KR20230104136A - 조성물 및 이의 용도 - Google Patents
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Abstract
본 개시내용은 일반적으로 고양잇과 대상체를 치료하기 위한 조성물 및 방법에 관한 것이다. 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열을 포함하는 핵산 분자를 포함하는 아데노 관련 바이러스 벡터가 제공된다.
Description
본 개시내용은 일반적으로 고양잇과 대상체(feline subject), 특히, 빈혈(anaemic)이 있거나 빈혈이 될 위험이 있는 고양잇과 대상체를 치료하기 위한 조성물 및 방법에 관한 것이다.
서열 목록에 관한 진술
이 출원과 연관된 서열 목록은 종이 카피 대신에 텍스트 형식으로 제공되며, 명세서에 참조로서 포함된다. 서열 목록을 함유하는 텍스트 파일의 이름은 SCTB-008-01WO_ST25이다. 텍스트 파일은 2021년 9월 24일에 생성된 14KB이며, 이로써 전자 형태로 제출되고 있다.
헤마토포이에틴 또는 헤모포이에틴으로도 공지된 에리트로포이에틴(EPO)은 세포 저산소증(cellular hypoxia)에 반응하여 신장의 관주위 세포 내에서 주로 만들어진 호르몬이다. EPO는 또한, 주로 태아 및 주 산기 기간 동안 간에서 생산되지만, 신장 합성은 성인에서 우세하다. 그것은 골수에 작용하여 적혈구 생성(erythropoiesis)을 자극하여 정상 적혈구 회전율(적혈구 항상성(red blood homeostasis))을 보상한다. 에리트로포이에틴은 성숙한 적혈구의 아폽토시스(프로그램된 세포 사멸)를 또한 제어한다.
신장 질환(renal disease)은 전형적으로 EPO 생산을 감소시킨다. 인간에서, 만성 신장 질환에서의 빈혈의 관리는 재조합 인간 EPO(에포에틴)의 발달에 의해 혁명을 일으켰다. 모두 삶의 품질에 바람직하지 않게 영향을 미치는 피로(fatigue), 무기력(lethargy), 졸림(somnolence) 및 호흡 곤란(shortness of breath)과 같은 만성 신장 질환에 기인한 많은 증상은 빈혈이 교정될 때 해결되거나 현저하게 개선된다. EPO는 또한 골수이형성증(myelodysplasia)과 같은 다른 질환과 화학요법으로 인한 빈혈 상태의 치료에 사용되었다. 그러나, 심근 경색(myocardial infarction), 뇌졸중(stroke) 및 정맥 혈전 색전증(venous thromboembolism)을 포함한 EPO 요법과 관련된 위험이 있다. 이러한 위험은 EPO 치료가 교란된 적혈구 항상성 또는 적혈구 증가증(polycythemia); 즉, 과도한 헤모글로빈 수치(전형적으로 인간에서 11-12g/dL 초과)를 초래할 때 증가할 수 있다.
만성 신장 질환으로 인한 빈혈(anaemia)을 포함한 빈혈은 또한 고양잇과를 포함한 동물에 영향을 미친다. 만성 신장 질환(CKD)을 앓고 있는 200백만 마리 이상의 고양이가 있고, CKD 관련 신부전을 갖는 고양이 및 개와 같은 반려동물은 전형적으로 적어도 부분적으로 EPO의 불충한 수준에 기인하는 빈혈을 포함한 인간 CKD에서 볼 수 있는 것과 유사한 병태생리학적 특징을 나타낼 것임을 주목한다. 빈혈을 갖는 반려동물에 대한 기존 치료는 인간 재조합 EPO의 투여를 포함한다. 그러나, 동물이 전형적으로 재조합 EPO에 대한 면역 반응을 발달시킬 것이므로, 장기간 치료는 일반적으로 비효과적이다. 따라서, 이를 필요로 하는 대상체, 특히 고양잇과에 대한 EPO의 연장된 전달을 위한 개선된 치료 섭생에 대한 절실한 필요성이 여전히 존재한다.
본원에 개시된 측면에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진하기 위한 방법이 제공되며, 상기 방법은 AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 AAV 캡시드는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩(encoding)하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열(expression control sequence)을 포함하며, 조성물은 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 대상체에게 투여되며, 용량은 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(genome copy)(gc/kg) 이하이다. 한 구현예에서, 용량은 체중 kg당 약 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하이다.
본 개시내용은 또한 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진하기 위한 약제의 제조에서의, AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)의 용도로 확장되고, 여기서 AAV 캡시드는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하며, rAAV는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 투여하기 위해 제형화되고, 용량은 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하이다. 한 구현예에서, 용량은 체중 kg당 약 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하이다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진하는 데 사용하기 위한 약제학적 조성물로서, 상기 조성물이 AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하고, 상기 AAV 캡시드가 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하며, 상기 rAAV가 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 투여하기 위해 제형화되고, 상기 용량이 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하인, 약제학적 조성물이 제공된다. 한 구현예에서, 용량은 체중 kg당 약 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하이다.
본원에 기재된 재조합 벡터는 만성 신장 질환 및 불충분한 수의 순환성 적혈구(즉, 빈혈)를 특징으로 하는 다른 상태를 치료하기 위한 섭생에 사용될 수 있다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 본원에 기재된 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 단위 투여 형태(unit dosage form)가 제공되며, 여기서 투여 형태는 약 1.0x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 양으로 rAAV를 포함한다.
본 개시내용은 또한 본원에 기재된 조성물 또는 투여 형태를 포함하는 키트(kit)로 확장된다.
본 발명의 다른 측면 및 이점은 본 발명의 다음의 상세한 설명으로부터 쉽게 명백해질 것이다.
도 1은 정상 실험실 고양이에서 헤마토크릿(HCT)에 대한 고양잇과 EPO를 발현하는 AAV1(AAV1-EPO)의 효과를 나타낸다. AAV1-EPO는 1.9x108, 6.0x108, 1.9x109 및 6.0x109 유전자 카피/kg 체중(gc/kg; 투여 그룹당 n= 6)으로 투여되었다. 대조군 동물은 인산염 완충 식염수(PBS)를 위약으로 투여받았다. 임의의 개별 고양이에서 HCT의 최대 증가는 15포인트(point)(%)였다. 정상적인 건강한 고양이에서, 용량 1.9x109 및 6.0x109 gc/kg은 그룹 평균 HCT에서 유의미하고 일관된 증가를 나타냈다. 1.9x108 gc/kg 및 6.0x108은 위약과 비교하여 평균 HCT에 대한 임의의 유의미한 영향을 나타내지 않았다. Y축- 헤마토크릿(HCT%); X축- AAV1-EPO의 투여 후 일수.
도 2는 CKD 관련 빈혈을 갖는 3마리 고양이에서 헤마토크릿(HCT)에 대한 3.0x109 gc/kg의 AAV1-EPO의 효과를 나타낸다. Y축- 헤마토크릿(HCT%); X축- 0일째 AAV1-EPO의 투여 후 일수.
도 3은 약 2.0x108 내지 약 6.0x108 gc/kg의 투여량 범위에서 AAV1-EPO의 투여 후 CKD 관련 빈혈 고양이의 적혈구 항상성을 나타낸다. AAV1-EPO로 치료를 받은 고양이는 적혈구 증가증에 대한 치료를 필요로 하지 않았다. Y축- 헤마토크릿 또는 패킹된 세포 용적(packed cell volume; PCV%); X축- 0일째(기준선) AAV1-EPO의 투여 후 일수. * 기준선(쌍을 이룬 T-테스트)과 비교하여 p <0.05; 오차 막대는 표준 편차를 나타내고; 각각 언급된 시점에서 n= 15, 15, 14, 13, 10, 9.
도 4는 고양잇과 EPO의 예시적인 아미노산 서열(서열번호 1)을 나타낸다. 리더 서열은 밑줄이 그어져 있다. 서열번호 1의 고양잇과 EPO 프로단백질을 인코딩하는 코돈 최적화(codon optimizing)된 뉴클레오티드 서열은 서열번호 2에 제시되어 있다. 바이러스 벡터를 생성하기 위한 발현 카세트는 바이러스 게놈의 패키징 신호에 의해 측면에 있는 고양잇과 EPO 작제물 서열을 함유하고, 다른 발현 제어 서열은 서열번호 3에 제시되어 있다.
도 5는 고양잇과 EPO 프로단백질을 인코딩하는 AAV1-고양잇과 EPO 발현 벡터(GenBank 수탁 번호 AFN85670.1), 치킨 베타-엑틴 프로모터(promoter) 및 부분 CMV 즉각적 초기 인핸서를 나타낸다. 발현 작제물은 5' 및 3' AAV 반전된 말단 반복(ITR)에 의해 측면에 있다. 이어서, 고양잇과 EPO 발현 작제물은 삼중 형질감염과 이오딕사놀 구배 정제에 의해 AAV 혈청형 1(AAV1) 캡시드에 패키징되고, Taqman 정량적 PCR에 의해 적정되었다.
도 6은 4기 만성 신장 질환의 진단으로부터 사망까지 SB-001로 치료된 고양이의 생존을 보여준다(n=9). 평균 생존 시간은 64일이었다.
도 2는 CKD 관련 빈혈을 갖는 3마리 고양이에서 헤마토크릿(HCT)에 대한 3.0x109 gc/kg의 AAV1-EPO의 효과를 나타낸다. Y축- 헤마토크릿(HCT%); X축- 0일째 AAV1-EPO의 투여 후 일수.
도 3은 약 2.0x108 내지 약 6.0x108 gc/kg의 투여량 범위에서 AAV1-EPO의 투여 후 CKD 관련 빈혈 고양이의 적혈구 항상성을 나타낸다. AAV1-EPO로 치료를 받은 고양이는 적혈구 증가증에 대한 치료를 필요로 하지 않았다. Y축- 헤마토크릿 또는 패킹된 세포 용적(packed cell volume; PCV%); X축- 0일째(기준선) AAV1-EPO의 투여 후 일수. * 기준선(쌍을 이룬 T-테스트)과 비교하여 p <0.05; 오차 막대는 표준 편차를 나타내고; 각각 언급된 시점에서 n= 15, 15, 14, 13, 10, 9.
도 4는 고양잇과 EPO의 예시적인 아미노산 서열(서열번호 1)을 나타낸다. 리더 서열은 밑줄이 그어져 있다. 서열번호 1의 고양잇과 EPO 프로단백질을 인코딩하는 코돈 최적화(codon optimizing)된 뉴클레오티드 서열은 서열번호 2에 제시되어 있다. 바이러스 벡터를 생성하기 위한 발현 카세트는 바이러스 게놈의 패키징 신호에 의해 측면에 있는 고양잇과 EPO 작제물 서열을 함유하고, 다른 발현 제어 서열은 서열번호 3에 제시되어 있다.
도 5는 고양잇과 EPO 프로단백질을 인코딩하는 AAV1-고양잇과 EPO 발현 벡터(GenBank 수탁 번호 AFN85670.1), 치킨 베타-엑틴 프로모터(promoter) 및 부분 CMV 즉각적 초기 인핸서를 나타낸다. 발현 작제물은 5' 및 3' AAV 반전된 말단 반복(ITR)에 의해 측면에 있다. 이어서, 고양잇과 EPO 발현 작제물은 삼중 형질감염과 이오딕사놀 구배 정제에 의해 AAV 혈청형 1(AAV1) 캡시드에 패키징되고, Taqman 정량적 PCR에 의해 적정되었다.
도 6은 4기 만성 신장 질환의 진단으로부터 사망까지 SB-001로 치료된 고양이의 생존을 보여준다(n=9). 평균 생존 시간은 64일이었다.
상세한 설명
본원에 사용된 용어는 단지 특정 구현예를 설명하는 목적을 위한 것이며, 제한하려는 의도는 아니다. 달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 모든 기술 및 과학 용어는 본 개시내용이 속하는 기술 분야의 숙련가에 의해 일반적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 본원에 기재된 것들과 유사하거나 동등한 임의의 물질 및 방법이 본 발명을 실시하는 데 사용될 수 있다. 실무자는 당해 기술 분야의 정의 및 용어 및 당업자에게 공지된 다른 방법에 대해서 문헌[Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Press, Plainsview, N.Y., and Ausubel et al. (1999) Current Protocols in Molecular Biology (Supplement 47), John Wiley & Sons, New York, Murphy et al. (1995) Virus Taxonomy Springer Verlag:79-87]을 참조할 수 있다.
본원에 사용된 용어 "약"은 참조 양, 수준, 값, 치수, 크기 또는 양에 대해10% 만큼(10%, 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2% 또는 1%) 변하는 양, 수준, 값, 치수, 크기 또는 양을 지칭한다.
이 명세서 전반에 걸쳐, 문맥이 달리 요구하지 않는 한, 단어 "포함하다", 또는 변형, 예를 들어, "포함한다" 또는 "포함하는"은 언급된 요소 또는 정수 또는 요소 또는 정수의 그룹을 포함하지만, 임의의 다른 요소 또는 정수 또는 요소 또는 정수의 그룹을 배제하는 것은 아님을 암시하는 것으로 이해될 것이다.
"~로 구성된"은 "~로 구성된"이라는 문구 뒤에 오는 모든 것을 포함하고, 이에 제한되는 것을 의미한다. 따라서, 문구 "~로 구성된"은 열거된 요소가 필요하거나 필수적이고, 다른 요소가 존재하지 않을 수 있음을 나타낸다. "본질적으로 ~로 구성된"은 그 문구 뒤에 나열된 임의의 요소를 포함하고, 열거된 요소에 대해 본 개시내용에 명시된 활동 또는 작용을 방해되거나 기여하지 않는 다른 요소로 제한된다. 따라서, 문구 "본질적으로 ~로 구성된"은 열거된 요소가 필요하거나 필수적이지만, 다른 요소가 임의적이고, 열거된 요소의 활동 또는 작용에 영향을 미치는지 여부에 따라 존재할 수도 있고 존재하지 않을 수도 있음을 나타낸다.
본원에 사용된 바와 같이, 단수 형태 "a", "an" 및 "the"는 문맥상 명백하게 달리 지시하지 않는 한 복수의 측면을 포함한다. 예를 들어, "벡터"에 대한 참조는 단일 벡터뿐만 아니라 둘 이상의 벡터를 포함하고; "세포"에 대한 참조는 하나의 세포뿐만 아니라 둘 이상 세포 등등을 포함한다.
뉴클레오티드 및 아미노산 서열은 서열 식별자 번호(서열번호)에 의해 지칭된다. 서열번호는 수치적으로 서열 식별자 <400>1, <400>2 등에 상응한다. 서열 식별자의 요약이 본원에 제공된다.
본 발명은 재조합 고양잇과 EPO의 발현을 구동하도록 적응되고, 그렇지 않으면 건강한 고양잇과 대상체에서 헤마토크릿 또는 패킹된 세포 용적을 증가시키기에 충분한 아데노바이러스 벡터의 용량이 예기치 않게 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에게 유해하거나 치명적이다는 발명자들의 놀라운 발견에 적어도 부분적으로 근거한다. 본 발명자들은 그럼에도 불구하고 고양잇과 EPO 발현 아데노바이러스 벡터가 건강한 고양잇과 대상체에서 헤마토크릿 또는 패킹된 세포 용적을 증가시킬 것으로 예상되지 않는 낮은 용량으로 빈혈 고양잇과 대상체에게 투여될 때 적혈구 항상성이 빈혈 고양잇과 대상체에서 회복될 수 있음을 예기치 않게 발견하였다. 유리하게, 본 발명자들은 본원에 기재된 저용량 치료 섭생이 빈혈 동물에서 적혈구 증가증의 위험을 최소화한다는 것을 또한 발견하였다.
따라서, 본원에 개시된 측면에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키기 위한 방법이 제공되고, 상기 방법은 AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 AAV 캡시드는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열과 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 조성물은 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 대상체에게 투여되고, 용량은 체중 kg당 약 2xl09 게놈 카피(gc/kg) 이하이다.
적혈구 항상성
본원에 사용된 바와 같이, 문구 "적혈구 항상성"은 그 종의 건강한 대상체에 대해 허용 가능한 또는 정상 한계 내에 있는 것으로 이해되는 대상체에서 순환성 적혈구 수준의 생리학적 유지를 지칭한다. 예를 들어, 고양잇과 대상체에서, 순환성 적혈구의 정상 수준은 전형적으로 약 28.2% 내지 약 50%(헤마토크릿 또는 패킹된 세포 용적)의 범위 내에 있다.
헤마토크릿은 평균 세포 용적(MCV)과 적혈구(RBC) 수의 산물로서 계산되며, 이들 둘 다 적합한 분석기에 의해 직접 측정될 수 있으며, 여기서 HCT = (MCV x RBC 수)÷10이다. MCV(예: RBC의 저장은 증가된 MCV로 RBC 부종을 초래할 수 있다) 또는 RBC 수(예: 용혈)를 잘못 증가시키거나 감소시킬 수 있는 인자는 HCT에 영향을 미칠 수 있지만, 반드시 PCV에 영향을 미칠 수는 없다. 패킹된 세포 용적(PCV)은 전형적으로 마이크로헤마토크릿 원심분리기에서 마이크로헤마토크릿 튜브에서 혈액 샘플을 원심분리함으로써 측정되고, 샘플의 총 높이의 백분율로 원심분리 후 마이크로헤마토크릿 튜브에서 적혈구 컬럼의 높이로서 취한다. HCT와 달리, PCV 측정은 플라즈마 포획 및 적혈구가 컬럼 내에서 어떻게 패킹되는지에 의해 영향을 받을 수 있다. HCT 및 PCV는 모두 혈액의 %(SI 단위는 전형적으로 L/L임); 즉 % ÷ 100 = L/L로 표현된다. 정상 (건강한) 고양잇과 대상체에서 HCT/PCV 값의 다양한 보고가 있지만, 이러한 값은 전형적으로 약 28.2% 내지 약 50%의 범위내이다. 대조적으로, 빈혈 고양잇과 대상체는 전형적으로 28.2% 미만의 HCT/PCV를 가질 것이다.
