JPH09243562A - Dna sequencer - Google Patents

Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To detect the fluorescence from a fluorescence labelled DNA fragment with high sensitivity. SOLUTION: Different DNA samples containing four kinds of multiple labelled DNA fragments are respectively charged in the sample charging slot 4 of a migration gel 2 and migration voltage is applied. The DNA samples become migration bands 3 to migrate through the migraion gel 2 in a migration direction 6 with the elapse of time to be separated and reach one straight line to be excited by exciting light 10 to emit the fluorescences corresponding to labels. The lights on one straight line 8 are incident on an interferometer 12 by a condensing mechanism 14 and modulated by the interferometer 12 to be detected by a unidimensional detector array 16. A signal processing part 18 obtains fluorescence spectra at the respective positions on one straight line 8 of the migration gel 2 to discriminate the kinds of the terminal bases of the DNA fragments migrated at the respective positions and joins the results in a time axis direction to determine the base sequences of the DNA samples migrated along respective migration lanes.

Description

【発明の詳細な説明】Detailed Description of the Invention

【０００１】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は蛍光物質により標識
されたＤＮＡフラグメントからなる複数の試料を泳動媒
体の異なる位置で同時に電気泳動させ、所定の泳動位置
で、泳動方向に直交する一直線上での蛍光を検出してＤ
ＮＡの塩基配列を決定するオンライン方式のＤＮＡシー
ケンサに関するものである。BACKGROUND OF THE INVENTION 1. Field of the Invention The present invention allows a plurality of samples consisting of a DNA fragment labeled with a fluorescent substance to be simultaneously electrophoresed at different positions of an electrophoretic medium, and to be electrophoresed at a predetermined electrophoretic position on a straight line orthogonal to the electrophoretic direction. D to detect fluorescence
The present invention relates to an online DNA sequencer for determining the base sequence of NA.

【０００２】[0002]

【従来の技術】ＤＮＡの塩基配列を決定する方法とし
て、蛍光プライマー（標識として螢光物質を化学結合さ
せたプライマー）を用いサンガーの方法で前処理された
ＤＮＡフラグメントからなる試料を泳動媒体の異なる位
置で同時に電気泳動させる電気泳動装置が用いられる。
泳動媒体としてスラブ状ゲルを用いるものの他、ゲルを
充填したキャピラリーを複数本配列したマルチキャピラ
リーＤＮＡシーケンサも提案されている。2. Description of the Related Art As a method for determining the base sequence of DNA, a sample consisting of a DNA fragment pretreated by Sanger's method using a fluorescent primer (a primer chemically bound with a fluorescent substance as a label) is used for different migration media. An electrophoretic device is used that allows electrophoresis at the same time.
In addition to using a slab-like gel as a migration medium, a multi-capillary DNA sequencer in which a plurality of gel-filled capillaries are arranged has been proposed.

【０００３】その際用いる蛍光標識の種類は、１種類の
場合と複数種類の場合がある。１種類の蛍光標識の場合
は、その末端塩基の種類Ａ（アデニン）、Ｇ（グアニ
ン）、Ｔ（チミン）、Ｃ（ヒトシン）に応じて別々の泳
動レーン又は別々のキャピラリーで泳動させる。The type of fluorescent label used at that time may be one type or plural types. In the case of one type of fluorescent label, electrophoresis is performed in different migration lanes or different capillaries depending on the types of terminal bases A (adenine), G (guanine), T (thymine), and C (human syn).

