KR102011956B1 - 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라(Klebsiella)속 균을 용균하는 박테리오파지 - Google Patents

항생제 내성을 갖는 클렙시엘라(Klebsiella)속 균을 용균하는 박테리오파지 Download PDF

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Abstract

본 발명은 항생제에 대한 내성을 갖는 클렙시엘라(Klebsiella)속 균을 용균시키는 박테리오파지에 관한 것으로, 구체적으로는 서열번호 2 또는 3으로 표시되는 유전체를 포함하는 YMC15/11/N54_KPN_BP 박테리오파지 (기탁번호: [KCTC18572P])를 제공한다.
본 발명에서 제공하는 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 대하여 특이적 사멸능을 가지므로, 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 의해 유발되는 질환의 예방 및 치료 목적으로 활용할 수 있다.

Description

항생제 내성을 갖는 클렙시엘라(Klebsiella)속 균을 용균하는 박테리오파지{LYTIC BACTERIOPHAGE SPECIFIC FOR KLEBSIELLA GENUS RESISTANT TO ANTIBIOTICS}
본 발명은 항생제에 대한 내성을 갖는 클렙시엘라(Klebsiella)속 균을 용균시키는 박테리오파지에 관한 것이다.
클렙시엘라(Klebsiella)속 균에 해당하는 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae)는 그람 음성의 피막을 가진 혐기성 세균으로 입, 피부, 장 등의 정상세균총에서 발견된다. 병원 밖 클렙시엘라 세균에 의해 유발되는 가장 흔한 감염질환은 폐렴이 있으며, 전형적으로 기관지폐렴 및 기관지염의 형태로 나타난다. 크렙시엘라 뉴모니아는 감염 및 출혈을 통해 인간 폐를 파괴할 수 있고, 때로는 점액성 객담을 생성하기도 한다. 상기 세균은 전형적으로 구강 인두에 대량으로 서식하는 미생물 흡입에 의해 기도로 들어가 감염을 유발하는 것으로 알려져 있다.
상기 클렙시엘라속 균의 감음은 대부분 면역력이 약한 사람에게서 두드러지게 나타나며, 항균치료를 수행하더라도 약 50%의 높은 사망률을 나타내고 있다. 특히, 클렙시엘라 뉴모니아는 구강 등의 흡입 이외에도 비뇨기관, 쓸개관, 및 수술에 의한 상처부위에서도 감염을 유발할 수 있다. 최근, 클렙시엘라 뉴모니아가 병원 내 감염에 있어서 매우 중요한 병원균으로 인식되고 있다.
항생제 오남용 및 이로 인한 내성균 출현 등으로 대표되는 기존 합성 항생제의 문제점이 세계적으로 크게 이슈화되어 있는 상황에서 이에 대한 해결책을 제시해 줄 수 있는 대상으로 주목을 받고 있는 것이 바로 박테리오파지(Bacteriophage) 및 박테리오파지 유래의 리신(Lysin) 단백질이다. 박테리오파지 및 리신 단백질은 기존 항생 물질과는 완전히 다른 계열이라 할 수 있으며 이에 따라 전혀 다른 항균(antibacterial) 작용 기작(mode of action)을 갖고 있다. 따라서 기존 항생제의 사용에서 나타나던 여러 부작용(side effect)이나 문제점을 개선할 수 있을 것으로 기대를 모으고 있다.
박테리오파지는 박테리아를 감염시킬 수 있으며 보통 파지(phage)라고 줄여서 부르기도 한다. 박테리오파지는 핵산으로 이루어진 유전물질 중심부를 단백질 외피가 싸고 있는 단순한 구조의 유기체이며, 핵산은 단일 사슬이거나 이중 사슬인 DNA 또는 RNA로 되어있다. 박테리오파지는 생존에 숙주(host)가 반드시 필요하며, 모든 박테리아에는 특정 박테리오파지가 존재한다고 알려져 있다. 박테리오파지는 박테리아의 세포벽(cell wall)의 펩티도글리칸(peptidoglycan) 층(layer)을 공격하여 세포벽을 파괴함으로써 박테리아를 사멸시킬 수 있다. 박테리오파지는 1915년 영국의 세균학자 Twort와 1917년 프랑스의 dHerelle에 의해 독립적으로 규명되었으며 세균을 잡아먹는다는 뜻에서 박테리오파지라고 명명되었다. 박테리오파지의 항 박테리아 활성(antibacterial activity) 때문에 발견 직후부터 인체와 동물의 질병 치료에 사용되었다. 그러나 Flemming에 의해 페니실린이 발견된 이후, 계속된 다양한 항생제의 등장 및 보급화로 인하여 서구에서는 관심이 점차 줄어들게 되었다. 그러나 러시아와 독일 등의 동구권 나라들은 박테리오파지 연구를 계속 해왔으며 관련하여 다수의 제품들이 산업화된 바도 있다. 하지만, 2000년대에 이르러 항생제 내성균 문제가 부각되면서 서구에서도 다시 박테리오파지에 대하여 관심을 갖게 되었으며 그 후 약 7~8년이 흐른 최근, 산업화 사례들이 속속 보고되고 있다. 즉, 박테리오파지가 세계적으로 새롭게 재조명되기 시작한 시기는 2000년대 초반으로, 실질적 산업화 노력이 약 7 ~ 8 여년 정도 진행된 신규한 분야로서, 생명공학기술의 발전과 맞물려 최근 매우 활발히 관련 개발이 진행되고 있는 분야라 할 수 있다.
박테리오파지의 가장 큰 특징으로는, 감염성 박테리아 속에 침투한 다음 박테리아의 세포벽을 파괴하여 박테리아의 사멸을 유도한다는 것이며, 이러한 박테리오파지에 의한 세포 사멸의 기작은 세균의 세포벽 합성을 방해하는 방식의 기존 합성 항생제의 기작과는 완전히 다르다. 따라서 기존 합성 항생제에 대한 감수성에 관계없이 자신의 항균 활성을 발휘할 수 있다. 이로 인하여 특히 기존 항생제에 대하여 이미 내성을 획득한 내성균에 대해서도 항균 효과가 있다. 또한, 박테리아에 대해서는 매우 특이적인 항균 활성을 가지고 있기 때문에 인간을 포함한 동물을 구성하는 세포인 진핵세포(eukaryotic cell)에는 영향을 주지 않는다는 장점을 갖고 있다.
본 발명의 일 목적은 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 대하여 특이적인 감염 및 세포 사멸 능력을 갖는 신규한 박테리오파지를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 클렙시엘라속 균에 대하여 특이적인 세포 사멸 능력을 갖는 신규한 박테리오파지를 유효성분으로 포함하여, 상기 클렙시엘라속 균에 의해 유발되는 질환의 예방 또는 치료용 약학 조성물 및 개선용 식품 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 본 발명에 따른 상기 박테리오파지를 포함하는 항생제 및 소독제를 제공하는 것이다.
그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.
본 발명의 발명자들은 항생제 내성 세균 감염증 치료의 대안 물질로 기존의 화학 용법 제제를 보완할 수 있는 박테리오파지를 검토하던 중 항생제 내성 클렙시엘라(Klebsiella)속 균을 선택적으로 사멸시킬 수 있는 박테리오파지를 분리하고, 분리된 박테리오파지의 형태적 및 유전적 특성을 분석하여 이를 타 박테리오파지와 구별하여 특정 지을 수 있는 유전체(genome)의 유전자 서열을 제공하며, 더 나아가 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 특이적 사멸능을 갖는 분리된 박테리오파지를 이용하여 상기 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 의해 유발되는 질환의 예방 및 치료 목적으로 이용함으로써 본 발명을 완성하였다.
구체적으로, 본 발명자들은 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 대하여 선택적으로 사멸시키기 위해 노력한 결과, 병원체로부터 카바페넴 내성을 갖는 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae)를 분리하였고, 상기 카바페넴 내성 클렙시엘라 뉴모니아를 특이적으로 사멸시킬 수 있는 신규한 박테리오파지를 선별하여, 이를 "YMC15/11/N54_KPN_BP"로 명명하였다. 이렇게 선별된 상기 박테리오파지를 2017년 5월 11일자로 한국생명공학연구원 미생물자원센터(기탁번호: [KCTC18572P])에 기탁하였다.
본 발명의 일 구현 예는 항생제 내성 클렙시엘라(Klebsiella)속 균에 대하여 특이적인 세포 사멸능을 갖고, 서열번호 2 또는 3으로 표시되는 유전체를 포함하는 박테리오파지일 수 있다.
