JPH09275983A - p53 標的蛋白質GML - Google Patents

p53 標的蛋白質GML

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JPH09275983A
JPH09275983A JP8092559A JP9255996A JPH09275983A JP H09275983 A JPH09275983 A JP H09275983A JP 8092559 A JP8092559 A JP 8092559A JP 9255996 A JP9255996 A JP 9255996A JP H09275983 A JPH09275983 A JP H09275983A
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dna
protein
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seq
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Abstract

(57)【要約】 【課題】癌抑制遺伝子p53 の新しい標的蛋白質を提供す
ることにある。 【解決手段】p53 応答配列を含むヒトコスミドクロ−ン
を単離し、p53 に応答する遺伝子の一つのエクソン部を
増幅し、エクソン部を両サイドに増幅などしてcDNA, ジ
ェノミックDNA を決定し、GMLと命名した。 【効果】癌組織におけるp53 遺伝子の変異は一定してい
ないことから、GML蛋白質またはDNAの発現量を測
定することにより、p53 の機能判定、癌の診断手段とし
て期待される。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】 癌抑制遺伝子p53によって
発現が誘導される新しい遺伝子に関し、医学の分野に属
する。
【0002】
【従来の技術】p53は腫瘍ウイルスの蛋白質と結合する
細胞内蛋白質として1979年に発見された。1989年に大腸
癌や肺癌で、p53遺伝子の突然変異がみつかり、その後
その変異が乳癌、膀胱癌、脳腫瘍をはじめ多種類の癌で
見つかったことから、癌の発生、進展に関与していると
考えられている。p53の作用機構については長い間不明
であったが、正常型p53を強制発現させると癌細胞の増
殖を抑制する能力があることから、癌抑制遺伝子として
機能すると推測された。
【0003】このp53の生理機能として、細胞周期をG
1期での停止作用およびDNA損傷によるアポトーシス
作用などが知られているがその作用機構については長い
間不明であった。しかし最近、p53が転写因子としての
活性を有することが判明し、p53によって発現が誘導さ
れる遺伝子群が細胞増殖抑制というp53の生理機能に直
接かかわっていることが推測された。その後の研究によ
り、p53によって発現が誘導される遺伝子としてp21/
WAF1、MDM2、GADD45、BAX、サイクリン
GおよびIGF−BP3などが報告された(El-Deiry,
W.S. et al., Cell, 75, 817-825,1993 . Wu, X. et a
l., Genes Dev., 7, 1126-1132,1993 . Kastan, M.B. e
t al., Cell, 71, 587-597,1992. Miyashita, T. & Ree
d, C.R. Cell, 80, 293-299,1995. Okamoto, K. & Beac
h, D. EMBO J., 13, 4816-4822,1994. Buckbinder, L.
et al., Nature, 377, 646-649,1995. )。これら遺伝
子はプロモーター領域または隣接領域にp53結合性配列
を有することが見い出され、それらの発現はp53蛋白質
の発現と相関関係を有することが証明された。
【0004】これまでp53標的遺伝子を同定するため
に、正常型p53が欠損した癌細胞に正常型p53を導入し
強制発現させて、発現量が増加しているcDNAをサブ
トラクション(消去)法でのスクリーニングやディフェ
レンシャルディスプレイ(differential display、分別
増幅)法によるスクリーニング法が用いられてきた。こ
れらの方法は比較的大量に発現される遺伝子については
同定は可能であるが、微量に発現する遺伝子や臓器特異
性を有する遺伝子の同定は困難である。
【0005】分子生物学の進展に伴い、癌の原因は細胞
増殖制御などに関与する複数の遺伝子の変異が単一の体
細胞に段階的に蓄積することであると考えられるに至っ
ている。癌抑制遺伝子p53の新規な標的遺伝子を解明
し、癌化機構の解明および医学への応用が待望されてい
る。
【0006】
【発明が解決しようとする課題】p53の新しい標的遺伝
子を提供することにある。
【0007】
【課題を解決しようとするための手段】これまでに酵母
(Saccharomyces cerevisiae)を用いるスクリーニング
法により、p53によって転写が促進されるヒトゲノム配
列(p53応答配列)が多数同定された(Tokino, T. et
al., Hum. Mol. Genet., 3, 1537-1542, 1994 )。これ
らの配列のほとんどはp53結合部位のコンセンサス配列
である2コピーの5'-PuPuPuC(A/T)(T/A)GPyPyPy-3'が存
在していた(El-Deiry, W.S. et al., NatureGenet.,
1, 45-49, 1992)。
【0008】そこで本発明者らは、p53応答配列を含有
し、p53依存性に発現される遺伝子を同定することを目
的として、p53応答配列をプローブとしてヒトコスミド
ライブラリーを鋭意スクリーニングし、陽性クロ−ンを
