KR101955073B1

KR101955073B1 - 무 판별용 snp 마커

Info

Publication number: KR101955073B1
Application number: KR1020160160267A
Authority: KR
Inventors: 유희주; 문정환; 정영민
Original assignee: 가톨릭대학교 산학협력단
Priority date: 2016-11-29
Filing date: 2016-11-29
Publication date: 2019-03-06
Also published as: KR20180060592A

Abstract

본 발명은 무의 다양한 유전체를 계통 분류할 수 있고, 다른 품종과 계통을 구분할 수 있는 무 유전자원 분석을 위한 SNP 및 이의 용도에 관한 것으로서, 구체적으로 17종의 무를 구별할 수 있는 702개의 SNP들 중, 무의 8번 및 9번 염색체 상에 존재하는 143개의 SNP를 선발함으로써, 다양한 무 유전자원을 계통별, 종별로 용이하고 신속하게 구분할 수 있으며 유전체 구조를 분석할 수 있어 고품질의 무 개량품종 개발, 농수산물의 수출입 원산지 판별, 무 유전체 보유 및 유지 등에 유용하게 활용할 수 있는 효과가 있다.

Description

무 판별용 SNP 마커{SNP MARKERS FOR DISCRIMINATION OF RAPHANUS SATIVUS}

본 발명은 무의 다양한 유전체를 계통 분류할 수 있고, 다른 품종과 계통을 구분할 수 있는 무 유전자원 분석을 위한 SNP 및 이의 용도에 관한 것이다.

분자 유전학의 발전과 염기서열 분석 기술의 발전에 따라 식물종의 다양성을 유전체 수준에서 구별할 수 있게 되었으며, 이들 정보를 이용하여 개발된 분자 표지는 유전자원의 구분 및 평가에 매우 중요하다.

배추과에 속하는 무는 아시아에서 뿌리 채소로써 이용되는 작물로써, 형태적으로 다양한 뿌리 모양을 가지며, 생리적으로는 개화시기, 영양성분 등의 차이가 다양하여 고품질을 생산하기 위한 유전자원의 확보 또는 유지가 필수적인 작물로, 분자육종을 통한 무 신품종 육성을 위해서는 정확하며 범용성이 높은 분자표지의 개발이 필수적이다. 특히 무는 벼, 배추와 같은 주요 작물과 상응되는 식량 필수 작물이며, 따라서 경제적으로도 중요한 작물이므로, 여러 가지의 분자표지 발굴에 대한 연구가 보고되고 있다. 그러나 현재까지 개발된 생물의 종 및 품종을 식별하는 방법은 형태적 또는 이화학적 방법이 사용되어 왔으나, 상기 배추과에 속하는 무를 포함하는 작물은 염색체 구성이 복잡하여 분속지표가 확립되기 어렵기 때문에 거의 주관적으로 품종 및 종 판별이 이루어지고 있는 실정에 있다.

이에 발명자들은 무 유전자원 평가를 위해 유전체 서열을 기반으로 SNP 분자표지세트를 개발하고자 노력한 결과, 무 표준 유전체 및 16개의 재배종 및 야생무 유전체 분석 결과를 기반으로 서열 다형성을 탐색하고 SNP 분석에 적합한 143개의 분자표지를 선별함으로써 본 발명을 완성하게 되었다.

1. 한국공개특허 제2013-022328호

본 발명의 목적은 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51번째 SNP(single nucleotide polymorphism) 뉴클레오티드를 포함하는 8 내지 200개의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도 판별을 위한 SNP 마커를 제공하는 것이다.

상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51번째 SNP(single nucleotide polymorphism) 뉴클레오티드를 포함하는 8 내지 200개의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도 판별을 위한 SNP 마커를 제공한다.

또한, 본 발명은 상기 SNP 마커를 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도 판별을 위한 키트를 제공한다.

또한, 본 발명은 (a) 시료로부터 핵산분자를 분리하는 단계; (b) 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열 이상의 51번째 SNP(single nucleotide polymorphism) 폴리뉴클레오티드의 염기타입을 확인하는 단계를 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도를 판별하는 방법을 제공한다.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 (b) 단계는 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열 이상의 51번째 SNP 폴리뉴클레오티드를 증폭할 수 있도록 제작된 프라이머쌍을 이용하여 상기 분리된 핵산 분자를 증폭하여 실시하는 것일 수 있다.

본 발명의 일실시예에 있어서, (ⅰ) SNP 뉴클레오타이드인, 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51 번째 뉴클레오타이드에 인접한 서열과 어닐링하며, (ⅱ) 3' 말단의 뉴클레오타이드가 상기 SNP 뉴클레오타이드로부터 -1 위치의 뉴클레오타이드와 매칭되는 지노타이핑(genotyping) 프라이머를 이용하여 SNP 뉴클레오타이드의 염기 타입을 분석하는 것일 수 있다.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 SNP 뉴클레오타이드는 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51 번째 뉴클레오티드를 포함하는 8 내지 200개의 폴리뉴클레오티드 서열 또는 이와 상보적인 서열을 포함하는 프로브를 이용하여 염기 타입을 분석하는 것일 수 있다.

본 발명에 따른 무의 종 또는 계통을 검출할 수 있는 SNP 마커는 무의 계통별, 종별로 용이하고 신속하게 구분할 수 있으며 유전체 구조를 분석할 수 있어 고품질의 무 개량품종 개발, 농수산물의 수출입 원산지 판별, 무 유전체 보유 및 유지 등에 유용하게 활용할 수 있다.

도 1은 본원발명의 SNP를 이용하여 구별할 수 있는 무의 종들을 나타낸 계통도이다.
도 2는 본원발명의 SNP를 이용하여 구별할 수 있는 무의 종들의 표현형을 확인한 도이다.
도 3은 본원발명의 SNP를 이용하여 구별할 수 있는 무의 종들의 모양을 나타낸 도이다.
도 4는 본원발명의 무 유전자원 평가용 SNP 분자표지 세트의 무 표준유전체 (염색체 9개) 상의 위치를 확인한 도이다.

본 발명은 무의 종 또는 계통을 검출할 수 있는 SNP 마커에 관한 것으로, 2013년에 보고된 R.raphanistrum 서열(Origin:USA, Accession:Moghe et al.(2014))을 기반으로, 재배종인 WK10039(Origin:Korea, Aceession: NIHHS(National Institute of Horticultural&Herbal science; WK10039)), WK10024(Origin:Europe, Accession: NIHHS(WK10024)), Long Scarlet(Origin: USA, Accession:NIAS(National Institute of Agricultural Science, Japan; JP27291)), DB102(Origin:Europe, Accession: Dongbu(Dongbu Farm Hannong, Co.Ltd, Korea)), DB104(origin:Korea, Accession: Dongbu), DB109(origin: China, Accession:Dongbu), DB110(origin:China, Accession:Dongbu), DB113(Origin:Japan, Accession:Dongbu), Aokubi(Origin:Japan, Accession: Kitashiba et al.(2014))및 Sayatori(origin:Japan, Accession: Kitashiba et al.(2014); 야생종인 Raphanistroides1(origin: Japan, Accession: RDA-GIC(Rural Development Administration-Genebank IT234955)), Raphanistroides2(origin: Japan, Accession: RDA-GIC(IT260989)), Raphanistroides3(origin: Japan, Accession: RDA-GIC(IT264026), Wild radish1(origin: Vietnam, Accession: RDA-GIC(IT182537)), Wild radish2(origin: India, Accession: RDA-GIC(IT32722)) 및 Wild radish3(origin:India, Accession: RDA-GIC(IT32723))에 대하여, SNP 다형성을 분석하였다. 이 중, 무의 9개의 염색체 중 8번 및 9번에 존재하는 SNP 다형성 마커 143개를 선별하였다.

일반적으로 식물 품종을 식별하는 방법은 크게 재배시험을 통한 형태적 특성 검정 방법, 종 또는 품종 간 동위효소의 차이를 통한 검정 방법 및 DNA에 기초한 분자 마커를 이용한 검정 방법으로 나뉜다. 이 중 분자 마커를 이용한 검정 방법은 작물의 유전·육종연구에서 유전적 다양성과 계통 유연 관계 분석, 식물 유전자원의 보존과 관리 등에 유용한 정보를 제공하고 있으며(Smith et al., 1997. Theor. Appl. Genet. 95: 163-173), 표현형에 근거한 전통적인 식별 방법에 비해 재배 환경 및 작물의 생장 단계에 영향을 받지 않아 객관적이며 재현성 또한 높다는 장점을 가진다.