본 발명에서 상기 클렙시엘라(Klebsiella)속 균은 장내세균과의 한 속으로, 협막을 지니며 점액을 생산하고, 탄소원으로서 구연산염을 이용하는 균으로, 자연계에 널리 존재하며 사람의 호흡기, 장관 및 비뇨기에서 검출된다. 일반적으로 상기 균은 비병원성이지만 다양한 질병의 2차 감염과 폐렴 등의 질환의 원인이 될 수 있다.
본 발명에서, 상기 클렙시엘라속 균은 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae), 클렙시엘라 옥시토카(Klebsiella oxytoca), 클렙시엘라 플란티콜라(Klebsiella planticola) 및 클렙시엘라 테리게나(Klebsiella terrigena)로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 한종일 수 있으며, 바람직하게는 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
단, 본 발명에서 상기 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae)는 간균으로도 불리우며, 아종으로 뉴모니아(Pneumoniae), 아자니아(azaenae) 및 리노스틸레로마티스(rhinoscleromatis)가 존재하며, 상기 균은 급성폐렴, 취비증, 비경종증을 유발할 수 있다. 또한, 항생 물질에 내성이 존재하고, 건조하지 않는 경우 실온에서 수개월 동안 생존할 수 있다.
본 발명에서 상기 "항생제 내성"은 특정 항생제에 내성을 보여 약효가 듣지 않는 것을 의미하며, 본 발명의 목적상 상기 항생제는 카바페넴(Carbapenem)의 구조를 갖는 항생제일 수 있다. 구체적으로, 아미카신(Amicacin), 앰피실린(Ampicillin), 엠피실린/설벡탐(Ampicillin/Sulbactam), 아즈트레오남(Aztreonam), 세즈타지딤(Ceftazidime), 세파졸린(Cefazolin), 에르타페넴(Ertapenem), 세페핌(Cefepime), 세폭시틴(Cefoxitin), 세포탁심(Cefotaxime), 젠타마이신(Gentamicine), 레보플록세신(Levoflocacin), 메로페넴(Meropenem), 피페라실린/타조박탐(Piperacillin/Tazobactam), 코트리목사(Cortrimoxa), 및 티게틸린(Tigecyline)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 본 발명의 목적상 상기 클렙시엘라 뉴모니아는 항생제 내성을 갖는 것일 수 있고, 상기 항생제 내성은 상기 카바페넴을 분해하여 효과의 발휘를 억제하는 카바페넴아제 효소(carbapenemase)를 생산함으로써 발생될 수 있다.
또한, 본 발명에서 상기 “박테리오파지”는 세균을 숙주세포로 하는 바이러스 일군의 총칭으로, 숙주에 감염된 후 증식하여 자손 파지를 방출하는 용균성을 갖는 회로 또는 숙주 염색체와 공존한 상태에서 숙주는 생존하고, 파지 DNA는 복제하는 회로를 갖는다. 본 발명의 목적상 상기 박테리오파지는 전체 게놈 크기가 59100bp 의 서열번호 1로 표시되는 유전체로 이루어진 것일 수 있고, 서열번호 2 또는 3으로 표시되는 유전체를 포함하는 것일 수 있다. 구체적으로, 상기 서열번호 2 또는 3은 상기 박테리오파지의 ORF(Open reading frame)로, 상기 클렙시엘라속 균에 흡착 및 용균의 기능을 수행하는 단백질 중에서도 특히 홀린(holin) 및 엔돌리신(endolysin)을 코딩하는 유전체를 표시하는 염기 서열일 수 있으며, 보다 상세하게는 상기 서열번호 2는 ORF48로 홀린을 코딩하는 유전체의 염기 서열이고, 서열번호 3은 ORF49로 엔돌리신을 코딩하는 유전체의 염기 서열이다.
또한, 본 발명에서 상기 박테리오파지는 시포비리데(siphoviridae)에 속하는 박테리오파지일 수 있다.
단, 본 발명에서 상기 “시포비리데(siphoviridae)”는 박테리오파지를 전자현미경을 통한 형태 관찰에 의해 분류 및 동정하는 방법에 의해 분류된 것으로, 수축성이 없는 수축성이 없는 긴 꼬리(a long non-contractile tail)를 갖는 복합형의 형태를 나타낸 것일 수 있다.
본 발명의 다른 구현 예는 본 발명에 따른 상기 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP를 유효성분으로 포함하는 항생제 내성 클렙시엘라속 균 유발성 질환의 예방 또는 치료용 약학 조성물을 제공한다.
본 발명의 약학 조성물은 1 × 103 내지 1 × 1010 pfu/㎖의 박테리오파지를 포함하며, 바람직하게는 1 × 106 내지 1 × 109 pfu/㎖의 박테리오파지를 포함할 수 있다.
본 발명의 약학 조성물에 포함되는 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP는 상술한 바와 같이, 항생제 내성 클렙시엘라속 균, 바람직하게는 카바페넴 내성 클렙시엘라속, 보다 바람직하게는 카바페넴 내성 클렙시엘라 뉴모니아를 특이적으로 사멸시킬 수 있는 용균능 및 흡착능이 존재하므로, 본 발명의 약학 조성물을 사용하는 경우 상기 항생제 내성 클렙시엘라속 균을 용균 및 사멸시켜 인체 내에서 상기 항생제 내성 클렙시엘라 속 균의 감염으로 인하여 유발되는 다양한 질환을 효과적으로 예방 또는 치료할 수 있다.
본 발명의 약학 조성물에서 상기 클렙시엘라속, 유전체, 박테리오파지, 항생제 내성, 시포비리데, 기탁번호, 및 클렙시엘라 뉴모니아에 대한 내용은 상기 박테리오파지에서 기재한 바와 중복되어, 이하 구체적인 기재를 생략한다.
본 발명에서 상기 클렙시엘라속 균 유발성 질환은 패혈증, 폐렴 및 폐기종으로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나인 것일 수 있다. 본 발명의 목적상 상기 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 의해 유발되는 질환은 패혈증, 폐렴 및 폐기종으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "치료"는 (ⅰ) 클렙시엘라속 균 에 의해 유발된 질환의 예방; (ⅱ) 클렙시엘라속 균 에 의해 유발된 질환의 억제; 및 (ⅲ) 클렙시엘라속 균 에 의해 유발된 질환의 경감을 의미한다.
본 발명에서 상기 약학 조성물은 캡슐, 정제, 과립, 주사제, 연고제, 분말 또는 음료 형태임을 특징으로 할 수 있으며, 상기 약학 조성물은 인간을 대상으로 하는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명에서 상기 약학 조성물은 이들로 한정되는 것은 아니지만, 각각 통상의 방법에 따라 산제, 과립제, 캡슐, 정제, 수성 현탁액 등의 경구형 제형, 외용제, 좌제 및 멸균 주사 용액의 형태로 제형화하여 사용될 수 있다. 본 발명의 약학 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함할 수 있다. 약학적으로 허용되는 담체는 경구 투여 시에는 결합제, 활탁제, 붕해제, 부형제, 가용화제, 분산제, 안정화제, 현탁화제, 색소, 향료 등을 사용할 수 있으며, 주사제의 경우에는 완충제, 보존제, 무통화제, 가용화제, 등장제, 안정화제 등을 혼합하여 사용할 수 있으며, 국소투여용의 경우에는 기제, 부형제, 윤활제, 보존제 등을 사용할 수 있다. 본 발명의 약학 조성물의 제형은 상술한 바와 같은 약제학적으로 허용되는 담체와 혼합하여 다양하게 제조될 수 있다. 예를 들어, 경구 투여시에는 정제, 트로키, 캡슐, 엘릭서(elixir), 서스펜션, 시럽, 웨이퍼 등의 형태로 제조할 수 있으며, 주사제의 경우에는 단위 투약 앰플 또는 다수회 투약 형태로 제조할 수 있다. 기타, 용액, 현탁액, 정제, 캡슐, 서방형 제제 등으로 제형화될 수 있다.
한편, 제제화에 적합한 담체, 부형제 및 희석제의 예로는, 락토즈, 덱스트로즈, 수크로즈, 솔비톨, 만니톨, 자일리톨, 에리스리톨, 말디톨, 전분, 아카시아 고무, 알지네이트, 젤라틴, 칼슘 포스페이트, 칼슘 실리케이트, 셀룰로즈, 메틸 셀룰로즈, 미정질 셀룰로즈, 폴리비닐피롤리돈, 물, 메틸하이드록시벤조에이트, 프로필하이드록시벤조에이트, 탈크, 마그네슘 스테아레이트 또는 광물유 등이 사용될 수 있다. 또한, 충진제, 항 응집제, 윤활제, 습윤제, 향료, 유화제, 방부제 등을 추가로 포함할 수 있다.