単離し、エクソン部を増幅、構造解析の結果、p53の新
しい標的遺伝子を同定することに成功し本発明を完成す
るに至った。本発明のDNAから演繹されるアミノ酸配
列はデータベースでの相同性検索の結果、グリコシルホ
スファチジルイノシトール(GPI)アンカー分子(Br
akenhoff, R.H. et al., J. Cell Biol., 129, 1677-16
89, 1995)と顕著な類似性を有していたことからGML
GPI anchor molecular like protein)蛋白質と命名
した。
【0009】すなわち本発明は、配列番号1に記載のア
ミノ酸配列の全部または一部を含む蛋白質およびそれを
コードするDNA。該DNA含有ベクター、形質転換
体、該蛋白質の製造方法、該DNAに由来するDNAプ
ローブ、プライマー、該遺伝子の解析方法、該蛋白質に
結合する抗体に関する。GML蛋白質のアミノ酸配列の
うち、1もしくは複数のアミノ酸が、付加、欠失もしく
は置換されたアミノ酸配列の全部または一部を含むも
の、およびそれをコードするDNAも本発明に含まれ
る。
【0010】
【発明の実施の形態】本発明者らは酵母でのp53の転写
活性化能を指標にして、ヒトゲノムDNAからp53の応
答配列を単離した(Tokino, J. et al., Human Mol. Ge
net., 3, 1537-1542, 1994)。すなわち、ヒトゲノムD
NAを制限酵素MboIで処理して得られたDNA断片
をHIS3レポータープラスミドpBM947 の上流に組
み込んだレポーターライブラリーを作製し、ヒトp53を
発現するプラスミドを保有する酵母にレポータープラス
ミドを導入し、His栄養要求性を指標にして1000クロ
ーンを単離した。このうち約1/4 のクローンがp53依存
性に転写を促進するコンセンサス配列を有していること
を報告した。
【0011】これらクローンより、制限酵素によりp53
応答配列を切り取り構造解析したものの中から、配列番
号3に記載のコンセンサス配列を有するp53 応答配列を
標識しプローブとして用い、コロニーハイブリダイゼー
ション法(Gene, 10, 63, 1980)によりヒトゲノムコス
ミドライブラリー(Tokino, T. et al., Am. J. Hum.Ge
net., 48, 258-268, 1991)をスクリーニングし、該プ
ローブとハイブリダイズするコスミドクローンを取得す
ることができる。このようにして得たコスミドクローン
を適当なプラスミドベクターにサブクローニングし、塩
基配列を決定することにより当p53応答遺伝子のゲノム
塩基配列が決定できる。
【0012】またこのようにして得たコスミドクローン
を制限酵素、例えばBam HIおよびBgl IIで消化し、得ら
れたDNA断片をpSPL3などのトラッピングベクタ
ーに挿入し、エクソントラッピング法によりエクソン部
分を増幅させ、エクソン配列を単離・構造解析、さらに
GenBank などのパブリックデ−タベ−スに対する相同性
検索によりエクソン配列を得ることができる。次いでこ
のエクソン配列をヒト組織、例えば精巣から調製したpo
ly(A) RNAを鋳型にして、5’−, 3’−RACE法
により該エクソンの両サイドを延長させ目的とするcD
NAを取得することができる。これらcDNAとジェノ
ミッククローンの構造決定された塩基配列を比較するこ
とによって、イントロン−エクソン結合部が解析され
る。
【0013】塩基配列の構造はマキサム・ギルバート法
(Maxam, A.M. and Gilbert, W., Proc. Natl. Acad. S
ci. U.S.A., 74, 560, 1977 )あるいはジデオキシ法
(Messing, J et al., Nucl. Acids Res., 9, 309, 198
1 )によって決められる。GML蛋白質組換え発現ベク
ターおよびその形質転換体の作製は、上記記載の方法に
より得られたGMLcDNAを適切なベクターに組み込
み、該ベクターを適切な宿主細胞に移入することにより
形質転換体を得ることができる。これを常法により培養
し培養物よりGML蛋白質を大量に生産することができ
る。
【0014】GML蛋白質をコードするcDNAをGM
L蛋白質の発現に適したベクターのプロモーター下流に
制限酵素とDNAリガーゼを用いる公知の方法により再
結合して組換発現ベクターを作成することができる。使
用できるべクターとしては、大腸菌由来のプラスミドp
BR322 、pUC18、枯草菌由来のプラスミドpUB11
0 、酵母由来のプラスミドpRB15、バクテリオファー
ジλgt10、λgt11あるいはSV40などが挙げられるが、
宿主内で複製、増幅可能なベクターであれば特に限定さ
れない。プロモーターおよびターミネーターに関しても
GML蛋白質をコードする塩基配列の発現に用いられる
宿主に対応したものであれば特に限定されず、宿主に応
じて適切な組み合わせも可能である。
【0015】GML蛋白質をコードするcDNAはGM
L蛋白質をコードするDNAであれば何れでもよく、ま
た化学合成によって合成されたものでもよい。さらに発
現される蛋白質がGML蛋白質の生理活性を有するもの
ならば、配列番号2記載の塩基配列に限定されるもので
はなく、アミノ酸配列の一部が付加、欠失もしくは置換
された、実質的に同等な蛋白質をコ−ドするDNAであ
ってもよい。
【0016】このようにして得られた組換え発現ベクタ
ーはコンビテント細胞法(J. Mol.Biol., 53, 154, 197
0)、プロトプラスト法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
75, 1929, 1978)、リン酸カルシウム法(Science, 22
1, 551, 1983 )、インビトロパッケージング法(Porc.
