JP7383158B2 - ロボットハンドラを使用して試薬リザーバから液体を移送する方法 - Google Patents

Description

（優先権の主張）
本特許出願は、参照することによってその全体として本明細書に組み込まれる、２０１９年１２月２３日に出願された、米国仮出願第６２／９５２，９６８号の優先権の利益を主張する。

次世代シーケンシング（ＮＧＳ）ライブラリを含む、核酸断片のライブラリ（例えば、細胞ＤＮＡまたはＲＮＡ分子から導出される断片のライブラリ）の調製等、生物学的サンプルを処理および分析するために使用される、ロボット液体ハンドラにおいて使用するための既存のバルク量試薬リザーバは、種々の短所に悩まされる。１つの短所は、キット内の試薬の量が自動化において使用するために十分な過剰量の各試薬を提供しないときに現れる。死体積（例えば、ウェルの底部を横断して均一であって、ピペット採取されるために十分なリザーバ内の量）が、標準的試薬リザーバ内では、高すぎ、これは、キットが処理し得る、実際のサンプルの数の減少をもたらす。換言すると、エントロピおよび表面張力は、体積が減少するにつれて、従来／既存のバルク量リザーバの底部を横断して、液体の不等分布をもたらし得る。本不等分布は、吸引されるにつれて、液体の局所枯渇を引き起こし、マルチチャネルピペットのプローブによる不等吸引または完全に吸引し損なわれる結果をもたらし得る

本明細書に説明されるバルク量試薬リザーバは、既存の試薬リザーバの短所に対処する。簡潔には、本明細書に説明されるバルク量試薬リザーバは、リザーバの底部上に正面から背面への傾きを含有する。これは、マルチチャネルピペットからの、全ての先端が傾きの上方にある状態にある、少なくとも８つのピペット先端（例えば、依然として、リザーバにアクセスし得る、０．４５ｍｍ間隔／先端において、１６の先端ピペットヘッド）が、同時に、例えば、約２０ｍＬ超またはわずか約５００μＬの体積にアクセスすることを可能にする。傾きははまた、単一先端アクセスポイントに向かってテーパを含有し、体積を単一先端のための簡便な場所の中に集めるであろう。本体積が、除去された後、単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルからの単一先端は、死体積を低減させるために、残りの体積にアクセスすることが可能となるであろう。バルク量リザーバ設計は、死体積を最小限にすることによって、増加されたサンプル数量を可能にするであろう。傾きが付けられた面積は、０．５ｍＬ未満の体積を含有し、体積が重要ではない試薬または水およびエタノール等のユーザ供給バルク量のためにリザーバ内に残され得る。

本開示は、したがって、ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、ロボット液体ハンドラのマルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引するステップであって、試薬リザーバは、試薬リザーバの長さに沿って傾きが付けられた底部を有し、傾きが付けられた底部は、試薬リザーバの浅側端および深側端を画定し、浅側端は、試薬リザーバの第１の側壁の近位にあって、深側端は、第１の側壁に対向する、試薬リザーバの第２の側壁の近位にある、ステップと、
ロボット液体ハンドラの単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルを使用して、液体の第２の体積を試薬リザーバの深側端から外に吸引するステップと、
を含み、深側端から外への第２の体積の吸引は、試薬リザーバの浅側端内の液体の枯渇をもたらす、方法に関する。

さらに、本開示は、ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、
試薬リザーバの傾きが付けられた底部が、深側端および浅側端を形成するように、試薬リザーバを液体で充填するステップと、
浅側端の近傍の第１の位置の中に延在する、第１のピペット先端と、深側端の近傍の第２の位置の中に延在する、第２のピペット先端とを有する、マルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の部分を試薬リザーバから除去するステップと、深側端の近傍の第２の位置の中に延在する、単一ピペット先端、または深側端の中に延在する、単一チャネルピペットのピペット先端を有する、マルチチャネルピペットを使用して、液体の第２の部分を試薬リザーバから除去するステップと、
を含む、方法に関する。

本開示はまた、ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、
ロボット液体ハンドラの第１のピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引するステップであって、第１のピペットは、第１の先端および第２の先端を含む、いくつかの先端を有し、試薬リザーバは、リザーバの長さに沿って、傾きが付けられた底部を有し、傾きが付けられた底部は、試薬リザーバの浅側端および深側端を画定し、液体の第１の体積の吸引の間、第１の先端は、試薬リザーバの浅側端にわたって位置付けられ、別の先端は、試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ステップと、
ロボット液体ハンドラの第２のピペットを使用して、液体の第２の体積を試薬リザーバから外に吸引するステップであって、第２のピペットは、第１のピペットの先端の数未満の先端の数を有し、第２のピペットの先端は、第２の体積の吸引の間、試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ステップと、
を含む、方法に関する。

また、本開示は、ロボット液体ハンドラを使用して、バルク量貯蔵容器から液体を移送する方法であって
深側端および浅側端を形成する、貯蔵リザーバの傾きが付けられた底部によって形成される、バルク量貯蔵リザーバの第１の体積が、充填され、
深側端および浅側端におけるバルク量貯蔵容器の第１および第２の端壁によって上方で形成される、第１の体積の上方におけるバルク量貯蔵容器の第２の体積が、少なくとも部分的に充填された状態になる、
ように、液体をバルク量貯蔵リザーバに添加するステップと、
マルチチャネルピペットを使用して、第２の体積を空にするステップと、
単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルを使用して、第１の体積を空にするステップと、
を含む、方法に関する。

実施形態１７は、
マルチチャネルピペットは、第１の体積の上方において、第１の端壁と第２の端壁との間に延在し、

単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルは、深側端を横断して延在する、
実施形態１６に記載の方法に関する。
本明細書は、例えば、以下の項目も提供する。
（項目１）
ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、前記方法は、
前記ロボット液体ハンドラのマルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引することであって、前記試薬リザーバは、前記試薬リザーバの長さに沿って傾きが付けられた底部を有し、前記傾きが付けられた底部は、前記試薬リザーバの浅側端および深側端を画定し、前記浅側端は、前記試薬リザーバの第１の側壁の近位にあり、前記深側端は、前記第１の側壁に対向する前記試薬リザーバの第２の側壁の近位にある、ことと、
前記ロボット液体ハンドラの単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルを使用して、液体の第２の体積を前記試薬リザーバの深側端から外に吸引することと
を含み、
前記深側端から外への前記第２の体積の吸引は、前記試薬リザーバの浅側端内の液体の枯渇をもたらす、方法。
（項目２）
前記単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルは、試薬リザーバの最深部分に位置付けられ、前記最深部分は、前記試薬リザーバの第２の側壁の近位にある、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記試薬リザーバは、前記第１の側壁から前記第２の側壁までの前記試薬リザーバの幅に沿って減少する断面を有する、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記ロボット液体ハンドラのマルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第１の体積を前記試薬リザーバから外に吸引することは、前記第１の側壁から前記第２の側壁までの前記試薬リザーバの幅に沿って、前記マルチチャネルピペットを使用して、前記第１の体積を吸引することを含む、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記試薬リザーバは、複数のチャンバを有し、それぞれが傾きが付けられた底部を伴う、項目１に記載の方法。
（項目６）
複数のチャンバは、前記リザーバの長さに沿って延設される壁を分割することによって形成される、項目５に記載の方法。
（項目７）
粒子を前記液体中に堆積することと、
前記粒子を前記液体中に懸濁された状態にさせることと
をさらに含み、
前記粒子は、前記傾きが付けられた底部に沿って均一に沈降する、項目１に記載の方法。
（項目８）
タブと前記液体ハンドラ上のスロットを整合させ、前記試薬リザーバを前記ロボット液体ハンドラのデッキ上に位置付けることをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記試薬リザーバのタブと前記ロボット液体ハンドラのデッキを係合させ、前記浅側端を前記深側端の上方に上昇させ、前記第１の側壁および前記第２の側壁を前記デッキ上に垂直に立設させること
をさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目１０）
ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、前記方法は、
試薬リザーバの傾きが付けられた底部が、深側端および浅側端を形成するように、試薬リザーバを液体で充填することと、
前記浅側端の近傍の第１の位置の中に延在する第１のピペット先端と、前記深側端の近傍の第２の位置の中に延在する第２のピペット先端とを有するマルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第１の部分を前記試薬リザーバから除去することと、
前記深側端の近傍の第２の位置の中に延在する単一ピペット先端、または前記深側端の中に延在する単一チャネルピペットのピペット先端を有するマルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第２の部分を前記試薬リザーバから除去することと
を含む、方法。
（項目１１）
前記マルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第１の部分を前記試薬リザーバから除去することは、前記液体が前記試薬リザーバの浅側端から空になる結果をもたらし得る、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
前記液体の第１の部分を前記試薬リザーバから除去することはさらに、前記第２のピペットを用いて、前記第２の体積からの液体の吸引を繰り返すことを含み得る、項目１０に記載の方法。
（項目１３）
前記深側端の近傍の第２の位置の中に延在する単一ピペット先端、または前記深側端の中に延在する単一チャネルピペットのピペット先端を有する前記マルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第２の部分を前記試薬リザーバから除去することは、前記第１の体積内の前記液体の全てを除去する結果をもたらし得る、項目１０に記載の方法。
（項目１４）
ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、前記方法は、
前記ロボット液体ハンドラの第１のピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引することであって、前記第１のピペットは、第１の先端および第２の先端を含むいくつかの先端を有し、前記試薬リザーバは、前記リザーバの長さに沿って、傾きが付けられた底部を有し、前記傾きが付けられた底部は、前記試薬リザーバの浅側端および深側端を画定し、前記液体の第１の体積の吸引の間、前記第１の先端は、前記試薬リザーバの浅側端にわたって位置付けられ、別の先端は、前記試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ことと、
前記ロボット液体ハンドラの第２のピペットを使用して、液体の第２の体積を前記試薬リザーバから外に吸引することであって、前記第２のピペットは、前記第１のピペットの先端の数未満の先端の数を有し、前記第２のピペットの先端は、前記第２の体積の吸引の間、前記試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ことと
を含む、方法。
（項目１５）
ロボット液体ハンドラを使用して、バルク量貯蔵容器から液体を移送する方法であって、前記方法は、
深側端および浅側端を形成する貯蔵リザーバの傾きが付けられた底部によって形成されるバルク量貯蔵リザーバの第１の体積が、充填され、
前記深側端および浅側端における前記バルク量貯蔵容器の第１および第２の端壁によって上方で形成される前記第１の体積の上方における前記バルク量貯蔵容器の第２の体積が、少なくとも部分的に充填された状態になる
ように、液体を前記バルク量貯蔵リザーバに添加することと、
マルチチャネルピペットを使用して、前記第２の体積を空にすることと、
単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルを使用して、前記第１の体積を空にすることと
を含む、方法。

