve ion 386 [M+Na] -ve ion 362 [M-H] .
Ejemplo 10
(lS-dimetilcarbamoil-3-metilbutil) -amida del ácido 2R (o S) [ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Diastereoisómero A: aceite incoloro. LRMS: +ve ion 352 [M+Na] -ve ion 328 [M-H] .
Ejemplo 11
[3-metil-lS-pirrolidin-l-carbonil) -butil] amida del ácido 2R (o S) - [ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Diastereómero A: aceite incolor. LRMS: -ve ion 354 [M-H] .
Ejemplo 12
Dimetilamida del ácido 1-{2R (o S) -[ (formilhidroxiamino) metil] -hexanoil} -pirrolidin-2S-carboxílico
Diastereoisómero A: aceite incoloro. LRMS: +ve ion 336 [M+Na], -ve ion 312 [M-H] . Diastereoisómero B: aceite incoloro. LRMS: +ve ion 336 [M+Na], -ve ion 312 [M-H] .
Ejemplo 13
(lS-dimetilcarbamoil-2, 2-dimetilpropil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Método I
Una ruta de síntesis para el compuesto del título se indica en el Esquema 2 y se describe a continuación con detalle .
Esquema 2
Etapa C [~
Etapa E
A. HCOOEt, NaOEt; B. HCl.NHOBzl, NaOAc, EtOH acuoso; C. NaOH, MeOH; D. H-TleNMe2, EDC, HOAt, DMF; E. NaCNBH3, AcOH y después separar diastereoisómeros,- F. HCOBt, THF; G. H2, Pd/C, MeOH.
Etapa A: éster etílico del ácido 2RS-formil-heptanoico
Se corta sodio metálico (4.38 g, 0.191 mmoles) en piezas pequeñas y se coloca en un matraz de fondo redondo de dos cuellos, secado al horno, bajo una atmósfera de argón. Se agregan 100 ml de éter dietílico anhidro y la suspensión se agita y se enfría a 0°C. El matraz se coloca con un condensador de reflujo antes de la adición a gotas de etanol (1.03 ml, 17.3 mmoles) . Después se agrega a gotas una mezcla de formiato de etilo (15.41 g, 0.208 mmoles) y caproato de etilo (25 g, 0.173 inmoles) por medio de un embudo de goteo durante un período de aproximadamente 20 minutos. Se permite que la suspensión naranja resultante (el sodio metálico aún es visible) se calienta hasta la temperatura ambiente y se agita durante la noche. La suspensión naranja espesa resultante (no hay sodio metálico visible) se enfría a 0°C y se diluye con 100 ml de agua enfriada con hielo. La mezcla se transfiere a un embudo de separación y se remueve la fase acuosa, se lava con éter dietílico, se enfría a 0°C y se acidifica con 200 ml de ácido clorhídrico 1 M. La emulsión se extrae con acetato de etilo y la capa orgánica se separa, se lava con salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro y se filtra. El filtrado se concentra bajo presión reducida para proporcionar un aceite amarillo que contiene principalmente 11.09 g del compuesto del
título el cual se utiliza sin purificación adicional en la etapa B .
Etapa B: éster etílico del ácido 2RS- (benciloxiimino-metil) -heptanoico
El producto de Claisen crudo de la Etapa (11.0 g, 63.9 mmoles) se disuelve en 100 ml de etanol y 10 ml de agua, y se enfría a 0°C durante la adición de acetato de sodio (6.2 g, 76.6 mmoles) y clorhidrato de O-bencilhidroxilamina (12.23 g, 76.6 mmoles) . Se permite que la mezcla se caliente hasta la temperatura ambiente y se agite durante la noche. La suspensión resultante se filtra y el filtrado se concentra bajo presión reducida. La pasta amarilla residual se divide entre acetato de etilo y agua. La capa orgánica se lava con ácido clorhídrico 1 M y salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y se evapora hasta un aceite amarillo. El producto deseado se obtiene por cromatografía instantánea (gel de sílice, gradiente de elución con acetato de etilo 10% a 25% en hexano. Rendimiento 9.19 g (52%). 1H-RMN: d (CDC13) , mezcla de syn- y anti -isómeros) , 7.46 (0.6H, d, J = 8.0 Hz), 7 38-7.28 (5H, m) , 6.79 (0.4H, d, J = 7.1 Hz) , 5.11 (0.8H, s), 5.08 (1.2H, s) , 4.16 (1.2H, c, J = 7.0 Hz) , 4.13 (0.6H, c, J = 7.0 Hz) , 3.91 (0.4H, c, J = 7.2 Hz) , 3.21 (0.6H, td, J = 8.0 y 6.1
Hz), 1.90-1.48 (2H, m) , 1.37-1.20 (7H, m) , 0.87 (3H, t, J = 7.0 Hz) .
Etapa C: ácido 2RS- (benciloxiimino-metil) -heptanoico
Se disuelve el éster etílico del ácido 2RS-(benciloxiiminometil) -heptanoico (7.0 g, 25.24 mmoles) en 125 ml de metanol y la solución se enfría a 0°C. Se agrega en porciones hidróxido de sodio 1 M (26 ml, 26 mmoles) durante 2 minutos para proporcionar una emulsión amarillo claro. Se agrega metanol adicional hasta que se obtiene una solución transparente. Se permite que la solución se agite durante 90 minutos a 0°C y después durante 5 horas a temperatura ambiente, después de lo cual el análisis por CCD sugiere que la totalidad del material inicial se ha consumido. El solvente se remueve bajo presión reducida y el residuo se divide entre agua y acetato de etilo. La capa acuosa se enfría a 0°C y se acidifica con ácido clorhídrico 1 M. La emulsión que se forma de esta manera se extrae dos veces con acetato de etilo. Los extractos orgánicos combinados se lavan con salmuera, se secan sobre sulfato de magnesio anhidro y se filtran. El filtrado se concentra bajo presión reducida para proporcionar el compuesto del título como un aceite amarillo (5.15 g, 82%) el cual se utiliza sin purificación adicional en la etapa D. 1H-RMN: d (CDC13, mezcla de syn) - y anti , -isómeros) , 8.00 (1H, s,
amplio), 7.46 (0.6H, d, J = 7.9 Hz) , 7.36-7.24 (5H, m) , 6.80 (0.4H, d, J = 7.0 Hz), 5.13 (0.8 H, s) , 5.09 (1.2H, s) , 3.194 (0.4H, c, J = 7.1 Hz), 3.27 (0.6H, td, J = 6.4 y 8.0 Hz), 1.94-1.58 (2H, m) , 1.48-1.24 (4H, m) y 0.94-0.84 (3H, m) .
Etapa 3: (lS-dimetilcarbamoil-2, 2-dimetilpropil) -amida del ácido 2RS- (benciloxiimino-metil) -heptanoico
El ácido 2- (benciloxiimino-metil) heptanoico (5.16 g, 20.7 mmoles) , ter-leucina N, N- dimet ilamida (3.60 g, 22.77 mmoles) y EDC (4.7 g, 24.84 mmoles) se agitan juntos en 75 ml de DMF y se enfrían a 0°C. Se agrega HOAt (250 mg, cat.) , y la mezcla amarilla brillante se permite que se caliente hasta la temperatura ambiente y se agita durante la noche. El solvente se remueve bajo presión reducida y el aceite residual se divide entre acetato de etilo y ácido clorhídrico 1 M. La capa orgánica se lava con salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y se concentra a sequedad bajo presión reducida. Se obtiene el compuesto del título como un aceite incoloro por cromatografía instantánea (gel de sílice, gradiente de elución con 33% a 66% de acetato de etilo en hexano). Rendimiento, 6.84 g (85%). 'H-RMN: d (CDC13, mezcla de syn) - y anti , -isómeros) , 7.45 (0.6H, 2d) , 7.40-7.26 (5H, m) , 6.72 (0.4H, 2d) , 6.58 (1H, m) , 5.20-4.69 (3H, m) , 3.82 (0.4H, m) , 3.16-3.10 (3H, m) , 3.05 (0.6H, m) , 2.99-2.92 (3H, m) , 1.90-
1.54 (2H, m) , 1.39-1.17 (4H, m) , 0.97 (2.7H, s) , 0.96 (1.8H, s) , 0.94 (2.7H, s) , 0.92 (1.8H, s) y 0.92-0.82 (3H, m) .
Etapa E: (lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetilpropil) amida del ácido 2R (o S) - (benciloxiamino-metil) -heptanoico
A una solución de (lS-dimetil-carbamoil-2 , 2 -dimetilpropil) amida del ácido 2RS- (benciloxiimino-metil) -heptanoico en 40 ml de ácido acético se agrega cianoborohidruro de sodio (2.02 g, 32.0 mmoles) en una porción. Durante el curso de una hora, el reactivo se disuelve lentamente con efervescencia moderada para proporcionar una solución incolora la cual se deja agitar durante la noche. El solvente se remueve por evaporación bajo presión reducida y se separa por formación de azeótropos con tolueno. El aceite restante se divide entre dietiléter y carbonato de sodio 1 M (¡PRECAUCIÓN! se produce un poco de gas) . La capa orgánica se lava con 70 ml de salmuera, se lava con salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y se concentra a sequedad bajo presión reducida. Los dos diastereoisómeros del compuesto del título se purifican y se separan por cromatografía instantánea (gel de sílice, gradiente de elución con 50% a 100% de acetato de etilo en hexano) . Diastereómero A (elución más rápida) : aceite incoloro (2.27 g, 45%). __-RMN: d (CDC13) , 7.43-7.28 (5H, m) , 6.76 (1H, d amplio,
J = 9.4 Hz) , 5.69 (1H, s amplio), 4.93 (1H, d, J = 9.4 Hz) , 4.72 (2H, S) , 3.15 (3H, s) , 3.18-3.00 (2H, m) , 2.96 (3H, s), 2.49 (1H, m) , 1.66-1.49 (2H, m) , 1.46-1.19 (4H, m) , 0.99 (9H, s) y 0.86 (3H, t, J = 6.8 Hz) . Diastereómero B (elución más lenta): aceite incoloro (1.44 g, 46%). -RMN: d (CDC13) , 7.40-7.27 (5H, m) , 6.70 (1H, d amplio, J = 9.0 Hz), 5.99 (1H, s amplio), 4.85 (1H, d, J = 9.0 Hz), 4.71 (2H, d, J = 1.6 Hz), 3.16 (3H, s) , 3.06-2.97 (2H, m) , 2.95 (3H, s) , 2.57 (1H, m) , 1.74-1.21 (6H, m) , 1.00 (9H, s) y 0.88 (3H, t amplio, J = 6.7 Hz) .
Etapa F: (lS-dimetilcarbamoil-2 , 2 -dimetil -propil) amida del ácido 2R (o S) -[ (benciloxiformilamino) -metil] -heptanoico
Se disuelve la 1 S - d ime t i 1 c a r amo i 1 - 2 , 2 -dimetilpropil ) amida del ácido 2 - (benciloxiamino-metil ) -heptanoico (diastereómero A) (2.02 g, 5.13 mmoles) en 50 ml de THF anhidra y se coloca bajo una atmósfera de argón. Se agrega N-formil-benzotriazol (A.R. Katritzky et al . , Synthesis 1995, 503) (0.83 g, 5.65 mmoles) y se permite que la mezcla se agite a temperatura ambiente durante 4 horas . El solvente se evapora bajo presión reducida y el aceite residual se divide entre diclorometano e hidróxido de sodio 1 M. La capa orgánica se lava con más hidróxido de sodio y salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y se concentra a
sequedad bajo presión reducida. El compuesto del título se obtiene como un sólido cristalino blanco por cromatografía instantánea (gel de sílice, elución con acetato de etilo 33% en hexano) . Rendimiento 1.60 g (74%) . __-RMN: d (CDC13 rotámeros), 8.00 (1H, m amplio) , 7.47-7.29 (5H, m) , 6.25 (1H, d amplio, J = 9.3 Hz) , 5.08-4.74 (2H, m amplio), 4.87 (1H, d, J = 9.4 Hz), 3.89-3.52 (2H, m amplio) , 3.13 (3H, s) , 2.94 (3H, s), 2.54 (1H, m) , 1.67-1.11 (6H, m) , 0.95 (9H, s) y 0.85 (3H, t amplio, J = 6.9 Hz) . La (lS-dimetilcarbamoil-2, 2-dimetilpropil)amida del ácido 2- (benciloxiaminometil) -heptanoico (diastereómero B) se prepara de manera similar a partir del diastereómero que eluye más lentamente en la etapa E. Rendimiento, 0.38 g (41%) . "H-RMN: d (CDC13, rotámeros), 8.00 (1H, m amplio), 7.47-7.28 (5H, m amplio) , 6.29 (1H, d amplio, J = 9.3 Hz), 5.01-4.63 (2H, m amplio), 4.88 (1H, d, J = 9.3 Hz) , 3.82-3.51 (1.5H, m amplio), 3.20-2.78 (6.5H, m amplio) , 2.50 (1H, m amplio) , 1.76-1.17 (6H, m amplio), 0.97 (9H, s) y 0.85 (3H, t amplio, J = 6.7 Hz) .
Etapa G: (lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetilpropil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Se disuelve (lS-dimetilcarbamoil-2, 2-dimetilpropil) amida del ácido 2- [ (benciloxiformilamino) -metil] -
heptanoico (1.43. g, 3.41 inmoles) en 50 ml de metanol y se coloca bajo una atmósfera de argón. Se agrega una suspensión de paladio 10% en carbón (100 mg, cat.) en 2 ml de acetato de etilo y la mezcla se agita vigorosamente mientras se burbujea hidrógeno gaseoso a través de la solución. Después de 10 minutos la mezcla se coloca bajo una atmósfera de hidrógeno y se deja agitar durante 3 horas, después de lo cual el análisis por CCD indica que la totalidad del material inicial se ha consumido. El sistema se purga con argón y el catalizador se remueve por filtración. El filtrado se concentra bajo presión reducida para proporcionar el compuesto del título como una espuma higroscópica incolora (1.11 g, 99%). 'H-RMN: d (CDC13, rotámeros), 8.41 (0.35H, s) , 7.83 (0.65H, s amplio), 6.80 (0.35H, d amplio, J = 8.9 Hz) , 6.62 (0.65H, d amplio, J = 9.4 Hz), 4.91 (0.65H, d amplio, J = 9.4 Hz) , 4.88 (0.35H, d amplio, J = 8.9 Hz) , 4.04 (1H, dd, J = 14.7 y 7.4 Hz) , 3.82 (0.65, dd, J = 14.0 y 9.7 Hz) , 3.56 (0.35H, dd, J = 14.7 y 3.3 Hz) , 3.48 (0.65H, dd, J = 14.0 y 4.0 Hz) , 3.16 (1.05H, s) , 3.15 (1.95H, S) , 2.98 (1.05H, S), 2.96 (1.95H, s) , 2.90-2.74 (0.65H, m amplio), 2.74-2.61 (0.35H, m amplio) 1.73-1.17 (6H, m amplio) , 0.99 (3.15H, s) . 0.95 (5.85H, s) y 0.87 (3H, t amplio, J = 6.7 Hz) . "C-RMN: d (CDC13) , 174.6, 171.2, 162.2, 157.2, 60.1, 54.5, 54.3, 52.3, 48.4, 44.8, 44.3, 35.6, 35.4, 29.6, 29. C, 26.3, 20.8, 20.2, 14.0 y 13.7. LREM: -ve ion 328 [M-H].
La (lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetilpropil) -amida delácido 2- [ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico (diastereómero B) se prepara de manera similar a partir del díastereómero B en la Etapa E -RMN: d (CDC13, rotámeros) , 9.37 (0.5H, s), 8.40 (0.5H, s) , 7.75 (0.5H, s amplio), 6.62 (0.5H, s amplio) , 6.41 (0.5H, d amplio, J = 7.1 Hz) , 4.87 (0.5H, d amplio, J = 6.6 Hz) , 4.66 (0.5H, d amplio, J = 7.6 Hz) , 3.84-3.39 (2H, m) , 3.21 (1.5H, s amplio), 3.14 (1.5H, s amplio), 2.98 (3H, s amplio), 2.91-2.54 (1H, m) , 1.79-1.23 (6H, m) , y 1.08-0.83 (12H, m) . "C-RMN: d (CDC13, rotámeros), 174.9, 173.3, 56.3, 54.8, 51.6, 50.3, 45.5, 45.1, 38.6, 38.4, 36.2, 36.0, 35.3, 34.4, 29.5, 29.4, 29.3, 29.2, 26.6, 26.5, 22.6, 22.5 y 13.9. LREM: +ve ion 352 [M+Na], -ve ion 328 [M-H] .
Método II
Una vía de síntesis asimétrica alternativa para el compuesto del Ejemplo 13 se establece en el Esquema 3 y se describe con detalle en lo siguiente.
Esquema 3
Reactivos y condiciones: A. piperidina, HCHO, EtOH, 80C, o/n; B. tBuCOCl , Et3N posteriormente 3-litio-4-bencil-5, 5-dimetil-oxazolidin- -ona,- C. HNOBzl, temperatura ambiente, o/n y después pTsOH, EtOAc; D. LiOH, acuoso THF, 0°C; E. H-TleNM2, HOBt, EDC, DMF,- F. HCOBt, THF; G. H2, Pd/C, EtOH.
Etapa A: Ácido 2-butilacrílico
A una solución de ácido n-butilmalónico (17.2 g, 107 mmoles) en 200 ml de etanol se agrega piperidina (12.76 ml, 129 mmoles) y formaldehído acuoso 37% (40.3 ml, 538 mmoles). La solución se calienta a 80 °C, tiempo durante el cual aparece un precipitado y después se vuelve a disolver gradualmente durante 1 hora. La mezcla de reacción se agita a 80°C durante la noche y después se enfría a temperatura ambiente. Los solventes se remueven bajo presión reducida y el residuo se disuelve en 200 ml de acetato de etilo, se lava sucesivamente con ácido clorhídrico 1 N y salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio y se filtra. El filtrado se concentra para proporcionar el compuesto del título como un aceite transparente (13.37 g, 97%). ^-RMN: d (CDC13) , 6.29 (1H, s) , 5.65 (1H, S) , 2.34-2.28 (2H, m) , 1.54-1.26 (4H, m) y 0.94 (3H, t, J = 7.1 Hz) .