빈혈은 전형적으로 적혈구 또는 헤모글로빈의 수 또는 품질의 결핍으로 정의된다. 빈혈은 다수의 상이한 인자에 의해 유발되며, 이의 예는 혈액 손실(예: 외상 및 위장 출혈), 적혈구 생산 감소(예: 철 결핍, 비타민 B12 결핍, 영양 실조, 지중해 빈혈(thalassemia) 및 골수 신생물), 및 적혈구 파괴 증가(예: 응고 질환, 기생충 감염(예: 벼룩, 진드기, 십이지장충, 미코플라스마 헤모펠리스) 및 자가면역 질환)를 포함한다. 본원에 개시된 구현예에서, 고양잇과 대상체는 빈혈성(즉, 빈혈을 갖는 것)으로 특성화될 것이며, 여기서 고양잇과 대상체는 약 29% 미만, 바람직하게는 약 28.2% 미만의 PCV의 헤마토크릿 또는 팩킹된 세포 용적을 갖는다. 한 구현예에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체는 약 28% 이하의 PCV를 갖는다. 또 다른 구현예에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체는 약 10% 내지 약 28% 범위의 PCV를 갖는다. 한 구현예에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체는 약 22% 내지 약 28% 범위의 PCV를 갖는다. 한 구현예에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체는 약 22.5%의 PCV를 갖는다.
한 구현예에서, 빈혈은 적어도 부분적으로 약물의 사용에 기인하며, 이의 예시적인 예는 화학요법을 포함한 FIV/고양잇과 AIDS 치료 및 암 치료제를 포함한다. 한 구현예에서, 빈혈은 적어도 부분적으로 의학적 상태에 기인하며, 이의 예시적인 예는 암, FIV/AIDS, 류마티스 관절염(rheumatoid arthritis), 크론병(Crohn's disease) 및 다른 만성 염증성 질환(other chronic inflammatory diseases) 및 기능 장애 골수(dysfunctional bone marrow)(예: 재생 불량성 빈혈(aplastic anaemia), 백혈병(leukemia), 골수이형성증(myelodysplasia) 또는 골수섬유증(myelofibrosis)), 다발성 골수종(multiple myeloma), 골수 증식성 장애(myeloproliferative disorders) 및 림프종(lymphoma), 용혈성 빈혈(hemolytic anaemia), 겸상 적혈구 빈혈(sickle cell anaemia) 및 지중해 빈혈을 포함한다. 한 구현예에서, 빈혈은 만성 신장 질환(chronic kidney disease)에 기인한다. 한 구현예에서, 빈혈은 만성 신장 질환과 관련된다.
일부 구현예에서, 빈혈이 발생할 위험이 있는 고양잇과 대상체, 예를 들어, 고양잇과 대상체가 빈혈 상태를 촉진할 가능성이 있는 질환 또는 상태로 진단되었지만 그렇지 않으면 정상 범위 내의 HCT/PCV를 갖는 고양잇과 대상체를 치료하는 것이 바람직할 수 있다. 이러한 상황에서, 본원에 기재된 방법은 고양잇과 대상체가 빈혈이 되면, 빈혈을 예방하거나 적혈구 항상성을 회복시키는데 사용될 수 있다. 따라서, 빈혈이 발생할 위험이 있는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진하는 방법이 또한 본원에서 고려되고, 상기 방법은 AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함하며, 여기서 AAV 캡시드는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 조성물은 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 대상체에 투여되고, 용량은 체중 kg당 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하이다.
당업자는 본원에 기재된 방법이 AAV 벡터의 투여 후 대상체에서 그 종의 건강한 대상체에 대해 허용 가능한 또는 정상 범위 내의 값으로 HCT/PVC의 증가가 존재하는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진(즉, 회복)시킬 것임을 이해할 것이다.
한 구현예에서, 용량은 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 5 내지 약 30 PCV 포인트만큼 증가시키는 데 효과적이다. 다른 구현예에서, 용량은 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 10 내지 약 20 PCV 포인트만큼 증가시키는 데 효과적이다. 또 다른 구현예에서, 용량은 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 15 PCV 포인트만큼 증가시키는 데 효과적이다.
한 구현예에서, 용량은 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 30% 내지 약 55%의 값으로 증가시키는 데 효과적이다. 다른 구현예에서, 용량은 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 30% 내지 약 35%의 값으로 증가시키는 데 효과적이다. 또 다른 구현예에서, 용량은 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 33% 내지 약 35%의 값으로 증가시키는 데 효과적이다.
본원의 다른 곳에서 언급된 바와 같이, 본 발명자들은 놀랍게도 본원에 기재된 투여 섭생이 적혈구 증가증(과도하거나 비정상적으로 높은 적혈구 수준)을 피하면서 적혈구 항상성을 촉진시키거나 그렇지 않으면 회복시킨다는 것을 발견하였다. 따라서, 한 구현예에서, 고양잇과 대상체는 조성물의 투여 후 70일째까지 적혈구 증가증이 발생하지 않는다. 다른 구현예에서, 고양잇과 대상체는 적혈구 증가증에 대한 치료를 필요로 하지 않으며, 바람직하게는 조성물의 투여 후 70일째까지 적혈구 증가증에 대한 치료를 필요로 하지 않는다.
한 구현예에서, 조성물은 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여된다. 한 구현예에서, 조성물은 체중 kg당 약 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여된다. 한 구현예에서, 조성물은 약 1.0x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여된다. 한 구현예에서, 조성물은 약 1.2x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여된다.
본 개시내용은 또한 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진하기 위한 약제의 제조에서의, AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)의 용도로 확장되고, 여기서 AAV 캡시드는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, rAAV는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 투여하기 위해 제형화되며, 용량은 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하이다. 한 구현예에서, 용량은 체중 kg당 약 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하이다. 한 구현예에서, 조성물은 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여하기 위해 제형화된다. 한 구현예에서, 조성물은 체중 kg당 약 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여하기 위해 제형화된다. 한 구현예에서, 조성물은 약 1.0x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여하기 위해 제형화된다. 한 구현예에서, 조성물은 약 1.2x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여하기 위해 제형화된다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진하는데 사용하기 위한 약제학적 조성물이 제공되며, 여기서 조성물은 AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하며, AAV 캡시드는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하며, rAAV는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 투여하기 위해 제형화되고, 용량은 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하이다. 한 구현예에서, 용량은 체중 kg당 약 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하이다. 한 구현예에서, 조성물은 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여하기 위해 제형화된다. 한 구현예에서, 조성물은 체중 kg당 약 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여하기 위해 제형화된다. 한 구현예에서, 조성물은 약 1.0x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여하기 위해 제형화된다. 한 구현예에서, 조성물은 약 1.2x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 단위 용량으로서 고양잇과 대상체에게 근육내 투여하기 위해 제형화된다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하는 방법이 제공되며, 상기 방법은 AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 AAV1 캡시드는 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 조성물은 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체에게 약 3.65 x109 게놈 카피의 용량으로 또는 (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 약 7.30x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여된다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하기 위한 약제의 제조에서의, AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)의 용도가 제공되고, 여기서 AAV1 캡시드는 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, rAAV는 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체에게 약 3.65 x109 게놈 카피의 용량으로 또는 (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 약 7.30x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화된다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하는 데 사용하기 위한 약제학적 조성물이 제공되고, 여기서 조성물은 AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하며, AAV1 캡시드는 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, rAAV는 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체에게 약 3.65 x109 게놈 카피의 용량으로 또는 (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 약 7.30x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화된다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하는 방법이 제공되고, 상기 방법은 AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 AAV1 캡시드는 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 조성물은 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체에게 약 3.65 x109 게놈 카피의 용량으로 또는 (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 각각 약 3.65 x109 게놈 카피를 포함하는 2개 용량의 형태로 투여된 약 7.30x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여된다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하기 위한 약제의 제조에서의, AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)의 용도가 제공되고, 여기서 AAV1 캡시드는 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, rAAV는 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체에게 약 3.65 x109 게놈 카피의 용량으로 또는 (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 각각 약 3.65 x109 게놈 카피를 포함하는 2개 용량의 형태로 투여된 약 7.30x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화된다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하는 데 사용하기 위한 약제학적 조성물이 제공되고, 여기서 조성물은 AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하며, AAV1 캡시드는 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, rAAV는 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체에게 약 3.65 x109 게놈 카피의 용량으로 또는 (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 각각 약 3.65 x109 게놈 카피를 포함하는 2개 용량의 형태로 투여된 약 7.30x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화된다.
에리트로포이에틴(EPO)
EPO는 신장에서 주로 생산되는 당단백질 호르몬이다. 인간 EPO는 심하게 글리코실화되고 약 30kDa의 분자량을 가지며, 그 중 40%는 탄수화물 성분으로부터 유래된다. EPO는 아직 헤모글로빈을 합성하기 시작하지 않은 EPO 의존성 콜로니 형성 단위-적혈구(CFU-E) 세포 및 적혈구 세포의 생존을 촉진한다. 리간드 결합시, 내재적 촉매 기능이 부족하고 저산소증 유도성인 EPO 수용체(EpoR)는 티로신 키나제 야누스 키나제 2(JAK2)와 결합하며, 이는 차례로 EpoR을 인산화하고 src 상동성 2(SH2) 도메인을 함유하는 신호 전달 단백질을 위한 다중 도킹 부위를 제공한다. EpoR에서의 신호전달은 신호 전달 및 전사 활성화제(STAT) 5 경로, 포스파티딜이노시톨-3-키나제/단백질 키나제 B(PI-3K/AKT) 및 미토겐-관련 단백질 키나제/세포외 신호 관련 키나제(MAPK/ERK) 경로뿐만 아니라 단백질 키나제 C를 포함하는 다중 경로를 통해 발생한다. 조직 산소화가 EPO 생산을 제어하고 EPO가 적혈구(RBC) 생산을 제어하는 음성 피드백 시스템은 신체 조직으로의 산소 전달에서 항상성을 제공한다(참조: Koury and Bondurant, 1991; Am J Kidney Dis.; 18(4 Suppl 1):20-3). EPO는 초기 적혈구 전구 세포에서 유사분열에 약간의 영향을 미칠 수 있지만, RBC 생산의 제어는 적혈구 세포 발달의 후기 단계에서 발생하는 것으로 나타나며, 여기서 그것은 프로그램된 세포 사멸을 방지한다.
문헌[참조: H. Franklin Bunn in the 2013 paper, "Erythropoietin" (Cold Spring Harb Perspect Med.; 3(3):a011619)]에 의해 언급된 바와 같이, 적혈구 생성은 일반적으로 인간 및 다른 포유동물에서 낮은 기저율로 진행되어 노화된 적혈구를 젊은 망상 적혈구로 대체한다. 인간에서, 적혈구 생산은 출혈, 용혈, 및 동맥 혈액의 산소화 또는 조직으로의 산소 전달을 손상시키는 다른 유형의 스트레스를 포함한 다양한 임상 환경에서 기준선 비율보다 8배까지 향상될 수 있다. 태아 발달 동안, EPO는 주로 간에서 생산되지만, 출생 후 신장은 EPO 생산의 약 80%를 차지한다.
인간 Epo 메신저 RNA(mRNA)는 193-잔기 폴리펩티드를 인코딩한다. 소포체에서 표준 리더 서열의 절단 및 번역후 글리코실화 후, 166-잔기 폴리펩티드가 방출된다. rhEpo의 1차 구조는 C-말단에서 아르기닌 잔기의 생체내 번역후 절단을 제외하고는 내인성 호르몬의 구조와 동일한 것으로 나타났다. EPO는 약 7 내지 8시간의 혈장 반감기를 갖는 혈장에서 순환하고, 골수에서 적혈구 전구 세포(CFUe)의 표면에 비교적 적은 수(약 1000개/세포)로 존재하는 고친화성(약 100pM) 수용체에 결합한다.
EPO는 상이한 종에 걸쳐 상동성을 공유하는 리더 서열과 함께, 프로펩티드 또는 전구체 단백질로서 생체내에서 발현된다(참조: 예를 들어, Wen et al. (1993), Blood, 82(5):1507-1516). 고양잇과 EPO의 아미노산 및 뉴클레오티드 서열은 당업자에게 친숙할 것이며, 이의 예시적인 예는 문헌(참조: GenBank 수탁 번호 NM_001009269, U00685, AFN85670, AAA18282, Wen et al. (1993, Blood, 82(5):1507-1516), Walker et al. (2005, AJVR, 66(3):450-456), Beall et al. (2000, Gene Therapy, 7:534-539) 및 WO 2017/040524)에 기재되어 있고, 이의 내용은 전체가 본원에 참조로 포함된다.
한 구현예에서, 고양잇과 EPO를 인코딩하는 핵산 서열은 서열번호 1의 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 70%의 서열 동일성(sequence identity)을 갖는 아미노산 서열을 포함하고, 이로 구성되거나 본질적으로 이로 구성되는 고양잇과 EPO 프로단백질을 인코딩한다. 서열번호 1의 고양잇과 EPO 프로단백질은 도 4에 제시되어 있으며, 성숙한 고양잇과 EPO 단백질이 서열번호 1의 아미노산 위치 27에서 시작한다는 점에 주목한다.
한 구현예에서, 고양잇과 EPO는 서열번호 2의 핵산 서열, 또는 이에 대해 적어도 70%의 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 산 서열을 포함하거나 이로 구성되거나 본질적으로 이로 구성되는 핵산 서열에 의해 인코딩된다.
한 구현예에서, 바이러스 벡터를 생성하기 위한 발현 카세트는 바이러스 게놈의 신호를 패키징함으로써 측면에 있는 고양잇과 EPO 작제물 서열 및 서열번호 3의 핵산 서열을 포함하거나 이로 구성되거나 본질적으로 이로 구성되는 다른 발현 제어 서열을 함유한다.
한 구현예에서, 발현 카세트는 서열번호 3의 핵산 서열, 또는 이에 대해 적어도 70%의 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 산 서열을 포함하거나 이로 구성되거나 본질적으로 이로 구성되는 핵산 서열에 의해 인코딩된다.
한 구현예에서, 고양잇과 EPO는 전장 고양잇과 EPO 단백질이다. "전장"이란 본원에 기재된 핵산 서열에 의해 인코딩된 고양잇과 EPO가 천연 고양잇과 EPO 단백질; 즉, 자연적으로 발생하는 고양잇과 EPO 단백질에 대해 100% 서열 동일성을 공유하는 아미노산 서열을 포함한다는 것을 의미한다.
고양잇과 EPO의 기능적 변이체가 또한 본원에서 고려된다. 본원에 사용된 용어 "기능적 변이체"는 전형적으로 천연 고양잇과 EPO 단백질에 귀속되는 생물학적 활성, 예를 들어, 생체내에서 적혈구 생산을 증가시키는 능력의 적어도 일부를 또한 보유하면서 천연 고양잇과 EPO에 대해 적어도 일부 서열 동일성을 공유하는 아미노산 서열을 지칭한다. 따라서, 기능적 변이체는 적합하게는 천연 고양잇과 EPO 단백질의 기능적 단편으로 확장될 수 있다. 본원에 기재된 바와 같이, 고양잇과 EPO의 기능적 변이체를 식별하는 방법은 당업자에게 익숙할 것이며, 이의 예시적인 예는 본원의 다른 곳에 기재되어 있다.
한 구현예에서, EPO의 기능적 변형체는 본원에 기재되거나 당업계에 공지된 EPO 핵산 또는 아미노산 서열로부터 최대 약 10% 변이를 포함할 수 있는 변이체를 포함하고, 이는 야생형 서열의 기능을 보유한다. 본원에서 사용되는 바와 같이, "기능을 보유한다"란 핵산 또는 아미노산이 야생형 서열과 동일한 방식으로 기능하지만, 반드시 동일한 수준의 발현 또는 활성에서는 아님을 의미한다. 예를 들어, 하나의 구현예에서, 기능적 변이체는 야생형 서열과 비교하여 증가된 발현 또는 활성을 갖는다. 다른 구현예에서, 기능적 변이체는 야생형 서열과 비교하여 감소된 발현 또는 활성을 갖는다. 하나의 구현예에서, 기능적 변이체는 야생형 서열과 비교하여 발현 또는 활성의 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 그 이상의 증가 또는 감소를 갖는다.
또 다른 구현예에서, EPO의 기능적 변이체는 본원에 기재되거나 당업계에 공지된 EPO 핵산 또는 아미노산 서열로부터 최대 약 20% 변이를 포함할 수 있는 변이체를 포함하고, 이는 야생형 서열의 기능을 보유한다. 하나의 구현예에서, EPO의 기능적 변이체는 본원에 기재되거나 당업계에 공지된 EPO 핵산 또는 아미노산 서열로부터 최대 약 30% 변이를 포함할 수 있는 변이체를 포함하고, 이는 야생형 서열의 기능을 보유한다.
