KR100487995B1 - Early selection analysis method for gene of pigs with quality meat - Google Patents
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Abstract
본 발명은 돼지의 혈액이나 조직으로부터 DNA를 추출한 후, 경제형질 연관 DNA marker를 이용하여 PCR을 행한 후, 각 microsatellite 부위의 특정 염기서열을 증폭하여 Genetic Analyzer에서 유전자형을 분석하여 확인함과 동시에 육질형질이 우수한 돼지 유전자를 조기에 선발하고자 안출된 것인바, 이를 위해 본 발명은 돼지혈액으로부터 DNA를 추출하는 제 1단계와; 상기 제 1단계에서 추출된 DNA를 이용하여 PCR 프라이머를 제작하는 제 2단계와; 상기 제 2단계에서 생성된 프라이머 염기서열 부분을 증폭하기 위해 PCR을 수행하는 제 3단계와; 상기 제 3단계를 Genetic Analyzer에서 유전자형(genotype)을 확인하여 DNA marker를 형성하는 제 4단계; 및 제 4단계의 공정을 거친 DNA marker를 통해 도체형질, 품질특성, 육색 및 지방색, 지방산조성의 공통적인 특성이 연관된 분석 결과를 용이하게 확인할 수 있도록 한 제 5단계가 구비됨을 특징으로 하고 있다.The present invention extracts DNA from blood or tissues of pigs, performs PCR using economic trait DNA markers, and then amplifies specific sequences of each microsatellite site by analyzing genotypes in the Genetic Analyzer and confirming meat quality. The excellent pig gene is designed to be selected early, for this purpose, the present invention comprises the first step of extracting DNA from pig blood; A second step of preparing a PCR primer using the DNA extracted in the first step; A third step of performing PCR to amplify the primer nucleotide sequence generated in the second step; A fourth step of forming a DNA marker by identifying a genotype in a genetic analyzer in the third step; And a fifth step for easily confirming an analysis result in which common characteristics of conductor shape, quality characteristics, meat color and fat color, and fatty acid composition are easily identified through the DNA marker processed in the fourth step.
Description
본 발명은 육질이 우수한 돼지의 유전자를 조기에 선발 분석하는 방법에 관한 것으로서, 특히 돼지의 혈액이나 조직으로부터 DNA를 추출한 후, 경제형질 연관 DNA marker를 이용하여 PCR을 행한 후 각 microsatellite 부위의 특정 염기서열을 증폭하여 Genetic Analyser에서 유전자형을 확인하여 우수한 육질의 돼지 유전자를 조기에 선발·분석할 수 있도록 한 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a method for early selection and analysis of genes of pigs with excellent meat quality, and particularly, after DNA extraction from blood or tissues of pigs, PCR is performed using an economical DNA marker, and then a specific base of each microsatellite site. The present invention relates to a method for amplifying a sequence to identify a genotype in a genetic analyzer so as to enable early selection and analysis of excellent meat pig genes.
최근, 국내에서는 외국산 비육돈에 대응할 수 있는 경쟁력 있는 양돈산업을 발전시키기 위해 국내산 종돈의 생산 및 보급을 자체적으로 연구개발하여 많은 효과를 거두고 있는 추세이다.Recently, in order to develop a competitive swine industry that can cope with foreign hogs, domestic production and dissemination of domestic hogs has been researched and developed in-house, which has produced many effects.
예를들면, 재래 흑돼지는 등지방 두께가 두껍고 사료 효율과 성장률 및 생산 율이 낮아 양돈 농가의 선호도가 낮았으나, 일반 개량종에 비해 단단한 지방 조직, 백색의 지방색, 좋은 질감, 풍부하고 담백한 육즙으로 우리 입맛에 맞는 풍미 때문에 꾸준히 그 소비가 증가하고 있다.For example, traditional black pigs have low backfat thickness, low feed efficiency, low growth rate, and low production rate, making them less preferred for hog farmers.However, compared to other breeds, they have hard fat tissue, white fat color, good texture, and rich and light gravy. Its consumption is steadily increasing because of its flavor.
그러나, 재래 돼지에 대한 유전적인 연구나 혈통 유지 관리, 육질에 연관된 유전자 분석에 대한 연구 결과는 현재까지 매우 미흡한 실정이고 특히, 육질에 관한 유전 형질은 육량에 관한 형질과는 달리 보다 많은 유전 형질에 대한 복합적인 결과로서 이에 대한 연구 결과는 많지 않다(Cameron, 1993).However, the results of genetic studies on conventional pigs, lineage maintenance, and genetic analysis related to meat have been very insufficient to date, and in particular, the genetic traits related to meat are more genetic than traits related to meat. As a complex result, there is not much research on this (Cameron, 1993).
한편, 현재까지 알려져 있는 돼지에서 육질에 영향을 미치는 중요한 유전자로는 PSE(pale, soft, exudative) 돈육색의 원인이 되는 ryanodine receptor gene(RYR), 산성육(acid meat) 유전자가 있고, 그 외에는 QTL (quantitative trait loci) 분석에 의한 육질에 연관된 염색체 구역이나 여러 가지 후보유전자(candidate gene)가 알려져 있다.On the other hand, important genes affecting meat quality in swine known to date include ryanodine receptor gene (RYR) and acid meat genes, which cause PSE (pale, soft, exudative) pork meat color, and others. Chromosomal regions or candidate genes involved in meat quality by quantitative trait loci (QTL) analysis are known.
7번 염색체에 존재하는 swine leucocyte antigen (SLA) 복합체와 이 부근에 위치하는 micorsatellite marker S0064, S0066, S0102나 TNF α는 등지방 두께, 등심 단면적, 육질 형질, 웅취 (boar taint)와 연관성이 있는 것으로 알려져 있다.The swine leucocyte antigen (SLA) complex on chromosome 7 and the micorsatellite markers S0064, S0066, S0102 or TNF α located nearby are associated with backfat thickness, loin cross-sectional area, meaty trait, and boar taint. Known.
그리고, microsatellite marker S0001∼S0175 위치에서 등지방 두께와 복부지방 함량과 연관된 QTL이 존재한다고 밝혀져 있고, 호르몬들의 조절인자로 알려진 뇌하수체 특이 전사 인자 (pituitary-specific transcription factor; PIT1) 유전자도 등지방 두께와 연관되어진 것으로 보고 되었다.The pituitary-specific transcription factor (PIT1) gene, also known as a regulator of hormones, was found to exist in the microsatellite markers S0001 to S0175. It has been reported to be related.
근내 지방 함량 (Intramuscula fat content; IMF)은 고기의 부드러움(tenderness), 수분량(juiciness), 그리고 맛에 크게 영향을 미치는 것으로 알려져있다.Intramuscula fat content (IMF) is known to significantly affect meat tenderness, juiciness, and taste.