図１は、試薬リザーバの実施例の側面図である。

図２は、試薬リザーバの実施例の正面図である。

図３は、試薬リザーバの実施例の上面図である。

図４は、試薬リザーバの底面図である。

図５Ａは、リザーバの「浅」側端上の試薬リザーバの実施例の断面である。

図５Ｂは、リザーバの「深」側端上の試薬リザーバの実施例の断面である。

図６は、試薬リザーバの実施例の断面である。

図７は、試薬リザーバの実施例の断面である。

図８は、ロボット液体ハンドラの実施例のブロック図である。

図９は、筐体と、カルーセルと、反応容器と、サーマルサイクラモジュールと、撮像デバイスとを備える、図９のロボット液体ハンドラの斜視図である。

図１０は、試薬リザーバを含む、種々の構成要素のための空間を伴う、図８の筐体の中に装填するためのデッキの実施例の平面図である。

図１１は、試薬リザーバの上面図写真である。

説明
ここで、開示される主題のある実施形態が、詳細に参照され、その実施例は、部分的に、付随の図面に図示される。開示される主題は、列挙される請求項と併せて説明されるであろうが、例示される主題は、請求項を開示される主題に限定することを意図するものではないことを理解されたい。

図１を参照すると、試薬リザーバ１００は、縦軸１０１と、試薬リザーバ１００の幅１０４に沿って傾きが付けられた底部１０２とを有する。傾きが付けられた底部１０２は、試薬リザーバ１００の浅側端１０６と、深側端１０８とを画定し、浅側端１０６は、試薬リザーバ１００の第１の側壁１１０の近位にあって、深側端１０８は、第１の側壁１１０に対向する、試薬リザーバ１００の第２の側壁１１２の近位にある。図１に示される試薬リザーバ１００は、第１の側壁１１０の外側縁１１６から第２の側壁１１２の外側縁１１８まで跨架し得る、蓋（図示せず）を有することができる。蓋は、汚染を防止し、少なくとも、試薬リザーバ１００の内側に位置する、試薬の蒸発を低減させるように機能する。

試薬リザーバ１００はまた、突起１２０を有し、これは、第１の端部１２２を第２の端部１２４に対して上昇させるように機能する。突起１２０は、カウンタトップまたは平坦表面１１４上に静置されると、リザーバの上部を平／水平に保つように機能する。突起１２０は、第１の端部１２２を第２の端部１２４に対して上昇させる限り、フィン、タブ、または切り欠き等の任意の好適な形態をとることができる。突起１２０は、角度（θ）１１５を平坦表面１１４と第１の端部１２２との間に作成する。角度θは、角度約３°～約５°等、任意の好適な角度であることができる。

試薬リザーバ１００は、随意に、図１に示されるように、体積マーキング１２５を備える。

図２は、第１の端部１２２からの試薬リザーバ１００の端面図を示す。図２に示される端面図は、複数の突起（この場合、２つのタブまたはフィン）１２０^Ａおよび１２０^Ｂを有する、試薬リザーバ１００の実施例を示し、これは、第１の端部１２２を第２の端部１２４に対して上昇させる。さらに、本試薬リザーバの端面図は、リザーバが、試薬リザーバ１００の幅１０４に跨架し、同様に幅１０４に跨架し、第１のチャネル１２６を第２のチャネル１２８から分離する役割を果たす、分割壁（図３における番号１３０）によって分割される、第１のチャネル１２６と、第２のチャネル１２８とを有することができることを示す。要するに、試薬リザーバは、複数のチャンバを有し、それぞれ、傾きが付けられた底部を伴うことができる。

試薬リザーバ１００の上面図が、蓋を伴わずに、図３に示される。図３は、試薬リザーバ１００と、第１のチャネル１２６と、第２のチャネル１２８とを示し、幅１０４に跨架する。チャネルは、分割壁１３０によって分離され、これもまた、幅１０４に跨架する。また、図３に示されるものは、辺縁１３２であって、これは、試薬リザーバ１００の上部部分の周囲に設けられ、その上に蓋が、存在するとき、着座することができる。第１のチャネル１２６および第２のチャネル１２８は、一定の傾きにおいて、第１の端部１２２から第２の端部１２４まで傾くことができる。図１は、第１の端部１２２から第２の端部１２８まで一定の傾きを有する、チャネル１２６および１２８（図１に図示せず）を有する、試薬リザーバ１００の実施例である。または、第１のチャネル１２６および第２のチャネル１２８の傾きは、第１の端部１２２から第２の端部１２４まで変動してもよい。具体的傾きは、水性液体が事実上浅側端（例えば、第２の端部１２４）内に貯留する一方、懸濁された粒子（例えば、本明細書に説明される磁気ビーズ）がその同一端部（例えば、第２の端部）に集中するであろうほど急峻ではないために要求され得るものに基づいて、選定されることができる。本傾きはまた、ピペットの全ての先端対単一先端にアクセス可能な体積に影響を及ぼし得る。

さらに、第１のチャネル１２６は、任意の好適な形状を有する、床部１３４を有することができる。同様に、第２のチャネル１２８は、任意の好適な形状を有する、床部１３６を有することができ、床部１３６は、床部１３４に対して同一形状または異なる形状を有する。図３において提示される実施例では、床部１３４および１３６は、第１の端部１２２から第２の端部１２４まで略同一三角形形状を有する。

図４は、試薬リザーバ１００の底面図である。図４は、試薬リザーバ１００と、第１のチャネル１２６と、第２のチャネル１２８とを示し、幅１０４に跨架する。チャネルは、分割壁１３０によって分離され、これもまた、幅１０４に跨架する。また、図４に示されるものは、辺縁１３２であって、これは、試薬リザーバ１００の上部部分の周囲に設けられ、その上に蓋１１４が、着座する。図４はまた、第１および第２の突起（例えば、タブまたはフィン）１２０^Ａおよび１２０^Ｂを示し、これは、第１の端部１２２を第２の端部１２４に対して上昇させる。

図５Ａは、浅側端１０６（図示せず）に向かって縦軸を見下ろしたときの、浅側端１０６における、図４における縦軸１０１と垂直な軸１４０^Ａに沿った図１の断面である。図５Ａは、第１および第２の突起（例えば、タブまたはフィン）１２０^Ａおよび１２０^Ｂを示し、これは、第１の端部１２２を第２の端部１２４（図５Ａに図示せず）に対して上昇させる。図５Ａにおける試薬リザーバ１００はまた、辺縁１３２を有し、これは、試薬リザーバ１００の上部部分１３８の周囲に設けられる。第１のチャネル１２６は、床部１３４を有し、第２のチャネル１２８は、床部１３６を有し、例えばＶ形状等の第１の側壁から第２の側壁まで試薬リザーバの幅に沿って減少する断面を伴う形状等の任意の好適な形状等であり、床部１３６は、床部１３４に対して同一形状または異なる形状を有する。図５Ａにおいて提示される実施例では、床部１３４および１３６は、幅１０４に沿って、略同一平坦形状を有する。しかし、床部１３４および１３６はまた、独立して、第１の端部１２２から第２の端部１２４まで丸みを帯び得る。

最後に、図５Ｂは、深側端１０８（図示せず）に向かって縦軸を見下ろしたときの、浅側端１０６における、図４における縦軸１０１と垂直な軸１４０^Ｂに沿った図１の断面である。図５Ｂにおける試薬リザーバ１００はまた、辺縁１３２を有し、これは、試薬リザーバ１００の上部部分１３８の周囲に設けられる。第１のチャネル１２６は、床部１３４を有し、第２のチャネル１２８は、床部１３６を有し、Ｖ形状等の任意の好適な形状を有する、床部１３６は、床部１３４に対して同一形状または異なる形状を有する。図５Ｂにおいて提示される実施例では、床部１３４および１３６は、幅１０４に沿って、略同一平坦形状を有する。床部１３４および１３６はまた、独立して、第１の端部１２２から第２の端部１２４まで丸みを帯び得る。

試薬リザーバ１００等の本明細書で検討される試薬リザーバは、限定ではないが、ポリカーボネート、ポリエチレン、ポリプロピレン、テレフタル酸ポリエチレン（ＰＥＴ）、および同等物等のポリマーを含む、任意の好適な材料から作製されることができる。本明細書で検討される試薬リザーバの１つの部分は、第１の材料から作製されることができる一方、他の部分は、第１の材料が、第２の材料と互換性がある限り、第２の材料から作製されることができることを理解されたい。

本明細書で検討される試薬リザーバは、ロボット液体ハンドラ２００（図９－１１参照）の文脈において使用されることができる。説明目的のために、ロボット液体ハンドラ２００は、主に、限定ではないが、次世代シーケンシング（ＮＧＳ）ライブラリを含む、核酸断片のライブラリ（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ分子から導出される断片のライブラリ）の調製等、生物学的サンプルを処理および分析するためのシステムとして、本明細書に説明されるであろう。

本明細書に説明される試薬リザーバは、ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、ロボット液体ハンドラのマルチチャネルピペット２０４（例えば、異なるチャネル間の独立運動および吸引／分注機能を伴う、Ｓｐａｎ－８型多チャネルピペット、および独立運動および吸引／分注機能を有していない、他の多チャネルピペットを包含する、同時に、液体を１つを上回るチャネルの中に吸引／分注する能力を伴う、任意のピペット。マルチチャネルピペットが、独立プローブ対固定されたプローブを有するかどうかは、固定されたシステムが、傾きが付けられた区分にアクセスするために、単一先端を装填し、単一チャネルピペットとして作用することを可能にする、または独立システムが、傾きに適応するために十分なプローブ間の垂直差を可能にする限り、重要ではないはずである。）を使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバ１００から外に吸引するステップであって、試薬リザーバ１００は、試薬リザーバ１００の幅１０４に沿って、傾きが付けられた底部１０２を有し、傾きが付けられた底部１０２は、試薬リザーバ１００の浅側端１０６および深側端１０８を画定し、浅側端１０６は、試薬リザーバ１００の第１の側壁１１０の近位にあって、深側端１０８は、試薬リザーバ１００の第１の側壁１１０に対向する、第２の側壁１１２の近位にある、ステップと、ロボット液体ハンドラの単一チャネルピペット２０８（図７参照、またはマルチチャネルピペットの単一チャネル）を使用して、液体の第２の体積を試薬リザーバ１００の深側端１０８から外に吸引するステップとを含み、深側端１０８から外への第２の体積の吸引は、試薬リザーバ１００の浅側端１０６内の液体の枯渇をもたらす、方法において使用されることができる。