한편, 식량의 주요 작물이라고 할 수 있는 무는 아직까지 계통분류학이 완성되지 않고 있고 원산지, 품종 등 유전자원의 내역을 신속히 구별할 수 있는 분자마커가 부재한 상황이다.

이러한 점에서 본 발명자들은 SNP에 기초한 분자적 방법은 간편하고 신속한 방법으로 무의 다양한 품종, 계통, 원산지 등을 구분할 수 있는 분자마커를 발굴하였다.

따라서, 본 발명은 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51번째 SNP(single nucleotide polymorphism) 뉴클레오티드를 포함하는 8 내지 200개의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도 판별을 위한 SNP 마커를 제공한다.

본 발명의 SNP 마커는 무에 적용되며, 가장 바람직하게는 무의 종자에 적용되고, 종 또는 계통이 알려지지 않은 미지의 종자에 상기 SNP 마커를 적용하여, WK10039, WK10024, Long Scarlet, DB102, DB104, DB109, DB110, DB113, Aokubi; 야생종인 Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Wild radish1, Wild radish2 및 Wild radish3 인지 여부를 확인할 수 있어, 종자단계에서부터 상기 무의 종 또는 계통을 구분할 수 있는 것을 특징으로 할 수 있다.

본 명세서에서 용어, "뉴클레오타이드"는 단일가닥 또는 이중가닥 형태로 존재하는 디옥시리보뉴클레오타이드 또는 리보뉴클레오타이드이며, 다르게 특별하게 언급되어 있지 않은 한 자연의 뉴클레오타이드의 유사체를 포함한다.

또한, 본 발명의 SNP 염기 변이가 이중가닥의 gDNA(genomic DNA)에서 발견되는 경우, 상기한 뉴클레오타이드 서열에 대하여 상보적인 폴리뉴클레오타이드 서열도 포함하는 것으로 해석된다. 따라서, 상보적인 폴리뉴클레오타이드 서열에서 SNP위치의 염기도 상보적인 염기가 된다.

본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명의 다음의 단계를 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도를 판별하는 방법을 제공한다:

a) 시료로부터 핵산분자를 분리하는 단계;

b) 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열 이상의 51번째 SNP(single nucleotide polymorphism) 폴리뉴클레오티드의 염기타입을 확인하는 단계.

본 발명의 시료는 종 또는 계통이 판별되지 않은 무 또는 무의 종자일 수 있다.

본 발명에서 용어, "핵산분자"는 DNA(gDNA 및 cDNA) 또는 RNA 분자를 포괄적으로 포함하는 의미를 갖으며, 핵산 분자에서 기본 구성 단위인 뉴클레오타이드는 자연의 뉴클레오타이드뿐만 아니라, 당 또는 염기부위가 변형된 유사체(analogue)도 포함한다.

본 발명의 방법에서 출발물질이 gDNA인 경우, gDNA의 분리는 당업계에 공지된 통상의 방법에 따라 실시될 수 있다 (참조: Rogers & Bendich (1994)). 출발물질이 mRNA인 경우에는, 당업계에 공지된 통상의 방법에 총 RNA를 분리하여 실시된다 (참조: Sambrook, J. et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001); Ausubel, F.M. et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Willey & Sons(1987); 및 Chomczynski, P. et al., Anal. Biochem. 162:156(1987)). 분리된 총 RNA는 역전사효소를 이용하여 cDNA로 합성된다. 상기 총 RNA는 식물세포부터 분리된 것이기 때문에, mRNA의 말단에는 폴리-A 테일을 갖고 있으며, 이러한 서열 특성을 이용한 올리고 dT 프라이머 및 역전사 효소를 이용하여 cDNA을 용이하게 합성할 수 있다 (참조: PNAS USA, 85:8998(1988); Libert F, et al., Science, 244:569(1989); 및 Sambrook, J. et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001)).

본 발명의 방법에 있어서, 상기 단계 (b)는 특정 서열을 규명하는 데 이용되는 당업계에 공지된 다양한 방법을 응용하여 실시될 수 있다. 예를 들어, 본 발명에 응용될 수 있는 기술은, 형광 인 시투 혼성화 (FISH), 직접적 DNA 서열결정, PFGE 분석, 서던 블롯 분석, 단일-가닥 컨퍼메이션 분석 (SSCA, Orita et al., PNAS, USA 86:2776(1989)), RNase 보호 분석 (Finkelstein et al., Genomics, 7:167(1990)), 닷트 블롯 분석, 변성 구배 젤 전기영동 (DGGE, Wartell et al., Nucl.Acids Res., 18:2699(1990)), 뉴클레오타이드 미스매치를 인식하는 단백질 (예: E. coli의 mutS 단백질)을 이용하는 방법 (Modrich, Ann. Rev. Genet., 25:229-253(1991)), 및 대립형-특이 PCR을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다.

서열 변화가 단일-가닥 분자내 염기 결합의 차이를 초래하여, 이동성이 다른 밴드를 출현하게 하는 데, SSCA는이 밴드를 검출한다. DGGE 분석은 변성 구배 젤을 이용하여, 야생형 서열과 다른 이동성을 나타내는 서열을 검출한다. 다른 기술들은 일반적으로 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 상보적인 프로브 또는 프라이머를 이용한다. 예를 들어, RNase 보호 분석에서, 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 상보적인 리보프로브가 이용된다. 상기 리보프로브와 식물체로부터 분리한 DNA 또는 mRNA를 혼성화시키고, 이어 미스매치를 검출할 수 있는 RNase A 효소로 절단한다. 만일, 미스매치가 있어 RNase A가 인식을 한 경우에는, 보다 작은 밴드가 관찰된다.

혼성화 시그널(hybridization signal)을 이용하는 분석에서, 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 상보적인 프로브가 이용된다. 이러한 기술에서, 프로브와 타깃 서열의 혼성화 시그널을 검출하여 직접적으로 SNP 변이체 여부를 결정한다.

본 명세서에서 용어, "프로브"는 특정 뉴클레오타이드 서열에 혼성화될 수 있는 디옥시리보뉴클레오타이드 및 리보뉴클레오타이드를 포함하는 자연 또는 변형되는 모노머 또는 결합을 갖는 선형의 올리고머를 의미한다. 바람직하게는, 프로브는 혼성화에서의 최대 효율을 위하여 단일가닥이다. 프로브는 바람직하게는 디옥시리보뉴클레오타이드이다. 본 발명에 이용되는 프로브로서, 상기 SNP를 포함하는 서열에 완전하게 (perfectly) 상보적인 서열이 이용될 수 있으나, 특이적 혼성화를 방해하지 않는 범위 내에서 실질적으로 (substantially) 상보적인 서열이 이용될 수도 있다.

바람직하게는, 본 발명에 이용되는 프로브는 SNP 뉴클레오타이드인 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열의 어느 한 서열의 51번째 뉴클레오타이드를 포함하는 8-100 개의 연속 뉴클레오타이드를 포함하는 서열에 혼성화될 수 있는 서열을 포함한다.

보다 바람직하게는, 상기 프로브의 3'-말단 또는 5'-말단은 상기 SNP 염기에 상보적인 염기를 갖는다. 일반적으로, 혼성화에 의해 형성되는 듀플렉스 (duplex)의 안정성은 말단의 서열의 일치에 의해 결정되는 경향이 있기 때문에, 3'-말단 또는 5'-말단에 SNP 염기에 상보적인 염기를 갖는 프로브에서 말단 부분이 혼성화되지 않으면,이러한 듀플렉스는 엄격한 조건에서 해체될 수 있다. 혼성화에 적합한 조건은 Joseph Sambrook, et al.,Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.(2001) 및 Haymes, B. D., et al., Nucleic Acid Hybridization, A Practical Approach, IRL Press, Washington, D.C. (1985)에 개시된 사항을 참조하여 결정할 수 있다. 혼성화에 이용되는 엄격한 조건(stringent condition)은 온도, 이온세기 (완충액 농도) 및 유기 용매와 같은 화합물의 존재 등을 조절하여 결정될 수 있다. 이러한 엄격한 조건은 혼성화되는 서열에 의존하여 다르게 결정될 수 있다.