본 발명에 상기 약학 조성물의 투여 경로는 이들로 한정되는 것은 아니지만 구강, 정맥내, 근육내, 동맥내, 골수내, 경막내, 심장내, 경피, 피하, 복강내, 비강내, 장관, 국소, 설하 또는 직장이 포함된다. 경구 또는 비경구 투하가 바람직하다.
본 발명에서 상기 "비경구"란, 피하, 피내, 정맥내, 근육내, 관절내, 활액낭내, 흉골내, 경막내, 병소내 및 두개골내 주사 또는 주입기술을 포함한다. 본 발명의 약학 조성물은 또한 직장 투여를 위한 좌제의 형태로 투여될 수 있다.
본 발명의 상기 약학 조성물은 사용된 특정 화합물의 활성, 연령, 체중, 일반적인 건강, 성별, 정식, 투여 시간, 투여 경로, 배출율, 약물 배합 및 예방 또는 치료될 특정 질환의 중증을 포함한 여러 요인에 따라 다양하게 변할 수 있고, 상기 약학 조성물의 투여량은 환자의 상태, 체중, 질병의 정도, 약무 형태, 투여 경로 및 기간에 따라 다르지만 당업자에 의해 적절하게 선택될 수 있고, 1일 0.0001 내지 50mg/kg 또는 0.001 내지 50mg/kg으로 투여할 수 있다. 투여는 하루에 한번 투여할 수도 있고, 수회 나누어 투여할 수도 있다. 상기 투여량은 어떠한 면으로든 본 발명의 범위를 한정하는 것은 아니다. 본 발명에 따른 의약 조성물은 환제, 당의정, 캡슐, 액제, 겔, 시럽, 슬러리, 현탁제로 제형화될 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예는 본 발명에 따른 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP를 유효성분으로 포함하는 항생제 내성 클렙시엘라속 균 유발성 질환의 예방 또는 개선용 식품 조성물을 제공한다.
본 발명의 식품 조성물은 1 × 103 내지 1 × 1010 pfu/㎖의 박테리오파지를 포함하며, 바람직하게는 1 × 106 내지 1 × 109 pfu/㎖의 박테리오파지를 포함할 수 있다.
본 발명의 식품 조성물에 포함되는 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP는 상술한 바와 같이, 항생제 내성 클렙시엘라속 균, 바람직하게는 카바페넴 내성 클렙시엘라속, 보다 바람직하게는 카바페넴 내성 클렙시엘라 뉴모니아를 특이적으로 사멸시킬 수 있는 용균능 및 흡착능이 존재하므로, 본 발명의 약학 조성물을 사용하는 경우 상기 항생제 내성 클렙시엘라속 균을 용균 및 사멸시켜 인체 내에서 상기 항생제 내성 클렙시엘라 속 균의 감염으로 인하여 유발되는 다양한 질환을 효과적으로 예방 또는 개선할 수 있다.
본 발명에서 상기 클렙시엘라속 균 유발성 질환은 패혈증, 폐렴 및 폐기종으로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나인 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 식품 조성물에서 상기 클렙시엘라속, 유전체, 박테리오파지, 항생제 내성, 시포비리데, 기탁번호, 클렙시엘라 뉴모니아, 클렙시엘라속 유발성 질환 및 예방에 대한 내용은 상기 박테리오파지에서 기재한 바와 중복되어, 이하 구체적인 기재를 생략한다.
한편, 본 발명에서, “개선”은 본 발명의 식품 조성물을 이용하여 클렙시엘라속 균의 감염으로 인해 발생한 증상이 호전 또는 이롭게 변경되는 모든 행위라면 제한없이 포함할 수 있다.
본 발명의 상기 화합물을 유효성분으로 포함하는 식품 조성물은 각종 식품류, 예를 들어, 음료, 껌, 차, 비타민 복합제, 분말, 과립, 정제, 캡슐, 과자, 떡, 빵 등의 형태로 제조될 수 있다.
본 발명에서 상기 화합물이 식품 조성물에 포함될 때 그 양은 전체 중량의 0.1 내지 50%의 비율로 첨가할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 식품 조성물이 음료 형태로 제조되는 경우 지시된 비율로 상기 식품 조성물을 포함하는 것 외에 특별한 제한점은 없으며, 통상의 음료와 같이 다양한 향미제 또는 천연 탄수화물 등을 추가 성분으로서 함유할 수 있다. 구체적으로, 천연 탄수화물로서 포도당 등의 모노사카라이드, 과당 등의 디사카라이드, 슈크로스 등의 및 폴리사카라이드, 덱스트린, 시클로덱스트린 등과 같은 통상적인 당 및 자일리톨, 소르비톨, 에리트리톨 등의 당알콜 등을 포함할 수 있다. 상기 향미제로서는 천연 향미제(타우마틴, 스테비아 추출물(예를 들어 레바우디오시드 A, 글리시르히진등) 및 합성 향미제(사카린, 아스파르탐 등) 등일 수 있다.
본 발명에서, 그 외 본 발명의 상기 식품 조성물은 여러 가지 영양제, 비타민, 광물(전해질), 합성 풍미제 및 천연 풍미제 등의 풍미제, 착색제, 펙트산 및 그의 염, 알긴산 및 그의 염, 유기산, 보호성 콜로이드 증점제, pH 조절제, 안정화제, 방부제, 글리세린, 알콜, 탄산 음료에 사용되는 탄산화제 등을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 성분은 독립적 또는 조합하여 사용할 수 있다. 상기 첨가제의 비율은 본 발명의 핵심적인 요소에 해당하지 아니하지만, 본 발명의 식품 조성물 100 중량부 당 0.1 내지 약 50 중량부의 범위에서 선택될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 구현 예는 본 발명에 따른 상기 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP를 유효성분으로 포함하는 항생제를 제공한다.
본 발명에서 상기 항생제는, 대부분의 다른 항생 물질들은 대상체인 균주의 내성이 증가함에 따라 갈수록 사용범위가 줄어들 수 밖에 없는데에 반하여, 본 발명의 상기 항생제는 상기와 같은 문제점과 무관하게 사용될 수 있으므로 항생제로 사용될 수 있는 수명이 길어질 수 있다.
단, 본 발명에서 상기 "항생제"는 방부제, 살균제 및 항균제를 총칭하는 의미를 나타낸다.
본 발명의 또 다른 구현 예는 본 발명에 따른 상기 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP를 유효성분으로 포함하는 소독제를 제공한다.
본 발명에서 상기 소독제는 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 대하여 특이적 사멸능을 갖는 박테리오파지를 유효성분으로 하고 있으므로, 병원에서의 감염을 방지하기 위한 병원 및 보건용 도구 등의 소독제로 유용하게 사용될 수 있고, 일반 생활 소독제, 식품 및 조리 장소 및 설비의 소독제, 축산 산업의 축사 소독제로 유용하게 사용될 수 있다.
본 발명에 따른 신규한 박테리오파지는 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 대하여 특이적 사멸능을 가지므로, 항생제 내성 클렙시엘라속 균에 의해 유발되는 질환의 예방 및 치료 목적으로 활용할 수 있다.
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라속 균에 대한 용균성 박테리오파지의 전자 현미경 사진을 나타낸 것이다.
도 2는 본 발명의 일 실시예에 따른 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라속 균에 대한 용균성 박테리오파지의 흡창능을 그래프로 나타낸 것이다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에 따른 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라속 균에 대한 용균성 박테리오파지의 1단 증식 곡선을 나타낸 것이다.
도 4는 본 발명의 일 실시예에 따른 생체 외에서 박테리오파지의 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라속 균에 대한 용균능을 그래프로 나타낸 것이다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에 따른 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라속 균에 대한 용균성 박테리오파지의 pH 안정성을 그래프로 나타낸 것이다.
도 6은 본 발명의 일 실시예에 따른 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라속 균에 대한 용균성 박테리오파지의 온도 안정성을 그래프로 나타낸 것이다.
도 7은 본 발명의 일 실시예에 따른 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라속 균에 대한 용균성 박테리오파지의 전체 유전체 서열분석 결과를 나타낸 것이다.
이하, 본 발명을 하기의 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.