한 구현예에서, 고양잇과 EPO는 서열번호 1의 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 70%, 바람직하게는 적어도 75%, 바람직하게는 적어도 80%, 바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 86%, 바람직하게는 적어도 87%, 바람직하게는 적어도 88%, 바람직하게는 적어도 89%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 91%, 바람직하게는 적어도 92%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 94%, 바람직하게는 적어도 95%, 바람직하게는 적어도 96%, 바람직하게는 적어도 97%, 바람직하게는 적어도 98%, 바람직하게는 적어도 99% 또는 바람직하게는 100% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하거나, 이로 구성되거나 본질적으로 이로 구성된다.
한 구현예에서, 고양잇과 EPO 서열은 서열번호 2의 핵산 서열 또는 이에 대해 적어도 70%, 바람직하게는 적어도 75%, 바람직하게는 적어도 80%, 바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 86%, 바람직하게는 적어도 87%, 바람직하게는 적어도 88%, 바람직하게는 적어도 89%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 91%, 바람직하게는 적어도 92%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 94%, 바람직하게는 적어도 95%, 바람직하게는 적어도 96%, 바람직하게는 적어도 97%, 바람직하게는 적어도 98%, 바람직하게는 적어도 99% 또는 바람직하게는 100% 서열 동일성을 갖는 핵산 서열에 의해 인코딩된다.
한 구현예에서, 바이러스 게놈 및 다른 발현 제어 서열의 신호를 패키징함으로써 측면에 있는 고양잇과 EPO 작제물 서열을 함유하는 바이러스 벡터를 생성하기 위한 발현 카세트는 서열번호 3의 핵산 서열 또는 또는 이에 대해 적어도 70%, 바람직하게는 적어도 75%, 바람직하게는 적어도 80%, 바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 86%, 바람직하게는 적어도 87%, 바람직하게는 적어도 88%, 바람직하게는 적어도 89%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 91%, 바람직하게는 적어도 92%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 94%, 바람직하게는 적어도 95%, 바람직하게는 적어도 96%, 바람직하게는 적어도 97%, 바람직하게는 적어도 98%, 바람직하게는 적어도 99% 또는 바람직하게는 100% 서열 동일성을 갖는 핵산 서열에 의해 인코딩된다.
본원에 사용된 용어 "인코딩하다", "인코딩하는" 등은 다른 핵산 또는 폴리펩티드를 제공하는 핵산의 용량을 지칭한다. 예를 들어, 핵산 서열은 폴리펩티드를 생산하기 위해 전형적으로 숙주 세포에서 전사되고/되거나 번역될 수 있는 경우 또는 폴리펩티드를 생산하기 위해 전사되고/되거나 번역될 수 있는 형태로 처리될 수 있는 경우 폴리펩티드를 "인코딩"한다고 한다. 이러한 핵산 서열은 코딩 서열 또는 코딩 서열과 비코딩 서열 모두를 포함할 수 있다. 따라서, 용어 "인코딩하다", "인코딩하는" 등은 DNA 분자의 전사로부터 생성되는 RNA 생성물, RNA 분자의 번역으로부터 생성되는 단백질, RNA 생성물을 형성하기 위한 DNA 분자의 전사 및 RNA 생성물의 후속적 번역으로부터 생성되는 단백질, 또는 RNA 생성물을 제공하기 위한 DNA 분자의 전사, 가공된 RNA 생성물(예: mRNA)을 제공하기 위한 RNA 생성물의 가공 및 가공된 RNA 생성물의 후속적 번역으로부터 생성되는 단백질을 포함한다.
"적어도 70%"에 대한 언급은 최적의 정렬 또는 최상 맞춤 분석 후 서열번호 1, 2 및 3을 포함한 인용된 서열 중 어느 하나에 대한 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 서열 동일성을 포함한다.
비교 윈도우를 정렬하기 위한 서열의 최적 정렬은 알고리즘의 컴퓨터화된 구현(the Wisconsin Genetics Software Package Release 7.0, Genetics Computer Group, 575 Science Drive Madison, WI, USA의 GAP, BESTFIT, FASTA, 및 TFASTA)에 의해 또는 당업자에게 공지된 임의의 적합한 방법에 의해 생성된 검사 및 최상 정렬(즉, 비교 윈도우에 비해 최고 백분율 상동성을 초래함)에 의해 수행될 수 있다. 또한, 예를 들어, 문헌(참조: Altschul et al. (1997) Nucl . Acids. Res. 25:3389)에 개시된 프로그램의 BLAST 패밀리에 대한 참조가 이루어질 수 있다. 서열 분석의 상세한 논의는 또한 문헌(참조: Unit 19.3 of Ausubel et al. (1994-1998) In: Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons Inc.)에서 찾을 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "서열 동일성"은 서열이 비교 윈도우에 걸쳐 뉴클레오티드별 기준 또는 아미노산별 기준 상에서 동일하거나 구조적으로 유사한 정도를 지칭한다. 예를 들어, 둘 이상의 펩티드 서열은 그들의 "퍼센트 동일성"을 결정함으로써 비교될 수 있다. 두 서열의 퍼센트 동일성은 두 정렬된 서열 사이의 정확한 매칭 수를 더 짧은 서열의 길이로 나누고 100을 곱한 값으로 기재될 수 있다. 핵산 서열에 대한 대략적인 정렬은 문헌[참조: Smith and Waterman, Advances in Applied Mathematics 2:482-489 (1981)]의 국소 상동성 알고리즘에 의해 제공된다. 이 알고리즘은 문헌[참조: Dayhoff, Atlas of Protein Sequences and Structure, M. O. Dayhoff ed., 5 suppl. 3:353-358, National Biomedical Research Foundation, Washington, D.C., USA]에 의해 개발되고, 문헌[참조: Gribskov, Nucl. Acids Res. 14(6):6745-6763 (1986)]에 의해 정규화된 스코어링 매트릭스를 사용하여 펩티드 서열과 함께 사용하도록 확장될 수 있다. 둘 이상의 아미노산 서열의 정렬을 수행하고 그들의 서열 동일성 또는 상동성을 결정하기 위한 적합한 방법 및 컴퓨터 프로그램은 당업자에게 익히 공지되어 있다. 예를 들어, 두 아미노산 서열의 동일성 또는 유사성의 백분율은 알고리즘, 예를 들어, BLAST, FASTA 또는 스미스-워터맨 알고리즘을 사용하여 쉽게 계산될 수 있다. 따라서, "서열 동일성의 백분율"은 비교 윈도우에 대해 2개의 최적으로 정렬된 서열을 비교하고, 동일한 핵산 염기(예: A, T, C, G, I) 또는 동일한 아미노산 잔기(예: Ala, Pro, Ser, Thr, Gly, Val, Leu, Ile, Phe, Tyr, Trp, Lys, Arg, His, Asp, Glu, Asn, Gln, Cys 및 Met)가 두 서열에서 발생하여 매칭된 위치의 수를 산출하는 위치의 수를 결정하고, 매칭된 위치의 수를 비교 윈도우의 총 위치의 수(즉, 윈도우 크기)로 나누고, 그 결과에 100을 곱하여 서열 동일성의 백분율을 산출함으로써 계산될 수 있다. 예를 들어, "서열 동일성"은 소프트웨어를 동반하는 참조 매뉴얼에 사용된 표준 디폴트를 사용하여 DNASIS 컴퓨터 프로그램(윈도우용 버전 2.5; 미국 캘리포니아주 사우스 샘프란시스코에 소재한 Hitachi Software engineering Co., Ltd.로부터 이용 가능함)에 의해 계산된 "매칭 백분율"이다.
본원에 사용된 용어 "서열 동일성"은 뉴클레오티드 또는 아미노산 수준에서 비교된 서열 사이의 정확한 동일성을 포함한다. 본원에 기재된 바와 같이, 서열 동일성은 전형적으로 서열을 정렬하고 필요한 경우 최대 백분율 상동성을 달성하기 위해 갭을 도입한 후, 서열 동일성의 일부로서 임의의 보존적 치환을 고려하지 않고 상응하는 펩티드 서열의 잔기와 동일한 후보 서열에서의 아미노산 잔기의 백분율에 관한 것이다. N- 또는 C-말단 연장 또는 삽입은 서열 동일성 또는 상동성을 감소시키는 것으로 해석되지 않는다.
본 개시내용은 또한 그럼에도 불구하고 구조적, 기능적, 생화학적 및/또는 형태적 수준에서 서로 관련되는 아미노산 (또는 뉴클레오티드의 맥락에서, 상기 뉴클레오티드에 의해 인코딩된 아미노산)과 관련하여 서열 사이의 임의의 차이(들)가 존재하는 뉴클레오티드 또는 아미노산 수준에서 서열의 부정확한 동일성(즉, 유사성)으로 확장된다. 예를 들어, 아미노산 수준에서 비동일성(유사성)이 있는 경우, "유사성"은 그럼에도 불구하고 구조적, 기능적, 생화학적 및/또는 형태적 수준에서 서로 관련되는 아미노산을 포함한다. 한 구현예에서, 뉴클레오티드 및 서열 비교는 유사성보다는 동일성의 수준에서 이루어진다. 예를 들어, 류신은 이소류신 또는 발린 잔기로 치환될 수 있다. 이는 보수적 치환으로 지칭될 수 있다. 한 구현예에서, 아미노산 서열은 변형이 변형되지 않은 폴리펩티드와 비교할 때 변형된 폴리펩티드의 기능적 활성에 대해 전혀 영향을 미치지 않거나 무시할 수 있는 영향을 미치도록 그 안에 함유된 임의의 아미노산 잔기의 보존적 치환에 의해 변형될 수 있다.
본원에 개시된 구현예에서, 핵산 서열은 코돈 최적화된다.
한 구현예에서, 고양잇과 EPO는 고양잇과 EPO 단백질에 대해 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 기능적 변이체를 포함하거나 이로 구성되거나 본질적으로 이로 구성되지만, 야생형 고양잇과 EPO 단백질과 동일하거나 실질적으로 동일한 기능을 보유한다. 고양잇과 EPO 변이체가 기초하는 서열은, 일부 구현예에서, 프로펩티드 리더 서열(예: 서열번호 1에 제시된 바와 같음; 도 4)을 포함할 수 있다. 다른 구현예에서, 본원에 기재된 고양잇과 EPO 변이체는 성숙한 펩티드(예: 서열번호 1의 아미노산 잔기 27-192)를 포함하거나, 이로 구성되거나 본질적으로 이로 구성된다. 본원에 사용된 용어 "기능을 유지한다"는 기능적 변이체가 야생형 고양잇과 EPO 단백질과 동일한 방식으로 또는 실질적으로 동일한 방식으로 기능하지만, 반드시 동일한 수준의 발현 또는 활성에서는 아니다. 예를 들어, 기능적 변이체는 야생형 고양잇과 EPO 단백질과 비교하여 증가된 발현 또는 활성을 가질 수 있다. 대안적으로, 기능적 변이체는 야생형 고양잇과 EPO 서열과 비교하여 감소된 발현 또는 활성을 가질 수 있다. 한 구현예에서, 기능적 변이체는 야생형 고양잇과 EPO 단백질의 발현 또는 활성의 적어도 10%, 바람직하게는 적어도 20%, 바람직하게는 적어도 30%, 바람직하게는 적어도 40%, 바람직하게는 적어도 50%, 바람직하게는 적어도 60%, 바람직하게는 적어도 70%, 바람직하게는 적어도 80%, 바람직하게는 적어도 90% 이상 또는 더욱 바람직하게는 적어도 95%를 갖는다.
본원에 개시된 구현예에서, 고양잇과 EPO를 인코딩하는 핵산 서열은 이종성 리더 서열(heterologous leader sequence)을 포함한다. 용어 "이종성"은 아미노산 또는 핵산 서열을 참조하여 사용된 경우, 전형적으로 아미노산 또는 핵산 서열이 자연에서 서로 동일한 관계로 발견되지 않는 두 개 이상의 서열 또는 하위서열을 포함한다는 것을 나타낸다. 예를 들어, 발현 카세트는 전형적으로 재조합적으로 생성되며, 새로운 기능적 핵산을 만들기 위해 배열된 관련되지 않는 유전자로부터의 두 개 이상의 서열을 갖는다. 하나의 구현예에서, 리더 서열은 상이한 유전자로부터 유래될 수 있고; 즉, EPO를 인코딩하는 유전자 이외의 것이다. 다른 구현예에서, 리더 서열은 고양잇과 이외의 종으로부터 유도된다. 적합한 리더 서열은 당업자에게 친숙할 것이며, 이의 예시적인 예는 사이토카인(예: IL-2, IL12, IL 18)의 신호 서열, 면역글로불린, 인슐린, 알부민, β-글루쿠로니다제, 알칼리성 프로테아제, 피브로넥틴 분비 신호 펩티드, 또는 조직 특이적 분비된 단백질로부터의 서열을 포함한다. 한 구현예에서, 리더 서열은 IL-2 신호 펩티드(예: 서열번호 4: M Y R M Q L L S C I A L S L A L V T N S)를 인코딩한다. 한 구현예에서, 리더 서열은 EPO 프로펩티드로부터의 내인성 리더 서열(예: 서열번호 1의 아미노산 잔기 1-26)이다.
용어 "유도된" 또는 "~로부터 유도된"은 서열(아미노산 또는 뉴클레오티드 서열)이 고양잇과 대상체로부터 공급되거나 고양잇과 대상체로부터 공급된 단백질 또는 뉴클레오티드 서열과 동일한 서열을 공유한다는 것을 의미하기 위해 본원에서 상호교환적으로 사용된다. 예를 들어, 고양잇과"로부터 유래된" 프로펩티드 서열은 고양잇과에서 발현된 것과 동일한 프로펩티드 서열과 동일한 서열 (또는 이의 기능적 변이체, 본원에서 정의된 바와 같음)을 공유할 수 있다. 그러나, 특정된 핵산 또는 아미노산은 실제로 고양잇과로부터 공급될 필요는 없다. 핵산 또는 아미노산 서열의 유사 단백질(예: 상동체)의 돌연변이유발 또는 인공 (재조합) 생산을 포함하여, 목적하는 서열을 생산하는 데 사용될 수 있는 다양한 기술이 당업자에게 공지될 것이다. 유도된 핵산 또는 아미노산은 전형적으로 유도된 서열의 실제 공급원과 관계 없이 그것이 유래되는 종에서 동일한 핵산 또는 아미노산의 동일하거나, 실질적으로 동일한 기능을 보유할 것이다.
본 개시내용은 또한 하나 이상의 아미노산 치환이 야생형 고양잇과 EPO 서열(예: 서열번호 1)에 대해 이루어진 고양잇과 EPO의 기능적 변이체로 확장된다. 한 구현예에서, 하나 이상의 아미노산 치환은 하나 이상의 보존적 아미노산 치환을 포함하고, 이의 예시적인 예는 본원의 다른 곳에 기재되어 있다.
용어 "아미노산 치환" 등은 다른 치환성 아미노산 잔기로 아미노산의 대체로 아미노산 서열의 변형을 포함하는 것으로 의도된다. 치환은 본원의 다른 곳에 기재된 바와 같이, 보존적 아미노산 치환일 수 있다. 일부 구현예에서, 치환은 비보존적 치환일 수 있다. 용어 "보존적"은, 두 개의 아미노산을 참조함에 있어서, 아미노산이 당업자에 의해 인식된 공통 특성을 공유함을 의미하는 것으로 의도된다. 예를 들어, 소수성 비산성 측쇄를 갖는 아미노산, 소수성 산성 측쇄를 갖는 아미노산, 친수성 비산성 측쇄를 갖는 아미노산, 친수성 산성 측쇄를 갖는 아미노산 및 친수성 염기성 측쇄를 갖는 아미노산. 공통 특성은 또한 소수성 측쇄를 갖는 아미노산, 지방족 소수성 측쇄를 갖는 아미노산, 방향족 소수성 측쇄를 갖는 아미노산, 극성 중성 측쇄를 갖는 아미노산, 전기적으로 하전된 측쇄를 갖는 아미노산, 전기적으로 하전된 산성 측쇄를 갖는 아미노산 및 전기적으로 하전된 염기성 측쇄를 갖는 아미노산일 수 있다. 천연 및 비천연 아미노산은 모두 당업계에 공지되어 있으며, 구현예에서 치환성 아미노산으로서 사용될 수 있다. 아미노산을 대체하는 방법은 당업자에게 익히 공지되어 있으며, 아미노산 서열을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열의 돌연변이를 포함하지만, 이에 제한되지 않는다.
본원에서 "하나 이상"에 대한 언급은, 예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 이상의 개별 구현예를 포함하는 것으로 의도된다.
본원의 다른 곳에서 언급된 바와 같이, 고양잇과 EPO를 인코딩하는 핵산 서열은 코돈 최적화될 수 있다. 예를 들어, 고양잇과 EPO 펩티드의 기능적 변이체가 목적시되는 경우, 이들 기능적 변이체에 대한 코딩 서열은 야생형 핵산 서열의 부위 지시된 돌연변이유발을 사용하여 생성될 수 있다. 웹 기반 또는 상업적으로 이용 가능한 컴퓨터 프로그램 뿐만 아니라 서비스 기반 회사는 아미노산 서열을 RNA 및/또는 cDNA 모두를 포함하는 핵산 코딩 서열로 역번역하는 데 사용될 수 있다. 예를 들어, backtranseq by EMBOSS, http://www.ebi.ac.uk/Tools/st/; Gene Infinity (http://www.geneinfinity.org/sms-/sms_backtranslation.html); ExPasy (http://www.expasy.org/tools/)를 참조한다. 한 구현예에서, RNA 및/또는 cDNA 코딩 서열은 본원에서 논의된 바와 같이, 투여가 궁극적으로 의도되는 대상체 종에서 최적의 발현을 위해 설계된다. 따라서, 하나의 구현예에서, 코딩 서열은 고양잇과에서 최적의 발현을 위해 설계된다.