본 발명 방법의 단계 (b)는 대립형-특이 유전자 증폭 방법에 의해 실시될 수 있다. SNP가 유전자 증폭 방법에 적용되는 경우, 특히 SNAP (single nucleotide amplified polymophism)라 통칭된다. 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 이러한 유전자 증폭은 SNP 뉴클레오타이드인 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열의 어느 한 서열의 51번째 뉴클레오타이드를 포함하는 폴리뉴클레오타이드를 증폭할 수 있도록 제작된 프라이머쌍(primer pair)을 기본적으로 이용한다.

본 발명의 명세서에서 "프라이머(primer)"는 단일가닥의 올리고뉴클레오타이드로서, 적합한 조건 (4 가지의 상이한 뉴클레오사이드 트리포스페이트 및 DNA 또는 RNA 폴리머라아제와 같은 중합효소의 존재), 적합한 온도 및 적합한 버퍼하에서 주형-지시적 DNA 합성을 개시할 수 있는 개시점으로서 작용하는 것을 의미한다.

프라이머의 적합한 길이는 사용하고자 하는 프라이머의 특성에 의해 결정하지만, 통상적으로 15 내지 30bp의 길이로서 사용한다. 프라이머는 주형의 서열과 정확하게 상보적일 필요는 없지만 주형과 혼성복합체(hybridcomplex)를 형성할 수 있을 정도로 상보적이어야만 한다.

본 발명의 방법에 이용될 수 있는 증폭 기술은 PCR 증폭 (참조: Miller, H. I. (WO 89/06700) 및 Davey, C. et al. (EP 329,822)), 리가아제 연쇄 반응 (LCR, Wu, D.Y. et al., Genomics 4:560 (1989)), 중합효소 리가아제 연쇄 반응 (Barany, PCR Methods and Applic., 1:5-16(1991)), Gap-LCR (WO 90/01069), 리페어 연쇄 반응 (EP439,182), 3SR (Kwoh et al., PNAS, USA, 86:1173(1989)) 및 NASBA (U.S. Pat. No. 5,130,238)을 포함하나,이에 한정되는 것은 아니다. 가장 바람직하게는 PCR 증폭 단계에 따라 증폭한다. 증폭기술이 적용되는 경우에, 본 발명의 SNP 염기를 확인하기 위해 적합한 프라이머를 디자인하는 것이 중요하다.

본 발명의 바람직한 구현예에 의하면, 본 발명은 (ⅰ) 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51번째 뉴클레오타이드에 인접한 서열과 어닐링하며, (ⅱ) 3'말단의 뉴클레오타이드가 상기 SNP 뉴클레오타이드로부터 -1 위치의 뉴클레오타이드와 매칭되도록 디자인된 지노타이핑(genotyping) 프라이머를 이용하여 SNP 뉴클레오타이드의 염기 타입을 분석하는 방법을 제공한다.

상기 본 발명의 바람직한 구현예에서, 증폭 반응액 중에 각각 상이한 색의 형광을 나타내도록 표지된 다이데옥시아데노신트리포스페이트(ddATP), 다이데옥시사이토신트리포스페이트(ddCTP), 다이데옥시구아노신트리포스페이트(ddGTP), 및 다이데옥시티미딘트리포스페이트(ddTTP)를 포함하여 증폭 반응시킨다.

상기와 같이 디자인한 지노타이핑 프라이머와, 반응기질로서 ddATP, ddCTP, ddGTP 및 ddTTP를 반응액에 포함시켜 증폭 반응시키면 지노타이핑 프라이머의 3' 말단으로부터 타깃 SNP 뉴클레오타이드와 매칭되는 1개의 염기만이 익스텐션(extension)되며, 익스텐션된 염기의 타입은 형광에 의해 용이하게 확인할 수 있다. 이러한 방법에 의해 SNP 뉴클레오타이드의 타입을 결정할 수 있다.

PCR에 의한 증폭 반응의 조건 및 사용되는 시약과 효소는 당업계에서 통상적으로 공지된 것을 사용할 수 있다.

본 발명의 또 다른 일 양태에 의하면, 본 발명은 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51번째 뉴클레오타이드를 포함하는 폴리뉴클레오타이드를 증폭할 수 있도록 제작된 프라이머쌍을 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도를 판별하는 키트를 제공한다.

본 발명의 바람직한 구현예에 의하면, 상기 프라이머쌍은 (ⅰ) 서열번호 1 내지 143 염기서열 중 어느 한 염기서열의 51 번째 뉴클레오타이드에 인접한 서열과 어닐링하며, (ⅱ) 3' 말단의 뉴클레오타이드가 상기 SNP 뉴클레오타이드로부터 -1 위치의 뉴클레오타이드와 매칭되는 지노타이핑 프라이머를 포함하는 것을 특징으로 하는 키트를 제공한다.

본 발명의 다른 바람직한 구현예에 의하면, 상기 키트에서 각각 상이한 색의 형광을 나타내도록 표지된, 다이데옥시아데노신트리포스페이트(ddATP), 다이데옥시사이토신트리포스페이트(ddCTP), 다이데옥시구아노신트리포스페이트(ddGTP), 다이데옥시티미딘트리포스페이트(ddTTP)를 더욱 포함하는 키트를 제공한다.

본 발명의 키트가 PCR 증폭 과정에 적용되는 경우, 본 발명의 키트는 선택적으로, PCR 증폭에 필요한 시약, 예컨대, 완충액, DNA 중합효소 (예컨대, Thermus aquaticus (Taq), Thermus thermophilus (Tth), Thermus filiformis, Thermisflavus, Thermococcus literalis 또는 Pyrococcus furiosus (Pfu)로부터 수득한 열 안정성 DNA 중합효소), DNA 중합 효소 조인자 및 dNTPs를 포함할 수 있다. 본 발명의 키트는 상기한 시약 성분을 포함하는 다수의 별도 패키징 또는 컴파트먼트로 제작될 수 있다.

본 발명의 또 다른 측면은 본 발명에 따른 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 마이크로어레이에 관한 것이다.

본 발명에 따른 마이크로어레이는 무의 종 또는 계통을 판별하기 위한 SNP를 이용하여 당분야의 당업자에게 알려져 있는 통상적인 방법에 의해 제조될 수있다.

예컨대, 상기 뉴클레오티드는 아미노 실란(amino-silane), 폴리-L-리신(poly-L-lysine) 및 알데히드(aldehyde)로 이루어진 군에서 선택되는 활성기가 코팅된 기판 상에 고정될 수 있다. 또한, 상기 기판은 실리콘 웨이퍼, 유리, 석영, 금속 및 플라스틱으로 이루어진 군에서 선택될 수 있다. 상기 폴리뉴클레오티드를 기판에 고정화시키는 방법은 파이조 일렉트릭(piezoelectric) 방식을 이용한 마이크로피펫팅법(micropipetting), 핀(pin) 형태의 스폿터(spotter)를 이용한 방법 등을 사용할 수 있다.

본 발명의 다른 측면은 본 발명에 따른 마이크로어레이를 포함하는 무의 계통, 종 또는 종자순도를 판별하는 키트에 관한 것이다.

본 발명에 따른 키트는 본 발명의 마이크로어레이 이외에 시료로부터 해당 SNP를 포함하는 DNA를 분리 및 증폭하는데 사용되는 프라이머 세트를 추가로 포함할 수 있다. 상기 적절한 프라이머 세트는 본 발명의 서열을 참조하여 당업자는 용이하게 설계할 수 있을 것이다.

