JPWO2020020359A5

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Publication number: JPWO2020020359A5
Application number: JP2021504286A
Authority: JP
Publication date: 2022-07-06

Description

本発明は、本明細書に記載される方法で有用なキット及び製品をさらに提供する。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
Ｎｅｆタンパク質をコードする第１の核酸を、前駆体Ｔ細胞に導入することを含む、修飾Ｔ細胞を生成する方法であって、前記Ｎｅｆタンパク質が発現すると、前記修飾Ｔ細胞の内在性Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が下方調節される前記方法。
（項目２）
前記下方調節が、前記内在性ＴＣＲの細胞表面発現を少なくとも約５０％下方制御することを含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記Ｎｅｆを発現する前記修飾Ｔ細胞が、修飾された内在性ＴＣＲ座位を含む、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
前記Ｎｅｆタンパク質が、ＳＩＶＮｅｆ、ＨＩＶ１Ｎｅｆ、ＨＩＶ２Ｎｅｆ、及びＮｅｆ相同タンパク質からなる群から選択される、項目１～３のいずれか１項に記載の方法。
（項目５）
前記Ｎｅｆタンパク質が、野生型Ｎｅｆである、項目１～４のいずれか１項に記載の方法。
（項目６）
前記Ｎｅｆタンパク質が、変異体Ｎｅｆである、項目１～４のいずれか１項に記載の方法。
（項目７）
前記変異体Ｎｅｆが、
（ｉ）配列番号１８～２２のいずれか１つのアミノ酸配列、
（ｉｉ）ａａ２～４、ａａ８～１０、ａａ１１～１３、ａａ３８～４０、ａａ４４～４６、ａａ４７～４９、ａａ５０～５２、ａａ５３～５５、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ９８～１００、ａａ１０７～１０９、ａａ１１０～１１２、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７０～１７２、ａａ１７３～１７５、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、１７９～１８１ａａ、ａａ１８２～１８４、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９１～１９３、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ２０６～２０８、ａａ２１２～２１４、ａａ２１５～２１７、ａａ２１８～２２０、ａａ２２１～２２３、ａａ８～１３、ａａ４４～６７、ａａ１０７～１１２、ａａ１６４～１９６、ａａ２０３～２０８、もしくはａａ２１２～２２３のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、
（ｉｉｉ）ａａ２～４、ａａ４４～４６、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ９８～１００、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、ａａ１７９～１８１、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ４４～６７、ａａ１６４～１６９、ａａ１７６～１８１、ａａ１８５～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、
（ｉｖ）ａａ２～４、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７０～１７２、ａａ１７３～１７５、ａａ１７６～１７８、１７８～１７９ａａ、ａａ１７９～１８１、ａａ１８２～１８４、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ５６～６７、もしくはａａ１６４～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、または
（ｖ）ａａ２～４、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、ａａ１７９～１８１、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ５６～６７、ａａ１６４～１６９、ａａ１７６～１８１、もしくはａａ１８５～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異
を含む、項目６に記載の方法。
（項目８）
前記前駆体Ｔ細胞が、細胞外リガンド結合ドメイン及び任意選択で細胞内シグナル伝達ドメインを含む機能的外因性受容体をコードする第２の核酸を含む、項目１～７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９）
細胞外リガンド結合ドメイン及び任意選択で細胞内シグナル伝達ドメインを含む機能的外因性受容体をコードする第２の核酸を、前記前駆体Ｔ細胞に導入することをさらに含む、項目１～７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０）
前記第１の核酸と前記第２の核酸とが、別々のベクター上にある、項目９に記載の方法。
（項目１１）
前記第１の核酸と前記第２の核酸とが、同じベクター上にある、項目９に記載の方法。
（項目１２）