Natl, Acad. Sci. USA, 72, 581, 1975 )、ウイルス
ベクター法(Cell, 37, 1053, 1984)などにより宿主に
導入し、形質転換体が作製される。宿主としては大腸
菌、枯草菌、酵母、昆虫細胞および動物細胞などが用い
られ、得られた形質転換体はその宿主に応じた適切な培
地中で培養される。培養は通常20℃〜45℃、pH5〜8の
範囲で行われ、必要に応じて通気、攪拌が行われる。培
養物からのGML蛋白質の分離・精製は公知の分離・精
製法を適宜組み合わせて実施すれば良い。これらの公知
の方法としては塩析、溶媒沈殿法、透析ゲル炉過法、電
気泳動法、イオン交換クロマトグラフィ、アフィニティ
クロマトグラフィー、逆相高速液体クロマトグラフィな
どが挙げられる。このようにして得られたGML蛋白質
は細胞内にマイクロインジェクション法により注入する
ことにより該細胞の増殖を抑制する活性を示すことが期
待される。
【0017】組織または細胞でのGML遺伝子の発現の
有無は組織または細胞から得られるmRNAまたは総R
NAをRT−PCR法にて解析することにより検討する
ことができる。例えば、検体試料からグアジニンチオシ
アネート法(Chirgwin, J.M.et al., Biochemistry, 1
8, 5294, 1979 )などに基づいてRNAを抽出する。必
要に応じて得られた総RNAをさらにオリゴ(dT)セ
ルロースカラムを用いるクロマトグラフィーによって精
製することによりmRNAを調製することができる。得
られたRNAを鋳型とし、オリゴ(dT)またはランダ
ムヘキサデオキシヌクレオチドをプライマーとして、逆
転写酵素により単鎖cDNAを合成する。 この単鎖c
DNAを鋳型として、GMLのcDNAより適切なプラ
イマーを選択し、PCRを行いPCR産物の量を測定す
ればよい。
【0018】mRNA量を測定する場合は、抽出したm
RNAをゲル上、電気泳動後、メンブレンに転写し標識
したGMLDNAプロ−ブとハイブリダイズさせるノー
ザンブロット分析することでも測定することができる。
エクソントラッピング法はBuckler らの方法に準ずれば
よい(Buckler, A.J.et al., Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 88, 4005-4009, 1991 )。例えば、ヒトコスミド
DNAをBam HIおよびBgl IIの制限酵素を用いて完全に
切断し、スプライシングベクターpSPL1のBam HI部
位にクローニングした後、大腸菌DH5αにトランスフ
ォームしてから、プラスミドDNAを回収し、Cos 7細
胞へエレクトロポレーションによりトランスフェクショ
ン(形質転換)を行う。ついで約48時間後にCos 7細胞
より細胞質RNAを調製し、ベクターのDNA配列を基
に設計されたプライマーを用いてRT−PCRを行い、
さらに内側のプライマーにより2nd−PCRを行うこと
により、未知のエクソンの増幅を行うことができる。得
られたエクソン部分はpBluescript IIなどのベクターに
クローニングし、塩基配列を決定することにより目的と
するエクソンを取得できる。 RACE法はmRNAを
鋳型として、cDNAの配列既知の部分の5’側を増幅
する5’−RACEと3’側を増幅する3’−RACE
があるがFrohman らの方法により行うことができる(Fr
ohman, M.A. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 8
5, 8998-9002, 1988 )。
【0019】抗体の作成は、GML蛋白質を抗原とし
て、常法に従い例えばマウス、モルモット、ウサギ等の
動物の皮下、筋肉内、腹腔内、静脈に複数回接種し十分
に免疫した後、斯かる動物から採血、血清分離し抗GM
Lポリクロ−ナル抗体を作製することができる。なお、
市販のアジュバントも使用できる。モノクローナル抗体
は公知の方法により作製しえる。たとえば、GML蛋白
質で免疫したマウスの脾細胞と市販のマウスミエローマ
細胞との細胞融合により得られるハイブリドーマを作成
後、該ハイブリドーマ培養上清、または該ハイブリドー
マ投与マウス腹水から抗GMLモノクローナル抗体を調
製することができる。抗原とするGML蛋白質は全アミ
ノ酸構造を有する必要はなく、部分構造を有するペプチ
ドや他のペプチドとの融合蛋白質であってもよく、調製
法は生物学的手法、化学合成手法いずれでもよい。これ
ら抗体はヒト生体試料中のGML蛋白質の同定や定量を
可能とし癌診断試薬などへの使用が期待される。GML
蛋白質の免疫学的測定法は、公知の方法に準ずればよ
く、たとえば蛍光抗体法、受身凝集反応法、酵素抗体法
などいずれの方法においても実施できる。
【0020】以上の方法はすでに公知の方法により実施
することが可能である。
【0021】
【実施例】以下の実施例により本発明を詳細に且つ具体
的に説明するが、本発明はこれらの実施例に限定される
ものではない。 実施例1.ゲノムDNAからのエクソン配列のクローニ
ングおよび塩基配列の解析。 p53応答配列(Tokino, T. et al., Hum. Mol. Genet.,
3, 1537-1542, 1994)を含むDNA断片(配列番号
3)を放射ラベルし、ヒトゲノムDNAコスミドライブ
ラリーを常法によりコロニーハイブリダイゼーション法
でスクリーニングしてコスミドクローンc169 を得た。
このクローンのDNAをBam HIとBgl IIで切断し、エク
ソントラップベクターpSPL3(Gibco-BRL 社)に挿
入してエクソントラッピングを行い、一つのエクソン配
列を単離した。
【0022】得られたエクソン配列をBLASTアルゴ
リズムを用いるホモロジー検索によって公開データベー