한편, 본 발명에서 서열번호 1의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP08808 또는 RsSNP08808:10107로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 575156번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides3, WK10039, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 2의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0996 또는 RSS0996:1268로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 1202557번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB110, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides3, WK10039, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 3의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL3554s 또는 RS2CL3554s:3350로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 1395769번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, Wild radish1, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 4의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP02738 또는 RsSNP02738:6183로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 2022118번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB113, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Aokubi, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 5의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2157 또는 RSS2157:3256로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 2526633번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB110, Raphanistroides1, WK10039 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 6의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP16035 또는 RsSNP16035:1583로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 3029080번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, WK10024, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 7의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0071 또는 RSS0071:4804로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 3035970번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 8의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3083 또는 RSS3083:6827로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 3701359번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, Wild radish3, Raphanistroides3, Aokubi, WK10024, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 9의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0512 또는 RSS0512:41576로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 4019289번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB109, DB113, Wild radish1, Raphanistroides1, Aokubi, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 10의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3548 또는 RSS3548:8083로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 4214931번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB109, Raphanistroides1, Aokubi. WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 11의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL5368s 또는 RS2CL5368s:14682로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 4487784번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB109, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides2, Sayatori, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 12의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0213 또는 RSS0213:1566로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 4961695번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB110, Wild radish1, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10039 종은 G이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 13의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP05495 또는 RsSNP05495:2612로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 5577768번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 14의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL3498s 또는 RS2CL3498s:7408로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 5647024번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB104, DB110, Wild radish1, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides3, WK10039 종은 T이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 15의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2014 또는 RSS2014:750로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 5824746번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB113, Wild radish2, Wild radish3, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 16의 경우, 승인번호(Accession number) RSS1589 또는 RSS1589:5385로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 6199214번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB110, DB113, Wild radish2, Raphanistroides1, Raphanistroides2, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 17의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP06292 또는 RsSNP06292:1445로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 6351945번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 18의 경우, 승인번호(Accession number) COS0858 또는 COS0858:10140로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 6360877번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 19의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3350 또는 RSS3350:5668로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 6388899번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB104, DB113, Wild radish1, Wild radish3, Raphanistroides1, Aokubi, WK10039 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 20의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0208 또는 RSS0208:4108로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 7970772번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 21의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL1475s 또는 RS2CL1475s:7113로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 8113669번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB113, Aokubi, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 22의 경우, 승인번호(Accession number) RGA19 또는 RGA19:10024로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 9192359번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, Wild radish2, WK10024, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 23의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL3284s 또는 RS2CL3284s:16422로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 9510259번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 24의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP11315 또는 RsSNP11315:20345로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 11190069번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, Wild radish2, Wild radish3, WK10024, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 25의 경우, 승인번호(Accession number) COS0334 또는 COS0334:5431로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 11214910번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB104, Raphanistroides1, Sayatori, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 26의 경우, 승인번호(Accession number) COS0717 또는 COS0717:806로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 11250249번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB104, Wild radish1, Wild radish3, Raphanistroides3, WK10039 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 27의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL1646s 또는 RS2CL1646s:23489로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 12193286번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB109, Wild radish3, Raphanistroides3, Aokubi, Sayatori, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 28의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL6872s 또는 RS2CL6872s:6412로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 13266630번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, Wild radish2, Sayatori, WK10039, R. raphanistrum 종은 T이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 29의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2649 또는 RSS2649:374로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 16201761번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB113, Sayatori, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 30의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0081 또는 RSS0081:1246로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 16240575번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Wild radish1, Sayatori, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 31의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP14867 또는 RsSNP14867:2430로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 16571251번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB109, DB110, DB113, Wild radish1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 32의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP14174 또는 RsSNP14174:1836로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 16641546번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 33의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3144 또는 RSS3144:1298로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 16922583번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB109, Wild radish1, Raphanistroides3, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 34의 경우, 승인번호(Accession number) COS1046 또는 COS1046:2296로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 17196603번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB113, Wild radish1, WK10039 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 35의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP10182 또는 RsSNP10182:4837로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 17286655번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB110, Raphanistroides2, Sayatori, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 36의 경우, 승인번호(Accession number) COS0941 또는 COS0941:2254로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 17753693번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB109, Wild radish3, Sayatori, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 37의 경우, 승인번호(Accession number) COS0011 또는 COS0011:8341로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 18417515번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB110, Wild radish2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 38의 경우, 승인번호(Accession number) COS0972 또는 COS0972:798로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 19552413번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB104, Wild radish3, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 39의 경우, 승인번호(Accession number) COS1140 또는 COS1140:613로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 26830114번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 40의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0974 또는 RSS0974:3190로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 27221312번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, Wild radish1, Raphanistroides1, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 41의 경우, 승인번호(Accession number) COS0753 또는 COS0753:1000로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 27238350번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Wild radish3, Raphanistroides3, WK10039, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 42의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3505 또는 RSS3505:5016로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 28964678번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 43의 경우, 승인번호(Accession number) RSS1748 또는 RSS1748:445로서, 무의 8번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 29229516째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB109, Wild radish2, Raphanistroides3, Aokubi, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 44의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP14504 또는 RsSNP14504:3529로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 90092째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 45의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0589 또는 RSS0589:5196로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 256078째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB110, Wild radish2 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 46의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15268 또는 RsSNP15268:2228로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 313590째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 47의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2714 또는 RSS2714:782로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 362485째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB109, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 48의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2664 또는 RSS2664:2077로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 812378째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB113, Wild radish3, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi, WK10039, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 49의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3584 또는 RSS3584:2232로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 970314째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB109, DB113, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 50의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL3487s 또는 RS2CL3487s:17149로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 1041577째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 51의 경우, 승인번호(Accession number) RSS1419 또는 RSS1419:26848로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 1185004째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, DB110, DB113, Wild radish2, Sayatori, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 52의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3486 또는 RSS3486:6286로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 1233764째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB109, Wild radish2, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 53의 경우, 승인번호(Accession number) RsSH042 또는 RsSH042:3976로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 1462064째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, Wild radish1, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 54의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0763 또는 RSS0763:1681로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 1858458째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Sayatori, WK10039, R. raphanistrum 종은 T이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 55의 경우, 승인번호(Accession number) RSS1826 또는 RSS1826:3156로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 1859933째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB104, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 56의 경우, 승인번호(Accession number) COS1052 또는 COS1052:3351로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 1940925째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 57의 경우, 승인번호(Accession number) Rs1SSR3384 또는 Rs1SSR3384:1425로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 2286164째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB113, Aokubi, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 58의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3135 또는 RSS3135:1062로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 2447424째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 59의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP08954 또는 RsSNP08954:19667로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 2966023째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 60의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3093 또는 RSS3093:939로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 2984757째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 61의 경우, 승인번호(Accession number) Rs1SSR7282 또는 Rs1SSR7282:1572로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 3114606째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 WK10024, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 62의 경우, 승인번호(Accession number) COS0870 또는 COS0870:24166로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 3328179째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 WK10024, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 63의 경우, 승인번호(Accession number) Rs1SSR72B 또는 Rs1SSR72B:679로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 3842694째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, DB109, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 64의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP14802 또는 RsSNP14802:5014로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 3966296째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, Sayatori, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 65의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL3460s 또는 RS2CL3460s:4916로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 4284610째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB110, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Aokubi, WK10024, R. raphanistrum 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 66의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP10149 또는 RsSNP10149:1559로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 4364193째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Wild radish1, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 67의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2971 또는 RSS2971:2482로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 4662622째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 68의 경우, 승인번호(Accession number) Rs1SSR1951 또는 Rs1SSR1951:23239로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 5191615째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 69의 경우, 승인번호(Accession number) Rs2SSR166.2 또는 Rs2SSR166.2:5266로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 5425843째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Wild radish1, Raphanistroides2, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 70의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP07307 또는 RsSNP07307:1929로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 5791344째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB109, Wild radish1, Wild radish2, Raphanistroides3, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 71의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL2301s 또는 RS2CL2301s:14547로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 5868902째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB110, Aokubi, Sayatori, WK10039, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 72의 경우, 승인번호(Accession number) COS0695 또는 COS0695:30450로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 5891949째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB110, Wild radish3, Raphanistroides1, Aokubi, WK10039, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 73의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP11584 또는 RsSNP11584:11616로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 6553355째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB110, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10039, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 74의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP13365 또는 RsSNP13365:2079로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 6979426째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 75의 경우, 승인번호(Accession number) COS0429 또는 COS0429:4403로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 7160590째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 76의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL3458s 또는 RS2CL3458s:2210로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 7174504째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB109, DB113, Wild radish2, Raphanistroides1, Raphanistroides2, WK10039, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 77의 경우, 승인번호(Accession number) COS1068 또는 COS1068:270로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 7858903째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 78의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0572 또는 RSS0572:4347로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 8174363째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, Raphanistroides3, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 79의 경우, 승인번호(Accession number) RSS1517 또는 RSS1517:3811로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 8538743째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Wild radish1, WK10039, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 80의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP10233 또는 RsSNP10233:11775로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 8678054째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 WK10024, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 81의 경우, 승인번호(Accession number) COS0091 또는 COS0091:9082로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 8808378째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Sayatori, WK10039 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 82의 경우, 승인번호(Accession number) COS0171 또는 COS0171:1701로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 9209212째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB104, DB113, Raphanistroides1, Raphanistroides2, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 83의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL1162s 또는 RS2CL1162s:8536로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 9577228째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB110, Wild radish2, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 84의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP07123 또는 RsSNP07123:463로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 10727890째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 85의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0706 또는 RSS0706:867로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 11197980째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 86의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP12397 또는 RsSNP12397:3270로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 11591824째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB113, WK10024, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 87의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL5261s 또는 RS2CL5261s:1700로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 12801130째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 종은 T이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 88의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL1092s 또는 RS2CL1092s:593로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 17460504째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Sayatori, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 89의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP12157 또는 RsSNP12157:12351로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 18069947째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 90의 경우, 승인번호(Accession number) COS1171 또는 COS1171:4895로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 18958278째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 91의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15934 또는 RsSNP15934:1166로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 20310243째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB109, DB110, DB113, Wild radish1, Wild radish3, Sayatori, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 92의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0346 또는 RSS0346:4154로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 20333834째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB109, DB110, DB113, Wild radish1, Wild radish3, Sayatori, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 93의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP14298 또는 RsSNP14298:10133로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 21568467째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 94의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15168 또는 RsSNP15168:3345로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 21852359째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB109, DB113, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 95의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15214 또는 RsSNP15214:1699로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 22995383째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, Wild radish2, Raphanistroides2, 12. Raphanistroides3, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 96의 경우, 승인번호(Accession number) Rs1SSR8316 또는 Rs1SSR8316:1859로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 24181387째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 97의 경우, 승인번호(Accession number) RSS1004 또는 RSS1004:1908로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 24364993째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB109, DB110, DB113, Wild radish2, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 98의 경우, 승인번호(Accession number) COS0540 또는 COS0540:9155로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 24850639째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 99의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2698 또는 RSS2698:3023로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 24932697째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB110, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 100의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2759 또는 RSS2759:1285로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 24993296째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB113, Wild radish2, Raphanistroides2, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 101의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP07479 또는 RsSNP07479:306로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 24994225째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB110, DB113, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 102의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP08087 또는 RsSNP08087:895로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 26313104째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, DB113, Wild radish2, Raphanistroides2, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 103의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2742 또는 RSS2742:2736로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 26473508째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 104의 경우, 승인번호(Accession number) UgRsr11 또는 UgRsr11:933로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 27046555째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, DB109, Wild radish1, Sayatori, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 105의 경우, 승인번호(Accession number) RSS1222 또는 RSS1222:2422로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 27179686째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB104, DB109, DB113, Wild radish1, Sayatori, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 106의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15239 또는 RsSNP15239:520로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 27480420째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 107의 경우, 승인번호(Accession number) COS0275 또는 COS0275:619로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 27623590째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB110, DB113, Wild radish1, Raphanistroides3, Aokubi, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 108의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0639 또는 RSS0639:23245로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 27646341째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB109, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Sayatori, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 109의 경우, 승인번호(Accession number) COS0279 또는 COS0279:2650로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 28041727째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB109, Wild radish2, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 종은 T이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 110의 경우, 승인번호(Accession number) Rpp1(12) 또는 Rpp1(12):13698로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 28083588째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, Raphanistroides1, WK10024, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 111의 경우, 승인번호(Accession number) COS0413 또는 COS0413:1293로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 28123507째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 112의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15255 또는 RsSNP15255:139로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 28488840째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 WK10024, R. raphanistrum 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 113의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL4058s 또는 RS2CL4058s:17459로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 28770515째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB113, Wild radish3, aphanistroides1, Raphanistroides3, Aokubi, WK10039 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 114의 경우, 승인번호(Accession number) rm25 또는 rm25:13310로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 29275401째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi, Sayatori, WK10039, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 115의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15526 또는 RsSNP15526:3767로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 29721235째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 116의 경우, 승인번호(Accession number) COS1110 또는 COS1110:56로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 30616787째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB110, Wild radish2, Aokubi, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 117의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0140 또는 RSS0140:1755로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 30808081째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, 3. DB104, DB113, Wild radish3, Raphanistroides1, Aokubi, WK10039 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 118의 경우, 승인번호(Accession number) RSS1089 또는 RSS1089:1012로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 31498893째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 119의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15376 또는 RsSNP15376:513로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 31739645째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB109, DB113, Raphanistroides2, Sayatori, WK10039, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 120의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL6327s 또는 RS2CL6327s:261로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 32045466째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB113, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 121의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3167 또는 RSS3167:1180로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 32230108째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB110, Sayatori, WK10039 종은 G이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 122의 경우, 승인번호(Accession number) COS0714 또는 COS0714:7237로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 32837833째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB109, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 123의 경우, 승인번호(Accession number) RSS2417 또는 RSS2417:2714로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 34030942째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB109, DB113, Wild radish1, Raphanistroides1, Raphanistroides3, WK10039, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 124의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP01618 또는 RsSNP01618:583로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 34288105째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 125의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0093 또는 RSS0093:2542로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 34625277째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, Wild radish1, Wild radish2, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 126의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0570 또는 RSS0570:11776로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 34687589째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 G이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 127의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0603 또는 RSS0603:3949로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 34778320째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Wild radish1, Wild radish2, Raphanistroides1, Raphanistroides2, WK10039, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 128의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0405 또는 RSS0405:4540로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 35024034째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, Wild radish3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 종은 G이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 129의 경우, 승인번호(Accession number) RSS1951 또는 RSS1951:3253로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 35217957째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB109 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 130의 경우, 승인번호(Accession number) COS0698 또는 COS0698:4463로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 35428885째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Wild radish2, WK10039, R. raphanistrum 종은 A이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 131의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP06697 또는 RsSNP06697:7926로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 35487900째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 132의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL3917s 또는 RS2CL3917s:430로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 35951590째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, Aokubi, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 133의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15353 또는 RsSNP15353:5195로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 35992051째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB113, Wild radish1, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Aokubi, Sayatori, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 134의 경우, 승인번호(Accession number) RPP8(3) 또는 RPP8(3):1062로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 36113744째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB109, DB110, Wild radish2, Raphanistroides1, Raphanistroides2, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 135의 경우, 승인번호(Accession number) RPP8(3) 또는 RS2CL5908s:619로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 36216939째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB113, Aokubi, WK10024, R. raphanistrum 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 136의 경우, 승인번호(Accession number) RSS3831 또는 RSS3831:3488로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 36404000째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 A를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 137의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15234 또는 RsSNP15234:1366로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 36889855째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 138의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP14676 또는 RsSNP14676:3752로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 37412815째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB113, Wild radish1, WK10024 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 139의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP08681 또는 RsSNP08681:5401로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 37531815째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB109, DB113,Wild radish1, Wild radish3, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 140의 경우, 승인번호(Accession number) RSS0882 또는 RSS0882:4013로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 37782244째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, Wild radish1, WK10024, R. raphanistrum 종은 T이고, 나머지 종은 C를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 141의 경우, 승인번호(Accession number) COS0478 또는 COS0478:5678로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 38054697째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, Raphanistroides3, WK10024 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 142의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP13509 또는 RsSNP13509:647로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 38168050째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, WK10024 종은 C이고, 나머지 종은 T를 갖는 것일 수 있다.