前記第１の核酸と前記第２の核酸とが、同じプロモーターに作動可能に連結している、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記第１の核酸が、前記第２の核酸の上流にある、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記第１の核酸と前記第２の核酸とが、連結配列を介して結合している、項目８～１３のいずれか１項に記載の方法。
（項目１５）
前記連結配列が、Ｐ２Ａ、Ｔ２Ａ、Ｅ２Ａ、Ｆ２Ａ、ＢｍＣＰＶ２Ａ、ＢｍＩＦＶ２Ａ、（ＧＳ） _ｎ、（ＧＳＧＧＳ） _ｎ、（ＧＧＧＳ） _ｎ、（ＧＧＧＧＳ） _ｎをコードする核酸配列、またはＩＲＥＳ、ＳＶ４０、ＣＭＶ、ＵＢＣ、ＥＦ１α、ＰＧＫ、ＣＡＧＧの核酸配列、またはそれらの任意の組み合わせ（式中、ｎは、少なくとも１の整数である）を含む、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記ベクターが、ウイルスベクターである、項目１０～１５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１７）
前記ウイルスベクターが、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、エピソームベクター発現ベクター、単純ヘルペスウイルスベクター、及びそれらの誘導体からなる群から選択される、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
前記ベクターが、非ウイルスベクターである、項目１０～１５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１９）
前記非ウイルスベクターが、ＰｉｇｇｙｂａｃベクターまたはＳｌｅｅｐｉｎｇＢｅａｕｔｙベクターである、項目１８に記載の方法。
（項目２０）
前記Ｎｅｆを発現する前記修飾Ｔ細胞が、組織不適合性の個体において、移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）応答を誘発しないか、または前記前駆体Ｔ細胞のドナーから単離された初代Ｔ細胞によって誘発されるＧｖＨＤ応答と比較して低減したＧｖＨＤ応答を誘発する、項目１～１９のいずれか１項に記載の方法。
（項目２１）
前記第１の核酸及び／または前記第２の核酸を含むＴ細胞を単離または濃縮することをさらに含む、項目１～２０のいずれか１項に記載の方法。
（項目２２）
前記Ｎｅｆを発現する前記修飾Ｔ細胞から、ＴＣＲ陰性Ｔ細胞を単離または濃縮することをさらに含む、項目１～２１のいずれか１項に記載の方法。
（項目２３）
前記Ｎｅｆを発現する前記修飾Ｔ細胞を、少なくとも１つの薬学的に許容される担体と配合することをさらに含む、項目１～２２のいずれか１項に記載の方法。
（項目２４）
前記機能的外因性受容体が、
（ａ）腫瘍抗原の１つ以上のエピトープを特異的に認識する抗原結合性断片を含む細胞外リガンド結合ドメイン、
（ｂ）任意選択のリンカー、
（ｃ）第１のＴＣＲサブユニットの任意選択の細胞外ドメインまたはその一部分、
（ｄ）第２のＴＣＲサブユニットの膜貫通ドメインを含む膜貫通ドメイン、及び
（ｅ）第３のＴＣＲサブユニットの細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、キメラＴＣＲ（ｃＴＣＲ）であり、
前記第１、前記第２、及び前記第３のＴＣＲサブユニットが全て、ＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＴＣＲγ、ＴＣＲδ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、及びＣＤ３δからなる群から選択される、項目８～２３のいずれか１項に記載の方法。
（項目２５）
前記第１、前記第２、及び前記第３のＴＣＲサブユニットが全てＣＤ３εである、項目２４に記載の方法。
（項目２６）
前記機能的外因性受容体が、
（ａ）腫瘍抗原の１つ以上のエピトープを特異的に認識する抗原結合性断片を含む細胞外リガンド結合ドメイン、
（ｂ）任意選択の第１のリンカー、
（ｃ）ＴＣＲサブユニットの細胞外ドメインを特異的に認識する細胞外ＴＣＲ結合ドメイン、
（ｄ）任意選択の第２のリンカー、
（ｅ）第１のＴＣＲ共受容体の任意選択の細胞外ドメインまたはその一部分、
（ｆ）第２のＴＣＲ共受容体の膜貫通ドメインを含む膜貫通ドメイン、及び
（ｇ）第３のＴＣＲ共受容体の細胞内シグナル伝達ドメインを含む任意選択の細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、Ｔ細胞抗原結合体（ＴＡＣ）であり、
前記ＴＣＲサブユニットが、ＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＴＣＲγ、ＴＣＲδ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、及びＣＤ３δからなる群から選択され、
前記第１、前記第２、及び前記第３のＴＣＲ共受容体が全て、ＣＤ４、ＣＤ８、及びＣＤ２８からなる群から選択される、項目８～２３のいずれか１項に記載の方法。
（項目２７）
前記第１、前記第２、及び前記第３のＴＣＲ共受容体が同じである、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記機能的外因性受容体が、
（ａ）腫瘍抗原の１つ以上のエピトープを特異的に認識する抗原結合性断片を含む細胞外リガンド結合ドメイン、
（ｂ）任意選択の第１のリンカー、
（ｃ）第１のＴＣＲサブユニットの細胞外ドメインを特異的に認識する細胞外ＴＣＲ結合ドメイン、
（ｄ）任意選択の第２のリンカー、
（ｅ）第２のＴＣＲサブユニットの任意選択の細胞外ドメインまたはその一部分、
（ｆ）第３のＴＣＲサブユニットの膜貫通ドメインを含む膜貫通ドメイン、及び
（ｇ）第４のＴＣＲサブユニットの細胞内シグナル伝達ドメインを含む任意選択の細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、Ｔ細胞抗原結合体（ＴＡＣ）様キメラ受容体であり、
