JP7329196B2 - Colony detection system - Google Patents

Description

本開示は、培養された微生物の集合体であるコロニーの数をカウントするコロニー検出システムに関する。 The present disclosure relates to a colony detection system that counts the number of colonies that are aggregates of cultured microorganisms.

食品に微生物が混入すると、人体に悪影響を及ぼすことがある。微生物は環境条件によって急激に繁殖するおそれがあり、食中毒などの大規模な健康被害を引き起こすこともありうる。食品に混入した微生物を検出するシステムとして、食品から採取した微生物をシャーレやフィルム上で培養し、培養された微生物の集合体であるコロニーの数をカウントする検出システムが提案されている。 Contamination of food with microorganisms can have adverse effects on the human body. Microorganisms can multiply rapidly depending on environmental conditions, and can cause large-scale health hazards such as food poisoning. As a system for detecting microorganisms contaminating food, a detection system has been proposed in which microorganisms collected from food are cultured on petri dishes or films, and the number of colonies, which are aggregates of the cultured microorganisms, is counted.

特開２０１１－２１２０１３号公報Japanese Unexamined Patent Application Publication No. 2011-212013

弁当や総菜などの多数の加工食品に微生物が混入しているか否かを短時間で検査するには、フィルム等の培地媒体を多数用意して、各培地媒体に微生物を培養させた培養面をスキャナ等の撮像装置で高速に読み取って画像解析を行う手法が取られる。しかしながら、培地媒体の種類によって、コロニーの色やサイズが異なるため、コロニーを検出してその数をカウントする処理アルゴリズムを、培地媒体の種類ごとに変えなければならない。したがって、複数種類の培地媒体が入れ混じった大量の培地媒体を効率的に処理するのは容易ではない。 In order to quickly test whether or not many processed foods such as box lunches and side dishes are contaminated with microorganisms, it is necessary to prepare a large number of medium media such as films, and to prepare a culture surface on which microorganisms are cultivated on each medium medium. A method of reading the image at high speed with an imaging device such as a scanner and analyzing the image is adopted. However, since the color and size of colonies differ depending on the type of culture medium, the processing algorithm for detecting and counting colonies must be changed for each type of culture medium. Therefore, it is not easy to efficiently process a large amount of medium containing a mixture of multiple types of medium.

また、培地媒体の種類によっては、複数の微生物がそれぞれ異なる色のコロニーとして検出される場合がある。しかしながら、従来のコロニー検出システムは、単色でのコロニー数のカウントしか行っておらず、一つの培地媒体上に存在する複数の微生物のそれぞれを区別して、別個にコロニー数をカウントすることができなかった。 Moreover, depending on the type of culture medium, a plurality of microorganisms may be detected as colonies of different colors. However, the conventional colony detection system only counts the number of colonies in a single color, and cannot distinguish between each of a plurality of microorganisms present on one culture medium and count the number of colonies separately. Ta.

このように、複数種類の培地媒体が入れ混じった大量の培地媒体についてのコロニー数のカウントを効率的に行う手法や、培地媒体中のコロニーを色別に効率的にカウントする手法が従来は存在しなかった。 Thus, conventionally, there is no method for efficiently counting the number of colonies in a large amount of medium containing a mixture of multiple types of medium, or a method for efficiently counting colonies in the medium by color. I didn't.

本開示は、上述した課題を解決するためになされたものであり、培地媒体上のコロニーを効率よく、かつ精度よくカウント可能なコロニー検出システムを提供するものである。 The present disclosure has been made to solve the above-described problems, and provides a colony detection system capable of efficiently and accurately counting colonies on a culture medium.

上記の課題を解決するために、本開示によれば、検体に含まれる特定の微生物を培養し、培養された前記特定の微生物の集合体であるコロニーを顕在化させる培地媒体と、
前記培地媒体の種類及びコロニーのカウント機能を含む情報を選択する選択部と、
前記培地媒体の培養面を撮像する撮像部と、
前記撮像部で撮像された画像に含まれる前記培地媒体の種類を示すコード情報を検出する第１情報検出部と、
前記撮像部で撮像された画像に対して、前記選択部で選択された情報と、前記第１情報検出部で検出されたコード情報と、に応じた処理を行って、前記培地媒体で培養された前記コロニーの数をカウントする第１コロニーカウント部と、
前記選択部で選択された情報と第１情報検出部で検出されたコード情報との少なくとも一方に基づいて、新たなコード情報を生成するコード情報生成部と、
前記撮像部で撮像された画像に含まれるコード情報を前記新たなコード情報に更新した新たな培地画像を生成する画像更新部と、
前記新たな培地画像に含まれる前記新たなコード情報を検出する第２情報検出部と、
前記新たな培地画像に対して、前記選択部で選択された情報と、前記第２情報検出部で検出されたコード情報と、に応じた処理を行って、前記培地媒体で培養された前記コロニーの数をカウントする第２コロニーカウント部と、を備える、コロニー検出システムが提供される。 In order to solve the above problems, according to the present disclosure, a culture medium for culturing specific microorganisms contained in a specimen and manifesting colonies that are aggregates of the cultured specific microorganisms;
a selection unit that selects information including the type of the culture medium and a colony counting function;
an imaging unit that images the culture surface of the culture medium;
a first information detection unit that detects code information indicating the type of the culture medium contained in the image captured by the imaging unit;
The image captured by the imaging unit is processed according to the information selected by the selection unit and the code information detected by the first information detection unit, and cultured in the culture medium. a first colony counting unit that counts the number of colonies;
a code information generation unit that generates new code information based on at least one of the information selected by the selection unit and the code information detected by the first information detection unit;
an image updating unit that generates a new culture medium image in which code information included in the image captured by the imaging unit is updated to the new code information;
a second information detection unit that detects the new code information included in the new culture medium image;
The colony cultured in the culture medium by performing processing on the new culture medium image according to the information selected by the selection unit and the code information detected by the second information detection unit. A colony detection system is provided, comprising a second colony counting unit that counts the number of.

前記新たなコード情報と、前記第１情報検出部が検出したコード情報とは、カウント対象のコロニーの種類とコロニーの色との少なくとも一方に関する情報が異なっていてもよい。 The new code information and the code information detected by the first information detection unit may differ in information relating to at least one of the colony type and colony color to be counted.

前記第１情報検出部が検出したコード情報と前記新たなコード情報との一方は、前記培地媒体上の全コロニーの数をカウントすることを指示する情報であり、他方は、前記培地媒体上の特定の色のコロニーの数をカウントすることを指示する情報であってもよい。 One of the code information detected by the first information detection unit and the new code information is information instructing to count the number of all colonies on the culture medium, and the other is information on the culture medium It may be information instructing to count the number of colonies of a specific color.

本開示によれば、検体に含まれる特定の微生物を培養し、培養された前記特定の微生物の集合体であるコロニーを顕在化させる複数種類の培地媒体と、
前記培地媒体の培養面を撮像する撮像部と、
前記撮像部で撮像した画像を所定の条件で分類して記憶する、複数の記憶部と、
前記複数の記憶部に記憶された画像に対して、各記憶部ごとに、前記所定の条件に応じた各記憶部固有の処理を行って、前記培地媒体で培養された前記コロニーの数をカウントするコロニーカウント部と、を備える、コロニー検出システムが提供される。 According to the present disclosure, a plurality of types of culture media for culturing specific microorganisms contained in a specimen and manifesting colonies that are aggregates of the cultured specific microorganisms;
an imaging unit that images the culture surface of the culture medium;
a plurality of storage units that classify and store images captured by the imaging unit according to predetermined conditions;
The images stored in the plurality of storage units are subjected to processing unique to each storage unit according to the predetermined conditions for each storage unit, and the number of colonies cultured in the culture medium is counted. A colony detection system is provided, comprising: a colony counting unit that

前記複数の記憶部に記憶された画像に対して、各記憶部ごとに、前記所定の条件に応じた各記憶部固有の画像処理を行う画像処理部を備え、
前記コロニーカウント部は、前記画像処理部で画像処理された後の画像に対して、各記憶部ごとに、前記所定の条件に応じた各記憶部固有の処理を行って、前記培地媒体で培養された前記コロニーの数をカウントしてもよい。 An image processing unit that performs image processing specific to each storage unit according to the predetermined condition for each storage unit on the images stored in the plurality of storage units,
The colony counting unit performs processing unique to each storage unit according to the predetermined conditions for each storage unit on the image after image processing by the image processing unit, and cultures the image in the culture medium. The number of said colonies picked may be counted.

前記コロニーカウント部は、前記複数の記憶部のうち、一つの記憶部に記憶されたすべての画像についての前記コロニーの数のカウントが終わった後、次の記憶部のカウント処理を行い、各記憶部ごとに、各記憶部に固有の条件により前記コロニーの数をカウントしてもよい。 After counting the number of colonies for all the images stored in one storage unit out of the plurality of storage units, the colony counting unit performs counting processing for the next storage unit, For each section, the number of colonies may be counted according to conditions unique to each storage section.

検体に含まれる特定の微生物を培養し、培養された前記特定の微生物の集合体であるコロニーを顕在化させる複数種類の培地媒体と、
前記培地媒体の培養面を撮像する撮像部と、
前記撮像部で撮像した画像のファイル名に、所定の条件に応じた識別子を付加して記憶する記憶部と、
前記記憶部に記憶された画像に対して、前記識別子に応じた固有の処理を行って、前記培地媒体で培養された前記コロニーの数をカウントするコロニーカウント部と、を備える、コロニー検出システム。 a plurality of types of culture media for culturing specific microorganisms contained in a specimen and manifesting colonies that are aggregates of the cultured specific microorganisms;
an imaging unit that images the culture surface of the culture medium;
a storage unit that adds an identifier according to a predetermined condition to the file name of the image captured by the imaging unit and stores the image;
a colony counting unit that counts the number of colonies cultured in the culture medium by performing unique processing according to the identifier on the image stored in the storage unit.

前記記憶部に記憶された画像に対して、前記識別子ごとに、前記所定の条件に応じた各記憶部固有の画像処理を行う画像処理部を備え、
前記コロニーカウント部は、前記画像処理部で画像処理された後の画像に対して、前記所定の条件に応じた各記憶部固有の処理を行って、前記培地媒体で培養された前記コロニーの数をカウントする、請求項７に記載のコロニー検出システム。 an image processing unit that performs image processing specific to each storage unit according to the predetermined condition for each identifier on the image stored in the storage unit;
The colony counting unit performs processing specific to each storage unit according to the predetermined conditions on the image after image processing by the image processing unit, and counts the colonies cultured in the culture medium. The colony detection system according to claim 7, which counts .

前記コロニーカウント部は、前記記憶部内において、ファイル名に特定の前記識別子が付記されたすべての画像について、対応する前記所定の条件に基づいて前記コロニーの数のカウントが終わった後、ファイル名に別の特定の前記識別子が付記されたすべての画像について、対応する前記所定の条件に基づいて前記コロニー数のカウントを行う処理を繰り返す、請求項７または８に記載のコロニー検出システム。 In the storage unit, after counting the number of colonies based on the corresponding predetermined conditions for all images with the specific identifier attached to the file name, 9. The colony detection system according to claim 7, wherein the process of counting the number of colonies based on the corresponding predetermined conditions is repeated for all images to which the different specific identifiers are added.