Etapa B: 4S-bencil-3- (2-butil-acriloil) -5, 5-dimetil-oxazolidin-2 -ona
Se disuelve ácido 2 -butilacrí lico (21.5 g,
168 mmoles) en 500 ml de THF seco y se enfría a -78°C bajo una atmósfera de argón. Se agregan trietilamina (30 ml, 218 inmoles)
y cloruro de pivaloílo (21 ml, 168 mmoles) a una velocidad tal que la temperatura permanece por debajo de -60°C. La mezcla se agita a -78°C durante 30 minutos, se calienta a temperatura ambiente durante 2 horas y finalmente se vuelve a enfriar de nuevo a -78°C. En un matraz separado, se disuelve 4S-bencil-5, 5-dimetil-oxazolidin-2-ona en 500 ml de THF seco y se enfría a -78°C bajo una atmósfera de argón. Se agrega lentamente n-butil-litio (solución 2.4 M en hexanos, 83 ml, 200 mmoles) y la mezcla se agita durante 30 minutos a temperatura ambiente. El anión resultante se transfiere vía una cánula en el recipiente de reacción original . Se permite que la mezcla se caliente a temperatura ambiente y se agita durante la noche a temperatura ambiente. La reacción se suspende con 200 ml de carbonato ácido de potasio l M y los solventes se remueven bajo presión reducida. El residuo se divide entre acetato de etilo y agua. La capa orgánica se lava con salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y se concentra bajo presión reducida para proporcionar un aceite naranja. El análisis de CCD muestra la presencia de un auxiliar quiral que no ha reaccionado además del producto requerido. Se disuelve una porción de 30 g del material en diclorometano y se lava a través de una almohadilla de sílice para proporcionar 25.3 g del compuesto del título puro como un aceite amarillo. *H-RMN: d (CDC13), 7.31-7.19 (5H, m) , 5.41 (2H, s) , 4.51 (1H, dd, J =
9.7, 4.2 Hz), 3.32 (1H, dd, J = 14.2, 4.2 Hz), 2.82 (1H, dd, J = 14.2, 9.7 Hz), 2.40-2.34 (2H, m) , 1.48-1.32 (4H, m) , 1.43 (3H, s) , 1.27 (3H, s) y 0.91 (3H, t, J = 7.1 Hz) . Se recupera un poco de auxiliar quiral mediante lavado de la almohadilla de sílice con metanol.
Etapa C: (sal del ácido p-toluensulfónico) de 4S-bencil-3- [2-(benciloxiamino-metil) -hexanoil] -5, 5-dimetil-oxazolidin-2-ona
Se mezcla 4S-bencil-3- (2-butilacriloil) -5, 5 -dimetil -oxazolidin-2-ona (19.8 g, 62.8 mmoles) con 0 -bencilhidroxilamina (15.4 g, 126 mmoles) y se agita durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla se disuelve en acetato de etilo y la solución se lava con ácido clorhídrico 1 M, carbonato de sodio 1 M y salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro y se filtra. El filtrado se concentra bajo presión reducida hasta 25.3 g de un aceite amarillo claro el cual se muestra por RMN y análisis por CLAP que contiene 4S-bencil-3- [2- (benciloxiamino-metil) -hexanoil] -5 , 5 -dimetil -oxazolidin-2-ona (ca. 82% d.e.) junto con trazas del material inicial. El producto se combina con otro lote (26.9 g, 76% d.e.) y se disuelve en 200 ml de acetato de etilo. Se agrega ácido p-toluensulfónico (22.7 g, 119 mmoles) y la mezcla se enfría a 0°C. El compuesto del título se obtiene como un sólido cristalino blanco mediante sembrado y raspado. Rendimiento:
.2 g, (34%, diastereoisómero único). También se obtiene una segunda cosecha (14.7 g, 20% de diastereoisómero solo) . *H-RMN: d (CDC13) , 7.89 (2H, d, J = 8.2 Hz) , 7.37-7.12 (10H, m) , 7.02 (2H, d, J = 6.9 Hz), 5.28-5.19 (2H, m) , 4.55 (1H, m) , 4.23 (1H, m) , 3.93 (1H, m) , 3.58 (1H, m) , 2.58 (1H, M) , 2.35 (3H, s) , 1.67-1.51 (2H, M) , 1.29-1.16 (4H, m) , 1.25 (3H, s), 1.11 (3H, s) y 0.80-0.75 (3H, m) .
Etapa D: Ácido 2R-benciloxiamino-metil) -hexanoico
La sal del ácido 4S-bencil-3- [2R- (benciloxiamino-metil) -hexanoil] -5 , 5 -dimetil -oxazolidin- 2 -ona (25.2 g, 40.2 mmoles) se divide entre acetato de etilo y carbonato de sodio 1 M. La fase orgánica se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y se evapora bajo presión reducida. El aceite residual se disuelve en 150 ml de THF y 50 ml de agua, y se enfría a 0°C y se trata con hidróxido de litio (1.86 g, 44.2 mmoles) . La solución se agita durante 30 minutos a 0°C, y después durante la noche a temperatura ambiente . La reacción se acidifica hasta pH 4 con ácido cítrico 1 M y loe solventes se remueven. El residuo se divide entre diclorometano y carbonato de sodio 1 M. La capa acuosa básica se acidifica a pH 4 con ácido cítrico 1 M y se extrae tres veces con acetato de etilo. Las capas orgánicas combinadas se secan sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtran y se concentran para
proporcionar el compuesto del título como un aceite incoloro (7.4 g, 73%). 'H-RMN: d (CDC13) , 8.42 (2H, s amplio), 7.34-7.25 (5H, m) , 4.76-4.66 (2H, m) , 3.20-3.01 (2H, m) , 2.73 (1H, m) , 1.70-1.44 (2H, m) , 1.34-1.22 (4H, m) y 0.92-0.86 (3H, m) .
Etapa E.- (lS-dimetilcarbamoil-2, 2-dimetil-l-propil) -amida del ácido 2R- (benciloxiamino-metil) -hexanoico
Se disuelve el ácido 2R-benciloxiamino-metil) -hexanoico (7.98 g, 3.18 mmoles) en 150 ml de DMF y la solución se enfría a 0°C. Se agregan EDC (6.1 g, 31.8 mmoles) y HOBt (430 mg, 3.2 mmoles) y la mezcla se agita durante 15 minutos. Se agrega ter-leucina-N,N-dimetilamida (5.53 g, 34 mmoles) y se permite que la reacción se caliente hasta la temperatura ambiente y se agita durante la noche. El solvente se remueve bajo presión reducida y el residuo se disuelve en acetato de etilo, se lava sucesivamente con ácido clorhídrico 1 M, carbonato ácido de sodio saturado y salmuera, se seca y se filtra. El solvente se remueve para dejar el compuesto del título como un aceite amarillo (8.7 g, 69%) el cual se utiliza en la Etapa F sin purificación adicional. "?-RMN: d (CDC13) , 7.35-7.28 (5H, m) , 6.77 (1H, d amplio, J = 9.2 Hz) , 5.69 (1H, 8 amplio), 4.93 (1H, d, J = 9.4 Hz) , 4.72 (2H, s) , 3.15 (3H, S) , 3.10-3.00 (2H, m) , 2.95 (3H, s), 2.49 (1H, m) , 1.64-1.21 (6H, m) , 0.99 (9H, s) y 0.86 (3H, t, J = 6.8 Hz).
Etapa F: (lS-dimetilcarbamoil-2,2-dimetil-l-propil) amida del ácido 2R- [ (benciloxiformilamino) -metil] -hexanoico
Se disuelve la (lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetil-l-propil) amida del ácido 2R- (benciloxiamino-metil) -hexanoico (7.8 g, 19.9 mmoles) en 100 ml de THF seco y se trata con 1-formil-benzotriazol (3.08 g, 21.0 mmoles) . La reacción se agita durante la noche a temperatura ambiente. El solvente se remueve bajo presión reducida y el residuo se disuelve en acetato de etilo, se lava con una solución de hidróxido de sodio 2 M y salmuera. La capa orgánica se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y se concentra a sequedad bajo presión reducida. El producto cristaliza a partir de éter-hexano (4.83 g, 57% en dos cosechas). -RMN: d (CDC13, rotámeros), 8.12 (0.6H, s amplio), 7.89 (0.4H, s amplio), 7.37 (5H, s) , 6.25 (1H, d, J = 9.3 Hz) , 4.96 (0.6H, s amplio), 4.86 (1H, d, J = 9.4 Hz) , 4.80 (0.4 H, s amplio), 3.74 (2H, s amplio), 3.13 (3H, S), 2.94 (3H, s), 2.53 (1H, m) , 1.387-1.21 (6H, m) , 0.95 (9H, s) y 0.85 (3H, t, J = 6.9 Hz) . Nota: se cristaliza una muestra pequeña a partir de éter-hexano para proporcionar cristales adecuados para cristalografía por rayos X. Se demuestra la estereoquímica como se establece aquí.
Etapa G: (lS-dimetilcarbamoil-2, 2-dimetil-l-propil) amida del ácido 2R- [ (formilhidroxiamino) -metil] -hexanoico
Se disuelve la (lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetil-l-propiUamida del ácido 2R- [ (benciloxiformilamino) -metil] -hexanoico (4.72 g, 11.3 mmoles) en 80 ml de etanol y se coloca bajo una atmósfera de argón. Se agrega una suspensión de 940 mg de paladio 10% en carbón, en 2 ml de acetato de etilo y la mezcla se agita vigorosamente en la medida en que se burbujea hidrógeno gaseoso a través del sistema. Después de 30 minutos, la suspensión se coloca debajo de un globo de hidrógeno y se agita durante la noche a temperatura ambiente. El matraz se purga con argón antes de remover el catalizador po filtraicón. El filtrado se concentra bajo presión reducida para proporcionar el compuesto del título como una espuma incolora la cual cristaliza al dejar reposar (3.65 g, 98%). 1H-RMN: d (CDC13, rotámeros), 9.32 (0.4H, s amplio), 8.41 (0.4 H, s) , 7.88 (0.6 H, s amplio), 7.27 (0.6 H, s) , 6.75 (0.4 H, d amplio, J = 8.8 Hz) , 6.58 (0.6H, d amplio, J = 9.3 Hz) , 4.89 (1H, m) , 4.04 (0.4H, m) , 3.82 (0.6H, m) , 3.53 (1H, m) , 3.16 (1.2H, s) , 3.15 (1.8H, s) , 2.98 (1.2H, s) , 2.96 (1.8H, s) , 2.79 ( = .6, m) , 2.65 (0.4H, m) , 1.78-1.58 (6H, m) , 0.99 (3.6H, s) , 0.95 (5.4H, s) y 0.87, 3H, t, J = 6.7Hz). 13C-RMN: d (CDC13, rotámeros), 175.8, 173.3, 172.0, 55.4, 54.9, 52.2, 48.8, 46.3, 38.9, 38.8, 36.3, 36.1, 30.3, 30.2, 29.7, 26.9, 23.0 y 14.3. LREM: +ve ion 352 [M+Na] , -ve ion 328 [M-H] .
Se preparan los compuestos de los Ejemplos 14 a 27 por analogía con el Ejemplo 13, método I, sustituyendo el éster apropiado por caproato de etilo en la etapa A. Cuando se preparan ambos diastereoisómeros, el diastereómero A es el que eluye más rápido y habitualmente es el más potente contra PDF in vi tro . En algunos casos únicamente se toma el diastereoisómero que corre más rápido (etapa E) hacia el producto final.
Ejemplo 14
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2 -dimetil-propil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -3-ciclopentil-propiónico
Diastereoisómero A - vidrio incoloro. 'H-RMN; d
(CDC13, rotámeros) , 9.33 (0.4H, s amplio), 8.94 (0.6H, s amplio), 8.40 (0.4H, s) , 7.82 (0.6H, s) , 6.82 (0.4H, d
amplio, J = 8.6 Hz) , 6.62 (0.6H, d amplio, J = 9.3 Hz), 4'.90 (1H, m) , 4.06 (0.4H, dd amplio, J = 14.7, 7.3 Hz), 3.81 (0.6H, dd amplio, J = 14.0, 9.7 Hz) , 3.50 (1 H, m) , 3.16 (1.2H, s) , 3.14 (1.8H, s), 2.97 (1.2H, s), 2.95 (1.8H, s),
2.80 (11H, m) , 1.87-1.32 (9H, m) , 1.16-0.95 (2H, m) , 0.99 (3.6H, s) , y 0.95 (5.4H, s) . "C-RMN; d (CDC13, rotámeros),
172.9, 171.3, 55.0, 54.5, 52.0, 48.6, 45.4, 44.2, 38.5, 38.4.
37.9, 37.6, 36.4, 36.3, 35.8, 35.6, 35.5, 32.7, 32.6, 26.5,
26.4 y 25.1. LREM: +ve ion 378 [M+Na], -ve ion 354 [M-H] .
Diastereoisómero B. Vidrio incoloro: 1H-RMN; d (CDC13, rotámeros), 9.30 (0.6H, s amplio), 8.41 (0.6H, s) , 7.75 (0.4H, s) , 6.52 (0.4H, d amplio, J = 8.7 Hz), 6.41 (0.6H, d amplio, J = 7.3 Hz) , 4.85 (0.4H, d amplio, J = 9.5 Hz), 4.63 (0.6H, d amplio, J = 7.5 Hz) . 3.85-3.40 (2H, m) , 3.25-2.95 (6H, 3 s amplio), 2.78 (1H, 2 m amplio), 1.90-1.40 (8H, m) , 1.30 (1H, m) , 1.20-1.00 (2H, m) y 1.05-0.95 (9H, 2s) . 13C-RMN; d (CDClj, rotámeros), 174.9, 173.3, 172.8, 56.5, 54.7, 51.5, 50.5, 44.7, 44.6, 38.6, 38.4, 38.0, 37.8, 36.2, 36.0, 35.7, 35.5, 35.3, 34.3, 33.0, 32.9, 32.4, 32.3, 30.9, 26.6, 26,5, 25.1, 25.0 y 24.9. LREM: +ve ion 378 [M+Na], -ve ion 354 [M-H] .
Ejemplo 15
(lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetil-propil) -amidadel acido 2R (o S) -[ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -heptanoico
Diastereoisómero A. Aceite naranja oscuro. jH-RMN; d (CDClj, rotámeros), 8.32 (0.33H, s) , 7.76 (0.67H, s amplio), 6.78 (0.33H, d amplio, J = 9.1 Hz), 6.68 (0.67H, d amplio, J = 9.1 Hz) , 4.87-4.79 (1H, m) , 3.96 (0.33H, dd amplio, J = 14.6, 7.6 Hz) , 3.14 (0.67H, dd amplio, J = 13.9, 9.7 Hz) , 3.51-3.36 (1H, m) , 3.09 (1H, s) , 3.08 (2H, s), 2.90 (1H, S) , 2.89 (2H, s) , 2.86-2.55 (1H, m) , 1.53-1.19 (8H, m amplio), 0.92 (3H, s) , 0.88 (6H, s) y 0.79 (3H, m) . 13C-RMN; d (CDClj, rotámeros), 174.3, 172.0, 170.5, 170.4, 54.0, 53.5, 53.4, 50.8, 49.7, 47.4, 44.9, 43.8, 37.5, 37.4, 34.8, 34.7, 34.6, 30.6, 29.2, 29.1, 25.8, 25.5, 21.4 y 12.9. LREM: +ve ion 344 [M+H] , -ve ion 342 [M-H] .
Diastereoisómero B. Aceite naranja oscuro. 'H-RMN; d (CDClj, rotámeros), 8.36 (0.5H, s) , 7.74 (0.5H, s) , 6.69
(0.5H, s amplio), 6.57 (0.5H, d amplio, J = 7.6 Hz) , 4.89
(0.5H, s amplio), 4.70 (0.5H, d, J = 7.8 Hz) , 3.76-3.40 (2H, m) , 3.21 (1.5H, S) , 3.16 (1.5H, s), 2.98 (3H, s), 2.81 (1H, s amplio) , 2.72-2.60 (1H, m) , 1.67 (2H, s amplio) , 1.42-1.22
(6H, m) , 1.02 (4.5H, s) , 0.99 (4.5H, s), 0.90 (1.5H, s) y
0.87 (1.5H, s) . 13C-RMN; d (CDC13, rotámeros), 175.2, 173.8,
173.1, 56.5, 55.1, 52.3, 51.1, 50.6, 45.8, 45.5, 39.0, 38.9, 36.6, 36.3, 35.6, 34.9, 32.1, 32.0, 30.1, 29.9, 27.4, 27.4,
27.0, 26.9, 22.9 y 14.3. LREM: +ve ion 344 [M+H], -ve ion
342 [M-H] .
Ejemplo 16
(lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetil-propil) -amidadel ácido 2R (o S) - [ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -pentanoico
Diastereoisómero A. Espuma hidroscópica blanca.
-I-RMN; d (CDC13, rotámeros), 8.40 (0.33H, s), 7.83 (0.67H, s amplio), 6.88 (0.33H, d amplio, J = 8.6 Hz) , 6.69 (0.67H, d amplio, J = 9.2 Hz), 4.90 (1H, t) , 4.06 (0.33H, dd amplio, J = 14.5, 7.4 Hz) , 3.82 (0.67H, dd amplio, J = 13.7, 9.8
Hz) , 3.57-3.44 (1H, m) , 3.16 (1H, s) , 3.15 (2H, s), 2.98
(1H, s), 2.96 (2H, s), 2.87-2.63 (1H, m) , 1.64-1.26 (4H, m amplio), 0.98 (3H, s) , 0.94 (6H, s) y 0.90 (3H, t, J = 7.3
Hz), "C-RMN; d (CDC13, rotámeros), 175.8, 173.2, 172.0, 55.4, 54.9, 52.2, 48.7, 46.2, 45.0, 38.9, 38.9, 36.3, 36.1, 36.1,
32.7, 32.6, 27.0, 26-9, 20.9, 20.8 y 14.4. LREM: tve ion 338
[M+Na] , -ve ion 314 [M-H] .