근내 지방 함량에 영향을 미치는 유전자로는 H-FAPB (heart-fatty acid binding protein)가 보고된 바 있고, 6번 염색체에 존재하는 microsatellite SW1823∼S0003 (74∼79cM) 위치에서도 이와의 연관성이 연구되었다.H-FAPB (heart-fatty acid binding protein) has been reported as a gene affecting intramuscular fat content, and its association with the microsatellite SW1823-S0003 (74-79 cM) located on chromosome 6 has been studied. .
이와 같이 4번, 6번, 7번 염색체에서 주로 육질 형질에 영향을 미치는 QTL이 많이 보고 되어짐에 따라, 이 염색체들을 중심으로 한 육질 연관 DNA marker 개발에 대한 연구가 전세계적으로 많이 진행되고 있다.As many QTLs that mainly affect meat traits on chromosomes 4, 6, and 7 have been reported, researches on the development of meat-associated DNA markers centering on these chromosomes have been conducted worldwide.
따라서, 본 발명은 돼지의 혈액이나 조직으로부터 DNA를 추출한 후 경제형질연관 DNA marker를 이용하여 PCR을 행하며 이후 각 microsatellite 부위의 특정 염기서열을 증폭하여 Genetic Analyzer에서 genotype을 분석하여 확인함으로 육질형질이 우수한 돼지 유전자를 조기에 선발하기 위한 방안을 제공함에 안출된 목적이 있다.Therefore, the present invention extracts DNA from blood or tissues of pigs and performs PCR using economically-associated DNA markers, and then amplifies specific sequences of each microsatellite site by analyzing genotypes in the Genetic Analyzer to identify superior meat traits. The purpose is to provide a method for early selection of porcine genes.
즉, 돼지의 유전인자 중 육질과 연관된 염색체를 분석하여 우수한 염색체를 선발하므로서 육질이 우수한 돼지의 유전인자를 보급시키기 위한 목적을 포함한다.In other words, by analyzing the chromosomes associated with meat from the genetic factors of pigs to select excellent chromosomes, it includes the purpose of disseminating the genetic factors of pigs with excellent meat quality.
상기의 목적 달성을 마련되는 본 발명은 돼지 혈액으로부터 DNA를 추출하는 제 1단계와; 상기 제 1단계에서 추출된 DNA를 이용하여 PCR 프라이머를 제작하는 제 2단계와; 상기 제 2단계에서 생성된 프라이머 염기서열 부분을 증폭하기 위해 PCR을 수행하는 제 3단계와; 상기 제 3단계를 Genetic Analyzer에서 유전자형(genotype)을 확인하여 DNA marker를 형성하는 제 4단계, 및 제 4단계의 공정을 거친 DNA marker를 통해 도체형질, 품질특성, 육색 및 지방색, 지방산조성의 공통적인 특성이 연관된 분석 결과를 용이하게 확인할 수 있도록 한 제 5단계가 구비됨을 그 기술적 사상의 특징으로 한다.The present invention to achieve the above object is the first step of extracting DNA from pig blood; A second step of preparing a PCR primer using the DNA extracted in the first step; A third step of performing PCR to amplify the primer nucleotide sequence generated in the second step; The third step is to identify the genotype in the Genetic Analyzer to form a DNA marker, and the common constituents of the conductor shape, quality characteristics, color and fat color, and fatty acid composition through the DNA marker that has undergone the fourth and fourth steps. A technical feature is that a fifth step is provided so that an analysis result associated with phosphorus can be easily identified.
본 발명인 돼지 유전인자의 조기 선발 분석을 위한 방법은 이하의 상세한 설명과 실시예를 통해 보다 양호한 상태로 재현될 수 있을 것이다.The method for early selection analysis of the present invention porcine genetic factors may be reproduced in a better state through the following detailed description and examples.
[실시예 1] 혈액으로부터 게놈 DNA 추출을 하는 제 1단계Example 1 First Step of Genomic DNA Extraction from Blood
돼지로부터 채취한 혈액은 Genomic DNA purification kit(Promega, USA)를 이용하여 순수 DNA를 추출하였다.Blood from pigs was extracted with pure DNA using Genomic DNA purification kit (Promega, USA).
혈액 300㎕ 취하여 1.5㎖ E-tube에 넣고 Cell Lysis solution 900㎕과 혼합하여 10분동안 상온에 방치한다.300 μl of blood was taken in a 1.5 ml E-tube and mixed with 900 μl of Cell Lysis solution and left at room temperature for 10 minutes.
원심분리기로 3분간 원심분리한 후, 흰색의 침점물이 생기면 붉은 색의 상층액 10-20㎕만 남기고 상층액 부분을 pipette을 이용하여 모두 버린다.After centrifugation for 3 minutes with a centrifuge, if white precipitates are formed, discard only 10-20 μl of the red supernatant and discard all of the supernatant using a pipette.
흰색의 침전물과 남은 10-20㎕ 상층액을 vortex를 이용하여 흰색 침전물이 보이지 않을 때까지 완전히 섞어 준다.Mix white precipitate and remaining 10-20μl supernatant thoroughly using vortex until white precipitate is not seen.
그런 다음 Nuclei Lysis solution 300㎕을 첨가하여 pipette으로 끈적끈적한 용액이 물처럼 풀어질 때까지 완전히 혼합한다.Then add 300µl of Nuclei Lysis solution and mix thoroughly with pipette until the sticky solution is released as water.
RNase(10mg/㎖) 3㎕을 첨가하고 37℃ 인큐베이터(incubator)에서 20분동안 배양한다.3 μl of RNase (10 mg / ml) is added and incubated for 20 minutes in a 37 ° C. incubator.
상온에서 5분정도 방치한 후, Protein Precipitaion solution 100㎕을 넣고 상기 용액과 vortex로 혼합해 주면 갈색의 작은 단백질 덩어리들이 보이게 된다.After standing at room temperature for 5 minutes, 100 μl of Protein Precipitaion solution is added and mixed with the solution and vortex to show small brown chunks of protein.
그런 다음 상온에서 13,000rpm으로 5분동안 원심분리하면 갈색 침전물과 흰색의 투명한 상층액으로 분리되어지고, 여기에서 상층액만을 새 깨끗한 E-tube로 이동한다.Then, centrifugation at 13,000 rpm for 5 minutes at room temperature separates the brown precipitate and the white transparent supernatant, where only the supernatant is transferred to a new clean E-tube.