前記所定の条件は、前記培地媒体の種類を含む、請求項４乃至９のいずれか一項に記載のコロニー検出システム。 The colony detection system according to any one of claims 4 to 9, wherein said predetermined condition includes the type of said medium.

前記所定の条件は、前記撮像部で撮像した画像に含まれるコロニーの数をカウント可能か否かを示す情報を含む、請求項４乃至９のいずれか一項に記載のコロニー検出システム。 10. The colony detection system according to any one of claims 4 to 9, wherein said predetermined condition includes information indicating whether or not the number of colonies contained in an image captured by said imaging unit can be counted.

前記所定の条件は、前記培地媒体の検査条件を含む、請求項４乃至９のいずれか一項に記載のコロニー検出システム。 10. The colony detection system according to any one of claims 4 to 9, wherein said predetermined conditions include inspection conditions for said medium.

本開示によれば、培地媒体上のコロニーを効率よく、かつ精度よくカウントすることができる。 According to the present disclosure, colonies on a culture medium can be efficiently and accurately counted.

第１の実施形態によるコロニー検出システムの概略構成を示す機能ブロック図。1 is a functional block diagram showing a schematic configuration of a colony detection system according to a first embodiment; FIG. 培地シートの平面図。The top view of a culture-medium sheet. 表示部の画面の表示例を示す図。FIG. 4 is a diagram showing a display example of a screen of a display unit; 本実施形態によるコロニー検出システムの概略の処理動作を示すフローチャート。4 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system according to the present embodiment; ＥＣ暫定処理を行うべき培地シートの撮像画像を表示部の画面に表示させた例を示す図。The figure which shows the example which displayed on the screen of the display part the captured image of the culture medium sheet which should perform EC provisional processing. 作業者が「ＥＣ暫定」を選択した場合の制御部の処理動作を示すフローチャート。4 is a flowchart showing the processing operation of the control unit when the operator selects "EC provisional"; 第１コロニーカウント部の処理動作の一例を示すフローチャート。4 is a flow chart showing an example of the processing operation of the first colony counting section; 第２コロニーカウント部の処理動作の一例を示すフローチャート。4 is a flow chart showing an example of the processing operation of a second colony counting section; 第２の実施形態によるコロニー検出システムの概略構成を示す機能ブロック図。FIG. 4 is a functional block diagram showing a schematic configuration of a colony detection system according to a second embodiment; 培地シートの撮像画像を複数の記憶部に分類して記憶する様子を模式的に示す図。The figure which shows typically a mode that the captured image of a culture medium sheet is classified and memorize|stored in several memory|storage parts. 第２の実施形態によるコロニー検出システムの概略的な処理動作を示すフローチャート。9 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system according to the second embodiment; 第３の実施形態によるコロニー検出システムの概略的な処理動作を示すフローチャート。10 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system according to the third embodiment; 第４の実施形態によるコロニー検出システムの概略的な処理動作を示すフローチャート。10 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system according to the fourth embodiment; 第５の実施形態によるコロニー検出システムの概略的な処理動作を示すフローチャート。11 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system according to the fifth embodiment;

以下、図面を参照して本開示の一実施の形態について説明する。なお、本件明細書に添付する図面においては、図示と理解のしやすさの便宜上、適宜縮尺及び縦横の寸法比等を、実物のそれらから変更し誇張してある。 An embodiment of the present disclosure will be described below with reference to the drawings. In addition, in the drawings attached to this specification, for the convenience of illustration and ease of understanding, the scale and the ratio of vertical and horizontal dimensions are appropriately changed and exaggerated from those of the real thing.

（第１の実施形態）
図１は第１の実施形態によるコロニー検出システム１の概略構成を示す機能ブロック図である。本実施形態によるコロニー検出システム１は、培地媒体上に培養された微生物のコロニーの数をカウントすることができる。ここで、コロニーとは、培地媒体上に培養された特定の微生物の集合体である。微生物の具体的な種類は問わないが、本実施形態では主に、食品に混入する各種の微生物を念頭に置いており、具体的には、大腸菌や黄色ブドウ球菌などである。培地媒体とは、微生物を培養可能な培地であり、フィルム状の培地シート２でもよいし、シャーレなどでもよい。大量の培地媒体の画像を短時間で読み取ってコロニー数のカウントを自動で行う場合には、連続して画像化が可能な培地シート２を用いるのが望ましい。以下では、培地媒体として培地シート２を用いる例を主に説明する。 (First embodiment)
FIG. 1 is a functional block diagram showing a schematic configuration of a colony detection system 1 according to the first embodiment. The colony detection system 1 according to this embodiment can count the number of colonies of microorganisms cultured on a culture medium. Here, a colony is an aggregation of specific microorganisms cultured on a culture medium. Although the specific types of microorganisms are not limited, this embodiment mainly considers various microorganisms that contaminate foods, specifically Escherichia coli, Staphylococcus aureus, and the like. A medium medium is a medium in which microorganisms can be cultured, and may be a film-like medium sheet 2 or a petri dish. When automatically counting the number of colonies by reading images of a large amount of medium in a short period of time, it is desirable to use a medium sheet 2 capable of continuous imaging. An example using the culture medium sheet 2 as the culture medium will be mainly described below.

図２は培地シート２の平面図である。図２の培地シート２は、基材層１１と、基材層１１の中心部付近の円形枠１２内に積層される培養層１３と、基材層１１及び培養層１３の上面全体を覆う透明な保護層１４とを有する。 FIG. 2 is a plan view of the medium sheet 2. FIG. The culture medium sheet 2 in FIG. 2 includes a substrate layer 11, a culture layer 13 laminated in a circular frame 12 near the center of the substrate layer 11, and a transparent layer covering the entire upper surfaces of the substrate layer 11 and the culture layer 13. and a protective layer 14 .

基材層１１の材料は、プラスチックフィルムや紙などである。プラスチックフィルムの具体例としては、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリエチレンテレフタレート、ポリエステル、ポリカーボネート等の樹脂フィルムを用いることができる。基材層１１は、樹脂と紙の多層構造であってもよい。 The material of the base material layer 11 is a plastic film, paper, or the like. As specific examples of plastic films, resin films such as polyethylene, polypropylene, polyethylene terephthalate, polyester, and polycarbonate can be used. The base material layer 11 may have a multilayer structure of resin and paper.

培養層１３の材料は、微生物の種類に応じて異なる。基材層１１の表面には、培養層１３がどの微生物の培養を行うものであるかを示す識別コードが印刷されている。図２の例では、識別コードとしてＱＲコード（登録商標）１５が印刷されている。ＱＲコード１５の代わりに、バーコード等の識別コードが印刷されていてもよい。 The material of the culture layer 13 differs depending on the type of microorganism. An identification code is printed on the surface of the base material layer 11 to indicate which microorganism the culture layer 13 is to culture. In the example of FIG. 2, a QR code (registered trademark) 15 is printed as an identification code. An identification code such as a bar code may be printed instead of the QR code 15 .

保護層１４は、基材層１１の上面全体を覆っており、培養層１３への異物の混入を防止する。保護層１４は、透明であるため、保護層１４を付けたままで、撮像部３にて培養面を撮像することができる。 The protective layer 14 covers the entire upper surface of the substrate layer 11 and prevents foreign matter from entering the culture layer 13 . Since the protective layer 14 is transparent, the culture surface can be imaged by the imaging unit 3 with the protective layer 14 attached.

図１のコロニー検出システム１は、図２に示した培地シート２と、撮像部３と、記憶部４と、ユーザインタフェース部５と、制御部６と、画像認識部７と、コロニーカウント部８と、表示部９とを備えている。 Colony detection system 1 of FIG. , and a display unit 9 .

作業者は、培地シート２の培養面に、検体を希釈した希釈液を滴下して、予め定めた培養時間だけ、検体に含まれる微生物を培地シート２にて培養する。培地シート２の具体的な構成材料は前述のものと同様である。検体とは、微生物が混入する可能性のある種々の食品などである。 An operator drips a diluent obtained by diluting the sample onto the culture surface of the medium sheet 2 and cultures the microorganisms contained in the sample on the medium sheet 2 for a predetermined culture time. Specific constituent materials of the culture medium sheet 2 are the same as those described above. Specimens are various foods that may be contaminated with microorganisms.

撮像部３は、予め定めた培養時間が経過した後に、培地シート２の培養面を撮像する。
撮像部３は、例えば市販の光学スキャナを適用することができる。特に、ＡＤＦ（Auto Document Feeder）機能を有する光学スキャナを用いると、複数の培地シート２の培養面を連続的に読み取ることができ、効率的な読取作業が可能となる。撮像部３で撮像された撮像画像は記憶部４に格納される。制御部６は、必要に応じて記憶部４から撮像画像を読み出して、画像認識部７や表示部９に送信する。 The imaging unit 3 images the culture surface of the culture medium sheet 2 after a predetermined culture time has elapsed.
A commercially available optical scanner, for example, can be applied to the imaging unit 3 . In particular, if an optical scanner having an ADF (Auto Document Feeder) function is used, the culture surfaces of a plurality of culture medium sheets 2 can be read continuously, enabling efficient reading work. A captured image captured by the imaging unit 3 is stored in the storage unit 4 . The control unit 6 reads the captured image from the storage unit 4 as necessary and transmits it to the image recognition unit 7 and the display unit 9 .

ユーザインタフェース部５は、作業者が種々の入力や選択を行う指示部材を有する。指示部材は、マウスやキーボード等の選択機器や入力機器でもよいし、表示部９の画面に内蔵されたタッチセンサでもよい。ユーザインタフェース部５は、培地シート２の種類及びコロニー数のカウントの条件を含む情報を選択する選択部５ａを有する。例えば、作業者は、選択部５ａにより、培地シート２の種類を選択するとともに、選択した種類の培地シート２中のコロニー数のカウントの条件を選択する。ここで、培地シート２の種類とは、培地シート２で培養する微生物の種類である。また、カウントの条件とは、培地シート２中のどのコロニーについてカウントを行うのかを指定する条件である。より具体的には、培地シート２中の特定色のコロニーのみについてカウントするとか、全色のコロニーのカウントをする等である。 The user interface unit 5 has an instruction member for the operator to make various inputs and selections. The pointing member may be a selection device or input device such as a mouse or keyboard, or may be a touch sensor built into the screen of the display unit 9 . The user interface section 5 has a selection section 5a for selecting information including the type of the medium sheet 2 and conditions for counting the number of colonies. For example, the operator selects the type of the medium sheet 2 and selects conditions for counting the number of colonies in the selected type of medium sheet 2 using the selection unit 5a. Here, the type of medium sheet 2 is the type of microorganisms cultured on the medium sheet 2 . The counting condition is a condition for designating which colonies in the medium sheet 2 are to be counted. More specifically, only colonies of a specific color in the medium sheet 2 are counted, or colonies of all colors are counted.

制御部６は、コロニー検出システム１内の各部を制御するとともに、コロニーカウント部８でカウントしたコロニーの数を表示部９に表示する制御を行う。 The control unit 6 controls each unit in the colony detection system 1 and controls the display unit 9 to display the number of colonies counted by the colony counting unit 8 .