코딩 서열은 코돈 최적화를 사용하는 최적의 발현을 위해 설계될 수 있다. 코돈 최적화된 코딩 영역은 다양한 상이한 방법에 의해 설계될 수 있다. 이러한 최적화는 이용 가능한 온라인 공개된 방법인 방법, 또는 코돈 최적화 서비스를 제공하는 회사를 사용하여 수행될 수 있다. 하나의 코돈 최적화 방법은, 예를 들어, 본원에 참조로 포함된 국제 특허 공보 제WO 2015/012924호에 기재되어 있다. 간략하게, 생성물을 인코딩하는 핵산 서열은 동의어 코돈 서열로 변형된다. 적합하게는, 생성물에 대한 개방 판독 프레임(ORF)의 전장이 변형된다. 그러나, 일부 구현예에서, ORF의 단편만이 변경될 수 있다. 이들 방법 중 하나를 사용함으로써, 임의의 주어진 폴리펩티드 서열에 주파수를 적용할 수 있고, 폴리펩티드를 인코딩하는 코돈 최적화된 코딩 영역의 핵산 단편을 생성할 수 있다.
하나의 구현예에서, EPO를 인코딩하는 핵산 서열은 기재된 서열과 적어도 90% 동일성을 공유하는 서열을 포함하여 본원에 기재된 임의의 EPO 펩티드를 인코딩하는 코돈 최적화된 서열이다. 하나의 구현예에서, 핵산 서열은 투여가 목적시되는 대상체에서의 발현에 대해 코돈 최적화된다.
아데노
관련 바이러스 벡터
고양잇과 EPO 발현 작제물을 운반하는 아데노 관련 바이러스 벡터는 고양잇과 대상체에서 사용하기 위해 개발되었다. 치료제로서의 재조합 고양잇과 EPO 단백질의 개발 및 제조는 영향을 받은 동물에서 재조합 EPO의 발현을 위한 바이러스 벡터 매개 시스템과 비교할 때 비용이 엄청날 것이다. 바이러스 벡터 치료제는 또한 재조합 EPO 단백질의 반복 투여를 필요로 하는 것과는 대조적으로 대상체를 치료하기 위해 단일 투여 또는 더 적은 수의 용량만이 필요할 수 있는 한, 편의성의 이점을 가지므로 삶의 질을 더욱 향상시킨다. 본원에 기재된 EPO 작제물은 치료될 고양잇과 대상체에 고유한 EPO 서열을 적합하게 제공하는데, 이는 전형적으로 대상체가 비천연 EPO 단백질에 대한 면역 반응을 발생시킬 위험을 감소시키거나 그렇지 않으면 피할 것이기 때문이다.
상호교환적으로 사용되는 "벡터" 및 "작제물"은 핵산 분자, 바람직하게는, 예를 들어, 고양잇과 EPO를 인코딩하는 핵산 서열이 삽입되거나 복제될 수 있는 플라스미드, 박테리오파지 또는 바이러스로부터 유래된 DNA 분자를 의미한다. 벡터는 바람직하게는 하나 이상의 고유 제한 부위를 함유하고, 표적 세포 또는 조직 또는 이의 전구 세포 또는 조직을 포함하는 정의된 숙주 세포에서 자율 복제가 가능할 수 있거나, 클로닝된 서열이 재현 가능하도록 정의된 숙주의 게놈과 통합 가능할 수 있다. 따라서, 벡터 또는 작제물은 자율적으로 복제하는 벡터(즉, 염색체외 실체로서 존재하는 벡터)일 수 있고, 이의 복제는 염색체 복제(예: 선형 또는 폐쇄된 원형 플라스미드, 염색체외 요소, 미니염색체 또는 인공 염색체)와 독립적이다. 벡터는 자체 복제를 보장하기 위한 임의의 수단을 함유할 수 있다. 대안적으로, 벡터는 숙주 세포에 도입될 때, 게놈에 통합되고 그것이 통합된 염색체(들)와 함께 복제되는 것일 수 있다. 벡터 시스템은 단일 벡터 또는 플라스미드, 두 개 이상의 벡터 또는 플라스미드를 포함할 수 있으며, 이는 숙주 세포의 게놈에 도입될 총 DNA 또는 트랜스포존을 함께 함유한다. 벡터의 선택은 전형적으로 벡터가 도입될 숙주 세포와 벡터의 상용성에 의존할 것이다. 벡터는 또한 적절한 형질전환체의 선택에 사용될 수 있는 항생제 내성 유전자와 같은 선택 마커를 포함할 수 있다. 이러한 내성 유전자의 예는 당업자에게 친숙할 것이다.
한 구현예에서, 벡터는 대상체에서 재조합 고양잇과 EPO의 지속적인 발현을 가능하게 하는 재조합 아데노 관련 바이러스(AAV) 벡터이다.
아데노 관련 바이러스는 파르보비리대 과(Parvoviridae family)의 구성원이고, 약 5,000개 미만의 뉴클레오티드의 선형의 단일 가닥 DNA 게놈을 포함한다. AVA는 효율적인 복제를 위해 헬퍼 바이러스(즉, 아데노바이러스 또는 헤르페스 바이러스)와의 공동 감염, 또는 헬퍼 유전자의 발현을 필요로 한다. 치료 핵산 투여에 사용되는 AAV 벡터는 전형적으로 부모 게놈의 약 96%가 결실되어 DNA 복제 및 패키징에 대한 인식 신호를 함유하는 말단 반복(ITR)만이 잔류하도록 한다. 이는 바이러스 유전자의 발현으로 인한 면역학적 또는 독성 부작용을 제거한다. 또한, 특정 AAV 단백질을 생산 세포에 전달하는 것은 목적하는 경우 AAV ITR을 포함하는 AAV 벡터의 세포 게놈의 특정 영역으로의 통합을 가능하게 한다(참조: 예를 들어, 미국 특허 제6,342,390호 및 제6,821,511호). 통합된 AAV 게놈을 포함하는 숙주 세포는 세포 성장 또는 형태학에서 어떠한 변화도 나타내지 않는다(참조: 예를 들어, 미국 특허 제4,797,368호).
AAV ITR은 비구조적 복제(Rep) 단백질 및 구조적 캡시드(Cap )단백질(비리온 단백질(VP)로도 공지됨)에 대한 고유한 코딩 뉴클레오티드 서열이 측면에 있다. 말단 145 뉴클레오티드는 자체-상보적이고, T-형상화 헤어핀을 형성하는 에너지적으로 안정한 분자내 듀플렉스가 형성될 수 있도록 조직화된다. 이러한 헤어핀 구조는 세포 DNA 폴리머라제 복합체에 대한 프라이머 역할을 함으로써 바이러스 DNA 복제를 위한 기원으로 기능한다. Rep 유전자는 Rep 단백질 Rep78, Rep68, Rep52 및 Rep40을 인코딩한다. Rep78 및 Rep68은 p5 프로모터로부터 전사되고, Rep52 및 Rep40은 p19 프로모터로부터 전사된다. Rep78 및 Rep68 단백질은 AAV 말단의 분해를 허용하기 위해 생산적 복제 동안 헬리카제 및 니카제 기능을 수행하는 다작용성 DNA 결합 단백질이다(참조: 예를 들어, Im et al., Cell, 61: 447-57 (1990)). 이러한 단백질은 또한 내인성 AAV 프로모터 및 헬퍼 바이러스 내의 프로모터로부터의 전사를 조절한다(참조: 예를 들어, Pereira et al., J. Virol., 71: 1079-1088 (1997)). 다른 Rep 단백질은 Rep78 및 Rep68의 기능을 수정한다. cap 유전자는 캡시드 단백질 VP1, VP2, 및 VP3을 인코딩한다. cap 유전자는 p40 프로모터로부터 전사된다.
본원에 기재된 바와 같이, 하나 이상의 조절 서열에 작동 가능하게 연결된EPO 분자를 인코딩하는 핵산 서열을 포함하는 발현 작제물이 또한 본원에 개시된다.
본원에 사용된 용어 "EPO 작제물", "EPO 발현 작제물" 및 동의어는 본원에 기재된 바와 같은 EPO 서열을 포함한다. 용어 "EPO 작제물", "EPO 발현 작제물" 및 이의 동의어는 EPO(내인성 또는 이종성 리더를 갖는 EPO 성숙 단백질 또는 프로펩티드 포함)를 인코딩하는 핵산 서열 또는 이의 발현 생성물을 지칭하기 위해 사용될 수 있다.
용어 "작제물"은 또한 상이한 공급원으로부터의 하나 이상의 단리된 핵산 서열을 포함하는 재조합 유전자 분자를 의미하는 것으로 간주된다. 따라서, 작제물은 상이한 기원의 두 개 이상의 핵산 서열이 단일 핵산 분자로 조립되고, (1) 자연에서 함께 발견되지 않는 조절 및 코딩 서열을 포함하는 핵산 서열(즉, 적어도 하나의 뉴클레오티드 서열은 그의 다른 뉴클레오티드 서열 중 적어도 하나에 대해 이종성이다) 또는 (2) 자연적으로 인접하지 않은 기능적 RNA 분자 또는 단백질의 일부를 인코딩하는 서열 또는 (3) 자연적으로 인접하지 않은 프로모터의 일부를 함유하는 임의의 작제물을 포함하는 키메라 분자이다. 대표적인 작제물은 임의의 재조합 핵산 분자, 예를 들어, 플라스미드, 코스미드, 바이러스, 자율적으로 복제되는 폴리뉴클레오티드 분자, 파지, 또는 하나 이상의 핵산 분자가 작동 가능하게 연결된 핵산 분자를 포함하는, 게놈 통합 또는 자율적 복제가 가능한, 임의의 공급원으로부터 유래된 선형 또는 원형 단일 가닥 또는 이중 가닥 DNA 또는 RNA 핵산 분자를 포함한다. 적합한 작제물은 일반적으로 또한, 예를 들어, 표적 핵산 서열 또는 조절제 핵산 서열과 같은 작제물에 함유된 관심 핵산 서열의 발현을 지시하는 데 필요한 요소를 포함할 것이다. 이러한 요소는 관심 핵산 서열(의 전사를 지시하기 위해)에 작동 가능하게 연결된 프로모터와 같은 제어 요소 또는 조절 서열을 포함할 수 있고, 종종 폴리아데닐화 서열도 포함한다. 본 발명의 특정 구체예 내에서, 작제물이 벡터 내에 함유될 수 있다. 작제물의 성분 이외에, 벡터는, 예를 들어, 하나 이상의 선택 가능한 마커, 하나 이상의 복제 기원, 예를 들어, 원핵생물 및 진핵생물 기원, 적어도 하나의 다중 클로닝 부위, 및/또는 숙주 세포의 게놈으로 작제물의 안정한 통합을 용이하게 하는 요소를 포함할 수 있다. 둘 이상의 작제물은 단일 핵산 분자, 예를 들어, 단일 벡터 내에 함유될 수 있거나, 둘 이상의 개별 핵산 분자, 예를 들어, 둘 이상의 별개의 벡터 내에 함유될 수 있다. "발현 작제물"은 일반적으로 적어도 관심 뉴클레오티드 서열에 작동 가능하게 연결된 제어 서열을 포함한다. 이러한 방식으로, 예를 들어, 발현될 뉴클레오티드 서열과 작동 가능한 연결의 프로모터는 숙주 세포를 포함하는 유기체 또는 이의 일부에서 발현을 위한 발현 작제물에 제공된다. 본 발명의 실시를 위해, 작제물 및 숙주 세포를 제조하고 사용하기 위한 종래의 조성물 및 방법은 당업자에게 익히 공지될 것이다. 예를 들어, 문헌(Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd edition Volumes 1, 2, and 3. J. F. Sambrook, D. W. Russell, and N. Irwin, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2000)을 참조한다.
본원에 사용된 바와 같이, "제어 요소", "제어 서열", "조절 서열" 등은 특정 숙주 세포에서 작동 가능하게 연결된 코딩 서열의 발현에 필요한 핵산 서열(예: DNA)을 의미한다. 원핵 세포에 적합한 제어 서열은, 예를 들어, 프로모터, 및 임의로 시스-작용 서열, 예를 들어, 조작자 서열 및 리보솜 결합 부위를 포함한다. 진핵 세포에 적합한 제어 서열은 전사 제어 서열, 예를 들어, 프로모터, 폴리아데닐화 신호, 전사 인핸서, 번역 제어 서열, 예를 들어, 번역 인핸서 및 내부 리보솜 결합 부위(IRES), mRNA 안정성을 조절하는 핵산 서열, 뿐만 아니라 전사된 폴리뉴클레오티드에 의해 인코딩된 생성물을 세포 내의 세포내 구획 또는 세포외 환경으로 표적으로 하는 표적화 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 본원에 기재된 고양잇과 EPO 작제물을 인코딩하는 핵산 서열은 임의의 적합한 유전 요소로 조작되고, 이의 예시적인 예는 네이키드 DNA, 파지, 트랜스포존, 코스미드, RNA 분자(예: mRNA),에피솜 등을 포함하고, 이는 그 위에 운반된 EPO 서열을 예를 들어, DNA 또는 RNA, 바이러스 벡터를 패키징 숙주 세포로 운반하는 나노 입자를 생성하고/하거나 대상체의 숙주 세포로 전달하기 위한 숙주 세포로 전달한다. 한 구현예에서, 유전 요소는 플라스미드이다. 선택된 유전 요소는 당업자에게 공지된 임의의 적합한 방법에 의해 전달될 수 있고, 이의 예시적인 예는 형질감염, 전기천공, 리포좀 전달, 막 융합 기술, 고속 DNA 코팅된 펠릿, 바이러스 감염 및 원형질체 융합을 포함한다. 이러한 작제물을 제조하는 데 사용되는 방법은 또한 핵산 조작 분야의 숙련가들에게 친숙할 것이고, 이의 예시적인 예는 유전 공학, 재조합 공학 및 합성 기술을 포함한다. 예를 들어, 문헌[Green and Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY (2012)]을 참조하고, 이의 전체 내용은 본원에 참조로 포함된다.
본원에 사용된 바와 같이, "발현 작제물"은 고양잇과 EPO, 프로모터에 대한 코딩 서열을 포함하는 핵산 분자를 지칭하고, 이에 대한 다른 조절 서열을 포함할 수 있고, 이 카세트는 유전 요소 내로 조작되고/되거나 바이러스 벡터(예: 바이러스 입자)의 캡시드 내로 패키징될 수 있다. 전형적으로, 바이러스 벡터를 생성하기 위한 이러한 발현 카세트는 바이러스 게놈 및 다른 발현 제어 서열, 예를 들어, 본원에 기재된 것들의 신호를 패키징함으로써 측면에 있는 본원에 기재된 고양잇과 EPO 작제물 서열을 함유한다. 임의의 발현 제어 서열은 본원의 다른 곳에 기재된 바와 같이, 예를 들어, 코돈 최적화를 포함하는 당업계에 공지된 기술을 사용하여 특정 종에 대해 최적화될 수 있다.
발현 카세트는 전형적으로 발현 제어 서열의 일부로서 프로모터 서열을 함유한다. 프로모터는 특정 유전자 또는 하류 핵산의 전사를 개시하는 핵산의 영역이다. 프로모터는 유전자의 전사 개시 부위 근처에 위치할 수 있다. 프로모터는 발현 카세트 및 발현 벡터의 중요한 요소이며, 다른 조절 요소, 예를 들어, 인핸서, 소음기 및 절연체와 함께 작동하여 주어진 유전자의 전사 수준을 지시할 수 있다. 이와 같이, 상이한 프로모터는 상이한 수준의 전사를 지시할 수 있다.
본원의 다른 곳에서 언급된 바와 같이, 본 개시내용은 이를 필요로 하는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진 (또는 복원)하기 위한 재조합 고양잇과 EPO의 조절된 발현을 위한 발현 작제물의 용도에 관한 것이다. 재조합 고양잇과 EPO의 발현 수준은 고양잇과 대상체에서 재조합 고양잇과 EPO의 발현을 유도하는 데 사용되는 프로모터의 유형에 의해 적절하게 제어될 수 있음이 이해될 것이다.
프로모터의 맥락에서, 용어 "강한" 및 "약한"은 전형적으로 전사 속도 및 후속적 유전자 발현에 대한 그들의 효과에 따라 프로모터를 기재하는데 사용되며, 여기서 "강한" 프로모터는 전형적으로 "약한" 프로모터와 비교하여 더 빠른 전사 속도를 제공한다는 것이 이해될 것이다. 프로모터는 RNA 폴리머라제 (및/또는 시그마 인자)에 대한 그의 친화도에 따라 강하거나 약한 것으로 분류될 수 있고; 이는 전형적으로 프로모터 서열이 폴리머라제에 대한 이상적인 컨센서스 서열과 얼마나 밀접하게 유사한지에 관련된다. 프로모터의 강도는 또한 전사의 개시가 높은 또는 낮은 빈도로 그 프로모터에서 발생하는지 여부에 의존할 수 있다. 상이한 강도를 갖는 상이한 프로모터는 상이한 수준의 유전자/단백질 발현을 갖는 유전자 회로를 작제하는데 사용될 수 있다(예를 들어, 약한 프로모터로부터 개시된 발현 수준은 강한 프로모터로부터 개시된 발현 수준보다 낮다).