マルチチャネルピペットは、Ｇｅｎｅｘ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｏｄｕｃｔｓ、Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ、Ｒａｎｉｎｇ、およびＧｉｌｓｏｎ等の製造業者から利用可能なもの等の４チャネルピペットを含む、任意の好適なピペットであることができる。さらに、マルチチャネルピペットは、試薬リザーバ１００の深側端１０８の任意の好適な位置に位置付けられることができる。例えば、図６を参照すると、マルチチャネルピペットは、マルチチャネルピペットの複数のピペット先端２１０が示されるように、縦軸１０１に沿って、縦方向に配列されるように位置付けられることができる。故に、ロボット液体ハンドラ２００のマルチチャネルピペット２０４を使用した試薬リザーバから外への液体の第１の体積２０２を吸引するステップは、第１の側壁１１０から第２の側壁１１２まで試薬リザーバ１００の幅に沿って（例えば、縦軸１０１に沿って）、マルチチャネルピペットを使用して、第１の体積を吸引するステップを含むことができる。

単一チャネルピペット（またはマルチチャネルピペットの単一チャネル）は、任意の好適なピペットであることができ、浅側端１０６の任意の好適な位置に位置付けられることができる。図７を参照すると、単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルは、試薬リザーバ１００の最深部分１０８^Ａに位置付けられることができ、最深部分１０８^Ａは、試薬リザーバ１００の第２の側壁１１２の近位にある。

本明細書に説明される方法はさらに、最初に、粒子（例えば、磁気ビーズ等のビーズ）を試薬リザーバ１００内に堆積し、その後、試薬／液体をその中に堆積するステップまたはビーズ試薬／液体（すでに試薬リザーバ内にある）を堆積するステップが続くステップと、ビーズを液体中に懸濁された状態にさせるステップとを含むことができ、ビーズは、（例えば、均一に）傾きが付けられた底部に沿って沈降し、傾きは、図１に説明されるように、角度θの観点から、約３°～約５°であることができる。ビーズは、例えば、磁気粒子であることができる。本明細書に説明される方法において使用するための好適な磁気粒子は、限定ではないが、Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ， Ｉｎｃ．（Ｂｒｅａ， ＣＡ）から利用可能なＡＭＰｕｒｅＸＰビーズを含む。好適な磁気粒子はまた、米国特許第５，７０５，６２８号、第５，８９８，０７１号、および第６，５３４，２６２号、および２０１９年７月１９日に出願された第ＰＣＴ／ＵＳ２０１９／０４２６２８号（その全ては、参照することによって、本明細書に完全に記載される場合と同様に、組み込まれる）に説明されるものを含む。

ビーズが、試薬リザーバ１００内に堆積されるとき、粒子を含有する、液体または試薬のために、リザーバ内の均一懸濁液を維持することが、所望される。経時的に、粒子は、リザーバの底部へと沈降するであろう。リザーバの傾きは、粒子が、浅側端（またはさらに言えば、深側端）内に蓄積せずに、リザーバの長さを横断して均一に沈降するであろうようなものである。このように、多チャネルピペットは、使用の直前に、粒子を効率的に再懸濁させ、均一懸濁液を再作成するために使用されることができる。

本開示の磁気粒子は、コーティングによって囲繞される、磁気または常磁性コアを備えることができる。ある実施例では、磁気または常磁性粒子は、非磁気材料の１つまたはそれを上回る層でコーティングされる。その表面上に暴露された鉄を有しない、コーティングされた磁気粒子の使用は、鉄がサンプルのある下流操作に干渉する可能性を排除することができる。コーティングは、例えば、ポリマー層またはシリカ層であることができる。

例示的ポリマー層は、ポリエチレン、ポリスチレン、ポリメタクリル酸メチル、ポリビニルアルコール、または任意の他の好適なポリマーを含むことができる。例示的シリカ層は、二酸化ケイ素、ホウケイ酸ガラス、ソーダ石灰、チタン酸バリウム、および他のタイプのガラスを含むことができる。ポリマーまたはシリカ層は、磁気粒子の密度を調節するためのものであることができる。例えば、ポリマーまたはシリカ層は、磁気粒子の密度をサンプル、例えば、水性サンプル（例えば、約１ｇ／ｃｍ^３）の密度に近づくように調節することができる。

コーティングはまた、本明細書に述べられたものを含む、標的検体に選択的または非選択的に結合するための捕捉試薬または官能基等のリガンドを備えることができる。官能基は、核酸等の生体分子を吸着するためのものであることができ、これは、非配列特有であって、磁気粒子をコーティングする官能基に可逆的に結合することができる。ポリヌクレオチドは、ＤＮＡ、ＲＮＡ、またはポリアミド核酸（ＰＮＡ）であることができる。ある実施例では、官能基は、カルボキシ基である。これらの目的のために好適な官能基を備える、種々のコーティングは、米国特許第５，７０５，６２８号、米国特許第５，８９８，０７１号、および米国特許第６，５３４，２６２号（その教示は、参照することによって本願の中にその全体として組み込まれる）に説明される。本明細書に説明されるコーティングのいずれかは、本明細書に説明されるように、表面化学物質、例えば、石炭酸、ストレプトアビジン、アミン、ヒドラジド、シラノール、アジ化物で官能化されることができる。また、それらはさらに、抗体、酵素、ＤＮＡまたはＲＮＡ断片、触媒等の生物学的分子で官能化されることができる。

いくつかの実施例では、コーティングは、捕捉試薬を備えることができる。捕捉試薬は、検体をサンプル中に捕捉するためのものであることができる。磁気粒子の表面は、好適なリガンドまたは受容体（例えば、抗体、レクチン、オリゴヌクレオチド、他の親和性基、または本明細書に述べられた他の捕捉試薬のいずれか）である、捕捉試薬でコーティングされることができ、これは、混合物中の標的検体または検体群に選択的に結合することができる。いくつかの実施例では、捕捉試薬は、抗体であることができる。

当業者は、任意の数の捕捉試薬、例えば、アプタマー、ナノ粒子、結合タンパク質、および同等物が、本目的のために使用されることができることを認識するであろう。捕捉試薬は、具体的検体または検体の具体的パネル、例えば、薬物パネルまたは内分泌パネル等を捕捉するように設計されることができる。

代替として、リガンドは、酵素を含むことができる。いくつかの実施形態では、酵素は、その酵素の基質と選択的に相互作用するために、コーティングに連結されることができる。基質と相互作用することに応じて、酵素は、基質を修飾、分解、または消化するように機能することができる。これは、酵素の作用またはサンプルからの基質の除去を通した着目物質の発生につながり得る。種々の実施形態による、酵素は、トリプシンであることができる。

本明細書に議論されるように、試薬リザーバ１００は、ロボット液体ハンドラの文脈において使用されることができる。試薬リザーバ１００は、本明細書でより詳細に説明されるように、液体ハンドラ上のスロットと整合され、試薬リザーバをロボット液体ハンドラのデッキ上に位置付け得る、タブまたはフィン１２０Ａおよび１２０Ｂ等の突起を有することができる。タブまたはフィン１２０Ａおよび１２０Ｂは、ロボット液体ハンドラ２００のデッキと係合され、浅側端１０６を深側端１０８の上方に上昇させ、第１の側壁１１０および第２の側壁１１２をデッキ上に垂直に立設させることができる。

図８は、ロボット液体ハンドラ２００の高レベルブロック図である。ロボット液体ハンドラ２００は、構造９４０、搬送デバイス９４１、処理装置９０１、およびサーマルサイクラシステム９０７に動作可能に結合される、制御コンピュータ９０８を備えることができる。入／出力インターフェースが、これらのデバイスのそれぞれ内に存在し、図示されるデバイスと外部デバイスとの間のデータ伝送を可能にしてもよい。ロボット液体ハンドラ２００は、本明細書に説明されるように、流体取扱システムを備えることができる。流体は、試薬および同等物等の種々の液体を含むことができる。その中に本開示が実装され得る、処理システムの実施例は、Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ， Ｉｎｃ．（Ｂｒｅａ， Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ）によって市販されている、Ｂｉｏｍｅｋ ｉ７自動化ワークステーションである。

説明目的のために、ロボット液体ハンドラ２００は、主に、限定ではないが、次世代シーケンシング（ＮＧＳ）ライブラリを含む、核酸断片のライブラリ（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ分子から導出される断片のライブラリ）の調製等の生物学的サンプルを処理および分析するためのシステムとして説明されるであろう。

構造９４０は、筐体（例えば、図９の筐体１００２）と、筐体を支持するための脚部またはキャスタと、電源と、筐体内に装填可能なデッキ９０５と、任意の他の好適な特徴とを含むことができる。デッキ９０５は、その上で構成要素が、実験、分析、およびプロセスのために設置およびアクセスされ得る、平面物理的表面等の物理的表面（例えば、図９のプラットフォーム１０１２）を含むことができる。いくつかの事例では、デッキ９０５は、床またはテーブルトップ表面であることができる。デッキ９０５は、異なる構成要素を設置するために、複数の離散デッキ場所（例えば、図１１の場所Ｌ１－Ｌ１６）に細分割されることができる。場所は、直接隣接することができる、または相互から離れるように離間されることができる。各デッキ場所は、異なるデッキ場所を分離し、構成要素を含有するために、分割器、挿入体、および／または任意の他の支持構造を含むことができる。例えば、図８は、第１の場所９０５Ａ、第２の場所９０５Ｂ、および第３の場所９０５Ｃをデッキ９０５上に示すが、付加的場所も、含まれることができる。場所９０５Ａ－９０５Ｃのうちの１つまたはそれを上回るものは、１つまたはそれを上回る構成要素を保持するための空間を含み得る、カルーセル（例えば、図９のカルーセル１００４）または１つまたはそれを上回る試薬リザーバまたは液体容器（例えば、図９の反応容器１０３）を装填されることができる。構造９４０は、加えて、カルーセルをデッキ９０５に対して回転させ、とりわけ、搬送デバイス９４１、試薬リザーバ、およびサーマルサイクラシステム９０７との相互作用を促進するために、モータまたは別のデバイスを含むことができる。さらに、構造９４０のモータまたは構造９４０の付加的モータは、デッキ９０５上に装填される個々のバイアル、デッキ９０５上に装填されるトレイまたは試薬リザーバ、またはデッキ９０５上に位置するカルーセルを回転させるために使用されることができる。

複数の搬送デバイスを表し得る、ｘおよびｙ方向における移動能力と、ｚ方向における巻上能力とを有する、運搬車、ブリッジ、または搬器システムを備え得る、搬送デバイス９４１は、デッキ９０５と処理装置９０１との間およびデッキ９０５上の異なる場所間で構成要素を調製および／または搬送することができる。搬送デバイスの実施例は、コンベヤ、クレーン、サンプルトラック、ピックアンドプレースグリッパ、独立して移動し得る、実験室搬送要素（例えば、パック、ハブ、または台座）、ロボットアーム、および他の管または構成要素運搬機構を含んでもよい。いくつかの実施形態では、搬送デバイス９４１は、液体を移送するように構成される、ピペット採取ヘッドを含む。そのようなピペット採取ヘッドは、除去可能ピペット／ピペット先端内で液体を移送してもよく、マイクロウェルプレートまたは試薬リザーバ１００のための蓋等の他の実験器具を握持または解放するために好適なグリッパを含んでもよい。