画像認識部７は、撮像部３で撮像された培地シート２の撮像画像に対して画像認識を行って、コロニーの検出を行う。また、画像認識部７は、必要に応じて、撮像画像から検体の識別コード等を自動認識する処理を行ってもよい。 The image recognition unit 7 performs image recognition on the captured image of the culture medium sheet 2 captured by the imaging unit 3 to detect colonies. In addition, the image recognition unit 7 may perform processing for automatically recognizing an identification code or the like of the specimen from the captured image, if necessary.

コロニーカウント部８は、培地シート２の撮像画像に含まれるコロニーの数をカウントする。コロニーカウント部８は、第１情報検出部８ａと、第１コロニーカウント部８ｂと、コード情報生成部８ｃと、画像更新部８ｄと、第２情報検出部８ｅと、第２コロニーカウント部８ｆとを有する。 A colony counting unit 8 counts the number of colonies included in the captured image of the culture medium sheet 2 . The colony counting section 8 includes a first information detecting section 8a, a first colony counting section 8b, a code information generating section 8c, an image updating section 8d, a second information detecting section 8e, and a second colony counting section 8f. have

第１情報検出部８ａは、撮像部３で撮像された画像に含まれる培地シート２の種類を示すコード情報を検出する。コード情報は、後述するように、例えばＱＲコード（登録商標）である。 The first information detection section 8 a detects code information indicating the type of the culture medium sheet 2 included in the image captured by the imaging section 3 . The code information is, for example, a QR code (registered trademark) as described later.

第１及び第２コロニーカウント部８ｂ、８ｆは、撮像部３で撮像された画像に対して、選択部５ａで選択された培地シート２の種類に応じた処理を行って、培地シート２で培養されたコロニーの数をカウントする。 The first and second colony counting units 8b and 8f process the image captured by the imaging unit 3 according to the type of the culture medium sheet 2 selected by the selection unit 5a, and culture the colony on the culture medium sheet 2. Count the number of infected colonies.

第１コロニーカウント部８ｂは、撮像部３で撮像された画像に対して、選択部５ａで選択された情報と、第１情報検出部８ａで検出されたコード情報と、に応じた処理を行って、培地シート２で培養されたコロニーの数をカウントする。 The first colony counting section 8b performs processing on the image captured by the imaging section 3 according to the information selected by the selecting section 5a and the code information detected by the first information detecting section 8a. to count the number of colonies cultured on the medium sheet 2.

コード情報生成部８ｃは、選択部５ａで選択された情報と第１情報検出部８ａで検出されたコード情報との少なくとも一方に基づいて、新たなコード情報を生成する。新たなコード情報は例えばＱＲコード（登録商標）である。新たなコード情報は、元々培地シート２に設けられていたコード情報とは、カウント対象のコロニーの種類とコロニーの色との少なくとも一方に関する情報が異なっている。具体的な一例としては、元々培地シート２に設けられていたコード情報と新たなコード情報とのいずれか一方は、培地シート２上の全コロニーの数をカウントすることを指示する情報であり、他方は、培地シート２上の特定の色のコロニーの数をカウントすることを指示する情報である。 The code information generator 8c generates new code information based on at least one of the information selected by the selector 5a and the code information detected by the first information detector 8a. The new code information is, for example, a QR code (registered trademark). The new code information is different from the code information originally provided on the culture medium sheet 2 in at least one of the colony type and colony color to be counted. As a specific example, one of the code information originally provided on the medium sheet 2 and the new code information is information instructing to count the number of all colonies on the medium sheet 2, The other is information instructing to count the number of colonies of a specific color on the medium sheet 2 .

画像更新部８ｄは、撮像部３で撮像された画像に含まれるコード情報を新たなコード情報に更新した新たな培地画像を生成する。 The image updating unit 8d generates a new culture medium image by updating the code information included in the image captured by the imaging unit 3 with new code information.

第２情報検出部８ｅは、新たな培地画像に含まれる新たなコード情報を検出する。第２コロニーカウント部８ｆは、新たな培地画像に対して、選択部５ａで選択された情報と、第２情報検出部８ｅで検出されたコード情報と、に応じた処理を行って、培地シート２で培養されたコロニーの数をカウントする。 The second information detection unit 8e detects new code information included in the new culture medium image. The second colony counting unit 8f performs processing on the new culture medium image according to the information selected by the selection unit 5a and the code information detected by the second information detection unit 8e to obtain a culture medium sheet. Count the number of colonies cultured in 2.

図３は表示部９の画面の表示例を示す図である。図３の画面には、第１表示領域３１と、第２表示領域３２と、第３表示領域３３とが設けられている。 FIG. 3 is a diagram showing a display example of the screen of the display unit 9. As shown in FIG. A first display area 31, a second display area 32, and a third display area 33 are provided on the screen of FIG.

第１表示領域３１には、撮像部３で撮像された画像に関する種々の情報が表示されている。例えば、第１表示領域３１には、撮像部３で撮像を行った読取日時を入力する欄３１ａと、培地シート２で培養を開始した日である検査日を入力する欄３１ｂと、培地シート２の種類（培地）を入力する欄３１ｃと、培地シート２のシリアル番号（Ｓ／Ｎ）を入力する欄３１ｄと、中間処理データのファイル名（設定ファイル）を入力する欄３１ｅと、カウントされたコロニー数を入力する欄３１ｆと、コメント欄３１ｇと、登録ボタン３１ｈなどが設けられている。第１表示領域３１に表示される各種の情報は、図３に限定されない。 Various information about the image captured by the imaging unit 3 is displayed in the first display area 31 . For example, the first display area 31 includes a field 31a for inputting the reading date and time when the image was captured by the imaging unit 3, a field 31b for inputting the examination date which is the day when the culture was started on the culture medium sheet 2, and the culture medium sheet 2. A column 31c for entering the type (medium) of the medium sheet 2, a column 31d for entering the serial number (S/N) of the medium sheet 2, a column 31e for entering the file name (setting file) of the intermediate processing data, and the counted A field 31f for inputting the number of colonies, a comment field 31g, a registration button 31h, and the like are provided. Various types of information displayed in the first display area 31 are not limited to those shown in FIG.

図３の培地シート２には、その基材層１１に培地シート２のシリアル番号を表すＱＲコード１５が印刷されている。したがって、撮像部３で撮像された画像からＱＲコード１５を抽出して画像認識を行うことで、ＱＲコード１５に対応するシリアル番号を第１表示領域３１内のＳ／Ｎの欄に自動入力することができる。 A QR code 15 indicating the serial number of the medium sheet 2 is printed on the base layer 11 of the medium sheet 2 in FIG. Therefore, by extracting the QR code 15 from the image captured by the imaging unit 3 and performing image recognition, the serial number corresponding to the QR code 15 is automatically entered in the S/N column in the first display area 31. be able to.

コメント欄３１ｇには、培地シート２に滴下した検体の情報などが入力される。コメント欄３１ｇには、キーボードのユーザインタフェース部５を介して、作業者が直接、種々の情報を入力することができる。また、培地シート２に、検体を特定するバーコード２ａなどの識別コードが設けられている場合は、撮像画像から識別コードを抽出して画像認識により、コメント欄３１ｇに検体の識別コードを自動入力し、また培地シート２に識別コードの代わりに文字情報が設けられている場合は、ＯＣＲ（Optical Character Recognition）機能を利用して自動読み取りを行った文字情報をコメント欄３１ｇに自動入力してもよい。ここで、検体の識別コードとは、例えば、ある食品の製品コードである。以下では、検体の識別コードを製品コードと呼ぶこともある。 Information about the sample dropped onto the culture medium sheet 2 is entered in the comment column 31g. The operator can directly input various information into the comment field 31g via the user interface section 5 of the keyboard. In addition, when the medium sheet 2 is provided with an identification code such as a bar code 2a for identifying the specimen, the identification code is extracted from the captured image and image recognition is performed to automatically input the identification code of the specimen in the comment field 31g. However, if the medium sheet 2 is provided with character information instead of the identification code, even if the character information automatically read using the OCR (Optical Character Recognition) function is automatically entered in the comment column 31g. good. Here, the specimen identification code is, for example, the product code of a certain food. In the following, the specimen identification code is also called a product code.

第２表示領域３２には、撮像部３で撮像された画像そのものが表示される。第３表示領域３３には、第２表示領域３２の撮像画像からコロニーを自動検出して、検出されたコロニーを枠で囲んだ画像が表示される。図３の例では、第３表示領域３３内に８個の枠があるため、第１表示領域３１内のコロニー数は８となる。 In the second display area 32, the image itself captured by the imaging section 3 is displayed. In the third display area 33, colonies are automatically detected from the captured image of the second display area 32, and an image surrounding the detected colonies with a frame is displayed. In the example of FIG. 3, since there are eight frames in the third display area 33, the number of colonies in the first display area 31 is eight.

図１に示したコロニー検出システム１は、一つ以上のハードウェア機器により構成可能である。具体的な一例としては、撮像部３と画像認識部７は光学スキャナで構成し、第１及び第２コロニーカウント部８ｂ、８ｆ、制御部６、及びユーザインタフェース部５はパーソナルコンピュータ（以下、ＰＣ）またはサーバ装置で構成してもよい。一台のＰＣまたはサーバ装置で構成する代わりに、ネットワーク接続された複数のＰＣまたはサーバ装置で構成してもよい。 The colony detection system 1 shown in FIG. 1 can be configured with one or more hardware devices. As a specific example, the imaging unit 3 and the image recognition unit 7 are configured by an optical scanner, and the first and second colony counting units 8b and 8f, the control unit 6, and the user interface unit 5 are a personal computer (hereinafter referred to as PC ) or a server device. Instead of using a single PC or server device, a plurality of network-connected PCs or server devices may be used.

図４は本実施形態によるコロニー検出システム１の概略の処理動作を示すフローチャートである。まず、検査作業者は、微生物の混入を検査する対象となる検体を所定の希釈液を用いて所定の希釈倍率で希釈する（ステップＳ１）。次に、検査作業者は、検査したい微生物の種類に応じた培地シート２上に、希釈した検体を含む液体を滴下して、予め定めた培養時間だけ微生物の培養を行う（ステップＳ２）。同一の検体について、異なる複数種類の微生物の混入を検査したい場合は、複数種類の培地シート２を用意して、上述したステップＳ１とＳ２の処理を繰り返す。 FIG. 4 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system 1 according to this embodiment. First, an inspection operator dilutes a sample to be inspected for microbial contamination with a predetermined diluent at a predetermined dilution ratio (step S1). Next, the inspection operator drips a liquid containing a diluted specimen onto the medium sheet 2 corresponding to the type of microorganism to be inspected, and cultures the microorganism for a predetermined incubation time (step S2). If it is desired to inspect the same specimen for contamination with different types of microorganisms, prepare a plurality of types of medium sheets 2 and repeat the above-described steps S1 and S2.