본원에 사용된 용어 "강한 프로모터"는 그의 조절하의 유전자가 약한 프로모터와 비교할 때 더 높은 수준에서 발현되도록 하는 프로모터를 지칭한다. 강한 프로모터는 천연일 수 있거나, 변형된 또는 합성 프로모터, 예를 들어, 천연 프로모터의 유도체일 수 있다. 따라서, 그것은 천연 또는 비천연일 수 있다. 용어 "강한 프로모터"는 당업자에게 친숙할 것이며, 이의 예시적인 예는 문헌에 널리 기재된다(참조: 예를 들어, Schlabeach et al., 2010, PNAS, 107(6):2538-2543 및 Bienick et al., 2014, PLoS online, 9(10):e109105, 이의 내용은 전체가 본원에 참조로 포함된다). 강한 프로모터는 관심 유전자로부터 다량의 전사체 및 최종 단백질 생성물을 생산할 수 있다. 예를 들어, 강한 프로모터는 전체 세포 단백질의 적어도 1%의 수준에서 단백질을 발현할 수 있다. 바람직하게는, 강한 프로모터는 전체 세포 단백질의 2, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 또는 50%의 수준에서 단백질을 발현할 수 있다. 따라서, 프로모터는 특정 숙주 세포 및 발현 시스템의 맥락에서 선택된 조건에서 상기 발현 수준을 달성하는 경우 강한 프로모터일 수 있고, 즉, 그것은 사용되는 특정 방법 및 시약에 대한 강한 프로모터일 수 있다. 바람직하게는, 강한 프로모터는 관심 유전자에 의해 인코딩된 단백질이 리터당 적어도 1밀리그램의 양으로 세포로부터 정제될 수 있도록 관심 유전자의 발현을 허용한다. 보다 바람직하게는, 리터당 5밀리그램에서이다. 더욱 더 바람직하게는, 리터당 10밀리그램에서이다. 강한 프로모터는 전형적으로 높은 수준에서, 또는 약 {분획 (1/10)} 전사체 내지 약 {분획 (1/1000)} 전사체 내지 약 {분획 (1/1,000)} 전사체에서 코딩 서열의 발현을 구동한다.
일반적으로, "약한 촉진제"란 강한 프로모터와 비교하여 낮은 수준에서 코딩 서열의 발현을 구동하는 프로모터이다. "낮은 수준"이란 약 {분획 (1/10,000)} 전사체 내지 약 {분획 (1/100,000)} 전사체의 수준에서 의도된다. 본 개시내용의 특정 측면에서, 고양잇과 EPO의 발현을 구동하는 프로모터는 약한 프로모터이다. 즉, 그것은 강한 프로모터보다 고양잇과 EPO의 낮은 수준의 전사를 지시한다. 프로모터의 상대적 약함은 당업계에 공지된 방법, 예를 들어, 문헌(참조: Qin et al. (2010, PloS One, 5(5): e10611; 1-4)에 기재된 방법에 의해 결정될 수 있고, 이의 전체 내용은 본원에 참조로 포함된다. 적합한 약한 프로모터는 당업자에게 친숙할 것이며, 이의 예시적인 예는 문헌[참조: Schlabeach et al. (2010, PNAS, 107(6):2538-2543) 및 Bienick et al. (2014, PLoS online, 9(10):e109105)]에 널리 기재되어 있고, 이의 내용은 전체가 본원에 참조로 포함된다).
"강하든" 또는 "약하든" 프로모터의 강도는 동일한 벡터 맥락으로 사용될 때(즉, 벡터의 다른 모든 요소가 동일하다), 그리고 동일한 세포 유형으로 동일한 조건하에 발현될 때 평가될 수 있다. 이 맥락에서, 프로모터 강도에 대한 임의의 적합한 척도, 예를 들어, 전사체 수 또는 생산된 단백질의 양이 사용될 수 있다.
적합한 강한 프로모터의 예시적인 예는 Pm 프로모터, Ptac, RNA 폴리머라제 프로모터(), XPL 및 PBAD 및 전술한 것 중 임의의 것의 유도체를 포함한다. 바람직하게는, 강한 프로모터는 재조합 고양잇과 EPO가 리터당 적어도 1밀리그램, 보다 바람직하게는 리터당 5밀리그램 또는 더욱 더 바람직하게는 리터당 10밀리그램의 양으로 세포로부터 정제될 수 있도록 숙주 세포에서 재조합 고양잇과 EPO의 발현을 허용한다. 강한 프로모터는 전형적으로 높은 수준에서, 또는 약 {분획 (1/10)} 전사체 내지 약 {분획 (1/1000)} 전사체 내지 약 {분획 (1/1,000)} 전사체에서 코딩 서열의 발현을 구동할 것이다.
강한 프로모터의 다른 예시적인 예는 인간 사이토메갈로바이러스(CMV) 프로모터, SV40 프로모터, EF1a 프로모터, 인간 β 액틴 프로모터, 닭 β 액틴 프로모터, lac 프로모터, trp 프로모터, trc 프로모터, tac 프로모터, MPSV, 람다 파지의 PR 프로모터 및 PL 프로모터, RSV LTR, HIV-1 LTR, HTLV-1 LTR을 포함하는 바이러스 LTR 등을 포함한다. 다른 요소, 예를 들어, HIV tat 및 TAR 시스템이 또한 발현을 향상시키는 데 사용될 수 있다. 다른 강한 프로모터는 유도성 프로모터를 포함한다.
약한 프로모터의 예시적인 예는 PCON(참조: 예를 들어, Dobrynin et al., Nucleic acid Res. Symp . Ser., 7, 365-376, 1980), UBC 프로모터 및 PGK 프로모터를 포함한다.
다른 구현예에서, 프로모터는 TBG 프로모터이다.
한 구현예에서, 프로모터는 CB7 프로모터이다. CB7은 사이토메갈로바이러스 인핸서 요소를 갖는 닭 β-액틴 프로모터이다. 대안적으로, 다른 간 특이적 프로모터가 사용될 수 있다(참조: 예를 들어, The Liver Specific Gene Promoter Database, Cold Spring Harbor, http://rulai.schl.edu/LSPD, alpha 1 anti-trypsin (A1AT); human albumin Miyatake et al., J. Virol., 71:512432 (1997), humAlb; and hepatitis B virus core promoter, Sandig et al., Gene Ther., 3:10029 (1996)). TTR 최소 인핸서/프로모터, 알파 항트립신 프로모터, LSP (845 nt)25(인트론(intron) 없는 scAAV를 필요로 함). 하나의 구현예에서, 간 특이적 프로모터 티록신 결합 글로불린(TBG)이 사용된다. 다른 프로모터, 예를 들어, 바이러스 프로모터, 구성적 프로모터, 조절 가능한 프로모터(참조: 예를 들어, WO 2011/126808 및 WO 2013/04943), 또는 사용될 수 있는 생리학적 신호에 반응성인 프로모터가 본원에 기재된 벡터에서 활용될 수 있다.
프로모터 이외에, 발현 카세트 및/또는 벡터는 다른 적절한 전사 개시, 종결, 인핸서 서열, 효율적인 RNA 처리 신호, 예를 들어, 스플라이싱 및 폴리아데닐화 (폴리 A) 신호; TATA 서열; 세포질 mRNA를 안정화시키는 서열; 번역 효율을 향상시키는 서열(즉, 코작 컨센서스 서열); 인트론; 단백질 안정성을 향상시키는 서열; 및 목적하는 경우, 인코딩된 생성물의 분비를 향상시키는 서열을 함유할 수 있다. 발현 카세트 또는 벡터는 본원에 기재된 하나 이상의 임의의 요소 중 어느 것도 함유하지 않을 수 있다. 적합한 폴리A 서열의 예는, 예를 들어, SV40, 소 성장 호르몬(bGH), 및 TK 폴리A를 포함한다. 적합한 인핸서의 예는 다른 것들 중에서, 예를 들어, CMV 인핸서, RSV 인핸서, 알파 태아단백질 인핸서, TTR 최소 프로모터/인핸서, LSP(TH-결합 글로불린 프로모터/알파1-마이크로글로불린/비쿠닌 인핸서)를 포함한다.
따라서, 고양잇과 EPO의 발현 수준, 및 이를 필요로 하는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는데 효과적인 용량은 사용되는 프로모터의 유형에 의존할 수 있고, 이는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키거나 회복하는 데 효과적인 용량을 결정할 수 있다. 따라서, 본원에 개시된 다른 측면에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키기 위한 방법이 제공되고, 상기 방법은 AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 AAV 캡시드는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 조성물은 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는데 효과적인 용량으로 대상체에게 투여되고, 용량은 고양잇과 대상체의 PCV를 약 5 내지 약 30 PCV% 포인트, 바람직하게는 적어도 약 15 PCV% 포인트의 값으로 증가시키는데 효과적이다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키기 위한 방법이 제공되고, 상기 방법은 AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 AAV 캡시드는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 조성물은 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는데 효과적인 용량으로 대상체에 투여되며, 용량은 고양잇과 EPO의 발현이 강한 프로모터에 의해 구동되는 AAV 캡시드의 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하의 용량에 의해 달성되는 PCV의 증가와 동등한 고양잇과 대상체에서 PCV의 증가를 제공하는데 효과적이다. 한 구현예에서, 용량은 고양잇과 EPO의 발현이 강한 프로모터에 의해 구동되는 AAV 캡시드의 체중 kg당 약 1x109 게놈 카피(gc/kg) 이하의 용량에 의해 달성되는 PCV의 증가와 동등한 고양잇과 대상체에서 PCV의 증가를 제공하는데 효과적이다.
한 구현예에서, 발현 제어 서열은 조직 특이적 프로모터(tissue-specific promoter)를 포함한다. 적합한 조직 특이적 프로모터는 당업자에게 친숙할 것이다. 한 구현예에서, 조직 특이적 프로모터는 신장 특이적 프로모터 또는 근육 특이적 프로모터이다. 한 구현예에서, 조직 특이적 프로모터는 Nkcc2 프로모터, 우로모둘린 프로모터, Ksp-카데린 프로모터 및 THP 유전자 프로모터로부터 선택된다.
한 구현예에서, AAV 캡시드는 하나 이상의 인트론, 코작 서열(Kozak sequence), 폴리A, 및 전사후 조절 요소를 추가로 포함한다.
적합한 AAV 캡시드는 당업자에게 친숙할 것이며, 이의 예시적인 예는 AAV1, AAV5, AAV6, AAV8, AAVrh64R1, AAV9, AAVrh91, AAVhu.37, AAV3b, AAV3b.AR2.12 및 AAVrh10을 포함한다. 한 구현예에서, AAV 캡시드는 AAV1, AAV5, AAV6, AAV8, AAVrh64R1, AAV9, AAVrh91, AAVhu.37, AAV3b, AAV3b.AR2.12 및 AAVrh10으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
한 구현예에서, AAV 캡시드는 AAV8 캡시드이다. 한 구현예에서, AAV 캡시드는 AAV1 캡시드이다.
프로모터 이외에, 발현 카세트 및/또는 벡터는 다른 적절한 전사 개시, 종결, 인핸서 서열, 효율적인 RNA 처리 신호, 예를 들어, 스플라이싱 및 폴리아데닐화 (폴리 A) 신호; TATA 서열; 세포질 mRNA를 안정화시키는 서열; 번역 효율을 향상시키는 서열(즉, 코작 컨센서스 서열); 인트론; 단백질 안정성을 향상시키는 서열; 및 목적하는 경우, 인코딩된 생성물의 분비를 향상시키는 서열을 함유할 수 있다. 발현 카세트 또는 벡터는 본원에 기재된 하나 이상의 임의의 요소 중 어느 것도 함유하지 않을 수 있다. 적합한 폴리A 서열의 예는 SV40, 소 성장 호르몬(bGH), 및 TK 폴리A를 포함한다. 적합한 인핸서의 예는 다른 것들 중에서, 예를 들어, CMV 인핸서, RSV 인핸서, 알파 태아단백질 인핸서, TTR 최소 프로모터/인핸서, LSP(TH-결합 글로불린 프로모터/알파1-마이크로글로불린/비쿠닌 인핸서)를 포함한다.
한 구현예에서, 바이러스 벡터는 5' AAV 반전된 말단 반복 서열(ITR), 임의의 인핸서를 갖는 프로모터, EPO 서열, 폴리 A 서열 및 3' AAV ITR을 포함하는 핵산 발현 카세트를 포함하고, 여기서 상기 발현 카세트는 숙주 세포에서 기능적 고양잇과 EPO를 발현한다.
이러한 제어 서열은 EPO 작제물 서열에 "작동 가능하게 연결"된다. 본원에 사용된 용어 "작동 가능하게 연결된"은 관심 유전자와 인접하는 발현 제어 서열 및 관심 유전자를 제어하기 위해 트랜스로 또는 원거리에서 작용하는 발현 제어 서열 둘 다를 지칭한다.
발현 카세트는 바이러스 벡터의 생산에 사용되는 플라스미드 상에서 조작될 수 있다. 발현 카세트를 AAV 바이러스 입자에 패키징하는데 필요한 최소 서열은 AAV 5' 및 3' ITR이고, 이는 캡시드와 동일한 AAV 기원, 또는 상이한 AAV 기원의 것일 수 있다(AAV 의사유형을 생산하기 위해). 하나의 구현예에서, AAV2로부터의 ITR 서열, 또는 이의 결실된 버전(△ITR)은 편의상, 그리고 규제 승인을 가속화하기 위해 사용된다. 그러나, 다른 AAV 공급원으로부터의 ITR이 선택될 수 있다. ITR의 공급원이 AAV2로부터 유래되고, AAV 캡시드가 다른 AAV 공급원으로부터 유래되는 경우, 생성되는 벡터는 의사유형화라고 할 수 있다. 전형적으로, AAV 벡터를 위한 발현 카세트는 AAV 5' ITR, 프로펩티드-EPO 활성 펩티드 코딩 서열 및 임의의 조절 서열, 및 AAV 3' ITR을 포함한다. 그러나, 이러한 요소의 다른 구성이 적합할 수 있다. D-서열 및 말단 분해 분위(trs)가 결실된 △ITR로 지칭되는 5' ITR의 단축된 버전이 기재되었다. 다른 구현예에서, 전장 AAV 5' 및 3' ITR이 사용된다.
약어 "sc"는 자체 상보적임을 지칭한다. "자체 상보적 AAV"는 재조합 AAV 핵산 서열에 의해 운반된 코딩 영역이 분자내 이중 가닥 DNA 주형을 형성하도록 설계된 발현 카세트를 갖는 플라스미드 또는 벡터를 지칭한다. 감염시, 제2 가닥의 세포 매개 합성을 기다리지 않고, scAAV의 두 상보적 절반이 결합하여 즉각적인 복제 및 전사가 준비된 하나의 이중 가닥 DNA(dsDNA) 단위를 형성할 것이다. 예를 들어, 문헌(D M McCarty et al, "Self-complementary recombinant adeno-associated virus (scAAV) vectors promote efficient transduction independently of DNA synthesis", Gene Therapy, (August 2001), Vol 8, Number 16, Pages 1248-1254)을 참조한다. 자체 상보적 AAV는, 예를 들어, 미국 특허 제6,596,535호; 제7,125,717호; 및 제7,456,683호에 기재되어 있고, 이들 각각은 그 전체가 본원에 참조로 포함된다.