前記第１、前記第２、前記第３、及び前記第４のＴＣＲサブユニットが全て、ＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＴＣＲγ、ＴＣＲδ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、及びＣＤ３δからなる群から選択される、項目８～２３のいずれか１項に記載の方法。
（項目２９）
前記第２、前記第３、及び前記第４のＴＣＲサブユニットが同じである、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
前記機能的外因性受容体が、
（ａ）腫瘍抗原の１つ以上のエピトープを特異的に認識する抗原結合性断片を含む細胞外リガンド結合ドメイン、
（ｂ）膜貫通ドメイン、及び
（ｃ）細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である、項目８～２３のいずれか１項に記載の方法。
（項目３１）
前記抗原結合性断片が、ラクダＩｇ、ＩｇＮＡＲ、Ｆａｂ断片、一本鎖Ｆｖ抗体、及び単一ドメイン抗体（ｓｄＡｂ、ナノボディ）からなる群から選択される、項目２４～３０のいずれか１項に記載の方法。
（項目３２）
前記抗原結合性断片が、ｓｄＡｂまたはｓｃＦｖである、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記細胞外リガンド結合ドメインが、一価である、項目２４～３２のいずれか１項に記載の方法。
（項目３４）
前記細胞外リガンド結合ドメインが、多価である、項目２４～３２のいずれか１項に記載の方法。
（項目３５）
前記細胞外リガンド結合ドメインが、多重特異性である、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
前記腫瘍抗原が、メソテリン、ＴＳＨＲ、ＣＤ１９、ＣＤ１２３、ＣＤ２２、ＣＤ３０、ＣＤ１７１、ＣＳ－１、ＣＬＬ－１、ＣＤ３３、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＧＤ２、ＧＤ３、ＢＣＭＡ、ＴｎＡｇ、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）、ＲＯＲ１、ＦＬＴ３、ＦＡＰ、ＴＡＧ７２、ＣＤ３８、ＣＤ４４ｖ６、ＣＥＡ、ＥＰＣＡＭ、Ｂ７Ｈ３、ＫＩＴ、ＩＬ－１３Ｒａ２、インターロイキン－１１受容体ａ（ＩＬ－１１Ｒａ）、ＰＳＣＡ、ＰＲＳＳ２１、ＶＥＧＦＲ２、ＬｅｗｉｓＹ、ＣＤ２４、血小板由来増殖因子受容体ベータ（ＰＤＧＦＲベータ）、ＳＳＥＡ－４、ＣＤ２０、葉酸受容体アルファ、ＥＲＢＢ２（Ｈｅｒ２／ｎｅｕ）、ＭＵＣ１、上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＮＣＡＭ、プロスターゼ、ＰＡＰ、ＥＬＦ２Ｍ、エフリンＢ２、ＩＧＦ－Ｉ受容体、ＣＡＩＸ、ＬＭＰ２、ｇｐ１００、ｂｃｒ－ａｂｌ、チロシナーゼ、ＥｐｈＡ２、フコシルＧＭ１、ｓＬｅ、ＧＭ３、ＴＧＳ５、ＨＭＷＭＡＡ、ｏ－アセチル－ＧＤ２、葉酸受容体ベータ、ＴＥＭ１／ＣＤ２４８、ＴＥＭ７Ｒ、ＣＬＤＮ６、ＣＬＤＮ１８．２、ＧＰＲＣ５Ｄ、ＣＸＯＲＦ６１、ＣＤ９７、ＣＤ１７９ａ、ＡＬＫ、ポリシアル酸、ＰＬＡＣ１、ＧｌｏｂｏＨ、ＮＹ－ＢＲ－１、ＵＰＫ２、ＨＡＶＣＲ１、ＡＤＲＢ３、ＰＡＮＸ３、ＧＰＲ２０、ＬＹ６Ｋ、ＯＲ５１Ｅ２、ＴＡＲＰ、ＷＴ１、ＮＹ－ＥＳＯ－１、ＬＡＧＥ－１ａ、ＭＡＧＥ－Ａ１、レグマイン、ＨＰＶＥ６、Ｅ７、ＭＡＧＥＡ１、ＥＴＶ６－ＡＭＬ、***タンパク質１７、ＸＡＧＥ１、Ｔｉｅ２、ＭＡＤ－ＣＴ－１、ＭＡＤ－ＣＴ－２、Ｆｏｓ関連抗原１、ｐ５３、ｐ５３変異体、プロステイン、サバイビン及びテロメラーゼ、ＰＣＴＡ－１／ガレクチン８、メランＡ／ＭＡＲＴ１、Ｒａｓ変異体、ｈＴＥＲＴ、肉腫転座切断点、ＭＬ－ＩＡＰ、ＥＲＧ（ＴＭＰＲＳＳ２ＥＴＳ融合遺伝子）、ＮＡ１７、ＰＡＸ３、アンドロゲン受容体、サイクリンＢ１、ＭＹＣＮ、ＲｈｏＣ、ＴＲＰ－２、ＣＹＰ１Ｂ１、ＢＯＲＩＳ、ＳＡＲＴ３、ＰＡＸ５、ＯＹ－ＴＥＳ１、ＬＣＫ、ＡＫＡＰ－４、ＳＳＸ２、ＲＡＧＥ－１、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、ＲＵ１、ＲＵ２、腸内カルボキシルエステラーゼ、ｍｕｔｈｓｐ７０－２、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＣＤ７２、ＬＡＩＲ１、ＦＣＡＲ、ＬＩＬＲＡ２、ＣＤ３００ＬＦ、ＣＬＥＣ１２Ａ、ＢＳＴ２、ＥＭＲ２、ＬＹ７５、ＧＰＣ３、ＦＣＲＬ５、及びＩＧＬＬ１からなる群から選択される、項目２４～３５のいずれか１項に記載の方法。
（項目３７）
前記腫瘍抗原が、ＢＣＭＡ、ＣＤ１９、またはＣＤ２０である、項目３６に記載の方法。
（項目３８）
前記膜貫通ドメインが、ＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＴＣＲγ、ＴＣＲδ、ＣＤ３ζ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、ＣＤ３δ、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ８α、ＣＤ９、ＣＤ１６、ＣＤ２２、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ３３、ＣＤ３７、ＣＤ４５、ＣＤ６４、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１３４、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）、ＣＤ１５２、ＣＤ１５４、及びＰＤ－１からなる群から選択される分子に由来する、項目３０～３７のいずれか１項に記載の方法。
（項目３９）
前記膜貫通ドメインが、ＣＤ８αに由来する、項目３８に記載の方法。
（項目４０）