【０００４】蛍光波長の異なる複数種類の蛍光標識を用
いた多重標識の場合には、各末端塩基別に異なる蛍光色
素で標識するか、２種類の標識色素の比率を変えること
によってコード化し、４種類の末端塩基別の試料が識別
できるようにした状態で、４種類のＤＮＡフラグメント
（ＤＮＡ断片）を含む試料をそれぞれの泳動レーン又は
キャピラリーに注入し、複数の泳動レーン又はキャピラ
リーで複数種類の試料を同時に泳動させる。具体的に
は、末端塩基の異なるＤＮＡフラグメントを識別するた
めの標識物質としては、ＦＡＭ、ＪＯＥ、ＴＡＭＲＡ及
びＲＯＸの４種類の発蛍光団を標識として用いる方法
（Anal. Chem. 1994, 66, 1021-1026（以下、引用例１
という）参照）や、ＦＡＭとＪＯＥの２種類を比率を異
ならせ結合させることによりコード化して４種類のＤＮ
Ａフラグメントを識別する方法（Anal. Chem. 1992, 6
4, 2149-2154（以下、引用例２という）参照）が提案さ
れている。In the case of multiple labeling using a plurality of types of fluorescent labels having different fluorescent wavelengths, each terminal base is labeled with a different fluorescent dye or is coded by changing the ratio of the two types of labeling dyes to obtain four types. Samples containing four types of DNA fragments (DNA fragments) are injected into the respective migration lanes or capillaries in a state in which the samples for each end base can be identified, and multiple types of samples can be sampled in multiple migration lanes or capillaries. Simultaneously run. Specifically, as a labeling substance for identifying DNA fragments having different terminal bases, a method of using four kinds of fluorophores of FAM, JOE, TAMRA and ROX as labels (Anal. Chem. 1994, 66, 1021). -1026 (hereinafter referred to as reference example 1
4) and 4 types of DN coded by combining two types of FAM and JOE with different ratios and combining them.
Method for identifying A fragment (Anal. Chem. 1992, 6
4, 2149-2154 (referred to below as Reference Example 2) has been proposed.

【０００５】複数種類の蛍光標識を用いた場合、すなわ
ち多重標識されたＤＮＡフラグメントを泳動させた場
合、検出した蛍光からそれがどのＤＮＡプラグメントに
対応するものであるかを識別するために、従来はバンド
パスフィルタなどの光学フィルタにより蛍光を分離した
り、分光器を用いることによって蛍光のスペクトルを測
定する方法が行なわれている。また、１種類の蛍光標識
を用いた場合にも蛍光を励起光から分離するために光学
フィルタが用いられている。When a plurality of types of fluorescent labels are used, that is, when multiple labeled DNA fragments are electrophoresed, in order to distinguish which DNA plugment it corresponds to from the detected fluorescence, conventional methods have been used. A method of separating fluorescence by an optical filter such as a bandpass filter or measuring a spectrum of fluorescence by using a spectroscope is used. Further, even when one type of fluorescent label is used, an optical filter is used to separate the fluorescence from the excitation light.

【０００６】[0006]

【発明が解決しようとする課題】光学フィルタを用いて
蛍光を識別する場合、フィルタを通すことによって光量
が約３０〜５０％に低下する。多重標識した場合には標
識の種類の数だけ光学フィルタが必要となり、その切換
え機構が必要になったり、切換えに時間を要するなどの
問題も生じる。When fluorescent light is identified using an optical filter, the amount of light is reduced to about 30 to 50% by passing through the filter. In the case of multiple labeling, there are problems that optical filters are required for the number of types of labeling, a switching mechanism therefor is required, and switching takes time.

【０００７】分光器を用いた場合、蛍光を分光器に入射
させる入口スリットで約１０％に光量が低下し、さらに
グレーティングでその３０％まで光量が低下する。ＤＮ
Ａフラグメントから発生する蛍光は微弱光であるため、
フィルタや分光器でこのように光量が減衰すれば、検出
部での低感度につながってしまう。そこで、本発明は蛍
光標識されたＤＮＡフラグメントからの蛍光を高感度に
検出できるようにすることを目的とするものである。When a spectroscope is used, the amount of light is reduced to about 10% at the entrance slit for allowing fluorescence to enter the spectroscope, and further to 30% at the grating. DN
Since the fluorescence emitted from the A fragment is weak light,
If the light quantity is attenuated by the filter or the spectroscope in this way, it leads to low sensitivity in the detection unit. Therefore, an object of the present invention is to make it possible to detect fluorescence from a fluorescently labeled DNA fragment with high sensitivity.