予め定めた培養時間が経過するまで待機し（ステップＳ３）、培養時間が経過すると、取込作業者は、培養済の培地シート２を撮像部３にて撮像する（ステップＳ４）。制御部６は、撮像画像を表示部９に表示し、画像認識部７は、撮像画像に製品コードのバーコード等がある場合には、画像認識により検体の製品コードを特定して、コメント欄３１ｇに自動入力する（ステップＳ５）。培地シート２に検体の製品コードがない場合は、取込作業者がユーザインタフェース部５を介して、製品コード等を入力してもよい。また、製品コード以外の任意の情報を、取込作業者がユーザインタフェース部５を介してコメント欄３１ｇに入力してもよい。 Waiting until a predetermined culture time elapses (step S3), and when the culture time elapses, the take-in operator takes an image of the cultured medium sheet 2 with the imaging unit 3 (step S4). The control unit 6 displays the captured image on the display unit 9, and the image recognition unit 7 identifies the product code of the specimen by image recognition when the captured image includes a bar code of the product code, etc., and displays the comment column. 31g (step S5). If the medium sheet 2 does not have the product code of the sample, the take-in operator may input the product code or the like via the user interface unit 5 . Also, any information other than the product code may be input to the comment field 31g by the importer via the user interface unit 5. FIG.

培養時間は、必ずしもすべての種類の培地シート２で同じとは限らない。同一の検体について、複数種類の培地シート２で培養を行う場合、各培地シート２ごとに定められた培養時間が経過した後に、上述したステップＳ４とＳ５の処理を行う必要がある。 Culture time is not necessarily the same for all types of medium sheets 2 . When culturing the same specimen on a plurality of types of medium sheets 2, the above-described steps S4 and S5 need to be performed after the culture time determined for each medium sheet 2 has elapsed.

次に、画像認識部７は、培地シート２の撮像画像に含まれるコロニーを自動認識して、図３の第３表示領域３３のように、各コロニーに枠３３ａを配置する（ステップＳ６）。
次に、第１及び第２コロニーカウント部８ｂ、８ｆは、枠３３ａの数をカウントしてコロニー数をカウントする（ステップＳ７）。 Next, the image recognition unit 7 automatically recognizes the colonies contained in the captured image of the culture medium sheet 2, and arranges a frame 33a for each colony like the third display area 33 in FIG. 3 (step S6).
Next, the first and second colony counting units 8b and 8f count the number of frames 33a to count the number of colonies (step S7).

本実施形態による第１及び第２コロニーカウント部８ｂ、８ｆがコロニー数のカウントを行うことができる培地シート２の種類は、例えば、ＡＣ、ＣＣ、ＥＣ、ＳＡ、ＹＭ、ＥＢ、ＬＢ、ＳＬ、ＬＳＭ、ＡＣＲ、ＨＥＴ、ＶＰなどである。ＡＣは一般生菌測定用培地、ＣＣは大腸菌群測定用培地、ＥＣは大腸菌及び大腸菌群測定用培地、ＳＡは黄色ブドウ球菌測定用培地、ＹＭはカビ・酵母測定用培地、ＥＢは腸内細菌科菌群測定用培地、ＬＢは乳酸菌測定用培地、ＳＬはサルモネラ測定用培地、ＬＳＭはリステリアモノサイトゲネス測定用培地、ＡＣＲは一般生菌測定用迅速培地、ＨＥＴは従属栄養細菌測定用培地、ＶＰは腸炎ビブリオ測定用培地である。 The types of medium sheets 2 that can be counted by the first and second colony counting units 8b and 8f according to the present embodiment are, for example, AC, CC, EC, SA, YM, EB, LB, SL, LSM, ACR, HET, VP, etc. AC is a medium for measuring general viable bacteria, CC is a medium for measuring coliforms, EC is a medium for measuring E. coli and coliforms, SA is a medium for measuring Staphylococcus aureus, YM is a medium for measuring molds and yeasts, EB is enterobacteria LB is a medium for measuring lactic acid bacteria, SL is a medium for measuring Salmonella, LSM is a medium for measuring Listeria monocytogenes, ACR is a rapid medium for measuring general viable bacteria, HET is a medium for measuring heterotrophic bacteria, VP is a medium for measuring Vibrio parahaemolyticus.

一部の培地シート２は、複数種類の微生物の培養を行うことができ、各微生物のコロニーが同一の培地シート２内でそれぞれ異なる色を呈することがある。この場合、コロニーの各色ごとに微生物の種類が異なるため、各色ごとにコロニーの数をカウントすれば、複数種類の微生物のコロニー数を個別に検出できる。 Some medium sheets 2 are capable of culturing multiple types of microorganisms, and the colonies of each microorganism may exhibit different colors within the same medium sheet 2 . In this case, since the types of microorganisms differ for each color of the colonies, the number of colonies of multiple types of microorganisms can be individually detected by counting the number of colonies for each color.

そこで、本実施形態によるコロニー検出システム１は、同一の培地シート２内で培養されたコロニーの色を判別して、各色ごとにコロニーの数をカウントできるようにしている。以下では、ＥＣについて、培地シート２内のコロニーの色を識別して、色別にコロニー数をカウントする処理手順を説明する。 Therefore, the colony detection system 1 according to the present embodiment distinguishes the colors of colonies cultured in the same medium sheet 2 and counts the number of colonies for each color. Below, a processing procedure for identifying the color of colonies in the medium sheet 2 and counting the number of colonies for each color will be described for EC.

従前のコロニー検出システム１では、培地シート２内のコロニーを単色として扱ってコロニー数を検出していた。従前の処理に近い処理手順にて、ＥＣの培地シート２内のコロニーを色別にカウントする処理を、以下では、ＥＣ暫定処理と呼ぶ。 In the conventional colony detection system 1, colonies in the medium sheet 2 were treated as monochromatic to detect the number of colonies. The process of counting the colonies in the EC medium sheet 2 by color in a process procedure similar to the conventional process is hereinafter referred to as EC provisional process.

作業者は、ＰＣにて、コロニー検出システム１を起動させて、ＥＣ暫定処理を行うべき培地シート２を撮像部３で撮像して、撮像画像を表示部９に表示させる。図５はＥＣ暫定処理を行うべき培地シート２の撮像画像を表示部９の画面に表示させた例を示している。
ここで、作業者は、図５の画面内の培地種類を選択する欄３４で、「ＥＣ暫定」を選択する。ＥＣ暫定処理では、培地シート２内の全てのコロニー数をカウントするＥＣ処理と、培地シート２内の青系統のコロニー数のみをカウントするＣＣ処理とを行う。 The operator activates the colony detection system 1 on the PC, captures an image of the culture medium sheet 2 to be subjected to EC provisional processing with the imaging unit 3 , and displays the captured image on the display unit 9 . FIG. 5 shows an example in which a picked-up image of the culture medium sheet 2 to be subjected to EC provisional processing is displayed on the screen of the display unit 9. As shown in FIG.
Here, the operator selects "EC provisional" in the column 34 for selecting the type of culture medium in the screen of FIG. In the EC provisional treatment, EC treatment for counting all colonies in the medium sheet 2 and CC treatment for counting only the number of blue colonies in the medium sheet 2 are performed.

本実施形態によるコロニー検出システム１では、作業者が図５の欄３４で「ＥＣ暫定」を選択すると、その選択情報は、選択部５ａを介して制御部６に送られる。図６は作業者が「ＥＣ暫定」を選択した場合の制御部６の処理動作を示すフローチャートである。 In the colony detection system 1 according to this embodiment, when the operator selects "EC provisional" in the column 34 of FIG. 5, the selection information is sent to the control unit 6 via the selection unit 5a. FIG. 6 is a flow chart showing the processing operation of the control unit 6 when the operator selects "EC provisional".

まず、制御部６は、第１コロニーカウント部８ｂに対してＥＣ処理を行うよう指示する（ステップＳ１１）。ステップＳ１１の処理に前後して、制御部６は、コード情報生成部８ｃに対して新たなコード情報の生成を指示する（ステップＳ１２）。ＥＣ暫定処理を行うべき培地シート２上のＱＲコードには、培地シート２の種類を識別する情報が含まれており、この情報は具体的には、大腸菌及び大腸菌群測定用培地を示すＥＣである。このため、このままでは、培地シート２内の全てのコロニーのカウントを行うことになる。そこで、コード情報生成部８ｃは、大腸菌測定用培地を示すＣＣの情報を含むＱＲコードを新たに生成する。 First, the control unit 6 instructs the first colony counting unit 8b to perform EC processing (step S11). Before or after the process of step S11, the control section 6 instructs the code information generating section 8c to generate new code information (step S12). The QR code on the medium sheet 2 to be subjected to EC provisional treatment contains information identifying the type of the medium sheet 2. Specifically, this information is an EC indicating the medium for measuring E. coli and coliforms. be. Therefore, all colonies in the medium sheet 2 will be counted in this state. Therefore, the code information generation unit 8c newly generates a QR code including CC information indicating the culture medium for E. coli measurement.

次に、制御部６は、画像更新部８ｄに対して、新たなＱＲコードを含む新たな培地シート２の画像（以下、培地画像）を生成するよう指示する（ステップＳ１３）。画像更新部８ｄは、撮像画像中のＱＲコードを、コード生成部が生成した新たなＱＲコードに置換する画像処理を行う。 Next, the control unit 6 instructs the image updating unit 8d to generate a new image of the culture medium sheet 2 including the new QR code (hereinafter referred to as culture medium image) (step S13). The image update unit 8d performs image processing to replace the QR code in the captured image with a new QR code generated by the code generation unit.

次に、制御部６は、画像更新部８ｄが生成した培地画像を第２コロニーカウント部８ｆに送信して、ＣＣ処理を行うよう指示する（ステップＳ１４）。 Next, the control unit 6 transmits the culture medium image generated by the image updating unit 8d to the second colony counting unit 8f, and instructs it to perform CC processing (step S14).

図７は第１コロニーカウント部８ｂの処理動作の一例を示すフローチャートである。まず、培地シート２の撮像画像中のＱＲコードが「ＥＣ」であるか否かを判定し（ステップＳ２１）、「ＥＣ」でなければエラー処理を行う（ステップＳ２２）。この場合、コロニーカウントを行わずに図７の処理を終了する。エラー処理の具体的内容は問わないが、例えば、表示部９の画面に培地種類が一致しない旨の表示を行う。 FIG. 7 is a flow chart showing an example of the processing operation of the first colony counting section 8b. First, it is determined whether or not the QR code in the captured image of the medium sheet 2 is "EC" (step S21), and if not "EC", error processing is performed (step S22). In this case, the process of FIG. 7 ends without colony counting. Although the specific contents of the error processing are not limited, for example, a message indicating that the culture medium types do not match is displayed on the screen of the display unit 9 .

ステップＳ２１で「ＥＣ」であると判定されると、マスク処理を行う（ステップＳ２３）。ここでは、培地シート２の撮像画像に含まれる培地エリア以外の画像を除去して、培地エリア内の画像を抽出する。 If it is determined to be "EC" in step S21, mask processing is performed (step S23). Here, images other than the culture medium area included in the captured image of the culture medium sheet 2 are removed to extract the image within the culture medium area.

次に、検出難易度判定処理を行う（ステップＳ２４）。ここでは、培地エリア内の画像からコロニーを検出する難易度を判定し、難易度が所定の値を超えていれば、所定の警告処理を行う。ここでは、青系統及び赤系統のコロニーを検出する難易度を判定する。 Next, detection difficulty level determination processing is performed (step S24). Here, the degree of difficulty of colony detection is determined from the image in the culture medium area, and if the degree of difficulty exceeds a predetermined value, predetermined warning processing is performed. Here, the degree of difficulty in detecting blue and red colonies is determined.