スの配列と比較したところ、GPI-anchored proteinの一
つ、E48(Brakenhoff, R.H. et al., J. Cell Biol.,
129, 1677-1689, 1995)とそのアミノ酸配列が顕著なホ
モロジーを示した。そこでこの新しい遺伝子をGML
(GPI-anchored molecule-like protein)と命名した。
本発明のGML蛋白質は、BLASTAプログラムによ
る解析から、GPIアンカーを有する膜蛋白質であるE
48抗原とホモロジーを有することが確認された。
【0023】DNAシークエンシングは二本鎖DNAを
鋳型とし、AmpliTaqFS DNAポリメラーゼを用いた
サイクルシークエンシングキット(dye-terminator使
用、Perkin Elmer社)を用いABI377 型DNAシーク
エンサー(Applied Biosystems社)によっておこなっ
た。DNA配列の確認はSequenase Version 2.0 (Unit
edStates Biochemical 社)を用いた35S−ラベルによ
るマニュアルシークエンシングにより行った。
【0024】実施例2.GML遺伝子の構造 実施例1によって得られたエクソン部をFromanらのRA
CE法により両側へ延長させた。5’−および3’−R
ACEは精巣のpoly(A) RNA(Clontech社)を用い、
Clontech社のキットによって行った。さらにコスミドク
ローンc169 に含まれている全ゲノムDNA配列を決定
し、コンピュータープログラムを用いてエクソンの可能
性のある配列を検索した。GRAILによる検索と5’
−RACE、3’−RACEによる検討を組み合わせる
ことにより、722bp よりなるほぼ全長の転写産物(Nort
hern blot 解析では転写産物のサイズはポリシグナルを
含めて0.9 kbと見積られている)を決定した。最初のA
TGコドンは塩基番号90位に存在し、終止コドンは塩基
番号564 位に存在した(配列番号2)。474bp のORF
(翻訳領域)より17kdの翻訳産物がコードされる。ゲノ
ムDNA配列決定により、機能をもつp53結合部位はコ
ーディング配列より19kb上流に位置することが明らかに
なった。GML蛋白質の保有するシステイン残基の11個
中10個までがこれらGPIアンカーを有する蛋白質のフ
ァミリーに保存されていた。GML遺伝子は染色体上8q
24.3-q terにマップされ、E48およびGMLを含むGP
Iアンカーを有するタンパクファミリーの遺伝子がこの
領域に集まっている可能性が示された。
【0025】実施例3.GML遺伝子(mRNA)の野
生型p53による発現誘導の確認 GMLが野生型p53によって誘導されるか否かを確認す
るため、野生型もしくは変異型p53遺伝子を発現する細
胞株を作製し、その細胞より総RNAを抽出してRT−
PCRによる解析を行った。大腸癌細胞株SW480 は片
方のp53のアレルが変異型(273 Arg to His)であり、
もう一方のアレルが欠失しており、この株の増殖は野生
型p53を発現するベクターを導入することにより抑制さ
れることが知られている。
【0026】そこで、まず、このSW480 に野生型もし
くは変異型(Kern, S. et al., Science, 256, 827-83
0, 1992)p53の発現ベクターをトランスフェクトし
た。1×106 個の細胞を25cm2 のフラスコにまき24時間
培養した後、25μg のリポフェクチンと5μg のプラス
ミドDNAを用いてトランスフェクションを行った。こ
れら細胞からTRizol試薬(Gibco-BRL 社)を用いて総R
NAを抽出し、DNase I(Boeringer Mannheim社)で消
化してから、Superscript II(Gibco-BRL 社)を用いて
cDNAを合成しPCRの鋳型として用いた。PCR反
応は200ng の総RNAから生成されたcDNAを12.5μ
l の反応液中に加えて、94℃、2分の変性の後、94℃、
30秒、55〜60℃、30秒、72℃、1分を25ないし35サイク
ルくり返して行った。PCR増幅産物は3%のNuSieve
GTG 2:1アガロースゲルによる電気泳動によって分析
した。使用したプライマーの配列は配列番号4および5
に記載した。これらはセンスコ−ド73-93 位、アンチセ
ンスコ−ド247-268 位に相当する。この際、p53 標的遺
伝子p21/WAF1の発現量も測定し、プライマ−は配列番号
6および7を使用した。対照遺伝子として、GAPDH の発
現量を測定し、配列番号8および9をプライマ−として
使用した。
【0027】その結果、図1に示す如く、GMLのmR
NAは、p21/WAF1と同様に野生型p53発現ベクターでト
ランスフェクトした細胞でより強く発現していた。 実施例4.正常組織および食道癌細胞株におけるGML
mRNAの発現。 種々のヒト組織のpoly(A) RNAのノーザンブロット膜
(Clontech社)を使用し、32Pで標識したヒトGMLc
DNA(配列番号2記載の73-673位DNA、601bp )を
プローブとして用いてハイブリダイゼーションを行っ
た。ハイブリダイゼーションはClontech社の指示通りに
行い、洗浄は 0.1×SSC、 0.1%SDSで50℃、20分
行った。食道癌細胞株の総RNAのRT−PCR解析は
実施例3に記載の方法で行った。PCR反応は少なくと
も2回行い結果を確認した。RNAの完全性はすべての
検体に同様なシグナルを示す陽性対照のGAPDH遺伝
子の転写産物の増幅により確認した。このためのGAP
DH遺伝子のPCRプライマーは配列番号8および9に
示した。
【0028】測定の結果、16種の正常組織からのmRN