Ejemplo 17
(ÍS -dimetilcarbamoil -2 , 2 -dimetil -propil) -amidadel acido 2R (o S) - [Formil-hidroxi-amino) -metil] -4-metil-pentanoico
Diastereoisómero A. Sólido hidroscópico blanco. -RMN; d (CDC13, rotámeros), 8.41 (0.4H, s) , 7.83 (0.6H, s) ,
6.65 (0.4H, d, J = 8.6 Hz), 6.55 (0.6H, d, J = 9.0 Hz),
4.91-4.83 (1H, m) , 4.03-3.95 (0.4H, m) , 3.84-3.74 (0.6H, m) , 3.62-3.43 (1H, m) , 3.16 (1H, s), 3.13 (2H, s), 2.98 (1H, s),
2.96 (2H, s) , 2.89-2.79 (0.6H, m) , 2.76-2.71 (0.4H, m) , 1.69- 1.34 (1.8H, m) , 1.29-1.20 (1.2H, m) , 1.0 (3.6H, s) , 0.95
(5.4H, s) y 0.93-0.88 (6H, m) . 13C-RMN; d (CDC13, rotámeros),
175.8, 173.3, 172.0, 171.7, 55.5, 55.0, 52.4, 49.1, 44.3, 43.2, 39.5, 39,4, 38.9, 38.8, 36.3, 36.1, 27.0, 26.9, 26.3,
26.0, 23.1, 23.0 y 22.8. LREM: +ve ion 352 [M+Na], -ve ion
328 [M-H] .
Ejemplo 18
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2-dimetil-propil) -amida del acido 3-Ciclohexil-2R (o S) -[ (formil-hidroxi-amino) -metil] -propionico
Sólido blanco. __-RMN, d (CDC13, rotámeros), 8.38
(0.25H, s) , 7.82 (0.75H, s), 6.93 (0.25H, d, J = 8.9 Hz),
6.74 (0.75H, d, J = 8.9 Hz), 4.90 (1H, d, J = 9.4 Hz), 4.02
(0.25H, dd, J = 9.7, 14.1 Hz), 3.78 (0.75H, dd, J = 9.7, 14.1 Hz), 3.46 (1H, m) , 3.15 (3H, s), 2.96 (3H, s), 2.92
(1H, m) , 1.65 (6H, m) , 1.20 (5H, m) , 0.98 (9H, s) y 0.87
(2H, m) . 13C-RMN; d (CDC13, rotámeros), 176.4, 174.2, 172.4,
56.0, 55.6, 53.4, 49.9, 44.0, 43.3, 39.6, 39.4, 38.7, 38.5,
36.9, 36.7, 36.6, 34.8, 34.5, 27.5, 27.4 y 27.2. LREM: +ve ion 370 [M+H] , 368 [M-H] .
Ejemplo 19
(ÍS-dimetil -carbamoil-2, 2 -dimetil-propil) -amida del ácido 2R (o S) -Ciclopentil-3- (Formil-hidroxi-amino) -propionico
Diastereoisómero A. Espuma blancuzca. ^-RMN; d (CD30D, rotámeros), 8.22 (0.33H, s) , 7.79 (0.66H, s) , 4.89 (1H, s) , 3.87 (1H, m) , 3.50 (1H, m) , 3.19 (3H, s, ) , 2.93 (3H, s) , 2.82 (0.66H, m) , 2.65 (0.33H, m) , 1.89 (2H, m) , 1.56 (5H, m) , 1.24 (2H, m) y 0.98 (9H, s) . 13C-RMN; d (CD30D, rotámeros), 176.0, 56.7, 53.2, 51.1, 42.7, 39.2, 36.5, 36.4, 32.0, 27.4, 26.4 y 26.2. IR (disco de reflección) vmax 3318, 2953, 1663, 1628, 1529, 1367, 1229, 1142, 1087, 877 cm'1. LREM: tve ion 364 [M+Na] , -ve ion 340 [M-H] .
Ejemplo 20
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2 -dimetil -propil) -amida del ácido 2R (o S) -[ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -octanoico
Diastereoisómero A. 'H-RMN; d (CDC13, rotámeros) , .40 (0.4H, s) , 7.83 (0.6H, s), 6.88 (0.4H, d, J = 8.9 Hz),
6.68 (0.6H, d, J = 9.2 Hz) , 4.90 (1H, m) , 4.05 (0.4H, m) , 3.81 (0.6H, m) , 3.50 (1H, m) , 3.16 (1.2H, s) , 3.15 (1.8H, s) , 2.97 (1.2H, s) , 2.96 (1.8H, s) , 2.86 (0.6H, m) , 2.69 (0.4H, m) , 1.59-1.25 (10H, m) , 1.14-0.95 (9H, m) y 0.89-0.77 (3H, m) . "C-RMN; d (CDC13, rotámeros) , 175.2, 172.9, 171.6, 171.4, 54.9, 54.5, 54.3, 52.0, 48.4. 46.1, 45.7, 45.1, 44.7, 39.7, 38.5, 38.4, 35.8, 35.6, 35.6, 31.7, 31.5, 30.2, 30.1, 29.1, 29.1, 27.0, 26.4, 22.4 y 14.0. LREM: +ve ion 380 [M+Na] , 358 [M+H] , -ve ion 356 [M-H] .
Ejemplo 21
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2 -dimetil-propil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -nonanoico
Diastereoisómero A: Sólido café. "H-RMN; d (CDC13, rotámeros), 9.30 (0.4H, s) , 8.41 (0.6H, s) , 7.83 (0.4H, s) , 6.66 (0.4H, d, J = 8.g Hz), 6.52 (0.6H, d, J = 9.7 Hz ) , 4.92-4.84 (1H, m) , 4.06-3.97 (0.4H, m) , 3.87-3.77 (0.6H, m) , 3.63-3.45 (1H, m) , 3.16 (1.2H, s) , 3.14 (1.8H, s), 2.98 (1.2H, S), 2.96 (1.8H, s) , 2.86-2.74 (0.6H, m) , 2.66-2.63 (0.4H, m) , 1.95-1.25 (12H, m) , 1.00-0.95 (gH, m) , y 0.90-0.84 (3H, M) . "C-RMN; d (CDC13, rotámeros), 175.5, 172.8, 171.4, 162.2, 156.1, 55.1, 54.5, 51.3, 50.8, 48.4, 46.3, 44.9, 38.4,
38.4, 35.8, 35.7, 33.9, 31.7, 30.3, 30.2, 29.4, 29.0, 27.1,
26.5, 26.5, 24.9, 22.6 y 14.0. LREM: +ve ion 394 [M+Na] , 372 [M+H] , -ve ion 370 [M-H] .
Ejemplo 22
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2 -dimetil -propil) -amida del ácido 2R (o S) -[ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -decanoico
Diastereoisómero A: Aceite incoloro. LREM: tve ion 408 [M+Na] , 386 [M+H] , -ve ion 384 [M-H] .
Ejemplo 23
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2 -dimetil -propil) -amida del ácido 2R (o S) -[ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -5-metil-hexanoico
Diastereoisómero A: Aceite incoloro. 'H-RMN; d (CDC13, rotámeros), 9.31 (0.4H, s) , 8.40 (0.4H, s) , 8.17 (0.6H, s) , 6.77 (0.4H, d, J = 7.5 Hz), 6.60 (0.6H, d, J = 8.0 Hz), 4.89 (1H, m) , 4.04 (0.4H, m) , 3.83 (0.6H, m) , 3.52 (1H, m) , 3.16 (1.2H, s) , 3.15 (1.8H, s), 2.98 (1.2H, s) , 2.96 (1.8H, s) , 2.70 (1H, m) , 1.58-1.14 (5H, m) , 1.00-0.95 (9H, m) y 0.87-0.84 (6H, m) . 13C-RMN; d (CDC13, rotámeros), 172.9, 171.5, 162.2, 156.3, 55.1, 54.6, 51.4, 48.5, 46.4, 45.0, 38.5, 38.4, 36.2, 35.9, 35.6, 29.7, 28.1, 28.0, 27.9,
26.7, 26.6, 26.5 y 22.4. LREM: tve ion 366 [M+Na], 344 [M+H] , -ve ion 342 [MH] .
Ejemplo 24
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2 -dimetil -propil) -amida del ácido 2R (o S) -[ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -propanoico
Diastereoisómero A: 'H-RMN; d (CDC13, rotámeros) ,
8.41 (0.55H, s) , 7.81 (0.45H, s), 6.67 (0.45H, d, J = 8.4 Hz), 6.51 (0.45H, d, J = 7.2 Hz), 4.88 (0.45H, d, J = 9.4 HZ) , 4.66 (0.55H, d, J = 7.7 Hz), 3.76 (1H, m) , 3.55 (0.55H, dd, J = 14.3, 9.8 Hz), 3.44 (0.45H, dd, J = 14.2, 5.3 Hz) , 3.21 (1.65H, s), 3.14 (1.35H, s), 2.99 (1.65H, s), 2.97 (1.35H, s) , 2.81 (1H, m) , 1.21 (1.65H, d, J = 6.7 Hz), 1.19 (1.35H, d, J = 6.8 Hz) , 1.01 (4.95H, s) y 0.98 (4.05H, s). LREM: +ve ion 310 [M+Na] , -ve ion 286 [M-H] .
Diastereoisómero B: -RMN; d (CDC13, rotámeros), 9.47 (0.4H, s amplio), 8.41 (0.4H, s), 7.86 (0.6H, s), 6.96 (0.4H, s amplio), 6.74 (0.6H, d, J = 7.3Hz), 4.91 (1H, m) , 3.9g (0.4H, dd, J = 14.2, 7.6 Hz) , 3.83 (0.6H, dd, J = 13.8, g.O Hz), 3.50 (1H, m) , 3.16 (1.2H, s), 3.15 (1.8H, s), 2.g7 (3H, s) , 2.90 (1H, m) , 1.21 (1.2H, d, J = 6.8 Hz), 1.15 (1.8H, d, J = 6.5Hz), 0.99 (3.6H, s) y 0.95 (5.4H,s). LREM: +ve ion 310 [M+Na] , -ve ion 286 [M-H] .
Ejemplo 25
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2-dimetil-propil) -amida del ácido 2R (o S) - [ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -3-metilbutírico
Diastereoisómero A: -RMN; d (CDC13, rotámeros) , 9.33 (0.4H, S) , 8.38 (0.4H, s), 7.81 (0.6H, s) , 6.86 (0.4H, s amplio), 6.58 (0.6H, d, J = 8.6 Hz) , 4.90 (1H, m) , 4.06 (0.4H, dd, J = 14.7, 7.3 Hz ) , 3.91 (0.6H, dd, J = 13.8, 10.6 Hz), 3.17 (1.2H, s) , 3.15 (1.8H, s), 2.98 (1.2H, s) , 2.96
(1.8H, s), 2.62 (0.6H, m) , 2.48 (0.4H, m) , 1.90 (1H, m) , 1.09-0.86 (15H, m) . LREM.- +ve ion 338 (M+Na), -ve ion 314 (M-H) .
Ejemplo 26
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2 -dimetil -propil) -amida del ácido 2R (o S) -[ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -3-fenil-propionilpropiónico
Diastereoisómero A. Vidrio incoloro. 1H-RMN; d (CDC13, rotámeros), 9.33 (0.3H, s amplio), 8.95 (0.7H, s amplio), 8.43 (0.3H, s amplio), 7.83 (0.7H, s amplio), 7.27-7.10 (5H, m) , 6.65 (0.3H, s amplio), 6.45 (0.7H, d amplio, J = 8.2 Hz), 4.80-4.70 (1H, m) , 4.22-4.10 (0.3H, m) , 3.89 (0.7H, dd, J = 13.7, 9.6 Hz), 3.63-3.47 (1H, m) , 3.20-2.69 (3H, m) , 3.04 (3H, s amplio), 2.86 (3H, s amplio), y 0.87 (9H, s amplio). 13C-RMN; 6 (CDC13, rotámeros), 137.9, 137.7,
128.8, 128.5, 126.6, 54.9, 54.5, 51.3, 48.3, 47.3, 46.6, 38.3, 38.2, 36.2, 36.1, 35.8, 35.7, 35.6, 35.5 y 26.4. LREM: +ve ion 386. (M+Na), -ve ion 362 (M-H).
Ejemplo 27
(lS-dimetil-carbamoil-2, 2-dimetil-propil) -amida del ácido 2R (o S) -[ (Formil-hidroxi-amino) -metil] -3- (4-metoxi-fenil) -propiónico
Diastereoisómero A: LREM: tve ion 416 (M+Na) , 394 (M+H) , -ve ion 392 (M-H) .
Se preparan los compuestos de los ejemplos 28 a 31 por analogía con el ejemplo 13, método II, sustituyendo la amida o éster bencílico del aminoácido apropiado por ter-leucina, N, N-dimetilamida en la etapa E.
Ej emplo 28
Ácido 2 S - { 2R- [ formil -hidroxi - amino) -met il ] hexanoi lamino} -3 - fenilpropiónico
Espuma blanca. ^-RMN; d (CD3OD, rotámeros), 8.11 (0.35H, s) , 7.80 (0.65H, s), 7.31-7.16 (5H, m) , 4.68 (1H, dd, J = 8.7, 5.5 Hz) , 3.58 (1H, m) , 3.39 (1H, m) , 3.19 (1H, m) , 2.98 (1H, m) , 2.76 (1H, m) , 1.55-1.26 (6H, m) y 0.90-0.85 (3H, m) . 13C-RMN; d (CD30D, rotámeros), 176.1, 175.7, 174.7, 174.5, 138.6, 138.5, 130.3, 129.5, 129.4, 127.7, 55.0, 53.3, 49.8, 45.4, 38.4, 38.3, 31.0, 30.8, 30.1, 23.7 y 14. 2. IR (disco de reflección) vnax 2932, 2359, 1727, 1660, 1551, 1454, 1381, 1221, 882, 701 crn"1. LREM: +ve ion 359 [M+Na], -ve ion 335 (M-H) .
Ejemplo 29
Ácido 2S-{2R- [formil-hidroxi-amino) -metil] hexanoil amino} -3, 3 -dimet ilbut í rico
Espuma blanca. -RMN; 6 (CD30D, rotámeros.), 8.25 (0.3H, s) , 7.82 (0.7H, s), 4.31 (1H, s) , 3.83-3.29 (2H, m) , 3.10-2.89 (1H, m) , 1.54-1.33 (6H, m) , 1.03 (3H, s), 1.01 (6H, s) y 0.92-0.87 (3H, m) . "C-RMN; d (CD3OD, rotámeros), 174.9, 172.9, 61.0, 52.4, 44.2, 44.0, 33.6, 30.1, 29.1, 26.2, 22.6 y 13.1. IR (disco de reflección) vm,_ 2959, 2359, 1644, 1537, 1371, 1218, 881 y 704 crn"1. LREM: +ve ion 325 (M+Na), -ve ion 301 (M-H) .
El emplo 30
{1- [ (2S-hidroximetil-pirrolidin-l-carbamoil] -2,2-dimetil -propil} -amida del ácido 2S- [2R- ( formil -hidroxi -amino) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. lH-RMN; d (CD3OD, rotámeros), 8.26 (0.4H, s), 7.84 (0.6H, s) , 4.62 (0.4H, d, J = 8.2 Hz), 4.39 (0.6H, d, J = 8.4 Hz) , 4.12 (1H, m) , 3.91-3.37 (6H, m amplio), 2.93 (0.6H, m) , 2.78 (0.4H, m) , 1.93 (5H, m) , 1.45 (2H, m) , 1.39 (3H, m) , 0.97 (3H, s amplio), 0.95 (3H, s amplio), y 0.89 (3H, t, J = 6.7 Hz) . "C-RMN; d (CDC13, rotámeros), 174.8, 172.9, 65.3, 65.1, 59.6, 59.5, 55.9, 55 7, 51.9, 47.8, 44.7, 44.0, 31.5, 30.5, 29.3, 28.7, 28.1, 27.3, 23.8, 22.0, 21.2, 18.7, 18.3, 17.6, 14.7 y 13.3. LREM: +ve ion 394 (M+Na) , 372 (M+H) , -ve ion 370 (M-H) .
Ejemplo 31
{1- [ (2 -hidroxi -etil) metil -carbamoil] -2, 2 -dimetil-propil} -amidadel ácido 2S- [2R- (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Espuma blanca. -RMN; d (CD3OD, rotámeros) , 8.25 (0.25H, s) , 8.03 (0.125H, s), 7.82 (0.625H, s), 4.88 (1H, m) , 3.83-3.54 (4H, m amplio), 3.41 (2H, m) , 3.25 (2H, s) , 2.96 (2H, s y m) , 1.49 (2H, m) , 1.23 (4H, m) , 1.00 (6H, s) , 0.99 (3H, s) , y 0.88 (3H, m) . 13C-RMN; d (CD3OD, rotámeros), 173.6, 164.4, 61.1, 61.0, 56.9, 56.5, 54.2, 53.9, 52.2, 41.8, 38.9, 36.9, 36.3, 35.3, 31.6, 30.8, 27.5, 24.1 y 14.7. LREM: +ve ion 382 [M+Na] , -ve ion 358 [M-H] .
Se preparan los compuestos de los Ejemplos 32 a 59 por analogía con el Ejemplo 7, método II, sustituyendo la amina apropiada o la amida de aminoácido/éster bencílico por
ter-leucina, N,N-dimetilamida en la etapa E. En algunos casos se utiliza HOAt en la etapa E y se lleva a cabo la desprotección hidrogenolítica (etapa G) bajo condiciones de transferencia catalítica (ciciohexano, paladio en carbón, en etanol) .
Ejemplo 32
(lR-dimetilcarbamoil-2, 2 -dimetil -propil) -amidadel ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. LREM: +ve ion 330 [M+H], -ve ion 328 [M-H] .
Ejemplo 33
(lS-dimetilcarbamoil-2S-metil-butil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Espuma blanca. LREM: +ve ion 352 [M+Na], -ve ion 328 [M-H] .
Ejemplo 34
(ÍS-dimetilcarbamoil-2 -metoxi-2 -metil -propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
forma racémica de la ß-hidroximetilvalina. Diastereoisómero A. Aceite incoloro. LREM: +ve ion 368
[M+Na], 346 [M+H], -ve ion 344 [M-H]. Diastereoisómero B. LREM: tve ion 368 [M+Na] , 346 [M+H] , -ve ion 344 [M-H] . Ejemplo 35
(ÍS -dimet ilcarbamoil -2 -hidroxi -2 -metil -propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. LREM:+ve ion 354 [M+Na], -ve ion 330 [M-H] .