次に、コロニー検出処理を行う（ステップＳ２５）。ここでは、培地シート２の背景色との相違度合いが所定の値以上のコロニーを検出する。より具体的には、青系統及び赤系統のコロニーを中心的に検出する。ＥＣ用の培地シート２では、大腸菌のコロニーは青系統であり、大腸菌群のコロニーは赤系統である。ＥＣ処理では、大腸菌と大腸菌群の両方のコロニー数をカウントすることを意図しているため、コロニー検出処理では、青系統及び赤系統のコロニーを検出する。 Next, colony detection processing is performed (step S25). Here, colonies whose degree of difference from the background color of the medium sheet 2 is greater than or equal to a predetermined value are detected. More specifically, colonies of blue and red strains are mainly detected. In the medium sheet 2 for EC, colonies of E. coli are of blue lineage, and colonies of coliform bacteria are of red lineage. Since the EC process is intended to count the number of colonies of both E. coli and coliforms, the colony detection process detects blue and red colonies.

次に、ノイズ除去を行う（ステップＳ２６）。ここでは、コロニー検出処理にて検出されたコロニーのうち、異物や着色等のノイズと考えられるコロニーを除去する。より詳細には、ステップＳ１４のノイズ除去では、主に緑系統のコロニーをノイズとして除去する。 Next, noise removal is performed (step S26). Here, among the colonies detected by the colony detection process, colonies considered to be noise such as foreign matter and coloring are removed. More specifically, in the noise removal in step S14, mainly green colonies are removed as noise.

次に、培地シート２内のコロニー同士の境界を検出する（ステップＳ２７）。ここでは、近接するコロニー同士の境界が曖昧な場合に、別個のコロニーか、一つのコロニーかを判別して、各コロニーの境界を画定する。 Next, boundaries between colonies in the medium sheet 2 are detected (step S27). Here, when the borders between adjacent colonies are ambiguous, the borders of each colony are demarcated by distinguishing between individual colonies and one colony.

次に、コロニー数のカウントを行う（ステップＳ２８）。ステップＳ２５のコロニー検出処理では、青系統及び赤系統のコロニーを検出しているため、ステップＳ２８では、青系統及び赤系統のコロニーを合わせた全てのコロニーの数をカウントすることになる。 Next, the number of colonies is counted (step S28). Since blue and red colonies are detected in the colony detection process in step S25, the total number of blue and red colonies is counted in step S28.

図８は第２コロニーカウント部８ｆの処理動作の一例を示すフローチャートである。まず、画像更新部８ｄが生成した培地画像中のＱＲコードが「ＣＣ」であるか否かを判定し（ステップＳ３１）、「ＣＣ」でなければエラー処理を行って（ステップＳ３２）。図８の処理を終了する。 FIG. 8 is a flow chart showing an example of the processing operation of the second colony counting section 8f. First, it is determined whether or not the QR code in the medium image generated by the image updating unit 8d is "CC" (step S31), and if not "CC", error processing is performed (step S32). The process of FIG. 8 ends.

ステップＳ３１で「ＣＣ」であると判定されると、マスク処理を行う（ステップＳ３３）。ここでは、図７のステップＳ２２と同様の処理を行う。次に、検出難易度判定処理を行う（ステップＳ３４）。ここでは、青系統のコロニーの検出難易度を判定する。次に、コロニー検出処理を行う（ステップＳ３５）。ここでは、青系統のみのコロニーを検出する。ＣＣ処理では、大腸菌のコロニー数のみをカウントすることを意図しているため、コロニー検出処理では、青系統のみのコロニーを検出する。 If it is determined to be "CC" in step S31, mask processing is performed (step S33). Here, the same processing as in step S22 in FIG. 7 is performed. Next, detection difficulty level determination processing is performed (step S34). Here, the degree of difficulty in detecting blue colonies is determined. Next, colony detection processing is performed (step S35). Here, colonies of only the blue lineage are detected. Since the CC treatment is intended to count only the number of E. coli colonies, the colony detection treatment detects colonies of only the blue lineage.

次に、ノイズ処理を行う（ステップＳ３６）。ここでは、ＨＳＶ座標系の色相Ｈ成分の値に基づいてノイズ除去を行う。次に行われるコロニー境界検出処理は、図７のステップＳ２６と同様である（ステップＳ３７）。次に行われるコロニーカウント処理は、ステップＳ３４で青系統のみのコロニーを検出しているため、青系統のコロニー数をカウントすることになる（ステップＳ３８）。 Next, noise processing is performed (step S36). Here, noise removal is performed based on the value of the hue H component in the HSV coordinate system. The next colony boundary detection process is the same as step S26 in FIG. 7 (step S37). In the subsequent colony counting process, since only blue colonies are detected in step S34, the number of blue colonies is counted (step S38).

図７と図８の処理により、ＥＣ用の培地シート２内の全てのコロニー数と、青系統のコロニー数とをカウントできる。ＥＣ用の培地シート２では、大腸菌のコロニーが存在するか否かが最も重要であるが、大腸菌と大腸菌群のコロニーの総数を把握したい場合もある。本実施形態によるＥＣ暫定処理では、大腸菌と大腸菌群のコロニーの総数と、大腸菌のコロニー数とをカウントできるため、両者の差分を取ることで、大腸菌群のコロニー数も推測可能となる。 7 and 8, the number of all colonies in the EC medium sheet 2 and the number of blue colonies can be counted. In the medium sheet 2 for EC, the presence or absence of colonies of E. coli is most important, but there are cases where it is desired to know the total number of colonies of E. coli and coliforms. In the EC provisional processing according to the present embodiment, the total number of colonies of E. coli and coliform bacteria and the number of E. coli colonies can be counted.

上述した説明では、大腸菌及び大腸菌群測定用培地を用いた例を説明したが、第１の実施形態によるコロニー検出システム１は、大腸菌及び大腸菌群測定用培地以外の培地シート２にも適用可能である。より具体的には、培地シート２内に複数色のコロニーが培養されている場合に、各色ごとに分別してコロニー数をカウントしたい場合に適用できる。 In the above description, an example using a medium for measuring E. coli and coliform bacteria was described, but the colony detection system 1 according to the first embodiment can also be applied to a medium sheet 2 other than a medium for measuring E. coli and coliform bacteria. be. More specifically, when colonies of a plurality of colors are cultured in the culture medium sheet 2, it can be applied to counting the number of colonies separately for each color.

このように、本実施形態では、作業者が「ＥＣ暫定」を選択すると、培地シート２上のＱＲコードに従って、第１コロニーカウント部８ｂにてＥＣ処理を行うとともに、培地シート２の撮像画像中のＱＲコードを書き換えた新たな培地画像を生成した上で、第２コロニーカウント部８ｆにてＣＣ処理を行う。これにより、作業者の手間を患わすことなく、ＥＣ処理とＣＣ処理を行うことができ、大腸菌及び大腸菌群を合わせたコロニーの総数と大腸菌のコロニー数とを別々に精度よくカウントできる。 Thus, in this embodiment, when the operator selects "EC provisional", EC processing is performed in the first colony counting unit 8b according to the QR code on the culture medium sheet 2, and the captured image of the culture medium sheet 2 After generating a new culture medium image by rewriting the QR code of , CC processing is performed in the second colony counting section 8f. As a result, the EC treatment and the CC treatment can be performed without bothering the operator, and the total number of colonies including E. coli and coliforms and the number of E. coli colonies can be counted separately with high accuracy.

（第２の実施形態）
培地シート２は、微生物の種類ごとに設けられており、食品工場等では、複数種類の微生物の検査を行うため、コロニー検出システム１では、複数種類の培地シート２が混在した大量の培地シート２を効率よく処理することが望まれている。以下に説明する第２～第５の実施形態によるコロニー検出システム１は、複数種類の培地シート２が混在した大量の培地シート２を効率よく処理することを念頭に置いたものである。より具体的には、第２～第５の実施形態では、撮像部３で撮像した画像を所定の条件で分類して複数の記憶部４に記憶するか、または撮像部３で撮像した画像のファイル名に、所定の条件に応じた識別子を付加して記憶部４に記憶する。所定の条件は、培地シート２の種類を含んでいてもよい。また、所定の条件は、撮像部３で撮像した画像に含まれるコロニーの数をカウント可能か否かを示す情報を含んでいてもよい。また、所定の条件は、培地シート２の検査条件を含んでいてもよい。 (Second embodiment)
The medium sheet 2 is provided for each type of microorganism, and in order to test a plurality of types of microorganisms in a food factory or the like, the colony detection system 1 provides a large amount of medium sheets 2 in which a plurality of types of medium sheets 2 are mixed. is desired to be processed efficiently. The colony detection system 1 according to the second to fifth embodiments described below is intended to efficiently process a large amount of medium sheets 2 in which a plurality of types of medium sheets 2 are mixed. More specifically, in the second to fifth embodiments, the images captured by the imaging unit 3 are classified according to predetermined conditions and stored in a plurality of storage units 4, or the images captured by the imaging unit 3 are stored. An identifier corresponding to a predetermined condition is added to the file name and stored in the storage unit 4 . The predetermined condition may include the type of culture medium sheet 2 . Further, the predetermined condition may include information indicating whether or not the number of colonies included in the image captured by the imaging unit 3 can be counted. Moreover, the predetermined conditions may include inspection conditions for the culture medium sheet 2 .

図９は第２の実施形態によるコロニー検出システム１の概略構成を示す機能ブロック図である。図９のコロニー検出システム１は、図２に示した培地シート２と、撮像部３と、複数の記憶部４と、ユーザインタフェース部５と、制御部６と、画像認識部７と、コロニーカウント部８と、表示部９と、画像処理部１０とを備えている。 FIG. 9 is a functional block diagram showing a schematic configuration of the colony detection system 1 according to the second embodiment. The colony detection system 1 of FIG. 9 includes the culture medium sheet 2 shown in FIG. A unit 8 , a display unit 9 , and an image processing unit 10 are provided.

このように、図９のコロニー検出システム１は、複数の記憶部４を備えている点で、図１のコロニー検出システム１とは異なっている。複数の記憶部４は、物理的には一つの記憶装置内に収納されていてもよいし、複数の記憶部４がそれぞれ物理的に別個の記憶装置で構成されていてもよい。各記憶部４は、複数種類の培地シート２の種類ごとに設けられ、対応する培地シート２の撮像画像をそれぞれ記憶する。なお、撮像部３で撮像した画像のファイル名に、所定の条件に応じた識別子を付加して記憶部４に記憶する場合には、記憶部４は一つだけ設けらればよい。すなわち、必ずしも複数の記憶部４を設けなくてもよい。 Thus, the colony detection system 1 of FIG. 9 differs from the colony detection system 1 of FIG. 1 in that a plurality of storage units 4 are provided. The plurality of storage units 4 may be physically housed in one storage device, or the plurality of storage units 4 may be configured by physically separate storage devices. Each memory|storage part 4 is provided for every kind of the culture medium sheet 2 of multiple types, and memorize|stores the picked-up image of the corresponding culture medium sheet 2, respectively. Note that if an identifier corresponding to a predetermined condition is added to the file name of the image captured by the imaging unit 3 and stored in the storage unit 4, only one storage unit 4 may be provided. That is, it is not always necessary to provide a plurality of storage units 4 .