処理装置９０１は、任意の好適なプロセスを実行するための任意の数の機械または器具を含むことができる。例えば、処理装置９０１は、分析器を含むことができ、これは、生物学的サンプル等のサンプルを分析することが可能である、任意の好適な器具を含み得る。分析器の実施例は、分光光度計、輝度計、質量分析計、免疫分析器、血液学分析器、微生物学分析器、および／または分子生物学分析器を含む。いくつかの実施形態では、処理装置９０１は、サンプル多段化装置を含むことができる。サンプル多段化装置は、生物学的サンプルを伴うサンプル管を受容するためのサンプル格納ユニット、サンプル管またはサンプル保定容器を一時的に保管するためのサンプル保管ユニット、アリコータ等のサンプルを分取するための手段またはデバイス、分析器のために必要とされる試薬を備える少なくとも１つの試薬パックを保持するための手段、および任意の他の好適な特徴を含むことができる。

サーマルサイクラシステム９０７は、デッキ９０５に対して位置付けられることができ、液体容器を受容するように構成されることができる。反応容器（例えば、図１０における１０３）は、手動で、または搬送デバイス９４１を介して、サーマルサイクラシステム９０７の中に装填されることができる。サーマルサイクラシステム９０７は、図１０を参照して下記により詳細に議論されるように、液体容器の異なる部分を異なる温度に加熱し得る、複数の異なる加熱ゾーンを提供するように構成されることができる。例えば、サーマルサイクラシステム９０７は、３つのスタックまたは垂直レベルの加熱を備え、上部、中央、および底部加熱ゾーンを液体容器に提供することができる。したがって、例えば、液体容器内に配置される液体の量およびタイプに応じて、異なる量の加熱が、熱循環およびインキュベートプロセスを実施する等のために印加されることができる。

ロボット液体ハンドラ２００は、撮像システム、例えば、カメラを具備し、デッキ９０５上に装填される試薬バイアルの標識を読み取ることができる。撮像システムは、ロボット液体ハンドラ２００の中に装填される任意の単一試薬バイアル標識の全ての部分が、少なくとも１つのカメラの視野内にあることを確実にすることができる。したがって、試薬バイアルの円周の周囲に巻着される、試薬バイアル標識に関して、１つまたはそれを上回る撮像デバイスが、ミラーまたはターンテーブルの使用の有無にかかわらず、各試薬バイアルの完全な３６０度視野を有することができる。撮像デバイスは、デッキ９０５およびデッキ９０５上の任意の構成要素または構造９４０の全体の画像を捕捉するための任意の好適なデバイスであることができる。撮像デバイスは、構造９４０に搭載される、またはその近傍にある、複数の撮像デバイスのうちの１つを備えることができる。付加的実施例では、複数の撮像デバイスは、デッキ９０５上に配置される試薬バイアルの複数の視野を取得するように搭載されることができる。例えば、撮像デバイスは、光カメラ、ビデオカメラ、３次元画像カメラ、赤外線カメラ等の任意の好適なタイプのカメラであることができる。いくつかの実施形態はまた、３次元レーザスキャナ、赤外線光深度感知技術、または物体および／または部屋の３次元表面マップを作成するための他のツールを含むことができる。実施例では、撮像デバイスは、細隙走査技術を利用して、パノラマ画像を生産することができる。撮像システムによって撮影される画像は、流体取扱システムによって、視覚的インジケータ、例えば、数、テキスト、または記号の認識のために分析されることができる。

制御コンピュータ９０８は、処理システム９００上で起動されるプロセスを制御し、最初に、プロセスを構成し、構成要素設定がプロセスのために正しく調製されているかどうかをチェックすることができる。制御コンピュータ９０８は、処理装置９０１、搬送デバイス９４１、および／またはサーマルサイクラシステム９０７を制御し、および／またはそこにメッセージを伝送することができる。制御コンピュータ９０８は、データプロセッサ９０８Ａと、データプロセッサ９０８Ａに結合される、非一過性コンピュータ可読媒体９０８Ｂおよびデータ記憶装置９０８Ｃと、１つまたはそれを上回る入力デバイス９０８Ｄと、１つまたはそれを上回る出力デバイス９０８Ｅとを備えることができる。制御コンピュータ９０８は、図８では、単一エンティティとして描写されるが、制御コンピュータ９０８は、分散型システムまたはクラウドベースの環境内に存在してもよいことを理解されたい。加えて、実施形態は、制御コンピュータ９０８、処理装置９０１、搬送デバイス９４１、および／またはサーマルサイクラシステム９０７のいくつかまたは全てが、単一デバイス内の構成部品として組み合わせられることを可能にする。

出力デバイス９０８Ｅは、データを出力し得る、任意の好適なデバイスを備えることができる。出力デバイス９０８Ｅの実施例は、ディスプレイ画面、ビデオモニタ、スピーカ、オーディオおよび視覚的アラーム、およびデータ伝送デバイスを含むことができる。入力デバイス９０８Ｄは、データを制御コンピュータ９０８の中に入力することが可能な任意の好適なデバイスを含むことができる。入力デバイスの実施例は、ボタン、キーボード、マウス、タッチスクリーン、タッチパッド、マイクロホン、ビデオカメラ、およびセンサ（例えば、光センサ、位置センサ、速度センサ、近接度センサ）を含むことができる。

データプロセッサ９０８Ａは、任意の好適なデータ算出デバイスまたはそのようなデバイスの組み合わせを含むことができる。データプロセッサの実施例は、協働し、所望の機能を遂行する、１つまたはそれを上回るマイクロプロセッサを備えてもよい。データプロセッサ９０８Ａは、ユーザおよび／またはシステム発生要求を実行するためのプログラムコンポーネントを実行するために適正な少なくとも１つの高速データプロセッサを備える、ＣＰＵを含むことができる。ＣＰＵは、ＡＭＤのＡｔｈｌｏｎ、Ｄｕｒｏｎ、および／またはＯｐｔｅｒｏｎ、ＩＢＭおよび／またはＭｏｔｏｒｏｌａのＰｏｗｅｒＰＣ、ＩＢＭおよびＳｏｎｙのＣｅｌｌプロセッサ、ＩｎｔｅｌのＣｅｌｅｒｏｎ、Ｉｔａｎｉｕｍ、Ｐｅｎｔｉｕｍ（登録商標）、Ｘｅｏｎ、および／またはＸＳｃａｌｅ、ＡＲＭベース／ファミリプロセッサ、および／または同等プロセッサ等のマイクロプロセッサであってもよい。

コンピュータ可読媒体９０８Ｂおよびデータ記憶装置９０８Ｃは、電子データを記憶し得る、任意の好適なデバイスまたは複数のデバイスであることができる。メモリの実施例は、１つまたはそれを上回るメモリチップ、ディスクドライブ等を備えてもよい。そのようなメモリは、任意の好適な電気、光学、および／または磁気動作モードを使用して、動作してもよい。

コンピュータ可読媒体９０８Ｂは、データプロセッサ９０８Ａによって実行可能なコードを備え、任意の好適な方法を実施することができる。例えば、コンピュータ可読媒体９０８Ｂは、プロセッサ９０８Ａによって実行可能なコードを備え、処理システム９００に、実験器具内の種々の試薬の異なるレベルまでの混合、実験器具の異なるレベルまでの加熱、付加的試薬の添加、およびサーマルサイクラシステム９０７を使用した付加的加熱の実施を含む、自動化された試薬処理および加熱方法を実施させることができる。

コンピュータ可読媒体９０８Ｂは、データプロセッサ９０８Ａによって実行可能なコードを備え、１つまたはそれを上回るプロトコル（例えば、生物学的サンプルを処理するためのプロトコルまたはライブラリ構築プロセスのためのプロトコル）のためのプロセスステップを受信および記憶し、かつサーマルサイクラシステム９０７、構造９４０、搬送デバイス９４１、および／または処理装置９０１を制御し、下記の実施例の節を参照して説明されるもの等の１つまたはそれを上回るプロトコルのためのプロセスステップを実行することができる。コンピュータ可読媒体９０８Ｂはまた、処理装置９０１からの結果（例えば、生物学的サンプルを分析することからの結果）を受信するため、および付加的分析の（例えば、患者を診断する）ために結果を転送する、または結果を使用するために、データプロセッサ９０８Ａによって実行可能なコードを含むことができる。加えて、コンピュータ可読媒体９０８Ｂは、デッキ９０５の画像を取得し、デッキ９０５の画像内の情報を識別し、解読された情報とプロトコル９０８Ｆ内に含有される情報を比較することによって、データ記憶装置９０８Ｃまたはコンピュータ可読媒体９０８Ｂ内に記憶される情報を使用して、画像内の情報を解読し、適宜、サーマルサイクラシステム９０７を装填するために、データプロセッサ９０８Ａによって実行可能なコードを備えることができる。

データ記憶コンポーネント９０８Ｃは、制御コンピュータ９０８の内部または外部にあることができる。データ記憶コンポーネント９０８Ｃは、１つまたはそれを上回るメモリチップ、ディスクドライブ等を含む、１つまたはそれを上回るメモリを含むことができる。データ記憶コンポーネント９０８Ｃはまた、Ｏｒａｃｌｅ^ＴＭまたはＳｙｂａｓｅ^ＴＭから市販のもの等の従来の、フォールトトレラントな、関係を示す、スケーラブルで、かつセキュアなデータベースを含むことができる。データ記憶装置９０８Ｃは、プロトコル９０８Ｆと、画像９０８Ｇとを記憶することができる。データ記憶コンポーネント９０８Ｃは、加えて、プロトコルを含む、データプロセッサ９０８Ａのための命令を含むことができる。コンピュータ可読媒体９０８Ｂおよびデータ記憶コンポーネント９０８Ｃは、不揮発性メモリ、磁気メモリ、フラッシュメモリ、揮発性メモリ、プログラマブル読取専用メモリ、および同等物等の任意の好適な記憶デバイスを備えることができる。