前記細胞内シグナル伝達ドメインが、ＣＤ３ζ、ＣＤ３γ、ＣＤ３ε、ＣＤ３δ、ＦｃＲγ（ＦＣＥＲ１Ｇ）、ＦｃＲβ（ＦｃイプシロンＲＩｂ）、ＣＤ５、ＣＤ２２、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＣＤ６６ｄ、ＦｃガンマＲＩＩａ、ＤＡＰ１０、及びＤＡＰ１２に由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む、項目３０～３９のいずれか１項に記載の方法。
（項目４１）
前記一次細胞内シグナル伝達ドメインが、ＣＤ３ζ、ＤＡＰ１２、またはＣＤ３γに由来する、項目４０に記載の方法。
（項目４２）
前記細胞内シグナル伝達ドメインが、ＣＡＲＤ１１、ＣＤ２（ＬＦＡ－２）、ＣＤ７、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＣＤ５４（ＩＣＡＭ－１）、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）、ＣＤ１６２（ＳＥＬＰＬＧ）、ＣＤ２５８（ＬＩＧＨＴ）、ＣＤ２７０（ＨＶＥＭ、ＬＩＧＨＴＲ）、ＣＤ２７６（Ｂ７－Ｈ３）、ＣＤ２７８（ＩＣＯＳ）、ＣＤ２７９（ＰＤ－１）、ＣＤ３１９（ＳＬＡＭＦ７）、ＬＦＡ－１（リンパ球機能関連抗原１）、ＮＫＧ２Ｃ、ＣＤＳ、ＧＩＴＲ、ＢＡＦＦＲ、ＮＫｐ８０（ＫＬＲＦ１）、ＣＤ１６０、ＣＤ１９、ＣＤ４、ＩＰＯ－３、ＢＬＡＭＥ（ＳＬＡＭＦ８）、ＬＴＢＲ、ＬＡＴ、ＧＡＤＳ、ＳＬＰ－７６、ＰＡＧ／Ｃｂｐ、ＮＫｐ４４、ＮＫｐ３０、ＮＫｐ４６、ＮＫＧ２Ｄ、ＣＤ８３、ＣＤ１５０（ＳＬＡＭＦ１）、ＣＤ１５２（ＣＴＬＡ－４）、ＣＤ２２３（ＬＡＧ３）、ＣＤ２７３（ＰＤ－Ｌ２）、ＣＤ２７４（ＰＤ－Ｌ１）、ＤＡＰ１０、ＴＲＩＭ、ＺＡＰ７０、ＣＤ８３に特異的に結合するリガンド、及びそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される共刺激分子に由来する共刺激シグナル伝達ドメインを含む、項目３０～４１のいずれか１項に記載の方法。
（項目４３）
前記共刺激シグナル伝達ドメインが、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）の細胞質ドメインを含む、項目４２に記載の方法。
（項目４４）
前記細胞外リガンド結合ドメインのＣ末端と前記膜貫通ドメインのＮ末端との間に位置するヒンジドメインをさらに含む、項目２４～４３のいずれか１項に記載の方法。
（項目４５）
前記ヒンジドメインが、ＣＤ８αに由来する、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
ポリペプチドのＮ末端に位置するシグナルペプチドをさらに含む、項目２４～４５のいずれか１項に記載の方法。
（項目４７）
前記シグナルペプチドが、ＣＤ８αに由来する、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
項目１～４７のいずれか１項に記載の方法によって得られる修飾Ｔ細胞。
（項目４９）
項目４８に記載の修飾Ｔ細胞と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
（項目５０）
有効量の項目４９に記載の医薬組成物を個体に投与することを含む、前記個体の疾患を処置する方法。
（項目５１）
前記疾患が、がんである、項目５０に記載の方法。
（項目５２）
ミリストイル化部位、Ｎ末端αヘリックス、チロシンベースのＡＰ動員、ＣＤ４結合部位、酸性クラスター、プロリンベースのリピート、ＰＡＫ結合ドメイン、ＣＯＰＩ動員ドメイン、ジロイシンベースのＡＰ動員ドメイン、Ｖ－ＡＴＰａｓｅ及びＲａｆ－１結合ドメイン、もしくはそれらの任意の組み合わせにおける１つ以上の変異、または表１１に示されるアミノ酸残基のいずれかにおける１つ以上の変異を含む、天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目５３）
変異体ＳＩＶＮｅｆタンパク質である、項目５２に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目５４）
（ｉ）配列番号１８～２２のいずれか１つのアミノ酸配列、
（ｉｉ）ａａ２～４、ａａ８～１０、ａａ１１～１３、ａａ３８～４０、ａａ４４～４６、ａａ４７～４９、ａａ５０～５２、ａａ５３～５５、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ９８～１００、ａａ１０７～１０９、ａａ１１０～１１２、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７０～１７２、ａａ１７３～１７５、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、１７９～１８１ａａ、ａａ１８２～１８４、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９１～１９３、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ２０６～２０８、ａａ２１２～２１４、ａａ２１５～２１７、ａａ２１８～２２０、ａａ２２１～２２３、ａａ８～１３、ａａ４４～６７、ａａ１０７～１１２、ａａ１６４～１９６、ａａ２０３～２０８、もしくはａａ２１２～２２３のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、
（ｉｉｉ）ａａ２～４、ａａ４４～４６、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ９８～１００、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、ａａ１７９～１８１、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ４４～６７、ａａ１６４～１６９、ａａ１７６～１８１、ａａ１８５～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、