ユーザインタフェース部５は、作業者が各種の入力及び選択を行うものであり、選択部５ａを有する。選択部５ａは、培地シート２の種類及びコロニー数のカウントの条件を含む情報を選択する。 The user interface section 5 is for the operator to make various inputs and selections, and has a selection section 5a. The selection unit 5a selects information including the type of the medium sheet 2 and conditions for counting the number of colonies.

コロニーカウント部８は、複数の記憶部４に記憶された画像を、各記憶部４ごとに、対応する培地シート２の種類に応じた処理を行って、培地シート２で培養されたコロニーの数をカウントする。すなわち、コロニーカウント部８は、同一の記憶部４に記憶された画像に対して、選択部５ａで選択された情報に応じた共通の処理を行って、コロニーの数をカウントする。より詳細には、コロニーカウント部８は、一つの記憶部４に記憶されたすべての画像についてのコロニーの数のカウントが終わった後、次の記憶部４のカウント処理を行い、各記憶部４ごとに、各記憶部４に固有の条件によりコロニーの数をカウントする。 The colony counting unit 8 processes the images stored in the plurality of storage units 4 according to the type of the corresponding medium sheet 2 for each storage unit 4, and counts the number of colonies cultured on the medium sheet 2. to count. That is, the colony counting section 8 performs common processing according to the information selected by the selecting section 5a for the images stored in the same storage section 4, and counts the number of colonies. More specifically, after counting the number of colonies for all images stored in one storage unit 4, the colony counting unit 8 counts the next storage unit 4. For each, the number of colonies is counted according to conditions unique to each storage unit 4 .

画像処理部１０は、コロニーカウント部がコロニー数のカウント処理を行う前に、記憶部４に記憶された撮像画像に対して、何らかの画像処理を行う。画像処理の具体的な処理内容は任意であるが、例えば、撮像画像中のコロニーのエッジ強調処理やノイズ除去処理などを行ってもよい。なお、画像処理部１０はコロニー検出システム１における必須の構成部分ではないため、省略してもよい。 The image processing unit 10 performs some kind of image processing on the captured image stored in the storage unit 4 before the colony counting unit performs colony count processing. Although the specific processing content of the image processing is arbitrary, for example, colony edge enhancement processing and noise removal processing in the captured image may be performed. Note that the image processing unit 10 is not an essential component in the colony detection system 1, and therefore may be omitted.

図１０は、撮像部３で撮像された培地シート２の撮像画像を複数の記憶部４に分類して記憶する様子を模式的に示す図である。制御部６は、培地シート２の撮像画像中のＱＲコードを画像認識した結果に基づいて、撮像画像を複数の記憶部４のいずれかに格納する。
図１０の例では、記憶装置（例えば、ＨＤＤ）内に設けた複数のフォルダが複数の記憶部４に対応する。具体的なフォルダ分けは任意であるが、図１０の例では、ＡＣ用フォルダ４ａと、ＣＣ用フォルダ４ｂと、ＥＣ用フォルダ４ｃと、ＳＡ用フォルダ４ｄを設けている。 FIG. 10 is a diagram schematically showing how captured images of the culture medium sheet 2 captured by the imaging unit 3 are classified and stored in a plurality of storage units 4 . Based on the result of image recognition of the QR code in the captured image of the culture medium sheet 2 , the control unit 6 stores the captured image in one of the plurality of storage units 4 .
In the example of FIG. 10 , multiple folders provided in a storage device (eg, HDD) correspond to multiple storage units 4 . Although specific folder division is arbitrary, in the example of FIG. 10, an AC folder 4a, a CC folder 4b, an EC folder 4c, and an SA folder 4d are provided.

制御部６は、培地シート２の撮像画像中のＱＲコードに従って、各撮像画像をＡＣ用フォルダ４ａと、ＣＣ用フォルダ４ｂと、ＥＣ用フォルダ４ｃと、ＳＡ用フォルダ４ｄのいずれかに記憶する。これら４つのフォルダのいずれにも該当しない撮像画像をまとめて記憶する別個のフォルダを設けてもよい。 The control unit 6 stores each captured image in one of the AC folder 4a, the CC folder 4b, the EC folder 4c, and the SA folder 4d according to the QR code in the captured image of the culture medium sheet 2. A separate folder may be provided for collectively storing captured images that do not correspond to any of these four folders.

図１１は第２の実施形態によるコロニー検出システム１の概略的な処理動作を示すフローチャートである。このフローチャートは、複数種類の培地シート２が混在した大量の培地シート２のコロニーカウントを行う場合の処理動作を示している。 FIG. 11 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system 1 according to the second embodiment. This flow chart shows the processing operation when colony counting is performed on a large amount of medium sheets 2 in which a plurality of types of medium sheets 2 are mixed.

まず、大量の培地シート２を順に撮像部３にて撮像して撮像画像を生成する（ステップＳ４１）。次に、生成された撮像画像の画像認識を順に行って、ＱＲコードに記述された培地種類を検出する（ステップＳ４２）。次に、検出された培地種類に応じたフォルダに撮像画像を記憶する（ステップＳ４３）。次に、全ての培地シート２のフォルダ分けが終了したか否かを判定する（ステップＳ４４）。まだ、フォルダ分けしていない培地シート２が残存していれば、ステップＳ４１に戻り、全ての培地シート２のフォルダ分けが終了した場合は、複数のフォルダ４ａ～４ｄのうちの一つを選択して、そのフォルダ内の撮像画像に対して、そのフォルダに共通の条件にて培地シート２内のコロニーのカウントを行う（ステップＳ４５）。フォルダに共通の条件とは、例えば、培地シート２内の全コロニーのカウントを行うとか、培地シート２内の特定色のコロニーのカウントを行う等の条件である。 First, a large number of culture medium sheets 2 are sequentially imaged by the imaging unit 3 to generate a captured image (step S41). Next, image recognition of the generated captured images is performed in order to detect the medium type described in the QR code (step S42). Next, the captured image is stored in a folder corresponding to the detected culture medium type (step S43). Next, it is determined whether or not all the medium sheets 2 have been divided into folders (step S44). If there are still medium sheets 2 that have not been divided into folders, the process returns to step S41, and if all the medium sheets 2 have been divided into folders, one of the plurality of folders 4a to 4d is selected. Then, the colonies in the medium sheet 2 are counted under the conditions common to the folder for the captured images in the folder (step S45). The conditions common to folders are, for example, conditions such as counting all colonies in the medium sheet 2 or counting colonies of a specific color in the medium sheet 2 .

次に、全フォルダのコロニーカウントは終了したか否かを判定し（ステップＳ４６）、まだ終了していなければ、各フォルダごとにステップＳ４５以降の処理を繰り返し、全てのフォルダについてコロニー数のカウントが終了すれば、図１１の処理を終了する。 Next, it is determined whether or not the colony count for all folders has been completed (step S46). If not, the processing from step S45 onward is repeated for each folder, and the colony count for all folders is completed. When finished, the process of FIG. 11 ends.

フォルダによっては、複数種類のコロニー数のカウント処理を行ってもよい。例えば、ＥＣ用フォルダ４ｃでは、大腸菌と大腸菌群を合わせたコロニー数のカウントと、大腸菌のみのコロニー数のカウントと、大腸菌群のみのコロニー数のカウントとの少なくとも２つを行ってもい。同様に、ＳＡ用フォルダ４ｄでは、黄色ブドウ球菌と偽陽性菌等を合わせたコロニー数のカウントと、黄色ブドウ球菌を表す青系統のみのコロニー数のカウントと、偽陽性菌等を表す赤系統のみのコロニー数のカウントとの少なくとも２つを行ってもよい。 Depending on the folder, multiple types of colony count processing may be performed. For example, in the EC folder 4c, at least two of the total colony count of E. coli and coliform bacteria, the colony count of only E. coli, and the colony count of only coliform bacteria may be performed. Similarly, in the SA folder 4d, the number of colonies combined with Staphylococcus aureus and false positive bacteria, etc., the number of colonies of only the blue system representing Staphylococcus aureus, and the number of colonies representing only the red system representing false positive bacteria etc. At least two colony counts may be performed.

図１１では、培地シート２の撮像画像を培地種類ごとに別フォルダに分類して記憶する例を説明したが、培地シート２の撮像画像のファイル名に培地種類を識別可能な識別子を付記してから記憶してもよい。この場合、各撮像画像を一つの記憶部４にまとめて記憶してもよい。これにより、ファイル名で各撮像画像の培地種類を特定できるため、フォルダ分けを行わなくても、各撮像画像ごとに、培地種類に応じたコロニー数のカウントを行うことができる。 In FIG. 11, an example in which captured images of the culture medium sheet 2 are classified and stored in separate folders for each culture medium type has been described. may be stored from In this case, each captured image may be collectively stored in one storage unit 4 . As a result, since the medium type of each captured image can be identified by the file name, the number of colonies corresponding to the medium type can be counted for each captured image without folder division.

このように、第２の実施形態では、撮像部３で撮像した培地シート２の撮像画像を、画像認識したＱＲコードに含まれる培地種類に従って複数の記憶部４に分類して記憶するか、あるいは各撮像画像のファイル名に培地種類を識別可能な識別子を付記して記憶部４に記憶し、各記憶部４に固有の条件にて、あるいはファイル名に同一の識別子を持つ撮像画像ごとに、コロニー数をカウントする処理を連続的に行う。これにより、撮像部３で培地シート２を撮像する前に、作業者が手作業で培地種類ごとに培地シート２を分類しなくて済むとともに、培地シート２ごとにコロニー数のカウントの条件を作業者が指定しなくてよいため、作業者の手間を省くことができる。したがって、本実施形態によれば、記憶部４に記憶された大量の培地シート２のコロニー数のカウントを短時間で効率よく行うことができる。 Thus, in the second embodiment, the captured image of the culture medium sheet 2 captured by the imaging unit 3 is classified and stored in a plurality of storage units 4 according to the culture medium type included in the image-recognized QR code, or An identifier that can identify the medium type is added to the file name of each captured image and stored in the storage unit 4, and under conditions unique to each storage unit 4 or for each captured image having the same identifier in the file name, The process of counting the number of colonies is performed continuously. As a result, the operator does not have to manually sort the culture medium sheets 2 by culture medium type before imaging the culture medium sheets 2 with the imaging unit 3, and the conditions for counting the number of colonies for each culture medium sheet 2 are set. Since there is no need for the operator to specify, it is possible to save the labor of the operator. Therefore, according to the present embodiment, it is possible to efficiently count the number of colonies on a large amount of medium sheets 2 stored in the storage unit 4 in a short time.

（第３の実施形態）
第３の実施形態は、培地シート２の撮像画像に基づいて、コロニー数の検出難易度を判定するものである。第３の実施形態によるコロニー検出システム１は、図９と同様の機能ブロック図で表すことができるが、記憶部４に記憶される撮像画像の種類が第２の実施形態とは異なる。 (Third embodiment)
3rd Embodiment determines the detection difficulty of a colony number based on the captured image of the culture medium sheet 2. FIG. The colony detection system 1 according to the third embodiment can be represented by a functional block diagram similar to that of FIG. 9, but the types of captured images stored in the storage unit 4 are different from those of the second embodiment.