【０００８】[0008]

【課題を解決するための手段】本発明のＤＮＡシーケン
サは、蛍光物質により標識されたＤＮＡフラグメントか
らなる複数の試料を泳動媒体の異なる位置で同時に電気
泳動させる電気泳動装置と、電気泳動装置の所定の泳動
位置で、泳動方向に直交する一直線上で前記泳動媒体に
ライン状の励起光を照射する励起光学系と、少なくとも
一次元に配列された複数の画素のインターフェログラム
を同時に得ることのできる干渉計と、泳動媒体が励起光
学系からの励起光で照射されている一直線上の光を集光
してその干渉計に導く集光機構と、その干渉計からの出
力光を泳動媒体が励起光で照射されている位置と対応さ
せて受光して検出する一次元的検出器アレイと、その一
次元的検出器アレイの検出信号から泳動媒体が励起光で
照射されている各位置から発生する光のスペクトルを得
て、泳動媒体の各位置を泳動したＤＮＡフラグメントを
検出し、その時間変化によりＤＮＡの塩基配列を決定す
る信号処理部とを備えている。The DNA sequencer of the present invention comprises an electrophoretic device for simultaneously electrophoresing a plurality of samples comprising DNA fragments labeled with a fluorescent substance at different positions of an electrophoretic medium, and a predetermined electrophoretic device. It is possible to simultaneously obtain an excitation optical system that irradiates the electrophoretic medium with linear excitation light on a straight line orthogonal to the electrophoretic direction at the electrophoretic position of 1 and an interferogram of a plurality of pixels arranged in at least one dimension. The interferometer, a focusing mechanism that collects the light on the straight line where the electrophoretic medium is irradiated with the excitation light from the excitation optical system and guides it to the interferometer, and the electrophoretic medium excites the output light from the interferometer. A one-dimensional detector array that receives and detects light corresponding to the position irradiated with light, and the migration medium is irradiated with excitation light from the detection signal of the one-dimensional detector array. To obtain a spectrum of the laid et generated light to detect DNA fragments electrophoresed each position of the loading medium, and a signal processing unit for determining the base sequence of DNA by the time change.

【０００９】泳動媒体としては、スラブ状ゲルも、ゲル
を充填したキャピラリーを複数本配列したキャピラリー
アレイもともに含む。蛍光標識は１種類の場合と複数種
類の場合をともに含む。干渉計はビームスプリッタやミ
ラーなど、殆ど光量の減衰のない部品で構成されてお
り、しかも連続した波長のスペクトル強度が得られるの
で、蛍光標識の種類の数に関係なく、高感度に検出する
ことができる。The electrophoretic medium includes both a slab-like gel and a capillary array in which a plurality of capillaries filled with the gel are arranged. The fluorescent label includes both one type and multiple types. The interferometer is composed of components such as a beam splitter and a mirror with almost no attenuation of light quantity, and since it can obtain a spectrum intensity of continuous wavelengths, it can detect with high sensitivity regardless of the number of fluorescent labels. You can

【００１０】[0010]

【実施例】図１は本発明を概略的に表わしたものであ
る。２はスラブ状泳動ゲルであり、ポリアクリルアミド
ゲルが使用されている。泳動ゲル２の両端は電極槽（図
示略）に浸され、両電極槽には電解液が収容され、両電
極槽間には泳動電源（図示略）によって泳動電圧が印加
される。1 is a schematic representation of the present invention. 2 is a slab-like migration gel, and polyacrylamide gel is used. Both ends of the electrophoretic gel 2 are immersed in electrode tanks (not shown), an electrolytic solution is contained in both electrode tanks, and an electrophoretic voltage is applied between both electrode tanks by an electrophoretic power supply (not shown).

【００１１】泳動ゲル２の一端には試料を注入するため
のサンプル投入スロット４が設けられており、各サンプ
ル投入スロット４には異なるＤＮＡ試料が投入される。
ＤＮＡ試料は、例えば引用例１のように末端塩基別に異
なる蛍光物質ＦＡＭ、ＪＯＥ、ＴＡＭＲＡ及びＲＯＸに
より標識された４種類のＤＮＡフラグメント、又は引用
例２のように２種類の蛍光物質ＦＡＭ及びＪＯＥを用い
て４種類が識別できるようにコードされた４種類のＤＮ
Ａフラグメントを含むＤＮＡ試料である。A sample input slot 4 for injecting a sample is provided at one end of the electrophoretic gel 2, and a different DNA sample is input to each sample input slot 4.
The DNA sample contains, for example, four kinds of DNA fragments labeled with fluorescent substances FAM, JOE, TAMRA and ROX which are different depending on the end bases as in the reference example 1, or two kinds of fluorescent substances FAM and JOE as in the reference example 2. 4 kinds of DN coded so that 4 kinds can be identified by using
A DNA sample containing the A fragment.