Ejemplo 36
[2- (4-cloro-fenil) -lS-dimetil-carbamoil-etil] -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. LREM: +ve ion 330 (M+H), -ve ion 328 (M-H) .
Ejemplo 37
[lS-dimetilcarbamoil-2 - (4 -hidroxi-fenil ) -etil] -amida del ácido 2R- [ ( formil -hidroxi-ammo) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. LREM: +ve ion 402 (M+Na), 380
(M+H)
Ejemplo 38
(ÍS -dimetilcarbamoil- 2 -naftalen- 2-il -etil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. LREM: +ve ion 414 (M+H), -ve ion
412 (M-H)
Ejemplo 39
(2 -ciciohexil -ÍS-dimetil -carbamoil -etil) -amidadel ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Espuma blanca. LREM: +ve ion 392 (M+Na) , 370 (M+H) .
Ejemplo 40
(lS-dimetilcarbamoil-fenil-metil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. LREM: +ve ion 350 (M+H),
348 (M-H)
Ejemplo 41
Dimetilamida del ácido 2- {2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoil} -1,2,3, 4 -tetrahidro- isoquinolin-3S-carboxílico
LREM: +ve ion 398 (M+Na) , 376 (M+H) , -ve ion 374 (M-H) .
Ejemplo 42
(4-amino-lS-dimetilcarbamoil-butil) -amida del ácido 2R- [ (formil -hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. LREM: +ve ion 345 (M+H) , -ve ion
343 (M-H)
Ejemplo 43
(ÍS -dimetilcarbamoil -2 -hidroxi-etil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. LREM: +ve ion 326 (M+Na) , -ve ion
302 (M-H) .
Ejemplo 44
N-Hidroxi -N- [2R- ( 4 -metil -piperaz in- 1 - carbonil ) -hexil] - formamida
LREM: +ve ion 272 [M+H] .
Ej mplo 45
N-Hidroxi-N- [2R- (morfolin-4 - carbonil ) -hexil] formamida
LREM: tve ion 281 (M+Na), 259 (M+H), -ve ion 257 (M-H) .
Ejemplo 46
N-Hidroxi-N- [2R- (2S-hidroximetil-pirrolidin-l-carbonil) -hexil] -formamida
LREM: -ve ion 271 (M-H)
Ejemplo 47
(lS-hidroximetil-2 , 2-dimetil-propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
LREM: tve ion 289 (M+H) , -ve ion 287 (M-H)
Ejemplo 48
(lS-metoximetil-2, 2 -dimetil -propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
LREM: +ve ion 303 (M+H) , -ve ion 301 (M-H) .
Ejemplo 49
[ÍS- (4 -bencil -piperidin- 1- carbonil) -2 , 2 -dimetil-propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
LREM: -ve ion 458 (M-H) .
Ejemplo 50
[ÍS- (bencil-fenetil-carbamoil) -2, 2 -dimetil -propil] -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
LREM: +ve ion 496 (M+H), -ve ion 494 (M-H).
Ejemplo 51
[2 , 2-dimetil-lS- (pirrolidin-1- carbonil) -propil] -amida del ácido 2S- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
LREM: +ve ion 356 (M+H) , -ve ion 354 (M-H) .
Ejemplo 52
[2 , 2-dimetil- lS- (marfolin-4-carbonil) -propil] -amida del ácido 2R- [ ( formil -hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
LREM: +ve ion 372 (M+H) , -ve ion 370 (M-H) .
Ejemplo 53
[2 , 2-dimetil-lS- (4-metil -piperazin- 1- carbonil ) -propil] -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] hexanoico
LREM: +ve ion 385 (M+H), -ve ion 383 (M-H).
Ejemplo 54
[2, 2-dimetil-lS- ( 4 -metil -piperidin-1- carbonil ) propil] -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] hexanoico
LREM: +ve ion 384 (M+H) , -ve ion 382 (M-H) . Ejemplo 55
(lS-ciclohexilcarbamoil-2 , 2 -dimetil -propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
LREM: +ve ion 398 (M+H) , -ve ion 396 (M-H)
Ejemplo 56
[ÍS- (4 -acetil -piperidin- 1- carbonil) -2 , 2 -dimetil -propil] -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
LREM: +ve ion 412 (M+H) , -ve ion 410 (M-H)
Ejemplo 57
Metiléster del ácido 1- (2S- {2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoilamino}-3, 3-dimetil-butiril) iperidin-4-carboxílico
LREM: tve ion 442 (M+H) , -ve ion 440 (M-H) .
Ejemplo 58
[2, 2 -dimetil -ÍS- ( octahidro-quinolin-1- carbonil) propil] -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] hexanoico
LREM: +ve ion 424 (M+H), -ve ion 422 (M-H)
Ejemplo 59
[ÍS- (3 , 4 - dihidro- 2H- quinol in-1- carbonil) -2,2-dimetil-propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
LREM: -ve ion 416 (M-H) .
Ejemplo 60
2S-{3-etilsulfanilmetil-2R- [ (formil-hidroxi-amino) metil] propionil amino} -3 , 3 ,N, N-tetrametilbutiramida
Una ruta de síntesis del compuesto del título se indica en el esquema 4 y se describe a continuación con detalle .
Esquema 4
Reactivos y condiciones: A. 3-litio-4-bencilo-oxazolidin-2-ona, THF, -78°C; B. LIN(SlMe3)2, THF, -78°C entonces AcCl; C. HCl H2N0Bzl, NaOAc, etanol acuoso; D. NaCNBH3, AcOH, temperatura ambiente; E. HCOBI, THF; F. LiOH, THF acuoso, 0°C; G. H-Tle-NMe2, HOAl, EDC, DMF; H. H2 , Pd/C, MeOH y después se separan los diastereoisómeros (CLAP) .
Etapa A: ácido 2-etilsulfanilmetil-acrílico
Una mezcla de ácido malónico (5.2 g, 50 mmol), paraformaldehido (3.3 g, 110 mmol), diciclohexilamina (9.g5 ml, 50 mmol) y etanotiol (4.06 ml , 55 mmol) en dioxano (120 mi) se calienta a 70 °C durante 2 horas. Los solventes se remueven bajo presión reducida, el residuo se vuelve a disolver en acetato de etilo y la solución se extrae con carbonato ácido de sodio acuoso saturado (4 x 20 ml) . Las capas acuosas combinadas se lavan con 20 ml de acetato de etilo y después se acidifican con ácido clorhídrico 1M. La suspensión resultante se extrae en diclorometano y la solución se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y evapora para proporcionar el compuesto del título como un sólido blanco (3.76 g, 52%). lH-RMN; d (CDC13) , .8g (1H, s amplio), 6.35 (1H, s) , 5.77 (1H, s) , 3.39 (2H, s) , 2.49 (2H, dd, J = 7.4, 14.5 Hz) y 1.25 (3H, t, J = 5.2 Hz ) .
Etapa B: 4S-bencil-3- (2-etilsulfanilmetil-acriloil) -5, 5 - imetil-oxazolidin- 2 -ona
Se disuelve ácido 2-etilsulfanilmetil-acrílico
(3.76 g, 25.8 mmol) en THF seco (75 ml) y se enfría a -78°C bajo una atmósfera de argón. Se agregan trietilamina (4.6 ml, 33.5 mmol) y cloruro de pivaloilo (3.17 ml , 25.8 mmol) a una
velocidad tal que la temperatura permanece por debajo de -60°C. La mezcla se agita a -78°C durante 30 minutos, se calienta hasta la temperatura ambiente durante 2 horas y finalmente se enfría nuevamente a -78 °C. En un matraz separado, se disuelven 4S-bencil-5 , 5-dimetil-oxazolidin-2-ona en THF seco (75 ml) y se enfría a -78 °C bajo una atmósfera de argón. Se agrega lentamente n-butillitio (solución 2.4M en hexanos, 12.9 ml, 30.9 mmol) y la mezcla se agita durante 30 minutos a temperatura ambiente. El anión resultante se transfiere vía una cánula al recipiente de reacción original. Se permite que la mezcla se caliente a temperatura ambiente y se agita durante la noche a temperatura ambiente. La reacción se suspende con 20 ml de carbonato ácido de sodio saturado y los solventes se remueven bajo presión reducida. El residuo se divide entre acetato de etilo y agua. La capa orgánica se lava sucesivamente con carbonato ácido de sodio saturado, ácido clorhídrico 1M y salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y se concentra bajo presión reducida. El residuo se purifica por cromatografía instantánea (gel de sílice, acetato de etilo 20% en hexano) para proporcionar el compuesto del título como un aceite amarillo (6.5 g, 76%). -RMN; d (CDC13) , 7.29 (5H, m) , 5.58 (1H, s) , 5.49 (1H, s), 4.54 (1H, dd, J = 3.9, 9.7 Hz), 3.52 (2H, dd, J = 15.8, 3.1 Hz) , 3.38 (1H, dd, J = 3.9, 14.5 Hz ) , 2.84. (1H, dd, J = 4.6,
14.3 Hz), 2.52 (2H, dd, J = 7.2, 14.6 Hz ) , 1.42 (3H, s), 1.29 (3H, s) y 1.22 (3H, t, J=7.5 Hz). LREM: tve ion 356 (M+Na) , 334 (M+H) .
Etapa C: 4S-bencil-3- [2R-ter-butoxiamino-metil) -3-etilsulfanilmetil -propionil] -5 , 5 -dimetil-oxazolidin- 2 -ona
Se disuelve 4S-bencil-3- (2-etilsulfanilmetil-acriloil) -5, 5-dimetil-oxazolidin-2-ona (2.1 g, 6.3 mmol) en etanol (10 ml) y se agrega clorhidrato de 0-ter-butil-hidroxilamina (0.95 g, 7.56 mmol), seguido por trietilamina (l.l ml, 7.87 mmol) . La mezzcla se agita a 30°C durante la noche. Los solventes se remueven bajo presión reducida y el residuo se disuelve en acetato de etilo. La solución orgánica se lava sucesivamente con ácido clorhídrico 1M, carbonato ácido de sodio saturado y salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro y se filtra. El filtrado se concentra bajo presión reducida para proporcionar el compuesto del título como un aceite amarillo claro (2.42 g, 91%; diastereoisómero único por CLAP). "H-RMN; d (CDC13) , 7.30 (5H, m) , 5.09 (1H, s amplio), 4.54 (1H, dd, J = 3.5, 9.9 Hz) , 4.33 (1H, m) , 3.19 (2H, m) , 3.08 (1H, dd, J = 5.4, 11.8 Hz), 2.80 (3H, m) , 2.56 (2H, dd, J = 7.4, 14.7 Hz), 1.41 (3H, s) , 1.36 (3H, s), 1.23 (3H, t, J = 7.3 Hz) y 1.13 (9H, s) . LREM: +ve ion 423 (M+H) .
- ng - Etapa D: ácido 2R-ter-butoxiamino-metil) -3-etilsulfanilmetil -propiónico
Una solución de 4S-bencil-3- [2R-ter-butoxiamino-metil) -3-etilsulfanilmetil-propionil] -5, 5-dimetil-oxazolidin-2-ona (2.42 g, 5.72 mmol) en THF (40 ml) se enfría a 0°C, y se agrega una solución de hidróxido de litio (288 mg, 6.86 mmol) en 10 ml de agua. Se permite que la mezcla se caliente hasta la temperatura ambiente y después se agita durante 5 horas. El solvente se remueve bajo presión reducida y el residuo se divide entre agua y acetato de etilo. La capa acuosa se remueve y la capa de acetato de etilo se lava sucesivamente con agua y carbonato ácido de sodio saturado. Las capas acuosas combinadas se lavan con 20 ml de acetato de etilo antes de acidificar con ácido clorhídrico 1M. La emulsión resultante se extrae con diclorometano (3 x 20 ml) y las capas orgánicas combinadas se secan sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y evaporan para proporcionar el compuesto del título como un aceite incoloro (0.68 g, 50%) . -RMN; d (CDC13) , 8.03 (2H, s amplio), 3.21 (2H, d, J = 6.1 Hz) , 2.8g (2H, m) , 2.75 (1H, m) , 2.57 (2H, dd, J = 7.4, 14.8 Hz) , 1.26 (3H, t, J = 7.4 Hz ) y 1.18 (9H, s). LREM: +ve ion 236 [M+H] , -ve ion 234 [M-H] .
Etapa E: una solución de 2S- [2R- (ter-butoxi-amino-metil) -3 -etil sulfanilmetil -propionil amino} -3 , 3 , N, N-tetrametilbutiramida
Se disuelve el ácido 2R-ter-butoxiamino-metil) -3 -etilsulfanilmetil-propiónico (340 mg, 1.44 mol) en DMF (10 ml) y se agregan ter-leucina-N,N-dimetilamida (272 mg, 1.73 mmol), HOAt (19.6 mg, 0.14 mmol) y EDC (331 mg, 1.73 mmol). La reacción se agita durante la noche a temperatura ambiente. El solvente se remueve bajo presión reducida y el residuo se disuelve en diclorometano. La solución orgánica se lava sucesivamente con ácido clorhídrico 1M, carbonato de sodio 1M y salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro y se filtra. El filtrado se concentra bajo presión reducida para proporcionar el producto requerido como un aceite incoloro (440 mg, 82%). 'H-RMN; d (CDC13) , 6.87 (1H, d, J = 9.0 Hz) , 5.11 (1H, s amplio), 4.93 (1H, d, J = 9.3 Hz), 3.15 (3H, S) , 3.11 (1H, m) , 2.95 (3H, s), 2.79 (3H, m) , 2.54 (3H, s) , 1.22 (3H, t, J = 7.6 Hz) , 1.18 (9H, s) y 1.01 (9H, s) . LREM: tve ion 398 [M+Na] , 376 [M+l] .
Etapa F: 2S-{2R- [ (ter-butoxi-formil-amino) -metil] -3 -etilsulfanilmetil -propionil amino} -3, 3 , N, N-tetrametilbutiramida
Una solución de 2S- [ R- (ter-butoxi-amino-metil) -3-etilsulfanilmetil-propionil amino} -3 , 3 , N, N-tetrametilbutiramida (220 mg, 0.58 mmol) en diclorometano (5 ml) se enfría a 0°C y se trata con 0.1 ml de anhídrido acético fórmico. Las reacción se agita a temperatura ambiente durante 4 horas el solvente se evapora bajo presión reducida. El residuo se purifica por cromatografía instantánea (gel de sílice, acetato de etilo 50% en hexanos como eluyente) para proporcionar el compuesto del título como un aceite incoloro (120 mg, 52%). "H-RMN; d (CDC13, rotámeros), 8.31 (1H, s amplio), 6.56 (1H, d, J = 9.1 Hz) , 4. g4 (0.33H, d, J = g.4 Hz), 4.88 (0.67H, d, J = g.2 Hz), 4.08 (0.67H, m amplio), 3.83 (1.34H, m amplio), 3.13 (3H, s) , 2.g5 (3H, s) , 2.80 (2H, m) , 2.61 (1H, dd, J = 6.8, 14.0 Hz) , 2.49 (2H, dd, J = 7.4, 14.7 Hz) , 1.29 (9H, s), 1.25 (3H, t, J = 7.2 Hz) y 0.g9 (9H, s) . LREM: tve ion 426 [M+Na] , 404 [M+H] .
Etapa G: 2S- {3-etilsulfanilmetil-2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metiljpropionil amino}-3,3,N,N-tetrametilbutiramida
Una solución de 2S- {2R- [ (ter-butoxi-formil-amino) -metil] -3-etilsulfanilmetilpropionil amino} -3, 3, N, N-tetrametilbutiramida (120 mg, 0.3 mmol) en 1 ml de deuterocloroformo se trata con TFA (4 ml) y se permite que
repose a 4°C durante la noche. Los solventes se remueven bajo presión reducida y el TFA residual se remueve por destilación azeotrópica con tolueno. El residuo se purifica por CLAP preparativa para proporcionar el compuesto del título como un aceite incoloro (40 mg, 38%; mezcla 7:2 de diastereómeros por CLAP). 'H-RMN; d (CDC13, rotámeros), 8.40 (0.33H, S) , 7.87 (0.67H, s) , 7.24 (0.33H, d, J = 9.3 Hz), 6.98 (0.67H, d, J = 9.3 Hz), 4.gi (0.67H, d, J = 9.3 Hz) , 4.90 (0.33H, d, J = 9.3 Hz), 4.07 (0.33H, dd, J = 7.5, 14.5 Hz), 3.86 (0.67H, dd, J = 8.8, 14.2 Hz ) , 3.75 (0.67H, m) , 3.68 (0.33H, m) , 3.16 (1H, s), 3.15 (2H, s), 3.05 (1H, m) , 2.96 (3H, s) , 2.77 (1H, m) , 2.66 (1H, m) , 2.52 (2H, dd, J = 7.4, 14.8 Hz), 1.22 (3H, t, J = 7.3 Hz), 0.9g (3H, s) y 0.96 (6H, s) . 13C-RMN; d (CDC13, rotámeros), 173.3, 171.6, 171.2, 55.2, 54.8, 51.1, 48.5, 45.2, 44.4, 38.5, 38.4, 35.9, 35.8, 35.7, 31.7, 31.4, 26.7, 26.6, 26.5 y 14.6 LREM : +ve ion 370 [M+Na] , 348 [M+H] , -ve ion 346 [M-H] .
Se prepara el compuesto del ejemplo 61 similarmente utilizando piperidina en lugar de etanotiol en la etapa A.