データ記憶コンポーネント９０８Ｃ内のプロトコル９０８Ｆは、１つまたはそれを上回るプロトコルについての情報を含むことができる。プロトコルは、完了するための１つまたはそれを上回る処理ステップ、プロセスの間に使用される構成要素、構成要素場所レイアウト、試薬リザーバ１００の装填、および／またはプロセスを完了するための任意の他の好適な情報についての情報を含むことができる。例えば、プロトコルは、生物学的サンプルを処理する、またはＤＮＡライブラリを処理するための１つまたはそれを上回る順序付けられたステップを含むことができる。プロトコルはまた、プロセスを開始する前に、構成要素のリストを準備するためのステップを含むことができる。構成要素は、試薬リザーバ（例えば、試薬リザーバ１００）内、カルーセル（例えば、カルーセル１００４）内、またはインデックスアダプタまたは他の試薬を含有する、周囲貯蔵場所に搭載されるマイクロプレート内の具体的場所にマッピングされることができ、そこで、搬送デバイス９４１は、構成要素を、それらを、またはそれらが処理装置９０１またはサーマルサイクラシステム９０７の中に装填される、コンテナを搬送するために、取得することができる。本マッピングは、ピペットに、ある体積の液体をカルーセル内の実験器具から吸引し、その体積を所定の目的地に分注するように指示する命令等、搬送デバイス９４１を動作させるための命令としてエンコーディングされることができ、マッピングはまた、ユーザが、構成要素をデッキ９０５、試薬リザーバ、およびカルーセル上に設置し得るように、ユーザに示される仮想画像によって表され得る。ロボット液体ハンドラ２００は、複数のプロセス（例えば、複数の異なるサンプルプロセスまたは調製手技）のために使用されることができる。故に、複数のプロトコル９０８Ｆについての情報は、必要に応じて、記憶され、読み出される。デッキ９０５、試薬リザーバ、およびカルーセル上の構成要素は、第１のプロセスから第２のプロセスに変更するとき、または第１のプロセスを再開するとき、必要に応じて、再配列され、変更され、および／または補充されることができる。

データ記憶装置９０８Ｃ内の画像９０８Ｇは、デッキ９０５、試薬リザーバ、およびカルーセル、および構成要素デッキ９０５、試薬リザーバ、およびカルーセル上または内に配置される構成要素、およびそれらの構成要素上に配置される標識の実世界またはシミュレートされた視覚的表現を含むことができる。各画像では、デッキ９０５、試薬リザーバ、およびカルーセルは、搬送デバイス９４１にアクセス可能な場所内に設置されたプロトコルを実行するための構成要素とともに、あるプロセスを開始するための準備完了状態に示されることができる。画像９０８Ｇはそれぞれ、記憶されたプロトコル９０８Ｆからの具体的プロトコルと関連付けられることができる。あるプロトコルのための単一画像が存在することができる、またはあるプロトコルのための複数の画像（例えば、異なる角度から、異なる照度レベルを伴う、またはいくつかの場所において容認可能実験器具代用物を含有する）が存在することができる。画像９０８Ｇは、ＪＰＥＧ、ＴＩＦＦ、ＧＩＦ、ＢＭＰ、ＰＮＧ、および／または未加工画像ファイル、およびＡＶＩ、ＷＭＶ、ＭＯＶ、ＭＰ４、および／またはＦＬ Ｖビデオファイルを含む、種々のタイプまたはフォーマットの画像ファイルとして記憶されることができる。

デッキ９０５は、異なる構成要素を多段化するために、複数の離散デッキ場所に細分割されることができる。離散場所は、任意の好適なサイズであってもよい。複数の場所を伴う、デッキ９０５の実施例は、図１０に示される。図１０におけるデッキ９０５は、Ｌ１－Ｌ１６として付番された別個の面積およびサーマルサイクラ１００８を示し、これは、別個のタイプの構成要素または構成要素のパッケージのための別個の場所として動作することができる。デッキ９０５は、所望に応じて、付加的場所またはより少ない場所を有することができる。これらの場所は、付番または命名され得るが、それらは、本システムの物理的実施形態内のデッキ９０５上で物理的に標識またはマークされる場合とそうではない場合がある。

画像９０８Ｇ等の画像は、適切な構成要素が、オペレータによって処理システム９００の中にプログラムされるプロトコル９０８Ｆを完了するために、デッキ９０５、必要とされる場合、試薬容器および蓋、カルーセル、およびサーマルサイクラシステム９０７の中に装填されているかどうかと、それらの構成要素が、プロトコルによって要求される場合、プログラムされるプロトコルを実行するための正しい位置に位置するかどうかとを照合するために使用されることができる。本明細書に議論されるように、処理システム９００は、その後、試薬リザーバ、例えば、試薬リザーバ１００の中に装填される、液体のために、混合手技を実行し、サーマルサイクラシステム１０７を使用して、試薬リザーバの中に装填される液体に応じて、種々の異なる様式において、試薬リザーバを制御可能に加熱し、それによって、処理システム９００内に含まれる、異なるタイプおよびサイズの試薬リザーバおよび異なる容量および構成のサーマルサイクラシステムを有する必要性を排除することができる。

図９は、図８のロボット液体ハンドラ２００の実施例を備え得る、液体取扱システム１０００の斜視図である。液体取扱システム１０００は、筐体１００２と、カルーセル１００４と、反応容器１０３と、撮像デバイス１００６と、サーマルサイクラシステム１００８とを備えることができる。図９の構成要素は、必ずしも、例証目的のために、正確な縮尺で描かれていないことに留意されたい。筐体１００２は、その中にカルーセル１００４が位置付けられ得る、エンクロージャを形成する、複数の壁またはパネルを備えることができる。エンクロージャは、それにわたってユーザ１０１０のためのドアまたは他のアクセスポイントが、位置付けられ、カルーセル１００４、撮像デバイス１００６、およびサーマルサイクラシステム１００８をエンクロージャ内にカプセル化し得る、開口部を有することができる。筐体１００２は、加えて、プラットフォーム１１２を含むことができ、その上にデッキ９０５（図８）またはデッキ９０５（図１０）等のデッキが、位置付けられることができる。デッキは、カルーセル１００４および試薬リザーバ１００のうちの１つまたはそれを上回るものを受容するためのスロットまたはソケットを含むことができる。実施例では、スロットまたはソケットは、カルーセル１００４および試薬リザーバ１００を撮像デバイス１００６に対して所定または既知の位置に保持するように構成されることができる。プラットフォーム１０１２は、デッキを撮像デバイス１００６に対して所定または既知の位置に保持することができる。筐体１００２は、加えて、制御コンピュータ９０８（図８）のもの等のコントローラ１０１４を保持するための空間を備えることができる。コントローラ１０１４は、無線または有線通信リンク等を介して、ネットワーク１０１６と通信するように構成されることができる。

図８を参照して説明される、撮像デバイスを備え得る、撮像デバイス１００６は、定常場所において、筐体１００２内に位置することができる。１つまたはそれを上回る撮像デバイス１００６は、筐体１００２内の単一場所または複数の場所に向くように構成されることができる。同時に、搬送デバイス９４１または処理装置９０１（図８）のピペットは、筐体１００２内に位置し、カルーセル１００４の場所にアクセスすることができる。搬送デバイス１０４１は、加えて、試薬リザーバ１００をサーマルサイクラシステム１００８の中に移動させるように構成されることができる。カルーセル１００４は、スピンまたは回転し、異なる場所をピペットおよび撮像デバイス１００６に提示することができる。他の実施例では、撮像デバイス１００６は、筐体１００２内に搭載され、視認面積を筐体１００２の内部の異なる部分にわたって移動させることができる。

コントローラ１０１４は、カルーセル１００４および試薬リザーバ１００の中に装填され、筐体１００２内のデッキ上に装填される、構成要素のためのプロトコルを実行するように構成されることができる。コントローラ１０１４が、カルーセル１００４および試薬リザーバ１００の中に装填される、バイアルのセット上で、プロトコルに従って、ステップの１つまたはそれを上回るシーケンスを実施するために、コントローラ１０１４は、カルーセル１００４および試薬リザーバ１００内の各バイアルの場所、例えば、カルーセル１００４および試薬リザーバ１００内の各場所における各バイアルの含有量を把握すべきである。本明細書に議論されるように、コントローラ１０１４は、撮像デバイス１００６を動作させ、カルーセル１００４および試薬リザーバ１００およびその中に装填される構成要素の画像を取得するように構成されることができる。特に、カルーセル１００４は、材料のバイアルを装填されることができ、各バイアルは、各バイアルの含有量、各バイアルが属するバイアルのセット、バイアルのセットの製造業者、液体取扱システム１０００がバイアルのセットを用いて実行するための１つまたはそれを上回るプロトコル等として、識別情報を提供する、標識を有することができる。バイアル標識の画像は、コントローラ１０１４によって読み取られ、標識に提示される情報を認識することができる。標識から読み取られた情報は、図８の媒体９０８Ｂ等のコンピュータ可読媒体内に記憶される、ネットワーク１０１６から取得される情報等の情報と比較されることができる。コンピュータ可読媒体内に記憶される情報は、試薬をカルーセル１００４および試薬リザーバ１００の中およびその間で移動させる等のために、搬送デバイス９４１が各バイアルと相互作用し得る、順序等、バイアルのセットと相互作用するためのステップの１つまたはそれを上回るシーケンスを含む、バイアルのセットのためのプロトコルを含むことができる。

反応容器１０３は、手動で、または搬送デバイス９４１によって自動的にのいずれかにおいて、サーマルサイクラシステム１００８の中に移動されることができる。コントローラ１０１４は、サーマルサイクラシステム１００８を動作させ、種々のプロトコルおよびプロトコルステップを実行または部分的に実行することができる。コントローラ１０１４は、サーマルサイクラシステム１００８および搬送デバイス９４１を動作させ、サーマルサイクラシステム１００８の中に装填される液体容器を加熱することができる。サーマルサイクラシステム１００８は、複数の加熱ゾーンを備えることができ、反応容器は、それぞれ、加熱ゾーンと相互作用するための異なる壁厚を有し得る、複数の異なる形状の貯蔵体積を形成する、幾何学形状を有することができる。したがって、単一サーマルサイクラシステム１００８および単一反応容器が、下記の実施例の節に説明されるもの等、付加的機器または反応容器の必要なく、加熱ゾーンおよび貯蔵体積の異なる組み合わせを使用して、バルク量の手技を実施するために使用されることができる。

図１０は、図１０の筐体１００２のプラットフォーム１０１２上に装填するためのデッキ９０５の平面図である。デッキ９０５は、カルーセル１００４を含む、種々の構成要素のための空間または場所を含むことができる。撮像デバイス１００６は、撮像デバイスが、プラットフォーム１０１２の全てを網羅する、視野を生産し得るように、プラットフォーム１０１２に対して筐体１００２内に搭載されることができる。しかしながら、種々の実施例では、視野は、プラットフォーム１０１２の一部のみを被覆するように構成されることができ、総網羅を達成するために、視野をプラットフォーム１０１２を横断して異なる場所に移動させ得る、複数の撮像デバイスが、使用されることができる、または連動式撮像デバイスが、使用されることができる。同様に、図８の搬送デバイス９４１等の搬送システムが、プラットフォーム１０１２の全体に到達するように構成されることもできる。