【００１２】泳動ゲル２の所定の泳動位置で、泳動方向
６に直交する一直線８上で、泳動ゲル２にライン状の励
起光１０を照射する励起光学系としては、次のようなも
のを使用することができる。その一例は、励起光ビーム
を発生するために、光源としてアルゴンイオンレーザ
と、非線形光学結晶を装備したＹＡＧレーザを備えてダ
イクロイックミラーにより両レーザからのレーザ光が同
じ光軸上の励起光ビームとなるように配置する。その場
合、励起光ビームを発生する方法としては、アルゴンイ
オンレーザからは４８８ｎｍのレーザ光を発振させ、非
線形光学結晶を装備したＹＡＧレーザからは５３２ｎｍ
のレーザ光を発振させて２種類の波長を含むレーザ光を
励起光ビームとする方法と、アルゴンイオンレーザのみ
を用い、その４８８ｎｍと５１４.５ｎｍの２種類の波
長のレーザ光を同時に発振させて励起光ビームとする方
法がある。その励起光ビームをビームエキスパンダーで
広げた後、シリンドリカルレンズにより泳動ゲル２の一
直線８上にライン状に収束させるものである。The following is used as the excitation optical system for irradiating the migration gel 2 with the linear excitation light 10 on the straight line 8 orthogonal to the migration direction 6 at a predetermined migration position of the migration gel 2. can do. An example thereof is an argon ion laser as a light source and a YAG laser equipped with a non-linear optical crystal in order to generate an excitation light beam, and a dichroic mirror causes the laser light from both lasers to be an excitation light beam on the same optical axis. Arrange so that In that case, as a method of generating the excitation light beam, a laser beam of 488 nm is oscillated from an argon ion laser and 532 nm is emitted from a YAG laser equipped with a nonlinear optical crystal.
Of oscillating the laser light of No. 2 and using the laser light containing two kinds of wavelengths as the excitation light beam, and using only the argon ion laser, the laser lights of two kinds of wavelengths of 488 nm and 514.5 nm are simultaneously oscillated. There is a method of using an excitation light beam. The excitation light beam is expanded by a beam expander and then linearly converged on a straight line 8 of the electrophoretic gel 2 by a cylindrical lens.

【００１３】励起光学系の他の例は、レーザ装置から発
生した励起光ビームが泳動ゲル２の一直線８に沿うよう
に、ガルバノミラー又はポリゴンミラーにより走査し、
その走査された励起光ビームをｆθレンズによって泳動
ゲル２に垂直方向から入射させるものである。励起光学
系のさらに他の例は、励起光ビームが一直線８上を通過
するように、泳動ゲル２の側面から入射させるものであ
る。Another example of the excitation optical system is that the excitation light beam generated from the laser device is scanned by a galvanometer mirror or a polygon mirror so that the excitation light beam is along the straight line 8 of the electrophoretic gel 2.
The scanned excitation light beam is made incident on the electrophoretic gel 2 from the vertical direction by the fθ lens. Still another example of the excitation optical system is one in which the excitation light beam is incident from the side surface of the electrophoretic gel 2 so as to pass on the straight line 8.

【００１４】泳動ゲル２に関し、励起光学系とは反対側
には少なくとも一次元に配列された複数の画素のインタ
ーフェログラムを同時に得ることのできる干渉計１２が
配置されている。そのような干渉計１２としては、Spec
tral Bio-Imaging System（ＡＳＩ社の製品）を使用す
ることができる。また、特開平７−３０１５６２号公報
に記載されている干渉計も使用することができる。Regarding the electrophoretic gel 2, an interferometer 12 capable of simultaneously obtaining interferograms of a plurality of pixels arranged in at least one dimension is arranged on the side opposite to the excitation optical system. As such an interferometer 12, Spec
The tral Bio-Imaging System (a product of ASI) can be used. Further, the interferometer described in JP-A-7-301562 can also be used.

【００１５】泳動ゲル２の一直線８上の像を干渉計１２
に入射させるために、泳動ゲル２と干渉計１２の間に集
光機構１４が配置されている。干渉計１２を作動させる
と、その出力として、泳動ゲル２の一直線８上に配列さ
れた各画素のインターフェログラムが得られる。そのイ
ンターフェログラムを泳動ゲル２の一直線８上の位置と
対応させて検出するために、ＣＣＤやＰＤＡ（フォトダ
イオードアレイ）などの一次元的検出器アレイ１６が配
置されている。The image on the straight line 8 of the electrophoresis gel 2 is interferometer 12
A light-collecting mechanism 14 is arranged between the electrophoretic gel 2 and the interferometer 12 in order to allow the light to enter. When the interferometer 12 is operated, an interferogram of each pixel arranged on the straight line 8 of the electrophoretic gel 2 is obtained as its output. In order to detect the interferogram corresponding to the position on the straight line 8 of the electrophoretic gel 2, a one-dimensional detector array 16 such as CCD or PDA (photodiode array) is arranged.