（ｉｖ）ａａ２～４、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７０～１７２、ａａ１７３～１７５、ａａ１７６～１７８、１７８～１７９ａａ、ａａ１７９～１８１、ａａ１８２～１８４、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ５６～６７、もしくはａａ１６４～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、または
（ｖ）ａａ２～４、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、ａａ１７９～１８１、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ５６～６７、ａａ１６４～１６９、ａａ１７６～１８１、もしくはａａ１８５～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異
を含む、項目５２または５３に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目５５）
内在性ＴＣＲの細胞表面発現を下方制御する、項目５２～５４のいずれか１項に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目５６）
内在性ＴＣＲの細胞表面発現を、前記野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて約３％以下の差で下方制御する、項目５２～５５のいずれか１項に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目５７）
ＣＤ４の細胞表面発現を下方制御しない、項目５２～５６のいずれか１項に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目５８）
ＣＤ４の細胞表面発現を下方制御する、項目５２～５６のいずれか１項に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目５９）
ＣＤ４の細胞表面発現を、前記野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて約３％以下の差で下方制御する、項目５８に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目６０）
ＣＤ４の細胞表面発現を、前記野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて少なくとも約３％小さく下方制御する、項目５８に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目６１）
ＣＤ２８の細胞表面発現を下方制御しない、項目５２～６０のいずれか１項に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目６２）
ＣＤ２８の細胞表面発現を下方制御する、項目５２～６０のいずれか１項に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目６３）
ＣＤ２８の細胞表面発現を、前記野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて約３％以下の差で下方制御する、項目６２に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目６４）
ＣＤ２８の細胞表面発現を、前記野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて少なくとも約３％小さく下方制御する、項目６２に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（項目６５）
項目５２～６４のいずれか１項に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質をコードする核酸を含む修飾Ｔ細胞。
（項目６６）
機能的外因性受容体をさらに含む、項目６５に記載の修飾Ｔ細胞。

Claims

ＮｅｇａｔｉｖｅＲｅｇｕｌａｔｏｒｙＦａｃｔｏｒ（Ｎｅｆ）タンパク質をコードする第１の核酸を、前駆体Ｔ細胞に導入することを含む、修飾Ｔ細胞を生成する方法であって、前記Ｎｅｆタンパク質が発現すると、前記修飾Ｔ細胞の内在性Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が下方調節される前記方法。
（ｉ）前記内在性ＴＣＲの前記下方調節が、前記内在性ＴＣＲの細胞表面発現を少なくとも約５０％下方制御することを含む；ならびに／あるいは
（ｉｉ）前記Ｎｅｆタンパク質が発現すると、内在性ＣＤ３ζを下方調節することはないか、または内在性ＣＤ３ζを最大で約５０％下方調節する、請求項１に記載の方法。
前記Ｎｅｆタンパク質を発現する前記修飾Ｔ細胞が、修飾された内在性ＴＣＲ座位を含む、請求項１または２に記載の方法。
前記Ｎｅｆタンパク質が、ＳＩＶＮｅｆ、ＨＩＶ１Ｎｅｆ、ＨＩＶ２Ｎｅｆ、及びＮｅｆ相同タンパク質からなる群から選択される、請求項１～３のいずれか１項に記載の方法。
前記Ｎｅｆタンパク質が、野生型Ｎｅｆタンパク質である、請求項１～４のいずれか１項に記載の方法。
前記Ｎｅｆタンパク質が、変異体Ｎｅｆタンパク質である、請求項１～４のいずれか１項に記載の方法。
前記変異体Ｎｅｆが、
（ｉ）配列番号１８～２２のいずれか１つのアミノ酸配列、