図１０は、Ｌ１－Ｌ１６として付番された場所およびサーマルサイクラシステム９０８等の他の構成要素を含む、デッキ９０５を示し、これは、別個のタイプの構成要素または構成要素のパッケージのための別個の場所として動作することができる。デッキ９０５の実施例は、所望に応じて、付加的場所またはより少ない場所を有することができる。これらの場所は、付番または命名され得るが、場所は、液体取扱システム１０００の物理的実施形態内のデッキ９０５上で物理的に標識またはマークされる場合とそうではない場合がある。液体取扱システム１０００の実施例では、場所のいくつかまたは全ては、あるプロトコルに従って、事前に定義されたタイプの構成要素によって占有されることができる。例えば、場所Ｌ１－Ｌ１０は、ピペット先端ラック１０１８および１１２０（例えば、種々の体積のピペット先端）のための貯蔵場所を備えることができ、場所Ｌ１１は、カルーセル１００４を装填されることができる。場所Ｌ１２は、反応容器、蓋、およびプラグのための低温試薬貯蔵面積を備えることができる。場所Ｌ１３は、反応容器のための加温試薬貯蔵面積を備えることができる。場所Ｌ１５は、試薬リザーバ１００のための貯蔵面積を備えることができる。場所Ｌ１４は、反応容器スタック貯蔵面積を備えることができる。場所Ｌ１６は、瓶１１２４のための廃棄物貯蔵面積を備えることができる。場所Ｌ１－Ｌ１６のうちのいくつかは、同一タイプの構成要素を含むことができる。構成要素は、試験管、マイクロウェルまたはマイクロタイタプレート、ピペット先端、プレート蓋、試薬リザーバ１００、または任意の他の好適な実験器具構成要素を備えることができる。構成要素はまた、震盪器、混練器、ミキサ、温度インキュベータ、真空マニホールド、磁気プレート、サーマルサイクラ、遠心分離機、または同等物等の実験室機器のアイテムを備えることができる。実施例では、１つまたはそれを上回る場所は、物理的に、構造９４０（図８）、筐体１００２（図９）、またはデッキ９０５（図１０）の一部であることができる、またはプラットフォーム１０１２上に配置される別個の構成要素であることができる。場所Ｌ１－Ｌ１６はそれぞれ、搬送デバイス９４１（図８）によってアクセスされることができる。例えば、場所Ｌ１－Ｌ１６およびサーマルサイクラ１１２４は、構造９４０またはデッキ９０５と物理的に別個であることができる。

撮像デバイス１００６は、例えば、場所Ｌ１－Ｌ１６のそれぞれにおける１つまたはそれを上回る構成要素の存在、場所Ｌ１１におけるカルーセル１００４の存在、および場所Ｌ１５における試薬リザーバ１００の存在を認識するように構成されることができる。さらに、撮像デバイス１００６は、情報を場所Ｌ１－Ｌ１６のそれぞれに位置する１つまたはそれを上回る構成要素から読み取るように構成されることができる。構成要素、例えば、液体のバイアルは、所望の様式において、例えば、プロトコルに従って、カルーセル１００４の中に装填されることができ、そこからまたは別の場所からの液体は、プロトコルに従って、サーマルサイクラシステム１００８の中に装填するために、反応容器１０３のうちの１つの中に装填されることができる。撮像デバイス１００６によって撮影されるカルーセル１００４の画像は、情報をカルーセル１００４の中に装填されるバイアルの標識から読み取るために使用されることができる。その後、サーマルサイクラシステム１００８は、下記の実施例の節を参照して議論されるもの等の加熱方法を実行し、プロトコルに従って、サーマルサイクラシステム１００８の中に装填される液体を加熱することができる。

本明細書で検討される他の方法は、ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、
試薬リザーバの傾きが付けられた底部が、深側端および浅側端を形成するように、試薬リザーバを液体で充填するステップと、浅側端の近傍の第１の位置の中に延在する、第１のピペット先端と、深側端の近傍の第２の位置の中に延在する、第２のピペット先端とを有する、マルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の部分を試薬リザーバから除去するステップと、
深側端の近傍の第２の位置の中に延在する、単一ピペット先端、または深側端の中に延在する、単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルのピペット先端を有する、マルチチャネルピペットを使用して、液体の第２の部分を試薬リザーバから除去するステップと、
を含む、方法を含む。マルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の部分を試薬リザーバから除去するステップは、液体が試薬リザーバの浅側端から空になる結果をもたらすことができる。液体の第１の部分を試薬リザーバから除去するステップはさらに、第２のピペットを用いて、第２の体積からの液体の吸引を繰り返すステップを含むことができる。深側端の近傍の第２の位置の中に延在する、単一ピペット先端、または深側端の中に延在する、単一チャネルピペットのピペット先端を有する、マルチチャネルピペットを使用して、液体の第２の部分を試薬リザーバから除去するステップは、第１の体積内の液体の全てを除去する結果をもたらすことができる。

本明細書で検討されるさらに他の方法は、ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、
ロボット液体ハンドラの第１のピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引するステップであって、第１のピペットは、第１の先端および第２の先端を含む、いくつかの先端を有し、試薬リザーバは、リザーバの長さに沿って、傾きが付けられた底部を有し、傾きが付けられた底部は、試薬リザーバの浅側端および深側端を画定し、液体の第１の体積の吸引の間、第１の先端は、試薬リザーバの浅側端にわたって位置付けられ、別の先端は、試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ステップと、
ロボット液体ハンドラの第２のピペットを使用して、液体の第２の体積を試薬リザーバから外に吸引するステップであって、第２のピペットは、第１のピペットの先端の数未満の先端の数を有し、第２のピペットの先端は、第２の体積の吸引の間、試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ステップと、
を含む、方法を含む。本方法はさらに、粒子が、優先的にまたは実質的に、深側端内に沈降しないように、粒子を液体中に懸濁させるステップを含むことができる。

本明細書で検討される付加的方法は、ロボット液体ハンドラを使用して、バルク量貯蔵リザーバから液体を移送する方法であって、
深側端および浅側端を形成する、貯蔵リザーバの傾きが付けられた底部によって形成される、バルク量貯蔵リザーバの第１の体積が、充填され、
深側端および浅側端におけるバルク量貯蔵容器の第１および第２の端壁によって上方で形成される、第１の体積の上方におけるバルク量貯蔵容器の第２の体積が、少なくとも部分的に充填された状態になる、
ように、液体をバルク量貯蔵リザーバに添加するステップと、
マルチチャネルピペットを使用して、第２の体積を空にするステップと、
単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルを使用して、第１の体積を空にするステップと、
を含む、方法を含む。マルチチャネルピペットは、第１の体積の上方の第１の端壁と第２の端壁との間に延在することができ、単一チャネルピペットは、深側端を横断して延在する。

本書では、用語「ａ」、「ａｎ」、または「ｔｈｅ」は、文脈によって別様に明確に決定付けられない限り、１つまたは１つを上回るものを含むために使用される。用語「または」は、別様に示されない限り、非排他的「または」を指すために使用される。加えて、本明細書で採用される語法または専門用語は、別様に定義されない限り、説明の目的のためのみのものであって、限定ではないことを理解されたい。見出しの任意の使用は、文書の読解を補助するように意図され、限定として解釈されるべきではない。さらに、見出しに関する情報は、その特定の節の範囲内または範囲外で生じ得る。さらに、本書で参照される、全ての刊行物、特許、および特許文書は、参照することによって個々に組み込まれる場合と同様に、参照することによってその全体として本明細書に組み込まれる。本書と参照することによってそのように組み込まれるそれらの文書との間の使用が矛盾する場合、組み込まれる参照における使用は、本書のものの補助と見なされるべきであって、対立する非一貫性に関しては、本書における使用が優先される。

本明細書に説明される方法では、ステップは、時間的または動作シーケンスが明示的に列挙されるときを除き、本発明の原理から逸脱することなく、任意の順序において行われることができる。さらに、規定されたステップは、請求項の明示的文言が、それらが別個に行われることを記載しない限り、並行して行われることができる。例えば、Ｘを行う請求されるステップおよびＹを行う請求されるステップは、単一動作において同時に行われることができ、結果として生じるプロセスは、請求されるプロセスの文字通りの範囲内に該当するであろう。

当業者は、本明細書に説明される実施形態の多くの修正が、本開示の精神および範囲から逸脱することなく、可能性として考えられることを理解するであろう。したがって、説明は、与えられる実施例に限定されることを意図するものではなく、そのように解釈されるべきでもなく、添付の請求項およびその均等物によって与えられる保護の完全範疇を付与されるべきである。加えて、他の特徴の対応する使用を伴わずに、本開示の特徴のうちのいくつかを使用することも可能である。故に、例証的実施形態の前述の説明は、本開示の原理を例証する目的のために提供され、その限定ではなく、その修正およびその置換を含むことができる。
（実施例）

本発明は、例証としてもたらされる、以下の実施例を参照することによって、より深く理解されることができる。本発明は、本明細書に与えられる実施例に限定されない。

本明細書に説明されるバルク量試薬リザーバは、本明細書に説明されるシステムが、速度およびスループットを増加させるように、サンプルを処理することを可能にしながら、死体積／廃棄物を減少させる。バルク量試薬リザーバは、１つの先端によってアクセスされる場合、５０μＬ、８つの先端をするとき、約５００μＬの死体積を有し得る。リザーバの底部部分における水平から３％勾配は、適液工程にわたって、リザーバの底における最下点に貯留する、リザーバ内の体積を減少させることを可能にすることができる。方法の開始時、リザーバは、適液を完了するために必要とされる試薬の推定された体積で充填されることができる。試薬が、バルク量リザーバから分取され、体積が、減少するにつれて、適液は、リザーバ内の液体の残量を追跡することができる。自動化が、次のピペット採取作用が計算された残りの体積を５００μＬを下回らせるであろう、点に到達すると、本明細書に説明されるシステムは、８つの先端の使用から１つの先端の使用に切り替えることができる。これは、リザーバを使用するために適液によって要求される死体積を低減させ、自動化がサンプルを効率的に処理することを可能にする。