실시예
[실시예 1] 임상검체 분리 및 항생제 내성 균주 선별
세브란스 병원 환자들로부터 환자의 분변 내 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae) 균을 배양하여 분리하였다. 그 뒤, 감수성 결과는 Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI, 2009)를 기준으로 판독하였다. 감수성 시험은 뮬러-힌튼(Mueller-Hinton) 아가를 사용하여 외기 37에서 하룻밤 동안 배양하는 CLSI 디스크 확산 시험방법을 사용하였다. 클렙시엘라 뉴모니아 균에 대한 시험 항생제는 아미카신(Amicacin), 앰피실린(Ampicillin), 엠피실린/설벡탐(Ampicillin/Sulbactam), 아즈트레오남(Aztreonam), 세즈타지딤(Ceftazidime), 세파졸린(Cefazolin), 에르타페넴(Ertapenem), 세페핌(Cefepime), 세폭시틴(Cefoxitin), 세포탁심(Cefotaxime), 젠타마이신(Gentamicine), 레보플록세신(Levoflocacin), 메로페넴(Meropenem), 피페라실린/타조박탐(Piperacillin/Tazobactam), 코트리목사(Cortrimoxa), 및 티게틸린(Tigecyline)을 사용하였다. 수집된 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae) 53개 주의 항생제 내성 프로파일은 하기 표 1에 나타내었다. 단, 하기 표 1에서 S, I 및 R은 항균제에 대한 감수성을 평가한 결과로, 'S'는 민감(Susceptible), 'I'는 중간(Intermediate), 'R'은 내성(Resistant)를 의미한다.
숙주 균주 아미카신 엠피실린 엠피실린/설벡탐 아즈트레오남 세즈타지딤 세파졸린 에르타페넴 세페핌 세폭시틴 세포탁심 젠타마이신 레보플록사신 메로페넴 피페라실린/타조박탐 코트리목사졸 티게틸린
YMC15/09/P488 ≤2 (S) ≥32 (R)
YMC15/09/P546 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC15/09/U2874 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≤1 (S) =8 (R) ≥16 (R) ≥16 (R) 40 (S) ≥8 (R)
YMC15/09/N45 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/09/P756 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≤1 (S) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≤40 (S) ≥8 (R)
YMC15/09/N55 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/09/T741 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≤1 (S) ≥8 (R) 10 (R) ≥128 (R) ≤40 (S) ≥8 (R)
YMC15/09/U4318 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≤1 (S) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≤40 (S) ≥8 (R)
YMC15/09/P860
YMC15/09/C1052
YMC15/10/N12 6 (R) 6 (R)
YMC15/10/U1383 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≤1 (S) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≤40 (S) ≥8 (R)
YMC15/10/P776 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC15/10/N150
YMC15/11/N1073
YMC15/11/G57 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 25 (S) 2 (S) ≥64 (R) ≥64 (R) ≤1 (S) 4 (I) 29 (S) ≥128 (R) ≤20 (S) ≤0.5 (S)
YMC15/11/B4059 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC15/11/U2284 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 =8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC15/11/N45 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/11/N53 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/11/N54 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC15/11/N96 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/11/N98 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/11/N101 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/11/N107 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/11/N115 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/11/N137 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≤1 (S) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≤40 (S) ≥8 (R)
YMC15/11/R3218 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC15/11/N154 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC15/11/R3705 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC15/11/G223 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC15/12/P746 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≤1 (S) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≤40 (S) ≥8 (R)
YMC15/12/C910
YMC16/01/R859 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC16/01/N136 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/01/N133 ≤2 (S) ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/01/N141 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/01/N164 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/01/N233 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/01/N359 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/01/R3917
YMC16/01/R3958 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥16 (R) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC16/02/B372 ≤2 (S) ≥32 (R) ≥32 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 ≥8 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥64 (R) ≤1 (S) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R) ≥320 (R) ≥8 (R)
YMC16/02/N11 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/02/N162 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/02/N394
YMC16/02/N393
YMC16/02/N499 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/02/N726 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/03/N942 ≥8 (R) ≥16 (R)
YMC16/04/R1602 ≤2 (S) ≥64 (R) ≥64 (R) ≥32 (R) 8 (I) ≥8 (R) ≥16 (R) ≥128 (R)
YMC16/05/N235
YMC16/05/N151 ≥8 (R) ≥16 (R)
상기 표 1에서 보는 바와 같이, 수집된 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae) 중 53개 주에서 항생제 내성을 가지며, 특히, 클렙시엘라 뉴모니아 YMC15/11/N54는 카바페넴 분해 효소인 bla KPC 유전자를 갖는 다재내성 균주임을 확인하였다.
[실시예 2] 박테리오파지 검체 수집
2-1 파지 은행 구축을 위한 검체 수집
세브란스 병원의 하수 처리시설에서 최초 침전지 거친 후 부유물질 및 침사물이 제거된 원수를 확보하였다. 이는 화학 처리 시설 전 단계의 하수로 제한하였다. 수집한 시료에 1L 당 염화나트륨 58g을 첨가한 후 10,000g에서 10분간 원심 분리하여 220nm 밀리포어 필터로 여과하였다. 얻어진 여과액에 폴리에틸렌글리콜(PEG, 분자량 8000)을 10% W/V으로 첨가하고 4에서 12시간 동안 냉장 보관하였다. 12시간 냉장 보관된 여과액을 12,000g에서 20분간 원심 분리하여 침전물을 파지 희석 완충액 (SM 완충액)에 재부유한 뒤, 동일한 양의 클로로포름을 첨가하여 냉동 보관하였다. 이를 3회 반복하여 300mL의 박테리오파지 부유액을 채취하였다.
2-2 용균성 파지 선별 및 용균역가 측정
용균성 파지의 분리 정제는 스팟 테스트(Spot Test)법 (Mazzocco A et al. In Bacteriophages, Clokie and Kropinski AM, eds. Humana Press. 2009)으로 실행하였다. 확보된 균주를 맥콘키 한천배지에서 접종 후 외기 35에서 하룻밤 동안 배양하였다. 배양 후, 투명한 플라크 형성을 보고 파지에 감수성인 균주를 선별하였다. 감수성인 균주를 맥콘키 한천 배지에 접종하여 35에서 12시간 동안 배양하였다. 살린 1ml 튜브에 McFarland 0.5 탁도로 각 균주의 현탁액 제조하고 H 탑 아가 (3 ml), 감수성 박테리아 100 ㎕ 및 파지 용액 (각각 1 ㎕, 10 ㎕ 및 50 ㎕)을 섞어 LB 아가에 도포한 후, 35에서 12시간 동안 배양하였다. 플라크 관찰한 후에 파스퇴르 파이펫으로 플라크를 채취하여 SM 완충 용액에 희석하고, 다시 감수성인 균주 현탁액을 이용하여 3회 반복 정제하였다. 이렇게 얻어진 순수한 박테리오파지는 SM 완충 용액에 희석하고 다시 감수성인 균주 현탁액을 이용하여 3회 반복 정제하였다. 이렇게 얻어진 순수한 박테리오파지는 SM 완충 용액에 희석하여 보관하였다.
실시예 1에서 확인한 항생제 내성 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae) 53주 각각을 맥콘키 한천배지에서 접종하여 배양한 후, 상기 과정에 의해 정제된 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP를 도말된 각각의 내성 균주에 5 ㎕로 접종하여 플라그 형성을 확인하고, 역가 범위를 확인하여, 용균성을 하기 표 2에 나타내었다.
단, 상기 표 2에서 + 및 -는 수집된 균주에 대한 플라크 활성을 평가한 것으로, '+'는 투명한 플라크(clear plaque)를 의미하고, '-'는 용균이 일어나지 않은 것을 의미한다.
숙주 균주 용균 여부 숙주 균주 용균 여부
YMC15/09/P488 + YMC15/11/R3218 +
YMC15/09/P546 + YMC15/11/N154 +
YMC15/09/U2874 + YMC15/11/R3705 +
YMC15/09/N45 - YMC15/11/G223 +
YMC15/09/P756 + YMC15/12/P746 +
YMC15/09/N55 + YMC15/12/C910 +
YMC15/09/T741 + YMC16/01/R859 +
YMC15/09/U4318 + YMC16/01/N136 +
YMC15/09/P860 + YMC16/01/N133 +
YMC15/09/C1052 + YMC16/01/N141 +
YMC15/10/N12 + YMC16/01/N164 +
YMC15/10/U1383 + YMC16/01/N233 +
YMC15/10/P776 + YMC16/01/N359 +
YMC15/10/N150 + YMC16/01/R3917 +
YMC15/11/N1073 + YMC16/01/R3958 +
YMC15/11/G57 + YMC16/02/B372 +
YMC15/11/B4059 + YMC16/02/N11 +
YMC15/11/U2284 + YMC16/02/N162 -
YMC15/11/N45 + YMC16/02/N394 +
YMC15/11/N53 + YMC16/02/N393 +
YMC15/11/N54 + YMC16/02/N499 -
YMC15/11/N96 + YMC16/02/N726 -
YMC15/11/N98 + YMC16/03/N942 +
YMC15/11/N101 + YMC16/04/R1602 +
YMC15/11/N107 + YMC16/05/N235 +
YMC15/11/N115 + YMC16/05/N151 +
YMC15/11/N137 +
상기 표 2에서 보는 바와 같이, 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP는 항생제 내성 클렙시엘라 뉴모니아 53주 중 49주(약 92%)를 용균 시키는 것을 확인할 수 있었다.