Ejemplo 61
2 - {2 - [ ( formil-hidroxi-amino) -metil ] -3 -piperidin- 1 -il -propionil amino} -3 , 3 , N, N- tetrametil -butiramida
Sólido blanco (mezcla 4:1 de diastereoisómeros por CLAP). -RMN; d (CDC1-,, rotámeros), 8.29 (1H, s) , 7.95 (1H, s amplio), 4.87 (1H, d, J = 9.1 Hz), 4.02 (1H, dd, J = 5.0, 14.6 Hz), 3.56 (1H, dd, J = 8.2, 14.6 Hz), 3.14 (3H, s), 2.96 (3H, s), 2.89 (1H, m) , 2.69 (1H, m) , 2.52 (5H, m) , 1.65 (4H, m) , 1.49 (2H, m) y 0.9g (gH, s) . "C-RMN; d (CDC13) 172.2, 171.3, 60.4, 55.0, 54. gi 48.6, 42.4, 38.8, 36.2, 36.1, 27.0, 25.6 y 24.3. LREM: +ve ion 371 [M+H], -ve ion 369 [M-H] .
Se preparan los compuestos de los ejemplos 62 a 65 por analogía con el ejemplo 7, método II, sustituyendo 0-ter-butilhidroxilamina por O-bencilhidroxilamina en la Etapa B y la amina o la amida de aminoácido/éster bencílico apropiados para terleucina N, N-dimetilamida en la Etapa E. La desproteccion final se lleva a cabo por acidólisis con TFA (véase Ejemplo 60, antes).
Ejemplo 62
( IR-dimetil carbamoil -2 -metil -2 -metilsulfanil -propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Aceite incoloro. 'H-RMN; d (CDCI3, rotámeros) , 8.4 (0.5H, S) , 7.85 (0.5H, s), 7.11 (0.5H, d, J = 9.1 Hz ) , 6.93
(0.5H, d, J = 9.1 Hz) , 5.15 (1H, d, J = 9.4 Hz ) , 3.90 (0.5H, m) , 3.73 (0.5H, m) , 3.64 (0.5H, d, J = 14.3 Hz), 3.48 (0.5H, dd, J = 14.0, 3.9 Hz), 3.22 (3H, s), 2.97 (3H, s), 2.83
(0.5H, m) , 2.70 (0.5H, m) , 2.07 (1.5H, s), 2.04 (1.5H, s), 1.58 (1H, m) , 1.36 (4H, m) , 1.32 (3H, s) , 1.28 (3H, s) y
0.86 (3H, t, J = 6.6 Hz) . "C-RMN; d (CDC13, rotámeros),
175.4, 173.5, 170.8, 63.6, 53.2, 53.1, 52.5, 49.5, 47.5,
46.1, 44.9, 41.6, 37.5, 36.5, 36.4, 35.4, 30.2, 29.8, 28.0,
14.3, 12.0 y 11.9. LREM: tve ion 362 [M+H], -ve ion 360 [M-H] .
Ejemplo 63
(2 -bencilsulfanil- IR-dimet ilcarbamoil -2 -metil -propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Espuma blanca. 'H-RMN; d (CDC13, rotámeros), 8.37
(0.33H, s) , 7.81 (0.66H, s), 7.31 (5H, m) , 7.06 (0.33H, d, J = 8.8 Hz) , 6.8g (0.66H, d, J = 9.3 Hz ) , 5.20 (1H, d, J = 9.3 Hz), 3.94 (0.33H, dd, J = 8.3, 14.6 Hz), 3.78 (2.66H, m) , 3.61 (0.33H, dd, J = 3.5, 14.4 Hz) , 3.42 (0.66H, dd, J = 5.1, 14.9 Hz) , 3.21 (3H, s), 3.03 (3H, s), 2.82 (0.66H, m) , 2.69 (0.33H, m) , 1.61 (1H, m) , 1.42 (1H, m) , 1.37 (3H, s) , 1.32 (3H, s) , 1.26 (4H, m) y 0.86 (3H, t, J = 6.6 Hz). 13C-RMN; d (CDClj, rotámeros), 175.3, 173.5, 171.0, 138.1, 137.4, 129.5, 129.3, 129.1, 129.0, 128.9, 127.6, 127.4, 55.9, 53.7, 52.5, 51.2, 49.6, 49.5, 46.1 44.9, 39.0, 38.6, 36.6,
36.4, 33.9, 33.7, 30.3, 30.1, 29.7, 26.7, 26.1, 25.7, 25.5, 24.2, 22.9 y 14.3. LREM: +ve ion 460 [M+Na], 438 [M+H], -ve ion 436 [M-H] .
Ejemplo 64
[2-bencilsulfanil-2-metil-lR- (morfolin-4-carbonil) -propil] -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Espuma blanca. 1H-RMN; d (CDC13, rotámeros), 8.44 (0.5H, s) , 8.37 (0.5H, s), 7.30 (5H, m) , 6.88 (0.5H, d, J = 8.3 Hz), 6.78 (0.5H, d, J = 9.2 Hz ) , 5.12 (1H, d, J = 9.5 Hz) , 3.91 (1H, dd, J = 8.2, 14.6 Hz) 3.78 (10H, m) , 3.45 (1H, dd, J = 4.5, 14.2 Hz) , 2.80 (0.5H, m) , 2.64 (0.5H, m) , 1.61 (1H, m) , 1.41 (1H, m) , 1.36 (3H, s) , 1.33 (3H, s) , 1.29 (4H, m) , y 0.87 (3H, t, J = 6.8 Hz). 13C-RMN-, d (CDC13,
rotámeros) , 175.5, 173.4, 169.4, 137.8, 129.5, 129.3, 129.1, 129.0, 127.8, 127.5, 67.1, 67.0, 53.3 , 53.2, 51.99, 49.6, 49.5, 49.2, 47.9 46.5, 45.0, 43.2, 43.0, 34.0, 30.3, 30.2, 29.7, 26.8, 26.5, 25.9, 25.8, 22.9 y 14.3. LREM: +ve ion 502 [M+Na] , 480 [M+H] , -ve ion 478 [M-H] .
Ejemplo 65
[2-bencilsulfanil-2-metil-lR (o S) - (4-metil-piperidin-1-carbonil) -propil] -amida del ácido 2- [(formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico
Diastereoisómero A. Sólido blanco. LREM: tve ion 514 [M+Na], 492 [M+H] , .-ve ion 490 [M-H].
Diastereoisómero B. Goma incolora. LREM: tve ion 514 [M+Na] , 492 [M+H] , -ve ion 490 [M-H] .
Se preparan los compuestos de los ejemplos 66 á 68 por analogía con el ejemplo 7, método II, sustituyendo el ácido malónico apropiado por ácido butilmalónico en la Etapa A, O-ter-butilhidroxilamina por O-bencilhidroxilamina en la Etapa C. La estereoselectividad en la adición de Michael es variable. La desprotección final se realiza por acidólisis con TFA (véase Ejemplo 60, anterior) .
Ejemplo 66
(ÍS-dimetilcarbamoil -2 , 2 -dimetil -propil) -amida del ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -pent-4-enoico
Diastereoisómero único. 1H-RMN, d (CDC13, rotámeros), 8.40 (0.25H, s) , 7.84 (0.75H, s) , 7.05 (0.35H, d, J = 9.0 Hz), 6.74 (0.65H, d, J = 9.3Hz), 5.70 (1H, m) , 5.03-5.24 (2H, m) , 4.88 (1H, dd, J = 9.4, 6.7Hz), 3.98 (0.5H, m) , 3.81 (0.5H, m) , 3.55 (1H, m) , 3.14 (3H, s) , 2.97 (1.3H, s) , 2.g6 (1.7H, s), 2.75-2.g2 (1H, m) , 2.16-2.50 (2H,
m) , 0.98 (4.5H, s) y 0.94 (4.5H, s). LREM: +ve ion 336
[M+Na] -ve ion 312 [M-H] .
Ejemplo 67
(lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetil-propil) -amidadel ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hex-5-enoico
Diastereoisómero A: Aceite incoloso. 'H-RMN; £ (CDC13, rotámeros) , 8.42 (0.45H, s) , 7.84 (0.55H, s) , 6.7E (0.45H, d, J = 8.4Hz), 6.60 (0.55H, d, J = 9.3Hz), 5.74 (1H, m) , 5.03 (2H, m) , 4.88 (1H, m) , 4.14 (0.4H, m) , 3.81 (0.6H, m) , 3.55 (1H, m) , 3.16 (1H, s) , 3.15 (2H, s) , 2.98 (1H, s) , 2.97 (2H, s) , 2.85 (0.7H, m) , 2.68 (0.3H, m) , 2.07 (2H, m) , 1.73 (1.6H, m) , 1.50 (0.4H, m) , 0.99 (4H, s) y 0.95 (5H, s) . LREM: +ve ion 350 [M+Na] , -ve ion 326 [M-H] .
Diastereoisómero B: Aceite incoloro. 'H-RMN,- d (CDClj, rotámeros), 8.41 (0.5H, s) , 7.75 (0.5H, s) , 6.58 (0.5H, d, J = 9.1 Hz) , 6.36 (0.5H, d, J = 9.1 Hz), 5.75 (1H, m 5.01 (2H, m) , 4.86 (0.5H, d, J = 9.5Hz), 4.64 (0.5H, d, J = 7.5Hz), 3.42-3.82 (2H, m) , 3.22 (1.5H, s), 3.07 (1.5H, s), 2.9g (3H, s) , 2.87 (0.5H, m) , 2.66 (0.5H, m) , 2.13 (2H, m 1.81 (1H, m) , 1.49 (1H, m) , 1.02 (4.5H, s) y 1.00 (4.5H, s) . LREM: +ve ion 350 [M+Na], -ve ion 326 [M-H].
Ejemplo 68
(lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetil-propil) -amidadel ácido 2R- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hex-4-inoico
Diastereoisómero A: Aceite incoloro. -RMN; d
(CDC13, rotámeros), 8.39 (0.4H, s) , 7.87 (0.6H, s) , 7.20
(0.4H, d, J = 8.4Hz), 6.94 (0.6H, d, J = 9.3Hz), 4.90 (1H, m) , 3.66-4.14 (2H, m) , 3.16 (2H, s) , 3.14 (2H, s) , 2.96 (l.H, s), 2.88 (1H, m) , 2.41 (2H, m) , 1.77 (3H, m) , 1.00
(3.5H, s) y 0.96 (5.5H, s) . LREM: +ve ion 348 [M+Na], -ve ion 324 [M-H] .
Diastereoisómero B: Aceite incoloro. lH-RMN; d (CDClj, rotámeros), 8.37 (0.5H, s) , 7.81 (0.5H, s) , 6.87 (1H, m) , 4.91 (0.5H, d, J = 9.4 Hz), 4.79 (0.5H, d, J = 8.2 Hz), L3.76 (1.5H, m) , 3.63 (0.5H, m) , 3.19 (1.5H, s) , 3.14 (1.5H, s) , 2.98 (3H, s) , 2.85 (1H, s), 2.41 (2H, m) , 1.77 (3H, m) , 1.03 (4.5H, S) y 1.01 (4.5H, s) . LREM: +ve ion 348 [M+Na], -ve ion 324 [M-H] .
Ejemplo 69
(l?-dimetilcarbamoil-2 , 2 -dimetil -propil) -amidadel ácido 2R- [IR (o S) - (formil-hidroxi-amino) -etil] -hexanoico
Se prepara el compuesto del título de acuerdo con la vía indicada en el esquema 5 y como se describe con detalle en lo siguiente:
Esquema 5
Reactivos y condiciones: A. (CHO)n, EtSH, diciclohexilamina, dioxano, 70°C, 2h; B. 'BuCOCl, Et3N entonces 3-litio-4-bencil-5 , 5-dimetil-oxazolidin-2-ona; C. HCl.H2NOBu, EtjN, o/n; D. LiOH, THF acuoso, 0°C; E. H-t-LeuNMe2, HOAt, EDC, DMF; H. HCOAc, CH2C12; G. TFA, CDC13.
Etapa A. : -bencil-3-hexanoil-oxazolidin-2-ona
Se disuelve S-bencil-oxazolidin-2-ona (14.5 g, 81'.7 m mol) en THF seco (75 ml) bajo una atmósfera de argón. La solución se enfría en un baño de hielo antes de la adición lenta de n-butillitio (1.6M en hexanos, 56 ml , 89.2 mmol) . La sal de litio cristalizada a partir de la solución como una masa sólida después se permite que se caliente hasta la temperatura ambiente durante la noche. La solución naranja resultante se enfría nuevamente en un baño de hielo durante la adición de una solución fria de cloruro de hexanoilo (10.4 ml , 74.3 mmol) en THF seco (50 ml). Se permite que la mezcla se caliente hasta la temperatura ambiente y después se agita durante 3 horas. La reacción se suspende con 5 ml de una solución de carbonato de sodio 1M y el solvente se remueve bajo presión reducida. El residuo se divide entre 100 ml de carbonato de sodio 1M y 150 ml de acetato de etilo. La capa orgánica se remueve y la capa acuosa se extrae con más acetato de etilo. Las capas orgánicas combinadas se lavan sucesivamente con agua, carbonato de sodio 1M y salmuera, se secan sobre sulfato de magnesio anhidro y se filtran. El filtrado se concentra para proporcionar un aceite naranja. La purificación por cromatografía instantánea proporciona el compuesto del título como un aceite amarillo (10.21 g, 50%). "H-RMN; d (CDC13) ,
7.38-7.24 (3H, m) , 7.24-7.16 (2H, m) , 4.68 (1H, m) , 4.24-4.12 (2H, m) , 3.30 (1H, dd, J = 13.4, 3.2 Hz) , 3.02-2.86 (2H, m) , 2.77 (1H, dd, J = 13.4, 9.6 Hz), 1.77-1.63 (2H, m) , 1.44-1.30 (4H, m) y 0.92 (3H, t amplio, J = 6.g Hz).
Etapa B: l- (4S-bencil-2-oxo-oxazolidin-3-il) -2R-butil-butan-1, 3-diona
Se disuelve 4-bencil-3-hexanoil-oxazolidin-2-ona (10.2 g, 37.1 mmol) en THF (150 ml) bajo una atmósfera de argón y se enfría a -78°C. Se agrega hexametildisilazida de litio (1M en THF, 41 ml , 41 mmol) vía una cánula durante algunos minutos, y la solución verde resultante se agita a -78°C durante 2 horas. Se agrega lentamente cloruro de acetilo (3.3 ml , 46.3 mmol) y la mezcla de reacción se agita durante 3.5 horas. Se agrega rápidamente para suspender la reacción una solución de ácido cítrico (3.0 g, 14 mmol) en agua (15 ml) . El solvente se remueve bajo presión reducida y el residuo se divide entre acetato de etilo y agua, se lava con salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro y se filtra. El filtrado se concentra para proporcionar el compuesto del título como un aceite amarillo (12.11 g, que contiene solvente residual) el cual se utiliza sin purificación adicional en la etapa C. -RMN; d (CDC13) , 7.37-7.21 (5H, m) , 4.68 (1H, m) , 4.53 (1H, dd, J = g.6, 3.7
Hz) , 4.23-4.13 (2H, m) , 3.43 (1H, dd, J = 13.5, 3.3 Hz), 2.75 (1H, dd, J = 13.5, g.9 Hz), 2.33 (3H, s), 2.03 (1H, m) , 1.77 (1H, m) , 1.46-1.26 (4H, m) y 0.98-0.86 (3H, m) .
Etapa C: 1- (4S-bencil-2-oxo-oxazolidin-3-il) -2R-butil-butan-1, 3-diona 3- (O-benciloxima)
A una solución de 1- (4S-bencil-2-oxo-oxazolidin-3-il) -2R-butil-butan-l, 3-diona (12.11 g, 38.15 mmol) en agua (10 ml) y etanol (90 ml) se agrega acetato de sodio (3.75 g, 45.78 mmol) y clorhidrato de O-bencilhidroxilamina (7.31 g, 45. 78 mmol). La suspensión reeultante se deja en agitación a temperatura ambiente durante la noche. El producto (7.3 g, 45%, isómero de oxima único) crietaliza directamente a partir de la reacción y ee filtra, ee lava con etanol acuoso (1:1) y se seca bajo vacío. Se obtiene material adicional (5.31 g, 33%, mezcla de isómeros de oxima) como un aceite amarillo a partir de las aguas madres por extracción ácido-base seguido por cromatografía en columna. "?-RMN; d (CDC13, isómero de oxima principal) , 7.34-7.20 (8H, m) , 7.12-7.07 (2H, m) , 5.14-5.02 (2H, m) , 4.53 (1H, m) , 4.13 (1H, dd, J = 9.4, 4.0 Hz) , 4.04 (1H, t amplio, J = 8.4 Hz) , 3.91 (1H, dd, J = 9.0, 2.7 Hz) , 3.16 (1H, dd, J = 13.4, 2.9 Hz), 2.09 (3H, s) , 1.97 (1H, m) , 1.75 (1H, dd, J = 13.4, 10.8 Hz ) , 1.67 (1H, m) , 1.45-1.22 (4H, m) y 0.9 1 (3H, t amplio, J = 6.9 Hz) .
Etapa D: 4S-bencil-3- [2R- (IR (o S) -beciloxiamino-etil) -hexanoil] -oxazolidin-2-ona
La mezcla de oxima de la Etapa C (5.31 g, 12.5 mmol) se dieuelve en 30 ml de ácido acético y ee enfría en un baño de agua con hielo antes de la adición de cianoborohidruro de sodio (0.8 g, 12.5 mmol) en una porción. La eferveecencia subsiste después de algunos minutos y se agrega una porción adicional de borohidruro (0.8 g) . Se permite que la reacción se caliente a temperatura ambiente y se agita durante la noche. El ácido acético se remueve bajo presión reducida y el residuo se destila por azeótropos con tolueno. El aceite resultante se disuelve en acetato de etilo, se lava con agua, carbonato de sodio 1M y salmuera, se seca sobre sulfato de magneeio anhidro y se filtra. El filtrado se evapora para dejar un aceite amarillo claro el cual se purifica por cromatografía instantánea (gel de sílice, acetato de etilo 10% a 25% en hexano como eluyente) . Rendimiento, 3.43 g, 64%. 'H-RMN; d (CDC13, mezcla de a-diastereoisómeros) , 7.36-7.17 (10H, m) , 5.80 (0.45H, e amplio), 5.55 (0.55H, d amplio, J = 8.9 Hz) , 4.72-4.59 (3H, m) , 4.20-4.05 {2H, m) , 3.97 (0.45H, m) , 3.82 (0.55H, m) , 3.47-3.22 (2H, m) , 2.45 (1H, m) , 1.90-1.48 (2H, m) , 1.40-1.14 (7H, m) y 0.95-0.84 (3H, m) .