ユーザが、２４個のサンプルを工程にかけることを所望し、６０μＬのサンプルのＡｍＰｕｒｅＸＰビーズを使用することを計画する場合、工程のために要求される体積は、死体積がないと仮定して、合計１，４４０μＬであろう。死体積は、ピペットが以下のように稼働するようにプログラムするとき、バルク量リザーバ内で５０μＬであると推定される。
・ 過程１－８つの先端毎に６０μＬ、除去される総体積は、４８０μＬとなるであろう。残りの体積は、６１０μＬ（１，４９０μＬ総体積）となるであろう。
・ 過程２－８つの先端毎に６０μＬ、移動される総体積は、４８０μＬとなるであろう。残りの体積は、６９０μＬとなるであろう。
・ 過程３－６０μＬが、最終移送のために、８つの先端毎に所望される。しかしながら、その総吸引は、バルク量試薬リザーバ内の追跡された体積を５００μＬ閾値を下回る計算された体積まで減少させるであろう。したがって、過程３から開始して、本明細書に説明されるシステムは、残りの８つの先端に対し、ピペット採取を一度に１つの先端に自動的に切り替えるようにプログラムされることができる（過程３－１０）。

本明細書に説明される試薬リザーバを利用することによって、バルク量試薬のために必要とされる死体積は、約４５０μＬ低減されることができる。これは、特に、自動化されたシステムのためにパッケージ化されていない、適液キットで現れる、試薬を用いる場合、重要である。低体積過剰量は、適液を自動化するとき、問題である。本明細書に説明される試薬リザーバは、システムが、工程のコストを低減させることを可能にするであろう。標準的コストを使用すると、上記に説明される試薬は、ユーザに＄２．４０／ｍＬ負担させるであろう。説明される試薬リザーバは、２４サンプル工程あたりコストを＄４．６６から＄３．４６まで低減させるであろう。

上記から分取されるビーズを洗浄するために、ユーザは、５０μＬの８０％エタノールを利用するであろう。必要とされる総体積は、５０×２４となるであろう。工程のための総体積は、死体積がないと仮定して、合計１，２００となるであろう。死体積は、以下のようにプログラムされるとき、バルク量リザーバ内で５０μＬと推定される。
・ 過程１－８つの先端毎に５０μＬ、除去される総体積は、４００μＬとなるであろう。残りの体積は、８５０μＬ（１２５０μＬ総体積）となるであろう。
・ 過程２－５０μＬが、最終移送のために、８つの先端毎に所望される。しかしながら、その総吸引は、バルク量試薬リザーバ内の追跡される体積を５００μＬ閾値を下回る計算された体積まで減少させるであろう。したがって、過程２から開始して、本明細書に説明されるシステムは、残りの８つの先端に対し、ピペット採取を一度に１つの先端に自動的に切り替えるようにプログラムされることができる（過程２－１７）。

本システムは、この場合では、選択肢が速度を最適化するためのものである場合、より大きい死入力のためにプログラムされ得る。これは、死体積およびピペット採取されている試薬のコストより速度を優先する所望に依存するであろう。バルク量試薬リザーバ設計は、必要とされる体積における低減を可能にする。上記の場合では、懸念されるものは、コストではない。しかしながら、エタノールは、可燃性である。バルク量試薬リザーバを使用することは、我々のピペット採取システム上で展開される、有害な化学物質の体積を減少させるであろう。これはまた、自動化プラットフォームによって作成される危険廃棄物の量を低減させるであろう。

本実施例は、以下の２４ＤＮＡ専用ワークフローを利用する、Ｉｌｌｕｍｉｎａ ＴｒｕＳｉｇｈｔ Ｏｎｃｏｌｏｇｙ ５００（文書番号１０００００００６７６２１ｖ０２）を使用する。

ＳＰＢ（サンプル調製ビーズ）が、ライブラリ作成および富化のための２日間プロトコルにおいて、２日１回、バルク量試薬リザーバにおいて使用されるであろう。

第１日目のライブラリ生成：標準的プロトコルは、連結反応を清浄するために、１１２μＬビーズの各ウェルへの添加を要求する。本明細書に説明されるシステムは、多先端ピペットを使用して、ビーズが溶液中に完全に懸濁されるまで、ビーズ混合物の吸引および分注によって、ビーズ溶液を混合することができる。吸引および分注の速度は、ビーズをバルク量リザーバの底部から押し上げるであろう。実験室内で試験されるとき、ビーズは、３％勾配を維持する場合、リザーバの傾きを辿って「摺動」しない。ＡＭＰｕｒｅＸＬビーズは、それほど迅速に溶液から溢れない。移送群あたり１回の混合のみが、必要とされるであろう。

バルク量リザーバのために必要とされる総体積は、１１２μＬ／サンプル＋５０μＬ死体積であって、リザーバ内の総体積は、２，７３８μＬである。
・ ＡＭＰｕｒｅＸＬビーズを８つの先端を使用して混合し、２６０μＬ／先端８回が再懸濁される。
・ 過程１－８つの先端を使用して、１１２μＬを第１の８サンプルに移送する（リザーバ内の残りの体積は、８９２μＬとなるであろう）
・ 過程２－８つの先端を使用して、１１２μＬをサンプル９－１６に移送する（残りの体積は、９４５μＬとなるであろう）
・ 過程３－１０－リザーバ内で追跡される体積が一度に８つの先端を使用するために要求される５００μＬ体積を下回って降下するであろうため、一度に１つの先端を使用して、１１２μＬを残りの８つのサンプルのそれぞれに移送する。

第２日目（Ｉｌｌｕｍｉｎａ説明書ページ２９）：標準的プロトコルは、増幅された富化ライブラリを清浄するために、１１０μＬビーズの各ウェルへの添加を要求する。ＮＧｅｎｉｕＳシステムは、多先端ピペットを使用して、ビーズが溶液中に完全に懸濁されるまで、ビーズ混合物の吸引および分注によって、ビーズ溶液を混合するであろう。ＡＭＰｕｒｅＸＬビーズは、それほど迅速に溶液から溢れない。移送群あたり１回の混合のみが、必要とされるであろう。

バルク量リザーバのために必要とされる総体積は、１１０μＬ／サンプル＋死体積であって、リザーバ内の総体積は、２，６９０μＬである。
・ ８つの先端を使用して、ＡＭＰｕｒｅＸＬビーズを混合し、２６０μＬ／先端８回を再懸濁させる。
・ 過程１－８つの先端を使用して、１１０μＬを第１の８サンプルに移送する（リザーバ内の残りの体積は、１，８１０μＬとなるであろう）
・ 過程２－８つの先端を使用して、１１０μＬをサンプル９－１６移送する（残りの体積は、９３０μＬとなるであろう）
・ 過程３－１０－リザーバ内で追跡される体積が一度に８つの先端を使用するために要求される５００μＬ体積を下回って降下するであろうため、一度に１つの先端を使用して、１１０μＬを残りの８つのサンプルのそれぞれに移送する。

本実施例に説明される手技はまた、Ｉｌｌｕｍｉｎａキット（ＲＳＢ－再懸濁液緩衝剤、８０％ＥｔＯＨ－エタノール、ＥＥＷ増強富化洗浄剤、ＬＮＡ１－ライブラリ正規化添加剤（ホルムアミドを含有する）、および他の磁気ビーズ溶液（ＬＮＢ１－ライブラリ正規化ビーズおよびＳＭＢ－ストレプトアビジン磁気ビーズ）内の非磁気試薬のために使用されることができる。

上記に列挙されたＬＮＡ１試薬は、ガスを放出し、吸入される場合、危険である。体積を本システム上での使用のために可能な限り低量に保つことが賢明である。

ビーズ（例えば、ＡＭＰｕｒｅＸＰおよびストレプトアビジンビーズ）が、それらが、試薬リザーバに添加され、沈降させられるとき、試薬リザーバのより深い端部に蓄積するかどうかを決定する実験が、行われた。そのために、２つの別個の試薬リザーバが、調製され、１ｍＬのＡＭＰｕｒｅＸＰが１つの区分に添加され、２ｍＬのＡＭＰｕｒｅＸＰが第２の区分に添加された。沈降前に、底側の写真が撮影された。試薬リザーバが、接着剤シールで被覆され、夜間にわたって、沈降させられた。翌朝、シールが、除去された。写真（本明細書に含まれない）は、夜間にわたって沈降させられたとき、試薬リザーバの深側端に向かった任意の顕著な沈降で現れないことを示した。

本実験は、ビーズ（例えば、ＡＭＰｕｒｅＸＰおよびストレプトアビジンビーズ）を試薬リザーバ内に再懸濁させることが困難である程度を調査するために意図された。そのために、１０ｍＬのＡＭＰｕｒｅＸＰが、試薬リザーバの片側に添加され、ビーズは、夜間にわたって沈降させられた。翌朝、マルチチャネルピペット、具体的には、Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ（Ｂｒｅａ， ＣＡ）から利用可能なｉ５ Ｓｐａｎ－８が、沈降したビーズを再懸濁させるために使用された。３～４回の混合後、ビーズは、完全に再懸濁されて現れた。

実施例５からのＡＭＰｕｒｅＸＰ懸濁液は、試薬リザーバから完全に除去され、４００μＬが、リザーバに戻された。修正されたピペット採取テンプレートを利用して、４００μＬ懸濁液から８つの１５μＬのＡＭＰｕｒｅＸＰが、ＰＣＲプレートの８つのウェルに添加され、４００μＬのうち１２０μＬを試薬リザーバから除去した。ピペット採取は、全ての８つのサンプルに関して成功した。

本実験は、複数の先端（例えば、ｉ５ Ｓｐａｎ－８ピペットから）を使用して、ビーズを再懸濁させる能力に及ぼされる、角度θ（図１参照）の影響を調べるために行われた。そのために、２ｍＬのＡＭＰｕｒｅＸＰが、一連の６つの試薬リザーバに添加され、リザーバは、シールされ、蒸発を防止した。ビーズは、夜間にわたって沈降させられた。リザーバのうちの３つが、３°の角度θを有し、３つが、８°の角度θを有した。予期されるように、ビーズによって画定された三角形は、傾きが増加するにつれて、図１１に示されるようになった。結果として、ビーズ沈降の面積は、θが増加するにつれて、より小さくなった。低減された面積は、１つを上回る先端がビーズ再懸濁液のために使用されることを可能にしない。いくつかの事例では、したがって、３～４°の傾きは、７～８°の傾きより良好であり得る。

本開示の選択実施形態は、限定ではないが、以下を含む。

実施形態１は、ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、
ロボット液体ハンドラのマルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引するステップであって、試薬リザーバは、試薬リザーバの長さに沿って傾きが付けられた底部を有し、傾きが付けられた底部は、試薬リザーバの浅側端および深側端を画定し、浅側端は、試薬リザーバの第１の側壁の近位にあって、深側端は、第１の側壁に対向する、試薬リザーバの第２の側壁の近位にある、ステップと、
ロボット液体ハンドラの単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルを使用して、液体の第２の体積を試薬リザーバの深側端から外に吸引するステップと、
を含み、深側端から外への第２の体積の吸引は、試薬リザーバの浅側端内の液体の枯渇をもたらす、方法に関する。