[실시예 3] 항생제 내성 클렙시엘라 뉴모니아균에 대한 용균성 박테리오파지의 전자 현미경 분석
상기 실시예 2의 방법에 의해 정제된 박테리오파지를 감수성 균주 배양 배지(20ml LB 배지)에 접종 및 배양한 뒤 220nm 밀리포어 필터로 여과하고, 상청액에 폴리에틸렌글리콜(MW 8,000)을 10%(w/v)의 양으로 첨가한 후 밤새 냉장 보관하였다. 이후 12,000g의 조건으로 20분 동안 원심 분리한 뒤, 에너지 여과 투과 전자현미경(Energy-Filtering Transmission Electron Microscope)을 이용하여 박테리오파지의 형태를 분석하여, 그 결과를 도 1에 나타내었다.
도 1에서 보는 바와 같이, 본 발명에 따른 상기 YMC15/11/N54_KPN_BP 박테리오파지를 모양으로 분류하는 기준으로 보았을 때, 파지가 수축성이 없는 긴 꼬리(a long non-contractile tail)를 갖고, 시스(sheath)가 없으므로 시포비리대(Siphoviridae)에 속하는 것으로 분류하였다.
[실시예 4] 박페리오파지의 흡착능 및 1단 증식 곡선(One-step growth curve) 분석
항생제 내성을 갖는 클렙시엘라 뉴모니아균을 OD 값이 0.5가 되도록 배양한 뒤, 클렙시엘라 뉴모니아균에 상기 실시예 2에서 정제된 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP를 MOI 0.001로 넣고 상온에서 배양한 뒤, 100ul 시료를 1, 2, 3, 4, 5분에 1ml씩 채취하여 LB 배지에 희석한 뒤 플라그 분석을 통해 상기 박테리오파지의 흡착능을 평가하여, 그 결과를 도 2에 나타내었다.
또한, 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라 뉴모니아균을 OD 값이 0.3이 되도록 배양한 뒤, 4에서 5분 동안 7,000g로 원심 분리하여 세포를 침전시킨 후, 0.5ml의 LB 배지에 희석시키고, 상기 실시예 2에서 정제된 박테리오파지를 MOI 0.001(titer 108 pfu/cells)를 넣고 37에서 5분 동안 배양하였다. 배양된 혼합 시료를 13,000g에서 1분 동안 원심 분리하여 얻어진 펠렛을 10ml의 LB 배지에 희석시키고 37℃℃에서 배양하였다. 배양 도중 10분 마다 시료를 채취하여 플라그 분석을 통해 상기 박테리오파지의 1단 증식 곡선을 평가하여, 그 결과를 도 3에 나타내었다.
도 2에서 보는 바와 같이, 상기 YMC15/11/N54_KPN_BP 박테리오파지의 접종 후 5분 이내에 박테리오파지의 99% 정도가 클렙시엘라 뉴모니아균에 흡착하였다.
또한, 도 3에서 보는 바와 같이, 1단 증식 곡선 결과 71 PFU/감염 세포의 높은 버스트 사이즈를 나타내었다.
상기 결과를 통해 본 발명에 따른 상기 YMC15/11/N54_KPN_BP 박테리오파지는 항생제 내성을 갖는 클렙시엘라 뉴모니아균에 매우 빠른 시간 내에 흡착할 수 있고, 현저하게 높은 버스트 사이즈를 나타내 항생제 내성 균주의 용균 효과를 발휘하는 것을 알 수 있다.
[실시예 5] 생체 외 항생제 내성 클렙시엘라 속 균에 대한 박테리오파지의 용균능 검증
항생제 내성 클렙시엘라 뉴모니아균 1 X 109 CFU/ml에 준비된 박테리오파지 YMC15/11/N54_KPN_BP를 1 X 108 CFU/ml(MOI: 0.1), 1 X 109 PFU/ml(MOI: 1), 1 X 1010 PFU/ml(MOI: 10)의 양으로 각각 처리하고 시간 별로 OD 값(파장 600nm)을 측정하였다. 단, 음성 대조군으로는 PBS+SM 버퍼를 처리하여, 그 값을 도 4에 나타내었다.
도 4에서 보는 바와 같이, 음성 대조군과 비교할 때, 클렙시엘라 뉴모니아균에 대하여 박테리오파지를 처리한 경우 OD 값이 감소하였고, MOI 값이 증가할수록 OD 값은 더욱 감소하였다.
상기 결과를 통해, 본 발명에 따른 박테리오파지는 항생제 내성 클렙시엘라 뉴모니아균에 대하여 용균성을 갖는 것을 알 수 있다.
[실시예 6] 항생제 내성 클렙시엘라 속 균에 대한 박테리오파지의 안정성 평가
본 발명에 따른 YMC15/11/N54_KPN_BP 박테리오파지가 온도 및 알칼리에서 파괴되지 않고 안정성을 유지하는지 확인하였다.
상기 실시예 2의 방법에 의해 정제된 박테리오 파지 1 ㎕를 4, 5, 6, 7, 8, 9 및 10의 pH로 맞춘 SM 버퍼 40 ㎕에 넣은 뒤, 37℃에서 1시간 동안 배양한 뒤 항생제 내성 클렙시엘라 뉴모니아균과 함께 상기 실시예 4의 방법으로 플라크 분석을 실시하여 그 결과를 도 5에 나타내었다.
또한, 상기 박테리오파지 용액을 각각 40℃, 50℃, 60℃ 및 70℃에서 배양하는 1시간 동안 10분 단위로 각각의 샘플을 클렙시엘라 뉴모니아균과 함께 상기 실시예 4의 방법으로 플라크 분석을 실시하여 그 결과를 도 6에 나타내었다.
도 5에서 보는 바와 같이, 본 발명에 따른 상기 파지는 pH 7에 해당하는 중성에서 가장 안정성을 나타내었고, 14일 동안 상기 파지는 알칼리성에서 좀 더 안정성을 나타내었다.
또한, 도 6에서 보는 바와 같이, 상기 파지는 40℃에서는 20분까지 약 40%의 PFU를 유지하였으나, 그 이상의 온도에서는 활성도를 나타내지 않았다.
[실시예 7] 항생제 내성 클렙시엘라 속 균에 대한 박테리오파지의 전체 게놈 서열 분석
본 발명에 따른 상기 YMC15/11/N54_KPN_BP 박테리오파지의 특성을 규명하기 위하여 전체 유전자 서열 분석을 Illumina sequencer(Roche)를 통하여 통상의 기술자에게 자명한 전체 게놈 서열 분석 방법을 기초로 분석하여, 그 결과를 도 7 및 하기 표 3에 나타내었다.