第３の実施形態による制御部６は、培地シート２の撮像画像に基づいて、コロニー数の検出難易度が高いか否かを判定し、検出難易度が高いと判定された撮像画像と、検出難易度が高くないと判定された撮像画像とをそれぞれ別個の記憶部４に記憶する。 The control unit 6 according to the third embodiment determines whether the difficulty of detecting the number of colonies is high based on the captured image of the culture medium sheet 2, and the captured image determined to be difficult to detect. The captured images determined as not having a high degree of difficulty are stored in separate storage units 4, respectively.

図１２は第３の実施形態によるコロニー検出システム１の概略的な処理動作を示すフローチャートである。培地シート２を順に撮像し（ステップＳ５１）、撮像画像に含まれるコロニーを正しく識別できず、コロニー数のカウントが不可であるか、すなわち検出難易度が高いか否かを判定する（ステップＳ５２）。例えば、コロニーの色が培地媒体の色と類似していて、コロニーを正しく識別できない場合は、ステップＳ５２ではカウント不可、すなわち検出難易度が高いと判定される。検出難易度が高い場合、その撮像画像を専用の記憶部４（例えば、専用のフォルダ）に記憶する（ステップＳ５３）。 FIG. 12 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system 1 according to the third embodiment. The medium sheet 2 is sequentially imaged (step S51), and it is determined whether the colonies contained in the captured image cannot be correctly identified and the number of colonies cannot be counted, that is, whether the detection difficulty is high (step S52). . For example, if the color of the colony is similar to the color of the culture medium and the colony cannot be correctly identified, it is determined in step S52 that the colony cannot be counted, that is, the difficulty of detection is high. If the detection difficulty is high, the captured image is stored in the dedicated storage unit 4 (for example, a dedicated folder) (step S53).

ステップＳ５２でカウント可能、すなわち検出難易度が低いと判定された場合、その撮像画像を専用の記憶部４とは異なる別の記憶部４（例えば、通常フォルダ）に記憶する（ステップＳ５４）。 If it is determined in step S52 that the count is possible, that is, the detection difficulty is low, the captured image is stored in another storage unit 4 (for example, a normal folder) different from the dedicated storage unit 4 (step S54).

ステップＳ５３またはＳ５４の処理が終わると、図１１のステップＳ４４～Ｓ４６と同様に、全培地シート２のフォルダ分けが終了した後に、各フォルダごとに各フォルダ固有の条件にて、各フォルダ内の各培地シート２のコロニー数のカウントを行う（ステップＳ５５～Ｓ５７）。コロニーの検出難易度の高い培地シート２が記憶される専用フォルダ内の各撮像画像のコロニー数のカウントを行う際には、通常フォルダとは異なるパラメータを設定してコロニー数のカウント処理を行う。ここで、パラメータとは、図８に示したステップＳ３３～Ｓ３８の各処理を行う際に用いる閾値などである。 When the process of step S53 or S54 is completed, similarly to steps S44 to S46 of FIG. The number of colonies on the medium sheet 2 is counted (steps S55 to S57). When counting the number of colonies of each captured image in the dedicated folder storing medium sheets 2 having a high degree of colony detection difficulty, the colony number counting process is performed by setting parameters different from those in the normal folder. Here, the parameter is a threshold or the like used when performing each process of steps S33 to S38 shown in FIG.

図１２では、培地シート２の撮像画像におけるコロニーの検出難易度が高いか否かでフォルダ分けを行う例を説明したが、検出難易度が高いか否かを示す識別子を、各撮像画像のファイル名に付記してから記憶してもよい。この場合、各撮像画像を一つの記憶部４にまとめて記憶すればよい。これにより、ファイル名で検出難易度を判断できるため、フォルダ分けを行わなくても、各撮像画像ごとに、検出難易度が高いか否かを判断した上で、コロニー数のカウントを行うことができる。 FIG. 12 illustrates an example in which folders are divided according to whether the colony detection difficulty level in the captured image of the culture medium sheet 2 is high. You can add it to your name and then memorize it. In this case, the captured images may be collectively stored in one storage unit 4 . As a result, it is possible to determine the degree of difficulty of detection from the file name, so it is possible to count the number of colonies after judging whether or not the degree of detection difficulty is high for each captured image without dividing into folders. can.

このように、第３の実施形態では、各培地シート２のコロニーの検出難易度の判定結果に基づいて、フォルダ分けを行うか、または検出難易度を判断する識別子を撮像画像のファイル名に付記する。より具体的には、コロニーの検出難易度が高い培地シート２だけ専用のフォルダに記憶するか、または特定の識別子をファイル名に付記し、それ以外の培地シート２は通常フォルダに記憶するか、別の識別子をファイル名に付記し、各フォルダ（または各識別子）ごとに別個のパラメータを設定してコロニー数のカウント処理を行う。
これにより、多数の撮像画像の中に、コロニーの検出難易度の高い撮像画像が含まれていても、作業者が事前に手作業で仕分ける作業を行わなくても、高精度にコロニー数をカウントできる。したがって、コロニーの検出難易度が高い撮像画像に対して、パラメータを設定し直してコロニー数の再カウントを行う手間をかけなくて済む。 As described above, in the third embodiment, based on the determination result of the colony detection difficulty of each medium sheet 2, folders are divided, or an identifier for determining the detection difficulty is added to the file name of the captured image. do. More specifically, only medium sheets 2 with high colony detection difficulty are stored in a dedicated folder, or a specific identifier is added to the file name and the other medium sheets 2 are stored in a normal folder, A separate identifier is appended to the file name, and separate parameters are set for each folder (or each identifier) to perform colony counting processing.
As a result, colonies can be counted with a high degree of accuracy, even if colonies are difficult to detect among the many captured images, without the operator having to manually sort them in advance. can. Therefore, it is not necessary to reset parameters and recount the number of colonies for captured images in which colony detection is highly difficult.

（第４の実施形態）
第４の実施形態は、上述した第２及び第３の実施形態の処理を組み合わせたものである。第４の実施形態によるコロニー検出システム１は、図９と同様の機能ブロック図で表すことができる。記憶部４に記憶される撮像画像の種類は、第２及び第３の実施形態で説明したものである。 (Fourth embodiment)
The fourth embodiment is a combination of the processes of the second and third embodiments described above. A colony detection system 1 according to the fourth embodiment can be represented by a functional block diagram similar to FIG. The types of captured images stored in the storage unit 4 are those described in the second and third embodiments.

図１３は第４の実施形態によるコロニー検出システム１の概略的な処理動作を示すフローチャートである。ステップＳ６１～Ｓ６３では、図１２のステップＳ５１～Ｓ５３と同様に、コロニー数の検出難易度が高い撮像画像と判定されると、その撮像画像を専用のフォルダに記憶する。このフォルダ内の撮像画像に対しては、特定のパラメータが設定された上で、コロニー数のカウント処理が行われる。 FIG. 13 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system 1 according to the fourth embodiment. In steps S61 to S63, similarly to steps S51 to S53 in FIG. 12, if the captured image is determined to have a high colony count detection difficulty level, the captured image is stored in a dedicated folder. For captured images in this folder, colony count processing is performed after setting specific parameters.

ステップＳ６４～Ｓ６８では、図１１のステップＳ４２～Ｓ４６と同様に、撮像画像のＱＲコードの培地種類に応じてフォルダ分けを行い、各フォルダごとに各フォルダ固有の条件にて、各フォルダ内の各培地シート２のコロニー数のカウント処理を行う。 In steps S64 to S68, similarly to steps S42 to S46 in FIG. 11, folders are divided according to the medium type of the QR code of the captured image. The number of colonies on the medium sheet 2 is counted.

図１３においても、複数のフォルダに分けて記憶する代わりに、撮像画像のファイル名に付記する識別子を変更してもよい。 In FIG. 13 as well, the identifier added to the file name of the captured image may be changed instead of dividing and storing in a plurality of folders.

このように、第４の実施形態では、培地シート２の撮像画像に基づいて、コロニー数の検出難易度が高いと判定された撮像画像を専用のフォルダに記憶するか、または撮像画像のファイル名に特定の識別子を付記するとともに、その他の撮像画像については各培地種類ごとに別々のフォルダに分類するか、各ファイル名に別個の識別子を付記するため、各フォルダ（または各識別子）ごとに各フォルダ固有のパラメータ等を設定した上でコロニー数のカウント処理を行うことができ、コロニー数のカウントを精度よく行うことができる。 Thus, in the fourth embodiment, based on the captured image of the culture medium sheet 2, the captured image determined to have a high degree of difficulty in detecting the number of colonies is stored in a dedicated folder, or the file name of the captured image is with a specific identifier, and other captured images are classified into separate folders for each medium type, or a separate identifier is appended to each file name, so each folder (or each identifier) Colony count processing can be performed after setting folder-specific parameters and the like, and the colony count can be performed with high accuracy.

（第５の実施形態）
第５の実施形態は、撮像画像のＱＲコードから読み取った各種の情報に基づいて、撮像画像のフォルダ分けを行うものである。第５の実施形態によるコロニー検出システム１は、図９と同様の機能ブロック図で表すことができるが、記憶部４に記憶される撮像画像の種類が第２～第４の実施形態とは異なる。 (Fifth embodiment)
The fifth embodiment divides the captured images into folders based on various information read from the QR code of the captured images. The colony detection system 1 according to the fifth embodiment can be represented by a functional block diagram similar to that of FIG. 9, but the types of captured images stored in the storage unit 4 are different from those of the second to fourth embodiments. .

図１４は第５の実施携帯によるコロニー検出システム１の概略的な処理動作を示すフローチャートである。撮像部３にて培地シート２を順に撮像して（ステップＳ７１）、撮像画像を画像認識して、例えばＱＲコードの情報を検出する（ステップＳ７２）。ここで、情報とは、第２の実施形態で説明した培地種類だけではなく、培地シート２の検査条件（培養条件）などの情報である。情報の具体的な内容は問わないが、培地種類以外の情報が含まれているものとする。 FIG. 14 is a flow chart showing a schematic processing operation of the colony detection system 1 according to the fifth embodiment. The culture medium sheet 2 is sequentially imaged by the imaging unit 3 (step S71), and the captured image is image-recognized to detect, for example, QR code information (step S72). Here, the information is not only the medium type described in the second embodiment, but also information such as inspection conditions (culture conditions) of the medium sheet 2 . The specific content of the information is not specified, but information other than the type of medium shall be included.

次に、ＱＲコードの情報に応じたフォルダに撮像画像を記憶する（ステップＳ７３）。
例えば、情報の中に検査条件が含まれていれば、検査条件ごとに撮像画像をフォルダ分けしてもよい。 Next, the captured image is stored in a folder corresponding to the information of the QR code (step S73).
For example, if inspection conditions are included in the information, captured images may be divided into folders for each inspection condition.

その後、図１１のステップＳ４２～Ｓ４６と同様に、すべての撮像画像についてフォルダ分けを行い、その後に、各フォルダごとに、各フォルダ固有の条件にて各フォルダ内の各培地シートのコロニー数をカウントする（ステップＳ７４～Ｓ７６）。 After that, similarly to steps S42 to S46 in FIG. 11, all captured images are divided into folders, and then, for each folder, the number of colonies on each medium sheet in each folder is counted under the conditions unique to each folder. (steps S74 to S76).