【００１６】１８は信号処理部であり、一次元的検出器
アレイ１６の検出信号であるインターフェログラムをフ
ーリエ変換し、泳動ゲル２の一直線８上の各位置での蛍
光スペクトルを得て、それぞれの位置を泳動したＤＮＡ
フラグメントの末端塩基の種類を識別する。その結果を
時間軸方向に結合して、各泳動レーンを泳動したＤＮＡ
試料の塩基配列を決定する。Reference numeral 18 denotes a signal processing section, which performs Fourier transform of the interferogram which is the detection signal of the one-dimensional detector array 16 to obtain the fluorescence spectrum at each position on the straight line 8 of the electrophoretic gel 2 and respectively. DNA migrating at the position
Identify the type of terminal base of the fragment. The results were combined in the direction of the time axis, and the DNA migrated in each migration lane
Determine the base sequence of the sample.

【００１７】この実施例の動作を説明する。泳動ゲル２
の一端のサンプル投入スロット４に、多重標識された４
種類のＤＮＡフラグメントを含む異なるＤＮＡ試料をそ
れぞれ投入し、泳動電圧を印加する。ＤＮＡ試料は泳動
バンド３となって泳動方向６に時間とともに泳動ゲル２
中を泳動して分離されていき、一直線８に達する。一直
線８の位置には励起光学系から励起光がライン状に照射
されているため、ＤＮＡフラグメントがその一直線８の
位置に到達すると、その標識に応じた蛍光を発する。一
直線８上の光は集光機構１４により干渉計１２に入射
し、干渉計１２で変調されて一次元的検出器アレイ１６
で検出される。干渉計１２の動作に伴ない、信号処理部
１８では泳動ゲル２の一直線８上の各位置でのインター
フェログラムが得られるので、信号処理部１８ではそれ
をフーリエ変換し、泳動ゲル２の一直線８上の各位置で
の蛍光スペクトルを得て、それぞれの位置を泳動したＤ
ＮＡフラグメントの末端塩基の種類を識別し、その結果
を時間軸方向に結合して、各泳動レーンを泳動したＤＮ
Ａ試料の塩基配列を決定する。The operation of this embodiment will be described. Electrophoresis gel 2
In the sample input slot 4 at one end of the
Different DNA samples containing different types of DNA fragments are respectively put in and a migration voltage is applied. The DNA sample becomes the migration band 3 and migrates in the migration direction 6 over time to the migration gel 2
It migrates inside and is separated, and reaches straight line 8. Since the excitation light is linearly irradiated to the position of the straight line 8 from the excitation optical system, when the DNA fragment reaches the position of the straight line 8, it emits fluorescence corresponding to the label. The light on the straight line 8 enters the interferometer 12 by the condensing mechanism 14, is modulated by the interferometer 12, and is converted into the one-dimensional detector array 16
Is detected by With the operation of the interferometer 12, the signal processing unit 18 obtains an interferogram at each position on the straight line 8 of the electrophoretic gel 2. Therefore, the signal processing unit 18 Fourier transforms the interferogram to obtain the straight line of the electrophoretic gel 2. Fluorescence spectra at each position on 8 were obtained and D was electrophoresed at each position.
The type of the terminal base of the NA fragment was identified, the results were bound in the time axis direction, and the DN migrated in each migration lane
Determine the base sequence of the A sample.