아데노 관련 바이러스(AAV) 바이러스 벡터는 표적 세포로의 전달을 위한 패키징된 핵산 서열인 AAV 단백질 캡시드를 갖는 AAV Dnase-내성 입자이다. AAV 캡시드는 선택된 AAV에 따라 대략 1:1:10 내지 1:1:20의 비율로 정이십면체 대칭으로 배열된 60개의 캡시드(cap) 단백질 서브유닛, VP1, VP2 및 VP3으로 구성된다. AAV 혈청형은, 예를 들어, AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV6.2, AAV7, AAV8, AAV9, rh10, AAVrh64R1, AAVrh64R2, rh8, rh.10, 임의의 공지된 또는 언급된 AAV의 변이체 또는 아직 발견되지 않은 AAV를 포함하는 AAV 바이러스 벡터(Dnase 내성 바이러스 입자)의 캡시드에 대한 공급원으로서 선택될 수 있다. 하나의 구현예에서, AAV는 AAV8 캡시드, 또는 이의 변이체이다. 다른 구현예에서, AAV는 AAV1 캡시드, 또는 이의 변이체이다. 예를 들어, US 공개 특허 출원 제2007-0036760-Al호; US 공개 특허 출원 제2009-0197338-A1호; EP 1310571을 참조한다. 또한, WO 2003/042397(AAV7 및 다른 시미안 AAV), US 특허 7790449 및 US 특허 7282199(AAV8), WO 2005/033321 및 US 7,906,111(AAV9) 및 WO 2006/110689, 및 WO 2003/042397(rh.10)을 참조한다. 대안적으로, 임의의 인용된 AAV에 기초한 재조합 AAV는 AAV 캡시드에 대한 공급원으로서 사용될 수 있다. 이러한 문서는 또한 AAV를 생성하기 위해 선택될 수 있는 다른 AAV를 기재하고, 참조로 포함된다. 일부 구현예에서, 바이러스 벡터에 사용하기 위한 AAV cap은 전술한 AAV Cap 중 하나 또는 이의 인코딩 핵산의 돌연변이생성에 의해(즉, 삽입, 결실 또는 치환에 의해) 생성될 수 있다. 일부 구현예에서, AAV 캡시드는 2개 또는 3개 또는 4개 이상의 전술한 AAV 캡시드 단백질로부터의 도메인을 포함하는 키메라이다. 일부 구현예에서, AAV 캡시드는 2개 또는 3개의 상이한 AAV 또는 재조합 AAV로부터의 Vpl, Vp2 및 Vp3 단량체의 모자이크이다. 일부 구현예에서, rAAV 조성물은 전술한 Cap 중 하나 이상을 포함한다. 다른 구현예에서, AAV 캡시드는 임의의 기재되거나 공지된 AAV 캡시드 서열로부터 최대 약 10% 변이를 포함할 수 있는 변이체를 포함한다. 즉, AAV 캡시드는 본원에 제공되고/되거나 당해 기술 분야에 공지된 AAV 캡시드에 대해 약 90% 동일성 내지 약 99.9% 동일성, 약 95% 내지 약 99% 동일성 또는 약 97% 내지 약 98% 동일성을 공유한다. 하나의 구현예에서, AAV 캡시드는 AAV1 캡시드와 적어도 95% 동일성을 공유한다. 하나의 구현예에서, AAV 캡시드는 AAV8 캡시드와 적어도 95% 동일성을 공유한다. AAV 캡시드의 퍼센트 동일성을 결정할 때, 비교는 임의의 가변 단백질(예: vpl, vp2 또는 vp3)에 걸쳐 이루어질 수 있다. 하나의 구현예에서, AAV 캡시드는 AAV8 vp3과 적어도 95% 동일성을 공유한다. 다른 구현예에서, AAV 캡시드는 AAV1 vp3과 적어도 95% 동일성을 공유한다. 다른 구현예에서, 자체 상보적 AAV가 사용된다.
발현 카세트를 비리온으로 패키징하기 위해, ITR은 유전자와 동일한 작제물의 시스에 필요한 유일한 AAV 성분이다. 하나의 구현예에서, 복제(rep) 및/또는 캡시드(cap)를 위한 코딩 서열은 AAV 게놈으로부터 제거되고, AAV 벡터를 생성하기 위해 트랜스로 또는 패키징 세포주에 의해 공급된다. 예를 들어, 상기 기재된 바와 같이, 의사유형화 AAV는 AAV 캡시드의 공급원과 상이한 공급원으로부터의 ITR을 함유할 수 있다. 추가로 또는 대안적으로, 키메라 AAV 캡시드가 이용될 수 있다. 또 다른 AAV 성분이 선택될 수 있다. 이러한 AAV 서열의 공급원이 본원에 기재되어 있고, 또한 학술적, 상업적 또는 공공 공급원(예: the American Type Culture Collection, Manassas, VA)로부터 단리되거나 수득될 수 있다. 대안적으로, AAV 서열은, 예를 들어, GenBank®, PublMed® 등과 같은 문헌에서 또는 데이터베이스에서 입수 가능한 것과 같은 공개된 서열을 참조함으로써 합성 또는 다른 적합한 수단을 통해 수득될 수 있다.
대상체에게 전달하기에 적합한 AAV 바이러스 벡터를 생성하고 단리하기 위한 방법은 당업계에 공지되어 있다(참조: 예를 들어, US 특허 7790449; US 특허 7282199; WO 2003/042397; WO 2005/033321, WO 2006/110689; US 7588772 B2 및 WO 2017/040524, 이의 내용은 전체가 본원에 참조로 포함된다). 한 구현예에서, 생산자 세포주는 반전된 말단 반복(ITR)에 의해 측면에 있는 도입유전자를 인코딩하는 작제물 및 rep 및 cap을 인코딩하는 작제물(들)로 일시적으로 형질감염된다. 다른 구현예에서, 안정하게 rep 및 cap을 공급하는 패키징 세포주는 ITR에 의해 측면에 있는 도입유전자를 인코딩하는 작제물로 일시적으로 형질감염된다. 이러한 시스템 각각에서, AAV 비리온은 헬퍼 아데노바이러스 또는 헤르페스바이러스에 의한 감염에 반응하여 생산되어 오염성 바이러스로부터 rAAV의 분리를 필요로 한다. 보다 최근에, AAV를 회복하기 위한 헬퍼 바이러스에 의한 감염을 필요로 하지 않는 시스템이 개발되었다- 필요한 헬퍼 기능(즉, 아데노바이러스 E1, E2a, VA 및 E4 또는 헤르페스바이러스 UL5, UL8, UL52, 및 UL29, 및 헤르페스바이러스 폴리머라제)도 또한 트랜스로 시스템에 의해 공급된다. 이러한 새로운 시스템에서, 헬퍼 기능은 필요한 헬퍼 기능을 인코딩하는 작제물에 의한 세포의 일시적인 형질감염에 의해 공급될 수 있거나, 세포는 헬퍼 기능을 인코딩하는 유전자를 안정하게 함유하도록 조작될 수 있고, 이의 발현은 전사 또는 전사 후 수준에서 제어될 수 있다. 또 다른 시스템에서, ITR 및 rep/cap 유전자에 의해 측면에 있는 도입유전자는 바쿨로바이러스 기반 벡터에 의한 감염에 의해 곤충 세포에 도입된다. 이러한 생산 시스템에 대한 검토를 위해, 일반적으로, 예를 들어, 문헌(Zhang et al. (2009, Human Gene Therapy 20:922-929, 이의 전체 내용은 본원에 참조로 포함됨)을 참조한다. 이들 및 다른 AAV 생산 시스템을 제조 및 사용하는 방법은 또한 전체 내용이 본원에 참조로 포함된 다음 미국 특허에 기재되어 있다: 5,139,941; 5,741,683; 6,057,152; 6,204,059; 6,268,213; 6,491,907; 6,660,514; 6,951,753; 7,094,604; 7,172,893; 7,201,898; 7,229,823; 및 7,439,065. 일반적으로, 예를 들어, 문헌(Grieger & Samulski, 2005, Adv . Biochem . Engin / Biotechnol. 99: 119-145; Buning et al., 2008, J. Gene Med.10:717-733)을 참조한다. 본원에 기재된 임의의 구현예를 작제하기 위한 적합한 방법은 핵산 조작 분야의 숙련가에게 친숙할 것이며, 이의 예시적인 예는 유전 공학, 재조합 공학 및 합성 기술을 포함한다(참조: 예를 들어, Green and Sambrook et al, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY (2012)). 유사하게, rAAV 비리온을 생성하는 방법은 당업자에게 익히 공지될 것이다(참조: 예를 들어, K. Fisher et al, (1993) J. Virol., 70:520-532 및 미국 특허 제5,478,745호).
본원에 기재된 바이러스 벡터 작제물을 포함하는 조성물이 또한 본원에 제공된다. 본원에 기재된 약제학적 조성물은 임의의 적합한 경로 또는 상이한 경로의 조합에 의해 이를 필요로 하는 대상체에게 전달하도록 설계된다. 간으로의 직접 전달(임의로 정맥내를 통해, 간 동맥을 통해 또는 이식에 의해), 경구, 흡입, 비강내, 기관내, 동맥내, 안구내, 정맥내, 근육내, 피하, 피내 및 다른 비경구 투여 경로. 본원에 기재된 바이러스 벡터는 단일 조성물 또는 다중 조성물로 전달될 수 있다. 임의로, 둘 이상의 상이한 AAV 또는 다수의 바이러스가 전달될 수 있다(참조: 예를 들어, WO 2011/126808 및 WO 2013/049493). 다른 구현예에서, 다수의 바이러스는 상이한 복제-결함 바이러스(예: AAV 및 아데노바이러스)를 함유할 수 있다.
복제-결함 바이러스는 유전자 전달 및 유전자 요법 적용에 사용하기 위해 생리학적으로 허용 가능한 담체와 함께 제형화될 수 있다. AAV 바이러스 벡터의 경우, 게놈 카피("GC")의 정량화는 제형 또는 현탁액에 함유된 용량의 척도로서 사용될 수 있다. 당해 기술 분야에 공지된 임의의 방법은 본 발명의 복제-결함 바이러스 조성물의 게놈 카피(GC) 수를 결정하는데 사용될 수 있다. AAV GC 수 적정을 수행하기 위한 하나의 방법은 다음과 같다: 정제된 AAV 벡터 샘플은 먼저 Dnase로 처리하여 생산 공정으로부터 캡시드화되지 않은 AAV 게놈 DNA 또는 오염성 플라스미드 DNA를 제거한다. 이어서, Dnase 내성 입자를 열 처리에 적용하여 캡시드로부터 게놈을 방출한다. 이어서, 방출된 게놈은 바이러스 게놈의 특정 영역(일반적으로 폴리 A 신호)을 표적으로 하는 프라이머/프로브 세트를 사용하여 실시간 PCR에 의해 정량화된다.
용량 및 투여 형태
본원의 다른 곳에서 언급된 바와 같이, 본 발명은 적어도 부분적으로 (i) 재조합 고양잇과 EPO의 발현을 구동하도록 적응되고 그렇지 않으면 건강한 고양잇과 대상체에서 헤마토크릿 또는 패킹된 세포 용적을 증가시키기에 충분한 아데노바이러스 벡터의 용량은 예기치 않게 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에게 유해하거나 치명적이고; (ii) 그럼에도 불구하고, 적혈구 항상성은 건강한 고양잇과 대상체에서 헤마토크릿 또는 패킹된 세포 용적을 증가시킬 것으로 예상되지 않는 더 낮은 용량으로 빈혈 고양잇과 대상체에게 고양잇과 EPO 발현 아데노바이러스 벡터가 투여될 때 빈혈 고양잇과 대상체에서 회복될 수 있고; (iii) 본원에 기재된 저용량 치료 섭생은 빈혈 동물에서 적혈구 증가증의 위험을 최소화한다는 발명자들의 놀라운 발견에 근거한다.
고양잇과 대상체, 특히 빈혈 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키거나 그렇지 않으면 회복시키는데 효과적인 용량은 바람직하게는 약 2x109 gc/kg 이하이다. 한 구현예에서, 고양잇과 대상체, 특히 빈혈 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키거나 그렇지 않으면 회복시키는데 효과적인 용량은 바람직하게는 약 1x109 gc/kg 이하이다. 용량 범위의 하한은 0이 아닌 약 2x 109 gc/kg 미만의 임의의 수일 수 있고, 이는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진하거나 그렇지 않으면 회복시키는데 효과적이며, 바람직하게는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 치료 개시 후 약 70일까지 촉진시키거나 그렇지 않으면 회복시키는 것이 바람직한 것으로 이해되어야 한다. 한 구현예에서, 용량은 약 1x108 내지 2x109 gc/kg이다. 한 구현예에서, 용량은 약 1x108 내지 1x109 gc/kg이다. 한 구현예에서, 용량은 약 2x108 내지 1x109 gc/kg이다. 한 구현예에서, 용량은 약 2x108 내지 6x108 gc/kg이다. 한 구현예에서, 용량은 약 5.5x108 내지 1.4x109 gc/kg이다. 한 구현예에서, 용량은 약 2x108 내지 1.8x109 gc/kg이다.
한 구현예에서, 용량은 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체의 경우 약 3.65 x109 게놈 카피이거나, (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체의 경우 약 7.30 x109 게놈 카피이다. 한 구현예에서, 용량은 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체의 경우 약 7.30 x109 게놈 카피이다.
고양잇과 EPO의 발현이 약한 프로모터에 의해 구동되는 경우, 본원의 다른 곳에서 기재된 바와 같이, 용량은 강한 프로모터와 비교하여 동일하거나 실질적으로 동일한 수준의 발현을 달성하도록 그에 따라 조정될 수 있다. 한 구현예에서, 약한 프로모터가 사용되는 경우, 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키거나 그렇지 않으면 회복시키는 데 효과적인 용량은 강한 프로모터가 사용될 때 약 3x109 gc/kg 이하의 용량에 의해 달성되는 발현 수준과 동등한 고양잇과 대상체에서 고양잇과 EPO의 발현 수준을 달성하기에 충분한 용량이다. 강한 프로모터가 사용될 때 약 2x109 gc/kg 이하의 용량으로 또는 대안적으로 약 1x109 gc/kg 이하의 용량으로 달성된 발현 수준과 동등한 고양잇과 대상체에서 고양잇과 EPO의 발현 수준을 달성하는 데 충분한 용량은 당업자에 의해 결정될 수 있다. 이러한 용량은 적합하게는 약 1x109 gc/kg 초과의 양을 투여함으로써 달성될 수 있다. 대안적으로, 또는 부가적으로, 이러한 용량은 적합하게는 연속적인 용량; 즉 하나 이상(예: 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 등)의 연속 용량에 의해 달성될 수 있다.
일부 구현예에서, 바이러스 게놈의 양은 분할 용량으로 전달될 수 있다. 한 구현예에서, 작제물은 수의학적 대상체를 위해 1μL 내지 약 100mL의 용적으로 전달될 수 있다(참조: 예를 들어, 다양한 수의학적 동물에게 물질의 투여를 위한 양호한 관행의 논의를 위해 Diehl et al, 2001,, J . Applied Toxicology, 21:15-23, 이의 내용은 전체가 본원에 참조로 포함된다). 따라서, 본원에 사용된 용어 "투여량" 또는 "용량"은 치료 과정에서 대상체에게 전달되는 총 투여량, 또는 단일 (다중) 투여로 전달되는 양을 지칭할 수 있다. 한 구현예에서, 고양잇과 대상체에게 투여되는 용량은 약 1.0x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피이다. 한 구현예에서, 고양잇과 대상체에게 투여되는 용량은 약 1.2x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피이다. 한 구현예에서, 고양잇과 대상체에게 투여되는 용량은 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체의 경우 약 3.65 x109 게놈 카피이거나, (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체의 경우 약 7.30 x109 게놈 카피이다. 한 구현예에서, 두 용량은 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 투여되고, 각 용량은 약 3.65 x109 게놈 카피를 포함한다.
숙주 세포에 재조합 벡터를 전달하는 적합한 방법은 당업자에게 공지될 것이다. 바람직하게는 생리학적으로 적합한 담체, 희석제, 부형제 및/또는 보조제에 현탁된 rAAV는 고양잇과 대상체에게 투여될 수 있다. 적합한 담체는 전달 바이러스가 지시되는 적응증의 관점에서 당업자에 의해 용이하게 선택될 수 있다. 예를 들어, 적합한 담체는 다양한 완충 용액(예: 인산염 완충 식염수)과 함께 제형화될 수 있는 식염수를 포함한다. 적합한 담체의 다른 예시적인 예는 멸균 식염수, 락토스, 수크로스, 인산칼슘, 젤라틴, 덱스트란, 한천, 펙틴, 땅콩 오일, 참기름, 및 물을 포함한다.
임의로, 본원에 기재된 조성물은 rAAV 및/또는 변이체 및 담체(들) 이외에, 다른 통상적인 약제학적 성분, 예를 들어, 방부제, 또는 화학적 안정화제를 함유할 수 있다. 적합한 예시적 방부제는 클로로부탄올, 칼륨 소르베이트, 소르브산, 이산화황, 프로필 갈레이트, 파라벤, 에틸 바닐린, 글리세린, 페놀 및 파라클로로페놀을 포함한다. 적합한 화학적 안정화제는 젤라틴 및 알부민을 포함한다.
본원에 기재된 바이러스 벡터 및 다른 작제물은 이를 필요로 하는 고양잇과 대상체에게 EPO 작제물을 전달하고/하거나 고양잇과 대상체에서 만성 신장 질환을 치료하기 위한 약제를 제조하는데 사용될 수 있다. 따라서, 다른 측면에서, 고양잇과 대상체에서 만성 신장 질환을 치료하는 방법이 제공된다. 따라서, 한 구현예에서, 고양잇과 대상체는 만성 신장 질환을 갖는다. 다른 구현예에서, 조성물은 고양잇과 대상체에게 정맥내로 투여된다.
한 구현예에서, 상기 방법은 본원에 기재된 바와 같은 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다. 하나의 구현예에서, 조성물은 본원에 기재된 바와 같이, EPO 발현 카세트를 함유하는 바이러스 벡터를 포함한다. 하나의 구현예에서, 대상체는 포유동물이다. 다른 구현예에서, 대상체는 고양잇과이다. 또 다른 측면에서, 빈혈을 치료하는 방법이 제공된다. 상기 방법은 본원에 기재된 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다. 한 구현예에서, 조성물은 본원에 기재된 바와 같이, EPO 발현 카세트를 함유하는 바이러스 벡터를 포함한다. 하나의 구현예에서, 대상체는 포유동물이다. 다른 구현예에서, 대상체는 고양잇과이다.
하나의 구현예에서, 고양잇과에서 만성 신장 질환을 치료하기 위한 방법이 제공된다. 상기 방법은 고양잇과 EPO를 인코딩하는 서열을 포함하는 핵산 분자를 포함하는 AAV 바이러스 벡터를 투여하는 단계를 포함한다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하는 방법이 제공되고, 상기 방법은 본원에 기재된 바와 같이, 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 조성물은 체중 kg당 약 2 x109 게놈 카피 이하의 용량으로 대상체에게 투여된다. 본원에 개시된 다른 측면에서, 본원에 기재된 바와 같은 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)의 용도가 제공되며, 여기서 조성물은 체중 kg당 약 2 x109 게놈 카피의 용량으로 투여하기 위해 제형화된다. 본원에 개시된 다른 측면에서, 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하는데 사용하기 위한 약제학적 조성물이 제공되고, 여기서 조성물은 본원에 기재된 바와 같은 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하며, 조성물은 체중 kg당 약 2 x109 게놈 카피 이하의 용량으로 투여하기 위해 제형화된다.