図１４では、培地シート２の撮像画像をＱＲコードの情報ごとに別フォルダに分類して記憶する例を説明したが、培地シート２の撮像画像のファイル名にＱＲコードの情報を識別可能な識別子を付記してから記憶してもよい。この場合、各撮像画像を一つの記憶部４にまとめて記憶すればよい。これにより、ファイル名で各撮像画像のＱＲコードの情報を特定できるため、フォルダ分けを行わなくても、各撮像画像ごとに、ＱＲコードの情報に応じたコロニー数のカウントを行うことができる。 FIG. 14 illustrates an example in which captured images of the culture medium sheet 2 are classified into separate folders for each QR code information and stored. may be added and then stored. In this case, the captured images may be collectively stored in one storage unit 4 . As a result, since the QR code information of each captured image can be specified by the file name, the number of colonies corresponding to the QR code information can be counted for each captured image without folder sorting.

このように、第５の実施形態では、培地種類だけでなく、検査条件などの情報を考慮に入れて撮像画像のフォルダ分けを行うか、または各情報を特定する識別子を撮像画像のファイル名に付記するため、各フォルダごとに、または各識別子ごとに、検査条件などの情報を考慮に入れた最適なパラメータを設定して、コロニー数のカウント処理を行うことができる。よって、コロニー数のカウント処理を精度よく行うことができる。 As described above, in the fifth embodiment, captured images are grouped into folders in consideration of information such as inspection conditions in addition to the medium type, or an identifier specifying each piece of information is added to the file name of the captured image. Because of the addition, colony count processing can be performed by setting optimal parameters in consideration of information such as inspection conditions for each folder or each identifier. Therefore, colony count processing can be performed with high accuracy.

上述した第２～第５の実施形態において、撮像画像のフォルダ分け（またはファイル名への識別子の付記）を行った段階で、図９に示す画像処理部１０にて、各フォルダ（または各識別子）ごとに、各フォルダ（または各識別子）固有の画像処理を行い、画像処理済みの撮像画像について、コロニー数のカウント処理を行ってもよい。画像処理部１０は、例えば、撮像画像中のコロニーのエッジ強調処理やノイズ除去処理などを行ってもよい。
図７に示すように、コロニー数のカウント処理の中でもノイズ除去処理などが行われるが、図７の処理を開始する前に、何らかの画像処理を行ってもよい。このように、コロニー数のカウント処理の前処理として、種々の画像処理を行うことで、既存のコロニー数のカウント処理を改造しなくて済む。 In the above-described second to fifth embodiments, when the captured images are divided into folders (or an identifier is added to the file name), each folder (or each identifier) is processed by the image processing unit 10 shown in FIG. ), image processing unique to each folder (or each identifier) may be performed, and colony count processing may be performed on the captured images that have undergone image processing. The image processing unit 10 may perform, for example, colony edge enhancement processing and noise removal processing in the captured image.
As shown in FIG. 7, noise removal processing and the like are performed during the colony count processing, but some image processing may be performed before starting the processing of FIG. In this way, by performing various image processing as preprocessing for counting the number of colonies, there is no need to modify the existing processing for counting the number of colonies.

上述した実施形態で説明したコロニー検出システム１の少なくとも一部は、ハードウェアで構成してもよいし、ソフトウェアで構成してもよい。ソフトウェアで構成する場合には、コロニー検出システム１の少なくとも一部の機能を実現するプログラムをフレキシブルディスクやＣＤ－ＲＯＭ等の記録媒体に収納し、コンピュータに読み込ませて実行させてもよい。記録媒体は、磁気ディスクや光ディスク等の着脱可能なものに限定されず、ハードディスク装置やメモリなどの固定型の記録媒体でもよい。 At least part of the colony detection system 1 described in the above embodiments may be configured with hardware or software. When configured with software, a program that implements at least part of the functions of the colony detection system 1 may be stored in a recording medium such as a flexible disk or CD-ROM, and read and executed by a computer. The recording medium is not limited to a detachable one such as a magnetic disk or an optical disk, and may be a fixed recording medium such as a hard disk device or memory.

また、コロニー検出システム１の少なくとも一部の機能を実現するプログラムを、インターネット等の通信回線（無線通信も含む）を介して頒布してもよい。さらに、同プログラムを暗号化したり、変調をかけたり、圧縮した状態で、インターネット等の有線回線や無線回線を介して、あるいは記録媒体に収納して頒布してもよい。 Also, a program that implements at least part of the functions of the colony detection system 1 may be distributed via a communication line (including wireless communication) such as the Internet. Furthermore, the program may be encrypted, modulated, or compressed and distributed via a wired line or wireless line such as the Internet, or stored in a recording medium and distributed.

本開示の態様は、上述した個々の実施形態に限定されるものではなく、当業者が想到しうる種々の変形も含むものであり、本開示の効果も上述した内容に限定されない。すなわち、特許請求の範囲に規定された内容及びその均等物から導き出される本開示の概念的な思想と趣旨を逸脱しない範囲で種々の追加、変更及び部分的削除が可能である。 Aspects of the present disclosure are not limited to the individual embodiments described above, but include various modifications that can be conceived by those skilled in the art, and the effects of the present disclosure are not limited to the above-described contents. That is, various additions, changes, and partial deletions are possible without departing from the conceptual idea and spirit of the present disclosure derived from the content defined in the claims and equivalents thereof.

１ コロニー検出システム、２ 培地シート、３ 撮像部、４ 記憶部、５ ユーザインタフェース部、６ 制御部、７ 画像認識部、８ コロニーカウント部、８ａ 第１情報検出部、８ｂ 第１コロニーカウント部、８ｃ コード情報生成部、８ｄ 画像更新部、８ｅ 第２情報検出部、８ｆ 第２コロニーカウント部、９ 表示部、１１ 基材層、１２ 円形枠、１３ 培養層、１４ 保護層 1 colony detection system, 2 culture medium sheet, 3 imaging unit, 4 storage unit, 5 user interface unit, 6 control unit, 7 image recognition unit, 8 colony count unit, 8a first information detection unit, 8b first colony count unit, 8c code information generation unit, 8d image update unit, 8e second information detection unit, 8f second colony count unit, 9 display unit, 11 substrate layer, 12 circular frame, 13 culture layer, 14 protection layer

Claims (6)

検体に含まれる特定の微生物を培養し、培養された前記特定の微生物の集合体であるコロニーを顕在化させる複数種類の培地媒体と、
前記培地媒体の培養面を撮像する撮像部と、
前記撮像部で撮像した画像を所定の条件で分類して記憶する、複数の記憶部と、
前記複数の記憶部に記憶された画像に対して、前記記憶部ごとに、前記所定の条件に応じて前記画像中のコロニーのエッジ強調処理又はノイズ除去処理の少なくとも一方を行う画像処理部と、
前記画像処理部で画像処理された後の画像に対して、前記記憶部ごとに、前記所定の条件に応じた各記憶部固有の処理を行って、前記培地媒体で培養された前記コロニーの数をカウントするコロニーカウント部と、を備え、
前記所定の条件は、前記培地媒体の検査条件を含む、コロニー検出システム。 a plurality of types of culture media for culturing specific microorganisms contained in a specimen and manifesting colonies that are aggregates of the cultured specific microorganisms;
an imaging unit that images the culture surface of the culture medium;
a plurality of storage units that classify and store images captured by the imaging unit according to predetermined conditions;
an image processing unit that performs at least one of edge enhancement processing and noise removal processing of colonies in the image according to the predetermined condition for each of the images stored in the plurality of storage units;
The number of colonies cultured in the culture medium by performing processing specific to each storage unit according to the predetermined conditions for each storage unit on the image after image processing in the image processing unit and a colony counting unit that counts the
The colony detection system, wherein the predetermined conditions include inspection conditions for the medium. 前記コロニーカウント部は、前記複数の記憶部のうち、一つの記憶部に記憶されたすべての画像についての前記コロニーの数のカウントが終わった後、次の記憶部のカウント処理を行い、各記憶部ごとに、各記憶部に固有の条件により前記コロニーの数をカウントする、請求項１に記載のコロニー検出システム。 After counting the number of colonies for all the images stored in one storage unit out of the plurality of storage units, the colony counting unit performs counting processing for the next storage unit, 2. The colony detection system according to claim 1, wherein the number of colonies is counted for each section according to a condition unique to each storage section. 検体に含まれる特定の微生物を培養し、培養された前記特定の微生物の集合体であるコロニーを顕在化させる複数種類の培地媒体と、
前記培地媒体の培養面を撮像する撮像部と、
前記撮像部で撮像した画像のファイル名に、所定の条件に応じた識別子を付加して記憶する記憶部と、
前記記憶部に記憶された画像に対して、前記識別子ごとに、前記所定の条件に応じて前記画像中のコロニーのエッジ強調処理又はノイズ除去処理の少なくとも一方を行う画像処理部と、
前記画像処理部で画像処理された後の画像に対して、前記識別子に応じた固有の処理を行って、前記培地媒体で培養された前記コロニーの数をカウントするコロニーカウント部と、を備え、
前記所定の条件は、前記培地媒体の検査条件を含む、コロニー検出システム。 a plurality of types of culture media for culturing specific microorganisms contained in a specimen and manifesting colonies that are aggregates of the cultured specific microorganisms;
an imaging unit that images the culture surface of the culture medium;
a storage unit that adds an identifier according to a predetermined condition to the file name of the image captured by the imaging unit and stores the image;
an image processing unit that performs at least one of edge enhancement processing and noise removal processing of a colony in the image according to the predetermined condition for each identifier on the image stored in the storage unit;
a colony counting unit that counts the number of colonies cultured in the culture medium by performing unique processing according to the identifier on the image after image processing by the image processing unit;
The colony detection system , wherein the predetermined conditions include inspection conditions for the medium . 前記コロニーカウント部は、前記記憶部内において、ファイル名に特定の前記識別子が付記されたすべての画像について、対応する前記所定の条件に基づいて前記コロニーの数のカウントが終わった後、ファイル名に別の特定の前記識別子が付記されたすべての画像について、対応する前記所定の条件に基づいて前記コロニーの数のカウントを行う処理を繰り返す、請求項３に記載のコロニー検出システム。 In the storage unit, after counting the number of colonies based on the corresponding predetermined conditions for all images with the specific identifier attached to the file name, 4. The colony detection system according to claim 3, wherein the process of counting the number of colonies based on the corresponding predetermined conditions is repeated for all images to which the other specific identifiers are attached. 前記所定の条件は、前記培地媒体の種類を含む、請求項１乃至４のいずれか一項に記載のコロニー検出システム。 The colony detection system according to any one of claims 1 to 4, wherein said predetermined condition includes the type of said medium. 前記所定の条件は、前記撮像部で撮像した画像に含まれるコロニーの数をカウント可能か否かを示す情報を含む、請求項１乃至４のいずれか一項に記載のコロニー検出システム。 5. The colony detection system according to any one of claims 1 to 4, wherein said predetermined condition includes information indicating whether or not the number of colonies contained in an image captured by said imaging unit can be counted.

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