AのNorthern blot 解析からおよそ0.9 kbのGMLmR
NAが精巣に発現していることが明らかになった。つい
で食道癌細胞株のパネル(Nishihira, T. et al., J. C
ancer Res. Clin. Oncol., 119, 441-449, 1993 )を用
いてRT−PCR解析法により11種の細胞株におけるG
MLの発現を検討した。その結果、図2に示されるごと
く11株のうち4株にGMLmRNAが発現しており、さ
らに1株に弱く発現していた。
【0029】実施例5.抗癌剤感受性とGML発現の相
関。 GMLを発現しているか否かによって抗癌剤に対する耐
性がどう変化するか検討した。使用する食道癌細胞株は
薬剤添加24時間前に 100mmディシュ当り1×10 6 個の細
胞をプレーティングしておく。ブレオマイシンを24時間
添加したのち4日後の細胞の生存率を測定した。各々の
ポイントは少なくとも3回の独立した実験から得た平均
値を示し、すべての値は同時に行った対応する非処理・
コントロールに対しての相対的生存率として表示した。
なお、使用した食道癌細胞株の性質を表1に示した。そ
の結果、図3に示す如く、GMLを発現している5種の
食道癌細胞株はブレオマイシンに対し感受性を示した。
一方RT−PCRでGML遺伝子の発現が認められなか
った6種の細胞株は同様のブレオマイシン処理に対し比
較的耐性であった。なお、CDDPに対しても同様の結果を
示した(図3)。
【0030】この如く、GMLの発現と薬剤感受性、耐
性が食道癌細胞株において明らかな相関性を示したこと
は、GMLがp53によって誘発されるアポトーシスの経
路に重要な役割を果していることが示唆された。
【0031】
【表1】
【0032】実施例6 形質転換体の作製 GML蛋白質(配列番号1)をコードするDNA(配列
番号2)を基質として、プライマーGML−AとGML
−Bを用いて、MDC蛋白質の一部をコードするDNA
断片をPCRで増幅する。用いたプライマーの配列は以
下の通りである。 GML−A 5’-CACAGATCTGTGAAGTGATGCTCCTCT- 3’
( コーディング鎖、配列番号2の塩基番号 82-99に相
当) GML−B 5’-AACAAGCTTCATGGCAATATATTGCT-3’(
アンチセンス鎖、配列番号2の塩基番号 548-566に相
当、下線は終止コドンを示す) ベクター構築用に、プライマーの5’端にはそれぞれ B
gl II 、Hind III の切断部位配列を付加してある。
【0033】PCR増幅産物をアガロースゲル電気泳動
によって分取し、 Bgl II と HindIII で切断した。こ
うして得られたGML蛋白質の一部をコードするDNA
断片を、予め BamH I と Hind III で切断しておいた p
MAL-c2 (New England Biolabs 社製) ベクターに結合し
てプラスミド pMAL-GML を構築する。同様に、予め Bam
H I と Hind III で切断しておいた pQE-13 (Diagen 社
製)ベクターに結合してプラスミド pH6-GMLを構築す
る。
【0034】pMAL-c2 ベクターに組み込んだ断片は、
N末端側にマルトース結合蛋白質(MBP)を有する融
合蛋白質として発現されるので、その融合蛋白質はアミ
ロースカラムによってアフィニティー精製する。また、
pQE-13 ベクターに組み込んだ断片は、N末端側に6個
のヒスチジン残基よりなるペプチド(His 6)を有する
融合蛋白質として発現されるので、その融合蛋白質は金
属キレートカラムによってアフィニティー精製する。
【0035】各プラスミド pMAL-GML および pH6-GMLを
用いて E.coli JM109 をトランスフォームし、アンピシ
リン耐性で選択してそれぞれの形質転換体を得る。 実施例7 組換えMDC蛋白質の発現と精製 実施例6で得られたそれぞれの形質転換体を培養し、培
養物より組換えMDC融合蛋白質を抽出、精製する。
【0036】すなわち、各形質転換体を 100ml のLB
培地 (1%ポリペプトン、 0.5% 酵母抽出物, 1%NaCl) で
37 ℃ 一夜振とう培養する。培養液を予め 37 ℃ に
加温したLB培地で10倍に希釈し、さらに30分〜9
0分培養して、対数増殖期の培養物を得る。培養物1リ
ッタ−にIPTG( Isopropyl-beta-D-thiogalactopyr
anoside )を終濃度1mMとなるように添加して3〜4
時間培養した。培養物から遠心分離により菌体を集め
る。
【0037】プラスミド pMAL-GML による形質転換体の
場合は、菌体に10mlのカラムバッファー(20mM Tri
s-HCl pH7.4, 200mM NaCl)を加え超音波によって破砕
する。組換えGML融合蛋白質は、破砕液の不溶性画分
に存在するので、これを遠心分離して変性バッファー
(8M 尿素、 20mM Tris-HCl pH8.5, 10mM ジチオスラ
イト−ル)に溶解する。次いで、これをカラムバッファ
ーに透析後、遠心分離して上清可溶画分を集める。透析
不溶性画分は、さらに変性、透析、遠心分離を繰返して
上清可溶画分を回収する。集めた可溶性画分をアミロー
スカラム (New England Biolabs 社製) にかけ、カラム
バッファーで洗浄後、10mMマルトースを含むカラム
バッファーで溶出する。溶出画分は、280nmの吸光
度およびSDSポリアクリルアミド電気泳動法(クマシ
ーブルー染色)で解析して分画する。この結果、プラス
ミド pMAL-GML による形質転換体のそれぞれで、期待さ
れる分子量のGML融合蛋白質が主要バンドとして検出
される画分が得られる。これらの融合蛋白質を以下、そ
れぞれ MBP-GMLと称する。