치료 과정은 임의로 동일한 바이러스 벡터(예: AAV8 벡터 또는 AAV1 벡터) 또는 상이한 바이러스 벡터(예: AAV8 및 AAVrh10; AAV1 및 AAV8; AAV1 및 AAVrh10; 등등)의 반복 투여를 포함할 수 있다. 다른 조합은 또한 본원에 기재된 것들을 포함하는 적절한 바이러스 벡터를 사용하여 선택될 수 있다. 본원에 기재된 조성물은 또한, 예를 들어, 재조합 고양잇과 EPO 단백질을 포함하는 다른 약물 또는 단백질 기반 요법, 및/또는 생활습관 변화, 예를 들어, 식이 및 운동 섭생을 포함하는 섭생에 적합하게 조합될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "조절" 또는 이의 변형은 생물학적 경로의 하나 이상의 성분을 억제하는 조성물의 능력을 지칭한다.
본원에 개시된 다른 측면에서, 본원에 기술된 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 단위 투여 형태가 제공되고, 여기서 투여 형태는 약 1.0x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 양으로 rAAV를 포함한다. 한 구현예에서, 단위 투여 형태는 약 1.2x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 양으로 rAAV를 포함한다. 한 구현예에서, 단위 투여 형태는 약 1.2x109 게놈 카피의 양으로 rAAV를 포함한다. 한 구현예에서, 단위 투여 형태는 약 2.4x109 게놈 카피의 양으로 rAAV를 포함한다. 한 구현예에서, 단위 투여 형태는 약 3.65x109 게놈 카피의 양으로 rAAV를 포함한다. 한 구현예에서, 단위 투여 형태는 약 4.86x109 게놈 카피의 양으로 rAAV를 포함한다. 한 구현예에서, 투여 형태는 근육내 투여 형태이다.
본 개시내용은 또한 본원에 기재된 조성물 또는 투여 형태를 포함하는 키트로 확장된다. 키트는 본원에 기재된 방법 및 용도에 따라 조성물 또는 투여 형태를 사용하기 위한 것을 포함하는 지침서를 추가로 포함할 수 있다. 키트는 동결 건조된 형태로 본원에 기재된 조성물 또는 투여 형태를 추가로 포함할 수 있다. 동결 건조된 형태를 제조하기 위한 적합한 방법은 당업자에게 친숙할 것이다. 키트가 동결 건조된 형태로 조성물 또는 투여 형태를 포함하는 경우, 키트는 본원에 기재된 방법 및 용도에 따른 근육내 투여를 포함하여 투여 전에 동결 건조된 형태를 재구성하기 위한 약제학적으로 허용되는 희석제를 포함하는 별도의 용기를 추가로 포함할 수 있다.
본 명세서에서 달리 정의되지 않는 한, 본원에서 사용된 기술 및 과학 용어는 당업자에 의해 그리고 당업자에게 본 출원에서 사용되는 많은 용어에 대한 일반적인 가이드를 제공하는 공개된 텍스트를 참조하여 통상적으로 이해되는 바와 동일한 의미를 갖는다.
하기 실시예는 단지 예시적인 것이며, 본 발명을 제한하는 것으로 의도되지 않는다.
실시예
실시예
1 -
AAV
-고양잇과 EPO 발현 벡터의
작제
고양잇과 EPO 프로단백질을 인코딩하는 핵산 서열은 GenBank 수탁 번호 AFN85670.1; 서열번호 1)의 고양잇과 EPO를 인코딩하는 핵산 서열을 코돈 최적화함으로써 생성되었다. 코돈 최적화된 핵산 서열(서열번호 2)을 부분 CMV 즉각적 초기 인핸서와 함께 닭 베타-액틴 프로모터를 함유하는 발현 벡터로 클로닝하였다. 발현 작제물은 두 (5' 및 3') AAV2 반전된 말단 반복(ITR)에 의해 측면에 있다. 고양잇과 작제물은 헬퍼 및 트랜스 플라스미드에 의한 삼중 형질감염 후 AAV 혈청형 1(AAV1) 캡시드에 패키징하였다. 이어서, 그것을 이오딕사놀 구배 정제를 통해 정제하고 Taqman 정량적 PCR에 의해 적정하였다. AAV1-고양잇과 EPO 발현 벡터는 도 5에 제시되어 있고, 또한 본원에서 SB-001로 지칭된다.
실시예
2 - 정상 고양이에서 고양잇과 에리트로포이에틴의
AAV
매개 발현
AAV1-고양잇과 EPO 발현 벡터, SB-001의 투여에 대한 안전성 및 혈액학적 반응을 평가하기 위해, 단일 근육내(IM) 용량을 건강한 성인 고양이에게 다양한 용량으로 투여하였다.
이 조사는 무작위 제어된 병렬 설계를 사용하는 단일 부위 비임상 실험실 연구로서 착수되었다. 34마리 고양이는 30마리 고양이가 투여 단계에 들어가기 위해 선택되기 전에 7일 동안 연구 조건에 적응시켰다. 고양이는 SB-001 또는 인산염 완충 식염수 위약의 단일 IM 용량을 투여받기 전에 5개의 성-균형 그룹에 무작위로 할당하였다. 투여 그룹은 도 1에 도시된 바와 같이 0일째에 1회 처리하였다. 주사 부위 평가, 신체 검사, 및 체중은 투여 전후 다양한 시점에 평가하였다. 혈액은 투여 전후 시점에서 임상 화학 및 잠재적인 면역원성 평가를 위해 수집하였다. 전반적인 건강을 평가하기 위한 임상 관찰이 매일 수행되었다. 자동화 분석기를 사용하는 포괄적인 혈액학 평가는 투약 전에 3회 수행된 다음, 연구 기간 내내 매주 수행되었다. 또한, 필요에 따라 과도하게 높은 HCT 수준을 갖는 고양이를 모니터링하기 위해 매주 1회 수동 PCV/TP 측정을 수행하였다. 투여 후 56일째 및 60일째에, 수동 PCV/TP 데이터가 모든 고양이에 대해 생성되었다. 연구의 종료시에, SB-001이 투여된 모든 고양이는 안락사시키고, 괴사시켰다.
단일 IM 주사 후, SB-001은 평가된 두 최고 용량 수준(T3; 체중 kg당 1.9x109 유전자 카피(gc/kg) 및 T4; 6.0x109 gc/kg)에서 HCT에서 지속적이고 통계적으로 유의한 변화를 생성하였다. 최저 용량(Tl; 1.9x108 gc/kg 및 T2; 6.0x108 gc/kg)은 연구 과정 동안 HCT에서 임의의 일관된 변화를 생성하지 않았다. 그룹 T2, T3 및 T4에서 적혈구 조영술에 대한 관찰된 변화는 대체로 예상되었고, 이러한 발견들 중 어느 것도 임상적으로 유의한 추가 안전 신호로 간주되지 않았다.
근육내 주사에 의해 제공된 SB-001의 단일 용량은 건강한 고양이에서 1.9 x 109(T3) 및 6.0 x 109 gc/kg(T4)의 용량에서 HCT에서 지속적이고 통계적으로 유의한 변화를 생성시켰다. 이 적혈구 혈액학적 반응은 62/63일의 기간에 걸쳐 지속되었고, 임의의 용량 수준에서 임상적으로 유의한 안전성 문제가 확인되지 않았다(도 1). 이러한 데이터는 문헌[참조: Walker et al. (2005, AJVR, 66(3):450-456) and Beall et al. (2000, Gene Therapy, 7:534-539)]에 보고된 이전 연구와 대체로 일치한다. 예를 들어, 문헌(참조: Beall et al.)은 아데노바이러스-고양잇과 EPO 발현 벡터의 1.25x1012 gc/kg의 용량만이 건강한 고양잇과 대상체의 HCT를 증가시키는데 효과적이었음을 보여주었다. 1.25x1010 gc/kg의 최저 용량은 비효과적인 것으로 나타났다. 유사하게, 문헌(참조: Walker et al.)은 시험된 용량(약 1.5x107, 1.5x108 및 1.5x109 gc/kg) 중에서 최고 용량만(1.5 x 109 gc/kg)이 건강한 고양이에서 HCT의 증가를 나타냈지만, 시험된 임의의 낮은 용량에서는 어떠한 효과도 없었음을 보여주었다.
건강한 고양이로부터의 전술한 데이터에 비추어, 본 발명자들은 3.0x109 gc/kg의 평균 용량을 취하여 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양이에서 SB-001 작제물의 효과를 조사하였다. 이는 이하 실시예 3에 명시되어 있다.
실시예
3 - 만성 신장 질환을 갖는 고양이에서 고양잇과 에리트로포이에틴의 AAV 매개 발현의 투여량 연구
이 연구에서, 각각 만성 신장 질환(CKD)과 연관된 빈혈로 진단된 3마리 고양이(클라라, 코스모 및 올리버)는 SB-001(IM; 3.0x109 gc/kg)을 투여하였다. 놀랍게도, 그렇지 않으면 건강한 고양이에서 HCT를 증가시키는데 효과적인 것으로 밝혀진 SB-001의 3.0x109 gc/kg 용량은 빈혈 고양이에서 잘 견디지 못하거나 치명적이었다. 이들 결과는 도 2에 제시되어 있고, 이하에 추가로 기재된다:
· 올리버: 18.5세, MC 메인 쿤
· 70일째에서 SB-001 EPO로 인한 적혈구 증가증(PCV 29.1% 내지 55.7%= 26.6 포인트 증가)
· 89일째 - 급성 괴사성 췌장염으로 사망하였다
· 클라라: 19.3세, FS, DSH
· 28일째에 SB-001 EPO로 인한 적혈구 증가증(PCV 15.3% 내지 54.5%= 39.2 포인트 증가)
· D27에서 발작, 2마리 정맥 절제술
· CKD 진행으로 인해 D55에서 안락사
· 코스모: 17세, MC, DSH
· IRIS IV: 등록시 크레아티닌/BUN:
· PCV가 너무 빠르게 증가하여, 연구를 계속할 수 있었다면, 적혈구 증가증이 발생했을 가능성이 있다(PCV 12% 내지 40.9%= 29 포인트 증가)
· D46에서 안락사 - CKD의 진행
실시예
4 - 만성 신장 질환을 갖는 고양이에서 고양잇과 에리트로포이에틴의 AAV 매개 발현의 최적화
이 연구는 저용량이 건강한 고양이에서 적혈구 항생성을 촉진하는 데 비효과적이다는 초기 발견(상기 실시예 2에 언급된 바와 같음, 문헌(참조: Beall et al. and Walker et al.)에 의한 발견과 일치함)에도 불구하고, 저용량의 SB-001이 빈혈 고양이에서 효과적일 수 있는지 여부를 조사하고자 하였다. 이 연구 설계는 맹검화되지 않았고 위약이 사용되지 않았다는 점을 제외하고, 상기 실시예 3의 연구와 유사하였다. 동물은 약 2.0x108 내지 6.0x108 gc/kg의 SB-001의 용량을 투여하였다.
처음 7마리의 고양이의 등록 후, 치료에 반응하지 않은 고양이가 42일째에 3x 부스팅 용량을 받을 수 있도록 보정이 이루어졌다. 8마리의 부스팅-용량 고양이 중 7마리가 성공 기준(PCV의 정상 범위로의 증가 또는 적어도 5 PCV 백분율 포인트의 증가)을 충족하였다. 치료 없이, 고양이의 PCV는 경시적으로 감소할 것으로 예상된다.
효능은 치료 후 PCV(마이크로헤마토크릿을 사용하여 회전된 전혈로부터 측정됨)를 안정화시키거나 증가시킴으로써 나타났다.
놀랍게도, 22.5%에서 33.6%로 PCV의 평균 증가가 연구 코호트에서 관찰되었으며(도 3), 적혈구 증가증에 대한 치료가 필요한 고양이는 없었다. 이러한 결과는 놀랍고 예상치 못한 것이었고, SB-001의 유사한 용량이 건강한 고양이에서 HCT 또는 PCV를 증가시키는데 비효과적이었음을 주목하였다.
실시예
5 - 만성 신장 질환을 갖는 고양이에서 고양잇과 에리트로포이에틴의 AAV 매개 발현의 용량 최적화
이 연구는 SB-001의 더 낮은 유효 용량이 빈혈 고양이에서 효과적이라는 것을 확인하고자 하였다.
이 연구 설계는 상기 실시예 4의 연구와 유사하였다. 간략하게, 동물은 연구의 개시시에 SB-001의 약 3.65 x 109 유전자 카피(gc)의 단일 용량을 투여하였다. 이 용량은 하기 표 1에 나타낸 바와 같이, 약 5.5x108 내지 1.4x109 gc/kg 체중(BW)과 동등하였다.
[표 1]
8마리의 치료된 고양이 중 7마리는 정상 범위로의 PCV의 증가 또는 적어도 5 PCV 백분율 포인트의 증가로서 취해진 성공 기준을 충족시켰다. 치료 없이, PCV 값은 경시적으로 감소할 것으로 예상된다.
효능은 치료 후 PCV(마이크로헤마토크릿을 사용하여 회전된 전혈로부터 측정됨)를 안정화시키거나 증가시킴으로써 나타났다.
놀랍게도, 하기 표 2에 나타낸 바와 같이, 21.25%에서 39.75%로 PCV의 평균 증가가 연구 코호트에서 관찰되었으며, 적혈구 증가증에 대한 후속적 치료가 필요한 고양이는 없었다. 이러한 결과는 놀랍고 예상치 못한 것이었고, SB-001의 유사한 용량이 건강한 고양이에서 HCT 또는 PCV를 증가시키는데 비효과적이었음을 주목하였다.
[표 2]
실시예
6 -
SB
-001로 치료 후 말기 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양이의 생존
이 연구는 말기(4기) 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양이에서의 생존에 대한 SB-001의 낮은 유효 용량의 효과를 결정하고자 했다. 이 연구는 상기 실시예 4 및 5에 제시된 연구와 유사하였다. 간단하게, 말기(4기) 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양이는 상기 실시예 4에 기재된 바와 같이, 필요한 경우, 투여된 제2 용량을 포함하여 약 2x108 내지 1.8x109 gc/kg 체중의 총 용량으로 SB-001을 투여하였다.
놀랍게도, 저용량 SB-001로 치료된 9마리 고양이 중 4마리는 99일보다 오래 살았다. 이는 문헌[참조: Boyd et al. (2008; J Vet Intern Med 2008;22:1111-1117)]의 발견과 대조적이고, 이는 4기 만성 신장 질환의 진단으로부터 사망까지 고양이의 생존 중앙값은 35일이었음을 보여주었다(참조: 문헌(참조: Boyd et al. 2008)의 표 2). SB-001로 치료된 4기 고양이는 64일의 증가된 중앙값 생존 시간(일)을 가졌다(참조: 도 6 및 표 3).
[표 3]
실시예 3 내지 6의 고양잇과 대상체로부터의 생존 데이터가 수집되었을 때, 저용량 SB-001로 치료된 고양이가 문헌(참조: Boyd et al. (2008))에 기재된 바와 같이, 대안적인 중재를 받은 고양잇과 대상체와 비교할 때 치료 시간보다 3배 이상 살았다는 것이 놀랍게도 발견되었다. 이러한 발견은 하기 표 4에 제시되어 있다.
[표 4]
실시예
7 - 고양잇과 에리트로포이에틴의
AAV8
-매개 발현으로 만성 신장
질
환을 갖는 빈혈 고양이의 치료
고양잇과 EPO 프로단백질을 인코딩하는 핵산 서열은 GenBank(예: 수탁 번호 AFN85670)로부터 수득될 것이다. 서열은 부분 CMV 즉각적 초기 인핸서와 함께 닭 베타-액틴 프로모터를 함유하는 발현 벡터로 클로닝될 것이다. 발현 작제물은 두(5' 및 3') AAV2 반전된 말단 반복(ITR)에 의해 측면에 있을 것이다. 고양잇과 작제물은 삼중 형질감염 및 이오딕사놀 구배 정제에 의해 AAV 혈청형 8(AAV8) 캡시드에 패키징되고 Taqman 정량적 PCR에 의해 적정되어 AAV8-고양잇과 EPO 발현 벡터를 생성할 것이다.
빈혈 고양이는 약 2.0x109 gc/kg 이하의 AAV8-고양잇과 EPO 발현 벡터의 근육내(IM) 용량을 투여할 것이고, HCT 및/또는 PCV에서의 변화는 본원의 다른 곳에서 기재된 바와 같이 결정될 것이다. 효능은 PCV의 정상 범위로의 안정화 또는 증가 또는 적어도 5 PCV 백분율 포인트의 증가(예: 마이크로헤마토크릿을 사용하여 회전된 전혈로부터 측정된 바와 같음)에 의해 나타날 것이다.
SEQUENCE LISTING
<110> Scout Bio, Inc.