（ｉｉ）ａａ２～４、ａａ８～１０、ａａ１１～１３、ａａ３８～４０、ａａ４４～４６、ａａ４７～４９、ａａ５０～５２、ａａ５３～５５、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ９８～１００、ａａ１０７～１０９、ａａ１１０～１１２、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７０～１７２、ａａ１７３～１７５、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、１７９～１８１ａａ、ａａ１８２～１８４、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９１～１９３、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ２０６～２０８、ａａ２１２～２１４、ａａ２１５～２１７、ａａ２１８～２２０、ａａ２２１～２２３、ａａ８～１３、ａａ４４～６７、ａａ１０７～１１２、ａａ１６４～１９６、ａａ２０３～２０８、もしくはａａ２１２～２２３のいずれかのアミノ酸（ａａ）残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、
（ｉｉｉ）ａａ２～４、ａａ４４～４６、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ９８～１００、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、ａａ１７９～１８１、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ４４～６７、ａａ１６４～１６９、ａａ１７６～１８１、ａａ１８５～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、
（ｉｖ）ａａ２～４、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７０～１７２、ａａ１７３～１７５、ａａ１７６～１７８、１７８～１７９ａａ、ａａ１７９～１８１、ａａ１８２～１８４、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ５６～６７、もしくはａａ１６４～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、または
（ｖ）ａａ２～４、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、ａａ１７９～１８１、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ５６～６７、ａａ１６４～１６９、ａａ１７６～１８１、もしくはａａ１８５～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異
を含む、請求項６に記載の方法。
（ｉ）前記前駆体Ｔ細胞が、細胞外リガンド結合ドメイン及び任意選択で細胞内シグナル伝達ドメインを含む機能的外因性受容体をコードする第２の核酸を含む；または
（ｉｉ）前記方法は、細胞外リガンド結合ドメイン及び任意選択で細胞内シグナル伝達ドメインを含む機能的外因性受容体をコードする第２の核酸を、前記前駆体Ｔ細胞に導入することをさらに含む、
請求項１～７のいずれか１項に記載の方法。
前記第１の核酸と前記第２の核酸とが、別々のベクター上にある、請求項８に記載の方法。
前記第１の核酸と前記第２の核酸とが、同じベクター上にある、請求項８に記載の方法。
（ｉ）前記第１の核酸と前記第２の核酸とが、同じプロモーターに作動可能に連結している；ならびに／あるいは
（ｉｉ）前記第１の核酸が、前記第２の核酸の上流にある；ならびに／あるいは
（ｉｉｉ）前記第１の核酸と前記第２の核酸とが、連結配列を介して結合している、請求項１０に記載の方法。
前記連結配列が、Ｐ２Ａ、Ｔ２Ａ、Ｅ２Ａ、Ｆ２Ａ、ＢｍＣＰＶ２Ａ、ＢｍＩＦＶ２Ａ、（ＧＳ）_ｎ、（ＧＳＧＧＳ）_ｎ、（ＧＧＧＳ）_ｎ、もしくは（ＧＧＧＧＳ）_ｎをコードする核酸配列、またはＩＲＥＳ、ＳＶ４０、ＣＭＶ、ＵＢＣ、ＥＦ１α、ＰＧＫ、もしくはＣＡＧＧの核酸配列、またはそれらの任意の組み合わせ（式中、ｎは、少なくとも１の整数である）を含む、請求項１１に記載の方法。
前記ベクターが、ウイルスベクターである、請求項９～１２のいずれか１項に記載の方法。
前記Ｎｅｆタンパク質を発現する前記修飾Ｔ細胞が、組織不適合性の個体において、移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）応答を誘発しないか、または前記前駆体Ｔ細胞のドナーから単離された初代Ｔ細胞によって誘発されるＧｖＨＤ応答と比較して低減したＧｖＨＤ応答を誘発する、請求項１～１３のいずれか１項に記載の方法。
（ｉ）前記方法が、前記第１の核酸及び／または前記第２の核酸を含む修飾Ｔ細胞を単離または濃縮することをさらに含む；ならびに／あるいは
（ｉｉ）前記方法が、前記Ｎｅｆタンパク質を発現する前記修飾Ｔ細胞から、ＴＣＲ陰性Ｔ細胞を単離または濃縮することをさらに含む；ならびに／あるいは
（ｉｉｉ）前記方法が、前記Ｎｅｆタンパク質を発現する前記修飾Ｔ細胞を、少なくとも１つの薬学的に許容される担体と配合することをさらに含む、請求項１～１４のいずれか１項に記載の方法。
前記機能的外因性受容体が、
（ｉ）腫瘍抗原の１つ以上のエピトープを特異的に認識する抗原結合性断片を含む細胞外リガンド結合ドメイン、
（ｉｉ）膜貫通ドメイン、及び
（ｉｉｉ）細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である、請求項８～１５のいずれか１項に記載の方法。
（ｉ）前記膜貫通ドメインが、ＣＤ８αに由来する；ならびに／あるいは
（ｉｉ）前記細胞内シグナル伝達ドメインが、ＣＤ３ζ、ＤＡＰ１２、またはＣＤ３γに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む；ならびに／あるいは
（ｉｉｉ）前記細胞内シグナル伝達ドメインが、４－１ＢＢに由来する共刺激シグナル伝達ドメインを含む、請求項１６に記載の方法。