유전체 번호 범위(Range) 개시코돈 스트랜드(strand) 길이(bp) 추정 기능
(Putative function)		 주석 출처
(Annotation source)		 E-value NCBI blastP identity (%) NCBI-Bank accession number
시작 종료
ORF1 939 1136 ATG + 186 　 　 　 　 　
ORF2 1139 1504 ATG + 366 　 　 　 　 　
ORF3 1779 1991 ATG + 213 putative DNA binding protein Salmonella phage 35 1.00E-14 53% AKJ74148.1
ORF4 1779 1991 ATG + 213 - 　 　 　 　
ORF5 2154 2807 ATG + 654 putative tail component K-like protein Salmonella phage 35 9.00E-08 43% AKJ74149.1
ORF6 2797 3048 ATG + 252 　 　 　 　 　
ORF7 3057 3182 ATG + 126 　 　 　 　 　
ORF8 3199 3405 ATG + 207 　 　 　 　 　
ORF9 3402 3701 GTG + 300 　 　 　 　 　
ORF10 3713 4057 ATG + 345 　 　 　 　 　
ORF11 4205 4735 ATG 　 531 　 　 　 　 　
ORF12 5087 5200 ATG 　 114 　 　 　 　 　
ORF13 5214 7805 ATG - 2592 　 　 　 　 　
ORF14 7802 8083 ATG - 282 　 　 　 　 　
ORF15 8314 8706 ATG + 393 RecT protein Salmonella phage 37 2.00E-04 64% YP_009221371.1
ORF16 8818 9111 ATG + 294 　 - - - -
ORF17 9104 10453 ATG + 1350 exonuclease Burkholderia phage AH2 1.00E-86 38% YP_006561159.1
ORF18 10500 11138 ATG + 639 　 　 　 　 　
ORF19 11205 13247 ATG + 2043 DNA polymerase I Salmonella phage FSL SP-124 0.00E+00 78% JX296113.1
ORF20 13286 13582 ATG + 297 VRR-NUC domain-containing protein Salmonella phage SPN19 2.00E-51 79% KU927500.1
ORF21 13629 15116 ATG + 1488 Salmonella phage FSL SP-030 complete genome 2.00E-163 75% KC139519.1
ORF22 15100 15669 ATG + 570 endonuclease Staphylococcus phage SA1 5.00E-95 87% GU169904.1
ORF23 15659 17734 ATG + 2076 RecT family recombinase Salmonella phage FSL SP-030 0 79% YP_006990312.1
ORF24 17737 17997 ATG + 261 head-tail joining protein lambda W Salmonella phage FSL SP-019 8.00E-34 80% AGF89268.1
ORF25 17997 19661 ATG + 1665 putative lambda family portal protein B Salmonella phage BP12C 0 77% KM366098.1
ORF26 19685 20998 ATG + 1314 prohead protease ClpP Salmonella phage FSL SP-019 5.00E-173 65% AGF89266.1
ORF27 21011 21400 ATG + 390 decorator protein D Salmonella phage FSLSP030 1.00E-58 76% YP_008239846.1
ORF28 21413 22477 ATG + 1065 capsid protein E Salmonella phage FSL SP-030 0 83% KC139519.1
ORF29 22528 22797 ATG + 270 tail length tape measure protein Salmonella phage 35 1.00E-45 62% AKJ74091.1
ORF30 22799 23164 ATG + 366 　 　 　 　 　
ORF31 23164 23784 ATG + 621 　 　 　 　 　
ORF32 23781 24284 ATG + 504 　 　 　 　 　
ORF33 24298 25437 ATG + 1140 　 　 　 　 　
ORF34 25544 26002 ATG + 459 tail assembly chaperone Salmonella phage Chi 4.00E-53 57% YP_009101119.1
ORF35 26044 26241 ATG + 198 pre-tape measure frameshift protein Enterobacter phage Enc34 7.00E-25 71% YP_007007021.1
ORF36 26234 30547 ATG + 4314 tape measure protein Salmonella phage BP12C 0% 66% YP_009300926.1
ORF37 30551 33337 ATG + 2787 conserved tail assembly protein 　 　 　 　
ORF38 33341 34189 GTG + 849 XRE family transcriptional regulator Pseudomonas phage vB_PaeS_PAO1_Ab18 1.00E-38 30% YP_009125171.1
ORF39 34198 34425 ATG + 228 tail assembly structural protein Pseudomonas phage MP1412 1.00E-08 44% YP_006561081.1
ORF40 34422 34628 ATG + 207 )conserved tail assembly protein Burkholderia phage BcepNazgul 1.00E-07 35% NP_918977.1
ORF41 34628 36913 ATG + 2286 virion structural protein Pseudomonas phage PaMx11 2.00E-111 33% YP_009196285.1
ORF42 36916 37698 ATG + 783 tail fiber protein Providencia phage Redjac 1.00E-13 35% YP_006905987.1
ORF43 37745 40354 ATG + 2610 　 　 　 　 　
ORF44 40359 41453 ATG + 1095 　 　 　 　 　
ORF45 41515 41673 ATG + 159 　 　 　 　 　
ORF46 41803 42129 ATG + 327 　 　 　 　 　
ORF47 42086 42229 ATG + 144 　 　 　 　 　
ORF48 42229 42561 ATG + 333 　 　 　 　 　
ORF49 42574 43158 ATG + 585 endolysin; PP_00051 Erwinia phage PEp14 2.00E-73 66% YP_005098432.1
ORF50 43158 43547 ATG + 390 　 　 　 　 　
ORF51 43544 43807 ATG + 264 　 　 　 　 　
ORF52 43831 44031 ATG - 201 　 　 　 　 　
ORF53 44025 44798 ATG - 774 nucleoside 2-deoxyribosyltransferase Salmonella phage FSLSP088 3.00E-24 45% YP_008239933.1
ORF54 44795 45094 ATG - 300 　 　 　 　 　
ORF55 45091 45387 ATG - 297 　 　 　 　 　
ORF56 45389 45598 ATG - 210 　 　 　 　 　
ORF57 45601 45948 ATG - 348 　 　 　 　 　
ORF58 45952 46464 ATG - 513 　 　 　 　 　
ORF59 46540 47253 ATG - 714 　 　 　 　 　
ORF60 47250 47570 ATG - 321 　 　 　 　 　
ORF61 47572 48321 ATG - 750 putative head morphogenesis protein 　 　 　 　
ORF62 48321 49559 ATG - 1239 　 　 　 　 　
ORF63 49620 50726 ATG - 1107 putative C-specific methylase Escherichia phage K1-ind(3) 1.00E-107 55% ADA82477.1
ORF64 50819 51211 GTG - 393 　 　 　 　 　
ORF65 51189 51452 ATG - 264 　 　 　 　 　
ORF66 51456 51671 ATG - 216 　 　 　 　 　
ORF67 51674 52384 GTG - 711 putative DNA adenine methylase Salmonella phage FSLSP030 6.00E-104 63% YP_008239882.1
ORF68 52377 52697 ATG - 321 　 　 　 　 　
ORF69 52694 53014 ATG - 321 　 　 　 　 　
ORF70 53011 53493 ATG - 483 　 　 　 　 　
ORF71 53483 53890 ATG - 408 　 　 　 　 　
ORF72 53887 54654 ATG - 768 　 　 　 　 　
ORF73 54811 55083 ATG - 273 endolysin Salmonella phage 37 2.00E-22 48% YP_009221448.1
ORF74 55085 55312 ATG - 228 tail fiber protein Salmonella phage 35 2.00E-14 59% AKJ74137.1
ORF75 55314 56384 ATG - 1071 putative recombination-associated protein RdgC Salmonella phage iEPS5 2.00E-162 65% AGF87999.1
ORF76 56374 56706 ATG - 333 　 　 　 　 　
ORF77 56703 57014 ATG - 312 　 　 　 　 　
ORF78 57014 57247 ATG - 234 　 　 　 　 　
ORF79 57240 57686 ATG - 447 　 　 　 　 　
ORF80 57699 58043 ATG - 345 viral integrase family 4 Salmonella phage 37 3.00E-24 45% YP_009221453.1
ORF81 58021 58482 ATG - 462 　 　 　 　 　
ORF82 58542 58919 ATG - 378 RecT family protein Salmonella phage 37 1.00E-28 50% YP_009221455.1
도 7 및 상기 표 3에서 보는 바와 같이, 상기 박테리오파지의 전체 유전자는 59100bp/ GC:56.33%의 linear dsDNA로, 82개의 ORF로 구성되어 있었다. 또한, 본 발명의 상기 ORF 중 용원성 유전자(lysogenic gene) 또는 독성 관련 유전자(toxin related gene)은 존재하지 않았다.
또한, 본 발명에 따른 YMC15/11/N54_KPN_BP 박테리오파지가 용균 효과를 나타내는 단백질을 코딩하는 유전자의 서열은 서열번호 2로 표시되는 ORF48 및 서열번호 3으로 표시되는 ORF49에 해당하였다.
상기 ORF48은 에스케리키아 파지(Escherichia phage) SerU-LTllb의 holin과 34%의 유사성을 보였고, ORF49가 코딩하는 엔돌리신(Endolysin)은 에위니아 파지(Erwinia phage) Pep14의 엔돌리신과 66%의 유사성을 보였으나, 본 발명에 따른 상기 박테리오파지의 전체 서열은 기존의 박테리오파지의 서열과 대조한 결과 유사성을 갖는 박테리오파지는 존재하지 않았다.
상기 결과를 통해 본 발명에 따른 YMC15/11/N54_KPN_BP 박테리오파지는 기존에 발견되지 않은 신규한 박테리오파지에 해당함을 알 수 있다.
이상에서 본 발명에 대하여 상세하게 설명하였지만 본 발명의 권리범위는 이에 한정되는 것은 아니고, 청구범위에 기재된 본 발명의 기술적 사상을 벗어나지 않는 범위 내에서 다양한 수정 및 변형이 가능하다는 것은 당 기술분야의 통상의 지식을 가진 자에게는 자명할 것이다.