여기에 isopropanol 300㎕을 넣고 E-tube를 아래위로 잘 섞어서 DNA가 엉기도록 한다.Add 300 μl of isopropanol and mix the E-tube up and down to clump the DNA.
흰색 실타래같은 DNA 가닥을 눈으로 확인할 수 있게 되고, 다시 13,000rpm이상에서 원심분리하면 흰 DNA 침전물과 상층액(용액+isopropanol)이 분리되고, 상층액 부분을 E-tube를 거꾸로 세워 완전히 제거한다.DNA strands like white thread can be seen with eyes, and centrifugation at 13,000 rpm or more separates white DNA precipitate and supernatant (solution + isopropanol), and removes the supernatant part upside down with E-tube.
마지막으로 여기에 70% ethanol을 첨가하여 한두번 조심스럽게 흔들어 주고, 13,000rpm 이상에서 재원심분리하고, E-tube의 ethanol을 완전히 제거한다.Finally, add 70% ethanol, shake it carefully once or twice, recentrifuge at 13,000 rpm or higher, and completely remove the ethanol from the E-tube.
침전된 DNA에 깨끗한 증류수 대략 50㎕을 첨가하여 DNA를 잘 녹여서 냉장 보관한다.Approximate 50 µl of clean distilled water is added to the precipitated DNA to dissolve the DNA and store in a refrigerator.
[실시예 2] 프라이머를 제작하는 제 2단계Example 2 Second Step of Producing a Primer
돼지의 육질형질이 우수한지의 여부를 확인할 수 있는 DNA marker는 총 60개를 제작하였다.A total of 60 DNA markers were prepared to confirm whether pigs had good meat quality.
이들 DNA marker는 동일한 marker가 1개 이상의 형질을 분석할 수 있으므로서 중복되는 marker를 제외하고 세 형질을 모두 합하여 총 23개 DNA marker에 대하여 forward 프라이머와 reverse 프라이머를 제작하여 각 DNA marker에 대한 유전자형을 확인하는데 이용하였다.Since these same DNA markers can analyze one or more traits, all three traits except the overlapping markers are combined to create forward and reverse primers for a total of 23 DNA markers. It was used to confirm.
제작된 각 프라이머에 의한 유전자형은 증폭된 DNA fragment의 size로서 microsatellite의 반복회수의 차이로서 구분되어진다.The genotypes of the prepared primers are divided by the difference in the number of repetitions of microsatellite as the size of the amplified DNA fragment.
23개 프라이머 세트(Forward + Reverse)의 염기서열은 표 1과 같다.The base sequences of 23 primer sets (Forward + Reverse) are shown in Table 1.
이들에 대해서 foward 프라이머의 5' 말단부위에 형광물질인 6-fam, hex, ned중 한 개를 붙인 프라이머를 합성한다.For these, primers with one of 6-fam, hex, and ned phosphors were synthesized at the 5 'end of the foward primer.
[실시예 3] DNA의 중합효소연쇄반응(PCR)을 하는 제 3단계Example 3 Third Step of DNA Polymerase Chain Reaction (PCR)
육질과 연관된 특이적인 유전자형을 확인하기 위해 실시한 PCR 조건은 표 2에 나타낸 바와 같다.PCR conditions performed to identify specific genotypes associated with meat quality are shown in Table 2.
23개 DNA marker의 프라이머에 따라 PCR 조건은 세 종류의 annealing 온도의 변화가 있어 세 부류로 나누어진 표 2와 같다.According to the primers of 23 DNA markers, PCR conditions are shown in Table 2, which is divided into three classes because of three kinds of annealing temperature changes.
[실시예 4] Genetic Analzyer에 의한 육질 연관 유전자형 확인하는 제 4단계혈액에서 추출한 genomic DNA를 주형으로 하여 PCR한 산물은 Genetic Analyzer에서 육질과 연관된 유전자형을 확인한다.[Example 4] 4th Step of Confirming Genotype-Related Genotypes by Genetic Analzyer As a template, genomic DNA extracted from blood was identified as a template and genotype-related genotypes were confirmed by Genetic Analyzer.
PCR 산물 15㎕ 중 10㎕을 취하여 95% 에탄올(2.5X) 과 3M 나트륨아세테이트(1/10X)를 첨가하여 ice에 15분동안 꽂아 두었다가 4℃ 초고속원심분리기에서 13,000rpm 이상으로 30분동안 원심분리시킨다.Take 10 µl of 15 µl of PCR product, add 95% ethanol (2.5X) and 3M sodium acetate (1 / 10X), place in ice for 15 minutes, and centrifuge for 30 minutes at 13,000 rpm or more in a 4 ° C ultra-centrifuge. Let's do it.
프라이머 합성에 붙여진 형광물질에 따라 색깔있는 침전물과 상층액으로 분리되어지면 이중 상층액 부분만을 E-tube를 거꾸로 해서 완전히 제거한다.When separated into colored precipitate and supernatant according to the fluorescent material attached to the primer synthesis, only the double supernatant part is completely removed by inverting the E-tube.
그런 다음 70% 에탄올 200㎕을 첨가하여 다시 4℃ 원심분리기에서 30분동안 원심분리하여 순수한 DNA 침전물을 얻고, 나머지 상층액은 완전히 제거한다.Then, 200 μl of 70% ethanol was added and centrifuged again in a 4 ° C. centrifuge for 30 minutes to obtain pure DNA precipitate, and the remaining supernatant was completely removed.
완전히 에탄올이 제거되고 dry된 DNA 침전물을 증류수(ddH2O) 10㎕에 녹여 둔다.The ethanol is completely removed and the dried DNA precipitate is dissolved in 10 µl of distilled water (ddH 2 O).
증류수에 녹여진 DNA 중 1㎕을 취하여 formamide 12㎕과 GeneScan Size marker(GS400HD, applied biosystems, USA) 0.5㎕을 함께 섞어준 다음, 95℃에서 5분동안 heating하여 이중가닥 DNA를 단일가닥 DNA로 변성시켜 준 다음 Genetic Analyzer에 loading으로 결과를 확인한다.Take 1µl of DNA dissolved in distilled water, mix 12µl of formamide with 0.5µl of GeneScan Size marker (GS400HD, applied biosystems, USA), and heat it at 95 ℃ for 5 minutes to denature double-stranded DNA into single-stranded DNA. After loading, check the result by loading in Genetic Analyzer.
육질 연관 실험의 실시예( DNA marker)Example of meat association experiment (DNA marker)
63개의 분석된 marker 중 50개의 marker에서 1개 이상의 여러 형질과 연관성이 있는 것으로 나타났다.Fifty of the 63 analyzed markers were associated with one or more traits.