본 발명에서 서열번호 143의 경우, 승인번호(Accession number) RsSNP15519 또는 RsSNP15519:445로서, 무의 9번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 38353167째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB109, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides2, Sayatori, WK10039 종은 A이고, 나머지 종은 G를 갖는 것일 수 있다.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하기로 한다. 이들 실시예는 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.

실시예 1. 실험방법

1.1. 유전체 재분석용 재배종 및 야생무 탐색

국내 및 해외에서 수집한 48 품종 무의 핵 DNA를 추출하고 이를 18개의 InDel 분자표지를 이용하여 지노타이핑을 실시하였다. 이들의 지노타입을 바탕으로 UPGMA 클러스터링을 수행하였다. 이들 클러스터링 결과와 형태적 특성, 원산지를 바탕으로 16개의 무 재배종 및 1개의 야생종을 선별하였다. 이에 대한 정보는 하기 표 1과 같다.

Type	Name	Origin	Source (Accession)¹
Cultivated	WK10039	Korea	NIHHS (WK10039)
	WK10024	Europe	NIHHS (WK10024)
	Long Scarlet	USA	NIAS (JP27291)
	DB102	Europe	Dongbu
	DB104	Korea	Dongbu
	DB109	China	Dongbu
	DB110	China	Dongbu
	DB113	Japan	Dongbu
	Aokubi	Japan	Kitashiba et al. (2014)
	Sayatori	Japan	Kitashiba et al. (2014)
Wild	Raphanistroides1	Japan	RDA-GIC (IT234955)
	Raphanistroides2	Korea	RDA-GIC (IT260989)
	Raphanistroides3	Korea	RDA-GIC (IT264026)
	Wild radish1	Vietnam	RDA-GIC (IT182537)
	Wild radish2	India	RDA-GIC (IT32722)
	Wild radish3	India	RDA-GIC (IT32723)
	Raphanistrum	USA	Moghe et al. (2014)

1.2. 유전체 재분석 및 SNP 다형성 분석

선발된 16개의 무 재배종 및 1개의 야생종으로부터 DNA를 추출하고 Illumina HiSeq2000을 이용하여 25X이상의 shotgun 서열을 생산하였다. 생산된 서열은 adaptor contamination, PCR duplicates, low quality 등의 기준으로 filtering 하였다. 또한, Kitashiba 등이 2014년에 보고한 R. sativus cv. Aokubi와 cv. Sayatori, Moghe 등이 2013년에 보고한 R. raphanistrum 서열을 NCBI에서 download하여 동일한 방법으로 fitering을 수행하였다. Filtering된 read들은 무 표준유전체 서열 Rs1.0에 BWA-MEM 0.7.9a를 이용하여 매핑하고 SNP를 탐색하였다. 이때, SNP는 각 accession에서 homozygous한 것만을 선택하였다.

1.3. 무 유전자원 평가를 위한 SNP 탐색

탐색된 대량의 SNP 중, 무 유전자원 평가를 위한 SNP를 고르기 위해 다음과 같은 선발 기준을 임의로 정하였다.

1. 일본 Plant Genome DataBase Japan (PGDB)에 등록된 각종 분자표지를 WK10039에 매핑시켰을 때, 해당 분자표지 +1 과 -1 kb 사이에 존재하는 SNP.

2. Raphanistrum 을 제외한 16개 품종/야생무에서 적어도 한 종 이상에서 polymorphism 이 존재하는 것.

3. 특정 SNP 기준 +/- 50 bp 이내에 그 자신을 제외하고 다른 SNP가 한 개 이하인 것.

4. 각 SNP 당 다른 SNP갯수가 적은 것을 고르고, 그 수가 같은 경우 랜덤하게 선별하였다.

실시예 2. 무 유전자원 평가용 SNP 분자표지 세트 작성

연구방법 C에 기술된 기준에 의하여 SNP를 탐색한 결과, 모두 702개의 분자표지가 선별되었다. 이들의 분포는 도 4와 같다.