한국생명공학연구원 KCTC18572P 20170511
<110> Industry-Academic Cooperation Foundation, Yonsei University <120> LYTIC BACTERIOPHAGE SPECIFIC FOR KLEBSIELLA GENUS RESISTANT TO <130> DPB172741 <160> 3 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 59100 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> Klebsiella pneumoniae bacteriophage YMC15/11/N54_KPN_BP <400> 1 atggccaccg tggcgccgca ggaattttac ctcaaggatt gccgggcatg gccaccggtc 60 aggcccatgg cgccgacctg gctggcgcgg cccgccgccg ggtttcagcc tgccagcttt 120 ttcaagtaag cgcgcaccgc taaaaatttt cagcccgcta ggtttgccaa gtaaggaagc 180 ccaaaatttt tatagaaaat ccggatttcg gcgtccccat ggatcccgaa aaaggtgcga 240 tttctgtaaa ccattgattt tattggttcc gcggggatgg cgccgatggg gcggaaaggc 300 cagcaagcca ggcgtggcgc gggttgcatg ggtatagatc cccgttgggt gacggcgtgg 360 cggcgcgccc tggggtgacg cggaaagcaa aaatgaaata aatctgcatc gaggggttgc 420 acacggaatg agtgcaagtt atgtttatcg aacccggcgg ggatacgcga acaacgaaac 480 aacataaacg aggtaaacga aatgaaaaag attaaacgtc tggcactgtc ctggtctgtc 540 tcccgcggtc gtgacactta cggctacaac atttgccgcc ttgatgacac atcaaccgga 600 gaccgcttta aatgcatggg cggcgggtat gacatggtag ggacggtgtt cggtgactgg 660 ctggccgcaa actatcagcc tgaattgttg gcgctgaaag atcgcgctgg ggccgtgtgg 720 gaagaggcgg gcggccgtaa atcggcggac cgcgcggacc gcctatacgg catggtatac 780 cgggaaaaag atagcgtagt tatccttgat ggcgcttgcg ggcttgattg catgatccgc 840 attgctgagg ctatcgggct ggaagtggag cgcgattata tcgctaaagg ccgccgccgg 900 ggtgagactg tgggctggta tgtaagcgag gccgaataat gataacaata atgtttatcg 960 gttatttcat tatcggcgtt tatatcgggg cggacgtccg ccgcgtttta aagcgttgcc 1020 gtattgagcg ccgcccgtgt tttggtcgca tgactattta tttgcgtgaa cgtaagaccg 1080 gacggttgat cggctgttct aataacattt tcactttaat tttgcagggg tcttgatcat 1140 gagaattaaa atagaatcgc ataaatatgc gccggaatta aaccgcgttt atttaaccgg 1200 aaaaaattca tcgagcgcgg cggtactccg cgccccgtcg gtaacgtccg taaaagatgc 1260 ccgcgcggcg ttattcccta aagcgcttcc attccgccgg gttgtaaccg tggaatcata 1320 ttatgatgat cctcgttttt acgggcttgg ccgccgctat tccggaaccg tggattcata 1380 cgaacatctt aaaaacgtga tcgctaacat taaagcccgt aacactgggg ggccgctgtt 1440 agatgggtcg 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ctggtccttt gaggctgatt ttgctttctg cctggatcgc gagctggacc 2340 gctacggcgt gaacaaatca gcggaggcgt attgcgtcgc tgataaccgc cgcccgtccc 2400 acgtaaaccg cgcggactac gcaacggacg ccgaatacag cgccgcgaag gtggcgtttt 2460 atgcgcatat actccgatcc ctgtggtccg tacgcgggaa cagcatttac cgtcgccagg 2520 taaagaaaac cattaaatca ctgcgagact ggaaagcggt cgcacgcaag gacgcggacg 2580 ccgccggggt ggcggcggta ttcggtaacg ccctcatggt taaacccgtc aaaatcacta 2640 cggcgggcgg aatgaccctt atcgcctcgc aatccgatat aaagatctac ccggctttaa 2700 tgcgcctaac ggcattgtgg gatatgcgcc acggcctaac ccgtgacacg cattacaacc 2760 attctctgcc gttccactgc atcgcgggga ttgaatatgc gggctaacga tattcgccgg 2820 gcgcaagccc gttacaccat ggaaaaatgg cacgggaatt tagtcgccaa aggctttaaa 2880 gcggctggcg atctgctgta tagccgaaat gatgccgatc taacgtggga tgacaaggcc 2940 cgcgcctgga cggtgactat ctggaccacc gaggggcggg accgtctcaa agtgctaact 3000 attcgcaaaa atccggtttt accggcgtta cttaaatctt ttttctaggg gtatctatgt 3060 tcgcattccg tgatgttctg gaagtcgttt taccggcggt aatgttcgcc gtggcgcttg 3120 tcgtcatttc 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tcatttccgt ttttccttct gtcgtgacac 53040 gaactggact ggggtgacga cctcaccgaa attcgggtaa cggctgcgca ccagctcaag 53100 ggtcagcggg ttgatctccg cacgcggcgt cttcacgtcg tacgcgcggt ccgggatgtc 53160 gatgcggcgc atgtacgtcg gtcgcatccc gacgcgtacg gcgtagttat acgcttcctt 53220 cgggccgttc gcccagacca cgaagccgac cccgcggcgc tgcagataat atgcctgcgc 53280 cgtattggag tcatcgcgag gcagattttg tggtatcgcg ggaaaacggg cgctacttcc 53340 tttcacggtt cctgtatacc aattggtcga agcatggcgt tcttccgaac actccggcgg 53400 gtacgggtca ttgatatccc acgtctttcc gcaccaggaa cagaacacct ggtccgattg 53460 ctggatagcg tttttgtggc cgttagtttc catcggtgtc ctccatcatc caggacggcc 53520 atacgccatc gcggatcatc tggcgctggg ccttccagtc ggcctgcgcg agttctttaa 53580 ctcgggtccg gatgacagcg tcgggcataa acgccgtcat tactttcgtc aggaaaactt 53640 tgttgtaggg gtcctccacg cggcagttta acgcccgggc gcaggactgg atcgccgcct 53700 tatcattgcc gtgttctttc atgcacagca tgagcgtaac gatcatgtct atcgcctcgg 53760 cgatatcccg gcacgctttc ttttctggcc cgtggacctc aatggaaata ctggtcgccg 53820 ggaataacag gtggtctttg tacgggcgca gccagtccgc tttcgcccgg tcttctgcgc 53880 tggtggtcat acttcgatgt cctcttcccg gatcagctgc agggcgttgc cgttcactgc 53940 ccacggttgc cacacgtcca ccaccagcgc cgcacggaat gaccggttga agcagttctc 54000 gatcatcgcc cagttatcgt ccggacggtc tgacgcaatg ccattgcgtt cccagtgcca 54060 ctggcgaggc gcctgggcca gctcgcggag gggcgggcgg gggtgtgagt agggattgca 54120 caggccggaa cgcagcaggc cacgctggag ccatgagcgc tgccaccaga ggtcacagcg 54180 ggtcgacccg acggcgtatt cctcttccag catgccgcac atgatcagcg cgcacacagt 54240 atcgcgtggc gccggcgcac cgatgaggtc gaaatcctcc agcctcttcg ccaggcggtc 54300 ggcggaccct tcgtcctgcc cgttgccgtc ggtacggtca tgcagaatta catcgaggat 54360 gatggccgga aaaacgactt gtttgccgtt gcgggtaaag cgggggtccg gctcattgaa 54420 gagggcgtga tacagccgcc cgaaccactc cgacaggtca ggcacgaagt cggcgatatc 54480 cggccagctg cgttcctctg tgttgtggat gcgcacggac gtctcttcct ctatcgggtc 54540 gtactcgacg cggacgatgc agcgcgggcc gtgcgggagg ggaaaaatgt agatggtctg 54600 tttgccgatt cgattctggt caaagcggcc aaacgacatt agatgcttct tcatgggatg 54660 ttcctttttg tggactccca agaaatgtag ctgaacacga ttcgtgtgtc aaacgctttc 54720 tgcaggcaaa aaagaagccc ggacaaagcg tgccgggctt taatgtcagt ggaacaccga 54780 gcatgaagat ttcatcccat gtcccgatca ctatacgtca ggattgcgat aaatcaaatc 54840 ccagtaggtg aatgtttcca ggtcgacttc cgtccagtcc gggtcgtcca ggtacgacag 54900 gcaggtgccg gcatcctcgg cgcagacctg cccggcggcc gcattatgca gcaggcggac 54960 ttcccggaaa tagatgaacc actcgcggca tggcgtatag gactcgggct gacgggtctt 55020 gatgatctgg cccgtctttt tgtcctgcca gtacgccgtc cgtttcttcg ccaggtagcc 55080 catatcagcc caccctcatg acgcgggatc ccatgcggcc