도체형질과 육질형질에 연관성 있는 것으로 나타난 50개의 marker는 다음과 같았다The 50 markers found to be correlated with carcass traits were:
* _ ; 4(도체형질, 품질특성, 육색 및 지방색, 지방산조성)종류의 항목 모두에 연관성 있게 나타난 marker이다.* _; It is a marker that is related to all 4 items (Conductor quality, quality characteristics, meat color and fat color, fatty acid composition).
전체 50개의 형질 연관 marker 중 도체형질, 품질특성, 육색 및 지방색, 그리고 지방산 조성에 모두 연관성있게 나타난 marker는 22개였고, 개별적인 육질 형질 항목에 대한 육질 연관성은 앞의 각 marker별 분석 결과와 같았다.Of the 50 trait markers, 22 markers were found to be correlated with carcass trait, quality characteristics, color and fat color, and fatty acid composition. The trait association of individual meat traits was the same as the previous analysis results.
그리고, 분석결과 중 도체형질, 품질특성, 육색 및 지방색, 지방산조성의 4항목에 대해서 구분하여 전체적으로 공통적인 특성을 연관성 있게 나타내는 육질분석 결과를 확인하는 제 5단계를 거쳐 육질과 연관된 DNA marker로 개발하는데 이용하고자 한다.In addition, it is developed as a DNA marker related to meat quality through the fifth step of identifying meat quality analysis results that show the common characteristics as a whole by classifying the four items of conductor quality, quality characteristics, meat color and fat color, and fatty acid composition among the analysis results. To use.
일단 각 형질과의 연관성이 확인된 상기의 50개 marker는 모두 육질 연관 DNA marker로 확보되어졌고, 육질 분석 결과에 대해서 나타나는 특징적인 결과에 대해서 4항목으로 구분하여 육질 연관 DNA marker로서 돼지의 선발 및 육종에 이용하고자 하는 방법을 설명하고자 한다.Once the above 50 markers were confirmed to be associated with each trait, all of the above 50 markers were obtained as meat-associated DNA markers. To explain how to use for breeding.
1) 도체형질1) conductor shape
도체형질은 도체시 생체중(LW, live weight), 도체중(CW, carcass weight), 정육율(DP, dressing percent), 등지방두께(BF, backfat thickness)를 조사하여 이 형질과 연관성이 있는 33개의 DNA marker를 확인할 수 있었다.Carcass morphology was analyzed by carcass weight (CW), carcass weight (CW), carcass weight (DP), dressing percent (DP) and backfat thickness (BF). DNA markers could be confirmed.
각 개별적으로 연관성 있게 나타난 분석 결과는 앞에서 설명된 marker 별 분석 결과와 같았다.The analysis results of each individual association were the same as those of the markers described above.
생체중과 도체중에서는 서로 정의 상관관계를 가지므로서 생체중이 높은 경우 도체중이 높게 나타나는 것을 확인할 수 있었고, 체중이 높은 경우 등지방두께 값도 높게 나타나는 것을 확인할 수 있었다.In the body weight and the carcass weight, there was a positive correlation between the carcass weight was high when the body weight was high, and when the weight was high, it was confirmed that the back fat thickness value was also high.
이러한 양상으로 나타나는 도체형질 연관 DNA marker는 다음과 같았다.Carcass-associated DNA markers in this pattern were as follows.
(1) SW841 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a154가 출현한 경우 생체중, 도체중, 등지방 두께가 모두 낮게 나타나고, a172가 출현한 경우 생체중, 도체중, 등지방두께가 모두 높게 나타난다.(1) SW841 : Four alleles appeared. When a154 appeared, all live weights, carcass weight, and backfat thickness were low. When a172 appeared, all live weight, carcass weight, and backfat thickness were high.
(2) SW270 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a160이 출현한 경우 생체중과 도체중이 낮고, a130이 출현한 경우 높게 나타난다.(2) SW270 : Five alleles appeared. When a160 appeared, live weight and carcass weight were low, and when a130 appeared, it appeared high.
(3) SW835 : 8개의 대림유전자가 출현하였는데 a246이 출현한 경우 생체중, 도체중, 정육율, 등지방두께 모두 낮고, a236이 출현한 경우 모두 높게 나타난다.(3) SW835 : Eight Daelim genes appeared. When a246 appeared, all live weights, carcass weight, meat mass, and backfat thickness were low, and a236 appeared high.
(4) SW1678 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a99가 출현한 경우 생체중, 도체중, 등지방두께가 낮고, a111이 출현한 경우 높게 나타난다.(4) SW1678 : Four alleles appeared, but a99 appeared low in live weight, carcass weight, and backfat thickness, and high when a111 appeared.
(5) S0301 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a251이 출현한 경우 생체중과 도체중이 낮고, a253이 출현한 경우 높게 나타난다.(5) S0301 : Five alleles appeared, but when a251 appeared, live weight and carcass weight were low, and appeared when a253 appeared.
(6) S0107 : 8개의 대립유전자가 출현하였는데 a164가 출현한 경우 생체중과 도체중이 낮고, a220이 출현한 경우 높게 나타난다.(6) S0107 : Eight alleles appeared, with a164 appearing lower in live weight and carcass weight, and a220 appearing higher.
(7) S0097 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a237이 출현한 경우 생체중과 도체중 높게 나타난다.(7) S0097 : Six alleles appeared, but a237 appeared high in live weight and carcass weight.
(8) SW2404 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a164가 출현한 경우 생체중, 도체중, 정육율, 등지방두께가 모두 낮고, a130이 출현한 경우 모두 높게 나타난다.(8) SW2404 : Six alleles appeared, but when a164 appeared, all live weight, carcass weight, meat mass, and backfat thickness were low, and a130 appeared high.
(9) SW2454 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a128이 출현한 경우 생체중과 도체중이 낮고, a94가 출현한 경우 높게 나타난다.(9) SW2454 : Five alleles appeared, with a128 appearing lower in live weight and carcass weight, and a94 appearing higher.
(10) SW839 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a145가 출현한 경우 생체중, 도체중, 등지방두께가 낮고, a163이 출현한 경우 높게 나타난다.(8) SW839 : 6 alleles appear, but a145 appears to have a low live weight, carcass weight, and backfat thickness, and a163 appears to appear high.
(11) SW714 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a141이 출현한 경우 생체중, 도체중, 등지방두께가 높게 나타난다.(11) SW714 : Four alleles appeared, but when a141 appeared, the body weight, carcass weight, and backfat thickness were high.
(12) SW58 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a219가 출현한 경우 생체중, 도체중, 등지방두께가 낮고, a217이 출현한 경우 높게 나타난다.(12) SW58 : Four alleles appeared, but a219 appeared low in live weight, carcass weight, and backfat thickness, and high when a217 appeared.