【0038】同様に、プラスミド pH6-GMLによる形質転
換体の場合は、菌体に10mlのソニケーションバッフ
ァー(10mM リン 酸ナトリウム pH8.0, 200mM NaCl)を加え超
音波によって破砕する。組換えGML融合蛋白質は、破
砕液の不溶性画分に存在するので、これを遠心分離して
バッファーA(6M塩酸ク゛アニシ゛ン, 100mM NaH2PO4, 10mMTr
is-HCl, pH8.0 ) に溶解し、遠心分離して上清可溶画分
を集め、Ni−NTAカラム (Diagen社製) にかけ、バ
ッファーA、次いでバッファーB(8M尿素, 100mM NaH2
PO4, 10mMTris-HCl, pH8.0 )で洗浄後、バッファーC
(8M尿素, 100mMNaH2PO4, 10mMTris-HCl, pH6.3 )、バ
ッファーD(8M尿素, 100mM NaH2PO4, 10mMTris-HCl, p
H5.9 )、バッファーE(8M尿素, 100mM NaH2PO4, 10mMT
ris-HCl, pH4.5 )およびバッファーF(6M塩酸ク゛アニシ゛ン,
200mM酢酸) で段階的に溶出する。溶出画分は、28
0nmの吸光度およびSDSポリアクリルアミド電気泳
動法(クマシーブルー染色)で解析して分画する。この
結果、バッファーFによる溶出液に、期待される約34
Kdの His6融合蛋白質が単一バンドとして検出される
画分が得らる。この融合蛋白質を以下、His 6-GMLと称
する。
【0039】実施例8 モノクローナル抗体およびウサ
ギポリクローナル抗体の作製 実施例7で得られる2種の組換え融合蛋白質、His 6-G
ML、 MBP-GMLを、それぞれ、免疫抗原、抗体精製・スク
リーニング用抗原、測定用標準抗原として用いる。抗G
ML蛋白特異的モノクローナル抗体は、His 6-GMLをマ
ウスに免疫して作製する。すなわち、His 6-GMLの3M
尿素/PBS溶液(500−1000ug/ml)を完
全アジュバントと1:1の割合で混合しマウスの腹腔内
に100ug/匹にて2週間隔で4〜6回免疫を行な
う。免疫終了後、P3U1細胞とB細胞とのハイブリド
ーマをPEG1500を用いて作製し、培養上清中の抗
体価をモニターし、抗GML蛋白特異的抗体を産生する
ハイブリドーマの選択を行う。抗体価の測定は、実施例
7で得た MBP-GML融合蛋白質を固相化(5ug/ml)
したポリスチレン製カップに培養上清100ulを加え
第一反応を行い、洗浄後、抗マウスIgG−HRP(Ho
rse-raddish peroxidase)を加え第二反応を行なう。洗
浄後、酵素基質溶液(過酸化水素水およびABTS
(2,2’−アジノ−ビス−(3−エチルベンゾチアゾ
リン−6−スルホン酸)混合液)を添加し、発色反応
(第三反応)を行いモニターする。
【0040】ハイブリドーマを96ウエルマルチプレー
トにて培養し、HAT選択を行い、約2週間後に培養上
清中の抗体価を測定し抗原と特異的に反応するクローン
を選択する。更に、クローニング操作を行い、各ハイブ
リドーマ細胞300万個を、予め約1週間前に0.5ml
のプリスタンを腹腔内に投与しておいた BALB/c マウス
の腹腔内に接種し、8〜10日後に腹水を採取する。各
腹水よりプロテインGカラムによるアフィニティークロ
マトグラフィーで抗体を精製する。
【0041】同様に、実施例7で得られた His6-GMLを
免疫抗原として、ウサギに免疫し、抗GML蛋白ポリク
ローナル抗体を作製する。すなわち、マウスと同様、 H
is6-GMLの3M尿素/PBS溶液(500−1000u
g/ml)を完全アジュバントと1:1の割合で混合し
免疫を行なう。免疫終了後、抗血清を得、実施例7で得
た MBP-GML融合蛋白質を固相化したポリスチレン製カッ
プを用いて、抗体価を測定する。抗血清を適宜希釈し、
その100ulをウエルに添加し、抗体価をヤギ抗ウサ
ギIgG−HRPを用いて検討する。さらに、この抗血
清を、プロテインGカラムおよび MBP-MDC(dC1) 融合蛋
白質を固相化したセファロースカラムによるアフィニテ
ィークロマトグラフィーで精製する。
【0042】このようにして得られる精製モノクローナ
ル抗体および精製ウサギポリクローナル抗体を用いたE
LISA法によるGML蛋白質の定量法を確立する。す
なわち、ハイブリドーマ由来の精製モノクローナル抗体
を96ウエルプレートに固相化し、BSA(Bovine ser
um albumin)でブロッキング後、精製 MBP-GML溶液を被
検液として、0.156 〜5.00 ug/ml の範囲で 100 ul /
ウエルずつ添加して室温1時間反応させる。ウエルを洗
浄後、精製ウサギポリクローナル抗体溶液(5ug/ml)を
100 ul /ウエルずつ添加して室温1時間反応させる。
ウエルを洗浄後、抗ウサギIgG−HRP(5ug/ml)を
100 ul /ウエルずつ添加して室温1時間反応させる。
反応終了後2mMアジ化ナトリウムを 100 ul /ウエル
ずつ添加し、405nm と 490nm の吸光値を測定する。
【0043】
【発明の効果】P53 遺伝子の変異は癌のおよそ50%に認
められ、その変移の検出は癌の発生、診断、治療などに
極めて重要な意義を有する。しかしながら癌組織でのP5
3 遺伝子の変異部位は一定しておらず、幾種類もの変異
が見いだされているため、p53 遺伝子の変移を検出・同
定するには多大の労力と時間を要した。それ故にP53 の
変異を測定する代わりに本発明の新しい標的たんぱく質
GML遺伝子の発現または蛋白質自体を測定することに
よって、P53 の変異、機能失活を判定することが可能と
なり、癌の診断手段として期待される。また、GML遺
伝子を癌病巣部に発現させる遺伝子治療への応用、P53
機能に依存せずにGMLを発現させる薬剤のスクリ−ニ