gtaaatcggg tcgcgcagca 55140 cccagcggat agccagctta taccccaact ggtaccccag gcgccgcacg tagcccaggt 55200 ccgcaggccg cttgccgctc acgaagaagg actcgccgac agccatagcg ccaagcaggc 55260 gtttatgctc ggcgatatgg gggttcggtt tagcgtgttt acggcctgcc atgtcacacc 55320 tcgtcgtcgt cttccagctg cgcgtcgacc tcaaccgtga tgtccatctt atcgcggaag 55380 acgtcaatga cgtcctgcag cgacagcacc gtctggaaca ggttggccat gtaggtcagg 55440 aacgtaccgc tgtcattgtt gtagcgctcc agcgtggctt cgtagttggc gtcaacatcc 55500 gcctcgccga tgtggatccc ggagatgatc gccttgtcgg taaggcggaa gaacacgttg 55560 cccacgcccg ggcgcatctc gccttcgtcg attcgcatgt tcagcgcccg aaccgtgtaa 55620 tgccgcgcca ggtagtcgag gaccacttcg tccttgtgga tgtcaatgtc cttgaacttc 55680 acgtcatcgc catcgtcgtg cttgatgtgg atgaagtcct cgccggtgac accctcgatg 55740 tcgccgcgta cgaccttctc cattgactga cgcagcacga agtcattgat cagcaggtgt 55800 tccactggcc aggtaccgaa cgcggcacgc agtagggagt taatctcttc ggcggtcctg 55860 gcgctggtgg tgaacacgta gacgtacggg acggcgatga tcacgttgta gcgggtcggg 55920 cggataggcg cggttttcag catttcggct tcaacatcgt ctttcagctg cgcccagtct 55980 ttccgggtcg gctcccagcc ttcaatctct ttctcgcgcc aggtgtccat acgcttcgtc 56040 acttcgttgc gcacgctgac gccgggcagc acgcgttcac gcttttcggc ctgcagcacg 56100 atggcgttag tacccgggat gcccatggca aacttgccgc ccacgtagtc cgcgtacggc 56160 gcaaagccaa tcgtcttata gccgatcggg tctttcactt catgcttcgc cagcagatcg 56220 ctcacacggc cggcggcgaa ttcatggacc gacatttcgt ccatgttcgg cgtgttcagc 56280 agcgtgcggt ggaaactttt taccgacttc tcgccagcgt ttgcggcgcc 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ctctttgtgc ttcattggtc 57180 ggcggttacg tttggtccag cggcgtatcc agttttcgcc gcggcggtgt acgaggctat 57240 cattcatcac ggttccctcg catggcatcg cgcaggtctt tcggcgggta gattttattg 57300 acgccatcac cttcacgcag gaaacggatt aacatggcca gggtctgcac gatctcttct 57360 tcgacatgga cccaggtatc acggcgctcc gcgtaatgca ctgctgcctt gatcacctcg 57420 ccggcctctt ccgagaattt cagcatggtg taattcggct gcgggtattt ttcgatagcc 57480 cgggccgatt cggctcgtgc ctggtcgacg aggatatcga aataatcggc cttcgcttcc 57540 gcctgcgaat tcatctgcag gtaaaagatg gccagcgtcg tgaggaattc cgggctggcg 57600 aaagtgatgt ccccacggcg taccgcatcg cgataccggg cgacgctttc cgggttgact 57660 tctctgaact cattttcatt tgacatgggg tttccttctt agtgtttttc gccagcaatc 57720 tccgccagta cggcagcgac ttccggcgtt ggcatgtggg tgttagccca gtacagcagc 57780 ccgatgatgt agtggatcat ctgaccgacc tctgccgcgc cgcgggcttt tccgcctttg 57840 gctttcgcat aatcgccttc gctgaacagc actttgccgg taccgcggta gccaacaatg 57900 gccgaaccgg tatgcgtgac gtaaatggcc acggcgtatt tgtcttccag ggatcgaaac 57960 gccgggccag cgtcgagtcg tttgcgcggc gccgcaacgc ggttcaccgc cagcgcgaca 58020 ttactcggtg tcgggttttc cattgagcgg ctctccgttc agggtgtaga tgacgacgcc 58080 cggcacgctg acgtcgatcg acagcgatgg cacaaagccg gacatgacgt tctgcggggt 58140 gatggtggcg cgtttcaggc cgttctcgta catgatgttc gcgatgcctg ccatgacgga 58200 cttctccacg atgttctggt tcgtctcttc gcgcatggtc agcagctgtt tcaactcttc 58260 gacttcattt ggaatgtcaa aggtatgctg taacatccgg ataagcgtaa tggcatcatc 58320 acgggtgatc ggggtcagta gctgggcata agcagggtca atatggtcga tcatgatctc 58380 gccatcctgc tgtcctggct tacggtaggt atgcaggact cgcgctaact cagggtagcc 58440 gggcataatt tccgacgttt tcctttggtc atcatatgac atagggtgtc tccgggtgaa 58500 aagggtggta cggcaaaaaa gaggtgccgc gtcctacagg attaaacttc gtcgtcttcc 58560 ggtgtgccgg cgccgtcatc aacgcgcttg atcgccacct ggataaacgc acggcccgac 58620 gggtacatga ccagcgccgt ttccagtgag aactgactat tgcaggcccg tttggcgtta 58680 cgcagggaag acgacacgcc gttacgcatt ttgtagcgca gcgccgtggc ttcggtctgc 58740 aggtctgcca gcgccttgct gctgtccagc tcctgcgcat aaacgtagac ctcgcccggc 58800 ttgaggccga tcaggttgcc agtgatactg ttagcccgga tacctgacgg cagttccacg 58860 tccgtctcca tggtcatcat ggccggcgtc aggtcatcca ggataatcgc gtcgttcatc 58920 ggtattctcc gtcgttaaat ttgcgtatct gtcacgctga aagatagttg catacgttcc 58980 gtgtgtcaat cgttttcact gaacgacaac ctgccagctt tttcaagtaa gaaatttcag 59040 ccggctaact ttttgaagta agacccgaac cgctatggcg ccggccatgg ttattacggg 59100 59100 <210> 2 <211> 333 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> Klebsiella pneumoniae bacteriophage YMC15/11/N54_KPN_BP ORF 48 <400> 2 atgtctgcct tcgcattttc ggataccatc atcacgacct tgccggatag cccggcattc 60 cttttcatca cccatacatt cgctattttc aacgttcttc tctgcctgtc tatcgtgtgg 120 cggctgttca ctttccagcg gaaaggggcg cgccaccgtt tagcaggcgg cgtgatcgcc 180 atgttgctga tggtctttta catgtggaca ccgttccagt tcgtgctggg acgcgtggcc 240 attgtggact gggcgaccgt cggtattaac tgcatcgtct tcatcgcgat attccgggcg 300 cggggaaatg tgatgcaact attcaagtcg tga 333 <210> 3 <211> 585 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> Klebsiella pneumoniae bacteriophage YMC15/11/N54_KPN_BP ORF 49 <400> 3 atgtcgctat cggatgacga gtaccagaag gccgcggcga agatcggaat cagtgtacct 60 gcgctgcggg cattcgcgga agtggaaagc aatggcagcg gctttatcga tggcaaacgg 120 ccaaaagttc agtatgagcc gcatgtgatg tatcagcggc tgaaagagaa cctcggggtt 180 agcgttgcta atggtgcgct gcggaaatgg cctgacctgg tggctaccaa acccggcagc 240 tatcagtcgc tgaacaagga agatcaggac atggaccggg cggccaaaga gattgaccgc 300 acaagcgcac tggaggccgc cagctggggg gcgtttcaga ttatgggcta ccactggaag 360 acttgcggat acccggtgct gcaggcattc gttaacgcgc aatactccga ggctgggcag 420 ctggacacac tggtccggtt cctgcgtgca tcgccggcca tcgtatctgc ggtcaaaagc 480 aagaactggt cgaaggcggc gcagctgtac aatggcccgg cgtataagaa aaacgcgtac 540 gacgataaac tggcgaaggc atataaaaaa tacgggggtg tgtga 585

Claims (15)

  1. 카바페넴(Carbapenem) 내성 클렙시엘라 뉴모니아(Klebsiella pneumoniae)에 대하여 특이적인 세포 사멸능을 갖고,
    서열번호 1로 표시되는 유전체로 이루어지며,
    명칭은 YMC15/11/N54_KPN_BP이고, 기탁번호는 [KCTC18572P]인 박테리오파지.
  2. 삭제
  3. 삭제
  4. 삭제
  5. 삭제
  6. 제 1항에 있어서,
    상기 박테리오파지는 시포비리데(Siphoviridae)에 속하며, 전체 게놈 크기가 59100bp인, 박테리오파지.
  7. 삭제
  8. 삭제
  9. 삭제
  10. 삭제
  11. 삭제
  12. 삭제
  13. 삭제
  14. 제 1항 또는 제 6항의 박테리오파지를 유효성분으로 포함하는 항생제.
  15. 제 1항 또는 제 6항의 박테리오파지를 유효성분으로 포함하는 소독제.
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