<110> Industry-Academic Cooperation Foundation of Catholic University <120> SNP MARKERS FOR DISCRIMINATION OF RAPHANUS SATIVUS <130> SNP4 <160> 143 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP08808:10107 <400> 1 atttgaaact agtggaaata taaaccaaac tatagaacaa aaatattcac naaaattgta 60 aagatcaaat tatgagtgga atgagagtca gtccatcgaa t 101 <210> 2 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0996:1268 <400> 2 gaccactggc ggtagcagca gcatagtggt ggttagggtt agggtttggt nggcaaggtg 60 gaagttggtg agaaagtagt ccgtggtcgc tcactaagct t 101 <210> 3 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL3554s:3350 <400> 3 attcaaatga tgagaagaaa gaaaacagta gtacatgaag agaaggcttt ngtgttgatg 60 cgtgaaacag atgatcctcc gagacctatc accgtcgatg g 101 <210> 4 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP02738:6183 <400> 4 cagttgagat gtctccatgt gcaatgcata cgtacatgtt tagaaaaaag ntaaaccaaa 60 tatttagagt tggctatcca tgttctttaa tgcagtaacg c 101 <210> 5 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2157:3256 <400> 5 attttatttt agagaatcga gattattgca aaacaaaacg aaaaagatat nttcagtttc 60 gccgactttt gtccaagtgt caagctgtct ttttcaatta t 101 <210> 6 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP16035:1583 <400> 6 cagacccatc ttttgtccaa agcccttagc atagggctaa gttgtgcctc nacatcacct 60 ctatagtcat ggtttcctaa aactataaga tacaaaatat a 101 <210> 7 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0071:4804 <400> 7 accaccacca ccaccaccat gattataatg cttgttaaac ccaggccctg ntgatctcct 60 tcctccaaat ttcacagtct gatccgagtt gtaatgcctt t 101 <210> 8 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3083:6827 <400> 8 ctttcttggc cggcggtgtc ccatatctga gctttgatgg tcttaccacc nacgcaaagt 60 ctactccgat cgtcggttta gagtctaacc ggaactcatc t 101 <210> 9 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0512:41576 <400> 9 caccgcctcc tgtctccgac gagctactca cggcggccat ttgaatgctt ntttccgatt 60 ttaccccttg cgtctgtttt ggttttttat tacaacaacc a 101 <210> 10 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3548:8083 <400> 10 aaaactgtat gatgttcact acttgatgca aaatatctac acccgaatct naaatgtact 60 taccgcaatg ttcattaaat tttgggtgtc atttcatatc g 101 <210> 11 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL5368s:14682 <400> 11 acaccgacga gtcctatcga gcttaggaga acgggaagcg agtacgtgac nataatgtct 60 ccaatccaga acaccatagc gcagatagca atgcagagac c 101 <210> 12 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0213:1566 <400> 12 atgcatggaa ataccacagg ccacctccaa ggcgtccgag tccctcctcc nctgggtcta 60 actactcaga cattagtaca ttttttaata tgatggagaa c 101 <210> 13 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP05495:2612 <400> 13 tagatggcca gatgctcttg catatggtaa acagttgaaa atactatttg ntttaaatat 60 tgataaataa tttattcgtt aactgatgta ctgataatta g 101 <210> 14 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL3498s:7408 <400> 14 cattccagag atgattccct tcaccttcat caatgtgtca acatcgtccc ngattataac 60 cgctccttct ggacgcagaa tcctatccat ctccagaaga a 101 <210> 15 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2014:750 <400> 15 gggttttacc gcccgctcgg gttcgtttcc gacccggatg ggatccgagg natggtgtat 60 gtacgcaaac agagaaaatg aataaacttt tttcttcgat t 101 <210> 16 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS1589:5385 <400> 16 ttcttctgtt tctgattttg gttaggctga ggtcgttttg acaatttcgt ngactatgtg 60 gccttctaca ggccctatat agtataaaga taggcaaaaa a 101 <210> 17 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP06292:1445 <400> 17 aatgacttgg caaaatgatg aatattaaca attaggtatt gtgtcatatt ntaatgttat 60 atatgacgat tggctttttg gttattgttg aaattaatgt c 101 <210> 18 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0858:10140 <400> 18 atatttccat cttcagcaca aataaaattt caattagtat tgcttacata nttacttata 60 caatcattgt tgtaattatt atacgatata aagaacaata a 101 <210> 19 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3350:5668 <400> 19 agttcaccat gccggggatt tcacatgtat tctcatggtg tccttctctg ncacatttgc 60 tgcatttatg tgacccacca ggggttaaaa ctactctcat g 101 <210> 20 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0208:4108 <400> 20 catcgcaaat ataagggcat gtttttttct caaatcaccc gaaggaatca naatttatct 60 tcaaaatgtt ccatttagaa gtaaaggcta attttgatag a 101 <210> 21 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL1475s:7113 <400> 21 taatttagat cgattttgac aaatttataa taatttaaac taatttaaaa nagttcaaac 60 tgaattaagt tgaacaaatt ggatattaaa gacattgttt c 101 <210> 22 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RGA19:10024 <400> 22 tttaaagcat cataactaaa ctttaatatg cttgcaattt ttccatctcg ntcaaggtga 60 gaccttaact ttggtagtgc cactgtccaa tcttgttcgg a 101 <210> 23 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL3284s:16422 <400> 23 tacaatttga atcttaaatc agggtgagcg tcacccattc aggccttata ntcaccgcta 60 cactaacgcc ttcaaaacct cagggagcat atcccctctt t 101 <210> 24 <211> 101 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Sequence <220> <223> COS0091:9082 <400> 81 ctcttactgt ctgtgtaatc taatatggct tcctctcaat ctcagggctc ntgtggtttc 60 ttcaaatggt gcaatgatga cgcagtcaaa tcgtctacaa c 101 <210> 82 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0171:1701 <400> 82 tcaatgagac catcttcatc ctcctcctca atatcaccat aatcattagc ngcagcagca 60 tcggcttctt tttgagatcg atcaagcaaa tagtctcttg t 101 <210> 83 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL1162s:8536 <400> 83 aaagcaattg cgttgagatc cacagattga cggtcgcagt aagcgttcat nagcttcttc 60 agctgagtgc tcctcttgat cttaaagaag acttcatttc c 101 <210> 84 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP07123:463 <400> 84 aactgataga tgtgttacat atgtggcaag tttcaatatt tgaacgacat ntgttaatac 60 gtttgcaagt tttaagattt gaacggtaaa atatcaccaa c 101 <210> 85 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0706:867 <400> 85 agcgcatatt aatttggaga tggtttacct atggacagtc catccatttg ncatccctag 60 tttagtgcaa ccgaggagat gcaataaatt ataaaggtta t 101 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60 gatcctacaa cggtttcagg gaacggagtc acggaagatt g 101 <210> 91 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15934:1166 <400> 91 aacagtcaga ttcttagggc gttacaggag tctttggcga gtgagctcgc ngctcggatg 60 agtgcgatga gtagtgcttc ggataatgca tcggatctta a 101 <210> 92 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0346:4154 <400> 92 atagaaactc tattgaatta aatgcaggaa gtcatctctc tctcactctt ntttcttttg 60 gataagttgg tcagtaaaac tctaatcagg taacatcatt a 101 <210> 93 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP14298:10133 <400> 93 gaaagatagt cgtgtgctga aaatcggacg acgacggtga atatagttga naagctcaac 60 taacaacaca tttcactcaa ctaatatata ttgtttatta c 101 <210> 94 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15168:3345 <400> 94 ggacaaatag taagagaaaa gtagaatggc aaaaccgtga atagatgtga ntagaggggc 60 aaaacataag catgacagac tgtcacgcca acgcgaccag a 101 <210> 95 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15214:1699 <400> 95 tcattgtcag atgtgtgact tctgacatat tccagatatt ccatatgtta ntatatgtgc 60 tttatgtgga atgagtattt tgaatctata ctatcgctgt g 101 <210> 96 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Rs1SSR8316:1859 <400> 96 ccgaagaggt gcactcaccc aaaacatatc agccatcatc aagattcatt naacatgcga 60 catcgagtaa caactttcct gaactcatcc aagcttagct g 101 <210> 97 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS1004:1908 <400> 97 cttgtggttc tcatctctcc tcttctaaat tactccaatc tcgtagctaa ngaaaatctg 60 aaacctcgat aaatctggaa taaggtatct tcctttccct t 101 <210> 98 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0540:9155 <400> 98 ttaccctcaa cagtctcctc ttgtgtctct gtcatttctg tcattctcat ntcttcctga 60 ctttccttct cctcctcaat atcagctacc gatgagtctc c 101 <210> 99 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2698:3023 <400> 99 aggttctata tacagagtta attacctgtt caggtcccag accatcagcc ntctgtcttc 60 accggaagat gcaagcactg tttcatggtt aggatcccac t 101 <210> 100 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2759:1285 <400> 100 gaagcgttta tgagaggtgg aaacttgaag tctgttgcgt ctgtgaagaa ncttgataag 60 gttggtgcta ggcttgtcag tagcatctcc aggtgatttg c 101 <210> 101 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP07479:306 <400> 101 tgcgtctgtt caaccgctgg atttggattg taagtaaagt gctattgaac nacatttttg 60 ctgtagacag aaactacaat ctacaactga ttgagttaaa a 101 <210> 102 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP08087:895 <400> 102 attaagaaaa aaaggtggta atgggttata attttttcaa acctgaaggt naagctatga 60 tctacccaga agtgttcatt gtttctggta atagtaaggc a 101 <210> 103 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2742:2736 <400> 103 ccaccaccta tgagcgggag gaaaccatat tttttaacga acattgccca ngggttcaag 60 attctgtcct ctgtgccaat catggtcgca ggcctcatga c 101 <210> 104 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> UgRsr11:933 <400> 104 atccagaaac tttttaaacc aaatgatatc taatgattag taaacgtaaa ntatgattaa 60 atctaagaaa aagggtactg aaatggaatg aaacaaaaaa a 101 <210> 105 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS1222:2422 <400> 105 tcttatgtta aatctatcct gttacttctt gtgccgactc cttcactgag ntgtgaaatt 60 catcgaatgt gagatccagt atatataatg gtagtacacc t 101 <210> 106 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15239:520 <400> 106 aaagataaaa tatatgatga gtttatgatg atcatcggaa tctatattgc nttttgttta 60 atcacggtga ctagagatta taaaattaac atttttgtat c 101 <210> 107 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0275:619 <400> 107 caccactatt ggtgcttgat gatgaaacat gaagtttcag gctctcaaaa ngcagcaaag 60 gccttccaat gtcagtgcca ctggacccct cttcttgatg t 101 <210> 108 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0639:23245 <400> 108 tgctctttca tgcggaggcc caagtgaggg attcgctcag agagctcaaa ngccaccttg 60 gcgttcatgg taggacccag cagcatcaga gacccgccac g 101 <210> 109 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0279:2650 <400> 109 tggggagatg attggggcga tggagatgaa gaacagccga acactccggt nttaccactc 60 acaccgagtg tttcttctag aggacttgct cctagacgac t 101 <210> 110 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Rpp1(12):13698 <400> 110 gagaccttca taaactggag gagctggaga tgaatttatg tgtaagtgta naggtttttc 60 cgactctact caacttggca tctcttgaat cactcaggat g 101 <210> 111 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0413:1293 <400> 111 tttggtgtta ttgtggatca tgctaacaca cctgatggtt tgtcaaggct ncttgattcg 60 gttcgagagc ttaagccaag aagaatcatt actggtatat a 101 <210> 112 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15255:139 <400> 112 aaggtaatac atctgaaagt atgttcgttt gttctagtag acagtcgtga nagaaagtgt 60 gattctttct ttctttaggg ctgattgatt tatcattgga g 101 <210> 113 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL4058s:17459 <400> 113 ttaagatcac caatgacatc accaagatgt tcttcaggtg taacaacttc nactctcatg 60 ataggttcaa gcattctcgg accagctttc ctcatccctt c 101 <210> 114 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> rm25:13310 <400> 114 gcctggagga acttctggat cgggaagttg accgcgtagg cgaagatcac ngggatcatg 60 ccgtagacga agacggaggc catcgacgcg acttgctccg g 101 <210> 115 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15526:3767 <400> 115 gagaaagaac aagtgcttag attccaatat actatacaca catatactta ntatcggatc 60 attttgttca tcctactcaa caaaacattt cttgaaaacg c 101 <210> 116 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS1110:56 <400> 116 gatccaagag tcctgcacca gctgaacact aggacctccg tagacattga ncatcgtctt 60 ataaggagga ggaccgaact tcgaaccgtc cggtctgtaa a 101 <210> 117 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0140:1755 <400> 117 atggcaaaac gtgttcagag gttttcatta aatactattc tttgttttca nccaaaccta 60 gtaaaatatt tgtttttaac acgttttgta attcctgcaa t 101 <210> 118 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS1089:1012 <400> 118 taaacataaa caaacaataa caaaaatcat ttgtttgaaa ttataaaaca ngtgcaaaaa 60 tcaaaatata gtctagctat ttcaagttta acaaaatata c 101 <210> 119 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15376:513 <400> 119 catgacctct tcaacgatct cttatatgct tcttagatta ctaagtaagt nttctactat 60 tcttcatgat gtaatacaac gaactgtgag atcctttctc c 101 <210> 120 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL6327s:261 <400> 120 cgctcaaaga actattattt tgagaggacc taaggtatta gatacaaagt ntttcacttc 60 gatagctacc gaaaatacta aaatttacaa catttagtcg c 101 <210> 121 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3167:1180 <400> 121 tattacaaga actggaatct tgatctcatg aaccgaccgt cttgggaggt ncgtgggctt 60 gtcgagtggt cttacatggc ttggctctcg ttccggtccg a 101 <210> 122 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0714:7237 <400> 122 aggttgatga gaaaaaggca aaagaaaaaa ctaccgagaa agagattaaa naaagaggtg 60 gaaaagatga gtccagaata caagtgaagg acaagaaaaa g 101 <210> 123 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2417:2714 <400> 123 catttgatct ttaatttctt taaaaagtca ttcatgatta tggttatgtg ntttgcgtgt 60 gctatatata cacgtgaaaa taatatgata aaataaaggt c 101 <210> 124 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP01618:583 <400> 124 aaaataataa taccgtcata aatggtttat agttgagtgg ttttccctaa nactctcgga 60 tatgaataat ggttacttga tcgatgacta attattaaaa t 101 <210> 125 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0093:2542 <400> 125 gctcgctgtg attcaaacct gttgaggaaa acataatcga gactcgaagc nataccattg 60 gctgcccata caaatggttt aggtggttta gacattctga g 101 <210> 126 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0570:11776 <400> 126 cgcgccgccg gagaagccgt cggagtgtcg aagaaattgc tgtggagcac nggaaaagcg 60 gcgtggatcg ctggtacgac gtttctcatc ctcgttgttc c 101 <210> 127 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0603:3949 <400> 127 ttggagcaac ctttcttcac aatggcagtg tcatcagaga gaacaaggtg nccttcagca 60 tcagtacccc agaagaaagg cacagtacca tcagcatcct g 101 <210> 128 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0405:4540 <400> 128 accagcttgt tggattcttt ggcggccttg aacttgttgt tccagtcatc nacggtgtgg 60 caagcgatca cttctcctgc tgggatcaat tctgctggtg c 101 <210> 129 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS1951:3253 <400> 129 tacgaaggtg ttgttacccg ttggggtgtg acgaggctgc cacgtaagac ncacaggggt 60 ctgcgtaagg ttgcttgtat cggtgcttgg catccagcta g 101 <210> 130 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0698:4463 <400> 130 ccacttctgc ttcccattct tcccccaaac ccgcctctat cttctctgtt ncctcttgat 60 ctacctgaac ctctgtaatc ttctccgtca ctatcaaaac c 101 <210> 131 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP06697:7926 <400> 131 ataggaactc cactatactt agactctatt ggatataagg tggtcaagtt natgcttaga 60 ctctattgga tataaggtgg tcaagtttat ttgataacta a 101 <210> 132 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL3917s:430 <400> 132 ggagctcttg ttgctaagga gagagccact ggtcaaccca gagggtttgg ntttgttcgc 60 tttgctaatg cttttgatgt cgataaagct ctcgctgatt c 101 <210> 133 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15353:5195 <400> 133 catttagttg accttgatgc ctcagctgca gtctcatggc cttcaaaatt naagtgatcc 60 agggagattg aagcaaaact tgaggcaact aacttagatg a 101 <210> 134 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RPP8(3):1062 <400> 134 agaactgcct tgacgttaaa actcttcagc tctgaccaaa acttgttttg nataattttc 60 aaattgctac ttaaaataaa aatgggatat ataatccaca a 101 <210> 135 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL5908s:619 <400> 135 gttcaaattg aaacataatc tctaacgatg aaaatctcaa aatgttattt nacggtatca 60 gtatttcttc ccctgagcca ggtttactcg aatggcccga c 101 <210> 136 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3831:3488 <400> 136 agttggacga tggtctcgag ctcagtcatc tcttcgggag tgagtttcac ngacaaagct 60 ccgatgttct gattgaggtt ctggatctta gtggttcccg g 101 <210> 137 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15234:1366 <400> 137 atgatttcta acaaaagaat tccaaatgca tagatgtctg atttctcaga naatattcct 60 gtccatgcat actcaggaga catatatcct ctgcatacat c 101 <210> 138 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP14676:3752 <400> 138 gaaaactcat taatcccttt actttgtctt ttgaattact tcaacaccca nactttattt 60 ttacttctcg taagatatgt gaaacagaca caccacccaa c 101 <210> 139 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP08681:5401 <400> 139 acaactaatt attgaactta cctgataaac tgacaaagac tggagttcta ntatgaatag 60 attaagattt ctttaccgat taatgtaacg tcaacatatt a 101 <210> 140 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0882:4013 <400> 140 acatacacag gagaaggagg aatattcgaa gtgtgttgga acaaggaagg naacaaactc 60 gcagcttgct tcgctgataa ctcggtctgt gttcttgatt t 101 <210> 141 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0478:5678 <400> 141 tacctctctc aacaaggcct aaccaagttc cgaaccaaac accgagccac nctccaaacc 60 cagcgtcagc taatccaagc ctctcgcctc ctcgctcgag c 101 <210> 142 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP13509:647 <400> 142 tgcaaaatat caacaaagaa cacaagaatc ctgctggaaa agacagttta nagattgtgt 60 atttgtgttg tagcttctcg attcttgata ggtcggatgt g 101 <210> 143 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15519:445 <400> 143 tattgtgatt acagttaaac cataccaagt ccccttgctg ctacatcagt ngcagtcatt 60 atcgggcttc taccgctctt aaattctgac aagacacgat c 101