(13) SW1475 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a158이 출현한 경우 생체중과 도체중이 낮고, a172이 출현한 경우 높게 나타난다.(13) SW1475 : Five alleles appeared, with a158 appearing low in live weight and carcass weight, and a172 appearing high.
(14) SW1710 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a172가 출현한 경우 생체중, 도체중, 등지방두께가 낮고, a158과 a160이 출현한 경우 높게 나타난다.(14) SW1710 : Six alleles appeared, but a172 appeared low in live weight, carcass weight, and backfat thickness, and high in a158 and a160.
(15) SW2066 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a202가 출현한 경우 생체중과 도체중이 낮고, a196이 출현한 경우 높게 나타난다.(15) SW2066 : Five alleles appeared, with a202 appearing lower in live weight and carcass weight, and a196 appearing higher.
(16) SW1336 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a133이 출현한 경우 생체중과 도체중이 낮고, a135가 출현한 경우 높게 나타난다.(16) SW1336 : Four alleles appeared, with a133 appearing lower in live weight and carcass weight, and a135 appearing higher.
상기의 도체형질 연관 DNA marker의 한 실시예는 그림1과 같다.One embodiment of the above conductor-associated DNA marker is shown in Figure 1.
2) 품질(육질)특성2) Quality (meat) characteristics
품질특성은 도체시 등심조직을 채취하여 이로부터 수분(MOS, moisture), 지방(CF, crude fat), pH, 전단가(SF, shear force), 가열함량(CL, heating )을 분석하여 이 형질과 연관성이 있는 45개 DNA marker를 확인할 수 있었다.The quality characteristics of the carcasses were collected from the carcasses of the carcass and analyzed from the moisture (MOS, moisture), fat (CF, crude fat), pH, shear value (SF) and heating content (CL, heating). 45 DNA markers were identified.
각 개별적으로 연관성있게 나타난 분석 결과는 앞에서 설명된 marker 별 분석 결과와 같았다.The analysis results of each individual association were the same as those of the markers described above.
수분함량이 높으면 지방함량은 낮게 나타나므로 수분과 지방색의 함량은 서로간에 상반되는 값을 가지는 경향을 보이고, pH가 높으면 보수력이 높고 Drip loss는 낮을 수 있으므로 pH값은 높으면 좋으나 다른 형질과의 높은 상관관계는 없는 것으로 나타났다.The higher the water content, the lower the fat content, so the water and fat color tend to have opposite values.The higher the pH, the higher the water retention capacity and the lower the drip loss. There was no relationship.
그리고, 전단가는 낮으면 질감이 부드러워서 좋고, 가열함량은 낮을수록 산출물이 적으므로 좋은데 비교적으로 지방함량이 높은 경우 전단가와 가열함량이 낮게 나타나는 경향을 보였다.The lower the shear value is, the better the texture is, and the lower the heating content is, the lower the output is. However, when the fat content is high, the shear value and the heating content tend to be low.
그러므로 지방함량이 높으면서 전단가와 가열함량이 낮게 나타나는 육질이 우수한 개체와 연관된 DNA marker는 다음과 같았다.Therefore, the following DNA markers were associated with high-quality individuals with high fat content and low shear value and low heating content.
(1) SW2434 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a169가 출현한 경우 수분함량이 높아 전단가와 가열함량도 높게 나타나고, a131이 출현한 경우 수분함량이 낮아 전단가와 가열함량이 높게 나타난다.(1) SW2434 : Six alleles appeared. When a169 appeared, the shear content and heating content were high because of high water content, and the shear value and heating content were high when a131 appeared.
(2) S2049 : 2개의 대립유전자가 출현하였는데 a234가 출현한 경우 지방함량이 높아 전단가가 낮게 나타나고, a226이 출현한 경우 지방함량이 낮아 전단가가 높게 나타난다.(2) S2049 : Two alleles appeared, but a234 appeared high shear content with high fat content, and a226 appeared high shear value with low fat content.
(3) SWR73 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a162가 출현한 경우 전단가와 가열함량이 낮게 나타나고, a184가 출현한 경우 전단가와 가열함량이 높게 나타난다.(3) SWR73 : Six alleles appeared, with a162 appearing low shear and heating content, and a184 appeared high shear and heating content.
(4) SWR2179 : 7개의 대립유전자가 출현하였는데 a148이 출현한 경우 지방함량이 높고 전단가가 낮게 나타나고, a162가 출현한 경우 지방함량이 낮아 전단가가 높게 나타나는 경향을 보였다.(4) SWR2179 : Seven alleles appeared, but a148 appeared to have high fat content and low shear value, and a162 showed a low fat content and high shear value.
(5) S0097 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a233이 출현한 경우 pH값이 낮고, 가열함량이 높아 육질이 떨어지는 것으로 나타난다.(5) S0097 : Six alleles appeared, but when a233 appeared, the pH value was low and the heating content was high.
(6) SW1707 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a111이 출현한 경우 전단가와 가열함량이 낮게 나타나고, a113이 출현한 경우 높게 나타난다.(6) SW1707 : Five alleles appeared, with a111 appearing low shear value and heating content, and a113 appearing high.
(7) SW2404 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a128이 출현한 경우 지방함량과 pH가 높게 나타나고, a164가 낮게 나타난다.(7) SW2404 : Six alleles appeared, but when a128 appeared, fat content and pH were high and a164 was low.
(8) S2049 : 2개의 대립유전자가 출현하였는데 a226이 출현한 경우 지방함량이 낮고 전단가는 높게 나타나고, a234가 출현한 경우 지방함량이 높고 전단가는 낮게 나타난다(8) S2049 : Two alleles appeared, where a226 appeared to have low fat content and high shear value, and when a234 appeared, high fat content and low shear value
(9) SW489 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a170이 출현한 경우 지방함량이 높고 가열함량은 낮게 나타나고, a168이 출현한 경우 지방함량이 낮고 가열함량이 높게 나타난다.(4) SW489 : Five alleles appeared, with a170 appearing high fat content and low heating content, and a168 appeared low fat content and high heating content.
(10) SWR1998 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a176이 출현한 경우 지방함량이 낮고 전단가는 높게 나타나고, a182가 출현한 경우 지방함량이 높고 전단가가 높게 나타난다.(10) SWR1998 : Six alleles appeared, with a176 appearing low fat content and high shear value, and a182 appeared high fat content and high shear value.
(11) SW2066 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a196이 출현한 경우 지방함량이 높고 전단가가 낮게 나타난다.(11) SW2066 : Five alleles appeared, but a196 showed high fat content and low shear value.