前記機能的外因性受容体が、
（ｉ）腫瘍抗原の１つ以上のエピトープを特異的に認識する抗原結合性断片を含む細胞外リガンド結合ドメイン、
（ｉｉ）任意選択のリンカー、
（ｉｉｉ）第１のＴＣＲサブユニットの任意選択の細胞外ドメインまたはその一部分、
（ｉｖ）第２のＴＣＲサブユニットの膜貫通ドメインを含む膜貫通ドメイン、及び
（ｖ）第３のＴＣＲサブユニットの細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、キメラＴＣＲ（ｃＴＣＲ）であり、
前記第１、前記第２、及び前記第３のＴＣＲサブユニットが全て、ＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＴＣＲγ、ＴＣＲδ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、及びＣＤ３δからなる群から独立して選択される、請求項８～１５のいずれか１項に記載の方法。
前記第１、前記第２、及び前記第３のＴＣＲサブユニットが全てＣＤ３εである、請求項１８に記載の方法。
前記機能的外因性受容体が、
（ｉ）腫瘍抗原の１つ以上のエピトープを特異的に認識する抗原結合性断片を含む細胞外リガンド結合ドメイン、
（ｉｉ）任意選択の第１のリンカー、
（ｉｉｉ）ＴＣＲサブユニットの細胞外ドメインを特異的に認識する細胞外ＴＣＲ結合ドメイン、
（ｉｖ）任意選択の第２のリンカー、
（ｖ）第１のＴＣＲ共受容体の任意選択の細胞外ドメインまたはその一部分、
（ｖｉ）第２のＴＣＲ共受容体の膜貫通ドメインを含む膜貫通ドメイン、及び
（ｖｉｉ）第３のＴＣＲ共受容体の細胞内シグナル伝達ドメインを含む任意選択の細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、Ｔ細胞抗原結合体（ＴＡＣ）であり、
前記ＴＣＲサブユニットが、ＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＴＣＲγ、ＴＣＲδ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、及びＣＤ３δからなる群から選択され、
前記第１、前記第２、及び前記第３のＴＣＲ共受容体が、ＣＤ４、ＣＤ８、及びＣＤ２８からなる群から独立して選択される、請求項８～１５のいずれか１項に記載の方法。
前記第１、前記第２、及び前記第３のＴＣＲ共受容体が同じである、請求項２０に記載の方法。
前記機能的外因性受容体が、
（ｉ）腫瘍抗原の１つ以上のエピトープを特異的に認識する抗原結合性断片を含む細胞外リガンド結合ドメイン、
（ｉｉ）任意選択の第１のリンカー、
（ｉｉｉ）第１のＴＣＲサブユニットの細胞外ドメインを特異的に認識する細胞外ＴＣＲ結合ドメイン、
（ｉｖ）任意選択の第２のリンカー、
（ｖ）第２のＴＣＲサブユニットの任意選択の細胞外ドメインまたはその一部分、
（ｖｉ）第３のＴＣＲサブユニットの膜貫通ドメインを含む膜貫通ドメイン、及び
（ｖｉｉ）第４のＴＣＲサブユニットの細胞内シグナル伝達ドメインを含む任意選択の細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、Ｔ細胞抗原結合体（ＴＡＣ）様キメラ受容体であり、
前記第１、前記第２、前記第３、及び前記第４のＴＣＲサブユニットが、ＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＴＣＲγ、ＴＣＲδ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、及びＣＤ３δからなる群から独立して選択される、請求項８～１５のいずれか１項に記載の方法。
前記第２、前記第３、及び前記第４のＴＣＲサブユニットが同じである、請求項２２に記載の方法。
（ｉ）前記抗原結合性断片が、ｓｄＡｂまたはｓｃＦｖである；ならびに／あるいは
（ｉｉ）前記腫瘍抗原が、ＢＣＭＡ、ＣＤ１９、またはＣＤ２０である；ならびに／あるいは
（ｉｉｉ）前記細胞外リガンド結合ドメインが、多重特異性および／または多価である；ならびに／あるいは
（ｉｖ）前記機能的外因性受容体が、前記細胞外リガンド結合ドメインのＣ末端と前記膜貫通ドメインのＮ末端との間に位置するヒンジドメインをさらに含む；ならびに／あるいは
（ｖ）前記機能的外因性受容体が、ポリペプチドのＮ末端に位置するシグナルペプチドをさらに含む、請求項１６～２３のいずれか１項に記載の方法。
（ｉ）前記ヒンジドメインが、ＣＤ８αに由来する；ならびに／あるいは
（ｉｉ）前記シグナルペプチドが、ＣＤ８αに由来する、請求項２４に記載の方法。
前記機能的外因性受容体が、Ｎ末端からＣ末端に向かって、ＢＣＭＡの１つ以上のエピトープを特異的に認識する１つ以上のｓｄＡｂ、ＣＤ８αに由来するヒンジドメイン、ＣＤ８αに由来する膜貫通ドメイン、４－１ＢＢに由来する共刺激シグナル伝達ドメイン、及びＣＤ３ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含むポリペプチドを含むＣＡＲである、請求項８～１７、２４および２５のいずれか１項に記載の方法。
請求項１～２６のいずれか１項に記載の方法によって得られる修飾Ｔ細胞。
ｉ）ミリストイル化部位、Ｎ末端αヘリックス、チロシンベースのＡＰ動員、ＣＤ４結合部位、酸性クラスター、プロリンベースのリピート、ＰＡＫ結合ドメイン、ＣＯＰＩ動員ドメイン、ジロイシンベースのＡＰ動員ドメイン、Ｖ－ＡＴＰａｓｅ及びＲａｆ－１結合ドメイン、もしくはそれらの任意の組み合わせにおける１つ以上の変異を含む；あるいは
ｉｉ）表１１に示されるアミノ酸残基のいずれかにおける１つ以上の変異を含む；ならびに／あるいは
ｉｉｉ）変異体ＳＩＶＮｅｆタンパク質である、
天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
（ｉ）配列番号１８～２２のいずれか１つのアミノ酸配列、