Etapa E: N- [2R- (4S-bencil-2-oxo-oxazolidin-3-carbonil) -IR (o S) -metil-hexil] N-benciloxi-formamida
Se disuelve 4S-bencil-3- [2R- (IR (o S) -benciloxi -amino-etil) -hexanoil] -oxazolidin- 2-ona (3.08 g, 7.3 mmol) en THF seco y se trata con N-formilbenzotriazol (1.60 g, 10.9 mmol). La reacción se agita durante 4 horas a temperatura ambiente. El solvente se remueve bajo presión reducida y el aceite restante se divide entre diclorometano (40 ml) y una solución de hidróxido de sodio 1M (30 ml) . La capa orgánica ee remueve, se lava con más hidróxido de sodio y después con salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y evapora. La purificación por cromatografía instantánea (gel de sílice, 20% a 50% de acetato de etilo en hexano) proporciona el compuesto del título como un sólido amarillo claro (2.50 g, 76%) . 41-RMN; d (CDC13, mezcla de a-diastereoisómeros y rotámeroe) , 8.22 (1H, m amplio) , 7.54-7.13 (10H, m) , 5.22-3.g2 (7H, m amplio) , 3.30 (1H, m) , 2.48 (1H, m amplio), 1.85-1.13 (9H, m amplio) y 0.93-0.83 (3H, m) .
Etapa F: ácido 2R- [IR (o S) - (benciloxi -formil -amino) -etil] -hexanoico
Se disuelve N- [2R- (4S-bencil-2-oxo-oxazolidin-3-carbonil)-lR (o S) -metil-hexil] N-benciloxi-formamida (1.50 g, 3.31 mmol) en THF (25 ml) y agua (5 ml), y la solución se enfría en un baño de hielo. Se agrega una solución de peróxido de hidrógeno (27%, p/p, 13.26 mmol) seguido inmediatamente por hidróxido de litio (167 mg, 3.98 mmol) . Se permite que la reacción se caliente a temperatura ambiente y se agita durante 3 horas adicionales. La solución se enfría nuevamente antes de la adición de nitrito de sodio (0.92 g, 13.3 mmol). Despuée de 10 minutos, la mayor parte del solvente se remueve bajo presión reducida para dejar una pasta blanca la cual se divide entre 25 ml de acetato de etilo y 30 ml de carbonato de sodio 1M. La capa orgánica se lava con máe eolución de carbonato de sodio y los extractos acuosos combinados se lavan con acetato de etilo. La capa acuosa se enfría y ee acidifica con ácido clorhídrico 1M y ee extrae dos veces con acetato de etilo. Las capas orgánicae combinadae se lavan con salmuera, se secan sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtran y evaporan para proporcionar el compuesto del título como un aceite amarillo (839 mg, 86%) . __-RMN; d (CDC13, mezcla de a-diastereoisómeros y rotámeros), 8.40-7.64 (2H, m amplio), 7.48-7.27 (5H, m) , 5.23-4,80 (2H, m) , 4.16 (1H, m amplio), 2.79 (1H, m) , 1.67-1.47 (2H, m) , 1.47-1.18 (7H, m) y 0.95-0.82 (3H, m) .
Etapa G: (lS-dimetilcarbamoil-2, 2-dimetil-propil) -amida del ácido 2R- [IR (o S) - (benciloxi-formil-amino) -etil] -hexanoico
Se disuelve juntoe el ácido 2R- [IR (o S) - (benciloxi-formil-amino) -etil] -hexanoico (839 mg, 2.86 mmol), ter-leucina N,N-dimetilamida (498 mg, 3.15 mmol) y EDC (658 mg, 3.43 mmol) en DMF (15 ml) y se agrega una cantidad catalítica, 60 mg, de HOAt. La solución se deja en agitación durante varios días a temperatura ambiente. El solvente se remueve bajo presión reducida y el aceite restante se divide entre acetato de etilo y 75 ml de ácido clorhídrico 1M. La capa orgánica se lava sucesivamente con ácido clorhídrico 1M, carbonato de sodio 1M y salmuera, se seca sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtra y evapora para dejar una espuma amarilla (1.08 g, 82%). "H-RMN; d (CDC13, mezcla de -diastereoisómeroe y rotámeros), 8.13 (1H, m amplio), 7.52-7.31 (5H, m) , 6.28 (1H, m amplio) , 5.36-4.67 (3H, m amplio) , 4.09 (1H, m amplio), 3.14 (3H, s) , 2.95 (1.2H, s) , 2.93 (1.8H, s) , 2.48 (1H, m amplio), 1.61-1.04 (9H, m) , 0.99 (3.6H, s) , 0.95 (5.4H, s) y 0.8g-0.75 (3H, m) .
Etapa H: (ÍS-dimetilcarbamoil-2, 2 -dimetil -propil) -amida del ácido 2R- [IR (o S) - (formil-hidroxi-amino) -etil) -hexanoico
La (lS-dimetilcarbamoil-2 , 2-dimetil-propil) -amida del ácido 2R- [IR (o S) - (benciloxi-formil-amino) -etil] -hexanoico (200 mg, 0.46 mmol) se disuelve en metanol (15 ml) y se coloca bajo una atmósfera de argón. Se agrega una suspensión de 20 mg de paladio 10% en carbón, en acetato de etilo, y la mezcla se agita bajo una atmósfera de hidrógeno durante 3 horas. El catalizador se remueve por filtración y el filtrado se evapora para proporcionar un aceite incoloro
(163 mg, cuant . ) . Los dos productos diastereoisoméricos se separan por CLAP preparativa.
Diastereoisómero A (27 mg) : -RMN; d (CDC13, principalmente un rotámero) , 8.67 (O.gH, s amplio), 8.33 (0.1H, s amplio), 7.92 (1H, s) , 6.74 (0.1H, m amplio), 6.54 (0.9H, d, J = 9.4 Hz), 4.93 (0.9H, d, J = 9.4 Hz), 4.64 (0.1H, m amplio), 3.89 (1H, cd, J = 6.6, 2.6 Hz) , 3.16 (3H, S) , 2.96 (3H, s) , 2.62-2.48 (1H, m) , 1.52-1.06 (6H, m) , 1.35 (3H, d, J = 6.6 Hz), 1.00 (9H, s) y 0.82 (3H, t, J = 6.9Hz). 13C-RMN; d (CDClj), 173.0, 171.3, 57.2, 54.4. 50.4, 38.4, 35.6, 29.9, 29.1, 26.6, 22.5, 17.2 y 13.9. LREM: tve ion 366 [M+Na] , -ve ion 342 [M-H] .
Diastereoisómero B (42 mg) : 'H-RMN; d (CDC13, mezcla de rotámeros), 9.15 (0.6H, s) , 8.60 (0.4H, s amplio), 8.42 (0.6H, e), 7.84 (0.4H, s), 6.83 (0.6H, d, J = 9.2 Hz), 6.55
(0.4H, d, J = g.4Hz), 4.gi (0.6H, d, J = 9.2 Hz), 4.89 (0.4H, d, J = 9.4 Hz), 4.69 (0.6H, cd, J = 7.0, 4.3 Hz), 3.92 (0.4H, dc, J = 9.1, 6.8 Hz ) , 3.15 (3H, s) , 2.97 (1.8H, s) , 2.95 (1.2H, s) , 2.59 (0.4H, td, J = 9.8, 4.3 Hz), 2.39 (0.6H, td, J = 7.4, 4.3 Hz), 1.92-1.07 (6H, m) , 1.37 (1.2H, d, J = 6.8 Hz), 1.31 (1.8H, d, J = 7.0 Hz) , 1.01 (5.4H, s) , 0.96 (3.6H, s) , 0.85 (1.8H, t, J = 7.2 Hz ) y 0.83 (1.2H, t, J = 7.2 Hz) . 13C-RMN; 6 (CDC13, mezcla de rotámeros), 175.7, 173.2, 171.3, 170.7, 56.7, 55.0, 54.4, 53.2, 50.8, 49. , 38.3, 35.7, 35.6, 35.5, 35.4, 30.3, 29.5, 29.3, 26.5, 26.4, 22.5, 22.4, 16.0, 15.4 y 13.8. LREM: +ve ion 366 [M+Na], -ve ion 342 [M-H] .
Ejemplo 70
N-ciclohexil -2 - { 2 - [ ( formil -hidroxi-amino) -metil] -3 -f enil -propionil amino} - 3 , 3 -dimetil -butiramida
Soluciones concentradas de amoníaco 1M en metanol
(1 ml, 1 mmol) y trimetilacetaldehido 1 M en metanol (1 ml,
1 mmol) se mezclan en un tubo de ebullición y se permite que reposen durante 1 hora. Se agrega una solución 1M de isocianuro de ciciohexilo en metanol (1 ml, 1 mmol) seguido por ácido 2RS- [ (benciloxi -formil -amino) -metil] hexanoico 0.5M en metanol (2 ml , 1 mmol). Se permite que la mezcla de reacción se agite a temperatura ambiente durante 2 días. El solvente se remueve utilizando un equipo Savant Speedvac y la mezcla de reacción se precristaliza a partir de acetato de etilo-hexano para proporcionar 2- {2- [ (beciloxi-formil-amino) -metil] -3 - fenil -propionilamino} -N- ciciohexil -3,3-dimetil-butiramida como un sólido blanco (93 mg, 18%) , el cual se desprotege por hidrogenólisis de transferencia catalítica (hidrógeno gaseoso, paladio 10% en carbón, metanol-acetato de etilo) para proporcionar el compuesto del titulo (75 mg, 99%) . Sólido blanco. LREM: +ve ion 440
[M+Na] , 418 [M+H] , -ve ion 416 [M-H] .
Los compuestos de los Ejemplos 71 a 77 se preparan de manera similar utilizando el componente Ugi4 de la reacción de condensación, como se describe antes. Todos los productos se obtienen con >85% de pureza, determinado por CLAP.
Ejemplo 71
Ciclohexilamida del acido 2- {2- [ (formil-hidroxi-amino-metil] -3-fenil-propionil amino} -3 , 3-dimetilhexanoico
Sólido blanco (90 mg). -RMN; d (CD30D) , 7.82 (1H, s), 7.29-7.08 (5H, m) , 4.20 (1H, d, J = 5.0 Hz), 3.89 (1H, m) , 3.19 (1H, m) , 2.95-2.67 (2H, m) , 1.88-1.58 (5H, m amplio) , 1.44-1.05 (9H, m amplio) y 0.8g (9H, s) . LREM: tve ion 468 [M+Na] , 446 [M+H] , -ve ion 444 [M-H] .
Ejemplo 72
Fenilmetilamida del ácido 2- {2- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -3 -fenil -propionil amino} -3, 3-dimetilhexanoico
Sólido blanco (77 mg) . 'H-RMN; d (CD3OD) , 7.82 (1H, s) , 7.35-7.1 1 (10H, m) , 4.38-4.19 (3H, m) , 3.85 (1H, m) , 3.52 (1H, m) , 2.97-2.63 (3H, m) , 1.37-1.11 (4H, m) y 0.93-0.78 (9H, ) . LREM: tve ion 476 [M+Na], 454 [M+H] .
Ejemplo 73
Ter-butilamida del ácido 2- {2- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -3-fenil-propionil amino} -3 , 3-dimetil-butírico
Sólido blanco (47 mg) . 'H-RMN; d (CD3OD) , 7.82 (1H, s) , 7.45 (1H, m) , 7.30-7.0g (5H, m) , 4.12 (1H, d, J = 7.2
Hz), 3.8g (1H, m) , 3.41 (1H, m) , 3.15 (1H, m) , 2.g7-2.68
(2H, m) , 1.28 (gH, s) y 0.g2 (gH, s) . LREM: +ve ion 414 [M+Na] , 3 2 [M+H] , -ve ion 3 ? [M-H] .
Ejemplo 74
(1, 1, 3, 3-tetrametil) -butiramida del ácido 2-{2-[ (formil-hidroxi-amino) -metil] -3 -fenil-propionilamino} -3,3-dimetilhexanoico
Sólido blanco (65 mg) . -RMN; d (CD3OD) , 7.7g (1H, s), 7.42-7.21 (1H, m) , 7.20-7.10 (5H, m) , 4.23 (1H, d, J = g. 1 Hz) , 3.86 (1H, m) , 3.51 (1H, m) , 3.23 (1H, m) , 3.00-2.56 (2H, m) , 1.50-1.15 (12H, m) y 1.02-0.83 (18H, m) . LREM: +ve ion 498 [M+Na] , 476 [M+H] , -ve ion 474 [M-H] .
Ejemplo 75
N- (ciclohexil-hexilcarbamoil-metil) -2- [ (formil-hidroxi-amino) -metil] -3-fenil-propionamida
Sólido blanco (98 mg) . 'H-RMN; d (CD30D) , 7.38-7.08 (5H, m) , 4.01 (1H, m) , 3.81 (1H, m) , 3.68-3.35 (2H, m) , 3.15
(1H, m) , 2.98-2.65 (2H, m) , 1.88-1.49 (10H, m amplio) y
1.45-0.83 (11H, m amplio) . LREM: tve ion 466 [M+Na] , 444
[M+H] , -ve ion 442 [M-H] .
Ejemplo 76
N- (ciciohexil -f enilmetilcarbamoil -met il ) -2-[ (formil-hidroxi-amino) -metil] -3-f enil-propionamida
Sólido blanco (34 mg) . ?-RMN; d (CD3OD) , 7.35-7.10 (10H, m) , 4.44-4.23 (2H, m) , 4.05 (1H, m) , 3.87-3.35 (2H, m) , 3.09 (1H, m) , 2.85-2.72 (2H, m) , 1.65-1.46 (4H, m) ,
1.38-0.93 (5H, m amplio) y 0.75-0.51 (2H, m amplio). LREM:
+ve ion 474 [M+Na] , -ve ion 450 [M-H] .
Ejemplo 78
N- [ciciohexil- (1,1,3, 3 -tetrametil -butilcarbamoil) -metil] -2- [ (formil-hidroxiamino) -metil] -3-fenil-propionamida
Sólido blanco (51 mg) . "H-RMN; d (CD3OD) , 7.80 (1H, s) , 7.36-7.10 (5H, m) , 4.05 (1H, m) , 3.85 (1H, m) , 3.49 (1H, m) , 3.15 (1H, m) , 2.91 (1H, m) , 2.68 (1H, m) , 1.90 (1H, m) ,
1.80-1.48 (7H, m) , 1.40-1.12 (10H, m) y 1.08-0.83 (10H, m) . LREM: +ve ion 496 [M+Na] , 474 [M+H] , -ve ion 472 [M-H] .
Ejemplo Biológico A
Demostración de efecto antibacteriano del compuesto 1 (ejemplo 1) y ejemplo 13 del compuesto 2 (ejemplo 2) .
a) . Lae concentraciones individuales mínimas (MIC) de los inhibidores contra E. coli cepa DH5a (genotipo,- F-f80d/acZ?M15? (lacZYA-argF) U16g deoR recAl endAl hedR17 (rk7 mk+)phoA supE44?" thi-1 gyrA96 relAl) obtenido de Gibco BRL Life Technologies, Enterobacter cloacae (American Type Culture Collection, número 13047) , Klebsiella pneumoniae (American Type Culture Collection, número 13883) o Staphylococcus capitis (American Type Culture Collection, número 35661), se determinan como sigue. Las soluciones concentradas del compuesto de prueba (compuestos 1 y 2 a partir de los ejemplos 1 y 2, respectivamente (ambos isómeroe A) ) y tres antibióticos de laboratorio estándar, carbenicilina (Sigma, catálogo número C3416) , canamicina
(Sigma, catálogo número K4000) y cloranfenicol (Sigma, catálogo número C1919) se preparan por disolución de cada compuesto en sulfóxido de dimetilo a 10 mM. Para la determinación de la concentración inhibidora mínima, se preparan diluciones seriadas dobles y se presentan en caldo 2xYT (tiptona 16 g/1, extracto de levadura 10 g/1, cloruro de sodio 5 g/1 obtenido de BIO 101 Inc., 1070 Joshua Way, Vista CA92083, USA), para proporcionar 0.05 ml de compuesto que contiene medio, por pozo. Se preparan los inóculos a partir de cultivos que crecen durante la noche en caldo 2xYT a 37°C. Se ajustan las densidades celulares a absorbancia a 660 nm (Ag60) = 0.1; las preparaciones estandarizadae por densidad óptica se diluyen 1:1000 caldo 2xYT; y cada pozo se inocula con 0.05 ml de las bacterias diluidas. Las placas de microtitulación se incuban a 37°C durante 18 horas en un incubador humidificado. Se registra la MIC (µM) y la concentración de medicamento más baja que inhibe el crecimiento visible.
Tabla 1
b) . Se determinaron como sigue las concentraciones inhibidoras mínimas (MIC) de los inhibidores contra Mycrobacterium ranae (American Type Culture Collection, número 110) , Pseudomonas aeruginosa (American Type Culture Collection, número 9027) , Klebsiella pneumoniae (American
Type Culture Collection, número 10031) , fíelico£>acter pylori (American Type Culture Collection, número 43504) , aislados clínicos de Streptococcus pneumoniae resistencia a aminoglicósido y eritromicina, y Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MR) (American Type Culture Collection, número 33591) . Se preparan soluciones concentradas de los compuestos de prueba 1 y 2 (isómero A para cada uno) y tres antibióticos de laboratorio estándar, gentamicina (G) , ampicilina (A) y eritromicina (E) por disolución de cada compuesto a 10 mg/ml en sulfóxido de dimetilo. Los métodoe utilizados fueron como los que se utilizan para el inciso a) , excepto que el medio para Mycobacterium ranae se utiliza con caldo de infusión de cerebro corazón (GIBCO) y se incuba a 37°C durante 48 horas, se utilizaron Staphylococcus aureus (MR) , Krebsiella pneumoniae y Pseudomonas aeruginosa con caldo nutritivo (DIFCO) y se incuba a 37°C durante 20 horas, se utiliza Heli cobacter pylori con agar base Columbia (OXOID) que contiene 7% de sangre de borrego y se incuba a 35 °C durante 72 horas, y se utiliza Streptococcus pneumoniae con caldo soya tríptico (DIFCO) que contiene 7% de suero bovino y se incuba a 37 °C durante 48 horas. Se registra la MIC (µg/ml) como la concentración de fármaco más baja que inhibe el crecimiento visible.