(12) SW1336 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a135가 출현한 경우 pH가 낮고 가열함량도 낮게 나타난다.(12) SW1336 : Four alleles appeared, but when a135 appeared, low pH and low heating content.
상기의 품질특성(육질) 연관 DNA marker의 한 실시예는 그림2와 같다.An example of the above quality-related (meat) DNA marker is shown in Figure 2.
3) 육색 및 지방색3) flesh color and fat color
육색 및 지방색은 밝기(L, light), 적색도(a, redness), 황색도(b, yellowness)에 대해서 분석하여 이 형질과 연관성이 있는 33개 DNA marker를 확인할 수 있었다.The color and fat colors were analyzed for brightness (L, light), redness (a, redness) and yellowness (b, yellowness) to identify 33 DNA markers associated with this trait.
각 개별적으로 연관성있게 나타난 분석 결과는 앞에서 설명된 marker 별 분석 결과와 같았다.The analysis results of each individual association were the same as those of the markers described above.
육색에서는 L값과 a값은 높고 b값은 낮게 나오면 좋고, 지방색은 L값은 높고, a와 b값은 낮게 나오면 좋다.In meat color, L value and a value should be high and b value should be low, and fat color should have high L value and a and b value low.
본 연구 결과에서는 비교적 육색과 지방색의 L값간에 연관성이 있는 것으로 나타났고, a와 Fa, b와 Fb값간에 연관성이 있는 것으로 나타났으며 a와 b값간에도 상관관계가 있는 것을 확인할 수 있었다.The results of this study showed that there was a correlation between the L value of flesh color and fat color, and that a and Fa, b and Fb values were correlated, and that a and b values were also correlated.
그러나, 실제적으로는 L, a, b값 간에는 서로 어떠한 유의적인 상관관계는 없는 것으로 알려져 있고, 육색 및 지방색에서 가장 중요한 값인 L값을 확인할 수 있는 marker 분석 방법과 이와 아울러 연관되게 나타나는 a값과 b값의 경향을 확인하여 육색과 지방색이 우수한 개체를 선발할 수 있는 DNA marker는 다음과 같았다.In practice, however, there is no significant correlation between L, a, and b values, and the marker analysis method that can identify L value, which is the most important value in color and fat color, and the a and b values associated with it. The following DNA markers were used to select individuals with superior color and fat color by checking the trend of values.
(1) SW841 : 3개의 대립유전자가 출현하였는데 a170이 출현한 경우 육색의 a 값은 높고 b값은 낮게 지방색의 a값은 낮고 b값은 높게 나타나고, a172가 출현한 경우 육색의 a값은 낮고 b값은 높게 지방색의 a값은 높고 b값은 낮게 나타난다.(1) SW841 : Three alleles appeared, but when a170 appeared, the a color of meat color was high and the value of b was low. The b value is high and the a value of the fat color is high, and the b value is low.
(2) SW1364 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a155가 출현한 경우 육색의 L값은 낮고 a값은 높고 b값은 낮게 지방색의 a값은 높고 b값은 낮게 나타나고, a161이 출현한 경우 육색의 a값은 낮고 b값은 높게 지방색의 a값은 높고 b값은 낮게 나타난다.(2) SW1364 : 6 alleles appeared, but when a155 appeared, L value of meat color was low, a value was high, b value was low, and a value of fat color was high, b value was low, and a161 appeared meat color The a value is low, the b value is high, and the a color value of the local color is high and the b value is low.
(3) SW270 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a130이 출현한 경우 L값과 FL값은 낮고 b와 Fb값은 낮게 나타나고, a158이 출현한 경우 L값과 FL값은 높게 나타난다.(3) SW270 : 6 alleles appeared, but when a130 appeared, L and FL values were low, b and Fb values were low, and when a158 appeared, L and FL values were high.
(4) SW524 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a174가 출현한 경우 지방색의 L, a값은 높고 b값은 낮게 a190이 출현한 경우 육색의 a값은 높고 b값은 낮게 나타난다.(4) SW524 : 4 alleles appeared. When a174 appeared, L and a values of local color were high and b value was low. When a190 appeared, the a value of meat color was high and b value was low.
(5) SW2435 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a131이 출현한 경우 육색과 지방색의 a값은 높고 b값은 낮게 나타난다.(5) SW2435 : Six alleles appeared, but when a131 appeared, a and b values of meat color and fat color were high.
(6) SW188 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a127이 출현한 경우 L값과 FL값이 모두 높게 나타난다.(6) SW188 : Five alleles appeared, but when a127 appeared, both L and FL values were high.
(7) SW835 : 7개의 대립유전자가 출현하였는데 a218이 출현한 경우 L값과 FL값이 모두 높게 나타난다.(7) SW835 : Seven alleles appear, but when a218 appears, both L and FL values are high.
(8) SWR73 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a184가 출현한 경우 L값과 FL값은 모두 높게 a값은 낮게 나타난다.(8) SWR73 : Six alleles appeared, but when a184 appeared, both L and FL values were high and a value was low.
(9) SW1492 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a115가 출현한 경우 육색과 지방색의 b값이 낮고 FL값은 높게 나타난다.(9) SW1492 : Four alleles appeared, but when a115 appeared, the b value of flesh color and fat color was low and the FL value was high.
(10) SWR1367 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a106이 출현한 경우 L값과 FL값은 높게 나타나고, a118이 출현한 경우 L값과 FL값은 낮게 나타난다.(10) SWR1367 : Six alleles appeared, and when a106 appeared, the L and FL values were high, and when a118 appeared, the L and FL values were low.
(11) SW2404 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a166이 출현한 경우 a값은 높고, b, Fa, Fb값은 낮게 나타난다.(11) SW2404 : Six alleles appeared, but when a166 appeared, a value was high and b, Fa and Fb values were low.
(12) SW58 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a205가 출현한 경우 육색과 지방색의 b값은 낮게 나타나고, a219가 출현한 경우 육색과 지방색의 b값은 높게 나타난다.(12) SW58 : Four alleles appeared. When a205 appeared, the b value of meat color and fat color was low, and when a219 appeared, b value of meat color and fat color was high.
(13) S2049 : 2개의 대립유전자가 출현하였는데 a226이 출현한 경우 L값과 FL값은 높게 나타나고, a158이 출현한 경우 L값과 FL값은 높게 나타난다.(13) S2049 : When two alleles appear, when a226 appears, the L value and the FL value are high, and when a158 appears, the L value and the FL value are high.
(14) SW1461 : 10개의 대립유전자가 출현하였는데 a138이 출현한 경우 L값과 FL값이 모두 높게 나타난다.(14) SW1461 : Ten alleles appeared, but when a138 appeared, both L and FL values were high.