ング法への応用、逆にGMLの発現を抑制する医薬、ア
ンチセンス医薬への応用など期待される。
【0044】
【配列表】
配列番号:1 配列の長さ:158 配列の型:アミノ酸 配列の種類:タンパク質 トポロジ−:直鎖状 起源 生物名:ホモサピエンス 直接の起源 ライブラリ−名:ヒトDNAコスミドライブラリ− 配列 Met Leu Leu Phe Ala Leu Leu Leu Ala Met Glu Leu Pro Leu Val Ala 1 5 10 15 Ala Ser Ala Thr Met Arg Ala Gln Trp Thr Tyr Ser Leu Arg Cys His 20 25 30 Asp Cys Ala Val Ile Asn Asp Phe Asn Cys Pro Asn Ile Arg Val Cys 35 40 45 Pro Tyr His Ile Arg Arg Cys Met Thr Ile Ser Ile Arg Ile Asn Ser 50 55 60 Arg Glu Leu Leu Val Tyr Lys Asn Cys Thr Asn Asn Cys Thr Phe Val 65 70 75 80 Tyr Ala Ala Glu Gln Pro Pro Glu Ala Pro Gly Lys Ile Phe Lys Thr 85 90 95 Asn Ser Phe Tyr Trp Val Cys Cys Cys Asn Ser Met Val Cys Asn Ala 100 105 110 Gly Gly Pro Thr Asn Leu Glu Arg Asp Met Leu Pro Asp Glu Val Thr 115 120 125 Glu Glu Glu Leu Pro Glu Gly Thr Val Arg Leu Gly Val Ser Lys Leu 130 135 140 Leu Leu Ser Phe Ala Ser Ile Ile Val Ser Asn Ile Leu Pro 145 150 155
【0045】配列番号:2 配列の長さ:722 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジ−:直鎖状 配列の種類:cDNA to mRNA 起源 生物名:ホモサピエンス 直接の起源 ライブラリ−名:ヒトDNAコスミドライブラリ− 配列 GTCGGCGCGG GAGGCTCAAA TGGCTGGAGG CGGCGGGCAC GCACACTGCG GGCTCCGAGG 60 GGCACAGGTC CAGGCTCCTG CGTGAAGTG ATG CTC CTC TTT GCC TTA CTC CTA 113 Met Leu Leu Phe Ala Leu Leu Leu 1 5 GCC ATG GAG CTC CCA TTG GTG GCA GCC AGT GCC ACC ATG CGC GCT CAG 161 Ala Met Glu Leu Pro Leu Val Ala Ala Ser Ala Thr Met Arg Ala Gln 10 15 20 TGG ACT TAC AGT TTG AGA TGC CAT GAC TGT GCG GTC ATA AAT GAC TTC 209 Trp Thr Tyr Ser Leu Arg Cys His Asp Cys Ala Val Ile Asn Asp Phe 25 30 35 40 AAC TGT CCC AAC ATT AGA GTA TGT CCG TAT CAT ATT AGG CGC TGT ATG 257 Asn Cys Pro Asn Ile Arg Val Cys Pro Tyr His Ile Arg Arg Cys Met 45 50 55 ACA ATC TCC ATT CGC ATA AAT TCT CGT GAA CTA CTT GTT TAT AAG AAC 305 Thr Ile Ser Ile Arg Ile Asn Ser Arg Glu Leu Leu Val Tyr Lys Asn 60 65 70 TGT ACA AAC AAC TGC ACA TTT GTA TAT GCA GCT GAA CAG CCT CCT GAA 353 Cys Thr Asn Asn Cys Thr Phe Val Tyr Ala Ala Glu Gln Pro Pro Glu 75 80 85 GCC CCA GGA AAA ATC TTC AAA ACT AAT AGC TTC TAC TGG GTT TGT TGT 401 Ala Pro Gly Lys Ile Phe Lys Thr Asn Ser Phe Tyr Trp Val Cys Cys 90 95 100 TGT AAT AGC ATG GTT TGC AAT GCA GGA GGA CCT ACT AAT CTT GAA AGG 449 Cys Asn Ser Met Val Cys Asn Ala Gly Gly Pro Thr Asn Leu Glu Arg 105 110 115 120 GAC ATG TTA CCC GAT GAA GTA ACT GAG GAG GAG CTT CCA GAA GGA ACT 497 Asp Met Leu Pro Asp Glu Val Thr Glu Glu Glu Leu Pro Glu Gly Thr 125 130 135 GTG AGG CTG GGG GTA TCA AAA CTG TTG CTG AGT TTT GCC TCT ATC ATA 545 Val Arg Leu Gly Val Ser Lys Leu Leu Leu Ser Phe Ala Ser Ile Ile 140 145 150 GTC AGC AAT ATA TTG CCA TGAGGACCCC ACCTTGGAGG GTCTGACCAT 593 Val Ser Asn Ile Leu Pro 155 CTTCACCTGT TCCGCAGAGA AATGTTGCTC TCCATTATTC CCTTCTAAGC CAGAGACCCT 653 TATCCACTGC TCCTCTAGGT GGCCCATTTA TGGTTTGTTG TAAGAGAAAA ATTAAAAAAA 713 TATTGTTTA 722