Claims

서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP(single nucleotide polymorphism) 뉴클레오티드를 포함하는 8 내지 200개의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 WK10039, WK10024, Long Scarlet, DB102, DB104, DB109, DB110, DB113, Aokubi, Sayatori, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3 및 Raphanistrum로부터 선택된 무의 종 판별용 SNP 마커 조성물.
제 1 항에 따른 SNP 마커 조성물을 포함하는 무의 종 판별을 위한 키트.
(a) 시료로부터 분리된 핵산분자를 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP 폴리뉴클레오티드를 증폭할 수 있도록 제작된 프라이머쌍을 이용하여 증폭하는 단계;
(b) 상기 (a)의 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP 폴리뉴클레오티드의 염기타입을 확인하는 단계;를 포함하는 WK10039, WK10024, Long Scarlet, DB102, DB104, DB109, DB110, DB113, Aokubi, Sayatori, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3 및 Raphanistrum 로부터 선택된 무의 종을 판별하는 방법.
삭제
제 3 항에 있어서,
상기 방법은 (i) 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP 뉴클레오타이드에 인접한 서열과 어닐링하고, (ii) 3' 말단의 뉴클레오타이드가 상기 SNP 뉴클레오타이드로부터 -1 위치의 뉴클레오타이드와 매칭되는 지노타이핑(genotyping) 프라이머를 이용하여 SNP 폴리뉴클레오티드의 염기타입을 분석하는 것을 특징으로 하는 방법.
제 3 항에 있어서,
상기 방법은 서열번호 1 내지 143으로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP 뉴클레오티드를 포함하는 8 내지 200개의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드에 결합할 수 있는 프로브를 이용하여 SNP 폴리뉴클레오티드의 염기타입을 분석하는 것을 특징으로 방법.