実施形態２は、単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルが、試薬リザーバの最深部分に位置付けられ、最深部分が、試薬リザーバの第２の側壁の近位にある、実施形態１に記載の方法に関する。

実施形態３は、試薬リザーバが、第１の側壁から第２の側壁までの試薬リザーバの幅に沿って減少する断面を有する、実施形態１－２に記載の方法に関する。

実施形態４は、ロボット液体ハンドラのマルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引するステップが、第１の側壁から第２の側壁までの試薬リザーバの幅に沿って、マルチチャネルピペットを使用して、第１の体積を吸引するステップを含む、実施形態３に記載の方法に関する。

実施形態５は、試薬リザーバが、複数のチャンバを有し、それぞれ、傾きが付けられた底部を伴う、実施形態１－４に記載の方法に関する。

実施形態６は、複数のチャンバが、リザーバの長さに沿って延設される壁を分割することによって形成される、実施形態５に記載の方法に関する。

実施形態７は、粒子を液体中に堆積するステップと、粒子を液体中に懸濁された状態にさせるステップとをさらに含み、粒子が、傾きが付けられた底部に沿って均一に沈降する、実施形態１－６に記載の方法に関する。

実施形態８は、タブと液体ハンドラ上のスロットを整合させ、試薬リザーバをロボット液体ハンドラのデッキ上に位置付けるステップをさらに含む、実施形態１－７に記載の方法に関する。

実施形態９は、試薬リザーバのタブとロボット液体ハンドラのデッキを係合させ、浅側端を深側端の上方に上昇させ、第１の側壁および第２の側壁をデッキ上に垂直に立設させるステップをさらに含む、実施形態１－８に記載の方法に関する。

実施形態１０は、ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、
試薬リザーバの傾きが付けられた底部が、深側端および浅側端を形成するように、試薬リザーバを液体で充填するステップと、
浅側端の近傍の第１の位置の中に延在する、第１のピペット先端と、深側端の近傍の第２の位置の中に延在する、第２のピペット先端とを有する、マルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の部分を試薬リザーバから除去するステップと、深側端の近傍の第２の位置の中に延在する、単一ピペット先端、または深側端の中に延在する、単一チャネルピペットのピペット先端を有する、マルチチャネルピペットを使用して、液体の第２の部分を試薬リザーバから除去するステップと、
を含む、方法に関する。

実施形態１１は、マルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の部分を試薬リザーバから除去するステップが、液体が試薬リザーバの浅側端から空になる結果をもたらし得る、実施形態１０に記載の方法に関する。

実施形態１２は、液体の第１の部分を試薬リザーバから除去するステップがさらに、第２のピペットを用いて、第２の体積からの液体の吸引を繰り返すステップを含み得る、実施形態１０に記載の方法に関する。

実施形態１３は、深側端の近傍の第２の位置の中に延在する、単一ピペット先端、または深側端の中に延在する、単一チャネルピペットのピペット先端を有する、マルチチャネルピペットを使用して、液体の第２の部分を試薬リザーバから除去するステップが、第１の体積内の液体の全てを除去する結果をもたらし得る、実施形態１０に記載の方法に関する。

実施形態１４は、ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、
ロボット液体ハンドラの第１のピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引するステップであって、第１のピペットは、第１の先端および第２の先端を含む、いくつかの先端を有し、試薬リザーバは、リザーバの長さに沿って、傾きが付けられた底部を有し、傾きが付けられた底部は、試薬リザーバの浅側端および深側端を画定し、液体の第１の体積の吸引の間、第１の先端は、試薬リザーバの浅側端にわたって位置付けられ、別の先端は、試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ステップと、
ロボット液体ハンドラの第２のピペットを使用して、液体の第２の体積を試薬リザーバから外に吸引するステップであって、第２のピペットは、第１のピペットの先端の数未満の先端の数を有し、第２のピペットの先端は、第２の体積の吸引の間、試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ステップと、
を含む、方法に関する。

実施形態１５は、粒子が深側端内に優先的に沈降しないように、粒子を液体中に懸濁させるステップをさらに含む、実施形態１４に記載の方法に関する。

実施形態１６は、ロボット液体ハンドラを使用して、バルク量貯蔵容器から液体を移送する方法であって、
深側端および浅側端を形成する、貯蔵リザーバの傾きが付けられた底部によって形成される、バルク量貯蔵リザーバの第１の体積が、充填され、
深側端および浅側端におけるバルク量貯蔵容器の第１および第２の端壁によって上方で形成される、第１の体積の上方におけるバルク量貯蔵容器の第２の体積が、少なくとも部分的に充填された状態になる、
ように、液体をバルク量貯蔵リザーバに添加するステップと、
マルチチャネルピペットを使用して、第２の体積を空にするステップと、
単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルを使用して、第１の体積を空にするステップと、
を含む、方法に関する。

実施形態１７は、
マルチチャネルピペットが、第１の体積の上方で第１の端壁と第２の端壁との間に延在し、
単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルが、深側端を横断して延在する、
実施形態１６に記載の方法に関する。

Claims (15)

1. ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、前記方法は、
   前記ロボット液体ハンドラのマルチチャネルピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引することであって、前記試薬リザーバは、前記試薬リザーバの長さに沿って傾きが付けられた底部を有し、前記傾きが付けられた底部は、前記試薬リザーバの浅側端および深側端を画定し、前記浅側端は、前記試薬リザーバの第１の側壁の近位にあり、前記深側端は、前記第１の側壁に対向する前記試薬リザーバの第２の側壁の近位にある、ことと、
   前記ロボット液体ハンドラの単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルを使用して、液体の第２の体積を前記試薬リザーバの深側端から外に吸引することと
   を含み、
   前記深側端から外への前記第２の体積の吸引は、前記試薬リザーバの浅側端内の液体の枯渇をもたらす、方法。
2. 前記単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルは、試薬リザーバの最深部分に位置付けられ、前記最深部分は、前記試薬リザーバの第２の側壁の近位にある、請求項１に記載の方法。
3. 前記試薬リザーバは、前記第１の側壁から前記第２の側壁までの前記試薬リザーバの幅に沿って減少する断面を有する、請求項１に記載の方法。
4. 前記ロボット液体ハンドラのマルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第１の体積を前記試薬リザーバから外に吸引することは、前記第１の側壁から前記第２の側壁までの前記試薬リザーバの幅に沿って、前記マルチチャネルピペットを使用して、前記第１の体積を吸引することを含む、請求項３に記載の方法。
5. 前記試薬リザーバは、複数のチャンバを有し、それぞれが傾きが付けられた底部を伴う、請求項１に記載の方法。
6. 複数のチャンバは、前記試薬リザーバの長さに沿って延設される壁を分割することによって形成される、請求項５に記載の方法。
7. 粒子を前記液体中に堆積することと、
   前記粒子を前記液体中に懸濁された状態にさせることと
   をさらに含み、
   前記粒子は、前記傾きが付けられた底部に沿って均一に沈降する、請求項１に記載の方法。
8. タブと前記液体ハンドラ上のスロットを整合させ、前記試薬リザーバを前記ロボット液体ハンドラのデッキ上に位置付けることをさらに含む、請求項１に記載の方法。
9. 前記試薬リザーバのタブと前記ロボット液体ハンドラのデッキを係合させ、前記浅側端を前記深側端の上方に上昇させ、前記第１の側壁および前記第２の側壁を前記デッキ上に垂直に立設させること
   をさらに含む、請求項１に記載の方法。
10. ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、前記方法は、
    試薬リザーバの傾きが付けられた底部が、深側端および浅側端を形成するように、試薬リザーバを液体で充填することと、
    前記浅側端の近傍の第１の位置の中に延在する第１のピペット先端と、前記深側端の近傍の第２の位置の中に延在する第２のピペット先端とを有するマルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第１の部分を前記試薬リザーバから除去することと、
    前記深側端の近傍の第２の位置の中に延在する単一ピペット先端、または前記深側端の中に延在する単一チャネルピペットのピペット先端を有するマルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第２の部分を前記試薬リザーバから除去することと
    を含む、方法。
11. 前記マルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第１の部分を前記試薬リザーバから除去することは、前記液体が前記試薬リザーバの浅側端から空になる結果をもたらし得る、請求項１０に記載の方法。
12. 前記液体の第１の部分を前記試薬リザーバから除去することはさらに、前記単一ピペット先端または前記単一チャネルピペットの前記ピペット先端を有する前記マルチチャネルピペットを用いて、前記液体の第２の部分からの液体の吸引を繰り返すことを含み得る、請求項１０に記載の方法。
13. 前記深側端の近傍の第２の位置の中に延在する単一ピペット先端、または前記深側端の中に延在する単一チャネルピペットのピペット先端を有する前記マルチチャネルピペットを使用して、前記液体の第２の部分を前記試薬リザーバから除去することは、前記液体の第１の部分内の前記液体の全てを除去する結果をもたらし得る、請求項１０に記載の方法。
14. ロボット液体ハンドラを使用して液体を移送する方法であって、前記方法は、
    前記ロボット液体ハンドラの第１のピペットを使用して、液体の第１の体積を試薬リザーバから外に吸引することであって、前記第１のピペットは、第１の先端および第２の先端を含むいくつかの先端を有し、前記試薬リザーバは、前記試薬リザーバの長さに沿って、傾きが付けられた底部を有し、前記傾きが付けられた底部は、前記試薬リザーバの浅側端および深側端を画定し、前記液体の第１の体積の吸引の間、前記第１の先端は、前記試薬リザーバの浅側端にわたって位置付けられ、別の先端は、前記試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ことと、
    前記ロボット液体ハンドラの第２のピペットを使用して、液体の第２の体積を前記試薬リザーバから外に吸引することであって、前記第２のピペットは、前記第１のピペットの先端の数未満の先端の数を有し、前記第２のピペットの先端は、前記第２の体積の吸引の間、前記試薬リザーバの深側端にわたって位置付けられる、ことと
    を含む、方法。
15. ロボット液体ハンドラを使用して、バルク量貯蔵容器から液体を移送する方法であって、前記方法は、
    深側端および浅側端を形成する貯蔵リザーバの傾きが付けられた底部によって形成されるバルク量貯蔵リザーバの第１の体積が、充填され、
    前記深側端および浅側端における前記バルク量貯蔵容器の第１および第２の端壁によって上方で形成される前記第１の体積の上方における前記バルク量貯蔵容器の第２の体積が、少なくとも部分的に充填された状態になる
    ように、液体を前記バルク量貯蔵リザーバに添加することと、
    マルチチャネルピペットを使用して、前記第２の体積を空にすることと、
    単一チャネルピペットまたはマルチチャネルピペットの単一チャネルを使用して、前記第１の体積を空にすることと
    を含む、方法。
    

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