El control de vehículo positivo (DMSO 1%; sin agente de prueba) provoca el crecimiento de todos los microorganismos . Un control negativo en blanco (ausencia de microorganismos; + agente de prueba) muestra que no hay crecimiento de microorganismos.
Tabla 2
nd no determinado.
En otro experimento se determinaron las concentraciones inhibidoras mínimas de los compuestoe 1 y del producto del ejemplo 13 (compuesto 3) contra una gama de bacterias Gram positivas y Gram negativas utilizando el método de microdilución en caldo, de acuerdo con el estándar probado por el National Committee for Clinical Laboratory Standards procedure (Methids for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that gro aerobically-Fourth Edition ISBN l-56238-309-4) .
Actividad contra bacterias Gram positiva
Actividad contra bacterias Gram negativa
Las actividades del compuesto 3 y del producto del ejemplo 14 (compuesto 4) contra un aislado clínico de Enterococcus faecalis multiresistente, determinado por el método utilizado para los resultados inmediatamente precedentes, se establece en la siguiente tabla y se compara con los resultados obtenidos por el mismo método para agentes antibacterianos conocidos.
Actividad contra aislados clínicos de Enterococcus feacalis multiresistente
Ejemplo Biológico B
i) Clonación del gen PDF de Escheri chia coli
Se clona el gen PDF de E. coli en pET24a(+)
(denominado pTE24-PDF) y se utiliza para transformar células BL21 DE3 de Novagen Inc. (Madison, Wisconsin) . Se seleccionan clonas a 37°C en placas de agar YT (8 g/1 de tiptona, 5 g/extracto de levadura, NaCl 5 g/1, agar 15 g/1) suplementado con 30 µg/ml de canamicina.
ii) Expresión de PDF
Se utiliza un cultivo durante la noche de 20 ml de células BL21 DE3 que alberga a pET24-PDF para infectar 500 ml de caldo 2xYT ( 16 g/1 de tiptona, 10 g/1 de extracto de lavadura, 5 g/1 de NaCl) que contiene 30 µg/ml de canamicina en un matraz con deflectores, de 2 litros, y se hace crecer a 37°C con agitación hasta una D0g00 de 0.6. Después se induce el cultivo mediante el ajuste del medio a isopropil ß-D tiogalactopiranosida 1.0 mM (IPTG). Se permite que la inducción proceda durante 3 horas adicionalee a 37 °C, las células se cosechan por centrifugación y el sedimento celular se lava con 250 ml de solución salina amortiguada con fosfato (PBS) y el sedimento se almacena a -70°C.
iii) Preparación de la fracción de proteína soluble
Las células de un 1 litro de expresión se resuspenden en 2 x 25 ml de solución salina amortiguada con fosfato enfriada con hielo. La suspensión celular se somete a sonicación en hielo un equipo MSE Soniprep 150 al que se le coloca una sonda de medio a una amplitud de 20-25 micrómetros en pulsos de 60 x 20 segundos. La suspeneión resultante después se aclara por centrifugación a 20,000 x g durante 15 minutos. Después se utiliza el sobrenadante para purificación adicional de la enzima.
iv) Purificación de PDF
El lisado de E. coli de un cultivo de 1 1 en solución salina amortiguada con fosfato (PBS) se ajusta con sulfato de amonio 2M. Se equilibra una columna de fenilsefarosa de 15 ml con PBS/sulfato de amonio 2M a 4°C. El lisado se carga en la columna y se lava con amortiguador de equilibrio. La columna se eluye al reducir la concentración de sulfato de amonio de 2M a 0M con 10 volúmenes de columna. Se recolectan fracciones de 5 ml y se analizan por SDS-PAGE. Se acumulan las fracciones que tienen la mayor parte de PDF 20 kDa. Las fracciones acumuladas se concentran utilizando una membrana de un límite de 3 kDa a
un volumen de 5 ml . La fracción después se carga en una columna Superdex 75 (cromatografía de exclusión de tamaño) equilibrada en PBS. El acumulado concentrado de PDF ee eluye a 1 ml/min, a 4°C y se recolectan fracciones de 5 ml y se analizan por SDS-PAGE. Las fracciones más puras se almacenan y acumulan a -70°C.
v) Ensayo in vi tro de PDF
El ensayo se realiza en una placa de 6 pozos única con un volumen final de 100 µl, que contiene:
- 20 µl de PDF (4 µg/ml) - 20 µl de Hepes lOOmM pH 7.0 + KCl 1M + Brij 0.05% - 10 µl de dilución seriada del compuesto de prueba en DMSO 20% - 50 µl de formil-Met-Ala-Ser (8 mM)
El ensayo se incuba a 37°C durante 30 minutos. El grupo amino libre del producto desformilado (Met-Ala-Ser) se detecta usando fluorescamina por las siguientes adiciones:
- 50 µl de borato 0.2M, pH 9.5 - 50 µl de fluorescamina (150 µg/ml en dioxano seco) .
Se cuantifica la fluorescencia en un lactor de placas SLT Fluostar utilizando una longitud de onda de excitación de 390 nM y una longitud de onda de emisión de 485 nM. Las reacciones de control estándar son sin inhibidor de reacción lo que proporciona una cantidad de inhibición cero y sin enzima y ein inhibidor de reacción, lo que proporciona la cantidad de inhibición de 100%. Los datoe se analizan por conversión de las unidades de fluorescencia a % de inhibición y la concentración de inhibidor se gráfica contra % de inhibición. Los datos se ajustan a una función sinoidal: y = A + ( (B-A) / (1+ ( (C/x) D) ) ) , en donde A representa inhibición cero, B representa 100% de inhibición y C representa la CI50, D representa la pendiente. La CI50 representa la concentración de inhibidor (nM) necesaria para disminuir la actividad de la enzima en 50%. Se encuentra que los compuestos de la invención inhiben la PDF bacteriana in vi tro . Además, también se encuentra que la actinonina (Sigma, catálogo número A-6671) también inhibe PDF bacteriano in vitro .
Ejemplo Biológico C
Demostración del compuesto 2 que inhibe PDF in vivo
1. Bloqueo de la reacción de trans formilación de tRNAi -Met confiere resistencia al compuesto 2 (diastereómero/ i somero A)
El trimetoprim inhibe específicamente dihidrofolato reductasa, por lo que disminuye las acumulaciones de derivados de tetrahidrofolato (THF) , incluyendo tetrahidrofolato de formilo (fTHF) , el sustrato de metionil-tRNA formil transferasa (EC 2.1.2.9). Si todos los metabolitos esencialee cuya biosíntesis involucra derivados de THF, por ejemplo pantotenato, metionina, glicina, nucleótidos de purina y timidina son suministrados exógenamente en forma de compuestos precursores en un medio rico suplementado con timidina, entonces las bacterias crecen en un medio rico más timidina (0.3 mM) y trimetopim (100 µg/ml) pueden sintetizar todos los compuestos químicos de las células normales, excepto f-Met-tRNAi (Baumstark, et al., J. Bacteriol. 129: 457-471, 1977). Se utiliza Met-tRNAi no formilado lo que resulta en la formación de polipéptidos que carecen de un grupo formilo en su parte N terminal, independientemente de la acción de la desformilasa . Como se predice por los inventores, las células DH5a crecen en medio LB (tiptona 10 g/1, extracto de levadura 5 g/1, NaCl 10 g/1, pH 7.5) suplementado con trimetoprim y timidina, y se encuentra que son resistentes al compuesto 2 (diastereómero
A) . La demostración de que las células que experimentan proceso de formilación normal sobre proteínas expresadas se inhiben por el compuesto 2A, mientras que, las proteínas no formiladas, como se producen en las células, crecen bajo estas condiciones, y no se inhiben por el compuesto 2A, demuestra que el compuesto 2A es probable que funcione inhibiendo la reacción de desformilación llevada a cabo por PDF.
Tabla 3
Tratamiento de bacterias con el compuesto 2A lleva a la acumulación de proteínas bloqueadas en la parte N terminal
Si los compuestos de la invención en realidad inhiben PDF in vivo, entonces una consecuencia del
tratamiento de bacteriae con el compueeto 2 (ejemplo 2, diastereómero A) será la acumulación de N-formil metionina en la parte N terminal de las proteínas recién sintetizadas. Tales proteínas estarán bloqueadas en la parte N terminal y serán incapacee de ser utilizadas como un sustrato para el secuenciado N terminal por química de degradación de Edman. Para probar eeta hipóteeis, se expreea una proteína deseada en presencia o ausencia del compuesto de prueba. La proteína se aisla, se purifica y después se somete a secuenciado de proteína por degradación de Edman utilizando técnicas conocidas por las personas expertas en el arte. Las células bacterianas transformadas con un vector de expresión permiten la expresión de la seguridad reguladora pequeña de calpaina humana y crecen hasta una DO600 de 0.6 y después se someten a IPTG para inducir la expresión de la proteína heteróloga en presencia de 200 µM de compuesto 2A en presencia de carbenicilina 240 µM o, en presencia de vehículo control durante 2.5 horas. Los extractos de proteínas se separan por SDS-PAGE, la eubunidad de calpaina eluye y la eecuencia de proteínas se determina por química de degradación de Edman utilizando un eecuenciador de proteína automatizado ABI . Se secuencias cantidades iguales de proteína. Los inventores encontraron que el rendimiento del compuesto 2A de proteína tratada se reduce
significativamente en 85% en comparación con el vehículo y los controles tratados con carbecilina. Se clonan subunidades reguladoras pequeñas de calpaina a partir de ARN mensajero obtenido de una biopsia de tumor gástrico utilizando el equipo de aislamiento de ARNm Invitrogen Micro Fats Track"R versión 2.2 (número de catálogo K1520-02) . El ADN copia de este ARNm se sintetiza utilizando un sistema de sínteeis de ADNc Promega Riboclone"" M-MLV-RT (H-) , Notl (Promega, número de catálogo C1660) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Se sintetizan dos cebadoree oligonucleotídicoe para uso en la reacción en cadena de polimerasa (PCR) por Applied Biosystems, Inc., Custo, Services, en base en la secuencia de la subunidad pequeña de calpaina publicada (EMBL, número de acceso X04106) . El fragmento de calpaina HindIII/Xhol después se clona en el vector de expresión dirigido con HindIII y Xhol pET24d(+) de Novagen Inc., (Madison, Wl, USA) utilizando procedimientos estándar. Se utiliza la mezcla de ligación para transformar células DH5a competentes (Life Technologies, Inc., Grand Ieland, NY, USACat# 18265-017). Lae coloniae se seleccionan por crecimiento durante la noche a 37 °C en placas YT más 30 µg/ml de canamicina. Se prepara el ADN plasmídico como se utiliza en el equipo de minipreparado Promega Plus SV y las clonas con el inserto de calpaina se identifican utilizando procedimientos estándar. Se confirma la secuencia
de ADN utilizando el secuenciado de ciclo de Applied Biosystems PE como se describe antes . El gen de E. coli clonado en pET24d(+) (denominado pET24-CANS) se utiliza para transformar células BL21 DE3 de Novagen Inc., (Madison, Wisconsin) . Las clonas se seleccionan a 37°C en placas de agar YT (8 g/1 de tiptona, 5 g/1 de extracto de levadura, 5 g/1 de NaCl, 5 g/1 de agar) suplemtado con 30 µg/ml de canamicina. Se hace constar que con relación a esta fecha, el mejor método conocido por la solicitante para llevar a la práctica la citada invención, es el convencional para la manufactura de los objetos o productos a que la misma se refiere .
Claims (30)
1. El uso de un compuesto de fórmula (I) o una sal farmacéutica o veterinariamente aceptable del mismo, en la preparación de una composición antibacteriana: caracterizado porque: R representa hidrógeno o alquilo de o alquilo de Ci-Cg sustituido por uno o más átomos de halógeno; R2 representa un grupo R10- (X) „- (ALK)„ en donde R10 representa hidrógeno o un grupo alquilo de C1-C6, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, cicloalquilo, arilo o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido por alquilo de C2-C6, alcoxi de Cj-Cg, hidroxi, mercapto, alquiltio de Cj-Cg, amino, halo (que incluye fluoro, cloro, bromo y yodo) , trifluorometilo, ciano, nitro, -COOH, -C0NH2, -COORA, -NHC0R\ -CONHRA, -NHRA, -NRARB, o -CONRARB en donde Rs y RB son independientemente un grupo alquilo de y ALK representa un radical lineal o ramificado divalente de alquileno de alquenileno de C2-C6 o alquinileno de C2-C6, y el cual puede estar interrumpido por uno o más enlaces adyacentes de -NH-, -0- o -S-, X representa -NH-, -0- o -S-, y m y n son independientemente 0 ó 1; y A representa (i) un grupo de fórmula (IA) , (IB) , (IC) o (ID) (IA) (IB) (ID) (IC) en donde : R3 representa hidrógeno y R4 representa la cadena lateral de un alfa aminoácido natural o no natural, o R3 y R4, cuando se toman junto con los átomos de nitrógeno y carbono a los cuales están unidos respectivamente, forman un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 5 a 8 átomos, anillo el cual está opcionalmente fusionado a un anillo carbocíclico o segundo anillo heterocíclico, Rs y R6, independientemente representan hidrógeno 0 alquilo de Cj-Cg opcionalmente sustituido, cicloalquilo, arilo, arilalquilo de Cj-Cg, heterocicliclo o alquilo de Cj-Cg heterocíclico, o R5 y R6, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, forman un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 3 a 8 átomos, anillo el cual está opcionalmente fusionado a un anillo carbocílico o segundo anillo heterocíclico, y R7 representa hidrógeno, alquilo de o un grupo acilo.
2. Un método para el tratamiento de infecciones bacterianas en mamíferos humanos y no humanos, caracterizado porque comprende administrar a un sujeto que padece tal infección, una dosis efectiva antibacteriana de un compuesto de fórmula (I), de conformidad con la reivindicación 1.
3. El uso de conformidad con la reivindicación 1 o un método de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado porque el compuesto de fórmula (I) : Rx representa hidrógeno o alquilo de C1-C€ ; R2 representa un grupo R10- (X)„- (ALK) - en donde' R10 representa hidrógeno o un grupo alquilo de alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, cicloalquilo, arilo o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido por alquilo de C2-C3, alcoxi de C_-C6, hidroxi, mercapto, alquiltio de C1-C6, amino, halo (que incluye fluoro, cloro, bromo y yodo) , trifluorometilo, ciano, nitro, -COOH, -CONH2, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHR\ -NRARB, o -CONR?RB en donde RA y RB son independientemente un grupo alquilo de C-i-Cg, y ALK representa un radical lineal o ramificado divalente de alquileno de C1-C6, alquenileno de C2-C6 o alquinileno de C2-C6, y el cual puede estar interrumpido por uno o más enlaces adyacentes de -NH-, -O- o -S-, X representa -NH-, -O- o -S-, y n es 0 ó 1; y R3 representa hidrógeno o alquilo de C3-Cg, y R4 representa la cadena lateral de un alfa aminoácido natural o no natural, y R5 y R6 representan independientemente hidrógeno o alquilo de o Rs y R6, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, forman un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 3 a 8 átomos, y R7 representa hidrógeno o un grupo acilo.
4. un compuesto de fórmula (I) o una sal farmacéutica o veterinariamente aceptable del mismo caracterizado porque Rx representa hidrógeno, alquilo de C1-C6 o alquilo de Ci-Cg sustituido con uno o más átomos de halógeno; R2 representa un grupo R10-(ALK)m- en donde R10 representa hidrógeno o un grupo alquilo de Cj-Cg, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C3, un cicloalquilo, arilo o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido por alquilo de alcoxi de Cj-Cg, hidroxi, mercapto, alquiltio de Cj-Cg, amino, halo (que incluye fluoro, cloro, bromo y yodo) , trifluorometilo, nitro, -COOH, -CONH2, -COOR\ -NHCORA, -CONHR\ -NHRA, -NRARB, o -CONRARB, en donde Rs y RB son independientemente un grupo alquilo de Cj-Cg. ALK representa un radical divalente lineal o ramificado de alquileno de alquenileno de C2-C6, alquinileno de C2-C6, y se pueden interrumpir por uno o más enlaces no adyacentes de -NH-, -0- o -S-, y m representa 0 ó 1; A representa (i) un grupo de fórmula (IA) , (IB) , (IC) o (ID) (IA) (IB) (ID) (IC) en donde .- R3 representa hidrógeno y R4 representa la cadena lateral de un alfa aminoácido natural o no natural, o R3 y R4, cuando se toman junto con los átomos de nitrógeno y carbono a los cuales están unidos respectivamente, forman un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 5 a 8 átomos, anillo el cual está opcionalmente fusionado a un anillo carbocíclico o segundo anillo heterocíclico, R5 y R6, independientemente representan hidrógeno o alquilo de Cj-Cg. opcionalmente sustituido, cicloalquilo, arilo, arilalquilo de C3-Cg, heterocicliclo o alquilo de heterocíclico, o R5 y R6, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, forman un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 3 a 8 átomos, anillo el cual está opcionalmente fusionado a un anillo carbocílico o segundo anillo heterocíclico, y R7 representa hidrógeno, alquilo de C1-C1 o un grupo acilo . CON LA CONDICIÓN DE QUE (i) cuando A es un grupo de fórmula (IA) o (IB) y R2 es alquilo de C2-C5, entonces R4 no es la cadena lateral de un alfa aminoácido natural o la cadena lateral de un alfa aminoácido natural en el cual cualquier sustituyente funcional está protegido, cualquier grupo amino esté acilado y cualquier grupo carboxilo esté esterificado; (ii) cuando A es un grupo de fórmula (IA) o (IB) entonces R4 no es un grupo biciclicarilmetilo; y (iii) cuando A es un grupo de fórmula (IA) y R2 es ciclopropilmetilo, ciclobutilmetilo o ciclopentilmetilo y uno de Rs y Rß es hidrógeno, entonces R4 no es terbutilo. (iv) cuando R^ es hidrógeno y A es un grupo de fórmula (IA) en donde -NRsRg es un grupo 2-carboxilpirrolidino, R4 es metilo y R3 es hidrógeno, entonces R2 no es hidrógeno; (v) R2 es una cadena de hidrocarburo C13-C24 saturado o insaturado lineal, opcionalmente sustituido por alquilo de hidroxi, metoxi, amino, halo (que incluye fluoro, cloro, bromo y yodo) , -COOH, -CONH2, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, o -CONRARB en donde RA y RB son independientemente metilo; y (vi) cuando R1 es hidrógeno y A es un grupo de fórmula (ID), en donde Rs es metilo y R6 es hidrógeno, entonces R2 no es bencilo.