（ｉｉ）ａａ２～４、ａａ８～１０、ａａ１１～１３、ａａ３８～４０、ａａ４４～４６、ａａ４７～４９、ａａ５０～５２、ａａ５３～５５、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ９８～１００、ａａ１０７～１０９、ａａ１１０～１１２、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７０～１７２、ａａ１７３～１７５、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、１７９～１８１ａａ、ａａ１８２～１８４、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９１～１９３、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ２０６～２０８、ａａ２１２～２１４、ａａ２１５～２１７、ａａ２１８～２２０、ａａ２２１～２２３、ａａ８～１３、ａａ４４～６７、ａａ１０７～１１２、ａａ１６４～１９６、ａａ２０３～２０８、もしくはａａ２１２～２２３のいずれかのアミノ酸（ａａ）残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、
（ｉｉｉ）ａａ２～４、ａａ４４～４６、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ９８～１００、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、ａａ１７９～１８１、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ４４～６７、ａａ１６４～１６９、ａａ１７６～１８１、ａａ１８５～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、
（ｉｖ）ａａ２～４、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７０～１７２、ａａ１７３～１７５、ａａ１７６～１７８、１７８～１７９ａａ、ａａ１７９～１８１、ａａ１８２～１８４、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ５６～６７、もしくはａａ１６４～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異、または
（ｖ）ａａ２～４、ａａ５６～５８、ａａ５９～６１、ａａ６２～６４、ａａ６５～６７、ａａ１０７～１０９、ａａ１３７～１３９、ａａ１５２～１５４、ａａ１６４～１６６、ａａ１６７～１６９、ａａ１７６～１７８、ａａ１７８～１７９、ａａ１７９～１８１、ａａ１８５～１８７、ａａ１８８～１９０、ａａ１９４～１９６、ａａ２０３～２０５、ａａ５６～６７、ａａ１６４～１６９、ａａ１７６～１８１、もしくはａａ１８５～１９０のいずれかのアミノ酸残基（ここで、前記アミノ酸残基の位置は、野生型ＳＩＶＮｅｆのものに対応する）における１つ以上の変異
を含む、請求項２８に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
前記天然に存在しないＮｅｆタンパク質がＴ細胞において発現すると、
（Ｉ）内在性ＴＣＲの細胞表面発現を下方制御する；ならびに／あるいは
（ＩＩ）（ｉ）前記Ｔ細胞においてＣＤ４の細胞表面発現を下方制御しない；または
（ｉｉ）前記Ｔ細胞においてＣＤ４の細胞表面発現を下方制御する；ならびに／あるいは
（ＩＩＩ）（ｉ）前記Ｔ細胞においてＣＤ２８の細胞表面発現を下方制御しない；または
（ｉｉ）前記Ｔ細胞においてＣＤ２８の細胞表面発現を下方制御する、請求項２８または２９に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
前記天然に存在しないＮｅｆタンパク質がＴ細胞において発現すると、
（Ｉ）前記Ｔ細胞において、内在性ＴＣＲの細胞表面発現を、野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて約３％以下の差で下方制御する；ならびに／あるいは
（ＩＩ）（ｉ）前記Ｔ細胞において、ＣＤ４の細胞表面発現を、野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて約３％以下の差で下方制御する、または
（ｉｉ）前記Ｔ細胞において、ＣＤ４の細胞表面発現を、野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて少なくとも約３％小さく下方制御する；ならびに／あるいは
（ＩＩＩ）（ｉ）前記Ｔ細胞において、ＣＤ２８の細胞表面発現を、野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて約３％以下の差で下方制御する、または
（ｉｉ）前記Ｔ細胞において、ＣＤ２８の細胞表面発現を、野生型ＳＩＶＮｅｆによる下方制御と比べて少なくとも約３％小さく下方制御する、請求項２８～３０のいずれか１項に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質。
請求項２８～３１のいずれか１項に記載の天然に存在しないＮｅｆタンパク質をコードする核酸を含む修飾Ｔ細胞。
機能的外因性受容体をさらに含む、請求項３２に記載の修飾Ｔ細胞。
前記機能的外因性受容体が、ｃＴＣＲ、ＴＡＣ、ＴＡＣ様キメラ受容体、またはＣＡＲである、請求項３３に記載の修飾Ｔ細胞。
請求項２７および３２～３４のいずれか１項に記載の修飾Ｔ細胞と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
個体の疾患を処置することにおける使用のための、請求項２７および３２～３４のいずれか１項に記載の修飾Ｔ細胞を含む組成物または請求項３５に記載の医薬組成物。
前記疾患が、がんである、請求項３６に記載の使用のための組成物または医薬組成物。