(15) SW724 : 3개의 대립유전자가 출현하였는데 a146이 출현한 경우 FL값은 높고 Fa값은 낮게 나타난다.(15) SW724: Three alleles appeared, but when a146 appeared, FL value was high and Fa value was low.
(16) SW2066 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a190이 출현한 경우 육색과 지방색의 b값은 낮게 나타나고, a202가 출현한 경우 육색과 지방색의 b값은 높게 나타난다.(16) SW2066 : Five alleles appeared. When a190 appeared, the b value of meat color and fat color was low, and when a202 appeared, b value of meat color and fat color was high.
상기의 육색 및 지방색 연관 DNA marker의 한 실시예는 그림3과 같다.An example of the above color and fat color associated DNA markers is shown in Figure 3.
4) 지방산 조성4) fatty acid composition
지방산 조성은 포화지방산인 C14:0, C16:0, C18:0과 불포화지방산인 C16:1, C18:1, C18:2, C20:4의 값을 분석하여 각 지방산과 연관성이 있는 44개 DNA marker 를 확인할 수 있었다.The fatty acid composition was analyzed by the values of saturated fatty acids C14: 0, C16: 0, C18: 0 and unsaturated fatty acids C16: 1, C18: 1, C18: 2, and C20: 4. I could check the marker.
각 개별적으로 연관성있게 나타난 분석 결과는 앞에서 설명된 marker 별 분석 결과와 같았다.The analysis results of each individual association were the same as those of the markers described above.
지방산은 포화지방산은 적고 불포화지방산은 많은 함량을 가지는 것이 몸에 이로우므로서 기능성이 우수한 육색의 생산이 가능하여 기능성 브랜드육 생산에 효과적인 것으로 알려져 있다.It is known that fatty acids have less saturated fatty acids and higher amounts of unsaturated fatty acids, which is beneficial to the production of functional color meats because it is possible to produce meat color with excellent functionality.
그리고, C18:2의 높은 함량은 동맥경화와 고혈압 예방에 좋으므로서 linoleic 산의 함량이 높은 marker도 중요하게 판단하였다.The high C18: 2 content was good for preventing atherosclerosis and hypertension, and the markers with high linoleic acid content were also important.
본 연구의 분석 결과 포화와 불포화지방산의 함량은 서로간에 C16과 C18에 대해서 각각 연관성을 가지는 것으로 나타났다.The results of this study showed that the saturated and unsaturated fatty acid contents were correlated with C16 and C18, respectively.
대체적으로 C14:0과 C16:0의 함량이 적게 나타나면 C16:1의 함량은 높게 나타나고 이와 반대로 C18:0의 함량은 높고 C18:1과 C18:2의 함량은 낮으며 C20:2의 함량은 높게 나타나는 경향을 확인할 수 있었다.In general, when the contents of C14: 0 and C16: 0 are low, the content of C16: 1 is high, on the contrary, the content of C18: 0 is high, the content of C18: 1 and C18: 2 is low, and the content of C20: 2 is high. The tendency to appear was confirmed.
모든 marker에서 그러한 경향을 보인 것은 아니었으나 많은 marker에서 이러한 서로간의 상관관계를 확인하여 이러한 포화와 불포화 지방산간의 상관관계에 대해서 육질을 평가할 수 있는 DNA marker는 다음과 같았다.Not all markers showed such a trend, but many markers showed the following DNA markers for assessing the quality of the correlations between saturated and unsaturated fatty acids.
(1) SW841 : 3개의 대립유전자가 출현하였는데 a172가 출현한 경우 C14:0, C16:0의 함량은 낮고, C16:1, C20:4의 함량은 높게 나타난다.(1) SW841 : Three alleles appeared, but when a172 appeared, the contents of C14: 0 and C16: 0 were low, and the contents of C16: 1 and C20: 4 were high.
(2) SW270 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a130이 출현한 경우 C18:2, C20:4의 함량은 낮게 C18:0의 함량은 높게 나타나고, a160이 출현한 경우 C18:2, C20:4의 함량은 높게 나타난다.(2) SW270 : 6 alleles appeared, but when a130 appeared, the contents of C18: 2 and C20: 4 were low, and the contents of C18: 0 were high, and when a160 appeared, C18: 2 and C20: 4 The content is high.
(3) SW524 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a178이 출현한 경우 C18:1의 함량은 높게 나타나고, a180이 출현한 경우 C18:2의 함량은 높게 나타난다.(3) SW524 : Five alleles appeared. When a178 appears, the content of C18: 1 is high, and when a180 appears, the content of C18: 2 is high.
(4) SW835 : 8개의 대립유전자가 출현하였는데 a248이 출현한 경우 C16:1과 C18:1의 함량은 낮고 C18:2의 함량은 높게 나타나고, a230이 출현한 경우 C18:1의 함량은 높고 C18:2의 함량은 낮게 나타난다.(4) SW835 : 8 alleles appeared, but when a248 appeared, the contents of C16: 1 and C18: 1 were low and the contents of C18: 2 were high, and when a230 appeared, the contents of C18: 1 were high and C18: 1. The content of 2 is low.
(5) SWR73 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a168이 출현한 경우 C18:1의 함량은 낮고 C18:2와 C20:4의 함량은 높게 나타난다.(5) SWR73 : Five alleles appeared, but when a168 appeared, the contents of C18: 1 were low and the contents of C18: 2 and C20: 4 were high.
(6) S0027 : 3개의 대립유전자가 출현하였는데 a250이 출현한 경우 C14:0과 C16:0의 함량은 낮고, C16:1의 함량은 높게 나타난다.(6) S0027 : Three alleles appeared, but when a250 appeared, the contents of C14: 0 and C16: 0 were low and the contents of C16: 1 were high.
(7) S0301 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a255가 출현한 경우 C16:1과 C18:1의 함량은 낮게 나타나고, a259가 출현한 경우 C16:1과 C18:1의 함량은 높게 나타난다.( S7 ) S0301 : Five alleles appeared, but when a255 appeared, the contents of C16: 1 and C18: 1 were low, and when a259 appeared, the contents of C16: 1 and C18: 1 were high.
(S) SWR2179 : 7개의 대립유전자가 출현하였는데 a146이 출현한 경우 C18:2와 C20:4의 함량이 모두 높게 나타난다.(S) SWR2179 : Seven alleles appeared, but when a146 appeared, the contents of both C18: 2 and C20: 4 were high.
(9) S0097 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a203이 출현한 경우 C16:0의 함량은 낮고 C16:1의 함량은 높게 나타나고, a233이 출현한 경우 C16:0의 함량은 높고 C16:1의 함량은 낮게 나타난다.(9) S0097 : 6 alleles appeared, but when a203 appeared, the content of C16: 0 was low and the content of C16: 1 was high, and when a233 appeared, the content of C16: 0 was high and the content of C16: 1 was high. Appears low.