5. El compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque: Rj representa hidrógeno o alquilo de R2 representa un grupo Rl0- (ALK) - en donde R10 representa hidrógeno o un grupo alquilo de C1-C1, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, un cicloalquilo, arilo o heteroarilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido por alquilo de alcoxi de Cj-C8, hidroxi, mercapto, alquiltio de Cj-Cg, amino, halo (que incluye fluoro, cloro, bromo y yodo) , trifluorometilo, nitro, -COOH, -CONH2, -COORA, -NHCOR\ -CONHRA, -NHRA, -NRARB, o - CONRARB, en donde RA y RE son independientemente un grupo alquilo de ALK representa un radical divalente lineal o ramificado de alquileno de alquenileno de C2-C6, alquinileno de C2-C6, y se pueden interrumpir por uno o más enlaces no adyacentes de -NH-, -0- o -S-; R3 representa hidrógeno o alquilo de C3-Cg, y R4 representa la cadena lateral de un alfa aminoácido natural o no natural, y ¡ y E¡ representan independientemente hidrógeno o alquilo de Ci-Cg, o Rs y R6, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, forman un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 3 a 8 átomos, y R7 representa hidrógeno o un grupo acilo; CON LA CONDICIÓN DE QUE (a) cuando A es un grupo de fórmula (IA) entonces: (i) R, no ee la cadena lateral de un alfa aminoácido natural o la cadena lateral de un alfa aminoácido natural en el cual cualquier sustituyente funcional está protegido, cualquier grupo amino esté acilado y cualquier grupo carboxilo esté esterificado; R4 no es un grupo biciclicarilmetilo fusionado, y (iii) R4 no es terbutilo cuando R2 es cicloalquil (alquilo de Cj-C6) ; y (IV) R2 no es una cadena de hidrdocarburo de C13-C24 saturada o insaturada lineal opcionalmente sustituida por alquilo de d-C8, hidroxi, metoxi, amino, halo (que incluye fluoro, cloro, bromo y yodo) , -COOH, -CONH2, -COORA, -NHCOR\ -CONHRA, -NHRA, -NRARB, o -CONRARB en donde RA y RB son independientemente metilo; y (b) cuando Rí es hidrógeno y A es un grupo de fórmula (ID) , en donde Rs es metilo y R6 es hidrógeno, entonces R2 no es bencilo.
6. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I), R es hidrógeno .
7. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2, o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque en el compuesto de fórmula (I), R2 es : alquilo de Cx-C, opcionalmente sustituido, alquenilo de C3-C6, alquinilo de C3-C6 o cicloalquilo; fenil (alquil de C,-C6) - , fenil (alquenil de C3-C6) -o fenil (alquenil de C3-Cß) - opcionalmente sustituido en el anillo fenilo; cicloalquil (alquil de C^C -, cicloalquil (alquenil de C3-C8) - o cicloalquil (alquinil de C3-C6)-, opcionalmente sustituido en el anillo cicloalquilo; heterociclil (alquil de ^C - , heterociclil (alquenil de C3-C6) - o heterociclil (alquinil de C3-C6) - opcionalmente sustituido en el anillo heterociclilo; o CH3(CH2)pO(CH2)q- o CH3(CH2)pS(CH2)q-, en donde p es 0, 1, 2 ó 3 y q es 1, 2 6 3.
8. El uso de conformidad con la reivindicación l, el método de conformidad con la reivindicación 2, o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I) , R2 es metilo, etilo, n- e iso-propilo, n- e iso-butilo, n-pentilo, iso-pentilo, 3-metil-but-l-ilo, n-hexilo, n-heptilo, n-acetilo, n-octilo, metilsulf aniletilo, etilsulf anilmetilo, 2-metoxietilo, 2-etoxietilo, 2-etoximetilo, 3 -hidroxipropilo, alilo, 3-fenilprop-3-en-l-ilo, prop-2-in-l-ilo, 3-f enilpro-2-in-l-ilo, 3- (2-clorof enil)prop-2-in-l-ilo, but-2-in-l-ilo, ciclopentilo, ciciohexilo, ciclopen ilmetilo, ciclopentiletilo, ciclopentilpropilo, ciclohexilmetilo, ciciohexiletilo, ciclohexilpropilo, furan-2-ilmetilo, furan-3-metilo, tetrahidrofuran-2-ilmetilo, tetrahidrofuran-2-ilmetilo, piperidinilmet ilo , f enilpropilo , 4- clorofenilpropilo, 4-metilfenilpropilo, 4-metoxifenilpropilo, bencilo, 4-clorobencilo, 4-metilbencilo y 4-metoxibencilo .
9. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2, o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de la fórmula (I), R2 es n-butilo, bencilo o ciclopentilmetilo.
10. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2, o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I), R3 es hidrógeno.
11. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2, o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I), R4 es: el grupo definitorio de un a aminoácido natural, por ejemplo bencilo, o 4-metoxifenilmetilo, en el cual cualquier grupo funcional puede estar protegido, cualquier grupo amino puede estar acilado y cualquier grupo carboxilo presente puede estar amidado; o un grupo - [Alk] _R9 en donde Alk es un grupo alquileno de Ci-C8 o alquenileno de C2-C6, opcionalmente interrumpido por uno o más átomos de -0- o -S-, o grupos -N(R12)- en donde R12 es un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo de Ci-C8, n es 0 ó 1 y R9 es hidrógeno o un grupo fenilo opcionalmente sustituido, arilo, heterociclilo, cicloalquilo o cicloalquenilo o (únicamente cuando n es 1) R9 adicionalmente puede ser hidroxi, mercapto, alquiltio de Ci-Cg, amino, halo, trifluorometilo, nitro, -COOH, -C0NH2, -C00RA, -NHC0RA, -C0NHRA, -NHRA, -NRARB, o -C0NRARB en donde RA y RB son independientemente un grupo alquilo de Cj-Cg,- o un grupo bencilo sustituido en el anillo fenilo por un grupo de fórmula -0CH2C0Rß en donde R8 es hidroxilo, amino, alcoxi de Cj-Cg, fenilalcoxi de C3-Cg, alquilamino de C1-C6, di (alquil de amino, fenilalquilamino de Ci-Cg,- o un grupo alquilo de Cj-Cg heterocíclico, ya sea que esté no sustituido o mono- o di-sustituido en el anillo heterocíclico con halo, nitro, carboxi, alcoxi de C1-Cß, ciano, alcanoilo de Cj-Cg, trifluorometilalquilo de Cj-Cg, hidroxi, formilo, ammo, alquilamino de C^-C8, dialquil (Ci-Cg) amino, mercapto, alquiltio de hidroxialquilo de mercaptoalquilo de Cj-C6 o alquil (Cj-Cg) fenilmetilo; o un grupo -CR,RbRc en el cual: cada uno de Ra, Rb y Rc es independientemente hidrógeno, alquilo de alquenilo de C2-C3, alquinilo de C2-C6, fenilalquilo de Cj-Cg, cicloalquilo de C3-Cß; o R. es hidrógeno y R, y Rb son independientemente fenilo o heteroarilo tal como piridilo; o Rc es hidrógeno, alquilo de d-Cg, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, fenilalquilo de Cj-Cg o cicloalquilo de C3-Cß, y R, y Rb junto con el átomo de carbono al cual están unidos, forman un cicloalquilo de 3 a 8 miembros o un anillo heterocíclico de 5 a 6 miembros; o R.< y o junto con el átomo de carbono al cual están unidos, forman un anillo tricíclico (por ejemplo adamantilo) ,- o R y _> son cada uno independientemente alquilo de Cx-C6, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, fenilalquilo de Cj-Cg o un grupo como se define para R. abajo, diferente de hidrógeno, o R, y R„, junto con el átomo de carbono al cual están unidos, forman un anillo cicloalquilo o heterocíclico, y 0 es hidrógeno, -OH, -SH, halógeno, -CN, -C02H, perfluoroalquilo de -CH2OH, -C02 alquilo de Cj-C8, -O alquilo de d-Cg, -O alquen lo de C2-C6, -S alquilo de -C8, - SO alquilo de -S02 alquilo de -S alquenilo de C2-C6, -SO alquenilo de C2-C6, -S02 alquenilo de C2-C6 o un grupo -Q-W, en donde Q representa un enlace -O-, -S-, -S0-o -S02- y W representa un grupo fenilo, fenilalquilo, cicloalquilo de C3-Cß, cicloalquilalquilo de C3-C8, cicloalquenilo de C4-Cß, cicloalquenilalquilo de C4-C8, heteroarilo o heteroarilalquilo, grupo W el cual opcionalmente está sustituido por uno o más sustituyentes que se seleccionan independientemente de hidroxilo, halógeno, -CN, -C02H, -C02 alquilo de C3-Cg, -C0NH2, -CONH alquilo de CÍ-CJ, -CONH (alquil de C1-C,)2, -CHO, -CH20H, perfluoroalquilo de CJ-CÍ, -0 alquilo de -S alquilo de -SO alquilo de Ci-Cg, -S02 alquilo de Cj-C,, -N0_, -NH2, -NH alquilo de Cj-Cg, -N (alquilo de -NHCO alquilo de alquilo de Cj-Cg, alquenilo de C2-C6, alquinilo de C2-C6, cicloalquilo de C3'-Ca, cicloalquenilo de C4-Cß, fenilo o bencilo.
12. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I) R4 es metilo, etilo, bencilo, 4-clorobencilo, 4-hidroxibencilo, fenilo, ciciohexilo, ciclohexilmetilo, piridin-3-ilmetilo, ter-butoximetilo, naftilmetilo, iso-butilo, sec-butilo, terbutilo, 1-benciltio-l-metiletilo, 1-metiltio-l-metiletilo, 1-mercapto-l-metiletilo, 1-metoxi-l-metiletilo, 1-hidroxi-l-metiletilo, 1-fluoro-1-metiletilo, 2-hidroxietilo, 2-carboxietilo, 2-metilcarbamoilo, 2-carbamoiletilo o 4-aminobutilo.
13. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I) , R4 es ter-butilo, iso-butilo, bencilo o metilo.
14. El uso de conformidad con la reivindicación l, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I), R3 y R4, cuando se toman junto con los átomos de nitrógeno y carbono a los cuales están unidos respectivamente, pueden formar un anillo heterocíclico saturado opcionalmente sustituido de 5 a 8 átomos.
15. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I) , R3 y R4 forman un puente entre los átomos de nitrógeno y carbono a los cuales están unidos, el puente está representado por el radical divalente -(CH2)3.6, o -(CH2)r- o -(CH2)„-, o -(CH2)r-S-(CH2)„-, en donde r y s son cada uno independientemente 1, 2 ó 3, con la condición de que r+s = 2, 3, 4 ó 5.
16. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I) , R5 y R6 son independientemente hidrógeno, metilo, etilo, ter-butilo, ciclopentilo, ciciohexilo, 1, 1, 3 , 3-tetrametilbutilo, bencilo, o 2-hidroxietilo.
17. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I) , R5 y R6, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, forman un anillo n-heterocíclico monocíclico de 5 a 8 miembros, saturado, el cual se une vía el átomo de N y el cual opcionalmente contiene -N(R31)- en donde Rlx es hidrógeno o aqluilo de Cj-Cg, bencilo, acilo o un grupo protector de amino, O, S, SO, o S02 como un miembro de anillo, y/o está opcionalmente sustituido en uno o más átomos de C por hidroxi, alquilo de -, alcoxi de oxo, oxo cetalizado, amino, mono (alquil de Cj-Cg) amino, di (alquil de amino, carboxi, alcoxicarbonilo de hidroximetilo, alcoximetilo de C1-Cg, carbamoilo, mono (alquil de Cj-Cg) carbamoilo, di (alquil de Cj-Cg) carbamoilo o hidroxiimino .
18. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I) , R5 y Rg, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, forman un anillo sustituido o no sustituido de 1-pirrolidinilo, piperidin-1-ilo, 1-piperazinilo, hexahidro-1-piridazinilo, morfolin-4-ilo, tetrahidro-1, 4-tiazin-4-ilo, 1-óxido de tetrahidro-1, 4-tiazin-4-ilo, 1,1-dióxido de t e t rahidro - 1 , 4 - t iaz in- 4 - i 1 o , t iaz iol idin- 3 - i 1 o , hexahidroazipino u octahidroazocino .
19. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I), Rs y R6, cuando se toman junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos, forman un anillo sustituido o no sustituido de 1-pirrolidinilo, piperidin-1-ilo, 1-piperazinilo, hexahidro-1-piridazinilo, morfolin-4-ilo, tetrahidro-1, 4-tiazin-4-ilo, 1-óxido de tetrahidro-1, 4-tiazin-4-ilo, 1,1, -dióxido de tetrahidro- 1 , 4 - tiazin-4 -ilo, hexahidroazipino u octahidroazocino; los ejemplos sustituidos de lo anterior son 2- (metilcarbamoil) -1-pirrolidinilo, 2- (hidroximetil) -1-pirrolidinilo, 4-hidroxipiperidino, 2- (metilcarbamoil)piperidino, 4-hidroxiiminopiperidino, 4-metoxipiperidino, 4-metilpiperidin-l-ilo, 4-bencilpiperidin-1-ilo, 4-acetilpiperidin-l-ilo, 4-metil-l-piperazinilo, 4-fenil-1-piperazinol, 1, 4-dioxa-8-azaspiro [4,5]decan-8-ilo, hexahidro-3- (metilcarbamoil) -2 -piridazinilo, y hexahidro-1- (benciloxicarbonil) -2-piridazinilo, decahidroisoquinolin-2-ilo, o 1, 2 , 3 , 4-tetrahidroisoquinolin-2-ilo .
20. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I), R7 es hidrógeno o un grupo R20C(O)- en donde R20 es un grupo alquilo de C1-C6 tal como metilo o etilo.
21. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I) , R20 es metilo o etilo.
22. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I) , A representa un grupo de fórmula (IA) , Rt representa hidrógeno, R2 representa n-butilo, bencilo o ciclopentilmetilo, R3 es hidrógeno, R4 es ter-butilo, isobutilo, bencilo o metilo, R5 es hidrógeno o metilo y R6 representa metilo.
23. El uso de conformidad con la reivindicación 1, el método de conformidad con la reivindicación 2 o el compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque, en el compuesto de fórmula (I), A representa un grupo de fórmula (IB) , R1 representa hidrógeno, R2 representa n-butilo, bencilo, o ciclopentilmetilo, R3 es hidrógeno, y R4 es ter-butilo, iso-butilo, bencilo o metilo.
24. La (lS-dimetilcarbamoil-etil) -amida del ácido 2R(o S) -[ (formil-hidroxi-amino) -metil] -hexanoico, o una sal farmacéutica o veterinariamente aceptable de la misma.
25. La (lS-dimetil-carbamoil-2, 2-dimetil-propil) -amida del ácido 2R(o S) -[ (formil-hidroxi-amino) -metil] -3-ciclopentil-propioico, o una sal farmacéutica o veterinariamente aceptable de la misma.
26. Un compuesto de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque se describe en cualquiera de los ejemplos 1-3, 5-13, o 15-78, o una sal farmacéutica o veterinariamente aceptable de la misma.
27. Una composición antibacteriana farmacéutica o veterinariamente, caracterizada porque comprende un compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 4 a 26, junto con un excipiente o portador farmacéutica o veterinariamente aceptable.
28. Un método para la identificación de compuestos antibacterianos, caracterizado porque comprende: (i) analizar compuestos de prueba para determinar actividad como inhibidores de PDF ín vi tro, (ii) analizar aquellos compuestos los cuales muestren actividad inhibidora para PDF con el fin de determinar capacidad para inhibir el crecimiento bacteriano.
29. El uso de un compuesto, caracterizado porque inhibe la actividad de PDF bacteriano, en la preparación deuna composición o agente antibacteriano, con la condición de que (i) el compuesto no sea de fórmula (XI) RCO-CH(W) -NH-CO (Y) -CH-CH2-CO-NH-OH (XI) en donde , (a) R es un grupo aminocíclico, W es hidrógeno, metilo, isopropilo, isobutilo o bencilo, e Y es hidrógeno, alquilo de C1-C3, fenilo, bencilo, 4-clorofenilmetilo, 4-nitrofenilmetilo o 4-aminofenilmetilo; o (b) R es 2-piridilamino o 2-tiazolilamino, W es isopropilo e Y es n-pentilo; o (c) R es dietilamino, W es metilo o isopropilo, e Y es n-pentilo; o (ii) el compuesto no es uno que contenga un grupo piperazin-1, 6-diilo divalente.
30. Un método para tratar una infección o contaminación bacteriana al administrar a un paciente que padece de tal infección o contaminación, o al aplicar al sitio de tal infección o contaminación, una cantidad efectiva antibacteriana de un compuesto el cual inhibe la actividad de la enzima PDF bacteriana, con la condición de que: (i) el compuesto no sea de fórmula (XI) RCO-CH(W) -NH-COCH(Y) -CH2-CO-NH-OH (XI) en donde, (a) R es un grupo aminocíclico, W es hidrógeno, metilo, isopropilo, isobutilo o bencilo, e Y es hidrógeno, alquilo de C -C3 ? fenilo, bencilo, 4-clorofenilmetilo, 4-nitrofenilmetilo o 4 -aminofenilmetilo; o (b) R es 2-piridilamino o 2-tiazolilamino, W es isopropilo e Y es n-pentilo; o (c) R es dietilamino, W es metilo o isopropilo, e Y es n-pentilo,• o (ii) el compuesto no es uno que contenga un grupo piperazin-1, 6-diilo divalente.
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