Traas, Anne
Wilson, Matthew J
<120> COMPOSITION AND USES THEREOF
<130> SCTB-008/01WO
<150> US 63/084,490
<151> 2020-09-28
<160> 4
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 192
<212> PRT
<213> Felis catus
<400> 1
Met Gly Ser Cys Glu Cys Pro Ala Leu Leu Leu Leu Leu Ser Leu Leu
1 5 10 15
Leu Leu Pro Leu Gly Leu Pro Val Leu Gly Ala Pro Pro Arg Leu Ile
20 25 30
Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Ile Leu Glu Ala Arg Glu Ala
35 40 45
Glu Asn Val Thr Met Gly Cys Ala Glu Gly Cys Ser Phe Ser Glu Asn
50 55 60
Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Thr Trp Lys Arg Met
65 70 75 80
Asp Val Gly Gln Gln Ala Val Glu Val Trp Gln Gly Leu Ala Leu Leu
85 90 95
Ser Glu Ala Ile Leu Arg Gly Gln Ala Leu Leu Ala Asn Ser Ser Gln
100 105 110
Pro Ser Glu Thr Leu Gln Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Ser Leu
115 120 125
Arg Ser Leu Thr Ser Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gln Lys Glu Ala
130 135 140
Thr Ser Leu Pro Glu Ala Thr Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Phe Thr
145 150 155 160
Val Asp Thr Leu Cys Lys Leu Phe Arg Ile Tyr Ser Asn Phe Leu Arg
165 170 175
Gly Lys Leu Thr Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Arg Gly Asp Arg
180 185 190
<210> 2
<211> 579
<212> DNA
<213> Felis catus
<400> 2
atgggcagct gcgagtgtcc tgctctcctg ctgctgctga gtttgctgct gctgcctctg 60
ggcctgcctg tgctgggagc acctcctaga ctgatctgcg acagccgggt gctggaacgg 120
tacatcctgg aagcccgcga ggccgagaat gtgaccatgg gatgtgccga gggctgcagc 180
ttcagcgaga acatcaccgt gcccgacacc aaagtgaact tctacacctg gaagagaatg 240
gacgtgggcc agcaggccgt ggaagtgtgg cagggactgg ccctgctgtc tgaggccatc 300
ctgagaggac aggctctgct ggccaacagc agccagccta gcgaaaccct gcagctgcac 360
gtggacaagg ccgtgtcctc cctgagaagc ctgaccagcc tgctgagagc actgggagcc 420
cagaaagagg ccacctctct gcctgaggcc acatctgccg cccctctgag aaccttcacc 480
gtggacaccc tgtgcaagct gttccggatc tacagcaact tcctgcgggg caagctgacc 540
ctgtacaccg gcgaggcttg tcggagaggc gacagatga 579
<210> 3
<211> 2928
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> transgene cassette
<220>
<221> 5' ITR
<222> (1)..(130)
<220>
<221> CB promoter
<222> (582)..(863)
<220>
<221> Chimeric intron
<222> (958)..(1930)
<220>
<221> CDS FelEpo
<222> (1942)..(2520)
<220>
<221> rBG poly A
<222> (2584)..(2710)
<220>
<221> 3' ITR
<222> (2799)..(2928)
<400> 3
ctgcgcgctc gctcgctcac tgaggccgcc cgggcaaagc ccgggcgtcg ggcgaccttt 60
ggtcgcccgg cctcagtgag cgagcgagcg cgcagagagg gagtggccaa ctccatcact 120
aggggttcct tgtagttaat gattaacccg ccatgctact tatctaccag ggtaatgggg 180
atcctctaga actatagcta gtcgacattg attattgact agttattaat agtaatcaat 240
tacggggtca ttagttcata gcccatatat ggagttccgc gttacataac ttacggtaaa 300
tggcccgcct ggctgaccgc ccaacgaccc ccgcccattg acgtcaataa tgacgtatgt 360
tcccatagta acgccaatag ggactttcca ttgacgtcaa tgggtggact atttacggta 420
aactgcccac ttggcagtac atcaagtgta tcatatgcca agtacgcccc ctattgacgt 480
caatgacggt aaatggcccg cctggcatta tgcccagtac atgaccttat gggactttcc 540
tacttggcag tacatctacg tattagtcat cgctattacc atggtcgagg tgagccccac 600
gttctgcttc actctcccca tctccccccc ctccccaccc ccaattttgt atttatttat 660
tttttaatta ttttgtgcag cgatgggggc gggggggggg ggggggcgcg cgccaggcgg 720
ggcggggcgg ggcgaggggc ggggcggggc gaggcggaga ggtgcggcgg cagccaatca 780
gagcggcgcg ctccgaaagt ttccttttat ggcgaggcgg cggcggcggc ggccctataa 840
aaagcgaagc gcgcggcggg cggggagtcg ctgcgacgct gccttcgccc cgtgccccgc 900
tccgccgccg cctcgcgccg cccgccccgg ctctgactga ccgcgttact cccacaggtg 960
agcgggcggg acggcccttc tcctccgggc tgtaattagc gcttggttta atgacggctt 1020
gtttcttttc tgtggctgcg tgaaagcctt gaggggctcc gggagggccc tttgtgcggg 1080
gggagcggct cggggggtgc gtgcgtgtgt gtgtgcgtgg ggagcgccgc gtgcggctcc 1140
gcgctgcccg gcggctgtga gcgctgcggg cgcggcgcgg ggctttgtgc gctccgcagt 1200
gtgcgcgagg ggagcgcggc cgggggcggt gccccgcggt gcgggggggg ctgcgagggg 1260
aacaaaggct gcgtgcgggg tgtgtgcgtg ggggggtgag cagggggtgt gggcgcgtcg 1320
gtcgggctgc aaccccccct gcacccccct ccccgagttg ctgagcacgg cccggcttcg 1380
ggtgcggggc tccgtacggg gcgtggcgcg gggctcgccg tgccgggcgg ggggtggcgg 1440
caggtggggg tgccgggcgg ggcggggccg cctcgggccg gggagggctc gggggagggg 1500
cgcggcggcc cccggagcgc cggcggctgt cgaggcgcgg cgagccgcag ccattgcctt 1560
ttatggtaat cgtgcgagag ggcgcaggga cttcctttgt cccaaatctg tgcggagccg 1620
aaatctggga ggcgccgccg caccccctct agcgggcgcg gggcgaagcg gtgcggcgcc 1680
ggcaggaagg aaatgggcgg ggagggcctt cgtgcgtcgc cgcgccgccg tccccttctc 1740
cctctccagc ctcggggctg tccgcggggg gacggctgcc ttcggggggg acggggcagg 1800
gcggggttcg gcttctggcg tgtgaccggc ggctctagag cctctgctaa ccatgttcat 1860
gccttcttct ttttcctaca gctcctgggc aacgtgctgg ttattgtgct gtctcatcat 1920
tttggcaaag aattcgccac catgggcagc tgcgagtgtc ctgctctcct gctgctgctg 1980
agtttgctgc tgctgcctct gggcctgcct gtgctgggag cacctcctag actgatctgc 2040
gacagccggg tgctggaacg gtacatcctg gaagcccgcg aggccgagaa tgtgaccatg 2100
ggatgtgccg agggctgcag cttcagcgag aacatcaccg tgcccgacac caaagtgaac 2160
ttctacacct ggaagagaat ggacgtgggc cagcaggccg tggaagtgtg gcagggactg 2220
gccctgctgt ctgaggccat cctgagagga caggctctgc tggccaacag cagccagcct 2280
agcgaaaccc tgcagctgca cgtggacaag gccgtgtcct ccctgagaag cctgaccagc 2340
ctgctgagag cactgggagc ccagaaagag gccacctctc tgcctgaggc cacatctgcc 2400
gcccctctga gaaccttcac cgtggacacc ctgtgcaagc tgttccggat ctacagcaac 2460
ttcctgcggg gcaagctgac cctgtacacc ggcgaggctt gtcggagagg cgacagatga 2520
tgaggtacct ctagagtcga cccgggcggc ctcgaggacg gggtgaacta cgcctgagga 2580
tccgatcttt ttccctctgc caaaaattat ggggacatca tgaagcccct tgagcatctg 2640
acttctggct aataaaggaa atttattttc attgcaatag tgtgttggaa ttttttgtgt 2700
ctctcactcg gaagcaattc gttgatctga atttcgacca cccataatac ccattaccct 2760
ggtagataag tagcatggcg ggttaatcat taactacaag gaacccctag tgatggagtt 2820
ggccactccc tctctgcgcg ctcgctcgct cactgaggcc gggcgaccaa aggtcgcccg 2880
acgcccgggc tttgcccggg cggcctcagt gagcgagcga gcgcgcag 2928
<210> 4
<211> 20
<212> PRT
<213> Felis catus
<400> 4
Met Tyr Arg Met Gln Leu Leu Ser Cys Ile Ala Leu Ser Leu Ala Leu
1 5 10 15
Val Thr Asn Ser
20
Claims (52)
- 빈혈(anaemia)을 갖는 고양잇과 대상체(feline subject)에서 적혈구 항상성(red blood homeostasis)을 촉진하기 위한 방법으로서, 상기 방법이 AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고, 상기 AAV 캡시드가 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩(encoding)하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열(expression control sequence)을 포함하며, 상기 조성물이 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 대상체에게 투여되며, 상기 용량이 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(genome copy)(gc/kg) 이하인, 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 용량이 약 1x109gc/kg 이하인, 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 용량이 약 1x108 내지 2x109gc/kg인, 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 용량이 약 1x108 내지 1x109gc/kg인, 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 용량이 약 2x108 내지 1x109gc/kg인, 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 용량이 약 2x108 내지 6x108gc/kg인, 방법.
- 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체가 약 28% 이하의 패킹된 세포 용적(packed cell volume; PCV)을 갖는, 방법.
- 제7항에 있어서, 상기 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체가 약 10% 내지 약 28% 범위의 PCV를 갖는, 방법.
- 제7항에 있어서, 상기 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체가 약 22% 내지 약 28% 범위의 PCV를 갖는, 방법.
- 제7항에 있어서, 상기 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체가 약 22.5%의 PCV를 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 용량이 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 30% 내지 약 55%의 값으로 증가시키는 데 효과적인, 방법.
- 제11항에 있어서, 상기 용량이 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 30% 내지 약 35%의 값으로 증가시키는 데 효과적인, 방법.
- 제11항에 있어서, 상기 용량이 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 33% 내지 약 35%의 값으로 증가시키는 데 효과적인, 방법.
- 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 용량이 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 5 내지 약 30 PCV% 포인트(point)의 양까지 증가시키는 데 효과적인, 방법.
- 제14항에 있어서, 상기 용량이 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 10 내지 약 20 PCV% 포인트의 양까지 증가시키는 데 효과적인, 방법.
- 제14항에 있어서, 상기 용량이 고양잇과 대상체에서 PCV를 조성물의 투여 후 70일째까지 약 15 PCV% 포인트까지 증가시키는 데 효과적인, 방법.
- 제1항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고양잇과 대상체가 적혈구 증가증(polycythemia)에 대한 치료를 필요로 하지 않는, 방법.
- 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 약 1.0x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 단위 용량으로서 근육내 투여되는, 방법.
- 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법이 조성물의 후속 용량을 고양잇과 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는, 방법.
- 제19항에 있어서, 상기 후속 용량이 조성물의 초기 투여 후 약 28일 내지 약 56일 동안 고양잇과 대상체에게 투여되는, 방법.
- 제19항에 있어서, 상기 후속 용량이 조성물의 초기 투여 후 약 40일 내지 약 45일 동안 고양잇과 대상체에게 투여되는, 방법.
- 제1항 내지 제21항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고양잇과 EPO가 전장 고양잇과 EPO 단백질인, 방법.
- 제1항 내지 제22항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 핵산 서열이 이종성 리더 서열(heterologous leader sequence)과 조합하여 성숙한 고양잇과 EPO 단백질을 인코딩하는, 방법.
- 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고양잇과 EPO 서열이 서열번호 1의 아미노산 서열 또는 이에 대해 적어도 70% 서열 동일성(sequence identity)을 갖는 아미노산 서열을 포함하는, 방법.
- 제1항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, 고양잇과 EPO를 인코딩하는 핵산 서열이 서열번호 2의 핵산 서열 또는 이에 대해 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, 방법.
- 제25항에 있어서, 상기 핵산 서열이 코돈 최적화(codon optimizing)되는, 방법.
- 제1항 내지 제26항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 발현 제어 서열이 프로모터(promoter)를 포함하는, 방법.
- 제27항에 있어서, 상기 프로모터가 CB7 프로모터인, 방법.
- 제27항에 있어서, 상기 프로모터가 TBG 프로모터인, 방법..
- 제27항에 있어서, 상기 발현 제어 서열이 조직 특이적 프로모터(tissue-specific promoter)를 포함하는, 방법.
- 제30항에 있어서, 상기 조직 특이적 프로모터가 신장 특이적 프로모터 또는 근육 특이적 프로모터인, 방법.
- 제30항에 있어서, 상기 조직 특이적 프로모터가 Nkcc2 프로모터, 우로모둘린 프로모터, Ksp-카데린 프로모터 및 THP 유전자 프로모터로부터 선택되는, 방법.
- 제1항 내지 제32항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 AAV 캡시드가 인트론(intron), 코작 서열(Kozak sequence), 폴리A, 및 전사후 조절 요소 중 하나 이상을 추가로 포함하는, 방법.
- 제1항 내지 제33항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 AAV 캡시드가 AAV1, AAV5, AAV6, AAV8, AAVrh64Rl, AAV9, AAVrh91, AAVhu.37, AAV3b, AAV3b.AR2.12 및 AAVrh 10으로 이루어지는 그룹으로부터 선택되는, 방법.
- 제34항에 있어서, 상기 AAV 캡시드가 AAV8 캡시드인, 방법.
- 제34항에 있어서, 상기 AAV 캡시드가 AAV1 캡시드인, 방법.
- 제1항 내지 제36항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고양잇과 대상체가 만성 신장 질환(chronic kidney disease)을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제37항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 고양잇과 대상체에게 정맥내로 투여되는, 방법.
- 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진하기 위한 약제의 제조에서의, AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)의 용도로서, 상기 AAV 캡시드가 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하며, 상기 rAAV가 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 투여하기 위해 제형화되며, 상기 용량이 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하인, 용도.
- 제39항에 있어서, 상기 조성물이 약 1.0x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 단위 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화되는, 용도.
- 빈혈을 갖는 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진하는 데 사용하기 위한 약제학적 조성물로서, 상기 조성물이 AAV 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하고, 상기 AAV 캡시드가 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하며, 상기 rAAV가 고양잇과 대상체에서 적혈구 항상성을 촉진시키는 데 효과적인 용량으로 투여하기 위해 제형화되고, 상기 용량이 체중 kg당 약 2x109 게놈 카피(gc/kg) 이하인, 약제학적 조성물.
- 제41항에 있어서, 상기 조성물이 약 1.0x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 단위 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화되는, 조성물.
- 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하는 방법으로서, 상기 방법이 AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 조성물을 대상체에게 투여하는 단계를 포함하며, 상기 AAV1 캡시드가 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 상기 조성물이 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체에게 약 3.65x109 게놈 카피의 용량으로 또는 (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 약 7.30x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여되는, 방법.
- 제43항에 있어서, 상기 rAAV가 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 각각 약 3.65 x109 게놈 카피를 포함하는 2개 용량의 형태로 투여된 약 7.30 x109 게놈 카피의 용량으로 투여되는, 방법.
- 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하기 위한 약제의 제조에서의, AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)의 용도로서, 상기 AAV1 캡시드가 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 상기 rAAV가 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체에게 약 3.65x109 게놈 카피의 용량으로 또는 (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 약 7.30x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화되는, 용도.
- 제45항에 있어서, 상기 rAAV가 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 각각 약 3.65 x109 게놈 카피를 포함하는 2개 용량의 형태로 투여된 약 7.30 x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화되는, 용도.
- 만성 신장 질환을 갖는 빈혈 고양잇과 대상체를 치료하는 데 사용하기 위한 약제학적 조성물로서, 상기 조성물이 AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하고, 상기 AAV1 캡시드가 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 상기 rAAV가 (i) 체중 2 내지 6kg의 고양잇과 대상체에게 약 3.65x109 게놈 카피의 용량으로 또는 (ii) 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 약 7.30x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화되는, 약제학적 조성물.
- 제47항에 있어서, 상기 rAAV가 체중 6kg 초과의 고양잇과 대상체에게 각각 약 3.65 x109 게놈 카피를 포함하는 2개 용량의 형태로 투여된 약 7.30 x109 게놈 카피의 용량으로 근육내 투여하기 위해 제형화되는, 조성물.
- AAV1 캡시드를 포함하는 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)를 포함하는 단위 투여 형태(unit dosage form)로서, 상기 AAV1 캡시드가 고양잇과 에리트로포이에틴(EPO)을 인코딩하는 핵산 서열, 및 고양잇과 대상체에서 EPO의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하고, 상기 단위 투여 형태가 약 1.2x109 내지 약 5.0x109 게놈 카피의 양으로 rAAV를 포함하는, 단위 투여 형태.
- 제49항에 있어서, 상기 단위 투여 형태가 약 3.65xl09 게놈 카피의 양으로 rAAV를 포함하는, 단위 투여 형태.
- 제49항 또는 제50항에 있어서, 상기 투여 형태가 근육내 투여 형태인, 단위 투여 형태.
- 제49항 내지 제51항 중 어느 한 항의 단위 투여 형태를 포함하는 키트(kit).
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