【００１８】実施例は泳動媒体としてスラブ状泳動ゲル
を用い、ＤＮＡ試料としてＤＮＡフラグメントを多重標
識した場合を示しているが、本発明が適用されるのはそ
の場合に限らない。泳動媒体としてゲルを充填したキャ
ピラリーアレイを用いてもよい。本発明は、１種類の蛍
光標識を用いた場合にも適用することができる。その場
合は、ＤＮＡ試料は末端塩基に応じて別々の泳動レーン
又は別々のキャピラリーで泳動させる。そして、干渉計
１２は蛍光を励起光から分離して検出する機能を果た
す。In the examples, a slab-like electrophoretic gel is used as an electrophoretic medium, and DNA fragments are multiply labeled as a DNA sample. However, the present invention is not limited to this case. A capillary array filled with gel may be used as the migration medium. The present invention can be applied to the case where one type of fluorescent label is used. In that case, the DNA sample is run in different migration lanes or different capillaries depending on the end bases. Then, the interferometer 12 has a function of separating the fluorescence from the excitation light and detecting the fluorescence.

【００１９】[0019]

【発明の効果】本発明のＤＮＡシーケンサでは、蛍光物
質により標識されたＤＮＡフラグメントから発生する蛍
光を検出するのに、少なくとも一次元に配列された複数
の画素のインターフェログラムを同時に得ることのでき
る干渉計を用いる。その結果、ＤＮＡフラグメントから
の蛍光を高感度に検出できるようになり、しかも複数の
ＤＮＡ試料を同時に測定することができるようになる。According to the DNA sequencer of the present invention, in order to detect fluorescence generated from a DNA fragment labeled with a fluorescent substance, it is possible to simultaneously obtain an interferogram of a plurality of pixels arranged in at least one dimension. Use an interferometer. As a result, the fluorescence from the DNA fragment can be detected with high sensitivity, and a plurality of DNA samples can be simultaneously measured.

【図面の簡単な説明】[Brief description of drawings]

【図１】 一実施例を示すブロック図である。FIG. 1 is a block diagram showing an embodiment.

【符号の説明】[Explanation of symbols]

２ スラブ状泳動ゲル ３ 泳動バンド ４ サンプル投入スロット ６ 泳動方向 ８ 泳動方向に直交する一直線 １０ 励起光 １２ 干渉計 １４ 集光機構 １６ 一次元的検出器アレイ １８ 信号処理部 2 Slab-like migration gel 3 Migration band 4 Sample input slot 6 Migration direction 8 Straight line orthogonal to migration direction 10 Excitation light 12 Interferometer 14 Focusing mechanism 16 One-dimensional detector array 18 Signal processing unit

Claims (1)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項１】 蛍光物質により標識されたＤＮＡフラグ
メントからなる複数の試料を泳動媒体の異なる位置で同
時に電気泳動させる電気泳動装置と、 前記電気泳動装置の所定の泳動位置で、泳動方向に直交
する一直線上で前記泳動媒体にライン状の励起光を照射
する励起光学系と、 少なくとも一次元に配列された複数の画素のインターフ
ェログラムを同時に得ることのできる干渉計と、 前記泳動媒体が励起光学系からの励起光で照射されてい
る前記一直線上の光を集光して前記干渉計に導く集光機
構と、 前記干渉計からの出力光を前記泳動媒体が励起光で照射
されている位置と対応させて受光して検出する一次元的
検出器アレイと、 前記一次元的検出器アレイの検出信号から前記泳動媒体
が励起光で照射されている各位置から発生する光のスペ
クトルを得て、前記泳動媒体の各位置を泳動したＤＮＡ
フラグメントを検出し、その時間変化によりＤＮＡの塩
基配列を決定する信号処理部と、を備えたことを特徴と
するＤＮＡシーケンサ。1. An electrophoretic device for simultaneously electrophoresing a plurality of samples composed of a DNA fragment labeled with a fluorescent substance at different positions of an electrophoretic medium, and orthogonal to the electrophoretic direction at a predetermined electrophoretic position of the electrophoretic device. An excitation optical system that irradiates the electrophoretic medium with linear excitation light on a straight line, an interferometer that can simultaneously obtain an interferogram of a plurality of pixels arranged in at least one dimension, and the electrophoretic medium is an excitation optical system. A condensing mechanism that condenses the light on the straight line irradiated with the excitation light from the system and guides the light to the interferometer, and a position where the migration medium is irradiated with the output light from the interferometer with the excitation light. A one-dimensional detector array for receiving and detecting in correspondence with, and the light generated from each position where the electrophoretic medium is irradiated with excitation light from the detection signal of the one-dimensional detector array. To obtain a spectrum was run to each position of the loading medium DNA
A signal sequencer that detects a fragment and determines the base sequence of DNA based on the change over time, and a DNA sequencer.