(10) SW2404 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a164가 출현한 경우 C18:와 C20:4의 함량이 모두 높게 나타난다.(10) SW2404 : Six alleles appeared, but when a164 appeared, both C18: and C20: 4 contents were high.
(11) SW839 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a143이 출현한 경우 C18:2와 C20:4의 함량이 모두 높게 나타난다.(11) SW839 : Six alleles appear, but a143 appears to be high in both C18: 2 and C20: 4.
(12) SW58 : 4개의 대립유전자가 출현하였는데 a219가 출현한 경우 C18:2와 C20:4의 함량이 모두 높게 나타난다.(12) SW58 : Four alleles appear, but a219 appears to be high in both C18: 2 and C20: 4.
(13) SW1461 : 9개의 대립유전자가 출현하였는데 a136이 출현한 경우 C16:0의 함량은 낮고 C16:1의 함량은 높게 나타난다.(13) SW1461 : 9 alleles appeared, but when a136 appeared, the content of C16: 0 was low and the content of C16: 1 was high.
(14) SWR1998 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a168이 출현한 경우 C18:2와 C20:4의 함량은 모두 높게 나타나고, C18:1의 함량은 낮게 나타난다.(14) SWR1998 : Six alleles appeared, but when a168 appeared, the contents of C18: 2 and C20: 4 were both high and the contents of C18: 1 were low.
(15) SW2066 : 5개의 대립유전자가 출현하였는데 a204가 출현한 경우 C18:2와 C20:4의 함량은 모두 높게 나타나고, C18:1의 함량은 낮게 나타난다.(15) SW2066 : Five alleles appeared, but when a204 appeared, the contents of C18: 2 and C20: 4 were both high and the contents of C18: 1 were low.
(16) S0161 : 6개의 대립유전자가 출현하였는데 a145가 출현한 경우 C18:2와 C20:4의 함량은 높고 C18:1의 함량은 낮게 나타나고, a139가 출현한 경우 C18:1의 함량은 높고 C18:2와 C20:4의 함량은 낮게 나타난다.(16) S0161 : Six alleles appeared, but when a145 appeared, the contents of C18: 2 and C20: 4 were high and the contents of C18: 1 were low, and when a139 appeared, the contents of C18: 1 were high and C18: 1. The content of: 2 and C20: 4 is low.
상기의 지방산 조성 DNA marker의 한 실시예는 그림4와 같다.An example of the fatty acid composition DNA marker is shown in Figure 4.
따라서, 본 발명에 따르면 상기와 같은 실시예 및 실험예의 과정을 거쳐 육질이 우수한 돼지의 유전인자를 조기에 선발 분석할 수 있게되어 단시간에 우수한 돼지의 양육과 동시에 육질이 우수한 돼지의 소비량을 증가시켜 수요를 확대를 도모함으로 양돈산업을 비약적인 발전을 기대할 수 있다는 실시상의 가치를 갖는다.Therefore, according to the present invention, it is possible to select and analyze the genetic factors of pigs having excellent meat at an early stage through the procedures of Examples and Experimental Examples as described above, thereby increasing the consumption of pigs having excellent meat at the same time raising the pigs having excellent meat quality. It is of practical value that it can expect a rapid development of the pig industry by promoting demand.
한편, 본 발명은 상기의 실시예에 한정되지 않으며, 청구범위의 요지를 벗어남이 없는 당 발명의 기술분야에서 다양한 변형적 실시예가 제시될 수 있음은 극히 자명하다.On the other hand, the present invention is not limited to the above embodiments, it is very obvious that various modifications can be presented in the art without departing from the scope of the claims.
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Cited By (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20130110140A (en) * | 2013-09-26 | 2013-10-08 | 경남과학기술대학교 산학협력단 | Snp marker associated to meat quality according to variation, and method for identification of high quality pigs using same |
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|---|---|---|---|---|
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Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR19990022827A (en) * | 1995-06-12 | 1999-03-25 | 케네쓰 조지 이탄나 브라이언 에드가 간디 | DNA markers expressing the pigs' |
| KR19990036056A (en) * | 1995-07-27 | 1999-05-25 | 달제티 피엘씨 | Genotyping method to determine pig skin color |
| WO2002020850A2 (en) * | 2000-09-08 | 2002-03-14 | Iowa State Universtiy Research Foundation, Inc. | Novel prkag3 alleles and use of the same as genetic markers for reproductive and meat quality traits |
| US20020160372A1 (en) * | 1996-07-19 | 2002-10-31 | Rothschild Max F. | Prolactin receptor gene as a genetic marker for increased litter size in animals |
| KR20040039059A (en) * | 2002-10-30 | 2004-05-10 | 김철욱 | Detection method of DNA marker associated to average daily gain(ADG), backfat thickness(BFT) , and loin muscle area(LMA) in pig. |
-
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- 2002-12-07 KR KR10-2002-0077616A patent/KR100487995B1/en not_active IP Right Cessation
Patent Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR19990022827A (en) * | 1995-06-12 | 1999-03-25 | 케네쓰 조지 이탄나 브라이언 에드가 간디 | DNA markers expressing the pigs' |
| KR19990036056A (en) * | 1995-07-27 | 1999-05-25 | 달제티 피엘씨 | Genotyping method to determine pig skin color |
| US20020160372A1 (en) * | 1996-07-19 | 2002-10-31 | Rothschild Max F. | Prolactin receptor gene as a genetic marker for increased litter size in animals |
| WO2002020850A2 (en) * | 2000-09-08 | 2002-03-14 | Iowa State Universtiy Research Foundation, Inc. | Novel prkag3 alleles and use of the same as genetic markers for reproductive and meat quality traits |
| KR20040039059A (en) * | 2002-10-30 | 2004-05-10 | 김철욱 | Detection method of DNA marker associated to average daily gain(ADG), backfat thickness(BFT) , and loin muscle area(LMA) in pig. |
Cited By (6)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR101457919B1 (en) | 2010-12-29 | 2014-11-06 | 경남과학기술대학교 산학협력단 | SNP marker associated to meat quality according to variation, and method for identification of high quality pigs using same |
| KR20130110140A (en) * | 2013-09-26 | 2013-10-08 | 경남과학기술대학교 산학협력단 | Snp marker associated to meat quality according to variation, and method for identification of high quality pigs using same |
| KR101644094B1 (en) | 2013-09-26 | 2016-08-03 | 경남과학기술대학교 산학협력단 | SNP marker associated to meat quality according to variation, and method for identification of high quality pigs using same |
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