【0046】配列番号:3 配列の長さ:30 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジ−:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) 配列 ATGCTTGCCC AGGCATGTCC AGGCTGGTCC
【0047】配列番号:4 配列の長さ:21 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジ−:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) 配列 GGCTCCTGCG TGAAGTGATG C
【0048】配列番号:5 配列の長さ:22 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジ−:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) 配列 ATGGAGATTG TCATACAGCG CC
【0049】配列番号:6 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジ−:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) 配列 GTTCCTTGTG GAGCCGGAGC
【0050】配列番号:7 配列の長さ:21 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジ−:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) 配列 GGTACAAGAC AGTAGCAGGT C
【0051】配列番号:8 配列の長さ:22 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジ−:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) 配列 CAACTACATG GTTTACATGT TC
【0052】配列番号:9 配列の長さ:18 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジ−:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) 配列 GCCAGTGGAC TCCACGAC
【0053】
【図面の簡単な説明】
【図1】SW480 細胞株におけるp53 によるGML遺伝
子の発現。W:野生型p53 、M:変異型p53
【図2】食道癌細胞株におけるGML遺伝子の発現。
W:野生型p53 、M:変異型p53
【図3】食道癌細胞株における、抗癌剤(Bleomycinn,C
DDP)感受性とGML発現の相関。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 C12P 21/02 C12P 21/08 21/08 7823−4B C12Q 1/68 A C12Q 1/68 C12N 5/00 B //(C12N 15/09 ZNA C12R 1:91) (C12N 5/10 C12R 1:91) (C12P 21/02 C12R 1:91) (C12P 21/08 C12R 1:91)

Claims (12)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】配列番号1に記載のアミノ酸配列を含む蛋
    白質をコードするDNA。
  2. 【請求項2】配列番号2に記載のDNAである、請求項
    1に記載のDNA。
  3. 【請求項3】配列番号1に記載のアミノ酸配列のうち1
    もしくは複数のアミノ酸が、付加、欠失もしくは置換さ
    れたアミノ酸配列を含む蛋白質をコードするDNA。
  4. 【請求項4】請求項1、2または3に記載のDNAを含
    有するベクター。
  5. 【請求項5】請求項4に記載のベクターを保持する形質
    転換体。
  6. 【請求項6】配列番号1に記載のアミノ酸配列を含む蛋
    白質。
  7. 【請求項7】配列番号1に記載のアミノ酸配列の1もし
    くは複数のアミノ酸が、付加、欠失もしくは置換された
    アミノ酸配列を含む蛋白質。
  8. 【請求項8】請求項5に記載の形質転換体を培養し、発
    現産物を回収することを含む、請求項6または7に記載
    の蛋白質の製造方法。
  9. 【請求項9】配列番号2に記載の塩基配列の全部または
    一部、またはその相補配列を含む1本鎖DNAからなる
    DNAプローブ。
  10. 【請求項10】配列番号2に記載の塩基配列の一部また
    はその相補配列を含む1本鎖DNAからなるDNAプラ
    イマー。
  11. 【請求項11】請求項6に記載の蛋白質と結合するポリ
    クローナル抗体またはモノクローナル抗体
  12. 【請求項12】請求項9または10に記載のプローブま
    たはプライマーを用いることを特徴とする請求項2に記
    載のDNAの解析方法。
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